View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF9701_high_3 (Length: 362)

Name: NF9701_high_3
Description: NF9701
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF9701_high_3
NF9701_high_3
[»] chr3 (151 HSPs)
chr3 (35-339)||(28169210-28169514)
chr3 (19-344)||(27883507-27883830)
chr3 (19-322)||(14321467-14321771)
chr3 (19-344)||(16077053-16077376)
chr3 (19-339)||(4457044-4457364)
chr3 (19-347)||(8739915-8740241)
chr3 (19-344)||(1064262-1064585)
chr3 (19-339)||(4404401-4404721)
chr3 (19-341)||(17909788-17910110)
chr3 (19-339)||(9390988-9391309)
chr3 (81-339)||(12567118-12567376)
chr3 (81-339)||(13261521-13261779)
chr3 (19-339)||(9380442-9380763)
chr3 (19-339)||(19887140-19887460)
chr3 (19-344)||(1053833-1054156)
chr3 (19-339)||(23635838-23636159)
chr3 (19-341)||(1783856-1784180)
chr3 (52-344)||(16665947-16666238)
chr3 (22-339)||(24706343-24706661)
chr3 (19-339)||(48337370-48337690)
chr3 (19-338)||(933757-934076)
chr3 (19-339)||(7794393-7794713)
chr3 (19-339)||(11216507-11216828)
chr3 (19-344)||(17281220-17281544)
chr3 (35-339)||(7804320-7804624)
chr3 (19-339)||(1794268-1794590)
chr3 (19-339)||(6490134-6490456)
chr3 (19-339)||(6500788-6501110)
chr3 (35-339)||(9535737-9536041)
chr3 (19-339)||(16391400-16391721)
chr3 (19-339)||(18851477-18851798)
chr3 (36-339)||(38314827-38315131)
chr3 (19-341)||(14581264-14581584)
chr3 (51-341)||(15216159-15216448)
chr3 (19-340)||(8995744-8996063)
chr3 (19-256)||(16348420-16348658)
chr3 (19-340)||(9006296-9006615)
chr3 (19-339)||(29460999-29461319)
chr3 (56-344)||(16670986-16671273)
chr3 (19-339)||(29471851-29472171)
chr3 (52-339)||(12249259-12249546)
chr3 (69-339)||(11163957-11164228)
chr3 (19-339)||(9993679-9993999)
chr3 (52-339)||(12237433-12237720)
chr3 (19-339)||(9981671-9981991)
chr3 (19-347)||(13199030-13199358)
chr3 (19-347)||(2246488-2246813)
chr3 (19-339)||(10626726-10627048)
chr3 (19-347)||(29947139-29947459)
chr3 (19-347)||(29996293-29996613)
chr3 (19-338)||(29933352-29933663)
chr3 (19-338)||(29982506-29982817)
chr3 (218-347)||(21736231-21736360)
chr3 (19-347)||(29905974-29906294)
chr3 (19-339)||(4174541-4174864)
chr3 (19-341)||(5510822-5511145)
chr3 (218-347)||(15651055-15651184)
chr3 (218-347)||(15662690-15662819)
chr3 (19-341)||(39672668-39672992)
chr3 (19-341)||(4743864-4744187)
chr3 (19-341)||(4754449-4754772)
chr3 (19-341)||(5521000-5521323)
chr3 (19-341)||(5536807-5537130)
chr3 (19-339)||(6220487-6220809)
chr3 (19-339)||(13383049-13383371)
chr3 (19-339)||(19789150-19789472)
chr3 (19-341)||(41683804-41684128)
chr3 (19-341)||(41694373-41694697)
chr3 (19-341)||(5547391-5547714)
chr3 (19-339)||(6180313-6180635)
chr3 (19-339)||(13372455-13372777)
chr3 (19-339)||(13393643-13393965)
chr3 (19-339)||(19778513-19778835)
chr3 (19-339)||(20672981-20673303)
chr3 (19-339)||(20683566-20683888)
chr3 (19-339)||(23647876-23648198)
chr3 (19-339)||(37759798-37760120)
chr3 (19-339)||(37866573-37866895)
chr3 (20-339)||(23768022-23768343)
chr3 (19-341)||(503953-504277)
chr3 (35-341)||(526335-526643)
chr3 (19-341)||(12286764-12287088)
chr3 (19-341)||(12296586-12296910)
chr3 (218-347)||(41045668-41045797)
chr3 (218-341)||(27172958-27173082)
chr3 (101-339)||(10655131-10655370)
chr3 (19-339)||(13121790-13122112)
chr3 (19-339)||(13132033-13132355)
chr3 (19-339)||(14465719-14466041)
chr3 (19-339)||(23757426-23757748)
chr3 (35-339)||(37885706-37886012)
chr3 (19-341)||(5579419-5579743)
chr3 (19-341)||(5627803-5628127)
chr3 (19-310)||(16476436-16476728)
chr3 (19-341)||(20721239-20721563)
chr3 (218-347)||(31113971-31114100)
chr3 (19-339)||(14476351-14476673)
chr3 (19-341)||(8774783-8775108)
chr3 (19-341)||(8785368-8785693)
chr3 (19-256)||(16493250-16493487)
chr3 (19-341)||(24383304-24383628)
chr3 (19-341)||(28314017-28314341)
chr3 (19-341)||(28324633-28324957)
chr3 (19-341)||(35187503-35187827)
chr3 (19-339)||(13557702-13558024)
chr3 (19-341)||(18484170-18484495)
chr3 (218-347)||(10529271-10529401)
chr3 (52-341)||(5865513-5865803)
chr3 (52-341)||(5876112-5876402)
chr3 (19-339)||(24660028-24660350)
chr3 (19-341)||(10099194-10099519)
chr3 (218-338)||(51989128-51989249)
chr3 (19-339)||(24670608-24670930)
chr3 (35-341)||(38194850-38195159)
chr3 (35-341)||(38205386-38205695)
chr3 (35-341)||(11272184-11272493)
chr3 (35-341)||(39382816-39383125)
chr3 (50-344)||(18006420-18006704)
chr3 (218-347)||(13148190-13148321)
chr3 (218-323)||(17021975-17022082)
chr3 (35-341)||(39372179-39372488)
chr3 (218-347)||(22151170-22151301)
chr3 (19-137)||(9092153-9092270)
chr3 (268-344)||(17961475-17961551)
chr3 (218-347)||(15850933-15851065)
chr3 (218-320)||(15833355-15833459)
chr3 (221-347)||(51340935-51341063)
chr3 (19-184)||(17961625-17961788)
chr3 (234-347)||(45861693-45861807)
chr3 (274-347)||(49990185-49990259)
chr3 (52-180)||(16487181-16487308)
chr3 (221-330)||(12752727-12752838)
chr3 (19-73)||(11167868-11167922)
chr3 (234-347)||(47405542-47405656)
chr3 (19-84)||(15662494-15662558)
chr3 (234-347)||(2784989-2785102)
chr3 (19-84)||(15650859-15650923)
chr3 (234-345)||(2561114-2561226)
chr3 (298-338)||(16386203-16386243)
chr3 (19-51)||(16665897-16665929)
chr3 (234-345)||(40799800-40799912)
chr3 (277-338)||(11909188-11909250)
chr3 (234-347)||(14393125-14393239)
chr3 (234-347)||(20646078-20646192)
chr3 (234-347)||(24775655-24775769)
chr3 (234-319)||(49666526-49666612)
chr3 (35-84)||(21736493-21736541)
chr3 (234-305)||(13780705-13780777)
chr3 (19-51)||(16670932-16670964)
chr3 (234-301)||(37467303-37467371)
chr3 (234-305)||(49642883-49642955)
[»] chr4 (83 HSPs)
chr4 (19-344)||(5873512-5873837)
chr4 (19-344)||(24713574-24713897)
chr4 (19-339)||(15207205-15207524)
chr4 (19-344)||(11535988-11536311)
chr4 (19-339)||(4987420-4987741)
chr4 (20-339)||(3370862-3371181)
chr4 (19-335)||(14835895-14836211)
chr4 (19-344)||(10300677-10301000)
chr4 (19-344)||(11515178-11515500)
chr4 (19-339)||(18077697-18078018)
chr4 (19-339)||(3390602-3390922)
chr4 (19-339)||(10909555-10909877)
chr4 (19-339)||(10695787-10696108)
chr4 (19-339)||(40454140-40454460)
chr4 (35-339)||(40470395-40470699)
chr4 (19-339)||(25657283-25657604)
chr4 (19-339)||(19581388-19581709)
chr4 (19-344)||(31266591-31266914)
chr4 (19-339)||(47151870-47152191)
chr4 (19-347)||(55651464-55651789)
chr4 (52-339)||(16317477-16317765)
chr4 (20-347)||(49001774-49002098)
chr4 (19-339)||(16305253-16305573)
chr4 (35-336)||(5022886-5023188)
chr4 (218-347)||(23509257-23509386)
chr4 (218-347)||(16819364-16819493)
chr4 (218-347)||(8997268-8997397)
chr4 (19-339)||(18752280-18752602)
chr4 (19-339)||(18762890-18763212)
chr4 (218-347)||(18774667-18774796)
chr4 (19-188)||(39525954-39526120)
chr4 (19-339)||(27814736-27815058)
chr4 (19-339)||(48371278-48371600)
chr4 (19-339)||(52703935-52704257)
chr4 (19-341)||(36018481-36018805)
chr4 (19-341)||(36029034-36029358)
chr4 (19-341)||(15560870-15561194)
chr4 (19-339)||(450723-451045)
chr4 (19-339)||(461304-461626)
chr4 (19-339)||(14843444-14843766)
chr4 (19-339)||(17918199-17918521)
chr4 (19-339)||(19944118-19944440)
chr4 (19-339)||(24027876-24028198)
chr4 (19-339)||(4948482-4948804)
chr4 (19-339)||(19954753-19955075)
chr4 (19-339)||(30936863-30937185)
chr4 (218-347)||(14778454-14778583)
chr4 (218-347)||(18007071-18007200)
chr4 (19-344)||(55745043-55745370)
chr4 (19-344)||(55755654-55755981)
chr4 (19-339)||(16256016-16256338)
chr4 (19-339)||(16266609-16266931)
chr4 (35-339)||(17928847-17929153)
chr4 (19-335)||(30926285-30926603)
chr4 (19-339)||(10750959-10751281)
chr4 (19-339)||(10964728-10965050)
chr4 (19-339)||(22007158-22007480)
chr4 (218-347)||(14710790-14710919)
chr4 (19-341)||(49518280-49518604)
chr4 (19-339)||(10740385-10740707)
chr4 (19-339)||(10954154-10954476)
chr4 (19-339)||(21996560-21996882)
chr4 (218-347)||(17993805-17993934)
chr4 (218-347)||(36210119-36210250)
chr4 (35-341)||(24640392-24640701)
chr4 (35-341)||(27656745-27657054)
chr4 (35-341)||(27667318-27667627)
chr4 (52-341)||(18130065-18130354)
chr4 (19-87)||(17198213-17198281)
chr4 (218-338)||(33378339-33378461)
chr4 (19-91)||(20648425-20648497)
chr4 (278-345)||(19242168-19242235)
chr4 (130-283)||(19243982-19244133)
chr4 (234-347)||(55380209-55380323)
chr4 (19-84)||(16819167-16819230)
chr4 (234-347)||(14604985-14605096)
chr4 (234-347)||(23750441-23750555)
chr4 (35-84)||(8997088-8997136)
chr4 (275-347)||(12600677-12600750)
chr4 (234-302)||(15475221-15475290)
chr4 (234-305)||(3395551-3395623)
chr4 (234-305)||(17398752-17398824)
chr4 (234-305)||(22190807-22190879)
[»] chr6 (100 HSPs)
chr6 (19-339)||(13913128-13913447)
chr6 (19-347)||(18826037-18826363)
chr6 (19-347)||(18834433-18834759)
chr6 (19-347)||(27166242-27166568)
chr6 (19-339)||(25787780-25788100)
chr6 (19-339)||(12827771-12828092)
chr6 (19-344)||(29765609-29765932)
chr6 (19-339)||(11147046-11147367)
chr6 (19-339)||(20029701-20030021)
chr6 (19-339)||(20062452-20062772)
chr6 (19-339)||(8653739-8654061)
chr6 (19-339)||(5845163-5845499)
chr6 (19-339)||(7375555-7375875)
chr6 (19-256)||(13928350-13928586)
chr6 (19-347)||(9933470-9933796)
chr6 (27-339)||(16123342-16123654)
chr6 (19-344)||(17745563-17745904)
chr6 (19-339)||(18925558-18925880)
chr6 (19-347)||(4292797-4293123)
chr6 (19-347)||(25518761-25519085)
chr6 (19-344)||(31572488-31572811)
chr6 (19-347)||(17741502-17741827)
chr6 (52-339)||(26044292-26044579)
chr6 (19-344)||(22308864-22309188)
chr6 (50-347)||(25686577-25686874)
chr6 (19-344)||(25986155-25986480)
chr6 (19-344)||(28251360-28251687)
chr6 (19-347)||(25735355-25735683)
chr6 (19-347)||(25675232-25675560)
chr6 (163-347)||(19289322-19289505)
chr6 (19-347)||(25679308-25679636)
chr6 (56-309)||(6158316-6158569)
chr6 (218-347)||(18555341-18555470)
chr6 (19-323)||(25722755-25723059)
chr6 (101-344)||(28356591-28356834)
chr6 (218-347)||(12953126-12953255)
chr6 (27-188)||(16123021-16123181)
chr6 (218-347)||(18498691-18498820)
chr6 (19-341)||(17042698-17043019)
chr6 (218-347)||(31931494-31931623)
chr6 (19-339)||(7751031-7751353)
chr6 (20-184)||(32761730-32761894)
chr6 (19-339)||(9122928-9123250)
chr6 (19-341)||(17064271-17064591)
chr6 (19-170)||(17577593-17577744)
chr6 (19-341)||(3661459-3661782)
chr6 (19-341)||(3672123-3672446)
chr6 (19-178)||(9421-9580)
chr6 (19-339)||(9112291-9112613)
chr6 (19-339)||(31542694-31543016)
chr6 (218-347)||(7586252-7586381)
chr6 (35-341)||(16930527-16930834)
chr6 (19-341)||(16959698-16960021)
chr6 (19-341)||(29384828-29385151)
chr6 (52-339)||(27506020-27506309)
chr6 (19-341)||(17984506-17984830)
chr6 (218-341)||(17047631-17047755)
chr6 (19-339)||(12855099-12855421)
chr6 (19-339)||(12865625-12865947)
chr6 (19-339)||(26875490-26875812)
chr6 (19-339)||(33199406-33199727)
chr6 (19-339)||(34806956-34807278)
chr6 (19-341)||(26036109-26036433)
chr6 (19-339)||(26864866-26865188)
chr6 (52-339)||(27372910-27373199)
chr6 (52-339)||(27463260-27463549)
chr6 (19-339)||(32961725-32962047)
chr6 (19-339)||(34817588-34817910)
chr6 (19-341)||(26025535-26025859)
chr6 (218-338)||(21128161-21128281)
chr6 (19-339)||(27384511-27384833)
chr6 (19-339)||(27474924-27475246)
chr6 (19-339)||(27504423-27504745)
chr6 (19-347)||(27341764-27342094)
chr6 (19-347)||(27402504-27402834)
chr6 (19-347)||(27413163-27413493)
chr6 (19-339)||(32972344-32972666)
chr6 (19-341)||(31982422-31982746)
chr6 (218-344)||(11206020-11206146)
chr6 (135-344)||(11235573-11235780)
chr6 (218-347)||(17608401-17608530)
chr6 (145-341)||(17982423-17982621)
chr6 (35-347)||(12716646-12716961)
chr6 (35-347)||(12727295-12727610)
chr6 (145-347)||(4630943-4631147)
chr6 (145-347)||(32300965-32301169)
chr6 (145-347)||(32311654-32311858)
chr6 (218-347)||(20635644-20635775)
chr6 (218-324)||(22386750-22386858)
chr6 (22-84)||(10971325-10971387)
chr6 (234-347)||(19086083-19086197)
chr6 (234-319)||(19623932-19624018)
chr6 (234-347)||(32544190-32544304)
chr6 (19-84)||(18498953-18499017)
chr6 (19-84)||(18555603-18555667)
chr6 (234-344)||(29917945-29918056)
chr6 (234-347)||(16265260-16265374)
chr6 (19-57)||(25800712-25800750)
chr6 (35-84)||(12952945-12952993)
chr6 (35-84)||(31931756-31931804)
[»] chr2 (84 HSPs)
chr2 (19-344)||(27978188-27978512)
chr2 (19-344)||(28064717-28065041)
chr2 (19-339)||(38585892-38586212)
chr2 (19-339)||(26867175-26867496)
chr2 (19-339)||(18768711-18769031)
chr2 (19-339)||(24414827-24415147)
chr2 (19-339)||(26879764-26880085)
chr2 (19-341)||(28731709-28732029)
chr2 (19-341)||(28721121-28721443)
chr2 (19-339)||(21172271-21172591)
chr2 (19-293)||(24425356-24425629)
chr2 (19-346)||(967310-967634)
chr2 (19-346)||(24275123-24275446)
chr2 (19-339)||(2561593-2561913)
chr2 (21-295)||(28374320-28374595)
chr2 (19-347)||(22774455-22774782)
chr2 (19-347)||(22779833-22780160)
chr2 (19-346)||(36784611-36784929)
chr2 (19-346)||(22763752-22764078)
chr2 (19-347)||(19497797-19498123)
chr2 (50-347)||(19312853-19313149)
chr2 (218-347)||(19356416-19356545)
chr2 (19-347)||(17969014-17969341)
chr2 (135-347)||(19299932-19300142)
chr2 (19-339)||(7005611-7005933)
chr2 (19-341)||(21650336-21650659)
chr2 (19-341)||(43355123-43355446)
chr2 (19-339)||(29244324-29244646)
chr2 (19-339)||(29254903-29255225)
chr2 (19-341)||(34478029-34478352)
chr2 (19-339)||(17857241-17857563)
chr2 (19-339)||(24327538-24327860)
chr2 (19-339)||(34790021-34790343)
chr2 (19-339)||(34804164-34804486)
chr2 (19-341)||(10267094-10267418)
chr2 (19-341)||(10277671-10277995)
chr2 (19-341)||(43345508-43345831)
chr2 (19-339)||(9773110-9773432)
chr2 (19-339)||(9897378-9897700)
chr2 (19-339)||(9907966-9908288)
chr2 (19-339)||(24338208-24338530)
chr2 (19-339)||(43082749-43083072)
chr2 (19-339)||(43093358-43093681)
chr2 (19-339)||(9762574-9762896)
chr2 (19-339)||(22914668-22914990)
chr2 (35-339)||(36251664-36251970)
chr2 (19-339)||(40222435-40222757)
chr2 (19-339)||(40251296-40251618)
chr2 (19-341)||(1098999-1099323)
chr2 (19-341)||(4209991-4210315)
chr2 (35-341)||(11388629-11388937)
chr2 (218-347)||(20646610-20646739)
chr2 (19-339)||(22960136-22960458)
chr2 (19-341)||(4099884-4100208)
chr2 (19-341)||(4220583-4220907)
chr2 (19-341)||(11394976-11395300)
chr2 (19-341)||(11405292-11405616)
chr2 (19-341)||(32217974-32218298)
chr2 (19-341)||(39169899-39170223)
chr2 (35-344)||(18392457-18392768)
chr2 (19-310)||(30488627-30488919)
chr2 (21-167)||(28379659-28379806)
chr2 (35-341)||(27221481-27221790)
chr2 (35-341)||(35253082-35253391)
chr2 (35-341)||(35263691-35264000)
chr2 (35-341)||(35274316-35274625)
chr2 (19-148)||(6081470-6081598)
chr2 (218-347)||(22755386-22755516)
chr2 (19-180)||(16777117-16777278)
chr2 (211-339)||(16769045-16769175)
chr2 (221-347)||(1083933-1084061)
chr2 (218-347)||(24814633-24814764)
chr2 (234-347)||(23392735-23392849)
chr2 (19-84)||(19356679-19356743)
chr2 (19-123)||(20236714-20236818)
chr2 (19-64)||(20417466-20417511)
chr2 (218-259)||(21025530-21025571)
chr2 (234-347)||(24377020-24377134)
chr2 (19-83)||(20070685-20070750)
chr2 (234-347)||(22188169-22188283)
chr2 (234-347)||(28711765-28711879)
chr2 (275-347)||(20152134-20152207)
chr2 (237-344)||(22258123-22258231)
chr2 (234-345)||(31800954-31801066)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (19-339)||(51928-52252)
[»] scaffold0407 (2 HSPs)
scaffold0407 (19-347)||(11943-12269)
scaffold0407 (19-345)||(15774-16098)
[»] scaffold0002 (5 HSPs)
scaffold0002 (19-339)||(117209-117529)
scaffold0002 (218-347)||(475305-475436)
scaffold0002 (218-347)||(481825-481956)
scaffold0002 (218-347)||(156681-156812)
scaffold0002 (19-65)||(347472-347518)
[»] chr7 (93 HSPs)
chr7 (19-341)||(38593601-38593923)
chr7 (19-339)||(40054620-40054940)
chr7 (19-344)||(18441305-18441628)
chr7 (19-339)||(31116377-31116698)
chr7 (19-339)||(1367743-1368063)
chr7 (19-339)||(15888195-15888515)
chr7 (19-339)||(589326-589646)
chr7 (19-339)||(9171099-9171419)
chr7 (19-344)||(18419224-18419547)
chr7 (19-342)||(8933631-8933952)
chr7 (19-339)||(21769809-21770129)
chr7 (19-339)||(9170298-9170618)
chr7 (19-347)||(26209417-26209742)
chr7 (19-335)||(9159847-9160163)
chr7 (19-339)||(30049632-30049953)
chr7 (19-339)||(20491120-20491440)
chr7 (19-339)||(44280610-44280930)
chr7 (22-345)||(15216425-15216745)
chr7 (19-339)||(3165848-3166168)
chr7 (19-339)||(14745535-14745856)
chr7 (19-347)||(29590099-29590424)
chr7 (19-296)||(6044079-6044354)
chr7 (19-347)||(12734035-12734360)
chr7 (19-339)||(19985678-19986000)
chr7 (19-347)||(3476209-3476534)
chr7 (22-347)||(13682427-13682749)
chr7 (19-256)||(48382343-48382578)
chr7 (218-347)||(24882485-24882614)
chr7 (19-339)||(9443972-9444294)
chr7 (19-339)||(20989765-20990087)
chr7 (19-339)||(21002874-21003196)
chr7 (19-339)||(9433376-9433698)
chr7 (19-341)||(9085394-9085717)
chr7 (19-341)||(9095108-9095431)
chr7 (19-339)||(467447-467769)
chr7 (19-339)||(2705478-2705800)
chr7 (35-339)||(5685631-5685937)
chr7 (19-339)||(6867091-6867413)
chr7 (19-339)||(6877723-6878045)
chr7 (19-339)||(37344312-37344634)
chr7 (19-341)||(48710357-48710681)
chr7 (19-341)||(40041975-40042298)
chr7 (19-341)||(40052524-40052847)
chr7 (19-339)||(454665-454987)
chr7 (35-339)||(541197-541503)
chr7 (19-339)||(2716082-2716404)
chr7 (19-339)||(8617498-8617820)
chr7 (19-339)||(24930469-24930791)
chr7 (218-347)||(8998998-8999127)
chr7 (19-339)||(4222722-4223044)
chr7 (19-339)||(8628061-8628383)
chr7 (19-339)||(11096167-11096489)
chr7 (19-339)||(17949984-17950306)
chr7 (19-339)||(26653191-26653513)
chr7 (19-339)||(26699520-26699842)
chr7 (19-341)||(166992-167316)
chr7 (19-339)||(4212123-4212445)
chr7 (35-341)||(1987650-1987958)
chr7 (35-341)||(1998271-1998579)
chr7 (19-341)||(177584-177908)
chr7 (19-341)||(11005295-11005619)
chr7 (19-341)||(26389962-26390286)
chr7 (19-339)||(17960590-17960912)
chr7 (19-339)||(22089235-22089557)
chr7 (19-339)||(22099850-22100172)
chr7 (19-341)||(26400604-26400928)
chr7 (19-344)||(8001930-8002258)
chr7 (19-344)||(8012575-8012903)
chr7 (19-341)||(24734863-24735187)
chr7 (19-341)||(24744810-24745134)
chr7 (220-347)||(11087110-11087237)
chr7 (35-341)||(42865937-42866245)
chr7 (35-341)||(42876563-42876871)
chr7 (218-347)||(13174668-13174799)
chr7 (276-344)||(38403331-38403399)
chr7 (19-180)||(26290217-26290378)
chr7 (19-111)||(9261629-9261721)
chr7 (213-341)||(26294089-26294219)
chr7 (19-129)||(23264457-23264567)
chr7 (234-347)||(21692208-21692322)
chr7 (19-84)||(19193268-19193332)
chr7 (234-347)||(21695322-21695436)
chr7 (234-343)||(48237025-48237135)
chr7 (35-159)||(22494045-22494169)
chr7 (234-305)||(331608-331680)
chr7 (234-347)||(16112007-16112121)
chr7 (234-347)||(30944446-30944560)
chr7 (234-347)||(33691835-33691949)
chr7 (234-347)||(41842396-41842510)
chr7 (234-287)||(19339373-19339426)
chr7 (237-305)||(21381555-21381624)
chr7 (35-84)||(24882304-24882352)
chr7 (275-347)||(30025826-30025899)
[»] scaffold0047 (2 HSPs)
scaffold0047 (19-339)||(32729-33049)
scaffold0047 (19-339)||(40278-40600)
[»] chr8 (87 HSPs)
chr8 (19-339)||(18768957-18769278)
chr8 (19-339)||(16747141-16747461)
chr8 (19-339)||(18153876-18154197)
chr8 (19-339)||(18158395-18158716)
chr8 (19-339)||(19225074-19225394)
chr8 (19-339)||(19418492-19418812)
chr8 (27-339)||(40212998-40213310)
chr8 (19-347)||(3843655-3843980)
chr8 (19-339)||(19429067-19429389)
chr8 (21-339)||(30314518-30314836)
chr8 (19-339)||(23469279-23469601)
chr8 (19-339)||(31215155-31215475)
chr8 (19-339)||(23457123-23457444)
chr8 (19-347)||(20259440-20259765)
chr8 (19-347)||(21046070-21046395)
chr8 (19-339)||(20161049-20161369)
chr8 (19-339)||(20196098-20196418)
chr8 (19-344)||(1750228-1750556)
chr8 (35-339)||(6318353-6318657)
chr8 (218-347)||(22211407-22211536)
chr8 (19-347)||(23370686-23371005)
chr8 (218-347)||(22135877-22136006)
chr8 (218-347)||(22167042-22167171)
chr8 (19-339)||(3220771-3221093)
chr8 (19-339)||(19139419-19139741)
chr8 (19-341)||(209973-210296)
chr8 (19-341)||(252546-252869)
chr8 (19-341)||(723596-723919)
chr8 (19-341)||(848787-849110)
chr8 (19-341)||(36293056-36293380)
chr8 (19-341)||(36303659-36303983)
chr8 (19-341)||(241961-242284)
chr8 (19-341)||(29076868-29077191)
chr8 (19-341)||(29087119-29087442)
chr8 (19-341)||(32077516-32077839)
chr8 (19-341)||(32088089-32088412)
chr8 (19-339)||(26111371-26111693)
chr8 (19-339)||(26121049-26121371)
chr8 (51-347)||(19461081-19461376)
chr8 (51-347)||(19558759-19559054)
chr8 (52-187)||(28691193-28691328)
chr8 (19-341)||(36078072-36078397)
chr8 (19-341)||(36088658-36088983)
chr8 (19-341)||(9341281-9341605)
chr8 (101-339)||(19128887-19129127)
chr8 (19-339)||(9856291-9856613)
chr8 (19-339)||(15780529-15780851)
chr8 (19-339)||(15791118-15791440)
chr8 (19-341)||(6161162-6161486)
chr8 (218-347)||(7018400-7018529)
chr8 (19-341)||(9368425-9368749)
chr8 (19-339)||(6151209-6151532)
chr8 (19-339)||(18449509-18449831)
chr8 (19-250)||(43248547-43248778)
chr8 (218-347)||(23271223-23271353)
chr8 (206-339)||(30325259-30325392)
chr8 (19-341)||(3348446-3348770)
chr8 (19-341)||(3359043-3359367)
chr8 (218-347)||(8031951-8032081)
chr8 (218-338)||(40003155-40003277)
chr8 (19-137)||(30325113-30325231)
chr8 (52-339)||(6576373-6576661)
chr8 (35-341)||(13688402-13688711)
chr8 (19-166)||(16436880-16437026)
chr8 (218-347)||(17519161-17519292)
chr8 (218-338)||(29379504-29379626)
chr8 (148-347)||(44481222-44481423)
chr8 (148-347)||(44491838-44492039)
chr8 (218-347)||(28903377-28903507)
chr8 (221-347)||(21540869-21540997)
chr8 (234-347)||(15336208-15336322)
chr8 (234-347)||(15425273-15425387)
chr8 (234-347)||(15516577-15516691)
chr8 (274-341)||(795316-795383)
chr8 (234-347)||(21932800-21932914)
chr8 (234-347)||(45568021-45568135)
chr8 (19-84)||(22135681-22135745)
chr8 (234-305)||(13430748-13430820)
chr8 (234-305)||(21288362-21288434)
chr8 (234-305)||(21300981-21301053)
chr8 (19-84)||(795588-795654)
chr8 (234-347)||(30421549-30421663)
chr8 (274-339)||(43248465-43248531)
chr8 (234-347)||(45538559-45538673)
chr8 (275-347)||(18121267-18121340)
chr8 (19-84)||(22211210-22211274)
chr8 (35-84)||(23783708-23783756)
[»] chr5 (130 HSPs)
chr5 (20-339)||(19477908-19478228)
chr5 (19-339)||(17457346-17457666)
chr5 (20-339)||(19463878-19464198)
chr5 (19-347)||(21414225-21414551)
chr5 (19-341)||(24926172-24926494)
chr5 (19-339)||(21706009-21706331)
chr5 (19-339)||(17446730-17447050)
chr5 (19-341)||(24983453-24983775)
chr5 (19-339)||(23406352-23406672)
chr5 (19-339)||(34062526-34062846)
chr5 (19-339)||(36084367-36084687)
chr5 (35-339)||(21703162-21703468)
chr5 (19-347)||(106025-106352)
chr5 (19-339)||(20797601-20797922)
chr5 (19-339)||(36228645-36228965)
chr5 (19-339)||(43043705-43044026)
chr5 (19-339)||(37406561-37406874)
chr5 (19-339)||(34771817-34772137)
chr5 (19-339)||(34782762-34783082)
chr5 (19-339)||(20551721-20552041)
chr5 (19-339)||(34051865-34052185)
chr5 (19-302)||(20562246-20562528)
chr5 (19-339)||(42394886-42395205)
chr5 (19-347)||(20416810-20417135)
chr5 (41-339)||(43621894-43622193)
chr5 (19-339)||(1109180-1109500)
chr5 (19-339)||(8521747-8522067)
chr5 (19-344)||(20624672-20624995)
chr5 (19-339)||(31418567-31418889)
chr5 (19-339)||(31448458-31448780)
chr5 (19-339)||(1121938-1122258)
chr5 (19-296)||(23392622-23392898)
chr5 (19-339)||(10754399-10754719)
chr5 (19-339)||(30069940-30070260)
chr5 (135-347)||(20168088-20168298)
chr5 (218-347)||(13533838-13533967)
chr5 (218-345)||(13523113-13523240)
chr5 (218-347)||(36095755-36095884)
chr5 (218-347)||(36097212-36097341)
chr5 (218-347)||(35543231-35543360)
chr5 (19-347)||(32753972-32754300)
chr5 (19-339)||(27622800-27623122)
chr5 (22-339)||(5290609-5290928)
chr5 (19-341)||(9335861-9336184)
chr5 (19-341)||(9346448-9346771)
chr5 (19-341)||(24807818-24808141)
chr5 (19-341)||(9377493-9377817)
chr5 (19-341)||(14558048-14558372)
chr5 (19-341)||(14568685-14569009)
chr5 (19-341)||(23296182-23296506)
chr5 (19-341)||(23306750-23307074)
chr5 (19-341)||(24816917-24817241)
chr5 (19-341)||(24827505-24827829)
chr5 (19-341)||(15694063-15694386)
chr5 (19-341)||(24566995-24567318)
chr5 (19-341)||(42042690-42043013)
chr5 (19-341)||(42053265-42053588)
chr5 (19-339)||(22146426-22146748)
chr5 (19-339)||(22157009-22157331)
chr5 (19-339)||(27603451-27603773)
chr5 (19-339)||(39352393-39352715)
chr5 (19-341)||(6975713-6976037)
chr5 (218-347)||(13405038-13405167)
chr5 (52-339)||(22559376-22559664)
chr5 (19-310)||(39362219-39362511)
chr5 (19-341)||(23707348-23707671)
chr5 (19-339)||(7032159-7032483)
chr5 (19-339)||(16003924-16004246)
chr5 (35-339)||(27203714-27204020)
chr5 (19-339)||(31843864-31844186)
chr5 (19-153)||(21519965-21520099)
chr5 (19-341)||(6986203-6986527)
chr5 (19-341)||(30227529-30227852)
chr5 (19-341)||(30238056-30238379)
chr5 (19-339)||(6130694-6131016)
chr5 (19-339)||(23362015-23362337)
chr5 (19-339)||(36582591-36582913)
chr5 (19-339)||(36593146-36593468)
chr5 (19-339)||(40400924-40401246)
chr5 (19-341)||(14029949-14030273)
chr5 (19-341)||(14040502-14040826)
chr5 (35-347)||(14447024-14447339)
chr5 (35-347)||(14457636-14457951)
chr5 (19-347)||(15739872-15740203)
chr5 (19-347)||(15769032-15769363)
chr5 (19-341)||(27460066-27460390)
chr5 (19-341)||(27470465-27470789)
chr5 (218-347)||(40228581-40228710)
chr5 (19-339)||(15993362-15993684)
chr5 (19-339)||(40390262-40390584)
chr5 (218-347)||(1915339-1915469)
chr5 (19-341)||(22676021-22676345)
chr5 (19-341)||(22685912-22686236)
chr5 (19-347)||(35225994-35226325)
chr5 (35-256)||(5301270-5301491)
chr5 (218-347)||(20215201-20215332)
chr5 (19-256)||(31815068-31815305)
chr5 (19-341)||(27042243-27042567)
chr5 (19-347)||(35215410-35215741)
chr5 (52-341)||(39490981-39491271)
chr5 (52-341)||(39502171-39502461)
chr5 (218-347)||(40032855-40032981)
chr5 (35-341)||(40514020-40514329)
chr5 (19-341)||(27052867-27053192)
chr5 (19-256)||(23372416-23372654)
chr5 (35-341)||(33951831-33952140)
chr5 (19-347)||(17718823-17719154)
chr5 (19-347)||(17729475-17729806)
chr5 (145-347)||(17607092-17607296)
chr5 (145-347)||(17617706-17617910)
chr5 (145-347)||(31348566-31348770)
chr5 (145-347)||(31359180-31359384)
chr5 (145-347)||(36687727-36687931)
chr5 (145-347)||(36698293-36698497)
chr5 (218-347)||(23478290-23478421)
chr5 (145-341)||(37729282-37729481)
chr5 (145-341)||(37740598-37740797)
chr5 (221-347)||(25111966-25112094)
chr5 (221-347)||(25171057-25171185)
chr5 (234-338)||(11208087-11208192)
chr5 (234-347)||(89524-89638)
chr5 (234-347)||(32160687-32160801)
chr5 (234-305)||(35986334-35986406)
chr5 (234-347)||(26784275-26784389)
chr5 (234-305)||(21660175-21660247)
chr5 (300-347)||(23488436-23488483)
chr5 (234-347)||(4886943-4887057)
chr5 (234-347)||(9398836-9398950)
chr5 (35-84)||(35543050-35543098)
chr5 (234-345)||(41566536-41566648)
[»] chr1 (90 HSPs)
chr1 (19-339)||(20441146-20441467)
chr1 (19-339)||(9050316-9050637)
chr1 (19-339)||(39193923-39194243)
chr1 (19-339)||(7689286-7689608)
chr1 (19-341)||(47195316-47195639)
chr1 (19-339)||(18381732-18382053)
chr1 (23-339)||(39587026-39587343)
chr1 (19-347)||(14387957-14388283)
chr1 (19-339)||(4250394-4250714)
chr1 (27-339)||(17957297-17957609)
chr1 (19-347)||(11194899-11195224)
chr1 (19-347)||(18310803-18311129)
chr1 (19-339)||(148043-148363)
chr1 (19-339)||(154118-154438)
chr1 (19-339)||(5973821-5974142)
chr1 (19-347)||(41132447-41132772)
chr1 (19-294)||(12946818-12947091)
chr1 (19-347)||(675496-675820)
chr1 (19-347)||(46180710-46181036)
chr1 (218-347)||(45070681-45070810)
chr1 (164-347)||(20195667-20195850)
chr1 (19-339)||(35012979-35013300)
chr1 (218-347)||(20798989-20799118)
chr1 (19-339)||(23580155-23580477)
chr1 (218-347)||(20883910-20884039)
chr1 (218-347)||(22610002-22610131)
chr1 (218-347)||(23926983-23927112)
chr1 (19-339)||(4167315-4167637)
chr1 (19-339)||(5639539-5639861)
chr1 (19-339)||(5650096-5650418)
chr1 (19-339)||(12730603-12730925)
chr1 (19-339)||(12897812-12898134)
chr1 (19-339)||(21877823-21878145)
chr1 (19-339)||(33084618-33084940)
chr1 (19-339)||(2538592-2538913)
chr1 (218-347)||(5929628-5929757)
chr1 (19-341)||(12614145-12614469)
chr1 (19-341)||(12623610-12623934)
chr1 (19-339)||(19179015-19179338)
chr1 (35-339)||(4177971-4178277)
chr1 (19-339)||(12741196-12741518)
chr1 (19-339)||(21863717-21864039)
chr1 (19-339)||(21895258-21895580)
chr1 (19-341)||(3171676-3172001)
chr1 (19-341)||(3182278-3182603)
chr1 (22-341)||(10997616-10997937)
chr1 (35-347)||(28474152-28474460)
chr1 (19-341)||(7507356-7507680)
chr1 (19-341)||(7517953-7518277)
chr1 (218-338)||(19037940-19038061)
chr1 (101-339)||(19187894-19188135)
chr1 (218-347)||(28379920-28380049)
chr1 (19-338)||(36236259-36236579)
chr1 (19-338)||(36246806-36247126)
chr1 (19-341)||(51629016-51629340)
chr1 (19-341)||(51656277-51656601)
chr1 (175-345)||(44200938-44201108)
chr1 (19-347)||(5833266-5833597)
chr1 (19-347)||(5843868-5844199)
chr1 (218-347)||(20251699-20251828)
chr1 (19-347)||(38095124-38095455)
chr1 (19-347)||(38105749-38106080)
chr1 (19-347)||(47607759-47608090)
chr1 (19-347)||(47618367-47618698)
chr1 (218-347)||(52350712-52350841)
chr1 (218-347)||(22019260-22019391)
chr1 (218-347)||(22642819-22642950)
chr1 (218-347)||(22655401-22655532)
chr1 (35-341)||(35401009-35401318)
chr1 (35-341)||(35404236-35404545)
chr1 (35-341)||(35648535-35648844)
chr1 (35-341)||(35637883-35638192)
chr1 (218-347)||(17370966-17371097)
chr1 (218-347)||(26548282-26548413)
chr1 (219-347)||(19170360-19170490)
chr1 (19-180)||(30291905-30292066)
chr1 (218-286)||(23064935-23065003)
chr1 (234-347)||(10757345-10757459)
chr1 (218-338)||(21543962-21544084)
chr1 (19-84)||(20883713-20883777)
chr1 (237-305)||(34255561-34255630)
chr1 (234-305)||(42284594-42284666)
chr1 (234-347)||(1900269-1900383)
chr1 (234-347)||(22464851-22464965)
chr1 (274-347)||(24028768-24028842)
chr1 (234-347)||(25448608-25448722)
chr1 (234-345)||(22153783-22153895)
chr1 (234-305)||(33256393-33256465)
chr1 (234-305)||(33276565-33276637)
chr1 (234-305)||(36134156-36134228)
[»] scaffold0627 (1 HSPs)
scaffold0627 (20-310)||(7889-8179)
[»] scaffold0068 (2 HSPs)
scaffold0068 (19-339)||(7579-7901)
scaffold0068 (35-339)||(10442-10748)
[»] scaffold0133 (2 HSPs)
scaffold0133 (19-339)||(42346-42666)
scaffold0133 (19-341)||(31239-31563)
[»] scaffold0216 (1 HSPs)
scaffold0216 (19-339)||(49-370)
[»] scaffold0497 (1 HSPs)
scaffold0497 (19-344)||(10115-10438)
[»] scaffold0272 (2 HSPs)
scaffold0272 (19-339)||(13432-13753)
scaffold0272 (19-84)||(13127-13192)
[»] scaffold0072 (1 HSPs)
scaffold0072 (35-339)||(36576-36881)
[»] scaffold0042 (2 HSPs)
scaffold0042 (19-344)||(5401-5724)
scaffold0042 (19-244)||(12896-13119)
[»] scaffold0322 (1 HSPs)
scaffold0322 (18-339)||(6710-7032)
[»] scaffold0267 (1 HSPs)
scaffold0267 (22-339)||(6048-6365)
[»] scaffold0084 (2 HSPs)
scaffold0084 (19-344)||(56608-56932)
scaffold0084 (274-347)||(483-557)
[»] scaffold0028 (2 HSPs)
scaffold0028 (19-339)||(53949-54269)
scaffold0028 (19-339)||(14693-15015)
[»] scaffold0747 (1 HSPs)
scaffold0747 (19-339)||(2909-3230)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (19-256)||(34984-35221)
[»] scaffold0201 (2 HSPs)
scaffold0201 (19-318)||(7362-7659)
scaffold0201 (19-79)||(7060-7120)
[»] scaffold0391 (1 HSPs)
scaffold0391 (19-339)||(2045-2364)
[»] scaffold1477 (1 HSPs)
scaffold1477 (64-288)||(1531-1755)
[»] scaffold0154 (1 HSPs)
scaffold0154 (19-347)||(35640-35965)
[»] scaffold0017 (4 HSPs)
scaffold0017 (19-347)||(175427-175753)
scaffold0017 (19-256)||(180430-180665)
scaffold0017 (218-347)||(40369-40499)
scaffold0017 (218-347)||(58915-59045)
[»] scaffold0012 (3 HSPs)
scaffold0012 (19-347)||(127749-128074)
scaffold0012 (19-347)||(140908-141233)
scaffold0012 (218-344)||(7674-7801)
[»] scaffold0739 (1 HSPs)
scaffold0739 (19-346)||(2098-2422)
[»] scaffold0099 (2 HSPs)
scaffold0099 (19-256)||(19444-19686)
scaffold0099 (36-302)||(16763-17044)
[»] scaffold0752 (2 HSPs)
scaffold0752 (138-347)||(1923-2130)
scaffold0752 (218-347)||(1308-1437)
[»] scaffold0163 (3 HSPs)
scaffold0163 (218-347)||(29578-29707)
scaffold0163 (19-84)||(29840-29904)
scaffold0163 (19-57)||(36607-36645)
[»] scaffold0481 (1 HSPs)
scaffold0481 (19-344)||(12652-12975)
[»] scaffold0073 (2 HSPs)
scaffold0073 (218-347)||(58404-58533)
scaffold0073 (19-84)||(58666-58730)
[»] scaffold1204 (1 HSPs)
scaffold1204 (19-184)||(2259-2424)
[»] scaffold0414 (1 HSPs)
scaffold0414 (19-187)||(2550-2718)
[»] scaffold0547 (2 HSPs)
scaffold0547 (218-347)||(821-950)
scaffold0547 (19-84)||(1084-1147)
[»] scaffold0410 (1 HSPs)
scaffold0410 (131-347)||(15832-16046)
[»] scaffold0001 (2 HSPs)
scaffold0001 (218-347)||(28820-28950)
scaffold0001 (19-83)||(408034-408099)
[»] scaffold0090 (2 HSPs)
scaffold0090 (35-347)||(749-1058)
scaffold0090 (35-347)||(5129-5438)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (218-347)||(59316-59444)
scaffold0007 (227-256)||(143114-143143)
[»] scaffold0178 (1 HSPs)
scaffold0178 (19-187)||(27001-27169)
[»] scaffold0226 (1 HSPs)
scaffold0226 (21-183)||(19045-19208)
[»] scaffold0027 (1 HSPs)
scaffold0027 (19-339)||(6667-6989)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (199-347)||(40605-40753)
[»] scaffold0386 (1 HSPs)
scaffold0386 (19-339)||(12465-12787)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (218-347)||(61147-61276)
scaffold0005 (234-347)||(212282-212393)
[»] scaffold0280 (1 HSPs)
scaffold0280 (218-347)||(17861-17992)
[»] scaffold0655 (1 HSPs)
scaffold0655 (221-338)||(5051-5170)
[»] scaffold0063 (1 HSPs)
scaffold0063 (19-188)||(15128-15295)
[»] scaffold0105 (3 HSPs)
scaffold0105 (19-341)||(8068-8393)
scaffold0105 (19-341)||(36782-37107)
scaffold0105 (19-341)||(47416-47741)
[»] scaffold0040 (1 HSPs)
scaffold0040 (19-186)||(69860-70025)
[»] scaffold0010 (1 HSPs)
scaffold0010 (218-347)||(61657-61788)
[»] scaffold0604 (1 HSPs)
scaffold0604 (19-188)||(7-174)
[»] scaffold0314 (1 HSPs)
scaffold0314 (19-120)||(20599-20700)
[»] scaffold0906 (1 HSPs)
scaffold0906 (19-256)||(4323-4562)
[»] scaffold0774 (1 HSPs)
scaffold0774 (218-280)||(6388-6450)
[»] scaffold0443 (1 HSPs)
scaffold0443 (274-347)||(1117-1190)
[»] scaffold0422 (1 HSPs)
scaffold0422 (218-347)||(11686-11816)
[»] scaffold0177 (1 HSPs)
scaffold0177 (218-347)||(20432-20562)
[»] scaffold0570 (1 HSPs)
scaffold0570 (218-347)||(1727-1858)
[»] scaffold0477 (1 HSPs)
scaffold0477 (145-256)||(6161-6272)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (218-347)||(6577-6708)
[»] scaffold0083 (1 HSPs)
scaffold0083 (19-128)||(53356-53466)
[»] scaffold1321 (1 HSPs)
scaffold1321 (218-347)||(990-1121)
[»] scaffold1263 (1 HSPs)
scaffold1263 (218-347)||(1183-1314)
[»] scaffold0185 (1 HSPs)
scaffold0185 (218-291)||(9278-9352)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (51-283)||(22030-22260)
[»] scaffold0334 (1 HSPs)
scaffold0334 (19-129)||(19618-19728)
[»] scaffold0297 (1 HSPs)
scaffold0297 (222-347)||(16880-17007)
[»] scaffold0269 (1 HSPs)
scaffold0269 (274-347)||(7209-7283)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (274-347)||(4008-4082)
[»] scaffold0544 (2 HSPs)
scaffold0544 (309-347)||(9907-9945)
scaffold0544 (19-84)||(9730-9794)
[»] scaffold0211 (1 HSPs)
scaffold0211 (234-343)||(15694-15804)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (234-347)||(38157-38270)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (234-315)||(165018-165100)
[»] scaffold0664 (1 HSPs)
scaffold0664 (278-330)||(1310-1363)
[»] scaffold0337 (1 HSPs)
scaffold0337 (234-305)||(14615-14687)
[»] scaffold0069 (1 HSPs)
scaffold0069 (234-305)||(5397-5469)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (316-347)||(38120-38151)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (277-338)||(1912-1974)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (35-84)||(163490-163538)
[»] scaffold0387 (1 HSPs)
scaffold0387 (234-305)||(7348-7420)
[»] scaffold0324 (1 HSPs)
scaffold0324 (234-305)||(9923-9995)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 241; Significance: 1e-133; HSPs: 151)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 35 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 28169514 - 28169210
Alignment:
35 catcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttctcgtttc 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
28169514 catcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaaggtacaattaatcagtgaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttctcgtttc 28169415  T
135 aacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaacagagttgacaaagtaca 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
28169414 aacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaagaacactgagtacttgtcctgcgttaatagagttgacaaagtaca 28169315  T
235 agtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttccttcaagataggaatgaatt 334  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||  | ||||  ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
28169314 agtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaattgttccttcaagatgggaatgaatt 28169215  T
335 tgaag 339  Q
    |||||    
28169214 tgaag 28169210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 19 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 27883830 - 27883507
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||     
27883830 atcagaagcagaagaccatcagaagcaagattt-catcagaagcgatatcatcaccagaagctacaattgatcagtaaatttaaactgaagattcaaagg 27883732  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaaca 218  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| ||    
27883731 agctgtttttcgtttcaacctcgtctaaga-gaacgaagaattgacagggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatca 27883633  T
219 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttccttc 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
27883632 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaaatgttccttc 27883533  T
319 aagataggaatgaatttgaagttgat 344  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||    
27883532 aagatgggaatgaatttgaaattgat 27883507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 19 - 322
Target Start/End: Original strand, 14321467 - 14321771
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
14321467 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatcagtgaatttaaactgaagattcaaagt 14321566  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtca-tttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||  |||| |    
14321567 agctgtttgtcgtttcaacctcatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcattttgaagaacactgagtacttgtcctttgttatc 14321666  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcctt 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||  ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||    
14321667 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacaactcttcctgcagaaatgttcctt 14321766  T
318 caaga 322  Q
    |||||    
14321767 caaga 14321771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 19 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 16077376 - 16077053
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| | ||| || ||||| ||||||||||||||||     
16077376 atcagaagcagaagaccatcagaagcaagattt-catcagaagctatatcatcaccagaagctacaaatgatcagtaaattttaactgaagattcaaagg 16077278  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaaca 218  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||| ||||| ||    
16077277 agctgtttttcgtttcaacctcgtctaaga-gaatgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaagaacactgagtacttgtccttcgttatca 16077179  T
219 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttccttc 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||    
16077178 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagcaatgttccttc 16077079  T
319 aagataggaatgaatttgaagttgat 344  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||    
16077078 aagatgggaatgaatttgaagttgat 16077053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 4457364 - 4457044
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||| |||| ||||||||||| ||||||    
4457364 atcagaagcagaaggtcgtcagaagcaaggttttcatcagaagcgatatcatcaccagaagctacatttgatctgtaaattcaaactgaagatccaaagt 4457265  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaaca 218  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| |||| ||||||||    
4457264 agctgtttctcatttcaacctcgtctaagaaaaatgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggagaacactgagtacttgtccttcgttaaca 4457165  T
219 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttccttc 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||  ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| |||||||||    
4457164 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaaatgttccttc 4457065  T
319 aagataggaatgaatttgaag 339  Q
    ||| | |||||||||||||||    
4457064 aagttgggaatgaatttgaag 4457044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 19 - 347
Target Start/End: Original strand, 8739915 - 8740241
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| | |||  | ||||||||||||||||||||||     
8739915 atcagaagcagaataccatcagaagcaagattt-catcagaagctacatcatcaccagaagctacaagtgatcattaaatttaaactgaagattcaaagg 8740013  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaaca 218  Q
    || ||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||| ||||| ||    
8740014 agttgtttttcgtttcaacctcgtcta-gaagaaagaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaagaacactgagtacttgtccttcgttatca 8740112  T
219 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttccttc 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
8740113 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttcttgtccacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaattgctccttc 8740212  T
319 aagataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||    
8740213 aagatgggaatgaatttgaagttgatcct 8740241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 19 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 1064585 - 1064262
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||||     
1064585 atcagaagcagaagaccatcagaagcaagattt-catcagaagctatatcatcaccagaagctacaagtgatcagtaaatttaaactgaagattcaaagg 1064487  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaaca 218  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  ||| || |||| ||||| ||    
1064486 agctgtttttcgtttcaacctcgtctaaga-gaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcgtttgaagagcactaggtatttgtccttcgttatca 1064388  T
219 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttccttc 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||  ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||    
1064387 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctacctgcagaaatgttccttc 1064288  T
319 aagataggaatgaatttgaagttgat 344  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||    
1064287 aagatgggaatgaatttgaagttgat 1064262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 4404721 - 4404401
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    |||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| || ||| || |||| ||||||||||| ||||||    
4404721 atcaaaagcagaaggtcatcagaagcaaggttttcatcagaagcgatatcatcactagaagctacatttgatccgtaaattcaaactgaagatccaaagt 4404622  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaaca 218  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| |||| ||||||||    
4404621 agctgtttctcatttcaacctcgtctaagaaaaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggagaacactgagtacttgtccttcgttaaca 4404522  T
219 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttccttc 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||  ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| |||||||||    
4404521 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaaatgttccttc 4404422  T
319 aagataggaatgaatttgaag 339  Q
    ||| | |||||||||||||||    
4404421 aagttgggaatgaatttgaag 4404401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 19 - 341
Target Start/End: Original strand, 17909788 - 17910110
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||    
17909788 atcagaagcagaagctcatcagaagcaaggttttcatcagaagcgatatcatcaccagaagctacatttaatctgtaaattcaaactgaagatccaaagt 17909887  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaaca 218  Q
    ||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| || |||| ||||||||    
17909888 agctgtttctcatttcaactttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagcactgagtatttgtccttcgttaaca 17909987  T
219 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcctt 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||| ||||||||||||||| |||| || ||||||||||| || | ||||    
17909988 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacatctatgcctgcagaatttatgcctt 17910086  T
318 caagataggaatgaatttgaagtt 341  Q
    |||||| |||||||||||||||||    
17910087 caagatgggaatgaatttgaagtt 17910110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Original strand, 9390988 - 9391309
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| || |||| ||||||||||| ||||||    
9390988 atcagaagcagaaaatcatcagaagcaaagttttcatcagaagcgatatcatcaccagaagctacatttaatccgtaaattcaaactgaagatccaaagt 9391087  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaaca 218  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||| || |||| ||||||||    
9391088 agctgtttctcatttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcacttgaagcgcactgagtatttgtccttcgttaaca 9391187  T
219 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcctt 317  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||  | ||||  ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| |||||||||    
9391188 gagttgagaaagtacaaatgtaccaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaatttgttcctt 9391287  T
318 caagataggaatgaatttgaag 339  Q
    |||||| |||||||||||||||    
9391288 caagatgggaatgaatttgaag 9391309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 81 - 339
Target Start/End: Original strand, 12567118 - 12567376
Alignment:
81 tacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgg 180  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
12567118 tacaattaatcagtgaatttaaactgaagatttaaagtagttgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgg 12567217  T
181 tcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctaca 280  Q
    |||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||  | ||||  |||||||    
12567218 tcatttgaagaacactgagtacttgtcctgcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactaccttcactactctgtttttgtctacgctaca 12567317  T
281 agacaagataacagctctgcctgcagaattgttccttcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
12567318 agacaagacaacagctatgcctgcagaattgttccttcaagatgggaatgaatttgaag 12567376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 81 - 339
Target Start/End: Original strand, 13261521 - 13261779
Alignment:
81 tacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgg 180  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
13261521 tacaattaatcagtgaatttaaactgaagatttaaagtagttgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgg 13261620  T
181 tcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctaca 280  Q
    |||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||  | ||||  |||||||    
13261621 tcatttgaagaacactgagtacttgtcctgcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactaccttcactactctgtttttgtctacgctaca 13261720  T
281 agacaagataacagctctgcctgcagaattgttccttcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
13261721 agacaagacaacagctatgcctgcagaattgttccttcaagatgggaatgaatttgaag 13261779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Original strand, 9380442 - 9380763
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||    
9380442 atcagaagcagaaaatcatcagaagcaaagttttcatcagaaccgatatcatcaccagaagctacatttaatctgtaaattcaaactgaagatccaaagt 9380541  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaaca 218  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||||| || |||| ||||||||    
9380542 agctatttctcatttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacagtcacttgaagcgcactgagtatttgtccttcgttaaca 9380641  T
219 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcctt 317  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||  | ||||  ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| |||||||||    
9380642 tagttgacaaagtacaaatgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaatttgttcctt 9380741  T
318 caagataggaatgaatttgaag 339  Q
    |||||| |||||||||||||||    
9380742 caagatgggaatgaatttgaag 9380763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Original strand, 19887140 - 19887460
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| || |||| ||||||||||| ||||||    
19887140 atcagaagcagaagctcatcagaagcaaggttttcatcagaagcgatatcatcaccagaagctacatttaatccgtaaattcaaactgaagatccaaagt 19887239  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaaca 218  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| || | || ||||||||    
19887240 agctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagcactgagtatttgtacttcgttaaca 19887339  T
219 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcctt 317  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| || |||  | ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||    
19887340 gagttgacaaagcacaagtgtacaaccactaactccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcctt 19887438  T
318 caagataggaatgaatttgaag 339  Q
    |||||| |||||||||||||||    
19887439 caagatgggaatgaatttgaag 19887460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 19 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 1054156 - 1053833
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||  || |||||| | |||||||||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||||     
1054156 atcagaagcagaagtccatcagaagcaagatttctat-agaagctatatcatcaccagaagctacaagtgatcagtaaatttaaactgaagattcaaagg 1054058  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaaca 218  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||| |||| ||||| ||    
1054057 agctgtttttcgtttcaacctcgtctaaga-gaacgaagaattgaaagggagatatcaacggtcatttgaagagcactaggtacttgtccttcgttatca 1053959  T
219 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttccttc 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||  | ||||  ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||    
1053958 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactttgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgtagaaatgttccttc 1053859  T
319 aagataggaatgaatttgaagttgat 344  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||    
1053858 aagatgggaatgaatttgaagttgat 1053833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 23636159 - 23635838
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||  ||| |||||||||||  |||||    
23636159 atcagaagcagaaggtcatcagaagcagggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacattcaatccgtatattcaaactgaagatctaaagt 23636060  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaaca 218  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||| | || |||| ||||||||    
23636059 agctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagtactgagcatttgtccttcgttaaca 23635960  T
219 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcctt 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||    
23635959 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcctt 23635860  T
318 caagataggaatgaatttgaag 339  Q
    |||||| |||||||||||||||    
23635859 caagatgggaatgaatttgaag 23635838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 19 - 341
Target Start/End: Original strand, 1783856 - 1784180
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| |||||||||||    
1783856 atcagaagcagatggtcatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattgatccgtaaatttaaactggagattcaaagt 1783955  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaaca 218  Q
    ||||||||  | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  ||  ||| ||||||| |||| ||||||||    
1783956 agctgtttaacatttcaaccttgtctaagaagaacgaagaattgaaagggagacatcaacggtcatttggagaaaactaagtacttgtccttcgttaaca 1784055  T
219 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagata-acagctctgcctgcagaattgttcct 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||| ||||||||||||||| | |||||  ||||||||||| |||||||    
1784056 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttttgtccacgctacaagacaagaaacacagccatgcctgcagaaatgttcct 1784155  T
317 tcaagataggaatgaatttgaagtt 341  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
1784156 tcaagatgggaatgaatttgaagtt 1784180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 52 - 344
Target Start/End: Original strand, 16665947 - 16666238
Alignment:
52 tcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaaga 151  Q
    ||||||||||| | |||||||||| ||||||||| | ||| || |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||    
16665947 tcatcagaagctatatcatcaccaaaagctacaagtgatcagtaaatttaaactgaagattcaaaggagctgtttttcgtttcaacctcgtcta-gaaga 16666045  T
152 acgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacc 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
16666046 acgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgggtacttgtccttcgttatcagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacc 16666145  T
252 tccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttccttcaagataggaatgaatttgaagttgat 344  Q
    ||||| ||  ||    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
16666146 tccactactttgttcttgtccacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaattgttccttcaagatgtgaatgaatttgaagttgat 16666238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 22 - 339
Target Start/End: Original strand, 24706343 - 24706661
Alignment:
22 agaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagtagc 121  Q
    ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| ||  ||| |||||||||||  ||||||||    
24706343 agaagcaaaaggtcatcagaagcaaggttttcatcagaaacgatatcatcaccagaagctacatttaatccgtatattcaaactgaagatcaaaagtagc 24706442  T
122 tgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaacagag 221  Q
    |||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| || |||| |||||||||||    
24706443 tgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagcactgagtatttgtccttcgttaacagag 24706542  T
222 ttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttccttcaa 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||   | ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||    
24706543 ttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctatttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgccttcaa 24706642  T
321 gataggaatgaatttgaag 339  Q
    ||| |||||||||||||||    
24706643 gatgggaatgaatttgaag 24706661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 48337690 - 48337370
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    |||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||| || |||| ||||||||||| ||||||    
48337690 atcagaagcataagctcatcagaagcaaggttttcatcagaagcgatatcatcaccagaagctacattttatccgtaaattcaaactgaagatccaaagt 48337591  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaaca 218  Q
    ||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||| || |||| ||||||||    
48337590 agctgtttctcatttcaacattatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcatcggtcatttggacagcactgagtatttgtccttcgttaaca 48337491  T
219 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcctt 317  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||    
48337490 gaattgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcctt 48337392  T
318 caagataggaatgaatttgaag 339  Q
    |||||| |||||||||||||||    
48337391 caagatgggaatgaatttgaag 48337370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 19 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 934076 - 933757
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||| || |||| ||||||||||| ||||||    
934076 atcagaagcagaagctcatcagaagcaagattttcatcagaagcgatatcaccaccagaagctacatttaatccgtaaattcaaactgaagatccaaagt 933977  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaaca 218  Q
    ||||||||||| |||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || ||||||| || |||| ||||||||    
933976 agctgtttctcatttcaatcttatctaagaagaatgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcttttgaagtgctctgagtatttgtccttcgttaaca 933877  T
219 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcctt 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||    
933876 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcctt 933778  T
318 caagataggaatgaatttgaa 338  Q
    |||||| ||||||||||||||    
933777 caagatgggaatgaatttgaa 933757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Original strand, 7794393 - 7794713
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||| || ||||||  | |||| ||||||||||| ||||||    
7794393 atcagaagcagaagctcatcagaagcaaggttttcatcaaaagcaatatcatcaccagaagctgcatttaatccataaattcaaactgaagatccaaagt 7794492  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaaca 218  Q
    ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    |||||| |||| ||||||| ||||||||    
7794493 agctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattaaaagggaggtatcaacggtcatttagatagcactaagtatttttccttcgttaaca 7794592  T
219 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcctt 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||    
7794593 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcctt 7794691  T
318 caagataggaatgaatttgaag 339  Q
    |||||| |||||||||||||||    
7794692 caagatgggaatgaatttgaag 7794713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Original strand, 11216507 - 11216828
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    |||||||||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | || ||| |  |||| ||||||||||| ||||||    
11216507 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaagttttcatcagaagcgatatcatcaccagaagctatatttgatccgcaaattcaaactgaagatccaaagt 11216606  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaaca 218  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |  || |||||| || |||| ||||||||    
11216607 agttgtttctcatttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaatgatcatttgaagtccattgagtatttgtccttcgttaaca 11216706  T
219 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcctt 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||    
11216707 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcctt 11216806  T
318 caagataggaatgaatttgaag 339  Q
    |||||| |||||||||||||||    
11216807 caagatgggaatgaatttgaag 11216828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 19 - 344
Target Start/End: Original strand, 17281220 - 17281544
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| | ||| || |||||||||||| |||||||||     
17281220 atcagaagcagaagaccatcagaagcaagattt-catcagaagctatatcatcaccagaagctacaagtgatcagtaaatttaaactgacgattcaaagg 17281318  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaac-gaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||| ||||| |    
17281319 agctgtttttcgtttcaacctcgtctaag-agaactgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaaaagcactgggtacttgtccttcgttatc 17281417  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcctt 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||  ||||||||||||| | ||||||| | ||||||||| ||||||||    
17281418 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaaacaacagctatacctgcagaaatgttcctt 17281517  T
318 caagataggaatgaatttgaagttgat 344  Q
    ||| ||   ||||||||||||||||||    
17281518 caaaatgaaaatgaatttgaagttgat 17281544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 35 - 339
Target Start/End: Original strand, 7804320 - 7804624
Alignment:
35 catcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttctcgtttc 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| || ||||||  | |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
7804320 catcagaagcaaggttttcatcagaagcaatatcatcaccagaagctgcatttaatccataaattcaaactgaagatccaaagtagctgtttctcatttc 7804419  T
135 aacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaacagagttgacaaagtaca 234  Q
    |||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||    
7804420 aaccttatctaagaagaacgaagaattaaaagggaggtatcaacggtcatttggatagcactgagtatttgtccttcgttaacagagttgacaaagtaca 7804519  T
235 agtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttccttcaagataggaatgaat 333  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||  | ||||| ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||    
7804520 agtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaatacaacagctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaat 7804618  T
334 ttgaag 339  Q
    ||||||    
7804619 ttgaag 7804624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Original strand, 1794268 - 1794590
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    |||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| |||||||||||    
1794268 atcagaagcagatggtcatcagaaacaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattgatccgtaaatttaaactggagattcaaagt 1794367  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaaca 218  Q
    || |||||  | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||  ||  ||| ||||||| |||| ||||||||    
1794368 agttgtttaacatttcaaccttgtctaagaagaacgaagaattgaaagggagacatcaacgatcatttggagaaaactaagtacttgtccttcgttaaca 1794467  T
219 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaag-ataacagctctgcctgcagaattgttcct 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||| |||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||||||    
1794468 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttttgtccacgctacaagacaagaaaaacagccatgcctgcagaaatgttcct 1794567  T
317 tcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
    ||||||| |||||||||||||||    
1794568 tcaagatgggaatgaatttgaag 1794590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Original strand, 6490134 - 6490456
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggtttt-catcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||  |  ||| ||||||||||| |||||    
6490134 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatatattcaaactgaagatccaaag 6490233  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||| ||||| | || |||| |||||||    
6490234 tagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattaaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgagcagttgtccttcgttaac 6490333  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaat-tgttcct 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||    
6490334 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgcct 6490433  T
317 tcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
    ||||||| |||||||||||||||    
6490434 tcaagatgggaatgaatttgaag 6490456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Original strand, 6500788 - 6501110
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggtttt-catcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||  |   || ||||||||||| |||||    
6500788 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatattttcaaactgaagatccaaag 6500887  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||| | || |||| |||||||    
6500888 tagctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgagcagttgtccttcgttaac 6500987  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaat-tgttcct 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||    
6500988 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgcct 6501087  T
317 tcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
    ||||||| |||||||||||||||    
6501088 tcaagatgggaatgaatttgaag 6501110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 35 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 9536041 - 9535737
Alignment:
35 catcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttctcgtttc 134  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||| || ||| || |||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||    
9536041 catcagaagcaaggatttcattagaagcgatatcatcaccagaagctacattttatccgtaaattcaaactgaagatccaaagtagttgtttctcatttc 9535942  T
135 aacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaacagagttgacaaagtaca 234  Q
    ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||    
9535941 aacattatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagcactgagtatttgtccttcgttaacagagttgacaaagtaca 9535842  T
235 agtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttccttcaagataggaatgaat 333  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||  | |||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||    
9535841 agtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccatgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaat 9535743  T
334 ttgaag 339  Q
    ||||||    
9535742 ttgaag 9535737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Original strand, 16391400 - 16391721
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  ||| ||||||||||| ||||||    
16391400 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacatttaatccgtatattcaaactgaagatccaaagt 16391499  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaaca 218  Q
    |||||||||||  ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   | ||||||| | || |||| ||||||||    
16391500 agctgtttctcaattcaatcttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcttttggataacactgagcatttgtccttcgttaaca 16391599  T
219 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaat-tgttcctt 317  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| || |||  | ||||| ||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||| || |    
16391600 gagttgacaaagtacaagtatacaaccactatctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaaaacaacagctatgcctgcagaatgtgtaccct 16391699  T
318 caagataggaatgaatttgaag 339  Q
    |||||| |||||||||||||||    
16391700 caagatgggaatgaatttgaag 16391721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Original strand, 18851477 - 18851798
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtga-atttaaactgaagattcaaag 117  Q
    ||||||||||||||  ||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||| || | ||| || ||||||||||||||    
18851477 atcagaagcagaagctcatcagaaataagattttcatcaaaagcgaaatcatcaccagaagttacatttgatcagtaatattcaatctgaagattcaaag 18851576  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    ||||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||  | |||| |||||||    
18851577 tagctatttaacatttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggaaaacactgagtaaatgtccttcgttaac 18851676  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcctt 317  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||  | ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||    
18851677 agagttgacaaagtacaagtatacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcaaaattgttcctt 18851776  T
318 caagataggaatgaatttgaag 339  Q
    |||||| |||||||||||||||    
18851777 caagatgggaatgaatttgaag 18851798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 36 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 38315131 - 38314827
Alignment:
36 atcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttctcgtttca 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| || |||  ||||||||||||||||||||||||||  | |||||    
38315131 atcagaagcaaggttttcatcagaagttaaatcatcaccagaagctacaattgatccgtaaatccaaactgaagattcaaagtagctgtttaacatttca 38315032  T
136 acctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaacagagttgacaaagtacaa 235  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  || |||| |||| || |||| |||||||||||||||||||||||||    
38315031 accttgtctaagaagaacgaagaattgaaagggagacatcaacggtcatttggagaacactaagtatttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaa 38314932  T
236 gtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaag-ataacagctctgcctgcagaattgttccttcaagataggaatgaatt 334  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||  | ||||| |||||||||||||| | |||||   ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
38314931 gtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagaaaaacagtcatgcctgcagaaatgttccttcaagatgggaatgaatt 38314832  T
335 tgaag 339  Q
    |||||    
38314831 tgaag 38314827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 19 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 14581584 - 14581264
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||||     
14581584 atcagaagcagaagtc-atcagaagcaagattt-catcagaagctatatcatcaccagaagctacaagtgatcagtaaatttaaactgaagattcaaagg 14581487  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaaca 218  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    ||||||| |||||| |||| | ||  ||    
14581486 agctttttttcgtttcaacctcgtct-agaagaacgaagaattgcaagggaggtatcaacggtcatttacaaagcactgggtacttgtccttcattttca 14581388  T
219 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcctt 317  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    ||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||    
14581387 gcgttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactaccctgttcttgtccacgctacaagacaagacaacagctctacctgcagaatttgttcctt 14581288  T
318 caagataggaatgaatttgaagtt 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
14581287 caagataggaatgaatttgaagtt 14581264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 51 - 341
Target Start/End: Original strand, 15216159 - 15216448
Alignment:
51 ttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaag 150  Q
    ||||||||||||   |||||||||||||||||||| | ||| || |||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |    
15216159 ttcatcagaagctctatcatcaccagaagctacaagtgatcagtaaatttaaactgacgattcaaaggagctgtttttcgtttcaacctcgtctaaga-g 15216257  T
151 aacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactac 250  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||| |||| | |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
15216258 aacgaagaattgaaagtgaggtatcaacgatcatttgaagagcactgggtacctgtccttcgttatcagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactac 15216357  T
251 ctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttccttcaagataggaatgaatttgaagtt 341  Q
    |||||| || |||  | ||||  ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
15216358 ctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaaatgttccttcaagatgggaatgaatttgaagtt 15216448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 19 - 340
Target Start/End: Original strand, 8995744 - 8996063
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||   ||| |||||||||| | |||||||||| ||||| ||| | | | || ||||||||||||||||||||||     
8995744 atcagaagcagaagaccatcataagcacaattt-catcagaagctatatcatcaccataagcttcaagtgaacagttaatttaaactgaagattcaaaga 8995842  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaaca 218  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| || |||| | ||| ||    
8995843 agctgtttttcgtttcaacctcgtctaaga-gaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcattttaaaagcactgagtatttgtccttcattatca 8995941  T
219 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttccttc 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||  ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| |||||||||    
8995942 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaaatgttccttc 8996041  T
319 aagataggaatgaatttgaagt 340  Q
    ||||| ||||||||||||||||    
8996042 aagatgggaatgaatttgaagt 8996063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 19 - 256
Target Start/End: Original strand, 16348420 - 16348658
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||| ||||||||||| ||||||    
16348420 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattgatttgtaaattcaaactgaagatccaaagt 16348519  T
119 agct-gtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| || || | |||||||    
16348520 agcttgtttctcatttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagcactgagtatttgtctttcgttaac 16348619  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccac 256  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
16348620 agagttgacaaaatacaagtgtgcaaccactacctccac 16348658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 19 - 340
Target Start/End: Original strand, 9006296 - 9006615
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||| | |||||||||||||||| ||| | | | || ||||||||||||||||||||||     
9006296 atcagaagcagaagaccatcagaagcacaattt-catcagaagctatatcatcaccagaagcttcaagtgaacagttaatttaaactgaagattcaaaga 9006394  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaaca 218  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |  ||||||||||| || |||| | ||| ||    
9006395 agctgtttttcgtttcaatctcgtctaaga-gaacgaagaattgaaagggagatatcaacgggcattttaaaagcactgagtatttgtccttcattatca 9006493  T
219 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttccttc 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||  ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| |||||||||    
9006494 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaaatgttccttc 9006593  T
319 aagataggaatgaatttgaagt 340  Q
    ||||| ||||||||||||||||    
9006594 aagatgggaatgaatttgaagt 9006615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Original strand, 29460999 - 29461319
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  |  ||| ||||| ||||| ||||||    
29460999 atcagaagcagaaggtaatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaagtcatcaccagaagctacatttaatccatatattcaaactaaagatccaaagt 29461098  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaaca 218  Q
    ||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||   ||| ||||| | || |||| ||||||||    
29461099 agctgtttctcatttcaatctcatctaagaagaacggagaattgaaaggaaggtatcaacggtcatttggacagcgctgagcatttgtccttcgttaaca 29461198  T
219 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcctt 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||| ||||||||||||||| ||||||| || |||||||| |||| ||||    
29461199 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgtctgcagaatttgtgcctt 29461297  T
318 caagataggaatgaatttgaag 339  Q
    |||  | |||||||||||||||    
29461298 caaagtgggaatgaatttgaag 29461319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 56 - 344
Target Start/End: Original strand, 16670986 - 16671273
Alignment:
56 cagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacga 155  Q
    ||||||| | |||||||||| ||||||||| | ||| || |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||    
16670986 cagaagctatatcatcaccaaaagctacaagtgatcagtaaatttaaactgaagattcaaaggagctgtttttcgtttcaacctcgtcta-gaagaatga 16671084  T
156 agaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctcca 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| || |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
16671085 agaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaagagcagtgggtatttgtccttcgttatcagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctcca 16671184  T
256 cgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttccttcaagataggaatgaatttgaagttgat 344  Q
    | ||  |     ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
16671185 ctacttttctcttgtccacactacaagacaagacaacagctctgcctgtagaattgttccttcaagatgtgaatgaatttgaagttgat 16671273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Original strand, 29471851 - 29472171
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  |  ||| ||||| ||||| ||||||    
29471851 atcagaagcagaaggtaatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaagtcatcaccagaagctacatttaatccatatattcaaactaaagatccaaagt 29471950  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaaca 218  Q
    ||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||   ||| ||||| | || |||| ||||||||    
29471951 agctgtttctcatttcaatctcatctaagaagaacagagaattgaaaggaaggtatcaacggtcatttggacagcgctgagcatttgtccttcgttaaca 29472050  T
219 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcctt 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||| ||||||||||||||| ||||||| || |||||||| |||| ||||    
29472051 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgtctgcagaatttgtgcctt 29472149  T
318 caagataggaatgaatttgaag 339  Q
    |||  | |||||||||||||||    
29472150 caaagtgggaatgaatttgaag 29472171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 52 - 339
Target Start/End: Original strand, 12249259 - 12249546
Alignment:
52 tcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaaga 151  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||  |  | | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||    
12249259 tcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatatagtcaaactgaagatccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaaga 12249358  T
152 acgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacc 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||| | || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
12249359 acgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgagcagttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacc 12249458  T
252 tccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaat-tgttccttcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
    ||||| || |||  | ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||    
12249459 tccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaag 12249546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 69 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 11164228 - 11163957
Alignment:
69 atcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaaggg 168  Q
    |||||| ||||||||| || ||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
11164228 atcaccggaagctacatttgatccgcaaattcaaactgaagattcaaagtagctgtttaacatttcaacctcgtctaagaagaacgaaaaattgaaaggg 11164129  T
169 aggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgt 268  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    |    
11164128 aggtatcaacggtcatttgaagtgcactgagtatttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttctt 11164029  T
269 gtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgtt-ccttcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| || |||||||||| |||||||||||||||    
11164028 gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctacagaatttttgccttcaagatgggaatgaatttgaag 11163957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Original strand, 9993679 - 9993999
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggtttt-catcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||  |  | | ||||||||||| |||||    
9993679 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatttactcaaactgaagatccaaag 9993778  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||||||||  ||||| |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||| | || |||| |||||||    
9993779 tagctgtttcttatttca-ccttatctaataagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgagcatttgtcctacgttaac 9993877  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcct 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||    
9993878 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcct 9993976  T
317 tcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
    ||||||| |||||||||||||||    
9993977 tcaagatgggaatgaatttgaag 9993999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 52 - 339
Target Start/End: Original strand, 12237433 - 12237720
Alignment:
52 tcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaaga 151  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||  |  | | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||    
12237433 tcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatatagtcaaactgaagatccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaaga 12237532  T
152 acgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacc 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||| | || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
12237533 acgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgagcagttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacc 12237632  T
252 tccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaat-tgttccttcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
    ||||| || |||  | ||||| ||||||||||||||| || |||| |||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||    
12237633 tccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaatagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaag 12237720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Original strand, 9981671 - 9981991
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggtttt-catcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||  |  | | ||||||||||| |||||    
9981671 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatttactcaaactgaagatccaaag 9981770  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||||||||  ||||| |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||| |  | |||| |||||||    
9981771 tagctgtttcttatttca-ccttatctaataagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgagcatctgtcctacgttaac 9981869  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcct 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||| ||||||||||||||| |||| || ||||||||||| |||| |||    
9981870 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacatctatgcctgcagaatttgtgcct 9981968  T
317 tcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
    ||||||| |||||||||||||||    
9981969 tcaagatgggaatgaatttgaag 9981991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 19 - 347
Target Start/End: Original strand, 13199030 - 13199358
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctg-tgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||||||||| || ||| |   | |||||||||||| |||||||    
13199030 atcagaagcagaagtccatcagaagcaagattt-catcagaagctatatcatcaccagaagctacagttgatcagaatattttaaactgaagtttcaaag 13199128  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
     |||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||  || |||| | || |     
13199129 gagctgtttttcgttttaacctcgtctaag-agaacgatgaattaaaagggaggtaccaacggtcatttgaaaagcactgggtgtttgtccttctttga- 13199226  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg--agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    | ||||   |||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||    
13199227 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttttgtctatgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaaatgatcc 13199326  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
13199327 ttcaagataggaatgaatttgaagttgatcct 13199358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 19 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 2246813 - 2246488
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||||||||| || ||| ||  ||||||||| ||| |||||||     
2246813 atcagaagcataagtccatcagaagcaagattt-catcagaagctatatcatcaccagaagctacagttgatcagtatatttaaactaaagtttcaaagg 2246715  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaaca 218  Q
    || ||||| |||||| |||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||  ||  || |||| | || | |    
2246714 agttgtttttcgttttaacctcgtctaaga-gaacgaaggattaaaagggaggtaccaacgttcatttgaaaagcactaggtgtttgtccttcattga-a 2246617  T
219 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttccttc 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||  | ||||   |||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||    
2246616 gagttgacaaagtacaagtgtacaactactacctccactactctgtttttgtctatgctacaagacaagacaacagctctgcctgcataaatgttccttc 2246517  T
319 aagataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
2246516 aagataggaatgaatttgaagttgatcct 2246488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Original strand, 10626726 - 10627048
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaat--catcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaa 116  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  | ||||||||||||||| || |||  | |||  ||||||||||||||||    
10626726 atcagaagcagaagatcatcagaagcaaggttttcatcagaagcaaaataccttcaccagaagctacatttgatcccttaatc-aaactgaagattcaaa 10626824  T
117 gtagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaa 216  Q
    |||||||| ||||  ||||  ||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   | ||||||| |||| ||     ||||    
10626825 gtagctgtctctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatatggatatcactgagcacttgtctcctattaa 10626924  T
217 cagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaat-tgttcc 315  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||  ||||||||||||||| ||||||  |||||||||| | ||  ||    
10626925 cagagttgacatagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgcttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagattctgcgcc 10627024  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
    |||||||| |||||||||||||||    
10627025 ttcaagatgggaatgaatttgaag 10627048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 19 - 347
Target Start/End: Original strand, 29947139 - 29947459
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctg-tgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||| | ||||||||||||||||||| || ||  | | | |||||||||||| |||||||    
29947139 atcagaagcagaagtccatcagaagcaatattt-catcagaagctatatcatcaccagaagctacatttgattagtttattttaaactgaagtttcaaag 29947237  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
     ||||||||||||||||||||| |       ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||| |||| | || |     
29947238 gagctgtttctcgtttcaaccttg-------agaacgaagaattaaaagagaggtatcaacggtcatttgaaaagcacggagtgcttgtccttctttga- 29947329  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcctt 317  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || ||   | ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||    
29947330 agagttgacaaagtacaagtttacaaccactacctatactactctatttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaaattttcctt 29947429  T
318 caagataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||    
29947430 caagataggaatggatttgaacttgatcct 29947459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 19 - 347
Target Start/End: Original strand, 29996293 - 29996613
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctg-tgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||| | ||||||||||||||||||| || ||  | | | |||||||||||| |||||||    
29996293 atcagaagcagaagtccatcagaagcaatattt-catcagaagctatatcatcaccagaagctacatttgattagtttattttaaactgaagtttcaaag 29996391  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
     ||||||||||||||||||||| |       ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||| |||| | || |     
29996392 gagctgtttctcgtttcaaccttg-------agaacgaagaattaaaagagaggtatcaacggtcatttgaaaagcacggagtgcttgtccttctttga- 29996483  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcctt 317  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || ||   | ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||    
29996484 agagttgacaaagtacaagtttacaaccactacctatactactctatttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaaattttcctt 29996583  T
318 caagataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||    
29996584 caagataggaatggatttgaacttgatcct 29996613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 19 - 338
Target Start/End: Original strand, 29933352 - 29933663
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaattt-aaactgaagattcaaag 117  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||| | || |||||||||||||||| || ||  ||  |||| ||||||||| |||||||    
29933352 atcagaagcagaagtccatcagaagcaatattt-catcagaagctatataatcaccagaagctacatttgattagtttattttaaactgaagtttcaaag 29933450  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
     || |||||||||||||||||| |       ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||   ||||| |||| ||| |||| | || |     
29933451 gagttgtttctcgtttcaaccttg-------agaacgaagaattaaaagagaggtatcaacggtcatttggaaagcacggagtgcttgtccttctttga- 29933542  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcctt 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||  ||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||    
29933543 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaatagctctgcctgcagaaatgttcctt 29933642  T
318 caagataggaatgaatttgaa 338  Q
    ||||||||||||| |||||||    
29933643 caagataggaatggatttgaa 29933663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 19 - 338
Target Start/End: Original strand, 29982506 - 29982817
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaattt-aaactgaagattcaaag 117  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||| | || |||||||||||||||| || ||  ||  |||| ||||||||| |||||||    
29982506 atcagaagcagaagtccatcagaagcaatattt-catcagaagctatataatcaccagaagctacatttgattagtttattttaaactgaagtttcaaag 29982604  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
     || |||||||||||||||||| |       ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||   ||||| |||| ||| |||| | || |     
29982605 gagttgtttctcgtttcaaccttg-------agaacgaagaattaaaagagaggtatcaacggtcatttggaaagcacggagtgcttgtccttctttga- 29982696  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcctt 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||  ||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||    
29982697 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaatagctctgcctgcagaaatgttcctt 29982796  T
318 caagataggaatgaatttgaa 338  Q
    ||||||||||||| |||||||    
29982797 caagataggaatggatttgaa 29982817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 218 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 21736360 - 21736231
Alignment:
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcctt 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||      
21736360 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagttaacagctctgcctgcagaattgttccca 21736261  T
318 caagataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
21736260 caagataggaatgaatttgaagttgatcct 21736231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 19 - 347
Target Start/End: Original strand, 29905974 - 29906294
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctg-tgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||| | ||||||||||||||||||| || ||  | | | |||||||||||| |||||||    
29905974 atcagaagcagaagtccatcagaagcaatattt-catcagaagctatatcatcaccagaagctacatttgattagtttattttaaactgaagtttcaaag 29906072  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
     ||||||||||||||||||||| |       ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||   ||||| |||| ||| |||| | || |     
29906073 gagctgtttctcgtttcaaccttg-------agaacgaagaattaaaagagaggtatcaacggtcatttgtaaagcacggagtgcttgtccttctttga- 29906164  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcctt 317  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || || ||   | ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||    
29906165 agagttgacaaagtacaagtttacaaccactacctatactactctatttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaaattttcctt 29906264  T
318 caagataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||    
29906265 caagataggaatggatttgaacttgatcct 29906294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Original strand, 4174541 - 4174864
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaa--ggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaa 116  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  ||||||||||||||||    
4174541 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaaggttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaa 4174639  T
117 gtagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaa 216  Q
    ||||||| |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||||||||| |||| ||   ||||||    
4174640 gtagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaa 4174739  T
217 cagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttc 314  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| |||| |    
4174740 tagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctgcgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaagttgtac 4174839  T
315 cttcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
     |||||||| |||||||||||||||    
4174840 gttcaagatgggaatgaatttgaag 4174864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 19 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 5511145 - 5510822
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| || |||  | |||  |||||||||||||||||    
5511145 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 5511047  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   |||||||||  ||| ||   ||||||     
5511046 tagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaat 5510947  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcct 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||||||| |      
5510946 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaattgtacac 5510847  T
317 tcaagataggaatgaatttgaagtt 341  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
5510846 tcaagatgggaatgaatttgaagtt 5510822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 218 - 347
Target Start/End: Original strand, 15651055 - 15651184
Alignment:
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcctt 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||    
15651055 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagcatgtcctcgctacaagaaaagacaacagctctgcctacagaatttttcctt 15651154  T
318 caagataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||    
15651155 caaaataggaatgaatttgaagttgatcct 15651184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 218 - 347
Target Start/End: Original strand, 15662690 - 15662819
Alignment:
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcctt 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||    
15662690 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagcatgtcctcgctacaagaaaagacaacagctctgcctacagaatttttcctt 15662789  T
318 caagataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||    
15662790 caaaataggaatgaatttgaagttgatcct 15662819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 19 - 341
Target Start/End: Original strand, 39672668 - 39672992
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
39672668 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 39672766  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  || ||   ||||||||| |||| ||   ||||||     
39672767 tagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaaggaaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaat 39672866  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||||       
39672867 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaagttgtatg 39672966  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaagtt 341  Q
    |||||||| |||||||||||||||||    
39672967 ttcaagatgggaatgaatttgaagtt 39672992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 19 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 4744187 - 4743864
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
4744187 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 4744089  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| || ||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   |||||||||  ||| ||   ||||||     
4744088 tagctgattttcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaat 4743989  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcct 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||||||| |      
4743988 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaattgtacac 4743889  T
317 tcaagataggaatgaatttgaagtt 341  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
4743888 tcaagatgggaatgaatttgaagtt 4743864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 19 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 4754772 - 4754449
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
4754772 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 4754674  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| || ||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   |||||||||  ||| ||   ||||||     
4754673 tagctgattttcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaat 4754574  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcct 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||||||| |      
4754573 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaattgtacac 4754474  T
317 tcaagataggaatgaatttgaagtt 341  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
4754473 tcaagatgggaatgaatttgaagtt 4754449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 19 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 5521323 - 5521000
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||  ||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||| || |||  | |||  |||||||||||||||||    
5521323 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagtaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 5521225  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   |||||||||  ||| ||   ||||||     
5521224 tagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaat 5521125  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcct 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||||||| |      
5521124 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaattgtacac 5521025  T
317 tcaagataggaatgaatttgaagtt 341  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
5521024 tcaagatgggaatgaatttgaagtt 5521000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 19 - 341
Target Start/End: Original strand, 5536807 - 5537130
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| || |||  | |||  |||||||||||||||||    
5536807 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 5536905  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| || ||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   |||||||||  ||| ||   ||||||     
5536906 tagctgattttcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaat 5537005  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcct 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||||||| |      
5537006 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaattgtacac 5537105  T
317 tcaagataggaatgaatttgaagtt 341  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
5537106 tcaagatgggaatgaatttgaagtt 5537130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Original strand, 6220487 - 6220809
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
6220487 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 6220585  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||||||||| |||| ||   ||||||     
6220586 tagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaat 6220685  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |     
6220686 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacg 6220785  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
    |||||||| |||||||||||||||    
6220786 ttcaagatgggaatgaatttgaag 6220809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Original strand, 13383049 - 13383371
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
13383049 atcagaagcagaaggtcttcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 13383147  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||||||||| |||| || | ||||||     
13383148 tagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctttcgttaat 13383247  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |     
13383248 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 13383347  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
     ||||||| |||||||||||||||    
13383348 ctcaagatgggaatgaatttgaag 13383371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 19789472 - 19789150
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
19789472 atcagaagcataaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 19789374  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||||||||| |||| ||   ||||||     
19789373 tagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaat 19789274  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |     
19789273 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacg 19789174  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
    |||||||| |||||||||||||||    
19789173 ttcaagatgggaatgaatttgaag 19789150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 19 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 41684128 - 41683804
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| || |||  | |||  |||||||||||||||||    
41684128 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 41684030  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   |||||||||  ||| ||   ||||||     
41684029 tagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaat 41683930  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |     
41683929 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 41683830  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaagtt 341  Q
     ||||||| |||||||||||||||||    
41683829 ctcaagatgggaatgaatttgaagtt 41683804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 19 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 41694697 - 41694373
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| || |||  | |||  |||||||||||||||||    
41694697 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 41694599  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   |||||||||  ||| ||   ||||||     
41694598 tagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaat 41694499  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |     
41694498 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 41694399  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaagtt 341  Q
     ||||||| |||||||||||||||||    
41694398 ctcaagatgggaatgaatttgaagtt 41694373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 19 - 341
Target Start/End: Original strand, 5547391 - 5547714
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| || |||  | |||  |||||||||||||||||    
5547391 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 5547489  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| || ||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   |||||||||  ||| ||   ||||||     
5547490 tagctgattttcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaat 5547589  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcct 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||| ||||||||| |      
5547590 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctacagaattgtacac 5547689  T
317 tcaagataggaatgaatttgaagtt 341  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
5547690 tcaagatgggaatgaatttgaagtt 5547714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Original strand, 6180313 - 6180635
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
6180313 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 6180411  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||||||||| |||| ||   ||||||     
6180412 tagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaat 6180511  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  |||||||| || |||| |     
6180512 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcataatttgtacg 6180611  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
    |||||||| |||||||||||||||    
6180612 ttcaagatgggaatgaatttgaag 6180635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Original strand, 13372455 - 13372777
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
13372455 atcagaagcagaaggtcttcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 13372553  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||||||||| |||| || | ||||||     
13372554 tagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctttcgttaat 13372653  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |     
13372654 aaagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 13372753  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
     ||||||| |||||||||||||||    
13372754 ctcaagatgggaatgaatttgaag 13372777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Original strand, 13393643 - 13393965
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
13393643 atcagaagcagaaggtcttcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgttttatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 13393741  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||||||||| |||| ||   ||||||     
13393742 tagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaat 13393841  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |     
13393842 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 13393941  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
     ||||||| |||||||||||||||    
13393942 ctcaagatgggaatgaatttgaag 13393965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 19778835 - 19778513
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
19778835 atcagaagcataaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 19778737  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| ||| |  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||||||||| |||| ||   ||||||     
19778736 tagctgattcccaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaat 19778637  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |     
19778636 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacg 19778537  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
    |||||||| |||||||||||||||    
19778536 ttcaagatgggaatgaatttgaag 19778513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Original strand, 20672981 - 20673303
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
20672981 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 20673079  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||||||||| |||| ||   | ||||     
20673080 tagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcattaat 20673179  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |     
20673180 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 20673279  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
     ||||||| |||||||||||||||    
20673280 ctcaagatgggaatgaatttgaag 20673303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Original strand, 20683566 - 20683888
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
20683566 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 20683664  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||||||||| |||| ||   | ||||     
20683665 tagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcattaat 20683764  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |     
20683765 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 20683864  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
     ||||||| |||||||||||||||    
20683865 ctcaagatgggaatgaatttgaag 20683888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 23648198 - 23647876
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
23648198 atcagaagcagaaggtaatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 23648100  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||||||||| |||| ||   ||||||     
23648099 tagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaat 23648000  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |     
23647999 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 23647900  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
     ||||||| |||||||||||||||    
23647899 ctcaagatgggaatgaatttgaag 23647876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 37760120 - 37759798
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
37760120 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 37760022  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||||||||| |||| ||   | ||||     
37760021 tagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcattaat 37759922  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |     
37759921 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 37759822  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
     ||||||| |||||||||||||||    
37759821 ctcaagatgggaatgaatttgaag 37759798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 37866895 - 37866573
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
37866895 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 37866797  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||||||||| |||| ||   ||||||     
37866796 tagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaat 37866697  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |     
37866696 agtgttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctcaactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaagttgtacg 37866597  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
    |||||||| |||||||||||||||    
37866596 ttcaagatgggaatgaatttgaag 37866573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 20 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 23768343 - 23768022
Alignment:
20 tcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  ||||||||||||||||||    
23768343 tcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaagt 23768245  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaaca 218  Q
    ||||  |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||||||||| |||| ||   |||||| |    
23768244 agctaattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaata 23768145  T
219 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcct 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |      
23768144 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacac 23768045  T
317 tcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
    ||||||| |||||||||||||||    
23768044 tcaagatgggaatgaatttgaag 23768022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 19 - 341
Target Start/End: Original strand, 503953 - 504277
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| || |||  | |||  |||||||||||||||||    
503953 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 504051  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   |||||||||  ||| ||   | ||||     
504052 tagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcattaat 504151  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |     
504152 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 504251  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaagtt 341  Q
     ||||||| |||||||||||||||||    
504252 ctcaagatgggaatgaatttgaagtt 504277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 35 - 341
Target Start/End: Original strand, 526335 - 526643
Alignment:
35 catcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttctcgttt 133  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| || |||  | |||  ||||||||||||||||||||||| |||||  ||    
526335 catcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaagtagctgattctcaatt 526433  T
134 caacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaacagagttgacaaagtac 233  Q
    ||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   |||||||||  ||| ||   |||||| ||||||||||||||||    
526434 cagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaatagagttgacaaagtac 526533  T
234 aagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttccttcaagataggaatga 331  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |  ||||||| |||||||    
526534 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatga 526633  T
332 atttgaagtt 341  Q
    ||||||||||    
526634 atttgaagtt 526643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 19 - 341
Target Start/End: Original strand, 12286764 - 12287088
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| || |||  | |||  |||||||||||||||||    
12286764 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 12286862  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||||||||   ||| ||   ||||||     
12286863 tagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgaactcttgtctctcgttaat 12286962  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |     
12286963 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 12287062  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaagtt 341  Q
     ||||||| |||||||||||||||||    
12287063 ctcaagatgggaatgaatttgaagtt 12287088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 19 - 341
Target Start/End: Original strand, 12296586 - 12296910
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| || |||  | |||  |||||||||||||||||    
12296586 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 12296684  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||||||||   ||| ||   ||||||     
12296685 tagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgaactcttgtctctcgttaat 12296784  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |     
12296785 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 12296884  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaagtt 341  Q
     ||||||| |||||||||||||||||    
12296885 ctcaagatgggaatgaatttgaagtt 12296910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 218 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 41045797 - 41045668
Alignment:
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcctt 317  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
41045797 agagttgacaaagtacaattgtacaaccactacctccacgactctgattgtgtctacgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaaatgttcctt 41045698  T
318 caagataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
    |||| |||||||| ||||||| ||||||||    
41045697 caagttaggaatggatttgaacttgatcct 41045668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 218 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 27173082 - 27172958
Alignment:
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgacc-ctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcct 316  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
27173082 agagttgacaaagtacaaatgtacaaccacgacctccacgaactctgagtgtgtcctcgctacaggacaagataacagctctgcctgcagatttgttctt 27172983  T
317 tcaagataggaatgaatttgaagtt 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
27172982 tcaagataggaatgaatttgaagtt 27172958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 101 - 339
Target Start/End: Original strand, 10655131 - 10655370
Alignment:
101 aaactgaagattcaaagtagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||  ||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   | |||||||     
10655131 aaactgaagattcaaagtagctgtctctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatatggatatcactgagc 10655230  T
201 acttttcctgcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgc 300  Q
    |||| ||     ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||  ||||||||||||||| ||||||  |||    
10655231 acttgtctcctattaacagagttgacatagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgcttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgc 10655330  T
301 ctgcaga-attgttccttcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
    |||||||  |||  |||||||||| |||||||||||||||    
10655331 ctgcagattttgcgccttcaagatgggaatgaatttgaag 10655370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 13122112 - 13121790
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||   || |||  | |||  |||||||||||||||||    
13122112 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctatgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 13122014  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| |||||  ||||  ||  || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||||||||| |||| ||   | ||||     
13122013 tagctgattctcaattcagtcttatcaacgaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcattaat 13121914  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| ||||||     
13121913 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgttca 13121814  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
     ||||||| |||||||||||||||    
13121813 ctcaagatgggaatgaatttgaag 13121790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 13132355 - 13132033
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||   || |||  | |||  |||||||||||||||||    
13132355 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctatgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 13132257  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| |||||  ||||  ||  || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||||||||| |||| ||   | ||||     
13132256 tagctgattctcaattcagtcttatcaacgaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcattaat 13132157  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| ||||||     
13132156 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgttca 13132057  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
     ||||||| |||||||||||||||    
13132056 ctcaagatgggaatgaatttgaag 13132033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 14466041 - 14465719
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||   || |||  | |||  |||||||||||||||||    
14466041 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctatgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 14465943  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| |||||  ||||  ||  || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||||||||| |||| ||   | ||||     
14465942 tagctgattctcaattcagtcttatcaacgaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcattaat 14465843  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| ||||||     
14465842 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgttca 14465743  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
     ||||||| |||||||||||||||    
14465742 ctcaagatgggaatgaatttgaag 14465719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 23757748 - 23757426
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
23757748 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 23757650  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||  |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||||||||| |||| ||   ||||||     
23757649 tagctaattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaat 23757550  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |     
23757549 agatttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 23757450  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
     ||||||| |||||||||||||||    
23757449 ctcaagatgggaatgaatttgaag 23757426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 35 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 37886012 - 37885706
Alignment:
35 catcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttctcgttt 133  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  ||||||||||||||||||||||| |||||  ||    
37886012 catcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaagtagctgattctcaatt 37885914  T
134 caacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaacagagttgacaaagtac 233  Q
    ||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||||||||| |||| ||   |||||| ||||||||||||||||    
37885913 cagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaatagagttgacaaagtac 37885814  T
234 aagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttccttcaagataggaatga 331  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| | |||||||| |||||||    
37885813 aagtgtacaaccactacttccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaagttgtacgttcaagatgggaatga 37885714  T
332 atttgaag 339  Q
    ||||||||    
37885713 atttgaag 37885706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 19 - 341
Target Start/End: Original strand, 5579419 - 5579743
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
5579419 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacttttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 5579517  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    | |||| |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   |||||||||  ||| ||   ||||||     
5579518 ttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaat 5579617  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |     
5579618 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 5579717  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaagtt 341  Q
     ||||||| |||||||||||||||||    
5579718 ctcaagatgggaatgaatttgaagtt 5579743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 19 - 341
Target Start/End: Original strand, 5627803 - 5628127
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
5627803 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacttttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 5627901  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    | |||| |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   |||||||||  ||| ||   ||||||     
5627902 ttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaat 5628001  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |     
5628002 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 5628101  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaagtt 341  Q
     ||||||| |||||||||||||||||    
5628102 ctcaagatgggaatgaatttgaagtt 5628127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 19 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 16476728 - 16476436
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||  ||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
16476728 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagtttttatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 16476630  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||||||||| |||| ||   ||||||     
16476629 tagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaat 16476530  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagt-gtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaatt 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  |  ||||  ||||||||||||| | ||||||  |||||||||||||    
16476529 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttcttgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatt 16476436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 19 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 20721563 - 20721239
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
20721563 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacttttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 20721465  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    | |||| |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   |||||||||  ||| ||   ||||||     
20721464 ttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaat 20721365  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |     
20721364 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 20721265  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaagtt 341  Q
     ||||||| |||||||||||||||||    
20721264 ctcaagatgggaatgaatttgaagtt 20721239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 218 - 347
Target Start/End: Original strand, 31113971 - 31114100
Alignment:
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcctt 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
31113971 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgactctgcttgtgtctgcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaaatgttcctt 31114070  T
318 caagataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
    |||| ||||||||  |||||| ||||||||    
31114071 caagttaggaatggttttgaacttgatcct 31114100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 14476673 - 14476351
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||   || |||  | |||  |||||||||||||||||    
14476673 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctatgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 14476575  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| |||||  ||||  ||  || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||||||||| |||| ||   | ||||     
14476574 tagctgattctcaattcagtcttatcaacgaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcattaat 14476475  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  | ||||||||||| | ||||||  ||||||||||| ||||||     
14476474 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacactacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgttca 14476375  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
     ||||||| |||||||||||||||    
14476374 ctcaagatgggaatgaatttgaag 14476351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 19 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 8775108 - 8774783
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| || |||  | |||  |||||||||||||||||    
8775108 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 8775010  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    | |||| |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||  ||||||||| |||| ||   | ||||     
8775009 ttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaactgaaagggaggtatcaacggatatatgaaaagcactgagcacttgtctctcattaat 8774910  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttc- 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |     
8774909 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaagttgtaca 8774810  T
315 cttcaagataggaatgaatttgaagtt 341  Q
      ||||||| |||||||||||||||||    
8774809 actcaagatgggaatgaatttgaagtt 8774783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 19 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 8785693 - 8785368
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| || |||  | |||  |||||||||||||||||    
8785693 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 8785595  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    | |||| |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||  ||||||||| |||| ||   | ||||     
8785594 ttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaactgaaagggaggtatcaacggatatatgaaaagcactgagcacttgtctctcattaat 8785495  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttc- 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |     
8785494 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaagttgtaca 8785395  T
315 cttcaagataggaatgaatttgaagtt 341  Q
      ||||||| |||||||||||||||||    
8785394 actcaagatgggaatgaatttgaagtt 8785368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 19 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 16493487 - 16493250
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||  ||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
16493487 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagtttttatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 16493389  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||||||||| |||| ||   ||||||     
16493388 tagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaat 16493289  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccac 256  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
16493288 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccac 16493250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 19 - 341
Target Start/End: Original strand, 24383304 - 24383628
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
24383304 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacttttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 24383402  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    | |||| |||||  ||||  ||  || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || ||   |||||||||  ||| ||   ||||||     
24383403 ttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacaaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaat 24383502  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |     
24383503 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 24383602  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaagtt 341  Q
     ||||||| |||||||||||||||||    
24383603 ctcaagatgggaatgaatttgaagtt 24383628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 19 - 341
Target Start/End: Original strand, 28314017 - 28314341
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| || |||  | |||  |||||||||||||||||    
28314017 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 28314115  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    | |||| |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || ||   | ||||||| |||| ||   | ||||     
28314116 ttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaactgaaagggaggtatcaacggatatatggataacactgagcacttgtctctcattaat 28314215  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |     
