View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF9773_low_3 (Length: 490)

Name: NF9773_low_3
Description: NF9773
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF9773_low_3
NF9773_low_3
[»] chr7 (27 HSPs)
chr7 (157-457)||(31971782-31972084)
chr7 (159-481)||(47325534-47325859)
chr7 (159-481)||(44353213-44353538)
chr7 (159-481)||(10244289-10244612)
chr7 (157-481)||(5859930-5860262)
chr7 (195-481)||(38306368-38306656)
chr7 (173-471)||(3419321-3419619)
chr7 (161-481)||(37795096-37795426)
chr7 (160-458)||(3867246-3867545)
chr7 (159-471)||(25160930-25161240)
chr7 (159-432)||(3419048-3419321)
chr7 (160-460)||(41089396-41089701)
chr7 (159-395)||(40726140-40726392)
chr7 (159-305)||(33434480-33434626)
chr7 (159-426)||(6585043-6585318)
chr7 (161-317)||(37795598-37795754)
chr7 (159-304)||(34391469-34391614)
chr7 (157-308)||(42454381-42454532)
chr7 (164-320)||(43482176-43482331)
chr7 (360-467)||(33435230-33435337)
chr7 (161-256)||(11378772-11378866)
chr7 (159-278)||(48161690-48161808)
chr7 (159-460)||(35745481-35745779)
chr7 (352-460)||(34390090-34390198)
chr7 (354-423)||(3478514-3478583)
chr7 (157-248)||(31225838-31225929)
chr7 (177-248)||(35401309-35401381)
[»] chr2 (29 HSPs)
chr2 (159-481)||(10524207-10524529)
chr2 (159-481)||(39338510-39338839)
chr2 (159-460)||(387302-387608)
chr2 (175-483)||(17116553-17116856)
chr2 (159-427)||(14106172-14106443)
chr2 (157-460)||(5254384-5254686)
chr2 (165-312)||(41877207-41877354)
chr2 (159-304)||(14436916-14437059)
chr2 (159-428)||(7460835-7461107)
chr2 (169-308)||(22888552-22888690)
chr2 (159-444)||(7874435-7874709)
chr2 (159-304)||(14405487-14405630)
chr2 (157-254)||(43816094-43816191)
chr2 (157-256)||(3745676-3745775)
chr2 (157-256)||(45311451-45311550)
chr2 (157-255)||(13512486-13512584)
chr2 (165-254)||(43248882-43248971)
chr2 (160-236)||(15457817-15457893)
chr2 (159-225)||(9823695-9823761)
chr2 (157-227)||(25280962-25281032)
chr2 (157-242)||(7455601-7455685)
chr2 (241-306)||(25281030-25281095)
chr2 (345-411)||(16952222-16952289)
chr2 (345-411)||(17022887-17022954)
chr2 (345-411)||(17060193-17060260)
chr2 (345-426)||(10173418-10173499)
chr2 (356-415)||(14405370-14405431)
chr2 (227-256)||(15457278-15457307)
chr2 (252-308)||(25281085-25281141)
[»] chr5 (13 HSPs)
chr5 (157-481)||(18593350-18593676)
chr5 (159-481)||(34378205-34378531)
chr5 (159-480)||(698469-698799)
chr5 (157-460)||(7161661-7161969)
chr5 (196-461)||(29087608-29087873)
chr5 (159-472)||(18313303-18313607)
chr5 (166-307)||(5656749-5656890)
chr5 (159-284)||(7452895-7453020)
chr5 (157-252)||(18255097-18255192)
chr5 (210-261)||(41250893-41250944)
chr5 (279-342)||(7451620-7451684)
chr5 (275-332)||(18255189-18255246)
chr5 (157-199)||(41250852-41250894)
[»] chr3 (28 HSPs)
chr3 (157-472)||(47235814-47236132)
chr3 (159-469)||(45163974-45164285)
chr3 (157-483)||(34475405-34475730)
chr3 (157-483)||(31482989-31483314)
chr3 (159-481)||(2392152-2392480)
chr3 (159-481)||(2393915-2394244)
chr3 (159-483)||(53248005-53248332)
chr3 (159-460)||(19176630-19176938)
chr3 (171-457)||(43012506-43012796)
chr3 (166-481)||(17551064-17551382)
chr3 (167-452)||(9583710-9583999)
chr3 (188-427)||(30352117-30352359)
chr3 (165-460)||(40023224-40023525)
chr3 (319-481)||(20611890-20612052)
chr3 (159-447)||(23327997-23328290)
chr3 (157-304)||(50305221-50305368)
chr3 (159-304)||(21343635-21343779)
chr3 (161-277)||(37158618-37158735)
chr3 (165-276)||(50559959-50560070)
chr3 (159-257)||(45399119-45399217)
chr3 (159-256)||(4463734-4463831)
chr3 (159-254)||(25506719-25506814)
chr3 (157-252)||(5556918-5557013)
chr3 (159-222)||(47439284-47439347)
chr3 (259-409)||(7105019-7105175)
chr3 (350-426)||(39021120-39021198)
chr3 (352-460)||(45398924-45399032)
chr3 (272-304)||(45399086-45399118)
[»] chr8 (28 HSPs)
chr8 (159-481)||(31207011-31207336)
chr8 (159-481)||(20138533-20138858)
chr8 (159-472)||(24995044-24995360)
chr8 (159-481)||(12897925-12898248)
chr8 (163-481)||(37986508-37986832)
chr8 (159-481)||(9519606-9519938)
chr8 (159-480)||(32065934-32066268)
chr8 (157-471)||(41893050-41893365)
chr8 (159-460)||(36630965-36631254)
chr8 (214-479)||(34388711-34388977)
chr8 (159-388)||(22773815-22774053)
chr8 (163-474)||(16457128-16457428)
chr8 (190-332)||(27889105-27889247)
chr8 (190-332)||(27947763-27947905)
chr8 (157-444)||(15821024-15821316)
chr8 (162-382)||(35815896-35816121)
chr8 (160-313)||(35821534-35821685)
chr8 (159-300)||(3584028-3584170)
chr8 (388-472)||(22773615-22773699)
chr8 (157-252)||(13538324-13538419)
chr8 (157-252)||(13686055-13686150)
chr8 (165-469)||(38577441-38577752)
chr8 (157-219)||(9659474-9659536)
chr8 (191-257)||(10837918-10837984)
chr8 (319-396)||(35821432-35821510)
chr8 (157-249)||(37267879-37267965)
chr8 (159-199)||(34866309-34866349)
chr8 (157-248)||(41309919-41310011)
[»] chr1 (18 HSPs)
chr1 (157-481)||(24449578-24449904)
chr1 (157-481)||(5459268-5459589)
chr1 (157-481)||(5389075-5389395)
chr1 (210-481)||(46692519-46692793)
chr1 (157-481)||(41920559-41920891)
chr1 (159-481)||(30685573-30685878)
chr1 (157-364)||(31584687-31584894)
chr1 (157-457)||(24684140-24684428)
chr1 (166-460)||(46814121-46814420)
chr1 (159-389)||(6804739-6804969)
chr1 (356-481)||(31585608-31585734)
chr1 (159-306)||(7002474-7002619)
chr1 (352-474)||(6764226-6764348)
chr1 (159-297)||(40216155-40216293)
chr1 (165-481)||(27031496-27031813)
chr1 (208-402)||(24659113-24659313)
chr1 (159-256)||(14320658-14320755)
chr1 (325-447)||(7857794-7857915)
[»] chr6 (8 HSPs)
chr6 (157-453)||(10541967-10542264)
chr6 (163-481)||(3117600-3117922)
chr6 (159-340)||(3254207-3254389)
chr6 (159-314)||(15944276-15944431)
chr6 (257-444)||(14663221-14663414)
chr6 (157-243)||(15132487-15132573)
chr6 (202-256)||(33697789-33697843)
chr6 (164-232)||(14663414-14663480)
[»] chr4 (21 HSPs)
chr4 (157-481)||(30964548-30964871)
chr4 (159-481)||(8255134-8255459)
chr4 (159-481)||(8268552-8268877)
chr4 (159-481)||(30167212-30167538)
chr4 (175-392)||(20464786-20465005)
chr4 (159-317)||(27555579-27555738)
chr4 (159-424)||(8705789-8706061)
chr4 (157-296)||(35329302-35329441)
chr4 (159-343)||(36689454-36689639)
chr4 (157-460)||(2825911-2826215)
chr4 (157-304)||(4305994-4306138)
chr4 (164-460)||(31050315-31050614)
chr4 (159-260)||(7703018-7703118)
chr4 (160-296)||(11281375-11281511)
chr4 (159-256)||(46698428-46698525)
chr4 (165-460)||(35341006-35341291)
chr4 (361-471)||(4305842-4305951)
chr4 (163-256)||(49528421-49528514)
chr4 (159-242)||(9750116-9750198)
chr4 (165-257)||(52868766-52868859)
chr4 (354-426)||(19673259-19673332)
[»] scaffold0343 (1 HSPs)
scaffold0343 (165-471)||(5823-6131)
[»] scaffold0172 (1 HSPs)
scaffold0172 (160-392)||(19113-19349)
[»] scaffold0434 (1 HSPs)
scaffold0434 (190-333)||(2353-2497)
[»] scaffold0085 (1 HSPs)
scaffold0085 (159-363)||(48560-48767)
[»] scaffold0068 (2 HSPs)
scaffold0068 (290-468)||(35557-35733)
scaffold0068 (157-212)||(35471-35526)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 259; Significance: 1e-144; HSPs: 27)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 157 - 457
Target Start/End: Original strand, 31971782 - 31972084
Alignment:
Q  157 tgaatcggcaaatattattaaacgccatcctcgcaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccac 256  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31971782 tgaatcggcaaatattattaaacgccatccccgcaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccac 31971881  T
Q  257 ctaaaaacacccctgaagataaacccaccaaagcacatcaccacctaaaacaaactcc-aaagaacaagcactgtaaacacggtatc-accaccgctcat 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  31971882 ctaaaaacacccctgaagataaacccaccaaaacacataaccacctaaaacaaactccaaaaaaacaagcactgtaaacacggtatcaaccaccgcccat 31971981  T
Q  355 cgtcactactcacccacaaagaacaccctcaaaataaaactcccagaccccaacacccaagctaagccacatttcgaagagcacctaaccgaaggatcat 454  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31971982 cgtcactactcacccacaaagaacaccctccaaataaaactcccagaccccaacacccaagctgagccacatttcgaagagcacctaaccgaaggatcat 31972081  T
Q  455 gca 457  Q
    |||    
T  31972082 gca 31972084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 159 - 481
Target Start/End: Original strand, 47325534 - 47325859
Alignment:
Q  159 aatcggcaaatattattaaacgccatcctcgcaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacct 258  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  47325534 aatcggcaaatattattaaacgtcatcctcgtaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgctgcatatagacggtacaccataaccacct 47325633  T
Q  259 aaaaacacccctgaagataaacccaccaaagcacatcaccacctaaaacaaactccaaagaa---caagcactgtaaacacggtatc-accaccgctcat 354  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||   |||||||||||||||| ||||| | || ||| |||    
T  47325634 aaaaacactc-tgaagataaacccaccaaaacacatcaccacctaaaacaaacttcaaaaaaaaacaagcactgtaaacacagtatccatcatcgcccat 47325732  T
Q  355 cgtcactactcacccacaaagaacaccctcaaaataaaactcccagaccccaacacccaagctaagccacatttcgaagagcacctaaccgaaggatcat 454  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47325733 cgtcactactcacccacaaagaacaccctcaaaataaaactcccagaccccaacacccaagctgagccacatttcgaagagcacctaaccgaaggatcat 47325832  T
Q  455 gcagctatcacaaacctcacaacctcc 481  Q
     ||||||||||||||||| | ||||||    
T  47325833 tcagctatcacaaacctcgcgacctcc 47325859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 159 - 481
Target Start/End: Original strand, 44353213 - 44353538
Alignment:
Q  159 aatcggcaaatattattaaacgccatcctcgcaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacct 258  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44353213 aatcggtaaatattattaaacgccatccccgcaagacgcaaagtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagatggtacaccataaccacct 44353312  T
Q  259 aaaaacacccctgaagataaacccaccaaagcacatcaccacctaaaacaaactccaaagaa-caagcactgtaaacacggtat-caccaccgctcatcg 356  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||    
T  44353313 aaaaacacccatggagataaacccaccaaaacacatcaccacctaaaacagactccaaaaaatcaagcactgtaaacacggtatccaccaccgtccatcg 44353412  T
Q  357 tcactactcacccacaaagaacaccctc-aaaataaaactcccagaccccaacacccaagctaagccacatttcgaagagcacctaaccgaaggatcatg 455  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44353413 tcactactcacctacaaagaacaccctcaaaaataaaactcccagaccccaacacccaagccgggtcacatttcgaagagcacctaaccgaaggatcatg 44353512  T
Q  456 cagctatcacaaacctcacaacctcc 481  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||    
T  44353513 cagctatcacaaacctcgcgacctcc 44353538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 159 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 10244612 - 10244289
Alignment:
Q  159 aatcggcaaatattattaaacgccatcctcgcaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacct 258  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10244612 aatcggcaaatattattaaactccatctccgcaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacagtacaccataaccacct 10244513  T
Q  259 aaaaacacccctgaagataaacccaccaaagcacatcaccacctaaaacaaactccaaagaacaagcactgtaaacacggtat-caccaccgctcatcgt 357  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| ||||| ||||| ||| ||||||    
T  10244512 aaaaacacccctgaagataagtccacgaaaacacatcaccacctaaaacaaactccaaaaaataagcaccgtaaacatggtatccaccatcgcccatcgt 10244413  T
Q  358 cactactcacccacaaagaacaccctcaaaataaaactcccagaccccaacacccaagctaagccacatttcgaagagcacctaaccgaaggatcatgca 457  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10244412 cactactcacccacaaagaccaccctccaactaaaaatcccagacccaaacacccaagctgagccacaattcaaagagcacctaaccgaaggatcatgca 10244313  T
Q  458 gctatcacaaacctcacaacctcc 481  Q
     |||||||||||||| | ||||||    
T  10244312 actatcacaaacctcgcgacctcc 10244289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 157 - 481
Target Start/End: Original strand, 5859930 - 5860262
Alignment:
Q  157 tgaatcggcaaatattattaaacgccatcctcgcaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccac 256  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5859930 tgaatcggcaaatattattaaacgtcatccccgcaagacgcatgatatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccac 5860029  T
Q  257 ctaaaaacacccctgaagataaacccaccaaagcacatcaccacctaaaacaaact-------ccaaagaacaagcactgtaaacacggta-tcaccacc 348  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||         ||| |||||||||| | ||||||||| ||||||      
T  5860030 ctaaaaacacccctaaagataatcccaccaaaacacatcaccacctaaaacagactaaaaaaaaaaaaaaacaagcactattaacacggtattcaccatt 5860129  T
Q  349 gctcatcgtcactactcacccacaaagaacaccctcaaaataaaactcccagaccccaacacccaagctaagccacatttcgaagagcacctaaccgaag 448  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5860130 gcccatcgtcactactcatccacaaagaacaccctgaaaataaaactcccagaccccaacacccaagctgagccacatttcgaagagcacctaactgaag 5860229  T
Q  449 gatcatgcagctatcacaaacctcacaacctcc 481  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  5860230 gatcatgcagctatcacaaacctcgcgacctcc 5860262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 195 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 38306656 - 38306368
Alignment:
Q  195 cgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacctaaaaacacccctgaagataaacccaccaaagcacat 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||    
T  38306656 cgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacctaaaaacacccctaaagataaaccaaccaaaacacat 38306557  T
Q  295 caccacctaaaacaaact-ccaaagaacaagcactgtaaacacggtat-caccaccgctcatcgtcactactcacccacaaagaacaccctcaaaataaa 392  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| | ||||| ||| ||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38306556 caccacctaaaacaaactcccaaaaaacaagaactgcagacacgatatccaccaccacccatcgtcactactcacctacaaagaacaccctcaaaataaa 38306457  T
Q  393 actcccagaccccaacacccaagctaagccacatttcgaagagcacctaaccgaaggatcatgcagctatcacaaacctcacaacctcc 481  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  38306456 actcacagaccccaacacccaagctgagccacatatcgaagagcacttaaccgaaggatcatgcagctatcacaaacctcgcgacctcc 38306368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 173 - 471
Target Start/End: Original strand, 3419321 - 3419619
Alignment:
Q  173 attaaacgccatcctcgcaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacctaaaaacacccctga 272  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3419321 attaaacgccatccccgcaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaacgttgccgcata--gacggtacaccataaccacctaaaaacactcctga 3419418  T
Q  273 agataaacccaccaaagcacatcaccacctaaaacaaactccaaagaa-caagcactgtaaacacggtatc-accaccgctcatcgtcactactcaccca 370  Q
    |||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| | |||||| || ||| || |||||||| | |||| ||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  3419419 agataaactcaccaaaacacaacaccacctaaaacagaatccaaaaaaacaancattgtaaacatgatatccaccaccgttcatcgtcactactcactca 3419518  T
Q  371 caaagaacaccctcaaaataaaactcccagaccccaacacccaagctaagccacatttcgaagagcacctaaccgaaggatcatgcagctatcacaaacc 470  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3419519 caaagaacacccttaaaataaaactcccaaaccccaacacccaagttaagccacaattcgaagcgcacctaaccgaaggatcaagcagctatcacaaacc 3419618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 161 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 37795426 - 37795096
Alignment:
Q  161 tcggcaaatattattaaacgccatcctcgcaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacctaa 260  Q
    |||||||||||||||||||| | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   || ||||||||||||||||||||||    
T  37795426 tcggcaaatattattaaacgtcgtccccacaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgtcgcgattaaacggtacaccataaccacctaa 37795327  T
Q  261 aaacacccctgaagataaacccaccaaagcacatcaccacctaaaacaaactccaaagaacaa---------gcactgtaaacacggtatc-accaccgc 350  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||| |||||||| || ||         ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37795326 aaacacccatgaagataaacccacaaaaacatatcaccacctaaaacagactccaaaaaaaaaaaaaaaaaagcactgtaaacacggtatccaccaccgc 37795227  T
Q  351 tcatcgtcactactcacccacaaagaacaccctcaaaataaaactcccagaccccaacacccaagctaagccacatttcgaagagcacctaaccgaagga 450  Q
     |||| | |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37795226 ccatcattactacttaaccacaaagaacaccctcaaaataaaactctcaaaccccaacacccaagctgagccacagttcgaagagcacctaaccgaagga 37795127  T
Q  451 tcatgcagctatcacaaacctcacaacctcc 481  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  37795126 tcatgcagctatcacaaacctcgcgacctcc 37795096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 160 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 3867545 - 3867246
Alignment:
Q  160 atcggcaaatattattaaacgccatcctcgcaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccaccta 259  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||    
T  3867545 atcggcaaatattattaaacttcatcc-cgcaagacgtaaggtattgacgaaacaagatacaaatggtgccacatatagacggtacaccataacaacata 3867447  T
Q  260 aaaacacccctgaagataaacccaccaaagcacatcaccacctaaaacaaactcc-aaagaacaagcactgtaaacacggtat-caccaccgctcatcgt 357  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||   | || ||  |||||||||||| ||| ||||||||  ||||||    
T  3867446 aaaacacccctgaagataaactcaccaaaacacatcaccacccaaaacaaactccttcacaaaaacaactgtaaacacgatatccaccaccgtccatcgt 3867347  T
Q  358 cactactcacccacaaagaacaccctcaaaataaaactcccagaccccaacacccaagctaagccacatttcgaagagcacctaaccgaaggatcatgca 457  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  3867346 cactactcacccccaaagaacaccctcaaaataaaacttccatactccaacacccaagctgagccacatatcgaagagcacctgaccaaaggatcatgca 3867247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 159 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 25161240 - 25160930
Alignment:
Q  159 aatcggcaaatattattaaacgccatcctcgcaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacct 258  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||   |||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25161240 aatcggcaaatattattaaacgtcatccccgtaagatttaaggtatgaacgaaacaagatgcaaatggtgccgtatatagacggtacaccataaccacct 25161141  T
Q  259 aaaaacacccctgaagataaacccaccaaagcacatcaccacctaaaacaaactccaaagaacaagcactgtaaacacggtat-caccaccgctcatcgt 357  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||  |||| ||||| ||| ||||||    
T  25161140 aaaaaca-ccctggagataaacccaccaaaacacatcaccacctaaaacagacttcaaaaaacaagcaatgtaaacatagtatccaccaacgcccatcgt 25161042  T
Q  358 cactactcacccacaaagaacaccctcaaaataaaactcccagaccccaacacccaagctaagccacatttcgaagagcacctaaccgaaggatcatgca 457  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||  ||||||| |||||||||||| | ||| | ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||  ||    
T  25161041 cactactcacccacaaagaacacctttaaa--aaaactctcagaccccaacatctaagttgagccacatttccaagagcacctaactgaaggatcacaca 25160944  T
Q  458 gctatcacaaacct 471  Q
    ||||||||||||||    
T  25160943 gctatcacaaacct 25160930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 159 - 432
Target Start/End: Original strand, 3419048 - 3419321
Alignment:
Q  159 aatcggcaaatattattaaacgccatcctcgcaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacct 258  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  3419048 aatcgacaaatattattaaacgtcatccccgcaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaacgttgccgcata--gacggtacaccataaccacct 3419145  T
