View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF9719_low_24 (Length: 278)

Name: NF9719_low_24
Description: NF9719
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF9719_low_24
NF9719_low_24
[»] chr1 (8 HSPs)
chr1 (44-278)||(43988526-43988760)
chr1 (44-278)||(39445291-39445523)
chr1 (45-278)||(25445151-25445382)
chr1 (45-278)||(1055073-1055304)
chr1 (70-278)||(44023935-44024140)
chr1 (70-151)||(41386566-41386646)
chr1 (70-163)||(41398055-41398147)
chr1 (99-278)||(24787438-24787617)
[»] chr3 (16 HSPs)
chr3 (44-278)||(8516886-8517120)
chr3 (45-278)||(8512007-8512240)
chr3 (44-278)||(10207724-10207957)
chr3 (44-278)||(2677149-2677383)
chr3 (44-278)||(2672993-2673227)
chr3 (45-278)||(32475276-32475508)
chr3 (44-278)||(32480132-32480366)
chr3 (103-278)||(24967957-24968130)
chr3 (70-224)||(18656251-18656403)
chr3 (73-197)||(22173336-22173458)
chr3 (99-278)||(7167092-7167267)
chr3 (95-210)||(28503995-28504108)
chr3 (238-278)||(2671660-2671699)
chr3 (238-278)||(8739137-8739176)
chr3 (238-278)||(9091375-9091414)
chr3 (238-278)||(40372869-40372908)
[»] chr8 (13 HSPs)
chr8 (44-278)||(35745182-35745414)
chr8 (44-278)||(10684326-10684559)
chr8 (75-278)||(6311121-6311320)
chr8 (70-278)||(39784884-39785091)
chr8 (70-278)||(25328340-25328545)
chr8 (75-210)||(7290055-7290188)
chr8 (99-278)||(33037880-33038056)
chr8 (238-278)||(10689217-10689256)
chr8 (238-278)||(18853242-18853281)
chr8 (238-278)||(36979361-36979400)
chr8 (99-278)||(4760149-4760325)
chr8 (99-210)||(30655488-30655599)
chr8 (238-275)||(18870639-18870675)
[»] chr5 (18 HSPs)
chr5 (45-278)||(2785167-2785398)
chr5 (44-278)||(33791107-33791339)
chr5 (44-278)||(31401912-31402144)
chr5 (44-278)||(31397055-31397287)
chr5 (43-278)||(33767969-33768202)
chr5 (45-278)||(37561506-37561740)
chr5 (44-278)||(37556684-37556919)
chr5 (45-278)||(28807634-28807868)
chr5 (75-278)||(1457224-1457423)
chr5 (95-278)||(43592120-43592302)
chr5 (70-278)||(15044507-15044709)
chr5 (75-210)||(43598547-43598680)
chr5 (75-210)||(43604039-43604172)
chr5 (75-210)||(43609531-43609664)
chr5 (75-210)||(27444793-27444926)
chr5 (75-278)||(27449637-27449837)
chr5 (95-278)||(30631249-30631429)
chr5 (237-278)||(31180197-31180237)
[»] chr6 (13 HSPs)
chr6 (44-278)||(33330507-33330741)
chr6 (45-278)||(6005209-6005440)
chr6 (45-278)||(33336004-33336237)
chr6 (45-278)||(16838536-16838767)
chr6 (44-278)||(5343271-5343504)
chr6 (70-278)||(28155631-28155837)
chr6 (44-278)||(6438293-6438524)
chr6 (70-197)||(14737718-14737843)
chr6 (44-197)||(11856764-11856915)
chr6 (70-197)||(14742577-14742702)
chr6 (70-197)||(28184320-28184448)
chr6 (73-197)||(22010838-22010960)
chr6 (238-278)||(22010759-22010798)
[»] scaffold0197 (2 HSPs)
scaffold0197 (44-278)||(19227-19459)
scaffold0197 (44-278)||(14371-14604)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (44-278)||(149018-149250)
[»] scaffold0259 (1 HSPs)
scaffold0259 (45-278)||(2313-2544)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (44-278)||(182026-182259)
[»] chr7 (16 HSPs)
chr7 (44-278)||(16879863-16880096)
chr7 (44-278)||(16884719-16884952)
chr7 (44-278)||(24261385-24261618)
chr7 (45-278)||(24266264-24266496)
chr7 (45-278)||(19992104-19992336)
chr7 (45-278)||(21812300-21812532)
chr7 (70-278)||(24024388-24024594)
chr7 (70-278)||(31109645-31109849)
chr7 (70-197)||(12396730-12396855)
chr7 (70-278)||(12406150-12406354)
chr7 (70-168)||(4866548-4866644)
chr7 (99-278)||(20357621-20357797)
chr7 (238-278)||(2057949-2057988)
chr7 (99-165)||(2057806-2057871)
chr7 (238-278)||(4866714-4866753)
chr7 (238-278)||(12396895-12396934)
[»] chr2 (9 HSPs)
chr2 (44-278)||(19349069-19349302)
chr2 (45-278)||(19344212-19344444)
chr2 (45-197)||(32246577-32246728)
chr2 (70-197)||(39812129-39812255)
chr2 (73-197)||(44312765-44312887)
chr2 (101-278)||(14291337-14291511)
chr2 (238-278)||(9296475-9296514)
chr2 (238-278)||(11099001-11099040)
chr2 (238-278)||(44312686-44312725)
[»] chr4 (13 HSPs)
chr4 (45-278)||(18855519-18855750)
chr4 (45-278)||(3813816-3814047)
chr4 (44-197)||(9224548-9224699)
chr4 (70-224)||(5732481-5732633)
chr4 (70-197)||(9229335-9229460)
chr4 (45-197)||(45347959-45348109)
chr4 (45-197)||(45357438-45357588)
chr4 (74-210)||(56146840-56146974)
chr4 (75-194)||(51520280-51520397)
chr4 (238-278)||(24741924-24741963)
chr4 (238-278)||(29760625-29760664)
chr4 (231-278)||(45347879-45347925)
chr4 (231-278)||(45357358-45357404)
[»] scaffold0464 (1 HSPs)
scaffold0464 (44-278)||(154-386)
[»] scaffold0355 (2 HSPs)
scaffold0355 (70-278)||(9704-9907)
scaffold0355 (70-215)||(13-148)
[»] scaffold0135 (1 HSPs)
scaffold0135 (70-197)||(35203-35328)
[»] scaffold0127 (1 HSPs)
scaffold0127 (70-151)||(34136-34216)
[»] scaffold0479 (1 HSPs)
scaffold0479 (44-134)||(13140-13229)
[»] scaffold0777 (1 HSPs)
scaffold0777 (44-93)||(6292-6341)
[»] scaffold0978 (1 HSPs)
scaffold0978 (237-278)||(310-350)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 8)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 44 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 43988760 - 43988526
Alignment:
Q  44 ttgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggc 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  43988760 ttgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacgccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagagcaaatggc 43988661  T
Q  144 ttccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcacaaccacacttagagctaacaagcatacaagataaaaccatgaaaagaaaagaac 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43988660 ttccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcacaaccacactaagagctaacaagcatacaagataaaaccatgaaaagaaaagaac 43988561  T
Q  244 aaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagcc 278  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  43988560 aaaacaccaagcaagattgtttacccagttcagcc 43988526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 44 - 278
Target Start/End: Original strand, 39445291 - 39445523
Alignment:
Q  44 ttgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggc 143  Q
    ||||||||||||||| || || || |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  39445291 ttgttgtgaatccggttctacaaacgaaccttcacaccaatga-aataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgtgaacaaatggc 39445389  T
Q  144 ttccaagctaacaacaacaaaacag-cctaagcctaatgtatagcacaaccacacttagagctaacaagcat--acaagataaaaccatgaaaagaaaag 240  Q
    |||||||| ||||||||| |||||| |||||| ||| ||||||||| ||||||||  |||||||||||||||  ||||||||||  |   ||||| ||||    
T  39445390 ttccaagcaaacaacaac-aaacagccctaag-ctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaa--cggtaaaaggaaag 39445485  T
Q  241 aacaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagcc 278  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  39445486 aacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagcc 39445523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 45 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 25445382 - 25445151
Alignment:
Q  45 tgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggct 144  Q
    |||||||||||||| || || || |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  25445382 tgttgtgaatccggttctacaaacgaaccttcacaccaatga-aataaaccaatgatgtgtggagcaagcgatagtgataatcaatgagaacaaatggct 25445284  T
Q  145 tccaagctaacaacaacaaaacag-cctaagcctaatgtatagcacaaccacacttagagctaacaagc--atacaagataaaaccatgaaaagaaaaga 241  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| |||||| ||| ||||||||| ||||||||  |||||||||||||  | ||||||||||  |   ||||| |||||    
T  25445283 tccaagcaaacaacaac-aaacagccctaag-ctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcgtaaacaagataaa--cggtaaaaggaaaga 25445188  T
Q  242 acaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagcc 278  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25445187 acaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagcc 25445151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 45 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 1055304 - 1055073
Alignment:
Q  45 tgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggct 144  Q
    |||||||||||||| || || |  |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| ||    
T  1055304 tgttgtgaatccggttctacaatcgaaccttcacaccaatga-aataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgtgaacaaatgtct 1055206  T
Q  145 tccaagctaacaacaacaaaacag-cctaagcctaatgtatagcacaaccacacttagagctaacaagcat--acaagataaaaccatgaaaagaaaaga 241  Q
    |||||||| |||||||| |||||| |||||| ||| ||||||||| ||||||||  |||||||||||||||  ||||||||||  |   ||||| |||||    
T  1055205 tccaagcttacaacaac-aaacagccctaag-ctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaa--cggtaaaaggaaaga 1055110  T
Q  242 acaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagcc 278  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1055109 acaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagcc 1055073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 70 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 44024140 - 44023935
Alignment:
Q  70 aaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggcttccaagctaacaacaacaaaacag- 168  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||     
T  44024140 aaccttcacaccaatga-aataaaccaatgatgtgtggagcaactgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaac-aaacagc 44024043  T
Q  169 cctaagcctaatgtatagcacaaccacacttagagctaacaagcat--acaagataaaaccatgaaaagaaaagaacaaaacaccaagcaagattgttga 266  Q
    |||||| ||| ||||||||| ||||||||  |||||||||||||||  ||||||||||     | |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44024042 cctaag-ctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaa---tggtaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttga 44023947  T
Q  267 cccagttcagcc 278  Q
    ||||||||||||    
T  44023946 cccagttcagcc 44023935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 70 - 151
Target Start/End: Original strand, 41386566 - 41386646
Alignment:
Q  70 aaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggcttccaagc 151  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  |||||||    
T  41386566 aaccttcacaccaatga-aataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagc 41386646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 70 - 163
Target Start/End: Original strand, 41398055 - 41398147
Alignment:
Q  70 aaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggcttccaagctaacaacaacaa 163  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||  ||||||| |||||||||||    
T  41398055 aaccttcacaccaatga-aataaaccaattatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacatatggtctccaagcaaacaacaacaa 41398147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 24787617 - 24787438
Alignment:
Q  99 gatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggcttccaagcta--acaacaacaaaa--cagcctaagcctaatgtatagcacaacca 194  Q
    ||||||||||||||| ||||| | |||| ||||||   |||||| |||||||| |  ||||||||||||  |||||  || || ||||| |||| |||||    
T  24787617 gatgtgtggagcaagagatagtggtaataaatgagca-aaatggtttccaagcaacaacaacaacaaaaaacagccctagacttatgtagagcaaaacca 24787519  T
Q  195 cacttagagctaacaa-gcatacaagataaaaccatgaaaagaaaagaacaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagcc 278  Q
    |||  |||| |||||| ||| |||||||||   || |||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24787518 cacaaagagataacaaagcaaacaagataag--caagaaaaggaa-gaacaaaacaccaag-aagattgttgacccagttcagcc 24787438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 16)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 44 - 278
