View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF9780_low_15 (Length: 297)

Name: NF9780_low_15
Description: NF9780
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF9780_low_15
NF9780_low_15
[»] chr3 (56 HSPs)
chr3 (143-287)||(26455579-26455723)
chr3 (143-278)||(35346471-35346606)
chr3 (143-287)||(20813441-20813585)
chr3 (143-287)||(38446473-38446617)
chr3 (143-278)||(1687657-1687792)
chr3 (143-278)||(20760071-20760206)
chr3 (143-287)||(1017041-1017185)
chr3 (143-287)||(33151693-33151837)
chr3 (143-278)||(21564502-21564637)
chr3 (143-278)||(42016879-42017014)
chr3 (143-278)||(50287572-50287707)
chr3 (143-287)||(21656515-21656659)
chr3 (143-287)||(31122659-31122803)
chr3 (143-287)||(47329175-47329319)
chr3 (151-287)||(12748388-12748524)
chr3 (143-287)||(20086314-20086458)
chr3 (143-287)||(41250883-41251027)
chr3 (143-278)||(21890176-21890311)
chr3 (143-278)||(36314972-36315107)
chr3 (149-287)||(22851993-22852131)
chr3 (143-287)||(42107099-42107243)
chr3 (143-287)||(53925979-53926123)
chr3 (148-287)||(19664538-19664677)
chr3 (143-278)||(32650820-32650955)
chr3 (143-278)||(51562168-51562303)
chr3 (143-287)||(44798265-44798408)
chr3 (143-278)||(3697152-3697287)
chr3 (143-278)||(10618480-10618615)
chr3 (144-287)||(29677473-29677616)
chr3 (143-278)||(35608131-35608266)
chr3 (143-278)||(40922165-40922300)
chr3 (175-287)||(19268518-19268630)
chr3 (143-287)||(27070739-27070883)
chr3 (143-287)||(37247953-37248097)
chr3 (143-287)||(48651245-48651389)
chr3 (143-287)||(52821049-52821193)
chr3 (143-287)||(53196011-53196155)
chr3 (143-287)||(55164115-55164259)
chr3 (143-278)||(20913754-20913889)
chr3 (143-278)||(20921872-20922007)
chr3 (165-278)||(50977870-50977983)
chr3 (165-278)||(51081002-51081115)
chr3 (165-278)||(51475268-51475381)
chr3 (143-287)||(1448735-1448876)
chr3 (165-287)||(50364909-50365031)
chr3 (143-287)||(33473239-33473383)
chr3 (143-287)||(39069723-39069867)
chr3 (143-287)||(45380260-45380404)
chr3 (171-287)||(28699682-28699798)
chr3 (143-287)||(38923998-38924142)
chr3 (165-278)||(34019466-34019579)
chr3 (207-287)||(44152697-44152777)
chr3 (165-253)||(42641200-42641288)
chr3 (224-287)||(47473227-47473290)
chr3 (19-69)||(26455797-26455847)
chr3 (143-185)||(44152772-44152814)
[»] chr1 (63 HSPs)
chr1 (143-287)||(23767414-23767558)
chr1 (143-287)||(19315637-19315781)
chr1 (143-287)||(38473626-38473770)
chr1 (143-287)||(46051447-46051591)
chr1 (143-287)||(7553016-7553160)
chr1 (143-287)||(7651659-7651803)
chr1 (143-287)||(12143069-12143213)
chr1 (143-287)||(41106013-41106157)
chr1 (143-287)||(46825528-46825672)
chr1 (143-278)||(9962757-9962892)
chr1 (143-278)||(49094711-49094846)
chr1 (143-278)||(49814306-49814441)
chr1 (143-287)||(26549385-26549529)
chr1 (143-287)||(28425363-28425507)
chr1 (143-287)||(52146990-52147134)
chr1 (143-278)||(25988271-25988406)
chr1 (143-287)||(36157678-36157821)
chr1 (143-287)||(50689940-50690084)
chr1 (143-278)||(9878784-9878919)
chr1 (143-278)||(36781172-36781307)
chr1 (143-287)||(33674014-33674158)
chr1 (143-278)||(5400877-5401011)
chr1 (144-287)||(19274556-19274699)
chr1 (143-278)||(26069898-26070033)
chr1 (143-287)||(23228194-23228338)
chr1 (143-287)||(33325724-33325868)
chr1 (143-278)||(45350717-45350850)
chr1 (143-278)||(45670486-45670621)
chr1 (143-287)||(48802331-48802475)
chr1 (143-287)||(52067651-52067795)
chr1 (143-278)||(48669396-48669531)
chr1 (143-292)||(16705862-16706011)
chr1 (143-287)||(7608766-7608910)
chr1 (143-287)||(18892326-18892470)
chr1 (146-278)||(24204474-24204606)
chr1 (143-287)||(52349924-52350068)
chr1 (143-278)||(37216902-37217037)
chr1 (145-278)||(41982237-41982370)
chr1 (143-287)||(46095075-46095219)
chr1 (143-278)||(8141486-8141621)
chr1 (143-278)||(18782089-18782224)
chr1 (144-287)||(50533380-50533523)
chr1 (144-278)||(18917530-18917664)
chr1 (165-278)||(48319068-48319181)
chr1 (143-287)||(6711437-6711581)
chr1 (143-287)||(17983898-17984042)
chr1 (143-287)||(43396672-43396816)
chr1 (165-287)||(33194673-33194795)
chr1 (165-278)||(9974848-9974961)
chr1 (180-287)||(12964643-12964750)
chr1 (143-278)||(21965071-21965206)
chr1 (143-278)||(34971086-34971221)
chr1 (165-278)||(16506810-16506923)
chr1 (143-287)||(40721339-40721484)
chr1 (165-287)||(30281628-30281750)
chr1 (143-278)||(21929527-21929667)
chr1 (143-278)||(33714361-33714494)
chr1 (143-278)||(25800650-25800782)
chr1 (143-244)||(44978768-44978868)
chr1 (206-287)||(50099217-50099298)
chr1 (236-287)||(44979281-44979332)
chr1 (240-287)||(32373650-32373697)
chr1 (240-278)||(17989864-17989902)
[»] chr8 (39 HSPs)
chr8 (143-287)||(1293483-1293627)
chr8 (143-287)||(2533269-2533413)
chr8 (143-278)||(15847118-15847253)
chr8 (143-278)||(37933648-37933783)
chr8 (143-287)||(3875905-3876049)
chr8 (143-287)||(36400070-36400214)
chr8 (143-278)||(38107105-38107240)
chr8 (143-287)||(513305-513448)
chr8 (143-287)||(43806533-43806677)
chr8 (143-278)||(259984-260118)
chr8 (143-278)||(655803-655937)
chr8 (143-278)||(841538-841672)
chr8 (143-287)||(22683988-22684132)
chr8 (143-287)||(35443308-35443452)
chr8 (143-287)||(38633710-38633854)
chr8 (143-278)||(35884430-35884565)
chr8 (143-278)||(28496355-28496489)
chr8 (143-269)||(41536527-41536653)
chr8 (143-287)||(28707446-28707590)
chr8 (143-278)||(40301893-40302028)
chr8 (143-287)||(12010546-12010693)
chr8 (143-268)||(23972295-23972420)
chr8 (143-287)||(9056338-9056482)
chr8 (143-278)||(38208758-38208894)
chr8 (143-278)||(440846-440981)
chr8 (165-287)||(7434883-7435005)
chr8 (165-287)||(23935230-23935352)
chr8 (143-287)||(33651838-33651982)
chr8 (143-287)||(24430571-24430715)
chr8 (143-278)||(36218781-36218915)
chr8 (148-278)||(39513344-39513474)
chr8 (165-278)||(6016211-6016324)
chr8 (143-275)||(13797098-13797229)
chr8 (143-278)||(4649156-4649291)
chr8 (165-287)||(29485284-29485405)
chr8 (143-278)||(42988227-42988361)
chr8 (206-287)||(24193356-24193436)
chr8 (144-208)||(24193131-24193195)
chr8 (224-278)||(8137180-8137234)
[»] chr7 (46 HSPs)
chr7 (143-287)||(35600122-35600266)
chr7 (143-287)||(1469493-1469637)
chr7 (143-287)||(31684134-31684278)
chr7 (143-287)||(47281124-47281268)
chr7 (144-287)||(44544406-44544549)
chr7 (144-278)||(33884325-33884459)
chr7 (143-278)||(37393998-37394133)
chr7 (144-278)||(47219151-47219285)
chr7 (143-287)||(30876256-30876400)
chr7 (143-287)||(38427563-38427707)
chr7 (143-287)||(47271978-47272122)
chr7 (143-278)||(47294291-47294426)
chr7 (143-292)||(48628797-48628946)
chr7 (143-271)||(2960640-2960768)
chr7 (143-287)||(8162712-8162856)
chr7 (143-287)||(11476556-11476700)
chr7 (143-287)||(23842302-23842446)
chr7 (143-287)||(27364339-27364483)
chr7 (143-287)||(30798368-30798512)
chr7 (143-287)||(30971941-30972085)
chr7 (143-287)||(40851271-40851415)
chr7 (143-278)||(44800410-44800545)
chr7 (143-287)||(43968259-43968403)
chr7 (143-287)||(45723491-45723635)
chr7 (148-278)||(4923222-4923352)
chr7 (143-287)||(41113374-41113518)
chr7 (143-287)||(43752776-43752920)
chr7 (143-278)||(11050261-11050396)
chr7 (143-261)||(221298-221416)
chr7 (165-278)||(37354285-37354398)
chr7 (143-278)||(7336066-7336200)
chr7 (143-287)||(41139408-41139556)
chr7 (165-287)||(3797545-3797667)
chr7 (144-278)||(29248348-29248482)
chr7 (143-287)||(42979338-42979482)
chr7 (143-287)||(47119988-47120134)
chr7 (143-287)||(47579086-47579231)
chr7 (165-287)||(27774105-27774227)
chr7 (143-278)||(18353150-18353285)
chr7 (191-287)||(40520915-40521011)
chr7 (224-287)||(39034059-39034122)
chr7 (143-196)||(42888937-42888990)
chr7 (143-199)||(5106127-5106182)
chr7 (241-277)||(43025119-43025155)
chr7 (233-272)||(12583313-12583352)
chr7 (235-287)||(29739778-29739829)
[»] chr4 (53 HSPs)
chr4 (143-287)||(11795154-11795298)
chr4 (143-287)||(33807780-33807924)
chr4 (143-287)||(42273799-42273943)
chr4 (143-287)||(55517185-55517329)
chr4 (143-287)||(28264640-28264784)
chr4 (143-278)||(26017429-26017564)
chr4 (143-278)||(49118617-49118752)
chr4 (143-287)||(4544985-4545129)
chr4 (143-287)||(12196466-12196610)
chr4 (143-287)||(19496102-19496246)
chr4 (143-287)||(31591073-31591216)
chr4 (143-287)||(31973588-31973732)
chr4 (143-287)||(48707733-48707877)
chr4 (143-278)||(23553071-23553205)
chr4 (144-287)||(32118711-32118854)
chr4 (144-287)||(40988630-40988773)
chr4 (144-278)||(37381852-37381986)
chr4 (143-287)||(28159953-28160097)
chr4 (143-287)||(33693333-33693477)
chr4 (143-278)||(2055284-2055419)
chr4 (143-278)||(5227396-5227531)
chr4 (143-278)||(8882013-8882148)
chr4 (143-274)||(23135006-23135137)
chr4 (143-278)||(24458631-24458766)
chr4 (143-278)||(28812287-28812421)
chr4 (143-278)||(32317959-32318094)
chr4 (143-278)||(44490325-44490460)
chr4 (143-278)||(48551764-48551899)
chr4 (144-278)||(33174021-33174155)
chr4 (143-287)||(15985007-15985151)
chr4 (143-287)||(17847096-17847239)
chr4 (143-287)||(35930037-35930180)
chr4 (143-287)||(48149496-48149640)
chr4 (143-278)||(30467003-30467138)
chr4 (143-287)||(9339123-9339270)
chr4 (143-278)||(50276138-50276270)
chr4 (143-287)||(17993017-17993161)
chr4 (143-278)||(39995167-39995302)
chr4 (145-263)||(10588601-10588719)
chr4 (165-287)||(19168817-19168939)
chr4 (165-287)||(24623145-24623267)
chr4 (143-287)||(14564793-14564937)
chr4 (143-287)||(30141108-30141252)
chr4 (143-287)||(50542354-50542498)
chr4 (143-278)||(25734223-25734358)
chr4 (143-287)||(39700042-39700186)
chr4 (143-287)||(51371047-51371191)
chr4 (143-278)||(25730246-25730381)
chr4 (143-252)||(31208776-31208885)
chr4 (143-287)||(22298514-22298659)
chr4 (165-268)||(42549644-42549747)
chr4 (203-287)||(56555200-56555284)
chr4 (143-218)||(20534231-20534306)
[»] chr5 (43 HSPs)
chr5 (143-278)||(14717611-14717746)
chr5 (143-278)||(39002025-39002160)
chr5 (143-287)||(38964114-38964257)
chr5 (144-287)||(30863250-30863393)
chr5 (143-287)||(3352002-3352146)
chr5 (143-287)||(6739955-6740099)
chr5 (143-287)||(8215897-8216041)
chr5 (143-287)||(26593280-26593424)
chr5 (143-287)||(27457197-27457341)
chr5 (143-287)||(30297749-30297893)
chr5 (143-287)||(31710279-31710423)
chr5 (143-278)||(14952330-14952465)
chr5 (143-289)||(23128913-23129059)
chr5 (143-287)||(11000728-11000872)
chr5 (143-287)||(11692147-11692291)
chr5 (143-287)||(16095960-16096103)
chr5 (143-287)||(33760470-33760614)
chr5 (143-287)||(35342177-35342321)
chr5 (143-287)||(42993515-42993659)
chr5 (143-278)||(6600136-6600271)
chr5 (144-287)||(41282339-41282482)
chr5 (143-287)||(6251969-6252113)
chr5 (143-287)||(8689569-8689713)
chr5 (143-287)||(39824553-39824697)
chr5 (143-287)||(40074947-40075091)
chr5 (143-292)||(43166269-43166418)
chr5 (143-287)||(19659501-19659645)
chr5 (143-287)||(20079258-20079402)
chr5 (143-278)||(4015874-4016009)
chr5 (143-278)||(20408539-20408674)
chr5 (143-276)||(1052541-1052674)
chr5 (143-287)||(30208402-30208546)
chr5 (143-287)||(28078405-28078549)
chr5 (143-278)||(27116099-27116234)
chr5 (165-287)||(16752113-16752235)
chr5 (143-278)||(19398193-19398328)
chr5 (165-287)||(26035368-26035490)
chr5 (182-287)||(6331374-6331479)
chr5 (143-278)||(11935452-11935586)
chr5 (165-276)||(444962-445073)
chr5 (143-287)||(8694863-8695007)
chr5 (143-287)||(27509975-27510112)
chr5 (143-187)||(6332873-6332917)
[»] chr6 (29 HSPs)
chr6 (143-287)||(3408186-3408330)
chr6 (143-287)||(10256234-10256378)
chr6 (143-278)||(1077243-1077378)
chr6 (143-287)||(12626633-12626777)
chr6 (144-287)||(6503715-6503858)
chr6 (143-292)||(9382511-9382660)
chr6 (143-287)||(1915343-1915487)
chr6 (143-278)||(2390271-2390406)
chr6 (143-278)||(30379023-30379158)
chr6 (143-287)||(2707456-2707600)
chr6 (143-287)||(8178249-8178393)
chr6 (143-287)||(29050269-29050413)
chr6 (143-278)||(17943042-17943177)
chr6 (143-278)||(26393009-26393144)
chr6 (143-278)||(17428272-17428407)
chr6 (143-273)||(2598099-2598229)
chr6 (143-287)||(3258807-3258951)
chr6 (143-287)||(26230932-26231076)
chr6 (143-278)||(16193316-16193451)
chr6 (143-287)||(11133870-11134015)
chr6 (165-278)||(26936613-26936726)
chr6 (165-269)||(35223921-35224025)
chr6 (143-278)||(26196321-26196456)
chr6 (143-269)||(6785101-6785224)
chr6 (143-263)||(10931148-10931267)
chr6 (143-230)||(31375971-31376058)
chr6 (144-278)||(25820550-25820684)
chr6 (143-201)||(12612971-12613029)
chr6 (143-223)||(12612848-12612928)
[»] chr2 (43 HSPs)
chr2 (143-287)||(16246193-16246337)
chr2 (143-287)||(27328581-27328725)
chr2 (143-287)||(7378960-7379104)
chr2 (143-287)||(9276571-9276715)
chr2 (143-287)||(28650426-28650570)
chr2 (143-287)||(40854606-40854750)
chr2 (143-278)||(921028-921163)
chr2 (143-278)||(33865267-33865402)
chr2 (149-287)||(771981-772119)
chr2 (143-287)||(2456007-2456151)
chr2 (143-287)||(11949426-11949570)
chr2 (143-287)||(34253139-34253283)
chr2 (143-287)||(41500502-41500646)
chr2 (143-278)||(7297234-7297369)
chr2 (143-278)||(37838303-37838438)
chr2 (144-287)||(17134226-17134369)
chr2 (143-278)||(19180428-19180562)
chr2 (143-272)||(33106969-33107098)
chr2 (143-287)||(1106559-1106703)
chr2 (143-287)||(2056923-2057067)
chr2 (143-287)||(2094410-2094554)
chr2 (143-287)||(8899679-8899822)
chr2 (143-287)||(12759750-12759893)
chr2 (143-278)||(2314975-2315110)
chr2 (143-278)||(17484550-17484685)
chr2 (144-287)||(36444229-36444372)
chr2 (144-287)||(38751045-38751188)
chr2 (150-287)||(3430631-3430768)
chr2 (143-287)||(43249412-43249556)
chr2 (143-278)||(25087796-25087931)
chr2 (165-287)||(8396573-8396695)
chr2 (143-276)||(42629970-42630103)
chr2 (143-287)||(29737745-29737889)
chr2 (148-287)||(36211043-36211182)
chr2 (143-287)||(37732193-37732337)
chr2 (143-278)||(45124125-45124260)
chr2 (168-270)||(37654122-37654224)
chr2 (143-235)||(14630663-14630755)
chr2 (165-278)||(19916009-19916122)
chr2 (183-287)||(41178059-41178163)
chr2 (143-278)||(9331762-9331897)
chr2 (143-233)||(23671811-23671901)
chr2 (228-275)||(23672958-23673005)
[»] scaffold1986 (1 HSPs)
scaffold1986 (143-287)||(111-255)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (143-287)||(218882-219027)
[»] scaffold0727 (1 HSPs)
scaffold0727 (143-278)||(5192-5326)
[»] scaffold0693 (1 HSPs)
scaffold0693 (143-278)||(5027-5162)
[»] scaffold0096 (1 HSPs)
scaffold0096 (143-278)||(47968-48103)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (143-287)||(252438-252582)
[»] scaffold0542 (1 HSPs)
scaffold0542 (165-287)||(1995-2117)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (143-278)||(13101-13236)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (143-278)||(59608-59743)
[»] scaffold0122 (1 HSPs)
scaffold0122 (144-278)||(11364-11498)
[»] scaffold1562 (1 HSPs)
scaffold1562 (143-218)||(605-680)
[»] scaffold1158 (1 HSPs)
scaffold1158 (143-218)||(1913-1988)
[»] scaffold0952 (1 HSPs)
scaffold0952 (143-218)||(3371-3446)
[»] scaffold0717 (1 HSPs)
scaffold0717 (143-218)||(1883-1958)
[»] scaffold0392 (1 HSPs)
scaffold0392 (231-287)||(289-345)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (234-287)||(19778-19831)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 141; Significance: 6e-74; HSPs: 56)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 26455723 - 26455579
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26455723 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 26455624  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26455623 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttg 26455579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 143 - 278
Target Start/End: Original strand, 35346471 - 35346606
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  35346471 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatctggctcctaacacccacttaaaa 35346570  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35346571 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 35346606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Original strand, 20813441 - 20813585
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  20813441 gaatcgtttcaaacaagtcataatgtagatagcataattggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 20813540  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  20813541 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctctttg 20813585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 38446617 - 38446473
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  38446617 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 38446518  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||    
T  38446517 ttagtcatctttttaggcatgacaaatagtagataatgctctttg 38446473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 143 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 1687792 - 1687657
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  1687792 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaa 1687693  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1687692 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 1687657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 143 - 278
Target Start/End: Original strand, 20760071 - 20760206
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||    
T  20760071 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacatccacttaaaa 20760170  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20760171 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 20760206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 1017185 - 1017041
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || ||||||||||||||||    
T  1017185 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgtctcataacacccacttaaaa 1017086  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  1017085 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctctttg 1017041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 33151837 - 33151693
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  33151837 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 33151738  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  33151737 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctctttg 33151693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 143 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 21564637 - 21564502
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  21564637 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtatcaaatatggctcctaacacccacttaaaa 21564538  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 278  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21564537 ttagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataa 21564502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 143 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 42017014 - 42016879
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  42017014 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagataacatagttggtaattgcttcattgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 42016915  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  42016914 ttagtcatctttttaggcatgacaaatgatggataa 42016879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 143 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 50287707 - 50287572
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  50287707 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttcattaaactcatatttggtaccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 50287608  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50287607 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 50287572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 21656659 - 21656515
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  21656659 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtatatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 21656560  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  21656559 ttagtcacctttttaggcatgataaatggtggataatgctctttg 21656515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 31122803 - 31122659
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||| |||||||    
T  31122803 gaatcgtttcaaacaagtcttattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaagacccgcttaaaa 31122704  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||    
T  31122703 ttagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatgctctttg 31122659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Original strand, 47329175 - 47329319
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  47329175 gaatcgtttccaacaagtcatatcgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 47329274  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||    
T  47329275 ttagtcatctttttaggtatggcaaatggtggataatgctctttg 47329319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 151 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 12748524 - 12748388
Alignment:
Q  151 tcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaattagtcat 250  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||    
T  12748524 tcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgttttctaacacccacttaaaattagtcat 12748425  T
Q  251 ctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| || |||||    
T  12748424 ctttttaggcatggcaaatggtggataatgctctttg 12748388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Original strand, 20086314 - 20086458
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||| | || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  20086314 gaatcgtttcaaacaagtcctattatagatagcatacttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 20086413  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||    
T  20086414 ttagtcatctttttaggcatggaaaatggtggataatgctctttg 20086458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 41251027 - 41250883
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    |||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||    
T  41251027 gaattgtttcaaacaagtcttattgtagatagcatagttggtaattgtttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacactcacttaaaa 41250928  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||    
T  41250927 ttagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatgctctttg 41250883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 143 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 21890311 - 21890176
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||| | || |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||    
T  21890311 gaatcgtttcaaacaagtcctattatagataacatatttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctagctcctaacacccacttaaaa 21890212  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21890211 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 21890176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 143 - 278
Target Start/End: Original strand, 36314972 - 36315107
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    |||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||| || ||||||||||||||||    
T  36314972 gaattgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttagtatcaaatctggctcttaacacccacttaaaa 36315071  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36315072 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 36315107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 149 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 22852131 - 22851993
Alignment:
Q  149 tttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaattagtc 248  Q
    ||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22852131 tttcaaataagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtactaaatatggctcctaacacccacttaaaattagtc 22852032  T
Q  249 atctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  22852031 atctgtttaggcatgacaaatggtggataatgctctttg 22851993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Original strand, 42107099 - 42107243
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  42107099 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagtatagttggtaattacttccttgaactcatctttgacaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 42107198  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||    
T  42107199 ttagtcatctttttaggcatgtcaaatggtggataatgctctttg 42107243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Original strand, 53925979 - 53926123