Q  259 aaaaacacccctgaagataaacccaccaaagcacatcaccacctaaaacaaactcc-aaagaacaagcactgtaaacacggtat-caccaccgctcatcg 356  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| | ||| ||| |||||||| |||||||| | ||| |||||||| |||||     
T  3419146 aaaaacactcctgaagataaactcaccaaaacacaacaccacctaaaacagaatccaaaaaaacaagcattgtaaacatgatatccaccaccgttcatca 3419245  T
Q  357 tcactactcacccacaaagaacaccctcaaaataaaactcccagaccccaacacccaagctaagccacatttcgaa 432  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  3419246 tcactactcactcacaaaaaacacccttaaaataaaactcccaaaccccaacacccaagttaagccacaattcgaa 3419321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 160 - 460
Target Start/End: Original strand, 41089396 - 41089701
Alignment:
Q  160 atcggcaaatattattaaacgccatcctcgcaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccaccta 259  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||   |||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41089396 atcggcaaatattattaaatgccatctctgcaagac--aaggtatggacgaaacaagatacaa-tggtgccgcatatagacggtacaccataaccaccta 41089492  T
Q  260 aaaacacccctgaagataaacccaccaaagcacatcaccacctaaaacaaactcc--------aaagaacaagcactgtaaacacggtatc-accaccgc 350  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| |||||        ||| ||||||   ||||||||| ||||| ||||||||    
T  41089493 aaaacacccatgaagataaatccaccaaaacacatcatcacctaaaacagactccaaaaaaaaaaaaaacaagtcatgtaaacacagtatctaccaccgc 41089592  T
Q  351 tcatcgtcactactcacccacaaagaacaccctcaaaataaaactcccagaccccaacacccaagctaagccacatttcgaagagcacctaaccgaagga 450  Q
     ||| ||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   | ||| ||| |||||||||||||| | ||||| |    
T  41089593 ccattgtcacta-ttacccgcaaagaacaccctcaaaataaaactcccagaccctaacacccatcttgagctacacttcgaagagcacctcaacgaagaa 41089691  T
Q  451 tcatgcagct 460  Q
    ||||||||||    
T  41089692 tcatgcagct 41089701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 159 - 395
Target Start/End: Original strand, 40726140 - 40726392
Alignment:
Q  159 aatcggcaaatattattaaacgccatcctcgcaagacgcaaggtatggacgaaacaagataca--------------aatggtgccgcatatagacggta 244  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||              |||| |||  |||||||||||||    
T  40726140 aatcggcaaatattattaaatgtcatccccgcaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacacgaaacaaaatacaaatgatgctacatatagacggta 40726239  T
Q  245 caccataaccacctaaaaacacccctgaagataaacccaccaaagcacatcaccacctaaaacaaactccaaagaa--caagcactgtaaacacggtat- 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||||||| |||||||||||||     
T  40726240 caccataaccacctaaaaacacccctggagataaacccaccaaaacacattaccacctaaaacagactccaaaaaaatcaagcacggtaaacacggtatc 40726339  T
Q  342 caccaccgctcatcgtcactactcacccacaaagaacaccctcaaaataaaact 395  Q
    |||||||||  ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  40726340 caccaccgcctatcatcactactca-ccacaaagaacaccctcaaaataaaact 40726392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 159 - 305
Target Start/End: Original strand, 33434480 - 33434626
Alignment:
Q  159 aatcggcaaatattattaaacgccatcctcgcaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacct 258  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||    
T  33434480 aatcggcaaatattattaaacgccatccccgcaatacgcaaggtatggacgaagcaagatacaaatggttctgtatatagacggtacaccataaccacct 33434579  T
Q  259 aaaaacacccctgaagataaacccaccaaagcacatcaccacctaaa 305  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33434580 aaaaacacccctggaaataaacccaccaaaacacatcaccacctaaa 33434626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 159 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 6585318 - 6585043
Alignment:
Q  159 aatcggcaaatattattaaacgccatcctcgcaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacct 258  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  6585318 aatcagcaaatattattaaacgccatccccgcaagatgcaaggaatggacgaaacaagatacaaatggtgccacatatagacggtacaccataaccacca 6585219  T
Q  259 aaaaacacccctgaagataaacccaccaaagcacatca-ccacctaaaacaaactcc---aaagaa--caagcactgtaaacacggtat-caccaccgct 351  Q
    || || ||||||||||||||| ||||| || ||||||| || ||||| ||  || ||   | ||||   || ||||| |||||| |||| ||| ||| ||    
T  6585218 aacaaaacccctgaagataaagccacctaaacacatcacccccctaagacggacaccttaacagaaacaaaacactgaaaacacagtatccacaaccact 6585119  T
Q  352 catcgtcactactcacccacaaagaaca-ccctcaaaataaaactcccagaccccaacacccaagctaagccacat 426  Q
    |||||||||||||||||  |||| | || |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  6585118 catcgtcactactcacctccaaatagcacccctcaaaataaaactcccagacttcaacacccaagctgagccacat 6585043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 161 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 37795754 - 37795598
Alignment:
Q  161 tcggcaaatattattaaacgccatcctcgcaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacctaa 260  Q
    |||||||||||||||||||| | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   || ||||||||||||||||||||||    
T  37795754 tcggcaaatattattaaacgtcgtccccacaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgtcgcgattaaacggtacaccataaccacctaa 37795655  T
Q  261 aaacacccctgaagataaacccaccaaagcacatcaccacctaaaacaaactccaaa 317  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||    
T  37795654 aaacacccatgaagataaacccacaaaaacatatcaccacctaaaacagactccaaa 37795598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 159 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 34391614 - 34391469
Alignment:
Q  159 aatcggcaaatattattaaacgccatcctcgcaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacct 258  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  34391614 aatcagcaaatattattaaacgtcatccccgcaggacgcagggtatggacgaaacaagatacaaataatgccgcatatagacgatacaccataaccacca 34391515  T
Q  259 aaaaacacccctgaagataaacccaccaaagcacatcaccacctaa 304  Q
    || ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34391514 aacaaagcccctgaagataaacccaccaaaacacatcaccacctaa 34391469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 157 - 308
Target Start/End: Original strand, 42454381 - 42454532
Alignment:
Q  157 tgaatcggcaaatattattaaacgccatcctcgcaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccac 256  Q
    |||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  42454381 tgaatcagcaaatattattaaacatcatccccgcaagacgcaagatatagacgaaacaaggtacaaatggtgccgcatatagacagtacaccataaccac 42454480  T
Q  257 ctaaaaacacccctgaagataaacccaccaaagcacatcaccacctaaaaca 308  Q
    ||||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||    
T  42454481 ctaaaaaaatccttgaagataaacccaccaaaacacatccttacctaaaaca 42454532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 164 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 43482331 - 43482176
Alignment:
Q  164 gcaaatattattaaacgccatcctcgcaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacctaaaaa 263  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  43482331 gcaaatattattaaacgtcatccccgta-gacgcaaggtatggacgaaataagatacaaatagtgctgcatacagacggtacaccacaaccacctaaaaa 43482233  T
Q  264 cacccctgaagataaacccaccaaagcacatcaccacctaaaacaaactccaaagaa 320  Q
    || || |  |||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| |||| ||||||    
T  43482232 catccattgagataaacccacaaaaacacaacaccacctaaaacagactcaaaagaa 43482176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 360 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 33435337 - 33435230
Alignment:
Q  360 ctactcacccacaaagaacaccctcaaaataaaactcccagaccccaacacccaagctaagccacatttcgaagagcacctaaccgaaggatcatgcagc 459  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  33435337 ctactcacccccaaagaacaccctcaaaagaaaactctcagacctcaacaaccaagctgagccacaattcgaagagcacctgaccgaaggatcatgtagc 33435238  T
Q  460 tatcacaa 467  Q
    | ||||||    
T  33435237 tttcacaa 33435230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 161 - 256
Target Start/End: Original strand, 11378772 - 11378866
Alignment:
Q  161 tcggcaaatattattaaacgccatcctcgcaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccac 256  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11378772 tcggcaaatattattaaacgccaaccccgcaagacgcaaggtatggacg-aataagatacagatgatgccgcatataaacggtacaccataaccac 11378866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 159 - 278
Target Start/End: Original strand, 48161690 - 48161808
Alignment:
Q  159 aatcggcaaatattattaaacgccatcctcgcaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacct 258  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| |||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  48161690 aatcagcaaatattattaaacgtcatccctgcaagacacaagatatggacgaa-caaaatacaaatagtgccgcatatagacggcacaccataaccacct 48161788  T
Q  259 aaaaacacccctgaagataa 278  Q
    || ||  |||||||||||||    
T  48161789 aacaaagcccctgaagataa 48161808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 159 - 460
Target Start/End: Original strand, 35745481 - 35745779
Alignment:
Q  159 aatcggcaaatattattaaacgccatcctcgcaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacct 258  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||  || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||          ||||||||||||||     
T  35745481 aatcagcaaatattattaaacgtcatctccgtaaaacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgtcgca----------acaccataaccacc- 35745569  T
Q  259 aaaaacacccctgaagataaacccaccaaagcacatcaccacctaaaacaaactcc---aaag-aacaagcactgtaaacacggtat-caccaccgctca 353  Q
    | | |  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| || ||   | || ||||| |||  |||||||   || |||| || | ||    
T  35745570 atacaagcccctgaagat-aacccaccaaaacacatcaccacctaagacagacaccttaacagaaacaaacacactaaacacaacatccacccccaccca 35745668  T
Q  354 tcgtcactactcacccacaaagaacacc-ctcaaaataaaactcccagaccccaacacccaagctaagccac---atttcgaagagcacctaaccgaagg 449  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||   |||||  ||||||||||||| ||||||   || ||||| ||| |||||||||| |    
T  35745669 tcgtcactactcacccccaaagaacacctctcaaaataaaacagtcagacttcaacacccaagctgagccactatatatcgaaaagctcctaaccgaatg 35745768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 352 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 34390198 - 34390090
Alignment:
Q  352 catcgtcactactcacccacaaagaacaccc-tcaaaataaaactcccagaccccaacacccaagctaagccacatttcgaagagcacctaaccgaagga 450  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||| ||| ||| ||||| |||| ||    
T  34390198 catcgtcactactcatccccaaagaacacccctcaaaataaaactcccagactacaacacccaagttgagccacattt-gaaaagctcctaatcgaatga 34390100  T
Q  451 tcatgcagct 460  Q
     |||||||||    
T  34390099 acatgcagct 34390090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 354 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 3478583 - 3478514
Alignment:
Q  354 tcgtcactactcacccacaaagaacac-cctcaaaataaaactcccagaccccaacacccaagctaagcca 423  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| || ||||||| ||||| |||||    
T  3478583 tcgtcactactcaccc-caaagaacactcctcaaaattaaactcccagtcctcaacaccaaagcttagcca 3478514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 157 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 31225929 - 31225838
Alignment:
Q  157 tgaatcggcaaatattattaaacgccatcctcgcaagacgcaaggtatggacgaaacaa-gatacaaatggtgccgcatatagacggtacacc 248  Q
    ||||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| | ||  ||| ||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  31225929 tgaatcggcaaaatttattaa-cgccaaccccgcaagacgcaaggtatggacgacataacaatataaaaggtgccatatatagacggtacacc 31225838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 177 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 35401381 - 35401309
Alignment:
Q  177 aacgccatcctcgcaagacgcaaggtatggacgaaacaa-gatacaaatggtgccgcatatagacggtacacc 248  Q
    |||||||||| || ||||||||| |||||||||  |||| || ||||  |||||||||||||||||| |||||    
T  35401381 aacgccatccccgtaagacgcaaagtatggacggcacaaagaaacaataggtgccgcatatagacggaacacc 35401309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 240; Significance: 1e-133; HSPs: 29)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 159 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 10524529 - 10524207
Alignment:
Q  159 aatcggcaaatattattaaacgccatcctcgcaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacct 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10524529 aatcggcaaatattattaaacgccaccct-gcaagacgcaaggtatggacgaaacaatatacaaatggtgcagcatatagatggtacaccataaccacct 10524431  T
Q  259 aaaaacacccctgaagataaacccaccaaagcacatcaccacctaaaacaaactccaaagaacaagcactgtaaacacggtat-caccaccgctcatcgt 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  10524430 aaaaacacccctgaagataaacccaccaaaacacgtcaccgtctaaaacaaactccaaaaaacaagcaccgtaaacacggtatccaccaccgcccatcgt 10524331  T
Q  358 cactactcacccacaaagaacaccctcaaaataaaactcccagaccccaacacccaagctaagccacatttcgaagagcacctaaccgaaggatcatgca 457  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10524330 cactactcacccacaaagaacaccctccaaataaaactcccaaaccccaacacccaagctgagccacatatcgaagagcacctaaccgaaggatcatgca 10524231  T
Q  458 gctatcacaaacctcacaacctcc 481  Q
    ||||||||||||||| | ||||||    
T  10524230 gctatcacaaacctcgcgacctcc 10524207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 159 - 481
Target Start/End: Original strand, 39338510 - 39338839
Alignment:
Q  159 aatcggcaaatattattaaacgccatcctcgcaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacct 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39338510 aatcggcaaatattattaaacgccatcatcgtaagacgcaatgtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacct 39338609  T
Q  259 aaaaacacccctgaagataaacccaccaaagcacatca-ccacctaaaacaaactc------caaagaacaagcactgtaaacacggtat-caccaccgc 350  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||       ||| |||||||||||||||||  |||| ||||| |||    
T  39338610 gaaaacacccctgaagataaacccaccaaaacacatcacccacctaaaacagactcaaaaaaaaaaaaacaagcactgtaaaca-agtatccaccatcgc 39338708  T
Q  351 tcatcgtcactactcacccacaaagaacaccctcaaaataaaactcccagaccccaacacccaagctaagccacatttcgaagagcacctaaccgaagga 450  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  39338709 ccatcgtcactactcacccacaaagaacaccctcaaaataaaactcccagacctcaacacccaagctgagtcacaattcgaagagcacctaaccgaagga 39338808  T
Q  451 tcatgcagctatcacaaacctcacaacctcc 481  Q
    |||| ||||||||||||||||| | ||||||    
T  39338809 tcattcagctatcacaaacctcgcgacctcc 39338839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 159 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 387608 - 387302
Alignment:
Q  159 aatcggcaaatattattaaacgccatcctcgcaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacct 258  Q
    ||||| || ||||||||||||| ||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  387608 aatcgacagatattattaaacgtcatcaccgcaagtcgcagggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccactt 387509  T
Q  259 aaaaacacccctgaagataaacccaccaaagcacatcaccacctaaaacaaactcc----aaagaacaagcactgtaaacacggta-tcaccaccgctca 353  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||     || |||||||| |||||||||   | |||||||||| ||    
T  387508 aaaaacacccatgaagataaacccaccaaaacacatcaccacctaaaacagactccttcacaaaaacaagcattgtaaacacaaaattcaccaccgccca 387409  T
Q  354 tcgtcactactcacccacaaagaacaccctcaaaataaaactcccagaccccaacacccaagctaagccacatttcgaagagcacctaaccgaaggatca 453  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| || ||| || ||    
T  387408 tcgtcactattcacccccaaagaacaccctcaaaataaaactcccagaccccaacacccaagctgagccacctatcgaagagcacctgactgaatgaaca 387309  T
Q  454 tgcagct 460  Q
    |||||||    
T  387308 tgcagct 387302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 175 - 483
Target Start/End: Original strand, 17116553 - 17116856
Alignment:
Q  175 taaacgccatcctcgcaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacctaaaaacacccctgaag 274  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||          |||||||    
T  17116553 taaacgtcatccccgcaagacgcaaggtatggacgagacaagatacaaatgatgccgcatatagacggtacactataaccacc----------cctgaag 17116642  T
Q  275 ataaacccaccaaagcacatcaccacctaaaacaaactccaaagaacaa---gcactgtaaacacggtatc-accaccgctcatcgtcactactcaccca 370  Q
    ||||| ||||  || ||||||||| ||||||||| |||  ||| || ||   ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||    
T  17116643 ataaatccacagaaacacatcaccgcctaaaacagactaaaaaaaaaaaaaagcactgtaaacacggtatccaccaccgcccatcgtcattactcaccca 17116742  T
Q  371 caaagaacaccctcaaaataaaa-ctcccagaccccaacacccaagctaagccacatttcgaagagcacctaaccgaaggatcatgcagctatcacaaac 469  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||    
T  17116743 caaagaacaccctcaaaataaaaactctcagaccccaacacccaagctgagccacattacgaagagcacctaaccgatggatcaagtagatatcacaaac 17116842  T
Q  470 ctcacaacctccaa 483  Q
    ||| | ||||||||    
T  17116843 ctcgcgacctccaa 17116856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 159 - 427
Target Start/End: Original strand, 14106172 - 14106443
Alignment:
Q  159 aatcggcaaatattattaaacgccatcctcgcaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacct 258  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  14106172 aatcagcaaatattattaaacgccatcctcgcaagacgcagggtatg-acgaaacaagatagaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacc- 14106269  T
Q  259 aaaaacacccctgaagataaacccaccaaagcacatcaccacctaaaacaaactcc---aaag-aacaagcactgtaaacacggtat-caccaccgctca 353  Q
    ||| |  ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| ||  || ||   | || ||||| || ||||||||| |||| ||| ||| ||||    
T  14106270 aaacaagcccctgaagat-aacccaccaaaacacaacaccacctaagacggacaccttaacagaaacaaacattgtaaacacagtatccacaaccactca 14106368  T
Q  354 tcgtcactactcacccacaaagaaca-ccctcaaaataaaactcccagaccccaacacccaagctaagccacatt 427  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| |||||||||    
T  14106369 tcgtcactactcacccccaaagaacacccctcaaaataaaactctcagacttcaacacccaagctgagccacatt 14106443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 157 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 5254686 - 5254384
Alignment:
Q  157 tgaatcggcaaatattattaaacgccatcctcgcaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccac 256  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  5254686 tgaatcagcaaatattattaaacgtcatcctcgcaagacgtaaggtatggacgaaa-tagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataacctc 5254588  T
Q  257 ctaaaaacacccctgaagataaacccaccaaagcacatcaccacctaaaacaaactcc---aaag-aacaagcactgtaaacacggtat-caccaccgct 351  Q
    | || ||  | | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  || ||   | || ||||| |||||||||||| |||| ||| ||| |     
T  5254587 caaacaaagctcatgaagataaacccaccaaaacacatcaccacctaagacggacaccttaacagaaacaaacactgtaaacacagtatccacaaccacc 5254488  T
Q  352 catcgtcactactcacccacaaagaaca-ccctcaaaataaaactcccagaccccaacacccaagctaagccacatttcgaagagcacctaaccgaagga 450  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||   ||||||| |||||  |||||||||| || ||||||| |||||| ||| || ||||||| ||    
T  5254487 catcgtcactactcacc--caaagaacacccctcaa---aaaactctcagacttcaacacccaaactgagccaca-ttcgaaaagctccaaaccgaatga 5254394  T
Q  451 tcatgcagct 460  Q
     |||||||||    
T  5254393 acatgcagct 5254384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 165 - 312
Target Start/End: Original strand, 41877207 - 41877354
