View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF9710_high_1 (Length: 411)

Name: NF9710_high_1
Description: NF9710
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF9710_high_1
NF9710_high_1
[»] chr4 (90 HSPs)
chr4 (1-360)||(40632434-40632794)
chr4 (3-341)||(379371-379710)
chr4 (1-349)||(41639415-41639762)
chr4 (1-341)||(41964404-41964743)
chr4 (1-342)||(35662430-35662767)
chr4 (1-349)||(50673678-50674025)
chr4 (1-373)||(2209702-2210078)
chr4 (1-299)||(8648128-8648432)
chr4 (1-303)||(12073381-12073685)
chr4 (1-299)||(8665397-8665693)
chr4 (1-258)||(6655945-6656203)
chr4 (1-267)||(54883009-54883278)
chr4 (1-258)||(27416886-27417144)
chr4 (1-279)||(26364225-26364504)
chr4 (1-249)||(46703489-46703740)
chr4 (23-382)||(50262495-50262857)
chr4 (1-178)||(56178637-56178816)
chr4 (1-178)||(26175637-26175815)
chr4 (1-170)||(9927467-9927637)
chr4 (1-178)||(36463390-36463568)
chr4 (1-178)||(47038412-47038588)
chr4 (1-178)||(12739551-12739729)
chr4 (1-178)||(36994513-36994691)
chr4 (1-178)||(54199908-54200085)
chr4 (1-178)||(5429668-5429846)
chr4 (45-285)||(26699335-26699577)
chr4 (1-178)||(34570415-34570593)
chr4 (1-170)||(37740614-37740784)
chr4 (1-178)||(46147392-46147570)
chr4 (1-178)||(48893639-48893821)
chr4 (1-178)||(52095363-52095541)
chr4 (1-178)||(48143031-48143211)
chr4 (1-276)||(12119527-12119810)
chr4 (1-178)||(5871809-5871987)
chr4 (1-178)||(52467355-52467533)
chr4 (1-180)||(29999804-29999985)
chr4 (1-184)||(31474139-31474324)
chr4 (34-296)||(33989867-33990131)
chr4 (1-178)||(5370083-5370266)
chr4 (24-178)||(12743926-12744080)
chr4 (24-178)||(12745315-12745469)
chr4 (1-184)||(6542174-6542360)
chr4 (1-141)||(12747794-12747935)
chr4 (1-362)||(21688237-21688591)
chr4 (1-178)||(29254483-29254661)
chr4 (1-139)||(12745476-12745615)
chr4 (1-178)||(45687183-45687362)
chr4 (1-178)||(3913437-3913614)
chr4 (1-184)||(37229716-37229901)
chr4 (17-230)||(22882703-22882913)
chr4 (17-230)||(22934367-22934577)
chr4 (2-137)||(24969102-24969238)
chr4 (1-182)||(4587947-4588130)
chr4 (12-178)||(13992293-13992461)
chr4 (1-102)||(55085442-55085543)
chr4 (4-181)||(5207840-5208018)
chr4 (33-139)||(12744087-12744193)
chr4 (32-259)||(33089899-33090129)
chr4 (1-182)||(51337053-51337235)
chr4 (187-340)||(55085286-55085433)
chr4 (12-178)||(31495316-31495485)
chr4 (1-121)||(52082715-52082836)
chr4 (201-341)||(46703739-46703879)
chr4 (1-99)||(41639252-41639351)
chr4 (12-178)||(8393394-8393562)
chr4 (12-178)||(8395603-8395771)
chr4 (1-170)||(13009453-13009610)
chr4 (25-103)||(5349924-5350002)
chr4 (1-162)||(48142393-48142557)
chr4 (33-230)||(34112839-34113034)
chr4 (33-184)||(21703830-21703983)
chr4 (1-123)||(53345206-53345330)
chr4 (20-138)||(6677477-6677597)
chr4 (23-103)||(34788851-34788930)
chr4 (23-184)||(44967823-44967985)
chr4 (135-224)||(38811144-38811235)
chr4 (33-103)||(32091500-32091570)
chr4 (17-117)||(44570427-44570527)
chr4 (145-184)||(24969799-24969838)
chr4 (5-184)||(29056351-29056532)
chr4 (111-175)||(5136165-5136230)
chr4 (111-175)||(5138390-5138455)
chr4 (268-341)||(54881561-54881629)
chr4 (24-119)||(16422666-16422761)
chr4 (188-246)||(32091618-32091677)
chr4 (24-100)||(1983250-1983325)
chr4 (187-233)||(3786139-3786185)
chr4 (20-78)||(35369542-35369600)
chr4 (20-78)||(35370449-35370507)
chr4 (188-245)||(6199801-6199858)
[»] chr2 (52 HSPs)
chr2 (1-382)||(45726918-45727298)
chr2 (1-360)||(1631552-1631911)
chr2 (1-360)||(35446707-35447063)
chr2 (1-337)||(42287953-42288289)
chr2 (1-336)||(17450580-17450898)
chr2 (36-292)||(33648195-33648454)
chr2 (1-178)||(33162451-33162629)
chr2 (1-178)||(36318010-36318188)
chr2 (1-178)||(38312229-38312407)
chr2 (1-178)||(723745-723923)
chr2 (1-178)||(17057370-17057548)
chr2 (1-178)||(17085353-17085531)
chr2 (1-178)||(2334418-2334597)
chr2 (59-341)||(7451166-7451448)
chr2 (1-178)||(36773551-36773729)
chr2 (1-173)||(29867858-29868031)
chr2 (1-178)||(34139771-34139950)
chr2 (1-178)||(6595006-6595186)
chr2 (1-178)||(36988076-36988255)
chr2 (1-178)||(5723256-5723434)
chr2 (1-164)||(42362341-42362505)
chr2 (1-170)||(14633834-14634005)
chr2 (1-184)||(17490143-17490321)
chr2 (1-178)||(45099743-45099922)
chr2 (3-178)||(11151592-11151768)
chr2 (1-267)||(24398044-24398318)
chr2 (1-178)||(4503133-4503312)
chr2 (1-171)||(11690490-11690661)
chr2 (1-178)||(11067294-11067472)
chr2 (12-178)||(32289565-32289732)
chr2 (1-178)||(36205665-36205843)
chr2 (33-178)||(4484330-4484477)
chr2 (1-178)||(30833334-30833514)
chr2 (6-181)||(26353178-26353354)
chr2 (1-143)||(13121758-13121899)
chr2 (1-184)||(7815269-7815452)
chr2 (1-184)||(11049539-11049727)
chr2 (12-178)||(6266691-6266859)
chr2 (17-267)||(30217956-30218207)
chr2 (1-113)||(24885650-24885763)
chr2 (12-175)||(13656035-13656200)
chr2 (1-141)||(14202450-14202584)
chr2 (12-178)||(12647386-12647555)
chr2 (107-178)||(39284932-39285003)
chr2 (33-299)||(42261363-42261632)
chr2 (1-119)||(12123644-12123763)
chr2 (3-55)||(39284876-39284929)
chr2 (33-119)||(34811281-34811368)
chr2 (57-139)||(42019910-42019995)
chr2 (33-99)||(41446161-41446227)
chr2 (70-167)||(28671989-28672088)
chr2 (33-119)||(41454256-41454343)
[»] chr7 (75 HSPs)
chr7 (1-358)||(34310535-34310895)
chr7 (1-382)||(4508505-4508885)
chr7 (4-373)||(4510356-4510724)
chr7 (4-373)||(4512198-4512566)
chr7 (43-375)||(32357863-32358190)
chr7 (1-339)||(3258984-3259322)
chr7 (1-341)||(8359157-8359496)
chr7 (1-311)||(29608726-29609037)
chr7 (1-299)||(48599213-48599513)
chr7 (1-349)||(2360811-2361151)
chr7 (1-341)||(2390271-2390615)
chr7 (54-349)||(6359784-6360077)
chr7 (1-184)||(22269962-22270146)
chr7 (1-174)||(6431960-6432134)
chr7 (1-171)||(30024740-30024911)
chr7 (1-178)||(27347806-27347984)
chr7 (1-178)||(14069834-14070012)
chr7 (1-178)||(14379862-14380040)
chr7 (1-178)||(31732970-31733148)
chr7 (1-178)||(23555028-23555208)
chr7 (1-178)||(35853903-35854082)
chr7 (1-178)||(29991043-29991221)
chr7 (1-178)||(43864233-43864411)
chr7 (1-170)||(47673953-47674122)
chr7 (1-161)||(48491568-48491729)
chr7 (33-262)||(22328306-22328538)
chr7 (1-184)||(31105388-31105572)
chr7 (3-178)||(41317435-41317611)
chr7 (1-167)||(1113646-1113813)
chr7 (1-171)||(47676144-47676315)
chr7 (1-178)||(26417305-26417482)
chr7 (1-178)||(48489420-48489598)
chr7 (1-173)||(4586150-4586323)
chr7 (1-178)||(8153331-8153509)
chr7 (5-178)||(18126637-18126811)
chr7 (1-178)||(36146409-36146587)
chr7 (5-178)||(495984-496158)
chr7 (1-178)||(41649012-41649189)
chr7 (23-178)||(25615865-25616021)
chr7 (1-178)||(38671223-38671401)
chr7 (37-178)||(2759198-2759339)
chr7 (3-184)||(4253523-4253706)
chr7 (1-171)||(23565069-23565243)
chr7 (12-178)||(39731369-39731537)
chr7 (1-178)||(19502166-19502346)
chr7 (1-178)||(25766960-25767137)
chr7 (23-184)||(31518915-31519076)
chr7 (1-184)||(23343964-23344146)
chr7 (1-121)||(31518784-31518905)
chr7 (1-178)||(12097868-12098038)
chr7 (1-159)||(4178763-4178921)
chr7 (12-178)||(20343897-20344064)
chr7 (1-184)||(36574511-36574694)
chr7 (12-178)||(43504154-43504323)
chr7 (1-178)||(48408791-48408972)
chr7 (85-173)||(24525508-24525596)
chr7 (1-92)||(4538627-4538719)
chr7 (12-178)||(24789841-24790009)
chr7 (12-178)||(6592340-6592509)
chr7 (12-178)||(18388760-18388929)
chr7 (12-178)||(18392196-18392365)
chr7 (1-90)||(24525985-24526076)
chr7 (23-171)||(3904624-3904773)
chr7 (12-178)||(6594558-6594727)
chr7 (87-180)||(18396393-18396488)
chr7 (107-178)||(30814532-30814603)
chr7 (33-141)||(5116626-5116735)
chr7 (12-178)||(32060322-32060493)
chr7 (97-173)||(1560671-1560749)
chr7 (91-184)||(5513662-5513755)
chr7 (23-97)||(43363556-43363629)
chr7 (3-75)||(5514113-5514186)
chr7 (197-299)||(1360051-1360154)
chr7 (316-350)||(30814698-30814732)
chr7 (316-349)||(22270249-22270282)
[»] chr1 (80 HSPs)
chr1 (1-373)||(13548810-13549179)
chr1 (1-360)||(11348687-11349049)
chr1 (1-382)||(13546894-13547268)
chr1 (1-338)||(37168286-37168622)
chr1 (1-349)||(47255171-47255519)
chr1 (1-304)||(31925581-31925886)
chr1 (1-349)||(29136236-29136585)
chr1 (83-360)||(37876585-37876862)
chr1 (1-360)||(37032888-37033252)
chr1 (1-341)||(47115160-47115502)
chr1 (5-341)||(7482064-7482406)
chr1 (1-349)||(42297807-42298154)
chr1 (1-342)||(34603565-34603894)
chr1 (1-254)||(19754483-19754737)
chr1 (1-247)||(193600-193849)
chr1 (1-258)||(19752674-19752930)
chr1 (88-341)||(28242382-28242635)
chr1 (1-178)||(834168-834346)
chr1 (1-178)||(3156854-3157032)
chr1 (1-178)||(28220227-28220405)
chr1 (1-178)||(31659227-31659405)
chr1 (1-178)||(49918339-49918517)
chr1 (1-178)||(8550787-8550966)
chr1 (1-178)||(28265555-28265733)
chr1 (1-178)||(4552638-4552816)
chr1 (1-178)||(13659337-13659515)
chr1 (1-178)||(28223422-28223600)
chr1 (1-173)||(44455149-44455322)
chr1 (1-171)||(50169218-50169389)
chr1 (1-178)||(46064907-46065085)
chr1 (1-178)||(13137977-13138153)
chr1 (1-178)||(3189319-3189498)
chr1 (1-178)||(3198136-3198315)
chr1 (1-178)||(3206975-3207154)
chr1 (1-178)||(41360903-41361081)
chr1 (1-178)||(10925212-10925393)
chr1 (1-178)||(45644355-45644534)
chr1 (1-178)||(50167176-50167354)
chr1 (12-178)||(13316352-13316520)
chr1 (1-184)||(23555261-23555444)
chr1 (1-178)||(37503558-37503733)
chr1 (1-178)||(37559868-37560048)
chr1 (1-178)||(3847122-3847300)
chr1 (1-181)||(15820296-15820477)
chr1 (1-164)||(1833511-1833675)
chr1 (3-175)||(20762662-20762837)
chr1 (1-171)||(196915-197087)
chr1 (1-184)||(927971-928156)
chr1 (1-184)||(16455611-16455794)
chr1 (1-178)||(40122197-40122377)
chr1 (11-178)||(30476447-30476615)
chr1 (17-184)||(22079322-22079491)
chr1 (33-178)||(51765416-51765565)
chr1 (12-178)||(9987202-9987369)
chr1 (12-178)||(20622237-20622406)
chr1 (1-169)||(37282701-37282870)
chr1 (12-178)||(9036417-9036584)
chr1 (1-81)||(37879009-37879090)
chr1 (12-178)||(40282377-40282545)
chr1 (3-249)||(12318452-12318700)
chr1 (38-267)||(6808479-6808710)
chr1 (23-184)||(36683702-36683853)
chr1 (239-339)||(194750-194845)
chr1 (22-184)||(3460706-3460869)
chr1 (12-175)||(21053958-21054123)
chr1 (12-178)||(44203631-44203800)
chr1 (19-246)||(2926516-2926746)
chr1 (1-98)||(8871129-8871227)
chr1 (48-184)||(2262968-2263106)
chr1 (59-249)||(9109347-9109540)
chr1 (17-119)||(16914234-16914338)
chr1 (1-169)||(44650172-44650342)
chr1 (61-189)||(5459956-5460085)
chr1 (111-181)||(8871060-8871130)
chr1 (17-128)||(13938143-13938255)
chr1 (36-128)||(32471486-32471578)
chr1 (33-119)||(25652108-25652195)
chr1 (17-103)||(1050520-1050606)
chr1 (33-118)||(4535541-4535627)
chr1 (33-95)||(35109496-35109557)
[»] scaffold0466 (1 HSPs)
scaffold0466 (1-373)||(7316-7684)
[»] chr8 (63 HSPs)
chr8 (1-300)||(4283513-4283813)
chr8 (5-347)||(18655393-18655738)
chr8 (1-373)||(42434797-42435170)
chr8 (1-359)||(11383975-11384332)
chr8 (1-338)||(40328768-40329102)
chr8 (1-258)||(40221734-40221992)
chr8 (1-341)||(3772181-3772521)
chr8 (1-258)||(10930118-10930378)
chr8 (1-178)||(15212775-15212953)
chr8 (1-178)||(27811267-27811445)
chr8 (1-178)||(33352139-33352317)
chr8 (1-178)||(43036412-43036590)
chr8 (1-178)||(34256507-34256685)
chr8 (1-178)||(42498182-42498362)
chr8 (1-184)||(1292459-1292642)
chr8 (1-178)||(4731647-4731825)
chr8 (1-178)||(34254331-34254509)
chr8 (1-172)||(18141810-18141981)
chr8 (1-178)||(31218245-31218425)
chr8 (1-170)||(30143329-30143499)
chr8 (1-178)||(40321069-40321247)
chr8 (1-183)||(4162489-4162668)
chr8 (1-178)||(19491700-19491878)
chr8 (1-178)||(17982641-17982821)
chr8 (3-178)||(3303671-3303847)
chr8 (1-178)||(12702635-12702818)
chr8 (1-178)||(5689260-5689438)
chr8 (1-178)||(6598961-6599139)
chr8 (1-178)||(6674414-6674592)
chr8 (1-178)||(1345372-1345550)
chr8 (1-178)||(19945359-19945540)
chr8 (1-178)||(9765734-9765911)
chr8 (1-178)||(1746219-1746398)
chr8 (1-170)||(30291595-30291767)
chr8 (1-178)||(44303842-44304023)
chr8 (3-141)||(44353784-44353923)
chr8 (1-173)||(18106087-18106257)
chr8 (1-181)||(8965689-8965870)
chr8 (16-172)||(41366622-41366778)
chr8 (12-176)||(2627735-2627902)
chr8 (1-178)||(4743215-4743382)
chr8 (49-184)||(10015119-10015252)
chr8 (2-141)||(1822282-1822423)
chr8 (2-141)||(1856727-1856868)
chr8 (156-258)||(2999723-2999825)
chr8 (1-167)||(8153753-8153914)
chr8 (1-81)||(10929788-10929869)
chr8 (12-178)||(25689955-25690122)
chr8 (12-178)||(3439504-3439671)
chr8 (89-178)||(4733784-4733873)
chr8 (71-183)||(3073870-3073981)
chr8 (45-171)||(7597648-7597776)
chr8 (45-141)||(11712038-11712135)
chr8 (23-100)||(41364926-41365003)
chr8 (31-120)||(10240173-10240264)
chr8 (157-297)||(10240270-10240411)
chr8 (33-103)||(3231872-3231943)
chr8 (61-155)||(32902197-32902292)
chr8 (111-175)||(42575327-42575392)
chr8 (111-174)||(15290624-15290688)
chr8 (111-174)||(15470993-15471057)
chr8 (187-246)||(11137203-11137262)
chr8 (204-246)||(9633546-9633588)
[»] chr3 (87 HSPs)
chr3 (1-373)||(6095408-6095778)
chr3 (1-373)||(54593693-54594068)
chr3 (1-341)||(46860463-46860804)
chr3 (1-346)||(30236114-30236461)
chr3 (1-360)||(49199284-49199649)
chr3 (1-349)||(43401627-43401981)
chr3 (28-373)||(55301776-55302132)
chr3 (1-341)||(41819363-41819702)
chr3 (1-349)||(43403570-43403924)
chr3 (1-349)||(47304240-47304591)
chr3 (33-343)||(46173379-46173688)
chr3 (5-258)||(4569945-4570202)
chr3 (4-341)||(36018844-36019178)
chr3 (8-178)||(34491208-34491379)
chr3 (1-178)||(44331534-44331712)
chr3 (1-173)||(40735372-40735545)
chr3 (1-178)||(7762254-7762433)
chr3 (1-178)||(45095153-45095331)
chr3 (1-178)||(40734487-40734665)
chr3 (1-178)||(19683889-19684068)
chr3 (1-178)||(9581272-9581450)
chr3 (1-171)||(22835010-22835181)
chr3 (1-178)||(29196387-29196566)
chr3 (1-178)||(37408447-37408626)
chr3 (1-178)||(5236458-5236635)
chr3 (1-178)||(16499019-16499196)
chr3 (1-178)||(44700480-44700657)
chr3 (1-178)||(760836-761014)
chr3 (1-178)||(51398803-51398981)
chr3 (1-184)||(53921498-53921682)
chr3 (4-178)||(29813055-29813230)
chr3 (1-178)||(29682348-29682526)
chr3 (1-178)||(29810857-29811035)
chr3 (1-170)||(31314434-31314604)
chr3 (1-178)||(5258144-5258324)
chr3 (1-178)||(7764456-7764632)
chr3 (1-178)||(39153362-39153540)
chr3 (70-258)||(40913352-40913544)
chr3 (1-178)||(5260323-5260503)
chr3 (1-178)||(23200138-23200316)
chr3 (162-360)||(31340047-31340240)
chr3 (1-184)||(32891092-32891277)
chr3 (1-178)||(9636126-9636306)
chr3 (1-178)||(23197939-23198117)
chr3 (1-178)||(9666467-9666646)
chr3 (1-178)||(23391910-23392088)
chr3 (12-178)||(801091-801260)
chr3 (25-178)||(32744437-32744589)
chr3 (15-178)||(7780004-7780168)
chr3 (1-178)||(23410330-23410508)
chr3 (5-112)||(31340268-31340376)
chr3 (12-178)||(6716500-6716667)
chr3 (12-178)||(54635125-54635292)
chr3 (1-103)||(5433952-5434057)
chr3 (17-276)||(20937662-20937923)
chr3 (1-140)||(51352150-51352289)
chr3 (110-183)||(2075071-2075144)
chr3 (12-178)||(45282983-45283154)
chr3 (12-178)||(3617449-3617618)
chr3 (1-104)||(5373220-5373326)
chr3 (17-122)||(35138762-35138868)
chr3 (31-119)||(25491027-25491116)
chr3 (12-175)||(25637426-25637592)
chr3 (45-140)||(33191866-33191960)
chr3 (1-63)||(26386597-26386660)
chr3 (195-300)||(5270557-5270663)
chr3 (17-123)||(4055819-4055926)
chr3 (112-184)||(27305705-27305777)
chr3 (17-115)||(3148054-3148153)
chr3 (12-175)||(4600747-4600914)
chr3 (23-81)||(28253365-28253423)
chr3 (1-103)||(8166533-8166635)
chr3 (1-221)||(26323027-26323253)
chr3 (111-175)||(4598526-4598591)
chr3 (111-175)||(10056319-10056384)
chr3 (111-175)||(10058541-10058606)
chr3 (111-175)||(10060763-10060828)
chr3 (111-175)||(10062985-10063050)
chr3 (111-175)||(10065207-10065272)
chr3 (111-175)||(10211495-10211560)
chr3 (316-360)||(34491488-34491530)
chr3 (36-155)||(39127572-39127693)
chr3 (33-128)||(54739004-54739100)
chr3 (45-128)||(1313855-1313939)
chr3 (33-99)||(4386876-4386941)
chr3 (157-209)||(49229607-49229659)
chr3 (111-175)||(10209275-10209340)
[»] chr6 (49 HSPs)
chr6 (1-349)||(21588920-21589268)
chr6 (1-373)||(26829927-26830303)
chr6 (1-373)||(17758012-17758384)
chr6 (1-338)||(2972777-2973118)
chr6 (1-349)||(17762979-17763329)
chr6 (1-349)||(5043616-5043966)
chr6 (1-349)||(3808534-3808888)
chr6 (1-361)||(22424644-22425006)
chr6 (1-207)||(21593653-21593860)
chr6 (54-341)||(26800630-26800917)
chr6 (1-258)||(603005-603259)
chr6 (1-184)||(28137403-28137587)
chr6 (1-178)||(9183032-9183210)
chr6 (1-178)||(5406200-5406378)
chr6 (1-178)||(5410525-5410703)
chr6 (5-178)||(33211186-33211360)
chr6 (1-178)||(2171532-2171710)
chr6 (1-178)||(26954287-26954464)
chr6 (1-171)||(5413401-5413572)
chr6 (1-176)||(30834538-30834716)
chr6 (1-178)||(31404675-31404853)
chr6 (1-178)||(16452329-16452509)
chr6 (1-156)||(3038926-3039082)
chr6 (1-178)||(33160352-33160532)
chr6 (12-178)||(412101-412270)
chr6 (12-178)||(3072759-3072928)
chr6 (16-178)||(16569037-16569189)
chr6 (12-178)||(6097451-6097608)
chr6 (87-171)||(5409076-5409161)
chr6 (1-135)||(4045412-4045548)
chr6 (12-178)||(27647861-27648028)
chr6 (12-178)||(16554869-16555037)
chr6 (12-178)||(16578518-16578686)
chr6 (12-178)||(16616694-16616862)
chr6 (12-178)||(16631425-16631593)
chr6 (12-178)||(16653112-16653280)
chr6 (33-261)||(25073590-25073826)
chr6 (12-178)||(25421305-25421474)
chr6 (88-286)||(9572667-9572868)
chr6 (12-178)||(6027246-6027415)
chr6 (111-178)||(34167180-34167248)
chr6 (282-349)||(602942-603004)
chr6 (17-103)||(5740074-5740160)
chr6 (111-175)||(13154015-13154080)
chr6 (23-79)||(16567208-16567265)
chr6 (111-175)||(33342108-33342173)
chr6 (111-175)||(34164958-34165023)
chr6 (33-103)||(186736-186806)
chr6 (135-181)||(14521676-14521722)
[»] chr5 (68 HSPs)
chr5 (1-346)||(213454-213803)
chr5 (1-341)||(27637454-27637792)
chr5 (1-258)||(40147250-40147508)
chr5 (1-349)||(5058036-5058383)
chr5 (9-349)||(27015528-27015856)
chr5 (1-184)||(28278305-28278489)
chr5 (1-173)||(13488192-13488365)
chr5 (1-184)||(16452069-16452253)
chr5 (1-178)||(533758-533936)
chr5 (1-178)||(25412750-25412928)
chr5 (1-178)||(42428431-42428609)
chr5 (1-299)||(16640818-16641119)
chr5 (1-178)||(39468550-39468728)
chr5 (1-178)||(13239740-13239919)
chr5 (1-171)||(538014-538185)
chr5 (1-178)||(32636813-32636991)
chr5 (1-178)||(42426236-42426414)
chr5 (1-178)||(33831669-33831847)
chr5 (1-173)||(28750661-28750834)
chr5 (33-261)||(316784-317014)
chr5 (1-178)||(8565947-8566125)
chr5 (1-180)||(31182962-31183140)
chr5 (3-173)||(38746996-38747167)
chr5 (1-178)||(13343049-13343228)
chr5 (1-178)||(30182577-30182756)
chr5 (12-178)||(16409475-16409643)
chr5 (33-178)||(37439163-37439309)
chr5 (1-184)||(3075653-3075837)
chr5 (12-178)||(18441648-18441816)
chr5 (12-178)||(26177883-26178050)
chr5 (12-178)||(9789224-9789392)
chr5 (1-171)||(30682930-30683100)
chr5 (1-178)||(36074043-36074224)
chr5 (3-184)||(13695685-13695868)
chr5 (1-181)||(9049340-9049520)
chr5 (1-167)||(42309947-42310114)
chr5 (229-349)||(40751195-40751311)
chr5 (229-349)||(40763200-40763316)
chr5 (1-105)||(5887490-5887595)
chr5 (12-178)||(29720364-29720532)
chr5 (12-178)||(29751160-29751328)
chr5 (12-178)||(26170774-26170930)
chr5 (12-178)||(22536290-22536457)
chr5 (12-178)||(29722524-29722692)
chr5 (114-261)||(4160702-4160850)
chr5 (12-178)||(10593258-10593426)
chr5 (1-78)||(19806372-19806449)
chr5 (26-184)||(33906024-33906184)
chr5 (85-184)||(42926965-42927064)
chr5 (12-178)||(25078120-25078289)
chr5 (12-178)||(25136089-25136258)
chr5 (17-141)||(10054854-10054978)
chr5 (33-140)||(3325935-3326043)
chr5 (102-178)||(19806454-19806530)
chr5 (12-178)||(40380090-40380259)
chr5 (12-178)||(40382301-40382470)
chr5 (17-103)||(30802835-30802920)
chr5 (18-247)||(10700580-10700809)
chr5 (55-112)||(42926911-42926968)
chr5 (33-119)||(35616191-35616278)
chr5 (24-128)||(22097877-22097980)
chr5 (60-141)||(8445764-8445846)
chr5 (111-175)||(16544509-16544574)
chr5 (111-175)||(16546731-16546796)
chr5 (70-240)||(30793195-30793362)
chr5 (316-350)||(28278592-28278626)
chr5 (316-373)||(38747281-38747336)
chr5 (316-349)||(40147538-40147571)
[»] scaffold0176 (1 HSPs)
scaffold0176 (5-373)||(17811-18178)
[»] scaffold0236 (1 HSPs)
scaffold0236 (1-342)||(10479-10820)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (1-178)||(149098-149276)
[»] scaffold0286 (1 HSPs)
scaffold0286 (1-178)||(11546-11725)
[»] scaffold0002 (2 HSPs)
scaffold0002 (1-178)||(434521-434701)
scaffold0002 (33-299)||(490198-490467)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (8-178)||(20416-20587)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (1-178)||(114591-114770)
[»] scaffold1519 (1 HSPs)
scaffold1519 (1-178)||(905-1083)
[»] scaffold0491 (2 HSPs)
scaffold0491 (1-178)||(11161-11341)
scaffold0491 (1-178)||(8735-8915)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (1-119)||(80343-80462)
[»] scaffold0219 (1 HSPs)
scaffold0219 (56-181)||(27439-27566)
[»] scaffold0565 (1 HSPs)
scaffold0565 (12-178)||(2604-2773)
[»] scaffold0053 (1 HSPs)
scaffold0053 (23-128)||(25066-25171)
[»] scaffold0674 (1 HSPs)
scaffold0674 (111-175)||(3729-3794)
[»] scaffold0137 (1 HSPs)
scaffold0137 (12-175)||(6272-6438)
[»] scaffold0197 (1 HSPs)
scaffold0197 (195-276)||(1298-1379)
[»] scaffold0927 (1 HSPs)
scaffold0927 (288-340)||(3431-3482)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 273; Significance: 1e-152; HSPs: 90)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Original strand, 40632434 - 40632794
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg-aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  40632434 tgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacctatttgtatctcttt 40632533  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaacatttcttcttgttgttatcttt 199  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||    
T  40632534 gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctctaaagtaagtcaagttggaccgaactgggtaaacatttcttggtgttgttatcttt 40632633  T
Q  200 tctttactctctttatcttgtttatcctttggttgaattgtggttttgctatgcacttggtttatagactaggtctatattattgttattgcttgtggtt 299  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40632634 tttttactctctttatcttgtttatcctttggttgaattgtggttttgccatgcacttggtatatagactaggtctatattgttgttattgcttgtggtt 40632733  T
Q  300 tatttacatttgattattggttgccattaatacttgctccacacatcatatagtttgtatt 360  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  40632734 tatttacatttggttattggttgccattgatacttgctctacacatcatatagtttgtatt 40632794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 3 - 341
Target Start/End: Original strand, 379371 - 379710
Alignment:
Q  3 tcttgttcattggtgagattg-gaaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctttgt 101  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  379371 tcttgttcatttgtgagattgagaaaatgggtagaaattaggtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatcgctttgt 379470  T
Q  102 aagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaa-gttggaccgaactgggtgaacatttcttcttgttgttatctttt 200  Q
    |||| || |||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  379471 aagaactaattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcattgttggaccgaactggatgaacatttcttggtgttgttatctttt 379570  T
Q  201 ctttactctctttatcttgtttatcctttggttgaattgtggttttgctatgcacttggtttatagactaggtctatattattgttattgcttgtggttt 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||    
T  379571 ctttactctctttatcttgtttatcctttggttagattgtggttttgttatgcacttggtttatagactaggtctatattgttgttgttgtttgtgg-tt 379669  T
Q  301 atttacatttgattattggttgccattaatacttgctccac 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  379670 atttacatttgattattggttgccactgatacttgctccac 379710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Original strand, 41639415 - 41639762
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg-aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    ||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  41639415 tgtcttgtttattggtaagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaactttttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctattt 41639514  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaacatttcttcttgttgttatcttt 199  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||| ||    
T  41639515 gtaagaactcatcgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggaccgaactgagtgaacatttcttggtgttgttatcgtt 41639614  T
Q  200 tctttactctctttatcttgtttatcctttggttgaattgtggttttgctatgcacttggtttatagactaggtctatatta---ttgttattgcttgtg 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||     ||||| |||||||||    
T  41639615 tctttactctctttatcttgtttatcctttggttgaattgtggttttgctatgcacttgatt-atagactaggtctatatatcatttgttgttgcttgtg 41639713  T
Q  297 gtttatttacatttgattattggttgccattaatacttgctccacacatcata 349  Q
    |||||    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41639714 gttta----catttggttattggttgccattgatacttgctccacacatcata 41639762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 341
Target Start/End: Original strand, 41964404 - 41964743
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg-aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccattt-gtatctctt 98  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||| ||||| |||    
T  41964404 tgtcttgttcgttggtgaaattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttattgtaacccattttgtatccctt 41964503  T
Q  99 tgtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaacatttcttcttgttgttatctt 198  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  41964504 tgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgagcatttcttggtgttgttatctt 41964603  T
Q  199 ttctttactctctttatcttgtttatcctttggttgaattgtggttttgctatgcacttggtttatagactaggtctatattattgttattgcttgtggt 298  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||| |||| ||| ||||||||||||||||     
T  41964604 ttctttactctc--tatcttgtttatcctttggttagattgtggttttgctatgcacttgttttctagattagatctagattgttgttattgcttgtgg- 41964700  T
Q  299 ttatttacatttgattattggttgccattaatacttgctccac 341  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  41964701 ttatttacatttgattgttggttgccattgatacttgctccac 41964743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Original strand, 35662430 - 35662767
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattggaaaa-tggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  35662430 tgtcttgttcattggtgagattgaaaaaatgggtagaaattagggttgttctttatgagtttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt 35662529  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaacatttcttcttgttgttatcttt 199  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||  |||||||||||||    
T  35662530 gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatatctcctcaagagtaggtcaagttggaccgaactgaatgaacattttttggtgttgttatcttt 35662629  T
Q  200 tctttactctctttatcttgtttatcctttggttgaattgtggttttgctatgcacttggtttatagactaggtctatattattgttattgcttgtggtt 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||||    
T  35662630 tctttactctctttatcttgtttattccttggttggattgtggttttgctatgcacttggtttatagactatgtctatattgttgttgttgcttatggtt 35662729  T
Q  300 tatttacatttgattattggttgccattaatacttgctccaca 342  Q
     ||     |||| || |||||||||||| ||||||||||||||    
T  35662730 aat-----tttggttgttggttgccattgatacttgctccaca 35662767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 50674025 - 50673678
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattg-gaaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    |||| |||||||| ||||||||| |||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  50674025 tgtcgtgttcatttgtgagattgagaaaatgagtagaaattaggattgt-ctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt 50673927  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaacatttcttcttgttgttatcttt 199  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  50673926 gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggaccgaactaggtgaacatttcttggtgttgttatcttt 50673827  T
Q  200 tctttactctctttatcttgttta-tcctttggttgaattgtggttttgctatgcacttggtttatagactaggtctatattattgttattgcttgtggt 298  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||   ||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||     
T  50673826 tctttactctctttatcttgtttattccttgctttggattgtggttttgctatgcactt-gattatagactagatctatattgttgttattgcttatgg- 50673729  T
Q  299 ttatttacatttgattattggttgccattaatacttgctccacacatcata 349  Q
    | ||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  50673728 tgatttacatttggttattggttgacattgatacttgctccacacatcata 50673678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 373
Target Start/End: Original strand, 2209702 - 2210078
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg-aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccattt-gtatctctt 98  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  2209702 tgtcttgttcattgttgagattgggaaaatgggtagaaattagggtttttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccattttgtatctctt 2209801  T
Q  99 tgtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaacatt-tcttcttgttgttatc 196  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| | ||||  ||||||| ||    
T  2209802 tgtaagaactcattgatagtggattggagagattaatctctcctccagagtaggtcatggttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgttgttgtc 2209901  T
Q  197 t---tttctttactctctttatcttgtttatcctttggttgaattgtggttttgctatgcacttggtttatagactaggtctatattattgttattgctt 293  Q
    |   ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||| |||| ||| ||||||||| ||    
T  2209902 tatttttctctactctctttatcttgtttatcatttggttagattgtggttttgctatgcacttgttttctagattagatctagattgttgttattgttt 2210001  T
Q  294 gtggtttatttacatttgattattggttgccattaatacttgctccacacatcatatagtttgtattagcgggaaatttg 373  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| | | ||||||||    
T  2210002 gtgg-ttatttacatttggttattggttgccattgatacttgctccacacatc--atagtttgtattggtgtgaaatttg 2210078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Original strand, 8648128 - 8648432
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg-aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  8648128 tgtcttgttcattggtgagaatgggaaaatggatagaaattagggttgttcattgtgagtttgttgaagctaatttcttataacccatttgtatctcttt 8648227  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaacatttcttcttgttgttatcttt 199  Q
    |||||| |||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  8648228 gtaagaactcattgatattggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggaccaaactgggtgaacatttcttggtgttgttatcttt 8648327  T
Q  200 tctttactctctttatcttgtttatcctttggttgaattgtggttttgctatgcacttggtt---tatagactaggtc--tatattattgttattgcttg 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||    ||||||||||||  |||||| ||||| |||||||    
T  8648328 tctttactctctttatcttgtttattccttggttggattgtggttttgctatgcatttgattatagatagactaggtctatatattgttgttgttgcttg 8648427  T
Q  295 tggtt 299  Q
    |||||    
T  8648428 tggtt 8648432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 12073381 - 12073685
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg-aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    ||||||| | |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||    
T  12073381 tgtcttgcttattggtgagattgggaaaatgggtagaaattaggtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaactcatttgtatctcttt 12073480  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaa-gttggaccgaactgggtgaacatttcttcttgttgttatctt 198  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||| || |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||    
T  12073481 gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcttccagagtaggtcattgttggaccgaactaggtgaacatttcttggtgttgttatctt 12073580  T
Q  199 ttctttactctctttatcttgtttatcctttggttgaattgtggttttgctatgcacttggtttatagactaggtctatattattgttattgcttgtggt 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| |||| ||| ||||| |||||||||||    
T  12073581 ttctttactctctttatcttgtttattctttggttagattgtggttttgttatgcacttggtttctagattagatctagattgttgttgttgcttgtggt 12073680  T
Q  299 ttatt 303  Q
    |||||    
T  12073681 ttatt 12073685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Original strand, 8665397 - 8665693
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg-aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8665397 tgtcttgttcattggtgagaatgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgagagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt 8665496  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaacatttcttcttgttgttatcttt 199  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||  |||||||||||||    
T  8665497 gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggaccaaactaggtgtacatttcttggtgttgttatcttt 8665596  T
Q  200 tctttactctctttatcttgtttatcctttggttgaattgtggttttgctatgcacttggtttatagactaggtctatattattgttattgcttgtggtt 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||| || | ||||||| || | ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  8665597 tctttactctctttatcttgtttattccttggttggattgtggttttgctatgca-tttgattataga-ta-gactatattgttgttgttgcttgtggtt 8665693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 258
Target Start/End: Original strand, 6655945 - 6656203
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattggaaaa-tggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    ||||||||||| | ||||||||| |||| ||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  6655945 tgtcttgttcacttgtgagattgaaaaaatgggtagaaattaaggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt 6656044  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaacatttcttcttgttgttatcttt 199  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  6656045 gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcatccagagtaggtcaagttggaccgaattgggtgaacatttcttggtgttgttatcttt 6656144  T
Q  200 tctttactctctttatcttgtttatcctttggttgaattgtggttttgctatgcacttg 258  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  6656145 tctttactctctttatcttgtttatccttttgttggattgtggttttgctatgcacttg 6656203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 267
Target Start/End: Original strand, 54883009 - 54883278
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg-aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  54883009 tgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttttttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt 54883108  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaac-atttcttcttgttgttatc-t 197  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||| |    
T  54883109 gtaagaactcattgatagtggattggagggatcaatctctcctccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaatttcttggtgttgttatctt 54883208  T
Q  198 tttctttactctctttatcttgtttatcctttggttgaattgtggttttgctatgcacttggtttataga 267  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  54883209 tttctttactctctttatcttatttattctttggttgaattgtggttttgctctgcatttggtttataga 54883278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 27417144 - 27416886
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg-aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27417144 tgtcttgttcattggtgagattggtaaaatgtgtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt 27417045  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaacatttcttcttgttgttatcttt 199  Q
    |||| | ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||| || |||| |  ||  ||||||||||||     
T  27417044 gtaaaaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgagtcaacaatctttggtgttgttatcttg 27416945  T
Q  200 tctttactctctttatcttgtttatcctttggttgaattgtggttttgctatgcacttg 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  27416944 tctttactctctttatcttgtttattctttggttggattgtggttttgccatgcacttg 27416886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Original strand, 26364225 - 26364504
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg-aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  26364225 tgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt 26364324  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaac-atttcttcttgttgttatctt 198  Q
    |||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||||||| | ||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||    
T  26364325 gtaagaactcattaatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaagtttgactgaactgggtcaacaatttcttggtgttgttatctt 26364424  T
Q  199 ttctttactctctttatcttgtttatcctttggttgaattgtggttttgctatgcacttggtttatagactaggtctatat 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| |||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||||||    
T  26364425 ttctttactctctttatcttgtttattccttgcttggattgtggttttgctatacactt-aattatagactaggtctatat 26364504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 46703489 - 46703740
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg-aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccattt-gtatctctt 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  46703489 tgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgagtagaaattagggttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccattttgtatctctt 46703588  T
Q  99 tgtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaa-gttggaccgaactgggtgaacatttcttcttgttgttatct 197  Q
    ||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  46703589 tgtaagaactcatttatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcattgttggaccgaattgggtgaacatttcttggtgttgttatct 46703688  T
Q  198 tttctttactctctttatcttgtttatcctttggttgaattgtggttttgct 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  46703689 tttctttactctctttatcttgtttatcatttggttagattgtggttttgct 46703740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 23 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 50262857 - 50262495
Alignment:
Q  23 ggaaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctttgtaagatctcattgatagtggat 122  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  50262857 ggaaaatggatcgaaattacggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagttgat 50262758  T
Q  123 tagagatatcaatctctcctcgagagtaggtca-agttggaccgaactgggtgaac-atttcttcttgttgttatc---ttttctttactctctttatct 217  Q
    | ||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||| ||   |||||| |||||| |||||||    
T  50262757 tggagatatcaatctttcctccagagtaggtcattgttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgttgttgtctatttttctctactctttttatct 50262658  T
Q  218 tgtttatcctttggttgaattgtggttttgctatgcacttggtttatagactaggtc--tatattattgttattgcttgtggtttatttacatttgatta 315  Q
    ||||||| | ||  ||| ||||||||||||| |||||||| | ||| | ||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||||   |||| ||     
T  50262657 tgtttattccttacttggattgtggttttgccatgcactt-gattacatactaggtctatatattgttgttgttgcttgtggttaattt-tttttgcttg 50262560  T
Q  316 ttggttgccattaatacttgctccacacatcatatagtttgtattagcgggaaatttgtgactgaat 382  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| | | |||||||| | ||||||    
T  50262559 ttggttgtcattgatacttgctccacacatc--atagtttgtattggtgtgaaatttgagtctgaat 50262495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 56178816 - 56178637
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg-aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  56178816 tgtcttgttcattggtgagattgggaaaaagggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttt 56178717  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  56178716 gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 56178637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 26175815 - 26175637
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg-aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26175815 tgtcttgttcattggtgagattgggaaaatggggagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaaactaatttcttgtaacccatttgtatctcttt 26175716  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26175715 gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaaca 26175637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 9927637 - 9927467
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg-aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9927637 tgtcttattcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt 9927538  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactg 170  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||    
T  9927537 gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactg 9927467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 36463568 - 36463390
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg-aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  36463568 tgtcttgttcattggtgagattgggaaaatggatagaaattagggctgttcattgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt 36463469  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    |||||| ||| |||| |||||||| |||| |||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36463468 gtaagaactctttgacagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaaca 36463390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 47038588 - 47038412
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattggaaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctttg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||    
T  47038588 tgtcttgttcattggtgagattggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgta-atcatttgtatctgtttg 47038490  T
Q  101 taagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    ||||  ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  47038489 taaggactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagagtaagtcaagttggaccgaactgggtcaaca 47038412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 12739729 - 12739551
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg-aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  12739729 tgtcttgttcattggtgagattgggaaaatggatagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctattt 12739630  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    ||| || ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12739629 gtatgaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaaca 12739551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 36994513 - 36994691
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg-aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  36994513 tgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattaaggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatcccttt 36994612  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | | | ||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  36994613 gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccatattagatcaagttggaccgaactgggtcaaca 36994691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 54200085 - 54199908
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg-aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  54200085 tgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt 54199986  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  54199985 gtaagaactcattgatagtgaattagagagatcattctctcccccagattaggtcaagttgga-cgaactgggtcaaca 54199908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 5429668 - 5429846
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg-aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  5429668 tgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgagtagaaattagggttattcttcgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctattt 5429767  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  5429768 gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggttaagttggaccgaactgggtcaaca 5429846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 45 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 26699577 - 26699335
Alignment:
Q  45 ttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctttgtaa-gatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctc 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| || |||||| ||| |||||| |||| ||||||||||   |    
T  26699577 ttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcttttgtatctctttgtaaagaactcatttataatggattggagagatcaatctctatcc 26699478  T
Q  144 gagagtaggtcaa-gttggaccgaactgggtgaacatttcttcttgttgttatcttttctttactctctttatcttgtttatcctttggttgaattgtgg 242  Q
     |||||||||||  ||||||||||||||||| || |||||||  ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||    
T  26699477 cagagtaggtcattgttggaccgaactgggtaaaaatttcttagtgccgttatcttttctttactctctttatcttgtttattctttggttcaattatgg 26699378  T
Q  243 ttttgctatgcacttggtttatagactaggtctatattattgt 285  Q
    ||||||||||||||||| || |||| ||| |||| ||| ||||    
T  26699377 ttttgctatgcacttggattctagattagatctagattgttgt 26699335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 34570593 - 34570415
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg-aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  34570593 tgtcttgttcattggtgagattgggaaaataggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccaattgtatctcttt 34570494  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | ||| ||||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  34570493 gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggttaagttggatcgaactgggtcaaca 34570415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 37740614 - 37740784
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagatt-ggaaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| || || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37740614 tgtcttgttcattggtgagatttggaaaaagggtataaattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt 37740713  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactg 170  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | ||| | ||||||||||||||||||||    
T  37740714 gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagatttggtcaagttggaccgaactg 37740784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 46147570 - 46147392
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattggaaaa-tggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  46147570 tgtcttgttcatcggtgagattggaaaaatgggtagaaattagggttgttcattgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt 46147471  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| |||| |||||||||||| | | | ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  46147470 gtaagaactctttgatagtggattggagacatcaatctctcccccaaattaggtcaagttggaccgaactgggtcaaca 46147392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 48893821 - 48893639
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattg-gaaaatggatagaaattagggttgttc----tttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatct 95  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  48893821 tgtcttgttcattggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggttgttcattgtttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatct 48893722  T
Q  96 ctttgtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| |||| |||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  48893721 ctttgtaagaactctttgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaaca 48893639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 52095541 - 52095363
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg-aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  52095541 tgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt 52095442  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagtt-ggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    ||||||  || ||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  52095441 gtaagaaatctttgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtagg-caagtttggaccgaactgggtgaaca 52095363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 48143031 - 48143211
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg--aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||  | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  48143031 tgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaaaggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctt 48143130  T
Q  99 tgtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
      ||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  48143131 cataagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccaaactgggtgaaca 48143211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 276
Target Start/End: Original strand, 12119527 - 12119810
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattggaaaatgga-tagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctt 98  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  12119527 tgtcttgttcataggtgagattggaaaaaagagtagaaattatggtttgttctttgtgaactttttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctt 12119626  T
Q  99 tgt-aagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtca-agttggaccgaactgggtgaac-atttcttcttgttgt--- 192  Q
    ||| |||| |||||| |||||||||| |||| |||||||||||| | |||||||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||||  ||||||       
T  12119627 tgtaaagaactcatttatagtggattggagagatcaatctctcc-caagagtaggtcattgttggaccgaactaggtgaacaatttcttggtgttgtcat 12119725  T
Q  193 -tatcttttctttactctctttatcttgtttatcctttggttgaattgtggttttgctatgcacttggtttatagactaggtcta 276  Q
     ||| |||||| ||||||||||||||||||||  |||||||   |||||||||||||||||||||| |||| |||| ||| ||||    
T  12119726 ctattttttctctactctctttatcttgtttagtctttggtccgattgtggttttgctatgcacttagtttctagattagatcta 12119810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 5871809 - 5871987
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattggaaaa-tggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  5871809 tgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattaggtttgttctttgtgagcttgtttaagcaaatttcttgtaacccatttttatcacttt 5871908  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    | |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  5871909 gcaagaactctttgatagtggattagagagatcaatctctcccccagattaggtcaagtttgaccgaactgggtcaaca 5871987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 52467533 - 52467355
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg-aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||    
T  52467533 tgtcttgttcatttgtgaggttgggaaaatgggtagaaattaggtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatatcttgtaacccatttgtatcacttt 52467434  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    |||| | ||  ||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  52467433 gtaataactttttgatagtggattggagagatcaatctctccccgagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaaca 52467355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 29999985 - 29999804
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattggaaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatc-tcttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||| | | |||||||| | |||    
T  29999985 tgtcttgttcattggtgagattgggaaaagggtagaaattagggttgttctttgtgaacatgtcaaagctaatttcttgtaactcttttgtatctttttt 29999886  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaacatt 180  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29999885 gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacatt 29999804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Original strand, 31474139 - 31474324
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattg-gaaaatggatagaaattaggg-ttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  31474139 tgtcttgttcattggtgagattgagaaaatgggtagaaattaggtcttgttctttttgagtttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctt 31474238  T
Q  99 tgtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaacatttctt 184  Q
    ||||||| |||||||||||| |||| |||| || ||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  31474239 tgtaagaactcattgatagttgattggagagataaatctctccaccagagtagatcaagttggaccgaactgggtaaacatatctt 31474324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 34 - 296
Target Start/End: Original strand, 33989867 - 33990131
Alignment:
Q  34 agaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctttgtaag-atctcattgatagtggattagagatatc 132  Q
    ||||| |||| |||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||  | ||| || |||||||||| |||| |||    
T  33989867 agaaactaggtttgttcttagagagtttgttgaagctaatttcttgtaatccttttgtatctctttgtaaataactcgttaatagtggattggagagatc 33989966  T
Q  133 aatctctcctcgagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaacatttcttcttgttgttatcttttctttactctctttatcttgtttatcctttgg 231  Q
    ||||||||| | |||||||||||   |||||  ||||||||| ||||||||||  |||| |||| |||| | ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33989967 aatctctccaccagagtaggtcattcttggattgaactgggtaaacatttcttggtgttattatattttttctactctctttatcttgtttattctttgg 33990066  T
Q  232 ttgaattgtggttttgctatgcacttggtttatagactaggtctatattattgttattgcttgtg 296  Q
    || |||| ||| ||||||||||||||||||| |||| ||| |||| ||| ||||| |||||||||    