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||| ||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  53925979 gaatcatttcaaataagtcatattgtagatagtatagttggtaattgcttcattgaactcatctttggtaccaaatatgactcctaacacccacttaaaa 53926078  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  53926079 ttagtcatctttttaagcatgacaaatggtggataatgctctttg 53926123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 148 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 19664677 - 19664538
Alignment:
Q  148 gtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaattagt 247  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  || ||||| |||||||||||||||    
T  19664677 gtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttgataccaaatctgactcataacatccacttaaaattagt 19664578  T
Q  248 catctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  19664577 catctttttaggcatgacaaatggtggataatgctctttg 19664538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 143 - 278
Target Start/End: Original strand, 32650820 - 32650955
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||| ||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  32650820 gaatcatttcaaacaagttctattatagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 32650919  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 278  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  32650920 ttagtcatctttctaggcatggcaaatggtggataa 32650955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 143 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 51562303 - 51562168
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||  |  |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  51562303 gaatcgtttcaaacaagttctaatgtagataacatagttggtaattgtttccttgaactcatctttggtaccaaatctgcctcctaacacccacttaaaa 51562204  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51562203 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 51562168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 44798408 - 44798265
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||    
T  44798408 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgctttcttgaactcatctttggtaccgaatctggctcctaacacccacttaaaa 44798309  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    ||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| || |||||    
T  44798308 ttactcat-tttttaggcatgtcaaatggtggataatgctctttg 44798265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 143 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 3697287 - 3697152
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||| ||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||    
T  3697287 gaatcctttcaaacaagtcctattgtagatagtatagttggtaattgcttcattgaattcatctttggtaccaaatctcgctcctaacacccacttaaaa 3697188  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 278  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3697187 ttagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataa 3697152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 143 - 278
Target Start/End: Original strand, 10618480 - 10618615
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  10618480 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatgacataattggtaattgcttcattgaactcatctttggtatcaaatctgactcctaacacccacttaaaa 10618579  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10618580 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 10618615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 144 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 29677616 - 29677473
Alignment:
Q  144 aatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaat 243  Q
    |||||||||||||| ||| | | ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||    
T  29677616 aatcgtttcaaacaggtcctatcgtagatatcatagtttgtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccatttaaaat 29677517  T
Q  244 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  29677516 taatcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctctttg 29677473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 143 - 278
Target Start/End: Original strand, 35608131 - 35608266
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||     
T  35608131 gaatcgtttcaaataagtcctattgtagatagcataattggtaattggttccttgaactcatctttggtaccaaatcggactcctaacacccacttaaac 35608230  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35608231 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 35608266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 143 - 278
Target Start/End: Original strand, 40922165 - 40922300
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||    
T  40922165 gaatcgtttcaaacaagtcgtattgtagatagcatagttggtaattacttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacatccacttaaaa 40922264  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 278  Q
    ||||| || ||||||||||||  |||||||||||||    
T  40922265 ttagtaatttttttaggcatggaaaatggtggataa 40922300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 175 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 19268630 - 19268518
Alignment:
Q  175 catagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtgg 274  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19268630 catagttggtaattgcttcattgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtgg 19268531  T
Q  275 ataacgccctttg 287  Q
    |||| || |||||    
T  19268530 ataatgctctttg 19268518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Original strand, 27070739 - 27070883
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||| |||||||||    
T  27070739 gaatcgtttcaaacaagtcttattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttgataccaaatctgcctcctaacactcacttaaaa 27070838  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    ||||||||||||| || ||| | ||||||||||||| || |||||    
T  27070839 ttagtcatcttttcagacattataaatggtggataatgctctttg 27070883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 37248097 - 37247953
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  37248097 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttcattgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaa 37247998  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||| || |||| || |||||    
T  37247997 ttagtcatcttttcatgcatgacaaatgatgaataatgctctttg 37247953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 48651389 - 48651245
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  48651389 gaatcgtttcaaacaagtcctaatgtagatagcatagttggtaattgcttccttaaactcatctttgataccaaatctggcttctaacacccacttaaaa 48651290  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    ||| || |||||||||||||| |||||||||||||| || |||||    
T  48651289 ttaatcgtctttttaggcatggcaaatggtggataatgctctttg 48651245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Original strand, 52821049 - 52821193
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||  ||| |||||||||||||||||||    
T  52821049 gaatcgttttaaacaagtcctgttgtagataacatagttggtaattgcttctttgaactcatctttggtagtaaaactggctcctaacacccacttaaaa 52821148  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| || |||||    
T  52821149 ttagtcatctttttaggcataacaaatgatggataatgctctttg 52821193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 53196155 - 53196011
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||    
T  53196155 gaatcgtttcaaagaagtcttattgtagataacatagttggtaattatttccttgaactcatctttggtaccaaatctcgctcctaacacccacttaaaa 53196056  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||    
T  53196055 ttagttatctttttaggcatggcaaatggtggataatgctctttg 53196011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Original strand, 55164115 - 55164259
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    |||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||||||| ||||||||    
T  55164115 gaattgtttcaaataagtcatattgtagatagcatagttgctaattgcttccttgaactcatctttgatatcaaatctggctcctaacacctacttaaaa 55164214  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||| || |||||    
T  55164215 ttagtcatctttttaggcatgataaatagtggataatgctctttg 55164259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 143 - 278
Target Start/End: Original strand, 20913754 - 20913889
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||    
T  20913754 gaatcgtttcaaacaagttctattgtagatagcatagttgataattgcttctttgaactcatctttggtaccaaatatggctcctaacatccacttaaaa 20913853  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 278  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||    
T  20913854 ttagtcatctttttaggcatggcgaatggtgaataa 20913889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 143 - 278
Target Start/End: Original strand, 20921872 - 20922007
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||    
T  20921872 gaatcgtttcaaacaagttctattgtagatagcatagttgataattgcttctttgaactcatctttggtaccaaatatggctcctaacatccacttaaaa 20921971  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 278  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||    
T  20921972 ttagtcatctttttaggcatggcgaatggtgaataa 20922007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 165 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 50977983 - 50977870
Alignment:
Q  165 ttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatga 264  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  50977983 ttgtagatagcatagttggtagttgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacgcccacttaaaatcagtcatgtttttaggcatga 50977884  T
Q  265 caaatggtggataa 278  Q
    ||||||||||||||    
T  50977883 caaatggtggataa 50977870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 165 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 51081115 - 51081002
Alignment:
Q  165 ttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatga 264  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  51081115 ttgtagatagcatagttggtagttgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacgcccacttaaaatcagtcatgtttttaggcatga 51081016  T
Q  265 caaatggtggataa 278  Q
    ||||||||||||||    
T  51081015 caaatggtggataa 51081002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 165 - 278
Target Start/End: Original strand, 51475268 - 51475381
Alignment:
Q  165 ttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatga 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  51475268 ttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttgataccaaatctgcctcataacacccacttaaaatcagtcatctttttaggcatga 51475367  T
Q  265 caaatggtggataa 278  Q
    ||||||||||||||    
T  51475368 caaatggtggataa 51475381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Original strand, 1448735 - 1448876
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||| ||||| | ||||   || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  1448735 gaatcgtttcaaagaagtcctattgt---taccatagttggtaattgcttccttgaactcatctttagtatcaaatctggctcctaacacccacttaaaa 1448831  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||    
T  1448832 ttagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatgctctttg 1448876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 165 - 287
Target Start/End: Original strand, 50364909 - 50365031
Alignment:
Q  165 ttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatga 264  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||     
T  50364909 ttgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggctcctaacactcacttaaaatcagtaatctttttaggcatgg 50365008  T
Q  265 caaatggtggataacgccctttg 287  Q
    |||||||||| ||| || |||||    
T  50365009 caaatggtgggtaatgctctttg 50365031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Original strand, 33473239 - 33473383
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||    
T  33473239 gaatcgtttcaaacaagttttattgtagataacatagttggtaattgtttccttgattttatctttggtaccaaatctggtttctaacacgcacttaaaa 33473338  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| || |||||    
T  33473339 ttagtcatctttttagtcatgataaatggtggataatgctctttg 33473383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 39069867 - 39069723
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||| |||||| |||||| |||| |||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||    
T  39069867 gaatcgtttcaaacaagtcatattgttaatagcatagttgataattgtttcctttaacttatctttggtaccaaatctggctcttaacacccacttaaaa 39069768  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    ||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| || |||||    
T  39069767 ttagtcatcttttcatgcatggcaaatggtggataatgctctttg 39069723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Original strand, 45380260 - 45380404
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttgg-taattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaa 241  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| | |||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| || ||||||| |||||||    
T  45380260 gaatcgtttcaaacaagttctattgtagatagcatagtttgataattgcttctttaaactcatctttggtaccaaatctggctcataacacc-acttaaa 45380358  T
Q  242 attagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| || |||||    
T  45380359 attagtcatctttttatgcatggtaaatggtggataatgctctttg 45380404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 171 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 28699798 - 28699682
Alignment:
Q  171 atagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatg 270  Q
    ||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  28699798 atagcttagtagataattgcttccttgaactcatctttggcaccaaatctgactcctaacacccacttaaaatcagtcatctttttaggcatggcaaatg 28699699  T
Q  271 gtggataacgccctttg 287  Q
    |||||||| || |||||    
T  28699698 gtggataatgctctttg 28699682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Original strand, 38923998 - 38924142
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    |||| |||||||||||||| | | |||||||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||    
T  38923998 gaattgtttcaaacaagtcctatcgtagataaaatagttggtaattgcttcgttgaacttatctttggtaccaaattggactcctaacatccacttaaaa 38924097  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    ||| |||||| |||| |||||||||||  || ||||||| |||||    
T  38924098 ttaatcatctctttaagcatgacaaataatgaataacgctctttg 38924142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 165 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 34019579 - 34019466
Alignment:
Q  165 ttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatga 264  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||   |||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||     
T  34019579 ttgtagatagcatagttgataattgcttacttgaactcactgttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaatcagccatatttttaggcatgt 34019480  T
Q  265 caaatggtggataa 278  Q
    ||||||||||||||    
T  34019479 caaatggtggataa 34019466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 207 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 44152777 - 44152697
Alignment:
Q  207 ttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  44152777 ttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaattaatcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctctttg 44152697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 165 - 253
Target Start/End: Original strand, 42641200 - 42641288
Alignment:
Q  165 ttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaattagtcatctt 253  Q
    ||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||| | |||||||    
T  42641200 ttgtatatagccaagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaagtctgcctcctaacacccacttaaaatcaatcatctt 42641288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 224 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 47473290 - 47473227
Alignment:
Q  224 tcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  47473290 tcctaacatccacttaaaattagccatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctctttg 47473227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 19 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 26455847 - 26455797
Alignment:
Q  19 gcttcagctaggaacaccatgatgacaaagtcggtcaaatgcatctaaagg 69  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26455847 gcttcagctgggaacaccatgatgacaaagtcggtcaaatgcatctaaagg 26455797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 143 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 44152814 - 44152772
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggta 185  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||    
T  44152814 gaatcgtttcaaacaagtcatattatagataacatagttggta 44152772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 63)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Original strand, 23767414 - 23767558
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  23767414 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 23767513  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  23767514 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctctttg 23767558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 19315781 - 19315637
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  19315781 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgcctcctaacacccacttaaaa 19315682  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  19315681 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctctttg 19315637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Original strand, 38473626 - 38473770
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38473626 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatatcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggttcctaacacccacttaaaa 38473725  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  38473726 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctctttg 38473770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 46051591 - 46051447
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  46051591 gaatcgtttcaaacaagtcctgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggttcctaacacccacttaaaa 46051492  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||    
T  46051491 ctagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatgctctttg 46051447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Original strand, 7553016 - 7553160
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  7553016 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 7553115  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||    
T  7553116 ttagtcatctttttagccatgacaaatggtggataatgctctttg 7553160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 7651803 - 7651659
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  7651803 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttgataattgcttcattgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 7651704  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  7651703 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctctttg 7651659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 12143213 - 12143069
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  12143213 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 12143114  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  12143113 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctctttg 12143069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 41106157 - 41106013
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  41106157 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaa 41106058  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  41106057 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctctttg 41106013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 46825672 - 46825528
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  46825672 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcataattggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 46825573  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  46825572 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctctttg 46825528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 143 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 9962892 - 9962757
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  9962892 gaatcgtttcaaacaagttctgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctagttcctaacacccacttaaaa 9962793  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 278  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9962792 ttagtcatctttttaggcatgataaatggtggataa 9962757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 143 - 278
Target Start/End: Original strand, 49094711 - 49094846
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  49094711 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 49094810  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 278  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  49094811 ttagtcatctttttaggcataacaaatggtggataa 49094846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 143 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 49814441 - 49814306
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  49814441 gaatcgtttcaaataagtcatattctagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 49814342  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49814341 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 49814306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 26549529 - 26549385
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26549529 gaatcgttttaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttgataccaaatctggttcctaacacccacttaaaa 26549430  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  26549429 ttagtcatctttttaggcatgataaatggtggataatgctctttg 26549385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Original strand, 28425363 - 28425507
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  28425363 gaatcgtttcaaacaagtcctattgcagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaa 28425462  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  28425463 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctctttg 28425507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 52147134 - 52146990
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  52147134 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtatatagcatagtttgtaattgcttcattgaactcatctttggtatcaaatctggttcctaacacccacttaaaa 52147035  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  52147034 ttattcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctctttg 52146990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 143 - 278
Target Start/End: Original strand, 25988271 - 25988406
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  25988271 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattggttccttgaactcatctttggtaccaaatctgcctcctaacacccacttaaaa 25988370  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25988371 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 25988406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Original strand, 36157678 - 36157821
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  36157678 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcataattgg-aattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 36157776  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  36157777 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctctttg 36157821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 50690084 - 50689940
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  50690084 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagataacatagttggtaattgcttcattgaactcatctttggtaccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 50689985  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| || |||||    
T  50689984 ttagtcatctttttaggcatagcaaatgatggataatgctctttg 50689940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 143 - 278
Target Start/End: Original strand, 9878784 - 9878919
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||    
T  9878784 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagataaaatagttggtaattgcttccttgaactcatctttagtaccatatcgggttcctaacacccacttaaaa 9878883  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9878884 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 9878919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 143 - 278
Target Start/End: Original strand, 36781172 - 36781307
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36781172 gaatcgtttcaaacaagtcttattgtagatatcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggttcctaacacccacttaaaa 36781271  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 278  Q