28314216 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttttgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 28314315  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaagtt 341  Q
     ||||||| |||||||||||||||||    
28314316 ctcaagatgggaatgaatttgaagtt 28314341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 19 - 341
Target Start/End: Original strand, 28324633 - 28324957
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| || |||  | |||  |||||||||||||||||    
28324633 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 28324731  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    | |||| |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || ||   | ||||||| |||| ||   | ||||     
28324732 ttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaactgaaagggaggtatcaacggatatatggataacactgagcacttgtctctcattaat 28324831  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |     
28324832 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttttgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 28324931  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaagtt 341  Q
     ||||||| |||||||||||||||||    
28324932 ctcaagatgggaatgaatttgaagtt 28324957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 19 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 35187827 - 35187503
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
35187827 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacttttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 35187729  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    | |||| |||||  ||||  ||  || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || ||   |||||||||  ||| ||   ||||||     
35187728 ttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacaaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaat 35187629  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |     
35187628 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 35187529  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaagtt 341  Q
     ||||||| |||||||||||||||||    
35187528 ctcaagatgggaatgaatttgaagtt 35187503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 13558024 - 13557702
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||  ||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
13558024 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttaatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 13557926  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||||| ||| |||| ||   ||||||     
13557925 tagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcacggagcacttgtctctcgttaat 13557826  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||| ||||||| |||| |     
13557825 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactatctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcatgcagaatttgtacg 13557726  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
    |||||||| ||||||| |||||||    
13557725 ttcaagatgggaatgagtttgaag 13557702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 19 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 18484495 - 18484170
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| || |||  | |||  |||||||||||||||||    
18484495 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 18484397  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    | |||| |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || ||   ||||||||| |||| ||   | ||||     
18484396 ttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaactgaaagggaggtatcaacggatatatggaaagcactgagcacttgtctctcattaat 18484297  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcc- 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  |||||||||||||  | |     
18484296 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 18484197  T
316 -ttcaagataggaatgaatttgaagtt 341  Q
      ||||||| |||||||||||||||||    
18484196 actcaagatgggaatgaatttgaagtt 18484170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 218 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 10529401 - 10529271
Alignment:
218 agagttgacaaagtac-aagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcct 316  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
10529401 agagttgacaaagtacgaagtgtacaaccactacctccacgactctgcttgtgtctacgctacaagacaagaaaacagctctgcctgcagaaatgttcct 10529302  T
317 tcaagataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
    |||||||||||||| |||||||  |||||||    
10529301 tcaagataggaatggatttgaacgtgatcct 10529271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 52 - 341
Target Start/End: Original strand, 5865513 - 5865803
Alignment:
52 tcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaaga 151  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||| |||| |||||  ||||  ||  || |||||||    
5865513 tcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacttttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaaga 5865611  T
152 acgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacc 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  || ||   |||||||||  ||| ||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
5865612 acgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacc 5865711  T
252 tccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttccttcaagataggaatgaatttgaagtt 341  Q
    ||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |  ||||||| |||||||||||||||||    
5865712 tccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtt 5865803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 52 - 341
Target Start/End: Original strand, 5876112 - 5876402
Alignment:
52 tcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaaga 151  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||| |||| |||||  ||||  ||  || |||||||    
5876112 tcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacttttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaaga 5876210  T
152 acgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacc 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  || ||   |||||||||  ||| ||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
5876211 acgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacc 5876310  T
252 tccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttccttcaagataggaatgaatttgaagtt 341  Q
    ||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |  ||||||| |||||||||||||||||    
5876311 tccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtt 5876402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 24660350 - 24660028
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
24660350 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacttttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 24660252  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    | |||| |||||  ||||  ||  || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||| |||||  ||| ||   ||||||     
24660251 ttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacaaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagctctgagctcttgtctctcgttaat 24660152  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |     
24660151 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 24660052  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
     ||||||| |||||||||||||||    
24660051 ctcaagatgggaatgaatttgaag 24660028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 19 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 10099519 - 10099194
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaa-tcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaaga-ttcaa 115  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||  | ||||||||||||| ||| |   |||||||||||||| || |||| | |||  |||||||| | |||||    
10099519 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagatttcatcagaagcaaaagttggcaccagaagctacatttgatcttttaatc-aaactgaaaaattcaa 10099421  T
116 agtagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgtta 215  Q
    |||||||| |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||||||||| ||||  |   | |||    
10099420 agtagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgcctctcatta 10099321  T
216 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttc 314  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||||||| |    
10099320 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaattgtac 10099221  T
315 cttcaagataggaatgaatttgaagtt 341  Q
      ||||||| |||||||||||||||||    
10099220 actcaagatgggaatgaatttgaagtt 10099194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 218 - 338
Target Start/End: Original strand, 51989128 - 51989249
Alignment:
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaag-ataacagctctgcctgcagaattgttcct 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||  |||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||    
51989128 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaatctgtttgtgtctacgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcagaaatgttcct 51989227  T
317 tcaagataggaatgaatttgaa 338  Q
    |||||||||||||| |||||||    
51989228 tcaagataggaatggatttgaa 51989249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 24670930 - 24670608
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
24670930 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacttttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 24670832  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    | |||| |||||  ||||  ||  || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||| |||||  ||| ||   ||||||     
24670831 ttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacaaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagctctgagctcttgtctctcgttaat 24670732  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | |||||   ||||||||||| |||| |     
24670731 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagtcatgcctgcagaatttgtaca 24670632  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
     ||||||| |||||||||||||||    
24670631 ctcaagatgggaatgaatttgaag 24670608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 35 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 38195159 - 38194850
Alignment:
35 catcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttctcgttt 133  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||| || |||  | |||  |||||||||||||||||| |||| |||||  ||    
38195159 catcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaagttgctgattctcaatt 38195061  T
134 caacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaacagagttgacaaagtac 233  Q
    ||  ||  || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || ||   |||||||||  ||| ||   |||||| ||||||||||||||||    
38195060 cagtcttatcaaagaagaacgaagaactgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaatagagttgacaaagtac 38194961  T
234 aagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcc--ttcaagataggaatg 330  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  |||||||||||||  | |   ||||||| ||||||    
38194960 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatg 38194861  T
331 aatttgaagtt 341  Q
    |||||||||||    
38194860 aatttgaagtt 38194850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 35 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 38205695 - 38205386
Alignment:
35 catcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttctcgttt 133  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||| || |||  | |||  |||||||||||||||||| |||| |||||  ||    
38205695 catcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaagttgctgattctcaatt 38205597  T
134 caacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaacagagttgacaaagtac 233  Q
    ||  ||  || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || ||   |||||||||  ||| ||   |||||| ||||||||||||||||    
38205596 cagtcttatcaaagaagaacgaagaactgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaatagagttgacaaagtac 38205497  T
234 aagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcc--ttcaagataggaatg 330  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  |||||||||||||  | |   ||||||| ||||||    
38205496 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatg 38205397  T
331 aatttgaagtt 341  Q
    |||||||||||    
38205396 aatttgaagtt 38205386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 35 - 341
Target Start/End: Original strand, 11272184 - 11272493
Alignment:
35 catcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttctcgttt 133  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||| || |||  | |||  |||||||||||||||||| |||| |||||  ||    
11272184 catcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaagttgctgattctcaatt 11272282  T
134 caacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaacagagttgacaaagtac 233  Q
    ||  ||  || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || ||   | ||||||| |||| ||   | |||| ||||||||||||||||    
11272283 cagtcttatcaaagaagaacgaagaactgaaagggaggtatcaacggatatatggataacactgagcacttgtctctcattaatagagttgacaaagtac 11272382  T
234 aagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcc--ttcaagataggaatg 330  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  |||||||||||||  | |   ||||||| ||||||    
11272383 aagtgtacaaccactacctccaccactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatg 11272482  T
331 aatttgaagtt 341  Q
    |||||||||||    
11272483 aatttgaagtt 11272493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 35 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 39383125 - 39382816
Alignment:
35 catcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttctcgttt 133  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||| || |||  | |||  |||||||||||||||||| |||| |||||  ||    
39383125 catcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaagttgctgattctcaatt 39383027  T
134 caacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaacagagttgacaaagtac 233  Q
    ||  ||  || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || ||   | ||||||| |||| ||   | |||| ||||||||||||||||    
39383026 cagtcttatcaaagaagaacgaagaactgaaagggaggtatcaacggatatatggataacactgagcacttgtctctcattaatagagttgacaaagtac 39382927  T
234 aagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcc--ttcaagataggaatg 330  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  |||||||||||||  | |   ||||||| ||||||    
39382926 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatg 39382827  T
331 aatttgaagtt 341  Q
    |||||||||||    
39382826 aatttgaagtt 39382816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 50 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 18006704 - 18006420
Alignment:
50 tttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaa-ctgaagattcaaagtagctgtttctcgtttcaacctcgtctaaga 148  Q
    |||| |||||||| | |||||||||||||||||||| | |||     ||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||    
18006704 tttcgtcagaagctagatcatcaccagaagctacaagtgatcaacagatttaaatctaaagattcaaaggagctgtttctcgtttcaatctcgtcta-ga 18006606  T
149 agaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccact 248  Q
    |||||||||||||| |||| || ||||||||||||| ||   | |||||  |           |||   ||||||||| ||||||   |||||||||||     
18006605 agaacgaagaattgcaaggaagatatcaacggtcatctgcaaaacactggat-----------gtttgaagagttgactaagtacttttgtacaaccacg 18006517  T
249 acctccacgacc-ctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttccttcaagataggaatgaatttgaagttgat 344  Q
    |  ||||||| | ||||   ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
18006516 aattccacgaactctgaacatgtccgcgctacaagacaagaaaacagctctgcctgcagatttgttccttcaagatagcaatgaatttgaagttgat 18006420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 218 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 13148321 - 13148190
Alignment:
218 agagttgacaaagtacaa-gtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataa-cagctctgcctgcagaattgttcc 315  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || ||| |||  || |||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||    
13148321 agagttgacaaagtacaaagtgtacaaccactacctccacgactatgcgtgcgtctacgatacaagacaagaaaaacagctctacctgcagaattgttcc 13148222  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
    ||||||||||||||| |||||||  |||||||    
13148221 ttcaagataggaatggatttgaacgtgatcct 13148190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 218 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 17022082 - 17021975
Alignment:
218 agagttgacaaagtacaa-gtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagat-aacagctctgcctgcagaattgttcc 315  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
17022082 agagttgacaaagtacaaagtgtacaaccactacctccacgactctgcttgtgtctacgctacaagacaagataaacagctctgcctgcagaaatgttcc 17021983  T
316 ttcaagat 323  Q
    ||||||||    
17021982 ttcaagat 17021975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 35 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 39372488 - 39372179
Alignment:
35 catcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttctcgttt 133  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||| || |||  | |||  |||||||||||||||||| |||| |||||  ||    
39372488 catcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaagttgctgattctcaatt 39372390  T
134 caacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaacagagttgacaaagtac 233  Q
    ||  ||  || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || |    | ||||||| |||| ||   | |||| ||||||||||||||||    
39372389 cagtcttatcaaagaagaacgaagaactgaaagggaggtatcaacggatatatagataacactgagcacttgtctctcattaatagagttgacaaagtac 39372290  T
234 aagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcc--ttcaagataggaatg 330  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  |||||||||||||  | |   ||||||| ||||||    
39372289 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatg 39372190  T
331 aatttgaagtt 341  Q
    |||||||||||    
39372189 aatttgaagtt 39372179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 218 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 22151301 - 22151170
Alignment:
218 agagttgacaaagtacaa-gtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataa-cagctctgcctgcagaattgttcc 315  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||  |||  ||||||  ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||     
22151301 agagttgacaaagtacaaagcgtacaaccactacctccacgattctgcttgtgtctacgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcagaaatgttct 22151202  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
    ||||||||||||||| |||||||  |||||||    
22151201 ttcaagataggaatggatttgaacgtgatcct 22151170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 19 - 137
Target Start/End: Original strand, 9092153 - 9092270
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| | |||  | ||||||||||||||||||||||     
9092153 atcagaagcagaataccatcagaagcaagattt-catcagaagctacatcatcaccagaagctacaagtgatcattaaatttaaactgaagattcaaagg 9092251  T
119 agctgtttctcgtttcaac 137  Q
    || ||||| ||||||||||    
9092252 agttgtttttcgtttcaac 9092270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 268 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 17961551 - 17961475
Alignment:
268 tgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttccttcaagataggaatgaatttgaagttgat 344  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
17961551 tgtccgcgctacaagacaagaaaacagctctgcctgcagatttgttccttcaagatagcaatgaatttgaagttgat 17961475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 218 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 15851065 - 15850933
Alignment:
218 agagttgacaaagtacaa-gtgtacaa-ccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataac-agctctgcctgcagaattgttc 314  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| || |||  | ||||  ||||||||||||||| ||  |||||||||| ||||| |||||    
15851065 agagttgacaaagtacaaagtgtacaaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagaaaaatagctctgcctccagaaatgttc 15850966  T
315 cttcaagataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
    |||||||||||||||| |||||||  |||||||    
15850965 cttcaagataggaatggatttgaacgtgatcct 15850933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 218 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 15833459 - 15833355
Alignment:
218 agagttgacaaagtacaa-gtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataa-cagctctgcctgcagaattgttcc 315  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||   | ||||  ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||    
15833459 agagttgacaaagtacaaagtgtacaaccactacctccactactctatttttgtctacgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcagaaatgttcc 15833360  T
316 ttcaa 320  Q
    |||||    
15833359 ttcaa 15833355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 221 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 51341063 - 51340935
Alignment:
221 gttgacaaagtac-aagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataa-cagctctgcctgcagaattgttccttc 318  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||  | ||||  ||||||||||||||| || |||||||||| |||||| |||||||||    
51341063 gttgacaaagtacgaagtgtacgaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagaaaaacagctctgcccgcagaaatgttccttc 51340964  T
319 aagataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
    |  ||||||||| |||||||  |||||||    
51340963 agaataggaatggatttgaacgtgatcct 51340935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 17961788 - 17961625
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaa-ctgaagattcaaag 117  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||  ||| | |||||||| | |||||||||||||||||||| | |||     ||||||| || | |||||||||    
17961788 atcagaagcagaagtc-atcagaagcaatattt-cgtcagaagctagatcatcaccagaagctacaagtgatcaacagatttaaatctaaggattcaaag 17961691  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcat 184  Q
     || |||||| |||||||| ||| |||| |||||||||||||||| |||| || |||||||||||||    
17961690 gagttgtttcacgtttcaatctcatcta-gaagaacgaagaattgcaaggaagatatcaacggtcat 17961625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 234 - 347
Target Start/End: Original strand, 45861693 - 45861807
Alignment:
234 aagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataa-cagctctgcctgcagaattgttccttcaagataggaatgaa 332  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||  ||  | ||||  ||||||||||||| | || ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| |    
45861693 aagtgtacgaccactacctccactactatgtttatgtctacgctacaagacaaaaaaaacagctctgcctgcagaaatgttccttcagaataggaatgga 45861792  T
333 tttgaagttgatcct 347  Q
    |||||| ||||||||    
45861793 tttgaacttgatcct 45861807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 274 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 49990259 - 49990185
Alignment:
274 cgctacaagacaagataa-cagctctgcctgcagaattgttccttcaagataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
    ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||    
49990259 cgctacaagacaagaaaaacagctttgcctgcagaaatgttccttcaagataggaatggatttgaacgtgatcct 49990185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 52 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 16487308 - 16487181
Alignment:
52 tcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaaga 151  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||| |||| |||||  ||||  ||  || |||||||    
16487308 tcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacttttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaaga 16487210  T
152 acgaagaattgaaagggaggtatcaacgg 180  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||    
16487209 acaaagaattgaaagggaggtatcaacgg 16487181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 221 - 330
Target Start/End: Original strand, 12752727 - 12752838
Alignment:
221 gttgacaaagtacaa-gtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataa-cagctctgcctgcagaattgttccttc 318  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| || |||  | ||||  ||||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||||    
12752727 gttgacaaagtacaaagtgtacgaccactatctccacaactctgtttatgtctacgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcaaaaatgttccttc 12752826  T
319 aagataggaatg 330  Q
    |  |||||||||    
12752827 agaataggaatg 12752838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 11167922 - 11167868
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcac 73  Q
    |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
11167922 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaggttttcatcagaagcgatatcatcac 11167868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 234 - 347
Target Start/End: Original strand, 47405542 - 47405656
Alignment:
234 aagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataa-cagctctgcctgcagaattgttccttcaagataggaatgaa 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  ||  | ||||   |||||||||||||| || |||||||||||||| |  ||||||||||  ||||||||| |    
47405542 aagtgtacaaccactacctccactactatgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcaaagatgttccttcacaataggaatgca 47405641  T
333 tttgaagttgatcct 347  Q
    |||||| ||||||||    
47405642 tttgaaattgatcct 47405656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 84
Target Start/End: Original strand, 15662494 - 15662558
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctaca 84  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||| | |||||||||||||| ||||    
15662494 atcagaagcagaagtccatcagaagcaa-gatttcatcagaagctatatcatcaccagaagttaca 15662558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 234 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 2785102 - 2784989
Alignment:
234 aagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaag-ataacagctctgcctgcagaattgttccttcaagataggaatgaa 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||| | ||||   ||||||||||||| | ||||||||||||||||  | |||||||||   || |||||| |    
2785102 aagtgtacaaccactacctccactactctga-tttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcaagaatgttccttctcaatgggaatgca 2785004  T
333 tttgaagttgatcct 347  Q
    |||||| ||||||||    
2785003 tttgaaattgatcct 2784989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #137
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 84
Target Start/End: Original strand, 15650859 - 15650923
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctaca 84  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||| ||| | |||||||| | |||||||||||||||||||    
15650859 atcagaagcagaagtccatgagaagcaagattt-cgtcagaagctatatcatcaccagaagctaca 15650923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #138
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 234 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 2561226 - 2561114
Alignment:
234 aagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaag-ataacagctctgcctgcagaattgttccttcaagataggaatgaa 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||   ||||||||||||| | ||||||||| ||||||    ||||||||||  || ||||||||    
2561226 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctacctgcaacgatgttccttcacaatgggaatgaa 2561127  T
333 tttgaagttgatc 345  Q
    |||||| ||||||    
2561126 tttgaaattgatc 2561114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #139
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 298 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 16386243 - 16386203
Alignment:
298 tgcctgcagaattgttccttcaagataggaatgaatttgaa 338  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
16386243 tgcctgcagaaatgttccttcaagatgggaatgaatttgaa 16386203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #140
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 51
Target Start/End: Original strand, 16665897 - 16665929
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttt 51  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
16665897 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttt 16665929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #141
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 234 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 40799912 - 40799800
Alignment:
234 aagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataa-cagctctgcctgcagaattgttccttcaagataggaatgaa 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||   ||||||||| |||| || ||||||||||||||  | ||||||||||  || |||||| |    
40799912 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctctgctacaagataagaaaaacagctctgcctgcaacaatgttccttcacaatgggaatgca 40799813  T
333 tttgaagttgatc 345  Q
    |||||| ||||||    
40799812 tttgaaattgatc 40799800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #142
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 277 - 338
Target Start/End: Original strand, 11909188 - 11909250
Alignment:
277 tacaagacaagataa-cagctctgcctgcagaattgttccttcaagataggaatgaatttgaa 338  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||| |||  ||||||||| |||||||    
11909188 tacaagacaagaaaaacagctctgcctgcagaaatgttccctcagaataggaatggatttgaa 11909250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #143
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 234 - 347
Target Start/End: Original strand, 14393125 - 14393239
Alignment:
234 aagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaaga-taacagctctgcctgcagaattgttccttcaagataggaatgaa 332  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||   |  ||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||| | | ||||||||||   | |||||| |    
14393125 aagtgtacaaccactatctccactacttagtttgtgtctctgctacaagacaagaataacagctctgcctgcggcaatgttccttcatacttggaatgga 14393224  T
333 tttgaagttgatcct 347  Q
    |||||| ||||||||    
14393225 tttgaaattgatcct 14393239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #144
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 234 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 20646192 - 20646078
Alignment:
234 aagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaag-ataacagctctgcctgcagaattgttccttcaagataggaatgaa 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | |  ||||||   ||||||||||||| ||||||| ||||||||||  | ||||||| ||   | |||||| |    
20646192 aagtgtacaaccactacctccactactcagtttgtgtctctgctacaagacaagaataacagttctgcctgcaacaatgttcctacatactgggaatgga 20646093  T
333 tttgaagttgatcct 347  Q
    |||||| ||||||||    
20646092 tttgaatttgatcct 20646078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #145
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 234 - 347
Target Start/End: Original strand, 24775655 - 24775769
Alignment:
234 aagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaag-ataacagctctgcctgcagaattgttccttcaagataggaatgaa 332  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || |||  | ||||   ||||||||||||| | ||||||||||||||||    ||||||||||  || |||||| |    
24775655 aagtgtacaaccactacatccactactctgtttttgtctctgctacaagacaagtaaaacagctctgcctgcaacgatgttccttcacaatgggaatgca 24775754  T
333 tttgaagttgatcct 347  Q
    |||||| ||||||||    
24775755 tttgaaattgatcct 24775769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #146
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 234 - 319
Target Start/End: Original strand, 49666526 - 49666612
Alignment:
234 aagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaag-ataacagctctgcctgcagaattgttccttca 319  Q
    |||||||||||||||| |||||| || |||| | ||||   ||||||||||||| | ||||||||||||||||  | ||||||||||    
49666526 aagtgtacaaccactatctccactactctgattctgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcaacaatgttccttca 49666612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #147
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 21736541 - 21736493
Alignment:
35 catcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctaca 84  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||||||||||    
21736541 catcagaagcaagattt-catcagaagctatatcatcaccagaagctaca 21736493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #148
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 234 - 305
Target Start/End: Original strand, 13780705 - 13780777
Alignment:
234 aagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaag-ataacagctctgcctgca 305  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| | |  ||||||   ||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
13780705 aagtgtacaaccactatctccacgactcagtttgtgtctctgctacaagacaagaataacagctttgcctgca 13780777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #149
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 51
Target Start/End: Original strand, 16670932 - 16670964
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttt 51  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
16670932 atcaaaagcagaagaccatcagaagcaaggttt 16670964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #150
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 234 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 37467371 - 37467303
Alignment:
234 aagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaa-gataacagctctgcc 301  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||| |  ||||||   |||||||||||| |||||||||||||||    
37467371 aagtgtacaaccactatctccactacccagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacagctctgcc 37467303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #151
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 234 - 305
Target Start/End: Original strand, 49642883 - 49642955
Alignment:
234 aagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaag-ataacagctctgcctgca 305  Q
    |||||||||||||||| |||||| || | |  ||||||   ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
49642883 aagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgctacaagacaagaataacagctctgcctgca 49642955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 238; Significance: 1e-132; HSPs: 83)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 19 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 5873837 - 5873512
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||    
5873837 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcaaaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaagctgaagattcaaagt 5873738  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaaca 218  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| | ||||||    
5873737 agttgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcattaaca 5873638  T
219 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttccttc 318  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||  | ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
5873637 tagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactttgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaaatgttccttc 5873538  T
319 aagataggaatgaatttgaagttgat 344  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||    
5873537 aagatgggaatgaaattgaagttgat 5873512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 19 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 24713897 - 24713574
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||  || || |||||||||||||||||||||||    
24713897 atcagaagcagaagaccatcagaagcaagattt-catcagaagcgatatcatcactagaagctacaattgttcagtaaatttaaactgaagattcaaagt 24713799  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaaca 218  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| ||    
24713798 agttgtttcttgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtattaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatca 24713699  T
219 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttccttc 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
24713698 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgt-cacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaaatgttccttc 24713600  T
319 aagataggaatgaatttgaagttgat 344  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||    
24713599 aagatgggaatgaatttgaagttgat 24713574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Original strand, 15207205 - 15207524
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||| || ||| |||||||||| ||||||||    
15207205 atcagaagcagaagctcatcagaagcaaggttttcatcagaagcaaaatcatcaccagaagttacatttaatcagtaaatataaactgaagtttcaaagt 15207304  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaaca 218  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||| ||||||||    
15207305 agctgtttctcatttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggaaagcactgagtacttgtccttcgttaaca 15207404  T
219 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttccttc 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||    
15207405 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagttatgcctgcagaattgttccttc 15207503  T
319 aagataggaatgaatttgaag 339  Q
    ||||| |||||||||||||||    
15207504 aagatgggaatgaatttgaag 15207524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 19 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 11536311 - 11535988
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||||     
11536311 atcagaagcagaagaccatcagaagcaagattt-catcagaagctatatcatcaccagaagctacaagtgatcagtaaatttaaactgaagattcaaagg 11536213  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaaca 218  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||| ||||| ||    
11536212 agctgtttttcgtttcaacctcgtctaaga-gaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaaaagcactgggtacttgtccttcgttatca 11536114  T
219 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttccttc 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
11536113 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaaatgttccttc 11536014  T
319 aagataggaatgaatttgaagttgat 344  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||    
11536013 aagatgggaatgaatttgaagttgat 11535988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 4987741 - 4987420
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||| || ||| || |||| ||||||||||||||||||    
4987741 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaggttttgatcaggagcgatatcatcaccagaagctacatttgatccgtaaattcaaactgaagattcaaagt 4987642  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaaca 218  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| || |||| |||||| |    
4987641 agctgtttctcatttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaagtgcactgagtatttgtccttcgttaaga 4987542  T
219 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcctt 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||    
4987541 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcctt 4987442  T
318 caagataggaatgaatttgaag 339  Q
    |||||| |||||||||||||||    
4987441 caagatgggaatgaatttgaag 4987420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 20 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 3371181 - 3370862
Alignment:
20 tcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagta 119  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || | |||||||||||||| |||||||    
3371181 tcagaagcagaagctcatcagaagcaaggttttcatcagaagcggaatcatcaccagaagctacaattaattcgtta-tttaaactgaagatccaaagta 3371083  T
120 gctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaacag 219  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| || |||| |||||||||    
3371082 gctgtttctcatttcaacctcgtctaagaagaacgaagatttgaaagggaggtatcaacggtcatttgaagtgcactgagtatttgtccttcgttaacag 3370983  T
220 agttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttccttc 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| || |||| |||||    
3370982 agttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccaccactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcaaaatttgtgccttc 3370883  T
319 aagataggaatgaatttgaag 339  Q
    ||||| |||||||||||||||    
3370882 aagatgggaatgaatttgaag 3370862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 19 - 335
Target Start/End: Original strand, 14835895 - 14836211
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||| ||||||||||| ||||||    
14835895 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattgatttgtaaattcaaactgaagatccaaagt 14835994  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaaca 218  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||| || |||| ||||||||    
14835995 agctgtttctcatttcaacctcgtctaagaagaacgaataattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagcactgagtatttgtccttcgttaaca 14836094  T
219 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcctt 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||    
14836095 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcctt 14836193  T
318 caagataggaatgaattt 335  Q
    |||||| |||||||||||    
14836194 caagatgggaatgaattt 14836211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 19 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 10301000 - 10300677
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||     
10301000 atcagaagcagaagaccatcagaagcacgattt-catcagaagctatatcatcaccagaagctacaattgatcagtaaatttaaactgaagattcaaagg 10300902  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaaca 218  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| || |||| ||||| ||    
10300901 agctgtttttcgtttcaacctcgtcta-gaagaacaaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaaaagcattgagtatttgtccttcgttatca 10300803  T
219 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttccttc 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | | ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
10300802 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttatctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaaatgttccttc 10300703  T
319 aagataggaatgaatttgaagttgat 344  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||    
10300702 aagatgggaatgaatttgaagttgat 10300677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 19 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 11515500 - 11515178
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||||     
11515500 atcagaagcagaagaccatcagaagcaagattt-catcagaagctatatcatcaccagaagctacaagtgatcagt-aatttaaactgaagattcaaagg 11515403  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaaca 218  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||||| ||    
11515402 agctgtttttcgtttcaacctcgtctaaga-gaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaaaagcactgagtacttgtccttcgttatca 11515304  T
219 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttccttc 318  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
11515303 gagttaacaaagtaaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaaatgttccttc 11515204  T
319 aagataggaatgaatttgaagttgat 344  Q
    |||||  |||||||||||||||||||    
11515203 aagatgagaatgaatttgaagttgat 11515178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Original strand, 18077697 - 18078018
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| || |||| ||||||||||| ||||||    
18077697 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaggttttcatcagaagcgatatcatcaccagaagctacatttaatccgtaaattcaaactgaagatccaaagt 18077796  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaaca 218  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| | || |||| ||||||||    
18077797 agctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagcactgagcatttgtccttcgttaaca 18077896  T
219 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcctt 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||  | ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||    
18077897 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactcctctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcctt 18077996  T
318 caagataggaatgaatttgaag 339  Q
    |||||| |||||||||||||||    
18077997 caagatgggaatgaatttgaag 18078018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 3390922 - 3390602
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||  || | |||||||||||||| ||||||    
3390922 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaggttttcatcagaagcggaatcatcaccagaagctataattaattcgtta-tttaaactgaagatccaaagt 3390824  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaaca 218  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| || |||| ||||||||    
3390823 agctgtttcttatttcaacctcgtctaagaagaacgaagatttgaaagggaggtatcaacggtcatttgaagtgcactgagtatttgtccttcgttaaca 3390724  T
219 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcctt 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| || | ||||    
3390723 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccaccactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcatgcagaatttatgcctt 3390624  T
318 caagataggaatgaatttgaag 339  Q
    |||||| |||||||||||||||    
3390623 caagatgggaatgaatttgaag 3390602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 10909877 - 10909555
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgt-gaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| || | | ||  |||| |||||||||||||||||    
10909877 atcagaagcagaagctcatcagaagcaaggttttcatcagaagataaatcatcaccagaagttacatttgaacagtaaaattcaaactgaagattcaaag 10909778  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||| |||| |||||||    
10909777 tagctgtttaacatttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggagagccctgagtacttgtccttcgttaac 10909678  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcct 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||    
10909677 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcct 10909578  T
317 tcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
    ||||||| |||||||||||||||    
10909577 tcaagatgggaatgaatttgaag 10909555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 10696108 - 10695787
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgt-gaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| || | | ||  |||| |||||||||||||||||    
10696108 atcagaagcagaagctcatcagaagcaaggttttcatcagaagataaatcatcaccagaagttacatttgaacagtaaaattcaaactgaagattcaaag 10696009  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||| |||| |||||||    
10696008 tagctgtttaacatttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggagagccctgagtacttgtccttcgttaac 10695909  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcctt 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | | ||  ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||    
10695908 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactaccctgtttttttctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaattgttcctt 10695809  T
318 caagataggaatgaatttgaag 339  Q
    | |||| |||||||||||||||    
10695808 cgagatgggaatgaatttgaag 10695787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Original strand, 40454140 - 40454460
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| ||||||||||| ||||||    
40454140 atcagaagcagaaggtcatcagaagtaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacatttaatccgtaaattcaaactgaagatccaaagt 40454239  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaaca 218  Q
    ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||||| | || |||| ||||||||    
40454240 agctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaatttaaagggaggtatcaacggtcatttggatagcactgagcatttgtccttcgttaaca 40454339  T
219 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcaga-attgttcctt 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||| ||||    
40454340 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagattttgtgcctt 40454438  T
318 caagataggaatgaatttgaag 339  Q
    |||||| |||||||||||||||    
40454439 caagatgggaatgaatttgaag 40454460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 35 - 339
Target Start/End: Original strand, 40470395 - 40470699
Alignment:
35 catcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttctcgtttc 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
40470395 catcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacatttaatctgtaaattcaaactgaagatccaaagtagctgtttctcatttc 40470494  T
135 aacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaacagagttgacaaagtaca 234  Q
    |||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||||| | || |||| ||||||||||||||||||||||||    
40470495 aaccttatctaagaagaacgaagaatttaaagggaggtatcaacggtcatttggatagcactgagcatttgtccttcgttaacagagttgacaaagtaca 40470594  T
235 agtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcaga-attgttccttcaagataggaatgaat 333  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||  | ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||| |||||||||| |||||||||    
40470595 agtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagattttgtgccttcaagatgggaatgaat 40470693  T
334 ttgaag 339  Q
    ||||||    
40470694 ttgaag 40470699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 25657604 - 25657283
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| ||||||||||| ||||||    
25657604 atcagaagcagaaggttatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacatttaatccgtaaattcaaactgaagatccaaagt 25657505  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac- 217  Q
    ||||||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   ||||||||| | || |||| |||||||     
25657504 agctgtttctcatttcaatcttatctaagaagaacgaagaattgaaagagaggtatcaacggtcatttggatagcactgagcatttgtccttcgttaaca 25657405  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcct 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||    
25657404 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ctttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcct 25657306  T
317 tcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
    ||||||| |||||||||||||||    
25657305 tcaagatgggaatgaatttgaag 25657283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 19581709 - 19581388
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaattt-aaactgaagattcaaag 117  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||| || || || |||||||||||||||||    
19581709 atcagaagcagatggtcatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagttacatttgatcagtaaaattcaaactgaagattcaaag 19581610  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    ||| |||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||   | |||||||||||| ||||  ||||||    
19581609 tagttgtttaacatttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattaaaagggaggtatcaacgatcatttggaaaacactgagtacttgtcctttgttaac 19581510  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcctt 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||||||||    
19581509 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagaaaacagccatgcctgcagaaatgttcctt 19581410  T
318 caagataggaatgaatttgaag 339  Q
    |||||| |||||||||||||||    
19581409 caagatgggaatgaatttgaag 19581388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 19 - 344
Target Start/End: Original strand, 31266591 - 31266914
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||| ||| ||||| | ||| || ||||||||||||| ||||||||     
31266591 atcagaagtagaagaccatcagaagcaagattt-catcagaagctatatcatcaccaaaagttacaagtgatcagtaaatttaaactgaatattcaaaga 31266689  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaaca 218  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||   ||||||||||| || |||| ||||||||    
31266690 agctgtttttcgtttcaacctcgtctaa-aagaacgaagaattgtaaaggaggtatcaacggtcatttggatagcactgagtatttgtccttcgttaaca 31266788  T
219 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttccttc 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
31266789 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttcttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaaatgttccttc 31266888  T
319 aagataggaatgaatttgaagttgat 344  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||    
31266889 aagatgggaatgaatttgaagttgat 31266914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Original strand, 47151870 - 47152191
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaattt-aaactgaagattcaaag 117  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||| || |   || || || |||||||||||||||||    
47151870 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaagattttcatcagaagcaaaatcatcaccagaagttacatttgaatagtaaaattcaaactgaagattcaaag 47151969  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    ||| |||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||| |||| |||||||    
47151970 tagttgtttaacatttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggagagccctgagtacttgtccttcgttaac 47152069  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcctt 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | | ||  ||||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||    
47152070 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttatctacgctacaagacaagacaacaaccatgcctgcagaattgttcctt 47152169  T
318 caagataggaatgaatttgaag 339  Q
    |||||| |||||||||||||||    
47152170 caagatgggaatgaatttgaag 47152191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 19 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 55651789 - 55651464
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||||| ||||||| ||| || |||||||||||||| |||||||     
55651789 atcagaagcagaagtccatcagaagcaagattt-catcagaagctatatcatcaccagaagttacaattgatcagtaaatttaaactgaagtttcaaagg 55651691  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaaca 218  Q
    |||||||| |||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| || ||| |||| | || | |    
55651690 agctgtttttcgttttaatctcgtctaagaa-aacgaagaattgaaagggaggtatcaacgttcatttgaaaagcactgggtgcttgtccttcattga-a 55651593  T
219 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttccttc 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
55651592 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaaatgttccttc 55651493  T
319 aagataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||    
55651492 aagataggaatgaatttgaatttgatcct 55651464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 52 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 16317765 - 16317477
Alignment:
52 tcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaaga 151  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||||    
16317765 tcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattgatccataaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttaacatttcaaccttgtctaagaaga 16317666  T
152 acgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacc 251  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||  || |||| |||| || |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
16317665 acgaagaattgaaagggagacatcaacggtcatttggagaacactaagtatttgtccttcgttaacagagttgacgaagtacaagtgtacaaccactacc 16317566  T
252 tccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaag-ataacagctctgcctgcagaattgttccttcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
    ||||| || |||  | ||||| |||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
16317565 tccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagaaaaacagccatgcctgcagaaatgttccttcaagatgggaatgaatttgaag 16317477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 20 - 347
Target Start/End: Original strand, 49001774 - 49002098
Alignment:
20 tcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagta 119  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||| ||| |||||||||| |  |||||||||||||||||| || ||| |  |||||||||||||| ||||||| |    
49001774 tcagaagcagaagtccatcagaagtaagattt-catcagaagctatttcatcaccagaagctacagttgatcagaaaatttaaactgaagtttcaaagga 49001872  T
120 gctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaacag 219  Q
    ||||||| |||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| || || ||| |||| | || | ||    
49001873 gctgtttttcgttttaatctcgtctaagaa-aacgaagaattgaaagggaggtatcaacagtcatttgaaaagcattgggtgcttgtccttcattga-ag 49001970  T
220 agttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttccttca 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
49001971 agttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaaatgttccttca 49002070  T
320 agataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||    
49002071 agataggaatgaatttgaagttaatcct 49002098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 16305573 - 16305253
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    |||||||| |||||  ||||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  | |||||||||||||||||||||||    
16305573 atcagaagtagaagctcatcagaagca-gatggtcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattgatccataaatttaaactgaagattcaaagt 16305475  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaaca 218  Q
    ||||||||  | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  || |||| |||| || |||| ||||||||    
16305474 agctgtttaacatttcaaccttgtctaagaagaacgaagaattgaaagggagacatcaacggtcatttggagaacactaagtatttgtccttcgttaaca 16305375  T
219 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaag-ataacagctctgcctgcagaattgttcctt 317  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||| |||||||||||||| | |||| |  ||||||||||| ||||||||    
16305374 gagttgacaaagtataagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagaaaaacaaccatgcctgcagaaatgttcctt 16305275  T
318 caagataggaatgaatttgaag 339  Q
    ||||||  ||||||||||||||    
16305274 caagatgagaatgaatttgaag 16305253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 35 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 5023188 - 5022886
Alignment:
35 catcagaagcaaggtttt-catcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttctcgttt 133  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||  |  ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
5023188 catcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatatattcaaactgaagatccaaagtagctgtttctcattt 5023089  T
134 caacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaacagagttgacaaagtac 233  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||| | || |||| |||||||||||||||||||||||    
5023088 caaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgagcagttgtccttcgttaacagagttgacaaagtac 5022989  T
234 aagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaat-tgttccttcaagataggaatgaa 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||    
5022988 aagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgcctttaagatgggaatgaa 5022890  T
333 tttg 336  Q
    ||||    
5022889 tttg 5022886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 218 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 23509386 - 23509257
Alignment:
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcctt 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
23509386 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcctt 23509287  T
318 caagataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||    
23509286 caagataggaatgaatttgaagttaatcct 23509257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 218 - 347
Target Start/End: Original strand, 16819364 - 16819493
Alignment:
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcctt 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
16819364 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtccttgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttccca 16819463  T
318 caagataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
16819464 caagataggaatgaatttgaagttgatcct 16819493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 218 - 347
Target Start/End: Original strand, 8997268 - 8997397
Alignment:
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcctt 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
8997268 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtatgtcctcgctacaagacaagataacagttctgcctgcagaagtgttcctt 8997367  T
318 caagataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||    
8997368 caagacaggaatgaatttgaagttgatcct 8997397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Original strand, 18752280 - 18752602
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttt-tcatcagaagcgaaat--catcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaa 115  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| |||| || |||||||| ||||  | ||||||||| || || || |||| | |||  || ||||||||| ||    
18752280 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcttcagaagcaaaatatcttcaccagaaactgcatttgatctcttaatc-aatctgaagatttaa 18752378  T
116 agtagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgtta 215  Q
    |||||| | |||||  |||| |||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || || || | || |||| |||||    
18752379 agtagccgattctccattcagccttatctaagtagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaattgctctaagcatttgtccttcgtta 18752478  T
216 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttc 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| |||| |    
18752479 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaaggcaacagctatgcctgcagaatttgtgc 18752577  T
315 cttcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
    ||||||||| |||||||||||||||    
18752578 cttcaagatgggaatgaatttgaag 18752602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Original strand, 18762890 - 18763212
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttt-tcatcagaagcgaaat--catcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaa 115  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| |||| || |||||||| ||||  | ||||||||| || || || |||| | |||  || ||||||||| ||    
18762890 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttctcttcagaagcaaaatatcttcaccagaaactgcatttgatctcttaatc-aatctgaagatttaa 18762988  T
116 agtagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgtta 215  Q
    |||||| | |||||  |||| |||  |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||| | || |||| |||||    
18762989 agtagccgattctccattcagccttatctaagtataacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaatagctctgagcatttgtccttcgtta 18763088  T
216 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttc 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||| ||||||||||||||  ||||| | ||||||||||| |||| |    
18763089 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaaggcaacagttatgcctgcagaatttgtgc 18763187  T
315 cttcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
    ||||||||| |||||||||||||||    
18763188 cttcaagatgggaatgaatttgaag 18763212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 218 - 347
Target Start/End: Original strand, 18774667 - 18774796
Alignment:
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcctt 317  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
18774667 agagttgacaaaatacaattgtacaaccactatctccacgaccctaagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcataattgttcctt 18774766  T
318 caagataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
18774767 caagataggaatgaatttgaagttgatcct 18774796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 19 - 188
Target Start/End: Original strand, 39525954 - 39526120
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||||     
39525954 atcagaagcagaagaccatcagaagcaagattt-catcagaagctatatcatcaccagaagctacaagtgatcagtaaatttaaactgaagattcaaagg 39526052  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttga 188  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
39526053 agctgtttttc-tttcaacctcgtctaag-agaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttga 39526120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Original strand, 27814736 - 27815058
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaagg-ttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    ||||||| ||||||  |||||||||||| | |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
27814736 atcagaaacagaaggtcatcagaagcaaagattttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 27814834  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| |||||  ||||  ||  || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||   ||||||||| |||| ||   ||||||     
27814835 tagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtataaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaat 27814934  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| |||| ||    
27814935 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttatgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaatttgtacc 27815034  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
    |||||||| |||||||||||||||    
27815035 ttcaagatgggaatgaatttgaag 27815058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 48371600 - 48371278
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaa-ggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
48371600 atcagaagcagaaggtcattagaagcaaaggttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 48371502  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| |||||  ||||  ||  || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||   ||||||||| |||| ||   ||||||     
48371501 tagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaaggggggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaat 48371402  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||||| ||||||  |||||||| || |||| ||    
48371401 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcataatttgtacc 48371302  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
    |||||||| |||||||||||||||    
48371301 ttcaagatgggaatgaatttgaag 48371278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 52704257 - 52703935
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
52704257 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 52704159  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||||||||| |||| ||   ||||||     
52704158 tagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaat 52704059  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |     
52704058 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacg 52703959  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
    |||||||| |||||||||||||||    
52703958 ttcaagatgggaatgaatttgaag 52703935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 19 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 36018805 - 36018481
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| || |||| | |||  |||||||||||||||||    
36018805 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcttttaatc-aaactgaagattcaaag 36018707  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||||||||| |||| ||   | ||||     
36018706 tagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcattaat 36018607  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |     
36018606 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 36018507  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaagtt 341  Q
     ||||||| |||||||||||||||||    
36018506 ctcaagatgggaatgaatttgaagtt 36018481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 19 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 36029358 - 36029034
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| || |||| | |||  |||||||||||||||||    
36029358 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcttttaatc-aaactgaagattcaaag 36029260  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||||||||| |||| ||   | ||||     
36029259 tagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcattaat 36029160  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |     
36029159 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 36029060  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaagtt 341  Q
     ||||||| |||||||||||||||||    
36029059 ctcaagatgggaatgaatttgaagtt 36029034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 19 - 341
Target Start/End: Original strand, 15560870 - 15561194
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
15560870 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 15560968  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   |||||||||  ||| ||   ||||||     
15560969 tagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaat 15561068  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |     
15561069 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 15561168  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaagtt 341  Q
     ||||||| |||||||||||||||||    
15561169 ctcaagatgggaatgaatttgaagtt 15561194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 451045 - 450723
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
451045 atcagaagcagaaggtcttcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 450947  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||||||||| |||| ||   ||||||     
450946 tagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttatctctcgttaat 450847  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |     
450846 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 450747  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
     ||||||| |||||||||||||||    
450746 ctcaagatgggaatgaatttgaag 450723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 461626 - 461304
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
461626 atcagaagcagaaggtcttcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 461528  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||||||||| |||| ||   ||||||     
461527 tagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaat 461428  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |     
461427 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 461328  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
     ||||||| |||||||||||||||    
461327 ctcaagatgggaatgaatttgaag 461304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Original strand, 14843444 - 14843766
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
14843444 atcagaagcagaaggtcttcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 14843542  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||||||||| |||| ||   ||||||     
14843543 tagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaat 14843642  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |     
14843643 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 14843742  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
     ||||||| |||||||||||||||    
14843743 ctcaagatgggaatgaatttgaag 14843766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 17918521 - 17918199
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
17918521 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 17918423  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||||||||| |||| ||   ||||||     
17918422 tagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaat 17918323  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |     
17918322 agagttgacagagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 17918223  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
     ||||||| |||||||||||||||    
17918222 ctcaagatgggaatgaatttgaag 17918199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Original strand, 19944118 - 19944440
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
19944118 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 19944216  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| |||||  ||||  ||  || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||   ||||||||| |||| ||   ||||||     
19944217 tagctgattctcaattcagtcttttccaagaagaacgaagaattgaaagggagctatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaat 19944316  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||| ||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |     
19944317 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctataagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacg 19944416  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
    |||||||| |||||||||||||||    
19944417 ttcaagatgggaatgaatttgaag 19944440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Original strand, 24027876 - 24028198
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
24027876 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 24027974  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||||||||| |||| ||   ||||||     
24027975 tagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaat 24028074  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | |||| |  ||||||||||| |||| |     
24028075 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacaaccatgcctgcagaatttgtaca 24028174  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
     ||||||| |||||||||||||||    
24028175 ctcaagatgggaatgaatttgaag 24028198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 4948804 - 4948482
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||  ||||| |||| |||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
4948804 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagtttttatcaaaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 4948706  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||||||||| |||| ||   ||||||     
4948705 tagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaat 4948606  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaat-tgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||| |     
4948605 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatatgtaca 4948506  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
     ||||||| |||||||||||||||    
4948505 ctcaagatgggaatgaatttgaag 4948482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Original strand, 19954753 - 19955075
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
19954753 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 19954851  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| |||||  ||||  ||  || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||   ||||||||| |||| ||   ||||||     
19954852 tagctgattctcaattcagtcttttccaagaagaacgaagaattgaaagggagctatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaat 19954951  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgac-cctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |     
19954952 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactcttttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacg 19955051  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
    ||||||||  ||||||||||||||    
19955052 ttcaagatgagaatgaatttgaag 19955075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Original strand, 30936863 - 30937185
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||  |||||||||| |||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
30936863 atcagaagcagaaggtcttcagaagcaaaagttttcatcataagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 30936961  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||||||||| |||| ||   ||||||     
30936962 tagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaat 30937061  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |     
30937062 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 30937161  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
     ||||||| |||||||||||||||    
30937162 ctcaagatgggaatgaatttgaag 30937185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 218 - 347
Target Start/End: Original strand, 14778454 - 14778583
Alignment:
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcctt 317  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
14778454 agagttgacaaagtacaattgtacaaccactacctccacgactctgcttgtgtctacgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaaatgttcctt 14778553  T
318 caagataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
    ||||| ||||||| ||||||| ||||||||    
14778554 caagaaaggaatggatttgaacttgatcct 14778583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 218 - 347
Target Start/End: Original strand, 18007071 - 18007200
Alignment:
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcctt 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||    
18007071 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgactctgcttgtgtctacgctacaagacaagaaaacagctctgcctgcaaaaatgttcctt 18007170  T
318 caagataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||    
18007171 caagataggaatggatttgaacttgatcct 18007200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 19 - 344
Target Start/End: Original strand, 55745043 - 55745370
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
55745043 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacttttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 55745141  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    | |||| |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || ||   ||||||||| |||| ||   | ||||     
55745142 ttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaactgaaagggaggtatcaacggatatatggaaagcactgagcacttgtctctcattaat 55745241  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |     
55745242 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 55745341  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaagttgat 344  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||||    
55745342 ctcaagatgggaatgaatttgaagttgat 55745370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 19 - 344
Target Start/End: Original strand, 55755654 - 55755981
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
55755654 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacttttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 55755752  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    | |||| |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || ||   ||||||||| |||| ||   | ||||     
55755753 ttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaactgaaagggaggtatcaacggatatatggaaagcactgagcacttgtctctcattaat 55755852  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |     
55755853 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 55755952  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaagttgat 344  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||||    
55755953 ctcaagatgggaatgaatttgaagttgat 55755981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 16256338 - 16256016
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||  ||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
16256338 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagtttttatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 16256240  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| |||||  ||||  ||  || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||||||||| |||| ||   | ||||     
16256239 tagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacaaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcattaat 16256140  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |     
16256139 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaacttgtaca 16256040  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
     ||||||| |||||||||||||||    
16256039 ctcaagatgggaatgaatttgaag 16256016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 16266931 - 16266609
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||  ||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
16266931 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagtttttatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 16266833  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| |||||  ||||  ||  || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||||||||| |||| ||   | ||||     
16266832 tagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacaaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcattaat 16266733  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |     
16266732 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 16266633  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
     ||||||| |||||||||||||||    
16266632 ctcaagatgggaatgaatttgaag 16266609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 35 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 17929153 - 17928847
Alignment:
35 catcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttctcgttt 133  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  ||||||||||||||||||||||| |||||  ||    
17929153 catcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaagtagctgattctcaatt 17929055  T
134 caacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaacagagttgacaaagtac 233  Q
    ||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||||||||| |||| ||   |||||| |||||||||| |||||    
17929054 cagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaatagagttgacagagtac 17928955  T
234 aagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttccttcaagataggaatga 331  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |  ||||||| |||||||    
17928954 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatga 17928855  T
332 atttgaag 339  Q
    ||||||||    
17928854 atttgaag 17928847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 19 - 335
Target Start/End: Original strand, 30926285 - 30926603
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||  |||||||||| |||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
30926285 atcagaagcagaaggtcttcagaagcaaaagttttcatcataagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 30926383  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||||||||| |||| ||   ||||||     
30926384 tagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaat 30926483  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |     
30926484 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 30926583  T
316 ttcaagataggaatgaattt 335  Q
     ||||||| |||||||||||    
30926584 ctcaagatgggaatgaattt 30926603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Original strand, 10750959 - 10751281
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
10750959 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacttttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 10751057  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    | |||| |||||  ||||  ||  || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || ||   |||||||||  ||| ||   ||||||     
10751058 ttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacaaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaat 10751157  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |     
10751158 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 10751257  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
     ||||||| |||||||||||||||    
10751258 ctcaagatgggaatgaatttgaag 10751281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Original strand, 10964728 - 10965050
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
10964728 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacttttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 10964826  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    | |||| |||||  ||||  ||  || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || ||   |||||||||  ||| ||   ||||||     
10964827 ttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacaaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaat 10964926  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |     
10964927 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 10965026  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
     ||||||| |||||||||||||||    
10965027 ctcaagatgggaatgaatttgaag 10965050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 22007480 - 22007158
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    |||||| |||||||  | ||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
22007480 atcagatgcagaaggtcttcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 22007382  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| ||| |  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||||||||| |||| ||   ||||||     
22007381 tagctgattcgcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaat 22007282  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |     
22007281 agagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 22007182  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
     ||||||| |||||||||||||||    
22007181 ctcaagatgggaatgaatttgaag 22007158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 218 - 347
Target Start/End: Original strand, 14710790 - 14710919
Alignment:
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcctt 317  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||    
14710790 agagttgacaaagtacaattgtacaaccactacctccacgactctgcttgtgtctacgctacaagacaagataacagctctgcctatagaaatgttcctt 14710889  T
318 caagataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
    ||||| ||||||| ||||||| ||||||||    
14710890 caagaaaggaatggatttgaacttgatcct 14710919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 19 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 49518604 - 49518280
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||| || |||  | | |  |||||||||||||||||    
49518604 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagctacatttgatcctttagtc-aaactgaagattcaaag 49518506  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    | |||| |||||  ||||  ||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||||||||| |||| ||   | ||||     
49518505 ttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaatgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcattaat 49518406  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |     
49518405 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 49518306  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaagtt 341  Q
     ||||||| |||||||||||||||||    
49518305 ctcaagatgggaatgaatttgaagtt 49518280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Original strand, 10740385 - 10740707
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
10740385 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacttttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 10740483  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    | |||| |||||  ||||  ||  || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||   || ||   |||||||||  ||| ||   ||||||     
10740484 ttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacaaagaattgaaagggaggtatcaacgaatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaat 10740583  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |     
10740584 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 10740683  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
     ||||||| |||||||||||||||    
10740684 ctcaagatgggaatgaatttgaag 10740707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Original strand, 10954154 - 10954476
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
10954154 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacttttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 10954252  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    | |||| |||||  ||||  ||  || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||   || ||   |||||||||  ||| ||   ||||||     
10954253 ttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacaaagaattgaaagggaggtatcaacgaatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaat 10954352  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |     
10954353 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 10954452  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
     ||||||| |||||||||||||||    
10954453 ctcaagatgggaatgaatttgaag 10954476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 21996882 - 21996560
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    |||||| |||||||  | ||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
21996882 atcagatgcagaaggtcttcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 21996784  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| ||| |  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||||||||| |||| ||   ||||||     
21996783 tagctgattcgcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaat 21996684  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |     
21996683 agagttgactaagtacaagtgtacaaccactacctctactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 21996584  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
     ||||||| |||||||||||||||    
21996583 ctcaagatgggaatgaatttgaag 21996560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 218 - 347
Target Start/End: Original strand, 17993805 - 17993934
Alignment:
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcctt 317  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||  ||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
17993805 agagttgacaaagtacaattgtacaaccactacctccacaactctgcttgtgtctacgctacaagacaagataatagctctgcctgcagaaatgtccctt 17993904  T
318 caagataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
    |||| |||||||| ||||||| ||||||||    
17993905 caagttaggaatggatttgaacttgatcct 17993934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 218 - 347
Target Start/End: Original strand, 36210119 - 36210250
Alignment:
218 agagttgacaaagtacaa-gtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagat-aacagctctgcctgcagaattgttcc 315  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||    
36210119 agagttgacaaagtacaaagtgtacaaccactacctccacgactctgcttgtgtctacgctacaagacaagataaacagctctgcctgcataaatgttcc 36210218  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
    ||||||||||||||| |||||||  |||||||    
36210219 ttcaagataggaatggatttgaatgtgatcct 36210250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 35 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 24640701 - 24640392
Alignment:
35 catcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttctcgttt 133  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||| || |||  | |||  |||||||||||||||||| |||| |||||  ||    
24640701 catcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaagttgctgattctcaatt 24640603  T
134 caacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaacagagttgacaaagtac 233  Q
    ||  ||  || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || ||   | ||||||| |||| ||   | |||| ||||||||||||||||    
24640602 cagtcttatcaaagaagaacgaagaactgaaagggaggtatcaacggatatatggataacactgagcacttgtctctcattaatagagttgacaaagtac 24640503  T
234 aagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcc--ttcaagataggaatg 330  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  |||||||||||||  | |   ||||||| ||||||    
24640502 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatg 24640403  T
331 aatttgaagtt 341  Q
    |||||||||||    
24640402 aatttgaagtt 24640392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 35 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 27657054 - 27656745
Alignment:
35 catcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttctcgttt 133  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||| || |||  | |||  |||||||||||||||||| |||| |||||  ||    
27657054 catcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaagttgctgattctcaatt 27656956  T
134 caacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaacagagttgacaaagtac 233  Q
    ||  ||  || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || ||   | ||||||| |||| ||   | |||| ||||||||||||||||    
27656955 cagtcttatcaaagaagaacgaagaactgaaagggaggtatcaacggatatatggataacactgagcacttgtctctcattaatagagttgacaaagtac 27656856  T
234 aagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcc--ttcaagataggaatg 330  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  |||||||||||||  | |   ||||||| ||||||    
27656855 aagtgtacaaccactacctccaccactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatg 27656756  T
331 aatttgaagtt 341  Q
    |||||||||||    
27656755 aatttgaagtt 27656745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 35 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 27667627 - 27667318
Alignment:
35 catcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttctcgttt 133  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||| || |||  | |||  |||||||||||||||||| |||| |||||  ||    
27667627 catcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaagttgctgattctcaatt 27667529  T
134 caacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaacagagttgacaaagtac 233  Q
    ||  ||  || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || ||   | ||||||| |||| ||   | |||| ||||||||||||||||    
27667528 cagtcttatcaaagaagaacgaagaactgaaagggaggtatcaacggatatatggataacactgagcacttgtctctcattaatagagttgacaaagtac 27667429  T
234 aagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcc--ttcaagataggaatg 330  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  |||||||||||||  | |   ||||||| ||||||    
27667428 aagtgtacaaccactacctccaccactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatg 27667329  T
331 aatttgaagtt 341  Q
    |||||||||||    
27667328 aatttgaagtt 27667318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 52 - 341
Target Start/End: Original strand, 18130065 - 18130354
Alignment:
52 tcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaaga 151  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||| |||| |||||  ||||  ||  || |||||||    
18130065 tcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacttttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaaga 18130163  T
152 acgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacc 251  Q
    || ||||||||||||||||||||||| | | || ||   |||||||||  ||| ||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
18130164 acaaagaattgaaagggaggtatcaaggat-atatggatagcactgagctcttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacc 18130262  T
252 tccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttccttcaagataggaatgaatttgaagtt 341  Q
    ||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |  ||||||| |||||||||||||||||    
18130263 tccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtt 18130354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 19 - 87
Target Start/End: Original strand, 17198213 - 17198281
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaatt 87  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
17198213 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaatt 17198281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 218 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 33378461 - 33378339
Alignment:
218 agagttgacaaagtacaa-gtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataa-cagctctgcctgcagaattgttcc 315  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||  | ||||  ||||||||||||||| || ||| ||| ||||||||| ||||||    
33378461 agagttgacaaagtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagaaaaacagttctacctgcagaaatgttcc 33378362  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaa 338  Q
    ||||||||||||||| |||||||    
33378361 ttcaagataggaatggatttgaa 33378339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 19 - 91
Target Start/End: Original strand, 20648425 - 20648497
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatc 91  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
20648425 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaggttttcatcagaagcgatatcatcaccagaagctacatttaatc 20648497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 278 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 19242235 - 19242168
Alignment:
278 acaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttccttcaagataggaatgaatttgaagttgatc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
19242235 acaagacaagataacagctctgcctgcagaaatgttccttcaagataggaatggatttgaacttgatc 19242168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 130 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 19244133 - 19243982
Alignment:
130 gtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaacagagttgacaaa 229  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||  | | ||||| |||| |||||| ||||||||  ||||||| || ||| ||||  ||| | ||||||||||||    
19244133 gttttaacctcgtctaaga-gagcgaaagactcaaaggaaggtgtcaacgttcatttgaaaagcactgggtgcttgtcctttgttga-agagttgacaaa 19244036  T
230 gtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaaga 283  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| || |||  ||||||  ||||||||||    
19244035 gtacaattgtacaaccactacctccacaactctgcctgtgtctacgctacaaga 19243982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 234 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 55380323 - 55380209
Alignment:
234 aagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaaga-taacagctctgcctgcagaattgttccttcaagataggaatgaa 332  Q
    |||||||||||||||| |||||| || | |  ||||||   |||||||||||| | |||||||||||||||||  | ||||||||||   | ||||||||    
55380323 aagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgctacaagacaataataacagctctgcctgcaacaatgttccttcatacttggaatgaa 55380224  T
333 tttgaagttgatcct 347  Q
    |||||| ||||||||    
55380223 tttgaaattgatcct 55380209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 84
Target Start/End: Original strand, 16819167 - 16819230
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctaca 84  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||||||||||    
16819167 atcagaagcagaagtc-atcagaagcaagattt-catcagaagctatatcatcaccagaagctaca 16819230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 234 - 347
Target Start/End: Original strand, 14604985 - 14605096
Alignment:
234 aagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaag-ataacagctctgcctgcagaattgttccttcaagataggaatgaa 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||   ||||||||||||| | |||||||||||||||   | ||||||||||  || |||||| |    
14604985 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctatgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgc---aatgttccttcacaattggaatgga 14605081  T
333 tttgaagttgatcct 347  Q
    |||||| ||||||||    
14605082 tttgaaattgatcct 14605096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 234 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 23750555 - 23750441
Alignment:
234 aagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaaga-taacagctctgcctgcagaattgttccttcaagataggaatgaa 332  Q
    ||||||||||||| || |||||| || | |  ||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||   | ||||||||    
23750555 aagtgtacaaccattatctccactactcagtttgtgtctctgctacaagacaagaataacagctctgcctgcaacaatgttccttcatacttggaatgaa 23750456  T
333 tttgaagttgatcct 347  Q
    ||| || ||||||||    
23750455 ttttaaattgatcct 23750441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 84
Target Start/End: Original strand, 8997088 - 8997136
Alignment:
35 catcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctaca 84  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||||||||||    
8997088 catcagaagcaagattt-catcagaagctatatcatcaccagaagctaca 8997136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 275 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 12600750 - 12600677
Alignment:
275 gctacaagacaag-ataacagctctgcctgcagaattgttccttcaagataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||  | ||||||| || | | |||||| ||||||| ||||||||    
12600750 gctacaagacaaggataacagctctgcctgcaacaatgttcctacatgctgggaatggatttgaaattgatcct 12600677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 234 - 302
Target Start/End: Original strand, 15475221 - 15475290
Alignment:
234 aagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaa-gataacagctctgcct 302  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| || |||||| ||||   |||||||||||| ||||||||||||||||    
15475221 aagtgtacaaccaatacttccactactctgagtttgtctctgctacaagacaaggataacagctctgcct 15475290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 234 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 3395623 - 3395551
Alignment:
234 aagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaag-ataacagctctgcctgca 305  Q
    |||||||||||||||| |||||| || | |  ||||||   ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
3395623 aagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacagctctgcctgca 3395551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 234 - 305
Target Start/End: Original strand, 17398752 - 17398824
Alignment:
234 aagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaa-gataacagctctgcctgca 305  Q
    |||||||||||||||| |||||| || |||  | ||||   |||||||||||| |||||||||||||||||||    
17398752 aagtgtacaaccactaactccactactctgtttttgtctctgctacaagacaaggataacagctctgcctgca 17398824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 234 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 22190879 - 22190807
Alignment:
234 aagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaa-gataacagctctgcctgca 305  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || |||  | ||||   |||||||||||| |||||||||||||||||||    
22190879 aagtgtacaaccactacttccactactctgtttttgtctctgctacaagacaaagataacagctctgcctgca 22190807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 100)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 13913447 - 13913128
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| |||||||||||    
13913447 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttt-catcagaagcgatatcatcaccagaagctacaattgatcagtaaatttaaactggagattcaaagt 13913349  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaaca 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| || |||||    
13913348 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgataaca 13913249  T
219 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttccttc 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||    ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||    
13913248 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactttgttcttgtccacgctacaagacaagacaacaactctgcctgcagaaatgttccttc 13913149  T
319 aagataggaatgaatttgaag 339  Q
    ||||| |||||||||||||||    
13913148 aagatgggaatgaatttgaag 13913128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 19 - 347
Target Start/End: Original strand, 18826037 - 18826363
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||||     
18826037 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttt-catcagaagctatatcatcaccagaagctacaagtgatcagtaaatttaaactgaagattcaaagg 18826135  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaaca 218  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||| ||||| ||    
18826136 agctgtttttcgtttcaacctcgtcta-gaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaagaacactgggtacttatccttcgttatca 18826234  T
219 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttccttc 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
18826235 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaattgttccttc 18826334  T
319 aagataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||    
18826335 aagatgggaatgaatttgaagttgatcct 18826363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 19 - 347
Target Start/End: Original strand, 18834433 - 18834759
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||||     
18834433 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttt-catcagaagctatatcatcaccagaagctacaagtgatcagtaaatttaaactgaagattcaaagg 18834531  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaaca 218  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||| ||||| ||    
18834532 agctgtttttcgtttcaacctcgtcta-gaagaacgaagaattaaaagggaggtatcaacggtcatttgaagaacactgggtacttgtccttcgttatca 18834630  T
219 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttccttc 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
18834631 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaattgttccttc 18834730  T
319 aagataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||    
18834731 aagatgggaatgaatttgaagttgatcct 18834759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 19 - 347
Target Start/End: Original strand, 27166242 - 27166568
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||  | |||||||||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||||     
27166242 atcagaagcagaagactatcagaagcaaggttt-catcagaagttatatcatcaccagaagctacaagtgatcagtaaatttaaactgaagattcaaagg 27166340  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaaca 218  Q
    || ||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| | ||| ||    
27166341 agttgtttttcgtttcaacatcgtcta-gaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgtgtacttgtccttcattatca 27166439  T
219 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttccttc 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    ||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
27166440 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactacactgttcttgtccacgctacaagacaagacaacggctctgcctgcagaattgttccttc 27166539  T
319 aagataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
27166540 aagataggaatgaatttgaagttgatcct 27166568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 25788100 - 25787780
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  ||| ||||||||||| ||||||    
25788100 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacatttaatccgtatattcaaactgaagatccaaagt 25788001  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaaca 218  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| || |||| ||||||||    
25788000 agctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagcactgagtatttgtccttcgttaaca 25787901  T
219 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcctt 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||    
25787900 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcctt 25787802  T
318 caagataggaatgaatttgaag 339  Q
    |||||| |||||||||||||||    
25787801 caagatgggaatgaatttgaag 25787780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 12828092 - 12827771
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||| ||||||||||| ||||||    
12828092 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaggttttcatcataagcgtaatcatcaccagaagctacatttaatccgtaaattcaaactgaagatccaaagt 12827993  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaaca 218  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| || |||| ||||||||    
12827992 agctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagcactgagtatttgtccttcgttaaca 12827893  T
219 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcctt 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||  ||||    
12827892 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgcgcctt 12827793  T
318 caagataggaatgaatttgaag 339  Q
    |||||| |||||||||||||||    
12827792 caagatgggaatgaatttgaag 12827771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 19 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 29765932 - 29765609
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | |||||||||||||||||| | ||  || |||||||||||||||||||||      
29765932 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttt-catcagaagctataccatcaccagaagctacaagtgattagtaaatttaaactgaagattcaaaag 29765834  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaaca 218  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||| ||||||||    
29765833 agctgtttttcgtttcaacatcgtcta-gaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaagaacactgggtacttgtccttcgttaaca 29765735  T
219 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttccttc 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||  |||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
29765734 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctatcagacaagacaacagctctgcctgcagaattgttccttc 29765635  T
319 aagataggaatgaatttgaagttgat 344  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||    
29765634 aagatgggaatgaatttgaagttgat 29765609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Original strand, 11147046 - 11147367
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    |||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| || |||| ||||||||||| ||||||    
11147046 atcagatgcagaaggtcatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcaacaccagaagctacatataatccgtaaattcaaactgaagatccaaagt 11147145  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaaca 218  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| || |||| ||||||||    
11147146 agctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagcactgagtatttgtccttcgttaaca 11147245  T
219 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcctt 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||   | ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||    
11147246 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctatttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcctt 11147345  T
318 caagataggaatgaatttgaag 339  Q
    |||||| |||||||||||||||    
11147346 caagatgggaatgaatttgaag 11147367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Original strand, 20029701 - 20030021
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||| || |||| ||||||||||| ||||||    
20029701 atcagaagcagaagctcatcagaagcaaggttttcatcagaagcgatatcatcaccagaagctacattttatccgtaaattcaaactgaagatccaaagt 20029800  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaaca 218  Q
    ||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| || |||| ||||||||    
20029801 agctgtttctcatttcaacattatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagcactgagtatttgtccttcgttaaca 20029900  T
219 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcctt 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||    
20029901 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcctt 20029999  T
318 caagataggaatgaatttgaag 339  Q
    |||||| |||||||||||||||    
20030000 caagatgggaatgaatttgaag 20030021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Original strand, 20062452 - 20062772
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||| || || | ||||||||||| ||||||    
20062452 atcagaagcagaagctcatcagaagcaaggttttcatcagaagcgatatcatcaccagaagctacattttatccgtaaaatcaaactgaagatccaaagt 20062551  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaaca 218  Q
    ||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| || |||| ||||||||    
20062552 agctgtttctcatttcaacattatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagcactgagtatttgtccttcgttaaca 20062651  T
219 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcctt 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||    
20062652 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcctt 20062750  T
318 caagataggaatgaatttgaag 339  Q
    |||||| |||||||||||||||    
20062751 caagatgggaatgaatttgaag 20062772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 8654061 - 8653739
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaa-tcatcaccagaagctacaattaatctgtgaattt-aaactgaagattcaaa 116  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| || ||| || || || ||||||||||||||||    
8654061 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaaatcaccaccagaagttacatttgatcagtaaaattcaaactgaagattcaaa 8653962  T
117 gtagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaa 216  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| ||||||    
8653961 gtagctgtttctcatttcaacctcgactaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgaatacttgtccttcgttaa 8653862  T
217 cagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcct 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||  ||||||||||||||| || |||| |||||| |||| |||||||    
8653861 cagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaaaagctatgcctgtagaaatgttcct 8653762  T
317 tcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
    |||| |  |||||||||||||||    
8653761 tcaaaacgggaatgaatttgaag 8653739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 5845499 - 5845163
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| || |||||||||||||||||||||||    
5845499 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttt-catcagaagcgatatcatcaccagaagctacaagtgatcagtaaatttaaactgaagattcaaagt 5845401  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcat-----------------ttgaggagcactgagta 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                 |||| ||||||||||||    
5845400 agctgtttctcgtttcaacctcgtctgagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaagagcacggtcatttgaagagcactgagta 5845301  T
202 cttttcctgcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcc 301  Q
    ||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||    
5845300 cttgtccttcgttatcagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcc 5845201  T
302 tgcagaattgttccttcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
    ||||| | ||||| |||||||| |||||||||||||||    
5845200 tgcaggaatgttcattcaagatgggaatgaatttgaag 5845163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Original strand, 7375555 - 7375875
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||| || |||| ||||||||||| ||||||    
7375555 atcagaagcagaagctcattagaagcaaggttttcatcagaagcgatatcatcaccagaagctacattttatccgtaaattcaaactgaagatccaaagt 7375654  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaaca 218  Q
    ||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| || |||| ||||||||    
7375655 agctgtttctcatttcaacattatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagcactgagtatttgtccttcgttaaca 7375754  T
219 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcctt 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||| ||||    
7375755 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgccagcagaatttgtgcctt 7375853  T
318 caagataggaatgaatttgaag 339  Q
    |||||| |||||||||||||||    
7375854 caagatgggaatgaatttgaag 7375875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 19 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 13928586 - 13928350
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| || ||||||||||| |||||||||||    
13928586 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttt-catcagaagcgatatcatcactagaagctacaattgatcagtaaatttaaactggagattcaaagt 13928488  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaaca 218  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| || |||||    
13928487 agttgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgataaca 13928388  T
219 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccac 256  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
13928387 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccac 13928350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 19 - 347
Target Start/End: Original strand, 9933470 - 9933796
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||| |||||||     
9933470 atcagaagcagaagtccatcagaagcaagattt-catcagaagctatatcatcaccagaagctacaattgatcagtaaatttaaactgaagtttcaaagg 9933568  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaaca 218  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || ||| |||| | ||| ||    
9933569 agctgtttttcgtttcaacctcgtctaaga-gaacgaagaattaaaagggaggtatcaacggtcatttgaaaagcactgggtgcttgtccttctttatca 9933667  T
219 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttccttc 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||  | ||||   |||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||    
9933668 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactatgtttctgtctatgctacaagacaagacaacaactctgcctgcagaaatgttccttc 9933767  T
319 aagataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||    
9933768 aagataggaaggaatttgaagttgatcct 9933796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 27 - 339
Target Start/End: Original strand, 16123342 - 16123654
Alignment:
27 cagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagtagctgttt 126  Q
    |||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||    
16123342 cagaagcccatcagaagcaaagttt-catcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatcagttaatttaaactggagattcaaagtagctgttt 16123440  T
127 ctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaacagagttgac 226  Q
    ||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||    
16123441 ctctttttaacctcgtctaacaagaacgaagatttgaaagggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttctttaacagagttgac 16123540  T
227 -aaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttccttcaagatag 325  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||  ||||||||||||||| |||| |  ||||| || || |||||||||||||| |    
16123541 aaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacatccatgccttcataaatgttccttcaagattg 16123640  T
326 gaatgaatttgaag 339  Q
     |||||||||||||    
16123641 taatgaatttgaag 16123654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 19 - 344
Target Start/End: Original strand, 17745563 - 17745904
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || || |||||||||||||||||||||||    
17745563 atcagaagcagaagaccatcagaagcaatattt-catcagaagcgatatcatcaccagaagctacaattgttcagttaatttaaactgaagattcaaagt 17745661  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatca-----------------acggtcatttgaggagcactgagta 201  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||                 |||||||||||| ||||||||||||    
17745662 agctgtttctcatttcaacctcgtccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaagagcacggtcatttgaagagcactgagta 17745761  T
202 cttttcctgcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcc 301  Q
    ||| |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || |||  | ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||    
17745762 cttgtccttcgttatcagagttgacaaagtagaagtgtacaaccattacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcc 17745861  T
302 tgcagaattgttccttcaagataggaatgaatttgaagttgat 344  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
17745862 tgcagaaatgttccttcaagatgggaatgaatttgaagttgat 17745904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Original strand, 18925558 - 18925880
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggtttt-catcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| ||||||||||    
18925558 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattgatccgtaaatttaaactggagattcaaag 18925657  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    ||| |||||  | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  || |||| ||||||| |||| |||||||    
18925658 tagttgtttaacatttcaaccttgtctaagaagaacgaagaattgaaagggagacatcaacggtcatttggagaacacttagtacttgtccttcgttaac 18925757  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaag-ataacagctctgcctgcagaattgttcct 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||| |||||||||||||| | |||||   ||||||||||| |||||||    
18925758 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagaaaaacagtcatgcctgcagaaatgttcct 18925857  T
317 tcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
    ||||||| |||||||||||||||    
18925858 tcaagatgggaatgaatttgaag 18925880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 19 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 4293123 - 4292797
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||| || ||||||||||||||||||||||     
4293123 atcagaagcagaagagcatcagaagcaca-ttttcatcagaagctatatcatcaccagaagctgcaattgatcagtaaatttaaactgaagattcaaagg 4293025  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaaca 218  Q
    |||| ||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||  ||||| |||| | | | ||    
4293024 agctatttttcgtttcaacctcatctaaga-gaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaaaagcattggatacttgtccttcttcatca 4292926  T
219 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttccttc 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
4292925 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaggacaagacaacagctctgcctgcagaaatgttccttc 4292826  T
319 aagataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||    
4292825 aagatgggaatgaatttgaagctgatcct 4292797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 19 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 25519085 - 25518761
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||||     
25519085 atcagaagcagaagaccatcagaagcaagattt-catcagaagctatatcatcaccagaagctacaagtgatcagtaaatttaaactgaagattcaaagg 25518987  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaaca 218  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||  ||||||| || ||| |||| | || | |    
25518986 agctgtttctcgttttaacctcgtctaag-agaacgaagaattaaaaagga-gtatcaacggtcatctgaaaagcactgggtgcttgtccttcattga-a 25518890  T
219 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttccttc 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||  || |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||    
25518889 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgttacaagacaagacaacagctctgcctccagaaatgttccttc 25518790  T
319 aagataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||    
25518789 aagacaggaatgaatttgaagttgatcct 25518761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 19 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 31572811 - 31572488
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||| || |||||||||| | |||||||||     
31572811 atcagaagcagaagttcatcagaagca-gaatttcatcagaagcgatatcatcaccagaagctacatttgatcagtaaatttaaactaacgattcaaagg 31572713  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaaca 218  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| || |||| ||||| ||    
31572712 agctgtttttcgtttcaacctcgtctaaga-gaatgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcttttgaaaagcactgagtatttgtccttcgttatca 31572614  T
219 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttccttc 318  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||  ||||||||||||||| |||  |  ||||||||||| |||||  ||    
31572613 gagttgacaaactacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacgaccatgcctgcagaaatgttctatc 31572514  T
319 aagataggaatgaatttgaagttgat 344  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||    
31572513 aagatgggaatgaatttgaagttgat 31572488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 19 - 347
Target Start/End: Original strand, 17741502 - 17741827
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    |||||||| ||||  |||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||||||||| || ||| || |||||||||||||| |||||||     
17741502 atcagaagtagaattccatcagaagcaagattt-catcagaagctatatcatcaccagaagctacagttgatcagtaaatttaaactgaagtttcaaagg 17741600  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaaca 218  Q
    |||||||| |||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||| || ||| |||| |  ||| |    
17741601 agctgtttttcgttttaatctcgtctaaga-gaatgaagaattgaaagggaggtatcaacaatcatttgaaaagcactgggtgcttgtccttctctaa-a 17741698  T
219 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttccttc 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||  ||||||||||||| | |||| |||||||||||||| |||||||||    
17741699 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaatacaacatctctgcctgcagaaatgttccttc 17741798  T
319 aagataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
17741799 aagataggaatgaatttgaagttgatcct 17741827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 52 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 26044579 - 26044292
Alignment:
52 tcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaaga 151  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||  |  ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||    
26044579 tcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccctatattcaaactgaagatccaaagtagctgtttctcatttcaaccttatctaagaaga 26044480  T
152 acgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacc 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||| | || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
26044479 acgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgagcagttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacc 26044380  T
252 tccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttccttcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
    ||||| || |||  | ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||    
26044379 tccactactctg-ctttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaag 26044292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 19 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 22309188 - 22308864
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatc-accagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  | |||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||| |||||||||    
22309188 atcagaagcagaagaccatcagaagcaagattt-catcagaagttatatcatccaccagaagctacaagtaatcagtaaatttaaactgacgattcaaag 22309090  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
     |||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||  ||||||| ||| || | || ||||| |    
22309089 gagctgtttttcgtttcaaccttgtctaaga-gaacgaagaattgaaagggatgtatcaacggtcgtttgaaaagcactgggtaattgttcttcgttatc 22308991  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcctt 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||  | ||||  | ||||||||||||| ||||||||| |||| |||| | ||||||    
22308990 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactaactccactactctgtttttgtctacactacaagacaagacaacagctctacctgtagaaatattcctt 22308891  T
318 caagataggaatgaatttgaagttgat 344  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||    
22308890 caagatgggaatgaatttgaaattgat 22308864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 50 - 347
Target Start/End: Original strand, 25686577 - 25686874
Alignment:
50 tttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaattt-aaactgaagattcaaagtagctgtttctcgtttcaacctcgtctaaga 148  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| || ||| ||  |||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |    
25686577 tttcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttgatcagtttattttaaactgaagtttcaatgaagctgtttctcgtttcaacctcgtctaa-a 25686675  T
149 agaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgagga-gcactgagtacttttcctgcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccac 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| || ||| |||| | || | ||||||||||||||||||||||||||||||    
25686676 agaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaagaagcactgggtgcttgtccttcattga-agagttgacaaagtacaagtgtacaaccac 25686774  T
248 tacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttccttcaagataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
    |||||| || || |||  | ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
25686775 tacctctactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaaatgttccttcaagataggaatggatttgaacttgatcct 25686874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 19 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 25986480 - 25986155
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||| |||||||||| || |||  | |||  ||||||||||| ||||||    
25986480 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaggttttcatcagaagcaatatcttcacaagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagatccaaagt 25986382  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaaca 218  Q
    ||||| |||||  |||   ||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  ||||||||| | || |||| ||||||||    
25986381 agctggttctcaattcggtcttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtaccaacggtcatatgaatagcactgagcatttgtccttcgttaaca 25986282  T
219 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcctt 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||   | ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||    
25986281 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctatttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcctt 25986182  T
318 caagataggaatgaatttgaagttgat 344  Q
    |||||| ||||| ||||||||| ||||    
25986181 caagatgggaataaatttgaagctgat 25986155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 19 - 344
Target Start/End: Original strand, 28251360 - 28251687
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggtttt-catcagaagcgaaat--catcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaa 115  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||  | |||||||||||| || || |||  | |||  |||||||||||| ||    
28251360 atcagaagcagaagatcatcagaagcaaggtttttcatcagaagcaaaatatcttcaccagaagctgcatttgatcctttaatc-aaactgaagatttaa 28251458  T
116 agtagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgtta 215  Q
    |||||||| |||||  |||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| ||||  | || |||| |||||    
28251459 agtagctggttctccattcagccttatctaagaagaacgaagaattaaaagggaggtatcaacggtcatttggagagctctgaacatttgtccttcgtta 28251558  T
216 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaat-tgttc 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |    
28251559 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgc 28251657  T
