View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF9782A_low_18 (Length: 367)

Name: NF9782A_low_18
Description: NF9782A
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF9782A_low_18
NF9782A_low_18
[»] chr1 (33 HSPs)
chr1 (1-218)||(44241361-44241579)
chr1 (1-218)||(29001735-29001953)
chr1 (1-218)||(9869109-9869327)
chr1 (1-218)||(31072322-31072540)
chr1 (1-220)||(4599532-4599753)
chr1 (1-218)||(1174609-1174828)
chr1 (1-218)||(6238659-6238877)
chr1 (1-218)||(39053338-39053556)
chr1 (1-218)||(39059710-39059928)
chr1 (1-218)||(42091900-42092118)
chr1 (1-218)||(45015785-45016003)
chr1 (1-218)||(26621473-26621692)
chr1 (1-218)||(44916334-44916560)
chr1 (1-218)||(41305514-41305733)
chr1 (1-218)||(11913262-11913479)
chr1 (1-218)||(41297520-41297739)
chr1 (1-187)||(27240161-27240349)
chr1 (1-218)||(43686631-43686851)
chr1 (1-218)||(32797740-32797945)
chr1 (1-218)||(1115982-1116202)
chr1 (1-218)||(41299188-41299407)
chr1 (1-129)||(23764521-23764650)
chr1 (1-154)||(5445028-5445181)
chr1 (1-213)||(28413678-28413892)
chr1 (139-218)||(23762336-23762415)
chr1 (4-213)||(39806064-39806274)
chr1 (1-213)||(2824824-2825037)
chr1 (1-196)||(38672788-38672986)
chr1 (83-209)||(47646755-47646883)
chr1 (71-212)||(23251426-23251568)
chr1 (106-213)||(5357752-5357861)
chr1 (106-213)||(45620149-45620258)
chr1 (170-214)||(9316137-9316181)
[»] scaffold0343 (1 HSPs)
scaffold0343 (1-218)||(2649-2867)
[»] chr7 (35 HSPs)
chr7 (1-218)||(37026052-37026270)
chr7 (1-218)||(26601916-26602134)
chr7 (1-218)||(15914642-15914860)
chr7 (1-218)||(39432912-39433129)
chr7 (1-218)||(15949163-15949381)
chr7 (1-218)||(3924093-3924311)
chr7 (1-218)||(36875549-36875767)
chr7 (4-218)||(14298907-14299122)
chr7 (1-218)||(5049912-5050130)
chr7 (1-218)||(14287719-14287937)
chr7 (1-218)||(2446650-2446868)
chr7 (1-218)||(6795442-6795660)
chr7 (1-218)||(23612393-23612611)
chr7 (14-218)||(21642535-21642740)
chr7 (1-218)||(9642916-9643136)
chr7 (5-218)||(1948633-1948848)
chr7 (1-218)||(6020864-6021083)
chr7 (1-218)||(8185392-8185611)
chr7 (1-218)||(8192952-8193171)
chr7 (1-218)||(48353480-48353699)
chr7 (1-215)||(45433589-45433805)
chr7 (1-218)||(19089811-19090030)
chr7 (4-218)||(33850643-33850858)
chr7 (1-218)||(48347096-48347315)
chr7 (1-218)||(5056307-5056526)
chr7 (1-218)||(1378951-1379169)
chr7 (1-218)||(8142446-8142664)
chr7 (216-361)||(42422112-42422257)
chr7 (1-213)||(10831130-10831344)
chr7 (1-213)||(11024922-11025136)
chr7 (144-218)||(13774130-13774204)
chr7 (1-213)||(21901193-21901408)
chr7 (1-47)||(1942049-1942095)
chr7 (152-213)||(27954243-27954303)
chr7 (170-213)||(28442628-28442671)
[»] chr6 (25 HSPs)
chr6 (1-218)||(13671817-13672035)
chr6 (1-218)||(27670098-27670316)
chr6 (1-218)||(31547899-31548117)
chr6 (1-218)||(32328493-32328711)
chr6 (1-218)||(1428423-1428641)
chr6 (1-218)||(34711557-34711775)
chr6 (1-218)||(9864760-9864979)
chr6 (1-218)||(21262574-21262793)
chr6 (1-218)||(4186689-4186907)
chr6 (1-218)||(11058150-11058368)
chr6 (1-218)||(4020235-4020454)
chr6 (1-218)||(4026661-4026880)
chr6 (1-218)||(34655254-34655473)
chr6 (1-218)||(34648803-34649022)
chr6 (1-218)||(4738323-4738542)
chr6 (6-218)||(7069702-7069916)
chr6 (1-151)||(29906894-29907045)
chr6 (1-151)||(30117335-30117486)
chr6 (1-123)||(7062578-7062702)
chr6 (75-218)||(1167480-1167630)
chr6 (20-213)||(10081567-10081762)
chr6 (156-218)||(7062516-7062578)
chr6 (77-213)||(9846601-9846738)
chr6 (181-218)||(29907044-29907081)
chr6 (181-218)||(30117299-30117336)
[»] chr5 (22 HSPs)
chr5 (1-218)||(4973567-4973785)
chr5 (1-218)||(22359968-22360186)
chr5 (1-218)||(22313834-22314052)
chr5 (5-218)||(5876226-5876440)
chr5 (1-218)||(34357288-34357506)
chr5 (1-218)||(34359079-34359297)
chr5 (1-218)||(2957862-2958081)
chr5 (1-218)||(2966331-2966550)
chr5 (1-218)||(29980463-29980681)
chr5 (1-218)||(30041244-30041462)
chr5 (1-218)||(40958617-40958835)
chr5 (1-218)||(25894649-25894868)
chr5 (7-218)||(2438811-2439022)
chr5 (1-218)||(12505765-12505991)
chr5 (1-216)||(42150822-42151039)
chr5 (5-218)||(29414669-29414883)
chr5 (4-213)||(33794099-33794309)
chr5 (1-213)||(9843353-9843566)
chr5 (1-213)||(2156125-2156336)
chr5 (107-209)||(19853484-19853588)
chr5 (106-213)||(12918955-12919064)
chr5 (106-213)||(30580195-30580304)
[»] chr2 (24 HSPs)
chr2 (1-218)||(2021448-2021666)
chr2 (1-218)||(21341882-21342100)
chr2 (1-218)||(21331994-21332212)
chr2 (1-218)||(42931372-42931590)
chr2 (1-218)||(16856487-16856704)
chr2 (1-218)||(12950800-12951018)
chr2 (1-218)||(16817330-16817547)
chr2 (1-218)||(36782184-36782403)
chr2 (1-218)||(34834812-34835030)
chr2 (1-218)||(34841256-34841474)
chr2 (1-218)||(29484930-29485149)
chr2 (1-218)||(45011986-45012205)
chr2 (1-218)||(15852553-15852772)
chr2 (1-218)||(43267862-43268081)
chr2 (1-218)||(2157616-2157834)
chr2 (1-218)||(2164032-2164250)
chr2 (1-218)||(13901957-13902175)
chr2 (1-218)||(21067958-21068176)
chr2 (69-218)||(45700644-45700793)
chr2 (1-213)||(41455610-41455823)
chr2 (54-218)||(11909950-11910116)
chr2 (54-213)||(17784443-17784604)
chr2 (71-209)||(13162892-13163032)
chr2 (54-213)||(17789096-17789257)
[»] chr4 (17 HSPs)
chr4 (1-218)||(55462772-55462990)
chr4 (1-218)||(16405346-16405568)
chr4 (4-218)||(16838359-16838573)
chr4 (1-218)||(27590309-27590527)
chr4 (1-218)||(41372990-41373209)
chr4 (1-217)||(37368315-37368533)
chr4 (1-218)||(13594110-13594330)
chr4 (1-218)||(7780411-7780629)
chr4 (1-218)||(8103885-8104104)
chr4 (1-218)||(30238264-30238482)
chr4 (1-218)||(17456858-17457077)
chr4 (1-218)||(36754791-36755017)
chr4 (24-218)||(30211536-30211731)
chr4 (71-218)||(5660549-5660696)
chr4 (1-195)||(13003809-13004005)
chr4 (1-213)||(2947849-2948062)
chr4 (1-92)||(48914903-48914996)
[»] chr8 (18 HSPs)
chr8 (1-218)||(12768748-12768966)
chr8 (1-218)||(11358193-11358412)
chr8 (1-218)||(7311353-7311571)
chr8 (1-218)||(8013320-8013538)
chr8 (1-218)||(36005482-36005700)
chr8 (1-218)||(36425730-36425949)
chr8 (1-218)||(6464576-6464794)
chr8 (1-218)||(36075971-36076189)
chr8 (2-218)||(15012393-15012610)
chr8 (1-218)||(36021799-36022018)
chr8 (4-218)||(41242116-41242331)
chr8 (1-218)||(1238217-1238436)
chr8 (1-218)||(16710668-16710887)
chr8 (75-218)||(26250591-26250734)
chr8 (1-218)||(31017403-31017608)
chr8 (26-218)||(45068416-45068609)
chr8 (1-213)||(7933931-7934145)
chr8 (1-49)||(14393738-14393786)
[»] chr3 (21 HSPs)
chr3 (5-218)||(4311486-4311700)
chr3 (4-218)||(10941304-10941519)
chr3 (1-218)||(32746374-32746592)
chr3 (4-218)||(6036273-6036488)
chr3 (1-218)||(24179077-24179296)
chr3 (1-218)||(9570548-9570768)
chr3 (1-218)||(27501967-27502186)
chr3 (1-218)||(13014990-13015208)
chr3 (1-218)||(9577050-9577270)
chr3 (1-218)||(43995073-43995300)
chr3 (1-218)||(25893234-25893458)
chr3 (3-218)||(43931588-43931799)
chr3 (1-218)||(23068468-23068686)
chr3 (71-208)||(20651135-20651272)
chr3 (1-122)||(41353865-41353987)
chr3 (1-146)||(41354142-41354288)
chr3 (1-213)||(4590798-4591012)
chr3 (1-62)||(3577095-3577156)
chr3 (1-213)||(20952759-20952981)
chr3 (106-213)||(4644354-4644463)
chr3 (156-213)||(2785865-2785922)
[»] scaffold0053 (1 HSPs)
scaffold0053 (1-218)||(49695-49912)
[»] scaffold0060 (1 HSPs)
scaffold0060 (1-218)||(15175-15393)
[»] scaffold0936 (1 HSPs)
scaffold0936 (1-218)||(3264-3481)
[»] scaffold0043 (1 HSPs)
scaffold0043 (1-218)||(5005-5223)
[»] scaffold0510 (2 HSPs)
scaffold0510 (1-218)||(8881-9100)
scaffold0510 (1-218)||(2560-2779)
[»] scaffold0513 (2 HSPs)
scaffold0513 (77-218)||(12014-12155)
scaffold0513 (1-60)||(11954-12014)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (1-102)||(99918-100020)
[»] scaffold0173 (1 HSPs)
scaffold0173 (1-195)||(24268-24464)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 33)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 44241361 - 44241579
Alignment:
Q  1 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaaactt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44241361 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgtttgaataactaagttgcaaatgatgaagttgagattaataaggcgtgaaactt 44241460  T
Q  100 gttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacac 199  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  44241461 gttaggattagagttcattgatcaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacac 44241560  T
Q  200 cattcgtgtccaaacaata 218  Q
    |||||||||||||||||||    
T  44241561 cattcgtgtccaaacaata 44241579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 29001735 - 29001953
Alignment:
Q  1 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaaactt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29001735 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgtttgaataactaagttgcaaatgataaagttgagattaataaggcgtaaaactt 29001834  T
Q  100 gttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacac 199  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29001835 gttaggattagagttccttggtcgagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacac 29001934  T
Q  200 cattcgtgtccaaacaata 218  Q
     |||| |||||||| ||||    
T  29001935 tattcatgtccaaataata 29001953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 9869109 - 9869327
Alignment:
Q  1 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaaactt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  9869109 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaaagataattggtagtttgttttaatgactaagttgcaaatgataaaattgagattaataaggtgtgaaactt 9869208  T