Target Start/End: Original strand, 8516886 - 8517120
Alignment:
Q  44 ttgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggc 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8516886 ttgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagagcaaatggc 8516985  T
Q  144 ttccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcacaaccacacttagagctaacaagcatacaagataaaaccatgaaaagaaaa-gaa 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| || ||| ||||| |||    
T  8516986 ttccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtgtagcacaaccacactaagagttaacaagcatacaagataaaacgat-aaacgaaaacgaa 8517084  T
Q  243 caaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagcc 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8517085 caaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagcc 8517120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 45 - 278
Target Start/End: Original strand, 8512007 - 8512240
Alignment:
Q  45 tgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggct 144  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8512007 tgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagagcaaatggct 8512106  T
Q  145 tccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcacaaccacacttagagctaacaagcatacaagataaaaccatgaaaagaaaa-gaac 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||    
T  8512107 tccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtgtagcacaaccacactaagagttaacaagcatacaagataaaacgat-aaacgaaaacgaac 8512205  T
Q  244 aaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagcc 278  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8512206 aaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagcc 8512240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 44 - 278
Target Start/End: Original strand, 10207724 - 10207957
Alignment:
Q  44 ttgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggc 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  10207724 ttgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggc 10207823  T
Q  144 ttccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcacaaccacacttagagctaacaagcat-acaagataaaaccatgaaaagaaaagaa 242  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10207824 ctccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcataacaagat-aaaccatgaaaagaaaagaa 10207922  T
Q  243 caaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagcc 278  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10207923 c-aaacaccaagcaagattgttgacccagttcagcc 10207957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 44 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 2677383 - 2677149
Alignment:
Q  44 ttgttgtgaatccggctcaactaatgaa-ccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatgg 142  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2677383 ttgttgtgaatccggctcaactaatgaaaccttcacaccaatgagaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagagcaaatgg 2677284  T
Q  143 cttccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcacaaccacacttagagctaacaagcat-acaagataaaaccatgaaaagaaaaga 241  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  2677283 cctccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcataacaagat-aaaccatgaaaagaaaaga 2677185  T
Q  242 acaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagcc 278  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2677184 ac-aaacaccaagcaagattgttgacccagttcagcc 2677149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 44 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 2673227 - 2672993
Alignment:
Q  44 ttgttgtgaatccggctcaactaatgaa-ccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatgg 142  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  2673227 ttgttgtgaatccggctcaactaatgaaaccttcacaccaatgagaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagagtaaatgg 2673128  T
Q  143 cttccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcacaaccacacttagagctaacaagcat-acaagataaaaccatgaaaagaaaaga 241  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  2673127 cctccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcataacaagat-aaaccatgaaaagaaaaga 2673029  T
Q  242 acaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagcc 278  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2673028 ac-aaacaccaagcaagattgttgacccagttcagcc 2672993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 45 - 278
Target Start/End: Original strand, 32475276 - 32475508
Alignment:
Q  45 tgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggct 144  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||     
T  32475276 tgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaaagatgtgtggagcaagagatagaggtaatctatgagtgcaaatggcc 32475375  T
Q  145 tccaagctaa-caacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcacaaccacacttagagctaacaagcatacaagataaaaccatgaaaagaaaa-gaa 242  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| |||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||| |||    
T  32475376 tccaaactaatcaacaacaaaacagcctaagcctaatgta-agcaaatccacactaagagctaacaagcatacaagat-aaacgat-aaaagaaaacgaa 32475472  T
Q  243 caaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagcc 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32475473 caaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagcc 32475508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 44 - 278
Target Start/End: Original strand, 32480132 - 32480366
Alignment:
Q  44 ttgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaat-caatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatgg 142  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  32480132 ttgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatccaaagatgtgtggagcaagagatagaggtaatctatgagtgcaaatgg 32480231  T
Q  143 cttccaagctaa-caacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcacaaccacacttagagctaacaagcatacaagataaaaccatgaaaagaaaa-g 240  Q
    | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| |||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||| |    
T  32480232 cctccaaactaatcaacaacaaaacagcctaagcctaatgta-agcaaatccacactaagagctaacaagcatacaagat-aaacgat-aaaagaaaacg 32480328  T
Q  241 aacaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagcc 278  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32480329 aacaaaacaccaaccaagattgttgacccagttcagcc 32480366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 103 - 278
Target Start/End: Original strand, 24967957 - 24968130
Alignment:
Q  103 tgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggcttccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcacaaccacacttaga 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  24967957 tgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcaaaaccacactaaga 24968056  T
Q  203 gctaacaagcatacaagataaaaccatgaaaagaaaa-gaacaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagcc 278  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24968057 gctaacaagcatacaagat-aaacgat-aaaagaaaacgaac-aaacaccgagcaagattgttgacccagttcagcc 24968130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 70 - 224
Target Start/End: Original strand, 18656251 - 18656403
Alignment:
Q  70 aaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggcttccaagctaacaacaacaaaacag- 168  Q
    ||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||     
T  18656251 aaccttcacaccaatgaaaata---caatgatgtgtggagcaagtgatggtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagctaacaacaacaaaacagc 18656347  T
Q  169 cctaagcctaatgtatagcacaaccacacttagagctaac-aagcatacaagataaa 224  Q
    |||||| ||| ||||||| | ||||||||  ||||||||| ||||| ||||||||||    
T  18656348 cctaag-ctagtgtatagaaaaaccacacaaagagctaacaaagcaaacaagataaa 18656403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 73 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 22173458 - 22173336
Alignment:
Q  73 cttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggcttccaagctaacaacaacaaaacagccta 172  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||      
T  22173458 cttcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagccct 22173361  T
Q  173 agcctaatgtatagcacaaccacac 197  Q
    || ||| ||||||||| ||||||||    
T  22173360 agactagtgtatagcaaaaccacac 22173336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 99 - 278
Target Start/End: Original strand, 7167092 - 7167267
Alignment:
Q  99 gatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggcttccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcacaaccacact 198  Q
    ||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||   |||||| |||||||| ||||||||||||||||||  || ||| |||| |||| ||||||||     
T  7167092 gatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgagca-aaatggtttccaagc-aacaacaacaaaacagccctagactagtgtagagcaaaaccacaca 7167189  T
Q  199 tagagctaacaa-gcatacaagataaaaccatgaaaagaaaagaacaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagcc 278  Q
     |||| |||||| ||||| |  | | || || |||| |||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7167190 aagagataacaaagcataaacaagataagcaagaaaggaa--gaacaaaacaccaag-aagattgttgacccagttcagcc 7167267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 95 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 28504108 - 28503995
Alignment:
Q  95 caatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggcttccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcacaacca 194  Q
    ||||||||||||||||||  | ||| ||||||| ||||||  |||||| |||||||| ||||||||||||||||||   | ||| ||||||||| |||||    
T  28504108 caatgatgtgtggagcaaaaggtagtgataatctatgagaa-aaatggtttccaagc-aacaacaacaaaacagcccttgactagtgtatagcaaaacca 28504011  T
Q  195 cacttagagctaacaa 210  Q
    |||  |||| ||||||    
T  28504010 cacaaagagataacaa 28503995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 238 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 2671699 - 2671660
Alignment:
Q  238 aagaacaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagcc 278  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2671699 aagaacaaaacaccaag-aagattgttgacccagttcagcc 2671660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 238 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 8739176 - 8739137
Alignment:
Q  238 aagaacaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagcc 278  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8739176 aagaacaaaacaccaag-aagattgttgacccagttcagcc 8739137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 238 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 9091414 - 9091375
Alignment:
Q  238 aagaacaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagcc 278  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9091414 aagaacaaaacaccaag-aagattgttgacccagttcagcc 9091375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 238 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 40372908 - 40372869
Alignment:
Q  238 aagaacaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagcc 278  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40372908 aagaacaaaacaccaag-aagattgttgacccagttcagcc 40372869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 179; Significance: 1e-96; HSPs: 13)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 44 - 278
Target Start/End: Original strand, 35745182 - 35745414
Alignment:
Q  44 ttgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggc 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  35745182 ttgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggc 35745281  T