Alignment:
Q  165 caaatattattaaacgccatcctcgcaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacctaaaaac 264  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  41877207 caaatattattaaactccatccccgcaagacgcaagatatggacgaaacaatatacaaatggtaccgtatatagacggtacaccataaccacctgaaaac 41877306  T
Q  265 acccctgaagataaacccaccaaagcacatcaccacctaaaacaaact 312  Q
    |||||||||||||||||| | ||| ||||||||  |||||||||||||    
T  41877307 acccctgaagataaaccctctaaaacacatcactgcctaaaacaaact 41877354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 159 - 304
Target Start/End: Original strand, 14436916 - 14437059
Alignment:
Q  159 aatcggcaaatattattaaacgccatcctcgcaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacct 258  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  14436916 aatcagcaaatattattaaacgccatccccgcaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataacaacc- 14437014  T
Q  259 aaaaacacccctgaagataaacccaccaaagcacatcaccacctaa 304  Q
    ||| |  | ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||    
T  14437015 aaacaagctcctgaagat-aacccaccaaatcacatcatcacctaa 14437059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 159 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 7461107 - 7460835
Alignment:
Q  159 aatcggcaaatattattaaacgccatcctcgcaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacct 258  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||     
T  7461107 aatcagcaaatattattaaacgtcatccccgcaagacgcagagtatg-acgaaacaaaatacaaatggtgttgcatatagacagtacaccataaccacc- 7461010  T
Q  259 aaaaacacccctgaagataaacccaccaaagcacatcaccacctaaaacaaactcc---aaag-aacaagcactgtaaacacggtat-caccaccgctca 353  Q
    ||| |  ||||||||||| ||||||||||| |||| |||| ||||| ||  || ||   | || ||||| ||||||||||||  ||| ||| ||| | ||    
T  7461009 aaacaagcccctgaagat-aacccaccaaatcacaacaccgcctaagacggacaccttaacagaaacaaacactgtaaacacaatatccacaaccacaca 7460911  T
Q  354 tcgtcactactcacccacaaagaaca-ccctcaaaataaaactcccagaccccaacacccaagctaagccacattt 428  Q
    ||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||    
T  7460910 tcgtcactactcaaccccaaagaacacccctcaaaataaaactcccagacttcaacacccaagctgagccacattt 7460835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 169 - 308
Target Start/End: Original strand, 22888552 - 22888690
Alignment:
Q  169 tattattaaacgccatcctcgcaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacctaaaaacaccc 268  Q
    |||||||||| | ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| || |||||||||| ||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||    
T  22888552 tattattaaatgtcatcc-cgcaagacgcaatgtatggatgaaacaaggtagaaatggtgccacatatagacggtatatcataaccaactaagaacaccc 22888650  T
Q  269 ctgaagataaacccaccaaagcacatcaccacctaaaaca 308  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  22888651 ctgaagataaacccaccaaaacgcatcaccacctaaaaca 22888690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 159 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 7874709 - 7874435
Alignment:
Q  159 aatcggcaaatattattaaa-cgccatcctcgcaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacc 257  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7874709 aatcagcaaatattattaaaacgccatcctcgcaagacacaaggtatagacaaaacaagatacaaatggcgccgcatatagacggtacaccataaccacc 7874610  T
Q  258 taaaaacacccctgaagataaacccaccaaagcacatcaccacctaaaacaaactccaaagaacaagcactgtaaacacggtat-caccaccgctcatcg 356  Q
     || ||  |||||||| |||||| |||| |||   |    |||||   ||| |        ||||| |||||||||||| |||| ||| ||| | |||||    
T  7874609 aaacaaagcccctgaatataaactcacctaag---acggacacct-tgacaga--------aacaaacactgtaaacacagtatccacaaccacccatcg 7874522  T
Q  357 tcactactcacccacaaagaaca-ccctcaaaataaaactcccagaccccaacacccaagctaagccacatttcgaagagcacctaacc 444  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||    
T  7874521 tcactactcaccc-caaagaacatccctcaaaataaaactccaagacttcaacacccaagctgagccaca-ttcgaaaagctcctaacc 7874435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 159 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 14405630 - 14405487
Alignment:
Q  159 aatcggcaaatattattaaacgccatcctcgcaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacct 258  Q
    |||| |||||||||||||||||  || |  |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14405630 aatcagcaaatattattaaacgttattcctgcaagacgtaaggtatgaacgaa-caagatacaaatggtgctgcatatagacggtacaccataaccacct 14405532  T
Q  259 aaaaacacccctgaagataaacccaccaaagcacatcaccacctaa 304  Q
    || ||  ||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||||||    
T  14405531 aacaaagcccctaaagat-aacctaccaaaacacatcaccacctaa 14405487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 157 - 254
Target Start/End: Original strand, 43816094 - 43816191
Alignment:
Q  157 tgaatcggcaaatattattaaacgccatcctcgcaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataacc 254  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43816094 tgaatcggcaaatattattaaacgtcattcccgcaaaacgcaaggtatggacgaaacaaagtacaaatgatgccgcatatagacggtacaccataacc 43816191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 157 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 3745775 - 3745676
Alignment:
Q  157 tgaatcggcaaatattattaaacgccatcctcgcaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccac 256  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||    
T  3745775 tgaatcggcaaatattattaaatgtcatccccataagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgctgcatatagatggtacatcataaccac 3745676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 157 - 256
Target Start/End: Original strand, 45311451 - 45311550
Alignment:
Q  157 tgaatcggcaaatattattaaacgccatcctcgcaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccac 256  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||    
T  45311451 tgaatcggccaatattattaaacgccaaccccgcaagatgcaaggaaaggacgaaacaagatacaaatggtgccacatatatacggaacaccataaccac 45311550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 157 - 255
Target Start/End: Original strand, 13512486 - 13512584
Alignment:
Q  157 tgaatcggcaaatattattaaacgccatcctcgcaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataacca 255  Q
    |||||||  ||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13512486 tgaatcgaaaaatattattaaacgtcattcccgcaagacgcaatgtatggacgaaacaaaatacaaatgatgccgcatatagacggtacaacataacca 13512584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 165 - 254
Target Start/End: Original strand, 43248882 - 43248971
Alignment:
Q  165 caaatattattaaacgccatcctcgcaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataacc 254  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| | |||||||    
T  43248882 caaatattattaaacgtcatcctcacaagacacaaggtatggacgaaacaagatataaatggcgccgcatatagacggtatatcataacc 43248971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 160 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 15457893 - 15457817
Alignment:
Q  160 atcggcaaatattattaaacgccatcctcgcaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatat 236  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15457893 atcggcaaataatattaaacgtcatccccgcaagacgcatgatatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatat 15457817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 159 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 9823761 - 9823695
Alignment:
Q  159 aatcggcaaatattattaaacgccatcctcgcaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatg 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||    
T  9823761 aatcggcaaatattattaaacgccatctccgcaagacacaaggtatgaatgaaacaagatacaaatg 9823695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 157 - 227
Target Start/End: Original strand, 25280962 - 25281032
Alignment:
Q  157 tgaatcggcaaatattattaaacgccatcctcgcaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggt 227  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  25280962 tgaatcggaaaatattattaaacgtcatccccacaagacgcagggtatggacgaaacaagatataaatggt 25281032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 157 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 7455685 - 7455601
Alignment:
Q  157 tgaatcggcaaatattattaaacgccatcctcgcaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacgg 242  Q
    |||||| | ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7455685 tgaatcagtaaataatattaaacgtcatccccgcaagacgca-ggtatgaacgaaataagatacaaatggtgccgcaaatagacgg 7455601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 241 - 306
Target Start/End: Original strand, 25281030 - 25281095
Alignment:
Q  241 ggtacaccataaccacctaaaaacacccctgaagataaacccaccaaagcacatcaccacctaaaa 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||  |||||| ||| |||||||||||||    
T  25281030 ggtacaccataaccacctaaaaacaccctcgaaaataaactaaccaaaacacgtcaccacctaaaa 25281095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 345 - 411
Target Start/End: Original strand, 16952222 - 16952289
Alignment:
Q  345 caccgctcatcgtcactactcacccacaaagaaca-ccctcaaaataaaactcccagaccccaacacc 411  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| |||||||||| || |||||||    
T  16952222 caccactcatcgtcactactcacccccaaagaacacccctctaaatgaaactcccagtcctcaacacc 16952289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 345 - 411
Target Start/End: Original strand, 17022887 - 17022954
Alignment:
Q  345 caccgctcatcgtcactactcacccacaaagaaca-ccctcaaaataaaactcccagaccccaacacc 411  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| |||||||||| || |||||||    
T  17022887 caccactcatcgtcactactcacccccaaagaacacccctctaaatgaaactcccagtcctcaacacc 17022954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 345 - 411
Target Start/End: Original strand, 17060193 - 17060260
Alignment:
Q  345 caccgctcatcgtcactactcacccacaaagaaca-ccctcaaaataaaactcccagaccccaacacc 411  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| |||||||||| || |||||||    
T  17060193 caccactcatcgtcactactcacccccaaagaacacccctctaaatgaaactcccagtcctcaacacc 17060260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 426
Target Start/End: Original strand, 10173418 - 10173499
Alignment:
Q  345 caccgctcatcgtcactactcacccacaaagaacac-cctcaaaataaaactcccagaccccaacacccaagctaagccacat 426  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||| |||||| ||| || ||||||| ||||| ||||||||    
T  10173418 caccactcatcgtcactactcaccc-caaagaatactcctcaaaattaaactctcagtcctcaacaccaaagctgagccacat 10173499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 356 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 14405431 - 14405370
Alignment:
Q  356 gtcactactcacccacaaa-gaaca-ccctcaaaataaaactcccagaccccaacacccaag 415  Q
    |||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  14405431 gtcactactcacccccaaaagaacatccctcaaaataaaactcccagacttcaacacccaag 14405370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 227 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 15457307 - 15457278
Alignment:
Q  227 tgccgcatatagacggtacaccataaccac 256  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15457307 tgccgcatatagacggtacaccataaccac 15457278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 252 - 308
Target Start/End: Original strand, 25281085 - 25281141
Alignment:
Q  252 accacctaaaaacacccctgaagataaacccaccaaagcacatcaccacctaaaaca 308  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||  |||||| ||| |||||||||||||||    
T  25281085 accacctaaaaacaccctcgaaaataaactaaccaaaacacgtcaccacctaaaaca 25281141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 235; Significance: 1e-130; HSPs: 13)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 157 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 18593676 - 18593350
Alignment:
Q  157 tgaatcggcaaatattattaaacgccatcctcgcaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccac 256  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18593676 tgaatcggcaaatattattaaacgtcatccccgcaagatgcaaggtatggacgaaacaagataaatatggtgccgcatatagacggtacaccataaccac 18593577  T
Q  257 ctaaaaacacccctgaagataaacccaccaaagcacatcaccacctaaaacaaactcc-aaagaacaagcactgtaaacacggtat-caccaccgctcat 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  18593576 ctaaaaacacccctgaagataaacccgccaaaacacatcaccacctaacacaaactccaaaaaaacaagcactgtaaacacggtatccaccaccgcccat 18593477  T
Q  355 cgtcactactcacccacaaagaacaccctcaaaataaaactcccagaccccaacacccaagctaagccacatttcgaagagcacctaaccgaaggatcat 454  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18593476 cgtcactactcacccacaaagaacatcctccaaataaaactcccagaccccaacacccaagttgagccacatttcgaagaacacctaaccgaaggatcat 18593377  T
Q  455 gcagctatcacaaacctcacaacctcc 481  Q
    ||| |||||||||| ||| | ||||||    
T  18593376 gcacctatcacaaatctcgcgacctcc 18593350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 159 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 34378531 - 34378205
Alignment:
Q  159 aatcggcaaatattattaaacgccatcctcgcaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacct 258  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  34378531 aatcgacaaatattattaaacgccatctccgcaagacgcaaggcatggacgagacgagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccatct 34378432  T
Q  259 aaaaacacccctgaagataaacccaccaaagcacatcaccacctaaaacaaact----ccaaagaacaagcactgtaaacacggtat-caccaccgctca 353  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||      ||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||  ||    
T  34378431 aaaaacacccctgaagataaacccacaaaaacacatcaccacctaaaacaaactaaaaaaaaaaaacaagca-tgtaaacacggtatccaccaccgtcca 34378333  T
Q  354 tcgtcactactcacccacaaagaacaccctcaaaataaaactcccagaccccaacacccaagctaagccacatttcgaagagcacctaaccgaaggatca 453  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  34378332 tcgtcactactcacccacaaagaacaccctcaaaataaaactctcaaaccccaacacccaagctgagccacattacgaagagcatctaaccgaaggatca 34378233  T
Q  454 tgcagctatcacaaacctcacaacctcc 481  Q
      || |||||||||||||| | ||||||    
T  34378232 aacaactatcacaaacctcgcgacctcc 34378205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 159 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 698799 - 698469
Alignment:
Q  159 aatcggcaaatattattaaacgccatcctcgcaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacct 258  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||   |||||||| |||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  698799 aatcagcaaatattattaaacgacatctctgcaagacgtaaggtatggatgaaatatgatacaaatggtgccgcatatagacggtacactataaccacct 698700  T
Q  259 aaaaacacccctgaagataaacccaccaaagcacatcaccacct--------aaaacaaactccaaagaa-caagcactgtaaacacggtatc-accacc 348  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| |        ||||||||||||||| || | | |||||||||  ||||||| |||| |    
T  698699 aaaaacacccttgaagataaacctaccaaaccacatcaccacatcaccacttaaaacaaactccaaaaaaaccaacactgtaaat-cggtatccaccatc 698601  T
Q  349 gctcatcgtcactactcacccacaaagaacaccctcaaaataaaactcccagaccccaacacccaagctaagccacatttcgaagagcacctaaccgaag 448  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  698600 gccgatcgtcactactcacccacaaagaacaccctccaaataaaactctcagaccccaacacccaagctgagccacatttcaaagagcacctaaccgaag 698501  T
Q  449 gatcatgcagctatcacaaacctcacaacctc 480  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  698500 gattatgcagctatcacaaacctcgcaacctc 698469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 168; E-Value: 8e-90
Query Start/End: Original strand, 157 - 460
Target Start/End: Original strand, 7161661 - 7161969
Alignment:
Q  157 tgaatcggcaaatattattaaacgccatcctcgcaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccac 256  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||    
T  7161661 tgaatcggcaaatattattaaacgtcttccccacaagacgcaagatatggacgaaataagatacaaatagtgtagcatatagacggtacaccataatcac 7161760  T
Q  257 ctaaaaacacccctgaagataaacccaccaaagcacatcaccacctaaaacaaactcc----aaagaacaagcactgtaaacacggtat-caccaccgct 351  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||     || ||||||||||||||||||| | | ||||||| |     
T  7161761 ctaaaaacacccctgaatataaacccaccaaaacacatcactacctaaaacagactccttcacaaaaacaagcactgtaaacacgatttccaccaccacc 7161860  T
Q  352 catcgtcactactcacccacaaagaacaccctcaaaataaaactcccagaccccaacacccaagctaagccacatttcgaagagcacctaaccgaaggat 451  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||    
T  7161861 caacgtcactactcacccccaaagaacaccatcaaaataaaactcccagaccccaacacacaagctgagccacatatcgaagaacacctgaccaaaggat 7161960  T
Q  452 catgcagct 460  Q
    |||||||||    
T  7161961 catgcagct 7161969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 196 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 29087873 - 29087608
Alignment:
Q  196 gcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacctaaaaacacccctgaagataaacccaccaaagcacatc 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29087873 gcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacatcataaccacctaaaaacaaccctgaagataaacccaccaaaacacatc 29087774  T
Q  296 accacctaaaacaaactcc-aaagaacaagcactgtaaacacggta-tcaccaccgctcatcgtcactactcacccacaaagaacaccctcaaaataaaa 393  Q
    | ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||     
T  29087773 agcacctaaaacagactccaaaaaaacaagcactgtaaacacggtattcaccaccgcccatcgtcactactcacccctaaagaa-accctcaaaataaag 29087675  T
Q  394 ctcccagaccccaacacccaagctaagccacatttcgaagagcacctaaccgaaggatcatgcagcta 461  Q
    |||||||||||||||| | ||| | ||||||| | |||||||||||| ||| |||||||||| |||||    
T  29087674 ctcccagaccccaacatctaagttgagccaca-tacgaagagcacctgaccaaaggatcatggagcta 29087608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 159 - 472
Target Start/End: Original strand, 18313303 - 18313607
Alignment:
Q  159 aatcggcaaatattattaaacgccatcctcgcaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacct 258  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||| |  | ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||             
T  18313303 aatcggtaaatattattaaacgtcattcctgtaagacgcaaggtatggatgaaacaagatgcaaatggtgccgcatatagacggtacacca--------- 18313393  T
Q  259 aaaaacacccctgaagataaacccaccaaagcacatcaccacctaaaacaaactccaaagaa-caagcactgtaaacacggtatc-accaccgctcatcg 356  Q
     |||||||||  | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||| ||||||||| |||| | |||| |||||||    
T  18313394 -aaaacaccctcggagataaacccaccaaaacacatcaccacctaaaacagactccaaaaaaacaaacaccgtaaacacgatatccatcaccactcatcg 18313492  T
Q  357 tcactactcacccacaaagaacaccctcaaaataaaactcccagaccccaacacccaagctaagccacatttcgaagagcacctaaccgaaggatcatgc 456  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| || | |||||||| | | || || |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  18313493 tcactactcacccatgaagaacaccctaaaga-aaaactccaaaatcctaaaacccaaactaagccacatttcgaagagcacctaaacgaatgatcatgc 18313591  T
Q  457 agctatcacaaacctc 472  Q
    ||||||||||||||||    
T  18313592 agctatcacaaacctc 18313607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 166 - 307
Target Start/End: Original strand, 5656749 - 5656890
Alignment:
Q  166 aaatattattaaacgccatcctcgcaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacctaaaaaca 265  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  5656749 aaatattattaaacgccatcaccgcaagacgcaaggtatgaacgaaataagatacaaatgatgccgcatatagacggtacatgataaccacctaaaaaca 5656848  T
Q  266 cccctgaagataaacccaccaaagcacatcaccacctaaaac 307  Q