Q  100 gttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacac 199  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||     
T  9869209 gttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcatgtatccctcgacaacat 9869308  T
Q  200 cattcgtgtccaaacaata 218  Q
    | |||||||||||||||||    
T  9869309 ctttcgtgtccaaacaata 9869327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 31072322 - 31072540
Alignment:
Q  1 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggcgtgaaactt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  31072322 ttcgacaccaaatatcattctaagctaaaagataatttgttgtttgttttagtaactaagttgcgaataataaaattgagattaataaggcatgaaactt 31072421  T
Q  100 gttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacac 199  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  31072422 gttaggattagagttccttaatcaagcgtcacacgtaacctaatgaccatacatggactctagcttttctttgatattatcatgtatccctcgacaacac 31072521  T
Q  200 cattcgtgtccaaacaata 218  Q
    |||||||||||||||||||    
T  31072522 cattcgtgtccaaacaata 31072540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 4599532 - 4599753
Alignment:
Q  1 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgcaatgataaa-gttgagattaataaggcgtgaaact 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||   |||| ||||||| ||||| ||||| |||||    
T  4599532 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaaagataatttgtttgtttgttttagtaactaaattgcaaaagtaaaagttgagagtaatagggcgtaaaact 4599631  T
Q  99 tgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaaca 198  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4599632 tgttaggattagagttccttgattaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaaca 4599731  T
Q  199 ccattcgtgtccaaacaatact 220  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  4599732 ccattcgtgtccaaacaatact 4599753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 1174609 - 1174828
Alignment:
Q  1 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgcaatgataaa-gttgagattaataaggcgtgaaact 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||   |||| ||||||| ||||| |||||||||||    
T  1174609 ttcgacaccaaatatcattctaagttgaaagataatttgtttgtttgttttagtaactaaattgcaaaagtaaaagttgagagtaatagggcgtgaaact 1174708  T
Q  99 tgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaaca 198  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1174709 tgttaggattagagttccttgagcaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaaca 1174808  T
Q  199 ccattcgtgtccaaacaata 218  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  1174809 ccattcgtgtccaaacaata 1174828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 6238659 - 6238877
Alignment:
Q  1 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaaactt 99  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||  |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||    
T  6238659 ttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactagattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaactt 6238758  T
Q  100 gttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacac 199  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6238759 gttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacac 6238858  T
Q  200 cattcgtgtccaaacaata 218  Q
    |||||||||||||||||||    
T  6238859 cattcgtgtccaaacaata 6238877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 39053556 - 39053338
Alignment:
Q  1 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtgaaactt 99  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  39053556 ttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtgaaactt 39053457  T
Q  100 gttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacac 199  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39053456 gttaggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacac 39053357  T
Q  200 cattcgtgtccaaacaata 218  Q
     ||||||||||||||||||    
T  39053356 tattcgtgtccaaacaata 39053338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 39059928 - 39059710
Alignment:
Q  1 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtgaaactt 99  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  39059928 ttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtgaaactt 39059829  T
Q  100 gttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacac 199  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39059828 gttaggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacac 39059729  T
Q  200 cattcgtgtccaaacaata 218  Q
     ||||||||||||||||||    
T  39059728 tattcgtgtccaaacaata 39059710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 42091900 - 42092118
Alignment:
Q  1 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaaactt 99  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||    
T  42091900 ttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaactt 42091999  T
Q  100 gttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacac 199  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  42092000 gttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacac 42092099  T
Q  200 cattcgtgtccaaacaata 218  Q
    |||||||||||||||||||    
T  42092100 cattcgtgtccaaacaata 42092118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 45015785 - 45016003
Alignment:
Q  1 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaaactt 99  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||    
T  45015785 ttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaactt 45015884  T
Q  100 gttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacac 199  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  45015885 gttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacac 45015984  T
Q  200 cattcgtgtccaaacaata 218  Q
    |||||||||||||||||||    
T  45015985 cattcgtgtccaaacaata 45016003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 26621473 - 26621692
Alignment:
Q  1 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttg-ttgtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggcgtgaaact 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||| || | || |  |||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  26621473 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaaagataatttgtttgtttgttttagtaactaaatttcaaaagtaaaagttgagagtaatagggcgtaaaact 26621572  T
Q  99 tgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaaca 198  Q
    |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26621573 tgttaggattagggttccttgattaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaaca 26621672  T
Q  199 ccattcgtgtccaaacaata 218  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  26621673 ccattcgtgtccaaacaata 26621692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 44916334 - 44916560
Alignment:
Q  1 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagtt---------gcaatgataaagttgagattaataaggcg 91  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||         | |||||||||||||||||||||||||||    
T  44916334 ttcgacaccaaatatcattctaaattaaaagatagtttgttgtttgttttaaaaactaagttaactatgttgaaatgataaagttgagattaataaggcg 44916433  T
Q  92 tgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctc 191  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||| | ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  44916434 tgaaacttgttaggattagaattccttaaccaaacgtcacacgtaacctaatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcatgtatccctc 44916533  T
Q  192 aacaacaccattcgtgtccaaacaata 218  Q
     ||||||||||||||||||||||||||    
T  44916534 gacaacaccattcgtgtccaaacaata 44916560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 41305733 - 41305514
Alignment:
Q  1 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgcaatgataaa-gttgagattaataaggcgtgaaact 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||   |||| ||||||| ||||| ||||| |||||    
T  41305733 ttcgacaccaaatatcattctaagtttaaagataatttgtttgtttgttttagtaactaaattgcaaaagtaaaagttgagagtaatagggcgtaaaact 41305634  T
Q  99 tgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaaca 198  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  41305633 tgttaggattagagttccttgattaagcgtcacacataacctaatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaaca 41305534  T
Q  199 ccattcgtgtccaaacaata 218  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  41305533 ccattcatgtccaaacaata 41305514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 11913479 - 11913262
Alignment:
Q  1 ttcgacaccaaatatcattctaagtt-aaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggcgtgaaac 97  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||||| |||||||| ||   ||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11913479 ttcgacaccaaatatcattctaagtttaaaagatagattgtttgtttgtttaaa---ctaagttgcgaataataaaattgagattaataaggcgtgaaac 11913383  T
Q  98 ttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaac 197  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11913382 ttgttaggattagagttccttgaccaagcatcacatgtaacctaatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaac 11913283  T
Q  198 accattcgtgtccaaacaata 218  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  11913282 accattcgtgtccaaacaata 11913262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 41297520 - 41297739
Alignment:
Q  1 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggcgtgaaact 98  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| || |||| |||||| |||||||||| ||||||| |||| || |  |||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  41297520 ttcgactccaaatatcattctaagttgaaagatagtttgtttgtttgttttagtaactaaattgctaaagtaaaagttgagagtaatagggcgtaaaact 41297619  T
Q  99 tgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaaca 198  Q
    |||||| ||||||||||||||||| | | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  41297620 tgttaggattagagttccttgatcgatcctcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacatatccctcgacaaca 41297719  T
Q  199 ccattcgtgtccaaacaata 218  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  41297720 ccattcgtgtccaaacaata 41297739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 27240349 - 27240161
Alignment:
Q  1 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtgaaact 98  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27240349 ttcgacaccaaataccattccaagttaaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaataaggcgtgaaact 27240250  T
Q  99 tgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatc 187  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27240249 tgttaggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatc 27240161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 43686631 - 43686851
Alignment:
Q  1 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggcgtgaaac 97  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||  |||||| |||| |||||||||| ||||||| |||| ||||  |||||||||||||| | ||||| ||||    
T  43686631 ttcgacaccaaataccattccaagttaaaaagataatctgtttgtttgttttagtaactaaattgctaatgtaaaagttgagattaacagggcgtaaaac 43686730  T
Q  98 ttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaac 197  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  43686731 ttgttaggattagagttccttgatcgagcgtctcatttaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcatgtatccctcgacaac 43686830  T
Q  198 accattcgtgtccaaacaata 218  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  43686831 accattcgtgtccaaacaata 43686851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 32797740 - 32797945
Alignment:
Q  1 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaatgataaagttgagattaataaggcgtgaaa-ctt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||            || ||||| ||||| ||| |||    
T  32797740 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaa-gataatttgttgtttgttttagaaactaagttgcaa------------gagtaatagggcgtaaaaactt 32797826  T
Q  100 gttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacac 199  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32797827 gttaggattagagttccttaatcaagcgtcacacgtaacctaatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacac 32797926  T
Q  200 cattcgtgtccaaacaata 218  Q
     ||||||||||||||||||    
T  32797927 aattcgtgtccaaacaata 32797945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 1116202 - 1115982
Alignment:
Q  1 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaatgataaa-gttgagattaataaggcgtgaaactt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | ||||||||||||||   |||| ||||||| |||||||| |||||||||    
T  1116202 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaaagctaatttgttgtttgttt-agtaactaagttgcaagagtaaaagttgagagtaataaggtgtgaaactt 1116104  T
Q  100 gttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaac-- 197  Q
     |||  ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||      
T  1116103 cttatgattagagttccttaatcaagcgtcacacgtaacctaatgactatacatggattctaccttttctttgatattatcatgtatccctcgacaacac 1116004  T
Q  198 -accattcgtgtccaaacaata 218  Q
     |||||| ||||||||||||||    
T  1116003 taccatttgtgtccaaacaata 1115982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 41299407 - 41299188
Alignment:
Q  1 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgcaatgataaa-gttgagattaataaggcgtgaaact 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| ||||||| ||||||   |||| ||||||| ||||| ||||| |||||    
T  41299407 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaaagataatttatttgtttgttttagtaactaaattgcaaaagtaaaagttgagagtaatagggcgtaaaact 41299308  T
Q  99 tgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaaca 198  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  41299307 tgttaggattagagttccttgattaagcgtcacatataacctaatgaccattcatggattcaagcttttctttgatattatcatgtatccctcgacaaca 41299208  T
Q  199 ccattcgtgtccaaacaata 218  Q
    |||||| | |||||||||||    
T  41299207 ccattcttttccaaacaata 41299188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 23764650 - 23764521
Alignment:
Q  1 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggcgtgaaactt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  23764650 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgtttgaataactaagttgcaaatgataaagttgagattaatagggcgtaaaactt 23764551  T
Q  100 gttagtattagagttccttgatcaagcgtc 129  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23764550 gttaggattagagttccttgatcaagcgtc 23764521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 5445181 - 5445028
Alignment:
Q  1 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaatgataaa-gttgagattaataaggcgtgaaactt 99  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  5445181 ttcgacaccaactatcattctaagttaaa-gataatttgttgtttgttttagtaactaagttgcaagagtaaaagttgagattaataaggtgtgaaactt 5445083  T
Q  100 gttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatg 154  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  5445082 gttaggattagagttccttgatcaagcctcacacataacctaatgaccatacatg 5445028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 28413892 - 28413678
Alignment:
Q  1 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggcgtgaaactt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || |  |||||||||| ||||||||||| |||       
T  28413892 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaaagataatttgttgtttgttttagtaaccaagttgcaaaagtaaaagttgagagtaataaggcgt-aaaaac 28413794  T
Q  100 gttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgat--catacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaac 197  Q
    ||| | |||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||| ||  |||| |||||||||||| |||     ||||||||||||||| ||||||||     
T  28413793 gttggaattagagttccttgattaagcgtcaaacataacctaataatcacatatatggattctagcattttaccaatattatcacgtatcgctcaacaag 28413694  T
Q  198 accattcgtgtccaaa 213  Q
    |  |||||||||||||    
T  28413693 attattcgtgtccaaa 28413678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 139 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 23762415 - 23762336
Alignment:
Q  139 ctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccattcgtgtccaaacaata 218  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  23762415 ctaatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcatgtatccctcgacaacactattcgtgtccaaacaata 23762336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 4 - 213
Target Start/End: Original strand, 39806064 - 39806274
Alignment:
Q  4 gacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgtt 102  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||  |||||||||||||  |  ||| |||||| ||||||||||| |||   |||    
T  39806064 gacaccaaatatcattttaagttaaa-gataatttgttgttcgttttagaaactaagttgcaagagtaaaaattgagagtaataaggcgt-aaaaacgtt 39806161  T
Q  103 agtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgat--catacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacacc 200  Q
     | |||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||| ||  |||| |||||||| ||| |||    |||||||||||||||| |||||||| |      
T  39806162 ggaattagagttccttgattaagcgtcaaacataacctaataatcacatatatggattccagcgttttaccgatattatcacgtatcgctcaacaagatt 39806261  T
Q  201 attcgtgtccaaa 213  Q
    |||||||||||||    
T  39806262 attcgtgtccaaa 39806274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 2825037 - 2824824
Alignment:
Q  1 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaatgataaagttgagattaataaggcgtgaaacttg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||   || |  |||||||||| ||||||||||| |||   |    
T  2825037 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaaagataatatgttgtttgttttagtaaccaagtataaaagtgaaagttgagagtaataaggcgt-aaaaacg 2824939  T
Q  101 ttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgat--catacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaaca 198  Q
    || | |||||||||||||||| | |||||| || ||| ||||| ||  |||| ||| |||||||| |||     ||||||||||||||| |||||||| |    
T  2824938 ttggaattagagttccttgattatgcgtcaaacataacctaataatcacatatatgaattctagcgttttacccatattatcacgtatcgctcaacaaga 2824839  T
Q  199 ccattcgtgtccaaa 213  Q
      |||| ||||||||    
T  2824838 ttattcatgtccaaa 2824824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 38672986 - 38672788
Alignment:
Q  1 ttcgacaccaaatatcattctaag-ttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaaact 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||  |||||||||||||  |  |||||||||| ||||||||||| |||      
T  38672986 ttcgacaccaaatatcattctaagtttgaaagataatttgttgttcgttttagaaactaagttgcaagagtaaaagttgagagtaataaggcgt-aaaaa 38672888  T
Q  99 tgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgat--catacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaa 196  Q
      || | |||||||||||||||| |||||||| || ||| || || ||  |||| |||||||||||| |||    |||||||||||||||| ||||||||    
T  38672887 cattggaattagagttccttgattaagcgtcaaacataacctgataatcacatatatggattctagcgttttaccgatattatcacgtatcgctcaacaa 38672788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 83 - 209