Q  144 ttccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcacaaccacacttagagctaacaagcatacaagataaaaccatgaaaagaaaagaac 243  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| || ||| |||||||||    
T  35745282 ctccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcatacaagat-aaacgataaaaggaaaagaac 35745380  T
Q  244 aaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagcc 278  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  35745381 -aaacaccgagcaagattgttgacccagttcagcc 35745414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 44 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 10684559 - 10684326
Alignment:
Q  44 ttgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggc 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  10684559 ttgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaaagatgtgtggagcaagagatagaggtaatctatgagtgcaaatggc 10684460  T
Q  144 ttccaagctaa-caacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcacaaccacacttagagctaacaagcatacaagataaaaccatgaaaagaaaa-ga 241  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| |||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||| ||    
T  10684459 ctccaagctaatcaacaacaaaacagcctaagcctaatgta-agcaaatccacactaagagctaacaagcatacaagat-aaacgat-aaaagaaaacga 10684363  T
Q  242 acaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagcc 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10684362 acaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagcc 10684326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 75 - 278
Target Start/End: Original strand, 6311121 - 6311320
Alignment:
Q  75 tcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggcttccaagctaacaacaacaaaacagcctaag 174  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| |||||  ||    
T  6311121 tcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaacaacaaagcagccctag 6311218  T
Q  175 cctaatgtatagcacaaccacacttagagctaac-aagcatacaagataaaaccatgaaaagaaaagaacaaaacaccaagcaagattgttgacccagtt 273  Q
     ||| ||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||| |  | | || || |||| |  |||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  6311219 actagtgtatagcaaaaccacactaagagataacaaagcataaacaagataagcaagaaagg--aagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagtt 6311315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 70 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 39785091 - 39784884
Alignment:
Q  70 aaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggcttccaagctaacaacaacaaaacag- 168  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  ||||||| || |||||||||||||     
T  39785091 aaccttcacaccaatga-aataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaataacaacaaaacagc 39784993  T
Q  169 cctaagcctaatgtatagcacaaccacacttagagctaacaa---gcatacaagataaaaccatgaaaagaaaagaacaaaacaccaagcaagattgttg 265  Q
    |||||| ||| ||||||||| ||||||||  |||| |  |||    || |||||||  || |   ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39784992 cctaag-ctagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcacaaacaagat--aagcggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttg 39784897  T
Q  266 acccagttcagcc 278  Q
    |||||||||||||    
T  39784896 acccagttcagcc 39784884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 70 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 25328545 - 25328340
Alignment:
Q  70 aaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggcttccaagctaacaacaacaaaac-ag 168  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||||| |     
T  25328545 aaccttcacaacaatga-aataaatcaatgatgtgcggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacaac 25328447  T
Q  169 cctaagcctaatgtatagcacaaccacacttagagctaac-aagcatacaagataaaaccatgaaaagaaaagaacaaaacaccaagcaagattgttgac 267  Q
    |||||  ||| ||||||||| ||||||||  |||| || | || |||| | || | || |   ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  25328446 cctaa--ctagtgtatagcaaaaccacac-aagagataccaaaacataaacgagataaacggtaaaggaaaagaacaaaacaccgag-aagattgttgac 25328351  T
Q  268 ccagttcagcc 278  Q
    |||||||||||    
T  25328350 ccagttcagcc 25328340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 75 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 7290188 - 7290055
Alignment:
Q  75 tcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggcttccaagctaacaacaacaaaacagcctaag 174  Q
    |||||||||||| |||||| || |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| |||||  ||    
T  7290188 tcacaccaatga-aataaa-cattgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaaacaaacaacaacaaagcagccctag 7290091  T
Q  175 cctaatgtatagcacaaccacacttagagctaacaa 210  Q
     ||| ||||||||| ||||||||  |||| ||||||    
T  7290090 actagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaa 7290055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 99 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 33038056 - 33037880
Alignment:
Q  99 gatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggcttccaagctaacaacaacaa--aacagcctaagcctaatgtatagcacaaccaca 196  Q
    ||||||||||||||| ||||| | |||||||||| |  |||||| |||||||| |||||||||||  |||||||  || ||| |||| |||| |||||||    
T  33038056 gatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatga-acaaaatggtttccaagc-aacaacaacaataaacagccctagactagtgtagagcaaaaccaca 33037959  T
Q  197 cttagagctaacaa-gcata-caagataaaaccatgaaaagaaaagaacaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagcc 278  Q
    |  |||| || ||| ||| | ||||||||   || ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33037958 caaagagataccaaagcaaaacaagataag--caagaaaagaa--gaacaaaacaccaag-aagattgttgacccagttcagcc 33037880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 238 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 10689256 - 10689217
Alignment:
Q  238 aagaacaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagcc 278  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10689256 aagaacaaaacaccaag-aagattgttgacccagttcagcc 10689217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 238 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 18853281 - 18853242
Alignment:
Q  238 aagaacaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagcc 278  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18853281 aagaacaaaacaccaag-aagattgttgacccagttcagcc 18853242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 238 - 278
Target Start/End: Original strand, 36979361 - 36979400
Alignment:
Q  238 aagaacaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagcc 278  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36979361 aagaacaaaacaccaag-aagattgttgacccagttcagcc 36979400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 4760325 - 4760149
Alignment:
Q  99 gatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggcttccaagctaacaacaacaaaa-cagcctaagcctaatgtatagcacaaccacac 197  Q
    |||||||||||| || ||||| | |||||||||||   |||||| |||||||| ||||||||||||| |||||  || ||| |||| |||| ||||||||    
T  4760325 gatgtgtggagctagagatagtggtaatcaatgagca-aaatggtttccaagc-aacaacaacaaaaacagccctagactagtgtagagcaaaaccacac 4760228  T
Q  198 ttagagctaacaa-gcatacaagataaaaccatgaaaagaaaagaacaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagcc 278  Q
      |||| |||||| ||||| |  | | || || |||| |||  |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  4760227 aaagagataacaaagcataaacaagataagcaagaaaggaa--gaacaaaacatcaag-aagattgttgacccagttcagcc 4760149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 210
Target Start/End: Original strand, 30655488 - 30655599
Alignment:
Q  99 gatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggcttccaagctaacaacaac--aaaacagcctaagcctaatgtatagcacaaccaca 196  Q
    ||||||||||||||| ||||| | |||||||||| |  |||||| |||||||| |||||||||  |||||||||  || ||| |||| |||| |||||||    
T  30655488 gatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatga-acaaaatggtttccaagc-aacaacaacaaaaaacagccctagactagtgtagagcaaaaccaca 30655585  T
Q  197 cttagagctaacaa 210  Q
    | ||||| ||||||    
T  30655586 catagagataacaa 30655599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 238 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 18870675 - 18870639
Alignment:
Q  238 aagaacaaaacaccaagcaagattgttgacccagttca 275  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18870675 aagaacaaaacaccaag-aagattgttgacccagttca 18870639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 178; Significance: 5e-96; HSPs: 18)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 45 - 278
Target Start/End: Original strand, 2785167 - 2785398
Alignment:
Q  45 tgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggct 144  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||     
T  2785167 tgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcc 2785266  T
Q  145 tccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcacaaccacacttagagctaacaagcatacaagataaaaccatgaaaagaaaagaaca 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| || ||| |||||||||     
T  2785267 tccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcatacaagat-aaacgataaaaggaaaagaac- 2785364  T
Q  245 aaacaccaagcaagattgttgacccagttcagcc 278  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2785365 aaacaccgagcaagattgttgacccagttcagcc 2785398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 44 - 278
Target Start/End: Original strand, 33791107 - 33791339
Alignment:
Q  44 ttgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggc 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  33791107 ttgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacatcaatgagaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggc 33791206  T
Q  144 ttccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcacaaccacacttagagctaacaagcatacaagataaaaccatgaaaagaaaagaac 243  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| |||| || ||| |||||||||    
T  33791207 ctccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcaaaaccacatatagagctaacaagcatacaagat-aaacgataaaaggaaaagaac 33791305  T
Q  244 aaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagcc 278  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  33791306 -aaacaccgagcaagattgttgacccagttcagcc 33791339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 44 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 31402144 - 31401912
Alignment:
Q  44 ttgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggc 143  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  31402144 ttgttgtgaattcggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggc 31402045  T
Q  144 ttccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcacaaccacacttagagctaacaagcatacaagataaaaccatgaaaagaaaa-gaa 242  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||| |||    
T  31402044 ctccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtaaagcaaaaccacactaagagctaacaagcatacaagat-aaacgat-aaaagaaaacgaa 31401947  T
Q  243 caaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagcc 278  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31401946 c-aaacaccgagcaagattgttgacccagttcagcc 31401912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 44 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 31397287 - 31397055
Alignment:
Q  44 ttgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggc 143  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  31397287 ttgttgtgaattcggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggc 31397188  T