    | ||| |||||||| |||||||| |||  |||||||||||||    
T  5656849 caccttaagataaatccaccaaaacacgccaccacctaaaac 5656890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 159 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 7453020 - 7452895
Alignment:
Q  159 aatcggcaaatattattaaacgccatcctcgcaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacct 258  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7453020 aatcggcaaatattattaaacatcatccatgcaagacgcaaggtatggacaaatcaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacct 7452921  T
Q  259 aaaaacacccctgaagataaacccac 284  Q
    ||||||||  ||| |||| |||||||    
T  7452920 aaaaacacatctggagattaacccac 7452895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 157 - 252
Target Start/End: Original strand, 18255097 - 18255192
Alignment:
Q  157 tgaatcggcaaatattattaaacgccatcctcgcaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataa 252  Q
    |||||||||||||||| |||||||  |||| || |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  18255097 tgaatcggcaaatattgttaaacgttatccccgtaagatgcagggtatagacgaaacaagatacaaatagtgccgcatatagacggtacatcataa 18255192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 210 - 261
Target Start/End: Original strand, 41250893 - 41250944
Alignment:
Q  210 aaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacctaaa 261  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41250893 aaacaagatataaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacgtaaa 41250944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 279 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 7451684 - 7451620
Alignment:
Q  279 acccaccaaagcacatcaccacctaaaacaaactcc-aaagaacaagcactgtaaacacggtatc 342  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  7451684 acccaccaaaatacatcaccacctaacacaaactccaaaaaaacaagcactgcaaacacggtatc 7451620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 275 - 332
Target Start/End: Original strand, 18255189 - 18255246
Alignment:
Q  275 ataaacccaccaaagcacatcaccacctaaaacaaactccaaagaacaagcactgtaa 332  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  18255189 ataaatccaccaaaacacatctccacctaaaacagactcaaaaaaacaagcactgtaa 18255246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 157 - 199
Target Start/End: Original strand, 41250852 - 41250894
Alignment:
Q  157 tgaatcggcaaatattattaaacgccatcctcgcaagacgcaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||    
T  41250852 tgaatcggcaaatattattaaacatcatcctcgcaaaacgcaa 41250894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 232; Significance: 1e-128; HSPs: 28)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 157 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 47236132 - 47235814
Alignment:
Q  157 tgaatcggcaaatattattaaacgccatcctcgcaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccac 256  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  47236132 tgaatcagcaaatattattaaacgccatccctgcaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtataccataaccat 47236033  T
Q  257 ctaaaaacacccctgaagataaacccaccaaagcacatcaccacctaaaacaaact--ccaaagaacaagcactgtaaacacggtat-caccaccgctca 353  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||    
T  47236032 ctaaaaacacccctggagataaacccaccaaaatacatcaccacctaaaacagacttaaaaaaaaacaagcactgtaaacacggtatccaccaccgtcca 47235933  T
Q  354 tcgtcactactcacccacaaagaacaccctcaaaataaaactcccagaccccaacacccaagctaagccacatttcgaagagcacctaaccgaaggatca 453  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47235932 tcgtcactactcacccacaaagaacaccctcaaaataaaactcgcagaccccaacacccaagctgaaccacatttcgaagagcacctaaccgaaggatca 47235833  T
Q  454 tgcagctatcacaaacctc 472  Q
    |||||||||||||||||||    
T  47235832 tgcagctatcacaaacctc 47235814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 159 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 45164285 - 45163974
Alignment:
Q  159 aatcggcaaatattattaaacgccatcctcgcaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacct 258  Q
    |||||||||||||||||||||   |||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45164285 aatcggcaaatattattaaacattatccccgcaagatgcaaggtatggactaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacct 45164186  T
Q  259 aaaaacacccctgaagataaacccaccaaagcacatcaccacctaaaacaaactccaaagaa-caagcactgtaaacacggtat-caccaccgctcatcg 356  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| |||||||||||||| || |||||| |||||    
T  45164185 aaaaacaccc-tggagataaacccaccaaaacacatcaccacctaaaatagactccaaagaaacaagcattgtaaacacggtattcatcaccgcccatcg 45164087  T
Q  357 tcactactcacccacaaagaacaccctcaaaataaaactcccagaccccaacacccaagctaagccacatttcgaagagcacctaaccgaaggatcatgc 456  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45164086 tcactaatcacctacaaataacaccctcaaaataaaactcctagaccccaacacccaagctaagccacatttcgaagagcacctaaccgaaggatcatgc 45163987  T
Q  457 agctatcacaaac 469  Q
    |||||||||||||    
T  45163986 agctatcacaaac 45163974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 157 - 483
Target Start/End: Original strand, 34475405 - 34475730
Alignment:
Q  157 tgaatcggcaaatattattaaacgccatcctcgcaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccac 256  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  34475405 tgaatcggcacatattattaaacgtcatccccgcaagacgcagggtatgaacgaaacaagatacaaatggtgccccatatagacggtataccataaccac 34475504  T
Q  257 ctaaaaacacccctgaagataaacccaccaaagcacatcaccacctaaaacaaactccaaagaacaagcactgtaaacacggtat-caccaccgctcatc 355  Q
    |||| |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  34475505 ctaagaacacccctggagataaactcaccaaaacacatcaccacctaaaacagactccaaaaaacaagcaatgtaaacacggtatccaccaccgcccatc 34475604  T
Q  356 gtcactactcacccacaaagaacaccctcaaaataaaactcccagaccccaacacccaagctaagccacatttcgaagagcacctaaccgaaggatcatg 455  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  34475605 gtcactactcacccacaaagaacacccttaaa--aaaactctcataccccaacacctaagctgagtcacatttcgaagagcacctaaccgaaggatcata 34475702  T
Q  456 cagctatcacaaacctcacaacctccaa 483  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||    
T  34475703 cagctatcacaaacctcgcgacctccaa 34475730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 157 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 31483314 - 31482989
Alignment:
Q  157 tgaatcggcaaatattattaaacgccatcctcgcaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccac 256  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31483314 tgaatcggcaaatattattaaacaccatccccacaagacgcaaggtatgaacaaaacaagatacaaatggtgctgcatatagacggtacaccataaccac 31483215  T
Q  257 ctaaaaacacccctgaagataaacccaccaaagcacatcaccacctaaaacaaactccaaagaacaagcactgtaaacacggtat-caccaccgctcatc 355  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||| | |||||    
T  31483214 ctaaaaacacccctggagataaactcaccaaaacacatcaccgcctaaaacaaactccaaa-aaaaagcaatgtaaacatggtatccaccactgttcatc 31483116  T
Q  356 gtcactactcacccacaaagaacaccctcaaaataaaactcccagaccccaacacccaagctaagccacatttcgaagagcacctaaccgaaggatcatg 455  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31483115 gtcactactaacccacaaagaacacccttaaaa-aaaactctcaaaccccaacacctaagctgagccacatttcgaagagcacctaaccgaaggatcatg 31483017  T
Q  456 cagctatcacaaacctcacaacctccaa 483  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||    
T  31483016 cagctatcacaaacctcgcgacctccaa 31482989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 159 - 481
Target Start/End: Original strand, 2392152 - 2392480
Alignment:
Q  159 aatcggcaaatattattaaacgccatcctcgcaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacct 258  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2392152 aatcggaaaatattattaaacgtcatccccgcaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacct 2392251  T
Q  259 aaaaacacccctgaagataaacccaccaaagcacatcaccacctaaaacaaact-----ccaaagaacaagcactgtaaacacggtat-caccaccgctc 352  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| | |||       ||| || |||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  2392252 aaaaacacccctgaaaataaacccaccaaaacacatcaccgcctaaaatagactaaaaaaaaaaaaaaaagcactgtaaacacggtatccaccaccgccc 2392351  T
Q  353 atcgtcactactcacccacaaagaacaccctcaaaataaaactcccagaccccaacacccaagctaagccacatttcgaagagcacctaaccgaaggatc 452  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||||||    
T  2392352 atcgtcactactcacccacaaataacacctacaaaataaaactcctagaccccaacacccaagctgagccacattttgaagagatcctaaccgaaggatc 2392451  T
Q  453 atgcagctatcacaaacctcacaacctcc 481  Q
    ||||||||| |||||||||| | ||||||    
T  2392452 atgcagctagcacaaacctcgcgacctcc 2392480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 159 - 481
Target Start/End: Original strand, 2393915 - 2394244
Alignment:
Q  159 aatcggcaaatattattaaacgccatcctcgcaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacct 258  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2393915 aatcggaaaatattattaaacgtcatccccgcaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacct 2394014  T
Q  259 aaaaacacccctgaagataaacccaccaaagcacatcaccacctaaaacaaact------ccaaagaacaagcactgtaaacacggtat-caccaccgct 351  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| | |||        ||| || |||||||||||||||||||| |||||||||     
T  2394015 aaaaacacccctgaaaataaacccaccaaaacacatcaccgcctaaaatagactaaaaaaaaaaaaaaaaagcactgtaaacacggtatccaccaccgcc 2394114  T
Q  352 catcgtcactactcacccacaaagaacaccctcaaaataaaactcccagaccccaacacccaagctaagccacatttcgaagagcacctaaccgaaggat 451  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||||    
T  2394115 catcgtcactactcacccacaaataacacctacaaaataaaactcctagaccccaacacccaagctgagccacattttgaagagatcctaaccgaaggat 2394214  T
Q  452 catgcagctatcacaaacctcacaacctcc 481  Q
    |||||||||| |||||||||| | ||||||    
T  2394215 catgcagctagcacaaacctcgcgacctcc 2394244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 159 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 53248332 - 53248005
Alignment:
Q  159 aatcggcaaatattattaaacgccatcctcgcaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacct 258  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||| |||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||   |||||||||||||| ||    
T  53248332 aatcgacaaatattattaaacgtcatccccgcaaggcgtaaggtatggacaaaacaagatacaaatggtgtcgcatataggttgtacaccataaccatct 53248233  T
Q  259 aaaaacacccctgaagataaacccaccaaagcacatcaccacctaaaacaaactcc-aaagaacaagcactgtaaacacggt-atcaccaccgctcatcg 356  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  53248232 aaaaacaaccctgaagataaccccacaaaaacacatcaccacctaaaacagactccaaaaaaacaagcactgtaaacacggtaaccaccaccgcccatcg 53248133  T
Q  357 tcactactcacccacaaagaacaccctcaaaat-aaaactcccagaccccaacacccaagctaagccacatttcgaagagcacctaaccgaaggatcatg 455  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  53248132 tcactactcacccacaaagaacactctcaaaataaaaactctcagaccccaacacccaaactgagccacatttcgaagagcacataaccgaaggatcata 53248033  T
Q  456 cagctatcacaaacctcacaacctccaa 483  Q
    || |||||||||||||| | ||||||||    
T  53248032 caactatcacaaacctcgcgacctccaa 53248005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 173; E-Value: 8e-93
Query Start/End: Original strand, 159 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 19176938 - 19176630
Alignment:
Q  159 aatcggcaaatattattaaacgccatcctcgcaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacct 258  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19176938 aatcggcaaatattattaaacgtcattcctgcaagacgcaaagtatggacgaaacatgatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataacgacct 19176839  T
Q  259 aaaaacacccctgaagataaacccaccaaagcacatcaccacctaaaacaaactcc----aaagaacaagcactgtaaacacggtat-caccaccgctca 353  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||    ||| ||||||||| |||||||| |||| |||||||   ||    
T  19176838 aaaaatacccctgaagacaaacccaccaaaacacataaccacctaaaacagactccaaaaaaaaaacaagcacagtaaacacagtatccaccaccatcca 19176739  T
Q  354 tcgtcactactcacccacaaagaacaccctcaaaataaaactcccagaccccaacacccaagctaagccacatttcgaagagcacctaaccg--aaggat 451  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||    
T  19176738 tcgtcactactcacccctaaagaacaccctcaaaataaaacacccagaccccgacacccaagctgagccacattacgaagagcacctgaccgaaaaggat 19176639  T
Q  452 catgcagct 460  Q
    |||||||||    
T  19176638 catgcagct 19176630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 171 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 43012796 - 43012506
Alignment:
Q  171 ttattaaacgccatcctcgcaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacctaaaaacacccct 270  Q
    |||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  43012796 ttattaaatgtcatcct-gcaagacgcaaggtatgaacgaaacaatatacaaatggtgccgcatatagacgatacaccataaccacctaaaaacactcct 43012698  T
Q  271 gaagataaacccaccaaagcacatcaccacctaaaacaaactcc----aaagaacaagcactgtaaacacggtat-caccaccgctcatcgtcactactc 365  Q
    ||||| ||||||||||||  ||||||||| |||||||| |||||     || |||||||| |||||||||||||| |||| |||  ||||| ||||||||    
T  43012697 gaagaaaaacccaccaaaagacatcaccatctaaaacagactccttcacaaaaacaagcattgtaaacacggtatccacccccgtccatcgccactactc 43012598  T
Q  366 acccacaaagaacaccctcaaaataaaactcccagaccccaacacccaagctaagccacatttcgaagagcacctaaccgaaggatcatgca 457  Q
    |||  ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  43012597 acctccaaagaacaccctcaaattaaaactcctagaccccaacacccaagctgagccacatttcgaagagcacctgaccgaacgatcatgca 43012506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 166 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 17551382 - 17551064
Alignment:
Q  166 aaatattattaaacgccatcctcgcaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacctaaaaaca 265  Q
    |||||||||||||||  ||||  |||||| ||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17551382 aaatattattaaacgttatccctgcaagatgcagggtatgaacgaaacaaaatacaaatggtgccgcatatagactgtacaccataaccacctaaaaaca 17551283  T
Q  266 cccctgaagataaacccaccaaagcacatcaccacctaaaacaaactccaaagaa-------caagcactgtaaacacggtatc-accaccgctcatcgt 357  Q
    || ||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| | |||  ||| ||       |||||| |  ||||| |||| | |||||||| ||||||    
T  17551282 cctctgaaaaaaaacccaccaaaacacatcaccacctaaaagagactaaaaaaaaaaaaaaacaagcattacaaacaaggtaaccaccaccgcccatcgt 17551183  T
Q  358 cactactcacccacaaagaacaccctcaaaataaaactcccagaccccaacacccaagctaagccacatttcgaagagcacctaaccgaaggatcatgca 457  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||     ||||||||    
T  17551182 cactactcaccgacaaagaacaccctcaaaataaaactctcagaccccaacacccaaactgagccacatttcgaagagcacctaacc-----atcatgca 17551088  T
Q  458 gctatcacaaacctcacaacctcc 481  Q
    ||||||||||||||| | ||||||    
T  17551087 gctatcacaaacctcgcgacctcc 17551064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 167 - 452
Target Start/End: Original strand, 9583710 - 9583999
Alignment:
Q  167 aatattattaaacgccatcctcgcaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacctaaaaacac 266  Q
    |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  9583710 aatattattaaacgccatctccgtaagacacaaggtatagacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacgatacaccataaccacctaaaaatac 9583809  T
Q  267 ccctgaagataaacccaccaaagcacatcaccacctaaaacaaactcc----aaagaacaagcactgtaaacacggtat-caccaccgctcatcgtcact 361  Q
    || |||| |||||||||||||| |||||||||||  |||  | |||||    ||| ||||||||| ||||||||| ||| |||||||||  |||||||||    
T  9583810 ccttgaaaataaacccaccaaaacacatcaccacaaaaattagactccttcaaaaaaacaagcaccgtaaacacgatatccaccaccgcctatcgtcact 9583909  T
Q  362 actcacccacaaagaacaccctcaaaataaaactcccagaccccaacacccaagctaagccacatttcgaagagcacctaaccgaaggatc 452  Q
    ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| |||||||||| ||| |||||||||||    
T  9583910 actca-ccgcaaagaacatcctcaaaataaaactcccagaccccaaaacccaagcagagccacaattcgaagagcgcctgaccgaaggatc 9583999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 188 - 427
Target Start/End: Original strand, 30352117 - 30352359
Alignment:
Q  188 cgcaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacctaaaaacacccctgaagataaacccaccaa 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30352117 cgcaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagaaggtacaccataaccacctaaaaacacccctgaagataagcccaccaa 30352216  T
Q  288 agcacatcaccac--ctaaaacaaact--ccaaagaacaagcactgtaaacacggtat-caccaccgctcatcgtcactactcacccacaaagaacaccc 382  Q
    | |||||||||||  |  ||| | |||    ||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30352217 aacacatcaccaccacctaaagagactaaaaaaaaaacaagtactgtaaacacggtatccaccaccacccatcgtcactactcatccacaaagaacaccc 30352316  T
Q  383 tcaaaataaaactcccagaccccaacacccaagctaagccacatt 427  Q
    |  ||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30352317 t--aaaaaaaactccgagaccccaacacccaagctgagccacatt 30352359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 165 - 460
Target Start/End: Original strand, 40023224 - 40023525
Alignment:
Q  165 caaatattattaaacgccatcctcgcaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacctaaaaac 264  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||     
T  40023224 caaatattattaaacatcatccccgcaagacgcattgtatggacgaaacaagatacaaatgatgccgcatatagacggtacaccataaccaccaaacaaa 40023323  T
Q  265 acccctgaagataaacccaccaaagcacatcaccacctaaaacaaactcc---aaagaa--caagcactgtaaacacggtat-caccaccgctcatcgtc 358  Q
     |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| || ||   | ||||   || ||||||||||||||||| ||| |||   |||||||    
T  40023324 gcccctgaagataaacccatcaaaacacatcaccacctaagacagacaccttaacagaaacaaaacactgtaaacacggtatccacaaccatccatcgtc 40023423  T
Q  359 actactcacccacaaagaac-accctcaaaataaaactcccagaccccaacacccaagctaagccacatttcgaagagcacctaaccgaaggatcatgca 457  Q
    |||||||| ||  |||||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||| |||||| ||| |||||||||| || ||||||    
T  40023424 actactcatcccaaaagaacgcccctcaaaataaaactcccagactacaacaccctagctgagccaca-ttcgaaaagctcctaaccgaatgaacatgca 40023522  T
Q  458 gct 460  Q
    |||    
T  40023523 gct 40023525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 319 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 20612052 - 20611890
Alignment:
Q  319 aacaagcactgtaaacacggtatc-accaccgctcatcgtcactactcacccacaaagaacaccctcaaaataaaactcccagaccccaacacccaagct 417  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  20612052 aacaagcactgtaaacacagtatccaccatcgcccatcgtcactactcacccacaaagaacaccctcagaataaaactcctagaccc-aacacccaagct 20611954  T
Q  418 aagccacatttcgaagagcacctaaccgaaggatcatgcagctatcacaaacctcacaacctcc 481  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||    
T  20611953 gagtcacatttcgaagagcacctaaccgaaggatcattcagctatcacaaacctcgcgacctcc 20611890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 159 - 447
Target Start/End: Original strand, 23327997 - 23328290
Alignment:
Q  159 aatcggcaaatattattaaacgccatcctcgcaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacct 258  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  23327997 aatcagcaaatattattaaacgctatccctgcaatacgcaaggtatggacgaaacaagatataaatggtgccgcatatatacggtacaccataaccacca 23328096  T
Q  259 aaaaacacccctgaagataaacccaccaaagcacatcaccacctaaaac-aaactccaaa---gaacaagcactgtaaacacggtat-caccaccgctca 353  Q
    || ||  ||| ||| ||||||||||| |||  | |||||||||||| ||  | |||  ||    ||||| |||||||| |||  ||| ||| ||| | ||    