Target Start/End: Original strand, 47646755 - 47646883
Alignment:
Q  83 aataaggcgtgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacat--ggattctagcttttctttgatattatc 180  Q
    |||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||| ||||  |||||  ||| |||||||||| | ||  ||||||||||||||  | |||||||||    
T  47646755 aataaggcgtaaaacttgttatgattagagttcgttgaccaagaatcacatataacctaatgatcacatatacggattctagcttttaatcgatattatc 47646854  T
Q  181 acgtatccctcaacaacaccattcgtgtc 209  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  47646855 acgtatccctcgacaacatcattcatgtc 47646883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 71 - 212
Target Start/End: Original strand, 23251426 - 23251568
Alignment:
Q  71 aaagttgagattaataaggcgtgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatc--atacatggattctagcttttc 168  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||   ||| | |||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||| |||  ||| |||||||||||| |||     
T  23251426 aaagttgagagtaataaggcgtaaaaac-gttggaattagagttccttgattaagcgtcaaacataacctaataatcgcatatatggattctagcgtttt 23251524  T
Q  169 tttgatattatcacgtatccctcaacaacaccattcgtgtccaa 212  Q
       |||||||||||||||| |||||||| |  ||||||||||||    
T  23251525 accgatattatcacgtatcgctcaacaagattattcgtgtccaa 23251568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 106 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 5357861 - 5357752
Alignment:
Q  106 attagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatca--tacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccatt 203  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||| ||||  || |||||||||||| |||     ||||||||||||||| |||||||| |  |||    
T  5357861 attagagttccttgattaagcgtcaaacataacctaataatcacatatatggattctagcattttcccaatattatcacgtatcgctcaacaagattatt 5357762  T
Q  204 cgtgtccaaa 213  Q
    ||||||||||    
T  5357761 cgtgtccaaa 5357752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 106 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 45620258 - 45620149
Alignment:
Q  106 attagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatca--tacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccatt 203  Q
    |||||||||||||||| |||| ||| || ||| ||||| ||||  || |||||||||||| |||    |||||||||||||||| ||| |||| |  |||    
T  45620258 attagagttccttgattaagcttcaaacataacctaataatcacatatatggattctagcgttttaccgatattatcacgtatcgctcgacaagattatt 45620159  T
Q  204 cgtgtccaaa 213  Q
    ||||||||||    
T  45620158 cgtgtccaaa 45620149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 170 - 214
Target Start/End: Original strand, 9316137 - 9316181
Alignment:
Q  170 ttgatattatcacgtatccctcaacaacaccattcgtgtccaaac 214  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||| |||||||||||||||    
T  9316137 ttgatattatcacatattgctcaacaacatcattcgtgtccaaac 9316181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0343 (Bit Score: 179; Significance: 2e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0343
Description:

Target: scaffold0343; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 2649 - 2867
Alignment:
Q  1 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaaactt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2649 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgtttgaataactaagctgcaaatgataaagttgagattaataaggcgtgaaactt 2748  T
Q  100 gttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacac 199  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  2749 gttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattatagcttttctttgatattatcatgtatccctcgacaacac 2848  T
Q  200 cattcgtgtccaaacaata 218  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  2849 cattcgtatccaaacaata 2867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 179; Significance: 2e-96; HSPs: 35)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 37026052 - 37026270
Alignment:
Q  1 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaaactt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37026052 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgtttgactaactaagttgtaaatgataaagttgagattaataaggcgtgaaactt 37026151  T
Q  100 gttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacac 199  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  37026152 gttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacattgattctagtttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacac 37026251  T
Q  200 cattcgtgtccaaacaata 218  Q
    |||||||||||||||||||    
T  37026252 cattcgtgtccaaacaata 37026270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 26601916 - 26602134
Alignment:
Q  1 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaaactt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  26601916 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgtttgaataactaagttgcaaatgataaagttgagattaatagggcgtaaaactt 26602015  T
Q  100 gttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacac 199  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26602016 gttaggattagaattccttgatcaagcgtcacacataacctaatgaacatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacac 26602115  T
Q  200 cattcgtgtccaaacaata 218  Q
     ||||||||||||||||||    
T  26602116 tattcgtgtccaaacaata 26602134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 15914642 - 15914860
Alignment:
Q  1 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaaactt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  15914642 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgtttgaataactaagttgcaaatgataaagttgagattaatagggcgtaaaactt 15914741  T
Q  100 gttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacac 199  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  15914742 gttaggattagagttccttgatcaagcgtcgcacataacctaatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcacatatccctcgacaacac 15914841  T
Q  200 cattcgtgtccaaacaata 218  Q
     ||||||||||||||||||    
T  15914842 tattcgtgtccaaacaata 15914860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 39432912 - 39433129
Alignment:
Q  1 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaatgataaagttgagattaataaggcgtgaaacttg 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39432912 ttcgacaacaaatatcattctaagttaaaagataatttgttgtttgttttagtaaccaagtgcaaatgataaagttgagattaataaggtgtgaaacttg 39433011  T
Q  101 ttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacacc 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  39433012 ttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatgaattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacgcc 39433111  T
Q  201 attcgtgtccaaacaata 218  Q
    ||||||||||||||||||    
T  39433112 attcgtgtccaaacaata 39433129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 15949163 - 15949381
Alignment:
Q  1 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaaactt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  15949163 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgtttgaataactaagttgcaaatgataaagttgagattaatagggcgtaaaactt 15949262  T
Q  100 gttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacac 199  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  15949263 gttaggattagagttccttgatcaagcgtcgcatataacctaatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcacatatccctcgacaacac 15949362  T
Q  200 cattcgtgtccaaacaata 218  Q
     ||||||||||||||||||    
T  15949363 tattcgtgtccaaacaata 15949381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 3924311 - 3924093
Alignment:
Q  1 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaaactt 99  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||    
T  3924311 ttcgataccaaatatcattccaagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaactt 3924212  T
Q  100 gttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacac 199  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3924211 gttaggattagagttccttgatcgagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacac 3924112  T
Q  200 cattcgtgtccaaacaata 218  Q
    |||||||||||||||||||    
T  3924111 cattcgtgtccaaacaata 3924093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 36875549 - 36875767
Alignment:
Q  1 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaaactt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||    
T  36875549 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaactt 36875648  T
Q  100 gttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacac 199  Q
    ||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  36875649 gttaggattggagttccttgatcgagcgtcacacgtaacctaatgatcatatatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacac 36875748  T
Q  200 cattcgtgtccaaacaata 218  Q
    |||||||||||||||||||    
T  36875749 cattcgtgtccaaacaata 36875767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Original strand, 14298907 - 14299122
Alignment:
Q  4 gacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgtt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||    
T  14298907 gacaccaaatatcattctaagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgtt 14299006  T
Q  103 agtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccat 202  Q
    || ||||||||||||||||| | |||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14299007 aggattagagttccttgatcgaacgtcgcacgtaccctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccat 14299106  T
Q  203 tcgtgtccaaacaata 218  Q
    ||||||||||||||||    