    |||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  36781272 ttagtcgtctttttgggcatggcaaatggtggataa 36781307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 33674158 - 33674014
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  33674158 gaatcgtgtcaaacaagtcctattgtagatagcatagctggtaattgcttccttgaactcatctttcgtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 33674059  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||    
T  33674058 ttagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatgctctttg 33674014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 143 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 5401011 - 5400877
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||    
T  5401011 gaatcttttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggtttctaacatccacttaaaa 5400912  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 278  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5400911 ttagtcatctttttaggcatg-caaatggtggataa 5400877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 144 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 19274699 - 19274556
Alignment:
Q  144 aatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaat 243  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  19274699 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagctggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 19274600  T
Q  244 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||    
T  19274599 tagtcatctttttaggcatgacaaatagtggataatgctctttg 19274556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 143 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 26070033 - 26069898
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||  || |||||||||||||||||||    
T  26070033 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatatcatagttggtaattgtttccttgaactcatttttggtatcaaatccggctcctaacacccacttaaaa 26069934  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26069933 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 26069898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Original strand, 23228194 - 23228338
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||| ||||||    
T  23228194 gaatcgtttcaaacaagtactattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacatccatttaaaa 23228293  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||    
T  23228294 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtagataatgctctttg 23228338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 33325868 - 33325724
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||| | |||| ||||||||||||    
T  33325868 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttaaactcatctttggtatcaaatctggcttctaagacccacttaaaa 33325769  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  33325768 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctctttg 33325724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 143 - 278
Target Start/End: Original strand, 45350717 - 45350850
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||  | | ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  45350717 gaatcgtttcaaacaa--cctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgatctcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 45350814  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45350815 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 45350850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 143 - 278
Target Start/End: Original strand, 45670486 - 45670621
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagtt-ggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaa 241  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||    
T  45670486 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagtttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgattcctaaca-ccacttaaa 45670584  T
Q  242 attagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45670585 attagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 45670621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Original strand, 48802331 - 48802475
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| ||||||||    
T  48802331 gaatcgtttcaaacaagtcttattgtagatagcatagttggtaattgcttcattgaactcatctttggtatcaaatatggctcctaacacctacttaaaa 48802430  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  48802431 ttagtcatctttgtaggcatgataaatggtggataatgctctttg 48802475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Original strand, 52067651 - 52067795
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  52067651 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatggcataatttgtaattgcttccttgaactcatcgttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaa 52067750  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||    
T  52067751 ttattcatctttttagggatgacaaatggtggataatgctctttg 52067795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 143 - 278
Target Start/End: Original strand, 48669396 - 48669531
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||    
T  48669396 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtgattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacatccacttaaaa 48669495  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  48669496 ttagtcatctttttaggcatgacaaataatggataa 48669531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 143 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 16706011 - 16705862
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| ||||||||||||    
T  16706011 gaatcgtttcaaacaagtcttattttagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggcgcctaaaacccacttaaaa 16705912  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttgcttct 292  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||| ||||    
T  16705911 ttagtcatctttttaggcatggaaaatggtggataatgctctttgtttct 16705862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Original strand, 7608766 - 7608910
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  7608766 gaatcgtttcaaacaagtcctattatagatagcatagttgataattgcttctttgaactcatcttttgtaccaaatctgcctcctaacacccacttaaaa 7608865  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  7608866 ttagtcatgtttttaggcatgacaaatggtggataatgctctttg 7608910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 18892470 - 18892326
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||| ||||    
T  18892470 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttctttgaactcatctttgataccaaatctggcttctaacacccactgaaaa 18892371  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| || |||||    
T  18892370 ttagtcatccttttaggaatgacaaatggtggataatgctctttg 18892326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 146 - 278
Target Start/End: Original strand, 24204474 - 24204606
Alignment:
Q  146 tcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaatta 245  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |    
T  24204474 tcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcgtctttggtaccaaatctggctcctaatacccacttaaaatga 24204573  T
Q  246 gtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 278  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  24204574 gtcatctttttaggcatggcaaatgatggataa 24204606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Original strand, 52349924 - 52350068
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||||||||| || ||||||||||||||||    
T  52349924 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtaaatagcatagttggtaattgcttccttaaactcatcttttctatcaaatttggctcttaacacccacttaaaa 52350023  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||    
T  52350024 ttagtcatctttttaggcatgacaaatagtggataatgctctttg 52350068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 143 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 37217037 - 37216902
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | | || ||||||||||||||||    
T  37217037 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgtttccttgaactcatctttggtaccaactctagctcataacacccacttaaaa 37216938  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 278  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  37216937 ttagtcatctttttagacatggcaaatggtggataa 37216902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 145 - 278
Target Start/End: Original strand, 41982237 - 41982370
Alignment:
Q  145 atcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaatt 244  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||    
T  41982237 atcgtttcaaacaagtcatattgtagataacatagttgataattacttctttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccatttaaaatt 41982336  T
Q  245 agtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 278  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  41982337 agtcatatttttaggcatgacaaatggtggataa 41982370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Original strand, 46095075 - 46095219
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| ||  |||||||| ||||||||||    
T  46095075 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgtttccttgaactcatctttgatatcaaatctgtctcctaacatccacttaaaa 46095174  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || |||||    
T  46095175 ttagtcatctttttaaacatgacaaatggtggataatgctctttg 46095219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 143 - 278
Target Start/End: Original strand, 8141486 - 8141621
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||  |  ||||||||||||||||    
T  8141486 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcataatttgtaattgcttctttgaactcatctttagtaccaaatctgacttgtaacacccacttaaaa 8141585  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8141586 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 8141621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 143 - 278
Target Start/End: Original strand, 18782089 - 18782224
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||||||||    
T  18782089 gaatcatttcaaacaagtcatattctagatagcatagttgataattgcttatttgaactcatctttggtacaaaatctggttcatagcacccacttaaaa 18782188  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 278  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18782189 ttagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataa 18782224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 144 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 50533523 - 50533380
Alignment:
Q  144 aatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaat 243  Q
    |||||||||||||||||| | || |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  50533523 aatcgtttcaaacaagtcctattatagataacatagttggtaattgcttcattgaactcatctttggtaccgaatctggctcctaacacccacttaaaat 50533424  T
Q  244 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  ||||||| || |||||    
T  50533423 tagtcatctttttaggcatgtcaaattttggataatgctctttg 50533380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 144 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 18917664 - 18917530
Alignment:
Q  144 aatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaat 243  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  18917664 aatcgtttcaaacaaatcatattgtagatagcatatttaataattgcttccttgaatttatctttggtaccaaatatgactcctaacacccacttaaaat 18917565  T
Q  244 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 278  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18917564 tagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataa 18917530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 165 - 278
Target Start/End: Original strand, 48319068 - 48319181
Alignment:
Q  165 ttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatga 264  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  48319068 ttgtatatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtactaaatctggctcctaacacccacttaaaatcagtcatctttttaggcatta 48319167  T
Q  265 caaatggtggataa 278  Q
    ||||||||||||||    
T  48319168 caaatggtggataa 48319181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 6711581 - 6711437
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  6711581 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagacattatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggcttctaacacccacttaaaa 6711482  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    |||| ||||||||||  ||||  ||||||||||||| || |||||    
T  6711481 ttagccatctttttacacatggtaaatggtggataatgctctttg 6711437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Original strand, 17983898 - 17984042
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    |||||||||||| |||||| |  |||| ||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||    
T  17983898 gaatcgtttcaaccaagtcctaatgtaaataacatagtttgtaattgcttctttgaactcatctttggtaccaaatctgattcataacacccacttaaaa 17983997  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||    
T  17983998 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtagataatgctctttg 17984042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 43396816 - 43396672
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    |||||||||||||||| || |  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  43396816 gaatcgtttcaaacaaatcctactgtagatagcagagttgataattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 43396717  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    ||||||||||||||| ||||  |||||| ||||||| || |||||    
T  43396716 ttagtcatctttttaagcatagcaaatgatggataatgctctttg 43396672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 165 - 287
Target Start/End: Original strand, 33194673 - 33194795
Alignment:
Q  165 ttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatga 264  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  33194673 ttgtagatagcatagttggtagttgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaatcagtcatctttttaggcatgg 33194772  T
Q  265 caaatggtggataacgccctttg 287  Q
    | |||||||| ||| || |||||    
T  33194773 cgaatggtggttaatgctctttg 33194795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 165 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 9974961 - 9974848
Alignment:
Q  165 ttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatga 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  9974961 ttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtactaaatatggctcgtaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgg 9974862  T
Q  265 caaatggtggataa 278  Q
     |||||||||||||    
T  9974861 taaatggtggataa 9974848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 180 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 12964750 - 12964643
Alignment:
Q  180 ttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataac 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||     
T  12964750 ttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatgttgtataat 12964651  T
Q  280 gccctttg 287  Q
    || |||||    
T  12964650 gctctttg 12964643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 143 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 21965206 - 21965071
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||  |||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||    
T  21965206 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatgacataattggtaattgcttcattaaactcatctttggtaccaaatctgactccttacacccacttaaaa 21965107  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 278  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  21965106 ttagtcatctttttaggcatggcaaatggtgtataa 21965071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 143 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 34971221 - 34971086
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||| ||  ||||||||| |||||||||    
T  34971221 gaatcgtttcaaacaagtcctaatgtagataacatagttggtaattgtttctttgaactcatatttggtatcaaatctgactcctaacactcacttaaaa 34971122  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 278  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34971121 ttagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataa 34971086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 165 - 278
Target Start/End: Original strand, 16506810 - 16506923
Alignment:
Q  165 ttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatga 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||     
T  16506810 ttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcaaccttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaatcagccatctttttaagcatgg 16506909  T
Q  265 caaatggtggataa 278  Q
    ||||||||||||||    
T  16506910 caaatggtggataa 16506923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 40721484 - 40721339
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacaccc-acttaaa 241  Q
    |||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||| || ||||    
T  40721484 gaatcgtttccaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgctttcttgaactcatctttgataccaaatctggctcctaatacccaacctaaa 40721385  T
Q  242 attagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  40721384 attaattatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctctttg 40721339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 165 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 30281750 - 30281628
Alignment:
Q  165 ttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatga 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||     
T  30281750 ttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaataccagttatctttttaggcatgt 30281651  T
Q  265 caaatggtggataacgccctttg 287  Q
     ||||||||||||| || |||||    
T  30281650 aaaatggtggataatgctctttg 30281628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 143 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 21929667 - 21929527
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcat-------ctttggtaccaaatttggttcctaacaccca 235  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||| ||| |||||| |||||    
T  21929667 gaatcgtttcaaacaagttctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttcatctttggtaccaaatctggctcctaaaaccca 21929568  T
Q  236 cttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 278  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||    
T  21929567 cttaaaattagtcatctttttag--atggcaaatggtggataa 21929527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 143 - 278
Target Start/End: Original strand, 33714361 - 33714494
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    |||||||||||||||| || | ||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||| |||||| | |    
T  33714361 gaatcgtttcaaacaaatcctattgtagataacatagttgataattgtttccttgaactcatctttgataccaaatctgactcctaaca-ccactt-aca 33714458  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33714459 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 33714494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 143 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 25800782 - 25800650
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctt----tggtaccaaatttggttcctaacacccactt 238  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||| |      ||||||||||||    
T  25800782 gaatcgtttcaaacaagtcttattgtagataacat-gttggtaattgcttccttgaactcatcttaatttggtaccaaatct------taacacccactt 25800690  T
Q  239 aaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25800689 aaaattagtcatctttttaggcatgataaatggtggataa 25800650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 143 - 244
Target Start/End: Original strand, 44978768 - 44978868
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| | ||||||||||    
T  44978768 gaatcgtttcaaacaagtcagaatgtagatagcataattgataattgcttccttgaacttatctttggtaccaaatctggctcctaata-ccacttaaaa 44978866  T
Q  243 tt 244  Q
    ||    
T  44978867 tt 44978868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 206 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 50099298 - 50099217
Alignment:
Q  206 tttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    ||||||||||||| ||  |  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  50099298 tttggtaccaaatatgacttttaacatccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctctttg 50099217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 236 - 287
Target Start/End: Original strand, 44979281 - 44979332
Alignment:
Q  236 cttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  44979281 cttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctctttg 44979332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 240 - 287
Target Start/End: Original strand, 32373650 - 32373697
Alignment:
Q  240 aaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  32373650 aaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctctttg 32373697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 240 - 278
Target Start/End: Original strand, 17989864 - 17989902
Alignment:
Q  240 aaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  17989864 aaattagtcatctttttaggcatgacaaatagtgaataa 17989902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 121; Significance: 5e-62; HSPs: 39)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 1293627 - 1293483
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  1293627 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtatcaaatctggtttctaacacccacttaaaa 1293528  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  1293527 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctctttg 1293483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 2533413 - 2533269
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||    
T  2533413 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatatcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctccaaacacccacttaaaa 2533314  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  2533313 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctctttg 2533269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 143 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 15847253 - 15847118
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  15847253 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 15847154  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 278  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15847153 ttagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataa 15847118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 143 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 37933783 - 37933648
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  37933783 gaatcgtttcaaacaagtcttatcgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 37933684  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37933683 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 37933648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 3876049 - 3875905
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||    
T  3876049 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtactatatctggttcctaacacccacttaaaa 3875950  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  3875949 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctctttg 3875905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Original strand, 36400070 - 36400214
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||     
T  36400070 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgccttctaacacccacttaaac 36400169  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  36400170 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctctttg 36400214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 143 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 38107240 - 38107105
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  38107240 gaatcgtttcaaacaagtcttattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 38107141  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 278  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  38107140 ttaatcatctttttaggcatgataaatggtggataa 38107105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 513448 - 513305
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  513448 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 513349  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  513348 ttagtcat-tttttaggcgtgacaaatggtggataatgctctttg 513305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Original strand, 43806533 - 43806677
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| |||||||||    