T  33990067 ttcaattctggatttgctatgcacttggtttctagattagatctagattgttgttgttgcttgtg 33990131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 5370266 - 5370083
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattggaaaatgga----tagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaa-gctaatttcttgtagcccatttgtatct 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   |    ||||||||||||||||||||||||| |||||  || |||||||||||||| ||| |||||||||    
T  5370266 tgtcttgttcattggtgagattggaaaaaaaagaggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaaagctaatttcttgtaacccttttgtatct 5370167  T
Q  96 ctttgtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  5370166 ctttgtaagaactcattgatagtggactagagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaaca 5370083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 24 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 12744080 - 12743926
Alignment:
Q  24 gaaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctttgtaagatctcattgatagtggatt 123  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12744080 gaaaataggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggatt 12743981  T
Q  124 agagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
     |||| |||||||||||| | | | ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12743980 ggagagatcaatctctcccccatattaggtcaagttggaccgaactgggtcaaca 12743926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 24 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 12745469 - 12745315
Alignment:
Q  24 gaaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctttgtaagatctcattgatagtggatt 123  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12745469 gaaaataggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggatt 12745370  T
Q  124 agagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
     |||| |||||||||||| | | | ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12745369 ggagagatcaatctctcccccatattaggtcaagttggaccgaactgggtcaaca 12745315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 6542360 - 6542174
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg---aaaatggatagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctc 96  Q
    ||||||||||||||| ||||||||   ||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||   || ||||||||||    
T  6542360 tgtcttgttcattggggagattgggaaaaaatgg-tagaaattaggatttgttctttgtgagcttgttgaaactaatttcttgttagccttttgtatctc 6542262  T
Q  97 tttgtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaacatttctt 184  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||| |||| |||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6542261 tttgtaagaactcgttgatagtggattggagagatcaatctctcccccagggtaggtcaagttggaccgaactgggtaaacatttctt 6542174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 12747935 - 12747794
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg-aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  12747935 tgtcttgttcattggtgagattgggaaaatggatagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctattt 12747836  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcc 141  Q
    ||| || ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  12747835 gtatgaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcc 12747794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 362
Target Start/End: Original strand, 21688237 - 21688591
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg--aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctt 98  Q
    |||||||||||| ||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  21688237 tgtcttgttcatcggtgagattgagaaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaaactaattttttgtaactcatttgtatctctt 21688336  T
Q  99 tgtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaac-atttcttcttgttgttatct 197  Q
     | |||| |||||||||| || ||| |||| ||||||| |||| | ||| ||||||||||| ||||||| || || ||| |||||||  ||||||||||     
T  21688337 cggaagaactcattgataatgaattggagagatcaatccctcccctagattaggtcaagttagaccgaattgagtcaacaatttcttggtgttgttatc- 21688435  T
Q  198 tttctttactctctttatcttgtttatcctttggtt-gaattgtggttttgctatgcacttggtttatagactaggtctatattattgttattgcttgtg 296  Q
     |||||| |  |  ||||||  ||  | ||||| ||   |||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  21688436 -ttcttt-cattgcttatct--ttattgctttgattatgattgtggttttgttatgcatttgatttatagactagatctatattattgttgttgcttgtg 21688531  T
Q  297 gtttatttacatttgattattggttgccattaatacttgctccacacatcatatagtttgtattag 362  Q
    ||| ||    ||||  || ||| ||| |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  21688532 gttaat----atttagttgttgattgtcattgatacttgctccacacatc--atagtttgtattag 21688591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 29254483 - 29254661
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattggaaaat-ggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||| |||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| | ||||||||| |||||||    
T  29254483 tgtcttgttcattggtgagattgggaaattgggtagaaattagagttgttttttatgagcttgttgaagttaatttcttgcaacccatttgtgtctcttt 29254582  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| |||| |||||||||||  | | | ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29254583 gtaagaactcgttgatagtggattggagagatcaatctctctcccaaattaggtcaagttggaccgaactgggtcaaca 29254661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 12745615 - 12745476
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagatt-ggaaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12745615 tgtcttgttcattggcgagattaggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaaactaatttcttgtaacccatttgtatctcttt 12745516  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctct 139  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  12745515 gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctct 12745476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 45687362 - 45687183
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg-aaaatggatagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctt 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||| || | ||||||||||| ||    
T  45687362 tgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggaagaaattaggttttgttctttgtgagcttgtcaaagctaatttcttataactcatttgtatctatt 45687263  T
Q  99 tgtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| | | || |||||||||||||||||||||| ||||    
T  45687262 tgtaagaactcattgatagtggattggagagatctatctctcctccatattatgtcaagttggaccgaactgggtcaaca 45687183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 3913437 - 3913614
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg-aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  3913437 tgtcttgttcatttgtgagattgggaaaatgagtagaaattagagctgttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttttaacccatttgtatatcttt 3913536  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | |||||| || |||||| | |||||||||| ||||    
T  3913537 gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcc-ctagagtatgtaaagttgtatcgaactgggtcaaca 3913614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 37229901 - 37229716
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg-aaaatggatagaaattagggt-tgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttg-tatctct 97  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| |||  |||||||    
T  37229901 tgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtgtgttctttgtgagcttgttaaagcaaatttgttgtaaccctttttatatctct 37229803  T
Q  98 ttgtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaacatttctt 184  Q
    |||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  37229802 ttgtaagaactcatttatagtggattggagagatcaatctctccctcatagtaggtcaagttggaccgaactaggtaaacatttctt 37229716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 17 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 22882913 - 22882703
Alignment:
Q  17 gagattggaaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctttgt-aagatctcattgat 115  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||| ||||||| |    
T  22882913 gagattgaaaaatggataaaaattaggtttgttcttggagagtttgttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttcgtaaagaactcattggt 22882814  T
Q  116 agtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtca-agttggaccgaactgggtgaacatttcttcttgttgttatcttttctttactctcttta 214  Q
    ||||||||||||| ||||||||| || || ||||||||||  ||||||||||||||| | |||||   |||||| |||||| |||||| |||||||||||    
T  22882813 agtggattagagaaatcaatctc-ccccg-gagtaggtcattgttggaccgaactggataaacat---ttcttggtgttattttttctatactctcttta 22882719  T
Q  215 tcttgtttatcctttg 230  Q
    |||| ||||| |||||    
T  22882718 tcttatttattctttg 22882703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 17 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 22934577 - 22934367
Alignment:
Q  17 gagattggaaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctttgt-aagatctcattgat 115  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||| ||||||| |    
T  22934577 gagattgaaaaatggataaaaattaggtttgttcttggagagtttgttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttcgtaaagaactcattggt 22934478  T
Q  116 agtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtca-agttggaccgaactgggtgaacatttcttcttgttgttatcttttctttactctcttta 214  Q
    ||||||||||||| ||||||||| || || ||||||||||  ||||||||||||||| | |||||   |||||| |||||| |||||| |||||||||||    
T  22934477 agtggattagagaaatcaatctc-ccccg-gagtaggtcattgttggaccgaactggataaacat---ttcttggtgttattttttctatactctcttta 22934383  T
Q  215 tcttgtttatcctttg 230  Q
    |||| ||||| |||||    
T  22934382 tcttatttattctttg 22934367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 2 - 137
Target Start/End: Original strand, 24969102 - 24969238
Alignment:
Q  2 gtcttgttcattggtgagattggaaaa-tggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctttg 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  24969102 gtcttgttctttggtgagattggaaaaatgggtagaaattagatttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttg 24969201  T
Q  101 taagatctcattgatagtggattagagatatcaatct 137  Q
    ||||| || |||||||||||||| |||| || |||||    
T  24969202 taagaactaattgatagtggattggagagataaatct 24969238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Original strand, 4587947 - 4588130
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg-aaaatggatagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctt 98  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| ||||  | ||||||||| | || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  4587947 tgtcatgttcattggtgaaattgggaaaaaaggtagaaattaagatttgttctttgtaagcttgttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctt 4588046  T
Q  99 tgtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaacatttc 182  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||| | |||||||||| | | | ||||| |||||||||| |||||||| ||||||||    
T  4588047 tgtaagaactcattgatagtggattggagagaacaatctctcccccataataggtgaagttggaccaaactgggtaaacatttc 4588130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 12 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 13992461 - 13992293
Alignment:
Q  12 ttggtgagattgg--aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctttgtaagatctc 109  Q
    |||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||||| | | |||||||||||| |||||| |||    
T  13992461 ttggtgagattgggaaaaaagggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactcttttgtatctctt-gtaagaactc 13992363  T
Q  110 attgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  13992362 attgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaaca 13992293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 55085543 - 55085442
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattggaaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctttg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  55085543 tgtcttgttcattggtgagattggaaaataggtagaaattaaggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaaaccatttgtatctctttg 55085444  T
Q  101 ta 102  Q
    ||    
T  55085443 ta 55085442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 4 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 5208018 - 5207840
Alignment:
Q  4 cttgttcattggtgagattggaaaatggatagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctttgta 102  Q
    |||||||||||| | |||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||| | | ||||| ||||||    
T  5208018 cttgttcattggagtgattggaaaaagggtagaaattagggtttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttattgcaacccttgtatatctatttgta 5207919  T
Q  103 agatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaacattt 181  Q
    ||| ||||||||||||||||| || | |||||||||||  | |||||||||||| |||||| ||| ||||| |||||||    
T  5207918 agaactcattgatagtggattggaaagatcaatctctctcccagagtaggtcaatttggactgaattgggtaaacattt 5207840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 33 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 12744193 - 12744087
Alignment:
Q  33 tagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctttgtaagatctcattgatagtggattagagatatc 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||    
T  12744193 tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatc 12744094  T
Q  133 aatctct 139  Q
    |||||||    
T  12744093 aatctct 12744087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 32 - 259
Target Start/End: Original strand, 33089899 - 33090129
Alignment:
Q  32 atagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctttgtaa-gatctcattgatagtggattagagata 130  Q
    |||||||||| | |||||||| | |||||||||||||||||||| || || ||  ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||| |    
T  33089899 atagaaattatgtttgttcttggagagcttgttgaagctaatttattataaccattttgtatctctctgtaaagaactcattgatagtggattagagaga 33089998  T
Q  131 tcaatctctcctcgagagtaggtca-agttggaccgaactgggtgaacatttc-ttcttgttgttatcttttctttactctctttatcttgtttatcctt 228  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |  ||||||||| ||| | | |||| ||| ||   |||||| |||||||| | |||||||||||||||||||  ||    
T  33089999 tcaatctctcctctagagtaggttattgttggaccggactagataaacaattctttgaagttgttctcttttctctgctctctttatcttgtttattttt 33090098  T
Q  229 tggttgaattgtggttttgctatgcacttgg 259  Q
    |||||  |||||||||||||| | |||||||    
T  33090099 tggttcgattgtggttttgctttacacttgg 33090129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Original strand, 51337053 - 51337235
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattg-gaaaatggatagaaattaggg--ttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctct 97  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||  ||||||||||||||||| |  ||| |||||| || || ||| |||||||||||    
T  51337053 tgtcctgttcattggtgagattgagaaaaagggtagaaattacggatttgttctttgtgagctttt--aagataatttattataacccttttgtatctct 51337150  T
Q  98 ttgtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaacatttc 182  Q
    || ||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||   | | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  51337151 ttttaagaactcattgatagtgtattagagagatcaatctctcccacacattaggtcaagttggaccgaactgggtaaacatttc 51337235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 187 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 55085433 - 55085286
Alignment:
Q  187 tgttgttatcttttctttactctctttatcttgtttatcctttggttgaattgtggttttgctatgcacttggtttatagactaggtctatattattgtt 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || | ||| |||| ||| |||||    
T  55085433 tgttgttatcttttctttactctctttatcttgtttattccttggttggattgtggttttgctatgcacttggtttctaaattagatctagattgttgtt 55085334  T
Q  287 attgcttgtggtttatttacatttgattattggttgccattaatacttgctcca 340  Q
    ||||||||| |||       |||||||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  55085333 attgcttgtagtt------aatttgattgttggttgtcattgatacttgctcca 55085286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 12 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 31495485 - 31495316
Alignment:
Q  12 ttggtgagattggaaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccattt-gtatctcttt-gtaagatctc 109  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||||||| |||||| |||||| |||||  || ||||||||||||| | | ||| |||||||||| |||||| |||    
T  31495485 ttggtgagattgggaaaagggtagaaattaggattgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactc 31495386  T
Q  110 attgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    ||||||||| |||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31495385 attgatagttgattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 31495316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 52082836 - 52082715
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg-aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  52082836 tgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaactagggttgttctttgtgaacttgtcaaaactaatttcttgtaacccatttgtatctcttt 52082737  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtgga 121  Q
    ||||||  || |||||||||||    
T  52082736 gtaagaaatctttgatagtgga 52082715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 201 - 341
Target Start/End: Original strand, 46703739 - 46703879
Alignment:
Q  201 ctttactctctttatcttgtttatcctttggttgaattgtggttttgctatgcacttggtttatagactaggtc--tatattattgttattgcttgtggt 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||  |||||| ||||| ||||||| ||     
T  46703739 ctttactctctttatcttgtttatcctttggttagattgtggttttgctatgcactt-gattatagaataggtctatatattgttgttgttgcttgagg- 46703836  T
Q  299 ttatttacatttgattattggttgccattaatacttgctccac 341  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||| ||||||    
T  46703837 ttatttacatttggttattggttgttattgatacttactccac 46703879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Original strand, 41639252 - 41639351
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg-aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    ||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41639252 tgtcttgtttattggtaagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtaaactttttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt 41639351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 12 - 178
Target Start/End: Original strand, 8393394 - 8393562
Alignment:
Q  12 ttggtgagattggaaaatggatagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt-gtaagatctc 109  Q
    ||||||||||||| ||| || |||||||||||||| |||| | |||| | |||  |||||||||||||||| ||  |||||||| |||| |||||| |||    
T  8393394 ttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatagtgaacatgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactc 8393491  T
Q  110 att-gatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    ||| ||||||||||| ||||   |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8393492 atttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 8393562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 12 - 178
Target Start/End: Original strand, 8395603 - 8395771
Alignment:
Q  12 ttggtgagattggaaaatggatagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt-gtaagatctc 109  Q
    ||||||||||||| ||| || |||||||||||||| |||| | |||| | |||  |||||||||||||||| ||  |||||||| |||| |||||| |||    
T  8395603 ttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatagtgaacatgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactc 8395700  T
Q  110 att-gatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    ||| ||||||||||| ||||   |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8395701 atttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 8395771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 13009610 - 13009453
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattg-gaaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||             |||||||   |||||||||| ||||    
T  13009610 tgtcttgttcatttgtgagattgtgaaaatgggtagaaattaggtttgttcttcgtgagctt-------------tcttgtaaaacatttgtatcccttt 13009524  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactg 170  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| | | ||||||||||| ||||||||||    
T  13009523 gtaagaactcattgatagtggattggagagatcgatctctcctccaaattaggtcaagttagaccgaactg 13009453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 25 - 103
Target Start/End: Original strand, 5349924 - 5350002
Alignment:
Q  25 aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctttgtaa 103  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||    
T  5349924 aaaatgggtagaaattaggtttgttctttgtgaacttgtcgaagctaattccttgtagctcgtttgtatctctttgtaa 5350002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 48142557 - 48142393
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattggaaaatggatagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    |||||||  ||||| ||||||||| ||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | | |||||||||    
T  48142557 tgtcttgcccattgatgagattgggaacatgatagaaattagggtttgttctttgtgagcttgttgaagctagtttcttgtaacccttgtatatctcttt 48142458  T
Q  100 gt-aagatctcattg--atagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttgga 162  Q
    || |||| |||||||  ||||| |||| || | |||||||||||| | | |||||||||| |||||    
T  48142457 gtaaagaactcattgatatagtagatttgaaagatcaatctctcc-ctacagtaggtcaatttgga 48142393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 33 - 230
Target Start/End: Original strand, 34112839 - 34113034
Alignment:
Q  33 tagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctttgt-aagatctcattgatagtggattagagatat 131  Q
    ||||||||| | |||||||  | ||||||||||||||||||||| |||| ||| |||| |||||||||| |||| ||||||||||||| | | |||| ||    
T  34112839 tagaaattatgtttgttctaggagagcttgttgaagctaatttcatgtaacccttttgcatctctttgtaaagaactcattgatagtgaagtggagagat 34112938  T
Q  132 caatctctcctcgagagtaggtca-agttggaccgaactgggtgaacatttcttcttgttgttatcttttctttactctctttatcttgtttatcctttg 230  Q
    |  ||||||| | | |||||||||  ||||||||||| | ||| |||| || |  ||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||    
T  34112939 c--tctctcccctatagtaggtcattgttggaccgaatttggtaaacaattat--ttggtgttctcttttctctactcactttatcttgtttattctttg 34113034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 33 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 21703983 - 21703830
Alignment:
Q  33 tagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctttgtaa-gatctcattgatagtggattagagata 130  Q
    ||||||||||| || |||||| |  |||||||||||| | |||||||||| ||  ||||||||| ||||||| || |||||||| |||||||| ||||||    
T  21703983 tagaaattaggttttgttcttagaaagcttgttgaagatgatttcttgtaccctttttgtatctttttgtaaagaactcattgacagtggattggagata 21703884  T
Q  131 tcaatctctcctcgagagtaggtca-agttggaccgaactgggtgaacatttctt 184  Q
    ||||||| ||| | | |||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  21703883 tcaatctatcc-ccatagtaggtcattgtttgaccgaactgggtaaacatttctt 21703830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Original strand, 53345206 - 53345330
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattg-gaaaatggatagaaattagggttg-ttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctt 98  Q
    ||||||||| || || ||||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||| ||||| ||    
T  53345206 tgtcttgtttatcggagagattgagaaaatg-atagaaattaaggttgattctttgtgagcttgttgaaactaatttcttgtaacccttttatatctttt 53345304  T
Q  99 tgt-aagatctcattgatagtggatt 123  Q
    ||| |||| |||||| ||| ||||||    
T  53345305 tgtaaagaactcattaatattggatt 53345330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 20 - 138
Target Start/End: Original strand, 6677477 - 6677597
Alignment:
Q  20 attggaaaatggatagaaattagggttgtt--ctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctttgt-aagatctcattgata 116  Q
    |||||||||||| ||||||||||| || ||  ||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||  || ||||||    
T  6677477 attggaaaatgg-tagaaattaggttttttttcttggagagcttgttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatatctttgtaaagaagtctttgata 6677575  T
Q  117 gtggattagagatatcaatctc 138  Q
     |||||| |||| |||||||||    
T  6677576 atggatttgagagatcaatctc 6677597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 23 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 34788930 - 34788851
Alignment:
Q  23 ggaaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctttgtaa 103  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  34788930 ggaaaatgg-tagaaattaggattgctcttggagagcttgttgaagttaatttcttgtaactcttttgtatctctttgtaa 34788851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 23 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 44967985 - 44967823
Alignment:
Q  23 ggaaaatggatagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctttgt-aagatctcattgatagtgg 120  Q
    ||||||||| ||||||||||| || | |||| | ||||||| |||||| ||||||||||| || |||||||||||||||| || | ||| |||| ||| |    
T  44967985 ggaaaatgg-tagaaattaggttttgctcttggagagcttgctgaagccaatttcttgtaacc-atttgtatctctttgtaaaaaactcgttgagagtag 44967888  T
Q  121 attagagatatcaatctctcctcgagagtaggtca-agttggaccgaactgggtgaacatttctt 184  Q
    |||||||  |||||||||||| | ||| || ||||  |||||||||| |||||| ||||||||||    
T  44967887 attagagggatcaatctctcccccagaataagtcactgttggaccgacctgggtaaacatttctt 44967823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 38811235 - 38811144
Alignment:
Q  135 tctctcctcgagagtaggtcaa-gttggaccgaactgggtgaacatttcttct-tgttgttatcttttctttactctctttatcttgtttat 224  Q
    ||||||| | |||||||||||  ||||||||||||||||| |||| ||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  38811235 tctctccccaagagtaggtcattgttggaccgaactgggtaaacaattcttcggtgttgttctcttttctctactctctttatattgtttat 38811144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 33 - 103
Target Start/End: Original strand, 32091500 - 32091570
Alignment:
Q  33 tagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctttgtaa 103  Q
    ||||||||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  32091500 tagaaattaggtttgttcttggagagtttgttgaaactaatttcttgtaactcttttgtatctctttgtaa 32091570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 44570527 - 44570427
Alignment:
Q  17 gagattggaaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctttgt-aagatctcattgat 115  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||| | ||||| || | |||||||||||| ||||||||||||| |   ||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  44570527 gagattgaaaaatgg-tagaaattatgtttgttgttggagagcttgttgaaactaatttcttgtaacatttttgtatctctttgtaaagaactcattgat 44570429  T
Q  116 ag 117  Q
    ||    
T  44570428 ag 44570427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 145 - 184
Target Start/End: Original strand, 24969799 - 24969838
Alignment:
Q  145 agagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaacatttctt 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24969799 agagtaggtcaagttggaccgaactgggtaaacatttctt 24969838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 184
Target Start/End: Original strand, 29056351 - 29056532
Alignment:
Q  5 ttgttcattggtgagattgg-aaaatggatagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctttgta 102  Q
    ||||||||| | |||||||| ||||||| ||| |||||| ||| |||||||||| |||||||  | ||||||||||| |  || ||| ||||||||||||    
T  29056351 ttgttcattagagagattgggaaaatgg-taggaattagagtttgttctttgtgtgcttgttagaactaatttcttgcaatccttttatatctctttgta 29056449  T
Q  103 a-gatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaacatttctt 184  Q
    |  | |||||||||| ||||||||||| | | |||||||  | || ||||||| | || |||||||||| || |||| |||||    
T  29056450 acaacctcattgataatggattagagagacctatctctcacccagtgtaggtccattttgaccgaactgtgtaaacacttctt 29056532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 111 - 175
Target Start/End: Original strand, 5136165 - 5136230
Alignment:
Q  111 ttgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtga 175  Q
    ||||||||||||| ||||   ||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5136165 ttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 5136230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 111 - 175
Target Start/End: Original strand, 5138390 - 5138455
Alignment:
Q  111 ttgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtga 175  Q
    ||||||||||||| ||||   ||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5138390 ttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 5138455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 268 - 341
Target Start/End: Original strand, 54881561 - 54881629
Alignment:
Q  268 ctaggtctatattattgttattgcttgtggtttatttacatttgattattggttgccattaatacttgctccac 341  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     || || ||||||| |||| |||||||||||||    
T  54881561 ctaggtctatattgttgttattgcttgtggtttattt-----tggttgttggttgtcattgatacttgctccac 54881629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 16422761 - 16422666
Alignment:
Q  24 gaaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctttgtaa-gatctcattgatagtg 119  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||| |||| |||||| ||||||||||||||| | | ||| ||||||| ||||||||| || ||||| |||||||    
T  16422761 gaaaatgg-tagaaattatgtttgttttttgagagctttttgaagctaatttctagaaacccttttgtatatctttgtaatgaactcatggatagtg 16422666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 188 - 246
Target Start/End: Original strand, 32091618 - 32091677
Alignment:
Q  188 gttgttatctttt-ctttactctctttatcttgtttatcctttggttgaattgtggtttt 246  Q
    ||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||    
T  32091618 gttgttatctttttctctacgctctttatcttgtttattctttagttcaattgtggtttt 32091677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 24 - 100
Target Start/End: Original strand, 1983250 - 1983325
Alignment:
Q  24 gaaaatggatagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctttg 100  Q
    ||||| |||||||||||| | || ||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||| |||||||| |||||    
T  1983250 gaaaaaggatagaaattatgttttgttctttgtgagcttgc--aagctaatttcttgtaacccctttgtatcactttg 1983325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 187 - 233
Target Start/End: Original strand, 3786139 - 3786185
Alignment:
Q  187 tgttgttatcttttctttactctctttatcttgtttatcctttggtt 233  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||    
T  3786139 tgttgttctcttttctctactctctttatcttgttcattctttggtt 3786185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 20 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 35369600 - 35369542
Alignment:
Q  20 attggaaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttctt 78  Q
    ||||| |||||  ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| ||||||||||    
T  35369600 attgggaaatgagtagaaattaggtttgttcttggtgagcttgatgaaactaatttctt 35369542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 20 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 35370507 - 35370449
Alignment:
Q  20 attggaaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttctt 78  Q
    ||||| |||||  ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| ||||||||||    
T  35370507 attgggaaatgagtagaaattaggtttgttcttggtgagcttgatgaaactaatttctt 35370449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 188 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 6199858 - 6199801
Alignment:
Q  188 gttgttatcttttctttactctctttatcttgtttatcctttggttgaattgtggttt 245  Q
    |||||| ||| | |||||||||||||||||||||| | ||||||||  ||||||||||    
T  6199858 gttgttctctatcctttactctctttatcttgtttgttctttggttcgattgtggttt 6199801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 268; Significance: 1e-149; HSPs: 52)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 382
Target Start/End: Original strand, 45726918 - 45727298
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg-aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  45726918 tgtcttattcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacctatttgtatctcttt 45727017  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaacatttcttcttgttgttatcttt 199  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  45727018 gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaacattttttagtgttgttatcttt 45727117  T
Q  200 tctttactctctttatcttgtttatcctttggttgaattgtggttttgctatgcacttggtttatagactaggtctatattattgttattgcttgtggtt 299  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  45727118 tctttactctctttatct--tttattctttggttggattgtggttttgctatgcacttagtttatagactaggtctatattattgttgttgcttgtggtt 45727215  T
Q  300 tatttacatttgattattggttgccattaatacttgctccacacatcatatagtttgtattagcgggaaatttgtgactgaat 382  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| | ||||||    
T  45727216 tatttacatttggttattagttgccattgatacttgctccacacatcatatagtttgtattggtgtgaaatttgagtctgaat 45727298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 1631911 - 1631552
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattggaaaa-tggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  1631911 tgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattaggattgttctttgtgagcttgttgaagctaatatcttgtaacccatttgtatctcttt 1631812  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaacatttcttcttgttgttatcttt 199  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||||||||||||    
T  1631811 gtaagaactcattgatagtggattggagaaatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggaccgaactgagtgaatatttcttagtgttgttatcttt 1631712  T
Q  200 tctttactctctttatcttgtttatcctttggttgaattgtggttttgctatgcacttggtttatagactaggtc--tatattattgttattgcttgtgg 297  Q
    || || ||||||||||||||||||| | ||  ||| |||||||||||||||| ||||| | ||| |||||| |||  |||||| ||||||||||||||||    
T  1631711 tccttgctctctttatcttgtttattcctt--ttggattgtggttttgctatacactt-gattacagactaagtctatatattgttgttattgcttgtgg 1631615  T
Q  298 tttatttacatttgattattggttgccattaatacttgctccacacatcatatagtttgtatt 360  Q
    |||||||| ||||| || ||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1631614 tttatttatatttggttgttggttgtcattgatacttactccacacatcatatagtttgtatt 1631552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 35447063 - 35446707
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg-aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  35447063 tgtcttgttcattggtgagattggtaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgatcttgttgaatctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt 35446964  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaacatttcttcttgttgttatcttt 199  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  35446963 gtaagaactcattgatagtggattggagagatcactctctcctccagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaacatttcttggtgttgttatcttt 35446864  T
Q  200 tctttactctctttatcttgtttatcctttggttgaattgtggttttgctatgcacttggtttatagactaggtctatattattgttattgcttgtggtt 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| ||||||| ||| ||| |  |    
T  35446863 tctttactctctttatcttgtttatgctttggttgaattgtggttttgctatgcactt-gattatagactagatctata-tattgttgttg-ttgagtgt 35446767  T
Q  300 tatttacatttgattattggttgccattaatacttgctccacacatcatatagtttgtatt 360  Q
      ||||| |||| || |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35446766 ggtttac-tttggttgttggttgggattgatacttgctccacacatcatatagtttatatt 35446707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 42288289 - 42287953
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg-aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  42288289 tgtcttgtgcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattaaggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatttcttt 42288190  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaa-catttcttcttgttgttatctt 198  Q
    |||||| |||||||||| |||||| |||| |||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||  || |||||||||    
T  42288189 gtaagagctcattgataatggattggagagatcaatctctcc-ccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaataatttcttggtgctgttatctt 42288091  T
Q  199 ttctttactctctttatcttgtttatcctttggttgaattgtggttttgctatgcacttggtttatagactaggtctatattattgttattgcttgtggt 298  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||| |||| ||| ||||||||||||||||     
T  42288090 ttctttaccctctttaacttgtttattccttggttggattgtggtttttctatgcacttgttttctagattagatctagattgttgttattgcttgtgg- 42287992  T
Q  299 ttatttacatttgattattggttgccattaatacttgct 337  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||    
T  42287991 ttatttacatttggttattggttgccattgatatttgct 42287953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Original strand, 17450580 - 17450898
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattggaaaa-tggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||            
T  17450580 tgtcttgttcattggtgagatttgaaaaatgggtagagattaggcttgttctttgtgagcttgttgaagctaattt-ttgtaacccatttgt-------- 17450670  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaacatttcttcttgttgttatcttt 199  Q
        || ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||  |||||||||||||    
T  17450671 ----gaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccac-agagtaggtcaagttggaccgaactaggtgaacaatctttggtgttgttatcttt 17450765  T
Q  200 tctttactctctttatcttgtttatcctttggttgaattgtggttttgctatgcacttggtttatagactaggtctatattattgttattgcttgtggtt 299  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||| ||||| |||||||||       
T  17450766 tctgtactctctttatcttgtttatcctttggttagattgtggttttgctatgcacttggtttctagattaggtttagattgttgttgttgcttgtg--- 17450862  T
Q  300 tatttacatttgattattggttgccattaatacttgc 336  Q
     ||||||||||| |||| ||||| |||| ||||||||    
T  17450863 -atttacatttggttatcggttgtcattgatacttgc 17450898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 36 - 292
Target Start/End: Original strand, 33648195 - 33648454
Alignment:
Q  36 aaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctttgtaa-gatctcattgatagtggattagagatatca 133  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||| ||||||||| || ||||||||||| ||||| |||| ||||    
T  33648195 aaattagggtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcctgtaacccttttgtatttctttgtaaagaactcattgatagcggattggagagatca 33648294  T
Q  134 atctctcctcgagagtaggtcaa-gttggaccgaactgggtgaacatttcttcttgttgttatcttttctttactctctttatcttgtttatcctttggt 232  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  33648295 atctctcctccagagtaggtcattgttggaccgaactgggtaaacatttattggtgttgttgtcttttctctactctctttatcttgtttattctttagt 33648394  T
Q  233 tgaattgtggttttgctatgcacttggtttatagactaggtctatattattgttattgct 292  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| ||||| |||||    
T  33648395 ttaattgtgattttgctatgcacttggcttatagattaggcctagattgttgttgttgct 33648454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 33162629 - 33162451
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagatt-ggaaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  33162629 tgtcttgttcattggtgaaattaggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctct 33162530  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  33162529 gtaagaactcattgatagtggattagagagatcaatctctcccctagattaggtcaagttggaccgaactaggtcaaca 33162451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 36318188 - 36318010
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattggaaaa-tggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  36318188 tgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaaactaatttattgtaacccatttgtatctcttt 36318089  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36318088 gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccttagagtaggtcaagttggaccgaactgggtcaaca 36318010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 38312229 - 38312407
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg-aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  38312229 tgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaaactaatttcttgtaacccatttgtatctcttt 38312328  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | ||| || |||||||||||||||||||||| ||||    
T  38312329 gtaagatctcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattatgtcaagttggaccgaactgggtcaaca 38312407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 723923 - 723745
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattggaaaa-tggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  723923 tgtcttgttcatttgtgagattggaaaactgggtagaaattaggtttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatcccttt 723824  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  723823 gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaaca 723745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 17057548 - 17057370
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattggaaaa-tggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||    
T  17057548 tgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagggttgttctttgcaagcttgttgaagctaattttttgtaactcatttgtatctcttt 17057449  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17057448 gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagactaggtcaagttggaccgaactgggtcaaca 17057370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 17085531 - 17085353
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattggaaaa-tggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||    
T  17085531 tgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagggttgttctttgcaagcttgttgaagctaattttttgtaactcatttgtatctcttt 17085432  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17085431 gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagactaggtcaagttggaccgaactgggtcaaca 17085353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 2334597 - 2334418
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg-aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||||    
T  2334597 tgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaataagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttctagtaactcttttgtatctcttt 2334498  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  2334497 gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggggaaca 2334418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 59 - 341
Target Start/End: Original strand, 7451166 - 7451448
Alignment:
Q  59 cttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctttgtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagt 158  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| | ||||||||||||    
T  7451166 cttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaataactcattgatagtggattgcagagatcaatctctcctctacagtaggtcaagt 7451265  T
Q  159 tggaccgaactgggtgaacatttcttcttgttgt-tatcttttcttta--ctctctttatcttgtttatcctttggttgaattgtggttttgctatgcac 255  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||  |||||| ||| |||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| |||||||    
T  7451266 tgga-cgaactgggtgaacatttattggtgttgtctat-ttttctctactctctctttatcttgtttattctttggttcgattgtggttttgttatgcac 7451363  T
Q  256 ttggtttatagactaggtctatattattgttattgcttgtggtttatttacatttgattattggttgccattaatacttgctccac 341  Q
    ||| ||| |||| ||| |||| ||| |||||||||||||||| ||||| |||   | |||||||||| |||| | |||||||||||    
T  7451364 ttgttttctagattagatctagattgttgttattgcttgtgg-ttattgacaagaggttattggttgtcattgaaacttgctccac 7451448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 36773551 - 36773729
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg-aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  36773551 tgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggaataaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt 36773650  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| |||| |||||||||||| | ||| || |||||||||||||||||||||| ||||    
T  36773651 gtaagaactctttgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattatgtcaagttggaccgaactgggtcaaca 36773729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Original strand, 29867858 - 29868031
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg-aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29867858 tgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt 29867957  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggt 173  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| |||| |||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||||||    
T  29867958 gtaagaactctttgatagtggattggagagatcaatctctcccccaaattaggtcaagttggaccgaactgggt 29868031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 34139950 - 34139771
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattg-gaaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctc-tt 98  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||| | ||    
T  34139950 tgtcttgttcatttgtgagattgagaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatatgtatcccttt 34139851  T
Q  99 tgtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34139850 tgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaaca 34139771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 6595186 - 6595006
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg---aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctct 97  Q
    |||||||||||||||||||||| |   ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||    
T  6595186 tgtcttgttcattggtgagattaggaaaaaatgg-tagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccttttgaatctct 6595088  T
Q  98 ttgtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  6595087 ttgtaagaactcgttgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaaca 6595006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 36988255 - 36988076
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattggaaaat-ggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||||||||||||| | | |||||||||||||    
T  36988255 tgtcttgttcattggtgggattggaaaaaagggtagaaattagggttgttctatgtgagcttgtcaaaactaatttcttgtaactcttttgtatctcttt 36988156  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  36988155 gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 36988076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 5723434 - 5723256
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattggaaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  5723434 tgtcttgttcattggtgagattgagaaaagggtagaaattaggcttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacctttttgtatctctttg 5723335  T
Q  101 taagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  5723334 taagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctctagagtaggttaagtttggaccgaactgggtgaaca 5723256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Original strand, 42362341 - 42362505
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg-aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  42362341 tgtcttgttcatttgtgagattgggaaaatgggtagaaattaggtttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatcccttt 42362440  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggacc 164  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| ||| |||||||| | ||| ||||||||||||||||    
T  42362441 gtaagaactcattgatagtggattggagagatctatctctcccccagattaggtcaagttggacc 42362505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 14634005 - 14633834
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg-aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctc-tt 98  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| | ||    
T  14634005 tgtcttgttcatttgtgagattggtaaaatgggtagaaattaggattgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatcccttt 14633906  T
Q  99 tgtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactg 170  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||    
T  14633905 tgtaagaactcatagatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactg 14633834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 17490321 - 17490143
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattggaaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctttg 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    || |||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||| |||||||    
T  17490321 tgtcttgttcattgttgagattggaaaatgg-tagaaatt----ttattctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcttttgtaactctttg 17490227  T
Q  101 taagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaacatttctt 184  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  17490226 taagaactcattgatagtggattgtagagatcaatctctcccctagagtaggtcaatttggaccgaactgggtaaacatttctt 17490143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 45099743 - 45099922
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg--aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| | | ||||||||||||    
T  45099743 tgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaagggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaactcttttgtatctctt 45099842  T
Q  99 tgtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    || |||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  45099843 tg-aagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 45099922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 3 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 11151768 - 11151592
Alignment:
Q  3 tcttgttcattggtgagattgg-aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctttgt 101  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  11151768 tcttgttcattggtgaaattgggaaaatgggtagaaattagatttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatcactttgt 11151669  T
Q  102 aagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    |||| ||| | ||||||||||| |||| ||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11151668 aagaactcttagatagtggattggagagatcaacctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaaca 11151592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 267
Target Start/End: Original strand, 24398044 - 24398318
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattg-gaa-aatggatagaaatt-agggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctct 97  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| || || ||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  24398044 tgtcttgttcattggtgagattgtgaagaaagggtagaagttaaggtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctct 24398143  T
Q  98 ttgt-aagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtca-agttggaccgaactgggtgaac-atttcttcttgttgtta 194  Q
    |||| |||| |||||||||| |||||| |||| |||||||||||| | | |||||||||  ||||||||||||||| ||||| ||| |||  ||||||||    
T  24398144 ttgtaaagaactcattgataatggattggagagatcaatctctcccccatagtaggtcattgttggaccgaactggctgaacaattacttggtgttgtta 24398243  T
Q  195 tc---ttttctttactctctttatcttgtttatcctttggttgaattgtggttttgctatgcacttggtttataga 267  Q
    ||   |||||| ||||||||||||||||||||  | |||||   |||| ||||||||||||||||| |||| ||||    
T  24398244 tctatttttctctactctctttatcttgtttagtc-ttggtccgattgcggttttgctatgcacttagtttctaga 24398318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 4503312 - 4503133
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg---aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctct 97  Q
    ||||||||||||||| ||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| | | |||||||||||    
T  4503312 tgtcttgttcattggagagattgggaaaaaatgg-tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaactcttttgtatctct 4503214  T
Q  98 ttgtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4503213 ttg-aagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 4503133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 171
Target Start/End: Original strand, 11690490 - 11690661
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg-aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  11690490 tgtcttgttcatttgtgagattgggaaaatgggtagaaattaggtttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatcccttt 11690589  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgg 171  Q
    ||||||  || ||||||||||||| |||| ||||| |||||| | | | || ||||||||||||||||||||    
T  11690590 gtaagaaatcgttgatagtggattggagagatcaacctctcccccatattacgtcaagttggaccgaactgg 11690661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 11067294 - 11067472
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattggaaaa-tggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11067294 tgtcttattcattggtgaaattggaaaaatgggtagaaattagtgttgtactttgtgagcttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt 11067393  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    |||||| |||||| ||| ||||||  ||| |||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  11067394 gtaagaactcatttataatggattgaagagatcaatctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactcggtcaaca 11067472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 12 - 178
Target Start/End: Original strand, 32289565 - 32289732
Alignment:
Q  12 ttggtgagattggaaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt-gtaagatctca 110  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||||| | | ||||||||||||| |||||| ||||    