T  14299107 tcgtgtccaaacaata 14299122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 5050130 - 5049912
Alignment:
Q  1 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaaactt 99  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||    
T  5050130 ttcgacaccaaatatcattccaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaactt 5050031  T
Q  100 gttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacac 199  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5050030 gttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacac 5049931  T
Q  200 cattcgtgtccaaacaata 218  Q
    |||||||||||||||||||    
T  5049930 cattcgtgtccaaacaata 5049912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 14287719 - 14287937
Alignment:
Q  1 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaaactt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| || |||    
T  14287719 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaatctt 14287818  T
Q  100 gttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacac 199  Q
    ||||| ||||||||||||||||| | |||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14287819 gttaggattagagttccttgatcgaacgtcgcacgtaccctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacac 14287918  T
Q  200 cattcgtgtccaaacaata 218  Q
    |||||||||||||||||||    
T  14287919 cattcgtgtccaaacaata 14287937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 2446650 - 2446868
Alignment:
Q  1 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaaactt 99  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||    
T  2446650 ttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaactt 2446749  T
Q  100 gttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacac 199  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2446750 gttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacac 2446849  T
Q  200 cattcgtgtccaaacaata 218  Q
    |||||||||||||||||||    
T  2446850 cattcgtgtccaaacaata 2446868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 6795442 - 6795660
Alignment:
Q  1 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaaactt 99  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||    
T  6795442 ttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaactt 6795541  T
Q  100 gttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacac 199  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6795542 gttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacac 6795641  T
Q  200 cattcgtgtccaaacaata 218  Q
    |||||||||||||||||||    
T  6795642 cattcgtgtccaaacaata 6795660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 23612393 - 23612611
Alignment:
Q  1 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaaactt 99  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| || ||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||    
T  23612393 ttcgacacgaaatatcattccaagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattacaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaactt 23612492  T
Q  100 gttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacac 199  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23612493 gttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacataacctaatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacac 23612592  T
Q  200 cattcgtgtccaaacaata 218  Q
     ||||||||||||||||||    
T  23612593 tattcgtgtccaaacaata 23612611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 14 - 218
Target Start/End: Original strand, 21642535 - 21642740
Alignment:
Q  14 atcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgttagtattagag 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  21642535 atcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtgaaacttgttaggattagag 21642634  T
Q  113 ttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccattcgtgtccaa 212  Q
    |||||||||||||| |||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  21642635 ttccttgatcaagcatcacacataacctaatgaacaaacatggattctagcttttcattgatattatcacgtatccctcgacaacactattcgtgtccaa 21642734  T
Q  213 acaata 218  Q
    ||||||    
T  21642735 acaata 21642740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 9643136 - 9642916
Alignment:
Q  1 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggcgtgaaac 97  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||| |||||||||| ||||||| |||| ||||  |||||||||||||| | ||||| ||||    
T  9643136 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaaaagataatatgtttgtttgttttagtaactaaattgctaatgtaaaagttgagattaacagggcgtaaaac 9643037  T
Q  98 ttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaac 197  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9643036 ttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaac 9642937  T
Q  198 accattcgtgtccaaacaata 218  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  9642936 accattcgtgtccaaacaata 9642916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 5 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 1948848 - 1948633
Alignment:
Q  5 acaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgtt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1948848 acaccaaatatcattctaagttaaaagataatttgtttgtttgttttagtaactaaattgcaaaagataaagttgagattaatagggcgtgaaacttgtt 1948749  T
Q  103 agtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccat 202  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  1948748 aggattagagttccttaatcaagcgtcacacataacctaatgaccatacatggattctagattttctttgagattatcacgtatccctcgacaacactat 1948649  T
Q  203 tcgtgtccaaacaata 218  Q
    ||||||||||||||||    
T  1948648 tcgtgtccaaacaata 1948633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 6021083 - 6020864
Alignment:
Q  1 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtgaaact 98  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  6021083 ttcgacaccaaataccattccaagttaaaaagataattggttgtttgttttagtaactcaattgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtgaaact 6020984  T
Q  99 tgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaaca 198  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  6020983 tgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacatatccctcgacaaca 6020884  T
Q  199 ccattcgtgtccaaacaata 218  Q
    | ||||||||||||||||||    
T  6020883 ctattcgtgtccaaacaata 6020864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 8185611 - 8185392
Alignment:
Q  1 ttcgacaccaaatatcattctaagtt-aaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtgaaact 98  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  8185611 ttcgacaccaaataccattccaagttgaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtgaaact 8185512  T
Q  99 tgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaaca 198  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8185511 tgttaggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaaca 8185412  T
Q  199 ccattcgtgtccaaacaata 218  Q
    | ||||||||||||||||||    
T  8185411 ctattcgtgtccaaacaata 8185392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 8193171 - 8192952
Alignment:
Q  1 ttcgacaccaaatatcattctaagtt-aaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtgaaact 98  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  8193171 ttcgacaccaaataccattccaagttgaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtgaaact 8193072  T
Q  99 tgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaaca 198  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8193071 tgttaggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaaca 8192972  T
Q  199 ccattcgtgtccaaacaata 218  Q
    | ||||||||||||||||||    
T  8192971 ctattcgtgtccaaacaata 8192952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 48353699 - 48353480
Alignment:
Q  1 ttcgacaccaaatatcattctaagtt-aaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtgaaact 98  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  48353699 ttcgacaccaaataccattccaagttgaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtgaaact 48353600  T
Q  99 tgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaaca 198  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  48353599 tgttaggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaaca 48353500  T
Q  199 ccattcgtgtccaaacaata 218  Q
    | ||||||||||||||||||    
T  48353499 ctattcgtgtccaaacaata 48353480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 45433589 - 45433805
Alignment:
Q  1 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaatgataaa-gttgagattaataaggcgtgaaa-ct 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||   |||| ||||||| ||||||||||| ||| ||    
T  45433589 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaaagataatttgttgtttgttttagtaactaagtttcaagagtaaaagttgagagtaataaggcgtaaaaact 45433688  T
Q  99 tgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaaca 198  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  45433689 tgttaggattagagttccttaatcaagcgtcacacgtaacctaatgaccatacatggattctagattttctttgatattatcatgtatccctcgacaaca 45433788  T
Q  199 ccattcgtgtccaaaca 215  Q
    |||||||||||||||||    
T  45433789 ccattcgtgtccaaaca 45433805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 19089811 - 19090030
Alignment:
Q  1 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgcaatgataaa-gttgagattaataaggcgtgaaact 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||   |||| ||||||| ||||| ||||| |||||    