Q  144 ttccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcacaaccacacttagagctaacaagcatacaagataaaaccatgaaaagaaaagaac 243  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||| ||     
T  31397187 ctccaagctaacaacaacaaaacatcctaagcctaatgtaaagcaaaaccacactaagagctaacaagcatacaagat-aaacgat-aaaagaaaacaaa 31397090  T
Q  244 aaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagcc 278  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31397089 caaacaccgagcaagattgttgacccagttcagcc 31397055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 43 - 278
Target Start/End: Original strand, 33767969 - 33768202
Alignment:
Q  43 cttgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatgg 142  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||     
T  33767969 cttgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacatcaatgagaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatga 33768068  T
Q  143 cttccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcacaaccacacttagagctaacaagcatacaagataaaaccatgaaaagaaaagaa 242  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||| ||| |||| || ||| ||||||||    
T  33768069 cctccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcaaaaccacatatagagctaacaagcatacaggat-aaacgataaaaggaaaagaa 33768167  T
Q  243 caaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagcc 278  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  33768168 c-aaacaccgagcaagattgttgacccagttcagcc 33768202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 45 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 37561740 - 37561506
Alignment:
Q  45 tgttgtgaatccggctcaactaatgaa-ccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggc 143  Q
    |||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  37561740 tgttgtgaatccggttcaactaatcaaaccttcacaccaatgataataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatctatgagagcaaatggc 37561641  T
Q  144 ttccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcacaaccacacttagagctaacaagcat--acaagataaaaccatgaaaagaaaaga 241  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||  |   ||| | |||||    
T  37561640 ctccaagctaacaacaacaaaacagcctatgacttgtgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcataaacaagataaa--cggtaaatggaaaga 37561543  T
Q  242 acaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagcc 278  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  37561542 acaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagcc 37561506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 44 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 37556919 - 37556684
Alignment:
Q  44 ttgttgtgaatccggctcaactaatgaac-cttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatgg 142  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||  |||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  37556919 ttgttgtgaatccggttcaactaatcaaatcttcacaccaatgataataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatctatgagagcaaatgg 37556820  T
Q  143 cttccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcacaaccacacttagagctaacaagcat--acaagataaaaccatgaaaagaaaag 240  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||  |   ||| | ||||    
T  37556819 cctccaagctaacaacaacaaaacagcctatgacttgtgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcataaacaagataaa--cggtaaatggaaag 37556722  T
Q  241 aacaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagcc 278  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  37556721 aacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagcc 37556684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 45 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 28807868 - 28807634
Alignment:
Q  45 tgttgtgaatccggctcaactaatgaa-ccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggc 143  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  28807868 tgttgtgaatccggttcaactaatgaaaccttcacaccaatga-aataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggc 28807770  T
Q  144 ttccaagctaacaacaacaaaacag-cctaagcctaatgtatagc--acaaccacacttagagctaacaagcat--acaagataaaaccatgaaaagaaa 238  Q
    |||||||| ||||||||| |||||| |||||| ||| ||||||||  | |||||| |  |||||||||||||||  ||||||||||  |   ||||| ||    
T  28807769 ttccaagcaaacaacaac-aaacagccctaag-ctagtgtatagcaaaaaaccactcaaagagctaacaagcataaacaagataaa--cggtaaaaggaa 28807674  T
Q  239 agaacaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagcc 278  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28807673 agaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagcc 28807634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 75 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 1457423 - 1457224
Alignment:
Q  75 tcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggcttccaagctaacaacaacaaaacagcctaag 174  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||| |||||  ||    
T  1457423 tcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaagcagccctag 1457326  T
Q  175 cctaatgtatagcacaaccacacttagagctaac-aagcat--acaagataaaaccatgaaaagaaaagaacaaaacaccaagcaagattgttgacccag 271  Q
     ||| ||||||||| ||||||||  |||| |||| ||||||  ||||||||| |  | |||| |  |||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  1457325 actagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataaga--aagaaagg--aagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccag 1457231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 95 - 278
Target Start/End: Original strand, 43592120 - 43592302
Alignment:
Q  95 caatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggcttccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcacaacca 194  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||| |||||  || ||| ||||||||| |||||    
T  43592120 caatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaagcagccctagactagtgtatagcaaaacca 43592219  T
Q  195 cacttagagctaac-aagcat--acaagataaaaccatgaaaagaaaagaacaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagcc 278  Q
    |||  |||| |||| ||||||  ||||||| ||   || ||| |  |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  43592220 cacaaagagataacaaagcataaacaagat-aagtgataaaagg--aagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagcc 43592302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 70 - 278
Target Start/End: Original strand, 15044507 - 15044709
Alignment:
Q  70 aaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggcttccaagctaacaacaacaaaacagc 169  Q
    ||||||||||||||||| ||||   |||||| |||| ||||||||||||| | |||||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||||||||    
T  15044507 aaccttcacaccaatga-aata---caatgacgtgtagagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaaaccaacaacaacaaaacagc 15044602  T
Q  170 ctaagcctaatgtatagcacaaccacacttagagctaac-aagcatacaagataaaaccatgaaaagaaaagaacaaaacaccaagcaagattgttgacc 268  Q
    |  || ||| ||||||||| ||||||||  |||| |  | ||||||| |  | | || || ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15044603 cctagactagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcataaacaagataagcaagaaaag-gaagaacaaaacaccaag-aagattgttgacc 15044699  T
Q  269 cagttcagcc 278  Q
    ||||||||||    
T  15044700 cagttcagcc 15044709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 75 - 210
Target Start/End: Original strand, 43598547 - 43598680
Alignment:
Q  75 tcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggcttccaagctaacaacaacaaaacagcctaag 174  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| ||| |||  ||||||| |||||||||||| |||||  ||    
T  43598547 tcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaattggtctccaagcaaacaacaacaaagcagccctag 43598644  T
Q  175 cctaatgtatagcacaaccacacttagagctaacaa 210  Q
     ||| ||||||||| ||||||||  |||| ||||||    
T  43598645 actagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaa 43598680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 75 - 210
Target Start/End: Original strand, 43604039 - 43604172
Alignment:
Q  75 tcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggcttccaagctaacaacaacaaaacagcctaag 174  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| ||| |||  ||||||| |||||||||||| |||||  ||    
T  43604039 tcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaattggtctccaagcaaacaacaacaaagcagccctag 43604136  T
Q  175 cctaatgtatagcacaaccacacttagagctaacaa 210  Q
     ||| ||||||||| ||||||||  |||| ||||||    
T  43604137 actagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaa 43604172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 75 - 210
Target Start/End: Original strand, 43609531 - 43609664
Alignment:
Q  75 tcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggcttccaagctaacaacaacaaaacagcctaag 174  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| ||| |||  ||||||| |||||||||||| |||||  ||    
T  43609531 tcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaattggtctccaagcaaacaacaacaaagcagccctag 43609628  T
Q  175 cctaatgtatagcacaaccacacttagagctaacaa 210  Q
     ||| ||||||||| ||||||||  |||| ||||||    
T  43609629 actagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaa 43609664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 75 - 210
Target Start/End: Original strand, 27444793 - 27444926
Alignment:
Q  75 tcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggcttccaagctaacaacaacaaaacagcctaag 174  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||  |||||||  ||||||| |||||||||| | |||||  ||    
T  27444793 tcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagtacaaatggtctccaagcaaacaacaacatagcagccctag 27444890  T
Q  175 cctaatgtatagcacaaccacacttagagctaacaa 210  Q
     ||| ||||||||| ||||||||  |||| ||||||    
T  27444891 actagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaa 27444926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 75 - 278
Target Start/End: Original strand, 27449637 - 27449837
Alignment:
Q  75 tcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggcttccaagctaacaacaacaaaacagcctaag 174  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||  |||||||  ||||||| |||||||||| | |||||  ||    
T  27449637 tcacaccaatga-aataaa-caatgatatgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagtacaaatggtctccaagcaaacaacaacatagcagccctag 27449734  T
Q  175 cctaatgtatagcacaaccacacttagagctaac-aagcat--acaagataaaaccatgaaaagaaaagaacaaaacaccaagcaagattgttgacccag 271  Q
     ||| ||||||||| ||||||||  |||| |||| ||||||  ||||||| ||   || ||| |  |||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  27449735 actagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagat-aagtgataaaagg--aagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccag 27449830  T
Q  272 ttcagcc 278  Q
    |||||||    
T  27449831 ttcagcc 27449837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 95 - 278
Target Start/End: Original strand, 30631249 - 30631429
Alignment:
Q  95 caatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggcttccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcacaacca 194  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||||||  || ||| ||||||||| || ||    
T  30631249 caatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgagaacaaatggttttcaagc-aacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaatca 30631347  T
Q  195 cacttagagctaacaa-gcatacaagataaaaccatgaaaagaaaagaacaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagcc 278  Q
    ||  || || |||||| ||||| |  | | ||  | |||| |||  ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  30631348 catatatagataacaaagcataaacaagataagtaagaaaggaa--gaacaaaacaccaag-aagattgttgactcagttcagcc 30631429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 278