T  43806533 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtactaaatctggctcctaacactcacttaaaa 43806632  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| || |||||    
T  43806633 ttagtcatctttttaggcatggcaaatgatggataatgctctttg 43806677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 143 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 260118 - 259984
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  260118 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 260019  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 278  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || ||||||||    
T  260018 ttagtcat-tttttaggcatgacagattgtggataa 259984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 143 - 278
Target Start/End: Original strand, 655803 - 655937
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  655803 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 655902  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 278  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || ||||||||    
T  655903 ttagtcat-tttttaggcatgacagattgtggataa 655937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 143 - 278
Target Start/End: Original strand, 841538 - 841672
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  841538 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 841637  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 278  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || ||||||||    
T  841638 ttagtcat-tttttaggcatgacagattgtggataa 841672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Original strand, 22683988 - 22684132
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  22683988 gaatcatttcaaacaagtcatattgtagatatcatagttggtaattgtttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 22684087  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| || |||||    
T  22684088 ttagtcatctttttagccatgacaaatggtgaataatgctctttg 22684132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 35443452 - 35443308
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  35443452 gaatcgtttcaaacaagttctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 35443353  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||    
T  35443352 ttagttatctttttaggcatggcaaatagtggataatgctctttg 35443308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Original strand, 38633710 - 38633854
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||    
T  38633710 gaatcgtttcaaacaagttctaatgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgatttctaacacccacttaaaa 38633809  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||    
T  38633810 ttagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatgctctttg 38633854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 143 - 278
Target Start/End: Original strand, 35884430 - 35884565
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||    
T  35884430 gaatcgtttcaaacaagtcttattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcgtaacacccacttaaaa 35884529  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 278  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  35884530 ttagtcatctttttaggcatggcaaatggaggataa 35884565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 143 - 278
Target Start/End: Original strand, 28496355 - 28496489
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||| ||||||||||||    
T  28496355 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctagtt-ctaatacccacttaaaa 28496453  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28496454 ttagtcatctttttaggcatgacaaatgatggataa 28496489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 143 - 269
Target Start/End: Original strand, 41536527 - 41536653
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  41536527 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaatttatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaa 41536626  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaat 269  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  41536627 ttagtcatctttttaggcatgacaaat 41536653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Original strand, 28707446 - 28707590
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    |||||||||||||||| || | ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| || ||||||||||||||||    
T  28707446 gaatcgtttcaaacaaatcctattgtagatatcataattggtaattgcttccttgaactcatctttgataccaaatctggctcataacacccacttaaaa 28707545  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||    
T  28707546 ttagtcatcttttaaggcatgacaaatggtggataatgctctttg 28707590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 143 - 278
Target Start/End: Original strand, 40301893 - 40302028
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| | | ||||||||| |||||||||    
T  40301893 gaatcgtttcaaaaaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttcattgaatttatctttggtaccaaatctagctcctaacactcacttaaaa 40301992  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 278  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40301993 ttaatcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 40302028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 12010693 - 12010546
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtag---atagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccactta 239  Q
    |||| |||||||||||||| | ||||||   ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12010693 gaattgtttcaaacaagtcctattgtagtagatagcatagttggtaattgttgccttgaactcatctttggtaccaaatttggctcctaacacccactta 12010594  T
Q  240 aaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||    
T  12010593 aaattagtcatctttttatgcatggcaaatggtggataatgctctttg 12010546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 143 - 268
Target Start/End: Original strand, 23972295 - 23972420
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||    
T  23972295 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctgactcctatcacccacttaaaa 23972394  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaa 268  Q
    |||||||||||||||| |||||||||    
T  23972395 ttagtcatctttttagacatgacaaa 23972420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Original strand, 9056338 - 9056482
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    |||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||| ||||||||||    
T  9056338 gaattgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttctttgaactcatctttgataccaaatctgactcctaacatccacttaaaa 9056437  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  9056438 ttagtcatctttttaggcatgataaatggtggataatgctctttg 9056482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 143 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 38208894 - 38208758
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  38208894 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagataacatagttggtaattgcttctttgaactcatctttgctaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 38208795  T
Q  243 ttagtcat-ctttttaggcatgacaaatggtggataa 278  Q
    |||||||| | |||||| |||| ||||||||||||||    
T  38208794 ttagtcatccattttagacatggcaaatggtggataa 38208758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 143 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 440981 - 440846
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  440981 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtatatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatttttcgtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 440882  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 278  Q
    ||| |||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  440881 ttactcatctttttagacatggcaaacggtggataa 440846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 165 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 7435005 - 7434883
Alignment:
Q  165 ttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatga 264  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  7435005 ttgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaattagtcatctttataggcttga 7434906  T
Q  265 caaatggtggataacgccctttg 287  Q
    |||||||||||||| || |||||    
T  7434905 caaatggtggataatgctctttg 7434883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 165 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 23935352 - 23935230
Alignment:
Q  165 ttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatga 264  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  23935352 ttgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatctttagtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaatcagtcatctttttaggcatgg 23935253  T
Q  265 caaatggtggataacgccctttg 287  Q
    |||||||||||||| || |||||    
T  23935252 caaatggtggataatgctctttg 23935230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 33651982 - 33651838
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  |||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  33651982 gaatcgtttcaaacaagtcctatcgtagatagcatagtttgtaattgtttccttgaactcatctttcataccaaatctgcctcctaacacccacttaaaa 33651883  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || |||||    
T  33651882 ttagtcatctttttagacatgacaaacggtggataatgctctttg 33651838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Original strand, 24430571 - 24430715
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| |||||| ||  |||||||||||||||||||||||| |   | |||||||||||||||||    
T  24430571 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagtatagttgataattgttttattgaactcatctttggtaccaaatctcactactaacacccacttaaaa 24430670  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||    
T  24430671 ttagtcatctttttaggcatgacaaaaggtggataatgctctttg 24430715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 143 - 278
Target Start/End: Original strand, 36218781 - 36218915
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  | ||| |||||||||||||    
T  36218781 gaatcgtttcaaacaagtcatgatgtagataatatagttgataattgcttc-ttgaactcatctttggtaccaaatctgacttctagcacccacttaaaa 36218879  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 278  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  36218880 ttagccatctttttaggcatggcaaatggtggataa 36218915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 148 - 278
Target Start/End: Original strand, 39513344 - 39513474
Alignment:
Q  148 gtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaattagt 247  Q
    |||||||| ||||| |  |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||    
T  39513344 gtttcaaataagtcctaatgtagataacatagttggtaattgctttcttgaactcatctttggtaccaaatctaactcctaacacccacttaaaattagt 39513443  T
Q  248 catctttttaggcatgacaaatggtggataa 278  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||    
T  39513444 catctttttaggcatggcatatggtggataa 39513474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 165 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 6016324 - 6016211
Alignment:
Q  165 ttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatga 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||  ||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6016324 ttgtagatagcatagttggtaattgcttctttaaactcatctttgatactcaatttggctcctaacatccacttaaaatcagtcatctttttaggcatga 6016225  T
Q  265 caaatggtggataa 278  Q
    ||||||||||||||    
T  6016224 caaatggtggataa 6016211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 143 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 13797229 - 13797098
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    |||||||||||||||| || | ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||| |||| |||||    
T  13797229 gaatcgtttcaaacaaatcctattgtatatagcatagttggtaattgcttctttgaactcat-tttggtatcaaatctggctcctaacatccacataaaa 13797131  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtgga 275  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13797130 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtgga 13797098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 143 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 4649291 - 4649156
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||  | | |||| ||||||||||    
T  4649291 gaatcgtttcaaacaagtccaattgtagatagcataattggtaattgtttccttgaactcgtctttggtaccaaatctgacttccaacatccacttaaaa 4649192  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 278  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  4649191 ttagtcatttttttaggcatggcaaatggtggataa 4649156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 165 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 29485405 - 29485284
Alignment:
Q  165 ttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatga 264  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||     
T  29485405 ttgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctaactcctaacacccacttaaaatcagtcat-tttttaggcatgg 29485307  T
Q  265 caaatggtggataacgccctttg 287  Q
    |||||| ||||||| || |||||    
T  29485306 caaatgatggataatgctctttg 29485284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 143 - 278
Target Start/End: Original strand, 42988227 - 42988361
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||| ||||| | |||||||||  ||||||| |||||||||| || |||| || ||||||||||||| |   |||||||||||||||||||    
T  42988227 gaatcgtttcaaa-aagtcctattgtagataatatagttgataattgcttcatttaacttatatttggtaccaaatctaactcctaacacccacttaaaa 42988325  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  42988326 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtagataa 42988361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 206 - 287
Target Start/End: Original strand, 24193356 - 24193436
Alignment:
Q  206 tttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||    
T  24193356 tttggtaccaaatctggctcctaacacc-acttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtgaataatgctctttg 24193436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 144 - 208
Target Start/End: Original strand, 24193131 - 24193195
Alignment:
Q  144 aatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatcttt 208  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24193131 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatcttt 24193195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 224 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 8137234 - 8137180
Alignment:
Q  224 tcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 278  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||    
T  8137234 tcctaacacctacttaaaattagtcatttttttaggcatagcaaatggtggataa 8137180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 121; Significance: 5e-62; HSPs: 46)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Original strand, 35600122 - 35600266
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  35600122 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatatggctcctaacacccacttaaaa 35600221  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  35600222 ttagttatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctctttg 35600266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Original strand, 1469493 - 1469637
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  1469493 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttgttaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 1469592  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  1469593 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctctttg 1469637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Original strand, 31684134 - 31684278
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31684134 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagaatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 31684233  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||    
T  31684234 ttagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatgctctttg 31684278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Original strand, 47281124 - 47281268
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  47281124 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataccatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 47281223  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  47281224 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctctttg 47281268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 144 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 44544549 - 44544406
Alignment:
Q  144 aatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaat 243  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  44544549 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatatggctcctaacacccacttaaaat 44544450  T
Q  244 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  44544449 tagtcatctttttaggcatgataaatggtggataatgctctttg 44544406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 144 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 33884459 - 33884325
Alignment:
Q  144 aatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaat 243  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  33884459 aatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaat 33884360  T
Q  244 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 278  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33884359 tagccatctttttaggcatgacaaatggtggataa 33884325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 143 - 278
Target Start/End: Original strand, 37393998 - 37394133
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||    
T  37393998 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtagttgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttgactcctaacacccagttaaaa 37394097  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37394098 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 37394133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 144 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 47219285 - 47219151
Alignment:
Q  144 aatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaat 243  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||| |||||||||||    
T  47219285 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtactaaatctggctcctaacatccacttaaaat 47219186  T
Q  244 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47219185 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 47219151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 30876400 - 30876256
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  30876400 gaatcgtttcaaacaagtgctattgtagatagcatagttggtaattgcttcattgaactcatttttggtaccaaattgggctcctaacacccacttaaaa 30876301  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  30876300 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctctttg 30876256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Original strand, 38427563 - 38427707
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  38427563 gaatcgtttcaaacaagtcctattatagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtatcaaatctggctcctaacacccacttaaaa 38427662  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||    
T  38427663 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggcggataatgctctttg 38427707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 47272122 - 47271978
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||    
T  47272122 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccgaatctggctcctaacacccacttaaaa 47272023  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||    
T  47272022 ttagtcatctttttaggcatgacaaatgatggataatgctctttg 47271978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 143 - 278
Target Start/End: Original strand, 47294291 - 47294426
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||    
T  47294291 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatcgttggtaattgcttccttgaactcatctttggtacaaaatctggctcctaacacccacttataa 47294390  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47294391 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 47294426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 143 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 48628946 - 48628797
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  48628946 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcattttttgcaccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 48628847  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttgcttct 292  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  48628846 ttaatcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctctttgtttct 48628797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 143 - 271
Target Start/End: Original strand, 2960640 - 2960768
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  2960640 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgtttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 2960739  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatgg 271  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2960740 ttagtcatctttttaggcatggcaaatgg 2960768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Original strand, 8162712 - 8162856
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    |||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  8162712 gaattgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttgttatcaaatctggctcctaacacccacttaaaa 8162811  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||    
T  8162812 ttagtcatctttttaggcatgacaaattgtggataatgctctttg 8162856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Original strand, 11476556 - 11476700
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  11476556 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 11476655  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    |||||||| |||||||||||| | |||||||| ||| || |||||    
T  11476656 ttagtcatttttttaggcatggcgaatggtgggtaatgctctttg 11476700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 23842446 - 23842302
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| |||    
T  23842446 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttgataccaaatctggctcctaacacccacttcaaa 23842347  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||    
T  23842346 ttagtcatctttttaggcatggcagatggtggataatgctctttg 23842302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Original strand, 27364339 - 27364483
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    |||||||||||||||  || | ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27364339 gaatcgtttcaaacagatcctattgtagataacatagttggtaattacttccttgaactcatctttggtaccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 27364438  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||    
T  27364439 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctctttg 27364483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Original strand, 30798368 - 30798512
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    |||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  30798368 gaatcgtttcaaacaaatcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 30798467  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| || |||||    
T  30798468 ttagtcatctttttaggcattgcaaatgatggataatgctctttg 30798512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Original strand, 30971941 - 30972085
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30971941 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatggcatagttggtaattacttccttaaacccatctttggtaccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 30972040  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||    
T  30972041 ttagtcatctttttaagcatgacaaattgtggataatgctctttg 30972085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 40851415 - 40851271
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  40851415 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtaggtagaatagttggtaattgcttccttgaactaatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 40851316  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||    
T  40851315 ttagtcatctttttaggcacgacaaatggtggataatgctctttg 40851271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 143 - 278
Target Start/End: Original strand, 44800410 - 44800545
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44800410 gaattgtttcaaacaagtcctgttgtagataacatagttggtaattgtttcattgaactcatctttggtaccaaatatggttcctaacacccacttaaaa 44800509  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 278  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  44800510 ttagtcatctttttaggcatgatatatggtggataa 44800545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Original strand, 43968259 - 43968403