T  19089811 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaaagataatttgtttgtttgttttagtaactaaattgcaaaagtaaaagttgagagtaatagggcgtaaaact 19089910  T
Q  99 tgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaaca 198  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19089911 tgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacataacctaatgaccatacatggattctaacttttctttgatattatcacgtatccctcgacaaca 19090010  T
Q  199 ccattcgtgtccaaacaata 218  Q
    | ||||||||||||||||||    
T  19090011 ctattcgtgtccaaacaata 19090030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 33850858 - 33850643
Alignment:
Q  4 gacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaatgataaa-gttgagattaataaggcgtgaaacttgtt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| ||||||| || |||||||| |||||||||    
T  33850858 gacaccaaatatcattctaagttaaaagtcaatttgttgtttgttttagtaactaagttgcaatagtaaaagttgagagtagtaaggcgttaaacttgtt 33850759  T
Q  103 agtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccat 202  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  33850758 aggattagagttccttaatcaagcgtcacacgtaacctaatgactatacatgtattctagcttttctttgatattatcatgtatccctcgacaacaccat 33850659  T
Q  203 tcgtgtccaaacaata 218  Q
    ||||||||||||||||    
T  33850658 tcgtgtccaaacaata 33850643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 48347315 - 48347096
Alignment:
Q  1 ttcgacaccaaatatcattctaagtt-aaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtgaaact 98  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  48347315 ttcgacaccaaataccattccaagttgaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcatgaaact 48347216  T
Q  99 tgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaaca 198  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  48347215 tgttaggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaaca 48347116  T
Q  199 ccattcgtgtccaaacaata 218  Q
    | ||||||||||||||||||    
T  48347115 ctattcgtgtccaaacaata 48347096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 5056526 - 5056307
Alignment:
Q  1 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaaact 98  Q
    ||||||||||| |||||||  |||| ||| ||||| ||||| |||||||||| ||||| | |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |||||    
T  5056526 ttcgacaccaattatcatttcaagtaaaaagataagttgtttgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaact 5056427  T
Q  99 tgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaaca 198  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5056426 tgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaaca 5056327  T
Q  199 ccattcgtgtccaaacaata 218  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  5056326 ccattcgtgtccaaacaata 5056307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 1378951 - 1379169
Alignment:
Q  1 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaaactt 99  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||| | |||||||||||| ||||| ||||||    
T  1378951 ttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgatacaattgagattaatagggcgtaaaactt 1379050  T
Q  100 gttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacac 199  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1379051 gttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgagcatacatggattctagcttgtctttgatattatcacgtatccctcgacaacac 1379150  T
Q  200 cattcgtgtccaaacaata 218  Q
    |||||||||||||||||||    
T  1379151 cattcgtgtccaaacaata 1379169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 8142664 - 8142446
Alignment:
Q  1 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaaactt 99  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | || ||| ||||| | |||||||||||| ||||| ||||||    
T  8142664 ttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattacaaatgatacaattgagattaatagggcgtaaaactt 8142565  T
Q  100 gttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacac 199  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8142564 gttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgagcatacatggattctagcttgtctttgatattatcacgtatccctcgacaacac 8142465  T
Q  200 cattcgtgtccaaacaata 218  Q
    |||||||||||||||||||    
T  8142464 cattcgtgtccaaacaata 8142446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 216 - 361
Target Start/End: Original strand, 42422112 - 42422257
Alignment:
Q  216 atactataacttttaagattgacatttactttgtagaccaccaaggagtgataagcgttgtgttttatatataaacttcctctctattgtttaaaagctc 315  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42422112 atactataacttttaagattgccatttgctttgtaggccactaagaagtgataagcgctgcattttatatataaacttcctctctattgtttaaaagctc 42422211  T
Q  316 ccgatgttagactattttcaaagcagcacaagagctacatgctctc 361  Q
    |||||||| || |||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  42422212 ccgatgttggaatattttcacaacagcacaagagctacatgctctc 42422257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 10831344 - 10831130
Alignment:
Q  1 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggcgtgaaactt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || |  |||||||||| ||||||||||| |||       
T  10831344 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaaagataatttgttgtttgttttagtaaccaagttgcaaaagtaaaagttgagagtaataaggcgt-aaaaac 10831246  T
Q  100 gttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgat--catacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaac 197  Q
    ||| | |||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||| ||  |||| |||||||||||  |||    |||||||||||||||| ||||||||     
T  10831245 gttggaattagagttccttgattaagcgtcaaacataacctaataatcacatatatggattctagagttttaccgatattatcacgtatcgctcaacaag 10831146  T
Q  198 accattcgtgtccaaa 213  Q
    |  |||| ||||||||    
T  10831145 attattcatgtccaaa 10831130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 11025136 - 11024922
Alignment:
Q  1 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggcgtgaaactt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || |  |||||||||| ||||||||||| |||       
T  11025136 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaaagataatttgttgtttgttttagtaaccaagttgcaaaagtaaaagttgagagtaataaggcgt-aaaaac 11025038  T
Q  100 gttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgat--catacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaac 197  Q
    ||| | |||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||| ||  |||| |||||||||||  |||    |||||||||||||||| ||||||||     
T  11025037 gttggaattagagttccttgattaagcgtcaaacataacctaataatcacatatatggattctagagttttaccgatattatcacgtatcgctcaacaag 11024938  T
Q  198 accattcgtgtccaaa 213  Q
    |  |||| ||||||||    
T  11024937 attattcatgtccaaa 11024922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 144 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 13774204 - 13774130
Alignment:
Q  144 gatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccattcgtgtccaaacaata 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  13774204 gatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacatcattcgtgtccaaacaata 13774130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 21901408 - 21901193
Alignment:
Q  1 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttg-ttgtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggcgtgaaact 98  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||| ||||||| || | || |  |||||||||| ||||| ||||| |||      
T  21901408 ttcgacaccatatatcattctaagttgaaagataatttgtttgtttgttttagtaactaaatttcaaaagtaaaagttgagagtaatagggcgt-aaaaa 21901310  T
Q  99 tgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgat--catacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaa 196  Q
     ||||| || ||||||||||||| |||||||| || ||||||||| ||  |||| |||||||||||| |||    |||||||||||||||| ||||||||    
T  21901309 cgttagaatcagagttccttgattaagcgtcaaacataatctaataatcacatatatggattctagcgttttaccgatattatcacgtatcgctcaacaa 21901210  T
Q  197 caccattcgtgtccaaa 213  Q
     |  |||||||||||||    
T  21901209 gattattcgtgtccaaa 21901193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 47
Target Start/End: Original strand, 1942049 - 1942095
Alignment:
Q  1 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgt 47  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1942049 ttcgacaccaaatatcattataagttaaacgataatttgttgtttgt 1942095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 152 - 213
Target Start/End: Original strand, 27954243 - 27954303
Alignment:
Q  152 atggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccattcgtgtccaaa 213  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  27954243 atggattctagctttactc-gatattatcacatattcctcaacaacatcattcgtgtccaaa 27954303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 170 - 213
Target Start/End: Original strand, 28442628 - 28442671
Alignment:
Q  170 ttgatattatcacgtatccctcaacaacaccattcgtgtccaaa 213  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  28442628 ttgatattatcacatatcgctcaacaacatcattcgtgtccaaa 28442671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 175; Significance: 4e-94; HSPs: 25)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 13672035 - 13671817
Alignment:
Q  1 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaaactt 99  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13672035 ttcgacaccaaatatcattataagttaaacgataatttgttgtttatttgaataactaagttgcaaatgataaagttgagattaataatgcgtgaaactt 13671936  T
Q  100 gttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacac 199  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13671935 gttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacac 13671836  T