T  23328097 aacaaagcccttgaggataaacccacgaaaatatatcaccacctaagacggacctcttaacagaaacaaacactgtaagcacaatatccacaaccaccca 23328196  T
Q  354 tcgtcactactcacccacaaagaacacc-ctcaaaataaaactcccagaccccaacacccaagctaagccacatttcgaagagcacctaaccgaa 447  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  23328197 tcgtcactactcacccccaaagaacaccactcaaaataaaactcccagacttcaacacccaagctgagccaca-ttcgaaaagctcctaaccgaa 23328290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 157 - 304
Target Start/End: Original strand, 50305221 - 50305368
Alignment:
Q  157 tgaatcggcaaatattattaaacgccatcctcgcaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccac 256  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  50305221 tgaatcagcaaatattattaaacgccattcccgcaagacgcaaggtatggacggaacaagatacaaatggtgtcgcatatagacggtacaccataaccat 50305320  T
Q  257 ctaaaaacacccctgaagataaacccaccaaagcacatcaccacctaa 304  Q
    | || ||  ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  50305321 caaataaagcccctgaagataaacccaccaaaacactacaccacctaa 50305368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 159 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 21343779 - 21343635
Alignment:
Q  159 aatcggcaaatattattaaacgccatcctcgcaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacct 258  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21343779 aatcgacaaatattattaaacgtcatcccggcaagacacaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacatcataaccacct 21343680  T
Q  259 aaaaacacccctgaagataaacccaccaaagcacatcaccacctaa 304  Q
    || |   ||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  21343679 aacatggcccgtgaagat-aacccaccaaaacacatcaccacctaa 21343635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 161 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 37158735 - 37158618
Alignment:
Q  161 tcggcaaatattattaaacgccatcctcgcaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatat-agacggt-acaccataaccacct 258  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | ||| |||| ||||||||||    
T  37158735 tcggcaaatattat-aaacgccatccccgcaagacgcaaggtatggacgaaacaggatacaaatggtgccgcatataatatggtaacactataaccacct 37158637  T
Q  259 aaaaacacccctgaagata 277  Q
    |||||||||||||||||||    
T  37158636 aaaaacacccctgaagata 37158618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 165 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 50560070 - 50559959
Alignment:
Q  165 caaatattattaaacgccatcctcgcaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacctaaaaac 264  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||     
T  50560070 caaatattattaaacgtcatcctcgcaatacgcaagatatggacgaaacaagatacaaaagatgccgcacatagacggtgcaccataaccaccaaacaaa 50559971  T
Q  265 acccctgaagat 276  Q
    |||| |||||||    
T  50559970 acccatgaagat 50559959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 159 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 45399217 - 45399119
Alignment:
Q  159 aatcggcaaatattattaaacgccatcctcgcaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacc 257  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45399217 aatcagcaaatattattaaacgacatctccgaaagacgcgaggtatgaacgaaacaagatacaaacggtgccgcatatagacggtacaccataaccacc 45399119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 159 - 256
Target Start/End: Original strand, 4463734 - 4463831
Alignment:
Q  159 aatcggcaaatattattaaacgccatcctcgcaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccac 256  Q
    |||||||||||||||||||||| || || | |||||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4463734 aatcggcaaatattattaaacgtcaaccccacaagacgcaagacatggacgaaacaacacacaaatggtgccgcatatagacggtgcaccataaccac 4463831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 159 - 254
Target Start/End: Original strand, 25506719 - 25506814
Alignment:
Q  159 aatcggcaaatattattaaacgccatcctcgcaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataacc 254  Q
    ||||| |||||||||||||||  ||||| |||||||| |||| |||  || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25506719 aatcgacaaatattattaaacatcatccccgcaagacccaagatataaacaaaacaatatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataacc 25506814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 157 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 5557013 - 5556918
Alignment:
Q  157 tgaatcggcaaatattattaaacgccatcctcgcaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataa 252  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||   || | || | ||||| || |||||||||||||||||| ||   ||||||||| ||||||||||||    
T  5557013 tgaatcggcaaatattattaaacgtcatttccgtaggatgtaaggtttgaacgaaacaagatacaaatagttatgcatatagatggtacaccataa 5556918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 159 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 47439347 - 47439284
Alignment:
Q  159 aatcggcaaatattattaaacgccatcctcgcaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaa 222  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||   ||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  47439347 aatcggcaaatattactaaacgtcatccctacaagacataaggtatggacgaaacaagatacaa 47439284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 259 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 7105175 - 7105019
Alignment:
Q  259 aaaaacacccctgaagataaacccaccaaagcacatcaccacctaaaacaaactcc----aaagaacaagcactgtaaacacggtatc-accaccgctca 353  Q
    |||||||| || ||||| |||||| ||||| ||  ||||||||||||||| ||| |    | | |||||||||| |||| || ||||| |||||| | ||    
T  7105175 aaaaacacgcccgaagacaaacccgccaaaacatgtcaccacctaaaacagacttcttcaagaaaacaagcactataaaaacagtatccaccaccaccca 7105076  T
Q  354 tcgtcactactcacccacaaag-aaca-ccctcaaaataaaactcccagaccccaaca 409  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| |||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  7105075 tcgtcactactcaccc-caaagaaacaccccttaaaataaaactcccagtccctaaca 7105019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 350 - 426
Target Start/End: Original strand, 39021120 - 39021198
Alignment:
Q  350 ctcatcgtcactactcacccacaaagaa-caccc-tcaaaataaaactcccagaccccaacacccaagctaagccacat 426  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||| ||| | ||||||| |||||| ||| || ||||||| ||||||||||||||    
T  39021120 ctcatcgtcactactcacacccaaagaaacacgcgtcaaaatgaaactctcagtcctcaacaccaaagctaagccacat 39021198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 352 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 45399032 - 45398924
Alignment:
Q  352 catcgtcactactcacccacaaagaaca-ccctcaaaataaaactcccagaccccaacacccaagctaagccacatttcgaagagcacctaaccgaagga 450  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||| ||| ||||||| |||||||| ||  ||||||| ||| |  |||||| |||||| ||| | |||||||| ||    
T  45399032 catcgtcactactcacccccaacgaacaccccacaaaatagaactcccaaacttcaacacctaagttgcgccaca-ttcgaaaagctcataaccgaatga 45398934  T
Q  451 tcatgcagct 460  Q
     |||||||||    
T  45398933 acatgcagct 45398924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 272 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 45399118 - 45399086
Alignment:
Q  272 aagataaacccaccaaagcacatcaccacctaa 304  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  45399118 aagataaacccaccaaaacacatcaccacctaa 45399086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 231; Significance: 1e-127; HSPs: 28)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 159 - 481
Target Start/End: Original strand, 31207011 - 31207336
Alignment:
Q  159 aatcggcaaatattattaaacgccatcctcgcaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacct 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  31207011 aatcggcaaatattattaaacgccatcctcgcaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgtatataaacggtacaccataaccacct 31207110  T
Q  259 aaaaacacccctgaagataaacccaccaaagcacatcaccacctaaaacaaactc--caaagaacaagcactgtaaacacggtat-caccaccgctcatc 355  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||   ||| || ||||||||||||||| |||| ||||| ||| ||||    
T  31207111 aaaaacactcctgaagataaactcaccaaaacacatcaccacctaaaacagactcaaaaaaaaaaaagcactgtaaacacagtatccaccatcgcccatc 31207210  T
Q  356 gtcactactcacccacaaagaacaccctcaaaataaaactcccagaccccaacacccaagctaagccacatttcgaagagcacctaaccgaaggatcatg 455  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  31207211 gtcactactcacccacaaagaacaccctcaaaataaaactcccatactccaacacccaagctgagccacatttcgaagagcacctaaccgaagggtcatt 31207310  T
Q  456 cagctatcacaaacctcacaacctcc 481  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||    
T  31207311 cagctatcacaaacctcgcgacctcc 31207336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 159 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 20138858 - 20138533
Alignment:
Q  159 aatcggcaaatattattaaacgccatcctcgcaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacct 258  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20138858 aatcggtaaatattattaaacgccatccccgcaagacgcaaagtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagatggtacaccataaccacct 20138759  T
Q  259 aaaaacacccctgaagataaacccaccaaagcacatcaccacctaaaacaaactccaaagaa-caagcactgtaaacacggtat-caccaccgctcatcg 356  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||    
T  20138758 aaaaacacccatggagataaacccaccaaaacacatcaccacctaaaacagactccaaaaaatcaagcactgtaaacacggtatccaccaccgtccatcg 20138659  T
Q  357 tcactactcacccacaaagaacaccctc-aaaataaaactcccagaccccaacacccaagctaagccacatttcgaagagcacctaaccgaaggatcatg 455  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20138658 tcactactcacctacaaagaacaccctcaaaaataaaactcccagaccccaacacccaagccgggtcacatttcgaagagcacctaaccgaaggatcatg 20138559  T
Q  456 cagctatcacaaacctcacaacctcc 481  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||    
T  20138558 cagctatcacaaacctcgcgacctcc 20138533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 159 - 472
Target Start/End: Original strand, 24995044 - 24995360
Alignment:
Q  159 aatcggcaaatattattaaacgccatcctcgcaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacct 258  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  24995044 aatcagcaaatattattgaacgccatccccgtaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcttatagacagtacaccataaccacct 24995143  T
Q  259 aaaaacacccctgaagataaacccaccaaagcacatcaccacctaaaacaaactcc-aaagaacaagcactgtaaacacggtat-caccaccgctcatcg 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  24995144 aaaaacacccctgaagataaacccaccaaaacatgtcaccacctaaaacaatctccaaaaaaacaagcattgtaaacacggtatccaccaccgcccatcg 24995243  T
Q  357 tcactactcacccacaaagaacaccctcaaaataaaactcccaga-ccccaacacccaagctaagccacatttcgaagagcacctaaccgaaggatcatg 455  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24995244 tcactactcacgcacaaagaacaccctcaaaataaaactcctagacccccaacacccaagctgagccatatttcgaagagcacctaaccgaaggatcatg 24995343  T
Q  456 cagctatcacaaacctc 472  Q
    |||||||||||||||||    
T  24995344 cagctatcacaaacctc 24995360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 159 - 481
Target Start/End: Original strand, 12897925 - 12898248
Alignment:
Q  159 aatcggcaaatattattaaacgccatcctcgcaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacct 258  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12897925 aatcggcaaatattattaaacgtcatccccgcaagatgcaagatatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccattaccacct 12898024  T
Q  259 aaaaacacccctgaagataaacccaccaaagcacatcaccacctaaaacaaactccaaagaa-caagcactgtaaacacggtatc-accaccgctcatcg 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||| |  || ||||| || ||| || |||| ||||||    
T  12898025 aaaaacacccctgaagataaacccaccaaaacacatcaccacctaaaacaaactccaaaaaaacaatccatgcaaacatggaatccacaaccgttcatcg 12898124  T
Q  357 tcactactcacccacaaagaacaccctcaaaataaaactcccagaccccaacacccaagctaagccacatttcgaagagcacctaaccgaaggatcatgc 456  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12898125 tcactactcacccacaaagaacaccctcaaaataaaactctaagaccccaacacccaagctgagccacatttcgaagagcacctaaccgaaggatca-gc 12898223  T
Q  457 agctatcacaaacctcacaacctcc 481  Q
    |||||||||||||||| | ||||||    
T  12898224 agctatcacaaacctcgcgacctcc 12898248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 163 - 481
Target Start/End: Original strand, 37986508 - 37986832
Alignment:
Q  163 ggcaaatattattaaacgccatcctcgcaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacctaaaa 262  Q
    |||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37986508 ggcaaatattattaaatgtcatccccgcaagacgcaaggcacggacgaaacaagatacaaatggtgctgcatatagacggtacaccataaccacctaaaa 37986607  T
Q  263 acacccctgaagataaacccaccaaagcacatcaccacctaaaacaaactccaaagaa-----caagcactgtaaacacggtatc-accaccgctcatcg 356  Q
    |||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||  ||| ||     |||||| ||||||||||||||| |||||| | |||||    
T  37986608 acacccctaaagataaacccattaaaacacatcaccacctaaaacaaactaaaaaaaaaaaaacaagcattgtaaacacggtatctaccaccacccatcg 37986707  T
Q  357 tcactactcacccacaaagaacaccctcaaaataaaactcccagaccccaacacccaagctaagccacatttcgaagagcacctaaccgaaggatcatgc 456  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  37986708 tcattactcacccacaaagaacaccctccaaataaaactcccagaccgaaacacccaagctgagccacatttcgaagagcacctaaccgaaggatcaggc 37986807  T
Q  457 agctatcacaaacctcacaacctcc 481  Q
    |||||||||||||||| | ||||||    
T  37986808 agctatcacaaacctcgcgacctcc 37986832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 159 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 9519938 - 9519606
Alignment:
Q  159 aatcggcaaatattattaaacgccatcctcgcaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacct 258  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  9519938 aatcgacaaatattattaaacaccatccctacaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacagtacatcataaccacct 9519839  T
Q  259 aaaaacacccctgaagataaacccaccaaagcacatcaccacctaaaacaaactccaaagaacaag--------cactgtaaacacggtatc-accaccg 349  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||| ||| || ||         |||||||||||||||||| |||||||    
T  9519838 aaaaacacccctgatgataaacccaccaaaacacgtcaccacctaaaacaacctcaaaaaaaaaaaaaaaaaatcactgtaaacacggtatccaccaccg 9519739  T
Q  350 ctcatcgtcactactcacccacaaagaacaccctcaaaataaaactcccagacccc-aacacccaagctaagccacatttcgaagagcacctaaccgaag 448  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||     
T  9519738 cccatcgtcactactcacccacaaagaacaccctcaaaataaaactctcagacccccaacacccaagctgagccatatttcgaagagcacctaaccgaat 9519639  T
Q  449 gatcatgcagctatcacaaacctcacaacctcc 481  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  9519638 gatcatgcagctatcacaaacttcgcaacctcc 9519606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 159 - 480
Target Start/End: Original strand, 32065934 - 32066268
Alignment:
Q  159 aatcggcaaatattattaaacgccatcctcgcaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacct 258  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32065934 aatcggcaaatattattaaacgccatcaccgcaagatgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtaca-cataaccacct 32066032  T
Q  259 aaaaacacccctgaagataaacccaccaaagcacatcaccacctaaaacaaactcc-aaagaacaagcactgta------------aacacggtat-cac 344  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | |||||||            ||||| |||| |||    
T  32066033 aaaaacacccctgaagataaacccaccaaaacacatcaccacctaaaacaaactccaaaaaaaccaacactgtatccaccacaaccaacactgtatccac 32066132  T
Q  345 caccgctcatcgtcactactcacccacaaagaacaccctcaaaataaaactcccagaccccaacacccaagctaagccacatttcgaagagcacctaacc 444  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||||||    
T  32066133 caccgcccatcgtcactactcactcacaaagaacaccctccaaataaaactctcagaccccaacacccaagctgaaccacatttcaaagagcatctaacc 32066232  T
Q  445 gaaggatcatgcagctatcacaaacctcacaacctc 480  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32066233 gaatgatcatgcagctatcacaaacctcgcaacctc 32066268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 157 - 471
Target Start/End: Original strand, 41893050 - 41893365
Alignment:
Q  157 tgaatcggcaaatattattaaacgccatcctcgcaagacg---caaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataac 253  Q
    ||||||| |||||||||||||||| | ||| |  |||| |   ||||||||| |||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41893050 tgaatcgacaaatattattaaacgtcgtccccataagatgtcacaaggtatgaacgaaaaaa-atacaaatggtgtcgcatatagacggtacaccataac 41893148  T
Q  254 cacctaaaaacacccctgaagataaacccaccaaagcacatcaccacctaaaacaaactccaaagaacaagcactgtaaacacggtatc-accaccgctc 352  Q
    |||||||||| | ||| || |||||| |||||||| |||||||| |||||||||| |||  ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||  |    
T  41893149 cacctaaaaaaaaccc-gaggataaatccaccaaaacacatcactacctaaaacagactaaaaaaaacaagaactgtaaacacggtatccaccaccgacc 41893247  T
Q  353 atcgtcactactcacccacaaagaacaccctcaaaataaaactcccagaccccaacacccaagctaagccacatttcgaagagcacctaaccgaaggatc 452  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |  ||||||||    
T  41893248 atcgtcactactcacccacaaagaacaccctgaaaatagaactcccagacctcaacacccaagctgagccacatttcgaagagtacct-atagaaggatc 41893346  T
Q  453 atgcagctatcacaaacct 471  Q
    |||||||||||||||||||    
T  41893347 atgcagctatcacaaacct 41893365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 159 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 36631254 - 36630965
Alignment:
Q  159 aatcggcaaatattattaaacgccatcctcgcaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacct 258  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  36631254 aatcggaaaatattattatacgccatccctgcaagacgcaaggtatgaa-gaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataatcacct 36631156  T
Q  259 aaaaacacccctgaagataaacccaccaaagcacatcaccacctaaaacaaactcc-aaagaacaagcactgtaaacacggtat-caccaccgctcatcg 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  36631155 aaaaacacccctgaagataaacccaccaaaacacatcaccacctaaaacagactccaaaaaaacaaacactgtaaacacggtatccaccaccgcccatcg 36631056  T
Q  357 tcactactcacccacaaagaacaccctcaaaataaaactcccagaccccaacacccaagctaagccacatttcgaagagcacctaaccgaaggatcatgc 456  Q
    | ||||||             ||||| |||| |||||| | |||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  36631055 taactact-------------cacccccaaactaaaacacgcagacccccacatccaagttgagccacatttcgaagagcacctgaccgaaggatcatgc 36630969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 214 - 479
Target Start/End: Original strand, 34388711 - 34388977
Alignment:
Q  214 aagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacctaaaaacacccctgaagataaacccaccaaagcacatcaccacctaaaacaaactc 313  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34388711 aagatacaaatagtgctgcatatagacggtacaccataaccacctaaaaacacccgtgaagataaacccagcaaaacacatcaccacctaaaacaaactc 34388810  T
Q  314 caaagaa--caagcactgtaaacacggtat-caccaccgctcatcgtcactactcacccacaaagaacaccctcaaaataaaactcccagaccccaacac 410  Q
    |||| ||   ||||| ||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  34388811 caaaaaaagaaagcaatgtaaacac-gtatccaccaccgcctatcgtcactactcacccacaaagaacaccctcaaaataaaactctcataccccaacac 34388909  T
Q  411 ccaagctaagccacatttcgaagagcacctaaccgaaggatcatgcagctatcacaaacctcacaacct 479  Q
    ||||||| ||||||||   ||||| |||||||| |||||||||   |||||||||||||||||| ||||    
T  34388910 ccaagctgagccacatgatgaagaacacctaactgaaggatca-ctagctatcacaaacctcacgacct 34388977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 159 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 22774053 - 22773815
