View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF9703_high_8 (Length: 431)

Name: NF9703_high_8
Description: NF9703
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF9703_high_8
NF9703_high_8
[»] chr7 (18 HSPs)
chr7 (10-414)||(2099325-2099729)
chr7 (10-414)||(2690950-2691354)
chr7 (10-311)||(2126688-2126989)
chr7 (10-414)||(2135959-2136363)
chr7 (10-414)||(2244775-2245179)
chr7 (10-311)||(2073702-2074002)
chr7 (10-311)||(2066601-2066902)
chr7 (10-311)||(2114798-2115099)
chr7 (10-307)||(2139298-2139595)
chr7 (31-242)||(2057553-2057764)
chr7 (19-309)||(1695827-1696117)
chr7 (236-403)||(2057228-2057398)
chr7 (345-415)||(2126605-2126675)
chr7 (345-414)||(2073620-2073689)
chr7 (345-414)||(2139209-2139278)
chr7 (346-414)||(2066513-2066581)
chr7 (346-414)||(2114716-2114784)
chr7 (377-415)||(2054599-2054637)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 269; Significance: 1e-150; HSPs: 18)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 10 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 2099729 - 2099325
Alignment:
Q  10 agcacagattgttattcatgggatggcattaaatgtcatgagcacacaaatcaagtgattcacattgatcttagtagcagccaactctatggtacaatgg 109  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2099729 agcacagattgttgttcatgggatggcattaaatgtcatgagcacacaaatcaagtgattcacattgatcttagtagcagccaactctatggtaaaatgg 2099630  T
Q  110 atgcaaatagcagtctatttcgccttgtacaccttcgagttcttgatctttctgacaatgaattcaattaccctcaaatcccgtccaagataggtcagct 209  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2099629 atgcaaatagcagtctctttcgccttgtacaccttcgagttcttgatctttctgacaatgacttcaattactctccaatcccgtccaagataggtcagct 2099530  T
Q  210 ttcacaattgaaatatttgaacctttctcttagcttattttctggagaaattccaccacaagtttcacagttgtccaaattgaggtctcttgatctaggc 309  Q
    ||||||||| ||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||  ||||||||||||||||    
T  2099529 ttcacaattaaaacatctgaacctttcccttagcttattttctggagaaattccaccacatgtttcacagttgtcaaagttgttgtctcttgatctaggc 2099430  T
Q  310 ttgaaaactattgtcagtcctaaaggtagtgtagtcaatctgttgcaactcaaactgtccagcttcaaaagcataattcaaaactcaacaaaacttgaga 409  Q
    |  | | |||| ||   |||||||||||||  |  |||| |||||||||||||| |||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2099429 tacagagctatagtacatcctaaaggtagtacatccaatttgttgcaactcaaattgtctagtctcagaagcataattcaaaactcaacaaaaattgaga 2099330  T
Q  410 tcctt 414  Q
    |||||    
T  2099329 tcctt 2099325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 10 - 414
Target Start/End: Original strand, 2690950 - 2691354
Alignment:
Q  10 agcacagattgttattcatgggatggcattaaatgtcatgagcacacaaatcaagtgattcacattgatcttagtagcagccaactctatggtacaatgg 109  Q
    ||||||||||| |  || |||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2690950 agcacagattgctgctcgtgggatggaattaaatgtcacgagcacacagatcatgtgattcacatcgatcttagtagcagccaactttatggtacaatgg 2691049  T
Q  110 atgcaaatagcagtctatttcgccttgtacaccttcgagttcttgatctttctgacaatgaattcaattaccctcaaatcccgtccaagataggtcagct 209  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||| || ||||||||||||||||||||  |||    
T  2691050 atgcaaatagcagtctctttcgtcttgtgcaccttcgagttcttgatctttctgataataacttcaattactctaaaatcccgtccaagataggtatgct 2691149  T
Q  210 ttcacaattgaaatatttgaacctttctcttagcttattttctggagaaattccaccacaagtttcacagttgtccaaattgaggtctcttgatctaggc 309  Q
    ||| ||| | |||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||    
T  2691150 ttcgcaactaaaatttctgaacctttctcttagcttattctctggagaaattccaccacaaatttcacagttgtccaagctgcagtctcttgatctaggc 2691249  T
