View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF9760_3 (Length: 651)

Name: NF9760_3
Description: NF9760
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF9760_3
NF9760_3
[»] chr1 (151 HSPs)
chr1 (32-573)||(44290458-44290992)
chr1 (43-573)||(26661522-26662054)
chr1 (33-447)||(50051777-50052189)
chr1 (190-595)||(48588465-48588870)
chr1 (32-346)||(48588340-48588655)
chr1 (405-598)||(44290799-44290993)
chr1 (41-307)||(34364507-34364774)
chr1 (223-494)||(3537226-3537496)
chr1 (352-584)||(41157311-41157545)
chr1 (41-268)||(31767094-31767319)
chr1 (41-267)||(41156991-41157218)
chr1 (377-564)||(37556071-37556260)
chr1 (45-262)||(9955911-9956129)
chr1 (33-199)||(41759475-41759641)
chr1 (407-573)||(41759475-41759641)
chr1 (407-584)||(3537589-3537765)
chr1 (33-210)||(3537589-3537765)
chr1 (43-304)||(34649440-34649702)
chr1 (41-199)||(41142372-41142531)
chr1 (415-573)||(41142372-41142531)
chr1 (383-574)||(34364891-34365084)
chr1 (41-273)||(22077422-22077653)
chr1 (41-210)||(41157375-41157545)
chr1 (41-273)||(66399-66630)
chr1 (384-584)||(22077484-22077683)
chr1 (415-597)||(41156991-41157175)
chr1 (43-237)||(17294579-17294773)
chr1 (33-195)||(3550712-3550871)
chr1 (407-569)||(3550712-3550871)
chr1 (388-573)||(11977251-11977438)
chr1 (41-253)||(37850548-37850758)
chr1 (415-598)||(31767137-31767319)
chr1 (417-570)||(17294579-17294733)
chr1 (44-303)||(37555733-37555990)
chr1 (32-225)||(45493949-45494146)
chr1 (43-190)||(37556113-37556260)
chr1 (406-598)||(45493950-45494146)
chr1 (415-598)||(34364507-34364689)
chr1 (41-199)||(29798199-29798357)
chr1 (415-573)||(29798199-29798357)
chr1 (417-573)||(34649440-34649596)
chr1 (41-200)||(34364925-34365084)
chr1 (407-598)||(50052000-50052189)
chr1 (415-573)||(5319965-5320123)
chr1 (41-199)||(5319965-5320123)
chr1 (49-199)||(14318875-14319025)
chr1 (423-573)||(14318875-14319025)
chr1 (419-598)||(9955911-9956091)
chr1 (42-191)||(40082408-40082556)
chr1 (416-565)||(40082408-40082556)
chr1 (43-199)||(11977282-11977438)
chr1 (407-597)||(32168674-32168853)
chr1 (33-223)||(32168674-32168853)
chr1 (409-541)||(32594748-32594880)
chr1 (35-167)||(32594748-32594880)
chr1 (41-223)||(45084382-45084557)
chr1 (415-597)||(45084382-45084557)
chr1 (415-601)||(3875304-3875489)
chr1 (41-197)||(3875333-3875489)
chr1 (415-586)||(37850588-37850758)
chr1 (412-558)||(38804370-38804516)
chr1 (38-184)||(38804370-38804516)
chr1 (41-266)||(41184340-41184583)
chr1 (418-564)||(37555733-37555878)
chr1 (415-598)||(66448-66630)
chr1 (415-566)||(24600321-24600472)
chr1 (41-192)||(24600321-24600472)
chr1 (41-251)||(30630586-30630796)
chr1 (415-573)||(39066201-39066358)
chr1 (41-199)||(39066201-39066358)
chr1 (383-582)||(22077101-22077311)
chr1 (41-253)||(22077776-22077986)
chr1 (383-562)||(66100-66278)
chr1 (47-223)||(5575110-5575284)
chr1 (421-597)||(5575110-5575284)
chr1 (382-563)||(30630648-30630828)
chr1 (32-120)||(3537226-3537314)
chr1 (415-598)||(41184382-41184583)
chr1 (415-597)||(24131965-24132143)
chr1 (41-223)||(24131965-24132143)
chr1 (31-161)||(44043810-44043945)
chr1 (406-535)||(44043810-44043944)
chr1 (112-319)||(11977015-11977224)
chr1 (66-208)||(22077101-22077243)
chr1 (42-193)||(22793279-22793431)
chr1 (416-567)||(22793279-22793431)
chr1 (41-188)||(66100-66247)
chr1 (51-225)||(5528728-5528902)
chr1 (425-598)||(5528729-5528902)
chr1 (415-584)||(22077818-22077986)
chr1 (415-595)||(19283434-19283613)
chr1 (41-221)||(19283434-19283613)
chr1 (43-189)||(45839629-45839779)
chr1 (417-563)||(45839629-45839779)
chr1 (415-599)||(21378034-21378199)
chr1 (41-224)||(21378035-21378199)
chr1 (486-573)||(11977015-11977102)
chr1 (41-189)||(44685456-44685605)
chr1 (415-563)||(44685456-44685605)
chr1 (415-586)||(1188574-1188746)
chr1 (41-212)||(1188574-1188746)
chr1 (112-240)||(47380126-47380254)
chr1 (485-573)||(50051689-50051776)
chr1 (111-199)||(50051689-50051776)
chr1 (415-586)||(1187349-1187522)
chr1 (41-212)||(1187349-1187522)
chr1 (486-597)||(47380143-47380254)
chr1 (56-198)||(44091909-44092051)
chr1 (430-572)||(44091909-44092051)
chr1 (397-474)||(50469180-50469256)
chr1 (83-159)||(10351202-10351278)
chr1 (457-533)||(10351202-10351278)
chr1 (68-188)||(4956218-4956340)
chr1 (442-562)||(4956218-4956340)
chr1 (366-467)||(47379891-47379990)
chr1 (415-462)||(35154150-35154197)
chr1 (41-88)||(35154150-35154197)
chr1 (41-100)||(50469180-50469239)
chr1 (41-107)||(4878803-4878869)
chr1 (415-481)||(4878803-4878869)
chr1 (382-564)||(24448245-24448426)
chr1 (464-509)||(41184152-41184197)
chr1 (90-135)||(41184152-41184197)
chr1 (514-573)||(4266798-4266855)
chr1 (140-199)||(4266798-4266855)
chr1 (415-575)||(5996870-5997029)
chr1 (41-201)||(5996870-5997029)
chr1 (470-530)||(35154046-35154106)
chr1 (96-156)||(35154046-35154106)
chr1 (407-480)||(4266875-4266948)
chr1 (33-106)||(4266875-4266948)
chr1 (82-198)||(9499020-9499136)
chr1 (456-572)||(9499020-9499136)
chr1 (123-159)||(12466365-12466401)
chr1 (497-533)||(12466365-12466401)
chr1 (41-73)||(22077248-22077280)
chr1 (424-483)||(30630912-30630972)
chr1 (50-109)||(30630912-30630972)
chr1 (41-93)||(47379891-47379943)
chr1 (488-534)||(9956212-9956258)
chr1 (114-160)||(9956212-9956258)
chr1 (134-211)||(30697310-30697387)
chr1 (508-585)||(30697310-30697387)
chr1 (181-223)||(45084576-45084617)
chr1 (555-597)||(45084576-45084617)
chr1 (309-400)||(3537495-3537587)
chr1 (497-533)||(31973375-31973411)
chr1 (123-159)||(31973375-31973411)
chr1 (352-400)||(41184198-41184246)
chr1 (41-177)||(50556451-50556587)
chr1 (415-551)||(50556451-50556587)
[»] chr5 (163 HSPs)
chr5 (33-595)||(6500443-6501002)
chr5 (33-599)||(623810-624380)
chr5 (31-361)||(9498496-9498822)
chr5 (33-310)||(32487386-32487661)
chr5 (407-598)||(6500443-6500633)
chr5 (323-586)||(3295002-3295266)
chr5 (32-234)||(6500814-6501015)
chr5 (44-273)||(25327938-25328167)
chr5 (415-597)||(40296292-40296473)
chr5 (41-223)||(40296292-40296473)
chr5 (407-597)||(27502013-27502202)
chr5 (33-223)||(27502013-27502202)
chr5 (407-569)||(18603124-18603286)
chr5 (33-195)||(18603124-18603286)
chr5 (407-573)||(32487386-32487551)
chr5 (34-199)||(41170627-41170792)
chr5 (408-573)||(41170627-41170792)
chr5 (412-572)||(36492218-36492378)
chr5 (38-198)||(36492218-36492378)
chr5 (388-597)||(26074122-26074330)
chr5 (383-584)||(13415750-13415951)
chr5 (418-598)||(25327938-25328118)
chr5 (382-595)||(26074577-26074792)
chr5 (41-199)||(15370099-15370257)
chr5 (415-573)||(15370099-15370257)
chr5 (43-299)||(26075058-26075318)
chr5 (42-273)||(299490-299721)
chr5 (32-224)||(624187-624379)
chr5 (41-212)||(3295002-3295172)
chr5 (418-573)||(3295345-3295498)
chr5 (44-199)||(3295345-3295498)
chr5 (41-210)||(13415750-13415918)
chr5 (43-236)||(26074614-26074807)
chr5 (417-597)||(42405574-42405752)
chr5 (43-223)||(42405574-42405752)
chr5 (43-267)||(6224198-6224420)
chr5 (41-221)||(41632782-41632961)
chr5 (415-595)||(41632782-41632961)
chr5 (406-573)||(9498655-9498821)
chr5 (417-599)||(1028491-1028673)
chr5 (41-223)||(26074122-26074304)
chr5 (41-267)||(35150007-35150230)
chr5 (43-224)||(1028492-1028673)
chr5 (417-585)||(6224198-6224366)
chr5 (422-573)||(11416977-11417128)
chr5 (48-199)||(11416977-11417128)
chr5 (415-597)||(36568545-36568725)
chr5 (41-223)||(36568545-36568725)
chr5 (416-573)||(299490-299647)
chr5 (425-569)||(34753029-34753173)
chr5 (51-195)||(34753029-34753173)
chr5 (415-573)||(12662652-12662810)
chr5 (41-199)||(12662652-12662810)
chr5 (417-566)||(26075168-26075318)
chr5 (382-585)||(24489194-24489394)
chr5 (415-574)||(35150007-35150165)
chr5 (382-547)||(26074807-26074975)
chr5 (67-212)||(15370428-15370573)
chr5 (441-586)||(15370428-15370573)
chr5 (53-195)||(33747783-33747925)
chr5 (427-569)||(33747783-33747925)
chr5 (412-550)||(29549278-29549416)
chr5 (38-176)||(29549278-29549416)
chr5 (407-553)||(5723811-5723957)
chr5 (33-179)||(5723811-5723957)
chr5 (43-211)||(24489194-24489360)
chr5 (43-173)||(26074807-26074938)
chr5 (383-565)||(38427525-38427697)
chr5 (46-191)||(38427553-38427697)
chr5 (415-565)||(26590918-26591068)
chr5 (41-191)||(26590918-26591068)
chr5 (43-197)||(300961-301107)
chr5 (417-571)||(300961-301107)
chr5 (382-547)||(36521922-36522086)
chr5 (417-573)||(35167838-35167994)
chr5 (43-199)||(35167838-35167994)
chr5 (44-210)||(2411010-2411176)
chr5 (418-584)||(2411010-2411176)
chr5 (128-253)||(38427306-38427431)
chr5 (44-199)||(35914852-35915007)
chr5 (418-573)||(35914852-35915007)
chr5 (382-533)||(36522277-36522427)
chr5 (33-116)||(7768842-7768925)
chr5 (407-490)||(7768842-7768925)
chr5 (382-533)||(31509589-31509742)
chr5 (42-173)||(36521922-36522053)
chr5 (501-583)||(26900007-26900089)
chr5 (127-209)||(26900007-26900089)
chr5 (43-136)||(42508614-42508707)
chr5 (417-510)||(42508614-42508707)
chr5 (44-159)||(36522277-36522392)
chr5 (43-121)||(26074320-26074398)
chr5 (417-495)||(26074320-26074398)
chr5 (41-159)||(31509623-31509742)
chr5 (418-552)||(41635212-41635346)
chr5 (44-178)||(41635212-41635346)
chr5 (43-237)||(13785964-13786157)
chr5 (417-572)||(13786002-13786157)
chr5 (55-166)||(31509745-31509857)
chr5 (429-540)||(31509745-31509857)
chr5 (108-159)||(13042606-13042657)
chr5 (482-533)||(13042606-13042657)
chr5 (502-573)||(38427306-38427377)
chr5 (43-122)||(39309686-39309764)
chr5 (417-496)||(39309686-39309764)
chr5 (473-574)||(13785631-13785732)
chr5 (99-200)||(13785631-13785732)
chr5 (499-551)||(795254-795306)
chr5 (125-177)||(795254-795306)
chr5 (486-553)||(9498343-9498410)
chr5 (112-179)||(9498343-9498410)
chr5 (472-551)||(36527117-36527196)
chr5 (98-177)||(36527117-36527196)
chr5 (43-136)||(42524719-42524811)
chr5 (417-510)||(42524719-42524811)
chr5 (99-159)||(32445943-32446003)
chr5 (473-533)||(32445943-32446003)
chr5 (108-155)||(13112604-13112651)
chr5 (482-529)||(13112604-13112651)
chr5 (387-450)||(13785732-13785794)
chr5 (28-81)||(5660285-5660338)
chr5 (44-101)||(6225047-6225104)
chr5 (418-475)||(6225047-6225104)
chr5 (407-455)||(5660290-5660338)
chr5 (78-166)||(19275566-19275653)
chr5 (452-540)||(19275566-19275653)
chr5 (121-159)||(13042784-13042822)
chr5 (495-533)||(13042784-13042822)
chr5 (121-159)||(13112782-13112820)
chr5 (495-533)||(13112782-13112820)
chr5 (209-267)||(35150510-35150567)
chr5 (41-83)||(35150747-35150789)
chr5 (415-457)||(35150747-35150789)
chr5 (41-83)||(35151038-35151080)
chr5 (415-457)||(35151038-35151080)
chr5 (99-197)||(42435486-42435583)
chr5 (473-571)||(42435486-42435583)
chr5 (301-354)||(795196-795249)
chr5 (214-304)||(13416036-13416127)
chr5 (214-304)||(26074400-26074492)
chr5 (143-195)||(24489583-24489635)
chr5 (517-569)||(24489583-24489635)
chr5 (119-262)||(3622828-3622968)
chr5 (383-427)||(15370380-15370426)
chr5 (482-533)||(36389016-36389067)
chr5 (108-159)||(36389016-36389067)
chr5 (123-153)||(5963765-5963795)
chr5 (497-527)||(5963765-5963795)
chr5 (469-547)||(9510546-9510624)
chr5 (95-173)||(9510546-9510624)
chr5 (407-464)||(22298956-22299014)
chr5 (33-90)||(22298956-22299014)
chr5 (513-549)||(795152-795189)
chr5 (139-175)||(795152-795189)
chr5 (131-195)||(5660340-5660405)
chr5 (505-569)||(5660340-5660405)
chr5 (112-153)||(34103625-34103666)
chr5 (486-527)||(34103625-34103666)
chr5 (146-199)||(35150810-35150863)
chr5 (520-573)||(35150810-35150863)
chr5 (44-76)||(13785732-13785764)
chr5 (109-153)||(41341523-41341567)
chr5 (483-527)||(41341523-41341567)
[»] chr8 (156 HSPs)
chr8 (32-585)||(3669678-3670229)
chr8 (33-565)||(1013879-1014411)
chr8 (41-598)||(9308977-9309536)
chr8 (43-237)||(3038251-3038446)
chr8 (43-273)||(34834878-34835105)
chr8 (405-585)||(30441071-30441255)
chr8 (32-211)||(30441072-30441255)
chr8 (44-304)||(147454-147715)
chr8 (43-273)||(30359273-30359501)
chr8 (417-571)||(3038292-3038446)
chr8 (393-583)||(34835185-34835377)
chr8 (43-267)||(40518071-40518296)
chr8 (382-583)||(34835439-34835643)
chr8 (382-583)||(34835705-34835909)
chr8 (43-209)||(34835211-34835377)
chr8 (382-571)||(40518550-40518738)
chr8 (417-565)||(34834878-34835026)
chr8 (407-597)||(20870550-20870741)
chr8 (33-223)||(20870550-20870741)
chr8 (349-566)||(45121663-45121881)
chr8 (383-573)||(8918764-8918956)
chr8 (415-563)||(45122067-45122215)
chr8 (41-189)||(45122067-45122215)
chr8 (51-268)||(18371926-18372142)
chr8 (417-598)||(30359273-30359455)
chr8 (366-569)||(30359558-30359763)
chr8 (415-585)||(45121898-45122068)
chr8 (41-211)||(45121898-45122068)
chr8 (388-573)||(45122604-45122782)
chr8 (66-303)||(9483084-9483320)
chr8 (383-575)||(6731872-6732055)
chr8 (393-569)||(9482608-9482784)
chr8 (417-576)||(25561812-25561972)
chr8 (43-202)||(25561812-25561972)
chr8 (43-239)||(37544452-37544646)
chr8 (32-191)||(1013879-1014038)
chr8 (415-573)||(6876862-6877021)
chr8 (41-199)||(6876862-6877021)
chr8 (41-200)||(9608745-9608904)
chr8 (415-574)||(9608745-9608904)
chr8 (417-572)||(33113368-33113523)
chr8 (43-198)||(33113368-33113523)
chr8 (43-209)||(34835476-34835643)
chr8 (43-209)||(34835742-34835909)
chr8 (417-573)||(40518071-40518229)
chr8 (43-197)||(40518584-40518738)
chr8 (55-268)||(45122638-45122854)
chr8 (383-573)||(45122972-45123164)
chr8 (41-225)||(9309355-9309537)
chr8 (417-573)||(37544490-37544646)
chr8 (418-573)||(147454-147609)
chr8 (48-195)||(9482608-9482755)
chr8 (440-586)||(9483174-9483320)
chr8 (35-240)||(40579466-40579670)
chr8 (417-573)||(1513915-1514071)
chr8 (43-199)||(1513915-1514071)
chr8 (422-570)||(70277-70425)
chr8 (48-196)||(70277-70425)
chr8 (41-199)||(8918764-8918922)
chr8 (366-569)||(18371665-18371863)
chr8 (409-567)||(40579512-40579670)
chr8 (41-199)||(5915872-5916025)
chr8 (415-573)||(5915872-5916025)
chr8 (41-197)||(5420651-5420807)
chr8 (415-571)||(5420651-5420807)
chr8 (43-195)||(30359611-30359763)
chr8 (41-196)||(41972158-41972316)
chr8 (415-570)||(41972158-41972316)
chr8 (425-598)||(18371969-18372142)
chr8 (41-199)||(45123006-45123164)
chr8 (32-201)||(6731895-6732055)
chr8 (366-487)||(18372342-18372463)
chr8 (382-563)||(147794-147968)
chr8 (386-573)||(6651476-6651652)
chr8 (418-599)||(32640506-32640682)
chr8 (366-487)||(18372785-18372905)
chr8 (44-189)||(32640542-32640682)
chr8 (43-192)||(45121663-45121811)
chr8 (366-519)||(18372988-18373139)
chr8 (419-572)||(18380020-18380171)
chr8 (45-198)||(18380020-18380171)
chr8 (41-253)||(4154615-4154824)
chr8 (32-199)||(6651496-6651652)
chr8 (48-195)||(18371665-18371807)
chr8 (35-199)||(32305478-32305635)
chr8 (409-573)||(32305478-32305635)
chr8 (415-563)||(4154678-4154824)
chr8 (41-189)||(147829-147968)
chr8 (41-192)||(9507777-9507933)
chr8 (415-566)||(9507777-9507933)
chr8 (64-178)||(9609108-9609222)
chr8 (438-552)||(9609108-9609222)
chr8 (41-253)||(9620625-9620834)
chr8 (370-459)||(18372485-18372574)
chr8 (407-493)||(41416251-41416335)
chr8 (33-119)||(41416251-41416335)
chr8 (418-528)||(43274824-43274934)
chr8 (44-154)||(43274824-43274934)
chr8 (382-584)||(4154270-4154472)
chr8 (119-212)||(41129066-41129159)
chr8 (493-586)||(41129066-41129159)
chr8 (43-159)||(8794113-8794229)
chr8 (417-533)||(8794113-8794229)
chr8 (415-585)||(9620666-9620834)
chr8 (490-573)||(40579269-40579352)
chr8 (116-199)||(40579269-40579352)
chr8 (123-253)||(8919093-8919220)
chr8 (45-145)||(18372988-18373085)
chr8 (41-190)||(12283873-12284021)
chr8 (415-564)||(12283873-12284021)
chr8 (44-113)||(18372785-18372854)
chr8 (497-573)||(8919144-8919220)
chr8 (417-523)||(18372656-18372758)
chr8 (43-149)||(18372656-18372758)
chr8 (41-210)||(4154270-4154438)
chr8 (44-113)||(18372342-18372411)
chr8 (418-505)||(3037776-3037865)
chr8 (44-131)||(3037776-3037865)
chr8 (419-564)||(43398077-43398225)
chr8 (45-190)||(43398077-43398225)
chr8 (152-240)||(3037927-3038016)
chr8 (425-488)||(25561729-25561792)
chr8 (51-114)||(25561729-25561792)
chr8 (141-268)||(18372216-18372342)
chr8 (46-146)||(20130454-20130553)
chr8 (420-520)||(20130454-20130553)
chr8 (41-173)||(5274775-5274907)
chr8 (415-547)||(5274775-5274907)
chr8 (492-585)||(20995404-20995497)
chr8 (118-211)||(20995404-20995497)
chr8 (44-208)||(40991756-40991920)
chr8 (418-582)||(40991756-40991920)
chr8 (509-573)||(43274635-43274699)
chr8 (135-199)||(43274635-43274699)
chr8 (526-598)||(3037943-3038016)
chr8 (122-179)||(16524446-16524503)
chr8 (496-553)||(16524446-16524503)
chr8 (44-85)||(18372485-18372526)
chr8 (451-507)||(18373236-18373292)
chr8 (77-133)||(18373236-18373292)
chr8 (366-441)||(43274699-43274776)
chr8 (469-556)||(40417733-40417820)
chr8 (95-182)||(40417733-40417820)
chr8 (515-569)||(18372288-18372342)
chr8 (486-523)||(12156708-12156745)
chr8 (112-149)||(12156708-12156745)
chr8 (415-472)||(20995502-20995559)
chr8 (41-98)||(20995502-20995559)
chr8 (41-118)||(33831978-33832055)
chr8 (415-492)||(33831978-33832055)
chr8 (177-230)||(3038020-3038074)
chr8 (221-304)||(9608932-9609017)
chr8 (99-140)||(11442911-11442952)
chr8 (473-514)||(11442911-11442952)
chr8 (415-447)||(18645713-18645745)
chr8 (41-73)||(18645713-18645745)
[»] chr2 (149 HSPs)
chr2 (32-573)||(5542625-5543165)
chr2 (33-566)||(14745300-14745833)
chr2 (49-572)||(29676543-29677065)
chr2 (32-292)||(36178513-36178772)
chr2 (383-571)||(37106156-37106344)
chr2 (37-265)||(37105920-37106147)
chr2 (33-225)||(41283449-41283641)
chr2 (406-573)||(36178605-36178772)
chr2 (407-598)||(41283450-41283641)
chr2 (32-197)||(37106179-37106344)
chr2 (43-270)||(6421387-6421612)
chr2 (407-573)||(14745667-14745833)
chr2 (41-253)||(35580671-35580881)
chr2 (41-253)||(42514649-42514859)
chr2 (411-573)||(37105920-37106082)
chr2 (405-569)||(5543002-5543166)
chr2 (387-567)||(15880233-15880415)
chr2 (343-522)||(36178320-36178498)
chr2 (113-597)||(3672773-3673249)
chr2 (417-598)||(6421387-6421567)
chr2 (41-273)||(962598-962827)
chr2 (415-570)||(962598-962753)
chr2 (43-193)||(15880265-15880415)
chr2 (41-238)||(38796578-38796778)
chr2 (383-570)||(40679632-40679818)
chr2 (415-598)||(42514649-42514831)
chr2 (382-573)||(6422084-6422268)
chr2 (383-583)||(7598577-7598769)
chr2 (422-573)||(15511495-15511646)
chr2 (48-199)||(15511495-15511646)
chr2 (415-573)||(35580724-35580881)
chr2 (382-571)||(28531316-28531504)
chr2 (41-304)||(7598228-7598491)
chr2 (433-573)||(36178171-36178311)
chr2 (59-199)||(36178171-36178311)
chr2 (57-199)||(6422126-6422268)
chr2 (43-224)||(6712978-6713160)
chr2 (417-598)||(6712978-6713160)
chr2 (32-192)||(14745300-14745461)
chr2 (417-566)||(36005887-36006035)
chr2 (43-192)||(36005887-36006035)
chr2 (415-598)||(38796592-38796778)
chr2 (46-223)||(33731653-33731831)
chr2 (420-597)||(33731653-33731831)
chr2 (382-573)||(40733482-40733675)
chr2 (54-273)||(23346250-23346466)
chr2 (41-196)||(40679632-40679787)
chr2 (43-268)||(40733519-40733744)
chr2 (415-597)||(37632575-37632755)
chr2 (41-223)||(37632575-37632755)
chr2 (382-573)||(40733848-40734040)
chr2 (43-304)||(40733885-40734147)
chr2 (103-267)||(6421793-6421956)
chr2 (33-225)||(1769884-1770075)
chr2 (407-563)||(1769884-1770040)
chr2 (32-209)||(7598600-7598769)
chr2 (419-554)||(28254258-28254391)
chr2 (45-180)||(28254258-28254391)
chr2 (41-197)||(28531316-28531472)
chr2 (33-148)||(36178320-36178435)
chr2 (426-583)||(40163362-40163520)
chr2 (52-209)||(40163362-40163520)
chr2 (428-597)||(23346250-23346417)
chr2 (415-574)||(7598228-7598387)
chr2 (43-185)||(5367457-5367599)
chr2 (417-559)||(5367457-5367599)
chr2 (41-198)||(29676903-29677065)
chr2 (395-523)||(31468800-31468926)
chr2 (383-493)||(38796298-38796410)
chr2 (477-596)||(6421793-6421911)
chr2 (41-235)||(30313178-30313370)
chr2 (41-148)||(16542449-16542556)
chr2 (415-522)||(16542449-16542556)
chr2 (423-573)||(29676543-29676687)
chr2 (41-149)||(31468800-31468904)
chr2 (95-223)||(3673122-3673249)
chr2 (415-563)||(12529038-12529186)
chr2 (41-189)||(12529038-12529186)
chr2 (41-223)||(16590888-16591065)
chr2 (415-597)||(16590888-16591065)
chr2 (385-598)||(30313147-30313359)
chr2 (352-472)||(36785664-36785786)
chr2 (382-532)||(30323430-30323581)
chr2 (418-503)||(31899496-31899581)
chr2 (44-129)||(31899496-31899581)
chr2 (382-533)||(33561491-33561641)
chr2 (382-585)||(29873525-29873729)
chr2 (417-573)||(29874023-29874179)
chr2 (43-199)||(29874023-29874179)
chr2 (423-527)||(37895107-37895211)
chr2 (49-153)||(37895107-37895211)
chr2 (418-531)||(31259658-31259774)
chr2 (44-157)||(31259658-31259774)
chr2 (41-159)||(33561491-33561609)
chr2 (383-533)||(37894732-37894881)
chr2 (41-119)||(38796298-38796376)
chr2 (103-195)||(6421688-6421780)
chr2 (477-569)||(6421688-6421780)
chr2 (41-158)||(30323464-30323581)
chr2 (468-560)||(36784273-36784365)
chr2 (94-186)||(36784273-36784365)
chr2 (396-523)||(33953821-33953947)
chr2 (382-522)||(41678419-41678559)
chr2 (41-211)||(29873525-29873695)
chr2 (41-159)||(37894732-37894850)
chr2 (415-596)||(3672719-3672882)
chr2 (41-98)||(36785664-36785721)
chr2 (44-199)||(9231252-9231407)
chr2 (418-573)||(9231252-9231407)
chr2 (42-172)||(31385738-31385868)
chr2 (416-546)||(31385738-31385868)
chr2 (431-520)||(28254165-28254254)
chr2 (57-146)||(28254165-28254254)
chr2 (41-149)||(33953821-33953929)
chr2 (383-477)||(42514981-42515078)
chr2 (418-571)||(3594180-3594333)
chr2 (44-197)||(3594180-3594333)
chr2 (505-586)||(31899090-31899170)
chr2 (131-212)||(31899090-31899170)
chr2 (479-569)||(35580443-35580534)
chr2 (105-195)||(35580443-35580534)
chr2 (44-148)||(12910231-12910335)
chr2 (418-522)||(12910231-12910335)
chr2 (41-148)||(41678419-41678527)
chr2 (83-235)||(30312831-30312983)
chr2 (43-89)||(6421306-6421352)
chr2 (417-463)||(6421306-6421352)
chr2 (415-556)||(33954279-33954419)
chr2 (41-182)||(33954279-33954419)
chr2 (457-533)||(30312831-30312907)
chr2 (469-528)||(25390313-25390372)
chr2 (95-154)||(25390313-25390372)
chr2 (108-159)||(28226404-28226455)
chr2 (482-533)||(28226404-28226455)
chr2 (56-103)||(42515031-42515078)
chr2 (83-140)||(2336666-2336723)
chr2 (457-514)||(2336666-2336723)
chr2 (41-77)||(3673085-3673121)
chr2 (111-159)||(8904498-8904546)
chr2 (485-533)||(8904498-8904546)
chr2 (112-159)||(28226726-28226772)
chr2 (486-533)||(28226726-28226772)
chr2 (145-223)||(2109988-2110066)
chr2 (519-597)||(2109988-2110066)
chr2 (382-437)||(40734243-40734300)
chr2 (482-531)||(13792536-13792585)
chr2 (108-157)||(13792536-13792585)
chr2 (41-77)||(3672719-3672755)
chr2 (217-253)||(36785893-36785928)
[»] chr6 (103 HSPs)
chr6 (43-573)||(2377756-2378284)
chr6 (41-575)||(10073989-10074521)
chr6 (145-573)||(3409405-3409818)
chr6 (43-572)||(16107680-16108208)
chr6 (33-322)||(29518495-29518784)
chr6 (352-573)||(29518857-29519078)
chr6 (33-281)||(35210196-35210442)
chr6 (41-268)||(2579805-2580030)
chr6 (32-199)||(29518911-29519078)
chr6 (407-573)||(29518495-29518661)
chr6 (33-199)||(32741171-32741337)
chr6 (407-573)||(32741171-32741337)
chr6 (33-314)||(26544041-26544321)
chr6 (32-199)||(2378117-2378284)
chr6 (43-264)||(16454577-16454797)
chr6 (42-303)||(2578730-2578991)
chr6 (46-303)||(2579387-2579645)
chr6 (407-598)||(35210196-35210385)
chr6 (383-573)||(2578443-2578634)
chr6 (33-189)||(3409251-3409407)
chr6 (407-563)||(3409251-3409407)
chr6 (382-584)||(10074352-10074553)
chr6 (41-273)||(10073918-10074149)
chr6 (28-210)||(3415445-3415629)
chr6 (33-223)||(3058218-3058409)
chr6 (407-597)||(3058218-3058409)
chr6 (32-199)||(3409651-3409818)
chr6 (382-586)||(16454872-16455078)
chr6 (406-584)||(3415449-3415629)
chr6 (407-573)||(14748342-14748504)
chr6 (33-199)||(14748342-14748504)
chr6 (415-586)||(2579860-2580030)
chr6 (34-199)||(1846741-1846906)
chr6 (408-573)||(1846741-1846906)
chr6 (43-199)||(2578443-2578598)
chr6 (43-268)||(2579042-2579261)
chr6 (386-587)||(2579478-2579678)
chr6 (47-212)||(16454913-16455078)
chr6 (390-586)||(2578822-2579016)
chr6 (407-563)||(26544041-26544197)
chr6 (33-211)||(1127352-1127530)
chr6 (407-585)||(1127352-1127530)
chr6 (417-598)||(16454577-16454757)
chr6 (383-598)||(2579086-2579297)
chr6 (47-199)||(2843560-2843713)
chr6 (421-573)||(2843560-2843713)
chr6 (382-585)||(10073604-10073804)
chr6 (417-595)||(5832007-5832182)
chr6 (43-221)||(5832007-5832182)
chr6 (41-211)||(10073604-10073772)
chr6 (418-570)||(6999799-6999951)
chr6 (44-196)||(6999799-6999951)
chr6 (415-586)||(593694-593867)
chr6 (41-212)||(593694-593867)
chr6 (41-270)||(12071621-12071849)
chr6 (418-558)||(1950200-1950340)
chr6 (44-184)||(1950200-1950340)
chr6 (420-523)||(32460630-32460733)
chr6 (46-149)||(32460630-32460733)
chr6 (41-195)||(10911565-10911720)
chr6 (415-569)||(10911565-10911720)
chr6 (41-268)||(12084967-12085191)
chr6 (421-540)||(9062383-9062501)
chr6 (47-166)||(9062383-9062501)
chr6 (41-272)||(31714671-31714899)
chr6 (41-253)||(12092429-12092640)
chr6 (415-586)||(12071678-12071849)
chr6 (382-534)||(8481893-8482045)
chr6 (415-586)||(12085021-12085191)
chr6 (415-585)||(12092470-12092640)
chr6 (410-567)||(5958613-5958766)
chr6 (36-193)||(5958613-5958766)
chr6 (382-547)||(6071098-6071264)
chr6 (41-173)||(6071132-6071264)
chr6 (415-596)||(31714671-31714849)
chr6 (41-160)||(8481927-8482045)
chr6 (382-488)||(35210456-35210551)
chr6 (419-584)||(17135058-17135223)
chr6 (45-210)||(17135058-17135223)
chr6 (48-234)||(30618584-30618766)
chr6 (383-531)||(2975521-2975668)
chr6 (352-474)||(33605913-33606034)
chr6 (56-157)||(2975567-2975668)
chr6 (61-114)||(35210498-35210551)
chr6 (422-598)||(30618594-30618766)
chr6 (166-236)||(2975296-2975365)
chr6 (165-253)||(2975029-2975116)
chr6 (483-527)||(22605301-22605345)
chr6 (109-153)||(22605301-22605345)
chr6 (483-534)||(11637760-11637811)
chr6 (109-160)||(11637760-11637811)
chr6 (452-498)||(14789279-14789325)
chr6 (78-124)||(14789279-14789325)
chr6 (483-527)||(21130103-21130147)
chr6 (109-153)||(21130103-21130147)
chr6 (41-268)||(33605654-33605867)
chr6 (507-565)||(10902438-10902496)
chr6 (133-191)||(10902438-10902496)
chr6 (540-598)||(2975296-2975353)
chr6 (491-533)||(11638053-11638095)
chr6 (117-159)||(11638053-11638095)
chr6 (549-599)||(35210554-35210603)
chr6 (175-224)||(35210554-35210602)
[»] chr7 (143 HSPs)
chr7 (33-573)||(37533011-37533530)
chr7 (41-534)||(22566702-22567196)
chr7 (228-570)||(14681323-14681663)
chr7 (32-313)||(37532897-37533177)
chr7 (41-273)||(1085543-1085774)
chr7 (415-598)||(1085592-1085774)
chr7 (328-544)||(7553937-7554154)
chr7 (41-223)||(7517580-7517762)
chr7 (415-597)||(7517580-7517762)
chr7 (35-225)||(29157559-29157749)
chr7 (409-598)||(29157559-29157748)
chr7 (383-573)||(30244236-30244428)
chr7 (43-307)||(45433243-45433505)
chr7 (407-598)||(37533340-37533530)
chr7 (415-573)||(23377-23535)
chr7 (41-199)||(23377-23535)
chr7 (383-599)||(30245043-30245256)
chr7 (43-273)||(47129097-47129324)
chr7 (422-599)||(11845198-11845374)
chr7 (43-268)||(45754718-45754939)
chr7 (41-253)||(8128387-8128599)
chr7 (48-224)||(11845198-11845373)
chr7 (43-199)||(30244272-30244428)
chr7 (41-302)||(40094664-40094932)
chr7 (43-199)||(6054562-6054718)
chr7 (417-573)||(6054562-6054718)
chr7 (417-585)||(45433243-45433411)
chr7 (415-573)||(40094774-40094932)
chr7 (415-595)||(22567017-22567196)
chr7 (415-565)||(36939741-36939891)
chr7 (41-191)||(36939741-36939891)
chr7 (328-573)||(45434548-45434794)
chr7 (41-170)||(7554025-7554154)
chr7 (32-196)||(14681501-14681663)
chr7 (417-562)||(45754718-45754862)
chr7 (49-189)||(19122740-19122879)
chr7 (423-563)||(19122740-19122879)
chr7 (43-224)||(30245079-30245255)
chr7 (41-199)||(24177435-24177593)
chr7 (415-573)||(24177435-24177593)
chr7 (421-571)||(34218036-34218186)
chr7 (47-197)||(34218036-34218186)
chr7 (43-199)||(45434638-45434794)
chr7 (415-597)||(118277-118459)
chr7 (41-223)||(118277-118459)
chr7 (417-586)||(47129097-47129265)
chr7 (415-598)||(8128416-8128599)
chr7 (41-235)||(36622960-36623153)
chr7 (415-596)||(36622960-36623140)
chr7 (46-199)||(30032572-30032725)
chr7 (420-573)||(30032572-30032725)
chr7 (44-197)||(9901648-9901799)
chr7 (418-571)||(9901648-9901799)
chr7 (41-161)||(16569196-16569316)
chr7 (415-535)||(16569196-16569316)
chr7 (415-535)||(16596346-16596466)
chr7 (41-161)||(16596346-16596466)
chr7 (415-569)||(40230295-40230449)
chr7 (41-195)||(40230295-40230449)
chr7 (388-541)||(1085280-1085436)
chr7 (418-550)||(24838724-24838857)
chr7 (44-176)||(24838724-24838857)
chr7 (41-167)||(1085280-1085407)
chr7 (44-196)||(20599317-20599471)
chr7 (418-570)||(20599317-20599471)
chr7 (415-564)||(36534795-36534942)
chr7 (41-190)||(36534795-36534942)
chr7 (41-199)||(41854635-41854792)
chr7 (415-573)||(41854635-41854792)
chr7 (62-197)||(37167808-37167937)
chr7 (436-571)||(37167808-37167937)
chr7 (83-199)||(30253534-30253646)
chr7 (457-573)||(30253534-30253646)
chr7 (461-597)||(28300229-28300366)
chr7 (87-223)||(28300229-28300366)
chr7 (383-485)||(30244667-30244771)
chr7 (386-488)||(30255308-30255412)
chr7 (418-567)||(41910592-41910749)
chr7 (44-193)||(41910592-41910749)
chr7 (496-599)||(47129450-47129551)
chr7 (122-224)||(47129450-47129550)
chr7 (41-162)||(43241495-43241616)
chr7 (415-536)||(43241495-43241616)
chr7 (386-488)||(30245463-30245567)
chr7 (415-503)||(28301613-28301701)
chr7 (41-129)||(28301613-28301701)
chr7 (142-240)||(30253671-30253768)
chr7 (124-304)||(28300473-28300644)
chr7 (142-240)||(30244453-30244550)
chr7 (142-240)||(30245256-30245353)
chr7 (41-114)||(30245494-30245567)
chr7 (41-114)||(30255339-30255412)
chr7 (498-572)||(28300569-28300644)
chr7 (41-111)||(30244701-30244771)
chr7 (415-483)||(36109007-36109075)
chr7 (41-109)||(36109007-36109075)
chr7 (503-571)||(37532753-37532821)
chr7 (129-197)||(37532753-37532821)
chr7 (516-597)||(30244453-30244533)
chr7 (516-597)||(30253671-30253751)
chr7 (420-520)||(44361517-44361616)
chr7 (46-146)||(44361517-44361616)
chr7 (337-412)||(37532822-37532896)
chr7 (366-533)||(37345868-37346036)
chr7 (383-465)||(40094502-40094583)
chr7 (482-533)||(21416181-21416232)
chr7 (108-159)||(21416181-21416232)
chr7 (516-598)||(30245256-30245337)
chr7 (151-223)||(7517767-7517839)
chr7 (525-597)||(7517767-7517839)
chr7 (151-223)||(7518033-7518105)
chr7 (525-597)||(7518033-7518105)
chr7 (484-532)||(23569043-23569091)
chr7 (110-158)||(23569043-23569091)
chr7 (415-533)||(4124128-4124246)
chr7 (41-159)||(4124128-4124246)
chr7 (35-78)||(14681281-14681324)
chr7 (409-452)||(14681281-14681324)
chr7 (483-562)||(40094424-40094503)
chr7 (109-188)||(40094424-40094503)
chr7 (41-91)||(40094502-40094552)
chr7 (124-186)||(45755010-45755072)
chr7 (498-560)||(45755010-45755072)
chr7 (482-527)||(21619091-21619136)
chr7 (108-153)||(21619091-21619136)
chr7 (112-244)||(37345652-37345783)
chr7 (275-323)||(45697753-45697801)
chr7 (96-199)||(37393114-37393216)
chr7 (470-573)||(37393114-37393216)
chr7 (417-467)||(36967335-36967385)
chr7 (43-93)||(36967335-36967385)
chr7 (41-159)||(37345916-37346036)
chr7 (83-199)||(15902342-15902457)
chr7 (457-573)||(15902342-15902457)
chr7 (483-527)||(27391815-27391859)
chr7 (109-153)||(27391815-27391859)
chr7 (510-564)||(4719305-4719359)
chr7 (136-190)||(4719305-4719359)
chr7 (177-223)||(7517982-7518028)
chr7 (551-597)||(7517982-7518028)
chr7 (108-148)||(27598052-27598092)
chr7 (482-522)||(27598052-27598092)
chr7 (242-303)||(48243356-48243419)
[»] scaffold0702 (2 HSPs)
scaffold0702 (43-573)||(147-670)
scaffold0702 (32-199)||(147-309)
[»] chr3 (171 HSPs)
chr3 (150-592)||(22304302-22304747)
chr3 (172-573)||(41359765-41360164)
chr3 (43-394)||(22303759-22304104)
chr3 (275-556)||(4823515-4823796)
chr3 (328-597)||(37990615-37990884)
chr3 (41-304)||(15772854-15773117)
chr3 (32-218)||(22304560-22304747)
chr3 (41-268)||(33803184-33803410)
chr3 (323-567)||(15773099-15773346)
chr3 (43-268)||(37990909-37991133)
chr3 (43-236)||(43346754-43346947)
chr3 (383-598)||(54017792-54018008)
chr3 (312-572)||(11661846-11662108)
chr3 (41-287)||(29644811-29645060)
chr3 (43-223)||(37990615-37990795)
chr3 (41-236)||(54017780-54017974)
chr3 (41-303)||(54018093-54018356)
chr3 (417-583)||(37990967-37991133)
chr3 (41-227)||(42342360-42342546)
chr3 (417-571)||(43346793-43346947)
chr3 (43-199)||(35946524-35946680)
chr3 (417-573)||(35946524-35946680)
chr3 (41-292)||(53577364-53577616)
chr3 (415-598)||(15772854-15773036)
chr3 (415-598)||(42342363-42342546)
chr3 (415-585)||(29644890-29645060)
chr3 (366-573)||(29644581-29644791)
chr3 (382-571)||(42342092-42342283)
chr3 (31-191)||(39934963-39935125)
chr3 (415-585)||(12114550-12114720)
chr3 (41-211)||(12114550-12114720)
chr3 (41-199)||(32589704-32589861)
chr3 (415-573)||(32589704-32589861)
chr3 (415-573)||(33803252-33803410)
chr3 (406-565)||(39934963-39935124)
chr3 (43-253)||(52634678-52634885)
chr3 (41-240)||(25739382-25739583)
chr3 (41-303)||(41359660-41359919)
chr3 (383-573)||(21832345-21832532)
chr3 (415-573)||(54018198-54018356)
chr3 (41-199)||(29644581-29644739)
chr3 (33-190)||(39389062-39389219)
chr3 (407-564)||(39389062-39389219)
chr3 (382-565)||(22303963-22304141)
chr3 (43-303)||(32462795-32463057)
chr3 (43-303)||(3135350-3135617)
chr3 (415-573)||(25739425-25739583)
chr3 (417-570)||(32462903-32463057)
chr3 (417-598)||(52634678-52634857)
chr3 (41-199)||(21832345-21832501)
chr3 (41-197)||(42342092-42342248)
chr3 (382-573)||(32462558-32462752)
chr3 (407-573)||(50612447-50612618)
chr3 (33-199)||(50612447-50612618)
chr3 (41-193)||(15773192-15773346)
chr3 (32-182)||(4823646-4823796)
chr3 (41-200)||(31190017-31190168)
chr3 (415-574)||(31190017-31190168)
chr3 (415-573)||(53577364-53577522)
chr3 (43-199)||(25755396-25755552)
chr3 (417-573)||(25755396-25755552)
chr3 (415-597)||(1634291-1634473)
chr3 (41-223)||(1634291-1634473)
chr3 (353-547)||(3135099-3135293)
chr3 (415-570)||(45395656-45395811)
chr3 (41-196)||(45395656-45395811)
chr3 (48-173)||(3135099-3135224)
chr3 (417-573)||(3135454-3135617)
chr3 (383-566)||(9240118-9240300)
chr3 (43-200)||(45901715-45901873)
chr3 (417-574)||(45901715-45901873)
chr3 (416-573)||(53117975-53118131)
chr3 (42-199)||(53117975-53118131)
chr3 (41-252)||(8327904-8328115)
chr3 (41-201)||(39914252-39914412)
chr3 (415-575)||(39914252-39914412)
chr3 (415-574)||(8327904-8328067)
chr3 (43-199)||(32462558-32462715)
chr3 (382-470)||(22304213-22304301)
chr3 (33-199)||(37726496-37726654)
chr3 (407-573)||(37726496-37726654)
chr3 (417-565)||(49336694-49336843)
chr3 (43-191)||(49336694-49336843)
chr3 (33-200)||(51886553-51886714)
chr3 (407-574)||(51886553-51886714)
chr3 (44-198)||(11661954-11662108)
chr3 (473-597)||(22303634-22303759)
chr3 (99-223)||(22303634-22303759)
chr3 (417-597)||(33175635-33175820)
chr3 (43-223)||(33175635-33175820)
chr3 (41-192)||(9240149-9240300)
chr3 (415-573)||(44160547-44160702)
chr3 (41-199)||(44160547-44160702)
chr3 (396-547)||(47964544-47964694)
chr3 (425-597)||(42584800-42584970)
chr3 (51-223)||(42584800-42584970)
chr3 (489-597)||(41359467-41359575)
chr3 (115-223)||(41359467-41359575)
chr3 (41-173)||(47964544-47964676)
chr3 (41-253)||(39336178-39336387)
chr3 (404-522)||(3384317-3384435)
chr3 (441-539)||(33362327-33362425)
chr3 (67-165)||(33362327-33362425)
chr3 (32-148)||(3384317-3384433)
chr3 (32-96)||(22304237-22304301)
chr3 (415-585)||(39336219-39336387)
chr3 (111-225)||(54017522-54017636)
chr3 (485-598)||(54017523-54017636)
chr3 (415-573)||(47964915-47965073)
chr3 (41-199)||(47964915-47965073)
chr3 (418-507)||(7767380-7767469)
chr3 (44-133)||(7767380-7767469)
chr3 (524-598)||(22304302-22304377)
chr3 (43-159)||(11661537-11661638)
chr3 (417-533)||(11661537-11661638)
chr3 (418-523)||(46546375-46546480)
chr3 (44-149)||(46546375-46546480)
chr3 (41-97)||(43346650-43346706)
chr3 (415-471)||(43346650-43346706)
chr3 (457-543)||(39336000-39336086)
chr3 (83-169)||(39336000-39336086)
chr3 (83-188)||(12749211-12749316)
chr3 (457-562)||(12749211-12749316)
chr3 (91-151)||(52634990-52635050)
chr3 (465-525)||(52634990-52635050)
chr3 (145-198)||(8328374-8328427)
chr3 (519-572)||(8328374-8328427)
chr3 (44-173)||(25317161-25317290)
chr3 (418-547)||(25317161-25317290)
chr3 (43-159)||(25991405-25991521)
chr3 (417-533)||(25991405-25991521)
chr3 (168-267)||(9239940-9240038)
chr3 (108-159)||(53596027-53596078)
chr3 (482-533)||(53596027-53596078)
chr3 (108-159)||(53596342-53596393)
chr3 (482-533)||(53596342-53596393)
chr3 (470-527)||(17731950-17732007)
chr3 (96-153)||(17731950-17732007)
chr3 (470-527)||(19033181-19033238)
chr3 (96-153)||(19033181-19033238)
chr3 (495-573)||(43978865-43978947)
chr3 (121-199)||(43978865-43978947)
chr3 (108-159)||(53596542-53596593)
chr3 (482-533)||(53596542-53596593)
chr3 (497-573)||(7766783-7766857)
chr3 (123-199)||(7766783-7766857)
chr3 (214-274)||(53577656-53577716)
chr3 (482-529)||(48127859-48127906)
chr3 (108-155)||(48127859-48127906)
chr3 (542-586)||(9239940-9239984)
chr3 (415-447)||(12747878-12747910)
chr3 (41-73)||(12747878-12747910)
chr3 (483-527)||(16871005-16871049)
chr3 (109-153)||(16871005-16871049)
chr3 (483-527)||(17735037-17735081)
chr3 (109-153)||(17735037-17735081)
chr3 (483-527)||(19036306-19036350)
chr3 (109-153)||(19036306-19036350)
chr3 (202-268)||(3135035-3135099)
chr3 (377-439)||(2299937-2300000)
chr3 (108-153)||(16143505-16143550)
chr3 (482-527)||(16143505-16143550)
chr3 (486-527)||(16869843-16869884)
chr3 (112-153)||(16869843-16869884)
chr3 (420-481)||(36986040-36986101)
chr3 (46-107)||(36986040-36986101)
chr3 (420-481)||(37011479-37011540)
chr3 (46-107)||(37011479-37011540)
chr3 (546-598)||(41360112-41360164)
chr3 (478-514)||(50329391-50329427)
chr3 (104-140)||(50329391-50329427)
[»] scaffold0078 (2 HSPs)
scaffold0078 (41-535)||(4982-5477)
scaffold0078 (415-566)||(4982-5133)
[»] chr4 (207 HSPs)
chr4 (33-347)||(41370349-41370662)
chr4 (40-563)||(54108537-54109060)
chr4 (47-568)||(20825842-20826370)
chr4 (41-358)||(10245920-10246237)
chr4 (41-524)||(2740700-2741180)
chr4 (228-573)||(18932747-18933102)
chr4 (41-317)||(3340807-3341083)
chr4 (41-240)||(25483336-25483534)
chr4 (382-596)||(36629205-36629418)
chr4 (405-595)||(50630731-50630921)
chr4 (32-221)||(50630731-50630920)
chr4 (415-598)||(25483336-25483518)
chr4 (43-222)||(36629239-36629418)
chr4 (407-573)||(41370349-41370515)
chr4 (407-582)||(55933113-55933288)
chr4 (33-208)||(55933113-55933288)
chr4 (352-586)||(44620595-44620830)
chr4 (415-598)||(10245920-10246102)
chr4 (43-273)||(39404020-39404249)
chr4 (50-307)||(44621011-44621266)
chr4 (41-253)||(22028313-22028527)
chr4 (41-273)||(44620660-44620889)
chr4 (352-572)||(39404334-39404555)
chr4 (415-570)||(54017596-54017751)
chr4 (41-196)||(54017596-54017751)
chr4 (38-240)||(50002423-50002625)
chr4 (384-598)||(22027935-22028150)
chr4 (415-598)||(3340807-3340989)
chr4 (41-268)||(49076763-49076986)
chr4 (415-572)||(1731646-1731803)
chr4 (41-198)||(1731646-1731803)
chr4 (417-586)||(39792845-39793014)
chr4 (43-212)||(39792845-39793014)
chr4 (412-573)||(50002423-50002584)
chr4 (41-224)||(22027935-22028117)
chr4 (43-198)||(39404400-39404555)
chr4 (415-585)||(36608647-36608817)
chr4 (41-211)||(36608647-36608817)
chr4 (417-598)||(39404020-39404201)
chr4 (41-189)||(52884695-52884844)
chr4 (415-563)||(52884695-52884844)
chr4 (385-563)||(52884856-52885038)
chr4 (50-268)||(44620362-44620571)
chr4 (415-598)||(22028341-22028527)
chr4 (417-572)||(34646648-34646803)
chr4 (43-198)||(34646648-34646803)
chr4 (33-179)||(49880152-49880297)
chr4 (407-553)||(49880152-49880297)
chr4 (44-198)||(50459724-50459878)
chr4 (418-572)||(50459724-50459878)
chr4 (425-573)||(54343006-54343147)
chr4 (51-199)||(54343006-54343147)
chr4 (43-240)||(36572021-36572216)
chr4 (424-573)||(44620362-44620511)
chr4 (42-307)||(16889426-16889691)
chr4 (95-307)||(23817569-23817783)
chr4 (417-573)||(36572021-36572177)
chr4 (41-189)||(52884887-52885038)
chr4 (415-582)||(22183253-22183420)
chr4 (41-208)||(22183253-22183420)
chr4 (415-556)||(4955332-4955473)
chr4 (41-182)||(4955332-4955473)
chr4 (424-573)||(44621011-44621160)
chr4 (60-225)||(54936215-54936378)
chr4 (32-199)||(18932747-18932925)
chr4 (434-598)||(54936215-54936377)
chr4 (415-574)||(49076828-49076986)
chr4 (421-598)||(20825842-20826019)
chr4 (383-574)||(3244448-3244638)
chr4 (416-583)||(16888804-16888971)
chr4 (42-209)||(16888804-16888971)
chr4 (415-566)||(32941128-32941279)
chr4 (41-192)||(32941128-32941279)
chr4 (378-573)||(49076449-49076643)
chr4 (44-200)||(49302907-49303065)
chr4 (418-574)||(49302907-49303065)
chr4 (414-573)||(54108537-54108694)
chr4 (415-586)||(2740700-2740869)
chr4 (372-573)||(3341083-3341286)
chr4 (416-572)||(16889535-16889691)
chr4 (56-170)||(45496820-45496934)
chr4 (430-544)||(45496820-45496934)
chr4 (41-200)||(3244448-3244607)
chr4 (415-570)||(4390102-4390257)
chr4 (41-196)||(4390102-4390257)
chr4 (391-586)||(43174480-43174677)
chr4 (383-572)||(45489331-45489522)
chr4 (469-573)||(23817679-23817783)
chr4 (41-228)||(54741149-54741334)
chr4 (92-303)||(31691203-31691415)
chr4 (43-212)||(43174508-43174677)
chr4 (417-533)||(41707503-41707618)
chr4 (43-159)||(41707503-41707618)
chr4 (415-598)||(54741153-54741334)
chr4 (407-538)||(6975489-6975620)
chr4 (33-164)||(6975489-6975620)
chr4 (415-570)||(34004586-34004739)
chr4 (41-196)||(34004586-34004739)
chr4 (41-199)||(49076449-49076604)
chr4 (41-199)||(3341128-3341286)
chr4 (43-187)||(19504707-19504842)
chr4 (417-561)||(19504707-19504842)
chr4 (43-198)||(45489331-45489485)
chr4 (415-570)||(51768061-51768216)
chr4 (41-196)||(51768061-51768216)
chr4 (41-196)||(3700365-3700512)
chr4 (415-570)||(3700365-3700512)
chr4 (87-197)||(18879852-18879962)
chr4 (461-571)||(18879852-18879962)
chr4 (81-199)||(43827480-43827597)
chr4 (455-573)||(43827480-43827597)
chr4 (169-293)||(45496678-45496803)
chr4 (466-567)||(31691203-31691306)
chr4 (352-481)||(44621361-44621492)
chr4 (428-523)||(54017750-54017845)
chr4 (54-149)||(54017750-54017845)
chr4 (43-178)||(40067045-40067181)
chr4 (417-552)||(40067045-40067181)
chr4 (41-199)||(28034229-28034387)
chr4 (415-573)||(28034229-28034387)
chr4 (295-504)||(10246240-10246436)
chr4 (436-573)||(48111696-48111833)
chr4 (62-199)||(48111696-48111833)
chr4 (63-199)||(3271806-3271947)
chr4 (437-573)||(3271806-3271947)
chr4 (46-210)||(760194-760356)
chr4 (420-584)||(760194-760356)
chr4 (47-263)||(45489650-45489864)
chr4 (457-556)||(15841383-15841482)
chr4 (83-182)||(15841383-15841482)
chr4 (133-250)||(43174233-43174350)
chr4 (41-130)||(10246347-10246436)
chr4 (407-467)||(50788087-50788147)
chr4 (33-93)||(50788087-50788147)
chr4 (151-253)||(19895406-19895506)
chr4 (49-107)||(44620304-44620362)
chr4 (423-481)||(44620304-44620362)
chr4 (104-253)||(11783499-11783646)
chr4 (415-547)||(23556890-23557022)
chr4 (41-173)||(23556890-23557022)
chr4 (421-573)||(45489712-45489864)
chr4 (44-251)||(34544107-34544314)
chr4 (507-573)||(43174233-43174299)
chr4 (41-107)||(44621426-44621492)
chr4 (108-159)||(11197293-11197344)
chr4 (482-533)||(11197293-11197344)
chr4 (418-533)||(34544107-34544225)
chr4 (440-571)||(39698944-39699077)
chr4 (66-197)||(39698944-39699077)
chr4 (399-481)||(44620926-44621011)
chr4 (43-107)||(44620946-44621011)
chr4 (478-598)||(11783527-11783646)
chr4 (154-225)||(23817429-23817498)
chr4 (528-598)||(23817430-23817498)
chr4 (386-452)||(41370673-41370738)
chr4 (121-195)||(41370738-41370812)
chr4 (495-569)||(41370738-41370812)
chr4 (415-503)||(11348396-11348484)
chr4 (41-129)||(11348396-11348484)
chr4 (421-533)||(15841023-15841134)
chr4 (47-159)||(15841023-15841134)
chr4 (352-411)||(16889315-16889375)
chr4 (41-239)||(6876060-6876253)
chr4 (108-159)||(10396198-10396249)
chr4 (482-533)||(10396198-10396249)
chr4 (108-159)||(10396483-10396534)
chr4 (482-533)||(10396483-10396534)
chr4 (108-160)||(922485-922537)
chr4 (482-534)||(922485-922537)
chr4 (109-148)||(1868119-1868158)
chr4 (483-522)||(1868119-1868158)
chr4 (525-564)||(19895406-19895445)
chr4 (473-531)||(11706584-11706641)
chr4 (99-157)||(11706584-11706641)
chr4 (107-153)||(51681604-51681650)
chr4 (481-527)||(51681604-51681650)
chr4 (529-586)||(11702284-11702341)
chr4 (155-212)||(11702284-11702341)
chr4 (469-529)||(2891864-2891924)
chr4 (95-155)||(2891864-2891924)
chr4 (41-89)||(45050601-45050649)
chr4 (415-463)||(45050601-45050649)
chr4 (493-569)||(50787996-50788072)
chr4 (119-195)||(50787996-50788072)
chr4 (108-159)||(11197003-11197054)
chr4 (482-533)||(11197003-11197054)
chr4 (407-438)||(18933103-18933134)
chr4 (33-64)||(18933103-18933134)
chr4 (96-139)||(45484774-45484817)
chr4 (470-513)||(45484774-45484817)
chr4 (543-598)||(45496678-45496733)
chr4 (459-533)||(31249896-31249970)
chr4 (85-159)||(31249896-31249970)
chr4 (32-78)||(41370692-41370738)
chr4 (491-533)||(41707279-41707321)
chr4 (117-159)||(41707279-41707321)
chr4 (415-456)||(11706636-11706677)
chr4 (41-82)||(11706636-11706677)
chr4 (152-189)||(19895533-19895570)
chr4 (526-563)||(19895533-19895570)
chr4 (104-137)||(29802604-29802637)
chr4 (478-511)||(29802604-29802637)
chr4 (543-583)||(1731581-1731621)
chr4 (169-209)||(1731581-1731621)
chr4 (504-600)||(11348236-11348330)
chr4 (497-533)||(34946151-34946187)
chr4 (123-159)||(34946151-34946187)
[»] scaffold0734 (1 HSPs)
scaffold0734 (41-564)||(5396-5931)
[»] scaffold0391 (6 HSPs)
scaffold0391 (224-599)||(1081-1465)
scaffold0391 (43-224)||(1082-1262)
scaffold0391 (88-287)||(1595-1802)
scaffold0391 (462-533)||(1731-1802)
scaffold0391 (382-466)||(3092-3178)
scaffold0391 (41-92)||(3092-3143)
[»] scaffold0171 (2 HSPs)
scaffold0171 (383-531)||(17496-17648)
scaffold0171 (41-157)||(17496-17614)
[»] scaffold0027 (2 HSPs)
scaffold0027 (41-199)||(47360-47518)
scaffold0027 (415-573)||(47360-47518)
[»] scaffold0504 (2 HSPs)
scaffold0504 (417-492)||(10192-10267)
scaffold0504 (43-118)||(10192-10267)
[»] scaffold0113 (4 HSPs)
scaffold0113 (43-253)||(39459-39665)
scaffold0113 (417-547)||(39459-39588)
scaffold0113 (382-540)||(39805-39963)
scaffold0113 (43-166)||(39840-39963)
[»] scaffold0807 (2 HSPs)
scaffold0807 (35-119)||(2869-2953)
scaffold0807 (409-493)||(2869-2953)
[»] scaffold0088 (2 HSPs)
scaffold0088 (453-493)||(10406-10446)
scaffold0088 (79-119)||(10406-10446)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 383; Significance: 0; HSPs: 151)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 383; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 44290992 - 44290458
Alignment:
Q  32 gtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaag 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44290992 gtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaag 44290893  T
Q  132 gttttgggtaa-gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtggtat 230  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  44290892 gttttgggtaaagagtgtggtgtatctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgagctccccccactgacccaacagtggtat 44290793  T
Q  231 cagagccccggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtcattgcgcagaaagccgcaacagcggtacaagtagcaagtggctccttgtgcaggaac 330  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| | |||||||        |||||||||||||||||||    
T  44290792 cagagccccggttcgacgaagggtgcgaccgaggcagccggttgttgcgcagaaagccgcaacggtggtacaa--------tggctccttgtgcaggaac 44290701  T
Q  331 ggcgatacaggcaaagtcaaaagcttccgctctaa-ggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagtta 429  Q
    | ||||||||||||||| || ||||||| ||  || |||||||| | | ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44290700 gacgatacaggcaaagt-aagagcttccccttgaagggggagcatgatgaatagatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagtta 44290602  T
Q  430 tatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtct 529  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  44290601 tatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtatggtgtct 44290502  T
Q  530 ctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 573  Q
     ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44290501 ttcttgcttgtacggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 44290458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 43 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 26662054 - 26661522
Alignment:
Q  43 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 142  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26662054 caagtgtgagttatatatcccatatcagataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtgagaagacccataaaccgattgccttaaggttttgggtaa 26661955  T
Q  143 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc-ccctaggctcccctcactgacccaacagtggtatcagagccccgg 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||| ||| |||| ||||| |||||||||  |||||||| |||||||| ||| || ||     
T  26661954 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcaatccttgatgcggatggtctcccta-gctcccctc-gtgacccaaaagtggtattagaacctcga 26661857  T
Q  242 ttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtc-attgcgcagaaagccgcaacagcggtacaagtagcaagtggctccttgtgcaggaacggcgatacag 340  Q
    ||||||||||||  |||||||||| ||  ||| |||||||||||||| |||||  ||||||||| | ||||||||||||||||||| |||| |||||||     
T  26661856 ttcgacgaagggtacgaccgaggccgccagtcaattgcgcagaaagcagcaacgacggtacaagcaacaagtggctccttgtgcagcaacgacgatacat 26661757  T
Q  341 gcaaagtcaaaagcttccgctctaaggg-gagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtccc 437  Q
    ||||||| || ||||||||||  ||||| ||| | | | ||  ||||||||||||||| |||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||    
T  26661756 gcaaagt-aagagcttccgcttgaagggagagtatgatgaatagatggactcacacttaagggggagtgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtccc 26661658  T
Q  438 acatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgct 537  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26661657 acatcgggtaaaagagtaaaggttgaacaccttataagtgagaggacccataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctcgct 26661558  T
Q  538 tgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 573  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  26661557 tgtgtggttgttcaagcctcgatatggacggtcccc 26661522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 33 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 50052189 - 50051777
Alignment:
Q  33 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 132  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| |    
T  50052189 tgttggtttttaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaacctattttcttaaag 50052090  T
Q  133 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtggtatca 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||   |||||||||  |||||||||||||||||||    
T  50052089 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgtttatgt-gttgttctaacctcgatgtggacagtcccccgagctcccctc-gtgacccaacagtggtatca 50051992  T
Q  233 gagccccggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtcattgcgcagaaagccgcaacagcggtacaagtagcaagtggctccttgtgcaggaacgg 332  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||  ||| |||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  50051991 gagccccggttcgacaaagggcgcgaccgaggcagccggtggttgggcagaaagccgcaacgacagtacaagcagcaagtggctccttgtgcaggaacgg 50051892  T
Q  333 cgatacaggcaaagtcaaaagcttccgctctaa-ggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttata 431  Q
    |||||| |||||||| || |||||| |||  || |||||||| | | || | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  50051891 cgatactggcaaagt-aagagcttctgcttgaagggggagcatgatgaattaatggactcacacttgagggggaatgttggtttgcaagtgtgagttata 50051793  T
Q  432 tgtcccacatcggata 447  Q
    ||||||||||||||||    
T  50051792 tgtcccacatcggata 50051777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 190 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 48588870 - 48588465
Alignment:
Q  190 gacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtggtatcagagccccggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtcattgcgcagaaagccg 289  Q
    ||||||||||   |||||||||| ||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||| |    
T  48588870 gacggtccccctagctcccctca-tgatccaacaatgatatcagagccccggttcgacgaagggtgcgactgaggcagccggtcattgtgcagaaagctg 48588772  T
Q  290 caacagcggtacaagtagcaagtggctccttgtgcaggaacggcgatacaggcaaagtcaaaagcttccgctctaagggg-agcacgttaaagtgatgga 388  Q
    ||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | || ||||||||||  |||||| |||| | | ||  ||||||    
T  48588771 caacgacggtacaagcagcaagtggctccttgtgcaggaacgacgatacatgcaaaat-aagagcttccgcttgaaggggtagcatgatgaatagatgga 48588673  T
Q  389 ctcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccat 488  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  48588672 ctcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttctatgtccgacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaagacccgt 48588573  T
Q  489 aaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc-ccctaggctcccctcac 587  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||    
T  48588572 aaattcattgccttaaggttttgggtaagagtgcggtgtctctcttacttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcgcccaaagttcccctcac 48588473  T
Q  588 tgacccaa 595  Q
    ||| ||||    
T  48588472 tgaaccaa 48588465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 32 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 48588655 - 48588340
Alignment:
Q  32 gtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaag 131  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||    
T  48588655 gtgttggtttgcaagtgtgagttctatgtccgacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaagacccgtaaattcattgccttaag 48588556  T
Q  132 gttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc-ccctaggctcccctcactgacccaacagtggtat 230  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||| |||| ||||||||    
T  48588555 gttttgggtaagagtgcggtgtctctcttacttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcgcccaaagttcccctcactgaaccaaaagtggtat 48588456  T
Q  231 cagagccccggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtcattgcgcagaaagccgcaacagcggtacaagtagcaagtggctccttgtgcaggaac 330  Q
    ||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||  || |||||  | |||||||||||||||||||||||    
T  48588455 cagagtcccggttcaacgaagggtgcaaccgaggcagccggttgttgcgcagaaagccgcaacgacgatacaaacaacaagtggctccttgtgcaggaac 48588356  T
Q  331 ggcgatacaggcaaag 346  Q
    ||||||||||||||||    
T  48588355 ggcgatacaggcaaag 48588340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 405 - 598
Target Start/End: Complemental strand, 44290993 - 44290799
Alignment:
Q  405 agtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa 504  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44290993 agtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa 44290894  T
Q  505 ggttttgggt-aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacag 598  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||    
T  44290893 ggttttgggtaaagagtgtggtgtatctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgagctccccccactgacccaacag 44290799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 41 - 307
Target Start/End: Original strand, 34364507 - 34364774
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 140  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||    
T  34364507 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccgtaaacccatagccttaaggttttgggt 34364606  T
Q  141 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtggtatcagagccccg 240  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| || ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  34364607 aagagtgtgatgtctctctcgcttatgcggttgctctagcctcgatgtggatggttccctgagctcccc-cagtgacccaacagtggtatcagagccccg 34364705  T
Q  241 gttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtc--attgcgcagaaagccgcaacagcggtacaagtag 307  Q
    |||||||||||||  ||||| || |||| ||||   ||| ||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  34364706 gttcgacgaagggtacgacccagacagccggtccgtttgtgcagaaagcagcaacggcgatacaagtag 34364774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 153; E-Value: 9e-81
Query Start/End: Original strand, 223 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 3537496 - 3537226
Alignment:
Q  223 agtggtatcagagccccggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtcattgcgcagaaagcc-gcaacagcggtacaagtagcaagtg--gctcct 319  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| | |||     |||||||||  ||||| |||||||||| ||||||||  ||||||    
T  3537496 agtggtatcagagccacggttcgacgaagggtacgaccgaggcagttagtc-----gcagaaagcaagcaacggcggtacaagcagcaagtgtggctcct 3537402  T
Q  320 tgtgcaggaacggcgatacaggcaaagtcaaaagcttccgctctaagggg-agcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgca 418  Q
    |||||||||||| ||||||| |||| || || ||||||||||  |||||| |||| | | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3537401 tgtgcaggaacgacgatacatgcaaggtaaagagcttccgcttgaagggggagcaagatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgca 3537302  T
Q  419 agtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaaccc 494  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3537301 agtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaaccc 3537226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 153; E-Value: 9e-81
Query Start/End: Original strand, 352 - 584
Target Start/End: Original strand, 41157311 - 41157545
Alignment:
Q  352 agcttccgctctaaggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaa 449  Q
    ||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  41157311 agcttccgctctg-ggggagcacgataaattgatggactcacacttaagggggagtattgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaa 41157409  T
Q  450 atagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgtt 549  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41157410 agagtaaaagttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctttaggttttgagtaagagtgtggtgtctgtcttgcttgtgtggttgtt 41157509  T
Q  550 ctagcctcgatgtggacggtccc-ctaggctcccct 584  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  41157510 ctagcctcgatgtgggcggtccctcaaggctcccct 41157545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 41 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 31767319 - 31767094
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 140  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||    
T  31767319 tgcaagtgtgggttatatgttccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccattaacctaatgccttaaggttttgggt 31767220  T
Q  141 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtggtatcagagccccg 240  Q
    |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  31767219 aagagtgtgacgtctatcttgcttgtgtggttgttctagactcgatgtggacggtcccccaagcttccctca-tgacccaacagtggtatcagagcccc- 31767122  T
Q  241 gttcgacgaagggagcgaccgaggcagc 268  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||    
T  31767121 gttcgacgaagggtacgaccgaggcagc 31767094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 41 - 267
Target Start/End: Original strand, 41156991 - 41157218
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 140  Q
    ||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  41156991 tgcaagtgtgaattatatgtcccataacggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgctttaaggttttgggt 41157090  T
Q  141 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt-cccctaggctcccc-tcactgacccaacagtggtatcagagccc 238  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  41157091 aagagtgtggtgtctctattgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgggcggtcccccaaggctccccttcagtgacccaacaatggtatcagagccc 41157190  T
Q  239 cggttcgacgaagggagcgaccgaggcag 267  Q
    | ||||||| |||||  ||||| ||||||    
T  41157191 c-gttcgacaaagggtacgaccaaggcag 41157218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 377 - 564
Target Start/End: Original strand, 37556071 - 37556260
Alignment:
Q  377 taaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaa-tagtaaaggttgaacaccttata 473  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  37556071 taaagtgatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaaatagtaaaggttgaacatcttata 37556170  T
Q  474 agtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgg 564  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37556171 agtaagaggacc-ataaacccatagccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcaagcctcgatgtgg 37556260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 45 - 262
Target Start/End: Original strand, 9955911 - 9956129
Alignment:
Q  45 agtgtgagttatatgtcccacatcggataaaata-gtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccat-aaacccattgccttaaggttttgggtaa 142  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9955911 agtgtgagttatatgtcccacatcagataaaaaaagtaaaggttgaacacattataagtaagaggacccattaaaccaattgccttaaggttttgggtaa 9956010  T
Q  143 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtggtatcagagccccggt 242  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9956011 gagtgtgatgtctctcttgcttgtgcggttgctctagcctcgatgtgagcggtcccctaggctctcctc-gtgacccaacagtggtatcagagcctcggt 9956109  T
Q  243 tcgacgaagggagcgaccga 262  Q
    |||||||||||  |||||||    
T  9956110 tcgacgaagggtacgaccga 9956129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 33 - 199
Target Start/End: Original strand, 41759475 - 41759641
Alignment:
Q  33 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||    
T  41759475 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcacacatcggataaaatagtaaaagttgaacaccttataagtaagatgatccataaatccattgccttaagg 41759574  T
Q  133 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41759575 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttatgtggttgttctagccttgatgtggacggtcccc 41759641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 407 - 573
Target Start/End: Original strand, 41759475 - 41759641
Alignment:
Q  407 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 506  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||    
T  41759475 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcacacatcggataaaatagtaaaagttgaacaccttataagtaagatgatccataaatccattgccttaagg 41759574  T
Q  507 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 573  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41759575 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttatgtggttgttctagccttgatgtggacggtcccc 41759641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 138; E-Value: 8e-72
Query Start/End: Original strand, 407 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 3537765 - 3537589
Alignment:
Q  407 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 506  Q
    |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  3537765 tgttggtttgtacgtgttagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttatgagtaagaggacctataaacccattggcttaagg 3537666  T
Q  507 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccct 584  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3537665 ttttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccct-ggctcccct 3537589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 138; E-Value: 8e-72
Query Start/End: Original strand, 33 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 3537765 - 3537589
Alignment:
Q  33 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 132  Q
    |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  3537765 tgttggtttgtacgtgttagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttatgagtaagaggacctataaacccattggcttaagg 3537666  T
Q  133 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccct 210  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3537665 ttttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccct-ggctcccct 3537589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 138; E-Value: 8e-72
Query Start/End: Original strand, 43 - 304
Target Start/End: Original strand, 34649440 - 34649702
Alignment:
Q  43 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 142  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   || ||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  34649440 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtgcaagaacccataaacctaatgccttaaggttttgggtaa 34649539  T
Q  143 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctag-gctcccctcactgacccaacagtggtatcagagccccgg 241  Q
    ||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| |    
T  34649540 gagtgaggcgtctctcttgctagtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccggagcttccct-agtgacccaacagtggtatcagagcccc-g 34649637  T
Q  242 ttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtc--attgcgcagaaagccgcaacagcggtacaag 304  Q
    ||||| ||||||  ||||||||||||| ||||   |||||||||||||  ||||  |||||||||    
T  34649638 ttcgatgaagggtacgaccgaggcagccggtccgtttgcgcagaaagcaacaacgacggtacaag 34649702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 41 - 199
Target Start/End: Original strand, 41142372 - 41142531
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  41142372 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggacccataaacccattgccttaaggtttttggt 41142471  T
Q  141 -aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 199  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41142472 aaagagtgtggcgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 41142531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 415 - 573
Target Start/End: Original strand, 41142372 - 41142531
Alignment:
Q  415 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 514  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  41142372 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggacccataaacccattgccttaaggtttttggt 41142471  T
Q  515 -aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 573  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41142472 aaagagtgtggcgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 41142531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 383 - 574
Target Start/End: Original strand, 34364891 - 34365084
Alignment:
Q  383 gatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaga 480  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34364891 gatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcacacatcggataaaataataaaggttgaacaccttataagtaaga 34364990  T
Q  481 ggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccct 574  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  |||| |||| |||||||||||| ||| ||||    
T  34364991 ggacccataaacccatagccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctcgcttatgcagttgctctaacctcgatgtggatggttccct 34365084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 133; E-Value: 8e-69
Query Start/End: Original strand, 41 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 22077653 - 22077422
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 140  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  22077653 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcgtagccttaaggttttgggt 22077554  T
Q  141 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtggtatcagagccccg 240  Q
    |||||||||| ||||||||  ||| || |||||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||||||||   |||||||||||||| |||||||||| |    
T  22077553 aagagtgtggcgtctctctcacttatgcggttgttcaagcatcgatatggacggtcccccaggctcccct-tgtgacccaacagtggcatcagagcccag 22077455  T
Q  241 gttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtc 273  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||||| ||||    
T  22077454 gttcgacgaagggtacgaccaaggcagccggtc 22077422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 41 - 210
Target Start/End: Original strand, 41157375 - 41157545
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  41157375 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaagagtaaaagttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctttaggttttgagt 41157474  T
Q  141 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc-ctaggctcccct 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  41157475 aagagtgtggtgtctgtcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgggcggtccctcaaggctcccct 41157545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 41 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 66630 - 66399
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 140  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || |||||||||||||||||    
T  66630 tgcaagtgtgagttatatgttccatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaacatatggccttaaggttttgggt 66531  T
Q  141 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtggtatcagagccccg 240  Q
    |||||| | | |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||   | | |||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||    
T  66530 aagagtatagcgtctctctcgcttgtgcggttgttctagcctcaatgtggacggttatccaagctcccctca-tgacccaacagtgatatcagagtcccg 66432  T
Q  241 gttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtc 273  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  66431 gttcgacgaagggtacgaccgaggcagccggtc 66399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 384 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 22077683 - 22077484
Alignment:
Q  384 atggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga 483  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22077683 atggactcacacttgagggggagtgttg-tgtgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga 22077585  T
Q  484 cccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccc 583  Q
    ||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| || |||||||| ||| ||||| |||||||||||| |||||||||    
T  22077584 cccataaactcgtagccttaaggttttgggtaagagtgtggcgtctctctcacttatgcggttgttcaagcatcgatatggacggtcccccaggctcccc 22077485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 415 - 597
Target Start/End: Original strand, 41156991 - 41157175
Alignment:
Q  415 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 514  Q
    ||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  41156991 tgcaagtgtgaattatatgtcccataacggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgctttaaggttttgggt 41157090  T
Q  515 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt-cccctaggctcccc-tcactgacccaaca 597  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||| ||||||||||    
T  41157091 aagagtgtggtgtctctattgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgggcggtcccccaaggctccccttcagtgacccaaca 41157175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 43 - 237
Target Start/End: Original strand, 17294579 - 17294773
Alignment:
Q  43 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 142  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17294579 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacactttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 17294678  T
Q  143 gagtgtggtgtctctcttgcttgtg-tggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtggtatcagagcc 237  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||| ||   |||||||||  ||||| |||||||| |||||||||    
T  17294679 gagtgtggtgtctctctcgcttatgcaggttgctctagcctcgatgtggacggtcgcccgagctcccctc-gtgacctaacagtggcatcagagcc 17294773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 33 - 195
Target Start/End: Original strand, 3550712 - 3550871
Alignment:
Q  33 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 132  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  3550712 tgttggttggcaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaacccattgccttaaag 3550811  T
Q  133 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||   |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  3550812 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgc---tacggttgttctagcctcgatgtggacggt 3550871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 407 - 569
Target Start/End: Original strand, 3550712 - 3550871
Alignment:
Q  407 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 506  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  3550712 tgttggttggcaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaacccattgccttaaag 3550811  T
Q  507 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 569  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||   |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  3550812 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgc---tacggttgttctagcctcgatgtggacggt 3550871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 388 - 573
Target Start/End: Original strand, 11977251 - 11977438
Alignment:
Q  388 actcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacc 485  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||     
T  11977251 actcacacttgagggggagtgttgctgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcgggtaaaacagtaaatgttgaacaccttataagtaagagcact 11977350  T
Q  486 cataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 573  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11977351 cataaacctaatgccttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttgcaagtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 11977438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 41 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 37850758 - 37850548
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||  ||||||||| || |    
T  37850758 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgcataaaacagtagaggttgaacaccttataagtaagagaacccataaacctaatgttttaaggtttcggat 37850659  T
Q  141 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtggtatcagagccccg 240  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||    
T  37850658 aagagtgtggtgtctctctcacttgtgcggttgctctagcctcgatgtggacggtccccta-gctcccctca-tgatccaactctggtatcagagccccg 37850561  T
Q  241 gttcgacgaaggg 253  Q
    ||||||| |||||    
T  37850560 gttcgacaaaggg 37850548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 415 - 598
Target Start/End: Complemental strand, 31767319 - 31767137
Alignment:
Q  415 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 514  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||    
T  31767319 tgcaagtgtgggttatatgttccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccattaacctaatgccttaaggttttgggt 31767220  T
Q  515 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacag 598  Q
    |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||||||    
T  31767219 aagagtgtgacgtctatcttgcttgtgtggttgttctagactcgatgtggacggtcccccaagcttccctca-tgacccaacag 31767137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 417 - 570
Target Start/End: Original strand, 17294579 - 17294733
Alignment:
Q  417 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 516  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17294579 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacactttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 17294678  T
Q  517 gagtgtggtgtctctcttgcttgtg-tggttgttctagcctcgatgtggacggtc 570  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17294679 gagtgtggtgtctctctcgcttatgcaggttgctctagcctcgatgtggacggtc 17294733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 44 - 303
Target Start/End: Original strand, 37555733 - 37555990
Alignment:
Q  44 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 143  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||  |||| || | ||||||||||||||||||||    
T  37555733 aagtgtgagttataagtcccacatcggataaaatagtgaaggttgaatacattataagtaagaggacct-taaatccttagccttaaggttttgggtaag 37555831  T
Q  144 agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtggtatcagagccccggtt 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  37555832 agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcaagcctcgatgtgg-cggtcgctcgagctcccc-caatgacccaacagtggtatcagagcccc-att 37555928  T
Q  244 cgacgaagggagcgaccgaggcagctggtc--attgcgcagaaagccgcaacagcggtacaa 303  Q
    || |||||||   || ||||||||||||||  |||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  37555929 cggcgaagggtatgatcgaggcagctggtccgattgcgcaaaaagcagcaacggcggtacaa 37555990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 32 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 45494146 - 45493949
Alignment:
Q  32 gtgttggtttgcaagtgtgagtt-atatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacacc----ttataagtaagaggacccataaacccattgcc 126  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  45494146 gtgttggtttgcaagtgtgagtttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccatatatataagtaagatgatccataaacccattgcc 45494047  T
Q  127 ttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagt 225  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| || ||||||||||||    
T  45494046 ttaaagttttggataagagtgtggtgtctctcttccttatgtggttgttcaagcctcgatgtggacggtccccca-gctccccccaatgacccaacagt 45493949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 43 - 190
Target Start/End: Original strand, 37556113 - 37556260
Alignment:
Q  43 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaa-tagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 141  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37556113 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggacc-ataaacccatagccttaaggttttgggta 37556211  T
Q  142 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgg 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37556212 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcaagcctcgatgtgg 37556260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 406 - 598
Target Start/End: Complemental strand, 45494146 - 45493950
Alignment:
Q  406 gtgttggtttgcaagtgtgagtt-atatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacacc----ttataagtaagaggacccataaacccattgcc 500  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  45494146 gtgttggtttgcaagtgtgagtttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccatatatataagtaagatgatccataaacccattgcc 45494047  T
Q  501 ttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacag 598  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| || |||||||||||    
T  45494046 ttaaagttttggataagagtgtggtgtctctcttccttatgtggttgttcaagcctcgatgtggacggtccccca-gctccccccaatgacccaacag 45493950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 415 - 598
Target Start/End: Original strand, 34364507 - 34364689
Alignment:
Q  415 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 514  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||    
T  34364507 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccgtaaacccatagccttaaggttttgggt 34364606  T
Q  515 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacag 598  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| || ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||  ||||||| || |||||||||||    
T  34364607 aagagtgtgatgtctctctcgcttatgcggttgctctagcctcgatgtggatggttccctgagctcccc-cagtgacccaacag 34364689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 41 - 199
Target Start/End: Original strand, 29798199 - 29798357
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 140  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |    
T  29798199 tgcaagtgtgagttatatgtcctacattggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaacccattgccttaaggtcttggat 29798298  T
Q  141 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 199  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  29798299 aagagtgtggtgtctctcttgcaagtgtggttgttctaacctcgatatagacggtcccc 29798357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 415 - 573
Target Start/End: Original strand, 29798199 - 29798357
Alignment:
Q  415 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 514  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |    
T  29798199 tgcaagtgtgagttatatgtcctacattggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaacccattgccttaaggtcttggat 29798298  T
Q  515 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 573  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  29798299 aagagtgtggtgtctctcttgcaagtgtggttgttctaacctcgatatagacggtcccc 29798357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 417 - 573
Target Start/End: Original strand, 34649440 - 34649596
Alignment:
Q  417 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 516  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   || ||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  34649440 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtgcaagaacccataaacctaatgccttaaggttttgggtaa 34649539  T
Q  517 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 573  Q
    ||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34649540 gagtgaggcgtctctcttgctagtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 34649596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 41 - 200
Target Start/End: Original strand, 34364925 - 34365084
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 140  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34364925 tgcaagtgtgagttatatgtcacacatcggataaaataataaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccatagccttaaggttttgggt 34365024  T
Q  141 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccct 200  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||  |||| |||| |||||||||||| ||| ||||    
T  34365025 aagagtgtggtgtctctctcgcttatgcagttgctctaacctcgatgtggatggttccct 34365084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 407 - 598
Target Start/End: Complemental strand, 50052189 - 50052000
Alignment:
Q  407 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 506  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| |    
T  50052189 tgttggtttttaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaacctattttcttaaag 50052090  T
Q  507 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacag 598  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||   |||||||||  |||||||||||    
T  50052089 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgtttatgt-gttgttctaacctcgatgtggacagtcccccgagctcccctc-gtgacccaacag 50052000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 415 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 5320123 - 5319965
Alignment:
Q  415 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 514  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  5320123 tgcaagtgtgagttatatgttccacatcggatagaaaagtaaaagttgaacaccttataagtgagaggacccataaactcatagccttaaggttttgggt 5320024  T
Q  515 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 573  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  5320023 aagagtgtagtgtctctcttgcttatgtggttgttctagcctcaatgtagacggtcccc 5319965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 41 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 5320123 - 5319965
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 140  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  5320123 tgcaagtgtgagttatatgttccacatcggatagaaaagtaaaagttgaacaccttataagtgagaggacccataaactcatagccttaaggttttgggt 5320024  T
Q  141 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 199  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  5320023 aagagtgtagtgtctctcttgcttatgtggttgttctagcctcaatgtagacggtcccc 5319965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 49 - 199
Target Start/End: Original strand, 14318875 - 14319025
Alignment:
Q  49 tgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgt 148  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14318875 tgagttatatgttccacgtcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaagacccataaatctattgccttaaggttttgggtaagagtgt 14318974  T
Q  149 ggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 199  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14318975 ggtgtctctcttatttgtgcggttgttctagcctcaatgtggacggtcccc 14319025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 423 - 573
Target Start/End: Original strand, 14318875 - 14319025
Alignment:
Q  423 tgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgt 522  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14318875 tgagttatatgttccacgtcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaagacccataaatctattgccttaaggttttgggtaagagtgt 14318974  T
Q  523 ggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 573  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14318975 ggtgtctctcttatttgtgcggttgttctagcctcaatgtggacggtcccc 14319025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 419 - 598
Target Start/End: Original strand, 9955911 - 9956091
Alignment:
Q  419 agtgtgagttatatgtcccacatcggataaaata-gtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccat-aaacccattgccttaaggttttgggtaa 516  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9955911 agtgtgagttatatgtcccacatcagataaaaaaagtaaaggttgaacacattataagtaagaggacccattaaaccaattgccttaaggttttgggtaa 9956010  T
Q  517 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacag 598  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  9956011 gagtgtgatgtctctcttgcttgtgcggttgctctagcctcgatgtgagcggtcccctaggctctcctc-gtgacccaacag 9956091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 42 - 191
Target Start/End: Original strand, 40082408 - 40082556
Alignment:
Q  42 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 141  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  40082408 gcaagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga-tcataaattcattgccttaaggttttgggta 40082506  T
Q  142 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 191  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  40082507 agagtgtggtatctctcttgcttgtgcgtttgttctagcctcgatgtgga 40082556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 416 - 565
Target Start/End: Original strand, 40082408 - 40082556
Alignment:
Q  416 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 515  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  40082408 gcaagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga-tcataaattcattgccttaaggttttgggta 40082506  T
Q  516 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 565  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  40082507 agagtgtggtatctctcttgcttgtgcgtttgttctagcctcgatgtgga 40082556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 43 - 199
Target Start/End: Original strand, 11977282 - 11977438
Alignment:
Q  43 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 142  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  11977282 caagtgtgagttatatgtcccacatcgggtaaaacagtaaatgttgaacaccttataagtaagagcactcataaacctaatgccttaaggttttgggtaa 11977381  T
Q  143 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 199  Q
    ||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11977382 gagtgtgatgtctctcttgcaagtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 11977438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 407 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 32168853 - 32168674
Alignment:
Q  407 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 506  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  32168853 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtccc-----ggataaaatagtaaaggttgaacacctta------agaggacccataaacccattgccttgagg 32168765  T
Q  507 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccct-aggctcccctcactgacccaaca 597  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| | ||||||||||    
T  32168764 ttttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacagtcccctaaggctcccct-agtgacccaaca 32168674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 33 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 32168853 - 32168674
Alignment:
Q  33 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 132  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  32168853 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtccc-----ggataaaatagtaaaggttgaacacctta------agaggacccataaacccattgccttgagg 32168765  T
Q  133 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccct-aggctcccctcactgacccaaca 223  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| | ||||||||||    
T  32168764 ttttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacagtcccctaaggctcccct-agtgacccaaca 32168674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 409 - 541
Target Start/End: Complemental strand, 32594880 - 32594748
Alignment:
Q  409 ttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtt 508  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  32594880 ttggtttgcaagtgtgagttatatgtcctacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgtcttaaggtt 32594781  T
Q  509 ttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtg 541  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32594780 ttgggtaagagtgtggtgtctctcttacttgtg 32594748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 35 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 32594880 - 32594748
Alignment:
Q  35 ttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtt 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  32594880 ttggtttgcaagtgtgagttatatgtcctacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgtcttaaggtt 32594781  T
Q  135 ttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtg 167  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32594780 ttgggtaagagtgtggtgtctctcttacttgtg 32594748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 41 - 223
Target Start/End: Original strand, 45084382 - 45084557
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 140  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       | |||||||||||||||    
T  45084382 tgcaagtgtgagttatatctcccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataa------cgtcttaaggttttgggt 45084475  T
Q  141 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 223  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||    
T  45084476 aagagagtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctaacctcgatgcggacggtcccccaggcttccctca-tgacccaaca 45084557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 415 - 597
Target Start/End: Original strand, 45084382 - 45084557
Alignment:
Q  415 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 514  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       | |||||||||||||||    
T  45084382 tgcaagtgtgagttatatctcccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataa------cgtcttaaggttttgggt 45084475  T
Q  515 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 597  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||    
T  45084476 aagagagtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctaacctcgatgcggacggtcccccaggcttccctca-tgacccaaca 45084557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 415 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 3875489 - 3875304
Alignment:
Q  415 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 514  Q
    |||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  3875489 tgcaagagtcagttatatgtcacacatcggataaaaaagtaaaggttgtacaccttataagtaagaggactcataaacccattgccttaaggttttaggt 3875390  T
Q  515 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagatt 601  Q
    |||| ||||| ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||| ||||| ||||||||    
T  3875389 aagaatgtggagtctctctcactagtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcctccgagctcccctca-tgacctaacagatt 3875304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 41 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 3875489 - 3875333
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 140  Q
    |||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  3875489 tgcaagagtcagttatatgtcacacatcggataaaaaagtaaaggttgtacaccttataagtaagaggactcataaacccattgccttaaggttttaggt 3875390  T
Q  141 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 197  Q
    |||| ||||| ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3875389 aagaatgtggagtctctctcactagtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 3875333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 415 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 37850758 - 37850588
Alignment:
Q  415 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 514  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||  ||||||||| || |    
T  37850758 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgcataaaacagtagaggttgaacaccttataagtaagagaacccataaacctaatgttttaaggtttcggat 37850659  T
Q  515 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctca 586  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37850658 aagagtgtggtgtctctctcacttgtgcggttgctctagcctcgatgtggacggtccccta-gctcccctca 37850588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 412 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 38804516 - 38804370
Alignment:
Q  412 gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttg 511  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  38804516 gtttacaagtgtgagttatacgtcccacatcgaataaaagagtaaaggttgaacacattataagtaagaggatccataaacccataaccttaaggttttg 38804417  T
Q  512 ggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcg 558  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38804416 ggtaagagtgtagtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcg 38804370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 38 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 38804516 - 38804370
Alignment:
Q  38 gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttg 137  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  38804516 gtttacaagtgtgagttatacgtcccacatcgaataaaagagtaaaggttgaacacattataagtaagaggatccataaacccataaccttaaggttttg 38804417  T
Q  138 ggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcg 184  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38804416 ggtaagagtgtagtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcg 38804370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 41 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 41184583 - 41184340
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaag--------- 131  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||             
T  41184583 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacactttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtttcagcc 41184484  T
Q  132 -----gttttgggtaagagtgtg---gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctag-gctcccctcactgacccaac 222  Q
         ||||||||||||||||||    |||| ||||| |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||  | |||||||||||||| |||||    
T  41184483 ttaaggttttgggtaagagtgtgatattgtcgctcttacttgtgcggttgttccagcctcgatgtcgacggtccccccgagctcccctcactgatccaac 41184384  T
Q  223 agtggtatcagagccccggttcgacgaagggagcgaccgaggca 266  Q
    ||||||||||||||||  | |||||||||||   ||||||||||    
T  41184383 agtggtatcagagcccgagctcgacgaagggtaagaccgaggca 41184340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 418 - 564
Target Start/End: Original strand, 37555733 - 37555878
Alignment:
Q  418 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 517  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||  |||| || | ||||||||||||||||||||    
T  37555733 aagtgtgagttataagtcccacatcggataaaatagtgaaggttgaatacattataagtaagaggacct-taaatccttagccttaaggttttgggtaag 37555831  T
Q  518 agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgg 564  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37555832 agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcaagcctcgatgtgg 37555878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 415 - 598
Target Start/End: Complemental strand, 66630 - 66448
Alignment:
Q  415 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 514  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || |||||||||||||||||    
T  66630 tgcaagtgtgagttatatgttccatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaacatatggccttaaggttttgggt 66531  T
Q  515 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacag 598  Q
    |||||| | | |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||   | | |||||||||| |||||||||||    
T  66530 aagagtatagcgtctctctcgcttgtgcggttgttctagcctcaatgtggacggttatccaagctcccctca-tgacccaacag 66448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 415 - 566
Target Start/End: Complemental strand, 24600472 - 24600321
Alignment:
Q  415 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 514  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||| ||    
T  24600472 tgcaagtgtgagttatatgtcccatatcggatagaaaagtaaaggttgaacatattataagtaagagaactcataaactcattgtcttaaggttttgtgt 24600373  T
Q  515 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggac 566  Q
    ||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  24600372 aagagtgtggtgtctctctcgctagtatggttgttctagcctcgatgtggac 24600321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 41 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 24600472 - 24600321
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 140  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||| ||    
T  24600472 tgcaagtgtgagttatatgtcccatatcggatagaaaagtaaaggttgaacatattataagtaagagaactcataaactcattgtcttaaggttttgtgt 24600373  T
Q  141 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggac 192  Q
    ||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  24600372 aagagtgtggtgtctctctcgctagtatggttgttctagcctcgatgtggac 24600321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 41 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 30630796 - 30630586
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 140  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| | ||||||||  |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  30630796 tgcaagtgtgatttatatgtctcacatcggataaaaaattaaaggtttgacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggt 30630697  T
Q  141 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtggtatcagagccccg 240  Q
    ||||||| || ||| || |  ||| |||||||||||| |||||||||||  | |||||| || |||| || | || ||||||||||||||||||| ||||    
T  30630696 aagagtggggcgtccctatcacttatgtggttgttctggcctcgatgtgagcagtcccccagactccacttagtgccccaacagtggtatcagagtcccg 30630597  T
Q  241 gttcgacgaag 251  Q
    |||||||||||    
T  30630596 gttcgacgaag 30630586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 415 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 39066358 - 39066201
Alignment:
Q  415 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 514  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||| |    
T  39066358 tgcaagtgtgagttatatattccacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagatgacccataaaatcattgtcttaaggttttggat 39066259  T
Q  515 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 573  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  39066258 aagagtgtggtgtctctcttacttatgtggttgttctagccttgatgt-gacggtcccc 39066201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 41 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 39066358 - 39066201
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 140  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||| |    
T  39066358 tgcaagtgtgagttatatattccacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagatgacccataaaatcattgtcttaaggttttggat 39066259  T
Q  141 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 199  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  39066258 aagagtgtggtgtctctcttacttatgtggttgttctagccttgatgt-gacggtcccc 39066201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 383 - 582
Target Start/End: Complemental strand, 22077311 - 22077101
Alignment:
Q  383 gatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggata--aaat----------agtaaaggttgaacacctt 470  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||          ||||||||||||| |||||    
T  22077311 gatggacacacacttgagggggagtgttg-tgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaatcggatagaaaagtaaaggttgaatacctt 22077213  T
Q  471 ataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 570  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||| ||  ||| || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  22077212 ataagtaagaggacccataaactcattgccctaaggttttggataagagtgtgacgtctccctcacttatgcggttgttcaagcctcgatgtggacggtc 22077113  T
Q  571 ccctaggctccc 582  Q
    ||| ||||||||    
T  22077112 ccccaggctccc 22077101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 41 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 22077986 - 22077776
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 140  Q
    ||||||||||||||||||||   | |||||||| || | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||    
T  22077986 tgcaagtgtgagttatatgttttaaatcggatagaaaaataaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaactcatagcc-taaggtttggggt 22077888  T
Q  141 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtggtatcagagccccg 240  Q
    |||||||||| |||||| |  ||| || |||||||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||||   |||||||||||||| |||||||||| |    
T  22077887 aagagtgtggcgtctctttcacttatgcggttgttcaagcatcgatgtggacggtcctccaggctcccct-tgtgacccaacagtggcatcagagcccag 22077789  T
Q  241 gttcgacgaaggg 253  Q
    |||||||||||||    
T  22077788 gttcgacgaaggg 22077776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 383 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 66278 - 66100
Alignment:
Q  383 gatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttat-atgtcccacatcggataaaatagtaaaggtt-gaacaccttataagtaaga 480  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  66278 gatggactcacacttgaggggaagtgttg-tgtgcaagtgtgagtaatcatgtctcacatcggatagaaaagtaaaggtttgaacaccttataagtaaga 66180  T
Q  481 ggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgt 562  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||   ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  66179 ggacccataaacctatggccttaaggttttgggtaagagtgtggcgcctctc--acttgtatggttgttctggcctcgatgt 66100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 47 - 223
Target Start/End: Original strand, 5575110 - 5575284
Alignment:
Q  47 tgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagt 146  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| || |||||||||||| |||||||    
T  5575110 tgtgaattatatgtcccacgtcggatagaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacctataaatccatagctttaaggttttggataagagt 5575209  T
Q  147 gtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 223  Q
    |||| ||||||||  ||| || ||| |||||||||||||||||||  |||||| || ||| ||||| ||||||||||    
T  5575210 gtggcgtctctct--cttatgaggtagttctagcctcgatgtggaatgtcccccagactctcctcagtgacccaaca 5575284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 421 - 597
Target Start/End: Original strand, 5575110 - 5575284
Alignment:
Q  421 tgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagt 520  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| || |||||||||||| |||||||    
T  5575110 tgtgaattatatgtcccacgtcggatagaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacctataaatccatagctttaaggttttggataagagt 5575209  T
Q  521 gtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 597  Q
    |||| ||||||||  ||| || ||| |||||||||||||||||||  |||||| || ||| ||||| ||||||||||    
T  5575210 gtggcgtctctct--cttatgaggtagttctagcctcgatgtggaatgtcccccagactctcctcagtgacccaaca 5575284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 382 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 30630828 - 30630648
Alignment:
Q  382 tgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 481  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||  | ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| | ||||||||  |||| |||||||||||||    
T  30630828 tgatggactcacacttgagagggagtgtta-tgtgcaagtgtgatttatatgtctcacatcggataaaaaattaaaggtttgacactttataagtaagag 30630730  T
Q  482 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtg 563  Q
     |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| || ||| || |  ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  30630729 aacccataaacacattgccttaaagttttgggtaagagtggggcgtccctatcacttatgtggttgttctggcctcgatgtg 30630648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 32 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 3537314 - 3537226
Alignment:
Q  32 gtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaaccc 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3537314 gtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaaccc 3537226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 415 - 598
Target Start/End: Complemental strand, 41184583 - 41184382
Alignment:
Q  415 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaag--------- 505  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||             
T  41184583 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacactttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtttcagcc 41184484  T
Q  506 -----gttttgggtaagagtgtg---gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctag-gctcccctcactgacccaac 596  Q
         ||||||||||||||||||    |||| ||||| |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||  | |||||||||||||| |||||    
T  41184483 ttaaggttttgggtaagagtgtgatattgtcgctcttacttgtgcggttgttccagcctcgatgtcgacggtccccccgagctcccctcactgatccaac 41184384  T