Alignment:
Q  159 aatcggcaaatattattaaacgccatcctcgcaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacct 258  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22774053 aatcggcaaatattattaaacgccatccccgcaagacgcaaggtatggacgaaactagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccatct 22773954  T
Q  259 aaaaacacccctgaagataaacccaccaaagcacatcaccacctaaaacaaactc--------caaagaacaagcactgtaaacacggt-atcaccaccg 349  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||         ||| |||||||| |||||||| ||| | |||||| |    
T  22773953 aaaaacaccagtgaagataaacccaccaaaacatatcaccacctaaaacaaattcaaaaaaaaaaaaaaacaagcattgtaaacatggtaaccaccactg 22773854  T
Q  350 ctcatcgtcactactcacccacaaagaacaccctcaaaa 388  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22773853 cccatcgtcactactcacccacaaagaacaccctcaaaa 22773815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 163 - 474
Target Start/End: Original strand, 16457128 - 16457428
Alignment:
Q  163 ggcaaatattattaaacgccatcctcgcaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacctaaaa 262  Q
    |||||||||||||||||| |||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16457128 ggcaaatattattaaacgtcatccctgcaagacgtaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccacatatagacggtacaccataaccacctaaaa 16457227  T
Q  263 acacccctgaagataaacccaccaaagcacatcaccacctaaaacaa-act--ccaaagaacaagcactgtaaacacggtat-caccaccgctcatcgtc 358  Q
    | | || ||| ||||| | ||||||| ||||||||||||||||| || |||    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||    
T  16457228 a-atccttgaggataatcgcaccaaaacacatcaccacctaaaaaaagactaaaaaaaaaacaagcactgtaaacacggtatccaccaccgtccatcgtc 16457326  T
Q  359 actactcacccacaaagaacaccctcaaaataaaactcccagaccccaacacccaagctaagccacatttcgaagagcacctaaccgaaggatcatgcag 458  Q
    |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||              |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  | ||||||||||    
T  16457327 actactcacccataaagaccaccctgaaaataaaact--------------cccaagctgagccacatttcaaagagcacctaaccacaagatcatgcag 16457412  T
Q  459 ctatcacaaacctcac 474  Q
    ||||||||||||||||    
T  16457413 ctatcacaaacctcac 16457428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 190 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 27889247 - 27889105
Alignment:
Q  190 caagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacctaaaaacacccctgaagataaacccaccaaag 289  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  27889247 caagacgcaaggtattgacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagactgtacaccataaccacctaaaaacacccctggagataaacccaccaaaa 27889148  T
Q  290 cacatcaccacctaaaacaaactccaaagaacaagcactgtaa 332  Q
    ||||||||||||||||||| |||  ||| | ||||||||||||    
T  27889147 cacatcaccacctaaaacagactaaaaaaaccaagcactgtaa 27889105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 190 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 27947905 - 27947763
Alignment:
Q  190 caagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacctaaaaacacccctgaagataaacccaccaaag 289  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  27947905 caagacgcaaggtattgacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagactgtacaccataaccacctaaaaacacccctggagataaacccaccaaaa 27947806  T
Q  290 cacatcaccacctaaaacaaactccaaagaacaagcactgtaa 332  Q
    ||||||||||||||||||| |||  ||| | ||||||||||||    
T  27947805 cacatcaccacctaaaacagactaaaaaaaccaagcactgtaa 27947763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 157 - 444
Target Start/End: Original strand, 15821024 - 15821316
Alignment:
Q  157 tgaatcggcaaatattattaaacgccatcctcgcaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccac 256  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15821024 tgaatcagcaaatattattaaacgtcatcct-gcaagacgcaaggtatggacggaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtataccataaccac 15821122  T
Q  257 ctaaaaacacccctgaagataaacccaccaaagcacatcaccacctaaaacaaactcc---aaagaa--caagcactgtaaacacggtat-caccaccgc 350  Q
    | || || ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| || ||   | ||||   || ||  ||||||||   || ||| ||| |    
T  15821123 caaataaaacccctgaagataaaaccaccaaaacacatcaccacctaagacagacaccttaacagaaacaaaacaaggtaaacacaaaatccacaaccac 15821222  T
Q  351 tcatcgtcactactcacccacaaagaacac-cctcaaaataaaactcccagaccccaacacccaagctaagccacatttcgaagagcacctaacc 444  Q
    |||||| |||||||||| |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| || |||| ||||||| |||||| ||| |||||||    
T  15821223 tcatcgccactactcactccaaaagaacactcctcaaaataaaactcccagacttcaacatccgagctgagccaca-ttcgaaaagctcctaacc 15821316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 162 - 382
Target Start/End: Original strand, 35815896 - 35816121
Alignment:
Q  162 cggcaaatattattaaacgccatcctcgcaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacctaaa 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||     
T  35815896 cggcaaatattattaaacgccatcctcgcaaaacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccacatatagacggtacaccataacccccaaac 35815995  T
Q  262 aacacccctgaagataaacccaccaaagcacatcaccacctaaaacaaactcc---aaag-aacaagcactgtaaacacggtat-caccaccgctcatcg 356  Q
    ||  ||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||| ||| || ||   | || ||||| || ||||||||| |||| ||| ||| | ||||     
T  35815996 aaagcccatgaagataaacccaccaaaacccatcaccacttaagacagacaccttaacagaaacaaacattgtaaacacagtatccacaaccacccatca 35816095  T
Q  357 tcactactcacccacaaagaacaccc 382  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||    
T  35816096 tcactactcacccccaaagaacaccc 35816121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 160 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 35821685 - 35821534
Alignment:
Q  160 atcggcaaatattattaaacgccatcctcgcaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccaccta 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  35821685 atcggcaaatattattaaacgccatctccgcaagacgcaagg-atggacgaaacatgatacaaatgatgccgcatatagacggtacaccataaccactta 35821587  T
Q  260 aaaacacccctgaagataaacccaccaaagcacatcaccacctaaaacaaactc 313  Q
    |||| ||| |||| ||||| | |||||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  35821586 aaaa-acctctgaggataatctcaccaaactacatcaccacctaaaacagactc 35821534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 159 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 3584170 - 3584028
Alignment:
Q  159 aatcggcaaatattattaaacgccatcctcgcaagacgcaaggtatggacgaaacaa-gatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacc 257  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3584170 aatcagcaaatattattaaacgccatccccacaagacgcgaggtatgaacgaaacaaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacc 3584071  T
Q  258 taaaaacacccctgaagataaacccaccaaagcacatcaccac 300  Q
     || ||  ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  3584070 aaacaaagccccttaagataaacccaccaacacacatcaccac 3584028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 388 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 22773699 - 22773615
Alignment:
Q  388 ataaaactcccagaccccaacacccaagctaagccacatttcgaagagcacctaaccgaaggatcatgcagctatcacaaacctc 472  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||    
T  22773699 ataaaactcccagaccccaacacccaaactgagccacatttcgaagagcacctaacagaaggatcatgtagatatcacaaacctc 22773615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 157 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 13538419 - 13538324
Alignment:
Q  157 tgaatcggcaaatattattaaacgccatcctcgcaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataa 252  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  13538419 tgaatcagcaaatattattaaacgccatctccacaagacgcaaggtatggacgaaagaatatacaaatggtaccgcatatagacggtacatcataa 13538324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 157 - 252
Target Start/End: Original strand, 13686055 - 13686150
Alignment:
Q  157 tgaatcggcaaatattattaaacgccatcctcgcaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataa 252  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  13686055 tgaatcagcaaatattattaaacgccatctccacaagacgcaaggtatggacgaaagaatatacaaatggtaccgcatatagacggtacatcataa 13686150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 165 - 469
Target Start/End: Original strand, 38577441 - 38577752
Alignment:
Q  165 caaatattattaaacgccatcctcgcaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacctaaaaac 264  Q
    |||||||||||||||| |||   ||||||| | || ||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||| || ||     
T  38577441 caaatattattaaacgtcatttccgcaagatgtaatgtatgaacgaaacaatatacaaatgatgccgcatatagacggtacaaaataactaccaaacaaa 38577540  T
Q  265 acccctgaagataaacccaccaaagcacatcaccacctaaaacaaactccaaag----aacaag-cactgtaaacacggtatc-accaccgctcatcgtc 358  Q
    |  | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  || || ||     |||||  |||||||||||| ||||| || | |   |||||||    
T  38577541 atacatgaagataaacccaccaaaacacatcaccacctaagacggacacctaaatataaacaaaacactgtaaacacagtatccacaatcatccatcgtc 38577640  T
Q  359 actactcacccacaaagaacac-cctcaaaataaaact-cccagaccccaacacccaagctaagccacatttcgaagagcacctaaccgaaggatcatgc 456  Q
    |||||||| || |||||||||| || |||||||||||| |||||||  ||||||||||| |  |||| | |||||| ||| || ||||||| || |||||    
T  38577641 actactcatccccaaagaacactccacaaaataaaactccccagacttcaacacccaagttgcgccata-ttcgaaaagctccaaaccgaatgaacatgc 38577739  T
Q  457 agctatcacaaac 469  Q
    ||||  |||||||    
T  38577740 agcttccacaaac 38577752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 157 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 9659536 - 9659474
Alignment:
Q  157 tgaatcggcaaatattattaaacgccatcctcgcaagacgcaaggtatggacgaaacaagata 219  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9659536 tgaatcggcaaatattattaaacgtcatccccgcaagacgcaaggtatggacgaaacaagata 9659474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 191 - 257
Target Start/End: Original strand, 10837918 - 10837984
Alignment:
Q  191 aagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacc 257  Q
    ||||||||||| ||| || ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10837918 aagacgcaaggaatgaacaaaataagatgcaaatcgtgccgcatatagacggtacaccataaccacc 10837984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 319 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 35821510 - 35821432
Alignment:
Q  319 aacaagcactgtaaacacggtatc-accaccgctcatcgtcactactcacccacaaagaacaccctcaaaataaaactc 396  Q
    |||||||||||||||||| ||||| | |||||| |||| |||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||    
T  35821510 aacaagcactgtaaacacagtatctagcaccgcccatcatcactactcatcctcaaagaacacccttaaaataaaactc 35821432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 37267965 - 37267879
Alignment:
Q  157 tgaatcggcaaatattattaaacgccatcctcgcaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacacca 249  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||| || ||||| | ||||     |||||||||||||||||||||||    
T  37267965 tgaatcgacaaatattatt-aacgccatccccgcaagatgcaaggtatgaacaaaacatgttaca-----tgccgcatatagacggtacacca 37267879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 159 - 199
Target Start/End: Original strand, 34866309 - 34866349
Alignment:
Q  159 aatcggcaaatattattaaacgccatcctcgcaagacgcaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  34866309 aatcggcaaatattattaaacgtcatccccgcaagacgcaa 34866349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 157 - 248
Target Start/End: Original strand, 41309919 - 41310011
Alignment:
Q  157 tgaatcggcaaatattattaaacgccatcctcgcaagacgcaaggtatggacga-aacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacacc 248  Q
    |||||| |||||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || || |  |||||||||| | |||||||||||||  |||||||    
T  41309919 tgaatcagcaaaatttattaaacgccaacctcgcaagacgtaaggtatagatgacataaagatacaaaagatgccgcatatagagagtacacc 41310011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 18)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 157 - 481
Target Start/End: Original strand, 24449578 - 24449904
Alignment:
Q  157 tgaatcggcaaatattattaaacgccatcctcgcaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccac 256  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24449578 tgaattggcaaatattattaaacgccatcc-cgcaagatgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgctgcatatagacggtacaccataaccac 24449676  T
Q  257 ctaaaaacacccctgaagataaacccaccaaagcacatcaccacctaaaacaaactccaaagaa--caagcactgtaaacacggtatc-accaccgctca 353  Q
     |||||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||  | |||||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  24449677 ataaaaacacccctagagataaacacaccaaaacacatcaccacctaaagtagactccaaaaaaaacaagcactgtaaacacggtatccaccaccgccca 24449776  T
Q  354 tcgtcactactcacccacaaagaacaccctcaaaataaaactcccagaccccaacacccaagctaagccacatttcgaagagcacctaaccgaaggatca 453  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24449777 tcgtcactactcacccacaaataacaccctcaaaataaaactcctagaccccaacacccaagctgagccgcatttcgaagagcacctaaccgaaggatca 24449876  T
Q  454 tgcagctatcacaaacctcacaacctcc 481  Q
    |||| |||||||||||||| | ||||||    
T  24449877 tgcaactatcacaaacctcgcgacctcc 24449904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 157 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 5459589 - 5459268
Alignment:
Q  157 tgaatcggcaaatattattaaacgccatcctcgcaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccac 256  Q
    |||||| |||||||||||||||||||     ||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5459589 tgaatcagcaaatattattaaacgcc-----cgcaatacgcaaggtatggacgaagcaacatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccac 5459495  T
Q  257 ctaaaaacacccctgaagataaacccaccaaagcacatcaccacctaaaacaaactccaaagaa-caagcactgtaaacacggtatc-accaccgctcat 354  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||| || |||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  5459494 ctaaaaatacccctgaagataaactcaccaaaacacatcactacttaaaacaaactccaaaaaaacaatcactgtaaacacggtatccaccaccgcccat 5459395  T
Q  355 cgtcactactcacccacaaagaacaccctcaaaataaaactcccagaccccaacacccaagctaagccacatttcgaagagcacctaaccgaaggatcat 454  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  5459394 cgtcactactcacccacaaagaacaccatcaaaataaaacttccagaccccaacacccaagctgagccacatttcaaagagcacctaactgaaggatcat 5459295  T
Q  455 gcagctatcacaaacctcacaacctcc 481  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||    
T  5459294 gcagctatcacaaacctcgcaacctcc 5459268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 157 - 481
Target Start/End: Original strand, 5389075 - 5389395
Alignment:
Q  157 tgaatcggcaaatattattaaacgccatcctcgcaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccac 256  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |     ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  5389075 tgaatcggaaaatattattaaacgccatcccc-----acgcaaggtatggacgaaataagatacaaatggtgccgcatatagacggcacactataaccac 5389169  T
Q  257 ctaaaaacacccctgaagataaacccaccaaagcacatcaccacctaaaacaaact-ccaaagaacaagcactgtaaacacggtat-caccaccgctcat 354  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||    
T  5389170 ctaaaaacacccctagagataaaccaaccaaaacacatcaccacctaaaacaaactcccaaaaaacaagcaccgtaaacacggtatccaccaccgcccat 5389269  T
Q  355 cgtcactactcacccacaaagaacaccctcaaaataaaactcccagaccccaacacccaagctaagccacatttcgaagagcacctaaccgaaggatcat 454  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||    
T  5389270 cgtcactactcacttac-aagaacaccctcaaaataaaactcccagaccccaacacccaagctgagccacatatcgaagagcacttaaccgaaggaccat 5389368  T
Q  455 gcagctatcacaaacctcacaacctcc 481  Q
    | ||||| |||||||||| | ||||||    
T  5389369 gtagctaacacaaacctcgcgacctcc 5389395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 210 - 481
Target Start/End: Original strand, 46692519 - 46692793
Alignment:
Q  210 aaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacctaaaaa-cacccctgaagataaacccaccaaagcacatcaccacctaaaaca 308  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  46692519 aaacaagataaaaatggtgccgcataaagacggtacaccataaccacctaaaaaacacccctgaagataaaccctccaaaacacatcaccacctaaaaca 46692618  T
Q  309 aactccaaagaa-caagcactgtaaacacggtatca-ccaccgctcatcgtcactactcacccacaaagaacaccctcaaaataaaactcccagacccca 406  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  46692619 aactccaaaaaaacaagcactgtaaacacgatatcaaccaccgcccatcgtcactactcacccacaaagaacaccctccaaataaaacttccagacccca 46692718  T
Q  407 acacccaagctaagccacatttcgaagagcacctaaccgaaggatcatgcagctatcacaaacctcacaacctcc 481  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||| | ||||||    
T  46692719 acacccaagctgagccacatttcgaagagcacttaaccggaggataatgcagctatcacaaacctcgcgacctcc 46692793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 178; E-Value: 8e-96
Query Start/End: Original strand, 157 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 41920891 - 41920559
Alignment:
Q  157 tgaatcggcaaatattattaaacgccatcctcgcaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccac 256  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  41920891 tgaatcgacaaatattattaaacgtcatctccgcaagacgtaaggtatggacgaaataaaatacaaattgtgctgcatatagacggtacaccgtaaccac 41920792  T
Q  257 ctaaaaacacccctgaagataaacccaccaaagcacatcaccacctaaaacaaactc--caaagaacaagcactgtaaacacggta-tcaccaccgctca 353  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||||||   ||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||  |    
T  41920791 ctaaaaacacccgtgaagataaaccaaccaaaatacaccaccacctaaaacaaactcaaaaaaaaacaagcaatgtaaacacggtattcaccaccgccta 41920692  T
Q  354 tcgtcactactcacccacaaagaacaccctcaaaataaaactcccagaccccaacacccaagctaagccacatttcgaagagcacctaaccga-----ag 448  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||| ||     ||    
T  41920691 tcgtcactactcacccacaaaaaacaccctcaaaataaaactccaagaccccaacacccaagctgagccacatgatgaagagcacctaactgaaggttag 41920592  T
Q  449 gatcatgcagctatcacaaacctcacaacctcc 481  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  41920591 gatcatgcagctatcacaaacctcgcgacctcc 41920559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 159 - 481
Target Start/End: Original strand, 30685573 - 30685878
Alignment:
Q  159 aatcggcaaatattattaaacgccatcctcgcaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacct 258  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30685573 aatcggcaaatattattaaacgtcatccccgcaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagatggtacaccataaccacct 30685672  T
Q  259 aaaaacacccctgaagataaacccaccaaagcacatcaccacctaaaacaaactcca--aagaacaagcactgtaaacacggtat-caccaccgctcatc 355  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  || |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  30685673 aaaaacacccctgaagataaacccaccaaaacacatcaccacctaaaacagactccaacaaaaacaagcaatgtaaacacggtatccaccaccgcccatc 30685772  T
Q  356 gtcactactcacccacaaagaacaccctcaaaataaaactcccagaccccaacacccaagctaagccacatttcgaagagcacctaaccgaaggatcatg 455  Q
     ||||||| ||||||||||||||||                    | ||||||||||||||| |||||||| || | |||||||||||| ||||||||||    
T  30685773 ttcactacacacccacaaagaacac--------------------atcccaacacccaagctgagccacatatcaaggagcacctaaccaaaggatcatg 30685852  T
Q  456 cagctatcacaaacctcacaacctcc 481  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||    