Target Start/End: Original strand, 31180197 - 31180237
Alignment:
Q  237 aaagaacaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagcc 278  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31180197 aaagaacaaaacaccaag-aagattgttgacccagttcagcc 31180237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 177; Significance: 2e-95; HSPs: 13)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 44 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 33330741 - 33330507
Alignment:
Q  44 ttgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggc 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  33330741 ttgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaattagaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggc 33330642  T
Q  144 ttccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagc-acaaccacacttagagctaacaagcat-acaagataaaaccatgaaaagaaaaga 241  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  33330641 ctccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcaaaaaccacactaagagctaacaagcataacaagat-aaaccatgaaaagaaaaga 33330543  T
Q  242 acaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagcc 278  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33330542 ac-aaacaccaagcaagattgttgacccagttcagcc 33330507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 45 - 278
Target Start/End: Original strand, 6005209 - 6005440
Alignment:
Q  45 tgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggct 144  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||     
T  6005209 tgttgtaaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcc 6005308  T
Q  145 tccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcacaaccacacttagagctaacaagcatacaagataaaaccatgaaaagaaaagaaca 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| || ||| |||||||||     
T  6005309 tccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcatacaagat-aaacgataaaaggaaaagaac- 6005406  T
Q  245 aaacaccaagcaagattgttgacccagttcagcc 278  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6005407 aaacaccgagcaagattgttgacccagttcagcc 6005440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 45 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 33336237 - 33336004
Alignment:
Q  45 tgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggct 144  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||     
T  33336237 tgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcc 33336138  T
Q  145 tccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatag-cacaaccacacttagagctaacaagcat-acaagataaaaccatgaaaagaaaagaa 242  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33336137 tccaaactaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagtaaaaaccacactaagagctaacaagcataacaagat-aaaccatgaaaagaaaagaa 33336039  T
Q  243 caaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagcc 278  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33336038 c-aaacaccaagcaagattgttgacccagttcagcc 33336004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 45 - 278
Target Start/End: Original strand, 16838536 - 16838767
Alignment:
Q  45 tgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggct 144  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||     
T  16838536 tgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaaccaatgatatgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcc 16838635  T
Q  145 tccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcacaaccacacttagagctaacaagcatacaagataaaaccatgaaaagaaaa-gaac 243  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||| ||||    
T  16838636 ttcaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcatacaagat-aaacgat-aaaagaaaacgaac 16838733  T
Q  244 aaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagcc 278  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16838734 -aaacaccgagcaagattgttgacccagttcagcc 16838767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 44 - 278
Target Start/End: Original strand, 5343271 - 5343504
Alignment:
Q  44 ttgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggc 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  5343271 ttgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataagtcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggc 5343370  T
Q  144 ttccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagc-acaaccacacttagagctaacaagcatacaagataaaaccatgaaaagaaaa-ga 241  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| || ||| ||||| ||    
T  5343371 ctccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaaagtatagcaaaaaccacactaagagctaacaagcatacaagat-aaacgat-aaaggaaaacga 5343468  T
Q  242 acaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagcc 278  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5343469 ac-aaacaccgagcaagattgttgacccagttcagcc 5343504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 70 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 28155837 - 28155631
Alignment:
Q  70 aaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggcttccaagctaacaacaacaaaacagc 169  Q
    ||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||    
T  28155837 aaccttcacaccaatgc-aataaa-caatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagagcaaatggtcttcaagctaacaacaacaaaacagc 28155740  T
Q  170 ctaagcctaatgtatagcacaaccacacttagagctaacaagcat--acaagataaaaccatgaaaagaaaagaacaaaacaccaagcaagattgttgac 267  Q
    ||| | ||  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||  |   ||| | ||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  28155739 ctatgacttgtgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcataaacaagataaa--cggtaaatggaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgac 28155642  T
Q  268 ccagttcagcc 278  Q
    |||||||||||    
T  28155641 ccagttcagcc 28155631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 44 - 278
Target Start/End: Original strand, 6438293 - 6438524
Alignment:
Q  44 ttgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggc 143  Q
    ||||||||| ||||| || || || |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| | ||||||    
T  6438293 ttgttgtgattccggttctacaaacgaaccttcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaaccaatggc 6438390  T
Q  144 ttccaagctaacaacaacaaaacag-cctaagcctaatgtatagcacaaccacacttagagctaacaagcat--acaagataaaaccatgaaaagaaaag 240  Q
    |||||||| ||||||||| |||||| |||||| ||| ||||||||| ||||||||  |||||||||||||||  ||||||||||  |   ||||| ||||    
T  6438391 ttccaagcaaacaacaac-aaacagccctaag-ctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaa--cggtaaaaggaaag 6438486  T
Q  241 aacaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagcc 278  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  6438487 aacaaaacaccgagcaagattgttgtcccagttcagcc 6438524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 70 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 14737843 - 14737718
Alignment:
Q  70 aaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggcttccaagctaacaacaacaaaacagc 169  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||||||||    
T  14737843 aaccttcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagc 14737746  T
Q  170 ctaagcctaatgtatagcacaaccacac 197  Q
    |  || ||| ||||||||| ||||||||    
T  14737745 cctagactagtgtatagcaaaaccacac 14737718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 44 - 197
Target Start/End: Original strand, 11856764 - 11856915
Alignment:
Q  44 ttgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggc 143  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||     
T  11856764 ttgttgtgaatccggttcaaaaaaaaaaccttcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggt 11856861  T
Q  144 ttccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcacaaccacac 197  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||  || ||| ||||||||| ||||||||    
T  11856862 ctccaagcaaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacac 11856915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 70 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 14742702 - 14742577
Alignment:
Q  70 aaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggcttccaagctaacaacaacaaaacagc 169  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  |||||||  ||||||||||||||||    
T  14742702 aaccttcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagcatacaacaacaaaacagc 14742605  T
Q  170 ctaagcctaatgtatagcacaaccacac 197  Q
    |  || ||| ||||||||| ||||||||    
T  14742604 cctagactagtgtatagcaaaaccacac 14742577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 70 - 197
Target Start/End: Original strand, 28184320 - 28184448
Alignment:
Q  70 aaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagc--aaatggcttccaagctaacaacaacaaaaca 167  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  28184320 aaccttcacaccaatga-aataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaaca 28184418  T
Q  168 gcctaagcctaatgtatagcacaaccacac 197  Q
    |||  || ||| ||||||||| ||||||||    
T  28184419 gccctagactagtgtatagcaaaaccacac 28184448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 73 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 22010960 - 22010838
Alignment:
Q  73 cttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggcttccaagctaacaacaacaaaacagccta 172  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||| | |||      
T  22010960 cttcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaagccgccct 22010863  T
Q  173 agcctaatgtatagcacaaccacac 197  Q
    || | | ||||||||| ||||||||    
T  22010862 agacaagtgtatagcaaaaccacac 22010838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 238 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 22010798 - 22010759
Alignment:
Q  238 aagaacaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagcc 278  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  22010798 aagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagcc 22010759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197 (Bit Score: 176; Significance: 7e-95; HSPs: 2)
Name: scaffold0197
Description:

Target: scaffold0197; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 44 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 19459 - 19227
Alignment:
Q  44 ttgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggc 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  19459 ttgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggc 19360  T
Q  144 ttccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcacaaccacacttagagctaacaagcatacaagataaaaccatgaaaagaaaa-gaa 242  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||| |||    
T  19359 ctccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcatacaagat-aaacgat-aaaagaaaacgaa 19262  T
Q  243 caaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagcc 278  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19261 c-aaacaccgagcaagattgttgacccagttcagcc 19227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 44 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 14604 - 14371
Alignment:
Q  44 ttgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggc 143  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  14604 ttgttgtgaatccggttcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaaagatgtgtggagcaagagatagaggtaatctatgagtgcaaatggc 14505  T
Q  144 ttccaagctaa-caacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcacaaccacacttagagctaacaagcatacaagataaaaccatgaaaagaaaa-ga 241  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| |||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||| ||    