Q  597 ag 598  Q
    ||    
T  41184383 ag 41184382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 415 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 24132143 - 24131965
Alignment:
Q  415 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 514  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  24132143 tgcaactgtgagttatatgtccctcatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataaataaggggatccataaactcattgccttaagg-tttgggt 24132045  T
Q  515 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 597  Q
    |  ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||| |||| || |||  || ||||||| ||||||||||    
T  24132044 a--agtgtggtgtctctctcactagtgtggttgttctagcctcgatgtagacgatctcctgagcccccctca-tgacccaaca 24131965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 41 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 24132143 - 24131965
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 140  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  24132143 tgcaactgtgagttatatgtccctcatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataaataaggggatccataaactcattgccttaagg-tttgggt 24132045  T
Q  141 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 223  Q
    |  ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||| |||| || |||  || ||||||| ||||||||||    
T  24132044 a--agtgtggtgtctctctcactagtgtggttgttctagcctcgatgtagacgatctcctgagcccccctca-tgacccaaca 24131965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 31 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 44043945 - 44043810
Alignment:
Q  31 tgtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaa------aggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattg 124  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||      | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  44043945 tgtgttggtttgcaagtgt-agttatatgtcccacatcgaataaaatagtaatagtaaatgttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccattg 44043847  T
Q  125 ccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttg 161  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44043846 tcttaagattttgggtaagagtgtggtgtctctcttg 44043810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 406 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 44043944 - 44043810
Alignment:
Q  406 gtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaa------aggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgc 499  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||      | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  44043944 gtgttggtttgcaagtgt-agttatatgtcccacatcgaataaaatagtaatagtaaatgttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccattgt 44043846  T
Q  500 cttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttg 535  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44043845 cttaagattttgggtaagagtgtggtgtctctcttg 44043810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 112 - 319
Target Start/End: Original strand, 11977015 - 11977224
Alignment:
Q  112 cataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctc 211  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||     
T  11977015 cataaacctaatgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcaagtgcggtagttctagcctcgatgtggacggtcccccgagctcctctt 11977114  T
Q  212 actgacccaac--agtggtatcagagccccggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtca-ttgcgcagaaagccgcaacagcggtacaagtagc 308  Q
      ||||| |||  ||||| ||||||| ||||||| |||||||||  |||||||||| |  ||||| ||||||||||||| |||||  ||||||||| |||    
T  11977115 tgtgacctaacaaagtggcatcagag-cccggtttgacgaagggtacgaccgaggccgtcggtcagttgcgcagaaagcagcaacgacggtacaagcagc 11977213  T
Q  309 aagtggctcct 319  Q
    |||||||||||    
T  11977214 aagtggctcct 11977224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 66 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 22077243 - 22077101
Alignment:
Q  66 atcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttg 165  Q
    |||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||| ||  |||     
T  22077243 atcggatagaaaagtaaaggttgaataccttataagtaagaggacccataaactcattgccctaaggttttggataagagtgtgacgtctccctcactta 22077144  T
Q  166 tgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctccc 208  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22077143 tgcggttgttcaagcctcgatgtggacggtcccccaggctccc 22077101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 42 - 193
Target Start/End: Original strand, 22793279 - 22793431
Alignment:
Q  42 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaaccca-ttgccttaaggttttgggt 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||| |||||||| || |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| ||    
T  22793279 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcgtatagaaaagtagaggttgaaaactttataagtgagaggatccataaacccatttgccttacggttttgagt 22793378  T
Q  141 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacg 193  Q
    |||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  22793379 aagagtgtgacgtctctcttacttgtgtggttgttctggcctcaatatggacg 22793431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 416 - 567
Target Start/End: Original strand, 22793279 - 22793431
Alignment:
Q  416 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaaccca-ttgccttaaggttttgggt 514  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||| |||||||| || |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| ||    
T  22793279 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcgtatagaaaagtagaggttgaaaactttataagtgagaggatccataaacccatttgccttacggttttgagt 22793378  T
Q  515 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacg 567  Q
    |||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  22793379 aagagtgtgacgtctctcttacttgtgtggttgttctggcctcaatatggacg 22793431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 41 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 66247 - 66100
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttat-atgtcccacatcggataaaatagtaaaggtt-gaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgg 138  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  66247 tgcaagtgtgagtaatcatgtctcacatcggatagaaaagtaaaggtttgaacaccttataagtaagaggacccataaacctatggccttaaggttttgg 66148  T
Q  139 gtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgt 188  Q
    |||||||||||| | |||||   ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  66147 gtaagagtgtggcgcctctc--acttgtatggttgttctggcctcgatgt 66100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 51 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 5528902 - 5528728
Alignment:
Q  51 agttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtgg 150  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||||  |||||||||||||||||  ||||||    
T  5528902 agttatatgtctcacatcggataaaagagtaaaggttgaacatcttataaataagaggactcataaactcattttcttaaggttttgggtaaatgtgtgg 5528803  T
Q  151 tgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagt 225  Q
     |||||||||  || || |||||||||| |||||||||||| |  ||||  | |||||||  |||||||||||||    
T  5528802 cgtctctcttctttatgcggttgttctatcctcgatgtggatgaccccccggactccccttcctgacccaacagt 5528728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 425 - 598
Target Start/End: Complemental strand, 5528902 - 5528729
Alignment:
Q  425 agttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtgg 524  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||||  |||||||||||||||||  ||||||    
T  5528902 agttatatgtctcacatcggataaaagagtaaaggttgaacatcttataaataagaggactcataaactcattttcttaaggttttgggtaaatgtgtgg 5528803  T
Q  525 tgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacag 598  Q
     |||||||||  || || |||||||||| |||||||||||| |  ||||  | |||||||  ||||||||||||    
T  5528802 cgtctctcttctttatgcggttgttctatcctcgatgtggatgaccccccggactccccttcctgacccaacag 5528729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 415 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 22077986 - 22077818
Alignment:
Q  415 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 514  Q
    ||||||||||||||||||||   | |||||||| || | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||    
T  22077986 tgcaagtgtgagttatatgttttaaatcggatagaaaaataaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaactcatagcc-taaggtttggggt 22077888  T
Q  515 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccct 584  Q
    |||||||||| |||||| |  ||| || |||||||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||||    
T  22077887 aagagtgtggcgtctctttcacttatgcggttgttcaagcatcgatgtggacggtcctccaggctcccct 22077818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 415 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 19283613 - 19283434
Alignment:
Q  415 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 514  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||  ||||||| ||| || ||| | ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |    
T  19283613 tgcaagtgtgagttatatgtcccacaccggatagaaaagtggaggttgagcactttgtaaatgagaggacacataaactcatcgccttaaggttttggat 19283514  T
Q  515 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaa 595  Q
    |||||||||| ||||||||  |||||| ||||| |||||||| |||||||  |||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  19283513 aagagtgtggcgtctctctcacttgtgcggttgctctagcctggatgtgggaggtccccttgactcccctca-tgacccaa 19283434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 41 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 19283613 - 19283434
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||  ||||||| ||| || ||| | ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |    
T  19283613 tgcaagtgtgagttatatgtcccacaccggatagaaaagtggaggttgagcactttgtaaatgagaggacacataaactcatcgccttaaggttttggat 19283514  T
Q  141 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaa 221  Q
    |||||||||| ||||||||  |||||| ||||| |||||||| |||||||  |||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  19283513 aagagtgtggcgtctctctcacttgtgcggttgctctagcctggatgtgggaggtccccttgactcccctca-tgacccaa 19283434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 43 - 189
Target Start/End: Original strand, 45839629 - 45839779
Alignment:
Q  43 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggtt-----gaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttg 137  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||     ||||||||||||||||||| ||||||||||   | |||||||||||||||    
T  45839629 caagtatgagttatatgtcccacatcggatagaa-aataaaggttgaatcgaacaccttataagtaagaagacccataaatgtaatgccttaaggttttg 45839727  T
Q  138 ggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtg 189  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||    
T  45839728 ggtaagattgtggtgtctctcttgcttgtgggattgttctggcctcgatgtg 45839779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 417 - 563
Target Start/End: Original strand, 45839629 - 45839779
Alignment:
Q  417 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggtt-----gaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttg 511  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||     ||||||||||||||||||| ||||||||||   | |||||||||||||||    
T  45839629 caagtatgagttatatgtcccacatcggatagaa-aataaaggttgaatcgaacaccttataagtaagaagacccataaatgtaatgccttaaggttttg 45839727  T
Q  512 ggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtg 563  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||    
T  45839728 ggtaagattgtggtgtctctcttgcttgtgggattgttctggcctcgatgtg 45839779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 415 - 599
Target Start/End: Complemental strand, 21378199 - 21378034
Alignment:
Q  415 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 514  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||                  |    
T  21378199 tgcaagtgtcagttatatgtcccagatcggatagaacagtaaaggttgaatatcttataagtaagaggacccataaaccca------------------t 21378118  T
Q  515 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacaga 599  Q
    |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||    
T  21378117 aagagtgtggcgtctatattgcttgtgtggttgttctagcctcaatgtggacggtcccctgcgctcccc-cagtgacccaacaga 21378034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 41 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 21378199 - 21378035
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 140  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||                  |    
T  21378199 tgcaagtgtcagttatatgtcccagatcggatagaacagtaaaggttgaatatcttataagtaagaggacccataaaccca------------------t 21378118  T
Q  141 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacag 224  Q
    |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| || |||||||||||    
T  21378117 aagagtgtggcgtctatattgcttgtgtggttgttctagcctcaatgtggacggtcccctgcgctcccc-cagtgacccaacag 21378035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 486 - 573
Target Start/End: Original strand, 11977015 - 11977102
Alignment:
Q  486 cataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 573  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11977015 cataaacctaatgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcaagtgcggtagttctagcctcgatgtggacggtcccc 11977102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 41 - 189
Target Start/End: Original strand, 44685456 - 44685605
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaagg-ttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttggg 139  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | ||||||    
T  44685456 tgcaagtgtgagttatatgtcccatatcggatagaaaagtaaaggtttgaaaaccttataagtaagaggaccaataaactcattgccttaatg-tttggg 44685554  T
Q  140 taagagtgtggtgtctctcttgcttgt-gtggttgttctagcctcgatgtg 189  Q
    ||| ||||||  |||| |||  ||||| | ||| |||||| ||||||||||    
T  44685555 taacagtgtgacgtctttctctcttgtgggggtagttctaacctcgatgtg 44685605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 415 - 563
Target Start/End: Original strand, 44685456 - 44685605
Alignment:
Q  415 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaagg-ttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttggg 513  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | ||||||    
T  44685456 tgcaagtgtgagttatatgtcccatatcggatagaaaagtaaaggtttgaaaaccttataagtaagaggaccaataaactcattgccttaatg-tttggg 44685554  T
Q  514 taagagtgtggtgtctctcttgcttgt-gtggttgttctagcctcgatgtg 563  Q
    ||| ||||||  |||| |||  ||||| | ||| |||||| ||||||||||    
T  44685555 taacagtgtgacgtctttctctcttgtgggggtagttctaacctcgatgtg 44685605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 415 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 1188746 - 1188574
Alignment:
Q  415 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 514  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||| || |||  |||||||| |  |||||||| ||| ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  1188746 tgcaagtgtgagttatatgttccatatcggatagaaaagtggaggttgaatattttataagtgagaagactcataaactcattgctttaaggttttgggt 1188647  T
Q  515 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccccta-ggctcccctca 586  Q
    || ||||||| ||||||||  ||| |||||||| |||  ||| ||||||  |||||||| | |||||||||||    
T  1188646 aaaagtgtggcgtctctctcacttatgtggttgctctgacctagatgtgtgcggtccccaagggctcccctca 1188574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 41 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 1188746 - 1188574
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 140  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||| || |||  |||||||| |  |||||||| ||| ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  1188746 tgcaagtgtgagttatatgttccatatcggatagaaaagtggaggttgaatattttataagtgagaagactcataaactcattgctttaaggttttgggt 1188647  T
Q  141 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccccta-ggctcccctca 212  Q
    || ||||||| ||||||||  ||| |||||||| |||  ||| ||||||  |||||||| | |||||||||||    
T  1188646 aaaagtgtggcgtctctctcacttatgtggttgctctgacctagatgtgtgcggtccccaagggctcccctca 1188574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 112 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 47380254 - 47380126
Alignment:
Q  112 cataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctc 211  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||  ||||| |||||| || ||||| |||||||  |||||||||| |||||||     
T  47380254 cataaactcattgccttaaagttttgggtaagagtgtgacatctctctcacttgtctggttgctcaagcctagatgtgggtggtcccctagactccccta 47380155  T
Q  212 actgacccaacagtggtatcagagccccg 240  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||    
T  47380154 attgacccaacaatggtatcagagccccg 47380126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 485 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 50051776 - 50051689
Alignment:
Q  485 ccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 573  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  50051776 ccataaacccattatcttaaggttttgcgtaagagtgtggtgtctctcttgtttatgt-gttgttctagcatcgatgtggacggtcccc 50051689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 111 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 50051776 - 50051689
Alignment:
Q  111 ccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 199  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  50051776 ccataaacccattatcttaaggttttgcgtaagagtgtggtgtctctcttgtttatgt-gttgttctagcatcgatgtggacggtcccc 50051689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 415 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 1187522 - 1187349
Alignment:
Q  415 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 514  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| || |||  ||||| ||||  |||||||| ||| ||||||||||| |||| ||||||| ||||| ||    
T  1187522 tgcaagtgtgaattatatgtctcacatcgaatataaaagtggaggttaaacattttataagtgagaagacccataaactcattaccttaagattttgagt 1187423  T
Q  515 aagagtgtggtgtctctcttgc-ttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctag-gctcccctca 586  Q
    || ||||||  ||||||||  | || | | ||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1187422 aaaagtgtgacgtctctctcactttttatagttgttctgacctagatgtggacggtcccctagagctcccctca 1187349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 41 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 1187522 - 1187349
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 140  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| || |||  ||||| ||||  |||||||| ||| ||||||||||| |||| ||||||| ||||| ||    
T  1187522 tgcaagtgtgaattatatgtctcacatcgaatataaaagtggaggttaaacattttataagtgagaagacccataaactcattaccttaagattttgagt 1187423  T
Q  141 aagagtgtggtgtctctcttgc-ttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctag-gctcccctca 212  Q
    || ||||||  ||||||||  | || | | ||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1187422 aaaagtgtgacgtctctctcactttttatagttgttctgacctagatgtggacggtcccctagagctcccctca 1187349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 486 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 47380254 - 47380143
Alignment:
Q  486 cataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctc 585  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||  ||||| |||||| || ||||| |||||||  |||||||||| |||||||     
T  47380254 cataaactcattgccttaaagttttgggtaagagtgtgacatctctctcacttgtctggttgctcaagcctagatgtgggtggtcccctagactccccta 47380155  T
Q  586 actgacccaaca 597  Q
    | ||||||||||    
T  47380154 attgacccaaca 47380143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 56 - 198
Target Start/End: Original strand, 44091909 - 44092051
Alignment:
Q  56 tatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtct 155  Q
    |||||| |||||| |||  || |||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| | | |   ||||| || ||||||||||||||| ||||    
T  44091909 tatgtcacacatcagatgtaaaagtaaaggttgaacactttataagtgagagaacccataaatctaatattttaagattgtgggtaagagtgtggcgtct 44092008  T
Q  156 ctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 198  Q
     |||  ||||| | |||||||| |||||||||| |||||||||    
T  44092009 ttctcacttgttttgttgttctggcctcgatgtagacggtccc 44092051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 430 - 572
Target Start/End: Original strand, 44091909 - 44092051
Alignment:
Q  430 tatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtct 529  Q
    |||||| |||||| |||  || |||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| | | |   ||||| || ||||||||||||||| ||||    
T  44091909 tatgtcacacatcagatgtaaaagtaaaggttgaacactttataagtgagagaacccataaatctaatattttaagattgtgggtaagagtgtggcgtct 44092008  T
Q  530 ctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 572  Q
     |||  ||||| | |||||||| |||||||||| |||||||||    
T  44092009 ttctcacttgttttgttgttctggcctcgatgtagacggtccc 44092051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #110
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 397 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 50469256 - 50469180
Alignment:
Q  397 tgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataa 474  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||| ||||||    
T  50469256 tgagggggagtgttg-tgtgcaagtgtgagttatatgtcctacatcagataataaagtaaaggttgaacactttataa 50469180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #111
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 83 - 159
Target Start/End: Original strand, 10351202 - 10351278
Alignment:
Q  83 aggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 159  Q
    ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  10351202 aggttgaacactttataagtgagagaacccataaacacattactttaagattttgggtaagagtgtggcgtctctct 10351278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #112
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 457 - 533
Target Start/End: Original strand, 10351202 - 10351278
Alignment:
Q  457 aggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 533  Q
    ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  10351202 aggttgaacactttataagtgagagaacccataaacacattactttaagattttgggtaagagtgtggcgtctctct 10351278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #113
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 68 - 188
Target Start/End: Original strand, 4956218 - 4956340
Alignment:
Q  68 cggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg--gtgtctctcttgcttg 165  Q
    |||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||  ||| ||||| ||||| ||||||  || | |||||||||||    
T  4956218 cggatagaaaagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggatccataaactcattgctctaaagttttaggtaaaagtgtgacgtctatctcttgcttg 4956317  T
Q  166 tgtggttgttctagcctcgatgt 188  Q
    || | ||| | || |||||||||    
T  4956318 tgcgattgctttaacctcgatgt 4956340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #114
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 442 - 562
Target Start/End: Original strand, 4956218 - 4956340
Alignment:
Q  442 cggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg--gtgtctctcttgcttg 539  Q
    |||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||  ||| ||||| ||||| ||||||  || | |||||||||||    
T  4956218 cggatagaaaagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggatccataaactcattgctctaaagttttaggtaaaagtgtgacgtctatctcttgcttg 4956317  T
Q  540 tgtggttgttctagcctcgatgt 562  Q
    || | ||| | || |||||||||    
T  4956318 tgcgattgctttaacctcgatgt 4956340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #115
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 366 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 47379990 - 47379891
Alignment:
Q  366 ggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaac 465  Q
    |||||||||| | || || |||||| ||| |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||  |||||||||    
T  47379990 ggggagcacgatgaattgttggacttacatttgagggggagtgttgat--gcaagtgtgagttatatatcccacatcggatagaaaagtggaggttgaac 47379893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #116
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 415 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 35154197 - 35154150
Alignment:
Q  415 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttg 462  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  35154197 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaagagtaaaggttg 35154150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #117
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 41 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 35154197 - 35154150
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttg 88  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  35154197 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaagagtaaaggttg 35154150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #118
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 41 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 50469239 - 50469180
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataa 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||| ||||||    
T  50469239 tgcaagtgtgagttatatgtcctacatcagataataaagtaaaggttgaacactttataa 50469180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #119
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 41 - 107
Target Start/End: Original strand, 4878803 - 4878869
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 107  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||| ||||    
T  4878803 tgcaattgtgagttatatgttccacatcggataaaatagtgaagcttgaacattttataagtgagag 4878869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #120
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 415 - 481
Target Start/End: Original strand, 4878803 - 4878869
Alignment:
Q  415 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 481  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||| ||||    
T  4878803 tgcaattgtgagttatatgttccacatcggataaaatagtgaagcttgaacattttataagtgagag 4878869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #121
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 382 - 564
Target Start/End: Original strand, 24448245 - 24448426
Alignment:
Q  382 tgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 481  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||   |||||  | | || |||  | ||||||||  |||||||| ||||    
T  24448245 tgatgggctcacaattgagggggagtgtt-gtgtgcaagtgtaagttatatgttagacatctcaaagaaaagtggaagttgaacattttataagtgagag 24448343  T
Q  482 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgg 564  Q
    | | ||||||| ||||| |||||| |||||| ||| ||||||| || |||||  ||| || ||||||||  |||| |||||||    
T  24448344 ggctcataaactcattgtcttaagattttggataaaagtgtggcgtgtctctcacttatgaggttgttcaggcctagatgtgg 24448426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #122
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 464 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 41184197 - 41184152
Alignment:
Q  464 acaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttt 509  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41184197 acactttataagtaagaggatccataaacccattgccttaaggttt 41184152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #123
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 90 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 41184197 - 41184152
Alignment:
Q  90 acaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttt 135  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41184197 acactttataagtaagaggatccataaacccattgccttaaggttt 41184152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #124
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 514 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 4266855 - 4266798
Alignment:
Q  514 taagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 573  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4266855 taagagtgtgatgtctctcttacttgtg--gttgttctagcctcgatgtgggcggtcccc 4266798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #125
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 140 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 4266855 - 4266798
Alignment:
Q  140 taagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 199  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4266855 taagagtgtgatgtctctcttacttgtg--gttgttctagcctcgatgtgggcggtcccc 4266798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #126
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 415 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 5997029 - 5996870
Alignment:
Q  415 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 514  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||  | || || |||   | |||||||  |||||| | |||||| ||||| | ||||||  ||||||||||| ||    
T  5997029 tgcaagcgtgggttatatgtcccacataagttagaaaagtggtgcttgaacattttataaatgagaggatccatatatccattgt-ttaaggttttgagt 5996931  T
Q  515 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccccta 575  Q
     ||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||  ||||||| | ||||||||    
T  5996930 gagagtgtggtgtctctctcatttgtgtggttgctctagccgagatgtgggcagtccccta 5996870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #127
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 41 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 5997029 - 5996870
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 140  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||  | || || |||   | |||||||  |||||| | |||||| ||||| | ||||||  ||||||||||| ||    
T  5997029 tgcaagcgtgggttatatgtcccacataagttagaaaagtggtgcttgaacattttataaatgagaggatccatatatccattgt-ttaaggttttgagt 5996931  T
Q  141 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccccta 201  Q
     ||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||  ||||||| | ||||||||    
T  5996930 gagagtgtggtgtctctctcatttgtgtggttgctctagccgagatgtgggcagtccccta 5996870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #128
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 470 - 530
Target Start/End: Complemental strand, 35154106 - 35154046
Alignment:
Q  470 tataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctc 530  Q
    ||||||||||||| |||||||||  |||| ||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  35154106 tataagtaagagggcccataaactgattgtcttaaggtttttggcaagagtgtggtgtctc 35154046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #129
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 35154106 - 35154046
Alignment:
Q  96 tataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctc 156  Q
    ||||||||||||| |||||||||  |||| ||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  35154106 tataagtaagagggcccataaactgattgtcttaaggtttttggcaagagtgtggtgtctc 35154046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #130
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 407 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 4266948 - 4266875
Alignment:
Q  407 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaga 480  Q
    ||||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||| ||||||||| ||| ||||||||    
T  4266948 tgttgttttacaaatgtgagttatatgtcctacattagataaaagagtaaatgttgaacacattagaagtaaga 4266875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #131
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 33 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 4266948 - 4266875
Alignment:
Q  33 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaga 106  Q
    ||||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||| ||||||||| ||| ||||||||    
T  4266948 tgttgttttacaaatgtgagttatatgtcctacattagataaaagagtaaatgttgaacacattagaagtaaga 4266875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #132
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 82 - 198
Target Start/End: Original strand, 9499020 - 9499136
Alignment:
Q  82 aaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcc 181  Q
    |||||||||||  ||||| || ||| |||| |||||  |||| |||| |  |||||| ||| ||||||||||| || || |||||||||||||| || ||    
T  9499020 aaggttgaacattttatatgttagatgacctataaattcattaccttcaaattttggataaaagtgtggtgtcacttttacttgtgtggttgttttatcc 9499119  T
Q  182 tcgatgtggacggtccc 198  Q
    |  ||||||||||||||    
T  9499120 tatatgtggacggtccc 9499136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #133
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 456 - 572
Target Start/End: Original strand, 9499020 - 9499136
Alignment:
Q  456 aaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcc 555  Q
    |||||||||||  ||||| || ||| |||| |||||  |||| |||| |  |||||| ||| ||||||||||| || || |||||||||||||| || ||    
T  9499020 aaggttgaacattttatatgttagatgacctataaattcattaccttcaaattttggataaaagtgtggtgtcacttttacttgtgtggttgttttatcc 9499119  T
Q  556 tcgatgtggacggtccc 572  Q
    |  ||||||||||||||    
T  9499120 tatatgtggacggtccc 9499136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #134
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 123 - 159
Target Start/End: Original strand, 12466365 - 12466401
Alignment:
Q  123 tgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 159  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12466365 tgccttaaggtttttggtaagagtgtggtgtctctct 12466401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #135
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 497 - 533
Target Start/End: Original strand, 12466365 - 12466401
Alignment:
Q  497 tgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 533  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12466365 tgccttaaggtttttggtaagagtgtggtgtctctct 12466401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #136
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 41 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 22077280 - 22077248
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggata 73  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22077280 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggata 22077248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #137
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 424 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 30630972 - 30630912
Alignment:
Q  424 gagttatatgtcccacatcggataaaatagt-aaaggttgaacaccttataagtaagagga 483  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||| | | ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30630972 gagttatatgtcttacatcggataaaaaaattaaaggctgaacaccttataagtaagagga 30630912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #138
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 50 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 30630972 - 30630912
Alignment:
Q  50 gagttatatgtcccacatcggataaaatagt-aaaggttgaacaccttataagtaagagga 109  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||| | | ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30630972 gagttatatgtcttacatcggataaaaaaattaaaggctgaacaccttataagtaagagga 30630912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #139
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 41 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 47379943 - 47379891
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacac 93  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||  |||||||||||    
T  47379943 tgcaagtgtgagttatatatcccacatcggatagaaaagtggaggttgaacac 47379891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #140
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 488 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 9956258 - 9956212
Alignment:
Q  488 taaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctt 534  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9956258 taaacacattgtcttaatgttttgggtaagagtgtgatgtctctctt 9956212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #141
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 114 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 9956258 - 9956212
Alignment:
Q  114 taaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctt 160  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9956258 taaacacattgtcttaatgttttgggtaagagtgtgatgtctctctt 9956212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #142
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 134 - 211
Target Start/End: Original strand, 30697310 - 30697387
Alignment:
Q  134 tttgggtaagagtgtggtgtctctcttgc-ttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctc 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||| | | |||| ||||||| |||||||| |||||||||||    
T  30697310 tttgggtaagagtgtggtgtctctctcactttgcgtggttgctatggcctagatgtgggcggtcccc-aggctcccctc 30697387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #143
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 508 - 585
Target Start/End: Original strand, 30697310 - 30697387
Alignment:
Q  508 tttgggtaagagtgtggtgtctctcttgc-ttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctc 585  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||| | | |||| ||||||| |||||||| |||||||||||    
T  30697310 tttgggtaagagtgtggtgtctctctcactttgcgtggttgctatggcctagatgtgggcggtcccc-aggctcccctc 30697387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #144
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 181 - 223
Target Start/End: Original strand, 45084576 - 45084617
Alignment:
Q  181 ctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  45084576 ctcgatgtggacggtcccctaggcttccctca-tgacccaaca 45084617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #145
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 555 - 597
Target Start/End: Original strand, 45084576 - 45084617
Alignment:
Q  555 ctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 597  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  45084576 ctcgatgtggacggtcccctaggcttccctca-tgacccaaca 45084617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #146
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 309 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 3537587 - 3537495
Alignment:
Q  309 aagtggctccttgtgcaggaacggcgatacaggcaaagtcaaaagcttccgctctaa-ggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgag 400  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||| ||| |||| || || ||||||||||  || |||||||| | | |  |||||||||||||||||||    
T  3537587 aagtggctccttgtgcaagaacgacgacacatgcaaggtaaagagcttccgcttgaagggggagcatgatgatttgatggactcacacttgag 3537495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #147
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 497 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 31973411 - 31973375
Alignment:
Q  497 tgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 533  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  31973411 tgccttaagattttgggtaagagtgtgatgtctctct 31973375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #148
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 123 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 31973411 - 31973375
Alignment:
Q  123 tgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 159  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  31973411 tgccttaagattttgggtaagagtgtgatgtctctct 31973375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #149
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 352 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 41184246 - 41184198
Alignment:
Q  352 agcttccgctctaaggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgag 400  Q
    ||||||||||  | |||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  41184246 agcttccgcttgagggggagcacgatgaagtgatggactcacacttgag 41184198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #150
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 41 - 177
Target Start/End: Original strand, 50556451 - 50556587
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 140  Q
    |||||||||| ||||||| || ||||||  ||| || ||   ||||||||||  |||||||| |||| | || |||||| |||  ||||||||||||  |    
T  50556451 tgcaagtgtgggttatatatcacacatcatatagaaaagcggaggttgaacaatttataagtgagagaatccgtaaacctattttcttaaggttttgaat 50556550  T
Q  141 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttct 177  Q
    || ||| |||| |||||||  |||||||| |||||||    
T  50556551 aaaagtttggtatctctctcacttgtgtgattgttct 50556587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #151
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 415 - 551
Target Start/End: Original strand, 50556451 - 50556587
Alignment:
Q  415 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 514  Q
    |||||||||| ||||||| || ||||||  ||| || ||   ||||||||||  |||||||| |||| | || |||||| |||  ||||||||||||  |    
T  50556451 tgcaagtgtgggttatatatcacacatcatatagaaaagcggaggttgaacaatttataagtgagagaatccgtaaacctattttcttaaggttttgaat 50556550  T
Q  515 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttct 551  Q
    || ||| |||| |||||||  |||||||| |||||||    
T  50556551 aaaagtttggtatctctctcacttgtgtgattgttct 50556587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 376; Significance: 0; HSPs: 163)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 376; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 33 - 595
Target Start/End: Original strand, 6500443 - 6501002
Alignment:
Q  33 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 132  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  6500443 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcc-acatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacctttaaacccattgccttaagg 6500541  T
Q  133 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtggtatca 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6500542 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccaggctcccctcacttacccaacagtggtatca 6500641  T
Q  233 gagccccggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtcattgcgcagaaagccgcaacagcggtacaagtagcaagtggctccttgtgcaggaacgg 332  Q
    |||  |||||||||||||||| || |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| || |||||||     
T  6500642 gagttccggttcgacgaagggtgcaaccgaggcagccagtcgttgcgcagaaagccgcaacggcggtataagcagcaagtggctccttatgtaggaacgc 6500741  T
Q  333 cgatacaggcaaagtcaaaagcttccgctctaa-ggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttata 431  Q
    ||||||| ||||||| || ||||||| ||  || |||||||| | | ||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6500742 cgataca-gcaaagt-aagagcttccccttgaagggggagcatgatgaatagatggactcacacttgatggggagtgttggtttgcaagtgtgagttata 6500839  T
Q  432 tgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctct 531  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6500840 tgt-ccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataaataaaaggacccataaactcattgccttaaggttttggataagagtgtggtgtctct 6500938  T
Q  532 cttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaa 595  Q
    ||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  6500939 cttacttgtgcggttattctagcctcgatgtggacggtcccccaggctcccctcacttacccaa 6501002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 33 - 599
Target Start/End: Original strand, 623810 - 624380
Alignment:
Q  33 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||  || ||||||||  || |||||||||    
T  623810 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggatataatagtaaaggttgaacactttacaagtaagttgagccataaacttatagccttaagg 623909  T
Q  133 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtggtatca 232  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||   |||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  623910 ttttgagtaagagtgtggtgtctctctcacttgtggggttgttctagcctcaatgtagacggtcccccgagctcc--tcagtgacccaacagtggtatca 624007  T
Q  233 gagccccggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtca--ttgcgcagaaagccgcaacagcggtacaagtagcaagtggctccttgtgc------ 324  Q
    |||||| | ||||| ||||||  |||||| |||||  ||||   ||||||||||||  |||||  ||||||||||||   || | ||| | |||          
T  624008 gagccctg-ttcgaagaagggtacgaccgtggcagtcggtccgtttgcgcagaaagaagcaacgacggtacaagtagt--gtcggtccgtttgcggagaa 624104  T
Q  325 ---aggaacggcgatacaggcaaagtcaaaagcttccgctctaaggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagt 421  Q
       || ||||||||||||     ||| || ||||||||||  |||||||||| | | ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  624105 cccagcaacggcgatacaaagcgagt-aagagcttccgcttaaaggggagcatgatgaatagatgga-tcacacttgaggggaagtgttggtttgcaagt 624202  T
Q  422 gtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtg 521  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  624203 gtgagttatatgtcccacattgtataaaatagtaaaggttgaacacgttataagtaagatgacccataaacccatagccttgaggttttgggtaagagtg 624302  T
Q  522 tggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacaga 599  Q
    ||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||  | ||||||||||||    
T  624303 tggtgtctctctcacttgtggggttgttctagcctcgatgtggacggttccccgagctccccctagtgacccaacaga 624380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 31 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 9498822 - 9498496
Alignment:
Q  31 tgtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa 130  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9498822 tgtgttggtttgcaaatgtgagttatatgtctcacatcagatagaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa 9498723  T
Q  131 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtggtat 230  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | || ||||||||| |||||||||||||||   |||||||||  ||||||||  | |||||    
T  9498722 gattttgggtaagagtgtggtgtctctcttgtttatgt-gctggtctagcctcaatgtggacggtccccctagctcccctc-gtgacccaagtgcggtat 9498625  T
Q  231 cagagccccggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtcattgcgcagaaagccgcaacagcggtacaagtagcaagtggctccttgtgcaggaac 330  Q
    ||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9498624 cagagcccc-gttcgacaaagggtacgaccgaggcagccggtcgttgcgcagaaagctgcaacggcgctacaagcagcaagtggctccttgtgcaggaac 9498526  T
Q  331 ggcgatacaggcaaagtcaaaagcttccgct 361  Q
    || |||||| ||||||| || ||||||||||    
T  9498525 ggtgatacatgcaaagt-aagagcttccgct 9498496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 182; E-Value: 5e-98
Query Start/End: Original strand, 33 - 310
Target Start/End: Original strand, 32487386 - 32487661
Alignment:
Q  33 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32487386 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacacct-ataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 32487484  T
Q  133 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtggtatca 232  Q
    |||||||||||||||||  || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| ||| || |||||||||  ||||||||    
T  32487485 ttttgggtaagagtgtgacgtatctcttgcttatgtggttgttctagcctcgatgtggatggtcccccaagcttccccca-tgacccaactctggtatca 32487583  T
Q  233 gagccccggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtcattgcgcagaaagccgcaacagcggtacaagtagcaa 310  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| | || ||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  32487584 gagccccgattcgacgaagggtgcgactgaggcagccgatcgttgtgcagaaagccgcaacggcggtacaagcagcaa 32487661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 407 - 598
Target Start/End: Original strand, 6500443 - 6500633
Alignment:
Q  407 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 506  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  6500443 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcc-acatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacctttaaacccattgccttaagg 6500541  T
Q  507 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacag 598  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  6500542 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccaggctcccctcacttacccaacag 6500633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 155; E-Value: 6e-82
Query Start/End: Original strand, 323 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 3295266 - 3295002
Alignment:
Q  323 gcaggaacggcgatacaggcaaagtcaaaagcttccgctctaaggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttg----gtttgca 418  Q
    |||| |||||||||||| |||| || || ||||||||||  | ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    || ||||    
T  3295266 gcagcaacggcgatacaagcaa-gt-aagagcttccgcttaagggggagcacgaaaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtgtgca 3295169  T
Q  419 agtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaaga 518  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  3295168 agtgtgagt-atatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaagacccataaacccattgccttgaggttttgggtatga 3295070  T
Q  519 gtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctca 586  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||   ||||||||||    
T  3295069 gtgtggtgtctctcttggttgtgtggttgttgtagcctcgatgtggacagtccccctcgctcccctca 3295002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 155; E-Value: 6e-82
Query Start/End: Original strand, 32 - 234
Target Start/End: Original strand, 6500814 - 6501015
Alignment:
Q  32 gtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaag 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  6500814 gtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcc-acatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataaataaaaggacccataaactcattgccttaag 6500912  T
Q  132 gttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtggtatc 231  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  6500913 gttttggataagagtgtggtgtctctcttacttgtgcggttattctagcctcgatgtggacggtcccccaggctcccctcacttacccaatagtggtatc 6501012  T
Q  232 aga 234  Q
    |||    
T  6501013 aga 6501015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 44 - 273
Target Start/End: Original strand, 25327938 - 25328167
Alignment:
Q  44 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 143  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  25327938 aagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaacagtaaaagttgaacaccttataagtaagaggacccataaacctaatgccttaaggttttgggtaag 25328037  T
Q  144 agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtggtatcagagccccggtt 243  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||  ||    
T  25328038 agtgtggtgtctctcttgcaagtgtggttgttctagcctcaatgtggacggtcccccgagctcccctcagtgacccaacagtggtaccagagcccccctt 25328137  T
Q  244 cgacgaagggagcgaccgaggcagctggtc 273  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||| ||||    
T  25328138 cgacgaagggcacgaacgaggcagccggtc 25328167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 415 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 40296473 - 40296292
Alignment:
Q  415 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 514  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  40296473 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagaaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttgaggttttgggt 40296374  T
Q  515 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 597  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||||||||    
T  40296373 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccaggcctccctca-tgacccaaca 40296292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 41 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 40296473 - 40296292
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  40296473 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagaaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttgaggttttgggt 40296374  T
Q  141 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||||||||    
T  40296373 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccaggcctccctca-tgacccaaca 40296292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 143; E-Value: 9e-75
Query Start/End: Original strand, 407 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 27502202 - 27502013
Alignment:
Q  407 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 506  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  27502202 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacattggataaaatagtaaaggttaaacaccttataagtaagaggacccataaacctattgccttaaga 27502103  T
Q  507 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 597  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||    
T  27502102 tttttggtaaaagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctatcctcgatgtggacggtccccctagctcccctca-tgacccaaca 27502013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 143; E-Value: 9e-75
Query Start/End: Original strand, 33 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 27502202 - 27502013
Alignment:
Q  33 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  27502202 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacattggataaaatagtaaaggttaaacaccttataagtaagaggacccataaacctattgccttaaga 27502103  T
Q  133 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 223  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||    
T  27502102 tttttggtaaaagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctatcctcgatgtggacggtccccctagctcccctca-tgacccaaca 27502013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 407 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 18603286 - 18603124
Alignment:
Q  407 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 506  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18603286 tgttagttttcaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 18603187  T
Q  507 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 569  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18603186 ttttgggtaagagtgtggcatctctcttgcttgtgtggtagttctagcctcgatgtggacggt 18603124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 33 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 18603286 - 18603124
Alignment:
Q  33 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 132  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18603286 tgttagttttcaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 18603187  T
Q  133 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 195  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18603186 ttttgggtaagagtgtggcatctctcttgcttgtgtggtagttctagcctcgatgtggacggt 18603124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 407 - 573
Target Start/End: Original strand, 32487386 - 32487551
Alignment:
Q  407 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 506  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32487386 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacacct-ataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 32487484  T
Q  507 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 573  Q
    |||||||||||||||||  || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32487485 ttttgggtaagagtgtgacgtatctcttgcttatgtggttgttctagcctcgatgtggatggtcccc 32487551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 138; E-Value: 8e-72
Query Start/End: Original strand, 34 - 199
Target Start/End: Original strand, 41170627 - 41170792
Alignment:
Q  34 gttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggt 133  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41170627 gttggtttgtaattgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggt 41170726  T
Q  134 tttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 199  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  41170727 tttgggtaagagtgtggtgtttttcttgcttgtgtggttgttctagcctcggtgtagacggtcccc 41170792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 138; E-Value: 8e-72
Query Start/End: Original strand, 408 - 573
Target Start/End: Original strand, 41170627 - 41170792
Alignment:
Q  408 gttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggt 507  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41170627 gttggtttgtaattgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggt 41170726  T
Q  508 tttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 573  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  41170727 tttgggtaagagtgtggtgtttttcttgcttgtgtggttgttctagcctcggtgtagacggtcccc 41170792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 412 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 36492378 - 36492218
Alignment:
Q  412 gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttg 511  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||| ||||||||    
T  36492378 gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggaccaataaacacattacctttaggttttg 36492279  T
Q  512 ggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 572  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36492278 gataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 36492218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 38 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 36492378 - 36492218
Alignment:
Q  38 gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttg 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||| ||||||||    
T  36492378 gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggaccaataaacacattacctttaggttttg 36492279  T
Q  138 ggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 198  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36492278 gataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 36492218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 388 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 26074330 - 26074122
Alignment:
Q  388 actcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggaccca 487  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  26074330 actcacacttgagggggagtgttg-tgtgcaagtgtgagttatatgtcacacatcggataaaaaagtaaaggttgaacacctcatatgtaagaggaccca 26074232  T
Q  488 taaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcac 587  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| |||| |||||||||||  | ||||| | ||||||||| |    
T  26074231 tgaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctcactagtgtggttgctctaacctcgatgtgggtgatccccaaagctcccctctc 26074132  T
Q  588 tgacccaaca 597  Q
    ||||||||||    
T  26074131 tgacccaaca 26074122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 133; E-Value: 8e-69
Query Start/End: Original strand, 383 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 13415951 - 13415750
Alignment:
Q  383 gatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaga 480  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13415951 gatggactcacacttgagggg-agtgctgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaattagtaaaggttgaacaccttataagtaaga 13415853  T
Q  481 ggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctc 580  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||  |||||    
T  13415852 ggacccataaacctattaccttaaggttttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgaaatgg-cggtccccgtggctc 13415754  T
Q  581 ccct 584  Q
    ||||    
T  13415753 ccct 13415750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 133; E-Value: 8e-69
Query Start/End: Original strand, 418 - 598
Target Start/End: Original strand, 25327938 - 25328118
Alignment:
Q  418 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 517  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  25327938 aagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaacagtaaaagttgaacaccttataagtaagaggacccataaacctaatgccttaaggttttgggtaag 25328037  T
Q  518 agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacag 598  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||    
T  25328038 agtgtggtgtctctcttgcaagtgtggttgttctagcctcaatgtggacggtcccccgagctcccctcagtgacccaacag 25328118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 133; E-Value: 8e-69
Query Start/End: Original strand, 382 - 595
Target Start/End: Original strand, 26074577 - 26074792
Alignment:
Q  382 tgatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaag 479  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  | ||  |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26074577 tgatggactcacacttgagggggagtgtttttgtgtacaagtgtgagttatatgttccatatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaag 26074676  T
Q  480 aggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggct 579  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| |||| |||||||||||  | ||||  | |||    
T  26074677 aggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctcactagtgtggttgctctaacctcgatgtgggtgatccctaaagct 26074776  T
Q  580 cccctcactgacccaa 595  Q
    |||||| |||||||||    
T  26074777 cccctctctgacccaa 26074792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 41 - 199
Target Start/End: Original strand, 15370099 - 15370257
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  15370099 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgaataaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaatccacagccttaaggttttgggt 15370198  T
Q  141 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15370199 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgggattgttctagcctcgatgtggacggtcccc 15370257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 415 - 573
Target Start/End: Original strand, 15370099 - 15370257
Alignment:
Q  415 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 514  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  15370099 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgaataaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaatccacagccttaaggttttgggt 15370198  T
Q  515 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 573  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15370199 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgggattgttctagcctcgatgtggacggtcccc 15370257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 43 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 26075318 - 26075058
Alignment:
Q  43 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt-a 141  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26075318 caagtgtgatttatatgtctcacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 26075219  T
Q  142 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt-cccctaggctcccct-cactgacccaacagtggtatcagagcccc 239  Q
    ||||||||  |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||  | |||||| ||||||||  |  || |||||||||||||||||||| |    
T  26075218 agagtgtgtcgtctctcttgcaagtgtggttgttttagcctcgatgtggactatccccctaagctcccctaaagcgatccaacagtggtatcagagcctc 26075119  T
Q  240 ggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtc--attgcgcagaaagccgcaacagcggt 299  Q
     |||||||||||||  ||||||||||||| ||||   ||||||||||||| ||||| |||||    
T  26075118 -gttcgacgaagggtacgaccgaggcagccggtctgtttgcgcagaaagcagcaacggcggt 26075058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 42 - 273
Target Start/End: Original strand, 299490 - 299721
Alignment:
Q  42 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||    
T  299490 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaactcatagccttaaggttttgtgta 299589  T
Q  142 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctag-gctcccctcactga-cccaacagtggtatcagagcccc 239  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||||||  | |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |    
T  299590 agagtgtggcgtctctattgcttgtacggttgttctagcatcgatgtggacagtcccccggagctcccctca-tgaccccaacagtggtatcagagcctc 299688  T
Q  240 ggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtc 273  Q
     ||||||||||||| |||| | ||||||| ||||    
T  299689 -gttcgacgaagggtgcgatcaaggcagccggtc 299721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 32 - 224
Target Start/End: Original strand, 624187 - 624379
Alignment:
Q  32 gtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaag 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||    
T  624187 gtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacattgtataaaatagtaaaggttgaacacgttataagtaagatgacccataaacccatagccttgag 624286  T
Q  132 gttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacag 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||  | |||||||||||    
T  624287 gttttgggtaagagtgtggtgtctctctcacttgtggggttgttctagcctcgatgtggacggttccccgagctccccctagtgacccaacag 624379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 41 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 3295172 - 3295002
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 140  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3295172 tgcaagtgtgagt-atatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaagacccataaacccattgccttgaggttttgggt 3295074  T
Q  141 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctca 212  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||   ||||||||||    
T  3295073 atgagtgtggtgtctctcttggttgtgtggttgttgtagcctcgatgtggacagtccccctcgctcccctca 3295002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 418 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 3295498 - 3295345
Alignment:
Q  418 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 517  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  3295498 aagtgtgagt-atatgttccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaaccaattgccttaaggtttt-ggtaag 3295401  T
Q  518 agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 573  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3295400 agtgtgttgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 3295345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 44 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 3295498 - 3295345
Alignment:
Q  44 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 143  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  3295498 aagtgtgagt-atatgttccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaaccaattgccttaaggtttt-ggtaag 3295401  T
Q  144 agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 199  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3295400 agtgtgttgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 3295345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 41 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 13415918 - 13415750
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  13415918 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaattagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacctattaccttaaggttttgggt 13415819  T
Q  141 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccct 210  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||  |||||||||    
T  13415818 aagagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgaaatgg-cggtccccgtggctcccct 13415750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 43 - 236
Target Start/End: Original strand, 26074614 - 26074807
Alignment:
Q  43 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 142  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26074614 caagtgtgagttatatgttccatatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 26074713  T
Q  143 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtggtatcagagc 236  Q
    |||||||||||||||||  || ||||||||| |||| |||||||||||  | ||||  | ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||    
T  26074714 gagtgtggtgtctctctcactagtgtggttgctctaacctcgatgtgggtgatccctaaagctcccctctctgacccaatagtagtatcagagc 26074807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 417 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 42405752 - 42405574
Alignment:
Q  417 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 516  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  42405752 caagtgtgagttatatgtccaacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttacaagtaaaaggactcataaacctaatgccttaaggttttgggtaa 42405653  T
Q  517 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 597  Q
    |||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| || ||||||||||    
T  42405652 gagtgtggtgt--ctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgagctccccccagtgacccaaca 42405574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 43 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 42405752 - 42405574
Alignment:
Q  43 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 142  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  42405752 caagtgtgagttatatgtccaacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttacaagtaaaaggactcataaacctaatgccttaaggttttgggtaa 42405653  T
Q  143 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 223  Q
    |||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| || ||||||||||    
T  42405652 gagtgtggtgt--ctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgagctccccccagtgacccaaca 42405574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 43 - 267
Target Start/End: Original strand, 6224198 - 6224420
Alignment:
Q  43 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 142  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||    
T  6224198 caagtgtgagttatatgtcccacttcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcatcgccttaaggtttttggtaa 6224297  T
Q  143 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtggtatcagagccccggt 242  Q
    |||||||||| |||  ||||||||| ||||| ||||||||| || |||||||||||| |||||||||||  ||  || ||||  ||||||||| ||||||    
T  6224298 gagtgtggtgcctcagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatatggacggtcccccaggctcccctc-gtgttcctacagcagtatcagag-cccggt 6224395  T
Q  243 tcgacgaagggagcgaccgaggcag 267  Q
    |||||||||||  |||| |||||||    
T  6224396 tcgacgaagggtacgactgaggcag 6224420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 41 - 221
Target Start/End: Original strand, 41632782 - 41632961
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 140  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||    
T  41632782 tgcaagtgtaagttatatgtctcacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccaatgctttaagattttgggt 41632881  T
Q  141 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaa 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| | |||||||| | ||||||||    
T  41632882 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttttagtctcgatgtggacggtccccca-gctccccttaatgacccaa 41632961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 415 - 595
Target Start/End: Original strand, 41632782 - 41632961
Alignment:
Q  415 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 514  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||    
T  41632782 tgcaagtgtaagttatatgtctcacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccaatgctttaagattttgggt 41632881  T
Q  515 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaa 595  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| | |||||||| | ||||||||    
T  41632882 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttttagtctcgatgtggacggtccccca-gctccccttaatgacccaa 41632961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 406 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 9498821 - 9498655
Alignment:
Q  406 gtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaag 505  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9498821 gtgttggtttgcaaatgtgagttatatgtctcacatcagatagaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaag 9498722  T
Q  506 gttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 573  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | || ||||||||| |||||||||||||||    
T  9498721 attttgggtaagagtgtggtgtctctcttgtttatgt-gctggtctagcctcaatgtggacggtcccc 9498655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 417 - 599
Target Start/End: Complemental strand, 1028673 - 1028491
Alignment:
Q  417 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 516  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| |||||    
T  1028673 caagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggatgaacactttataagtaagaggacccataaacctataaccttaaggtttttggtaa 1028574  T
Q  517 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacaga 599  Q
    |||||||| ||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||||    
T  1028573 gagtgtggcgtctctctcacttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccctagctcccctcagtgacccaacaga 1028491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 41 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 26074304 - 26074122
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 140  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26074304 tgcaagtgtgagttatatgtcacacatcggataaaaaagtaaaggttgaacacctcatatgtaagaggacccatgaacccattgccttaaggttttgggt 26074205  T
Q  141 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 223  Q
    |||||||||||||||||||  || ||||||||| |||| |||||||||||  | ||||| | ||||||||| |||||||||||    
T  26074204 aagagtgtggtgtctctctcactagtgtggttgctctaacctcgatgtgggtgatccccaaagctcccctctctgacccaaca 26074122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 41 - 267
Target Start/End: Original strand, 35150007 - 35150230
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  35150007 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtcaaggttgaacaccttataagtaaga-gacccataaatccattgtcttaaggttttgggt 35150105  T
Q  141 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtggtatcagagccccg 240  Q
    || ||||||||||||||||  || |||||||||||||| |||| |||||||| |||||||  ||||||| || |||||||||  ||||||||||| | |     
T  35150106 aaaagtgtggtgtctctctcactagtgtggttgttctaacctcaatgtggaccgtcccct-tgctcccccca-tgacccaactctggtatcagagtcgca 35150203  T
Q  241 gttcgacgaagggagcgaccgaggcag 267  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||||    
T  35150204 gttcgacgaagggtacgaccaaggcag 35150230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 43 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 1028673 - 1028492
Alignment:
Q  43 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 142  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| |||||    
T  1028673 caagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggatgaacactttataagtaagaggacccataaacctataaccttaaggtttttggtaa 1028574  T
Q  143 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacag 224  Q
    |||||||| ||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||    
T  1028573 gagtgtggcgtctctctcacttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccctagctcccctcagtgacccaacag 1028492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 417 - 585
Target Start/End: Original strand, 6224198 - 6224366
Alignment:
Q  417 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 516  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||    
T  6224198 caagtgtgagttatatgtcccacttcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcatcgccttaaggtttttggtaa 6224297  T
Q  517 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctc 585  Q
    |||||||||| |||  ||||||||| ||||| ||||||||| || |||||||||||| |||||||||||    
T  6224298 gagtgtggtgcctcagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatatggacggtcccccaggctcccctc 6224366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 422 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 11417128 - 11416977
Alignment:
Q  422 gtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtg 521  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11417128 gtgagttatatgttccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaacccattgccttaaggttttgtgtaagagtg 11417029  T
Q  522 tggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 573  Q
    || | ||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| |||||||    
T  11417028 tgatctctctcttgcttgtgggattgttctagcttcgatgtggatggtcccc 11416977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 48 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 11417128 - 11416977
Alignment:
Q  48 gtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtg 147  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11417128 gtgagttatatgttccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaacccattgccttaaggttttgtgtaagagtg 11417029  T
Q  148 tggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 199  Q
    || | ||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| |||||||    
T  11417028 tgatctctctcttgcttgtgggattgttctagcttcgatgtggatggtcccc 11416977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 415 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 36568725 - 36568545
Alignment:
Q  415 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 514  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  36568725 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaagttgaacaccttataagtgagatgacccgtaaacccattgccttaaggtttttggt 36568626  T
Q  515 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 597  Q
    |||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||   |||||||||| ||||||||||    
T  36568625 aagagtgtggcgtctctct--cttgtgtggttgttctatcctcgatgtggaaggtcccccgagctcccctcaatgacccaaca 36568545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 41 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 36568725 - 36568545
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  36568725 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaagttgaacaccttataagtgagatgacccgtaaacccattgccttaaggtttttggt 36568626  T
Q  141 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 223  Q
    |||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||   |||||||||| ||||||||||    
T  36568625 aagagtgtggcgtctctct--cttgtgtggttgttctatcctcgatgtggaaggtcccccgagctcccctcaatgacccaaca 36568545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 416 - 573
Target Start/End: Original strand, 299490 - 299647
Alignment:
Q  416 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 515  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||    
T  299490 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaactcatagccttaaggttttgtgta 299589  T
Q  516 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 573  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  299590 agagtgtggcgtctctattgcttgtacggttgttctagcatcgatgtggacagtcccc 299647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 425 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 34753173 - 34753029
Alignment:
Q  425 agttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtgg 524  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34753173 agttatatgtcccacattggatagaaaagtaaaagttgaacaccttataagtaagaagacccataaaccgattgccttaaggttttgggtaagagtgtgg 34753074  T
Q  525 tgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 569  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34753073 cgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggt 34753029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 51 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 34753173 - 34753029
Alignment:
Q  51 agttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtgg 150  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34753173 agttatatgtcccacattggatagaaaagtaaaagttgaacaccttataagtaagaagacccataaaccgattgccttaaggttttgggtaagagtgtgg 34753074  T
Q  151 tgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 195  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34753073 cgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggt 34753029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 415 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 12662810 - 12662652
Alignment:
Q  415 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 514  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||| |||||| |||||| ||||||||    
T  12662810 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacattttataagtaagaaaacccataaatccattgtcttaagtttttgggt 12662711  T
Q  515 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 573  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  12662710 aagagtgtggtgcctttcttgcttgtggggttcttctagcctcgatgtggtcggtcccc 12662652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 41 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 12662810 - 12662652
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||| |||||| |||||| ||||||||    
T  12662810 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacattttataagtaagaaaacccataaatccattgtcttaagtttttgggt 12662711  T
Q  141 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 199  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  12662710 aagagtgtggtgcctttcttgcttgtggggttcttctagcctcgatgtggtcggtcccc 12662652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 417 - 566
Target Start/End: Complemental strand, 26075318 - 26075168
Alignment:
Q  417 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt-a 515  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26075318 caagtgtgatttatatgtctcacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 26075219  T
Q  516 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggac 566  Q
    ||||||||  |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26075218 agagtgtgtcgtctctcttgcaagtgtggttgttttagcctcgatgtggac 26075168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 382 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 24489394 - 24489194
Alignment:
Q  382 tgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 481  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| |||| || || ||||||| |||||||||| |||||||     
T  24489394 tgatggactcacacttgagggggagtgttgtgtt-caagtgtgagttatatgtcccacatcagatagaaaagaaaaggttaaacaccttattagtaaga- 24489297  T
Q  482 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcc 581  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| || |||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||  || ||||    
T  24489296 -acccataaacccattgccttaagattttgcgtaagagtgtggcgtctcttttacttgtgcggttgttctagtctcgatgtgggcggtccctcagactcc 24489198  T
Q  582 cctc 585  Q
    ||||    
T  24489197 cctc 24489194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 415 - 574
Target Start/End: Original strand, 35150007 - 35150165
Alignment:
Q  415 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 514  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  35150007 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtcaaggttgaacaccttataagtaaga-gacccataaatccattgtcttaaggttttgggt 35150105  T
Q  515 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccct 574  Q
    || ||||||||||||||||  || |||||||||||||| |||| |||||||| |||||||    
T  35150106 aaaagtgtggtgtctctctcactagtgtggttgttctaacctcaatgtggaccgtcccct 35150165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 382 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 26074975 - 26074807
Alignment:
Q  382 tgatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaag 479  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| |    
T  26074975 tgatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacacaatataagtagg 26074876  T
Q  480 aggacccataaacccattgccttaaggttttgggt-aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttg 547  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||  |||||||||    
T  26074875 aggacccataaacctattgtcttaaggttttgggtaaagagtgtggcgtctctcttgcaagtgtggttg 26074807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 67 - 212
Target Start/End: Original strand, 15370428 - 15370573
Alignment:
Q  67 tcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgt 166  Q
    |||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||    
T  15370428 tcggatgaaacagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccatagccttaaggttttgcgtaagagtgtggcgtctctcttgtttgt 15370527  T
Q  167 gtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctca 212  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||    
T  15370528 ggggttgttctagcctcgatgtggacggtcctccatgctcccctca 15370573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 441 - 586
Target Start/End: Original strand, 15370428 - 15370573
Alignment:
Q  441 tcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgt 540  Q
    |||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||    
T  15370428 tcggatgaaacagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccatagccttaaggttttgcgtaagagtgtggcgtctctcttgtttgt 15370527  T
Q  541 gtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctca 586  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||    
T  15370528 ggggttgttctagcctcgatgtggacggtcctccatgctcccctca 15370573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 53 - 195
Target Start/End: Original strand, 33747783 - 33747925
Alignment:
Q  53 ttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtg 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  33747783 ttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttaaatactttataagtaagaggatccataaactcattgccttaagattttggataagagtgtggtg 33747882  T
Q  153 tctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 195  Q
    |||||||| ||| || |||||||||||||| ||||||||||||    
T  33747883 tctctcttccttatgcggttgttctagccttgatgtggacggt 33747925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 427 - 569
Target Start/End: Original strand, 33747783 - 33747925
Alignment:
Q  427 ttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtg 526  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  33747783 ttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttaaatactttataagtaagaggatccataaactcattgccttaagattttggataagagtgtggtg 33747882  T
Q  527 tctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 569  Q
    |||||||| ||| || |||||||||||||| ||||||||||||    
T  33747883 tctctcttccttatgcggttgttctagccttgatgtggacggt 33747925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 412 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 29549416 - 29549278
Alignment:
Q  412 gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttg 511  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  29549416 gtttgcaagtgtgagttatatgttccatatcagataaaatagtaaaggatgaacaccatataagtaagaagacccataaacacattaccttaaggttttg 29549317  T
Q  512 ggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttc 550  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  29549316 gataagagtgtggcgtctctcttgcttatgtggttgttc 29549278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 38 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 29549416 - 29549278
Alignment:
Q  38 gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttg 137  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  29549416 gtttgcaagtgtgagttatatgttccatatcagataaaatagtaaaggatgaacaccatataagtaagaagacccataaacacattaccttaaggttttg 29549317  T
Q  138 ggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttc 176  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  29549316 gataagagtgtggcgtctctcttgcttatgtggttgttc 29549278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 407 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 5723957 - 5723811
Alignment:
Q  407 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 506  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||| ||   |||| |||||||    
T  5723957 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaataataaaagttgaacacattatatgtaagagaacccattaatttattgtcttaagg 5723858  T
Q  507 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctag 553  Q
    ||||||| |||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5723857 ttttgggaaagagtatagtgtctctcttgcttgtgcggttgttctag 5723811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 33 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 5723957 - 5723811
Alignment:
Q  33 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 132  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||| ||   |||| |||||||    
T  5723957 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaataataaaagttgaacacattatatgtaagagaacccattaatttattgtcttaagg 5723858  T
Q  133 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctag 179  Q
    ||||||| |||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5723857 ttttgggaaagagtatagtgtctctcttgcttgtgcggttgttctag 5723811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 43 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 24489360 - 24489194
Alignment:
Q  43 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 142  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| || || ||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  24489360 caagtgtgagttatatgtcccacatcagatagaaaagaaaaggttaaacaccttattagtaaga--acccataaacccattgccttaagattttgcgtaa 24489263  T
Q  143 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctc 211  Q
    |||||||| |||||| || |||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||  || ||||||||    
T  24489262 gagtgtggcgtctcttttacttgtgcggttgttctagtctcgatgtgggcggtccctcagactcccctc 24489194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 43 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 26074938 - 26074807
Alignment:
Q  43 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt-a 141  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |    
T  26074938 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacacaatataagtaggaggacccataaacctattgtcttaaggttttgggtaa 26074839  T
Q  142 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttg 173  Q
    ||||||||| |||||||||||  |||||||||    
T  26074838 agagtgtggcgtctctcttgcaagtgtggttg 26074807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 383 - 565
Target Start/End: Original strand, 38427525 - 38427697
Alignment:
Q  383 gatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagg 482  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  38427525 gatggactcacacttgagggggagtgttg---------tgtgagttatatgtcccacattggatagaaaagtaaaggttgaacatcttataagta-gagg 38427614  T
Q  483 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 565  Q
    |||||| || |||||| |||||||||||| |||||||||||  ||||||||  |||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  38427615 acccattaatccattgtcttaaggttttgtgtaagagtgtgacgtctctctcacttgtgcggttgttctaacctcgatgtgga 38427697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 46 - 191
Target Start/End: Original strand, 38427553 - 38427697
Alignment:
Q  46 gtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagag 145  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| || |||||| |||||||||||| |||||||    
T  38427553 gtgtgagttatatgtcccacattggatagaaaagtaaaggttgaacatcttataagta-gaggacccattaatccattgtcttaaggttttgtgtaagag 38427651  T
Q  146 tgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 191  Q
    ||||  ||||||||  |||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  38427652 tgtgacgtctctctcacttgtgcggttgttctaacctcgatgtgga 38427697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 415 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 26591068 - 26590918
Alignment:
Q  415 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 514  Q
    ||||||||||| ||| |||| ||| |||| ||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||| ||    
T  26591068 tgcaagtgtgatttaaatgttccatatcgaatcgaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaattcaatgccttaaggttttgagt 26590969  T
Q  515 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 565  Q
    |||||||||| ||||||||  || |||||||||||||| ||||||||||||    
T  26590968 aagagtgtggcgtctctctcactagtgtggttgttctaacctcgatgtgga 26590918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 41 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 26591068 - 26590918
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 140  Q
    ||||||||||| ||| |||| ||| |||| ||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||| ||    
T  26591068 tgcaagtgtgatttaaatgttccatatcgaatcgaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaattcaatgccttaaggttttgagt 26590969  T
Q  141 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 191  Q
    |||||||||| ||||||||  || |||||||||||||| ||||||||||||    
T  26590968 aagagtgtggcgtctctctcactagtgtggttgttctaacctcgatgtgga 26590918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 43 - 197
Target Start/End: Original strand, 300961 - 301107
Alignment:
Q  43 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 142  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||        || ||||||||||||| |||| |||||    
T  300961 caagtgtgggttatatgtcccacatcagataaaacagtaaaggttgaataccttataagtaagag--------aatccattgccttaagatttttggtaa 301052  T
Q  143 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||| |||||||    
T  301053 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggctgttcaagtctcgacgtgaacggtcc 301107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 417 - 571
Target Start/End: Original strand, 300961 - 301107
Alignment:
Q  417 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 516  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||        || ||||||||||||| |||| |||||    
T  300961 caagtgtgggttatatgtcccacatcagataaaacagtaaaggttgaataccttataagtaagag--------aatccattgccttaagatttttggtaa 301052  T
Q  517 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 571  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||| |||||||    
T  301053 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggctgttcaagtctcgacgtgaacggtcc 301107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 382 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 36522086 - 36521922
Alignment:
Q  382 tgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 481  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||  |||||||||||  | ||| | ||||    
T  36522086 tgatggactcacacttgagggagagtgttg-tgcgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagatagaaaagttgaggttgaacactctttaaatgagag 36521988  T
Q  482 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttg 547  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||   |||||||||||    
T  36521987 gacccataaaccaattgccttaaggttttgggtaagagtgtgtcatctctctcatttgtgtggttg 36521922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 417 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 35167994 - 35167838
Alignment:
Q  417 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 516  Q
    ||||| |||||||| | || |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| | |||||||| | ||||| |||||    
T  35167994 caagtatgagttatgtatctcacatcagataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaggatgacccataaatctattgccttgatgtttttggtaa 35167895  T
Q  517 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 573  Q
    ||||||| ||||||||   || |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  35167894 gagtgtgatgtctctcacactagtgtggttgttctagcatcgatgtggactgtcccc 35167838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 43 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 35167994 - 35167838
Alignment:
Q  43 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 142  Q
    ||||| |||||||| | || |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| | |||||||| | ||||| |||||    
T  35167994 caagtatgagttatgtatctcacatcagataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaggatgacccataaatctattgccttgatgtttttggtaa 35167895  T
Q  143 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 199  Q
    ||||||| ||||||||   || |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  35167894 gagtgtgatgtctctcacactagtgtggttgttctagcatcgatgtggactgtcccc 35167838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 44 - 210
Target Start/End: Original strand, 2411010 - 2411176
Alignment:
Q  44 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 143  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| |  |||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  2411010 aagtgtgagttatatgtcctacattggatagagaagtaaaagttgaacatcttgtaagtaagagaacccataaacttattgccttaaggttttgagtaag 2411109  T
Q  144 agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccct 210  Q
    ||||| || ||||| || ||||  || |||||||| ||||||| |||||||||||| | ||||||||    
T  2411110 agtgtagtttctctattacttgaatgattgttctaacctcgatatggacggtcccccaagctcccct 2411176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 418 - 584
Target Start/End: Original strand, 2411010 - 2411176
Alignment:
Q  418 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 517  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| |  |||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  2411010 aagtgtgagttatatgtcctacattggatagagaagtaaaagttgaacatcttgtaagtaagagaacccataaacttattgccttaaggttttgagtaag 2411109  T
Q  518 agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccct 584  Q
    ||||| || ||||| || ||||  || |||||||| ||||||| |||||||||||| | ||||||||    
T  2411110 agtgtagtttctctattacttgaatgattgttctaacctcgatatggacggtcccccaagctcccct 2411176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 128 - 253
Target Start/End: Original strand, 38427306 - 38427431
Alignment:
Q  128 taaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtgg 227  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | ||||||||   |||||| ||  ||| ||||||||||    
T  38427306 taagattttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgttctaacctcgatgttggcggtcccccgagctcccttcgatgatccaacagtgg 38427405  T
Q  228 tatcagagccccggttcgacgaaggg 253  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||    
T  38427406 tattagagccccggttcgacgaaggg 38427431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 44 - 199
Target Start/End: Original strand, 35914852 - 35915007
Alignment:
Q  44 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 143  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||  | |||| ||||    
T  35914852 aagtatgagttatatgtcacacatcggataaaagagtaaaggttgaacattttataagtaagaagacccgtaaatccattgccctaaattattggataag 35914951  T
Q  144 agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 199  Q
    | |||||| |||||||||||| | || ||| || | |||| |||||||||||||||    
T  35914952 aatgtggtatctctcttgcttatatgattggtcaaacctcaatgtggacggtcccc 35915007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 418 - 573
Target Start/End: Original strand, 35914852 - 35915007
Alignment:
Q  418 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 517  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||  | |||| ||||    
T  35914852 aagtatgagttatatgtcacacatcggataaaagagtaaaggttgaacattttataagtaagaagacccgtaaatccattgccctaaattattggataag 35914951  T
Q  518 agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 573  Q
    | |||||| |||||||||||| | || ||| || | |||| |||||||||||||||    
T  35914952 aatgtggtatctctcttgcttatatgattggtcaaacctcaatgtggacggtcccc 35915007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 382 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 36522427 - 36522277
Alignment:
Q  382 tgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 481  Q
    ||||||| | ||| |||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| ||||| ||||| || | |  | ||||||||  |||||||| ||||    
T  36522427 tgatggatttacaattgagggggagtgttg-tatgaaagtgtgagttatatgtctcacattggatagaaaaatggaagttgaacattttataagtgagag 36522329  T
Q  482 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 533  Q
    |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36522328 gaccaataaacccattatcttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 36522277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 33 - 116
Target Start/End: Original strand, 7768842 - 7768925
Alignment:
Q  33 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataa 116  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7768842 tgttggttttcaagtgtgagttatatatcctacatcggataaaataataaaggttgaacaccttataagtaaaaggacccataa 7768925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 407 - 490
Target Start/End: Original strand, 7768842 - 7768925
Alignment:
Q  407 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataa 490  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7768842 tgttggttttcaagtgtgagttatatatcctacatcggataaaataataaaggttgaacaccttataagtaaaaggacccataa 7768925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 382 - 533
Target Start/End: Original strand, 31509589 - 31509742
Alignment:
Q  382 tgatggactcacacttgagggggag--tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaag 479  Q
    ||||||||||||||||||||| |||  ||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||  ||||||| ||| |||||||| ||    
T  31509589 tgatggactcacacttgagggagagattgttg-tgtgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggatagaaaagtggaggttgagcactttataagtgag 31509687  T
Q  480 aggacccataaacccattgccttaagg-ttttgggtaagagtgtggtgtctctct 533  Q
    ||||| ||||||| ||||||||| ||| |||| ||||||| ||| ||||||||||    
T  31509688 aggactcataaactcattgccttgaggttttttggtaagaatgtagtgtctctct 31509742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 42 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 36522053 - 36521922
Alignment:
Q  42 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||  |||||||||||  | ||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  36522053 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcagatagaaaagttgaggttgaacactctttaaatgagaggacccataaaccaattgccttaaggttttgggta 36521954  T
Q  142 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttg 173  Q
    ||||||||   |||||||   |||||||||||    
T  36521953 agagtgtgtcatctctctcatttgtgtggttg 36521922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 501 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 26900089 - 26900007
Alignment:
Q  501 ttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccc 583  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||    
T  26900089 ttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgggtttgttctagccttgatgtggacggtcccccaagctcccc 26900007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 127 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 26900089 - 26900007
Alignment:
Q  127 ttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccc 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||    
T  26900089 ttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgggtttgttctagccttgatgtggacggtcccccaagctcccc 26900007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 43 - 136
Target Start/End: Original strand, 42508614 - 42508707
Alignment:
Q  43 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtttt 136  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||| || |||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  42508614 caagtgtgaattatatatcccacatcggatagaaaagtaaaggttaaacatctaataagtaagaggactcataaacccattgccttaaggtttt 42508707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 417 - 510
Target Start/End: Original strand, 42508614 - 42508707
Alignment:
Q  417 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtttt 510  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||| || |||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  42508614 caagtgtgaattatatatcccacatcggatagaaaagtaaaggttaaacatctaataagtaagaggactcataaacccattgccttaaggtttt 42508707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 44 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 36522392 - 36522277
Alignment:
Q  44 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 143  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||| || | |  | ||||||||  |||||||| |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  36522392 aagtgtgagttatatgtctcacattggatagaaaaatggaagttgaacattttataagtgagaggaccaataaacccattatcttaaggttttgggtaag 36522293  T
Q  144 agtgtggtgtctctct 159  Q
    ||||||||||||||||    
T  36522292 agtgtggtgtctctct 36522277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 43 - 121
Target Start/End: Original strand, 26074320 - 26074398
Alignment:
Q  43 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaaccca 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| || | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26074320 caagtgtgagttatatgtcccacatcagatagaaaactaaagattgaacaccttataagtaagaggacccataaaccca 26074398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 417 - 495
Target Start/End: Original strand, 26074320 - 26074398
Alignment:
Q  417 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaaccca 495  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| || | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26074320 caagtgtgagttatatgtcccacatcagatagaaaactaaagattgaacaccttataagtaagaggacccataaaccca 26074398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 41 - 159
Target Start/End: Original strand, 31509623 - 31509742
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg-ttttggg 139  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||  ||||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||| |||| ||    
T  31509623 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggatagaaaagtggaggttgagcactttataagtgagaggactcataaactcattgccttgaggttttttgg 31509722  T
Q  140 taagagtgtggtgtctctct 159  Q
    ||||| ||| ||||||||||    
T  31509723 taagaatgtagtgtctctct 31509742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 418 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 41635346 - 41635212
Alignment:
Q  418 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 517  Q
    |||| ||||||||||||  | |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| |||||  |||| ||||||    