T  30685853 cagctatcacaaacctcgcgacctcc 30685878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 157 - 364
Target Start/End: Original strand, 31584687 - 31584894
Alignment:
Q  157 tgaatcggcaaatattattaaacgccatcctcgcaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccac 256  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31584687 tgaatcggcaaatattattaaacaccatcctcgcaagacgcaaggtatg-acgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacgatacaccataaccac 31584785  T
Q  257 ctaaaaacacccctgaagataaacccaccaaagcacatcaccacctaaaacaaactcc-aaagaacaagcactgtaaacacggtat-caccaccgctcat 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| | |||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31584786 ctaaaaacacccctgaagataaacccaccaaaacatgtcaccacctaaaac-acctccaaaaaaacaatcactgtaaacacggtatccaccaccgctcat 31584884  T
Q  355 cgtcactact 364  Q
    ||||||||||    
T  31584885 cgtcactact 31584894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 157 - 457
Target Start/End: Original strand, 24684140 - 24684428
Alignment:
Q  157 tgaatcggcaaatattattaaacgccatcctcgcaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccac 256  Q
    |||||||||||||||||||| | | |||||  |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  24684140 tgaatcggcaaatattattatatgtcatccctgcaagatgcaaggtatgaac-aaacaagatacaaatggtgccacatatagacggtacaccataatcac 24684238  T
Q  257 ctaaaaacacccctgaagataaacccaccaaagcacatcaccacctaaaacaaactcc-aaagaacaagcactgtaaacacggtat-caccaccgctcat 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||| ||| ||||||||| |||    
T  24684239 ctaaaaacacccctgaagataaacccaccaaaacacatcaccacctaaaacaaactccaaaaaaacaaactctgtaaacacgatatccaccaccgcccat 24684338  T
Q  355 cgtcactactcacccacaaagaacaccctcaaaataaaactcccagaccccaacacccaagctaagccacatttcgaagagcacctaaccgaaggatcat 454  Q
    ||||||||||||            |||| |||| |||||| | |||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24684339 cgtcactactca------------accc-caaactaaaacacgcagaccccgacatccaagttgagccacatttcgaagagcacctgaccgaaggatcat 24684425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 166 - 460
Target Start/End: Original strand, 46814121 - 46814420
Alignment:
Q  166 aaatattattaaacgccatcctcgcaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacctaaaaaca 265  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||      
T  46814121 aaatattattaaacgccatcctcgcaagacgtaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccaccaaacaaag 46814220  T
Q  266 cccctgaagataaacccaccaaagcacatcaccacctaaaacaaactcc---aaag-aacaagcactgtaaacacggtat-caccaccgctcatcgtcac 360  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| || ||   | || ||||| | |||||||||| |||| ||| ||||  |||||||||    
T  46814221 cccctgaagataaacctaccaaaacacatcaccacctaagacagacaccttaacagaaacaaaccctgtaaacacagtatccacaaccgtccatcgtcac 46814320  T
Q  361 tactcacccacaaagaaca-ccctcaaaataaaactcccagaccccaacacccaagctaagccacatttcgaagagcacctaaccgaaggatcatgcagc 459  Q
    ||||||||  |||| |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||| ||  ||||||| |||||| ||| ||||| |||| || | ||||||    
T  46814321 tactcacctccaaataacacccctcgaaataaaactcccatacttcaacacccacgccgagccaca-ttcgaaaagctcctaatcgaatgaacttgcagc 46814419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 159 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 6804969 - 6804739
Alignment:
Q  159 aatcggcaaatattattaaacgccatcctcgcaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacct 258  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6804969 aatcggtaaatattattaaacgctatccccgcaagacgcaaggtatggacgaaa-aagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacct 6804871  T
Q  259 a-aaaacacccctgaagataaacccaccaaagcacatcaccacctaaaacaaactccaaagaacaagcactgtaaacacggtat-caccaccgctcatcg 356  Q
    | |||| | ||| || ||||| ||||||||| ||||||||||||||  | |  ||  ||| ||||||||||||||| || |||| ||||||||| |||||    
T  6804870 aaaaaaaaaccccgaggataatcccaccaaaacacatcaccacctattagactct-aaaaaaacaagcactgtaaatacagtatccaccaccgcccatcg 6804772  T
Q  357 tcactactcacccacaaagaacaccctcaaaat 389  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  6804771 tcactcctcacccacaaagaacaccctgaaaat 6804739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 356 - 481
Target Start/End: Original strand, 31585608 - 31585734
Alignment:
Q  356 gtcactactcacccacaaagaacaccctcaaaataaaactcccagacccc-aacacccaagctaagccacatttcgaagagcacctaaccgaaggatcat 454  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31585608 gtcactactcacccacaaagaacaccctcaaaataaaactctcagacccccaacacccaagcttagccacatttcgaagagcacctaaccaaaggatcat 31585707  T
Q  455 gcagctatcacaaacctcacaacctcc 481  Q
     ||||||||||||||||| | ||||||    
T  31585708 acagctatcacaaacctcgcgacctcc 31585734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 159 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 7002619 - 7002474
Alignment:
Q  159 aatcggcaaatattattaaacgccatcctcgcaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacct 258  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  7002619 aatcggcaaatattattaaacgtcatcctcgcaaaatgtaaggtatggacgaaacaagatacaaaaggtgccgcatataaacggtacaccataaccactt 7002520  T
Q  259 aaaaacacccctgaagataaacccaccaaagcacatcaccacctaaaa 306  Q
    ||||  | ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7002519 aaaa--aaccctagagataaacccaccaaaacacatcaccacctaaaa 7002474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 352 - 474
Target Start/End: Original strand, 6764226 - 6764348
Alignment:
Q  352 catcgtcactactcacccacaaagaacaccctcaaaataaaactcccagaccccaacacccaagctaagccacatttcgaagagcacctaaccgaaggat 451  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||  | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  6764226 catcgtcactactcacccacaaagaacatcctgaaaataaaactcccagaccccagtatccaagttgagccacatttcgaagagcacctaaccgaaggac 6764325  T
Q  452 catgcagctatcacaaacctcac 474  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  6764326 catgcagctatcacaaacctcac 6764348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 159 - 297
Target Start/End: Original strand, 40216155 - 40216293
Alignment:
Q  159 aatcggcaaatattattaaacgccatcctcgcaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacct 258  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  40216155 aatcagcaaatattattaaacgtcatcctcgcaagacgccagatatggacgaatcaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacatcataaccacct 40216254  T
Q  259 aaaaacacccctgaagataaacccaccaaagcacatcac 297  Q
    ||||||||  ||| |||| |||||||| || ||||||||    
T  40216255 aaaaacacatctggagattaacccaccgaaacacatcac 40216293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 165 - 481
Target Start/End: Original strand, 27031496 - 27031813
Alignment:
Q  165 caaatattattaaacgccatcctcgcaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacctaaaaac 264  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  | ||     
T  27031496 caaatattattaaacgtcatcctcgcaagacgcaagatatggacggaacaatatataaatggtgccgcatatatacggtacaccataacccccatacaaa 27031595  T
Q  265 acccctgaagataaacccaccaaagcacatcaccacctaaaacaaactcc---aaag-aacaagcactgtaaacacggtat-caccaccgctcatcgtca 359  Q
     ||| |||||||||  || ||||| ||||||||||||||| ||  || ||   | || ||||| | |||||||||| |||| ||  || ||  |||||||    
T  27031596 gcccttgaagataa--cccccaaaacacatcaccacctaagacggacaccttaacagaaacaaaccctgtaaacacagtatccataacggcctatcgtca 27031693  T
Q  360 ctactcacccacaaagaaca-ccctcaaaataaaactcccagaccccaacacccaagctaagccacatttcgaagagcacctaaccgaaggatcatgcag 458  Q
    |||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| |||| || ||||||| |||||| ||| | |||||||| || |||||||    
T  27031694 ctactcaccc-cagagaacacccctcaaaataaaactcccagacttcaacatccaaactgagccaca-ttcgaaaagctcttaaccgaatgaacatgcag 27031791  T
Q  459 ctatcacaaacctcacaacctcc 481  Q
    ||  ||| |||||| ||||||||    
T  27031792 cttccac-aacctctcaacctcc 27031813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 208 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 24659313 - 24659113
Alignment:
Q  208 cgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacctaaaaacacccctgaagataaacccaccaaagcacatcaccacctaaaac 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |     
T  24659313 cgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccaccaaacaaagcccctgaagataaacccaccaaaacacataaccacctaagat 24659214  T
Q  308 aaactcc---aaag-aacaagcactgtaaacacggt-atcaccaccgctcatcgtcactactcacccacaaagaaca-ccctcaaaataaaactcccaga 401  Q
      || ||   |||| ||||| || ||||||||| || | ||  ||| | |||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  24659213 ggacaccttaaaagaaacaaacattgtaaacacagtaaccataaccacccatcgtcactactcacccccaaataacacccctcaaaataaaactcccaga 24659114  T
Q  402 c 402  Q
    |    
T  24659113 c 24659113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 159 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 14320755 - 14320658
Alignment:
Q  159 aatcggcaaatattattaaacgccatcctcgcaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccac 256  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14320755 aatcggcaaatattattaaacgtcatccccacaagatgcaaggtatggacaaaaccaaatacaaatggtgtcgcatatagacggtacaccataaccac 14320658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 325 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 7857915 - 7857794
Alignment:
Q  325 cactgtaaacacggtatcaccaccgctcatcgtcactactcacccacaaagaacaccc-tcaaaataaaactcccagaccccaacacccaagctaagcca 423  Q
    |||||||||||||||  ||| ||| | ||||| |||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| || |||||    
T  7857915 cactgtaaacacggtc-cacaaccacccatcgccactactcacccccatagaacacccctcaaaataaaactcccagacttcaacacccaaactgagcca 7857817  T
Q  424 catttcgaagagcacctaaccgaa 447  Q
    |||||| || ||| ||||||||||    
T  7857816 catttc-aaaagctcctaaccgaa 7857794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 8)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 157 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 10542264 - 10541967
Alignment:
Q  157 tgaatcggcaaatattattaaacgccatcctcgcaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccac 256  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10542264 tgaatcggaaaatattattaagcgccatcc-cgcaagatgcaagatatgaacgaaacaagatacaaaaggtgccgcatatagacgatacaccataaccac 10542166  T
Q  257 ctaaaaacacccctgaagataaacccaccaaagcacatcaccacctaaaacaaactcc-aaagaacaagcactgtaaacacggtat-caccaccgctcat 354  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||||| ||||||||| |||    
T  10542165 ctaaaaacacccctgaagataaacccatcaaattacaccaccacctaaaacaaactccaaaaaaacaagcactttaaatacggtatccaccaccgcccat 10542066  T
Q  355 cgtcactactcacccacaaagaacaccctcaaaataaaactcccagaccccaacacccaagctaagccacatttcgaagagcacctaaccgaaggatca 453  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10542065 cgtcactactcacccacaaagaataccctccaaataaaacttccagaccccaacacccaagctgagccacatttcgaagagcacctaaccgaaggatca 10541967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 163 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 3117922 - 3117600
Alignment:
Q  163 ggcaaatattattaaacgccatcctcgcaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacctaaaa 262  Q
    |||||||||||||||||| ||| |  |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3117922 ggcaaatattattaaacgtcattcctgcaagacgtaaggtatggacgaaataagatacaaatggtgcagcatatagacgctacaccataaccacctaaaa 3117823  T
Q  263 acacccctgaagataaacccaccaaagcacatcaccacctaaaacaaact---ccaaagaacaagcactgtaaacacggt-atcaccaccgctcatcgtc 358  Q
    ||||| |  |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||     ||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  3117822 acacctccaaagataaacctaccaaaccacatcaccacctaaaacaaactaaaaaaaaaaacaagcactgtaaacacggtaaccaccaccgctcatcgtc 3117723  T
Q  359 actactcacccacaaagaacaccctcaaaataaaactcccagaccccaacacccaagctaagccacatttcgaagagcacctaaccgaaggatcatgcag 458  Q
     ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||     
T  3117722 tctacttacccacaaagaacaccctataaataaaactcccagaccccaacacccaagttgagccacatttcgaagagcacataatcgaaggatcatgcaa 3117623  T
Q  459 ctatcacaaacctcacaacctcc 481  Q
    |||||||||||||| | ||||||    
T  3117622 ctatcacaaacctcgcgacctcc 3117600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 159 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 3254389 - 3254207
Alignment:
Q  159 aatcggcaaatattattaaacgccatcctcgcaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacct 258  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||    
T  3254389 aatcggcaaatattattaaacgtcatccccgcaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgtatatagatagtacaccatagccacct 3254290  T
Q  259 aaaaacacccctgaagataaacccaccaaagcacatcaccacctaaaacaaactcc-aaagaacaagcactgtaaacacggta 340  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  3254289 aaaaacacccctgaaaataaacccaccaaaatacatcaccacctaaaacagactccaaaaaaacaagcaccgtaaacacggta 3254207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 159 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 15944431 - 15944276
Alignment:
Q  159 aatcggcaaatattattaaacgccatcctcgcaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacct 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15944431 aatcggcaaatattattaaacgccatccctgtaagacgcaaggtatggacagaagaagatacaaatggtgtcgcatatagacggtacaccataaacacct 15944332  T
Q  259 aaaaacacccctgaagataaacccaccaaagcacatcaccacctaaaacaaactcc 314  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  15944331 aaaaatacccctgaatataaacccaccaaaacacatcaccacctaaaacagactcc 15944276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 257 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 14663414 - 14663221
Alignment:
Q  257 ctaaaaacacccctgaagataaacccaccaaagcacatcaccacctaaaacaaactccaaagaaca-----agcactgtaaacacggtatc-accaccgc 350  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| || |     ||||||||||||||  |||| ||||||||    
T  14663414 ctaaaaacacccctggagataaacccacgaaaacacatcaccacctaaaacagactccaaaaaaaacaaaaagcactgtaaacacaatatccaccaccgc 14663315  T
Q  351 tcatcgtcactactcacccacaaagaacaccctcaaaataaaactcccagaccccaacacccaagctaagccacatttcgaagagcacctaacc 444  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  |||||||||||||||| || ||||||    
T  14663314 ccatcgtcactactcacccgcaaagaacatcctcaaaataaaactcccaaaccccaacatccaagccgagccacatttcgaagaacatctaacc 14663221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 157 - 243
Target Start/End: Original strand, 15132487 - 15132573
Alignment:
Q  157 tgaatcggcaaatattattaaacgccatcctcgcaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggt 243  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  15132487 tgaatcagcaaatattattaaacgccatcatcgcaagacgtaaggtatggacaaaacaagatacaaatgatgccgtatatagacggt 15132573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 202 - 256
Target Start/End: Original strand, 33697789 - 33697843
Alignment:
Q  202 tatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccac 256  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33697789 tatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccac 33697843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 164 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 14663480 - 14663414
Alignment:
Q  164 gcaaatattattaaacgccatcctcgcaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgc 232  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  14663480 gcaaatattattaaacgtcatcct-gcaagacgaaaggtatggacg-aacaagatacaaatgctgccgc 14663414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 21)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 157 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 30964871 - 30964548
Alignment:
Q  157 tgaatcggcaaatattattaaacgccatcctcgcaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccac 256  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  30964871 tgaatcgacaaatattattaaacaccatccctgcaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatgatgttgcatatagacggtacaccataaccac 30964772  T
Q  257 ctaaaaacacccctgaagataaacccaccaaagcacatcaccacctaaaacaaactccaaagaa--caagcactgtaaacacggta-tcaccaccgctca 353  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||  || |||||||||| ||| || |||||||||| ||    
T  30964771 ctaaaaacactcctggagataaacccaccaaaacacatcaccacctaaaacagactccaaaaaaatcacgcactgtaaatacgatattcaccaccgccca 30964672  T
Q  354 tcgtcactactcacccacaaagaacaccctcaaaataaaactcccagaccccaacacccaagctaagccacatttcgaagagcacctaaccgaaggatca 453  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     | |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30964671 tcatcactactcacccacaaagaacaccctcaaaataaaactcccag----taccacccaagcagggccacatttcgaagagcacctaaccgaatgatca 30964576  T
Q  454 tgcagctatcacaaacctcacaacctcc 481  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||    
T  30964575 tgcagctatcacaaacctcgcgacctcc 30964548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 159 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 8255459 - 8255134
Alignment:
Q  159 aatcggcaaatattattaaacgccatcctcgcaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacct 258  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||   ||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8255459 aatcggcaaatattattaaacgctatctccgcaagatataaggtgtggacgagacaagatacaaatgatgccgcatatagacggtacatcataaccacct 8255360  T
Q  259 aaaaacacccctgaagataaacccaccaaagcacatcaccacctaaaacaaactccaa--agaacaagcactgtaaacacggtat-caccaccgctcatc 355  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||  | |||||||||||||||||| |||| ||||||  | ||||    
T  8255359 aaaaacactcctgaagataaactcacaaaaacacatcaccacctaaaacagactccaaataaaacaagcactgtaaacacagtatccaccacatcccatc 8255260  T
Q  356 gtcactactcacccacaaagaacaccctcaaaataaaactcccagaccccaacacccaagctaagccacatttcgaagagcacctaaccgaaggatcatg 455  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| || |||||| |    
T  8255259 gtcactactcacccacaaagaacaccctcaaaataaaactcacagaccctaacacccaagctgagccacattacgaagagcacctaactgatggatcaag 8255160  T
Q  456 cagctatcacaaacctcacaacctcc 481  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||    
T  8255159 cagctatcacaaacctcgcgacctcc 8255134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 159 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 8268877 - 8268552
Alignment:
Q  159 aatcggcaaatattattaaacgccatcctcgcaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacct 258  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||   ||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8268877 aatcggcaaatattattaaacgctatctccgcaagatataaggtgtggacgagacaagatacaaatgatgccgcatatagacggtacatcataaccacct 8268778  T
Q  259 aaaaacacccctgaagataaacccaccaaagcacatcaccacctaaaacaaactccaa--agaacaagcactgtaaacacggtat-caccaccgctcatc 355  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||  | |||||||||||||||||| |||| ||||||  | ||||    
T  8268777 aaaaacactcctgaagataaactcacaaaaacacatcaccacctaaaacagactccaaataaaacaagcactgtaaacacagtatccaccacatcccatc 8268678  T
Q  356 gtcactactcacccacaaagaacaccctcaaaataaaactcccagaccccaacacccaagctaagccacatttcgaagagcacctaaccgaaggatcatg 455  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| || |||||| |    
T  8268677 gtcactactcacccacaaagaacaccctcaaaataaaactcacagaccctaacacccaagctgagccacattacgaagagcacctaactgatggatcaag 8268578  T