T  32289565 ttggtgagattggaaaaggg-tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactcttttgtatctcttttgtaagaactca 32289663  T
Q  111 ttgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    ||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32289664 ttgatagtaaattagagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 32289732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 36205843 - 36205665
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg--aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| | | ||||||||||||    
T  36205843 tgtcttgttcattggtgagattgggaaaaatgg-tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaactcttttgtatctctt 36205745  T
Q  99 tgtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    || |||| |||||||| || ||||| ||||  ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  36205744 tg-aagaactcattgacagcggattggagagttcaatctatcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 36205665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 33 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 4484477 - 4484330
Alignment:
Q  33 tagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctc-tttgtaagatctcattgatagtggattagagatat 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |    
T  4484477 tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagtt 4484378  T
Q  132 caatctctcctcgagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  4484377 caatctctcctccagagtaggtcaagtttggacagaactgggtgaaca 4484330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 30833334 - 30833514
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattggaa--aatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctc-t 97  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |  || || ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||||||||| ||| |||||||||| |    
T  30833334 tgtcttgttc-ttggtgagattgggagaaaagggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagttaatttcttgtaacccttttgtatctctt 30833432  T
Q  98 ttgtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  30833433 ttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggactgaactgggtgaaca 30833514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 6 - 181
Target Start/End: Original strand, 26353178 - 26353354
Alignment:
Q  6 tgttcattggtgagattggaaaatggatagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctttgtaag 104  Q
    ||||| |||||||||||| |||| |  ||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||||||||| ||||||||    
T  26353178 tgttctttggtgagattgaaaaaagtgtagaaattaaggtttgttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaacacttttgtatctttttgtaag 26353277  T
Q  105 atctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaacattt 181  Q
      ||||||||||||||||| |||| |||| |||||||   |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  26353278 tactcattgatagtggattggagagatcactctctcccttagagtaggtcaagttggaccgaaccgggtaaacattt 26353354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Original strand, 13121758 - 13121899
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg-aaaatggatagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctt 98  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||||||||||    
T  13121758 tgtcttgttcattggtgagactgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttctttgtgagcttgttgaagataatttcttgtaacc--tttgtatctctt 13121854  T
Q  99 tgtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctc 143  Q
    ||||  | |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||    
T  13121855 tgtagaaactcattgatagtggattgaagaaatcaatctctcctc 13121899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 7815452 - 7815269
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattg-gaaaatggatagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||    
T  7815452 tgtcttgttcattggtgagattgagaaaaaggtt-gaaattagggtttgttctttagaagcttgttgaagctaatttcttgtaactcttttgtatctctt 7815354  T
Q  99 tgtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaacatttctt 184  Q
    ||||||| |||||| |||||||||| |||| || ||||||||| | | ||||  |||| |||||| ||||||||| || |||||||    
T  7815353 tgtaagaactcatttatagtggattggagagattaatctctccac-atagtatatcaaattggactgaactgggtaaatatttctt 7815269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Original strand, 11049539 - 11049727
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagatt-ggaaaatggatagaaattagggtt-gttct---ttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccattt-gtatc 94  Q
    |||||||||  ||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| |||||   ||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| |||||    
T  11049539 tgtcttgttttttggtgagattaggaaaatgg-tataaattagggtttgttctaatttgtgagcttgttgaagctaatttcttataacccttttagtatc 11049637  T
Q  95 tctttgtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaacatttctt 184  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||  | | |||||||||||||  | | |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  11049638 tctttgtaagaactcattgatagtagattgaaaagatcaatctctccttcataataggtcaaattggactgaactgggtaaacatttctt 11049727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 12 - 178
Target Start/End: Original strand, 6266691 - 6266859
Alignment:
Q  12 ttggtgagattggaaaatggatagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt-gtaagatctc 109  Q
    ||||||||||||| ||| || |||||||||||||| |||| |||||| |||||  || ||||||||||||| ||  |||||||| |||| |||||| |||    
T  6266691 ttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactc 6266789  T
Q  110 attgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
     ||||||||||||| ||||   |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6266790 tttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 6266859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 17 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 30218207 - 30217956
Alignment:
Q  17 gagattggaaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctttgt-aagatctcattgat 115  Q
    |||||||  |||||| ||||| ||||| |||||||| | |||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| || |  ||||||||    
T  30218207 gagattgagaaatgggtagaagttaggtttgttcttggagagcttattgaagctaatttcttgtaaccattttgtatctctttgtaaataattcattgat 30218108  T
Q  116 agtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtca-agttggaccgaactgggtgaacatttcttcttgttgttatcttttctttactctcttta 214  Q
    ||||| ||  | | ||||||| |||| | |||||| ||||  ||||||| ||||| ||| ||||||| ||  ||| | | | |||||| |||||||||||    
T  30218107 agtgggttgaaaagatcaatcactcccccagagtaagtcattgttggactgaactcggtaaacattttttggtgtagctct-ttttctctactctcttta 30218009  T
Q  215 tcttgtttatcctttggttgaattgtggttttgctatgcacttggtttataga 267  Q
    |||||||||| ||||||||  ||||||||| || | | |||||||||| ||||    
T  30218008 tcttgtttattctttggtttgattgtggttgtgttttacacttggtttctaga 30217956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Original strand, 24885650 - 24885763
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg-aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    ||||||||||||| || | ||||| ||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| | || |    
T  24885650 tgtcttgttcatttgtaaaattgggaaaatgagtagaaattaggtttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtacccctct 24885749  T
Q  100 gtaagatctcattg 113  Q
    |||||| |||||||    
T  24885750 gtaagaactcattg 24885763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 12 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 13656200 - 13656035
Alignment:
Q  12 ttggtgagattggaaaatggatagaaattaggg-ttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctc-tttgtaagatctc 109  Q
    ||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||| | |||| |||| | ||||||||||||||||  ||  ||||||| | ||||||||| |||    
T  13656200 ttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttg-tcaagctaatttcttgta-acctcttgtatcccttttgtaagaactc 13656103  T
Q  110 a-ttgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtga 175  Q
    | ||||||||||||| ||||   |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13656102 atttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 13656035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 14202584 - 14202450
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg-aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    |||||| ||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||        ||||    
T  14202584 tgtctttttcatttctgagattgggaaaatgggtagaaattatgtttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaactcat-------ccttt 14202492  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcc 141  Q
    |||||| |||||||||||| |||| |||| ||||||||||||    
T  14202491 gtaagaactcattgatagtagattggagagatcaatctctcc 14202450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 12 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 12647555 - 12647386
Alignment:
Q  12 ttggtgagattggaaaatggatagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt-gtaa-gatct 108  Q
    ||||||||||||| ||| || |||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||| ||  || ||||| |||| |||| || ||    
T  12647555 ttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaaagaact 12647458  T
Q  109 catt-gatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    |||| ||||||||||| ||||   |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12647457 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 12647386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 107 - 178
Target Start/End: Original strand, 39284932 - 39285003
Alignment:
Q  107 ctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39284932 ctcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaaca 39285003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 33 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 42261632 - 42261363
Alignment:
Q  33 tagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctttgt-aagatctcattgatagtggattagagatat 131  Q
    ||||||||| | |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||| |||  ||||||||||||| |   |||| ||    
T  42261632 tagaaattaagtttgttcttggagagcttgttgaagctaatttcttgtaactcttttgtatatctttgtaaagtactcattgatagtgaagcggagagat 42261533  T
Q  132 ca--atctctcctcgagagtaggtca-agttggaccgaactgggtgaac-atttcttcttgttgttatcttttctttactctctttatcttgtttatcct 227  Q
    ||   ||||||| | | ||||||| |  |||| || ||||||||| ||| |||  ||  ||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||  |    
T  42261532 cattctctctcccccatagtaggttagtgttgaactgaactgggtaaacaattatttgatgttgttct-ttttctttactctctttatcttgattat--t 42261436  T
Q  228 ttggttgaattgtggttttgctatgcacttggtttatagactaggtctatat-tattgttattgcttgtggtt 299  Q
    ||||||   ||||||||||||||| |||||||||  |||| ||| |||| || ||||||| ||||||| ||||    
T  42261435 ttggtttgtttgtggttttgctatacacttggttgctagattagatctagatatattgttgttgcttgcggtt 42261363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 12123763 - 12123644
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattggaaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctttg 100  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||  || ||||||| |||||||||| |||  ||||||||||| |||||||||| | | ||||||||  ||||    
T  12123763 tgtcttgttcatttgagagattggaaaatgagtataaattagagttgttctttatgattttgttgaagcttatttcttgtaactcttttgtatcattttg 12123664  T
Q  101 t-aagatctcattgatagtg 119  Q
    | |||| |||| ||||||||    
T  12123663 taaagaactcaatgatagtg 12123644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 55
Target Start/End: Original strand, 39284876 - 39284929
Alignment:
Q  3 tcttgttcattggtgagattgg-aaaatggatagaaattagggttgttctttgt 55  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  39284876 tcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagggttgctctttgt 39284929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 33 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 34811368 - 34811281
Alignment:
Q  33 tagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctttgtaag-atctcattgatagtg 119  Q
    ||||||||| | ||| |||| | |||||||||||||||||||| ||||| | | ||| |||||||||||||| | |||||||||||||    
T  34811368 tagaaattaagattgctcttagagagcttgttgaagctaatttattgtaactcttttatatctctttgtaagaaactcattgatagtg 34811281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 57 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 42019995 - 42019910
Alignment:
Q  57 agcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctttgtaagat---ctcattgatagtggattagagatatcaatctct 139  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| |    ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||    
T  42019995 agcttgtagaagctaatttcttgtaactcttttgtatctctttgtaaaaaaaactcattgatagtgaatttgagagatcaatctct 42019910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 99
Target Start/End: Original strand, 41446161 - 41446227
Alignment:
Q  33 tagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    ||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||   ||| ||| |||||||||||||    
T  41446161 tagaaattatgtttgttctttgagagcttgttgaagctaattttaagtaacccttttgtatctcttt 41446227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 70 - 167
Target Start/End: Original strand, 28671989 - 28672088
Alignment:
Q  70 taatttcttgtagcccatttgtatctctttgtaa-gatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtca-agttggaccgaa 167  Q
    |||||||||||  ||  |||||||||||||  || || |||| ||| |||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||    
T  28671989 taatttcttgttaccgttttgtatctctttacaaagaactcactgacagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcattgttggaccgaa 28672088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 33 - 119
Target Start/End: Original strand, 41454256 - 41454343
Alignment:
Q  33 tagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctttgt-aagatctcattgatagtg 119  Q
    ||||||||||  ||||| |||| |||||||||||||||||||||| | | | | ||||||| | ||||| |||| |||||||||||||    
T  41454256 tagaaattagatttgttttttgagagcttgttgaagctaatttctagcaactcttttgtatatatttgtaaagaactcattgatagtg 41454343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 257; Significance: 1e-143; HSPs: 75)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 34310895 - 34310535
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg-aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||    
T  34310895 tgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaaattgttgaagctaatttcttgtaacacatttgtatcttttt 34310796  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagtt-ggaccgaactgggtgaacatttcttcttgttgttatctt 198  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  ||  ||||||||||||    
T  34310795 gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctttggtgttgttatctt 34310696  T
Q  199 ttctttactctctttatcttgtttat-cctttggttgaattgtggttttgctatgcacttggtttatagactaggtctatattattgttattgcttgtgg 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34310695 ttctttactctctttatcttgtttattcctttggttgaattgtggttttgctatgcacttggtttatagactaggtctatattgttgttattgcttgtgg 34310596  T
Q  298 tttatttacatttgattattggttgccattaatacttgctccacacatcatatagtttgta 358  Q
    | |||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34310595 tctatttacatttggttattggttgtcattgatacttgctccacacatcatatagtttgta 34310535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 4508885 - 4508505
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg-aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4508885 tgtcttgttgattggtgagattgggaaaatgagtagaaattagggttgttctttgtgagcttattgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt 4508786  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaacatttcttcttgttgttatcttt 199  Q
    |||||| |||||||| |||||||| |||| |||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||    
T  4508785 gtaagaactcattgagagtggattggagagatcaatctcttcttcagagtaggttaagttggaccgaactgggtgaacatttcttggtgttgttatattt 4508686  T
Q  200 tctttactctctttatcttgtttatcctttggttgaattgtggttttgctatgcacttggtttatagactaggtctatattattgttattgcttgtggtt 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4508685 tctttactctctttatcttgtttatcctttggttgaattgtggttttgctatgcacttggtttatagactaggtctatattgttgttattgcttgtggtt 4508586  T
Q  300 tatttacatttgattattggttgccattaatacttgctccacacatcatatagtttgtattagcgggaaatttgtgactgaat 382  Q
    |||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||| || || ||  |||||||||||| | | |||||||| ||| ||||    
T  4508585 tatttatatttggttattggttggcattgatacttgcttcatacttc--atagtttgtattggtgtgaaatttgagaccgaat 4508505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 4 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 4510724 - 4510356
Alignment:
Q  4 cttgttcattggtgagatt-ggaaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctttgta 102  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  4510724 cttgttgattggtgagatttggaaaatgggtagaaattaaggttgttctttgtgagtttattgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttata 4510625  T
Q  103 agatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaacatttcttcttgttgttatcttttct 202  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  4510624 agaactcattgatagtggattgaagaaatcaatctctcctgtagagtaggtcaagttggaccgtactgggtgaacatttcttggtgttgttatcttttct 4510525  T
Q  203 ttactctctttatcttgtttatcctttggttgaattgtggttttgctatgcacttggtttatagactaggtctatattattgttattgcttgtggtttat 302  Q
    |||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4510524 ttactctcttgatcttgtttatccattagttgaattgtgtttttgctatgcacttgatttatagactaggtctatattgttgttattgcttgtggtttat 4510425  T
Q  303 ttacatttgattattggttgccattaatacttgctccacacatcatatagtttgtattagcgggaaatttg 373  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| | | ||||||||    
T  4510424 ttacatttggttattggttgccattgatacttgctccacacatc--atagtttgtattggtgtgaaatttg 4510356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 4 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 4512566 - 4512198
Alignment:
Q  4 cttgttcattggtgagatt-ggaaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctttgta 102  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  4512566 cttgttgattggtgagatttggaaaatgggtagaaattaaggttgttctttgtgagtttattgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttata 4512467  T
Q  103 agatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaacatttcttcttgttgttatcttttct 202  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  4512466 agaactcattgatagtggattgaagaaatcaatctctcctgtagagtaggtcaagttggaccgtactgggtgaacatttcttggtgttgttatcttttct 4512367  T
Q  203 ttactctctttatcttgtttatcctttggttgaattgtggttttgctatgcacttggtttatagactaggtctatattattgttattgcttgtggtttat 302  Q
    |||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4512366 ttactctcttgatcttgtttatccattagttgaattgtgtttttgctatgcacttgatttatagactaggtctatattgttgttattgcttgtggtttat 4512267  T
Q  303 ttacatttgattattggttgccattaatacttgctccacacatcatatagtttgtattagcgggaaatttg 373  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| | | ||||||||    
T  4512266 ttacatttggttattggttgccattgatacttgctccacacatc--atagtttgtattggtgtgaaatttg 4512198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 43 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 32358190 - 32357863
Alignment:
Q  43 ggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctttgtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcct 142  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  32358190 ggttgtgctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcct 32358091  T
Q  143 cgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaacatttcttcttgttgttatcttttctttactctctttatcttgtttatcctttggttgaattgtgg 242  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||||||||    
T  32358090 ccagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaacatttcttggtgttgttatcttttctttactctctttaacttgtttattccttgcttgaattgtgg 32357991  T
Q  243 ttttgctatgcacttggtttatagactaggtctatattattgttattgcttgtggtttatttacatttgattattggttgccattaatacttgctccaca 342  Q
    ||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||     || || ||||||| |||| |||||| |||||||    
T  32357990 ttttgttatgcaattggattataaactaggtctatattattgttgttgcttgtggtttactt-----tggttgttggttgtcattgatacttactccaca 32357896  T
Q  343 catcatatagtttgtattagcgggaaatttgtg 375  Q
    ||||||||| |||||||| | | ||||||||||    
T  32357895 catcatataatttgtattggtgtgaaatttgtg 32357863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Original strand, 3258984 - 3259322
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg-aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| | |||||||||||||||    
T  3258984 tgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaactagggttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttattgtaactcatttgtatctcttt 3259083  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaacatttcttcttgttgttatcttt 199  Q
    |||| | | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  3259084 gtaaaaacccattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagttgaaccgaactgggtgaacatttcctggtgttgttatcttt 3259183  T
Q  200 tctttactctctttatcttgtttatcctttggttgaattgtggttttgctatgcacttggtttatagactaggtctatattattgttattgcttgtggtt 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| | || ||| |||| ||| |||| ||| |||||||||||||||| |    
T  3259184 tctttactctctttatcttgtttattccttggttggattgtggttttgctatgcccgtgttttctagattagatctagattgttgttattgcttgtgg-t 3259282  T
Q  300 tatttacatttgattattggttgccattaatacttgctcc 339  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||    
T  3259283 tatttacatttggttattggttgtcattgatacttgctcc 3259322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 8359496 - 8359157
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg-aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccattt-gtatctctt 98  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  8359496 tgtcttgttcattggggagattgggaaaatgggtagaaattagggtttttctttgtgagcttgtttaaactaatttcttgtaacccattttgtatctctt 8359397  T
Q  99 tgtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaa-gttggaccgaactgggtgaacatttcttcttgttgttatct 197  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  8359396 tgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcattgttggaccgaactgggtgaacatttcttggtgttgttatct 8359297  T
Q  198 tttctttactctctttatcttgtttatcctttggttgaattgtggttttgctatgcacttggtttatagactaggtctatattattgttattgcttgtgg 297  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||| |||| ||| ||||| |||||||||     
T  8359296 tttctctactctcattatcttgtttatcctttggttagattgtggttttgctatgcacttgttttctagattagatctagattgttgttgttgcttgtg- 8359198  T
Q  298 tttatttacatttgattattggttgccattaatacttgctccac 341  Q
       |||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  8359197 ---atttacttttgattgttggttgccattgatacttgctccac 8359157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Original strand, 29608726 - 29609037
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg-aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  29608726 tgtcttgttctttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt 29608825  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaacatttcttcttgttgttatcttt 199  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||||||||||||    
T  29608826 gtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatcactcctccagagtaggtcaagttggaccgaactgagtgaatatttcttggtgttgttatcttt 29608925  T
Q  200 tctttactctctttatcttgtttatcctttggttgaattgtgg-ttttgctatgcacttggtttatagactaggtctatattattgttattgcttgtggt 298  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||| |||||||||||||| || | ||| |||| ||| ||||| ||||||||||     
T  29608926 tctctactctctttatcttgtttatcctttgcttagattgtggtttttgatatgcacttggtttctatattagatctagattgttgttgttgcttgtgg- 29609024  T
Q  299 ttatttacatttg 311  Q
    |||||||||||||    
T  29609025 ttatttacatttg 29609037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 48599513 - 48599213
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg-aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  48599513 tgtcttgttcattggtgatattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt 48599414  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaacatttcttcttgttgttatcttt 199  Q
    | |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  48599413 ggaagagctcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagcagatcaagttggaccgaactgggtgaacatttcttgatgttgttatcttt 48599314  T
Q  200 tctttactctctttatcttgtttatcctttggttgaattgtggttttgctatgcacttggtttatagactaggtc--tatattattgttattgcttgtgg 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||| |||||||| ||||||| | ||||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||    
T  48599313 tctttactctctttatcttgtttattccttggttggattgtagttttgctgtgcactt-gattatagactaggtctatatattattgttgttgtttgtgg 48599215  T
Q  298 tt 299  Q
    ||    
T  48599214 tt 48599213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 2361151 - 2360811
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg-aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  2361151 tgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt 2361052  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaacatttcttcttgttgttatcttt 199  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||| |||||||||||| || |   ||  ||| || | |||||    
T  2361051 gtaagaactcattgatagtggatttgagatatcaatctctcccccagattaggtcaagttgaaccgaactgggtcaata-acct--ttggtg-tgtcttt 2360956  T
Q  200 tctttactctctttatcttgtttatcctttggttgaattgtggttttgctatgcacttggtttatagactaggtctatattattgttattgcttgtggtt 299  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||  |||| |||||||||       
T  2360955 tctttattctctttatcttgtttattccttggttgaattgtggttttgatatgcacttggtttctagactaggtctatattgatgttgttgcttgtg--- 2360859  T
Q  300 tatttacatttgattattggttgccattaatacttgctccacacatcata 349  Q
     |||||| |||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2360858 -atttac-tttggttgttggttgccattgatacttgctccacacatcata 2360811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 341
Target Start/End: Original strand, 2390271 - 2390615
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattggaaaa-tggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2390271 tgtcttgttcattggtgaaattcgaaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt 2390370  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaa-catttct---tcttgttgttat 195  Q
    |||| | |||||  |||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  || |||   | ||||||||      
T  2390371 gtaataactcatatatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggaccgaactaggtgaataatctcttggtgttgttgttta 2390470  T
Q  196 cttttctttactctctttatcttgtttatcctttggttgaattgtggttttgctatgcacttggtttatagactaggtctatattattgttattgcttgt 295  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| || ||| ||| |||| ||| |||| ||| ||||||||| ||||    
T  2390471 tttttctctactctctttatcttgtttatccttttgttggattgtggttttgctatacatttgttttctagattagatctagattgttgttattgattgt 2390570  T
Q  296 ggtttatttacatttgattattggttgccattaatacttgctccac 341  Q
    || ||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||    
T  2390571 gg-ttatttacatttggttattggttgtcattgatacttgctccac 2390615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 54 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 6360077 - 6359784
Alignment:
Q  54 gtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctttgtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggt 153  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| |||||||||| | | | | |||||    
T  6360077 gtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagttgattggagagatcaatctcttccccatattaggt 6359978  T
Q  154 caagttggaccgaactgggtgaaca-tttcttcttgttgttatcttttc-tttactctctttatcttgtttat-cctttggttgaattgtggttttgcta 250  Q
    ||||||||| |||||||||| |||| ||||||  ||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||| ||||  |||| |||||||||||||||    
T  6359977 caagttggatcgaactgggtcaacaatttcttggtgttgttatcttttcatttgctttctttatcttgtttattccttaagttggattgtggttttgcta 6359878  T
Q  251 tgcacttggtttatagactaggtctatattattgttattgcttgtggtttatttacatttgattattggttgccattaatacttgctccacacatcata 349  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||     || || |||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  6359877 tgcacttggtttatagactaggtatatattattgttgttgcttgtggtttactt-----tggttgttggttcccattgatacttgctccacacatcata 6359784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Original strand, 22269962 - 22270146
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg-aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22269962 tgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt 22270061  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaacatttctt 184  Q
    |||||| || |||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22270062 gtaagaactgattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaacatctctt 22270146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 6431960 - 6432134
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg-aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6431960 tgtcttgttcattggttagattgggaaaatgggtagaaattaggattgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt 6432059  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtg 174  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6432060 gtaagaactcgttgatagtggattggagagatcaatctctccttcagagtaggtcaagttggaccgaactgggtg 6432134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 30024911 - 30024740
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattg-gaaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  30024911 tgtcttgttcattggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggttgttcattgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt 30024812  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgg 171  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| |||| ||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  30024811 gtaagaactctttgatagtggattggagagatcaatcactcccccagagtaggtcaagttggaccgaactgg 30024740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 27347806 - 27347984
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg-aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27347806 tgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattaggattgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt 27347905  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    |||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27347906 gtaagaactcattgatagtggattgcagagatcaatctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaaca 27347984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 14070012 - 14069834
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg-aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14070012 tgtcttgttcattggtgagattgggaaaaagggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt 14069913  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14069912 gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccaagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaaca 14069834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 14380040 - 14379862
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg-aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14380040 tgtcttgttcattggtgagattgggaaaaagggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt 14379941  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14379940 gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccctagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaaca 14379862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 31733148 - 31732970
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattg-gaaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31733148 tgtcttgttcattggtgagactgagaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttggtgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt 31733049  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    |||||| |||||||||| |||||| |||| |||||||||||| | | | ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31733048 gtaagaactcattgatactggattggagagatcaatctctcccccaaattaggtcaagttggaccgaactgggtcaaca 31732970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 23555028 - 23555208
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg---aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctct 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | |||||| ||||    
T  23555028 tgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatgg-tagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacacttttgtacctct 23555126  T
Q  98 ttgtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23555127 ttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 23555208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 35853903 - 35854082
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg-aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  35853903 tgtcttgttcattggtgagattgggaaaaagggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttt 35854002  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  35854003 gtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 35854082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 29991043 - 29991221
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattggaaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||| ||| |||||||||||||     
T  29991043 tgtcttgttcattggtgagattgggaaaaggatagaaattagggttgttatttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttc 29991142  T
Q  101 taagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    ||| | ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29991143 taataactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 29991221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 43864233 - 43864411
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattggaaaa-tggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  43864233 tgtcttgttcattggtgagattggaaaagtgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcctgtaacccatttgtatctcttt 43864332  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    |||| | || |||||||||||||| |||| |||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  43864333 gtaaaaactaattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaaca 43864411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 47674122 - 47673953
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattg-gaaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  47674122 tgtcttgttcattggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt 47674023  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactg 170  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | | | || |||||||||||||||||||    
T  47674022 gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcc-ccatattaagtcaagttggaccgaactg 47673953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Original strand, 48491568 - 48491729
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg-aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  48491568 tgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt 48491667  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttgg 161  Q
    | |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | ||| |||||||||||||    
T  48491668 gaaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaagttgg 48491729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 33 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 22328538 - 22328306
Alignment:
Q  33 tagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctttgtaag-atctcattgatagtggattagagata 130  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| ||| |  ||||| |||||||||| |||| |    
T  22328538 tagaaattagagtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcttttgtatctctttgcaaggaagtcattaatagtggatttgagaga 22328439  T
Q  131 tcaatctctcctcgagagtaggtcaa-gttggaccgaactgggtgaacatttcttcttgttgttatcttttctttactctctttatcttgtttatccttt 229  Q
    ||||||||||| | |||||||||||  ||||||||||||||||| || |||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  22328438 tcaatctctcccctagagtaggtcattgttggaccgaactgggtaaatattttttggtgttgttatcttttctctactctctttatcttgtttattcttt 22328339  T
Q  230 ggttgaattgtggttttgctatgcacttggttt 262  Q
     |||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  22328338 tgttcgattgtggttttgttatgcacttggttt 22328306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 31105572 - 31105388
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg-aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  31105572 tgtcttgttcatttgtgagattgggaaaatgggtagaaattagattttttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatcttttt 31105473  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaacatttctt 184  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| |||| || ||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31105472 gtaagaactcattgatggtggattggagagataaatctctccccaagagtagatcaagttggaccgaactgggtaaacatttctt 31105388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 3 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 41317611 - 41317435
Alignment:
Q  3 tcttgttcattggtgagattgg-aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctttgt 101  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||    
T  41317611 tcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgtcaaagctaatttcttgtaatccatttgtatccctttgt 41317512  T
Q  102 aagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41317511 aagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaaca 41317435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 167
Target Start/End: Original strand, 1113646 - 1113813
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattg-gaaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  1113646 tgtcttgttcatttgtgagattgagaaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttataacccatttgtatctcttt 1113745  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaa 167  Q
    |||||| |||||||||||| |||| |||| |||||||||||| | | | ||||||||||| |||||||    
T  1113746 gtaagaactcattgatagtagattggagagatcaatctctcccccatattaggtcaagtttgaccgaa 1113813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 47676315 - 47676144
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattg-gaaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  47676315 tgtcttgttcattggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaatttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt 47676216  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgg 171  Q
    |||||| |||| |||||||||| | |||| |||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||||    
T  47676215 gtaagaactcaatgatagtggaatggagagatcaatctctcccccatattaggtcaagttggaccgaactgg 47676144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 26417305 - 26417482
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg-aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26417305 tgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagataatttcttgtaacccatttgtatctcttt 26417404  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| |||| |||||||||||| | ||  |||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  26417405 gtaagaactcgttgatagtggattggagagatcaatctctcc-ccaggttaggtcaaattggaccaaactgggtcaaca 26417482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 48489420 - 48489598
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg-aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  48489420 tgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgaaaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt 48489519  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    | || | |||||| |||||||||| |||| |||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  48489520 gcaataactcattcatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtaaaca 48489598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Original strand, 4586150 - 4586323
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg-aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||    
T  4586150 tgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaattttttgtaacccatttttatctcttt 4586249  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggt 173  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | | | || ||||| ||||||||||||||||    
T  4586250 gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccatattatgtcaacttggaccgaactgggt 4586323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 8153331 - 8153509
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg-aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  8153331 tgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgagtagaaattagggttgttctttgtgagattgtcaaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt 8153430  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    |||| | ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  8153431 gtaataactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaagttggactgaactgggtcaaca 8153509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 5 - 178
Target Start/End: Original strand, 18126637 - 18126811
Alignment:
Q  5 ttgttcattggtgagattggaaaa-tggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctttgtaa 103  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18126637 ttgttcattggtgagattggaaaaatgtgtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttcaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaa 18126736  T
Q  104 gatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    || ||||||||||||||||| |||  |||||||||||| | ||| ||||||||||| |||||| |||||| ||||    
T  18126737 gaactcattgatagtggattggaggaatcaatctctcccccagactaggtcaagtttgaccgacctgggtcaaca 18126811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 36146587 - 36146409
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg-aaaatggatagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctt 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  36146587 tgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagtttgttatttgtgagcttgttgaagctaatttct-gtaacccatttgtatctctt 36146489  T
Q  99 tgtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | | | ||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  36146488 tgtaagaactcattgatagtggatttgagagatcaatctctcccccatattaggtcaagttggaccgaactaggtcaaca 36146409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 5 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 496158 - 495984
Alignment:
Q  5 ttgttcattggtgagattgg-aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctttgtaa 103  Q
    ||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||    
T  496158 ttgttaatttgtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtagttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgcaacccatttgtatctctttataa 496059  T
Q  104 gatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    || ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | | ||||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  496058 gaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccctatagtaggtcaagttggacagaaccgggtcaaca 495984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 41649189 - 41649012
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattggaaaa-tggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  41649189 tgtcttgttcatttgtgagattggaaaaattggtagaaattaggtttgttctttgtgagcttgttta-gctaatttcttgtaacccatttgtatcccttt 41649091  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | | | ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41649090 gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccaaattaggtcaagttggaccgaactgggtcaaca 41649012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 23 - 178
Target Start/End: Original strand, 25615865 - 25616021
Alignment:
Q  23 ggaaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctttgtaagatctcattgatagtggat 122  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||    
T  25615865 ggaaaatgggtagaaattaggtttgttctatgtgcgcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatcattttgtaagaactcattgatagtggat 25615964  T
Q  123 tagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  25615965 tagagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggcgaaca 25616021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 38671401 - 38671223
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg-aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| | |||||||||| ||||    
T  38671401 tgtcttgttcatttgtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttattgtaacacatttgtatcacttt 38671302  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    |||||| |||||||||||||||||  ||| || ||||| ||| | | | ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38671301 gtaagaactcattgatagtggattgaagagataaatctatcccccaaaataggtcaagttggaccgaactgggtcaaca 38671223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 37 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 2759339 - 2759198
Alignment:
Q  37 aattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctttgtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatc 136  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2759339 aattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaactcatttatatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatc 2759240  T
Q  137 tctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    ||| | | ||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  2759239 tcttccccagattaggtcaagttggaccgaacttggtcaaca 2759198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 3 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 4253706 - 4253523
Alignment:
Q  3 tcttgttcattggtgagattgg-aaaatggatagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctttg 100  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||    
T  4253706 tcttgttcattggtgaaattggtaaaatgg-tagaaattagggtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcatgtaacccttttatatctctttg 4253608  T
Q  101 taa-gatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaacatttctt 184  Q
     || || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||    
T  4253607 gaaagaactcattgataatggattagagagatcaatctctcccacagagtaggtcaatttggaccgaactaggtaaacatttctt 4253523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 23565243 - 23565069
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg---aaaatggatagaaattaggg-ttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctc 96  Q
    |||||||||||||||||||||| |   ||||| | |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | ||||||||||    
T  23565243 tgtcttgttcattggtgagattaggaaaaaataggtagaaattaggtcttgttctttgtgagcttgttgaaactaatttcttgtaactcttttgtatctc 23565144  T
Q  97 tttgtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgg 171  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||||||    
T  23565143 tttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcctagagtaggtcaagttggactgaactgg 23565069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 12 - 178
Target Start/End: Original strand, 39731369 - 39731537
Alignment:
Q  12 ttggtgagattggaaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctc-tttgtaagatctca 110  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||   | ||||||||||||| | | |||||||||| ||||||||| ||||    
T  39731369 ttggtgagattggaaaaagggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcagatctaatttcttgtaactcttttgtatctcttttgtaagaactca 39731468  T
Q  111 ttgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  39731469 ttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 39731537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 19502166 - 19502346
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg--aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctt 98  Q
    ||||||||||| |||||||||||   |||| || ||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| | | ||||||||||||    
T  19502166 tgtcttgttcagtggtgagattgcgaaaaaaggttagaaattaaggttgttttttgtgagcttgtcaaagctaatttcttgtaactcttttgtatctctt 19502265  T
Q  99 tgtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||| ||||||||||    
T  19502266 tgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaagtcaagtttggaacgaagtgggtgaaca 19502346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 25767137 - 25766960
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattggaaaat-ggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccattt-gtatctctt 98  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||| ||| |||||||||    
T  25767137 tgtcttgttcattg---agattggaaaaaagggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaaccccttttgtatctctt 25767041  T
Q  99 tgtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    |  |||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  25767040 ttgaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttagaccgaactgggtgaaca 25766960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 23 - 184
Target Start/End: Original strand, 31518915 - 31519076
Alignment:
Q  23 ggaaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctttgtaagatctcattgatagtggat 122  Q
    ||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| || |||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  31518915 ggaaaataggtagaaattaggtttgttctctgtgagcttattgaagctagtt-cttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcattgacagtggat 31519013  T
Q  123 tagagatatcaatctctc-ctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaacatttctt 184  Q
    | |||| ||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  31519014 tggagagatcaatctctctccccagagtaggtcaagttggaccgaactggataaacatttctt 31519076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Original strand, 23343964 - 23344146
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattggaaaatggatagaaattagggttg-ttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    ||||| |||||||||||||||| | ||| || ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||| |||||    
T  23343964 tgtctagttcattggtgagatttggaaaagggtagaaattaaggtttattctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaaccctttagtatatcttt 23344063  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaacatttctt 184  Q
    || ||| |||||||||| | |||| |||| || ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||    
T  23344064 gtgagaactcattgataatagattggagaaattaatctctc--ccagagtaggtcaagttggaccgaacaaggtaaacatttctt 23344146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Original strand, 31518784 - 31518905
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg-aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||    
T  31518784 tgtcttgttcattggtgagattgggaaaataggtagaaattaggtttgttctttgtgagcttattgaagctagtttcttgtaactcatttgtatctcttt 31518883  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtgga 121  Q
    |||||| |||||||| ||||||    
T  31518884 gtaagaactcattgacagtgga 31518905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 12098038 - 12097868
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg-aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||      
T  12098038 tgtcttgttcattggttagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcattgtgagcttgttgaagttaatttcttgtaacccatttgtatctct-- 12097941  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
         | ||| ||| ||||||||| |||| || ||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  12097940 -----aactctttg-tagtggattggagagatgaatctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactaggtcaaca 12097868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Original strand, 4178763 - 4178921
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg-aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||  | ||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  4178763 tgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaaggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgggaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttt 4178862  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagtt 159  Q
    | |||| |||||||||||||||||  | |  ||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  4178863 g-aagaactcattgatagtggattgaacagttcaatctctcctccagagcaggtcaagtt 4178921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 12 - 178
Target Start/End: Original strand, 20343897 - 20344064
Alignment:
Q  12 ttggtgagattggaaaatggatagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt-gtaagatctc 109  Q
    ||||||||||||| ||| || |||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||| ||  |||||||| |||| |||||| |||    
T  20343897 ttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactc 20343994  T
Q  110 att-gatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    ||| ||||||||||| ||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20343995 atttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaaca 20344064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 36574694 - 36574511