T  41635346 aagtatgagttatatgtttcccatcagataaaagagtaaatgttgaacaccttataaataagaggatccataaatccattgtcttaaaattttaggtaag 41635247  T
Q  518 agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 552  Q
    ||||| || ||||| || ||||| |||||| ||||    
T  41635246 agtgtagtatctcttttacttgtatggttgctcta 41635212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 44 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 41635346 - 41635212
Alignment:
Q  44 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 143  Q
    |||| ||||||||||||  | |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| |||||  |||| ||||||    
T  41635346 aagtatgagttatatgtttcccatcagataaaagagtaaatgttgaacaccttataaataagaggatccataaatccattgtcttaaaattttaggtaag 41635247  T
Q  144 agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 178  Q
    ||||| || ||||| || ||||| |||||| ||||    
T  41635246 agtgtagtatctcttttacttgtatggttgctcta 41635212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 43 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 13786157 - 13785964
Alignment:
Q  43 caagtgtgagttat-atgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 141  Q
    ||||||||||| || ||||  |||||||||||||| ||| | |||||||||| |||||||||||| ||||| |||| | |||| |||||| |||||| ||    
T  13786157 caagtgtgagtaattatgtttcacatcggataaaa-agtgatggttgaacactttataagtaagatgacccgtaaatctattgtcttaagattttggata 13786059  T
Q  142 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc-ctaggctcccctcactgacccaacagtggtatcagagcc 237  Q
    |||||||| |||||||||  ||  | || ||||||| |||||| ||| ||||||||| |||  ||||||||| ||||||| || |||||||||||||    
T  13786058 agagtgtgatgtctctctcactattatgattgttctggcctcgttgtcgacggtccctcta-actcccctca-tgacccatcaatggtatcagagcc 13785964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 417 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 13786157 - 13786002
Alignment:
Q  417 caagtgtgagttat-atgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 515  Q
    ||||||||||| || ||||  |||||||||||||| ||| | |||||||||| |||||||||||| ||||| |||| | |||| |||||| |||||| ||    
T  13786157 caagtgtgagtaattatgtttcacatcggataaaa-agtgatggttgaacactttataagtaagatgacccgtaaatctattgtcttaagattttggata 13786059  T
Q  516 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 572  Q
    |||||||| |||||||||  ||  | || ||||||| |||||| ||| |||||||||    
T  13786058 agagtgtgatgtctctctcactattatgattgttctggcctcgttgtcgacggtccc 13786002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 55 - 166
Target Start/End: Original strand, 31509745 - 31509857
Alignment:
Q  55 atatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg-ttttgggtaagagtgtggtgt 153  Q
    ||||||| ||||||||||| || |||  ||||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||    
T  31509745 atatgtctcacatcggatagaaaagtggaggttgagcactttataagtgagaggactcataaactcattgccttgaggttttttggtaagaatgtggtgt 31509844  T
Q  154 ctctcttgcttgt 166  Q
    |||||| ||||||    
T  31509845 ctctctcgcttgt 31509857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 429 - 540
Target Start/End: Original strand, 31509745 - 31509857
Alignment:
Q  429 atatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg-ttttgggtaagagtgtggtgt 527  Q
    ||||||| ||||||||||| || |||  ||||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||    
T  31509745 atatgtctcacatcggatagaaaagtggaggttgagcactttataagtgagaggactcataaactcattgccttgaggttttttggtaagaatgtggtgt 31509844  T
Q  528 ctctcttgcttgt 540  Q
    |||||| ||||||    
T  31509845 ctctctcgcttgt 31509857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 108 - 159
Target Start/End: Original strand, 13042606 - 13042657
Alignment:
Q  108 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13042606 gacccataaacccattgccttaaggttttggataagagtgtggtgtctctct 13042657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 482 - 533
Target Start/End: Original strand, 13042606 - 13042657
Alignment:
Q  482 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 533  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13042606 gacccataaacccattgccttaaggttttggataagagtgtggtgtctctct 13042657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 502 - 573
Target Start/End: Original strand, 38427306 - 38427377
Alignment:
Q  502 taaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 573  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | ||||||||    
T  38427306 taagattttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgttctaacctcgatgttggcggtcccc 38427377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 43 - 122
Target Start/End: Original strand, 39309686 - 39309764
Alignment:
Q  43 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccat 122  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||    
T  39309686 caagtatgagttatatgtcccacatcggataaaagggtaaatgttgaacacattataaataagagga-ccataaacccat 39309764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #105
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 417 - 496
Target Start/End: Original strand, 39309686 - 39309764
Alignment:
Q  417 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccat 496  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||    
T  39309686 caagtatgagttatatgtcccacatcggataaaagggtaaatgttgaacacattataaataagagga-ccataaacccat 39309764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #106
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 473 - 574
Target Start/End: Complemental strand, 13785732 - 13785631
Alignment:
Q  473 aagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 572  Q
    |||||| |||| | ||||||||||  ||||||||||||  |||| |||||||||| ||||| | |||| ||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  13785732 aagtaataggatctataaacccataaccttaaggttttaagtaaaagtgtggtgtttctctcgtttgtatggttgttctaacttcgatgtggacggtccc 13785633  T
Q  573 ct 574  Q
    ||    
T  13785632 ct 13785631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #107
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 99 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 13785732 - 13785631
Alignment:
Q  99 aagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 198  Q
    |||||| |||| | ||||||||||  ||||||||||||  |||| |||||||||| ||||| | |||| ||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  13785732 aagtaataggatctataaacccataaccttaaggttttaagtaaaagtgtggtgtttctctcgtttgtatggttgttctaacttcgatgtggacggtccc 13785633  T
Q  199 ct 200  Q
    ||    
T  13785632 ct 13785631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #108
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 499 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 795306 - 795254
Alignment:
Q  499 ccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttct 551  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  795306 ccttaaggttttaggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttct 795254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #109
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 125 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 795306 - 795254
Alignment:
Q  125 ccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttct 177  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  795306 ccttaaggttttaggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttct 795254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #110
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 486 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 9498410 - 9498343
Alignment:
Q  486 cataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctag 553  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||    
T  9498410 cataaacccattgccttaagcatttgagtaagagtgtggcgtctctcttgcaagtgtggttgttctag 9498343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #111
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 112 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 9498410 - 9498343
Alignment:
Q  112 cataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctag 179  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||    
T  9498410 cataaacccattgccttaagcatttgagtaagagtgtggcgtctctcttgcaagtgtggttgttctag 9498343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #112
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 472 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 36527196 - 36527117
Alignment:
Q  472 taagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttct 551  Q
    ||||| |||||| |||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||  ||||||||| ||||||    
T  36527196 taagtgagaggatccataaacgcattgccttaagattttggataagagtgtgctgtctctctcacttgtgtggctgttct 36527117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #113
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 36527196 - 36527117
Alignment:
Q  98 taagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttct 177  Q
    ||||| |||||| |||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||  ||||||||| ||||||    
T  36527196 taagtgagaggatccataaacgcattgccttaagattttggataagagtgtgctgtctctctcacttgtgtggctgttct 36527117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #114
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 43 - 136
Target Start/End: Original strand, 42524719 - 42524811
Alignment:
Q  43 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtttt 136  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||| |||||||| ||||| | ||||||||| |||||| |||||| || ||||||||    
T  42524719 caagtgtgaattatatgtctcacatcggatagaaaagtaaa-gttgaacatcttatgaataagaggactcataaatccattgtctgaaggtttt 42524811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #115
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 417 - 510
Target Start/End: Original strand, 42524719 - 42524811
Alignment:
Q  417 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtttt 510  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||| |||||||| ||||| | ||||||||| |||||| |||||| || ||||||||    
T  42524719 caagtgtgaattatatgtctcacatcggatagaaaagtaaa-gttgaacatcttatgaataagaggactcataaatccattgtctgaaggtttt 42524811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #116
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 99 - 159
Target Start/End: Original strand, 32445943 - 32446003
Alignment:
Q  99 aagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 159  Q
    |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  32445943 aagtgagaggacccataaacccaacgccttaaggttttgggttaaagtgtggtgtctctct 32446003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #117
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 473 - 533
Target Start/End: Original strand, 32445943 - 32446003
Alignment:
Q  473 aagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 533  Q
    |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  32445943 aagtgagaggacccataaacccaacgccttaaggttttgggttaaagtgtggtgtctctct 32446003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #118
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 155
Target Start/End: Original strand, 13112604 - 13112651
Alignment:
Q  108 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtct 155  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13112604 gacccataaacccattgtcttaaggttttggataagagtgtggtgtct 13112651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #119
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 482 - 529
Target Start/End: Original strand, 13112604 - 13112651
Alignment:
Q  482 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtct 529  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13112604 gacccataaacccattgtcttaaggttttggataagagtgtggtgtct 13112651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #120
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 387 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 13785794 - 13785732
Alignment:
Q  387 gactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaa 450  Q
    |||||||| |||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13785794 gactcacatttgagggggagtgttg-tgtggaagtgtgagttatatgtcccaaatcggataaaa 13785732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #121
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 28 - 81
Target Start/End: Original strand, 5660285 - 5660338
Alignment:
Q  28 acctgtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagta 81  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  5660285 acctatgttggtttgcaaatgtgagttatatgttccacatcgaataaaatagta 5660338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #122
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 44 - 101
Target Start/End: Original strand, 6225047 - 6225104
Alignment:
Q  44 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataag 101  Q
    |||| |||||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  6225047 aagtctgagttatatatcccacatcagataaaagaataaaggttgaacaccttataag 6225104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #123
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 418 - 475
Target Start/End: Original strand, 6225047 - 6225104
Alignment:
Q  418 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataag 475  Q
    |||| |||||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  6225047 aagtctgagttatatatcccacatcagataaaagaataaaggttgaacaccttataag 6225104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #124
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 407 - 455
Target Start/End: Original strand, 5660290 - 5660338
Alignment:
Q  407 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagta 455  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  5660290 tgttggtttgcaaatgtgagttatatgttccacatcgaataaaatagta 5660338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #125
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 78 - 166
Target Start/End: Original strand, 19275566 - 19275653
Alignment:
Q  78 agtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgt 166  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||  ||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||    
T  19275566 agtagaggttgaacac-ttataaggaagaagacccataaattcattgtcttaagattttgggtaagattgtggcgtctgtctcgcttgt 19275653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #126
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 452 - 540
Target Start/End: Original strand, 19275566 - 19275653
Alignment:
Q  452 agtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgt 540  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||  ||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||    
T  19275566 agtagaggttgaacac-ttataaggaagaagacccataaattcattgtcttaagattttgggtaagattgtggcgtctgtctcgcttgt 19275653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #127
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 121 - 159
Target Start/End: Original strand, 13042784 - 13042822
Alignment:
Q  121 attgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 159  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13042784 attgccttaaggttttgggtaagaatgtggtgtctctct 13042822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #128
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 495 - 533
Target Start/End: Original strand, 13042784 - 13042822
Alignment:
Q  495 attgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 533  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13042784 attgccttaaggttttgggtaagaatgtggtgtctctct 13042822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #129
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 121 - 159
Target Start/End: Original strand, 13112782 - 13112820
Alignment:
Q  121 attgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 159  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13112782 attgccttaaggttttgggtaagaatgtggtgtctctct 13112820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #130
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 495 - 533
Target Start/End: Original strand, 13112782 - 13112820
Alignment:
Q  495 attgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 533  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13112782 attgccttaaggttttgggtaagaatgtggtgtctctct 13112820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #131
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 209 - 267
Target Start/End: Original strand, 35150510 - 35150567
Alignment:
Q  209 ctcactgacccaacagtggtatcagagccccggttcgacgaagggagcgaccgaggcag 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||   |||||||||||    
T  35150510 ctcactgacccaacagtggtatcagagcccc-gtttgacgaagggtatgaccgaggcag 35150567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #132
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 41 - 83
Target Start/End: Original strand, 35150747 - 35150789
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaa 83  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  35150747 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgaataaaagagtaaa 35150789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #133
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 415 - 457
Target Start/End: Original strand, 35150747 - 35150789
Alignment:
Q  415 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaa 457  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  35150747 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgaataaaagagtaaa 35150789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #134
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 41 - 83
Target Start/End: Original strand, 35151038 - 35151080
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaa 83  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  35151038 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgaataaaagagtaaa 35151080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #135
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 415 - 457
Target Start/End: Original strand, 35151038 - 35151080
Alignment:
Q  415 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaa 457  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  35151038 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgaataaaagagtaaa 35151080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #136
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 197
Target Start/End: Original strand, 42435486 - 42435583
Alignment:
Q  99 aagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 197  Q
    ||||||||||| |||||| |  ||| |||||||||||||  | |||||||| |||||||||     |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  42435486 aagtaagaggatccataatct-attaccttaaggttttgaatcagagtgtgatgtctctctcataagtgtggttgttctagcatcgatgtggacggtcc 42435583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #137
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 473 - 571
Target Start/End: Original strand, 42435486 - 42435583
Alignment:
Q  473 aagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 571  Q
    ||||||||||| |||||| |  ||| |||||||||||||  | |||||||| |||||||||     |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  42435486 aagtaagaggatccataatct-attaccttaaggttttgaatcagagtgtgatgtctctctcataagtgtggttgttctagcatcgatgtggacggtcc 42435583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #138
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 301 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 795249 - 795196
Alignment:
Q  301 caagtagcaagtggctccttgtgcaggaacggcgatacaggcaaagtcaaaagc 354  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  795249 caagcagcaagtggctccttgtgcagcaacggtgatacagacaaagtaaaaagc 795196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #139
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 214 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 13416127 - 13416036
Alignment:
Q  214 tgacccaacagtggtatcagagccccggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtc--attgcgcagaaagccgcaacagcggtacaag 304  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||  ||||||||||| | ||||   ||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  13416127 tgacccaacagtggtatcagagtccc-gttcgtcgaagggtacgaccgaggcaaccggtccgtttgcgcagaaagcagcaacggcggtgcaag 13416036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #140
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 214 - 304
Target Start/End: Original strand, 26074400 - 26074492
Alignment:
Q  214 tgacccaacagtggtatcagagccccggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtc--attgcgcagaaagccgcaacagcggtacaag 304  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| |||||  |||||||| ||||| |||   ||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  26074400 tgacccaacaatggcatcagagccccggtttgacaaagggtacgaccgagacagctagtctgtttgcgcagaaagcagcaacggcggtgcaag 26074492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #141
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 143 - 195
Target Start/End: Original strand, 24489583 - 24489635
Alignment:
Q  143 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| || |||||    
T  24489583 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcagttgttctaacctcgatatgaacggt 24489635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #142
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 517 - 569
Target Start/End: Original strand, 24489583 - 24489635
Alignment:
Q  517 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 569  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| || |||||    
T  24489583 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcagttgttctaacctcgatatgaacggt 24489635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #143
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 119 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 3622968 - 3622828
Alignment:
Q  119 ccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacc 218  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||| |  || |||||||||  || |||| |||||||  |||||||  |||| |||||| |||||    
T  3622968 ccattgccttaag-ttttaggtaagagtgtgacgtctctgtcactagtgtggttgccct-gcctggatgtgggtggtccccagggcttccctca-tgacc 3622872  T
Q  219 caacagtggtatcagagccccggttcgacgaagggagcgaccga 262  Q
    ||||| |||||||||||    ||||||||||||||  |||||||    
T  3622871 caacaatggtatcagagttgaggttcgacgaagggttcgaccga 3622828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #144
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 383 - 427
Target Start/End: Original strand, 15370380 - 15370426
Alignment:
Q  383 gatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagt 427  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||    
T  15370380 gatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtgcaagtgtgagt 15370426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #145
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 482 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 36389067 - 36389016
Alignment:
Q  482 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 533  Q
    ||||||||||| || ||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||    
T  36389067 gacccataaactcagtgccttagggttttgggtcagagtgtggtgtttctct 36389016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #146
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 36389067 - 36389016
Alignment:
Q  108 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 159  Q
    ||||||||||| || ||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||    
T  36389067 gacccataaactcagtgccttagggttttgggtcagagtgtggtgtttctct 36389016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #147
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 123 - 153
Target Start/End: Original strand, 5963765 - 5963795
Alignment:
Q  123 tgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 153  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5963765 tgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 5963795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #148
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 497 - 527
Target Start/End: Original strand, 5963765 - 5963795
Alignment:
Q  497 tgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 527  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5963765 tgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 5963795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #149
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 469 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 9510624 - 9510546
Alignment:
Q  469 ttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttg 547  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| | ||||||||  |||| ||||| | | | ||||||||||| ||||||||||||    
T  9510624 ttataagtgagaggagccataaacctaatgccttaaaattttaggtaaaaatatagtgtctctcttacttgtgtggttg 9510546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #150
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 95 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 9510624 - 9510546
Alignment:
Q  95 ttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttg 173  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| | ||||||||  |||| ||||| | | | ||||||||||| ||||||||||||    
T  9510624 ttataagtgagaggagccataaacctaatgccttaaaattttaggtaaaaatatagtgtctctcttacttgtgtggttg 9510546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #151
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 407 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 22299014 - 22298956
Alignment:
Q  407 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggat-aaaatagtaaaggttgaa 464  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||| |||||| |||||||||||    
T  22299014 tgttggtttgcatgtgtgggttatatgtctcacatcagataaaaataataaaggttgaa 22298956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #152
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 33 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 22299014 - 22298956
Alignment:
Q  33 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggat-aaaatagtaaaggttgaa 90  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||| |||||| |||||||||||    
T  22299014 tgttggtttgcatgtgtgggttatatgtctcacatcagataaaaataataaaggttgaa 22298956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #153
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 513 - 549
Target Start/End: Complemental strand, 795189 - 795152
Alignment:
Q  513 gtaagagtgtggtgtctctcttgc-ttgtgtggttgtt 549  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  795189 gtaagagtgtggtgtctctcttgctttgtgtggttgtt 795152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #154
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 795189 - 795152
Alignment:
Q  139 gtaagagtgtggtgtctctcttgc-ttgtgtggttgtt 175  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  795189 gtaagagtgtggtgtctctcttgctttgtgtggttgtt 795152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #155
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 131 - 195
Target Start/End: Original strand, 5660340 - 5660405
Alignment:
Q  131 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctc-gatgtggacggt 195  Q
    |||||||| ||| ||| |||||| | ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  5660340 ggttttggataaaagtatggtgtttttcttgtttgtgtggttgttctagcctcaaatgtggacggt 5660405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #156
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 505 - 569
Target Start/End: Original strand, 5660340 - 5660405
Alignment:
Q  505 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctc-gatgtggacggt 569  Q
    |||||||| ||| ||| |||||| | ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  5660340 ggttttggataaaagtatggtgtttttcttgtttgtgtggttgttctagcctcaaatgtggacggt 5660405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #157
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 153
Target Start/End: Original strand, 34103625 - 34103666
Alignment:
Q  112 cataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 153  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  34103625 cataaactcattgccttaaggttttgaataagagtgtggtgt 34103666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #158
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 486 - 527
Target Start/End: Original strand, 34103625 - 34103666
Alignment:
Q  486 cataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 527  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  34103625 cataaactcattgccttaaggttttgaataagagtgtggtgt 34103666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #159
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 146 - 199
Target Start/End: Original strand, 35150810 - 35150863
Alignment:
Q  146 tgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 199  Q
    ||||||||||||||  || ||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  35150810 tgtggtgtctctctcactagtgtgattgttttagcctcgatgtggatggtcccc 35150863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #160
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 520 - 573
Target Start/End: Original strand, 35150810 - 35150863
Alignment:
Q  520 tgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 573  Q
    ||||||||||||||  || ||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  35150810 tgtggtgtctctctcactagtgtgattgttttagcctcgatgtggatggtcccc 35150863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #161
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 44 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 13785764 - 13785732
Alignment:
Q  44 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaa 76  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13785764 aagtgtgagttatatgtcccaaatcggataaaa 13785732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #162
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 109 - 153
Target Start/End: Original strand, 41341523 - 41341567
Alignment:
Q  109 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 153  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  41341523 acccatacactcattgccttaaggtttttggtaagaatgtggtgt 41341567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #163
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 483 - 527
Target Start/End: Original strand, 41341523 - 41341567
Alignment:
Q  483 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 527  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  41341523 acccatacactcattgccttaaggtttttggtaagaatgtggtgt 41341567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 371; Significance: 0; HSPs: 156)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 371; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 585
Target Start/End: Original strand, 3669678 - 3670229
Alignment:
Q  32 gtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaag 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  3669678 gtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaactcattgccttaag 3669777  T
Q  132 gttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtggtatc 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||  ||||||||| ||||||||    
T  3669778 gttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtccccctagctcccctcg-tgacccaacggtggtatc 3669876  T
Q  232 agagccccggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtcattgcgcagaaagccgcaacagcggtacaagtagcaagtggctccttgtgcaggaacg 331  Q
    ||||||||  ||| | ||||||  ||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  3669877 agagccccccttcaatgaagggtacgatcgaggcagccggtcgttgcgcagaaagccgcaacaacggtacaagcaacaagtggctccttgtgcaggaacg 3669976  T
Q  332 gcgatacaggcaaagtcaaaagcttccgctctaaggg-gagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttat 430  Q
    |||||||| ||||||| || |||||| |||  ||||| ||||| | | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3669977 gcgatacatgcaaagt-aagagcttctgcttgaagggtgagcatgatgaattgatggactcacacttgagggggactgttggtttgcaagtgtgagttat 3670075  T
Q  431 atgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctc 530  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3670076 atgtcccacatcggataaaatagtaaaggtttaacaccttataagtatgaggacccataaacctatttccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctc 3670175  T
Q  531 tcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctc 585  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  3670176 tcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggttcccta-gctcccctc 3670229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 33 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 1014411 - 1013879
Alignment:
Q  33 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 132  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||| |    
T  1014411 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccgtaaactcgttaccttaaag 1014312  T
Q  133 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctag-gctcccctcactgacccaacagtggtatc 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||  | ||||||| || |||  |||||||||||||    
T  1014311 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcctgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggttcccccgagctcccc-cagtgatacaacagtggtatc 1014213  T
Q  232 agagccccggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtcattgcgcagaaagccgcaacagcggtacaagtagcaagtggctccttgtgcaggaacg 331  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1014212 agagccccggttcgacgaagggtacgactgaggcagccggtcgttgcgcagaaagccgcaacggcggtacaagcagcaagtggctccttgtgcaggaacg 1014113  T
Q  332 gcgatacaggcaaagtcaaaagcttccgctctaagggg-agcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttat 430  Q
     ||||||| ||||||| || ||||||||||  |||||| || | | | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1014112 acgatacatgcaaagt-aagagcttccgcttgaagggggagtatgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttat 1014014  T
Q  431 atgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctc 530  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||    
T  1014013 atgttccacatcggataaaatagtaaaagttgaacaccctataagtaagaggaccaataaacccattgccttagagttttgagtaagagtgtgttgtctc 1013914  T
Q  531 tcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 565  Q
    | || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1013913 ttttacttgtgcggttgttctagcctcgatgtgga 1013879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 41 - 598
Target Start/End: Original strand, 9308977 - 9309536
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcc--cacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgg 138  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9308977 tgcaagtgtgagttatatgtcctacacatcagataaaagagtaaaagttgaacatgttataagtaagaggacccataaacccattgcctaaaggttttgg 9309076  T
Q  139 gtaag---agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtggtatcagag 235  Q
    | |||   ||||||||||||||||  | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| || |||||||| ||||||||||||     
T  9309077 gcaagagtagtgtggtgtctctctcac-tatgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgagctcccc-cagtgacccaaaagtggtatcagaa 9309174  T
Q  236 ccccggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtca-ttgcgcagaaagccgcaacagcggtacaagtagcaagtggctccttgtgcaggaacggcg 334  Q
    |||| |||||||| ||||  |||||||||| || ||||| ||||| |||||||  ||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||| | |    
T  9309175 ccccagttcgacggagggtacgaccgaggccgccggtcagttgcgtagaaagcaacaacgacggcacaagcagcaagtggctccttgtgcagcaacagtg 9309274  T
Q  335 atacaggcaaagtcaaaagcttccgctctaaggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatat 432  Q
    |||||    |||| |||| |||| |   |  |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||    
T  9309275 atacaaagcaagtaaaaaacttctg--ttggggggagcacgataaagtgatggactcacaattgagggggagtgttgttgtgtgcaagtgtgagttatat 9309372  T
Q  433 gtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctc 532  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  9309373 gtcccacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggacccttaaactcattgccttaaggtgtcgggtaagagtgtggtgtctctc 9309472  T
Q  533 ttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacag 598  Q
     |   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| || |||||||||||    
T  9309473 -tcagtatgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgagctcccc-cagtgacccaacag 9309536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 43 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 3038446 - 3038251
Alignment:
Q  43 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 142  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3038446 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacactttataagtaaaaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 3038347  T
Q  143 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctccc-ctcactgacccaacagtggtatcagagcc 237  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3038346 gagtgtggcatctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcctccgagctccctctcagtgacccaacagtggtatcagagcc 3038251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 43 - 273
Target Start/End: Original strand, 34834878 - 34835105
Alignment:
Q  43 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 142  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34834878 caagtgtgagttatatgtcccacattggataaaatagtaaaggttaaacaccttataagtaagatgactcataaactcattgccttaaggttttgggtaa 34834977  T
Q  143 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtggtatcagagccccggt 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |  ||||||   | |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34834978 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggatgatcccttgcgctccc--tagtgacccaacagtggtatcagag-cccggt 34835074  T
Q  243 tcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtc 273  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  34835075 tcgacgaagggtacgaccgaggcagccggtc 34835105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 405 - 585
Target Start/End: Original strand, 30441071 - 30441255
Alignment:
Q  405 agtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacacctta----taagtaagaggacccataaacccattgcc 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  30441071 agtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggctaaaatagtaaaggttgaacaccttaattataagtaagagggcccataaacccattgcc 30441170  T
Q  501 ttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctc 585  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  30441171 ttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacagtcaccttggctcccctc 30441255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 143; E-Value: 9e-75
Query Start/End: Original strand, 32 - 211
Target Start/End: Original strand, 30441072 - 30441255
Alignment:
Q  32 gtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacacctta----taagtaagaggacccataaacccattgcct 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30441072 gtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggctaaaatagtaaaggttgaacaccttaattataagtaagagggcccataaacccattgcct 30441171  T
Q  128 taaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctc 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  30441172 taaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacagtcaccttggctcccctc 30441255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 44 - 304
Target Start/End: Original strand, 147454 - 147715
Alignment:
Q  44 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  147454 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataaataagaggacccataaacctattgccttaaagttttgggtaag 147553  T
Q  144 agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccccta-ggctcccctcactgacccaacagtggtatcagagccccggt 242  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||| | |||||||  ||||||| |  ||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  147554 agtgtggcgtctctcttgcttgtgcggtagttctagcattgatgtgggtggtcccccatagctcccc-ca-tgacccaacagtgatatcagagccccggt 147651  T
Q  243 tcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtc--attgcgcagaaagccgcaacagcggtacaag 304  Q
    ||||| |||||  ||| |||||||||  |||   ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  147652 tcgacaaagggtacgatcgaggcagccagtccgtttgcgcagaaagcagcaacagcggtacaag 147715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 43 - 273
Target Start/End: Original strand, 30359273 - 30359501
Alignment:
Q  43 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 142  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30359273 caagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttataagcaagaggacccataaacccatagccttaaggttttgggtaa 30359372  T
Q  143 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctag-gctcccctcactgacccaacagtggtatcagagccccgg 241  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||| ||||||| ||| |||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||  || |    
T  30359373 gagtgtggtgtctctctttcttgtgatgttgttttagcctcaatgtggatggttccctcgagctcccctcaatgacccaacagtggtatcagag--cctg 30359470  T
Q  242 ttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtc 273  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  30359471 ttcgacgaaggga-cgaccgaggcagccggtc 30359501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 417 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 3038446 - 3038292
Alignment:
Q  417 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 516  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3038446 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacactttataagtaaaaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 3038347  T
Q  517 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 571  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3038346 gagtgtggcatctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 3038292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 138; E-Value: 8e-72
Query Start/End: Original strand, 393 - 583
Target Start/End: Original strand, 34835185 - 34835377
Alignment:
Q  393 cacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataa 490  Q
    ||||||||||||||||||| | ||  |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34835185 cacttgagggggagtgttgctgtgtacaagggtgagttatatgtcccacatccgataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataa 34835284  T
Q  491 acccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccc 583  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  34835285 actcattgccttaaagttttgggtaagagtgtggtgtcactcttgcttgtgtggttattctagcctcgatgtagacggtccccctggctcccc 34835377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 43 - 267
Target Start/End: Original strand, 40518071 - 40518296
Alignment:
Q  43 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaata--gtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 140  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40518071 caagtgtgagttatatgttccacattggataaaaaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaaatggacccataaacccaatgccttaaggttttgggt 40518170  T
Q  141 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtggtatcagagccccg 240  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||| |  ||||| |||| |||||||||||||||     
T  40518171 aagagtgtggcgtctctcttgcttgtgtggttgttctagccttgatgtggacggtcccccgagctccccccggtgaccaaacaatggtatcagagcccc- 40518269  T
Q  241 gttcgacgaagggagcgaccgaggcag 267  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||    
T  40518270 gttcgacgaagggtacgaccgaggcag 40518296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 382 - 583
Target Start/End: Original strand, 34835439 - 34835643
Alignment:
Q  382 tgatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcg-gataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaa 478  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||  |||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34835439 tgatggactcacacttgagggggagtgttgctgtgtacaagggtgagttatatgtcccacgtcccgataaaatagtaaaggtttaacaccttataagtaa 34835538  T
Q  479 gaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggc 578  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  |||    
T  34835539 gaggacccataaactcattgccttaaagttttgggtaagagtgtggtgtcactcttgcttgtgtggttattctagcctcgatgtagacggtccccctggc 34835638  T
Q  579 tcccc 583  Q
    |||||    
T  34835639 tcccc 34835643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 382 - 583
Target Start/End: Original strand, 34835705 - 34835909
Alignment:
Q  382 tgatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcg-gataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaa 478  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||  |||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34835705 tgatggactcacacttgagggggagtgttgctgtgtacaagggtgagttatatgtcccacgtcccgataaaatagtaaaggtttaacaccttataagtaa 34835804  T
Q  479 gaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggc 578  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  |||    
T  34835805 gaggacccataaactcattgccttaaagttttgggtaagagtgtggtgtcactcttgcttgtgtggttattctagcctcgatgtagacggtccccctggc 34835904  T
Q  579 tcccc 583  Q
    |||||    
T  34835905 tcccc 34835909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 43 - 209
Target Start/End: Original strand, 34835211 - 34835377
Alignment:
Q  43 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 142  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  34835211 caagggtgagttatatgtcccacatccgataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaagttttgggtaa 34835310  T
Q  143 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccc 209  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  34835311 gagtgtggtgtcactcttgcttgtgtggttattctagcctcgatgtagacggtccccctggctcccc 34835377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 382 - 571
Target Start/End: Original strand, 40518550 - 40518738
Alignment:
Q  382 tgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 481  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||  || |||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  40518550 tgatggactcacacttgagggggagtattgtgtt-caagtgtgagttatatgtcccacatcagatagaaaagtaaaggttgaacaccttataaataagag 40518648  T
Q  482 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 571  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40518649 gacccataaacccaatgacttaaggttttgggtaagagtgtgacgtcactcttgcttgtgtggttgttctagcctcaatgtggacggtcc 40518738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 417 - 565
Target Start/End: Original strand, 34834878 - 34835026
Alignment:
Q  417 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 516  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34834878 caagtgtgagttatatgtcccacattggataaaatagtaaaggttaaacaccttataagtaagatgactcataaactcattgccttaaggttttgggtaa 34834977  T
Q  517 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 565  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34834978 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 34835026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 407 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 20870741 - 20870550
Alignment:
Q  407 tgttggtttgcaagtgtgagttatat--gtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa 504  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20870741 tgttggtttgcaagtgtgagttatatatgttccacatcagataaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaacccactgccttaa 20870642  T
Q  505 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 597  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||    
T  20870641 gattttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctaaccttgatatggacggtcctcctggctcccctca-tgacccaaca 20870550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 33 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 20870741 - 20870550
Alignment:
Q  33 tgttggtttgcaagtgtgagttatat--gtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20870741 tgttggtttgcaagtgtgagttatatatgttccacatcagataaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaacccactgccttaa 20870642  T
Q  131 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 223  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||    
T  20870641 gattttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctaaccttgatatggacggtcctcctggctcccctca-tgacccaaca 20870550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 349 - 566
Target Start/End: Complemental strand, 45121881 - 45121663
Alignment:
Q  349 aaaagcttccgctctaaggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcggat 446  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||  |||||||||||| | |||||||||||||||    
T  45121881 aaaagcttccgctctggggggagcacgataaagtgatggactcacacttaagggggagtgttgttgtgtacaagtgtgagttgt-tgtcccacatcggat 45121783  T
Q  447 aaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggtt 546  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||| ||| || ||||    
T  45121782 aaaagagtaaaggttgatcaccttataagtaagaggatccataaacctacagccttaaggttttgagtaagagtgtgatatctctcttacttatggggtt 45121683  T
Q  547 gttctagcctcgatgtggac 566  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  45121682 gttctagcctcgatgtggac 45121663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 383 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 8918956 - 8918764
Alignment:
Q  383 gatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaga 480  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| |||||||||||| ||||  | |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8918956 gatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtgcaagtgtgagttacatgtcccacatcagatagcagagtaaaggttgaacactttataagtaaga 8918857  T
Q  481 ggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 573  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  8918856 ggacccataaacctattgacttaaggttttgggtaagagtgtgacgtctttcttgcgtgtgtggttgttttaacctcgatgtggacggtcccc 8918764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 415 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 45122215 - 45122067
Alignment:
Q  415 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 514  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  45122215 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagaacccataaactcattttcttaaggttttgggt 45122116  T
Q  515 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtg 563  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  45122115 aagagtgtggtgtctctcttacttgtggggttgttctagcctcgatgtg 45122067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 41 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 45122215 - 45122067
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 140  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  45122215 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagaacccataaactcattttcttaaggttttgggt 45122116  T
Q  141 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtg 189  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  45122115 aagagtgtggtgtctctcttacttgtggggttgttctagcctcgatgtg 45122067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 51 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 18372142 - 18371926
Alignment:
Q  51 agttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtgg 150  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18372142 agttatatgtaccacatccaataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaactcattgctttaaggttttgggtaagagtgtgg 18372043  T
Q  151 tgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacgg-tcccctaggctcccctcactgacccaacagtggtatcagagccccggttcgacga 249  Q
    ||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||| |||||   |||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||| |    
T  18372042 tgtttctctcgcttgtgcggttgctctagcctcaatgtgaacggttcccccgagctcccctca-tgacccaacagtggtatcagag-cctggttcgacaa 18371945  T
Q  250 agggagcgaccgaggcagc 268  Q
    ||||  |||||||||||||    
T  18371944 agggtacgaccgaggcagc 18371926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 417 - 598
Target Start/End: Original strand, 30359273 - 30359455
Alignment:
Q  417 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 516  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30359273 caagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttataagcaagaggacccataaacccatagccttaaggttttgggtaa 30359372  T
Q  517 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctag-gctcccctcactgacccaacag 598  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||| ||||||| ||| |||| | |||||||||| |||||||||||    
T  30359373 gagtgtggtgtctctctttcttgtgatgttgttttagcctcaatgtggatggttccctcgagctcccctcaatgacccaacag 30359455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 366 - 569
Target Start/End: Original strand, 30359558 - 30359763
Alignment:
Q  366 ggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttga 463  Q
    |||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| | ||  ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| |||||    
T  30359558 ggggagcatgataaattgatggactcacacttgagggggaatgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtctcacatcagataaaagagtaaaagttga 30359657  T
Q  464 acaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtg 563  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||| | ||||||||    
T  30359658 acaccttataagtaagaggactcataaacccataaccttaagattttgggtaagagtgtggtgtctctcttacttatgcggttgttctaacttcgatgtg 30359757  T
Q  564 gacggt 569  Q
    ||||||    
T  30359758 gacggt 30359763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 415 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 45122068 - 45121898
Alignment:
Q  415 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 514  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  45122068 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgcataaaatagtaaaggttgaacactttataagtaagaggactcataaactcattgccttaagattttgggt 45121969  T
Q  515 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctc 585  Q
    || ||||||| |||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  45121968 aacagtgtggcgtctcttttgctcgtgtggttattcaagcctcgatgtggaaggtcccccaggctcccctc 45121898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 41 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 45122068 - 45121898
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  45122068 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgcataaaatagtaaaggttgaacactttataagtaagaggactcataaactcattgccttaagattttgggt 45121969  T
Q  141 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctc 211  Q
    || ||||||| |||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  45121968 aacagtgtggcgtctcttttgctcgtgtggttattcaagcctcgatgtggaaggtcccccaggctcccctc 45121898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 388 - 573
Target Start/End: Original strand, 45122604 - 45122782
Alignment:
Q  388 actcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggaccca 487  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||      ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45122604 actcacacttgagggggagtgttg-tgtgcaagtg------atatggcccgcatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggaccca 45122696  T
Q  488 taaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 573  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  45122697 taaactcattgtcttaaggttttgggtatgagtgtggcgtctctcttgcttgtgtggttgttcaagcctcgatgtggaaggtcccc 45122782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 66 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 9483320 - 9483084
Alignment:
Q  66 atcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttg 165  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  9483320 atcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctcttttgctcg 9483221  T
Q  166 tgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtggtatcagagccccggttcgacgaagggagcgaccgaggc 265  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||| |  ||||||| |||  ||||||||||  || |||||||||  | ||||||||    
T  9483220 tgcggttgttctagcctcgatgtggacggttcccatagctcccctcagtatcccaacaatgg--tcagagcccc-tttggacgaagggtacaaccgaggc 9483124  T
Q  266 agctggtc--attgcgcagaaagccgcaacagcggtacaa 303  Q
    ||  ||||   ||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  9483123 agtcggtccgtttgcgcagaaagcagcaacggcggtacaa 9483084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 383 - 575
Target Start/End: Original strand, 6731872 - 6732055
Alignment:
Q  383 gatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagg 482  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||     
T  6731872 gatggactcacatttgagggggagtgttgttttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttga---------aagtaagaga 6731962  T
Q  483 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccccta 575  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||| | |||||||    
T  6731963 acccataaattcattgccttaaggttttgagtaagagtgtggtgtctctcttgcttatgcggttgttctaacctcgatgtggatgatccccta 6732055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 393 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 9482784 - 9482608
Alignment:
Q  393 cacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaac 492  Q
    ||||||||||||||||||| | || |   ||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9482784 cacttgagggggagtgttgttgtgtacaagtgagttatatgttccacatgggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaac 9482685  T
Q  493 ccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 569  Q
    ||||||||| ||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9482684 ccattgcctaaagattttgtataagagtgtggtatctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggt 9482608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 417 - 576
Target Start/End: Complemental strand, 25561972 - 25561812
Alignment:
Q  417 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtttt-gggta 515  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  25561972 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaacgttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgtcttaaggttttggggta 25561873  T
Q  516 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctag 576  Q
    ||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25561872 agagtgtgacatctctcttgcttgtgtggttgctctagcctcgatgtggaaggtcccctag 25561812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 43 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 25561972 - 25561812
Alignment:
Q  43 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtttt-gggta 141  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  25561972 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaacgttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgtcttaaggttttggggta 25561873  T
Q  142 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctag 202  Q
    ||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25561872 agagtgtgacatctctcttgcttgtgtggttgctctagcctcgatgtggaaggtcccctag 25561812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 43 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 37544646 - 37544452
Alignment:
Q  43 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 142  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  37544646 caagtgtgagttataagtcgcacatcggataaaatagtaaaggttgaacacattataagaaagaggacccataaatccattactttaaggttttgggtaa 37544547  T
Q  143 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtggtatcagagcccc 239  Q
    ||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| | | |||||||| |||||||||  || ||||||||||||    
T  37544546 gagtgtggtgtctttcttacttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacgatccccga-gttcccctca-tgacccaactctgatatcagagcccc 37544452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 32 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 1014038 - 1013879
Alignment:
Q  32 gtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaag 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||      
T  1014038 gtgttggtttgcaagtgtgagttatatgttccacatcggataaaatagtaaaagttgaacaccctataagtaagaggaccaataaacccattgccttaga 1013939  T
Q  132 gttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 191  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1013938 gttttgagtaagagtgtgttgtctcttttacttgtgcggttgttctagcctcgatgtgga 1013879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 415 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 6877021 - 6876862
Alignment:
Q  415 tgcaagtgtgagttatat-gtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttggg 513  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||| |||||||||    
T  6877021 tgcaagtgtgagttatatagtcccacatcggataaaaaagtaaaggttgaacaccttataaataagatgacccatacactcattgtcttagggttttggg 6876922  T
Q  514 taagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 573  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6876921 taagagtgtggtgtttctcttgtttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 6876862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 41 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 6877021 - 6876862
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatat-gtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttggg 139  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||| |||||||||    
T  6877021 tgcaagtgtgagttatatagtcccacatcggataaaaaagtaaaggttgaacaccttataaataagatgacccatacactcattgtcttagggttttggg 6876922  T
Q  140 taagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 199  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6876921 taagagtgtggtgtttctcttgtttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 6876862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 41 - 200
Target Start/End: Original strand, 9608745 - 9608904
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 140  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  9608745 tgcaagtgtgagttatatgtcccatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcaccttaaggttttgggt 9608844  T
Q  141 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccct 200  Q
    | |||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9608845 atgagtgtggcgtctctcttgctagtgaggttgttctagcctcgatgtggacggccccct 9608904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 415 - 574
Target Start/End: Original strand, 9608745 - 9608904
Alignment:
Q  415 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 514  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  9608745 tgcaagtgtgagttatatgtcccatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcaccttaaggttttgggt 9608844  T
Q  515 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccct 574  Q
    | |||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9608845 atgagtgtggcgtctctcttgctagtgaggttgttctagcctcgatgtggacggccccct 9608904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 417 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 33113523 - 33113368
Alignment:
Q  417 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 516  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  33113523 caagtttgagttatatgtcctacatcggataaaatagtaaaggttgaacgtcttataagtaagaggacccataaactcattgccttaagattttgggtaa 33113424  T
Q  517 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 572  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  33113423 gagtgtggtgtctctcttgctagtgtggttgttctaggctcaatgcggacggtccc 33113368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 43 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 33113523 - 33113368
Alignment:
Q  43 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 142  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  33113523 caagtttgagttatatgtcctacatcggataaaatagtaaaggttgaacgtcttataagtaagaggacccataaactcattgccttaagattttgggtaa 33113424  T
Q  143 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 198  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  33113423 gagtgtggtgtctctcttgctagtgtggttgttctaggctcaatgcggacggtccc 33113368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 43 - 209
Target Start/End: Original strand, 34835476 - 34835643
Alignment:
Q  43 caagtgtgagttatatgtcccacatcg-gataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 141  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  34835476 caagggtgagttatatgtcccacgtcccgataaaatagtaaaggtttaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaagttttgggta 34835575  T
Q  142 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccc 209  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  34835576 agagtgtggtgtcactcttgcttgtgtggttattctagcctcgatgtagacggtccccctggctcccc 34835643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 43 - 209
Target Start/End: Original strand, 34835742 - 34835909
Alignment:
Q  43 caagtgtgagttatatgtcccacatcg-gataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 141  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  34835742 caagggtgagttatatgtcccacgtcccgataaaatagtaaaggtttaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaagttttgggta 34835841  T
Q  142 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccc 209  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  34835842 agagtgtggtgtcactcttgcttgtgtggttattctagcctcgatgtagacggtccccctggctcccc 34835909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 417 - 573
Target Start/End: Original strand, 40518071 - 40518229
Alignment:
Q  417 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaata--gtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 514  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40518071 caagtgtgagttatatgttccacattggataaaaaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaaatggacccataaacccaatgccttaaggttttgggt 40518170  T
Q  515 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 573  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40518171 aagagtgtggcgtctctcttgcttgtgtggttgttctagccttgatgtggacggtcccc 40518229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 43 - 197
Target Start/End: Original strand, 40518584 - 40518738
Alignment:
Q  43 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 142  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  40518584 caagtgtgagttatatgtcccacatcagatagaaaagtaaaggttgaacaccttataaataagaggacccataaacccaatgacttaaggttttgggtaa 40518683  T
Q  143 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 197  Q
    |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40518684 gagtgtgacgtcactcttgcttgtgtggttgttctagcctcaatgtggacggtcc 40518738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 55 - 268
Target Start/End: Original strand, 45122638 - 45122854
Alignment:
Q  55 atatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtc 154  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||| |||    
T  45122638 atatggcccgcatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgtcttaaggttttgggtatgagtgtggcgtc 45122737  T
Q  155 tctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctagg-----ctcccctcactgacccaacagtggtatcagagccccggttcgacga 249  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  ||     |||||| || ||||| |||||||| ||||||| ||  |||||||||    
T  45122738 tctcttgcttgtgtggttgttcaagcctcgatgtggaaggtccccctggcccgactcccccca-tgaccaaacagtggcatcagag-cctagttcgacga 45122835  T
Q  250 agggagcgaccgaggcagc 268  Q
    ||||  |||||||||||||    
T  45122836 agggtacgaccgaggcagc 45122854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 383 - 573
Target Start/End: Original strand, 45122972 - 45123164
Alignment:
Q  383 gatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaga 480  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||    
T  45122972 gatggacttacacttgagggggagtgttgctgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttaaacacct--taagtaaga 45123069  T
Q  481 ggacccataaacccattgccttaaggttttgggta--agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 573  Q
     |||||||||||| |||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  45123070 tgacccataaacctattttcttaaggttttgggtaagagagtgtggtgtctctcttatttgtggggttgttctaatctcgatgtggacggtcccc 45123164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 41 - 225
Target Start/End: Original strand, 9309355 - 9309537
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||    
T  9309355 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggacccttaaactcattgccttaaggtgtcgggt 9309454  T
Q  141 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagt 225  Q
    |||||||||||||||||||   |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| || ||||||||||||    
T  9309455 aagagtgtggtgtctctctcagta-tgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgagctcccc-cagtgacccaacagt 9309537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 417 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 37544646 - 37544490
Alignment:
Q  417 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 516  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  37544646 caagtgtgagttataagtcgcacatcggataaaatagtaaaggttgaacacattataagaaagaggacccataaatccattactttaaggttttgggtaa 37544547  T
Q  517 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 573  Q
    ||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37544546 gagtgtggtgtctttcttacttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacgatcccc 37544490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 418 - 573
Target Start/End: Original strand, 147454 - 147609
Alignment:
Q  418 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 517  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  147454 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataaataagaggacccataaacctattgccttaaagttttgggtaag 147553  T
Q  518 agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 573  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||| | |||||||  |||||||    
T  147554 agtgtggcgtctctcttgcttgtgcggtagttctagcattgatgtgggtggtcccc 147609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 48 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 9482755 - 9482608
Alignment:
Q  48 gtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtg 147  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||    
T  9482755 gtgagttatatgttccacatgggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctaaagattttgtataagagtg 9482656  T
Q  148 tggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 195  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9482655 tggtatctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggt 9482608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 440 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 9483320 - 9483174
Alignment:
Q  440 atcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttg 539  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  9483320 atcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctcttttgctcg 9483221  T
Q  540 tgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctca 586  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||    
T  9483220 tgcggttgttctagcctcgatgtggacggttcccatagctcccctca 9483174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 35 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 40579670 - 40579466
Alignment:
Q  35 ttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtt 134  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||  || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||    
T  40579670 ttggtttccaagtgtgaattatatgtttcatattggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacttattgctttaaggtt 40579571  T
Q  135 ttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtggtatcaga 234  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||||| ||| | | ||||||| || |||||||  | ||||||||||    
T  40579570 ttaggtaagagtgtggtgtctctattgcttgtacggttgttctatcctcgatgtggacgatcctccatgctccccaca-tgacccagtattggtatcaga 40579472  T
Q  235 gccccg 240  Q
    ||||||    
T  40579471 gccccg 40579466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 417 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 1514071 - 1513915
Alignment:
Q  417 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 516  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  1514071 caagtatgagttatatatcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccttaaacccataaccttaaggttttgggtaa 1513972  T
Q  517 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 573  Q
     |||||||| |||||||| | |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1513971 aagtgtggtatctctcttacatgtggggttattctagcctcgatgtggacggtcccc 1513915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 43 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 1514071 - 1513915
Alignment:
Q  43 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 142  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  1514071 caagtatgagttatatatcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccttaaacccataaccttaaggttttgggtaa 1513972  T
Q  143 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 199  Q
     |||||||| |||||||| | |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1513971 aagtgtggtatctctcttacatgtggggttattctagcctcgatgtggacggtcccc 1513915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 422 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 70425 - 70277
Alignment:
Q  422 gtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtg 521  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  70425 gtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaatgttgaacatcttataagtaagaggacccataaacccactgccttaaggttttaggtaagagtg 70326  T
Q  522 tggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 570  Q
    ||  |||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||    
T  70325 tgacgtctatcttgcttgtgtggttgttctaacctcaatgcggacggtc 70277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 48 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 70425 - 70277
Alignment:
Q  48 gtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtg 147  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  70425 gtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaatgttgaacatcttataagtaagaggacccataaacccactgccttaaggttttaggtaagagtg 70326  T
Q  148 tggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 196  Q
    ||  |||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||    
T  70325 tgacgtctatcttgcttgtgtggttgttctaacctcaatgcggacggtc 70277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 41 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 8918922 - 8918764
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 140  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||  | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  8918922 tgcaagtgtgagttacatgtcccacatcagatagcagagtaaaggttgaacactttataagtaagaggacccataaacctattgacttaaggttttgggt 8918823  T
Q  141 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 199  Q
    |||||||||  |||| |||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  8918822 aagagtgtgacgtctttcttgcgtgtgtggttgttttaacctcgatgtggacggtcccc 8918764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 366 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 18371863 - 18371665
Alignment:
Q  366 ggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaac 465  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | || |   |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18371863 ggggggcacgataaagtgatggactcacacttgagggggagtgctgttgtgtagaagtgagttatatgtcacacatcggataaaatagtaaaggttgaac 18371764  T
Q  466 accttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 565  Q
    |     ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||| ||||| |||||| ||||||||||    
T  18371763 a----ttaagtaagaagacccataaaccca-tgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtgtctctcatttgtgcggttgctctagcttcgatgtgga 18371669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 409 - 567
Target Start/End: Complemental strand, 40579670 - 40579512
Alignment:
Q  409 ttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtt 508  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||  || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||    
T  40579670 ttggtttccaagtgtgaattatatgtttcatattggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacttattgctttaaggtt 40579571  T
Q  509 ttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacg 567  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||    
T  40579570 ttaggtaagagtgtggtgtctctattgcttgtacggttgttctatcctcgatgtggacg 40579512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 41 - 199
Target Start/End: Original strand, 5915872 - 5916025
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 140  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||| ||| ||||| |||    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5915872 tgcaagtgtgagttatatgtcctacattggataaaaatgtaaa-gtttaacacttta----taagaggacccataaactcattgccttaaggttttgggt 5915966  T
Q  141 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5915967 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 5916025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 415 - 573
Target Start/End: Original strand, 5915872 - 5916025
Alignment:
Q  415 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 514  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||| ||| ||||| |||    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5915872 tgcaagtgtgagttatatgtcctacattggataaaaatgtaaa-gtttaacacttta----taagaggacccataaactcattgccttaaggttttgggt 5915966  T
Q  515 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 573  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5915967 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 5916025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 41 - 197
Target Start/End: Original strand, 5420651 - 5420807
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 140  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||    
T  5420651 tgcaagtgtgtattatatgtcccacatcggatagaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggactcataaacccattgccttaaggttttttgt 5420750  T
Q  141 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 197  Q
    |||||||||  ||||| ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  5420751 aagagtgtgacgtctccctcacttgtgtggttgttcaagcctcgatgtggaccgtcc 5420807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 415 - 571
Target Start/End: Original strand, 5420651 - 5420807
Alignment:
Q  415 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 514  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||    
T  5420651 tgcaagtgtgtattatatgtcccacatcggatagaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggactcataaacccattgccttaaggttttttgt 5420750  T
Q  515 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 571  Q
    |||||||||  ||||| ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  5420751 aagagtgtgacgtctccctcacttgtgtggttgttcaagcctcgatgtggaccgtcc 5420807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 43 - 195
Target Start/End: Original strand, 30359611 - 30359763
Alignment:
Q  43 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 142  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  30359611 caagtgtgagttatatgtctcacatcagataaaagagtaaaagttgaacaccttataagtaagaggactcataaacccataaccttaagattttgggtaa 30359710  T
Q  143 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 195  Q
    |||||||||||||||||| ||| || |||||||||| | ||||||||||||||    
T  30359711 gagtgtggtgtctctcttacttatgcggttgttctaacttcgatgtggacggt 30359763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 41 - 196
Target Start/End: Original strand, 41972158 - 41972316
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtt---ttg 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| |||   |||    
T  41972158 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtgataggacccataaacccattgccataaagttttgttg 41972257  T
Q  138 ggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 196  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||    
T  41972258 ggtaagagtgtggcgtcactcttgcttgtgtggttgttccagcctcaatatggacggtc 41972316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 415 - 570
Target Start/End: Original strand, 41972158 - 41972316
Alignment:
Q  415 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtt---ttg 511  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| |||   |||    
T  41972158 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtgataggacccataaacccattgccataaagttttgttg 41972257  T
Q  512 ggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 570  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||    
T  41972258 ggtaagagtgtggcgtcactcttgcttgtgtggttgttccagcctcaatatggacggtc 41972316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 425 - 598
Target Start/End: Complemental strand, 18372142 - 18371969
Alignment:
Q  425 agttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtgg 524  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18372142 agttatatgtaccacatccaataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaactcattgctttaaggttttgggtaagagtgtgg 18372043  T
Q  525 tgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacgg-tcccctaggctcccctcactgacccaacag 598  Q
    ||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||| |||||   |||||||||| |||||||||||    
T  18372042 tgtttctctcgcttgtgcggttgctctagcctcaatgtgaacggttcccccgagctcccctca-tgacccaacag 18371969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 41 - 199
Target Start/End: Original strand, 45123006 - 45123164
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| |||||||||||| |||  |||||||||||||||    
T  45123006 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttaaacacct--taagtaagatgacccataaacctattttcttaaggttttgggt 45123103  T
Q  141 a--agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 199  Q
    |  |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  45123104 aagagagtgtggtgtctctcttatttgtggggttgttctaatctcgatgtggacggtcccc 45123164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 32 - 201
Target Start/End: Original strand, 6731895 - 6732055
Alignment:
Q  32 gtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaag 131  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  6731895 gtgttgttttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaa---------agtaagagaacccataaattcattgccttaag 6731985  T
Q  132 gttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccccta 201  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||| | |||||||    
T  6731986 gttttgagtaagagtgtggtgtctctcttgcttatgcggttgttctaacctcgatgtggatgatccccta 6732055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 366 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 18372463 - 18372342
Alignment:
Q  366 ggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaac 465  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18372463 ggggagcacgataaagtgatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgaaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaac 18372364  T
Q  466 accttataagtaagaggaccca 487  Q
    ||||||||||||||| ||||||    
T  18372363 accttataagtaagaagaccca 18372342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 382 - 563
Target Start/End: Original strand, 147794 - 147968
Alignment:
Q  382 tgatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaag 479  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| | |||||         
T  147794 tgatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatctgataaaaaagtaaatgttgaacaacatataa----- 147888  T
Q  480 aggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtg 563  Q
        |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| |||||    
T  147889 ----cccataaacctattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttacttgtgcagttgttctagcctcaatgtg 147968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 386 - 573
Target Start/End: Original strand, 6651476 - 6651652
Alignment:
Q  386 ggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacc 485  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |         |||||| |||    
T  6651476 ggactcacacttgaggggaggtgttgttttgcaagtg--agttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaaaa---------taagagaacc 6651564  T
Q  486 cataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 573  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| |||||||    
T  6651565 cataaattcattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcgattgttctaacctcgatgtggatggtcccc 6651652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 418 - 599
Target Start/End: Complemental strand, 32640682 - 32640506
Alignment:
Q  418 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 517  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||     || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32640682 aagtgtgagttatctgtctcacatcggataaaagagtaaaggttgaaca-----taggtaagaggaccgataaacccattgccttaaggttttgggtaag 32640588  T
Q  518 agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctag-gctcccctcactgacccaacaga 599  Q
    ||||| | ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||  |||||| | || |||||||||| ||||| ||||||    
T  32640587 agtgttgcgtctctcttgcttttgtgattgttctagcctcgatgtgagcggtccgccagagctcccctca-tgaccaaacaga 32640506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 366 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 18372905 - 18372785
Alignment:
Q  366 ggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaac 465  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||| | || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18372905 ggggagcacgataaagtgatggactcacacttgaggag-agtgttgttgtgaaagtgtgagttatatgtcacacatcggataaaatagtaaaggttgaac 18372807  T
Q  466 accttataagtaagaggaccca 487  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  18372806 accttataagtaagaggaccca 18372785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 44 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 32640682 - 32640542
Alignment:
Q  44 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 143  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||     || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32640682 aagtgtgagttatctgtctcacatcggataaaagagtaaaggttgaaca-----taggtaagaggaccgataaacccattgccttaaggttttgggtaag 32640588  T
Q  144 agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtg 189  Q
    ||||| | ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  32640587 agtgttgcgtctctcttgcttttgtgattgttctagcctcgatgtg 32640542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 43 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 45121811 - 45121663
Alignment:
Q  43 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 142  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||||| ||||    
T  45121811 caagtgtgagttgt-tgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgatcaccttataagtaagaggatccataaacctacagccttaaggttttgagtaa 45121713  T
Q  143 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggac 192  Q
    ||||||| | |||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  45121712 gagtgtgatatctctcttacttatggggttgttctagcctcgatgtggac 45121663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 366 - 519
Target Start/End: Complemental strand, 18373139 - 18372988
Alignment:
Q  366 ggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgca-agtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaa 464  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | || | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18373139 ggggagcacgataaagtgatggactcacacttgagatggagtgttgttgtgtacagtgtgatttatatgtcccacttcggataaaatagtaaaggttgaa 18373040  T
Q  465 caccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagag 519  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||   ||||||||||||||||    
T  18373039 caccttataaataagaggactcataaactcattgcc---aggttttgggtaagag 18372988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 419 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 18380171 - 18380020
Alignment:
Q  419 agtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaaga 518  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||| | ||||||||||||| ||||||    
T  18380171 agtgtgagttatatatcccacatcgaataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagggggcctataaacccactaccttaaggttttgagtaaga 18380072  T
Q  519 gtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 572  Q
    ||||||||   |||||||||||| | || ||||||| ||||||||||| |||||    
T  18380071 gtgtggtg--cctcttgcttgtgcgattcttctagcttcgatgtggacagtccc 18380020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 45 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 18380171 - 18380020
Alignment:
Q  45 agtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaaga 144  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||| | ||||||||||||| ||||||    
T  18380171 agtgtgagttatatatcccacatcgaataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagggggcctataaacccactaccttaaggttttgagtaaga 18380072  T
Q  145 gtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 198  Q
    ||||||||   |||||||||||| | || ||||||| ||||||||||| |||||    
T  18380071 gtgtggtg--cctcttgcttgtgcgattcttctagcttcgatgtggacagtccc 18380020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 41 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 4154824 - 4154615
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||  ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||    
T  4154824 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatctgatagaaaagtggaggttgaacactttataagtgaaaggacccataaactcattgccccaaggttttgggt 4154725  T
Q  141 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtggtatcagagccccg 240  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||| |||| ||||||   ||||||   | ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||  |    
T  4154724 aagagtgtggcgtctctc--gcttgtgtggttgctctggcctagatgtgagtggtccctcggactcccttca-tgacccaacagtggtatcaaagccgag 4154628  T
Q  241 gttcgacgaaggg 253  Q
     ||||||||||||    
T  4154627 tttcgacgaaggg 4154615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 32 - 199
Target Start/End: Original strand, 6651496 - 6651652
Alignment:
Q  32 gtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaag 131  Q
    |||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |         |||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  6651496 gtgttgttttgcaagtg--agttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaaaa---------taagagaacccataaattcattgccttaag 6651584  T
Q  132 gttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| |||||||    
T  6651585 gttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcgattgttctaacctcgatgtggatggtcccc 6651652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 48 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 18371807 - 18371665
Alignment:
Q  48 gtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtg 147  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18371807 gtgagttatatgtcacacatcggataaaatagtaaaggttgaaca----ttaagtaagaagacccataaaccca-tgccttaaggttttgggtaagagtg 18371713  T
Q  148 tggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 195  Q
    |||||| |||||   ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||    
T  18371712 tggtgtgtctctcatttgtgcggttgctctagcttcgatgtggacggt 18371665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 35 - 199
Target Start/End: Original strand, 32305478 - 32305635
Alignment:
Q  35 ttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtt 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||    
T  32305478 ttggtttgcaagtgtgagttatatgtc-------ggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaagacctataaacccattaccttaagatt 32305570  T
Q  135 ttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 199  Q
    |||| ||||||||||| |||| | || ||| ||  ||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  32305571 ttggataagagtgtggcgtctttattacttatgcagttgttctaaccttgatgtggacggtcccc 32305635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 409 - 573
Target Start/End: Original strand, 32305478 - 32305635
Alignment:
Q  409 ttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtt 508  Q
    |||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||    
T  32305478 ttggtttgcaagtgtgagttatatgtc-------ggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaagacctataaacccattaccttaagatt 32305570  T
Q  509 ttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 573  Q
    |||| ||||||||||| |||| | || ||| ||  ||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  32305571 ttggataagagtgtggcgtctttattacttatgcagttgttctaaccttgatgtggacggtcccc 32305635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 415 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 4154824 - 4154678
Alignment:
Q  415 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 514  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||  ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||    
T  4154824 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatctgatagaaaagtggaggttgaacactttataagtgaaaggacccataaactcattgccccaaggttttgggt 4154725  T
Q  515 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtg 563  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||| |||| ||||||    
T  4154724 aagagtgtggcgtctctc--gcttgtgtggttgctctggcctagatgtg 4154678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 41 - 189
Target Start/End: Original strand, 147829 - 147968
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| | |||||         |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  147829 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatctgataaaaaagtaaatgttgaacaacatataa---------cccataaacctattgccttaaggttttgggt 147919  T
Q  141 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtg 189  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| |||||    
T  147920 aagagtgtggtgtctctcttacttgtgcagttgttctagcctcaatgtg 147968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 41 - 192
Target Start/End: Original strand, 9507777 - 9507933
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcc--cacatcggataaaat---agtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttt 135  Q
    |||||||||||||||||| |||  || || ||||||||    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  9507777 tgcaagtgtgagttatatctcctccatattggataaaagtacagtaaaggttgaataccttataagtaagaggactcataaacccattaccttaaggttt 9507876  T
Q  136 tgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggac 192  Q
    ||||||||||||||| |||||| |  ||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  9507877 tgggtaagagtgtggcgtctctatctcttatatggttgttcaagcctcgatgtggac 9507933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 415 - 566
Target Start/End: Original strand, 9507777 - 9507933
Alignment:
Q  415 tgcaagtgtgagttatatgtcc--cacatcggataaaat---agtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttt 509  Q
    |||||||||||||||||| |||  || || ||||||||    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  9507777 tgcaagtgtgagttatatctcctccatattggataaaagtacagtaaaggttgaataccttataagtaagaggactcataaacccattaccttaaggttt 9507876  T
Q  510 tgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggac 566  Q
    ||||||||||||||| |||||| |  ||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  9507877 tgggtaagagtgtggcgtctctatctcttatatggttgttcaagcctcgatgtggac 9507933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 64 - 178
Target Start/End: Original strand, 9609108 - 9609222
Alignment:
Q  64 acatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgct 163  Q
    ||||| |||| || ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  9609108 acatcagatagaaaagtaaaggttgaacatcttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaatgttttcggtaagagtgtggcgtctctcttgct 9609207  T
Q  164 tgtgtggttgttcta 178  Q
     ||||||||||||||    
T  9609208 agtgtggttgttcta 9609222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 438 - 552
Target Start/End: Original strand, 9609108 - 9609222
Alignment:
Q  438 acatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgct 537  Q
    ||||| |||| || ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  9609108 acatcagatagaaaagtaaaggttgaacatcttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaatgttttcggtaagagtgtggcgtctctcttgct 9609207  T
Q  538 tgtgtggttgttcta 552  Q
     ||||||||||||||    
T  9609208 agtgtggttgttcta 9609222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 41 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 9620834 - 9620625
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 140  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| | |||| || |||| | ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||   |    
T  9620834 tgcaagtgtgagttatatgtctcacaacagatagaaaagtagaagttgatcactttataagtgagaggacccataaactcattgccttaagatttt--at 9620737  T
Q  141 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtggtatcagagccccg 240  Q
    |||||| || |||||||||  |||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||  |||||||||||    |    
T  9620736 aagagtttgatgtctctctcacttgtgtggttgctcaggcctggatgtggacggtcccccgggctcccctc-gtgacccaacgatggtatcagagttgtg 9620638  T
Q  241 gttcgacgaaggg 253  Q
    |||||||||||||    
T  9620637 gttcgacgaaggg 9620625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 370 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 18372574 - 18372485
Alignment:
Q  370 agcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaagg 459  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18372574 agcacgataaagtgatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgaaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaagg 18372485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 407 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 41416335 - 41416251
Alignment:
Q  407 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacc 493  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  41416335 tgttggtttgcaagtg--agttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaacc 41416251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 33 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 41416335 - 41416251
Alignment:
Q  33 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacc 119  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  41416335 tgttggtttgcaagtg--agttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaacc 41416251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 418 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 43274934 - 43274824
Alignment:
Q  418 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 517  Q
    |||||||||||||||||  |||||| ||||||| ||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||    
T  43274934 aagtgtgagttatatgtttcacatcagataaaagagtaaaggttgaatatattataagtaagaggacccataaacctattgtcttaaggttttgagtaag 43274835  T
Q  518 agtgtggtgtc 528  Q
    |||||||||||    
T  43274834 agtgtggtgtc 43274824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 44 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 43274934 - 43274824
Alignment:
Q  44 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 143  Q
    |||||||||||||||||  |||||| ||||||| ||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||    
T  43274934 aagtgtgagttatatgtttcacatcagataaaagagtaaaggttgaatatattataagtaagaggacccataaacctattgtcttaaggttttgagtaag 43274835  T
Q  144 agtgtggtgtc 154  Q
    |||||||||||    
T  43274834 agtgtggtgtc 43274824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 382 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 4154472 - 4154270
Alignment:
Q  382 tgatggactcacacttgagggggag--tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaag 479  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||| | ||||| |||||||||||||||| ||||| |||| || |||  ||||||||||| |||||||| ||    
T  4154472 tgatggactcacacttgagggggaaattgttg-tgtgcaaatgtgagttatatgtcctacatcagatagaaaagtggaggttgaacactttataagtgag 4154374  T
Q  480 aggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggct 579  Q
    || |||||||||| |||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||||   |||| |||||| ||| |||| |||||||  ||||||| || ||    
T  4154373 ag-acccataaactcattgccttaatattttgggtaagtgtgtgatgtctctctcaattgtttggttgctctggcctagatgtgggtggtccccgagact 4154275  T
Q  580 cccct 584  Q
    |||||    
T  4154274 cccct 4154270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #100
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 119 - 212
Target Start/End: Original strand, 41129066 - 41129159
Alignment:
Q  119 ccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctca 212  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41129066 ccattgtcttaaggttttgggtatgagtgtggtgtctctcttacttgtgtggttgttcaaacctcgatgtggacggtcccccaggctcccctca 41129159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #101
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 493 - 586
Target Start/End: Original strand, 41129066 - 41129159
Alignment:
Q  493 ccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctca 586  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41129066 ccattgtcttaaggttttgggtatgagtgtggtgtctctcttacttgtgtggttgttcaaacctcgatgtggacggtcccccaggctcccctca 41129159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #102
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 43 - 159
Target Start/End: Original strand, 8794113 - 8794229
Alignment:
Q  43 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 142  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | |  ||||||||||||||| |    
T  8794113 caagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaagaataaatgttgaacatcttataagtaagaggactcataaacctaatatcttaaggttttgggtga 8794212  T
Q  143 gagtgtggtgtctctct 159  Q
    ||||| |||||||||||    
T  8794213 gagtgcggtgtctctct 8794229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #103
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 417 - 533
Target Start/End: Original strand, 8794113 - 8794229
Alignment:
Q  417 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 516  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | |  ||||||||||||||| |    
T  8794113 caagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaagaataaatgttgaacatcttataagtaagaggactcataaacctaatatcttaaggttttgggtga 8794212  T
Q  517 gagtgtggtgtctctct 533  Q
    ||||| |||||||||||    
T  8794213 gagtgcggtgtctctct 8794229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #104
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 415 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 9620834 - 9620666
Alignment:
Q  415 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 514  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| | |||| || |||| | ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||   |    
T  9620834 tgcaagtgtgagttatatgtctcacaacagatagaaaagtagaagttgatcactttataagtgagaggacccataaactcattgccttaagatttt--at 9620737  T
Q  515 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctc 585  Q
    |||||| || |||||||||  |||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  9620736 aagagtttgatgtctctctcacttgtgtggttgctcaggcctggatgtggacggtcccccgggctcccctc 9620666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #105
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 490 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 40579352 - 40579269
Alignment:
Q  490 aacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 573  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  40579352 aacccattgccttaggattttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggactgtcccc 40579269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #106
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 116 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 40579352 - 40579269
Alignment:
Q  116 aacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 199  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  40579352 aacccattgccttaggattttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggactgtcccc 40579269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #107
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 123 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 8919220 - 8919093
Alignment:
Q  123 tgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaac 222  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| |||||  |||| ||||    
T  8919220 tgccttaaggttttggataagagtgtggtgtctcttttgcttgtgtggttgttctagcttcgatgtggacggtccccca-gcttccctc-gtgactcaac 8919123  T
Q  223 agtggtatcagagccccggttcgacgaaggg 253  Q
    | ||||||||||| ||| |||| ||||||||    
T  8919122 aatggtatcagagtccc-gttcaacgaaggg 8919093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #108
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 45 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 18373085 - 18372988
Alignment:
Q  45 agtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaaga 144  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||   |||||||||||||||    
T  18373085 agtgtgatttatatgtcccacttcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataaataagaggactcataaactcattgcc---aggttttgggtaaga 18372989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #109
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 41 - 190
Target Start/End: Original strand, 12283873 - 12284021
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 140  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| || ||||||| |||||| |||||| | |||| |||||| | ||| ||||||| ||  | ||||||||||||| |    
T  12283873 tgcaagtgtaagttatatgtcccacgtcagataaaaaagtaaatgttgaatatcttaaaagtaaaatgacacataaactcaa-gtcttaaggttttggat 12283971  T
Q  141 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgg 190  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12283972 aagagtgtagtgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctctatgtgg 12284021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #110
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 415 - 564
Target Start/End: Original strand, 12283873 - 12284021
Alignment:
Q  415 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 514  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| || ||||||| |||||| |||||| | |||| |||||| | ||| ||||||| ||  | ||||||||||||| |    
T  12283873 tgcaagtgtaagttatatgtcccacgtcagataaaaaagtaaatgttgaatatcttaaaagtaaaatgacacataaactcaa-gtcttaaggttttggat 12283971  T
Q  515 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgg 564  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12283972 aagagtgtagtgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctctatgtgg 12284021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #111
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 44 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 18372854 - 18372785
Alignment:
Q  44 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggaccca 113  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18372854 aagtgtgagttatatgtcacacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggaccca 18372785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #112
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 497 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 8919220 - 8919144
Alignment:
Q  497 tgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 573  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8919220 tgccttaaggttttggataagagtgtggtgtctcttttgcttgtgtggttgttctagcttcgatgtggacggtcccc 8919144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #113
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 417 - 523
Target Start/End: Complemental strand, 18372758 - 18372656
Alignment:
Q  417 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 516  Q
    ||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||    
T  18372758 caagtgtgatttatatgttccatttcggataaaatagtaaaggttgaaca-cttataagtaagaggactcataaacccattgcc---aggttttgggtaa 18372663  T
Q  517 gagtgtg 523  Q
    |||||||    
T  18372662 gagtgtg 18372656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #114
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 43 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 18372758 - 18372656
Alignment:
Q  43 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 142  Q
    ||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||    
T  18372758 caagtgtgatttatatgttccatttcggataaaatagtaaaggttgaaca-cttataagtaagaggactcataaacccattgcc---aggttttgggtaa 18372663  T
Q  143 gagtgtg 149  Q
    |||||||    
T  18372662 gagtgtg 18372656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #115
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 41 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 4154438 - 4154270
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 140  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||| |||| || |||  ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||| |||||||||||  ||||||||    
T  4154438 tgcaaatgtgagttatatgtcctacatcagatagaaaagtggaggttgaacactttataagtgagag-acccataaactcattgccttaatattttgggt 4154340  T
Q  141 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccct 210  Q
    ||| ||||| |||||||||   |||| |||||| ||| |||| |||||||  ||||||| || |||||||    
T  4154339 aagtgtgtgatgtctctctcaattgtttggttgctctggcctagatgtgggtggtccccgagactcccct 4154270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #116
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 44 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 18372411 - 18372342
Alignment:
Q  44 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggaccca 113  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18372411 aagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaagaccca 18372342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #117
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 418 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 3037865 - 3037776
Alignment:
Q  418 aagtgtgagttatat--gtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaag 505  Q
    |||||||||||||||  || ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  3037865 aagtgtgagttatatatgttccacatcggatgaaatagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggactcataaacccattgtcttaag 3037776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #118
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 44 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 3037865 - 3037776
Alignment:
Q  44 aagtgtgagttatat--gtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaag 131  Q
    |||||||||||||||  || ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  3037865 aagtgtgagttatatatgttccacatcggatgaaatagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggactcataaacccattgtcttaag 3037776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #119
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 419 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 43398225 - 43398077
Alignment:
Q  419 agtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaa---gaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 515  Q
    |||||||||||||| || || |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||    
T  43398225 agtgtgagttatatatctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataaataagaggaggacccataaattcattgccttaaagttttggata 43398126  T
Q  516 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgg 564  Q
    ||| ||||| || ||| || || ||| ||||| |||| |||||||||||    
T  43398125 agaatgtggcgtttcttttactagtgcggttgctctaacctcgatgtgg 43398077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #120
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 45 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 43398225 - 43398077
Alignment:
Q  45 agtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaa---gaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 141  Q
    |||||||||||||| || || |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||    
T  43398225 agtgtgagttatatatctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataaataagaggaggacccataaattcattgccttaaagttttggata 43398126  T
Q  142 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgg 190  Q
    ||| ||||| || ||| || || ||| ||||| |||| |||||||||||    
T  43398125 agaatgtggcgtttcttttactagtgcggttgctctaacctcgatgtgg 43398077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #121
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 152 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 3038016 - 3037927
Alignment:
Q  152 gtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggct-cccctcactgacccaacagtggtatcagagccccg 240  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3038016 gtctctctatcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgagctccccctcagtgacccaacagtggtatcagagccccg 3037927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #122
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 425 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 25561792 - 25561729
Alignment:
Q  425 agttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccat 488  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25561792 agttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagagtacccat 25561729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #123
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 51 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 25561792 - 25561729
Alignment:
Q  51 agttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccat 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25561792 agttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagagtacccat 25561729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #124
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 141 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 18372342 - 18372216
Alignment:
Q  141 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacgg-tcccctaggctcccctcactgacccaacagtggtatcagagcccc 239  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | ||| |||||||||||||| |||||   |||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||     
T  18372342 aagagtgtggtgtctctctcgcttgtgcggttgctttagtctcgatgtggacggttcccccgagctcccctca-tgacccaatagtggtatcagag-cct 18372245  T
Q  240 ggttcgacgaagggagcgaccgaggcagc 268  Q
    |||||||| |||||  |||||||||||||    
T  18372244 ggttcgacaaagggtacgaccgaggcagc 18372216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #125
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 46 - 146
Target Start/End: Original strand, 20130454 - 20130553
Alignment:
Q  46 gtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagag 145  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||    
T  20130454 gtgtgagatatatgtctcacatcggataaaagagtaaaagttgaacacctt-taagtaagatgatccataaacccataaccttacggttttaggtaagag 20130552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #126
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 420 - 520
Target Start/End: Original strand, 20130454 - 20130553
Alignment:
Q  420 gtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagag 519  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||    
T  20130454 gtgtgagatatatgtctcacatcggataaaagagtaaaagttgaacacctt-taagtaagatgatccataaacccataaccttacggttttaggtaagag 20130552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #127
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 41 - 173
Target Start/End: Original strand, 5274775 - 5274907
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 140  Q
    ||||||| |||||||||||| | |||| | |||||| || | ||||||||||| |||||| |  || ||||||||||  |||||||||||| ||||| ||    
T  5274775 tgcaagtatgagttatatgttctacattgaataaaaaaggagaggttgaacactttataaatgggaagacccataaaatcattgccttaagattttgagt 5274874  T
Q  141 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttg 173  Q
    ||||||||| ||||||| | |||||||| ||||    
T  5274875 aagagtgtgatgtctctatcgcttgtgttgttg 5274907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #128
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 415 - 547
Target Start/End: Original strand, 5274775 - 5274907
Alignment:
Q  415 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 514  Q
    ||||||| |||||||||||| | |||| | |||||| || | ||||||||||| |||||| |  || ||||||||||  |||||||||||| ||||| ||    
T  5274775 tgcaagtatgagttatatgttctacattgaataaaaaaggagaggttgaacactttataaatgggaagacccataaaatcattgccttaagattttgagt 5274874  T
Q  515 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttg 547  Q
    ||||||||| ||||||| | |||||||| ||||    
T  5274875 aagagtgtgatgtctctatcgcttgtgttgttg 5274907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #129
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 492 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 20995497 - 20995404
Alignment:
Q  492 cccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctc 585  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| ||| |||| ||| |||  ||||||   ||||||||||    
T  20995497 cccattgccttaaggttttgggtaagaatgtggtgtctctctcacttgtgtggttgctctggcctagatatgggtggtccctctggctcccctc 20995404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #130
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 118 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 20995497 - 20995404
Alignment:
Q  118 cccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctc 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| ||| |||| ||| |||  ||||||   ||||||||||    
T  20995497 cccattgccttaaggttttgggtaagaatgtggtgtctctctcacttgtgtggttgctctggcctagatatgggtggtccctctggctcccctc 20995404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #131
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 44 - 208
Target Start/End: Original strand, 40991756 - 40991920
Alignment:
Q  44 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt-aa 142  Q
    |||||||||||| | ||||||||| |  || || |||  ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||    
T  40991756 aagtgtgagttagaagtcccacattgcttagaaaagtggaggttgaacacttcataagtgagaggacccataaacccaatgcctcaaggttttgggttaa 40991855  T
Q  143 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctccc 208  Q
    || |||||||||   ||  | |||||||||| ||||| | | ||||||| | ||||||||||||||    
T  40991856 ga-tgtggtgtccaactcacctgtgtggttgctctaggcccaatgtggatgatcccctaggctccc 40991920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #132
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 418 - 582
Target Start/End: Original strand, 40991756 - 40991920
Alignment:
Q  418 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt-aa 516  Q
    |||||||||||| | ||||||||| |  || || |||  ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||    
T  40991756 aagtgtgagttagaagtcccacattgcttagaaaagtggaggttgaacacttcataagtgagaggacccataaacccaatgcctcaaggttttgggttaa 40991855  T
Q  517 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctccc 582  Q
    || |||||||||   ||  | |||||||||| ||||| | | ||||||| | ||||||||||||||    
T  40991856 ga-tgtggtgtccaactcacctgtgtggttgctctaggcccaatgtggatgatcccctaggctccc 40991920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #133
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 509 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 43274699 - 43274635
Alignment:
Q  509 ttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 573  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  43274699 ttgggtatgagtgtggtgtctctcttacttatggggttgttccagcctcgatgtggacggtcccc 43274635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #134
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 135 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 43274699 - 43274635
Alignment:
Q  135 ttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 199  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  43274699 ttgggtatgagtgtggtgtctctcttacttatggggttgttccagcctcgatgtggacggtcccc 43274635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #135
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 526 - 598
Target Start/End: Complemental strand, 3038016 - 3037943
Alignment:
Q  526 gtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggct-cccctcactgacccaacag 598  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||| |||||||||||    
T  3038016 gtctctctatcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgagctccccctcagtgacccaacag 3037943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #136
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 122 - 179
Target Start/End: Original strand, 16524446 - 16524503
Alignment:
Q  122 ttgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctag 179  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  16524446 ttgctttaaggttttgagtaagagtgtggtgtctctcttacttgtgtggttgctctag 16524503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #137
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 496 - 553
Target Start/End: Original strand, 16524446 - 16524503
Alignment:
Q  496 ttgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctag 553  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  16524446 ttgctttaaggttttgagtaagagtgtggtgtctctcttacttgtgtggttgctctag 16524503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #138
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 18372526 - 18372485
Alignment:
Q  44 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaagg 85  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18372526 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaagg 18372485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #139
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 451 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 18373292 - 18373236
Alignment:
Q  451 tagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggt 507  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  18373292 tagtaaaggttgaacaccttataaataagaggatccattaacccattgtcttaaggt 18373236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #140
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 77 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 18373292 - 18373236
Alignment:
Q  77 tagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggt 133  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  18373292 tagtaaaggttgaacaccttataaataagaggatccattaacccattgtcttaaggt 18373236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #141
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 366 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 43274776 - 43274699
Alignment:
Q  366 ggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacat 441  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||  || | |||||||||||||||| || |||||    
T  43274776 ggggagcacgataaagtgatggactcacacttgagggacagtgttgttgtgtacaagtgtgagttatatatctcacat 43274699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #142
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 469 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 40417820 - 40417733
Alignment:
Q  469 ttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcct 556  Q
    |||||||||||| ||| | |||| ||||||| ||||| |||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||    
T  40417820 ttataagtaagatgactcgtaaatccattgcgttaagattttggataaaagtgtggtgtctctctcacttgtgtgattgctcttgcct 40417733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #143
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 95 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 40417820 - 40417733
Alignment:
Q  95 ttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcct 182  Q
    |||||||||||| ||| | |||| ||||||| ||||| |||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||    
T  40417820 ttataagtaagatgactcgtaaatccattgcgttaagattttggataaaagtgtggtgtctctctcacttgtgtgattgctcttgcct 40417733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #144
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 515 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 18372342 - 18372288
Alignment:
Q  515 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 569  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||    
T  18372342 aagagtgtggtgtctctctcgcttgtgcggttgctttagtctcgatgtggacggt 18372288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #145
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 486 - 523
Target Start/End: Complemental strand, 12156745 - 12156708
Alignment:
Q  486 cataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 523  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12156745 cataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 12156708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #146
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 112 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 12156745 - 12156708
Alignment:
Q  112 cataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 149  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12156745 cataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 12156708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #147
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 415 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 20995559 - 20995502
Alignment:
Q  415 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttat 472  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||  ||||||||||| ||||    
T  20995559 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcagataaaaaagtggaggttgaacactttat 20995502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #148
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 41 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 20995559 - 20995502
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttat 98  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||  ||||||||||| ||||    
T  20995559 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcagataaaaaagtggaggttgaacactttat 20995502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #149
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 41 - 118
Target Start/End: Original strand, 33831978 - 33832055
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaac 118  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| | | | | || |||| | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  33831978 tgcaagtgtgagttatatgtctcacgttgaagagaaaagtagaagttgaacactttataagtaagaggacctataaac 33832055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #150
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 415 - 492
Target Start/End: Original strand, 33831978 - 33832055
Alignment:
Q  415 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaac 492  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| | | | | || |||| | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  33831978 tgcaagtgtgagttatatgtctcacgttgaagagaaaagtagaagttgaacactttataagtaagaggacctataaac 33832055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #151
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 177 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 3038074 - 3038020
Alignment:
Q  177 tagcctcgatgtggacggtcccctaggct-cccctcactgacccaacagtggtat 230  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  3038074 tagcctcgatgtggacggtcccccgagctccccctcagtgacccaacagtggtat 3038020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #152
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 221 - 304
Target Start/End: Original strand, 9608932 - 9609017
Alignment:
Q  221 acagtggtatcagagccccggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtc--attgcgcagaaagccgcaacagcggtacaag 304  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||  ||||||||| | | ||||   ||||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  9608932 acagtggtatcagtgccccggttcgacaaagggtacgaccgaggaaaccggtccgtttgcgcataaagcagcaacggcggtacaag 9609017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #153
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 140
Target Start/End: Original strand, 11442911 - 11442952
Alignment:
Q  99 aagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 140  Q
    |||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  11442911 aagtgagaggacccataaactcaatgccttaaggttttgggt 11442952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #154
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 473 - 514
Target Start/End: Original strand, 11442911 - 11442952
Alignment:
Q  473 aagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 514  Q
    |||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  11442911 aagtgagaggacccataaactcaatgccttaaggttttgggt 11442952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #155
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 415 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 18645745 - 18645713
Alignment:
Q  415 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggata 447  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18645745 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggata 18645713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #156
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 41 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 18645745 - 18645713
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggata 73  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18645745 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggata 18645713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 343; Significance: 0; HSPs: 149)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 343; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 5543165 - 5542625
Alignment:
Q  32 gtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaag 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  5543165 gtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatccgataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaacctattgccttaag 5543066  T
Q  132 gttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtggtatc 231  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| || |  ||||||| || ||| ||||||||||||||    
T  5543065 attttgggtaagagtgtggtgtctctattgcttgtgcggttgttcaagcctcgatgtggacggtaccttgagctcccccca-tgatccaacagtggtatc 5542967  T
Q  232 agagccccggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtcattgcgcagaaagccgcaacagcggtacaagtagcaagtggctccttgtgcaggaacg 331  Q
    |||||  ||||||||||| |   || ||||||||||  |||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||     
T  5542966 agagcttcggttcgacgacgaatgcaaccgaggcagtcggtcgttgtgcagaaagccgcaacggcggtacaagcaacaagtggctccttgtgcaggaaca 5542867  T
Q  332 gcgatacaggcaaagtcaaaagcttccgctctaagggg-agcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttat 430  Q
    ||||||||||||||||  | ||||||||||  |||||| |||| | | ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5542866 gcgatacaggcaaagt-tagagcttccgcttgaaggggaagcatgatgaatagatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttat 5542768  T
Q  431 atgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctc 530  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5542767 atgtcccatatcgaataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacctattgccttaaggtttttggtaagagtgtggtgtctc 5542668  T
Q  531 tcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 573  Q
    ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||    
T  5542667 tcttgcttgtgcggttgttcaagtctcgatgtggacggtcccc 5542625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 33 - 566
Target Start/End: Complemental strand, 14745833 - 14745300
Alignment:
Q  33 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14745833 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacattggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 14745734  T
Q  133 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtggtatca 232  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||||    |||||||||||||||||||    
T  14745733 ttttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcaagtgtggttgttctagcctcgatgtggacagtcccccgagctccccctcgtgacccaacagtggtatca 14745634  T
Q  233 gagccccggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtcattgcgcagaaagccgcaacagcggtacaagtagcaagtggctccttgtgcaggaacgg 332  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| | || || ||||||||||||||||  | ||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  14745633 gagccccggttcgatgaagggtgcgaccaaggcagccgatcgttacgcagaaagccgcaacgacagtacaagcaacaagtggctccttgtgcaggaacgg 14745534  T
Q  333 cgatacaggcaaagtcaaaagcttccgctctaa-ggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttata 431  Q
    |||||||| |||||| || ||||||||||  || |||||||| | | ||  |||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14745533 cgatacagacaaagt-aagagcttccgcttgaagggggagcatgatgaatagatgtactcaaacttga-ggggagtgttggtttgcaactgtgagttata 14745436  T
Q  432 tgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctct 531  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14745435 tgtcccacatcgaataaaatagtaatggttgaacatcttgtaagtatgaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggcgtctct 14745336  T
Q  532 cttgcttgt-gtggttgttctagcctcgatgtggac 566  Q
    ||||   || ||||||||||||||||||||||||||    
T  14745335 cttgtaagtggtggttgttctagcctcgatgtggac 14745300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 49 - 572
Target Start/End: Original strand, 29676543 - 29677065
Alignment:
Q  49 tgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgt 148  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||| |||||||| |||| |||||||||| |||||||||      ||||||||||||||    
T  29676543 tgagttatatgtctcacattggataaaagagtaaagattgaacacattataagtgagagaacccataaactcattgcctt------ttgggtaagagtgt 29676636  T
Q  149 ggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtggtatcagagccccggttcgacg 248  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| | ||||||||||||||||||||    ||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  29676637 ggtgtctctcttgcttgtggggttattcaaacctcgatgtggacggtccccggaactcccc--agtgacccaacagtggtatcagagccccggttcaacg 29676734  T
Q  249 aagggagcgaccgaggcagctggtca-ttgcgcagaaagccgcaacagcggtacaagtagcaagtggctccttgtgcaggaacggcgatacaggcaaagt 347  Q
    |||||   ||| ||||| || | ||| |||||||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||| |||| ||    
T  29676735 aagggtatgactgaggccgccgatcagttgcgcagaaagcaacaacgacagtacaagcagcaagtggctccttgtgcagcaacggaaatacaagcaa-gt 29676833  T
Q  348 caaaagcttccgctctaaggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgga 445  Q
     ||||||||||| |||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  29676834 aaaaagcttccggtctggggggagcacgataaagtgatggactcacacttgagggggtgtgttgttgtgtgcaggtgtgagttatatgtcccacatcgga 29676933  T
Q  446 taaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga-----cccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgt 540  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||| || ||||||     ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||  ||||    
T  29676934 taaaagagtaaaggtttaacaccttataggtgagaggagaagacccataaacccattgccttaaggctttaagtaagagtgtggtgtctctcttaattgt 29677033  T
Q  541 gtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 572  Q
    | |||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  29677034 ggggttgttccaacctcgatgtggatggtccc 29677065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 182; E-Value: 5e-98
Query Start/End: Original strand, 32 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 36178772 - 36178513
Alignment:
Q  32 gtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaag 131  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36178772 gtgttagtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaag 36178673  T
Q  132 gttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtggtatc 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||   ||| |||||  |||||||| |||||||||    
T  36178672 gttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctctatgtggacgatcccccgcgct-ccctc-gtgacccaatagtggtatc 36178575  T
Q  232 agagccccggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtca-ttgcgcagaaagccgcaa 292  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||  | ||||| ||||||||||||| ||||    
T  36178574 agagccccggttcgacgaagggtgcgaccaaggccaccggtcagttgcgcagaaagcagcaa 36178513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 383 - 571
Target Start/End: Original strand, 37106156 - 37106344
Alignment:
Q  383 gatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagg 482  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37106156 gatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagg 37106255  T
Q  483 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 571  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  37106256 acccataaacccatttccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtttctcttgcttgtgcgattgttctagcctcgatgtggacggtcc 37106344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 37 - 265
Target Start/End: Original strand, 37105920 - 37106147
Alignment:
Q  37 ggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtttt 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  37105920 ggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgaataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaggggacccataaactcattgccttaagatttt 37106019  T
Q  137 gggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtggtatcagagc 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  37106020 gggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtacggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgagctcccct-tgtgacccaacagtggtatcagagc 37106118  T
Q  237 cccggttcgacgaagggagcgaccgaggc 265  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  37106119 cccggttcgacgaagggtgcgactgaggc 37106147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 33 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 41283641 - 41283449
Alignment:
Q  33 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 132  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  41283641 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccatatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaagg 41283542  T
Q  133 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagt 225  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||    
T  41283541 ttttaggtaagagtgtggcgtctctcttgtttgtgtggttgttctagccttgatgtggacggtcccccatgctcccctcacttacccaacagt 41283449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 406 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 36178772 - 36178605
Alignment:
Q  406 gtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaag 505  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36178772 gtgttagtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaag 36178673  T
Q  506 gttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 573  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  36178672 gttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctctatgtggacgatcccc 36178605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 407 - 598
Target Start/End: Complemental strand, 41283641 - 41283450
Alignment:
Q  407 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 506  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  41283641 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccatatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaagg 41283542  T
Q  507 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacag 598  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||    
T  41283541 ttttaggtaagagtgtggcgtctctcttgtttgtgtggttgttctagccttgatgtggacggtcccccatgctcccctcacttacccaacag 41283450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 150; E-Value: 6e-79
Query Start/End: Original strand, 32 - 197
Target Start/End: Original strand, 37106179 - 37106344
Alignment:
Q  32 gtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaag 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  37106179 gtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccatttccttaag 37106278  T
Q  132 gttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 197  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  37106279 gttttgggtaagagtgtggtgtttctcttgcttgtgcgattgttctagcctcgatgtggacggtcc 37106344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 148; E-Value: 9e-78
Query Start/End: Original strand, 43 - 270
Target Start/End: Original strand, 6421387 - 6421612
Alignment:
Q  43 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 142  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  6421387 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaactcattgccttgaggttttgggtaa 6421486  T
Q  143 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtggtatcagagccccggt 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||    
T  6421487 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagtctcgatgtggacggtcccccgagctcccctc-gtgacccaacagtggtatcagagcacc-gt 6421584  T
Q  243 tcgacgaagggagcgaccgaggcagctg 270  Q
    ||||| |||||  |||| |||| |||||    
T  6421585 tcgacaaagggtacgactgagggagctg 6421612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 407 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 14745833 - 14745667
Alignment:
Q  407 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 506  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14745833 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacattggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 14745734  T
Q  507 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 573  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14745733 ttttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcaagtgtggttgttctagcctcgatgtggacagtcccc 14745667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 41 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 35580881 - 35580671
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35580881 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaacaataaatgttgaacaccttataagtgagaggacc-ataaacccattgccttaaggttttgggt 35580783  T
Q  141 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtggtatcagagccccg 240  Q
    ||||||| || |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| || |||||||| | ||||||||||||||||    
T  35580782 aagagtgcggcgtctctcttgtttgtggggttgttctagcctcgatgtggacggtccccctgactcccc-caatgacccaataatggtatcagagccccg 35580684  T
Q  241 gttcgacgaaggg 253  Q
    |||||||||||||    
T  35580683 gttcgacgaaggg 35580671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 41 - 253
Target Start/End: Original strand, 42514649 - 42514859
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 140  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  42514649 tgcaagtgtgagttatatgtcctacatcagatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccatcgccttaagattttgggt 42514748  T
Q  141 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtggtatcagagccccg 240  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||  |||||||||||||||||||||| |||     
T  42514749 aagagtgtggcgtctctcttacttgtggggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgagctcccctc-gtgacccaacagtggtatcagag-ccct 42514846  T
Q  241 gttcgacgaaggg 253  Q
    |||||||||||||    
T  42514847 gttcgacgaaggg 42514859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 411 - 573
Target Start/End: Original strand, 37105920 - 37106082
Alignment:
Q  411 ggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtttt 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  37105920 ggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgaataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaggggacccataaactcattgccttaagatttt 37106019  T
Q  511 gggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 573  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37106020 gggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtacggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 37106082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 405 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 5543166 - 5543002
Alignment:
Q  405 agtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa 504  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  5543166 agtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatccgataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaacctattgccttaa 5543067  T
Q  505 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 569  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  5543066 gattttgggtaagagtgtggtgtctctattgcttgtgcggttgttcaagcctcgatgtggacggt 5543002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 387 - 567
Target Start/End: Original strand, 15880233 - 15880415
Alignment:
Q  387 gactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggac 484  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||| | ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15880233 gactcacacttaaggggaagtgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgttccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggac 15880332  T
Q  485 ccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacg 567  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  15880333 ccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgttttagcctcgatgtggacg 15880415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 343 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 36178498 - 36178320
Alignment:
Q  343 aaagtcaaaagcttccgctctaaggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatc 442  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  36178498 aaagtaaaaagcttccgctcta-ggggaacacattaaagtgatggactcacacttgagggggactgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacttc 36178400  T
Q  443 ggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgt 522  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36178399 ggataaaatagtaaaggtggaacaccttataagtaaggggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgt 36178320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 113 - 597
Target Start/End: Original strand, 3672773 - 3673249
Alignment:
Q  113 ataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctca 212  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  ||||||||  |    
T  3672773 ataaacccattgccttaagattttgggtaagagtgtggtgtctctcttaattgtgtggttgttctagtctcgatgtggacggttcccctggctcccccta 3672872  T
Q  213 ctgacccaacagtggtatcagagccccggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtc--attgcgcagaaagccgcaacagcggtacaagtagcaa 310  Q
     |||||||||  || |||||||||||| ||||||||||||| | || ||||||||| ||||   ||||||||||||| ||  | ||||| |||| ||       
T  3672873 gtgacccaacgctgttatcagagcccc-gttcgacgaagggtgtgatcgaggcagccggtccgtttgcgcagaaagcagcggcggcggtgcaagcag--t 3672969  T
Q  311 gtggctccttgtg---------caggaacggcgatacaggcaaagtcaaaagcttccgctctaag-gggagcacgttaaagtgatggactcacacttgag 400  Q
    || | ||| | ||         ||| |||| | ||||| ||||||| |||||||||||||  ||| ||||||| | | || |||||||||||||||||||    
T  3672970 gtcggtccgtttgcggagaaaccagcaacgacaatacatgcaaagt-aaaagcttccgcttgaagagggagcatgatgaattgatggactcacacttgag 3673068  T
Q  401 ggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattg 498  Q
    | |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||                 ||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  3673069 gaggagtgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacattggataaaat-----------------ttataagtaagaggatccataaactcattg 3673151  T
Q  499 ccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 597  Q
    | ||||| |||||| |||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||||||||    
T  3673152 ctttaagattttggctaagagtgtgatgtctctcttactagtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccccctggctcccc-cagtgacccaaca 3673249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 417 - 598
Target Start/End: Original strand, 6421387 - 6421567
Alignment:
Q  417 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 516  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  6421387 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaactcattgccttgaggttttgggtaa 6421486  T
Q  517 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacag 598  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||  |||||||||||    
T  6421487 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagtctcgatgtggacggtcccccgagctcccctc-gtgacccaacag 6421567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 133; E-Value: 8e-69
Query Start/End: Original strand, 41 - 273
Target Start/End: Original strand, 962598 - 962827
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  962598 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtgagaggacccataaacccattgtcttaaggttttgggt 962697  T
Q  141 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtggtatcagagccccg 240  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    |||||| || ||| |||||||| |||| |||| ||||    
T  962698 aagagtgtgttgtcactcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtctcccgaactcccc-ca-tgatccaacagtagtattagag-cccg 962794  T
Q  241 gttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtc 273  Q
    |||||| |||||| ||||| |||| ||| ||||    
T  962795 gttcgatgaagggtgcgactgaggtagccggtc 962827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 415 - 570
Target Start/End: Original strand, 962598 - 962753
Alignment:
Q  415 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 514  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  962598 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtgagaggacccataaacccattgtcttaaggttttgggt 962697  T
Q  515 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 570  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  962698 aagagtgtgttgtcactcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 962753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 43 - 193
Target Start/End: Original strand, 15880265 - 15880415
Alignment:
Q  43 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 142  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15880265 caagtgtgagttatatgttccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 15880364  T
Q  143 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacg 193  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  15880365 gagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgttttagcctcgatgtggacg 15880415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 41 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 38796778 - 38796578
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  38796778 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatctgataaaacaataaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacctaatgccttaaggttttgggt 38796679  T
Q  141 aagag--tgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc--cctaggctcccctcactgacccaacagtggtatcagagc 236  Q
    |||||  ||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  || ||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  38796678 aagagtatgtggcgtctctattgcttgtgtggttgttcaagcctcgatgtcgacggtccctccaaggctcccc-caatgacccaacagtggtatcagagc 38796580  T
Q  237 cc 238  Q
    ||    
T  38796579 cc 38796578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 383 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 40679818 - 40679632
Alignment:
Q  383 gatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagg 482  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  40679818 gatggactcacacttgagggggagtgttg-tgtgcaaatgtgagttatatgtcccatatcggatagaaaagtaagggttgaacaccttataagtaagaga 40679720  T
Q  483 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 570  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40679719 acccataaacccatcgccttaagattttgggtaagagtgtggcgtctctcttacttgtggggttgttctagtctcgatgtggacggtc 40679632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 415 - 598
Target Start/End: Original strand, 42514649 - 42514831
Alignment:
Q  415 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 514  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  42514649 tgcaagtgtgagttatatgtcctacatcagatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccatcgccttaagattttgggt 42514748  T
Q  515 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacag 598  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||  |||||||||||    
T  42514749 aagagtgtggcgtctctcttacttgtggggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgagctcccctc-gtgacccaacag 42514831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 382 - 573
Target Start/End: Original strand, 6422084 - 6422268
Alignment:
Q  382 tgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 481  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| |||||      ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  6422084 tgatggactcacacttgagggggagtcttg-tgtgcaaatgtga------tgtcccacatcagataaaaaagtaaaggttgaacacattataattaagag 6422176  T
Q  482 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 573  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6422177 gacccataaacccatagccttaaggttttaggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggactgtcccc 6422268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 383 - 583
Target Start/End: Original strand, 7598577 - 7598769
Alignment:
Q  383 gatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagg 482  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7598577 gatggactcacacttgagagggagtgttggtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagagg 7598676  T
Q  483 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctccc 582  Q
    ||||||||        |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || || |||||||    
T  7598677 acccataa--------ccttaacgtttttggtaagagtgtggtgtctctctcacttgtgtggttgttcaagcatcgatgtggacggcccactgggctccc 7598768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 422 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 15511646 - 15511495
Alignment:
Q  422 gtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtg 521  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  15511646 gtgagttatatgtcacacaacggataaaagagtaaaggttgaacacgttataagtaagaggacccataaacccattgtcttaagattttgggtaagagtg 15511547  T
Q  522 tggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 573  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  15511546 tggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagtctcgatgtggacgatcccc 15511495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 48 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 15511646 - 15511495
Alignment:
Q  48 gtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtg 147  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  15511646 gtgagttatatgtcacacaacggataaaagagtaaaggttgaacacgttataagtaagaggacccataaacccattgtcttaagattttgggtaagagtg 15511547  T
Q  148 tggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  15511546 tggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagtctcgatgtggacgatcccc 15511495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 415 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 35580881 - 35580724
Alignment:
Q  415 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 514  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35580881 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaacaataaatgttgaacaccttataagtgagaggacc-ataaacccattgccttaaggttttgggt 35580783  T
Q  515 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 573  Q
    ||||||| || |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35580782 aagagtgcggcgtctctcttgtttgtggggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 35580724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 382 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 28531504 - 28531316
Alignment:
Q  382 tgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 481  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||    
T  28531504 tgatggactcacacttgagggggagtgttg-tgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaagcaaaggttgaacaccttataagtaagag 28531406  T
Q  482 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 571  Q
    | ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||   || ||  |||| ||||||||||||||||| |||||    
T  28531405 gtcccataaactcattgccttaagattttgggtaagagtgtggtgactctctcagttatgcagttgctctagcctcgatgtggatggtcc 28531316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 41 - 304
Target Start/End: Original strand, 7598228 - 7598491
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 140  Q
    ||||||||||| |||||||| | |||||| ||| || |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  7598228 tgcaagtgtgaattatatgttctacatcgaatagaaaagtaaaggttcaacaccttataaataagaggacccataaactcatagccttaaggttttgggt 7598327  T
Q  141 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtggtatcagagccccg 240  Q
    |||| | ||||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||   ||||||||  |||||||||| |||||||| ||||| |    
T  7598328 aagaatatggtgtctctctcacttgtgcggttgttcaagcctcgatgtgaacggtcccctgatctcccctc-gtgacccaacactggtatcaaagcccag 7598426  T
Q  241 gttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggt-cattgcgcagaaagccgcaacagcggtacaag 304  Q
    |||||||||||||  |||| |||| ||| ||| | ||||||||||||| |||||  |||||||||    
T  7598427 gttcgacgaagggtacgactgaggtagccggtccgttgcgcagaaagcagcaacgacggtacaag 7598491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 433 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 36178311 - 36178171
Alignment:
Q  433 gtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctc 532  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  36178311 gtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagggaacccataaacccattgccttaagattttgggtaagagtgtggtgcctctc 36178212  T
Q  533 ttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 573  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  36178211 ttgcttgtgtggttgttatagcctcgatgtagacggtcccc 36178171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 59 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 36178311 - 36178171
Alignment:
Q  59 gtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctc 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  36178311 gtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagggaacccataaacccattgccttaagattttgggtaagagtgtggtgcctctc 36178212  T
Q  159 ttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 199  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  36178211 ttgcttgtgtggttgttatagcctcgatgtagacggtcccc 36178171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 57 - 199
Target Start/End: Original strand, 6422126 - 6422268
Alignment:
Q  57 atgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctc 156  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6422126 atgtcccacatcagataaaaaagtaaaggttgaacacattataattaagaggacccataaacccatagccttaaggttttaggtaagagtgtggtgtctc 6422225  T
Q  157 tcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6422226 tcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggactgtcccc 6422268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 43 - 224
Target Start/End: Original strand, 6712978 - 6713160
Alignment:
Q  43 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg-ttttgggta 141  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||    
T  6712978 caagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaacagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggacccataaacctattgctttaaggtttttgggta 6713077  T
Q  142 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacag 224  Q
    |||||||| |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||    || |||||||||| |||||||    
T  6713078 agagtgtgatgtctctcttgcttatgggattgttctagcctcgatgtggacggtcccccgaacttccctcactgatccaacag 6713160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 417 - 598
Target Start/End: Original strand, 6712978 - 6713160
Alignment:
Q  417 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg-ttttgggta 515  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||    
T  6712978 caagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaacagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggacccataaacctattgctttaaggtttttgggta 6713077  T
Q  516 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacag 598  Q
    |||||||| |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||    || |||||||||| |||||||    
T  6713078 agagtgtgatgtctctcttgcttatgggattgttctagcctcgatgtggacggtcccccgaacttccctcactgatccaacag 6713160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 32 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 14745461 - 14745300
Alignment:
Q  32 gtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaag 131  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14745461 gtgttggtttgcaactgtgagttatatgtcccacatcgaataaaatagtaatggttgaacatcttgtaagtatgaggacccataaacccattgccttaag 14745362  T
Q  132 gttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgt-gtggttgttctagcctcgatgtggac 192  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||   || ||||||||||||||||||||||||||    
T  14745361 gttttgggtaagagtgtggcgtctctcttgtaagtggtggttgttctagcctcgatgtggac 14745300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 417 - 566
Target Start/End: Complemental strand, 36006035 - 36005887
Alignment:
Q  417 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 516  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36006035 caagtgtgagttatatgtcccacatcgaatagaa-agtaaaagttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttgggtaa 36005937  T
Q  517 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggac 566  Q
     ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36005936 aagtgtggcgtctctcttgcttgtggggttgttctagcctcgatgtggac 36005887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 43 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 36006035 - 36005887
Alignment:
Q  43 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 142  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36006035 caagtgtgagttatatgtcccacatcgaatagaa-agtaaaagttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttgggtaa 36005937  T
Q  143 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggac 192  Q
     ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36005936 aagtgtggcgtctctcttgcttgtggggttgttctagcctcgatgtggac 36005887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 415 - 598
Target Start/End: Complemental strand, 38796778 - 38796592
Alignment:
Q  415 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 514  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  38796778 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatctgataaaacaataaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacctaatgccttaaggttttgggt 38796679  T
Q  515 aagag--tgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc--cctaggctcccctcactgacccaacag 598  Q
    |||||  ||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  || ||||||||| || |||||||||||    
T  38796678 aagagtatgtggcgtctctattgcttgtgtggttgttcaagcctcgatgtcgacggtccctccaaggctcccc-caatgacccaacag 38796592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 46 - 223
Target Start/End: Original strand, 33731653 - 33731831
Alignment:
Q  46 gtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagag 145  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33731653 gtgtgagttatatatctcacatcggataaaagagtaaaggttgagcaccttataagtaagaggatccataaacctattgccttaaggttttgggtaagag 33731752  T
Q  146 tgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc-cctaggctcccctcactgacccaaca 223  Q
    | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||  ||||||| || | |||||||||  ||||||||||    
T  33731753 tatggtgtctctcttgcttatgcggttgttctagcctcgatgtaaacggtcctccaaagctcccctcggtgacccaaca 33731831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 420 - 597
Target Start/End: Original strand, 33731653 - 33731831
Alignment:
Q  420 gtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagag 519  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33731653 gtgtgagttatatatctcacatcggataaaagagtaaaggttgagcaccttataagtaagaggatccataaacctattgccttaaggttttgggtaagag 33731752  T
Q  520 tgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc-cctaggctcccctcactgacccaaca 597  Q
    | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||  ||||||| || | |||||||||  ||||||||||    
T  33731753 tatggtgtctctcttgcttatgcggttgttctagcctcgatgtaaacggtcctccaaagctcccctcggtgacccaaca 33731831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 382 - 573
Target Start/End: Original strand, 40733482 - 40733675
Alignment:
Q  382 tgatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaag 479  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||  | ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  40733482 tgatagactcacacttgaggggaagtgttattgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaaaagtaaatgttgaacaccttataagtaag 40733581  T
Q  480 aggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 573  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||    
T  40733582 aggacccataaacctacaaccttaaagttttgggtaagagtgtggtgtctctctcgcttgtgtggtagttcaagtctcgatgtggatggtcccc 40733675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 54 - 273
Target Start/End: Original strand, 23346250 - 23346466
Alignment:
Q  54 tatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 153  Q
    |||||||| ||||||| ||| || |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  23346250 tatatgtctcacatcgtatagaaaagtaaaggttaaacaccttataa-taagagggcccataaacccatagccttaaggttttcggtaagagtgtgatgt 23346348  T
Q  154 ctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtggtatcagagccccggttcgacgaaggg 253  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||   |||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  23346349 ctctcttgcttgtgcggttgttctagcctagatgtggacggtcgcccgagctcccctca-tgacccaacaatggtatcagag-cccggtttgacgtaggg 23346446  T
Q  254 agcgaccgaggcagctggtc 273  Q
      ||||||||| ||| ||||    
T  23346447 tacgaccgaggtagccggtc 23346466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 41 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 40679787 - 40679632
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 140  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  40679787 tgcaaatgtgagttatatgtcccatatcggatagaaaagtaagggttgaacaccttataagtaagagaacccataaacccatcgccttaagattttgggt 40679688  T
Q  141 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 196  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40679687 aagagtgtggcgtctctcttacttgtggggttgttctagtctcgatgtggacggtc 40679632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 43 - 268
Target Start/End: Original strand, 40733519 - 40733744
Alignment:
Q  43 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 142  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||| |||||||||||    
T  40733519 caagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaaaagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggacccataaacctacaaccttaaagttttgggtaa 40733618  T
Q  143 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt-cccctaggctcccc-tcactgacccaacagtggtatcagagccccg 240  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| || ||||||||||| ||| ||||| | |||||| ||| |||  | |||||||||||| ||||||     
T  40733619 gagtgtggtgtctctctcgcttgtgtggtagttcaagtctcgatgtggatggtcccccttgactccccttcagtgaatc-acagtggtatcaaagcccc- 40733716  T
Q  241 gttcgacgaagggagcgaccgaggcagc 268  Q
    ||||||| |||||  |||||||||||||    
T  40733717 gttcgacaaagggtacgaccgaggcagc 40733744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 415 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 37632755 - 37632575
Alignment:
Q  415 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 514  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||    
T  37632755 tgcaagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaatagtaaaggtttgacattttataagtaagaggacccataaacccataactttaaggttttgggt 37632656  T
Q  515 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 597  Q
    ||||||||||||| |||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||    
T  37632655 aagagtgtggtgtatctcttacaagtgtgattgttctagcctcgatgtggacgg-cccct-ggctcccctcagtgtcccaaca 37632575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 41 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 37632755 - 37632575
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 140  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||    
T  37632755 tgcaagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaatagtaaaggtttgacattttataagtaagaggacccataaacccataactttaaggttttgggt 37632656  T
Q  141 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 223  Q
    ||||||||||||| |||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||    
T  37632655 aagagtgtggtgtatctcttacaagtgtgattgttctagcctcgatgtggacgg-cccct-ggctcccctcagtgtcccaaca 37632575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 382 - 573
Target Start/End: Original strand, 40733848 - 40734040
Alignment:
Q  382 tgatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaag 479  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  | ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||||||||||||    
T  40733848 tgatggactcacacttgagggggagtgttattgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcgaataaaagagtaaagatttaacaccttataagtaag 40733947  T
Q  480 aggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 573  Q
    ||| | ||||| || |  ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  40733948 agggctcataa-cctacagccttaaagttttgggtaagagtgtggtgtctgtctcgcttgtgtggttgttcaagtctcgatgtggacggtcccc 40734040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 43 - 304
Target Start/End: Original strand, 40733885 - 40734147
Alignment:
Q  43 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 142  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||| || |  ||||||| |||||||||||    
T  40733885 caagtgtgagttatatgtcccacatcgaataaaagagtaaagatttaacaccttataagtaagagggctcataa-cctacagccttaaagttttgggtaa 40733983  T
Q  143 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc-taggctcccct-cactgacccaacagtggtatcagagccccg 240  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| | | ||||||| || ||| ||| |||||||||||||||||||    
T  40733984 gagtgtggtgtctgtctcgcttgtgtggttgttcaagtctcgatgtggacggtcccccttgactccccttcagtgaacca-cagtggtatcagagccccg 40734082  T
Q  241 gttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtca--ttgcgcagaaagccgcaacagcggtacaag 304  Q
     |||| | |||||  ||||||||||||| |||    ||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  40734083 -ttcgtcaaagggtacgaccgaggcagccggttcgtttgcgcagaaagcagcaacaacggtacaag 40734147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 103 - 267
Target Start/End: Original strand, 6421793 - 6421956
Alignment:
Q  103 aagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctag 202  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||       
T  6421793 aagaggacccataaacctattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctaacttgtgtggttgttctggcctcgatgtggacggtcccccga 6421892  T
Q  203 gctcccctcactgacccaacagtggtatcagagccccggttcgacgaagggagcgaccgaggcag 267  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  6421893 gctcccctca-tgacccaacggtggtattagagcctcggttcgacaaagggtacgaccgaggcag 6421956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 33 - 225
Target Start/End: Original strand, 1769884 - 1770075
Alignment:
Q  33 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 132  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| || || | |    
T  1769884 tgttggtgtgcaagtgtgagttatatgtcacacatcggataaaagagtaaaagttgaacaccttataagtaagaggactcataaactcatagctttgaag 1769983  T
Q  133 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc-cctaggctcccctcactgacccaacagt 225  Q
     ||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||| || ||||||||||||    
T  1769984 ctttgaataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgaggttgttctagcctcgatgtgaacgatcctccta-gctcccc-caatgacccaacagt 1770075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 407 - 563
Target Start/End: Original strand, 1769884 - 1770040
Alignment:
Q  407 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 506  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| || || | |    
T  1769884 tgttggtgtgcaagtgtgagttatatgtcacacatcggataaaagagtaaaagttgaacaccttataagtaagaggactcataaactcatagctttgaag 1769983  T
Q  507 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtg 563  Q
     ||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1769984 ctttgaataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgaggttgttctagcctcgatgtg 1770040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 32 - 209
Target Start/End: Original strand, 7598600 - 7598769
Alignment:
Q  32 gtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaag 131  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||     
T  7598600 gtgttggtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataa--------ccttaac 7598691  T
Q  132 gttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccc 209  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || || ||||||||    
T  7598692 gtttttggtaagagtgtggtgtctctctcacttgtgtggttgttcaagcatcgatgtggacggcccactgggctcccc 7598769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 419 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 28254391 - 28254258
Alignment:
Q  419 agtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaaga 518  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28254391 agtgtgacttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttgggtaaga 28254292  T
Q  519 gtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagc 554  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||||||||||    
T  28254291 gtgtggtgtctctct--cttgtggggttgttctagc 28254258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 45 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 28254391 - 28254258
Alignment:
Q  45 agtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaaga 144  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28254391 agtgtgacttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttgggtaaga 28254292  T
Q  145 gtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagc 180  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||||||||||    
T  28254291 gtgtggtgtctctct--cttgtggggttgttctagc 28254258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 41 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 28531472 - 28531316
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  28531472 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaagcaaaggttgaacaccttataagtaagaggtcccataaactcattgccttaagattttgggt 28531373  T
Q  141 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 197  Q
    |||||||||||| ||||||   || ||  |||| ||||||||||||||||| |||||    
T  28531372 aagagtgtggtgactctctcagttatgcagttgctctagcctcgatgtggatggtcc 28531316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 33 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 36178435 - 36178320
Alignment:
Q  33 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||    
T  36178435 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacttcggataaaatagtaaaggtggaacaccttataagtaaggggactcataaacccattgtcttaagg 36178336  T
Q  133 ttttgggtaagagtgt 148  Q
    ||||||||||||||||    
T  36178335 ttttgggtaagagtgt 36178320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 426 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 40163520 - 40163362
Alignment:
Q  426 gttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctt-aaggttttgggtaagagtgtgg 524  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | || ||| |||||||||||||| |||||||    
T  40163520 gttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccattaacctagtgtctttaaggttttgggtaaaagtgtgg 40163421  T
Q  525 tgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccc 583  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||| |||  |||||||    
T  40163420 tgtctctcttgcttgtgtggttgttctaacctcgatgtagatggtctcctgagctcccc 40163362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 52 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 40163520 - 40163362
Alignment:
Q  52 gttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctt-aaggttttgggtaagagtgtgg 150  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | || ||| |||||||||||||| |||||||    
T  40163520 gttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccattaacctagtgtctttaaggttttgggtaaaagtgtgg 40163421  T
Q  151 tgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccc 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||| |||  |||||||    
T  40163420 tgtctctcttgcttgtgtggttgttctaacctcgatgtagatggtctcctgagctcccc 40163362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 428 - 597
Target Start/End: Original strand, 23346250 - 23346417
Alignment:
Q  428 tatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 527  Q
    |||||||| ||||||| ||| || |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  23346250 tatatgtctcacatcgtatagaaaagtaaaggttaaacaccttataa-taagagggcccataaacccatagccttaaggttttcggtaagagtgtgatgt 23346348  T
Q  528 ctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 597  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||   |||||||||| ||||||||||    
T  23346349 ctctcttgcttgtgcggttgttctagcctagatgtggacggtcgcccgagctcccctca-tgacccaaca 23346417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 415 - 574
Target Start/End: Original strand, 7598228 - 7598387
Alignment:
Q  415 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 514  Q
    ||||||||||| |||||||| | |||||| ||| || |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  7598228 tgcaagtgtgaattatatgttctacatcgaatagaaaagtaaaggttcaacaccttataaataagaggacccataaactcatagccttaaggttttgggt 7598327  T
Q  515 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccct 574  Q
    |||| | ||||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  7598328 aagaatatggtgtctctctcacttgtgcggttgttcaagcctcgatgtgaacggtcccct 7598387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 43 - 185
Target Start/End: Original strand, 5367457 - 5367599
Alignment:
Q  43 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 142  Q
    |||||||||  ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| |||  ||||||||||||||||||    
T  5367457 caagtgtgatatatatgtcccagatcggataaaagagcaaaggttgaacaccttataagtaagatgatccatgaacacataaccttaaggttttgggtaa 5367556  T
Q  143 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcga 185  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  5367557 gagtgtggcgtctctcttgcttgtgcagttgttctagcctcga 5367599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 417 - 559
Target Start/End: Original strand, 5367457 - 5367599
Alignment:
Q  417 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 516  Q
    |||||||||  ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| |||  ||||||||||||||||||    
T  5367457 caagtgtgatatatatgtcccagatcggataaaagagcaaaggttgaacaccttataagtaagatgatccatgaacacataaccttaaggttttgggtaa 5367556  T
Q  517 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcga 559  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  5367557 gagtgtggcgtctctcttgcttgtgcagttgttctagcctcga 5367599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 41 - 198
Target Start/End: Original strand, 29676903 - 29677065
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga-----cccataaacccattgccttaaggttt 135  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || ||||||     ||||||||||||||||||||||| ||    
T  29676903 tgcaggtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggtttaacaccttataggtgagaggagaagacccataaacccattgccttaaggctt 29677002  T
Q  136 tgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 198  Q
    |  ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  29677003 taagtaagagtgtggtgtctctcttaattgtggggttgttccaacctcgatgtggatggtccc 29677065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 395 - 523
Target Start/End: Complemental strand, 31468926 - 31468800
Alignment:
Q  395 cttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaac 492  Q
    |||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    |||||||||||||||||    
T  31468926 cttgagggggagtgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaatatctta----taagaggacccataaac 31468831  T
Q  493 ccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 523  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31468830 tcattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 31468800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 383 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 38796410 - 38796298
Alignment:
Q  383 gatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaga 480  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38796410 gatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaacagtaaatgttgaacaccttataagtaaga 38796311  T
Q  481 ggacccataaacc 493  Q
    ||||| |||||||    
T  38796310 ggacctataaacc 38796298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 477 - 596
Target Start/End: Original strand, 6421793 - 6421911
Alignment:
Q  477 aagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctag 576  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||       
T  6421793 aagaggacccataaacctattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctaacttgtgtggttgttctggcctcgatgtggacggtcccccga 6421892  T
Q  577 gctcccctcactgacccaac 596  Q
    |||||||||| |||||||||    
T  6421893 gctcccctca-tgacccaac 6421911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 41 - 235
Target Start/End: Original strand, 30313178 - 30313370
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 140  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||||||| || |||  ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||    
T  30313178 tgcaagcgtgtgttatatgtctcacatcggatagaaaagtggaggttgaacac-ttataagtgagaggacccaaaaactcattgccttaagattttgggt 30313276  T
Q  141 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtggtatcagag 235  Q
    |||||||||| ||||||||  |||||||||||| ||| |||| ||| | |||| |||||  ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  30313277 aagagtgtggcgtctctctcacttgtgtggttgctctggcctggattttgacgatcccccgggctctcctc-gtgacccaacagtggtatcagag 30313370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 41 - 148
Target Start/End: Original strand, 16542449 - 16542556
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 140  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| |||||||||||| ||||| ||    
T  16542449 tgcaagtgtgagttataagtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataaataagaggacttataaactcattgccttaagattttgagt 16542548  T
Q  141 aagagtgt 148  Q
    ||||||||    
T  16542549 aagagtgt 16542556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 415 - 522
Target Start/End: Original strand, 16542449 - 16542556
Alignment:
Q  415 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 514  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| |||||||||||| ||||| ||    
T  16542449 tgcaagtgtgagttataagtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataaataagaggacttataaactcattgccttaagattttgagt 16542548  T
Q  515 aagagtgt 522  Q
    ||||||||    
T  16542549 aagagtgt 16542556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 423 - 573
Target Start/End: Original strand, 29676543 - 29676687
Alignment:
Q  423 tgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgt 522  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||| |||||||| |||| |||||||||| |||||||||      ||||||||||||||    
T  29676543 tgagttatatgtctcacattggataaaagagtaaagattgaacacattataagtgagagaacccataaactcattgcctt------ttgggtaagagtgt 29676636  T
Q  523 ggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 573  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| | ||||||||||||||||||||    
T  29676637 ggtgtctctcttgcttgtggggttattcaaacctcgatgtggacggtcccc 29676687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 41 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 31468904 - 31468800
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31468904 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaatatctta----taagaggacccataaactcattgccttaaggttttgggt 31468809  T
Q  141 aagagtgtg 149  Q
    |||||||||    
T  31468808 aagagtgtg 31468800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 95 - 223
Target Start/End: Original strand, 3673122 - 3673249
Alignment:
Q  95 ttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacgg 194  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| |||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3673122 ttataagtaagaggatccataaactcattgctttaagattttggctaagagtgtgatgtctctcttactagtgtggttgttctagcctcgatgtggacgg 3673221  T
Q  195 tcccctaggctcccctcactgacccaaca 223  Q
    |||||  |||||||| || ||||||||||    
T  3673222 tccccctggctcccc-cagtgacccaaca 3673249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 415 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 12529186 - 12529038
Alignment:
Q  415 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 514  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| | |    
T  12529186 tgcaagtgtgagttatatgtcctacatcaaataaaacagtaaagattgaacaccgtataagtaagaggactcataaactcattgccttaaagttttagat 12529087  T
Q  515 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtg 563  Q
    ||||  || |||||||||||| ||||| |||||||||| |||| |||||    
T  12529086 aagaacgtagtgtctctcttgtttgtgcggttgttctaacctcaatgtg 12529038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 41 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 12529186 - 12529038
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 140  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| | |    
T  12529186 tgcaagtgtgagttatatgtcctacatcaaataaaacagtaaagattgaacaccgtataagtaagaggactcataaactcattgccttaaagttttagat 12529087  T
Q  141 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtg 189  Q
    ||||  || |||||||||||| ||||| |||||||||| |||| |||||    
T  12529086 aagaacgtagtgtctctcttgtttgtgcggttgttctaacctcaatgtg 12529038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 41 - 223
Target Start/End: Original strand, 16590888 - 16591065
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaata-gtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttggg 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||||||      |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |    
T  16590888 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcaaataaaaaaagtaaaggttgaaca------aagtaagaggacccataaacacattgccttaaggttttaag 16590981  T
Q  140 taagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 223  Q
    ||||| | |  |||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||   |||||||||| ||||||||||    
T  16590982 taagaatctaatgtctctcttacttgtggggttgttctagcctcaatgtggacagtctcccgagctcccctcaatgacccaaca 16591065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 415 - 597
Target Start/End: Original strand, 16590888 - 16591065
Alignment:
Q  415 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaata-gtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttggg 513  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||||||      |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |    
T  16590888 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcaaataaaaaaagtaaaggttgaaca------aagtaagaggacccataaacacattgccttaaggttttaag 16590981  T
Q  514 taagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 597  Q
    ||||| | |  |||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||   |||||||||| ||||||||||    
T  16590982 taagaatctaatgtctctcttacttgtggggttgttctagcctcaatgtggacagtctcccgagctcccctcaatgacccaaca 16591065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 385 - 598
Target Start/End: Original strand, 30313147 - 30313359
Alignment:
Q  385 tggactcacacttgagggggag--tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagg 482  Q
    ||||||||||||||||||| ||  ||||| | |||||| ||| |||||||||| ||||||||||| || |||  ||||||||||| |||||||| |||||    
T  30313147 tggactcacacttgaggggaagattgttg-tgtgcaagcgtgtgttatatgtctcacatcggatagaaaagtggaggttgaacac-ttataagtgagagg 30313244  T
Q  483 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctccc 582  Q
    ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| ||| |||| ||| | |||| |||||  ||||| |    
T  30313245 acccaaaaactcattgccttaagattttgggtaagagtgtggcgtctctctcacttgtgtggttgctctggcctggattttgacgatcccccgggctctc 30313344  T
Q  583 ctcactgacccaacag 598  Q
    |||  |||||||||||    
T  30313345 ctc-gtgacccaacag 30313359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 352 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 36785786 - 36785664
Alignment:
Q  352 agcttccgctctaaggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaa 449  Q
    ||||||||||  | |||||||| | | || |||||||||||||||| |||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36785786 agcttccgcttgagggggagcatgatgaattgatggactcacactttagggggagtgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaa 36785687  T
Q  450 atagtaaaggttgaacaccttat 472  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  36785686 atagtaaaggttgaacaccttat 36785664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 382 - 532
Target Start/End: Original strand, 30323430 - 30323581
Alignment:
Q  382 tgatggactcacacttgagggggag--tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaag 479  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||| | |||||||||| ||||||||||||| ||| |||| || | |  ||||||||||| ||| |||| ||    
T  30323430 tgatggactcacacttgagggggagattgttg-tgtgcaagtgtgtgttatatgtcccaaatcagatagaaaattggaggttgaacactttagaagtgag 30323528  T
Q  480 aggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctc 532  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30323529 aggacctataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgtggcgtctctc 30323581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 418 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 31899581 - 31899496
Alignment:
Q  418 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctta 503  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31899581 aagtgtgagttatatgttccacatcggataaaatagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgcctta 31899496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 44 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 31899581 - 31899496
Alignment:
Q  44 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctta 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31899581 aagtgtgagttatatgttccacatcggataaaatagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgcctta 31899496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 382 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 33561641 - 33561491
Alignment:
Q  382 tgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 481  Q
    |||||||| | ||||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||||| ||||||| |||| || |||  ||||| ||||| |||||||| ||||    
T  33561641 tgatggacacgcacttgatggggaatgttg-tgtgcaagtgtgagttatatgttccacatcagatagaaaagtggaggttaaacactttataagtgagag 33561543  T
Q  482 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 533  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  33561542 gacccataaactcattgtcttaaggttttgggtaagagtgtgatatctctct 33561491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 382 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 29873729 - 29873525
Alignment:
Q  382 tgatggactcacacttgagggggag--tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaag 479  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||| | |||||| ||| |||| |||||||||||| |||| || |||  ||||||||||  ||||||||  |    
T  29873729 tgatggactcacacttgagggggagattgttg-tgtgcaagggtgtgttacatgtcccacatcagatagaaaagtggaggttgaacattttataagtggg 29873631  T
Q  480 aggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggct 579  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||  |||||||||||| ||| | || ||||| | |||||| |  ||||    
T  29873630 aggactcataaactcattgccttaaggttttgagtaagagtgtgacgtctctctcacttgtgtggttgctctggtctggatgtaggcggtcctcctggct 29873531  T
Q  580 cccctc 585  Q
    ||||||    
T  29873530 cccctc 29873525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 417 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 29874179 - 29874023
Alignment:
Q  417 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 516  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||| || |||  ||||||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  29874179 caagtgtgtgttatatgtcccacatcagatagaaaagtggaggttgaacactttataattgggaggacccataaacccattgccttaaggttttggataa 29874080  T
Q  517 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 573  Q
    |||||||| |||| ||   |||||| ||||| | | |||| ||||||| ||||||||    
T  29874079 gagtgtggcgtctatcccacttgtgcggttgctttggcctggatgtgggcggtcccc 29874023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 43 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 29874179 - 29874023
Alignment:
Q  43 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 142  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||| || |||  ||||||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  29874179 caagtgtgtgttatatgtcccacatcagatagaaaagtggaggttgaacactttataattgggaggacccataaacccattgccttaaggttttggataa 29874080  T
Q  143 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 199  Q
    |||||||| |||| ||   |||||| ||||| | | |||| ||||||| ||||||||    
T  29874079 gagtgtggcgtctatcccacttgtgcggttgctttggcctggatgtgggcggtcccc 29874023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 423 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 37895211 - 37895107
Alignment:
Q  423 tgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgt 522  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || | |||| |||||| |||||| |||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37895211 tgagttatatgtcccacatcggatagaaaaataaaagttgaaaaccttaaaagtaaaagaacacataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgt 37895112  T
Q  523 ggtgt 527  Q
    |||||    
T  37895111 ggtgt 37895107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 49 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 37895211 - 37895107
Alignment:
Q  49 tgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgt 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || | |||| |||||| |||||| |||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37895211 tgagttatatgtcccacatcggatagaaaaataaaagttgaaaaccttaaaagtaaaagaacacataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgt 37895112  T
Q  149 ggtgt 153  Q
    |||||    
T  37895111 ggtgt 37895107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 418 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 31259774 - 31259658
Alignment:
Q  418 aagtgtgagttatatgtcccacatc---ggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 514  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||   |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  31259774 aagtgcgagttatatgtctcacatcatcggataaaagagtaaaggttcaacaccttataagtaagatgacccataaacctatcaccttaaggttttgggt 31259675  T
Q  515 aagagtgtggtgtctct 531  Q
    ||||||||||| |||||    
T  31259674 aagagtgtggtatctct 31259658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 44 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 31259774 - 31259658
Alignment:
Q  44 aagtgtgagttatatgtcccacatc---ggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 140  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||   |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  31259774 aagtgcgagttatatgtctcacatcatcggataaaagagtaaaggttcaacaccttataagtaagatgacccataaacctatcaccttaaggttttgggt 31259675  T
Q  141 aagagtgtggtgtctct 157  Q
    ||||||||||| |||||    
T  31259674 aagagtgtggtatctct 31259658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 41 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 33561609 - 33561491
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 140  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||| || |||  ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  33561609 tgcaagtgtgagttatatgttccacatcagatagaaaagtggaggttaaacactttataagtgagaggacccataaactcattgtcttaaggttttgggt 33561510  T
Q  141 aagagtgtggtgtctctct 159  Q
    ||||||||| | |||||||    
T  33561509 aagagtgtgatatctctct 33561491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 383 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 37894881 - 37894732
Alignment:
Q  383 gatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagg 482  Q
    |||||||||| |||| ||||||||| ||| | ||||| ||||||||||||||||||||| | ||| || |||||||| | || ||||||||||||||| |    
T  37894881 gatggactcatacttaagggggagtattg-tgtgcaaatgtgagttatatgtcccacattgaatagaaaagtaaaggctaaaaaccttataagtaagaag 37894783  T
Q  483 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 533  Q
    || |||||| ||||||||||||| |||||| ||| |||||||||| |||||    
T  37894782 actcataaatccattgccttaagattttggttaaaagtgtggtgtgtctct 37894732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 41 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 38796376 - 38796298
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacc 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  38796376 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaacagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggacctataaacc 38796298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 103 - 195
Target Start/End: Original strand, 6421688 - 6421780
Alignment:
Q  103 aagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 195  Q
    ||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  6421688 aagaggacccataaacctattgactaaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctaacttgtgtggttgttccggcctcgatgtggacggt 6421780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 477 - 569
Target Start/End: Original strand, 6421688 - 6421780
Alignment:
Q  477 aagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 569  Q
    ||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  6421688 aagaggacccataaacctattgactaaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctaacttgtgtggttgttccggcctcgatgtggacggt 6421780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #99
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 41 - 158
Target Start/End: Original strand, 30323464 - 30323581
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 140  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||| |||| || | |  ||||||||||| ||| |||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  30323464 tgcaagtgtgtgttatatgtcccaaatcagatagaaaattggaggttgaacactttagaagtgagaggacctataaactcattgccttaaggttttgggt 30323563  T
Q  141 aagagtgtggtgtctctc 158  Q
    |||||||||| |||||||    
T  30323564 aagagtgtggcgtctctc 30323581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #100
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 468 - 560
Target Start/End: Complemental strand, 36784365 - 36784273
Alignment:
Q  468 cttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgat 560  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  36784365 cttataagtaagatgacccataaaccctttgtcttaaggttttggataaaagtgttgtgtctctcttgcttgtgtggttattcaagcctcgat 36784273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #101
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 94 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 36784365 - 36784273
Alignment:
Q  94 cttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgat 186  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  36784365 cttataagtaagatgacccataaaccctttgtcttaaggttttggataaaagtgttgtgtctctcttgcttgtgtggttattcaagcctcgat 36784273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #102
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 396 - 523
Target Start/End: Complemental strand, 33953947 - 33953821
Alignment:
Q  396 ttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaaccca 495  Q
    |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||||| |||| || |||  |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||      
T  33953947 ttgagggggagtgttg-tgtgcaaatgtgagttataagtcccacatcagatagaaaagtggaggttgaacactatataagtgagaggacccataaacctg 33953849  T
Q  496 ttgccttaaggttttgggtaagagtgtg 523  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||    
T  33953848 ttgccttaaaattttgggtaagagtgtg 33953821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #103
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 382 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 41678559 - 41678419
Alignment:
Q  382 tgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatat--gtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaag 479  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||| |||||| |||| || ||   ||||| ||||| |||||||| ||    
T  41678559 tgatggactcacacttgaaggggagtgttg-tgtgcaagtgtgagttatatatgtctcacatcagatagaaaaggggaggttaaacactttataagtgag 41678461  T
Q  480 aggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgt 522  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||    
T  41678460 aggacccataaa-cctttgccttaaggttttgagtaagagtgt 41678419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #104
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 41 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 29873695 - 29873525
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 140  Q
    |||||| ||| |||| |||||||||||| |||| || |||  ||||||||||  ||||||||  |||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  29873695 tgcaagggtgtgttacatgtcccacatcagatagaaaagtggaggttgaacattttataagtgggaggactcataaactcattgccttaaggttttgagt 29873596  T
Q  141 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctc 211  Q
    |||||||||  ||||||||  |||||||||||| ||| | || ||||| | |||||| |  ||||||||||    
T  29873595 aagagtgtgacgtctctctcacttgtgtggttgctctggtctggatgtaggcggtcctcctggctcccctc 29873525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #105
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 41 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 37894850 - 37894732
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 140  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| | ||| || |||||||| | || ||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||| |    
T  37894850 tgcaaatgtgagttatatgtcccacattgaatagaaaagtaaaggctaaaaaccttataagtaagaagactcataaatccattgccttaagattttggtt 37894751  T
Q  141 aagagtgtggtgtctctct 159  Q
    || |||||||||| |||||    
T  37894750 aaaagtgtggtgtgtctct 37894732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #106
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 415 - 596
Target Start/End: Original strand, 3672719 - 3672882
Alignment:
Q  415 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 514  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||                 |||||||||| | || | ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3672719 tgcaagtatgagttatatgtcccacatcgaataaaat-----------------ttataagtaa-aagatctataaacccattgccttaagattttgggt 3672800  T
Q  515 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaac 596  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  ||||||||  | |||||||||    
T  3672801 aagagtgtggtgtctctcttaattgtgtggttgttctagtctcgatgtggacggttcccctggctccccctagtgacccaac 3672882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #107
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 41 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 36785721 - 36785664
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttat 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36785721 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttat 36785664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #108
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 44 - 199
Target Start/End: Original strand, 9231252 - 9231407
Alignment:
Q  44 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 143  Q
    |||| ||||||||||||| || ||| |||| || |||||||||||||||  |||||| |||||||| |||| ||||||  ||||||| ||||||| ||||    
T  9231252 aagtatgagttatatgtctcatatcagatagaaaagtaaaggttgaacatattataaataagaggatccatcaacccaccgccttaaagttttggttaag 9231351  T
Q  144 agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 199  Q
    ||||| || |||||||  ||| || |||| ||||| ||| |||||||||| |||||    
T  9231352 agtgtagtatctctctaacttatgcggttattctaaccttgatgtggacgatcccc 9231407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #109
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 418 - 573
Target Start/End: Original strand, 9231252 - 9231407
Alignment:
Q  418 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 517  Q
    |||| ||||||||||||| || ||| |||| || |||||||||||||||  |||||| |||||||| |||| ||||||  ||||||| ||||||| ||||    
T  9231252 aagtatgagttatatgtctcatatcagatagaaaagtaaaggttgaacatattataaataagaggatccatcaacccaccgccttaaagttttggttaag 9231351  T
Q  518 agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 573  Q
    ||||| || |||||||  ||| || |||| ||||| ||| |||||||||| |||||    
T  9231352 agtgtagtatctctctaacttatgcggttattctaaccttgatgtggacgatcccc 9231407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #110
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 42 - 172
Target Start/End: Original strand, 31385738 - 31385868
Alignment:
Q  42 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 141  Q
    |||||||||||||| | |||  ||||||| || || | |  ||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  31385738 gcaagtgtgagttagaagtctgacatcggttagaaaaatggaggttgagcaccttataagtgaaaggacccataaacccattgccttaaggttttgggaa 31385837  T
Q  142 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggtt 172  Q
      |||||||||||||| |  |||||||||||    
T  31385838 taagtgtggtgtctctttcacttgtgtggtt 31385868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #111
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 416 - 546
Target Start/End: Original strand, 31385738 - 31385868
Alignment:
Q  416 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 515  Q
    |||||||||||||| | |||  ||||||| || || | |  ||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  31385738 gcaagtgtgagttagaagtctgacatcggttagaaaaatggaggttgagcaccttataagtgaaaggacccataaacccattgccttaaggttttgggaa 31385837  T
Q  516 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggtt 546  Q
      |||||||||||||| |  |||||||||||    
T  31385838 taagtgtggtgtctctttcacttgtgtggtt 31385868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #112
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 431 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 28254254 - 28254165
Alignment:
Q  431 atgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagt 520  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||    
T  28254254 atgtctcacatcggatagaaaagtaaaggttgaacactttataagtaagaggactcataaacactttgccttaaagtttagggtaagagt 28254165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #113
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 57 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 28254254 - 28254165
Alignment:
Q  57 atgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagt 146  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||    
T  28254254 atgtctcacatcggatagaaaagtaaaggttgaacactttataagtaagaggactcataaacactttgccttaaagtttagggtaagagt 28254165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #114
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 41 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 33953929 - 33953821
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 140  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||| |||| || |||  |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||    
T  33953929 tgcaaatgtgagttataagtcccacatcagatagaaaagtggaggttgaacactatataagtgagaggacccataaacctgttgccttaaaattttgggt 33953830  T
Q  141 aagagtgtg 149  Q
    |||||||||    
T  33953829 aagagtgtg 33953821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #115
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 383 - 477
Target Start/End: Original strand, 42514981 - 42515078
Alignment:
Q  383 gatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatg----tcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagta 477  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||    
T  42514981 gatggactcacatttgagggggagtgttg-tgtgcaggtgtgagttatatgtatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggttaaacaccttataagta 42515078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #116
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 418 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 3594333 - 3594180
Alignment:
Q  418 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 517  Q
    ||||||||||| |||||  |||| || ||| || |||  |||| |||||| |||||||| | |||| |||||||| |||||| ||||| ||||| |||||    
T  3594333 aagtgtgagttgtatgtttcacaacgaatagaaaagtggaggtcgaacactttataagtgataggatccataaacacattgctttaagattttgagtaag 3594234  T
Q  518 agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 571  Q
    |||||| | |||||| | || ||||| || ||||| |||||||||| |||||||    
T  3594233 agtgtgatatctctcatactagtgtgtttattctaacctcgatgtgaacggtcc 3594180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #117
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 44 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 3594333 - 3594180
Alignment:
Q  44 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 143  Q
    ||||||||||| |||||  |||| || ||| || |||  |||| |||||| |||||||| | |||| |||||||| |||||| ||||| ||||| |||||    