T  14504 ctccaagctaatcaacaacaaaacagcctaagcctaatgta-agcaaatccacactaagagctaacaagcatacaagat-aaacgat-aaaagaaaacga 14408  T
Q  242 acaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagcc 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14407 acaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagcc 14371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 172; Significance: 2e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 44 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 149250 - 149018
Alignment:
Q  44 ttgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggc 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  149250 ttgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggc 149151  T
Q  144 ttccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcacaaccacacttagagctaacaagcatacaagataaaaccatgaaaagaaaa-gaa 242  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| || ||| ||||| |||    
T  149150 ctccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcatacaagat-aaacgat-aaaggaaaacgaa 149053  T
Q  243 caaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagcc 278  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  149052 c-aaacaccgagcaagattgttgacccagttcagcc 149018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0259 (Bit Score: 167; Significance: 2e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0259
Description:

Target: scaffold0259; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 45 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 2544 - 2313
Alignment:
Q  45 tgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggct 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||     
T  2544 tgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgataaagataatccatgagtgcaaatggcc 2445  T
Q  145 tccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcacaaccacacttagagctaacaagcatacaagataaaaccatgaaaagaaaa-gaac 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| || ||| ||||| ||||    
T  2444 tccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcatacaagat-aaacgat-aaaggaaaacgaac 2347  T
Q  244 aaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagcc 278  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2346 -aaacaccgagcaagattgttgacccagttcagcc 2313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 157; Significance: 2e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 44 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 182259 - 182026
Alignment:
Q  44 ttgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggc 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  182259 ttgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaaagatgtgtggagcaagagatagaggtaatctatgagtgcaaatggc 182160  T
Q  144 ttccaagctaa-caacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcacaaccacacttagagctaacaagcatacaagataaaaccatgaaaagaaaa-ga 241  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| |||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||| ||    
T  182159 ctccaagctaatcaacaacaaaacagcctaagcctaatgta-agcaaatccacactaagagctaacaagcatacaagat-aaacgat-aaaagaaaacga 182063  T
Q  242 acaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagcc 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  182062 acaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagcc 182026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 157; Significance: 2e-83; HSPs: 16)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 44 - 278
Target Start/End: Original strand, 16879863 - 16880096
Alignment:
Q  44 ttgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggc 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  16879863 ttgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaaagatgtgtggagcaagagatagaggtaatctatgagtgcaaatggc 16879962  T
Q  144 ttccaagctaa-caacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcacaaccacacttagagctaacaagcatacaagataaaaccatgaaaagaaaa-ga 241  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| |||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||| ||    
T  16879963 ctccaagctaatcaacaacaaaacagcctaagcctaatgta-agcaaatccacactaagagctaacaagcatacaagat-aaacgat-aaaagaaaacga 16880059  T
Q  242 acaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagcc 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16880060 acaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagcc 16880096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 44 - 278
Target Start/End: Original strand, 16884719 - 16884952
Alignment:
Q  44 ttgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggc 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  16884719 ttgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaaagatgtgtggagcaagagatagaggtaatctatgagtgcaaatggc 16884818  T
Q  144 ttccaagctaa-caacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcacaaccacacttagagctaacaagcatacaagataaaaccatgaaaagaaaa-ga 241  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| |||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||| ||    
T  16884819 ctccaagctaatcaacaacaaaacagcctaagcctaatgta-agcaaatccacactaagagctaacaagcatacaagat-aaacgat-aaaagaaaacga 16884915  T
Q  242 acaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagcc 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16884916 acaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagcc 16884952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 44 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 24261618 - 24261385
Alignment:
Q  44 ttgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggc 143  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  24261618 ttgttgtgaatccggttcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaaagatgtgtggagcaagagatagaggtaatctatgagtgcaaatggc 24261519  T
Q  144 ttccaagctaa-caacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcacaaccacacttagagctaacaagcatacaagataaaaccatgaaaagaaaa-ga 241  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| |||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||| ||    
T  24261518 ctccaagctaatcaacaacaaaacagcctaagcctaatgta-agcaaatccacactaagagctaacaagcatacaagat-aaacgat-aaaagaaaacga 24261422  T
Q  242 acaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagcc 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24261421 acaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagcc 24261385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 45 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 24266496 - 24266264
Alignment:
Q  45 tgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggct 144  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||     
T  24266496 tgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaaagatgtgtggagcaagagatagaggtaatctatgagtgcaaatggcc 24266397  T
Q  145 tccaagctaa-caacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcacaaccacacttagagctaacaagcatacaagataaaaccatgaaaagaaaa-gaa 242  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| | || ||| ||||| |||    
T  24266396 tccaagctaatcaacaacaaaacagcctaagcctaatgta-agcaaatccacactaagagctaacaagcatacaagataaa-cgat-aaaggaaaacgaa 24266300  T
Q  243 caaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagcc 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24266299 caaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagcc 24266264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 45 - 278
Target Start/End: Original strand, 19992104 - 19992336
Alignment:
Q  45 tgttgtgaatccggctcaactaatg-aaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggc 143  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  19992104 tgttgtgaatccggttcaactaatggaaccttcacaccaatga-aataaaccaaagatgtgtggagcaggtgatagtgataatcaatgagaacaaatggc 19992202  T
Q  144 ttccaagctaacaacaacaaaacag-cctaagcctaatgtatagcacaaccacacttagagctaacaagcat--acaagataaaaccatgaaaagaaaag 240  Q
    ||||||||| |||||||| |||||| |||||| ||| ||||||||| ||||||||  |||||||||||||||  ||||||||||  |   ||||| ||||    
T  19992203 ttccaagcttacaacaac-aaacagccctaag-ctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaa--cggtaaaaggaaag 19992298  T
Q  241 aacaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagcc 278  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19992299 aacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagcc 19992336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 45 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 21812532 - 21812300
Alignment:
Q  45 tgttgtgaatccggctcaactaatgaa-ccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggc 143  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||    
T  21812532 tgttgtgaatccgattcaactaatgaaaccttcacaccaatga-aataaaccaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgagagcaaatggc 21812434  T
Q  144 ttccaagctaacaacaacaaaacag-cctaagcctaatgtatagcacaaccacacttagagctaacaagcat--acaagataaaaccatgaaaagaaaag 240  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||||||| ||||||||  |||| ||||||||||  ||||||||||  |   ||||||||||    
T  21812433 ttccaagctaacaacaac-aaacagccctaag-ctagtgtatagcaaaaccacacaaagagttaacaagcataaacaagataaa--cggtaaaagaaaag 21812338  T
Q  241 aacaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagcc 278  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21812337 aacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagcc 21812300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 70 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 24024594 - 24024388
Alignment:
Q  70 aaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggcttccaagctaacaacaacaaaacagc 169  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||||||||    
T  24024594 aaccttcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagc 24024497  T
Q  170 ctaagcctaatgtatagcacaaccacacttagagctaacaagcatacaagataaaaccatgaaaagaaaagaac-aaaacaccaagcaagattgttgacc 268  Q
    ||| | ||| | ||||||| ||||||||  |||||||||||||||| |  | | || || ||||||  |||||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  24024496 ctatgactagtatatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaaag-gaagaacaaaaacaccgaacaagattgttgacc 24024398  T
Q  269 cagttcagcc 278  Q
    ||||||||||    
T  24024397 cagttcagcc 24024388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 70 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 31109849 - 31109645
Alignment:
Q  70 aaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggcttccaagctaacaacaacaaaacag- 168  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||||     
T  31109849 aaccttcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtgcagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagc 31109752  T
Q  169 cctaagcctaatgtatagcacaaccacacttagagctaac-aagcat--acaagataaaaccatgaaaagaaaagaacaaaacaccaagcaagattgttg 265  Q
    |||||  ||| ||||||||| ||||||||  |||| |  | ||||||  ||||||||||  || ||||||  |||||||||||||| | |||||||||||    
T  31109751 cctaa--ctagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcataaacaagataaa--caagaaaag-gaagaacaaaacaccgaacaagattgttg 31109658  T
Q  266 acccagttcagcc 278  Q
    |||||||||||||    
T  31109657 acccagttcagcc 31109645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 70 - 197
Target Start/End: Original strand, 12396730 - 12396855
Alignment:
Q  70 aaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggcttccaagctaacaacaacaaaacagc 169  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||| ||||    