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||| ||||||||||||    
T  43968259 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcgtagttggtaattgcttccttgaactcatctttgatatcaaatttggctcataatacccacttaaaa 43968358  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  43968359 ttagtcatctttataggcatgacaaatggtggataatgctctttg 43968403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Original strand, 45723491 - 45723635
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| || ||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  45723491 gaatcgtttcaaacaaatcatattgtagatagcataattagtaattgttttcttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaa 45723590  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  45723591 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctctttg 45723635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 148 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 4923352 - 4923222
Alignment:
Q  148 gtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaattagt 247  Q
    |||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  4923352 gtttcaaacaagtcctattgtggatagcatagttggtaattacttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacatccacttaaaattagt 4923253  T
Q  248 catctttttaggcatgacaaatggtggataa 278  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4923252 catctttttaggcatggcaaatggtggataa 4923222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 41113518 - 41113374
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  41113518 gaatcatttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatatttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 41113419  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| || |||| || |||||    
T  41113418 ttagtcatctttttagacatggcaaatgatgaataatgctctttg 41113374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Original strand, 43752776 - 43752920
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  |||||||| ||||||||||    
T  43752776 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcataattggtaattgcttccttgaactcatctttggtactaaatctgactcctaacatccacttaaaa 43752875  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| || |||||    
T  43752876 ttagtcatcttttgaggcaggacaaatggtggataatgctctttg 43752920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 143 - 278
Target Start/End: Original strand, 11050261 - 11050396
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  |||||| ||||||||||||    
T  11050261 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatatttggtaattgcttccttgaattcatctttggtaccaaatctgcctcctaatacccacttaaaa 11050360  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 278  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  11050361 ttagtcatctttttaggcatggtaaatggtggataa 11050396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 143 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 221416 - 221298
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  221416 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgtttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 221317  T
Q  243 ttagtcatctttttaggca 261  Q
    |||||| ||||||||||||    
T  221316 ttagtcttctttttaggca 221298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 165 - 278
Target Start/End: Original strand, 37354285 - 37354398
Alignment:
Q  165 ttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatga 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  37354285 ttgtagatagcatagttggtaattgcttcattgaactcatctttggtatcaaatttggctcctaacacccacttaaaatcagtcatctttttaggcatgg 37354384  T
Q  265 caaatggtggataa 278  Q
    ||||||||||||||    
T  37354385 caaatggtggataa 37354398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 143 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 7336200 - 7336066
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    |||||||||||||||  || | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  7336200 gaatcgtttcaaacagttc-tattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatcattgataccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 7336102  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7336101 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtgaataa 7336066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Original strand, 41139408 - 41139556
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcata----gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccactt 238  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||    
T  41139408 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtaaatagcatatatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtactaaatctggctcctaacacccgctt 41139507  T
Q  239 aaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||    
T  41139508 aaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtgaataatgctctttg 41139556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 165 - 287
Target Start/End: Original strand, 3797545 - 3797667
Alignment:
Q  165 ttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatga 264  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  3797545 ttgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaatcagtcatctttttaggcatgt 3797644  T
Q  265 caaatggtggataacgccctttg 287  Q
     ||||||||||||| || |||||    
T  3797645 taaatggtggataatgctctttg 3797667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 144 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 29248482 - 29248348
Alignment:
Q  144 aatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaat 243  Q
    |||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  29248482 aatcatttcaaacaagtcttattgtagatagcatagttggtaattgattccttgaactcatctttggcatcaaatctgcctcctaacacccacttaaaat 29248383  T
Q  244 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 278  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  29248382 tagtcatctttttaggcatggcaaattgtggataa 29248348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Original strand, 42979338 - 42979482
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| ||  |||||||| ||||||||||    
T  42979338 gaatcgtttcaaacaagtcctactgtagataacatagttggtaattgcttcgttgaactcatctttgatatcaaatctgactcctaacatccacttaaaa 42979437  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||    
T  42979438 ttagtcatctttttaggcatgacaaatagtggataatgctctttg 42979482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 47120134 - 47119988
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcata--gttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaa 240  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||  |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  47120134 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagagagcatatagttggtaattgctttcttgaactcatatttggtaccaaatatgactcctaacacccacttaa 47120035  T
Q  241 aattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  47120034 aattagttatctttttaggcatgataaatggtggataatgctctttg 47119988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Original strand, 47579086 - 47579231
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaatt-gcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaa 241  Q
    |||| |||||| ||||||| | || ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  47579086 gaattgtttcagacaagtcctattatagatagcataattggtaatttgcttccttgaactcatctttggtaccaaatatggctcctaacacccacttaaa 47579185  T
Q  242 attagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    ||||  |||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||    
T  47579186 attaaccatctttttaggaatgacaaatggtggataatgctctttg 47579231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 165 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 27774227 - 27774105
Alignment:
Q  165 ttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatga 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||     
T  27774227 ttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcaaccttggtaccaaatctggctcctaaaacccacttaaaatcagccatctttttaggcatgg 27774128  T
Q  265 caaatggtggataacgccctttg 287  Q
    |||||||||||||| || |||||    
T  27774127 caaatggtggataatgctctttg 27774105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 143 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 18353285 - 18353150
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||| | ||||||    
T  18353285 gaatcgtttcaaacaagtcctaaggtagatagcatagttggtaattgttttcttgaactcatctttgataccaaatctgactcctaacacctaattaaaa 18353186  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 278  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  18353185 ttagtcatctttttagacatgataaatggtggataa 18353150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 191 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 40521011 - 40520915
Alignment:
Q  191 ttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||| || |||||    
T  40521011 ttccttgaactcatctttggtaccaaatatggctcctaacacccacttaaaatcagtcatctttttagccatggcaaatggtggataatgctctttg 40520915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 224 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 39034122 - 39034059
Alignment:
Q  224 tcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  39034122 tcctaacgcccacttaaaattaatcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctctttg 39034059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 143 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 42888990 - 42888937
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttcctt 196  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42888990 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttcctt 42888937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 143 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 5106182 - 5106127
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaa 199  Q
    |||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5106182 gaatcgtttcaaacat-tcttattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaa 5106127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 241 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 43025155 - 43025119
Alignment:
Q  241 aattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggata 277  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  43025155 aattagtcatctttttaggcatgacaaatgatggata 43025119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 233 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 12583352 - 12583313
Alignment:
Q  233 ccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggt 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  12583352 ccacttaaaattagtcatctttttacgcatgaaaaatggt 12583313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 235 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 29739829 - 29739778
Alignment:
Q  235 acttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| || |||||    
T  29739829 acttaaaattagtcatc-ttttaggcatggtaaatggtggataatgctctttg 29739778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 121; Significance: 5e-62; HSPs: 53)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Original strand, 11795154 - 11795298
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11795154 gaatcgtttcaaacaagtcatattctagatagcatagttggtaattgtttccttgaactcatctttggtaccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 11795253  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  11795254 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctctttg 11795298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Original strand, 33807780 - 33807924
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33807780 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 33807879  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  33807880 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctctttg 33807924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 42273943 - 42273799
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  42273943 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaa 42273844  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  42273843 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctctttg 42273799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Original strand, 55517185 - 55517329
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  55517185 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttctttgaactcatctttgataccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 55517284  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  55517285 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctctttg 55517329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 28264784 - 28264640
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || ||||||||||||||||    
T  28264784 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgtctcataacacccacttaaaa 28264685  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  28264684 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctctttg 28264640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 143 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 26017564 - 26017429
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  26017564 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 26017465  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 278  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  26017464 ttagtcatctttttaggcatgataaatagtggataa 26017429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 143 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 49118752 - 49118617
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  49118752 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttcattgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaa 49118653  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49118652 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 49118617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Original strand, 4544985 - 4545129
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  4544985 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttaaactcatctttgataccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 4545084  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  4545085 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctctttg 4545129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 12196610 - 12196466
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  12196610 gaatcatttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 12196511  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  12196510 ttaatcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctctttg 12196466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Original strand, 19496102 - 19496246
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    |||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  19496102 gaattgtttcaaacaagtcctattgtagataccatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggcgcctaacacccacttaaaa 19496201  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||    
T  19496202 ttagtcatctttttaggcatgtcaaatggtggataatgctctttg 19496246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 31591216 - 31591073
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  31591216 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 31591117  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  31591116 ttagtcat-tttttaggcgtgacaaatggtggataatgctctttg 31591073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 31973732 - 31973588
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  31973732 gaatcgtttcaaacaagttctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaa 31973633  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||    
T  31973632 ttagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatgctctttg 31973588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Original strand, 48707733 - 48707877
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||    
T  48707733 gaatcttttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacatccacttaaaa 48707832  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  48707833 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctctttg 48707877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 143 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 23553205 - 23553071
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| ||||||||||    
T  23553205 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcataattgttaattgcttccttgaactcatctttgataccaaatctggctcctaaca-ccacttaaaa 23553107  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23553106 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 23553071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 144 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 32118854 - 32118711
Alignment:
Q  144 aatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaat 243  Q
    |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  32118854 aatcgtttcaaacaagttctattgtagatagcatagttggtaattgcttcattgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccccttaaaat 32118755  T
Q  244 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  32118754 taatcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgctctttg 32118711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 144 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 40988773 - 40988630
Alignment:
Q  144 aatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaat 243  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  40988773 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatctttggtatcaaatctggctcctaacacccacttaaaat 40988674  T
Q  244 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||    
T  40988673 tagtcatctttttaggcatgacaaattgtggataatgctctttg 40988630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 144 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 37381986 - 37381852
Alignment:
Q  144 aatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaat 243  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  37381986 aatcatttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttccttaaactcatttttggtaccatatctggttcctaacacccacttaaaat 37381887  T
Q  244 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 278  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37381886 tagtcatctttttagacatgacaaatggtggataa 37381852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Original strand, 28159953 - 28160097
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  28159953 gaatcatttcaaacaagtcttattgtagataccatagttggtaattgctttcttgaactcatctttggtatcaaatctggctcctaacacccacttaaaa 28160052  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  28160053 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctctttg 28160097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Original strand, 33693333 - 33693477
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  33693333 gaatcgtttcaaacaagtcctgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgattcctaacacccacttaaaa 33693432  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    ||| |||||||||||| |||| |||||| | ||||| || |||||    
T  33693433 ttattcatctttttagacatggcaaatgatagataatgctctttg 33693477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 143 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 2055419 - 2055284
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  2055419 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagataacatagttgataattgcttccttaaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaag 2055320  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 278  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2055319 ttaatcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 2055284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 143 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 5227531 - 5227396
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||  | ||||||||||    
T  5227531 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctagtatccacttaaaa 5227432  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5227431 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 5227396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 143 - 278
Target Start/End: Original strand, 8882013 - 8882148
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  8882013 gaatcgtttcaaacaagtcctattctagatagcatagttgataattgcttctttgaactcatctttggtatcaaatctggctcctaacacccacttaaaa 8882112  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8882113 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 8882148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 143 - 274
Target Start/End: Original strand, 23135006 - 23135137
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  23135006 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 23135105  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtgg 274  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  23135106 ttagtcatttttttaggcatgccaaatggtgg 23135137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 143 - 278
Target Start/End: Original strand, 24458631 - 24458766
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||    
T  24458631 gaatcgtttcaaacaagtcttattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcgtaacacccacttaaaa 24458730  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 278  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  24458731 ttagtcatctttttaggcatggcaaatggaggataa 24458766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 143 - 278
Target Start/End: Original strand, 28812287 - 28812421
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||    
T  28812287 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaagtcatctttggtaccaaatctggctcctaaca-ccacttaaaa 28812385  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 278  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28812386 ttagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataa 28812421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 143 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 32318094 - 32317959
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||| ||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  32318094 gaatcatttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttcattgaactcatctttggtaccaaatctgtctcctaacacccacttaaaa 32317995  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32317994 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 32317959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 143 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 44490460 - 44490325
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||     
T  44490460 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatatcatagttggtaattgcttcattgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaag 44490361  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44490360 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 44490325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 143 - 278
Target Start/End: Original strand, 48551764 - 48551899
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||  |||||||||||||||||||    
T  48551764 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatggttggtaattgctttcttgaactcatctttggtacaaaatctgactcctaacacccacttaaaa 48551863  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 278  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  48551864 ttagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataa 48551899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 144 - 278
Target Start/End: Original strand, 33174021 - 33174155
Alignment:
Q  144 aatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaat 243  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  33174021 aatcgtttcaaacaagtcttattgtagatttcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttagtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 33174120  T
Q  244 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 278  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33174121 tagtcatctttttatgcatgacaaatggtggataa 33174155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 15985151 - 15985007