T  3594333 aagtgtgagttgtatgtttcacaacgaatagaaaagtggaggtcgaacactttataagtgataggatccataaacacattgctttaagattttgagtaag 3594234  T
Q  144 agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 197  Q
    |||||| | |||||| | || ||||| || ||||| |||||||||| |||||||    
T  3594233 agtgtgatatctctcatactagtgtgtttattctaacctcgatgtgaacggtcc 3594180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #118
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 505 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 31899170 - 31899090
Alignment:
Q  505 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctca 586  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||| | ||||||||||    
T  31899170 ggttttgggtaagagtgaggtatctctcttgcttgtggggttcttctaacctcgatgtgaacggtcccc-aagctcccctca 31899090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #119
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 131 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 31899170 - 31899090
Alignment:
Q  131 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctca 212  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||| | ||||||||||    
T  31899170 ggttttgggtaagagtgaggtatctctcttgcttgtggggttcttctaacctcgatgtgaacggtcccc-aagctcccctca 31899090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #120
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 479 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 35580534 - 35580443
Alignment:
Q  479 gaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta--agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 569  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| | | | |||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  35580534 gaggacccataaactcattgccttaaggttttgggtaagagagtgtggcgtctctc-tccctatgtgattgttttagcctcgatgtggacggt 35580443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #121
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 105 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 35580534 - 35580443
Alignment:
Q  105 gaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta--agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 195  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| | | | |||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  35580534 gaggacccataaactcattgccttaaggttttgggtaagagagtgtggcgtctctc-tccctatgtgattgttttagcctcgatgtggacggt 35580443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #122
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 44 - 148
Target Start/End: Original strand, 12910231 - 12910335
Alignment:
Q  44 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 143  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||  || |||| ||||||||| |||||||||| | | |||  |||||  ||||| ||||||||||||||||||    
T  12910231 aagtttgagttatatgttccacatcggatggaaaagtacaggttgaaccccttataagtgaaatgacttataaattcattgtcttaaggttttgggtaag 12910330  T
Q  144 agtgt 148  Q
    |||||    
T  12910331 agtgt 12910335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #123
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 418 - 522
Target Start/End: Original strand, 12910231 - 12910335
Alignment:
Q  418 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 517  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||  || |||| ||||||||| |||||||||| | | |||  |||||  ||||| ||||||||||||||||||    
T  12910231 aagtttgagttatatgttccacatcggatggaaaagtacaggttgaaccccttataagtgaaatgacttataaattcattgtcttaaggttttgggtaag 12910330  T
Q  518 agtgt 522  Q
    |||||    
T  12910331 agtgt 12910335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #124
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 41 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 41678527 - 41678419
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatat--gtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgg 138  Q
    ||||||||||||||||||  ||| |||||| |||| || ||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||     
T  41678527 tgcaagtgtgagttatatatgtctcacatcagatagaaaaggggaggttaaacactttataagtgagaggacccataaa-cctttgccttaaggttttga 41678429  T
Q  139 gtaagagtgt 148  Q
    ||||||||||    
T  41678428 gtaagagtgt 41678419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #125
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 235
Target Start/End: Original strand, 30312831 - 30312983
Alignment:
Q  83 aggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct-tgcttgtgtggttgttctagcc 181  Q
    ||||||||||| |||||| | ||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||    ||||| ||||| ||| |||    
T  30312831 aggttgaacactttataacttagatgacccataaacttatttccttaaggttttgggtaaaagtgtgtagtctctctcaatttgtgcggttgctctggcc 30312930  T
Q  182 tcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtggtatcagag 235  Q
    |  ||||||  |||||||   |||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  30312931 tgaatgtgggtggtcccccgagctcccctc-gtgacccaacagtggtatcagag 30312983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #126
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 43 - 89
Target Start/End: Original strand, 6421306 - 6421352
Alignment:
Q  43 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttga 89  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6421306 caagtgtaagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttga 6421352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #127
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 417 - 463
Target Start/End: Original strand, 6421306 - 6421352
Alignment:
Q  417 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttga 463  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6421306 caagtgtaagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttga 6421352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #128
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 415 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 33954419 - 33954279
Alignment:
Q  415 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 514  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||  ||||| ||||   ||||| | | | ||| |||||| | | ||||||| | ||||||||    
T  33954419 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagatagaaaagttgaggttaaacattatataacttaaatgactcataaatcta-tgccttacgattttgggt 33954321  T
Q  515 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcct 556  Q
    |||||||||| ||||||||  ||| | |||||||||| ||||    
T  33954320 aagagtgtggcgtctctctcacttatatggttgttctggcct 33954279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #129
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 41 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 33954419 - 33954279
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||  ||||| ||||   ||||| | | | ||| |||||| | | ||||||| | ||||||||    
T  33954419 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagatagaaaagttgaggttaaacattatataacttaaatgactcataaatcta-tgccttacgattttgggt 33954321  T
Q  141 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcct 182  Q
    |||||||||| ||||||||  ||| | |||||||||| ||||    
T  33954320 aagagtgtggcgtctctctcacttatatggttgttctggcct 33954279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #130
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 457 - 533
Target Start/End: Original strand, 30312831 - 30312907
Alignment:
Q  457 aggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 533  Q
    ||||||||||| |||||| | ||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  30312831 aggttgaacactttataacttagatgacccataaacttatttccttaaggttttgggtaaaagtgtgtagtctctct 30312907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #131
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 469 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 25390372 - 25390313
Alignment:
Q  469 ttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtc 528  Q
    |||||| ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  25390372 ttataactaagaagacccataaacctattgtcttaaggttttgggtagaagtgtggtgtc 25390313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #132
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 95 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 25390372 - 25390313
Alignment:
Q  95 ttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtc 154  Q
    |||||| ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  25390372 ttataactaagaagacccataaacctattgtcttaaggttttgggtagaagtgtggtgtc 25390313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #133
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 108 - 159
Target Start/End: Original strand, 28226404 - 28226455
Alignment:
Q  108 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 159  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28226404 gacccataaacacattgtcttagggttttaggtaagagtgtggtgtctctct 28226455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #134
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 482 - 533
Target Start/End: Original strand, 28226404 - 28226455
Alignment:
Q  482 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 533  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28226404 gacccataaacacattgtcttagggttttaggtaagagtgtggtgtctctct 28226455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #135
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 56 - 103
Target Start/End: Original strand, 42515031 - 42515078
Alignment:
Q  56 tatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagta 103  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||    
T  42515031 tatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggttaaacaccttataagta 42515078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #136
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 83 - 140
Target Start/End: Original strand, 2336666 - 2336723
Alignment:
Q  83 aggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 140  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  || ||||||||| ||||||||    
T  2336666 aggttgaacactttataagtgagaggacccataaattcaatgccttaagattttgggt 2336723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #137
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 457 - 514
Target Start/End: Original strand, 2336666 - 2336723
Alignment:
Q  457 aggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 514  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  || ||||||||| ||||||||    
T  2336666 aggttgaacactttataagtgagaggacccataaattcaatgccttaagattttgggt 2336723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #138
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 41 - 77
Target Start/End: Original strand, 3673085 - 3673121
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaat 77  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3673085 tgcaagtgtgagttatatgtcccacattggataaaat 3673121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #139
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 111 - 159
Target Start/End: Original strand, 8904498 - 8904546
Alignment:
Q  111 ccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 159  Q
    ||||||||| |||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8904498 ccataaaccaattgccatatggttttgggtaaaagtgtggtgtctctct 8904546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #140
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 485 - 533
Target Start/End: Original strand, 8904498 - 8904546
Alignment:
Q  485 ccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 533  Q
    ||||||||| |||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8904498 ccataaaccaattgccatatggttttgggtaaaagtgtggtgtctctct 8904546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #141
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 112 - 159
Target Start/End: Original strand, 28226726 - 28226772
Alignment:
Q  112 cataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 159  Q
    ||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28226726 cataaacccattgtctta-ggtttttggtaagagtgtggtgtctctct 28226772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #142
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 486 - 533
Target Start/End: Original strand, 28226726 - 28226772
Alignment:
Q  486 cataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 533  Q
    ||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28226726 cataaacccattgtctta-ggtttttggtaagagtgtggtgtctctct 28226772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #143
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 145 - 223
Target Start/End: Original strand, 2109988 - 2110066
Alignment:
Q  145 gtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 223  Q
    |||||| ||| |||| |||||| || ||| ||||| |||||||||||||||||||  | ||||||||| | ||||||||    
T  2109988 gtgtggcgtccctctcgcttgtatgattgctctagtctcgatgtggacggtccccctgactcccctcagtaacccaaca 2110066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #144
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 519 - 597
Target Start/End: Original strand, 2109988 - 2110066
Alignment:
Q  519 gtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 597  Q
    |||||| ||| |||| |||||| || ||| ||||| |||||||||||||||||||  | ||||||||| | ||||||||    
T  2109988 gtgtggcgtccctctcgcttgtatgattgctctagtctcgatgtggacggtccccctgactcccctcagtaacccaaca 2110066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #145
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 382 - 437
Target Start/End: Original strand, 40734243 - 40734300
Alignment:
Q  382 tgatggactcacacttgagggggagtgt--tggtttgcaagtgtgagttatatgtccc 437  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||  | || | |||||||||||||||||||||    
T  40734243 tgatggaatcacacttgagggggagtgttattgtgtacaagtgtgagttatatgtccc 40734300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #146
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 482 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 13792585 - 13792536
Alignment:
Q  482 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctct 531  Q
    ||||| || |||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  13792585 gacccgtacacccattgacttgaggttttgggtaagagtgtgatgtctct 13792536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #147
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 13792585 - 13792536
Alignment:
Q  108 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctct 157  Q
    ||||| || |||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  13792585 gacccgtacacccattgacttgaggttttgggtaagagtgtgatgtctct 13792536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #148
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 41 - 77
Target Start/End: Original strand, 3672719 - 3672755
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaat 77  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3672719 tgcaagtatgagttatatgtcccacatcgaataaaat 3672755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #149
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 217 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 36785928 - 36785893
Alignment:
Q  217 cccaacagtggtatcagagccccggttcgacgaaggg 253  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  36785928 cccaacagtggtatcagagcccc-gttcgacgaaggg 36785893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 340; Significance: 0; HSPs: 103)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 340; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 43 - 573
Target Start/End: Original strand, 2377756 - 2378284
Alignment:
Q  43 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 142  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2377756 caagtgtgagttatatgtcccacatcggttaaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 2377855  T
Q  143 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtggtatcagagccccggt 242  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||   ||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2377856 gagtgtggtgtctttcttgcttgagtggtttttctagcctcgatgtggaaggtcccccgagcttccc-cagtgacccaacagtggtatcagagccccggt 2377954  T
Q  243 tcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtcattgcgcagaaagccgcaacagcggtacaagtagcaagtggctccttgtgcaggaacggcgatacaggc 342  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||  |||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||||     
T  2377955 tcgacgaagggtgcaaccgaggtagtcggtcgttgcgaagaaagtcgcaacagcagtacaagcagcaagtggctccttgtgcaggaacaatgatacaggt 2378054  T
Q  343 aaagtcaaaagcttccgctctaa-ggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacat 441  Q
    ||| | || ||||||||||  || |||||||| | | ||   ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2378055 aaact-aagagcttccgcttgaagggggagcatgatgaataaatggactcacatttg-gggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacat 2378152  T
Q  442 cggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtg 541  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  2378153 cggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttaggtaagaatgtggtgtctctcttgcttgag 2378252  T
Q  542 tggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 573  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2378253 tggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 2378284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 41 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 10074521 - 10073989
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 140  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10074521 tgcaagtgtgagttagaggtcccacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttgggt 10074422  T
Q  141 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtggtatcagagccccg 240  Q
    |||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||   |||||||||  | ||||||||||||||    
T  10074421 aagagtgtggtgtctctctcactagtgtggttgttctagcctcgatgtggatagtcccccaggctcccct-tgtgacccaactcttgtatcagagccccg 10074323  T
Q  241 gttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtca-ttgcgcagaaagccgcaacagcggtacaagtagcaagtggctccttgtgcaggaacggcgataca 339  Q
    |||||| ||||||  |||||||||| || ||||| ||||||||||||  |||||  ||||||||| |||||||||||| |||||||  ||||||||||||    
T  10074322 gttcgaagaagggtacgaccgaggccgccggtcagttgcgcagaaagtagcaacgacggtacaagcagcaagtggctcattgtgcaacaacggcgataca 10074223  T
Q  340 ggcaaagtcaaaagcttccgctctaa-ggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtccca 438  Q
     || |||| || ||||||||||  || |||||||| | | || |||| ||||| |||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||| |||||    
T  10074222 agc-aagt-aagagcttccgcttgaagggggagcatgatgaattgatagactcgcacttgagggggagtgtt-gtgtgcaagggtgagttatatatccca 10074126  T
Q  439 catcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgctt 538  Q
    ||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  10074125 catcggatagaaaagtaaacgttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaaaagtgtggtgtctctctcgctt 10074026  T
Q  539 gtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccccta 575  Q
     | |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10074025 atttggttgttctagcctcgacgtggacggtccccta 10073989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 145 - 573
Target Start/End: Original strand, 3409405 - 3409818
Alignment:
Q  145 gtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtggtatcagagccccggttc 244  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||               || || |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3409405 gtgtggtgtctctcttgcttatgcggttgttctagcctcgatgtggac---------------ccccagtgacccaatagtggtatcagagccccggttc 3409489  T
Q  245 gacgaagggagcgaccgaggcagctggtcattgcgcagaaagccgcaacagcggtacaagtagcaagtggctccttgtgcaggaacggcgatacaggcaa 344  Q
    |||||||     |||||||||||| |||| ||||| | ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||    
T  3409490 gacgaagtatatgaccgaggcagccggtcgttgcgtaaaaagcagcaacggcggtacaagtagcaagtggctccttgtgcagggatggcaatacaggcaa 3409589  T
Q  345 agtcaaaagcttccgctctaaggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgg 444  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  3409590 agtcaaaagcttcggctctaaggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtaccacatcag 3409689  T
Q  445 ataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtgg 544  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  3409690 ataaaatagtaaaagttgaacatcttataagtaagaggacccataaacccattgcctttattttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcgg 3409789  T
Q  545 ttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 573  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3409790 ttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 3409818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 43 - 572
Target Start/End: Original strand, 16107680 - 16108208
Alignment:
Q  43 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 142  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16107680 caagtgtgagttatatgtgtcacatcggataaaaaagtaaaggttaaacaccttataagtaagaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaa 16107779  T
Q  143 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt-cccctaggctcccc-tcactgacccaacagtggtatcagagccccg 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16107780 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgctctagcctcgatgtgggtggtaccccta-actccccttcagtgacccaacagtggtatcagagccccg 16107878  T
Q  241 gttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtc--attgcgcagaaagccgcaacagcggtacaagtagca-agtggctccttgtg---------cagga 328  Q
    |||||||||||||   |||||||||||| ||||   ||| ||||||||| ||||| |||||||||  ||||  || | ||  | ||         ||| |    
T  16107879 gttcgacgaagggtatgaccgaggcagccggtccatttgtgcagaaagcagcaacggcggtacaa--agcagtgtcggtctgtttgcgaagaaaccagca 16107976  T
Q  329 acggcgatacaggcaaagtcaaaagcttccgctctaaggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgag 426  Q
    |||||||| || | ||||| || ||||||||||  |||||||||| | | || ||||||||||||||||||||||||||||||  || | ||||||||||    
T  16107977 acggcgatgcaag-aaagt-aagagcttccgcttgaaggggagcatgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtacaagtgtgag 16108074  T
Q  427 ttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtg 526  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            ||||||||    
T  16108075 ttatatgttccacatcagataaaagagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg------------gtgtggtg 16108162  T
Q  527 tctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 572  Q
    ||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  16108163 tctctcttgcttgtggggttgttataacctcgatgtggacggtccc 16108208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 33 - 322
Target Start/End: Original strand, 29518495 - 29518784
Alignment:
Q  33 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29518495 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaagg 29518594  T
Q  133 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtggtatca 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||| | |||||||||||||||||    
T  29518595 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcctctca-taacccaacagtggtatca 29518693  T
Q  233 gagccccggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtca-ttgcgcagaaagccgcaacagcggtacaagtagcaagtggctccttgt 322  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| | || ||| | ||||||||||||| |||||  ||||||||| |||||||||||||||||    
T  29518694 gagccccggttcgacgaagggtgcgaccgagaccgccggttagttgcgcagaaagcagcaacgacggtacaagcagcaagtggctccttgt 29518784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 352 - 573
Target Start/End: Original strand, 29518857 - 29519078
Alignment:
Q  352 agcttccgctctaaggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaat 451  Q
    ||||||||||  | |||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29518857 agcttccgcttgagggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaat 29518956  T
Q  452 agtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttct 551  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29518957 agtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttct 29519056  T
Q  552 agcctcgatgtggacggtcccc 573  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  29519057 agcctcgatgtggacggtcccc 29519078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 33 - 281
Target Start/End: Original strand, 35210196 - 35210442
Alignment:
Q  33 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35210196 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaaaccattgccttaagg 35210295  T
Q  133 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtggtatca 232  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||    
T  35210296 ttttgggtaagagtgtggtgtttcttttgcttgtgcggttgctctagcctcgatgtggacggtcccct-ggctcccc-cagtgacccaacagtggtatca 35210393  T
Q  233 gagccccggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtcattgcgca 281  Q
     |||| |||||||||||||||  ||||||| | ||| |||| |||||||    
T  35210394 aagcctcggttcgacgaagggtacgaccgaagtagccggtcgttgcgca 35210442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 41 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 2580030 - 2579805
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  2580030 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacacattataagtaagaggacccataaacccacagccttaaggttttgggt 2579931  T
Q  141 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtggtatcagagccccg 240  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  2579930 aagaatgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggaaggtcccc-aagctcccctca-ttacccaacagtggtatcagagccccg 2579833  T
Q  241 gttcgacgaagggagcgaccgaggcagc 268  Q
    |||| ||||||||  |||||||||||||    
T  2579832 gttccacgaagggtacgaccgaggcagc 2579805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 32 - 199
Target Start/End: Original strand, 29518911 - 29519078
Alignment:
Q  32 gtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaag 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29518911 gtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaag 29519010  T
Q  132 gttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29519011 gttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 29519078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 407 - 573
Target Start/End: Original strand, 29518495 - 29518661
Alignment:
Q  407 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 506  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29518495 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaagg 29518594  T
Q  507 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 573  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29518595 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 29518661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 33 - 199
Target Start/End: Original strand, 32741171 - 32741337
Alignment:
Q  33 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32741171 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaagg 32741270  T
Q  133 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32741271 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 32741337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 407 - 573
Target Start/End: Original strand, 32741171 - 32741337
Alignment:
Q  407 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 506  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32741171 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaagg 32741270  T
Q  507 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 573  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32741271 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 32741337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 33 - 314
Target Start/End: Original strand, 26544041 - 26544321
Alignment:
Q  33 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  26544041 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacacgttataagtaagaggacccataaacccaccgccttaagg 26544140  T
Q  133 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtggtatca 232  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| |  ||||||   ||| ||| || |||||||||| |||||| |    
T  26544141 ttttgagtaagagtgtgatgtctctcttgcttgtgcgattgttctagcctcaatgtgaagagtcccccgagcttccc-cagtgacccaacactggtatta 26544239  T
Q  233 gagccccggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtcattgcgcagaaagccgcaacagcggtacaagtagcaagtgg 314  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||  ||||| |||||||||||||   |||||||  |||||||||    
T  26544240 gagccccggttcgatgaagggtgcgaccgaggcagccggtatttgcgtagaaagccgcaacgctggtacaaacagcaagtgg 26544321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 32 - 199
Target Start/End: Original strand, 2378117 - 2378284
Alignment:
Q  32 gtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaag 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2378117 gtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaag 2378216  T
Q  132 gttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 199  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2378217 gttttaggtaagaatgtggtgtctctcttgcttgagtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 2378284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 150; E-Value: 6e-79
Query Start/End: Original strand, 43 - 264
Target Start/End: Original strand, 16454577 - 16454797
Alignment:
Q  43 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 142  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  16454577 caagtgtgagttatgtgtcccacatcagataaaagaataaaagttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagattttggataa 16454676  T
Q  143 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtggtatcagagccccggt 242  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16454677 gagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgagctcccctc-gtgacccaacagtggtatcagagcccaggt 16454775  T
Q  243 tcgacgaagggagcgaccgagg 264  Q
    |||||||||||  |||||||||    
T  16454776 tcgacgaagggtacgaccgagg 16454797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 42 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 2578991 - 2578730
Alignment:
Q  42 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 141  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  2578991 gcaagtgtgatttatatgtccctcatcggataaaa-agtaaatgttgaataccttataaataagaggatccataaactcattaccttaaggttttgggta 2578893  T
Q  142 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtggtatcagagccccgg 241  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||    
T  2578892 agagtgtggtgtctcttttgcttgtgtggttgttctgacctcgatgtggacggtcccccaggctcccctca-tgaatcaacagtggtatcagagccccgg 2578794  T
Q  242 ttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtc--attgcgcagaaagccgcaacagcggtacaa 303  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||| ||||   ||| ||||||||| ||||| ||| |||||    
T  2578793 ttcgacgaagggtacgaccgaggcagccggtccgcttgggcagaaagcagcaacggcgttacaa 2578730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 46 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 2579645 - 2579387
Alignment:
Q  46 gtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagag 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | | ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  2579645 gtgtgagttatatgtcccacatcggacaaaaaagtaaaggtcggataccttataagtaagagggcccataaactcattgccttaaggttttgggtaaaag 2579546  T
Q  146 tgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtggtatcagagccccggttcg 245  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||  ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  2579545 tatggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctaacctcgatgtggatggttccacaggctcccctcac-gaatcaacagtggtatcagagccccggttcg 2579447  T
Q  246 acgaagggagcgaccgaggcagctggtc--attgcgcagaaagccgcaacagcggtacaa 303  Q
    ||||| ||  ||||||||||||| ||||   ||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  2579446 acgaacggtacgaccgaggcagccggtccacttgcgcagaaagcagcaacggcggtacaa 2579387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 148; E-Value: 9e-78
Query Start/End: Original strand, 407 - 598
Target Start/End: Original strand, 35210196 - 35210385
Alignment:
Q  407 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 506  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35210196 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaaaccattgccttaagg 35210295  T
Q  507 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacag 598  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||    
T  35210296 ttttgggtaagagtgtggtgtttcttttgcttgtgcggttgctctagcctcgatgtggacggtcccct-ggctcccc-cagtgacccaacag 35210385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 383 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 2578634 - 2578443
Alignment:
Q  383 gatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaga 480  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2578634 gatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccaca-cggataaaagagtaaaggttgaacactttataagtaaga 2578536  T
Q  481 ggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 573  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2578535 ggacccataaacccatagccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctcttttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 2578443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 33 - 189
Target Start/End: Original strand, 3409251 - 3409407
Alignment:
Q  33 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 132  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3409251 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaagg 3409350  T
Q  133 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtg 189  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3409351 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtg 3409407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 407 - 563
Target Start/End: Original strand, 3409251 - 3409407
Alignment:
Q  407 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 506  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3409251 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaagg 3409350  T
Q  507 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtg 563  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3409351 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtg 3409407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 143; E-Value: 9e-75
Query Start/End: Original strand, 382 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 10074553 - 10074352
Alignment:
Q  382 tgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 481  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10074553 tgatggactcacacttaagggggagtgttg-tgtgcaagtgtgagttagaggtcccacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 10074455  T
Q  482 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcc 581  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||    
T  10074454 gacccataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctcactagtgtggttgttctagcctcgatgtggatagtcccccaggctcc 10074355  T
Q  582 cct 584  Q
    |||    
T  10074354 cct 10074352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 41 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 10074149 - 10073918
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 140  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10074149 tgcaagggtgagttatatatcccacatcggatagaaaagtaaacgttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 10074050  T
Q  141 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtggtatcagagccccg 240  Q
    || |||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||  ||||| |||||||||| |||||||||| |||||    
T  10074049 aaaagtgtggtgtctctctcgcttatttggttgttctagcctcgacgtggacggtcccctaa-ctatcctcaatgacccaacaatggtatcagatccccg 10073951  T
Q  241 gttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtc 273  Q
    |||| ||||| ||  ||||||||||||| ||||    
T  10073950 gttcaacgaaaggtacgaccgaggcagccggtc 10073918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 138; E-Value: 8e-72
Query Start/End: Original strand, 28 - 210
Target Start/End: Original strand, 3415445 - 3415629
Alignment:
Q  28 acctgtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcct 127  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3415445 acctgtgttggtttgcgagtgtgagttatatgtcccacatcacataaaatagtaaaggttgaacaccatataagtaagaggacccataaacccattgcct 3415544  T
Q  128 taaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgt--tctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccct 210  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  3415545 taaggtttttggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctctagcctcgatgtggaaggtcccccaagctcccct 3415629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 33 - 223
Target Start/End: Original strand, 3058218 - 3058409
Alignment:
Q  33 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 132  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3058218 tgttggtttgcaagtgttagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtatgaggatccataaacccattgccttaagg 3058317  T
Q  133 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt-cccctaggctcccctcactgacccaaca 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||||||||||| || |||| | ||||||||||| || ||||||    
T  3058318 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtagggtggttctaacctcgatgtggaccgtcccccaaagctcccctcaccgaaccaaca 3058409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 407 - 597
Target Start/End: Original strand, 3058218 - 3058409
Alignment:
Q  407 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 506  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3058218 tgttggtttgcaagtgttagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtatgaggatccataaacccattgccttaagg 3058317  T
Q  507 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt-cccctaggctcccctcactgacccaaca 597  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||||||||||| || |||| | ||||||||||| || ||||||    
T  3058318 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtagggtggttctaacctcgatgtggaccgtcccccaaagctcccctcaccgaaccaaca 3058409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 32 - 199
Target Start/End: Original strand, 3409651 - 3409818
Alignment:
Q  32 gtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaag 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  3409651 gtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtaccacatcagataaaatagtaaaagttgaacatcttataagtaagaggacccataaacccattgcctttat 3409750  T
Q  132 gttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 199  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3409751 tttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 3409818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 382 - 586
Target Start/End: Original strand, 16454872 - 16455078
Alignment:
Q  382 tgatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaag 479  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||| | ||  ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  16454872 tgatggagtcacagttgagggggagtgttgttgtgtacaaatgtgagttatgtgtcccacatcagataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaat 16454971  T
Q  480 aggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggct 579  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |||    
T  16454972 aggacccataaacctattgccttaaggttttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgagct 16455071  T
Q  580 cccctca 586  Q
    |||||||    
T  16455072 cccctca 16455078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 406 - 584
Target Start/End: Original strand, 3415449 - 3415629
Alignment:
Q  406 gtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaag 505  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3415449 gtgttggtttgcgagtgtgagttatatgtcccacatcacataaaatagtaaaggttgaacaccatataagtaagaggacccataaacccattgccttaag 3415548  T
Q  506 gttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgt--tctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccct 584  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  3415549 gtttttggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctctagcctcgatgtggaaggtcccccaagctcccct 3415629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 407 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 14748504 - 14748342
Alignment:
Q  407 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 506  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  14748504 tgttgatttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataaataagaggacccataaactcattgcgttaagg 14748405  T
Q  507 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 573  Q
    ||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14748404 ttttgggtaagagtgtgg----tctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 14748342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 33 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 14748504 - 14748342
Alignment:
Q  33 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 132  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  14748504 tgttgatttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataaataagaggacccataaactcattgcgttaagg 14748405  T
Q  133 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 199  Q
    ||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14748404 ttttgggtaagagtgtgg----tctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 14748342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 415 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 2580030 - 2579860
Alignment:
Q  415 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 514  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  2580030 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacacattataagtaagaggacccataaacccacagccttaaggttttgggt 2579931  T
Q  515 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctca 586  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  2579930 aagaatgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggaaggtcccc-aagctcccctca 2579860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 34 - 199
Target Start/End: Original strand, 1846741 - 1846906
Alignment:
Q  34 gttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggt 133  Q
    ||||| |||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  1846741 gttgggttgcaagtgtgaattctatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagcacccataaatccattgccttaaggt 1846840  T
Q  134 tttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 199  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1846841 tttggataagagtgtggtgtctcttttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 1846906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 408 - 573
Target Start/End: Original strand, 1846741 - 1846906
Alignment:
Q  408 gttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggt 507  Q
    ||||| |||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  1846741 gttgggttgcaagtgtgaattctatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagcacccataaatccattgccttaaggt 1846840  T
Q  508 tttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 573  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1846841 tttggataagagtgtggtgtctcttttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 1846906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 43 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 2578598 - 2578443
Alignment:
Q  43 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 142  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2578598 caagtgtgagttatatgtcccaca-cggataaaagagtaaaggttgaacactttataagtaagaggacccataaacccatagccttaaggttttgggtaa 2578500  T
Q  143 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 199  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2578499 gagtgtggtgtctcttttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 2578443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 43 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 2579261 - 2579042
Alignment:
Q  43 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 142  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    |||| ||||||||||||  | |||||| ||||| |||    
T  2579261 caagtgttagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaagttgaacaccttataag----aggaaccataaacccataactttaaggctttggctaa 2579166  T
Q  143 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtggtatcagagccccggt 242  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  2579165 gagtgtggtgtctctcttgctcgtgtggttgttctagcctcgatgtgcacggtccccga-gctcccctca-tgacccaacagtgatatcagagtcccggt 2579068  T
Q  243 tcgacgaagggagcgaccgaggcagc 268  Q
    |||||||||||  |||||||||||||    
T  2579067 tcgacgaagggtacgaccgaggcagc 2579042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 386 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 2579678 - 2579478
Alignment:
Q  386 ggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacc 485  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | | ||||||||||||||||| ||    
T  2579678 ggactcacacttgagggagagtgttg-ttagcaggtgtgagttatatgtcccacatcggacaaaaaagtaaaggtcggataccttataagtaagagggcc 2579580  T
Q  486 cataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctc 585  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||  |||||||||||    
T  2579579 cataaactcattgccttaaggttttgggtaaaagtatggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctaacctcgatgtggatggttccacaggctcccctc 2579480  T
Q  586 ac 587  Q
    ||    
T  2579479 ac 2579478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 47 - 212
Target Start/End: Original strand, 16454913 - 16455078
Alignment:
Q  47 tgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagt 146  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16454913 tgtgagttatgtgtcccacatcagataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaataggacccataaacctattgccttaaggttttgggtaagagt 16455012  T
Q  147 gtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctca 212  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  16455013 gtggcgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgagctcccctca 16455078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 390 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 2579016 - 2578822
Alignment:
Q  390 tcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccata 489  Q
    |||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| |||||||| |||||    
T  2579016 tcacacttgagggggagtgttg-tgagcaagtgtgatttatatgtccctcatcggataaaa-agtaaatgttgaataccttataaataagaggatccata 2578919  T
Q  490 aacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctca 586  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2578918 aactcattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctcttttgcttgtgtggttgttctgacctcgatgtggacggtcccccaggctcccctca 2578822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 407 - 563
Target Start/End: Original strand, 26544041 - 26544197
Alignment:
Q  407 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 506  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  26544041 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacacgttataagtaagaggacccataaacccaccgccttaagg 26544140  T
Q  507 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtg 563  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||    
T  26544141 ttttgagtaagagtgtgatgtctctcttgcttgtgcgattgttctagcctcaatgtg 26544197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 33 - 211
Target Start/End: Original strand, 1127352 - 1127530
Alignment:
Q  33 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 132  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  1127352 tgttggtttgcaactgtgagttatatatcccacatcgggtaaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaacccattaccttaagg 1127451  T
Q  133 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctc 211  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||| |||| |||||||||||  ||||||| | |||||||||    
T  1127452 ttttgggtaagagtgtggcgtctctcttacttatgtggttgctctaacctcgatgtgggtggtccccaaagctcccctc 1127530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 407 - 585
Target Start/End: Original strand, 1127352 - 1127530
Alignment:
Q  407 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 506  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  1127352 tgttggtttgcaactgtgagttatatatcccacatcgggtaaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaacccattaccttaagg 1127451  T
Q  507 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctc 585  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||| |||| |||||||||||  ||||||| | |||||||||    
T  1127452 ttttgggtaagagtgtggcgtctctcttacttatgtggttgctctaacctcgatgtgggtggtccccaaagctcccctc 1127530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 417 - 598
Target Start/End: Original strand, 16454577 - 16454757
Alignment:
Q  417 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 516  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  16454577 caagtgtgagttatgtgtcccacatcagataaaagaataaaagttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagattttggataa 16454676  T
Q  517 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacag 598  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||  |||||||||||    
T  16454677 gagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgagctcccctc-gtgacccaacag 16454757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 383 - 598
Target Start/End: Complemental strand, 2579297 - 2579086
Alignment:
Q  383 gatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaga 480  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    |    
T  2579297 gatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtacaagtgttagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaagttgaacaccttataag----a 2579202  T
Q  481 ggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctc 580  Q
    ||| ||||||||||||  | |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||    
T  2579201 ggaaccataaacccataactttaaggctttggctaagagtgtggtgtctctcttgctcgtgtggttgttctagcctcgatgtgcacggtccccga-gctc 2579103  T
Q  581 ccctcactgacccaacag 598  Q
    |||||| |||||||||||    
T  2579102 ccctca-tgacccaacag 2579086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 47 - 199
Target Start/End: Original strand, 2843560 - 2843713
Alignment:
Q  47 tgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggaccc-ataaacccattgccttaaggttttgggtaagag 145  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2843560 tgtgagttatatgtttcacatcggataaaataataaaagttgaacaccttataagtaagaggaccccataaactcattgccttaaggttttgggtaagag 2843659  T
Q  146 tgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 199  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2843660 tgtggtatctctcttgcttgagtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 2843713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 421 - 573
Target Start/End: Original strand, 2843560 - 2843713
Alignment:
Q  421 tgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggaccc-ataaacccattgccttaaggttttgggtaagag 519  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2843560 tgtgagttatatgtttcacatcggataaaataataaaagttgaacaccttataagtaagaggaccccataaactcattgccttaaggttttgggtaagag 2843659  T
Q  520 tgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 573  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2843660 tgtggtatctctcttgcttgagtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 2843713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 382 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 10073804 - 10073604
Alignment:
Q  382 tgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 481  Q
    |||||||||||||||| || ||| |||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10073804 tgatggactcacacttaagagggggtgttg-tgtgcaagtgttagttatatgtcccacatcggagaaaa--gtaaaggttgaacaccttataagtaagag 10073708  T
Q  482 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcc 581  Q
    || |||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||    
T  10073707 gatccataaactcattggcttaagattttgggtaagagtgtggtgtctctctcactagtgtggttgttctagcatcgatgtggacggtccttcaggctcc 10073608  T
Q  582 cctc 585  Q
    ||||    
T  10073607 cctc 10073604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 417 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 5832182 - 5832007
Alignment:
Q  417 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 516  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||| ||||||||||    
T  5832182 caagtgtaagttatatgtcccacattggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaagcca-ccccttaagattttgggtaa 5832084  T
Q  517 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaa 595  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  5832083 aagtgtggtgtctctcttacttgtgtggttgttctagcctcgatgtagacggtcccc-aggctcccctca-tgacccaa 5832007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 43 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 5832182 - 5832007
Alignment:
Q  43 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 142  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||| ||||||||||    
T  5832182 caagtgtaagttatatgtcccacattggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaagcca-ccccttaagattttgggtaa 5832084  T
Q  143 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaa 221  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  5832083 aagtgtggtgtctctcttacttgtgtggttgttctagcctcgatgtagacggtcccc-aggctcccctca-tgacccaa 5832007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 41 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 10073772 - 10073604
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 140  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  10073772 tgcaagtgttagttatatgtcccacatcggagaaaa--gtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaactcattggcttaagattttgggt 10073675  T
Q  141 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctc 211  Q
    |||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||    
T  10073674 aagagtgtggtgtctctctcactagtgtggttgttctagcatcgatgtggacggtccttcaggctcccctc 10073604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 418 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 6999951 - 6999799
Alignment:
Q  418 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 517  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||||||||||| ||||    
T  6999951 aagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaaaagtaaaagttgaacaccttatatgtaagaggatccataaactcactgccttaaggttttggataag 6999852  T
Q  518 agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 570  Q
    ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6999851 agtgtggcgtctctcttgctaatgtggttgttctagtctcgatgtggacggtc 6999799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 44 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 6999951 - 6999799
Alignment:
Q  44 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 143  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||||||||||| ||||    
T  6999951 aagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaaaagtaaaagttgaacaccttatatgtaagaggatccataaactcactgccttaaggttttggataag 6999852  T
Q  144 agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 196  Q
    ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6999851 agtgtggcgtctctcttgctaatgtggttgttctagtctcgatgtggacggtc 6999799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 415 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 593867 - 593694
Alignment:
Q  415 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 514  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  593867 tgcaagtgtgagttgtatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaaccgactgccttaaggttttgggt 593768  T
Q  515 aagagtgtgg--tgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctca 586  Q
    || |||||||  | |||||||| |||||  ||||||||||| |||||||| ||||||||||   ||||||||||    
T  593767 aatagtgtggtatctctctcttacttgtacggttgttctaggctcgatgttgacggtcccccgagctcccctca 593694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 41 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 593867 - 593694
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 140  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  593867 tgcaagtgtgagttgtatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaaccgactgccttaaggttttgggt 593768  T
Q  141 aagagtgtgg--tgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctca 212  Q
    || |||||||  | |||||||| |||||  ||||||||||| |||||||| ||||||||||   ||||||||||    
T  593767 aatagtgtggtatctctctcttacttgtacggttgttctaggctcgatgttgacggtcccccgagctcccctca 593694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 41 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 12071849 - 12071621
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 140  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||| |||| || | |  || |||||||| ||||||   | ||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  12071849 tgcaagtgtgagttatatgtctcgcatcagatagaaaaatggagtttgaacactttataatagaaaggactcataaacctatgaccttaaggttttgggt 12071750  T
Q  141 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtggtatcagagccccg 240  Q
    |||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||    
T  12071749 aagagtgtggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtgaacggtcccctaagctcccctca-tgacctaacagtggtatcagagtcccg 12071651  T
Q  241 gttcgacgaagggagcgaccgaggcagctg 270  Q
     ||||| |||| |  ||||| |||||||||    
T  12071650 attcgatgaagagtacgaccaaggcagctg 12071621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 418 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 1950340 - 1950200
Alignment:
Q  418 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 517  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | | ||||||||||||||| |||||    
T  1950340 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttacaagtaagaggagccataaatctaatgccttaaggttttgagtaag 1950241  T
Q  518 agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcg 558  Q
    ||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  1950240 agtgtgacgtctctcttacttgtgcggttgttctagcctcg 1950200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 44 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 1950340 - 1950200
Alignment:
Q  44 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | | ||||||||||||||| |||||    
T  1950340 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttacaagtaagaggagccataaatctaatgccttaaggttttgagtaag 1950241  T
Q  144 agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcg 184  Q
    ||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  1950240 agtgtgacgtctctcttacttgtgcggttgttctagcctcg 1950200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 420 - 523
Target Start/End: Complemental strand, 32460733 - 32460630
Alignment:
Q  420 gtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagag 519  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32460733 gtgtgagttatatgtcccacatcgtataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagag 32460634  T
Q  520 tgtg 523  Q
    ||||    
T  32460633 tgtg 32460630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 46 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 32460733 - 32460630
Alignment:
Q  46 gtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagag 145  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32460733 gtgtgagttatatgtcccacatcgtataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagag 32460634  T
Q  146 tgtg 149  Q
    ||||    
T  32460633 tgtg 32460630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 41 - 195
Target Start/End: Original strand, 10911565 - 10911720
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaata-gtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttggg 139  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||      
T  10911565 tgcaagtgtgagttatatgtcctacatcagataaaaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaactcattgccttaaagttttgaa 10911664  T
Q  140 taagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 195  Q
    |||||||||| |||||||||| ||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  10911665 taagagtgtgatgtctctcttactaatgttgttgttcaagcctcgatgtggacggt 10911720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 415 - 569
Target Start/End: Original strand, 10911565 - 10911720
Alignment:
Q  415 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaata-gtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttggg 513  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||      
T  10911565 tgcaagtgtgagttatatgtcctacatcagataaaaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaactcattgccttaaagttttgaa 10911664  T
Q  514 taagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 569  Q
    |||||||||| |||||||||| ||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  10911665 taagagtgtgatgtctctcttactaatgttgttgttcaagcctcgatgtggacggt 10911720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 41 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 12085191 - 12084967
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 140  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| |||| || |||  || |||||||| ||||||   | ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||    
T  12085191 tgcaagtgtgagttatatgtcctgcatcagatagaa-agtggagtttgaacactttataatagaaaggactcataaaaccatggccttaaggttttgggt 12085093  T
Q  141 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtggtatcagagccccg 240  Q
    |||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||    
T  12085092 aagagtgtggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgcgaacggtctcctaagctcccctca-tgaccc-acagtggtatcagagtcccg 12084995  T
Q  241 gttcgacgaagggagcgaccgaggcagc 268  Q
    ||| || |||| |  |||| ||||||||    
T  12084994 gtttgatgaagagtacgactgaggcagc 12084967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 421 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 9062501 - 9062383
Alignment:
Q  421 tgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagt 520  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||    
T  9062501 tgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggactcataaactcattgtcttaa-gttttgggtaaaagt 9062403  T
Q  521 gtggtgtctctcttgcttgt 540  Q
    ||||| |||||||| |||||    
T  9062402 gtggtatctctcttacttgt 9062383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 47 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 9062501 - 9062383
Alignment:
Q  47 tgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagt 146  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||    
T  9062501 tgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggactcataaactcattgtcttaa-gttttgggtaaaagt 9062403  T
Q  147 gtggtgtctctcttgcttgt 166  Q
    ||||| |||||||| |||||    
T  9062402 gtggtatctctcttacttgt 9062383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 41 - 272
Target Start/End: Original strand, 31714671 - 31714899
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 140  Q
    ||||||||||| | |||||||| |||||||||| || |||  |||||||||    ||||| | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||    
T  31714671 tgcaagtgtgact-atatgtcctacatcggatagaaaagtggaggttgaacgttatataa-tgagaggacccattaactcattgccttaaggttttgagt 31714768  T
Q  141 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtggtatcagagccccg 240  Q
    |||||||||| || | | | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || || ||||||||| ||||||||| |||| || |||| ||||    
T  31714769 aagagtgtggcgttttt-tcgcttgtgtggttgctctagcctcgatgtggacggtctcccagactcccctcaatgacccaactgtggaattagagtcccg 31714867  T
Q  241 gttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggt 272  Q
    ||| |||||||||  ||||||||||| |||||    
T  31714868 gtttgacgaagggtacgaccgaggcaactggt 31714899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 41 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 12092640 - 12092429
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 140  Q
    |||||| ||| |||| ||||||||||||||||| || |||  ||||||| ||| |||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  12092640 tgcaagggtgtgttagatgtcccacatcggatagaaaagtggaggttgagcactttataagtgagaggatccataaactcattgccttaaggttttgagt 12092541  T
Q  141 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtggtatcagagccccg 240  Q
    |||| ||||||||||||||  |||||| ||||| ||| |||| |||||||  |||||||| ||| ||||||  || ||||||  |||||| |||||| ||    
T  12092540 aagactgtggtgtctctctcacttgtgaggttgctctggcctggatgtgggtggtccccttggcccccctc-gtgtcccaactctggtattagagccgcg 12092442  T
Q  241 gttcgacgaaggg 253  Q
    ||| |||||||||    
T  12092441 gtttgacgaaggg 12092429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 415 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 12071849 - 12071678
Alignment:
Q  415 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 514  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||| |||| || | |  || |||||||| ||||||   | ||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  12071849 tgcaagtgtgagttatatgtctcgcatcagatagaaaaatggagtttgaacactttataatagaaaggactcataaacctatgaccttaaggttttgggt 12071750  T
Q  515 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctca 586  Q
    |||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  12071749 aagagtgtggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtgaacggtcccctaagctcccctca 12071678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 382 - 534
Target Start/End: Original strand, 8481893 - 8482045
Alignment:
Q  382 tgatggactcacacttgagggggag--tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaag 479  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| |||| || |||  ||||||||||| |||||| | ||    
T  8481893 tgatggactcacacttgagggggagattgttg-tgtgcaagtgtgagttatatgtcc-acatcagatataaaagtggaggttgaacactttataaatgag 8481990  T
Q  480 aggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctt 534  Q
    | ||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8481991 atgactcataaactcattgccttaagattttgggtaagagtgtggtgtctctctt 8482045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 415 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 12085191 - 12085021
Alignment:
Q  415 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 514  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| |||| || |||  || |||||||| ||||||   | ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||    
T  12085191 tgcaagtgtgagttatatgtcctgcatcagatagaa-agtggagtttgaacactttataatagaaaggactcataaaaccatggccttaaggttttgggt 12085093  T
Q  515 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctca 586  Q
    |||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| ||||||||||    
T  12085092 aagagtgtggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgcgaacggtctcctaagctcccctca 12085021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 415 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 12092640 - 12092470
Alignment:
Q  415 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 514  Q
    |||||| ||| |||| ||||||||||||||||| || |||  ||||||| ||| |||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  12092640 tgcaagggtgtgttagatgtcccacatcggatagaaaagtggaggttgagcactttataagtgagaggatccataaactcattgccttaaggttttgagt 12092541  T
Q  515 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctc 585  Q
    |||| ||||||||||||||  |||||| ||||| ||| |||| |||||||  |||||||| ||| ||||||    
T  12092540 aagactgtggtgtctctctcacttgtgaggttgctctggcctggatgtgggtggtccccttggcccccctc 12092470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 410 - 567
Target Start/End: Complemental strand, 5958766 - 5958613
Alignment:
Q  410 tggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttt 509  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||| ||||| ||||| ||||    
T  5958766 tggtgtgcaattgtgagttatatgtgttacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataaataagagaactcataaactcattgtcttaaagttt 5958667  T
Q  510 tgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacg 567  Q
    ||||  |||||||| |||||||    |||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  5958666 tgggatagagtgtgatgtctct----cttgtgtgattgttctaacctcgatgtggacg 5958613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 36 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 5958766 - 5958613
Alignment:
Q  36 tggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttt 135  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||| ||||| ||||| ||||    
T  5958766 tggtgtgcaattgtgagttatatgtgttacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataaataagagaactcataaactcattgtcttaaagttt 5958667  T
Q  136 tgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacg 193  Q
    ||||  |||||||| |||||||    |||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  5958666 tgggatagagtgtgatgtctct----cttgtgtgattgttctaacctcgatgtggacg 5958613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 382 - 547
Target Start/End: Original strand, 6071098 - 6071264
Alignment:
Q  382 tgatggactcacacttgagggggag--tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaag 479  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||  ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | ||| || |||  ||||||||||| |||||||| ||    
T  6071098 tgatggactcacatttgaggggaagattgttg-tgtgcaagtgtgagttatatgtcccacattgaatagaaaagtggaggttgaacactttataagtgag 6071196  T
Q  480 aggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttg 547  Q
    | || |||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  6071197 atgatccataaactcattgccttaagattttggataagagtgtggcgtctctctcgcttgtatggttg 6071264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 41 - 173
Target Start/End: Original strand, 6071132 - 6071264
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||| || |||  ||||||||||| |||||||| ||| || |||||||| |||||||||||| |||||| |    
T  6071132 tgcaagtgtgagttatatgtcccacattgaatagaaaagtggaggttgaacactttataagtgagatgatccataaactcattgccttaagattttggat 6071231  T
Q  141 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttg 173  Q
    |||||||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  6071232 aagagtgtggcgtctctctcgcttgtatggttg 6071264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 415 - 596
Target Start/End: Original strand, 31714671 - 31714849
Alignment:
Q  415 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 514  Q
    ||||||||||| | |||||||| |||||||||| || |||  |||||||||    ||||| | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||    
T  31714671 tgcaagtgtgact-atatgtcctacatcggatagaaaagtggaggttgaacgttatataa-tgagaggacccattaactcattgccttaaggttttgagt 31714768  T
Q  515 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaac 596  Q
    |||||||||| || | | | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || || ||||||||| |||||||||    
T  31714769 aagagtgtggcgttttt-tcgcttgtgtggttgctctagcctcgatgtggacggtctcccagactcccctcaatgacccaac 31714849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 41 - 160
Target Start/End: Original strand, 8481927 - 8482045
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 140  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| || |||  ||||||||||| |||||| | ||| ||| ||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  8481927 tgcaagtgtgagttatatgtcc-acatcagatataaaagtggaggttgaacactttataaatgagatgactcataaactcattgccttaagattttgggt 8482025  T
Q  141 aagagtgtggtgtctctctt 160  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  8482026 aagagtgtggtgtctctctt 8482045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 382 - 488
Target Start/End: Original strand, 35210456 - 35210551
Alignment:
Q  382 tgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 481  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  35210456 tgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgc-----------cccacatcggataaaatagtaaaggttgaataccttgtaagtaagag 35210544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 419 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 17135223 - 17135058
Alignment:
Q  419 agtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaaga 518  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||| ||| || |||||||||| |||||||  ||||||| |||||    || ||||||| |||||    
T  17135223 agtgtgagttatatgtctcacatcggatagagaagtaaatgtttaataccttataagcaagaggattcataaactcattgttagaaagttttggataaga 17135124  T
Q  519 gtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccct 584  Q
    |||||  | |||| | ||||||| ||||||||  |||| |||||||||||||||| || |||||||    
T  17135123 gtgtgacggctctttcgcttgtgcggttgttccggccttgatgtggacggtcccccagactcccct 17135058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 45 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 17135223 - 17135058
Alignment:
Q  45 agtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaaga 144  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||| ||| || |||||||||| |||||||  ||||||| |||||    || ||||||| |||||    
T  17135223 agtgtgagttatatgtctcacatcggatagagaagtaaatgtttaataccttataagcaagaggattcataaactcattgttagaaagttttggataaga 17135124  T
Q  145 gtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccct 210  Q
    |||||  | |||| | ||||||| ||||||||  |||| |||||||||||||||| || |||||||    
T  17135123 gtgtgacggctctttcgcttgtgcggttgttccggccttgatgtggacggtcccccagactcccct 17135058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 48 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 30618766 - 30618584
Alignment:
Q  48 gtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtg 147  Q
    |||||||| | |||| ||||||| | ||| |||  ||| ||||||| |||||||||||| |||| |||||||  ||| ||||||||| ||||||| | ||    
T  30618766 gtgagttagaagtcctacatcggttgaaaaagtggaggatgaacactttataagtaagatgacc-ataaaccg-ttgtcttaaggttatgggtaaaaatg 30618669  T
Q  148 tggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtggtatcaga 234  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||  ||||||  ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||| |||||    
T  30618668 tggtgtctctcttacttatgtggttgctcttgcct-aatgtgggtggtccccaaggctcccctc-gtgacccaacagtggtctcaga 30618584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 383 - 531
Target Start/End: Original strand, 2975521 - 2975668
Alignment:
Q  383 gatggactcacacttgagggggagtgttg-gtttgcaagtgtgagttat-atgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaga 480  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||| ||||  |||||| ||| || ||||||||||||  ||| || |||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  2975521 gatgcactcacacttg-gggggagtgttgtgttt--aagtgtaagtaattatgtcccacatcaaatagaaaagtaaatgttgaacaccttataagcaaga 2975617  T
Q  481 ggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctct 531  Q
     |||||||||| || ||| ||||| ||||||  |||||||||| |||||||    
T  2975618 tgacccataaatcctttgtcttaaagttttgaataagagtgtgatgtctct 2975668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 352 - 474
Target Start/End: Original strand, 33605913 - 33606034
Alignment:
Q  352 agcttccgctctaaggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaat 451  Q
    ||||||||||| |||  | ||||| | || ||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||     
T  33605913 agcttccgctcgaagaagggcacggtgaattgatggactcacacttgagggggagtgat-gtgtgcaaatgtaagttatatgtcccacatcgaatagaaa 33606011  T
Q  452 agtaaaggttgaacaccttataa 474  Q
    |||  ||||||||||| ||||||    
T  33606012 agtggaggttgaacactttataa 33606034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 56 - 157
Target Start/End: Original strand, 2975567 - 2975668
Alignment:
Q  56 tatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtct 155  Q
    |||||||||||||  ||| || |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||| || ||| ||||| ||||||  |||||||||| |||||    
T  2975567 tatgtcccacatcaaatagaaaagtaaatgttgaacaccttataagcaagatgacccataaatcctttgtcttaaagttttgaataagagtgtgatgtct 2975666  T
Q  156 ct 157  Q
    ||    
T  2975667 ct 2975668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 61 - 114
Target Start/End: Original strand, 35210498 - 35210551
Alignment:
Q  61 cccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccat 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  35210498 cccacatcggataaaatagtaaaggttgaataccttgtaagtaagaggacccat 35210551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 422 - 598
Target Start/End: Complemental strand, 30618766 - 30618594
Alignment:
Q  422 gtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtg 521  Q
    |||||||| | |||| ||||||| | ||| |||  ||| ||||||| |||||||||||| |||| |||||||  ||| ||||||||| ||||||| | ||    
T  30618766 gtgagttagaagtcctacatcggttgaaaaagtggaggatgaacactttataagtaagatgacc-ataaaccg-ttgtcttaaggttatgggtaaaaatg 30618669  T
Q  522 tggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacag 598  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||  ||||||  ||||||| |||||||||||  |||||||||||    
T  30618668 tggtgtctctcttacttatgtggttgctcttgcct-aatgtgggtggtccccaaggctcccctc-gtgacccaacag 30618594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 166 - 236
Target Start/End: Original strand, 2975296 - 2975365
Alignment:
Q  166 tgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtggtatcagagc 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| || | ||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  2975296 tgtggttgttctagcctcgatgtggacagtcctct-gactcccctcagtgacctaacagtggtatcagagc 2975365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 165 - 253
Target Start/End: Original strand, 2975029 - 2975116
Alignment:
Q  165 gtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtggtatcagagccccggttcgacgaaggg 253  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||    ||||| |||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  2975029 gtgtggttgttctagcctcgatgtggcaggtcccacgcgctcctctca-tgatccaacagtgatatcagagccccggttcgaagaaggg 2975116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 483 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 22605345 - 22605301
Alignment:
Q  483 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 527  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22605345 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagaatgtggtgt 22605301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 109 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 22605345 - 22605301
Alignment:
Q  109 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 153  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22605345 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagaatgtggtgt 22605301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 483 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 11637811 - 11637760
Alignment:
Q  483 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctt 534  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  11637811 acccataaacccattgtcttaagattttggataagagtgtggtgtctctctt 11637760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 109 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 11637811 - 11637760
Alignment:
Q  109 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctt 160  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  11637811 acccataaacccattgtcttaagattttggataagagtgtggtgtctctctt 11637760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 452 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 14789325 - 14789279
Alignment:
Q  452 agtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattg 498  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  14789325 agtaaaggttgaacaccttacaagtaagaggacccataaaccaattg 14789279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 78 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 14789325 - 14789279
Alignment:
Q  78 agtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattg 124  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  14789325 agtaaaggttgaacaccttacaagtaagaggacccataaaccaattg 14789279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 483 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 21130147 - 21130103
Alignment:
Q  483 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 527  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21130147 acccataaatccattgccttaaggttttggataagagtgtggtgt 21130103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #95
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 109 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 21130147 - 21130103
Alignment:
Q  109 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 153  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21130147 acccataaatccattgccttaaggttttggataagagtgtggtgt 21130103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #96
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 41 - 268
Target Start/End: Original strand, 33605654 - 33605867
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 140  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||| |||| || |||  ||||||||||| |||||| | ||| |||| ||        | |||||| |||||||||    
T  33605654 tgcaagtgtgagctatatgtctcacatcagatagaaaagtggaggttgaacactttataattgagaagacctat--------ttccttaaagttttgggt 33605745  T
Q  141 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtggtatcagagccccg 240  Q
    ||| ||||||| ||||||| |||| ||       ||||||||| ||||||   ||| ||  ||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| |    
T  33605746 aagtgtgtggtatctctctcgcttatgc------tctagcctcaatgtgggttgtcaccctggctcccctcaatgacacaacagtggtattagagccctg 33605839  T
Q  241 gttcgacgaagggagcgaccgaggcagc 268  Q
     | ||||||||||   ||||||||||||    
T  33605840 ctacgacgaagggtaggaccgaggcagc 33605867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #97
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 507 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 10902496 - 10902438
Alignment:
Q  507 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 565  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||  ||| ||||||||    
T  10902496 ttttgggtaagagtgtggtgtctctctcacttgtatggttgttctgacctagatgtgga 10902438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #98
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 133 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 10902496 - 10902438
Alignment:
Q  133 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 191  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||  ||| ||||||||    
T  10902496 ttttgggtaagagtgtggtgtctctctcacttgtatggttgttctgacctagatgtgga 10902438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #99
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 540 - 598
Target Start/End: Original strand, 2975296 - 2975353
Alignment:
Q  540 tgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacag 598  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| || | ||||||||| ||||| |||||    
T  2975296 tgtggttgttctagcctcgatgtggacagtcctct-gactcccctcagtgacctaacag 2975353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #100
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 491 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 11638095 - 11638053
Alignment:
Q  491 acccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 533  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||    
T  11638095 acccattgccttaggattttgggtaagagtatggtgtctctct 11638053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #101
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 117 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 11638095 - 11638053
Alignment:
Q  117 acccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 159  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||    
T  11638095 acccattgccttaggattttgggtaagagtatggtgtctctct 11638053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #102
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 549 - 599
Target Start/End: Original strand, 35210554 - 35210603
Alignment:
Q  549 tctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacaga 599  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||||||||||    
T  35210554 tctagcctcgatgtggacggtccccctggctcccc-cagtgacccaacaga 35210603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #103
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 175 - 224
Target Start/End: Original strand, 35210554 - 35210602
Alignment:
Q  175 tctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacag 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||| || |||||||||||    
T  35210554 tctagcctcgatgtggacggtccccctggctcccc-cagtgacccaacag 35210602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 328; Significance: 0; HSPs: 143)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 33 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 37533530 - 37533011
Alignment:
Q  33 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 132  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||| | |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37533530 tgttgatttgtaagtgtgagttatatgttctacattgaataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaatccattgccttaagg 37533431  T
Q  133 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtggtatca 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||  |||||||||||||||||||    
T  37533430 ttttgggtaagagtgtggtgtctcttttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcg-tgacccaacagtggtatca 37533332  T
Q  233 gagccccggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtca-ttgcgcagaaagccgcaacagcggtacaagtagcaagtggctccttgtgcaggaacg 331  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||| |||||  ||||||||| |||||                   ||    
T  37533331 gagccccggttcgacgaagggtgcgaccgaggccgccggtcagttgcgtagaaagcagcaacgacggtacaagcagcaa-------------------cg 37533251  T
Q  332 gcgatacaggcaaagtcaaaagcttccgctctaaggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttata 431  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37533250 gcgatacagacaaagtaaaaagcttccgctcta-ggggaacacgttaaagtgatggactcacgcttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttata 37533152  T
Q  432 tgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctct 531  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37533151 tgtcccacattggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttgggtaa-agtgtggtgtctct 37533053  T
Q  532 cttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 573  Q
    |||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37533052 cttgcttgtgcgcttgttctaacctcgatgtggacggtcccc 37533011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 41 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 22567196 - 22566702
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 140  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  22567196 tgcaagtgtgagtaatatgtcc-acatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggtttttggt 22567098  T
Q  141 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtggtatcagagcccc- 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||   ||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||     
T  22567097 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtggggttgttcgggcctcgatgtggatggtcccccgagctcccctcaacgacccaatagtggtatcagagccccc 22566998  T
Q  240 ggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtca-ttgcgcagaaagccgcaacagcggtacaagtagcaagtggctccttgtgcaggaacggcgatac 338  Q
    ||| ||||||||||  ||||| ||||  | ||| | ||| ||||||| | ||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | ||||    
T  22566997 ggtccgacgaagggtacgaccaaggccaccggttagttgtgcagaaaacagcaaagacggtacaagaagcaagtggctccttgtgcagcaacgacaatac 22566898  T
Q  339 aggcaaagtcaaaagcttccgctctaaggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcc 436  Q
    | |||| || |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||||||||    
T  22566897 aagcaa-gtaaaaagcttccgctctggggggagcacgataaagtgatagactaacatttgagggggagtgttgttgtatgcaagtgtgagtaatatgtcc 22566799  T
Q  437 cacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctt 534  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22566798 cacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtgg-gtctctctt 22566702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 228 - 570
Target Start/End: Original strand, 14681323 - 14681663
Alignment:
Q  228 tatcagagccccggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtcattgcgcagaaagccgcaacagcggtacaagtagcaagtggctccttgtgcagg 327  Q
    |||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||| ||||||    
T  14681323 tatcagagccccggttggatgaagggtgcgaccgaggcagccggttgttgcgcagaaagccgcaacagcggtacaaacagcaaatggctccttatgcagg 14681422  T
Q  328 aacggcgatacaggcaaagtcaaaagcttccgctctaagggg--agcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtga 425  Q
    || ||||||||| ||||||| || ||||||||||  ||||||  |||| | | ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14681423 aa-ggcgatacatgcaaagt-aagagcttccgcttgaaggggggagcatgatgaatagatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtaa 14681520  T
Q  426 gttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggt 525  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14681521 gttatatgtcccacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttgtaagtaagagggcccataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgtggt 14681620  T
Q  526 gtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 570  Q
    |||||||   |  |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14681621 gtctctca--caagtgtggttgttctagccttgatgtggacggtc 14681663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 32 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 37533177 - 37532897
Alignment:
Q  32 gtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaag 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  37533177 gtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacattggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaag 37533078  T
Q  132 gttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtggtatc 231  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||   |||||| ||  ||||||||||||||||||    
T  37533077 gttttgggtaa-agtgtggtgtctctcttgcttgtgcgcttgttctaacctcgatgtggacggtcccccgcgctcccatc-gtgacccaacagtggtatc 37532980  T
Q  232 agagccccggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtca-ttgcgcagaaagccgcaacagcggtacaagtagcaagtg 313  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||| |||||  | ||||||| ||||||||    
T  37532979 agagccccggttcgacgaagggtgcgaccgaggccgccggtcagttgcgcagaaagcagcaacgactgtacaagcagcaagtg 37532897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 41 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 1085774 - 1085543
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1085774 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacactttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 1085675  T
Q  141 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtggtatcagagccccg 240  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  1085674 aagagtgtggcgtctctcttacttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccccctggctcccctca-tgacccaacagtggtatcatagccccg 1085576  T
Q  241 gttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtc 273  Q
    |||||| ||||||   |||||||||||| ||||    
T  1085575 gttcgatgaagggtatgaccgaggcagccggtc 1085543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 415 - 598
Target Start/End: Complemental strand, 1085774 - 1085592
Alignment:
Q  415 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 514  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1085774 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacactttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 1085675  T
Q  515 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacag 598  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||    
T  1085674 aagagtgtggcgtctctcttacttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccccctggctcccctca-tgacccaacag 1085592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 148; E-Value: 9e-78
Query Start/End: Original strand, 328 - 544
Target Start/End: Original strand, 7553937 - 7554154
Alignment:
Q  328 aacggcgatacaggcaaagtcaaaagcttccgctctaaggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtga 425  Q
    |||||||| ||| ||||||| || ||||||||||  | |||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||    
T  7553937 aacggcgacacatgcaaagt-aagagcttccgcttgagggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtgcaagtgtga 7554035  T
Q  426 gttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggt 525  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7554036 gttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaacccatagccttaaggttttgggtaagagtgtggt 7554135  T
Q  526 gtctctcttgcttgtgtgg 544  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  7554136 gtctctctcgcttgtgtgg 7554154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 41 - 223
Target Start/End: Original strand, 7517580 - 7517762
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7517580 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 7517679  T
Q  141 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 223  Q
    ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| | ||||||||    
T  7517680 aagagtgtggtgtctgtctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtgggtggtccccttggctcccctcagtaacccaaca 7517762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 415 - 597
Target Start/End: Original strand, 7517580 - 7517762
Alignment:
Q  415 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 514  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7517580 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 7517679  T
Q  515 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 597  Q
    ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| | ||||||||    
T  7517680 aagagtgtggtgtctgtctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtgggtggtccccttggctcccctcagtaacccaaca 7517762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 143; E-Value: 9e-75
Query Start/End: Original strand, 35 - 225
Target Start/End: Original strand, 29157559 - 29157749
Alignment:
Q  35 ttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtt 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  29157559 ttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacaccggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagacgacccataaatccattgccttaaggtt 29157658  T
Q  135 ttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagt 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||| || ||||||||||||| || || ||| ||||||||||||||||||    
T  29157659 ttgggtaagagtgtggtgtctctcttgctcgtgtagttgctctagtcttgatgtggacggtctcccagactctcctcactgacccaacagt 29157749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 409 - 598
Target Start/End: Original strand, 29157559 - 29157748
Alignment:
Q  409 ttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtt 508  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  29157559 ttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacaccggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagacgacccataaatccattgccttaaggtt 29157658  T
Q  509 ttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacag 598  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||| || ||||||||||||| || || ||| |||||||||||||||||    
T  29157659 ttgggtaagagtgtggtgtctctcttgctcgtgtagttgctctagtcttgatgtggacggtctcccagactctcctcactgacccaacag 29157748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 383 - 573
Target Start/End: Original strand, 30244236 - 30244428
Alignment:
Q  383 gatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaga 480  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30244236 gatgaactcacacttgagggggagtgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaagaccttataagtaaga 30244335  T
Q  481 ggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 573  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  30244336 ggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctcacttgtgtggttgttcaagcctcgatgtggatggtcccc 30244428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 43 - 307
Target Start/End: Original strand, 45433243 - 45433505
Alignment:
Q  43 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 142  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  45433243 caagtgtgagttatatgatccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagagaactcataaacctattgccttaagattttgggtaa 45433342  T
Q  143 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtggtatcagagccccggt 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||  ||||||  ||   ||||||||| ||||||    
T  45433343 gagtgtggtgtctctcttgcttgtggggttgttctagcctcgatgtggtcggtccccctggctcccctctatgaccctgca---gtatcagag-cccggt 45433438  T
Q  243 tcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtc--attgcgcagaaagccgcaacagcggtacaagtag 307  Q
    ||||| |||||  ||||||||||||||||||   ||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||    
T  45433439 tcgacaaagggtacgaccgaggcagctggtccgtttgcgcataaagcagcaacggcggttcaagtag 45433505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 407 - 598
Target Start/End: Complemental strand, 37533530 - 37533340
Alignment:
Q  407 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 506  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||| | |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37533530 tgttgatttgtaagtgtgagttatatgttctacattgaataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaatccattgccttaagg 37533431  T
Q  507 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacag 598  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||  |||||||||||    
T  37533430 ttttgggtaagagtgtggtgtctcttttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctc-gtgacccaacag 37533340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 415 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 23535 - 23377
Alignment:
Q  415 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 514  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23535 tgcaattgtgagttatatgttccacatcggatacaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacctattgccttaaggttttgggt 23436  T
Q  515 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 573  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23435 aagagtgtggtgtctctcttgcatgtgcggttgttctagcctcgatttggacggtcccc 23377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 41 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 23535 - 23377
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 140  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23535 tgcaattgtgagttatatgttccacatcggatacaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacctattgccttaaggttttgggt 23436  T
Q  141 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 199  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23435 aagagtgtggtgtctctcttgcatgtgcggttgttctagcctcgatttggacggtcccc 23377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 383 - 599
Target Start/End: Original strand, 30245043 - 30245256
Alignment:
Q  383 gatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaga 480  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  30245043 gatggactcgcacttgagggggagtgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgttccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaaga 30245142  T
Q  481 ggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctc 580  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||   ||||    
T  30245143 cgacccataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctct----cttgtgtggttgttcaagcctcgatgtggatggtcccccgagctc 30245238  T
Q  581 ccctcactgacccaacaga 599  Q
    |||||  ||||||||||||    
T  30245239 ccctc-gtgacccaacaga 30245256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 43 - 273
Target Start/End: Original strand, 47129097 - 47129324
Alignment:
Q  43 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 142  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||     
T  47129097 caagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacctcttataagtaagaggacccataaacccatcgctttaaggttttgggtag 47129196  T
Q  143 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtggtatcagagccccggt 242  Q
    |||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| | |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  47129197 gagtgtggtgtctctctcacaagtgtggttgttctagcctcaatgtagacggtccccga-gctcccctca-tgatccaacagtggtatcagagcccc-gt 47129293  T
Q  243 tcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtc 273  Q
    |||| ||| || |||| ||||||||| ||||    
T  47129294 tcgatgaatggtgcgatcgaggcagccggtc 47129324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 422 - 599
Target Start/End: Original strand, 11845198 - 11845374
Alignment:
Q  422 gtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtg 521  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11845198 gtgagttatatgttccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaatccattgccttaaggttttggataagagtg 11845297  T
Q  522 tggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacaga 599  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||| || ||||||||||||    
T  11845298 tggtgtctctcttgcttgtgcagttgttctagcctcgatgtagacggtcccccgtgctcccc-cagtgacccaacaga 11845374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 43 - 268
Target Start/End: Original strand, 45754718 - 45754939
Alignment:
Q  43 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 142  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  45754718 caagtgtgagttatatgtcc-acatcggataaaatagtaaatgttgaacaccttataagtaagatgactcataaacccatagccttaaggttttgggtaa 45754816  T
Q  143 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtggtatcagagccccggt 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||| |    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  45754817 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcaagcctcgatgtag-cggtcactcgagctcccc-caatgacccaacagtggtatcagagcccc-gt 45754913  T
Q  243 tcgacgaagggagcgaccgaggcagc 268  Q
    ||| |||||||   ||||||||||||    
T  45754914 tcggcgaagggtatgaccgaggcagc 45754939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 41 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 8128599 - 8128387
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 140  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| || | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |    
T  8128599 tgcaagtgtgagttatatgtcccatatcggatagaaaaataaaggttgaacaccttatatgtaagaggacccataaacccataaccttaaggttttggtt 8128500  T
Q  141 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtggtatcagagccccg 240  Q
    |||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||| |||||||| || ||||||    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |    
T  8128499 aagagtgtggtgtcactctcgcttatgtggttgttctagcatcgatgtgaacagtcccccgcactcccctcactaacccaacagtggtatcaaagccctg 8128400  T
Q  241 gttcgacgaaggg 253  Q
    |||||||||||||    
T  8128399 gttcgacgaaggg 8128387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 48 - 224
Target Start/End: Original strand, 11845198 - 11845373
Alignment:
Q  48 gtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtg 147  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11845198 gtgagttatatgttccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaatccattgccttaaggttttggataagagtg 11845297  T
Q  148 tggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacag 224  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||| || |||||||||||    
T  11845298 tggtgtctctcttgcttgtgcagttgttctagcctcgatgtagacggtcccccgtgctcccc-cagtgacccaacag 11845373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 43 - 199
Target Start/End: Original strand, 30244272 - 30244428
Alignment:
Q  43 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 142  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30244272 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaagaccttataagtaagaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaa 30244371  T
Q  143 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 199  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  30244372 gagtgtggtgtctctctcacttgtgtggttgttcaagcctcgatgtggatggtcccc 30244428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 41 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 40094932 - 40094664
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 140  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  40094932 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcgaataaaagagtaaaggttcaacaccttataagtaagaggacccataaacccatcgtcttaaggttttgggt 40094833  T