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattggaaaatggatagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||  || || ||||||||| | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||    
T  36574694 tgtcttgtttattggagagattggggaaagg-tagaaattaagatttgttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaacccttttatatctcttt 36574596  T
Q  100 gt-aagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaacatttctt 184  Q
    || |||| |||||||||||||| || |||| |||||||  ||| | |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||    
T  36574595 gtaaagaactcattgatagtggtttggagagatcaatccatcc-ctagagtaggtcaatttggaccaaactgggtaaacatttctt 36574511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 12 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 43504323 - 43504154
Alignment:
Q  12 ttggtgagattggaaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagc-ccatttgtatctc-tttgtaagatctc 109  Q
    ||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||||| |||||  || ||||||||||||| | |  |||||||||| ||||||||| |||    
T  43504323 ttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactc 43504224  T
Q  110 attgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    |||||||||| ||| ||||  ||||||||||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  43504223 attgatagtgaattggagagttcaatctctcctccatagtaggtcaagtttggatcgaactgggtgaaca 43504154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 48408791 - 48408972
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg-aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccattt-gtatctctt 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||  |||||||||||| | |||||  |||||||||||||||| ||| ||| |||||||||    
T  48408791 tgtcttgttcattggtgagattgggaaaaagggtagaaattaatgttgttctttgtaaacttgtcaaagctaatttcttgtaaccccttttgtatctctt 48408890  T
Q  99 t-gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    | | || | ||||||||||||||||| ||||  | ||||||||||| |||||| |||||| || ||||||||||||||||||    
T  48408891 ttgaaataactcattgatagtggattggagagtttaatctctcctccagagtatgtcaagtttagaccgaactgggtgaaca 48408972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 85 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 24525596 - 24525508
Alignment:
Q  85 catttgtatctctttgtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggt 173  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  24525596 catttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccaagattaggtcaagttggacggaactgggt 24525508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 4538719 - 4538627
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattggaaaa-tggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgta 92  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||  || || |||||||||||||||| ||||||||||    
T  4538719 tgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagggttgttctttatgaaattttttaagctaatttcttgtaacccatttgta 4538627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 12 - 178
Target Start/End: Original strand, 24789841 - 24790009
Alignment:
Q  12 ttggtgagattggaaaatggatagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctc-tttgtaagatctc 109  Q
    ||||| ||||||| ||| || || ||||||||||| |||| |||||| |||||  ||||||||||||||||  |  |||||||| | ||||||| | |||    
T  24789841 ttggtaagattgggaaaagggtaaaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaaagctaatttcttgta-acattttgtatcccttttgtaaaaactc 24789939  T
Q  110 attgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
     ||||||||||||| ||||   | |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24789940 tttgatagtggattggagagtactatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 24790009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 12 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 6592509 - 6592340
Alignment:
Q  12 ttggtgagattggaaaatggatagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt-gtaa-gatct 108  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||| ||  || ||||| |||| |||| || ||    
T  6592509 ttggtgagattgggaaatgggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaaagaact 6592412  T
Q  109 catt-gatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    |||| ||||||||||| ||||   ||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6592411 catttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 6592340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 12 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 18388929 - 18388760
Alignment:
Q  12 ttggtgagattggaaaatggatagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt-gtaa-gatct 108  Q
    ||||||||||||| ||| || |||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||| ||  || ||||| |||| |||| || ||    
T  18388929 ttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaaagaact 18388832  T
Q  109 catt-gatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    |||| ||||||||||| ||||   |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18388831 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 18388760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 12 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 18392365 - 18392196
Alignment:
Q  12 ttggtgagattggaaaatggatagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt-gtaa-gatct 108  Q
    ||||||||||||| ||| || |||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||| ||  || ||||| |||| |||| || ||    
T  18392365 ttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaaagaact 18392268  T
Q  109 catt-gatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    |||| ||||||||||| ||||   |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18392267 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 18392196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 24526076 - 24525985
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg-aaaatggatagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttg 90  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||  |||||||||||||||| | ||||||    
T  24526076 tgtcttgttcattggtgaaattgggaaaatgggtagaaattaggttttgttctttgtgagcttgtcaaagctaatttcttgtaactcatttg 24525985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 23 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 3904773 - 3904624
Alignment:
Q  23 ggaaaatggatagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctttgt-aagatctcattgatagtgg 120  Q
    ||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||| | |||||  |||||||||||| | | |||| |||||||||| |||| |||||||||||| |    
T  3904773 ggaaaatgg-tagaaattaggttttgttctttgagagcctattgaatgtaatttcttgtaacacttttgcatctctttgtaaagaactcattgatagt-g 3904676  T
Q  121 attagagatatcaatctctcctcgagagtaggtca-agttggaccgaactgg 171  Q
    || ||||| ||||||||||||   |||||||||||  |||||||||||||||    
T  3904675 atcagagagatcaatctctccctcagagtaggtcattgttggaccgaactgg 3904624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 12 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 6594727 - 6594558
Alignment:
Q  12 ttggtgagattggaaaatggatagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt-gtaa-gatct 108  Q
    ||||||||||||| ||| || |||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||| ||  || ||||| |||| |||| || ||    
T  6594727 ttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaaagaact 6594630  T
Q  109 catt-gatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    |||| ||||||||||| ||||   ||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6594629 catttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 6594558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 87 - 180
Target Start/End: Original strand, 18396393 - 18396488
Alignment:
Q  87 tttgtatctctttgtaa-gatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaa-gttggaccgaactgggtgaacatt 180  Q
    ||||||||||||| ||| ||  |||||||||| ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  18396393 tttgtatctctttataaagaattcattgatagaggattggagagatcaatctctcctcaagagtaggtcaatggtggaccgaactgggtaaacatt 18396488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 107 - 178
Target Start/End: Original strand, 30814532 - 30814603
Alignment:
Q  107 ctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | | | ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30814532 ctcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccatattaggtcaagttggaccgaactgggtcaaca 30814603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 141
Target Start/End: Original strand, 5116626 - 5116735
Alignment:
Q  33 tagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctttgt-aagatctcattgatagtggattagagatat 131  Q
    ||||||||||| |||||||| |  || ||||||||| |||||| |||||  || ||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||| |||| ||    
T  5116626 tagaaattaggtttgttcttggatagtttgttgaagataatttattgtaaaccttttgtatctctttgtaaagaactcattgatagtgaattggagagat 5116725  T
Q  132 caatctctcc 141  Q
     |||||||||    
T  5116726 aaatctctcc 5116735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 32060493 - 32060322
Alignment:
Q  12 ttggtgagattggaaaatggatagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctc---tttgtaa-gat 106  Q
    ||||||||||||| ||| || |||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||| ||  || ||||| |   ||||||| ||     
T  32060493 ttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccctttttgtaaagaa 32060396  T
Q  107 ctcatt-gatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    |||||| ||||||||||| ||||   |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  32060395 ctcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaacttggtgaaca 32060322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 97 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 1560749 - 1560671
Alignment:
Q  97 tttgtaagatctcatt-gatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggt 173  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||| ||||   |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1560749 tttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 1560671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 91 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 5513755 - 5513662
Alignment:
Q  91 tatctctttgtaa-gatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaacatttctt 184  Q
    ||||||||||||| || |||||||| | || ||| |||| ||||||||| |||| |||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  5513755 tatctctttgtaaagaactcattgacactgaattggaga-atcaatctcacctccagagtaggtcaatttggactgaactgggtaaacatttctt 5513662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 23 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 43363629 - 43363556
Alignment:
Q  23 ggaaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctct 97  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||| ||||| | | |||||||||||    
T  43363629 ggaaaatgg-tagaaattaggtttgttcttggagagcttgttgaaactaatttattgtaactcttttgtatctct 43363556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 3 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 5514186 - 5514113
Alignment:
Q  3 tcttgttcattggtgagattggaaaatggatagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaattt 75  Q
    ||||||||||| | ||||||| |||| |  ||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5514186 tcttgttcatttgagagattgaaaaaagagtagaaattatgttttgttctttgtgagcttgttgaagctaattt 5514113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 197 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 1360154 - 1360051
Alignment:
Q  197 ttttctttactctctttatcttgtttatcctttggttgaattgtggttttgctatgcacttggtttatagactaggtct-atattattgttattgcttgt 295  Q
    |||||| || |||||||||||||||| | |||| |||  |||||||||||||| | ||||| |||| |||| ||| ||| | ||| ||||| ||||||||    
T  1360154 ttttctctattctctttatcttgtttcttcttttgttcgattgtggttttgctttacacttagtttttagattagatctaaaattgttgttgttgcttgt 1360055  T
Q  296 ggtt 299  Q
    ||||    
T  1360054 ggtt 1360051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 316 - 350
Target Start/End: Original strand, 30814698 - 30814732
Alignment:
Q  316 ttggttgccattaatacttgctccacacatcatat 350  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30814698 ttggttgccattgatacttgctccacacatcatat 30814732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 316 - 349
Target Start/End: Original strand, 22270249 - 22270282
Alignment:
Q  316 ttggttgccattaatacttgctccacacatcata 349  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22270249 ttggttgccattgatacttgctccacacatcata 22270282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 251; Significance: 1e-139; HSPs: 80)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 13549179 - 13548810
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg-aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  13549179 tgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttaaacctaatttcatgtaacccatttgtatctcttt 13549080  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaacatttcttcttgttgttatcttt 199  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  13549079 gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaacatttcttggtgttgttatcttt 13548980  T
Q  200 tctttactctctttatcttgtttatcctttggttgaattgtggttttgctatgcactt-ggtttatagactaggtctatattattgttattgcttgtggt 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13548979 tctttactctctttatcttgtttattctttggttggattgtggttttgctatgcactttggtttatagactaggtctatattattgttgttgcttgtggt 13548880  T
Q  299 ttatttacatttgattattggttgccattaatacttgctccacacatcatatagtttgtattagcgggaaatttg 373  Q
    ||| ||     || || ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||    
T  13548879 ttactt-----tggttgttggttgtcattgatacttgctccacacatcatatagtttgtattggtgtgaaatttg 13548810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Original strand, 11348687 - 11349049
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg-aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11348687 tgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt 11348786  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaacatttcttcttgttgttatcttt 199  Q
     ||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||    
T  11348787 ctaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggaccgaactgagtgaacatttcttgatgttgttatcttt 11348886  T
Q  200 tcttta--ctctctttatcttgttta-tcctttggttgaattgtggttttgctatgcacttggtttatagactaggtctatattattgttattgcttgtg 296  Q
    ||||||  |||||||||||||||||| |||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11348887 tctttactctctctttatcttgtttattccttgctttggattgtggttttgctatgcacttggtttatagactaggtctatattgttgttattgcttgtg 11348986  T
Q  297 gtttatttacatttgattattggttgccattaatacttgctccacacatcatatagtttgtatt 360  Q
    | |||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11348987 g-ttatttacatttgattattaattgtcattgatacttgctccacacatcatatagtttgtatt 11349049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 13547268 - 13546894
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg-aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  13547268 tgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctattttcttgtaacccatttgtatctcttt 13547169  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaacatttcttcttgttgttatcttt 199  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  13547168 gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaacatttcttggtgttgttatcttt 13547069  T
Q  200 tctttactctctttatcttgtttatcctttggttgaattgtggttttgctatgcacttggtttatagacta--ggtctatattattgttattgcttgtgg 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||     |||||||||||| ||||  |||||||||||||||| ||||||||||    
T  13547068 tctttactctctttatcttgtttattctttggttggattgtggttttgc-----acttggtttataaactataggtctatattattgttgttgcttgtgg 13546974  T
Q  298 tttatttacatttgattattggttgccattaatacttgctccacacatcatatagtttgtattagcgggaaatttgtgactgaat 382  Q
    |||| ||     || || |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| | | |||||||| ||| ||||    
T  13546973 tttactt-----tggttgttggttgccattgatacttgctccacacattatatagtttgtattggtgagaaatttgagaccgaat 13546894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 338
Target Start/End: Original strand, 37168286 - 37168622
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg-aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccattt-gtatctctt 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  37168286 tgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccattttgtatctctt 37168385  T
Q  99 tgtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaacatttcttcttgttgttatctt 198  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  37168386 tgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaacatttcttggtgttgttatctt 37168485  T
Q  199 ttctttactctctttatcttgtttatcctttggttgaattgtggttttgctatgcacttggtttatagactaggtctatattattgttattgcttgtggt 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||     
T  37168486 ttctttactctctttatcttgtttattccttggtttgattgtggttttgctatgcactt-gattatagactaggtctata-tattgttgttgcttgagg- 37168582  T
Q  299 ttatttacatttgattattggttgccattaatacttgctc 338  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||    
T  37168583 ttatttacatttggttattggttgtcattgatacttgctc 37168622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 47255519 - 47255171
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattggaaaa-tggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  47255519 tgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt 47255420  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaa-gttggaccgaactgggtgaacatttcttcttgttgttatctt 198  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||    
T  47255419 gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcattgttggaccgaactgggtgaacatttcttggtgttgttatttt 47255320  T
Q  199 ttct---ttactctctttatcttgtttatcctttggttgaattgtggttttgctatgcacttggtttatagactaggtctatattattgttattgcttgt 295  Q
    || |   |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  47255319 ttttcttttactctctttatcttgtttatcctttggttagattgtggttttgctatgcacttggtttatagactaggtctatattattgttgttgcttat 47255220  T
Q  296 ggtttatttacatttgattattggttgccattaatacttgctccacacatcata 349  Q
    |||||| ||     || || |||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  47255219 ggtttactt-----tggttgttggttgccattgatacctgctccacacatcata 47255171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 31925886 - 31925581
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattggaaaa-tggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31925886 tgtcttgttcattggtgagagtggaaaaatgggtagaaattagggatgttcattgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt 31925787  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaacatttcttcttgttgttatcttt 199  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| |||    
T  31925786 gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctctagagtaggtcaagttggaccgaactaggtgaacatttcttggtgttgttattttt 31925687  T
Q  200 tctttactctctttatcttgt-ttatcctttggttgaattgtggttttgctatgcacttggtttatagactaggtctatattattgttattgcttgtggt 298  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31925686 tctttactctcgttatcttgtattattctttggttggattgtggttttgctatgcacttggtttatagactaggtctatattattgttattgcttgtggt 31925587  T
Q  299 ttattt 304  Q
    | ||||    
T  31925586 taattt 31925581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Original strand, 29136236 - 29136585
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg-aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||    
T  29136236 tgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttggaacccatttgtatttcttt 29136335  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaacatttcttcttgttgt-tatct 197  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  || ||| ||| |    
T  29136336 gtaagaactcattgatcgtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaacatttcttggtgctgtctat-t 29136434  T
Q  198 tttctttactctctttatcttgtttatcctttggttgaattgtggttttgctatgcacttggtttatagactaggtctatattattgttattgcttgtgg 297  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  29136435 tttctctactctctttatcttgtttatcctttggttagattgtggttttgctatgcacttggtttatagactaggtctattttgttgttattgcttgtgg 29136534  T
Q  298 tttatttacatttgattattggttgccattaatacttgctccacacatcata 349  Q
     ||| ||| ||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  29136535 -ttagttatatttggttattggttgtcattggtacttgctccacacatcata 29136585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 83 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 37876862 - 37876585
Alignment:
Q  83 cccatttgtatctctttgtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaacatttc 182  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37876862 cccatttgtatctctttgtaataactcattgatagtggattgcagagatcaatctctcctccagagtacatcaagttgaaccgaactgggtgaacatttc 37876763  T
Q  183 ttcttgttgttatcttttctttactctctttatcttgtttatcctttggttgaattgtggttttgctatgcacttggtttatagactaggtctatattat 282  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  37876762 ttggtgttgttatcttttctttactctctttatcttgtttatcatttggttgaattgtggtttttctatgcacttggtttatagactaggtctatagtgt 37876663  T
Q  283 tgttattgcttgtggtttatttacatttgattattggttgccattaatacttgctccacacatcatatagtttgtatt 360  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37876662 tgtttttgcttgtggtttatttacatttggttattggttgccattgatacttgctccacacatcatatagtttgtatt 37876585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 37033252 - 37032888
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg-aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccattt-gtatctctt 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | |||||||    
T  37033252 tgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaatccattttgcatctctt 37033153  T
Q  99 tgtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaacatt-tcttcttgttgttatc 196  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||| || ||||||| ||| | ||||||||| | ||||||||||||||||||||| | | ||| ||||||| ||    
T  37033152 tgtaagaactcattgatagtggattggagagattaatctcttctccatagtaggtcatggttggaccgaactgggtgaacaatctattcgtgttgttgtc 37033053  T
Q  197 t--tttctttactctctttatcttgtttatcctttggttgaattgtggttttgctatgcacttggtttatagactaggtctatattattgttattgcttg 294  Q
    |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||||||||||| ||| |||| ||| |||| ||| |||||||||||||    
T  37033052 tattttctctactctctttatcttgtttatcctttggttagagtgtgattttgctatgcacttgttttctagattagatctagattgttgttattgcttg 37032953  T
Q  295 tggtttatttacatttgattattggttgccattaatacttgctccacacatcatatagtttgtatt 360  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37032952 tgg-ttatttacatttggttattggttgccattgatatttgctccacacatcatatagtttgtatt 37032888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 341
Target Start/End: Original strand, 47115160 - 47115502
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg-aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccattt-gtatctctt 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  47115160 tgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccattttgtatctctt 47115259  T
Q  99 tgtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaa-gttggaccgaactgggtgaacatttcttcttgttgttatct 197  Q
    ||||| | | ||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  47115260 tgtaaaaacccattgatagtggattggagagatcaatctctgctccagagtaggtcattgttggaccgaactgggtgaacatttcttgatgttgttatct 47115359  T
Q  198 tttctttactctctttatcttgtttatcctttggttgaattgtggttttgctatgcacttggtttatagactaggtctatattattgttattgcttgtgg 297  Q
    ||||| | |||| ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| |||||||||| ||| |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| |    
T  47115360 tttctctgctctttttatcttgtttatccttttgttagattgtggttttgttatgcacttgttttctagattagatctagattgttgttattgcttgt-g 47115458  T
Q  298 tttatttacatttgattattggttgccattaatacttgctccac 341  Q
     |||||||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||    
T  47115459 attatttacatttgattgttgattgtcattgatacttgctccac 47115502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 5 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 7482406 - 7482064
Alignment:
Q  5 ttgttcattggtgagattgga-aaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccattt-gtatctctttgta 102  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  7482406 ttgttcattggtgagattgggtaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccattttgtatctctttgta 7482307  T
Q  103 agatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaacatttcttcttgttgttatcttttct 202  Q
    ||| ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  | |||| |||||||||    
T  7482306 agaactcattgatagtgaattggagagatcaatctctccttcagagtaggtcaagttggaccgaactaggtgaacatttcatggtattgtcatcttttct 7482207  T
Q  203 ttactctctttatcttgtttatcctttggttgaattgtggttttgctatgcacttggtttatagactaggtc--tatattattgttattgcttgtggttt 300  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||| || ||    
T  7482206 ttactctctttatcttgtttattccttggttggattgtggttttgctatgcactt-gattatagactaggtctatatattgttgttgttgcttgagg-tt 7482109  T
Q  301 atttac----atttgattattggttgccattaatacttgctccac 341  Q
    ||||||    ||||| |||||||||| |||| |||||||||||||    
T  7482108 atttacattaatttggttattggttgtcattgatacttgctccac 7482064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 42298154 - 42297807
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg-aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  42298154 tgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttttttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt 42298055  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtca-agttggaccgaactgggtgaac-atttcttcttgttgttatc- 196  Q
    |||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||| ||     
T  42298054 gtaagaactcattgatagtggattgaagagatcaatctctcctccagagtaggtcatggttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgttgttgtct 42297955  T
Q  197 --ttttctttactctctttatcttgtttatcctttggttgaattgtggttttgctatgcacttggtttatagactaggtctatattattgttattgcttg 294  Q
      ||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||     
T  42297954 atttttctttactct-tttatcttgtttattatttggttggattgtgattttgctatgcacttggtttatagacttggtatatattattgttattgctta 42297856  T
Q  295 tggtttatttacatttgattattggttgccattaatacttgctccacacatcata 349  Q
    |||||       ||||| || |||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  42297855 tggtt------aatttggttgttggttgccattgatactttctccacacatcata 42297807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Original strand, 34603565 - 34603894
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattggaaaa-tggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgt-atctctt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| | |||||||    
T  34603565 tgtcttgttcattggtgagattgaaaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccattttttatctctt 34603664  T
Q  99 tgtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaacatttcttcttgttgttatctt 198  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||  ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||              ||||||||||||    
T  34603665 tgtaagaactcattgatggtggattgaagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggaccgaactagg--------------tgttgttatctt 34603750  T
Q  199 ttctttactctctttatcttgtttatcctttggttgaattgtggttttgctatgcacttggtttatagactaggtc--tatattattgttattgcttgtg 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||  ||||||  ||||  |||||| |    
T  34603751 ttctttactctctttatcttgtttattccttggttggattgtggttttgctatgcactt-gattatagactaggtctatatattgctgttggtgcttgag 34603849  T
Q  297 gtttatttacatttgattattggttgccattaatacttgctccaca 342  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  34603850 g-ttatttacatttgattattggttgtcattgatacttgctccaca 34603894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 19754483 - 19754737
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg--aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctt 98  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  19754483 tgtcttgttcattggtgagattgagaaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaaccgatttgtatctctt 19754582  T
Q  99 tgtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaacatttcttcttgttgttatctt 198  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||| || ||  || |||||||||    
T  19754583 tgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccctcagattaggtcaagttggaccgaagtgggtcaacaatttttggtg-tgttatctt 19754681  T
Q  199 ttctttactctctttatcttgtttatcctttggttgaattgtggttttgctatgca 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  19754682 ttctttactctctttatcttgtttatccttttgttggattgtggttttgctatgca 19754737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Original strand, 193600 - 193849
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattg-gaaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  193600 tgtcttgttcattggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggttgttctttattagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt 193699  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaacatttcttcttgtt-gttatctt 198  Q
    |||| | ||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||    
T  193700 gtaataactcattgatagtggattggagagatcaatctcttctccagagtatgtcaagttggaccgaactgggtgaacatttcttggtgttcgttatctt 193799  T
Q  199 ttc-tttactctctttatcttgtttatcctttggttgaattgtggttttg 247  Q
     || ||| || | |||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||    
T  193800 ctcttttgctttatttatcttgtttattccttggttggattgtggttttg 193849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 258
Target Start/End: Original strand, 19752674 - 19752930
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg--aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctt 98  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  19752674 tgtcttgttcattggtgagattgagtaaaatgggtagaaattagggttgttctttgcgagcttgttgaagctaatttcttgtaaccgatttgtatctctt 19752773  T
Q  99 tgtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaacatttcttcttgttgttatctt 198  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||||||  | | | ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||| ||| |||||||||    
T  19752774 tgtaagaactcattgatagaggattggagagatcaatctctctcccatattaggtcaagttggaccgaactaggtcaaca-atctt-ttg-tgttatctt 19752870  T
Q  199 ttctttactctctttatcttgtttatcctttggttgaattgtggttttgctatgcacttg 258  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||    
T  19752871 ttatttactctctttatcttgtttatccttttgttggattgtggttttactatgcacttg 19752930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 88 - 341
Target Start/End: Original strand, 28242382 - 28242635
Alignment:
Q  88 ttgtatctctttgtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaa-gttggaccgaactgggtgaacatttcttct 186  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||      
T  28242382 ttgtatctctttgtaagaactcatt-atagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcattgttggaccgaactgggtgaacatttcttgg 28242480  T
Q  187 tgttgttatcttttctttactctctttatcttgtttatcctttggttgaattgtgg-ttttgctatgcacttggtttatagactaggtctatattattgt 285  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||||| ||||||||| |||||||||| || | ||| |||| ||| ||||    
T  28242481 tgttgttatcttttctctactctctttatcttgtttatcattttgttagattgtggtttttgctattcacttggtttctaaattagatctagattgttgt 28242580  T
Q  286 tattgcttgtggtttatttacatttgattattggttgccattaatacttgctccac 341  Q
    | ||||||| || ||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||    
T  28242581 tgttgcttgagg-ttatttacatttggttattggttgtcattgatacttgctccac 28242635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 834346 - 834168
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg-aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  834346 tgtcttgttcatttgtgagattgggaaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatcccttt 834247  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| ||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  834246 gtaagaactcattgatagtggattggagagatctatctctcccccagagtaggtcaagttggaccgaactgggtcaaca 834168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 3156854 - 3157032
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattg-gaaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3156854 tgtcttgttcattggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt 3156953  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | | | ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3156954 gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccatattaggtcaagttggaccgaactgggtcaaca 3157032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 28220405 - 28220227
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagatt-ggaaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28220405 tgtcttattcattggtgagattcggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt 28220306  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28220305 gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaaca 28220227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 31659227 - 31659405
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattggaaaa-tggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31659227 tgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagggctgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt 31659326  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    |||||| || |||||||||||||| |||| ||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31659327 gtaagaacttattgatagtggattggagagatcaatctctccctcagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaaca 31659405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 49918339 - 49918517
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattg-gaaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  49918339 tgtcttgttcattggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt 49918438  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | | | ||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  49918439 gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccaaattaggtcaagttggaccgaactaggtcaaca 49918517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 8550966 - 8550787
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg-aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| ||||    
T  8550966 tgtcttgttcatttgtgagattgggaaaatgggtagaaattaggtttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaactcatttgtatcccttt 8550867  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8550866 gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 8550787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 28265733 - 28265555
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg-aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28265733 tgtcttgttcattggcgagattgggaaaataggtagaaattagggttgttcattgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt 28265634  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| |||| |||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28265633 gtaagaactctttgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaaca 28265555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 4552816 - 4552638
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattg-gaaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||    
T  4552816 tgtcttgttcattggtgagattgagaaaatgggtagaaattaggtttgtcctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccctttgtatcccttt 4552717  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    |||||| |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4552716 gtaagaactcattgataatggattggagagatcaatctctccctcagagtaggtcaagttggaccgaactgggtcaaca 4552638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 13659515 - 13659337
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg-aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||    
T  13659515 tgtcttgttcatttgtgagattgggaaaacggatagaaattagggttgttttttgtaagcttgttgaagctaatttcttgttacccatttatatctcttt 13659416  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  13659415 gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagagtaggttaagttggaccgaactgggtcaaca 13659337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 28223600 - 28223422
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg-aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28223600 tgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattatggttgatctttctgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt 28223501  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | | | ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28223500 gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccatattaggtcaagttggaccgaactgggtcaaca 28223422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Original strand, 44455149 - 44455322
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg-aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| |||    
T  44455149 tgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaaactaatttcttgtaactcatttgtatcttttt 44455248  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggt 173  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  44455249 gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaagtttgaccgaactgggt 44455322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 50169389 - 50169218
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattggaaaa-tggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  50169389 tgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgtcaaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt 50169290  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgg 171  Q
    |||||  |||||||||||||||||  ||| |||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||    
T  50169289 gtaagtactcattgatagtggattgaagagatcaatctctcccctagattaggtcaagttggaccgaactgg 50169218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 46064907 - 46065085
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg-aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  46064907 tgtcttgttcatttgtgagattgggaaaatggataaaaattaggtttgttctttgtgagctcgttgaagctaatttcttgtaactcatgtgtatctcttt 46065006  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    |||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  46065007 gtaagaactcattcatagtggattggagagatcaatctctcccccagagtaggtcaagttggatcgaactgggtaaaca 46065085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 13138153 - 13137977
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattggaaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctttg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  13138153 tgtcttgttcattggtgagattgaaaaatggatagaaattagg-tcgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgcatctctttg 13138055  T
Q  101 taagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    ||||| | |||||||||||||||  ||| | |||||||||| | |||||||||||  |||||||||||||||| ||||    
T  13138054 taagaacacattgatagtggattgaagagagcaatctctcccctagagtaggtcatattggaccgaactgggtcaaca 13137977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 3189319 - 3189498
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagatt-ggaaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| || || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| | | ||||||||| |||    
T  3189319 tgtcttgttcattggtgagatttggaaaaagggtataaattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcctgtaactcttttgtatcttttt 3189418  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3189419 gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcatccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 3189498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 3198136 - 3198315
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagatt-ggaaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| || || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| | | ||||||||| |||    
T  3198136 tgtcttgttcattggtgagatttggaaaaagggtataaattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcctgtaactcttttgtatcttttt 3198235  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3198236 gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcatccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 3198315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 3206975 - 3207154
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagatt-ggaaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| || || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| | | ||||||||| |||    
T  3206975 tgtcttgttcattggtgagatttggaaaaagggtataaattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcctgtaactcttttgtatcttttt 3207074  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3207075 gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcatccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 3207154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 41360903 - 41361081
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg-aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41360903 tgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattaggtttgttctttgtgagcttgttgaaactaatttcttgtaacccatttgtatctcttt 41361002  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    |||||| ||| |||||||||||||| ||| |||||| ||||| | | |||||||||  |||||||||||| ||| ||||    
T  41361003 gtaagaactcgttgatagtggattaaagagatcaatatctcccccatagtaggtcatattggaccgaactaggtcaaca 41361081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 10925212 - 10925393
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattggaaaa-tggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  10925212 tgtcttgttcattggtgagattgaaaaaatggatagaaattatggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt 10925311  T
Q  100 gtaagatc---tcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    ||||||     |||||||||||||||| |||| |||||||||||| | ||| ||||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  10925312 gtaagaagaattcattgatagtggattggagaaatcaatctctcccctagattaggtaaagttggatcgaactgggtcaaca 10925393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 45644534 - 45644355
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattg-gaaaatggatagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||  |||||||||||||| | | ||||||||||||||    
T  45644534 tgtcttgttcattggtgagattgagaaaatggatagaaattaagttttgttctttgtgagcttgtcaaagctaatttcttgcaactcatttgtatctctt 45644435  T
Q  99 tgtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  45644434 tgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatatctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaaca 45644355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 50167354 - 50167176
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg-aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  50167354 tgtcttgttcattggtgagattgggaaaattagtagaaattagggttgttatttgtgagcttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt 50167255  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    |||| | ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | ||| ||| ||||||||||||||||| ||| ||||    
T  50167254 gtaaaaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattagctcaagttggaccgaactaggtcaaca 50167176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 12 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 13316520 - 13316352
Alignment:
Q  12 ttggtgagattgg-aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctttgtaagatctca 110  Q
    ||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| ||||    
T  13316520 ttggtgagattgggaaaaagggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactca 13316421  T
Q  111 ttgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13316420 ttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 13316352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 23555444 - 23555261
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattggaaaa-tggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| || | |||||||||||||||    
T  23555444 tgtcttattctttggtgagattggaaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaaactaatttcttataactcatttgtatctcttt 23555345  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaacatttctt 184  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| | | |||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||    
T  23555344 gtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcc-ccatagtaggtcaagttggatcgaactgagtaaacatttctt 23555261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 37503733 - 37503558
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg-aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||    
T  37503733 tgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtaaaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacc---ttgtatctcttt 37503637  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | ||| || ||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  37503636 gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattatgtcaagttggatcgaactaggtcaaca 37503558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 37560048 - 37559868
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagatt-ggaaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaa-gctaatttcttgtagcccatttgtatctctt 98  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37560048 tgtcttgttcattggtgagattaggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgttgaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctt 37559949  T
Q  99 tgtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctct-cctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    ||||||| ||| ||||||||| ||| |||| |||||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  37559948 tgtaagaactcgttgatagtgaattggagagatcaatctctccccctagattaggtcaagttggaccgaacttggtcaaca 37559868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 3847300 - 3847122
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg-aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || ||||| |||||||||||| ||||    
T  3847300 tgtcttgttcatttgtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagtttgtttaagctaaatttttgtaacccatttgtatcccttt 3847201  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| ||| |||||| | | ||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  3847200 gtaagaactcattgatagtggattggagagatccatctcttccccagattaggtcaagttggaccgaacttggtcaaca 3847122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Original strand, 15820296 - 15820477
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattggaaa-atggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||| |||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  15820296 tgtcttgttctttggtgatattggaaagatgggtaaaaattaggtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacacatttgtatctcttt 15820395  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaacattt 181  Q
     ||||| ||||||||||||| |||  ||| || |||||||| || |||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||    
T  15820396 ttaagaactcattgatagtgcattgaagagataaatctctcatccagagtaggtcaagttggatcgaactaggtaaacattt 15820477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Original strand, 1833511 - 1833675
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg-aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||   | |||||||||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  1833511 tgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaatctattgaagctaaattcttgtaactcatttgtatctcttt 1833610  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggacc 164  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | ||| |||||||| |||||||    
T  1833611 gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccaccagattaggtcaaattggacc 1833675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 3 - 175
Target Start/End: Original strand, 20762662 - 20762837
Alignment:
Q  3 tcttgttcattggtgagattgg--aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||   |||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||| |||||||||||| |    
T  20762662 tcttgttcattggtgagattgagaaaaaagggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttcg 20762761  T
Q  101 taagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtga 175  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  20762762 taagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctacagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtga 20762837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 197087 - 196915
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattg-gaaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| | |||||||||| ||||    
T  197087 tgtcttgttcatttgtgagattgagaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgtttaagttaatttcttgtaactcatttgtatcccttt 196988  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctct-cctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgg 171  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| ||  |||||| || | ||| |||||||||||||||||||||||    
T  196987 gtaagaactcattgatagtggattggagagatttatctctccccccagattaggtcaagttggaccgaactgg 196915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 928156 - 927971
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattggaaaatg-gatagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctt 98  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||    
T  928156 tgtcttgttctttggtgatattggaaaaaatgatagaaattagggtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccttttggatctctt 928057  T
Q  99 tgtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaacatttctt 184  Q
    ||||| | |||||| ||||||||||||||| | ||| |||| | | |  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  928056 tgtaaaaactcattaatagtggattagagagaccaacctcttccccaaggtaggtcaagttagaccgaactgggtaaacatttctt 927971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Original strand, 16455611 - 16455794
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg-aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||  || ||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  16455611 tgtcttgttcattggtgagattggtaaaatggtgagaaattagattttttcta-gtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctgt 16455709  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaacatttctt 184  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||  | | ||| |||||| ||||||| ||||| || ||||||||||    
T  16455710 gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccatagtcggtcaaattggaccaaactgtgtaaacatttctt 16455794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 40122377 - 40122197
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattggaaaa-tggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||||||| ||||    
T  40122377 tgtcttgttcatttgtgagattggaaaaatgggtcgaaattagatttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttataactcatttgtatcacttt 40122278  T
Q  100 gtaagatctcattg--atagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    |||||| ||| |||  ||||||||||||||| |||||||||||| | | | ||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  40122277 gtaagaactctttgatatagtggattagagagatcaatctctcccccatattaggtcaagttggaccgaactaggtcaaca 40122197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 11 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 30476615 - 30476447
Alignment:
Q  11 attggtgagattgg-aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctttgtaagatctc 109  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  30476615 attggtgagattgggaaaataggtagaaattagggttgttctttatgaacttgttgaagataatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactc 30476516  T
Q  110 attgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    ||||||| |||||| || | |||||||||| | | | |  |||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  30476515 attgatactggattggacagatcaatctctaccccatatgaggttaagttggaccgaactgggtcaaca 30476447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 17 - 184
Target Start/End: Original strand, 22079322 - 22079491
Alignment:
Q  17 gagattggaaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctttgt-aagatctcattgat 115  Q
    ||||||||||||  | ||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  22079322 gagattggaaaaatggtagaaattatgtttgttctttgtgagcttgttaaagctaatttcttgtaaccattttgtatctctttgtaaagaactcattgat 22079421  T
Q  116 agtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtca-agttggaccgaactgggtgaacatttctt 184  Q
    | |||||| |||| |||||| ||||||| | |||||||||  | |||||| |||| ||| ||||||||||    
T  22079422 attggattggagagatcaatttctcctccaaagtaggtcattgctggaccaaacttggtaaacatttctt 22079491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 33 - 178
Target Start/End: Original strand, 51765416 - 51765565
Alignment:
Q  33 tagaaattagggttgttc-tttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccattt-gtatctcttt-gtaagatctcattgatagtggattagagat 129  Q
    |||||||||||||||| | ||||||| |||||  |||||||||||||||| ||| ||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||     
T  51765416 tagaaattagggttgtacctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaaccccttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagag 51765515  T
Q  130 atcaatctctcctcgagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
     ||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  51765516 ttcaatctctcctccagagtaggacaagtttggaccgaactgggtgaaca 51765565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 12 - 178
Target Start/End: Original strand, 9987202 - 9987369
Alignment:
Q  12 ttggtgagattggaaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctc-tttgtaagatctca 110  Q
    ||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||||| |||||  || ||||||||||| |  || |||||||| | |||| |||| ||||    
T  9987202 ttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggttgttcattgtgaacttgtctaatctaatttcttgca-accttttgtatcccttttgcaagaactca 9987300  T
Q  111 ttgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    ||||||||||||| ||||   |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9987301 ttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 9987369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 12 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 20622406 - 20622237
Alignment:
Q  12 ttggtgagattggaaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatc---tctttgtaagatct 108  Q
    ||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||||| |||||  || |||||||||||||  || ||||||||   | ||||||||| ||    
T  20622406 ttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgta-accttttgtatcccttttttgtaagaact 20622308  T
Q  109 cattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    | ||||||||||||| ||||   |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20622307 ctttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 20622237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 37282870 - 37282701
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattggaaaatggatagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||| || ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| | ||| ||| |||| ||||||||    
T  37282870 tgtcttgttcattggagagattgaaaaatgg-tataaattagggtttgttccttgtgagcttgttgaagctaatttatggtaacccttttgcatctcttt 37282772  T
Q  100 gt-aagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaact 169  Q
    || |||| ||||||  ||||||||| |||| || ||||||||||   ||||||||||| |||||| |||||    
T  37282771 gtaaagaactcattagtagtggattggagagataaatctctcctttggagtaggtcaatttggactgaact 37282701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 12 - 178
Target Start/End: Original strand, 9036417 - 9036584
Alignment:
Q  12 ttggtgagattggaaaatggatagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt-gtaagatctc 109  Q
    ||||||||||||| ||| || |||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||| ||  |||||||| |||| |||||| |||    
T  9036417 ttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactc 9036514  T
Q  110 attgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
     |||||||||||||  |||   |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9036515 tttgatagtggattgaagagtacaatctctcctcgagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 9036584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 37879090 - 37879009
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg-aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgta 81  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37879090 tgtcttgttcattggtgagattgggaaaataggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgta 37879009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 12 - 178
Target Start/End: Original strand, 40282377 - 40282545
Alignment:
Q  12 ttggtgagattggaaaatggatagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt-gtaagatctc 109  Q
    ||||||||||||| ||| || |||||||||||||| |||| |||||| |||||  || ||||||||||||| ||  |||||||| |||| |||||| |||    
T  40282377 ttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggttagttcattgtgaacttgtctaatctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactc 40282475  T
Q  110 attgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
     ||||||||||||| ||||   |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  40282476 tttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 40282545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 12318700 - 12318452
Alignment:
Q  3 tcttgttcattggt-gagattggaaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctt-tg 100  Q
    |||||||||| ||| |||||| | |||||| ||||||||||| |||||| | | |||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| |||| |     
T  12318700 tcttgttcatgggtagagatttggaaatgggtagaaattaggtttgttcatggagagcttgttgaagctaatttcttgtaaccattttgtatgtcttctt 12318601  T
Q  101 taagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtca-agttggaccgaactgggtgaac-atttcttcttgttgttatctt 198  Q
    ||||| |||||||||| || |  ||||| |||  ||||||| | | ||||| |||   |||||||||||| ||| ||| |||| ||  ||||||| ||||    
T  12318600 taagaactcattgatactgaagcagagagatc--tctctcccccatagtagttcattattggaccgaactaggtaaacaattttttggtgttgttctctt 12318503  T
Q  199 ttctttactctctttatcttgtttatcctttggttgaattgtggttttgct 249  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||| || |||||||    
T  12318502 ttctttactccctttatcttgtttattctttggttcaattatgattttgct 12318452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 38 - 267
Target Start/End: Original strand, 6808479 - 6808710
Alignment:
Q  38 attagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctttgt-aagatctcattgatagtggattagagatatcaatc 136  Q
    |||||| |||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| | | ||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||| |||| |||||||    
T  6808479 attaggtttgttcttggagagcttgttgaagctaacttcttgtaactcttttgtatctctttgtaaagaactcatttatagtggattggagagatcaatc 6808578  T
Q  137 tc-tcctcgagagtaggtca-agttggaccgaactgggtgaacatttcttcttgttgttatcttttctttactctctttatcttgtttatcctttggttg 234  Q
    || ||||| ||||||||| |  ||||| ||||||| | | || |||||||   |||||| | | || | ||||||||||||||||||||| |||| |||     
T  6808579 tcttcctc-agagtaggttattgttggtccgaactagataaatatttcttggagttgttctttgttttctactctctttatcttgtttatgctttagttt 6808677  T
Q  235 aattgtggttttgctatgcacttggtttataga 267  Q
     || ||| ||||||| | |||||||||| ||||    
T  6808678 gatagtgattttgctttacacttggtttctaga 6808710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 23 - 184
Target Start/End: Original strand, 36683702 - 36683853
Alignment:
Q  23 ggaaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctttgtaagatctcattgatagtggat 122  Q
    ||||||| | ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||          ||| ||||||||||||||||    
T  36683702 ggaaaataggtagaaattaggtttattctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgta----------agaactcattgatagtggat 36683791  T
Q  123 tagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaacatttctt 184  Q
    |  ||| |||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||| || ||||| ||||    
T  36683792 tgtagaaatcaatctctcccccagagtaggtcaagttagaccgaactgagtaaacatctctt 36683853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 239 - 339
Target Start/End: Original strand, 194750 - 194845
Alignment:
Q  239 gtggttttgctatgcacttggtttatagactaggtctatattattgttattgcttgtggtttatttacatttgattattggttgccattaatacttgctc 338  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||     || || |||||||||||| ||||||||||    
T  194750 gtggttttgatatgcacttggtttatagactaggtctatattattgttgttgcttgtggtttactt-----tggttgttggttgccattgatacttgctc 194844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 22 - 184
Target Start/End: Original strand, 3460706 - 3460869
Alignment:
Q  22 tggaaaatggatagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctttgt-aagatctcattgatagtg 119  Q
    ||||||| || |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||||| |||| |  |||||||||     
T  3460706 tggaaaaagggtagaaattagagtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccttttgtatatctttgtaaagaacatattgatagtc 3460805  T
Q  120 gattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaacatttctt 184  Q
    |||| |||| |||||| ||| | | |||||||||||| || |||| || | ||| ||||||||||    
T  3460806 gattggagagatcaatatcttc-ctagagtaggtcaatttagaccaaattaggtaaacatttctt 3460869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 12 - 175
Target Start/End: Original strand, 21053958 - 21054123
Alignment:
Q  12 ttggtgagattggaaaatggatagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt-gtaagatctc 109  Q
    ||||||||||||| ||| |  |||||||||||||| |||| |||||| |||||  || ||||||||||| | ||  |||||||| |||| |||||| |||    
T  21053958 ttggtgagattgggaaaagtgtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgcaacct-tttgtatcccttttgtaagaactc 21054056  T
Q  110 attgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtga 175  Q
     ||||||||||||| ||||   ||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21054057 tttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 21054123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 12 - 178
Target Start/End: Original strand, 44203631 - 44203800
Alignment:
Q  12 ttggtgagattggaaaatggatagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt-gtaa-gatct 108  Q
    ||||||||||||| ||| || |||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||| ||  || ||||| |||| |||| || ||    
T  44203631 ttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaaagaact 44203728  T
Q  109 catt-gatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    |||| ||||||||||| ||||   |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  44203729 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 44203800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 19 - 246
Target Start/End: Original strand, 2926516 - 2926746
Alignment:
Q  19 gattggaaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctttgtaa-gatctcattgatag 117  Q
    ||||||||||  | ||||||||||| |||| |||   || |||||| ||| |||||| ||||| ||  |||| ||||||||| || ||  |||||| |||    
T  2926516 gattggaaaaatggtagaaattaggtttgtgcttgaagaacttgttaaagttaatttattgtaacctttttgcatctctttgaaacgaattcattggtag 2926615  T
Q  118 tggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaa-gttggaccgaactgggtgaacatttcttct-tgttgttatcttttctttactctctttat 215  Q
    |||||| |||| |||||||||| ||  |||||||||||  |||| |||||||| ||| |||| |||||   ||||||| | ||| || ||||||||||||    
T  2926616 tggattggagagatcaatctcttctgcagagtaggtcattgttgcaccgaactaggtaaacaattctttggtgttgttctttttactctactctctttat 2926715  T
Q  216 cttgtttatcctttggttgaattgtggtttt 246  Q
    ||||||||| ||||| || |||| |||||||    
T  2926716 cttgtttattctttgatttaattatggtttt 2926746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 8871227 - 8871129
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagatt-ggaaaatggatagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctt 98  Q
    |||||||||| || |||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||  |||||| |||||    
T  8871227 tgtcttgttcttttgtgagatttggaaaatgg-tagaaattagggtttgttctttgtgagttcgttgaagctaatttcttgtaaccattttgtaactctt 8871129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 48 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 2263106 - 2262968
Alignment:
Q  48 ttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctttgt-aagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgag 146  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||| ||||| |||| || ||||||||||||||  ||| |||||||| |||   ||    
T  2263106 ttcttggtgagcttgttgaagataatttcttgtaacccttttatatctttttgtaaagaacttattgatagtggattgaagagatcaatctttcccttag 2263007  T
Q  147 agtaggtca-agttggaccgaactgggtgaacatttctt 184  Q
     ||||||||  ||||| |||||||| || ||||||||||    
T  2263006 ggtaggtcattgttggtccgaactgagtaaacatttctt 2262968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 59 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 9109540 - 9109347
Alignment:
Q  59 cttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctttgt-aagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtca-a 156  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| | | ||||||||| ||| |||| |||||||||| |   |||||| ||||      
T  9109540 cttgttgaagttaatttcttgtaacccttttgtatctctttgtaaagaacacgttgatagtgtattggagagatcaatctcttccatagagtaagtcatc 9109441  T
Q  157 gttggaccgaactgggtgaacatttcttcttgttgttatcttttctttactctctttatc-ttgtttatcctttggttgaattgtggttttgct 249  Q
    |||| ||| |||| ||| ||||||| ||   | |||||| |  ||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||  ||||||||| ||||    
T  9109440 gttgaaccaaactaggtaaacattttttggggctgttatttagtctctactctctttatctttgtttattctttggtttgattgtggttatgct 9109347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 17 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 16914338 - 16914234
Alignment:
Q  17 gagattggaaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaa-tttcttgtagcccatttgtatctctttgt-aagatctcattga 114  Q
    |||||||| |||||| || |||||| | |||||||| | |||| |||||||||||| |||||| || ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  16914338 gagattgggaaatgggtaaaaattatgtttgttcttggagagcctgttgaagctaagtttcttctaacccttttgtatctctttgtaaagaactcattga 16914239  T
Q  115 tagtg 119  Q
    |||||    
T  16914238 tagtg 16914234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 44650342 - 44650172
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattg-gaaaatggatagaaatta-gggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctt 98  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||  | || |||||| || |||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||   | ||| ||||||||    
T  44650342 tgtcttgttcattggagagattgagaaaaatg-taaaaattatggtttgttctttgtgagtttgttaacgctaatttattgtaaatcttttatatctctt 44650244  T
Q  99 tgt-aagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaact 169  Q
    ||| || |  ||||| ||||||||||  ||| |||||||||| | | | |||||||||| ||||||||||||    
T  44650243 tgtaaataattcattaatagtggattgaagagatcaatctcttcccaaaagtaggtcaatttggaccgaact 44650172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 61 - 189
Target Start/End: Original strand, 5459956 - 5460085
Alignment:
Q  61 tgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctttgtaa-gatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtca-agt 158  Q
    ||||||||||||||||||||| |   ||| ||| ||||||||| || |||||||||||| |||| |||| ||||||||||| || ||||||| |||  ||    
T  5459956 tgttgaagctaatttcttgtaacat-tttatatttctttgtaaagaactcattgatagtagattggagagatcaatctctcatctagagtagatcattgt 5460054  T
Q  159 tggaccgaactgggtgaacatttcttcttgt 189  Q
    ||| | ||||| ||| |||||||||| ||||    
T  5460055 tgggctgaactaggtaaacatttcttgttgt 5460085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 111 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 8871130 - 8871060
Alignment:
Q  111 ttgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaacattt 181  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||| | | |||||| |||||||||||||| || || |||||||    
T  8871130 ttgatagtggattggagagatcaatctctcccccatagtaggccaagttggaccgaattgagtaaacattt 8871060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 17 - 128
Target Start/End: Original strand, 13938143 - 13938255
Alignment:
Q  17 gagattggaaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcc-catttgtatctctttgtaag-atctcattga 114  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| | || |||||  ||  |||||||||||| ||   |||||||||||||||||| | ||||||||    
T  13938143 gagattgggaaatgggtagaaatta-ggttgttcttggagaacttgtaaaatataatttcttgtaaccttttttgtatctctttgtaagaaactcattga 13938241  T
Q  115 tagtggattagaga 128  Q
    ||||||||| ||||    
T  13938242 tagtggattggaga 13938255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 36 - 128
Target Start/End: Original strand, 32471486 - 32471578
Alignment:
Q  36 aaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctttgtaag-atctcattgatagtggattagaga 128  Q
    |||||||| |||||||||| || || ||||||| |||||| ||| | | | |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||    
T  32471486 aaattaggtttgttctttgagaact-gttgaagttaatttattgcaactcttttgtatctctttgtaagaaactcattgatagtggattcgaga 32471578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 33 - 119
Target Start/End: Original strand, 25652108 - 25652195
Alignment:
Q  33 tagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctttgt-aagatctcattgatagtg 119  Q
    ||||||||| |  |||| |||| ||| |||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||||| |||| ||| |||||||||    
T  25652108 tagaaattaagtgtgttatttgagagtttgttgaagctaatttcttgtaactctcttgtatctctttgtaaagaactctttgatagtg 25652195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 17 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 1050606 - 1050520
Alignment:
Q  17 gagattggaaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctttgtaa 103  Q
    |||||||| |||||| |  ||||||||  ||||||| | |||||| ||||||||||||||||||| |   ||||| |||||||||||    
T  1050606 gagattgggaaatgggtgaaaattaggtgtgttcttcgagagcttattgaagctaatttcttgtaacatttttgtgtctctttgtaa 1050520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 33 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 4535627 - 4535541
Alignment:
Q  33 tagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctttgt-aagatctcattgatagt 118  Q
    ||||||||| | |||||||| | |||||| ||||||  ||||||||||| |   ||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  4535627 tagaaattaagtttgttcttggagagcttattgaagtcaatttcttgtaacatttttgtatctctttgtaaagaactcattgatagt 4535541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 33 - 95
Target Start/End: Original strand, 35109496 - 35109557
Alignment:
Q  33 tagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatct 95  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||||| || ||||||||||    
T  35109496 tagaaattaaggtttgttctttgtgagctttt--aagctaatttcttgtaacctatttgtatct 35109557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0466 (Bit Score: 250; Significance: 1e-139; HSPs: 1)
Name: scaffold0466
Description:

Target: scaffold0466; HSP #1
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 373
Target Start/End: Original strand, 7316 - 7684
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattggaaaa-tggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7316 tgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattaaggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt 7415  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaacatttcttcttgttgttatcttt 199  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || | |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  7416 gtaagaactcattgatagtggattggaaagatcaatctctcctctagagtaggttaagttggaccgaactgggtgaacatttcttggtgttgttatcttt 7515  T
Q  200 tctttactctctttatcttgtttatcctttggttgaattgtggttttgctatgcacttggtttatagactaggtctatat--tattgttattgcttgtgg 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  7516 tctttactctctttatcttgtttatcctttggttgaattgtggttttgctatgcacttggtttatagactaggtctatatattattgttgttgcttgtgg 7615  T
Q  298 tttatttacatttgattattggttgccattaatacttgctccacacatcatatagtttgtattagcgggaaatttg 373  Q
    |||| ||     || || |||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| | | ||||||||    
T  7616 tttactt-----tggttgttggttgccattgatacttgctccacacatc--atagtttgtattggtgtgaaatttg 7684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 249; Significance: 1e-138; HSPs: 63)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 300
Target Start/End: Original strand, 4283513 - 4283813
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg-aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4283513 tgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttttttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt 4283612  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaacatttcttcttgttgttatcttt 199  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  4283613 gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctcccctctagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaacatttcttggtgttgttatcttt 4283712  T
Q  200 tctttactctctttatcttgtttatcctttggttgaattgtggttttgctatgcacttggtttatagactaggtctatattattgttattgcttgtggtt 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4283713 tctttactctctttatcttgtttatcctttggttgaattgtggttttgctatgcacttggtttatagactaggtctatattgttgttattgcttgtggtt 4283812  T
Q  300 t 300  Q
    |    
T  4283813 t 4283813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 5 - 347
Target Start/End: Original strand, 18655393 - 18655738
Alignment:
Q  5 ttgttcattggtgagattg-gaaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctttgtaa 103  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18655393 ttgttcattggtgagattgagaaaatgggtagaaattaaggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaa 18655492  T
Q  104 gatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaacatttcttcttgttgttatcttttctt 203  Q
    || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  18655493 gaactcattgatagtggattagagagatcaatctctcctccaaagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaacattttttggtgttgttatcttttctt 18655592  T
Q  204 ta--ctctctttatcttgttta-tcctttggttgaattgtggttttgctatgcacttggtttatagactaggtctatattattgttattgcttgtggttt 300  Q
    ||  |||||||||||||||||| |||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  18655593 tactctctctttatcttgtttattccttgctttggattgtggttttgctatgcacttggtttatagactagatctatattgttgttattgcttgt-gttt 18655691  T
Q  301 atttacatttgattattggttgccattaatacttgctccacacatca 347  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||    
T  18655692 atttacatttggttattggttgtcattgatatttgctccacacatca 18655738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 42435170 - 42434797
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattggaaaa-tggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  42435170 tgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt 42435071  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaacatttcttcttgttgttatcttt 199  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  42435070 gtaagaactcattgatagtggattggagaaatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaacatttcttggtgttgttatcttt 42434971  T
Q  200 tctttactctctttatcttgttta-tcctttggttgaattgtggttttgctatgcacttggtttatagactaggtcta--tattattgttattgcttgtg 296  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||   ||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||    
T  42434970 tctttactttctttatcttgtttattccttgctttggattgtggttttgctatgcactt-gattatagactaggtctatctattgttgttgttgcttgtg 42434872  T
Q  297 gtttatttacatttgattattggttgccattaatacttgctccacacatcatatagtttgtattagcgggaaatttg 373  Q
    ||| |   |  |||| || |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| | | ||||||||    
T  42434871 gttaa--catttttggttgttggttgccattgatacttgctcctcacatcatatagtttgtattggtgtgaaatttg 42434797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Original strand, 11383975 - 11384332
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattggaaaa-tggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  11383975 tgtcttgttcatta-tgagattggaaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt 11384073  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaacatttcttcttgttgt-tatctt 198  Q
    |||||| | |||||||| |||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| ||| ||    
T  11384074 gtaagaacccattgatactggattggagacatcgatctctcctccagagtaggttaagttggaccgaactgggtgaacattttttggtgttgtctat-tt 11384172  T
Q  199 ttctttactctctttatcttgtttatcctttggttgaattgtggttttgctatgcacttggtttatagactaggtctatattattgttattgcttgtggt 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||| |||| ||| ||||||||||||||||     
T  11384173 ttctttactctctttatcttgtttatcctttggttagattgtggttttgctatgcacttgttttctagattagatctagattgttgttattgcttgtgg- 11384271  T
Q  299 ttatttacatttgattattggttgccattaatacttgctccacacatcatatagtttgtat 359  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| || | |||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  11384272 ttatttacatttggttattgcttgtcaatgatacttactccacacatcatataatttgtat 11384332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 338
Target Start/End: Original strand, 40328768 - 40329102
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg-aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccattt-gtatctctt 98  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||| | ||||| |||||||||    
T  40328768 tgtcttgttcatttgtgagattgggaaaatgggtagaaattaggtttgttctttgtgagcttgtttaaactaatttcttgtaactcattttgtatctctt 40328867  T
Q  99 tgtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaacatttcttcttgttgttatctt 198  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||    |||||| |||||| |||||||||||||  ||||||||||||    
T  40328868 tgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggt----ttggacggaactgagtgaacatttcttggtgttgttatctt 40328963  T
Q  199 ttctttactctctttatcttgtttatcctttggttgaattgtggttttgctatgcacttggtttatagactaggtctatattattgttattgcttgtggt 298  Q
    |||| ||||||| || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||| |||| | | ||||||||||||||||     
T  40328964 ttctctactctccttttcttgtttatcctttggttagattgtggttttgctatgcacttgttttctagattagatctagactgttgttattgcttgtgg- 40329062  T
Q  299 ttatttacatttgattattggttgccattaatacttgctc 338  Q
    ||||||||||||| || ||||||| |||| ||||||||||    
T  40329063 ttatttacatttggttgttggttgtcattgatacttgctc 40329102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 258
Target Start/End: Original strand, 40221734 - 40221992
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg-aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  40221734 tgtcttgttctttggtgagattggtaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaaactaatttcttgtaacccatttgtatctcttt 40221833  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaacatttcttcttgttgttatcttt 199  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| |||| |||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||| || | |  ||  ||||||||||||     
T  40221834 gtaagaactcgttgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaataatctttggtgttgttatcttg 40221933  T
Q  200 tctttactctctttatcttgtttatcctttggttgaattgtggttttgctatgcacttg 258  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40221934 tctttactctctttatcttgttcattctttggttggattgtggttttgctatgcacttg 40221992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 341
Target Start/End: Original strand, 3772181 - 3772521
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattg-gaaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  3772181 tgtcttgttcattggtgagattgagaaaattgatagaaattaggtttgttctttgtgagcttatttaagctaatttcttgtaactcatttgtatatcttt 3772280  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctc-ctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaacatttcttcttgttgttatctt 198  Q
    ||||||  | |||||||||||||| |||| |||||||| || ||| |||||||||||||||||||| |||||| | || |||||||  || |||||||||    
T  3772281 gtaagaatttattgatagtggattggagagatcaatctatctctc-agagtaggtcaagttggaccaaactggataaatatttcttggtggtgttatctt 3772379  T
Q  199 ttctttactctctttatcttgtttatcctttggttgaattgtggttttgctatgcacttggtttatagactaggtctatattattgttattgcttgtggt 298  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||  |||| ||| ||||| ||||||||||     
T  3772380 ttctctactctctttatcttgtttattctttggttagattgtggttttgctatgcacttgatttctagattaaatctagattgttgttgttgcttgtgg- 3772478  T
Q  299 ttatttacatttgattattggttgccattaatacttgctccac 341  Q
    |||||| | |||| | ||||||||||||| |||| ||||||||    
T  3772479 ttattttcttttggtgattggttgccattgatacctgctccac 3772521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 10930378 - 10930118
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg-aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  10930378 tgtcttgttcatcggtgagattgggaaaatggatagaaattagggttgctctttgtgagctcgttgaagctaatttcttgtaacccatttatatctcttt 10930279  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaac-atttcttcttgttgttatctt 198  Q
    |||||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||    
T  10930278 gtaagaacacattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaatttcttggtgttgttatctt 10930179  T
Q  199 ttc-tttactctctttatcttgtttatcctttggttgaattgtggttttgctatgcacttg 258  Q
    ||| ||| ||| ||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  10930178 ttcttttgctccctttatcttgtttattcttttgttggattgtggttttgctatgcacttg 10930118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 15212775 - 15212953
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg-aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15212775 tgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt 15212874  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    |||||| |||||||||| |||||| |||| |||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15212875 gtaagaactcattgataatggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaaca 15212953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 27811267 - 27811445
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg-aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27811267 tgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt 27811366  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    |||||| | |||||||||||||||  ||| |||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27811367 gtaagaacccattgatagtggattgaagagatcaatctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaaca 27811445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 33352139 - 33352317
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg-aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33352139 tgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtaaaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaacctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt 33352238  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33352239 gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaaca 33352317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 43036412 - 43036590
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg-aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||    
T  43036412 tgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaaactaatttcttgtaattcatttgtatctcttt 43036511  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  43036512 gtaagaactcattgatagtggatttgagagatcaatctctcctccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaaca 43036590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 34256685 - 34256507
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattggaaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctttg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  34256685 tgtcttgttcattggtgagattggaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagttaatttcttgtaacccttttgtatctctttg 34256586  T
Q  101 taagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34256585 taagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctctagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 34256507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 42498182 - 42498362
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg--aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||  | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||    
T  42498182 tgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaaaggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatttctt 42498281  T
Q  99 tgtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  42498282 tgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 42498362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 1292642 - 1292459
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattg-gaaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  1292642 tgtcttgttctttggtgagattgagaaaatgggtagaaattaagtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt 1292543  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaacatttctt 184  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| || ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  1292542 gtaagaactcattgatagtggatttgagaaataaatctctcc-ccagagtaggtcaagttggaccgaactgggcaaacatttctt 1292459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 4731647 - 4731825
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg-aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4731647 tgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgctctttgtgagcttgttgaacctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt 4731746  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| ||| |||||||| | ||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  4731747 gtaagaactcattgatagtggattggagagatcgatctctcccccagattcggtcaagttggaccgaattgggtcaaca 4731825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 34254509 - 34254331
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattggaaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  34254509 tgtcttgttcattggtgagattgggaaaagggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagttaatttcttgtaacccttttgtatctctttg 34254410  T
Q  101 taagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    ||||| || |||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34254409 taagaacttattgatagtggattggagagatcaatctctcctctagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 34254331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 172
Target Start/End: Original strand, 18141810 - 18141981
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattg-gaaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  18141810 tgtcttgttcattggtgagattgtgaaaatgggtagaaattagg-ttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatcacttt 18141908  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactggg 172  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| |||| |||||||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||    
T  18141909 gtaagaactctttgatagtggattggagagatcaatctctcccctagattaggtcaagttggaccaaactggg 18141981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 31218245 - 31218425
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg---aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctct 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  31218245 tgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatgg-tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctct 31218343  T
Q  98 ttgtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31218344 ttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 31218425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 30143329 - 30143499
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg-aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    |||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  30143329 tgtcttgttcattggccagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt 30143428  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactg 170  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | |||  ||||||||||| || ||||||    
T  30143429 gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagataaggtcaagttgaactgaactg 30143499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 40321069 - 40321247
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg-aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  40321069 tgtcttgttcataggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcattgtgagcttgttgaagttaatttcttgtaacccattagtatctcttt 40321168  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    |||| | ||| ||||||||||||| |||| |||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  40321169 gtaaaaactctttgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaaca 40321247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Original strand, 4162489 - 4162668
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattggaaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctttg 100  Q
    ||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||| ||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  4162489 tgtcttgttcattagtgaga--ggaaaatgggtagaagttaggtttgttctttgagaacttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttg 4162586  T
Q  101 taagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaacatttct 183  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  4162587 taagaactcattgatag-ggattggagatatcaatctctccccaagagtaggtcaagttggaccgaattgggtaaacatttct 4162668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 19491878 - 19491700
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg-aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19491878 tgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattaggtttgttctttgtgagcttgttgaaactaatttcttgtaacccatttgtatctcttt 19491779  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    |||||| ||| |||||||||||||| ||| |||||| ||||| | | |||||||||  |||||||||||| ||| ||||    
T  19491778 gtaagaactcgttgatagtggattaaagagatcaatatctcccccatagtaggtcatattggaccgaactaggtcaaca 19491700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 17982641 - 17982821
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg--aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  17982641 tgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaagggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagttaatttcttgtaacccttttgtatctctt 17982740  T
Q  99 tgtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    || |||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17982741 tggaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 17982821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 3 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 3303847 - 3303671
Alignment:
Q  3 tcttgttcattggtgagattgg-aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctttgt 101  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  3303847 tcttgtttattggtgagattgggaaaatgggtagaaattaagtttgttctttgtgagcttgtttaacctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgt 3303748  T
Q  102 aagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3303747 aagaactcattgatagtggattgaagagatcaatctctcccccacagtaggtcaagttggaccgaactgggtaaaca 3303671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 12702818 - 12702635
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg------aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatc 94  Q
    ||||||||||||||||||||||||      |||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||    
T  12702818 tgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaaaaaagggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccttttgtgtc 12702719  T
Q  95 tctttgtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||| |||| |||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12702718 tctttgtaagaactcattgatattggattggagagatcaatctctcccctagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaaca 12702635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 5689260 - 5689438
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattggaaaa-tggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||| ||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5689260 tgtcttgttcattaatgagattggaaaaatgggtagaaattaaggtggtgctttgtgagcttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt 5689359  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | ||| | ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5689360 gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagatttggtcaagttggaccgaactgggtcaaca 5689438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 6598961 - 6599139
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg-aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||| | |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||   |||    
T  6598961 tgtcttgttcatttgtgagattgggaaaatgggtagaaattaagtttgttctttgcgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatactttt 6599060  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| | | | ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6599061 gtaagaactcattgatagtggattagagagatcaatctctcccccatattaggtcaagttggaccgaactgggtcaaca 6599139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 6674414 - 6674592
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg-aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||| | |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||   |||    
T  6674414 tgtcttgttcatttgtgagattgggaaaatgggtagaaattaagtttgttctttgcgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatactttt 6674513  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| | | | ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6674514 gtaagaactcattgatagtggattagagagatcaatctctcccccatattaggtcaagttggaccgaactgggtcaaca 6674592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 1345550 - 1345372
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg-aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  1345550 tgtcttgttcatttgtgagattgggaaaatgtgtagaaattagggttgttctttgtgagtttattgaagctaatttcttgtaacccatatgtatctcttt 1345451  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    | |||| |||||||||||||||||  |||  ||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||    
T  1345450 gaaagaactcattgatagtggattgaagagttcaatctctcccccagagtaggtcaagttagaccgaactaggtcaaca 1345372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 19945540 - 19945359
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg--aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcc-catttgtatctct 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||| ||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| || | |||||||||||    
T  19945540 tgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaagggtagaaattatggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaaccacttttgtatctct 19945441  T
Q  98 ttgtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  19945440 ttggaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctcgagagtaggtcaagtttgaaccgaactgggtgaaca 19945359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 9765734 - 9765911
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg-aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9765734 tgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttggcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt 9765833  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||  |   ||||||| | ||| |||||||  |||||||||||||||| ||||    
T  9765834 gtaagaactcattgatagtggattggagagct-gctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaaca 9765911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 1746398 - 1746219
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattggaaaatgga--tagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||   |  ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  1746398 tgtcttgttcattggtgagattgaaaaaaaaaggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctt 1746299  T
Q  99 tgtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    || |||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1746298 tg-aagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccatagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 1746219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 30291595 - 30291767
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattg-gaaaatggatagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||    
T  30291595 tgtcttgttcattggtgagattgagaaaatgggtagaaattaggttttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatcactt 30291694  T
Q  99 tgtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctct-cctcgagagtaggtcaagttggaccgaactg 170  Q
    |||||||  || ||||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||| || | |||||||||||||||||    
T  30291695 tgtaagaattctttgatagtggattggagagatcaatctctccctccagattatgccaagttggaccgaactg 30291767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 44303842 - 44304023
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg---aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctct 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||| || ||||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||  || |||||||||||    
T  44303842 tgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaaagggtagaaattaaggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaatccttttgtatctct 44303941  T
Q  98 ttgtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    || ||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  44303942 ttttaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggatcgaactaggtgaaca 44304023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 3 - 141
Target Start/End: Original strand, 44353784 - 44353923
Alignment:
Q  3 tcttgttcattggtgagattgg-aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctttgt 101  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  44353784 tcttgttcatttgtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacacatttgtatctctttgt 44353883  T
Q  102 aagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcc 141  Q
    |||| |||||||||||||||||  | | ||||||||||||    
T  44353884 aagaactcattgatagtggattgaaaagatcaatctctcc 44353923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 18106257 - 18106087
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattggaaaa-tggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||    
T  18106257 tgtcttgttcatcggtgagattggaaaaatggatagaaactatagttgttctttgcgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatct-ttt 18106159  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggt 173  Q
    |||||| |||||||||||| | || |||| |||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18106158 gtaagaactcattgatagt-gtttggagagatcaatctctcc-ccagaataggtcaagttggaccgaactgggt 18106087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 8965870 - 8965689
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattggaaaatggatagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  | |||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||||| || ||| ||| |||||||||    
T  8965870 tgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaggtagaaattagggtttgttctttatgagtttgttgaagttaatttcttataacccttttatatctcttt 8965771  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaacattt 181  Q
    |||||| ||||||||||||| ||  |||| || ||||||||| | | | ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8965770 gtaagaactcattgatagtgcatcggagagataaatctctcccccatattaggtcaagttggaccgaactgggtaaacattt 8965689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 16 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 41366778 - 41366622
Alignment:
Q  16 tgagattg-gaaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctttgtaagatctcattga 114  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| || || ||||||||| |||||||||| |||||| |    
T  41366778 tgagattgagaaaatgggtagaaattatgtttgttctttgtaagcttgtttaagctaatttcttttaacctatttgtatccctttgtaagaactcattta 41366679  T
Q  115 tagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactggg 172  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41366678 tagtggattggagagatcaatctctcc-ctagattaggtcaagttggaccgaactggg 41366622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 12 - 176
Target Start/End: Original strand, 2627735 - 2627902
Alignment:
Q  12 ttggtgagattggaaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagc-ccatttgtatctctt-tgtaagatctc 109  Q
    ||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||||| |||||  || ||||||||||| | | |  |||||||||||| ||||||| |||    
T  2627735 ttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgcaactctttttgtatctcttgtgtaagaactc 2627834  T
Q  110 attgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaa 176  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2627835 attgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 2627902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 4743382 - 4743215
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattggaaaa-tggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||||| | |||||||||||||  ||||||| ||||||||||           
T  4743382 tgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaa-ttaggtttgttctttgtgtgtttgttgaagctaaaatcttgtaacccatttgta------- 4743291  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
       ||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4743290 ---agaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccaaagtaggtcaagttggaccgaactgggtcaaca 4743215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 49 - 184
Target Start/End: Original strand, 10015119 - 10015252
Alignment:
Q  49 tctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctttgtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagag 148  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||| || ||||||| ||| | ||    
T  10015119 tctttgtgtgcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-taggaactcattgatagtggattggagagataaatctct-ctccatag 10015216  T
Q  149 taggtcaagttggaccgaactgggtgaacatttctt 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  10015217 taggtcaagttggaccgaactgggtaatcatttctt 10015252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 2 - 141
Target Start/End: Original strand, 1822282 - 1822423
Alignment:
Q  2 gtcttgttcattggtgagattggaaaatggatagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctttg 100  Q
    |||||||||||| | ||||||| |||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||    
T  1822282 gtcttgttcatttgagagattgcaaaaaggatagaaattatggtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccttttatatctatttg 1822381  T
Q  101 t-aagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcc 141  Q
    | || | |||| | |||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  1822382 taaataactcactaatagtgaattggagagatcaatctctcc 1822423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 2 - 141
Target Start/End: Original strand, 1856727 - 1856868
Alignment:
Q  2 gtcttgttcattggtgagattggaaaatggatagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctttg 100  Q
    |||||||||||| | ||||||| |||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||    
T  1856727 gtcttgttcatttgagagattgcaaaaaggatagaaattatggtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccttttatatctatttg 1856826  T
Q  101 t-aagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcc 141  Q
    | || | |||| | |||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  1856827 taaataactcactaatagtgaattggagagatcaatctctcc 1856868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 156 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 2999825 - 2999723
Alignment:
Q  156 agttggaccgaactgggtgaacatttcttcttgttgttatcttttctttactctctttatcttgtttatcctttggttgaattgtggttttgctatgcac 255  Q
    |||| |||||||||| || ||||||||||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| |||||||||||||    
T  2999825 agtttgaccgaactgagtaaacatttcttgatgttgatatcttttctctactctctttatcttgtttattctttggttagattgtgattttgctatgcac 2999726  T
Q  256 ttg 258  Q
    |||    
T  2999725 ttg 2999723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 167
Target Start/End: Original strand, 8153753 - 8153914
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattg-gaaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagctt-gttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctt 98  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||      | ||||||| ||||||||||| ||| |||| | | ||||||| ||||    
T  8153753 tgtcatgttcattggtgagattgagaaaatgg-tagaaattagggtt------tctgagctttgttgaagctaaattcgtgtaactcttttgtatatctt 8153845  T
Q  99 tgtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctc-tcctcgagagtaggtcaagttggaccgaa 167  Q
    ||||||| |||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8153846 tgtaagaactcattgatagttgattggagagatcaatctcttcctc-agagtaggtcaagttggaccgaa 8153914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 81
Target Start/End: Original strand, 10929788 - 10929869
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagat-tggaaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgta 81  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10929788 tgtcttgttctttggtgagatatggaaaatgggtagaaattatgtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgta 10929869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 178
Target Start/End: Original strand, 25689955 - 25690122
Alignment:
Q  12 ttggtgagattggaaaatggatagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt-gtaagatctc 109  Q