Q  310 ttgaaaactattgtcagtcctaaaggtagtgtagtcaatctgttgcaactcaaactgtccagcttcaaaagcataattcaaaactcaacaaaacttgaga 409  Q
    || | |  ||| |  |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| || |||||||||||||    
T  2691250 ttaagagatatagcaagtcctaaaggtagtgcagttaatctgttgcaactcaaattgtccagcctcaaaagcataattaaaaattccacaaaacttgaga 2691349  T
Q  410 tcctt 414  Q
    |||||    
T  2691350 tcctt 2691354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 10 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 2126989 - 2126688
Alignment:
Q  10 agcacagattgttattcatgggatggcattaaatgtcatgagcacacaaatcaagtgattcacattgatcttagtagcagccaactctatggtacaatgg 109  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2126989 agcacagattgttgctcatgggatggcattaaatgtcatgagcacacagaccatgtgattcacattgatcttagtagcagccaactctatggtacaatgg 2126890  T
Q  110 atgcaaatagcagtctatttcgccttgtacaccttcgagttcttgatctttctgacaatgaattcaattaccctcaaatcccgtccaagataggtcagct 209  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  2126889 atgcaaatagcagtctctttcgccttgtgcaccttcgagttcttgatctttctgacaatgacttcaattactctcaaatcccatccaagataggtgagct 2126790  T
Q  210 ttcacaattgaaatatttgaacctttctcttagcttattttctggagaaattccaccacaagtttcacagttgtccaaattgaggtctcttgatctaggc 309  Q
    ||||||||| ||| || |||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||    
T  2126789 ttcacaattaaaacatctgaacctttccctgagcttcttttctggagaaattccaccacaagtttcacagttgtccaagttgttgtctcttgatctaggc 2126690  T
Q  310 tt 311  Q
    ||    
T  2126689 tt 2126688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 10 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 2136363 - 2135959
Alignment:
Q  10 agcacagattgttattcatgggatggcattaaatgtcatgagcacacaaatcaagtgattcacattgatcttagtagcagccaactctatggtacaatgg 109  Q
    ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2136363 agcacagattgctgctcatgggatggcattaaatgtcataagcacacagatcatgtgattcacatcaatcttagtagcagccaactctatggtacaatgg 2136264  T
Q  110 atgcaaatagcagtctatttcgccttgtacaccttcgagttcttgatctttctgacaatgaattcaattaccctcaaatcccgtccaagataggtcagct 209  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||| || |||||||  ||||||||||| ||||    
T  2136263 atgcaaatagcagtctctttcgccttgtgcaccttcgagttcttgatctatctgataataacttcaattactctaaaatccctaccaagataggtgagct 2136164  T
Q  210 ttcacaattgaaatatttgaacctttctcttagcttattttctggagaaattccaccacaagtttcacagttgtccaaattgaggtctcttgatctaggc 309  Q
    ||||||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||     
T  2136163 ttcacaactaaaatttttgaacctttctcttaacttattttctggagaaattccacgacaagtttcccagttgtccaagttgttgtctcttgatctaggt 2136064  T
Q  310 ttgaaaactattgtcagtcctaaaggtagtgtagtcaatctgttgcaactcaaactgtccagcttcaaaagcataattcaaaactcaacaaaacttgaga 409  Q
    || | | |||| ||  ||||||||||||||  |  |||| |||||||||||||| |||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2136063 ttcagagctatagtacgtcctaaaggtagtacatccaatttgttgcaactcaaattgtctagtctcagaagcataattcaaaactcaacaaaaattgaga 2135964  T
Q  410 tcctt 414  Q
    |||||    
T  2135963 tcctt 2135959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 10 - 414
Target Start/End: Original strand, 2244775 - 2245179
Alignment:
Q  10 agcacagattgttattcatgggatggcattaaatgtcatgagcacacaaatcaagtgattcacattgatcttagtagcagccaactctatggtacaatgg 109  Q
    ||||||||||| |  |||||||||||||||||||| || ||||||||  |||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2244775 agcacagattgctgctcatgggatggcattaaatgccacgagcacactgatcatgtgatccatattgatctaagtagcagccaactctatggtacaatgg 2244874  T