Q  141 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctagg------ctcccctcactgacccaacagtggtatcaga 234  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||   |      | |||| | | |||| |||||||||||||||    
T  40094832 aagagtgtggcgtctctcttgcttgtgaggttgttctagcctcgatgtggtcggtcccccgagtccccccccccccccccgacctaacagtggtatcaga 40094733  T
Q  235 gccccggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtc--attgcgcagaaagccgcaacagcggtaca 302  Q
    | ||| |||||||||||||  ||||||||||||| ||||   ||||||||||||  ||||| ||||||||    
T  40094732 g-ccctgttcgacgaagggtacgaccgaggcagccggtccgtttgcgcagaaagtagcaacggcggtaca 40094664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 43 - 199
Target Start/End: Original strand, 6054562 - 6054718
Alignment:
Q  43 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 142  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6054562 caagtgttagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgccttaaggttttgggtaa 6054661  T
Q  143 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 199  Q
    |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6054662 gagtgtggtgtctctcctacttgtatggttgttctagccttgatgtggacggtcccc 6054718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 417 - 573
Target Start/End: Original strand, 6054562 - 6054718
Alignment:
Q  417 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 516  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6054562 caagtgttagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgccttaaggttttgggtaa 6054661  T
Q  517 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 573  Q
    |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6054662 gagtgtggtgtctctcctacttgtatggttgttctagccttgatgtggacggtcccc 6054718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 417 - 585
Target Start/End: Original strand, 45433243 - 45433411
Alignment:
Q  417 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 516  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  45433243 caagtgtgagttatatgatccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagagaactcataaacctattgccttaagattttgggtaa 45433342  T
Q  517 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctc 585  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||    
T  45433343 gagtgtggtgtctctcttgcttgtggggttgttctagcctcgatgtggtcggtccccctggctcccctc 45433411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 415 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 40094932 - 40094774
Alignment:
Q  415 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 514  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  40094932 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcgaataaaagagtaaaggttcaacaccttataagtaagaggacccataaacccatcgtcttaaggttttgggt 40094833  T
Q  515 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 573  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  40094832 aagagtgtggcgtctctcttgcttgtgaggttgttctagcctcgatgtggtcggtcccc 40094774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 415 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 22567196 - 22567017
Alignment:
Q  415 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 514  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  22567196 tgcaagtgtgagtaatatgtcc-acatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggtttttggt 22567098  T
Q  515 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaa 595  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||   ||||||||||  |||||||    
T  22567097 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtggggttgttcgggcctcgatgtggatggtcccccgagctcccctcaacgacccaa 22567017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 415 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 36939891 - 36939741
Alignment:
Q  415 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 514  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36939891 tgcaagtgtgagttatatgtcccaaatcgtataaaatagtaaaagttgaacaccttataagtaagaggacccataaatccattgccttaaggttttgggt 36939792  T
Q  515 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 565  Q
    || |||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  36939791 aaaagtgtggtgtttctcttgcttatgcggttgttctagcctcgatgtgga 36939741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 41 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 36939891 - 36939741
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 140  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36939891 tgcaagtgtgagttatatgtcccaaatcgtataaaatagtaaaagttgaacaccttataagtaagaggacccataaatccattgccttaaggttttgggt 36939792  T
Q  141 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 191  Q
    || |||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  36939791 aaaagtgtggtgtttctcttgcttatgcggttgttctagcctcgatgtgga 36939741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 328 - 573
Target Start/End: Original strand, 45434548 - 45434794
Alignment:
Q  328 aacggcgatacaggcaaagtcaaaagcttccgctctaagggg-agcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgag 426  Q
    |||||||||||| ||||    |||||||||||||  |||||| |||| | | || ||| ||||||||||||| ||||| ||  | || | ||||||| ||    
T  45434548 aacggcgatacaagcaagtaaaaaagcttccgcttgaagggggagcatgatgaattgaaggactcacacttgggggggtgttgttgtgtacaagtgtaag 45434647  T
Q  427 ttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtg 526  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  45434648 ttatatgtcccacatcggataaaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacttactgccttaaggttttgggtaagagtgtgatg 45434747  T
Q  527 tctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 573  Q
    |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  45434748 tctctcttacttgtggagttgttctagcctcgatgtgatcggtcccc 45434794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 41 - 170
Target Start/End: Original strand, 7554025 - 7554154
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7554025 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaacccatagccttaaggttttgggt 7554124  T
Q  141 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtgg 170  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7554125 aagagtgtggtgtctctctcgcttgtgtgg 7554154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 32 - 196
Target Start/End: Original strand, 14681501 - 14681663
Alignment:
Q  32 gtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaag 131  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  14681501 gtgttggtttgcaagtgtaagttatatgtcccacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttgtaagtaagagggcccataaacccattgtcttaag 14681600  T
Q  132 gttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   |  |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14681601 gttttgggtaagagtgtggtgtctctca--caagtgtggttgttctagccttgatgtggacggtc 14681663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 417 - 562
Target Start/End: Original strand, 45754718 - 45754862
Alignment:
Q  417 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 516  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  45754718 caagtgtgagttatatgtcc-acatcggataaaatagtaaatgttgaacaccttataagtaagatgactcataaacccatagccttaaggttttgggtaa 45754816  T
Q  517 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgt 562  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  45754817 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcaagcctcgatgt 45754862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 49 - 189
Target Start/End: Original strand, 19122740 - 19122879
Alignment:
Q  49 tgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgt 148  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19122740 tgagttatatgtcc-acatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaatccattgccttaaggttttgggtaagagtgt 19122838  T
Q  149 ggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtg 189  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19122839 ggtgtctatcttgcttgtgtggttgttctagtctcgatgtg 19122879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 423 - 563
Target Start/End: Original strand, 19122740 - 19122879
Alignment:
Q  423 tgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgt 522  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19122740 tgagttatatgtcc-acatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaatccattgccttaaggttttgggtaagagtgt 19122838  T
Q  523 ggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtg 563  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19122839 ggtgtctatcttgcttgtgtggttgttctagtctcgatgtg 19122879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 43 - 224
Target Start/End: Original strand, 30245079 - 30245255
Alignment:
Q  43 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 142  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30245079 caagtgtgagttatatgttccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagacgacccataaactcattgccttaaggttttgggtaa 30245178  T
Q  143 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacag 224  Q
    |||||||||||||||    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||   |||||||||  |||||||||||    
T  30245179 gagtgtggtgtctct----cttgtgtggttgttcaagcctcgatgtggatggtcccccgagctcccctc-gtgacccaacag 30245255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 41 - 199
Target Start/End: Original strand, 24177435 - 24177593
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 140  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  24177435 tgcaagtatgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggctgaacaccttataagtaagcggacccataaacccattgccttaaagtttttggt 24177534  T
Q  141 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 199  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||||||| |||||||||||||    
T  24177535 aagagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgtcttagcctcgacgtggacggtcccc 24177593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 415 - 573
Target Start/End: Original strand, 24177435 - 24177593
Alignment:
Q  415 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 514  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  24177435 tgcaagtatgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggctgaacaccttataagtaagcggacccataaacccattgccttaaagtttttggt 24177534  T
Q  515 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 573  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||||||| |||||||||||||    
T  24177535 aagagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgtcttagcctcgacgtggacggtcccc 24177593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 421 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 34218186 - 34218036
Alignment:
Q  421 tgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagt 520  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34218186 tgtgagttatatgtctcacatcggataaaaaagtaaatgttgaacaccttataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagt 34218087  T
Q  521 gtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 571  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34218086 gtggtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcc 34218036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 47 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 34218186 - 34218036
Alignment:
Q  47 tgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagt 146  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34218186 tgtgagttatatgtctcacatcggataaaaaagtaaatgttgaacaccttataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagt 34218087  T
Q  147 gtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 197  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34218086 gtggtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcc 34218036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 43 - 199
Target Start/End: Original strand, 45434638 - 45434794
Alignment:
Q  43 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 142  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||    
T  45434638 caagtgtaagttatatgtcccacatcggataaaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacttactgccttaaggttttgggtaa 45434737  T
Q  143 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 199  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  45434738 gagtgtgatgtctctcttacttgtggagttgttctagcctcgatgtgatcggtcccc 45434794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 415 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 118459 - 118277
Alignment:
Q  415 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 514  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||    
T  118459 tgcaagtgtaagttatatgtcccacatcagatagaaaagtaaaggttgaacacctaataagtaagaggatccataaacccattaccgtaaggttttgggt 118360  T
Q  515 aagagtgtggtgtc--tctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 597  Q
    |||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||    
T  118359 aagagtgtggcgtctatctcttgcttgtgtggttgttctagctttgatgtggacggtcccc-aggctcccc-cagtgacccaaca 118277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 41 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 118459 - 118277
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 140  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||    
T  118459 tgcaagtgtaagttatatgtcccacatcagatagaaaagtaaaggttgaacacctaataagtaagaggatccataaacccattaccgtaaggttttgggt 118360  T
Q  141 aagagtgtggtgtc--tctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 223  Q
    |||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||    
T  118359 aagagtgtggcgtctatctcttgcttgtgtggttgttctagctttgatgtggacggtcccc-aggctcccc-cagtgacccaaca 118277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 417 - 586
Target Start/End: Original strand, 47129097 - 47129265
Alignment:
Q  417 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 516  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||     
T  47129097 caagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacctcttataagtaagaggacccataaacccatcgctttaaggttttgggtag 47129196  T
Q  517 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctca 586  Q
    |||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| | ||||||||||    
T  47129197 gagtgtggtgtctctctcacaagtgtggttgttctagcctcaatgtagacggtccccga-gctcccctca 47129265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 415 - 598
Target Start/End: Complemental strand, 8128599 - 8128416
Alignment:
Q  415 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 514  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| || | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |    
T  8128599 tgcaagtgtgagttatatgtcccatatcggatagaaaaataaaggttgaacaccttatatgtaagaggacccataaacccataaccttaaggttttggtt 8128500  T
Q  515 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacag 598  Q
    |||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||| |||||||| || ||||||    ||||||||||| |||||||||    
T  8128499 aagagtgtggtgtcactctcgcttatgtggttgttctagcatcgatgtgaacagtcccccgcactcccctcactaacccaacag 8128416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 41 - 235
Target Start/End: Original strand, 36622960 - 36623153
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36622960 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttaaacattttataagtaggaggatccataaatccattgccttaaggttttgggt 36623059  T
Q  141 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtggtatcagag 235  Q
    | |||| ||||| ||||||| |||||||| |||||||  ||| ||||||||||||||| |  |||||||||| |||||||||  |||||| ||||    
T  36623060 aggagtatggtgcctctcttacttgtgtgattgttctgaccttgatgtggacggtcccttgagctcccctca-tgacccaactctggtatgagag 36623153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 415 - 596
Target Start/End: Original strand, 36622960 - 36623140
Alignment:
Q  415 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 514  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36622960 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttaaacattttataagtaggaggatccataaatccattgccttaaggttttgggt 36623059  T
Q  515 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaac 596  Q
    | |||| ||||| ||||||| |||||||| |||||||  ||| ||||||||||||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  36623060 aggagtatggtgcctctcttacttgtgtgattgttctgaccttgatgtggacggtcccttgagctcccctca-tgacccaac 36623140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 46 - 199
Target Start/End: Original strand, 30032572 - 30032725
Alignment:
Q  46 gtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagag 145  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  30032572 gtgtgagttatatgtcccacatcgaataaaagagtaagtgttgaacaccttataagtaagagtatccataaacctatagccttaaggttttgggtaagag 30032671  T
Q  146 tgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 199  Q
    ||||   ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30032672 tgtgacatctctcttgcttgtgcggttgttctatcctcgatgtggacggtcccc 30032725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 420 - 573
Target Start/End: Original strand, 30032572 - 30032725
Alignment:
Q  420 gtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagag 519  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  30032572 gtgtgagttatatgtcccacatcgaataaaagagtaagtgttgaacaccttataagtaagagtatccataaacctatagccttaaggttttgggtaagag 30032671  T
Q  520 tgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 573  Q
    ||||   ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30032672 tgtgacatctctcttgcttgtgcggttgttctatcctcgatgtggacggtcccc 30032725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 44 - 197
Target Start/End: Original strand, 9901648 - 9901799
Alignment:
Q  44 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 143  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  9901648 aagtgtgagttatatgtcc-acatcggataaaacagtaaaggttgaacatcttatacgta-gaggatccataaactcattgtcttaaggttttgggtaag 9901745  T
Q  144 agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 197  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  9901746 agtgtggtgtctctcttgctagtgcggttgttctagcctcggtgtggactgtcc 9901799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 418 - 571
Target Start/End: Original strand, 9901648 - 9901799
Alignment:
Q  418 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 517  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  9901648 aagtgtgagttatatgtcc-acatcggataaaacagtaaaggttgaacatcttatacgta-gaggatccataaactcattgtcttaaggttttgggtaag 9901745  T
Q  518 agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 571  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  9901746 agtgtggtgtctctcttgctagtgcggttgttctagcctcggtgtggactgtcc 9901799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 41 - 161
Target Start/End: Original strand, 16569196 - 16569316
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 140  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16569196 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggatagaacagtaaaggttgaataccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtttttggt 16569295  T
Q  141 aagagtgtggtgtctctcttg 161  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  16569296 aagagtgcggtgtctctcttg 16569316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 415 - 535
Target Start/End: Original strand, 16569196 - 16569316
Alignment:
Q  415 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 514  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16569196 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggatagaacagtaaaggttgaataccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtttttggt 16569295  T
Q  515 aagagtgtggtgtctctcttg 535  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  16569296 aagagtgcggtgtctctcttg 16569316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 415 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 16596466 - 16596346
Alignment:
Q  415 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 514  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16596466 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggatagaacagtaaaggttgaataccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtttttggt 16596367  T
Q  515 aagagtgtggtgtctctcttg 535  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  16596366 aagagtgcggtgtctctcttg 16596346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 41 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 16596466 - 16596346
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 140  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16596466 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggatagaacagtaaaggttgaataccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtttttggt 16596367  T
Q  141 aagagtgtggtgtctctcttg 161  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  16596366 aagagtgcggtgtctctcttg 16596346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 415 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 40230449 - 40230295
Alignment:
Q  415 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 514  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  40230449 tgcaagtgtaagttatatgtcccacatcgaataaaaaagtaaaagttgaacatcttataagtaagaggacccataaacccatagtcttaaggttttgggt 40230350  T
Q  515 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 569  Q
    || ||| |||||||||||||||  |||| ||| ||||| |||| |||||||||||    
T  40230349 aaaagtctggtgtctctcttgcaagtgtagttattctaacctctatgtggacggt 40230295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 41 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 40230449 - 40230295
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 140  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  40230449 tgcaagtgtaagttatatgtcccacatcgaataaaaaagtaaaagttgaacatcttataagtaagaggacccataaacccatagtcttaaggttttgggt 40230350  T
Q  141 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 195  Q
    || ||| |||||||||||||||  |||| ||| ||||| |||| |||||||||||    
T  40230349 aaaagtctggtgtctctcttgcaagtgtagttattctaacctctatgtggacggt 40230295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 388 - 541
Target Start/End: Complemental strand, 1085436 - 1085280
Alignment:
Q  388 actcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttat-atgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggac 484  Q
    |||||||||||| |||||||||||  || |||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||    
T  1085436 actcacacttgaaggggagtgttgttgtgtgcaagtgtgagtttttatgtcccatatcggataaaatagtaaaagttgaacaactcataagtaagagaac 1085337  T
Q  485 ccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtg 541  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  1085336 ccataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtttctcttccttgtg 1085280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 418 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 24838857 - 24838724
Alignment:
Q  418 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaga-ggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 516  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  24838857 aagtgtaagttatatgtctcacatcgaataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaaggatccataaacccgttgtcttaaggttttgggtaa 24838758  T
Q  517 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttc 550  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  24838757 gagtgtgacgtctctcttgcttgtgtggttgttc 24838724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 44 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 24838857 - 24838724
Alignment:
Q  44 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaga-ggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 142  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  24838857 aagtgtaagttatatgtctcacatcgaataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaaggatccataaacccgttgtcttaaggttttgggtaa 24838758  T
Q  143 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttc 176  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  24838757 gagtgtgacgtctctcttgcttgtgtggttgttc 24838724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 41 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 1085407 - 1085280
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttat-atgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttggg 139  Q
    |||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1085407 tgcaagtgtgagtttttatgtcccatatcggataaaatagtaaaagttgaacaactcataagtaagagaacccataaactcattgccttaaggttttggg 1085308  T
Q  140 taagagtgtggtgtctctcttgcttgtg 167  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||    
T  1085307 taagagtgtggtgtttctcttccttgtg 1085280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 44 - 196
Target Start/End: Original strand, 20599317 - 20599471
Alignment:
Q  44 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta-- 141  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||||| |||||| |||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||||||      
T  20599317 aagtgtgagttatatgtcccatatcggataaaaaagtaaaggataaacactttataaataagaggacatataaactcattgccttaacgttttgggtaag 20599416  T
Q  142 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||| ||||||    
T  20599417 agagtgtggtgtctctcttgcttgtatggttgttttaaccttgatgtgaacggtc 20599471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 418 - 570
Target Start/End: Original strand, 20599317 - 20599471
Alignment:
Q  418 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta-- 515  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||||| |||||| |||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||||||      
T  20599317 aagtgtgagttatatgtcccatatcggataaaaaagtaaaggataaacactttataaataagaggacatataaactcattgccttaacgttttgggtaag 20599416  T
Q  516 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 570  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||| ||||||    
T  20599417 agagtgtggtgtctctcttgcttgtatggttgttttaaccttgatgtgaacggtc 20599471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 415 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 36534942 - 36534795
Alignment:
Q  415 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 514  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  | |||||||||||||||    
T  36534942 tgcaagtgtaacttatatgtcccacctcggataaaacagtagaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacctaaagtcttaaggttttgggt 36534843  T
Q  515 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgg 564  Q
    |||||||||| |||||||   |  |||||||||||| |||||||||||||    
T  36534842 aagagtgtggcgtctctc--acaagtgtggttgttccagcctcgatgtgg 36534795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 41 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 36534942 - 36534795
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 140  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  | |||||||||||||||    
T  36534942 tgcaagtgtaacttatatgtcccacctcggataaaacagtagaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacctaaagtcttaaggttttgggt 36534843  T
Q  141 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgg 190  Q
    |||||||||| |||||||   |  |||||||||||| |||||||||||||    
T  36534842 aagagtgtggcgtctctc--acaagtgtggttgttccagcctcgatgtgg 36534795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 41 - 199
Target Start/End: Original strand, 41854635 - 41854792
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 140  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||   | ||||||||||||||||||    
T  41854635 tgcaagtatgagttatatgtcccacatcag-taaaagagtaaaggttgaacaccttataagcaagatgacctataaatataatgccttaaggttttgggt 41854733  T
Q  141 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 199  Q
    |||||||||  |||| |||| |||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  41854734 aagagtgtgacgtctttcttacttgtgcggttgttctagcctcaatgtagacggtcccc 41854792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 415 - 573
Target Start/End: Original strand, 41854635 - 41854792
Alignment:
Q  415 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 514  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||   | ||||||||||||||||||    
T  41854635 tgcaagtatgagttatatgtcccacatcag-taaaagagtaaaggttgaacaccttataagcaagatgacctataaatataatgccttaaggttttgggt 41854733  T
Q  515 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 573  Q
    |||||||||  |||| |||| |||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  41854734 aagagtgtgacgtctttcttacttgtgcggttgttctagcctcaatgtagacggtcccc 41854792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 62 - 197
Target Start/End: Original strand, 37167808 - 37167937
Alignment:
Q  62 ccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttg 161  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||       |||||||||| ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37167808 ccacatcagataaaatagtaaatgttgaacag------agtaagaggatccataaatccattgacttaaagttttgggtaagagtgtggtgtctctcttg 37167901  T
Q  162 cttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 197  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37167902 cttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 37167937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 436 - 571
Target Start/End: Original strand, 37167808 - 37167937
Alignment:
Q  436 ccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttg 535  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||       |||||||||| ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37167808 ccacatcagataaaatagtaaatgttgaacag------agtaagaggatccataaatccattgacttaaagttttgggtaagagtgtggtgtctctcttg 37167901  T
Q  536 cttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 571  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37167902 cttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 37167937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 83 - 199
Target Start/End: Original strand, 30253534 - 30253646
Alignment:
Q  83 aggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcct 182  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| |||||    
T  30253534 aggttgaagaccttataagtaagagaacccataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctct----cttgtgtggttgttcaagcct 30253629  T
Q  183 cgatgtggacggtcccc 199  Q
    ||||||||| |||||||    
T  30253630 cgatgtggatggtcccc 30253646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 457 - 573
Target Start/End: Original strand, 30253534 - 30253646
Alignment:
Q  457 aggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcct 556  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| |||||    
T  30253534 aggttgaagaccttataagtaagagaacccataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctct----cttgtgtggttgttcaagcct 30253629  T
Q  557 cgatgtggacggtcccc 573  Q
    ||||||||| |||||||    
T  30253630 cgatgtggatggtcccc 30253646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 461 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 28300366 - 28300229
Alignment:
Q  461 tgaacaccttataagtaagaggaccc-ataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcga 559  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||  |||||||    
T  28300366 tgaacaccttataagtaagagaaccccataaacccattgccttaagattttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcaagtgtggttgttcgggcctcga 28300267  T
Q  560 tgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 597  Q
    |||||||||||| |  | ||||||| | ||||||||||    
T  28300266 tgtggacggtcctcctgactccccttattgacccaaca 28300229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 87 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 28300366 - 28300229
Alignment:
Q  87 tgaacaccttataagtaagaggaccc-ataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcga 185  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||  |||||||    
T  28300366 tgaacaccttataagtaagagaaccccataaacccattgccttaagattttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcaagtgtggttgttcgggcctcga 28300267  T
Q  186 tgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 223  Q
    |||||||||||| |  | ||||||| | ||||||||||    
T  28300266 tgtggacggtcctcctgactccccttattgacccaaca 28300229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 383 - 485
Target Start/End: Original strand, 30244667 - 30244771
Alignment:
Q  383 gatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaga 480  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30244667 gatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacattggataaaagagtaaaggttgaacaccttataaataaga 30244766  T
Q  481 ggacc 485  Q
    |||||    
T  30244767 ggacc 30244771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 386 - 488
Target Start/End: Original strand, 30255308 - 30255412
Alignment:
Q  386 ggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga 483  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  30255308 ggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtgcaagtgtgcgttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggg 30255407  T
Q  484 cccat 488  Q
    |||||    
T  30255408 cccat 30255412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 418 - 567
Target Start/End: Complemental strand, 41910749 - 41910592
Alignment:
Q  418 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa--------ggttt 509  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||        | |||    
T  41910749 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaataccttataactgagaggacccataaacccattggcttaagatttttggattt 41910650  T
Q  510 tgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacg 567  Q
    | |||||||||||||||| |||||  |  |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41910649 ttggtaagagtgtggtgtttctctcacaagtgtggttgttctaacctcgatgtggacg 41910592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 44 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 41910749 - 41910592
Alignment:
Q  44 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa--------ggttt 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||        | |||    
T  41910749 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaataccttataactgagaggacccataaacccattggcttaagatttttggattt 41910650  T
Q  136 tgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacg 193  Q
    | |||||||||||||||| |||||  |  |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41910649 ttggtaagagtgtggtgtttctctcacaagtgtggttgttctaacctcgatgtggacg 41910592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 496 - 599
Target Start/End: Original strand, 47129450 - 47129551
Alignment:
Q  496 ttgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaa 595  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||    
T  47129450 ttgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgatctagcctcgatgtggacggtccccga-gctcccctca-tgacccaa 47129547  T
Q  596 caga 599  Q
    ||||    
T  47129548 caga 47129551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 122 - 224
Target Start/End: Original strand, 47129450 - 47129550
Alignment:
Q  122 ttgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaa 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||    
T  47129450 ttgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgatctagcctcgatgtggacggtccccga-gctcccctca-tgacccaa 47129547  T
Q  222 cag 224  Q
    |||    
T  47129548 cag 47129550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 41 - 162
Target Start/End: Original strand, 43241495 - 43241616
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 140  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||| ||||||||||| |||    
T  43241495 tgcaagtgtgagttatatgttccacatcggataaaaaaataaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacttattgacttaaggttttaggt 43241594  T
Q  141 aagagtgtggtgtctctcttgc 162  Q
    || ||| || ||||||||||||    
T  43241595 aaaagtatgatgtctctcttgc 43241616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 415 - 536
Target Start/End: Original strand, 43241495 - 43241616
Alignment:
Q  415 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 514  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||| ||||||||||| |||    
T  43241495 tgcaagtgtgagttatatgttccacatcggataaaaaaataaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacttattgacttaaggttttaggt 43241594  T
Q  515 aagagtgtggtgtctctcttgc 536  Q
    || ||| || ||||||||||||    
T  43241595 aaaagtatgatgtctctcttgc 43241616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 386 - 488
Target Start/End: Original strand, 30245463 - 30245567
Alignment:
Q  386 ggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga 483  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  30245463 ggacacacacttgagggggactgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggg 30245562  T
Q  484 cccat 488  Q
    |||||    
T  30245563 cccat 30245567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 415 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 28301701 - 28301613
Alignment:
Q  415 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctta 503  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28301701 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggatagaaaagtaaaagctgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctta 28301613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 41 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 28301701 - 28301613
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctta 129  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28301701 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggatagaaaagtaaaagctgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctta 28301613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 142 - 240
Target Start/End: Original strand, 30253671 - 30253768
Alignment:
Q  142 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtggtatcagagccccg 240  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  30253671 agagtgtggtgtctctctcacttgtgtggttgttcaagcctcgatgtggactgtcccccaggctcccctca-tgacccaacaatggtatcagagccccg 30253768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 124 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 28300644 - 28300473
Alignment:
Q  124 gccttaaggttttggg-taagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaac 222  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||          | |||| ||| ||| |||||    
T  28300644 gccttaaggttttggggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttattctagcctcgatgtggac----------gatcccttcaatgaaccaac 28300555  T
Q  223 agtggtatcagagccccggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggt-cattgcgcagaaagccgcaacagcggtacaag 304  Q
    | ||||||||||| || | ||||||||||||  ||||||||||||  ||| ||||||||||||||| |||||  |||||||||    
T  28300554 actggtatcagag-cctgattcgacgaagggtacgaccgaggcagtcggtccattgcgcagaaagcagcaacgacggtacaag 28300473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 142 - 240
Target Start/End: Original strand, 30244453 - 30244550
Alignment:
Q  142 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtggtatcagagccccg 240  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||    
T  30244453 agagtgtggtgtctctctcacttgtgtggttgttcaagcctcgatgtggacggtccctcaggctcccctca-tgacccaacaatggtatcaaagccccg 30244550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 142 - 240
Target Start/End: Original strand, 30245256 - 30245353
Alignment:
Q  142 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtggtatcagagccccg 240  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  30245256 agagtgtggtgtctctctcacttgtgtggttgttcaagcctcaatgtggacggtcccccatgctcccctta-tgacccaacagtggtatcagagccccg 30245353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 41 - 114
Target Start/End: Original strand, 30245494 - 30245567
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccat 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30245494 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagagggcccat 30245567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 41 - 114
Target Start/End: Original strand, 30255339 - 30255412
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccat 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30255339 tgcaagtgtgcgttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagagggcccat 30255412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 498 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 28300644 - 28300569
Alignment:
Q  498 gccttaaggttttggg-taagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 572  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  28300644 gccttaaggttttggggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttattctagcctcgatgtggacgatccc 28300569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 41 - 111
Target Start/End: Original strand, 30244701 - 30244771
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacc 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30244701 tgcaagtgtgagttatatgtcccacattggataaaagagtaaaggttgaacaccttataaataagaggacc 30244771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 415 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 36109075 - 36109007
Alignment:
Q  415 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga 483  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36109075 tgcaagtgtgagttatatttctcacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga 36109007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 41 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 36109075 - 36109007
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga 109  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36109075 tgcaagtgtgagttatatttctcacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga 36109007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 503 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 37532821 - 37532753
Alignment:
Q  503 aaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 571  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37532821 aaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctagcttgtgctgttgttctagcctcgatgtggacggtcc 37532753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 129 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 37532821 - 37532753
Alignment:
Q  129 aaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37532821 aaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctagcttgtgctgttgttctagcctcgatgtggacggtcc 37532753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 516 - 597
Target Start/End: Original strand, 30244453 - 30244533
Alignment:
Q  516 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 597  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||    
T  30244453 agagtgtggtgtctctctcacttgtgtggttgttcaagcctcgatgtggacggtccctcaggctcccctca-tgacccaaca 30244533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 516 - 597
Target Start/End: Original strand, 30253671 - 30253751
Alignment:
Q  516 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 597  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  30253671 agagtgtggtgtctctctcacttgtgtggttgttcaagcctcgatgtggactgtcccccaggctcccctca-tgacccaaca 30253751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 420 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 44361616 - 44361517
Alignment:
Q  420 gtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagag 519  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||    
T  44361616 gtgtgagatatatgtctcacatcggataaaagagtaaaagttgaacacctt-taagtaagatgatccataaacccataaccttacggttttaggtaagag 44361518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 46 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 44361616 - 44361517
Alignment:
Q  46 gtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagag 145  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||    
T  44361616 gtgtgagatatatgtctcacatcggataaaagagtaaaagttgaacacctt-taagtaagatgatccataaacccataaccttacggttttaggtaagag 44361518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 337 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 37532896 - 37532822
Alignment:
Q  337 acaggcaaagtcaaaagcttccgctctaaggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttgg 412  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37532896 acaggcaaagtaaaaagcttccgctata-ggggaacacgttaaagtgaaggactcacacttgagggggagtgttgg 37532822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 366 - 533
Target Start/End: Original strand, 37345868 - 37346036
Alignment:
Q  366 ggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatat--gtcccacatcggataaaatagtaaaggttga 463  Q
    |||||||||| | || ||||| |||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||  |||  | ||| |||| || |||  ||||| |    
T  37345868 ggggagcacgatgaattgatgaactcacacttgaaggggagtgttg-tgtgcaagtgtgagttatatatgtcatatatctgatagaaaagtggaggttaa 37345966  T
Q  464 acaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 533  Q
    |||  |||||||| ||| |||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||    
T  37345967 acattttataagtgagaagacccataaacatattgccttaaagttttgagtaagagtgtgacgtctctct 37346036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 383 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 40094583 - 40094502
Alignment:
Q  383 gatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaac 465  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  40094583 gatggactcacactttaggaggagtgttg-tgtgcaagtgtgagttatatgtccaacatcagataaaagagtaaaggttgaac 40094502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 482 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 21416232 - 21416181
Alignment:
Q  482 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 533  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21416232 gacccataaacccattgccttagggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 21416181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 108 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 21416232 - 21416181
Alignment:
Q  108 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 159  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21416232 gacccataaacccattgccttagggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 21416181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 516 - 598
Target Start/End: Original strand, 30245256 - 30245337
Alignment:
Q  516 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacag 598  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||||    
T  30245256 agagtgtggtgtctctctcacttgtgtggttgttcaagcctcaatgtggacggtcccccatgctcccctta-tgacccaacag 30245337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 151 - 223
Target Start/End: Original strand, 7517767 - 7517839
Alignment:
Q  151 tgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 223  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  7517767 tgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatatgggtggtccccttggctcccctcagtgacccaaca 7517839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 525 - 597
Target Start/End: Original strand, 7517767 - 7517839
Alignment:
Q  525 tgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 597  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  7517767 tgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatatgggtggtccccttggctcccctcagtgacccaaca 7517839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 151 - 223
Target Start/End: Original strand, 7518033 - 7518105
Alignment:
Q  151 tgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 223  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  7518033 tgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatatgggtggtccccttggctcccctcagtgacccaaca 7518105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 525 - 597
Target Start/End: Original strand, 7518033 - 7518105
Alignment:
Q  525 tgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 597  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  7518033 tgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatatgggtggtccccttggctcccctcagtgacccaaca 7518105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 484 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 23569091 - 23569043
Alignment:
Q  484 cccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctc 532  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23569091 cccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctc 23569043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 110 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 23569091 - 23569043
Alignment:
Q  110 cccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctc 158  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23569091 cccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctc 23569043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #115
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 415 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 4124246 - 4124128
Alignment:
Q  415 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 514  Q
    ||||| ||||| ||| |||||| ||||||| || || | |  |||||  |||| |||||||| |||||||| |||||| |||||| |||||||||||| |    
T  4124246 tgcaactgtgaattacatgtcctacatcggttagaaaatttgaggtttgacactttataagtgagaggaccaataaactcattgcattaaggttttggat 4124147  T
Q  515 aagagtgtggtgtctctct 533  Q
    || ||||||||||||||||    
T  4124146 aaaagtgtggtgtctctct 4124128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #116
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 41 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 4124246 - 4124128
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 140  Q
    ||||| ||||| ||| |||||| ||||||| || || | |  |||||  |||| |||||||| |||||||| |||||| |||||| |||||||||||| |    
T  4124246 tgcaactgtgaattacatgtcctacatcggttagaaaatttgaggtttgacactttataagtgagaggaccaataaactcattgcattaaggttttggat 4124147  T
Q  141 aagagtgtggtgtctctct 159  Q
    || ||||||||||||||||    
T  4124146 aaaagtgtggtgtctctct 4124128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #117
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 78
Target Start/End: Original strand, 14681281 - 14681324
Alignment:
Q  35 ttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaata 78  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14681281 ttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacattggataaaata 14681324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #118
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 409 - 452
Target Start/End: Original strand, 14681281 - 14681324
Alignment:
Q  409 ttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaata 452  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14681281 ttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacattggataaaata 14681324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #119
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 483 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 40094503 - 40094424
Alignment:
Q  483 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgt 562  Q
    |||||||||| |||| | |||| ||||||||||||||||||  |||| |||| ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  40094503 acccataaactcattactttaaagttttgggtaagagtgtgacgtctttcttacttatgtggttgttctagccccgatgt 40094424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #120
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 109 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 40094503 - 40094424
Alignment:
Q  109 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgt 188  Q
    |||||||||| |||| | |||| ||||||||||||||||||  |||| |||| ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  40094503 acccataaactcattactttaaagttttgggtaagagtgtgacgtctttcttacttatgtggttgttctagccccgatgt 40094424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #121
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 41 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 40094552 - 40094502
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaac 91  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  40094552 tgcaagtgtgagttatatgtccaacatcagataaaagagtaaaggttgaac 40094502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #122
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 124 - 186
Target Start/End: Original strand, 45755010 - 45755072
Alignment:
Q  124 gccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgat 186  Q
    |||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  45755010 gccttaaaattttgggtaaaagtgtggtgtctcccttacttgtgtggttgttcaagcctcgat 45755072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #123
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 498 - 560
Target Start/End: Original strand, 45755010 - 45755072
Alignment:
Q  498 gccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgat 560  Q
    |||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  45755010 gccttaaaattttgggtaaaagtgtggtgtctcccttacttgtgtggttgttcaagcctcgat 45755072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #124
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 482 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 21619136 - 21619091
Alignment:
Q  482 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 527  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21619136 gacccataaacccattgtcttaaggttttgggtaaaagtgtggtgt 21619091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #125
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 108 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 21619136 - 21619091
Alignment:
Q  108 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 153  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21619136 gacccataaacccattgtcttaaggttttgggtaaaagtgtggtgt 21619091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #126
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 244
Target Start/End: Original strand, 37345652 - 37345783
Alignment:
Q  112 cataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctc 211  Q
    |||||||  |||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||  |||||  ||||| ||| |||| ||||||   ||||| |  ||||||||      
T  37345652 cataaacatattgccttaaggtttttggtaagagtctgacgtctctctcacttgtacggttgctct-gcctggatgtgagtggtccgccgggctccccct 37345750  T
Q  212 actgacccaacagtggtatcagagccccggttc 244  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37345751 cttgacccaacagtggtatcagagccccggttc 37345783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #127
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 275 - 323
Target Start/End: Original strand, 45697753 - 45697801
Alignment:
Q  275 ttgcgcagaaagccgcaacagcggtacaagtagcaagtggctccttgtg 323  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45697753 ttgcgcagaaagcagcaacggcggtacaagaagcaagtggctccttgtg 45697801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #128
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 96 - 199
Target Start/End: Original strand, 37393114 - 37393216
Alignment:
Q  96 tataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 195  Q
    ||||||||||| |||| |||||| || |||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||    ||| |||||||| |||| |||||||||||||| |    
T  37393114 tataagtaagatgacc-ataaactcaatgccttgaggttttgagtaaaagtgtggcgtctcttccacttatgtggttgctctaacctcgatgtggacgat 37393212  T
Q  196 cccc 199  Q
    ||||    
T  37393213 cccc 37393216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #129
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 470 - 573
Target Start/End: Original strand, 37393114 - 37393216
Alignment:
Q  470 tataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 569  Q
    ||||||||||| |||| |||||| || |||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||    ||| |||||||| |||| |||||||||||||| |    
T  37393114 tataagtaagatgacc-ataaactcaatgccttgaggttttgagtaaaagtgtggcgtctcttccacttatgtggttgctctaacctcgatgtggacgat 37393212  T
Q  570 cccc 573  Q
    ||||    
T  37393213 cccc 37393216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #130
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 417 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 36967385 - 36967335
Alignment:
Q  417 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacac 467  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| || |||||    
T  36967385 caagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaaaagtaaagattaaacac 36967335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #131
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 43 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 36967385 - 36967335
Alignment:
Q  43 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacac 93  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| || |||||    
T  36967385 caagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaaaagtaaagattaaacac 36967335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #132
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 41 - 159
Target Start/End: Original strand, 37345916 - 37346036
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatat--gtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgg 138  Q
    ||||||||||||||||||  |||  | ||| |||| || |||  ||||| ||||  |||||||| ||| |||||||||||  |||||||||| ||||||     
T  37345916 tgcaagtgtgagttatatatgtcatatatctgatagaaaagtggaggttaaacattttataagtgagaagacccataaacatattgccttaaagttttga 37346015  T
Q  139 gtaagagtgtggtgtctctct 159  Q
    |||||||||||  ||||||||    
T  37346016 gtaagagtgtgacgtctctct 37346036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #133
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 83 - 199
Target Start/End: Original strand, 15902342 - 15902457
Alignment:
Q  83 aggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcct 182  Q
    ||||||||||| |||||||| | |  || ||||| | | ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||  |||||||| ||||||| ||||    
T  15902342 aggttgaacactttataagtgaaatcacacataagctcgttgtcttaaggttttggataaaagtgtggtgtcgctctcacttgtgtgattgttct-gcct 15902440  T
Q  183 cgatgtggacggtcccc 199  Q
     |||||||  |||||||    
T  15902441 ggatgtgggtggtcccc 15902457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #134
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 457 - 573
Target Start/End: Original strand, 15902342 - 15902457
Alignment:
Q  457 aggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcct 556  Q
    ||||||||||| |||||||| | |  || ||||| | | ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||  |||||||| ||||||| ||||    
T  15902342 aggttgaacactttataagtgaaatcacacataagctcgttgtcttaaggttttggataaaagtgtggtgtcgctctcacttgtgtgattgttct-gcct 15902440  T
Q  557 cgatgtggacggtcccc 573  Q
     |||||||  |||||||    
T  15902441 ggatgtgggtggtcccc 15902457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #135
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 483 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 27391859 - 27391815
Alignment:
Q  483 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 527  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27391859 acccataaatccactgccttaaggttttaggtaagagtgtggtgt 27391815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #136
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 109 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 27391859 - 27391815
Alignment:
Q  109 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 153  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27391859 acccataaatccactgccttaaggttttaggtaagagtgtggtgt 27391815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #137
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 510 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 4719359 - 4719305
Alignment:
Q  510 tgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgg 564  Q
    |||||||||||||||| | ||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||    
T  4719359 tgggtaagagtgtggtatttctcttgtttgtgcggttgctctagcctcgttgtgg 4719305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #138
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 136 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 4719359 - 4719305
Alignment:
Q  136 tgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgg 190  Q
    |||||||||||||||| | ||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||    
T  4719359 tgggtaagagtgtggtatttctcttgtttgtgcggttgctctagcctcgttgtgg 4719305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #139
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 177 - 223
Target Start/End: Original strand, 7517982 - 7518028
Alignment:
Q  177 tagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 223  Q
    ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  7517982 tagcctcgatgtgggtggtccccttggctcccctcagtgacccaaca 7518028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #140
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 551 - 597
Target Start/End: Original strand, 7517982 - 7518028
Alignment:
Q  551 tagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 597  Q
    ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  7517982 tagcctcgatgtgggtggtccccttggctcccctcagtgacccaaca 7518028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #141
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 108 - 148
Target Start/End: Original strand, 27598052 - 27598092
Alignment:
Q  108 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgt 148  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||    
T  27598052 gacccataaacccattgtcttagggttttgcgtaagagtgt 27598092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #142
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 482 - 522
Target Start/End: Original strand, 27598052 - 27598092
Alignment:
Q  482 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgt 522  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||    
T  27598052 gacccataaacccattgtcttagggttttgcgtaagagtgt 27598092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #143
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 242 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 48243419 - 48243356
Alignment:
Q  242 ttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtca--ttgcgcagaaagccgcaacagcggtacaa 303  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||| ||||   ||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  48243419 ttcgacgaagggtacgaccgaggcagccggtccgtttgcgcagaaagcagcaacggcggtacaa 48243356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0702 (Bit Score: 301; Significance: 1e-169; HSPs: 2)
Name: scaffold0702
Description:

Target: scaffold0702; HSP #1
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 43 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 670 - 147
Alignment:
Q  43 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 142  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  670 caagtgtgagttatatgtcccacatcggttaaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 571  T
Q  143 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtggtatcagagccccggt 242  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||   ||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  570 gagtgtggtgtctttcttgcttgagtggtttttctagcctcgatgtggaaggtcccccgagcttccc-cagtgacccaacagtggtatcagagccccggt 472  T
Q  243 tcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtcattgcgcagaaagccgcaacagcggtacaagtagcaagtggctccttgtgcaggaacggcgatacaggc 342  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||  |||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||||     
T  471 tcgacgaagggtgcaaccgaggtagtcggtcgttgcgaagaaagtcgcaacagcagtacaagcagcaagtggctccttgtgcaggaacaatgatacaggt 372  T
Q  343 aaagtcaaaagcttccgctctaa-ggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacat 441  Q
    ||| | || ||||||||||  || |||||||| | | ||   ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  371 aaact-aagagcttccgcttgaagggggagcatgatgaataaatggactcacatttg-gggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacat 274  T
Q  442 cggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtg 541  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||   ||| ||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  273 cggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga-ccataaa-ccat--actttagg-tttaggtaagaatgtggtgtctctcttgcttgag 179  T
Q  542 tggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 573  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  178 tggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0702; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 32 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 309 - 147
Alignment:
Q  32 gtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaag 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||   ||| ||    
T  309 gtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga-ccataaa-ccat--actttag 214  T
Q  132 gttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 199  Q
    | ||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  213 g-tttaggtaagaatgtggtgtctctcttgcttgagtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 291; Significance: 1e-163; HSPs: 171)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 150 - 592
Target Start/End: Original strand, 22304302 - 22304747
Alignment:
Q  150 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc-taggctcccctcactgacccaacagtggtatcagagccccggttcgacg 248  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22304302 gtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccctagcttcccctcactgacccaacagtggtatcagagccccggttcgacg 22304401  T
Q  249 aagggagcgaccgaggcagctggtcattgcgcagaaagcc-gcaacagcggtacaagtagcaagtggctccttgtgcaggaacggcgatacaggcaaagt 347  Q
    |||||  ||||||||||||| |||| |||||||||||||  |||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||    
T  22304402 aagggtacgaccgaggcagccggtcgttgcgcagaaagcaagcaacagctgtacaagtagtaagtggctccttgttcaggaacgacgatacaagcaaagt 22304501  T
Q  348 caaaagcttccgctctaagggg-agcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggat 446  Q
     || ||||||||||  |||||| |||| | | ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22304502 -aagagcttccgcttgaagggggagcatgatgaatagatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagctatatgtcccacatcggat 22304600  T
Q  447 aaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggtt 546  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22304601 aaaatagtaaaggttgaataccttataagtaagaggacccataaacacattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggtt 22304700  T
Q  547 gttctagcctcgatgtggacggt-cccctaggctcccctcactgacc 592  Q
    ||||||| |||||||||||| || |||||||  ||||||||||||||    
T  22304701 gttctagtctcgatgtggacagtccccctagcttcccctcactgacc 22304747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 172 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 41360164 - 41359765
Alignment:
Q  172 tgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtggtatcagagccccggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctgg 271  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||  ||||| ||    
T  41360164 tgttctagcctcgatgtggacggttccccgggctcccctcgctgtcctaacagtggtatcagagcgccggttcgacgaagagtacgaccg--gcagccgg 41360067  T
Q  272 tcattgcgcagaaagccgcaacagcggtacaagtag--caagtggctccttgtgcaggaacggcgatacaggcaaagtcaaaagcttccgctctaaggg- 368  Q
    || ||| ||||||||| |||||  ||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| ||  |||||     
T  41360066 tcgttgtgcagaaagcagcaacgacggtacaagcagagcaagtggctccttgtgcaagaacggcgatacaggcaaagtaaagagcttccacttgaaggga 41359967  T
Q  369 gagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaaca 466  Q
    ||||| | | ||  |||| |||||||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||||    ||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  41359966 gagcatgatgaatagatg-actcacacttaagggggagtgttgttgtgtgcaagtgtgagttat----cccacatcggatacaatagtaaaggttgaata 41359872  T
Q  467 ccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggac 566  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  41359871 ccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagaatgtggcgtctctctcgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgggc 41359772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 43 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 22304104 - 22303759
Alignment:
Q  43 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 142  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||       |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22304104 caagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaatagtaaaggt-------cttataagtaagcggacccataaacccattgccttaaggttttggataa 22304012  T
Q  143 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt-cccctaggctcccctcactgacccaacagtggtatcagagccccgg 241  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22304011 gagtgtggtgtctctcttgcttgagtggttgttctagcctcgatgtggattgtcccccaaggctcccc-cagtgacctaacagtggtatcagagccccgg 22303913  T
Q  242 ttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtca-ttgcgcagaaagccgcaacagcggtacaagtagcaagtggctccttgtgcaggaacggcgatacag 340  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||    
T  22303912 ttcgacgaagggtgcgacagaggccgccggtcagttgcgcagaaagcagcaacgacggtacaagcagcaagtggcttcttgtgcagcaacggcgattcag 22303813  T
Q  341 gc-aaagtcaaaagcttccgctctaaggggagcacgttaaagtgatggactcaca 394  Q
    || ||||| ||||||||||||| | |||||| |||||| || |||||||||||||    
T  22303812 gcaaaagtaaaaagcttccgct-ttaggggaacacgttgaattgatggactcaca 22303759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 275 - 556
Target Start/End: Original strand, 4823515 - 4823796
Alignment:
Q  275 ttgcgcagaaagcc-gcaacagcggtacaagtagcaagtggctccttgtgcaggaacggcgatacaggcaaagtcaaaagcttccgctctaaggggagca 373  Q
    |||||||||||||  ||||| | |||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  4823515 ttgcgcagaaagcaagcaacggtggtacaagcaacaagtggctccttgtgcaggaatggcgatacatgcaaagtaaaaagcttccgctcta-ggggagca 4823613  T
Q  374 cgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttata 473  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  4823614 cgttaaagtgatggactcacacttgaaggggagtgttggtttgcaagtgtgagttataagtctcacatcggataaaatagtaaaagttaaacaccttata 4823713  T
Q  474 agtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcct 556  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||| || || |||||||||||    
T  4823714 agtaggaggacccataaactcattgccttaagattttgggtaagagtgtggtgtcttttttgcttatgcggatgttctagcct 4823796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 165; E-Value: 6e-88
Query Start/End: Original strand, 328 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 37990884 - 37990615
Alignment:
Q  328 aacggcgatacaggcaaagtcaaaagcttccgctctaaggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtga 425  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | ||||| ||| | | || ||||||||||||| |||||||||||||||| | ||  |||||||||    
T  37990884 aacggcgatacatgcaaagt-aaaagcttccgct-tgaggggggcatgatgaattgatggactcacagttgagggggagtgttgttgtgtacaagtgtga 37990787  T
Q  426 gttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggt 525  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37990786 gttatatgttccacatcggataaaatagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggactcataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgtggt 37990687  T
Q  526 gtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 597  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   |||| ||||| ||||||||||    
T  37990686 gtctctcttgcttgtgtgattgttctagcctcgatgtggacggtcccccgagctctcctcaatgacccaaca 37990615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 41 - 304
Target Start/End: Original strand, 15772854 - 15773117
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 140  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |    
T  15772854 tgcaagtgtgagttatatgtcccatatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgctttaaggttttggat 15772953  T
Q  141 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtggtatcagagccccg 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  15772954 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctaacctcgatgtggacggtccttttgactcccctca-tgacccaacagtggtatcagagccctg 15773052  T
Q  241 gttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtca-ttgcgcagaaagccgcaacagcggtacaag 304  Q
     ||||||||||||  ||| |||||| || ||||| ||  ||||||||| ||||||||| ||||||    
T  15773053 attcgacgaagggtacgatcgaggccgccggtcagttatgcagaaagcagcaacagcgatacaag 15773117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 148; E-Value: 9e-78
Query Start/End: Original strand, 32 - 218
Target Start/End: Original strand, 22304560 - 22304747
Alignment:
Q  32 gtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaag 131  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22304560 gtgttggtttgcaagtgtgagctatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaataccttataagtaagaggacccataaacacattgccttaag 22304659  T
Q  132 gttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt-cccctaggctcccctcactgacc 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || |||||||  ||||||||||||||    
T  22304660 gttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagtctcgatgtggacagtccccctagcttcccctcactgacc 22304747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 148; E-Value: 9e-78
Query Start/End: Original strand, 41 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 33803410 - 33803184
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 140  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  33803410 tgcaattgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccatataagtaagaggacccataaacccattgcattaaggtattgggt 33803311  T
Q  141 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtggtatcagagccccg 240  Q
    |||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| ||| ||| |||||||||||||||||||| ||    
T  33803310 aagagtgtggcgtctccctctcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccaaactcccatcaatga-ccaacagtggtatcagagcctcg 33803212  T
Q  241 gttcgacgaagggagcgaccgaggcagc 268  Q
     ||||||||||||  |||| ||||||||    
T  33803211 attcgacgaagggtacgactgaggcagc 33803184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 323 - 567
Target Start/End: Original strand, 15773099 - 15773346
Alignment:
Q  323 gcaggaacggcgatacaggcaaagtcaaaagcttccgctctaaggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaag 420  Q
    |||| ||| |||||||| |||| || |||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||    
T  15773099 gcagcaacagcgatacaagcaa-gtaaaaagcttccgctcttgggggagcacgataaagtgatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtgcaag 15773197  T
Q  421 tgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagt 520  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| |||||||||||||||    
T  15773198 tgtgagttatatgtcccacatcgaataaaagagtaaaagttgaacatcttataagtaagaggactcataagctcattgccttaaagttttgggtaagagt 15773297  T
Q  521 gtggtgtctct--cttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacg 567  Q
    ||| |||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15773298 gtgatgtctcttgcttgcttgtgtggttgttctaacctcgatgtggacg 15773346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 43 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 37991133 - 37990909
Alignment:
Q  43 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 142  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  37991133 caagtgtgagttatatgtctcacattggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacctataaactcatcgccttaaggttttgggtaa 37991034  T
Q  143 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggct-cccctcactgacccaacagtggtatcagagccccgg 241  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||      
T  37991033 gagtgtggtgtctctcttgcttatgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccctcaggctccccctca-tgacccaacagtggtatcagggcccc-a 37990936  T
Q  242 ttcgacgaagggagcgaccgaggcagc 268  Q
    |||||| |||||  ||| |||||||||    
T  37990935 ttcgacaaagggtacgatcgaggcagc 37990909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 143; E-Value: 9e-75
Query Start/End: Original strand, 43 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 43346947 - 43346754
Alignment:
Q  43 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 142  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43346947 caagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagaacccataaactcattgccttaaggttttgggtaa 43346848  T
Q  143 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc-cctaggctcccctcactgacccaacagtggtatcagagc 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||||||| || || |||||||||||||||||    
T  43346847 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctctatgtggacggtcctccgaagctcccctca-tgtcctaacagtggtatcagagc 43346754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 143; E-Value: 9e-75
Query Start/End: Original strand, 383 - 598
Target Start/End: Complemental strand, 54018008 - 54017792
Alignment:
Q  383 gatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaga 480  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||  || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  54018008 gatggactcacacttgagggggagtattgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaaga 54017909  T
Q  481 ggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctc 580  Q
    |||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  |||||    
T  54017908 ggactcataaacctaacgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttacttgtgtggttgttctagcttcgatgtgggcggtccccctggctc 54017809  T
Q  581 ccctcactgacccaacag 598  Q
    ||| || |||||||||||    
T  54017808 ccc-cagtgacccaacag 54017792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 312 - 572
Target Start/End: Original strand, 11661846 - 11662108
Alignment:
Q  312 tggctccttgtgcaggaacggcgatacaggcaaagtcaaaagcttccgctctaaggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttg 411  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  11661846 tggctccttgtgcagcaacggcgatacatgcaaagtaaaaagcttccgctctaggaggagcacgataaagtgatggactcacacttttgggggagtgttg 11661945  T
Q  412 --gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg-tt 508  Q
      || || |||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||| | |||||||| |||||||||||| ||    
T  11661946 ttgtatgtaagtgtgagttaaatgccccacattggataaaagagtaaaggttgaacaccttaaaagtgagaggcctcataaaccaattgccttaaggttt 11662045  T
Q  509 ttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 572  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  11662046 ttgggtaagagtgaggtgtctctc-tcattgtgtggttgttctagcctcgatgtgaacagtccc 11662108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 41 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 29645060 - 29644811
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 140  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29645060 tgcaagtgtaagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttaaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgtcttaaggttttgggt 29644961  T
Q  141 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtggtatcagagccc-- 238  Q
    |||||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||  ||||||| |  |||||||| |||||      
T  29644960 aagagtgtggcgtctctcttgcttatgcggttgttttagcctcgatgtggacggtcccccaagctcccctc-gtgacccagctttggtatcaaagccccg 29644862  T
Q  239 -cggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtc-attgcgcagaaagc 287  Q
     |||||||||||||||  |||||||||| || | || ||||||||||||||    
T  29644861 tcggttcgacgaagggtacgaccgaggccgccgttcaattgcgcagaaagc 29644811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 43 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 37990795 - 37990615
Alignment:
Q  43 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 142  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37990795 caagtgtgagttatatgttccacatcggataaaatagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggactcataaactcattgccttaaggttttgggtaa 37990696  T
Q  143 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   |||| ||||| ||||||||||    
T  37990695 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtgattgttctagcctcgatgtggacggtcccccgagctctcctcaatgacccaaca 37990615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 41 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 54017974 - 54017780
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 140  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||    
T  54017974 tgcaagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaacctaacgccttaaggttttgggt 54017875  T
Q  141 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtggtatcagagc 236  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  |||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  54017874 aagagtgtggtgtctctcttacttgtgtggttgttctagcttcgatgtgggcggtccccctggctcccc-cagtgacccaacagtggtatcagagc 54017780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 138; E-Value: 8e-72
Query Start/End: Original strand, 41 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 54018356 - 54018093
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 140  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  54018356 tgcaagtgtgagttatatgtcctgcatcggataaaagagtaaagattgaacaccttataagtaagaggacccataaacctaacgccttaaggttttgggt 54018257  T
Q  141 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtggtatcagagccccg 240  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | || ||  |  ||||| |||||||| |||||||| |||    
T  54018256 aagagtgtggtgtctctcatgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgggcggtccccctgact-cctacggtgaccaaacagtggcatcagagctccg 54018158  T
Q  241 gttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtc--attgcgcagaaagccgcaacagcggtacaa 303  Q
    |||| |||||||| |||| ||||||||| ||||   ||||||||||||| ||||  |||||||||    
T  54018157 gttcaacgaagggtgcgatcgaggcagccggtccgtttgcgcagaaagcagcaatggcggtacaa 54018093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 417 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 37991133 - 37990967
Alignment:
Q  417 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 516  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  37991133 caagtgtgagttatatgtctcacattggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacctataaactcatcgccttaaggttttgggtaa 37991034  T
Q  517 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccc 583  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  37991033 gagtgtggtgtctctcttgcttatgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccctcaggctcccc 37990967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 41 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 42342546 - 42342360
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  42342546 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatccgataaaagagtaaaggttcaacaccttataagtaagaggacccataaatccattgtcttaaggttttgggt 42342447  T
Q  141 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtgg 227  Q
    |||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||    
T  42342446 aagagtgtgacgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcaatgtggacggtccccctggctccccttagtgacccaacagtgg 42342360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 417 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 43346947 - 43346793
Alignment:
Q  417 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 516  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43346947 caagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagaacccataaactcattgccttaaggttttgggtaa 43346848  T
Q  517 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 571  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  43346847 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctctatgtggacggtcc 43346793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 133; E-Value: 8e-69
Query Start/End: Original strand, 43 - 199
Target Start/End: Original strand, 35946524 - 35946680
Alignment:
Q  43 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 142  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  35946524 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccgttgccttaaggttttgggtaa 35946623  T
Q  143 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 199  Q
     ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35946624 aagtgtggtgtctctcttgcttgtgcaattgttctagcctcgatgtggacggtcccc 35946680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 133; E-Value: 8e-69
Query Start/End: Original strand, 417 - 573
Target Start/End: Original strand, 35946524 - 35946680
Alignment:
Q  417 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 516  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  35946524 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccgttgccttaaggttttgggtaa 35946623  T
Q  517 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 573  Q
     ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35946624 aagtgtggtgtctctcttgcttgtgcaattgttctagcctcgatgtggacggtcccc 35946680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 133; E-Value: 8e-69
Query Start/End: Original strand, 41 - 292
Target Start/End: Original strand, 53577364 - 53577616
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 140  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| || |||| ||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  53577364 tgcaagtgtgagttatatgtcacacatcggataaaacagtaaaggttgaacatcttaaaaataagtggatccataaacatattgccttaaggtcttgggt 53577463  T
Q  141 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtggtatcagagccccg 240  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||| |||||||    |||| ||   |||||||||||||||||||||| ||||    
T  53577464 aagagtgtggtgtctctcttgcaagtgtggttgttctagcctcggtgtggatggtcccccgaactcctctttgtgacccaacagtggtatcagagtcccg 53577563  T
Q  241 gttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtca-ttgcgcagaaagccgcaa 292  Q
    |||||||||||||  |||||||||| || ||||| ||||||||||||| ||||    
T  53577564 gttcgacgaagggtacgaccgaggccgccggtcagttgcgcagaaagcagcaa 53577616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 415 - 598
Target Start/End: Original strand, 15772854 - 15773036
Alignment:
Q  415 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 514  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |    
T  15772854 tgcaagtgtgagttatatgtcccatatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgctttaaggttttggat 15772953  T
Q  515 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacag 598  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | | ||||||||| |||||||||||    
T  15772954 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctaacctcgatgtggacggtccttttgactcccctca-tgacccaacag 15773036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 415 - 598
Target Start/End: Complemental strand, 42342546 - 42342363
Alignment:
Q  415 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 514  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  42342546 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatccgataaaagagtaaaggttcaacaccttataagtaagaggacccataaatccattgtcttaaggttttgggt 42342447  T
Q  515 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacag 598  Q
    |||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| | |||||||||||    
T  42342446 aagagtgtgacgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcaatgtggacggtccccctggctccccttagtgacccaacag 42342363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 415 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 29645060 - 29644890
Alignment:
Q  415 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 514  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29645060 tgcaagtgtaagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttaaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgtcttaaggttttgggt 29644961  T
Q  515 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctc 585  Q
    |||||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  29644960 aagagtgtggcgtctctcttgcttatgcggttgttttagcctcgatgtggacggtcccccaagctcccctc 29644890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 366 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 29644791 - 29644581
Alignment:
Q  366 ggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgaggggga---gtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttg 462  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||    || || || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  29644791 ggggagcacgataaagtgatgaagtcacacttgaggggggaatgtttttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggattaaagagtaaaggttg 29644692  T
Q  463 aacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgt 562  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| |||| |||||||    
T  29644691 aacaccttataagtaagagaacccataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcttatgcggttgttttagcttcgatgt 29644592  T
Q  563 ggacggtcccc 573  Q
    ||| |||||||    
T  29644591 ggatggtcccc 29644581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 382 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 42342283 - 42342092
Alignment:
Q  382 tgatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaag 479  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| | |||||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||  |||||||||||||    
T  42342283 tgatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtgcaagtgtgattcatatgttccacatcggataaaagagtaaatgttcaatgccttataagtaag 42342184  T
Q  480 aggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 571  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  42342183 aggactcataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 42342092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 31 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 39935125 - 39934963
Alignment:
Q  31 tgtgttggtttgcaagtgtgag--ttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctt 128  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  39935125 tgtgttggtttgcaagtgtgagagttatatgtcctacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaacccattgcctt 39935026  T
Q  129 aaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 191  Q
    || |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39935025 aaagttttgagtaagagtgtgatgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 39934963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 415 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 12114720 - 12114550
Alignment:
Q  415 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 514  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12114720 tgcaagtgtaagttatatatcccacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgtcttaaggttttgggt 12114621  T
Q  515 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctc 585  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||    
T  12114620 aagagtgtggtgtctctcttacttgtgcggttgttctagccacgatgtggtcggtcccccagactcccctc 12114550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 41 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 12114720 - 12114550
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 140  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12114720 tgcaagtgtaagttatatatcccacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgtcttaaggttttgggt 12114621  T
Q  141 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctc 211  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||    
T  12114620 aagagtgtggtgtctctcttacttgtgcggttgttctagccacgatgtggtcggtcccccagactcccctc 12114550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 41 - 199
Target Start/End: Original strand, 32589704 - 32589861
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 140  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32589704 tgcaagtgtgagt-atatgtcccacataagataaaataataaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 32589802  T
Q  141 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 199  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  32589803 aagagtgcgatgtctctcttgcttgtgtggttgttctaggctcgatgtggacggtcccc 32589861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 415 - 573
Target Start/End: Original strand, 32589704 - 32589861
Alignment:
Q  415 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 514  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32589704 tgcaagtgtgagt-atatgtcccacataagataaaataataaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 32589802  T
Q  515 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 573  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  32589803 aagagtgcgatgtctctcttgcttgtgtggttgttctaggctcgatgtggacggtcccc 32589861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 415 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 33803410 - 33803252
Alignment:
Q  415 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 514  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  33803410 tgcaattgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccatataagtaagaggacccataaacccattgcattaaggtattgggt 33803311  T
Q  515 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 573  Q
    |||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33803310 aagagtgtggcgtctccctctcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 33803252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 406 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 39935124 - 39934963
Alignment:
Q  406 gtgttggtttgcaagtgtgag--ttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctta 503  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39935124 gtgttggtttgcaagtgtgagagttatatgtcctacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaacccattgcctta 39935025  T
Q  504 aggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 565  Q
    | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39935024 aagttttgagtaagagtgtgatgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 39934963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 43 - 253
Target Start/End: Original strand, 52634678 - 52634885
Alignment:
Q  43 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 142  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52634678 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaacagtaaaggttgaacgccttataagtaagag-acccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 52634776  T
Q  143 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtggtatcagagccccggt 242  Q
    |||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| ||| ||||||   ||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||  |    
T  52634777 gagtgtgacgtctctcttgcttgtgcagttgttctagccttgatgtagactgtcccccgagctcccc-cagtgacccaacagtgatatcagagcccc-ct 52634874  T
Q  243 tcgacgaaggg 253  Q
    |||||||||||    
T  52634875 tcgacgaaggg 52634885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 41 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 25739583 - 25739382
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||    
T  25739583 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaagttgaacatcatataagtaagaggacccataaactcattgcttttaggttttgggt 25739484  T
Q  141 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt-cccctaggctcccc-tcactgacccaacagtggtatcagagccc 238  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| |||| ||| ||||||||||||||||    
T  25739483 aagagtgtgacgtctctctagcttgtgcggtagttctagcctcgatgtggacggtcccccaaggctccccttcagtgacgcaatagtggtatcagagccc 25739384  T
Q  239 cg 240  Q
    ||    
T  25739383 cg 25739382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 41 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 41359919 - 41359660
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 140  Q
    ||||||||||||||||    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41359919 tgcaagtgtgagttat----cccacatcggatacaatagtaaaggttgaataccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 41359824  T
Q  141 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctag-gctcccctcactgacccaacagtggtatcagagcccc 239  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||||||| || |||||||| |||||||||| ||||||    
T  41359823 aagaatgtggcgtctctctcgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgggcggtccccccgagctcccc-cagtgacccaatagtggtatcatagcccc 41359725  T
Q  240 ggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtc--attgcgcagaaagccgcaacagcggtacaa 303  Q
      ||||||||||||   || |||||||||  |||    |||||| ||||| |||||||||||||||    
T  41359724 -attcgacgaagggtaagatcgaggcagccagtccgtctgcgcataaagcagcaacagcggtacaa 41359660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 383 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 21832532 - 21832345
Alignment:
Q  383 gatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagg 482  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21832532 gatggactcacacttgaggcggagtgtta-tgtgcaagtgtgagttatatgtcccacattggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagagg 21832434  T
Q  483 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 573  Q
    || ||||||| ||| |||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21832433 actcataaactcatagccttaaggttttgggtaaga--gtggcgtctctcttgcttgtctggttgttctagcctcgatgtggacagtcccc 21832345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 415 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 54018356 - 54018198
Alignment:
Q  415 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 514  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  54018356 tgcaagtgtgagttatatgtcctgcatcggataaaagagtaaagattgaacaccttataagtaagaggacccataaacctaacgccttaaggttttgggt 54018257  T
Q  515 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 573  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  54018256 aagagtgtggtgtctctcatgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgggcggtcccc 54018198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 41 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 29644739 - 29644581
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29644739 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggattaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagagaacccataaacccattgtcttaaggttttgggt 29644640  T
Q  141 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 199  Q
    |||||||||| ||||||||||||| || ||||||| |||| |||||||||| |||||||    
T  29644639 aagagtgtggcgtctctcttgcttatgcggttgttttagcttcgatgtggatggtcccc 29644581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 33 - 190
Target Start/End: Original strand, 39389062 - 39389219
Alignment:
Q  33 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 132  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39389062 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttaaaactaagaggacccataaacccattgtcttaagg 39389161  T
Q  133 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgg 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||   |||||||||||| |||||||    
T  39389162 ttttgggtaagagtgtggtgtctcttttgcctgtgcaattgttctagccttgatgtgg 39389219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 407 - 564
Target Start/End: Original strand, 39389062 - 39389219
Alignment:
Q  407 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 506  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39389062 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttaaaactaagaggacccataaacccattgtcttaagg 39389161  T
Q  507 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgg 564  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||   |||||||||||| |||||||    
T  39389162 ttttgggtaagagtgtggtgtctcttttgcctgtgcaattgttctagccttgatgtgg 39389219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 382 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 22304141 - 22303963
Alignment:
Q  382 tgatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaag 479  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||       ||||||||||||    
T  22304141 tgatggactcacacttgagggagaatgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaatagtaaaggt-------cttataagtaag 22304049  T
Q  480 aggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 565  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22304048 cggacccataaacccattgccttaaggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgagtggttgttctagcctcgatgtgga 22303963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 43 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 32463057 - 32462795
Alignment:
Q  43 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaa-ggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  32463057 caagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaagagtaaaaggttgaataccttataagtaagaagactcataaacccattgccttaaggttttgagta 32462958  T
Q  142 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtggtatcagagccccgg 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  | | |||||||| | ||  | |||||||| ||||||| ||  |    
T  32462957 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgtacggtcttccaagctccccttagtgttctaacagtggcatcagag-cctag 32462859  T
Q  242 ttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggt--cattgcgcagaaagccgcaacagcggtacaa 303  Q
    ||||||||||||  ||||||  ||||  |||    ||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  32462858 ttcgacgaagggtacgaccggagcagtcggttcgtttgcgcagaaagcagcaacggcggtacaa 32462795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 43 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 3135617 - 3135350
Alignment:
Q  43 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataa-----gtaagaggaccc--ataaacccattgccttaaggttt 135  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| |||||||||||||| |     ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  3135617 caagtgtgagttatatgtcccacctcagataaaagagtaaaagttgaacaccttattatattagtaagaggacccccataaacccattgccttaaggttt 3135518  T
Q  136 tgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtggtatcagag 235  Q
    | | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  3135517 tagataagagtgtggtgtctcttttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccctgactctcctca-tgacccaactgtggtatcagag 3135419  T
Q  236 ccccggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtc--attgcgcagaaagccgcaacagcggtacaa 303  Q
    ||||  |||||| |||||  ||| |||||||| |||||   || |||||||||| ||||| |||||||||    
T  3135418 cccc-attcgacaaagggtacgaacgaggcagttggtccgtttacgcagaaagcagcaacggcggtacaa 3135350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 415 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 25739583 - 25739425
Alignment:
Q  415 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 514  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||    
T  25739583 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaagttgaacatcatataagtaagaggacccataaactcattgcttttaggttttgggt 25739484  T
Q  515 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 573  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25739483 aagagtgtgacgtctctctagcttgtgcggtagttctagcctcgatgtggacggtcccc 25739425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 417 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 32463057 - 32462903
Alignment:
Q  417 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaa-ggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 515  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  32463057 caagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaagagtaaaaggttgaataccttataagtaagaagactcataaacccattgccttaaggttttgagta 32462958  T
Q  516 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 570  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32462957 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgtacggtc 32462903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 417 - 598
Target Start/End: Original strand, 52634678 - 52634857
Alignment:
Q  417 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 516  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52634678 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaacagtaaaggttgaacgccttataagtaagag-acccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 52634776  T
Q  517 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacag 598  Q
    |||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| ||| ||||||   ||||||| || |||||||||||    
T  52634777 gagtgtgacgtctctcttgcttgtgcagttgttctagccttgatgtagactgtcccccgagctcccc-cagtgacccaacag 52634857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 41 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 21832501 - 21832345
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  21832501 tgcaagtgtgagttatatgtcccacattggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaactcatagccttaaggttttgggt 21832402  T