315 cttcaagataggaatgaatttgaagttgat 344  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||    
28251658 cttcaagatgggaatgaatttgaagctgat 28251687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 19 - 347
Target Start/End: Original strand, 25735355 - 25735683
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaattt--aaactgaagattcaaa 116  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||  ||| |||||||||    ||||||| ||||||||||| || ||| ||  ||||  ||||||||| ||||||    
25735355 atcagaagcagaagtctatcagaagcaacattt-catcagaagttgtatcatcagcagaagctacatttgatcagtttatttttaaactgaagtttcaaa 25735453  T
117 gtagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgagga-gcactgagtacttttcctgcgtta 215  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| || ||| |||| | ||     
25735454 gaagctgtttctcgtgtcaacctcgtctaaga-gaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaaaaagcactgggtgcttgtccttcattg 25735552  T
216 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcc 315  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||  | ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
25735553 a-agagttgacaaagtacaaatgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaaatgttcc 25735651  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
25735652 ttcaagataggaatggatttgaacttgatcct 25735683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 19 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 25675560 - 25675232
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaattt--aaactgaagattcaaa 116  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||  ||| |||||||||    ||||||||||||||||||| || ||| ||  ||||  ||||||||| ||||||    
25675560 atcagaagcagaagtctatcagaagcaacattt-catcagaagatctatcatcaccagaagctacatttgatcagttcatttttaaactgaagtttcaaa 25675462  T
117 gtagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgagga-gcactgagtacttttcctgcgtta 215  Q
    | || |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||| || ||| |||| | ||     
25675461 gaagttgtttctcgtgtcaacctcgtctaaga-gaacgaagaattgaaaggaaggtatcaacggtcatttgaaaaagcactgggtgcttgtccttcattg 25675363  T
216 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcc 315  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||  | ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
25675362 a-agagttgacaaagtacaaatgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaaatgttcc 25675264  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
25675263 ttcaagataggaatggatttgaacttgatcct 25675232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 163 - 347
Target Start/End: Original strand, 19289322 - 19289505
Alignment:
163 aaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccct 262  Q
    ||||||||||  ||||| ||||||||  ||||||| || ||| |||| | || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
19289322 aaagggaggtgccaacgttcatttgaaaagcactgggtgcttgtccttcattga-agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccct 19289420  T
263 gagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttccttcaagataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
19289421 gagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttccttcaagataggaatgaatttgaagtcgatcct 19289505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 19 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 25679636 - 25679308
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaattt--aaactgaagattcaaa 116  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||  ||| |||||||||    ||||||||||||||||||| || ||| ||  ||||  ||||||||| ||||||    
25679636 atcagaagcagaagtctatcagaagcaacattt-catcagaagatctatcatcaccagaagctacatttgatcagttcatttttaaactgaagtttcaaa 25679538  T
117 gtagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgagga-gcactgagtacttttcctgcgtta 215  Q
    | || |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||| || ||| |||| | ||     
25679537 gaagttgtttctcgtgtcaacctcgtctaaga-gaacgaagaattgaaaggtaggtatcaacggtcatttgaaaaagcactgggtgcttgtccttcattg 25679439  T
216 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcc 315  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||  | ||||  ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||| ||||||    
25679438 a-agagttgacaaagtacaaatgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacatcagctcttcctgcagaaatgttcc 25679340  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
25679339 ttcaagataggaatggatttgaacttgatcct 25679308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 56 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 6158569 - 6158316
Alignment:
56 cagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacga 155  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||  |  ||||||||||||||| |||||||| ||||||||  ||||| ||  ||||||||||||||    
6158569 cagaagcaatatcatcaccagaagctacatttaatccatatatttaaactgaagatccaaagtagttgtttctcaattcaatcttatctaagaagaacga 6158470  T
156 agaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctcca 255  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||   ||||||||| | || |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
6158469 agaattgaaagggaggtaacaacggtcatatggatagcactgagcatttgtccctcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctcca 6158370  T
256 cgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaat 309  Q
    | || |||  | ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
6158369 ctactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaat 6158316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 218 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 18555470 - 18555341
Alignment:
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcctt 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
18555470 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttccct 18555371  T
318 caagataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
18555370 caagataggaatgaatttgaagttgatcct 18555341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 19 - 323
Target Start/End: Original strand, 25722755 - 25723059
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaa--tttaaactgaagattcaaa 116  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||  ||| ||||||||||   ||||||||||||||||||| || ||| ||  |  |||||||||||| | ||||    
25722755 atcagaagcagaagtctatcagaagcaacattt-catcagaagctgtatcatcaccagaagctacatttgatcagtttatttttaaactgaagttgcaaa 25722853  T
117 gtagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttg-aggagcactgagtacttttcctgcgtta 215  Q
    | ||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||| |||| | ||     
25722854 gaagctgtttctcctgtcaacctcgtctaag-agaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaaaaagcactgggtacttgtccttcattg 25722952  T
216 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcc 315  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||  | ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
25722953 a-agagttgacaaagtacaaatgtacaactactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaaatgttcc 25723051  T
316 ttcaagat 323  Q
    ||||||||    
25723052 ttcaagat 25723059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 101 - 344
Target Start/End: Original strand, 28356591 - 28356834
Alignment:
101 aaactgaagattcaaagtagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagt 200  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||  |||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| ||||      
28356591 aaactgaagatttaaagtagctggttctccattcagccttatctaagaagaacgaagaattaaaagggaggtatcaacggtcatttggagagctctgaac 28356690  T
201 acttttcctgcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgc 300  Q
    | || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||    
28356691 atttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgc 28356789  T
301 ctgcagaat-tgttccttcaagataggaatgaatttgaagttgat 344  Q
    ||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||    
28356790 ctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctgat 28356834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 218 - 347
Target Start/End: Original strand, 12953126 - 12953255
Alignment:
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcctt 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
12953126 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaatacaagataacagctctgcctgtagaattgttcctt 12953225  T
318 caagataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
12953226 caagataggaatgaatttgaagttgatcct 12953255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 27 - 188
Target Start/End: Original strand, 16123021 - 16123181
Alignment:
27 cagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagtagctgttt 126  Q
    |||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||    
16123021 cagaagcccatcagaagcaaagttt-catcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactggagattcaaagtagctgttt 16123119  T
127 ctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttga 188  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
16123120 ctcgttttaacctcgtctaacaagaacgaagatttgaaagggaggtatcaacggtcatttga 16123181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 218 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 18498820 - 18498691
Alignment:
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcctt 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
18498820 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaaaataacagctctgcctgcagaattgttcctt 18498721  T
318 caagataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||    
18498720 caagataagaatgaatttgaagttgatcct 18498691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 19 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 17043019 - 17042698
Alignment:
19 atcagaagc-agaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||| | | |||||||||| | |||||||||||||||| ||| | ||| ||   || ||||| |||||| ||||    
17043019 atcagaagctagaagac-atcagaagcaagatat-catcagaagctatatcatcaccagaagcttcaagtgatcagttgtttcaaactaaagatttaaag 17042922  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
     |||||||| ||| |||  ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||   ||||||| |||||| || | ||||  |    
17042921 gagctgtttttcggttcgtcctcgtcta-gaagaacgaagaattgcaagggaggtatcaacggtcttttgcaaagcactgggtacttgtctttcgttttc 17042823  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcct 316  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
17042822 agcgttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactttgttcttgtccacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaatttgttcct 17042723  T
317 tcaagataggaatgaatttgaagtt 341  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
17042722 tcaagatgggaatgaatttgaagtt 17042698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 218 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 31931623 - 31931494
Alignment:
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcctt 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
31931623 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagttaacaactctgcctgcagaattgttcctt 31931524  T
318 caagataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||    
31931523 caagttaggaatgaatttgaagttgatcct 31931494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Original strand, 7751031 - 7751353
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaat--catcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaa 116  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||  ||||  | |||||||||||| || || |||  | |||  ||||||||||||||||    
7751031 atcagaagcagaggatcatcagaagcaaggttttcatcagaaggaaaatatcttcaccagaagctgcatttgatccctcaatc-aaactgaagattcaaa 7751129  T
117 gtagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaa 216  Q
    |||||||||||||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||||||||| |||| ||   | |||     
7751130 gtagctgtttctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctctttac 7751229  T
217 cagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaat-tgttcc 315  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||  ||||||||||||||| ||||||  |||||||||||| ||  ||    
7751230 tagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatgtgcgcc 7751329  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
    |||||||| |||||||||||||||    
7751330 ttcaagatgggaatgaatttgaag 7751353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 20 - 184
Target Start/End: Original strand, 32761730 - 32761894
Alignment:
20 tcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagta 119  Q
    ||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| || |||| ||||||||||| |||||||    
32761730 tcagaagcaaaaggtcatcagaagcaaggttttcatcagaagcgatatcatcaccagaagctacatttaatccgtaaattcaaactgaagatccaaagta 32761829  T
120 gctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcat 184  Q
    | |||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
32761830 gttgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcat 32761894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Original strand, 9122928 - 9123250
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaa-ggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||| ||||    
9122928 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaggttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagatttaaag 9123026  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| |||||  ||||  ||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||   || ||   ||||||||| |||| ||   ||||||     
9123027 tagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgaatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaat 9123126  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| |||| ||    
9123127 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaatttgtacc 9123226  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
    |||||||| |||||||||||||||    
9123227 ttcaagatgggaatgaatttgaag 9123250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 19 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 17064591 - 17064271
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    |||||||||||||| | |||||| ||||| | | |||||||| | | |||||||||||||||| ||| | ||| ||   || ||||| |||||| ||||     
17064591 atcagaagcagaagtc-atcagatgcaagatat-catcagaaactatatcatcaccagaagcttcaagtgatcagttgtttcaaactaaagatttaaagg 17064494  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaaca 218  Q
    |||||||| ||| |||  ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||   ||||||| |||||| || | | ||  ||    
17064493 agctgtttttcggttcgtcctcgtcta-gaagaacgaagaattgcaagggaggtatcaacggtcttttgcaaagcactgggtacttgtctttcattttca 17064395  T
219 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcctt 317  Q
    | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
17064394 gcgttgacaaagtacaagtgtacaacaactacctccactactatgttcttgtccacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaatttgttcctt 17064295  T
318 caagataggaatgaatttgaagtt 341  Q
    |||||| |||||||||||||||||    
17064294 caagatgggaatgaatttgaagtt 17064271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 19 - 170
Target Start/End: Original strand, 17577593 - 17577744
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| |||||||||||    
17577593 atcagaagcagatggtcatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattgatccgtaaatttaaactggagattcaaagt 17577692  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggag 170  Q
    ||||||||  | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
17577693 agctgtttaacatttcaaccttgtctaagaagaacgaagaattgaaagggag 17577744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 19 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 3661782 - 3661459
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| || |||  | |||  |||||||||||||||||    
3661782 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 3661684  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   |||||||||  ||| ||   ||||||     
3661683 tagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaat 3661584  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcct 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||||||| |      
3661583 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaattgtacac 3661484  T
317 tcaagataggaatgaatttgaagtt 341  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
3661483 tcaagatgggaatgaatttgaagtt 3661459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 19 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 3672446 - 3672123
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| || |||  | |||  |||||||||||||||||    
3672446 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 3672348  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   |||||||||  ||| ||   ||||||     
3672347 tagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaat 3672248  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcct 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||||||| |      
3672247 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaattgtacac 3672148  T
317 tcaagataggaatgaatttgaagtt 341  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
3672147 tcaagatgggaatgaatttgaagtt 3672123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 19 - 178
Target Start/End: Original strand, 9421 - 9580
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |  ||| ||||||||||| ||||||    
9421 atcagaagcagaaggtaatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacatttaatccatatattcaaactgaagatccaaagt 9520  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaac 178  Q
    || ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
9521 agttgtttctcgtttcaatctcatctaagaagaacgaagaattgaaaggaaggtatcaac 9580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Original strand, 9112291 - 9112613
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaa-ggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||| ||||    
9112291 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaggttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagatttaaag 9112389  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| |||||  ||||  ||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||   || ||   ||||||||| |||| ||   ||||||     
9112390 tagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgaatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaat 9112489  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||||| ||||||  |||||||| || |||| ||    
9112490 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcaaaatttgtacc 9112589  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
    |||||||| |||||||||||||||    
9112590 ttcaagatgggaatgaatttgaag 9112613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Original strand, 31542694 - 31543016
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
31542694 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaacagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 31542792  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||||||||| |||| ||   ||||||     
31542793 tagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaat 31542892  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |     
31542893 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacg 31542992  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
    |||||||| |||||||||||||||    
31542993 ttcaagatgggaatgaatttgaag 31543016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 218 - 347
Target Start/End: Original strand, 7586252 - 7586381
Alignment:
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcctt 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
7586252 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgactctgtttgtgtctacgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaaatgttcctt 7586351  T
318 caagataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||    
7586352 caagataggaatggatttgaacttgatcct 7586381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 35 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 16930834 - 16930527
Alignment:
35 catcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttctcgttt 133  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| || |||  | |||  |||||||||||||||||| |||| |||||  ||    
16930834 catcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaagttgctgattctcaatt 16930736  T
134 caacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaacagagttgacaaagtac 233  Q
    ||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   |||||||||  ||| ||   |||||| ||||||||||||||||    
16930735 cagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaatagagttgacaaagtac 16930636  T
234 aagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttccttcaagataggaatgaa 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||||||| |  ||||||| ||||||||    
16930635 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaattgtacactcaagatgggaatgaa 16930536  T
333 tttgaagtt 341  Q
    |||||||||    
16930535 tttgaagtt 16930527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 19 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 16960021 - 16959698
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| || |||  | |||  |||||||||||||||||    
16960021 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 16959923  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    | |||| |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   |||||||||  ||| ||   ||||||     
16959922 ttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaat 16959823  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcct 316  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||||||| |      
16959822 agagttgacaaagtacaagtgtgcaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaattgtacac 16959723  T
317 tcaagataggaatgaatttgaagtt 341  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
16959722 tcaagatgggaatgaatttgaagtt 16959698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 19 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 29385151 - 29384828
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    |||||||||||||   |||||||| |||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| || ||   | |||  |||||||||||||||||    
29385151 atcagaagcagaaagtcatcagaaacaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgattctttaatc-aaactgaagattcaaag 29385053  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   |||||||||  ||| ||   ||||||     
29385052 tagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaat 29384953  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcct 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||||||| |      
29384952 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaattgtacac 29384853  T
317 tcaagataggaatgaatttgaagtt 341  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
29384852 tcaagatgggaatgaatttgaagtt 29384828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 52 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 27506309 - 27506020
Alignment:
52 tcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaaga 151  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||||||||| | || |||  | |||  ||||||||||| ||||||||||| |||||  ||||| ||  ||||||||||    
27506309 tcatcagaagcaatatcttcaccagaagctatatttgatcctttaatc-aaactgaagatccaaagtagctgattctcaattcaatcttatctaagaaga 27506211  T
152 acgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacc 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||||||||| |||| ||   |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
27506210 acgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttagtagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacc 27506111  T
252 tccacgaccctg--agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttccttcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
    ||||| || |||    | ||||  ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||    
27506110 tccactactctgtttttttgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaag 27506020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 19 - 341
Target Start/End: Original strand, 17984506 - 17984830
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| || |||  | |||  |||||||||||||||||    
17984506 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 17984604  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| || ||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   |||||||||  ||| ||   ||||||     
17984605 tagctgattttcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaat 17984704  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |     
17984705 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 17984804  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaagtt 341  Q
     ||||||| |||||||||||||||||    
17984805 ctcaagatgggaatgaatttgaagtt 17984830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 218 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 17047755 - 17047631
Alignment:
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgacc-ctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcct 316  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
17047755 agagttgacaaagtacaaatgtacaaccacgacctccacgaactctgagtgtgtcctcgctacaggacaagataacagctctgcctgcagatttgttcct 17047656  T
317 tcaagataggaatgaatttgaagtt 341  Q
    ||||||||||||||||||| |||||    
17047655 tcaagataggaatgaattttaagtt 17047631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 12855421 - 12855099
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  ||||| |||||||||||    
12855421 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactaaagattcaaag 12855323  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||||||||| |||| ||   | ||||     
12855322 tagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcattaat 12855223  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |     
12855222 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 12855123  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
     ||||||| |||||||||||||||    
12855122 ctcaagatgggaatgaatttgaag 12855099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 12865947 - 12865625
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  ||||| |||||||||||    
12865947 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactaaagattcaaag 12865849  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||||||||| |||| ||   | ||||     
12865848 tagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcattaat 12865749  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |     
12865748 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 12865649  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
     ||||||| |||||||||||||||    
12865648 ctcaagatgggaatgaatttgaag 12865625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 26875812 - 26875490
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||| || |||  | |||  |||||||||||||||||    
26875812 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 26875714  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||||||||| |||| ||   | ||||     
26875713 tagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcattaat 26875614  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcaga-attgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||  |||| |     
26875613 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagattttgtaca 26875514  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
     ||||||| |||||||||||||||    
26875513 ctcaagatgggaatgaatttgaag 26875490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 33199727 - 33199406
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  ||||||||||||||| |    
33199727 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaa-g 33199630  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| |||||  ||||  ||  || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||  || ||   | ||||||| |||| ||   ||||||     
33199629 tagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaaaaattgaaagggaggtatcaacggatatatggataacactgagcacttgtctctcgttaat 33199530  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |     
33199529 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 33199430  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
33199429 ttcaagataggaatgaatttgaag 33199406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Original strand, 34806956 - 34807278
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
34806956 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 34807054  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||||||||| |||| ||   | ||||     
34807055 tagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcattaat 34807154  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | | ||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |     
34807155 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctatctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 34807254  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
     ||||||| |||||||||||||||    
34807255 ctcaagatgggaatgaatttgaag 34807278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 19 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 26036433 - 26036109
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
26036433 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacttttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 26036335  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    | |||| |||||  ||||| ||  || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || ||   |||||||||  ||| ||   ||||||     
26036334 ttgctgattctcaattcaatcttatcaaagaagaacaaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaat 26036235  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |     
26036234 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 26036135  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaagtt 341  Q
     ||||||| |||||||||||||||||    
26036134 ctcaagatgggaatgaatttgaagtt 26036109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 26865188 - 26864866
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    |||||||| |||||  ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||| || |||  | |||  |||||||||||||||||    
26865188 atcagaagtagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 26865090  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||||||||| |||| ||   | ||||     
26865089 tagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcattaat 26864990  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcaga-attgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||  |||| |     
26864989 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagattttgtaca 26864890  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
     ||||||| |||||||||||||||    
26864889 ctcaagatgggaatgaatttgaag 26864866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 52 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 27373199 - 27372910
Alignment:
52 tcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaaga 151  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||||||||| | || |||  | |||  ||||||||||| ||||||||||| |||||  ||||| ||  ||||||||||    
27373199 tcatcagaagcaatatcttcaccagaagctatatttgatcctttaatc-aaactgaagatccaaagtagctgattctcaattcaatcttatctaagaaga 27373101  T
152 acgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacc 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  || ||   ||||||||| |||| ||   |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
27373100 acgaagaattgaaagggaggtatcaacagatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttagtagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacc 27373001  T
252 tccacgaccctg--agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttccttcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
    ||||| || |||    | ||||  | ||||||||||||| ||||||  ||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||    
27373000 tccactactctgtttttttgtctacactacaagacaagacaacagccatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaag 27372910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 52 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 27463549 - 27463260
Alignment:
52 tcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaaga 151  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||||||||| | || |||  | |||  ||||||||||| ||||||||||| |||||  ||||| ||  ||||||||||    
27463549 tcatcagaagcaatatcttcaccagaagctatatttgatcctttaatc-aaactgaagatccaaagtagctgattctcaattcaatcttatctaagaaga 27463451  T
152 acgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacc 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  || ||   ||||||||| |||| ||   |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
27463450 acgaagaattgaaagggaggtatcaacagatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttagtagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacc 27463351  T
252 tccacgaccctg--agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttccttcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
    ||||| || |||    | ||||  | ||||||||||||| ||||||  ||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||    
27463350 tccactactctgtttttttgtctacactacaagacaagacaacagccatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaag 27463260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Original strand, 32961725 - 32962047
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
32961725 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 32961823  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| |||||  ||||  ||  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||||||||| |||| ||   | ||||     
32961824 tagctgattctcaattcagtcttatgaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcattaat 32961923  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | | ||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |     
32961924 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctctctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 32962023  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
     ||||||| |||||||||||||||    
32962024 ctcaagatgggaatgaatttgaag 32962047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Original strand, 34817588 - 34817910
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||| |||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
34817588 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcataagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 34817686  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||||||||| |||| ||   | ||||     
34817687 tagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcattaat 34817786  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | | ||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |     
34817787 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctatctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 34817886  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
     ||||||| |||||||||||||||    
34817887 ctcaagatgggaatgaatttgaag 34817910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 19 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 26025859 - 26025535
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
26025859 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacttttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 26025761  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    | |||| |||||  ||||  ||  || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || ||   |||||||||  ||| ||   ||||||     
26025760 ttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacaaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaat 26025661  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |     
26025660 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 26025561  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaagtt 341  Q
     ||||||| |||||||||||||||||    
26025560 ctcaagatgggaatgaatttgaagtt 26025535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 218 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 21128281 - 21128161
Alignment:
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcctt 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  ||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
21128281 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacttccacgactctgtttgtgtctacgctacaagacaagataacatctctgcctgcagaaatgttcctt 21128182  T
318 caagataggaatgaatttgaa 338  Q
    ||||||||||||| |||||||    
21128181 caagataggaatggatttgaa 21128161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 27384833 - 27384511
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaat--catcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaa 116  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||  ||||  | |||||||||||| || || |||  | |||  ||||||||||||||||    
27384833 atcagaagcagaggatcatcagaagcaaggttttcatcagaaggaaaatatcttcaccagaagctgcatttgatccctcaatc-aaactgaagattcaaa 27384735  T
117 gtagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaa 216  Q
    |||||||  ||||  ||||  ||  || ||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||  || ||   ||||||||| |||| ||   | |||     
27384734 gtagctggctctcaattcagtcttatccaagaagaacaaagaattgaaagggaggttccaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctctttac 27384635  T
217 cagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaat-tgttcc 315  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||  | |||| |||||||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||  ||    
27384634 tagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccattactctgtttttgtcttcgctacaagacaaaacaacagccttgcctgcagaatgtgcgcc 27384535  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
    |||||||| ||||||| |||||||    
27384534 ttcaagatgggaatgattttgaag 27384511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 27475246 - 27474924
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaat--catcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaa 116  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||  ||||  | |||||||||||| || || |||  | |||  ||||||||||||||||    
27475246 atcagaagcagaggatcatcagaagcaaggttttcatcagaaggaaaatatcttcaccagaagctgcatttgatccctcaatc-aaactgaagattcaaa 27475148  T
117 gtagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaa 216  Q
    |||||||  ||||  ||||  ||  || ||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||  || ||   ||||||||| |||| ||   | |||     
27475147 gtagctggctctcaattcagtcttatccaagaagaacaaagaattgaaagggaggttccaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctctttac 27475048  T
217 cagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaat-tgttcc 315  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||  | |||| |||||||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||  ||    
27475047 tagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccattactctgtttttgtcttcgctacaagacaaaacaacagccttgcctgcagaatgtgcgcc 27474948  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
    |||||||| ||||||| |||||||    
27474947 ttcaagatgggaatgattttgaag 27474924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 27504745 - 27504423
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcat--caccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaa 116  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||  |  ||||||||||| || || |||  | |||  ||||||||||||||||    
27504745 atcagaagcagaggatcatcagaagcaaggttttcatcagaagcaaaatattttcaccagaagctgcatttgatccctcaatc-aaactgaagattcaaa 27504647  T
117 gtagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaa 216  Q
    |||||||  ||||  ||||  ||  || ||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||  || ||   ||||||||| |||| ||   | |||     
27504646 gtagctggctctcaattcagtcttatccaagaagaacaaagaattgaaagggaggttccaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctctttac 27504547  T
217 cagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaat-tgttcc 315  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||  | |||| |||||||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||  ||    
27504546 tagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccattactctgtttttgtcttcgctacaagacaaaacaacagccttgcctgcagaatgtgcgcc 27504447  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
    |||||||| ||||||| |||||||    
27504446 ttcaagatgggaatgattttgaag 27504423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 19 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 27342094 - 27341764
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||| || |||  | | |  |||||||||||||||||    
27342094 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagctacatttgatcctttagtc-aaactgaagattcaaag 27341996  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    | |||| |||||  ||||  ||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||||||||| |||| ||   | ||||     
27341995 ttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaatgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcattaat 27341896  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |     
27341895 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 27341796  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
     ||||||| ||||||||||||||||| |||||    
27341795 ctcaagatgggaatgaatttgaagtttatcct 27341764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 19 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 27402834 - 27402504
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||| || |||  | | |  |||||||||||||||||    
27402834 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagctacatttgatcctttagtc-aaactgaagattcaaag 27402736  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    | |||| |||||  ||||  ||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||||||||| |||| ||   | ||||     
27402735 ttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaatgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcattaat 27402636  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |     
27402635 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 27402536  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
     ||||||| ||||||||||||||||| |||||    
27402535 ctcaagatgggaatgaatttgaagtttatcct 27402504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 19 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 27413493 - 27413163
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||| || |||  | | |  |||||||||||||||||    
27413493 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagctacatttgatcctttagtc-aaactgaagattcaaag 27413395  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    | |||| |||||  ||||  ||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||||||||| |||| ||   | ||||     
27413394 ttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaatgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcattaat 27413295  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |     
27413294 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 27413195  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
     ||||||| ||||||||||||||||| |||||    
27413194 ctcaagatgggaatgaatttgaagtttatcct 27413163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Original strand, 32972344 - 32972666
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
32972344 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccaaaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 32972442  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| |||||  ||||  ||  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||||||||| |||| ||   | ||||     
32972443 tagctgattctcaattcagtcttatgaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcattaat 32972542  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | | ||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |     
32972543 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctctctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 32972642  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
     ||||||| |||||||||||||||    
32972643 ctcaagatgggaatgaatttgaag 32972666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 19 - 341
Target Start/End: Original strand, 31982422 - 31982746
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||| || |||  | | |  |||||||||||||||||    
31982422 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagctacatttgatcctttagtc-aaactgaagattcaaag 31982520  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    | |||| |||||  ||||  ||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||||||||| |||| ||   | ||||     
31982521 ttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaatgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcattaat 31982620  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |     
31982621 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 31982720  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaagtt 341  Q
     ||||||| |||||||||||||||||    
31982721 ctcaagatgggaatgaatttgaagtt 31982746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 218 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 11206146 - 11206020
Alignment:
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcctt 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
11206146 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgcttttgtctatgctacaacacaagataacagctctgcctgcagaaatgttcctt 11206047  T
318 caagataggaatgaatttgaagttgat 344  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||    
11206046 caagataggaatggatttgaacttgat 11206020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 135 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 11235780 - 11235573
Alignment:
135 aacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaacagagttgacaaagtaca 234  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||  ||||||| ||  ||||| ||||||||  ||||||| || ||| |||| | || | |||||||||||| ||||    
11235780 aacctcgtctaaga-gagcgaaggatcaaaagggaagttccaacgttcatttgaaaagcactgggtgcttgtccttcattga-agagttgacaaattaca 11235683  T
235 agtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttccttcaagataggaatgaatt 334  Q
    |||||||||||||||||||||| |  ||   | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
11235682 agtgtacaaccactacctccactattctacttttgtctacgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaaatgttccttcaagataggaatggatt 11235583  T
335 tgaagttgat 344  Q
    |||| |||||    
11235582 tgaacttgat 11235573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 218 - 347
Target Start/End: Original strand, 17608401 - 17608530
Alignment:
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataa-cagctctgcctgcagaattgttcct 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||  | ||||  ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||    
17608401 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactttgttt-tgtctacgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcagaaatgttcct 17608499  T
317 tcaagataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||    
17608500 tcaagataggaatgaatttgaacgtgatcct 17608530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 145 - 341
Target Start/End: Original strand, 17982423 - 17982621
Alignment:
145 aagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaac 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   |||||||||  ||| ||   |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
17982423 aagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaac 17982522  T
245 cactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttccttcaagataggaatgaatttgaagtt 341  Q
    |||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |  ||||||| |||||||||||||||||    
17982523 cactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtt 17982621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 35 - 347
Target Start/End: Original strand, 12716646 - 12716961
Alignment:
35 catcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttctcgttt 133  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||  | ||||||||||||| || |||  | |||  |||||||||||||||||| |||| |||||  ||    
12716646 catcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatttttaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaagttgctgattctcaatt 12716744  T
134 caacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaacagagttgacaaagtac 233  Q
    ||  ||  || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || ||   |||||||||  ||| ||   | |||| ||||||||||||||||    
12716745 cagtcttatcaaagaagaacgatgaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctctttaatagagttgacaaagtac 12716844  T
234 aagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcc--ttcaagataggaatg 330  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  |||||||||||||  | |   ||||||| ||||||    
12716845 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatg 12716944  T
331 aatttgaagttgatcct 347  Q
    ||||||||||| |||||    
12716945 aatttgaagtttatcct 12716961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 35 - 347
Target Start/End: Original strand, 12727295 - 12727610
Alignment:
35 catcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttctcgttt 133  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||  | ||||||||||||| || |||  | |||  |||||||||||||||||| |||| |||||  ||    
12727295 catcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatttttaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaagttgctgattctcaatt 12727393  T
134 caacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaacagagttgacaaagtac 233  Q
    ||  ||  || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || ||   |||||||||  ||| ||   | |||| ||||||||||||||||    
12727394 cagtcttatcaaagaagaacgatgaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctctttaatagagttgacaaagtac 12727493  T
234 aagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcc--ttcaagataggaatg 330  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  |||||||||||||  | |   ||||||| ||||||    
12727494 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatg 12727593  T
331 aatttgaagttgatcct 347  Q
    ||||||||||| |||||    
12727594 aatttgaagtttatcct 12727610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 145 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 4631147 - 4630943
Alignment:
145 aagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaac 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||||||  | |||| ||   | |||| |||||||||||||||||||||||||||    
4631147 aagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggaaagcactctgcacttgtctctcattaatagagttgacaaagtacaagtgtacaac 4631048  T
245 cactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttccttcaagataggaatgaatttgaagttg 342  Q
    |||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |  ||||||| |||||||||||||||||     
4631047 cactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagttt 4630948  T
343 atcct 347  Q
    |||||    
4630947 atcct 4630943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 145 - 347
Target Start/End: Original strand, 32300965 - 32301169
Alignment:
145 aagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaac 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||||||  | |||| ||   | |||| |||||||||||||||||||||||||||    
32300965 aagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggaaagcactctgcacttgtctctcattaatagagttgacaaagtacaagtgtacaac 32301064  T
245 cactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttccttcaagataggaatgaatttgaagttg 342  Q
    |||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |  ||||||| |||||||||||||||||     
32301065 cactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagttt 32301164  T
343 atcct 347  Q
    |||||    
32301165 atcct 32301169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 145 - 347
Target Start/End: Original strand, 32311654 - 32311858
Alignment:
145 aagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaac 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||||||  | |||| ||   | |||| |||||||||||||||||||||||||||    
32311654 aagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggaaagcactctgcacttgtctctcattaatagagttgacaaagtacaagtgtacaac 32311753  T
245 cactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttccttcaagataggaatgaatttgaagttg 342  Q
    |||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |  ||||||| |||||||||||||||||     
32311754 cactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagttt 32311853  T
343 atcct 347  Q
    |||||    
32311854 atcct 32311858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 218 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 20635775 - 20635644
Alignment:
218 agagttgacaaagtacaa-gtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataa-cagctctgcctgcagaattgttcc 315  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||  | ||||  ||||||||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||    
20635775 agagttgacaaagtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcagcaatgttcc 20635676  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
    ||||||||||||||| |||||||  |||||||    
20635675 ttcaagataggaatggatttgaacgtgatcct 20635644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 218 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 22386858 - 22386750
Alignment:
218 agagttgacaaagtac-aagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaag-ataacagctctgcctgcagaattgttcc 315  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||  |||||||||||||| | ||||||||||||||||| | ||||||    
22386858 agagttgacaaagtaccaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcagtaatgttcc 22386759  T
316 ttcaagata 324  Q
    |||||||||    
22386758 ttcaagata 22386750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 84
Target Start/End: Original strand, 10971325 - 10971387
Alignment:
22 agaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctaca 84  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||    
10971325 agaagcagaaggtcatcagaagcaaggttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctaca 10971387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 234 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 19086197 - 19086083
Alignment:
234 aagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaaga-taacagctctgcctgcagaattgttccttcaagataggaatgaa 332  Q
    |||||||||||||||| |||||| || | |  ||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||   | ||||||||    
19086197 aagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgctacaagacaagaataacagctctgcctgcatcaatgttccttcatacttggaatgaa 19086098  T
333 tttgaagttgatcct 347  Q
    |||||| ||||||||    
19086097 tttgaaattgatcct 19086083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 234 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 19624018 - 19623932
Alignment:
234 aagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaaga-taacagctctgcctgcagaattgttccttca 319  Q
    |||||||||||||||| |||||| || | |  |||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||    
19624018 aagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctttgctacaagacaagaataacagctctgcctgcagcaatgttccttca 19623932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 234 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 32544304 - 32544190
Alignment:
234 aagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaag-ataacagctctgcctgcagaattgttccttcaagataggaatgaa 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||   ||||||||||||| | ||||||||||||||||    ||||||||||  || |||||| |    
32544304 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttctgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcaacgatgttccttcacaatgggaatgga 32544205  T
333 tttgaagttgatcct 347  Q
    |||||| ||||||||    
32544204 tttgaaattgatcct 32544190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 18499017 - 18498953
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctaca 84  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||  ||| |||||||||| | |||||||||||||||||||    
18499017 atcagaagcagaagttcatcagaagcaaaattt-catcagaagctatatcatcaccagaagctaca 18498953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #95
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 18555667 - 18555603
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctaca 84  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||  ||| |||||||||| | |||||||||||||||||||    
18555667 atcagaagcagaagttcatcagaagcaaaattt-catcagaagctatatcatcaccagaagctaca 18555603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #96
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 234 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 29918056 - 29917945
Alignment:
234 aagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaag-ataacagctctgcctgcagaattgttccttcaagataggaatgaa 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||   ||||||||||||| | |||||||||||||||| |  ||||| ||||  || |||||| |    
29918056 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctatgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcaaagatgttcattcacaatgggaatgca 29917957  T
333 tttgaagttgat 344  Q
    |||||| |||||    
29917956 tttgaaattgat 29917945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #97
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 234 - 347
Target Start/End: Original strand, 16265260 - 16265374
Alignment:
234 aagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaag-ataacagctctgcctgcagaattgttccttcaagataggaatgaa 332  Q
    |||||| |||||||||||||||| || |||  ||||||   ||||||||||||| | || ||||||||||||| |  |||||||||   || |||||| |    
16265260 aagtgtgcaaccactacctccactactctgtttgtgtctctgctacaagacaagaaaaatagctctgcctgcaaagatgttccttcgcaatgggaatgca 16265359  T
333 tttgaagttgatcct 347  Q
    |||||| ||||||||    
16265360 tttgaaattgatcct 16265374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #98
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 25800750 - 25800712
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatca 57  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
25800750 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaggttttcatca 25800712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #99
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 84
Target Start/End: Original strand, 12952945 - 12952993
Alignment:
35 catcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctaca 84  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||||||||||    
12952945 catcagaagcaagattt-catcagaagctatatcatcaccagaagctaca 12952993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #100
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 31931804 - 31931756
Alignment:
35 catcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctaca 84  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||||||||||    
31931804 catcagaagcaagattt-catcagaagctatatcatcaccagaagctaca 31931756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 84)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 19 - 344
Target Start/End: Original strand, 27978188 - 27978512
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |  ||  | |||||||||||||||||||||||    
27978188 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttt-catcagaagcgatatcatcaccagaagctacaagtgttcaattaatttaaactgaagattcaaagt 27978286  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaaca 218  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| ||    
27978287 agctgtttctcatttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatca 27978386  T
219 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttccttc 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
27978387 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaaatgttccttc 27978486  T
319 aagataggaatgaatttgaagttgat 344  Q
    |||||  |||||||||||||||||||    
27978487 aagatgagaatgaatttgaagttgat 27978512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 19 - 344
Target Start/End: Original strand, 28064717 - 28065041
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |  ||  | |||||||||||||||||||||||    
28064717 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttt-catcagaagcgatatcatcaccagaagctacaagtgttcaattaatttaaactgaagattcaaagt 28064815  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaaca 218  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| ||    
28064816 agctgtttctcatttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttatca 28064915  T
219 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttccttc 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
28064916 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaaatgttccttc 28065015  T
319 aagataggaatgaatttgaagttgat 344  Q
    |||||  |||||||||||||||||||    
28065016 aagatgagaatgaatttgaagttgat 28065041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Original strand, 38585892 - 38586212
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||    
38585892 atcagaagaagaagcccatcagaagcaaggtttt-atcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgtagattcaaagt 38585990  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaaca 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| | ||||||    
38585991 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagatttgaaagggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttctttaaca 38586090  T
219 gagttgac-aaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcctt 317  Q
     ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||  ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
38586091 tagttgacaaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctaaaagacaagacaacagctctgcctgcagaaatgttcctt 38586190  T
318 caagataggaatgaatttgaag 339  Q
    |||||| |||||||||||||||    
38586191 caagatgggaatgaatttgaag 38586212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 26867496 - 26867175
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaattt-aaactgaagattcaaag 117  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||| || || || |||||||||||||||||    
26867496 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcaccaccagaagttacatttgatcagtaaaattcaaactgaagattcaaag 26867397  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||    
26867396 tagctgtttaacatttcaacctcgtctaagaagaacgaagcattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttaac 26867297  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcctt 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
26867296 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttcttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaattgttcctt 26867197  T
318 caagataggaatgaatttgaag 339  Q
    |||||| |||||||||||||||    
26867196 caagatgggaatgaatttgaag 26867175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Original strand, 18768711 - 18769031
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| || |||| ||||||||||| ||||||    
18768711 atcagaagcagaagctcatcagaagcaaggttttcatcagaagcgatatcatcaccagaagctacatttaatccgtaaattcaaactgaagatccaaagt 18768810  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaaca 218  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| || |||| ||||||||    
18768811 agctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagcactgagtatttgtccttcgttaaca 18768910  T
219 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcctt 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||    
18768911 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcctt 18769009  T
318 caagataggaatgaatttgaag 339  Q
    |||||| |||||||||||||||    
18769010 caagatgggaatgaatttgaag 18769031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Original strand, 24414827 - 24415147
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||| ||||||||||| ||||||    
24414827 atcagaagcagaagctcatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattgatttgtaaattcaaactgaagatccaaagt 24414926  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaaca 218  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||| || |||| ||||||||    
24414927 agctgtttctcatttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagcactgagtatttgtccttcgttaaca 24415026  T
219 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcctt 317  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||    
24415027 aagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcctt 24415125  T
318 caagataggaatgaatttgaag 339  Q
    ||||||  ||||||||||||||    
24415126 caagatgagaatgaatttgaag 24415147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 26880085 - 26879764
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaac-tgaagattcaaag 117  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||| || || || ||| ||||||||||||     
26880085 atcagaagcagaagatcatcataagcaaggttttcatcagaagcgaaatcaccaccagaagttacatttgatcagtaaaattcaacctgaagattcaaat 26879986  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| | |||||    
26879985 tagctgtttaacatttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttatccttcattaac 26879886  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcctt 317  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
26879885 aaagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttcttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaattgttcctt 26879786  T
318 caagataggaatgaatttgaag 339  Q
    |||||| |||||||||||||||    
26879785 caagatgggaatgaatttgaag 26879764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 19 - 341
Target Start/End: Original strand, 28731709 - 28732029
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| || |||| ||||||||||| ||||||    
28731709 atcagaagcagaagctcatcagaagcaaggttttcatcagaagcgatatcatcaccagaagctacatttaatccgtaaattcaaactgaagatccaaagt 28731808  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaaca 218  Q
    ||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| || |||| ||||||||    
28731809 agctgtttctcatttcaacatcatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagcactgagtatttgtccttcgttaaca 28731908  T
219 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcctt 317  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| || |||  | ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||    
28731909 gagttgacaaagtacaagtgt--aaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcctt 28732005  T
318 caagataggaatgaatttgaagtt 341  Q
    |||||| |||||||||||||||||    
28732006 caagatgggaatgaatttgaagtt 28732029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 19 - 341
Target Start/End: Original strand, 28721121 - 28721443
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| || |||| ||||| ||||| ||||||    
28721121 atcagaagcagaagctcatcagaagcaaggttttcatcagaagcgatatcatcaccagaagctacatttaatccgtaaattcaaactcaagatccaaagt 28721220  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaaca 218  Q
    ||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||  | |||| ||||||||    
28721221 agctgtttctcatttcaacattatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagcactgagtatctgtccttcgttaaca 28721320  T
219 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcctt 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||    
28721321 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcctt 28721419  T
318 caagataggaatgaatttgaagtt 341  Q
    |||||| |||||||||||||||||    
28721420 caagatgggaatgaatttgaagtt 28721443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Original strand, 21172271 - 21172591
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    |||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| || |||| ||||||||||| ||||||    
21172271 atcagaagcaaaaggtcatcagaagcaaggttttcatcagaagcgatatcatcaccagaagctacatttaatccgtaaattcaaactgaagatccaaagt 21172370  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaaca 218  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| || |||| |||||| |    
21172371 agctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagcactgagtatttgtccttcgttaata 21172470  T
219 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcctt 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| |||| ||||    
21172471 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcttgcagaatttgtgcctt 21172569  T
318 caagataggaatgaatttgaag 339  Q
    |||||| |||||||||||||||    
21172570 caagatgggaatgaatttgaag 21172591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 19 - 293
Target Start/End: Original strand, 24425356 - 24425629
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||| ||||||||||| ||||||    
24425356 atcagaagcagaagctcatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattgatttgtaaattcaaactgaagatccaaagt 24425455  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaaca 218  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| || |||| ||||||||    
24425456 agttgtttctcatttcaacctcgtctaagaagaacgaaaaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagcactgagtatttgtccttcgttaaca 24425555  T
219 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataaca 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||| ||||||||||||||| ||||    
24425556 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaaca 24425629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 19 - 346
Target Start/End: Original strand, 967310 - 967634
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||||||||| || ||| || |||||||||||||| |||||||     
967310 atcagaagcagaaatccatcagaagcaagattt-catcagaagctatatcatcaccagaagctacagttgatcagtaaatttaaactgaagtttcaaagg 967408  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaaca 218  Q
    |||||||| |||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || ||| |||| | || | |    
967409 agctgtttttcgttttaatctcgtctaagaa-aacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaaaagcactgggtgcttgtccttcattga-a 967506  T
219 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttccttc 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||  ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||    
967507 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaaatgttccttc 967606  T
319 aagataggaatgaatttgaagttgatcc 346  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
967607 aagataggaatgaatttgaagttgatcc 967634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 19 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 24275446 - 24275123
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||||||||| || ||| || |||||||||||||| |||||||     
24275446 atcagaagcagaagtccatcagaagcaagattt-catcagaagctatatcatcaccagaagctacagttgatcagt-aatttaaactgaagtttcaaagg 24275349  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaaca 218  Q
    |||||||| |||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || ||| |||| | || | |    
24275348 agctgtttttcgttttaatctcgtctaagaa-aacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaaaagcactgggtgcttgtccttcattga-a 24275251  T
219 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttccttc 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||   |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
24275250 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctatgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaaatgttccttc 24275151  T
319 aagataggaatgaatttgaagttgatcc 346  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||    
24275150 aagataggaatgaatttgaatttgatcc 24275123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 2561913 - 2561593
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  |  ||| ||||||||||| ||||||    
2561913 atcagaagcagaaggtaatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaagtcatcaccagaagctacatttaatccatatattcaaactgaagatccaaagt 2561814  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaaca 218  Q
    ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||   ||| ||||| | || |||| ||||||||    
2561813 agctgtttctcatttcaatctcatctaagaagaacgaagaattgaaaggaaggtatcaacggtcacttggacagcgctgagcatttgtccttcgttaaca 2561714  T
219 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcctt 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||| ||||||||||||||| ||||||| || |||||||| |||| ||||    
2561713 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgtctgcagaatttgtgcctt 2561615  T
318 caagataggaatgaatttgaag 339  Q
    |||  | |||||||||||||||    
2561614 caaagtgggaatgaatttgaag 2561593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Original strand, 28374320 - 28374595
Alignment:
21 cagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgt-gaatttaaactgaagattcaaagta 119  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| || | | ||  |||| |||||||||||||||||||    
28374320 cagaagcagaaggtcatcagaaacaaagttttcatcagaagcaaaatcatcaccagaagttacatttgaacagtaaaattcaaactgaagattcaaagta 28374419  T
120 gctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaacag 219  Q
    |||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| |||| |||||||||    
28374420 gctgtttaacatttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaaggaaggtatcaacggtcagttggagagcactgagtacttgtccttcgttaacag 28374519  T
220 agttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagc 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||| ||||||||||||||| ||||||    
28374520 agttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagc 28374595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 19 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 22774782 - 22774455
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaattt-aaactgaagattcaaag 117  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||  ||||  |||||||| | ||||||||||||||||||| || ||| ||  |||| ||| ||||| |||||||    
22774782 atcagaagcagaagtccatcagaagcaatattttg-tcagaagctatatcatcaccagaagctacatttgatcagtttattttaaattgaagtttcaaag 22774684  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgagga-gcactgagtacttttcctgcgttaa 216  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||| || ||| |||| | || |    
22774683 gagctgtttttcgtttcaacctcgtctaaga-gaacgaagaattaaaagggaggtatcaacggtcatttgaagaagcactgggtgcttgtccttcattga 22774585  T
217 cagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcct 316  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||   | ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
22774584 -agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctatttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaaatgttcct 22774486  T
317 tcaagataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||    
22774485 tcaagataggaatggatttgaacttgatcct 22774455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 19 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 22780160 - 22779833
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaattt-aaactgaagattcaaag 117  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||  ||||  |||||||| | ||||||||||||||||||| || ||| ||  |||| ||| ||||| |||||||    
22780160 atcagaagcagaagtccatcagaagcaatattttg-tcagaagctatatcatcaccagaagctacatttgatcagtttattttaaattgaagtttcaaag 22780062  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgagga-gcactgagtacttttcctgcgttaa 216  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||| || ||| |||| | || |    
22780061 gagctgtttttcgtttcaacctcgtctaaga-gaacgaagaattaaaagggaggtatcaacggtcatttgaagaagcactgggtgcttgtccttcattga 22779963  T
217 cagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcct 316  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||   | ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
22779962 -agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctatttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaaatgttcct 22779864  T
317 tcaagataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||    
22779863 tcaagataggaatggatttgaacttgatcct 22779833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 19 - 346
Target Start/End: Original strand, 36784611 - 36784929
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |     |||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||| || ||||||||||||||||||||||     
36784611 atcagaagcagaagtccatcagaagca-gaagaccatcagaagctatatcatcaccagaagctgcaattgatcagtaaatttaaactgaagattcaaagg 36784709  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaaca 218  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| ||  ||||| |||| || || ||    
36784710 agctgtttttcgtttcaacctcatctaag-agaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggaaagcattggatacttgtccttcgctatca 36784808  T
219 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttccttc 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||  ||||||||||||||| ||       ||||||||||||||||||||    
36784809 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaa-------gcctgcagaattgttccttc 36784901  T
319 aagataggaatgaatttgaagttgatcc 346  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||    
36784902 aagatgggaatgaatttgaagttgatcc 36784929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 19 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 22764078 - 22763752
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaattt-aaactgaagattcaaag 117  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||  ||||  |||||||| | ||||||||||||||||||| || ||| ||  |||| ||||||||| |||||||    
22764078 atcagaagcagaagtccatcagaagcaatattttt-tcagaagctatatcatcaccagaagctacatttgatcagtttattttaaactgaagtttcaaag 22763980  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgagga-gcactgagtacttttcctgcgttaa 216  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||| || ||| |||| | || |    
22763979 gagctgtttttcgtttcaacctcgtctaaga-gaacgaagaattaaaagggaggtatcaacggtcatttgaagaagcactgggtgcttgtccttcattga 22763881  T
217 cagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcct 316  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||  ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||| |||||||    
22763880 -agagttgataaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaccagctctacctgcagaaatgttcct 22763782  T
317 tcaagataggaatgaatttgaagttgatcc 346  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||    
22763781 tcaagataggaatggatttgaacttgatcc 22763752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 19 - 347
Target Start/End: Original strand, 19497797 - 19498123
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||||||| | || ||| ||  ||||||||||||| |||||||     
19497797 atcagaagcagaagtccatcagaagcaagattt-catcagaagctatatcatcaccagaagctatagttgatcagtatatttaaactgaagtttcaaagg 19497895  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaa-gggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||||| |||||| || | |||||||||| ||||||| | | ||| |||||||  ||||| ||||||||  ||||||| || ||| |||| | || |     
19497896 agctgtttttcgttttaatcccgtctaagaa-aacgaaggactaaaaagggaggtgccaacgttcatttgaaaagcactgggtgcttgtccttcattga- 19497993  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcctt 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||||  | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
19497994 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttgtgtctactctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaaatgttcctt 19498093  T
318 caagataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||    
19498094 taagataggaatgaatttgaacttgatcct 19498123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 50 - 347
Target Start/End: Original strand, 19312853 - 19313149
Alignment:
50 tttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttctcgt-ttcaacctcgtctaaga 148  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| |   ||| || ||| |  ||||||  |||||| ||| |  || ||||||||||||||    
19312853 tttcatcagaagctatatcatcaccagaagctacagttaatcagaagattcaatctggaatttcaaaagagctgtctcttgaatttaacctcgtctaaga 19312952  T
149 agaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccact 248  Q
     || ||||| ||  ||||||| || |||||| ||||||||  ||||||| || ||| |||| | || | |||||||||||||||||||||||||||||||    
19312953 -gagcgaaggatcaaaagggatgtttcaacgttcatttgaaaagcactgtgtgcttgtccttcattga-agagttgacaaagtacaagtgtacaaccact 19313050  T
249 acctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttccttcaagataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
    | |||||| || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
19313051 atctccacaactctgagtgtgtctacgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttccttcaagatagaaatgaatttgaagttgatcct 19313149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 218 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 19356545 - 19356416
Alignment:
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcctt 317  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
19356545 agagttggcaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtctcctcgttacaagacaagttaacagctctgcctgcagaattgttcctt 19356446  T
318 caagataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
19356445 caagataggaatgaatttgaagttgatcct 19356416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 19 - 347
Target Start/End: Original strand, 17969014 - 17969341
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaa--actgaagattcaaa 116  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||    |||||||||||||||||| || |||     |||| |  ||||||| ||||||    
17969014 atcagaagca-aagtccatcagaagcaagattt-catcagaagctgtgtcatcaccagaagctacagttgatcaaaatattttataactgaagtttcaaa 17969111  T
117 gtagctgtttct-cgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgtta 215  Q
    | |||||||| | ||||| | |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || ||  |||| | ||     
17969112 ggagctgttttttcgttttatcctcgtctgagaa-aacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaaaagcactgggtgctcgtccttcattg 17969210  T
216 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcc 315  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||    
17969211 a-agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacatccactactctatttttgtctacgctacaagacaaaacaacagctctgcctgcagaaatgttcc 17969309  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||    
17969310 ttcaagataggaatgaatttgaagttaatcct 17969341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 135 - 347
Target Start/End: Original strand, 19299932 - 19300142
Alignment:
135 aacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaacagagttgacaaagtaca 234  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||  |||||||||| |||||| ||||||||  ||||||| ||  || |||| | || | |||||||||||||||||    
19299932 aacctcgtctaaga-gagcgaaggatcaaaagggaggtgtcaacgttcatttgaaaagcactgggtgtttgtccttcattga-agagttgacaaagtaca 19300029  T
235 agtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttccttcaagataggaatgaatt 334  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
19300030 agtgtacaaccactacctccacaactctgagtgtgtctacgctaccagacaagataacagctctgcctgcagaattgttccttcaagataggaatgaatt 19300129  T
335 tgaagttgatcct 347  Q
    ||||||| |||||    
19300130 tgaagtttatcct 19300142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Original strand, 7005611 - 7005933
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
7005611 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 7005709  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| |||||  ||||| ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||||||||| |||| ||   ||||||     
7005710 tagctgattctcaattcaatcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaat 7005809  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |     
7005810 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaagttgtacg 7005909  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
    |||||||| |||||||||||||||    
7005910 ttcaagatgggaatgaatttgaag 7005933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 19 - 341
Target Start/End: Original strand, 21650336 - 21650659
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| || |||  | |||  |||||||||||||||||    
21650336 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 21650434  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   |||||||||  ||| ||   ||||||     
21650435 tagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaat 21650534  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcct 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||||||| |      
21650535 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaattgtacac 21650634  T
317 tcaagataggaatgaatttgaagtt 341  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
21650635 tcaagatgggaatgaatttgaagtt 21650659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 19 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 43355446 - 43355123
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| || |||  | |||  |||||||||||||||||    
43355446 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 43355348  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   |||||||||  ||| ||   ||||||     
43355347 tagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaat 43355248  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcct 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||||||| |      
43355247 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaattgtacac 43355148  T
317 tcaagataggaatgaatttgaagtt 341  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
43355147 tcaagatgggaatgaatttgaagtt 43355123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 29244646 - 29244324
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
29244646 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 29244548  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    || ||| |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||||||||| |||| ||   ||||||     
29244547 taactgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaat 29244448  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| |||| |     
29244447 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaagttgtacg 29244348  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
    |||||||| |||||||||||||||    
29244347 ttcaagatgggaatgaatttgaag 29244324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 29255225 - 29254903
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
29255225 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 29255127  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    || ||| |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||||||||| |||| ||   ||||||     
29255126 taactgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaat 29255027  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| |||| |     
29255026 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaagttgtacg 29254927  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
    |||||||| |||||||||||||||    
29254926 ttcaagatgggaatgaatttgaag 29254903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 19 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 34478352 - 34478029
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| || |||  | |||  |||||||||||||||||    
34478352 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 34478254  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| || ||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   |||||||||  ||| ||   ||||||     
34478253 tagctgattttcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaat 34478154  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcct 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||||||| |      
34478153 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaattgtacac 34478054  T
317 tcaagataggaatgaatttgaagtt 341  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
34478053 tcaagatgggaatgaatttgaagtt 34478029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Original strand, 17857241 - 17857563
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  ||||| |||||||||||    
17857241 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactaaagattcaaag 17857339  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||||||||| |||| ||   ||||||     
17857340 tagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaat 17857439  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |     
17857440 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacg 17857539  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
    |||||||| |||||||||||||||    
17857540 ttcaagatgggaatgaatttgaag 17857563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Original strand, 24327538 - 24327860
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
24327538 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 24327636  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||||||||| |||| ||   ||||||     
24327637 tagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaat 24327736  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | |||||   ||||||||||| |||| |     
24327737 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagtcatgcctgcagaatttgtacg 24327836  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
    |||||||| |||||||||||||||    
24327837 ttcaagatgggaatgaatttgaag 24327860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Original strand, 34790021 - 34790343
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
34790021 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 34790119  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   |||||| || |||| ||   ||||||     
34790120 tagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactaagcacttgtctctcgttaat 34790219  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | |||| |||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |     
34790220 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtcttcgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 34790319  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
     ||||||| |||||||||||||||    
34790320 ctcaagatgggaatgaatttgaag 34790343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Original strand, 34804164 - 34804486
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
34804164 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 34804262  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   |||||| || |||| ||   ||||||     
34804263 tagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactaagcacttgtctctcgttaat 34804362  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | |||| |||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |     
34804363 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtcttcgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 34804462  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
     ||||||| |||||||||||||||    
34804463 ctcaagatgggaatgaatttgaag 34804486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 19 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 10267418 - 10267094
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| || |||  | |||  |||||||||||||||||    
10267418 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 10267320  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   |||||||||  ||| ||   ||||||     
10267319 tagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaat 10267220  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |     
10267219 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 10267120  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaagtt 341  Q
     ||||||| |||||||||||||||||    
10267119 ctcaagatgggaatgaatttgaagtt 10267094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 19 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 10277995 - 10277671
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| || |||  | |||  |||||||||||||||||    
10277995 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 10277897  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   |||||||||  ||| ||   ||||||     
10277896 tagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaat 10277797  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |     
10277796 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 10277697  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaagtt 341  Q
     ||||||| |||||||||||||||||    
10277696 ctcaagatgggaatgaatttgaagtt 10277671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 19 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 43345831 - 43345508
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| || |||  | |||  |||||||||||||||||    
43345831 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 43345733  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || ||   |||||||||  ||| ||   ||||||     
43345732 tagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaatggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaat 43345633  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcct 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||||||| |      
43345632 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaattgtacac 43345533  T
317 tcaagataggaatgaatttgaagtt 341  Q
    ||||||| | |||||||||||||||    
43345532 tcaagatggaaatgaatttgaagtt 43345508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Original strand, 9773110 - 9773432
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
9773110 atcagaagcagaaggtcttcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 9773208  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||||||||| |||| ||   ||||||     
9773209 tagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaat 9773308  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |     
9773309 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 9773408  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
     ||||||| |||||||||||||||    
9773409 ctcaagatgggaatgaatttgaag 9773432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Original strand, 9897378 - 9897700
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||  ||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
9897378 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagtttttatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 9897476  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||||||||| |||| ||   ||||||     
9897477 tagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaat 9897576  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |     
9897577 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 9897676  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
     ||||||| |||||||||||||||    
9897677 ctcaagatgggaatgaatttgaag 9897700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Original strand, 9907966 - 9908288
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||  ||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
9907966 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagtttttatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 9908064  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||||||||| |||| ||   ||||||     
9908065 tagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaat 9908164  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |     
9908165 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 9908264  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
     ||||||| |||||||||||||||    
9908265 ctcaagatgggaatgaatttgaag 9908288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Original strand, 24338208 - 24338530
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  ||||||| |||||||||    
24338208 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgatgattcaaag 24338306  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   |||| |||| |||| ||   ||||||     
24338307 tagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcattgagcacttgtctctcgttaat 24338406  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |     
24338407 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacg 24338506  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
    |||||||| |||||||||||||||    
24338507 ttcaagatgggaatgaatttgaag 24338530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 43083072 - 43082749
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||  ||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
43083072 atcagaagcagaaggtcgtcagaagcaaaagttttcatcggaagcaatatcttcaccagaagctacgcttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 43082974  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcat-ttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaa 216  Q
    |||||| |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||   ||||||||| |||| ||   ||||||    
43082973 tagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatattggatagcactgagcacttatctctcgttaa 43082874  T
217 cagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttc 314  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||   | ||||  ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| |||| |    
43082873 tagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactagtctgttttctgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaagttgtac 43082774  T
315 cttcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
     |||||||| |||||||||||||||    
43082773 gttcaagatgggaatgaatttgaag 43082749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 43093681 - 43093358
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
43093681 atcagaagcagaaggtcgtcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgcttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 43093583  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcat-ttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaa 216  Q
    |||||| |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||   ||||||||| |||| ||   ||||||    
43093582 tagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatattggatagcactgagcacttgtctctcgttaa 43093483  T
217 cagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttc 314  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||   | ||||  ||||||||||||||| |||||   ||||||||||| |||| |    
43093482 tagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactagtctgttttctgtctacgctacaagacaagacaacagtcatgcctgcagaagttgtac 43093383  T
315 cttcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
     |||||||| |||||||||||||||    
43093382 gttcaagatgggaatgaatttgaag 43093358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Original strand, 9762574 - 9762896
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
9762574 atcagaagcagaaggtcttcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 9762672  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||||||||| |||| ||   | ||||     
9762673 tagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctctttaat 9762772  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |     
9762773 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 9762872  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
     ||||||| |||||||||||||||    
9762873 ctcaagatgggaatgaatttgaag 9762896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Original strand, 22914668 - 22914990
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
22914668 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 22914766  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||||||||| |||| ||   | ||||     
22914767 tagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcattaat 22914866  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | || |||  ||||||||||| |||| |     
22914867 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaatagccatgcctgcagaatttgtaca 22914966  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
     ||||||| |||||||||||||||    
22914967 ctcaagatgggaatgaatttgaag 22914990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 35 - 339
Target Start/End: Original strand, 36251664 - 36251970
Alignment:
35 catcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttctcgttt 133  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  ||||||||||||||||||||||| |||||  ||    
36251664 catcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaagtagctgattctcaatt 36251762  T
134 caacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaacagagttgacaaagtac 233  Q
    ||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||||||||| |||| ||   |||||| ||||||||||||||||    
36251763 cagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaatagagttgacaaagtac 36251862  T
234 aagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttccttcaagataggaatga 331  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |  ||||||| |||||||    
36251863 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatga 36251962  T
332 atttgaag 339  Q
    ||||||||    
36251963 atttgaag 36251970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 40222757 - 40222435
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  ||||| |||||||||||    
40222757 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactaaagattcaaag 40222659  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||||||||| |||| ||   | ||||     
40222658 tagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcattaat 40222559  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |     
40222558 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 40222459  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
     ||||||| |||||||||||||||    
40222458 ctcaagatgggaatgaatttgaag 40222435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 40251618 - 40251296
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  ||||| |||||||||||    
40251618 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactaaagattcaaag 40251520  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||||||||| |||| ||   | ||||     
40251519 tagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcattaat 40251420  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |     
40251419 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 40251320  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
     ||||||| |||||||||||||||    
40251319 ctcaagatgggaatgaatttgaag 40251296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 19 - 341
Target Start/End: Original strand, 1098999 - 1099323
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||   || |||  | |||  ||||| |||||||||||    
1098999 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctatgtttgatcctttaatc-aaactaaagattcaaag 1099097  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||||||||| |||| ||   | ||||     
1099098 tagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcattaat 1099197  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |     
1099198 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 1099297  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaagtt 341  Q
     ||||||| |||||||||||||||||    
1099298 ctcaagatgggaatgaatttgaagtt 1099323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 19 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 4210315 - 4209991
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||  ||||| || |||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
4210315 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagtttttattagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 4210217  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||||||||| |||| ||   | ||||     
4210216 tagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcattaat 4210117  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |     
4210116 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 4210017  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaagtt 341  Q
     ||||||| |||||||||||||||||    
4210016 ctcaagatgggaatgaatttgaagtt 4209991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 35 - 341
Target Start/End: Original strand, 11388629 - 11388937
Alignment:
35 catcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttctcgttt 133  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||| |||| |||||  ||    
11388629 catcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacttttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaagttgctgattctcaatt 11388727  T
134 caacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaacagagttgacaaagtac 233  Q
    ||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||||||||| |||| ||   |||||| ||||||||||||||||    
11388728 cagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaatagagttgacaaagtac 11388827  T
234 aagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttccttcaagataggaatga 331  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |  ||||||| |||||||    
11388828 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatga 11388927  T
332 atttgaagtt 341  Q
    ||||||||||    
11388928 atttgaagtt 11388937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 218 - 347
Target Start/End: Original strand, 20646610 - 20646739
Alignment:
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcctt 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||    
20646610 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgactctgcttgtgtctacgctacaagacaagaaaacagctctgcctgcaaaaatgttcctt 20646709  T
318 caagataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||    
20646710 caagataggaatggatttgaacttgatcct 20646739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Original strand, 22960136 - 22960458
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
22960136 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 22960234  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||||||||| |||| ||   | ||||     
22960235 tagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcattaat 22960334  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | || |||  ||||||||||| |||| |     
22960335 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaatagccatgcctgcagaatttgtaca 22960434  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
     |||||||  ||||||||||||||    
22960435 ctcaagatgagaatgaatttgaag 22960458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 19 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 4100208 - 4099884
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||   || |||  | |||  ||||| |||||||||||    
4100208 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctatgtttgatcctttaatc-aaactaaagattcaaag 4100110  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| || ||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||||||||| |||| ||   | ||||     
4100109 tagctgattttcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcattaat 4100010  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |     
4100009 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 4099910  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaagtt 341  Q
     ||||||| |||||||||||||||||    
4099909 ctcaagatgggaatgaatttgaagtt 4099884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 19 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 4220907 - 4220583
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    |||| |||||||||  ||||||||||||  ||||| ||||||||| | ||| |||||||||| |||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
4220907 atcaaaagcagaaggtcatcagaagcaaaagtttttatcagaagcaatatcttcaccagaagttacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 4220809  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||||||||| |||| ||   | ||||     
4220808 tagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcattaat 4220709  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |     
4220708 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 4220609  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaagtt 341  Q
     ||||||| |||||||||||||||||    
4220608 ctcaagatgggaatgaatttgaagtt 4220583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 19 - 341
Target Start/End: Original strand, 11394976 - 11395300
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
11394976 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacttttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 11395074  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    | |||| |||||  ||||  ||  || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || ||   |||||||||  ||| ||   ||||||     
11395075 ttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacaaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaat 11395174  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |     
11395175 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 11395274  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaagtt 341  Q
     ||||||| |||||||||||||||||    
11395275 ctcaagatgggaatgaatttgaagtt 11395300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 19 - 341
Target Start/End: Original strand, 11405292 - 11405616
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
11405292 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacttttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 11405390  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    | |||| |||||  ||||  ||  || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || ||   |||||||||  ||| ||   ||||||     
11405391 ttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacaaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaat 11405490  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |     
11405491 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 11405590  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaagtt 341  Q
     ||||||| |||||||||||||||||    
11405591 ctcaagatgggaatgaatttgaagtt 11405616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 19 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 32218298 - 32217974
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||  | ||| |||||||||||||   || |||  | |||  ||||| |||||||||||    
32218298 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagtaatatcttcaccagaagctatgtttgatcatttaatc-aaactaaagattcaaag 32218200  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||||||||| |||| ||   | ||||     
32218199 tagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcattaat 32218100  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |     
32218099 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 32218000  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaagtt 341  Q
     ||||||| |||||||||||||||||    
32217999 ctcaagatgggaatgaatttgaagtt 32217974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 19 - 341
Target Start/End: Original strand, 39169899 - 39170223
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||| ||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
39169899 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagcaacttttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 39169997  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    | |||| |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   |||||||||  ||| ||   ||||||     
39169998 ttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaat 39170097  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |     
39170098 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 39170197  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaagtt 341  Q
     ||||||| |||||||||||||||||    
39170198 ctcaagatgggaatgaatttgaagtt 39170223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 35 - 344
Target Start/End: Original strand, 18392457 - 18392768
Alignment:
35 catcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttctcgttt 133  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||| || |||  | |||  |||||||||||||||||| |||| |||||  ||    
18392457 catcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaagttgctgattctcaatt 18392555  T
134 caacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaacagagttgacaaagtac 233  Q
    ||  ||  || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || ||   ||||||||| |||| ||   | |||| ||||||||||||||||    
18392556 cagtcttatcaaagaagaacgaagaactgaaagggaggtatcaacggatatatggaaagcactgagcacttgtctctcattaatagagttgacaaagtac 18392655  T
234 aagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttccttcaagataggaatga 331  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |  ||||||| |||||||    
18392656 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatga 18392755  T
332 atttgaagttgat 344  Q
    |||||||||||||    
18392756 atttgaagttgat 18392768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 19 - 310
Target Start/End: Original strand, 30488627 - 30488919
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| || |||  | |||  ||||| |||||||||||    
30488627 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactaaagattcaaag 30488725  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    | |||| |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||||||||| |||| ||   | ||||     
30488726 ttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcattaat 30488825  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaatt 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  |||||||||||||    
30488826 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatt 30488919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 21 - 167
Target Start/End: Original strand, 28379659 - 28379806
Alignment:
21 cagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgt-gaatttaaactgaagattcaaagta 119  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| || | | ||  |||| |||||||||||||||||||    
28379659 cagaagcagaaggtcatcagaaacaaagttttcatcagaagcaaaatcatcaccagaagttacatttgaacagtaaaattcaaactgaagattcaaagta 28379758  T
120 gctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagg 167  Q
    |||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
28379759 gctgtttaacatttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagg 28379806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 35 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 27221790 - 27221481
Alignment:
35 catcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttctcgttt 133  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||| || |||  | |||  |||||||||||||||||| |||| |||||  ||    
27221790 catcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaagttgctgattctcaatt 27221692  T
134 caacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaacagagttgacaaagtac 233  Q
    ||  ||  || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || ||   |||||||||  ||| ||   |||||| ||||||||||||||||    
27221691 cagtcttatcaaagaagaacgaagaactgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaatagagttgacaaagtac 27221592  T
234 aagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcc--ttcaagataggaatg 330  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  |||||||||||||  | |   ||||||| ||||||    
27221591 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatg 27221492  T
331 aatttgaagtt 341  Q
    |||||||||||    
27221491 aatttgaagtt 27221481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 35 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 35253391 - 35253082
Alignment:
35 catcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttctcgttt 133  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||| || |||  | |||  |||||||||||||||||| |||| |||||  ||    
35253391 catcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaagttgctgattctcaatt 35253293  T
134 caacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaacagagttgacaaagtac 233  Q
    ||  ||  || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || ||   | ||||||| |||| ||   | |||| ||||||||||||||||    
35253292 cagtcttatcaaagaagaacgaagaactgaaagggaggtatcaacggatatatggataacactgagcacttgtctctcattaatagagttgacaaagtac 35253193  T
234 aagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcc--ttcaagataggaatg 330  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  |||||||||||||  | |   ||||||| ||||||    
35253192 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatg 35253093  T
331 aatttgaagtt 341  Q
    |||||||||||    
35253092 aatttgaagtt 35253082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 35 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 35264000 - 35263691
Alignment:
35 catcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttctcgttt 133  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||| || |||  | |||  |||||||||||||||||| |||| |||||  ||    
35264000 catcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaagttgctgattctcaatt 35263902  T
134 caacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaacagagttgacaaagtac 233  Q
    ||  ||  || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || ||   | ||||||| |||| ||   | |||| ||||||||||||||||    
35263901 cagtcttatcaaagaagaacgaagaactgaaagggaggtatcaacggatatatggataacactgagcacttgtctctcattaatagagttgacaaagtac 35263802  T
234 aagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcc--ttcaagataggaatg 330  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  |||||||||||||  | |   ||||||| ||||||    
35263801 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatg 35263702  T
331 aatttgaagtt 341  Q
    |||||||||||    
35263701 aatttgaagtt 35263691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 35 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 35274625 - 35274316
Alignment:
35 catcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttctcgttt 133  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||| || |||  | |||  |||||||||||||||||| |||| |||||  ||    
35274625 catcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaagttgctgattctcaatt 35274527  T
134 caacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaacagagttgacaaagtac 233  Q
    ||  ||  || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || ||   | ||||||| |||| ||   | |||| ||||||||||||||||    
35274526 cagtcttatcaaagaagaacgaagaactgaaagggaggtatcaacggatatatggataacactgagcacttgtctctcattaatagagttgacaaagtac 35274427  T
234 aagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcc--ttcaagataggaatg 330  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  |||||||||||||  | |   ||||||| ||||||    
35274426 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatg 35274327  T
331 aatttgaagtt 341  Q
    |||||||||||    
35274326 aatttgaagtt 35274316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 19 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 6081598 - 6081470
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||| | ||||||||||||||||| || | ||| || |||||||||||| ||| |||||     
6081598 atcagaagcagaagaccatcagaagcaagattt-caccagaagctatatcatcaccagaagctataagtgatcggtaaatttaaactgacgatacaaagg 6081500  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaaga 148  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||    
6081499 agctgtttttcgtttcaaccttgtctaaga 6081470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 218 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 22755516 - 22755386
Alignment:
218 agagttgacaaagtacaag-tgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaag-ataacagctctgcctgcagaattgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || |||  | ||||  |||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||    
22755516 agagttgacaaagtacaaggtgtacgaccactacttccactactctgttt-tgtctgcgctacaagacaagtataacagctctgtctgcagaaatgttcc 22755418  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
22755417 ttcaagataggaatggatttgaacttgatcct 22755386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 19 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 16777278 - 16777117
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
16777278 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 16777180  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgg 180  Q
    |||||| |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
16777179 tagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaaggaaggtatcaacgg 16777117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 211 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 16769175 - 16769045
Alignment:
211 cgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa- 308  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||||| |||||   |||||||||||     
16769175 cgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaagacaacagtcatgcctgcagaag 16769076  T
309 ttgttccttcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
    |||| | |||||||| |||||||||||||||    
16769075 ttgtacgttcaagatgggaatgaatttgaag 16769045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 221 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 1084061 - 1083933
Alignment:
221 gttgacaaagtacaa-gtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataa-cagctctgcctgcagaattgttccttc 318  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || |||  | ||||  ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||    
1084061 gttgacaaagtacaaagtgtacgaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcagaaatgttccttc 1083962  T
319 aagataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
    |  ||||||||| |||||||  |||||||    
1083961 agaataggaatggatttgaacgtgatcct 1083933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 218 - 347
Target Start/End: Original strand, 24814633 - 24814764
Alignment:
218 agagttgacaaagtac-aagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataa-cagctctgcctgcagaattgttcc 315  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || | |  | | ||  ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||    
24814633 agagttgacaaagtacgaagtgtacaaccactacctccactactccgcttttttctacgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcagaaatgttcc 24814732  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
    ||||  ||||||||| |||||||  |||||||    
24814733 ttcagaataggaatggatttgaacgtgatcct 24814764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 234 - 347
Target Start/End: Original strand, 23392735 - 23392849
Alignment:
234 aagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaa-gataacagctctgcctgcagaattgttccttcaagataggaatgaa 332  Q
    ||||||||||||||||| ||||  || || ||| ||||   |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| |||| |    
23392735 aagtgtacaaccactacttccattactctaagtttgtctctgctacaagacaatgataacagctctgcctgcagaaatgttccttcagaatagaaatgga 23392834  T
333 tttgaagttgatcct 347  Q
    ||||||  |||||||    
23392835 tttgaacgtgatcct 23392849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 19356743 - 19356679
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctaca 84  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||||||||||    
19356743 atcagaagcagaagttcatcagaagcaagattt-catcagaagctatatcatcaccagaagctaca 19356679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 20236818 - 20236714
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | || | |||||||||||||||||    
20236818 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaa-tcaaactgaagattcaaag 20236720  T
118 tagctg 123  Q
    ||||||    
20236719 tagctg 20236714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 64
Target Start/End: Original strand, 20417466 - 20417511
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcga 64  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
20417466 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaggttttcatcagaagcga 20417511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 218 - 259
Target Start/End: Original strand, 21025530 - 21025571
Alignment:
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgac 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
21025530 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccacttcctccacgac 21025571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 234 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 24377134 - 24377020
Alignment:
234 aagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaaga-taacagctctgcctgcagaattgttccttcaagataggaatgaa 332  Q
    |||||||||||||||| |||||| || | |  ||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||   | |||||| |    
24377134 aagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgctacaagacaagaataacagctctgcctgcaataatgttccttcatacttggaatgga 24377035  T
333 tttgaagttgatcct 347  Q
    |||||| ||||||||    
24377034 tttgaaattgatcct 24377020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 83
Target Start/End: Original strand, 20070685 - 20070750
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctac 83  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||    
20070685 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctac 20070750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 234 - 347
Target Start/End: Original strand, 22188169 - 22188283
Alignment:
234 aagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaa-gataacagctctgcctgcagaattgttccttcaagataggaatgaa 332  Q
    |||||||||||||||| |||||| || | |  ||||||   |||||||||||| |||||||||||||||||||  | ||||||| ||   | |||||| |    
22188169 aagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacagctctgcctgcaacaatgttcctacatactgggaatgga 22188268  T
333 tttgaagttgatcct 347  Q
    |||||| ||||||||    
22188269 tttgaaattgatcct 22188283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 234 - 347
Target Start/End: Original strand, 28711765 - 28711879
Alignment:
234 aagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaag-ataacagctctgcctgcagaattgttccttcaagataggaatgaa 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||   |||| |||||||| | ||||||||||||||||    ||||||||||  || |||||| |    
28711765 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctctgctaaaagacaagaaaaacagctctgcctgcaatgatgttccttcacaatgggaatgga 28711864  T
333 tttgaagttgatcct 347  Q
    |||||| ||||||||    
28711865 tttgaaattgatcct 28711879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 275 - 347
Target Start/End: Original strand, 20152134 - 20152207
Alignment:
275 gctacaagacaagataa-cagctctgcctgcagaattgttccttcaagataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||| |  ||||||||||  || |||||| ||||||| ||||||||    
20152134 gctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcaaagatgttccttcacaatgggaatgcatttgaaattgatcct 20152207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 237 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 22258231 - 22258123
Alignment:
237 tgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaag-ataacagctctgcctgcagaattgttccttcaagataggaatgaattt 335  Q
    ||||||||||||| |||||| || | |  ||||||   ||||||||||||| ||||||||||||||||||  | ||||||| ||   |||||||| ||||    
22258231 tgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacagctctgcctgcaacaatgttcctacatactaggaatggattt 22258132  T
336 gaagttgat 344  Q
    ||| |||||    
22258131 gaaattgat 22258123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 234 - 345
Target Start/End: Original strand, 31800954 - 31801066
Alignment:
234 aagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaag-ataacagctctgcctgcagaattgttccttcaagataggaatgaa 332  Q
    |||||||||||||||| |||||| || |||  | ||||   ||||||||||||| | ||||||||||||||||    ||||||||||  || |||||| |    
31800954 aagtgtacaaccactatctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcaacgatgttccttcacaatgggaatgca 31801053  T
333 tttgaagttgatc 345  Q
    |||||| ||||||    
31801054 tttgaaattgatc 31801066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 216; Significance: 1e-118; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Original strand, 51928 - 52252
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||    
51928 atcagaagcagaagtccatcagaagcaaggttt-catcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaactaatcagtaaatttaaactgaagattcaaagt 52026  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaaca 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| | ||||||    
52027 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaataagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttctttaaca 52126  T
219 gagttgac-aaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgt---cct-cgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgtt 313  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | |||   ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
52127 gagttgacaaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacctacgctgcaagacaagataacagctctgcctgcataaatgtt 52226  T
314 ccttcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
    |||||||||| |||||||||||||||    
52227 ccttcaagatgggaatgaatttgaag 52252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0407 (Bit Score: 213; Significance: 1e-117; HSPs: 2)
Name: scaffold0407
Description:

Target: scaffold0407; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 19 - 347
Target Start/End: Original strand, 11943 - 12269
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||||     
11943 atcagaagcagaagaccatcagaagcaagattt-catcagaagctatatcatcaccagaagctacaagtgatcagtaaatttaaactgaagattcaaagg 12041  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaaca 218  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||| ||||| ||    
12042 agctgtttttcgtttcaacctcgtctaaga-gaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaaaagcactgggtacttgtccttcgttatca 12140  T
219 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttccttc 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
12141 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctccgcctgcagaattgttccttc 12240  T
319 aagataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||    
12241 aagatgggaatgaatttgaagttgatcct 12269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0407; HSP #2
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 19 - 345
Target Start/End: Original strand, 15774 - 16098
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||| || ||||||||||||||||||||||     
15774 atcagaagcagaagaccatctgaagcaagattt-catcagaagctatatcatcaccagaagctgcaattgatcagtaaatttaaactgaagattcaaagg 15872  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaaca 218  Q
    ||||| || ||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||  ||||| || | |  ||  |    
15873 agctgattttcgtttcaacctcatctaag-ggaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaaaagcaatggatacttgtcattcaatataa 15971  T
219 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttccttc 318  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||  | ||||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
15972 aagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctacactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctccgcctgcagaattgttccttc 16071  T
319 aagataggaatgaatttgaagttgatc 345  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||    
16072 aagatgggaatgaatttgaagttgatc 16098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 213; Significance: 1e-117; HSPs: 5)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 117529 - 117209
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| || ||| || |||||||||||||||||||||||    
117529 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaggttttcatcagaagcaaaatcatcaccagaagttacatttgatcagtaaatttaaactgaagattcaaagt 117430  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaaca 218  Q
    ||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||    
117429 agctggttaacatttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggatgtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttcgttaaca 117330  T
219 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttccttc 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||  | ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||    
117329 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccgctactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcaaaattgttccttc 117230  T
319 aagataggaatgaatttgaag 339  Q
    ||||| |||||||||||||||    
117229 aagatgggaatgaatttgaag 117209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 218 - 347
Target Start/End: Original strand, 475305 - 475436
Alignment:
218 agagttgacaaagtacaa-gtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataa-cagctctgcctgcagaattgttcc 315  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
475305 agagttgacaaagtacaaagtgtacaaccactacctccacgactctgcttgtgtctacgctacaagacaagataaacagctctgcctgcagaaatgttcc 475404  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||    
475405 ttcaagataggaatgaatttgaacatgatcct 475436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #3
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 218 - 347
Target Start/End: Original strand, 481825 - 481956
Alignment:
218 agagttgacaaagtacaa-gtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataa-cagctctgcctgcagaattgttcc 315  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
481825 agagttgacaaagtacaaagtgtacaaccactacctccacgactctgcttgtgtctacgctacaagacaagataaacagctctgcctgcagaaatgttcc 481924  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||    
481925 ttcaagataggaatgaatttgaacatgatcct 481956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #4
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 218 - 347
Target Start/End: Original strand, 156681 - 156812
Alignment:
218 agagttgacaaagtacaa-gtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataa-cagctctgcctgcagaattgttcc 315  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || ||| |||  || |||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||    
156681 agagttgacaaagtacaaagtgtacaaccactacctccacgactatgcgtgcgtctacgatacaagacaagaaaaacagctctacctgcagaattgttcc 156780  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
    ||||||||||||||| |||||||  |||||||    
156781 ttcaagataggaatggatttgaacgtgatcct 156812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #5
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 65
Target Start/End: Original strand, 347472 - 347518
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaa 65  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
347472 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaa 347518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 93)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 19 - 341
Target Start/End: Original strand, 38593601 - 38593923
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| | || |||||||||||    
38593601 atcagaagcagaagctcatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttatattggagattcaaagt 38593700  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaaca 218  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| | ||||||    
38593701 agctggttcttgtttcaacctcgtctaataagaacgaagatttgaaagggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttctttaaca 38593800  T
219 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttccttc 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||  | ||||  |||||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||    
38593801 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactaccttcactactctgtttttgtctacgctacaagacaagataacagtcatgcctgcagaaatgttccttc 38593900  T
319 aagataggaatgaatttgaagtt 341  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
38593901 aagatgggaatgaatttgaagtt 38593923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Original strand, 40054620 - 40054940
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||    
40054620 atcataagcagaagcccatcagaagcaaggttt-catcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactggagattcaaagt 40054718  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaaca 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| | ||||||    
40054719 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaacaagaacgaagatttgaaagggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtccttctttaaca 40054818  T
219 gagttgac-aaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcctt 317  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||  ||||||||||||||| |||| |  |||||||| || ||||||||    
40054819 gagttgacaaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacaaccatgcctgcataaatgttcctt 40054918  T
318 caagataggaatgaatttgaag 339  Q
    ||||||||||||||||||||||    
40054919 caagataggaatgaatttgaag 40054940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 19 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 18441628 - 18441305
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||||     
18441628 atcagaagcagaagaccatcagaagcaagattt-catcagaagctatatcatcaccagaagctacaagtgatcagtaaatttaaactgaagattcaaagg 18441530  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaaca 218  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||| |||| ||||| ||    
18441529 agttgtttttcgtttcaacctcgtctaaga-gaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggaaagcactgggtacttgtccttcgttatca 18441431  T
219 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttccttc 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
18441430 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaaatgttccttc 18441331  T
319 aagataggaatgaatttgaagttgat 344  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||    
18441330 aagatgggaatgaatttgaagttgat 18441305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Original strand, 31116377 - 31116698
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| ||||| ||||| ||||||    
31116377 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacatttaatccgtaaattcaaactaaagatccaaagt 31116476  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaaca 218  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| |||| || |||| ||||| ||    
31116477 agctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagcactaagtatttgtccttcgttagca 31116576  T
219 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcctt 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||    
31116577 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcctt 31116676  T
318 caagataggaatgaatttgaag 339  Q
    |||||| |||||||||||||||    
31116677 caagatgggaatgaatttgaag 31116698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 1368063 - 1367743
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||| || |||| ||||||||||| ||||||    
1368063 atcagaagcagaagctcatcagaagcaaggttttcatcagaagcgatatcatcaccagaagctacattttatccgtaaattcaaactgaagatccaaagt 1367964  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaaca 218  Q
    ||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| || |||| ||||||||    
1367963 agctgtttctcatttcaacattatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagcactgagtatttgtccttcgttaaca 1367864  T
219 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcctt 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||    
1367863 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcctt 1367765  T
318 caagataggaatgaatttgaag 339  Q
    |||||| |||||||||||||||    
1367764 caagatgggaatgaatttgaag 1367743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Original strand, 15888195 - 15888515
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  ||| ||||||||||| ||||||    
15888195 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacatttaatccgtatattcaaactgaagatccaaagt 15888294  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaaca 218  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| | || |||| ||||||||    
15888295 agctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagcactgagcatttgtccttcgttaaca 15888394  T
219 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcctt 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||    
15888395 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctttgcctgcagaatttgtgcctt 15888493  T
318 caagataggaatgaatttgaag 339  Q
    |||||| |||||||||||||||    
15888494 caagatgggaatgaatttgaag 15888515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 589646 - 589326
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    |||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| || |||| ||||||||||| ||||||    
589646 atcagaagcaaaaggtcatcagaagcaaggttttcatcagaagcgatatcatcaccagaagctacatttaatccgtaaattcaaactgaagatccaaagt 589547  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaaca 218  Q
    || |||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| || |||| ||||||||    
589546 agttgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagcactgagtatttgtccttcgttaaca 589447  T
219 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcctt 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||||| |||| ||||    
589446 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctaggcctgcagaatttgtgcctt 589348  T
318 caagataggaatgaatttgaag 339  Q
    |||||| |||||||||||||||    
589347 caagatgggaatgaatttgaag 589326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 9171419 - 9171099
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| || |||| |||||||| |||||||||    
9171419 atcagaagcagaagctcatcagaagcaaggttttcatcagaagcaatatcatcaccagaagctacatttaatccgtaaattcaaactgaaaattcaaagt 9171320  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaaca 218  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| || |||| ||||||||    
9171319 agctgtttctcatttcaaccttatctaagaggaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagcactgagtatttgtccttcgttaaca 9171220  T
219 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcctt 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||  ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||    
9171219 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttctgtctacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcctt 9171121  T
318 caagataggaatgaatttgaag 339  Q
    |||||| |||||||||||||||    
9171120 caagatgggaatgaatttgaag 9171099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 19 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 18419547 - 18419224
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||||     
18419547 atcagaagcagaagaccatcagaagcaagattt-catcagaagctatatcatcaccagaagctacaagtgatcagtaaatttaaactgaagattcaaagg 18419449  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaaca 218  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||| |||| |||||  |    
18419448 agttgtttttcgtttcaacctcgtctaaga-gaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggaaagcactgggtacttgtccttcgttatta 18419350  T
219 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttccttc 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||  ||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |||||||||    
18419349 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaaacaacagctcttcctgcagaaatgttccttc 18419250  T
319 aagataggaatgaatttgaagttgat 344  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||    
18419249 aagatgggaatgaatttgaagttgat 18419224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 19 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 8933952 - 8933631
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||||||||| || ||| || |||||||||||||| || || |     
8933952 atcagaagcagaagtccatcagaagcaagattt-catcagaagctatatcatcaccagaagctacagttgatcagtaaatttaaactgaagttttaatgg 8933854  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaaca 218  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || ||| |||| | ||| ||    
8933853 agctgtttttcgtttcaacctcgtctaaga-gaacgaagaattaaaagggaggtatcaacggtcatttgaaaagcactgggtgcttgtccttctttatca 8933755  T
219 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttccttc 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
8933754 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaattgttccttc 8933655  T
319 aagataggaatgaatttgaagttg 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
8933654 aagataggaatgaatttgaagttg 8933631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Original strand, 21769809 - 21770129
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||  || |||| |||||| |||| ||||||    
21769809 atcagaagcagaagctcatcagaagcaaggttttcatcagaagcgatatcatcaccagaagctacattttatacgtaaattcaaactggagatccaaagt 21769908  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaaca 218  Q
    ||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| || |||| ||||||||    
21769909 agctgtttctcatttcaacattatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagcactgagtatttgtccttcgttaaca 21770008  T
219 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcctt 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||| ||||||||||||||| |||| || ||||||||||| |||| ||||    
21770009 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacaactatgcctgcagaatttgtgcctt 21770107  T
318 caagataggaatgaatttgaag 339  Q
    |||||| |||||||||||||||    
21770108 caagatgggaatgaatttgaag 21770129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 9170618 - 9170298
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| || |||| |||||||| |||||||||    
9170618 atcagaagcagaagctcatcagaagcaaggttttcatcagaagcaatatcatcaccagaagctacatttaatccgtaaattcaaactgaaaattcaaagt 9170519  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaaca 218  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| |||||| || |||| ||||||||    
9170518 agctgtttctcatttcaaccttatctaagaggaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagcantgagtatttgtccttcgttaaca 9170419  T
219 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcctt 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||  ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||| ||||    
9170418 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttctgtctacgctacaagacaanacaacagctatgcctgcagaatttgtgcctt 9170320  T
318 caagataggaatgaatttgaag 339  Q
    |||||| ||||||||||| |||    
9170319 caagatgggaatgaatttnaag 9170298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 19 - 347
Target Start/End: Original strand, 26209417 - 26209742
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||||||||| || ||| || |||||||||||||| |||||||     
26209417 atcagaagcagaagtccatcagaagcaagattt-catcagaagctatatcatcaccagaagctacagttgatcagtaaatttaaactgaagtttcaaagg 26209515  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaaca 218  Q
    |||||||| |||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || ||| |||| | || | |    
26209516 agctgtttttcgttttaatctcgtctaagaa-aacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaaaagcactgggtgcttgtccttcattga-a 26209613  T
219 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttccttc 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||   | ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
26209614 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctatttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaaatgttccttc 26209713  T
319 aagataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
26209714 aagataggaatgaatttgaagttgatcct 26209742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 19 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 9160163 - 9159847
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| || |||| |||||||| |||||||||    
9160163 atcagaagcagaagctcatcagaagcaaggttttcatcagaagcaatatcatcaccagaagctacatttaatccgtaaattcaaactgaaaattcaaagt 9160064  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaaca 218  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| |||||| || |||| ||||||||    
9160063 agctgtttctcatttcaaccttatctaagaggaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagcattgagtatttgtccttcgttaaca 9159964  T
219 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcctt 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||  ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||| ||||    
9159963 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttctgtctacgctacaagacaaaacaacagctatgcctgcagaatttgtgcctt 9159865  T
318 caagataggaatgaattt 335  Q
    |||||| |||||||||||    
9159864 caagatgggaatgaattt 9159847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 30049953 - 30049632
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| ||||||||| |    
30049953 atcagaagcagatggtcatcagaagcaaggttttcatcataagcgaaatcatcaccagaagctacaattgatccgtaaatttaaactggagattcaaatt 30049854  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaaca 218  Q
    ||||||||  | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||  ||  ||| ||||||| |||| ||||||||    
30049853 agctgtttaacatttcaaccttgtctaagaagaacgaagaattgaaagggagacatcaacagtcatttggagaaaactaagtacttgtccttcgttaaca 30049754  T
219 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaag-ataacagctctgcctgcagaattgttcctt 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||| |||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| ||||| ||    
30049753 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagaaaaacagccatgcctgcagaaatgttcatt 30049654  T
318 caagataggaatgaatttgaag 339  Q
    |||||| |||||||||||||||    
30049653 caagatgggaatgaatttgaag 30049632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 20491440 - 20491120
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  |  ||| ||||||||||| ||||||    
20491440 atcagaagcagaaggtaatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaagtcatcaccagaagctacatttaatccatatattcaaactgaagatccaaagt 20491341  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaaca 218  Q
    ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   | | ||||| | || |||| ||||||||    
20491340 agctgtttctcatttcaatctcatctaagaagaacgaagaattgaaaggaaggtatcaacggtcatttggacaacgctgagcatttgtccttcgttaaca 20491241  T
219 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcctt 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||  | ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| || |||| ||||    
20491240 gagttgacaaagtacaagtgtacaatcactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcaaaatttgtgcctt 20491142  T
318 caagataggaatgaatttgaag 339  Q
    ||||||  ||||||||||||||    
20491141 caagatgagaatgaatttgaag 20491120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 44280930 - 44280610
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  |  ||| ||||| ||||| ||||||    
44280930 atcagaagcagaaggtaatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaagtcatcaccagaagctacatttaatccatatattcaaactaaagatccaaagt 44280831  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaaca 218  Q
    ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||| ||||| | || |||| ||||||||    
44280830 agctgtttctcatttcaatctcatctaagaagaacgaagaattgaaaggaaggtatcaacggtcatttggacagcgctgagcatttgtccttcgttaaca 44280731  T
219 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcctt 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||| ||||||||||||||| ||||||| || |||||||| |||| ||||    
44280730 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgtctgcagaatttgtgcctt 44280632  T
318 caagataggaatgaatttgaag 339  Q
    |||  | |||||||||||||||    
44280631 caaagtgggaatgaatttgaag 44280610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 22 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 15216745 - 15216425
Alignment:
22 agaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagtagc 121  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |  ||| |||||||||| | ||||||||||||||||||| || ||| || |||||||||||||| ||||||| |||    
15216745 agaagcagaagtccatcagaagcgaaattt-catcagaagctatatcatcaccagaagctacagttgatcagtaaatttaaactgaagtttcaaaggagc 15216647  T
122 tgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaacagag 221  Q
    | ||| |||||| || ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||| |||| | || | ||||    
15216646 tatttttcgttttaatctcgtttaagaa-aacgaagaattgaaagggaggtatcaacggccatttgagaagcactgggtgcttgtccttctttga-agag 15216549  T
222 ttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttccttcaag 321  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
15216548 ttgacaaagtaaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctgcgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaaatgttccttcaag 15216449  T
322 ataggaatgaatttgaagttgatc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
15216448 ataggaatgaatttgaagttgatc 15216425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 3166168 - 3165848
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  |  ||| ||||| ||||| ||||||    
3166168 atcagaagcagaaggtaatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaagtcatcaccagaagctacatttaatccatatattcaaactaaagatccaaagt 3166069  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaaca 218  Q
    || |||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||| ||||| | || |||| ||||||||    
3166068 agttgtttctcatttcaatctcatctaagaagaacgaagaattgaaaggaaggtatcaacggtcatttggacagcgctgagcatttgtccttcgttaaca 3165969  T
219 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcctt 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||| ||||||||||||||| ||||| | || |||||||| |||| ||||    
3165968 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacaggtatgtctgcagaatttgtgcctt 3165870  T
318 caagataggaatgaatttgaag 339  Q
    |||  | |||||||||||||||    
3165869 caaagtgggaatgaatttgaag 3165848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Original strand, 14745535 - 14745856
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||| |||||   |  ||| ||||||||||| ||||||    
14745535 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaggttttcatcagaagctatatcatcaccagatgctacatttaattcatttattcaaactgaagatccaaagt 14745634  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaaca 218  Q
    || ||||||||  ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||| | || |||| ||||||||    
14745635 agatgtttctcaattcaatcttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatatggatagcactgagcatttgtccttcgttaaca 14745734  T
219 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcctt 317  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| || |||  | ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| || |    
14745735 gagttgacaaaatacaagtgtacaaccactatctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgccct 14745834  T
318 caagataggaatgaatttgaag 339  Q
    |||||| |||||||||||||||    
14745835 caagatgggaatgaatttgaag 14745856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 19 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 29590424 - 29590099
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||||||||| || ||| |   ||||||||||||| |||||||     
29590424 atcagaagcagaagtccatcagaagcaagattt-catcagaagctatatcatcaccagaagctacagttgatcaggacatttaaactgaagtttcaaagg 29590326  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaaca 218  Q
    || ||||| |||||| || ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| || ||| |||| | || | |    
29590325 agttgtttttcgttttaatctcgtctaa-aagaacgaaggattaaaagggaggtaccaacgttcatttgaaaagcactgggtgcttgtccttcattga-a 29590228  T
219 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttccttc 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||  | ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
29590227 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactaccttcactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaaatgttccttc 29590128  T
319 aagataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
29590127 aagataggaatgaatttgaagttgatcct 29590099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 19 - 296
Target Start/End: Original strand, 6044079 - 6044354
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||   ||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||||     
6044079 atcagaagcagaagttcatcagaagcacaattt-catcagaagctatatcatcaccagaagctacaagtgatcagtaaatttaaactgaagattcaaagg 6044177  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaaca 218  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| |||||| |||| ||||| ||    
6044178 agctgtttttcgtttcaacctcgtctaaga-gaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaaaggcactgggtacttgtccttcgttatca 6044276  T
219 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagct 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||  ||||||||||||||| |||||||    
6044277 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagct 6044354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 19 - 347
Target Start/End: Original strand, 12734035 - 12734360
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |   | |||||||||| | |||||||||| |||||| | || ||| || |||||||||||||| |||||||     
12734035 atcagaagcagaagtccatcagaagca-gaagtccatcagaagctatatcatcaccataagctatagttgatcagtaaatttaaactgaagtttcaaagg 12734133  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaaca 218  Q
    |||||||| |||||| || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || ||| |||| |  | | |    
12734134 agctgtttttcgttttaatctcgtctaagaa-aacgaagaatttaaagggaggtatcaacggtcatttgaaaagcactgggtgcttgtccttctctga-a 12734231  T
219 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttccttc 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||  | ||||  ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||    
12734232 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccattactctgtttttgtctacgctataagacaagacaacaactctgcctgcagaaatgttccttc 12734331  T
319 aagataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||    
12734332 aagataggaataaatttgaagttgatcct 12734360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Original strand, 19985678 - 19986000
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatct-gtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| ||||||||| ||||||  || | |  ||||| ||||| |||||    
19985678 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaggttttcatcagaagcaatatcttcacccgaagctacatttaatcaagttattcaaaacttaagatccaaag 19985777  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    ||| |||||||   ||||| ||  ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||  | || |||| |||||||    
19985778 tagttgtttcttaattcaatcttatctaagaggaacgaagaaatgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagcactgaacatttgtccttcgttaac 19985877  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcct 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||| ||||||||||||||| |||| || ||||||||||| |||| |||    
19985878 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacaactatgcctgcagaatttgtgcct 19985977  T
317 tcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
    ||||||| |||||||||||||||    
19985978 tcaagatgggaatgaatttgaag 19986000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 19 - 347
Target Start/End: Original strand, 3476209 - 3476534
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||||||||| || ||| ||  ||| ||||||||| |||||||     
3476209 atcagaaccagaagtccatcagaagcaagattt-catcagaagctatatcatcaccagaagctacagttgatcagtatattcaaactgaagtttcaaagg 3476307  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaaca 218  Q
    |||||||| || ||  |  ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| || ||| |||| |  | | |    
3476308 agctgtttttcattatattctcgtctaa-aagaacgaaggattaaaagggaggtaccaacgttcatttgaaaagcactgggtgcttgtccttctctga-a 3476405  T
219 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttccttc 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
3476406 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaaatgttccttc 3476505  T
319 aagataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||    
3476506 aagataggaatgaatttgaagttaatcct 3476534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 22 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 13682749 - 13682427
Alignment:
22 agaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagtagc 121  Q
    |||||||||||  ||||||||||||  ||| |||||||||| | ||||||||||||||||||| || ||| || |||||||||||||| ||||||| |||    
13682749 agaagcagaagttcatcagaagcaaaattt-catcagaagctatatcatcaccagaagctacagttgatcagtaaatttaaactgaagtttcaaaggagc 13682651  T
122 tgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaacagag 221  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||  | ||||| || ||| |||| |  | | ||||    
13682650 tgtttttcgttttaacctcgtctaag-agaacgaagaattaaaagggaggtaccaacgttcatttgaaaatcactgggtgcttgtccttctctga-agag 13682553  T
222 ttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttccttcaag 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||  ||||||||||||| | ||||||| | ||||||||| |||||||||||     
13682552 ttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaaacaacagctattcctgcagaaatgttccttcaaa 13682453  T
322 ataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
    || ||||||||||||||||| |||||    
13682452 atgggaatgaatttgaagttaatcct 13682427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 19 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 48382578 - 48382343
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||  || || |||||||||||||| |||||||     
48382578 atcagaagcagaagtccgtcagaagcaagattt-catcagaagctatatcatcaccagaagctacaattgctcagtaaatttaaactgaagtttcaaagg 48382480  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaaca 218  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| || ||| |||| | ||| ||    
48382479 agctgtttttcgtttcaacctcgtctaaga-gaacgaagaattaaaagggatgtatcaacggtcatttgaaaagcactgggtgcttgtccttctttatca 48382381  T
219 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccac 256  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
48382380 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccgctacctccac 48382343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 218 - 347
Target Start/End: Original strand, 24882485 - 24882614
Alignment:
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcctt 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
24882485 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctcaacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagttaacagctctgcctgcagaattgttcctt 24882584  T
318 caagataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
24882585 caagataggaatgaatttgaagttgatcct 24882614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 9444294 - 9443972
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaa-ggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
9444294 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaggttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 9444196  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| || ||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||||||||| |||| ||   ||||||     
9444195 tagctgattttcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaat 9444096  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgag-tgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | | ||||  ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| |||| |     
9444095 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtgttctgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaagttgtacg 9443996  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
    |||||||| |||||||||||||||    
9443995 ttcaagatgggaatgaatttgaag 9443972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 20990087 - 20989765
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaa-ggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
20990087 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaggttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 20989989  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    ||||||  ||||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||||||||| | || ||   ||||||     
20989988 tagctgactctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcatttgtctctcgttaat 20989889  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| |||| ||    
20989888 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaatttgtacc 20989789  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
    |||||||| |||||||||||||||    
20989788 ttcaagatgggaatgaatttgaag 20989765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Original strand, 21002874 - 21003196
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaa-ggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
21002874 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaggttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 21002972  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    ||||||  ||||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||||||||| |||| ||   ||||||     
21002973 tagctgactctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaat 21003072  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| || | ||    
21003073 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaatttctacc 21003172  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
    |||||||| |||||||||||||||    
21003173 ttcaagatgggaatgaatttgaag 21003196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 9433698 - 9433376
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaa-ggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||| | | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
9433698 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaggttttcatcagaaacaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 9433600  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| || ||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||||||||| |||| ||   ||||||     
9433599 tagctgattttcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaat 9433500  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| |||| |     
9433499 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaagttgtacg 9433400  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
    |||||||| |||||||||||||||    
9433399 ttcaagatgggaatgaatttgaag 9433376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 19 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 9085717 - 9085394
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| || |||  | |||  |||||||||||||||||    
9085717 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 9085619  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| || ||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   |||||||||  ||| ||   ||||||     
9085618 tagctgattttcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaat 9085519  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcct 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||||||| |      
9085518 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaattgtacac 9085419  T
317 tcaagataggaatgaatttgaagtt 341  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
9085418 tcaagatgggaatgaatttgaagtt 9085394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 19 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 9095431 - 9095108
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| || |||  | |||  |||||||||||||||||    
9095431 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 9095333  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| || ||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   |||||||||  ||| ||   ||||||     
9095332 tagctgattttcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaat 9095233  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcct 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||||||| |      
9095232 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaattgtacac 9095133  T
317 tcaagataggaatgaatttgaagtt 341  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
9095132 tcaagatgggaatgaatttgaagtt 9095108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Original strand, 467447 - 467769
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
467447 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 467545  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||||||||| |||| ||   ||||||     
467546 tagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaat 467645  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |     
467646 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 467745  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
     ||||||| |||||||||||||||    
467746 ctcaagatgggaatgaatttgaag 467769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Original strand, 2705478 - 2705800
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
2705478 atcagaagcagaagatcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 2705576  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||||||||| |||| ||   ||||||     
2705577 tagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaat 2705676  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | |||| |  ||||||||||| |||| |     
2705677 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacaaccatgcctgcagaatttgtaca 2705776  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
     ||||||| |||||||||||||||    
2705777 ctcaagatgggaatgaatttgaag 2705800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 35 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 5685937 - 5685631
Alignment:
35 catcagaagcaa-ggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttctcgttt 133  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | ||   ||||||||||||||||||||||| |||||  ||    
5685937 catcagaagcaaaggttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaaac-aaactgaagattcaaagtagctgattctcaatt 5685839  T
134 caacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaacagagttgacaaagtac 233  Q
    ||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||||||||| |||| ||   |||||| ||||||||||||||||    
5685838 cagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaatagagttgacaaagtac 5685739  T
234 aagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttccttcaagataggaatga 331  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| |||| | |||||||| |||||||    
5685738 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaagttgtacgttcaagatgggaatga 5685639  T
332 atttgaag 339  Q
    ||||||||    
5685638 atttgaag 5685631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Original strand, 6867091 - 6867413
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
6867091 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 6867189  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  || ||   ||||||||| |||| ||   ||||||     
6867190 tagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaaggaaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaat 6867289  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |     
6867290 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacg 6867389  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
    |||||||| |||||||||||||||    
6867390 ttcaagatgggaatgaatttgaag 6867413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Original strand, 6877723 - 6878045
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
6877723 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 6877821  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||||||||| |||| ||   ||||||     
6877822 tagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaat 6877921  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |     
6877922 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 6878021  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
    |||||| | |||||||||||||||    
6878022 ttcaagttgggaatgaatttgaag 6878045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 37344634 - 37344312
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
37344634 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 37344536  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||||||||| ||||  |   ||||||     
37344535 tagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgcctctcgttaat 37344436  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |     
37344435 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacg 37344336  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
    |||||||| |||||||||||||||    
37344335 ttcaagatgggaatgaatttgaag 37344312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 19 - 341
Target Start/End: Original strand, 48710357 - 48710681
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| || |||  | |||  |||||||||||||||||    
48710357 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 48710455  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   |||||||||  ||| ||   ||||||     
48710456 tagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaat 48710555  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |     
48710556 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 48710655  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaagtt 341  Q
     ||||||| |||||||||||||||||    
48710656 ctcaagatgggaatgaatttgaagtt 48710681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 19 - 341
Target Start/End: Original strand, 40041975 - 40042298
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| || |||  | |||  |||||||||||||||||    
40041975 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 40042073  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| || ||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   |||||||||  ||| ||   ||||||     
40042074 tagctgattttcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaat 40042173  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcct 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||||||| |      
40042174 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaattgtacac 40042273  T
317 tcaagataggaatgaatttgaagtt 341  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||    
40042274 tcaagatgggaaggaatttgaagtt 40042298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 19 - 341
Target Start/End: Original strand, 40052524 - 40052847
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| || |||  | |||  |||||||||||||||||    
40052524 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 40052622  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| || ||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   |||||||||  ||| ||   ||||||     
40052623 tagctgattttcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaat 40052722  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcct 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||||||| |      
40052723 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaattgtacac 40052822  T
317 tcaagataggaatgaatttgaagtt 341  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||    
40052823 tcaagatgggaaggaatttgaagtt 40052847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Original strand, 454665 - 454987
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
454665 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 454763  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| |||||  ||||  ||  || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||||||||| |||| ||   ||||||     
454764 tagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacaaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaat 454863  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |     
454864 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 454963  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
     ||||||| |||||||||||||||    
454964 ctcaagatgggaatgaatttgaag 454987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 35 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 541503 - 541197
Alignment:
35 catcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttctcgttt 133  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||  || |||  | |||  ||||||||||||||||||||||| |||||  ||    
541503 catcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaagtagctgattctcaatt 541405  T
134 caacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaacagagttgacaaagtac 233  Q
    ||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||||||||| |||| ||   |||||| ||||||||||||||||    
541404 cagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaatagagttgacaaagtac 541305  T
234 aagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttccttcaagataggaatga 331  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| |||| | |||||||| |||||||    
541304 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaagttgtacgttcaagatgggaatga 541205  T
332 atttgaag 339  Q
    ||||||||    
541204 atttgaag 541197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Original strand, 2716082 - 2716404
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
2716082 atcagaagcagaagatcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 2716180  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||||||||| |||| ||   ||||||     
2716181 tagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaat 2716280  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |     
2716281 agagttgaaaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 2716380  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
     |||||||  ||||||||||||||    
2716381 ctcaagatgagaatgaatttgaag 2716404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 8617820 - 8617498
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
8617820 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 8617722  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||||||||| |||| ||   | ||||     
8617721 tagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcattaat 8617622  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |     
8617621 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 8617522  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
     ||||||| |||||||||||||||    
8617521 ctcaagatgggaatgaatttgaag 8617498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Original strand, 24930469 - 24930791
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||  ||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
24930469 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagtttttatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 24930567  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||||||||| |||| ||   ||||||     
24930568 tagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaat 24930667  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | |||||   ||||||||||| |||| |     
24930668 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagtcatgcctgcagaatttgtacg 24930767  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
    |||||||| |||||||||||||||    
24930768 ttcaagatgggaatgaatttgaag 24930791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 218 - 347
Target Start/End: Original strand, 8998998 - 8999127
Alignment:
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcctt 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
8998998 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgactctgcttgtgtctacgctacaagacaatataacagctctgcctgcagaaatgttcctt 8999097  T
318 caagataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||    
8999098 caagataggaatggatttgaacttgatcct 8999127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 4223044 - 4222722
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||  |||||| |||||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
4223044 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcttcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 4222946  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||||||||| |||| ||   | ||||     
4222945 tagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcattaat 4222846  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |     
4222845 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 4222746  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
     ||||||| |||||||||||||||    
4222745 ctcaagatgggaatgaatttgaag 4222722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 8628383 - 8628061
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
8628383 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 8628285  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| |||||  ||||  |   || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||||||||| |||| ||   | ||||     
8628284 tagctgattctcaattcagtcctatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcattaat 8628185  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |     
8628184 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 8628085  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
     ||||||| |||||||||||||||    
8628084 ctcaagatgggaatgaatttgaag 8628061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 11096489 - 11096167
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||| | |   ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
11096489 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaataatttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 11096391  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||||||||| |||| ||   ||||||     
11096390 tagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaat 11096291  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |     
11096290 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 11096191  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
     ||||||| |||||||||||||||    
11096190 ctcaagatgggaatgaatttgaag 11096167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Original strand, 17949984 - 17950306
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||   || |||  | |||  |||||||||||||||||    
17949984 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctatgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 17950082  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||||||||| |||| ||   | ||||     
17950083 tagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcattaat 17950182  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |     
17950183 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 17950282  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
     ||||||| |||||||||||||||    
17950283 ctcaagatgggaatgaatttgaag 17950306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Original strand, 26653191 - 26653513
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| || |||  | |||  |||| ||||||||||||    
26653191 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaacggaagattcaaag 26653289  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| |||||  ||||  ||  || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||||||||| |||| ||   | ||||     
26653290 tagctgattctcaattcagtcttatcaacgaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcattaat 26653389  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| ||||||     
26653390 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgttca 26653489  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
     ||||||| |||||||||||||||    
26653490 ctcaagatgggaatgaatttgaag 26653513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Original strand, 26699520 - 26699842
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| || |||  | |||  |||| ||||||||||||    
26699520 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaacggaagattcaaag 26699618  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| |||||  ||||  ||  || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||||||||| |||| ||   | ||||     
26699619 tagctgattctcaattcagtcttatcaacgaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcattaat 26699718  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| ||||||     
26699719 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgttca 26699818  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
     ||||||| |||||||||||||||    
26699819 ctcaagatgggaatgaatttgaag 26699842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 19 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 167316 - 166992
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||   || |||  | |||  ||||| |||||||||||    
167316 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctatgtttgatcctttaatc-aaactaaagattcaaag 167218  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||||||||| |||| ||   | ||||     
167217 tagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcattaat 167118  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |     
167117 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 167018  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaagtt 341  Q
     ||||||| |||||||||||||||||    
167017 ctcaagatgggaatgaatttgaagtt 166992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 4212445 - 4212123
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||  |||||| |||||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
4212445 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcttcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 4212347  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||||||||| |||| ||   | ||||     
4212346 tagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcattaat 4212247  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |     
4212246 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 4212147  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
     ||||||| | |||||||||||||    
4212146 ctcaagatggaaatgaatttgaag 4212123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 35 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 1987958 - 1987650
Alignment:
35 catcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttctcgtttc 134  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||| | ||  ||||||||||||||| || |||  | |||  ||||||||||||||||||||||| |||||  |||    
1987958 catcagaagcaatattttcatcagaagcaatattttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaagtagctgattctcaattc 1987860  T
135 aacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaacagagttgacaaagtaca 234  Q
    |  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   |||||||||  ||| ||   |||||| |||||||||||||||||    
1987859 agtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaatagagttgacaaagtaca 1987760  T
235 agtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcc--ttcaagataggaatga 331  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  |||||||||||||  | |   ||||||| |||||||    
1987759 agtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatga 1987660  T
332 atttgaagtt 341  Q
    ||||||||||    
1987659 atttgaagtt 1987650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 35 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 1998579 - 1998271
Alignment:
35 catcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttctcgtttc 134  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||| | ||  ||||||||||||||| || |||  | |||  ||||||||||||||||||||||| |||||  |||    
1998579 catcagaagcaatattttcatcagaagcaatattttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaagtagctgattctcaattc 1998481  T
135 aacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaacagagttgacaaagtaca 234  Q
    |  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   |||||||||  ||| ||   |||||| |||||||||||||||||    
1998480 agtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaatagagttgacaaagtaca 1998381  T
235 agtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcc--ttcaagataggaatga 331  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  |||||||||||||  | |   ||||||| |||||||    
1998380 agtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatga 1998281  T
332 atttgaagtt 341  Q
    ||||||||||    
1998280 atttgaagtt 1998271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 19 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 177908 - 177584
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||   ||| |||||||||||||   || |||  | |||  ||||| |||||||||||    
177908 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcattatcttcaccagaagctatgtttgatcctttaatc-aaactaaagattcaaag 177810  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||||||||| |||| ||   | ||||     
177809 tagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcattaat 177710  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |     
177709 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 177610  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaagtt 341  Q
     ||||||| |||||||||||||||||    
177609 ctcaagatgggaatgaatttgaagtt 177584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 19 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 11005619 - 11005295
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| || |||  | |||  |||||||||||||||||    
11005619 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 11005521  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    | |||| |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || ||   | ||||||| |||| ||   | ||||     
11005520 ttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaactgaaagggaggtatcaacggatatatggataacactgagcacttgtctctcattaat 11005421  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |     
11005420 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 11005321  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaagtt 341  Q
     ||||||| |||||||||||||||||    
11005320 ctcaagatgggaatgaatttgaagtt 11005295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 19 - 341
Target Start/End: Original strand, 26389962 - 26390286
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
26389962 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacttttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 26390060  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    | |||| |||||  ||||  ||  || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || ||   |||||||||  ||| ||   ||||||     
26390061 ttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacaaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaat 26390160  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |     
26390161 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 26390260  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaagtt 341  Q
     ||||||| |||||||||||||||||    
26390261 ctcaagatgggaatgaatttgaagtt 26390286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Original strand, 17960590 - 17960912
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    ||||||||||||||  |||| |||||||  ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||   || |||  | |||  |||||||||||||||||    
17960590 atcagaagcagaaggtcatccgaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctatgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 17960688  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||||||||| |||| ||   | ||||     
17960689 tagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcattaat 17960788  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||   |||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |     
17960789 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctatgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 17960888  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
     ||||||| |||||||||||||||    
17960889 ctcaagatgggaatgaatttgaag 17960912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 22089557 - 22089235
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
22089557 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 22089459  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| |||||  ||||  ||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||   || ||   ||||||||| |||| ||   | ||||     
22089458 tagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgaatatatggatagcactgagcacttgtctctcattaat 22089359  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| |  ||||   ||||||||||| |||| |     
22089358 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacgacagtcatgcctgcagaatttgtaca 22089259  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
     ||||||| |||||||||||||||    
22089258 ctcaagatgggaatgaatttgaag 22089235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 22100172 - 22099850
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
22100172 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 22100074  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| |||||  ||||  ||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||   || ||   ||||||||| |||| ||   | ||||     
22100073 tagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgaatatatggatagcactgagcacttgtctctcattaat 22099974  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| |  ||| |  ||||||||||| |||| |     
22099973 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacgacaaccatgcctgcagaatttgtaca 22099874  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
     ||||||| |||||||||||||||    
22099873 ctcaagatgggaatgaatttgaag 22099850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 19 - 341
Target Start/End: Original strand, 26400604 - 26400928
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||  |||||||||| |||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
26400604 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcataagcaatatcttcaccagaagctacttttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 26400702  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    | |||| |||||  ||||  ||  || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || ||   |||||||||  ||| ||   ||||||     
26400703 ttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacaaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaat 26400802  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |     
26400803 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 26400902  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaagtt 341  Q
     ||||||| |||||||||||||||||    
26400903 ctcaagatgggaatgaatttgaagtt 26400928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 19 - 344
Target Start/End: Original strand, 8001930 - 8002258
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||| || |||  | |||  || ||||||||||||||    
8001930 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagctacatttgatcctttaatccaa-ctgaagattcaaag 8002028  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    | |||| |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || ||   ||||||||| |||| ||   | ||||     
8002029 ttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaactgaaagggaggtatcaacggatatatggaaagcactgagcacttgtctctcattaat 8002128  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcc- 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  |||||||||||||  | |     
8002129 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 8002228  T
316 -ttcaagataggaatgaatttgaagttgat 344  Q
      ||||||| ||||||||||||||||||||    
8002229 actcaagatgggaatgaatttgaagttgat 8002258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 19 - 344
Target Start/End: Original strand, 8012575 - 8012903
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||| || |||  | |||  || ||||||||||||||    
8012575 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagctacatttgatcctttaatccaa-ctgaagattcaaag 8012673  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    | |||| |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || ||   ||||||||| |||| ||   | ||||     
8012674 ttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaactgaaagggaggtatcaacggatatatggaaagcactgagcacttgtctctcattaat 8012773  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcc- 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  |||||||||||||  | |     
8012774 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 8012873  T
316 -ttcaagataggaatgaatttgaagttgat 344  Q
      ||||||| ||||||||||||||||||||    
8012874 actcaagatgggaatgaatttgaagttgat 8012903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 19 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 24735187 - 24734863
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
24735187 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacttttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 24735089  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    | |||| |||||  ||||  ||  || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||||||||| |||| ||   | |||      
24735088 ttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacaaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcattatt 24734989  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |     
24734988 agagttgacaaagtacaaatgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 24734889  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaagtt 341  Q
     ||||||| |||||||||||||||||    
24734888 ctcaagatgggaatgaatttgaagtt 24734863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 19 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 24745134 - 24744810
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
24745134 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacttttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 24745036  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    | |||| |||||  ||||  ||  || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||||||||| |||| ||   | |||      
24745035 ttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacaaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcattatt 24744936  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |     
24744935 agagttgacaaagtacaaatgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 24744836  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaagtt 341  Q
     ||||||| |||||||||||||||||    
24744835 ctcaagatgggaatgaatttgaagtt 24744810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 220 - 347
Target Start/End: Original strand, 11087110 - 11087237
Alignment:
220 agttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttccttca 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |    
11087110 agttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccatgactctgcttgtgtctacactacaagacaagataacagctctgcctgcataaatgttccttta 11087209  T
320 agataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
    ||||||||||| |||||||  |||||||    
11087210 agataggaatggatttgaacgtgatcct 11087237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 35 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 42866245 - 42865937
Alignment:
35 catcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttctcgtttc 134  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||| | ||  ||||||||||||||| || ||   | |||  |||||||||||||||||| |||| |||||  |||    
42866245 catcagaagcaatattttcatcagaagcaatattttcaccagaagctacatttgattctttaatc-aaactgaagattcaaagttgctgattctcaattc 42866147  T
135 aacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaacagagttgacaaagtaca 234  Q
    |  ||  || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || ||   ||||||||| |||| ||   | |||| |||||||||||||||||    
42866146 agtcttatcaaagaagaacgaagaactgaaagggaggtatcaacggatatatggaaagcactgagcacttgtctctcattaatagagttgacaaagtaca 42866047  T
235 agtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttc-cttcaagataggaatga 331  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |   ||||||| |||||||    
42866046 agtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaagttgtacaactcaagatgggaatga 42865947  T
332 atttgaagtt 341  Q
    ||||||||||    
42865946 atttgaagtt 42865937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 35 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 42876871 - 42876563
Alignment:
35 catcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttctcgtttc 134  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||| | ||  ||||||||||||||| || ||   | |||  |||||||||||||||||| |||| |||||  |||    
42876871 catcagaagcaatattttcatcagaagcaatattttcaccagaagctacatttgattctttaatc-aaactgaagattcaaagttgctgattctcaattc 42876773  T
135 aacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaacagagttgacaaagtaca 234  Q
    |  ||  || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || ||   ||||||||| |||| ||   | |||| |||||||||||||||||    
42876772 agtcttatcaaagaagaacgaagaactgaaagggaggtatcaacggatatatggaaagcactgagcacttgtctctcattaatagagttgacaaagtaca 42876673  T
235 agtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttc-cttcaagataggaatga 331  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |   ||||||| |||||||    
42876672 agtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaagttgtacaactcaagatgggaatga 42876573  T
332 atttgaagtt 341  Q
    ||||||||||    
42876572 atttgaagtt 42876563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 218 - 347
Target Start/End: Original strand, 13174668 - 13174799
Alignment:
218 agagttgacaaagtacaa-gtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaag-ataacagctctgcctgcagaattgttcc 315  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||  | |||||||||||| | ||||||| ||| ||||||| |||| |    
13174668 agagttgacaaagtacaaagtgtacaaccactacctccacgactctgattgtctctacactacaagacaagaaaaacagctttgcatgcagaaatgttac 13174767  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
    ||||||||||||||| |||||||  |||||||    
13174768 ttcaagataggaatggatttgaacgtgatcct 13174799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 276 - 344
Target Start/End: Original strand, 38403331 - 38403399
Alignment:
276 ctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttccttcaagataggaatgaatttgaagttgat 344  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
38403331 ctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaaatgttccttcaagatgggaatgaatttgaagttgat 38403399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 19 - 180
Target Start/End: Original strand, 26290217 - 26290378
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||   || |||  | |||  ||||| |||||||||||    
26290217 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctatgtttgatcctttaatc-aaactaaagattcaaag 26290315  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgg 180  Q
    |||||| |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
26290316 tagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgg 26290378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 19 - 111
Target Start/End: Original strand, 9261629 - 9261721
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagat 111  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  |  ||| |||||||||||    
9261629 atcagaagcagaaggtaatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaagtcatcaccagaagctacatttaatccatatattcaaactgaagat 9261721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 213 - 341
Target Start/End: Original strand, 26294089 - 26294219
Alignment:
213 ttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-tt 310  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| ||    
26294089 ttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaattt 26294188  T
311 gttccttcaagataggaatgaatttgaagtt 341  Q
    || |  ||||||| |||||||||||||||||    
26294189 gtacactcaagatgggaatgaatttgaagtt 26294219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 19 - 129
Target Start/End: Original strand, 23264457 - 23264567
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaa-ggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | || | |||||||||||||||||    
23264457 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaggttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaa-tcaaactgaagattcaaag 23264555  T
118 tagctgtttctc 129  Q
    |||||| |||||    
23264556 tagctgattctc 23264567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 234 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 21692322 - 21692208
Alignment:
234 aagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaag-ataacagctctgcctgcagaattgttccttcaagataggaatgaa 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | |  ||||||   ||||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||   | |||||| |    
21692322 aagtgtacaaccactacctccactactcagtttgtgtctctgctacaagacaagtataacatctctgcctgcaacattgttccttcatacttggaatgga 21692223  T
333 tttgaagttgatcct 347  Q
    |||||| ||||||||    
21692222 tttgaaattgatcct 21692208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 19193332 - 19193268
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctaca 84  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| |  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
19193332 atcagaagcagaagttcatcagaagca-gaatttcatcagaagcgatatcatcaccagaagctaca 19193268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 234 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 21695436 - 21695322
Alignment:
234 aagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaaga-taacagctctgcctgcagaattgttccttcaagataggaatgaa 332  Q
    ||||||||||||| |||||| || || | |  ||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||   | |||||| |    
21695436 aagtgtacaaccagtacctcaactactcagtttgtgtctctgctacaagacaagaataacagctctgcctgcaacattgttccttcatacttggaatgga 21695337  T
333 tttgaagttgatcct 347  Q
    |||||| ||||||||    
21695336 tttgaaattgatcct 21695322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 234 - 343
Target Start/End: Original strand, 48237025 - 48237135
Alignment:
234 aagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataa-cagctctgcctgcagaattgttccttcaagataggaatgaa 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  ||  | ||||   |||||||||||||| || |||||||||||||| |  ||||||||||  ||||||||| |    
48237025 aagtgtacaaccactacctccactactttgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcaaagatgttccttcacaataggaatgca 48237124  T
333 tttgaagttga 343  Q
    |||||| ||||    
48237125 tttgaaattga 48237135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 159
Target Start/End: Original strand, 22494045 - 22494169
Alignment:
35 catcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttctcgttt 133  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | || ||||||| ||||||||||||||||| |||||  ||    
22494045 catcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaa-ttaaactaaagattcaaagtagctgattctcaatt 22494143  T
134 caacctcgtctaagaagaacgaagaa 159  Q
    ||  ||  || |||||||||||||||    
22494144 cagtcttatccaagaagaacgaagaa 22494169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 234 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 331680 - 331608
Alignment:
234 aagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaa-gataacagctctgcctgca 305  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | |  ||||||   |||||||||||| |||||||||||||||||||    
331680 aagtgtacaaccactacctccactacacagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacagctctgcctgca 331608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 234 - 347
Target Start/End: Original strand, 16112007 - 16112121
Alignment:
234 aagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaa-gataacagctctgcctgcagaattgttccttcaagataggaatgaa 332  Q
    |||||||||||||||| |||||| || |||  | ||||   |||||||||||| || ||||||||||||||||    ||||||||||  || |||||| |    
16112007 aagtgtacaaccactatctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaaggaaaacagctctgcctgcaacgatgttccttcataatgggaatgca 16112106  T
333 tttgaagttgatcct 347  Q
    |||||| ||||||||    
16112107 tttgaaattgatcct 16112121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 234 - 347
Target Start/End: Original strand, 30944446 - 30944560
Alignment:
234 aagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaag-ataacagctctgcctgcagaattgttccttcaagataggaatgaa 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||   ||||||||||||| | ||||||||||||||||  | |||||| |||  || | |||| |    
30944446 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcaacaatgttccctcacaatggaaatgca 30944545  T
333 tttgaagttgatcct 347  Q
    |||||| ||||||||    
30944546 tttgaaattgatcct 30944560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 234 - 347
Target Start/End: Original strand, 33691835 - 33691949
Alignment:
234 aagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaag-ataacagctctgcctgcagaattgttccttcaagataggaatgaa 332  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || |||  | ||||   ||||||||||||| | ||||||||||||||||    ||||||||||  || |||||| |    
33691835 aagtgtataaccactacctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcaacgatgttccttcacaatgggaatgga 33691934  T
333 tttgaagttgatcct 347  Q
    |||||| ||||||||    
33691935 tttgaaattgatcct 33691949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 234 - 347
Target Start/End: Original strand, 41842396 - 41842510
Alignment:
234 aagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaag-ataacagctctgcctgcagaattgttccttcaagataggaatgaa 332  Q
    ||||||||||||||||||| ||| || | |  ||||||   ||||||||||||| ||||||||||||||||||  | |||||||| |   | |||||| |    
41842396 aagtgtacaaccactacctgcactactcagtttgtgtctctgctacaagacaagaataacagctctgcctgcaacaatgttcctttatacttggaatgga 41842495  T
333 tttgaagttgatcct 347  Q
    |||||| ||||||||    
41842496 tttgaaattgatcct 41842510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 234 - 287
Target Start/End: Original strand, 19339373 - 19339426
Alignment:
234 aagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaag 287  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||   |||||||||||||    
19339373 aagtgtacaaccactacctccactactctgagtttgtctctgctacaagacaag 19339426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 237 - 305
Target Start/End: Original strand, 21381555 - 21381624
Alignment:
237 tgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaa-gataacagctctgcctgca 305  Q
    |||||||||||||| ||||| || |||||| ||||   || ||||||||| |||||||||||||||||||    
21381555 tgtacaaccactacttccactactctgagtttgtctctgcaacaagacaaggataacagctctgcctgca 21381624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 84
Target Start/End: Original strand, 24882304 - 24882352
Alignment:
35 catcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctaca 84  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||||||||||    
24882304 catcagaagcaagattt-catcagaagctatatcatcaccagaagctaca 24882352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 275 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 30025899 - 30025826
Alignment:
275 gctacaagacaag-ataacagctctgcctgcagaattgttccttcaagataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||  ||  ||||| ||||||| ||||||||    
30025899 gctacaagacaaggataacagctctgcctgcaacaatgttccttcacaattagaatggatttgaaattgatcct 30025826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 2)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Original strand, 32729 - 33049
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||| ||||||||||| ||||||    
32729 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattgatttgtaaattcaaactgaagatccaaagt 32828  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaaca 218  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||| || |||| ||||||||    
32829 agctgtttctcatttcaacctcgtctaagaagaacgaataattgaaagggaggtatcaacgatcatttggatagcactgagtatttgtccttcgttaaca 32928  T
219 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcctt 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||    
32929 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcctt 33027  T
318 caagataggaatgaatttgaag 339  Q
    |||||| |||||||||||||||    
33028 caagatgggaatgaatttgaag 33049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Original strand, 40278 - 40600
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
40278 atcagaagcagaaggtcttcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 40376  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||||||||| |||| ||   ||||||     
40377 tagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaat 40476  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |     
40477 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 40576  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
     ||||||| |||||||||||||||    
40577 ctcaagatgggaatgaatttgaag 40600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 87)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Original strand, 18768957 - 18769278
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||    
18768957 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattgatccgtaaatttaaactgaagattcaaagt 18769056  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaaca 218  Q
    || |||||  | |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || |||| ||||||||    
18769057 agttgtttaacatttcaacctcgtcttagaagaacgaagaattgacagggaggtatcaacggtcatttgaagaacactgagtatttgtccttcgttaaca 18769156  T
219 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcctt 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||| |||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||    
18769157 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagataagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcctt 18769256  T
318 caagataggaatgaatttgaag 339  Q
    |||||| |||||||||||||||    
18769257 caagatgggaatgaatttgaag 18769278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 16747461 - 16747141
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||| |||| ||||||||||| ||||||    
16747461 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaggttttcatcagaagtgaaatcatcaccagaagctacaattgatttgtaaattcaaactgaagatccaaagt 16747362  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaaca 218  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| || |||| ||||||||    
16747361 agctgtttctcatttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagcactgagtatttgtccttcgttaaca 16747262  T
219 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcctt 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||| ||||||||||||||| |||| || ||||||||||| |||| ||||    
16747261 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacaactatgcctgcagaatttgtgcctt 16747163  T
318 caagataggaatgaatttgaag 339  Q
    |||||| | |||||||||||||    
16747162 caagatggaaatgaatttgaag 16747141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 18154197 - 18153876
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttc-atcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaattt-aaactgaagattcaaa 116  Q
    |||| |||||||||  ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| |||| || ||| || || || ||||||||||||||||    
18154197 atcataagcagaaggtcatcagaagcaaggttttttatcagaagcaaaatcatcaccagaagttacatttgatcagtaaaattcaaactgaagattcaaa 18154098  T
117 gtagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaa 216  Q
    ||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||||    
18154097 gtagctgtttaacatttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggagagcactgagtacttgtccttcgttaa 18153998  T
217 cagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcct 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||    
18153997 cagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgca-aattgttcct 18153899  T
317 tcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
    |||||||||||||||||||||||    
18153898 tcaagataggaatgaatttgaag 18153876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 18158716 - 18158395
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaattt-aaactgaagattcaaag 117  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| || ||| || || || |||||||||||||||||    
18158716 atcagaagcagaaggtcatcagaagaaaggtttttatcagaagcgaaatcatcaccagaagttacatttgatcagtaaaattcaaactgaagattcaaag 18158617  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    ||| |||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| |||| |||||||    
18158616 tagatgtttaacatttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggagagaactgagtacttgtccttcgttaac 18158517  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcctt 317  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||| | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
18158516 ggagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccactctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaattgttcctt 18158417  T
318 caagataggaatgaatttgaag 339  Q
    |||||| |||||||||||||||    
18158416 caagatgggaatgaatttgaag 18158395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 19225394 - 19225074
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |  ||| ||||||||||| ||||||    
19225394 atcagaagcagaagctcatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacatttaatccatatattcaaactgaagatccaaagt 19225295  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaaca 218  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||| | || |||| ||||||||    
19225294 agctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagcgctgagcatttgtccttcgttaaca 19225195  T
219 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcctt 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||    
19225194 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcctt 19225096  T
318 caagataggaatgaatttgaag 339  Q
    |||||| |||||||||||||||    
19225095 caagatgggaatgaatttgaag 19225074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 19418812 - 19418492
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||| || |||| ||||||||||| ||||||    
19418812 atcagaagcagaagctcatcagaagcaaggttttcatcagaagcgatatcatcaccagaagctacattttatccgtaaattcaaactgaagatccaaagt 19418713  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaaca 218  Q
    ||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| |||||| ||||||| ||||||||    
19418712 agctgtttctcatttcaacattatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagcattgagtatttttccttcgttaaca 19418613  T
219 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcctt 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| |||| ||||    
19418612 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaatttgtgcctt 19418514  T
318 caagataggaatgaatttgaag 339  Q
    |||||| |||||||||||||||    
19418513 caagatgggaatgaatttgaag 19418492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 27 - 339
Target Start/End: Original strand, 40212998 - 40213310
Alignment:
27 cagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagtagctgttt 126  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
40212998 cagaagcccatcagaagcaaggttt-catcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatcagtgaatttaaactggagattcaaagtagctgttt 40213096  T
127 ctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaacagagttgac 226  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| |||||| |||| | ||||||||||||||    
40213097 ctcgtttcaacctcgtctaacaagaacgaagatttgaaagggaggtatcaacggccgtttgaagagcactgcgtacttgtccttctttaacagagttgac 40213196  T
227 -aaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttccttcaagatag 325  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||| || |||  | ||||  | ||||||||||||| |||||   ||||||||||| |||||||||||||| |    
40213197 aaaagtacaagtgtacaaccactacttccactactctgtttttgtctacactacaagacaagacaacagtcatgcctgcagaaatgttccttcaagatgg 40213296  T
326 gaatgaatttgaag 339  Q
    ||||||||||||||    
40213297 gaatgaatttgaag 40213310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 19 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 3843980 - 3843655
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||||||||| || ||| || |||||||||||||| |||||||     
3843980 atcagaagcagaagtccatcagaagcaagattt-catcagaagctatatcatcaccagaagctacagttgatcagtaaatttaaactgaagtttcaaagg 3843882  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaaca 218  Q
    |||||||| |||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || ||| |||| | || | |    
3843881 agctgtttttcgttttaatctcgtctaagaa-aacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaaaagcactgggtgcttgtccttcattga-a 3843784  T
219 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttccttc 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
3843783 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaaatgttccttc 3843684  T
319 aagataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
3843683 aagataggaatgaatttgaagttgatcct 3843655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 19429389 - 19429067
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||| || |||| ||||||||||| ||||||    
19429389 atcagaagcagaagctcatcagaagcaaggttttcatcagaagcgatatcatcaccagaagctacattttatccgtaaattcaaactgaagatccaaagt 19429290  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaaca 218  Q
    ||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| |||||| ||||||| ||||||||    
19429289 agctgtttctcatttcaacattatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagcattgagtatttttccttcgttaaca 19429190  T
219 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcct 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| |||| |||    
19429189 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaatttgtgcct 19429090  T
317 tcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
    ||||||| |||||||||||||||    
19429089 tcaagatgggaatgaatttgaag 19429067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 21 - 339
Target Start/End: Original strand, 30314518 - 30314836
Alignment:
21 cagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagtag 120  Q
    ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |  ||| ||||||||||||||||||||    
30314518 cagaagcagaaggtaatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacatttaatccatatattcaaactgaagattcaaagtag 30314617  T
121 ctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaacaga 220  Q
     |||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   ||| || || | || |||| ||||||||||    
30314618 ttgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtaccaacggtcatttggatagcgcttagcatttgtccttcgttaacaga 30314717  T
221 gttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttccttca 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||||    
30314718 gttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtcctcgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgccttca 30314816  T
320 agataggaatgaatttgaag 339  Q
    |||| |||||||||||||||    
30314817 agatgggaatgaatttgaag 30314836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Original strand, 23469279 - 23469601
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaattt-aaactgaagattcaaag 117  Q
    |||||||| |||| | |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| || || || ||||||||||| |||||    
23469279 atcagaagtagaaaatcatcagaagcaaagttgtcatcagaagcgatatcatcaccagaagctacatttaatccgtaaaattcaaactgaagatccaaag 23469378  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    ||| |||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||   ||||||||||| ||||||| |||||||    
23469379 tagttgtttctcatttcaaccttatctaagaagaaccaagaattgaaagggaggtatcaatggtcatttggatagcactgagtatttttccttcgttaac 23469478  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcct 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||  | ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||    
23469479 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactcctctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcct 23469578  T
317 tcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
    ||||||| |||||||||||||||    
23469579 tcaagatgggaatgaatttgaag 23469601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 31215475 - 31215155
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  | |||| ||||||||||| ||||||    
31215475 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaggttttcatcagaagcgatatcatcaccagaagctacatttaatccataaattcaaactgaagatccaaagt 31215376  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaaca 218  Q
    ||||||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| | || |||| | ||||||    
31215375 agctgtttctcttttcaatcttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaactgtcatttga-tagcactgagcatttgtccttcattaaca 31215277  T
219 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcctt 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||| || || | ||||    
31215276 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctataagacaagacaacagctatgcctgcataatttatgcctt 31215177  T
318 caagataggaatgaatttgaag 339  Q
    |||||| |||||||||||||||    
31215176 caagatgggaatgaatttgaag 31215155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Original strand, 23457123 - 23457444
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaattt-aaactgaagattcaaag 117  Q
    |||||||| |||| | |||||||||||| ||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||| || || || ||||||||||| |||||    
23457123 atcagaagtagaaaatcatcagaagcaaagttgtcatcataagcgatatcatcaccagaagctacatttaatccgtaaaattcaaactgaagatccaaag 23457222  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    ||| |||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||   ||||||||||| ||||||| |||||||    
23457223 tagttgtttctcatttcaaccttatctaagaagaaccaagaattgaaagggaggtatcaatggtcatttggatagcactgagtatttttccttcgttaac 23457322  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcct 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||    
23457323 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcct 23457421  T
317 tcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
    ||||||| |||||||||||||||    
23457422 tcaagatgggaatgaatttgaag 23457444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 19 - 347
Target Start/End: Original strand, 20259440 - 20259765
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||  | ||||||||||||||||||| || ||  || |||||||||||||| |||||||     
20259440 atcagaagcagaagtccatcagaagcaagattt-catcagaagttatatcatcaccagaagctacagttgattagtaaatttaaactgaagtttcaaagg 20259538  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaaca 218  Q
    |||||||| |||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || ||| |||| | || | |    
20259539 agctgtttttcgttttaatctcgtctaagaa-aacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaaaagcactgggtgcttgtccttcattga-a 20259636  T
219 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttccttc 318  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
20259637 gagttgaaaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttgtgtctgcgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaaatgttccttc 20259736  T
319 aagataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||    
20259737 aagataggaatgaattcaaagttgatcct 20259765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 19 - 347
Target Start/End: Original strand, 21046070 - 21046395
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||  | ||||||||||||||||||| || ||  || |||||||||||||| |||||||     
21046070 atcagaagcagaagtccatcagaagcaagattt-catcagaagttatatcatcaccagaagctacagttgattagtaaatttaaactgaagtttcaaagg 21046168  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaaca 218  Q
    |||||||| |||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || ||| |||| | || | |    
21046169 agctgtttttcgttttaatctcgtctaagaa-aacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaaaagcactgggtgcttgtccttcattga-a 21046266  T
219 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttccttc 318  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
21046267 gagttgaaaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttgtgtctgcgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaaatgttccttc 21046366  T
319 aagataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||    
21046367 aagataggaatgaattcaaagttgatcct 21046395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Original strand, 20161049 - 20161369
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  |  ||| ||||| ||||| ||||||    
20161049 atcagaagcagaaggtaatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaagtcatcaccagaagctacatttaatccatatattcaaactaaagatccaaagt 20161148  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaaca 218  Q
    ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||| ||||| | || |||| ||||||||    
20161149 agctgtttctcatttcaatctcatctaagaagaacgaagaattgaaaggaaggtatcaacggtcatttggacagcgctgagcatttgtccttcgttaaca 20161248  T
219 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcctt 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||| ||||||||||||||| ||||||| || |||||||| |||| ||||    
20161249 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgtctgcagaatttgtgcctt 20161347  T
318 caagataggaatgaatttgaag 339  Q
    |||  | |||||||||||||||    
20161348 caaagtgggaatgaatttgaag 20161369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 20196418 - 20196098
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  |  ||| ||||| ||||| ||||||    
20196418 atcagaagcagaaggtaatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaagtcatcaccagaagctacatttaatccatatattcaaactaaagatccaaagt 20196319  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaaca 218  Q
    ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||| ||||| | || |||| ||||||||    
20196318 agctgtttctcatttcaatctcatctaagaagaacgaagaattgaaaggaaggtatcaacggtcatttggacagcgctgagcatttgtccttcgttaaca 20196219  T
219 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcctt 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||| ||||||||||||||| ||||||| || |||||||| |||| ||||    
20196218 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgtctgcagaatttgtgcctt 20196120  T
318 caagataggaatgaatttgaag 339  Q
    |||  | |||||||||||||||    
20196119 caaagtgggaatgaatttgaag 20196098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 19 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 1750556 - 1750228
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaagg-ttttcatcagaagcgaa--atcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaa 115  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||  ||| |||||||||||| || || || | | ||| | ||||||||||| ||    
1750556 atcagaagcagaagatcatcagaagcaaggtttttcatcagaagcaaaatatcttcaccagaagctgcatttgatatcttaatct-aactgaagatttaa 1750458  T
116 agtagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgtta 215  Q
    |||||||| |||||   ||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||| ||||| | || |||| |||||    
1750457 agtagctggttctcaactcagccttatctaagaagaacgaagaattaaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgagcatttgtccttcgtta 1750358  T
216 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaat-tgttc 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||| ||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||| |    
1750357 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaaaacaacagctatgcctgcagaatatgtgc 1750258  T
315 cttcaagataggaatgaatttgaagttgat 344  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||    
1750257 cttcaagatgggaatgaatttgaagctgat 1750228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 35 - 339
Target Start/End: Original strand, 6318353 - 6318657
Alignment:
35 catcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttctcgtttc 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| || |||  | |||  || |||||||||||||||||||| |||||  |||    
6318353 catcagaagcaaggttttcatcagaagctatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aatctgaagattcaaagtagctggttctcaattc 6318451  T
135 aacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaacagagttgacaaagtaca 234  Q
    || ||  |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||   ||||||||| | || |||  ||||||||||||||||||||||||    
6318452 aatcttatctaagaagaacgaagaattgaaagggatgtaccaacggtcatatggatagcactgagcatttgtccctcgttaacagagttgacaaagtaca 6318551  T
235 agtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttccttcaagataggaatgaat 333  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||  | ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||  | ||||||| |||||||||    
6318552 agtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcataatttgtgtcctcaagatgggaatgaat 6318651  T
334 ttgaag 339  Q
    ||||||    
6318652 ttgaag 6318657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 218 - 347
Target Start/End: Original strand, 22211407 - 22211536
Alignment:
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcctt 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
22211407 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagccctgcctgcagaattgttcctt 22211506  T
318 caagataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
22211507 caagataggaatgaatttgaagttgatcct 22211536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 19 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 23371005 - 23370686
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||||||||| || ||| || |||||||||||||  |||||||     
23371005 atcagaagca-aagtccatcagaagcaagattt-catcagaagctatatcatcaccagaagctacagttgatcagtaaatttaaactgaaatttcaaagg 23370908  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaaca 218  Q
    |||||||| |||||| | |||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| || ||| |||| | || | |    
23370907 agctgtttttcgttttatcctcatctgagaa-aacgaagaattaaaagggaggtaccaacggtcatttgaaaagcactgggtgcttgtccttctttga-a 23370810  T
219 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttccttc 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | |||     ||||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||     
23370809 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgt-----ctacaagacaagacaacacctctgcctacagaaatgttccttt 23370715  T
319 aagataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||    
23370714 aagataggaatgaattcaaagttgatcct 23370686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 218 - 347
Target Start/End: Original strand, 22135877 - 22136006
Alignment:
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcctt 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
22135877 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagcatgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcctt 22135976  T
318 caagataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||    
22135977 caagatgggaatgaatttgaagttgatcct 22136006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 218 - 347
Target Start/End: Original strand, 22167042 - 22167171
Alignment:
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcctt 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
22167042 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagcatgtcctcgctacaagataagataacagctttgcctgcagaattgttcctt 22167141  T
318 caagataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||    
22167142 caagatgggaatgaatttgaagttgatcct 22167171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 3221093 - 3220771
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
3221093 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 3220995  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| |||||  ||||  ||  |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||   ||||||||| |||| ||   ||||||     
3220994 tagctgattctcaattcagtcttattcaagaagaacgaagaattgaaagggaagtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaat 3220895  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | |||| |||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| |||| ||    
3220894 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtcttcgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaatttgtacc 3220795  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
    |||||||| |||||||||||||||    
3220794 ttcaagatgggaatgaatttgaag 3220771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 19139741 - 19139419
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
19139741 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 19139643  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||||||||| |||| ||   ||||||     
19139642 tagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaat 19139543  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| |||| |     
19139542 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaagttgtacg 19139443  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
    |||||||| |||||||||||||||    
19139442 ttcaagatgggaatgaatttgaag 19139419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 19 - 341
Target Start/End: Original strand, 209973 - 210296
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| || |||  | |||  |||||||||||||||||    
209973 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 210071  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   |||||||||  ||| ||   ||||||     
210072 tagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaat 210171  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcct 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||||||| |      
210172 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaattgtacac 210271  T
317 tcaagataggaatgaatttgaagtt 341  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
210272 tcaagatgggaatgaatttgaagtt 210296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 19 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 252869 - 252546
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| || |||  | |||  |||||||||||||||||    
252869 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 252771  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   |||||||||  ||| ||   ||||||     
252770 tagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaat 252671  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcct 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||||||| |      
252670 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaattgtacac 252571  T
317 tcaagataggaatgaatttgaagtt 341  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
252570 tcaagatgggaatgaatttgaagtt 252546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 19 - 341
Target Start/End: Original strand, 723596 - 723919
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| || |||  | |||  |||||||||||||||||    
723596 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 723694  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   |||||||||  ||| ||   ||||||     
723695 tagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaat 723794  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcct 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||||||| |      
723795 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaattgtacac 723894  T
317 tcaagataggaatgaatttgaagtt 341  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
723895 tcaagatgggaatgaatttgaagtt 723919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 19 - 341
Target Start/End: Original strand, 848787 - 849110
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| || |||  | |||  |||||||||||||||||    
848787 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 848885  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   |||||||||  ||| ||   ||||||     
848886 tagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaat 848985  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcct 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||||||| |      
848986 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaattgtacac 849085  T
317 tcaagataggaatgaatttgaagtt 341  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
849086 tcaagatgggaatgaatttgaagtt 849110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 19 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 36293380 - 36293056
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| || |||  | |||  |||||||||||||||||    
36293380 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 36293282  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   |||||||||  ||| ||   ||||||     
36293281 tagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaat 36293182  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |     
36293181 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 36293082  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaagtt 341  Q
     ||||||| |||||||||||||||||    
36293081 ctcaagatgggaatgaatttgaagtt 36293056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 19 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 36303983 - 36303659
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| || |||  | |||  |||||||||||||||||    
36303983 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 36303885  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   |||||||||  ||| ||   ||||||     
36303884 tagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaat 36303785  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |     
36303784 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 36303685  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaagtt 341  Q
     ||||||| |||||||||||||||||    
36303684 ctcaagatgggaatgaatttgaagtt 36303659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 19 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 242284 - 241961
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| || |||  | |||  ||||||||||||||| |    
242284 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaatg 242186  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| |||||  ||||  ||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || ||   |||||||||  ||| ||   ||||||     
242185 tagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacagatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaat 242086  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcct 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||||||| |      
242085 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaattgtacac 241986  T
317 tcaagataggaatgaatttgaagtt 341  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
241985 tcaagatgggaatgaatttgaagtt 241961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 19 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 29077191 - 29076868
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| || |||  | |||  |||||||||||||||||    
29077191 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 29077093  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| || ||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   |||||||||  ||| ||   ||||||     
29077092 tagctgattttcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaat 29076993  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcct 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||||||| |      
29076992 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaattgtacac 29076893  T
317 tcaagataggaatgaatttgaagtt 341  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||    
29076892 tcaagatgggaaggaatttgaagtt 29076868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 19 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 29087442 - 29087119
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| || |||  | |||  |||||||||||||||||    
29087442 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 29087344  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| || ||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   |||||||||  ||| ||   ||||||     
29087343 tagctgattttcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaat 29087244  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcct 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||||||| |      
29087243 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaattgtacac 29087144  T
317 tcaagataggaatgaatttgaagtt 341  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||    
29087143 tcaagatgggaaggaatttgaagtt 29087119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 19 - 341
Target Start/End: Original strand, 32077516 - 32077839
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
32077516 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 32077614  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| || ||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   |||||||||  ||| ||   ||||||     
32077615 tagctgattttcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaat 32077714  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcct 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||||||| |      
32077715 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaattgtacac 32077814  T
317 tcaagataggaatgaatttgaagtt 341  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
32077815 tcaagatgggaatgaatttgaagtt 32077839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 19 - 341
Target Start/End: Original strand, 32088089 - 32088412
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
32088089 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 32088187  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| || ||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   |||||||||  ||| ||   ||||||     
32088188 tagctgattttcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaat 32088287  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcct 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||||||| |      
32088288 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaattgtacac 32088387  T
317 tcaagataggaatgaatttgaagtt 341  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
32088388 tcaagatgggaatgaatttgaagtt 32088412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 26111693 - 26111371
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| || |||  | |||  |||||||||||||||||    
26111693 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 26111595  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| |||||  ||||  ||  || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || ||   ||||||||| |||| ||   ||||||     
26111594 tagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagagaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaat 26111495  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | |||||   ||||||||||| |||| |     
26111494 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccacaacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagtcatgcctgcagaatttgtacg 26111395  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
    |||||||| |||||||||||||||    
26111394 ttcaagatgggaatgaatttgaag 26111371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 26121371 - 26121049
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
26121371 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 26121273  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    ||| || |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||||||||| |||| ||   ||||||     
26121272 tagttgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaat 26121173  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |     
26121172 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacg 26121073  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
    |||||||| ||||| |||||||||    
26121072 ttcaagatgggaataaatttgaag 26121049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 51 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 19461376 - 19461081
Alignment:
51 ttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttctcgt-ttcaacctcgtctaagaa 149  Q
    ||||| |||||| | ||||||||||||||||||| || ||| |   ||| || |||||| ||||||  |||||| | | |  || ||||||||||||||     
19461376 ttcattagaagctatatcatcaccagaagctacagttgatcagaagattcaacctgaagtttcaaaagagctgtcttttgaatttaacctcgtctaaga- 19461278  T
150 gaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccacta 249  Q
    || ||||| ||| ||||||||||  ||||| ||||||||  ||||||| || ||| |||| | || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
19461277 gagcgaaggattaaaagggaggtgccaacgttcatttgaaaagcactgggtgcttgtccttcattga-agagttgacaaagtacaagagtacaaccacta 19461179  T
250 cctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttccttcaagataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
    |||||||||| |||  ||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||||    
19461178 cctccacgactctgcttgtgtctacgctataagacaagataacagctctgcctgcagaaatgttccttcaatataggaatagatttgaacttgatcct 19461081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 51 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 19559054 - 19558759
Alignment:
51 ttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttctcgt-ttcaacctcgtctaagaa 149  Q
    ||||| |||||| | ||||||||||||||||||| || ||| |   ||| || |||||| ||||||  |||||| | | |  || ||||||||||||||     
19559054 ttcattagaagctatatcatcaccagaagctacagttgatcagaagattcaacctgaagtttcaaaagagctgtcttttgaatttaacctcgtctaaga- 19558956  T
150 gaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccacta 249  Q
    || ||||| ||| ||||||||||  ||||| ||||||||  ||||||| || ||| |||| | || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
19558955 gagcgaaggattaaaagggaggtgccaacgttcatttgaaaagcactgggtgcttgtccttcattga-agagttgacaaagtacaagagtacaaccacta 19558857  T
250 cctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttccttcaagataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
    |||||||||| |||  ||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||||    
19558856 cctccacgactctgcttgtgtctacgctataagacaagataacagctctgcctgcagaaatgttccttcaatataggaatagatttgaacttgatcct 19558759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 52 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 28691328 - 28691193
Alignment:
52 tcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaaga 151  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| || |||| |||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||  ||||||||||    
28691328 tcatcagaagcgatatcatcaccagaagctacatttaatccgtaaattcaaactgaagatctaaagtagttgtttctcatttcaaccttatctaagaaga 28691229  T
152 acgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttg 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
28691228 acgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttg 28691193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 19 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 36078397 - 36078072
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| || |||  | |||  |||||||||||||||||    
36078397 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 36078299  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   |||||||||  ||| ||   ||||||     
36078298 tagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaat 36078199  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcc- 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  |||||||||||||  | |     
36078198 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 36078099  T
316 -ttcaagataggaatgaatttgaagtt 341  Q
      ||||||| |||||||||||||||||    
36078098 actcaagatgggaatgaatttgaagtt 36078072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 19 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 36088983 - 36088658
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| || |||  | |||  |||||||||||||||||    
36088983 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 36088885  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   |||||||||  ||| ||   ||||||     
36088884 tagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaat 36088785  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcc- 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  |||||||||||||  | |     
36088784 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 36088685  T
316 -ttcaagataggaatgaatttgaagtt 341  Q
      ||||||| |||||||||||||||||    
36088684 actcaagatgggaatgaatttgaagtt 36088658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 19 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 9341605 - 9341281
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
9341605 atcagaagcagaaaatcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacttttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 9341507  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    | |||| |||||  ||||  ||  || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || ||   |||||||||  ||| ||   ||||||     
9341506 ttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacaaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaat 9341407  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |     
9341406 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 9341307  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaagtt 341  Q
     ||||||| |||||||||||||||||    
9341306 ctcaagatgggaatgaatttgaagtt 9341281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 101 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 19129127 - 19128887
Alignment:
101 aaactgaagattcaaagtagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||  |||   ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   |||||||||     
19129127 aaactgaagattcaaagtagctgattctcaattctgtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagc 19129028  T
201 acttttcctgcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctg 299  Q
    |||| ||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||||| ||||||  ||    
19129027 acttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaagacaacagccatg 19128928  T
300 cctgcagaa-ttgttccttcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
    ||||||||| |||| | |||||||| |||||||||||||||    
19128927 cctgcagaagttgtacgttcaagatgggaatgaatttgaag 19128887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Original strand, 9856291 - 9856613
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  ||||| |||||||||||    
9856291 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactaaagattcaaag 9856389  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| |||||  ||||  ||  || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||   ||||||||| |||| ||   ||||||     
9856390 tagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggagatatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaat 9856489  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |     
9856490 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctctactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 9856589  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
     ||||||| |||||||||||||||    
9856590 ctcaagatgggaatgaatttgaag 9856613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Original strand, 15780529 - 15780851
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| || |||  | |||  | |||||||||||||||    
15780529 atcagaagcaaaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-atactgaagattcaaag 15780627  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||   ||||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||   |||||||||||||| ||   ||||||     
15780628 tagctaactctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggatgtatcaacggatatatggatagcactgagtacttgtctctcgttaat 15780727  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |     
15780728 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 15780827  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
     ||||||| |||||||||||||||    
15780828 ctcaagatgggaatgaatttgaag 15780851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Original strand, 15791118 - 15791440
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
15791118 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 15791216  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||   ||||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||   ||||||||| |||| ||   ||||||     
15791217 tagctaactctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggatgtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaat 15791316  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |     
15791317 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 15791416  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
     ||||||| |||||||||||||||    
15791417 ctcaagatgggaatgaatttgaag 15791440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 19 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 6161486 - 6161162
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
6161486 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 6161388  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || ||   ||||||||| |||| ||   | ||||     
6161387 tagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcattaat 6161288  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  |||||||| |||| | |||| |  ||||||||||| |||| |     
6161287 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaaaacaaaacaacaaccatgcctgcagaatttgtaca 6161188  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaagtt 341  Q
     ||||||| |||||||||||||||||    
6161187 ctcaagatgggaatgaatttgaagtt 6161162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 218 - 347
Target Start/End: Original strand, 7018400 - 7018529
Alignment:
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcctt 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||||  ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||    
7018400 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttgtgtctacgctacaagacaagacaacagctttgcctgcagaaatgttcctt 7018499  T
318 caagataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||    
7018500 caagataggaatggatttgaacttgatcct 7018529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 19 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 9368749 - 9368425
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
9368749 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacttttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 9368651  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    | |||| |||||  ||||  ||  || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || ||   |||||||||  ||| ||   ||||||     
9368650 ttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacaaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaat 9368551  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |     
9368550 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 9368451  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaagtt 341  Q
     ||||||| |||||||||||||||||    
9368450 ctcaagatgggaatgaatttgaagtt 9368425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 6151532 - 6151209
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
6151532 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 6151434  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaa-gaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaa 216  Q
    |||||| |||||  ||||  ||  || ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  || ||   ||||||||| |||| ||   | ||||    
6151433 tagctgattctcaattcagtcttatcaaagaaagaacgaagaattgaaatggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcattaa 6151334  T
217 cagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttc 314  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |    
6151333 tagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtac 6151234  T
315 cttcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
      ||||||| |||||||||||||||    
6151233 actcaagatgggaatgaatttgaag 6151209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 18449831 - 18449509
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||  ||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
18449831 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagtttttatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 18449733  T
118 tagctgtttctcgtttcaa-cctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaa 216  Q
    |||||| |||||  ||||  |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||||||||| |||| ||   ||||||    
18449732 tagctgattctcaattcagtcctattc-aagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaa 18449634  T
217 cagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttc 314  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |    
18449633 tagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtac 18449534  T
315 cttcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
      |||| || |||||||||||||||    
18449533 actcaaaatgggaatgaatttgaag 18449509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 19 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 43248778 - 43248547
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
43248778 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 43248680  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||||||||| |||| ||   ||||||     
43248679 tagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaat 43248580  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactac 250  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
43248579 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactac 43248547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 218 - 347
Target Start/End: Original strand, 23271223 - 23271353
Alignment:
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagat-aacagctctgcctgcagaattgttcct 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||  ||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
23271223 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacttccactactctgcctgtgtctacgctacaagacaagataaacagctctgcctgcagaaatgttcct 23271322  T
317 tcaagataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||    
23271323 tcaagataggaatggatttgaatttgatcct 23271353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 206 - 339
Target Start/End: Original strand, 30325259 - 30325392
Alignment:
206 tcctgcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgca 305  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
30325259 tccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtcctcgctacaagacaagacaacagctatgcctgca 30325357  T
306 gaa-ttgttccttcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
    ||| |||| |||||||||| |||||||||||||||    
30325358 gaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaag 30325392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 19 - 341
Target Start/End: Original strand, 3348446 - 3348770
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  || ||||||||||||||    
3348446 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacttttgatcctttaatc-aatctgaagattcaaag 3348544  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    | |||| |||||  ||||  ||  || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || ||   |||||||||  ||| ||   ||||||     
3348545 ttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacaaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaat 3348644  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |     
3348645 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 3348744  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaagtt 341  Q
     ||||||| |||||||||||||||||    
3348745 ctcaagatgggaatgaatttgaagtt 3348770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 19 - 341
Target Start/End: Original strand, 3359043 - 3359367
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  || ||||||||||||||    
3359043 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacttttgatcctttaatc-aatctgaagattcaaag 3359141  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    | |||| |||||  ||||  ||  || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || ||   |||||||||  ||| ||   ||||||     
3359142 ttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacaaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaat 3359241  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |     
3359242 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 3359341  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaagtt 341  Q
     ||||||| |||||||||||||||||    
3359342 ctcaagatgggaatgaatttgaagtt 3359367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 218 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 8032081 - 8031951
Alignment:
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagat-aacagctctgcctgcagaattgttcct 316  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||    
8032081 agagttgacaaagtacaaatgtacaaccactacctccacgactctgcttgtgtctacgctacaagacaagataaacagctctgcttgcagaaatgttcct 8031982  T
317 tcaagataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
    |||||||||||||| |||||||  |||||||    
8031981 tcaagataggaatggatttgaacgtgatcct 8031951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 218 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 40003277 - 40003155
Alignment:
218 agagttgacaaagtacaa-gtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataa-cagctctgcctgcagaattgttcc 315  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||    
40003277 agagttgacaaagtacaaagtgtacaaccactacctccacgactctgactgtgtctacgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcagaaatgttcc 40003178  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaa 338  Q
    ||||||||||||||| |||||||    
40003177 ttcaagataggaatggatttgaa 40003155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 19 - 137
Target Start/End: Original strand, 30325113 - 30325231
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |  ||| ||||||||||| ||||||    
30325113 atcagaagcagaaggtaatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacatttaatccatatattcaaactgaagatccaaagt 30325212  T
119 agctgtttctcgtttcaac 137  Q
    ||||||||||| |||||||    
30325213 agctgtttctcatttcaac 30325231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 52 - 339
Target Start/End: Original strand, 6576373 - 6576661
Alignment:
52 tcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaaga 151  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  ||||||||||||||||||||||   ||||  ||||  ||  || |||||||    
6576373 tcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaagtagctaactctcaattcagtcttatccaagaaga 6576471  T
152 acgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacc 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||||||||| | || ||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
6576472 acgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcatttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacc 6576571  T
252 tccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttccttcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
    ||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |  ||||||| |||||||||||||||    
6576572 tccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaag 6576661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 35 - 341
Target Start/End: Original strand, 13688402 - 13688711
Alignment:
35 catcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttctcgttt 133  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||| || |||  | |||  |||||||||||||||||| |||| |||||  ||    
13688402 catcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaagttgctgattctcaatt 13688500  T
134 caacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaacagagttgacaaagtac 233  Q
    ||  ||  || |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  || ||   | ||||||| |||| ||   | |||| ||||||||||||||||    
13688501 cagtcttatcaaagaaggacgaagaactgaaagggaggtatcaacggatatatggataacactgagcacttgtctctcattaatagagttgacaaagtac 13688600  T
234 aagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcc--ttcaagataggaatg 330  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  |||||||||||||  | |   ||||||| ||||||    
13688601 aagtgtacaaccactacctccaccactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatg 13688700  T
331 aatttgaagtt 341  Q
    |||||||||||    
13688701 aatttgaagtt 13688711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 19 - 166
Target Start/End: Original strand, 16436880 - 16437026
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| || |||  | || | ||||||||||||||||||    
16436880 atcagaagcagaagatcatcagaagcaaggttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatccctcaa-tcaaactgaagattcaaagt 16436978  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaag 166  Q
    |||||| ||||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||    
16436979 agctgtctctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaag 16437026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 218 - 347
Target Start/End: Original strand, 17519161 - 17519292
Alignment:
218 agagttgacaaagtacaa-gtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataa-cagctctgcctgcagaattgttcc 315  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||  ||||||||||||||| || ||||||| ||||||||| ||||||    
17519161 agagttaacaaagtacaaagtgtacaaccactacctccacgactctgcttgtgtctacgctacaagacaagaaaaacagctcttcctgcagaaatgttcc 17519260  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
    ||||||||||||||| |||||||  |||||||    
17519261 ttcaagataggaatggatttgaacatgatcct 17519292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 218 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 29379626 - 29379504
Alignment:
218 agagttgacaaagtacaa-gtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaag-ataacagctctgcctgcagaattgttcc 315  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  |||||||||||||| | |||| |||||||||||||| ||||||    
29379626 agagttgacaaagtagaaagtgtacaaccactacctccacgactctgattgtgtctacgctacaagacaagaaaaacatctctgcctgcagaaatgttcc 29379527  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaa 338  Q
    |||| |||||||||| |||||||    
29379526 ttcaggataggaatggatttgaa 29379504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 148 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 44481423 - 44481222
Alignment:
148 aagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccac 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||||||  | |||| ||   | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
44481423 aagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggaaagcactctgcacttgtctctcattaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccac 44481324  T
248 tacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttccttcaagataggaatgaatttgaagttgatc 345  Q
    ||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |  ||||||| ||||||||||||||||| |||    
44481323 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttatc 44481224  T
346 ct 347  Q
    ||    
44481223 ct 44481222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 148 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 44492039 - 44491838
Alignment:
148 aagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccac 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||||||  | |||| ||   | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
44492039 aagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggaaagcactctgcacttgtctctcattaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccac 44491940  T
248 tacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttccttcaagataggaatgaatttgaagttgatc 345  Q
    ||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |  ||||||| ||||||||||||||||| |||    
44491939 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttatc 44491840  T
346 ct 347  Q
    ||    
44491839 ct 44491838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 218 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 28903507 - 28903377
Alignment:
218 agagttgacaaagtacaa-gtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataa-cagctctgcctgcagaattgttcc 315  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| || |||  | ||||  ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||    
28903507 agagttgacaaagtacaaagtgtacaaccactagctccactactctgttt-tgtctacgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcagaaatgttcc 28903409  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
    ||||||||||||||| |||||||  |||||||    
28903408 ttcaagataggaatggatttgaacgtgatcct 28903377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 221 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 21540997 - 21540869
Alignment:
221 gttgacaaagtac-aagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataa-cagctctgcctgcagaattgttccttc 318  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||   | ||||  ||||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||||    
21540997 gttgacaaagtacgaagtgtacgaccactacctccactactctatttatgtctacgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcataaatgttccttc 21540898  T
319 aagataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
    |  ||||||||| |||||||  |||||||    
21540897 agaataggaatggatttgaacgtgatcct 21540869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 234 - 347
Target Start/End: Original strand, 15336208 - 15336322
Alignment:
234 aagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaag-ataacagctctgcctgcagaattgttccttcaagataggaatgaa 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||  | |||| | ||||||||||||| | ||||||| ||||||||  | ||||||||||  || |||||| |    
15336208 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctttgctacaagacaagaaaaacagctatgcctgcaacaatgttccttcacaatgggaatgca 15336307  T
333 tttgaagttgatcct 347  Q
    |||||| ||||||||    
15336308 tttgaaattgatcct 15336322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 234 - 347
Target Start/End: Original strand, 15425273 - 15425387
Alignment:
234 aagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaag-ataacagctctgcctgcagaattgttccttcaagataggaatgaa 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||  | |||| | ||||||||||||| | ||||||| ||||||||  | ||||||||||  || |||||| |    
15425273 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctttgctacaagacaagaaaaacagctatgcctgcaacaatgttccttcacaatgggaatgca 15425372  T
333 tttgaagttgatcct 347  Q
    |||||| ||||||||    
15425373 tttgaaattgatcct 15425387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 234 - 347
Target Start/End: Original strand, 15516577 - 15516691
Alignment:
234 aagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaag-ataacagctctgcctgcagaattgttccttcaagataggaatgaa 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||  | |||| | ||||||||||||| | ||||||| ||||||||  | ||||||||||  || |||||| |    
15516577 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctttgctacaagacaagaaaaacagctatgcctgcaacaatgttccttcacaatgggaatgca 15516676  T
333 tttgaagttgatcct 347  Q
    |||||| ||||||||    
15516677 tttgaaattgatcct 15516691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 274 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 795383 - 795316
Alignment:
274 cgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttccttcaagataggaatgaatttgaagtt 341  Q
    ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||    
795383 cgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaattgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtt 795316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 234 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 21932914 - 21932800
Alignment:
234 aagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaag-ataacagctctgcctgcagaattgttccttcaagataggaatgaa 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | | || ||||   ||||||||||||| | ||||||||||||||||    ||||||||||  || |||||| |    
21932914 aagtgtacaaccactacctccactactcagtgtttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcaacgatgttccttcacaatgggaatgga 21932815  T
333 tttgaagttgatcct 347  Q
    |||||| ||||||||    
21932814 tttgaaattgatcct 21932800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 234 - 347
Target Start/End: Original strand, 45568021 - 45568135
Alignment:
234 aagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataa-cagctctgcctgcagaattgttccttcaagataggaatgaa 332  Q
    |||||||| |||||||||| ||| || |||  | ||||  ||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||| |||  ||||||||| |    
45568021 aagtgtacgaccactaccttcactactctgtttatgtctacgctataagacaagaaaaacagctctgcctgcagaaatgttccctcagaataggaatgga 45568120  T
333 tttgaagttgatcct 347  Q
    ||||||  |||||||    
45568121 tttgaatgtgatcct 45568135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 84
Target Start/End: Original strand, 22135681 - 22135745
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctaca 84  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||||| ||||    
22135681 atcagaagcagaagttcatcagaagcaagattt-catcagaagctatatcatcaccagaagttaca 22135745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 234 - 305
Target Start/End: Original strand, 13430748 - 13430820
Alignment:
234 aagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaa-gataacagctctgcctgca 305  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || |||  | |||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||    
13430748 aagtgtacaaccactacttccactactctgtttttgtccctgctacaagacaaggataacagctctgcctgca 13430820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 234 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 21288434 - 21288362
Alignment:
234 aagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaa-gataacagctctgcctgca 305  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||  ||||| ||||   |||||||||||| |||||||||||||||||||    
21288434 aagtgtacaaccactacttccactactttgagtttgtctctgctacaagacaaggataacagctctgcctgca 21288362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 234 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 21301053 - 21300981
Alignment:
234 aagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaa-gataacagctctgcctgca 305  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||   |||||||||||| |||||| ||||||||||||    
21301053 aagtgtacaaccactacttccactactctgagtttgtctctgctacaagacaaggataactgctctgcctgca 21300981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 795654 - 795588
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctaca 84  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||    
795654 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctaca 795588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 234 - 347
Target Start/End: Original strand, 30421549 - 30421663
Alignment:
234 aagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaag-ataacagctctgcctgcagaattgttccttcaagataggaatgaa 332  Q
    |||| |||||||||||||||||| || |||  | ||||   || |||||||||| | ||||||||| |||||| |  ||||||||||  ||||||||| |    
30421549 aagtttacaaccactacctccactactctgtttttgtctctgcaacaagacaagaaaaacagctcttcctgcatagatgttccttcacaataggaatgca 30421648  T
333 tttgaagttgatcct 347  Q
    |||||| ||||||||    
30421649 tttgaaattgatcct 30421663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 274 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 43248531 - 43248465
Alignment:
274 cgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttccttcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
    ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| | |||||||| |||||||||||||||    
43248531 cgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacgttcaagatgggaatgaatttgaag 43248465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 234 - 347
Target Start/End: Original strand, 45538559 - 45538673
Alignment:
234 aagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaag-ataacagctctgcctgcagaattgttccttcaagataggaatgaa 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||   ||||||||||||| | ||||||||||||||||    ||||||||||  || |||||| |    
45538559 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcaacgatgttccttcacaatgggaatgca 45538658  T
333 tttgaagttgatcct 347  Q
    ||| || ||||||||    
45538659 tttaaaattgatcct 45538673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 275 - 347
Target Start/End: Original strand, 18121267 - 18121340
Alignment:
275 gctacaagacaagataa-cagctctgcctgcagaattgttccttcaagataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||    ||||||||||  || |||||||||||||| ||||||||    
18121267 gctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcaacgatgttccttcacaatgggaatgaatttgaaattgatcct 18121340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 84
Target Start/End: Original strand, 22211210 - 22211274
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctaca 84  Q
    |||||||| |||||  |||||||||||||  || |||||||||| | |||||||||||||||||||    
22211210 atcagaagtagaagttcatcagaagcaagaatt-catcagaagctatatcatcaccagaagctaca 22211274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 23783756 - 23783708
Alignment:
35 catcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctaca 84  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||||||||||    
23783756 catcagaagcaagattt-catcagaagctatatcatcaccagaagctaca 23783708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 130)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 20 - 339
Target Start/End: Original strand, 19477908 - 19478228
Alignment:
20 tcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagta 119  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || ||| |||| ||||||||||| |||||||    
19477908 tcagaagcagaaggtcatcagaagcaaggttttcatcagaagcgatatcaacaccagaagctacaattgatttgtaaattcaaactgaagatccaaagta 19478007  T
120 gctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaacag 219  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| || |||| |||||||||    
19478008 gctgtttctcatttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagcactgagtatttgtccttcgttaacag 19478107  T
220 agttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttccttc 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||  | ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||    
19478108 agttgacaaagtacaagtgtacaaccactacgtccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgccttc 19478207  T
319 aagataggaatgaatttgaag 339  Q
    ||||| |||||||||||||||    
19478208 aagatgggaatgaatttgaag 19478228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 17457666 - 17457346
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||| || |||| ||||||||||| ||||||    
17457666 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaggttttcatcagaagcgatatcatcaccagaagctacatttgatccgtaaattcaaactgaagatccaaagt 17457567  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaaca 218  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| |||| ||||||||    
17457566 agctgtttctcatttcaacctcgtctaagaaaaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggagaacactgagtacttgtccttcgttaaca 17457467  T
219 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttccttc 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | |||   ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| |||||||||    
17457466 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtatacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaaatgttccttc 17457367  T
319 aagataggaatgaatttgaag 339  Q
    ||| | |||||||||||||||    
17457366 aagttgggaatgaatttgaag 17457346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 20 - 339
Target Start/End: Original strand, 19463878 - 19464198
Alignment:
20 tcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagta 119  Q
    |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || ||| |||| ||||||||||| |||||||    
19463878 tcagaagcagaaggtcatcaaaagcaaggttttcatcagaagcgatatcaacaccagaagctacaattgatttgtaaattcaaactgaagatccaaagta 19463977  T
120 gctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaacag 219  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| || |||| ||||||||     
19463978 gctgtttctcatttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagcactgagtatttgtccttcgttaacaa 19464077  T
220 agttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttccttc 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||  | ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||    
19464078 agttgacaaagtacaagtgtacaaccactacgtccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgccttc 19464177  T
319 aagataggaatgaatttgaag 339  Q
    ||||| |||||||||||||||    
19464178 aagatgggaatgaatttgaag 19464198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 19 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 21414551 - 21414225
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||| | | ||||||||||||||||||||||  || || ||||||||||||||||||||||     
21414551 atcagaagtagaagaccatcagaagcaagattt-catcagaacctatatcatcaccagaagctacaattgttcagtaaatttaaactgaagattcaaagg 21414453  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaaca 218  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| ||| || |||| ||||| ||    
21414452 agctgtttttcgtttcaacctcgtctaaga-gaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcgtttgaaaagcactgggtaattgtccttcgttatca 21414354  T
219 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttccttc 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
21414353 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaaatgttccttc 21414254  T
319 aagataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||    
21414253 aagatgggaatgaatttgaagttgatcct 21414225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 19 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 24926494 - 24926172
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| || |||| ||||||||||| ||||||    
24926494 atcagaagcagaagctcatcagaagcaaggttttcatcagaagcgatatcatcaccagaagctacatttaatccgtaaattcaaactgaagatccaaagt 24926395  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaaca 218  Q
    ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||| || |||| ||||||||    
24926394 agctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaaaggaggtatcaacggtcatttggatagcactgagtatttgtccttcgttaaca 24926295  T
219 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcctt 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||| ||||||||||||||| |||| || ||||||||||| |||| ||||    
24926294 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacacctatgcctgcagaatttgtgcctt 24926196  T
318 caagataggaatgaatttgaagtt 341  Q
    |||||| |||||||||||||||||    
24926195 caagatgggaatgaatttgaagtt 24926172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 21706331 - 21706009
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaattt-aaactgaagattcaaag 117  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||| || || || |||||||||||||||||    
21706331 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcaccaccagaagttacatttgatcagtaaaattcaaactgaagattcaaag 21706232  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    ||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||| || |||| |||||||    
21706231 tagttgtttctcattccaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcacttgaagaacactgagtatttgtccttcgttaac 21706132  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcct 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||    
21706131 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcct 21706032  T
317 tcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
    ||||||| |||||||||||||||    
21706031 tcaagatgggaatgaatttgaag 21706009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 17447050 - 17446730
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| || ||| || |||| ||||||||||| ||||||    
17447050 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaggttttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacatttgatccgtaaattcaaactgaagatccaaagt 17446951  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaaca 218  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| |||| ||||||||    
17446950 agctgtttctcatttcaacctcgtataagaaaaatgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggagaacactgagtacttgtccttcgttaaca 17446851  T
219 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttccttc 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||  ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| |||||||||    
17446850 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaaatgttccttc 17446751  T
319 aagataggaatgaatttgaag 339  Q
    ||| | |||||||||||||||    
17446750 aagttgggaatgaatttgaag 17446730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 19 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 24983775 - 24983453
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| || |||| ||||||||||| ||||||    
24983775 atcagaagcagaagctcatcagaagcaaggttttcatcagaagcgatatcatcaccagaagctacatttaatccgtaaattcaaactgaagatccaaagt 24983676  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaaca 218  Q
    ||||||||||| |||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| || |||| | ||||||    
24983675 agctgtttctcatttcaaccttatttaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagcactgagtatttgtccttcattaaca 24983576  T
219 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcctt 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||| ||||||||||||||| |||| || ||||||||||| |||| ||||    
24983575 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacaactatgcctgcagaatttgtgcctt 24983477  T
318 caagataggaatgaatttgaagtt 341  Q
    |||||| |||||||||||||||||    
24983476 caagatgggaatgaatttgaagtt 24983453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Original strand, 23406352 - 23406672
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||  || |||| ||||||||||| ||||||    
23406352 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaggttttcatcagaagcgtaatcatcaccagaagcttcaattgattcgtaaattcaaactgaagatccaaagt 23406451  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaaca 218  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| || |||| ||||||||    
23406452 agctatttctcatttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattaaaagggaggtatcaacggtcatttggatagcactgagtatttgtccttcgttaaca 23406551  T
219 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcctt 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||| ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||| ||||    
23406552 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaatacaacagctatgcctgcagaatttgtgcctt 23406650  T
318 caagataggaatgaatttgaag 339  Q
    |||||| |||||||||||||||    
23406651 caagatgggaatgaatttgaag 23406672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Original strand, 34062526 - 34062846
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaattt-aaactgaagattcaaag 117  Q
    ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || || || |||||||||||||||||    
34062526 atcagaagcagaaggtcat-agaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattgatccgtaaaattcaaactgaagattcaaag 34062624  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    ||| |||||  | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| |||| |||||||    
34062625 tagttgtttaacatttcaacctcgtctaagaagtacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggagaacactgagtacttgtccttcgttaac 34062724  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcctt 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||  ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||||||||    
34062725 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaaatgttcctt 34062824  T
318 caagataggaatgaatttgaag 339  Q
    |||| | |||||||||||||||    
34062825 caagttgggaatgaatttgaag 34062846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Original strand, 36084367 - 36084687
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||| || |||| |||||||| || ||||||    
36084367 atcagaagcagaagctcatcagaagcaaggttttcatcagaagtgatatcatcaccagaagctacatttaatccgtaaattcaaactgaatatccaaagt 36084466  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaaca 218  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| || |||| ||||||||    
36084467 agctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagcactgagtatttgtccttcgttaaca 36084566  T
219 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcctt 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||    
36084567 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacatgacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcctt 36084665  T
318 caagataggaatgaatttgaag 339  Q
    |||||| |||||||||||||||    
36084666 caagatgggaatgaatttgaag 36084687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 35 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 21703468 - 21703162
Alignment:
35 catcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaattt-aaactgaagattcaaagtagctgtttctcgttt 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||| || || || ||||||||||||||||||||||||||||| ||     
21703468 catcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcaccaccagaagttacatttgatcagtaaaattcaaactgaagattcaaagtagctgtttctcattc 21703369  T
134 caacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaacagagttgacaaagtac 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||| |||| || |||| |||||||||||||||||||||||    
21703368 caacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcacttgaagaacactaagtatttgtccttcgttaacagagttgacaaagtac 21703269  T
234 aagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttccttcaagataggaatgaa 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||    
21703268 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 21703169  T
333 tttgaag 339  Q
    |||||||    
21703168 tttgaag 21703162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 19 - 347
Target Start/End: Original strand, 106025 - 106352
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaattt-aaactgaagattcaaag 117  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| | ||| || ||||| ||||||||||||||||     
106025 atcagaagcagaagagcatcagaagcaagattt-catcagaagctatatcatcaccagaagctacaagtgatcagtaaattttaaactgaagattcaaat 106123  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||| ||||| |    
106124 gagctgtttttcgtttcaacctcgtctaaga-gaatgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaaaagcactgggtacttgtccttcgttatc 106222  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcctt 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | | ||  ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||    
106223 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttttctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgtagaaatgttcctt 106322  T
318 caagataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||    
106323 caagatgggaatgaatttgaagttgatcct 106352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Original strand, 20797601 - 20797922
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |  ||| ||||||||||| ||||||    
20797601 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaagattttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacatttaatccatatattcaaactgaagatccaaagt 20797700  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaaca 218  Q
    || |||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| | || |||| ||||||||    
20797701 agttgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagcactgagcatttgtccttcgttaaca 20797800  T
219 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcctt 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||| |||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||    
20797801 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctgcaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcctt 20797900  T
318 caagataggaatgaatttgaag 339  Q
    |||||| |||||||||||||||    
20797901 caagatgggaatgaatttgaag 20797922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Original strand, 36228645 - 36228965
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| || |||| ||||||||||| ||||||    
36228645 atcagaagcagaagctcatcagaagcaaggttttcatcagaagcgatatcatcaccagaagctacatttaatccgtaaattcaaactgaagatccaaagt 36228744  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaaca 218  Q
    || |||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   | ||||||||| || |||| ||||||||    
36228745 agttgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgtaagggaggtatcaacggtcatttggataacactgagtatttgtccttcgttaaca 36228844  T
219 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcctt 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||| ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||    
36228845 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgccacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcctt 36228943  T
318 caagataggaatgaatttgaag 339  Q
    |||||| |||||||||||||||    
36228944 caagatgggaatgaatttgaag 36228965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 43044026 - 43043705
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  ||  ||| ||||||||||| ||||||    
43044026 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaggttttcatcagaagcgatatcatcaccagaagctacatttaattcgtatattcaaactgaagatccaaagt 43043927  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaaca 218  Q
    || |||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| | || |||| ||||||||    
43043926 agttgtttctcatttcaatcttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagcactgagcatttgtccttcgttaaca 43043827  T
219 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcctt 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||    
43043826 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgcttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcctt 43043727  T