Q  110 atgcaaatagcagtctatttcgccttgtacaccttcgagttcttgatctttctgacaatgaattcaattaccctcaaatcccgtccaagataggtcagct 209  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2244875 atgcaaatagcagtctctttcgccttgtacaccttcgattacttgatctttttgacaacgacttcaattactctcaaatcccgtccaagataggtgagct 2244974  T
Q  210 ttcacaattgaaatatttgaacctttctcttagcttattttctggagaaattccaccacaagtttcacagttgtccaaattgaggtctcttgatctaggc 309  Q
    ||||||| | |||||| | ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||     
T  2244975 ttcacaactaaaatatctaaacctttctattagcttattttcaggagaaattccacaacaattttcacagttgtccaagttgttgtctcttgatctaggt 2245074  T
Q  310 ttgaaaactattgtcagtcctaaaggtagtgtagtcaatctgttgcaactcaaactgtccagcttcaaaagcataattcaaaactcaacaaaacttgaga 409  Q
    || | | |||| ||  ||||||||||||||  |  |||| |||||||||||||| |||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2245075 ttcagagctatagtacgtcctaaaggtagtacatccaatttgttgcaactcaaattgtctagtctcagaagcataattcaaaactcaacaaaaattgaga 2245174  T
Q  410 tcctt 414  Q
    |||||    
T  2245175 tcctt 2245179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 10 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 2074002 - 2073702
Alignment:
Q  10 agcacagattgttattcatgggatggcattaaatgtcatgagcacacaaatcaagtgattcacattgatcttagtagcagccaactctatggtacaatgg 109  Q
    |||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2074002 agcacagattgttgctcatgggatg-cgttaaatgtcatgagcacacagaccatgtgattcacattgatcttagtagcagccaactctatggtagaatgg 2073904  T
Q  110 atgcaaatagcagtctatttcgccttgtacaccttcgagttcttgatctttctgacaatgaattcaattaccctcaaatcccgtccaagataggtcagct 209  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  2073903 atgcaaatagcagtctctttcgccttgtgcaccttcgagttcttgatctttctgacaatgacttcaattactctcaaatcccatccaagataggtgagct 2073804  T
Q  210 ttcacaattgaaatatttgaacctttctcttagcttattttctggagaaattccaccacaagtttcacagttgtccaaattgaggtctcttgatctaggc 309  Q
    ||||||||| ||| || |||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||    
T  2073803 ttcacaattaaaacatctgaaactttccctgagcttcttttctggagaaattccaccacaagtttcacagttgtccaagttgttgtctcttgatctaggc 2073704  T
Q  310 tt 311  Q
    ||    
T  2073703 tt 2073702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 10 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 2066902 - 2066601
Alignment:
Q  10 agcacagattgttattcatgggatggcattaaatgtcatgagcacacaaatcaagtgattcacattgatcttagtagcagccaactctatggtacaatgg 109  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2066902 agcacagattgttgctcatgggatggcattaaatgtcatgagcacactgatcatgtgattcatattgatctaagtagcagccaactctacggtacaatgg 2066803  T
Q  110 atgcaaatagcagtctatttcgccttgtacaccttcgagttcttgatctttctgacaatgaattcaattaccctcaaatcccgtccaagataggtcagct 209  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  2066802 atgcaaatagcagtctctttcgccttgtgcaccttcgagttcttgatctttccgacaatgacttcaattactctcaaatcccatccaagataggtaagct 2066703  T
Q  210 ttcacaattgaaatatttgaacctttctcttagcttattttctggagaaattccaccacaagtttcacagttgtccaaattgaggtctcttgatctaggc 309  Q
    ||||||| | |||| | |||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||    
T  2066702 ttcacaactaaaatttctgaacctttctcgtagtttattttccggagaaattccaccacaagtttcacagctgtccaagttgttgtctcttgatctaggc 2066603  T
Q  310 tt 311  Q
    ||    
T  2066602 tt 2066601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 10 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 2115099 - 2114798
Alignment:
Q  10 agcacagattgttattcatgggatggcattaaatgtcatgagcacacaaatcaagtgattcacattgatcttagtagcagccaactctatggtacaatgg 109  Q
    ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| | |||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  2115099 agcacagattgctgctcatgggatggcattaaatgtcatgagcgcacagatcatgtgattcacgtcgatcttaggagcagccaaatctatggtacaatgg 2115000  T
Q  110 atgcaaatagcagtctatttcgccttgtacaccttcgagttcttgatctttctgacaatgaattcaattaccctcaaatcccgtccaagataggtcagct 209  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||  ||||    
T  2114999 atgcaaatagcagtctctttcgccttgtgcaccttcgagttcttgatctttctgacaatgacttcaattactctcaaatcccatccaagataggcgagct 2114900  T
Q  210 ttcacaattgaaatatttgaacctttctcttagcttattttctggagaaattccaccacaagtttcacagttgtccaaattgaggtctcttgatctaggc 309  Q
    ||||||| | |||| | |||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||||||||||||||    
T  2114899 ttcacaactaaaatttctgaacctttctcgtagtttattttccggagaaattccaccacaagtttcacagttgtctaagttgttgtctcttgatctaggc 2114800  T
Q  310 tt 311  Q
    ||    
T  2114799 tt 2114798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 10 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 2139595 - 2139298
Alignment:
Q  10 agcacagattgttattcatgggatggcattaaatgtcatgagcacacaaatcaagtgattcacattgatcttagtagcagccaactctatggtacaatgg 109  Q
    ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||    
T  2139595 agcacagattgctgctcatgggatggcattaaatgtcacgagcacacaggtcatgtgattcacattgatctaagtagcagccaactctacggtagaatgg 2139496  T
Q  110 atgcaaatagcagtctatttcgccttgtacaccttcgagttcttgatctttctgacaatgaattcaattaccctcaaatcccgtccaagataggtcagct 209  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| || |||||||||||| ||||    
T  2139495 atgcaaatagcagtctctttcgccttgtgcatcttcgagttcttgatctttctgacaatgacttcaattactctcaaattccatccaagataggtaagct 2139396  T
Q  210 ttcacaattgaaatatttgaacctttctcttagcttattttctggagaaattccaccacaagtttcacagttgtccaaattgaggtctcttgatctag 307  Q
    ||||||| | |||| | |||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||    
T  2139395 ttcacaactaaaatttctgaacctttctcgtagtttattttccggagaaattccaccacaagtttcacagttgtccaagttgttgtctcttgatctag 2139298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 31 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 2057764 - 2057553
Alignment:
Q  31 gatggcattaaatgtcatgagcacacaaatcaagtgattcacattgatcttagtagcagccaactctatggtacaatggatgcaaatagcagtctatttc 130  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  2057764 gatggcattaaatgtcatcagcacacaaatcaagtgattcacattgatcttagtagcagtcaactctacggtacattggttgcaaatagcagtctatttc 2057665  T
Q  131 gccttgtacaccttcgagttcttgatctttctgacaatgaattcaattaccctcaaatcccgtccaagataggtcagctttcacaattgaaatatttgaa 230  Q
     |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||| ||||||||| ||||| ||| | | |||| | ||||    
T  2057664 accttgtgcaccttcaagttcttgatctttctgacaatgacttcaattactccaaaatcccgtctaagataggtgagcttccacgactaaaatttctgaa 2057565  T
Q  231 cctttctcttag 242  Q
    ||||||||||||    
T  2057564 cctttctcttag 2057553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 19 - 309
Target Start/End: Original strand, 1695827 - 1696117
Alignment:
Q  19 tgttattcatgggatggcattaaatgtcatgagcacacaaatcaagtgattcacattgatcttagtagcagccaactctatggtacaatggatgcaaata 118  Q
    |||| |||||||||||| |||  |||| || || |||||||||| ||  ||  |||||||||||||||||||   |||||||||| |||  |||| ||||    
T  1695827 tgttgttcatgggatggaattcgatgtgatcagaacacaaatcatgtcgttagcattgatcttagtagcagcatgctctatggtaaaattcatgctaata 1695926  T
Q  119 gcagtctatttcgccttgtacaccttcgagttcttgatctttctgacaatgaattcaattaccctcaaatcccgtccaagataggtcagctttcacaatt 218  Q
     |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | || ||||| ||||| ||| ||| |||||| || | ||||||  ||||||| ||  |    