Q  141 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 199  Q
    ||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21832401 aaga--gtggcgtctctcttgcttgtctggttgttctagcctcgatgtggacagtcccc 21832345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 41 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 42342248 - 42342092
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 140  Q
    ||||||||||| | |||||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  42342248 tgcaagtgtgattcatatgttccacatcggataaaagagtaaatgttcaatgccttataagtaagaggactcataaactcattgccttaaggttttgggt 42342149  T
Q  141 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 197  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  42342148 aagagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 42342092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 382 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 32462752 - 32462558
Alignment:
Q  382 tgatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaa-ggttgaacaccttataagtaa 478  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  32462752 tgatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcgaatgaaagagtaaaaggttgaacaccttataagtaa 32462653  T
Q  479 gaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 573  Q
    || || ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||| ||||| ||||    
T  32462652 gatgatccataaacctattgctttaaggttttggataagagtgtggggtctctcttgtttgtgggattgttttagcctcgatgtagacggccccc 32462558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 407 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 50612618 - 50612447
Alignment:
Q  407 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccata-----aacccattgcct 501  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||     |||  |||  ||    
T  50612618 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaagattgaacaccttataagtaagaggactcataaatctaacatattatct 50612519  T
Q  502 taaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 573  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| | |||||| |||||||||||||    
T  50612518 taaggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttgcttgagtggttgttccatcctcgacgtggacggtcccc 50612447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 33 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 50612618 - 50612447
Alignment:
Q  33 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccata-----aacccattgcct 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||     |||  |||  ||    
T  50612618 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaagattgaacaccttataagtaagaggactcataaatctaacatattatct 50612519  T
Q  128 taaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 199  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| | |||||| |||||||||||||    
T  50612518 taaggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttgcttgagtggttgttccatcctcgacgtggacggtcccc 50612447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 41 - 193
Target Start/End: Original strand, 15773192 - 15773346
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  15773192 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgaataaaagagtaaaagttgaacatcttataagtaagaggactcataagctcattgccttaaagttttgggt 15773291  T
Q  141 aagagtgtggtgtctct--cttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacg 193  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15773292 aagagtgtgatgtctcttgcttgcttgtgtggttgttctaacctcgatgtggacg 15773346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 32 - 182
Target Start/End: Original strand, 4823646 - 4823796
Alignment:
Q  32 gtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaag 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  4823646 gtgttggtttgcaagtgtgagttataagtctcacatcggataaaatagtaaaagttaaacaccttataagtaggaggacccataaactcattgccttaag 4823745  T
Q  132 gttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcct 182  Q
     ||||||||||||||||||||||| | |||||| || || |||||||||||    
T  4823746 attttgggtaagagtgtggtgtcttttttgcttatgcggatgttctagcct 4823796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 41 - 200
Target Start/End: Original strand, 31190017 - 31190168
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 140  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||        |||||||||||||||||    
T  31190017 tgcaagtgtgagtgatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagttagaggacccata--------gccttaaggttttgggt 31190108  T
Q  141 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  31190109 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtcgggttgttctagcctcgatttggacgctcccct 31190168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 415 - 574
Target Start/End: Original strand, 31190017 - 31190168
Alignment:
Q  415 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 514  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||        |||||||||||||||||    
T  31190017 tgcaagtgtgagtgatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagttagaggacccata--------gccttaaggttttgggt 31190108  T
Q  515 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccct 574  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  31190109 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtcgggttgttctagcctcgatttggacgctcccct 31190168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 415 - 573
Target Start/End: Original strand, 53577364 - 53577522
Alignment:
Q  415 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 514  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| || |||| ||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  53577364 tgcaagtgtgagttatatgtcacacatcggataaaacagtaaaggttgaacatcttaaaaataagtggatccataaacatattgccttaaggtcttgggt 53577463  T
Q  515 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 573  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  53577464 aagagtgtggtgtctctcttgcaagtgtggttgttctagcctcggtgtggatggtcccc 53577522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 43 - 199
Target Start/End: Original strand, 25755396 - 25755552
Alignment:
Q  43 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 142  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||| | ||| ||| |||||||    
T  25755396 caagtgtgagttatatgtctcacatcagataaaagagtaaaggttgaataccttataagtaagaggactcataaatccattgtcctaaagttgtgggtaa 25755495  T
Q  143 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 199  Q
     ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25755496 aagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccc 25755552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 417 - 573
Target Start/End: Original strand, 25755396 - 25755552
Alignment:
Q  417 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 516  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||| | ||| ||| |||||||    
T  25755396 caagtgtgagttatatgtctcacatcagataaaagagtaaaggttgaataccttataagtaagaggactcataaatccattgtcctaaagttgtgggtaa 25755495  T
Q  517 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 573  Q
     ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25755496 aagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccc 25755552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 415 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 1634473 - 1634291
Alignment:
Q  415 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaa-ggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttggg 513  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1634473 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaaataaaaggttaaacacattataagtaagaggacccataaacccattggcttaaggttttggg 1634374  T
Q  514 taagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 597  Q
    |||||||| ||| |||||||  | | | ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| |||| |||||    
T  1634373 taagagtgcggtatctctctcac-tatatggttgttctagcctcgatgtggacggtccccctagctcccctcagtgacacaaca 1634291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 41 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 1634473 - 1634291
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaa-ggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttggg 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1634473 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaaataaaaggttaaacacattataagtaagaggacccataaacccattggcttaaggttttggg 1634374  T
Q  140 taagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 223  Q
    |||||||| ||| |||||||  | | | ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| |||| |||||    
T  1634373 taagagtgcggtatctctctcac-tatatggttgttctagcctcgatgtggacggtccccctagctcccctcagtgacacaaca 1634291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 353 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 3135293 - 3135099
Alignment:
Q  353 gcttccgctctaaggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtt-tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaat 451  Q
    |||||||||  | |||||||||| | || ||||| |||||||||||| || ||||||| ||| || |   ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3135293 gcttccgctagagggggagcacgatgaattgatg-actcacacttgatggtgagtgtttgttgtgtacaagtgagttatatgtcccacatcggataaaat 3135195  T
Q  452 agtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttg 547  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3135194 agtaaatgttgaacaccttataagtaaaagaacccataaacccactgccataaggttttgagtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttg 3135099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 415 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 45395811 - 45395656
Alignment:
Q  415 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 514  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  45395811 tgcaagtgtaagttatatatcccacatcgaataaaagagtaaaggttaaacacgttataagtaagaggatccataaacccattgtcttaatgttttgggt 45395712  T
Q  515 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 570  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  45395711 aagagtgtggtgtctctctcacttgtggggttgctctagcctcgatgtggagggtc 45395656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 41 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 45395811 - 45395656
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 140  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  45395811 tgcaagtgtaagttatatatcccacatcgaataaaagagtaaaggttaaacacgttataagtaagaggatccataaacccattgtcttaatgttttgggt 45395712  T
Q  141 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 196  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  45395711 aagagtgtggtgtctctctcacttgtggggttgctctagcctcgatgtggagggtc 45395656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 48 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 3135224 - 3135099
Alignment:
Q  48 gtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtg 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||    
T  3135224 gtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaatgttgaacaccttataagtaaaagaacccataaacccactgccataaggttttgagtaagagtg 3135125  T
Q  148 tggtgtctctcttgcttgtgtggttg 173  Q
    |||||||||||||||||||| |||||    
T  3135124 tggtgtctctcttgcttgtgcggttg 3135099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 417 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 3135617 - 3135454
Alignment:
Q  417 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataa-----gtaagaggaccc--ataaacccattgccttaaggttt 509  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| |||||||||||||| |     ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  3135617 caagtgtgagttatatgtcccacctcagataaaagagtaaaagttgaacaccttattatattagtaagaggacccccataaacccattgccttaaggttt 3135518  T
Q  510 tgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 573  Q
    | | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3135517 tagataagagtgtggtgtctcttttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 3135454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 383 - 566
Target Start/End: Original strand, 9240118 - 9240300
Alignment:
Q  383 gatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagg 482  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||| |  |||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  9240118 gatggactcacacttgaggaggagtgttg-tgtgcaagtgtgagttatatgttccacatcggatagagaagtaaaagctgaacaccttataagtaagagg 9240216  T
Q  483 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggac 566  Q
    ||||||||| ||||| ||||||| ||| || ||||| ||||||||||||||   | ||| |||| |||||||||||||||||||    
T  9240217 acccataaatccattaccttaagatttcggataagaatgtggtgtctctctcaatagtgcggttattctagcctcgatgtggac 9240300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 43 - 200
Target Start/End: Original strand, 45901715 - 45901873
Alignment:
Q  43 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaa-ggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 141  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||| ||||    
T  45901715 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagaaaaaaaggttgaacaccttataagtaagaggacgcataaactcatggccttaaagtttttggta 45901814  T
Q  142 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccct 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |  |||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  45901815 agagtgtggtgtctctcttacttatagggttgttctaacttcgatgtggacggtcccct 45901873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 417 - 574
Target Start/End: Original strand, 45901715 - 45901873
Alignment:
Q  417 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaa-ggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 515  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||| ||||    
T  45901715 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagaaaaaaaggttgaacaccttataagtaagaggacgcataaactcatggccttaaagtttttggta 45901814  T
Q  516 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccct 574  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |  |||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  45901815 agagtgtggtgtctctcttacttatagggttgttctaacttcgatgtggacggtcccct 45901873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 416 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 53118131 - 53117975
Alignment:
Q  416 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 515  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||| |||||||||    
T  53118131 gcaagtgtgagttatatgttccatatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtgagaggattca-aaacccattgccttaagattttgggta 53118033  T
Q  516 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 573  Q
    ||||||| ||||||||||  |  |||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  53118032 agagtgtagtgtctctctcacaagtgtggttgttctagcatcgatgtgaacggtcccc 53117975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 42 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 53118131 - 53117975
Alignment:
Q  42 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 141  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||| |||||||||    
T  53118131 gcaagtgtgagttatatgttccatatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtgagaggattca-aaacccattgccttaagattttgggta 53118033  T
Q  142 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 199  Q
    ||||||| ||||||||||  |  |||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  53118032 agagtgtagtgtctctctcacaagtgtggttgttctagcatcgatgtgaacggtcccc 53117975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 41 - 252
Target Start/End: Original strand, 8327904 - 8328115
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  8327904 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggatgaatatcttataagtaagagaacccataaacgtaatgccttaaggttttgggt 8328003  T
Q  141 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtg----gttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtggtatcagagc 236  Q
    |||||||||||||||||||  |  ||| |    |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||    | ||| ||||| ||||||||||||     
T  8328004 aagagtgtggtgtctctctcacaagtgagtgcagttgttctagcctcgatgtggacgctcccctgagctcc---tagtgatccaactgtggtatcagag- 8328099  T
Q  237 cccggttcgacgaagg 252  Q
    ||||||||||| ||||    
T  8328100 cccggttcgacaaagg 8328115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 41 - 201
Target Start/End: Original strand, 39914252 - 39914412
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 140  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||  |||||| |    
T  39914252 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcagataaaacagtagaggttgaacaccttataaataagaggacccataaacctaatgccttaatattttggat 39914351  T
Q  141 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccccta 201  Q
    |||||||||||||||||||  ||| || |||||||||||||||||||| ||| | ||||||    
T  39914352 aagagtgtggtgtctctctcacttatgcggttgttctagcctcgatgtagacagcccccta 39914412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 415 - 575
Target Start/End: Original strand, 39914252 - 39914412
Alignment:
Q  415 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 514  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||  |||||| |    
T  39914252 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcagataaaacagtagaggttgaacaccttataaataagaggacccataaacctaatgccttaatattttggat 39914351  T
Q  515 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccccta 575  Q
    |||||||||||||||||||  ||| || |||||||||||||||||||| ||| | ||||||    
T  39914352 aagagtgtggtgtctctctcacttatgcggttgttctagcctcgatgtagacagcccccta 39914412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 415 - 574
Target Start/End: Original strand, 8327904 - 8328067
Alignment:
Q  415 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 514  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  8327904 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggatgaatatcttataagtaagagaacccataaacgtaatgccttaaggttttgggt 8328003  T
Q  515 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtg----gttgttctagcctcgatgtggacggtcccct 574  Q
    |||||||||||||||||||  |  ||| |    |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8328004 aagagtgtggtgtctctctcacaagtgagtgcagttgttctagcctcgatgtggacgctcccct 8328067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 43 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 32462715 - 32462558
Alignment:
Q  43 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaa-ggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||||||| ||    
T  32462715 caagtgtgagttatatgtcccacatcgaatgaaagagtaaaaggttgaacaccttataagtaagatgatccataaacctattgctttaaggttttggata 32462616  T
Q  142 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 199  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||| ||||| ||||    
T  32462615 agagtgtggggtctctcttgtttgtgggattgttttagcctcgatgtagacggccccc 32462558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 382 - 470
Target Start/End: Original strand, 22304213 - 22304301
Alignment:
Q  382 tgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacacctt 470  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22304213 tgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacacctt 22304301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 33 - 199
Target Start/End: Original strand, 37726496 - 37726654
Alignment:
Q  33 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||        | |||||||||| |||    
T  37726496 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaatgttgaataccttataagtaagagg--------atccattgcctttagg 37726587  T
Q  133 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 199  Q
    |||||| ||||||||||  || | |||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37726588 ttttggataagagtgtgacgtttatcttacttgtatagttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 37726654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 407 - 573
Target Start/End: Original strand, 37726496 - 37726654
Alignment:
Q  407 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 506  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||        | |||||||||| |||    
T  37726496 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaatgttgaataccttataagtaagagg--------atccattgcctttagg 37726587  T
Q  507 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 573  Q
    |||||| ||||||||||  || | |||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37726588 ttttggataagagtgtgacgtttatcttacttgtatagttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 37726654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 417 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 49336843 - 49336694
Alignment:
Q  417 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 516  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||    
T  49336843 caagtgtgagttacatgtctcacatcggatagaaaagtaaaggttgaccaccttataagtaagaggacccataaacccatagtcttaaagttctgggtaa 49336744  T
Q  517 gagtgtggtgtctctc-ttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 565  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||| |||| |||||||    
T  49336743 gagtgtggtgtctctctttttttgtgcggttgttctatcctcaatgtgga 49336694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 43 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 49336843 - 49336694
Alignment:
Q  43 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 142  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||    
T  49336843 caagtgtgagttacatgtctcacatcggatagaaaagtaaaggttgaccaccttataagtaagaggacccataaacccatagtcttaaagttctgggtaa 49336744  T
Q  143 gagtgtggtgtctctc-ttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 191  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||| |||| |||||||    
T  49336743 gagtgtggtgtctctctttttttgtgcggttgttctatcctcaatgtgga 49336694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 33 - 200
Target Start/End: Original strand, 51886553 - 51886714
Alignment:
Q  33 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||      |    
T  51886553 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtctcacatcgaataaaatagtaaaggttgaacatcatataagtaagaggacccataaactcattgc------g 51886646  T
Q  133 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccct 200  Q
    |||||| |||||||||| ||||||| ||||  ||||| ||||||||  ||||||||| ||||| ||||    
T  51886647 ttttggataagagtgtgatgtctcttttgcaagtgtgattgttctaatctcgatgtgaacggtaccct 51886714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 407 - 574
Target Start/End: Original strand, 51886553 - 51886714
Alignment:
Q  407 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 506  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||      |    
T  51886553 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtctcacatcgaataaaatagtaaaggttgaacatcatataagtaagaggacccataaactcattgc------g 51886646  T
Q  507 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccct 574  Q
    |||||| |||||||||| ||||||| ||||  ||||| ||||||||  ||||||||| ||||| ||||    
T  51886647 ttttggataagagtgtgatgtctcttttgcaagtgtgattgttctaatctcgatgtgaacggtaccct 51886714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 44 - 198
Target Start/End: Original strand, 11661954 - 11662108
Alignment:
Q  44 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg-ttttgggtaa 142  Q
    |||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||| | |||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  11661954 aagtgtgagttaaatgccccacattggataaaagagtaaaggttgaacaccttaaaagtgagaggcctcataaaccaattgccttaaggtttttgggtaa 11662053  T
Q  143 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 198  Q
    ||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  11662054 gagtgaggtgtctctc-tcattgtgtggttgttctagcctcgatgtgaacagtccc 11662108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 473 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 22303759 - 22303634
Alignment:
Q  473 aagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc-c 571  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| | |||||||||||||||||| ||||||| |    
T  22303759 aagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtttctcttacttgtgcgattgttctagcctcgatgtagacggtctc 22303660  T
Q  572 cctaggctcccctcactgacccaaca 597  Q
    |||||  || |||||||||| |||||    
T  22303659 cctagcttctcctcactgactcaaca 22303634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 99 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 22303759 - 22303634
Alignment:
Q  99 aagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc-c 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| | |||||||||||||||||| ||||||| |    
T  22303759 aagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtttctcttacttgtgcgattgttctagcctcgatgtagacggtctc 22303660  T
Q  198 cctaggctcccctcactgacccaaca 223  Q
    |||||  || |||||||||| |||||    
T  22303659 cctagcttctcctcactgactcaaca 22303634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 417 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 33175820 - 33175635
Alignment:
Q  417 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggaccc---ataaacccattgccttaaggttttggg 513  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  33175820 caagtgtgagttatatgtctcacatcagatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagagaacccataataaactcatagccttaaggttttggg 33175721  T
Q  514 taaga--gtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 597  Q
    |||||  |||||  ||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||   |||||||||| || |||||||    
T  33175720 taagagtgtgtgacgtctctctcacttgtgtgattgttctagcctcggtgtgggcagtcccccgagctcccctcagtggcccaaca 33175635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 43 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 33175820 - 33175635
Alignment:
Q  43 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggaccc---ataaacccattgccttaaggttttggg 139  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  33175820 caagtgtgagttatatgtctcacatcagatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagagaacccataataaactcatagccttaaggttttggg 33175721  T
Q  140 taaga--gtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 223  Q
    |||||  |||||  ||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||   |||||||||| || |||||||    
T  33175720 taagagtgtgtgacgtctctctcacttgtgtgattgttctagcctcggtgtgggcagtcccccgagctcccctcagtggcccaaca 33175635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 41 - 192
Target Start/End: Original strand, 9240149 - 9240300
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 140  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |  |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| || |    
T  9240149 tgcaagtgtgagttatatgttccacatcggatagagaagtaaaagctgaacaccttataagtaagaggacccataaatccattaccttaagatttcggat 9240248  T
Q  141 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggac 192  Q
    |||| ||||||||||||||   | ||| |||| |||||||||||||||||||    
T  9240249 aagaatgtggtgtctctctcaatagtgcggttattctagcctcgatgtggac 9240300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 415 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 44160702 - 44160547
Alignment:
Q  415 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 514  Q
    ||||||||| ||||||||||  || || |||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  44160702 tgcaagtgtcagttatatgtttcatattggataaaacaataaaggttgaacaccttataaataagaggatccataaacccattgtcttaaggtttt-ggt 44160604  T
Q  515 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 573  Q
    |||| ||||| ||||||||| ||  || | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44160603 aagaatgtggcgtctctcttact--tgcgattgttctagcctcgatgtggacggtcccc 44160547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 41 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 44160702 - 44160547
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 140  Q
    ||||||||| ||||||||||  || || |||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  44160702 tgcaagtgtcagttatatgtttcatattggataaaacaataaaggttgaacaccttataaataagaggatccataaacccattgtcttaaggtttt-ggt 44160604  T
Q  141 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 199  Q
    |||| ||||| ||||||||| ||  || | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44160603 aagaatgtggcgtctctcttact--tgcgattgttctagcctcgatgtggacggtcccc 44160547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 396 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 47964694 - 47964544
Alignment:
Q  396 ttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaaccca 495  Q
    ||||||| |||||||| | |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||  ||  ||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||| |    
T  47964694 ttgagggcgagtgttg-tgtgcaagtgtgagttgtatgtcccgcatcggatagaaatgtggaggttgaacgctatataagtgagaggacccataaaccta 47964596  T
Q  496 ttgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttg 547  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  47964595 ttgccttaaggttttgggtaagagtgtggcgtctctctcacttgtgtggttg 47964544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 425 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 42584970 - 42584800
Alignment:
Q  425 agttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtgg 524  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| ||||| | ||||||||||    
T  42584970 agttatatgtcccacatcggatagaagagtaaagattgaacaccttataagtaagaggatccataaaccaattgtcttaagattttgagaaagagtgtgg 42584871  T
Q  525 tgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 597  Q
    |||  ||||| ||| || |||||||||||  || ||||||||||  |||  | ||| ||||| ||||||||||    
T  42584870 tgt--ctcttacttatgcggttgttctagtttcaatgtggacggctcccccgactctcctcaatgacccaaca 42584800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 51 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 42584970 - 42584800
Alignment:
Q  51 agttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtgg 150  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| ||||| | ||||||||||    
T  42584970 agttatatgtcccacatcggatagaagagtaaagattgaacaccttataagtaagaggatccataaaccaattgtcttaagattttgagaaagagtgtgg 42584871  T
Q  151 tgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaaca 223  Q
    |||  ||||| ||| || |||||||||||  || ||||||||||  |||  | ||| ||||| ||||||||||    
T  42584870 tgt--ctcttacttatgcggttgttctagtttcaatgtggacggctcccccgactctcctcaatgacccaaca 42584800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 489 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 41359575 - 41359467
Alignment:
Q  489 aaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcact 588  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| ||    
T  41359575 aaacccataaccttaaggttttgggtaagagtgtggcgtctcttttgcttgtgcggttgttctagcctcaatgtggacggtcccccagactcccctcgct 41359476  T
Q  589 gacccaaca 597  Q
    |||||||||    
T  41359475 gacccaaca 41359467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 115 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 41359575 - 41359467
Alignment:
Q  115 aaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcact 214  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| ||    
T  41359575 aaacccataaccttaaggttttgggtaagagtgtggcgtctcttttgcttgtgcggttgttctagcctcaatgtggacggtcccccagactcccctcgct 41359476  T
Q  215 gacccaaca 223  Q
    |||||||||    
T  41359475 gacccaaca 41359467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 41 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 47964676 - 47964544
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 140  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||  ||  ||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  47964676 tgcaagtgtgagttgtatgtcccgcatcggatagaaatgtggaggttgaacgctatataagtgagaggacccataaacctattgccttaaggttttgggt 47964577  T
Q  141 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttg 173  Q
    |||||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  47964576 aagagtgtggcgtctctctcacttgtgtggttg 47964544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 41 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 39336387 - 39336178
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   |  ||||||||||| |||||||| |||||| |||||||| |||||| |||||||||||| |    
T  39336387 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaagttggaggttgaacactttataagtgagaggatccataaactcattgctttaaggttttggat 39336288  T
Q  141 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt-cccctaggctcccctcactgacccaacagtggtatcagagcccc 239  Q
    || |||||  || |||||| ||| ||||||||| ||| |||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||  ||| |||||| ||||||||||| |      
T  39336287 aatagtgt--tgcctctctcgctcgtgtggttgctct-gcctggatgtggatggtcccccttggctcccctc-gtgatccaacattggtatcagagtcgt 39336192  T
Q  240 ggttcgacgaaggg 253  Q
    ||||| ||||||||    
T  39336191 ggttcaacgaaggg 39336178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 404 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 3384435 - 3384317
Alignment:
Q  404 gagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctta 503  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||  | |||||||    
T  3384435 gagtgttggtgtgcaagcgtgagttatatgtcccacatatgataaaacagtataggttaaacactttataaggaagaggacccataaacttaatgcctta 3384336  T
Q  504 aggttttgggtaagagtgt 522  Q
    | |||||||||||||||||    
T  3384335 aagttttgggtaagagtgt 3384317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 441 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 33362425 - 33362327
Alignment:
Q  441 tcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttg 539  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||  || |||||||||||||    
T  33362425 tcggataaaataataaaggttgaataccttataagtaagaggacccataaacccatttccttaagattttgggtaagtgtggcgtctctctcttgcttg 33362327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 67 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 33362425 - 33362327
Alignment:
Q  67 tcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttg 165  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||  || |||||||||||||    
T  33362425 tcggataaaataataaaggttgaataccttataagtaagaggacccataaacccatttccttaagattttgggtaagtgtggcgtctctctcttgcttg 33362327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 32 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 3384433 - 3384317
Alignment:
Q  32 gtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaag 131  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||  | ||||||||     
T  3384433 gtgttggtgtgcaagcgtgagttatatgtcccacatatgataaaacagtataggttaaacactttataaggaagaggacccataaacttaatgccttaaa 3384334  T
Q  132 gttttgggtaagagtgt 148  Q
    |||||||||||||||||    
T  3384333 gttttgggtaagagtgt 3384317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 32 - 96
Target Start/End: Original strand, 22304237 - 22304301
Alignment:
Q  32 gtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacacctt 96  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22304237 gtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacacctt 22304301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 415 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 39336387 - 39336219
Alignment:
Q  415 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 514  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   |  ||||||||||| |||||||| |||||| |||||||| |||||| |||||||||||| |    
T  39336387 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaagttggaggttgaacactttataagtgagaggatccataaactcattgctttaaggttttggat 39336288  T
Q  515 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt-cccctaggctcccctc 585  Q
    || |||||  || |||||| ||| ||||||||| ||| |||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||    
T  39336287 aatagtgt--tgcctctctcgctcgtgtggttgctct-gcctggatgtggatggtcccccttggctcccctc 39336219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 111 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 54017636 - 54017522
Alignment:
Q  111 ccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccct 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||| ||||| | |||||||||||| ||||||||    |||||||    
T  54017636 ccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctattacttatgtgattgttttggcctcgatgtggtcggtccccctaactcccct 54017537  T
Q  211 cactgacccaacagt 225  Q
    |  ||||||||||||    
T  54017536 ctatgacccaacagt 54017522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 485 - 598
Target Start/End: Complemental strand, 54017636 - 54017523
Alignment:
Q  485 ccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccct 584  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||| ||||| | |||||||||||| ||||||||    |||||||    
T  54017636 ccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctattacttatgtgattgttttggcctcgatgtggtcggtccccctaactcccct 54017537  T
Q  585 cactgacccaacag 598  Q
    |  |||||||||||    
T  54017536 ctatgacccaacag 54017523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 415 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 47965073 - 47964915
Alignment:
Q  415 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 514  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||||| || |||  ||||| ||||   ||||||| ||||| | ||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  47965073 tgcaagtgtgagttatatgttttacatcggatagaaaagtggaggttaaacattatataagtgagagggctcataagcccattgccttaagattttgggt 47964974  T
Q  515 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 573  Q
    |||||||||| ||||||||  ||| | || ||||||| |||| |||||||||| |||||    
T  47964973 aagagtgtggcgtctctctcacttatatgattgttctggcctagatgtggacgttcccc 47964915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 41 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 47965073 - 47964915
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 140  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||||| || |||  ||||| ||||   ||||||| ||||| | ||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  47965073 tgcaagtgtgagttatatgttttacatcggatagaaaagtggaggttaaacattatataagtgagagggctcataagcccattgccttaagattttgggt 47964974  T
Q  141 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 199  Q
    |||||||||| ||||||||  ||| | || ||||||| |||| |||||||||| |||||    
T  47964973 aagagtgtggcgtctctctcacttatatgattgttctggcctagatgtggacgttcccc 47964915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 418 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 7767469 - 7767380
Alignment:
Q  418 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggt 507  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  7767469 aagtctgagttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggttggacactttataactaagaggactcataaacccattgtcttaaggt 7767380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 44 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 7767469 - 7767380
Alignment:
Q  44 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggt 133  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  7767469 aagtctgagttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggttggacactttataactaagaggactcataaacccattgtcttaaggt 7767380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 524 - 598
Target Start/End: Original strand, 22304302 - 22304377
Alignment:
Q  524 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc-taggctcccctcactgacccaacag 598  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  22304302 gtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccctagcttcccctcactgacccaacag 22304377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 43 - 159
Target Start/End: Original strand, 11661537 - 11661638
Alignment:
Q  43 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 142  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||               |||||||||||||||||||    
T  11661537 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaacggttaaacatcttataagtaagagg---------------gccttaaggttttgggtaa 11661621  T
Q  143 gagtgtggtgtctctct 159  Q
    |||||||||||||||||    
T  11661622 gagtgtggtgtctctct 11661638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 417 - 533
Target Start/End: Original strand, 11661537 - 11661638
Alignment:
Q  417 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 516  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||               |||||||||||||||||||    
T  11661537 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaacggttaaacatcttataagtaagagg---------------gccttaaggttttgggtaa 11661621  T
Q  517 gagtgtggtgtctctct 533  Q
    |||||||||||||||||    
T  11661622 gagtgtggtgtctctct 11661638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 418 - 523
Target Start/End: Complemental strand, 46546480 - 46546375
Alignment:
Q  418 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 517  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||  ||  ||  ||||||||||| |||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  46546480 aagtgtgagttatatgtcctacattggattgaaatgtggaggttgaacactttataagttagagaatccataaacccattgccttaaggttttgtgtaag 46546381  T
Q  518 agtgtg 523  Q
    ||||||    
T  46546380 agtgtg 46546375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 44 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 46546480 - 46546375
Alignment:
Q  44 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 143  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||  ||  ||  ||||||||||| |||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  46546480 aagtgtgagttatatgtcctacattggattgaaatgtggaggttgaacactttataagttagagaatccataaacccattgccttaaggttttgtgtaag 46546381  T
Q  144 agtgtg 149  Q
    ||||||    
T  46546380 agtgtg 46546375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 41 - 97
Target Start/End: Original strand, 43346650 - 43346706
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacacctta 97  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43346650 tgcaagtgtgagttgtatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacacctta 43346706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 415 - 471
Target Start/End: Original strand, 43346650 - 43346706
Alignment:
Q  415 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacacctta 471  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43346650 tgcaagtgtgagttgtatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacacctta 43346706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 457 - 543
Target Start/End: Complemental strand, 39336086 - 39336000
Alignment:
Q  457 aggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtg 543  Q
    ||||||||||| |||||| | | | ||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  39336086 aggttgaacactttataaatgataagactcataaaatcattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctcgcttgtgtg 39336000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 83 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 39336086 - 39336000
Alignment:
Q  83 aggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtg 169  Q
    ||||||||||| |||||| | | | ||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  39336086 aggttgaacactttataaatgataagactcataaaatcattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctcgcttgtgtg 39336000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 83 - 188
Target Start/End: Original strand, 12749211 - 12749316
Alignment:
Q  83 aggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcct 182  Q
    ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||| |||||||||| | |||||||||||  || ||||| ||| |||||||||||||| ||    
T  12749211 aggttgaacactttataagtgtgaggacccataaaccaattgcattaaggtttttgataagagtgtggactcactcttacttatgtggttgttctagtct 12749310  T
Q  183 cgatgt 188  Q
     |||||    
T  12749311 ggatgt 12749316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 457 - 562
Target Start/End: Original strand, 12749211 - 12749316
Alignment:
Q  457 aggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcct 556  Q
    ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||| |||||||||| | |||||||||||  || ||||| ||| |||||||||||||| ||    
T  12749211 aggttgaacactttataagtgtgaggacccataaaccaattgcattaaggtttttgataagagtgtggactcactcttacttatgtggttgttctagtct 12749310  T
Q  557 cgatgt 562  Q
     |||||    
T  12749311 ggatgt 12749316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 91 - 151
Target Start/End: Original strand, 52634990 - 52635050
Alignment:
Q  91 caccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggt 151  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  52634990 caccttataaataagaggacccataaactcattgccttaagattttgggtaagagtgtggt 52635050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 465 - 525
Target Start/End: Original strand, 52634990 - 52635050
Alignment:
Q  465 caccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggt 525  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  52634990 caccttataaataagaggacccataaactcattgccttaagattttgggtaagagtgtggt 52635050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 145 - 198
Target Start/End: Original strand, 8328374 - 8328427
Alignment:
Q  145 gtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 198  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8328374 gtgtggtgtctctcttgcttgtggggttgttttagcctcgatgtggacggtccc 8328427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 519 - 572
Target Start/End: Original strand, 8328374 - 8328427
Alignment:
Q  519 gtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 572  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8328374 gtgtggtgtctctcttgcttgtggggttgttttagcctcgatgtggacggtccc 8328427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 44 - 173
Target Start/End: Original strand, 25317161 - 25317290
Alignment:
Q  44 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 143  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | |||  || |||  ||||||| ||| || ||| | |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||     
T  25317161 aagtgtgagttatgtgtcccacaccagatggaaaagtggaggttgagcactttgtaactgagaggacccataaacttgttgccttaaggttttgggtaaa 25317260  T
Q  144 agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttg 173  Q
    ||||| |||| |||||  ||||||||||||    
T  25317261 agtgtagtgtgtctctcacttgtgtggttg 25317290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 418 - 547
Target Start/End: Original strand, 25317161 - 25317290
Alignment:
Q  418 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 517  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | |||  || |||  ||||||| ||| || ||| | |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||     
T  25317161 aagtgtgagttatgtgtcccacaccagatggaaaagtggaggttgagcactttgtaactgagaggacccataaacttgttgccttaaggttttgggtaaa 25317260  T
Q  518 agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttg 547  Q
    ||||| |||| |||||  ||||||||||||    
T  25317261 agtgtagtgtgtctctcacttgtgtggttg 25317290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 43 - 159
Target Start/End: Original strand, 25991405 - 25991521
Alignment:
Q  43 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 142  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||  |||||  ||| || ||| ||||  |||||||| |||| ||| ||||||| | |||||||||||||||||| |    
T  25991405 caagtgtgagtaatatgtcccacatcaaataaacaagttaatgttaaacattttataagtgagagaacctataaacctaatgccttaaggttttgggtta 25991504  T
Q  143 gagtgtggtgtctctct 159  Q
     |||||||| |||||||    
T  25991505 aagtgtggtctctctct 25991521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 417 - 533
Target Start/End: Original strand, 25991405 - 25991521
Alignment:
Q  417 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 516  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||  |||||  ||| || ||| ||||  |||||||| |||| ||| ||||||| | |||||||||||||||||| |    
T  25991405 caagtgtgagtaatatgtcccacatcaaataaacaagttaatgttaaacattttataagtgagagaacctataaacctaatgccttaaggttttgggtta 25991504  T
Q  517 gagtgtggtgtctctct 533  Q
     |||||||| |||||||    
T  25991505 aagtgtggtctctctct 25991521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 168 - 267
Target Start/End: Original strand, 9239940 - 9240038
Alignment:
Q  168 tggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtggtatcagagccccggttcgacgaagggagcgaccgaggcag 267  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| |||||||| |||||||| || |||||| || |||||  ||| ||||||||    
T  9239940 tggtttttctagcctcgatgtggacggtcccccaagctcccctca-tgatccaacagtagtatcagaacctcggttcaacaaagggtacgatcgaggcag 9240038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 159
Target Start/End: Original strand, 53596027 - 53596078
Alignment:
Q  108 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 159  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53596027 gacccataaacccgttaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 53596078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 482 - 533
Target Start/End: Original strand, 53596027 - 53596078
Alignment:
Q  482 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 533  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53596027 gacccataaacccgttaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 53596078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 159
Target Start/End: Original strand, 53596342 - 53596393
Alignment:
Q  108 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 159  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53596342 gacccataaacccgttaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 53596393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 482 - 533
Target Start/End: Original strand, 53596342 - 53596393
Alignment:
Q  482 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 533  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53596342 gacccataaacccgttaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 53596393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #137
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 470 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 17732007 - 17731950
Alignment:
Q  470 tataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 527  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17732007 tataagaaagggaacccataaacccattgccttaaggttttgagtaagagtgtggtgt 17731950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #138
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 17732007 - 17731950
Alignment:
Q  96 tataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 153  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17732007 tataagaaagggaacccataaacccattgccttaaggttttgagtaagagtgtggtgt 17731950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #139
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 470 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 19033238 - 19033181
Alignment:
Q  470 tataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 527  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19033238 tataagaaagggaacccataaacccattgccttaaggttttgagtaagagtgtggtgt 19033181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #140
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 19033238 - 19033181
Alignment:
Q  96 tataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 153  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19033238 tataagaaagggaacccataaacccattgccttaaggttttgagtaagagtgtggtgt 19033181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #141
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 495 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 43978947 - 43978865
Alignment:
Q  495 attgccttaaggttttgggtaag----agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 573  Q
    |||||||||||||||||||||||    ||||||| ||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  43978947 attgccttaaggttttgggtaagctagagtgtggcgtctctctcacttgtgtgtttgttctaacctcgatgtggactgtcccc 43978865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #142
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 121 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 43978947 - 43978865
Alignment:
Q  121 attgccttaaggttttgggtaag----agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 199  Q
    |||||||||||||||||||||||    ||||||| ||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  43978947 attgccttaaggttttgggtaagctagagtgtggcgtctctctcacttgtgtgtttgttctaacctcgatgtggactgtcccc 43978865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #143
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 159
Target Start/End: Original strand, 53596542 - 53596593
Alignment:
Q  108 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 159  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  53596542 gacccataaacccattgacttaagattttaggtaagagtgtggtgtctctct 53596593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #144
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 482 - 533
Target Start/End: Original strand, 53596542 - 53596593
Alignment:
Q  482 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 533  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  53596542 gacccataaacccattgacttaagattttaggtaagagtgtggtgtctctct 53596593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #145
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 497 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 7766857 - 7766783
Alignment:
Q  497 tgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 573  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||   ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  7766857 tgccttaaggttttaggtaagattgtggcgtctctca--cttgtatggttgttctagcctcgatgtagatggtcccc 7766783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #146
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 123 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 7766857 - 7766783
Alignment:
Q  123 tgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 199  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||   ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  7766857 tgccttaaggttttaggtaagattgtggcgtctctca--cttgtatggttgttctagcctcgatgtagatggtcccc 7766783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #147
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 214 - 274
Target Start/End: Original strand, 53577656 - 53577716
Alignment:
Q  214 tgacccaacagtggtatcagagccccggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtca 274  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||| || |||||    
T  53577656 tgacccaacagtggtatcagagtcccggttcgaagaagggtacgaccgaggccgccggtca 53577716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #148
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 482 - 529
Target Start/End: Complemental strand, 48127906 - 48127859
Alignment:
Q  482 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtct 529  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  48127906 gacccataaacccattgctttaatgttttggataagagtgtggtgtct 48127859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #149
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 108 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 48127906 - 48127859
Alignment:
Q  108 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtct 155  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  48127906 gacccataaacccattgctttaatgttttggataagagtgtggtgtct 48127859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #150
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 542 - 586
Target Start/End: Original strand, 9239940 - 9239984
Alignment:
Q  542 tggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctca 586  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  9239940 tggtttttctagcctcgatgtggacggtcccccaagctcccctca 9239984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #151
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 415 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 12747910 - 12747878
Alignment:
Q  415 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggata 447  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12747910 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggata 12747878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #152
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 41 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 12747910 - 12747878
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggata 73  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12747910 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggata 12747878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #153
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 483 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 16871049 - 16871005
Alignment:
Q  483 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 527  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  16871049 acccataaactcattgccttaaggttttaggtaagagtgtcgtgt 16871005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #154
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 109 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 16871049 - 16871005
Alignment:
Q  109 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 153  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  16871049 acccataaactcattgccttaaggttttaggtaagagtgtcgtgt 16871005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #155
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 483 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 17735081 - 17735037
Alignment:
Q  483 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 527  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  17735081 acccataaactcattgacttaaggttttgggtaagagtgcggtgt 17735037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #156
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 109 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 17735081 - 17735037
Alignment:
Q  109 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 153  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  17735081 acccataaactcattgacttaaggttttgggtaagagtgcggtgt 17735037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #157
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 483 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 19036350 - 19036306
Alignment:
Q  483 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 527  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  19036350 acccataaactcattgacttaaggttttgggtaagagtgcggtgt 19036306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #158
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 109 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 19036350 - 19036306
Alignment:
Q  109 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 153  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  19036350 acccataaactcattgacttaaggttttgggtaagagtgcggtgt 19036306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #159
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 202 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 3135099 - 3135035
Alignment:
Q  202 ggctcccctcactgacccaacagtggtatcagagccccggttcgacgaagggagcgaccgaggcagc 268  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||| |||||  |||||||||||||    
T  3135099 ggctcccctca-tgacccaatagtggtatcagagcacc-gttcgacaaagggtacgaccgaggcagc 3135035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #160
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 377 - 439
Target Start/End: Original strand, 2299937 - 2300000
Alignment:
Q  377 taaagtgatggactcacacttgagggggag--tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccac 439  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||   ||||| | |||||||||| ||||||||||||||    
T  2299937 taaattgatggactcacacttgagggggatattgttg-tgtgcaagtgtgggttatatgtcccac 2300000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #161
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 153
Target Start/End: Original strand, 16143505 - 16143550
Alignment:
Q  108 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 153  Q
    ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  16143505 gacccataagctcattgccttaaagttttgggtaagagtgtagtgt 16143550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #162
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 482 - 527
Target Start/End: Original strand, 16143505 - 16143550
Alignment:
Q  482 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 527  Q
    ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  16143505 gacccataagctcattgccttaaagttttgggtaagagtgtagtgt 16143550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #163
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 486 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 16869884 - 16869843
Alignment:
Q  486 cataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 527  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  16869884 cataaactcattgccttaaggttttgagcaagagtgtggtgt 16869843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #164
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 16869884 - 16869843
Alignment:
Q  112 cataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 153  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  16869884 cataaactcattgccttaaggttttgagcaagagtgtggtgt 16869843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #165
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 420 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 36986101 - 36986040
Alignment:
Q  420 gtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 481  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||  || |||||||| ||||    
T  36986101 gtgtgagttatatgtcccacatcgaatagaaaagtgaaggttgagaactttataagtgagag 36986040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #166
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 46 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 36986101 - 36986040
Alignment:
Q  46 gtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 107  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||  || |||||||| ||||    
T  36986101 gtgtgagttatatgtcccacatcgaatagaaaagtgaaggttgagaactttataagtgagag 36986040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #167
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 420 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 37011540 - 37011479
Alignment:
Q  420 gtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 481  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||  || |||||||| ||||    
T  37011540 gtgtgagttatatgtcccacatcgaatagaaaagtgaaggttgagaactttataagtgagag 37011479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #168
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 46 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 37011540 - 37011479
Alignment:
Q  46 gtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 107  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||  || |||||||| ||||    
T  37011540 gtgtgagttatatgtcccacatcgaatagaaaagtgaaggttgagaactttataagtgagag 37011479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #169
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 546 - 598
Target Start/End: Complemental strand, 41360164 - 41360112
Alignment:
Q  546 tgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacag 598  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||| || |||||    
T  41360164 tgttctagcctcgatgtggacggttccccgggctcccctcgctgtcctaacag 41360112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #170
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 478 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 50329427 - 50329391
Alignment:
Q  478 agaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 514  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  50329427 agaggacccataaatccaatgccttaaggttttgggt 50329391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #171
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 104 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 50329427 - 50329391
Alignment:
Q  104 agaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 140  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  50329427 agaggacccataaatccaatgccttaaggttttgggt 50329391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 271; Significance: 1e-151; HSPs: 2)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 41 - 535
Target Start/End: Original strand, 4982 - 5477
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 140  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||| | || |||||||||| || | ||||||||||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  4982 tgcaagtgtgaattatatgtctcacatcggagagaacagtaaaggtttaatatcttataagtaaaaagacccataaactcattgccttatggttttgggt 5081  T
Q  141 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtggtatcagagccccg 240  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||||||||||||||||  | ||||   ||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||    
T  5082 aagagtgtggtgtctctctcgcttatgcggttgctctagcctcgatgtggaccattcccttttctcccctaagtgacccaacagtggcatcacagccccg 5181  T
Q  241 gttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtcattgcgcagaaagccgcaacagcggtacaagtagcaagtggctccttgtgcaggaacggcgatacag 340  Q
     ||||||||| ||  ||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5182 -ttcgacgaaaggtacgatcgaggcagctggtcgttgcgcagaaagcagcaacggcggtacaagcagcaagtggctccttgtgcaggaacggcgatacag 5280  T
Q  341 gcaaagtcaaaagcttccgctctaagggg-agcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtccc 437  Q
    ||||||| || ||||||||||  |||||| |||||| | || ||||||||||||||||||||| |||| |||  || |||||||||||||||||||| ||    
T  5281 gcaaagt-aagagcttccgcttgaagggggagcacgatgaactgatggactcacacttgagggagagttttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgttcc 5379  T
Q  438 acatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttg 535  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5380 acatcggatagaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagattttggataagagtgtggtgtctctcttg 5477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 415 - 566
Target Start/End: Original strand, 4982 - 5133
Alignment:
Q  415 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 514  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||| | || |||||||||| || | ||||||||||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  4982 tgcaagtgtgaattatatgtctcacatcggagagaacagtaaaggtttaatatcttataagtaaaaagacccataaactcattgccttatggttttgggt 5081  T
Q  515 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggac 566  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  5082 aagagtgtggtgtctctctcgcttatgcggttgctctagcctcgatgtggac 5133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 207)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 33 - 347
Target Start/End: Original strand, 41370349 - 41370662
Alignment:
Q  33 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 132  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  41370349 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccaaatcggataaaatagtaaatgttgaaaaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaag 41370448  T
Q  133 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtggtatca 232  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    || ||| || ||||||||||||| |||||    
T  41370449 ttttgggtaagagtgtagtgtctctcttgcttgagtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgaacttccc-cagtgacccaacagtgatatca 41370547  T
Q  233 gagccccggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtcattgcgcagaaagccgcaacagcggtacaagtagcaagtggctccttgtgcaggaacgg 332  Q
    |||||||  |||||||||||| |||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  41370548 gagcccccattcgacgaagggtgcgaccgaggcagccggtcgttgcacagaaagccgcaacggcggtacaagcagcaagtagctccttgtgcaggaacgg 41370647  T
Q  333 cgatacaggcaaagt 347  Q
    ||||||||| |||||    
T  41370648 cgatacaggtaaagt 41370662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 40 - 563
Target Start/End: Original strand, 54108537 - 54109060
Alignment:
Q  40 ttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacc-cattgccttaaggttttgg 138  Q
    |||||||||||||||||  |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  54108537 ttgcaagtgtgagttat--gtcccatataggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggacccataaaattcattgccttaaggttttgg 54108634  T
Q  139 gtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctag-gctcccctcactgacccaacagtggtatcagagcc 237  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |  ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||    
T  54108635 ctaagagtgtggtgtctatcttgcttgtgtggttgttctagcctcaatgtgg-cggtcccccatagctcccc-cagtgacccaacagcggtatcagagcc 54108732  T
Q  238 ccggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtca--ttgcgcagaaagccgcaacagcggtacaagtagcaagtggctcc--ttgtg-------cag 326  Q
     || ||||||||||||  |||| |||||||| ||||   ||||||| ||||| ||||  |||||||||||||   || | | |  |||||       |||    
T  54108733 acg-ttcgacgaagggtacgac-gaggcagccggtccgtttgcgcataaagcagcaatggcggtacaagtagt--gtcggttcgtttgtggagaaaccag 54108828  T
Q  327 gaacggcgatacaggcaaagtcaaaagcttccgctctaagggg-agcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtga 425  Q
     |||||||||||| |||| || || ||||||||||  |||||| |||| | | || | || ||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |    
T  54108829 caacggcgatacaagcaa-gt-aagagcttccgcttgaagggggagcatgatgaattaatagactcacacttaagggggagtgttg-tgtgcaagtgtca 54108925  T
Q  426 gttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggt 525  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  54108926 gttat--gtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa-gttttgggtaagagtgtggt 54109022  T
Q  526 gtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtg 563  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  54109023 gtctctcttgcttgtgcggttgttctagcttcgatgtg 54109060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 47 - 568
Target Start/End: Original strand, 20825842 - 20826370
Alignment:
Q  47 tgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagt 146  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||    
T  20825842 tgtgagttatatgttccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataaataagagcacccataaacctttagccttaaggttttgggtaagagt 20825941  T
Q  147 gtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtggtatcagagccccggttcga 246  Q
    ||||||| |||||| ||| || |||||||||||||| ||||||||| |||||| | |||||| ||| ||| |||||||||| |||||||||||  |||||    
T  20825942 gtggtgtttctcttccttatgcggttgttctagccttgatgtggacagtcccccatgctcccttcaatgatccaacagtggcatcagagccccaattcga 20826041  T
Q  247 cgaagggagcgaccgaggcagctggtc--attgcgcagaaagccgcaacagcggtacaagtagcaagtggctccttgtg---------caggaacggcga 335  Q
    |||||||  ||||||||||||| ||||   ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||   || | ||| | ||         ||| ||||||||    
T  20826042 cgaagggtacgaccgaggcagccggtccatttgcgcagaaagcagcaacggcggtacaagcag--tgttgatccgtttgcggagaaaccagcaacggcga 20826139  T
Q  336 tacaggcaaagtcaaaagcttccgctctaa-ggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgt 434  Q
    |||| || |||| || ||| ||||||  || |||||||| | | ||  ||||||||||||||||||||||||||||  | |  || ||||||||||||||    
T  20826140 tacaagc-aagt-aatagcgtccgcttgaagggggagcatgatgaatagatggactcacacttgagggggagtgtt-atgtagaaatgtgagttatatgt 20826236  T
Q  435 cccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctt 534  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||    
T  20826237 cccacatcggataaaatagtaaaagttgaacacgttataagtaagagaacccataaacccatagccttaacattttaggtaagagtgtgatgtctctctt 20826336  T
Q  535 gcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacgg 568  Q
     ||| || | ||||||||||||||||||||||||    
T  20826337 ccttatgcgattgttctagcctcgatgtggacgg 20826370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 41 - 358
Target Start/End: Original strand, 10245920 - 10246237
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 140  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||    
T  10245920 tgcaagtgtgagttatatgccccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacc-ataaacccaaagccttaaggttttgggt 10246018  T
Q  141 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtggtatcagagccccg 240  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  10246019 aagagtgtggtgtctcccttgcttgtctggttgttctagcctcgatgtggacgctcccccaagctcccctcgctgacccaacagtggtatcagaaccccg 10246118  T
Q  241 gttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtca-ttgcgcagaaagccgcaacagcggtacaagtagcaagtggctccttgtgcaggaacggcgataca 339  Q
    |||||| ||||||  |||| ||||| ||  |||| ||| ||||||||| |||||  ||||||||| | ||||||||| ||||||||| |||||| |||||    
T  10246119 gttcgatgaagggtacgactgaggccgcctgtcagttgtgcagaaagcagcaacgacggtacaagcaacaagtggcttcttgtgcagcaacggctataca 10246218  T
Q  340 ggcaaagtcaaaagcttcc 358  Q
     ||||||| ||||||||||    
T  10246219 tgcaaagtaaaaagcttcc 10246237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 41 - 524
Target Start/End: Original strand, 2740700 - 2741180
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||  ||    
T  2740700 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacctataaacccagagccttaaggttttacgt 2740799  T
Q  141 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtggtatcagagccccg 240  Q
    |||||||||| ||||||||  ||||||  ||||||||||||||||| |||| |||||||   ||||||||||        ||||||||||||||||||||    
T  2740800 aagagtgtggcgtctctctcacttgtg--gttgttctagcctcgatatggatggtcccccgagctcccctca--------acagtggtatcagagccccg 2740889  T
Q  241 gttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtca--ttgcgcagaaagccgcaacagcggtacaagtagcaagtggctccttgtgcagg---------aa 329  Q
     ||||||||||||  ||||||||||||| | ||   ||||||||||||| |||||||||||||||    |  || | ||| | |||||          ||    
T  2740890 -ttcgacgaagggtacgaccgaggcagccgatccgtttgcgcagaaagcagcaacagcggtacaat---cgtgtcggtccgtttgcagagaaaccagcaa 2740985  T
Q  330 cggcgatacaggcaaagtcaaaagcttccgctctaaggggag--cacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagt 427  Q
    |||||||||  ||||||| || ||||||||||  ||||||||  || | | || |||||||||||||||||| ||||||||||  | |||||||||||||    
T  2740986 cggcgatacgagcaaagt-aagagcttccgcttgaaggggagagcatgatgaattgatggactcacacttgaaggggagtgtta-tgtgcaagtgtgagt 2741083  T
Q  428 tatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtgg 524  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2741084 tatatgtcccacatcagatagaatagtaaaggttgaataccttataagtaagaggacccataactccattgccttaaggttttgggtaagagtgtgg 2741180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 180; E-Value: 7e-97
Query Start/End: Original strand, 228 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 18933102 - 18932747
Alignment:
Q  228 tatcagagccccggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtcattgcgcagaaagccgcaacagcggtacaagtagcaagtggctccttgtgcagg 327  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||  ||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18933102 tatcagagccccggttcgacgaagtgtgcgaccgaggcagccggtggttgtgcagaaagtcgcaacggcggtacaagcagcaagtggctccttgtgcagg 18933003  T
Q  328 aacggcgatacaggcaaagtcaaaagcttccgctctaagggg-agcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgag 426  Q
    |||||||||||||| ||| | || || |||||||  |||||| |||| | | ||  ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  18933002 aacggcgatacaggtaaaat-aagagtttccgcttgaagggggagcatgatgaatagatagactcacacttgaggggg-gtgttggtttgcaagtctgag 18932905  T
Q  427 ttatatgtcccacatcgg-----------ataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 515  Q
    ||||||||||||||||||           |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18932904 ttatatgtcccacatcggtcctacatcggataaaatagtaaaggttgaataccttataaataagaggacccataaacccattgccttaaggttttaggta 18932805  T
Q  516 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 573  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  18932804 agagtgtggtgtctctcttacttgagtggttgttatagcctcgatgtgtacggtcccc 18932747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 170; E-Value: 7e-91
Query Start/End: Original strand, 41 - 317
Target Start/End: Original strand, 3340807 - 3341083
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 140  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3340807 tgcaagtgtgagttatatgtcccgcatcagatgaaagagtaaaggttgagcaccttataagtaagaggacccataaacccactgccttaaggttttgggt 3340906  T
Q  141 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtggtatcagagccccg 240  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  3340907 aagagtgtggtgtctttcttgcttgtggggttgttctagcctcgatgtggacggtctcctgagctcccc-cagtgacccaacagtggtatcagagccccg 3341005  T
Q  241 gttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtca-ttgcgcagaaagccgcaacagcggtacaagtagcaagtggctc 317  Q
    |||||||||| ||  |||||||||  |||||||| ||||||||||||| |||||  ||||||||  | ||||||||||    
T  3341006 gttcgacgaacggtacgaccgaggtcgctggtcagttgcgcagaaagcagcaacgacggtacaaacaacaagtggctc 3341083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 41 - 240
Target Start/End: Original strand, 25483336 - 25483534
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 140  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25483336 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggatccataaacccattgccttaaggttttgggt 25483435  T
Q  141 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtggtatcagagccccg 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||    
T  25483436 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtctccctggctcccc-cagtgacccaacagtggtatcatagccccg 25483534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 382 - 596
Target Start/End: Original strand, 36629205 - 36629418
Alignment:
Q  382 tgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 481  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  36629205 tgatgggctcacacttgagggggagtgttgtgtt-caagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaagttaaacaccttataagtaagag 36629303  T
Q  482 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcc 581  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||    
T  36629304 gacccataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccacatgctcc 36629403  T
Q  582 cctcactgacccaac 596  Q
    ||||| |||||||||    
T  36629404 cctcaatgacccaac 36629418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 405 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 50630921 - 50630731
Alignment:
Q  405 agtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa 504  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50630921 agtgttggtttgcaagcgtgagttatatgtcctacatcggataaaatagtaaaggttgaacacattataagtaagaggacccataaacccattgccttaa 50630822  T
Q  505 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc-cctaggctcccctcactgacccaa 595  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  50630821 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttttagcctcgatgtgggcggtccgcctag-ctcccctcactgacccaa 50630731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 32 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 50630920 - 50630731
Alignment:
Q  32 gtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaag 131  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50630920 gtgttggtttgcaagcgtgagttatatgtcctacatcggataaaatagtaaaggttgaacacattataagtaagaggacccataaacccattgccttaag 50630821  T
Q  132 gttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc-cctaggctcccctcactgacccaa 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  50630820 gttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttttagcctcgatgtgggcggtccgcctag-ctcccctcactgacccaa 50630731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 148; E-Value: 9e-78
Query Start/End: Original strand, 415 - 598
Target Start/End: Original strand, 25483336 - 25483518
Alignment:
Q  415 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 514  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25483336 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggatccataaacccattgccttaaggttttgggt 25483435  T
Q  515 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacag 598  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| || |||||||||||    
T  25483436 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtctccctggctcccc-cagtgacccaacag 25483518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 43 - 222
Target Start/End: Original strand, 36629239 - 36629418
Alignment:
Q  43 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 142  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36629239 caagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaagttaaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttgggtaa 36629338  T
Q  143 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaac 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||| |||||||||    
T  36629339 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccacatgctcccctcaatgacccaac 36629418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 143; E-Value: 9e-75
Query Start/End: Original strand, 407 - 573
Target Start/End: Original strand, 41370349 - 41370515
Alignment:
Q  407 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 506  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  41370349 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccaaatcggataaaatagtaaatgttgaaaaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaag 41370448  T
Q  507 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 573  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41370449 ttttgggtaagagtgtagtgtctctcttgcttgagtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 41370515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 407 - 582
Target Start/End: Complemental strand, 55933288 - 55933113
Alignment:
Q  407 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 506  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  55933288 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaatagtaagggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaag 55933189  T
Q  507 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctccc 582  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  55933188 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttacttgtacagttgttctagcctcgatgtggacggtcccccaagctccc 55933113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 33 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 55933288 - 55933113
Alignment:
Q  33 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 132  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  55933288 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaatagtaagggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaag 55933189  T
Q  133 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctccc 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  55933188 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttacttgtacagttgttctagcctcgatgtggacggtcccccaagctccc 55933113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 138; E-Value: 8e-72
Query Start/End: Original strand, 352 - 586
Target Start/End: Original strand, 44620595 - 44620830
Alignment:
Q  352 agcttccgctctaaggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaa 449  Q
    |||||||||| |  |||||||||| | || |||||||||||||||||||| ||||||| |  || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  44620595 agcttccgcttttgggggagcacgatgaattgatggactcacacttgaggtggagtgtcgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatgaa 44620694  T
Q  450 atagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgtt 549  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  44620695 atagtagaggttgaacactttataagtaagaggacccataaa-ccataaccttaaggttttgggtaagagtgtggtttctctcttgcttgtgcggttgtt 44620793  T
Q  550 ctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctca 586  Q
     || |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  44620794 atatcctcgatgtggacggtcccccaagctcccctca 44620830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 415 - 598
Target Start/End: Original strand, 10245920 - 10246102
Alignment:
Q  415 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 514  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||    
T  10245920 tgcaagtgtgagttatatgccccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacc-ataaacccaaagccttaaggttttgggt 10246018  T
Q  515 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacag 598  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  10246019 aagagtgtggtgtctcccttgcttgtctggttgttctagcctcgatgtggacgctcccccaagctcccctcgctgacccaacag 10246102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 43 - 273
Target Start/End: Original strand, 39404020 - 39404249
Alignment:
Q  43 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 142  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| || ||||||||||||||||    
T  39404020 caagtgtgagttatatgtcctacattgaataaaagagtaaaggttgaacactttataagtaagaggactcataaactcatagcattaaggttttgggtaa 39404119  T
Q  143 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtggtatcagagccccggt 242  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| | |||||||||||||||| | | | ||    
T  39404120 gagtgtggcgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgagctcccctcactaatccaacagtggtatcag-gacactgt 39404218  T
Q  243 tcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtc 273  Q
    |||||||||||   |||||||||||| ||||    
T  39404219 tcgacgaagggtatgaccgaggcagccggtc 39404249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 50 - 307
Target Start/End: Original strand, 44621011 - 44621266
Alignment:
Q  50 gagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 149  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44621011 gagttgtatgacccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagagggcacataaactcattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 44621110  T
Q  150 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtggtatcagagccccggttcgacga 249  Q
    |||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  44621111 gtgtttctcttgcttgtgcggttattctagcctcgatgtggacggtcccc---gctcctctca-tgatccaacagtggtatcagagccctggtttgacga 44621206  T
Q  250 agggagcgaccgaggcagctggtc--attgcgcagaaagccgcaacagcggtacaagtag 307  Q
    ||||  |||||||| |||| ||||   || |||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  44621207 agggtacgaccgagacagccggtccgttttcgcagaaagcagcaacggcgatacaagtag 44621266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 133; E-Value: 8e-69
Query Start/End: Original strand, 41 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 22028527 - 22028313
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatag--taaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgg 138  Q
    ||||||||| | |||||||||| ||||||||||||| |   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  22028527 tgcaagtgttacttatatgtcctacatcggataaaaaaaaataaaggttgaacaccttattagtaagaggacccataaactcattgtcttaatgttttgg 22028428  T
Q  139 gtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt-cccctaggctcccctcactgacccaacagtggtatcagagcc 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22028427 gtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgaggttgttctagcctcaatgtggacggtcccccaaagctcccctcactgacccaacagtggtatcggagcc 22028328  T
Q  238 ccggttcgacgaaggg 253  Q
    || |||||||||||||    
T  22028327 cc-gttcgacgaaggg 22028313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 133; E-Value: 8e-69
Query Start/End: Original strand, 41 - 273
Target Start/End: Original strand, 44620660 - 44620889
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||    
T  44620660 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatgaaatagtagaggttgaacactttataagtaagaggacccataaa-ccataaccttaaggttttgggt 44620758  T
Q  141 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtggtatcagagccccg 240  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||     
T  44620759 aagagtgtggtttctctcttgcttgtgcggttgttatatcctcgatgtggacggtcccccaagctcccctca-tgatccaatagtggtatcagagcccc- 44620856  T
Q  241 gttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtc 273  Q
    ||||| | |||||  ||||||||| ||| ||||    
T  44620857 gttcgtcaaagggtacgaccgaggtagccggtc 44620889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 352 - 572
Target Start/End: Original strand, 39404334 - 39404555
Alignment:
Q  352 agcttccgctctaaggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaa 449  Q
    ||||||||||  | || ||||||| | || ||||||||| |||||||||| ||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  39404334 agcttccgcttgagggagagcacgatgaattgatggact-acacttgaggaggagtgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaa 39404432  T
Q  450 atagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgtt 549  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39404433 agagtaaaggtggaacaccttataagtaagaggacccataaacctatagccttaaggttttgggcaagaatgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgtt 39404532  T
Q  550 ctagcctcgatgtggacggtccc 572  Q
    |||||||||||||| ||||||||    
T  39404533 ctagcctcgatgtgaacggtccc 39404555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 415 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 54017751 - 54017596
Alignment:
Q  415 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 514  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  54017751 tgcaagtgtgagttatatgtcccacgtcagataaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttaggt 54017652  T
Q  515 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 570  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54017651 aagagtgtgatgtctctcttgcttatgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 54017596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 41 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 54017751 - 54017596
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  54017751 tgcaagtgtgagttatatgtcccacgtcagataaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttaggt 54017652  T
Q  141 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 196  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54017651 aagagtgtgatgtctctcttgcttatgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 54017596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 38 - 240
Target Start/End: Original strand, 50002423 - 50002625
Alignment:
Q  38 gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttg 137  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  50002423 gtttgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaaggttgaacactttttaagtaagaggacccataaatccattgtcttaaggttttg 50002522  T
Q  138 ggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtggtatcagagcc 237  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    |  |||| | |||||||||| |||||||||||||    
T  50002523 ggtaagagtgtggtgtctctcttacttgtgcggttgttctagcctcgatgtgggcggtcccccgaaccaccctaagtgacccaacaatggtatcagagcc 50002622  T
Q  238 ccg 240  Q
    |||    
T  50002623 ccg 50002625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 384 - 598
Target Start/End: Complemental strand, 22028150 - 22027935
Alignment:
Q  384 atggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 481  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||||  || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  22028150 atggactcacacttaaggaggggtgttgttgtgtgcaagtgtgacttatatgtcccacatcggataaaatacgaaaggttgaacaccttataagtaagag 22028051  T
Q  482 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcc 581  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||||  |||||||    
T  22028050 gacccataaacatattgccttaaggttttgggtaagaatgtggtgtctctctcgcttatgtggttgttttagtctcgatgtggacagtccctcaggctcc 22027951  T
Q  582 cctcactgacccaacag 598  Q
    ||||| |||||||||||    
T  22027950 cctca-tgacccaacag 22027935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 415 - 598
Target Start/End: Original strand, 3340807 - 3340989
Alignment:
Q  415 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 514  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3340807 tgcaagtgtgagttatatgtcccgcatcagatgaaagagtaaaggttgagcaccttataagtaagaggacccataaacccactgccttaaggttttgggt 3340906  T
Q  515 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacag 598  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||| || |||||||||||    
T  3340907 aagagtgtggtgtctttcttgcttgtggggttgttctagcctcgatgtggacggtctcctgagctcccc-cagtgacccaacag 3340989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 41 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 49076986 - 49076763
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 140  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  49076986 tgcaagtgtgagttatatgttccatattggctaaaatagtaaaggttgaacaccttata-gtaagagaacccataaacccataaccttaaggttttgggt 49076888  T
Q  141 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtggtatcagagccccg 240  Q
     |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  49076887 tagagtgtggtgtctttcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggactgtcccctgagct-ccctca-tgacccaacagtggtatcagagcccc- 49076791  T
Q  241 gttcgacgaagggagcgaccgaggcagc 268  Q
    ||||||| |||||  | |||||||||||    
T  49076790 gttcgacaaagggtactaccgaggcagc 49076763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 415 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 1731803 - 1731646
Alignment:
Q  415 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 514  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1731803 tgcaaatgtgagttatatgtcccacatcagataaaacagtaaaggttgaacatcttataaataagaggacccataaaccaattgccttaaggttttgggt 1731704  T
Q  515 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 572  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1731703 aagagtgtggtgtttctcttgcttgtgtggttgttctagcctcaatgtggacggtccc 1731646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 41 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 1731803 - 1731646
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 140  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1731803 tgcaaatgtgagttatatgtcccacatcagataaaacagtaaaggttgaacatcttataaataagaggacccataaaccaattgccttaaggttttgggt 1731704  T
Q  141 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 198  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1731703 aagagtgtggtgtttctcttgcttgtgtggttgttctagcctcaatgtggacggtccc 1731646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 417 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 39793014 - 39792845
Alignment:
Q  417 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 516  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| ||||||||||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  39793014 caagtgtgagttatatgtcccacatcagatagaaaagtaaatgttgaacaccttataagaaagaggaaccgtaaactcattgccttaaggttttgggtaa 39792915  T
Q  517 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctca 586  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  39792914 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcctctgagctcccctca 39792845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 43 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 39793014 - 39792845
Alignment:
Q  43 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 142  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| ||||||||||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  39793014 caagtgtgagttatatgtcccacatcagatagaaaagtaaatgttgaacaccttataagaaagaggaaccgtaaactcattgccttaaggttttgggtaa 39792915  T
Q  143 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctca 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  39792914 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcctctgagctcccctca 39792845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 412 - 573
Target Start/End: Original strand, 50002423 - 50002584
Alignment:
Q  412 gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttg 511  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  50002423 gtttgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaaggttgaacactttttaagtaagaggacccataaatccattgtcttaaggttttg 50002522  T
Q  512 ggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 573  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  50002523 ggtaagagtgtggtgtctctcttacttgtgcggttgttctagcctcgatgtgggcggtcccc 50002584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 41 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 22028117 - 22027935
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 140  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  22028117 tgcaagtgtgacttatatgtcccacatcggataaaatacgaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacatattgccttaaggttttgggt 22028018  T
Q  141 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacag 224  Q
    |||| |||||||||||||| |||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  22028017 aagaatgtggtgtctctctcgcttatgtggttgttttagtctcgatgtggacagtccctcaggctcccctca-tgacccaacag 22027935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 43 - 198
Target Start/End: Original strand, 39404400 - 39404555
Alignment:
Q  43 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 142  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||    
T  39404400 caagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaagagtaaaggtggaacaccttataagtaagaggacccataaacctatagccttaaggttttgggcaa 39404499  T
Q  143 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 198  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  39404500 gaatgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgaacggtccc 39404555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 415 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 36608817 - 36608647
Alignment:
Q  415 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 514  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  36608817 tgcaagtgtgagttatatgtccaacatcggataaaagagtaaaagttgaacacctcataagtaagaggatccataaatccattgtcttaaggttttgggt 36608718  T
Q  515 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctc 585  Q
    |||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  36608717 aagagtgtggtgtctctctcactagtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccaagctcccctc 36608647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 41 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 36608817 - 36608647
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 140  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  36608817 tgcaagtgtgagttatatgtccaacatcggataaaagagtaaaagttgaacacctcataagtaagaggatccataaatccattgtcttaaggttttgggt 36608718  T
Q  141 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctc 211  Q
    |||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  36608717 aagagtgtggtgtctctctcactagtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccaagctcccctc 36608647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 417 - 598
Target Start/End: Original strand, 39404020 - 39404201
Alignment:
Q  417 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 516  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| || ||||||||||||||||    
T  39404020 caagtgtgagttatatgtcctacattgaataaaagagtaaaggttgaacactttataagtaagaggactcataaactcatagcattaaggttttgggtaa 39404119  T
Q  517 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacag 598  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| | |||||||    
T  39404120 gagtgtggcgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgagctcccctcactaatccaacag 39404201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 41 - 189
Target Start/End: Original strand, 52884695 - 52884844
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtttt-ggg 139  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| |||    
T  52884695 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgatcgataaacccattgccttaaggttttgggg 52884794  T
Q  140 taagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtg 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  52884795 taagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgatctagcctcgatgtg 52884844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 415 - 563
Target Start/End: Original strand, 52884695 - 52884844
Alignment:
Q  415 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtttt-ggg 513  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| |||    
T  52884695 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgatcgataaacccattgccttaaggttttgggg 52884794  T
Q  514 taagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtg 563  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  52884795 taagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgatctagcctcgatgtg 52884844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 385 - 563
Target Start/End: Original strand, 52884856 - 52885038
Alignment:
Q  385 tggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagg 482  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52884856 tggactcacacttgagggg-agtgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagg 52884954  T
Q  483 acccataaacccattgccttaaggtttt-gggtaagagtgtggtg--tctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtg 563  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||    
T  52884955 atccataaacccattgccttaaggttttggggtaagaatgtggtgtctctctcttatttgtgtggttgatctagcctcgatgtg 52885038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 50 - 268
Target Start/End: Original strand, 44620362 - 44620571
Alignment:
Q  50 gagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 149  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44620362 gagttatatgttccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataaataagagagcccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 44620461  T
Q  150 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtggtatcagagccccggttcgacga 249  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||   ||||| |||| ||| ||||||||||||||     || ||||||||||    
T  44620462 atgtttctcttgcttgtgtggttgttctaaccttgatgtggacggtcccc---gctcctctca-tgatccaacagtggtatc-----cctggttcgacga 44620552  T
Q  250 agggagcgaccgaggcagc 268  Q
    ||||  | |||||||||||    
T  44620553 agggtacaaccgaggcagc 44620571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 415 - 598
Target Start/End: Complemental strand, 22028527 - 22028341
Alignment:
Q  415 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatag--taaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgg 512  Q
    ||||||||| | |||||||||| ||||||||||||| |   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  22028527 tgcaagtgttacttatatgtcctacatcggataaaaaaaaataaaggttgaacaccttattagtaagaggacccataaactcattgtcttaatgttttgg 22028428  T
Q  513 gtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt-cccctaggctcccctcactgacccaacag 598  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  22028427 gtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgaggttgttctagcctcaatgtggacggtcccccaaagctcccctcactgacccaacag 22028341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 417 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 34646803 - 34646648
Alignment:
Q  417 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 516  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34646803 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaacagtaaatgttgaacaccttataactaagaggactcataaactcattgccttaaggttttgggtaa 34646704  T
Q  517 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 572  Q
    ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  34646703 gagtgtggtgtctctctggtctgtgtggttgttctagccttgttgtggacggtccc 34646648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 43 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 34646803 - 34646648
Alignment:
Q  43 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 142  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34646803 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaacagtaaatgttgaacaccttataactaagaggactcataaactcattgccttaaggttttgggtaa 34646704  T
Q  143 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 198  Q
    ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  34646703 gagtgtggtgtctctctggtctgtgtggttgttctagccttgttgtggacggtccc 34646648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 33 - 179
Target Start/End: Original strand, 49880152 - 49880297
Alignment:
Q  33 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  49880152 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacattgaataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccactgccttaagg 49880251  T
Q  133 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctag 179  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||||||    