T  12396730 aaccttcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaagcagc 12396827  T
Q  170 ctaagcctaatgtatagcacaaccacac 197  Q
    |  || ||| ||||||||| ||||||||    
T  12396828 cctagactagtgtatagcaaaaccacac 12396855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 70 - 278
Target Start/End: Original strand, 12406150 - 12406354
Alignment:
Q  70 aaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggcttccaagctaacaacaacaaaacagc 169  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||| ||||    
T  12406150 aaccttcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaagcagc 12406247  T
Q  170 ctaagcctaatgtatagcacaaccacacttagagctaacaa-gcata-caagataaaaccatgaaaagaaaagaacaaaacaccaagcaagattgttgac 267  Q
    |  || ||| ||||||||| ||||||||  |||| || ||| ||| | ||||||||   |   |||||||| |||||||||||| || ||||||||||||    
T  12406248 cctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcaaaacaagataag--cggtaaaagaaa-gaacaaaacaccgag-aagattgttgac 12406343  T
Q  268 ccagttcagcc 278  Q
    |||||||||||    
T  12406344 ccagttcagcc 12406354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 70 - 168
Target Start/End: Original strand, 4866548 - 4866644
Alignment:
Q  70 aaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggcttccaagctaacaacaacaaaacag 168  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||  |||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  4866548 aaccttcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgaggacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacag 4866644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 99 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 20357797 - 20357621
Alignment:
Q  99 gatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggcttccaagctaacaacaacaaaa-cagcctaagcctaatgtatagcacaaccacac 197  Q
    ||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||  |||||||  ||||||||||||||||||||| |||||  || ||| |||| |||| ||||||||    
T  20357797 gatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgagc-caaatggtctccaagctaacaacaacaaaaacagccctagactagtgtagagcaaaaccacac 20357699  T
Q  198 ttagagctaacaa-gcatacaagataaaaccatgaaaagaaaagaacaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagcc 278  Q
      |||| |||||| ||| |||||||||   || |||||| || |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20357698 aaagagataacaaagcaaacaagataag--caagaaaaggaa-gaacaaaataccaag-aagattgttgacccagttcagcc 20357621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 238 - 278
Target Start/End: Original strand, 2057949 - 2057988
Alignment:
Q  238 aagaacaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagcc 278  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2057949 aagaacaaaacaccaag-aagattgttgacccagttcagcc 2057988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 165
Target Start/End: Original strand, 2057806 - 2057871
Alignment:
Q  99 gatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggcttccaagctaacaacaacaaaa 165  Q
    ||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  2057806 gatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgagt-caaatggtttccaagcaaacaacaacaaaa 2057871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 238 - 278
Target Start/End: Original strand, 4866714 - 4866753
Alignment:
Q  238 aagaacaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagcc 278  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  4866714 aagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagcc 4866753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 238 - 278
Target Start/End: Original strand, 12396895 - 12396934
Alignment:
Q  238 aagaacaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagcc 278  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  12396895 aagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagcc 12396934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 156; Significance: 6e-83; HSPs: 9)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 44 - 278
Target Start/End: Original strand, 19349069 - 19349302
Alignment:
Q  44 ttgttgtgaatccggctcaactaatgaa-ccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatgg 142  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||||||    
T  19349069 ttgttgtgaatccggttcaactaatgaaaccttcacaccaatga-aataaaccaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgagagcaaatgg 19349167  T
Q  143 cttccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcacaaccacacttagagctaacaagcatacaagataaaaccatgaaaagaaaagaa 242  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| || ||| ||||||||    
T  19349168 cctccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcatacaagat-aaacgataaaaggaaaagaa 19349266  T
Q  243 caaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagcc 278  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19349267 caaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagcc 19349302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 45 - 278
Target Start/End: Original strand, 19344212 - 19344444
Alignment:
Q  45 tgttgtgaatccggctcaactaatgaa-ccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggc 143  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||    
T  19344212 tgttgtgaatccggttcaactaatgaaaccttcacaccaatga-aataaaccaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgagagcaaatggc 19344310  T
Q  144 ttccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcacaaccacacttagagctaacaagcatacaagataaaaccatgaaaagaaaagaac 243  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| || ||| |||||||||    
T  19344311 ctccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcatacaagat-aaacgataaaaggaaaagaac 19344409  T
Q  244 aaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagcc 278  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19344410 aaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagcc 19344444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 45 - 197
Target Start/End: Original strand, 32246577 - 32246728
Alignment:
Q  45 tgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggct 144  Q
    |||||||||||||| || || ||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||| |||||||      
T  32246577 tgttgtgaatccggttctacaaagaaaccttcacaccaatga-aataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatctatgagaacaaatggtc 32246675  T
Q  145 tccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcacaaccacac 197  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  || ||| ||||||||| ||||||||    
T  32246676 tccaagctaacaacaacaaaacagtcctagactagtgtatagcaaaaccacac 32246728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 70 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 39812255 - 39812129
Alignment:
Q  70 aaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggcttccaagctaacaacaacaaaacag- 168  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||||     
T  39812255 aaccttcacaccaatga-aataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagc 39812157  T
Q  169 cctaagcctaatgtatagcacaaccacac 197  Q
    |||||| ||| ||||||||| ||||||||    
T  39812156 cctaag-ctagtgtatagcaaaaccacac 39812129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 73 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 44312887 - 44312765
Alignment:
Q  73 cttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggcttccaagctaacaacaacaaaacagccta 172  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||| | |||      
T  44312887 cttcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaagccgccct 44312790  T
Q  173 agcctaatgtatagcacaaccacac 197  Q
    || | | ||||||||| ||||||||    
T  44312789 agacaagtgtatagcaaaaccacac 44312765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 101 - 278
Target Start/End: Original strand, 14291337 - 14291511
Alignment:
Q  101 tgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggcttccaagctaacaacaacaaaa-cagcctaagcctaatgtatagcacaaccacactt 199  Q
    ||||||||||||| ||||| | ||||||||| |   |||||| |||||||| ||||||||||||| |||||  || |||||||| |||| ||||||||      
T  14291337 tgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgggca-aaatggtttccaagcaaacaacaacaaaaacagccctagactaatgtagagcaaaaccacacaa 14291435  T
Q  200 agagctaacaa-gcata-caagataaaaccatgaaaagaaaagaacaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagcc 278  Q
    |||| |||||| ||| | ||||||||   || |||| |||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14291436 agagataacaaagcaaaacaagataag--caagaaaggaa--gaacaaaacaccaag-aagattgttgacccagttcagcc 14291511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 238 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 9296514 - 9296475
Alignment:
Q  238 aagaacaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagcc 278  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9296514 aagaacaaaacaccaag-aagattgttgacccagttcagcc 9296475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 238 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 11099040 - 11099001
Alignment:
Q  238 aagaacaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagcc 278  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11099040 aagaacaaaacaccaag-aagattgttgacccagttcagcc 11099001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 238 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 44312725 - 44312686
Alignment:
Q  238 aagaacaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagcc 278  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  44312725 aagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagcc 44312686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 111; Significance: 4e-56; HSPs: 13)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 45 - 278
Target Start/End: Original strand, 18855519 - 18855750
Alignment:
Q  45 tgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggct 144  Q
    |||||||||||||| || || |  |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  18855519 tgttgtgaatccggttctacaagcgaaccttcacaccaatga-aataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggct 18855617  T
Q  145 tccaagctaacaacaacaaaacag-cctaagcctaatgtatagcacaaccacacttagagctaacaagcat--acaagataaaaccatgaaaagaaaaga 241  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| |||||| ||| ||||||||| ||||||||  |||||||||||||||  ||||||||||  |   ||||| |||||    
T  18855618 tccaagcaaacaacaac-aaacagccctaag-ctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaa--cggtaaaaggaaaga 18855713  T
Q  242 acaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagcc 278  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18855714 acaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagcc 18855750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 45 - 278
Target Start/End: Original strand, 3813816 - 3814047
Alignment:
Q  45 tgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggct 144  Q
    |||||||||||||| || || ||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||      
T  3813816 tgttgtgaatccggttctacaaagaaaccttcacaccaatga-aataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtc 3813914  T
Q  145 tccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagc-acaaccacacttagagctaacaagcatacaagataaaaccatgaaaagaaaagaac 243  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |  || ||| ||||| || | ||||||||  |||||||||||||||| |  | | || || |||| |  ||||||    
T  3813915 tccaagcaaacaacaacaaaacagtcctagactagtgtatcgcaaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaagg--aagaac 3814012  T