Q  200 cattcgtgtccaaacaata 218  Q
     ||| ||||||||||||||    
T  13671835 tattagtgtccaaacaata 13671817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 27670098 - 27670316
Alignment:
Q  1 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaaactt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  27670098 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaaatgataaagttgagattaataaagtgtgaaactt 27670197  T
Q  100 gttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacac 199  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  27670198 gttaggattagagttccttgatcaagtgtcacacgtaacctaataatcatacatgaattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacat 27670297  T
Q  200 cattcgtgtccaaacaata 218  Q
    |||||||||||||||||||    
T  27670298 cattcgtgtccaaacaata 27670316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 31547899 - 31548117
Alignment:
Q  1 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtgaaactt 99  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  31547899 ttcgacaccaaatatcattcttagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactcaattgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtgaaactt 31547998  T
Q  100 gttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacac 199  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31547999 gttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacctaatgatcacacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacac 31548098  T
Q  200 cattcgtgtccaaacaata 218  Q
     ||||||||||||||||||    
T  31548099 tattcgtgtccaaacaata 31548117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 32328711 - 32328493
Alignment:
Q  1 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaaactt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||    
T  32328711 ttcgacaccagatatcattctaagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaactt 32328612  T
Q  100 gttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacac 199  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32328611 gttaggattagagttccttgatcgagcgtcacatataacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacac 32328512  T
Q  200 cattcgtgtccaaacaata 218  Q
    |||||||||||||||||||    
T  32328511 cattcgtgtccaaacaata 32328493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 1428641 - 1428423
Alignment:
Q  1 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaaactt 99  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  1428641 ttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaataaggcgtaaaactt 1428542  T
Q  100 gttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacac 199  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1428541 gttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacac 1428442  T
Q  200 cattcgtgtccaaacaata 218  Q
    |||||||||||||||||||    
T  1428441 cattcgtgtccaaacaata 1428423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 34711775 - 34711557
Alignment:
Q  1 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaaactt 99  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||    
T  34711775 ttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaactt 34711676  T
Q  100 gttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacac 199  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34711675 gttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacac 34711576  T
Q  200 cattcgtgtccaaacaata 218  Q
    |||||||||||||||||||    
T  34711575 cattcgtgtccaaacaata 34711557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 9864979 - 9864760
Alignment:
Q  1 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtgaaact 98  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  9864979 ttcgacaccaaataccattctaagttaaaaagataattggttgtttgttttagtaactcaattgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtgaaact 9864880  T
Q  99 tgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaaca 198  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  9864879 tgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacttaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaata 9864780  T
Q  199 ccattcgtgtccaaacaata 218  Q
    | ||||||||||||||||||    
T  9864779 ctattcgtgtccaaacaata 9864760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 21262793 - 21262574
Alignment:
Q  1 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgcaatgataaa-gttgagattaataaggcgtgaaact 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||   |||| ||||||| ||||| ||||| |||||    
T  21262793 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaaagataatttgtttgtttgttttagtaactaaattgcaaaagtaaaagttgagagtaatagggcgtaaaact 21262694  T
Q  99 tgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaaca 198  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21262693 tgttaggattagagttccttgattaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagtttttctttgatattatcacgtatccctcgacaaca 21262594  T
Q  199 ccattcgtgtccaaacaata 218  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  21262593 ccattcgtgtccaaacaata 21262574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 4186689 - 4186907
Alignment:
Q  1 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaaactt 99  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| |||||  |||||    
T  4186689 ttcgacaccaaatataattctaagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtagaactt 4186788  T
Q  100 gttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacac 199  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  4186789 gttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctaacttttctttgatattatcatgtatccctcgacaacac 4186888  T
Q  200 cattcgtgtccaaacaata 218  Q
    |||||||||||||||||||    
T  4186889 cattcgtgtccaaacaata 4186907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 11058368 - 11058150
Alignment:
Q  1 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaaactt 99  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||    
T  11058368 ttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaactt 11058269  T
Q  100 gttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacac 199  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11058268 gttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacac 11058169  T
Q  200 cattcgtgtccaaacaata 218  Q
    |||||||||||||||||||    
T  11058168 cattcgtgtccaaacaata 11058150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 4020454 - 4020235
Alignment:
Q  1 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtgaaact 98  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  4020454 ttcgacaccaaataccattccaagttaaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtgaaact 4020355  T
Q  99 tgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaaca 198  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4020354 tgttaggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaaca 4020255  T
Q  199 ccattcgtgtccaaacaata 218  Q
    | ||||||||||||||||||    
T  4020254 ctattcgtgtccaaacaata 4020235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 4026880 - 4026661
Alignment:
Q  1 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtgaaact 98  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  4026880 ttcgacaccaaataccattccaagttaaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtgaaact 4026781  T
Q  99 tgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaaca 198  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4026780 tgttaggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaaca 4026681  T
Q  199 ccattcgtgtccaaacaata 218  Q
    | ||||||||||||||||||    
T  4026680 ctattcgtgtccaaacaata 4026661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 34655254 - 34655473
Alignment:
Q  1 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtgaaact 98  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  34655254 ttcgacaccaaataccattccaagttaaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtgaaact 34655353  T
Q  99 tgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaaca 198  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34655354 tgttaggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaaca 34655453  T
Q  199 ccattcgtgtccaaacaata 218  Q
    | ||||||||||||||||||    
T  34655454 ctattcgtgtccaaacaata 34655473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 34648803 - 34649022
Alignment:
Q  1 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtgaaact 98  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||| || || | ||||||  |||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  34648803 ttcgacaccaaataccattccaagttaaaaagataattggttgtttgttttagtatctcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtgaaact 34648902  T
Q  99 tgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaaca 198  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34648903 tgttaggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaaca 34649002  T
Q  199 ccattcgtgtccaaacaata 218  Q
    | ||||||||||||||||||    
T  34649003 ctattcgtgtccaaacaata 34649022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 4738542 - 4738323
Alignment:
Q  1 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtgaaact 98  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  4738542 ttcgacaccaaataccattccaagttaaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtgaaact 4738443  T