Q  456 cagctatcacaaacctcacaacctcc 481  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||    
T  8268577 cagctatcacaaacctcgcgacctcc 8268552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 159 - 481
Target Start/End: Original strand, 30167212 - 30167538
Alignment:
Q  159 aatcggcaaatattattaaacgccatcctcgcaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgca--tatagacggtacaccataaccac 256  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |  |||||||||||||| |||||||     
T  30167212 aatcgacaaatattattaaacgtcatcctcgcaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatgatgcaaaaaatatagacggtacactataaccat 30167311  T
Q  257 ctaaaaacacccctgaagataaacccaccaaagcacatcaccacctaaaacaaactccaaagaa--caagcactgtaaacacggtatc-accaccgctca 353  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  30167312 ctaaaaataccactgaagataaacccaccaaaacacatcacatcctaaaacagactccaaaaaaatcaagcactgtaaacacggtatccaccaccgc-ca 30167410  T
Q  354 tcgtcactactcacccacaaagaacaccctcaaaataaaactcccagaccccaacacccaagctaagccacatttcgaagagcacctaaccgaaggatca 453  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| | |||||||||| |||    
T  30167411 acgtcaccactcacccacaaagaacaccctcaaaataaaactcccataccccaacacccaagttgggccacatttcgaagagcgcttaaccgaagggtca 30167510  T
Q  454 tgcagctatcacaaacctcacaacctcc 481  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  30167511 tgcagctatcataaacctcgcgacctcc 30167538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 175 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 20465005 - 20464786
Alignment:
Q  175 taaacgccatcctcgcaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacctaaaaacacccctgaag 274  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20465005 taaacgtcatcctcacaagatgcaaggtatgaaagaaacaagatacaaatggtgccgtatatagacggtacaccataaccacctaaaaacacccctgaag 20464906  T
Q  275 ataaacccaccaaagcacatcaccacctaaaacaaac-tccaaagaacaagcactgtaaacacggtat-caccaccgctcatcgtcactactcacccaca 372  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||||||||| || ||| ||||| | ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  20464905 ataaacccaccaacatacatcaccacctaaaacaaacttcaaaaaaacaaaccctgtaaacacggtatccaccaccgcccatcgtcactactcaccccca 20464806  T
Q  373 aagaacaccctcaaaataaa 392  Q
    || |||||||||||||||||    
T  20464805 aataacaccctcaaaataaa 20464786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 159 - 317
Target Start/End: Original strand, 27555579 - 27555738
Alignment:
Q  159 aatcggcaaatattattaaacgccatcctc-gcaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacc 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27555579 aatcggcaaatattattaaacgccatcccccgcaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaattgtgccgcatatagatggtacaccataaccacc 27555678  T
Q  258 taaaaacacccctgaagataaacccaccaaagcacatcaccacctaaaacaaactccaaa 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27555679 taaaaacacccctgaagataaacccaccaaaacacatcaccacctaaaacaaactccaaa 27555738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 159 - 424
Target Start/End: Original strand, 8705789 - 8706061
Alignment:
Q  159 aatcggcaaatattattaaacgccatcctcgcaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacct 258  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||   |||||||| ||||||||||||  || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8705789 aatcggcaaatattattaaacgtcatcccttcaagacgcgaggtatggacgaggcaggatacaaatggtgctgcatatagacggtacaccataaccacct 8705888  T
Q  259 aaaaacacccctgaagataaacccaccaaagcacatcaccacctaaaacaaactc----------caaagaacaagcactgtaaacacggtat-caccac 347  Q
    |||||||||| |||||||    |||| ||| ||||||||||||||||| | ||||           ||| |||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  8705889 aaaaacacccttgaagat----ccacaaaaacacatcaccacctaaaatagactcaaaaaaaaaaaaaaaaacaagcactgtaaacacagtatccaccac 8705984  T
Q  348 cgctcatcgtcactactcacccacaaagaacaccctcaaaataaaactcccagaccccaacacccaagctaagccac 424  Q
     || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||    
T  8705985 tgcccatcgtcactacccacccacaaagaacaccctcaaaataaaactcttagaccccaacacccaagctgagccac 8706061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 157 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 35329441 - 35329302
Alignment:
Q  157 tgaatcggcaaatattattaaacgccatcctcgcaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccac 256  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  35329441 tgaatcggcaaatattagtaaacgccatccccgcaagacgtaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgctgcatatagacggtacaccataaccac 35329342  T
Q  257 ctaaaaacacccctgaagataaacccaccaaagcacatca 296  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  35329341 ctaaaaatacccatgaagataaacccaccaaaacacatca 35329302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 159 - 343
Target Start/End: Original strand, 36689454 - 36689639
Alignment:
Q  159 aatcggcaaatattattaaacgccatcctcgcaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacct 258  Q
    ||||| ||||||||||||||  |||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| |    
T  36689454 aatcgacaaatattattaaataccatctccgcaagacgcgaggtatggacgaaataagatacaaatggtatcgcatatagacggtacactataaccactt 36689553  T
Q  259 aaaaacacccctgaagataaacccaccaaagcacatcaccacctaaaacaaactcc-aaagaacaagcactgtaaacacggtatca 343  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  36689554 aaaaacacccctgaagataaactcaccaaaacacatcaccatctaaaacatactccaaaaaaacaagccttgtaaacacggtatca 36689639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 157 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 2826215 - 2825911
Alignment:
Q  157 tgaatcggcaaatattattaaacgccatcctcgcaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccac 256  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  2826215 tgaatcagcaaatattattaaacgtcatctctgcaagacgcaaggtatggacggaacaagatacaaatggtgccgcatatatacggtacaccataacc-c 2826117  T
Q  257 ctaaaaacacccctgaagataaacccaccaaagcacatcaccacctaaaacaaactcc---aaag-aacaagcactgtaaacacggtat-caccaccgct 351  Q
    | ||| | | ||||||||||||  || ||||| ||||||| ||||||| |||||| ||   | || ||||| | |||||||| | |||| ||| ||  |     
T  2826116 ccaaacaaaaccctgaagataa--cctccaaaacacatcatcacctaagacaaacaccttaacagaaacaaaccctgtaaacgcagtatccacaacgtcc 2826019  T
Q  352 catcgtcactactcacccacaaagaaca-ccctcaaaataaaactcccagaccccaacacccaagctaagccacatttcgaagagcacctaaccgaagga 450  Q
    |||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| ||  |||||||||| || | ||||  |||||| ||| |||||||||| ||    
T  2826018 catcgtcactactcaccc-cagagaacacccctcaaaataaaactcccaaacttcaacacccaaactgaaccac-cttcgaaaagctcctaaccgaatga 2825921  T
Q  451 tcatgcagct 460  Q
     |||||||||    
T  2825920 acatgcagct 2825911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 157 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 4306138 - 4305994
Alignment:
Q  157 tgaatcggcaaatattattaaacgccatcctcgcaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccac 256  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||| || ||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4306138 tgaatcggcaaatattattaaatgtcatccccggaagacgcaaggtatgaacgaaa-aagatataaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccac 4306040  T
Q  257 ctaaaaacacccctgaagataaacccaccaaagcacatcaccacctaa 304  Q
    ||||||| | ||  || ||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  4306039 ctaaaaaaatcc--gaggataatcccaccaaaacacatcaccacctaa 4305994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 164 - 460
Target Start/End: Original strand, 31050315 - 31050614
Alignment:
Q  164 gcaaatattattaaacgccatcctcgcaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacc-taaaa 262  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||||| || | ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  31050315 gcaaatattattaaacgtcgtccccgcaagatgcgatgtatggacgaaacaagatacaaatgatgtcgcatatagacggtacaccataaccaccatacaa 31050414  T
Q  263 acacccctgaagataaacccaccaaagcacatcaccacctaaaacaaa---ctccaaagaa-caagcactgtaaacacggtat-caccaccgctcatcgt 357  Q
     ||  ||||||||| ||| || |||| ||||||||||||||| || ||   ||| | |||| ||| ||||||||||||   || ||||| |   ||||||    
T  31050415 gca--cctgaagat-aactcatcaaaacacatcaccacctaagacgaacacctcaacagaagcaaacactgtaaacacaacatccaccatcatccatcgt 31050511  T
Q  358 cactactcacccacaaagaaca-ccctcaaaataaaactcccagaccccaacacccaagctaagccacatttcgaagagcacctaaccgaaggatcatgc 456  Q
    |||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||| |||||||  ||||| ||| |||||||||| || |||||    
T  31050512 cactactcacccccaaggaacacccctcaaaataaaacagccagacttcaacacccaagcttagccaca-atcgaaaagctcctaaccgaatgaacatgc 31050610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 159 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 7703118 - 7703018
Alignment:
Q  159 aatcggcaaatattattaaacgccatcctcgcaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacct 258  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7703118 aatcggcaaatattattaaacgtcatccccgcaagacacaaggtatggatgaaa-aagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacct 7703020  T
Q  259 aa 260  Q
    ||    
T  7703019 aa 7703018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 160 - 296
Target Start/End: Original strand, 11281375 - 11281511
Alignment:
Q  160 atcggcaaatattattaaacgccatcctcgcaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccaccta 259  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||  | ||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||    
T  11281375 atcggcaaatattattgaacgtcatctccacaagacgcaagatatggacgaaacatgatataaatggtgctgtatatagacggtataccataaccaccta 11281474  T
Q  260 aaaacacccctgaagataaacccaccaaagcacatca 296  Q
    |||||||| |||||||||| ||||| ||| |||||||    
T  11281475 aaaacacctctgaagataaccccactaaaacacatca 11281511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 159 - 256
Target Start/End: Original strand, 46698428 - 46698525
Alignment:
Q  159 aatcggcaaatattattaaacgccatcctcgcaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccac 256  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46698428 aatcagcaaatattattaaacgtcatccatgaaagacgcaaggtatggtcgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccac 46698525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 165 - 460
Target Start/End: Original strand, 35341006 - 35341291
Alignment:
Q  165 caaatattattaaacgccatcctc--gcaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacctaaaa 262  Q
    |||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  | |    
T  35341006 caaatattattaaacgtcatccccccgcaagacgcaatgtatggacgaaacaagatacaaatggtgccacatatagacggtacaccataacccccggaca 35341105  T
Q  263 acacccctgaagataaacccaccaaagcacatcaccacctaaaacaaactccaaagaacaagcactgtaaacacggtat-caccaccgctcatcgtcact 361  Q
    |  |||||||||||||  || ||| | |||||||||||||  ||||||        ||||| |||||||||||| |||| | | ||| | ||||||||||    
T  35341106 aagcccctgaagataa--cccccataacacatcaccacct-taacaaa--------aacaaacactgtaaacacagtatccgcaaccacccatcgtcact 35341194  T
Q  362 actcacccacaaagaaca-ccctcaaaataaaactcccagaccccaacacccaagctaagccacatttcgaagagcacctaaccgaaggatcatgcagct 460  Q
    |||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||| |||| || ||||||| |||||| ||| | |||| ||| || |||||||||    
T  35341195 actcaccc-cagagaacacccctcaaaataaaactcccaaacttcaaca-ccaaactgagccaca-ttcgaaaagctcataactgaatgaacatgcagct 35341291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 361 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 4305951 - 4305842
Alignment:
Q  361 tactcacccacaaagaacaccctcaaaataaaactcccagaccccaacacccaagctaagccacatttcgaagagcacctaaccgaaggatcatgcagct 460  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| || ||||||| | ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  4305951 tactcacccacaaagatcaccctgaaaataaaactcccaaacccaaatacccaagttgagccaca-ttcgaagagcacctcaccgaaggatcatgcagtt 4305853  T
Q  461 atcacaaacct 471  Q
    |||||||||||    
T  4305852 atcacaaacct 4305842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 163 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 49528514 - 49528421
Alignment:
Q  163 ggcaaatattattaaacgccatcctcgcaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccac 256  Q
    ||||||||| ||||||| ||| || ||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  49528514 ggcaaatatcattaaacaccaaccccgcaaaacataaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccaaaaccac 49528421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 159 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 9750198 - 9750116
Alignment:
Q  159 aatcggcaaatattattaaacgccatcctcgcaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacgg 242  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9750198 aatcgacaaatattattaaacgtcatccccgcaagacgca-ggtttggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacgg 9750116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 165 - 257
Target Start/End: Original strand, 52868766 - 52868859
Alignment:
Q  165 caaatattattaaa-cgccatcctcgcaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacc 257  Q
    |||||||||||||| || |||| || ||||||| |||||||| |||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  52868766 caaatattattaaaacgtcatcttcacaagacgtaaggtatgaacgaattaagatacaaatggtgtcgcgtatagacggtacaccataaccacc 52868859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 354 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 19673332 - 19673259
Alignment:
Q  354 tcgtcactactcacccacaaagaacac-cctcaaaataaaactcccagaccccaacacccaagctaagccacat 426  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| ||| || ||||||| ||| | ||||||||    
T  19673332 tcgtcactactcacccccaaagaacactcctcaaaattaaactctcagtcctcaacaccaaagtttagccacat 19673259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0343 (Bit Score: 181; Significance: 1e-97; HSPs: 1)
Name: scaffold0343
Description:

Target: scaffold0343; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 165 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 6131 - 5823
Alignment:
Q  165 caaatattattaaacgccatcctcgcaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacctaaaaac 264  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  6131 caaatattattaaacgtcatccccgcaagacgcaagatatgaacgagacaagatacaaatggtgccgtatatagacgttacatcataaccacctaaaaac 6032  T
Q  265 acccctgaagataaaccc-accaaagcacatcaccacctaaaacaaactccaaagaacaagcactgtaaacacggtatc-accaccgctcatcgtcacta 362  Q
    ||| |||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||  |  || ||| ||||||||| ||||||| |||||| |||||| | |||| ||||||    
T  6031 acctctgaagataaaccccacaaaaacacatcaccacctaaaaagacttcaaaaaaacaagcaccgtaaacatggtatccaccacctcccatcatcacta 5932  T
Q  363 ctcacccacaaagaacaccctcaaaataaaactcccagaccccaacacccaagctaagccacatttcgaagagcacctaaccgaaggatcatgcagctat 462  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  5931 ctcacccacaaaaaacaccctcaaaataaaactcccagatcccaacacccaagctgagccacattacgaagagcacctaaccgaaggatcaagtagctat 5832  T
Q  463 cacaaacct 471  Q
    |||||||||    
T  5831 cacaaacct 5823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0172 (Bit Score: 124; Significance: 1e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0172
Description:

Target: scaffold0172; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 160 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 19349 - 19113
Alignment:
Q  160 atcggcaaatattattaaacgccatcctcgcaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataa-ccacct 258  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19349 atcggcaaatattattaaacgtcatcctcgcaagacgcatggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataacccacct 19250  T
Q  259 aaaaacacccctgaagataaacccaccaaagcacatcaccacctaaaacaaactc------caaagaacaagcactgtaaacacggtatc-accaccgct 351  Q
    ||||| |   ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||       ||| || ||  ||||||||||||||||| |||||||||    
T  19249 aaaaa-aaatctgaagataaacccaccaaaatacatcaccacctaaaacagactcaaaaaaaaaaaaaaaaatactgtaaacacggtatctaccaccgct 19151  T
Q  352 catcgtcactactcacccacaaagaacaccctcaaaataaa 392  Q
    ||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19150 ca---tcactactcacccacaatgaacaccctcaaaataaa 19113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0434 (Bit Score: 117; Significance: 2e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0434
Description:

Target: scaffold0434; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 190 - 333
Target Start/End: Original strand, 2353 - 2497
Alignment:
Q  190 caagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacctaaaaacacccctgaagataaacccaccaaag 289  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  2353 caagacgcaaggtatggacgaaacaagatacagatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacctaaaaacacccttgaagataaacccaccaaac 2452  T
Q  290 cacatcaccacctaaaacaaactcc-aaagaacaagcactgtaaa 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||    
T  2453 cacatcaccacctaaaacaaactccaaaaaaacaagcaccgtaaa 2497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0085 (Bit Score: 101; Significance: 7e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0085
Description:

Target: scaffold0085; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 159 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 48767 - 48560
Alignment:
Q  159 aatcggcaaatattattaaacgccatcctcgcaagacgcaaggtatggacgaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacct 258  Q
    |||| |||||||||||| |||| | ||| |||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48767 aatccgcaaatattattcaacgtcctccccgcaagacacaagatatggactaaacaagatacaaatggtgccgcatatagacggtacaccataaccacct 48668  T
Q  259 aaaaacacccctgaagataaacccaccaaagcacatcaccacctaaaacaaact--ccaaagaacaagcactgtaaacacggta-tcaccaccgctcatc 355  Q
    |||||||||| | ||||||| || |||||| ||||||| ||||||||||| |||    ||| |||||||||||| ||||||||| ||||||  || ||||    
T  48667 aaaaacacccttaaagataatcctaccaaaacacatcatcacctaaaacagactaaaaaaaaaacaagcactgttaacacggtattcaccatagcccatc 48568  T
Q  356 gtcactac 363  Q
    ||||||||    
T  48567 gtcactac 48560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 93; Significance: 4e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 290 - 468
Target Start/End: Original strand, 35557 - 35733
Alignment:
Q  290 cacatcaccacctaaaacaaactccaaagaacaagcactgtaaacacggtatc-accaccgctcatcgtcactactcacccacaaagaacaccctcaaaa 388  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||| |||||||  | |||||||| || ||||    
T  35557 cacatcatcacctaaaacagactccaaaaaacaagcactgtaaacacagtatccaccactgcccatcgtcac-actcacctgctaagaacactctaaaaa 35655  T
Q  389 taaaactcccagaccccaacacccaagctaagccacatttcgaagagcacctaaccgaaggatcatgcagctatcacaaa 468  Q
      ||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  35656 --aaactcccacaccccaacacccaagctgagcctcatttcgaagagcacctaaccgatggatcatgcagctatcacaaa 35733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 157 - 212
Target Start/End: Original strand, 35471 - 35526
Alignment:
Q  157 tgaatcggcaaatattattaaacgccatcctcgcaagacgcaaggtatggacgaaa 212  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| || |||||| |||||||||||||||    
T  35471 tgaatcggcaaatattattgaacgtcatccccgtaagacgtaaggtatggacgaaa 35526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University