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||| ||||||||    
T  15985151 gaatcgtttcaaacaagtcatattctagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttagtaccaaatctggctcctaacacctacttaaaa 15985052  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  15985051 tcagtaatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctctttg 15985007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Original strand, 17847096 - 17847239
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  17847096 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcataattggtaattgcttccttgaactcatctttgataccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 17847195  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||    
T  17847196 ttagtcatc-ttttaggcatggcaaatggtggataatgctctttg 17847239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 35930180 - 35930037
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  35930180 gaatcgtttcaaacaagttctattgtagatagcatagttggtaattgcttccatgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 35930081  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||    
T  35930080 ttagtcatctttttaggcatgacaaa-ggtggataatgctctttg 35930037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 48149640 - 48149496
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||    
T  48149640 gaatcgtttcaaacaagtcctaatgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctgacacccacttaaaa 48149541  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  48149540 ttactcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgcactttg 48149496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 143 - 278
Target Start/End: Original strand, 30467003 - 30467138
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||| ||||||    
T  30467003 gaatcgtttcaaacaagttctattgtagatagcatagttggtaatttcttccttgaactcatctttggtaccaaatctcgctcctaacacccatttaaaa 30467102  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 278  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30467103 ttagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataa 30467138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Original strand, 9339123 - 9339270
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatc---tttggtaccaaatttggttcctaacacccactta 239  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  9339123 gaatcatttcaaacaagtcatattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatcatatttggtaccaaatctggctcctaacacccactta 9339222  T
Q  240 aaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| || |||||    
T  9339223 aaattagtcatctttttatgcatgacaaatggtgaataatgctctttg 9339270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 143 - 278
Target Start/End: Original strand, 50276138 - 50276270
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  50276138 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgattcctaacacccacttaaaa 50276237  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 278  Q
    ||||   |||||||||||||| |||| |||||||||    
T  50276238 ttag---tctttttaggcatggcaaacggtggataa 50276270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Original strand, 17993017 - 17993161
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||||||||| || ||||||||||||||||    
T  17993017 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtaaatagcatagttggtaattgcttccttaaactcatcttttctatcaaatttggctcttaacacccacttaaaa 17993116  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||    
T  17993117 ttagtcatctttttaggcatgacaaatagtggataatgctctttg 17993161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 143 - 278
Target Start/End: Original strand, 39995167 - 39995302
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||    
T  39995167 gaatcgtttcaaacaagttctattgtagataacatagttggtaattgcttcattgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaaaacccacttaaaa 39995266  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 278  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  39995267 ttaatcatctttttaggcatggcaaatggtggataa 39995302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 145 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 10588719 - 10588601
Alignment:
Q  145 atcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaatt 244  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |    
T  10588719 atcgtttcaaacaagtcgtattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatatttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaact 10588620  T
Q  245 agtcatctttttaggcatg 263  Q
    |||||||||||||||||||    
T  10588619 agtcatctttttaggcatg 10588601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 165 - 287
Target Start/End: Original strand, 19168817 - 19168939
Alignment:
Q  165 ttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatga 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19168817 ttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtatcaaatttgactcataacacccacttaaaatcagtcatctttttaggcatga 19168916  T
Q  265 caaatggtggataacgccctttg 287  Q
    |||||||||||||| || |||||    
T  19168917 caaatggtggataatgctctttg 19168939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 165 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 24623267 - 24623145
Alignment:
Q  165 ttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatga 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||    
T  24623267 ttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaatcagttatttttttaggcatga 24623168  T
Q  265 caaatggtggataacgccctttg 287  Q
    |||||||||||||| || |||||    
T  24623167 caaatggtggataatgctctttg 24623145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 14564937 - 14564793
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||||||||| ||||||    
T  14564937 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtatatagcatagttggtaattgcttcattgaactcatttttcgtaccaaatctggctcctaacacccagttaaaa 14564838  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || |||||    
T  14564837 ttagtcatctttttaggcatggcaaacggtggataatgctctttg 14564793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Original strand, 30141108 - 30141252
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| || ||||||||||||||||    
T  30141108 gaatcgtttcaaacaagtcctattgttgatagcatagttggtaattgcttcattgaactcatctttggtatcaaatctggctcttaacacccacttaaaa 30141207  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| || |||||    
T  30141208 ttagtcatctttttaggcattgcaaatgatggataatgctctttg 30141252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Original strand, 50542354 - 50542498
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||| |||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  50542354 gaatcgttttaaacaaatcttattgtagatagcatagttggtaattgcttcattgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaa 50542453  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||    
T  50542454 ttaatcatctttttaggcatggtaaatggtggataatgctctttg 50542498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 143 - 278
Target Start/End: Original strand, 25734223 - 25734358
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||| ||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  25734223 gaatcatttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttaattgaactcatctttcgtaccaaatctgcctcctaacacccacttaaaa 25734322  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25734323 ttagtcatctttttaggcatgacaaacggtggataa 25734358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 39700186 - 39700042
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||| | || |||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||| |||||||||    
T  39700186 gaatcgtttcaaacaagtcttattatagataacataattggtaattgtttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcttaacactcacttaaaa 39700087  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| || |||||    
T  39700086 ttagtcatctttttaggcatgacaaattgtgaataatgctctttg 39700042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Original strand, 51371047 - 51371191
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||    
T  51371047 gaatcgtttcaaacaagttctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaattcatctttggtaccaaatctaactcctaacacccacttaaaa 51371146  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    |||||||| ||||||| |||| ||||||||| |||| || |||||    
T  51371147 ttagtcatttttttagacatggcaaatggtgaataatgctctttg 51371191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 143 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 25730381 - 25730246
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||  |  |||||||| ||||||||||    
T  25730381 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgattccttgaactcatctttggcactaaatccgactcctaacatccacttaaaa 25730282  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 278  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||    
T  25730281 ttagtcatctttttaggcatagcaaatagtggataa 25730246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 143 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 31208885 - 31208776
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||||||    
T  31208885 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtatcaaatctggctcccaacacccacttaaaa 31208786  T
Q  243 ttagtcatct 252  Q
    ||||||||||    
T  31208785 ttagtcatct 31208776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 22298659 - 22298514
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||| | | |||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||| || ||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  22298659 gaatcgtttcaaacaagccctattgtagatagcataattggtaattgtttccttaaactcatctttgatatcaaatctggctcctaacacccacttaaaa 22298560  T
Q  243 ttagtcatct-ttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    |||||||||| ||||||||||  |||||||||||||| || |||||    
T  22298559 ttagtcatcttttttaggcatagcaaatggtggataatgctctttg 22298514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 165 - 268
Target Start/End: Original strand, 42549644 - 42549747
Alignment:
Q  165 ttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatga 264  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  42549644 ttgtagataacatagttggtaattgcttcattgaacttatctttggtactaaatttggctcctaacacccacttaaaatcaatcatctttttaggcatga 42549743  T
Q  265 caaa 268  Q
    ||||    
T  42549744 caaa 42549747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 203 - 287
Target Start/End: Original strand, 56555200 - 56555284
Alignment:
Q  203 atctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    |||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  56555200 atctttggtaccaaatctggctcctgacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctctttg 56555284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 143 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 20534306 - 20534231
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaat 218  Q
    ||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20534306 gaatcgtttcaaacaagtcctattgttgatagcatagttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaccaaat 20534231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 43)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 143 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 14717746 - 14717611
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  14717746 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 14717647  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14717646 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 14717611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 143 - 278
Target Start/End: Original strand, 39002025 - 39002160
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  39002025 gaattgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 39002124  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39002125 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 39002160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Original strand, 38964114 - 38964257
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  38964114 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 38964213  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  38964214 ttagtcat-tttttaggcatgacaaatggtggataatgctctttg 38964257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 144 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 30863393 - 30863250
Alignment:
Q  144 aatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaat 243  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  30863393 aatcgtttcaaacaagtcataatgtagatagcatagttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 30863294  T
Q  244 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  30863293 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctctttg 30863250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Original strand, 3352002 - 3352146
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3352002 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatatttggtaccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 3352101  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||    
T  3352102 ttagtcatctttttaggcatgacaaagggtggataatgctctttg 3352146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Original strand, 6739955 - 6740099
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  6739955 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgcctcctaacacccacttaaaa 6740054  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  6740055 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctctttg 6740099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 8216041 - 8215897
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  8216041 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 8215942  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||    
T  8215941 ttagtcatctttttaggaatgacaaatggtggataatgctctttg 8215897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Original strand, 26593280 - 26593424
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  26593280 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttctttgaacttatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 26593379  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  26593380 ttaatcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctctttg 26593424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Original strand, 27457197 - 27457341
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||    
T  27457197 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccactttaaa 27457296  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||    
T  27457297 ttagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatgctctttg 27457341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Original strand, 30297749 - 30297893
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||    
T  30297749 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttcaactcatctttggtaccaaatctggctcctagcacccacttaaaa 30297848  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  30297849 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctctttg 30297893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 31710423 - 31710279
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||    
T  31710423 gaatcgtttcaaacaagtcataatgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacatccacttaaaa 31710324  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  31710323 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctctttg 31710279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 143 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 14952465 - 14952330
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  14952465 gaatcgtttcaaacaagtcttgttgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtatcaaatctggctcctaacacccacttaaaa 14952366  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 278  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14952365 ttagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataa 14952330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 143 - 289
Target Start/End: Original strand, 23128913 - 23129059
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||    
T  23128913 gaatcgtttcaaacaagtcatatcgtagatagcataattggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacaaccacttaaaa 23129012  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttgct 289  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||    
T  23129013 ttagtcatctttttaggcatgataaatggtggataatgctctttgct 23129059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Original strand, 11000728 - 11000872
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  11000728 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 11000827  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    |||||||||||||||||| || ||| |||||||||| || |||||    
T  11000828 ttagtcatctttttaggcctggcaagtggtggataatgctctttg 11000872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Original strand, 11692147 - 11692291
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  11692147 gaatcgtttcaaacaagtcatattgcagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttgataccaaatctgcctcctaacacccacttaaaa 11692246  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||    
T  11692247 ttagtcatctttttaggcatcacaaatggtggataatgctctttg 11692291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Original strand, 16095960 - 16096103
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  16095960 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctt-ggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 16096058  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||    
T  16096059 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataatgctctttg 16096103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Original strand, 33760470 - 33760614
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  33760470 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattacttctttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 33760569  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||    
T  33760570 ttagtcatctttttagtcatgacaaatggtggataatgctctttg 33760614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 35342321 - 35342177
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  35342321 gaatcgtttcaaacaagtctcattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatctttggtatcaaatctggctcctaacacccacttaaaa 35342222  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  35342221 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctctttg 35342177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 42993659 - 42993515
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    |||| ||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  42993659 gaattgtttcaaacaattcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 42993560  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||    
T  42993559 ttagtcatctttttaggcatggtaaatggtggataatgctctttg 42993515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 143 - 278
Target Start/End: Original strand, 6600136 - 6600271
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  6600136 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggcttctaacacccacttaaaa 6600235  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 278  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  6600236 ttagtcatctttttaggcatggtaaatggtggataa 6600271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 144 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 41282482 - 41282339
Alignment:
Q  144 aatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaat 243  Q
    |||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||    
T  41282482 aatcatttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacactcacttaaaat 41282383  T
Q  244 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  41282382 tagtcatctttttaggcatgataaatggtggataatgctctttg 41282339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 6252113 - 6251969
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||    
T  6252113 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctgccttctaacacccacttaaaa 6252014  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||    
T  6252013 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtgaataatgctctttg 6251969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 8689713 - 8689569
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  8689713 gaatcgtttcaaacaagtcataatgtagataacatagttggtaattgattccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 8689614  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||    
T  8689613 ttagtcatctttttaggcatggcaaatagtggataatgctctttg 8689569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 39824697 - 39824553
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  39824697 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatgacatagttggtaattgcttccttgaacttatctttggtaccaaatctgcctcctaacacccacttaaaa 39824598  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  39824597 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctctttg 39824553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 40075091 - 40074947
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    |||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  40075091 gaattgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttcattgaactcatctttggtactaaatctggctcctaacacccacttaaaa 40074992  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  40074991 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctctttg 40074947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 143 - 292
Target Start/End: Original strand, 43166269 - 43166418
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    |||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  || ||||||||||||||||    
T  43166269 gaattgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgctttcttgaactcatctttggtaccaaatctgactcataacacccacttaaaa 43166368  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttgcttct 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||| ||||    
T  43166369 ttagtcatctttttaggcatgacaaatgatggataatgctctttgtttct 43166418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Original strand, 19659501 - 19659645
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||    
T  19659501 gaatcgtttcaaataagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttttttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaatacccacttaaaa 19659600  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||    
T  19659601 ttagtcatctttttaggcatgacaaattgtggataatgctctttg 19659645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Original strand, 20079258 - 20079402
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  20079258 gaatcgtttcaaacaagtcctaatgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttagtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaa 20079357  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||    
T  20079358 ttagtcatctttttaggcatgacaaattgtggataatgctctttg 20079402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 143 - 278
Target Start/End: Original strand, 4015874 - 4016009
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    |||||||||||| |||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||    
T  4015874 gaatcgtttcaagcaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacctacttaaaa 4015973  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 278  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  4015974 ttagtcatatttttaggcatgataaatggtggataa 4016009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 143 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 20408674 - 20408539
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||    
T  20408674 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttcattgaactcatatttggtaccaaatctagctcctaacacccgcttaaaa 20408575  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 278  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20408574 ttagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataa 20408539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 143 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 1052674 - 1052541