318 caagataggaatgaatttgaag 339  Q
    |||||| |||||||||||||||    
43043726 caagatgggaatgaatttgaag 43043705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Original strand, 37406561 - 37406874
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||    
37406561 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcaacatcatcaccagaagctacaattgatcagtaaatttaaactgaagattcaaagt 37406660  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaaca 218  Q
    || |||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       | |||||||||||| |||| ||||| ||    
37406661 agttgtttaacatttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtca-------aacactgagtacttgtccttcgttatca 37406753  T
219 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttccttc 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||   | ||||  ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||    
37406754 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactatctccactactctatttttgtctacgctacaagacaagacaacagttatgcctgcagaattgttccttc 37406853  T
319 aagataggaatgaatttgaag 339  Q
    |||||  |||| |||||||||    
37406854 aagatgagaattaatttgaag 37406874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Original strand, 34771817 - 34772137
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  |  ||| ||||||||||| ||||||    
34771817 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaggttttcatcagaagcgatatcatcaccagaagctacatttaatccatatattcaaactgaagatccaaagt 34771916  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaaca 218  Q
    || |||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| | || |||| ||||||||    
34771917 agttgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagcactgagcatttgtccttcgttaaca 34772016  T
219 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcctt 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||| ||||||||||||||| ||||||| || |||||||| |||| ||||    
34772017 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccaccactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgtctgcagaatttgtgcctt 34772115  T
318 caagataggaatgaatttgaag 339  Q
    |||||| |||||||||||||||    
34772116 caagatgggaatgaatttgaag 34772137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Original strand, 34782762 - 34783082
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  |  ||| ||||||||||| ||||||    
34782762 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaggttttcatcagaagcgatatcatcaccagaagctacatttaatccatatattcaaactgaagatccaaagt 34782861  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaaca 218  Q
    || |||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| | || |||| ||||||||    
34782862 agttgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagcactgagcatttgtccttcgttaaca 34782961  T
219 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcctt 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||| ||||||||||||||| ||||||| || |||||||| |||| ||||    
34782962 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgtctgcagaatttgtgcctt 34783060  T
318 caagataggaatgaatttgaag 339  Q
    |||||| |||||||||||||||    
34783061 caagatgggaatgaatttgaag 34783082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Original strand, 20551721 - 20552041
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    ||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||| || |||| ||||| ||||| ||||||    
20551721 atcagaagcagaagctcatcagaagagaggttttcatcagaagcgatatcatcaccagaagctacattttatccgtaaattcaaactaaagatccaaagt 20551820  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaaca 218  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| || |||| ||||||||    
20551821 agctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagatttgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagcactgagtatttgtccttcgttaaca 20551920  T
219 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcaga-attgttcctt 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || | | ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||| ||||    
20551921 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactct-attttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagattttgtgcctt 20552019  T
318 caagataggaatgaatttgaag 339  Q
    |||||| |||||||||||||||    
20552020 caagatgggaatgaatttgaag 20552041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Original strand, 34051865 - 34052185
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaattt-aaactgaagattcaaag 117  Q
    ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || || || |||||||||||||||||    
34051865 atcagaagcagaaggtcat-agaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattgatccgtaaaattcaaactgaagattcaaag 34051963  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||||||  | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| |||| | |||||    
34051964 tagctgtttaacatttcaacctcgtctaagaagtacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggagaacactgagtacttgtccttcattaac 34052063  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcctt 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||   | ||||  ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||||||||    
34052064 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactagtctatttttgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaaatgttcctt 34052163  T
318 caagataggaatgaatttgaag 339  Q
    |||| | | |||||||||||||    
34052164 caagttggaaatgaatttgaag 34052185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 19 - 302
Target Start/End: Original strand, 20562246 - 20562528
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||| || |||| ||||||||||| ||||||    
20562246 atcagaagcagaagctcatcagaagcaaggttttcatcagaagcgatatcatcaccagaagctacattttatccgtaaattcaaactgaagatccaaagt 20562345  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaaca 218  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||| ||||||||    
20562346 agctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagcactgagtatttttccttcgttaaca 20562445  T
219 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcct 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | |||||  |||||||||||||| ||||||| |||||    
20562446 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccatgctacaagacaagacaacagctatgcct 20562528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Original strand, 42394886 - 42395205
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |  ||| ||||||||||| ||||||    
42394886 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacatttaatccatatattcaaactgaagatccaaagt 42394985  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaaca 218  Q
    ||||||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||| | || |||| ||||||||    
42394986 agctgtttctcatttcaatcttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagcgctgagcatttgtccttcgttaaca 42395085  T
219 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcctt 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||  | ||||| | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||    
42395086 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacta-tctg-ttttgtccacactacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcctt 42395183  T
318 caagataggaatgaatttgaag 339  Q
    |||||| | |||||||||||||    
42395184 caagatggaaatgaatttgaag 42395205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 19 - 347
Target Start/End: Original strand, 20416810 - 20417135
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||||||||| || ||| || |||||||||||||| |||||||     
20416810 atcagaagcagaagtccatcagaagcaagattt-catcagaagctatatcatcaccagaagctacagttgatcagtaaatttaaactgaagtttcaaagg 20416908  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaaca 218  Q
    |||||||| |||||  ||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || ||| |||| | || | |    
20416909 agctgtttttcgttctaatatcgtctaagaa-aacgaaaaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaaaagcactgggtgcttgtccttcattga-a 20417006  T
219 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttccttc 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
20417007 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaaatgttccttc 20417106  T
319 aagataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||    
20417107 aagagaggaatgaatttgaagttgatcct 20417135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 41 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 43622193 - 43621894
Alignment:
41 aagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttctcgtttcaacctc 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| || |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |       
43622193 aagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacattttatccgtaaattcaaactgaagatccaaagtagctgtttctcatttcagcact 43622094  T
141 gtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtca-tttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaacagagttgacaaagtacaagtgt 239  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
43622093 atctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcattttggatagcactgagtatttgtccttcgttaacagagttgacaaagtacaagtgt 43621994  T
240 acaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttccttcaagataggaatgaatttgaa 338  Q
    ||||||||||||||||| || |||  | ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||    
43621993 acaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaa 43621895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 1109500 - 1109180
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  |  ||| ||||||||||| ||||||    
1109500 atcagaagcagaaggtaatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaagtcatcaccagaagctacatttaatccatatattcaaactgaagatccaaagt 1109401  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaaca 218  Q
    ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||| ||||| | || |||| ||||||||    
1109400 agctgtttctcatttcaatctcatctaagaagaacgaagaattgaaaggaaggtatcaacggtcatttggacagcgctgagcatttgtccttcgttaaca 1109301  T
219 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcctt 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||| ||||||||||||||| ||||||| || |||||||| |||| ||||    
1109300 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgtctgcagaatttgtgcctt 1109202  T
318 caagataggaatgaatttgaag 339  Q
    |||  | |||||||||||||||    
1109201 caaagtgggaatgaatttgaag 1109180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Original strand, 8521747 - 8522067
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |  ||| ||||||||||| ||||||    
8521747 atcagaagcagaaggtaatcagaagcaaagttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacatttaatccatatattcaaactgaagatccaaagt 8521846  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaaca 218  Q
    ||||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||| ||||  | || |||| ||||| ||    
8521847 agctgtttctcatttcaatcttatctaagaagaacgaagaattgaaaggaaggtatcaacggtcatttggatagcgctgatcatttgtccttcgttatca 8521946  T
219 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcctt 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||    
8521947 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcctt 8522045  T
318 caagataggaatgaatttgaag 339  Q
    |||||| |||||||||||||||    
8522046 caagatgggaatgaatttgaag 8522067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 19 - 344
Target Start/End: Original strand, 20624672 - 20624995
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||   ||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| |||||||||     
20624672 atcagaagcagaagttcatcagaagcacaattt-catcagaagctatatcatcaccagaagctacaagtaatcagtaaatttaaactgacgattcaaagg 20624770  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaaca 218  Q
    ||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| |||||| |||| ||||| ||    
20624771 agcagtttttcgtttcaacctcatctaaga-gaatgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaaaggcactgggtacttgtccttcgttatca 20624869  T
219 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttccttc 318  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||  ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||    
20624870 gagttgataaagtacaagtgtacaaccactacctccaccactctgtttttgtctacgctacaagacaagaaaacagctatgcctgcagaaatgttccttc 20624969  T
319 aagataggaatgaatttgaagttgat 344  Q
    |||||  |||||||||||||||||||    
20624970 aagatgagaatgaatttgaagttgat 20624995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Original strand, 31418567 - 31418889
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| ||||| ||||| ||||||    
31418567 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacatttaatctgtatattcaaactaaagatccaaagt 31418666  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaaca 218  Q
    |||||||||||  |||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   |||| |||| | || |||| ||||||||    
31418667 agctgtttctcaattcaatattatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatatggatagcattgagcatttgtccttcgttaaca 31418766  T
219 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcct 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| || | |||    
31418767 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttttgtctgcgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaatttatgcct 31418866  T
317 tcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
    ||||||| |||||||||||||||    
31418867 tcaagatgggaatgaatttgaag 31418889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Original strand, 31448458 - 31448780
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  ||| ||||||||||| ||||||    
31448458 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacatttaatccgtatattcaaactgaagatccaaagt 31448557  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaaca 218  Q
    |||| ||| ||  ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||| | || ||||  |||||||    
31448558 agctatttatcaattcaatcttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatatggatagcactgagcatttgtccttggttaaca 31448657  T
219 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcct 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| |||| |||    
31448658 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttttgtctgcgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaatttgtgcct 31448757  T
317 tcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
    ||||||| |||||||||||||||    
31448758 tcaagatgggaatgaatttgaag 31448780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 1122258 - 1121938
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  |  ||| ||||||||||| ||||||    
1122258 atcagaagcagaaggtaatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaagtcatcaccagaagctacatttaatccatatattcaaactgaagatccaaagt 1122159  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaaca 218  Q
    ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||   ||| ||||| | || |||| ||||||||    
1122158 agctgtttctcatttcaatctcatctaagaagaacgaagaattgaaaggaatgtatcaacggtcatttggacagcgctgagcatttgtccttcgttaaca 1122059  T
219 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcctt 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||| ||||||||||||||| ||||||| || |||||||| |||| ||||    
1122058 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgtctgcagaatttgtgcctt 1121960  T
318 caagataggaatgaatttgaag 339  Q
    |||  | |||||||||||||||    
1121959 caaagtgggaatgaatttgaag 1121938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 19 - 296
Target Start/End: Original strand, 23392622 - 23392898
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| ||  || |||| ||||||||||| ||||||    
23392622 atcaaaagcagaaggtcatcagaagcaaggttttcatcagaagcgtaatcatcaccagaagtttcaattgattcgtaaattcaaactgaagatccaaagt 23392721  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaaca 218  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||   ||||||||||| || |||| ||||||||    
23392722 agctgtttctcatttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattaaaagggaggtatcaaaggtcatttggatagcactgagtatttgtccttcgttaaca 23392821  T
219 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagct 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||| ||||||||||||||| |||||||    
23392822 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagct 23392898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Original strand, 10754399 - 10754719
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggtttt-catcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||  |  ||| ||||||||||| |||||    
10754399 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatatattcaaactgaagatccaaag 10754498  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||||||||  |||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||| | || |||| |||||||    
10754499 tagctgtttcttatttcaaccttatcta-gaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctctgagcatttgtcctacgttaac 10754597  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaat-tgttcct 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||    
10754598 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgcct 10754696  T
317 tcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
    ||||||| |||||||||||||||    
10754697 tcaagatgggaatgaatttgaag 10754719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 30070260 - 30069940
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || |||  | |||  ||||||||||| ||||||    
30070260 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaggttttcatcagaagcgatatcttcaccagaagctacatttgatccattaatc-aaactgaagatccaaagt 30070162  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaaca 218  Q
    ||||| |||||  ||||  ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||| | || |||| |||| |||    
30070161 agctggttctcaattcagtcttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatatggatagcactgagcatttgtccttcgttgaca 30070062  T
219 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcctt 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||| ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||| ||||    
30070061 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaaaacaacagctatgcctgcagaatttgtgcctt 30069962  T
318 caagataggaatgaatttgaag 339  Q
    |||||| |||||||||||||||    
30069961 caagatgggaatgaatttgaag 30069940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 135 - 347
Target Start/End: Original strand, 20168088 - 20168298
Alignment:
135 aacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaacagagttgacaaagtaca 234  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||  ||||||||||  ||||| ||||||||  ||||||| || ||| |||| | || | |||||||||||||||||    
20168088 aacctcgtctaaga-gagcgaaggatcaaaagggaggtgccaacgttcatttgaaaagcactgggtgcttgtccttcattga-agagttgacaaagtaca 20168185  T
235 agtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttccttcaagataggaatgaatt 334  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
20168186 aatgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttccctcaagataggaatgaatt 20168285  T
335 tgaagttgatcct 347  Q
    |||||||||||||    
20168286 tgaagttgatcct 20168298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 218 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 13533967 - 13533838
Alignment:
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcctt 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
13533967 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactatctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcctt 13533868  T
318 caagataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
13533867 caagataggaatgaatttgaagttgatcct 13533838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 218 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 13523240 - 13523113
Alignment:
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcctt 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
13523240 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactatctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcctt 13523141  T
318 caagataggaatgaatttgaagttgatc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
13523140 caagataggaatgaatttgaagttgatc 13523113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 218 - 347
Target Start/End: Original strand, 36095755 - 36095884
Alignment:
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcctt 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
36095755 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcaaaattgttcctt 36095854  T
318 caagataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||    
36095855 caagataggaatgaatttgaagttaatcct 36095884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 218 - 347
Target Start/End: Original strand, 36097212 - 36097341
Alignment:
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcctt 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
36097212 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcaaaattgttcctt 36097311  T
318 caagataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||    
36097312 caagataggaatgaatttgaagttaatcct 36097341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 218 - 347
Target Start/End: Original strand, 35543231 - 35543360
Alignment:
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcctt 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
35543231 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctcgacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaatataacagctctgcctgcagaattgttcctt 35543330  T
318 caagataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||    
35543331 caagatatgaatgaatttgaagttgatcct 35543360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 19 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 32754300 - 32753972
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaa--actgaagattcaaa 116  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||  ||| ||||||||||   ||||||||||||||||||| || ||| |   |||| |  ||||||| ||||||    
32754300 atcagaagca-aagtccatcagaagcaacattt-catcagaagctgtatcatcaccagaagctacagttgatcagaatattttataactgaagtttcaaa 32754203  T
117 gtagctgtttct--cgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgtt 214  Q
    | |||||||| |  ||||| | |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||  | ||  |||| | ||    
32754202 ggagctgtttttttcgttttatcctcgtctgagaa-aacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaaaagcattggatgctcgtccttcatt 32754104  T
215 aacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttc 314  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||  ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||    
32754103 ga-agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaaacaacagctctgcctgcagaaatgttc 32754005  T
315 cttcaagataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
32754004 cttcaagataggaatgaatttgaagttaatcct 32753972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 27623122 - 27622800
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
27623122 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 27623024  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||||||||| |||| ||   ||||||     
27623023 tagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaat 27622924  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| |||| |     
27622923 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaagttgtacg 27622824  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
    |||||||| |||||||||||||||    
27622823 ttcaagatgggaatgaatttgaag 27622800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 22 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 5290928 - 5290609
Alignment:
22 agaagcagaagaccatcagaagcaa-ggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagtag 120  Q
    |||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  ||||||||||||||||||||    
5290928 agaagcagaaggtcatcagaagcaaaggttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaagtag 5290830  T
121 ctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaacaga 220  Q
    ||| |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||||||||| |||| ||   |||||| |||    
5290829 ctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaataga 5290730  T
221 gttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttccttc 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| |||| | |||    
5290729 gttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaagttgtacgttc 5290630  T
319 aagataggaatgaatttgaag 339  Q
    ||||| | |||||||||||||    
5290629 aagatggtaatgaatttgaag 5290609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 19 - 341
Target Start/End: Original strand, 9335861 - 9336184
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| || |||  | |||  |||||||||||||||||    
9335861 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 9335959  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| || ||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   |||||||||  ||| ||   ||||||     
9335960 tagctgattttcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaat 9336059  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcct 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||||||| |      
9336060 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaattgtacac 9336159  T
317 tcaagataggaatgaatttgaagtt 341  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
9336160 tcaagatgggaatgaatttgaagtt 9336184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 19 - 341
Target Start/End: Original strand, 9346448 - 9346771
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| || |||  | |||  |||||||||||||||||    
9346448 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 9346546  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| || ||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   |||||||||  ||| ||   ||||||     
9346547 tagctgattttcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaat 9346646  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcct 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||||||| |      
9346647 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttttgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaattgtacac 9346746  T
317 tcaagataggaatgaatttgaagtt 341  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
9346747 tcaagatgggaatgaatttgaagtt 9346771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 19 - 341
Target Start/End: Original strand, 24807818 - 24808141
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| || |||  | |||  ||||| |||||||||||    
24807818 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactcaagattcaaag 24807916  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   |||||||||  ||| ||   ||||||     
24807917 tagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaat 24808016  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcct 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||||||| |      
24808017 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaattgtacac 24808116  T
317 tcaagataggaatgaatttgaagtt 341  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
24808117 tcaagatgggaatgaatttgaagtt 24808141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 19 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 9377817 - 9377493
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| || |||  | |||  |||||||||||||||||    
9377817 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 9377719  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   |||||||||  ||| ||   ||||||     
9377718 tagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaat 9377619  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |     
9377618 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 9377519  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaagtt 341  Q
     ||||||| |||||||||||||||||    
9377518 ctcaagatgggaatgaatttgaagtt 9377493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 19 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 14558372 - 14558048
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| || |||  | |||  |||||||||||||||||    
14558372 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 14558274  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   |||||||||  ||| ||   ||||||     
14558273 tagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaat 14558174  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |     
14558173 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 14558074  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaagtt 341  Q
     ||||||| |||||||||||||||||    
14558073 ctcaagatgggaatgaatttgaagtt 14558048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 19 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 14569009 - 14568685
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| || |||  | |||  |||||||||||||||||    
14569009 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 14568911  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   |||||||||  ||| ||   ||||||     
14568910 tagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaat 14568811  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |     
14568810 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 14568711  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaagtt 341  Q
     ||||||| |||||||||||||||||    
14568710 ctcaagatgggaatgaatttgaagtt 14568685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 19 - 341
Target Start/End: Original strand, 23296182 - 23296506
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| || |||  | |||  |||||||||||||||||    
23296182 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 23296280  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   |||||||||  ||| ||   ||||||     
23296281 tagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaat 23296380  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |     
23296381 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 23296480  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaagtt 341  Q
     ||||||| |||||||||||||||||    
23296481 ctcaagatgggaatgaatttgaagtt 23296506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 19 - 341
Target Start/End: Original strand, 23306750 - 23307074
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| || |||  | |||  |||||||||||||||||    
23306750 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 23306848  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   |||||||||  ||| ||   ||||||     
23306849 tagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaat 23306948  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |     
23306949 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 23307048  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaagtt 341  Q
     ||||||| |||||||||||||||||    
23307049 ctcaagatgggaatgaatttgaagtt 23307074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 19 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 24817241 - 24816917
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| || |||  | |||  |||||||||||||||||    
24817241 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 24817143  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   |||||||||  ||| ||   ||||||     
24817142 tagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaat 24817043  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |     
24817042 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 24816943  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaagtt 341  Q
     ||||||| |||||||||||||||||    
24816942 ctcaagatgggaatgaatttgaagtt 24816917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 19 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 24827829 - 24827505
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| || |||  | |||  |||||||||||||||||    
24827829 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 24827731  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   |||||||||  ||| ||   ||||||     
24827730 tagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaat 24827631  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |     
24827630 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 24827531  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaagtt 341  Q
     ||||||| |||||||||||||||||    
24827530 ctcaagatgggaatgaatttgaagtt 24827505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 19 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 15694386 - 15694063
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| || |||  | |||  |||||||||||||||||    
15694386 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 15694288  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| || ||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   |||||||||  ||| ||   ||||||     
15694287 tagctgattttcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaat 15694188  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcct 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||||||| |      
15694187 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaattgtacac 15694088  T
317 tcaagataggaatgaatttgaagtt 341  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||    
15694087 tcaagatgggaaggaatttgaagtt 15694063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 19 - 341
Target Start/End: Original strand, 24566995 - 24567318
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| || |||  | |||  |||||||||||||||||    
24566995 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 24567093  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| || ||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   |||||||||  ||| ||   ||||||     
24567094 tagctgattttcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaat 24567193  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcct 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||||||| |      
24567194 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaattgtacac 24567293  T
317 tcaagataggaatgaatttgaagtt 341  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||    
24567294 tcaagatgggaaggaatttgaagtt 24567318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 19 - 341
Target Start/End: Original strand, 42042690 - 42043013
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| || |||  | |||  |||||||||||||||||    
42042690 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 42042788  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   |||||| ||  ||| ||   ||||||     
42042789 tagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactaagctcttgtctctcgttaat 42042888  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcct 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||||||| |      
42042889 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaattgtacac 42042988  T
317 tcaagataggaatgaatttgaagtt 341  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||    
42042989 tcaagatgggaaggaatttgaagtt 42043013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 19 - 341
Target Start/End: Original strand, 42053265 - 42053588
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| || |||  | |||  |||||||||||||||||    
42053265 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 42053363  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   |||||| ||  ||| ||   ||||||     
42053364 tagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactaagctcttgtctctcgttaat 42053463  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcct 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||||||| |      
42053464 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaattgtacac 42053563  T
317 tcaagataggaatgaatttgaagtt 341  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||    
42053564 tcaagatgggaaggaatttgaagtt 42053588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Original strand, 22146426 - 22146748
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
22146426 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 22146524  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||||||||| |||| ||   | ||||     
22146525 tagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcattaat 22146624  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |     
22146625 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 22146724  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
     ||||||| |||||||||||||||    
22146725 ctcaagatgggaatgaatttgaag 22146748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Original strand, 22157009 - 22157331
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
22157009 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 22157107  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||||||||| |||| ||   | ||||     
22157108 tagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcattaat 22157207  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |     
22157208 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 22157307  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
     ||||||| |||||||||||||||    
22157308 ctcaagatgggaatgaatttgaag 22157331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 27603773 - 27603451
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
27603773 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccataagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 27603675  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| |||||  ||||  ||  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||||||||| |||| ||   ||||||     
27603674 tagctgattctcaattcagtcttattcaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaat 27603575  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| |||| |     
27603574 agagttgacaaagtacaagtatacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaagttgtacg 27603475  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
    |||||||| |||||||||||||||    
27603474 ttcaagatgggaatgaatttgaag 27603451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Original strand, 39352393 - 39352715
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||  ||||| ||||||||| | ||| |||||||||||||   || |||  | |||  |||||||||||||||||    
39352393 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagtttttatcagaagcaatatcttcaccagaagctatgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 39352491  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||||||||| |||| ||   ||||||     
39352492 tagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaat 39352591  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |     
39352592 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacg 39352691  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
    |||||||| |||||||||||||||    
39352692 ttcaagatgggaatgaatttgaag 39352715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 19 - 341
Target Start/End: Original strand, 6975713 - 6976037
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| || |||  | |||  |||||||||||||||||    
6975713 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 6975811  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| |||||  ||||  ||  || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || ||   |||||||||  ||| ||   ||||||     
6975812 tagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacaaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaat 6975911  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |     
6975912 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 6976011  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaagtt 341  Q
     ||||||| |||||||||||||||||    
6976012 ctcaagatgggaatgaatttgaagtt 6976037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 218 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 13405167 - 13405038
Alignment:
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcctt 317  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
13405167 agagttgacaaagtacaattgtacaaccactacctccacgactctgattgtgtctacgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaaatgttcctt 13405068  T
318 caagataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
    ||||| ||||||| ||||||| ||||||||    
13405067 caagaaaggaatggatttgaacttgatcct 13405038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 52 - 339
Target Start/End: Original strand, 22559376 - 22559664
Alignment:
52 tcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaaga 151  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||| |||||||||| |||||  ||||  ||  || |||||||    
22559376 tcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagatttaaagtagctgattctcaattcagtcttatccaagaaga 22559474  T
152 acgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacc 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||||||||| |||| ||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
22559475 acgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggttagcactgagcacttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacc 22559574  T
252 tccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttccttcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
    ||||| || |||   | ||||  ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||    
22559575 tccactactctgttttctgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaatttgtaccttcaagatgggaatgaatttgaag 22559664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 19 - 310
Target Start/End: Original strand, 39362219 - 39362511
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
39362219 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcccttaatc-aaactgaagattcaaag 39362317  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||||||||| |||| ||   ||||||     
39362318 tagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaat 39362417  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaatt 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  |||||||||||||    
39362418 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatt 39362511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 19 - 341
Target Start/End: Original strand, 23707348 - 23707671
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||  ||||||||||||| | | ||| ||||||||||||||| || |||  | |||  |||||||||||||||||    
23707348 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaatcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 23707446  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| || ||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   |||||||||  ||| ||   ||||||     
23707447 tagctgattttcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaat 23707546  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcct 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||||||| |      
23707547 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaattgtacac 23707646  T
317 tcaagataggaatgaatttgaagtt 341  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||    
23707647 tcaagatgggaaggaatttgaagtt 23707671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 7032483 - 7032159
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  ||| |||||||||||||    
7032483 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaattgaagattcaaag 7032385  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||   ||||||||| |||| ||   ||||||     
7032384 tagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgagagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaat 7032285  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg---agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgtt 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||     | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| ||||     
7032284 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgta 7032185  T
314 ccttcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
    | |||||||| |||||||||||||||    
7032184 cgttcaagatgggaatgaatttgaag 7032159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 16004246 - 16003924
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
16004246 atcagaagcagaaggtcttcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 16004148  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   |||||| || |||| ||   ||||||     
16004147 tagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactaagcacttgtctctcgttaat 16004048  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |     
16004047 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 16003948  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
     ||||||| |||||||||||||||    
16003947 ctcaagatgggaatgaatttgaag 16003924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 35 - 339
Target Start/End: Original strand, 27203714 - 27204020
Alignment:
35 catcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttctcgttt 133  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  ||||||||||||||||||||||| |||||  ||    
27203714 catcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaagtagctgattctcaatt 27203812  T
134 caacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaacagagttgacaaagtac 233  Q
    ||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||||||||| |||| ||   |||||| ||||||||||||||||    
27203813 cagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaatagagttgacaaagtac 27203912  T
234 aagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttccttcaagataggaatga 331  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |  ||||||| |||||||    
27203913 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatga 27204012  T
332 atttgaag 339  Q
    ||||||||    
27204013 atttgaag 27204020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Original strand, 31843864 - 31844186
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
31843864 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagaaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 31843962  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| |||||  ||||  |   || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||||||||| |||| ||   ||||||     
31843963 tagctgattctcaattcagtcctatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaat 31844062  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |     
31844063 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 31844162  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
     ||||||| |||||||||||||||    
31844163 ctcaagatgggaatgaatttgaag 31844186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 19 - 153
Target Start/End: Original strand, 21519965 - 21520099
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| |||||||||||    
21519965 atcagaagcagatggtcatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattgatccgtaaatttaaactggagattcaaagt 21520064  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaac 153  Q
    ||||||||  | ||||||||| |||||||||||||    
21520065 agctgtttaacatttcaaccttgtctaagaagaac 21520099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 19 - 341
Target Start/End: Original strand, 6986203 - 6986527
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| || |||  | |||  |||||||||||| ||||    
6986203 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagatttaaag 6986301  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| |||||  ||||  ||  || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || ||   |||||||||  ||| ||   ||||||     
6986302 tagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacaaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaat 6986401  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |     
6986402 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 6986501  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaagtt 341  Q
     ||||||| |||||||||||||||||    
6986502 ctcaagatgggaatgaatttgaagtt 6986527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 19 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 30227852 - 30227529
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||  ||||||||||||| | | ||| ||||||||||||||| || |||  | |||  |||||||||||||||||    
30227852 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaatcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 30227754  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| || ||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   |||||| ||  ||| ||   ||||||     
30227753 tagctgattttcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactaagctcttgtctctcgttaat 30227654  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcct 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||||||| |      
30227653 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaattgtacac 30227554  T
317 tcaagataggaatgaatttgaagtt 341  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||    
30227553 tcaagatgggaaggaatttgaagtt 30227529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 19 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 30238379 - 30238056
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||  ||||||||||||| | | ||| ||||||||||||||| || |||  | |||  |||||||||||||||||    
30238379 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaatcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 30238281  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| || ||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   |||||| ||  ||| ||   ||||||     
30238280 tagctgattttcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactaagctcttgtctctcgttaat 30238181  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcct 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||||||| |      
30238180 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaattgtacac 30238081  T
317 tcaagataggaatgaatttgaagtt 341  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||    
30238080 tcaagatgggaaggaatttgaagtt 30238056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Original strand, 6130694 - 6131016
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||   || |||  | |||  ||||| |||||||||||    
6130694 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctatgtttgatcctttaatc-aaactaaagattcaaag 6130792  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||||||||| |||| ||   | ||||     
6130793 tagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcattaat 6130892  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |     
6130893 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 6130992  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
     ||||||| |||||||||||||||    
6130993 ctcaagatgggaatgaatttgaag 6131016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Original strand, 23362015 - 23362337
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| || |||  | |||  |||||||||||||||||    
23362015 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 23362113  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| |||||  ||||  ||  || | |||||||||||||||||||||||||||||||||   |  ||   ||||||||| |||| ||   | ||||     
23362114 tagctgattctcaattcagtcttatcaacgaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgaataaatggatagcactgagcacttgtctctcattaat 23362213  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| ||||||     
23362214 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgttca 23362313  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
     ||||||| |||||||||||||||    
23362314 ctcaagatgggaatgaatttgaag 23362337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 36582913 - 36582591
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| || |||  | |||  |||||||||||||||||    
36582913 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 36582815  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| |||||  ||||  ||  || | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||   ||||||||  |||| ||   | ||||     
36582814 tagctgattctcaattcagtcttatcaacgaagaacgaagaattgaaagggatgtatcaacggatatatggatagcactgaccacttgtctctcattaat 36582715  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| ||||||     
36582714 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgttca 36582615  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
     ||||||| |||||||||||||||    
36582614 ctcaagatgggaatgaatttgaag 36582591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 36593468 - 36593146
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| || |||  | |||  |||||||||||||||||    
36593468 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 36593370  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| |||||  ||||  ||  || | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||   ||||||||  |||| ||   | ||||     
36593369 tagctgattctcaattcagtcttatcaacgaagaacgaagaattgaaagggatgtatcaacggatatatggatagcactgaccacttgtctctcattaat 36593270  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| ||||||     
36593269 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgttca 36593170  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
     ||||||| |||||||||||||||    
36593169 ctcaagatgggaatgaatttgaag 36593146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Original strand, 40400924 - 40401246
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||   || |||  | |||  |||||||||||||||||    
40400924 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcgtcaccagaagctatgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 40401022  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||||||||| |||| ||   ||| ||     
40401023 tagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgtaaat 40401122  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | |||||   ||||||||||| |||| |     
40401123 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagtcatgcctgcagaatttgtacg 40401222  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
    |||||||| |||||||||||||||    
40401223 ttcaagatgggaatgaatttgaag 40401246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 19 - 341
Target Start/End: Original strand, 14029949 - 14030273
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
14029949 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacttttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 14030047  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    | |||| |||||  ||||  ||  || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || ||   |||||||||  ||| ||   ||||||     
14030048 ttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacaaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaat 14030147  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |     
14030148 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 14030247  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaagtt 341  Q
     ||||||| |||||||||||||||||    
14030248 ctcaagatgggaatgaatttgaagtt 14030273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 19 - 341
Target Start/End: Original strand, 14040502 - 14040826
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
14040502 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacttttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 14040600  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    | |||| |||||  ||||  ||  || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || ||   |||||||||  ||| ||   ||||||     
14040601 ttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacaaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaat 14040700  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |     
14040701 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 14040800  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaagtt 341  Q
     ||||||| |||||||||||||||||    
14040801 ctcaagatgggaatgaatttgaagtt 14040826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 35 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 14447339 - 14447024
Alignment:
35 catcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttctcgttt 133  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| || |||  || | | |||||||||||||||||| |||| |||||  ||    
14447339 catcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcc-tgtaatcaaactgaagattcaaagttgctgattctcaatt 14447241  T
134 caacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaacagagttgacaaagtac 233  Q
    ||  ||  || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||   ||||||||| |||| ||   | |||| ||||||||||||||||    
14447240 cagtcttatcaaagaagaacgatgaattgaaagggaggtatcaacggacatatggaaagcactgagcacttgtctctctttaatagagttgacaaagtac 14447141  T
234 aagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcc--ttcaagataggaatg 330  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  |||||||||||||  | |   ||||||| ||||||    
14447140 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatg 14447041  T
331 aatttgaagttgatcct 347  Q
    ||||||||||| |||||    
14447040 aatttgaagtttatcct 14447024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 35 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 14457951 - 14457636
Alignment:
35 catcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttctcgttt 133  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| || |||  || | | |||||||||||||||||| |||| |||||  ||    
14457951 catcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcc-tgtaatcaaactgaagattcaaagttgctgattctcaatt 14457853  T
134 caacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaacagagttgacaaagtac 233  Q
    ||  ||  || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||   ||||||||| |||| ||   | |||| ||||||||||||||||    
14457852 cagtcttatcaaagaagaacgatgaattgaaagggaggtatcaacggacatatggaaagcactgagcacttgtctctctttaatagagttgacaaagtac 14457753  T
234 aagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcc--ttcaagataggaatg 330  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  |||||||||||||  | |   ||||||| ||||||    
14457752 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatg 14457653  T
331 aatttgaagttgatcct 347  Q
    ||||||||||| |||||    
14457652 aatttgaagtttatcct 14457636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 19 - 347
Target Start/End: Original strand, 15739872 - 15740203
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||| || |||  | |||  |||||||||||||||||    
15739872 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 15739970  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    | |||| |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||||||||| |||| ||   | ||||     
15739971 ttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcattaat 15740070  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcc- 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  |||||||||||||  | |     
15740071 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 15740170  T
316 -ttcaagataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
      ||||||| ||||||||||||||||| |||||    
15740171 actcaagatgggaatgaatttgaagtttatcct 15740203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 19 - 347
Target Start/End: Original strand, 15769032 - 15769363
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||| || |||  | |||  |||||||||||||||||    
15769032 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 15769130  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    | |||| |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||||||||| |||| ||   | ||||     
15769131 ttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcattaat 15769230  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcc- 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  |||||||||||||  | |     
15769231 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 15769330  T
316 -ttcaagataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
      ||||||| ||||||||||||||||| |||||    
15769331 actcaagatgggaatgaatttgaagtttatcct 15769363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 19 - 341
Target Start/End: Original strand, 27460066 - 27460390
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
27460066 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacttttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 27460164  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    | |||| |||||  ||||  ||  || ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||  || ||   |||||||||  ||| ||   ||||||     
27460165 ttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacaaagaattgaaagagaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaat 27460264  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |     
27460265 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 27460364  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaagtt 341  Q
     ||||||| |||||||||||||||||    
27460365 ctcaagatgggaatgaatttgaagtt 27460390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 19 - 341
Target Start/End: Original strand, 27470465 - 27470789
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
27470465 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacttttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 27470563  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    | |||| |||||  ||||  ||  || ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||  || ||   |||||||||  ||| ||   ||||||     
27470564 ttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacaaagaattgaaagagaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaat 27470663  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |     
27470664 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 27470763  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaagtt 341  Q
     ||||||| |||||||||||||||||    
27470764 ctcaagatgggaatgaatttgaagtt 27470789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 218 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 40228710 - 40228581
Alignment:
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcctt 317  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
40228710 agagctgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccatgactctgcttgtgtctacgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaaatgttcctt 40228611  T
318 caagataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
    ||||||||||||| |||||||  |||||||    
40228610 caagataggaatggatttgaacgtgatcct 40228581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 15993684 - 15993362
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
15993684 atcagaagcagaaggtcttcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 15993586  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    || ||| || ||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||||||||| |||| ||   ||||||     
15993585 taactgattttcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaat 15993486  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |     
15993485 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactaatctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 15993386  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
     ||||||| |||||||||||||||    
15993385 ctcaagatgggaatgaatttgaag 15993362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Original strand, 40390262 - 40390584
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
40390262 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcgtcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 40390360  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| |||||  || |  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   |||||| || | || ||   ||| ||     
40390361 tagctgattctcaatttagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactaagcaattgtctctcgtaaat 40390460  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |     
40390461 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacg 40390560  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
    |||||||| |||||||||||||||    
40390561 ttcaagatgggaatgaatttgaag 40390584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 218 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 1915469 - 1915339
Alignment:
218 agagttgacaaagtacaa-gtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcct 316  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
1915469 agagttgacaaagtacaaagtgtacaaccactacctccacgactctgcttgtgtctacgctacaagacaagataacaactctgcctgcagaaatgttcct 1915370  T
317 tcaagataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
    |||||||||||||| |||||||  |||||||    
1915369 tcaagataggaatggatttgaacgtgatcct 1915339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 19 - 341
Target Start/End: Original strand, 22676021 - 22676345
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
22676021 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacttttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 22676119  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    | |||| |||||  ||||  ||  || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||||||||   ||| ||   ||||||     
22676120 ttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacaaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgaactcttgtctctcgttaat 22676219  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |     
22676220 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 22676319  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaagtt 341  Q
     ||||||| |||||||||||||||||    
22676320 ctcaagatgggaatgaatttgaagtt 22676345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 19 - 341
Target Start/End: Original strand, 22685912 - 22686236
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
22685912 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacttttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 22686010  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    | |||| |||||  ||||  ||  || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||||||||   ||| ||   ||||||     
22686011 ttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacaaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgaactcttgtctctcgttaat 22686110  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |     
22686111 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 22686210  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaagtt 341  Q
     ||||||| |||||||||||||||||    
22686211 ctcaagatgggaatgaatttgaagtt 22686236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 19 - 347
Target Start/End: Original strand, 35225994 - 35226325
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||| || |||  | |||  |||||||||||||||||    
35225994 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 35226092  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    | |||| |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || ||   ||||||||| |||| ||   | ||||     
35226093 ttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaactgaaagggaggtatcaacggatatatggaaagcactgagcacttgtctctcattaat 35226192  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcc- 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  |||||||||||||  | |     
35226193 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 35226292  T
316 -ttcaagataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
      ||||||| ||||||||||||||||| |||||    
35226293 actcaagatgggaatgaatttgaagtttatcct 35226325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 35 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 5301491 - 5301270
Alignment:
35 catcagaagcaa-ggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttctcgttt 133  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  ||||||||||||||||||||||| |||||  ||    
5301491 catcagaagcaaaggttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaagtagctgattctcaatt 5301393  T
134 caacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtactt-ttcctgcgttaacagagttgacaaagta 232  Q
    ||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||||||||| |||| || || |||||| |||| ||||||||||    
5301392 cagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtttct-cgttaatagagctgacaaagta 5301294  T
233 caagtgtacaaccactacctccac 256  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
5301293 caagtgtacaaccactacctccac 5301270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 218 - 347
Target Start/End: Original strand, 20215201 - 20215332
Alignment:
218 agagttgacaaagtacaa-gtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataa-cagctctgcctgcagaattgttcc 315  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
20215201 agagttgacaaagtacaaagtgtacaaccactacctccacgactctgcttgtgtctacgctacaagacaagataaacagctctgcctgcagaaatgttcc 20215300  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
    ||||||||||||||| |||||||  |||||||    
20215301 ttcaagataggaatggatttgaacgtgatcct 20215332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 19 - 256
Target Start/End: Original strand, 31815068 - 31815305
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
31815068 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagaaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 31815166  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    ||| || |||||  ||||  |   || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||||||||| |||| ||   ||||||     
31815167 tagttgattctcaattcagtcctatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaat 31815266  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccac 256  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
31815267 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccac 31815305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 19 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 27042567 - 27042243
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||| || |||  | | |  |||||||||||||||||    
27042567 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagctacatttgatcctttagtc-aaactgaagattcaaag 27042469  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    | |||| |||||  ||||  ||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||||||||| |||| ||   | ||||     
27042468 ttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaatgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcattaat 27042369  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |     
27042368 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactaccaccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 27042269  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaagtt 341  Q
     ||||||| |||||||||||||||||    
27042268 ctcaagatgggaatgaatttgaagtt 27042243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 19 - 347
Target Start/End: Original strand, 35215410 - 35215741
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||| || |||  | |||  | |||||||||||||||    
35215410 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-atactgaagattcaaag 35215508  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    | |||| |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || ||   ||||||||| |||| ||   | ||||     
35215509 ttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaactgaaagggaggtatcaacggatatatggaaagcactgagcacttgtctctcattaat 35215608  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcc- 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  |||||||||||||  | |     
35215609 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 35215708  T
316 -ttcaagataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
      ||||||| ||||||||||||||||| |||||    
35215709 actcaagatgggaatgaatttgaagtttatcct 35215741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 52 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 39491271 - 39490981
Alignment:
52 tcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaaga 151  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||| |||| |||||  ||||  ||  || |||||||    
39491271 tcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacttttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaaga 39491173  T
152 acgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacc 251  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||  || ||   |||||||||  ||| ||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
39491172 acaaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacc 39491073  T
252 tccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttccttcaagataggaatgaatttgaagtt 341  Q
    ||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |  ||||||| |||||||||||||||||    
39491072 tccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtt 39490981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 52 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 39502461 - 39502171
Alignment:
52 tcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaaga 151  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||| |||| |||||  ||||  ||  || |||||||    
39502461 tcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacttttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaagttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaaga 39502363  T
152 acgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacc 251  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||  || ||   |||||||||  ||| ||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
39502362 acaaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacc 39502263  T
252 tccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttccttcaagataggaatgaatttgaagtt 341  Q
    ||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |  ||||||| |||||||||||||||||    
39502262 tccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtt 39502171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 218 - 347
Target Start/End: Original strand, 40032855 - 40032981
Alignment:
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcctt 317  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
40032855 agagttgacaaagta---gtgtacaaccactacctccacgactctgcttgtgtctacgctacaagacaagataacagctctgcttgcagaaatgttcctt 40032951  T
318 caagataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
    ||||||||||||| |||||||  |||||||    
40032952 caagataggaatggatttgaacgtgatcct 40032981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 35 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 40514329 - 40514020
Alignment:
35 catcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttctcgttt 133  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||| |||| |||||  ||    
40514329 catcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacttttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaagttgctgattctcaatt 40514231  T
134 caacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaacagagttgacaaagtac 233  Q
    ||  ||  || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || ||   | ||||||| |||| ||   | |||| ||||||||||||||||    
40514230 cagtcttatcaaagaagaacgaagaactgaaagggaggtatcaacggatatatggataacactgagcacttgtctctcattaatagagttgacaaagtac 40514131  T
234 aagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcc--ttcaagataggaatg 330  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  |||||||||||||  | |   ||||||| ||||||    
40514130 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatg 40514031  T
331 aatttgaagtt 341  Q
    |||||||||||    
40514030 aatttgaagtt 40514020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 19 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 27053192 - 27052867
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||| || |||  | | |  |||||||||||||||||    
27053192 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagctacatttgatcctttagtc-aaactgaagattcaaag 27053094  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    | |||| |||||  ||||  ||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||||||||| |||| ||   | ||||     
27053093 ttgctgattctcaattcattcttatcaaagaagaatgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcattaat 27052994  T
218 agagttgacaaagtacaagtg-tacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttc 314  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |    
27052993 agagttgacaaagtacaagtgttacaaccactaccaccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtac 27052894  T
315 cttcaagataggaatgaatttgaagtt 341  Q
      ||||||| |||||||||||||||||    
27052893 actcaagatgggaatgaatttgaagtt 27052867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #105
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 19 - 256
Target Start/End: Original strand, 23372416 - 23372654
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| || |||  | |||  |||||||||||||||||    
23372416 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 23372514  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| |||||  ||||  ||  || | |||||||||||||||||||||||||||||||||   |  ||   ||||||||| |||| ||   | ||||     
23372515 tagctgattctcaattcagtcttatcaacgaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgaataaatggatagcactgagcacttgtctctcattaat 23372614  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaa-ccactacctccac 256  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
23372615 agagttgacaaagtacaagtgtacaacccactacctccac 23372654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #106
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 35 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 33952140 - 33951831
Alignment:
35 catcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttctcgttt 133  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||| || |||  | |||  |||||||||||||||||| |||| |||||  ||    
33952140 catcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaagttgctgattctcaatt 33952042  T
134 caacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaacagagttgacaaagtac 233  Q
    ||  ||  || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || ||   | ||||||| |||| ||   | |||| ||||||||||||||||    
33952041 cagtcttatcaaagaagaacgaagaactgaaagggaggtatcaacggatatatggataacactgagcacttgtctctcattaatagagttgacaaagtac 33951942  T
234 aagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcc--ttcaagataggaatg 330  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  |||| ||||||||  | |   ||||||| ||||||    
33951941 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcccgcagaatttgtacaactcaagatgggaatg 33951842  T
331 aatttgaagtt 341  Q
    |||||||||||    
33951841 aatttgaagtt 33951831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #107
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 19 - 347
Target Start/End: Original strand, 17718823 - 17719154
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||  ||||||||||||| | || |||  | | |  |||||||||||||||||    
17718823 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagctaaatttgatcctttagtc-aaactgaagattcaaag 17718921  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    | |||| |||||  ||||  ||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||||||  | |||| ||   | ||||     
17718922 ttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaatgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggaaagcactctgcacttgtctctcattaat 17719021  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcc- 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  |||||||||||||  | |     
17719022 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 17719121  T
316 -ttcaagataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
      ||||||| ||||||||||||||||| |||||    
17719122 actcaagatgggaatgaatttgaagtttatcct 17719154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #108
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 19 - 347
Target Start/End: Original strand, 17729475 - 17729806
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||  ||||||||||||| | || |||  | | |  |||||||||||||||||    
17729475 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagctaaatttgatcctttagtc-aaactgaagattcaaag 17729573  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    | |||| |||||  ||||  ||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||||||  | |||| ||   | ||||     
17729574 ttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaatgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggaaagcactctgcacttgtctctcattaat 17729673  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcc- 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  |||||||||||||  | |     
17729674 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 17729773  T
316 -ttcaagataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
      ||||||| ||||||||||||||||| |||||    
17729774 actcaagatgggaatgaatttgaagtttatcct 17729806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #109
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 145 - 347
Target Start/End: Original strand, 17607092 - 17607296
Alignment:
145 aagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaac 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||||||  | |||| ||   | |||| |||||||||||||||||||||||||||    
17607092 aagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggaaagcactctgcacttgtctctcattaatagagttgacaaagtacaagtgtacaac 17607191  T
245 cactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttccttcaagataggaatgaatttgaagttg 342  Q
    |||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |  ||||||| |||||||||||||||||     
17607192 cactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagttt 17607291  T
343 atcct 347  Q
    |||||    
17607292 atcct 17607296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #110
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 145 - 347
Target Start/End: Original strand, 17617706 - 17617910
Alignment:
145 aagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaac 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||||||  | |||| ||   | |||| |||||||||||||||||||||||||||    
17617706 aagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggaaagcactctgcacttgtctctcattaatagagttgacaaagtacaagtgtacaac 17617805  T
245 cactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttccttcaagataggaatgaatttgaagttg 342  Q
    |||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |  ||||||| |||||||||||||||||     
17617806 cactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagttt 17617905  T
343 atcct 347  Q
    |||||    
17617906 atcct 17617910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #111
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 145 - 347
Target Start/End: Original strand, 31348566 - 31348770
Alignment:
145 aagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaac 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||||||  | |||| ||   | |||| |||||||||||||||||||||||||||    
31348566 aagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggaaagcactctgcacttgtctctcattaatagagttgacaaagtacaagtgtacaac 31348665  T
245 cactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttccttcaagataggaatgaatttgaagttg 342  Q
    |||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |  ||||||| |||||||||||||||||     
31348666 cactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagttt 31348765  T
343 atcct 347  Q
    |||||    
31348766 atcct 31348770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #112
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 145 - 347
Target Start/End: Original strand, 31359180 - 31359384
Alignment:
145 aagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaac 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||||||  | |||| ||   | |||| |||||||||||||||||||||||||||    
31359180 aagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggaaagcactctgcacttgtctctcattaatagagttgacaaagtacaagtgtacaac 31359279  T
245 cactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttccttcaagataggaatgaatttgaagttg 342  Q
    |||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |  ||||||| |||||||||||||||||     
31359280 cactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagttt 31359379  T
343 atcct 347  Q
    |||||    
31359380 atcct 31359384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #113
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 145 - 347
Target Start/End: Original strand, 36687727 - 36687931
Alignment:
145 aagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaac 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||||||  | |||| ||   | |||| |||||||||||||||||||||||||||    
36687727 aagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggaaagcactctgcacttgtctctcattaatagagttgacaaagtacaagtgtacaac 36687826  T
245 cactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttccttcaagataggaatgaatttgaagttg 342  Q
    |||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |  ||||||| |||||||||||||||||     
36687827 cactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagttt 36687926  T
343 atcct 347  Q
    |||||    
36687927 atcct 36687931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #114
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 145 - 347
Target Start/End: Original strand, 36698293 - 36698497
Alignment:
145 aagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaac 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||||||  | |||| ||   | |||| |||||||||||||||||||||||||||    
36698293 aagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggaaagcactctgcacttgtctctcattaatagagttgacaaagtacaagtgtacaac 36698392  T
245 cactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttccttcaagataggaatgaatttgaagttg 342  Q
    |||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |  ||||||| |||||||||||||||||     
36698393 cactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagttt 36698492  T
343 atcct 347  Q
    |||||    
36698493 atcct 36698497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #115
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 218 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 23478421 - 23478290
Alignment:
218 agagttgacaaagtacaa-gtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataa-cagctctgcctgcagaattgttcc 315  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||  | ||||  ||||||||||||||| || ||||| |||||| |||| ||||||    
23478421 agagttgacaaagtacaaagtgtacaaccactacttccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagaaaaacagctatgcctgtagaaatgttcc 23478322  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
    ||||||||||||||| |||||||  |||||||    
23478321 ttcaagataggaatggatttgaatgtgatcct 23478290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #116
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 145 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 37729481 - 37729282
Alignment:
145 aagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaac 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||||||  | |||| ||   | |||| |||||||||||||||||||||||||||    
37729481 aagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggaaagcactttgcacttgtctctcattaatagagttgacaaagtacaagtgtacaac 37729382  T
245 cactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcc--ttcaagataggaatgaatttgaagtt 341  Q
    |||||||||||| |  |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  |||||||||||||  | |   ||||||| |||||||||||||||||    
37729381 cactacctccactattctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatgaatttgaagtt 37729282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #117
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 145 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 37740797 - 37740598
Alignment:
145 aagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaac 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||||||  | |||| ||   | |||| |||||||||||||||||||||||||||    
37740797 aagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggaaagcactttgcacttgtctctcattaatagagttgacaaagtacaagtgtacaac 37740698  T
245 cactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcc--ttcaagataggaatgaatttgaagtt 341  Q
    |||||||||||| |  |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  |||||||||||||  | |   ||||||| |||||||||||||||||    
37740697 cactacctccactattctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatgaatttgaagtt 37740598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #118
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 221 - 347
Target Start/End: Original strand, 25111966 - 25112094
Alignment:
221 gttgacaaagtac-aagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataa-cagctctgcctgcagaattgttccttc 318  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||   | ||||  ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||    
25111966 gttgacaaagtacgaagtgtacgaccactacctccactactctatttatgtctacgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcagaaatgttccttc 25112065  T
319 aagataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
    |  ||||||||| |||||||  |||||||    
25112066 ataataggaatggatttgaatgtgatcct 25112094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #119
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 221 - 347
Target Start/End: Original strand, 25171057 - 25171185
Alignment:
221 gttgacaaagtac-aagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataa-cagctctgcctgcagaattgttccttc 318  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||   | ||||  ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||    
25171057 gttgacaaagtacgaagtgtacgaccactacctccactactctatttatgtctacgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcagaaatgttccttc 25171156  T
319 aagataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
    |  ||||||||| |||||||  |||||||    
25171157 ataataggaatggatttgaatgtgatcct 25171185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #120
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 234 - 338
Target Start/End: Original strand, 11208087 - 11208192
Alignment:
234 aagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataa-cagctctgcctgcagaattgttccttcaagataggaatgaa 332  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || |||  | ||||  ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| |    
11208087 aagtgtataaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcagaaatgttccttcaaaataagaatgga 11208186  T
333 tttgaa 338  Q
    ||||||    
11208187 tttgaa 11208192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #121
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 234 - 347
Target Start/End: Original strand, 89524 - 89638
Alignment:
234 aagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaaga-taacagctctgcctgcagaattgttccttcaagataggaatgaa 332  Q
    |||||||||||||||| |||||| || | |  ||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||   | ||||||||    
89524 aagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgctacaagacaagaataacagctctgcctgcatcaatgttccttcatacttggaatgaa 89623  T
333 tttgaagttgatcct 347  Q
    |||||| ||||||||    
89624 tttgaaattgatcct 89638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #122
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 234 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 32160801 - 32160687
Alignment:
234 aagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataa-cagctctgcctgcagaattgttccttcaagataggaatgaa 332  Q
    |||||||| |||||||||||||| || |||  | ||||  |||||||||| |||| || ||||||||||||||||| |||||| | |  ||||||||| |    
32160801 aagtgtacgaccactacctccactactctgtttatgtctacgctacaagataagaaaaacagctctgcctgcagaaatgttcccttagaataggaatgga 32160702  T
333 tttgaagttgatcct 347  Q
    |||||| ||||||||    
32160701 tttgaacttgatcct 32160687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #123
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 234 - 305
Target Start/End: Original strand, 35986334 - 35986406
Alignment:
234 aagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaa-gataacagctctgcctgca 305  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||   |||||||||||| |||||||||||||||||||    
35986334 aagtgtacaaccactacttccactactctgagtttgtctctgctacaagacaaggataacagctctgcctgca 35986406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #124
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 234 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 26784389 - 26784275
Alignment:
234 aagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaaga-taacagctctgcctgcagaattgttccttcaagataggaatgaa 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | |  |||||    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||| || | | |||||| |    
26784389 aagtgtacaaccactacctccactactcagtttgtgtgtctgctacaagacaagaataacaactctgcctgcaaaaatgttcctacatgctgggaatgga 26784290  T
333 tttgaagttgatcct 347  Q
    |||||| ||||||||    
26784289 tttgaaattgatcct 26784275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #125
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 234 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 21660247 - 21660175
Alignment:
234 aagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaa-gataacagctctgcctgca 305  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||   |||||||||||| ||||||| |||||||||||    
21660247 aagtgtacaaccactacttccactactctgagtttgtctctgctacaagacaaggataacaactctgcctgca 21660175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #126
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 300 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 23488483 - 23488436
Alignment:
300 cctgcagaattgttccttcaagataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||    
23488483 cctgcagaaatgttccttcaagataggaatggatttgaacatgatcct 23488436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #127
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 234 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 4887057 - 4886943
Alignment:
234 aagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaag-ataacagctctgcctgcagaattgttccttcaagataggaatgaa 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||   ||||||||||||| | ||||||||||||||||    ||||||||||  || |||||  |    
4887057 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcaacgatgttccttcacaatgggaataca 4886958  T
333 tttgaagttgatcct 347  Q
    |||||| ||||||||    
4886957 tttgaaattgatcct 4886943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #128
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 234 - 347
Target Start/End: Original strand, 9398836 - 9398950
Alignment:
234 aagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaaga-taacagctctgcctgcagaattgttccttcaagataggaatgaa 332  Q
    ||||||| |||||||| |||||| || | |  ||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||| |||   | |||||| |    
9398836 aagtgtataaccactatctccactactcagtttgtgtctctgctacaagacaagaataacagctctgcctgcaacattgttccctcagacttggaatgga 9398935  T
333 tttgaagttgatcct 347  Q
    |||||| ||||||||    
9398936 tttgaaattgatcct 9398950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #129
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 84
Target Start/End: Original strand, 35543050 - 35543098
Alignment:
35 catcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctaca 84  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||||||||||    
35543050 catcagaagcaagattt-catcagaagctatatcatcaccagaagctaca 35543098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #130
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 234 - 345
Target Start/End: Original strand, 41566536 - 41566648
Alignment:
234 aagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaa-gataacagctctgcctgcagaattgttccttcaagataggaatgaa 332  Q
    |||||||||||||||| |||||| || | |  ||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||| |  | ||||||| || |   ||||||||    
41566536 aagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgctacaagacaaggataacagctctgcctgaaacaatgttcctacatgcatggaatgaa 41566635  T
333 tttgaagttgatc 345  Q
    |||||| ||||||    
41566636 tttgaaattgatc 41566648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 198; Significance: 1e-108; HSPs: 90)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Original strand, 20441146 - 20441467
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| || ||||  || | ||||||||||||    
20441146 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaggttttcatcagaagcgatatcatcaccagaagctacatttaatccgtaaattctaattaaagattcaaagt 20441245  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaaca 218  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||| ||||||||    
20441246 agctgtttctcatttcaacatcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagcactgagtatttttccttcgttaaca 20441345  T
219 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcctt 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||| ||||||||||||||| |||| || ||||| ||||| |||| ||||    
20441346 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacaactatgcctacagaatttgtgcctt 20441445  T
318 caagataggaatgaatttgaag 339  Q
    |||||| |||||||||||||||    
20441446 caagatgggaatgaatttgaag 20441467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Original strand, 9050316 - 9050637
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  || |||||||||||    
9050316 atcagaagcagaaaaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaatttggagattcaaagt 9050415  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaaca 218  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| || | | ||||||    
9050416 agctggttctcatttcaacctcgtctaacaagaacgaagatttgaaagggaggtattaacggtcatttgaagagcactgagtacttgtcattctttaaca 9050515  T
219 gagttgac-aaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcctt 317  Q
     ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||  ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||||||||    
9050516 aagttgacaaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaaatgttcctt 9050615  T
318 caagataggaatgaatttgaag 339  Q
    |||||| | |||||||||||||    
9050616 caagatggtaatgaatttgaag 9050637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Original strand, 39193923 - 39194243
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| || |||| ||||||||||| ||||||    
39193923 atcagaagcagaagctcatcagaagcaaggttttcatcagaagcgatatcatcaccagaagctacatttaatccgtaaattcaaactgaagatccaaagt 39194022  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaaca 218  Q
    ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||  | |||| ||||||||    
39194023 agctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggttatttggatagcactgagtatctgtccttcgttaaca 39194122  T
219 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcctt 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||    
39194123 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcctt 39194221  T
318 caagataggaatgaatttgaag 339  Q
    |||||| |||||||||||||||    
39194222 caagatgggaatgaatttgaag 39194243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Original strand, 7689286 - 7689608
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagc-aaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    ||||||||||||||  || ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| |||||    
7689286 atcagaagcagaaggtcaacagaagctaaggttttcatcagaagcgatatcatcaccagaagctacaattaatccgtaaattcaaactgaagatccaaag 7689385  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgag-tacttttcctgcgttaa 216  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| || || |||| ||||||    
7689386 tagctgtttctcatttcaaccttgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagcactgagttatttgtccttcgttaa 7689485  T
217 cagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||    
7689486 cagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcc 7689584  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
    ||||||||  ||||||||||||||    
7689585 ttcaagatgtgaatgaatttgaag 7689608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 19 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 47195639 - 47195316
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  | ||||||||||| |||||||||||    
47195639 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattgatccataaatttaaactggagattcaaagt 47195540  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaaca 218  Q
    ||||||||  | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  ||  ||| ||||||| |||| ||||||||    
47195539 agctgtttaacatttcaaccttgtctaagaagaacgaagaattgaaagggagacatcaacggtcatttggagaaaactaagtacttgtccttcgttaaca 47195440  T
219 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaag-ataacagctctgcctgcagaattgttcctt 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||| |||||||||||||| | |||||   ||||||||||| ||||||||    
47195439 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagaaaaacagtcatgcctgcagaaatgttcctt 47195340  T
318 caagataggaatgaatttgaagtt 341  Q
    |||||| |||||||||||||||||    
47195339 caagatgggaatgaatttgaagtt 47195316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Original strand, 18381732 - 18382053
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgt-gaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| || | | ||  |||| |||||||||||||||||    
18381732 atcagaagcagaagctaatcagaagcaaggttttcatcagaagcaaaatcatcaccagaagttacatttgaacagtaaaattcaaactgaagattcaaag 18381831  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||| |||||||||| |||| |||||||    
18381832 tagctgtttaacatttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacagtcatttggagagccctgagtacttgtccttcgttaac 18381931  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcctt 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||  ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||||||||    
18381932 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaaatgttcctt 18382031  T
318 caagataggaatgaatttgaag 339  Q
    |||||| |||||||||||||||    
18382032 caagatgggaatgaatttgaag 18382053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 23 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 39587343 - 39587026
Alignment:
23 gaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagtagct 122  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  | | |||||||||||||||||||||||||    
39587343 gaagcagaaggtcatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaattatcaccagaagctacaattgatccataagtttaaactgaagattcaaagtagct 39587244  T
123 gtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaacagagt 222  Q
    ||||  | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  || |||| ||||||| |||| ||||||||||||    
39587243 gtttaacatttcaaccttgtctaagaagaacgaagaattgaaagggagacatcaacggtcatttggagaacactaagtacttgtccttcgttaacagagt 39587144  T
223 tgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaag-ataacagctctgcctgcagaattgttccttcaag 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||| |||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| ||||||||||||    
39587143 tgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagaaaaacagccatgcctgcagaaatgttccttcaag 39587044  T
322 ataggaatgaatttgaag 339  Q
    || |||||||||||||||    
39587043 atgggaatgaatttgaag 39587026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 19 - 347
Target Start/End: Original strand, 14387957 - 14388283
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||||||||| || ||| || |||||||||||||| |||||||     
14387957 atcaaaagcagaagtccatcagaagcaagattt-catcagaagctatatcatcaccagaagctacagttgatcagtaaatttaaactgaagtttcaaagg 14388055  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaaca 218  Q
    |||||||| |||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || ||| |||| | ||| ||    
14388056 agctgtttttcgttctaacctcgtctaa-aagaacgaagaattaaaagggaggtatcaacggtcatttgaaaagcactgggtgcttgtccttctttatca 14388154  T
219 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttccttc 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
14388155 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttctgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaaatgttccttc 14388254  T
319 aagataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
14388255 aagataggaatgaatttgaagttgatcct 14388283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Original strand, 4250394 - 4250714
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |  ||| ||||||||||| ||||||    
4250394 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacatttaatccatatattcaaactgaagatccaaagt 4250493  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaaca 218  Q
    ||||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||| ||||| | || |||| ||||||||    
4250494 agctgtttctcatttcaatcttatctaagaagaacgaagaattgaaaggaaggtatcaacggtcatttggatagcgctgagcatttgtccttcgttaaca 4250593  T
219 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcctt 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||    
4250594 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcctt 4250692  T
318 caagataggaatgaatttgaag 339  Q
    |||||| |||||||||||||||    
4250693 caagatgggaatgaatttgaag 4250714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 27 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 17957609 - 17957297
Alignment:
27 cagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagtagctgttt 126  Q
    |||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
17957609 cagaagcccatcagaagcaaagttt-catcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatcagtgaatttaaactggagattcaaagtagctgttt 17957511  T
127 ctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaacagagttgac 226  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||| | ||| ||||||| ||    
17957510 ctcatttcaacctcgtctaacaagaacgaagatttgaaagggaggtatcaacggtcatttgaagagcactgagtatttgtccttctttatcagagtttac 17957411  T
227 -aaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttccttcaagatag 325  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||  || |||  | ||||  | ||||||||||||| |||| |  ||||||||||| |||||||||||||| |    
17957410 aaaagtacaagtgtacaaccactacctccattactctgtttttgtctacactacaagacaagaaaacaaccatgcctgcagaaatgttccttcaagatgg 17957311  T
326 gaatgaatttgaag 339  Q
    ||||||||||||||    
17957310 gaatgaatttgaag 17957297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 19 - 347
Target Start/End: Original strand, 11194899 - 11195224
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||| ||||||| ||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||     
11194899 atcagaagcagaataccatcagaagcaagattt-catcagaagctatatcatcac-agaagctgcaattgatcagtatatttaaactgaagattcaaagg 11194996  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaaca 218  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||| || | ||||| ||    
11194997 agctgtttttcgtttcaacctcgtctaaga-gaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggaaagcactgggtacttgtctttcgttatca 11195095  T
219 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttccttc 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||  | ||||  ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||    
11195096 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccattacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctttgcctgcagaaatgttccttc 11195195  T
319 aagataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||    
11195196 aagatgggaatgaatttgaagttgatcct 11195224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 19 - 347
Target Start/End: Original strand, 18310803 - 18311129
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||| || |||||||  ||||| |||||||     
18310803 atcagaaacagaagtccatcagaagcaagattt-catcagaagctatatcatcaccagaagctacaattgatcagtaaatttaatttgaagtttcaaagg 18310901  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaaca 218  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||| || ||| |||| | ||| ||    
18310902 agctgtttttcgtttcaacctcgtctaa-aagaacgaaggattgaaaggaagatatcaacggtcatttgaaaagcactgggtgcttgtccttctttatca 18311000  T
219 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttccttc 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||  ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||    
18311001 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttctgtctacgctacaagacaagacaacagctctacctgcagaaatgttccttc 18311100  T
319 aagataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
18311101 aagataggaatgaatttgaagttgatcct 18311129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Original strand, 148043 - 148363
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  |  ||| ||||||||||| ||||||    
148043 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaagtcatcaccagaagctacatttaatccatatattcaaactgaagatccaaagt 148142  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaaca 218  Q
    ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||   ||| ||||| | || |||| ||||||||    
148143 agctgtttctcatttcaatctcatctaagaagaacgaagaattgaaaggaaagtatcaacggtcatttggacagcgctgagcatttgtccttcgttaaca 148242  T
219 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcctt 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||  | ||||| ||||||||||||||| ||||||| || |||||||| |||| ||||    
148243 gagttgacaaagtacaagtgtacaatcactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgtctgcagaatttgtgcctt 148341  T
318 caagataggaatgaatttgaag 339  Q
    |||  | |||||||||||||||    
148342 caaagtgggaatgaatttgaag 148363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Original strand, 154118 - 154438
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  |  ||| ||||||||||| ||||||    
154118 atcagaagcagaaggtaatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaagtcatcaccagaagctacatttaatccatatattcaaactgaagatccaaagt 154217  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaaca 218  Q
    ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||| ||||| | || |||| ||||||||    
154218 agctgtttctcatttcaatctcatctaagaagaacgaagaattgaaaggaaggtatcaacggtcatttggacagcgctgagcatttgtccttcgttaaca 154317  T
219 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcctt 317  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||  | ||||| ||||||||||||||| ||||||| || |||||||| |||| ||||    
154318 gagttgacaaagtacaagtgtataaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgtctgcagaatttgtgcctt 154416  T
318 caagataggaatgaatttgaag 339  Q
    |||  | |||||||||||||||    
154417 caaagtgggaatgaatttgaag 154438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 5974142 - 5973821
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  |  ||| ||||||||||| ||||||    
5974142 atcagaagcagaaggtaatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaagtcatcaccagaagctacatttaatccatatattcaaactgaagatccaaagt 5974043  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtca-tttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    || |||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||   | | ||||| | || |||| |||||||    
5974042 agttgtttctcatttcaatctcatctaagaagaacgaagaattgaaaggaaggtatcaacggtcattttggacaacgctgagcatttgtccttcgttaac 5973943  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcct 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||  | ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||    
5973942 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactgcctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcct 5973844  T
317 tcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
    ||||||| |||||||||||||||    
5973843 tcaagatgggaatgaatttgaag 5973821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 19 - 347
Target Start/End: Original strand, 41132447 - 41132772
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||||||||| || ||| || |||||||||||||| ||||||      
41132447 atcagaagtagaagtccatcagaagcaagattt-catcagaagctatatcatcaccagaagctacagttgatcagtaaatttaaactgaagtttcaaatg 41132545  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaaca 218  Q
    |||||||| |||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||  || |||| | || | |    
41132546 agctgtttttcgttttaatctcgtctaagaa-aacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaaaagcattgggtgtttgtccttctttga-a 41132643  T
219 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttccttc 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||  | ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
41132644 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctctactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaactgttccttc 41132743  T
319 aagataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
    || || |||||||||||||||||||||||    
41132744 aaaatgggaatgaatttgaagttgatcct 41132772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 19 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 12947091 - 12946818
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||||| | |||||||||||||||| ||| | | | || ||||||||||||||||||||||     
12947091 atcagaagcagaagatcatcagaagcacgattt-catcagaagctatatcatcaccagaagcttcaagtgaacagttaatttaaactgaagattcaaagg 12946993  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaaca 218  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| || |||| ||||| ||    
12946992 agctgtttttcgtttcaacctcgtctaagaa-aacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaaaagcactgagtatttatccttcgttatca 12946894  T
219 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacag 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||  ||||||||||||||| |||||    
12946893 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacag 12946818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 19 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 675820 - 675496
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    |||||||||| ||| ||| |||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||||||||| || | | |   ||||||||||||| |||||||     
675820 atcagaagca-aagtccaccagaagcaagattt-catcagaagctatatcatcaccagaagctacagttgaacagaatatttaaactgaagtttcaaagg 675723  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaaca 218  Q
    |||||||| |||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  || ||| |||| | || | |    
675722 agctgtttttcgttttaatctcgtctaagagga-cgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaaaagcactcggtgcttgtccttcattga-a 675625  T
219 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttccttc 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
675624 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgcttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaaatgttccttc 675525  T
319 aagataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
    || || |||||||||||||||||||||||    
675524 aaaatgggaatgaatttgaagttgatcct 675496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 19 - 347
Target Start/End: Original strand, 46180710 - 46181036
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||||||||| || ||| |   ||| || ||| |   |||||      
46180710 atcagaagcagaagttcatcagaagcaagattt-catcagaagctatatcatcaccagaagctacagttgatcagaagattcaatctggaatctcaaaag 46180808  T
119 agctgtttctc---gtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgtta 215  Q
    || |||||||    |||  |||||||||||||| || ||||| ||  ||||||| ||  ||||| ||||||||  ||||||| || ||| |||  | ||     
46180809 agttgtttctttaagtt--aacctcgtctaaga-gagcgaaggatcaaaagggaagtgccaacgttcatttgaaaagcactgggtgcttgtccctcattg 46180905  T
216 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcc 315  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
46180906 a-agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcttcgctacaagacaagttaacagctctgcctgcagaattgttcc 46181004  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
46181005 ttcaagataggaatgaatttgaagttgatcct 46181036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 218 - 347
Target Start/End: Original strand, 45070681 - 45070810
Alignment:
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcctt 317  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
45070681 agagttgacaaattacaaatgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcctt 45070780  T
318 caagataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
45070781 caagataggaatgaatttgaagttgatcct 45070810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 164 - 347
Target Start/End: Original strand, 20195667 - 20195850
Alignment:
164 aagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
20195667 aagggaggtatcaacggtcatttgaagagcactaggtacttgtccttcgttatcagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg 20195766  T
264 agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttccttcaagataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
        ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
20195767 ttcttgtccacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaattgttccatcaagatgggaatgaatttgaagttgatcct 20195850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 35013300 - 35012979
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggtttt-catcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| ||||| |||||||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
35013300 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaagtttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 35013202  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||||||||| |||| ||   ||||||     
35013201 tagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaat 35013102  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcct 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||  ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| |||| |||    
35013101 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaatttgtacct 35013002  T
317 tcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
    ||||||| |||||||||||||||    
35013001 tcaagatgggaatgaatttgaag 35012979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 218 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 20799118 - 20798989
Alignment:
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcctt 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
20799118 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagcatgtcctcgctacaagacaaaataacagctctgcctgcagaattgttcctt 20799019  T
318 caagataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
20799018 caagataggaatgaatttgaagttgatcct 20798989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Original strand, 23580155 - 23580477
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaa-ggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
23580155 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaggttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 23580253  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||||||||| |||| ||   ||||||     
23580254 tagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaat 23580353  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| |||| ||    
23580354 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaatttgtacc 23580453  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
    |||||||| |||||||||||||||    
23580454 ttcaagatgggaatgaatttgaag 23580477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 218 - 347
Target Start/End: Original strand, 20883910 - 20884039
Alignment:
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcctt 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
20883910 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccattagctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgccagcagaattcttcctt 20884009  T
318 caagataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
20884010 caagataggaatgaatttgaagttgatcct 20884039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 218 - 347
Target Start/End: Original strand, 22610002 - 22610131
Alignment:
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcctt 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
22610002 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagcatgtcctcgctacaagacaatataacagctctgcctgcagaattgttcctt 22610101  T
318 caagataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||    
22610102 caagataggaatgaatttgaatttgatcct 22610131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 218 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 23927112 - 23926983
Alignment:
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcctt 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
23927112 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtatgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctacagaaatgttcctt 23927013  T
318 caagataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
    ||||||||||||| |||||||  |||||||    
23927012 caagataggaatggatttgaacgtgatcct 23926983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 4167637 - 4167315
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
4167637 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 4167539  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||||||||| |||| ||   ||||||     
4167538 tagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaat 4167439  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | || |||  ||||||||||| |||| |     
4167438 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaatagccatgcctgcagaatttgtacg 4167339  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
    |||||||| |||||||||||||||    
4167338 ttcaagatgggaatgaatttgaag 4167315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Original strand, 5639539 - 5639861
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
5639539 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 5639637  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||||||||| |||| ||   ||||||     
5639638 tagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaat 5639737  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | |||| |  ||||||||||| |||| |     
5639738 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacaaccatgcctgcagaatttgtacg 5639837  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
    |||||||| |||||||||||||||    
5639838 ttcaagatgggaatgaatttgaag 5639861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Original strand, 5650096 - 5650418
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
5650096 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 5650194  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||||||||| |||| ||   ||||||     
5650195 tagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaat 5650294  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | |||| |  ||||||||||| |||| |     
5650295 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacaaccatgcctgcagaatttgtacg 5650394  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
    |||||||| |||||||||||||||    
5650395 ttcaagatgggaatgaatttgaag 5650418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 12730925 - 12730603
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
12730925 atcagaagcagaaggtcttcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 12730827  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||||||||| |||| ||   ||||||     
12730826 tagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaat 12730727  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |     
12730726 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 12730627  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
     ||||||| |||||||||||||||    
12730626 ctcaagatgggaatgaatttgaag 12730603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Original strand, 12897812 - 12898134
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
12897812 atcagaagcaaaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 12897910  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||||||||| |||| ||   ||||||     
12897911 tagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaat 12898010  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |     
12898011 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 12898110  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
     ||||||| |||||||||||||||    
12898111 ctcaagatgggaatgaatttgaag 12898134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 21878145 - 21877823
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
21878145 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 21878047  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |    ||||||||| |||| ||   ||||||     
21878046 tagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatagatagcactgagcacttgtctctcgttaat 21877947  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |     
21877946 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 21877847  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
     ||||||| |||||||||||||||    
21877846 ctcaagatgggaatgaatttgaag 21877823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 33084940 - 33084618
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  || || | | |||  |||||||||||||||||    
33084940 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgattttttaatc-aaactgaagattcaaag 33084842  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||||||||| |||| ||   ||||||     
33084841 tagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaat 33084742  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccct-gagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    | ||||   |||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |     
33084741 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctattttctgtctatgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacg 33084642  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
    |||||||| |||||||||||||||    
33084641 ttcaagatgggaatgaatttgaag 33084618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 2538913 - 2538592
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| || |||  | |||  |||||||||||||||||    
2538913 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 2538815  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   |||||||||  ||| ||   ||||||     
2538814 tagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaat 2538715  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcct 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  |||||||||  |||| |      
2538714 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagttttgtacac 2538615  T
317 tcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
    ||||||| |||||||||||||||    
2538614 tcaagatgggaatgaatttgaag 2538592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 218 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 5929757 - 5929628
Alignment:
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcctt 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||    
5929757 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgactctgattgtgtctacgctacaagacaagacaccagctctgcctgcagaaatgttcctt 5929658  T
318 caagataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||    
5929657 caagataggaatggatttgaacttgatcct 5929628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 19 - 341
Target Start/End: Original strand, 12614145 - 12614469
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
12614145 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 12614243  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || ||   ||||||||| |||| ||   | ||||     
12614244 tagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaactgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcattaat 12614343  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |     
12614344 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 12614443  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaagtt 341  Q
     ||||||| |||||||||||||||||    
12614444 ctcaagatgggaatgaatttgaagtt 12614469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 19 - 341
Target Start/End: Original strand, 12623610 - 12623934
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
12623610 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 12623708  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   | ||||||| |||| ||   | ||||     
12623709 tagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatatcactgagcacttgtctctcattaat 12623808  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |     
12623809 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 12623908  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaagtt 341  Q
     ||||||| |||||||||||||||||    
12623909 ctcaagatgggaatgaatttgaagtt 12623934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 19179338 - 19179015
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
19179338 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 19179240  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcat-ttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaa 216  Q
    |||||| |||||  ||||  ||  || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || |||   |||||| || |||| ||   ||||||    
19179239 tagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggagttatcaacggatatattggatagcactaagcacttgtctctcgttaa 19179140  T
217 cagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttc 314  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| |||| |    
19179139 tatagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaagttgtac 19179040  T
315 cttcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
     |||||||| |||||||||||||||    
19179039 gttcaagatgggaatgaatttgaag 19179015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 35 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 4178277 - 4177971
Alignment:
35 catcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttctcgttt 133  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  ||||||||||||||||||||||| |||||  ||    
4178277 catcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaagtagctgattctcaatt 4178179  T
134 caacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaacagagttgacaaagtac 233  Q
    ||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||||||||| |||| ||   |||||| ||||||||||||||||    
4178178 cagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaatagagttgacaaagtac 4178079  T
234 aagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttccttcaagataggaatga 331  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  |||||||| || |||| | |||||||| |||||||    
4178078 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcaaaatttgtacgttcaagatgggaatga 4177979  T
332 atttgaag 339  Q
    ||||||||    
4177978 atttgaag 4177971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 12741518 - 12741196
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  ||| |||||||||||||    
12741518 atcagaagcagaaggtcttcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaattgaagattcaaag 12741420  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||||||||| |||| ||   ||||||     
12741419 tagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaat 12741320  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |     
12741319 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 12741220  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
     ||||||| |||||||||||||||    
12741219 ctcaagatgggaatgaatttgaag 12741196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 21864039 - 21863717
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
21864039 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 21863941  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||||||||| |||| ||   | ||||     
21863940 tagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcattaat 21863841  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | |||   ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |     
21863840 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtttacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 21863741  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
     ||||||| |||||||||||||||    
21863740 ctcaagatgggaatgaatttgaag 21863717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 21895580 - 21895258
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
21895580 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 21895482  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||||||||| |||| ||   | ||||     
21895481 tagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcattaat 21895382  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |     
21895381 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 21895282  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
     ||||||| |||||||||||||||    
21895281 ctcaagatgggaatgaatttgaag 21895258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 19 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 3172001 - 3171676
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| || |||  | |||  |||||||||||||||||    
3172001 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 3171903  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || ||   ||||||||| |||| ||   | ||||     
3171902 tagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaactgaaagggaggtatcaacggatatatggaaagcactgagcacttgtctctcattaat 3171803  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttc- 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |     
3171802 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaagttgtaca 3171703  T
315 cttcaagataggaatgaatttgaagtt 341  Q
      ||||||| |||||||||||||||||    
3171702 actcaagatgggaatgaatttgaagtt 3171676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 19 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 3182603 - 3182278
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| || |||  | |||  |||||||||||||||||    
3182603 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 3182505  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || ||   ||||||||| |||| ||   | ||||     
3182504 tagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaactgaaagggaggtatcaacggatatatggaaagcactgagcacttgtctctcattaat 3182405  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttc- 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |     
3182404 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaagttgtaca 3182305  T
315 cttcaagataggaatgaatttgaagtt 341  Q
      ||||||| |||||||||||||||||    
3182304 actcaagatgggaatgaatttgaagtt 3182278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 22 - 341
Target Start/End: Original strand, 10997616 - 10997937
Alignment:
22 agaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagtag 120  Q
    |||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||   || |||  | |||  ||||| ||||||||||||||    
10997616 agaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctatgtttgatcctttaatc-aaactaaagattcaaagtag 10997714  T
121 ctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaacaga 220  Q
    ||| |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||||||||| |||| ||   | |||| |||    
10997715 ctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcattaataga 10997814  T
221 gttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttccttc 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |  ||    
10997815 gttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactc 10997914  T
319 aagataggaatgaatttgaagtt 341  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
10997915 aagatgggaatgaatttgaagtt 10997937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 35 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 28474460 - 28474152
Alignment:
35 catcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttctcgt-tt 133  Q
    |||||||||||| |||  |||||||||| | || |||||||||||||||| || ||| |   ||| || |||||| |||||| | ||||||| | |  ||    
28474460 catcagaagcaaagtt--catcagaagctatatgatcaccagaagctacagttgatcagaagattcaatctgaagtttcaaa-tggctgtttattggatt 28474364  T
134 caacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaacagagttgacaaagtac 233  Q
     |||||||||||||| || ||||  | | ||||| ||||  ||||| ||||||||  ||||||| || ||| ||||  ||| | ||||||||||||||||    
28474363 taacctcgtctaaga-gagcgaaagactcaaaggaaggtgccaacgttcatttgaaaagcactgggtgcttgtcctttgttga-agagttgacaaagtac 28474266  T
234 aagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttccttcaagataggaatgaat 333  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||    
28474265 aattgtacaaccactacctccacgactctgcttgtgtctgcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaaatgttcctttaagataggaatggat 28474166  T
334 ttgaagttgatcct 347  Q
    |||||  |||||||    
28474165 ttgaacgtgatcct 28474152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 19 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 7507680 - 7507356
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
7507680 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacttttgatccattaatc-aaactgaagattcaaag 7507582  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    | |||| |||||  ||||  ||  || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || ||   |||||||||  ||| ||   ||||||     
7507581 ttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacaaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaat 7507482  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |     
7507481 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 7507382  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaagtt 341  Q
     ||||||| |||||||||||||||||    
7507381 ctcaagatgggaatgaatttgaagtt 7507356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 19 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 7518277 - 7517953
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
7518277 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacttttgatccattaatc-aaactgaagattcaaag 7518179  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    | |||| |||||  ||||  ||  || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || ||   |||||||||  ||| ||   ||||||     
7518178 ttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacaaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaat 7518079  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |     
7518078 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 7517979  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaagtt 341  Q
     ||||||| |||||||||||||||||    
7517978 ctcaagatgggaatgaatttgaagtt 7517953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 218 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 19038061 - 19037940
Alignment:
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaag-ataacagctctgcctgcagaattgttcct 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  |||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||    
19038061 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgactctgattgtgtctgcgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcagaaatgttcct 19037962  T
317 tcaagataggaatgaatttgaa 338  Q
    |||||||||||||| |||||||    
19037961 tcaagataggaatggatttgaa 19037940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 101 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 19188135 - 19187894
Alignment:
101 aaactgaagattcaaagtagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcat-ttgaggagcactgag 199  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||   |||||||||    
19188135 aaactgaagattcaaagtagttgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatattggatagcactgag 19188036  T
200 tacttttcctgcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctct 298  Q
     |||| ||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||||| ||||||  |    
19188035 cacttgtctctcgttaatagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaagacaacagccat 19187936  T
299 gcctgcagaa-ttgttccttcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
    |||||||||| |||| | |||||||| |||||||||||||||    
19187935 gcctgcagaagttgtacgttcaagatgggaatgaatttgaag 19187894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 218 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 28380049 - 28379920
Alignment:
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcctt 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
28380049 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccagtacctccacgactctaattgtgtctacgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaaatgttcctt 28379950  T
318 caagataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
    ||||||||||||  |||||||  |||||||    
28379949 caagataggaattgatttgaacgtgatcct 28379920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 19 - 338
Target Start/End: Original strand, 36236259 - 36236579
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  ||||||  | |||  |||||||||||||||||    
36236259 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacttttaatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 36236357  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    | |||| || ||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   |||||| ||  ||| ||   ||||||     
36236358 ttgctgattttcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactaagctcttgtctctcgttaat 36236457  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcct 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||||||| |      
36236458 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaattgtacac 36236557  T
317 tcaagataggaatgaatttgaa 338  Q
    ||||||| |||| |||||||||    
36236558 tcaagatgggaaggaatttgaa 36236579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 19 - 338
Target Start/End: Original strand, 36246806 - 36247126
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  ||||||  | |||  |||||||||||||||||    
36246806 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacttttaatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 36246904  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    | |||| || ||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   |||||| ||  ||| ||   ||||||     
36246905 ttgctgattttcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactaagctcttgtctctcgttaat 36247004  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcct 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||||||| |      
36247005 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaattgtacac 36247104  T
317 tcaagataggaatgaatttgaa 338  Q
    ||||||| |||| |||||||||    
36247105 tcaagatgggaaggaatttgaa 36247126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 19 - 341
Target Start/End: Original strand, 51629016 - 51629340
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
51629016 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacttttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 51629114  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    | |||| |||||  ||||  ||  || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || ||   |||||||||  ||| ||   ||||||     
51629115 ttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacaaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaat 51629214  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |     
51629215 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 51629314  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaagtt 341  Q
     ||||||| |||||||||||||||||    
51629315 ctcaagatgggaatgaatttgaagtt 51629340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 19 - 341
Target Start/End: Original strand, 51656277 - 51656601
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
51656277 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacttttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 51656375  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    | |||| |||||  ||||  ||  || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || ||   |||||||||  ||| ||   ||||||     
51656376 ttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacaaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaat 51656475  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |     
51656476 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 51656575  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaagtt 341  Q
     ||||||| |||||||||||||||||    
51656576 ctcaagatgggaatgaatttgaagtt 51656601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 175 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 44201108 - 44200938
Alignment:
175 caacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaacagagttgacaaagtacaa-gtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcct 273  Q
    ||||| ||||||||  |||||||||| ||| |||| | || | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||      
44201108 caacgttcatttgaaaagcactgagtgcttgtccttcattga-agagttgacaaagtacaaagtgtacaaccactacctccacgactctgtttgtgtcta 44201010  T
274 cgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttccttcaagataggaatgaatttgaagttgatc 345  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
44201009 cgctacaagacaagataacaactttgcctgcagaaatgttccttcaagataggaatggatttgaacttgatc 44200938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 19 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 5833597 - 5833266
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||| || |||  | |||  |||||||||||||||||    
5833597 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 5833499  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    | |||| |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || ||   ||||||||| |||| ||   | ||||     
5833498 ttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaactgaaagggaggtatcaacggatatatggaaagcactgagcacttgtctctcattaat 5833399  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcc- 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  |||||||||||||  | |     
5833398 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 5833299  T
316 -ttcaagataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
      ||||||| ||||||||||||||||| |||||    
5833298 actcaagatgggaatgaatttgaagtttatcct 5833266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 19 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 5844199 - 5843868
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||| || |||  | |||  |||||||||||||||||    
5844199 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 5844101  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    | |||| |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || ||   ||||||||| |||| ||   | ||||     
5844100 ttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaactgaaagggaggtatcaacggatatatggaaagcactgagcacttgtctctcattaat 5844001  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcc- 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  |||||||||||||  | |     
5844000 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 5843901  T
316 -ttcaagataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
      ||||||| ||||||||||||||||| |||||    
5843900 actcaagatgggaatgaatttgaagtttatcct 5843868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 218 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 20251828 - 20251699
Alignment:
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcctt 317  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
20251828 agagttgacaaagtgcaagggtacaaccactacctccacgactctgcttgtgtctatgctacaaaacaagataacagctctgcctgcagaaatgttcctt 20251729  T
318 caagataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
    ||||||||||||| |||||||  |||||||    
20251728 caagataggaatggatttgaacgtgatcct 20251699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 19 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 38095455 - 38095124
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||| || |||  | |||  || ||||||||||||||    
38095455 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagctacatttgatcctttaatccaa-ctgaagattcaaag 38095357  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    | |||| |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || ||   ||||||||| || | ||   | ||||     
38095356 ttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaactgaaagggaggtatcaacggatatatggaaagcactgagcacctgtctctcattaat 38095257  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcc- 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  |||||||||||||  | |     
38095256 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 38095157  T
316 -ttcaagataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
      ||||||| |||||||||||||||||||||||    
38095156 actcaagatgggaatgaatttgaagttgatcct 38095124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 19 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 38106080 - 38105749
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||| || |||  | |||  || ||||||||||||||    
38106080 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagctacatttgatcctttaatccaa-ctgaagattcaaag 38105982  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    | |||| |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || ||   ||||||||| || | ||   | ||||     
38105981 ttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaactgaaagggaggtatcaacggatatatggaaagcactgagcacctgtctctcattaat 38105882  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcc- 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  |||||||||||||  | |     
38105881 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 38105782  T
316 -ttcaagataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
      ||||||| |||||||||||||||||||||||    
38105781 actcaagatgggaatgaatttgaagttgatcct 38105749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 19 - 347
Target Start/End: Original strand, 47607759 - 47608090
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||| || |||  | |||  |||||||||||||||||    
47607759 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 47607857  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    | || | |||||  ||||  ||  || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || ||   ||||||||| |||| ||   | ||||     
47607858 ttgcggattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgatgaattgaaagggaggtatcaacggatatatggaaagcactgagcacttgtctctctttaat 47607957  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcc- 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  |||||||||||||  | |     
47607958 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 47608057  T
316 -ttcaagataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
      ||||||| ||||||||||||||||| |||||    
47608058 actcaagatgggaatgaatttgaagtttatcct 47608090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 19 - 347
Target Start/End: Original strand, 47618367 - 47618698
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||| || |||  | |||  |||||||||||||||||    
47618367 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 47618465  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    | || | |||||  ||||  ||  || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || ||   ||||||||| |||| ||   | ||||     
47618466 ttgcggattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgatgaattgaaagggaggtatcaacggatatatggaaagcactgagcacttgtctctctttaat 47618565  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcc- 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  |||||||||||||  | |     
47618566 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 47618665  T
316 -ttcaagataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
      ||||||| ||||||||||||||||| |||||    
47618666 actcaagatgggaatgaatttgaagtttatcct 47618698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 218 - 347
Target Start/End: Original strand, 52350712 - 52350841
Alignment:
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcctt 317  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||  ||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
52350712 agagttgacaaagtacaattgtacaaccactacctccacaactctgcttgtgtctacgctacaagacaagataatagctctgcctgcagaaatgtccctt 52350811  T
318 caagataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
    |||| |||||||| ||||||| ||||||||    
52350812 caagttaggaatggatttgaacttgatcct 52350841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 218 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 22019391 - 22019260
Alignment:
218 agagttgacaaagtacaa-gtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataa-cagctctgcctgcagaattgttcc 315  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||    
22019391 agagttgacaaagtacaaagtgtacaaccactacctccacgactctgcttgtgtctacgctacaagacaagataaacagctcttcctgcagaaatgttcc 22019292  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
    ||||||||||||||| |||||||  |||||||    
22019291 ttcaagataggaatggatttgaacatgatcct 22019260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 218 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 22642950 - 22642819
Alignment:
218 agagttgacaaagtacaa-gtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataa-cagctctgcctgcagaattgttcc 315  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||  || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||    
22642950 agagttgacaaagtacaaagtgtacaaccactacctccacgactctgcttgtgtctacggtacaagacaagataaacagttctgcctgcagaaatgttcc 22642851  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
    ||||||||||||||| |||||||  |||||||    
22642850 ttcaagataggaatggatttgaacatgatcct 22642819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 218 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 22655532 - 22655401
Alignment:
218 agagttgacaaagtacaa-gtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataa-cagctctgcctgcagaattgttcc 315  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||  ||||||||||||||| || ||| ||||||||||||| ||||||    
22655532 agagttgacaaagtacaaagtgtacaaccactacctccacgactctgcttgtgtctacgctacaagacaagaaaaacagttctgcctgcagaaatgttcc 22655433  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
    ||||||||||||||| |||||||  |||||||    
22655432 ttcaagataggaatggatttgaatgtgatcct 22655401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 35 - 341
Target Start/End: Original strand, 35401009 - 35401318
Alignment:
35 catcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttctcgttt 133  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||| || |||  | |||  |||||||||||||||||| |||| |||||  ||    
35401009 catcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaagttgctgattctcaatt 35401107  T
134 caacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaacagagttgacaaagtac 233  Q
    ||  ||  || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || ||   | ||||||| |||| ||   | |||| ||||||||||||||||    
35401108 cagtcttatcaaagaagaacgaagaactgaaagggaggtatcaacggatatatggataacactgagcacttgtctctcattaatagagttgacaaagtac 35401207  T
234 aagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcc--ttcaagataggaatg 330  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  |||||||||||||  | |   ||||||| ||||||    
35401208 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatg 35401307  T
331 aatttgaagtt 341  Q
    |||||||||||    
35401308 aatttgaagtt 35401318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 35 - 341
Target Start/End: Original strand, 35404236 - 35404545
Alignment:
35 catcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttctcgttt 133  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||| || |||  | |||  |||||||||||||||||| |||| |||||  ||    
35404236 catcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaagttgctgattctcaatt 35404334  T
134 caacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaacagagttgacaaagtac 233  Q
    ||  ||  || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || ||   | ||||||| |||| ||   | |||| ||||||||||||||||    
35404335 cagtcttatcaaagaagaacgaagaactgaaagggaggtatcaacggatatatggataacactgagcacttgtctctcattaatagagttgacaaagtac 35404434  T
234 aagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcc--ttcaagataggaatg 330  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  |||||||||||||  | |   ||||||| ||||||    
35404435 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatg 35404534  T
331 aatttgaagtt 341  Q
    |||||||||||    
35404535 aatttgaagtt 35404545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 35 - 341
Target Start/End: Original strand, 35648535 - 35648844
Alignment:
35 catcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttctcgttt 133  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||| || |||  | |||  |||||||||||||||||| |||| |||||  ||    
35648535 catcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaagttgctgattctcaatt 35648633  T
134 caacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaacagagttgacaaagtac 233  Q
    ||  ||  || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || ||   | ||||||| |||| ||   | |||| ||||||||||||||||    
35648634 cagtcttatcaaagaagaacgaagaactgaaagggaggtatcaacggatatatggataacactgagcacttgtctctcattaatagagttgacaaagtac 35648733  T
234 aagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcc--ttcaagataggaatg 330  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  |||||||||||||  | |   ||||||| ||||||    
35648734 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatg 35648833  T
331 aatttgaagtt 341  Q
    |||||||||||    
35648834 aatttgaagtt 35648844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 35 - 341
Target Start/End: Original strand, 35637883 - 35638192
Alignment:
35 catcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttctcgttt 133  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||| || |||  | |||  |||||||| ||||||||| |||| |||||  ||    
35637883 catcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaaaattcaaagttgctgattctcaatt 35637981  T
134 caacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaacagagttgacaaagtac 233  Q
    ||  ||  || ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  || ||   | ||||||| |||| ||   | |||| ||||||||||||||||    
35637982 cagtcttatcaaagaagaacgaagaactgaaagggaggtatcaacagatatatggataacactgagcacttgtctctcattaatagagttgacaaagtac 35638081  T
234 aagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcc--ttcaagataggaatg 330  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  |||||||||||||  | |   ||||||| ||||||    
35638082 aagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatg 35638181  T
331 aatttgaagtt 341  Q
    |||||||||||    
35638182 aatttgaagtt 35638192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 218 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 17371097 - 17370966
Alignment:
218 agagttgacaaagtac-aagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataac-agctctgcctgcagaattgttcc 315  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||  ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||    
17371097 agagttgacaaagtacgaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagaaaaatagctctgcctgcagaaatgttcc 17370998  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
    |||| |||||||||| |||||||  |||||||    
17370997 ttcatgataggaatggatttgaacgtgatcct 17370966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 218 - 347
Target Start/End: Original strand, 26548282 - 26548413
Alignment:
218 agagttgacaaagtacaa-gtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagat-aacagctctgcctgcagaattgttcc 315  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  | ||||  |||||||||||| ||| |||||||||| ||||| || |||||     
26548282 agagttgacaaagtacaaagtgtacaaccactacctccacgacactgcctctgtctacgctacaagacaggataaacagctctgtctgcataaatgttct 26548381  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
    ||||||||||||||| |||||||  |||||||    
26548382 ttcaagataggaatggatttgaacgtgatcct 26548413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 219 - 347
Target Start/End: Original strand, 19170360 - 19170490
Alignment:
219 gagttgacaaagtacaa-gtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataa-cagctctgcctgcagaattgttcct 316  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||  | ||||  ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |    
19170360 gagttgacaaagtacaaagtgtacaaccactacttccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcagaaatgttcgt 19170459  T
317 tcaagataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
    |||||||||||||| |||||||  |||||||    
19170460 tcaagataggaatggatttgaacgtgatcct 19170490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 19 - 180
Target Start/End: Original strand, 30291905 - 30292066
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||   || |||  | |||  ||||| |||||||||||    
30291905 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctatgtttgatcctttaatc-aaactaaagattcaaag 30292003  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgg 180  Q
    |||||| |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
30292004 tagctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacgg 30292066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 218 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 23065003 - 23064935
Alignment:
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaa 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||  |||||||||||||    
23065003 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgactctgtttgtgtctacgctacaagacaa 23064935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 234 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 10757459 - 10757345
Alignment:
234 aagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaaga-taacagctctgcctgcagaattgttccttcaagataggaatgaa 332  Q
    |||||||||||||||| || ||| || | |  ||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||   | ||||||||    
10757459 aagtgtacaaccactatcttcactactcagtttgtgtctctgctacaagacaagaataacagctctgcctgcagcattgttccttcatacttggaatgaa 10757360  T
333 tttgaagttgatcct 347  Q
    |||||| ||||||||    
10757359 tttgaaattgatcct 10757345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 218 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 21544084 - 21543962
Alignment:
218 agagttgacaaagtac-aagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataa-cagctctgcctgcagaattgttcc 315  Q
    |||||||||||||||  || ||||| |||||||||||||| ||  ||  | ||||  ||||||||||||||| || |||||||||||| |||| ||||||    
21544084 agagttgacaaagtaagaaatgtacgaccactacctccactactttgcttttgtctacgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgtagaaatgttcc 21543985  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaa 338  Q
    |||||| |||||||| |||||||    
21543984 ttcaagttaggaatggatttgaa 21543962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 84
Target Start/End: Original strand, 20883713 - 20883777
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctaca 84  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||||||||||    
20883713 atcagaaccagaagtccatcagaagcaagattt-catcagaagctatatcatcaccagaagctaca 20883777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 237 - 305
Target Start/End: Original strand, 34255561 - 34255630
Alignment:
237 tgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaa-gataacagctctgcctgca 305  Q
    |||||||||||||| ||||| || |||||| ||||   |||||||||||| |||||||||||||||||||    
34255561 tgtacaaccactacttccactactctgagtttgtctctgctacaagacaaggataacagctctgcctgca 34255630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 234 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 42284666 - 42284594
Alignment:
234 aagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaa-gataacagctctgcctgca 305  Q
    ||||||||||||||||||||||| |   ||||| ||||   |||||||||||| |||||||||||||||||||    
42284666 aagtgtacaaccactacctccactattatgagtttgtctctgctacaagacaaggataacagctctgcctgca 42284594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 234 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 1900383 - 1900269
Alignment:
234 aagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaag-ataacagctctgcctgcagaattgttccttcaagataggaatgaa 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||   ||||||||||||| | ||||||||||||||||  | | ||||||||  || || ||| |    
1900383 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcaacaatattccttcacaatggggatgga 1900284  T
333 tttgaagttgatcct 347  Q
    |||||| ||||||||    
1900283 tttgaaattgatcct 1900269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 234 - 347
Target Start/End: Original strand, 22464851 - 22464965
Alignment:
234 aagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataa-cagctctgcctgcagaattgttccttcaagataggaatgaa 332  Q
    ||||||||| ||||||||||||| || ||   | ||||   |||||||||||||| || |||||||||||||| |  ||||||||||  || |||||| |    
22464851 aagtgtacatccactacctccactactctatttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcaaagatgttccttcacaatgggaatgca 22464950  T
333 tttgaagttgatcct 347  Q
    |||||| ||||||||    
22464951 tttgaaattgatcct 22464965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 274 - 347
Target Start/End: Original strand, 24028768 - 24028842
Alignment:
274 cgctacaagacaagataac-agctctgcctgcagaattgttccttcaagataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
    ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||||||| || ||||  |||||||  |||||||    
24028768 cgctacaagacaagaaaaatagctctgcctgcagaaatgttccttcaagttatgaatagatttgaacgtgatcct 24028842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 234 - 347
Target Start/End: Original strand, 25448608 - 25448722
Alignment:
234 aagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaag-ataacagctctgcctgcagaattgttccttcaagataggaatgaa 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||   ||||||||||||| | ||||||| ||||||||    ||||||||||  || |||||| |    
25448608 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctttgcctgcaacgatgttccttcacaatgggaatgca 25448707  T
333 tttgaagttgatcct 347  Q
    |||||| ||||||||    
25448708 tttgaaattgatcct 25448722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 234 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 22153895 - 22153783
Alignment:
234 aagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaag-ataacagctctgcctgcagaattgttccttcaagataggaatgaa 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||   ||||||||||||| | |||| |||| | |||| || |||||| |||  ||||||||| |    
22153895 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacaactctacatgcaaaaatgttccatcacaataggaatgga 22153796  T
333 tttgaagttgatc 345  Q
    |||||| ||||||    
22153795 tttgaaattgatc 22153783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 234 - 305
Target Start/End: Original strand, 33256393 - 33256465
Alignment:
234 aagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaag-ataacagctctgcctgca 305  Q
    |||||||||||||||| |||||| || | |  ||||||   ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
33256393 aagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgctacaagacaagaataacagctctgcctgca 33256465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 234 - 305
Target Start/End: Original strand, 33276565 - 33276637
Alignment:
234 aagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaag-ataacagctctgcctgca 305  Q
    |||||||||||||||| |||||| || | |  ||||||   ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
33276565 aagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgctacaagacaagaataacagctctgcctgca 33276637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 234 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 36134228 - 36134156
Alignment:
234 aagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaag-ataacagctctgcctgca 305  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||   ||||||||||||| | ||||||||||||||||    
36134228 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca 36134156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0627 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 1)
Name: scaffold0627
Description:

Target: scaffold0627; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 20 - 310
Target Start/End: Original strand, 7889 - 8179
Alignment:
20 tcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagta 119  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| |||| ||||||||||| |||||||    
7889 tcagaagcagaagctcatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagatacaattgatttgtaaattcaaactgaagatccaaagta 7988  T
120 gctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaacag 219  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||| || |||| |||||||||    
7989 gctgtttctcatttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggttagctctgagtatttgtccttcgttaacag 8088  T
220 agttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaatt 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
8089 agttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatt 8179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 2)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Original strand, 7579 - 7901
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaattt-aaactgaagattcaaag 117  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||| || || || |||||||||||||||||    
7579 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcaccaccagaagttacatttgatcagtaaaattcaaactgaagattcaaag 7678  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    ||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||| || |||| |||||||    
7679 tagttgtttctcattccaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcacttgaagaacactgagtatttgtccttcgttaac 7778  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcct 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||    
7779 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcct 7878  T
317 tcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
    ||||||| |||||||||||||||    
7879 tcaagatgggaatgaatttgaag 7901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068; HSP #2
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 35 - 339
Target Start/End: Original strand, 10442 - 10748
Alignment:
35 catcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaattt-aaactgaagattcaaagtagctgtttctcgttt 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||| || || || ||||||||||||||||||||||||||||| ||     
10442 catcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcaccaccagaagttacatttgatcagtaaaattcaaactgaagattcaaagtagctgtttctcattc 10541  T
134 caacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaacagagttgacaaagtac 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||| |||| || |||| |||||||||||||||||||||||    
10542 caacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcacttgaagaacactaagtatttgtccttcgttaacagagttgacaaagtac 10641  T
234 aagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttccttcaagataggaatgaa 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||    
10642 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaa 10741  T
333 tttgaag 339  Q
    |||||||    
10742 tttgaag 10748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 2)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Original strand, 42346 - 42666
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| || |||| ||||||||||| ||||||    
42346 atcagaagcagaagctcatcagaagcaaggttttcatcagaagcgatatcatcaccagaagctacatttaatccgtaaattcaaactgaagatccaaagt 42445  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaaca 218  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| || |||| ||||||||    
42446 agctgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagcactgagtatttgtccttcgttaaca 42545  T
219 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcctt 317  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || |||  | ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| |||| ||||    
42546 gagttgacaacgtacaagtgtacaacgactacctccactactctg-ttttgtcctcgctacaagacaagacatcagctatgcctgcagaatttgtgcctt 42644  T
318 caagataggaatgaatttgaag 339  Q
    |||||| |||||||||||||||    
42645 caagatgggaatgaatttgaag 42666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 19 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 31563 - 31239
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
31563 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacttttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 31465  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    | |||| |||||  ||||  ||  || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || ||   |||||||||  ||| ||   ||||||     
31464 ttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacaaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagctcttgtctctcgttaat 31365  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |     
31364 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 31265  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaagtt 341  Q
     ||||||| |||||||||||||||||    
31264 ctcaagatgggaatgaatttgaagtt 31239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216 (Bit Score: 186; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold0216
Description:

Target: scaffold0216; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 370 - 49
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    |||| |||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||  ||| ||||||||||||||||||    
370 atcaaaagcagaaggtcatcagaagcaaggtttttatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattgattcgtatattcaaactgaagattcaaagt 271  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaaca 218  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||| || |||| ||||||||    
270 agctgtttctcatttcaacctagtctaagaaaaatgaagaattgaaaggaaggtatcaacggtcatttggatagcactgagtatttgtccttcgttaaca 171  T
219 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcctt 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||    
170 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcctt 71  T
318 caagataggaatgaatttgaag 339  Q
    |||||| ||||| |||||||||    
70 caagatgggaataaatttgaag 49  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0497 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0497
Description:

Target: scaffold0497; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 19 - 344
Target Start/End: Original strand, 10115 - 10438
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| | | |||||||||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||||     
10115 atcagaagcagaagaccatcagaagcaagattt-catcagaaactatatcatcaccagaagctacaagtgatcagtaaatttaaactgaagattcaaagg 10213  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaaca 218  Q
    |||||||| | || |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||||| |||| ||||| ||    
10214 agctgttttttgtctcaacctcgtataaga-gaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcgtttgaaaagcactgggtacttgtccttcgttatca 10312  T
219 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttccttc 318  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||  | ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||     
10313 gagttgacaaagtacaaatgtacaaccactacctccactactctgcttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaaatgttccttt 10412  T
319 aagataggaatgaatttgaagttgat 344  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||    
10413 aagatgggaatgaatttgaagttgat 10438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0272 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 2)
Name: scaffold0272
Description:

Target: scaffold0272; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Original strand, 13432 - 13753
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgt-gaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||  ||  |||| |||||||||||||||||    
13432 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaagttttcatcagaagcgaaatcaccaccagaagttacatttgattagtaaaattcaaactgaagattcaaag 13531  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    ||| |||||||| |||||||||| |||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||| ||||||     
13532 tagttgtttctcatttcaacctcatctaaggaaaacgaagaatcgaaagggaggtatcaacggtcatttcagaagcactgagtatttgtccttcgttaat 13631  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcctt 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||  | ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||    
13632 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactatgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcataattattcctt 13731  T
318 caagataggaatgaatttgaag 339  Q
    |||||| |||||||||||||||    
13732 caagatgggaatgaatttgaag 13753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0272; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 19 - 84
Target Start/End: Original strand, 13127 - 13192
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctaca 84  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
13127 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaagttttcatcagaagcgaaatcaccaccagaagttaca 13192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0072
Description:

Target: scaffold0072; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 35 - 339
Target Start/End: Original strand, 36576 - 36881
Alignment:
35 catcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttctcgtttc 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||  | ||||    
36576 catcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattgatccgtaaatttaaactggagattcaaagtagctgtttaacatttc 36675  T
135 aacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaacagagttgacaaagtaca 234  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  ||  ||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||    
36676 aaccttgtctaagaagaacgaagaattgaaagggagacatcaacggtcatttggagaaaactaagtacttgtccttcgttaacagagttaacaaagtaca 36775  T
235 agtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaag-ataacagctctgcctgcagaattgttccttcaagataggaatgaat 333  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||  | ||||| |||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
36776 agtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagaaaaacagccatgcctgcagaaatgttccttcaagatgggaatgaat 36875  T
334 ttgaag 339  Q
    ||||||    
36876 ttgaag 36881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 2)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 19 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 5724 - 5401
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| | ||| || || |||||||||||||||||||     
5724 atcagaagcagaagtccatcagaagcaagattt-catcagaagctatatcatcaccagaagctacaagtgatcagtaaaattaaactgaagattcaaagg 5626  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaaca 218  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||  ||||||| ||| || |||| ||||| ||    
5625 agctgtttttcgtttcaacctcgtctaaga-gaacgaagaattgaaagggagatatcaacggtcggttgaaaagcactgggtaattgtccttcgttatca 5527  T
219 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttccttc 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||  | ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
5526 gagttgacaaagtacaagtgtacaactactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaaatgttccttc 5427  T
319 aagataggaatgaatttgaagttgat 344  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||    
5426 aagatgggaatgaatttgaagttgat 5401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 19 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 13119 - 12896
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| | ||| || || |||||||||||||||||||     
13119 atcagaagcagaagaccatcagaagcaagattt-catcagaagctatatcatcaccagaagctacaagtgatcagtaaaattaaactgaagattcaaagg 13021  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaaca 218  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||  ||||||| ||| || |||| ||||| ||    
13020 agctgtttttcgtttcaacctcgtctaag-agaacgaagaattgaaagggagatatcaacggtcggttgaaaagcactgggtaattgtccttcgttatca 12922  T
219 gagttgacaaagtacaagtgtacaac 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
12921 gagttgacaaagtacaagtgtacaac 12896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 179; Significance: 2e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 18 - 339
Target Start/End: Original strand, 6710 - 7032
Alignment:
18 aatcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  ||| ||||||||||| ||||     
6710 aatcagaagcagaaggtcatcaaaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacatttaatccgtatattcaaactgaagatccaaac 6809  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    ||||||||||||  ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||| || | || |||| |||||||    
6810 tagctgtttctcaattcaatcttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatatggatagcactaagcatttgtccttcgttaac 6909  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcct 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||    
6910 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcct 7009  T
317 tcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
    ||||||| |||||||||||||||    
7010 tcaagatgggaatgaatttgaag 7032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0267 (Bit Score: 175; Significance: 4e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold0267
Description:

Target: scaffold0267; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 22 - 339
Target Start/End: Original strand, 6048 - 6365
Alignment:
22 agaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagtagc 121  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| |||| || |||||||| |||||||||    
6048 agaagcagaaggtcttcagaagcaaggttttcatcagaagcgtaatcatcaccagaagctacaattgatttgtaaattcaa-ctgaagatccaaagtagc 6146  T
122 tgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaacagag 221  Q
    |||||||| ||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| || |||| ||||||||||     
6147 tgtttctcatttcaacataatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatatgaaaagcactgagtatttgtccttcgttaacagaa 6246  T
222 ttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttccttcaa 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| || |||| |||| ||    
6247 ttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcaaaatttgtgccttaaa 6346  T
321 gataggaatgaatttgaag 339  Q
    ||| |||||||||||||||    
6347 gatgggaatgaatttgaag 6365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 175; Significance: 4e-94; HSPs: 2)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 19 - 344
Target Start/End: Original strand, 56608 - 56932
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||| ||||||||| | ||| || |||||| ||||| |||||||||     
56608 atcagaagcagaagaccatcagaagcaagattt-catcagaagctatatcatcaccataagctacaagtgatcagtaaatttacactgacgattcaaagg 56706  T
119 agctg-tttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| | | | ||||||| ||||| |    
56707 agctggtttttcgtttcaacctcgtctaaga-gaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcgtttgaaaagcacggggaaattttccttcgttatc 56805  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcctt 317  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
56806 agatttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaaatgttcctt 56905  T
318 caagataggaatgaatttgaagttgat 344  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||    
56906 caagatgggaatgaatttgaagttgat 56932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 274 - 347
Target Start/End: Original strand, 483 - 557
Alignment:
274 cgctacaagacaagataa-cagctctgcctgcagaattgttccttcaagataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||| |||  ||||||||| ||||||| ||||||||    
483 cgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcagaaatgttccctcagaataggaatggatttgaacttgatcct 557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 166; Significance: 9e-89; HSPs: 2)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Original strand, 53949 - 54269
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||  |  | | ||||||||||| ||||||    
53949 atcagaagcagaaggaaatcagaagcaagattttcatcaaaagcgaagtcatcaccagaagctacatttaatccatatactcaaactgaagatccaaagt 54048  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaaca 218  Q
    ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||| ||||| | || |||||||||||||    
54049 agctgtttctcatttcaatctcatctaagaagaacgaagaattgaaaggaaggtatcaacggtcatttggacagcgctgagcatttgtcctgcgttaaca 54148  T
219 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcctt 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | |||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||    
54149 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccatgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgcctt 54247  T
318 caagataggaatgaatttgaag 339  Q
    |||||| |||||||||||||||    
54248 caagatgggaatgaatttgaag 54269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 15015 - 14693
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaa-ggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||   || |||  | ||   |||| ||||||||||||    
15015 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaggttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctatgtttgatcctttaaac-aaacggaagattcaaag 14917  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||||||||| |||| ||   ||||||     
14916 tagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaat 14817  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| |||| ||    
14816 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgctttctgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaatttgtacc 14717  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
    |||||||| |||||||||||||||    
14716 ttcaagatgggaatgaatttgaag 14693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747 (Bit Score: 159; Significance: 1e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0747
Description:

Target: scaffold0747; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 3230 - 2909
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggtttt-catcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||  |  ||| ||||||||| | |||||    
3230 atcagaagcagaagttcatcagaagcaaggtttttcatcagaagctatatcatcaccagaagctacaattaatccatatattcaaactgaaggtccaaag 3131  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   ||| || || | || |||| |||||||    
3130 tagctgtttctcatttcaacctaatctaagaagaacgaagaagtgaaagggaggtatcaacggtcatttggatagctcttagcatttgtccttcgttaac 3031  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcct 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||  | ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||     
3030 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccaatacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgccc 2932  T
317 tcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
    ||||||| |||||||||||||||    
2931 tcaagatgggaatgaatttgaag 2909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 158; Significance: 5e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 19 - 256
Target Start/End: Original strand, 34984 - 35221
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| |||||||||||    
34984 atcagaagcagatggtcatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattgatccgtaaatttaaactggagattcaaagt 35083  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaaca 218  Q
    ||||||||  | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  ||  ||| ||||||| |||| ||||||||    
35084 agctgtttaacatttcaaccttgtctaagaagaacgaagaattgaaagggagacatcaacggtcatttggagaaaactaagtacttgtccttcgttaaca 35183  T
219 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccac 256  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
35184 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccac 35221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0201 (Bit Score: 152; Significance: 2e-80; HSPs: 2)
Name: scaffold0201
Description:

Target: scaffold0201; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 19 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 7659 - 7362
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||| || ||| |||||||||| |||||||     
7659 atcagaagcagaagtccatcagaagcaatattt-catcagaagctatatcatcaccagaagctacaattgatcagtaaatctaaactgaagtttcaaagg 7561  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaaca 218  Q
    |||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || ||| |||| | ||| ||    
7560 agctgtctttcgtttcaaccttgtctaaga-gaacgaaaaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaaaagcactgggtgcttgtccttctttatca 7462  T
219 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttccttc 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||    
7461 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctgcgctacaagacaagacaacagctctgcctgcataaatgttccttc 7362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0201; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 19 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 7120 - 7060
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaag 79  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
7120 atcagaagcagaaaaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaag 7060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391 (Bit Score: 150; Significance: 3e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0391
Description:

Target: scaffold0391; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Original strand, 2045 - 2364
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| |    ||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| || |||| |||||||||||  |||||    
2045 atcagaagcagaagctcatcagaagca-gaagctcatcagaagcaatatcatcaccagaagctacatttaatccgtaaattcaaactgaagataaaaagt 2143  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaaca 218  Q
    || |||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| || |||| ||||||||    
2144 agatgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattaaaagggaggtatcaacggtcatttggatagcactgagtatttgtccttcgttaaca 2243  T
219 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcaga-attgttcctt 317  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||  |||| ||||    
2244 gagttgacaaaatacaagtgtacaaccactacctccactactctg-ttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcttgcagattttgtgcctt 2342  T
318 caagataggaatgaatttgaag 339  Q
    |||||| |||||||||||||||    
2343 caagatgggaatgaatttgaag 2364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1477 (Bit Score: 149; Significance: 1e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold1477
Description:

Target: scaffold1477; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 64 - 288
Target Start/End: Original strand, 1531 - 1755
Alignment:
64 aaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattga 163  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
1531 aaatcatcaccagaagctacaattaatcagtaaatttaaactgaagattcaaagtagctatttctcgtttcaacctcatctaagaagaacgaagaattaa 1630  T
164 aagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||| | |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
1631 aagggaggtatcaacggtcatttgaagaacactgagtacttgtccttcattattagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctg 1730  T
264 agtgtgtcctcgctacaagacaaga 288  Q
      | ||||  |||||||||||||||    
1731 tttttgtctacgctacaagacaaga 1755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0154 (Bit Score: 145; Significance: 3e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0154
Description:

Target: scaffold0154; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 19 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 35965 - 35640
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||||||||| || ||| ||  ||| ||||||||  |||||||     
35965 atcagaagcagaagtccatcagaagcaagattt-catcagaagctatatcatcaccagaagctacagttgatcagtatattcaaactgaaatttcaaagg 35867  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaaca 218  Q
    |||||||| || ||  | |||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| || ||| |||| | || | |    
35866 agctgtttttcattatatcctcgtctaaga-gaacgaaggattaaaagggaggtaccaacgttcatttgaaaagcactgggtgcttgtccttctttga-a 35769  T
219 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttccttc 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
35768 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaaatgttccttc 35669  T
319 aagataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||    
35668 aagataggaatgaatttgaagttaatcct 35640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 145; Significance: 3e-76; HSPs: 4)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 19 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 175753 - 175427
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |   |||| |||||||||   |||||||||||||||| ||||| ||| || ||||||||||||||||||||||     
175753 atcagaagcagaagagcatcagaaggacattttt-atcagaagctgtatcatcaccagaagctgcaattgatcagtaaatttaaactgaagattcaaagg 175655  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaaca 218  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||  ||||| |||| | | | ||    
175654 agctatttttcgtttcaacctagtctaag-agaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaaaagcattggatacttgtccttcttcatca 175556  T
219 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttccttc 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||   | ||||  ||||||| ||||||| ||||||| ||  ||||||| |||||||||    
175555 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctatttatgtctacgctacaggacaagacaacagctttgtttgcagaaatgttccttc 175456  T
319 aagataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||    
175455 aagatgggaatgaatttgaagctgatcct 175427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 19 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 180665 - 180430
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||   |||| ||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||| || ||||||||||||||||||||||     
180665 atcagaagcagaagagcatcagaagcacattttt-atcagaagctatatcatcaccagaagctgcaattgatcagtaaatttaaactgaagattcaaagg 180567  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaaca 218  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||  ||||| |||| | | | ||    
180566 agctatttttcgtttcaacctagtctaag-agaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaaaagcattggatacttgtccttcttcatca 180468  T
219 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccac 256  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
180467 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccac 180430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #3
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 218 - 347
Target Start/End: Original strand, 40369 - 40499
Alignment:
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaag-ataacagctctgcctgcagaattgttcct 316  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  |||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||    
40369 agagttgacaaagtacaattgtacaaccactacctccacgactctgcttgtgtcttcgctacaagacaagtataacagctttgcctgcagaaatgttcct 40468  T
317 tcaagataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||    
40469 tcaagataggaatggatttgaacttgatcct 40499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #4
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 218 - 347
Target Start/End: Original strand, 58915 - 59045
Alignment:
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaag-ataacagctctgcctgcagaattgttcct 316  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  |||  |||||   | |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
58915 agagttgacaaagtacaattgtacaatcactacctccacgaatctgcttgtgtttgcactacgagacaagtataacagctctgcctgcagaaatgttcct 59014  T
317 tcaagataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||    
59015 tcaagataggaatggatttgaacttgatcct 59045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 141; Significance: 7e-74; HSPs: 3)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 19 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 128074 - 127749
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||  ||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||| || ||| |||||||||| |||||||     
128074 atcagaagcagaagttcatcagaagcaatattt-catcagaagctatatcatcaccagaagctacaattgatcagtaaatctaaactgaagtttcaaagg 127976  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaaca 218  Q
    || ||| | |||||||||||| |||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||| || ||| |||| | || | |    
127975 aggtgtctttcgtttcaaccttgtctaaga-gaacgaataattaaaagggaggtatcaacggtcatttaaaaagcactgggtgcttgtccttcattga-a 127878  T
219 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttccttc 318  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||  | ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
127877 gatttgactaagtacaagtgtacaaccactacttccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaaatgttccttc 127778  T
319 aagataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||    
127777 aagataggaatggatttgaacttgatcct 127749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 19 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 141233 - 140908
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||| | |||||||| |||| |||||||| ||| || ||| |||||||||| |||||||     
141233 atcagaagcagaagtccatcagaagcaatattt-catcagaagctatatcatcactagaaactacaattgatcagtaaatctaaactgaagtttcaaagg 141135  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaaca 218  Q
    || ||| | || |||| | || |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |  ||||||| ||  || |||| | || | |    
141134 agttgtctttcctttccatcttgtctaaga-gaacgaagaattaaaagggaggtatcaacagtcatttaaaaagcactgggtgtttgtccttcattgaaa 141036  T
219 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttccttc 318  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
141035 -agtttacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaaatgttccttc 140937  T
319 aagataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||    
140936 aagatgggaatgagtttgaagttgatcct 140908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #3
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 218 - 344
Target Start/End: Original strand, 7674 - 7801
Alignment:
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaag-ataacagctctgcctgcagaattgttcct 316  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |    
7674 agagttgacaaagtacaattgtacaaccactacctccacgactctgagtgtgtctgcgctacaagacaagtataacagctctgcctgcagaaatgttcat 7773  T
317 tcaagataggaatgaatttgaagttgat 344  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||    
7774 tcaagatatgaatgaatttgaacttgat 7801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0739 (Bit Score: 140; Significance: 3e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0739
Description:

Target: scaffold0739; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 19 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 2422 - 2098
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |  |||| ||| |||| | ||||||||||||||||||| || ||| ||  ||| ||||||||| |||||||     
2422 atcagaagcagaagtccatcagaagca-gtatttcctcataagctatatcatcaccagaagctacagttgatcagtatattcaaactgaagtttcaaagg 2324  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaaca 218  Q
    |||||||| |||||| |||||||||| |||| |||| || ||| ||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| || | |||||| | || | |    
2323 agctgtttttcgttttaacctcgtctgagaa-aacgtaggattaaaagggaggtaccaacgttcatttgaaaagcactgggtgcctttccttctttga-a 2226  T
219 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttccttc 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||   | ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
2225 gagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctatttttgtctgcgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaaatgttccttc 2126  T
319 aagataggaatgaatttgaagttgatcc 346  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
2125 aagataggaatgaatttgaagttgatcc 2098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 131; Significance: 7e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 19 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 19686 - 19444
Alignment:
19 atcagaagcagaagac-catcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaattt-aaactg-aagattcaa 115  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| || || || |||||| ||||| |||    
19686 atcagaagcagaagtctcatcagaagcaaggttttcatcagaagcgatatcatcaccagaagctacatttaatccgtaaaattcaaactgtaagatccaa 19587  T
116 agtagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaa-cgaagaatt-gaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgt 213  Q
    |||||||||||||| |||||||||  | ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| || |||| | |    
19586 agtagctgtttctcatttcaaccttatttaagaagaaacgaagaattagaaagggaggtatcaacggtcatttggatagcactgagtatttgtccttcat 19487  T
214 taacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccac 256  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
19486 taacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccac 19444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 36 - 302
Target Start/End: Original strand, 16763 - 17044
Alignment:
36 atcagaagcaaggttttcatcagaag-cgaaatcatca-ccagaag-ctacaattaatctgt-gaatttaaactgaagattcaaagtagc-tgtttctcg 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||| |||||| ||  |||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||     
16763 atcagaagcaaggttttcatcagaagtcgatatcatcacccagaagtctacatttaatccgtaaaattcaaactgaagatccaaagtagcttgtttctca 16862  T
131 tttcaacc-tcgtctaagaagaacgaagaattg-aaagggaggt-atc-aacggtcattt-gaggagcactgagtacttttcctgcg--ttaacagagtt 223  Q
    |||||||| |  ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||| ||  ||||||||||| || |||| ||  |||||||||||    
16863 tttcaacctttatctaagaagaacgaagaattgaaaaaggaggtaatcaaacggtcatttggaatagcactgagtatttgtccttcgttttaacagagtt 16962  T
224 gacaaagtacaagt-gtacaa-ccactacctccacgaccctgagtgtgtcc-tcgctacaagacaagataacagctctgcct 302  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| || |||  | |||||  ||||||||||||||| |||| || |||||    
16963 gacaaagtacaagtagtacaacccactacctccactactctgtttttgtccaacgctacaagacaagacaacacctatgcct 17044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0752 (Bit Score: 130; Significance: 3e-67; HSPs: 2)
Name: scaffold0752
Description:

Target: scaffold0752; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 138 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 2130 - 1923
Alignment:
138 ctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaacagagttgacaaagtacaagt 237  Q
    ||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||  ||||| ||||||||  ||||||| || | | |||| | || | |||||||||||||||||| |    
2130 ctcgtctaaga-gaacgaaggatcaaaagggaggtgccaacgttcatttgaaaagcactgggtgcctgtccttcattga-agagttgacaaagtacaaat 2033  T
238 gtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttccttcaagataggaatgaatttga 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
2032 gtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttccttcaagataggaatgaatttga 1933  T
338 agttgatcct 347  Q
    ||||||||||    
1932 agttgatcct 1923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0752; HSP #2
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 218 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 1437 - 1308
Alignment:
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcctt 317  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
1437 agagttgacaaagtacaaatgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcctt 1338  T
318 caagataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
1337 caagataggaatgaatttgaagttgatcct 1308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0163 (Bit Score: 130; Significance: 3e-67; HSPs: 3)
Name: scaffold0163
Description:

Target: scaffold0163; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 218 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 29707 - 29578
Alignment:
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcctt 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
29707 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcctt 29608  T
318 caagataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
29607 caagataggaatgaatttgaagttgatcct 29578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0163; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 29904 - 29840
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctaca 84  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||||||||||    
29904 atcagaagcaaaagttcatcagaagcaagattt-catcagaagctatatcatcaccagaagctaca 29840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0163; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 57
Target Start/End: Original strand, 36607 - 36645
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatca 57  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
36607 atcagaagcagaagctcatcagaagcaaggttttcatca 36645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0481 (Bit Score: 127; Significance: 2e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0481
Description:

Target: scaffold0481; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 19 - 344
Target Start/End: Original strand, 12652 - 12975
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaattta-aactgaagattcaaag 117  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||||||||| || ||| ||  ||||  |||||||| |||||||    
12652 atcagaagcagaaatccatcagaagcaagattt-catcagaagctatatcatcaccagaagctacagttgatcagtatattttgaactgaagtttcaaag 12750  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
     |||||||| |||||| || |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| || ||| |||  | || |     
12751 gagctgtttttcgttttaatctcgtctaagaa-aacgaaggattaaaagggaggtaccaacgttcatttgaaaagcactgggtgcttgtccctctttga- 12848  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcctt 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||  ||||||||||||||| ||||||| ||| || | || ||||||||    
12849 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctatgcatgaaaaaatgttcctt 12948  T
318 caagataggaatgaatttgaagttgat 344  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
12949 caagataggaatgaatttgaagttgat 12975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0073 (Bit Score: 126; Significance: 6e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0073
Description:

Target: scaffold0073; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 218 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 58533 - 58404
Alignment:
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcctt 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
58533 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctaagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcctt 58434  T
318 caagataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
58433 caagataggaatgaatttgaagttgatcct 58404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0073; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 58730 - 58666
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctaca 84  Q
    ||||||||||||||  ||||| ||||||| ||| ||||||| || | |||||||||||||||||||    
58730 atcagaagcagaagttcatcaaaagcaagattt-catcagatgctatatcatcaccagaagctaca 58666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1204 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold1204
Description:

Target: scaffold1204; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 19 - 184
Target Start/End: Original strand, 2259 - 2424
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||| |||||| || |||||||||||||| ||||||||    
2259 atcagaagtagaagcccatcagaagcaaggttttcatcagaagcaaaatcatcactagaagttacatttaatcagtaaatttaaactgaagtttcaaagt 2358  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcat 184  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
2359 agccgtttctcatttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcat 2424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0414 (Bit Score: 121; Significance: 6e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0414
Description:

Target: scaffold0414; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 19 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 2718 - 2550
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    ||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | | |||| ||||||||||| ||||||    
2718 atcagaagcagaagctcatcaggtgcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattgatttttaaattcaaactgaagatccaaagt 2619  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttg 187  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
2618 agttgtttctcatttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttg 2550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0547 (Bit Score: 118; Significance: 4e-60; HSPs: 2)
Name: scaffold0547
Description:

Target: scaffold0547; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 218 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 950 - 821
Alignment:
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcctt 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
950 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtccttgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttccca 851  T
318 caagataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
850 caagataggaatgaatttgaagttgatcct 821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0547; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 1147 - 1084
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctaca 84  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||||||||||    
1147 atcagaagcagaagtc-atcagaagcaagattt-catcagaagctatatcatcaccagaagctaca 1084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0410 (Bit Score: 113; Significance: 4e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0410
Description:

Target: scaffold0410; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 131 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 16046 - 15832
Alignment:
131 tttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaacagagttgacaaag 230  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || ||| |||| | || | ||||||||||| |    
16046 tttcaatctcgtctaagaa-aacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaaaagcactgggtgcttgtccttcattga-agagttgacaagg 15949  T
231 tacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttccttcaagataggaatg 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
15948 tacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacatctctgcctgcagaaatgttccttcaagaaaggaatg 15849  T
331 aatttgaagttgatcct 347  Q
    |||| ||||||||||||    
15848 aattagaagttgatcct 15832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 111; Significance: 6e-56; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 218 - 347
Target Start/End: Original strand, 28820 - 28950
Alignment:
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccacta-cctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcct 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
28820 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactatcctctacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcct 28919  T
317 tcaagataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||||    
28920 ttaagattggaatgaatttgaagttgatcct 28950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 83
Target Start/End: Original strand, 408034 - 408099
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctac 83  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||    
408034 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctac 408099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 35 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 1058 - 749
Alignment:
35 catcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttctcgt-tt 133  Q
    |||||||||||| |||  |||||||||| | ||||||||||||| ||||| || ||| |   ||| || ||| | |||||||  |||||| ||| |  ||    
1058 catcagaagcaaagtt--catcagaagctatatcatcaccagaaactacagttgatcagaacattcaatctggaaattcaaaagagctgtctcttgaatt 961  T
134 caacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaacagagttgacaaagtac 233  Q
     |||||||||||||| || ||||| ||  |||||||||| |||||| ||||||||  ||||||| || ||| |||| | || | ||||||||||||||||    
960 taacctcgtctaaga-gagcgaaggatcaaaagggaggtgtcaacgttcatttgaaaagcactgtgtgcttgtccttcattga-agagttgacaaagtac 863  T
234 aagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttccttcaagataggaatgaat 333  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||  | ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
862 aagtgtacaaccactacctccacaactctgagcgtgtctacactacaagacaagatagcagctctgcctgtagaattgttccttcaagataggaatgatt 763  T
334 ttgaagttgatcct 347  Q
    ||||||||||||||    
762 ttgaagttgatcct 749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #2
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 35 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 5438 - 5129
Alignment:
35 catcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttctcgt-tt 133  Q
    |||||||||||| |||  |||||||||| | ||||||||||||| ||||| || ||| |   ||| || ||| | |||||||  |||||| ||| |  ||    
5438 catcagaagcaaagtt--catcagaagctatatcatcaccagaaactacagttgatcagaacattcaatctggaaattcaaaagagctgtctcttgaatt 5341  T
134 caacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaacagagttgacaaagtac 233  Q
     |||||||||||||| || ||||| ||  |||||||||| |||||| ||||||||  ||||||| || ||| |||| | || | ||||||||||||||||    
5340 taacctcgtctaaga-gagcgaaggatcaaaagggaggtgtcaacgttcatttgaaaagcactgtgtgcttgtccttcattga-agagttgacaaagtac 5243  T
234 aagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttccttcaagataggaatgaat 333  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||  | ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
5242 aagtgtacaaccactacctccacaactctgagcgtgtctacactacaagacaagatagcagctctgcctgtagaattgttccttcaagataggaatgatt 5143  T
334 ttgaagttgatcct 347  Q
    ||||||||||||||    
5142 ttgaagttgatcct 5129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 106; Significance: 6e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 218 - 347
Target Start/End: Original strand, 59316 - 59444
Alignment:
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcctt 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
59316 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccattatctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaggacaagataacagctctgcctgcagaattg-tcctt 59414  T
318 caagataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||    
59415 caagataggaatgaatttgaagttcatcct 59444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 227 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 143143 - 143114
Alignment:
227 aaagtacaagtgtacaaccactacctccac 256  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
143143 aaagtacaagtgtacaaccactacctccac 143114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0178 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0178
Description:

Target: scaffold0178; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 19 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 27169 - 27001
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  |  ||| ||||| ||||| ||||||    
27169 atcagaagcagaaggtcatcaaaagcaaggttttcatcagaagtgaaatcatcaccagaagctacatttaatccatatattcaaactaaagatccaaagt 27070  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttg 187  Q
    || |||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
27069 agttgtttctcatttcaaccttatctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttg 27001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0226 (Bit Score: 104; Significance: 9e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0226
Description:

Target: scaffold0226; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 21 - 183
Target Start/End: Original strand, 19045 - 19208
Alignment:
21 cagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgt-gaatttaaactgaagattcaaagta 119  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| || | | ||  |||| |||||||||||||||||||    
19045 cagaagcagaaggtcatcagaagcaaggttttcatcagaagcaaaatcatcaccagaagttacatttgaacagtaaaattcaaactgaagattcaaagta 19144  T
120 gctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtca 183  Q
    |||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
19145 gctgtttaacatttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtca 19208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0027 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0027
Description:

Target: scaffold0027; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Original strand, 6667 - 6989
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
6667 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 6765  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||||||||| |||| ||   ||||||     
6766 tagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaat 6865  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |     
6866 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaagttgtacg 6965  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
    |||||||| |||||||||||||||    
6966 ttcaagatgggaatgaatttgaag 6989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 199 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 40753 - 40605
Alignment:
199 gtacttttcctgcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctct 298  Q
    |||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||  ||||||||||||||| |||||||||    
40753 gtacttgtccttcgttatcagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctct 40654  T
299 gcctgcagaattgttccttcaagataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
40653 gcctgcagaaatgttccttcaagatgggaatgaatttgaagttgatcct 40605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0386 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0386
Description:

Target: scaffold0386; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 19 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 12787 - 12465
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | |||  |||||||||||||||||    
12787 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 12689  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    |||||| |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || ||   ||||||||| |||| ||   ||||||     
12688 tagctgattctcaattcagtcttatccaagaagaacgaagaatttaaagggaggtatcaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgttaat 12589  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-ttgttcc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  | ||||||||||| | ||||||  ||||||||||| |||| |     
12588 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctactctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 12489  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaag 339  Q
     ||||||| |||||||||||||||    
12488 ctcaagatgggaatgaatttgaag 12465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 218 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 61276 - 61147
Alignment:
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcctt 317  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
61276 agagttgacaaagtacaattgtacaaccactacctccacgactctgcttgtgtctacgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaaatgttcctt 61177  T
318 caagataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
    ||||| ||||||| ||||||| ||||||||    
61176 caagaaaggaatggatttgaacttgatcct 61147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 234 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 212393 - 212282
Alignment:
234 aagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaag-ataacagctctgcctgcagaattgttccttcaagataggaatgaa 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||  | ||||   ||||||||||||| | |||||||||||||||   | ||||||||||  || |||||| |    
212393 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctatgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgc---aatgttccttcacaattggaatgga 212297  T
333 tttgaagttgatcct 347  Q
    |||||| ||||||||    
212296 tttgaaattgatcct 212282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0280 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0280
Description:

Target: scaffold0280; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 218 - 347
Target Start/End: Original strand, 17861 - 17992
Alignment:
218 agagttgacaaagtacaa-gtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataa-cagctctgcctgcagaattgttcc 315  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
17861 agagttgacaaagtacaaagtgtacaaccactacctccacgactctgcttgtgtctacgctacaagacaagataaacagctctgcctgcagaaatgttcc 17960  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
    ||||||||||||||| |||||||  |||||||    
17961 ttcaagataggaatggatttgaacatgatcct 17992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0655 (Bit Score: 76; Significance: 4e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0655
Description:

Target: scaffold0655; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 221 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 5170 - 5051
Alignment:
221 gttgacaaagtacaa-gtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataa-cagctctgcctgcagaattgttccttc 318  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||    
5170 gttgacaaagtacaaagtgtacaaccactacctccacgactctgcgtgtgtctacgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcagaaatgttccttc 5071  T
319 aagataggaatgaatttgaa 338  Q
    |||||||||||| |||||||    
5070 aagataggaatggatttgaa 5051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063 (Bit Score: 74; Significance: 7e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0063
Description:

Target: scaffold0063; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 19 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 15295 - 15128
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||   ||||||||||||||||||| || ||| ||  ||||||||||||| |||||||     
15295 atcagaagcagaagtccatcagaagcaagattt-catcagaagctgtatcatcaccagaagctacagttgatcagtatatttaaactgaagtttcaaagg 15197  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttga 188  Q
    |||||||| || ||| |||||||| |||| ||||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
15196 agctgtttttcattttaacctcgtttaag-agaacgaaggattaaaagggaggtaccaacgttcatttga 15128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0105 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 3)
Name: scaffold0105
Description:

Target: scaffold0105; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 19 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 8393 - 8068
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||| || |||  | |||  |||||||||||||||||    
8393 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 8295  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    | |||| |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || ||   | ||||||| ||||  |   | ||||     
8294 ttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaactgaaagggaggtatcaacggatatatggataacactgagcacttgcctctcattaat 8195  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcc- 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  |||||||||||||  | |     
8194 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 8095  T
316 -ttcaagataggaatgaatttgaagtt 341  Q
      ||||||| |||||||||||||||||    
8094 actcaagatgggaatgaatttgaagtt 8068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0105; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 19 - 341
Target Start/End: Original strand, 36782 - 37107
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||| || |||  | |||  |||||||||||||||||    
36782 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 36880  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    | |||| |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || ||   | ||||||| ||||  |   | ||||     
36881 ttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaactgaaagggaggtatcaacggatatatggataacactgagcacttgcctctcattaat 36980  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcc- 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  |||||||||||||  | |     
36981 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 37080  T
316 -ttcaagataggaatgaatttgaagtt 341  Q
      ||||||| |||||||||||||||||    
37081 actcaagatgggaatgaatttgaagtt 37107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0105; HSP #3
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 19 - 341
Target Start/End: Original strand, 47416 - 47741
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaag-gttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||  ||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||| || |||  | |||  |||||||||||||||||    
47416 atcagaagcagaaagtcatcagaagcaaaagttttcatcagaagcaatattttcaccagaagctacatttgatcctttaatc-aaactgaagattcaaag 47514  T
118 tagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaac 217  Q
    | |||| |||||  ||||  ||  || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || ||   | ||||||| ||||  |   | ||||     
47515 ttgctgattctcaattcagtcttatcaaagaagaacgaagaactgaaagggaggtatcaacggatatatggataacactgagcacttgcctctcattaat 47614  T
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctg-agtgtgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttcc- 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   | ||||  ||||||||||||| | ||||||  |||||||||||||  | |     
47615 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtaca 47714  T
316 -ttcaagataggaatgaatttgaagtt 341  Q
      ||||||| |||||||||||||||||    
47715 actcaagatgggaatgaatttgaagtt 47741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 19 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 70025 - 69860
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||||||||| || ||| ||  ||| ||||||||| |||||||     
70025 atcagaagcagaagtccatcagaagcaagattt-catcagaagctatatcatcaccagaagctacagttgatcagtatattcaaactgaagtttcaaagg 69927  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcattt 186  Q
    |||||||| |||||  |||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||    
69926 agctgtttttcgttataacctcgtctgag-agaacgaaggattaaaagggaggtaccaacgttcattt 69860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 218 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 61788 - 61657
Alignment:
218 agagttgacaaagtacaa-gtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagat-aacagctctgcctgcagaattgttcc 315  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| || || ||||||    
61788 agagttgacaaagtacaaagtgtacaaccactacctccacgactctgcttgtgtctacgctacaagacaagataaacagctctgcctacaaaaatgttcc 61689  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
    ||||||||||||||| |||||||  |||||||    
61688 ttcaagataggaatggatttgaacgtgatcct 61657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0604 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0604
Description:

Target: scaffold0604; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 19 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 174 - 7
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||| | ||||||||||||||||||| || ||| ||  ||| ||||||||| |||||||     
174 atcagaagcagaagtccatcagaagcaatattt-catcagaagctatatcatcaccagaagctacagttgatcagtatattcaaactgaagtttcaaagg 76  T
119 agctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttga 188  Q
    |||||||| |||||  | ||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
75 agctgtttttcgttatatcctcgtctaag-agaacgaaggattaaaagggaggtaccaacgttcatttga 7  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0314 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0314
Description:

Target: scaffold0314; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 19 - 120
Target Start/End: Original strand, 20599 - 20700
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagt 118  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || ||| ||||||||||| ||||||    
20599 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacatttaatccatgtattcaaactgaagatccaaagt 20698  T
119 ag 120  Q
    ||    
20699 ag 20700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0906 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0906
Description:

Target: scaffold0906; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 19 - 256
Target Start/End: Original strand, 4323 - 4562
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggtttt-catcagaagcgaaat--catcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaa 115  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| ||||  | |||||||||||| || || |||  | |||  |||||||||||||||    
4323 atcagaagcagaagatcattagaagcaaggtttttcatcagaagcaaaatatcttcaccagaagctgcatttgatccctcaatc-aaactgaagattcaa 4421  T
116 agtagctgtttctcgtttcaacctcgtctaagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgtta 215  Q
    ||||| ||  ||||  ||||  ||  || ||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||  || ||   ||||||||| |||| ||   |||||    
4422 agtagatgaatctcaattcagtcttatccaagaagaacaaagaatcgaaagggaggttccaacggatatatggatagcactgagcacttgtctctcgtta 4521  T
216 acagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccac 256  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
4522 atagagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccac 4562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0774 (Bit Score: 59; Significance: 6e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0774
Description:

Target: scaffold0774; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 218 - 280
Target Start/End: Original strand, 6388 - 6450
Alignment:
218 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctaca 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
6388 agagttgacaaagtacaagtgtacaaccactacctccacgaccttgagtgtgtcctcgctaca 6450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0443 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0443
Description:

Target: scaffold0443; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 274 - 347
Target Start/End: Original strand, 1117 - 1190
Alignment:
274 cgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaattgttccttcaagataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
1117 cgctacaagacaagataacagctctgtctgcagaaatgttccttcaagataggaatggatttgaacttgatcct 1190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0422 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0422
Description:

Target: scaffold0422; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 218 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 11816 - 11686
Alignment:
218 agagttgacaaagtacaa-gtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataa-cagctctgcctgcagaattgttcc 315  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || |||  | ||||  |||||||||| |||| || |||||||||||||||||||| |||    
11816 agagttgacaaagtacaaagtgtaaaaccactacctccactactctgttt-tgtctacgctacaagataagaaaaacagctctgcctgcagaattgatcc 11718  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
    ||||||||||||||| |||||||  |||||||    
11717 ttcaagataggaatggatttgaacgtgatcct 11686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0177 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0177
Description:

Target: scaffold0177; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 218 - 347
Target Start/End: Original strand, 20432 - 20562
Alignment:
218 agagttgacaaagtacaa-gtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaag-ataacagctctgcctgcagaattgttcc 315  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||  | ||||  |||||||||||||| | |||||||||||||| |||| || |||    
20432 agagttgacaaagtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgtagaaatg-tcc 20530  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
    ||||||||||||||| |||||||  |||||||    
20531 ttcaagataggaatggatttgaacgtgatcct 20562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0570 (Bit Score: 52; Significance: 9e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0570
Description:

Target: scaffold0570; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 218 - 347
Target Start/End: Original strand, 1727 - 1858
Alignment:
218 agagttgacaaagtac-aagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataa-cagctctgcctgcagaattgttcc 315  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| || |||  | ||||  ||||||||||||||| || |||||||||||  | || ||||||    
1727 agagttgacaaagtacgaagtttacaaccactacctccactactctgcttttgtctacgctacaagacaagaaaaacagctctgcctaaaaaaatgttcc 1826  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
    ||||||||||||||| |||||||  |||||||    
1827 ttcaagataggaatggatttgaacatgatcct 1858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0477 (Bit Score: 52; Significance: 9e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0477
Description:

Target: scaffold0477; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 145 - 256
Target Start/End: Original strand, 6161 - 6272
Alignment:
145 aagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaac 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||||||  | |||| ||   | |||| |||||||||||||||||||||||||||    
6161 aagaagaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggatatatggaaagcactctgcacttgtctctcattaatagagttgacaaagtacaagtgtacaac 6260  T
245 cactacctccac 256  Q
    ||||||||||||    
6261 cactacctccac 6272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 52; Significance: 9e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 218 - 347
Target Start/End: Original strand, 6577 - 6708
Alignment:
218 agagttgacaaagtac-aagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataa-cagctctgcctgcagaattgttcc 315  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || | |  | | ||  ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||    
6577 agagttgacaaagtacgaagtgtacaaccactacctccactactccgcttttttctacgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcagaaatgttcc 6676  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
    ||||  ||||||||| |||||||  |||||||    
6677 ttcagaataggaatggatttgaacgtgatcct 6708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 19 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 53466 - 53356
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggtttt-catcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||  |  | | ||||||||||| |||||    
53466 atcagaagcagaagttcatcagaagcaaagtttttcatcagaagctatatcatcaccagaagctacatttaatccatttactcaaactgaagatccaaag 53367  T
118 tagctgtttct 128  Q
    |||||||||||    
53366 tagctgtttct 53356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1321 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold1321
Description:

Target: scaffold1321; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 218 - 347
Target Start/End: Original strand, 990 - 1121
Alignment:
218 agagttgacaaagtac-aagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataa-cagctctgcctgcagaattgttcc 315  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  ||  | ||||  | ||||||||||||| || ||| ||||||||||||| ||||||    
990 agagttgacaaagtacgaagtgtacaaccactacctccactactatgcttatgtctactctacaagacaagaaaaacagttctgcctgcagaaatgttcc 1089  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
    ||||  ||||||||| |||||||  |||||||    
1090 ttcataataggaatggatttgaatgtgatcct 1121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1263 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold1263
Description:

Target: scaffold1263; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 218 - 347
Target Start/End: Original strand, 1183 - 1314
Alignment:
218 agagttgacaaagtac-aagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataa-cagctctgcctgcagaattgttcc 315  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  ||  | ||||  | ||||||||||||| || ||| ||||||||||||| ||||||    
1183 agagttgacaaagtacgaagtgtacaaccactacctccactactatgcttatgtctactctacaagacaagaaaaacagttctgcctgcagaaatgttcc 1282  T
316 ttcaagataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
    ||||  ||||||||| |||||||  |||||||    
1283 ttcataataggaatggatttgaatgtgatcct 1314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0185 (Bit Score: 47; Significance: 9e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0185
Description:

Target: scaffold0185; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 218 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 9352 - 9278
Alignment:
218 agagttgacaaagtacaa-gtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataa 291  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||  ||||||||||||||||||    
9352 agagttgacaaagtacaaagtgtacaaccactacctccacgactctgcttgtgtctacgctacaagacaagataa 9278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 51 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 22260 - 22030
Alignment:
51 ttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaagtagctgtttctcg-tttcaacctcgtctaagaa 149  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||| || ||| |   ||| ||  ||||| |||||| | ||||||| | | ||| ||||||||||||||     
22260 ttcatcagaagctatatcatcaccagaagctacagttgatcagaagattcaatttgaagtttcaaa-tggctgtttattggttttaacctcgtctaaga- 22163  T
150 gaacgaagaattgaaagggaggtatcaacggtcatttgaggagcactgagtacttttcctgcgttaacagagttgacaaagtacaagtgtacaaccacta 249  Q
    || ||||  | | ||||| |||| |||||| ||||||||  ||||||| || ||| ||||  ||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||    
22162 gagcgaaagactcaaaggaaggtgtcaacgttcatttgaaaagcactgggtgcttgtcctttgttga-agagttgacaaagtacaattgtacaaccacta 22064  T
250 cctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaaga 283  Q
    ||||||| || |||  ||||||  ||||||||||    
22063 cctccacaactctgcctgtgtctacgctacaaga 22030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0334 (Bit Score: 44; Significance: 6e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0334
Description:

Target: scaffold0334; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 19 - 129
Target Start/End: Original strand, 19618 - 19728
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaa-ggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctacaattaatctgtgaatttaaactgaagattcaaag 117  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  || |||  | || | |||||||||||||||||    
19618 atcagaagcagaaggtcatcagaagcaaaggttttcatcagaagcaatatcttcaccagaagctacgtttgatcctttaa-tcaaactgaagattcaaag 19716  T
118 tagctgtttctc 129  Q
    |||||| |||||    
19717 tagctgattctc 19728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 44; Significance: 6e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 222 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 17007 - 16880
Alignment:
222 ttgacaaagtac-aagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataa-cagctctgcctgcagaattgttccttca 319  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||   | ||||  ||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||    
17007 ttgacaaagtacgaagtgtacgaccactacctccactactctatttatgtctacgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcataaatgttccttca 16908  T
320 agataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
      ||||||||| |||||||  |||||||    
16907 gaataggaatggatttgaacgtgatcct 16880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0269
Description:

Target: scaffold0269; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 274 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 7283 - 7209
Alignment:
274 cgctacaagacaagataa-cagctctgcctgcagaattgttccttcaagataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||    
7283 cgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcagaaaagttccttcaagataggaatggatttgaacgtgatcct 7209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 274 - 347
Target Start/End: Original strand, 4008 - 4082
Alignment:
274 cgctacaagacaagataa-cagctctgcctgcagaattgttccttcaagataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||    
4008 cgctacaagacaagaaaaacagctctacctgcagaaaagttccttcaagataggaatggatttgaacgtgatcct 4082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0544 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0544
Description:

Target: scaffold0544; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 309 - 347
Target Start/End: Original strand, 9907 - 9945
Alignment:
309 ttgttccttcaagataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
9907 ttgttccttcaagataggaatgaatttgaagttgatcct 9945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0544; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 84
Target Start/End: Original strand, 9730 - 9794
Alignment:
19 atcagaagcagaagaccatcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctaca 84  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||  ||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||    
9730 atcagaagcagaagttcatcagaagcaaaattt-catccgaagctatatcatcaccagaagctaca 9794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 234 - 343
Target Start/End: Original strand, 15694 - 15804
Alignment:
234 aagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataa-cagctctgcctgcagaattgttccttcaagataggaatgaa 332  Q
    |||||||| ||||||| |||||| || |||  | ||||  ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||| |||  ||||||||| |    
15694 aagtgtacgaccactatctccactactctgtttatgtctacgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcagaaatgttccctcagaataggaatgga 15793  T
333 tttgaagttga 343  Q
    |||||| ||||    
15794 tttgaacttga 15804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 234 - 347
Target Start/End: Original strand, 38157 - 38270
Alignment:
234 aagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaagataa-cagctctgcctgcagaattgttccttcaagataggaatgaa 332  Q
    |||||||| |||||||||||||| || |||  | ||||   |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| |    
38157 aagtgtacgaccactacctccactactctgttt-tgtctatgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcagaaatgttccatcaaaataggaatgga 38255  T
333 tttgaagttgatcct 347  Q
    ||||||  |||||||    
38256 tttgaacgtgatcct 38270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 234 - 315
Target Start/End: Original strand, 165018 - 165100
Alignment:
234 aagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaag-ataacagctctgcctgcagaattgttcc 315  Q
    |||||||| |||||||||||||| || |||  | ||||  |||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||    
165018 aagtgtacgaccactacctccactactctgtttatgtctacgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcagaaatgttcc 165100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0664 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0664
Description:

Target: scaffold0664; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 278 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 1363 - 1310
Alignment:
278 acaagacaagataa-cagctctgcctgcagaattgttccttcaagataggaatg 330  Q
    ||||||||||| || ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
1363 acaagacaagaaaaacagctctgcatgcagaaatgttccttcaagataggaatg 1310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0337 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0337
Description:

Target: scaffold0337; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 234 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 14687 - 14615
Alignment:
234 aagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaag-ataacagctctgcctgca 305  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | |  ||||||   ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
14687 aagtgtacaaccactacctccactactcagtttgtgtctctgctacaagacaagaataacagctctgcctgca 14615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0069 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0069
Description:

Target: scaffold0069; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 234 - 305
Target Start/End: Original strand, 5397 - 5469
Alignment:
234 aagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaa-gataacagctctgcctgca 305  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||   ||||||||| || |||||||||||||||||||    
5397 aagtgtacaaccactacttccactactctgagtttgtctctgctacaagaaaaggataacagctctgcctgca 5469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 316 - 347
Target Start/End: Original strand, 38120 - 38151
Alignment:
316 ttcaagataggaatgaatttgaagttgatcct 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
38120 ttcaagataggaatgaatttgaagttgatcct 38151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 277 - 338
Target Start/End: Original strand, 1912 - 1974
Alignment:
277 tacaagacaagataa-cagctctgcctgcagaattgttccttcaagataggaatgaatttgaa 338  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||| |||  ||||||||| |||||||    
1912 tacaagacaagaaaaacagctctgcctgcagaaatgttccctcagaataggaatggatttgaa 1974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 163538 - 163490
Alignment:
35 catcagaagcaaggttttcatcagaagcgaaatcatcaccagaagctaca 84  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||||||||||    
163538 catcagaagcaagattt-catcagaagctatatcatcaccagaagctaca 163490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0387 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0387
Description:

Target: scaffold0387; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 234 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 7420 - 7348
Alignment:
234 aagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaag-ataacagctctgcctgca 305  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || |||  | |||||  ||||||||||||| | ||||||||||||||||    
7420 aagtgtacaaccactacttccactactctgtttttgtccctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca 7348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 234 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 9995 - 9923
Alignment:
234 aagtgtacaaccactacctccacgaccctgagtgtgtcctcgctacaagacaa-gataacagctctgcctgca 305  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | |  ||||||   |||||||||||| |||||||||| ||||||||    
9995 aagtgtacaaccactacctccactactcagtttgtgtcgctgctacaagacaaggataacagctatgcctgca 9923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University