    ||||||||||||| |||  | |||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||| ||  |||||||| |||| |||||| |||    
T  25689955 ttggtgagattgggaaaaaggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactc 25690052  T
Q  110 attgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
     ||||||||||||| ||||   ||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25690053 tttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 25690122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 12 - 178
Target Start/End: Original strand, 3439504 - 3439671
Alignment:
Q  12 ttggtgagattggaaaatggatagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt-gtaagatctc 109  Q
    ||||||||||||| ||| || |||||||||||||| |||| || ||| ||||   |||||||||||||||| ||  |||||||| |||| |||||| |||    
T  3439504 ttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattatgaacttggc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactc 3439601  T
Q  110 attgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
     ||||||||||||| ||||   |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  3439602 tttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactggatgaaca 3439671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 89 - 178
Target Start/End: Original strand, 4733784 - 4733873
Alignment:
Q  89 tgtatctctttgtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| ||| |||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4733784 tgtatctctttgtaagaattcattgatagtggattggagagatcgatctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaaca 4733873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 71 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 3073981 - 3073870
Alignment:
Q  71 aatttcttgtagcccatttgtatctctttgtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactg 170  Q
    ||||||||||| |   ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || |||| |||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||||||    
T  3073981 aatttcttgtaacatttttgtatctctttgtaagaactcattgataatggcttggagagatcaatctctcc-ccatagtaggtcaagttgggccgaactg 3073883  T
Q  171 ggtgaacatttct 183  Q
    ||| |||||||||    
T  3073882 ggtaaacatttct 3073870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 45 - 171
Target Start/End: Original strand, 7597648 - 7597776
Alignment:
Q  45 ttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctttgt-aagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctc 143  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||  || ||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||| |||| |||||||||||| |    
T  7597648 ttgttcttggagagcttgttgaagctaatttcttataatccttttgtatctctttgtaaagaatgcattgatagtggattggagagatcaatctctcccc 7597747  T
Q  144 gagagtaggtca-agttggaccgaactgg 171  Q
     | |||||||||  ||| |||||||||||    
T  7597748 catagtaggtcattgttagaccgaactgg 7597776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 45 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 11712135 - 11712038
Alignment:
Q  45 ttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctttgt-aagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcc 141  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | ||| ||| ||||||||||| || | |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||    
T  11712135 ttgttccttgagagcttgttgaagctaatttcttgaaacccttttatatctctttgtaaataactcattgatagtggattgaagagatcaatctctcc 11712038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 23 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 41365003 - 41364926
Alignment:
Q  23 ggaaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctttg 100  Q
    ||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| | |||||||||| |||||    
T  41365003 ggaaaattggtagaaattaggtttgttctttgtgagtttgtttaagctaatttcttgtaacacatttgtatccctttg 41364926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 31 - 120
Target Start/End: Original strand, 10240173 - 10240264
Alignment:
Q  31 gatagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctttgt-aagatctcattgatagtgg 120  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||   ||| |||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  10240173 gatagaaatttgggtttgttctttgtgagcttgttgaatctaatttcttgtaaccatgttggatctctttgtaaagaactcattgatagtgg 10240264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 297
Target Start/End: Original strand, 10240270 - 10240411
Alignment:
Q  157 gttggaccgaactgggtgaacatttcttcttgttgttatcttttctttactctctttatcttgttta-tcctttggttgaattgtggttttgctatgcac 255  Q
    |||||| | |||| ||| ||||||||||  | ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||  |||||||||||||| | ||     
T  10240270 gttggatcaaactaggtaaacatttcttggttttgttctcttttcttcactctctttatcttgtttatttttttggttcgattgtggttttgctttacat 10240369  T
Q  256 ttggtttatagactaggtctatattattgttattgcttgtgg 297  Q
    || |||| |||| ||| |||| ||| ||||||||| ||||||    
T  10240370 ttcgtttctagattagatctagattgttgttattgtttgtgg 10240411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 33 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 3231943 - 3231872
Alignment:
Q  33 tagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctttgtaa 103  Q
    ||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| || || ||  |||||||||||||||||    
T  3231943 tagaaattaggctttgttcttcgtgagcttgttgaagctaattttttttaaccattttgtatctctttgtaa 3231872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 61 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 32902292 - 32902197
Alignment:
Q  61 tgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctttgtaa-gatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtca 155  Q
    ||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||| ||| ||  |||||||||||| ||| |||| |||||||||||| |  ||||||||||    
T  32902292 tgttgaagctaatttcttgtaacttttttgtatctctttctaaagaattcattgatagtgaatttgagagatcaatctctccccctgagtaggtca 32902197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 111 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 42575392 - 42575327
Alignment:
Q  111 ttgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtga 175  Q
    ||||||||||||| ||||   ||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  42575392 ttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 42575327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 111 - 174
Target Start/End: Original strand, 15290624 - 15290688
Alignment:
Q  111 ttgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtg 174  Q
    ||||||||||||| ||||   ||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15290624 ttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtg 15290688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 111 - 174
Target Start/End: Original strand, 15470993 - 15471057
Alignment:
Q  111 ttgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtg 174  Q
    ||||||||||||| ||||   ||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15470993 ttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtg 15471057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 187 - 246
Target Start/End: Original strand, 11137203 - 11137262
Alignment:
Q  187 tgttgttatcttttctttactctctttatcttgtttatcctttggttgaattgtggtttt 246  Q
    ||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||  |||||||||||    
T  11137203 tgttgttttgttttctctactctctttatcttgtttattcattggttcgattgtggtttt 11137262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 204 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 9633588 - 9633546
Alignment:
Q  204 tactctctttatcttgtttatcctttggttgaattgtggtttt 246  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||    
T  9633588 tactctctttatcttgtttattctttggttcaattgtgatttt 9633546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 247; Significance: 1e-137; HSPs: 87)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 6095778 - 6095408
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg-aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6095778 tgtcttattcattggtgagattgggaaaatgagtagaaattagggttgttctttgtaaacttcttgaagttaatttcttgtaacccatttgtatctcttt 6095679  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaacatttcttcttgttgttatcttt 199  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||    
T  6095678 gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggaccgaactgtgtgaacatttcttggtgttgttatcttt 6095579  T
Q  200 tctttactctctttatcttgtttatcctttggttgaattgtggttttgctatgcacttggtttatagactaggtctatattattgttattgcttgtggtt 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  6095578 tctttactctctttatcttgtttatgccttggttggattgtggttttgctatacacttcgtttatagactaggtctatattgttgttattgcttgtgg-t 6095480  T
Q  300 tatttacatttgattattggttgccattaatacttgctccacacatcatatagtttgtattagcgggaaatttg 373  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| | | ||||||||    
T  6095479 tatttacatttgattattggttgccattgatacttgctccacacatc--atagtttgtattggtgtgaaatttg 6095408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 373
Target Start/End: Original strand, 54593693 - 54594068
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg-aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  54593693 tgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgtgcagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctcttt 54593792  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaacatttcttcttgttgttatcttt 199  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  54593793 gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtatgtcaagttggaccaaactgggtgaacatttcttggtgttgttatcttt 54593892  T
Q  200 tcttta--ctctctttatcttgttta-tcctttggttgaattgtggttttgctatgcacttggtttatagactaggtctatattattgttattgcttgtg 296  Q
    ||||||  |||||||||||||||||| |||||   ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  54593893 tctttagtctctctttatcttgtttattccttgctttggattgtggttttgctatgcacatggtttatagactatgtctatattcttgttattgcttgtg 54593992  T
Q  297 gtttatttacatttgattattggttgccattaatacttgctccacacatcatatagtttgtattagcgggaaatttg 373  Q
    | ||||||| ||||| |||||||||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||| | | ||||||||    
T  54593993 g-ttatttatatttggttattggttgtcattgatacttgctctacatatcatatagtttgtattggtgtgaaatttg 54594068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 341
Target Start/End: Original strand, 46860463 - 46860804
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattg-gaaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  46860463 tgtcttgttcattggtgagattgagaaaatgggtagaaattaggtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt 46860562  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaa-gttggaccgaactgggtgaacatttcttcttgttgttatctt 198  Q
    |||| | ||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||| ||| ||||||||| ||  ||||||||||||    
T  46860563 gtaataactcattgatagtggattggagagatcaatctttcctccagagtaggtcattgttggaccgaattggatgaacattttttggtgttgttatctt 46860662  T
Q  199 ttctttactctctttatcttgtttatcctttggttgaattgtggttttgctatgcacttggtttatagactaggtctatattattgttattgcttgtggt 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| ||||||     
T  46860663 ttctttactctctttatcttgtttatcctttggttagattgtggttttgctatgcacttggtttatagattaggtctatattgttgttgttgtttgtgg- 46860761  T
Q  299 ttatttacatttgattattggttgccattaatacttgctccac 341  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  46860762 ttatttacatttggttattggttgccattgatatttgctccac 46860804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 346
Target Start/End: Original strand, 30236114 - 30236461
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg-aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  30236114 tgtcttgttcattgatgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacctatttgtatctcttt 30236213  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaac-atttcttcttgttgttatctt 198  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||  ||||||||||||    
T  30236214 gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactaggtcaacaatttcttggtgttgttatctt 30236313  T
Q  199 ttctttactctctttatcttgtttatcctttggttgaattgtggttttgctatgcacttggtttatagactaggtctatattattgttattgcttgtggt 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  30236314 ttctttactctctttatcttgtttataccttggttggattgtgtttttgttatgcacttggtttatagactaggtctatattgttgttgttgcttgtggt 30236413  T
Q  299 ttatttacatttgattattggttgccattaatacttgctccacacatc 346  Q
    | ||  |  |||| || ||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  30236414 taatcaatttttggttgttggttgacattgatacttgctccacacatc 30236461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 49199649 - 49199284
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg-aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccattt-gtatctctt 98  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  49199649 tgtcttgttcgttggtgagattgggaaaatgggtagaaattaaggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccattttgtatctctt 49199550  T
Q  99 tgtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaacatt-tcttcttgttgttatc 196  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| ||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| | ||||  ||||||| ||    
T  49199549 tgtaagaactcattgatagtggattggagagattaatctctcctccagactaggtcatggttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgttgttgtc 49199450  T
Q  197 t---tttctttactctctttatcttgtttatcctttggttgaattgtggttttgctatgcacttggtttatagactaggtctatattattgttattgctt 293  Q
    |   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||| |||| ||| ||||||||||||    
T  49199449 tatttttctctactctctttatcttgtttatcctttggttagattgtggttttgctatgcacttgttttctagattagatctagattgttgttattgctt 49199350  T
Q  294 gtggtttatttacatttgattattggttgccattaatacttgctccacacatcatatagtttgtatt 360  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  49199349 gtgg-ttatttacatttggttattggttgccattgatacttgctccacacatcatataatttgtatt 49199284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 43401981 - 43401627
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg-aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgt-atctctt 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| | |||||||    
T  43401981 tgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacgcattttttatctctt 43401882  T
Q  99 tgtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaacatt-tcttcttgttgttatc 196  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| | ||||  ||||||| ||    
T  43401881 tgtaagaactcattgatagtggattggagaaattaatctctcctccagagtaggtcatggttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgttgttgtc 43401782  T
Q  197 t---tttctttactctctttatcttgtttatcctttggttgaattgtggttttgctatgcacttggtttatagactaggtctatattattgttattgctt 293  Q
    |   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||| |||| ||| |||| ||| ||||||||||||    
T  43401781 tatttttctctactctctttatcttgtttatcctttggttagattgtgattttgctatgcacttgttttctagattagatctagattgttgttattgctt 43401682  T
Q  294 gtggtttatttacatttgattattggttgccattaatacttgctccacacatcata 349  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  43401681 gtgg-ttatttacatttggttattggttgccattgatacttgctccacagatcata 43401627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 28 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 55302132 - 55301776
Alignment:
Q  28 atggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtag---------cccatttgtatctctttgtaagatctcattgatagt 118  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||          || ||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  55302132 atgggtagaaattagggttgttctttgtaagtttgttgaagctaatttcttgtatttcttgtaacctatttgtatctctttgtaagaattcattgatagt 55302033  T
Q  119 ggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaa-gttggaccgaactgggtgaacatttcttcttgttgttatcttttctttactctctttatct 217  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| | |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55302032 ggattggagagatcaatctctcctccatagtaggtcattgttggaccgaacttggtgaacatttcttagtgttgttatcttttctttactctctttatct 55301933  T
Q  218 tgtttatcctttggttgaattgtggttttgctatgcacttgg-tttatagactaggtctatattattgttattgcttgtggtttatttacatttgattat 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||| ||| |||| ||| || ||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  55301932 tgtttatcctttggttgaattgtggctttgctatgcacttggttttctagattagatctagattgtttttattgcttgtggtttattcacatttggttat 55301833  T
Q  317 tggttgccattaatacttgctccacacatcatatagtttgtattagcgggaaatttg 373  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| | | ||||||||    
T  55301832 tggttgtcattgatacttgctccacacctcatataatttgtattggtgtgaaatttg 55301776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 41819702 - 41819363
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg-aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccattt-gtatctctt 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  41819702 tgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttttttgtgagcttgtctaagctaatttcttgtaacccattttgtatctctt 41819603  T
Q  99 tgtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaa-gttggaccgaactgggtgaacatttcttcttgttgttatct 197  Q
    ||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| ||  ||||||||| |    
T  41819602 tgtaagaactcatt-atagtggattggagacatcaatctctcctccagagtaggtcattgttggaccaaactgggtgaacatttattggtgttgttattt 41819504  T
Q  198 ttt-ctttactctctttatcttgtttatcctttggttgaattgtggttttgctatgcacttggtttatagactaggtctatattattgttattgcttgtg 296  Q
    ||| || |||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  41819503 ttttctctactttctttatcttgtttatcctttggttagattgtggttttgctatgcacttggtttatggactaggtctatattgttgttgttgcttgtg 41819404  T
Q  297 gtttatttacatttgattattggttgccattaatacttgctccac 341  Q
        |||||| |||| || |||||||||||| |||||||||||||    
T  41819403 ----atttacttttggttgttggttgccattgatacttgctccac 41819363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 43403924 - 43403570
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg-aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccat-ttgtatctctt 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||| || ||||||||    
T  43403924 tgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattaggcttgttctttgtgagcttgttgaagctcatttcttgtaactcatgttttatctctt 43403825  T
Q  99 tgtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtca-agttggaccgaactgggtgaac-atttct---tcttgttgtt 193  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| || |||   | ||||||||    
T  43403824 tgtaagaactcattgatagtggattggagagattaatctctcctccagagtaggtcatggttggaccgaactgggtgaacaatctcttgatgttgttgtt 43403725  T
Q  194 atcttttctttactctctttatcttgtttatcctttggttgaattgtggttttgctatgcacttggtttatagactaggtctatattattgttattgctt 293  Q
       ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||| |||| ||| || |||||||||    
T  43403724 tatttttctccactctctttatcttgtttatcctttggttagattgtggttttgctatgcacttgttttctagattagatctagattgttattattgctt 43403625  T
Q  294 gtggtttatttacatttgattattggttgccattaatacttgctccacacatcata 349  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  43403624 gtgg-ttatttacatttggttattggttgccattgatacttgctccacacatcata 43403570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Original strand, 47304240 - 47304591
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattg-gaaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||| ||||||||||     
T  47304240 tgtcttgttcatttgtgagattgagaaaatgggtagaaattatggttgttctttgtgagcttgttgaagttaatatcttgtaacccatctgtatctcttc 47304339  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaac-atttcttcttgttgttatctt 198  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| ||  ||||||||||||    
T  47304340 gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccaagattaggtcaagtttgaccgaactgggtcaacaatttattggtgttgttatctt 47304439  T
Q  199 ttc------tttactctctttatcttgtttatcctttggttgaattgtggttttgctatgcacttggtttatagactaggtctatattattgttattgct 292  Q
    |||      ||| || |||||||||||||||| | || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  47304440 ttcttttcttttgctttctttatcttgtttattccttagttggattgtggttttgctatgcacttggtttatagactaggtctatattattgttgttgct 47304539  T
Q  293 tgtggtttatttacatttgattattggttgccattaatacttgctccacacatcata 349  Q
    ||||    |||||| |||| || ||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  47304540 tgtg----atttac-tttggttgttggttgtcattgatacttgctccacacatcata 47304591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 33 - 343
Target Start/End: Original strand, 46173379 - 46173688
Alignment:
Q  33 tagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctttgtaagatctcattgatagtggattagagatatc 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| |||    
T  46173379 tagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaattcattgatagtggattggagagatc 46173478  T
Q  133 aatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaaca-tttcttcttgttgttatcttttcttta-ctctctttatcttgtttatcctttg 230  Q
    ||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||| | | |||| ||||||  ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||   ||     
T  46173479 aatctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactagatcaacaatttcttggtgttgttatcttttcttttgctttctttatcttgtttatttctta 46173578  T
Q  231 gttgaattgtggttttgctatgcacttggtttatagactaggtctatat--tattgttattgcttgtggtttatttacatttgattattggttgccatta 328  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  ||||| | |||||||||||||| ||     || || ||||||||||||     
T  46173579 gttggattgtggttttgctatgcacttggtttatagaataggtttatatattattgctgttgcttgtggtttactt-----tggttgttggttgccattg 46173673  T
Q  329 atacttgctccacac 343  Q
    |||||||||||||||    
T  46173674 atacttgctccacac 46173688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 5 - 258
Target Start/End: Original strand, 4569945 - 4570202
Alignment:
Q  5 ttgttcattggtgagattgg-aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctttgtaa 103  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  4569945 ttgttctttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcattgtgagcttattgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaa 4570044  T
Q  104 gatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaacatttcttcttgttgttatcttttc- 201  Q
    || ||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||     
T  4570045 gaactcattgatagtggattggagagatcaatctctactccagagtaggtgaagtttggaccgaactgggtcaacatttcttggtgttgttatattttct 4570144  T
Q  202 tttactctctttatcttgttta-tcctttggttgaattgtggttttgctatgcacttg 258  Q
    ||| ||| |||||||||||||| |||||   ||| |||||||||||||||||||||||    
T  4570145 tttgctccctttatcttgtttattccttgctttggattgtggttttgctatgcacttg 4570202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 4 - 341
Target Start/End: Original strand, 36018844 - 36019178
Alignment:
Q  4 cttgttcattggtgagattgg-aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccattt-gtatctctttgt 101  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||||||||||    
T  36018844 cttgttcattggtgaaattgggaaaatgggttgaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagttaatttcttgtaactcattttgtatctctttgt 36018943  T
Q  102 aagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaacatttcttcttgttgttatcttttc 201  Q
    |||| |||||| |||||||||| ||||  ||||||||||| | ||  || ||   ||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||||||||     
T  36018944 aagaactcatt-atagtggattggagaggtcaatctctcccccag--tatgttt-gttggaccgaactggatgaacattttttggtgttgttatcttttt 36019039  T
Q  202 tttactctctttatcttgtttatcctttggttgaattgtggttttgctatgcacttggtttatagactaggtctatattattgttattgcttgtggttta 301  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||  |||||| ||| |||| ||| |||| ||| || || |||||||||| | |    
T  36019040 tctactctctttatcttgtttatcctttggttagattgtggttttgttaaacacttgttttctagattagatctagattgttattgttgcttgtgg-taa 36019138  T
Q  302 tttacatttgattattggttgccattaatacttgctccac 341  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  36019139 tttacatttgattattggttgtgattgatacttgctccac 36019178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 8 - 178
Target Start/End: Original strand, 34491208 - 34491379
Alignment:
Q  8 ttcattggtgagattgg-aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctttgtaagat 106  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||     
T  34491208 ttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaa 34491307  T
Q  107 ctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34491308 ctcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaaca 34491379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 44331534 - 44331712
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagatt-ggaaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  44331534 tgtcttgttcattggtgagattaggaaaatgggtagaaattagggttgttcattgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaagccatttgtatctcttt 44331633  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    |||||| || |||||||||||||| |||| |||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  44331634 gtaagaacttattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaaca 44331712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Original strand, 40735372 - 40735545
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattg-gaaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||    
T  40735372 tgtcttgttcattggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaaccagtttgtatctcttt 40735471  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggt 173  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40735472 gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggt 40735545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 7762254 - 7762433
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattg-gaaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||    
T  7762254 tgtcttattcattggtgagattgagaaaaagggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaactcttttgtatctcttt 7762353  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7762354 gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 7762433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 45095153 - 45095331
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagatt-ggaaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  45095153 tgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttt 45095251  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  45095252 gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctctagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 45095331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 40734487 - 40734665
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg-aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||| ||||    
T  40734487 tgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaacctaatttcttgtaacacatttgtatcccttt 40734586  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | | | ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  40734587 gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccaaattaggtcaagttggaccgaactgggtcaaca 40734665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 19684068 - 19683889
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg-aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  19684068 tgtcttgttcatttgtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttt 19683969  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19683968 gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccatagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 19683889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 9581272 - 9581450
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattggaaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctttg 100  Q
    ||||||||||||| ||| |||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||| |||||    
T  9581272 tgtcttgttcatttgtgggattcggaaatgggtagaaattaggtttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttttaacccatttgtatccctttg 9581371  T
Q  101 taagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9581372 taagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 9581450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 22835181 - 22835010
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg-aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  22835181 tgtcttgttcatttgtgagattgggaaaatgggtagaaattaggtttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatcccttt 22835082  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgg 171  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||||    
T  22835081 gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccgccatattaggtcaagttggaccgaactgg 22835010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 29196566 - 29196387
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg-aaaatggatagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctt 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  29196566 tgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtttgttctttgtgagcttgtcaaagctaatttcttggaacccatttgtatctctt 29196467  T
Q  99 tgtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | | | ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29196466 tgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccaaattaggtcaagttggaccgaactgggtcaaca 29196387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 37408447 - 37408626
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg-aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  37408447 tgtcttgttcattggtgagattgggaaaaagggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttt 37408546  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    |||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  37408547 gtaagaactcattgatagtggattgaagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggatcgaactgggtgaaca 37408626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 5236635 - 5236458
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg-aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5236635 tgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt 5236536  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    |||||| |||||||||| |||||| |||| |||||||| ||| | ||| |||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  5236535 gtaagaactcattgataatggattcgagagatcaatctttcc-ccagattaggtcaatttggaccaaactgggtcaaca 5236458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 16499019 - 16499196
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg-aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||    
T  16499019 tgtcttgttcatttgtgagattgggaaaacggatagaaattagggttgtt-tttgtaagcttgttgaagctaatttcttgttacccatttatatctcttt 16499117  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  16499118 gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagagtaggttaagttggaccgaactgggtcaaca 16499196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 44700657 - 44700480
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg-aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  44700657 tgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaacctatttgtatctcttt 44700558  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| |||| |||||||||||| | | | ||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  44700557 gtaagaactctttgatagtggattggagagatcaatctctcc-ccacattaggtcaagttggaccgaactaggtcaaca 44700480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 760836 - 761014
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg-aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  760836 tgtcttgttcatttgtgagattgggaaaatgggtagaaattaggtctgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatcccttt 760935  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | ||| ||||||||||||||| ||| ||||| ||||    
T  760936 gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaagttggactgaaatgggttaaca 761014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 51398803 - 51398981
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattggaaaa-tggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  51398803 tgtcttgttcattgatgagattggaaaaatgggtagaaattagggttgttcttagtgaacttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt 51398902  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| ||  |||||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  51398903 gtaagaactcattgatagtggattggagagatttatctctcccccagattaggtcaagttggaccgaacttggtcaaca 51398981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 53921682 - 53921498
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattggaaaa-tggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||  |||    
T  53921682 tgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattaggtttgttgtttgtgagcttgttaaagctaatttcttgtaactcatttgtatcatttt 53921583  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaacatttctt 184  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |  |||||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||||    
T  53921582 gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccggagtagatcaagtttgaccgaactggataaacatttctt 53921498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 4 - 178
Target Start/End: Original strand, 29813055 - 29813230
Alignment:
Q  4 cttgttcattggtgagattggaaaa-tggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctttgta 102  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  29813055 cttgttaattggtgagattggaaaaataggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgcatctctttgta 29813154  T
Q  103 agatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    ||| |||||| |||||||||| |||| |||||||||||| | ||| | ||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  29813155 agaactcatttatagtggattggagagatcaatctctcccccagatttggtcatgttggaccgaactgggtcaaca 29813230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 29682348 - 29682526
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg-aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    ||||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| ||||    
T  29682348 tgtcttgtttatttgtgagattgggaaaatgggtagaaattatgtttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtcacccatttgtatcccttt 29682447  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  29682448 gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccctagattagatcaagttggaccgaactgggtcaaca 29682526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 29810857 - 29811035
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagatt-ggaaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||   |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29810857 tgtcttattcattggtgagattaggaaaatatgtagaaattagagttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt 29810956  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | ||| |||||||||||  |||||| ||||| ||||    
T  29810957 gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaagttaaaccgaattgggtcaaca 29811035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 31314434 - 31314604
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattg-gaaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  31314434 tgtcttgttcataggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggttgttcattgtgatcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatcttttt 31314533  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactg 170  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| |||| |||||| ||||| | | | ||||||||||||||||||||||    
T  31314534 gtaagaactctttgatagtggattggagagatcaatatctcccccatattaggtcaagttggaccgaactg 31314604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 5258324 - 5258144
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg--aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  5258324 tgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaagggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctt 5258225  T
Q  99 tgtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    || |||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  5258224 tggaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctcttctccagagtaggtcaagtttggaccgaacttggtgaaca 5258144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 7764456 - 7764632
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattggaaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctttg 100  Q
    ||||||||||||||||||||  || ||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| | | ||||||||||||||    
T  7764456 tgtcttgttcattggtgaga--gggaaaagggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttaaagctaatttcttgtaactcttttgtatctctttg 7764553  T
Q  101 taagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtc-aagttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| || || ||||||||||||||||||    
T  7764554 taagaactcattgatagtggattggagagatgaatctctcctccagagtaggtcaaatttagaccgaactgggtgaaca 7764632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 39153540 - 39153362
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg-aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    ||||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| ||||    
T  39153540 tgtcttgttcatgtgtgagattgggaaaatgggtagaaattaggtttgttcattgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaactcatttgtatcccttt 39153441  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
     ||||| ||||||||||||||||| |||| | |||||||||| | ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  39153440 ataagaactcattgatagtggattggagagaacaatctctcccccagattaggtcaagttggactgaactgggtcaaca 39153362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 70 - 258
Target Start/End: Original strand, 40913352 - 40913544
Alignment:
Q  70 taatttcttgtagcccatttgtatctctttgtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaact 169  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||    
T  40913352 taatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcatcgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaagttggaccgaact 40913451  T
Q  170 gggtgaac-atttcttcttgttgttatc---ttttctttactctctttatcttgtttatcctttggttgaattgtggttttgctatgcacttg 258  Q
    |||| ||| || ||||  |||| || ||   |||||| || |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  40913452 gggtcaacaatctcttggtgttattgtctatttttctctaatctctttatcttgtttatcctttggttagattgtggttttgctatgcacttg 40913544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 5260503 - 5260323
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg--aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctt 98  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  5260503 tgtcttggtcattggtgagattgggaaaaaagggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctt 5260404  T
Q  99 tgtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    || |||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  5260403 tggaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctcttctccaaagtaggtcaagtttggaccgaacttggtgaaca 5260323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 23200316 - 23200138
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg--aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctt 98  Q
    |||||||||| |||||||||||||  ||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||| ||    
T  23200316 tgtcttgttc-ttggtgagattgggaaaaatgg-tagaaattagagttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctttt 23200219  T
Q  99 tgtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23200218 tgtaagaactcattgatagtgaattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 23200138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 162 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 31340240 - 31340047
Alignment:
Q  162 accgaactgggtgaacattt-cttcttgttgttatcttttcttta-ctctctttatcttgtttatcctttggttgaattgtggttttgctatgcacttgg 259  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| | || |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31340240 accgaactgggtcaacattttcttggtgttgttatcttttcttttgctttctttatcttgtttattccttagttggattgtggttttgctatgcacttgg 31340141  T
Q  260 tttatagactaggtctatattattgttattgcttgtggtttatttacatttgattattggttgccattaatacttgctccacacatcatatagtttgtat 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||     || || |||||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  31340140 tttatagactaggtctatattattgttgttgcttgtggtttactt-----tggttgttggttgccattgatacatgctccacacat--tatagtttgtat 31340048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Original strand, 32891092 - 32891277
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattg-gaaaatggatagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctt 98  Q
    |||||||||| | |||||||||| |||||||| ||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  32891092 tgtcttgttcttcggtgagattgagaaaatgggtagaaattaagttttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctt 32891191  T
Q  99 tgtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaacatttctt 184  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| |||| || ||||||||| |  |||||||||| ||||||||||||||| | | ||||||||    
T  32891192 tgtaagaactcgttgatagtggattggagagataaatctctcccccggagtaggtcatgttggaccgaactggataatcatttctt 32891277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 9636306 - 9636126
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattggaa--aatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctt 98  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |  || || ||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||||| ||| ||||||||| ||    
T  9636306 tgtcttggtcattggtgagattgggagaaaagggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaaactaatttcttgtaacccttttgtatctttt 9636207  T
Q  99 tgtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  9636206 tgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccaaagtaggtcaagtttgaaccgaactgggtgaaca 9636126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 23198117 - 23197939
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg--aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctt 98  Q
    |||||||||| |||||||||||||  ||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||| ||    
T  23198117 tgtcttgttc-ttggtgagattgggaaaaatgg-tagaaattagagttgttttttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctttt 23198020  T
Q  99 tgtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23198019 tgtaagaactcattgatagtgaattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 23197939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 9666646 - 9666467
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattggaaaa-tggatagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctt 98  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||    
T  9666646 tgtcttgttcatttgtgagattggaaaaatgggtagaaattagattttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttatacctctt 9666547  T
Q  99 tgtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    |||||||  || ||||||||||||| |||| ||  |||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  9666546 tgtaagaattctttgatagtggattggagagattgatctctcccccagattaggtaaagttggaccgaactgggtcaaca 9666467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 23392088 - 23391910
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg-aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    |||||| |||||||||||| |||| ||||||  ||||||||| | |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  23392088 tgtctttttcattggtgagtttgggaaaatgagtagaaattaagtttgttctttgtgagcttgtttaagataatttcttgtaacccatttgtatcacttt 23391989  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    | |||| ||| |||||||||||||  ||| || ||||||||| | | | ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23391988 gcaagaactctttgatagtggattgtagagataaatctctcccccaaattaggtcaagttggaccgaactgggtcaaca 23391910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 12 - 178
Target Start/End: Original strand, 801091 - 801260
Alignment:
Q  12 ttggtgagattggaaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccattt-gtatctcttt-gtaagatctc 109  Q
    ||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||||| |||||  || ||||||||||||| | | ||| |||||||||| |||||| |||    
T  801091 ttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactc 801190  T
Q  110 attgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    |||||||||||||| ||||   |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  801191 attgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 801260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 25 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 32744589 - 32744437
Alignment:
Q  25 aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctttgtaagatctcattgatagtggatta 124  Q
    ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||     
T  32744589 aaaatgggtagaaattagt-ttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaactcatttgtatcactttgtaagaactctttgatagtggattg 32744491  T
Q  125 gagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
     ||| || ||||| ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32744490 aagagataaatctatcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaaca 32744437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 7780168 - 7780004
Alignment:
Q  15 gtgagattggaaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt-gtaagatctcattg 113  Q
    |||||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||||| |||||  || ||||||||||||| ||  ||||||||||||| |||||| |||||||    
T  7780168 gtgagattgggaaaagggtagaaattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaacct-tttgtatctcttttgtaagaactcattg 7780070  T
Q  114 atagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    |||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || ||||||||||    
T  7780069 atagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccaaagtgggtgaaca 7780004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 23410508 - 23410330
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagatt-ggaaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    ||||||||||||| |||| ||| ||||||||| ||||||||| | || ||||||||||||||||| ||||||||||| | || |||||||||||| ||||    
T  23410508 tgtcttgttcattagtgaaatttggaaaatgggtagaaattatgtttattctttgtgagcttgtttaagctaatttcgtataacccatttgtatcacttt 23410409  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    |||||| ||| | |||| |||||| |||| || ||||||||| | | | |||||||||||||| |||| ||||| ||||    
T  23410408 gtaagaactcttagataatggattggagagataaatctctcccccaaattaggtcaagttggaacgaattgggtcaaca 23410330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 5 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 31340376 - 31340268
Alignment:
Q  5 ttgttcattggtgagattgg-aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctttgtaa 103  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||    
T  31340376 ttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattgaggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcatgtaactcatttgtatctctttgtaa 31340277  T
Q  104 gatctcatt 112  Q
    || ||||||    
T  31340276 gaactcatt 31340268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 12 - 178
Target Start/End: Original strand, 6716500 - 6716667
Alignment:
Q  12 ttggtgagattggaaaatggatagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt-gtaagatctc 109  Q
    ||||||||||||| ||| || |||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||| ||  |||||||| |||| |||||| |||    
T  6716500 ttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactc 6716597  T
Q  110 attgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
     ||||||||||||| ||||   ||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6716598 tttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 6716667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 12 - 178
Target Start/End: Original strand, 54635125 - 54635292
Alignment:
Q  12 ttggtgagattggaaaatggatagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt-gtaagatctc 109  Q
    ||||||||||||| ||| || |||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||| ||  |||||||| |||| |||||| |||    
T  54635125 ttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactc 54635222  T
Q  110 attgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
     ||||||||||||| ||||   ||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  54635223 tttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 54635292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 5434057 - 5433952
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg---aaaatggatagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctc 96  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| ||||||    
T  5434057 tgtcttgttcattggtgagattgggagaaaatgg-tagaaattagggtttgttctttgtgagcttgttaaagctaatttcttgtaacccttttatatctc 5433959  T
Q  97 tttgtaa 103  Q
    |||||||    
T  5433958 tttgtaa 5433952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 17 - 276
Target Start/End: Original strand, 20937662 - 20937923
Alignment:
Q  17 gagattggaaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctttg-taagatctcattgat 115  Q
    ||||| ||||||| | ||||||||| | ||||| || | ||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||  |||| |||||||||    
T  20937662 gagatcggaaaataggtagaaattatgtttgtttttggagagcttgttgaagttaatttcttgtaacccttttgtatctctttgaaaagaactcattgat 20937761  T
Q  116 agtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtca-agttggaccgaactgggtgaacatttcttct-tgttgttatcttttctttactctcttt 213  Q
    | | |||| |||| |||||||  ||| | | |||| |||| |||||||| ||||| ||| |||| || || | ||| ||| |||||||| ||||||||||    
T  20937762 a-tagattggagagatcaatcgttcccccaaagtatgtcatagttggacagaactaggtaaacaattattttgtgtggttctcttttctctactctcttt 20937860  T
Q  214 atcttgtttatcctttggttgaattgtggttttgctatgcacttggtttatagactaggtcta 276  Q
    |||||||||||  |||||||  |||||| |||| || | |||||| || ||||| ||| ||||    
T  20937861 atcttgtttattatttggttcgattgtgattttactttacacttgattaatagattagatcta 20937923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 51352289 - 51352150
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagatt-ggaaaatggatagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctt 98  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||| |||||||| |||| |||||||||| || ||| |||||||||||| || |||||||| ||||    
T  51352289 tgtcttgtttattggtgagattaggaaaatg-atagaagttagggtttgttcattgtgagctttttaaagttaatttcttgtaacc-atttgtatttctt 51352192  T
Q  99 tgtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctc 140  Q
    ||||| | |||||||| |||||||| |||| |||||||||||    
T  51352191 tgtaataactcattgagagtggatttgagagatcaatctctc 51352150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 110 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 2075144 - 2075071
Alignment:
Q  110 attgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaacatttct 183  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  2075144 attgatagtggatttgagagatcaatctctccccgagagtaggtcaagttggatcgaactgggtaaacatttct 2075071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 12 - 178
Target Start/End: Original strand, 45282983 - 45283154
Alignment:
Q  12 ttggtgagattggaaaatggatagaaattaggg-ttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatc----tctttgtaagat 106  Q
    ||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||| | |||| |||| | ||||||||||||||||  || ||||||||    | |||||||||     
T  45282983 ttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttg-tcaagctaatttcttgta-accttttgtatccctttttttgtaagaa 45283080  T
Q  107 ctca-ttgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    |||| ||||||||||||| ||||   |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  45283081 ctcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaaca 45283154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 12 - 178
Target Start/End: Original strand, 3617449 - 3617618
Alignment:
Q  12 ttggtgagattggaaaatggatagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt-gtaa-gatct 108  Q
    ||||||||||||| ||| || |||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||| ||  || ||||| |||| |||| || ||    
T  3617449 ttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaaagaact 3617546  T
Q  109 catt-gatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    |||| ||||||||||| ||||   |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3617547 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 3617618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 104
Target Start/End: Original strand, 5373220 - 5373326
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg--aaaatggatagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctct 97  Q
    ||||||||||||||  ||||||||  |||| || ||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| |||||||    
T  5373220 tgtcttgttcattgaagagattgggaaaaaagggtagaaattaggctttgttctttttgagcttgttgaagctaatttattgtaacccttttatatctct 5373319  T