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    |||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  1052674 gaattgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatccttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 1052575  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggat 276  Q
    ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  1052574 ttactcatctttttaagcatggcaaatggtggat 1052541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Original strand, 30208402 - 30208546
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||| ||||||||||||  | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  30208402 gaatcatttcaaacaagttctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacctacttaaaa 30208501  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  30208502 ttaatcatctttttaggcatgataaatggtggataatgctctttg 30208546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Original strand, 28078405 - 28078549
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  28078405 gaatcgtttcaaacaagtcctaatgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttgataccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 28078504  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    ||||| | ||  |||||||||||||||||| ||||| || |||||    
T  28078505 ttagtaaactaattaggcatgacaaatggtagataatgctctttg 28078549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 143 - 278
Target Start/End: Original strand, 27116099 - 27116234
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||| |||||| |||    
T  27116099 gaatcattttaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatatttggtaccaaatctggctcctaacatccacttcaaa 27116198  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 278  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  27116199 ttagtcatctttttaggcattacaaatcgtggataa 27116234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 165 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 16752235 - 16752113
Alignment:
Q  165 ttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatga 264  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16752235 ttgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggatcctaacatccacttaaaatcagtcatctttttaggcatga 16752136  T
Q  265 caaatggtggataacgccctttg 287  Q
    ||||||||| |||| || |||||    
T  16752135 caaatggtgaataatgctctttg 16752113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 143 - 278
Target Start/End: Original strand, 19398193 - 19398328
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||| ||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |   |||||||||||||||||    
T  19398193 gaatcatttcaaacaagttctattgtagatagcatagttggtaattgtttctttgaactcatctttggtaccaaatctagcctctaacacccacttaaaa 19398292  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 278  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19398293 ttagtcatctttttaggtatgacaaatggtggataa 19398328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 165 - 287
Target Start/End: Original strand, 26035368 - 26035490
Alignment:
Q  165 ttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatga 264  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  26035368 ttgtagataccatagttggtaattgctttcttgaactcatctttggtaccaaatatggctcctaatacccacttaaaatcagtcatctttttaggcacga 26035467  T
Q  265 caaatggtggataacgccctttg 287  Q
    |||||||||||||| || |||||    
T  26035468 caaatggtggataatgctctttg 26035490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 182 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 6331479 - 6331374
Alignment:
Q  182 ggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgc 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  6331479 ggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtgaataatgc 6331380  T
Q  282 cctttg 287  Q
     |||||    
T  6331379 tctttg 6331374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 143 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 11935586 - 11935452
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||| ||| ||||||||| |||||||||    
T  11935586 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgtttccttgatctcatcttt-gaaccaaatgtggctcctaacactcacttaaaa 11935488  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 278  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  11935487 ttagccatctttttaggcataacaaatagtggataa 11935452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 165 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 445073 - 444962
Alignment:
Q  165 ttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatga 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||     
T  445073 ttgtagatagcatagttggtaattgctttcttgaactcatctttggtatcaaatatgactcctaaaacccacttaaaatcagtcgtctttttaggcgtgg 444974  T
Q  265 caaatggtggat 276  Q
    ||||||||||||    
T  444973 caaatggtggat 444962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 8695007 - 8694863
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    |||| |||||||||||||| | |||||||||||||| ||| |||||  ||| |||||||||||||| ||||||||| ||| || ||| || |||||||||    
T  8695007 gaattgtttcaaacaagtcctattgtagatagcataattgataattatttcattgaactcatctttagtaccaaatctggctcataatactcacttaaaa 8694908  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    |||||||| || |||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  8694907 ttagtcatgttcttaggcatgataaatggtggataatgctctttg 8694863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 27510112 - 27509975
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||   ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||        |||| |   ||||||||    
T  27510112 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtaataagcatagttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaccaaa------aactaa-aaggacttaaaa 27510020  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  27510019 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctctttg 27509975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 143 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 6332917 - 6332873
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaat 187  Q
    ||||||||||||||||||  | |||||||||| ||||||||||||    
T  6332917 gaatcgtttcaaacaagttctattgtagatagaatagttggtaat 6332873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 29)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 3408330 - 3408186
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  3408330 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagtatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 3408231  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  3408230 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctctttg 3408186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 10256378 - 10256234
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10256378 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggttcctaacacccacttaaaa 10256279  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || |||||    
T  10256278 ttagtcatctttttaggcattgcaaatggtggataatgctctttg 10256234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 143 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 1077378 - 1077243
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1077378 gaatcgtttcaaataagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtatcaaatctggttcctaacacccacttaaaa 1077279  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 278  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1077278 ttaatcatctttttaggcatggcaaatggtggataa 1077243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 12626777 - 12626633
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12626777 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagaatagttggtaattgcttccttgaacttatctttggtaccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 12626678  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||    
T  12626677 ttagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatgctctttg 12626633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 144 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 6503858 - 6503715
Alignment:
Q  144 aatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaat 243  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  6503858 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatatcatagttggtaattgcttccttgaacccatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 6503759  T
Q  244 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  6503758 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctctttg 6503715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 143 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 9382660 - 9382511
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  9382660 gaatcgtttcaaacaagtcctgatgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgcctcctaacacccacttaaaa 9382561  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttgcttct 292  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  9382560 ttagtcatctttttaagcatgacaaatggtggataatgctctttgtttct 9382511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Original strand, 1915343 - 1915487
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    |||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  1915343 gaatagtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttgataccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 1915442  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  1915443 ttaatcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctctttg 1915487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 143 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 2390406 - 2390271
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| ||    
T  2390406 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatatagctcctaacacccacttataa 2390307  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2390306 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 2390271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 143 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 30379158 - 30379023
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  30379158 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggcttctaacacccacttaaaa 30379059  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 278  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  30379058 ttagtcatctttttaggcatggtaaatggtggataa 30379023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 2707600 - 2707456
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||    
T  2707600 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatatcatagttggtaattgcttccttgaactcgtctttggtaccaaatctggctcctaacactcacttaaaa 2707501  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||    
T  2707500 ttagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatgctctttg 2707456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Original strand, 8178249 - 8178393
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  8178249 gaatcgtttcaaacatgtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatttttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 8178348  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||    
T  8178349 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtggataatgctctttg 8178393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 29050413 - 29050269
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  29050413 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 29050314  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    |||||||| |||||||||||| | |||||||| ||| || |||||    
T  29050313 ttagtcatttttttaggcatggcgaatggtgggtaatgctctttg 29050269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 143 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 17943177 - 17943042
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  17943177 gaatcgtttcaaacaagtcctaatgtagatagcataattggtaattgcttccttaaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 17943078  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17943077 ttagtcatctttttaggcatgacaaatagtggataa 17943042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 143 - 278
Target Start/End: Original strand, 26393009 - 26393144
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||| || |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||    
T  26393009 gaatcgtttcaaaaaacttctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacactcacttaaaa 26393108  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26393109 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 26393144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 143 - 278
Target Start/End: Original strand, 17428272 - 17428407
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||| ||||||||||    
T  17428272 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtactaaatctggctcctaacatccacttaaaa 17428371  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  17428372 ttagtcatctttttaggcatgacaaacggtgaataa 17428407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 143 - 273
Target Start/End: Original strand, 2598099 - 2598229
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  2598099 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatatcatagttggtaattgctttattgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 2598198  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtg 273  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  2598199 ttactcatctttttaggcatggcaaatggtg 2598229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Original strand, 3258807 - 3258951
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagtt-ggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaa 241  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||    
T  3258807 gaatcgtttcaaacaagttctattgtagataccatagtttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacc-acttaaa 3258905  T
Q  242 attagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3258906 attagtcatctttttatgcatgacaaatggtggataacgctctttg 3258951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Original strand, 26230932 - 26231076
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||| |  |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  26230932 gaatcgtttcaaacaagtcctaatgtaaataacatagttggtagtttcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggcttctaacacccacttaaaa 26231031  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  26231032 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctctttg 26231076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 143 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 16193451 - 16193316
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||  |  || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16193451 gaatcgtttcaaacaagttctaatgcagataaaatagttggtaattgcttccttgaactcatctttgataccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 16193352  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 278  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16193351 ttagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataa 16193316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 11134015 - 11133870
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttcctt-gaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaa 241  Q
    ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  11134015 gaatcgtttcaaacaagtcctatcgtagatagcatagatggtaattgcttcctttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaa 11133916  T
Q  242 attagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| || |||||    
T  11133915 attagtcatctttttagacataacaaatgatggataatgctctttg 11133870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 165 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 26936726 - 26936613
Alignment:
Q  165 ttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatga 264  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26936726 ttgtagatagcatagttgataattgtttccttgaactcatctttggtaccaaatccggctcctaacacccacttaaaatcagtcatctttttaggcatga 26936627  T
Q  265 caaatggtggataa 278  Q
    ||||||||||||||    
T  26936626 caaatggtggataa 26936613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 165 - 269
Target Start/End: Original strand, 35223921 - 35224025
Alignment:
Q  165 ttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatga 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  35223921 ttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtatcaaatctagctcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgt 35224020  T
Q  265 caaat 269  Q
    |||||    
T  35224021 caaat 35224025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 143 - 278
Target Start/End: Original strand, 26196321 - 26196456
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagtt-ggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaa 241  Q
    |||||| ||||| |||||| | ||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||| |||||||| | |||||||    
T  26196321 gaatcggttcaaccaagtcctattgtagataacatagtttggtaattgcttccgtgaactcatctttggtactaaatctggctcctaacaac-acttaaa 26196419  T
Q  242 attagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 278  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26196420 attaatcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 26196456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 143 - 269
Target Start/End: Original strand, 6785101 - 6785224
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||| |  |||||||| |||| |||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  6785101 gaatcgtttcaaacaagtcctaatgtagataacataattggt---tgcttccttgaactcatatttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 6785197  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaat 269  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||    
T  6785198 ttagtcatctttttagtcatgtcaaat 6785224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 143 - 263
Target Start/End: Original strand, 10931148 - 10931267
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||| ||||||||||| |  ||| ||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||| |||||||    
T  10931148 gaatcgtatcaaacaagtcctaatgtggatagcatagttg-taattgttttcttgaactcatctttggtaccaaatctgacttctaacacccgcttaaaa 10931246  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatg 263  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  10931247 ttagtcatctttttaggcatg 10931267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 143 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 31376058 - 31375971
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaac 230  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||    
T  31376058 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgttaattgcttccttgaacttatctttggtaccaaatctggctcctaac 31375971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 144 - 278
Target Start/End: Original strand, 25820550 - 25820684
Alignment:
Q  144 aatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaat 243  Q
    ||||||||||||||| || | | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |   || ||||||||| |||||||    
T  25820550 aatcgtttcaaacaattcctatcgtagatagcatagttggtaattgcttcattgaactcatgtttggtaccaaatctaactcataacacccatttaaaat 25820649  T
Q  244 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 278  Q
    |||||||  |||||| |||| |||||  |||||||    
T  25820650 tagtcataattttagtcatgtcaaattatggataa 25820684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 143 - 201
Target Start/End: Original strand, 12612971 - 12613029
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaact 201  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12612971 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaact 12613029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 143 - 223
Target Start/End: Original strand, 12612848 - 12612928
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggt 223  Q
    ||||| ||||||||||||| | |||||||||||| |||| ||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  12612848 gaatcatttcaaacaagtcctattgtagatagcaaagttagtacttgcttcattgaactcatctttgctaccaaatctggt 12612928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 43)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Original strand, 16246193 - 16246337
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  16246193 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 16246292  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||    
T  16246293 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtagataatgctctttg 16246337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 27328725 - 27328581
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  27328725 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaa 27328626  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  27328625 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctctttg 27328581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 7379104 - 7378960
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  7379104 gaatcgtttcaaacaagtcataatgtagatagaatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 7379005  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  7379004 ttagtcctctttttaggcatgacaaatggtggataatgctctttg 7378960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 9276715 - 9276571
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9276715 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggctcctaacacccacttaaaa 9276616  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    ||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  9276615 ttagctatctttttatgcatgacaaatggtggataatgctctttg 9276571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Original strand, 28650426 - 28650570
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  28650426 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaatttcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 28650525  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||    
T  28650526 ttagtcatctttttagacatgacaaatggtggataatgctctttg 28650570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 40854750 - 40854606
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||||    
T  40854750 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtatcaaatctggctcctaacatccacttaaaa 40854651  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  40854650 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctctttg 40854606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 143 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 921163 - 921028
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  921163 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 921064  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 278  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  921063 ttagtcatctttttatgcatgacaaatggtggataa 921028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 143 - 278
Target Start/End: Original strand, 33865267 - 33865402
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  33865267 gaatcgtttcaaacaagtcttattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 33865366  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 278  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  33865367 ttagtcatttttttaggcatgacaaatggtggataa 33865402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 149 - 287
Target Start/End: Original strand, 771981 - 772119
Alignment:
Q  149 tttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaattagtc 248  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  771981 tttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtc 772080  T
Q  249 atctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||    
T  772081 atctttttaggcatggcaaatggtggataatgctctttg 772119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 2456151 - 2456007
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    |||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  2456151 gaattgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttaactcctaacacccacttaaaa 2456052  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||    
T  2456051 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtgaataatgctctttg 2456007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Original strand, 11949426 - 11949570