T  1695927 acagtctgtttcgccttgtgcaccttcgagttcttgatcttgcagataatgatttcaaatactctcgaatcccatctaggataggcgagctttcgcagat 1696026  T
Q  219 gaaatatttgaacctttctcttagcttattttctggagaaattccaccacaagtttcacagttgtccaaattgaggtctcttgatctaggc 309  Q
     |||||||| |||||||||| || |  | |||  |||||||||||||| ||||||||| |  | ||||| |||  ||||||||||||||||    
T  1696027 aaaatatttaaacctttctcgtaccaaacttttcggagaaattccaccgcaagtttcaaaactatccaacttgttgtctcttgatctaggc 1696117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 236 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 2057398 - 2057228
Alignment:
Q  236 ctcttagcttattttctggagaaattccaccacaagtttcacagttgtccaaattgaggtctcttgatct---aggcttgaaaactattgtcagtcctaa 332  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||   |||||||||||   |||||| | | || | ||   ||||||    
T  2057398 ctcttagcttattttctagagaaattccaccacaagtttcacagttgttcatgttgctctctcttgatcttggaggctttagagctgtagtacatcctaa 2057299  T
Q  333 aggtagtgtagtcaatctgttgcaactcaaactgtccagcttcaaaagcataattcaaaactcaacaaaac 403  Q
    |||||||  |  ||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2057298 aggtagtacatccaatctgttgcaattaaaattgtccagcctcaaaagcataattcaaaactcaacaaaac 2057228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 345 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 2126675 - 2126605
Alignment:
Q  345 caatctgttgcaactcaaactgtccagcttcaaaagcataattcaaaactcaacaaaacttgagatccttc 415  Q
    ||||||| ||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2126675 caatctgctgcaactcaaattatccagtctcaaaagcataattcaaaactcaacaaaacttgagacccttc 2126605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 345 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 2073689 - 2073620
Alignment:
Q  345 caatctgttgcaactcaaactgtccagcttcaaaagcataattcaaaactcaacaaaacttgagatcctt 414  Q
    ||||||| ||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2073689 caatctgctgcaactcaaattatccagtctcaaaagcataattcaaaactcaacaaaacttgagaccctt 2073620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 345 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 2139278 - 2139209
Alignment:
Q  345 caatctgttgcaactcaaactgtccagcttcaaaagcataattcaaaactcaacaaaacttgagatcctt 414  Q
    ||||||| ||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2139278 caatctgctgcaactcaaattatccagtctcaaaagcataattcaaaactcaacaaaacttgagaccctt 2139209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 346 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 2066581 - 2066513
Alignment:
Q  346 aatctgttgcaactcaaactgtccagcttcaaaagcataattcaaaactcaacaaaacttgagatcctt 414  Q
    |||||| ||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2066581 aatctgctgcaactcaaattatccagtctcaaaagcataattcaaaactcaacaaaacttgagaccctt 2066513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 346 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 2114784 - 2114716
Alignment:
Q  346 aatctgttgcaactcaaactgtccagcttcaaaagcataattcaaaactcaacaaaacttgagatcctt 414  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2114784 aatctgctgcaactcaaattgtccattctcaaaagcataattcaaaactcaacaaaactcgagatcctt 2114716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 377 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 2054637 - 2054599
Alignment:
Q  377 aaagcataattcaaaactcaacaaaacttgagatccttc 415  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  2054637 aaagcataattcaaagctcaacaaaacttgagatgcttc 2054599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University