Q  98 ttgtaag 104  Q
    |||||||    
T  5373320 ttgtaag 5373326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 17 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 35138868 - 35138762
Alignment:
Q  17 gagattggaaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctttgt-aagatctcattgat 115  Q
    |||||||  |||||| ||||||||| | |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| | | | ||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  35138868 gagattgagaaatgggtagaaattatgtttgttcttggtgagtttgttgaagttaatttcttgcaactcttttgtatctctttgtaaagaactcattgat 35138769  T
Q  116 agtggat 122  Q
    |||||||    
T  35138768 agtggat 35138762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 31 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 25491116 - 25491027
Alignment:
Q  31 gatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctttgt-aagatctcattgatagtg 119  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||  || ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  25491116 gatagaaattaggtttgttctttgagagcttgttgaagctgatttcttatactccttttgtatctctttgtaaagaaatcattgatagtg 25491027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 12 - 175
Target Start/End: Original strand, 25637426 - 25637592
Alignment:
Q  12 ttggtgagattggaaaatggatagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt-gtaa-gatct 108  Q
    ||||||||||||| ||| || |||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||| ||  || ||||| |||| |||| || ||    
T  25637426 ttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaaagaact 25637523  T
Q  109 catt-gatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtga 175  Q
    |||| ||||||||||| ||||   |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25637524 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 25637592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 45 - 140
Target Start/End: Original strand, 33191866 - 33191960
Alignment:
Q  45 ttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctttgtaa-gatctcattgatagtggattagagatatcaatctctc 140  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| || |||| ||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33191866 ttgttcttagagagcttgttgaagctaagttcttgtaacc-attt-tatgtctttgtaaagaactcattgatagtggattagagagatcaatctctc 33191960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 26386660 - 26386597
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg-aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgt 63  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26386660 tgtcttgttcatttgtgagattgggaaaatgggtagaaattaggtttgttctttgtgagcttgt 26386597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 195 - 300
Target Start/End: Original strand, 5270557 - 5270663
Alignment:
Q  195 tcttttctttactctctttatcttgtttatcctttggttgaattgtggttttgctatgcacttggtttatagactaggtctatat-tattgttattgctt 293  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||||||||||  | |||||||||  |||| ||| |||| || ||||||| ||||||    
T  5270557 tcttttctctactctctttatcatgtttattctttggttcgattgtggttttgcattacacttggttgctagattagatctagatctattgttgttgctt 5270656  T
Q  294 gtggttt 300  Q
    |||||||    
T  5270657 gtggttt 5270663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 17 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 4055926 - 4055819
Alignment:
Q  17 gagattggaaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcc-catttgtatctctttgtaag-atctcattga 114  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| | || |||||  ||| |||||||||||| || | |||||||||||||||||| | ||||||||    
T  4055926 gagattgggaaatgggtagaaattagg-ttgttcttggagaacttgtaaaagttaatttcttgtaacctcttttgtatctctttgtaagaaactcattga 4055828  T
Q  115 tagtggatt 123  Q
    |||||||||    
T  4055827 tagtggatt 4055819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 112 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 27305777 - 27305705
Alignment:
Q  112 tgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaacatttctt 184  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||    
T  27305777 tgatagtggattggagagatcaatctctcctccaaagtaggtcaatttggaccgaactgtgtatacatttctt 27305705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 3148153 - 3148054
Alignment:
Q  17 gagattggaaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctttgtaag-atctcattgat 115  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| || |||||   |||||||||||||||||||||||||| ||   |||||| | |||||||| |||||||||||    
T  3148153 gagattgagaaatggatagaaattaggtttcttcttgaagagcttgttgaagctaatttcttgtaaccttattgtatttgtttgtaagaatctcattgat 3148054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 4600914 - 4600747
Alignment:
Q  12 ttggtgagattggaaaatggatagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt-gtaa-gatct 108  Q
    ||||||||||||| ||| || |||||||||||||| |||| | |||| | |  | |||||||||||||||| ||  |||||||  |||| |||| || ||    
T  4600914 ttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacct-tttgtattccttttgtaaagaact 4600816  T
Q  109 catt-gatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtga 175  Q
    |||| ||||||||||| ||||   ||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4600815 catttgatagtggattggagagtacaaactctcctctagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 4600747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 23 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 28253423 - 28253365
Alignment:
Q  23 ggaaaatggatagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgta 81  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28253423 ggaaaatgg-tagaaattagggttcgttcattgtgagcttgttgaagttaatttcttgta 28253365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 8166635 - 8166533
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattggaaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctttg 100  Q
    |||||||||||| |  |||||||  |||||  ||||||||||| |||||||| | ||| ||||||||| |||| |||| || ||  ||||||||||||||    
T  8166635 tgtcttgttcatggaagagattgataaatgagtagaaattaggtttgttcttggagagtttgttgaagttaatatcttataacctttttgtatctctttg 8166536  T
Q  101 taa 103  Q
    |||    
T  8166535 taa 8166533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 26323253 - 26323027
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattgg-tgagattggaaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    |||||||||||| || ||||||||  ||| || || |||||||| ||||| ||   ||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||     
T  26323253 tgtcttgttcatgggatgagattgagaaaagggtaaaaattaggtttgtttttgaagagtttgttgaagctaatttcttgtaacctttttgtatatcttg 26323154  T
Q  100 gt-aagatctcattgatagtggattagagatatc-aatctct-cctcgagagtaggtca-agttggaccgaactgggtgaacatttc-ttcttgttgtta 194  Q
    || || | ||||||||||||| | | ||||||||  || | | || | |||||||||||  ||||||||||| ||||| |||| ||| ||  |||| ||     
T  26323153 gtaaaaaactcattgatagtgaagtggagatatcttatttatccccctagagtaggtcattgttggaccgaagtgggtaaacaattctttggtgttattc 26323054  T
Q  195 tcttttctttactctctttatcttgtt 221  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||    
T  26323053 tcttttctctactctctttatcttgtt 26323027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 111 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 4598591 - 4598526
Alignment:
Q  111 ttgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtga 175  Q
    ||||||||||||| ||||   ||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4598591 ttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 4598526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 111 - 175
Target Start/End: Original strand, 10056319 - 10056384
Alignment:
Q  111 ttgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtga 175  Q
    ||||||||||||| ||||   ||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10056319 ttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 10056384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 111 - 175
Target Start/End: Original strand, 10058541 - 10058606
Alignment:
Q  111 ttgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtga 175  Q
    ||||||||||||| ||||   ||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10058541 ttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 10058606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 111 - 175
Target Start/End: Original strand, 10060763 - 10060828
Alignment:
Q  111 ttgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtga 175  Q
    ||||||||||||| ||||   ||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10060763 ttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 10060828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 111 - 175
Target Start/End: Original strand, 10062985 - 10063050
Alignment:
Q  111 ttgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtga 175  Q
    ||||||||||||| ||||   ||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10062985 ttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 10063050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 111 - 175
Target Start/End: Original strand, 10065207 - 10065272
Alignment:
Q  111 ttgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtga 175  Q
    ||||||||||||| ||||   ||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10065207 ttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 10065272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 111 - 175
Target Start/End: Original strand, 10211495 - 10211560
Alignment:
Q  111 ttgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtga 175  Q
    ||||||||||||| ||||   ||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10211495 ttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 10211560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 316 - 360
Target Start/End: Original strand, 34491488 - 34491530
Alignment:
Q  316 ttggttgccattaatacttgctccacacatcatatagtttgtatt 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  34491488 ttggttgccattaatacttgctccacacat--tatagtttgtatt 34491530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 36 - 155
Target Start/End: Original strand, 39127572 - 39127693
Alignment:
Q  36 aaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctttgt-aagatctcattgat-agtggattagagatatca 133  Q
    |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    ||||||||| || || || | ||||||||| | |||||| || | ||||    
T  39127572 aaattatgtttgttcttggtgagcttgttgaagctaatttcttatagtttttttgtatcttttcgtaaataactcattgataaatggatttgaaagatca 39127671  T
Q  134 atctctcctcgagagtaggtca 155  Q
    |||||||||| |||| ||||||    
T  39127672 atctctcctccagagcaggtca 39127693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 33 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 54739100 - 54739004
Alignment:
Q  33 tagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctttgt-aagatctcattgatagtggattagaga 128  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||  |||| | | ||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||| ||||    
T  54739100 tagaaattagtgtttgttctttgtgagcttgttgaaactaattt-atgtaactcttttatatctctctgtaaagaactcattgatagtggattggaga 54739004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 45 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 1313939 - 1313855
Alignment:
Q  45 ttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctttg-taagatctcattgatagtggattagaga 128  Q
    |||||||| | ||||||||| |||||||||||||| |  || ||||||| ||||||  |||| |||||||||| |||||||||||    
T  1313939 ttgttcttggagagcttgttaaagctaatttcttgcaagccttttgtatatctttgaaaagaactcattgatattggattagaga 1313855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 33 - 99
Target Start/End: Original strand, 4386876 - 4386941
Alignment:
Q  33 tagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||| |  |||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  4386876 tagaaattaggttttgttctttgtgagctttt--aagctaatttcttgtaacccatttgtatcacttt 4386941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 49229659 - 49229607
Alignment:
Q  157 gttggaccgaactgggtgaacatttcttcttgttgttatcttttctttactct 209  Q
    |||||| |||||||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  49229659 gttggatcgaactgggtaaatatttcttagtgttgttatcttttctttactct 49229607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 111 - 175
Target Start/End: Original strand, 10209275 - 10209340
Alignment:
Q  111 ttgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtga 175  Q
    ||||||||||||| ||||   ||| |||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  10209275 ttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccaaactgggtga 10209340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 239; Significance: 1e-132; HSPs: 49)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Original strand, 21588920 - 21589268
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg-aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21588920 tgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt 21589019  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaacatttcttcttgttgttatcttt 199  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  21589020 gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaacatttcttggtgttgttatcttt 21589119  T
Q  200 tctttactctctttatcttgtttatcctttggttgaattgtggttttgctatgcacttggtttatagactaggtctatattattgttattgcttgtggtt 299  Q
    |||||||| || ||||||||||||| | || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21589120 tctttactttccttatcttgtttattccttagttggattgtggttttgctatgcacttggtttatagactaggtctatattgttgttattgcttgtggtt 21589219  T
Q  300 --tatttacatttgattattggttgccattaatacttgctccacacatcata 349  Q
       ||||   |||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  21589220 aacattt---tttggttgttggtttccattgatacttgctccacacatcata 21589268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 26830303 - 26829927
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattgg-tgagattggaaaa-tggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctt 98  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  26830303 tgtcttgttcattgggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaatccatttgtatctctt 26830204  T
Q  99 tgtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaacatttcttcttgttgttatctt 198  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  26830203 tgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccaaagtaggtcaagtttgactgaactgggtgaacatttcttggtgttgttatctt 26830104  T
Q  199 ttctttact--ctctttatcttgttta-tcctttggttgaattgtggttttgctatgcacttggtttatagactaggtctatattattgttattgcttgt 295  Q
    |||||||||  |||||||||||||||| |||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  26830103 ttctttactctctctttatcttgtttattccttgctttggattgtggttttgctatgcacttggtttatagactaggtttatattgttgttattgcttgt 26830004  T
Q  296 ggtttatttacatttgattattggttgccattaatacttgctccacacatcatatagtttgtattagcgggaaatttg 373  Q
    || ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||    
T  26830003 gg-ttatttacatttggttattggtttccattgatacttgctccacacatcatatagtttgtattggtgtgaaatttg 26829927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 373
Target Start/End: Original strand, 17758012 - 17758384
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg-aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    |||||| |||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17758012 tgtcttcttcatttgtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt 17758111  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaacatttcttcttgttgttatctt 198  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||    
T  17758112 gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctcccctctagagtagttcaagtttggaccgaactaggtgaacatttcttggtgttgttatctt 17758211  T
Q  199 ttc-tttactctctttatcttgtttatcctttggttgaattgtggttttgctatgcacttggtttatagactaggtctatattattgttattgcttgtgg 297  Q
    | | ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||| |||| ||| ||||||||||||| ||    
T  17758212 tccttttacgctctttatcttgtttatcctttggttagattgtggttttgctatgcacttgttttctagattagatctagattgttgttattgcttgcgg 17758311  T
Q  298 tttatttacatttgattattggttgccattaatacttgctccacacatcatatagtttgtattagcgggaaatttg 373  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| | | ||||||||    
T  17758312 -ttatttacatttggttattggttgccattgatacttgctccacacatc--atagtttgtattggtgtgaaatttg 17758384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 2973118 - 2972777
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg-aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2973118 tgtcgtgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattaggtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt 2973019  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaacatttcttcttgttgttatcttt 199  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| |||    
T  2973018 gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctcaagagtaggtcaagttcgaccgaactaggtgaacatttcttggtgttgttat-ttt 2972920  T
Q  200 tcttta----ctctctttatcttgtttatcctttggttgaattgtgg-ttttgctatgcacttggtttatagactaggtctatattattgttattgcttg 294  Q
    | ||||    |||||| ||||||||||||| |||||||  ||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||    
T  2972919 tttttactctctctctatatcttgtttatcatttggttagattgtggttttttctatgcacttagtttatagactaggtctatattgttgttgttgtttg 2972820  T
Q  295 tggtttatttacatttgattattggttgccattaatacttgctc 338  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2972819 tgg-ttatttacatttgattattggttgccattgatacttgctc 2972777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Original strand, 17762979 - 17763329
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattg-gaaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||    
T  17762979 tgtcttgttcattggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatcttttt 17763078  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaacatttcttcttgttgttatctt 198  Q
    | |||| ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||    
T  17763079 ggaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtagatcaagtttggaccgaactaggtgaacatttcttggtgttgttatctt 17763178  T
Q  199 ttc-tttactctctttatcttgtttatcctttggttgaattgtggttttgctatgcacttggtttatagactaggtctatattattgttattgcttgtgg 297  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| | | |||| ||| |||| ||| ||||||||| |||| |    
T  17763179 ttcttttactctctttatcttgttcatcctttggttagattgtagttttgctatgcacttgttatctagattagatctagattgttgttattgtttgt-g 17763277  T
Q  298 tttatttacatttgattattggttgccattaatacttgctccacacatcata 349  Q
     ||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  17763278 attatttacatttggttattggttgtcattgatacttgctccacacatcata 17763329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Original strand, 5043616 - 5043966
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattg-gaaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  5043616 tgtcttgttcattcgtgagattgagaaaatgagtagaaattaggtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt 5043715  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtca-agttggaccgaactgggtgaacatttcttcttgttgttatctt 198  Q
    |||||| |||||||||||| |||| |||| |||||||||||||| | |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  5043716 gtaagaactcattgatagtagattggagagatcaatctctcctccatagtaggtcattgttggaccgaactgggtgaacatttcttggtgttgttatctt 5043815  T
Q  199 ttctttactctctttatcttgtttatcctttggttgaattgtggttttgctatgcacttggtttatagactaggtc--tatattattgttattgcttgtg 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||  |||||| ||||| ||||||| |    
T  5043816 ttctttactctctttatcttgtttatttcttggttggattgtggttttgctatgcactt-gattatagaataggtctatatattgttgttgttgcttgag 5043914  T
Q  297 gtttatttacatttgattattggttgccattaatacttgctccacacatcata 349  Q
    | ||||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||    
T  5043915 g-ttatttacatttggttattggttgtcattgatacgtgctccacacatcata 5043966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 3808888 - 3808534
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg-aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccattt-gtatctctt 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  3808888 tgtcttgttcattggtgagattgggaaaataggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaaactaatttcttgtaacccattttgtatctctt 3808789  T
Q  99 tgtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaac-atttcttcttgttgttatc 196  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||||| || ||||   |||||| ||    
T  3808788 tgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcatgattggaccgaactaggtgaacaatctcttggggttgttgtc 3808689  T
Q  197 ---ttttctttactctctttatcttgtttatcctttggttgaattgtggttttgctatgcacttggtttatagactaggtctatattattgttattgctt 293  Q
       |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||| ||| |||| ||| |||| ||| ||| ||||||||    
T  3808688 tatttttctctactctctttatcttgtttatcctttggttagattatggttttgctatgcatttgttttctagattagatctagattgttgctattgctt 3808589  T
Q  294 gtggtttatttacatttgattattggttgccattaatacttgctccacacatcata 349  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  3808588 ttgg-ttatttacatttgattattggttgccattgatacttgctccacatatcata 3808534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 22425006 - 22424644
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattggaaaa-tggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccattt--gtatctct 97  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||  ||||||||    
T  22425006 tgtcttgttcgttggtgagattggaaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttttgtatctct 22424907  T
Q  98 ttgtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaa-gttggaccgaactgggtgaacatttcttcttgttgttatc 196  Q
    |||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||  |||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  22424906 ttgtaagaactcatt-atagtggattggagagatcaatctctccttcagagtaggtcattgttggaccgtactgggtgaacatttcttggtgttgttatc 22424808  T
Q  197 ttttctttactctctttatcttgtttatcctttggttgaattgtgg--ttttgctatgcacttggtttatagactaggtctatattattgttattgcttg 294  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||  |||| | ||||||||||||| || | ||| |||| ||| ||||| ||| |||    
T  22424807 ttttctctactctctttatcttgtttatccttaggttagattgtggtttttttcaatgcacttggtttctatattagatctagattgttgttgttgtttg 22424708  T
Q  295 tggtttatttacatttgattattggttgccattaatacttgctccacacatcatatagtttgtatta 361  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  22424707 tgg-ttatttacatttggttattggttaccattgatacttgctccacacatc--atagtttgtatta 22424644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 21593653 - 21593860
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg-aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21593653 tgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt 21593752  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaacatttcttcttgttgttatcttt 199  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  21593753 gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaacatttcttggtgttgttatcttt 21593852  T
Q  200 tctttact 207  Q
    ||||||||    
T  21593853 tctttact 21593860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 54 - 341
Target Start/End: Original strand, 26800630 - 26800917
Alignment:
Q  54 gtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccattt-gtatctctttgtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtagg 152  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  26800630 gtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactaattttgtatctctttgtaagaactcatt-atagtggattggagagatcaatctctcctccagagtagg 26800728  T
Q  153 tcaa-gttggaccgaactgggtgaacatttcttcttgttgttatcttttctttactctctttatcttgtttatcctttggttgaattgtggttttgctat 251  Q
    |||  ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  26800729 tcattgttggaccgaactggatgaacatttcttggtgttgttatcttttctctactctttttatcttgtttatcttttggttagattgtggttttgctat 26800828  T
Q  252 gcacttggtttatagactaggtctatattattgttattgcttgtggtttatttacatttgattattggttgccattaatacttgctccac 341  Q
    ||||||| ||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26800829 gcacttgttttctagactagatctagattgttgttattgcttgtgg-taatttacatttggttattggttgccattgatacttgctccac 26800917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 603259 - 603005
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattggaaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctttg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||        |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  603259 tgtcttgttcattggtgagattggg-------tagaaatttgtgttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttg 603167  T
Q  101 taagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaac-atttcttcttgttgttatc--- 196  Q
    ||||| ||| ||||||||||||| |||| |||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||  ||||||| ||       
T  603166 taagaactcgttgatagtggattggagaaatcaatctctccccaagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctcttgatgttgttgtctat 603067  T
Q  197 ttttctttactctctttatcttgtttatcctttggttgaattgtggttttgctatgcacttg 258  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  603066 ttttctctactctctttatcttgtttatgccttggttggattgtggttttactatgcacttg 603005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 28137587 - 28137403
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg-aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  28137587 tgtcttgttcattggtgagaatgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatttcttt 28137488  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaacatttctt 184  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  28137487 gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagagtaggtcaagttggaccgaattgtgtgaacatttctt 28137403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 9183210 - 9183032
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattg-gaaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9183210 tgtcttgttcattggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaatttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt 9183111  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||| ||||    
T  9183110 gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagattatgtcaagttggaccgaactgggtcaaca 9183032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 5406378 - 5406200
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg-aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  5406378 tgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttt 5406280  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  5406279 gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgaaccgaactgggtgaaca 5406200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 5410703 - 5410525
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg-aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  5410703 tgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttt 5410605  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  5410604 gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgaaccgaactgggtgaaca 5410525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 5 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 33211360 - 33211186
Alignment:
Q  5 ttgttcattggtgagattgg-aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctttgtaa 103  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33211360 ttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattatggttgttctttgtgagcttgatgaagttaatttcttgtagctcatttgtatctctttgtaa 33211261  T
Q  104 gatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    || |||||| ||| |||||| |||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33211260 gaactcatttataatggattggagagatcaatctctcccccagagtaggtcaagttggaccgaactgggtcaaca 33211186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 2171710 - 2171532
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg--aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  2171710 tgtcttgttcattggtgagattgggaaaaatgg-tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaaccc-tttgtatctctt 2171613  T
Q  99 tgtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2171612 tgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 2171532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 26954464 - 26954287
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattggaaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctttg 100  Q
    ||||||||||||  |||||||||| |||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||    
T  26954464 tgtcttgttcatatgtgagattgggaaattggtataaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatctgtatctctttg 26954365  T
Q  101 taagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  26954364 taagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccaaagtaggtcaagttggaccgaactaggtcaaca 26954287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 5413572 - 5413401
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattggaaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  | |||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  5413572 tgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaggtagaaattagggttgttctttgcgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttg 5413473  T
Q  101 taagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaag-ttggaccgaactgg 171  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5413472 taagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgg 5413401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 30834716 - 30834538
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg--aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  30834716 tgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaagggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctt 30834617  T
Q  99 tgtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaa 176  Q
    || |||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30834616 tggaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 30834538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 31404853 - 31404675
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg-aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    ||||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  31404853 tgtcttgttcatcagtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttt 31404755  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  31404754 gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggccaagtttggaccgaactgggtgaaca 31404675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 16452509 - 16452329
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg--aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||| ||  ||||||||    
T  16452509 tgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaagggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaaccctttcatatctctt 16452410  T
Q  99 tgtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    || |||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16452409 tggaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 16452329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 3039082 - 3038926
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg-aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3039082 tgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttcattgtgagctttttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt 3038983  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaa 156  Q
    |||||| ||| || |||||||||| |||| || ||||||||| | ||| ||||||||    
T  3038982 gtaagaactctttaatagtggattggagagattaatctctcccccagattaggtcaa 3038926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 33160532 - 33160352
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg--aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctt 98  Q
    |||||| |||||||||||||||||  ||||  | |||||||||| |||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| | | ||||||||||||    
T  33160532 tgtcttattcattggtgagattgggaaaaaaaggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaactcttttgtatctctt 33160433  T
Q  99 tgtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||    
T  33160432 tgtaagaactcattgatggtggattggagagatcaatctctcctccagagtatttcaagtttggaccaaactgggtgaaca 33160352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 12 - 178
Target Start/End: Original strand, 412101 - 412270
Alignment:
Q  12 ttggtgagattggaaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccattt-gtatctcttt-gtaagatctc 109  Q
    ||||||||||||| |||  | |||||||||||||||||| |||||| ||| |  || ||||||||||||| | | ||| |||||||||| |||||| |||    
T  412101 ttggtgagattgggaaaaaggtagaaattagggttgttcattgtgaacttatcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactc 412200  T
Q  110 attgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  412201 attgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 412270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 12 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 3072928 - 3072759
Alignment:
Q  12 ttggtgagattgg-aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccattt-gtatctcttt-gtaagatct 108  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||  || ||||||||||||| | | ||| |||||||||| |||||| ||    
T  3072928 ttggtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaact 3072830  T
Q  109 cattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    ||||||||||| ||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3072829 cattgatagtgaattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 3072759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 16 - 178
Target Start/End: Original strand, 16569037 - 16569189
Alignment:
Q  16 tgagattg-gaaaatggatagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctttgtaagatctcattg 113  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||            ||||||||| |||||||    
T  16569037 tgagattgagaaaatgggtagaaattaggttttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacc------------tttgtaagaactcattg 16569124  T
Q  114 atagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16569125 atagtggattggagagatcaatctctcctccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaaca 16569189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 12 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 6097608 - 6097451
Alignment:
Q  12 ttggtgagattggaaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctttgtaagatctcat 111  Q
    |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||||||||||| |||||  || ||||||||||||| |         ||| ||||||||| |||||    
T  6097608 ttggtgagattggaaaaatggtagaaattaggattgttctttgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaac---------tct-tttgtaagaactcat 6097519  T
Q  112 tgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6097518 tgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 6097451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 87 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 5409161 - 5409076
Alignment:
Q  87 tttgtatctctttgtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaag-ttggaccgaactgg 171  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5409161 tttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgg 5409076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Original strand, 4045412 - 4045548
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg-aaaatggatagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctt 98  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |  ||| ||||||||    
T  4045412 tgtcttgtttattggagagattgggaaaatgg-tagaaattagggtttgttctttatgagcttgttgaagctaatttcttgtaatcattttatatctctt 4045510  T
Q  99 tgt-aagatctcattgatagtggattagagatatcaat 135  Q
    ||| || | ||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  4045511 tgtaaataactcattgatagtggattggagagatcaat 4045548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 178
Target Start/End: Original strand, 27647861 - 27648028
Alignment:
Q  12 ttggtgagattggaaaatggatagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt-gtaagatctc 109  Q
    ||||||||||||| ||| || |||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||| ||  |||||||| |||| |||||| |||    
T  27647861 ttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactc 27647958  T
Q  110 attgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
     ||||||||||||| ||||   ||| |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  27647959 tttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtagatcaagtttggaccgaactgggtgaaca 27648028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 12 - 178
Target Start/End: Original strand, 16554869 - 16555037
Alignment:
Q  12 ttggtgagattggaaaatggatagaaattaggg-ttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctc-tttgtaagatctc 109  Q
    ||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||| |||||| |||| | ||||||||||||||||  || |||||||| | ||||||||| |||    
T  16554869 ttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttg-tcaagctaatttcttgta-accttttgtatcccttttgtaagaactc 16554966  T
Q  110 a-ttgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    | ||||||||||||| ||||   ||| |||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16554967 atttgatagtggattggagagtgcaaactctcctccaaagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 16555037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 12 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 16578686 - 16578518
Alignment:
Q  12 ttggtgagattggaaaatggatagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt-gtaagatctc 109  Q
    ||||||||||||| ||| || |||||||||||||| | || |||||| |||||  |||||||||||||||| ||  |||||||| |||| |||||| |||    
T  16578686 ttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgctcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactc 16578589  T
Q  110 att-gatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    ||| ||||||||||| ||||   ||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16578588 atttgatagtggattggagagtgcaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 16578518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 12 - 178
Target Start/End: Original strand, 16616694 - 16616862
Alignment:
Q  12 ttggtgagattggaaaatggatagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt-gtaagatctc 109  Q
    ||||||||||||| ||| || |||||||||||||| | || |||||| |||||  |||||||||||||||| ||  |||||||| |||| |||||| |||    
T  16616694 ttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgctcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactc 16616791  T
Q  110 att-gatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    ||| ||||||||||| ||||   ||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16616792 atttgatagtggattggagagtgcaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 16616862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 12 - 178
Target Start/End: Original strand, 16631425 - 16631593
Alignment:
Q  12 ttggtgagattggaaaatggatagaaattaggg-ttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctc-tttgtaagatctc 109  Q
    ||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||| |||||| |||| | ||||||||||||||||  || |||||||| | ||||||||| |||    
T  16631425 ttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttg-tcaagctaatttcttgta-accttttgtatcccttttgtaagaactc 16631522  T
Q  110 a-ttgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    | ||||||||||||| ||||   ||| |||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16631523 atttgatagtggattggagagtgcaaactctcctccaaagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 16631593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 12 - 178
Target Start/End: Original strand, 16653112 - 16653280
Alignment:
Q  12 ttggtgagattggaaaatggatagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt-gtaagatctc 109  Q
    ||||||||||||| ||| || || ||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||| ||  |||||||| |||| |||||| |||    
T  16653112 ttggtgagattgggaaaagggtaaaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactc 16653209  T
Q  110 att-gatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    ||| ||||||||||| ||||   ||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16653210 atttgatagtggattggagagtgcaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 16653280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 33 - 261
Target Start/End: Original strand, 25073590 - 25073826
Alignment:
Q  33 tagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctttgt-aagatctcattgatagtggattagagatat 131  Q
    ||||||||||  || ||||| ||||||||||| |||||| ||| ||||| ||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  25073590 tagaaattagatttattcttcgtgagcttgttaaagctattttattgtaacccttttgtatctctatgtaaagaactcattgatagtggattagagaaat 25073689  T
Q  132 caatctctcctcgagagtaggtca-agttggaccgaactgggtgaacatttcttcttg------ttgttatcttttctttactctctttatcttgtttat 224  Q
    ||||||||| |  | | ||||| |  ||| |||  |||| ||| ||||||||||  ||      ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  25073690 caatctctcattcaaattaggttattgttagactaaactaggtaaacatttcttggtgtgttgtttgttctcttttctctgctctctttatcttgtttat 25073789  T
Q  225 cctttggttgaattgtggttttgctatgcacttggtt 261  Q
     ||||||||  ||  ||||||||| || |||||||||    
T  25073790 tctttggtttgatattggttttgcaatacacttggtt 25073826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 12 - 178
Target Start/End: Original strand, 25421305 - 25421474
Alignment:
Q  12 ttggtgagattggaaaatggatagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt-gtaa-gatct 108  Q
    ||||||||||||| ||| || |||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||| ||  || ||||| |||| |||| || ||    
T  25421305 ttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaaagaact 25421402  T
Q  109 catt-gatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    |||| ||||||||||| ||||   |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25421403 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 25421474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 88 - 286
Target Start/End: Original strand, 9572667 - 9572868
Alignment:
Q  88 ttgtatctctttgt-aagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaac-atttctt 184  Q
    ||||| |||||||| |||| | |||||||||||||||  ||| |||||||||| ||  |||||||||||   ||| | |||||||||| ||  |||||||    
T  9572667 ttgtaactctttgttaagaacccattgatagtggattgcagagatcaatctctactttagagtaggtcatcattgaaacgaactgggtaaaatatttctt 9572766  T
Q  185 cttgttgttatcttttctttactctctttatcttgtttatcctttggttgaattgtggttttgctatgcacttggtttatagactaggtctatattattg 284  Q
      |||||||||||||||| |  | |||||||||| | ||| ||||| ||  |||||||| || ||||||||||||||| |||| ||| |||| |||||||    
T  9572767 gatgttgttatcttttctctcgtgtctttatcttatctattctttgattcgattgtggtatttctatgcacttggtttctagattagatctagattattg 9572866  T
Q  285 tt 286  Q
    ||    
T  9572867 tt 9572868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 12 - 178
Target Start/End: Original strand, 6027246 - 6027415
Alignment:
Q  12 ttggtgagattggaaaatggatagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt-gtaa-gatct 108  Q
    ||||||||||||| ||| || |||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||| ||  || ||||| |||| |||| || ||    
T  6027246 ttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaaagaact 6027343  T
Q  109 catt-gatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    |||| ||||||||||| ||||   |||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  6027344 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtatgtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 6027415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 111 - 178
Target Start/End: Original strand, 34167180 - 34167248
Alignment:
Q  111 ttgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    ||||||||||||| ||||   ||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34167180 ttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 34167248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 282 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 603004 - 602942
Alignment:
Q  282 ttgttattgcttgtggtttatttacatttgattattggttgccattaatacttgctccacacatcata 349  Q
    ||||| |||||||||||||||||     ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  603004 ttgttgttgcttgtggtttattt-----tgattgttggttgccattgatacttgctccacacatcata 602942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 5740160 - 5740074
Alignment:
Q  17 gagattggaaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctttgtaa 103  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||| | || | |||||||||||| | ||||| |||||  || ||||||| |||||||||    
T  5740160 gagattggaaaatggatagaaactaggtttgcttttagagagcttgttgaaaccaatttattgtaaaccttttgtatttctttgtaa 5740074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 111 - 175
Target Start/End: Original strand, 13154015 - 13154080
Alignment:
Q  111 ttgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtga 175  Q
    ||||||||||||| ||||   ||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13154015 ttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 13154080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 23 - 79
Target Start/End: Original strand, 16567208 - 16567265
Alignment:
Q  23 ggaaaatggatagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttg 79  Q
    ||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16567208 ggaaaatggttagaaattaggttttgttttttgtgagcttgtttaagctaatttcttg 16567265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 111 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 33342173 - 33342108
Alignment:
Q  111 ttgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtga 175  Q
    ||||||||||||| ||||   ||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33342173 ttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 33342108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 111 - 175
Target Start/End: Original strand, 34164958 - 34165023
Alignment:
Q  111 ttgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtga 175  Q
    ||||||||||||| ||||   ||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34164958 ttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 34165023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 33 - 103
Target Start/End: Original strand, 186736 - 186806
Alignment:
Q  33 tagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctttgtaa 103  Q
    ||||||| ||| |||||||| | ||||||||||||| ||| || || |||| | |||||||||||||||||    
T  186736 tagaaataaggtttgttcttggagagcttgttgaagttaaatttttatagctcttttgtatctctttgtaa 186806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 135 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 14521722 - 14521676
Alignment:
Q  135 tctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaacattt 181  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||    
T  14521722 tctctcctcgagagtaggtcatattggaccgaactaggtcaacattt 14521676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 68)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 346
Target Start/End: Original strand, 213454 - 213803
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg-aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  213454 tgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt 213553  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagtt-ggaccgaactgggtgaacatttcttcttgttgttatctt 198  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  213554 gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccatagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacatttcttggtgttgttatctt 213653  T
Q  199 ttctttactctct--ttatcttgtttatcctttggttga-attgtggttttgctatgcacttggtttatagactaggtctatattattgttattgcttgt 295  Q
    | |||||||||||  ||||||||||||| | ||| ||   |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  213654 tcctttactctctctttatcttgtttattccttgcttttgattgtggttttgctatgcacttagttaatagactaggtctatattgttgttattgcttgt 213753  T
Q  296 ggtttatttacatttgattattggttgccattaatacttgctccacacatc 346  Q
    ||||| |||||||||| |||||| |||| ||| |||||||||| |||||||    
T  213754 ggttt-tttacatttggttattgattgctattgatacttgctctacacatc 213803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 27637792 - 27637454
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattg-gaaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccattt-gtatctctt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  27637792 tgtcttgttcattggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggttgttctttatgagcttgtttaaactaatttcttgtaacccattttgtatctctt 27637693  T
Q  99 tgtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaa-gttggaccgaactgggtgaacatttcttcttgttgttatct 197  Q
    ||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  27637692 tgtaagaactcatt-atagtggattggagagatcaatctctcctgcagagtaggtcattgttggaccgaactgggtgaatatttcttggtgttgttatct 27637594  T
Q  198 tttctttactctctttatcttgtttatcctttggttgaattgtggttttgctatgcacttggtttatagactaggtctatattattgttattgcttgtgg 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||     
T  27637593 tttctttactctctttatcttgtttattccttagttggattgtggttttgctatgcacttggtttatagactaggtctatattgttgttgttgcttgtg- 27637495  T
Q  298 tttatttacatttgattattggttgccattaatacttgctccac 341  Q
       |||||| |||| || ||| || |||||||||||||||||||    
T  27637494 ---atttacttttggttgttgattaccattaatacttgctccac 27637454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 258
Target Start/End: Original strand, 40147250 - 40147508
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg-aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  40147250 tgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttcgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt 40147349  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaacatttcttcttgttgttatcttt 199  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||    
T  40147350 gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaacatttttttgtgtttttatcttt 40147449  T
Q  200 tctttactctctttatcttgtttatcctttggttgaattgtggttttgctatgcacttg 258  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40147450 tctttactctatttatcttgtttatcctttggttgaattgtggttttgttatgcacttg 40147508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Original strand, 5058036 - 5058383
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg-aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  5058036 tgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttct--gtgagcttgttgaagctattttcttgtatcccatttgtatctcttt 5058133  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaacatttcttcttgttgttatcttt 199  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  5058134 gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctctagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaacatttcttggtgttgttatcttt 5058233  T
Q  200 tctttactctctttatcttgttta-tcctttggttgaattgtggttttgctatgcacttggtttatagactaggtc--tatattattgttattgcttgtg 296  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||   ||| ||| ||||||| |||||||||| | ||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||    
T  5058234 tctttactctctttatcttgtttattccttgctttggattatggttttactatgcactt-gattatagactaggtctatatattgttgttgttgcttgtg 5058332  T
Q  297 gtttatttacatttgattattggttgccattaatacttgctccacacatcata 349  Q
    ||| |   |  |||| || |||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  5058333 gttaa--catttttggttgttggttgccattgatacttgttccacacatcata 5058383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 9 - 349
Target Start/End: Original strand, 27015528 - 27015856
Alignment:
Q  9 tcattggtgagattgg-aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctttgtaagatc 107  Q
    |||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||| |    
T  27015528 tcattggtgagattgggaaaataggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaata--------cccatttgtatctctttgtaagaac 27015619  T
Q  108 tcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaacatttcttcttgttgttatcttttctttact 207  Q
    ||||||||||||||||  | | |||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || |||||| |||||||||||    
T  27015620 tcattgatagtggattgtacagatcaatctctcctccaaaataggtcaagttggaccgaactgggtgaacattttttggtg-tgttattttttctttact 27015718  T
Q  208 ctctttatcttgtttatcctttggttgaattgtggttttgctatgcacttggtttatagactagg--tctatattattgttattgcttgtggtttattta 305  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||  | |||||| ||||| |||||||||    |||||    
T  27015719 ctctttatcttgtttatgctttggttgaattgtggttttgatatgcactt-gattatagactaggtatatatattgttgttgttgcttgtg----attta 27015813  T
Q  306 catttgattattggttgccattaatacttgctccacacatcata 349  Q
    | |||| || ||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27015814 c-tttggttgttgattgccattaatacttgctccacccatcata 27015856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Original strand, 28278305 - 28278489