Q  244 aaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagcc 278  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3814013 aaaacaccatgcaagattgttgacccagttcagcc 3814047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 44 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 9224699 - 9224548
Alignment:
Q  44 ttgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggc 143  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||     
T  9224699 ttgttgtgaatccggttcaaaaaaaaaaccttcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggt 9224602  T
Q  144 ttccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcacaaccacac 197  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||  || ||| ||||||||| ||||||||    
T  9224601 ctccaagcaaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacac 9224548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 70 - 224
Target Start/End: Original strand, 5732481 - 5732633
Alignment:
Q  70 aaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggcttccaagctaacaacaacaaaacag- 168  Q
    ||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||     
T  5732481 aaccttcacaccaatgaaaata---caatgatgtgtggagcaagtgatggtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagctaacaacaacaaaacagc 5732577  T
Q  169 cctaagcctaatgtatagcacaaccacacttagagctaac-aagcatacaagataaa 224  Q
    |||||| ||| ||||||| | ||||||||  ||||||||| ||||| ||||||||||    
T  5732578 cctaag-ctagtgtatagtaaaaccacacaaagagctaacaaagcaaacaagataaa 5732633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 70 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 9229460 - 9229335
Alignment:
Q  70 aaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggcttccaagctaacaacaacaaaacagc 169  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||||||||    
T  9229460 aaccttcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagc 9229363  T
Q  170 ctaagcctaatgtatagcacaaccacac 197  Q
    |  || ||| ||||||||| ||||||||    
T  9229362 cctagactagtgtatagcaaaaccacac 9229335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 45 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 45348109 - 45347959
Alignment:
Q  45 tgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggct 144  Q
    |||||||||||||| || || ||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||| |||||||      
T  45348109 tgttgtgaatccggttctacaaagaaaccttcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatctatgagaacaaatggtc 45348012  T
Q  145 tccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcacaaccacac 197  Q
    | |||||||||||||||||||||| |  || ||| |||| |||| ||||||||    
T  45348011 ttcaagctaacaacaacaaaacagtcctagactagtgtaaagcaaaaccacac 45347959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 45 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 45357588 - 45357438
Alignment:
Q  45 tgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggct 144  Q
    |||||||||||||| || || ||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||| |||||||      
T  45357588 tgttgtgaatccggttctacaaagaaaccttcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatctatgagaacaaatggtc 45357491  T
Q  145 tccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcacaaccacac 197  Q
    | |||||||||||||||||||||| |  || ||| |||| |||| ||||||||    
T  45357490 ttcaagctaacaacaacaaaacagtcctagactagtgtaaagcaaaaccacac 45357438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 74 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 56146974 - 56146840
Alignment:
Q  74 ttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggcttccaagctaacaacaacaaaacagcctaa 173  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| ||| |||  ||||||| |||||||||||| |||||  |    
T  56146974 ttcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaattggtctccaagcaaacaacaacaaagcagcccta 56146877  T
Q  174 gcctaatgtatagcacaaccacacttagagctaacaa 210  Q
    | ||| ||||||||| ||||||||  |||| ||||||    
T  56146876 gactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaa 56146840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 75 - 194
Target Start/End: Original strand, 51520280 - 51520397
Alignment:
Q  75 tcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggcttccaagctaacaacaacaaaacagcctaag 174  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||| |||||  ||    
T  51520280 tcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaagcagccctag 51520377  T
Q  175 cctaatgtatagcacaacca 194  Q
     ||| ||||||||| |||||    
T  51520378 actagtgtatagcaaaacca 51520397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 238 - 278
Target Start/End: Original strand, 24741924 - 24741963
Alignment:
Q  238 aagaacaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagcc 278  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24741924 aagaacaaaacaccaag-aagattgttgacccagttcagcc 24741963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 238 - 278
Target Start/End: Original strand, 29760625 - 29760664
Alignment:
Q  238 aagaacaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagcc 278  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29760625 aagaacaaaacaccaag-aagattgttgacccagttcagcc 29760664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 231 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 45347925 - 45347879
Alignment:
Q  231 aaaagaaaagaacaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagcc 278  Q
    ||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  45347925 aaaaggaaagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagcc 45347879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 231 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 45357404 - 45357358
Alignment:
Q  231 aaaagaaaagaacaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagcc 278  Q
    ||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  45357404 aaaaggaaagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagcc 45357358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0464 (Bit Score: 108; Significance: 3e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0464
Description:

Target: scaffold0464; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 44 - 278
Target Start/End: Original strand, 154 - 386
Alignment:
Q  44 ttgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggc 143  Q
    ||||||||||||||| || || || |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||    
T  154 ttgttgtgaatccggttctacaaacgaaccttcacaccaatga-aataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatggtgataatcaatgagaacaaatggc 252  T
Q  144 ttccaagctaacaacaacaaaacag-cctaagcctaatgtatagcacaaccacacttagagctaacaagcat--acaagataaaaccatgaaaagaaaag 240  Q
    |||||||| ||||||||| |||||| |||||| ||| ||||||||| ||||||||  |||||||||||||||  ||||||||||  |   ||||| ||||    
T  253 ttccaagcaaacaacaac-aaacagccctaag-ctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaa--cggtaaaaggaaag 348  T
Q  241 aacaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagcc 278  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  349 aacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagcc 386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0355 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0355
Description:

Target: scaffold0355; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 70 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 9907 - 9704
Alignment:
Q  70 aaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggcttccaagctaacaacaacaaaacag- 168  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| | ||||||||||||||||     
T  9907 aaccttcacaccaatga-aataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagagcaaatggtctccaaccaaacaacaacaaaacagc 9809  T
Q  169 cctaagcctaatgtatagcacaaccacacttagagctaacaagcatacaagataaaaccatgaaaagaaaagaacaaaacaccaagcaagattgttgacc 268  Q
    |||||| ||| | ||||||| ||||||||  |||||||||||||||| |  | | || || |||| |  |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  9808 cctaag-ctagtatatagcaaaaccacac-aagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaagg--aagaacaaaacaccgag-aagattgttgacc 9714  T
Q  269 cagttcagcc 278  Q
    ||||||||||    
T  9713 cagttcagcc 9704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0355; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 70 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 148 - 13
Alignment:
Q  70 aaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggcttccaagctaacaacaacaaaacag- 168  Q
    ||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||     
T  148 aaccttcacaccaatta-aataaaccaatgatgtgtggagcaagtgata------atcaatgagagcaaatggtctccaagtaaacaacaacaaaacagc 56  T
Q  169 cctaagcctaatgtatagcacaaccacacttagagctaacaagcata 215  Q
    |||||| ||| ||||||||| ||||||||   |||||||||||||||    
T  55 cctaag-ctagtgtatagcaaaaccacac---gagctaacaagcata 13  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0135 (Bit Score: 64; Significance: 5e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0135
Description:

Target: scaffold0135; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 70 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 35328 - 35203
Alignment:
Q  70 aaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggcttccaagctaacaacaacaaaacagc 169  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||||||||    
T  35328 aaccttcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagc 35231  T
Q  170 ctaagcctaatgtatagcacaaccacac 197  Q
    |  || ||| ||||||||| ||||||||    
T  35230 cctagactagtgtatagcaaaaccacac 35203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0127 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0127
Description:

Target: scaffold0127; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 70 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 34216 - 34136
Alignment:
Q  70 aaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggcttccaagc 151  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  |||||||    
T  34216 aaccttcacaccaatga-aataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagc 34136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0479 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0479
Description:

Target: scaffold0479; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 44 - 134
Target Start/End: Original strand, 13140 - 13229
Alignment:
Q  44 ttgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgaga 134  Q
    ||||||||||||||| || || || |||||||||||||||||| |||||| ||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13140 ttgttgtgaatccggttctacaaacgaaccttcacaccaatga-aataaaccaaagatatgtggagcaagtgatagtgataatcaatgaga 13229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0777 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0777
Description:

Target: scaffold0777; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 44 - 93
Target Start/End: Original strand, 6292 - 6341
Alignment:
Q  44 ttgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaa 93  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6292 ttgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaa 6341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0978 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0978
Description:

Target: scaffold0978; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 237 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 350 - 310
Alignment:
Q  237 aaagaacaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagcc 278  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  350 aaagaacaaaacaccaag-aagattgttgacctagttcagcc 310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University