View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF9736_4 (Length: 497)

Name: NF9736_4
Description: NF9736
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF9736_4
NF9736_4
[»] chr7 (55 HSPs)
chr7 (23-470)||(14956459-14956906)
chr7 (23-470)||(11551020-11551467)
chr7 (23-470)||(12689407-12689854)
chr7 (23-470)||(11235131-11235578)
chr7 (23-470)||(15158975-15159422)
chr7 (23-470)||(8709510-8709957)
chr7 (23-470)||(14334301-14334748)
chr7 (23-470)||(10872595-10873042)
chr7 (23-471)||(15267-15715)
chr7 (31-470)||(44789269-44789708)
chr7 (29-470)||(18179656-18180097)
chr7 (100-470)||(13688023-13688393)
chr7 (29-471)||(15146801-15147244)
chr7 (124-470)||(18588089-18588435)
chr7 (35-467)||(14041612-14042044)
chr7 (35-467)||(14351642-14352074)
chr7 (229-471)||(9590479-9590721)
chr7 (29-470)||(48813170-48813610)
chr7 (29-471)||(15100498-15100940)
chr7 (29-449)||(12204717-12205137)
chr7 (29-449)||(15626436-15626856)
chr7 (30-449)||(14262162-14262580)
chr7 (29-449)||(19149123-19149541)
chr7 (29-449)||(20748522-20748940)
chr7 (29-441)||(16070222-16070632)
chr7 (23-467)||(14139585-14140029)
chr7 (29-471)||(13675364-13675806)
chr7 (29-449)||(16948389-16948809)
chr7 (23-467)||(23503769-23504213)
chr7 (29-471)||(13023269-13023711)
chr7 (29-194)||(11770435-11770600)
chr7 (29-471)||(11386324-11386766)
chr7 (64-471)||(12458587-12458994)
chr7 (64-471)||(13966563-13966970)
chr7 (29-471)||(15342343-15342785)
chr7 (29-471)||(19614587-19615029)
chr7 (23-467)||(18051852-18052296)
chr7 (64-471)||(26116485-26116892)
chr7 (29-471)||(26092693-26093135)
chr7 (29-471)||(49154213-49154655)
chr7 (29-338)||(14284404-14284713)
chr7 (30-470)||(7825812-7826252)
chr7 (30-470)||(27105692-27106132)
chr7 (30-470)||(27172193-27172633)
chr7 (29-471)||(11301108-11301550)
chr7 (23-122)||(14213579-14213678)
chr7 (23-108)||(8200533-8200618)
chr7 (367-470)||(11770320-11770423)
chr7 (411-471)||(16727300-16727360)
chr7 (411-471)||(17704372-17704432)
chr7 (23-76)||(13687969-13688022)
chr7 (340-470)||(4442150-4442280)
chr7 (171-324)||(39210-39363)
chr7 (347-469)||(17925879-17926001)
chr7 (405-470)||(13379170-13379235)
[»] chr2 (44 HSPs)
chr2 (23-470)||(21143490-21143937)
chr2 (23-470)||(24875199-24875646)
chr2 (31-470)||(44384019-44384458)
chr2 (30-470)||(41606834-41607274)
chr2 (23-470)||(24263917-24264364)
chr2 (23-470)||(27372816-27373263)
chr2 (31-470)||(16926915-16927354)
chr2 (31-470)||(17000555-17000994)
chr2 (23-469)||(24711581-24712027)
chr2 (23-470)||(9485763-9486210)
chr2 (31-470)||(10870405-10870844)
chr2 (31-470)||(27219571-27220010)
chr2 (29-470)||(21323715-21324156)
chr2 (23-471)||(24677036-24677484)
chr2 (23-470)||(24705931-24706378)
chr2 (23-437)||(23189466-23189879)
chr2 (100-470)||(9337206-9337576)
chr2 (29-467)||(22734226-22734664)
chr2 (29-470)||(23106177-23106618)
chr2 (29-470)||(23073416-23073857)
chr2 (29-470)||(24818679-24819120)
chr2 (30-449)||(23112290-23112712)
chr2 (29-471)||(19650498-19650940)
chr2 (23-195)||(22323580-22323752)
chr2 (214-471)||(25255657-25255914)
chr2 (23-467)||(27789287-27789731)
chr2 (23-467)||(12575900-12576344)
chr2 (29-471)||(23098466-23098908)
chr2 (40-471)||(23278340-23278771)
chr2 (46-449)||(30209387-30209790)
chr2 (109-471)||(1065384-1065746)
chr2 (29-449)||(30010654-30011074)
chr2 (64-471)||(19717465-19717872)
chr2 (64-471)||(31832246-31832653)
chr2 (40-377)||(24950154-24950491)
chr2 (29-191)||(25264607-25264769)
chr2 (29-289)||(27208802-27209062)
chr2 (40-246)||(23295499-23295705)
chr2 (30-470)||(24829637-24830077)
chr2 (29-149)||(45534493-45534613)
chr2 (372-437)||(23611069-23611134)
chr2 (393-467)||(22280022-22280096)
chr2 (435-471)||(23204273-23204309)
chr2 (406-470)||(25130539-25130603)
[»] scaffold0431 (1 HSPs)
scaffold0431 (23-470)||(9313-9760)
[»] chr6 (60 HSPs)
chr6 (23-470)||(22828409-22828856)
chr6 (31-470)||(25114340-25114779)
chr6 (30-469)||(24293837-24294276)
chr6 (31-470)||(2872857-2873296)
chr6 (23-471)||(19866467-19866915)
chr6 (23-471)||(27563886-27564334)
chr6 (31-470)||(28261251-28261690)
chr6 (31-470)||(28284226-28284665)
chr6 (31-470)||(28340000-28340439)
chr6 (31-470)||(27189224-27189663)
chr6 (31-470)||(27259577-27260016)
chr6 (23-471)||(22435649-22436097)
chr6 (29-471)||(16925692-16926133)
chr6 (29-469)||(16961537-16961977)
chr6 (29-471)||(5837272-5837714)
chr6 (29-455)||(25763297-25763723)
chr6 (32-475)||(22760504-22760947)
chr6 (29-470)||(20633994-20634435)
chr6 (29-467)||(25607918-25608356)
chr6 (23-391)||(22444047-22444415)
chr6 (29-470)||(18405998-18406439)
chr6 (232-470)||(16573879-16574117)
chr6 (232-470)||(16621263-16621501)
chr6 (32-334)||(23080258-23080560)
chr6 (91-470)||(23085825-23086204)
chr6 (29-471)||(25769630-25770072)
chr6 (228-469)||(18183422-18183663)
chr6 (29-446)||(19881084-19881501)
chr6 (29-449)||(14377991-14378411)
chr6 (29-449)||(14379541-14379961)
chr6 (312-471)||(21755002-21755160)
chr6 (40-471)||(19454821-19455251)
chr6 (40-471)||(21473398-21473828)
chr6 (29-470)||(15461122-15461563)
chr6 (27-471)||(10466902-10467346)
chr6 (29-449)||(18796476-18796896)
chr6 (227-470)||(18963142-18963385)
chr6 (29-233)||(18196024-18196228)
chr6 (23-467)||(28280870-28281314)
chr6 (29-471)||(34643639-34644081)
chr6 (117-471)||(19436876-19437230)
chr6 (30-470)||(16380427-16380867)
chr6 (64-471)||(24366233-24366640)
chr6 (316-470)||(30679061-30679215)
chr6 (29-190)||(18965629-18965790)
chr6 (262-471)||(24516461-24516670)
chr6 (30-470)||(16648023-16648463)
chr6 (29-278)||(19487528-19487767)
chr6 (29-469)||(21568046-21568486)
chr6 (30-470)||(23998035-23998475)
chr6 (30-470)||(1646868-1647308)
chr6 (379-470)||(23080559-23080650)
chr6 (346-471)||(8761805-8761930)
chr6 (29-157)||(5295573-5295701)
chr6 (29-442)||(18450289-18450702)
chr6 (347-470)||(14130573-14130696)
chr6 (347-470)||(23025800-23025923)
chr6 (432-470)||(28311819-28311857)
chr6 (435-471)||(23496245-23496281)
chr6 (347-470)||(16100119-16100242)
[»] chr4 (42 HSPs)
chr4 (23-470)||(14682483-14682930)
chr4 (23-470)||(14301628-14302075)
chr4 (23-470)||(40474956-40475403)
chr4 (23-470)||(8051272-8051719)
chr4 (23-470)||(12478516-12478963)
chr4 (23-470)||(19776442-19776889)
chr4 (23-470)||(23957663-23958110)
chr4 (31-470)||(8388336-8388775)
chr4 (23-470)||(27713252-27713699)
chr4 (23-471)||(18225094-18225542)
chr4 (23-471)||(15145541-15145981)
chr4 (99-470)||(16234641-16235012)
chr4 (102-470)||(17092798-17093166)
chr4 (23-385)||(16353241-16353604)
chr4 (29-470)||(14849015-14849456)
chr4 (30-470)||(14696036-14696476)
chr4 (29-471)||(15001273-15001714)
chr4 (40-470)||(14161403-14161833)
chr4 (202-469)||(16218325-16218592)
chr4 (202-469)||(16221645-16221912)
chr4 (29-471)||(15357028-15357470)
chr4 (30-449)||(15072282-15072701)
chr4 (23-200)||(18613743-18613920)
chr4 (23-467)||(51604704-51605148)
chr4 (29-471)||(16149633-16150075)
chr4 (29-471)||(16153779-16154221)
chr4 (29-471)||(8707833-8708271)
chr4 (313-470)||(22631910-22632067)
chr4 (119-449)||(1647207-1647537)
chr4 (238-469)||(23443237-23443467)
chr4 (29-471)||(27902308-27902750)
chr4 (66-471)||(44659774-44660179)
chr4 (100-470)||(15257921-15258290)
chr4 (29-471)||(29451445-29451887)
chr4 (29-471)||(3262702-3263144)
chr4 (29-275)||(15323139-15323385)
chr4 (109-471)||(11205140-11205502)
chr4 (367-471)||(16251498-16251602)
chr4 (23-133)||(1640326-1640436)
chr4 (30-470)||(15291067-15291507)
chr4 (405-475)||(16353174-16353244)
chr4 (23-96)||(29037427-29037500)
[»] chr5 (48 HSPs)
chr5 (23-470)||(22349767-22350214)
chr5 (23-470)||(14997830-14998277)
chr5 (23-467)||(22330981-22331425)
chr5 (23-470)||(37289587-37290034)
chr5 (23-470)||(27612202-27612649)
chr5 (23-470)||(29474164-29474611)
chr5 (23-470)||(41772690-41773137)
chr5 (23-470)||(27520254-27520701)
chr5 (23-470)||(16358350-16358797)
chr5 (23-470)||(22136516-22136963)
chr5 (23-470)||(27683491-27683938)
chr5 (23-470)||(34568342-34568789)
chr5 (23-470)||(19771808-19772255)
chr5 (31-470)||(27666581-27667020)
chr5 (31-470)||(40710636-40711075)
chr5 (23-447)||(20801245-20801669)
chr5 (23-470)||(18780962-18781409)
chr5 (29-470)||(25428287-25428728)
chr5 (29-470)||(26736818-26737259)
chr5 (29-470)||(21337385-21337826)
chr5 (29-467)||(23473081-23473519)
chr5 (29-470)||(20466190-20466631)
chr5 (30-449)||(22234032-22234451)
chr5 (73-471)||(21562115-21562512)
chr5 (23-467)||(17267428-17267872)
chr5 (29-471)||(20823289-20823731)
chr5 (29-471)||(28893032-28893474)
chr5 (29-471)||(28921858-28922300)
chr5 (64-471)||(20344153-20344560)
chr5 (64-471)||(24796487-24796894)
chr5 (29-471)||(25849911-25850353)
chr5 (64-471)||(14885081-14885488)
chr5 (23-471)||(22463781-22464229)
chr5 (29-471)||(22504515-22504957)
chr5 (29-471)||(20777749-20778191)
chr5 (46-471)||(37541471-37541896)
chr5 (30-470)||(21935279-21935719)
chr5 (30-470)||(23507521-23507961)
chr5 (29-449)||(21408991-21409408)
chr5 (29-334)||(28914640-28914945)
chr5 (29-334)||(28929908-28930213)
chr5 (29-302)||(21679037-21679310)
chr5 (30-470)||(24583047-24583487)
chr5 (33-156)||(24618700-24618823)
chr5 (33-156)||(24714931-24715054)
chr5 (33-156)||(24747959-24748082)
chr5 (23-71)||(23442056-23442104)
chr5 (334-449)||(21676946-21677061)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (23-470)||(8885-9332)
[»] chr3 (73 HSPs)
chr3 (23-470)||(15400665-15401112)
chr3 (31-470)||(12888252-12888691)
chr3 (31-470)||(5108759-5109198)
chr3 (29-470)||(10007141-10007582)
chr3 (29-470)||(10907751-10908192)
chr3 (23-470)||(13254225-13254672)
chr3 (23-470)||(20060202-20060649)
chr3 (31-470)||(3687486-3687925)
chr3 (31-470)||(5423078-5423517)
chr3 (31-470)||(15346393-15346832)
chr3 (23-470)||(48426982-48427429)
chr3 (23-470)||(16637308-16637755)
chr3 (29-470)||(6602277-6602718)
chr3 (23-470)||(15587540-15587987)
chr3 (30-471)||(16805094-16805535)
chr3 (31-468)||(53383168-53383605)
chr3 (31-470)||(16754849-16755288)
chr3 (23-471)||(16693699-16694147)
chr3 (23-441)||(14874676-14875094)
chr3 (23-382)||(15723170-15723529)
chr3 (29-467)||(17491391-17491829)
chr3 (23-332)||(12499783-12500092)
chr3 (29-470)||(15261171-15261612)
chr3 (23-295)||(15340804-15341076)
chr3 (291-470)||(15357886-15358065)
chr3 (249-469)||(14579557-14579777)
chr3 (46-471)||(11959305-11959730)
chr3 (29-449)||(15229154-15229574)
chr3 (29-449)||(15235022-15235442)
chr3 (29-471)||(12179889-12180337)
chr3 (333-470)||(24185035-24185172)
chr3 (29-471)||(11950044-11950486)
chr3 (129-449)||(16826439-16826754)
chr3 (29-449)||(17187925-17188345)
chr3 (40-471)||(31693321-31693752)
chr3 (40-471)||(31940465-31940896)
chr3 (29-471)||(12358663-12359105)
chr3 (30-470)||(15013904-15014344)
chr3 (29-475)||(13318634-13319080)
chr3 (23-467)||(16379068-16379512)
chr3 (23-467)||(41179067-41179511)
chr3 (23-467)||(13943569-13944013)
chr3 (23-467)||(44778792-44779236)
chr3 (29-471)||(10418181-10418623)
chr3 (29-471)||(14088224-14088666)
chr3 (64-471)||(47125530-47125937)
chr3 (23-471)||(16834651-16835094)
chr3 (29-467)||(28755869-28756307)
chr3 (285-446)||(11888526-11888687)
chr3 (240-449)||(14291690-14291899)
chr3 (29-449)||(18132504-18132924)
chr3 (379-470)||(15714204-15714295)
chr3 (29-449)||(13970278-13970698)
chr3 (30-470)||(30139358-30139798)
chr3 (30-470)||(30148909-30149349)
chr3 (379-470)||(43164566-43164657)
chr3 (143-397)||(12269875-12270129)
chr3 (30-469)||(8272548-8272987)
chr3 (52-470)||(15948618-15949036)
chr3 (230-471)||(10407720-10407961)
chr3 (30-470)||(13965500-13965941)
chr3 (30-470)||(15611655-15612095)
chr3 (100-275)||(11889623-11889798)
chr3 (204-471)||(12510619-12510886)
chr3 (29-471)||(16327796-16328238)
chr3 (250-471)||(24189076-24189297)
chr3 (370-470)||(18437022-18437122)
chr3 (418-470)||(26791561-26791613)
chr3 (64-238)||(10385257-10385431)
chr3 (262-467)||(8745530-8745735)
chr3 (30-470)||(6151001-6151441)
chr3 (394-464)||(12272254-12272324)
chr3 (406-471)||(17200562-17200627)
[»] chr1 (44 HSPs)
chr1 (23-470)||(21838881-21839328)
chr1 (23-470)||(19108299-19108746)
chr1 (31-470)||(16348576-16349016)
chr1 (23-470)||(21832233-21832680)
chr1 (31-470)||(33389010-33389449)
chr1 (23-458)||(24792609-24793044)
chr1 (23-471)||(21233711-21234159)
chr1 (30-470)||(51331474-51331914)
chr1 (23-471)||(17042995-17043443)
chr1 (23-458)||(22503282-22503717)
chr1 (31-470)||(41351649-41352082)
chr1 (30-471)||(20140021-20140462)
chr1 (29-470)||(430097-430538)
chr1 (29-449)||(50618400-50618820)
chr1 (29-470)||(21750877-21751318)
chr1 (29-471)||(22360224-22360666)
chr1 (32-470)||(21862354-21862792)
chr1 (29-449)||(21743554-21743974)
chr1 (147-470)||(16378150-16378473)
chr1 (29-471)||(19661116-19661558)
chr1 (23-194)||(21026104-21026275)
chr1 (29-475)||(19856242-19856688)
chr1 (23-471)||(20854740-20855188)
chr1 (29-449)||(20833902-20834322)
chr1 (229-473)||(41310694-41310938)
chr1 (64-471)||(20296384-20296791)
chr1 (29-467)||(24097587-24098025)
chr1 (181-302)||(20944119-20944240)
chr1 (29-471)||(20938043-20938485)
chr1 (64-471)||(37679052-37679459)
chr1 (29-471)||(48424841-48425283)
chr1 (29-471)||(52987709-52988151)
chr1 (64-471)||(21952881-21953288)
chr1 (29-471)||(38910806-38911248)
chr1 (30-470)||(20829373-20829813)
chr1 (29-471)||(31537977-31538419)
chr1 (29-195)||(41308610-41308776)
chr1 (29-106)||(16378079-16378156)
chr1 (40-157)||(23196543-23196660)
chr1 (394-470)||(35930806-35930882)
chr1 (405-470)||(20527366-20527431)
chr1 (405-470)||(41215837-41215902)
chr1 (103-191)||(20927065-20927153)
chr1 (328-470)||(20927290-20927432)
[»] scaffold0109 (2 HSPs)
scaffold0109 (23-470)||(40100-40547)
scaffold0109 (23-475)||(14031-14484)
[»] scaffold0079 (4 HSPs)
scaffold0079 (23-471)||(35442-35891)
scaffold0079 (202-385)||(28225-28408)
scaffold0079 (29-471)||(2669-3111)
scaffold0079 (405-475)||(28405-28475)
[»] scaffold0028 (4 HSPs)
scaffold0028 (30-467)||(10428-10865)
scaffold0028 (30-467)||(16890-17327)
scaffold0028 (31-466)||(45106-45541)
scaffold0028 (29-449)||(48447-48867)
[»] chr8 (59 HSPs)
chr8 (31-470)||(17672375-17672814)
chr8 (23-470)||(18858559-18859006)
chr8 (23-470)||(20016615-20017062)
chr8 (23-470)||(22118527-22118974)
chr8 (23-470)||(22127311-22127758)
chr8 (23-471)||(30311495-30311943)
chr8 (23-471)||(15535365-15535813)
chr8 (23-471)||(22041809-22042257)
chr8 (23-471)||(21164889-21165337)
chr8 (23-471)||(22131392-22131840)
chr8 (29-471)||(32602132-32602575)
chr8 (23-471)||(19979949-19980397)
chr8 (31-470)||(19482424-19482855)
chr8 (29-449)||(23652029-23652449)
chr8 (29-470)||(21252932-21253373)
chr8 (29-470)||(21392213-21392654)
chr8 (29-470)||(21782772-21783213)
chr8 (29-470)||(21786707-21787148)
chr8 (23-470)||(22422244-22422691)
chr8 (29-469)||(19864446-19864887)
chr8 (29-469)||(22375806-22376246)
chr8 (29-467)||(22246788-22247226)
chr8 (29-385)||(21920185-21920541)
chr8 (29-471)||(29301777-29302219)
chr8 (32-470)||(23887015-23887457)
chr8 (29-449)||(21927415-21927836)
chr8 (29-248)||(22988718-22988937)
chr8 (29-449)||(20008294-20008714)
chr8 (43-471)||(31414820-31415248)
chr8 (29-467)||(20394488-20394926)
chr8 (32-467)||(23656918-23657353)
chr8 (206-470)||(22522711-22522975)
chr8 (29-440)||(19861423-19861834)
chr8 (23-185)||(19114672-19114834)
chr8 (29-471)||(21323630-21324071)
chr8 (64-471)||(16269575-16269982)
chr8 (23-467)||(31569198-31569641)
chr8 (32-471)||(20390090-20390516)
chr8 (271-468)||(22989275-22989472)
chr8 (318-470)||(21781539-21781691)
chr8 (29-471)||(22052851-22053293)
chr8 (262-449)||(19984401-19984588)
chr8 (64-471)||(4984065-4984472)
chr8 (64-471)||(28982934-28983341)
chr8 (64-471)||(28988153-28988560)
chr8 (64-471)||(27356559-27356966)
chr8 (64-388)||(6605681-6606005)
chr8 (30-470)||(16875447-16875887)
chr8 (346-471)||(22373173-22373298)
chr8 (64-278)||(22372954-22373168)
chr8 (30-470)||(21848689-21849129)
chr8 (408-471)||(22030470-22030533)
chr8 (256-471)||(22061030-22061245)
chr8 (64-305)||(14567165-14567406)
chr8 (30-470)||(20650707-20651147)
chr8 (171-324)||(19869823-19869976)
chr8 (347-470)||(23155394-23155517)
chr8 (405-470)||(16414455-16414520)
chr8 (405-470)||(21194892-21194957)
[»] scaffold0042 (2 HSPs)
scaffold0042 (23-471)||(37731-38179)
scaffold0042 (32-470)||(22661-23099)
[»] scaffold0029 (3 HSPs)
scaffold0029 (29-470)||(107723-108164)
scaffold0029 (29-473)||(114512-114956)
scaffold0029 (231-471)||(94805-95045)
[»] scaffold0080 (6 HSPs)
scaffold0080 (23-471)||(11150-11598)
scaffold0080 (23-467)||(30829-31273)
scaffold0080 (23-467)||(36294-36739)
scaffold0080 (79-470)||(53638-54029)
scaffold0080 (30-245)||(50044-50259)
scaffold0080 (393-471)||(13805-13883)
[»] scaffold0008 (5 HSPs)
scaffold0008 (34-469)||(85709-86144)
scaffold0008 (31-470)||(85142-85581)
scaffold0008 (328-470)||(132401-132543)
scaffold0008 (30-152)||(132719-132841)
scaffold0008 (103-191)||(25853-25941)
[»] scaffold0044 (2 HSPs)
scaffold0044 (31-471)||(16113-16553)
scaffold0044 (31-470)||(2375-2816)
[»] scaffold0017 (3 HSPs)
scaffold0017 (23-471)||(57962-58410)
scaffold0017 (29-425)||(195444-195840)
scaffold0017 (23-473)||(17975-18426)
[»] scaffold0031 (2 HSPs)
scaffold0031 (23-471)||(54902-55350)
scaffold0031 (30-469)||(109584-110023)
[»] scaffold0102 (2 HSPs)
scaffold0102 (59-469)||(51258-51668)
scaffold0102 (29-471)||(41650-42091)
[»] scaffold0081 (2 HSPs)
scaffold0081 (23-467)||(35973-36417)
scaffold0081 (23-467)||(20549-20993)
[»] scaffold0055 (1 HSPs)
scaffold0055 (127-470)||(21296-21639)
[»] scaffold0621 (1 HSPs)
scaffold0621 (29-470)||(3385-3826)
[»] scaffold0022 (5 HSPs)
scaffold0022 (32-470)||(40588-41026)
scaffold0022 (32-470)||(74308-74746)
scaffold0022 (29-449)||(55708-56128)
scaffold0022 (30-191)||(9017-9178)
scaffold0022 (394-470)||(8738-8814)
[»] scaffold0256 (1 HSPs)
scaffold0256 (29-361)||(23095-23427)
[»] scaffold0309 (2 HSPs)
scaffold0309 (29-470)||(16594-17035)
scaffold0309 (29-449)||(11746-12167)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (29-470)||(24857-25298)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (29-470)||(6999-7440)
[»] scaffold0023 (4 HSPs)
scaffold0023 (29-470)||(151063-151504)
scaffold0023 (30-470)||(2417-2857)
scaffold0023 (29-399)||(86722-87091)
scaffold0023 (23-63)||(27725-27765)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (32-470)||(691-1126)
[»] scaffold0647 (2 HSPs)
scaffold0647 (29-470)||(7571-8012)
scaffold0647 (29-470)||(2852-3293)
[»] scaffold0319 (1 HSPs)
scaffold0319 (29-469)||(719-1157)
[»] scaffold0120 (2 HSPs)
scaffold0120 (29-470)||(7973-8414)
scaffold0120 (406-470)||(24506-24570)
[»] scaffold2004 (1 HSPs)
scaffold2004 (29-470)||(725-1162)
[»] scaffold0312 (1 HSPs)
scaffold0312 (29-470)||(12-453)
[»] scaffold0575 (1 HSPs)
scaffold0575 (29-469)||(3534-3974)
[»] scaffold0324 (1 HSPs)
scaffold0324 (29-470)||(13123-13564)
[»] scaffold1602 (1 HSPs)
scaffold1602 (29-448)||(1-420)
[»] scaffold0358 (2 HSPs)
scaffold0358 (29-470)||(8002-8443)
scaffold0358 (29-470)||(17198-17639)
[»] scaffold0228 (1 HSPs)
scaffold0228 (29-470)||(20191-20632)
[»] scaffold0011 (3 HSPs)
scaffold0011 (30-470)||(24445-24885)
scaffold0011 (29-471)||(150522-150964)
scaffold0011 (29-137)||(193949-194057)
[»] scaffold0676 (1 HSPs)
scaffold0676 (23-389)||(7961-8327)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (29-470)||(7174-7615)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (30-470)||(8326-8765)
[»] scaffold1423 (1 HSPs)
scaffold1423 (29-470)||(1294-1735)
[»] scaffold0501 (1 HSPs)
scaffold0501 (23-356)||(4141-4474)
[»] scaffold0282 (1 HSPs)
scaffold0282 (29-467)||(14394-14832)
[»] scaffold0114 (3 HSPs)
scaffold0114 (32-470)||(18253-18691)
scaffold0114 (204-475)||(22002-22273)
scaffold0114 (327-467)||(39307-39447)
[»] scaffold0333 (1 HSPs)
scaffold0333 (29-470)||(17607-18042)
[»] scaffold0010 (4 HSPs)
scaffold0010 (29-458)||(3867-4296)
scaffold0010 (29-471)||(40244-40686)
scaffold0010 (229-467)||(45342-45580)
scaffold0010 (29-156)||(45626-45752)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (29-405)||(30898-31274)
scaffold0026 (29-449)||(50763-51183)
[»] scaffold0215 (3 HSPs)
scaffold0215 (73-418)||(28446-28772)
scaffold0215 (23-179)||(28774-28930)
scaffold0215 (439-471)||(28406-28438)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (29-469)||(103186-103618)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (30-458)||(405-832)
[»] scaffold0018 (3 HSPs)
scaffold0018 (29-470)||(10653-11094)
scaffold0018 (29-470)||(24210-24651)
scaffold0018 (29-357)||(16958-17286)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (36-470)||(494978-495412)
scaffold0001 (29-449)||(453146-453566)
scaffold0001 (29-471)||(515264-515706)
[»] scaffold0040 (2 HSPs)
scaffold0040 (29-470)||(16830-17270)
scaffold0040 (29-95)||(111775-111841)
[»] scaffold0270 (2 HSPs)
scaffold0270 (30-469)||(5825-6264)
scaffold0270 (30-469)||(12955-13394)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (33-361)||(6352-6680)
[»] scaffold0074 (2 HSPs)
scaffold0074 (29-469)||(5065-5504)
scaffold0074 (127-441)||(11172-11486)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (31-449)||(14423-14841)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (29-468)||(15135-15574)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (100-470)||(2623-2993)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (29-467)||(217335-217773)
[»] scaffold1985 (1 HSPs)
scaffold1985 (23-315)||(407-699)
[»] scaffold0181 (1 HSPs)
scaffold0181 (202-469)||(29828-30095)
[»] scaffold0393 (1 HSPs)
scaffold0393 (249-470)||(15906-16128)
[»] scaffold0331 (1 HSPs)
scaffold0331 (29-470)||(15890-16330)
[»] scaffold0083 (3 HSPs)
scaffold0083 (29-458)||(8958-9387)
scaffold0083 (368-458)||(1324-1414)
scaffold0083 (368-458)||(6628-6718)
[»] scaffold0509 (1 HSPs)
scaffold0509 (29-471)||(10781-11223)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (29-471)||(201379-201821)
scaffold0004 (29-441)||(324657-325069)
[»] scaffold0149 (3 HSPs)
scaffold0149 (250-467)||(1-218)
scaffold0149 (40-471)||(5262-5692)
scaffold0149 (40-471)||(9693-10123)
[»] scaffold0379 (1 HSPs)
scaffold0379 (29-467)||(5804-6242)
[»] scaffold0067 (4 HSPs)
scaffold0067 (64-470)||(28610-29016)
scaffold0067 (103-449)||(50113-50459)
scaffold0067 (103-449)||(59147-59493)
scaffold0067 (103-449)||(65535-65881)
[»] scaffold0130 (3 HSPs)
scaffold0130 (29-230)||(44795-44996)
scaffold0130 (29-302)||(8888-9161)
scaffold0130 (316-449)||(4822-4955)
[»] scaffold0865 (1 HSPs)
scaffold0865 (40-471)||(2183-2614)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (40-471)||(29196-29627)
[»] scaffold0523 (1 HSPs)
scaffold0523 (29-471)||(1822-2264)
[»] scaffold0122 (2 HSPs)
scaffold0122 (29-260)||(38070-38301)
scaffold0122 (405-470)||(41417-41482)
[»] scaffold0108 (1 HSPs)
scaffold0108 (39-449)||(49067-49477)
[»] scaffold0244 (1 HSPs)
scaffold0244 (29-449)||(19305-19725)
[»] scaffold0104 (2 HSPs)
scaffold0104 (29-471)||(24167-24609)
scaffold0104 (41-449)||(44350-44758)
[»] scaffold0035 (2 HSPs)
scaffold0035 (29-470)||(4702-5143)
scaffold0035 (31-470)||(42019-42458)
[»] scaffold0266 (2 HSPs)
scaffold0266 (32-449)||(16068-16485)
scaffold0266 (30-475)||(7768-8213)
[»] scaffold0297 (1 HSPs)
scaffold0297 (23-231)||(7844-8052)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (29-449)||(49808-50228)
[»] scaffold0751 (1 HSPs)
scaffold0751 (39-449)||(4139-4552)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (29-471)||(33287-33730)
[»] scaffold0993 (1 HSPs)
scaffold0993 (197-471)||(1-275)
[»] scaffold0476 (2 HSPs)
scaffold0476 (194-424)||(10284-10514)
scaffold0476 (29-425)||(1502-1898)
[»] scaffold0585 (1 HSPs)
scaffold0585 (32-449)||(5022-5439)
[»] scaffold0261 (2 HSPs)
scaffold0261 (29-471)||(13247-13689)
scaffold0261 (29-471)||(21426-21868)
[»] scaffold0304 (1 HSPs)
scaffold0304 (40-449)||(1418-1827)
[»] scaffold0192 (1 HSPs)
scaffold0192 (32-449)||(28481-28898)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (29-469)||(22099-22538)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (29-471)||(250573-251015)
[»] scaffold0560 (2 HSPs)
scaffold0560 (302-467)||(8657-8822)
scaffold0560 (247-306)||(10916-10975)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (32-449)||(176277-176694)
[»] scaffold0298 (1 HSPs)
scaffold0298 (29-471)||(9969-10410)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (29-443)||(2892-3306)
scaffold0034 (29-471)||(69323-69765)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (29-471)||(14153-14601)
scaffold0124 (30-470)||(5718-6160)
[»] scaffold0056 (1 HSPs)
scaffold0056 (23-179)||(3556-3712)
[»] scaffold0404 (1 HSPs)
scaffold0404 (29-416)||(6703-7090)
[»] scaffold1288 (1 HSPs)
scaffold1288 (29-471)||(766-1207)
[»] scaffold0405 (1 HSPs)
scaffold0405 (142-471)||(566-895)
[»] scaffold0053 (2 HSPs)
scaffold0053 (29-449)||(46967-47387)
scaffold0053 (29-449)||(55780-56200)
[»] scaffold0739 (1 HSPs)
scaffold0739 (23-182)||(999-1158)
[»] scaffold0206 (1 HSPs)
scaffold0206 (29-471)||(25066-25508)
[»] scaffold1477 (1 HSPs)
scaffold1477 (30-471)||(181-621)
[»] scaffold0148 (1 HSPs)
scaffold0148 (29-443)||(950-1364)
[»] scaffold0077 (2 HSPs)
scaffold0077 (77-471)||(19545-19939)
scaffold0077 (30-191)||(26457-26618)
[»] scaffold0054 (1 HSPs)
scaffold0054 (30-449)||(64452-64860)
[»] scaffold0445 (1 HSPs)
scaffold0445 (29-331)||(1900-2202)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (29-449)||(31252-31672)
[»] scaffold0139 (1 HSPs)
scaffold0139 (40-471)||(37612-38043)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (29-471)||(268561-269003)
scaffold0007 (31-470)||(84432-84870)
[»] scaffold0076 (4 HSPs)
scaffold0076 (29-471)||(31588-32030)
scaffold0076 (262-471)||(54322-54531)
scaffold0076 (30-470)||(42212-42652)
scaffold0076 (29-248)||(55034-55253)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (29-471)||(99473-99915)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (29-192)||(115171-115334)
scaffold0037 (257-470)||(114950-115163)
[»] scaffold0239 (1 HSPs)
scaffold0239 (73-471)||(10697-11095)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (29-471)||(262177-262619)
[»] scaffold0058 (2 HSPs)
scaffold0058 (29-470)||(27160-27600)
scaffold0058 (106-471)||(21150-21515)
[»] scaffold0420 (2 HSPs)
scaffold0420 (73-471)||(642-1038)
scaffold0420 (319-471)||(7857-8007)
[»] scaffold0046 (1 HSPs)
scaffold0046 (32-471)||(79742-80181)
[»] scaffold0126 (1 HSPs)
scaffold0126 (64-471)||(42905-43311)
[»] scaffold0090 (2 HSPs)
scaffold0090 (29-471)||(20802-21244)
scaffold0090 (29-269)||(24964-25204)
[»] scaffold0222 (2 HSPs)
scaffold0222 (29-471)||(9014-9456)
scaffold0222 (229-471)||(1400-1642)
[»] scaffold0730 (1 HSPs)
scaffold0730 (29-380)||(3-354)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (319-449)||(11201-11331)
[»] scaffold0072 (1 HSPs)
scaffold0072 (29-471)||(52998-53440)
[»] scaffold1373 (1 HSPs)
scaffold1373 (29-469)||(747-1187)
[»] scaffold0225 (1 HSPs)
scaffold0225 (30-470)||(25348-25788)
[»] scaffold0162 (3 HSPs)
scaffold0162 (30-470)||(14862-15302)
scaffold0162 (103-191)||(11365-11453)
scaffold0162 (406-467)||(11089-11150)
[»] scaffold0550 (1 HSPs)
scaffold0550 (352-473)||(11067-11189)
[»] scaffold1830 (1 HSPs)
scaffold1830 (29-254)||(947-1172)
[»] scaffold1715 (1 HSPs)
scaffold1715 (46-471)||(922-1347)
[»] scaffold0235 (2 HSPs)
scaffold0235 (29-471)||(9372-9810)
scaffold0235 (29-471)||(19586-20024)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (64-471)||(28921-29327)
[»] scaffold0170 (1 HSPs)
scaffold0170 (30-470)||(34039-34479)
[»] scaffold0285 (1 HSPs)
scaffold0285 (66-141)||(9215-9290)
[»] scaffold2111 (1 HSPs)
scaffold2111 (228-449)||(520-741)
[»] scaffold0177 (1 HSPs)
scaffold0177 (403-471)||(12267-12335)
[»] scaffold0180 (3 HSPs)
scaffold0180 (27-221)||(33914-34108)
scaffold0180 (40-242)||(380-582)
scaffold0180 (40-242)||(4700-4902)
[»] scaffold0708 (1 HSPs)
scaffold0708 (46-471)||(6056-6481)
[»] scaffold0060 (1 HSPs)
scaffold0060 (29-278)||(44736-44985)
[»] scaffold1646 (1 HSPs)
scaffold1646 (29-269)||(1277-1517)
[»] scaffold0894 (1 HSPs)
scaffold0894 (32-148)||(3882-3998)
[»] scaffold0348 (3 HSPs)
scaffold0348 (262-471)||(18394-18603)
scaffold0348 (29-425)||(9831-10242)
scaffold0348 (393-471)||(5760-5838)
[»] scaffold0089 (2 HSPs)
scaffold0089 (68-305)||(14790-15027)
scaffold0089 (40-242)||(416-618)
[»] scaffold0203 (1 HSPs)
scaffold0203 (103-302)||(12379-12578)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (29-302)||(16229-16502)
[»] scaffold0302 (2 HSPs)
scaffold0302 (30-471)||(165-606)
scaffold0302 (30-471)||(7107-7548)
[»] scaffold0146 (2 HSPs)
scaffold0146 (363-471)||(9865-9973)
scaffold0146 (363-471)||(17532-17640)
[»] scaffold0692 (1 HSPs)
scaffold0692 (340-469)||(1797-1926)
[»] scaffold0234 (1 HSPs)
scaffold0234 (29-122)||(23339-23432)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (29-146)||(195193-195310)
[»] scaffold0387 (1 HSPs)
scaffold0387 (405-469)||(16387-16451)
[»] scaffold0697 (1 HSPs)
scaffold0697 (29-96)||(6939-7006)
[»] scaffold0218 (3 HSPs)
scaffold0218 (400-470)||(26651-26721)
scaffold0218 (405-469)||(1865-1929)
scaffold0218 (32-191)||(2143-2302)
[»] scaffold0467 (2 HSPs)
scaffold0467 (393-470)||(1533-1610)
scaffold0467 (115-191)||(1812-1888)
[»] scaffold1488 (1 HSPs)
scaffold1488 (394-470)||(715-791)
[»] scaffold0876 (2 HSPs)
scaffold0876 (405-469)||(859-923)
scaffold0876 (103-191)||(1137-1225)
[»] scaffold0610 (1 HSPs)
scaffold0610 (403-470)||(4838-4905)
[»] scaffold0369 (1 HSPs)
scaffold0369 (340-467)||(7008-7135)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (32-131)||(36069-36168)
[»] scaffold0465 (1 HSPs)
scaffold0465 (393-470)||(13537-13614)
[»] scaffold0269 (1 HSPs)
scaffold0269 (30-86)||(2218-2274)
[»] scaffold0249 (1 HSPs)
scaffold0249 (29-113)||(242-326)
[»] scaffold0092 (1 HSPs)
scaffold0092 (406-470)||(422-486)
[»] scaffold0827 (1 HSPs)
scaffold0827 (229-324)||(5259-5354)
[»] scaffold0375 (1 HSPs)
scaffold0375 (436-471)||(2838-2873)
[»] scaffold0062 (1 HSPs)
scaffold0062 (46-245)||(8920-9119)
[»] scaffold1208 (1 HSPs)
scaffold1208 (228-302)||(1769-1843)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 408; Significance: 0; HSPs: 55)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 408; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 470
Target Start/End: Original strand, 14956459 - 14956906
Alignment:
Q  23 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 122  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14956459 catcaccagaaataacatggccaagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 14956558  T
Q  123 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 222  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14956559 gacaatcttcagatgctcagcatcttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 14956658  T
Q  223 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14956659 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtct 14956758  T
Q  323 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 422  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14956759 tctgcatattttcatcttttactttaatttggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 14956858  T
Q  423 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14956859 aattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 14956906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 400; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 11551467 - 11551020
Alignment:
Q  23 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 122  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11551467 catcaccagaaataacatggccaagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 11551368  T
Q  123 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 222  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11551367 gacaatcttcagatgctcaacatgttcttcttcagtcttggaataaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaaccgatccaaaaatgcatggaag 11551268  T
Q  223 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  11551267 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctaaaagctgtct 11551168  T
Q  323 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 422  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11551167 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 11551068  T
Q  423 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11551067 aattcttggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 11551020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 392; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 470
Target Start/End: Original strand, 12689407 - 12689854
Alignment:
Q  23 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 122  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12689407 catcaccagaaataacatggccaagaaaactcacttctttcaaccagaactcacacttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 12689506  T
Q  123 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12689507 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaatacaactacgaaccgatccaaaaatgcatggaag 12689606  T
Q  223 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||    
T  12689607 atgcgattcatatactccataaacactctaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctcagagctgtct 12689706  T
Q  323 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 422  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12689707 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 12689806  T
Q  423 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12689807 aattctcggaagtggatacctattcttgatagttactttgttcaactg 12689854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 380; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 11235578 - 11235131
Alignment:
Q  23 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 122  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11235578 catcaccagaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagcttcttctctttcaacacttgcaa 11235479  T
Q  123 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 222  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  11235478 aacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacaaaccgatccaaaaatgcatggaag 11235379  T
Q  223 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  11235378 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgtgttctgaaagctgtct 11235279  T
Q  323 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 422  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11235278 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 11235179  T
Q  423 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11235178 aattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 11235131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 372; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 15159422 - 15158975
Alignment:
Q  23 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 122  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15159422 catcaccagaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagcttcttctctttcaacacttgcaa 15159323  T
Q  123 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 222  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  15159322 aacaatcttcagatgctcagcatgttcttcgtcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacaaaccgatccaaaaatgcatggaag 15159223  T
Q  223 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15159222 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtct 15159123  T
Q  323 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 422  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15159122 tctgcatatcttcatcctttactttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctaaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 15159023  T
Q  423 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15159022 aattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 15158975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 470
Target Start/End: Original strand, 8709510 - 8709957
Alignment:
Q  23 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 122  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8709510 catcaccagaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagcttcttctctttcaacacttgcaa 8709609  T
Q  123 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 222  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |  || |||||||||||||||||||||    
T  8709610 aacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccataaaccgatccaaaaatgcatggaag 8709709  T
Q  223 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8709710 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtct 8709809  T
Q  323 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 422  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8709810 tctgcatatcttcatcctttaccttaatctggtgatatcctgacctcaaatcaatcttgctaaaaacacgtgcacccactagctgatccatcaaatcatc 8709909  T
Q  423 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8709910 aattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 8709957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 470
Target Start/End: Original strand, 14334301 - 14334748
Alignment:
Q  23 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 122  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14334301 catcaccagaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 14334400  T
Q  123 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 222  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  14334401 aacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacaaaccgatccaaaaatgcatggaag 14334500  T
Q  223 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  14334501 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttttgaaagctgtct 14334600  T
Q  323 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 422  Q
    |||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14334601 tctgcatatcctcatcctttaccttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatc 14334700  T
Q  423 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14334701 aattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 14334748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 470
Target Start/End: Original strand, 10872595 - 10873042
Alignment:
Q  23 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 122  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10872595 catcaccagaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttaggataaagtttcttctctttcaacacttgtaa 10872694  T
Q  123 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || || || ||||||| |||||||||||||    
T  10872695 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtagatcaaaatatcgtcgataaacacgaccacaaaccgatccagaaatgcatggaag 10872794  T
Q  223 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10872795 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtct 10872894  T
Q  323 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 422  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10872895 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatc 10872994  T
Q  423 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10872995 aattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 10873042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 15715 - 15267
Alignment:
Q  23 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 122  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15715 catcaccaaaaataacatggccaagaaaacttacttccttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 15616  T
Q  123 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 222  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  15615 gacaatcatcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacgcaactacgaaccgatccaaaaaggcatggaag 15516  T
Q  223 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15515 atgcgattcatatactccataaacactctaggcgcattgtttacaccgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtct 15416  T
Q  323 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 422  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15415 tctgcatatcttcatctttcactttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctgaaaacttttgcacccactaactgatccatcaaatcctc 15316  T
Q  423 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 471  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15315 aattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 15267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 340; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 31 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 44789708 - 44789269
Alignment:
Q  31 gaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatct 130  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44789708 gaaataacatggccaaggaaactcacctctttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagcttcttctctttcaacacttgtaagacaatct 44789609  T
Q  131 tcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgatt 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| ||| || || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44789608 tcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtagatcaaaatatcgtcgataaacataaccacaaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgatt 44789509  T
Q  231 catatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcata 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  44789508 catatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagccgtcttctgcata 44789409  T
Q  331 tcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacg 430  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  44789408 tcttcgtcttttactttaatctggtgacaacctgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcg 44789309  T
Q  431 gaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44789308 gaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 44789269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 29 - 470
Target Start/End: Original strand, 18179656 - 18180097
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttc-ttctctttcaacacttgcaagacaa 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||| |||||||    
T  18179656 cagaaataacatggccaagaaaactcacctctttcaaccagaattcatacttagacaatttggcataaagtgtcnttctctt-caacacttgtaagacaa 18179754  T
Q  128 tcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcg 227  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  18179755 tcttgagatgctcggcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatggtcgataaacacaattacgaaccaatccaaaaatgcatggaagatgcg 18179854  T
Q  228 attcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgc 327  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18179855 attcatatactccataaacactctaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttatattcgtagtggccataacgcgttctgaaagctgtcttctgc 18179954  T
Q  328 atatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattc 427  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18179955 atatcctcatcctttactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattc 18180054  T
Q  428 acggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18180055 tctgaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 18180097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 100 - 470
Target Start/End: Original strand, 13688023 - 13688393
Alignment:
Q  100 ttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |    
T  13688023 ttcttctctttcaacacttgcaaaacaatcttcagatgctcagcatgttcttcgtcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacaa 13688122  T
Q  200 atcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgacc 299  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13688123 accgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagggacc 13688222  T
Q  300 ataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcaccc 399  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  13688223 ataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcctttactttaatctagtgataacctgacctcaaatcaatcttgctaaaaacacgtgcaccc 13688322  T
Q  400 actaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13688323 actaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 13688393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 29 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 15147244 - 15146801
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15147244 cagaaataacatggccaagaaaacttacctctttcaaccagaactcacacttagacaattttgcataaagtttcttctctttcaacacttgcaaaacaat 15147145  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaa-tgcatggaagatgcg 227  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| | ||| ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  15147144 cttcaaatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtagataaaaatatcatcaatgaaaaaaaccacgaaccgatccaaaaaatgcatggaaaatgcg 15147045  T
Q  228 attcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgc 327  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || || ||||| ||| || | ||||| |||||||||    
T  15147044 attcatgtactccataaacacaccaggtgcatttgtaacaccaaaaggcataactttatactcgtaatgtccatatcgcgttttaaaagccgtcttctgc 15146945  T
Q  328 atatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattc 427  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||  || |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15146944 atatcttcatctttcactttaatctggtgataacccgatctcaaatctatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaagtcatcaattc 15146845  T
Q  428 acggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 471  Q
      |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||    
T  15146844 ttggaagtggatacctattcttcatagttactttattcaactga 15146801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 124 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 18588435 - 18588089
Alignment:
Q  124 acaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaaga 223  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||    
T  18588435 acaatcttcaaatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacaaaccgatccaaaaatgcatggaaga 18588336  T
Q  224 tgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtctt 323  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  18588335 tgcaattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttattttcatagtgaccataacgcgttctgaaagttgtctt 18588236  T
Q  324 ctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatca 423  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18588235 ctgcatatcttcatcctttactttaatctggtgatatcctgacctcaaatcaatcttgctaaaaacacgtgcacccactagctgatccatcaaatcatca 18588136  T
Q  424 attcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18588135 attctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 18588089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 35 - 467
Target Start/End: Original strand, 14041612 - 14042044
Alignment:
Q  35 taacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcag 134  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| || || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  14041612 taacatgtccaagaaaactcacctctttcaactagaattcacactttgataatttagcataaagtttattctctttcaacacttgcaaaacaatcttcaa 14041711  T
Q  135 atgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcata 234  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| || ||| |||||||     
T  14041712 atgctcatcatgttcttcctcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcaatgaaaataactacgaaacgatccaaaaatgcatgaaaaatgtgattcatg 14041811  T
Q  235 tactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatctt 334  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||    
T  14041812 tactccataaacacatcaggtgcatttgtaacaccgaaaggcatcactttgtactcataatgtccataacgcgttctaaaagctgtcttctccatatctt 14041911  T
Q  335 catcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaag 434  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||  |||||    
T  14041912 catctttcactttaatctggtgataacccgatctcaagtcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaagttctcaattcttggaag 14042011  T
Q  435 tggatacctattcttgatagttaccttgttcaa 467  Q
    |||| |||||||||| || ||||| ||||||||    
T  14042012 tggacacctattctttatcgttactttgttcaa 14042044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 35 - 467
Target Start/End: Original strand, 14351642 - 14352074
Alignment:
Q  35 taacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcag 134  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| || || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  14351642 taacatgtccaagaaaactcacctctttcaactagaattcacactttgataatttagcataaagtttattctctttcaacacttgcaaaacaatcttcaa 14351741  T
Q  135 atgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcata 234  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| || ||| |||||||     
T  14351742 atgctcatcatgttcttcctcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcaatgaaaataactacgaaacgatccaaaaatgcatgaaaaatgtgattcatg 14351841  T
Q  235 tactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatctt 334  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||    
T  14351842 tactccataaacacatcaggtgcatttgtaacaccgaaaggcatcactttgtactcataatgtccataacgcgttctaaaagctgtcttctccatatctt 14351941  T
Q  335 catcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaag 434  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||  |||||    
T  14351942 catctttcactttaatctggtgataacccgatctcaagtcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaagttctcaattcttggaag 14352041  T
Q  435 tggatacctattcttgatagttaccttgttcaa 467  Q
    |||| |||||||||| || ||||| ||||||||    
T  14352042 tggacacctattctttatcgttactttgttcaa 14352074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 229 - 471
Target Start/End: Original strand, 9590479 - 9590721
Alignment:
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9590479 ttcatatactccataaacactccaagtgcattggtcacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgca 9590578  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  9590579 tatcttcatctttcactttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctgaaaaattttgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattct 9590678  T
Q  429 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 471  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9590679 cagaagtggatacctatacttgatagttaccttgttcaactga 9590721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 29 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 48813610 - 48813170
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||| |||||| |  |||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  48813610 cagaaataacatggccaagaaaactcacctcattcaaccagaattcacactttgacaatt-ggcatataacttcttctccttcagcacttgcaacacaat 48813512  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||| | ||||| || || | |    
T  48813511 cttcaaatgctcagcatgttcttcttcagacttagagtatatcaaaatatcatcaatgaacacaaccacgaagcgatctaaataagcatgaaaaatacaa 48813412  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    ||||| |||||||||||||| |  || ||||| |||||||| |||||||| |||  |||||| || || ||||||||  | || || | |||||||||||    
T  48813411 ttcatgtactccataaacacacttggcgcattagtaacaccgaaaggcatcactgaatattcgtaatgtccataacgtgtcctaaaggttgtcttctgca 48813312  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    |||| || ||||| |||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  48813311 tatcctcgtctttcactttaatttggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctaaacacacgtgcgcccactaactgatccatcaaatcatcaattct 48813212  T
Q  429 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
     ||||||||||||| || ||| || ||||| || ||||||||    
T  48813211 tggaagtggataccaatactttatcgttactttattcaactg 48813170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 29 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 15100940 - 15100498
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    |||||||||  |||||||||||||| || ||  | |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  15100940 cagaaataatgtggccaagaaaacttacttcacttaaccagaactcacattttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaacacttgcaagacgat 15100841  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
    ||||||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||| || ||||| || |||||||| ||||||  |||||   | |||||||| || ||     
T  15100840 cttcagatgttctgcatgctcttcttcagtcttagaataaatcaagatgtcatcaataaacacaaccacgaatttatccaggtaagcatggaaaattcgg 15100741  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| || |||||||  || |||||||| ||  | || || |  ||||||||||    
T  15100740 ttcatatactccataaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttatatttgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggtcgtcttctgca 15100641  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    |||| ||||| || || |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |     
T  15100640 tatcctcatccttcaccttaatctgatggtaacctgacctcaaatcaattttgctgaatacacgagcacccactaactgatccattaagtcatcaatcct 15100541  T
Q  429 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 471  Q
    ||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||    
T  15100540 cggaagtggatacctattctttatcgtaaccttgttcaactga 15100498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 29 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 12205137 - 12204717
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    |||||||||  |||||||||||||| || ||  | ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |  ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  12205137 cagaaataatgtggccaagaaaacttacttcacttaaccagaattcacatttggacaacttggcatacaacttcttttctttcaacacttgcaacacaat 12205038  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
     ||||||||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||| || |||||||| || ||||| || ||  ||  ||||| | | |||||||| || | |    
T  12205037 tttcagatgctctgcatgctcttcttcagtcttaaaataaattaagatatcatcaataaacacgaccacagatttatccagataagcatggaaaattcta 12204938  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| || || || || || || |||||||    
T  12204937 ttcatgtactccataaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttatattcataatgtccatatcgtatcctaaaggccgttttctgca 12204838  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    |||||||||  || || |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  12204837 tatcttcatacttcaccttaatctgatggtaacctgacctcaaatcaattttgctgaacacgcatgcacccactaactgatccattaaatcatcaattct 12204738  T
Q  429 cggaagtggatacctattctt 449  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  12204737 cggaagtggatacctattctt 12204717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 29 - 449
Target Start/End: Original strand, 15626436 - 15626856
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| || ||||| |  ||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  15626436 cagaaataatatggccaaggaaactcacctcattcaaccagaattcacactttgacaacttagcatataacttcttctctttcagcacttgcaaaacaat 15626535  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
    ||||| || |||  ||||||||||||||| |||  |||| || |||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| | ||||| || || ||     
T  15626536 cttcaaatactcgacatgttcttcttcagacttatagtatattaaaatatcatcgatgaacgcaaccacgaagcgatctaaataagcatgaaaaatacgg 15626635  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    ||||| ||||||||||| || || |||||||| |||||||  |||||||| ||   |||||| || || |  |||||  | || ||||| ||||||| |     
T  15626636 ttcatgtactccataaatacacctggtgcattagtaacactgaaaggcatcaccgaatattcgtaatgtctgtaacgtgtcctaaaagccgtcttcttcg 15626735  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||| |  || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  15626736 tatcttcatctttcagtttaatctggtgatagcccgatctcaaatcaatcttgctaaacacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattct 15626835  T
Q  429 cggaagtggatacctattctt 449  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  15626836 tggaagtggatacctattctt 15626856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 30 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 14262580 - 14262162
Alignment:
Q  30 agaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatc 129  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || ||  | ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |  ||||| ||||||||||||||||| | ||||    
T  14262580 agaaataatatggccaagaaaacttacttcacttaaccaaaattcacattttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaacacttgcaacataatc 14262481  T
Q  130 ttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgat 229  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||| | || ||||| || || ||||| || |||||||| || |||  ||||| | | |||||||| || | ||    
T  14262480 ttcagatgctctgcatgctcttcttcagtc-tagaataaattaagatgtcatcaataaacacaaccacaaatttatccagataagcatggaaaattctat 14262382  T
Q  230 tcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcat 329  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||  |  | || || ||  ||||||||||    
T  14262381 tcatatactccataaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttatattcataatgaccatattgtgtcctaaaggccatcttctgcat 14262282  T
Q  330 atcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcac 429  Q
    ||| ||||| || || ||||| || || |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  | |    
T  14262281 atcctcatccttcaccttaatatgatggtaacctgacctcaaatcaatcttgctgaacacacgagcacccactaactgatccattaaatcatcaaacctc 14262182  T
Q  430 ggaagtggatacctattctt 449  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  14262181 ggaagtggatacctattctt 14262162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 29 - 449
Target Start/End: Original strand, 19149123 - 19149541
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| || ||  | ||||||||||||||||| ||||| ||| || | |  ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  19149123 cagaaataatatggccaagaaaacttacttcacttaaccagaattcacatttggacaacttgacacacaacttcttttctttcaacacttgcaacacaat 19149222  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||| || || ||||| || |||||||| || |||  ||||| | | |||||||| || | |    
T  19149223 cttcagatgctctgcatgctcttcatcagtcttagaataaattaagatgtcatcaataaacacaaccacaaatttatccagataagcatggaaaattcaa 19149322  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||||  | || || || ||||||||||    
T  19149323 ttcatatactccataaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttatattcatagtgaccgtaacgtgtcctaaaggccgtcttctgca 19149422  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
     ||| ||||| || || |||||||   | |||| |||||||||||||||||| || || | |||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||     
T  19149423 -atcctcatccttcaccttaatct-taggtaacctgacctcaaatcaattttactaaacatacgtgcacccactaaccgatccattaaatcgtcaattct 19149520  T
Q  429 cggaagtggatacctattctt 449  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  19149521 tggaagtggatacctattctt 19149541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 29 - 449
Target Start/End: Original strand, 20748522 - 20748940
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| || ||  | ||||||||||||||||| ||||| ||| || | |  ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  20748522 cagaaataatatggccaagaaaacttacttcacttaaccagaattcacatttggacaacttgacacacaacttcttttctttcaacacttgcaacacaat 20748621  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||| || || ||||| || |||||||| || |||  ||||| | | |||||||| || |      
T  20748622 cttcagatgctctgcatgctcttcatcagtcttagaataaattaagatgtcatcaataaacacaaccacaaatttatccagataagcatggaaaattctg 20748721  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||||  | || || || ||||||||||    
T  20748722 ttcatatactccataaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttatattcatagtgaccgtaacgtgtcctaaaggccgtcttctgca 20748821  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
     ||| ||||| || || |||||||   | |||| |||||||||||||||||| || || | |||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||     
T  20748822 -atcctcatccttcaccttaatct-taggtaacctgacctcaaatcaattttactaaacatacgtgcacccactaaccgatccattaaatcgtcaattct 20748919  T
Q  429 cggaagtggatacctattctt 449  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  20748920 tggaagtggatacctattctt 20748940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 29 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 16070632 - 16070222
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    ||||||||| ||| || |||||||| || ||  | |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |  ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  16070632 cagaaataatatgacccagaaaacttacttcacttaaccagaactcacatttggacaacttggcatacaacttcttttctttcaacacttgcaatacaat 16070533  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
    |||||||| ||| ||||| |||||||||||||| || ||||| | ||||||||| || |||||||| || |||  ||||| | |  ||||||| || |      
T  16070532 cttcagatactctgcatgctcttcttcagtcttagaataaatgagaatatcatcaataaacacaaccacaaatttatccagatagacatggaaaattctg 16070433  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| ||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| ||  | || || || ||||||||||    
T  16070432 ttcatatactccataaacact--aggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttatattcataatgtccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgca 16070335  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    |||| ||||| || || |||||||| || |||| |||||||||||||||||| || |  ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||     
T  16070334 tatcctcatccttcaccttaatctgatggtaacctgacctcaaatcaattttactaagcacacgagcacccactaactggtccatcaagtcatcaattct 16070235  T
Q  429 cggaagtggatac 441  Q
    |||||||||||||    
T  16070234 cggaagtggatac 16070222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 23 - 467
Target Start/End: Original strand, 14139585 - 14140029
Alignment:
Q  23 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 122  Q
    ||||| ||||||||| ||| ||||| ||||| || ||  | | ||| || |||||||| |||||||||||||| |  ||||| |||||||| ||||||||    
T  14139585 catcaccagaaataatatgaccaaggaaacttacttcacttagccaaaactcacattttgacaatttggcatacaacttcttttctttcaatacttgcaa 14139684  T
Q  123 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 222  Q
     |||||  ||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| || || || || ||||||  ||||| ||| ||||| ||     
T  14139685 cacaattctcagatgttctgcatgctcttcttcagtcttagaataaatcaaaatatcatcaataaataccaccacgaatttatccagaaaagcatgaaaa 14139784  T
Q  223 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 322  Q
    || ||||||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||| || ||  | || || || ||||    
T  14139785 attcgattcatatactccatgaacacaccaggcgcgttagtaacaccgaaaggcatcactttgtattcgtaatgaccgtatcgtgtcctaaaggccgtct 14139884  T
Q  323 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 422  Q
    |||||||||||||||| || || ||||| || || |||| ||||||||| ||||| || || |||||   ||||||||| | ||| |||||||| |||||    
T  14139885 tctgcatatcttcatccttcaccttaatttgatggtaacctgacctcaagtcaatattactaaaaacctttgcacccaccagctggtccatcaagtcatc 14139984  T
Q  423 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaa 467  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||| || || || ||||||||    
T  14139985 aatcctcggaagtggatacctattcttaattgtaactttgttcaa 14140029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 29 - 471
Target Start/End: Original strand, 13675364 - 13675806
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    |||||||||  ||||||||| ||||||| ||  | |||||||| ||||| || ||||| || ||||| |  || ||||| ||||| |||||||| |||||    
T  13675364 cagaaataatgtggccaagataactcacttcacttaaccagaactcacacttcgacaacttagcatacaactttttctcattcaatacttgcaatacaat 13675463  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||| ||| ||||| || || ||||| || |||  |||||   | |||||||| || ||     
T  13675464 cttcagatgctctgcatgctcttcttcagtctttgaataaatcagaatgtcatcaataaatacaaccacaaatttatccaggtaagcatggaaaattcgg 13675563  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| || || ||||| || || ||||| ||  | || || || ||||||| ||    
T  13675564 ttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttgtattcgtaatgtccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctcca 13675663  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    |||| ||||| || || |||||||| || |||| ||||||||| ||||| ||| |||||||   ||||||||||||||||||||| |  |||||||| |     
T  13675664 tatcctcatccttcaccttaatctgatggtaacctgacctcaagtcaatcttgttgaaaacctttgcacccactaactgatccattatgtcatcaatcct 13675763  T
Q  429 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 471  Q
    ||||||||||||||| ||||| || || || ||||||||||||    
T  13675764 cggaagtggatacctgttctttattgtaactttgttcaactga 13675806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 29 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 16948809 - 16948389
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    |||||||||  ||||| ||||||||||| ||  | ||||| || ||||| || ||||  || ||||| |  ||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  16948809 cagaaataatgtggcccagaaaactcacttcacttaaccaaaactcacactttgacagcttagcatacaacttcttttctttcaagacttgcaacacaat 16948710  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
    |||||||||||| || || || |||||  | || || ||||||| ||||||||| || |||||||| || |||  ||||| ||| |||||||| || ||     
T  16948709 cttcagatgctctgcgtgctcctcttcgattttagaataaatcagaatatcatcaataaacacaaccacaaatttatccagaaaagcatggaaaattcgg 16948610  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| || || ||||| || || ||||| ||  | || || || ||||||||||    
T  16948609 ttcatatactccataaacacgccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttttattcgtaatgtccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgca 16948510  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    |||| ||||| || || ||||| || || |||| ||||||||| ||||| |||||||| ||   ||||||||||||||||||||| || ||||||||||     
T  16948509 tatcctcatccttcaccttaatttgatggtaacctgacctcaagtcaatcttgctgaacacctttgcacccactaactgatccattaagtcatcaattct 16948410  T
Q  429 cggaagtggatacctattctt 449  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  16948409 cgggagtggatacctattctt 16948389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 23 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 23504213 - 23503769
Alignment:
Q  23 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 122  Q
    ||||| ||||||||| ||| ||||| |||||||| ||  | | ||| || |||||||| |||| ||||||||| |  ||| | |||||||| ||||||||    
T  23504213 catcaccagaaataatatgaccaaggaaactcacttcacttagccaaaactcacatttcgacagtttggcatacaacttcctttctttcaaaacttgcaa 23504114  T
Q  123 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 222  Q
     |||||  ||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||||| ||||||||| || || || || ||||||  ||||| ||| ||||| ||     
T  23504113 cacaattctcagatgttctgcatgctcttcttcagtcttcgaataaatcagaatatcatcaataaataccaccacgaatttatccagaaaagcatgaaaa 23504014  T
Q  223 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 322  Q
    || ||||||||||||||||| ||||| || || || || |||||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||| || ||  | || || || ||||    
T  23504013 attcgattcatatactccatgaacacaccgggcgcgttagtaacaccgaaaggcatcactttgtattcgtaatgaccgtatcgtgtcctaaaggccgtct 23503914  T
Q  323 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 422  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||| || || |||| ||||||||| ||||| || ||||| ||   ||||||||||| ||| |||||||| |||||    
T  23503913 tctgcatatcttcatctttcaccttaatttgatggtaacctgacctcaagtcaatcttactgaacacctttgcacccactagctggtccatcaagtcatc 23503814  T
Q  423 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaa 467  Q
    ||| | |||||| ||||| |||||||| || || || ||||||||    
T  23503813 aatcctcggaagcggatatctattcttaattgtaactttgttcaa 23503769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 29 - 471
Target Start/End: Original strand, 13023269 - 13023711
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    |||||||||  || || ||||||||||| ||  | ||||| || |||||||| ||||| |||||||| |  ||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  13023269 cagaaataatgtgacccagaaaactcacttcacttaaccacaactcacattttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaaaacttgcaatacaat 13023368  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
      ||||||| || ||||| || ||||||||||| || ||||||||| ||||||| || ||||| || || |||  ||||| ||| |||||||| || ||     
T  13023369 tctcagatgttctgcatgctcctcttcagtcttagaataaatcaaattatcatcaataaacaccaccacaaatttatccagaaaagcatggaaaattcgg 13023468  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    |||||||| | |||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| ||  | || || || ||||||||||    
T  13023469 ttcatataatacataaaaacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttgtattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgca 13023568  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    |||| ||||| || || || ||||| || ||||  |||||||| ||||| ||||| || ||    |||||||| || ||||||||||||||||||||||     
T  13023569 tatcctcatcattcacctttatctgatggtaaccagacctcaagtcaatcttgctaaacaccttcgcacccaccaattgatccatcaaatcatcaattct 13023668  T
Q  429 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 471  Q
    |||||||||||| |||||||| || || || ||||||||||||    
T  13023669 cggaagtggatatctattctttatcgtaactttgttcaactga 13023711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 29 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 11770600 - 11770435
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11770600 cagaaataacatggccaagaaaacttacctctttcaaccagaattcacacttagacaatttaacatataacttcttctctttcaacacttgcaaaacaat 11770501  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaac 194  Q
    ||||| |||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11770500 cttcaaatgctcagcatgttctccctcagacttggagtatatcaaaatatcatcgatgaacacaac 11770435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 29 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 11386766 - 11386324
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    |||||||||  ||||| ||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| ||||| || ||||| |  || ||||||||||  || || || |||||    
T  11386766 cagaaataatgtggccgagaaaactcacttcacttaaccagaattcacatttcgacaacttagcatacaactttttctctttcagaacctgtaatacaat 11386667  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
    | |||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| || ||||||| ||||| ||| ||||| || || |      
T  11386666 cctcagatgctcggcatgctcttcttcagtcttagaataaattaaaatatcatcaataaacaccaccacgaatctatccagaaaagcatgaaaaattctg 11386567  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    ||| ||||||||||||| || || || ||||| |||||||| |||||||| || || ||||| || |||||| ||||  | || ||  | ||||||||||    
T  11386566 ttcttatactccataaatacacctggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttgtattcgtaatgaccacaacgtgtcctaaagtccgtcttctgca 11386467  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    |||||||||| || || || ||||| || |||| ||||||||| ||||| || || ||||    |||||| || |||||||||||||| || ||||| |     
T  11386466 tatcttcatccttcacctttatctgatggtaacctgacctcaagtcaatcttactaaaaatctttgcaccaaccaactgatccatcaagtcgtcaatcct 11386367  T
Q  429 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 471  Q
    |||||| |||||||| ||||| || || || ||||||||||||    
T  11386366 cggaagcggatacctgttctttatcgtaactttgttcaactga 11386324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 64 - 471
Target Start/End: Original strand, 12458587 - 12458994
Alignment:
Q  64 aaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttgg 163  Q
    |||||||| |||||||| ||||| || ||||| |  ||||| |||||||| |||||||| |||||  |||||||||| ||||| || |||||| ||||||    
T  12458587 aaccagaactcacattttgacaactttgcatacaacttcttttctttcaaaacttgcaatacaattctcagatgctctgcatgctcctcttcattcttgg 12458686  T
Q  164 agtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggt 263  Q
    | || || ||||||||||| || |||||||| |||||   ||||| ||| |||||||||||    |||| ||||||||| ||||| ||||| || || ||    
T  12458687 aatagattaaaatatcatcaataaacacaacaacgaaattatccagaaaagcatggaagattatgttcaaatactccatgaacacaccaggcgcgttagt 12458786  T
Q  264 aacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataactt 363  Q
    |||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||  |||| || || |||||||||||||| |||||||| || || ||||| || ||||      
T  12458787 aacaccgaaaggcatcactttgtattcgtaatgaccatatcgtgttctaaaggccgtcttctgcatatcctcatctttcacctttatctgatggtaacca 12458886  T
Q  364 gacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgt 463  Q
    ||||||||||| || || ||||| ||    ||||| |||||||||||||| |  |||||||| | |||||| |||||||| ||||| || || || ||||    
T  12458887 gacctcaaatcgatcttactgaacactttcgcacctactaactgatccattaggtcatcaatcctcggaagcggatacctgttctttattgtaactttgt 12458986  T
Q  464 tcaactga 471  Q
    ||||||||    
T  12458987 tcaactga 12458994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 64 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 13966970 - 13966563
Alignment:
Q  64 aaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttgg 163  Q
    |||||||| |||||||| ||||| || ||||| |   ||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||| || |||||| ||||||    
T  13966970 aaccagaactcacattttgacaacttagcatacaacctcttctctttcaaaacttgcaagacaattctcagatgctctgcatgctcctcttcattcttgg 13966871  T
Q  164 agtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggt 263  Q
    | ||||| || |||||||| || ||||| || || ||   ||||| ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||    
T  13966870 aataaattaagatatcatcaataaacaccacaacaaacttatccagaaaagcatggaagattcggttcatgtactccataaacacaccaggcgcgttagt 13966771  T
Q  264 aacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataactt 363  Q
    |||||| |||||||| ||||| || || || |||||||||||  | || || |  |||||||||||||| ||||| || || |||||||| || ||||      
T  13966770 aacaccgaaaggcatcactttgtactcgtaatgaccataacgtgtcctaaaggtcgtcttctgcatatcctcatccttcaccttaatctgatggtaacca 13966671  T
Q  364 gacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgt 463  Q
    || ||||||||||| || || ||||     ||||| || |||||||||||||| || |||||||  ||||| |||||||| ||||| || || || ||||    
T  13966670 gatctcaaatcaatcttactaaaaattttagcaccaaccaactgatccatcaagtcgtcaattctaggaagcggatacctgttctttatcgtgactttgt 13966571  T
Q  464 tcaactga 471  Q
    ||||||||    
T  13966570 tcaactga 13966563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 29 - 471
Target Start/End: Original strand, 15342343 - 15342785
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| ||||| || ||||| |  || ||||||||||  |||||||| |||||    
T  15342343 cagaaataatgtggccaagaaaactcacttcacttaaccagaattcacatttcgacaacttagcatacaactttttctctttcagtacttgcaatacaat 15342442  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
    | ||||||| || ||||| || |||| |||||| || ||||| |  ||||| || ||||| ||||| || ||   ||||| |||  ||||||| || |      
T  15342443 cctcagatgttctgcatgctcctctttagtcttagaataaattaggatatcgtcaatgaatacaaccacaaacttatccagaaagacatggaaaattcag 15342542  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||||||  | || || || ||||||||||    
T  15342543 ttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttgtattcgtaatgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgca 15342642  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    |||||||||| || || ||||| || || ||||  |||||||| ||||| || |||||||    |||||| || |||||||||||||| |||| ||| |     
T  15342643 tatcttcatccttcaccttaatttgatggtaaccagacctcaagtcaatcttactgaaaatctttgcaccaaccaactgatccatcaagtcataaatcct 15342742  T
Q  429 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 471  Q
    || ||| |||||||| ||||| || || || ||||||||||||    
T  15342743 cgaaagcggatacctgttctttattgtaactttgttcaactga 15342785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 29 - 471
Target Start/End: Original strand, 19614587 - 19615029
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||  | ||||| || || || || |||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  19614587 cagaaataatatggccaagaaaactcacttcacttaaccaaaactcgcactttgacaatttggcatacaacttcttctctttcaatacttgcaatacaat 19614686  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
    | ||||||| || ||||| ||||| |||||  | || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || |||  |||||   | ||||| || || |      
T  19614687 cctcagatgttctgcatgctcttcctcagttctcgaatagatcaaaatgtcatcaatgaatacaaccacaaatttatccaggtaagcatgaaaaattctg 19614786  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||| ||  | || || || ||||||||||    
T  19614787 ttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggcagtcttctgca 19614886  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    | || |||||||| || || ||||| || |||| ||||||||| |||||||| || ||||    |||||| || |||||||||||||  || |||||||     
T  19614887 tgtcctcatctttcaccttgatctgatggtaacctgacctcaagtcaattttactaaaaatctttgcaccaaccaactgatccatcaggtcgtcaattct 19614986  T
Q  429 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 471  Q
    |||||| ||||| || ||||| || || || || |||||||||    
T  19614987 cggaagcggatatctgttctttatcgtaactttattcaactga 19615029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 23 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 18052296 - 18051852
Alignment:
Q  23 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 122  Q
    ||||| ||||||||| ||| ||||| |||||||| ||  | | ||| || |||||||| |||| ||||||||| |  ||| | |||||||| ||||||||    
T  18052296 catcaccagaaataatatgaccaaggaaactcacttcacttagccaaaactcacatttcgacagtttggcatacaacttcctttctttcaaaacttgcaa 18052197  T
Q  123 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 222  Q
     |||||  ||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||||| ||| ||||| || || || || ||||||  ||||| ||| ||||| ||     
T  18052196 cacaattctcagatgttctgcatgctcttcttcagtcttcgaataaatcagaatgtcatcaataaataccaccacgaatttatccagaaaagcatgaaaa 18052097  T
Q  223 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 322  Q
    || ||||||||||||||||| || || || || || || |||||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||| || ||  | || || || ||||    
T  18052096 attcgattcatatactccatgaatacaccgggcgcgttagtaacaccgaaaggcatcactttgtattcgtaatgaccgtatcgtgtcctaaaggccgtct 18051997  T
Q  323 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 422  Q
    |||||||||| ||||| || || ||||| || || |||| ||||||||| ||||| || ||||| ||   ||||||||||| ||| |||||||| |||||    
T  18051996 tctgcatatcctcatccttcaccttaatttgatggtaacctgacctcaagtcaatcttactgaacacctttgcacccactagctggtccatcaagtcatc 18051897  T
Q  423 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaa 467  Q
    ||| | |||||| ||||| |||||||| || || || ||||||||    
T  18051896 aatcctcggaagcggatatctattcttaattgtaactttgttcaa 18051852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 64 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 26116892 - 26116485
Alignment:
Q  64 aaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttgg 163  Q
    |||||||| |||||||| ||||| || ||||| |   |||| || |||||||||||||| |||||  |||||||||| ||||| || || ||| ||||||    
T  26116892 aaccagaactcacatttcgacaactttgcatacaacctcttttccttcaacacttgcaacacaattctcagatgctctgcatgctcctcctcattcttgg 26116793  T
Q  164 agtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggt 263  Q
    | || || |||||||| || || ||||| || |  ||   ||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||| || || ||    
T  26116792 aatagattaaaatatcgtcaataaacaccacaagaaacttatccagaaaagcatggaagattcgattcatgtactccataaaaacaccaggcgcgttagt 26116693  T
Q  264 aacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataactt 363  Q
    |||||| |||||||| ||||| || || || ||||||||| |  | || || || |||||||||||||||||||| || || || ||||| |||||||      
T  26116692 aacaccgaaaggcatcactttgtactcgtaatgaccataatgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcttcatccttcacctttatctgatgataacca 26116593  T
Q  364 gacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgt 463  Q
    |||||||||||||| || |||||||     ||||| || |||||||||||||| || |||||||  ||||| |||||||| |||||||| || || ||||    
T  26116592 gacctcaaatcaatcttactgaaaatcttagcaccaaccaactgatccatcaagtcgtcaattctaggaagcggatacctgttcttgatcgtaactttgt 26116493  T
Q  464 tcaactga 471  Q
    ||||||||    
T  26116492 tcaactga 26116485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 29 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 26093135 - 26092693
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    |||||||||  || || |||||||| || || || |||||||| |||||||| || || || ||||| |   |||| || |||||||||||||| |||||    
T  26093135 cagaaataatgtgacccagaaaacttacttcatttaaccagaactcacattttgataacttagcatacaacctcttttccttcaacacttgcaatacaat 26093036  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
      |||||||||| ||||| || || ||| ||||||| || || ||||||||||| || ||||| || || ||   ||||| ||| |||||||| || ||     
T  26093035 tctcagatgctctgcatgctcctcctcattcttggaatagattaaaatatcatcaataaacaccacaacaaacttatccagaaaagcatggaaaattcgg 26092936  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || |||||||||||  | || || || ||||||||||    
T  26092935 ttcatgtactccataaaaacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcactttgtactcgtaatgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgca 26092836  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    |||| ||||| || || || ||||| |||||||  |||||||||||||| || || ||||     ||||| || |||||||||||||| || |||||||     
T  26092835 tatcctcatccttcacctttatctgatgataaccagacctcaaatcaatcttactaaaaatcttagcaccaaccaactgatccatcaagtcgtcaattct 26092736  T
Q  429 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 471  Q
     ||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||||||    
T  26092735 aggaagcggatacctgttcttgatcgtaactttgttcaactga 26092693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 29 - 471
Target Start/End: Original strand, 49154213 - 49154655
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    |||||||||  || || |||||||| || || || |||||||| |||||||| || || || ||||| |   |||| || |||||||||||||| |||||    
T  49154213 cagaaataatgtgacccagaaaacttacttcatttaaccagaactcacattttgataacttagcatacaacctcttttccttcaacacttgcaatacaat 49154312  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
      |||||||||| ||||| || || ||| ||||||| || || ||||||||||| || ||||| || || ||   ||||| ||| |||||||| || ||     
T  49154313 tctcagatgctctgcatgctcctcctcattcttggaatagattaaaatatcatcaataaacaccacaacaaacttatccagaaaagcatggaaaattcgg 49154412  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    ||||| ||| ||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || |||||||||||  | || || || ||||||||||    
T  49154413 ttcatgtaccccataaaaacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcactttgtactcgtaatgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgca 49154512  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    |||| ||||| || || || ||||| |||||||  |||||||||||||| || || || |     ||||| || |||||||||||||| || |||||||     
T  49154513 tatcctcatccttcacctttatctgatgataaccagacctcaaatcaatcttactaaatatcttagcaccaaccaactgatccatcaagtcgtcaattct 49154612  T
Q  429 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 471  Q
     ||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||||||    
T  49154613 aggaagcggatacctgttcttgatcgtaactttgttcaactga 49154655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 29 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 14284713 - 14284404
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| ||  | ||| |||| |||||||| ||||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||| | |||    
T  14284713 cagaaataatgtggccaagaaaactcacttcacttaactagaactcacatttcgacaacttagcatacagcttcttctctttcaatacttgcaatataat 14284614  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
    | ||||||| || | ||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||   |||||  || ||||| || || |      
T  14284613 cctcagatgttctgtatgctcctcttcagtcttagaataaatcaaaatgtcatcaatgaatacaaccacaaacttatccaggaaagcatgaaaaatcctg 14284514  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| || |||||||| || |||| ||||||  | || || || ||||||||||    
T  14284513 tttatatactccatgaacacgccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgacaataacgtgtcctaaaggccgtcttctgca 14284414  T
Q  329 tatcttcatc 338  Q
    ||||||||||    
T  14284413 tatcttcatc 14284404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 30 - 470
Target Start/End: Original strand, 7825812 - 7826252
Alignment:
Q  30 agaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatc 129  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||| || ||||| |||||||| |||||| | |  |  ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  7825812 agaaatcacatgaccaaggaaactcacttccttcaaccaaaactcacacttagacaacttggcacacaactggttctctttcaagacttgcaacacaatc 7825911  T
Q  130 ttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgat 229  Q
     ||| |||||||||||| ||||| |||| ||| || || | |||||||||||| |||||||| || || || || |||| | | | ||| || || | ||    
T  7825912 ctcaaatgctcagcatgctcttcctcagactttgaatacaccaaaatatcatctatgaacaccaccacaaaacggtccagataaggatgaaatattctat 7826011  T
Q  230 tcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcat 329  Q
    |||| || |||||||| || || |||||||| |  || ||||| ||||| ||   ||| |||||||| ||||| | | ||| ||| || || ||    ||    
T  7826012 tcatgtattccataaagacacctggtgcattagatactccaaatggcatcacagaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcagttttggatat 7826111  T
Q  330 atcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcac 429  Q
    ||||||  | |||||| ||||||| ||||| | ||| ||||||||||| || || || ||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |      
T  7826112 atcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcacccactagctgatccatcaaatcatcaatcctt 7826211  T
Q  430 ggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    ||||||||||||| |||||| || || ||||||||||||||    
T  7826212 ggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactg 7826252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 30 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 27106132 - 27105692
Alignment:
Q  30 agaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatc 129  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||| || ||||| |||||||| |||||| | |  |  ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  27106132 agaaatcacatgaccaaggaaactcacttccttcaaccaaaactcacacttagacaacttggcacacaactggttctctttcaagacttgcaacacaatc 27106033  T
Q  130 ttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgat 229  Q
     ||| |||||||||||| ||||| |||| ||| || || | |||||||||||| |||||||| || || || || |||| | | | ||| || || | ||    
T  27106032 ctcaaatgctcagcatgctcttcctcagactttgaatacaccaaaatatcatctatgaacaccaccacaaaacggtccagataaggatgaaatattctat 27105933  T
Q  230 tcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcat 329  Q
    |||| || |||||||| || || |||||||| |  || ||||| ||||| ||   ||| |||||||| ||||| | | ||| ||| || || ||    ||    
T  27105932 tcatgtattccataaagacacctggtgcattagatactccaaatggcatcacagaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcagttttggatat 27105833  T
Q  330 atcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcac 429  Q
    ||||||  | |||||| ||||||| ||||| | ||| ||||||||||| || || || ||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |      
T  27105832 atcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcacccactagctgatccatcaaatcatcaatcctt 27105733  T
Q  430 ggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    ||||||||||||| |||||| || || ||||||||||||||    
T  27105732 ggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactg 27105692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 30 - 470
Target Start/End: Original strand, 27172193 - 27172633
Alignment:
Q  30 agaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatc 129  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||| || ||||| |||||||| |||||| | |  |  ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  27172193 agaaatcacatgaccaaggaaactcacttccttcaaccaaaactcacacttagacaacttggcacacaactggttctctttcaagacttgcaacacaatc 27172292  T
Q  130 ttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgat 229  Q
     ||| |||||||||||| ||||| |||| ||| || || | |||||||||||| |||||||| || || || || |||| | | | ||| || || | ||    
T  27172293 ctcaaatgctcagcatgctcttcctcagactttgaatacaccaaaatatcatctatgaacaccaccacaaaacggtccagataaggatgaaatattctat 27172392  T
Q  230 tcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcat 329  Q
    |||| || |||||||| || || |||||||| |  || ||||| ||||| ||   ||| |||||||| ||||| | | ||| ||| || || ||    ||    
T  27172393 tcatgtattccataaagacacctggtgcattagatactccaaatggcatcacagaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcagttttggatat 27172492  T
Q  330 atcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcac 429  Q
    ||||||  | |||||| ||||||| ||||| | ||| ||||||||||| || || || ||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |      
T  27172493 atcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcacccactagctgatccatcaaatcatcaatcctt 27172592  T
Q  430 ggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    ||||||||||||| |||||| || || ||||||||||||||    
T  27172593 ggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactg 27172633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 29 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 11301550 - 11301108
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    |||||||||  || || |||||||| || || || |||||||  |||||||| ||||| || ||||| |   |||| || |||||||||||||| || ||    
T  11301550 cagaaataatgtgacccagaaaacttacttcatttaaccagatctcacattttgacaacttagcatacaacctcttttccttcaacacttgcaacactat 11301451  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
      |||||||||| ||||| || || ||| ||||||| ||||| || |||||||| || ||||| || || ||   ||||| ||| |||||||| || ||     
T  11301450 tctcagatgctctgcatgctcctcctcattcttggaataaattaagatatcatcaataaacaccacaacaaacttatccagaaaagcatggaaaattcgg 11301351  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || |||||||||||  | || || || ||||||||||    
T  11301350 ttcatgtactccataaaaacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcactttgtactcgtaatgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgca 11301251  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    |||| ||||| || || || ||||| || ||||  |||||||||||||| || || || |     ||||| || |||||||||||||| || |||||||     
T  11301250 tatcctcatccttcacctttatctgatggtaaccagacctcaaatcaatcttactaaatatcttagcaccaaccaactgatccatcaagtcgtcaattct 11301151  T
Q  429 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 471  Q
     ||||| ||||| || |||||||| || || ||||||||||||    
T  11301150 aggaagcggatatctgttcttgatcgtaactttgttcaactga 11301108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 23 - 122
Target Start/End: Original strand, 14213579 - 14213678
Alignment:
Q  23 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 122  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14213579 catcaccagaaataacatggccaagaaaacttacttctttcaaccagaattcacactttgacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 14213678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 23 - 108
Target Start/End: Original strand, 8200533 - 8200618
Alignment:
Q  23 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctct 108  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  8200533 catcaccagaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagcttcttctct 8200618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 367 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 11770423 - 11770320
Alignment:
Q  367 ctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttca 466  Q
    ||||||| ||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||    
T  11770423 ctcaaattaatcttgctaaacacacgagcacccactaactgatccatcaagtcatcaattcttggaagtggatacctattctttatcgttactttgttca 11770324  T
Q  467 actg 470  Q
    ||||    
T  11770323 actg 11770320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 411 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 16727360 - 16727300
Alignment:
Q  411 catcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 471  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16727360 catcaaatcatcaattctcagaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 16727300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 411 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 17704432 - 17704372
Alignment:
Q  411 catcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 471  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17704432 catcaaatcatcaattctcagaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 17704372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 23 - 76
Target Start/End: Original strand, 13687969 - 13688022
Alignment:
Q  23 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcac 76  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13687969 catcaccagaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaaccagaattcac 13688022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 340 - 470
Target Start/End: Original strand, 4442150 - 4442280
Alignment:
Q  340 tttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggat 439  Q
    |||||| ||||||| ||||| | ||| ||||||||||| || || || ||    ||||| || | ||||||||||||||||||||| | |||||| ||||    
T  4442150 tttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacttccgcaccaaccagctgatccatcaaatcatcaatcctcggaagcggat 4442249  T
Q  440 acctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    ||| |||||| || || ||||| ||||||||    
T  4442250 accgattcttaatcgtcaccttcttcaactg 4442280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 171 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 39363 - 39210
Alignment:
Q  171 caaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacacca 270  Q
    |||||||||||| ||||| || || |||||  |||| ||| ||| |||||| || |  ||||||||||||||||| ||||| || || ||||  || |||    
T  39363 caaaatatcatcaatgaatactacaacgaactgatctaaatatggatggaaaattctgttcatatactccataaaaactcctggcgcgttggacactcca 39264  T
Q  271 aaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttc 324  Q
    |||||||| ||   ||| ||||| |||||||||||  ||||||| || ||||||    
T  39263 aaaggcatcaccgaatactcataatgaccataacgggttctgaaggcagtcttc 39210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 347 - 469
Target Start/End: Original strand, 17925879 - 17926001
Alignment:
Q  347 taatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctatt 446  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || ||     |||| || | ||||||| ||||||||||||| | |||||| ||||||  |||    
T  17925879 taatctgatgatatcttgatctcaaatcaattttactaaatacttccacaccaaccagctgatccctcaaatcatcaatcctcggaagcggatactgatt 17925978  T
Q  447 cttgatagttaccttgttcaact 469  Q
    ||| || || |||||||||||||    
T  17925979 cttaatcgtcaccttgttcaact 17926001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 405 - 470
Target Start/End: Original strand, 13379170 - 13379235
Alignment:
Q  405 ctgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    ||||||||||||||||||||| |  ||||| |||||   |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  13379170 ctgatccatcaaatcatcaatccttggaagaggataaagattcttaatagtcaccttgttcaactg 13379235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 404; Significance: 0; HSPs: 44)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 404; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 21143937 - 21143490
Alignment:
Q  23 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 122  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21143937 catcaccagaaataacatggccaagaaaactcacttctttcaaccagaactcacacttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 21143838  T
Q  123 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21143837 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaaccgatccaaaaatgcatggaag 21143738  T
Q  223 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21143737 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtct 21143638  T
Q  323 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 422  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21143637 tctgtatatcttcatcttttactttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 21143538  T
Q  423 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21143537 aattctcggaagttgatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 21143490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 384; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 24875646 - 24875199
Alignment:
Q  23 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 122  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24875646 catcaccagaaataacatggccaagaaaactcacttctttcaaccagaactcacacttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 24875547  T
Q  123 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24875546 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcaatgaatacaactacgaaccgatccaaaaatgcatggaag 24875447  T
Q  223 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  24875446 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagccgtct 24875347  T
Q  323 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 422  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  24875346 tctgcatatcctcatcttttactttaatctgatgataacctgacctcaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaatcgatccatcaaatcatc 24875247  T
Q  423 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24875246 aattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 24875199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 376; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 31 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 44384458 - 44384019
Alignment:
Q  31 gaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatct 130  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44384458 gaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatct 44384359  T
Q  131 tcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgatt 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44384358 tcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtagatcaaaatatcgtcgatgaacacaactacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgatt 44384259  T
Q  231 catatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcata 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44384258 catatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcata 44384159  T
Q  331 tcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacg 430  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  44384158 tcttcatcttttactttaatctggtgataacctaatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcg 44384059  T
Q  431 gaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44384058 gaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 44384019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 369; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 41607274 - 41606834
Alignment:
Q  30 agaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatc 129  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  41607274 agaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagcttcttctctttcaacacttgcaaaacaatc 41607175  T
Q  130 ttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgat 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||| |||    
T  41607174 ttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacaaaccgatccaaaaatgcatggaagatgtgat 41607075  T
Q  230 tcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcat 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41607074 tcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcat 41606975  T
Q  330 atcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcac 429  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  41606974 atcttcatcctttactttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctaaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctc 41606875  T
Q  430 ggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41606874 ggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 41606834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 368; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 470
Target Start/End: Original strand, 24263917 - 24264364
Alignment:
Q  23 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 122  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24263917 catcaccagaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagcttcttctctttcaacacttgcaa 24264016  T
Q  123 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 222  Q
     |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || || | |||||||||||||||||||    
T  24264017 aacaatcttcagatgctcaacatgttcctcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacaaaccaatccaaaaatgcatggaag 24264116  T
Q  223 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24264117 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtct 24264216  T
Q  323 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 422  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24264217 tctgcatatcttcatcctttactttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 24264316  T
Q  423 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24264317 aattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 24264364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 470
Target Start/End: Original strand, 27372816 - 27373263
Alignment:
Q  23 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 122  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27372816 catcaccagaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagcttcttctctttcaacacttgcaa 27372915  T
Q  123 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 222  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  27372916 aacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacaaaccgatccaaaaatgcatggaag 27373015  T
Q  223 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 322  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27373016 atgcgattcatatattccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtct 27373115  T
Q  323 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 422  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27373116 tctgcatatcttcatcctttactttaatctggtgatatcctgacctcaaatcaatcttgctaaaaacacgtgcacccactagctgatccatcaaatcatc 27373215  T
Q  423 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27373216 aattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 27373263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 31 - 470
Target Start/End: Original strand, 16926915 - 16927354
Alignment:
Q  31 gaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatct 130  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16926915 gaaataacatggccaaggaaactcacctctttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagcttcttctctttcaacacttgtaagacaatct 16927014  T
Q  131 tcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgatt 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16927015 tcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtagatcaaaatatcgtcgataaacacaactacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgatt 16927114  T
Q  231 catatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcata 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  16927115 catatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagccgtcttctgcata 16927214  T
Q  331 tcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacg 430  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  16927215 tcttcgtcttttactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcg 16927314  T
Q  431 gaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16927315 gaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 16927354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 31 - 470
Target Start/End: Original strand, 17000555 - 17000994
Alignment:
Q  31 gaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatct 130  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17000555 gaaataacatggccaaggaaactcacctctttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagcttcttctctttcaacacttgtaagacaatct 17000654  T
Q  131 tcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgatt 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17000655 tcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtagatcaaaatatcgtcgataaacacaactacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgatt 17000754  T
Q  231 catatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcata 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  17000755 catatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagccgtcttctgcata 17000854  T
Q  331 tcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacg 430  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  17000855 tcttcgtcttttactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcg 17000954  T
Q  431 gaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17000955 gaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 17000994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 355; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 469
Target Start/End: Original strand, 24711581 - 24712027
Alignment:
Q  23 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 122  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24711581 catcaccagaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagcttcttctctttcaacacttgcaa 24711680  T
Q  123 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 222  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||     
T  24711681 aacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacaaaccgatccaaaaatgcatggaaa 24711780  T
Q  223 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24711781 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtct 24711880  T
Q  323 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 422  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24711881 tctgcatatcctcatcctttactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 24711980  T
Q  423 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaact 469  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24711981 aattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaact 24712027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 470
Target Start/End: Original strand, 9485763 - 9486210
Alignment:
Q  23 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 122  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  9485763 catcaccagaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagcttcttctctttcaacacttgtaa 9485862  T
Q  123 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9485863 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtagatcaaaatatcgtcgataaacacaactacgaaccgatccaaaaatgcatggaag 9485962  T
Q  223 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  9485963 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaagggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagccgtct 9486062  T
Q  323 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 422  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9486063 tctgcatatcttcgtcttttactttaatctggtgatagcctgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatc 9486162  T
Q  423 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9486163 aattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 9486210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 344; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 31 - 470
Target Start/End: Original strand, 10870405 - 10870844
Alignment:
Q  31 gaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatct 130  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10870405 gaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttcgcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatct 10870504  T
Q  131 tcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgatt 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10870505 tcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtagatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacaaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgatt 10870604  T
Q  231 catatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcata 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  10870605 catatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagccgtcttctgcata 10870704  T
Q  331 tcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacg 430  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  10870705 tcttcatcctttactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgctcccactagctgatccatcaaatcatcaattctcg 10870804  T
Q  431 gaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10870805 gaagtggatacctgttcttgatagttaccttgttcaactg 10870844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 340; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 31 - 470
Target Start/End: Original strand, 27219571 - 27220010
Alignment:
Q  31 gaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatct 130  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27219571 gaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagcttcttctctttcaacacttgtaagacaatct 27219670  T
Q  131 tcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgatt 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27219671 tcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtagatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacaaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgatt 27219770  T
Q  231 catatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcata 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||    
T  27219771 catatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttatattcatagtgaccatatcgcgttctgaaagccgtcttctgcata 27219870  T
Q  331 tcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacg 430  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  27219871 tcttcgtcttttactttaatctggtgatagcctgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcg 27219970  T
Q  431 gaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27219971 gaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 27220010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 29 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 21324156 - 21323715
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21324156 cagaaatgacatggccaagaaaacttacctctttcaaccagaactcacacttagatagtttagcataaagtttcttctccttcaacacttgcaagacaat 21324057  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  21324056 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgatgaaaacaactacgaaccaatccaaaaatgcatggaagatgcga 21323957  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  21323956 ttcatatactccataaatactccaggtgtattggtaacaccaaaaggcataactttatactcatagtggccataacgtgttctgaaagctgtcttctgca 21323857  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  21323856 tatcttcatcttttaccttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattct 21323757  T
Q  429 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21323756 cggaagtggatatctattcttgatagttaccttgtttaactg 21323715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 471
Target Start/End: Original strand, 24677036 - 24677484
Alignment:
Q  23 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 122  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24677036 catcaccagaaataacatggcccagaaaacttacctctttcaaccagaactcacacttagataatttagcataaagtttcttctcttttaacacttgcaa 24677135  T
Q  123 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  24677136 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaattaaaatatcatcgatgaaaaaaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaag 24677235  T
Q  223 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  24677236 atgcgattcatatactccataaacactacaggtgcattcgtaacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctatct 24677335  T
Q  323 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 422  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24677336 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctgaaatcttttgcacccactaactgatccatcaaatcatc 24677435  T
Q  423 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 471  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24677436 aattctcggaagtggatacctattcttgatagttactttgttcaactga 24677484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 24706378 - 24705931
Alignment:
Q  23 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 122  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24706378 catcaccagaaataacatggccaagaaaacttacctctttcaaccagaactcacatttagataatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 24706279  T
Q  123 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||| || |||    
T  24706278 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcaatgaaaacagccacgaaccgatccaaaaatgcgtgaaag 24706179  T
Q  223 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 322  Q
    ||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24706178 atatgattcatgtactccataaacactccaggtacattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtct 24706079  T
Q  323 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 422  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||    ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24706078 tctgcatatcttctttttttactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctgaaaactttcgcacccactaactaatccatcaaatcatc 24705979  T
Q  423 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24705978 aattctcggaagtggatacctatttttgatagttaccttgttcaactg 24705931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 23 - 437
Target Start/End: Original strand, 23189466 - 23189879
Alignment:
Q  23 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 122  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||| || |  |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  23189466 catcaccagaaataacatggcccagaaaacttactttcttcaaccagaat-cacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaa 23189564  T
Q  123 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23189565 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcctcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtctataaacacaactacgaaccgatccaaaaatgcatggaag 23189664  T
Q  223 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23189665 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtct 23189764  T
Q  323 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 422  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||| |||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23189765 tctgcatatcttcatcttttactttaatctagtgataacctaacctcaagtcaatcttgctgaaaacttttgcacccactaaccgatccatcaaatcatc 23189864  T
Q  423 aattcacggaagtgg 437  Q
    ||||| |||||||||    
T  23189865 aattctcggaagtgg 23189879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 100 - 470
Target Start/End: Original strand, 9337206 - 9337576
Alignment:
Q  100 ttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacga 199  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || |    
T  9337206 ttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtagatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacaa 9337305  T
Q  200 atcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgacc 299  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  9337306 accgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaagggcataactttatattcatagtgacc 9337405  T
Q  300 ataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcaccc 399  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  9337406 ataacgcgttctgaaagccgtcttctgcatatcttcgtcttttactttaatctggtgatagcctgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcaccc 9337505  T
Q  400 actaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9337506 actagctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 9337576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 29 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 22734664 - 22734226
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |     
T  22734664 cagaaataacatgtccaagaaagctcacttctttcaaccagaatttacacttagacaatttcgcataaagcttcttctctttcaacacttgcaaaaccag 22734565  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||| |||| |||||||||    
T  22734564 cttcaaatgctcagcatgttcttcttcagacttggagtaaattaaaatatcatcaataaaaacaaccacgaaccgatccaaaaattcatgaaagatgcga 22734465  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    ||||| |||| |||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| || ||||| || ||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  22734464 ttcatgtactacataaatactccaggtgcatttataacaccgaaaggcataactttgtactcataatgtccataacgcgttctgaaagttgtcttctgca 22734365  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| || ||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22734364 tatcttcatcttttactttaatatggtgataacctgatctcaaatctatcttgttgaaaacacttgtacccactaactgatccatcaaatcatcaattct 22734265  T
Q  429 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaa 467  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  22734264 cggaagtggatacctattctttattgttaccttgttcaa 22734226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 29 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 23106618 - 23106177
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |     
T  23106618 cagaaataacatgtccaagaaagctcacttcttttaaccataattcgcacttagacaatttcgcataaagcttcttctctttcaacacttgcaaaaccag 23106519  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||  |||||||||||||||| || ||||||    
T  23106518 cttcaaatgctcagcatgttcttcttcagacttggagtaaatcaaaatatcatcaatgaaaacaaccacgaactgatccaaaaatgcatgaaaaatgcga 23106419  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||    
T  23106418 ttcatgtactccataaatactccaggtgcattcgtaacaccgaaaggcataactttgtactcatagtgaccataccgcgttctaaaagctgtcttctgca 23106319  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || |||||||||||   ||||||||| |||||||||||||| |||||||| |     
T  23106318 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacctgatctcaaatctatcttgctgaaaacttttgcacccaccaactgatccatcaagtcatcaatcct 23106219  T
Q  429 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  23106218 cggaagtggatacctattctttattgtcaccttgttcaactg 23106177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 29 - 470
Target Start/End: Original strand, 23073416 - 23073857
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || || |     
T  23073416 cagaaataacatgtccaagaaagctcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagcttcttctctttcaacacttggaaaaccaa 23073515  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
    ||||| |||   || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |  |||||||||||||| ||||||||     
T  23073516 cttcaaatggctagtatgttcttcttcagacttggagtaaatcaaaatatcatcaatgaaaacaaccacgaaacattccaaaaatgcatgaaagatgcgg 23073615  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  23073616 ttcatgtactccataaatactccaggtgcatttgtaacaccgaaaggcataactttgtattcataatggccatatcgcgttctgaaagctgtcttctgca 23073715  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||| || |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  23073716 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcagatctatcttgctgaaaatacttgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattct 23073815  T
Q  429 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  23073816 cggaagtggatacctattctttattgttactttgttcaactg 23073857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 29 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 24819120 - 24818679
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||| |||||| || ||||| || |||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||    
T  24819120 cagaaataacatggccaagaaaacttacttcattcaaccagagttcacactttgacaacttagcataaagcttcttctccttcagcacttgcaagacaat 24819021  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||| ||| | ||||| || || |||    
T  24819020 cctcaaatgctcagcatgttcttcttcagtcttagagtatatcaaaatatcatcaatgaacacaaccatgaagcgatctaaatacgcatgaaaaatacga 24818921  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    ||||  |||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||| |||  |||||| || || ||||||||  | || || || ||||||||||    
T  24818920 ttcaagtactccataaacacacctggcgcatttgtaacaccgaaaggcatcactgaatattcgtaatgtccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgca 24818821  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  24818820 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaatacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcagttct 24818721  T
Q  429 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
     |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  24818720 tggaagtggatacctattctttatcgttaccttattcaactg 24818679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 30 - 449
Target Start/End: Original strand, 23112290 - 23112712
Alignment:
Q  30 agaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatc 129  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || ||  | ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |  ||||| || |||||||||||||| ||||||    
T  23112290 agaaataatatggccaagaaaacttacttcacttaaccagaattcacatttggacaacttggcatacaacttcttttccttcaacacttgcaacacaatc 23112389  T
Q  130 ttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgat 229  Q
    || | |||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||| || ||||||||||| ||  |||||| | | |||||||| || | ||    
T  23112390 tttaaatgctctgcatgctcttcttcagtcttagaataaatcaagatatcatcaataaacacaactacaaactgatccagataagcatggaaaattctat 23112489  T
Q  230 tcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcat 329  Q
    |||| |||||||||||||| | ||| ||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||| || ||||| ||| | || || || || |||| |||    
T  23112490 tcatgtactccataaacacactaggcgcattagtaacaccgaaagacatcactttatattcataatgtccatatcgcgtcctaaaggccgttttctacat 23112589  T
Q  330 atcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaa---atcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaatt 426  Q
    |||||||||||| || |||||||| || ||||  ||||||||   |||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23112590 atcttcatctttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcatcaatcttgctgaatatgcgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatt 23112689  T
Q  427 cacggaagtggatacctattctt 449  Q
    | |||||||||||||||||||||    
T  23112690 ctcggaagtggatacctattctt 23112712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 29 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 19650940 - 19650498
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    |||||||||  |||||||||||||| || ||  | ||| |||| |||||||| ||||| || ||||| |  ||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  19650940 cagaaataatgtggccaagaaaacttacttcacttaactagaactcacattttgacaacttagcatacaacttcttttctttcaaaacttgcaatacaat 19650841  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
    |||||||||||| ||||| || ||||| ||||| || ||||| | ||||||||| || |||||||| || |||  ||||||||| |||||||| ||  |     
T  19650840 cttcagatgctctgcatgctcctcttcggtcttagaataaattagaatatcatcaataaacacaaccacaaatttatccaaaaaagcatggaaaatttgg 19650741  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || || || ||||| |||||||| || || || || || |||||||| ||  | || || |  ||||||||||    
T  19650740 ttcatatactccatgaacacaccaggcgcgttagtgacaccgaaaggcatcaccttgtactcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggtcgtcttctgca 19650641  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    |||||||||| || || |||||||| || |||| |||| |||| ||||| || ||||||||   ||||||||||||||||||||| || |||||||| |     
T  19650640 tatcttcatccttcaccttaatctgatggtaacctgacttcaagtcaatcttactgaaaacctttgcacccactaactgatccattaagtcatcaatcct 19650541  T
Q  429 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 471  Q
    ||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||    
T  19650540 cggaagtggatacctattctttatcgtaactttgttcaactga 19650498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 23 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 22323752 - 22323580
Alignment:
Q  23 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 122  Q
    ||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22323752 catcaccagaaacaacatggcctagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagcttcttctctttcaacacttgcaa 22323653  T
Q  123 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaact 195  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  22323652 aacaatcttcagatgctcggcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaagatatcgtcgataaacacaact 22323580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 214 - 471
Target Start/End: Original strand, 25255657 - 25255914
Alignment:
Q  214 gcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctga 313  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||||| ||| | ||||| |||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||| ||  | || |    
T  25255657 gcatggaaaattcggttcatatactccataaacacaccaagcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaa 25255756  T
Q  314 aagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccat 413  Q
    | || |||||||||||||| ||||| || || |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25255757 aggccgtcttctgcatatcctcatccttcaccttaatctgatggtaacctgacctcaaatcaattttgctgaacacacgtgcacccactaactgatccat 25255856  T
Q  414 caaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 471  Q
     || |||||||| | ||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||    
T  25255857 taagtcatcaatcctcggaagtggatacctattctttatcgtaaccttgttcaactga 25255914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 23 - 467
Target Start/End: Original strand, 27789287 - 27789731
Alignment:
Q  23 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 122  Q
    ||||| ||||||||| ||| ||||| |||||||| ||  | | ||| || |||||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||     
T  27789287 catcaccagaaataatatgaccaaggaaactcacttcacttagccaaaactcacatttcgacaatttggcatacaacttcttctctttcaaaacttgcag 27789386  T
Q  123 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 222  Q
     |||||  ||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||||| ||||||||| || || || || ||||||  ||||| ||| ||||| ||     
T  27789387 cacaattctcagatgttctgcatgctcttcttcagtcttcgaataaatcagaatatcatcaataaataccaccacgaatttatccagaaaagcatgaaaa 27789486  T
Q  223 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 322  Q
    || ||||||||||||||||| ||||| || || || || |||||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||| || ||  | || || || ||||    
T  27789487 attcgattcatatactccatgaacacaccgggcgcgttagtaacaccgaaaggcatcactttgtattcgtaatgaccgtatcgtgtcctaaaggccgtct 27789586  T
Q  323 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 422  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||| || || |||| ||||||||| ||||| || ||||| ||   ||||||||||| ||| |||||||| |||||    
T  27789587 tctgcatatcttcatctttcaccttaatttgatggtaacctgacctcaagtcaatcttactgaacacctttgcacccactagctggtccatcaagtcatc 27789686  T
Q  423 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaa 467  Q
    ||| | |||||| ||||| |||||||| || || || ||||||||    
T  27789687 aatcctcggaagcggatatctattcttaattgtaactttgttcaa 27789731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 23 - 467
Target Start/End: Original strand, 12575900 - 12576344
Alignment:
Q  23 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 122  Q
    ||||| ||||||||| ||| ||||| |||||||| ||  | | ||| ||||||||||| |||| ||||||||| |  ||| | |||||||| ||||||||    
T  12575900 catcaccagaaataatatgaccaaggaaactcacttcacttagccaaaattcacatttcgacagtttggcatacaacttcctttctttcaaaacttgcaa 12575999  T
Q  123 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 222  Q
     |||||  ||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||||| ||| ||||| || || || || ||||||  ||||||||| ||||| ||     
T  12576000 cacaattctcagatgttctgcatgctcttcttcagtcttcgaataaatcagaatgtcatcaataaataccaccacgaatttatccaaaaaagcatgaaaa 12576099  T
Q  223 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 322  Q
    || ||||||||||||||||| || || || || || || |||||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||| || ||  | || || || ||||    
T  12576100 attcgattcatatactccatgaatacaccgggcgcgttagtaacaccgaaaggcatcactttgtattcgtaatgaccgtatcgtgtcctaaaggccgtct 12576199  T
Q  323 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 422  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||| ||||||||| ||||| || ||||| ||   ||||||||||| ||| |||||||| |||||    
T  12576200 tctgcatatcttcatctttcaccttaatttggtggtaacctgacctcaagtcaatcttactgaacacctttgcacccactagctggtccatcaagtcatc 12576299  T
Q  423 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaa 467  Q
    ||| | |||||| ||||| |||||||| || || || ||||||||    
T  12576300 aatcctcggaagcggatatctattcttaattgtaactttgttcaa 12576344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 29 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 23098908 - 23098466
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    |||||||||  ||||| ||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| ||||| || ||||| |   | ||||||||||  || || || |||||    
T  23098908 cagaaataatgtggccgagaaaactcacttcacttaaccagaattcacatttcgacaacttagcatacaacattttctctttcagaacctgtaatacaat 23098809  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
    | |||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| || ||||||| ||||| ||| ||||| || || | |    
T  23098808 cctcagatgctcggcatgctcttcttcagtcttagaataaattaaaatatcatcaataaacaccaccacgaatctatccagaaaagcatgaaaaatccta 23098709  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||||||  | || || || ||||||||||    
T  23098708 ttcatatactccataaatacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttctattcgtaatgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgca 23098609  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    |||||||||| || || || ||||| || || | ||||||||| ||||| || || ||||    |||||| || |||||||||||||| || ||||| |     
T  23098608 tatcttcatccttcacctttatctgatggtatcctgacctcaagtcaatcttactaaaaatctttgcaccaaccaactgatccatcaagtcgtcaatcct 23098509  T
Q  429 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 471  Q
    | |||| |||||||| ||||| || || || ||||||||||||    
T  23098508 cagaagcggatacctgttctttatcgtcactttgttcaactga 23098466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 40 - 471
Target Start/End: Original strand, 23278340 - 23278771
Alignment:
Q  40 tggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgct 139  Q
    ||||| ||||||||||| ||  | |||||||| || || || ||||| || ||||| |  || ||||||||||| | |||||| |||||||||||||| |    
T  23278340 tggcctagaaaactcacttcacttaaccagaactcgcacttcgacaacttagcatacaactttttctctttcaatatttgcaacacaatcttcagatgtt 23278439  T
Q  140 cagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactc 239  Q
    | ||||| |||||||||||||| || ||||||| ||| ||||| || || ||||| |||||   ||||| | | |||||||| || || |||||||||||    
T  23278440 ctgcatgctcttcttcagtcttagaataaatcagaatgtcatcaataaaaacaaccacgaaattatccagataagcatggaaaattcggttcatatactc 23278539  T
Q  240 cataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatct 339  Q
    ||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| || || ||||| || || ||||| ||  | || || |  |||||||||||||| |  ||     
T  23278540 catgaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttgtattcgtaatgtccatatcgtgtcctaaaggtcgtcttctgcatatccttgtcc 23278639  T
Q  340 tttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggat 439  Q
    || || ||||| || || |||| |||| |||| ||||| || || |||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||    
T  23278640 ttcaccttaatttgatggtaacctgacttcaagtcaatcttactaaaaacctttgcacccactaactgatccatcaagtcatcaatcctcggaagtggat 23278739  T
Q  440 acctattcttgatagttaccttgttcaactga 471  Q
    |||| |||||||| || || ||||||||||||    
T  23278740 acctgttcttgattgtaactttgttcaactga 23278771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 46 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 30209790 - 30209387
Alignment:
Q  46 agaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcat 145  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| || || || || |||||| | |  ||||||||||||| |||||| || |||||  ||| ||| ||  |||    
T  30209790 agaaaactcacttcgttcaaccagaattcgcacttcgataacttggcagataacttcttctctttcagcacttgaaaaacaattctcaaatgttcgacat 30209691  T
Q  146 gttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaa 245  Q
    |||| || || | ||||||||| |||||||||||||| || |||||||| || || ||||||| | | | ||| || ||  |||||||||| ||||||||    
T  30209690 gttcctcctcggacttggagtatatcaaaatatcatctataaacacaacaacaaaacgatccagataagtatgaaaaatatgattcatatattccataaa 30209591  T
Q  246 cactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttact 345  Q
    ||||||  | ||||| |||||||| |||||||| ||   |||||  || || |  |||||  | || || || |||||||| ||||| |||||||| |||    
T  30209590 cactcccagcgcattagtaacaccgaaaggcatcacaaaatatttgtaatgtctgtaacgtgtcctaaaggccgtcttctgaatatcctcatctttcact 30209491  T
Q  346 ttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctat 445  Q
    || ||||||||||| | |||||| || |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || || | ||||||||||||| |||    
T  30209490 ttgatctggtgatagcctgaccttaactcaattttactgaacacacgcgcacccactaactgatccatcaaatcttcgatcctcggaagtggatacttat 30209391  T
Q  446 tctt 449  Q
    ||||    
T  30209390 tctt 30209387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 109 - 471
Target Start/End: Original strand, 1065384 - 1065746
Alignment:
Q  109 ttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatcca 208  Q
    |||||||||||||| || ||  |||||||||| ||||| || || ||| ||||||| || || ||||||||||| || || || || || ||   |||||    
T  1065384 ttcaacacttgcaacactattctcagatgctctgcatgctcctcctcattcttggaatagattaaaatatcatcaataaataccaccacaaacttatcca 1065483  T
Q  209 aaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcat 308  Q
     ||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || |||||||||||  |    
T  1065484 gaaaagcatggaagattcgattcatgtactccataaaaacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcactttgtactcgtaatgaccataacgtgt 1065583  T
Q  309 tctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactga 408  Q
     || || || |||||||||||||||||||| || || || ||||| |||||||  |||||||||||||| || |||||||     ||||| || ||||||    
T  1065584 cctaaaggccgtcttctgcatatcttcatccttcacctttatctgatgataaccagacctcaaatcaatcttactgaaaatcttagcaccaaccaactga 1065683  T
Q  409 tccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 471  Q
    |||||||| || |||||||  ||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||||||    
T  1065684 tccatcaagtcgtcaattctaggaagcggatacctgttcttgatcgtaactttgttcaactga 1065746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 29 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 30011074 - 30010654
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    ||||||||| ||| || ||||||||||| || |||||||||||||| ||  | || || |||||||| |  |||||||||| || ||||||||| |||||    
T  30011074 cagaaataatatgaccgagaaaactcacttcgttcaaccagaattcgcacatcgataacttggcatataacttcttctcttgcagcacttgcaaaacaat 30010975  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
      ||| ||||||  ||||||| || || | ||||||||| |||||||||||||| || ||||| || || || ||||||| | | | ||| || || |||    
T  30010974 tctcaaatgctcgacatgttcctcctcggacttggagtatatcaaaatatcatctataaacacgacaacaaaacgatccagataagtatgaaaaatacga 30010875  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    |||||||| | |||||||||||| || ||||| |||||||  |||||||| ||   |||||| || || || |||||  | || || |  |||||||| |    
T  30010874 ttcatatatttcataaacactcctggcgcattagtaacactgaaaggcatcacagaatattcgtaatgtccgtaacgtgtcctaaaggtcgtcttctgaa 30010775  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||| | | | || || || ||||| ||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| || || |     
T  30010774 tatcctcatctttcactttaatctggtgatagcctaatcttaagtccattttactgaacacacgcgcacccactaacggatccatcaaatcgtcgatcct 30010675  T
Q  429 cggaagtggatacctattctt 449  Q
    ||||||||||||| |||||||    
T  30010674 cggaagtggatacttattctt 30010654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 64 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 19717872 - 19717465
Alignment:
Q  64 aaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttgg 163  Q
    |||||||| ||||| || ||||| || ||||| || ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| |  ||||||||||| |    
T  19717872 aaccagaactcacacttcgacaacttagcatacagcttcttttctttcaaaacttgcaatacaatcttcagatgttctgcatgctgatcttcagtcttag 19717773  T
Q  164 agtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggt 263  Q
    | ||||| | ||||||||| || ||||||||    |||  ||||| ||| |||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| || || ||    
T  19717772 aataaattagaatatcatcaataaacacaacccaaaatttatccagaaaagcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgctttagt 19717673  T
Q  264 aacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataactt 363  Q
    |||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| ||  | || || || ||||| |||||||| ||||| || |  || ||||| || |||| |    
T  19717672 aacaccgaaaggcatcaccttgtattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggccgtcttgtgcatatcctcatccttcaacttgatctgatggtaacct 19717573  T
Q  364 gacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgt 463  Q
    |||||||| ||||| ||| | |||||   ||||||||| |||||||||||||| |||||||| | | |||||||||| || ||||| || || || ||||    
T  19717572 gacctcaagtcaatcttgttaaaaacctttgcacccaccaactgatccatcaagtcatcaatcctcagaagtggatatctgttctttatcgtaactttgt 19717473  T
Q  464 tcaactga 471  Q
    ||||||||    
T  19717472 tcaactga 19717465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 64 - 471
Target Start/End: Original strand, 31832246 - 31832653
Alignment:
Q  64 aaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttgg 163  Q
    |||||||| |||||||| ||||| || ||||| |   |||| || |||||||||||||| |||||  |||||||||| ||||| || || ||| ||||||    
T  31832246 aaccagaactcacatttcgacaactttgcatacaacctcttttccttcaacacttgcaatacaattctcagatgctctgcatgctcctcctcattcttgg 31832345  T
Q  164 agtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggt 263  Q
    | ||||| || |||||||| || ||||| || || ||   ||||| ||| |||||||| || || ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||    
T  31832346 aataaattaagatatcatcaataaacaccacaacaaacttatccagaaaagcatggaaaattcggttcatgtactccataaaaacaccaggcgcattagt 31832445  T
Q  264 aacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataactt 363  Q
    |||||| |||||||| || || || || || |||||||||||  | || || || |||||||||||||| ||||| || || || ||||| |||||||      
T  31832446 aacaccgaaaggcatcaccttgtactcgtaatgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcacctttatctgatgataacca 31832545  T
Q  364 gacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgt 463  Q
    |||||||||||||| || || ||||     ||||| || || ||||||||||| || |||||||  ||||| |||||||| |||||||| || || ||||    
T  31832546 gacctcaaatcaatcttactaaaaatcttagcaccaaccaattgatccatcaagtcgtcaattctaggaagcggatacctgttcttgatcgtaactttgt 31832645  T
Q  464 tcaactga 471  Q
    ||||||||    
T  31832646 tcaactga 31832653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 40 - 377
Target Start/End: Original strand, 24950154 - 24950491
Alignment:
Q  40 tggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgct 139  Q
    |||||||||| |||||| ||  | ||||| || ||||| || ||||| || ||||| |  || ||||||||||| | |||||| |||||||||||||| |    
T  24950154 tggccaagaagactcacttcacttaaccataactcacacttcgacaacttagcatacaactttttctctttcaatatttgcaacacaatcttcagatgtt 24950253  T
Q  140 cagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactc 239  Q
    | ||||| |||||||||||||| || ||||||| ||||||||| |  || |||||  | |||  |||||   | |||||||| || || |||||||||||    
T  24950254 ctgcatgctcttcttcagtctttgaataaatcagaatatcatcaacaaatacaaccgcaaatttatccaggtaagcatggaaaattcggttcatatactc 24950353  T
Q  240 cataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatct 339  Q
    ||| ||||| ||||| || || |||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| ||  | || || || ||||||||||||||||||||     
T  24950354 catgaacacaccaggcgcgttagtaacaccgaaaggcatcaccttgtattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcttcatcc 24950453  T
Q  340 tttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaat 377  Q
    ||||| |||||||| || |||| ||||||||| |||||    
T  24950454 tttaccttaatctgatggtaacctgacctcaagtcaat 24950491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 29 - 191
Target Start/End: Original strand, 25264607 - 25264769
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    |||||||||  |||||||||||||| || ||  | |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25264607 cagaaataatgtggccaagaaaacttacttcacttaaccagaactcacattttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaacacttgcaagacaat 25264706  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacac 191  Q
    ||||||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||| || ||||| || |||||    
T  25264707 cttcagatgttctgcatgctcttcttcagtcttagaataaatcaagatgtcatcaataaacac 25264769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 29 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 27209062 - 27208802
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcata-aagtttcttctctttcaacacttgcaagacaa 127  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| ||  | |||||||| || || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||| |  ||||| ||||    
T  27209062 cagaaataacgtggcctagaaaactcacttcacttaaccagaactcgcacttcgacaagttggcatacaactttct-ctctttcaaaatctgcaacacaa 27208964  T
Q  128 tcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcg 227  Q
    ||||||| ||||| |||||  | ||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| || ||||||  ||||| ||| |||||||| || ||    
T  27208963 tcttcaggtgctctgcatgcacctcttcagtcttagaataaatcaaaatatcatctataaacaccaccacgaatttatccagaaaagcatggaaaattcg 27208864  T
Q  228 attcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatatt 289  Q
     |||||||||||||| ||||| | ||| || || |||||||| |||| ||| ||||| ||||    
T  27208863 gttcatatactccatgaacacactaggcgctttagtaacaccgaaagacatcactttgtatt 27208802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 40 - 246
Target Start/End: Original strand, 23295499 - 23295705
Alignment:
Q  40 tggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgct 139  Q
    ||||| ||||||||||| ||  | |||||||| ||||| || ||||| || ||||| |  || ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |    
T  23295499 tggcccagaaaactcacttcaattaaccagaactcacacttcgacaacttagcatacaactttttctctttcaaaacttgtaacacaatcttcagatgtt 23295598  T
Q  140 cagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactc 239  Q
    | ||||| |||||||||||||| || |||||||  || ||||| || |||||||| || |||  |||||   | |||||||| || || |||||||||||    
T  23295599 ctgcatgctcttcttcagtctttgaataaatcaggatgtcatcaataaacacaaccacaaatttatccaggtaagcatggaaaattcggttcatatactc 23295698  T
Q  240 cataaac 246  Q
    ||| |||    
T  23295699 catnaac 23295705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 30 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 24830077 - 24829637
Alignment:
Q  30 agaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatc 129  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||||| || || ||||| || ||||| |||||||| |||||| | |  |  ||||||||||| | |||||| ||||||    
T  24830077 agaaatcacatgaccaaggaaactcacttccttgaaccaaaactcacacttagacaacttggcacacaactggttctctttcaagaattgcaacacaatc 24829978  T
Q  130 ttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgat 229  Q
     ||| |||||| ||||| ||||| |||| ||| || || | |||||||||||| |||||||| || || || || |||| | | | ||| || || | ||    
T  24829977 ctcaaatgctccgcatgctcttcctcagactttgaatacaccaaaatatcatctatgaacaccaccacaaaacggtccagataaggatgaaatattctat 24829878  T
Q  230 tcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcat 329  Q
    |||| || |||||||| || || || ||||| |  || ||||| ||||| ||   ||| |||||||| ||||| | | |||  || || || ||    ||    
T  24829877 tcatgtattccataaagacacctggcgcattagatactccaaatggcatcacagaatactcatagtgtccatacctcgttcgaaacgcggttttggatat 24829778  T
Q  330 atcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcac 429  Q
    ||||||  | |||||| ||||||| |||||   ||| ||| ||||||| || || || ||   |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |      
T  24829777 atcttccgcctttactctaatctgatgatattctgatctctaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatcctt 24829678  T
Q  430 ggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    ||||||||||||| |||||| || || ||||||||||||||    
T  24829677 ggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactg 24829637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 29 - 149
Target Start/End: Original strand, 45534493 - 45534613
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    ||||||||| ||| || ||||||||||| || |||||||||||||| || || || || |||||||| |  ||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  45534493 cagaaataatatgaccgagaaaactcacttcgttcaaccagaattcgcacttcgataacttggcatataacttcttctctttcagcacttgcaaaacaat 45534592  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttc 149  Q
      ||| |||||| ||||||||    
T  45534593 tctcaaatgctcggcatgttc 45534613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 372 - 437
Target Start/End: Original strand, 23611069 - 23611134
Alignment:
Q  372 atcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtgg 437  Q
    |||||| |||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23611069 atcaatcttgctgaaaacttttgcacccactaaccgatccatcaaatcatcaattctcggaagtgg 23611134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 393 - 467
Target Start/End: Original strand, 22280022 - 22280096
Alignment:
Q  393 tgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaa 467  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| |||||| || || |||||||||||    
T  22280022 tgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaa 22280096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 435 - 471
Target Start/End: Original strand, 23204273 - 23204309
Alignment:
Q  435 tggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 471  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23204273 tggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 23204309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 406 - 470
Target Start/End: Original strand, 25130539 - 25130603
Alignment:
Q  406 tgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    |||||||| ||||||||||| | |||||| ||||||| |||||| || || |||| |||||||||    
T  25130539 tgatccataaaatcatcaatcctcggaagcggataccgattcttaatcgtcacctagttcaactg 25130603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0431 (Bit Score: 396; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0431
Description:

Target: scaffold0431; HSP #1
Raw Score: 396; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 470
Target Start/End: Original strand, 9313 - 9760
Alignment:
Q  23 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9313 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacttctttcaaccagaactcacacttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 9412  T
Q  123 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9413 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaataaaaatatcatcgatgaatacaactacgaaccgatccaaaaatgcatggaag 9512  T
Q  223 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9513 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtct 9612  T
Q  323 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 422  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  9613 tctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctgaaaacacgtgtacccactaactgatccatcagatcatc 9712  T
Q  423 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9713 aattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 9760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 396; Significance: 0; HSPs: 60)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 396; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 22828856 - 22828409
Alignment:
Q  23 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 122  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22828856 catcaccagaaataacatggccaagaaaactcacttctttcaaccagaactcacacttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 22828757  T
Q  123 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22828756 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacgcaactacgaaccgatccaaaaatgcatggaag 22828657  T
Q  223 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 322  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22828656 atacgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtct 22828557  T
Q  323 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 422  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22828556 tctgcatatctttatcttttactttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 22828457  T
Q  423 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22828456 aattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttattcaactg 22828409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 368; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 31 - 470
Target Start/End: Original strand, 25114340 - 25114779
Alignment:
Q  31 gaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatct 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25114340 gaaataacatggccaagaaaactcacctctttcaaccagaattcacacttagataatttgacataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatct 25114439  T
Q  131 tcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgatt 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25114440 tcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtagatcaaaatatcatcgatgaacaaaactacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgatt 25114539  T
Q  231 catatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcata 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25114540 catatactccataaacactccaggtgtattggtaacaccaaaaggcataactttatattcacagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcata 25114639  T
Q  331 tcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacg 430  Q
    |||||| | |||||||||||||| ||||||| || || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  25114640 tcttcaacctttactttaatctgatgataacctggccccaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcg 25114739  T
Q  431 gaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25114740 gaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 25114779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 24294276 - 24293837
Alignment:
Q  30 agaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatc 129  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24294276 agaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagcttcttctctttcaacacttgcaaaacaatc 24294177  T
Q  130 ttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgat 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24294176 ttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacaaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgat 24294077  T
Q  230 tcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcat 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  24294076 tcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacacgttctgaaagctgtcttctgcat 24293977  T
Q  330 atcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcac 429  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  24293976 atcttcatcctttactttaatctggtgatatcctgacctcaaatcaatcttgctaaaaacacgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctc 24293877  T
Q  430 ggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaact 469  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24293876 ggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaact 24293837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 31 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 2873296 - 2872857
Alignment:
Q  31 gaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatct 130  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  2873296 gaaataacatggccaaggaaactcacttctttcaaccaaaattcacacttagacaatttagcataaagcttcttctccttcaacacttgcaaaacaatct 2873197  T
Q  131 tcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgatt 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| || || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2873196 tcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacataaccacaaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgatt 2873097  T
Q  231 catatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcata 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2873096 catatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcata 2872997  T
Q  331 tcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacg 430  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  2872996 tcttcatcctttactttaatctggtgataacccgacctcaaatcaatcttgctaaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcg 2872897  T
Q  431 gaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2872896 gaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 2872857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 471
Target Start/End: Original strand, 19866467 - 19866915
Alignment:
Q  23 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 122  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||  ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19866467 catcaccagaaataacatggccaagaaaacttacctctttcaaccagaactcacgcttagatagtttagcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 19866566  T
Q  123 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  19866567 gacaatcttcagatgctcagcatgttctttttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgataaaaacaaccacaaagcgatccaaaaatgcatggaag 19866666  T
Q  223 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  19866667 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataccgcgttctgaaagctgtct 19866766  T
Q  323 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 422  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19866767 tctgcatatcttcatcttttactttaatctcgtgataacctgatcttaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 19866866  T
Q  423 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 471  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19866867 aattctcggaagtggatacctattcttgatagttactttgttcaactga 19866915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 349; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 27564334 - 27563886
Alignment:
Q  23 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 122  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27564334 catcaccagaaataacatggccaagaaaacttacttctttcaaccagaattcacacttagataatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 27564235  T
Q  123 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||    
T  27564234 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatttcatcgatgaacacaaccacgaaccgatctaaaaatgcatggaag 27564135  T
Q  223 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  27564134 atgcgattcatatactccataaacactttaggtgcaatggtcacaccgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgcct 27564035  T
Q  323 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 422  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27564034 tctgcatatcttcatcttttactttaatttggtgataacctgatcttaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 27563935  T
Q  423 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 471  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  27563934 aattctcggaagtggatacctattcttgatagtaactttgttcaactga 27563886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 344; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 31 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 28261690 - 28261251
Alignment:
Q  31 gaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatct 130  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28261690 gaaataacatggccagggaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatct 28261591  T
Q  131 tcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgatt 230  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28261590 tcagatgctctgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgatgaacacaactacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgatt 28261491  T
Q  231 catatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcata 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  28261490 catatactccataaacactccaggtgcattggtcacaacgaaaggcataactttgtattcatagtgaccatagcgcgttctgaaagctgtcttctgcata 28261391  T
Q  331 tcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacg 430  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  28261390 tcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaacttgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcg 28261291  T
Q  431 gaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28261290 gaagtggatacctattcttgatagttactttgttcaactg 28261251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 344; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 31 - 470
Target Start/End: Original strand, 28284226 - 28284665
Alignment:
Q  31 gaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatct 130  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28284226 gaaataacatggccagggaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatct 28284325  T
Q  131 tcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgatt 230  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28284326 tcagatgctctgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgatgaacacaactacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgatt 28284425  T
Q  231 catatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcata 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  28284426 catatactccataaacactccaggtgcattggtcacaacgaaaggcataactttgtattcatagtgaccatagcgcgttctgaaagctgtcttctgcata 28284525  T
Q  331 tcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacg 430  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  28284526 tcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaacttgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcg 28284625  T
Q  431 gaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28284626 gaagtggatacctattcttgatagttactttgttcaactg 28284665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 344; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 31 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 28340439 - 28340000
Alignment:
Q  31 gaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatct 130  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28340439 gaaataacatggccagggaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatct 28340340  T
Q  131 tcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgatt 230  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28340339 tcagatgctctgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgatgaacacaactacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgatt 28340240  T
Q  231 catatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcata 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  28340239 catatactccataaacactccaggtgcattggtcacaacgaaaggcataactttgtattcatagtgaccatagcgcgttctgaaagctgtcttctgcata 28340140  T
Q  331 tcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacg 430  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  28340139 tcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaacttgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcg 28340040  T
Q  431 gaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28340039 gaagtggatacctattcttgatagttactttgttcaactg 28340000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 31 - 470
Target Start/End: Original strand, 27189224 - 27189663
Alignment:
Q  31 gaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatct 130  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27189224 gaaataacatggccaaggaaactcacttctttcaaccagaattcacacttggacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatct 27189323  T
Q  131 tcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgatt 230  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27189324 tcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaagatatcgtcgatgaatacaaccacgaaccgatctaaaaatgcatggaagatgcgatt 27189423  T
Q  231 catatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcata 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27189424 catatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttgtattcgtagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcata 27189523  T
Q  331 tcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacg 430  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27189524 tcctcatcttttaccttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaacttgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcg 27189623  T
Q  431 gaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27189624 gaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 27189663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 31 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 27260016 - 27259577
Alignment:
Q  31 gaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatct 130  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27260016 gaaataacatggccaaggaaactcacttctttcaaccagaattcacacttggacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatct 27259917  T
Q  131 tcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgatt 230  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27259916 tcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaagatatcgtcgatgaatacaaccacgaaccgatctaaaaatgcatggaagatgcgatt 27259817  T
Q  231 catatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcata 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27259816 catatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttgtattcgtagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcata 27259717  T
Q  331 tcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacg 430  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27259716 tcctcatcttttaccttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaacttgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcg 27259617  T
Q  431 gaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27259616 gaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 27259577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 471
Target Start/End: Original strand, 22435649 - 22436097
Alignment:
Q  23 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 122  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22435649 catcaccagaaataacatggccaagaaaacttacctctttcaaccagaactcacacttagataatttaggataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 22435748  T
Q  123 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 222  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||    
T  22435749 gacaatcttcagatgctcaacatgttcttctttagtcttggagtaaattaaaatatcatcgataaaaacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatgaaag 22435848  T
Q  223 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 322  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | || ||||||||||||    
T  22435849 atgcgattcatgtactccataaatactctaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacacgttttgaaagctgtct 22435948  T
Q  323 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 422  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22435949 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctgaaaacacatgcacccactaactgatccatcaaatcatc 22436048  T
Q  423 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 471  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||    
T  22436049 aattctcggaagtggatacctattattgatagttactttgtttaactga 22436097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 29 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 16926133 - 16925692
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16926133 cagaaatgacatggccaagaaaacttacctctttcaaccagaattcacacttagataacttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 16926034  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  16926033 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaaaacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgc 16925934  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||    
T  16925933 ttcatatactccaaaaacactccaggtgcattggtcacaccgaacggcataacattatattcatagtgaccataccgcgttctgaaagctgtcttctaca 16925834  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16925833 tatcttcatctttcactttaatctggtgataaccttacctcaaatcaatcttgctaaaaacttttgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattct 16925734  T
Q  429 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 471  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16925733 c-gaagtagatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 16925692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 29 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 16961977 - 16961537
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16961977 cagaaatgacatggccaagaaaacttacctctttcaaccagaattcacacttagatgacttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 16961878  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16961877 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcaatgaaaacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcga 16961778  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  16961777 ttcatatactccataaacacttcaggtgcattggtcacaccgaacgacataactttatattcatagtgaccataccgcgttctgaaagctgtcttctgca 16961678  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  16961677 tatcttcatctttcactttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctaaaaactttcgcaccgactaactgatccatcaaatcatcaattct 16961578  T
Q  429 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaact 469  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16961577 tggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaact 16961537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 29 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 5837714 - 5837272
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| |    
T  5837714 cagaaataacgtggccaagaaaacttacctctttcaaccagaactcacacttagacaacttggcataaagcttcttttctttcaacacttgcaaaacagt 5837615  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| || || ||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||||||    
T  5837614 cttcagatgctcaacatgttcttcctcagtcttggaataaatcagaatgtcgtcaatgaagacaaccacaaagcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 5837515  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  5837514 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttgtactcatagtgaccataacgcgttctgaaagcggtcttctgca 5837415  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  5837414 tatcttcatcctttactttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctgaaaacaaaagcacccactaactgatccatcaaatcatcaattct 5837315  T
Q  429 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 471  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5837314 cggaagtggatacctattcttgatagttactttgttcaactga 5837272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 29 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 25763723 - 25763297
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| | |||  |||||||||||||||||||||||||    
T  25763723 cagaaatgacatggccaagaaaacttacctctttcaaccagaattcacaattagataatttagcatacatttttatctctttcaacacttgcaagacaat 25763624  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||| |  || ||||||||||||||| |||||||||||    
T  25763623 cttcagatgctcagcatgttctccttcagtcttggagtaaattaaaatgtcatcaataaagacaaccataaagcgatccaaaaatgcaaggaagatgcga 25763524  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25763523 ttcatatactccataaacagtccaggtgcatttgtaacaccgaaaggcataactttatactcatagtggccataacgcgttctgaaagctgtcttctgca 25763424  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  25763423 tatcttcatcttttacttttttctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattct 25763324  T
Q  429 cggaagtggatacctattcttgatagt 455  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  25763323 cggaagtggatacctattcttgatagt 25763297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 32 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 22760947 - 22760504
Alignment:
Q  32 aaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatctt 131  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||| || | |||    
T  22760947 aaataacatgtccaagaaagctcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttcgcataaagcttcttctctttcaacacttacaaaaccagctt 22760848  T
Q  132 cagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattc 231  Q
    || |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22760847 caaatgctcagcatgctcttcttcagacttggagtaaatcaaaatatcattaataaaaacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatgaaagatgcgattc 22760748  T
Q  232 atatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatat 331  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  22760747 atgtactccataaatactccaggtgcatttgtaacaccgaaaggcataactttatactcataatgtccataacgcgttctgaaagctgtcttgtgcatat 22760648  T
Q  332 cttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacgg 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  22760647 cttcatcttttactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctgacaacacgtgcacccactaactaatccatcaaatcatcaattctcgg 22760548  T
Q  432 aagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactgatgat 475  Q
    |||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||    
T  22760547 aagtggatacctattctttattgttacattgttcaactgttgat 22760504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 29 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 20634435 - 20633994
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |     
T  20634435 cagaaataacatgtccaagaaagctcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttcgcataaagcttcttctctttcaacacttgcaaaaccag 20634336  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  20634335 cttcaaatgctcagcatgttcttctttagacttggagtaaatcaaaatatcatcaataaaaacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatgaaagatgcga 20634236  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20634235 ttcatgtactccataaatactccaggtgcatttgtaacaccgaaaggcataactttgtactcataatgtccataacgcgttctgaaagctgtcttctgca 20634136  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||||||| || |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  20634135 tatcttcatcttctactttaatctggtgataaccagatctcaaatctatcttgctgaaaacttttgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattct 20634036  T
Q  429 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  20634035 cggaagtggatacctattctttattgtcaccttgttcaactg 20633994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 29 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 25608356 - 25607918
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  25608356 cagaaataacatggccaagaaaacttacctctttcaaccagaattcacactttgacaatttagcataaagcttcttctctttcaacacttgtaaaacaat 25608257  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  25608256 cttcaaatgctcagcatcttcttcttcagacttggagtaaatcaaaatatcatcaataaaaacaactacgaatcgatccaaaaatgcatgaaagatgcaa 25608157  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||  |||| || || || ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25608156 ttcatgtactccataaatactccaggtgcatttgtaacaccgaacagcattaccttgtactcataatgtccataacgcgttctgaaagctgtcttctgca 25608057  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |     
T  25608056 tgtcttcatcttttactttaatctggtgataacctgatctcaaatctatcttgctgaaaacacatgcacccactaactgatccatcaagtcatcaatcct 25607957  T
Q  429 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaa 467  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  25607956 cggaagtggatacctattctttatagtcaccttgttcaa 25607918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 23 - 391
Target Start/End: Original strand, 22444047 - 22444415
Alignment:
Q  23 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 122  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22444047 catcaccagaaataacatggccaagaaaacttacctctttcaaccagaactcacacttagataatttaggataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 22444146  T
Q  123 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 222  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||    
T  22444147 gacaatcttcagatgctcaacatgttcttctttagtcttggagtaaattaaaatatcatcgataaaaacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatgaaag 22444246  T
Q  223 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 322  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | || ||||||||||||    
T  22444247 atgcgattcatgtactccataaatactctaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacacgttatgaaagctgtct 22444346  T
Q  323 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacac 391  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  22444347 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctgaaaacac 22444415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 29 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 18406439 - 18405998
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |     
T  18406439 cagaaataacatgtccaagaaagctcacttctttcaaccagaattcacacttaaacaatttagcatatagtttcttctctttcaacacttgcaaaaccag 18406340  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||    
T  18406339 tttcaaatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcaatgaaaacaaccacaaaacgatccaaaaatgcatgaaagatgcga 18406240  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||| ||||| || ||||||  | ||||||| |||||||||||||    
T  18406239 ttcatgtactccataaatactccaggtgcatttgtaacaccgaacggcatcaccttatactcataatgtccataatacgttctgaaggctgtcttctgca 18406140  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| ||  || |||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  18406139 tatcttaatctttcactttaatctggtgatgacccgatctcaaatctatcttgctgaaaacacttgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattct 18406040  T
Q  429 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    |||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  18406039 cggaggtggatacctattctttattgttaccttgttcaactg 18405998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 232 - 470
Target Start/End: Original strand, 16573879 - 16574117
Alignment:
Q  232 atatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatat 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16573879 atatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatat 16573978  T
Q  332 cttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacgg 431  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  16573979 cttcatcctttactttaatctggtgatatcctgacctcaaatcaatcttgctaaaaacacgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcgg 16574078  T
Q  432 aagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16574079 aagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 16574117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 232 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 16621501 - 16621263
Alignment:
Q  232 atatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatat 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16621501 atatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatat 16621402  T
Q  332 cttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacgg 431  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  16621401 cttcatcctttactttaatctggtgatatcctgacctcaaatcaatcttgctaaaaacacgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcgg 16621302  T
Q  432 aagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16621301 aagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 16621263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 32 - 334
Target Start/End: Original strand, 23080258 - 23080560
Alignment:
Q  32 aaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatctt 131  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | || || ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  23080258 aaataacatggccaaggaaactcacctctttcaaccagaattcaaactttgataatttagcataaagtttcttctctttcagcacttgcaaaacaatctt 23080357  T
Q  132 cagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattc 231  Q
    || |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||| || |||||||||    
T  23080358 caaatgctcagcatgttcttcctcagacttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaaccacgaaacgatctagaaatgcatgaaaaatgcgattc 23080457  T
Q  232 atatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatat 331  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||| || ||||||||| |||| ||| | |||||||||||||    
T  23080458 atgtactccataaacactccaggtgcatttgtaacaccgaaagacatcactttatattcataatgtccataacgcgttctaaaatccgtcttctgcatat 23080557  T
Q  332 ctt 334  Q
    |||    
T  23080558 ctt 23080560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 91 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 23086204 - 23085825
Alignment:
Q  91 gcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaaca 190  Q
    |||||||| |||||||| | || ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23086204 gcataaagcttcttctcctccagcacttgcaaaacaatcttcaaatgctcagcatgttcttcttcatacttagagtatatcaaaatatcatcgatgaaca 23086105  T
Q  191 caactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattc 290  Q
    |||| ||||| ||||||||| | ||||| || || |||||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||| |||  ||||||    
T  23086104 caaccacgaagcgatccaaatacgcatgaaaaatacgattcatgtactccataaacacacccggcgcatttgtaacaccgaaaggcatcactgaatattc 23086005  T
Q  291 atagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaaca 390  Q
    ||| || ||||||||  | || || || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||| ||||| ||||| || |||    
T  23086004 ataatgtccataacgtgtcctaaaggccgtcttctagatatcttcatcttttactttaatctgatggtaacccgacctcaagtcaatcttgctaaacaca 23085905  T
Q  391 cgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||  ||||| | |||||||||||| || ||||| || ||||||||    
T  23085904 cgtgcacccactaactgatccatcaagtcgtcaattcttggaagggaatacctattctttatcgttactttattcaactg 23085825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 29 - 471
Target Start/End: Original strand, 25769630 - 25770072
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    |||||||||  |||||||||||||| || ||  | ||||||||||||||||| ||||| || ||||| |  ||| | | ||||||||||||||| |||||    
T  25769630 cagaaataatgtggccaagaaaacttacttcacttaaccagaattcacatttggacaacttagcatacaacttcatttatttcaacacttgcaacacaat 25769729  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||  ||| || ||||| |  |||||||| || |||||||| || |||  ||||  | | |||||||| || ||     
T  25769730 cttcagatgctctgcatgctcttcttcatacttagaataaattaggatatcatcaataaacacaaccacaaatttatccggataagcatggaaaattcgg 25769829  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||| ||| || ||||| ||||| || ||||| ||  | || || ||  | |||||||    
T  25769830 ttcatatactccataaatacaccaggcgcattagtaacaccgaaagacatcaccttatactcataatgtccatatcgtgtcctaaaggccattttctgca 25769929  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    |||| ||||| || || |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  25769930 tatcctcatcattcaccttaatctgatggtaacctgacctcaaatcaattttgctgaatacacgagcacccactaactgatccattaaatcatcaattct 25770029  T
Q  429 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 471  Q
    ||||||||||||||| ||||| || || || || |||||||||    
T  25770030 cggaagtggatacctgttctttatcgtcactttattcaactga 25770072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 228 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 18183663 - 18183422
Alignment:
Q  228 attcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgc 327  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||| | || ||||  |||||||||    
T  18183663 attcatgtacaccataaacacaccaggcgcatttgtaacaccgaaaggcatcactttatattcataatgtccataacgcgtgctaaaagacgtcttctgc 18183564  T
Q  328 atatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattc 427  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  18183563 atatcttcatctttcactttaatctggtgataaccggacctcaaatcaatcttgctaaacacacgtgcacccactaactgatgcatcaagtcatcaattc 18183464  T
Q  428 acggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaact 469  Q
     ||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||    
T  18183463 tcggaagtggatacctattctttatcgttaccttattcaact 18183422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 29 - 446
Target Start/End: Original strand, 19881084 - 19881501
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||  | |||||||| || || || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  19881084 cagaaataatatggccaagaaaactcacttcacttaaccagaactcgcactttgacaatttggcatacagtttcttctctttcaatacttgcaatacaat 19881183  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
    | ||||||| || ||||| ||||| |||||  | || || |||||||| ||||| ||||||||||| || |||  |||||   | ||||| || || | |    
T  19881184 cctcagatgttctgcatgctcttcctcagttctcgaatagatcaaaatgtcatcaatgaacacaaccacaaatttatccaggtaagcatgaaaaatccta 19881283  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| || |||||||  || |||||||| ||  | || || || ||||||||||    
T  19881284 ttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttatatttgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggcagtcttctgca 19881383  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    | ||||||||||| || || ||||| || |||| ||||||||| |||||||| || ||||    |||||| || |||||||||||||| || ||||| |     
T  19881384 tgtcttcatctttcaccttgatctgatggtaacctgacctcaagtcaattttactaaaaatctttgcaccaaccaactgatccatcaagtcgtcaatcct 19881483  T
Q  429 cggaagtggatacctatt 446  Q
    |||||| ||||| |||||    
T  19881484 cggaagcggatatctatt 19881501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 29 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 14378411 - 14377991
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    |||||||||  |||||||||||||| || ||  | ||||| || |||||||| ||||| |||||||| |  || ||||||||||| |||||||| |||||    
T  14378411 cagaaataatgtggccaagaaaacttacttcacttaaccaaaactcacatttcgacaacttggcatacaactttttctctttcaagacttgcaatacaat 14378312  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
    |||||||||||| ||||| || ||||||||||| || ||||||| | ||||||| || || ||||| || |||  ||||| ||| ||||| || || ||     
T  14378311 cttcagatgctctgcatgctcctcttcagtcttagaataaatcagactatcatcaataaatacaaccacaaatttatccagaaaagcatgtaaaattcgg 14378212  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| ||  | || || || ||||||||||    
T  14378211 ttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttgtattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgca 14378112  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    |||| ||||| || || ||||| || || |||| ||| ||||| ||||| || ||||||||   |||||||||||||||||||| ||| |||| ||| |     
T  14378111 tatcctcatccttcaccttaatttgatggtaacctgatctcaattcaatcttactgaaaacctttgcacccactaactgatccaacaagtcataaatcct 14378012  T
Q  429 cggaagtggatacctattctt 449  Q
     |||||||||||||| |||||    
T  14378011 aggaagtggatacctgttctt 14377991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 29 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 14379961 - 14379541
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    |||||||||  |||||||||||||| || ||  | ||||| || |||||||| ||||| |||||||| |  || ||||||||||| |||||||| |||||    
T  14379961 cagaaataatgtggccaagaaaacttacttcacttaaccaaaactcacatttcgacaacttggcatacaactttttctctttcaagacttgcaatacaat 14379862  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
    |||||||||||| ||||| || ||||||||||| || ||||||| | ||||||| || || ||||| || |||  ||||| ||| ||||| || || ||     
T  14379861 cttcagatgctctgcatgctcctcttcagtcttagaataaatcagactatcatcaataaatacaaccacaaatttatccagaaaagcatgtaaaattcgg 14379762  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| ||  | || || || ||||||||||    
T  14379761 ttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttgtattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgca 14379662  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    |||| ||||| || || ||||| || || |||| ||| ||||| ||||| || ||||||||   |||||||||||||||||||| ||| |||| ||| |     
T  14379661 tatcctcatccttcaccttaatttgatggtaacctgatctcaattcaatcttactgaaaacctttgcacccactaactgatccaacaagtcataaatcct 14379562  T
Q  429 cggaagtggatacctattctt 449  Q
     |||||||||||||| |||||    
T  14379561 aggaagtggatacctgttctt 14379541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 312 - 471
Target Start/End: Original strand, 21755002 - 21755160
Alignment:
Q  312 gaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatcc 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || ||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  21755002 gaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacctgatctcaaatctatcttgctgaaaacaaatgcacccactaactgatcc 21755101  T
Q  412 atcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 471  Q
    ||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21755102 atcaagtcatcaatcctcggaagtggatacctattcttgatagtta-cttgttcaactga 21755160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 40 - 471
Target Start/End: Original strand, 19454821 - 19455251
Alignment:
Q  40 tggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgct 139  Q
    ||||||||||||||||| ||  | |||||||| ||||| || ||||| || ||||| |  ||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||    
T  19454821 tggccaagaaaactcacttcacttaaccagaactcacactttgacaacttagcatacaacttcttttctttcaaaacttgcaatactatcttcagatgct 19454920  T
Q  140 cagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactc 239  Q
    | ||||| ||||||| |||||| || |||||||| || ||||| || || ||||| || |||  ||||||  | |||||||| || || |||||||||||    
T  19454921 ctgcatgctcttctttagtctttgaataaatcaagatgtcatcaataaatacaaccacaaatttatccaagtaggcatggaaaattcggttcatatactc 19455020  T
Q  240 cataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatct 339  Q
    ||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||| ||| || || ||||| || |||||||| ||  | || || || ||||||| ||||||||||||     
T  19455021 catgaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaagacatcaccttgtattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctacatatcttcatcc 19455120  T
Q  340 tttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggat 439  Q
    || || |||||||| || |||| ||||||||| | ||| || || || |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| | ||| |||||||    
T  19455121 ttcaccttaatctgatggtaacctgacctcaagtaaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaagtcatcaatcctcgg-agtggat 19455219  T
Q  440 acctattcttgatagttaccttgttcaactga 471  Q
     ||| ||| | || || || ||||||||||||    
T  19455220 tcctgttcgttatcgtaactttgttcaactga 19455251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 40 - 471
Target Start/End: Original strand, 21473398 - 21473828
Alignment:
Q  40 tggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgct 139  Q
    |||||||||||||| || ||  | ||||||||||||||||| ||||| ||| |||| |  ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  21473398 tggccaagaaaacttacttcacttaaccagaattcacatttggacaacttgacatacaacttcctttctttcaacacttgcaacacaatcttcagatgtt 21473497  T
Q  140 cagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactc 239  Q
    | ||||| || |||||| |||| || ||||| |  |||||||  || |||||||| || |||  ||||| | | ||||| || || || |||||||||||    
T  21473498 ctgcatgctcctcttcattcttagaataaattaggatatcataaataaacacaaccacaaatttatccagataagcatgaaaaattcggttcatatactc 21473597  T
Q  240 cataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatct 339  Q
    ||||||||| ||||  ||||| |||||| | |||| ||| || ||||| ||||| || ||||| ||  | || || || || ||||||||||| |||||     
T  21473598 cataaacacaccagc-gcattagtaacatcgaaagacatcaccttatactcataatgtccatatcgtgtcctaaaggccgttttctgcatatcctcatcc 21473696  T
Q  340 tttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggat 439  Q
    || ||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||  |||||| |||    
T  21473697 ttcactttaatctgatggtaacctgacctcaaatcaattttgttgaacacacgagcacccactaactgattcattaaatcatcaattctaggaagtcgat 21473796  T
Q  440 acctattcttgatagttaccttgttcaactga 471  Q
    || | ||||| || || || || |||||||||    
T  21473797 acatgttctttatcgtcactttattcaactga 21473828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 29 - 470
Target Start/End: Original strand, 15461122 - 15461563
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcata-aagtttcttctctttcaacacttgcaagacaa 127  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| ||  | |||||||| || || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||| |  ||||| ||||    
T  15461122 cagaaataacgtggcctagaaaactcacttcacttaaccagaaatcgcacttcgacaacttggcatacaactttct-ctctttcaaaatctgcaacacaa 15461220  T
Q  128 tcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcg 227  Q
    ||||||  || || || ||||| |||||||| || || ||||||| ||||||||| || ||||| || || |||  ||| | ||| |||||||| || ||    
T  15461221 tcttcaagtgttcggcgtgttcctcttcagttttagaataaatcagaatatcatctataaacaccaccacaaatttatctagaaaggcatggaaaattcg 15461320  T
Q  228 attcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgc 327  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||  |||| || || ||||| |||    
T  15461321 gttcatatactccatgaacacaccaggcgcgttagtaacaccgaaaggcatcactttgtattcgtaatgaccatatcgtgttctaaaggccgtcttttgc 15461420  T
Q  328 atatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattc 427  Q
    |||||||| ||||| |||||||| || || ||||  |||||||| ||||| ||||| |||||    ||||| || ||||| ||||||||||||||||| |    
T  15461421 atatcttcgtctttcactttaatttgatggtaacccgacctcaagtcaatcttgctaaaaactttagcacctaccaactggtccatcaaatcatcaatcc 15461520  T
Q  428 acggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
     |||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||    
T  15461521 gcggaagtggatatctattcttgattgtaactttgttcaactg 15461563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 27 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 10467346 - 10466902
Alignment:
Q  27 atcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagaca 126  Q
    |||||||||||  || || ||||||||||| ||  | |||||||| |||||||| ||||| || ||||| |   |||| |||||||| |||||||| |||    
T  10467346 atcagaaataatgtgacccagaaaactcacttcgcttaaccagaactcacattttgacaactttgcatacaacctcttttctttcaaaacttgcaataca 10467247  T
Q  127 atcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgc 226  Q
    ||  |||||||||| ||||| || |||||| ||||||| || || | ||||||||| || ||||| || || ||   ||||| ||| |||||||| || |    
T  10467246 attctcagatgctctgcatgctcctcttcattcttggaatagattagaatatcatcaataaacaccacaacaaacttatccataaaagcatggaaaattc 10467147  T
Q  227 gattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctg 326  Q
    | |||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||  || ||  | || || || ||||||||    
T  10467146 ggttcatatactccatgaacacaccaggcgcgttagtaacaccgaaaggcatcactttgtattcgtaatgactttatcgtgtcctaaaggccgtcttctg 10467047  T
Q  327 catatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaatt 426  Q
    |||||| ||||| || || || ||||| || ||||  |||||||| ||||| || ||||| ||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10467046 catatcctcatccttcacctttatctgatggtaaccagacctcaagtcaatcttactgaacacctttgcacccactaactgatccatcaagtcatcaatt 10466947  T
Q  427 cacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 471  Q
    | ||||||||||||||| ||||| |  || || ||||||||||||    
T  10466946 ctcggaagtggatacctgttctttactgtaactttgttcaactga 10466902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 29 - 449
Target Start/End: Original strand, 18796476 - 18796896
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    |||||||||  |||||| |||||||||| || || |||||||| ||||| || |||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  18796476 cagaaataatgtggccatgaaaactcacttcatttaaccagaactcacacttcgacaatttggcatacaacttcttctctttcaatacttgcaacacaat 18796575  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
    ||||||||| || ||||| |||||||||||  | || || |||||||| | ||| ||||| ||||| || |||  ||||| | | |||||||| || |      
T  18796576 cttcagatgttctgcatgctcttcttcagttctagaatagatcaaaatgttatcaatgaatacaaccacaaatttatccagataggcatggaaaattctg 18796675  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||  |||| |||||||  |||||||| || |||||||| || |||||||| ||  | || || || ||||||||||    
T  18796676 ttcatatactccatgaacacaccaggcacattagtaacactgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggcagtcttctgca 18796775  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    |||| ||||| || || || ||||| || || | ||||||||| |||||||| || ||||    |||||| || |||||||||||||| || ||||| |     
T  18796776 tatcctcatccttcaccttgatctgatggtagcctgacctcaagtcaattttactaaaaatctttgcaccaaccaactgatccatcaagtcgtcaatcct 18796875  T
Q  429 cggaagtggatacctattctt 449  Q
    |||||| |||||||| |||||    
T  18796876 cggaagcggatacctgttctt 18796896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 227 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 18963385 - 18963142
Alignment:
Q  227 gattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctg 326  Q
    ||||||| ||||||||||| || || |||||||| |||||||| |||||||| |||  |||||| || || ||||||||  | || ||||  ||||||||    
T  18963385 gattcatgtactccataaatacacctggtgcattagtaacaccgaaaggcatcactgaatattcgtaatgtccataacgtgtcctaaaagtcgtcttctg 18963286  T
Q  327 catatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaatt 426  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||| |  || ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18963285 catatcgtcatctttcactttaatctggtgatagcccgatctcaaatcaatcttgctaaacacacgtgcacccactaactgatacatcaaatcatcaatt 18963186  T
Q  427 cacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    |  |||||||||||||||||||| || || || || ||||||||    
T  18963185 cttggaagtggatacctattctttatcgtcactttattcaactg 18963142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 29 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 18196228 - 18196024
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||| | || |||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  18196228 cagaaataacatggccaagaaaattcacatctttcaaccaaaattcatactttgacaatttagcatatagcttcttctctttcagcacttgcaaaacaat 18196129  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
    ||||| ||||| |||||| |||||||| | ||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| || || ||||||||||| ||||| || || |||    
T  18196128 cttcaaatgcttagcatgctcttcttcggacttggagtatatcaaaatatcataaatgaacacaaccacaaaacgatccaaaaacgcatgaaaaatacga 18196029  T
Q  229 ttcat 233  Q
    |||||    
T  18196028 ttcat 18196024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 23 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 28281314 - 28280870
Alignment:
Q  23 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 122  Q
    ||||| |||||||||  || ||||| |||||||| ||  | | ||| ||||||||||| |||| ||||||||| |  ||| | |||||||| ||||||||    
T  28281314 catcaccagaaataatgtgaccaaggaaactcacttcacttagccaaaattcacatttcgacagtttggcatacaacttcctttctttcaaaacttgcaa 28281215  T
Q  123 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 222  Q
     |||||  ||||||| || ||||| ||| |||||||||| || ||||||| ||| ||||| || || || || ||||||  ||||| ||| ||||| ||     
T  28281214 cacaattctcagatgttctgcatgctctccttcagtcttcgaataaatcagaatgtcatcaataaataccaccacgaatttatccagaaaagcatgaaaa 28281115  T
Q  223 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 322  Q
    || ||||||||||||||||| ||||| || || || || |||||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||  | || || || ||||    
T  28281114 attcgattcatatactccatgaacacacccggcgcgttagtaacaccgaaaggcatcactttgtattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggccgtct 28281015  T
Q  323 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 422  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||| || || |||| ||||||||| ||||| || ||||| ||   |||||| || | ||| |||||||| |||||    
T  28281014 tctgcatatcttcatctttcaccttaatttgatggtaacctgacctcaagtcaatcttactgaacacctttgcacctaccagctggtccatcaagtcatc 28280915  T
Q  423 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaa 467  Q
    ||| | |||||| ||||| |||||||| || || || ||||||||    
T  28280914 aatcctcggaagcggatatctattcttaattgtaactttgttcaa 28280870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 29 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 34644081 - 34643639
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||| || ||  | |||||||| ||||| || |||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  34644081 cagaaataatatggccaaggaaacttacttcacttaaccagaactcacacttcgacaatttggcatacaacttcttctctttcaatacttgcaacacaat 34643982  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
      | ||||| || ||||| ||||| || ||  | || || |||||||| ||||| ||| ||||||| || |||  ||||| | | ||||| || || | |    
T  34643981 tcttagatgttctgcatgctcttcctccgttgtcgaatagatcaaaatgtcatcaatgtacacaaccacaaatttatccagataagcatgaaaaattcta 34643882  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||| ||  | || || || ||||||||||    
T  34643881 ttcatatactccatgaacaccccaggcgcgttagtaacaccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggcagtcttctgca 34643782  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    | ||||||||||| || || || || || |||| ||||||||| |||||||| || ||||     ||||| || |||||||||||||| || |||||||     
T  34643781 tgtcttcatctttcaccttgatttgatggtaacctgacctcaagtcaattttactaaaaatcttggcaccaaccaactgatccatcaagtcgtcaattct 34643682  T
Q  429 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 471  Q
    |||||| ||||| || ||||| || || || || |||||||||    
T  34643681 cggaagaggatatctgttctttatcgtaactttattcaactga 34643639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 117 - 471
Target Start/End: Original strand, 19436876 - 19437230
Alignment:
Q  117 ttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgca 216  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||  | || || |||| ||| ||||| || |||||||| || |||  ||||| | | |||    
T  19436876 ttgcaacacaatcttcagatgttctgcatgctcttcttcagttctagaatagatcagaatgtcatcaataaacacaaccacaaatttatccagataggca 19436975  T
Q  217 tggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaag 316  Q
    ||||| ||  | |||||||||||||| ||||| | ||| ||||| |||||||| |||||||| || || ||||| || || ||||| ||  | || || |    
T  19436976 tggaaaatttggttcatatactccatgaacacactaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttgtattcgtaatgtccatatcgtgtcctaaagg 19437075  T
Q  317 ctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaa 416  Q
    |||||||||||||||| ||||| || || || ||||| || |||| ||||||||| ||||| || || |||||   ||||||||| ||||||||||||||    
T  19437076 ctgtcttctgcatatcctcatccttcaccttgatctgatggtaacctgacctcaagtcaatcttactaaaaacctctgcacccaccaactgatccatcaa 19437175  T
Q  417 atcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 471  Q
     |||| ||| | ||||||||||||||| ||||| || || || || |||||||||    
T  19437176 gtcataaatcctcggaagtggatacctgttctttattgtaactttattcaactga 19437230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 30 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 16380867 - 16380427
Alignment:
Q  30 agaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatc 129  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||| || ||||| |||||||| |||||| | |  |  ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  16380867 agaaatcacatgaccaaggaaactcacttccttcaaccaaaactcacacttagacaacttggcacacaactggttctctttcaagacttgcaacacaatc 16380768  T
Q  130 ttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgat 229  Q
     ||| |||||||||||| ||||| |||| ||| || || | |||||||||||| |||||||| || || || || |||| | | | ||| || || | ||    
T  16380767 ctcaaatgctcagcatgctcttcctcagactttgaatacaccaaaatatcatctatgaacaccaccacaaaacggtccagataaggatgaaatattctat 16380668  T
Q  230 tcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcat 329  Q
    |||| || |||||||| || || |||||||| |  || ||||| ||||| ||   ||| |||||||| ||||| | | ||| ||| || || ||    ||    
T  16380667 tcatgtattccataaagacacctggtgcattagatactccaaatggcatcacagaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcagttttggatat 16380568  T
Q  330 atcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcac 429  Q
    ||||||  | |||||| ||||||| ||||| | ||| ||||||||||| || || || ||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |      
T  16380567 atcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcacccactagctgatccatcaaatcatcaatcctt 16380468  T
Q  430 ggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    ||||||||||||| |||||| || || ||||||||||||||    
T  16380467 ggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactg 16380427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 64 - 471
Target Start/End: Original strand, 24366233 - 24366640
Alignment:
Q  64 aaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttgg 163  Q
    |||||||| ||||| || ||||| || ||||| |   |||| || |||||||||||||| |||||  |||| ||||| ||||| || || ||| ||||||    
T  24366233 aaccagaactcacacttcgacaactttgcatacaacctcttttccttcaacacttgcaatacaattctcaggtgctctgcatgctcctcctcattcttgg 24366332  T
Q  164 agtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggt 263  Q
    | || || ||||||||||| || ||||| || || ||   ||||| ||| |||||||| || || ||||| ||||||||||| || || ||  |||| ||    
T  24366333 aatagattaaaatatcatcaataaacaccacaacaaacttatccagaaaagcatggaaaattcggttcatgtactccataaatacacctggcacattagt 24366432  T
Q  264 aacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataactt 363  Q
    |||||| |||||||| ||||| || || || |||||||||||  | || || || ||||| |||||||| ||||| || || || ||||| |||||||      
T  24366433 aacaccgaaaggcatcactttgtactcgtaatgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttttgcatatcctcatccttcacctttatctgatgataacca 24366532  T
Q  364 gacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgt 463  Q
    |||||||||||||| || |||||||     ||||| || |||||||||||||| || |||||||  ||||| |||||||| |||||||| || || ||||    
T  24366533 gacctcaaatcaatcttactgaaaatcttagcaccaaccaactgatccatcaagtcgtcaattctaggaagcggatacctgttcttgatcgtaactttgt 24366632  T
Q  464 tcaactga 471  Q
    ||||||||    
T  24366633 tcaactga 24366640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 316 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 30679215 - 30679061
Alignment:
Q  316 gctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatca 415  Q
    ||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30679215 gctgtcttctgcatatcctcatccgtcactttaatctgatgatagcctgatctcaaatcaatcttgctaaacacacgtgtacccactaactgatccatca 30679116  T
Q  416 aatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    ||||||||||||  |||||| ||||||||||||| || || || |||||||||||    
T  30679115 aatcatcaattcttggaagtagatacctattctttattgtcactttgttcaactg 30679061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 29 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 18965790 - 18965629
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| || ||||| |  ||||||||||||| |||||| || |||||    
T  18965790 cagaaataatatggccaaggaaactcacctcattcaaccagaattcacactttgacaacttagcatataacttcttctctttcatcacttgaaaaacaat 18965691  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaaca 190  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| ||| |  || |||||||||||||| |||||||    
T  18965690 cttcaaatgctcagaatgttcttcttcagacttagcatatatcaaaatatcatcaatgaaca 18965629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 262 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 24516670 - 24516461
Alignment:
Q  262 gtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataac 361  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||  | || ||||| |||||||||||||||||||| || || ||||| || || ||||    
T  24516670 gtaacaccgaaaggcatcactttgtattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaagccgtcttctgcatatcttcatccttcaccttaatttgatggtaac 24516571  T
Q  362 ttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttacctt 461  Q
     ||||||||| ||||| || || |||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||| || || || ||    
T  24516570 ctgacctcaagtcaatcttactaaaaacctttgcacccactaactgatccatcaagtcatcaatcctcggaagtggatacctgttctttattgtaacttt 24516471  T
Q  462 gttcaactga 471  Q
     |||||||||    
T  24516470 attcaactga 24516461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 30 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 16648463 - 16648023
Alignment:
Q  30 agaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatc 129  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||| || ||||| |||||||| |||||  | |  |  ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  16648463 agaaatcacatgaccaaggaaactcacttccttcaaccaaaactcacacttagacaacttggcgcacaactggttctctttcaagacttgcaacacaatc 16648364  T
Q  130 ttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgat 229  Q
     ||| |||||||||||| ||||| |||| ||| || || | |||||||||||| |||||||| || || || || |||| | | | ||| || || | ||    
T  16648363 ctcaaatgctcagcatgctcttcctcagactttgaatacaccaaaatatcatctatgaacaccaccacaaaacggtccagataaggatgaaatattctat 16648264  T
Q  230 tcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcat 329  Q
    |||| || |||||||| || || || ||||| |  || ||||| ||||| ||   ||| |||||||| ||||| | | ||| ||| || || ||    ||    
T  16648263 tcatgtattccataaagacacctggcgcattagatactccaaatggcatcacagaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcagttttggatat 16648164  T
Q  330 atcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcac 429  Q
    ||||||  | |||||| ||||||| ||||| | ||| ||||||||||| || || || ||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |      
T  16648163 atcttctgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctttgcacccactagctgatccatcaaatcatcaatcctt 16648064  T
Q  430 ggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    ||||||||||||| |||||| || || ||||||||||||||    
T  16648063 ggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactg 16648023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 29 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 19487767 - 19487528
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| || ||  | ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |  |||||  | |||||||||||||| |||||    
T  19487767 cagaaataatatggccaagaaaacttacttcacttaaccagaattcacatttggacaacttggcatacaacttctttaccttcaacacttgcaacacaat 19487668  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
    ||| | |||||| ||||| |||||||||| ||| || |||||||| || ||||| || || ||||| || || ||||||||| | ||||          |    
T  19487667 ctttaaatgctctgcatgctcttcttcagacttagaataaatcaagatgtcatcaataaaaacaaccacaaaccgatccaaataagcat----------a 19487578  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcat 278  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  19487577 ttcatgtactccataaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcat 19487528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 29 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 21568486 - 21568046
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    |||||||||  ||||| |||||||| || ||  | | ||||||||||||||| ||||| || ||||| |  ||||| |||||||| || |  ||  ||||    
T  21568486 cagaaataatgtggccgagaaaacttacttcaattagccagaattcacatttcgacaacttagcatacaacttcttttctttcaaaacctataattcaat 21568387  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
    | ||||||| ||  |||| || ||||| ||||| || ||||||| ||||||||| || || ||||| |  |||  ||||| ||| ||||| || || ||     
T  21568386 cctcagatgttctacatgctcctcttcggtcttagaataaatcagaatatcatcaataaatacaaccataaatttatccagaaaagcatgaaaaattcgg 21568287  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||| |||| ||| ||||| ||||| || ||||||||| |  | || || || ||||||||||    
T  21568286 ttcatatactccatgaacacaccaggcgcgttagtaacaccgaaagacatcactttgtattcgtaatgaccataaagtgtcctaaaggccgtcttctgca 21568187  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    |||||||||| || || || ||||| || |||| ||||||||| ||||| || || ||||    |||||| |  || ||||||||||| || ||||| |     
T  21568186 tatcttcatccttcacctttatctgatggtaacctgacctcaagtcaatcttactaaaaatctttgcaccaaacaattgatccatcaagtcgtcaatcct 21568087  T
Q  429 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaact 469  Q
    ||| || |||||||| ||||| || || || ||||||||||    
T  21568086 cggcagcggatacctgttctttatcgtcactttgttcaact 21568046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 30 - 470
Target Start/End: Original strand, 23998035 - 23998475
Alignment:
Q  30 agaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatc 129  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||||| || | |||||| || ||||| |||||||| |||||| | |  |  ||||||||||| |||| ||| ||||||    
T  23998035 agaaatcacatgaccaaggaaactcacttcctccaaccaaaactcacacttagacaacttggcacataactggttctctttcaagacttacaacacaatc 23998134  T
Q  130 ttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgat 229  Q
     ||| ||| |||||||| ||||| || | |||  | || | |||||||||||| |||||||| || || || || |||| | | | ||| || || | ||    
T  23998135 ctcaaatgttcagcatgctcttcctcggactttcaatacaccaaaatatcatctatgaacaccaccacaaaacggtccagataaggatgaaatattctat 23998234  T
Q  230 tcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcat 329  Q
    |||| || |||||||| || || || ||||| |  || ||||| ||||| ||   ||| |||||||| ||||| | | ||| ||| || || ||    ||    
T  23998235 tcatgtattccataaagacacctggcgcattagatactccaaatggcatcacagaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcagttttggatat 23998334  T
Q  330 atcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcac 429  Q
    ||||||  | |||||| ||||||| ||||| | ||| ||||||||||| ||||| || ||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |      
T  23998335 atcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttgctaaacacctctgcacccactagctgatccatcaaatcatcaatcctt 23998434  T
Q  430 ggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    ||||||||||||| |||||| || || ||||||||||||||    
T  23998435 ggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactg 23998475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 30 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 1647308 - 1646868
Alignment:
Q  30 agaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatc 129  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||| || ||||| |||||||| |||||| | |     || |||||||| |||||||| ||||||    
T  1647308 agaaatcacatgaccaaggaaactcacttccttcaaccaaaactcacacttagacaacttggcacacaaccggttatctttcaagacttgcaacacaatc 1647209  T
Q  130 ttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgat 229  Q
     ||| |||||||||||| ||||| |||  ||| || || | |||||| ||||| |||||||| || || || || |||| | | | ||| || || | ||    
T  1647208 ctcaaatgctcagcatgctcttcctcaaacttcgaatacaccaaaatgtcatctatgaacaccaccacaaaacggtccagataaggatgaaatattctat 1647109  T
Q  230 tcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcat 329  Q
    ||||||| |||||||| || || || ||||| |  || ||||| ||||| ||   ||| |||||||| ||||| | | ||| ||| || || ||    ||    
T  1647108 tcatatattccataaagacacctggcgcattagatactccaaatggcatcacagaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcagttttggatat 1647009  T
Q  330 atcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcac 429  Q
    ||||||  | || ||| ||||||| ||||| | ||| ||||||||||| || || || ||    ||||| |||| ||||||||||||||||||||| |      
T  1647008 atcttccgccttcactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctcagcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatcctt 1646909  T
Q  430 ggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    ||||||||||||| |||||| || || ||||||||||||||    
T  1646908 ggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactg 1646868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 379 - 470
Target Start/End: Original strand, 23080559 - 23080650
Alignment:
Q  379 ttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||| |||||||| || ||||| || ||||||||    
T  23080559 ttgctaaacacacgtgcacccactaactgatccatcaagtcatcaattcttggaagtgaatatctattctttatcgttactttattcaactg 23080650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 346 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 8761930 - 8761805
Alignment:
Q  346 ttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctat 445  Q
    |||||||| || |||| ||||||||| ||||| |||||||||||    |||||||||||||||||||| || |||||||| | ||||||||||||| | |    
T  8761930 ttaatctgatggtaacctgacctcaagtcaatcttgctgaaaactttcgcacccactaactgatccattaagtcatcaatcctcggaagtggatacttgt 8761831  T
Q  446 tcttgatagttaccttgttcaactga 471  Q
    |||| || ||  | ||||||||||||    
T  8761830 tctttattgtacctttgttcaactga 8761805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 29 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 5295701 - 5295573
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    |||||||||  |||||||||||||| || ||  | ||||||||  | ||||| ||||| |||||||| |   |||| ||||||||||||||||| |||||    
T  5295701 cagaaataatgtggccaagaaaacttacttcacttaaccagaacacgcatttggacaacttggcatacaacctcttttctttcaacacttgcaacacaat 5295602  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcag 157  Q
     ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  5295601 tttcagatgctctgcatgctcttcttcag 5295573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 29 - 442
Target Start/End: Original strand, 18450289 - 18450702
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| | || |||||||||||||| || || || || |||||||| |  |||||| | |||| ||||||||| |||||    
T  18450289 cagaaataatatgaccaagaaaactcccttcgttcaaccagaattcgcacttcgataacttggcatataacttcttccccttcagcacttgcaaaacaat 18450388  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttc-ttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcg 227  Q
      ||| ||||||  ||||||| || || | | || ||||| |||| ||||||||| || |||||||| || || ||||| | | | | ||| || || ||    
T  18450389 tctcaaatgctcgacatgttcctccttgaat-ttagagtatatcagaatatcatctataaacacaacaacaaaacgatctagataagtatgaaaaatacg 18450487  T
Q  228 attcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgc 327  Q
     || ||||| |||||||| |||||  | ||||| |||||||| |||||||| ||   |||||| || |  |  |||||  | || || |  ||||||||     
T  18450488 gttaatatattccataaatactcccagcgcattagtaacaccgaaaggcatcacaaaatattcgtaatttctgtaacgtgtcctaaaggtcgtcttctga 18450587  T
Q  328 atatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattc 427  Q
    ||||| || ||||| ||||| |||| |||||| |  || || || |||||||| ||||| ||| | ||||||||||| |||||||||||||| |  || |    
T  18450588 atatcctcttctttcactttgatctagtgatagcccgagcttaagtcaattttactgaacacaagcgcacccactaattgatccatcaaatcgttgatcc 18450687  T
Q  428 acggaagtggatacc 442  Q
     ||||||||||||||    
T  18450688 tcggaagtggatacc 18450702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 347 - 470
Target Start/End: Original strand, 14130573 - 14130696
Alignment:
Q  347 taatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctatt 446  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||    ||||| || | ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| |||    
T  14130573 taatctgatgatatcttgacctcaaatcaatcttgctaaacacttccgcaccaaccagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 14130672  T
Q  447 cttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
     || || || || |||||||||||    
T  14130673 tttaatcgtcactttgttcaactg 14130696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 347 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 23025923 - 23025800
Alignment:
Q  347 taatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctatt 446  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||| || || || ||     |||| || | ||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||    
T  23025923 taatctgatgatatcttgacctcaaatcaatcttactaaacacctccacaccaaccagctgatccatcaaatcatcaatcctcggaagcggataccgatt 23025824  T
Q  447 cttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    ||| || || ||||||||||||||    
T  23025823 cttaatcgtcaccttgttcaactg 23025800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 432 - 470
Target Start/End: Original strand, 28311819 - 28311857
Alignment:
Q  432 aagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28311819 aagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 28311857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 435 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 23496281 - 23496245
Alignment:
Q  435 tggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 471  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23496281 tggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 23496245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 347 - 470
Target Start/End: Original strand, 16100119 - 16100242
Alignment:
Q  347 taatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctatt 446  Q
    ||||||| ||||| | ||| ||||||||||| || || || ||   |||||| ||||  |||||||||||||||||||| |  || |||||||||| |||    
T  16100119 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagttgatccatcaaatcatcaatccttggtagtggataccgatt 16100218  T
Q  447 cttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    ||| || || ||||||||||||||    
T  16100219 cttaatcgtcaccttgttcaactg 16100242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 396; Significance: 0; HSPs: 42)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 396; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 470
Target Start/End: Original strand, 14682483 - 14682930
Alignment:
Q  23 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 122  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14682483 catcaccagaaataacatggccaagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 14682582  T
Q  123 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14682583 gacaatcttcagatgctcagcatgttctttttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaaccgatccaaaaatgcatggaag 14682682  T
Q  223 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 322  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14682683 atgcgattcatatactccataaactctccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataaccttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtct 14682782  T
Q  323 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 422  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14682783 tctgcatatcgtcatcttttactttaatctggtgataacctgacctcagatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 14682882  T
Q  423 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14682883 aattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 14682930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 384; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 14302075 - 14301628
Alignment:
Q  23 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 122  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14302075 catcaccagaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 14301976  T
Q  123 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 222  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  14301975 aacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgataaacacaaccacaaaccgatccaaaaatgcatggaag 14301876  T
Q  223 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  14301875 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagttgtct 14301776  T
Q  323 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 422  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14301775 tctgcatatcttcatctttcactttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 14301676  T
Q  423 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14301675 aattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 14301628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 372; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 470
Target Start/End: Original strand, 40474956 - 40475403
Alignment:
Q  23 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 122  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40474956 catcaccagaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttcgacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 40475055  T
Q  123 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 222  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||    
T  40475056 aacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaaccacaaaccgatccaaaaatgcatgaaag 40475155  T
Q  223 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  40475156 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgggttctgaaagctgtct 40475255  T
Q  323 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 422  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40475256 tatgcatatcttcatcctttactttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctaaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 40475355  T
Q  423 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40475356 aattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 40475403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 368; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 8051719 - 8051272
Alignment:
Q  23 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 122  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8051719 catcaccagaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 8051620  T
Q  123 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 222  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  8051619 aacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacaaaccgatccaaaaatgcatggaag 8051520  T
Q  223 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8051519 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtct 8051420  T
Q  323 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 422  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8051419 tctgcatatcctcatcctttactttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatc 8051320  T
Q  423 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8051319 aattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 8051272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 368; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 470
Target Start/End: Original strand, 12478516 - 12478963
Alignment:
Q  23 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 122  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12478516 catcaccagaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 12478615  T
Q  123 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 222  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12478616 aacaatcttcagatgctcggcatgttcttcttcggtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgatgaacacaactacgaaccgatccaaaaatgcatggaag 12478715  T
Q  223 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12478716 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaactccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtct 12478815  T
Q  323 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 422  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12478816 tctgcatatcctcatcctttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatc 12478915  T
Q  423 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12478916 aattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 12478963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 368; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 19776889 - 19776442
Alignment:
Q  23 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 122  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19776889 catcaccagaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 19776790  T
Q  123 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 222  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19776789 aacaatcttcagatgctcggcatgttcttcttcggtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgatgaacacaactacgaaccgatccaaaaatgcatggaag 19776690  T
Q  223 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19776689 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaactccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtct 19776590  T
Q  323 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 422  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19776589 tctgcatatcctcatcctttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatc 19776490  T
Q  423 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19776489 aattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 19776442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 368; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 470
Target Start/End: Original strand, 23957663 - 23958110
Alignment:
Q  23 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 122  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23957663 catcaccagaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagcttcttctctttcaacacttgcaa 23957762  T
Q  123 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 222  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  23957763 aacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacaaaccgatccaaaaatgcatggaag 23957862  T
Q  223 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23957863 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtct 23957962  T
Q  323 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 422  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23957963 tctgcatatcttcatcctttactttaatctggtgatatcctgacctcaaatcaatcttgctaaaaacacgtgcacccactagctgatccatcaaatcatc 23958062  T
Q  423 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23958063 aattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 23958110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 31 - 470
Target Start/End: Original strand, 8388336 - 8388775
Alignment:
Q  31 gaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatct 130  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8388336 gaaataacatggccaaggaaactcacctcattcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatct 8388435  T
Q  131 tcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgatt 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8388436 tcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaattaaaatatcgtcgataaacacaactacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgatt 8388535  T
Q  231 catatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcata 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  8388536 catatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagccgtcttctgcata 8388635  T
Q  331 tcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacg 430  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  8388636 tcttcgtcttttactttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcg 8388735  T
Q  431 gaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8388736 gaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 8388775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 470
Target Start/End: Original strand, 27713252 - 27713699
Alignment:
Q  23 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 122  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27713252 catcaccagaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaactagaattcacacttagacaatttagcataaagcttcttctctttcaacacttgcaa 27713351  T
Q  123 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 222  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  27713352 aacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacaaaccgatccaaaaatgcatggaag 27713451  T
Q  223 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27713452 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtct 27713551  T
Q  323 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 422  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  27713552 tctgcatatcttcatcctttactttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgacccatcaaatcatc 27713651  T
Q  423 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27713652 aattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 27713699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 18225542 - 18225094
Alignment:
Q  23 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 122  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18225542 catcaccagaaataacatggccaagaaaaggtacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 18225443  T
Q  123 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  18225442 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatgtcgtcaataaacacaactacgaaccgatccaaaaaggcatggaag 18225343  T
Q  223 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18225342 atgcgattcatatactccataaacagtccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtct 18225243  T
Q  323 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 422  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18225242 tctgcatatcttcatctttcactttaatctggtgataccctgatctcaaatcaatcttgctgaaaacttttgcacccactaactgatccatcaaatcatc 18225143  T
Q  423 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 471  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18225142 aattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 18225094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 15145981 - 15145541
Alignment:
Q  23 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 122  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15145981 catcaccagaaataacatggccaagaaaacttacctctttcaaccagaactcacacttagataatttagcataaagtttcctctctttcaacacttgcaa 15145882  T
Q  123 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 222  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  15145881 gacaatgttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgataaagacaaccacgaatcgatccaaaaatgcatgaaag 15145782  T
Q  223 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 322  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15145781 atacgattcatgtactccataaacactccaggtgcattggtaacaccgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtct 15145682  T
Q  323 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 422  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||    
T  15145681 tctgcatatcttcatcttttactttaatctagtgataacccgatctcaaatcaatgttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatcca--------tc 15145590  T
Q  423 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 471  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15145589 aattctcggaagtggatacctattcttgatagttactttgttcaactga 15145541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 99 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 16235012 - 16234641
Alignment:
Q  99 tttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacg 198  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16235012 tttcttctctttcaacacttgcaaaacaatcttcagatgctcggcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgatgaacacaactacg 16234913  T
Q  199 aatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgac 298  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16234912 aaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgtattggtaactccaaaaggcataactttatattcatagtgac 16234813  T
Q  299 cataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacc 398  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  16234812 cataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcctttactttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacc 16234713  T
Q  399 cactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16234712 cactagctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 16234641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 102 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 17093166 - 17092798
Alignment:
Q  102 cttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaat 201  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || ||     
T  17093166 cttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtagatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacaaac 17093067  T
Q  202 cgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccat 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17093066 cgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttatattcatagtgaccat 17092967  T
Q  302 aacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccac 401  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  17092966 aacgcgttctgaaagccgtcttctgcatatcttcgtcttttactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccac 17092867  T
Q  402 taactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    ||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17092866 tagttgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 17092798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 23 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 16353604 - 16353241
Alignment:
Q  23 catcatcagaaataacatggcca-agaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgca 121  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16353604 catcaccagaaataacatggccanagaaaacttacctcttttaaccagaactcacacttagataatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgca 16353505  T
Q  122 agacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaa 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  16353504 agacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcggtcttggagtaaattaaaatatcatcgatgagaacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaa 16353405  T
Q  222 gatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtc 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16353404 gatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtc 16353305  T
Q  322 ttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctga 385  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  16353304 ttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctga 16353241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 29 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 14849456 - 14849015
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |  |||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  14849456 cagaaataacttggccaagaaaacttacctctttcaaccagaattcacactttgacaatttagcatataacttcttctccttcagcacttgcaaaacaat 14849357  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || || |||    
T  14849356 cttcaaatgctcaacatgttcttcttcggacttggagtatatcaaaatatcgtcgatgaacacaaccacgaagcgatccaaaaatgcatgaaaaatacga 14849257  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    ||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||||| ||||||||  ||||||||||||| || ||||||||| |||| ||||| ||||||||||    
T  14849256 ttcatgtactccataaacacacctggcgcatttgtaacaccgaaaggcatctctttatattcataatgtccataacgcgttctaaaagccgtcttctgca 14849157  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    ||||||||||| | |||||||| ||||||||||  || ||||||||||  ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||      
T  14849156 tatcttcatctctcactttaatttggtgataacccgatctcaaatcaaccttgctaaatacacgcgcacccactaactgatccatcaagtcatcaatttt 14849057  T
Q  429 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
     ||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||    
T  14849056 tggaagtggatatctattctttatcgttactttattcaactg 14849015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 30 - 470
Target Start/End: Original strand, 14696036 - 14696476
Alignment:
Q  30 agaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatc 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| |  ||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  14696036 agaaataacatggccaagaaaactcacctcattcaaccagaactcacactttgacaacttagcatataaattcttctctttcagcacttgcaaaacaatc 14696135  T
Q  130 ttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgat 229  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||| | ||||| || ||    |    
T  14696136 ttcaaatgctcagcatgttcttcttcggacttcgagtatatcaaaatatcatcaatgaacacaaccacgaagcaatccaaatacgcatgaaaaatagagt 14696235  T
Q  230 tcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcat 329  Q
    |||| |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||| |||  ||||| ||| || ||||||||| |||| || || |||||||||||    
T  14696236 tcatgtactccataaacacacctggcgcatttgtaacaccaaaaggcatcactgaatattaataatgtccataacgcgttctaaaggccgtcttctgcat 14696335  T
Q  330 atcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcac 429  Q
    ||| | |||||| |||||||| ||||| ||||  || ||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||      
T  14696336 atccttatctttcactttaatttggtgttaacccgatctcaaatcaatcttgctaaacacacgtacacccactaactgatccataaaatcatcaattctt 14696435  T
Q  430 ggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    |||||| ||||| ||||||| || ||||| |||||||||||    
T  14696436 ggaagtagatacatattctttatcgttactttgttcaactg 14696476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 29 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 15001714 - 15001273
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    |||||||||  |||||||||||||| || ||  | ||||||| | |||||||| |||| |||||||| |  ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  15001714 cagaaataatgtggccaagaaaacttacttcacttaaccagact-cacatttaaacaacttggcatacaacttcttttctttcaacacttgcaacacaat 15001616  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
    | ||||||| || ||||| ||||||||| |||| || |||||||| || ||||| || |||||||| || |||  ||||| | | |||||||| || ||     
T  15001615 cctcagatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaatcaagatgtcatcaataaacacaaccacaaatttatccagataagcatggaaaattcgg 15001516  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| ||||| ||| |||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||   | || || || ||||||||||    
T  15001515 ttcatatactccataaacacaacaggcgcattagtatcaccgaaaggcatcaccttatattcatagtgaccataacatgtcctaaaggccgtcttctgca 15001416  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    |||| ||||| || || |||||||| || |||| |||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |     
T  15001415 tatcctcatccttcaccttaatctgatggtaacctgacctcaaatcaattttactaaacacacgtgcacccactaactgatccattaaatcgtcaatcct 15001316  T
Q  429 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 471  Q
    ||||||||||||||||||||| || || || || |||||||||    
T  15001315 cggaagtggatacctattctttatcgtcactttattcaactga 15001273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 40 - 470
Target Start/End: Original strand, 14161403 - 14161833
Alignment:
Q  40 tggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcata-aagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgc 138  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || || ||| || |||||||| || |  |||||||||| ||||    
T  14161403 tggccaagaaaactcacctcattcaaccagaattcacatttcgacaacttggcatacaacttactt-tccttcaacacctgtagaacaatcttcaaatgc 14161501  T
Q  139 tcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatact 238  Q
    ||||||||||||||||| ||||  || ||||| |  |||||||| || || |||||||||||   ||||| | | ||||| || || |  ||||||||||    
T  14161502 tcagcatgttcttcttctgtctcagaataaattaggatatcatcaataaatacaactacgaacttatccagataagcatgaaaaattctgttcatatact 14161601  T
Q  239 ccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatc 338  Q
    ||||||| |||||||||||||| | |||||| |||||||| |||  | ||||||| || |  |||||  | || ||||| |||||||| ||||||||||     
T  14161602 ccataaatactccaggtgcattagaaacaccgaaaggcatcactgaaaattcataatgtctgtaacgtgtcctaaaagccgtcttctgtatatcttcatt 14161701  T
Q  339 ttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtgga 438  Q
     |||||| |||||||||||||||  || ||||||||||| ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  14161702 ctttactctaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgttgaacacgcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcttggaagtgga 14161801  T
Q  439 tacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||||||    
T  14161802 tacctattctgtatcgttaccttgttcaactg 14161833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 202 - 469
Target Start/End: Original strand, 16218325 - 16218592
Alignment:
Q  202 cgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccat 301  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| || |   |||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||    
T  16218325 cgatccaaaaatgcatgaaaaatgcgattcatgtactccataaacacacctgacacatttgtaacaccgaagggcatcactttatattcataatgtccat 16218424  T
Q  302 aacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccac 401  Q
    ||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  16218425 aacgtgttctaaaagctgtcttctgcatatcctcatctttcactttaatctggtgataacccgacctcaagtcaatcttgctaaacacacgtgcacccac 16218524  T
Q  402 taactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaact 469  Q
    ||||| |||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  16218525 taactaatccattaagtcatcaattctcggaagtggatacctattctttatcgttactttgttcaact 16218592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 202 - 469
Target Start/End: Original strand, 16221645 - 16221912
Alignment:
Q  202 cgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccat 301  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| || |   |||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||    
T  16221645 cgatccaaaaatgcatgaaaaatgcgattcatgtactccataaacacacctgacacatttgtaacaccgaagggcatcactttatattcataatgtccat 16221744  T
Q  302 aacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccac 401  Q
    ||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  16221745 aacgtgttctaaaagctgtcttctgcatatcctcatctttcactttaatctggtgataacccgacctcaagtcaatcttgctaaacacacgtgcacccac 16221844  T
Q  402 taactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaact 469  Q
    ||||| |||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  16221845 taactaatccattaagtcatcaattctcggaagtggatacctattctttatcgttactttgttcaact 16221912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 29 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 15357470 - 15357028
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    |||||||||  |||||||||||||| |  ||  | |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |  ||||| |||||||| ||||| || |||||    
T  15357470 cagaaataatgtggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacatttcgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatacttgtaatacaat 15357371  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
    ||||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||||| ||| ||||| || || |||||  ||||   |||||   | |||||||| || ||     
T  15357370 cttcagatgttctgcatgctcttcttcagtcttagaataaatcagaatgtcatcaataaatacaaccgcgaacttatccaggtaggcatggaaaattcgg 15357271  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||  | || || || ||||||||||    
T  15357270 ttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttgtattcatagtgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgca 15357171  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    |||| ||||| || || |||||||| || |||| |||||| || ||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||| || |||||||| |     
T  15357170 tatcctcatccttcaccttaatctgatggtaacctgaccttaagtcaatcttgctgaaaacctttgcacccactaactgatccattaagtcatcaatcct 15357071  T
Q  429 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 471  Q
    ||||||||||||||| ||||| || || || ||||||||||||    
T  15357070 cggaagtggatacctgttctttatcgtaactttgttcaactga 15357028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 30 - 449
Target Start/End: Original strand, 15072282 - 15072701
Alignment:
Q  30 agaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatc 129  Q
    ||||||||  || ||||||||||| || ||  | ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |   |||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  15072282 agaaataatgtgaccaagaaaacttacttcacttaaccagaattcacatttggacaacttggcatacaacctcttttctttcaacacttgcaacacaatc 15072381  T
Q  130 ttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgat 229  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |||| |||| || ||||| |  |||||||| || |||||||| || |||  ||||| | | |||||||| |  | ||    
T  15072382 ttcagatgctctgcatgctcttattcattcttagaataaattaggatatcatcaataaacacaaccacaaatttatccagataagcatggaaaactctat 15072481  T
Q  230 tcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcat 329  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| ||  | || || || || || ||| |    
T  15072482 tcatgtactccataaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttatattcataatgtccatatcgtgtcctaaaggccgttttttgcgt 15072581  T
Q  330 atcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcac 429  Q
    ||||||||| || || ||||| || || |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  |    
T  15072582 atcttcatccttcaccttaatttgatggtaacctgacctcaaatcaattttgctgaacacacgagcacccactaactgatccattaaatcatcaattatc 15072681  T
Q  430 ggaagtggatacctattctt 449  Q
    ||||||||||| || |||||    
T  15072682 ggaagtggatatctgttctt 15072701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 23 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 18613920 - 18613743
Alignment:
Q  23 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 122  Q
    ||||| |||| ||||||||||| |||||||| || | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18613920 catcaccagatataacatggcctagaaaacttacttttttcaaccagaattcacacttagacaattttgcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 18613821  T
Q  123 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||    
T  18613820 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatgtcgtcaataaacacaactacgaa 18613743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 23 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 51605148 - 51604704
Alignment:
Q  23 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 122  Q
    ||||| ||||||||| ||| ||||| |||||||| ||  | | ||| || |||||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||     
T  51605148 catcaccagaaataatatgaccaaggaaactcacttcacttagccaaaactcacatttcgacaatttggcatacaacttcttctctttcaaaacttgcag 51605049  T
Q  123 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 222  Q
     |||||  ||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||||| ||||||||| || || || || ||||||  ||||| ||| ||||| ||     
T  51605048 cacaattctcagatgttctgcatgctcttcttcagtcttcgaataaatcagaatatcatcaataaataccaccacgaatttatccagaaaagcatgaaaa 51604949  T
Q  223 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 322  Q
    || ||||||||||||||||| ||||| || || || || |||||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||| || ||  | || ||||| ||||    
T  51604948 attcgattcatatactccatgaacacaccgggcgcgttagtaacaccgaaaggcatcactttgtattcgtaatgaccgtatcgtgtcctaaaagccgtct 51604849  T
Q  323 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 422  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||| || || |||| ||||||||| ||||| || ||||| ||   ||||||||||| ||| |||||||| |||||    
T  51604848 tctgcatatcttcatctttcaccttaatttgatggtaacctgacctcaagtcaatcttactgaacacctttgcacccactagctggtccatcaagtcatc 51604749  T
Q  423 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaa 467  Q
    ||| | |||||| ||||| |||||||| || || || ||||||||    
T  51604748 aatcctcggaagcggatatctattcttaattgtaactttgttcaa 51604704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 29 - 471
Target Start/End: Original strand, 16149633 - 16150075
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    |||||||||  |||| ||||||||| || ||  | |||||||| ||||| || || || || ||||| |  ||||| |||||||| | |||||| |||||    
T  16149633 cagaaataatgtggcaaagaaaacttacttcacttaaccagaactcacacttcgataacttagcatacaacttcttttctttcaatatttgcaatacaat 16149732  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
    ||||||||| || ||||| |||||||||||| | || ||||||| |||||| || || |||||||| || |||  |||||   | |||||||| || ||     
T  16149733 cttcagatgttctgcatgctcttcttcagtcattgaataaatcagaatatcgtcaataaacacaaccacaaatttatccaggtaggcatggaaaattcgg 16149832  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| ||  | || || || ||||||||||    
T  16149833 ttcatatactccatgaacacaccaggtgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttgtattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgca 16149932  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    |||| ||||| || || ||||||||||| |||| ||||||||| ||||| || ||||||||   ||||||||||||||||||||| || |||||||| |     
T  16149933 tatcctcatccttcaccttaatctggtggtaacctgacctcaagtcaatcttactgaaaacctttgcacccactaactgatccattaagtcatcaatcct 16150032  T
Q  429 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 471  Q
    ||||||||||||||| ||||| || || || || |||||||||    
T  16150033 cggaagtggatacctgttctttattgtaactttattcaactga 16150075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 29 - 471
Target Start/End: Original strand, 16153779 - 16154221
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    |||||||||  |||| ||||||||| || ||  | |||||||| ||||| || || || || ||||| |  ||||| |||||||| | |||||| |||||    
T  16153779 cagaaataatgtggctaagaaaacttacttcacttaaccagaactcacacttcgataacttagcatacaacttcttttctttcaatatttgcaatacaat 16153878  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
    ||||||||| || ||||| |||||||||||| | || ||||||| |||||| || || |||||||| || |||  |||||   | |||||||| || ||     
T  16153879 cttcagatgttctgcatgctcttcttcagtcattgaataaatcagaatatcgtcaataaacacaaccacaaatttatccaggtaggcatggaaaattcgg 16153978  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| ||  | || || || ||||||||||    
T  16153979 ttcatatactccatgaacacaccaggtgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttgtattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgca 16154078  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    |||| ||||| || || ||||||||||| |||| ||||||||| ||||| || ||||||||   ||||||||||||||||||||| || |||||||| |     
T  16154079 tatcctcatccttcaccttaatctggtggtaacctgacctcaagtcaatcttactgaaaacctttgcacccactaactgatccattaagtcatcaatcct 16154178  T
Q  429 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 471  Q
    ||||||||||||||| ||||| || || || || |||||||||    
T  16154179 cggaagtggatacctgttctttattgtaactttattcaactga 16154221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 29 - 471
Target Start/End: Original strand, 8707833 - 8708271
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    ||||||||| |||||||| |||||| || ||  | ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |  ||||| || |||||||||||||| ||||     
T  8707833 cagaaataatatggccaataaaacttacttcacttaaccaaaattcacatttggacaacttggcatacatcttcttttccttcaacacttgcaacacaac 8707932  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
     |||  |||||| ||||| |||||||||| ||| || |||||||| || ||||| || |||||||| || || ||||||||| | |||||||| || | |    
T  8707933 tttctaatgctctgcatgctcttcttcagacttagaataaatcaagatgtcatcaataaacacaaccacaaaccgatccaaataagcatggaaaattcta 8708032  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    ||||| |||||||||||||| ||  | || || |||||||| |||||||| |||  |||||| || || ||||| ||  | || || || || |||| ||    
T  8708033 ttcatgtactccataaacacaccccgcgcgttagtaacaccgaaaggcatcactgaatattcgtaatgtccatatcgtgtgctaaaggccgttttctaca 8708132  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    |||||||||||||||||||||| || || ||||  |||||||||||    || || || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  8708133 tatcttcatcttttactttaatatgatggtaacccgacctcaaatc----ttactaaacacgcgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaattct 8708228  T
Q  429 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 471  Q
    ||||||||||||||||||||| || || || || |||||||||    
T  8708229 cggaagtggatacctattctttatcgtcactttattcaactga 8708271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 313 - 470
Target Start/End: Original strand, 22631910 - 22632067
Alignment:
Q  313 aaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatcca 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22631910 aaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacctgatctcaaatctatcttgctgaaaacacttgcacccactaactgatcca 22632009  T
Q  413 tcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  22632010 tcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctttattgtcaccttgttcaactg 22632067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 119 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 1647537 - 1647207
Alignment:
Q  119 gcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatg 218  Q
    |||| ||||||||||| || || ||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| || || ||||||  ||||| ||| |||||    
T  1647537 gcaacacaatcttcaggtgttctgcatgctcctcttcagtcttagaataaatcaaaatatcatcaatgaataccaccacgaatttatccagaaaagcatg 1647438  T
Q  219 gaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagct 318  Q
    ||| || | ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| ||  | || || ||     
T  1647437 gaaaatcctattcatatactccataaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttgtattcgtaatgaccatatcgagtcctaaaggcc 1647338  T
Q  319 gtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaat 418  Q
    |||||||||||||| ||||| || |||||||| || || |||| ||||||||| |||||||| || |||||   |||||| || ||||| |||||||| |    
T  1647337 gtcttctgcatatcctcatccttcactttaatttgatggtaacctgacctcaagtcaattttactaaaaacttttgcacctaccaactggtccatcaagt 1647238  T
Q  419 catcaattcacggaagtggatacctattctt 449  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  1647237 catcaatcctcggaagtggatacctattctt 1647207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 238 - 469
Target Start/End: Original strand, 23443237 - 23443467
Alignment:
Q  238 tccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcat 337  Q
    ||||||||||| || || ||||| |||| ||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||||||  |||| |||| |||||| |||||||||||||    
T  23443237 tccataaacacacctggcgcattcgtaa-accgaaaggcatcactttatactcataatgtccataacgtgttctaaaagttgtcttatgcatatcttcat 23443335  T
Q  338 cttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtgg 437  Q
    |||| |||||||||||||||||||   | ||||||||||| ||| | || |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  23443336 ctttcactttaatctggtgataacccaatctcaaatcaatcttggtaaacacacatgcacccactaactgatccatcaagtcatcaattctcggaagtgg 23443435  T
Q  438 atacctattcttgatagttaccttgttcaact 469  Q
    |||| ||||||| || ||||| ||||||||||    
T  23443436 atacatattctttatcgttactttgttcaact 23443467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 29 - 471
Target Start/End: Original strand, 27902308 - 27902750
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcata-aagtttcttctctttcaacacttgcaagacaa 127  Q
    |||||||||  ||||| ||||||||||| || || ||| |||| || || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||| |  ||||| ||||    
T  27902308 cagaaataatgtggcctagaaaactcacttcatttaactagaactcgcacttcgacaacttggcatacaactttct-ctctttcaaaatctgcaacacaa 27902406  T
Q  128 tcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcg 227  Q
    ||||||  || || ||||| || ||||||||||| || ||||||||||||| ||| || || || || ||||||  |||||  || |||||||| || ||    
T  27902407 tcttcatgtgttctgcatgctcctcttcagtcttagaataaatcaaaatatgatcaataaataccaccacgaatttatccaggaaagcatggaaaattcg 27902506  T
Q  228 attcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgc 327  Q
     |||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||  | || || || |||||||||    
T  27902507 gttcatatactccatgaacactccaggcgctttagtaacaccgaaaggcatcactttgtattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgc 27902606  T
Q  328 atatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattc 427  Q
    ||||||||||| || |||||||| || || |||| ||||||||| |||||||| || |||||   |||||| || |  || |||||||| |||||||| |    
T  27902607 atatcttcatccttcactttaatttgatggtaacctgacctcaagtcaattttactaaaaacttttgcacctaccatttggtccatcaagtcatcaatcc 27902706  T
Q  428 acggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 471  Q
     |||||||||||| || ||||| || || || ||||||||||||    
T  27902707 tcggaagtggatatctgttctttattgtaactttgttcaactga 27902750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 66 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 44660179 - 44659774
Alignment:
Q  66 ccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggag 165  Q
    |||||| |||||||| ||||| || ||||| |   |||| || |||||||||||||| |||||  |||||||||| ||||| || || ||| |||||||     
T  44660179 ccagaactcacatttcgacaactttgcatacaacctcttttccttcaacacttgcaacacaattctcagatgctctgcatgctcctcctcattcttggaa 44660080  T
Q  166 taaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaa 265  Q
    || || |||||||| || || ||||| || || ||   ||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||| || || ||||    
T  44660079 tagattaaaatatcgtcaataaacaccacaacaaacttatccagaaaagcatggaagattcgattcatgtactccataaatacaccaggcgcgttagtaa 44659980  T
Q  266 caccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttga 365  Q
    |||| |||||||| ||||| || || || |||||||||||  | || || || |||||||||||||||||||| || || || ||||| ||||||| |||    
T  44659979 caccgaaaggcatcactttgtactcgtaatgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcttcatccttcacctttatctgatgataacctga 44659880  T
Q  366 cctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttc 465  Q
    |||||||||||| || |||||||     ||||| || |||||||||||||| || |||||||  || || ||||| || |||||||| || |||||||||    
T  44659879 cctcaaatcaatcttactgaaaatcttagcaccaaccaactgatccatcaagtcgtcaattctagggagcggatatctgttcttgatcgtaaccttgttc 44659780  T
Q  466 aactga 471  Q
    ||||||    
T  44659779 aactga 44659774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 100 - 470
Target Start/End: Original strand, 15257921 - 15258290
Alignment:
Q  100 ttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacga 199  Q
    ||||| |||||| | |||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||| | || |||||||| |||||||| || |||||||| || |    
T  15257921 ttcttttctttcgatacttgcaatacaatctttagatgctctgcatgctcttcttcggtccttgaataaatcaagatatcatcaataaacacaaccacaa 15258020  T
Q  200 atcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgacc 299  Q
    ||  || || | | |||||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| || |||||||| || |||||    
T  15258021 atttattcagataggcatggaaaattcggttcatatattccatgaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgacc 15258120  T
Q  300 ataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcaccc 399  Q
    ||| ||  | || || || |||||||||||||  ||||| || || || ||||| || |||| ||||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||||    
T  15258121 atatcgtgtcctaaaggccgtcttctgcatattctcatccttcaccttgatctgatggtaacctgacctcaagtcaatcttgctaaacacacgagcaccc 15258220  T
Q  400 actaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||| | || |||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||    
T  15258221 actaactgatcgat-taatcatcaatcctcgaaagtggatacctgttctttatcgtaaccttattcaactg 15258290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 29 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 29451887 - 29451445
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    ||||||||| ||| || ||||| ||||| ||  | |||||||| |||||||| ||||| || ||||| | | |||| || |||||||||||||| |||||    
T  29451887 cagaaataatatgacccagaaagctcacttcacttaaccagaactcacatttcgacaactttgcatacaatctcttttccttcaacacttgcaatacaat 29451788  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
      ||||||| || ||||| || || ||| ||||||| || || ||||||||||| || || || || || ||   ||||| ||| |||||||| || ||     
T  29451787 tctcagatgatctgcatgctcctcctcattcttggaatagattaaaatatcatcaataaataccacaacaaacttatccagaaaagcatggaaaattcgg 29451688  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || |||||||||||  | || || || ||||||||||    
T  29451687 ttcatgtactccataaaaacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcactttgtactcgtaatgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgca 29451588  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    |||| ||||| || || || ||||| |||||||  |||||||||||||| || |||||||     ||||| || |||||||||||||| || |||||||     
T  29451587 tatcctcatccttcacctttatctgatgataaccagacctcaaatcaatcttactgaaaatcttagcaccaaccaactgatccatcaagtcgtcaattct 29451488  T
Q  429 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 471  Q
     ||||| ||||| || |||||||| || |||||||||||||||    
T  29451487 aggaagcggatatctgttcttgatcgtaaccttgttcaactga 29451445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 29 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 3263144 - 3262702
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    |||||||||  || || |||||||| || || || |||||||| |||||||| || || || ||||| |   |||| || |||||||||||||| |||||    
T  3263144 cagaaataatgtgacccagaaaacttacttcatttaaccagaactcacattttgataacttagcatacaacctcttttccttcaacacttgcaatacaat 3263045  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
      |||||||||| ||||| || || ||| ||||||| || || ||||||||||| || ||||| || || ||   ||||| ||| |||||||| || ||     
T  3263044 tctcagatgctctgcatgctcctcctcattcttggaatagattaaaatatcatcaataaacaccacaacaaacttatccagaaaagcatggaaaattcgg 3262945  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || |||||||||||  | || || || ||||||||||    
T  3262944 ttcatgtactccataaaaacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcactttgtactcgtaatgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgca 3262845  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    |||| ||||| || || || ||||| |||||||  |||||||||||||| || || ||||     ||||| || |||||||||||||| || |||||||     
T  3262844 tatcctcatccttcacctttatctgatgataaccagacctcaaatcaatcttactaaaaatcttagcaccaaccaactgatccatcaagtcgtcaattct 3262745  T
Q  429 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 471  Q
     ||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||||||    
T  3262744 aggaagcggatacctgttcttgatcgtaactttgttcaactga 3262702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 29 - 275
Target Start/End: Original strand, 15323139 - 15323385
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| || ||  | ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |  ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  15323139 cagaaataatatggccaagaaaacttacttcacttaaccagaattcacatttggacaacttggcatacaacttcttttctttcaacacttgcaacacaat 15323238  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
     ||||||||||| ||||| ||||||||| |||| || ||||| | ||||||||| || |||||||| || |||  ||||| | | |||||||| || | |    
T  15323239 tttcagatgctctgcatgctcttcttcactcttagaataaattacaatatcatcaataaacacaaccacaaatttatccagataagcatggaaaattcta 15323338  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaagg 275  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||    
T  15323339 ttcatgtattccataaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaagg 15323385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 109 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 11205502 - 11205140
Alignment:
Q  109 ttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatcca 208  Q
    |||||||||||||| |||||  |||| || || ||||| || |||||| ||||||| ||||| || |||||||| || ||||| || || ||   |||||    
T  11205502 ttcaacacttgcaatacaattctcaggtgttctgcatgctcctcttcattcttggaataaattaagatatcatcaataaacaccacaacaaacttatcca 11205403  T
Q  209 aaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcat 308  Q
     ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||||| |||||||| ||||| || || || |||||||||||  |    
T  11205402 gaaaagcatggaagattcggttcatgtactccataaacacaccaggcgcgttagtaacaccgaaaggcatcactttgtactcgtaatgaccataacgtgt 11205303  T
Q  309 tctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactga 408  Q
     || || || |||||||||||||| ||||| || || || ||||| |||||||  |||||||| ||||| ||||| || |     ||||| || || |||    
T  11205302 cctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcacctttatctgatgataaccagacctcaagtcaatcttgctaaagatcttagcaccaaccaattga 11205203  T
Q  409 tccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 471  Q
    |||||||| || |||||||  ||||| |||||||| ||||| || || |||||||||||||||    
T  11205202 tccatcaagtcgtcaattctaggaagcggatacctgttctttatcgtaaccttgttcaactga 11205140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 367 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 16251602 - 16251498
Alignment:
Q  367 ctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttca 466  Q
    ||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16251602 ctcaaatcaatcttgctgaaaacttttgcacccactaactgatacatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttca 16251503  T
Q  467 actga 471  Q
    |||||    
T  16251502 actga 16251498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 23 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 1640436 - 1640326
Alignment:
Q  23 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 122  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1640436 catcaccagaaataacatggctaagaaaacttacctctttcaaccagaattcacactttgaaaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 1640337  T
Q  123 gacaatcttca 133  Q
     ||||||||||    
T  1640336 aacaatcttca 1640326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 30 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 15291507 - 15291067
Alignment:
Q  30 agaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatc 129  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||| || ||||| |||||||| |||||  | |  |  ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  15291507 agaaatcacatgaccaaggaaactcacttccttcaaccaaaactcacacttagacaacttggcgcacaactggttctctttcaagacttgcaacacaatc 15291408  T
Q  130 ttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgat 229  Q
     ||| |||||||||||| ||||| |||| ||| || || | |||||||||||| |||||||| || || ||  | |||| | | | ||| || ||   ||    
T  15291407 ctcaaatgctcagcatgctcttcctcagactttgaatacaccaaaatatcatctatgaacaccaccacaaaatggtccagataaggatgaaatattttat 15291308  T
Q  230 tcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcat 329  Q
    |||| || |||||||| || || || ||||| |  || ||||| ||||| ||   ||| |||||||| ||||| | | ||| ||| || || ||    ||    
T  15291307 tcatgtattccataaagacacctggcgcattagatactccaaatggcatcacagaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcagttttggatat 15291208  T
Q  330 atcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcac 429  Q
    ||||||  | |||||| ||||||| ||||| | ||| ||||||||||| || || || ||   |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |      
T  15291207 atcttctgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatcctt 15291108  T
Q  430 ggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    ||||||||||||| |||||| || || ||||||||||||||    
T  15291107 ggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactg 15291067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 405 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 16353244 - 16353174
Alignment:
Q  405 ctgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactgatgat 475  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  16353244 ctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttactttattcaactgatgat 16353174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 23 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 29037500 - 29037427
Alignment:
Q  23 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataa 96  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  29037500 catcaccagaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataa 29037427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 388; Significance: 0; HSPs: 48)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 388; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 470
Target Start/End: Original strand, 22349767 - 22350214
Alignment:
Q  23 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 122  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22349767 catcaccataaataacatggccaagaaaactcacttctttcaaccagaactcacacttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 22349866  T
Q  123 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22349867 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaatacaactacgaaccgatccaaaaatgcatggaag 22349966  T
Q  223 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 322  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  22349967 atgtgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagccgtct 22350066  T
Q  323 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 422  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22350067 tctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 22350166  T
Q  423 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22350167 aattctcggaaatggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 22350214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 372; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 14998277 - 14997830
Alignment:
Q  23 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 122  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14998277 catcaccagaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagcttcttctctttcaacacttgcaa 14998178  T
Q  123 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 222  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  14998177 aacaatcttcagatgctcagcatgttcctcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacaaaccgatccaaaaatgcatggaag 14998078  T
Q  223 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14998077 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtct 14997978  T
Q  323 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 422  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14997977 tctgcatatcttcatcctttactttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctaaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 14997878  T
Q  423 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14997877 aattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 14997830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 369; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 22331425 - 22330981
Alignment:
Q  23 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 122  Q
    ||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22331425 catcaccagaaataacatagcctagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagcttcttctctttcaacacttgcaa 22331326  T
Q  123 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 222  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  22331325 aacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacaaaccgatccaaaaatgcatggaag 22331226  T
Q  223 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22331225 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtct 22331126  T
Q  323 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 422  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22331125 tctgcatatcttcatcctttactttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctaaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 22331026  T
Q  423 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaa 467  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22331025 aattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaa 22330981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 368; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 37290034 - 37289587
Alignment:
Q  23 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 122  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37290034 catcaccagaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 37289935  T
Q  123 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 222  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  37289934 aacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacaaaccgatccaaaaatgcatggaag 37289835  T
Q  223 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  37289834 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcataatgaccataacgcgttctgaaagctgtct 37289735  T
Q  323 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 422  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37289734 tctgcatatcttcatcctttactttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctaaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 37289635  T
Q  423 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  37289634 aattctcggaagtggatacctattcttgatagttactttattcaactg 37289587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 470
Target Start/End: Original strand, 27612202 - 27612649
Alignment:
Q  23 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 122  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27612202 catcaccagaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 27612301  T
Q  123 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  27612302 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaag 27612401  T
Q  223 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  27612402 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaactccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagccgtct 27612501  T
Q  323 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 422  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  27612502 tctgcatatcttcatcctttactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctggtccatcaaatcatc 27612601  T
Q  423 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27612602 aattctcggaagtggatacctatttttgatagttaccttgttcaactg 27612649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 29474611 - 29474164
Alignment:
Q  23 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 122  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29474611 catcaccagaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttcgataatttatcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 29474512  T
Q  123 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 222  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||  |||||||||||||||| |||    
T  29474511 aacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgataaacacaaccacaaactgatccaaaaatgcatgaaag 29474412  T
Q  223 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29474411 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtct 29474312  T
Q  323 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 422  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29474311 tctgcatatctccatcctttactttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctaaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 29474212  T
Q  423 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29474211 aattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 29474164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 470
Target Start/End: Original strand, 41772690 - 41773137
Alignment:
Q  23 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 122  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  41772690 catcaccagaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaaccagaattcacatttagacaatttagcataaaaattcttctctttcaacacttgcaa 41772789  T
Q  123 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 222  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  41772790 aacaatcttcagatgctcggcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaagatatcgtcgataaacacaaccacaaaccgatccaaaaatgcatggaag 41772889  T
Q  223 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41772890 atgcgattcatatactccataaacactctaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtct 41772989  T
Q  323 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 422  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41772990 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatc 41773089  T
Q  423 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41773090 aattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 41773137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 470
Target Start/End: Original strand, 27520254 - 27520701
Alignment:
Q  23 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 122  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27520254 catcaccagaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaa 27520353  T
Q  123 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  27520354 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaattaaaatatcgtcgataaacacaaccacaaaccgatccaaaaatgcatggaag 27520453  T
Q  223 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  27520454 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagccgtct 27520553  T
Q  323 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 422  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27520554 tctgcatatcctcatcctttactttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatc 27520653  T
Q  423 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27520654 aattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 27520701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 470
Target Start/End: Original strand, 16358350 - 16358797
Alignment:
Q  23 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 122  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  16358350 catcaccagaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagcttcttctctttcaacacttgtaa 16358449  T
Q  123 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16358450 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtagatcaaaatatcgtcgataaacacaactacgaaccgatccaaaaatgcatggaag 16358549  T
Q  223 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  16358550 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaagggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagccgtct 16358649  T
Q  323 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 422  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16358650 tctgcatatcttcgtcttttactttaatctggtgatagcctgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatc 16358749  T
Q  423 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16358750 aattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 16358797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 470
Target Start/End: Original strand, 22136516 - 22136963
Alignment:
Q  23 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 122  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22136516 catcaccagaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttagcaaaaagtttcttctctttcaacacttgcaa 22136615  T
Q  123 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 222  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  22136616 aacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatgtcgtcgataaacacaaccacaaaccgatccaaaaatgcatggaag 22136715  T
Q  223 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 322  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||    
T  22136716 atgcgattcatataccccataaacactccaggtgcattagtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgtcctgaaagccgtct 22136815  T
Q  323 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 422  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22136816 tctgcatatcttcatcctttactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctaaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 22136915  T
Q  423 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22136916 aattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 22136963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 27683938 - 27683491
Alignment:
Q  23 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 122  Q
    ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  27683938 catcaccagagataacatggcctagaaaactcacttctttgaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagcttcttctctctcaacacttgcaa 27683839  T
Q  123 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 222  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  27683838 aacaatcttcagatgctcagcatgttcttcgtcagtcttggagtaaatcaaaatattgtcgataaacacaaccacaaaccgatccaaaaatgcatggaag 27683739  T
Q  223 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 322  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27683738 atgcgattcatatactccatagacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtct 27683639  T
Q  323 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 422  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27683638 tctgcatatcttcatcctttactttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctaaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 27683539  T
Q  423 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27683538 aattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 27683491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 470
Target Start/End: Original strand, 34568342 - 34568789
Alignment:
Q  23 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 122  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  34568342 catcaccagaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagcttcttctctttcaacacttgtaa 34568441  T
Q  123 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34568442 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtagatcaaaatatcgtcgataaacacaactacgaaccgatccaaaaatgcatggaag 34568541  T
Q  223 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  34568542 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaagggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagccgtct 34568641  T
Q  323 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 422  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34568642 tctgcatatcttcgtcttttactttaatctggtgatagcctgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatc 34568741  T
Q  423 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34568742 aattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 34568789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 470
Target Start/End: Original strand, 19771808 - 19772255
Alignment:
Q  23 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 122  Q
    ||||| || ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19771808 catcaccaaaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagcttcttctctttcaacacttgcaa 19771907  T
Q  123 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 222  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  19771908 aacaatcttcagatgctcggcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaagatatcgtcgatgaacacaaccacaaaccgatccaaaaatgcatggaag 19772007  T
Q  223 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19772008 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtct 19772107  T
Q  323 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 422  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  19772108 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgatatcctcacctcaaatcaatcttgctaaaaacacgtgcacccactagttgatccatcaaatcatc 19772207  T
Q  423 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19772208 aattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 19772255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 344; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 31 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 27667020 - 27666581
Alignment:
Q  31 gaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatct 130  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27667020 gaaataacatggccaaggaaactcacttcattcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatct 27666921  T
Q  131 tcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgatt 230  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27666920 tcagatgctcggcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaagatatcgtcgatgaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgatt 27666821  T
Q  231 catatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcata 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27666820 catatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcaaaactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcata 27666721  T
Q  331 tcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacg 430  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  27666720 tcctcatcttttactttaatctggtgataacctgatctcaaatctatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaagtcatcaattctcg 27666621  T
Q  431 gaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27666620 aaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 27666581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 344; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 31 - 470
Target Start/End: Original strand, 40710636 - 40711075
Alignment:
Q  31 gaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatct 130  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40710636 gaaataacatggccaaggaaactcacctctttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagcttcttctctttcaacacttgtaagacaatct 40710735  T
Q  131 tcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgatt 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  40710736 tcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtagatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacaaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgatt 40710835  T
Q  231 catatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcata 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  40710836 catatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagccgtcttctgcata 40710935  T
Q  331 tcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacg 430  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  40710936 tcttcgtcttttactttaatctggtgatagcctgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcg 40711035  T
Q  431 gaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40711036 gaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 40711075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 447
Target Start/End: Original strand, 20801245 - 20801669
Alignment:
Q  23 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 122  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20801245 catcaccagaaatgacatggccaaggaaacttacctctttcaaccagaactcacacttagataatttagcataaagtttcttctctttcagcacttgcaa 20801344  T
Q  123 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20801345 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaattaaaatatcatcgataaagaaaactacgaaccgatccaaaaatgcatggaag 20801444  T
Q  223 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20801445 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 20801544  T
Q  323 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 422  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20801545 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataccctgatctcaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatgaaatcatc 20801644  T
Q  423 aattcacggaagtggatacctattc 447  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||    
T  20801645 aattctcggaagaggatacctattc 20801669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 336; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 470
Target Start/End: Original strand, 18780962 - 18781409
Alignment:
Q  23 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 122  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18780962 catcaccagaaataacatggccaagaaaacttacttccttcaatcagaattcacacttagacaatttcgcaaaaagtttcttctctttcaacacttgcaa 18781061  T
Q  123 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  18781062 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatgtcgtcgataaacacaactacgaaccgatccaaaaaggcatggaag 18781161  T
Q  223 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18781162 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcgttggtcacaccgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtct 18781261  T
Q  323 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 422  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18781262 tctgcatatcttcatctttcactttaatctggtgataccctgatctcaaatcaatcttgctgaaaacttttgcacccactaactgatccattaaatcatc 18781361  T
Q  423 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18781362 aattctcggaggtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 18781409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 29 - 470
Target Start/End: Original strand, 25428287 - 25428728
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |     
T  25428287 cagaaataacatgtccaagaaagctcacttctttcaactagaattcacacttagacaatttcgcataaagcttcttctctttcaacacttgcaaaaccag 25428386  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  25428387 attcaaatgctcagcatgttcttcttcagacttggagtaaatcaaaatatcatcaataaaaacaaccacgaatcggtccaaaaatgcatgaaagatgcga 25428486  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    ||||| ||||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||||||||||    
T  25428487 ttcatgtactccataaatagtccaggtgcatttgtaacaccgaaaggcataactttgtattcatagtggccataccgcgttctgaaagttgtcttctgca 25428586  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  25428587 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcagatctatcttgctgaaaacacttgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattct 25428686  T
Q  429 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  25428687 cggaagtggatacctattctttattgttaccttgttcaactg 25428728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 29 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 26737259 - 26736818
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || || ||||| ||||| |  ||||| ||||||| ||||||||| | |||    
T  26737259 cagaaataacatggccaagaaaacttacctctttcaaccagaattcacactttgataatttagcatataacttcttatctttcagcacttgcaaaataat 26737160  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| || ||  ||    
T  26737159 cttcaaatgttcagcatgttcttcttcggacttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaaccacgaaacgatctaaaaatgcatgaaaaatttga 26737060  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||  |||| |||| |||||||||||    
T  26737059 ttcatgtactccataaacacaccaggtgcatttgtaacaccgaaaggcatcactttatattcatattgtccataacgtgttctaaaagttgtcttctgca 26736960  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  26736959 tatcttcatctttcactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctaaatacatgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattct 26736860  T
Q  429 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    ||||||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||    
T  26736859 cggaagtggatacatattctttatcgttactttgttcaactg 26736818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 29 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 21337826 - 21337385
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  21337826 cagaaataacgtggccgagaaaactcacctctttcaaccagaattcacactttgataatttagcataaagtttcttctctttcagcacttgcaaaacaat 21337727  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || || | ||||||||| ||||| || || |||    
T  21337726 cttcaagtgctcagcatgttcttcttcaaacttggagtaaatcaaaatatcgtcgatgaatacaaccactaagctatccaaaaacgcatgaaaaatacga 21337627  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    ||||| || ||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |  ||||||||  |||| |||||||| |||||||    
T  21337626 ttcatgtattccataaacacacctggcgcattcgtaacaccgaaaggcatcactttatattcataatatccataacgtgttctaaaagctgtattctgca 21337527  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| || |||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||     
T  21337526 tatcttcatctttcactttaatctggtgataacccgacctcaaatcaatcttgctaaacacacatgcacccaataactgatccatcaagtcatcaattct 21337427  T
Q  429 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
     |||| ||||||||||||||| || ||||| ||| |||||||    
T  21337426 tggaattggatacctattctttatcgttactttggtcaactg 21337385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 29 - 467
Target Start/End: Original strand, 23473081 - 23473519
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||| ||||| || |||||||| ||||| |  ||||||||||||| ||||||||| ||||     
T  23473081 cagaaataacatggccaagaaaactcacctcattcaactagaactcacactttgacaatttagcatataacttcttctctttcagcacttgcaaaacaac 23473180  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
     || | | ||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || || |||    
T  23473181 ttttaaacgctcagcatgttcttcttcagactttgagtacatcaaaatatcgtcgatgaacacaaccacgaaacgatccaaaaatgcatgaaaaatacga 23473280  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    ||||| ||||||||| |||| || || ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||  |||| ||||| ||||||| ||    
T  23473281 ttcatgtactccatagacacacctggcgcatttgtaacaccgaaaggcatcactttatattcataatgtccataacgtgttctaaaagccgtcttctaca 23473380  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    ||||||||||||| |||||||| || ||||||   || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  23473381 tatcttcatctttcactttaatttgatgataaaccgatctcaaatcaatcttgctaaacacacgtgcacccactaactgatccatcaagtcatcaattct 23473480  T
Q  429 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaa 467  Q
     |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  23473481 tggaagtggatacctattctttatcgttactttgttcaa 23473519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 29 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 20466631 - 20466190
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||| |  |||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  20466631 cagaaataacatggccaagaaaactcacctcattcaaccagaactcacactttgacaacttggcatataacttcttctccttcagcacttgcaaaacaat 20466532  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||| ||| | ||||| || || |||    
T  20466531 cttcaaatgctcaacatgttcttcttcagacttagagtatatcaaaatatcatcgatgatcacaaccacgaagcgatctaaatacgcatgaaaaatacga 20466432  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    ||||| |||| ||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||  |||||| || || ||||||||  | || || || ||||| ||||    
T  20466431 ttcatgtacttcataaacacacccggtgcattagtaacaccaaaaggcatcactgaatattcgtaatgtccataacgtgtcctaaaggccgtcttttgca 20466332  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    |||| || ||||| ||||||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  20466331 tatcctcgtctttcactttaatctggtgataacctgatcttaaatcaatcttgctaaacacacgtgcacccagtaactgatccatcaaatcatcaattct 20466232  T
Q  429 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
     |||||||||||| ||||||| || ||||  || ||||||||    
T  20466231 tggaagtggatacttattctttattgttagtttattcaactg 20466190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 30 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 22234451 - 22234032
Alignment:
Q  30 agaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatc 129  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || ||  | ||||||||||||||||| || || ||| |||| |  ||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  22234451 agaaataatatggccaagaaaacttacttcacttaaccagaattcacattttgataacttgacatacaacttcttttctttcaacacttgcaatacaatc 22234352  T
Q  130 ttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgat 229  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||| || || ||||| || |||||||| || |||  ||||| | | |||||||| ||    |    
T  22234351 ttcagatgatctgcatgctcttcttcagtcttagaataaattaagatgtcatcaataaacacaaccacaaatttatccagataagcatggaaaattttgt 22234252  T
Q  230 tcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcat 329  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||   | || || || |||||| ||||    
T  22234251 tcatatactccacaaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttatattcatagtgaccataacatgtcctaaaggccgtcttcggcat 22234152  T
Q  330 atcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcac 429  Q
    ||| |||||  | || |||||||| || |||| | |||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |    
T  22234151 atcctcatccatcaccttaatctgatggtaacctaacctcaaatcaattttactaaacacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcctc 22234052  T
Q  430 ggaagtggatacctattctt 449  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  22234051 ggaagtggatacctattctt 22234032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 73 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 21562512 - 21562115
Alignment:
Q  73 tcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatca 172  Q
    |||||||| || || |||||||| || || || || ||||||||||| || ||||| || | |||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||    
T  21562512 tcacatttggaaaacttggcatacagctttttttccttcaacacttgaaacacaatttttaaatgctctgcatgctcttcttcagtcttagaataaatca 21562413  T
Q  173 aaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaa 272  Q
      || ||||| || ||||||||||| || | ||| ||| | |||||||| || | |||||| |||||||||||||| ||||  ||||| |||||||| ||    
T  21562412 ggatgtcatctataaacacaactacaaaccaatctaaataggcatggaaaattctattcatgtactccataaacacaccagacgcattagtaacaccgaa 21562313  T
Q  273 aggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaa 372  Q
    || ||| |||||||||||||| || ||||| ||  | || || || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||    
T  21562312 agacatcactttatattcataatgtccatatcgtgtcctaaaggccgttttctgcatatcttcatctttcactttaatctggtggtaacccgacctcaaa 21562213  T
Q  373 tcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 471  Q
    ||||| |||||||| || |||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || || || || |||||||||    
T  21562212 tcaatcttgctgaacacgcgtgca-ccactaactgatccattaaaccatcaattctcggaagtggatacctattctttatcgtcactttattcaactga 21562115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 23 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 17267872 - 17267428
Alignment:
Q  23 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 122  Q
    ||||| ||||||||| ||| ||||| |||||||| ||  | | ||| || | |||||| |||||||||||||| |  ||||| |||||||||||||||||    
T  17267872 catcaccagaaataatatgaccaaggaaactcacttcacttagccaaaacttacatttcgacaatttggcatacaacttcttttctttcaacacttgcaa 17267773  T
Q  123 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 222  Q
     |||||  |||| || || ||||| |||||||||||||| || ||||||| ||||||||| || || || || || |||  ||||| ||| ||||| ||     
T  17267772 cacaattctcaggtgttctgcatgctcttcttcagtctttgaataaatcagaatatcatcaataaataccaccacaaatttatccagaaaggcatgaaaa 17267673  T
Q  223 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 322  Q
    || ||||||||||||||||| ||||| || || || || |||||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||| || ||  | || || || ||||    
T  17267672 attcgattcatatactccatgaacacaccgggcgcgttagtaacaccgaaaggcatcactttgtattcgtaatgaccgtatcgtgtcctaaaggccgtct 17267573  T
Q  323 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 422  Q
    |||||||||| |||||||| || ||||| || || |||| ||||||||| ||||| || ||||| ||   ||||||||||| ||| |||||||| |||||    
T  17267572 tctgcatatcctcatctttcaccttaatttgatggtaacctgacctcaagtcaatcttactgaacacctttgcacccactagctggtccatcaagtcatc 17267473  T
Q  423 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaa 467  Q
    ||| | |||||| ||||| |||||||| || || || ||||||||    
T  17267472 aatcctcggaagcggatatctattcttaattgtaactttgttcaa 17267428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 29 - 471
Target Start/End: Original strand, 20823289 - 20823731
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcata-aagtttcttctctttcaacacttgcaagacaa 127  Q
    |||||||||| ||||| || |||||||| ||  | |||||||| || || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||| |  ||||| ||||    
T  20823289 cagaaataacgtggccgaggaaactcacttcacttaaccagaactcgcacttcgacaacttggcatacaactttct-ctctttcaaaatctgcaacacaa 20823387  T
Q  128 tcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcg 227  Q
    ||||||| || || || ||||| |||||||| || || || ||||| |||||||| || ||||| || || |||  ||||| ||| |||||||| || ||    
T  20823388 tcttcaggtgttcggcgtgttcctcttcagtttttgaatagatcaatatatcatctataaacaccaccacaaatttatccagaaaagcatggaaaattcg 20823487  T
Q  228 attcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgc 327  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||  | || ||||| |||||||||    
T  20823488 gttcatatactccatgaacacaccaggcgcgttagtaacaccgaaaggcatcactttgtattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaagccgtcttctgc 20823587  T
Q  328 atatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattc 427  Q
    |||||||| ||||| |||||||| || || ||||  |||||||| ||||| || || |||||    ||||| || ||||| ||||||||||||||||| |    
T  20823588 atatcttcgtctttcactttaatttgatggtaacccgacctcaagtcaatcttactaaaaactttagcacctaccaactggtccatcaaatcatcaatcc 20823687  T
Q  428 acggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 471  Q
     |||||||||||| |||||||| || || || ||||||||||||    
T  20823688 gcggaagtggatatctattctttattgtaactttgttcaactga 20823731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 29 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 28893474 - 28893032
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcata-aagtttcttctctttcaacacttgcaagacaa 127  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||| ||  | |||||||| || || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||| |  ||||| ||||    
T  28893474 cagaaatgacatggcctagaaaactcacttcacttaaccagaactcgcacttcgacaacttggcatacaactttct-ctctttcaaaatctgcaacacaa 28893376  T
Q  128 tcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcg 227  Q
    ||||||| || || || ||||| |||||||| || || || ||||| |||||||| || || || || || |||  ||||| ||| |||||||| || ||    
T  28893375 tcttcaggtgttcggcgtgttcctcttcagttttagaatagatcaatatatcatctataaataccaccacaaatttatccagaaaagcatggaaaattcg 28893276  T
Q  228 attcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgc 327  Q
     |||||||||||||| ||||| || || || || |||||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||  | || ||||| |||||||||    
T  28893275 gttcatatactccatgaacacacccggcgcgttagtaacaccgaaaggcatcactttgtattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaagccgtcttctgc 28893176  T
Q  328 atatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattc 427  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| || ||||  |||||||| ||||| ||||| |||||    ||||| || ||||| |||||||| |||||||| |    
T  28893175 atatcttcatccttcactttaatctgatggtaacccgacctcaagtcaatcttgctaaaaactttagcacctaccaactggtccatcaagtcatcaatcc 28893076  T
Q  428 acggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 471  Q
     |||||||||||| |||||||| || || || ||||||||||||    
T  28893075 gcggaagtggatatctattctttattgtaactttgttcaactga 28893032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 29 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 28922300 - 28921858
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcata-aagtttcttctctttcaacacttgcaagacaa 127  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||| ||  | |||||||| || || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||| |  ||||| ||||    
T  28922300 cagaaatgacatggcctagaaaactcacttcacttaaccagaactcgcacttcgacaacttggcatacaactttct-ctctttcaaaatctgcaacacaa 28922202  T
Q  128 tcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcg 227  Q
    ||||||| || || || ||||| |||||||| || || || ||||| |||||||| || || || || || |||  ||||| ||| |||||||| || ||    
T  28922201 tcttcaggtgttcggcgtgttcctcttcagttttagaatagatcaatatatcatctataaataccaccacaaatttatccagaaaagcatggaaaattcg 28922102  T
Q  228 attcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgc 327  Q
     |||||||||||||| ||||| || || || || |||||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||  | || ||||| |||||||||    
T  28922101 gttcatatactccatgaacacacccggcgcgttagtaacaccgaaaggcatcactttgtattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaagccgtcttctgc 28922002  T
Q  328 atatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattc 427  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| || ||||  |||||||| ||||| ||||| |||||    ||||| || ||||| |||||||| |||||||| |    
T  28922001 atatcttcatccttcactttaatctgatggtaacccgacctcaagtcaatcttgctaaaaactttagcacctaccaactggtccatcaagtcatcaatcc 28921902  T
Q  428 acggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 471  Q
     |||||||||||| |||||||| || || || ||||||||||||    
T  28921901 gcggaagtggatatctattctttattgtaactttgttcaactga 28921858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 64 - 471
Target Start/End: Original strand, 20344153 - 20344560
Alignment:
Q  64 aaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttgg 163  Q
    |||||||| |||||||| ||||| || ||||| |   ||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||| || |||||| ||||||    
T  20344153 aaccagaactcacattttgacaacttagcatacaacctcttctctttcaaaacttgcaagacaattctcagatgctctgcatgctcctcttcattcttgg 20344252  T
Q  164 agtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggt 263  Q
    | ||||| || |||||||| || ||||| || || ||   ||||| ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||  | || ||    
T  20344253 aataaattaagatatcatcaataaacaccacaacaaacttatccagaaaagcatggaagattcggttcatgtactccataaacacaccaggcacgttagt 20344352  T
Q  264 aacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataactt 363  Q
    |||||| |||||||| ||||| || || || |||||||||||  | || || || |||||||||||||| ||||| || || || ||||| |||||||      
T  20344353 aacaccgaaaggcatcactttgtactcgtaatgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcacctttatctgatgataacca 20344452  T
Q  364 gacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgt 463  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||     ||||| || |||||||||||||| || |||||||  ||||| |||||||| ||||| || || || ||||    
T  20344453 gacctcaagtcaatcttgctaaaaatcttagcaccaaccaactgatccatcaagtcgtcaattctaggaagcggatacctgttctttatcgtgactttgt 20344552  T
Q  464 tcaactga 471  Q
    ||||||||    
T  20344553 tcaactga 20344560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 64 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 24796894 - 24796487
Alignment:
Q  64 aaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttgg 163  Q
    ||||||||||||||||| || || || ||||| |   |||| || |||||||||||||| || ||  |||||||||| ||||| || || ||| ||||||    
T  24796894 aaccagaattcacattttgataacttagcatacaacctcttttccttcaacacttgcaacactattctcagatgctctgcatgctcctcctcattcttgg 24796795  T
Q  164 agtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggt 263  Q
    | ||||| | ||||||||| || ||||| || || ||   ||||| ||| |||||||| || || ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||    
T  24796794 aataaattagaatatcatcaataaacaccacaacaaacttatccagaaaagcatggaaaattcggttcatgtactccataaaaacaccaggcgcattagt 24796695  T
Q  264 aacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataactt 363  Q
    |||||| |||||||| ||||| || || || |||||||||||  | || || || |||||||||||||| |||||||| || || ||||| |||||||      
T  24796694 aacaccgaaaggcatcactttgtactcgtaatgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatctttcacctttatctgatgataacca 24796595  T
Q  364 gacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgt 463  Q
    |||||||||||||| || |||||||     ||||| || |||||||||||||| || |||||||  ||||| |||||||| |||||||| || || ||||    
T  24796594 gacctcaaatcaatcttactgaaaatcttggcaccaaccaactgatccatcaagtcgtcaattctaggaagcggatacctgttcttgatcgtaactttgt 24796495  T
Q  464 tcaactga 471  Q
    ||||||||    
T  24796494 tcaactga 24796487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 29 - 471
Target Start/End: Original strand, 25849911 - 25850353
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    |||||||||  || || ||||||||||| ||  | |||||||| |||||||| ||||| || ||||| |   |||| || |||||||||||||| || ||    
T  25849911 cagaaataatgtgacccagaaaactcacttcacttaaccagaactcacatttcgacaactttgcatacaacctcttttccttcaacacttgcaatactat 25850010  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
      |||||||||| ||||| || |||||| |||| || |||||||| |||||||| |||||||| || || ||   ||||| ||| |||||||||||  |     
T  25850011 tctcagatgctctgcatgctcctcttcattcttcgaataaatcaagatatcatcaatgaacactacaacaaacttatccagaaaagcatggaagatttgg 25850110  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| ||||| || || || |||||||||||  | || || || ||||||||||    
T  25850111 ttcatgtactccataaatacaccaggcgcgttagtaacaccgaaaggcatcactttgtactcgtaatgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgca 25850210  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    |||| ||||| || || || ||||| |||||||  |||||||||||||| || || ||||     ||||| || |||||||||||||| || |||||||     
T  25850211 tatcctcatccttcacctttatctgatgataaccagacctcaaatcaatcttactaaaaattttagcaccaaccaactgatccatcaagtcgtcaattct 25850310  T
Q  429 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 471  Q
    |||||| ||||| || ||||| || || |||||||||||||||    
T  25850311 cggaagcggatatctgttctttatcgtaaccttgttcaactga 25850353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 64 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 14885488 - 14885081
Alignment:
Q  64 aaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttgg 163  Q
    |||||||| |||||||| ||||| || ||||| |   |||| || |||||||||||||| || ||  |||||||||| || ||||| || ||| ||||||    
T  14885488 aaccagaactcacattttgacaacttagcatacaacctcttttccttcaacacttgcaacactattctcagatgctctgcgtgttcctcctcattcttgg 14885389  T
Q  164 agtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggt 263  Q
    | ||||| || |||||||| || || || || || ||   ||||| ||| |||||||| || || ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||    
T  14885388 aataaattaagatatcatcaataaataccaccacaaacttatccagaaaagcatggaaaattcggttcatgtactccataaaaacaccaggcgcattagt 14885289  T
Q  264 aacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataactt 363  Q
    |||||| |||||||| ||||| || || || |||||||||||  | || || || |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||      
T  14885288 aacaccgaaaggcatcactttgtactcgtaatgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatcctttacctttatctgatgataacca 14885189  T
Q  364 gacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgt 463  Q
    |||||||||||||| || |||||||     ||||| || |||||||||||||| || |||||||  ||||| |||||||| |||||||| || || ||||    
T  14885188 gacctcaaatcaatcttactgaaaatcttggcaccaaccaactgatccatcaagtcgtcaattctaggaagcggatacctgttcttgatcgtaactttgt 14885089  T
Q  464 tcaactga 471  Q
    ||||||||    
T  14885088 tcaactga 14885081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 23 - 471
Target Start/End: Original strand, 22463781 - 22464229
Alignment:
Q  23 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcata-aagtttcttctctttcaacacttgca 121  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||  | |||||||| ||  | || ||||| |||||||| || ||||| ||| ||||| |  ||||    
T  22463781 catcaccagaaataacatggcctagaaaactcacttcacttaaccagaactcgtacttcgacaacttggcatacaactttct-ctccttcaaaatctgca 22463879  T
Q  122 agacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaa 221  Q
    | ||||||||||  || || ||||| || |||||||| || || ||||||||||||||||| || || || || || |||  ||||| ||| ||||||||    
T  22463880 acacaatcttcaagtgttctgcatgctcctcttcagttttagaataaatcaaaatatcatctataaataccaccacaaatttatccagaaaagcatggaa 22463979  T
Q  222 gatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtc 321  Q
     || || |||||||||||||| ||||  ||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||  | || || || |||    
T  22463980 aattcggttcatatactccatgaacataccaggcgcgttagtaacaccgaaaggcatcactttgtattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggccgtc 22464079  T
Q  322 ttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcat 421  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||| || || ||||  |||||||  ||||| || || |||||    ||||| || ||||| |||||||| ||||    
T  22464080 ttctgcatatcttcatccttcactttaatttgatggtaacccgacctcaggtcaatcttactaaaaactttagcacctaccaactggtccatcaagtcat 22464179  T
Q  422 caattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 471  Q
    |||| | |||||||||||| |||||||| || || || ||||||||||||    
T  22464180 caatccgcggaagtggatatctattctttattgtaactttgttcaactga 22464229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 29 - 471
Target Start/End: Original strand, 22504515 - 22504957
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    |||||||||  || || ||||||||||| ||  | |||||||| |||||||| ||||| || ||||| |   ||||||||||||| |||||||| |||||    
T  22504515 cagaaataatgtgacccagaaaactcacttcacttaaccagaactcacattttgacaactttgcatacaacctcttctctttcaaaacttgcaatacaat 22504614  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
      |||||||||| ||||| || |||||  |||| || ||||| || |||||||| || ||||| || || ||   ||||| ||| |||||||| || ||     
T  22504615 tctcagatgctctgcatgctcctcttcgttcttagaataaattaagatatcatcaataaacaccacaacaaacttatccagaaaagcatggaaaattcgg 22504714  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||  | || |||||||| |||||||| ||||| || || || |||||||| ||  | || || ||  |||||||||    
T  22504715 ttcatgtactccataaacacaccaggctcgttagtaacaccgaaaggcatcactttgtactcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggccatcttctgca 22504814  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    |||| ||||| || || || ||||| |||||||  |||||||| ||||| || |||||||  |  ||||| || ||||||| |||||| ||||||||||     
T  22504815 tatcctcatccttcacctttatctgatgataaccagacctcaagtcaatcttactgaaaatcctagcaccaaccaactgattcatcaagtcatcaattct 22504914  T
Q  429 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 471  Q
      |||| |||||||| ||||| || || |||||||||||||||    
T  22504915 atgaagcggatacctgttctttatcgtaaccttgttcaactga 22504957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 29 - 471
Target Start/End: Original strand, 20777749 - 20778191
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcata-aagtttcttctctttcaacacttgcaagacaa 127  Q
    ||||| |||||||||| || |||||||| ||  | |||||||| || || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||| |  ||||| ||||    
T  20777749 cagaagtaacatggcctaggaaactcacttcacttaaccagaactcgcacttcgacaacttggcatacaactttct-ctctttcaaaatctgcaacacaa 20777847  T
Q  128 tcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcg 227  Q
    |||| || || |  || ||||| |||||| | || || || |||||||||||||| || ||||| || || |||  ||||| ||| |||||||| || ||    
T  20777848 tctttaggtgtttggcgtgttcctcttcaattttagaatagatcaaaatatcatctataaacaccaccacaaatttatccagaaaagcatggaaaattcg 20777947  T
Q  228 attcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgc 327  Q
     |||||||||||||| || || ||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||| || || ||||| ||  |||| || || |||||||||    
T  20777948 gttcatatactccatgaatacaccaggcgcgttagtaacaccgaaaggcatcactttgtattcgtaatgtccatatcgtgttctaaaggccgtcttctgc 20778047  T
Q  328 atatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattc 427  Q
    ||||| ||||| || |||||||| || || ||||  |||||||| ||||| || || |||||    ||||| || ||||| |||||||| || ||||| |    
T  20778048 atatcctcatccttcactttaatttgatggtaacccgacctcaagtcaatcttactaaaaactttagcacctaccaactggtccatcaagtcgtcaatcc 20778147  T
Q  428 acggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 471  Q
     ||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||    
T  20778148 gcgggagtggatacctattctttattgtaaccttgttcaactga 20778191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 46 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 37541896 - 37541471
Alignment:
Q  46 agaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcat 145  Q
    |||||||| || || || |||||||| |||||||| || || || ||||| |   |||| || |||||||||||||| || ||  |||||||||| || |    
T  37541896 agaaaacttacttcatttaaccagaactcacattttgataacttagcatacaacctcttttccttcaacacttgcaacactattctcagatgctctgcgt 37541797  T
Q  146 gttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaa 245  Q
    |||| || ||| ||||||| || || | ||||||||| || || || || || ||   ||||| ||| |||||||| || |||||||| || ||||||||    
T  37541796 gttcctcctcattcttggaatagattagaatatcatcaataaataccacaacaaacttatccagaaaggcatggaaaattcgattcatgtattccataaa 37541697  T
Q  246 cactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttact 345  Q
     || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || |||||||||||  | || || || |||||||||||||| ||||| || ||     
T  37541696 aacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcactttgtactcgtaatgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcacc 37541597  T
Q  346 ttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctat 445  Q
    || ||||| |||||||  |||||||||||||| || || ||||     ||||| || || ||||||||||| || |||||||  ||||| |||||||| |    
T  37541596 tttatctgatgataaccagacctcaaatcaatcttactaaaaatcttagcaccaaccaattgatccatcaagtcgtcaattctaggaagcggatacctgt 37541497  T
Q  446 tcttgatagttaccttgttcaactga 471  Q
    ||||||| || || ||||||||||||    
T  37541496 tcttgatcgtaactttgttcaactga 37541471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 30 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 21935719 - 21935279
Alignment:
Q  30 agaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatc 129  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||| || ||||| |||||||| |||||| | |  |  ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  21935719 agaaatcacatgaccaaggaaactcacttccttcaaccaaaactcacacttagacaacttggcacacaactggttctctttcaagacttgcaacacaatc 21935620  T
Q  130 ttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgat 229  Q
     ||| |||||||||||| ||||| |||| ||| || || | |||||||||||| |||||||| || || || || |||| | | | ||| || || | ||    
T  21935619 ctcaaatgctcagcatgctcttcctcagactttgaatacaccaaaatatcatctatgaacaccaccacaaaacggtccagataaggatgaaatattctat 21935520  T
Q  230 tcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcat 329  Q
    |||| || |||||||| || || |||||||| |  || ||||| ||||| ||   ||| |||||||| ||||| |   ||| ||| || || ||    ||    
T  21935519 tcatgtattccataaagacacctggtgcattagatactccaaatggcatcacagaatactcatagtgtccataccttgttcggaacgcagttttggatat 21935420  T
Q  330 atcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcac 429  Q
    ||||||  | |||||| ||||||| ||||| | ||| ||||||||||| || || || ||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |      
T  21935419 atcttctgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcacccactagctgatccatcaaatcatcaatcctt 21935320  T
Q  430 ggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    ||||||||||||| |||||| || || ||||||||||||||    
T  21935319 ggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactg 21935279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 30 - 470
Target Start/End: Original strand, 23507521 - 23507961
Alignment:
Q  30 agaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatc 129  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||| || ||||| |||||||| || ||| |    |  ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  23507521 agaaatcacatgaccaaggaaactcacttccttcaaccaaaactcacacttagacaactttgcacatcactggttctctttcaatacttgcaacacaatc 23507620  T
Q  130 ttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgat 229  Q
     ||| |||||||||||| ||||| |||| ||| || || | |||||||||||| |||||||| || || || || |||| | | | ||| || || | ||    
T  23507621 ctcaaatgctcagcatgctcttcctcagacttcgaatacaccaaaatatcatctatgaacaccaccacaaaacggtccagataaggatgaaatattctat 23507720  T
Q  230 tcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcat 329  Q
    |||| || |||||||| || || |||||||| |  || ||||| ||||| ||   ||| |||||||| ||||| | | ||| ||| || || ||    ||    
T  23507721 tcatgtattccataaagacacctggtgcattagatactccaaatggcatcacagaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcagttttggatat 23507820  T
Q  330 atcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcac 429  Q
    ||||||  | |||||| ||||||| ||||| | ||| ||||||||||| || || || ||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |      
T  23507821 atcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcacccactagctgatccatcaaatcatcaatcctt 23507920  T
Q  430 ggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    ||||||||||||| |||||| || || ||||||||||||||    
T  23507921 ggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactg 23507961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 29 - 449
Target Start/End: Original strand, 21408991 - 21409408
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| || || || || |||||||| |  ||||||   |||| ||||||||| |||||    
T  21408991 cagaaataatatgaccaagaaaactcacttcgttcaaccagaattcgcacttcgataacttggcatataaattcttc---ttcagcacttgcaaaacaat 21409087  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
      ||| |||||| |||||||| || |||| ||| |||||  ||| ||||||||| || |||||||| || || ||||| | | | | ||| || || | |    
T  21409088 tctcaaatgctcggcatgttcctcctcagacttagagtatttcagaatatcatctataaacacaacaacaaaacgatctagataagtatgaaaaatacaa 21409187  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    |||||||| |||||||| ||||| || |||||  ||||||| |||||||| ||   |||||| |  || || ||| |  | || || || |||||||| |    
T  21409188 ttcatatattccataaatactcctggcgcattaataacaccgaaaggcatcacagaatattcgttatgtccgtaatgtgtcctaaaggccgtcttctgaa 21409287  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    |||| |||||||| ||||| || |||||||| |   | || || |||||||| ||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||| || || |     
T  21409288 tatcctcatctttcactttgatatggtgatagccccatcttaagtcaattttactgaacacacgcgcacccatcaactgatccatcaaatcgtcgatcct 21409387  T
Q  429 cggaagtggatacctattctt 449  Q
    |||| ||||||| ||||||||    
T  21409388 cggaggtggatatctattctt 21409408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 29 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 28914945 - 28914640
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcata-aagtttcttctctttcaacacttgcaagacaa 127  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||| ||  | |||||||| || || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||| |  ||||| ||||    
T  28914945 cagaaatgacatggcctagaaaactcacttcacttaaccagaactcgcacttcgacaacttggcatacaactttct-ctctttcaaaatctgcaacacaa 28914847  T
Q  128 tcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcg 227  Q
    ||||||| || || || ||||| |||||||| || || || ||||| |||||||| || || || || || |||  ||||| ||| |||||||| || ||    
T  28914846 tcttcaggtgttcggcgtgttcctcttcagttttagaatagatcaatatatcatctataaataccaccacaaatttatccagaaaagcatggaaaattcg 28914747  T
Q  228 attcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgc 327  Q
     |||||||||||||| ||||| || || || || |||||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||  | || ||||| |||||||||    
T  28914746 gttcatatactccatgaacacacccggcgcgttagtaacaccgaaaggcatcactttgtattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaagccgtcttctgc 28914647  T
Q  328 atatctt 334  Q
    |||||||    
T  28914646 atatctt 28914640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 29 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 28930213 - 28929908
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcata-aagtttcttctctttcaacacttgcaagacaa 127  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||| ||  | |||||||| || || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||| |  ||||| ||||    
T  28930213 cagaaatgacatggcctagaaaactcacttcacttaaccagaactcgcacttcgacaacttggcatacaactttct-ctctttcaaaatctgcaacacaa 28930115  T
Q  128 tcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcg 227  Q
    ||||||| || || || ||||| |||||||| || || || ||||| |||||||| || || || || || |||  ||||| ||| |||||||| || ||    
T  28930114 tcttcaggtgttcggcgtgttcctcttcagttttagaatagatcaatatatcatctataaataccaccacaaatttatccagaaaagcatggaaaattcg 28930015  T
Q  228 attcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgc 327  Q
     |||||||||||||| ||||| || || || || |||||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||  | || ||||| |||||||||    
T  28930014 gttcatatactccatgaacacacccggcgcgttagtaacaccgaaaggcatcactttgtattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaagccgtcttctgc 28929915  T
Q  328 atatctt 334  Q
    |||||||    
T  28929914 atatctt 28929908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 29 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 21679310 - 21679037
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||  | ||||| || || || || |||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  21679310 cagaaataatatggccaagaaaactcacttcacttaaccaaaactcgcactttgacaatttggcatacaacttcttctctttcaatacttgcaatacaat 21679211  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
    | || |||| || ||||| ||||| |||||  | || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || |||  ||| |   |  |||| || || |      
T  21679210 cctcggatgttctgcatgctcttcctcagttctcgaatagatcaaaatgtcatcaatgaatacaaccacaaatttatctaggtaaacatgaaaaattctg 21679111  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccata 302  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| || |||||| | || ||||||||    
T  21679110 ttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttatatccgtaatgaccata 21679037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 30 - 470
Target Start/End: Original strand, 24583047 - 24583487
Alignment:
Q  30 agaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatc 129  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||| || ||||| |||||||| |||||  | |  |  ||||||||||| |||||||| |||||     
T  24583047 agaaatcacatgaccaaggaaactcacttccttcaaccaaaactcacacttagacaacttggcgcacaactggttctctttcaagacttgcaacacaatt 24583146  T
Q  130 ttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgat 229  Q
     ||| |||||||||||| ||||| |||  ||| || || | |||||||||||| |||||||| || || || || |||| | | | ||| || || | ||    
T  24583147 ctcaaatgctcagcatgctcttcctcaaactttgaatacaccaaaatatcatctatgaacaccaccacaaaacggtccagataaggatgaaatattctat 24583246  T
Q  230 tcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcat 329  Q
    |||| || |||||||| || || || ||||| |  || ||||| ||||| ||   ||| |||||||| ||||| | | ||| ||| || || ||    ||    
T  24583247 tcatgtattccataaagacacctggcgcattagatactccaaatggcatcacagaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcagttttggatat 24583346  T
Q  330 atcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcac 429  Q
    |||||   | |||||| ||||||| ||||| | ||| ||||||||||| || || || ||   |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |      
T  24583347 atcttttgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatcctt 24583446  T
Q  430 ggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    ||||||||||||| |||||| || || ||||||||||||||    
T  24583447 ggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactg 24583487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 33 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 24618823 - 24618700
Alignment:
Q  33 aataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttc 132  Q
    ||||| |||||| |||||||| || ||  | |||||||| || ||||| ||||| |||||||| |   |||| ||||||||||||||||| ||||| |||    
T  24618823 aataatatggcccagaaaacttacttcacttaaccagaactcgcatttggacaacttggcatacaacctcttttctttcaacacttgcaacacaattttc 24618724  T
Q  133 agatgctcagcatgttcttcttca 156  Q
    |||||||| ||||| |||||||||    
T  24618723 agatgctctgcatgctcttcttca 24618700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 33 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 24715054 - 24714931
Alignment:
Q  33 aataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttc 132  Q
    ||||| |||||| |||||||| || ||  | |||||||| || ||||| ||||| |||||||| |   |||| ||||||||||||||||| ||||| |||    
T  24715054 aataatatggcccagaaaacttacttcacttaaccagaactcgcatttggacaacttggcatacaacctcttttctttcaacacttgcaacacaattttc 24714955  T
Q  133 agatgctcagcatgttcttcttca 156  Q
    |||||||| ||||| |||||||||    
T  24714954 agatgctctgcatgctcttcttca 24714931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 33 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 24748082 - 24747959
Alignment:
Q  33 aataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttc 132  Q
    ||||| |||||| |||||||| || ||  | |||||||| || ||||| ||||| |||||||| |   |||| ||||||||||||||||| ||||| |||    
T  24748082 aataatatggcccagaaaacttacttcacttaaccagaactcgcatttggacaacttggcatacaacctcttttctttcaacacttgcaacacaattttc 24747983  T
Q  133 agatgctcagcatgttcttcttca 156  Q
    |||||||| ||||| |||||||||    
T  24747982 agatgctctgcatgctcttcttca 24747959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 23 - 71
Target Start/End: Original strand, 23442056 - 23442104
Alignment:
Q  23 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaa 71  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23442056 catcaccagaaatgacatggccaagaaaactcacttctttcaaccagaa 23442104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 334 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 21677061 - 21676946
Alignment:
Q  334 tcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaa 433  Q
    |||||||| || || ||||| || |||| ||||||||| |||||||| || ||||    |||||| || |||||||||||||  || ||||||| |||||    
T  21677061 tcatctttcaccttgatctgatggtaacctgacctcaagtcaattttactaaaaatctttgcaccaaccaactgatccatcaggtcgtcaattctcggaa 21676962  T
Q  434 gtggatacctattctt 449  Q
    | ||||| ||||||||    
T  21676961 gcggatatctattctt 21676946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 384; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 384; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 470
Target Start/End: Original strand, 8885 - 9332
Alignment:
Q  23 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 122  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8885 catcaccagaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 8984  T
Q  123 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 222  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  8985 aacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgataaacacaaccacaaaccgatccaaaaatgcatggaag 9084  T
Q  223 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  9085 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagttgtct 9184  T
Q  323 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 422  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9185 tctgcatatcttcatctttcactttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 9284  T
Q  423 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9285 aattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 9332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 384; Significance: 0; HSPs: 73)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 384; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 15401112 - 15400665
Alignment:
Q  23 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 122  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15401112 catcaccagaaataacatggccaagaaaactcacttctttcaaccagaactcacacttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacactcgcaa 15401013  T
Q  123 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  15401012 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgataaacacaaccacaaaccgatccaaaaatgcatggaag 15400913  T
Q  223 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15400912 atgcgattcatatactccataaacactccaagtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtct 15400813  T
Q  323 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 422  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15400812 tctgcatatcttcatctttcactttaatttggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 15400713  T
Q  423 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15400712 aattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 15400665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 372; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 31 - 470
Target Start/End: Original strand, 12888252 - 12888691
Alignment:
Q  31 gaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatct 130  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12888252 gaaataacatggccaagtaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagacaattttgcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatct 12888351  T
Q  131 tcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgatt 230  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12888352 tcaggtgctcggcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacactactacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgatt 12888451  T
Q  231 catatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcata 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12888452 catatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcata 12888551  T
Q  331 tcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacg 430  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  12888552 tcttcatcctttactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcg 12888651  T
Q  431 gaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12888652 gaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 12888691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 368; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 31 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 5109198 - 5108759
Alignment:
Q  31 gaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatct 130  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  5109198 gaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagcttcttttctttcaacacttgcaaaacaatct 5109099  T
Q  131 tcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgatt 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5109098 tcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaagatatcgtcgatgaacacaactacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgatt 5108999  T
Q  231 catatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcata 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5108998 catatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcata 5108899  T
Q  331 tcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacg 430  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  5108898 tcttcatcttttactttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcg 5108799  T
Q  431 gaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5108798 gaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 5108759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 366; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 29 - 470
Target Start/End: Original strand, 10007141 - 10007582
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10007141 cagaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagcttcttctctttcaacacttgcaaaacaat 10007240  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10007241 cttcagatgctcagaatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgatgaacacaactacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcga 10007340  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  10007341 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaactccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagccgtcttctgca 10007440  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  10007441 tatcttcatcctttactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattct 10007540  T
Q  429 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10007541 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 10007582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 362; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 29 - 470
Target Start/End: Original strand, 10907751 - 10908192
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10907751 cagaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagcttcttctctttcaacacttgcaaaacaat 10907850  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10907851 cttcagatgctcaaaatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgatgaacacaactacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcga 10907950  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  10907951 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaactccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagccgtcttctgca 10908050  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  10908051 tatcttcatcctttactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattct 10908150  T
Q  429 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10908151 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 10908192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 470
Target Start/End: Original strand, 13254225 - 13254672
Alignment:
Q  23 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 122  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13254225 catcaccagaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagcttcttctctttcaacacttgcaa 13254324  T
Q  123 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 222  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  13254325 aacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtagatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacaaaccgatccaaaaatgcatggaag 13254424  T
Q  223 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13254425 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaactccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtct 13254524  T
Q  323 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 422  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  13254525 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagttgatccatcaaatcatc 13254624  T
Q  423 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13254625 aattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 13254672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 20060649 - 20060202
Alignment:
Q  23 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 122  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20060649 catcaccagaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaaccaaaattcacacttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 20060550  T
Q  123 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 222  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || || ||||||| |||||||||||||    
T  20060549 aacaatcttcagatgctcggcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacaaaccgatccagaaatgcatggaag 20060450  T
Q  223 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20060449 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaactccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtct 20060350  T
Q  323 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 422  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20060349 tctgcatatcttcatcctttactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatc 20060250  T
Q  423 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20060249 aattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 20060202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 31 - 470
Target Start/End: Original strand, 3687486 - 3687925
Alignment:
Q  31 gaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatct 130  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3687486 gaaataacatgacctagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagataatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatct 3687585  T
Q  131 tcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgatt 230  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3687586 tcagatgctctgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgatgaacacaactacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgatt 3687685  T
Q  231 catatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcata 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  3687686 catatactccataaacactccaggtgcattggtaactccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagccgtcttctgcata 3687785  T
Q  331 tcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacg 430  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  3687786 tcttcatcctttactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgctcccactagctgatccatcaaatcatcaattctcg 3687885  T
Q  431 gaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3687886 gaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 3687925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 31 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 5423517 - 5423078
Alignment:
Q  31 gaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatct 130  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || |||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5423517 gaaataacatggccaaggaaactcacttcattcaacaagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatct 5423418  T
Q  131 tcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgatt 230  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5423417 tcagatgctcggcatgttcttcttcagtcttagagtaaatcaagatatcgtcgatgaacataactacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgatt 5423318  T
Q  231 catatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcata 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  5423317 catatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctaaaagctgtcttctgcata 5423218  T
Q  331 tcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacg 430  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  5423217 tcttcatcttttactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcg 5423118  T
Q  431 gaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5423117 gaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 5423078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 31 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 15346832 - 15346393
Alignment:
Q  31 gaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatct 130  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15346832 gaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagcttcttctctttcaacacttgcaaaacaatct 15346733  T
Q  131 tcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgatt 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15346732 tcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacaaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgatt 15346633  T
Q  231 catatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcata 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15346632 catatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcata 15346533  T
Q  331 tcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacg 430  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  15346532 tcttcatcctttactttaagctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcg 15346433  T
Q  431 gaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15346432 gaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 15346393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 470
Target Start/End: Original strand, 48426982 - 48427429
Alignment:
Q  23 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 122  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  48426982 catcaccagaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagcttcttctctttcaacacttgcaa 48427081  T
Q  123 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 222  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  48427082 aacaatcttcagatgctcggcatgttcttcttcagtcttggagtagatcaaaatatcgtcgataaacacaactacgaaccgatccaaaaatgcatggaag 48427181  T
Q  223 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  48427182 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagccgtct 48427281  T
Q  323 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 422  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  48427282 tctgcatatcttcgtcttttactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatc 48427381  T
Q  423 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48427382 aattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 48427429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 470
Target Start/End: Original strand, 16637308 - 16637755
Alignment:
Q  23 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 122  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  16637308 catcaccagaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagcttcttctctttcaacacttgtaa 16637407  T
Q  123 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16637408 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtagatcaaaatatcgtcgataaacacaactacgaaccgatccaaaaatgcatggaag 16637507  T
Q  223 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  16637508 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaagggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagccgtct 16637607  T
Q  323 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 422  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16637608 tctgcatatcttcgtcttttactttaatctggtgatagcctgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatc 16637707  T
Q  423 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16637708 aattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 16637755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 350; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 29 - 470
Target Start/End: Original strand, 6602277 - 6602718
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6602277 cagaaataacatggccaaggaaactcacttcattcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaat 6602376  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6602377 cgtcagatgctcagcatgttcttcttcggtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgatgaacacaactacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcga 6602476  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  6602477 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttttgca 6602576  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  6602577 tatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattct 6602676  T
Q  429 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6602677 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgctcaactg 6602718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 15587987 - 15587540
Alignment:
Q  23 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 122  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15587987 catcaccagaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaa 15587888  T
Q  123 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 222  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || ||||||| |||||||||||||    
T  15587887 gacaatcttcagatgctcaacatgttcttcttcagtcttggagtagatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacaaaccgatccagaaatgcatggaag 15587788  T
Q  223 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  15587787 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttatattcatagtgaccatatcgcgttctgaaagctgtct 15587688  T
Q  323 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 422  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15587687 tctgcatatcttcatcctttactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatc 15587588  T
Q  423 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15587587 aattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 15587540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 16805535 - 16805094
Alignment:
Q  30 agaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatc 129  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16805535 agaaataacatggccaagaaaacttacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatc 16805436  T
Q  130 ttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgat 229  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16805435 ttcagatgctcagcatgttctccttcagtcttggagtaaatcaaaatgtcgtcgataaacacaactacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgat 16805336  T
Q  230 tcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcat 329  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  16805335 tcatgtactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgtgctgaaagctgtcttctgcat 16805236  T
Q  330 atcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcac 429  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16805235 atcttcatctttcactttaatctggtgataccctgatctcaaatcaatcttgctgaaaacttttgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctc 16805136  T
Q  430 ggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 471  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16805135 ggaagtggatacctattcttgatagttactttgttcaactga 16805094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 342; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 31 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 53383605 - 53383168
Alignment:
Q  31 gaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatct 130  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  53383605 gaaataacatggccaaggaaactcacttcattcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacctgtaagacaatct 53383506  T
Q  131 tcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgatt 230  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  53383505 tcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgatgaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgatt 53383406  T
Q  231 catatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcata 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  53383405 catatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcata 53383306  T
Q  331 tcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacg 430  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  53383305 tcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcg 53383206  T
Q  431 gaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 468  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  53383205 gaagtggatacctattcttgatagttactttgttcaac 53383168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 31 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 16755288 - 16754849
Alignment:
Q  31 gaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatct 130  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||   | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  16755288 gaaataacatggccaaggaaactcacttcattcaaccagaattcacacacaaacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaaaacaatct 16755189  T
Q  131 tcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgatt 230  Q
    ||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16755188 tcaaatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcaataaacacaaccacaaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgatt 16755089  T
Q  231 catatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcata 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16755088 catatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcata 16754989  T
Q  331 tcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacg 430  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16754988 tcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcg 16754889  T
Q  431 gaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16754888 gaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 16754849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 23 - 471
Target Start/End: Original strand, 16693699 - 16694147
Alignment:
Q  23 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 122  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16693699 catcaccagaaataacatgaccaagaaaacttacttctttcaaccagaactcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaa 16693798  T
Q  123 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  16693799 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtatatcaaaatttcgtctataaacacaactactaaccgatccaaaaatgcatggaag 16693898  T
Q  223 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 322  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  16693899 atgcgattcatttactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaatggcataactttatattcatagtgaccatagcgcgttctgaaagctgtct 16693998  T
Q  323 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 422  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||    ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16693999 tctgcatatcttcatctttcacattaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctgaagactttcgcacccactaactgatccatcaagtcatc 16694098  T
Q  423 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 471  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16694099 aattctcggaagtggatacatattcttgatagttaccttattcaactga 16694147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 23 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 14875094 - 14874676
Alignment:
Q  23 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 122  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14875094 catcaccagaaataacaaggccaagaaaacttacttctttcaaccagaactcacacttagataatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 14874995  T
Q  123 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||    
T  14874994 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgataaaaacaaccacgaatcgatccaaaaaggcatgaaag 14874895  T
Q  223 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 322  Q
    ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||    
T  14874894 atgcgattcatgtactccatgaatactccaggtgcattcgtaacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataccgcgttctgaaagatgtct 14874795  T
Q  323 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 422  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14874794 tctgcaaatcttcgtcttttactttaatctggtgataacctgatctcaaatctatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 14874695  T
Q  423 aattcacggaagtggatac 441  Q
    ||||| |||||||||||||    
T  14874694 aattctcggaagtggatac 14874676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 23 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 15723529 - 15723170
Alignment:
Q  23 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 122  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15723529 catcaccagaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttcgacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 15723430  T
Q  123 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 222  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| |||    
T  15723429 aacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgataaacacaaccacaaaccgatccaaaaatgcatgaaag 15723330  T
Q  223 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  15723329 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgtgttctgaaagctgtct 15723230  T
Q  323 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgc 382  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  15723229 tctgcatatcttcatcctttactttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgc 15723170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 29 - 467
Target Start/End: Original strand, 17491391 - 17491829
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |     
T  17491391 cagaaataacatgtccaagaaagctcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttcgcataaagcttcttctctttcaacacttgcaaaaccag 17491490  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||    
T  17491491 cttcaaatgctcagcatgttcttcttcagacttggagtaaattaaaatatcatcaataaaaacaaccacgaaccgatccaaaaatgaatgaaagatgcga 17491590  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    ||||| |||| |||||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| || ||||| || ||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  17491591 ttcatgtacttcataaatactccaggtgcatttgtaacactgaaaggcataactttgtactcataatgtccataacgcgttctgaaagctgttttctgca 17491690  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||  || |||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  17491691 tatcttcatctttcactttaatctggtgataacccgatctcaaatctatcttgctgaaaacacttgcacccactaactgatccatcaaataatcaattct 17491790  T
Q  429 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaa 467  Q
    ||||||||||||||||||||| || || |||||||||||    
T  17491791 cggaagtggatacctattctttattgtcaccttgttcaa 17491829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 23 - 332
Target Start/End: Original strand, 12499783 - 12500092
Alignment:
Q  23 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 122  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12499783 catcaccagaaataacatggccaagaaaacttacctctttcaaccagaactcacacttagataatttagcataaagtttcttctctatcaacacttgcaa 12499882  T
Q  123 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  12499883 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaaaacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaag 12499982  T
Q  223 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 322  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12499983 atgcgattcatgtactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtct 12500082  T
Q  323 tctgcatatc 332  Q
    | ||||||||    
T  12500083 tatgcatatc 12500092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 29 - 470
Target Start/End: Original strand, 15261171 - 15261612
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||| |||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  15261171 cagaaataacatggccaagaaaactcacctctttcaaccagaattcacacttttacaatttagcataaagcttcttctccttcagcacttgcaaaacaat 15261270  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||    
T  15261271 cttcaaatgctcagcatgttcttcttcagtcttggaatatatcaaaatatcatcgatgaatacaaccacgaaacgatccaaaaacgcatgaaagatacga 15261370  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    ||||| |||||||||||||| || || |||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||  |||| |||||  |||||||||    
T  15261371 ttcatgtactccataaacacacctggcgcatttctaacaccgaaaggcatcactttatattcataatgtccataacgtgttctaaaagccatcttctgca 15261470  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    ||||||||||||| | |||||||| ||||||||  || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  15261471 tatcttcatctttcagtttaatctagtgataacccgatctcaaatcaatcttgctaaacacacgtgcacccactaactgatccatcaattcatcaattct 15261570  T
Q  429 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    |||||||||||| |||||||| || || || ||||| |||||    
T  15261571 cggaagtggatatctattctttatcgtcactttgtttaactg 15261612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 23 - 295
Target Start/End: Original strand, 15340804 - 15341076
Alignment:
Q  23 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 122  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15340804 catcaccagaaataacatggccaagaaaactcacttctttcaaccagaactcacacttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacactcgcaa 15340903  T
Q  123 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  15340904 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgataaacacaaccacaaaccgatccaaaaatgcatggaag 15341003  T
Q  223 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagt 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15341004 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagt 15341076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 291 - 470
Target Start/End: Original strand, 15357886 - 15358065
Alignment:
Q  291 atagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaaca 390  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15357886 atagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcatcatctttcactttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctgaaaaca 15357985  T
Q  391 cgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15357986 cgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagtaaccttgttcaactg 15358065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 249 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 14579777 - 14579557
Alignment:
Q  249 tccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttacttta 348  Q
    |||||||||||| |||||||| || | ||| || ||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14579777 tccaggtgcatttgtaacaccgaacgacatcaccttatactcataatgtccataccgcattctaaaagctgtcttctgcatatcttcatctttcacttta 14579678  T
Q  349 atctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattct 448  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  14579677 atctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaattgatccatcaaatcatcaattcttggaagtggatacctattct 14579578  T
Q  449 tgatagttaccttgttcaact 469  Q
    | || |||||||| |||||||    
T  14579577 ttatcgttaccttattcaact 14579557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 46 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 11959730 - 11959305
Alignment:
Q  46 agaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcat 145  Q
    ||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| ||||| || ||||| |   |||| |||||||| |||||||| |||||  |||||||||| ||||    
T  11959730 agaaaactcacttcacttaaccagaattcacattttgacaactttgcatacaacctcttttctttcaaaacttgcaatacaattctcagatgctctgcat 11959631  T
Q  146 gttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaa 245  Q
    | || |||||| ||||||| || || ||||||||||| || ||||||||||  |||  ||||| ||| |||||||| || | ||||||||| ||||||||    
T  11959630 gctcctcttcattcttggaatagattaaaatatcatcaataaacacaactagaaatttatccagaaaagcatggaaaatcctattcatatattccataaa 11959531  T
Q  246 cactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttact 345  Q
    ||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| ||  | || ||||  |||||||||||||| ||||| || ||     
T  11959530 cacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttgtattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaagtcgtcttctgcatatcctcatccttgacc 11959431  T
Q  346 ttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctat 445  Q
    || ||||| || ||||  |||||||||||||| || ||||| ||   ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  11959430 ttcatctgatggtaaccagacctcaaatcaatcttactgaacacctttgcactcactaactgatccatcaagtcatcaattctcggaagtggatacctat 11959331  T
Q  446 tcttgatagttaccttgttcaactga 471  Q
    |||| || || || ||||||||||||    
T  11959330 tctttatcgtaactttgttcaactga 11959305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 29 - 449
Target Start/End: Original strand, 15229154 - 15229574
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    |||||||||  |||||||||||||| || ||  | |||| |||||||||||| |||||  ||||||| |  ||||| ||||||||||||||||| | |||    
T  15229154 cagaaataatgtggccaagaaaacttacttcacttaacccgaattcacatttggacaacatggcatacaacttcttttctttcaacacttgcaacataat 15229253  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
     ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| || |||||||| || |||||||| || |||  ||| | | | ||||||||  | | |    
T  15229254 tttcagatgctctgcatgctcttcttcagtcttagaataaattaagatatcatcaataaacacaaccacaaatttatctagataagcatggaaagttcta 15229353  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    ||||| || ||||||||||| | ||| ||||| ||||| || |||||||| || ||||||||||| || ||||| ||  | || || || || |||| ||    
T  15229354 ttcatgtattccataaacacactaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcataatgtccatatcgtgtcctaaaggccgttttctaca 15229453  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    |||||||  | || || |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||     
T  15229454 tatcttcccccttcaccttaatctgatggtaacctgacctcaaatcaattttgctgaacacgcgtgcacccactaactgatcgattaaatcatcaattct 15229553  T
Q  429 cggaagtggatacctattctt 449  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  15229554 cggaagtggatacctattctt 15229574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 29 - 449
Target Start/End: Original strand, 15235022 - 15235442
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    |||||||||  |||||||||||||| || ||  | |||| |||||||||||| |||||  ||||||| |  ||||| ||||||||||||||||| | |||    
T  15235022 cagaaataatgtggccaagaaaacttacttcacttaacccgaattcacatttggacaacatggcatacaacttcttttctttcaacacttgcaacataat 15235121  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
     ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| || |||||||| || |||||||| || |||  ||| | | | ||||||||  | | |    
T  15235122 tttcagatgctctgcatgctcttcttcagtcttagaataaattaagatatcatcaataaacacaaccacaaatttatctagataagcatggaaagttcta 15235221  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    ||||| || ||||||||||| | ||| ||||| ||||| || |||||||| || ||||||||||| || ||||| ||  | || || || || |||| ||    
T  15235222 ttcatgtattccataaacacactaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcataatgtccatatcgtgtcctaaaggccgttttctaca 15235321  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    |||||||  | || || |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||     
T  15235322 tatcttcccccttcaccttaatctgatggtaacctgacctcaaatcaattttgctgaacacgcgtgcacccactaactgatcgattaaatcatcaattct 15235421  T
Q  429 cggaagtggatacctattctt 449  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  15235422 cggaagtggatacctattctt 15235442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 29 - 471
Target Start/End: Original strand, 12179889 - 12180337
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| ||  | |||||||| ||||| || ||||| || ||||| |  ||||| |||||||| | |||||| |||||    
T  12179889 cagaaataatgtggccaagaaaactcacttcaattaaccagaactcacacttcgacaacttagcatacaacttcttttctttcaatatttgcaacacaat 12179988  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||| | ||| ||||| ||  ||||||| ||||||  || ||   | |||||||| || ||     
T  12179989 cttcagatgctctgcatgctcttcttcagtcttataataaattagaatgtcatcaatagacacaaccacgaatttattcaggtaggcatggaaaattcgg 12180088  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcata------gtgaccataacgcattctgaaagctgtct 322  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||| || |||||||||||      ||||||||||||  | || || || ||||    
T  12180089 ttcatatactccatgaacacaccaggtgcattagtaacaccgaaagacatcaccttatattcatatatatagtgaccataacgtgtcctaaaggccgtct 12180188  T
Q  323 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 422  Q
    |||||||||| ||||| || || ||||| || || |||| ||||||||| ||||| || || || |||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  12180189 tctgcatatcctcatccttcaccttaatttgatggtaacctgacctcaagtcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaagtcatc 12180288  T
Q  423 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 471  Q
    ||| | ||||||||||||||| ||||| || || || ||||||||||||    
T  12180289 aatcctcggaagtggatacctgttctttatcgtaactttgttcaactga 12180337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 333 - 470
Target Start/End: Original strand, 24185035 - 24185172
Alignment:
Q  333 ttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacgga 432  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24185035 ttcatcttttactttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcgga 24185134  T
Q  433 agtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24185135 agtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 24185172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 29 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 11950486 - 11950044
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| ||  | |||||||| ||||| || ||||| || ||||| |  |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  11950486 cagaaataatgtggccaagaaaactcacttcacttaaccagaactcacacttcgacaacttagcatacaacttcttctctttcaatacttgcaacacaat 11950387  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
    ||||| ||| || ||||| |||||||||||||| || ||||||| ||||||||| || |||||||| ||||||  |||||   | |||||||| || ||     
T  11950386 cttcaaatgttctgcatgctcttcttcagtcttagaataaatcagaatatcatcaataaacacaaccacgaatttatccaggtaagcatggaaaattcgg 11950287  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||  | || ||||| || |||||||| ||  | || || || ||||||||||    
T  11950286 ttcatctactccatgaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatccccttgtattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgca 11950187  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    |||| ||||| || || || ||||| || |||| ||||||||| ||||| || || ||||| | ||||||||| || ||||||||||| || ||||| |     
T  11950186 tatcctcatccttcaccttgatctgatggtaacctgacctcaagtcaatcttactaaaaacccttgcacccaccaaatgatccatcaagtcgtcaatcct 11950087  T
Q  429 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 471  Q
    ||||||||||||||| ||||| || || || || |||||||||    
T  11950086 cggaagtggatacctgttctttattgtaactttattcaactga 11950044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 129 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 16826754 - 16826439
Alignment:
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||  || |||||||| || ||||| || |||||||| || |||  |||||     |||||||| || ||     
T  16826754 cttcagatgctctgcatgctcttcttcagtctcagaataaatcaagatgtcatcaataaacacaaccacaaatttatcca-----gcatggaaaattcgg 16826660  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| ||||  | || || |  ||||||||||    
T  16826659 ttcatatactccataaacacaccagacgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttatattcatagtgaccaaaacgtgtcctaaaggtcgtcttctgca 16826560  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    |||| ||||| || || |||||||| || |||| |||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |     
T  16826559 tatcctcatccttcaccttaatctgatggtaacctgacctcaaatcaattttactaaacacacgtgcacccactaactgatccattaaatcgtcaatcct 16826460  T
Q  429 cggaagtggatacctattctt 449  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  16826459 cggaagtggatacctattctt 16826439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 29 - 449
Target Start/End: Original strand, 17187925 - 17188345
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| ||  | |||||||| ||||| || |||||||||||||| |  || ||||||||||| |||||||| |||||    
T  17187925 cagaaataatgtggccaagaaaactcacttcacttaaccagaactcacacttcgacaatttggcatacaactttttctctttcaatacttgcaatacaat 17188024  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
     |||||||| || ||||| ||||| |||||| | || ||||||| ||| ||||| ||||| ||||| || |||  ||||||| | ||||| || || |      
T  17188025 tttcagatgttctgcatgctcttcctcagtccttgaataaatcagaatgtcatcaatgaatacaaccacaaatttatccaaataggcatgaaaaattctg 17188124  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||| || ||  | || || || ||||||||||    
T  17188125 ttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcactttatattcgtaatgaccgtatcgtgtcctaaaggcagtcttctgca 17188224  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    |||| ||||| || || || ||||| || |||| ||||||||| ||||| || || |||||   ||||||||| |||||||||||||| ||||| || |     
T  17188225 tatcctcatccttcaccttgatctgatggtaacctgacctcaagtcaatcttactaaaaacctttgcacccaccaactgatccatcaagtcatccatcct 17188324  T
Q  429 cggaagtggatacctattctt 449  Q
    ||||||||||||||| |||||    
T  17188325 cggaagtggatacctgttctt 17188345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 40 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 31693752 - 31693321
Alignment:
Q  40 tggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgct 139  Q
    |||||||||||||| || ||  | |||||||| |||||||| ||||| || ||||| |  ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |    
T  31693752 tggccaagaaaacttacttcacttaaccagaactcacattttgacaacttagcatacaacttcttttctttcaaaacttgcaatacaatcttcagatgtt 31693653  T
Q  140 cagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactc 239  Q
    | ||||| ||||||||||||||  | |||||||  || ||||| || || ||||| ||||||  ||||| | | |||||||| || |  |||||||||||    
T  31693652 ctgcatgctcttcttcagtctttaaataaatcagtatgtcatcaataaatacaaccacgaatttatccagataagcatggaaaattcagttcatatactc 31693553  T
Q  240 cataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatct 339  Q
    ||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| || || |||||||| || ||||| ||  | || ||||| |||||||||||||| |||||     
T  31693552 cataaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttgtattcataatgtccatatcgtgtcctaaaagccgtcttctgcatatcctcatcc 31693453  T
Q  340 tttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggat 439  Q
    || || || || || || |||| ||||||||| ||||| || ||||||||   ||||||||||||||| |||||||| || ||||  | |||||||||||    
T  31693452 ttcaccttgatttgatggtaacctgacctcaagtcaatcttactgaaaacctttgcacccactaactggtccatcaagtcgtcaaccctcggaagtggat 31693353  T
Q  440 acctattcttgatagttaccttgttcaactga 471  Q
    |||| ||||| || || || ||||||||||||    
T  31693352 acctgttctttatcgtaactttgttcaactga 31693321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 40 - 471
Target Start/End: Original strand, 31940465 - 31940896
Alignment:
Q  40 tggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgct 139  Q
    |||||||||||||| || ||  | |||||||| |||||||| ||||| || ||||| |  ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |    
T  31940465 tggccaagaaaacttacttcacttaaccagaactcacattttgacaacttagcatacaacttcttttctttcaaaacttgcaatacaatcttcagatgtt 31940564  T
Q  140 cagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactc 239  Q
    | ||||| | |||||||||||| || |||||||  || ||||| || || ||||| ||||||  ||||| | | |||||||| || || |||||||||||    
T  31940565 ctgcatgctattcttcagtctttgaataaatcagtatgtcatcaataaatacaaccacgaatttatccagataagcatggaaaattcggttcatatactc 31940664  T
Q  240 cataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatct 339  Q
    ||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| || || |||||||| ||  |||| ||  | || || |||||||| |||||||| |||||     
T  31940665 cataaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttgtattcataatgtgcatatcgtgtcctaaaggctgtcttatgcatatcctcatcc 31940764  T
Q  340 tttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggat 439  Q
    || || || || || || |||| ||||||||| ||||| || ||||||||   ||||||||||||||| |||||||| || ||||| | |||||||||||    
T  31940765 ttcaccttgatttgatggtaacctgacctcaagtcaatcttactgaaaacctttgcacccactaactggtccatcaagtcgtcaatcctcggaagtggat 31940864  T
Q  440 acctattcttgatagttaccttgttcaactga 471  Q
    |||| ||||| || || || ||||||||||||    
T  31940865 acctgttctttatcgtaactttgttcaactga 31940896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 29 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 12359105 - 12358663
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| ||  | |||||||| ||||| || ||||| || ||||| |  || ||||||||||| |||||||| |||||    
T  12359105 cagaaataatgtggccaagaaaactcacttcacttaaccagaactcacacttcgacaacttagcatacaactttttctctttcaatacttgcaatacaat 12359006  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
    ||||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||||| ||| ||||| || || ||||| || |||  |||||   | |||||||| || ||     
T  12359005 cttcagatgttctgcatgctcttcttcagtctttgaataaatcagaatgtcatcaataaatacaaccactaatttatccaggtaagcatggaaaattcgg 12358906  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||| |||||||| || || ||||| || || ||||| ||  |  | || || ||||||||||    
T  12358905 ttcatatactccatgaacacaccaggcgctttagtaacaccgaaaggcatcaccttgtattcgtaatgtccatatcgtgtcttaaaggccgtcttctgca 12358806  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    |||| ||||| || || |||||||| || |||| ||||||||| ||| | || ||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||| |     
T  12358805 tatcctcatccttcaccttaatctgatggtaacctgacctcaagtcattcttactgaaaacctttgcacccactaactgatccatcaagtcatcaatcct 12358706  T
Q  429 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 471  Q
    ||||||||||||||| ||||| || || || |||| |||||||    
T  12358705 cggaagtggatacctgttctttattgtaactttgtgcaactga 12358663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 30 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 15014344 - 15013904
Alignment:
Q  30 agaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat- 128  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || || || |||||||| |  |||||||| |||| ||||||||| |||||     
T  15014344 agaaataatatggccaagaaaactcacttcgttcaaccagaattcgcacttcgataacttggcatataacttcttctccttcagcacttgcaaaacaatt 15014245  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
    || || |||||| |||||||| || || ||||| ||||| || | ||||||||| || |||||||| || |||||||||||| | ||||| || || |||    
T  15014244 ctaca-atgctcggcatgttcctcctcggtcttagagtatattagaatatcatctataaacacaacaacaaatcgatccaaataagcatgaaaaatacga 15014146  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||   |||||| || || |||||||   | || || |  |||||||| |    
T  15014145 ttcatatattccataaacactccaggcgcgttagtaacaccgaaaggcatcaccgaatattcgtaatgtccataacatgtcctaaaggtcgtcttctgaa 15014046  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    |||| |||||||| ||| | || |||||||| |  || || |||||||| || ||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||| |  || |     
T  15014045 tatcctcatctttcactctgatatggtgatagcccgatcttaaatcaatcttactgaacacacgtgcatccactaactaatccatcaaatcgtggatcct 15013946  T
Q  429 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    ||||||||||||||||||||| || || || |||||||||||    
T  15013945 cggaagtggatacctattctttattgtcactttgttcaactg 15013904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 29 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 13319080 - 13318634
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcata-aagtttcttctctttcaacacttgcaagacaa 127  Q
    |||||||||| | ||| ||||||||||| ||  | |||||||| || || || |||||||| ||||| || ||||| ||||||||| | |||||| | ||    
T  13319080 cagaaataacgtagcctagaaaactcacttcacttaaccagaactcgcacttcgacaatttagcatacaaatttct-ctctttcaaaatttgcaacataa 13318982  T
Q  128 tcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcg 227  Q
    |||||||||| || ||||| || |||| ||||||||| ||||| ||||||||||| || || || || || |||  ||||| ||| ||||| || || ||    
T  13318981 tcttcagatgttctgcatgctcctctttagtcttggaataaattaaaatatcatcaataaataccaccacaaatttatccagaaaagcatgaaaaattcg 13318882  T
Q  228 attcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgc 327  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||| || || ||||| || ||||||||  |  | || || || |||||||||    
T  13318881 gttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacaccgaatggcatcaccttgtattcgtaatgaccatattgtgtcctaaaggccgtcttctgc 13318782  T
Q  328 atatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattc 427  Q
    |||||||||||||| || ||||| || || |||| ||||||||| |||||||| || |||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  13318781 atatcttcatctttcaccttaatttgatggtaacctgacctcaagtcaattttactaaaaacttttgcacccaccaactgatccatcaaatcatcaatcc 13318682  T
Q  428 acggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactgatgat 475  Q
     ||| |||||||| || ||||| || || || || |||||||||||||    
T  13318681 tcgggagtggatatctgttctttattgtaactttattcaactgatgat 13318634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 23 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 16379512 - 16379068
Alignment:
Q  23 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 122  Q
    ||||| ||||||||| ||| ||||| ||||| || ||  | | ||| || |||||||| |||||||||||||| |  ||||| |||||||| ||||||||    
T  16379512 catcaccagaaataatatgaccaaggaaacttacttcacttagccaaaactcacattttgacaatttggcatacaacttcttttctttcaatacttgcaa 16379413  T
Q  123 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 222  Q
     |||||  ||||||| || ||||| ||||||| |||||| || ||||||| ||||||||| || || || || | ||||  ||||| ||| ||||| ||     
T  16379412 cacaattctcagatgttctgcatgctcttcttaagtcttagaataaatcagaatatcatcaataaataccaccaggaatttatccagaaaggcatgaaaa 16379313  T
Q  223 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 322  Q
    || ||||||||||||||||| ||||| || || || || |||||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||| || ||  | || || || ||||    
T  16379312 attcgattcatatactccatgaacacaccgggcgcgttagtaacaccgaaaggcatcactttgtattcgtaatgaccgtatcgtgtcctaaaggccgtct 16379213  T
Q  323 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 422  Q
    |||||||||||||||| || || ||||| || || |||| ||||||||||||||| || || |||||   |||||||||||  || |||||||| |||||    
T  16379212 tctgcatatcttcatcattcaccttaatttgatggtaacctgacctcaaatcaatcttactaaaaacctttgcacccactaggtggtccatcaagtcatc 16379113  T
Q  423 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaa 467  Q
    ||| | ||||||||||| ||||||||| || || || ||||||||    
T  16379112 aatcctcggaagtggatgcctattcttaattgtaactttgttcaa 16379068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 23 - 467
Target Start/End: Original strand, 41179067 - 41179511
Alignment:
Q  23 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 122  Q
    ||||| ||||||||| ||| ||||| |||||||| ||  | | ||| || |||||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||     
T  41179067 catcaccagaaataatatgaccaaggaaactcacttcacttagccaaaactcacatttcgacaatttggcatacaacttcttctctttcaaaacttgcag 41179166  T
Q  123 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 222  Q
     |||||  ||||||| || | ||| |||||||||||||| || ||||||| ||||||||| || || || || ||||||  ||||| ||| ||||| ||     
T  41179167 cacaattctcagatgttctgaatgctcttcttcagtcttcgaataaatcagaatatcatcaataaataccaccacgaatttatccagaaaagcatgaaaa 41179266  T
Q  223 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 322  Q
    || ||||||||||||||||| ||||| || ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| || ||  | || || || ||||    
T  41179267 attcgattcatatactccatgaacacaccgggtgcgttagtaacaccgaaaggcatcactttgtactcgtaatgaccgtatcgtgtcctaaaggccgtct 41179366  T
Q  323 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 422  Q
    |||||||||| ||||| || || ||||| || || |||| ||||||||| ||||| || ||||| ||   ||||||||||| ||| |||||||| |||||    
T  41179367 tctgcatatcctcatccttcaccttaatttgatggtaacctgacctcaagtcaatcttactgaacacctttgcacccactagctggtccatcaagtcatc 41179466  T
Q  423 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaa 467  Q
    ||| | |||||| ||||| |||||||| || || || ||||||||    
T  41179467 aatcctcggaagcggatatctattcttaattgtaactttgttcaa 41179511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 23 - 467
Target Start/End: Original strand, 13943569 - 13944013
Alignment:
Q  23 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 122  Q
    ||||| ||||||||| ||| ||||| |||||||| ||  | | ||| || |||||||| |||| ||||||||| |  ||| | |||||||| |||||||     
T  13943569 catcaccagaaataatatgaccaaggaaactcacttcacttagccaaaactcacatttcgacagtttggcatacaacttcctttctttcaaaacttgcag 13943668  T
Q  123 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 222  Q
     | |||  ||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||||| ||||||||| || || || || ||||||  ||||| ||| ||||| ||     
T  13943669 cataattctcagatgttctgcatgctcttcttcagtcttcgaataaatcagaatatcatcaataaataccaccacgaatttatccagaaaagcatgaaaa 13943768  T
Q  223 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 322  Q
    || ||||||||||||||||| ||||| || || || || |||||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||| || ||  | || || || ||||    
T  13943769 attcgattcatatactccatgaacacaccgggcgcgttagtaacaccgaaaggcatcactttgtattcgtaatgaccgtatcgtgtcctaaaggccgtct 13943868  T
Q  323 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 422  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||| || || |||| ||||||||| ||||| || ||||| ||   ||||||||||| ||| |||||||| |||||    
T  13943869 tctgcatatcttcatctttcaccttaatttgatggtaacctgacctcaagtcaatcttactgaacacctttgcacccactagctggtccatcaagtcatc 13943968  T
Q  423 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaa 467  Q
    ||| | |||||| ||||| |||||||| || || || ||||||||    
T  13943969 aatcctcggaagcggatatctattcttaattgtaactttgttcaa 13944013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 23 - 467
Target Start/End: Original strand, 44778792 - 44779236
Alignment:
Q  23 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 122  Q
    ||||| ||||||||| ||| ||||| |||||||| ||  | | ||| || |||||||| |||| ||||||||| | |||| | |||||||| ||||||||    
T  44778792 catcaccagaaataatatgaccaaggaaactcacttcacttagccaaaactcacatttcgacagtttggcatacaatttcctttctttcaaaacttgcaa 44778891  T
Q  123 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 222  Q
     |||||  ||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||||| ||| ||||| || || || || ||||||  ||||| ||| ||||| ||     
T  44778892 cacaattctcagatgttctgcatgctcttcttcagtcttcgaataaatcagaatgtcatcaataaataccaccacgaatttatccagaaaagcatgaaaa 44778991  T
Q  223 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 322  Q
    || ||||||||| ||||||| || || || || || || |||||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||| || ||  | || || || ||||    
T  44778992 attcgattcataaactccatgaatacaccgggcgcgttagtaacaccgaaaggcatcactttgtattcgtaatgaccgtatcgtgtcctaaaggccgtct 44779091  T
Q  323 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 422  Q
    |||||||||| ||||| || || ||||| || || |||| ||||||||| ||||| || ||||| ||   ||||||||||| ||| |||||||| |||||    
T  44779092 tctgcatatcctcatccttcaccttaatttgatggtaacctgacctcaagtcaatcttactgaacacctttgcacccactagctggtccatcaagtcatc 44779191  T
Q  423 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaa 467  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||||| || || || ||||||||    
T  44779192 aattctcggaagcggatatctattcttaattgtaactttgttcaa 44779236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 29 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 10418623 - 10418181
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| || || |||||||| || || || ||||  |||||||| |  ||| |||||||||| | |||||| |||||    
T  10418623 cagaaataacgtggcctagaaaactcacttcatttaaccagaactcgcacttcgacagcttggcatacaacttcctctctttcaatatttgcaacacaat 10418524  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
    |||||| || || || ||||| |||||||| || || || ||||| |||||||| || || || || || |||  ||||| ||| |||||||| || ||     
T  10418523 cttcaggtgttcggcgtgttcctcttcagtttttgaatagatcaagatatcatctataaataccaccacaaatttatccagaaaagcatggaaaattcgg 10418424  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| || ||  | || || || ||||||||||    
T  10418423 ttcatatactccatgaacacaccaggcgcgttagtaacaccgaaaggcatcactttgtactcgtaatgaccgtatcgtgtcctaaaggccgtcttctgca 10418324  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    ||||||| || || |||||||| || || ||||  |||||||| ||||| || || |||||    ||||| || ||||| ||||||||||||||||| |     
T  10418323 tatcttcgtccttcactttaatttgatggtaacccgacctcaagtcaatcttactaaaaactttagcacctaccaactggtccatcaaatcatcaatccg 10418224  T
Q  429 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 471  Q
    |||||||||||| |||||||| || || || ||||||||||||    
T  10418223 cggaagtggatatctattctttattgtaactttgttcaactga 10418181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 29 - 471
Target Start/End: Original strand, 14088224 - 14088666
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||  | ||||| || || || || |||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  14088224 cagaaataatatggccaagaaaactcacttcacttaaccaaaactcgcactttgacaatttggcatacaacttcttctctttcaatacttgcaatacaat 14088323  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
    | ||||||| || ||||| ||||| |||||  | || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || |||  |||||   | ||||| || || |      
T  14088324 cctcagatgttctgcatgctcttcctcagttctcgaatagatcaaaatgtcatcaatgaatacaaccacaaatttatccaggtaagcatgaaaaattctg 14088423  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||| ||  | || || || ||||||||||    
T  14088424 ttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggcagtcttctgca 14088523  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    | || |||||||| || || ||||| || |||| ||||||||| |||||||| || ||||    |||||| || |||||||||||||  || |||||||     
T  14088524 tgtcctcatctttcaccttgatctgatggtaacctgacctcaagtcaattttactaaaaatctttgcaccaaccaactgatccatcaggtcgtcaattct 14088623  T
Q  429 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 471  Q
    |||||| ||||| || ||||| || || || || |||||||||    
T  14088624 cggaagcggatatctgttctttatcgtaactttattcaactga 14088666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 64 - 471
Target Start/End: Original strand, 47125530 - 47125937
Alignment:
Q  64 aaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttgg 163  Q
    ||||||||||||||||| || || || ||||| |   |||| || |||||||||||||| || ||  |||||||||| ||||| || || ||| ||||||    
T  47125530 aaccagaattcacattttgataacttagcatacaacctcttttccttcaacacttgcaacactattctcagatgctctgcatgctcctcctcattcttgg 47125629  T
Q  164 agtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggt 263  Q
    | || || | ||||||||| || ||||| || || ||   ||||| ||| |||||||| || || ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||    
T  47125630 aatagattagaatatcatcaataaacaccacaacaaacttatccagaaaagcatggaaaattcggttcatgtactccataaaaacaccaggcgcattagt 47125729  T
Q  264 aacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataactt 363  Q
    |||||| |||||||| ||||| || || || |||||||||||  | || || || |||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||      
T  47125730 aacaccgaaaggcatcactttgtactcgtaatgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcacttttatctgatgataacca 47125829  T
Q  364 gacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgt 463  Q
    |||||||||||||| || || ||||     ||||| || |||||||||||||| || |||||||  ||||| |||||||| |||||||| || || ||||    
T  47125830 gacctcaaatcaatcttactaaaaatcttggcaccaaccaactgatccatcaagtcgtcaattctaggaagcggatacctgttcttgatcgtaactttgt 47125929  T
Q  464 tcaactga 471  Q
    ||||||||    
T  47125930 tcaactga 47125937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 23 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 16835094 - 16834651
Alignment:
Q  23 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 122  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||| |||||||| ||  | | ||| || |||||||| |||||||||||||| |  ||||| |||||||| ||||||||    
T  16835094 catcaccagaaataatatggccaaggaaactcacttcacttagccaaaactcacattttgacaatttggcatacaacttcttttctttcaatacttgcaa 16834995  T
Q  123 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 222  Q
     |||||| ||||||| || ||||| || || |||||||| || ||||| |  || ||||| || || ||||| || ||   ||||| ||||||||| ||     
T  16834994 tacaatcctcagatgttctgcatgctcctcgtcagtcttagaataaattaggatgtcatcaataaatacaaccacaaacttatccagaaatgcatgaaaa 16834895  T
Q  223 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 322  Q
    || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| || || ||| | || |||||||||||  | || || || ||||    
T  16834894 attcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttgtatacgtaatgaccataacgtgtcctaaaggccgtct 16834795  T
Q  323 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 422  Q
    ||||||||||| |||| || || ||||| || || ||||  |||||||| ||||| || |||||||    |||||| || |||||||||||||| |||      
T  16834794 tctgcatatctccatccttcaccttaatttgatggtaaccagacctcaagtcaatcttactgaaaatctttgcaccaaccaactgatccatcaagtca-- 16834697  T
Q  423 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 471  Q
       || |||||| |||||||| ||||| || || || ||||||||||||    
T  16834696 ---tctcggaagcggatacctgttctttattgtaactttgttcaactga 16834651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 29 - 467
Target Start/End: Original strand, 28755869 - 28756307
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    |||||||||  || || |||||||| || || || |||||||| |||||||| || || || ||||| |   |||| || |||||||||||||| |||||    
T  28755869 cagaaataatgtgacccagaaaacttacttcatttaaccagaactcacattttgataacttagcatacaacctcttttccttcaacacttgcaacacaat 28755968  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
      |||||||||| ||||| || || ||| ||||||| ||||| || |||||||| || ||||| || || ||   ||||| ||| |||||||| || ||     
T  28755969 tctcagatgctctgcatgctcctcctcattcttggaataaattaagatatcatcaataaacaccacaacaaacttatccagaaaagcatggaaaattcgg 28756068  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    ||||| ||||||||||| || || || ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | || || || ||||||||||    
T  28756069 ttcatgtactccataaaaacacccggcgcattagtaacaccgaaaggcatcactttgtattcgtaatgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgca 28756168  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||| |||||||  |||||||||||||| || || ||||      |||| || || ||||||||||| || |||||||     
T  28756169 tatcctcatccttcacttttatctgatgataaccagacctcaaatcaatcttactaaaaatcttaacaccaaccaattgatccatcaagtcgtcaattct 28756268  T
Q  429 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaa 467  Q
     ||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||    
T  28756269 aggaagcggatacctgttcttgatcgtaactttgttcaa 28756307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 285 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 11888687 - 11888526
Alignment:
Q  285 atattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctg 384  Q
    ||||||||| || ||||||||  | || || ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||  || ||||||||||| |||||     
T  11888687 atattcataatgtccataacgtgtcctaaaggctgtcttctgcatatcctcgtctttcactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgcta 11888588  T
Q  385 aaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctatt 446  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  11888587 aacacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggatacctatt 11888526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 240 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 14291899 - 14291690
Alignment:
Q  240 cataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatct 339  Q
    ||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||| |||| |  |||||||||||||||||| ||||  | || || || |||||||||||||| |||||     
T  14291899 cataaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaatgcatcatcttatattcatagtgaccaaaacgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatcc 14291800  T
Q  340 tttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggat 439  Q
    || || |||||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | |||||||||    
T  14291799 ttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaattttgctgaacacacaagcacccactaactgatccattaaatcgtcaattctcagaagtggat 14291700  T
Q  440 acctattctt 449  Q
    |||| |||||    
T  14291699 acctgttctt 14291690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 29 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 18132924 - 18132504
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    |||||||||  |||||||||||| |||| ||  | || ||||| || || || ||||| || ||||| |  ||||| ||||||||||||||||| | |||    
T  18132924 cagaaataatgtggccaagaaaagtcacttcacttaatcagaactcgcacttcgacaacttagcatacaacttcttttctttcaacacttgcaacataat 18132825  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
    | ||||||| || | | | || ||||||||||| || ||||| |  ||||| || || |||||||| || |||  |||||   | ||||| || || ||     
T  18132824 cctcagatgttccgtaagctcctcttcagtctttgaataaattaggatatcgtcaataaacacaaccacaaatttatccaggtaagcatgaaaaattcgg 18132725  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| || || ||||| || ||||| || ||  | || || || ||||| ||||    
T  18132724 ttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttgtattcgtaatgaccgtatcgtgtcctaaaggccgtcttttgca 18132625  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    |||| ||||| || || |||||||| || |||| ||||||||| ||||| || ||||||||   |||||||||||||||||||||||| || ||||| |     
T  18132624 tatcctcatccttcaccttaatctgatggtaacctgacctcaagtcaatcttactgaaaacctttgcacccactaactgatccatcaagtcgtcaatcct 18132525  T
Q  429 cggaagtggatacctattctt 449  Q
    ||||||||||||||| |||||    
T  18132524 cggaagtggatacctgttctt 18132504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 379 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 15714295 - 15714204
Alignment:
Q  379 ttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15714295 ttgctaaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 15714204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 29 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 13970698 - 13970278
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||  | ||||| || || || || |||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||| ||||     
T  13970698 cagaaataatatggccaagaaaactcacttcacttaaccaaaactcgcactttgacaatttggcatacaacttcttctctttcaatacttgcaatacaac 13970599  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
    | ||||||| || ||||| ||||| |||||  | || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || |||  |||||   | ||||| || || |      
T  13970598 cctcagatgttctgcatgctcttcctcagttctcgaatagatcaaaatgtcatcaatgaatacaaccacaaatttatccaggtaagcatgaaaaattctg 13970499  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||| ||  | || || || ||||||||||    
T  13970498 ttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggcagtcttctgca 13970399  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    | || |||||||| || || ||||| || |||| ||| ||||| |||||||| || ||||     ||||| || |||||||||||||  || ||||| |     
T  13970398 tgtcctcatctttcaccttgatctgatggtaacctgatctcaagtcaattttactaaaaatcttcgcaccaaccaactgatccatcaggtcgtcaatcct 13970299  T
Q  429 cggaagtggatacctattctt 449  Q
    |||||| ||||| || |||||    
T  13970298 cggaagcggatatctgttctt 13970278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 30 - 470
Target Start/End: Original strand, 30139358 - 30139798
Alignment:
Q  30 agaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatc 129  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||| || ||||| |||||||| |||||| | |  |  ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  30139358 agaaatcacatgaccaaggaaactcacttccttcaaccaaaactcacacttagacaacttggcacacaactggttctctttcaagacttgcaacacaatc 30139457  T
Q  130 ttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgat 229  Q
     ||| |||||||||||| ||||| |||| ||| || || | |||||||||||| |||||||| || || || || |||| | | | ||| || || | ||    
T  30139458 ctcaaatgctcagcatgctcttcctcagactttgaatacaccaaaatatcatctatgaacaccaccacaaaacggtccagataaggatgaaatattctat 30139557  T
Q  230 tcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcat 329  Q
    |||| || |||||||| || || |||||||| |  || ||||| ||||| ||   ||| |||||||| ||||| | | ||| ||| || || ||    ||    
T  30139558 tcatgtattccataaagacacctggtgcattagatactccaaatggcatcacagaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcagttttggatat 30139657  T
Q  330 atcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcac 429  Q
    ||||||  | |||||| ||||||| ||||| | ||| ||||||||||| || || || ||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |      
T  30139658 atcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcacccactagctgatccatcaaatcatcaatcctt 30139757  T
Q  430 ggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    ||||||||||||| |||||| || || ||||||||||||||    
T  30139758 ggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactg 30139798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 30 - 470
Target Start/End: Original strand, 30148909 - 30149349
Alignment:
Q  30 agaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatc 129  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||| || ||||| |||||||| |||||| | |  |  ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  30148909 agaaatcacatgaccaaggaaactcacttccttcaaccaaaactcacacttagacaacttggcacacaactggttctctttcaagacttgcaacacaatc 30149008  T
Q  130 ttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgat 229  Q
     ||| |||||||||||| ||||| |||| ||| || || | |||||||||||| |||||||| || || || || |||| | | | ||| || || | ||    
T  30149009 ctcaaatgctcagcatgctcttcctcagactttgaatacaccaaaatatcatctatgaacaccaccacaaaacggtccagataaggatgaaatattctat 30149108  T
Q  230 tcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcat 329  Q
    |||| || |||||||| || || |||||||| |  || ||||| ||||| ||   ||| |||||||| ||||| | | ||| ||| || || ||    ||    
T  30149109 tcatgtattccataaagacacctggtgcattagatactccaaatggcatcacagaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcagttttggatat 30149208  T
Q  330 atcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcac 429  Q
    ||||||  | |||||| ||||||| ||||| | ||| ||||||||||| || || || ||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |      
T  30149209 atcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcacccactagctgatccatcaaatcatcaatcctt 30149308  T
Q  430 ggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    ||||||||||||| |||||| || || ||||||||||||||    
T  30149309 ggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactg 30149349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 379 - 470
Target Start/End: Original strand, 43164566 - 43164657
Alignment:
Q  379 ttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43164566 ttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 43164657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 143 - 397
Target Start/End: Original strand, 12269875 - 12270129
Alignment:
Q  143 catgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccat 242  Q
    |||| ||||||||| |||| || |||||||| || ||||| || |||||||| || |||  ||| | | | |||||||| || || ||||||||||||||    
T  12269875 catgctcttcttcaatctttgaataaatcaagatgtcatcaataaacacaaccacaaatttatcaagataagcatggaaaattcggttcatatactccat 12269974  T
Q  243 aaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatctttt 342  Q
    ||||||  ||||  |||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||  | || || || |||||||||||||| ||||| ||     
T  12269975 aaacacatcaggaacattagtaacaccgaaaggcatcaccttatattcatagtgtccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttc 12270074  T
Q  343 actttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcac 397  Q
    || |||||||| || |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  12270075 accttaatctgatggtaacctgacctcaaatcaatcttgctgaatacacgagcac 12270129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 30 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 8272987 - 8272548
Alignment:
Q  30 agaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatc 129  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||| || ||||| |||||||| |||||  | |  |  ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  8272987 agaaatcacatgaccaaggaaactcacttccttcaaccaaaactcacacttagacaacttggcgcacaactggttctctttcaagacttgcaacacaatc 8272888  T
Q  130 ttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgat 229  Q
     ||| |||||||||||| ||||| |||| ||| || || | |||||||||||| |||||||| || || || || |||| | | | ||| || || | ||    
T  8272887 ctcaaatgctcagcatgctcttcctcagactttgaatacaccaaaatatcatctatgaacaccaccacaaaacggtccagataaggatgaaatattctat 8272788  T
Q  230 tcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcat 329  Q
    |||| || |||||||| || || || ||||| |  || ||||| ||||| ||   ||| |||||||| ||||| | | ||| ||| || || ||    ||    
T  8272787 tcatgtattccataaagacacctggcgcattagatactccaaatggcatcacagaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcagttttggatat 8272688  T
Q  330 atcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcac 429  Q
    ||||||  | |||||| ||||||| ||||| | ||| ||||||||||| || || || ||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |      
T  8272687 atcttctgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcacccactagctgatccatcaaatcatcaatcctt 8272588  T
Q  430 ggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaact 469  Q
    ||||||||||||| |||||| || || |||||||||||||    
T  8272587 ggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaact 8272548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 52 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 15949036 - 15948618
Alignment:
Q  52 ctcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttctt 151  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| |||||||| |||||  | |  |  ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  15949036 ctcacttccttcaaccaaaattcacacttagacaacttggctcacaactggttctctttcaagacttgcaacacaatcctcagatgctcaacatgctctt 15948937  T
Q  152 cttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactcc 251  Q
    | |||| ||| || || | |||||||||||| ||||| || || || ||||| |||||| | | ||| || || | ||||||||| |||||||| || ||    
T  15948936 cctcagacttcgaatacaccaaaatatcatctatgaaaaccaccacaaatcggtccaaataaggatgaaatattctattcatatattccataaagacacc 15948837  T
Q  252 aggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatc 351  Q
     || |||||||  || ||||| ||||| ||   ||| |||||||| ||||| | | ||| ||| || || ||    ||||||||  | |||||| |||||    
T  15948836 tggcgcattggatactccaaatggcatcacggaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcggttttggatatatcttccgcctttactctaatc 15948737  T
Q  352 tggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttga 451  Q
    || ||||| | | | ||||||||||| || || || ||   |||||| || | ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| |||||| |    
T  15948736 tgatgatatcctaatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaaccagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaa 15948637  T
Q  452 tagttaccttgttcaactg 470  Q
    | ||||| |||||||||||    
T  15948636 tcgttactttgttcaactg 15948618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 230 - 471
Target Start/End: Original strand, 10407720 - 10407961
Alignment:
Q  230 tcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcat 329  Q
    |||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||  |||||||| ||||| || || || |||||||||||  | || || || |||||||||||    
T  10407720 tcatgtactccataaaaacaccaggcgcattagtaacacagaaaggcattactttgtactcgtaatgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgcat 10407819  T
Q  330 atcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcac 429  Q
    ||| ||||| || || || ||||| |||||||  |||||||||||||| || |||||||     ||||| || |||||||||||||| || |||||||      
T  10407820 atcctcatccttcacctttatctgatgataaccagacctcaaatcaatcttactgaaaatcttagcaccaaccaactgatccatcaagtcgtcaattcta 10407919  T
Q  430 ggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 471  Q
    ||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||||||    
T  10407920 ggaagcggatacctgttcttgatcgtaactttgttcaactga 10407961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 30 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 13965941 - 13965500
Alignment:
Q  30 agaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatc 129  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||| |||||| | |  |  |||||||||||  ||||||| ||||||    
T  13965941 agaaatcacatgaccaagaaaactcacttccttcaaccaaaactcacacttagacaaattggcagacaactggttctctttcaagtcttgcaacacaatc 13965842  T
Q  130 ttcagatgctcagcatg-ttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
     ||| |||||||||||| |||||| |||| ||| || || | |||||||||||| |||||||| || || || || |||| | | | ||| || || | |    
T  13965841 ctcaaatgctcagcatgcttcttcctcagacttcgaatacaccaaaatatcatctatgaacaccaccacaaaacggtccagataaggatgaaatattcta 13965742  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    ||||| || |||||||| || || || |||||||  || ||||| ||||| ||   ||| |||||||| ||||| | | ||| ||| || || ||    |    
T  13965741 ttcatgtattccataaagacacctggcgcattggatactccaaatggcatcacagaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcagttttggata 13965642  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    ||||| |  | |||||| ||||||| ||||| | ||| ||| ||||||| || || || ||   |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |     
T  13965641 tatctaccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcgaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatcct 13965542  T
Q  429 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
     ||||||||||||| |||||| || || ||||||||||||||    
T  13965541 tggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactg 13965500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 30 - 470
Target Start/End: Original strand, 15611655 - 15612095
Alignment:
Q  30 agaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatc 129  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||| || ||||  |||||||| |||||| | |     || |||||||| |||||||||||||||    
T  15611655 agaaatcacatgaccaaggaaactcacttccttcaaccaaaactcacgcttagacaacttggcacacaaccggttatctttcaaaacttgcaagacaatc 15611754  T
Q  130 ttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgat 229  Q
     ||| |||||||||||| ||||| |||| ||| || || | |||||||||||| |||||||| || || || || |||| | | | ||| || || | ||    
T  15611755 ctcaaatgctcagcatgctcttcctcagacttcgaatacaccaaaatatcatctatgaacaccaccacaaaacggtccagataaggatgaaatattctat 15611854  T
Q  230 tcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcat 329  Q
    ||||||| |||||||| || || |||||||| |  || ||||| ||||| ||   ||| |||||||| ||||| | | ||| ||| || || ||    ||    
T  15611855 tcatatattccataaagacacctggtgcattagatactccaaatggcatcacagaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcagttttggatat 15611954  T
Q  330 atcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcac 429  Q
    ||||||  | || ||| ||||||| ||||| | ||| ||||||||||| || || || ||    ||||| |||| ||||||||||||||||||||| |      
T  15611955 atcttccgccttcactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctcagcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatcctt 15612054  T
Q  430 ggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    ||||||||||||| |||||| || || ||||||||||||||    
T  15612055 ggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactg 15612095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 100 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 11889798 - 11889623
Alignment:
Q  100 ttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacga 199  Q
    |||||||| |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| | |  ||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  11889798 ttcttctccttcagcacttgcaaaacaatcttcaaatgctcagcatgttcttccttaaacttagagtatatcaaaatatcatcaatgaacacaaccacga 11889699  T
Q  200 atcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaagg 275  Q
    | ||||| ||| | ||||| || || |||||||| || ||||| ||||| || || ||||| || ||||| |||||    
T  11889698 agcgatctaaatacgcatgaaaaatacgattcatgtattccatgaacacacctggcgcattagtgacaccgaaagg 11889623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 204 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 12510886 - 12510619
Alignment:
Q  204 atccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataa 303  Q
    ||||| ||| |||||||| || || |||||||||| ||||||||| ||||| || || |||||||| |||||||| | ||| || || || |||||||||    
T  12510886 atccagaaaagcatggaaaattcggttcatatacttcataaacacaccaggcgcgttagtaacaccgaaaggcatcattttgtactcgtaatgaccataa 12510787  T
Q  304 cgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccacta 403  Q
    ||  | || || || |||||||||||||| ||||| || || || ||||  || ||||  |||||||| ||||| || |||||||     ||||| || |    
T  12510786 cgtgtcctaaatgccgtcttctgcatatcctcatccttcacctttatctaatggtaaccagacctcaagtcaatcttactgaaaatcttagcaccaacca 12510687  T
Q  404 actgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 471  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| ||||| || || ||||| |||||||||    
T  12510686 actgatccatcaaatcgtcaattctcggaagcggatacctgttctttatcgtaacctttttcaactga 12510619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 29 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 16328238 - 16327796
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    ||||||||| ||| || ||||||||||| ||  | ||||| || |||||||| ||||| || ||||| |   |||||||||||||  ||||||| |||||    
T  16328238 cagaaataatatgacccagaaaactcacttcacttaaccataactcacattttgacaactttgcatacaacctcttctctttcaaatcttgcaatacaat 16328139  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
      |||||||||| ||||| || |||||| |||| || || || ||||||||||| || ||||| || || ||   ||||  ||| |||||||| || ||     
T  16328138 tctcagatgctctgcatgctcctcttcattcttagaatagattaaaatatcatcaataaacaccacaacaaacttatccggaaaggcatggaaaattcgg 16328039  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| |  || |||||||| |||||||| || || || || || |||||||| ||  | || ||||  || |||||||    
T  16328038 ttcatgtactccataaacacaccaggcgtgttagtaacaccgaaaggcatcaccttgtactcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaagtcgttttctgca 16327939  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    |||| ||||  || || |||||||| || ||||  ||| |||| ||||| || || ||||     ||||| || |||||||||||||| || |||||||     
T  16327938 tatcctcattcttcaccttaatctgatggtaaccagacatcaagtcaatcttactaaaaatcttagcaccaaccaactgatccatcaagtcgtcaattct 16327839  T
Q  429 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 471  Q
    || |||||||||||| ||||| ||  | ||||| |||||||||    
T  16327838 cgaaagtggatacctgttctttatcatgaccttattcaactga 16327796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 250 - 471
Target Start/End: Original strand, 24189076 - 24189297
Alignment:
Q  250 ccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaa 349  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||| || ||||| || ||  | || || || |||||||||||||| ||||| || || || |    
T  24189076 ccaggcgcattagtaacaccgaaagacatcactttatattcgtaatgaccgtatcgtgtcctaaaggcagtcttctgcatatcctcatccttcaccttga 24189175  T
Q  350 tctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattctt 449  Q
    |||| || |||| ||||||||| ||||| || || |||||   ||||||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| |||||    
T  24189176 tctgatggtaacctgacctcaagtcaatcttactaaaaacctttgcacccaccaactgatccatcaagtcatcaatcctcggaagtggatacctgttctt 24189275  T
Q  450 gatagttaccttgttcaactga 471  Q
     || || || || |||||||||    
T  24189276 tatcgtaactttattcaactga 24189297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 370 - 470
Target Start/End: Original strand, 18437022 - 18437122
Alignment:
Q  370 aaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaact 469  Q
    ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| || || || ||||| ||||    
T  18437022 aaatctatcttgctgaaaacacttgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcgggagtggatacatattctttattgtcactttgttaaact 18437121  T
Q  470 g 470  Q
    |    
T  18437122 g 18437122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 418 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 26791613 - 26791561
Alignment:
Q  418 tcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26791613 tcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 26791561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 64 - 238
Target Start/End: Original strand, 10385257 - 10385431
Alignment:
Q  64 aaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttgg 163  Q
    |||||||| |||||||| ||||| || ||||| |   |||| || |||||||||||||| |||||  |||||||| | ||||| ||||| ||  ||||||    
T  10385257 aaccagaactcacattttgacaacttagcatacaacctcttttccttcaacacttgcaatacaattctcagatgccctgcatgctcttcctcgttcttgg 10385356  T
Q  164 agtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatact 238  Q
    | |||||||| |||||||| |||||||| || || ||   ||| | ||| ||||||||||| |||||||| ||||    
T  10385357 aataaatcaagatatcatcaatgaacaccacaacaaacttatctagaaaagcatggaagattcgattcatgtact 10385431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 262 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 8745735 - 8745530
Alignment:
Q  262 gtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataac 361  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||| || ||  | || || |  |||||||||||||| ||||| || || ||||| || || ||||    
T  8745735 gtaacaccgaaaggcatcactttgtattcgtaatgaccgtatcgtgtcctaaagggcgtcttctgcatatcctcatccttcaccttaatttgatggtaac 8745636  T
Q  362 ttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttacctt 461  Q
     || |||||| ||||| || ||||| ||   ||||||||||| ||| |||||||| |||||||| | |||||| ||||| |||||||| || || || ||    
T  8745635 ctgtcctcaagtcaatcttactgaacacctttgcacccactagctggtccatcaagtcatcaatcctcggaagcggatatctattcttaattgtaacttt 8745536  T
Q  462 gttcaa 467  Q
    ||||||    
T  8745535 gttcaa 8745530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 6151441 - 6151001
Alignment:
Q  30 agaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatc 129  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||| || || || |||||||| || ||| | |  |  ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  6151441 agaaatcacatgaccaaggaaactcacttccttcaaccaaaactcgcacttagacaacttagcacataactggttctccttcaacacttgcaacacaatc 6151342  T
Q  130 ttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgat 229  Q
     |||||||||||||||| || || ||||  || || || | |||||||||||| || ||||| || || || || || | | | | ||| || ||   ||    
T  6151341 gtcagatgctcagcatgctcctcctcagatttcgaatacaccaaaatatcatctataaacaccaccacaaaacggtctagataaggatgaaatattttat 6151242  T
Q  230 tcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcat 329  Q
    |||||||||||||||| || || || ||||| |  || ||||| ||||| ||   ||| |||||||| ||||| | | ||| |||  | || ||    ||    
T  6151241 tcatatactccataaagacacctggcgcattagatactccaaatggcatcacaaaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacacagttttggatat 6151142  T
Q  330 atcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcac 429  Q
    ||||||  | || ||| ||||||| ||||| | ||| ||||||||||| || || || ||   |||||| || | ||||||||||||||||||||| |      
T  6151141 atcttctgccttcactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaaccagctgatccatcaaatcatcaatcctt 6151042  T
Q  430 ggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    ||||||||||| | |||||| || || ||||||||||||||    
T  6151041 ggaagtggatatcgattcttaatcgtcaccttgttcaactg 6151001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 394 - 464
Target Start/End: Original strand, 12272254 - 12272324
Alignment:
Q  394 gcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgtt 464  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||| | ||||||||||||||| ||||| || || ||||||||    
T  12272254 gcacccactaactgatccattaagtcatcaatcctcggaagtggatacctgttctttatcgtaaccttgtt 12272324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 406 - 471
Target Start/End: Original strand, 17200562 - 17200627
Alignment:
Q  406 tgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 471  Q
    |||||||||||||||||||| | ||| || ||||||| |||||| || || |||||||||||||||    
T  17200562 tgatccatcaaatcatcaatcctcgggagcggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactga 17200627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 384; Significance: 0; HSPs: 44)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 384; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 470
Target Start/End: Original strand, 21838881 - 21839328
Alignment:
Q  23 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 122  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21838881 catcaccagaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 21838980  T
Q  123 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 222  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  21838981 aacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgataaacacaaccacaaaccgatccaaaaatgcatggaag 21839080  T
Q  223 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  21839081 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagttgtct 21839180  T
Q  323 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 422  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21839181 tctgcatatcttcatctttcactttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 21839280  T
Q  423 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21839281 aattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 21839328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 380; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 470
Target Start/End: Original strand, 19108299 - 19108746
Alignment:
Q  23 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 122  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  19108299 catcaccagaaataacatggccaagaaaactcacttctttcaaccagaactcacacttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttggaa 19108398  T
Q  123 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  19108399 gacaatcttcagatgctcagcatgttctttttcagtcttagagtaaatcaaaatatcatcgataaacacaactacgaaccgatccaaaaatgcgtggaag 19108498  T
Q  223 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  19108499 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatggtgaccataacgcgttctgaaagttgtct 19108598  T
Q  323 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 422  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19108599 tctgcatatcttcatcttttacttttatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 19108698  T
Q  423 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19108699 aattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 19108746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 361; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 31 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 16349016 - 16348576
Alignment:
Q  31 gaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatct 130  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16349016 gaaataacatgacctagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatct 16348917  T
Q  131 tcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgatt 230  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16348916 tcagatgctctgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgatgaacacaactacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgatt 16348817  T
Q  231 catatactccataaacactccaggtgcattggtaac-accaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcat 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  16348816 catatactccataaacactccaggtgcattggtaactcccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagccgtcttctgcat 16348717  T
Q  330 atcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcac 429  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  16348716 atcttcatcctttactttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctc 16348617  T
Q  430 ggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16348616 ggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 16348576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 470
Target Start/End: Original strand, 21832233 - 21832680
Alignment:
Q  23 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 122  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21832233 catcaccagaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 21832332  T
Q  123 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 222  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  21832333 aacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacaaaccgatccaaaaatgcatggaag 21832432  T
Q  223 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  21832433 atgcgattcatatactccataaacactccatgtgcattggtcacaccgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttttgaaagctgtct 21832532  T
Q  323 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 422  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21832533 tctgcatatcttcatcctttactttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatc 21832632  T
Q  423 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21832633 aattctcggaagtggatacctaatcttgatagttaccttgttcaactg 21832680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 31 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 33389449 - 33389010
Alignment:
Q  31 gaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatct 130  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33389449 gaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagcttcttctctttcaacacttgcaaaacaatct 33389350  T
Q  131 tcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgatt 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33389349 tcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacaaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgatt 33389250  T
Q  231 catatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcata 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33389249 catatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcata 33389150  T
Q  331 tcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacg 430  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  33389149 tcttcatcctttactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcg 33389050  T
Q  431 gaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33389049 gaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 33389010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 24793044 - 24792609
Alignment:
Q  23 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 122  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24793044 catcaccagaaataacatggccaagaaaacttacttctttcaaccagaactcacacttagataatttagcataaagtttcttttctttcaacacttgcaa 24792945  T
Q  123 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 222  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  24792944 gacaatcttcagatgctcaacatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcaataaaaacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaag 24792845  T
Q  223 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24792844 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccaaaaggcatacctttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtct 24792745  T
Q  323 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 422  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24792744 tctgcatatcttcatctttcactttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 24792645  T
Q  423 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttac 458  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24792644 aattctcggaagtggatacctattcttgatagttac 24792609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 349; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 21234159 - 21233711
Alignment:
Q  23 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 122  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21234159 catcaccagaaataacatggccaagaaaacttacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 21234060  T
Q  123 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 222  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21234059 gacaatcttcagatgttcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatgtcgtcgataaacacaactacgaaccgatccaaaaatgcatggaag 21233960  T
Q  223 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  21233959 atgcgattcatatactccataaacactcgaggtgcattgatcacaccgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagttgtct 21233860  T
Q  323 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 422  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21233859 tctgcatatcttcatctttcactttaatctggtgataccctgatctcaaatcaatcttgctgaaaacttttgcacccactaactgatccatcaaatcatc 21233760  T
Q  423 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 471  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21233759 aattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 21233711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 51331914 - 51331474
Alignment:
Q  30 agaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatc 129  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  51331914 agaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaaacttcttctctttcaacacttgcaaaacaatc 51331815  T
Q  130 ttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgat 229  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  51331814 ttcagatgctccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacaaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgat 51331715  T
Q  230 tcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcat 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  51331714 tcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagccgtcttctgcat 51331615  T
Q  330 atcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcac 429  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  51331614 atcttcgtcttttactttaatctggtgatagcctgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctc 51331515  T
Q  430 ggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51331514 ggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 51331474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 17043443 - 17042995
Alignment:
Q  23 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 122  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17043443 catcaccagaaataacatggccaagaaaacttacttctttcaaccagaattcacactttgacaatttagcataaagtttcttctctttcaatacttgcaa 17043344  T
Q  123 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 222  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  17043343 gacaatcttcatatgctcagcatgttcttctttagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgataaacacaacaacgaaccgatccaaaaaggcatggaag 17043244  T
Q  223 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  17043243 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagatgtct 17043144  T
Q  323 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 422  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17043143 tctgcatatcttcatctttcactttaatctggtgataccctgatctcaaatcaatcttgctgaaaacttttgcacccactaactgatccatcaaatcatc 17043044  T
Q  423 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 471  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17043043 aattctcggtagtggatacctattcttgatagttactttgttcaactga 17042995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 332; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 22503717 - 22503282
Alignment:
Q  23 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 122  Q
    ||||| || |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22503717 catcaccataaatgacatggccaagaaaacttacctctttcaaccagaactcacacttagatattttagcataaagtttcttctcttttaacacttgcaa 22503618  T
Q  123 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 222  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||| |||||||||||||||||||||    
T  22503617 gacaatcttcagatgctcaacatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaaaacaaccccgaaccgatccaaaaatgcatggaag 22503518  T
Q  223 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 322  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  22503517 atgcgattcatttactccataaacactccaggtgcattggtaacaccgaaagacataactttatattcatagtgaccataccgcgttctgaaagctgtct 22503418  T
Q  323 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 422  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22503417 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactatctgatccatcaaatcatc 22503318  T
Q  423 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttac 458  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22503317 aattctcggaagtggatacctattcttgatagttac 22503282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 31 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 41352082 - 41351649
Alignment:
Q  31 gaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatct 130  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41352082 gaaataacatgaccaagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatct 41351983  T
Q  131 tcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgatt 230  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41351982 tcagatgttctgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgatgaacacaaccacgaactgatccaaaaatgcatggaagatgcgatt 41351883  T
Q  231 catatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcata 330  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41351882 catataccccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcata 41351783  T
Q  331 tcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacg 430  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||       | ||| ||    
T  41351782 tcctcatcctttactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgcgcacccactaactgatccatca-------atttctcg 41351690  T
Q  431 gaagtggataccta-ttcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  41351689 gaagtggatacctatttcttgatagttaccttgttcaactg 41351649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 30 - 471
Target Start/End: Original strand, 20140021 - 20140462
Alignment:
Q  30 agaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatc 129  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  20140021 agaaataacatggccaagaaagctcacttttttcaaccagaattcacacttagacaatttagcatagagcttcttttctttcaacacttgcaaaacaatc 20140120  T
Q  130 ttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgat 229  Q
    ||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |  || ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20140121 ttcaagtgatcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcaatgaaaacaaccaaaaaacgatccaaaaatgcatgaaagatgcgat 20140220  T
Q  230 tcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcat 329  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||| || | ||| || || || ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20140221 tcatgtactccataaatactccaggtgcatttgtgacaccgaacgacattaccttgtactcataatgtccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcat 20140320  T
Q  330 atcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcac 429  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  20140321 atcttcatcttttactttaatctggtgataacctgaactcaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcgattctc 20140420  T
Q  430 ggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 471  Q
    |||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||    
T  20140421 ggaagtggatacctattctttattgtcactttgttcaactga 20140462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 29 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 430538 - 430097
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |     
T  430538 cagaaataacatgcccaagaaagctcacttcttttaaccagaattcacacttagataatttcgcataaagcttcttctctttcaacacttgcaaaaccag 430439  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  430438 cttcaaatgctcagcatgttcttcttcagacttggagtaaatcaaaatatcatcaatgaaaacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatgaaagatgcga 430339  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
     |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||| |||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  430338 atcatgtactccataaatactccaggtgcattcgtaacaccgaaaggcataaccttgtactcatagtgagcataccgcgttctgaaggctgtcttctgca 430239  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| || |||||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||| |     
T  430238 tatcttcatcttttactttaatatggtgataacctgatctcaaatctatcttgctgaaaacttttgcacccactaactgatccatcaagtcatcaatcct 430139  T
Q  429 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
     |||||| ||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  430138 tggaagttgatacctattctttattgtcaccttgttcaactg 430097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 29 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 50618820 - 50618400
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  50618820 cagaaataacatgtccaagaaaactcacctctttcaaccagaattcacactttgataatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgcaaaacagt 50618721  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || ||| ||    
T  50618720 cttcaaatgctcaacatgttcttcctcagtcttggagtaaatcaaaatgtcatcaatgaaaacaaccacgaaacgatcaaaaaatgcatgaaaaatgtga 50618621  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||| |||| |||| |||||||||||    
T  50618620 ttcatgtactccataaacactccaggggcatttgtaacaccgaaaggcatcactttatactcataatgtccatatcgcgttctaaaagttgtcttctgca 50618521  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  50618520 tatcttcatctttcactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgttaaacacacgtgcacccactaactgatccatcaagtcatcaattct 50618421  T
Q  429 cggaagtggatacctattctt 449  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  50618420 cggaagtggatacctattctt 50618400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 29 - 470
Target Start/End: Original strand, 21750877 - 21751318
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| || |     
T  21750877 cagaaataacatgtccaagaaaaattacttcttttaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagcttcttctttttcaacacttgcaaaaccaa 21750976  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  21750977 cttcaaatgctcagcatgttcttcttcagacttggagtaaattaaaatatcatcaatgaaaacaaccacgaaacgatccaaaaatgcatgaaagatgcga 21751076  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||| | || |||| |||||||| ||    
T  21751077 ttcatgtactccataaatactccaagagcattagtaacaccaaaaggcataactttatactcataatgtccataccgcgtcctaaaagttgtcttctaca 21751176  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||  || |||||||| || ||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |     
T  21751177 tatcttcatctttcactttaatctggtgatgacccgatctcaaatctatcttgttgaaaacacttgcacctactaactgatccatcaaatcatcaatcct 21751276  T
Q  429 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  21751277 cggaagtggatacctattctttattgttactttgttcaactg 21751318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 29 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 22360666 - 22360224
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    ||||||||||||| |||||| | ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||   |||||||||||||||| ||||| || |     
T  22360666 cagaaataacatgtccaagatagctcacttccttcaaccagaattcacacttagacaatttcgcataaatcatcttctctttcaacacctgcaaaaccag 22360567  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
     |||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||| |||||| |||||||||| |||||||||    
T  22360566 tttcaaatgctcagcaggttcttcttcagacttggagtaaatcaaaatatcatcaataaaaacaacgacgaaccgatcctaaaatgcatgaaagatgcga 22360467  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    ||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22360466 ttcatgtactccataaatactcaaggtgcatttgtaacaccgaaaggcataactttgtactcataatgtccataacgcgttctgaaagctgtcttctgca 22360367  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| || ||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  22360366 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaaatctatcttgttgaaaacttttgcacccactaactgatccatcaaatcatcaatcct 22360267  T
Q  429 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 471  Q
    |||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||    
T  22360266 cggaagtggatatctattctttattgtcaccttgttcaactga 22360224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 32 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 21862792 - 21862354
Alignment:
Q  32 aaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatctt 131  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  21862792 aaataacatgtccaagaaaactcacctctttcaaccagaattcacacttagataatttagcataaagcttcttctctttgaacacttgcaaaaccatctt 21862693  T
Q  132 cagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattc 231  Q
    || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||| || |||||||||||||| || |||||||||    
T  21862692 caaatgctcagcatgttcttcctcagtcttggagtaaattaaaatgtcatcaataaaaacaaccacgaaacggtccaaaaatgcatgaaaaatgcgattc 21862593  T
Q  232 atatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatat 331  Q
    || | |||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||  |||| ||| |||| |||||||||||||||||||    
T  21862592 atgtgctccataaacacactaggtgcatttgtaacaccgaaaggcataactttatactcataatgtgcataccgcgttctaaaagctgtcttctgcatat 21862493  T
Q  332 cttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacgg 431  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||  || |||||||  || |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||  ||    
T  21862492 cttcatctttcactttaatctggtgataacccgatctcaaatgtatcttgctgaacacacgtgcacccaccaactgatccatcaagtcatctattcttgg 21862393  T
Q  432 aagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||| |||||||||||    
T  21862392 aagtggatacctattctttctcgttactttgttcaactg 21862354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 173; E-Value: 8e-93
Query Start/End: Original strand, 29 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 21743974 - 21743554
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    |||||||||  |||||||||| ||| || ||  | |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |  ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  21743974 cagaaataatgtggccaagaagacttacttcacttaaccagaactcacatttggacaacttggcatacaacttcttttctttcaacacttgcaatacaat 21743875  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| || || | ||| || |||||||| || |||  ||||| | | |||||||| || |      
T  21743874 cttcagatgctctgcatgctcttcttcagtcttagaataaattaagatgtgatcaataaacacaaccacaaatttatccagataagcatggaaaattctg 21743775  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||  | || || || ||||||||||    
T  21743774 ttcatatactccataaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttatattcatagtgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgca 21743675  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    |||| ||||  || || |||||||| || |||| |||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  21743674 tatcctcattcttcaccttaatctgatggtaacctgacctcaaatcaattttactaaacacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcgtcaattct 21743575  T
Q  429 cggaagtggatacctattctt 449  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  21743574 cggaagtggatacctattctt 21743554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 147 - 470
Target Start/End: Original strand, 16378150 - 16378473
Alignment:
Q  147 ttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaac 246  Q
    ||||||||| | |||| |||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||  |||| || || |||||||| |||||||| |||    
T  16378150 ttcttcttcggacttgaagtatatcaaaatgtcatcaataaacacaaccacgaaacgatccaaaaacacatgaaaaattcgattcatgtactccatgaac 16378249  T
Q  247 actccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactt 346  Q
    || ||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  16378250 acaccaggcgcatttgtaacaccgaaaggcatcactttatattcataatgtccataacgcgttctaaaagccgtcttctgcatatcctcatctttcactt 16378349  T
Q  347 taatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctatt 446  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  16378350 taatctagtgataacctgatctcaaatcaatcttgttgaacacgcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcttggaagtggatacctatt 16378449  T
Q  447 cttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    ||| || ||||| || ||||||||    
T  16378450 ctttatcgttactttattcaactg 16378473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 29 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 19661558 - 19661116
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    |||||||||  |||||| |||||||||| ||  | |||||||| ||||| || ||||| || ||||| |  ||||| ||||| ||||||| ||| |||||    
T  19661558 cagaaataatgtggccaggaaaactcacttcacttaaccagaactcacacttcgacaacttagcatacaacttcttttcttttaacacttacaatacaat 19661459  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
    |||||||||||  ||||| |||||||||||| | || |||||||| || ||||| || |||||||| ||||||  ||| |   | |||||||| || ||     
T  19661458 cttcagatgctatgcatgctcttcttcagtccttgaataaatcaagatgtcatcaataaacacaaccacgaatttatctaggtaggcatggaaaattcgg 19661359  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||  | ||  | || ||||||||||    
T  19661358 ttcatatactccataaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttatattcatagtgaccataacgtgtcctagaggccgtcttctgca 19661259  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    |||| ||||| || || |||||||| || |||| ||||||||| ||||| || |||||||||  ||||||||||||||||||||| || || |||||||     
T  19661258 tatcctcatccttcaccttaatctgatggtaacctgacctcaagtcaatcttactgaaaacatttgcacccactaactgatccattaagtcgtcaattct 19661159  T
Q  429 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 471  Q
    ||||||||||||||| ||||| || || || || |||||||||    
T  19661158 cggaagtggatacctgttctttatcgtaactttattcaactga 19661116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 23 - 194
Target Start/End: Original strand, 21026104 - 21026275
Alignment:
Q  23 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 122  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21026104 catcaccagaaataacatggccaaaaaaactcacttctttcaaccagaactcacacttagatattttagcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 21026203  T
Q  123 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaac 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  21026204 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaattaaaatatcatcgatgaaaacaac 21026275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 29 - 475
Target Start/End: Original strand, 19856242 - 19856688
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    |||||||||  |||||||| |||||||| ||  | ||| |||| ||||| || ||||| || ||||| |  ||||| ||||| || | |||||| || ||    
T  19856242 cagaaataatgtggccaaggaaactcacttcacttaactagaactcacactttgacaacttagcatacaacttcttttcttttaatatttgcaatactat 19856341  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
    ||||||||| ||  |||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||| | || |||||||| ||||||  |||||   | |||||||| || ||     
T  19856342 cttcagatgttcttcatgctcttcttcagtcttagaataaatcaaaatgtcaccaataaacacaaccacgaatttatccaggtaggcatggaaaattcgg 19856441  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||| | |||||||| || ||||||||||||| |||||||||  | || || || ||||||||||    
T  19856442 ttcatatactccataaacacaccaggcgcatgagtaacaacgaaaggcatcaccttatattcatagtaaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgca 19856541  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    |||| ||||| || || |||||||| || |||| |||||| || ||||| || ||||||||   |||||||||||| |||||||| || || |||||||     
T  19856542 tatcctcatccttcaccttaatctgatggtaacctgaccttaagtcaatcttactgaaaacctttgcacccactaattgatccattaagtcgtcaattct 19856641  T
Q  429 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactgatgat 475  Q
    ||||||||||||||| ||||| || || || || |||||||||||||    
T  19856642 cggaagtggatacctgttctttattgtaactttattcaactgatgat 19856688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 23 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 20855188 - 20854740
Alignment:
Q  23 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcata-aagtttcttctctttcaacacttgca 121  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||  | |||||||| || || || ||||| |||||||| || ||||| ||| ||||| |  ||||    
T  20855188 catcaccagaaataacatggcctagaaaactcacttcacttaaccagaactcgcacttcgacaacttggcatacaactttct-ctccttcaaaatctgca 20855090  T
Q  122 agacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaa 221  Q
    | ||||||||||  || || ||||| || |||||||| || || ||||||||||||||||| || || || || || |||  ||||| ||| ||||||||    
T  20855089 acacaatcttcaagtgttctgcatgctcctcttcagttttagaataaatcaaaatatcatctataaataccaccacaaatttatccagaaaagcatggaa 20854990  T
Q  222 gatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtc 321  Q
     || || |||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||  | || ||||| |||    
T  20854989 aattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcgttagtaacaccgaaaggcatcactttgtattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaagccgtc 20854890  T
Q  322 ttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcat 421  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||  |||||||| ||||| || || |||||    ||||| || ||||| |||||||| ||||    
T  20854889 ttctgcatatcttcatccttcactttaatctgatggtaacccgacctcaagtcaatcttactaaaaactttagcacctaccaactggtccatcaagtcat 20854790  T
Q  422 caattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 471  Q
    |||| | |||||||||||| |||||||| || || || ||||||||||||    
T  20854789 caatccgcggaagtggatatctattctttattgtaactttgttcaactga 20854740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 29 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 20834322 - 20833902
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    |||||||||  ||||||||||||||| | ||    |||||||| ||||| || ||||| || ||||| |   | ||||||||||| | |||||| |||||    
T  20834322 cagaaataatgtggccaagaaaactcgcttcacataaccagaactcacacttcgacaacttagcatacaaccttttctctttcaaaatttgcaacacaat 20834223  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
    ||||| ||| || |||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||| || |||||||| ||||||  |||||   | |||||||| || ||     
T  20834222 cttcaaatgttctgcatgttcttcttcagtctttgaataaatcagaatatcatcaataaacacaaccacgaatttatccaggtaagcatggaaaattcgg 20834123  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| | ||||| |||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| ||  | || || || ||||||||||    
T  20834122 ttcatatactccatgaacacaccacgcgcattagtaacacctaaaggcatcaccttgtattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgca 20834023  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    |||||||||| || || ||||| || || |||| ||||||||| |||||  | ||||||||   ||||||||| |||||||||||||| |||||||| |     
T  20834022 tatcttcatccttcaccttaatttgatggtaacctgacctcaagtcaatcatactgaaaacctttgcacccaccaactgatccatcaagtcatcaatcct 20833923  T
Q  429 cggaagtggatacctattctt 449  Q
    |||||||||||| || |||||    
T  20833922 cggaagtggatatctgttctt 20833902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 229 - 473
Target Start/End: Original strand, 41310694 - 41310938
Alignment:
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    |||||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||| |||| ||| || |||||||||||||||||||||||  | || || || ||||||||||    
T  41310694 ttcatatactccataaacacactaggcgcattagtaacaccgaaagacatcacgttatattcatagtgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgca 41310793  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    |||| ||||| || || |||||||| || ||||  |||||||||||| |||| |  || |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||     
T  41310794 tatcctcatccttcaccttaatctgatggtaaccggacctcaaatcagttttacgaaacacacgtgcacccactaactgatccattaaatcgtcaattct 41310893  T
Q  429 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactgatg 473  Q
    ||||||||||||||||||||| || || || || |||||||||||    
T  41310894 cggaagtggatacctattctttatcgtcactttattcaactgatg 41310938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 64 - 471
Target Start/End: Original strand, 20296384 - 20296791
Alignment:
Q  64 aaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttgg 163  Q
    |||||||| |||||||| ||||| || ||||| | | |||| || |||||||||||||| |||||  | |||||||| ||||| || |||||| |||| |    
T  20296384 aaccagaactcacattttgacaactttgcatacaatctcttttccttcaacacttgcaatacaattcttagatgctctgcatgctcctcttcattcttag 20296483  T
Q  164 agtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggt 263  Q
    | ||||| || |||||||| || ||||| || || ||   ||||| ||| ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| || || ||    
T  20296484 aataaattaagatatcatcaataaacaccacaacaaacttatccagaaaagcatggaagattcggttcatgtactccatgaacacaccaggcgcgttagt 20296583  T
Q  264 aacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataactt 363  Q
    |||||| |||||||| ||||| || || || |||||||||||  | || || || |||||||||||||| ||||| || || |||||||| || ||||      
T  20296584 aacaccgaaaggcatcactttgtactcgtaatgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcaccttaatctgatggtaacca 20296683  T
Q  364 gacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgt 463  Q
    |||||||||||||| || || ||||     ||||| || ||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| ||||| || || |||||||    
T  20296684 gacctcaaatcaatcttactaaaaatcttagcaccaaccaactgatccatcaaatcctcaattctcggaagcggatacctgttctttatcgtaaccttgt 20296783  T
Q  464 tcaactga 471  Q
    ||||||||    
T  20296784 tcaactga 20296791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 29 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 24098025 - 24097587
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    |||||||||  || || ||||||||||| ||  | |||||||| ||||| || ||||| || ||||| |  ||||| |||||||| |||| ||| |||||    
T  24098025 cagaaataatgtgacccagaaaactcacttcacttaaccagaactcacactttgacaacttagcatacaacttcttttctttcaagacttacaatacaat 24097926  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
    ||||||||  || ||||| || ||||||||||| || || |||| ||| ||||| || || || || ||||||  ||||| ||| |||||||| ||  |     
T  24097925 cttcagattttctgcatgctcctcttcagtcttagaatagatcagaatgtcatcaataaataccaccacgaatttatccagaaaagcatggaaaatttgg 24097826  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| || || ||||| || ||  |||| ||  | || || || ||||||||||    
T  24097825 ttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttgtattcgtaatgttcatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgca 24097726  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    |||| ||||| || || |||||||| || |||| ||||||||| || || |||||||| ||   ||||||||||||||||||||| || ||||||||||     
T  24097725 tatcctcatccttcaccttaatctgatggtaacctgacctcaagtcgatcttgctgaacacctttgcacccactaactgatccattaagtcatcaattct 24097626  T
Q  429 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaa 467  Q
    ||||||||||||||| ||||| || || || ||||||||    
T  24097625 cggaagtggatacctgttctttatcgtaactttgttcaa 24097587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 181 - 302
Target Start/End: Original strand, 20944119 - 20944240
Alignment:
Q  181 tcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataa 280  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  20944119 tcgatgaacacaactacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataa 20944218  T
Q  281 ctttatattcatagtgaccata 302  Q
    |||| |||||||| ||||||||    
T  20944219 ctttttattcataatgaccata 20944240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 29 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 20938485 - 20938043
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    |||||||||  |||||||||||||| || ||  | |||||||| ||||| || ||||| || ||||| |  || ||||||||||| ||||| || || ||    
T  20938485 cagaaataatgtggccaagaaaacttacttcaattaaccagaactcacacttcgacaacttagcatacaactttttctctttcaatacttgtaatactat 20938386  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
      ||||||||||  |||| |||||||||||||| || ||||||| | | ||||| || |||||||| ||||||  ||||||  | |||||||| || ||     
T  20938385 tctcagatgctctacatgctcttcttcagtcttcgaataaatcagactgtcatcaataaacacaaccacgaatttatccaagtaagcatggaaaattcgg 20938286  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| ||  | || || || || |||||||    
T  20938285 ttcatatactccatgaacacaccaggcgcgttagtaacaccgaaaggcatcaccttgtattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggccgttttctgca 20938186  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    |||| ||||| || || ||||| || || |||| ||||||||| ||||| || || |||||   |||||||||||||||||||||||| || ||||| |     
T  20938185 tatcctcatccttcaccttaatttgatggtaacctgacctcaagtcaatcttactaaaaacctttgcacccactaactgatccatcaagtcgtcaatcct 20938086  T
Q  429 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 471  Q
     |||||||||||||| ||||| || || || || |||||||||    
T  20938085 aggaagtggatacctgttctttattgtaactttattcaactga 20938043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 64 - 471
Target Start/End: Original strand, 37679052 - 37679459
Alignment:
Q  64 aaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttgg 163  Q
    ||||||||||||||||| || || || ||||| |   |||| || |||||||||||||| |||||  |||||||||| ||||| |  || ||| ||||||    
T  37679052 aaccagaattcacattttgataacttagcatacaacctcttttccttcaacacttgcaatacaattctcagatgctctgcatgcttctcctcattcttgg 37679151  T
Q  164 agtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggt 263  Q
    | || || ||||||||||| || ||||| || || ||   ||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||    
T  37679152 aatagattaaaatatcatcaataaacaccacaacaaacttatccagaaaagcatggaagattcgattcatgtactccataaaaacaccaggcgcattagt 37679251  T
Q  264 aacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataactt 363  Q
    |||||| |||||||| ||||| || || || |||||||||||  | || || || |||||||||||||| |||||||| || || ||||| |||||||      
T  37679252 aacaccgaaaggcatcactttgtactcgtaatgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatctttcacctttatctgatgataacca 37679351  T
Q  364 gacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgt 463  Q
    |||||||||||||| || || || |     ||||| || || ||||||||||| || |||||||  ||||| |||||||| |||||||| || || ||||    
T  37679352 gacctcaaatcaatcttactaaatatcttagcaccaaccaattgatccatcaagtcgtcaattctaggaagcggatacctgttcttgatcgtaactttgt 37679451  T
Q  464 tcaactga 471  Q
    ||||||||    
T  37679452 tcaactga 37679459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 29 - 471
Target Start/End: Original strand, 48424841 - 48425283
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    |||||||||  || || |||||||| || || || |||||||| |||||||| || || || ||||| |   |||| || |||||||||||||| |||||    
T  48424841 cagaaataatgtgacccagaaaacttacttcatttaaccagaactcacattttgataacttagcatacaacctcttttccttcaacacttgcaatacaat 48424940  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
      |||||||||| ||||| || || ||| ||||||| || || ||||||||||| || ||||| || || ||   ||||| ||| |||||||| || ||     
T  48424941 tctcagatgctctgcatgctcctcctcattcttggaatagattaaaatatcatcaataaacaccacaacaaacttatccagaaaagcatggaaaattcgg 48425040  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || |||||||||||  | || || || ||||||||||    
T  48425041 ttcatgtactccataaaaacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcactttgtactcgtaatgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgca 48425140  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    |||| ||||| || || || ||||| |||||||  |||||||||||||| || || ||||     ||||| || |||||||||||||| || |||||||     
T  48425141 tatcctcatccttcacctttatctgatgataaccagacctcaaatcaatcttactaaaaatcttagcaccaaccaactgatccatcaagtcgtcaattct 48425240  T
Q  429 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 471  Q
     ||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||||||    
T  48425241 aggaagcggatacctgttcttgatcgtaactttgttcaactga 48425283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 29 - 471
Target Start/End: Original strand, 52987709 - 52988151
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    |||||||||  || || |||||||| || || || |||||||| |||||||| || || || ||||| |   |||| || |||||||||||||| |||||    
T  52987709 cagaaataatgtgacccagaaaacttacttcatttaaccagaactcacattttgataacttagcatacaacctcttttccttcaacacttgcaatacaat 52987808  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
      |||||||||| ||||| || || ||| ||||||| || || ||||||||||| || ||||| || || ||   ||||| ||| |||||||| || ||     
T  52987809 tctcagatgctctgcatgctcctcctcattcttggaatagattaaaatatcatcaataaacaccacaacaaacttatccagaaaagcatggaaaattcgg 52987908  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || |||||||||||  | || || || ||||||||||    
T  52987909 ttcatgtactccataaaaacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcactttgtactcgtaatgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgca 52988008  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    |||| ||||| || || || ||||| |||||||  |||||||||||||| || || ||||     ||||| || |||||||||||||| || |||||||     
T  52988009 tatcctcatccttcacctttatctgatgataaccagacctcaaatcaatcttactaaaaatcttagcaccaaccaactgatccatcaagtcgtcaattct 52988108  T
Q  429 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 471  Q
     ||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||||||    
T  52988109 aggaagcggatacctgttcttgatcgtaactttgttcaactga 52988151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 64 - 471
Target Start/End: Original strand, 21952881 - 21953288
Alignment:
Q  64 aaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttgg 163  Q
    |||||||| |||||||| ||||| || ||||| |   |||| |||||||| |||||||| |||||  |||||||||| ||||| || |||||  ||||||    
T  21952881 aaccagaactcacattttgacaacttcgcatacaacctcttttctttcaaaacttgcaatacaattctcagatgctctgcatgctcctcttcgttcttgg 21952980  T
Q  164 agtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggt 263  Q
    | ||||| || |||||||| || ||||| || || ||   ||||| ||| |||||||| || || ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||    
T  21952981 aataaattaagatatcatcaataaacaccacaacaaacttatccagaaaagcatggaaaattcggttcatgtactccataaacacaccaggcgcgttagt 21953080  T
Q  264 aacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataactt 363  Q
    |||||| |||||||| ||||| || || || |||||||||||  | || || || |||||||||||||| ||||| || || || ||||| || ||||      
T  21953081 aacaccgaaaggcatcactttgtactcgtaatgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcacctttatctgatggtaaccc 21953180  T
Q  364 gacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgt 463  Q
    |||||||| ||||| || || ||||     ||||| || |||||||||||||| || |||||||  ||||| |||||||| ||||| || || || ||||    
T  21953181 gacctcaagtcaatcttactaaaaatcttagcaccaaccaactgatccatcaagtcgtcaattccaggaagcggatacctgttctttatcgtaactttgt 21953280  T
Q  464 tcaactga 471  Q
    ||||||||    
T  21953281 tcaactga 21953288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 29 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 38911248 - 38910806
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    ||||||||| ||| || ||||| ||||| ||  | |||||||| |||||||| ||||  || ||||| |   |||| || |||||||||||||| |||||    
T  38911248 cagaaataatatgacccagaaagctcacttcacttaaccagaactcacatttcgacagcttagcatacaacctcttttccttcaacacttgcaatacaat 38911149  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
      |||||||||| ||||| || || ||| ||||||| || || ||||||||||| || || || || || ||   |||||  || |||||||| ||  |     
T  38911148 tctcagatgctctgcatgctcctcctcattcttggaatagattaaaatatcatcaataaataccacaacaaacttatccaggaaagcatggaaaatttgg 38911049  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| || || ||||| || || ||||||||  | || || || ||||||||||    
T  38911048 ttcatgtactccataaaaacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttgtattcgtaatgtccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgca 38910949  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    |||||||||| || || || ||||| |||||||  |||||||||||||| || |||||||     ||||| || |||||||||||||| || |||||||     
T  38910948 tatcttcatccttcacctttatctgatgataaccagacctcaaatcaatcttactgaaaatcttagcaccaaccaactgatccatcaagtcgtcaattct 38910849  T
Q  429 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 471  Q
     ||||| ||||| || |||||||| || || ||||||||||||    
T  38910848 aggaagcggatatctgttcttgatcgtaactttgttcaactga 38910806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 30 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 20829813 - 20829373
Alignment:
Q  30 agaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatc 129  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||| || ||||| |||||||| |||||| | |  |  ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  20829813 agaaatcacatgaccaaggaaactcacttccttcaaccaaaactcacacttagacaacttggcacacaactggttctctttcaagacttgcaacacaatc 20829714  T
Q  130 ttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgat 229  Q
     ||| |||||||||||| ||||| |||| ||| || || | |||||||||||| |||||||| || || || || |||| | | | ||| || || | ||    
T  20829713 ctcaaatgctcagcatgctcttcctcagactttgaatacaccaaaatatcatctatgaacaccaccacaaaacggtccagataaggatgaaatattctat 20829614  T
Q  230 tcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcat 329  Q
    |||| || |||||||| || || |||||||| |  || ||||| ||||| ||   ||| |||||||| ||||| | | ||| ||| || || ||    ||    
T  20829613 tcatgtattccataaagacacctggtgcattagatactccaaatggcatcacagaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcagttttggatat 20829514  T
Q  330 atcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcac 429  Q
    ||||||  | |||||| ||||||| ||||| | ||| ||||||||||| || || || ||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |      
T  20829513 atcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcacccactagctgatccatcaaatcatcaatcctt 20829414  T
Q  430 ggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    ||||||||||||| |||||| || || ||||||||||||||    
T  20829413 ggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactg 20829373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 29 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 31538419 - 31537977
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    |||||||||  || || |||||||| || || || |||||||| |||||||| || || || ||||| |   |||| || |||||||||||||| |||||    
T  31538419 cagaaataatgtgacccagaaaacttacttcatttaaccagaactcacattttgataacttagcatacaacctcttttccttcaacacttgcaatacaat 31538320  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
      |||||||||| ||||| || || ||| ||||||| || || ||||||||||| || ||||| || || ||   ||||| ||| |||||||| || ||     
T  31538319 tctcagatgctctgcatgctcctcctcattcttggaatagattaaaatatcatcaataaacaccacaacaaacttatccagaaaagcatggaaaattcgg 31538220  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || |||||||||||  | || || || ||||||||||    
T  31538219 ttcatgtactccataaaaacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcactttgtactcgtaatgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgca 31538120  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||| |||||||  ||||||||||| || || || || |     ||||| || |  ||||||||||| || |||||||     
T  31538119 tatcctcatccttcacttttatctgatgataaccagacctcaaatctatcttactaaatatcttagcaccaaccagttgatccatcaagtcgtcaattct 31538020  T
Q  429 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 471  Q
     ||||| ||||| || |||||||| || || ||||||||||||    
T  31538019 aggaagcggatatctgttcttgatcgtaactttgttcaactga 31537977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 29 - 195
Target Start/End: Original strand, 41308610 - 41308776
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| || ||  | ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |  ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  41308610 cagaaataatatggccaagaaaacttacttcacttaaccaaaattcacatttggacaacttggcatacaacttcttttctttcaacacttgcaatacaat 41308709  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaact 195  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| || || ||||| || |||||||||    
T  41308710 cttcagatgctctgcatgctcttcttcagtcttagaataaattaagatgtcatcaataaacacaact 41308776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 29 - 106
Target Start/End: Original strand, 16378079 - 16378156
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttct 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| || |||||||    
T  16378079 cagaaataacatggccaagaaaactaacctctttcaaccagaattcacactttgacaatttagcatatagcttcttct 16378156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 40 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 23196660 - 23196543
Alignment:
Q  40 tggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgct 139  Q
    |||||||||||||| || ||  | |||||||| || ||||| ||||| |||||||| |   |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  23196660 tggccaagaaaacttacttcacttaaccagaactcgcatttggacaacttggcatacaacctcttttctttcaacacttgcaacacaattttcagatgct 23196561  T
Q  140 cagcatgttcttcttcag 157  Q
    |  |||| ||||||||||    
T  23196560 ctacatgctcttcttcag 23196543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 394 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 35930882 - 35930806
Alignment:
Q  394 gcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| |||||| || || ||||||||||||||    
T  35930882 gcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactg 35930806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 405 - 470
Target Start/End: Original strand, 20527366 - 20527431
Alignment:
Q  405 ctgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| |||||| || || || |||||||||||    
T  20527366 ctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcactttgttcaactg 20527431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 405 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 41215902 - 41215837
Alignment:
Q  405 ctgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    ||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||| |||||| || || ||||||||||||||    
T  41215902 ctgatccatcaaatcatcaatccttggaagcggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactg 41215837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 103 - 191
Target Start/End: Original strand, 20927065 - 20927153
Alignment:
Q  103 ttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacac 191  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||| ||| ||||||| |||| ||||| |||| ||| || || | |||||||||||| ||||||||    
T  20927065 ttctccttcaagacttgcaacacaatcctcaaatgctcatcatgctcttcctcagacttcgaatacaccaaaatatcatctatgaacac 20927153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 328 - 470
Target Start/End: Original strand, 20927290 - 20927432
Alignment:
Q  328 atatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattc 427  Q
    ||||||||  | |||||| ||||||| ||||| | ||| |||| |||||| ||||| || ||   |||||| || | ||||||||||||||||||||| |    
T  20927290 atatcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcatatcaatcttgctaaacacctctgcaccaaccagctgatccatcaaatcatcaatcc 20927389  T
Q  428 acggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
       |||||||||| | |||||| || || || |||||||||||    
T  20927390 tttgaagtggatatcgattcttaatcgtcactttgttcaactg 20927432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 368; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 368; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 470
Target Start/End: Original strand, 40100 - 40547
Alignment:
Q  23 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 122  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40100 catcaccagaaataacatggccaagaaaacttacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 40199  T
Q  123 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  40200 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatgtcatcgataaacacaactacgaaccgatccaaaaatgcatggaag 40299  T
Q  223 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  40300 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttttgaaagctgtct 40399  T
Q  323 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 422  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40400 tctgcatatcttcatctttcactttaatctagtgataccctgatctcaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 40499  T
Q  423 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40500 agttctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 40547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 23 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 14484 - 14031
Alignment:
Q  23 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 122  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14484 catcaccagaaataacatggccaagaaaacttacttccttcaaacagaattcacacttagaaaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 14385  T
Q  123 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaa-tatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaa 221  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  14384 gacaatcttcagatgctcagcatattcttcttcagtcatggagtaaataaaaaatatcatcgataaacaccaccacgaaccgatccaaaaaggcatggaa 14285  T
Q  222 gatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtc 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  14284 gatgcgattcatatactccataaacattccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctatc 14185  T
Q  322 ttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcat 421  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| |  || ||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14184 ttctgcatatcatcatctttcactttaatctagtgataccccgatctcaaatcaatcttgctgaaaacttttgcacccactaactgatccatcaaatcat 14085  T
Q  422 caattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactgatgat 475  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14084 caattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactgatgat 14031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 366; Significance: 0; HSPs: 4)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 366; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 471
Target Start/End: Original strand, 35442 - 35891
Alignment:
Q  23 catcatcagaaataacatggccaagaaaac-tcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgca 121  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35442 catcaccagaaataacatggccaacaaaaccttacctctttcaaccagaactcacacttagataatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgca 35541  T
Q  122 agacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaa 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  35542 agacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcggtcttggagtaaattaaaatatcatcgatgagaacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaa 35641  T
Q  222 gatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtc 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35642 gatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtc 35741  T
Q  322 ttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcat 421  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35742 ttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcat 35841  T
Q  422 caattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 471  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  35842 caattctcggaagtggatacctattcttgatagttactttgttcaactga 35891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079; HSP #2
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 202 - 385
Target Start/End: Original strand, 28225 - 28408
Alignment:
Q  202 cgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccat 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28225 cgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttgtattcatagtgaccat 28324  T
Q  302 aacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctga 385  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  28325 aacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctga 28408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079; HSP #3
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 29 - 471
Target Start/End: Original strand, 2669 - 3111
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    |||||||||  |||||||||||||| || ||  | |||||||| |||||||||||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2669 cagaaataatgtggccaagaaaacttacttcacttaaccagaactcacatttagacaacttggcatacaacttcttctctttcaacacttgcaatacaat 2768  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
    ||||||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||| || ||||| || |||||||| ||||||  |||||   | |||||||| || ||     
T  2769 cttcagatgttctgcatgctcttcttcagtctttgaataaatcaagatgtcatcaataaacacaaccacgaatttatccaggtaagcatggaaaattcgg 2868  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||| |   | || || |  ||||||||||    
T  2869 ttcatatactccataaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcactttatattcgtaatgtccatatcatgtcctaaaggtcgtcttctgca 2968  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    |||| ||||| ||    |||||||| || |||| |||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||       
T  2969 tatcctcatccttcgacttaatctgatggtaacctgacctcaaatcaattttactaaacacacgtgcacccactaactgatccattaagtcatcaatcgt 3068  T
Q  429 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 471  Q
    ||||||||||||||| ||||| || || || ||||||||||||    
T  3069 cggaagtggatacctgttctttatcgtaactttgttcaactga 3111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079; HSP #4
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 405 - 475
Target Start/End: Original strand, 28405 - 28475
Alignment:
Q  405 ctgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactgatgat 475  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  28405 ctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttactttattcaactgatgat 28475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 366; Significance: 0; HSPs: 4)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 366; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 467
Target Start/End: Original strand, 10428 - 10865
Alignment:
Q  30 agaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatc 129  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10428 agaaataacatggccaaggaaactcacttctctcaaccagaactcacacttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatc 10527  T
Q  130 ttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgat 229  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10528 tttagatgctcagcatgttctttttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaatacaactacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgat 10627  T
Q  230 tcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcat 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  10628 tcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagtcgtcttctgcat 10727  T
Q  330 atcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcac 429  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  10728 atcctcatcttttactttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctt 10827  T
Q  430 ggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaa 467  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10828 ggaagtcgatacctattcttgatagttaccttgttcaa 10865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 366; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 467
Target Start/End: Original strand, 16890 - 17327
Alignment:
Q  30 agaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatc 129  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16890 agaaataacatggccaaggaaactcacttctctcaaccagaactcacacttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatc 16989  T
Q  130 ttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgat 229  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||    
T  16990 ttcagatgctcagcatgttctttttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaatacaactacgaaccaatccaaaaatgcatggaagatgtgat 17089  T
Q  230 tcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcat 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  17090 tcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagccgtcttctgcat 17189  T
Q  330 atcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcac 429  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  17190 atcctcatcttttactttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctt 17289  T
Q  430 ggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaa 467  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17290 ggaagtcgatacctattcttgatagttaccttgttcaa 17327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 31 - 466
Target Start/End: Original strand, 45106 - 45541
Alignment:
Q  31 gaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatct 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  45106 gaaataacatggccaagaaaactcacctctttcaaccagaattcacacttagacaatttggcataaagttttttctctttcaatacttgcaagacaatct 45205  T
Q  131 tcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgatt 230  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  45206 tcagatgatcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgatt 45305  T
Q  231 catatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcata 330  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  45306 catatactccataaatactctaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcata 45405  T
Q  331 tcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacg 430  Q
    || ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |    
T  45406 tcctcatcctttaccttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcgtcaattcttg 45505  T
Q  431 gaagtggatacctattcttgatagttaccttgttca 466  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45506 gaagcggatacctattcttgatagttaccttgttca 45541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 29 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 48867 - 48447
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||  | ||||| || || || || |||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  48867 cagaaataatatggccaagaaaactcacttcacttaaccaaaactcgcactttgacaatttggcatacaacttcttctctttcaatacttgcaatacaat 48768  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
    | ||||||| || ||||| ||||| |||||  | || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || |||  |||||   | ||||| || || |      
T  48767 cctcagatgttctgcatgctcttcctcagttctcgaatagatcaaaatgtcatcaatgaatacaaccacaaatttatccaggtaagcatgaaaaattctg 48668  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||| ||  | || || || ||||||||||    
T  48667 ttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtgctaaaggcagtcttctgca 48568  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    | || |||||||| || || ||||| || |||| ||||||||| |||||||| || ||||    |||||| || |||||||||||||  || |||||||     
T  48567 tgtcctcatctttcaccttgatctgatggtaacctgacctcaagtcaattttactaaaaatctttgcaccaaccaactgatccatcaggtcgtcaattct 48468  T
Q  429 cggaagtggatacctattctt 449  Q
    |||||| ||||| ||||||||    
T  48467 cggaagcggatatctattctt 48447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 364; Significance: 0; HSPs: 59)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 31 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 17672814 - 17672375
Alignment:
Q  31 gaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatct 130  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17672814 gaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgcaaaacaatct 17672715  T
Q  131 tcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgatt 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17672714 tcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacaaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgatt 17672615  T
Q  231 catatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcata 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17672614 catatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcata 17672515  T
Q  331 tcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacg 430  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  17672514 tcttcatcttttactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcg 17672415  T
Q  431 gaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17672414 gaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 17672375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 470
Target Start/End: Original strand, 18858559 - 18859006
Alignment:
Q  23 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 122  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18858559 catcaccagaaataacatggccaagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 18858658  T
Q  123 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 222  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  18858659 aacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatgtcgtcgataaacacaaccacaaaccgatccaaaaatgcatggaag 18858758  T
Q  223 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||    
T  18858759 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgtcctgaaagccgtct 18858858  T
Q  323 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 422  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18858859 tctgcatatcttcatcctttactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctaaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 18858958  T
Q  423 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18858959 aattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttccactg 18859006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 20017062 - 20016615
Alignment:
Q  23 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 122  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20017062 catcaccagaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 20016963  T
Q  123 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 222  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  20016962 aacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacaaaccgatccaaaaatgcatggaag 20016863  T
Q  223 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20016862 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtct 20016763  T
Q  323 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 422  Q
    |||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20016762 tctgcatatcctcatcctttaccttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatc 20016663  T
Q  423 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20016662 aattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 20016615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 22118974 - 22118527
Alignment:
Q  23 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 122  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22118974 catcaccagaaataacatggcctagaaaactcacctctttcgaccagaattcacacttagacaatttagcataaagcttcttctctttcaacacttgcaa 22118875  T
Q  123 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 222  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  22118874 aacaatcttcagatgctcagcacgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacaaaccgatccaaaaatgcatggaag 22118775  T
Q  223 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22118774 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcaaagtgaccataacgcgttctgaaagctgtct 22118675  T
Q  323 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 422  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22118674 tctacatatcttcatcctttactttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctaaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 22118575  T
Q  423 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22118574 aattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 22118527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 22127758 - 22127311
Alignment:
Q  23 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 122  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22127758 catcaccagaaataacatggcctagaaaactcacctctttcgaccagaattcacacttagacaatttagcataaagcttcttctctttcaacacttgcaa 22127659  T
Q  123 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 222  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  22127658 aacaatcttcagatgctcagcacgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacaaaccgatccaaaaatgcatggaag 22127559  T
Q  223 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22127558 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcaaagtgaccataacgcgttctgaaagctgtct 22127459  T
Q  323 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 422  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22127458 tctacatatcttcatcctttactttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctaaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 22127359  T
Q  423 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22127358 aattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 22127311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 30311943 - 30311495
Alignment:
Q  23 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 122  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30311943 catcaccagaaataacatggccaagaaaacttacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 30311844  T
Q  123 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  30311843 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaattaaaatatcgtcaataaacacaacaacgaaccgatccaaaaatgcatggaag 30311744  T
Q  223 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30311743 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtct 30311644  T
Q  323 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 422  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30311643 tctgcatatcttcatctttcactttaatctggtgataccctgatctcaaatcaatcttgctgaaaacttttgcacccactaactgatccatcaaatcatc 30311544  T
Q  423 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 471  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30311543 aattatcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 30311495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 471
Target Start/End: Original strand, 15535365 - 15535813
Alignment:
Q  23 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 122  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15535365 catcaccagaaataacatggccaagaaaacttacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 15535464  T
Q  123 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15535465 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatgtcgtcgataaacacaactacgaaccgatccaaaaatgcatggaag 15535564  T
Q  223 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 322  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||| |    
T  15535565 atgtgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgataactgttt 15535664  T
Q  323 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 422  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15535665 tctgcatatcttcatctttcactttaatctggtgataccctgatctcaaatcaatcttgctgaaaacttttgcacccactaactgatccatcaaatcatc 15535764  T
Q  423 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 471  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15535765 aattctcggaagtggatacctattcttgatagttactttgttcaactga 15535813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 471
Target Start/End: Original strand, 22041809 - 22042257
Alignment:
Q  23 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 122  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22041809 catcaccagaaataacatggccaagaaaacttatttctttcaaccagaattctcacttagataatttagcataaagtttcttctctttcaacgcttgcaa 22041908  T
Q  123 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  22041909 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtacatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaag 22042008  T
Q  223 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  22042009 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgaattggtcacaccgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacacgttctgaaagctgtct 22042108  T
Q  323 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 422  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22042109 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctgaaaactttcgcacccactaactgatccatcaaatcatc 22042208  T
Q  423 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 471  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22042209 aattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 22042257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 21165337 - 21164889
Alignment:
Q  23 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 122  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| || || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21165337 catcaccagaaataacatggccaagaaaacttacctctttcaaccagaactcacacttggataatttagcataaagtttcttctcttttaacacttgcaa 21165238  T
Q  123 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| |||    
T  21165237 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaattaaaatatcatagataaaaacaaccacgaatcgatccaagaatgcatgaaag 21165138  T
Q  223 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 322  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  21165137 atgcgattcatgtactccataaacactccaggtgcattcgtaacaccgaaaggcataactttatattcatagtgaccataccgcgttctgaaagctgtct 21165038  T
Q  323 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 422  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21165037 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctgaaaatgcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 21164938  T
Q  423 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 471  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21164937 aattctcggaagtggatacctattcttgatagttactttgttcaactga 21164889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 22131840 - 22131392
Alignment:
Q  23 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 122  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22131840 catcaccagaaataacatggccaagaaaacttacttccttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 22131741  T
Q  123 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 222  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| |||||||||    
T  22131740 gacaatcttcaaatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtagatcaaaatatcatcgataaacacaacaaagaatcgatccaaaaaggcatggaag 22131641  T
Q  223 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||| ||||||||||    
T  22131640 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttatattcatagtgaccgtaatgcgttcttaaagctgtct 22131541  T
Q  323 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 422  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||  ||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22131540 tctgcatatcttcatctttcactttaatctggtgataccctgttctcaaatcaatcttgctgaaaacttttgcacccactaactgatccatcaaatcatc 22131441  T
Q  423 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 471  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22131440 aattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 22131392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 336; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 29 - 471
Target Start/End: Original strand, 32602132 - 32602575
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaacca-gaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaa 127  Q
    |||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||| ||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32602132 cagaaataacatggccaaaaaaacttacttctttcaaccaagaattcacactttgacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaa 32602231  T
Q  128 tcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  32602232 tcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgataaacacaacaacgaaccgatccaaaaaggcatggaagatgcg 32602331  T
Q  228 attcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgc 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32602332 attcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgc 32602431  T
Q  328 atatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattc 427  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  32602432 atatcttcatctttcaccttaatctggtgataccctgatctcaaatcaatcttgctgaaaacttttgcaccctctaactgatccatcaaatcatcaattc 32602531  T
Q  428 acggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 471  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32602532 tcggtagtggatacctattcttgatagttactttgttcaactga 32602575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 471
Target Start/End: Original strand, 19979949 - 19980397
Alignment:
Q  23 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 122  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| | ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19979949 catcaccagaaataacatggccaagaaaacttacctctttcaaccagaaatcatacttagataatttagcataaaatttcttctctttcaacacttgcaa 19980048  T
Q  123 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 222  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||    
T  19980049 gacaatcttcagattctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaaaacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatgaaag 19980148  T
Q  223 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 322  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||| |||||    
T  19980149 atgcgattcatgtactccataaacactccaggcgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccatacagtgttctgaaagttgtct 19980248  T
Q  323 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 422  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19980249 tctacatatcttcatcttttactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaagtcatc 19980348  T
Q  423 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 471  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19980349 aattctcggaagtggatacctattcttgatagttactttgttcaactga 19980397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 31 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 19482855 - 19482424
Alignment:
Q  31 gaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatct 130  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19482855 gaaataacatgaccaagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatct 19482756  T
Q  131 tcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgatt 230  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19482755 tcagatgttctgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgatgaacacaaccacgaactgatccaaaaatgcatggaagatgcgatt 19482656  T
Q  231 catatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcata 330  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19482655 catataccccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcata 19482556  T
Q  331 tcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacg 430  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||        ||||||| ||    
T  19482555 tcctcatcctttactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgcgcacccactaactgatcca--------tcaattctcg 19482464  T
Q  431 gaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19482463 gaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 19482424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 29 - 449
Target Start/End: Original strand, 23652029 - 23652449
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| || |||||    
T  23652029 cagaaatgacatggccaagaaaacttacctctttcaaccaaaattcacacttagacaatttagcatatagcttcttctctttcaacacttgtaaaacaat 23652128  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  23652129 cttcaaatgctcagcatgttcctcttcagtcttggagtaaatcaaagtatcatcaatgaaaacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatgaaagatgcga 23652228  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  23652229 ttcatgtactccataaacacaccaggtgcatttgtaacaccaaaaggcataactttgtactcataatgtccataacgcgttctgaaacctgtcttctgca 23652328  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  23652329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacctgatcttaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattct 23652428  T
Q  429 cggaagtggatacctattctt 449  Q
    | ||||| |||||||||||||    
T  23652429 cagaagtagatacctattctt 23652449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 29 - 470
Target Start/End: Original strand, 21252932 - 21253373
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||  || |     
T  21252932 cagaaataacatgtccaagaaagctcacttctttcaaccagaattctcacttagacaatttcgcataaagcttcttctctttcaatacttgcagaaccag 21253031  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  21253032 cttcaaatgctcagcatgttcttcttcagacttggagtaaatcaaaatatcatcgataaaaacaacctcgaaccgatccaaaaatgcatgaaagatgcga 21253131  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  21253132 ttcatgtactccataaatactccaggtgcattcgtaacaccgaaaggcataactttgtactcatagtgaccataccgcgttctgaaagctgtcttctgca 21253231  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  21253232 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacctgatctcaaatctatcttgctgaaaacttttgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattct 21253331  T
Q  429 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    || |||| ||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  21253332 cgaaagttgatacctattctttattgtcaccttgttcaactg 21253373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 29 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 21392654 - 21392213
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |     
T  21392654 cagaaataacatgtccaagaaagctcacttctttcaaccagaattcgcacttagacaattttgcataaagcttcttctctttcaacacttgcaaaaccag 21392555  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||||    
T  21392554 cttcaaatgctcaacatgttcttcttcagacttggagtaaatcaatatatcatcgataaaaacaaccacgaaccaatccaaaaatgcatgaaagatgcga 21392455  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    ||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| |||  |||||||| |||||||||||    
T  21392454 ttcatgtaatccataaatactccaggtgcattcgtaacaccgaaaggcataactttgtactcatagtgaccataccgcgctctgaaagttgtcttctgca 21392355  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  21392354 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacctgatctcaaatctatcttgctgaaaacttttgcacccactaactgatccatcaaatcatcaatcct 21392255  T
Q  429 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  21392254 cggaagtggatacctattctttattgtcaccttgttcaactg 21392213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 29 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 21783213 - 21782772
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |     
T  21783213 cagaaataacatgtccaagaaagctcacttctttcaaccagaattcgcacttagacaatttagcataaagcttcttctctttcaacacttgcaaaaccag 21783114  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||||    
T  21783113 cttcaaatgctcaacatgttcttcttcagacttggagtaaatcaatatatcatcgataaaaacaaccacgaaccaatccaaaaatgcatgaaagatgcga 21783014  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    ||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| |||  |||||||| |||||||||||    
T  21783013 ttcatgtaatccataaatactccaggtgcattcgtaacaccgaaaggcataactttgtactcatagtgaccataccgcgctctgaaagttgtcttctgca 21782914  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  21782913 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacctgatctcaaatctatcttgctgaaaacttttgcacccactaactgatccatcaaatcatcaatcct 21782814  T
Q  429 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  21782813 cggaagtggatacctattctttattgtcaccttgttcaactg 21782772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 29 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 21787148 - 21786707
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |     
T  21787148 cagaaataacatgtccaagaaagctcacttctttcaaccagaattcgcacttagacaattttgcataaagcttcttctctttcaacacttgcaaaaccag 21787049  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||||    
T  21787048 cttcaaatgctcaacatgttcttcttcagacttggagtaaatcaatatatcatcgataaaaacaaccacgaaccaatccaaaaatgcatgaaagatgcga 21786949  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    ||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| |||  |||||||| |||||||||||    
T  21786948 ttcatgtaatccataaatactccaggtgcattcgtaacaccgaaaggcataactttgtactcatagtgaccataccgcgctctgaaagttgtcttctgca 21786849  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  21786848 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacctgatctcaaatctatcttgctgaaaacttttgcacccactaactgatccatcaaatcatcaatcct 21786749  T
Q  429 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  21786748 cggaagtggatacctattctttattgtcaccttgttcaactg 21786707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 23 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 22422691 - 22422244
Alignment:
Q  23 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 122  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22422691 catcaccagaaataacatggccaaggaaactcacctctttcaaccataattcacactttgataatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 22422592  T
Q  123 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 222  Q
     |||||||||| ||| ||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||     
T  22422591 aacaatcttcaaatgttcaacatgttcttcttcggacttggagtaaatcaaaatatcatcaatgaatacaaccacgaaacgatccaaaaatgcatgaaaa 22422492  T
Q  223 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 322  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||| ||| |||    
T  22422491 atgcgattcatgtactccataaacacacctggcgcatttgtaacaccgaaaggcatcactttatattcataatgtccataacgcgttctgaatgctatct 22422392  T
Q  323 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 422  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  || ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22422391 tctgcatatcttcatctttcactttaatctggtgataacccgatctcaagtcaatcttgctaaacacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 22422292  T
Q  423 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||| || || || || ||||||||    
T  22422291 aattctcggaagtgaatacctattctttatcgtcactttattcaactg 22422244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 29 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 19864887 - 19864446
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaaga-caa 127  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || | | |    
T  19864887 cagaaataacatgtccaagaaaactcacttctttcaaccagaattcgcacttagacaatttcgcataaagcttcttctctttcaacacttgtaaaaacca 19864788  T
Q  128 tcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcg 227  Q
      |||| |||||||  |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| | ||| | ||||||||||||||| |||||| |    
T  19864787 gtttcaaatgctcaatatgttcttcttcagacttagagtaaatcaaaatatcatcaatgaaaacaaccatgaaccaatccaaaaatgcatgaaagatgag 19864688  T
Q  228 attcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgc 327  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  19864687 attcatgtactccataaatactccaggtgcattcgtaacaccgaaaggcataactttctactcatagtgaccataccgcgttctgaaagctgtcttctgc 19864588  T
Q  328 atatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattc 427  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || ||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19864587 atatcttcatattttactttaatctggtgataacctgatctcaaatctatcttgctgaaaaatttagcacccactaactgatccatcaaatcatcaatcc 19864488  T
Q  428 acggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaact 469  Q
     ||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  19864487 tcggaagtggatacctattctttattgtcaccttgttcaact 19864446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 29 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 22376246 - 22375806
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| | | || |||||||| ||||| |  ||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  22376246 cagaaataacatggccaagaaaactcatctatttcaaccagaatttatagtttgacaatttagcatataacttcttctctttcagcacttgcaaaacaat 22376147  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||| || || |||    
T  22376146 cttcaaatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtatataaaaatatcgtcgatgaacacaaccacaaaacgatccaaaaatgcatgaaaaatacga 22376047  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||  |  |||||||| |||||||||| ||| || ||||||||  |||| ||||| ||||||||||    
T  22376046 ttcatgtactccataaacacacctggtgcatttgtaatgctgaaaggcatcactttatattaataatgtccataacgtgttctaaaagccgtcttctgca 22375947  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||  || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22375946 tatcttcatctttcactttaatctgttgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaatacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattct 22375847  T
Q  429 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaact 469  Q
     ||||||||||| |||||||| || ||||| || |||||||    
T  22375846 tggaagtggatatctattctttatcgttactttattcaact 22375806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 29 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 22247226 - 22246788
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||| || || ||||| ||||| |  ||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  22247226 cagaaataacatggccatgaaaactcgcctctttcaaccagaattcacactttgaaaatttagcatataacttcttctctttcagcacttgcaaaacaat 22247127  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
    || || ||||||| |||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||||||||||| ||| | || || |||    
T  22247126 ctacaaatgctcaacatgttctccttcaatcttggagtatatcaaaatatcgtcgatgaacacaaccatgaaacgatccaaaaacgcaggaaaaatacga 22247027  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    ||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||   |||| ||||| ||||||||||    
T  22247026 ttcatgtactccataaacacacctggcgcatttgtaacaccgaaaggcatcactttatattcataatgtccataacttgttctaaaagcggtcttctgca 22246927  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||  || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  22246926 tatcttcatctttcactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaacacacgtgcacccactaactgatccatcaaagcatcaattct 22246827  T
Q  429 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaa 467  Q
     ||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||    
T  22246826 tggaagtggatacccattctttatcgttaccttattcaa 22246788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 29 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 21920541 - 21920185
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |     
T  21920541 cagaaataacatgtccaagaaagctcacttctttcaaccagaactcacacttagacaatttcgcataaagtttcttctctttcaacacttgcaaaactaa 21920442  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| | |    
T  21920441 cttcaaatgctcagcatattcttcttcagtcttgaagtaaatcaaaatatcatcaataaaaacaaccacgaaccgatccaaaaatgcttgaaagatacaa 21920342  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| || | ||| || ||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  21920341 ttcatgtactccataaatactccatgtgcatttgtaacaccgaacgacatcaccttatactcataatgtccataacgcgttctaaaagctgtcttctgca 21920242  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctga 385  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||  || |||||||| || |||||||    
T  21920241 tatcttcatctttcactttaatctggtgataacccgatctcaaatctatcttgctga 21920185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 29 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 29302219 - 29301777
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |  ||| |||||||||||||||| || |||||    
T  29302219 cagaaataacgtggccaagaaaacttacttcactcaaccagaattcacattttgacaacttggcatacaacttcctctctttcaacacttgtaacacaat 29302120  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
    |||||  || || ||||||| |||||| ||||| |||||||||| ||| ||||| || || || || || ||  |||| || |||||||| || || |      
T  29302119 cttcaagtgttctgcatgttattcttcggtcttagagtaaatcagaatgtcatcaataaataccacaacaaactgatctaagaatgcatgaaaaattctg 29302020  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||  ||||||| || ||||||||||    
T  29302019 ttcatgtactccataaataccccaggtgcatttgtaacaccaaaaggcatcaccttatactcataatgcccataacgtgttctgaatgccgtcttctgca 29301920  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    |||  |||||||| || ||||||| ||||||||  |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |     
T  29301919 tattctcatctttcaccttaatctagtgataacccgacctcaagtcaattttactgaacacacgtgcacccactaactgatccatcagatcatcaatcct 29301820  T
Q  429 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 471  Q
    |||||| |||||||| ||||| || || || ||||||||||||    
T  29301819 cggaagcggatacctgttctttatcgtaactttgttcaactga 29301777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 32 - 470
Target Start/End: Original strand, 23887015 - 23887457
Alignment:
Q  32 aaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatctt 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| || ||||| |||||||| |  |||||||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  23887015 aaataacatggccaagaaaactcacctcattcaactagaattcacactttgacaacttggcatataacttcttctccttcagcacttgcaaaacaatctt 23887114  T
Q  132 cagatgctca----gcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcg 227  Q
    || |||||||     |||||||||||| || ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| | ||||| || ||  |    
T  23887115 caaatgctcaacatacatgttcttctttagacttagagtatatcaaaatatcatcgatgaacacaaccacgaagcgatctaaataagcatgaaaaatatg 23887214  T
Q  228 attcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgc 327  Q
    |||||| ||||||||||||||  | || ||||| |||||||| |||||||| |||  ||| || || || ||||||||  | || || || ||||| |||    
T  23887215 attcatgtactccataaacacatctggcgcattagtaacaccgaaaggcatcactgaatactcgtaatgtccataacgtgtcctaaaggccgtcttatgc 23887314  T
Q  328 atatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattc 427  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23887315 atatcctcgtctttcactttaatctggtgataacccaacctcaaatcaatcttgctaaacacacgtgcacccactaactaatccatcaaatcatcaattc 23887414  T
Q  428 acggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
       ||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||    
T  23887415 ttcgaagtggatacctattctttatcgttactttattcaactg 23887457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 29 - 449
Target Start/End: Original strand, 21927415 - 21927836
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    ||||||||| |||||||||||| || || ||  | ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |  ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  21927415 cagaaataatatggccaagaaatcttacttcacttaaccagaattcacattttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaacacttgcaatacaat 21927514  T
Q  129 cttcagatgctcagca-tgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcg 227  Q
    |||||||||||| ||| || |||||||||||||| || ||||| || || ||||| || |||||||| || |||  ||||| | | |||||||| || |     
T  21927515 cttcagatgctctgcaatgctcttcttcagtcttagaataaattaagatgtcatcaataaacacaaccacaaatttatccagataagcatggaaaattct 21927614  T
Q  228 attcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgc 327  Q
     |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||  |||||||| || |||||||||||||||||||||||  | || || |  |||||||||    
T  21927615 gttcatatactccataaacacaccaggcgcattagtaacactgaaaggcatcaccttatattcatagtgaccataacgtgtcctaaaggtcgtcttctgc 21927714  T
Q  328 atatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattc 427  Q
    ||||  ||||| || || |||||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||    
T  21927715 atatgctcatccttcaccttaatctgatggtaacctgacctcaaatcaattttactgaacacacgagcacccactaactgatccattaagtcgtcaattc 21927814  T
Q  428 acggaagtggatacctattctt 449  Q
     |||||||||||||||||||||    
T  21927815 tcggaagtggatacctattctt 21927836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 29 - 248
Target Start/End: Original strand, 22988718 - 22988937
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  22988718 cagaaataacatggccaagaaaactcacctctttcaaccagaattcacactttgacaatttagcataaagcttcttctctttcagcacttgcaaaacaat 22988817  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||| ||    
T  22988818 cttcaaatgctcagcatgttcttcttcagtcttggaatatatcaaaatatcatcgatgaacacaaccacgaaacgatccaaaaatgcatgaaaaatgtga 22988917  T
Q  229 ttcatatactccataaacac 248  Q
    ||||| || |||||||||||    
T  22988918 ttcatgtattccataaacac 22988937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 29 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 20008714 - 20008294
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| || ||  | ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |  ||||| |||||||||| |||||| |||||    
T  20008714 cagaaataatatggccaagaaaacttacttcacttaaccaaaattcacatttggacaacttggcatacaacttcttttctttcaacagttgcaacacaat 20008615  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
    ||||| |||||| ||||| ||||||||| |||| || ||||| |  ||||||||  | |||||||| || |||  ||||| | | |||||||| || |      
T  20008614 cttcatatgctctgcatgctcttcttcattcttagaataaattaggatatcatcactaaacacaaccacaaatttatccagataagcatggaaaattctg 20008515  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| ||  | || || || ||||||||||    
T  20008514 ttcatatactccataaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttatattcataatgtccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgca 20008415  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    |||| |||||||| || |||||||| || |||| ||| ||||||||||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||     
T  20008414 tatcctcatctttcaccttaatctgatggtaacctgagctcaaatcaatcttactgaacacgcgtgcacccactaattgatccattaaatcatcaattct 20008315  T
Q  429 cggaagtggatacctattctt 449  Q
    |||||||||||| ||||||||    
T  20008314 cggaagtggatatctattctt 20008294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 43 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 31415248 - 31414820
Alignment:
Q  43 ccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcag 142  Q
    ||||||||| |||| ||  | |||||||| | ||| || ||||| || ||||| |  ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  31415248 ccaagaaaattcacttcacttaaccagaacttacactttgacaacttagcatacaacttcttttcttttaacacttgcaatacaatcttcagatgctctg 31415149  T
Q  143 catgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccat 242  Q
    |||| || ||||| ||||| || ||||||| ||||||||| || |||||||| || |||  ||||| ||| |||||||| || || ||||||||||||||    
T  31415148 catgctcctcttcggtcttagaataaatcagaatatcatcaataaacacaaccacaaatttatccagaaaagcatggaaaattcggttcatatactccat 31415049  T
Q  243 aaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatctttt 342  Q
     ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| ||  | || || || |||||||||||||||||||| ||     
T  31415048 gaacaccccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttgtattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcttcatccttc 31414949  T
Q  343 actttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacc 442  Q
    || |||||||| || |||| ||||||||| ||||| |||||||| ||   ||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||    
T  31414948 accttaatctgatggtaacctgacctcaagtcaatcttgctgaacacctttgcacccactaactgatccattaagtcatcaattctcggaagtggatacc 31414849  T
Q  443 tattcttgatagttaccttgttcaactga 471  Q
    ||||||| || || || ||||||||||||    
T  31414848 tattctttatcgtaactttgttcaactga 31414820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 29 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 20394926 - 20394488
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |  || |||||||||| ||||||||| |||||    
T  20394926 cagaaataatatggccaagaaaactcaccttattcaaccagaattcacactttgacaacttggcatataactttttctctttcagcacttgcaaaacaat 20394827  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||| || || ||||| ||| | ||||| || || |||    
T  20394826 cttcaaatgctcggcatgttcttcttcagacttagagtatatcaaaatatcgtcaatgaacacaacaacaaagcgatctaaataagcatgaaaaatacga 20394727  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    ||||| || |||||||| || || |||||||| ||| ||| ||||||||| | |   ||||| || || || |||||  | || ||||| ||||||| ||    
T  20394726 ttcatgtattccataaatacacccggtgcatttgtagcactaaaaggcatcattgattattcgtaatgtccgtaacgtgtcctaaaagccgtcttctaca 20394627  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    |||||||||| || | ||||||||| ||||| |  || ||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  20394626 tatcttcatccttcagtttaatctgatgatagcccgatctcaaatcaatcttaataaacacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcgattct 20394527  T
Q  429 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaa 467  Q
      ||||||||| ||||||||| || || || ||||||||    
T  20394526 tagaagtggatccctattctttattgtcactttgttcaa 20394488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 32 - 467
Target Start/End: Original strand, 23656918 - 23657353
Alignment:
Q  32 aaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatctt 131  Q
    |||||| ||||||||||||||| || ||  | ||||| || ||||| || ||||| |||||||| |  |||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  23656918 aaataatatggccaagaaaacttacttcacttaaccataactcacactttgacaacttggcatacaacttcttctctttcaatacttgcaatacaatctt 23657017  T
Q  132 cagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattc 231  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||||| || || || | ||||||||| || || ||||| |  |||  ||||| ||| |||||||| || || |||    
T  23657018 cagatgttctgcatgctcttcttcagtcttagaatatattagaatatcatcaataaatacaaccataaatttatccagaaaagcatggaaaattcggttc 23657117  T
Q  232 atatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatat 331  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||| ||  | || || || |||||||||||||    
T  23657118 atatactccataaacacgccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgcatat 23657217  T
Q  332 cttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacgg 431  Q
    | ||||| || ||||||||||| || |||| ||||||||| ||||| |||||||||||   |||||| || ||||||||||| || |||||||| | |||    
T  23657218 cctcatccttcactttaatctgatggtaacctgacctcaagtcaatcttgctgaaaacttttgcacctacgaactgatccattaagtcatcaatcctcgg 23657317  T
Q  432 aagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaa 467  Q
    |||||||||||| ||||| || || || ||||||||    
T  23657318 aagtggatacctgttctttatcgtaactttgttcaa 23657353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 206 - 470
Target Start/End: Original strand, 22522711 - 22522975
Alignment:
Q  206 ccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacg 305  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||| || | ||||||    
T  22522711 ccaaaaatgcatgaaaaatgcgattcatgtactccataaacactcctggcgcatttgtaacaccgaaaggcatcactttatactcataatgtcgataacg 22522810  T
Q  306 cattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaac 405  Q
      |||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||  || ||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||    
T  22522811 tgttctaaaagccgttttctgcatatcttcatctttcactttattctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctaaacacacgagcacccactaac 22522910  T
Q  406 tgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    ||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||    
T  22522911 tgatccatcaagtcatcaattcttggaagtggatacctgttctttatcgttactttgttcaactg 22522975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 29 - 440
Target Start/End: Original strand, 19861423 - 19861834
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| || ||  | ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |  ||||| | |||||||||||||||  ||||    
T  19861423 cagaaataatatggccaagaaaacttacttcacttaaccaaaattcacatttggacaacttggcatacaacttcttttatttcaacacttgcaactcaat 19861522  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||| || ||||| |  |||||||| || |||||||| || |||  ||||| | | |||||||| || |      
T  19861523 cttcagatgctctgcatgttcttcttcattcttagaataaattaggatatcatcaataaacacaaccacaaatttatccagataagcatggaaaattctg 19861622  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||| || ||||| ||||| || ||||| ||  | || || || ||||||||||    
T  19861623 ttcatatacttcataaacacaccaggcgcattagtaacaccgaagggcattaccttatactcataatgtccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgca 19861722  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    |||||||||| || || |||||||| || |||| ||||||||||| |||||   |||| |||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  19861723 tatcttcatccttcaccttaatctgatggtaacctgacctcaaattaatttacatgaacacacgaccacccactaactgatccattaaatcatcaattct 19861822  T
Q  429 cggaagtggata 440  Q
    ||||||| ||||    
T  19861823 cggaagtcgata 19861834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 23 - 185
Target Start/End: Original strand, 19114672 - 19114834
Alignment:
Q  23 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 122  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19114672 catcaccagaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagcttcttctctttcaacacttgcaa 19114771  T
Q  123 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgat 185  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19114772 aacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcggtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgat 19114834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 29 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 21324071 - 21323630
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| ||  | |||||||| ||||| || ||||| || ||||| |  || ||||||||||| | |||||| |||||    
T  21324071 cagaaataatgtggccaagaaaactcacttcacttaaccagaactcacacttcgacaacttagcatacaactt-ttctctttcaaaatttgcaacacaat 21323973  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
    ||||||||| || ||||| |||||||||||||| || || |||| ||| |||||||| |||||||| ||||||  |||||   | |||||||| || ||     
T  21323972 cttcagatgttctgcatgctcttcttcagtctttgaatagatcagaatgtcatcgataaacacaaccacgaatttatccaggtaagcatggaaaattcgg 21323873  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| || || || || || || ||||| ||  | || || || ||||||||||    
T  21323872 ttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcacattgtactcgtaatgtccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgca 21323773  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    |||||||||| || || |||||||| || |||| ||||||||| ||||| || || |||||   |||||||||||||||||||||||| || ||||| |     
T  21323772 tatcttcatccttcaccttaatctgatggtaacctgacctcaagtcaatcttactaaaaacttttgcacccactaactgatccatcaagtcgtcaatcct 21323673  T
Q  429 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 471  Q
    ||||||||||||||||||||| || || || || |||||||||    
T  21323672 cggaagtggatacctattctttattgtaactttattcaactga 21323630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 64 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 16269982 - 16269575
Alignment:
Q  64 aaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttgg 163  Q
    |||||||| |||||||| ||||| || ||||| |   |||| || |||||||||||||| |||||  |||| ||||| ||||| || |||||| ||||||    
T  16269982 aaccagaactcacattttgacaactttgcatacaacctcttttccttcaacacttgcaatacaattctcaggtgctctgcatgctcctcttcattcttgg 16269883  T
Q  164 agtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggt 263  Q
    | |||||||| |||||||| |||||||| || || ||   ||||| ||| |||||||| || || ||||| |||||||||||||| |||||  | || ||    
T  16269882 aataaatcaagatatcatcaatgaacaccacaacaaacttatccagaaaagcatggaaaattcggttcatgtactccataaacacaccaggcccgttagt 16269783  T
Q  264 aacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataactt 363  Q
    |||||| |||||||| ||||| || || || |||||||||||  | || || || |||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||     
T  16269782 aacaccgaaaggcatcactttgtactcgtaatgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcacctttatctgatgataacta 16269683  T
Q  364 gacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgt 463  Q
    |||||||||||||| || || ||||     ||||| || ||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| ||||| || || |||||||    
T  16269682 gacctcaaatcaatcttactaaaaatcttagcaccaaccaactgatccatcaaatcgtcaattctcggaagcggatacctgttctttatcgtaaccttgt 16269583  T
Q  464 tcaactga 471  Q
    ||||||||    
T  16269582 tcaactga 16269575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 23 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 31569641 - 31569198
Alignment:
Q  23 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 122  Q
    ||||| ||||||||| ||| ||||| |||||||| ||  | | ||| || |||||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||     
T  31569641 catcaccagaaataatatgaccaaggaaactcacttcacttagccaaaactcacatttcgacaatttggcatacaacttcttctctttcaaaacttgcag 31569542  T
Q  123 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 222  Q
     |||||  ||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||||| ||||||||| || || || || ||||||  ||||| ||| ||||| ||     
T  31569541 cacaattctcagatgttctgcatgctcttcttcagtcttcgaataaatcagaatatcatcaataaataccaccacgaatttatccagaaaagcatgaaaa 31569442  T
Q  223 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 322  Q
    || ||||||||||||||||| ||||| || || || || |||||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||| || ||  | || || || ||||    
T  31569441 attcgattcatatactccatgaacacaccgggcgcgttagtaacaccgaaaggcatcactttgtattcgtaatgaccgtatcgtgtcctaaaggccgtct 31569342  T
Q  323 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 422  Q
    |||||||||| ||||| || || ||||| || || |||| ||||||||| ||||| || ||||| ||   ||||||||||| ||| |||||||| |||||    
T  31569341 tctgcatatcctcatccttcaccttaatttgatggtaac-tgacctcaagtcaatcttactgaacacctttgcacccactagctggtccatcaagtcatc 31569243  T
Q  423 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaa 467  Q
    ||| | |||||| ||||| |||||||| || || || ||||||||    
T  31569242 aatcctcggaagcggatatctattcttaattgtaactttgttcaa 31569198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 32 - 471
Target Start/End: Original strand, 20390090 - 20390516
Alignment:
Q  32 aaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatctt 131  Q
    |||||| |||||||||||||||  | ||  | ||| |||||||| |||| ||||| |||||||| |  || || || |||||||||||||| ||||||||    
T  20390090 aaataatatggccaagaaaacttgcttcacttaactagaattcaaatttggacaacttggcatacaactttttttccttcaacacttgcaacacaatctt 20390189  T
Q  132 cagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattc 231  Q
     | |||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||| || ||||| || |||||||| || || |||||||| || |||||||| || | ||||    
T  20390190 taaatgctccgcatgctcttcttcagtcttagaataaatcaagatgtcatcaataaacacaaccacaaaccgatccaagaaagcatggaaaattctattc 20390289  T
Q  232 atatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatat 331  Q
    ||  ||             ||||  |||| |||||||| |||| ||| ||||||||||  || || ||||| ||  | || || || || ||||||||||    
T  20390290 atgcac-------------caggcacattagtaacaccgaaagacatcactttatatttgtaatgtccatatcgtgtcctaaaggccgttttctgcatat 20390376  T
Q  332 cttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacgg 431  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||| ||||| || ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  20390377 cttcatcttttactttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttgctaaacacacgtgaacccactaactgatccataaaatcatcaattctcgg 20390476  T
Q  432 aagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 471  Q
    ||||||||||||||| || || || || || |||||||||    
T  20390477 aagtggatacctattatttatcgtcactttattcaactga 20390516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 271 - 468
Target Start/End: Original strand, 22989275 - 22989472
Alignment:
Q  271 aaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctca 370  Q
    |||||||| |||||||||||||| |  ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  || ||||    
T  22989275 aaaggcatcactttatattcataatacccataacgcgttctgaaagctgtattctgcatatcttcatctttcactttaatctggtgataacccgatctca 22989374  T
Q  371 aatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 468  Q
    ||||||| ||||| || |||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||   |||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||    
T  22989375 aatcaatcttgctaaacacacttgcagccactaactgatccatcaagtcatcaattattggaagtggatacctattctttatcgttactttattcaac 22989472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 318 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 21781691 - 21781539
Alignment:
Q  318 tgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaa 417  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  21781691 tgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacctgatctcaaatctatcttgctgaaaacttttgcacccactaactgatccatcaaa 21781592  T
Q  418 tcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  21781591 tcatcaatcctcggaagtggatacctattctttattgtcaccttgttcaactg 21781539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 29 - 471
Target Start/End: Original strand, 22052851 - 22053293
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||| || ||||| |  || ||||||||||  |||||||| |||||    
T  22052851 cagaaataatgtggccaagaaaactcacttcacttaaccagaattcacatttcaacaacttagcatacaactttttctctttcagtacttgcaatacaat 22052950  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
    | ||||||| || ||||| || ||||||||||| || ||||| |  |||||||| ||||| ||| | || ||   ||||| ||| ||||| || || ||     
T  22052951 cctcagatgttctgcatgctcctcttcagtcttagaataaattaggatatcatcaatgaatacacccacaaacttatccagaaaggcatgaaaaattcgg 22053050  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| || |  ||||| || |||||||||||  | || || || ||||||||||    
T  22053051 ttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcacctggtattcgtaatgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgca 22053150  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    |||||||||| || || ||||| || || ||||  |||||||| ||||| ||  ||||||    |||||| || | |||||||||||| ||||||||||     
T  22053151 tatcttcatccttcaccttaatttgatggtaaccagacctcaagtcaatcttattgaaaatctttgcaccaaccagctgatccatcaagtcatcaattct 22053250  T
Q  429 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 471  Q
    |||||| |||||||| ||||| || || || ||||||||||||    
T  22053251 cggaagcggatacctgttctttattgtaactttgttcaactga 22053293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 262 - 449
Target Start/End: Original strand, 19984401 - 19984588
Alignment:
Q  262 gtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataac 361  Q
    |||||||| |||||||| || || |||||||| |||||||| ||  | || || || |||||||||||||| ||||| || || |||||||| || ||||    
T  19984401 gtaacaccgaaaggcatcaccttttattcataatgaccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcaccttaatctgatggtaac 19984500  T
Q  362 ttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattctt 449  Q
     |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | | |||||||||||||||||||    
T  19984501 ctgacctcaaatcaattttactgaacacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcctcagaagtggatacctattctt 19984588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 64 - 471
Target Start/End: Original strand, 4984065 - 4984472
Alignment:
Q  64 aaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttgg 163  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||  |||| | |  |||||| || ||||||||||| || ||  |||||||||| ||||| ||||| ||  ||||||    
T  4984065 aaccagaactcacattttgacaacttaacatacaatcgcttctcctttaacacttgcaatactattctcagatgctctgcatgctcttcctcgttcttgg 4984164  T
Q  164 agtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggt 263  Q
    | ||||||||  ||||||  |||||||| || || ||   ||| | ||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||| || || ||    
T  4984165 aataaatcaaggtatcattaatgaacaccacaacaaacttatctagaaaagcatggaagattcgattcatgtactccataaaaacaccaggcgctttagt 4984264  T
Q  264 aacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataactt 363  Q
     ||||| |||||||| ||||| || || || |||||||||||  | || || || |||||||||||||| ||||| || || |||||||| |||||||      
T  4984265 tacaccgaaaggcatcactttgtactcgtaatgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcaccttaatctgatgataacca 4984364  T
Q  364 gacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgt 463  Q
    |||||||||||||| || || ||||     ||||| || |||||||||||||| || |||||||  ||||| |||||| | |||||||| || || ||||    
T  4984365 gacctcaaatcaatcttactaaaaatcttagcaccaaccaactgatccatcaagtcgtcaattctaggaagcggatacttgttcttgatcgtaactttgt 4984464  T
Q  464 tcaactga 471  Q
    ||||||||    
T  4984465 tcaactga 4984472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 64 - 471
Target Start/End: Original strand, 28982934 - 28983341
Alignment:
Q  64 aaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttgg 163  Q
    ||||||||||||||||  || || || ||||| |   |||| || |||||||||||||| || ||  |||||||||| ||||| || || ||| ||||||    
T  28982934 aaccagaattcacattgtgataacttagcatacaacctcttttccttcaacacttgcaacactattctcagatgctctgcatgctcctcctcattcttgg 28983033  T
Q  164 agtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggt 263  Q
    | || || | ||||||||| || || || || || ||   ||||| ||| |||||||| || || ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||    
T  28983034 aatagattagaatatcatcaataaataccaccacaaacttatccagaaaagcatggaaaattcggttcatgtactccataaaaacaccaggcgcattagt 28983133  T
Q  264 aacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataactt 363  Q
    |||||| |||||||| ||||| || || || |||||||||||  | || || || |||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||      
T  28983134 aacaccgaaaggcatcactttgtactcgtaatgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcacttttatctgatgataacca 28983233  T
Q  364 gacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgt 463  Q
    | |||||||||||| || |||||||     ||||| || |||||||||||||| || |||||||  ||||| |||||||| |||||||| || || ||||    
T  28983234 gccctcaaatcaatcttactgaaaatcttggcaccaaccaactgatccatcaagtcgtcaattctaggaagcggatacctgttcttgatcgtaactttgt 28983333  T
Q  464 tcaactga 471  Q
    ||||||||    
T  28983334 tcaactga 28983341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 64 - 471
Target Start/End: Original strand, 28988153 - 28988560
Alignment:
Q  64 aaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttgg 163  Q
    ||||||||||||||||  || || || ||||| |   |||| || |||||||||||||| || ||  |||||||||| ||||| || || ||| ||||||    
T  28988153 aaccagaattcacattgtgataacttagcatacaacctcttttccttcaacacttgcaacactattctcagatgctctgcatgctcctcctcattcttgg 28988252  T
Q  164 agtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggt 263  Q
    | || || | ||||||||| || || || || || ||   ||||| ||| |||||||| || || ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||    
T  28988253 aatagattagaatatcatcaataaataccaccacaaacttatccagaaaagcatggaaaattcggttcatgtactccataaaaacaccaggcgcattagt 28988352  T
Q  264 aacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataactt 363  Q
    |||||| |||||||| ||||| || || || |||||||||||  | || || || |||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||      
T  28988353 aacaccgaaaggcatcactttgtactcgtaatgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcacttttatctgatgataacca 28988452  T
Q  364 gacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgt 463  Q
    | |||||||||||| || |||||||     ||||| || |||||||||||||| || |||||||  ||||| |||||||| |||||||| || || ||||    
T  28988453 gccctcaaatcaatcttactgaaaatcttggcaccaaccaactgatccatcaagtcgtcaattctaggaagcggatacctgttcttgatcgtaactttgt 28988552  T
Q  464 tcaactga 471  Q
    ||||||||    
T  28988553 tcaactga 28988560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 64 - 471
Target Start/End: Original strand, 27356559 - 27356966
Alignment:
Q  64 aaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttgg 163  Q
    |||||||| |||||||| ||||| || ||||| |   |||||||||| || |||||||| |||||  |||||||||| ||||| || |||||| ||||||    
T  27356559 aaccagaactcacatttcgacaacttcgcatacaacctcttctcttttaaaacttgcaatacaattctcagatgctctgcatgctcctcttcattcttgg 27356658  T
Q  164 agtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggt 263  Q
    | ||||| || |||||||| || ||||| || || ||   ||||| ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||    
T  27356659 aataaattaagatatcatcaataaacaccacaacaaacttatccagaaaagcatggaagattcggttcatgtactccataaacacaccaggcgcattagt 27356758  T
Q  264 aacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataactt 363  Q
    |||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| ||  | || || || |||||||||||||| ||||| || || || ||||| |  ||||      
T  27356759 aacaccgaaaggcatcaccttgtattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcacctttatctgatagtaacca 27356858  T
Q  364 gacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgt 463  Q
    || ||||| ||||| || || ||||     ||||| || |||||||||||||| || |||||||  ||||| |||||||| ||||| || |  || ||||    
T  27356859 gatctcaagtcaatcttactaaaaatcttagcaccaaccaactgatccatcaagtcgtcaattctaggaagcggatacctgttctttatcgaaactttgt 27356958  T
Q  464 tcaactga 471  Q
    ||||||||    
T  27356959 tcaactga 27356966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 64 - 388
Target Start/End: Original strand, 6605681 - 6606005
Alignment:
Q  64 aaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttgg 163  Q
    |||||||| |||||||| || || || ||||| |   |||| || |||||||| ||||| |||||  |||||||||| ||||| || || ||| ||||||    
T  6605681 aaccagaactcacattttgataacttagcatacaacctcttttccttcaacacctgcaatacaattctcagatgctctgcatgctcctcctcattcttgg 6605780  T
Q  164 agtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggt 263  Q
    | || || ||||||||||| || || || || || ||   ||||| ||| |||||||| || || ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||    
T  6605781 aatagattaaaatatcatcaataaataccacaacaaacttatccagaaaagcatggaaaattcggttcatgtactccataaaaacaccaggcgcattagt 6605880  T
Q  264 aacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataactt 363  Q
    |||||| |||||||| ||||| || || || |||||||||||  | || || || |||||||||||||||||||| || || || ||||| |||||||      
T  6605881 aacaccgaaaggcatcactttgtactcgtaatgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcttcatccttcacctttatctgatgataacca 6605980  T
Q  364 gacctcaaatcaattttgctgaaaa 388  Q
    |||||||||||||| || |||||||    
T  6605981 gacctcaaatcaatcttactgaaaa 6606005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 30 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 16875887 - 16875447
Alignment:
Q  30 agaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatc 129  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||| || ||||| |||||||| |||||| | |  |  ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  16875887 agaaatcacatgaccaaggaaactcacttccttcaaccaaaactcacacttagacaacttggcacacaactggttctctttcaagacttgcaacacaatc 16875788  T
Q  130 ttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgat 229  Q
     ||| |||||||||||| ||||| |||| ||| || || | |||||||||||| |||||||| || || || || |||| | | | ||| || || | ||    
T  16875787 ctcaaatgctcagcatgctcttcctcagactttgaatacaccaaaatatcatctatgaacaccaccacaaaacggtccagataaggatgaaatattctat 16875688  T
Q  230 tcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcat 329  Q
    |||| || |||||||| || || || ||||| |  || ||||| ||||| ||   ||| |||||||| ||||| | | ||| ||| || || ||    ||    
T  16875687 tcatgtattccataaagacacctggcgcattagatactccaaatggcatcacagaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcagttttggatat 16875588  T
Q  330 atcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcac 429  Q
    ||||||  | |||||| ||||||| ||||| | ||| ||||||||||| || || || ||   |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |      
T  16875587 atcttctgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatcctt 16875488  T
Q  430 ggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    ||||||||||||| |||||| || || ||||||||||||||    
T  16875487 ggaagtggataccaattcttaatcgtcaccttgttcaactg 16875447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 346 - 471
Target Start/End: Original strand, 22373173 - 22373298
Alignment:
Q  346 ttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctat 445  Q
    |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  22373173 ttaatctgatggtaacctgacctcaaatcaattttgctgaacacacgagcacccactaactgatccattaaatcatcaattcttggaagtggatatctat 22373272  T
Q  446 tcttgatagttaccttgttcaactga 471  Q
    |||| || || || || |||||||||    
T  22373273 tctttatcgtcactttattcaactga 22373298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 64 - 278
Target Start/End: Original strand, 22372954 - 22373168
Alignment:
Q  64 aaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttgg 163  Q
    ||||| ||||||||||| ||| | |||||||| |  ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||| |||| |    
T  22372954 aaccataattcacatttggaccacttggcatacaacttcttttctttcaacacttgcaacacaatcttaagatgctctgcatggtcttcttcattcttag 22373053  T
Q  164 agtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggt 263  Q
    | ||||| |  ||||||||  | |||||||| || |||  ||||| | | |||||||| || | |||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||    
T  22373054 aataaattaggatatcatcagtaaacacaaccacaaatttatccagataagcatggaaaattcaattcatgtactccatgaacacaccaggcgcattagt 22373153  T
Q  264 aacaccaaaaggcat 278  Q
    |||||| ||||||||    
T  22373154 aacacccaaaggcat 22373168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 30 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 21849129 - 21848689
Alignment:
Q  30 agaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatc 129  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||| || || || |||||||| |||||| | |  |  ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  21849129 agaaatcacatgaccaagaaaactcacttccttcaaccaaaactcccacttagacaacttggcacacaactggttctctttcaagacttgcaacacaatc 21849030  T
Q  130 ttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgat 229  Q
     ||| |||||||||||| ||||| |||| ||| || || | |||||||||||| |||||||| || || || || |||| | | | ||| || || | ||    
T  21849029 ctcaaatgctcagcatgctcttcctcagactttgaatacaccaaaatatcatctatgaacaccaccacaaaacggtccagataaggatgaaatattctat 21848930  T
Q  230 tcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcat 329  Q
    |||| || |||||||| || || || ||||| |  || ||||| ||||| ||   ||| |||||||| ||||| |   ||| ||| || || ||    ||    
T  21848929 tcatgtattccataaagacacctggcgcattagatactccaaatggcatcacagaatactcatagtgtccataccttgttcggaacgcagttttggatat 21848830  T
Q  330 atcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcac 429  Q
    |||||   | |||||| ||||||| ||||| | ||| ||||||||||| || || || ||   |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |      
T  21848829 atctttcgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatcctt 21848730  T
Q  430 ggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    |||| |||||||| |||||| || || ||||||||||||||    
T  21848729 ggaaatggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactg 21848689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 408 - 471
Target Start/End: Original strand, 22030470 - 22030533
Alignment:
Q  408 atccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 471  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22030470 atccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 22030533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 256 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 22061245 - 22061030
Alignment:
Q  256 gcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggt 355  Q
    ||||| |||||||| |||||||| || || |||||||| |||||||| ||  | || || ||  |||||||||| || ||||| || || |||||||| |    
T  22061245 gcattagtaacaccgaaaggcatcaccttgtattcataatgaccatatcgtgtcctaaaggccttcttctgcatttcctcatccttcaccttaatctgat 22061146  T
Q  356 gataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagt 455  Q
    | |||| ||||||||| ||||| || ||||||||   ||||||||| ||||||| ||| || |||||||| |  |||||||||||||| ||||| || ||    
T  22061145 ggtaacctgacctcaagtcaatcttactgaaaacttttgcacccaccaactgattcattaagtcatcaatcctgggaagtggatacctgttctttatcgt 22061046  T
Q  456 taccttgttcaactga 471  Q
     || ||||||||||||    
T  22061045 aactttgttcaactga 22061030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 64 - 305
Target Start/End: Original strand, 14567165 - 14567406
Alignment:
Q  64 aaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttgg 163  Q
    |||||||| |||||||| ||||| || ||||| | | |||| || |||||||||||||| || || || || ||||  ||||| || || ||| ||||||    
T  14567165 aaccagaactcacatttcgacaactttgcatacaatctcttttccttcaacacttgcaacactatttttaggtgctttgcatgctcctcctcattcttgg 14567264  T
Q  164 agtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggt 263  Q
    | ||||| || |||||||| || ||||| || || ||   ||||| ||| |||||||| || || ||||| ||||||||||| || ||||| || || ||    
T  14567265 aataaattaagatatcatcaataaacaccacaacaaacttatccagaaaagcatggaaaattcggttcatgtactccataaaaacaccaggcgccttagt 14567364  T
Q  264 aacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacg 305  Q
    |||||| |||||||| ||||| || || || |||||||||||    
T  14567365 aacaccgaaaggcatcactttgtactcgtaatgaccataacg 14567406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 30 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 20651147 - 20650707
Alignment:
Q  30 agaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatc 129  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||| |  ||||| |||||||| || ||| | |  |  ||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  20651147 agaaatcacatgaccaaggaaactcacttccttcaaccaaatctcacacttagacaacttagcacataactggttctccttcaagacttgcaacacaatc 20651048  T
Q  130 ttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgat 229  Q
     ||| |||||| ||||| || || ||||  || || || | |||||||||||| |||||||| ||||| || || |||| | | | ||  || || | ||    
T  20651047 ctcaaatgctcggcatgctcctcctcagatttcgaatacaccaaaatatcatctatgaacaccactacaaaacggtccagataaggataaaatattctat 20650948  T
Q  230 tcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcat 329  Q
    |||||||||| || || || || || ||||| |  || ||||| ||||| ||   ||| |||||||| ||||| | | ||| ||| ||||| ||    ||    
T  20650947 tcatatactctatgaagacacctggcgcattagatactccaaatggcatcacagaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgctgttttggatat 20650848  T
Q  330 atcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcac 429  Q
    ||||||  | |||||| |||| || ||||| | ||| ||||||||||| || || || ||   |||||| ||||  |||||||||||||||||||| | |    
T  20650847 atcttctgcctttactctaatttgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagttgatccatcaaatcatcaatcctc 20650748  T
Q  430 ggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    ||||||||||||| |||||| || || ||||||||||||||    
T  20650747 ggaagtggataccgattcttaattgtcaccttgttcaactg 20650707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 324
Target Start/End: Original strand, 19869823 - 19869976
Alignment:
Q  171 caaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacacca 270  Q
    |||||||||||| ||||| || || |||||  |||| ||| | | |||||| || |  ||||||||||||||||||||||| || || ||||  || |||    
T  19869823 caaaatatcatcaatgaatactacaacgaactgatctaaatacggatggaaaattctgttcatatactccataaacactcctggcgcgttggacactcca 19869922  T
Q  271 aaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttc 324  Q
    |||||||| |||  ||| ||||| |||||||||||  ||||||| || ||||||    
T  19869923 aaaggcatcactgaatactcataatgaccataacgggttctgaaggcagtcttc 19869976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 347 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 23155517 - 23155394
Alignment:
Q  347 taatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctatt 446  Q
    ||||||| ||||| | ||| ||||||||||| || || || ||   |||||| || | ||||||||||||||||||||| | | |||| ||||||| |||    
T  23155517 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacttctgcaccaaccagctgatccatcaaatcatcaatcctcagaagcggataccgatt 23155418  T
Q  447 cttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    ||| || || ||||||||||||||    
T  23155417 cttaatcgtcaccttgttcaactg 23155394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 405 - 470
Target Start/End: Original strand, 16414455 - 16414520
Alignment:
Q  405 ctgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| |||||| || || || |||||||||||    
T  16414455 ctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcactttgttcaactg 16414520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 405 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 21194957 - 21194892
Alignment:
Q  405 ctgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    ||||||||| ||||||||||| | | |||| ||||||| |||||| || || ||||||||||||||    
T  21194957 ctgatccattaaatcatcaatcctcagaagcggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactg 21194892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 357; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 38179 - 37731
Alignment:
Q  23 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 122  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38179 catcaccagaaataacatggccaagaaaacttacctctttcaaccagaactcacacttagataatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 38080  T
Q  123 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||| |||||||||||||||||||||    
T  38079 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaaaacaaccgcgaaccgatccaaaaatgcatggaag 37980  T
Q  223 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 322  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  37979 atgcgatttatatactccataaacactccaggtgcattcgtaacaccgaaaggcataactttatattcatagtgaccataccgcgttctgaaagctgtct 37880  T
Q  323 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 422  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37879 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctgaaaacatgtgcacccactaactaatccatcaaatcatc 37780  T
Q  423 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 471  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  37779 aattctcggaagtggatacctattcttgatagttactttgttcaactga 37731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 32 - 470
Target Start/End: Original strand, 22661 - 23099
Alignment:
Q  32 aaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatctt 131  Q
    |||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||| |  ||||| || |||  ||||||||| ||||||||    
T  22661 aaataacatggccaagaaaacttacctcattcaaccagaactcacactttgacaacttggcatataacttcttttccttcggcacttgcaaaacaatctt 22760  T
Q  132 cagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattc 231  Q
    || ||||||||  ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||  |||||||| | ||||| || || ||||||    
T  22761 caaatgctcagtgtgttcttcttcagacttagagtatatcaaaatatcattgatgaacacaaccacgaagtgatccaaatacgcatgaaaaatacgattc 22860  T
Q  232 atatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatat 331  Q
    || |||||||||||||| || || ||| | |||||| | |||||||| ||   |||||| || || ||||||||  | || || || |||||||||||||    
T  22861 atgtactccataaacacacctggcgcagttgtaacaacgaaaggcatcaccgaatattcgtaatgtccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgcatat 22960  T
Q  332 cttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacgg 431  Q
    | || ||||| |||||||||||||| || |  || ||||||||||| ||||| || | || | |||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||    
T  22961 cctcgtctttcactttaatctggtggtagcccgatctcaaatcaatcttgctaaacagacattcacccactaactgatccatcaaatcatctattcttgg 23060  T
Q  432 aagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    |||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||    
T  23061 aagtggatacctattctttatcgttactttattcaactg 23099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 354; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 354; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 29 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 108164 - 107723
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  108164 cagaaataacatggccaagaaaacttacctctttcaaccagaattcacacttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 108065  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  108064 cttcagatgctcagcatgttcctcttcaatcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaaccgatccaaaaacgcatggaagatgcga 107965  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||    
T  107964 ctcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctatcttctaca 107865  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  107864 tatcctcatcttttactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcttgcacccactaactgatccatcaaatcatccattct 107765  T
Q  429 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  107764 cggaagtggatacctattcttgatagttatcttgttcaactg 107723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 29 - 473
Target Start/End: Original strand, 114512 - 114956
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| || || |||||||| || || || |||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  114512 cagaaataatatggccaagaaaactcacttcatttaaccagaactcgcacttcgacaatttggcatacaatttcttctctttcaatacttgcaatacaat 114611  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
    | ||||||| || ||||| ||||| |||||  | || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || |||  |||||   | ||||| || || | |    
T  114612 catcagatgttctgcatgctcttcctcagttcttgaatagatcaaaatgtcatcaatgaatacaaccacaaatttatccaggtaagcatgaaaaattcta 114711  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||| ||  | || || || ||||||||||    
T  114712 ttcatatattccatgaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggcagtcttctgca 114811  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    | ||||||||||| || || ||||| || |||| ||||| ||| |||||||| || ||||    |||||| || |||||||||||||  || |||||||     
T  114812 tgtcttcatctttcaccttgatctgatggtaacctgaccacaagtcaattttactaaaaatctttgcaccaaccaactgatccatcaggtcgtcaattct 114911  T
Q  429 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactgatg 473  Q
    |||||| ||||| || ||||| || || || || |||||||||||    
T  114912 cggaagaggatatctgttctttatcgtaactttattcaactgatg 114956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #3
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 231 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 95045 - 94805
Alignment:
Q  231 catatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcata 330  Q
    |||||||||||| ||||| || || || || |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||  | || ||||| ||||||||||||    
T  95045 catatactccatgaacacacccggcgcgttagtaacaccgaaaggcatcactttgtattcgtagtgaccatatcgtgtcctaaaagccgtcttctgcata 94946  T
Q  331 tcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacg 430  Q
    |||||||| || ||||||||||| || ||||  |||||||| ||||| ||||| |||||    ||||| || ||||| |||||||| |||||||| | ||    
T  94945 tcttcatccttcactttaatctgatggtaacccgacctcaagtcaatcttgctaaaaactttagcacctaccaactggtccatcaagtcatcaatccgcg 94846  T
Q  431 gaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 471  Q
    |||||||||| |||||||| || || || ||||||||||||    
T  94845 gaagtggatatctattctttattgtaactttgttcaactga 94805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 349; Significance: 0; HSPs: 6)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 349; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 11598 - 11150
Alignment:
Q  23 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 122  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11598 catcaccagaaataacatggccaagaaaacttacttccttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaaatttcttctctttcaacacttgcaa 11499  T
Q  123 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  11498 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgataaacaccaccacgaaccgatccaaaaaggcatggaag 11399  T
Q  223 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  11398 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagttgtct 11299  T
Q  323 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 422  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11298 tctgcatatcttcatctttcactttaatctggtgataccctgatctcaaatcaatcttgctgaaaacttttgcacccactaactgatccatcaaatcatc 11199  T
Q  423 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 471  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11198 aattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 11150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 467
Target Start/End: Original strand, 30829 - 31273
Alignment:
Q  23 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 122  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  30829 catcaccagaaataacatggccaagaaaactgacctctttcaaccagaactcacacttagataatttagcataaagtttcttttcttttaacacctgcaa 30928  T
Q  123 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  30929 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaattaaaatatcttcgatgaaaacaaccacgaactgatccaaaaatgcatggaag 31028  T
Q  223 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31029 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattcataacatcgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 31128  T
Q  323 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 422  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31129 tctgcatatcttcatcttttactttgatctggtgataacctaatctcaaattaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 31228  T
Q  423 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaa 467  Q
    |  || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31229 atatctcggaagtggatacctattcttgatagttactttgttcaa 31273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #3
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 23 - 467
Target Start/End: Original strand, 36294 - 36739
Alignment:
Q  23 catcatcagaaataacatggccaagaaaac-tcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgca 121  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  36294 catcaccagaaataacatggccaacaaaaccttacctctttcaaccagaactcacacttagataatttagcataaagtttcttttcttttaacacctgca 36393  T
Q  122 agacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaa 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||| || ||  |||||||||||||||||||    
T  36394 agacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaataaaaatatcatcaataaaaacaaccacaaaaagatccaaaaatgcatggaa 36493  T
Q  222 gatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtc 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36494 gatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattcataacatcgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtc 36593  T
Q  322 ttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcat 421  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36594 ttctgcatatcttcatcttttactttgatctggtgataacctaatctcaaattaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcat 36693  T
Q  422 caattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaa 467  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  36694 caaatctcggaagtggatacctattcttgatagttactttgttcaa 36739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #4
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 79 - 470
Target Start/End: Original strand, 53638 - 54029
Alignment:
Q  79 ttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatat 178  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || | ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  53638 ttagacaatttcgcataaagcttcttctctttcaacacttgcaaaaccagcttcaaatgctcagcatgttcttcttcagacttggagtaaatcaaaatat 53737  T
Q  179 catcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcat 278  Q
    ||||  |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  53738 catcattgaaaacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatgaaagatgtgattcatgtactccataaatactccaggtgcattcgtaacaccgaaaggcat 53837  T
Q  279 aactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaatt 378  Q
    |||||| || |||||| ||||||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||     
T  53838 aactttgtactcatagggaccataccgtgttcagaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacctgatctcaaatctatc 53937  T
Q  379 ttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  53938 ttgctgaaaacttttgcacccactaactgatccatcaaatcatcaatcctcggaagtggatacctattctttattgtcaccttgttcaactg 54029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #5
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 30 - 245
Target Start/End: Original strand, 50044 - 50259
Alignment:
Q  30 agaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatc 129  Q
    |||||||||||| |||||||| | ||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || | |    
T  50044 agaaataacatgtccaagaaagcccacttctttcaaccaaaattcgcacttagacaatttcgcataaagcttcttctctttcaacacttgcaaaaccagc 50143  T
Q  130 ttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgat 229  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||    
T  50144 ttcaaatgctcaacatgttcttcttcagacttggagtaaatcaaaatatcatcattgaaaacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatgaaagatgtgat 50243  T
Q  230 tcatatactccataaa 245  Q
    |||| |||||||||||    
T  50244 tcatgtactccataaa 50259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #6
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 393 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 13883 - 13805
Alignment:
Q  393 tgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 471  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13883 tgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 13805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 348; Significance: 0; HSPs: 5)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 34 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 86144 - 85709
Alignment:
Q  34 ataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttca 133  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  86144 ataacatggccaagaaaacttacctctttcaaccagaattcacacttagataatttagcataaagtttcttctccttcaacacttgcaagacaatcttca 86045  T
Q  134 gatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcat 233  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  86044 gatgctcaatatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatgtcatcgatgaaaacaaccacaaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcat 85945  T
Q  234 atactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatct 333  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  85944 ttactctataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatct 85845  T
Q  334 tcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaa 433  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  85844 tcatcttttactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttactgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcgtaa 85745  T
Q  434 gtggatacctattcttgatagttaccttgttcaact 469  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  85744 gtggatacctattcttgatagttaccttgttcaact 85709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 31 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 85581 - 85142
Alignment:
Q  31 gaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatct 130  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  85581 gaaataacatgtccaagaaagctcacttctttcaaccagaattcgcacttagacaatttcgcataaagcttcttctctttcaacacttgcaaaacaagct 85482  T
Q  131 tcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgatt 230  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  85481 tcaaatgctcagcatgttcttcttcagacttggaggaaattaaaatatcatcaataaaaacaaccacgaaccgatctaaaaatgcatgaaagatgcgatt 85382  T
Q  231 catatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcata 330  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||    
T  85381 catgtactccataaatactccaggtgcattcgtaacaccgaaaggcataactttgtactcatagtgaccataccgtgttctgaaagctgtcttctgcata 85282  T
Q  331 tcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacg 430  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| || |||||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  85281 tcttcatcttttactttaatctggtgataaccttatctcaaatctatcttgctgaaaacttttgtacccactaactgatccatcaaatcatcaatcctcg 85182  T
Q  431 gaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
     |||||||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  85181 taagtggatacctattctttattgtcaccttgttcaactg 85142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 328 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 132543 - 132401
Alignment:
Q  328 atatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattc 427  Q
    ||||||||| | |||||| ||||||| ||||| | ||| ||||||||||| || || || ||   |||||| || | ||||||||||||||||||||| |    
T  132543 atatcttcagcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaaccagctgatccatcaaatcatcaatcc 132444  T
Q  428 acggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
      ||||||||||||| |||||| || |  || |||||||||||    
T  132443 ttggaagtggataccgattcttaatcgccactttgttcaactg 132401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #4
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 30 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 132841 - 132719
Alignment:
Q  30 agaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatc 129  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||| || ||||| |||||||| || ||| | |  |  ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  132841 agaaatcacatgaccaaggaaactcacttccttcaaccaaaactcacacttagacaacttagcacataactggttctctttcaaaacttgcaacacaatc 132742  T
Q  130 ttcagatgctcagcatgttcttc 152  Q
     ||| |||||||||||| |||||    
T  132741 ctcaaatgctcagcatgctcttc 132719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #5
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 103 - 191
Target Start/End: Original strand, 25853 - 25941
Alignment:
Q  103 ttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacac 191  Q
    ||||| |||||  ||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||  || || || | |||||||||||| ||||||||    
T  25853 ttctccttcaaatcttgcaacacaatcctcaaatgctcagcatgttcttcctcagatttcgaatataccaaaatatcatctatgaacac 25941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 345; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 31 - 471
Target Start/End: Original strand, 16113 - 16553
Alignment:
Q  31 gaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatct 130  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16113 gaaataacatggccaagaaaacttaattctttcaaccagaattcacacttagacaagttagcataaattttcttctctttcaacacttgcaagacaatct 16212  T
Q  131 tcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgatt 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16213 tcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcaataaacacaactacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgatt 16312  T
Q  231 catatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcata 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  16313 catatactccataaacactccaggtgcattggtcacacggaaaggcataactttatattcatagtgaccacaacgcgttctgaaaactgtcttctgcata 16412  T
Q  331 tcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacg 430  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16413 tcttcatctttcactttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctgaaaacttttgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcg 16512  T
Q  431 gaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 471  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16513 gaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 16553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 31 - 470
Target Start/End: Original strand, 2375 - 2816
Alignment:
Q  31 gaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagac-aatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatc 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| |||||| || || |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  2375 gaaataacatggccaagaaaacttaattctttcaaccagaattcacacttagaccaagttagcataaaggttattctctttcaacacttgcaagacaatc 2474  T
Q  130 ttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgat 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2475 ttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgat 2574  T
Q  230 tcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacacca-aaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  2575 tcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccggaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaaactgtcttctgca 2674  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  2675 tatcttcatctttcactttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctaaaaacacgttcacccactaactaatccatcaaatcatcaattct 2774  T
Q  429 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2775 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 2816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 345; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 471
Target Start/End: Original strand, 57962 - 58410
Alignment:
Q  23 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 122  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  57962 catcaccagaaataacatggccaagaaaacttacctctttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttggaa 58061  T
Q  123 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 222  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  58062 gacaatcttcagatgcacagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatgtcatcgataaacacaactacgaactgatccaaaaatgcatggaag 58161  T
Q  223 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 322  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  58162 atgcgattcatataatccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttatattcatagtgaccataccgcgttctgaaagctgtct 58261  T
Q  323 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 422  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||   |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  58262 tctgcatatcttcatctttcactttaatctggtgataacccgacctcaaatcaatcttgctaaaaacttttgcacccactaattgatccatcaaatcatc 58361  T
Q  423 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 471  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  58362 aattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 58410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 29 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 195840 - 195444
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  195840 cagaaatgacatggccaagaaaacttacctctttcaaccagaactcacacttagatagtttagcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaac 195741  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || || ||||||| |||||||||||||||||||    
T  195740 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagacttggagtaaatcaaaatatcatcgataaagacaaccacaaaacgatccagaaatgcatggaagatgcga 195641  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  195640 ttcatatactccataaatacttctggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagccgtcttctgca 195541  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaat 425  Q
    |||||||||| ||||  ||||||||||||||||  || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  195540 tatcttcatcatttatcttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaat 195444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #3
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 23 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 18426 - 17975
Alignment:
Q  23 catcatcagaaataacatggccaagaaaac-tcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgca 121  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18426 catcaccagaaataacatggccaacaaaaccttacctctttcaaccagaactcacacttagataatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgca 18327  T
Q  122 agacaatcttc-agatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatgga 220  Q
    ||||||| ||  ||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||    
T  18326 agacaattttttagatgttcagcatgttcttcttaatacttggagtaaat-aaaatgtcatcaatgaaaacaaccacgaaccgctccaaaaatgcttgga 18228  T
Q  221 agatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgt 320  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| | |    
T  18227 agatgcgattcatgtactacataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgtactgaaagatat 18128  T
Q  321 cttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatca 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18127 cttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacatgatctcaaatcaatcttgctgaaaacttttgcacccactaactgatccatcaaatca 18028  T
Q  421 tcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactgatg 473  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  18027 tcaattctcggtagtggatacctatttttgatagttactttgttcaactgatg 17975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 321; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 55350 - 54902
Alignment:
Q  23 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 122  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  55350 catcaccagaaataacatggccaagaaaacttacctttttcaaccagaactcacacttagataatttagcataaagtttcttctctttaaacacttgcaa 55251  T
Q  123 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |  || ||||| || ||  ||||||||||||||||||||    
T  55250 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtattggagtaaataaaaatatcatccagaaaaacaaccacaaagggatccaaaaatgcatggaag 55151  T
Q  223 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 322  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  55150 atgcgattcaattactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccatatcgtgttctgaaagctgtct 55051  T
Q  323 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 422  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55050 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggttataacctgatctcaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 54951  T
Q  423 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 471  Q
    |||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  54950 aattcttggaagtggatatctattcttgatagttactttgttcaactga 54902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 30 - 469
Target Start/End: Original strand, 109584 - 110023
Alignment:
Q  30 agaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatc 129  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || ||  | |||||||| || ||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  109584 agaaataatatggccaagaaaacttacttcacttaaccagaactcgcattttgacaatttggcatacaacttcttctctttcaatacttgcaatacaatc 109683  T
Q  130 ttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgat 229  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||  || ||||| || |||||||| || |||  ||| | | | |||||||| || || |    
T  109684 ttcagatgttctgcatgctcttcttcagtcttagaataaatcacgatgtcatcaataaacacaaccacaaatttatctagataggcatggaaaattcggt 109783  T
Q  230 tcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcat 329  Q
    ||||| ||||||||||||| | |||  |||| |||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||| ||  | || ||||| |||||||||||    
T  109784 tcatagactccataaacacactaggcacattagtaacaccgaaaggcatcaccttatattcataatgaccatatcgtgtcctaaaagccgtcttctgcat 109883  T
Q  330 atcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcac 429  Q
    ||| ||||| || || |||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |    
T  109884 atcctcatccttcaccttaatctgatggtaaccagacctcaaatcaattttactaaacacacgtgcacccactaactgatccattaaatcgtcaattctc 109983  T
Q  430 ggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaact 469  Q
    ||||| |||||||| ||||| || || ||| |||||||||    
T  109984 ggaagcggatacctgttctttatcgtaaccatgttcaact 110023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 303; Significance: 1e-170; HSPs: 2)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 59 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 51668 - 51258
Alignment:
Q  59 ctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagt 158  Q
    |||||||| |||| ||||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  51668 ctttcaactagaactcacacttagatagtttagcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatcttcttcttcagt 51569  T
Q  159 cttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgca 258  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||  ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  51568 cttggagtaaatcaaaatgtcatcgatgaaaacaaccacaaagtgatccaaaagtgcatgaaagatgcgattcatatactccataaatactcgaggtgca 51469  T
Q  259 ttggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgat 358  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  51468 ttggtaacaccaaaaggcatgactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttaccttaatctggtgat 51369  T
Q  359 aacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttac 458  Q
    |||  || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51368 aacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttac 51269  T
Q  459 cttgttcaact 469  Q
     ||||||||||    
T  51268 tttgttcaact 51258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102; HSP #2
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 29 - 471
Target Start/End: Original strand, 41650 - 42091
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    |||| |||| ||||||||||||||| || ||    |||||||||||||| || ||||  ||| |||| |  ||||| |||| |||||||||||| |||||    
T  41650 cagatataatatggccaagaaaacttacttcgcgtaaccagaattcacacttggacagcttgtcatacaacttcttttctt-caacacttgcaacacaat 41748  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||| |||| || ||||| || || ||||| || |||||||| || |||  ||||| | | ||||| || || |      
T  41749 cttcagatgctctgcatgctcttcttcattcttagaataaattaagatgtcatcaataaacacaaccacaaatttatccatataagcatgcaaaattctg 41848  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||||||  | || || || || |||||||    
T  41849 ttcatatactccataaacacaccaggcgcattagtaactccgaaaggcatcaccttatattcatagtgaccataacgtgtcctaaaggccgtattctgca 41948  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    |||| ||||| || || |||||||| || |||| |||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  41949 tatcctcatccttcaccttaatctgatggtaacctgacctcaaatcaattttactaaacacacgagcacccactaactgatccattaaatcatcaattct 42048  T
Q  429 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 471  Q
    ||||||||||||||| ||||| || || || || |||||||||    
T  42049 cggaagtggatacctgttcttaatcgtcactttattcaactga 42091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 289; Significance: 1e-162; HSPs: 2)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 23 - 467
Target Start/End: Original strand, 35973 - 36417
Alignment:
Q  23 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 122  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  35973 catcaccagaaataacatggccaagaaaacttacttctttcatccagaactcacacttagataatttagcataaagtttcttctctattaacacttgcaa 36072  T
Q  123 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||    
T  36073 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttagagtaaattaaaatatcatcaatgaaaacaaccacaaatcgatccaaaaatgcatgaaag 36172  T
Q  223 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 322  Q
    ||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  36173 atgtgattcatgtactccataaatactccaggtgcattcgtaacaccgaaaggcataactttatactcatagtgaccataccgcgttctgaaagctgtct 36272  T
Q  323 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 422  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || |||||||||||   |  ||||||||||||||||||||||||||     
T  36273 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacctgatctcaaatctatcttgctgaaaacttttcaacccactaactgatccatcaaatcatt 36372  T
Q  423 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaa 467  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| || || |||||||||||    
T  36373 aattctcggaagtggatacctattctttattgtcaccttgttcaa 36417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #2
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 23 - 467
Target Start/End: Original strand, 20549 - 20993
Alignment:
Q  23 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 122  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  20549 catcaccagaaataacatggccaagaaaacttacttctttcatccagaactcacacttagataatttagcataaagtttcttctctcttaacacttgcaa 20648  T
Q  123 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||    
T  20649 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttagagtaaattaaaatatcatcaatgaaaacaaccacaaatcgatccaaaaatgcatgaaag 20748  T
Q  223 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 322  Q
    ||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| || |||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  20749 atgtgattcatgtactccataaatactccaggtgcattcgtaacaccgaaaggcatatctttgtactcatagtgaccataccgcgttctgaaagctgtct 20848  T
Q  323 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 422  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || |||||||||||   |  ||||||||||||||||||||||||||     
T  20849 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacctgatctcaaatctatcttgctgaaaacttttcaacccactaactgatccatcaaatcatt 20948  T
Q  423 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaa 467  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| || || |||||||||||    
T  20949 aattctcggaagtggatacctattctttattgtcaccttgttcaa 20993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0055 (Bit Score: 280; Significance: 1e-156; HSPs: 1)
Name: scaffold0055
Description:

Target: scaffold0055; HSP #1
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 127 - 470
Target Start/End: Original strand, 21296 - 21639
Alignment:
Q  127 atcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgc 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||    
T  21296 atcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacaaaccgatccaaaaatgcatggaagatgc 21395  T
Q  227 gattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctg 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21396 gattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtaaccataacgcgttctgaaagctgtcttctg 21495  T
Q  327 catatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaatt 426  Q
    ||| ||| |||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21496 catctctccatcctttactttaatctggtgatatcctgacctcaaatcaatcttgctaaaaacacgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaatt 21595  T
Q  427 cacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21596 ctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 21639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 278; Significance: 1e-155; HSPs: 1)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 29 - 470
Target Start/End: Original strand, 3385 - 3826
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| || |     
T  3385 cagaaataacatggccaagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagataatttagcataaagtttcttctctttcaacaattgcaaaaccag 3484  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||    
T  3485 cttcaaatgctcagcatgttcttcttcagagttggagtaaatcaaaatatcatcaatgaaaacaaccacaaaacgatccaaaaatgcatgaaagatgcga 3584  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||  || |||||||||||||||||||||    
T  3585 ttcatgtactccataaatactccaggtgaattagtaacaccgaaaggcataactttatactcataatgtccatactgcgttctgaaagctgtcttctgca 3684  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||  || |||| ||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  3685 tatcttcatctttcactttaatctggtgataacccgatctcagatctatcttgctgaaaacacttgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattct 3784  T
Q  429 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    || |||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  3785 cgaaagtggatacctattctttattgttactttgttcaactg 3826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 271; Significance: 1e-151; HSPs: 5)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 32 - 470
Target Start/End: Original strand, 40588 - 41026
Alignment:
Q  32 aaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatctt 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  40588 aaataacatggccaagaaaactcacctctttcaaccagaattcacacttagataatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgcaaaacagtctt 40687  T
Q  132 cagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattc 231  Q
    || |||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||    
T  40688 caaatgctcagcatgatcttcctcggtcttggagtaaattaaaatgtcatcaatgaaaaaaaccacgaaacgatccaaaaatgcatgaaaaatgcgattc 40787  T
Q  232 atatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatat 331  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  40788 atgtactccataaatactccaggtgcatttgtaacaccgaaaggcatcactttatactcataatgtccatatcgcattctaaaagctgtcttctgcatat 40887  T
Q  332 cttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacgg 431  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||||||  || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  ||    
T  40888 ctttatctttcactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaagtcatcagttcttgg 40987  T
Q  432 aagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    |||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  40988 aagtggatacctattctttattgttactttgttcaactg 41026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 32 - 470
Target Start/End: Original strand, 74308 - 74746
Alignment:
Q  32 aaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatctt 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  74308 aaataacatggccaagaaaactcacctctttcaaccagaattcacacttagataatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgcaaaacagtctt 74407  T
Q  132 cagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattc 231  Q
    || |||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||    
T  74408 caaatgctcagcatgatcttcctcggtcttggagtaaattaaaatgtcatcaatgaaaaaaaccacgaaacgatccaaaaatgcatgaaaaatgcgattc 74507  T
Q  232 atatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatat 331  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  74508 atgtactccataaatactccaggtgcatttgtaacaccgaaaggcatcactttatactcataatgtccatatcgcattctaaaagctgtcttctgcatat 74607  T
Q  332 cttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacgg 431  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||||||  || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  ||    
T  74608 ctttatctttcactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaagtcatcagttcttgg 74707  T
Q  432 aagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    |||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  74708 aagtggatacctattctttattgttactttgttcaactg 74746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 29 - 449
Target Start/End: Original strand, 55708 - 56128
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  55708 cagaaataacatgtccaagaaaactcacctctttcaaccagaattcacactttgataatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgcaaaacagt 55807  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || ||| ||    
T  55808 cttcaaatgctcaacatgttcttcctcagtcttggagtaaatcaaaatgtcatcaatgaaaacaaccacgaaacgatcaaaaaatgcatgaaaaatgtga 55907  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||| |||| |||| |||||||||||    
T  55908 ttcatgtactccataaacactccaggggcatttgtaacaccgaaaggcatcactttatactcataatgtccatatcgcgttctaaaagttgtcttctgca 56007  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  56008 tatcttcatctttcactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgttaaacacacgtgcacccactaactgatccatcaagtcatcaattct 56107  T
Q  429 cggaagtggatacctattctt 449  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  56108 cggaagtggatacctattctt 56128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #4
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 9178 - 9017
Alignment:
Q  30 agaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatc 129  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||| || ||||| ||||| || ||  || | |  |  ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  9178 agaaatcacatgaccaaggaaactcacttccttcaaccaaaactcacacttagataacttaacacataactagttctctttcaatacttgcaacacaatc 9079  T
Q  130 ttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacac 191  Q
     ||| |||||||||||| ||||| |||| ||| || || | |||||||||||| ||||||||    
T  9078 ctcaaatgctcagcatgctcttcctcagactttgaatacaccaaaatatcatctatgaacac 9017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #5
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 394 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 8814 - 8738
Alignment:
Q  394 gcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| |||||| ||||| |  |||||||||||    
T  8814 gcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatagtcaaattgttcaactg 8738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0256 (Bit Score: 269; Significance: 1e-150; HSPs: 1)
Name: scaffold0256
Description:

Target: scaffold0256; HSP #1
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 29 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 23427 - 23095
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23427 cagaaataacatggccaagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagacagtttggcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaat 23328  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||    
T  23327 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagttttggagtaaatcaaaatgtcgtcgataaacacaactactaaccgatccaaaaatgcatggaagatgtga 23228  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  23227 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccgaaaggcataactttgtactcatagtgaccataacgcgttctgaacgctgtcttctgca 23128  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataac 361  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23127 tatcttcatcttttactttaatctggtgataac 23095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 266; Significance: 1e-148; HSPs: 2)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 29 - 470
Target Start/End: Original strand, 16594 - 17035
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||| || |     
T  16594 cagaaataacatgtccaagaaagctcacttctttcaaccagaattcgcaattagacaatttcgcataaagcttcttctctttcaacacttacaaaaccag 16693  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || || || ||||| |||||||||| |||||| |||||||||    
T  16694 cttcaaatgctcagcatgttcttcttcagacttggagtaaatcaaaatatcatcgataaaaaccaccacgaaccgatccaaaagtgcatgaaagatgcga 16793  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  16794 ttcatgtactccataaatactcctggtgcatttgtaacaccgaaaggcataactttgtactcataatgaccataccgcgttctgaaagctgtcttctgca 16893  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||| || |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  16894 tatcttcacctttcactttaatctggtgataacctgatctcaaatctatcttgctgaaaacttttgcacccactaactgatccatcaaatcatcaatcct 16993  T
Q  429 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  16994 cggaagtggatacctattctttattgtcaccttgttcaactg 17035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309; HSP #2
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 29 - 449
Target Start/End: Original strand, 11746 - 12167
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |  ||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |  ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  11746 cagaaataatatggccaagaaaacttaattcactcaaccagaattcacatttggacaacttggcatacaacttcttttctttcaacacttgcaatacaat 11845  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||| |||| || ||||| |  |||||||| || |||||||| || |||  ||||| | | ||||| || || |      
T  11846 cttcagatgctctgcatgctcttcttcattcttagaataaattaggatatcatcaataaacacaaccacaaatttatccagataggcatgaaaaattctg 11945  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||  | || || || ||||||||||    
T  11946 ttcatatactccataaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttatattcatagtgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgca 12045  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaa-tcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattc 427  Q
    |||| ||||| || || |||||||| || |||| |||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  12046 tatcctcatccttcaccttaatctgatggtaacctgacctcaaattcaattttactaaacacacgtgcacccactaattgatccattaaatcgtcaattc 12145  T
Q  428 acggaagtggatacctattctt 449  Q
     ||||||||||||||| |||||    
T  12146 tcggaagtggatacctgttctt 12167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 266; Significance: 1e-148; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 29 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 25298 - 24857
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || |     
T  25298 cagaaataacatatccaagaaaactcaattctttcaaccagaattcacacttagataatttagcataaagtttcttatctttcaacacttgcaaaaccag 25199  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| || || || | ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  25198 cttcaaatgctcagcatgttcttcctcaatcttggagtaaatcaaaatatcgtcaataaaaagaaccacgaaacgatccaaaaatgcatgaaagatgcga 25099  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25098 ttcatgtactccataaacacttcaggtgcatttgtaacaccgaaaggcatcactttatattcatattgtccataacgcgttctgaaagctgtcttctgca 24999  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||  || ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  24998 tatcatcatctttcactttaatctggtgataacccgatctcaagtcaatcttgctgaaaacacttgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattat 24899  T
Q  429 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||    
T  24898 cggaagtggatacctattctttatcgttattttgttcaactg 24857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 266; Significance: 1e-148; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 29 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 7440 - 6999
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  7440 cagaaataacatggccaagaaaactcacctcattcaaccagaattcacactttgacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgcaaaacagt 7341  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||| |||    
T  7340 cttcaaatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaaccaaaatgtcatcgatgaatacaaccatgaaacgatccaaaaatgcatgaaagattcga 7241  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || | ||| |||||||| ||||| || ||||||||| |||| |||| |||||||||||    
T  7240 ttcatgtactccataaacacaccaggtgcatttgtaacaccgaacgacatcactttatactcataatgtccataacgcgttctaaaagttgtcttctgca 7141  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  7140 tatctccatctttcactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctaaacacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcgtcaattct 7041  T
Q  429 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
     |||||||||||||||||||| || || || ||||| |||||    
T  7040 tggaagtggatacctattctttatcgtcactttgtttaactg 6999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 266; Significance: 1e-148; HSPs: 4)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 29 - 470
Target Start/End: Original strand, 151063 - 151504
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    ||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| || |     
T  151063 cagaaattacatgtcctagaaagctcacttctttcaaccagaattcgcacttagacaatttcgcataaagcttattctctttcaacacttgcaacaccag 151162  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  151163 cttcaaatgctcagcatgttcttcttcagacttggagtaaattaaaatattatcgataaaaacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatgaaagatgcga 151262  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| |||||||  ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  151263 ttcatgtactccataaatactccaagtgcattcataacaccgaaaggcataactttgtactcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgca 151362  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| || |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  151363 tatcttcatcttttactttaatctggtgataaccagatctcaaatctatcttgctgaaaacttttgcacccactaactgatccatcaaatcatcaatcct 151462  T
Q  429 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  151463 cggaagtggatacctattctttattgtcaccttgttcaactg 151504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 30 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 2857 - 2417
Alignment:
Q  30 agaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatc 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||    
T  2857 agaaataacatggccaagaaaactcatctctttcaaccagaattcacactttgataatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgcaaactagtc 2758  T
Q  130 ttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgat 229  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||    
T  2757 ttcaaatgctcagcatgttcttcctcagacttggagtaaatcaaaatatcatcaatgaatacaaccacgaaacgatccaaaaatgcatgaaaaatgcgat 2658  T
Q  230 tcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcat 329  Q
    |||| |||||||||||||| ||| | || || ||||||||| ||||||| |||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||| |||||||||||    
T  2657 tcatgtactccataaacacaccaagcgcgtttgtaacaccagaaggcatcactttatactcataatgtccataacgcgttctaaaagccgtcttctgcat 2558  T
Q  330 atcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcac 429  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||  || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||| |    
T  2557 atcttcatctttcactttaatatggtgataaccggatctcaaatcaatcttgctaaacacacgtgcacccactaattcatccatcaagtcatcaattctc 2458  T
Q  430 ggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  2457 ggaagtggatacctattctttatcgttactttgttcaactg 2417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 29 - 399
Target Start/End: Original strand, 86722 - 87091
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| || || |||||||||||||| || || || || | |||||| |  || ||||| |||| ||||||||| ||| |    
T  86722 cagaaataatatggccaagaaaacttacttcgttcaaccagaattcgcacttcgataactaggcatataacttattctccttcagcacttgcaaaacatt 86821  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
    ||| | |||||| |||||||| || || ||||| ||||| || | ||| ||||| || |||| ||| || ||||||| |||| | ||||| || ||  ||    
T  86822 cttaa-atgctcggcatgttcctcctcggtcttagagtatattagaatctcatctataaacataacaacaaatcgattcaaataagcatgaaaaatatga 86920  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||| |    |||||  || || || |||||  | || || || |||||||| |    
T  86921 ttcatatattccataaacactccaggggcgttagtaacaccgaaaggcatcatcgaatatttgtaatgtccgtaacgtgtcctaaaggccgtcttctgaa 87020  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcaccc 399  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||||||||| |  || || |||||||| || ||||| ||||||||||||    
T  87021 tatcctcatctttcactttgatctggtgatagcccgatcttaaatcaatcttactgaacacacgtgcaccc 87091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 23 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 27765 - 27725
Alignment:
Q  23 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttc 63  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  27765 catcaccagaaataacatggccaagaaaacttacctctttc 27725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 265; Significance: 1e-147; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 32 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 1126 - 691
Alignment:
Q  32 aaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatctt 131  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || | |||    
T  1126 aaataacatgtccaagaaagctcacttctctcaaccagaattcacacttagacaatttcgcataaagcttcttctctttcaacacttgcaaaaccagctt 1027  T
Q  132 cagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattc 231  Q
    || ||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1026 caaatgctcagcatgttcttc---agacttggagtaaatcaaaatatcatcaatgaaaacaaccacgaaacgatccaaaaatgcatgaaagatgcgattc 930  T
Q  232 atatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatat 331  Q
    || ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| || ||||| || ||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  929 atgtactccataaatactctaggtgcatttgtaacaccgaacggcatcaccttatactcataatgtccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatat 830  T
Q  332 cttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacgg 431  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  829 cttcatctttcactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaacacgttcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcttgg 730  T
Q  432 aagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  729 aagtggatacctattctttattgttaccttattcaactg 691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 262; Significance: 1e-146; HSPs: 2)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 29 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 8012 - 7571
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |     
T  8012 cagaaataacatgtccaagaaagctcactcctttcaaccagaattcatacttagacaatttcgcataaagcttcttctctttcaacacttgcaaaaccag 7913  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || || ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  7912 cttcaaatgctcaacatgttcttcttcagacttggagtaaatcaaaatatcatcaataaaaacaactatgaaccgatccaaaaatgcatgaaagatgcga 7813  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| || ||||||| | |||||||||| ||||||||||    
T  7812 ttcatgtactccataaatactccaggtgcatttgtaacaccgaaaggcataactttgtactcataatgtccataacccgttctgaaagcagtcttctgca 7713  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||  || |||||||| || ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  7712 tatcttcatctttcactttaatctggtgataacccgatctcaaatctatcttgctgaaaacatttgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattct 7613  T
Q  429 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
     | |||||||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  7612 tgaaagtggatacctattctttattgtcaccttgttcaactg 7571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647; HSP #2
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 29 - 470
Target Start/End: Original strand, 2852 - 3293
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    ||||||||| ||||||| | |||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||  ||||| |  ||||||||||||| ||||||||| | |||    
T  2852 cagaaataatatggccacggaaactcacctcattcaaccagaattcacactttgacaattgagcatataacttcttctctttcagcacttgcaaaataat 2951  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||| || || |||    
T  2952 cttcaaatgttcagcatgttcttcttcagacttagattatatcaaaatatcatcgatgaacacaaccacgaaacgatccaaataagcatgaaaaatacga 3051  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    ||||| || |||||||| || || |||||||| |||||||| |||||||| |||  |||||  || || || |||||  | || || ||  |||||||||    
T  3052 ttcatgtattccataaatacacccggtgcattagtaacaccgaaaggcatcactgaatatttgtaatgtccgtaacgtgtcctaaaggccatcttctgca 3151  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||| |  || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  3152 tatcctcatctttcactttaatctggtgatagcccgatctcaaatcaatcttgctaaacacacgtgcacccactaattgatccatcaaatcatcaattct 3251  T
Q  429 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
     |||||||| ||||||||||| || || || || ||||||||    
T  3252 tggaagtgggtacctattctttatcgtcactttattcaactg 3293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0319 (Bit Score: 262; Significance: 1e-146; HSPs: 1)
Name: scaffold0319
Description:

Target: scaffold0319; HSP #1
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 29 - 469
Target Start/End: Original strand, 719 - 1157
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |     
T  719 cagaaataacatgtccaagaaagctcacttctttcaaccagaattcacccttagacaatttcgcataaaggttcttctctttcaacacttgcaaaaccag 818  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  819 cttcaaatgctcagcatgttcttcttcagacttgaagtaaatcaaaatatcatcgataaaaacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatgaaagatgcga 918  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||||| || ||||| ||||| || ||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  919 ttcatgtactccataaatactccaggcgcatttgtaacaccgaacggcatcaccttatactcataatggccataccgcgttctgaaagctgtcttctgca 1018  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| || |||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |     
T  1019 tatcttcatcttttactttaatctggtgataac--gatctcaaatctatcttgctgaaaacttttgcacccaccaactgatccatcaaatcatcaatact 1116  T
Q  429 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaact 469  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  1117 cggaagtggatacctattcttgattgtcaccttgttcaact 1157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 262; Significance: 1e-146; HSPs: 2)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 29 - 470
Target Start/End: Original strand, 7973 - 8414
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |     
T  7973 cagaaataacatgtccaagaaagctcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttcgcataaagcttcttctctttcaacacttgcaaaactag 8072  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||    
T  8073 cttcaaatgcttagcatgttcttcttcagacatggagtaaatcaaaatatcatcaatgaaaacaaccacaaaacgatccaaaaatgcatgaaagatgcga 8172  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||| ||||| |  ||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  8173 ttcatgtactccataaatactccaggtgcatttgtaacaccgaacggcatcaccttatactcataatctccataacgcgttctgaaaactgtcttctgca 8272  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||  || |||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  8273 tatcttcatctttcactttaatctggtgataacccgatctcaaatctatcttgctgaaaacacttgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattct 8372  T
Q  429 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    ||||||||||||||||||||| || || || || ||||||||    
T  8373 cggaagtggatacctattctttattgtcactttattcaactg 8414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 406 - 470
Target Start/End: Original strand, 24506 - 24570
Alignment:
Q  406 tgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    |||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||| |||||| || || ||||||||||||||    
T  24506 tgatccatcaaatcatcaatccttggaagcggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactg 24570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2004 (Bit Score: 260; Significance: 1e-144; HSPs: 1)
Name: scaffold2004
Description:

Target: scaffold2004; HSP #1
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 29 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 1162 - 725
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |     
T  1162 cagaaataacatgtccaagaaaactcacctctttcaaccagaattcacacttagataatttagcataaagcttcttctctttcaacacttgcaaaaccag 1063  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| || ||  |||||||||||||||| |||||||||    
T  1062 cttcaaatgctcagcatgttcttcttcagacttggagtaaatcaaaataccatctatgaaaacaaccacaaactgatccaaaaatgcatgaaagatgcga 963  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||    
T  962 ttcatgtactccataaacactccaggtgcatttgtaacaccgaaaggcatcactttatattcatagtgaccataccgcgttctaaaagctgtcttctgca 863  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  ||   ||||   |||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  862 tatcttcatctttcactttaatcttctg--cactt--tctcaaatctatcttgctgaaaacacttgcacccactaactaatccatcaaatcatcaattct 767  T
Q  429 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||    
T  766 cggaagtggatacctattctttattgttacttttttcaactg 725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0312 (Bit Score: 258; Significance: 1e-143; HSPs: 1)
Name: scaffold0312
Description:

Target: scaffold0312; HSP #1
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 29 - 470
Target Start/End: Original strand, 12 - 453
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |     
T  12 cagaaataacatgcccaagaaagctcacttcttttaaccagaattcacacttagataatttcgcataaagcttcttctctttcaacacttgcaaaaccag 111  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  112 cttcaaatgctcagcatgttcttcttcagacttggagtaaatcaaaatatcatcaatgaaaacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatgaaagatgcga 211  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
     |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||| |||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  212 atcatgtactccataaatactccaggtgcattcgtaacaccgaaaggcataaccttgtactcatagtgagcataccgcgttctgaaggctgtcttctgca 311  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| || |||||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||| |     
T  312 tatcttcatcttttactttaatatggtgataacctgatctcaaatctatcttgctgaaaacttttgcacccactaactgatccatcaagtcatcaatcct 411  T
Q  429 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
     |||||| ||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  412 tggaagttgatacctattctttattgtcaccttgttcaactg 453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0575 (Bit Score: 257; Significance: 1e-143; HSPs: 1)
Name: scaffold0575
Description:

Target: scaffold0575; HSP #1
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 29 - 469
Target Start/End: Original strand, 3534 - 3974
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||  || |||||||||||||||| ||| ||| |    
T  3534 cagaaataacatgtctaagaaaactcacctctttcaaccataattcacactttgacaatttagcataaaactttttctctttcaacacttccaaaacagt 3633  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||    
T  3634 cttcaaatgctcagcatgttcttcctcagtcttggagtaaatcaaaatgtcatcaatgaaaacaaccacgaaacgatccaaaaatgcatgaaaaatgcga 3733  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    ||||  ||||||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  3734 ttcacgtactccataaacacagcaggtgcatttgtaacaccgaaaggcatcactttatattcatagtgtccataacgcgttctaaaagctgtcttctgca 3833  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||  || |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  3834 tatcttcatctttcactttaatatggtgataacccgatctcaaatctatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaagtcatcaattct 3933  T
Q  429 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaact 469  Q
     ||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||    
T  3934 tggaagtggatacctattttttatcgttactttgttcaact 3974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 254; Significance: 1e-141; HSPs: 1)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 29 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 13564 - 13123
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |     
T  13564 cagaaataacatgtccaagaaagctcacttcttttaaccagaattcgcacttagacaatttcgcataaagcttcttctctttcaacacttgcaaaaccag 13465  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  | ||  |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  13464 cttcaaatgctcatcatgttcttcttcagacttggagtaaatcaaaatatcatcttttaaatcaaccacgaaccgatccaaaaatgcatgaaagatgcga 13365  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||    
T  13364 ttcatgtactccataaatactccacgtgcattcgtaacaccaaaaggcataactttgtactcatagtgaccataccgtgttctgaaagttgtcttctgca 13265  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||  || |||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  13264 tatcttcatctttcactttaatctggagataacccgatctcaaatctattcttctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaagtcatcaattct 13165  T
Q  429 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
     |||||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||    
T  13164 tggaagtggatacttattctttatcgttactttgttcaactg 13123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1602 (Bit Score: 252; Significance: 1e-140; HSPs: 1)
Name: scaffold1602
Description:

Target: scaffold1602; HSP #1
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 29 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 420 - 1
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  420 cagaaataacatggccaagaaaactcacctcattcaaccagaattcacactttgacaatttagcataaagcttcttctctttcaacacttgcaacacagt 321  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||    
T  320 cttcaaatgctcagcatgttcttcctcagtcttggagtaaatcaaaatgtcatcaatgaaaacaaccacgaaacgatccaaaaatgcatgaaaaatgcga 221  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||| ||||| || ||||||| | |||| ||||||||||||||||    
T  220 ttcatgtactccatcaacacaccaggtgcatttgtaacaccgaacggcatcacgttatactcataatgtccataacacgttctaaaagctgtcttctgca 121  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||  || ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  120 tatcttcatctttcactttaatctggtgataacccgatctcaagtcaatcttgctgaacacgcgtgcacccactaactgatccatcaagtcatcaattct 21  T
Q  429 cggaagtggatacctattct 448  Q
     |||||||||||||||||||    
T  20 tggaagtggatacctattct 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 250; Significance: 1e-139; HSPs: 2)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 29 - 470
Target Start/End: Original strand, 8002 - 8443
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |     
T  8002 cagaaataacatatccaagaaagctcacttctttcaaccagaattcgcacttagacaatttcgcataaagcttcttctctttcaacacttgcaaaaccag 8101  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
    ||||| ||||||| ||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||    
T  8102 cttcaaatgctcaacatattcttcctcaaacttggagtaaatcaaaatatcatcaatgaaaacaagcacgaaccgatccaaaaatgcatgaaagatgtga 8201  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||    
T  8202 ttcatatactccataaatactccaggtgcattcgtaacaccgaaaggcataactttgtactcatagtgaccatactgcgttctgaaagctgtcttctgca 8301  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || |||||||||||   |||||||||||| |||||||||||||||||||| |     
T  8302 tatcttcatcctttactttaatctggtgataacctgatctcaaatctatcttgctgaaaacttttgcacccactaattgatccatcaaatcatcaatcct 8401  T
Q  429 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    || |||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||    
T  8402 cgaaagtggatacctattctttattgacaccttgttcaactg 8443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358; HSP #2
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 29 - 470
Target Start/End: Original strand, 17198 - 17639
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |     
T  17198 cagaaataacatatccaagaaagctcacttctttcaaccagaattcgcacttagacaatttcgcataaagcttcttctctttcaacacttgcaaaaccag 17297  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
    ||||| |||||||  || |||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  | ||| ||||||||||||||||| |||||| ||    
T  17298 cttcaaatgctcaaaatattcttcatcaaacttggagtaaatcaaaatatcatcaatgaaaacaagcaagaaccgatccaaaaatgcatgaaagatgtga 17397  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||    
T  17398 ttcatatactccataaatactccaggtgcattcgtaacaccgaaaggcataactttgtactcatagtgaccatactgcgttctgaaagctgtcttctgca 17497  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || |||||||||||   |||||||||||| |||||||||||||||||||| |     
T  17498 tatcttcatcctttactttaatctggtgataacctgatctcaaatctatcttgctgaaaacttttgcacccactaattgatccatcaaatcatcaatcct 17597  T
Q  429 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    || |||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||    
T  17598 cgaaagtggatacctattctttattgacaccttgttcaactg 17639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 250; Significance: 1e-139; HSPs: 1)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 29 - 470
Target Start/End: Original strand, 20191 - 20632
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    |||||||| |||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |     
T  20191 cagaaatagcatgtccaagaaagctcaattctttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgcaaaaccaa 20290  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||  ||    
T  20291 cttcaaatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcaataaaaacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatgaaagatatga 20390  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || ||||| || ||||| ||||| || ||||| ||| ||||||||| |||||||||||    
T  20391 ttcatgtactccataaacactctaggtgcatttgtaacaccgaacggcatcaccttatactcataatgtccataccgcgttctgaaagttgtcttctgca 20490  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||| || ||||||||||     
T  20491 tatcttcatctttcactttaatctgttgataacctgatctcaagtcaatcttgctgaaaacactagcacccactaactgatccattaagtcatcaattct 20590  T
Q  429 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
     |||||||||||||||||||| || || || |||||||||||    
T  20591 tggaagtggatacctattctttattgtcactttgttcaactg 20632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 249; Significance: 1e-138; HSPs: 3)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 30 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 24885 - 24445
Alignment:
Q  30 agaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatc 129  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || || ||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24885 agaaataacatggccaagaaaacttacctctttcaaccagaattcacactttgataatttagcatataacttcttctctttcaacacttgcaaaacaatc 24786  T
Q  130 ttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgat 229  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| || || ||||    
T  24785 ttcaaatgctcagcatgttcttcttcagtcttcgagtatatcaaaatatcatcgatgaacacaaccacgaaacgttccaaaaatgcatgaaaaatacgat 24686  T
Q  230 tcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcat 329  Q
    |||| |||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||| |||| ||||| |||||||||||    
T  24685 tcatgtactccataaacacacctggcgcatttgtaacaccgaaaggcatcactttatattcataatgtccataacgcgttctaaaagccgtcttctgcat 24586  T
Q  330 atcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcac 429  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||      
T  24585 atcttcatctttcactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctaaacacacgtgcacccactaattgatccattaagtcgtcaattctt 24486  T
Q  430 ggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||    
T  24485 ggaagtggatacctattctttatcgttactttattcaactg 24445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 29 - 471
Target Start/End: Original strand, 150522 - 150964
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    |||||||||  |||||||||||||| || ||  | |||||||||||||| || ||||| |||||||| |  ||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  150522 cagaaataatgtggccaagaaaacttacctcacttaaccagaattcacactttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatacttgcaatacaat 150621  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
    ||||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || ||  |||| | ||||  |||||   | |||||||| || ||     
T  150622 cttcagatgttctgcatgctcttcttcagtcttagaataaatcaaaatgtcatcaataaattcaaccatgaatttatccaggtaagcatggaaaattcgg 150721  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |   | || || || ||||||||||    
T  150722 ttcatatactccatgaacacactaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcactttatattcatagtgtccatatcatgtcctaaaggccgtcttctgca 150821  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    |||| ||||| || || |||||||| || |||| ||||||||| ||||| || || || |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |     
T  150822 tatcctcatccttcaccttaatctgatggtaacctgacctcaagtcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaagtcatcaatcct 150921  T
Q  429 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 471  Q
    ||||||||||||||| ||||| || || || ||||||||||||    
T  150922 cggaagtggatacctgttctttattgtaactttgttcaactga 150964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 29 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 194057 - 193949
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| ||  | |||||||| ||||| || ||||| || |||||    ||||| |||||||| ||||| || |||||    
T  194057 cagaaataatgtggccaagaaaactcacttcacttaaccagaactcacacttcgacaacttagcatacgacttcttttctttcaaaacttgtaacacaat 193958  T
Q  129 cttcagatg 137  Q
    | |||||||    
T  193957 cctcagatg 193949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676 (Bit Score: 247; Significance: 1e-137; HSPs: 1)
Name: scaffold0676
Description:

Target: scaffold0676; HSP #1
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 23 - 389
Target Start/End: Original strand, 7961 - 8327
Alignment:
Q  23 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 122  Q
    ||||| |||||||||||||||| | |||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7961 catcaccagaaataacatggcccataaaacttacctctttcaaccagaactcacatttagataatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 8060  T
Q  123 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 222  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| | ||| ||||||||||| |||||||||    
T  8061 gacaatcttcagatgttcagcatgttcctcctcagttttgaagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaacaatgaaccgatccaaaaaggcatggaag 8160  T
Q  223 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 322  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8161 atgtgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttatattcatagtgaccataaagcattctgaaagctgtct 8260  T
Q  323 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaac 389  Q
    |||||||||||||||| || |||||||| |||||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  8261 tctgcatatcttcatccttcactttaatatggtgataccctgatctcaaatcaatcttgctgaaaac 8327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 246; Significance: 1e-136; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 29 - 470
Target Start/End: Original strand, 7174 - 7615
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |     
T  7174 cagaaataacatgtccaagaaaactcacttcttttaaccagaattcacacttagacaatttcgcataaagtttcttctctttcaacacttgcaaaaccaa 7273  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||    
T  7274 cttcaaatgctcaacatgttcttcctcggtcttggagtaaatcaaaatatcatcaataaaaacaaccacgaaccgatctaaaaatgcatgaaagatacga 7373  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || | ||| || ||||| ||||| || ||||| | | ||||||| |||||||||||||    
T  7374 ttcatgtactccataaacactctaggtgcatttgtaacaccgaacgacatcaccttatactcataatgtccataccacgttctgaacgctgtcttctgca 7473  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| ||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||||| |     
T  7474 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaagtcaatcttgctgaaaacattagcacccactaactgatccatcaagtcatcaatcct 7573  T
Q  429 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  7574 cggaagtggatacctattctttatcgttactttgttcaactg 7615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 245; Significance: 1e-136; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 30 - 470
Target Start/End: Original strand, 8326 - 8765
Alignment:
Q  30 agaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatc 129  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||||||| || | |    
T  8326 agaaataacatgtccaagaaagctcacttctttcaaccagaattcgcacttagacaatttcgcataatgcttcttttctttcaacacttgcaaaaccagc 8425  T
Q  130 ttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgat 229  Q
    |||| |||||||| ||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8426 ttcaaatgctcagaatgttcttccttagacttggagtaaatcaaaatatcatcgataaaaacaaccacgaaacgatccaaaaatgcatgaaagatgcgat 8525  T
Q  230 tcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcat 329  Q
    |||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||    
T  8526 tcatgtactccataaatactacaggtgcattcgtaacaccgaaaggcataactttgtactcatagtgaccataacgcgttatgaaagatgtcttctgcat 8625  T
Q  330 atcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcac 429  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || |||||| ||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||| | |    
T  8626 atcttcatcttttactttaatctggtgataacctgatctcaaatctatcttgctg-aaacttttgcacccactaactgatccatcaagtcatcaatcctc 8724  T
Q  430 ggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    ||||||| |||||||||||| || || ||||| ||||||||    
T  8725 ggaagtgaatacctattctttattgtcacctttttcaactg 8765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1423 (Bit Score: 242; Significance: 1e-134; HSPs: 1)
Name: scaffold1423
Description:

Target: scaffold1423; HSP #1
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 29 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 1735 - 1294
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |     
T  1735 cagaaataacatgtacaagaaagctcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttcgcataaagcttcttctctttcaacacttgcaaaaccag 1636  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | ||| | ||||||||||||||| |||||| ||    
T  1635 cttcaaatgctcaacatgttcttcttcagacttggagtaaatcaaaatatcatcaatgaaaacaaccatgaaccaatccaaaaatgcatgaaagatgtga 1536  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| || |||||  || |||||||||||||||||||||    
T  1535 ttcatgtactccataaatactccaggtgcattcgtaacaccgaaaggcataactttgtactcataatggccatactgcgttctgaaagctgtcttctgca 1436  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||  || |||||| | || |||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |     
T  1435 tatcttcatcttttactttaatatggtgataacccgatctcaaagctatcttgctgaaaacttttgcacccactaactgatccataaaatcatcaatcct 1336  T
Q  429 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    ||||||||||||||| ||||| || || |||||||| |||||    
T  1335 cggaagtggataccttttctttattgtcaccttgtttaactg 1294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0501 (Bit Score: 242; Significance: 1e-134; HSPs: 1)
Name: scaffold0501
Description:

Target: scaffold0501; HSP #1
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 23 - 356
Target Start/End: Original strand, 4141 - 4474
Alignment:
Q  23 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 122  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4141 catcaccaaaaataacatggccaagaaaacttacctctttcaaccagaactcacacttagataatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 4240  T
Q  123 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| || || ||||| || || | |||||||||||||||||||    
T  4241 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcattcttgaagtaaatcagaatatcatcaataaaaacaaccacaaagccatccaaaaatgcatggaag 4340  T
Q  223 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 322  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  4341 atacgattcatatactccataaacactccaagtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttttgaaagctgtct 4440  T
Q  323 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtg 356  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4441 tctgcatatcttcatcttttaccttaatctggtg 4474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282 (Bit Score: 239; Significance: 1e-132; HSPs: 1)
Name: scaffold0282
Description:

Target: scaffold0282; HSP #1
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 29 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 14832 - 14394
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| || |||||||| ||||| |  ||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  14832 cagaaataacatggccaagaaaactcacctctttcaactagaattcacactttgacaatttagcatataacttcttctctttcagcacttgcaaaacaat 14733  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| || || |||    
T  14732 cttcaaatgctcaacatgttcttcttcaatcttggagtatatcaaaatatcgtcgatgaacacaaccacgaaactatccaaaaatgcatgaaaaatacga 14633  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    ||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||  |||| ||||| ||||||||||    
T  14632 ttcatgtactccataaacacacctggcgcatttgtaacaccgaaaggcatcactttatattcataatgtccataacgtgttctaaaagcagtcttctgca 14533  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||  || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||     
T  14532 tatcttcatctttcactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaacacacgtgcacccactaactgatccataaaatcattaattct 14433  T
Q  429 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaa 467  Q
     |||||||||||  ||||||| || ||||| || |||||    
T  14432 tggaagtggatatttattctttatcgttactttattcaa 14394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 239; Significance: 1e-132; HSPs: 3)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 32 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 18691 - 18253
Alignment:
Q  32 aaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatctt 131  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||| || | |||    
T  18691 aaataacatgtccaagaaagctcacttctttcaaccagaattcgcacttagacaatttcgcataaagcttcatctcttttaacacttgcaaaaccagctt 18592  T
Q  132 cagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattc 231  Q
    || ||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18591 caaatgctcatcatgttcttcttcaaacttggggtaaatcaaaatatcatcgataaaaacaaccacgaactgatccaaaaatgcatgaaagatgcgattc 18492  T
Q  232 atatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatat 331  Q
    || ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||| |||| ||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  18491 atgtactccataaatactctaggtgcattcgtaacaccgaaaggcataactttgtactcatagtgatcataccgcgttctgaaagttgtcttctgcatat 18392  T
Q  332 cttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacgg 431  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||| || |||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | | |    
T  18391 cttcatcttttactataatctagtgataacctgatctcaaatctatcttgctgaaaacttttgcactcactaactgatccatcaaatcatcaatcctcag 18292  T
Q  432 aagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    |||||||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  18291 aagtggatacctattctttattgtcaccttgttcaactg 18253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 204 - 475
Target Start/End: Original strand, 22002 - 22273
Alignment:
Q  204 atccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataa 303  Q
    ||||| ||| |||||||| || || |||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||||| || || || ||||| ||||||||     
T  22002 atccagaaaagcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggtgcgttagtaacaccgaaaggcatcaccttgtactcataatgaccatat 22101  T
Q  304 cgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccacta 403  Q
    ||  | || || || |||||||||||||| ||||| || || ||||| || || |||| ||||||||| || || || || |||||   | ||||||| |    
T  22102 cgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcaccttaatttgatggtaacctgacctcaagtcgatcttactaaaaactttttcacccacca 22201  T
Q  404 actgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactgatgat 475  Q
    |||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| || ||||| || || || ||||||||||||||||    
T  22202 actggtccatcaagtcatcaatcctcggaagtggatatctgttctttatcgtaactttgttcaactgatgat 22273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 327 - 467
Target Start/End: Original strand, 39307 - 39447
Alignment:
Q  327 catatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaatt 426  Q
    |||||||||||| || || ||||| || || |||| ||||||||| || || || || |||||   ||||||||| ||||| ||||| || ||||||||     
T  39307 catatcttcatccttcaccttaatttgatggtaacctgacctcaagtcgatcttactaaaaacttttgcacccaccaactggtccatgaagtcatcaatc 39406  T
Q  427 cacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaa 467  Q
    | ||||||||||||||| ||||| || || || ||||||||    
T  39407 ctcggaagtggatacctgttctttatcgtaactttgttcaa 39447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 238; Significance: 1e-131; HSPs: 1)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 29 - 470
Target Start/End: Original strand, 17607 - 18042
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |     
T  17607 cagaaataacatggccaagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagataatttagcataaagattcttctctttcaacacttgcaaaaccag 17706  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||     |||||  |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  17707 cttcaaatgctcagcatgttcttcttcagtattgaagtaaatca-----tcatcattgaaaacaaccacgaaacgatccaaaaatgcatgaaagatgcga 17801  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||| ||||| || ||||| ||| |||| |||| |||||||||||    
T  17802 ttcatgtactccataaatactccaggtgcatttgtaacaccgaaaggcatcaccttatactcataatgtccataccgcgttctaaaagttgtcttctgca 17901  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||  || |||||||| || ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||      
T  17902 tatcttcatctttcactttaatctggtgataacccgatctcaaatctatcttgctgaaaacacgt-cacccaccaactgatccatcaagtcatcaattat 18000  T
Q  429 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
     |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  18001 tggaagtggatacctattctttattgttactttgttcaactg 18042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 238; Significance: 1e-131; HSPs: 4)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 29 - 458
Target Start/End: Original strand, 3867 - 4296
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  3867 cagaaataacattgccaagaaaactcacctctttcaaccagaattcacactttgacaatttagcatatagcttcttctctttcagcacttgcaatacaat 3966  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || || |||    
T  3967 cttcaaatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtatatcaaaatatcgtcgatgaacacaaccacgaaacgatccaaaaatgcatgaaaaatacga 4066  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    ||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||| || | ||||||  |||| ||||| ||||||||||    
T  4067 ttcatgtactccataaacacacctggcgtatttgtaacaccgaaagacatcactttatattcataatgtctataacgtgttctaaaagccgtcttctgca 4166  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||  || || |||||||| ||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||     
T  4167 tatcttcatctttcactttaatctggtgataacccgatcttaaatcaatcttgctaaacacacgtgcacccacaaaatgatccatcaaatcatcaattct 4266  T
Q  429 cggaagtggatacctattcttgatagttac 458  Q
     ||||| |||||||||||||| || |||||    
T  4267 tggaagcggatacctattctttatcgttac 4296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 29 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 40686 - 40244
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    |||||||||  || || |||||||| || || || |||||||| |||||||| || || || ||||| |   |||| || |||||||||||||| |||||    
T  40686 cagaaataatgtgacccagaaaacttacttcatttaaccagaactcacattttgataacttagcatacaacctcttttccttcaacacttgcaatacaat 40587  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
      |||||||||| ||||| || || ||| ||||||| || || ||||||||||| || ||||| || || ||   ||||| ||| |||||||| || ||     
T  40586 tctcagatgctctgcatgctcctcctcattcttggaatagattaaaatatcatcaataaacaccacaacaaacttatccagaaaagcatggaaaattcgg 40487  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || |||||||||||  | || || || ||||||||||    
T  40486 ttcatgtactccataaaaacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcactttgtactcgtaatgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgca 40387  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||| |||||||  |||||||||||||| || || || |     ||||| || |||||||||||||| || |||||||     
T  40386 tatcctcatccttcacttttatctgatgataaccagacctcaaatcaatcttactaaatatcttagcaccaaccaactgatccatcaagtcgtcaattct 40287  T
Q  429 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 471  Q
     ||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||||||    
T  40286 aggaagcggatacctgttcttgatcgtaactttgttcaactga 40244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 229 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 45580 - 45342
Alignment:
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| ||  | || || ||  |||||||||    
T  45580 ttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttttattcttaatgaccatatcgtgtcctaaaggccatcttctgca 45481  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    |||| ||||| || || |||||||| || |||| ||||||||| ||||| || || |||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||| |     
T  45480 tatcctcatccttcaccttaatctgatggtaacctgacctcaagtcaatcttactaaaaacctttgcacccactaactgatccatcaagtcatcaatcct 45381  T
Q  429 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaa 467  Q
    |||||| ||||| |||||||| || || || ||||||||    
T  45380 cggaagcggatatctattcttaattgtaactttgttcaa 45342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #4
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 29 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 45752 - 45626
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    |||||||||  |||||||||||||| || ||  | |||||||| ||||| || ||||||| | |||| |  |||||||||||||| ||||| || |||||    
T  45752 cagaaataatgtggccaagaaaacttacttcacttaaccagaactcacacttcgacaattag-catacaacttcttctctttcaaaacttgtaacacaat 45654  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttca 156  Q
    ||||||||| |  ||||| |||||||||    
T  45653 cttcagatgttttgcatgctcttcttca 45626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 29 - 405
Target Start/End: Original strand, 30898 - 31274
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| || |     
T  30898 cagaaataacatgtccaagaaagctcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttaacataaagcttcttctctttcaacacttgcaaaaccag 30997  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || || ||||| | ||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  30998 cttcaaatgctcagcatgttcttattaagacttggagtaaatcaaaatatcatcaataaaaacaaccatgaaccgatccaaaaatgcatgaaagatgcga 31097  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    |||||  |||||||||| |||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  31098 ttcatgcactccataaatactctaggtgcatttgtaacaccgaaaggcataactttatattcatagtggccataccgcgttctgaaagctgtcttctgca 31197  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaac 405  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||| ||| || ||||||||||||| |||||||||||||    
T  31198 tatcttcatctttcactttaatctggtgataactcgatctcagatctatcttgctgaaaacacttgcacccactaac 31274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 29 - 449
Target Start/End: Original strand, 50763 - 51183
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| || ||  | ||| ||||||||||||| ||||| |||||||| |  ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  50763 cagaaataatatggccaagaaaacttacttcacttaacaagaattcacatttggacaacttggcatacaacttcttatctttcaacacttgcaatacaat 50862  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||| | || ||||| || || ||||| || |||||||| |  |||  ||||| | | ||||| || || | |    
T  50863 cttcagatgctctgcatgctcttcttcagtcatagaataaattaagatgtcatcaataaacacaaccaaaaatttatccagataggcatgaaaaattcta 50962  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||| ||  | || || || |||||| |||    
T  50963 ttcatatactccataaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttatattcataatgaccatatcgtgtcctaaaggccgtcttcggca 51062  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    |||| ||||| || || |||||||| || |||| |||||||||||||||||| || || ||| | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||     
T  51063 tatcctcatccttcaccttaatctgatggtaacctgacctcaaatcaattttactaaatacaagagcacccactaactgatccattaaatcttcaattct 51162  T
Q  429 cggaagtggatacctattctt 449  Q
    || ||||||||||||||||||    
T  51163 cgaaagtggatacctattctt 51183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 228; Significance: 1e-125; HSPs: 3)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 73 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 28772 - 28446
Alignment:
Q  73 tcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatca 172  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28772 tcacacttagataatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatca 28673  T
Q  173 aaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaa 272  Q
    ||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                     
T  28672 aaatatcgtcgataaaaacaaccacgaaacgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggt----------------- 28590  T
Q  273 aggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaa 372  Q
      |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  28589 --gcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacctgatctcaaa 28492  T
Q  373 tcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaat 418  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28491 tcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccattaaat 28446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 23 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 28930 - 28774
Alignment:
Q  23 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 122  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || | ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28930 catcaccagaaataacatggccaagaaaacttacctctttcaaccataacttacacttagataatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 28831  T
Q  123 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatc 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28830 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatc 28774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 439 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 28438 - 28406
Alignment:
Q  439 tacctattcttgatagttaccttgttcaactga 471  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28438 tacctattcttgatagttactttgttcaactga 28406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 228; Significance: 1e-125; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 29 - 469
Target Start/End: Original strand, 103186 - 103618
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||| |    
T  103186 cagaaataacatggccaagaaaactcacctctttcaatcagaattcacactttgataatttagcataaagcttcttctctttcagcacttgcaaaacagt 103285  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
    ||||| ||| || ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||| || ||||||    
T  103286 cttcaaatgttcggcatgttcttcctcagacttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaatactaccacgaaacgatccaaaaatgcatgaaaaatgcga 103385  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    |||||  ||||||||||||| || || ||||| | |||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| |||| ||| |  |||||||||    
T  103386 ttcatgcactccataaacacacctggcgcatttgcaacaccgaaaggcatcactttatactcatagtgtccataacgcgttctaaaatccatcttctgca 103485  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||        |||||||||     
T  103486 tatcttcatctttcactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaattgatc--------catcaattct 103577  T
Q  429 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaact 469  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  103578 cggaagtggatacctattctttatcgttactttgttcaact 103618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 30 - 458
Target Start/End: Original strand, 405 - 832
Alignment:
Q  30 agaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatc 129  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||| || | |    
T  405 agaaataacatggccaagaaaacttacctctttcaaccaaaattcacagttagataacttcgcataaagtttcttctctttcaacacttgcaaaaccagc 504  T
Q  130 ttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgat 229  Q
    |||| |||||||  |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||  || || |||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||    
T  505 ttcaaatgctcat-atgttcttcttcagacttagagtaaatcaaaatatcataaataaaaacaactacgaactgatccaaaaatgcatgaaagatgcgat 603  T
Q  230 tcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcat 329  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||  |||||||| || ||||| ||||| || |||||  ||||||| |||||||||||||| |     
T  604 tcatatactccataaatactccaggtgcattagtaaaactgaaaggcattaccttatactcataatgtccatactgcattctaaaagctgtcttctggac 703  T
Q  330 atcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcac 429  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||  || |||||||| || |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| |    
T  704 atcttcatctttcactttaatctggtgataacccgatctcaaatctatcttgcggaaaacacgtgcactcactaactgatccatcaagttatcaattctc 803  T
Q  430 ggaagtggatacctattcttgatagttac 458  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||    
T  804 ggaagtggatacctattctttattgttac 832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 3)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 29 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 11094 - 10653
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||| |||||| || ||||| || |||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||    
T  11094 cagaaataacatggccaagaaaacttacttcattcaaccagagttcacactttgacaacttagcataaagcttcttctccttcagcacttgcaagacaat 10995  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||| ||| | ||||| || || |||    
T  10994 cctcaaatgctcagcatgttcttcttcagtcttagagtatatcaaaatatcatcaatgaacacaaccatgaagcgatctaaatacgcatgaaaaatacga 10895  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    ||||  |||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||| |||  |||||| || || ||||||||  | || || || ||||||||||    
T  10894 ttcaagtactccataaacacacctggcgcatttgtaacaccgaaaggcatcactgaatattcgtaatgtccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgca 10795  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  10794 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaatacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcagttct 10695  T
Q  429 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
     |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  10694 tggaagtggatacctattctttatcgttaccttattcaactg 10653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 29 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 24651 - 24210
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |  ||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  24651 cagaaataacatggcctagaaaactcacctcattcaaccagaattcacattttgacaacttagcatataacttcttctctttcagcacttgcaaaacaat 24552  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
    ||||| |||| || || |||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| | | | ||||| || ||||||    
T  24551 cttcaaatgcgcaacaagttcttcttcagtcttagagtatatcaaaatgtcgtcgatgaacacaaccacgaaacgatctagatacgcatgaaaaatgcga 24452  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    ||||| |||||||||||||| |  || || || |||||||| |||||||| |||  ||||| |||||| | ||||||  |||| |||| |||||||||||    
T  24451 ttcatgtactccataaacacacttggcgcgtttgtaacaccgaaaggcatcactgaatatttatagtgtcaataacgtgttctaaaagttgtcttctgca 24352  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    |||| || |||||||||||||||| ||||||||   | ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  24351 tatcctcgtcttttactttaatctagtgataacccaatctcaagtcaatcttgctaaacacacgtgcacccactaactgatccatcaagtcatcaattct 24252  T
Q  429 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  24251 cggaagtggatacctattctttatcgttaccttattcaactg 24210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #3
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 29 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 17286 - 16958
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||| |||||| || ||||| || |||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||    
T  17286 cagaaataacatggccaagaaaacttacttcattcaaccagagttcacactttgacaacttagcataaagcttcttctccttcagcacttgcaagacaat 17187  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||| ||| | ||||| || || |||    
T  17186 cctcaaatgctcagcatgttcttcttcagtcttagagtatatcaaaatatcatcaatgaacacaaccatgaagcgatctaaatacgcatgaaaaatacga 17087  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    ||||  |||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||| |||  |||||| || || ||||||||  | || || || ||||||||||    
T  17086 ttcaagtactccataaacacacctggcgcatttgtaacaccgaaaggcatcactgaatattcgtaatgtccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgca 16987  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtga 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16986 tatcttcatcttttactttaatctggtga 16958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 36 - 470
Target Start/End: Original strand, 494978 - 495412
Alignment:
Q  36 aacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcaga 135  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| | || |||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |    
T  494978 aacatggccaagaaaactcacctcattcaaccagaactcagactttgacaatttagcatatagcttcttctctttcagcacttgcaaaacaatcttcaaa 495077  T
Q  136 tgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatat 235  Q
    | |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| || || |||||||| |    
T  495078 tactcagcatgttcttcttcagacttcgagtatatcaaaatatcgtcgatgaacacaaccacaaaacgatccaaaaacgcatgaaaaatacgattcatgt 495177  T
Q  236 actccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttc 335  Q
    |||| |||||||| || || ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||  |||| ||||| |||||||||||||||||    
T  495178 actcaataaacacacctggcgcatttgtaacaccgaaaggcatcactttatattcataatgtccataacgtgttctaaaagccgtcttctgcatatcttc 495277  T
Q  336 atcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagt 435  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||  || ||||||| ||| ||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||    
T  495278 atctttcactttaatcaggtgataaccagatctcaaataaatattgctaaacacacgtgaacccactaactgatccatcaagtcatcaattcttggaagt 495377  T
Q  436 ggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  495378 ggatacctattctttatcgttactttgttcaactg 495412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 29 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 453566 - 453146
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    |||||||||  ||||||||||| || || ||  | |||||||| |||||||| ||||| ||| |||| |  |||||||||||||| ||||| || |||||    
T  453566 cagaaataatgtggccaagaaatcttacttcacttaaccagaactcacattttgacaacttgacatacaacttcttctctttcaatacttgtaatacaat 453467  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
    ||||||||| || ||||| ||||||||||||||  | |||||||| || ||||| || |||||||| || |||  ||||| | | |||||||| || ||     
T  453466 cttcagatgttctgcatgctcttcttcagtcttcaaataaatcaagatgtcatcaataaacacaaccacaaatttatccagataggcatggaaaattcgg 453367  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||  |  | || || ||||||||||    
T  453366 ttcatatattccataaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcactttatattcatagtgtccatatcgtgtcttaaaggccgtcttctgca 453267  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    |||| ||||| || || |||||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||| || |     
T  453266 tatcctcatccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaattttgctgaatacactagcacccactaactgatccattaaatcatcgatcct 453167  T
Q  429 cggaagtggatacctattctt 449  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  453166 cggaagtggatacctattctt 453146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 29 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 515706 - 515264
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    |||||||||  || || ||||||||||| ||  | |||||||| |||||||| ||||| || ||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  515706 cagaaataatgtgacccagaaaactcacttcacttaaccagaactcacattttgacaactttgcatacaacctcttctctttcaacacttgcaagacaat 515607  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
      |||||||||| || ||||| |||||| ||||||| ||||| || |||||||| || |||||||| || ||   ||||| ||| |||||||| || ||     
T  515606 tctcagatgctctgcgtgttcctcttcattcttggaataaattaagatatcatcaataaacacaacgacaaacttatccagaaaagcatggaaaattcgg 515507  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| ||||| || || || |||||||| ||  | || || || ||||||||||    
T  515506 ttcatgtactccataaatacaccaggcgcgttagtaacaccgaaaggcatcactttgtaatcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgca 515407  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    |||| ||||| || || || ||||| || ||||  |||||||| ||||| || || ||||     ||||| || |||||||||||||| ||||||||||     
T  515406 tatcctcatccttcacctttatctgatggtaaccagacctcaagtcaatcttactaaaaatcttagcaccaaccaactgatccatcaagtcatcaattct 515307  T
Q  429 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 471  Q
     ||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||    
T  515306 aggaagcggatacctattctttatcgtaaccttgttcaactga 515264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 2)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 29 - 470
Target Start/End: Original strand, 16830 - 17270
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    |||||||||||| ||||| || |||||| |||||||| ||||||| ||| || |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16830 cagaaataacattgccaaaaacactcacctctttcaatcagaattgacactttgacaatttggcatataacttcttctctttcaacacttgcaaaacaat 16929  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||| | ||||| || || |||    
T  16930 cttcaaatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtatatcaaaatatcgtcgatgaacacaaccacgaagcgatctaaatacgcatgaaaaatacga 17029  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    ||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||| || |||  ||||||||| || ||||||||  |||| |||| |||||||||||    
T  17030 ttcatgtactccataaacacacctggcgcattggtaacaccgaaagg-atcactgaatattcataatgtccataacgtgttctaaaagttgtcttctgca 17128  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    |||| || ||||| |||||||||||||||||||  || ||||||| ||| || || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  17129 tatcctcgtctttcactttaatctggtgataacccgatctcaaattaatcttactaaacacacgtgcacccactaattgatccatcaaatcatcaattct 17228  T
Q  429 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
     |||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||    
T  17229 tggaagtggatacctattctttatcgttactttattcaactg 17270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 29 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 111841 - 111775
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcata 95  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  111841 cagaaataatatggccaagaaaactcacctctttcaaccagaattcacacttagacaatttagcata 111775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 2)
Name: scaffold0270
Description:

Target: scaffold0270; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 30 - 469
Target Start/End: Original strand, 5825 - 6264
Alignment:
Q  30 agaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatc 129  Q
    ||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||| ||| ||  ||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||    
T  5825 agaaataacgtggccaagaaaacttacctctttcaaccagaatttacactttaacagtttagcatatagcttcttctctttcaacacttgtaaaacaatc 5924  T
Q  130 ttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgat 229  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| || |  || ||||    
T  5925 ttcaaatgctcagcatgttcttcttcggacttcgagtatatcaaaatatcatcgatgaacacaaccacgaagcgatcaaaaaatgcttgaataatacgat 6024  T
Q  230 tcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcat 329  Q
    |||| || ||||||||||| || || ||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  6025 tcatgtattccataaacacacctggcgcatttgtaacaccgaaagacatcactttatattcataatgtccataacgcattctaaaagtcgtcttctgcat 6124  T
Q  330 atcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcac 429  Q
    ||| | |||||| |||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| || |||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||      
T  6125 atcctgatctttcactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctaaacacacgtgcactcactaactgatccaacaagtcatcaattctt 6224  T
Q  430 ggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaact 469  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  6225 ggaagtggatacctattctttatcgttactttgttcaact 6264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270; HSP #2
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 30 - 469
Target Start/End: Original strand, 12955 - 13394
Alignment:
Q  30 agaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatc 129  Q
    ||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||| ||| ||  ||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||    
T  12955 agaaataacgtggccaagaaaacttacctctttcaaccagaatttacactttaacagtttagcatatagcttcttctctttcaacacttgtaaaacaatc 13054  T
Q  130 ttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgat 229  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| || |  || ||||    
T  13055 ttcaaatgctcagcatgttcttcttcggacttcgagtatatcaaaatatcatcgatgaacacaaccacgaagcgatcaaaaaatgcttgaataatacgat 13154  T
Q  230 tcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcat 329  Q
    |||| || ||||||||||| || || ||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  13155 tcatgtattccataaacacacctggcgcatttgtaacaccgaaagacatcactttatattcataatgtccataacgcattctaaaagtcgtcttctgcat 13254  T
Q  330 atcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcac 429  Q
    ||| | |||||| |||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| || |||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||      
T  13255 atcctgatctttcactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctaaacacacgtgcactcactaactgatccaacaagtcatcaattctt 13354  T
Q  430 ggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaact 469  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  13355 ggaagtggatacctattctttatcgttactttgttcaact 13394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 33 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 6680 - 6352
Alignment:
Q  33 aataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttc 132  Q
    ||||||||| |||||||| | ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  6680 aataacatgtccaagaaagcacacttctttcaaccagaattcgcacttagacaatttcgcataaagcttcttctctttcaacacttgcaaaaccagcttc 6581  T
Q  133 agatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattca 232  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  6580 aaatgctcagcatgttcttcttcagacttggagtaaatcaaaatatcatcgataaaaacaaccacgaaccgatccaaaaacgcatgaaagatgcgattca 6481  T
Q  233 tatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatc 332  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| || |||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  6480 tgtactccataaatactccaggtgcattcgtaacaccgaaaggcaaaactttgtactcatagtgaccataccgcgttctgaaagttgtcttctgcatatc 6381  T
Q  333 ttcatcttttactttaatctggtgataac 361  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6380 ttcatctttcactttaatctggtgataac 6352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 2)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 29 - 469
Target Start/End: Original strand, 5065 - 5504
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| |  ||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  5065 cagaaataacatggccaagaaaactcacctcattcaaccagaactcacactttgacaactttgcatataacttcttctctttcagcacttgcaaaacaat 5164  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||| | ||||| || || |||    
T  5165 cttcaaatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtatatcaaaatatcgtcaatgaacacaaccacaaagcgatccaaatacgcatgaaaaatacga 5264  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    ||||| |||| ||| ||||| || || ||||| |||||||| |||||||| |||  |||||||||  | ||||||||  |||| || || ||||||||||    
T  5265 ttcatgtact-catgaacacacctggcgcattcgtaacaccgaaaggcatcactgaatattcataaagcccataacgtgttctaaaggccgtcttctgca 5363  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||      
T  5364 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacccaatctcaaatcaatcttgctaaacacacgtgcacccactaactgatccaacaaatcatcaattat 5463  T
Q  429 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaact 469  Q
     |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  5464 aggaagtggatacctattctttatcgttactttgttcaact 5504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 127 - 441
Target Start/End: Original strand, 11172 - 11486
Alignment:
Q  127 atcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgc 226  Q
    ||||||||||| || ||||| || ||||||||||| || ||||| | ||||||||| || |||||||| || |||  ||||||| | |||||||| || |    
T  11172 atcttcagatgttctgcatgctcctcttcagtcttagaataaattagaatatcatcaataaacacaaccacaaatttatccaaagaagcatggaaaattc 11271  T
Q  227 gattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctg 326  Q
    | |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| || || ||||| || || ||||| ||  | || || || ||||||||    
T  11272 ggttcatatactccatgaacacaccaggtgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttgtattcgtaatgtccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctg 11371  T
Q  327 catatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaatt 426  Q
    |||||| | ||| || || |||||| | || |||| ||||||||| ||||| || || |||||   ||||||||| |||||||||||||| ||||||||     
T  11372 catatcctaatccttcaccttaatcagatggtaacctgacctcaagtcaatcttactaaaaacctttgcacccaccaactgatccatcaagtcatcaatc 11471  T
Q  427 cacggaagtggatac 441  Q
    | |||||||||||||    
T  11472 ctcggaagtggatac 11486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 31 - 449
Target Start/End: Original strand, 14423 - 14841
Alignment:
Q  31 gaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatct 130  Q
    ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| || |||||||| | ||| || ||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  14423 gaaataacatggccaagaaaactaacctcattcaaccagaactcacactttgacaatttagaatatagcttcttctctttcagcacttgcaaaacaatct 14522  T
Q  131 tcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgatt 230  Q
    ||| |||||||||||| |||||||| | ||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || || |||||    
T  14523 tcaaatgctcagcatgctcttcttcggacttcgagtatatcaaaatatcgtcgatgaacacaaccacgaaacgatccaaaaacgcatgaaaaattcgatt 14622  T
Q  231 catatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcata 330  Q
    ||| || ||||||||||| |||||||| || |||||| | |||||||| |||||||||||||| || ||||||||  |||| ||||  ||||||||||||    
T  14623 catgtattccataaacacaccaggtgcctttgtaacatcgaaaggcatcactttatattcataatgtccataacgtgttctaaaagtcgtcttctgcata 14722  T
Q  331 tcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacg 430  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||| |||||||  || ||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  |    
T  14723 tcttcatctttcactttaatcgggtgataacctgatctcaaattgatgttgctaaacacacgtgtacccactaactgatccatcaagtcatcaattcttg 14822  T
Q  431 gaagtggatacctattctt 449  Q
    |||||||||||||||||||    
T  14823 gaagtggatacctattctt 14841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 29 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 15574 - 15135
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| || |||||||| ||||| |  || |||||||| | ||||||||| |||||    
T  15574 cagaaattacatggccaagaaaactcacctctttcaactagaattcacactttgacaatttagcatataactttttctcttttagcacttgcaaaacaat 15475  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| || || |||    
T  15474 cttcaaatgctcagcttgttcttcttcagtcttggagtatatcaaaatatcgtcgatgaacacaatcacgaaacgatccaaaaatgcatgaaaaatacga 15375  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    ||||| ||||||||||| |  || || ||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||| || | |||||   |||| ||||| ||||||||||    
T  15374 ttcatgtactccataaagatacctggcgcatttgtaacaccgaaaggaatcactttatattcataatgtctataacaagttctaaaagccgtcttctgca 15275  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | |||||||  || |||||| |||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  15274 tatcttcatctttcactttaatccgatgataacccgatctcaaagcaatcttgctaaacacacgtgcacccactaactgatccatcaagtcatcaattct 15175  T
Q  429 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 468  Q
     ||||||| |||||||||||| || ||||| || ||||||    
T  15174 tggaagtgtatacctattctttattgttactttcttcaac 15135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 100 - 470
Target Start/End: Original strand, 2623 - 2993
Alignment:
Q  100 ttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacga 199  Q
    |||||||| || ||||||||||| || | ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| || || ||||| ||||    
T  2623 ttcttctcctttaacacttgcaaaaccagcttcaaatgctcagcatgttcttcttcagacttgcagtaaatcaaaatatcatcaataaaaacaaccacga 2722  T
Q  200 atcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgacc 299  Q
    |  ||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||  || ||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  2723 aatgattcaaaaatgcatgaaagatgcgattcatgtactccataaacactcgaggtgcatttgtaacactgaacggcatcactttttattcatagtgtcc 2822  T
Q  300 ataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcaccc 399  Q
    ||| ||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||  || |||||||| || ||| |||||||||||||| ||    
T  2823 atatcgcgttctaaaaggtgtcttctggatatcttcatctttcactttaatctggtgataacccgatctcaaatctatcttgatgaaaacacgtgcatcc 2922  T
Q  400 actaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  2923 actaactgatccatcaagtcatcaattcatggaagtggatacctattctttatcgttactttgttcaactg 2993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 29 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 217773 - 217335
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| |||| ||||| || ||||||||  |||| || ||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  217773 cagaaataacgtggccaagaaaactcacctcattcaactagaactcacactttgacaatttaacatatagcttcttctctttcagcacttgcaaaacaat 217674  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||   ||| ||||| |||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||  ||    
T  217673 cttcaaatgctcaacatgttcttcttcgaacttcgagtatatcaaaatatcatcaatgatcacaaccacgaaacgatcaaaaaacgcatgaaaaatatga 217574  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    ||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||  |||| || |  ||||||||||    
T  217573 ttcatgtactccataaacacacctggggcatttgtaacaccgaaaggcatcactttatattcataatgtccataacgtgttctaaaggacgtcttctgca 217474  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    |||| || ||||| |||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  217473 tatcctcgtctttcactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgcaaaacacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattct 217374  T
Q  429 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaa 467  Q
     |||||||||||||||||||| || || || ||||||||    
T  217373 tggaagtggatacctattctttatcgtcactttgttcaa 217335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1985 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold1985
Description:

Target: scaffold1985; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 23 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 699 - 407
Alignment:
Q  23 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 122  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| ||||| || || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  699 catcaccagaaataacatggccaagaaaacttacttctttcagccagaactcacactttgataatttagcataaagtttcttctcttttaacacttgcag 600  T
Q  123 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 222  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  599 gacaatcttcaaatgctcagcatgttcttctttagtcttggagtcaatcaaattatcatcgatgaacacaactaagaaccgatccaaaaatgcatggaag 500  T
Q  223 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaa 315  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||||||    
T  499 atgcgattcatgtactccataaatactccaggtgcattcgtaacaccgaaaggcataactttatattaatagtgaccataccgtgttctgaaa 407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0181 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 1)
Name: scaffold0181
Description:

Target: scaffold0181; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 202 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 30095 - 29828
Alignment:
Q  202 cgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccat 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30095 cgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataattactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccat 29996  T
Q  302 aacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccac 401  Q
    | ||  || ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| |||||||||||  ||||||||||    
T  29995 atcgggttttgaaagctgtcttctacatgtcttcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaacttgtgcacccac 29896  T
Q  402 taactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaact 469  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||    
T  29895 tatctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatactaactttgttcaact 29828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0393 (Bit Score: 183; Significance: 9e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0393
Description:

Target: scaffold0393; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 249 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 16128 - 15906
Alignment:
Q  249 tccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatctttt-acttt 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16128 tccaggtgcattggtaacaccaaaacgcataaccttatattcataatgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcttcatctttttacttt 16029  T
Q  348 aatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattc 447  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16028 aatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattc 15929  T
Q  448 ttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  15928 ttgatagttaccttgttcaactg 15906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0331 (Bit Score: 182; Significance: 3e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0331
Description:

Target: scaffold0331; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 29 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 16330 - 15890
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    ||||||||||| || |||||||||| || || ||||||||||||||||| || ||||| || ||||| |  |||||||| || ||||||||||| | |||    
T  16330 cagaaataacacggtcaagaaaacttacctcattcaaccagaattcacactttgacaacttagcatataacttcttctccttgaacacttgcaaaa-aat 16232  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| | ||| ||||| ||||| | | | ||||| || ||||||    
T  16231 cttcaaatgctcagcatattcctcttcagtcttagagtatatcaaaatatcatcgatgaatataaccacgaaacgatctagatacgcatgaaaaatgcga 16132  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    ||||| |||| ||||||||| || || || || |||||||| |||||||| |||  ||| ||||| || ||||||||  |||| |||||  |||||||||    
T  16131 ttcatgtactacataaacacacctggcgcgtttgtaacacccaaaggcatcactgaatactcataatgtccataacgttttctaaaagccatcttctgca 16032  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  16031 tatcctcgtcttttactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctgaacacatgtgcacccactaactaatccatcaaatcatcaattct 15932  T
Q  429 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    ||||||||||||||||||||| || || || || ||||||||    
T  15931 cggaagtggatacctattctttattgtcactttattcaactg 15890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 178; Significance: 8e-96; HSPs: 3)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 8e-96
Query Start/End: Original strand, 29 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 9387 - 8958
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| || ||||  |||||||| |  |||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  9387 cagaaataacatggccaagaaaactcacctcatccaaccagaattcacactttgacagcttggcatataacttcttctccttcagcacttgcaaaacaat 9288  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
    | ||| ||||||| ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||| | ||||| || || |||    
T  9287 cctcaaatgctcaacatgttcttcttcagacttagagtatatcaaaatatcatccatgaacacaaccacgaaacgatctaaatacgcatgaaaaatacga 9188  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    ||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||| |||  ||||||||| || ||||||||  | || ||||| ||||||| ||    
T  9187 ttcatgtactccataaacacacctggcgcatttgtaacaccgaaaggcatcactgaatattcataatgtccataacgtgtcctaaaagccgtcttctcca 9088  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    ||||  | ||||| || ||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||| || |     
T  9087 tatccccgtctttcaccttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctaaacacgcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatctatcct 8988  T
Q  429 cggaagtggatacctattcttgatagttac 458  Q
     |||||||||||||||||||| || |||||    
T  8987 tggaagtggatacctattctttatcgttac 8958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 368 - 458
Target Start/End: Original strand, 1324 - 1414
Alignment:
Q  368 tcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttac 458  Q
    |||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| || |||||    
T  1324 tcaaatcaatcttgctaaacacgcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatctatccttggaagtggatacctattctttatcgttac 1414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083; HSP #3
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 368 - 458
Target Start/End: Original strand, 6628 - 6718
Alignment:
Q  368 tcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttac 458  Q
    |||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| || |||||    
T  6628 tcaaatcaatcttgctaaacacgcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatctatccttggaagtggatacctattctttatcgttac 6718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0509 (Bit Score: 171; Significance: 1e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0509
Description:

Target: scaffold0509; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 29 - 471
Target Start/End: Original strand, 10781 - 11223
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| || ||  | ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |  ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  10781 cagaaatgatatggccaagaaaacttacttcacttaaccagaattcacatttggacaacttggcatacaacttcttttctttcaacacttgcaatacaat 10880  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
    ||| | |||||| | ||| |||||||||||||| || |||||||| || ||||| || ||||||||||| ||| |||||||| | |||||||| || | |    
T  10881 ctttaaatgctctgtatgctcttcttcagtcttagaataaatcaagatgtcatcaataaacacaactacaaattgatccaaataagcatggaaaattcta 10980  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || || || ||  |  | || || || |||||||    
T  10981 ttcatgtactccataaacacaccaggcgcattggtaacaccgaaaggcatcactttatattcataatgcccgtatcgtgtcttaaaggccgttttctgca 11080  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    ||||||  ||||| ||||||||||| || ||||  |||||||| ||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  11081 tatctttttctttcactttaatctgatggtaacccgacctcaagtcaatcttgttgaacacgcgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaattct 11180  T
Q  429 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 471  Q
    ||||||||||||||||||||| || || || || |||||||||    
T  11181 cggaagtggatacctattctttattgtcactttattcaactga 11223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 167; Significance: 3e-89; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 29 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 201821 - 201379
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    ||||||||| ||||||||||||| | || ||  | ||||||||||||||||| ||| |||||||||| || ||||| || |||||||||||||| ||||     
T  201821 cagaaataatatggccaagaaaatttacttcacttaaccagaattcacatttggaccatttggcatacagcttcttttccttcaacacttgcaacacaac 201722  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
    ||||| ||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||| || || ||||||||| | |||||||| || | |    
T  201721 cttcaaatgttctgcatgttcttcttcagtcttagagtatatcaaaatatcatcaataaacacaaccacaaaccgatccaaataagcatggaaaattcta 201622  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    ||||| |||||||||||||| || || |  || |||||||| |||||||| |||  |||||| || || ||||| ||  | || || || || |||||||    
T  201621 ttcatgtactccataaacacacccggcgtgttagtaacaccgaaaggcatcactgaatattcgtaatgtccatatcgtgtcctaaaggccgttttctgca 201522  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||| ||||| || || |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  201521 tatcttcatcttttactttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttgctaaacactcgtgtacccactaactgatccattaaatcatcaattct 201422  T
Q  429 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 471  Q
    |||||||||||||||||| || || || || || |||||||||    
T  201421 cggaagtggatacctattttttatcgtcactttattcaactga 201379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 29 - 441
Target Start/End: Original strand, 324657 - 325069
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    |||||||||  |||||||||||||| || ||  | |||||||||||||| || ||| | || ||||| |  || ||||||||||| | |||||| |||||    
T  324657 cagaaataatgtggccaagaaaacttacttcacttaaccagaattcacacttcgacgacttagcatacaactttttctctttcaaaatttgcaatacaat 324756  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
    ||||||||| ||  |||| |||||||||||| | || || |||| ||| ||||| || || ||||| ||||||  ||||| | | |||||||| || ||     
T  324757 cttcagatgttctacatgctcttcttcagtccttgaatagatcagaatgtcatcaataaatacaaccacgaatttatccagataggcatggaaaattcgg 324856  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| ||  | || || || ||||||||||    
T  324857 ttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttgtattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgca 324956  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    |||||||||| || || |||||||| || |||| |||||| || ||||| || || |||||    ||||||||||||||||||||||| || ||||| |     
T  324957 tatcttcatccttcaccttaatctgatggtaacctgaccttaagtcaatcttactaaaaaccttcgcacccactaactgatccatcaagtcgtcaatcct 325056  T
Q  429 cggaagtggatac 441  Q
    |||||||||||||    
T  325057 cggaagtggatac 325069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 166; Significance: 1e-88; HSPs: 3)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 250 - 467
Target Start/End: Original strand, 1 - 218
Alignment:
Q  250 ccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaa 349  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1 ccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatatacatagtgaccataccgtgttctgaaatctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaa 100  T
Q  350 tctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattctt 449  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  101 tctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctgaaaacgcgtgcacccacaaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 200  T
Q  450 gatagttaccttgttcaa 467  Q
    |||||| || ||||||||    
T  201 gatagtcacattgttcaa 218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #2
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 40 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 5692 - 5262
Alignment:
Q  40 tggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgct 139  Q
    |||||||||||||| || ||  | |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  5692 tggccaagaaaacttacttcacttaaccagaactcacattttgacaacttggcatacaacttcttctctttcaacacttgcaacacaatcttcagatgtt 5593  T
Q  140 cagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactc 239  Q
    | ||||| |||||||||||||| || |||||||| || ||||| || |||||||| || |||  ||||| | | |||||||| || || |||||||||||    
T  5592 ctgcatgctcttcttcagtctttgaataaatcaagatgtcatcaataaacacaaccacaaatttatccagataagcatggaaaattcggttcatatactc 5493  T
Q  240 cataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatct 339  Q
    |||||||||  |||  ||||| |||||||| ||| |||| || |||||||||||||||||||| ||  | || || || |||||||||||||| |||||     
T  5492 cataaacac-gcagtcgcattagtaacaccgaaatgcatcaccttatattcatagtgaccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatcc 5394  T
Q  340 tttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggat 439  Q
    || || |||||||| || |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| | |||||||||||    
T  5393 ttcaccttaatctgatggtaacctgacctcaaatcaatcttgctgaatacacgagcacccactaattgatccattaagtcatcaatcctcggaagtggat 5294  T
Q  440 acctattcttgatagttaccttgttcaactga 471  Q
    |||| ||||| || || |||||||||||||||    
T  5293 acctgttctttatcgtaaccttgttcaactga 5262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #3
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 40 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 10123 - 9693
Alignment:
Q  40 tggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgct 139  Q
    |||||||||||||| || ||  | |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  10123 tggccaagaaaacttacttcacttaaccagaactcacattttgacaacttggcatacaacttcttctctttcaacacttgcaacacaatcttcagatgtt 10024  T
Q  140 cagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactc 239  Q
    | ||||| |||||||||||||| || |||||||| || ||||| || |||||||| || |||  ||||| | | |||||||| || || |||||||||||    
T  10023 ctgcatgctcttcttcagtctttgaataaatcaagatgtcatcaataaacacaaccacaaatttatccagataagcatggaaaattcggttcatatactc 9924  T
Q  240 cataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatct 339  Q
    |||||||||  |||  ||||| |||||||| ||| |||| || |||||||||||||||||||| ||  | || || || |||||||||||||| |||||     
T  9923 cataaacac-gcagtcgcattagtaacaccgaaatgcatcaccttatattcatagtgaccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatcc 9825  T
Q  340 tttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggat 439  Q
    || || |||||||| || |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| | |||||||||||    
T  9824 ttcaccttaatctgatggtaacctgacctcaaatcaatcttgctgaatacacgagcacccactaattgatccattaagtcatcaatcctcggaagtggat 9725  T
Q  440 acctattcttgatagttaccttgttcaactga 471  Q
    |||| ||||| || || |||||||||||||||    
T  9724 acctgttctttatcgtaaccttgttcaactga 9693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379 (Bit Score: 163; Significance: 8e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0379
Description:

Target: scaffold0379; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 8e-87
Query Start/End: Original strand, 29 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 6242 - 5804
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | || || ||||||||||||||||| || ||||| || ||||| |  ||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  6242 cagaaataacatgaccaagaaaaatgacctcattcaaccagaattcacactttgacaacttagcatataacttcttctctttcagcacttgcaaaacaat 6143  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| | | |||||||||| || |||    
T  6142 cttcaattgctcagcatgttcttcttcagccttagagtatatcaaaatatcgtcgatgaacacaaccacgaaacgatctagatatgcatggaaaatacga 6043  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    ||||| |||||||||||||| || || || || |||||||| |||||||| ||   |||||| || || ||||  ||  |||| ||||| ||||| ||||    
T  6042 ttcatgtactccataaacacacctggcgcgtttgtaacaccgaaaggcatcaccgaatattcctaatgtccatgtcgtgttctaaaagccgtcttttgca 5943  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    |||  || || || |||||||||||||||||||  || ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||     
T  5942 tattgtcgtccttcactttaatctggtgataacccgatctcaagtcaatcttgctaaacacacgtgcacccactaactggtccatcaagtcgtcaattct 5843  T
Q  429 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaa 467  Q
     |||||||||||||||||||| || ||||| || |||||    
T  5842 tggaagtggatacctattctttatcgttactttattcaa 5804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067 (Bit Score: 163; Significance: 8e-87; HSPs: 4)
Name: scaffold0067
Description:

Target: scaffold0067; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 8e-87
Query Start/End: Original strand, 64 - 470
Target Start/End: Original strand, 28610 - 29016
Alignment:
Q  64 aaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttgg 163  Q
    |||||||| |||||||| ||||| || ||| | |  ||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |    
T  28610 aaccagaactcacattttgacaacttcgcagacaacttcttttctttcaacactttcaagacgatcttcagatgttctgcatgctcttcttcagtcttag 28709  T
Q  164 agtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggt 263  Q
    | |||||||| || ||||| || |||||||| || |||  |||||   | |||||||| || || |||||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||    
T  28710 aataaatcaagatgtcatcaataaacacaaccacaaatttatccaggtaagcatggaaaattcggttcatatactccataagcacaccaggcgcattagt 28809  T
Q  264 aacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataactt 363  Q
    |||||| |||||||| || |||||||| || |||||||| ||  | || || || |||||||||||||| ||||| || || |||||||| || |||| |    
T  28810 aacaccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcaccttaatctgatggtaacct 28909  T
Q  364 gacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgt 463  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28910 gacctcaaatcaattttgttgaatacacgagcacccactaactgatccattaagtcatcaatcctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgt 29009  T
Q  464 tcaactg 470  Q
    |||||||    
T  29010 tcaactg 29016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #2
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 103 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 50459 - 50113
Alignment:
Q  103 ttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatc 202  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||     
T  50459 ttctctttcaacacttgcaacacaatcttcagatgttccgcatgctcttcttccgtcttagaataaattaaaatatcatcaatgaatacaaccacgaatt 50360  T
Q  203 gatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccata 302  Q
     ||||||||| ||||| || || || |||||||||||||| ||||| || || |  || |||||||| |||||||| ||||| ||||| || || |||||    
T  50359 tatccaaaaaagcatgaaaaattcggttcatatactccatgaacacaccgggcgtgttagtaacaccgaaaggcatcactttgtattcgtaatgtccata 50260  T
Q  303 acgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccact 402  Q
     ||  | || || || |||||||||||||||||||| || || ||||| || || |||| ||||||||| || || || || |||||   ||||| |||     
T  50259 tcgtgtcctaaatgccgtcttctgcatatcttcatccttcaccttaatttgatggtaacctgacctcaagtcgatcttactaaaaacttttgcactcacc 50160  T
Q  403 aactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattctt 449  Q
    ||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||||||||| |||||    
T  50159 aactggtccatcaagtcatcaatcctcggtagtggatacctgttctt 50113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #3
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 103 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 59493 - 59147
Alignment:
Q  103 ttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatc 202  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||     
T  59493 ttctctttcaacacttgcaacacaatcttcagatgttccgcatgctcttcttccgtcttagaataaattaaaatatcatcaatgaatacaaccacgaatt 59394  T
Q  203 gatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccata 302  Q
     ||||||||| ||||| || || || |||||||||||||| ||||| || || |  || |||||||| |||||||| ||||| ||||| || || |||||    
T  59393 tatccaaaaaagcatgaaaaattcggttcatatactccatgaacacaccgggcgtgttagtaacaccgaaaggcatcactttgtattcgtaatgtccata 59294  T
Q  303 acgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccact 402  Q
     ||  | || || || |||||||||||||||||||| || || ||||| || || |||| ||||||||| || || || || |||||   ||||| |||     
T  59293 tcgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcttcatccttcaccttaatttgatggtaacctgacctcaagtcgatcttactaaaaacttttgcactcacc 59194  T
Q  403 aactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattctt 449  Q
    ||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||||||||| |||||    
T  59193 aactggtccatcaagtcatcaatcctcggtagtggatacctgttctt 59147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #4
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 103 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 65881 - 65535
Alignment:
Q  103 ttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatc 202  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||     
T  65881 ttctctttcaacacttgcaacacaatcttcagatgttccgcatgctcttcttccgtcttagaataaattaaaatatcatcaatgaatacaaccacgaatt 65782  T
Q  203 gatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccata 302  Q
     ||||||||| ||||| || || || |||||||||||||| ||||| || || |  || |||||||| |||||||| ||||| ||||| || || |||||    
T  65781 tatccaaaaaagcatgaaaaattcggttcatatactccatgaacacaccgggcgtgttagtaacaccgaaaggcatcactttgtattcgtaatgtccata 65682  T
Q  303 acgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccact 402  Q
     ||  | || || || |||||||||||||||||||| || || ||||| || || |||| ||||||||| || || || || |||||   ||||| |||     
T  65681 tcgtgtcctaaatgccgtcttctgcatatcttcatccttcaccttaatttgatggtaacctgacctcaagtcgatcttactaaaaacttttgcactcacc 65582  T
Q  403 aactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattctt 449  Q
    ||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||||||||| |||||    
T  65581 aactggtccatcaagtcatcaatcctcggtagtggatacctgttctt 65535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 162; Significance: 3e-86; HSPs: 3)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 29 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 44996 - 44795
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  44996 cagaaataacatggccaagaaaactcacctctttcaaccagaagtcacacttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacatttgcaagacaat 44897  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  44896 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtatatcaaaatatcttcgattaattcaactacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcga 44797  T
Q  229 tt 230  Q
    ||    
T  44796 tt 44795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 29 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 9161 - 8888
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| ||| ||    ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |  ||||| ||||||||||||||||| | |||    
T  9161 cagaaataatatggcgaagaaaacacacttcacataaccagaattcacatttggacaacttggcatacaacttcttttctttcaacacttgcaacataat 9062  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
     ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| || |||||||| || ||||| || || |||  ||||| | | |||||||| ||        
T  9061 tttcagatgctctgcatgctcttcttcagtcttagaataaataaagatatcatcaataaacacgaccacaaatttatccagataagcatggaaaattaag 8962  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccata 302  Q
    ||||| |||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||| || |||||    
T  8961 ttcatgtacttcataaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttatattcataatgtccata 8888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130; HSP #3
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 316 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 4955 - 4822
Alignment:
Q  316 gctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatca 415  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || || |||||| | || |||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4955 gctgttttctgcatatcttcatccttcaccttaatcagatggtaacctaacctcaaataaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatta 4856  T
Q  416 aatcatcaattcacggaagtggatacctattctt 449  Q
    |||||||||||| | |||||||||| ||||||||    
T  4855 aatcatcaattctcagaagtggatatctattctt 4822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0865 (Bit Score: 160; Significance: 5e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0865
Description:

Target: scaffold0865; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 40 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 2614 - 2183
Alignment:
Q  40 tggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgct 139  Q
    |||||||||||||| || ||  | ||||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||| | ||||| ||||||||||| | ||||||||||||||    
T  2614 tggccaagaaaacttacttcacttaaccagaattcacatttagacaacttggcatacaacttcctttctttaaacacttgcaacaaaatcttcagatgct 2515  T
Q  140 cagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactc 239  Q
    | ||||| ||||||||| |||| || ||||| | ||||||||| || |||||||| || |||  ||||||| | |||||||| || || |||||||||||    
T  2514 ctgcatgctcttcttcattcttagaataaattagaatatcatcaataaacacaaccacaaatttatccaaataagcatggaaaattcggttcatatactc 2415  T
Q  240 cataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatct 339  Q
    ||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||  | || || |  || ||||||||||| |||||     
T  2414 catgaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcattactttatattcataatgtccatatcgtgtcctaaaggtcgttttctgcatatcctcatcc 2315  T
Q  340 tttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggat 439  Q
    || || |||||||| || |||| ||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  2314 ttcaccttaatctgatggtaacctgacctcaaatcaattttgttgaatacacaagcacccactaactgatccattaaatcatcaattctcggaagtggat 2215  T
Q  440 acctattcttgatagttaccttgttcaactga 471  Q
    |||| ||||| || || || || |||||||||    
T  2214 acctgttctttatcgtaactttattcaactga 2183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 160; Significance: 5e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 40 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 29627 - 29196
Alignment:
Q  40 tggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgct 139  Q
    |||||||||||||| || ||  | ||||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||| | ||||| ||||||||||| | ||||||||||||||    
T  29627 tggccaagaaaacttacttcacttaaccagaattcacatttagacaacttggcatacaacttcctttctttaaacacttgcaacaaaatcttcagatgct 29528  T
Q  140 cagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactc 239  Q
    | ||||| ||||||||| |||| || ||||| | ||||||||| || |||||||| || |||  ||||||| | |||||||| || || |||||||||||    
T  29527 ctgcatgctcttcttcattcttagaataaattagaatatcatcaataaacacaaccacaaatttatccaaataagcatggaaaattcggttcatatactc 29428  T
Q  240 cataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatct 339  Q
    ||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||  | || || |  || ||||||||||| |||||     
T  29427 catgaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcattactttatattcataatgtccatatcgtgtcctaaaggtcgttttctgcatatcctcatcc 29328  T
Q  340 tttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggat 439  Q
    || || |||||||| || |||| ||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  29327 ttcaccttaatctgatggtaacctgacctcaaatcaattttgttgaatacacaagcacccactaactgatccattaaatcatcaattctcggaagtggat 29228  T
Q  440 acctattcttgatagttaccttgttcaactga 471  Q
    |||| ||||| || || || || |||||||||    
T  29227 acctgttctttatcgtaactttattcaactga 29196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0523 (Bit Score: 159; Significance: 2e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0523
Description:

Target: scaffold0523; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 29 - 471
Target Start/End: Original strand, 1822 - 2264
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    ||||||||| |||| |||||||||| || ||  | ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |  || || ||||||||||||||||| |||||    
T  1822 cagaaataatatggtcaagaaaacttacttcacttaaccaaaattcacatttggacaacttggcatacaacttattttctttcaacacttgcaatacaat 1921  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| || || ||||| || |||||||| || | |  ||||| | | |||||||| || |      
T  1922 cttcagatgctctgcatgctcttcttcagtcttagaataaattaagatgtcatcaataaacacaaccacaattttatccagataagcatggaaaattctg 2021  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    |||||||||||||||||||| | ||| ||||| ||| |||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||  | || || || ||||||||||    
T  2022 ttcatatactccataaacacactaggcgcattagtagcaccgaaaggcatcaccttatattcatagtgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgca 2121  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    |||| ||||| || || |||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||     
T  2122 tatcctcatccttcaccttaatctgatggtaaccagacctcaaatcaattttactaaacacacgtgcacccactaattgatccattaaatcgtcaattct 2221  T
Q  429 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 471  Q
    ||||||||||||||||||||| || || || || |||||||||    
T  2222 cggaagtggatacctattctttatcgtcactttattcaactga 2264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 156; Significance: 1e-82; HSPs: 2)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 29 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 38301 - 38070
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |     
T  38301 cagaaataacatgtccaagaaagctcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagcttcttctctttcaacacttgcaaaaccag 38202  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  38201 cttcaaatgctcagcatgttcttcttcagacttgtagtaaatcaaaatatcatcaatgaaaacaaccacgaaacgatccaaaaatgcatgaaagatgcga 38102  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcatt 260  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  38101 ttcatgtactccataaatactccaggtgcatt 38070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 405 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 41482 - 41417
Alignment:
Q  405 ctgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  41482 ctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctttatggtcaccttgttcaactg 41417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 155; Significance: 4e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 39 - 449
Target Start/End: Original strand, 49067 - 49477
Alignment:
Q  39 atggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgc 138  Q
    ||||||||||||||| || |   | |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  49067 atggccaagaaaacttacttgacttaaccagaactcacattttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaacacttgcaatacaatcttcagatgt 49166  T
Q  139 tcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatact 238  Q
    || ||||| |||||||||||||| || |||||||| || ||||| || |||||||| || |||  ||||| | | |||||||| ||    ||||||||||    
T  49167 tctgcatgctcttcttcagtcttagaataaatcaagatgtcatcaataaacacaaccacaaatttatccagataagcatggaaaattttgttcatatact 49266  T
Q  239 ccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatc 338  Q
    |||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||||||  | || || || |||||||||||||| |||||    
T  49267 ccataaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcatagtgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatc 49366  T
Q  339 ttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtgga 438  Q
     || || |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| || | | ||||||||    
T  49367 cttcaccttaatctgatggtaacctgacctcaaatcaattttgctgaatacacgagcacccactaactgatccattaaaccatcgatcctcagaagtgga 49466  T
Q  439 tacctattctt 449  Q
    |||||| ||||    
T  49467 tacctaatctt 49477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244 (Bit Score: 153; Significance: 7e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0244
Description:

Target: scaffold0244; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 29 - 449
Target Start/End: Original strand, 19305 - 19725
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    |||||||||  |||||||||||||| || ||  | ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |  ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  19305 cagaaataatgtggccaagaaaacttacttcacttaaccagaattcacattttgacaacttggcatacaacttcttatctttcaacacttgcaatacaat 19404  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
    |||||||||||| ||||| || ||||| ||||| || ||||| || || ||||| || |||| ||| || |||  ||| | | | |||||||| ||        
T  19405 cttcagatgctctgcatgctcctcttcggtcttagaataaattaagatgtcatcaataaacataaccacaaatttatctagataagcatggaaaattttg 19504  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    || ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||  | || || || ||||||||||    
T  19505 tttatatactccataaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttatattcatagtgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgca 19604  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    |||| ||||| || || |||||||| || |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| | ||||||||| |     
T  19605 tatcctcatccttcaccttaatctgatggtaacctgacctcaaatcaatcttgctgaacacacgagcacccactaattgatccattagatcatcaatcct 19704  T
Q  429 cggaagtggatacctattctt 449  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  19705 cggaagtggatacctattctt 19725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 151; Significance: 1e-79; HSPs: 2)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 29 - 471
Target Start/End: Original strand, 24167 - 24609
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    |||||||||  |||||||||||||| || ||  | |||||||| ||||| || ||||| || ||||| |  ||||| ||||| || |||||||| |||||    
T  24167 cagaaataatgtggccaagaaaacttacttcacttaaccagaactcacacttcgacaacttagcatacaacttcttttcttttaatacttgcaacacaat 24266  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
    ||||||||| || ||||| || ||||||||||| || ||||||| ||||||||| || |||||||| || |||  ||||| | | |||||||| || ||     
T  24267 cttcagatgttctgcatgctcctcttcagtcttagaataaatcagaatatcatcaataaacacaaccacaaatttatccagagaagcatggaaaattcgg 24366  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| || || ||||| || || ||||| ||  | || || |||||||||||||    
T  24367 ttcatatactccataaacaccccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttgtattcgtaatgtccatatcgtgtcctaaaggctgtcttctgca 24466  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    |||| ||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| || | ||||||||||||||||||||| || ||||||||||     
T  24467 tatcgtcatccttcaccttaatctggtggtaacttgacctcaagtcaatcttactgaacacccttgcacccactaactgatccattaagtcatcaattct 24566  T
Q  429 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 471  Q
    ||||||||||||||||||||| || || || ||||| ||||||    
T  24567 cggaagtggatacctattctttatcgtaactttgtttaactga 24609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #2
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 41 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 44758 - 44350
Alignment:
Q  41 ggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctc 140  Q
    ||||||||||||| || ||  | ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |  || || |||||||| |||||||| |||||||||||||| |     
T  44758 ggccaagaaaacttacttcacttaaccaaaattcacattttgacaacttggcatacaacttattttctttcaatacttgcaatacaatcttcagatgttt 44659  T
Q  141 agcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactcc 240  Q
     | ||| ||||||| |||||| || ||||| || || ||||| || |||||||| || |||  ||||| | |||||||||| ||    ||||||||||||    
T  44658 tgtatgctcttctttagtcttagaataaattaagatgtcatcaataaacacaaccacaaatttatccagatatgcatggaaaatttttttcatatactcc 44559  T
Q  241 ataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatctt 340  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||  | || || || ||||||| |||||| ||||| |    
T  44558 ataaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttatattcatagtgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctccatatcctcatcct 44459  T
Q  341 ttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggata 440  Q
    | || |||||||| || ||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  44458 tcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaattttactgaacacacgagcacccactaactgatccatcaaatcgtcaattctcggaagtggata 44359  T
Q  441 cctattctt 449  Q
    ||| |||||    
T  44358 cctgttctt 44350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 150; Significance: 4e-79; HSPs: 2)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 29 - 470
Target Start/End: Original strand, 4702 - 5143
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    |||||||||  |||||||||||||| || ||  | |||||||| ||||| || ||||| || ||||| |  ||||| |||||||| ||||| || |||||    
T  4702 cagaaataatgtggccaagaaaactgacttcacttaaccagaactcacaattcgacaacttagcatacaacttcttttctttcaatacttgtaatacaat 4801  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
    ||||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||||| ||| ||||| || |||||||||||||||  |||||   | |||||||| || ||     
T  4802 cttcagatgttctgcatgctcttcttcagtcttagaataaatcagaatgtcatcaataaacacaactacgaatttatccaggtaggcatggaaaattcgg 4901  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||| |||||||||    || || || |||||| |||    
T  4902 ttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttatattcatagtaaccataacgtgacctaaaggccgtcttcggca 5001  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    |||| ||||| || || |||||||| || |||| ||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||     
T  5002 tatcctcatccttcaccttaatctgatggtaacctgacctcaagtcaattttactaaacacacgtgcacccactaattgatccattaaatcgtcaattct 5101  T
Q  429 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    ||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||    
T  5102 cggaagtggatacctgttctttatcgtaaccttattcaactg 5143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 31 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 42458 - 42019
Alignment:
Q  31 gaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatct 130  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| || || || ||  ||||||| |  |||||||| |||| ||||||||| ||||       
T  42458 gaaataatatgaccaagaaaactcacttcgttcaaccagaattcgcacttcgataaactggcatataacttcttctccttcagcacttgcaaaacaaatc 42359  T
Q  131 tcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgatt 230  Q
    ||| |||||| |||||||| || || ||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||  || |||||||||||| | ||||| || ||  ||||    
T  42358 tcaaatgctcggcatgttcctcctcggtcttggagtatatcagaatatcatctataaacacaaaaacaaatcgatccaaataagcatgaaaaatatgatt 42259  T
Q  231 catatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcata 330  Q
    |||||| ||||||||||||||  | || || |||||||| |||||||| ||   |||||| || ||  | ||| |  | || || || |||||||| |||    
T  42258 catatattccataaacactccttgcgcgttagtaacaccgaaaggcatcaccgaatattcgtaatgttcgtaatgtgtcctaaaggccgtcttctgaata 42159  T
Q  331 tcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacg 430  Q
    ||  ||||||| ||||| ||||||||||| | ||| || || ||||| ||   ||| |||  ||||||||||||||||||||||||||| || || | |     
T  42158 tccccatctttcactttgatctggtgatagcctgatcttaagtcaatcttaaagaacacaaatgcacccactaactgatccatcaaatcgtcgatcctca 42059  T
Q  431 gaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    ||||||||||||||||||| || || || |||||||||||    
T  42058 gaagtggatacctattctttattgtcactttgttcaactg 42019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 146; Significance: 1e-76; HSPs: 2)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 32 - 449
Target Start/End: Original strand, 16068 - 16485
Alignment:
Q  32 aaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatctt 131  Q
    |||||| ||||||||||||||| || ||  | ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |   |||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  16068 aaataatatggccaagaaaacttacttcacttaaccaaaattcacattttgacaacttggcatacaacctcttttccttcaacacttgcaatacaatctt 16167  T
Q  132 cagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattc 231  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||| | || ||||| || || ||||| || |||||||| || |||  ||||| | | |||||||| || |  |||    
T  16168 cagatgctctgcatgctcttcttcagtcgtagaataaattaagatgtcatcaataaacacaaccacaaatttatccagataagcatggaaaattccgttc 16267  T
Q  232 atatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatat 331  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||  | || || || |||||||||| ||    
T  16268 atatactccataaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttatattcatagtgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgcaaat 16367  T
Q  332 cttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacgg 431  Q
    | ||||| || || |||||||| || |||| ||||||||||| |||||| || || ||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||    
T  16368 cctcatccttcaccttaatctgatggtaacctgacctcaaataaattttactaaacacacaagcacccactaactgatccattaaatcgtcaattctcgg 16467  T
Q  432 aagtggatacctattctt 449  Q
    || ||||||||| |||||    
T  16468 aactggatacctgttctt 16485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 8213 - 7768
Alignment:
Q  30 agaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatc 129  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||  |||| |||||||| || ||| | |  |  ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  8213 agaaatcacatgaccaaggaaactcacttccttcaaccaaaacacacacttagacaacttagcacataactggttctctttcaaaacttgcaacacaatc 8114  T
Q  130 ttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgat 229  Q
     ||||||||||| |||| ||||| || | ||| || || |  ||||||||||| || ||||| || |  || || |||| | | | ||| || || | ||    
T  8113 ctcagatgctcaacatgctcttcctccgacttcgaatacactaaaatatcatctataaacaccaccaaaaaacggtccagataaggatgaaatattctat 8014  T
Q  230 tcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcat 329  Q
    |||| || |||||||| || || |||||||| |  || ||||| ||||| ||   ||| |||||||| ||||| | | ||| ||| || || ||    ||    
T  8013 tcatgtattccataaagacacctggtgcattagatactccaaatggcatcacagaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcggttttggatat 7914  T
Q  330 atcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcac 429  Q
    |||||   | |||||| ||||||| ||||| | ||||||||||||||| || || || ||   |||||| || |  |||||||||||||||||||| |      
T  7913 atctttcgcctttactctaatctgatgatatcctgacctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaaccagttgatccatcaaatcatcaatccgt 7814  T
Q  430 ggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactgatgat 475  Q
    ||||||||||| | |||||| || || |||||||||||||| ||||    
T  7813 ggaagtggatatcgattcttaatcgtcaccttgttcaactgttgat 7768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 145; Significance: 4e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 23 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 8052 - 7844
Alignment:
Q  23 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 122  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8052 catcaccagaaataacatgggcaagaaaacttacctctttcaaccagaactcacacttagatagtttagcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 7953  T
Q  123 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||    
T  7952 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgacaaaaacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatgaaag 7853  T
Q  223 atgcgattc 231  Q
    |||||||||    
T  7852 atgcgattc 7844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 145; Significance: 4e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 29 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 50228 - 49808
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| || ||  | ||| ||||||||||||| ||||| |||||||| |  ||||| |||||||||||||| || |||||    
T  50228 cagaaataatatggccaagaaaacttacttcacttaacaagaattcacattttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaacacttgaaacacaat 50129  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| || || ||||| || |||||||| || |||  ||||| | | |||||||| || ||     
T  50128 cttcagatgctctgcatgctcttcttcagtcttagaataaattaagatgtcatcaataaacacaaccacaaatttatccagataggcatggaaaattcgg 50029  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| | |||||||| || ||||||||||| |||||||| ||  | || || |  || |||||||    
T  50028 ttcatatactccataaacacaccaggcgcattagtaacatcgaaaggcatcaccttatattcataatgaccatatcgtgtcctaaagggcgtattctgca 49929  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    |||| ||||| || || |||||||  || |||| ||||||||||||||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||     
T  49928 tatcctcatcattcaccttaatctaatggtaacctgacctcaaatcaatcttgcagaacacacgagcacccactaactgatccatgaaatcgtcaattct 49829  T
Q  429 cggaagtggatacctattctt 449  Q
    || |||| ||||||| |||||    
T  49828 cgaaagtagatacctgttctt 49808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0751 (Bit Score: 144; Significance: 2e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0751
Description:

Target: scaffold0751; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 39 - 449
Target Start/End: Original strand, 4139 - 4552
Alignment:
Q  39 atggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgc 138  Q
    |||||| |||||||| || ||  | ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  4139 atggcccagaaaacttacttcacttaaccaaaattcacattttgacaacttggcatacaacttcttctctttcaacacttgcaatacaatcttcagatgt 4238  T
Q  139 tcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatact 238  Q
    |  ||||| ||||||||||||||  | |||||||| || | ||| || |||||||| || |||  ||||| | | |||||||| || || ||||||||||    
T  4239 tatgcatgctcttcttcagtcttataataaatcaagatgtgatcaataaacacaaccacaaatttatccagataggcatggaaaattcggttcatatact 4338  T
Q  239 ccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataac---tttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttc 335  Q
    |||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||    ||||||||||| |||||||||||  | || || || |||||||||||||| ||    
T  4339 ccataaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttattatattcataatgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctc 4438  T
Q  336 atcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagt 435  Q
    ||| || ||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || ||| |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||    
T  4439 atccttcactttaatctgatggtaaccggacctcaaatcaattttactaaacacaggtgcacccacaaactgatccattaaatcgtcaattctcggaagt 4538  T
Q  436 ggatacctattctt 449  Q
    |||||||| |||||    
T  4539 ggatacctgttctt 4552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 144; Significance: 2e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 29 - 471
Target Start/End: Original strand, 33287 - 33730
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    |||||||||  |||||||||||||| || ||  | ||| |||| ||||||||  |||| |||||||| |  ||||||||||||||||| || || |||||    
T  33287 cagaaataatgtggccaagaaaacttacttcacttaactagaactcacattttaacaacttggcatacaacttcttctctttcaacacctgtaatacaat 33386  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
    ||| ||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||  ||||||| | |||||||| ||  |     
T  33387 ctttagatgttctgcatgctcttcttcagtcttagaataaatcaagatgtcatcaatgaacacaaccacgaatttatccaaataggcatggaaaatttgg 33486  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| || |||||||| || || ||||| ||  | || || || ||||||||||    
T  33487 ttcatatactccataaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgtccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgca 33586  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    |||| ||||| || || |||||||| || |||| ||||||||| ||||| ||| | || ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |     
T  33587 tatcctcatccttcacattaatctgatggtaacctgacctcaagtcaatcttgttaaacacacgtgcacccactaattgatccattaagtcatcaatcct 33686  T
Q  429 cggaagtggatacctattc-ttgatagttaccttgttcaactga 471  Q
    ||||||||||||||| ||| || || || |||||||||||||||    
T  33687 cggaagtggatacctgttctttaatggtaaccttgttcaactga 33730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0993 (Bit Score: 143; Significance: 6e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0993
Description:

Target: scaffold0993; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 197 - 471
Target Start/End: Original strand, 1 - 275
Alignment:
Q  197 cgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtg 296  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||  | ||||| ||||||||| ||||| ||    
T  1 cgaaacgatccaaaaatgcatgaaagatgcgattcatgtactccataaatactccaggtgcatttgtaacactgagaggcaaaactttatactcataatg 100  T
Q  297 accataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgca 396  Q
     ||||| ||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||  || |||||||| || ||| |||||||||| |||    
T  101 tccataccgcgttctaaaagccgtcttctgcatatcttcatccttcactttaatctagtgataacccgatctcaaatctatcttgttgaaaacacgcgca 200  T
Q  397 cccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 471  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||    
T  201 cccactaacggatccatcaagtcatcaattcttggaagtggatacctattctttatagttacttttttcaactga 275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 143; Significance: 6e-75; HSPs: 2)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 194 - 424
Target Start/End: Original strand, 10284 - 10514
Alignment:
Q  194 ctacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcata 293  Q
    ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||| |||||    
T  10284 ctacgaaccgatccaaaaatgcttgaaagatgcgattcatgtactccataaatactccaggtgcatttgtaacaccgaaaggcatcaccttatactcata 10383  T
Q  294 gtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgt 393  Q
     |||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||| || ||||||||||||| |    
T  10384 atgaccatcccgcgttctaaaagctgtcttctgcatatcttcatctttcactttaatctggtgataacctgatctcaaatctatcttgctgaaaacacat 10483  T
Q  394 gcacccactaactgatccatcaaatcatcaa 424  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10484 gcacccactaactgatccatcaagtcatcaa 10514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 29 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 1898 - 1502
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| ||  | |||||||| ||||| || |||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  1898 cagaaataatgtggccaagaaaactcacttcacttaaccagaactcacacttcgacaatttggcatacaacttcttctctttcaatacttgcaatacaat 1799  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
    ||||||||| || ||||| |||||||| ||| | || | ||||| ||| ||||| ||||| | ||| || |||  |||||   | ||||| || || |      
T  1798 cttcagatgttctgcatgctcttcttctgtccttgaattaatcagaatgtcatcaatgaatagaaccacaaatttatccaggtaggcatgaaaaattctg 1699  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||| | |||| ||| || |||||||| || |||||||| ||  | || || || ||||||||||    
T  1698 ttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacaacgaaagacatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggcagtcttctgca 1599  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaat 425  Q
    |||| | ||| || || || ||||| || || | ||||||||| ||||| || |||||||| |  |||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  1598 tatccttatccttcaccttgatctgatggtagcctgacctcaagtcaatcttactgaaaaccctcgcacccactagctgatccatcaagtcatcaat 1502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585 (Bit Score: 142; Significance: 3e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0585
Description:

Target: scaffold0585; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 32 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 5439 - 5022
Alignment:
Q  32 aaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatctt 131  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||  |  | ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  5439 aaataatatggccaagaaaacttactccacttaaccaaaattcacatttggacaacttggcatacaacttcttttctttcaacacttgcaacacaatctt 5340  T
Q  132 cagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattc 231  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||| |||| || ||||| |  |||||||| || |||||||| || |||  ||||| | | |||||||| || | ||||    
T  5339 cagatgctctgcatgctcttcttcattcttagaataaattaggatatcatcaataaacacaaccacaaatttatccagataagcatggaaaattctattc 5240  T
Q  232 atatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatat 331  Q
    || |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||| ||| |  ||||| ||||| || ||||| ||  | || || || || ||||||||||    
T  5239 atgtactccataaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaagacatcatcttatactcataatgtccatatcgtgtcctaaaggccgttttctgcatat 5140  T
Q  332 cttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacgg 431  Q
    ||||||| || || ||||| || || |||| |||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  5139 cttcatccttcaccttaatttgatggtaacctgacctcaaatcaatttgtctgaacacacgagcacccactaactgatccattaaatcatcaattctcgg 5040  T
Q  432 aagtggatacctattctt 449  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  5039 aagtggatatctattctt 5022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 139; Significance: 2e-72; HSPs: 2)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 29 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 13689 - 13247
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    |||||||||  |||||||||||||| || ||  | |||||||| |||||||| |||||||| ||||| |  |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  13689 cagaaataatgtggccaagaaaacttacttcacttaaccagaactcacattttgacaattttgcatacaacttcttctctttcaatacttgcaatacaat 13590  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
    ||||||||| || ||||| |||||||| ||||| || |||||||| || ||||| || |||||||| || |||  ||||| | | || ||||| || ||     
T  13589 cttcagatgttctgcatgctcttcttctgtcttcgaataaatcaagatgtcatcaataaacacaaccacaaatttatccagataggcgtggaaaattcgg 13490  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||| |||||||| || |||||||| || || ||||| |   | || || || ||||||||||    
T  13489 ttcatatactccataaacacaccaggcgcattagtaagaccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgtccatatcatgtcctaaaggccgtcttctgca 13390  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    |||| ||||| || || |||||||| || |||| ||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| || | |||||| |     
T  13389 tatcctcatccttcacattaatctgatggtaacctgacctcaaatcaatcttgctaaacacacgagcacccactaaatgatccatgaagttatcaatcct 13290  T
Q  429 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 471  Q
    ||||||||||||||| ||||| || || ||||| |||||||||    
T  13289 cggaagtggatacctgttctttatcgtaaccttattcaactga 13247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #2
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 29 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 21868 - 21426
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    |||||||||  |||||||||||||| || ||  | |||||||| |||||||| ||||| || ||||| |  |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  21868 cagaaataatgtggccaagaaaacttacttcacttaaccagaactcacattttgacaacttcgcatacaacttcttctctttcaatacttgcaatacaat 21769  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
    ||||||||| || ||||| |||||||| ||||| || |||||||| || ||||| || |||||||| || |||  ||||| | | || ||||| || ||     
T  21768 cttcagatgttctgcatgctcttcttctgtcttcgaataaatcaagatgtcatcaataaacacaaccacaaatttatccagataggcgtggaaaattcgg 21669  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||| |||||||| || |||||||| || || ||||| |   | || || || ||||||||||    
T  21668 ttcatatactccataaacacaccaggcgcattagtaagaccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgtccatatcatgtcctaaaggccgtcttctgca 21569  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    |||| ||||| || || |||||||| || |||| ||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| || | |||||| |     
T  21568 tatcctcatccttcacattaatctgatggtaacctgacctcaaatcaatcttgctaaacacacgagcacccactaaatgatccatgaagttatcaatcct 21469  T
Q  429 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 471  Q
    ||||||||||||||| ||||| || || ||||| |||||||||    
T  21468 cggaagtggatacctgttctttatcgtaaccttattcaactga 21426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0304 (Bit Score: 138; Significance: 6e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0304
Description:

Target: scaffold0304; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 40 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 1827 - 1418
Alignment:
Q  40 tggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgct 139  Q
    |||||||||||||| || || || |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |    
T  1827 tggccaagaaaactaacttcatttaaccagaactcacattttgacaacttggcatacaacttcttctctttcaacacttgcaatacaatcttcagatctt 1728  T
Q  140 cagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactc 239  Q
    | ||||| |||||||||||||| || |||||||| || ||||| || |||||||| || |||  ||||| | | |||||||| || || || ||||||||    
T  1727 ctgcatgctcttcttcagtcttagaataaatcaagatgtcatcaataaacacaaccacaaatttatccagataggcatggaaaattcggtttatatactc 1628  T
Q  240 cataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatct 339  Q
    ||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||  || || ||||||||||||||  |||| ||  | || ||  | |||||||||||||| |||||     
T  1627 cataaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaagatatcaccttatattcatagtgttcatatcgtgtcctaaagaccgtcttctgcatatcctcatcc 1528  T
Q  340 tttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggat 439  Q
    || || |||||||| || |||| |||||||||||||||||| ||  | ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||| | ||||| |||||    
T  1527 ttcaccttaatctgatggtaacctgacctcaaatcaattttactatacacacgagcacccactgactgatccattaaatcatcaatcctcggaaatggat 1428  T
Q  440 acctattctt 449  Q
    |||| |||||    
T  1427 acctgttctt 1418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 138; Significance: 6e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 32 - 449
Target Start/End: Original strand, 28481 - 28898
Alignment:
Q  32 aaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatctt 131  Q
    |||||| ||||||||||||||| || ||  | ||||||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||| ||||||||||||||||| |||||| |    
T  28481 aaataatatggccaagaaaacttacttcacttaaccagaattcacatttggacaacttggcatacaatttcttttctttcaacacttgcaacacaatcat 28580  T
Q  132 cagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattc 231  Q
    ||||||||| ||||| | ||||||| || | || ||||| |  |||||||| || |||||||| || |||  ||||| | | |||||||| || |  |||    
T  28581 cagatgctctgcatgcttttcttcattcctagaataaattaggatatcatcaataaacacaaccacaaatttatccagataggcatggaaaattctgttc 28680  T
Q  232 atatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatat 331  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| || ||||| ||||| || ||||| ||  | || || |  || ||||||||||    
T  28681 atatactccataaatacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttatactcataatgtccatatcgtgtcctaaaggtcgttttctgcatat 28780  T
Q  332 cttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacgg 431  Q
    | ||||| || || |||||||| || |||| ||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||    
T  28781 cctcatccttcaccttaatctgatggtaacctgacctcaagtcaattttactgaacacgcgtgcacccactaactgatctattaaatcatcaattctcgg 28880  T
Q  432 aagtggatacctattctt 449  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  28881 aagtggatatctattctt 28898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 29 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 22538 - 22099
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |   | ||||||| || ||||||||| |||||    
T  22538 cagaaataatatggccaaaaaaactcacctcattcaaccagaattcacactttgacaacttggcatataacgttttctcttgcagcacttgcaaaacaat 22439  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
    ||||| |||||  || ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |  ||||| ||| | |||||  | |||| |    
T  22438 cttcaaatgcttggcgtgttcttcttcagacttagagtatatcaaaatatcatcaatgaacacaacaacaatgcgatctaaataagcatgagaaatgcaa 22339  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    ||||| || ||| |||| || || |||||||| ||||||| ||| ||||| |||  |||||  || || || |||||  | || || || ||||||||||    
T  22338 ttcatgtattccgtaaatacacccggtgcattagtaacacgaaa-ggcatcactgaatatttgtaatgtccgtaacgtgtcctaaaggccgtcttctgca 22240  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    |||| ||||| || ||||||||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  22239 tatcctcatccttcactttaatctgatgatagctcgatctcaaatcaatcttgctaaacacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcgattct 22140  T
Q  429 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaact 469  Q
     ||||||||||| |||||||| || || || ||||||||||    
T  22139 tggaagtggataactattctttattgtcactttgttcaact 22099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 135; Significance: 4e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 29 - 471
Target Start/End: Original strand, 250573 - 251015
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    |||||||||  || || ||||||||||| ||  | |||||||| |||||||| ||||| || ||||| |   |||| || |||||||||||||| |||||    
T  250573 cagaaataatgtgacccagaaaactcacttcacttaaccagaactcacatttcgacaacttagcatacaacctcttttccttcaacacttgcaatacaat 250672  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
    |||||||||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||| || ||||| || |||||||| || |||  ||||| ||| |||||||| || ||     
T  250673 cttcagatgctctgcatgctcctcttcagtcttagaataaatcaagatgtcatcaataaacacaacaacaaatttatccagaaaagcatggaaaattcgg 250772  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| ||  | || || || ||||||||||    
T  250773 ttcatatactccatgaacactccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttgtattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgca 250872  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    |||  ||||| || || |||||||| || ||||  |||||||| ||||| |||||||| ||   ||||||||| || |||||||| || ||||||||||     
T  250873 tattctcatccttcaccttaatctgatggtaaccagacctcaagtcaatcttgctgaacacctttgcacccaccaattgatccattaagtcatcaattct 250972  T
Q  429 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 471  Q
    ||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||    
T  250973 cggaagtggatacctattctttatcgtaactttgttcaactga 251015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0560 (Bit Score: 134; Significance: 2e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold0560
Description:

Target: scaffold0560; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 302 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 8822 - 8657
Alignment:
Q  302 aacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccac 401  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8822 aacgcgttctgaaagatgtcttctgcatatcttcatctttcactttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccac 8723  T
Q  402 taactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaa 467  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  8722 taactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggattcctattcttgatagttaccttcttcaa 8657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0560; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 247 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 10975 - 10916
Alignment:
Q  247 actccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgc 306  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10975 actccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttatactcatagtgaccataacgc 10916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 134; Significance: 2e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 32 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 176694 - 176277
Alignment:
Q  32 aaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatctt 131  Q
    |||||| ||||||||||||| | || ||  | ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |  ||||| || |||||||||| ||| ||||||||    
T  176694 aaataatatggccaagaaaatttacttcacttaaccagaattcacatttggacaacttggcatacaacttcttttcattcaacacttacaacacaatctt 176595  T
Q  132 cagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattc 231  Q
     | |||||| ||||| |||||||||| ||| || |||||||| || ||||| || || ||||| || || ||||||||| | |||||||| || | ||||    
T  176594 taaatgctctgcatgctcttcttcagacttagaataaatcaagatgtcatcaataaatacaacaacaaaccgatccaaataagcatggaaaattctattc 176495  T
Q  232 atatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatat 331  Q
    || |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||  || |||  |||||| || || ||||| ||  | || || |  || || |||||||    
T  176494 atgtactccataaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaagatatcactgaatattcgtaatgtccatatcgtgtcctaaaggtcgttttatgcatat 176395  T
Q  332 cttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacgg 431  Q
    |||||||||||||||||||||  || ||||  ||||||||||||||  |||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  176394 cttcatcttttactttaatctaatggtaacccgacctcaaatcaatcatgctaaacacgcgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaattcgcgg 176295  T
Q  432 aagtggatacctattctt 449  Q
    ||||||||||||||||||    
T  176294 aagtggatacctattctt 176277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298 (Bit Score: 131; Significance: 9e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0298
Description:

Target: scaffold0298; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 29 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 10410 - 9969
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| || ||  | |||||||| ||||| || ||||| ||| |||| |  ||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  10410 cagaaataatatggccaagaaaacttacttcacttaaccagaactcacactttgacaacttgacatacaacttcttttctttcaatacttgcaatacaat 10311  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
    ||||||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||| || ||||| || |||||||| ||||||  ||| |   | |||||||| || ||     
T  10310 cttcagatgttctgcatgctcttcttcagtctttgaataaatcaagatgtcatcaataaacacaaccacgaatttatctaggtaagcatggaaaattcgg 10211  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    |||||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||| ||  | |  || || ||||||||||    
T  10210 ttcatatactccataaacacactaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcccaaaggccgtcttctgca 10111  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    |||| |||||||| || |||||||| || | || |||||| || ||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||| || || ||||| |     
T  10110 tatcctcatctttcaccttaatctgatggt-acctgaccttaagtcaatcttgctgaaaacctttgcacccactaactgatccattaagtcgtcaatcct 10012  T
Q  429 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 471  Q
    ||||||||||||||| ||||| || || || ||||||||||||    
T  10011 cggaagtggatacctgttctttatcgtaactttgttcaactga 9969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 131; Significance: 9e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 29 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 3306 - 2892
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    |||||||||  |||||||||||||  || ||  | |||||||| ||||| || ||||| || ||||| |  || ||||||||||| |||||||| |||||    
T  3306 cagaaataatgtggccaagaaaacaaacttcactaaaccagaactcacacttcgacaacttagcatacaactttttctctttcaatacttgcaatacaat 3207  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| |  || ||||| || |||||||| ||||||  ||||| | | |||||||| || ||     
T  3206 cttcagatgctctgcatgctcttcttcagtctttgaataaattaggatgtcatcaataaacacaaccacgaatttatccagataggcatggaaaattcgg 3107  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| || || ||||| || || ||||| ||  | || ||||| ||||||||||    
T  3106 ttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttgtattcgtaatgtccatatcgtgtcctaaaagccgtcttctgca 3007  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    |||| ||||| || || |||||||| || |||| ||||||||| ||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||| || |||||||| |     
T  3006 tatcctcatccttcaccttaatctgatggtaacctgacctcaagtcaatcttgctgaaaacctttgcacccactaactgatccattaagtcatcaatcct 2907  T
Q  429 cggaagtggatacct 443  Q
    |||||||||||||||    
T  2906 cggaagtggatacct 2892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 29 - 471
Target Start/End: Original strand, 69323 - 69765
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcata-aagtttcttctctttcaacacttgcaagacaa 127  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| ||  | ||| |||| || || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||| |  ||||| ||||    
T  69323 cagaaataacgtggcctagaaaactcacttcacttaacaagaactcgcacttcgacaacttggcatacaactttct-ctctttcaaaatctgcaacacaa 69421  T
Q  128 tcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcg 227  Q
    ||||||   | || ||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||| || || || || ||||||  ||||| ||| |||||||| || ||    
T  69422 tcttcaagcgttctgcatgctcctcttcagtcttagaataaatcaaaatatcatcaataaataccaccacgaatttatccagaaaagcatggaaaattcg 69521  T
Q  228 attcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgc 327  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| ||  | || ||||| |||||||||    
T  69522 gttcatatactccatgaacacaccaggcgcgttagtaacaccgaaaggcatcaccttgtattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaagccgtcttctgc 69621  T
Q  328 atatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattc 427  Q
    ||||||||||| || |||||||| || || |||| ||||||||| |||||||| || |||||   |||||| || || || |||||||| |||||||| |    
T  69622 atatcttcatccttcactttaatttgatggtaacctgacctcaagtcaattttactaaaaacttttgcacctaccaattggtccatcaagtcatcaatcc 69721  T
Q  428 acggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 471  Q
     |||||||||||| || ||||| || || || ||||||||||||    
T  69722 tcggaagtggatatctgttctttattgtaactttgttcaactga 69765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 126; Significance: 9e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 29 - 471
Target Start/End: Original strand, 14153 - 14601
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| ||  | |||||||| ||||| || ||||| || ||||| |  ||||| |||||||| | |||||| |||||    
T  14153 cagaaataatgtggccaagaaaactcacttcaattaaccagaactcacacttcgacaacttagcatacaacttcttttctttcaatatttgcaacacaat 14252  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||| | ||| ||||| ||  ||||||| ||||||  || ||   | |||||||| || ||     
T  14253 cttcagatgctctgcatgctcttcttcagtcttataataaattagaatgtcatcaatagacacaaccacgaatttattcaggtaggcatggaaaattcgg 14352  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcata------gtgaccataacgcattctgaaagctgtct 322  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||| || |||||||||||      ||||||||||||  | || || || ||||    
T  14353 ttcatatactccatgaacacaccaggtgcattagtaacaccgaaagacatcaccttatattcatatatatagtgaccataacgtgtcctaaaggccgtct 14452  T
Q  323 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 422  Q
    |||||||||| ||||| || || ||||| || || |||| ||||||||| ||||| || || || |||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  14453 tctgcatatcctcatccttcaccttaatttgatggtaacctgacctcaagtcaatcttactaaacacacgtgcacccactaactgatccattaagtcatc 14552  T
Q  423 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 471  Q
    ||| | ||||||||||||||| ||||| || || || ||||||||||||    
T  14553 aatcctcggaagtggatacctgttctttatcgtaactttgttcaactga 14601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 30 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 6160 - 5718
Alignment:
Q  30 agaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatc 129  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||| || ||||| |||||||| |||||| | |  |  ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  6160 agaaatcacatgaccaaggaaactcacttccttcaaccaaaactcacacttagacaacttggcacacaactggttctctttcaagacttgcaacacaatc 6061  T
Q  130 ttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgc-ga 228  Q
     ||| |||||||||||| ||||| |||| ||| || || | |||||||||||| |||||||| || || || || |||| | | | ||| || || |  |    
T  6060 ctcaaatgctcagcatgctcttcctcagacttcgaatacaccaaaatatcatctatgaacaccaccacaaaacggtccagataaggatgaaatattctta 5961  T
Q  229 ttcatata-ctccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgc 327  Q
    ||||| ||  || ||||| || || || ||||| |  || ||||| ||||| ||   ||| |||||||| ||||| | | ||| ||| || || ||        
T  5960 ttcatgtatttcaataaagacacctggcgcattagatactccaaatggcatcacagaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcagttttggat 5861  T
Q  328 atatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattc 427  Q
    ||||||||  | |||||| ||||||| ||||| | ||| ||||||||||| || || || ||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  5860 atatcttctgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcacccactagctgatccatcaaatcatcaatcc 5761  T
Q  428 acggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
      ||||||||||||| |||||| || || ||||||||||||||    
T  5760 ttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactg 5718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 125; Significance: 4e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 23 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 3712 - 3556
Alignment:
Q  23 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 122  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3712 catcaccagaaataacatggccaagaaaacttacctctttcaaccagaactcacacttagataatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 3613  T
Q  123 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatc 179  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3612 gataatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatc 3556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404 (Bit Score: 124; Significance: 1e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0404
Description:

Target: scaffold0404; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 29 - 416
Target Start/End: Original strand, 6703 - 7090
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| ||  | |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  6703 cagaaataatgtggccaagaaaactcacttcacttaaccagaactcacattttgacaacttggcatacaacttcttctctttcaatacttgcaatacaat 6802  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
    ||||||||| ||  |||| ||||| |||||||| || |||||||| || ||||| || |||||||| || |||  |  || ||| ||||| || || ||     
T  6803 cttcagatgttctacatgctcttcctcagtcttagaataaatcaagatgtcatcaataaacacaaccacaaatttaatcagaaaagcatgaaaaattcgg 6902  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||| ||||| |||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||| ||  | || || || ||||||||||    
T  6903 ttcatatactctataaacacatcaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgca 7002  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaa 416  Q
    |||| ||||| || ||||||||||| || |||| ||||||||||||||| || | ||| ||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  7003 tatcctcatccttcactttaatctgatggtaacctgacctcaaatcaatcttacggaatacacgagcacccactaaccgatccatcaa 7090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1288 (Bit Score: 123; Significance: 6e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold1288
Description:

Target: scaffold1288; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 29 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 1207 - 766
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| ||  | ||||| |||||||| || ||||| |||||||| |  |||||||| || || |||||||| |||||    
T  1207 cagaaataatgtggccaagaaaactcacttcacttaaccaaaattcacacttcgacaacttggcatacaacttcttctcctttaatacttgcaatacaat 1108  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
    ||||||||| || ||||  ||||||||| |||| || |||||||| || ||||| || ||| |||| ||||||  |||||   | |||||||| || ||     
T  1107 cttcagatgttctgcattctcttcttcattcttagaataaatcaagatgtcatcaataaactcaaccacgaatttatccaggtaggcatggaaaattcgg 1008  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| || |||||||| || || ||||| ||  | || || |  ||||||||||    
T  1007 ttcatatactccataaacacgccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgtccatatcgtgtcctaaaggtcgtcttctgca 908  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    |||| ||||| || || |||||||| || |||| ||||||||| ||||| |||||| ||||   ||||||||||||||||||||| || || ||||| |     
T  907 tatcctcatccttcaccttaatctgatggtaacctgacctcaagtcaatcttgctg-aaacctttgcacccactaactgatccattaagtcgtcaatcct 809  T
Q  429 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 471  Q
    ||||||||||||||| ||||| || || || ||||||||||||    
T  808 cggaagtggatacctgttctttatcgtaactttgttcaactga 766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0405 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0405
Description:

Target: scaffold0405; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 142 - 471
Target Start/End: Original strand, 566 - 895
Alignment:
Q  142 gcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactcca 241  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||| || || ||||| || |||||||| || |||  ||| | | | |||||||| || |  |||||||||||||    
T  566 gcatgctcttcttcagtcttagaataaattaagatgtcatcaataaacacaaccacaaatttatctagataagcatggaaaattctgttcatatactcca 665  T
Q  242 taaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttt 341  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||||| ||  | || || ||||||||||||||||| ||||| ||    
T  666 taaacacaccaggcgcattagtaacaccgaatggcatcaccttatattcataatgaccatatcgtgtcctaaaggctgtcttctgcatatcctcatcctt 765  T
Q  342 tactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatac 441  Q
     || |||||||| || |||| |||||||||| |||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  766 caccttaatctgatggtaacctgacctcaaaccaattttgctaaacacacgagcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagttgatac 865  T
Q  442 ctattcttgatagttaccttgttcaactga 471  Q
    |||||||| || || || || |||||||||    
T  866 ctattctttatcgtcactttattcaactga 895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 121; Significance: 9e-62; HSPs: 2)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 29 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 47387 - 46967
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  || ||  | ||||| ||||||||||| |||||  | ||||| |  || || ||||||||||||||||| |||||    
T  47387 cagaaataatatggccaagaaaacctacttcacttaaccaaaattcacattttgacaacgtcgcatacaactttttttctttcaacacttgcaatacaat 47288  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
    || ||||||||| ||||| || |||||| ||||  | ||||| |  |||||||| || |||||||| || |||  ||| | | | |||||||| ||  |     
T  47287 ctgcagatgctctgcatgctcatcttcattcttaaaataaattaggatatcatcaataaacacaaccacaaatttatctagataggcatggaaaatttgg 47188  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||||  | || || ||  |||||||||    
T  47187 ttcatatacttcataaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttatattcataatgaccataacgtgtcctaaaggccatcttctgca 47088  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    |||| ||||| || || |||||||| || ||||  |||||| |||||||||| || || |||||||||||||||| ||||||||| ||||| | |||||     
T  47087 tatcctcatccttcaccttaatctgatggtaaccggacctccaatcaattttactaaacacacgtgcacccactagctgatccattaaatcgttaattct 46988  T
Q  429 cggaagtggatacctattctt 449  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  46987 cggaagtggatacctattctt 46967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 29 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 56200 - 55780
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    |||||||||  |||| |||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| ||||| || ||||| |  || ||||||||||  |||||||| |||||    
T  56200 cagaaataatgtggctaagaaaactcacttcacttaaccagaattcacatttcgacaacttagcatacaactttttctctttcagtacttgcaatacaat 56101  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
    | ||||||| || ||||| || |||||||||||||| ||||| |  || ||||| ||||| ||||| |  ||   ||||| ||| ||||| || || ||     
T  56100 cctcagatgttctgcatgctcctcttcagtcttggaataaattaggatgtcatcaatgaatacaaccataaacttatccagaaaagcatgaaaaatacgg 56001  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    |||||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||| || |||||||||||  | || || |  ||||||||||    
T  56000 ttcatatactccatgaatacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaatttgtattcgtaatgaccataacgtgtcctaaaggtcgtcttctgca 55901  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    |||||||||| || || | ||| || || |||| ||||||||| ||||| ||  ||||||    |||||| || ||||| |||||||| || ||||| |     
T  55900 tatcttcatccttcacctgaatttgatggtaacctgacctcaagtcaatcttattgaaaatctttgcaccgaccaactggtccatcaagtcgtcaatcct 55801  T
Q  429 cggaagtggatacctattctt 449  Q
    |||||| ||||| || |||||    
T  55800 cggaagcggatatctgttctt 55780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0739 (Bit Score: 120; Significance: 3e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0739
Description:

Target: scaffold0739; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 23 - 182
Target Start/End: Original strand, 999 - 1158
Alignment:
Q  23 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 122  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  999 catcaccagaaataacatggccaagaaaacttacctctttcaaccagaactcacacttagatagtttagcataaagtttcttttctttcaacacttgcaa 1098  T
Q  123 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatc 182  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1099 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcagaatatcatc 1158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0206 (Bit Score: 120; Significance: 3e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0206
Description:

Target: scaffold0206; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 29 - 471
Target Start/End: Original strand, 25066 - 25508
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcata-aagtttcttctctttcaacacttgcaagacaa 127  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| ||  | |||||||| || || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||| |  ||||| ||||    
T  25066 cagaaataacgtggcctagaaaactcacttcagttaaccagaactcccacttcgacaacttggcatacaactttct-ctctttcaaaatctgcaacacaa 25164  T
Q  128 tcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcg 227  Q
    ||||||  ||||| ||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||| || || || || ||||||  ||||| ||| |||||||| || ||    
T  25165 tcttcaagtgctctgcatgctcctcttcagtcttagaataaatcaaaatatcatctataaataccaccacgaatttatccagaaaggcatggaaaattcg 25264  T
Q  228 attcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgc 327  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||| || ||  ||||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||||||  |  | || || || |||||||||    
T  25265 gttcatatactccatgaacacgccaggcgcgttaataacaccgaaaggcatcactttgtattcgtaatgaccatattgtgtcctaaaggccgtcttctgc 25364  T
Q  328 atatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattc 427  Q
    |||||||||||||| |||||||| || || ||||  |||||||| |||||||| || |||||   ||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||    
T  25365 atatcttcatctttcactttaatttgatggtaaccagacctcaagtcaattttactaaaaacttttgcacccaccaactggtccatcaagtcatcaaatc 25464  T
Q  428 acggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 471  Q
     |||||||||||| || ||||| || || || ||||||||||||    
T  25465 tcggaagtggatatctgttctttattgtaactttgttcaactga 25508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1477 (Bit Score: 118; Significance: 5e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold1477
Description:

Target: scaffold1477; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 30 - 471
Target Start/End: Original strand, 181 - 621
Alignment:
Q  30 agaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatc 129  Q
    ||||||||  |||||||||||||| || ||  | |||||||| ||||| || ||||| |||||||| |  ||||| |||||||| |||||||| ||||||    
T  181 agaaataatgtggccaagaaaactaacatcacttaaccagaaatcacactttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatacttgcaatacaatc 280  T
Q  130 ttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgat 229  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||| |  | | ||||||||| ||||| || || ||||| | ||||  ||||| | | |||||||| || || |    
T  281 ttcagatgttctgcatgctcttcttcagtcctaaaat-aatcaaaatgtcatcaataaatacaaccatgaatttatccagataggcatggaaaattcggt 379  T
Q  230 tcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcat 329  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| || || ||||| ||  | || || || |||||||||||    
T  380 tcatatacttcataaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcactttgtattcttaatgtccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgcat 479  T
Q  330 atcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcac 429  Q
    ||| ||||| || || |||||||| || |||  ||||||||| ||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||| || || ||||| | |    
T  480 atcctcatccttcaccttaatctgatggtaagctgacctcaagtcaatcttgctgaaaacctttgcacccactaactgatccattaagtcgtcaatcctc 579  T
Q  430 ggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 471  Q
    |||||||||||||  ||||| || || || ||||||||||||    
T  580 ggaagtggatacccgttctttattgtaactttgttcaactga 621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 115; Significance: 3e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 29 - 443
Target Start/End: Original strand, 950 - 1364
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    ||||||| | ||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| || || ||||||||||| |  |||||||| ||||  |||||||| |||||    
T  950 cagaaatgatatggccaagaaaagtcacttcgttcaaccagaattcacacttcgataatttggcatataacttcttctccttcagtacttgcaaaacaat 1049  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
      ||| |||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||| ||||||||| || |||||||| || ||  |||||||| | ||||| || || |||    
T  1050 tctcaaatgctccgcatgttcctcttcggtcttagagtatatcataatatcatctataaacacaacaacaaactgatccaaataagcatgaaaaatacga 1149  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    |||||||| |||||||||||||| || || || |||||||| |||||||| ||   |||||  || || |  |||||  | || || |||||||| || |    
T  1150 ttcatatattccataaacactcccggcgcgttagtaacaccgaaaggcatcaccgaatatttgtaatgtctgtaacgtgtcctaaaggctgtcttatgaa 1249  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||||||||  |  || || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  || || |     
T  1250 tatcctcatctttcactttgatctggtgatggcccgatcttaaatcaatcttactgaacacacgtgcacccactaactgatccatcaaattgtcgatcct 1349  T
Q  429 cggaagtggatacct 443  Q
    |||||||||||||||    
T  1350 cggaagtggatacct 1364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 115; Significance: 3e-58; HSPs: 2)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 77 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 19939 - 19545
Alignment:
Q  77 atttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaat 176  Q
    |||||||||| |||||||| |  || |||||||| || |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||| |||| || |||||||| ||    
T  19939 atttagacaacttggcatacaacttattctctttgaatacttgcaatacaatcttcagatgttctgcatgctcttcttcattcttagaataaatcaagat 19840  T
Q  177 atcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggc 276  Q
     ||||| || |||||||| ||||||  ||||||  | |||||||| || || ||||||||||||||||||||  |||  ||||| |||||||  ||||||    
T  19839 gtcatcaataaacacaaccacgaatttatccaagtaggcatggaaaattcggttcatatactccataaacacgtcagacgcattagtaacactgaaaggc 19740  T
Q  277 ataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaa 376  Q
    || || |||||||| || || ||||| ||  | || || || |||||||||||||| ||||| || || |||||||| || ||||  |||||||||||||    
T  19739 atcaccttatattcgtaatgtccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaa 19640  T
Q  377 ttttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 471  Q
    | |||||||||||   ||||||||||||||||||||| || || ||||| | | ||||||||||||| ||||| || || || || |||||||||    
T  19639 tcttgctgaaaacttttgcacccactaactgatccattaagtcgtcaatcctcagaagtggatacctgttctttattgtaactttattcaactga 19545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 30 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 26618 - 26457
Alignment:
Q  30 agaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatc 129  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||| || ||||| |||||||| || ||| | |  |  ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  26618 agaaatcacatgaccaaggaaactcacttccttcaaccaaaactcacacttagacaacttagcacataactggttctctttcaagacttgcaacacaatc 26519  T
Q  130 ttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacac 191  Q
     ||| ||| |||||||| ||||| |||| ||| || || | |||||||||||| ||||||||    
T  26518 ctcaaatgttcagcatgctcttcctcagacttcgaatacaccaaaatatcatctatgaacac 26457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054 (Bit Score: 114; Significance: 1e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0054
Description:

Target: scaffold0054; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 30 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 64860 - 64452
Alignment:
Q  30 agaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatc 129  Q
    ||||||||  |||||||||||||| || ||  | ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  64860 agaaataatgtggccaagaaaacttacttcacttaaccagaattcacattttgacaacttggcatacaacttcttctttttcaacacttgcaacacaatc 64761  T
Q  130 ttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgat 229  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| || || ||||| || |||||||| || |||  ||||| | | |||||||| || || |    
T  64760 ttcagatgctctgcatgctcttcttcagtctttgaataaattaagatgtcatcaataaacacaaccacaaatttatccagataagcatggaaaattcggt 64661  T
Q  230 tcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcat 329  Q
    ||||||||||||||||||| |||||           | || || ||||| || |||||||| || |||||||| ||  | || || |  |||||||||||    
T  64660 tcatatactccataaacacaccagg-----------cgccgaacggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggacgtcttctgcat 64572  T
Q  330 atcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcac 429  Q
    ||| ||||| || || |||||||| || ||||  |||||||||||||| |||||||| ||||| ||| ||||||||||||| || ||| ||||||| | |    
T  64571 atcctcatccttcaccttaatctgatggtaaccggacctcaaatcaatcttgctgaacacacgagcatccactaactgatcaattaaaccatcaatcctc 64472  T
Q  430 ggaagtggatacctattctt 449  Q
    | ||||||||||||||||||    
T  64471 gtaagtggatacctattctt 64452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0445 (Bit Score: 111; Significance: 8e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0445
Description:

Target: scaffold0445; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 29 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 2202 - 1900
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| |||||||  |  |||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  2202 cagaaataacatgaccaagaaaactcacctcattcaaccagaattcacactttgacaacttggcatttaacttcttctccttcagcacttgcaaaacaat 2103  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||| || ||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||| ||| | ||||| || || |||    
T  2102 cttcaaatgctcaacatgttcttcttgagacttagagtatatcaaaatatcatcaatgaacacaaccatgaagcgatctaaatacgcatgaaaaatacga 2003  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    ||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||| ||| |||  |||||| || || ||||||||  | || || || ||||||||||    
T  2002 ttcatgtactccataaacacacccggcgcattagtaacaccgaaagccatcactgcatattcgtaatgtccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgca 1903  T
Q  329 tat 331  Q
    |||    
T  1902 tat 1900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 109; Significance: 1e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 29 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 31672 - 31252
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    |||||||||  || || ||||||||||| ||  | |||||||| ||||| || ||||  || ||||| |  ||||| |||||||| |||||||| | |||    
T  31672 cagaaataatgtgacccagaaaactcacttcacttaaccagaactcacactttgacagctttgcatacaacttcttttctttcaagacttgcaatataat 31573  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
    |||||||||||| ||||| || ||||||||||| || ||||||| ||||||||| || ||||| || || |||  | ||| ||| |||||||| || ||     
T  31572 cttcagatgctctgcatgctcctcttcagtcttagaataaatcagaatatcatcaataaacaccaccacaaatttaaccagaaaagcatggaaaattcgg 31473  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    |||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||  |||||||| |  || ||||| || || ||||| ||  | || || || ||||||||||    
T  31472 ttcatatattccataaataccccaggcgcattagtaacactgaaaggcatcaacttgtattcgtaatgtccatatcgtctcctaaaggccgtcttctgca 31373  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    |||| |||||||| || || ||||| || ||||  |||||||| ||||| || ||||| ||   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  31372 tatcctcatctttcacctttatctgatggtaaccagacctcaagtcaatcttactgaacacctttgcacccactaactgatccatcaagtcatcaattct 31273  T
Q  429 cggaagtggatacctattctt 449  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  31272 cggaagtggatacctattctt 31252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 104; Significance: 1e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 40 - 471
Target Start/End: Original strand, 37612 - 38043
Alignment:
Q  40 tggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgct 139  Q
    ||||||||||||||||| |   | ||||| || ||||| || ||||| || ||||| |  ||||| |||||||| ||||  || |||||||||||||| |    
T  37612 tggccaagaaaactcactttacttaaccaaaactcacactttgacaacttagcatacaacttcttttctttcaatacttctaatacaatcttcagatgtt 37711  T
Q  140 cagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactc 239  Q
    | ||||| |||||||||||||| || ||||||| ||| ||||| || ||  |||| || |||  |||||   | |||||||| || || |||||||||||    
T  37712 ctgcatgctcttcttcagtctttgaataaatcagaatgtcatcaataaattcaaccacaaatttatccaggtaagcatggaaaattcggttcatatactc 37811  T
Q  240 cataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatct 339  Q
    ||| ||||| ||||| ||||| ||||||||  ||||||| || || ||||| || |||||||||||  |||| || || |||||||||||||| |||||     
T  37812 catgaacacaccaggcgcattagtaacaccgtaaggcatcaccttgtattcgtaatgaccataacgtgttctaaaggccgtcttctgcatatcctcatcc 37911  T
Q  340 tttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggat 439  Q
    || || ||||| || || |||| ||||||||| ||||| || ||||||||   |||||||||||| |||||||| || |||||||| | || ||||||||    
T  37912 ttcaccttaatttgatggtaacctgacctcaagtcaatcttactgaaaacctttgcacccactaattgatccattaagtcatcaatcctcgaaagtggat 38011  T
Q  440 acctattcttgatagttaccttgttcaactga 471  Q
    |||| ||||| || || || ||||||||||||    
T  38012 acctgttctttattgtaactttgttcaactga 38043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 104; Significance: 1e-51; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 29 - 471
Target Start/End: Original strand, 268561 - 269003
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcata-aagtttcttctctttcaacacttgcaagacaa 127  Q
    |||||||||||||||| || |||||||| ||  | |||||||| || || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||| |  ||||| ||||    
T  268561 cagaaataacatggcctaggaaactcacttcacttaaccagaactcgcacttcgacaacttggcatacaactttct-ctctttcaaaatctgcaacacaa 268659  T
Q  128 tcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcg 227  Q
    ||||||| || || || ||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| || ||||| || ||||||  ||||| ||| |||||||| ||  |    
T  268660 tcttcaggtgttcggcgtgttcctcttcagttttagaataaatcaaaatatcatctataaacaccaccacgaatttatccagaaaagcatggaaaatctg 268759  T
Q  228 attcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgc 327  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||| | ||  | || || || |||||||||    
T  268760 gttcatatactccatgaacacaccaggcgcgttagtaacaccgaaaggcatcactttgtattcgtaatgaccacatcgtgtcctaaaggccgtcttctgc 268859  T
Q  328 atatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattc 427  Q
    ||||| ||||| || |||||||| || || ||||  |||||||| ||||| || || |||||    ||||| || ||||| |||||||| |||||||| |    
T  268860 atatcctcatccttcactttaatttgatggtaacccgacctcaagtcaatcttactaaaaactttagcacctaccaactggtccatcaagtcatcaatcc 268959  T
Q  428 acggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 471  Q
     ||| ||||||||||||||||| || || || ||||||||||||    
T  268960 gcgggagtggatacctattctttattgtaactttgttcaactga 269003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 31 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 84870 - 84432
Alignment:
Q  31 gaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatct 130  Q
    ||||||| ||| ||||| |||||||| |  |||||||||||||| || || || || |||||||| |  ||||||||||||| ||||||||| |||||      
T  84870 gaaataatatgaccaaggaaactcactttgttcaaccagaattcgcactttgataacttggcatataacttcttctctttcagcacttgcaaaacaattc 84771  T
Q  131 tcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgatt 230  Q
    ||| |||||| ||||| || || |  ||||| ||||| |||| ||||||||| || |||||||| || || ||||| | | | | ||| || || |||||    
T  84770 tcaaatgctcggcatgctcctccttggtcttagagtatatcataatatcatctataaacacaacaacaaaacgatctagataagtatgaaaaatacgatt 84671  T
Q  231 catatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcata 330  Q
    |||||| |||||||| ||||   | ||||| |||||||| |||||||| ||   |||||| || || || |||||  | || || |  |||||||| |||    
T  84670 catatattccataaatactctcagcgcattagtaacaccgaaaggcatcacaaaatattcgtaatgtccgtaacgtgtcctaaaggtcgtcttctgaata 84571  T
Q  331 tcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacg 430  Q
    || |||||||| ||||| ||| ||||||| |  || ||||| ||||||||  |||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||| | ||| | ||    
T  84570 tcctcatctttcactttgatccggtgatagcccgatctcaagtcaattttattgaacacacgcgcacccactaact-atccatcaaatcgttaatcctcg 84472  T
Q  431 gaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    ||||| ||||||||||||| || || || || ||||||||    
T  84471 gaagtcgatacctattctttattgtcactttattcaactg 84432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 103; Significance: 5e-51; HSPs: 4)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 29 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 32030 - 31588
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||  | ||||| || || || || |||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  32030 cagaaataatatggccaagaaaactcacttcacttaaccaaaactcgcactttgacaatttggcatacaacttcttctctttcaatacttgcaatacaat 31931  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
    | ||||||| || ||||| ||||| |||||  | || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || |||  |||||   | ||||| || || |      
T  31930 cctcagatgttctgcatgctcttcctcagttctcgaatagatcaaaatgtcatcaatgaatacaaccacaaatttatccaggtaagcatgaaaaattctg 31831  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||| ||  | || || || ||||||||||    
T  31830 ttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggcagtcttctgca 31731  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    | || |||||||| || || ||||| || |||| ||||||||| |||||||| || ||||    |||||| || |||||||||||||  || |||||||     
T  31730 tgtcctcatctttcaccttgatctgatggtaacctgacctcaagtcaattttactaaaaatctttgcaccaaccaactgatccatcatgtcgtcaattct 31631  T
Q  429 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 471  Q
    |||||||||||| || ||||| || || || || |||||||||    
T  31630 cggaagtggatatcttttctttattgtaactttattcaactga 31588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 262 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 54531 - 54322
Alignment:
Q  262 gtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataac 361  Q
    |||||||| |||||||| || || ||||| || || ||||| ||  | || || || |||||||||||||| ||||| || || |||||||| || ||||    
T  54531 gtaacaccgaaaggcatcaccttgtattcgtaatgtccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcaccttaatctgatggtaac 54432  T
Q  362 ttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttacctt 461  Q
     ||||||||| ||||| || ||||| ||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| || || || ||    
T  54431 ctgacctcaagtcaatcttactgaacacctttgcacccactatctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatatctattctttatcgtaacttt 54332  T
Q  462 gttcaactga 471  Q
    ||||||||||    
T  54331 gttcaactga 54322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #3
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 30 - 470
Target Start/End: Original strand, 42212 - 42652
Alignment:
Q  30 agaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatc 129  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||| || ||||| |||||||| |||||| | |  |  ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  42212 agaaatcacatgaccaaggaaactcacttccttcaaccaaaactcacacttagacaacttggcacacaactggttctctttcaagacttgcaacacaatc 42311  T
Q  130 ttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgat 229  Q
     ||| |||||||||||| ||||| |||| ||| || || | |||||||||||| |||||||| || || || || |||| | | | ||| || || | ||    
T  42312 ctcaaatgctcagcatgctcttcctcagactttgaatacaccaaaatatcatctatgaacaccaccacaaaacggtccagataaggatgaaatattctat 42411  T
Q  230 tcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcat 329  Q
    |||| || |||||||| || ||  | ||||| |  || ||||| ||||| ||   ||| |||||||| ||||| | | ||| ||| || || ||    ||    
T  42412 tcatgtattccataaagacacctagcgcattagatactccaaatggcatcacaaaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcagttttggatat 42511  T
Q  330 atcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcac 429  Q
    ||||||  | |||||| ||||||| ||||| | ||| ||||||||||| || || || ||   |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |      
T  42512 atcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctatgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatcctt 42611  T
Q  430 ggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    ||||||||||||| |||||| || || ||||||||||||||    
T  42612 ggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactg 42652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #4
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 29 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 55253 - 55034
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    |||||||||  |||||||||||||| || ||  | ||||| || ||  |||| ||||| || ||||| |  ||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  55253 cagaaataatgtggccaagaaaacttacttcacttaaccaaaactcttatttcgacaacttagcatacaacttcttttctttcaaaacttgcaatacaat 55154  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
    ||||||||| || ||||| || ||||||||||| || || || | ||||||||| || || || || ||||||  | | | ||| |||||||| || ||     
T  55153 cttcagatgttctgcatgctcctcttcagtcttagaatagattagaatatcatcaataaataccaccacgaatttaactagaaaagcatggaaaattcgg 55054  T
Q  229 ttcatatactccataaacac 248  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  55053 ttcatatactccatgaacac 55034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 103; Significance: 5e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 29 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 99915 - 99473
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    |||||||||  ||||| ||||||||||| ||  | |||||||| ||||| || ||||| || ||||| |  || |||||||| |  | |||||| |||||    
T  99915 cagaaataatgtggcccagaaaactcacttcacttaaccagaactcacacttcgacaacttagcatataactttttctcttttagaatttgcaacacaat 99816  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
    ||||||||| || ||||| |||||||||||  | || || |||| ||| ||||| || |||||||| || |||  ||||| | | |||||||| || |||    
T  99815 cttcagatgttctgcatgctcttcttcagttctagaatagatcagaatgtcatcaataaacacaaccacaaatttatccagataggcatggaaaattcga 99716  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| || || ||||| || || ||||| ||  | || || |||||||||||||    
T  99715 ttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttgtattcgtaatgtccatatcgtgtcctaaaggctgtcttctgca 99616  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    |||| ||||| || || || ||||| || |||| ||||||||| ||||| || || |||||   ||||||||| ||||||||||| || |||||||| |     
T  99615 tatcctcatccttcaccttgatctgatggtaacctgacctcaattcaatcttactaaaaacctttgcacccaccaactgatccattaagtcatcaatcct 99516  T
Q  429 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 471  Q
    ||||||||||||||| ||||| || || || || |||||||||    
T  99515 cggaagtggatacctgttctttattgtaactttattcaactga 99473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 100; Significance: 3e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 29 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 115334 - 115171
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||| |  | |||||| |||| ||||||||| |||||    
T  115334 cagaaataacatggccaagaaaactcacctctttcaaccaaaattcacactttgacaacttggcatataactacttctccttcagcacttgcaaaacaat 115235  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacaca 192  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  115234 cttcaaatgctcagcatgttcttcttcagacttagagtatatcaaaatatcatcgatgaacaca 115171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 257 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 115163 - 114950
Alignment:
Q  257 cattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtg 356  Q
    |||| |||||||| |||||||| |||  |||||| || || ||||||||  | || || ||  ||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  115163 catttgtaacaccgaaaggcatcactcaatattcgtaatgtccataacgtgtcctaaaggccatcttctggatatcctcgtctttcactttaatctggtg 115064  T
Q  357 ataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagtt 456  Q
    |||||  || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| || |||    
T  115063 ataacccgatctcaaatcaatcttgctaaacacacgtgcacccactaactgatccatcaagtcatcaattcttggaagtggatacctattctttatcgtt 114964  T
Q  457 accttgttcaactg 470  Q
    || || ||||||||    
T  114963 actttattcaactg 114950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239 (Bit Score: 99; Significance: 1e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0239
Description:

Target: scaffold0239; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 73 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 11095 - 10697
Alignment:
Q  73 tcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatca 172  Q
    |||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||| || |||||||| |||||| ||||||| || ||||| || ||||||||||| || ||||| |    
T  11095 tcacattttgacaatttggcatacaacttcttctctttaaatacttgcaatacaatcctcagatgttctgcatgctcctcttcagtcttagaataaatta 10996  T
Q  173 aaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaa 272  Q
    |||||||||| || || || |||||||||  |||||  || ||||| || || || |||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||| ||    
T  10995 aaatatcatcaataaataccactacgaatttatccaggaaagcatgaaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcgttagtaacaccgaa 10896  T
Q  273 aggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaa 372  Q
    |||||| ||||| ||||| || |||||||| ||  | || || || |||||||||||||||||||| || || || ||||| || ||||  ||||||||     
T  10895 aggcatcactttgtattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcttcatccttcacctttatctgatggtaaccagacctcaag 10796  T
Q  373 tcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 471  Q
    || || || || |||| |  |||||| || |||||||||||||| ||||||||   | ||||  ||||||| ||||| || || || ||||||||||||    
T  10795 tcgatcttactaaaaatatttgcaccaaccaactgatccatcaagtcatcaatcttcagaagcagatacctgttctttattgtaactttgttcaactga 10697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 99; Significance: 1e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 29 - 471
Target Start/End: Original strand, 262177 - 262619
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| ||||| || ||||| |  || ||||||||||  |||||||| |||||    
T  262177 cagaaataatgtggccaagaaaactcacttcacttaaccagaattcacatttcgacaacttagcatacaactttttctctttcagtacttgcaatacaat 262276  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
    | ||||||| || ||||| || |||| |||||| || ||||| |  ||||| || ||||| ||||| || ||   ||||| |||  ||||||| || |      
T  262277 cctcagatgttctgcatgctcctctttagtcttagaataaattaggatatcgtcaatgaatacaaccacaaacttatccagaaagacatggaaaattcag 262376  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||||||  | || || || ||||||||||    
T  262377 ttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttgtattcgtaatgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgca 262476  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    |||||||||| || || ||||| || || ||||  |||||||| ||||| || |||||||    |||||| || |||||||||||||| |||| ||| |     
T  262477 tatcttcatccttcaccttaatttgatggtaaccagacctcaagtcaatcttactgaaaatctttgcaccaaccaactgatccatcaagtcataaatcct 262576  T
Q  429 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 471  Q
    || ||| |||||||| ||||| || || || ||||||||||||    
T  262577 cgaaagcggatacctgttctttattgtaactttgttcaactga 262619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 98; Significance: 5e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 29 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 27600 - 27160
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| || || || || |||||||| |  ||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  27600 cagaaataatatgaccaagaaaactcac-tcgttcaaccagaattctcactttgataacttggcatataacttcttctctttcagcacttgcaaaacaat 27502  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
      ||| |||||| |||||||| || |||| ||| ||||| ||||  |||||||| || |||||||| || || ||||| | | | | ||| || || |||    
T  27501 tctcaaatgctcggcatgttcctcctcagacttagagtatatcaggatatcatctataaacacaacaacaaaacgatctagataagtatgaaaaatacga 27402  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    |||||||| |||| ||| ||||| || ||||| |||||||| |||||||| ||   ||||||||| |  || ||||| || || ||  |  ||||||| |    
T  27401 ttcatatattccacaaatactcccggcgcattagtaacaccgaaaggcatcacagaatattcataatttccgtaacgtatcctaaagtccatcttctgaa 27302  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    | || |||||||| | ||| ||| ||||||| |  || || || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||  || |     
T  27301 tgtcctcatctttcagtttgatccggtgatagcccgatcttaagtcaattttactgaacacacgtgcacccactaactgatacatcaaatcattgatcct 27202  T
Q  429 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    ||||||||||||||||||||| || || || || ||||||||    
T  27201 cggaagtggatacctattctttattgtcactttattcaactg 27160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 106 - 471
Target Start/End: Original strand, 21150 - 21515
Alignment:
Q  106 tctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgat 205  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| || ||||||||||| || ||||| | ||||||||| |  || |||||||| |||  ||    
T  21150 tctttcaaaacttgcaatacaatcttcagatgttctgcatgctcctcttcagtcttagaataaattagaatatcatcaagaaatacaactacaaatttat 21249  T
Q  206 ccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacg 305  Q
    ||| ||| ||||| || || || |||||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||| ||||| || || || |||||||| ||||| |  ||    
T  21250 ccagaaaagcatgaaaaattcggttcatatactccatgaatacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggtatcaccttctattcataatgaccgtgtcg 21349  T
Q  306 cattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaac 405  Q
      | || || || |||||||||||||| ||||| || |||||||| || || |||| ||||||||| ||||| || || |||||   ||||||||| |      
T  21350 tgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatttgatggtaacctgacctcaagtcaatcttactaaaaacttttgcacccaccact 21449  T
Q  406 tgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 471  Q
    ||||||| ||| || ||||| | ||||||||||||||| ||||| || || || ||||||||||||    
T  21450 tgatccaccaagtcgtcaatcctcggaagtggatacctgttctttatcgtaactttgttcaactga 21515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 96; Significance: 7e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 73 - 471
Target Start/End: Original strand, 642 - 1038
Alignment:
Q  73 tcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatca 172  Q
    |||||||| |||||||| ||||| |  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| || ||||||||||| || ||||| |    
T  642 tcacatttcgacaatttagcatacaacttcttttctttcaacacttgcaatacaatcttcagatgttctgcatgctcctcttcagtcttagaataaatta 741  T
Q  173 aaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaa 272  Q
     ||| ||||| || ||||| || || |||  ||||| ||| |||||||| || || |||||||||| ||| ||||| || || ||||| |||||||| ||    
T  742 gaatgtcatcaataaacaccaccacaaatttatccagaaaagcatggaaaattcggttcatatactacatgaacacacccggcgcattagtaacaccgaa 841  T
Q  273 aggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaa 372  Q
    |||||| || || ||||| || |||||||| ||  | || || || |||||||||||||||||||| || || ||||| || || |||| |||||||||     
T  842 aggcatcaccttgtattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcttcatccttcaccttaatttgatggtaacctgacctcaag 941  T
Q  373 tcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 471  Q
    ||||| || || ||||    ||  | ||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||| || || || || |||||||||    
T  942 tcaatattactaaaaaactttg--ctcaccaactgatccatcaagtcatcaatcctcggaagtggatacctgttctttatcgtaactttattcaactga 1038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 319 - 471
Target Start/End: Original strand, 7857 - 8007
Alignment:
Q  319 gtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaat 418  Q
    |||||||||||||||||||| || || ||||| || || |||| ||||||||| ||||| || || ||||    ||| |  || |||||||||||||| |    
T  7857 gtcttctgcatatcttcatccttcaccttaatttgatggtaacctgacctcaagtcaatattactaaaaaactttgctc--accaactgatccatcaagt 7954  T
Q  419 catcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 471  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||||| || || || || |||||||||    
T  7955 catcaatcctcggaagtggatacctgttctttatcgtaactttattcaactga 8007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 96; Significance: 7e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 32 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 80181 - 79742
Alignment:
Q  32 aaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatctt 131  Q
    |||||| ||||||||| ||||| || ||  | ||||| || || ||||| |||||||| ||||| |  ||||| |||||||| || || || |||||| |    
T  80181 aaataatatggccaaggaaacttacttcacttaaccaaaactcgcattttgacaatttagcatacaacttcttttctttcaaaacctgtaatacaatcct 80082  T
Q  132 cagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattc 231  Q
    ||||||||  ||||| || ||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| || || || ||   |||||  || ||||| || || |  |||    
T  80081 cagatgctttgcatgctcctcttcagtcttagaataaattaaaatatcatcaatgaatactaccacaaacttatccaggaaagcatgaaaaatcctgttc 79982  T
Q  232 atatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatat 331  Q
    ||||||||||| ||||| ||| | ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||  | || || || |||||||||||||    
T  79981 atatactccatgaacacaccaagcgcattagtaacaccgaaaggcatcactttgtattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgcatat 79882  T
Q  332 cttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacgg 431  Q
    ||||||| || || ||||| || || |||| ||||||||| ||||| || |||||||    |||||| || |||||||||||||| |||||||| | ||     
T  79881 cttcatccttcaccttaatttgatggtaacctgacctcaagtcaatcttactgaaaatctttgcaccaaccaactgatccatcaagtcatcaatcctcga 79782  T
Q  432 aagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 471  Q
    |||||||||||| ||||| || || || ||||||||||||    
T  79781 aagtggatacctgttctttatggtaactttgttcaactga 79742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126 (Bit Score: 92; Significance: 2e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0126
Description:

Target: scaffold0126; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 64 - 471
Target Start/End: Original strand, 42905 - 43311
Alignment:
Q  64 aaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttgg 163  Q
    |||||||| ||||| || ||||| || ||||| |  |||||||||||||| | |||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |    
T  42905 aaccagaactcacacttcgacaacttagcatacaacttcttctctttcaatatttgcaacacaattttcagatgttctgcatgctcttcttcagtctttg 43004  T
Q  164 agtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggt 263  Q
    | || |||| ||||||||| || |||||||| || |||  |||||   | |||| ||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||    
T  43005 aatagatcagaatatcatcaataaacacaaccacaaatttatccaggtaagcatagaa-attcggttcatatactcgatgaacacaccaggcgcattagt 43103  T
Q  264 aacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataactt 363  Q
    |||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| ||  | || || ||  ||||||||||| | ||||| || || ||||| || || |||| |    
T  43104 aacaccgaaaggcatcaccttgtattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggccctcttctgcataccctcatccttcaccttaatttgatggtaacct 43203  T
Q  364 gacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgt 463  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||   |||||||||||||||||||||||| || ||||| | || |||||||||||| ||||| || || || || |    
T  43204 gacctcaagtcaatcttactgaaaacctttgcacccactaactgatccatcaagtcgtcaatcctcgaaagtggatacctgttctttattgtaactttat 43303  T
Q  464 tcaactga 471  Q
    ||||||||    
T  43304 tcaactga 43311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 91; Significance: 7e-44; HSPs: 2)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 29 - 471
Target Start/End: Original strand, 20802 - 21244
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||  | |||||||| ||||| || |||||||||||||| |  ||||||||| | || |||||||| ||| |    
T  20802 cagaaataatatggccaagaaaactcacttcacttaaccagaactcacacttcgacaatttggcatacaacttcttctctatgaatacttgcaatacagt 20901  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
    | ||||||| || ||||| ||||| ||| |  | || || |||||||| ||||| ||||| || || || |||  |||||   | ||||| || || |      
T  20902 cctcagatgttctgcatgctcttcctcatttctagaatagatcaaaatgtcatcaatgaataccaccacaaatttatccaggtaggcatgaaaaattctg 21001  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||| |||| || |||||||| ||||||||||| ||  | || || || ||||||||||    
T  21002 ttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaagcatcaccttatattcgtagtgaccatatcgtgtcctaaaggcagtcttctgca 21101  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    | || |||||||| || |||||||  || |||| ||||||||| |||||||| || ||||    |||||| || ||||| |||||||| ||||||||||     
T  21102 tgtcctcatctttcaccttaatctaatggtaacctgacctcaagtcaattttactaaaaatctttgcaccaaccaactggtccatcaagtcatcaattct 21201  T
Q  429 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 471  Q
    |||||| ||||| || ||||| || || || || |||||||||    
T  21202 cggaagcggatatctgttctttatcgtaactttattcaactga 21244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 29 - 269
Target Start/End: Original strand, 24964 - 25204
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||  | |||||||| ||||| || |||||||||||||| |  ||||||||| | || |||||||| ||| |    
T  24964 cagaaataatatggccaagaaaactcacttcacttaaccagaactcacacttcgacaatttggcatacaacttcttctctatgaatacttgcaatacagt 25063  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
    | ||||||| || ||||| ||||| ||| |  | || || |||||||| ||||| ||||| || || || |||  |||||   | ||||| || || |      
T  25064 cctcagatgttctgcatgctcttcctcatttctagaatagatcaaaatgtcatcaatgaataccaccacaaatttatccaggtaggcatgaaaaattctg 25163  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacacc 269  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  25164 ttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacacc 25204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222 (Bit Score: 87; Significance: 2e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0222
Description:

Target: scaffold0222; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 29 - 471
Target Start/End: Original strand, 9014 - 9456
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    |||||||||  ||||| ||||||||||| ||  | ||| |||| ||||| || ||||| || ||| | |  || ||||||||||| ||||| || |||||    
T  9014 cagaaataatgtggcccagaaaactcacttcacttaactagaactcacacttcgacaacttagcacacaactttttctctttcaaaacttgtaacacaat 9113  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
    ||||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||| || || ||||| || || ||||| || |||  ||||| | | |||||||| ||  |     
T  9114 cttcagatgttctgcatgctcttcttcagtctttgaataaattaagatgtcatcaataaatacaaccacaaatttatccagataggcatggaaaatttgg 9213  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||| |||| ||| || || ||||| || |||||||| ||  | || || || ||||||||||    
T  9214 ttcatatactccatgaacacaccaggcgcgttagtaacaccgaaagacatcaccttgtattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgca 9313  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    |||| || || || || ||||| || || |||| ||| ||||| ||||| || || |||||   |||| ||||||||||||||||||| |||||||| |     
T  9314 tatcctcgtccttcaccttaatttgatggtaacctgatctcaagtcaatcttactaaaaacctttgcatccactaactgatccatcaagtcatcaatcct 9413  T
Q  429 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 471  Q
    ||||||||||||||| ||||| || || || || |||||||||    
T  9414 cggaagtggatacctgttctttattgtaactttattcaactga 9456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 229 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 1642 - 1400
Alignment:
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    ||||||| |||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||  | || || || ||||||| ||    
T  1642 ttcatatcctccatgaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcactttgtattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggccgtcttcttca 1543  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||| || |||| ||||||||| ||||| || || |||||   ||||||||| |||||||||||||| |||||||| |     
T  1542 tatcctcatcctttaccttaatctgatggtaacctgacctcaagtcaatcttactaaaaacttttgcacccaccaactgatccatcaagtcatcaatcct 1443  T
Q  429 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 471  Q
    |||||||||||| || ||||| || || || ||||||||||||    
T  1442 cggaagtggatatctgttctttatcgtaactttgttcaactga 1400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0730 (Bit Score: 84; Significance: 1e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0730
Description:

Target: scaffold0730; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 29 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 354 - 3
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||| || ||  | |||||||| ||||| || |||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  354 cagaaataatatggccaaggaaacttacttcacttaaccagaactcacacttcgacaatttggcatacaacttcttctctttcaatacttgcaacacaat 255  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
      ||||||| || ||||| ||||| || ||  | || || |||||||| ||||| ||| |||| || || |||  ||||| | | ||||| || || | |    
T  254 tctcagatgttctgcatgctcttcctccgttgtcgaatagatcaaaatgtcatcaatgtacactaccacaaatttatccagataagcatgaaaaattcta 155  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||| ||  | || || || ||||||||||    
T  154 ttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggcagtcttctgca 55  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaatttt 380  Q
    | ||||||||||| || || || || || |||| ||||||||| ||||||||    
T  54 tgtcttcatctttcaccttgatttgatggtaacctgacctcaagtcaatttt 3  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 83; Significance: 4e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 319 - 449
Target Start/End: Original strand, 11201 - 11331
Alignment:
Q  319 gtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaat 418  Q
    |||||||||||||| ||||| || || |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  11201 gtcttctgcatatcctcatccttcaccttaatctgatggtaacctgacctcaaatcaattttgctgaacacacgagcacccactaactgatccattaaat 11300  T
Q  419 catcaattcacggaagtggatacctattctt 449  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11301 cgtcaattctcggaagtggatacctattctt 11331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072 (Bit Score: 83; Significance: 4e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0072
Description:

Target: scaffold0072; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 29 - 471
Target Start/End: Original strand, 52998 - 53440
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    |||||||||  ||||| ||||||||||| ||  | |||||||| ||||| || ||||| ||  |||| |  || ||||||||||| | |||||| |||||    
T  52998 cagaaataatgtggcccagaaaactcacttcacttaaccagaactcacacttcgacaacttaacatacaactttttctctttcaatatttgcaacacaat 53097  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
    ||||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||||| ||||||||| || || ||||| || |||  |||||   | |||||||| || ||     
T  53098 cttcagatgttctgcatgctcttcttcagtcttagaataaatcagaatatcatcaataaatacaaccacaaatttatccaggtaagcatggaaaatccgg 53197  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    |||||||||||||| ||||  |||||  |||| |||||| | ||||| || || || || || || || ||||| ||  | || || || ||||||||||    
T  53198 ttcatatactccatgaacaaaccaggcacattagtaacatcgaaaggtatcaccttgtactcgtaatgtccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgca 53297  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    |||||||||| || || ||||| || || |||| ||||||||| ||||| || || |||||   |||||||||||| ||||||||||| |||||||| |     
T  53298 tatcttcatccttcaccttaatttgatggtaacctgacctcaagtcaatcttactaaaaacctttgcacccactaattgatccatcaagtcatcaatcct 53397  T
Q  429 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 471  Q
     | ||||||||| || ||||| || || || || |||||||||    
T  53398 agaaagtggatatctgttctttattgtaactttattcaactga 53440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1373 (Bit Score: 81; Significance: 6e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold1373
Description:

Target: scaffold1373; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 29 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 1187 - 747
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    ||||||||| ||| || ||||||||||| ||  | |||||||| |||||||| ||||| || ||||| |   |||| |||||||| |||||||| |||||    
T  1187 cagaaataatatgacccagaaaactcacttcacttaaccagaactcacattttgacaactttgcatacaacctcttttctttcaaaacttgcaacacaat 1088  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
      |||||||||| ||||| || |||||| ||||||| || || |||||||| || ||||| ||||| || |||  ||||| |||  ||||||| ||  |     
T  1087 tctcagatgctctgcatgctcctcttcattcttggaatagattaaaatatcgtcaatgaatacaacaacaaatttatccagaaaatcatggaaaatttgg 988  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||| |||||||| ||||| || || || |||||||| ||  | || || || ||||||||||    
T  987 ttcatatactccataaacacaccaggcgcgttagtaacaccgaaaggcatcactttgtactcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgca 888  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    |||| ||||| || || || ||||| || ||||  |||||||| ||||| || || ||||     ||||| || |||||||||||||| || ||||| |     
T  887 tatcctcatccttcacctttatctgatggtaaccagacctcaagtcaatcttactaaaaatcttagcaccaaccaactgatccatcaagtcgtcaatcct 788  T
Q  429 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaact 469  Q
    ||||||  ||||||  ||||| || || || ||||||||||    
T  787 cggaagcagataccggttctttatcgtaactttgttcaact 747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225 (Bit Score: 81; Significance: 6e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0225
Description:

Target: scaffold0225; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 30 - 470
Target Start/End: Original strand, 25348 - 25788
Alignment:
Q  30 agaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatc 129  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||| || ||||| |||||||| |||||| | |  |  ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  25348 agaaatcacatgaccaaggaaactcacttccttcaaccaaaactcacacttagacaacttggcacacaactggttctctttcaagacttgcaacacaatc 25447  T
Q  130 ttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgat 229  Q
     ||| |||||||||||| ||||| |||| ||| || || | |||||||||||| |||||||| || || || || |||| | | | ||| || || | ||    
T  25448 ctcaaatgctcagcatgctcttcctcagactttgaatacaccaaaatatcatctatgaacaccaccacaaaacggtccagataaggatgaaatattctat 25547  T
Q  230 tcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcat 329  Q
    |||| || |||||||| || || |||||||| |  || ||||| ||||| ||   ||| |||||||| ||||| | | ||| ||| || || ||    ||    
T  25548 tcatgtattccataaagacacctggtgcattagatactccaaatggcatcacagaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcagttttggatat 25647  T
Q  330 atcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcac 429  Q
    ||||||  | |||||| ||||||| ||||| | ||| ||||||||||| || || || ||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |      
T  25648 atcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcacccactagctgatccatcaaatcatcaatcctt 25747  T
Q  430 ggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    ||||||||||||| |||||| || || ||||||||||||||    
T  25748 ggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactg 25788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 81; Significance: 6e-38; HSPs: 3)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 30 - 470
Target Start/End: Original strand, 14862 - 15302
Alignment:
Q  30 agaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatc 129  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||| || ||||| |||||||| |||||| | |  |  ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  14862 agaaatcacatgaccaaggaaactcacttccttcaaccaaaactcacacttagacaacttggcacacaactggttctctttcaagacttgcaacacaatc 14961  T
Q  130 ttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgat 229  Q
     ||| |||||||||||| ||||| |||| ||| || || | |||||||||||| |||||||| || || || || |||| | | | ||| || || | ||    
T  14962 ctcaaatgctcagcatgctcttcctcagactttgaatacaccaaaatatcatctatgaacaccaccacaaaacggtccagataaggatgaaatattctat 15061  T
Q  230 tcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcat 329  Q
    |||| || |||||||| || || |||||||| |  || ||||| ||||| ||   ||| |||||||| ||||| | | ||| ||| || || ||    ||    
T  15062 tcatgtattccataaagacacctggtgcattagatactccaaatggcatcacagaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcagttttggatat 15161  T
Q  330 atcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcac 429  Q
    ||||||  | |||||| ||||||| ||||| | ||| ||||||||||| || || || ||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |      
T  15162 atcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcacccactagctgatccatcaaatcatcaatcctt 15261  T
Q  430 ggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    ||||||||||||| |||||| || || ||||||||||||||    
T  15262 ggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactg 15302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 103 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 11453 - 11365
Alignment:
Q  103 ttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacac 191  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| ||| |||||||  ||| ||||| |||| ||| || || | |||||||||||| ||||||||    
T  11453 ttctctttcaagacttgcaacacaatcctcaaatgctcattatgctcttcctcagacttcgaatacaccaaaatatcatctatgaacac 11365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 406 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 11150 - 11089
Alignment:
Q  406 tgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaa 467  Q
    |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| |||||| || || || ||||||||    
T  11150 tgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcactttgttcaa 11089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0550 (Bit Score: 79; Significance: 1e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0550
Description:

Target: scaffold0550; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 352 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 11189 - 11067
Alignment:
Q  352 tggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttga 451  Q
    |||||||||| ||| |||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |    
T  11189 tggtgataacctgatctcaaatctatcttgctgaaaacatgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctgttcttaa 11090  T
Q  452 tagttac-cttgttcaactgatg 473  Q
    |||||||  ||||||||||||||    
T  11089 tagttacttttgttcaactgatg 11067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1830 (Bit Score: 78; Significance: 4e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold1830
Description:

Target: scaffold1830; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 29 - 254
Target Start/End: Original strand, 947 - 1172
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| || || || ||| |||| |||||||| ||||| |||||||| |  ||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  947 cagaaataatatggccaagaaaacttacttcatttaactagaactcacattttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatacttgcaatacaat 1046  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
     |||||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||| || ||||| || |||||||| || |||  ||||| | | |||||||| || |      
T  1047 attcagatgttctgcatgctcttcttcagtctttgaataaatcaagatgtcatcaataaacacaaccacaaatttatccagataagcatggaaaattctg 1146  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccagg 254  Q
    |||||||||||||||||||| |||||    
T  1147 ttcatatactccataaacacaccagg 1172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1715 (Bit Score: 74; Significance: 1e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold1715
Description:

Target: scaffold1715; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 46 - 471
Target Start/End: Original strand, 922 - 1347
Alignment:
Q  46 agaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcat 145  Q
    ||||||||||| ||  | ||| |||| |||||||| ||||  || ||||| | | |||| |||||||| |||||||| |||||  |||||||||| ||||    
T  922 agaaaactcacttcacttaactagaactcacattttgacagctttgcatacaatctcttttctttcaaaacttgcaatacaattctcagatgctctgcat 1021  T
Q  146 gttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaa 245  Q
    | || |||||| |||| || ||||| ||||||||||| || || ||||| || |||   |||| ||| |||||||| || || |||||||||||||| ||    
T  1022 gctcctcttcattcttagaataaattaaaatatcatcaataaatacaacaacaaatttgtccagaaaagcatggaaaattcggttcatatactccatgaa 1121  T
Q  246 cactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttact 345  Q
    ||| ||||| || || |||||||| |||||||| ||||| || || || |||||||| ||  | || || || |||||||| ||||| ||||| || ||     
T  1122 cacaccaggcgcgttagtaacaccgaaaggcattactttgtactcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgaatatcctcatccttcacc 1221  T
Q  346 ttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctat 445  Q
    |||||||| || ||||  |||||||| || || || || ||||     ||||| || |||||||||||||| || ||||| | |||||| |||||  | |    
T  1222 ttaatctgatggtaaccagacctcaagtcgatcttactaaaaatcttagcaccaaccaactgatccatcaagtcgtcaatcctcggaagcggatatatgt 1321  T
Q  446 tcttgatagttaccttgttcaactga 471  Q
    |||| || || |||||||||||||||    
T  1322 tctttatcgtaaccttgttcaactga 1347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 74; Significance: 1e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 29 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 9810 - 9372
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    |||||||||  ||||||||||| || || ||  | |||||||| ||||| || ||||| || ||||| |  || ||||||||||| | |||||| |||||    
T  9810 cagaaataatgtggccaagaaatcttacttcacttaaccagaactcacacttcgacaacttagcatacaactttttctctttcaaaatttgcaacacaat 9711  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
    ||||| ||| || | ||| || ||||||||| | |  ||||||| ||||||||| || |||||||| || |||  |   |     |||||||| || ||     
T  9710 cttcaaatgttctgtatgctcctcttcagtcctagcttaaatcagaatatcatcaataaacacaaccacaaatttaggtag----gcatggaaaattcgg 9615  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| ||  | || ||||| ||||||||||    
T  9614 ttcatatactccatgaacacaccaggcgcgttagtaacaccgaaaggcatcaccttgtattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaagccgtcttctgca 9515  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    |||||||||| || || ||||| || || |||| ||||||||| |||||||  |  |||||   ||||||||||| ||||||| |||| |||||||| |     
T  9514 tatcttcatccttcaccttaatttgatggtaacctgacctcaagtcaatttaacaaaaaacctttgcacccactagctgatccgtcaagtcatcaatcct 9415  T
Q  429 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 471  Q
    | ||||||||||||| ||||| || || || || |||||||||    
T  9414 cagaagtggatacctgttctttattgtaactttattcaactga 9372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 29 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 20024 - 19586
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    |||||||||  ||||||||||| || || ||  | |||||||| ||||| || ||||| || ||||| |  || ||||||||||| | |||||| |||||    
T  20024 cagaaataatgtggccaagaaagcttacttcacttaaccagaactcacacttcgacaacttagcatacaactttttctctttcaaaatttgcaacacaat 19925  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
    ||||| ||| || | ||| || ||||||||| | |  ||||||| ||||||||| || |||||||| || |||  |   |     |||||||| || ||     
T  19924 cttcaaatgttctgtatgctcctcttcagtcctagcttaaatcagaatatcatcaataaacacaaccacaaatttaggtag----gcatggaaaattcgg 19829  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 328  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| ||  | || ||||| ||||||||||    
T  19828 ttcatatactccatgaacacaccaggcgcgttagtaacaccgaaaggcatcaccttgtattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaagccgtcttctgca 19729  T
Q  329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 428  Q
    |||||||||| || || ||||| || || |||| ||||||||| |||||||  |  |||||   ||||||||||| ||||||| |||| |||||||| |     
T  19728 tatcttcatccttcaccttaatttgatggtaacctgacctcaagtcaatttaacaaaaaacctttgcacccactagctgatccgtcaagtcatcaatcct 19629  T
Q  429 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 471  Q
    | ||||||||||||| ||||| || || || || |||||||||    
T  19628 cagaagtggatacctgttctttattgtaactttattcaactga 19586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 72; Significance: 2e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 64 - 471
Target Start/End: Original strand, 28921 - 29327
Alignment:
Q  64 aaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttgg 163  Q
    |||||||| |||||||| ||||| || ||||| |   |||| |||||||| |||||||| |||||  |||| ||||| ||||| ||| ||||| |||| |    
T  28921 aaccagaactcacattttgacaacttcgcatacaacctcttttctttcaaaacttgcaacacaattctcaggtgctctgcatgctct-cttcattcttag 29019  T
Q  164 agtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggt 263  Q
    | || || || |||||||| || ||||| || || ||   ||||| ||| |||||||| ||  | |||||||||| ||||||||| ||||| || || ||    
T  29020 aatagattaagatatcatcaataaacaccacaacaaacttatccagaaaagcatggaaaattaggttcatatactacataaacacaccaggcgcgttagt 29119  T
Q  264 aacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataactt 363  Q
    |||||| |||||||| ||||| || || || |||||||| ||  | || || ||  ||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| || ||||      
T  29120 aacaccgaaaggcatcactttgtactcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggccatcttctgcatatcctcatccttcacttttatctgatggtaacca 29219  T
Q  364 gacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgt 463  Q
     ||||||| ||||| || |||||||  |  ||||| || || |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| ||||| || || ||||| |    
T  29220 aacctcaagtcaatcttactgaaaatcctagcaccaaccaattgatccatcaaatcgtcaattctcggaagcggatacctgttctttatcgtaaccttat 29319  T
Q  464 tcaactga 471  Q
    ||||||||    
T  29320 tcaactga 29327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0170 (Bit Score: 69; Significance: 9e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0170
Description:

Target: scaffold0170; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 30 - 470
Target Start/End: Original strand, 34039 - 34479
Alignment:
Q  30 agaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatc 129  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||| || || | |||||| |||||||| |||||||| || ||| | |  |  ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  34039 agaaatcacatgaccaaggaaacttacttcctccaaccaaaattcacacttagacaactttgcacataactggttctctttcaagacttgcaacacaatc 34138  T
Q  130 ttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgat 229  Q
     ||| |||||||||||| ||||| |||| ||| || || | |||||||||||| |||||||| || || || || |||| | | | ||| || || | ||    
T  34139 ctcaaatgctcagcatgctcttcctcagacttcgaatacaccaaaatatcatctatgaacaccaccacaaaacggtccagataaggatgaaatattctat 34238  T
Q  230 tcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcat 329  Q
    ||||||||||||| || || || || |||||||  || ||||| ||||| ||   ||| |||||||| ||||| | | |||  || || || ||  | ||    
T  34239 tcatatactccatgaagacacctggcgcattggatactccaaatggcatcacagaatactcatagtgtccatacctcgttcgaaacgcggttttgggtat 34338  T
Q  330 atcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcac 429  Q
    ||||||  | |||||| ||||||| ||||| | ||| ||||||||||| || || || ||   |||||| || | ||||||||||||||||||||| | |    
T  34339 atcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccgaccagctgatccatcaaatcatcaatcctc 34438  T
Q  430 ggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    ||||||| ||||| |||||| || || ||||||||||||||    
T  34439 ggaagtgcataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactg 34479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0285 (Bit Score: 68; Significance: 4e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0285
Description:

Target: scaffold0285; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 66 - 141
Target Start/End: Original strand, 9215 - 9290
Alignment:
Q  66 ccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctca 141  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9215 ccagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctca 9290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2111 (Bit Score: 66; Significance: 6e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold2111
Description:

Target: scaffold2111; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 228 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 741 - 520
Alignment:
Q  228 attcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgc 327  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||| ||  | || || || |||||||||    
T  741 attcatatactccatgaacacaccaggtgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgc 642  T
Q  328 atatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattc 427  Q
    |||||||||||||| |||||||| |  || ||||  |||||||| ||||| || || |||||   |||||| || |||||||||||||  || ||| |||    
T  641 atatcttcatctttcactttaatttcatggtaacccgacctcaagtcaatcttactaaaaacttttgcaccaaccaactgatccatcaggtcgtcagttc 542  T
Q  428 acggaagtggatacctattctt 449  Q
     |||||| ||||| || |||||    
T  541 tcggaagcggatatctgttctt 520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0177 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0177
Description:

Target: scaffold0177; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 403 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 12335 - 12267
Alignment:
Q  403 aactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 471  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12335 aactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 12267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180 (Bit Score: 63; Significance: 4e-27; HSPs: 3)
Name: scaffold0180
Description:

Target: scaffold0180; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 27 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 34108 - 33914
Alignment:
Q  27 atcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagaca 126  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| || ||  | ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |  ||||| || || ||||||||||| | |    
T  34108 atcagaaataatatggccaagaaaacttacttcacttaaccagaattcacatttggacaacttggcatacatcttcttttcctttaacacttgcaacata 34009  T
Q  127 atcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaa 221  Q
    ||||| | |||||| ||||| |||||||||| | | || ||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| | ||||||| | ||||||||    
T  34008 atctttaaatgctctgcatgctcttcttcagacctagaataaatcaaaatgtcatcaataaatacaaccacgaaccaatccaaataagcatggaa 33914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 40 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 582 - 380
Alignment:
Q  40 tggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgct 139  Q
    ||||||||||||||||| ||  | |||||||| ||||| || ||||| || ||||| |  || ||||||||||| |  ||||| |||||||||||||| |    
T  582 tggccaagaaaactcacttcacttaaccagaactcacacttcgacaacttagcatacaactttttctctttcaaaatctgcaacacaatcttcagatgtt 483  T
Q  140 cagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactc 239  Q
    | | ||| | |||||||||| | || || |||| ||| ||||| || |||||||| || |||  ||||| | | |||||||| || || |||||||||||    
T  482 ctgaatgctattcttcagtccttgaatagatcagaatgtcatcaataaacacaaccacaaatttatccagataagcatggaaaattcggttcatatactc 383  T
Q  240 cat 242  Q
    |||    
T  382 cat 380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 40 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 4902 - 4700
Alignment:
Q  40 tggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgct 139  Q
    ||||||||||||||||| ||  | |||||||| ||||| || ||||| || ||||| |  || ||||||||||| |  ||||| |||||||||||||| |    
T  4902 tggccaagaaaactcacttcacttaaccagaactcacacttcgacaacttagcatacaactttttctctttcaaaatctgcaacacaatcttcagatgtt 4803  T
Q  140 cagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactc 239  Q
    | | ||| | |||||||||| | || || |||| ||| ||||| || |||||||| || |||  ||||| | | |||||||| || || |||||||||||    
T  4802 ctgaatgctattcttcagtccttgaatagatcagaatgtcatcaataaacacaaccacaaatttatccagataagcatggaaaattcggttcatatactc 4703  T
Q  240 cat 242  Q
    |||    
T  4702 cat 4700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0708 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0708
Description:

Target: scaffold0708; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 46 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 6481 - 6056
Alignment:
Q  46 agaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcat 145  Q
    ||||||||||| ||  | ||||| || ||||||||  |||| || ||||| |  ||||| |||||||| || ||||| |||||  ||||||| || ||||    
T  6481 agaaaactcacttcacttaaccataactcacattttaacaactttgcatacaacttcttttctttcaaaacgtgcaatacaattctcagatgttctgcat 6382  T
Q  146 gttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaa 245  Q
    | || |||||| ||||||| || || ||||||||||| || || || || | ||||  |||||  || |||||||| || || |||||||||||||| ||    
T  6381 gctcctcttcattcttggaatagattaaaatatcatcaataaataccaccatgaatttatccaggaaagcatggaaaattcggttcatatactccatgaa 6282  T
Q  246 cactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttact 345  Q
    ||| ||| | || || |||||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||  ||  | || || || ||||||||||| |||||||| ||  |     
T  6281 cacaccatgcgcgttagtaacaccgaaaggcatcactttgtattcgtaatgaccatttcgtgtcctaaaggccgtcttctgcatgtcttcatccttcccc 6182  T
Q  346 ttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctat 445  Q
    || ||||| || ||||  |||||||| || || || || ||||    |||||| || |||||||||||||| || ||||| | | |||| |||||||| |    
T  6181 tttatctgatggtaaccagacctcaagtcgatcttactaaaaatctttgcaccaaccaactgatccatcaagtcgtcaatcctcagaagcggatacctgt 6082  T
Q  446 tcttgatagttaccttgttcaactga 471  Q
    |||| || || |||||||||||||||    
T  6081 tctttatcgtaaccttgttcaactga 6056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0060 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0060
Description:

Target: scaffold0060; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 29 - 278
Target Start/End: Original strand, 44736 - 44985
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    |||||||||  || || ||||||||||| ||  | |||||||| |||||||| ||||  || ||||| |   |||| || |||||||||||||| | |||    
T  44736 cagaaataatgtgacctagaaaactcacttcacttaaccagaactcacattttgacagcttagcatacaacctcttttccttcaacacttgcaatataat 44835  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
      ||||||| |  ||||| || |||||| ||||||| |||||||| || ||||| || |||||||| || |||  ||||| ||| |||||||| || ||     
T  44836 tctcagatgttttgcatgctcctcttcattcttggaataaatcaagatgtcatcaataaacacaaccacaaatttatccagaaaagcatggaaaattcgg 44935  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcat 278  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  44936 ttcatatactccatgaacactccaggcgcattagtaacaccgaaaggcat 44985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1646 (Bit Score: 61; Significance: 6e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold1646
Description:

Target: scaffold1646; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 29 - 269
Target Start/End: Original strand, 1277 - 1517
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||| || ||  | ||||| || || ||||| |||||||| ||||| |  ||||| |||||||| || || || |||||    
T  1277 cagaaataatatggccaaggaaacttacttcacttaaccaaaactcgcattttgacaatttagcatacaacttcttttctttcaaaacctgtaatacaat 1376  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
    | ||||||| || ||||| || ||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||  ||||| ||| ||||| || || ||     
T  1377 cctcagatgttctgcatgctcctcttcagtcttagaataaattaaaatatcatcaatgaatactaccacgaatttatccagaaaagcatgaaaaattcgg 1476  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacacc 269  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||    
T  1477 ttcatatactccatgaacacaccaggcgcgttagtaacacc 1517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0894 (Bit Score: 61; Significance: 6e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0894
Description:

Target: scaffold0894; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 32 - 148
Target Start/End: Original strand, 3882 - 3998
Alignment:
Q  32 aaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatctt 131  Q
    |||||||||| | ||||||||| || ||||| ||||||||||||||  |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |  | |||    
T  3882 aaataacatgtctaagaaaacttacttcttttaaccagaattcacacatagacaatttagcataaagcttcttctctttcaacacttgcaaaatcacctt 3981  T
Q  132 cagatgctcagcatgtt 148  Q
    || ||||||||||||||    
T  3982 caaatgctcagcatgtt 3998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 3)
Name: scaffold0348
Description:

Target: scaffold0348; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 262 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 18603 - 18394
Alignment:
Q  262 gtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataac 361  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||  |||| || || |||||||||||||||||||| || || ||||| || || ||||    
T  18603 gtaacaccgaaaggcatcactttgtattcgtaatgaccatatcgtgttctaaaggccgtcttctgcatatcttcatccttcaccttaatttgatggtaac 18504  T
Q  362 ttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttacctt 461  Q
     ||||||||| || || || || |||||   ||||||||| || || |||||||| |||||||| | |||| |||||||||| ||||| || || || ||    
T  18503 ctgacctcaagtcgatcttactaaaaacttttgcacccaccaattggtccatcaagtcatcaatcctcggatgtggatacctgttctttatcgtaacttt 18404  T
Q  462 gttcaactga 471  Q
    ||||||||||    
T  18403 gttcaactga 18394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 29 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 10242 - 9831
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||| || ||  | ||||| || |||||||| |||||||||||||| |  ||||| |||||||| ||  | || |||||    
T  10242 cagaaataatatggccaaggaaacttacttcacttaaccaaaactcacattttgacaatttggcatacaacttcttttctttcaaaacacgtaacacaat 10143  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaat----------cg-----atccaaaaat 213  Q
    | ||||||| || ||||| || ||||||||||| || ||||| || |||||||| || || || || ||||||          ||     | ||| |||     
T  10142 cctcagatgttctgcatgctcctcttcagtcttagaataaattaacatatcatcaataaataccaccacgaatttaaccagaacgaatttaaccagaaaa 10043  T
Q  214 gcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctga 313  Q
    ||||| || || || |||||||||||||| ||||| || || ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||  | || |    
T  10042 gcatgaaaaattcggttcatatactccatgaacacacctggcgcattagtaacaccgaaaggcatcactttgtattcgtaatgaccatatcgtgtcctaa 9943  T
Q  314 aagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccat 413  Q
    | || |||||||||||||||||||| || || ||||| || || |||| ||||||||| || || || || |||||   ||||||||| ||||| |||||    
T  9942 aggccgtcttctgcatatcttcatccttcaccttaatttgatggtaacctgacctcaagtcgatcttactaaaaacttttgcacccaccaactggtccat 9843  T
Q  414 caaatcatcaat 425  Q
    ||| ||||||||    
T  9842 caagtcatcaat 9831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 393 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 5838 - 5760
Alignment:
Q  393 tgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 471  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||| || || || ||||||||||||    
T  5838 tgcacccaccaactggtccatcaagtcatcaatcctcggaagtggatacctgttctttatcgtaactttgttcaactga 5760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 68 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 15027 - 14790
Alignment:
Q  68 agaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagta 167  Q
    |||| |||||||| ||||| || ||||| |   |||| || |||||||||||||| |||||  |||||||||| ||||| || || ||| ||||||| ||    
T  15027 agaactcacatttcgacaactttgcatacaacctcttttccttcaacacttgcaatacaattctcagatgctctgcatgctcctcctcattcttggaata 14928  T
Q  168 aatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaaca 267  Q
     || ||||||||||| || ||||| || || ||   ||||| ||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||| || ||||| || || ||||||    
T  14927 gattaaaatatcatcaataaacaccacaacaaacttatccagaaaagcatggaagattagattcatgtactccataaaaacaccaggcgcgttagtaaca 14828  T
Q  268 ccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacg 305  Q
    || |||||||| ||||| || || || |||||||||||    
T  14827 ccgaaaggcatcactttgtactcgtaatgaccataacg 14790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 40 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 618 - 416
Alignment:
Q  40 tggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgct 139  Q
    ||||||||||||||||| ||  | |||||||| ||||| || ||||| || ||||| |  || ||||||||||| |  ||||| |||||||||||||| |    
T  618 tggccaagaaaactcacttcacttaaccagaactcacacttcgacaacttagcatacaactttttctctttcaaaatctgcaacacaatcttcagatgtt 519  T
Q  140 cagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactc 239  Q
    | | ||| | |||||||||| | || || |||| ||| ||||| || |||||||| || |||  ||||| | | |||||||| || || |||||||||||    
T  518 ctgaatgctattcttcagtccttgaatagatcagaatgtcatcaataaacacaaccacaaatttatccagataagcatggaaaattcggttcatatactc 419  T
Q  240 cat 242  Q
    |||    
T  418 cat 416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203 (Bit Score: 56; Significance: 5e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0203
Description:

Target: scaffold0203; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 103 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 12578 - 12379
Alignment:
Q  103 ttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatc 202  Q
    ||||||||||| | |||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| || || |||| ||||| ||| || || ||||| || |||     
T  12578 ttctctttcaataattgcaacacaatcttcagatgttctgcatgctcttcttcagtctttgaatagatcagaatattatcaataaatacaaccacaaatt 12479  T
Q  203 gatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccata 302  Q
      |||||  | |||||||| || || ||| |||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| || || ||||| || ||||||||    
T  12478 tttccaagtaagcatggaaaattcggttcgtatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttgtattcgtaatgaccata 12379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 54; Significance: 8e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 29 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 16502 - 16229
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    |||||||||  |||||||||||||| || ||  | |||||||| ||||| || ||||| || ||||| |  ||||| || ||||| | |||||| || ||    
T  16502 cagaaataatgtggccaagaaaacttacttcacttaaccagaactcacacttcgacaacttagcatacaacttcttttccttcaatatttgcaatactat 16403  T
Q  129 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 228  Q
    ||||||||| ||  ||||  ||| ||||||||| || ||||||| ||||||||| || |||||||| ||||||  |||||   | |||||||| || ||     
T  16402 cttcagatgttctacatgcactttttcagtctttgaataaatcagaatatcatcaataaacacaaccacgaatttatccaggtaagcatggaaaattcgg 16303  T
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccata 302  Q
    ||||||||||| |  ||||| ||||| || || |||||||| |||||||| || || ||||| || ||||||||    
T  16302 ttcatatactctaggaacacaccaggcgcgttagtaacaccgaaaggcatcaccttgtattcgtaatgaccata 16229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 30 - 471
Target Start/End: Original strand, 165 - 606
Alignment:
Q  30 agaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatc 129  Q
    |||||| | ||| ||||| |||||||| || |||||||| || ||||| ||||| || || ||| | |  |  ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  165 agaaatcaaatgaccaaggaaactcacttccttcaaccaaaactcacacttagaaaacttagcacataactggttctctttcaaaacttgcaacacaatc 264  T
Q  130 ttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgat 229  Q
     ||| |||||||||||| ||||| |||| ||| || || | |||||||||||| || ||||| || || || || |||| | | | ||| || || | ||    
T  265 ctcaaatgctcagcatgctcttcctcagacttcgaatacaccaaaatatcatctataaacaccaccacaaaacggtccagataaggatgaaatattctat 364  T
Q  230 tcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcat 329  Q
    |||| || |||||||| || || || ||||| |  || ||||| | ||| ||   ||| |||||||| ||||| | | ||| ||| || || ||    ||    
T  365 tcatgtattccataaaaacacctggcgcattagatactccaaatgacatcacagaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcggttttggatat 464  T
Q  330 atcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcac 429  Q
    ||||||  | |||||| ||||||||||||| | ||| ||||||||||| || || || ||   |||||| || | | ||||||||||||||||||| |      
T  465 atcttccgcctttactctaatctggtgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaaccagcagatccatcaaatcatcaatcctt 564  T
Q  430 ggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 471  Q
    ||||||||||||| |||||| || || |||||||||||||||    
T  565 ggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactga 606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 30 - 471
Target Start/End: Original strand, 7107 - 7548
Alignment:
Q  30 agaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatc 129  Q
    |||||| | ||| ||||| |||||||| || |||||||| || ||||| |||||||| || ||| | |  |  ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  7107 agaaatcaaatgaccaaggaaactcacttccttcaaccaaaactcacacttagacaacttagcacataactggttctctttcaagacttgcaacacaatc 7206  T
Q  130 ttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgat 229  Q
     ||| |||||||||||| ||||| |||| ||| || || | |||||||||||| || ||||| || || || || |||| | | | ||| || || | ||    
T  7207 ctcaaatgctcagcatgctcttcctcagacttcgaatacaccaaaatatcatctataaacaccaccacaaaacggtccagataaggatgaaatattctat 7306  T
Q  230 tcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcat 329  Q
    |||| || |||||||| || || || ||||| |  || ||||| | ||| ||   ||| |||||||| ||||| | | ||| ||| || || ||    ||    
T  7307 tcatgtattccataaaaacacctggcgcattagatactccaaatgacatcacagaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcggttttggatat 7406  T
Q  330 atcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcac 429  Q
    ||||||  | |||||| ||||||| ||||| | ||| ||||||||||| || || || ||   |||||| || | ||||||||||| ||||||||| |      
T  7407 atcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctatgcaccaaccagctgatccatcatatcatcaatcctt 7506  T
Q  430 ggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 471  Q
    ||||||||||||| |||||| || || |||||||||||||||    
T  7507 ggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactga 7548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0146 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0146
Description:

Target: scaffold0146; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 363 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 9973 - 9865
Alignment:
Q  363 tgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttg 462  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| | ||||||||||||||| ||||| || || |||||     
T  9973 tgacctcaagtcaatcttactaaacacacgagcacccactaagtgatccattaagtcatcaatcctcggaagtggatacctgttctttatcgtaacctta 9874  T
Q  463 ttcaactga 471  Q
    |||||||||    
T  9873 ttcaactga 9865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0146; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 363 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 17640 - 17532
Alignment:
Q  363 tgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttg 462  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| | ||||||||||||||| ||||| || || |||||     
T  17640 tgacctcaagtcaatcttactaaacacacgagcacccactaagtgatccattaagtcatcaatcctcggaagtggatacctgttctttatcgtaacctta 17541  T
Q  463 ttcaactga 471  Q
    |||||||||    
T  17540 ttcaactga 17532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0692 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0692
Description:

Target: scaffold0692; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 340 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 1926 - 1797
Alignment:
Q  340 tttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggat 439  Q
    |||||| ||||||| ||||| | ||| ||||||||||| ||||| || ||   |||||| || ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  1926 tttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttgctaaacacctctgcaccaaccaactgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggat 1827  T
Q  440 acctattcttgatagttaccttgttcaact 469  Q
    ||| |||| | || || || ||||||||||    
T  1826 accgattcataatcgtcactttgttcaact 1797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 29 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 23432 - 23339
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 122  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| || ||  | ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |  ||||| || ||||||||||||||    
T  23432 cagaaataatatggccaagaaaacttacttcacttaaccagaattcacatttggacaacttggcatacaccttcttttccttcaacacttgcaa 23339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 29 - 146
Target Start/End: Original strand, 195193 - 195310
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 128  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| ||||| || ||||| |  || ||||||||||  |||||||| |||||    
T  195193 cagaaataatgtggccaagaaaactcacttcacttaaccagaattcacatttcgacaacttagcatacaactttttctctttcagtacttgcaatacaat 195292  T
Q  129 cttcagatgctcagcatg 146  Q
    | ||||||| || |||||    
T  195293 cctcagatgttctgcatg 195310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0387 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0387
Description:

Target: scaffold0387; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 405 - 469
Target Start/End: Original strand, 16387 - 16451
Alignment:
Q  405 ctgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaact 469  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| || || |||||||||||||    
T  16387 ctgatccatcaaatcatcaatcctcggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaact 16451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0697 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0697
Description:

Target: scaffold0697; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 7006 - 6939
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataa 96  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  7006 cagaaataacatgtccaagaaaaattacttcttttaaccagaattcacacttagacaatttagcataa 6939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000007; HSPs: 3)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 400 - 470
Target Start/End: Original strand, 26651 - 26721
Alignment:
Q  400 actaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| | |||||| ||||||| |||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  26651 actaactgatccatcaaataatcaatcctcggaagcggataccaattctttatagtcaccatgttcaactg 26721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 405 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 1929 - 1865
Alignment:
Q  405 ctgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaact 469  Q
    ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| |||||| || || || ||||||||||    
T  1929 ctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcactttgttcaact 1865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 2302 - 2143
Alignment:
Q  32 aaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatctt 131  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||| || | |||||| || ||||| |||||||| || ||| | |  |  ||||||||||| || ||||| | |||| |    
T  2302 aaatcacatgaccaaggaaactcacttcctccaaccaaaactcacacttagacaacttagcacataactggttctctttcaagacctgcaacataatcct 2203  T
Q  132 cagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacac 191  Q
    || |||||||||||| ||||| |||| ||| || || | |||||||||||| || |||||    
T  2202 caaatgctcagcatgctcttcctcagactttgaatacaccaaaatatcatctattaacac 2143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0467
Description:

Target: scaffold0467; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 393 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 1610 - 1533
Alignment:
Q  393 tgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| |||||| || || || |||||||||||    
T  1610 tgcaccaaccaactgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcactttgttcaactg 1533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 115 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 1888 - 1812
Alignment:
Q  115 acttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacac 191  Q
    |||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||| |||| ||| || || | |||||||||||| || |||||    
T  1888 acttgcaacacaatcctcaaatgctcagcatgctcttcctcagacttcgaatacaccaaaatatcatctataaacac 1812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1488 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1488
Description:

Target: scaffold1488; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 394 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 791 - 715
Alignment:
Q  394 gcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||| | |||||  ||||||| |||||| || || ||||||||||||||    
T  791 gcaccaaccaactgatccatcaaatcatcaatcctcggaatcggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactg 715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0876 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0876
Description:

Target: scaffold0876; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 405 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 923 - 859
Alignment:
Q  405 ctgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaact 469  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||| || || |||||||||||||    
T  923 ctgatccatcaaatcatcaatcctcggaagcggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaact 859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0876; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 103 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 1225 - 1137
Alignment:
Q  103 ttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacac 191  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||| ||| |||||||||||| || || |||| ||| || || | |||||||||||| || |||||    
T  1225 ttctccttcaagacttgcaacacaatcctcaaatgctcagcatgctcctcctcagacttcgaatacaccaaaatatcatctataaacac 1137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0610
Description:

Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 403 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 4905 - 4838
Alignment:
Q  403 aactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||  |||||| |||||| || || ||||||||||||||    
T  4905 aactgatccatcaaatcatcaatcctcggaagcagataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactg 4838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 340 - 467
Target Start/End: Original strand, 7008 - 7135
Alignment:
Q  340 tttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggat 439  Q
    |||||| ||||||| ||||| | ||| ||||||||||| || || || ||   |||||| || | ||||||||||||||||||||| | | |||||||||    
T  7008 tttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaaccagctgatccatcaaatcatcaatcctctgaagtggat 7107  T
Q  440 acctattcttgatagttaccttgttcaa 467  Q
    ||| ||| || || || |||||||||||    
T  7108 accgatttttaatcgtcaccttgttcaa 7135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 32 - 131
Target Start/End: Original strand, 36069 - 36168
Alignment:
Q  32 aaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatctt 131  Q
    |||||| ||||||||||||||| || ||  | |||||||| ||||| || ||||| |||||||| |  ||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  36069 aaataatatggccaagaaaacttacttcacttaaccagaactcacactttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatacttgcaatacaatctt 36168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 393 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 13614 - 13537
Alignment:
Q  393 tgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||  |||||| || || || |||||||||||    
T  13614 tgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggatactcattcttaatcgtcactttgttcaactg 13537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0269
Description:

Target: scaffold0269; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 86
Target Start/End: Original strand, 2218 - 2274
Alignment:
Q  30 agaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaa 86  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| || ||||| ||||||||    
T  2218 agaaataacatgaccaagaaaactcacttccttcaaccaaaactcacacttagacaa 2274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0249
Description:

Target: scaffold0249; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 29 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 326 - 242
Alignment:
Q  29 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaa 113  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| || ||  | ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |  ||||| ||||||||    
T  326 cagaaataatatggccaagaaaacttacttcacttaaccaaaattcacatttggacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 406 - 470
Target Start/End: Original strand, 422 - 486
Alignment:
Q  406 tgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 470  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||||| || |||||| || ||||| |||||||||||    
T  422 tgatccatcaaatcatcaatcttcggaagtggattccgattcttaatcgttactttgttcaactg 486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0827 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0827
Description:

Target: scaffold0827; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 229 - 324
Target Start/End: Original strand, 5259 - 5354
Alignment:
Q  229 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttc 324  Q
    ||||||||||||||||||||||| || || ||||  || ||||||||||| ||   ||| ||||| |||||||||||  ||||||| || ||||||    
T  5259 ttcatatactccataaacactcctggcgcgttggacactccaaaaggcatcaccgaatactcataatgaccataacggcttctgaaggcagtcttc 5354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0375 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0375
Description:

Target: scaffold0375; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 436 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 2873 - 2838
Alignment:
Q  436 ggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 471  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2873 ggatacctattcttgatagttactttgttcaactga 2838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0062 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0062
Description:

Target: scaffold0062; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 46 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 9119 - 8920
Alignment:
Q  46 agaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcat 145  Q
    |||||||| || || || |||||||| |||||||| || || || ||||| |   |||| || |||||||||||||| |||||  |||||||||| ||||    
T  9119 agaaaacttacttcatttaaccagaactcacattttgataacttagcatacaacctcttttccttcaacacttgcaatacaattctcagatgctctgcat 9020  T
Q  146 gttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaa 245  Q
    | || || ||| ||||||| || || || |||||||| || ||||| || || ||   ||||| ||| |||||||| ||  | ||||| |||||||||||    
T  9019 gctcctcctcattcttggaatatattaatatatcatcaataaacaccacaacaaacttatccagaaaagcatggaaaatttggttcatgtactccataaa 8920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1208 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold1208
Description:

Target: scaffold1208; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 228 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 1843 - 1769
Alignment:
Q  228 attcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccata 302  Q
    |||||| | |||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||||||||   |||||| |||||||||||    
T  1843 attcatgtgctccatgaacactcctggtgcattagtcaccccaaaaggcataaccaaatattcgtagtgaccata 1769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University