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg-aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28278305 tgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattatggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt 28278404  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaacatttctt 184  Q
    |||| | ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28278405 gtaaaaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaacaattctt 28278489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Original strand, 13488192 - 13488365
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg-aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13488192 tgtcttgttcattggtaagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt 13488291  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggt 173  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13488292 gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccgagattaggtcaagttggaccgaactgggt 13488365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Original strand, 16452069 - 16452253
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattggaaaa-tggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16452069 tgtcttgttcattgatgagattggaaaaatgggtagaaattaagtttgttctttctgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt 16452168  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaacatttctt 184  Q
    |||||| |||||| |||||||||| |||| || ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16452169 gtaagaactcattcatagtggattggagagataaatctctcccccagagtaggtcaagttggaccgaactgggtaaacatttctt 16452253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 533758 - 533936
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg-aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  533758 tgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttggtctttgtgagcttgttgaagctaattttttgtaacccatttgtatctcttt 533857  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || | |||||||||||| | | | ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  533858 gtaagaactcattgatagtggattggaaagatcaatctctcccccatattaggtcaagttggaccgaactgggtcaaca 533936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 25412750 - 25412928
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattggaaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  25412750 tgtcttgttcattggtgagattgggaaaagggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttg 25412849  T
Q  101 taagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  25412850 taagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggactgaactgggtgaaca 25412928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 42428609 - 42428431
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg-aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  42428609 tgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattatggtttttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt 42428510  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | | | ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  42428509 gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccatattaggtcaagttggaccgaactgggtcaaca 42428431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 16641119 - 16640818
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg----aaaatggatagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatct 95  Q
    ||||||||||||||| |||||||     ||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  || | | |||||||||    
T  16641119 tgtcttgttcattggcgagattgagaaaaaaatgg-tagaaattagtgtttgttctttgtgagcttgttgaagctgatttctgataactcttttgtatct 16641021  T
Q  96 ctttgtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaacatttcttcttgttgttat 195  Q
    |||||||||| ||   |||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||  |||||||||    
T  16641020 ctttgtaagaact---tgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtagggccgaactgggtaaacatttcttggtgttgttat 16640924  T
Q  196 cttttctttactctc--tttatcttgtttatcctttggttgaattgtggttttgctatgcacttggtttatagactaggtctatattattgttattgctt 293  Q
    ||||||||| |||||  ||||||||| |||| |||| ||| ||||||||||||| |||||| ||| ||| |||| ||  |||| ||| ||||| ||||||    
T  16640923 cttttctttgctctctatttatcttgcttattctttagttaaattgtggttttgttatgcatttgatttctagattaaatctagatttttgttgttgctt 16640824  T
Q  294 gtggtt 299  Q
    ||||||    
T  16640823 gtggtt 16640818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 39468728 - 39468550
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg-aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  39468728 tgtcttgttcattagtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt 39468629  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| | | | ||||| || |||||| ||||||||| ||||    
T  39468628 gtaagaactcattgatagtggattagagagatcaatctctcccccatattaggttaaattggactgaactgggtcaaca 39468550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 13239740 - 13239919
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattggaaaa--tggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||    
T  13239740 tgtcttgttcattggtgagattggaaaaaatgg-tagaaattagggtttttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaactcttttgtatctctt 13239838  T
Q  99 tgtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtc-aagttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  13239839 tgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaaatttggaccgaactgggtgaaca 13239919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 171
Target Start/End: Original strand, 538014 - 538185
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg-aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  538014 tgtcttgttcattagtgagattgggaaaatgggtagaaattaaggttgctctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt 538113  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgg 171  Q
    |||||| |||||||||||| |||| |||| |||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||||    
T  538114 gtaagaactcattgatagtagattggagagatcaatctctcccccatattaggtcaagttggaccgaactgg 538185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 32636813 - 32636991
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg-aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32636813 tgtcttattcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattatggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt 32636912  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| |||| |||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32636913 gtaagaactctttgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaaca 32636991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 42426414 - 42426236
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattg-gaaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  42426414 tgtcttgttcattggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaaattgttgaagctaatttcttgcaacccatttgtatctcttt 42426315  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |  || ||||||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  42426314 gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccctgattaggtcaagttggactgaactaggtcaaca 42426236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 33831669 - 33831847
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattggaaaa-tggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33831669 tgtcttattcatttgtgagattggaaaaatgggtagaaattaggtttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt 33831768  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    |||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||| | | | ||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  33831769 gtaagaactcattgatagtggattgaagagatcaatctctcccccatattaggtcaagttggactgaactgggtcaaca 33831847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 28750834 - 28750661
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg-aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||    
T  28750834 tgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttatgaaattgttgaagttaatttcctgtaacccatttgtatcttttt 28750735  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggt 173  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  28750734 gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaagttggaccgaattgggt 28750661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 33 - 261
Target Start/End: Original strand, 316784 - 317014
Alignment:
Q  33 tagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctttgtaa-gatctcattgatagtggattagagatat 131  Q
    ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| || |||||||||| |||||  |||  ||    
T  316784 tagaaattaggtttgttcttggagagcttgttgaagctaatttcttgtaatccttttgtatctctttgtaaagaactcattgataatggatcggagggat 316883  T
Q  132 caatctctcctcgagagtaggtcaa-gttggaccgaactgggtgaacatttcttcttgttgttatcttttctttactctctttatcttgtttatcctttg 230  Q
    |||||||||| | |||||||||||  ||||||||||||| ||| |||| |||||  ||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||| |||||    
T  316884 caatctctcccctagagtaggtcattgttggaccgaacttggtaaacaattctttgtgttgttctcttttccctactctctttattttgtttattctttg 316983  T
Q  231 gttgaattgtggttttgctatgcacttggtt 261  Q
    ||| ||||||||||||||| | |||||||||    
T  316984 gttcaattgtggttttgctttacacttggtt 317014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 8566125 - 8565947
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattg-gaaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || |    
T  8566125 tgtcttgttcatttgtgagattgagaaaatgggtagaacttaggtttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatccctct 8566026  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  8566025 gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcacccagattaggtcaagttggaccgaactaggtcaaca 8565947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 31182962 - 31183140
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattggaaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctttg 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||| |||||    
T  31182962 tgtcttgttcatttgtgagattggaaaatgggtagaaattaggattgttctttgtgagtttgtttaagttaatttcttgta-accatttgtatccctttg 31183060  T
Q  101 taagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaacatt 180  Q
    ||||| |||||||||| |||||| |||| ||| |||||||| | | | ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31183061 taagaactcattgatactggattggagagatctatctctcccccatattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacatt 31183140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 3 - 173
Target Start/End: Original strand, 38746996 - 38747167
Alignment:
Q  3 tcttgttcattggtgagattgg-aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctttgt 101  Q
    |||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  38746996 tcttgttcattaatgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgg 38747095  T
Q  102 aagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggt 173  Q
    || | ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||   |||  ||||||||||||||| ||||||||    
T  38747096 aaaaactcattgatagaggattggagagatcaatctctccctcagatcaggtcaagttggaccaaactgggt 38747167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 13343049 - 13343228
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg--aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||  || ||||||||||||    
T  13343049 tgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaagggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaatccttttgtatctctt 13343148  T
Q  99 tgtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    || |||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  13343149 tg-aagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcatgtttggaccgaactgggtgaaca 13343228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 30182577 - 30182756
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg--aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||| ||| ||||||||    
T  30182577 tgtcttgttcattggtgagattgggaaaaatgg-tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttctatctctt 30182675  T
Q  99 tgtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    || |||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  30182676 tggaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtatgtcaagtttggaccgaactggatgaaca 30182756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 12 - 178
Target Start/End: Original strand, 16409475 - 16409643
Alignment:
Q  12 ttggtgagattggaaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctc-tttgtaagatctca 110  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||||| | | |||||||||| ||||||||| ||||    
T  16409475 ttggtgagattggaaaaagggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactcttttgtatctcttttgtaagaactca 16409574  T
Q  111 ttgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16409575 ttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 16409643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 33 - 178
Target Start/End: Original strand, 37439163 - 37439309
Alignment:
Q  33 tagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctttgtaagatctcattgatagtggattagagatatc 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||||||||| | | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||    
T  37439163 tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagttaatttcttgtaactcttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatc 37439262  T
Q  133 aatctctcctcgagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37439263 aatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 37439309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 3075837 - 3075653
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattg-gaaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    ||||| ||||||| ||||||||| |||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  3075837 tgtctcgttcatttgtgagattgagaaaataggtagaaattaggtttgttctttgtgagcttgctgaatctaatttcttgtaacccatttgtatcttttt 3075738  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaacatttctt 184  Q
    ||||||  || ||||||||| ||| |||| ||||||||||||   | |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  3075737 gtaagaattcgttgatagtgaattggagagatcaatctctccctcatagtaggtcaagttggaccaaattgggtgaacatttctt 3075653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 12 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 18441816 - 18441648
Alignment:
Q  12 ttggtgagattggaaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctc-tttgtaagatctca 110  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||| |||||  || ||||||||||||| | | |||||||||| ||||||||| ||||    
T  18441816 ttggtgagattggaaaaagggtagaaattagggttgttccttgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactcttttgtatctcttttgtaagaactca 18441717  T
Q  111 ttgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18441716 ttgatagtggattggagagttcaatctctcctctagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 18441648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 12 - 178
Target Start/End: Original strand, 26177883 - 26178050
Alignment:
Q  12 ttggtgagattggaaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt-gtaagatctca 110  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||||| | | ||||||||||||| |||||| ||||    
T  26177883 ttggtgagattggaaaaggg-tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactcttttgtatctcttttgtaagaactca 26177981  T
Q  111 ttgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26177982 ttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 26178050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 12 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 9789392 - 9789224
Alignment:
Q  12 ttggtgagattggaaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctc-tttgtaagatctca 110  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| |||||| |||||  || ||||||||||||| | | |||||||||| ||||||||| ||||    
T  9789392 ttggtgagattggaaaaagggtagaaattaaggttgttccttgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactcttttgtatctcttttgtaagaactca 9789293  T
Q  111 ttgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9789292 ttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 9789224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 30683100 - 30682930
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg-aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||| || ||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||    
T  30683100 tgtcttgttcatttgtgagattgggaaaaagggtagaaattagggtt---ctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatttcttt 30683004  T
Q  100 gtaagat--ctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgg 171  Q
    ||||||   ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||    
T  30683003 gtaagaatactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgg 30682930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 36074224 - 36074043
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg----aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctc 96  Q
    ||||||||||||||||||||||||    |||| || |||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||| | | ||||||||||    
T  36074224 tgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaaaagggtagaaattagggttgttctttgcgaacttgtcaaagctaatttcttgtaactcttttgtatctc 36074125  T
Q  97 tttgtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  36074124 tttg-aagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccaaagtaggtcaagtttggaccgaactggatgaaca 36074043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 3 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 13695868 - 13695685
Alignment:
Q  3 tcttgttcattggtgagattggaaaatggatagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctttgt 101  Q
    |||| ||| |||| |||||||| ||| || || ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  13695868 tctttttctttggagagattgggaaaagggtacaaattagggtttgttctttgtgagcttgttaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgt 13695769  T
Q  102 -aagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaacatttctt 184  Q
     |||| |||||| ||||||||||||||| || | ||||||||| | |||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||||    
T  13695768 aaagaactcattaatagtggattagagagattattctctcctccatagtaggtcaacttggaccaaactaggtaaacatttctt 13695685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 9049520 - 9049340
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattggaaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctttg 100  Q
    ||||||||| ||| ||||| |||| |||  |||||||||||| |||  | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  9049520 tgtcttgttgattagtgagtttgggaaaatgatagaaattagtgtttgtttttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaaccattttgtatctctttg 9049421  T
Q  101 taagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaacattt 181  Q
    ||||| |||||||| |||||||| |||| |||||| ||||| | | ||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||    
T  9049420 taagaactcattgacagtggattggagagatcaatatctcccccaaagtaggtgaagttggaccgaaatggataaacattt 9049340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 42310114 - 42309947
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattg-gaaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||||||| | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||    
T  42310114 tgtcttgctcattggtgagattgagaaattgggtagaaatcaagtttgatctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcttttgtatctcttt 42310015  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaa 167  Q
    |||||| || |||||||||||||||| || |||||||||||| | | ||||| | ||||| |||||||    
T  42310014 gtaagaacttattgatagtggattagcgagatcaatctctcccccatagtagattaagtttgaccgaa 42309947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 229 - 349
Target Start/End: Original strand, 40751195 - 40751311
Alignment:
Q  229 tggttgaattgtggttttgctatgcacttggtttatagactaggtctatattattgttattgcttgtggtttatttacatttgattattggttgccatta 328  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    |||||||||| |||||||||| ||||     
T  40751195 tggttaaattgtggttttgctatgcacttggtttatagattaggtctatattgttgttattgcttgtgg----tttacatttggttattggttgtcattg 40751290  T
Q  329 atacttgctccacacatcata 349  Q
    |||||| ||||||| ||||||    
T  40751291 atacttactccacaaatcata 40751311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 229 - 349
Target Start/End: Original strand, 40763200 - 40763316
Alignment:
Q  229 tggttgaattgtggttttgctatgcacttggtttatagactaggtctatattattgttattgcttgtggtttatttacatttgattattggttgccatta 328  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||    ||||||||||||||||||||| ||||     
T  40763200 tggttaaattatggttttgctatgcacttggtttatagattaggtctatattgttgttattgcttatgg----tttacatttgattattggttgtcattg 40763295  T
Q  329 atacttgctccacacatcata 349  Q
    |||||||||||||| ||||||    
T  40763296 atacttgctccacagatcata 40763316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 5887595 - 5887490
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattg-gaaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||| ||||    
T  5887595 tgtcttgttcatttgtgagattgagaaaatggatagaaattagatttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgcaacccatttgtatcacttt 5887496  T
Q  100 gtaaga 105  Q
    ||||||    
T  5887495 gtaaga 5887490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 12 - 178
Target Start/End: Original strand, 29720364 - 29720532
Alignment:
Q  12 ttggtgagattggaaaatggatagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt-gtaagatctc 109  Q
    ||||||||||||| ||| || |||||||||||||| |||| |||||| |||||  || ||||||||||||| ||  |||||||| |||| |||||| |||    
T  29720364 ttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggttagttcattgtgaacttgtctaatctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactc 29720462  T
Q  110 attgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
     ||||||||||||| ||||   |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29720463 tttgatagtggattggagagtacaatctctcctctagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 29720532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 12 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 29751328 - 29751160
Alignment:
Q  12 ttggtgagattggaaaatggatagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt-gtaagatctc 109  Q
    ||||||||||||| ||| || |||||||||||||| |||| |||||| |||||  || ||||||||||||| ||  |||||||| |||| |||||| |||    
T  29751328 ttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactc 29751230  T
Q  110 attgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
     ||||||||||||| ||||   |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29751229 tttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 29751160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 12 - 178
Target Start/End: Original strand, 26170774 - 26170930
Alignment:
Q  12 ttggtgagattggaaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctttgtaagatctcat 111  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||||  || ||||||||||||| |         ||| ||||||||| |||||    
T  26170774 ttggtgagattggaaaaggg-tagaaattaggattgttctttgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaac---------tct-tttgtaagaactcat 26170862  T
Q  112 tgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26170863 tgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 26170930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 12 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 22536457 - 22536290
Alignment:
Q  12 ttggtgagattggaaaatggatagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt-gtaagatctc 109  Q
    ||||||||||||| ||| || |||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||| ||  |||||||| |||| |||||| |||    
T  22536457 ttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactc 22536360  T
Q  110 attgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
     ||||||||||||| | ||   |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22536359 tttgatagtggattggggagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 22536290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 12 - 178
Target Start/End: Original strand, 29722524 - 29722692
Alignment:
Q  12 ttggtgagattggaaaatggatagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt-gtaagatctc 109  Q
    ||||||||||||| ||| || |||||||||||||| |||| |||||| |||||  || ||||||||||||| ||  |||||||| |||| |||||| |||    
T  29722524 ttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggttagttcattgtgaacttgtctaatctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactc 29722622  T
Q  110 attgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtc-aagttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
     ||||||||||||| ||||   |||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  29722623 tttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaaatttggaccgaactgggtgaaca 29722692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 114 - 261
Target Start/End: Original strand, 4160702 - 4160850
Alignment:
Q  114 atagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaa-gttggaccgaactgggtgaacatttcttcttgttgttatcttttctttactctctt 212  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||  |||||||| |||||||| || |||| ||  |||||||||||||||| |  |||| |    
T  4160702 atagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcattgttggaccaaactgggtaaatatttattagtgttgttatcttttctatgttctcat 4160801  T
Q  213 tatcttgtttatcctttggttgaattgtggttttgctatgcacttggtt 261  Q
    |||||||||||| ||||||||  ||| |||||||||| | |||||||||    
T  4160802 tatcttgtttattctttggttcgattatggttttgctttacacttggtt 4160850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 12 - 178
Target Start/End: Original strand, 10593258 - 10593426
Alignment:
Q  12 ttggtgagattggaaaatggatagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt-gtaagatctc 109  Q
    ||||||||||||| | | || |||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||| ||  |||||||| |||| |||||| |||    
T  10593258 ttggtgagattgggagaagggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacct-tttgtatcccttttgtaagaactc 10593355  T
Q  110 att-gatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    ||| ||||||||||| ||||   |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10593356 atttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 10593426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Original strand, 19806372 - 19806449
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattggaaaa-tggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttctt 78  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19806372 tgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagg-ttgttctttgtgagtttgttgaagctaatttctt 19806449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 26 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 33906184 - 33906024
Alignment:
Q  26 aaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctttgt-aagatctcattgatagtggatta 124  Q
    |||||| || |||||||| | || ||| | |||||||| |||||||| ||||||||  || ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||     
T  33906184 aaatgggtataaattaggttagtgcttggagagcttgtcgaagctaacttcttgtaatccttttgtatctctttgtaaagaactcattgatagtagattg 33906085  T
Q  125 gagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaa-gttggaccgaactgggtgaacatttctt 184  Q
    || | |||||||||| | | |||||||||||| |||||||||| |||||| |||| |||||    
T  33906084 gaaagatcaatctcttccctagagtaggtcaatgttggaccgagctgggtaaacaattctt 33906024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 85 - 184
Target Start/End: Original strand, 42926965 - 42927064
Alignment:
Q  85 catttgtatctctttgtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctc-ctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaacatttct 183  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  ||| || |||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  42926965 catttgtatctctttgtaagaactcattgacagtggattgaagaaataaatctctctctc-atagtaggtcaagttggaccgaactgggtaaacatttct 42927063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 12 - 178
Target Start/End: Original strand, 25078120 - 25078289
Alignment:
Q  12 ttggtgagattggaaaatggatagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt-gtaa-gatct 108  Q
    ||||||||||||| ||| || |||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||| ||  || ||||| |||| |||| || ||    
T  25078120 ttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaaagaact 25078217  T
Q  109 catt-gatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    |||| ||||||||||| ||||   |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25078218 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 25078289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 12 - 178
Target Start/End: Original strand, 25136089 - 25136258
Alignment:
Q  12 ttggtgagattggaaaatggatagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt-gtaa-gatct 108  Q
    ||||||||||||| ||| || |||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||| ||  || ||||| |||| |||| || ||    
T  25136089 ttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaaagaact 25136186  T
Q  109 catt-gatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    |||| ||||||||||| ||||   |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25136187 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 25136258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 17 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 10054978 - 10054854
Alignment:
Q  17 gagattggaaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctttgtaa-gatctcattgat 115  Q
    |||||||  |||||| ||||||||| | ||||||||   ||| ||||||||||||||||||| ||  || ||||||||||||||||| || |||||||||    
T  10054978 gagattgagaaatgggtagaaattatgtttgttcttgaagagtttgttgaagctaatttcttata-accttttgtatctctttgtaatgaactcattgat 10054880  T
Q  116 agtggattagagatatcaatctctcc 141  Q
    |||| ||| ||||||||||| |||||    
T  10054879 agtgtattggagatatcaatatctcc 10054854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 33 - 140
Target Start/End: Original strand, 3325935 - 3326043
Alignment:
Q  33 tagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctttgt-aagatctcattgatagtggattagagatat 131  Q
    ||||||||||  ||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||| |||| |||| |||| |||||||||||| ||    
T  3325935 tagaaattagttttgttcttgaagagcttgttgaagctaatttcttgtaaccattgtgtatctctttgtaaagaactcaatgatggtggattagagagat 3326034  T
Q  132 caatctctc 140  Q
    |||| ||||    
T  3326035 caatatctc 3326043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 102 - 178
Target Start/End: Original strand, 19806454 - 19806530
Alignment:
Q  102 aagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    |||| ||| ||||||||||||| |||| |||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19806454 aagaactccttgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaaca 19806530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 12 - 178
Target Start/End: Original strand, 40380090 - 40380259
Alignment:
Q  12 ttggtgagattggaaaatggatagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt-gtaa-gatct 108  Q
    ||||||||||||| ||| || |||||||||||||| |||| | |||| |||||  || ||||||||||||| ||  || ||||| |||| |||| || ||    
T  40380090 ttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaaa-ctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaaagaact 40380187  T
Q  109 catt-gatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    |||| ||||||||||| ||||  |||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  40380188 catttgatagtggattggagagttcaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 40380259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 12 - 178
Target Start/End: Original strand, 40382301 - 40382470
Alignment:
Q  12 ttggtgagattggaaaatggatagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt-gtaa-gatct 108  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||| |||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||| ||  || ||||| |||| |||| || ||    
T  40382301 ttggtgagattgggaaaggggtagaagttagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaaagaact 40382398  T
Q  109 catt-gatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    |||| ||||||||||| ||||  |||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  40382399 catttgatagtggattggagagttcaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 40382470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 103
Target Start/End: Original strand, 30802835 - 30802920
Alignment:
Q  17 gagattggaaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctttgtaa 103  Q
    ||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  || ||||||||| |||||||    
T  30802835 gagattgaaaaatgggtagaa-ttaggtttgttctttgtgagcttgttgaaactaatttattgtaatccttttgtatctatttgtaa 30802920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 10700809 - 10700580
Alignment:
Q  18 agattggaaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt-gtaagatctcattgata 116  Q
    |||||||||||  | ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||| ||||| || |   |||||||||||||   |||| ||||||||||    
T  10700809 agattggaaaaaaggtagaaattaggtttgttcttagagagcttgttgaagctaa-ttcttataacatttttgtatctctttaaaaagaactcattgata 10700711  T
Q  117 gtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtca-agttggaccgaactgggtgaacatttc-ttcttgttgttatcttttctttactctcttta 214  Q
    ||| | | |||| |||  ||||||| | | |||||||||  |||  ||||||||| || || | ||| ||| ||||||| |||||||| ||| |||||||    
T  10700710 gtgaagtggagagatc--tctctcccccatagtaggtcattgtttcaccgaactgagtaaataattctttcgtgttgttctcttttctctacgctcttta 10700613  T
Q  215 tcttgtttatcctttggttgaattgtggttttg 247  Q
    ||||| |||| ||||| ||  ||||||||||||    
T  10700612 tcttgcttattctttgatttgattgtggttttg 10700580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 112
Target Start/End: Original strand, 42926911 - 42926968
Alignment:
Q  55 tgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctttgtaagatctcatt 112  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  42926911 tgagattgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcatt 42926968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 33 - 119
Target Start/End: Original strand, 35616191 - 35616278
Alignment:
Q  33 tagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctttgt-aagatctcattgatagtg 119  Q
    ||||||||||| |||||||| | ||||| ||| ||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||||| |||| |||||||||||||    
T  35616191 tagaaattaggtttgttcttggagagctcgtttaagttaatttcttgtaacccttttgtatttctttgtaaagaactcattgatagtg 35616278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 24 - 128
Target Start/End: Original strand, 22097877 - 22097980
Alignment:
Q  24 gaaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctttgt-aagatctcattgatagtggat 122  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||| | ||  ||||||||| ||||||||| || |||  |||||||| ||||| || | ||||||||||||||||    
T  22097877 gaaaaagggtagaaattagggttgttcttggagaatttgttgaagttaatttcttataaccc--ttgtatctatttgtaaaaaactcattgatagtggat 22097974  T
Q  123 tagaga 128  Q
    ||||||    
T  22097975 tagaga 22097980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 60 - 141
Target Start/End: Original strand, 8445764 - 8445846
Alignment:
Q  60 ttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctttgt-aagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcc 141  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| | |||| || ||||||||| ||||||| | || |||||||||    
T  8445764 ttgttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatttctttataaagaactaattgatagtagattagaaagatgaatctctcc 8445846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 111 - 175
Target Start/End: Original strand, 16544509 - 16544574
Alignment:
Q  111 ttgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtga 175  Q
    ||||||||||||| ||||   ||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16544509 ttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 16544574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 111 - 175
Target Start/End: Original strand, 16546731 - 16546796
Alignment:
Q  111 ttgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtga 175  Q
    ||||||||||||| ||||   ||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16546731 ttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 16546796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 70 - 240
Target Start/End: Original strand, 30793195 - 30793362
Alignment:
Q  70 taatttcttgtagcccatttgtatctctttgtaa-gatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaa-gttggaccgaa 167  Q
    |||||| ||||| ||  ||||||||||||||||| || || |||||||||| | | |||| |||  ||||||| | |||||| ||||  |||||||||||    
T  30793195 taatttattgtaaccattttgtatctctttgtaaagaactaattgatagtgaagtggagagatc--tctctcccctagagtaagtcattgttggaccgaa 30793292  T
Q  168 ctgggtgaacatttcttcttgttgttatcttttctttactctctttatcttgtttatcctttggttgaattgt 240  Q
    |  ||| ||||||||||  |||  || |   |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  30793293 caaggtaaacatttcttggtgtgtttgt---ttctctactctctttatcttgtttattctttggtttaattgt 30793362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 316 - 350
Target Start/End: Original strand, 28278592 - 28278626
Alignment:
Q  316 ttggttgccattaatacttgctccacacatcatat 350  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28278592 ttggttgccattgatacttgctccacacatcatat 28278626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 316 - 373
Target Start/End: Original strand, 38747281 - 38747336
Alignment:
Q  316 ttggttgccattaatacttgctccacacatcatatagtttgtattagcgggaaatttg 373  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| | | ||||||||    
T  38747281 ttggttgccattgatacttgctccacacatc--atagtttgtattggtgtgaaatttg 38747336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 316 - 349
Target Start/End: Original strand, 40147538 - 40147571
Alignment:
Q  316 ttggttgccattaatacttgctccacacatcata 349  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  40147538 ttggtttccattaatacttgctccacacatcata 40147571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 1)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 5 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 18178 - 17811
Alignment:
Q  5 ttgttcattggtgagattgg-aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctttgtaa 103  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  18178 ttgttcattggtgagagtgggaaaattggtagaaattagggttgttcattgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaa 18079  T
Q  104 gatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaacatttcttcttgttgttatcttttct 202  Q
     | ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| || |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  18078 -aactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagggtaggtcaagtttggatcgaactgggtgaacatttcttggtgttgttatcttttct 17980  T
Q  203 ttactctctttatcttgttta-tcctttggttgaattgtggttttgctatgcacttggtttatagactaggtctatattattgttattgcttgtggttta 301  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||| |||| ||| |||||||||||||||| |||    
T  17979 ttactctctttatcttgtttattcctttggttagattgtggttttgctatgcatttgttttctagattagatctagattgttgttattgcttgtgg-tta 17881  T
Q  302 tttacatttgattattggttgccattaatacttgctccacacatcatatagtttgtattagcgggaaatttg 373  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||  |||||||||||| | | ||||||||    
T  17880 tttacatttgattattggttgctattgatacttgctacacacatc--atagtttgtattggtgtgaaatttg 17811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0236 (Bit Score: 125; Significance: 3e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0236
Description:

Target: scaffold0236; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Original strand, 10479 - 10820
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattggaaaatg-gatagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctt 98  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||   |||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||  |||||||| ||||| ||  ||||||||||||    
T  10479 tgtcttgttcatttgtgagattggaaaaaaagatataaattagggtttgttctttgtgagctc-ttgt-gctaatttattgtaaccattttgtatctctt 10576  T
Q  99 tgtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaacatttcttcttgttgttatctt 198  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  10577 tgtaagaactcgttgatagtggattgaagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggaccgaactgggtaaacatttcttggtgttgttatctt 10676  T
Q  199 ttctttactctc-tttatcttgtttatcctttggttgaattgtggttttgctatgcacttggtttatagactaggtctatattattgttattgcttgtgg 297  Q
    | || ||||||| |||||||||||||| ||||| ||  ||||| ||||| |||| |||||| ||| |||| ||  |||| ||| ||||| ||||||||||    
T  10677 tcctctactctcttttatcttgtttattctttgattagattgtagttttactatacacttgatttctagattaaatctagattgttgttgttgcttgtgg 10776  T
Q  298 tttatttacatttgattattggttgccattaatacttgctccaca 342  Q
     |||||| | |||| |||| ||||| |||| |||||| |||||||    
T  10777 -ttattttcttttggttatcggttgtcattgatactttctccaca 10820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 115; Significance: 3e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 149276 - 149098
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg-aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||    
T  149276 tgtcttgttcatttgtgagattgggaaaacggatagaaattagggttgttttttgtaagcttgttgaagctaatttcttgttacccatttatatctcttt 149177  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  149176 gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagagtaggttaagttggaccgaactgggtcaaca 149098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0286 (Bit Score: 114; Significance: 1e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0286
Description:

Target: scaffold0286; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 11546 - 11725
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg--aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  11546 tgtcttgttcattggtgagattgggaaaaatgg-tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctt 11644  T
Q  99 tgtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11645 tgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 11725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 114; Significance: 1e-57; HSPs: 2)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 434521 - 434701
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg--aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  434521 tgtcttgttcattggtgagattggggaaaaagggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctt 434620  T
Q  99 tgtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  434621 tgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 434701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 33 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 490467 - 490198
Alignment:
Q  33 tagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctttgt-aagatctcattgatagtggattagagatat 131  Q
    ||||||||| | |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||| |||  ||||||||||||| |   |||| ||    
T  490467 tagaaattaagtttgttcttggagagcttgttgaagctaatttcttgtaactcttttgtatatctttgtaaagtactcattgatagtgaagcggagagat 490368  T
Q  132 ca--atctctcctcgagagtaggtca-agttggaccgaactgggtgaac-atttcttcttgttgttatcttttctttactctctttatcttgtttatcct 227  Q
    ||   ||||||| | | ||||||| |  |||| || ||||||||| ||| |||  ||  ||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||  |    
T  490367 cattctctctcccccatagtaggttagtgttgaactgaactgggtaaacaattatttgatgttgttct-ttttctttactctctttatcttgattat--t 490271  T
Q  228 ttggttgaattgtggttttgctatgcacttggtttatagactaggtctatat-tattgttattgcttgtggtt 299  Q
    ||||||   ||||||||||||||| |||||||||  |||| ||| |||| || ||||||| ||||||| ||||    
T  490270 ttggtttgtttgtggttttgctatacacttggttgctagattagatctagatatattgttgttgcttgcggtt 490198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 8 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 20587 - 20416
Alignment:
Q  8 ttcattggtgagattgg-aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctttgtaagat 106  Q
    ||||||||||||||||| ||||||   |||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  20587 ttcattggtgagattgggaaaatgagcagaaattaggtttgttttttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaa 20488  T
Q  107 ctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    ||| |||||| |||||| |||| |||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20487 ctctttgatattggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaaca 20416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 114591 - 114770
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg-aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||| ||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| | | |||||||||||||    
T  114591 tgtcttgttcattggtgagattgggaaaaagggtagaaattaaggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacgcttttgtatctcttt 114690  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||| ||| || ||||||||||| ||||||    
T  114691 gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggttaagtttagaccgaactggatgaaca 114770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1519 (Bit Score: 94; Significance: 9e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold1519
Description:

Target: scaffold1519; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 905 - 1083
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg--aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctt 98  Q
    |||||||||| |||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  905 tgtcttgttc-ttggtgagattgggaaaaaagggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctt 1003  T
Q  99 tgtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    || || | ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1004 tg-aacaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 1083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0491 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0491
Description:

Target: scaffold0491; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 11341 - 11161
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattggaa--aatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctc-t 97  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |  || || ||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||||| ||| |||||||||| |    
T  11341 tgtcttgttc-ttggtgagattgggagaaaagggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtaaaatctaatttcttgtaacccttttgtatctctt 11243  T
Q  98 ttgtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11242 ttgtaagaactcgttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 11161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0491; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 8915 - 8735
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattggaa--aatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctt 98  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |  || || ||||||||||||||||||||||||| ||| |  || ||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  8915 tgtcttgttc-ttggtgagattgggagaaaagggtagaaattagggttgttctttgtgaacttataaaatctaatttcttgtaacccttttgtatctctt 8817  T
Q  99 t-gtaagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    | |||||| ||| ||||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8816 ttgtaagaactcgttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 8735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 84; Significance: 9e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 80462 - 80343
Alignment:
Q  1 tgtcttgttcattggtgagattgg-aaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||    
T  80462 tgtcttgttcattgctgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgcaacccatttgtatcttttt 80363  T
Q  100 gtaagatctcattgatagtg 119  Q
    |||||| ||||| |||||||    
T  80362 gtaagaactcatagatagtg 80343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0219 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0219
Description:

Target: scaffold0219; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 56 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 27566 - 27439
Alignment:
Q  56 gagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctttgt-aagatctcattgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtc 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || | || |||||||||||||| |||| |||||||||||| | | ||||||||    
T  27566 gagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaaataacttattgatagtggattggagagatcaatctctcccccatagtaggtc 27467  T
Q  155 a-agttggaccgaactgggtgaacattt 181  Q
    |  ||||||||||| | ||| |||||||    
T  27466 attgttggaccgaattaggtaaacattt 27439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0565 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0565
Description:

Target: scaffold0565; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 12 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 2773 - 2604
Alignment:
Q  12 ttggtgagattggaaaatggatagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctcttt-gtaa-gatct 108  Q
    ||||||||||||| ||| || |||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||| ||  || ||||| |||| |||| || ||    
T  2773 ttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtatcccttttgtaaagaact 2676  T
Q  109 catt-gatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 178  Q
    |||| ||||||||||| ||||   |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2675 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 2604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 23 - 128
Target Start/End: Original strand, 25066 - 25171
Alignment:
Q  23 ggaaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtagcccatttgtatctctttgt-aagatctcattgatagtgga 121  Q
    ||||||||| |||||| |||  |||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| ||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |    
T  25066 ggaaaatgg-tagaaactagttttgttctttgagagtttgttgaaggtaatttcttgtaacctttttgtatctctttgtaaagaactcattgatagtgaa 25164  T
Q  122 ttagaga 128  Q
     ||||||    
T  25165 gtagaga 25171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0674 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0674
Description:

Target: scaffold0674; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 111 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 3794 - 3729
Alignment:
Q  111 ttgatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtga 175  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3794 ttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 3729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0137 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0137
Description:

Target: scaffold0137; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 12 - 175
Target Start/End: Original strand, 6272 - 6438
Alignment:
Q  12 ttggtgagattggaaaatggatagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgta-gcccatttgtatctcttt-gtaa-gatc 107  Q
    ||||||||||||| ||| || |||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||| ||||  ||||||| |||| |||| || |    
T  6272 ttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaagccc--ttgtatcccttttgtaaagaac 6368  T
Q  108 tcatt-gatagtggattagagatatcaatctctcctcgagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtga 175  Q
    ||||| ||||||||||| ||||   ||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  6369 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggttaagtttggaccgaactgggtga 6438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0197
Description:

Target: scaffold0197; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 195 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 1379 - 1298
Alignment:
Q  195 tcttttctttactctctttatcttgtttatcctttggttgaattgtggttttgctatgcacttggtttatagactaggtcta 276  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||  |||||||  ||||||||||| || | |||||||||| |||| ||| ||||    
T  1379 tcttctctttactctctttatcttatttattttttggtttgattgtggttttactttacacttggtttctagattagatcta 1298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0927 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0927
Description:

Target: scaffold0927; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 288 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 3482 - 3431
Alignment:
Q  288 ttgcttgtggtttatttacatttgattattggttgccattaatacttgctcca 340  Q
    |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3482 ttgcttgtggtt-atttacatttagttattggttgccattgatacttgctcca 3431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University