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| |    
T  11949426 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgtttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaata 11949525  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  11949526 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctctttg 11949570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 34253283 - 34253139
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| |    
T  34253283 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgctttcttgaactcatctttggtatcaaatctggctcctaacacccacttaata 34253184  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  34253183 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctctttg 34253139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Original strand, 41500502 - 41500646
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  41500502 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtacatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccgcttaaaa 41500601  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||    
T  41500602 ttagtcatctttttaggcatggcaaatggtggataatgctctttg 41500646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 143 - 278
Target Start/End: Original strand, 7297234 - 7297369
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||    
T  7297234 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgtcttcttgaactcatctttggtaccaaatctagctcctaacacccacttaaaa 7297333  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7297334 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 7297369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 143 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 37838438 - 37838303
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  37838438 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttctttgaactcatctttgataccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 37838339  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37838338 ttagtcatctttttaggcatgacaaatagtggataa 37838303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 144 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 17134369 - 17134226
Alignment:
Q  144 aatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaat 243  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||     
T  17134369 aatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaag 17134270  T
Q  244 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| || |||||    
T  17134269 tagtcatctttttaggaatggcaaatgatggataatgctctttg 17134226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 143 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 19180562 - 19180428
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  19180562 gaatcgtttcaaacaagtcttattgtagatagtatagttagtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggct-ctaacacccacttaaaa 19180464  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19180463 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 19180428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 143 - 272
Target Start/End: Original strand, 33106969 - 33107098
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    |||||||||||||| |||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  33106969 gaatcgtttcaaacgagtcctattgtagatatcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatatggctcctaacacccacttaaaa 33107068  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggt 272  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33107069 ttagtcatctttttaggcatgaaaaatggt 33107098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Original strand, 1106559 - 1106703
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||| ||||||| ||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  1106559 gaatcatttcaaataagtcctattgtagatagcataattggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaa 1106658  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||    
T  1106659 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtgaataatgctctttg 1106703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 2057067 - 2056923
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||    
T  2057067 gaatcgtttcaaacaagtcttattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatccagctcctaacacccacttaaaa 2056968  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||    
T  2056967 ttagtcatctttttaggcatggtaaatggtggataatgcactttg 2056923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Original strand, 2094410 - 2094554
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  2094410 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactaatctttgatactaaatttggctccaaacacccacttaaaa 2094509  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||    
T  2094510 ttagtcatctttttaagcatggcaaatggtggataatgctctttg 2094554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 8899822 - 8899679
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  8899822 gaatcgtttcaa-caagtcatattgtagatagcatagttggtaattgcttccatgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 8899724  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
     ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||    
T  8899723 ctagtcatctttttaggcatggtaaatggtggataatgctctttg 8899679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Original strand, 12759750 - 12759893
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  | |||||||||||||||||    
T  12759750 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatttttcgtaccaaatttgcct-ctaacacccacttaaaa 12759848  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  12759849 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctctttg 12759893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 143 - 278
Target Start/End: Original strand, 2314975 - 2315110
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    |||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||    
T  2314975 gaattgtttcaaacaagtcttattgtagatagcatagttggtaattgtttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacactcacttaaaa 2315074  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 278  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  2315075 ttagtcatctttttaggcatggtaaatggtggataa 2315110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 143 - 278
Target Start/End: Original strand, 17484550 - 17484685
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  17484550 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttctttgaactcatctttggtaccaaatttgactcctaacaaccacttaaaa 17484649  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 278  Q
    ||||||||||||||| |||||  |||||||||||||    
T  17484650 ttagtcatctttttaagcatggaaaatggtggataa 17484685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 144 - 287
Target Start/End: Original strand, 36444229 - 36444372
Alignment:
Q  144 aatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaat 243  Q
    |||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||| |||||||||    
T  36444229 aatcgtttcaaacaagtcctatagtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcataacacctacttaaaat 36444328  T
Q  244 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||    
T  36444329 tagtcatctttttaagcatggcaaatggtggataatgctctttg 36444372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 144 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 38751188 - 38751045
Alignment:
Q  144 aatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaat 243  Q
    |||||||||||||||||| |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| |||||||||||    
T  38751188 aatcgtttcaaacaagtcctaatgtagatagtatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtatcaaatgtggctcctaacatccacttaaaat 38751089  T
Q  244 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  38751088 taatcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctctttg 38751045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 150 - 287
Target Start/End: Original strand, 3430631 - 3430768
Alignment:
Q  150 ttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaattagtca 249  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  3430631 ttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttgataccaaatctggctcataacacccacttaaaattagtca 3430730  T
Q  250 tctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||| || |||||    
T  3430731 tctttttaggcatggcaaatggtgtataatgctctttg 3430768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Original strand, 43249412 - 43249556
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    |||||||||| |||||||| | |||  |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  43249412 gaatcgtttcgaacaagtcctattgatgatagcatagttggtaattgtttccttgaatacatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 43249511  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  43249512 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctctttg 43249556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 143 - 278
Target Start/End: Original strand, 25087796 - 25087931
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    |||| |||||||||||||| | ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  25087796 gaattgtttcaaacaagtcttattgtatataacatagttgataattgcttccttgaactcatctctggtactaaatctggctcctaacacccacttaaaa 25087895  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25087896 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 25087931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 165 - 287
Target Start/End: Original strand, 8396573 - 8396695
Alignment:
Q  165 ttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatga 264  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8396573 ttgtagatagcatagttgataattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatatggctcctaaaacccacttaaaatcagtcatctttttaggcatga 8396672  T
Q  265 caaatggtggataacgccctttg 287  Q
    |||||||||||||| || |||||    
T  8396673 caaatggtggataatgctctttg 8396695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 143 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 42630103 - 42629970
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||| | |  ||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  42630103 gaatcgtttcaaacaagtcctatcatagatagcataattgataattgctttcttgaactcatctttggtaccaaatctggcttctaacacccacttaaaa 42630004  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggat 276  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42630003 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggat 42629970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 29737889 - 29737745
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    |||| |||||||||||||| | |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| | ||| ||||||    
T  29737889 gaattgtttcaaacaagtcctattgtcgatagcatagttgataattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaagatccatttaaaa 29737790  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  29737789 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctctttg 29737745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 148 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 36211182 - 36211043
Alignment:
Q  148 gtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaattagt 247  Q
    |||||||||||||| | || |||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  36211182 gtttcaaacaagtcctattctagataacatagtttgtaattgcttctttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaaaattagt 36211083  T
Q  248 catctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||    
T  36211082 catctttttaggcatggcaaatggtggataatgctctttg 36211043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Original strand, 37732193 - 37732337
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  37732193 gaatcgtttcaaacaagtcttattgtaaataacatagttggtaattgctttcttgaactcatttttggtatcaaatctgactcctaacacccacttaaaa 37732292  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || |||||    
T  37732293 ttagtcatctttttatgtatgacaaatggtggataatgctctttg 37732337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 143 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 45124260 - 45124125
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    |||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||  |  || ||||||||||||||||    
T  45124260 gaatcgtttcaaacaaatcttattgtagatagcatagttggtaattgtttccttaaactcatctttggtatcaaatcagactcttaacacccacttaaaa 45124161  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 278  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45124160 ttaatcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 45124125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 168 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 37654224 - 37654122
Alignment:
Q  168 tagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaa 267  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37654224 tagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacatccacttaaaatcagtcatctttttaggcatgacaa 37654125  T
Q  268 atg 270  Q
    |||    
T  37654124 atg 37654122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 143 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 14630755 - 14630663
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacaccca 235  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14630755 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagataacatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggctcctaacaccca 14630663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 165 - 278
Target Start/End: Original strand, 19916009 - 19916122
Alignment:
Q  165 ttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatga 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| || | |||||||||||||| |||    
T  19916009 ttgtagatagcatagttggtaattggttccttgaactcatctttggtaccaaatctgactcctaacacccacttaatatcaatcatctttttaggcttga 19916108  T
Q  265 caaatggtggataa 278  Q
    ||||| ||||||||    
T  19916109 caaattgtggataa 19916122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 183 - 287
Target Start/End: Original strand, 41178059 - 41178163
Alignment:
Q  183 gtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgcc 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||     
T  41178059 gtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaattagtcatttttttaggcatggtaaatggtggataatgct 41178158  T
Q  283 ctttg 287  Q
    |||||    
T  41178159 ctttg 41178163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 143 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 9331897 - 9331762
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||| || ||||||||||||||||  ||  | ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||| |    
T  9331897 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagtattgttggtaattgcttcccagatattatcttaggtaccaaatttggctcctaacacccacctaaga 9331798  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 278  Q
    ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9331797 ttagctatctttttatgcatgacaaatggtggataa 9331762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 143 - 233
Target Start/End: Original strand, 23671811 - 23671901
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacc 233  Q
    ||||||||||||||||||| | || |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||    
T  23671811 gaatcgtttcaaacaagtcttattatagataacatggttggtaattgcttccttgaactcatctttggtactaaatctggctcctaacacc 23671901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 228 - 275
Target Start/End: Original strand, 23672958 - 23673005
Alignment:
Q  228 aacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtgga 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23672958 aacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtgga 23673005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1986 (Bit Score: 113; Significance: 3e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold1986
Description:

Target: scaffold1986; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 255 - 111
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  255 gaatcgtttcaaacaagtcctaatgtagatagcatagtcggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaa 156  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  155 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctctttg 111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 219027 - 218882
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaaca-cccacttaaa 241  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| ||||||||||    
T  219027 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttgataccaaatctggctcctaacaccccacttaaa 218928  T
Q  242 attagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  218927 attagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctctttg 218882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0727 (Bit Score: 108; Significance: 3e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0727
Description:

Target: scaffold0727; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 143 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 5326 - 5192
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| ||||||||||    
T  5326 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcataattgttaattgcttccttgaactcatctttgataccaaatctggctcctaaca-ccacttaaaa 5228  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5227 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 5192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0693 (Bit Score: 108; Significance: 3e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0693
Description:

Target: scaffold0693; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 143 - 278
Target Start/End: Original strand, 5027 - 5162
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  5027 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcatagttggtaattgttttcttgaactcatctttggtaccaaatatggctcctaacaccctcttaaaa 5126  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 278  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5127 ttagtcatctttttagacatgacaaatggtggataa 5162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 143 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 48103 - 47968
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||| |||||||||   ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  48103 gaatcgttttaaacaagtccgattgtatatcacatagttggtaattgcttccttgaactcacctttggtaccaaatctggttcctaacacccacttaaaa 48004  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48003 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 47968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 93; Significance: 3e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 143 - 287
Target Start/End: Original strand, 252438 - 252582
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||||||||| ||||||    
T  252438 gaatcgtttcaaacaagtcctattgtatatagcatagttggtaattgcttcattgaactcatttttcgtaccaaatctggctcctaacacccagttaaaa 252537  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || |||||    
T  252538 ttagtcatctttttaggcatggcaaacggtggataatgctctttg 252582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0542 (Bit Score: 91; Significance: 4e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0542
Description:

Target: scaffold0542; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 165 - 287
Target Start/End: Original strand, 1995 - 2117
Alignment:
Q  165 ttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaattagtcatctttttaggcatga 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  1995 ttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccgaatctggctcctaacacctacttaaaatcagtcatcttattaggcatga 2094  T
Q  265 caaatggtggataacgccctttg 287  Q
    |||||||||||||| || |||||    
T  2095 caaatggtggataatgctctttg 2117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 143 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 13236 - 13101
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||| | ||||||||||    
T  13236 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcataattgataattccttccttgaactcatctttggtaccaaatctagctcctaatatccacttaaaa 13137  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 278  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  13136 ttattcatctttttaggcatggcaaatgatggataa 13101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 143 - 278
Target Start/End: Original strand, 59608 - 59743
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||| | ||||||||||    
T  59608 gaatcgtttcaaacaagtcatattgtagatagcataattgataattccttccttgaactcatctttggtaccaaatctagctcctaatatccacttaaaa 59707  T
Q  243 ttagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 278  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  59708 ttattcatctttttaggcatggcaaatgatggataa 59743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 144 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 11498 - 11364
Alignment:
Q  144 aatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaatttggttcctaacacccacttaaaat 243  Q
    |||||||| ||| ||| | | |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  11498 aatcgttttaaataagacctattgtaggtagcatagttggtaattgcttccttaaacttatctatggtaccaaatctggctcctaacacccacttaaaat 11399  T
Q  244 tagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataa 278  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  11398 tagtcatctttttaggcatggtaaatggtggataa 11364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1562 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold1562
Description:

Target: scaffold1562; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 143 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 680 - 605
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaat 218  Q
    ||||||||||||||||||| |  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  680 gaatcgtttcaaacaagtcctaatgttaatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaat 605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1158 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold1158
Description:

Target: scaffold1158; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 143 - 218
Target Start/End: Original strand, 1913 - 1988
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaat 218  Q
    ||||||||||||||||||| |  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1913 gaatcgtttcaaacaagtcctaatgttaatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaat 1988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0952 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0952
Description:

Target: scaffold0952; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 143 - 218
Target Start/End: Original strand, 3371 - 3446
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaat 218  Q
    ||||||||||||| ||||| |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3371 gaatcgtttcaaataagtcctaatgttgatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaat 3446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0717 (Bit Score: 52; Significance: 8e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0717
Description:

Target: scaffold0717; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 143 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 1958 - 1883
Alignment:
Q  143 gaatcgtttcaaacaagtcatgttgtagatagcatagttggtaattgcttccttgaactcatctttggtaccaaat 218  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1958 gaatcgtttcaaacaagtcctaatgttgatagcatagttgataattgcttccttgacctcatctttggtaccaaat 1883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0392 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0392
Description:

Target: scaffold0392; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 231 - 287
Target Start/End: Original strand, 289 - 345
Alignment:
Q  231 acccacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  289 acccacttaaaattattcatctttttaggcatgacaaatggtggataatgctctttg 345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 234 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 19831 - 19778
Alignment:
Q  234 cacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatggtggataacgccctttg 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||    
T  19831 cacttaaaattagtcatctttttaggcatgacaaatagtggataatgctctttg 19778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University