T  49880252 ttttgggtaagagcgtggtgtctctcttgtttatgt-gttgttctag 49880297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 407 - 553
Target Start/End: Original strand, 49880152 - 49880297
Alignment:
Q  407 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 506  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  49880152 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacattgaataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccactgccttaagg 49880251  T
Q  507 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctag 553  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||||||    
T  49880252 ttttgggtaagagcgtggtgtctctcttgtttatgt-gttgttctag 49880297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 44 - 198
Target Start/End: Original strand, 50459724 - 50459878
Alignment:
Q  44 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 143  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||||    
T  50459724 aagtgtgagttatatgttccacatcggttaaaagagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggactcataaacccattatcttaaggttttaggtaag 50459823  T
Q  144 agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 198  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  50459824 agcgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgcacggtccc 50459878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 418 - 572
Target Start/End: Original strand, 50459724 - 50459878
Alignment:
Q  418 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 517  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||||    
T  50459724 aagtgtgagttatatgttccacatcggttaaaagagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggactcataaacccattatcttaaggttttaggtaag 50459823  T
Q  518 agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 572  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  50459824 agcgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgcacggtccc 50459878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 425 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 54343147 - 54343006
Alignment:
Q  425 agttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtgg 524  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54343147 agttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggaccc-------cattgccttaaggttttgggtaagagtgtgg 54343055  T
Q  525 tgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 573  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  54343054 tgtctctcttgcttgagtggttgttctagcctcgatgtggatggtcccc 54343006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 51 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 54343147 - 54343006
Alignment:
Q  51 agttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtgg 150  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54343147 agttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggaccc-------cattgccttaaggttttgggtaagagtgtgg 54343055  T
Q  151 tgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 199  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  54343054 tgtctctcttgcttgagtggttgttctagcctcgatgtggatggtcccc 54343006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 43 - 240
Target Start/End: Original strand, 36572021 - 36572216
Alignment:
Q  43 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 142  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  36572021 caagtgtgagttatatgtcccacatcgaataaaagagtaaatgttgaacaccttataagtaagaagacccataaatccattgccttaaggttttgggtta 36572120  T
Q  143 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtggtatcagagccccg 240  Q
    |||| |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| | | ||| | ||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  36572121 gagtatggtgtctctctcgcttgtgcggttgttcaagcctcgatgtgaacggtccccga-gatcctc-cagcgacccaacagtgatatcagagccccg 36572216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 424 - 573
Target Start/End: Original strand, 44620362 - 44620511
Alignment:
Q  424 gagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 523  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44620362 gagttatatgttccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataaataagagagcccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 44620461  T
Q  524 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 573  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  44620462 atgtttctcttgcttgtgtggttgttctaaccttgatgtggacggtcccc 44620511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 42 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 16889691 - 16889426
Alignment:
Q  42 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 141  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||| | |||||||| ||||||||||    
T  16889691 gcaagtgtgagttatatgtctcaaatcggatagaaaagtaaaggttgaataccttataagtaagaggattcataaacctactgccttaaagttttgggta 16889592  T
Q  142 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtggtatcagagccccgg 241  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    ||||||| |  |||||||||| ||||| ||||| ||| |    
T  16889591 agagtatggtgtctctcttccttgtgtgattgttctaacctcgatgtggacggtccctcgagctccccac-gtgacccaacaatggtaccagag-ccctg 16889494  T
Q  242 ttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtc--attgcgcagaaagccgcaacagcggtacaagtag 307  Q
    ||||||||||||  |||| |||||| | ||||   ||| ||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  16889493 ttcgacgaagggtacgactgaggcaaccggtccgtttgtgcagaaagcagcaacggcggtacaagtag 16889426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 95 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 23817783 - 23817569
Alignment:
Q  95 ttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacgg 194  Q
    |||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23817783 ttataagtaagaggattcataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgctagtgtggttgttctagcctcgatgtggacgg 23817684  T
Q  195 tccccta-ggctcccctcactgacccaacagtggtatcagagccccggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtc--attgcgcagaaagccgca 291  Q
    ||||| |  |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||  ||| ||||||||| ||||   ||||||||||||| |||    
T  23817683 tcccccatagctcccctcgatgatccaacagtggtatcatagcccc-attcgacgaagggtacgatcgaggcagccggtctgtttgcgcagaaagcagca 23817585  T
Q  292 acagcggtacaagtag 307  Q
    ||  ||||||||||||    
T  23817584 acgacggtacaagtag 23817569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 417 - 573
Target Start/End: Original strand, 36572021 - 36572177
Alignment:
Q  417 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 516  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  36572021 caagtgtgagttatatgtcccacatcgaataaaagagtaaatgttgaacaccttataagtaagaagacccataaatccattgccttaaggttttgggtta 36572120  T
Q  517 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 573  Q
    |||| |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  36572121 gagtatggtgtctctctcgcttgtgcggttgttcaagcctcgatgtgaacggtcccc 36572177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 41 - 189
Target Start/End: Original strand, 52884887 - 52885038
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtttt-ggg 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  52884887 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaacccattgccttaaggttttgggg 52884986  T
Q  140 taagagtgtggtg--tctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtg 189  Q
    ||||| |||||||  ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||    
T  52884987 taagaatgtggtgtctctctcttatttgtgtggttgatctagcctcgatgtg 52885038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 415 - 582
Target Start/End: Complemental strand, 22183420 - 22183253
Alignment:
Q  415 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 514  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22183420 tgcaagtgtgagttatatatcccacatcggataaaagagtaaatgttgaacaatttataagtaaaaggacccataaacccattgccttaaggttttggat 22183321  T
Q  515 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctccc 582  Q
    |||||||||| ||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  22183320 aagagtgtggcgtctctctcacttgtacggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccagactccc 22183253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 41 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 22183420 - 22183253
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 140  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22183420 tgcaagtgtgagttatatatcccacatcggataaaagagtaaatgttgaacaatttataagtaaaaggacccataaacccattgccttaaggttttggat 22183321  T
Q  141 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctccc 208  Q
    |||||||||| ||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  22183320 aagagtgtggcgtctctctcacttgtacggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccagactccc 22183253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 415 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 4955473 - 4955332
Alignment:
Q  415 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 514  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4955473 tgcaagtgtgagttatatgtctcatatcggataaaatagttaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaacccattgccttaaggttttgggt 4955374  T
Q  515 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcct 556  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||    
T  4955373 aagagtgtggcgtctctcttacttgtgcggttgctctagcct 4955332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 41 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 4955473 - 4955332
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 140  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4955473 tgcaagtgtgagttatatgtctcatatcggataaaatagttaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaacccattgccttaaggttttgggt 4955374  T
Q  141 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcct 182  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||    
T  4955373 aagagtgtggcgtctctcttacttgtgcggttgctctagcct 4955332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 424 - 573
Target Start/End: Original strand, 44621011 - 44621160
Alignment:
Q  424 gagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 523  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44621011 gagttgtatgacccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagagggcacataaactcattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 44621110  T
Q  524 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 573  Q
    |||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  44621111 gtgtttctcttgcttgtgcggttattctagcctcgatgtggacggtcccc 44621160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 60 - 225
Target Start/End: Original strand, 54936215 - 54936378
Alignment:
Q  60 tcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 159  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54936215 tcccacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttgtaagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 54936314  T
Q  160 tgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagt 225  Q
      | | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||| || ||||||||||||    
T  54936315 cac-tatgtggttgttctagcctcgatgtggacagtcccccgagctcccc-cagtgacccaacagt 54936378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 32 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 18932925 - 18932747
Alignment:
Q  32 gtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccaca-----------tcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaaccc 120  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||           |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18932925 gtgttggtttgcaagtctgagttatatgtcccacatcggtcctacatcggataaaatagtaaaggttgaataccttataaataagaggacccataaaccc 18932826  T
Q  121 attgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 199  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  18932825 attgccttaaggttttaggtaagagtgtggtgtctctcttacttgagtggttgttatagcctcgatgtgtacggtcccc 18932747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 434 - 598
Target Start/End: Original strand, 54936215 - 54936377
Alignment:
Q  434 tcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 533  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54936215 tcccacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttgtaagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 54936314  T
Q  534 tgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacag 598  Q
      | | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||| || |||||||||||    
T  54936315 cac-tatgtggttgttctagcctcgatgtggacagtcccccgagctcccc-cagtgacccaacag 54936377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 415 - 574
Target Start/End: Complemental strand, 49076986 - 49076828
Alignment:
Q  415 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 514  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  49076986 tgcaagtgtgagttatatgttccatattggctaaaatagtaaaggttgaacaccttata-gtaagagaacccataaacccataaccttaaggttttgggt 49076888  T
Q  515 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccct 574  Q
     |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  49076887 tagagtgtggtgtctttcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggactgtcccct 49076828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 421 - 598
Target Start/End: Original strand, 20825842 - 20826019
Alignment:
Q  421 tgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagt 520  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||    
T  20825842 tgtgagttatatgttccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataaataagagcacccataaacctttagccttaaggttttgggtaagagt 20825941  T
Q  521 gtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacag 598  Q
    ||||||| |||||| ||| || |||||||||||||| ||||||||| |||||| | |||||| ||| ||| |||||||    
T  20825942 gtggtgtttctcttccttatgcggttgttctagccttgatgtggacagtcccccatgctcccttcaatgatccaacag 20826019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 383 - 574
Target Start/End: Complemental strand, 3244638 - 3244448
Alignment:
Q  383 gatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagg 482  Q
    ||||||||||| ||| |||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3244638 gatggactcacgcttaagggagagtgttg-tgtgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggatagaaaagtaaaggttgaacatcttataagtaagagg 3244540  T
Q  483 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccct 574  Q
    |||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||  ||||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  3244539 acccataaactcattgtcttaaagttttgggtaagaatgtgtcgtctctctcacttgtatggttgttccagcctcgatgtgggcagtcccct 3244448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 416 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 16888971 - 16888804
Alignment:
Q  416 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 515  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |||| |||||||||||    
T  16888971 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggttgaataccttataagtaagagaacctataaactcattgtcttacggttttgggta 16888872  T
Q  516 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccc 583  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| | |||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||    
T  16888871 agagtgtgatgtctctcttgtttgtgcgattgttctagtttcgatgtagacggtcccctaagctcccc 16888804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 42 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 16888971 - 16888804
Alignment:
Q  42 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 141  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |||| |||||||||||    
T  16888971 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggttgaataccttataagtaagagaacctataaactcattgtcttacggttttgggta 16888872  T
Q  142 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccc 209  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| | |||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||    
T  16888871 agagtgtgatgtctctcttgtttgtgcgattgttctagtttcgatgtagacggtcccctaagctcccc 16888804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 415 - 566
Target Start/End: Complemental strand, 32941279 - 32941128
Alignment:
Q  415 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 514  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||| | || ||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32941279 tgcaagtgtgagttatatgtcttacatcggaaagaacagtaaaggttgaacaccttataaataagagggctcataaactcattgccttaaggttttgggt 32941180  T
Q  515 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggac 566  Q
    |||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32941179 aagagtgtgacgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggac 32941128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 41 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 32941279 - 32941128
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 140  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||| | || ||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32941279 tgcaagtgtgagttatatgtcttacatcggaaagaacagtaaaggttgaacaccttataaataagagggctcataaactcattgccttaaggttttgggt 32941180  T
Q  141 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggac 192  Q
    |||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32941179 aagagtgtgacgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggac 32941128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 378 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 49076643 - 49076449
Alignment:
Q  378 aaagtgatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataag 475  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||  || |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  49076643 aaagtgatggactcacacttgaggaggagtgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtaccatatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataag 49076544  T
Q  476 taagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 573  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||| | ||||||||  || | ||||||| ||| |||| || | ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  49076543 taagaggacctataaacccattgtcttaaag-tttgggta--agggcggtgtctgtctcgcttatgcgattgttatagcctcgatgtggacggtcccc 49076449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 44 - 200
Target Start/End: Original strand, 49302907 - 49303065
Alignment:
Q  44 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataa--gtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 141  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49302907 aagtgtgagttatatgtcccacatcaaataaaaaagtaaaggttgaacatcttataaaagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 49303006  T
Q  142 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccct 200  Q
    |||||||||||| |||||| ||| || | |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  49303007 agagtgtggtgtatctcttacttatgcgattgttctatcctcgatgtggacgatcccct 49303065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 418 - 574
Target Start/End: Original strand, 49302907 - 49303065
Alignment:
Q  418 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataa--gtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 515  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49302907 aagtgtgagttatatgtcccacatcaaataaaaaagtaaaggttgaacatcttataaaagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 49303006  T
Q  516 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccct 574  Q
    |||||||||||| |||||| ||| || | |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  49303007 agagtgtggtgtatctcttacttatgcgattgttctatcctcgatgtggacgatcccct 49303065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 414 - 573
Target Start/End: Original strand, 54108537 - 54108694
Alignment:
Q  414 ttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacc-cattgccttaaggttttgg 512  Q
    |||||||||||||||||  |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  54108537 ttgcaagtgtgagttat--gtcccatataggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggacccataaaattcattgccttaaggttttgg 54108634  T
Q  513 gtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 573  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  54108635 ctaagagtgtggtgtctatcttgcttgtgtggttgttctagcctcaatgtgg-cggtcccc 54108694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 415 - 586
Target Start/End: Original strand, 2740700 - 2740869
Alignment:
Q  415 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 514  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||  ||    
T  2740700 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacctataaacccagagccttaaggttttacgt 2740799  T
Q  515 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctca 586  Q
    |||||||||| ||||||||  ||  ||||||||||||||||||||| |||| |||||||   ||||||||||    
T  2740800 aagagtgtggcgtctctctcact--tgtggttgttctagcctcgatatggatggtcccccgagctcccctca 2740869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 372 - 573
Target Start/End: Original strand, 3341083 - 3341286
Alignment:
Q  372 cacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacacct 469  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |    
T  3341083 cacgataaagtgatggactcacacttgaggcagagtgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacattggataaaagagtaaaggttaaacactt 3341182  T
Q  470 tataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 569  Q
    |||||||||||||||||||||   |||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||  || ||||||| || || ||||||||| ||||||    
T  3341183 tataagtaagaggacccataacatcattgttttaagattttgggtaagagtgtgatgtctttcttaattatgtggttattttaacctcgatgtagacggt 3341282  T
Q  570 cccc 573  Q
    ||||    
T  3341283 cccc 3341286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 416 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 16889691 - 16889535
Alignment:
Q  416 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 515  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||| | |||||||| ||||||||||    
T  16889691 gcaagtgtgagttatatgtctcaaatcggatagaaaagtaaaggttgaataccttataagtaagaggattcataaacctactgccttaaagttttgggta 16889592  T
Q  516 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 572  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  16889591 agagtatggtgtctctcttccttgtgtgattgttctaacctcgatgtggacggtccc 16889535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 56 - 170
Target Start/End: Original strand, 45496820 - 45496934
Alignment:
Q  56 tatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtct 155  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45496820 tatgtcccacatcggataaaatcgtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacctataaactcattgtcttaaggttttgggtaagagtgtggtgtct 45496919  T
Q  156 ctcttgcttgtgtgg 170  Q
    |||||||||||||||    
T  45496920 ctcttgcttgtgtgg 45496934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 430 - 544
Target Start/End: Original strand, 45496820 - 45496934
Alignment:
Q  430 tatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtct 529  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45496820 tatgtcccacatcggataaaatcgtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacctataaactcattgtcttaaggttttgggtaagagtgtggtgtct 45496919  T
Q  530 ctcttgcttgtgtgg 544  Q
    |||||||||||||||    
T  45496920 ctcttgcttgtgtgg 45496934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 41 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 3244607 - 3244448
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 140  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  3244607 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggatagaaaagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaactcattgtcttaaagttttgggt 3244508  T
Q  141 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccct 200  Q
    |||| ||||  ||||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  3244507 aagaatgtgtcgtctctctcacttgtatggttgttccagcctcgatgtgggcagtcccct 3244448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 415 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 4390257 - 4390102
Alignment:
Q  415 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 514  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | | | |||||| ||||||||||||||    
T  4390257 tgcaagtgtgagttacatatcccacatcagataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatcctttagcacattgcgttaaggttttgggt 4390158  T
Q  515 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 570  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||    
T  4390157 aagagtgtgacgtctctcttgcttgtgcagttgttctagcctcgatgcggacggtc 4390102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 41 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 4390257 - 4390102
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 140  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | | | |||||| ||||||||||||||    
T  4390257 tgcaagtgtgagttacatatcccacatcagataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatcctttagcacattgcgttaaggttttgggt 4390158  T
Q  141 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 196  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||    
T  4390157 aagagtgtgacgtctctcttgcttgtgcagttgttctagcctcgatgcggacggtc 4390102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 391 - 586
Target Start/End: Original strand, 43174480 - 43174677
Alignment:
Q  391 cacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaat-agtaaaggttgaacaccttataagtaagaggaccca 487  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||| | |||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  43174480 cacacttgagggggagtgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgccacacatcagataaaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacaca 43174579  T
Q  488 taaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctca 586  Q
    |||||| ||  |||||| || |||||||||||||||| |||||||||| || | |||||||| |||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  43174580 taaacctatgaccttaaagtgttgggtaagagtgtggcgtctctcttgtttatatggttgttgtagccttgatgtggacggttcccta-gctcccctca 43174677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 383 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 45489522 - 45489331
Alignment:
Q  383 gatggactcacacttgaggggg-agtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaag 479  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| | ||  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  45489522 gatggactcacacttgaggggggagtgttgttgtgtacaagtgtgaattatatgtctcacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccatataagtaag 45489423  T
Q  480 aggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 572  Q
    || || | |||||| | ||  ||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  45489422 agaactcttaaacctactg-tttaagatttttggtaagagtgtgatgtctcttttgctagtgtgattgttctagcctcgatgtggatggtccc 45489331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 469 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 23817783 - 23817679
Alignment:
Q  469 ttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacgg 568  Q
    |||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23817783 ttataagtaagaggattcataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgctagtgtggttgttctagcctcgatgtggacgg 23817684  T
Q  569 tcccc 573  Q
    |||||    
T  23817683 tcccc 23817679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 41 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 54741334 - 54741149
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 140  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||| |    
T  54741334 tgcaagtgtgaattatatgtctcacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccatacacagattgtcttaaggttttggat 54741235  T
Q  141 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtggt 228  Q
    |||||||| || |||||||  |  |||| ||||||||||||||  ||| || ||||||   ||||||||||| |||||||||||||||    
T  54741234 aagagtgtagtctctctct--cacgtgttgttgttctagcctcagtgtagatggtccctcgggctcccctcagtgacccaacagtggt 54741149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 92 - 303
Target Start/End: Original strand, 31691203 - 31691415
Alignment:
Q  92 accttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtc--tctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtg 189  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  31691203 accttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgtggcgtctatctcttgcttgtacgattgttctagcctcgatgtg 31691302  T
Q  190 gacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtggtatcagagccccggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtc--attgcgcagaaagc 287  Q
    |||| |||     ||||||| || ||||||||||||||||| |||||||  ||| |||||||||  |||||||||| |||||||   ||||||||||| |    
T  31691303 gacgatccttcgagctcccc-caatgacccaacagtggtattagagccc--gtttgacgaagggtacgaccgaggccgctggtccgtttgcgcagaaaac 31691399  T
Q  288 cgcaacagcggtacaa 303  Q
     |||| | ||||||||    
T  31691400 agcaaaaacggtacaa 31691415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 43 - 212
Target Start/End: Original strand, 43174508 - 43174677
Alignment:
Q  43 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaat-agtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 141  Q
    ||||||||||||||||| | |||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||| || |||||||    
T  43174508 caagtgtgagttatatgccacacatcagataaaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacacataaacctatgaccttaaagtgttgggta 43174607  T
Q  142 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctca 212  Q
    ||||||||| |||||||||| || | |||||||| |||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  43174608 agagtgtggcgtctctcttgtttatatggttgttgtagccttgatgtggacggttcccta-gctcccctca 43174677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 417 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 41707618 - 41707503
Alignment:
Q  417 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 516  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  41707618 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccatataagtaaaagaacccataaactcattgtcttaaggtttt-ggtaa 41707520  T
Q  517 gagtgtggtgtctctct 533  Q
    |||||||||||||||||    
T  41707519 gagtgtggtgtctctct 41707503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 43 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 41707618 - 41707503
Alignment:
Q  43 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 142  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  41707618 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccatataagtaaaagaacccataaactcattgtcttaaggtttt-ggtaa 41707520  T
Q  143 gagtgtggtgtctctct 159  Q
    |||||||||||||||||    
T  41707519 gagtgtggtgtctctct 41707503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 415 - 598
Target Start/End: Complemental strand, 54741334 - 54741153
Alignment:
Q  415 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 514  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||| |    
T  54741334 tgcaagtgtgaattatatgtctcacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccatacacagattgtcttaaggttttggat 54741235  T
Q  515 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacag 598  Q
    |||||||| || |||||||  |  |||| ||||||||||||||  ||| || ||||||   ||||||||||| |||||||||||    
T  54741234 aagagtgtagtctctctct--cacgtgttgttgttctagcctcagtgtagatggtccctcgggctcccctcagtgacccaacag 54741153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 407 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 6975620 - 6975489
Alignment:
Q  407 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 506  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||     
T  6975620 tgttagtttgcaaatgtgagttatatgtctcacatccgataaaatagtaaaggttgaatatcttataagtaagaggactcataaatccattatcttaaga 6975521  T
Q  507 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgctt 538  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6975520 ttttgggtaagagtgtggcgtctctcttgctt 6975489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 33 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 6975620 - 6975489
Alignment:
Q  33 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 132  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||     
T  6975620 tgttagtttgcaaatgtgagttatatgtctcacatccgataaaatagtaaaggttgaatatcttataagtaagaggactcataaatccattatcttaaga 6975521  T
Q  133 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgctt 164  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6975520 ttttgggtaagagtgtggcgtctctcttgctt 6975489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 415 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 34004739 - 34004586
Alignment:
Q  415 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 514  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | |    
T  34004739 tgcaagtgtgagttatatgtcacacatatgataaaa-actaaaggttgaacaacttataagtaagaggacccataaactcatt-ccttaaggttttcgat 34004642  T
Q  515 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 570  Q
    |||||||||  ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34004641 aagagtgtgccgtctctctcccttgtgcggttgttctagcctcgatgtgaacggtc 34004586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 41 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 34004739 - 34004586
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 140  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | |    
T  34004739 tgcaagtgtgagttatatgtcacacatatgataaaa-actaaaggttgaacaacttataagtaagaggacccataaactcatt-ccttaaggttttcgat 34004642  T
Q  141 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 196  Q
    |||||||||  ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34004641 aagagtgtgccgtctctctcccttgtgcggttgttctagcctcgatgtgaacggtc 34004586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 41 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 49076604 - 49076449
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 140  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| | |||||||    
T  49076604 tgcaagtgtgagttatatgtaccatatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacctataaacccattgtcttaaag-tttgggt 49076506  T
Q  141 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 199  Q
    |  || | ||||||| ||| |||| || | ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  49076505 a--agggcggtgtctgtctcgcttatgcgattgttatagcctcgatgtggacggtcccc 49076449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 41 - 199
Target Start/End: Original strand, 3341128 - 3341286
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||   |||||  ||||| ||||||||    
T  3341128 tgcaagtgtgagttatatgtcccacattggataaaagagtaaaggttaaacactttataagtaagaggacccataacatcattgttttaagattttgggt 3341227  T
Q  141 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 199  Q
    ||||||||| ||||| ||||  || ||||||| || || ||||||||| ||||||||||    
T  3341228 aagagtgtgatgtctttcttaattatgtggttattttaacctcgatgtagacggtcccc 3341286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 43 - 187
Target Start/End: Original strand, 19504707 - 19504842
Alignment:
Q  43 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 142  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||         ||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||    
T  19504707 caagtatgagttatatgtcccatatcggataaaatagtaaaagttgaacac---------aagaggacccataaatctattgccttaaagttttgggtaa 19504797  T
Q  143 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatg 187  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19504798 gagtgtggcgtctatcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatg 19504842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 417 - 561
Target Start/End: Original strand, 19504707 - 19504842
Alignment:
Q  417 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 516  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||         ||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||    
T  19504707 caagtatgagttatatgtcccatatcggataaaatagtaaaagttgaacac---------aagaggacccataaatctattgccttaaagttttgggtaa 19504797  T
Q  517 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatg 561  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19504798 gagtgtggcgtctatcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatg 19504842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 43 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 45489485 - 45489331
Alignment:
Q  43 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 142  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| || | |||||| | ||  ||||| |||| |||||    
T  45489485 caagtgtgaattatatgtctcacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccatataagtaagagaactcttaaacctactg-tttaagatttttggtaa 45489387  T
Q  143 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 198  Q
    ||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  45489386 gagtgtgatgtctcttttgctagtgtgattgttctagcctcgatgtggatggtccc 45489331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 415 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 51768216 - 51768061
Alignment:
Q  415 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 514  Q
    ||||| |||||||||||||||| | |||| ||| || |||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  51768216 tgcaaatgtgagttatatgtcctatatcgaatataagagtaaatgttgaacaccttataaataagaggactcataaactcattgtcttaaggttttgggt 51768117  T
Q  515 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 570  Q
    || |||  | |||||||||| ||| || | |||||||| |||||||||||||||||    
T  51768116 aaaagtacgatgtctctcttacttatgggattgttctaacctcgatgtggacggtc 51768061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 41 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 51768216 - 51768061
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 140  Q
    ||||| |||||||||||||||| | |||| ||| || |||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  51768216 tgcaaatgtgagttatatgtcctatatcgaatataagagtaaatgttgaacaccttataaataagaggactcataaactcattgtcttaaggttttgggt 51768117  T
Q  141 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 196  Q
    || |||  | |||||||||| ||| || | |||||||| |||||||||||||||||    
T  51768116 aaaagtacgatgtctctcttacttatgggattgttctaacctcgatgtggacggtc 51768061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 41 - 196
Target Start/End: Original strand, 3700365 - 3700512
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 140  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||        || ||||||||||||||||||| |    
T  3700365 tgcaagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttataagtaaaagg--------actcattgccttaaggttttggat 3700456  T
Q  141 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 196  Q
    |||||| || |||||||||   |||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  3700457 aagagtatgatgtctctctcatttgtgtggttattcaagcctcgatgtggacggtc 3700512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 415 - 570
Target Start/End: Original strand, 3700365 - 3700512
Alignment:
Q  415 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 514  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||        || ||||||||||||||||||| |    
T  3700365 tgcaagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttataagtaaaagg--------actcattgccttaaggttttggat 3700456  T
Q  515 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 570  Q
    |||||| || |||||||||   |||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  3700457 aagagtatgatgtctctctcatttgtgtggttattcaagcctcgatgtggacggtc 3700512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 87 - 197
Target Start/End: Original strand, 18879852 - 18879962
Alignment:
Q  87 tgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgat 186  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||| |||||    
T  18879852 tgaacaccttataagtaagatgacctataaacctatttccttaaggttttgggtaagagtgtgacgtctcttttggttgtgtggttgttctagcttcgat 18879951  T
Q  187 gtggacggtcc 197  Q
    |||||||||||    
T  18879952 gtggacggtcc 18879962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 461 - 571
Target Start/End: Original strand, 18879852 - 18879962
Alignment:
Q  461 tgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgat 560  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||| |||||    
T  18879852 tgaacaccttataagtaagatgacctataaacctatttccttaaggttttgggtaagagtgtgacgtctcttttggttgtgtggttgttctagcttcgat 18879951  T
Q  561 gtggacggtcc 571  Q
    |||||||||||    
T  18879952 gtggacggtcc 18879962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 81 - 199
Target Start/End: Original strand, 43827480 - 43827597
Alignment:
Q  81 aaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagc 180  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |    
T  43827480 aaagattgaactccttataaataagaggacccataaattcattgccttaaggttt-ggataagagtgtggtgtctctcttacttgtgcggttgttctaac 43827578  T
Q  181 ctcgatgtggacggtcccc 199  Q
    |||||||||||||||||||    
T  43827579 ctcgatgtggacggtcccc 43827597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 455 - 573
Target Start/End: Original strand, 43827480 - 43827597
Alignment:
Q  455 aaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagc 554  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |    
T  43827480 aaagattgaactccttataaataagaggacccataaattcattgccttaaggttt-ggataagagtgtggtgtctctcttacttgtgcggttgttctaac 43827578  T
Q  555 ctcgatgtggacggtcccc 573  Q
    |||||||||||||||||||    
T  43827579 ctcgatgtggacggtcccc 43827597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 169 - 293
Target Start/End: Original strand, 45496678 - 45496803
Alignment:
Q  169 ggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtggtatcagagccccggttcgacgaagggagcgaccgaggcagc 268  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  45496678 ggttgttctagcctcgatgtagacggtccctcgagctccccttactgacccaacagtggtatcagagccccggttcgacgaagggtgcgaccgaggccgc 45496777  T
Q  269 tggtca-ttgcgcagaaagccgcaac 293  Q
     ||||| ||||| ||||||| |||||    
T  45496778 cggtcagttgcgtagaaagcagcaac 45496803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 466 - 567
Target Start/End: Original strand, 31691203 - 31691306
Alignment:
Q  466 accttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtc--tctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtg 563  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  31691203 accttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgtggcgtctatctcttgcttgtacgattgttctagcctcgatgtg 31691302  T
Q  564 gacg 567  Q
    ||||    
T  31691303 gacg 31691306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 352 - 481
Target Start/End: Original strand, 44621361 - 44621492
Alignment:
Q  352 agcttccgctctaaggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaa 449  Q
    |||||||||| |  |||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  44621361 agcttccgcttttgggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgtcgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtccaacatgggataaa 44621460  T
Q  450 atagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 481  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  44621461 acagtaaaggttaaacaccttataagtaagag 44621492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 428 - 523
Target Start/End: Complemental strand, 54017845 - 54017750
Alignment:
Q  428 tatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 523  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  54017845 tatatatcccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccatattcccattgtcttaaggttttaggtaagagtgtg 54017750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 54 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 54017845 - 54017750
Alignment:
Q  54 tatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 149  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  54017845 tatatatcccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccatattcccattgtcttaaggttttaggtaagagtgtg 54017750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 43 - 178
Target Start/End: Original strand, 40067045 - 40067181
Alignment:
Q  43 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaag-gttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 141  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||  |||||  ||||||||| |||||||||||||||| |||| | ||| | ||||||| |||||||||    
T  40067045 caagtgtgagttatatgttctacatcggataaaagtgtaaaaagttgaacacattataagtaagaggacacatagatccactaccttaagattttgggta 40067144  T
Q  142 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 178  Q
    | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  40067145 aaagtgtgatgtctctcttgcttatgtggttgttcta 40067181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 417 - 552
Target Start/End: Original strand, 40067045 - 40067181
Alignment:
Q  417 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaag-gttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 515  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||  |||||  ||||||||| |||||||||||||||| |||| | ||| | ||||||| |||||||||    
T  40067045 caagtgtgagttatatgttctacatcggataaaagtgtaaaaagttgaacacattataagtaagaggacacatagatccactaccttaagattttgggta 40067144  T
Q  516 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 552  Q
    | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  40067145 aaagtgtgatgtctctcttgcttatgtggttgttcta 40067181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 41 - 199
Target Start/End: Original strand, 28034229 - 28034387
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 140  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || |||  ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||  ||||| |||||||||| |||    
T  28034229 tgcaagtgtgaattatatgtcccgcatcggatagaaaagtggaggttgaacactttataagtgagagaacccataaacttattgctttaaggttttaggt 28034328  T
Q  141 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 199  Q
    |||||||||| ||||||||  ||| || ||||| ||| | || |||||||| |||||||    
T  28034329 aagagtgtggcgtctctctcacttatgcggttgctctggtctggatgtggatggtcccc 28034387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 415 - 573
Target Start/End: Original strand, 28034229 - 28034387
Alignment:
Q  415 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 514  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || |||  ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||  ||||| |||||||||| |||    
T  28034229 tgcaagtgtgaattatatgtcccgcatcggatagaaaagtggaggttgaacactttataagtgagagaacccataaacttattgctttaaggttttaggt 28034328  T
Q  515 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 573  Q
    |||||||||| ||||||||  ||| || ||||| ||| | || |||||||| |||||||    
T  28034329 aagagtgtggcgtctctctcacttatgcggttgctctggtctggatgtggatggtcccc 28034387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 295 - 504
Target Start/End: Original strand, 10246240 - 10246436
Alignment:
Q  295 gcggtacaagtagcaagtggctccttgtgcaggaacggcgatacaggcaaagtcaaaagcttccgctctaaggggagcacgttaaagtgatggactcaca 394  Q
    |||||||||| | ||||||||| ||||||||| || ||| ||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||              |||||||     
T  10246240 gcggtacaagcaacaagtggcttcttgtgcagcaatggctatacatgcaaagtaaaaagcttccactcta-ggggagc--------------gactcacg 10246324  T
Q  395 cttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaac 492  Q
    |||||||||||||| ||  || |||||||||  |||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  10246325 cttgagggggagtgctgttgtgtgcaagtgtctgttatatgtctcaaatcggataaaagagtaaaggttgaacatcttataagttagaggacccataaac 10246424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 436 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 48111833 - 48111696
Alignment:
Q  436 ccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttg 535  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||  ||||| ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||      
T  48111833 ccacctcggataaaagagtaaaggttgaacacattataagtaaaaggacttataaatccattaccttaaggttttaggtatgagtgtggtgtctctctca 48111734  T
Q  536 cttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 573  Q
    |   ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||    
T  48111733 caaatgtggtttttctaacctcaatgtggacggtcccc 48111696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 62 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 48111833 - 48111696
Alignment:
Q  62 ccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttg 161  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||  ||||| ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||      
T  48111833 ccacctcggataaaagagtaaaggttgaacacattataagtaaaaggacttataaatccattaccttaaggttttaggtatgagtgtggtgtctctctca 48111734  T
Q  162 cttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 199  Q
    |   ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||    
T  48111733 caaatgtggtttttctaacctcaatgtggacggtcccc 48111696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 63 - 199
Target Start/End: Original strand, 3271806 - 3271947
Alignment:
Q  63 cacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttat---aagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg-gtgtctctc 158  Q
    |||||| |||| || |||||| ||| ||||||||||   ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  3271806 cacatcagatagaaaagtaaaagttaaacaccttattataagtaagagaacccataaacctattgccttaaggttttgggtaagagtgtgtgtctctctc 3271905  T
Q  159 -ttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 199  Q
     ||  || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3271906 gtttattatgtggttgttctagcctcgatgtggacagtcccc 3271947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 437 - 573
Target Start/End: Original strand, 3271806 - 3271947
Alignment:
Q  437 cacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttat---aagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg-gtgtctctc 532  Q
    |||||| |||| || |||||| ||| ||||||||||   ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  3271806 cacatcagatagaaaagtaaaagttaaacaccttattataagtaagagaacccataaacctattgccttaaggttttgggtaagagtgtgtgtctctctc 3271905  T
Q  533 -ttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 573  Q
     ||  || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3271906 gtttattatgtggttgttctagcctcgatgtggacagtcccc 3271947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 46 - 210
Target Start/End: Original strand, 760194 - 760356
Alignment:
Q  46 gtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagag 145  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| || | | ||||||||  || |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||    
T  760194 gtgtgagttatatgtcccacatcgaatagaaaaatgaaggttgagaactttataagtgagaggacccataaactcattgccttaagatttt-ggtaaaag 760292  T
Q  146 tgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccct 210  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||| |||   || |||||||  |||||||| |||||||||    
T  760293 tgtggtgtctctctcatttgtgtggttgctct-tactggatgtgggtggtcccctgggctcccct 760356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #127
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 420 - 584
Target Start/End: Original strand, 760194 - 760356
Alignment:
Q  420 gtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagag 519  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| || | | ||||||||  || |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||    
T  760194 gtgtgagttatatgtcccacatcgaatagaaaaatgaaggttgagaactttataagtgagaggacccataaactcattgccttaagatttt-ggtaaaag 760292  T
Q  520 tgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccct 584  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||| |||   || |||||||  |||||||| |||||||||    
T  760293 tgtggtgtctctctcatttgtgtggttgctct-tactggatgtgggtggtcccctgggctcccct 760356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #128
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 47 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 45489864 - 45489650
Alignment:
Q  47 tgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagt 146  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||||| ||||| | | ||||||||||| || || ||||||       |||||||||||||||| |||    
T  45489864 tgtgagttatatgtatcacattggataaaagagtaaagattgaatatcatataagtaagatgatccttaaaccttaaagtttaaggttttgggtaatagt 45489765  T
Q  147 gtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtggtatcagagccccggttcga 246  Q
    ||||||||||||| |||||  |||||||||||| |||||||||| || ||||| |  |||| | || |||||||||| ||||||||||| ||| ||| ||    
T  45489764 gtggtgtctctctcgcttgcatggttgttctagtctcgatgtggccgatcccccaaactcctc-cagtgacccaacaatggtatcagagtccc-gtttga 45489667  T
Q  247 cgaagggagcgaccgag 263  Q
    |||||||  ||||||||    
T  45489666 cgaagggtacgaccgag 45489650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #129
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 457 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 15841482 - 15841383
Alignment:
Q  457 aggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcct 556  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||    
T  15841482 aggttgaacactttgtaagtgagaggattcataaacacattgccttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctctcacttgtgtggttgctctagcct 15841383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #130
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 83 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 15841482 - 15841383
Alignment:
Q  83 aggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcct 182  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||    
T  15841482 aggttgaacactttgtaagtgagaggattcataaacacattgccttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctctcacttgtgtggttgctctagcct 15841383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #131
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 133 - 250
Target Start/End: Original strand, 43174233 - 43174350
Alignment:
Q  133 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggct-cccctcactgacccaacagtggtatc 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||   ||| ||||||||  ||||||||||||||||    
T  43174233 ttttgggtaagagtgtggtgtctctctcacttgtgtggttgttcaagccttgatgtggacggtcccccgagctccccctcacaaacccaacagtggtatc 43174332  T
Q  232 agagccccggttcgacgaa 250  Q
    | ||| || ||||||||||    
T  43174333 aaagcacc-gttcgacgaa 43174350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #132
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 41 - 130
Target Start/End: Original strand, 10246347 - 10246436
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa 130  Q
    |||||||||  |||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  10246347 tgcaagtgtctgttatatgtctcaaatcggataaaagagtaaaggttgaacatcttataagttagaggacccataaacccatagccttaa 10246436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #133
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 407 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 50788147 - 50788087
Alignment:
Q  407 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacac 467  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50788147 tgttggtttgcaagtgtaagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacac 50788087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #134
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 33 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 50788147 - 50788087
Alignment:
Q  33 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacac 93  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50788147 tgttggtttgcaagtgtaagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacac 50788087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #135
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 151 - 253
Target Start/End: Original strand, 19895406 - 19895506
Alignment:
Q  151 tgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtggtatcagagccccggttcgacgaa 250  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||   ||||||| || |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  19895406 tgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgg-tggtccccatagctcccccca-tgacccaacagtggtatcagagcttcggttcgacgaa 19895503  T
Q  251 ggg 253  Q
    |||    
T  19895504 ggg 19895506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #136
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 49 - 107
Target Start/End: Original strand, 44620304 - 44620362
Alignment:
Q  49 tgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 107  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44620304 tgagttatatgtcccacatgggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 44620362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #137
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 423 - 481
Target Start/End: Original strand, 44620304 - 44620362
Alignment:
Q  423 tgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 481  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44620304 tgagttatatgtcccacatgggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 44620362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #138
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 104 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 11783646 - 11783499
Alignment:
Q  104 agaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctagg 203  Q
    |||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||||||  || ||||| |||||| | |||| |||||||| |||||||  |||||||  ||    
T  11783646 agaggacccatacacctattgccataaagttttgggtaagagtgtgtcgtttctctcgcttgtatagttgctctagcctagatgtgggtggtccccctgg 11783547  T
Q  204 ctcccctcactgacccaacagtggtatcagagccccggttcgacgaaggg 253  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||    
T  11783546 cacccctca-tgacccaacagtggtatcaaag-ctcggttccacgaaggg 11783499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #139
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 415 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 23557022 - 23556890
Alignment:
Q  415 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 514  Q
    ||||||||||||||| ||||   |||||||||| || |||  ||||||||||  |||||| |||||| | |||||||  ||||||||||| ||||||| |    
T  23557022 tgcaagtgtgagttaaatgttttacatcggatagaaaagtggaggttgaacattttataaataagagaatccataaaatcattgccttaaagttttggat 23556923  T
Q  515 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttg 547  Q
    |||||||||  ||||||||| ||||||||||||    
T  23556922 aagagtgtgacgtctctcttacttgtgtggttg 23556890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #140
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 41 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 23557022 - 23556890
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 140  Q
    ||||||||||||||| ||||   |||||||||| || |||  ||||||||||  |||||| |||||| | |||||||  ||||||||||| ||||||| |    
T  23557022 tgcaagtgtgagttaaatgttttacatcggatagaaaagtggaggttgaacattttataaataagagaatccataaaatcattgccttaaagttttggat 23556923  T
Q  141 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttg 173  Q
    |||||||||  ||||||||| ||||||||||||    
T  23556922 aagagtgtgacgtctctcttacttgtgtggttg 23556890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #141
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 421 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 45489864 - 45489712
Alignment:
Q  421 tgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagt 520  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||||| ||||| | | ||||||||||| || || ||||||       |||||||||||||||| |||    
T  45489864 tgtgagttatatgtatcacattggataaaagagtaaagattgaatatcatataagtaagatgatccttaaaccttaaagtttaaggttttgggtaatagt 45489765  T
Q  521 gtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 573  Q
    ||||||||||||| |||||  |||||||||||| |||||||||| || |||||    
T  45489764 gtggtgtctctctcgcttgcatggttgttctagtctcgatgtggccgatcccc 45489712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #142
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 44 - 251
Target Start/End: Original strand, 34544107 - 34544314
Alignment:
Q  44 aagtgtgagttatatgt--cccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg-ttttgggt 140  Q
    ||||||||||||||| |  | ||||||| ||| || |||  ||||||| ||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  34544107 aagtgtgagttatatatatctcacatcgaatagaaaagtggaggttgatcactttataaatgagaggacccataaactcattgccttaaggtttttgggt 34544206  T
Q  141 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtggtatcagagccccg 240  Q
    ||||||||||| |||||||  |||||  ||||| ||   ||  |||||||  |||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||  |    
T  34544207 aagagtgtggtatctctctcacttgtacggttgctc-ccccaggatgtgggtggtcccct-ggctcccctc-gtgacccaacattggtatcagagccgag 34544303  T
Q  241 gttcgacgaag 251  Q
    |||| ||||||    
T  34544304 gttcaacgaag 34544314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #143
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 507 - 573
Target Start/End: Original strand, 43174233 - 43174299
Alignment:
Q  507 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 573  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  43174233 ttttgggtaagagtgtggtgtctctctcacttgtgtggttgttcaagccttgatgtggacggtcccc 43174299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #144
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 41 - 107
Target Start/End: Original strand, 44621426 - 44621492
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 107  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  44621426 tgcaagtgtgagttatatgtccaacatgggataaaacagtaaaggttaaacaccttataagtaagag 44621492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #145
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 108 - 159
Target Start/End: Original strand, 11197293 - 11197344
Alignment:
Q  108 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 159  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11197293 gacccataaacccattgccttagggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 11197344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #146
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 482 - 533
Target Start/End: Original strand, 11197293 - 11197344
Alignment:
Q  482 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 533  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11197293 gacccataaacccattgccttagggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 11197344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #147
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 418 - 533
Target Start/End: Original strand, 34544107 - 34544225
Alignment:
Q  418 aagtgtgagttatatgt--cccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg-ttttgggt 514  Q
    ||||||||||||||| |  | ||||||| ||| || |||  ||||||| ||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  34544107 aagtgtgagttatatatatctcacatcgaatagaaaagtggaggttgatcactttataaatgagaggacccataaactcattgccttaaggtttttgggt 34544206  T
Q  515 aagagtgtggtgtctctct 533  Q
    ||||||||||| |||||||    
T  34544207 aagagtgtggtatctctct 34544225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #148
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 440 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 39699077 - 39698944
Alignment:
Q  440 atcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctt--aaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgct 537  Q
    |||||||| || |||||||||||||||  || |||||||||||| ||||||| || |  | ||  ||||||||| |||||||||| |  |||||||||||    
T  39699077 atcggatataaaagtaaaggttgaacatattctaagtaagaggatccataaatccgtgtcgttttaaggttttgagtaagagtgtagcatctctcttgct 39698978  T
Q  538 tgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 571  Q
    |||| |||| |||||| |||||||||||| ||||    
T  39698977 tgtgcggttattctagtctcgatgtggacagtcc 39698944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #149
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 66 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 39699077 - 39698944
Alignment:
Q  66 atcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctt--aaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgct 163  Q
    |||||||| || |||||||||||||||  || |||||||||||| ||||||| || |  | ||  ||||||||| |||||||||| |  |||||||||||    
T  39699077 atcggatataaaagtaaaggttgaacatattctaagtaagaggatccataaatccgtgtcgttttaaggttttgagtaagagtgtagcatctctcttgct 39698978  T
Q  164 tgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 197  Q
    |||| |||| |||||| |||||||||||| ||||    
T  39698977 tgtgcggttattctagtctcgatgtggacagtcc 39698944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #150
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 399 - 481
Target Start/End: Original strand, 44620926 - 44621011
Alignment:
Q  399 agggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtccca-catcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 481  Q
    ||||||||||||| | ||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44620926 agggggagtgttgttgtggacaagtgtgagttagatgtcccaacatcggataaaactgtaaaggttgaacaccttataagtaagag 44621011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #151
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 43 - 107
Target Start/End: Original strand, 44620946 - 44621011
Alignment:
Q  43 caagtgtgagttatatgtccca-catcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 107  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44620946 caagtgtgagttagatgtcccaacatcggataaaactgtaaaggttgaacaccttataagtaagag 44621011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #152
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 478 - 598
Target Start/End: Complemental strand, 11783646 - 11783527
Alignment:
Q  478 agaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctagg 577  Q
    |||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||||||  || ||||| |||||| | |||| |||||||| |||||||  |||||||  ||    
T  11783646 agaggacccatacacctattgccataaagttttgggtaagagtgtgtcgtttctctcgcttgtatagttgctctagcctagatgtgggtggtccccctgg 11783547  T
Q  578 ctcccctcactgacccaacag 598  Q
    | ||||||| |||||||||||    
T  11783546 cacccctca-tgacccaacag 11783527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #153
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 23817498 - 23817429
Alignment:
Q  154 ctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagt 225  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||    
T  23817498 ctctcttgctagtgtggttgttctagcctcgatgtggacggttccc-aggctcccc-cagtgacccaacagt 23817429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #154
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 528 - 598
Target Start/End: Complemental strand, 23817498 - 23817430
Alignment:
Q  528 ctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacag 598  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| || |||||||||||    
T  23817498 ctctcttgctagtgtggttgttctagcctcgatgtggacggttccc-aggctcccc-cagtgacccaacag 23817430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #155
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 386 - 452
Target Start/End: Original strand, 41370673 - 41370738
Alignment:
Q  386 ggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaata 452  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  41370673 ggactcacacttgagggg-agtgttggtttgaaagagtgagttatatatcccatatcggataaaata 41370738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #156
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 121 - 195
Target Start/End: Original strand, 41370738 - 41370812
Alignment:
Q  121 attgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 195  Q
    ||||||||||| |||| ||||| | |||| |||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41370738 attgccttaagattttaggtaaaaatgtgatgtctctcttacttgagtggttgttctaacctcgatgtggacggt 41370812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #157
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 495 - 569
Target Start/End: Original strand, 41370738 - 41370812
Alignment:
Q  495 attgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 569  Q
    ||||||||||| |||| ||||| | |||| |||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41370738 attgccttaagattttaggtaaaaatgtgatgtctctcttacttgagtggttgttctaacctcgatgtggacggt 41370812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #158
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 415 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 11348484 - 11348396
Alignment:
Q  415 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctta 503  Q
    ||||| |||||||||||||| | ||||| |||||||||||  ||||||||||| |||||||| |||||| ||||| |  ||||||||||    
T  11348484 tgcaattgtgagttatatgttctacatcagataaaatagtggaggttgaacactttataagtgagaggatccatatattcattgcctta 11348396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #159
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 41 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 11348484 - 11348396
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctta 129  Q
    ||||| |||||||||||||| | ||||| |||||||||||  ||||||||||| |||||||| |||||| ||||| |  ||||||||||    
T  11348484 tgcaattgtgagttatatgttctacatcagataaaatagtggaggttgaacactttataagtgagaggatccatatattcattgcctta 11348396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #160
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 421 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 15841134 - 15841023
Alignment:
Q  421 tgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagt 520  Q
    ||||| |||||||||||| ||| |||| || |||  ||| ||||||  |||||||| |||||| | ||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  15841134 tgtgaattatatgtcccatatcagatagaaaagtggaggctgaacattttataagtgagaggatctataaacccattgctttaa-gttttgggtaagagt 15841036  T
Q  521 gtggtgtctctct 533  Q
    ||  |||||||||    
T  15841035 gtattgtctctct 15841023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #161
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 47 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 15841134 - 15841023
Alignment:
Q  47 tgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagt 146  Q
    ||||| |||||||||||| ||| |||| || |||  ||| ||||||  |||||||| |||||| | ||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  15841134 tgtgaattatatgtcccatatcagatagaaaagtggaggctgaacattttataagtgagaggatctataaacccattgctttaa-gttttgggtaagagt 15841036  T
Q  147 gtggtgtctctct 159  Q
    ||  |||||||||    
T  15841035 gtattgtctctct 15841023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #162
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 352 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 16889375 - 16889315
Alignment:
Q  352 agcttccgctctaaggggagcacg-ttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttg 411  Q
    ||||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16889375 agcttccgcttgagggggagcacgattaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttg 16889315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #163
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 41 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 6876253 - 6876060
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 140  Q
    ||||||||||| |||||| ||  ||||||||||||| | |  |||| |||||| |||||||  |||| ||| |||||| ||| | ||||||||||||| |    
T  6876253 tgcaagtgtgatttatatatcttacatcggataaaa-actggaggtcgaacactttataag--agagaaccaataaacgcatcgacttaaggttttggat 6876157  T
Q  141 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtggtatcagagcccc 239  Q
    || ||||||  ||||||||  ||||| |||||||| | || | |||||||  |||||   || || |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6876156 aaaagtgtgacgtctctctcacttgt-tggttgttttggcattgatgtgggtggtccatcagccttccctca-tgacccaacagtggtatcagagcccc 6876060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #164
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 159
Target Start/End: Original strand, 10396198 - 10396249
Alignment:
Q  108 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 159  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||    
T  10396198 gacccataaacccattgccttagggttttaggtaagagggtggtgtctctct 10396249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #165
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 482 - 533
Target Start/End: Original strand, 10396198 - 10396249
Alignment:
Q  482 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 533  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||    
T  10396198 gacccataaacccattgccttagggttttaggtaagagggtggtgtctctct 10396249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #166
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 159
Target Start/End: Original strand, 10396483 - 10396534
Alignment:
Q  108 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 159  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||    
T  10396483 gacccataaacccattgccttagggttttggataagagtgtggtctctctct 10396534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #167
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 482 - 533
Target Start/End: Original strand, 10396483 - 10396534
Alignment:
Q  482 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 533  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||    
T  10396483 gacccataaacccattgccttagggttttggataagagtgtggtctctctct 10396534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #168
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 160
Target Start/End: Original strand, 922485 - 922537
Alignment:
Q  108 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctt 160  Q
    ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||||||    
T  922485 gacccataaacccattgtcttaggggtttggataagagtgtggtgtctctctt 922537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #169
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 482 - 534
Target Start/End: Original strand, 922485 - 922537
Alignment:
Q  482 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctt 534  Q
    ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||||||    
T  922485 gacccataaacccattgtcttaggggtttggataagagtgtggtgtctctctt 922537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #170
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 109 - 148
Target Start/End: Original strand, 1868119 - 1868158
Alignment:
Q  109 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgt 148  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1868119 acccataaacccattgccttaaagttttgggtaagagtgt 1868158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #171
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 483 - 522
Target Start/End: Original strand, 1868119 - 1868158
Alignment:
Q  483 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgt 522  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1868119 acccataaacccattgccttaaagttttgggtaagagtgt 1868158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #172
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 525 - 564
Target Start/End: Original strand, 19895406 - 19895445
Alignment:
Q  525 tgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgg 564  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19895406 tgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgg 19895445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #173
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 473 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 11706641 - 11706584
Alignment:
Q  473 aagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctct 531  Q
    ||||||||||||  |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11706641 aagtaagaggact-ataaactcattgctttaaggttttgggtaagagtgtggcgtctct 11706584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #174
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 11706641 - 11706584
Alignment:
Q  99 aagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctct 157  Q
    ||||||||||||  |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11706641 aagtaagaggact-ataaactcattgctttaaggttttgggtaagagtgtggcgtctct 11706584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #175
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 107 - 153
Target Start/End: Original strand, 51681604 - 51681650
Alignment:
Q  107 ggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 153  Q
    |||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  51681604 ggactcatatacccattgccttaagattttgggtaagagtgtggtgt 51681650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #176
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 481 - 527
Target Start/End: Original strand, 51681604 - 51681650
Alignment:
Q  481 ggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 527  Q
    |||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  51681604 ggactcatatacccattgccttaagattttgggtaagagtgtggtgt 51681650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #177
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 529 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 11702341 - 11702284
Alignment:
Q  529 tctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctca 586  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||   ||||||||||    
T  11702341 tctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgaacagtccccctcgctcccctca 11702284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #178
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 155 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 11702341 - 11702284
Alignment:
Q  155 tctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctca 212  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||   ||||||||||    
T  11702341 tctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgaacagtccccctcgctcccctca 11702284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #179
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 469 - 529
Target Start/End: Complemental strand, 2891924 - 2891864
Alignment:
Q  469 ttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtct 529  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| | || ||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  2891924 ttataagtaagaggatccataaacctaatgtcttaaggttttgggttaaagtgtgatgtct 2891864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #180
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 95 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 2891924 - 2891864
Alignment:
Q  95 ttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtct 155  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| | || ||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  2891924 ttataagtaagaggatccataaacctaatgtcttaaggttttgggttaaagtgtgatgtct 2891864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #181
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 41 - 89
Target Start/End: Original strand, 45050601 - 45050649
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttga 89  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||    
T  45050601 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcaaataaaagagtaaaggttga 45050649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #182
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 415 - 463
Target Start/End: Original strand, 45050601 - 45050649
Alignment:
Q  415 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttga 463  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||    
T  45050601 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcaaataaaagagtaaaggttga 45050649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #183
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 493 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 50788072 - 50787996
Alignment:
Q  493 ccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 569  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| | |||| | |||||| |||| | || |||| ||||||    
T  50788072 ccattgccttaaggttttagataagagtgtggtgtctctgtcgcttatttggttgctctaacttcaatgtagacggt 50787996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #184
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 119 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 50788072 - 50787996
Alignment:
Q  119 ccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 195  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| | |||| | |||||| |||| | || |||| ||||||    
T  50788072 ccattgccttaaggttttagataagagtgtggtgtctctgtcgcttatttggttgctctaacttcaatgtagacggt 50787996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #185
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 159
Target Start/End: Original strand, 11197003 - 11197054
Alignment:
Q  108 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 159  Q
    ||||| |||||||||||||||| | |||| |||||||||| |||||||||||    
T  11197003 gacccttaaacccattgccttaggattttaggtaagagtgaggtgtctctct 11197054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #186
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 482 - 533
Target Start/End: Original strand, 11197003 - 11197054
Alignment:
Q  482 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 533  Q
    ||||| |||||||||||||||| | |||| |||||||||| |||||||||||    
T  11197003 gacccttaaacccattgccttaggattttaggtaagagtgaggtgtctctct 11197054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #187
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 407 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 18933134 - 18933103
Alignment:
Q  407 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtccca 438  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18933134 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtccca 18933103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #188
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 18933134 - 18933103
Alignment:
Q  33 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtccca 64  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18933134 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtccca 18933103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #189
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 139
Target Start/End: Original strand, 45484774 - 45484817
Alignment:
Q  96 tataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttggg 139  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  45484774 tataagtgagagaacccataaacccaatgccttaaggttttggg 45484817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #190
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 470 - 513
Target Start/End: Original strand, 45484774 - 45484817
Alignment:
Q  470 tataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttggg 513  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  45484774 tataagtgagagaacccataaacccaatgccttaaggttttggg 45484817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #191
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 543 - 598
Target Start/End: Original strand, 45496678 - 45496733
Alignment:
Q  543 ggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacag 598  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||    |||||||| |||||||||||||    
T  45496678 ggttgttctagcctcgatgtagacggtccctcgagctccccttactgacccaacag 45496733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #192
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 459 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 31249970 - 31249896
Alignment:
Q  459 gttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 533  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | || | | | ||||||||| | |||||||| |||||||    
T  31249970 gttgaacactttataagttagaggacccataaacctaatgacgtcaagttttgggttaaagtgtggtctctctct 31249896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #193
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 85 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 31249970 - 31249896
Alignment:
Q  85 gttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 159  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | || | | | ||||||||| | |||||||| |||||||    
T  31249970 gttgaacactttataagttagaggacccataaacctaatgacgtcaagttttgggttaaagtgtggtctctctct 31249896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #194
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 32 - 78
Target Start/End: Original strand, 41370692 - 41370738
Alignment:
Q  32 gtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaata 78  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  41370692 gtgttggtttgaaagagtgagttatatatcccatatcggataaaata 41370738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #195
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 491 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 41707321 - 41707279
Alignment:
Q  491 acccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 533  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  41707321 acccattaccttaaggttttgggtaaaagtgtggtatctctct 41707279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #196
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 117 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 41707321 - 41707279
Alignment:
Q  117 acccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 159  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  41707321 acccattaccttaaggttttgggtaaaagtgtggtatctctct 41707279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #197
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 415 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 11706677 - 11706636
Alignment:
Q  415 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaa 456  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  11706677 tgcaagggtgagttgtatgtcccacatcggataaaaaagtaa 11706636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #198
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 41 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 11706677 - 11706636
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaa 82  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  11706677 tgcaagggtgagttgtatgtcccacatcggataaaaaagtaa 11706636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #199
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 152 - 189
Target Start/End: Original strand, 19895533 - 19895570
Alignment:
Q  152 gtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtg 189  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19895533 gtctatcttgcttgtgtggttgttctagcttcgatgtg 19895570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #200
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 526 - 563
Target Start/End: Original strand, 19895533 - 19895570
Alignment:
Q  526 gtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtg 563  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19895533 gtctatcttgcttgtgtggttgttctagcttcgatgtg 19895570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #201
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 104 - 137
Target Start/End: Original strand, 29802604 - 29802637
Alignment:
Q  104 agaggacccataaacccattgccttaaggttttg 137  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29802604 agaggacccataaacccaatgccttaaggttttg 29802637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #202
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 478 - 511
Target Start/End: Original strand, 29802604 - 29802637
Alignment:
Q  478 agaggacccataaacccattgccttaaggttttg 511  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29802604 agaggacccataaacccaatgccttaaggttttg 29802637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #203
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 543 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 1731621 - 1731581
Alignment:
Q  543 ggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccc 583  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  1731621 ggttattctagcctcgatgtggatggtcccccaggctcccc 1731581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #204
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 169 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 1731621 - 1731581
Alignment:
Q  169 ggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccc 209  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  1731621 ggttattctagcctcgatgtggatggtcccccaggctcccc 1731581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #205
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 504 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 11348330 - 11348236
Alignment:
Q  504 aggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagat 600  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||| || ||||||||| | ||||| | |  ||||||||| |||||| ||||||    
T  11348330 aggtttttggtaagagtgtg-tgtctctctcacttatgtggttgttcaagtctcgatgtgaaaggtcctcca-actcccctcagtgacccgacagat 11348236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #206
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 497 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 34946187 - 34946151
Alignment:
Q  497 tgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 533  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  34946187 tgccttaggattttgggtaagagtgtggtgtctctct 34946151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #207
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 123 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 34946187 - 34946151
Alignment:
Q  123 tgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 159  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  34946187 tgccttaggattttgggtaagagtgtggtgtctctct 34946151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0734 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 1)
Name: scaffold0734
Description:

Target: scaffold0734; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 41 - 564
Target Start/End: Original strand, 5396 - 5931
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctt-aaggttttggg 139  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| ||| ||| |||||||    
T  5396 tgcaagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagggcccataaacatattgtcttaaagtttttggg 5495  T
Q  140 taagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtggtatcagagcccc 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |||| | ||| |||||| |||||||| |||||||||||||  ||    
T  5496 taagagtgtggtgtctctcttgcttgtggggttgttcaagcctcgatgtgg-cggaccccaaagct-ccctcagtgacccaatagtggtatcagag--cc 5591  T
Q  240 ggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtc--attgcgcagaaagccgcaacagcggtacaagtagcaagtggctccttgtg---------cagga 328  Q
     ||||||||||||| | || | ||||||  ||||   ||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||   || | ||| | ||         ||| |    
T  5592 tgttcgacgaagggtgtgatccaggcagtcggtccgtttgcgcagaaagcagcaacggcggtgcaagcag--tgtcggtccgtttgcagagaaaccagta 5689  T
Q  329 acggcgatacaggcaaagtcaaaagcttccgctctaaggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgag 426  Q
    ||||||| ||| ||||||| || ||||||||||  | |||||||| | | || ||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||    
T  5690 acggcgacacatgcaaagt-aagagcttccgcttgagggggagcaagatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtgcaagtgtgag 5788  T
Q  427 ttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaag-----gttttgggtaagagtg 521  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||    
T  5789 ttatatgtcgcacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagattaaattttgagtaagagtg 5888  T
Q  522 tggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgg 564  Q
    |||||||||| || |||||| |||||||| | | |||||||||    
T  5889 tggtgtctcttttacttgtggggttgttcaaacttcgatgtgg 5931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391 (Bit Score: 141; Significance: 1e-73; HSPs: 6)
Name: scaffold0391
Description:

Target: scaffold0391; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 224 - 599
Target Start/End: Complemental strand, 1465 - 1081
Alignment:
Q  224 gtggtatcagagccccggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtca--ttgcgcagaaagccgcaacagcggtacaagtagcaagtggctccttg 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| ||||   ||| ||||||||| ||||| |||||||||||||   || | ||| |     
T  1465 gtggtatcagagccccggttcgacgaagggtatgaccgaggcagccggtccgtttgtgcagaaagcagcaacggcggtacaagtagt--gtcggtccgtt 1368  T
Q  322 tgc---------aggaacggcgatacaggcaaagtcaaaagcttccgctctaagggg-agcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttg 411  Q
    |||         || |||| ||||||| |||| || || ||||||||||| |||||| |||| | | ||  ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1367 tgcggagaaaccagcaacgacgatacaagcaa-gt-aagagcttccgctcgaagggggagcatgatcaaaagatggactcacacttgagggggaatgttg 1270  T
Q  412 gtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttt 509  Q
     | ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1269 ttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacattggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagaaaaaggactcataaacccattgccttaaggttt 1170  T
Q  510 tgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacaga 599  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| || ||||||||||||    
T  1169 tgggtaagagtatggtgtctctcttgtttatgtggttgttctagcctcgatgtggacggttccccaagctcccc-cagtgacccaacaga 1081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391; HSP #2
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 43 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 1262 - 1082
Alignment:
Q  43 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 142  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1262 caagtgtgagttatatgtcccacattggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagaaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaa 1163  T
Q  143 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacag 224  Q
    |||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| || |||||||||||    
T  1162 gagtatggtgtctctcttgtttatgtggttgttctagcctcgatgtggacggttccccaagctcccc-cagtgacccaacag 1082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391; HSP #3
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 88 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 1802 - 1595
Alignment:
Q  88 gaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgct--------tgtgtggttgttctag 179  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||         |||||||||||||||    
T  1802 gaacaccttataagtgagaggacccataaacccattgccttaaggtttttggtaagagtgtggtgtctctctctctctcacacaagtgtggttgttctag 1703  T
Q  180 cctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtggtatcagagccccggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtc--attg 277  Q
    ||||||||||| | ||||||   |||||||||  |||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||  | ||||||||||||||||   |||    
T  1702 cctcgatgtgggcagtccccctagctcccctc-gtgacccaacagtggtatcagagcctc-gttcgacaaagggtacaaccgaggcagctggtccgtttg 1605  T
Q  278 cgcagaaagc 287  Q
    ||||||||||    
T  1604 cgcagaaagc 1595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391; HSP #4
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 462 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 1802 - 1731
Alignment:
Q  462 gaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 533  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1802 gaacaccttataagtgagaggacccataaacccattgccttaaggtttttggtaagagtgtggtgtctctct 1731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391; HSP #5
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 382 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 3178 - 3092
Alignment:
Q  382 tgatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaaca 466  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3178 tgatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtgcaggtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaaca 3092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391; HSP #6
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 41 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 3143 - 3092
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaaca 92  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3143 tgcaggtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaaca 3092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 107; Significance: 3e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 383 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 17648 - 17496
Alignment:
Q  383 gatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaga 480  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17648 gatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcacacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttgtaagtaaga 17549  T
Q  481 ggacccataaacccattgccttaagg--ttttgggtaagagtgtggtgtctct 531  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  17548 ggacccataaacccatagccttaaggttttttgggtaagagtatggtgtctct 17496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 41 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 17614 - 17496
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg--ttttgg 138  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||    
T  17614 tgcaagtgtgagttatatgtcacacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttgtaagtaagaggacccataaacccatagccttaaggttttttgg 17515  T
Q  139 gtaagagtgtggtgtctct 157  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  17514 gtaagagtatggtgtctct 17496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0027 (Bit Score: 107; Significance: 3e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0027
Description:

Target: scaffold0027; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 41 - 199
Target Start/End: Original strand, 47360 - 47518
Alignment:
Q  41 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 140  Q
    ||||||||||| ||| ||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  47360 tgcaagtgtgaattaaatgtctcacatccgataaaatagtaaagtttgaacaccttataagtaagagaatccataaacccattgccttaaagttttgggt 47459  T
Q  141 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 199  Q
    || | |||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  47460 aaaaatgtggtgtctctcttgcttgcgcggttgttctaacctcgatgtggacggtcccc 47518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0027; HSP #2
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 415 - 573
Target Start/End: Original strand, 47360 - 47518
Alignment:
Q  415 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 514  Q
    ||||||||||| ||| ||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  47360 tgcaagtgtgaattaaatgtctcacatccgataaaatagtaaagtttgaacaccttataagtaagagaatccataaacccattgccttaaagttttgggt 47459  T
Q  515 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 573  Q
    || | |||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  47460 aaaaatgtggtgtctctcttgcttgcgcggttgttctaacctcgatgtggacggtcccc 47518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0504 (Bit Score: 64; Significance: 1e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0504
Description:

Target: scaffold0504; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 417 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 10267 - 10192
Alignment:
Q  417 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaac 492  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10267 caagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatggtaaaagttgaacaccttataagtaagaggacccataaac 10192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0504; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 43 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 10267 - 10192
Alignment:
Q  43 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaac 118  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10267 caagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatggtaaaagttgaacaccttataagtaagaggacccataaac 10192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 64; Significance: 1e-27; HSPs: 4)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 43 - 253
Target Start/End: Original strand, 39459 - 39665
Alignment:
Q  43 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 142  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || ||| || |||  ||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||   |||||||||| ||||||||||    
T  39459 caagtgtgagttatatgtctcaca-cgcatagaaaagtggaggttgaactccttataagtgagaggaactataaacatgttgccttaag-ttttgggtaa 39556  T
Q  143 gagtgt-ggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccctaggctcccctcactgacccaacagtggtatcagagccccgg 241  Q
     ||||| || |||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||   || |||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  ||    
T  39557 aagtgttggcgtctctcttgcttgtgtggttgatct-gcct-gatgtgggtagttcccctggctcccct-agtgacccaacagtggtatcagagccgagg 39653  T
Q  242 ttcgacgaaggg 253  Q
    ||||||||||||    
T  39654 ttcgacgaaggg 39665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 417 - 547
Target Start/End: Original strand, 39459 - 39588
Alignment:
Q  417 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 516  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || ||| || |||  ||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||   |||||||||| ||||||||||    
T  39459 caagtgtgagttatatgtctcaca-cgcatagaaaagtggaggttgaactccttataagtgagaggaactataaacatgttgccttaag-ttttgggtaa 39556  T
Q  517 gagtgt-ggtgtctctcttgcttgtgtggttg 547  Q
     ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  39557 aagtgttggcgtctctcttgcttgtgtggttg 39588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 382 - 540
Target Start/End: Original strand, 39805 - 39963
Alignment:
Q  382 tgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 481  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |  | || | ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   ||||| || | |||||||| |||     
T  39805 tgatgaactcacacttgagggggaattgttgtgttcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaagtggtggttggactctttataagtgagat 39904  T
Q  482 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgt 540  Q
    ||   ||||||  ||| ||||||  |||||| ||| | |||||||||||||| ||||||    
T  39905 gagatataaacttattaccttaaaattttggttaaaaatgtggtgtctctctcgcttgt 39963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113; HSP #4
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 43 - 166
Target Start/End: Original strand, 39840 - 39963
Alignment:
Q  43 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 142  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   ||||| || | |||||||| ||| ||   ||||||  ||| ||||||  |||||| |||    
T  39840 caagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaagtggtggttggactctttataagtgagatgagatataaacttattaccttaaaattttggttaa 39939  T
Q  143 gagtgtggtgtctctcttgcttgt 166  Q
     | |||||||||||||| ||||||    
T  39940 aaatgtggtgtctctctcgcttgt 39963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0807 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000009; HSPs: 2)
Name: scaffold0807
Description:

Target: scaffold0807; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 35 - 119
Target Start/End: Original strand, 2869 - 2953
Alignment:
Q  35 ttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacc 119  Q
    |||| |||||||| ||||||||| ||  ||||| |  |||||  ||||||||||||||| |||||  |||||||| |||||||||    
T  2869 ttggattgcaagtatgagttataagtttcacattgtttaaaaatgtaaaggttgaacactttatatataagaggatccataaacc 2953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0807; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 409 - 493
Target Start/End: Original strand, 2869 - 2953
Alignment:
Q  409 ttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacc 493  Q
    |||| |||||||| ||||||||| ||  ||||| |  |||||  ||||||||||||||| |||||  |||||||| |||||||||    
T  2869 ttggattgcaagtatgagttataagtttcacattgtttaaaaatgtaaaggttgaacactttatatataagaggatccataaacc 2953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000009; HSPs: 2)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 453 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 10446 - 10406
Alignment:
Q  453 gtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacc 493  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||    
T  10446 gtaaaggttgaacactttatatgtaagaggatccataaacc 10406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 79 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 10446 - 10406
Alignment:
Q  79 gtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacc 119  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||    
T  10446 gtaaaggttgaacactttatatgtaagaggatccataaacc 10406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University