Q  99 tgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaaca 198  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  4738442 tgttaggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcatgtatccctcgacaaca 4738343  T
Q  199 ccattcgtgtccaaacaata 218  Q
    | ||||| ||||||||||||    
T  4738342 ctattcgagtccaaacaata 4738323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 6 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 7069916 - 7069702
Alignment:
Q  6 caccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgtta 103  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7069916 caccaaataccattccaagttaaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtgaaacttgtta 7069817  T
Q  104 gtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccatt 203  Q
    | |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||    
T  7069816 ggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcatgtatccctcgacaacactatt 7069717  T
Q  204 cgtgtccaaacaata 218  Q
    |||||||||||||||    
T  7069716 cgtgtccaaacaata 7069702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Original strand, 29906894 - 29907045
Alignment:
Q  1 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggcgtgaaactt 99  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29906894 ttcgacactaaatatcattctaagttaaaatataatttgttgtttgttttagtaactaaattgctaataataaaattgagattaataaggcgtgaaactt 29906993  T
Q  100 gttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatac 151  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  29906994 gttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacctaatgaccatac 29907045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 30117486 - 30117335
Alignment:
Q  1 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggcgtgaaactt 99  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30117486 ttcgacactaaatatcattctaagttaaaatataatttgttgtttgttttagtaactaaattgctaataataaaattgagattaataaggcgtgaaactt 30117387  T
Q  100 gttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatac 151  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||    
T  30117386 gttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacctaaggaccatac 30117335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 7062702 - 7062578
Alignment:
Q  1 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtgaaact 98  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  7062702 ttcgacaccaaataccattccaagttaaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtgaaact 7062603  T
Q  99 tgttagtattagagttccttgatca 123  Q
    |||||| ||||||||||||||||||    
T  7062602 tgttaggattagagttccttgatca 7062578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 75 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 1167630 - 1167480
Alignment:
Q  75 ttgagattaataaggcgtgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttt-------t 167  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| ||| || ||||||||| | ||||||||| |||       |    
T  1167630 ttgagattaataaggcgtgaaacttgttaggattagaattctttgatcaagcgtcacacataacctgatgatcatatacggattctagttttttttttat 1167531  T
Q  168 ctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccattcgtgtccaaacaata 218  Q
     ||| ||||||||| |||||||||||||| | | |||||||||||| ||||    
T  1167530 tttttatattatcatgtatccctcaacaatatcgttcgtgtccaaataata 1167480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 20 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 10081762 - 10081567
Alignment:
Q  20 ctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaatgataaagtt-gagattaataaggcgtgaaacttgttagtattagagttcctt 118  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||   |||| || |||| ||||||||||| |||   ||| | |||||||||||||    
T  10081762 ctaagttaaaagataatttgttgtttgttttagaaactaagttgcaagagtaaaatttgagagtaataaggcgtaaaaac-gttggaattagagttcctt 10081664  T
Q  119 gatcaagcgtcacacgtaatctaatgat--catacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccattcgtgtccaaa 213  Q
    ||| |||||||| || ||| ||||| ||  |||| |||||||||||| |||    ||||||||||| |||| |||||||| |  |||||||||||||    
T  10081663 gattaagcgtcaaacataacctaataatcacatatatggattctagcgttttaccgatattatcacatatcgctcaacaagattattcgtgtccaaa 10081567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 156 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 7062578 - 7062516
Alignment:
Q  156 attctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccattcgtgtccaaacaata 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  7062578 attctagcttttctttgatattatcatgtatccctcgacaacactattcgtgtccaaacaata 7062516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 77 - 213
Target Start/End: Original strand, 9846601 - 9846738
Alignment:
Q  77 gagattaataaggcgtgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacat--ggattctagcttttctttgat 174  Q
    |||||||||||||||| |||   ||| | |||||||||| ||||| |||||||| || ||| || || |||| | ||  |||||||||| |||  | |||    
T  9846601 gagattaataaggcgtaaaagc-gttggaattagagttcgttgattaagcgtcaaacataacctgataatcacatatacggattctagcattttatcgat 9846699  T
Q  175 attatcacgtatccctcaacaacaccattcgtgtccaaa 213  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||| ||||    
T  9846700 attatcacgtatcgctcgacaacatcattcgtgttcaaa 9846738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 181 - 218
Target Start/End: Original strand, 29907044 - 29907081
Alignment:
Q  181 acgtatccctcaacaacaccattcgtgtccaaacaata 218  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  29907044 acgtgtccctcgacaacaccattcgtgtccaaacaata 29907081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 181 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 30117336 - 30117299
Alignment:
Q  181 acgtatccctcaacaacaccattcgtgtccaaacaata 218  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  30117336 acgtgtccctcgacaacaccattcgtgtccaaacaata 30117299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 175; Significance: 4e-94; HSPs: 22)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 4973567 - 4973785
Alignment:
Q  1 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaaactt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  4973567 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaaatgataaaattgagattaataaggggtgaaactt 4973666  T
Q  100 gttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacac 199  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||     
T  4973667 gttaggatcagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacataatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacatatccctcgacaacat 4973766  T
Q  200 cattcgtgtccaaacaata 218  Q
    |||||||||||||||||||    
T  4973767 cattcgtgtccaaacaata 4973785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 22359968 - 22360186
Alignment:
Q  1 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaaactt 99  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  22359968 ttcgacaccaaatattattctaagttaaacgataatttgttgtttgtttgaataactaagttgcaaatgataaagttgagattaatagggcgtaaaactt 22360067  T
Q  100 gttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacac 199  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22360068 gttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacctaatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacac 22360167  T
Q  200 cattcgtgtccaaacaata 218  Q
     ||||||||||||||||||    
T  22360168 tattcgtgtccaaacaata 22360186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 22313834 - 22314052
Alignment:
Q  1 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaaactt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  22313834 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttatttgtttgaataactaagttgcaaatgataaagttgagattaatagggcgtaaaactt 22313933  T
Q  100 gttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacac 199  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22313934 gttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacctaatgaccgtacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacac 22314033  T
Q  200 cattcgtgtccaaacaata 218  Q
     ||||||||||||||||||    
T  22314034 tattcgtgtccaaacaata 22314052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 5 - 218
Target Start/End: Original strand, 5876226 - 5876440
Alignment:
Q  5 acaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgtta 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  5876226 acaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgtttgaataactaagttgcaaatgataaagttgagattaatagggcgtaaaacttgtta 5876325  T
Q  104 gtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccatt 203  Q
    | |||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  5876326 ggattagagttccttgatcaagcgtcgcacataacctaatgaccatacatggattctagattttctttgatattatcacgtatccctcgacaacactatt 5876425  T
Q  204 cgtgtccaaacaata 218  Q
    |||||||||||||||    
T  5876426 cgtgtccaaacaata 5876440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 34357506 - 34357288
Alignment:
Q  1 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaaactt 99  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||    
T  34357506 ttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaactt 34357407  T
Q  100 gttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacac 199  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34357406 gttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacac 34357307  T
Q  200 cattcgtgtccaaacaata 218  Q
    |||||||||||||||||||    
T  34357306 cattcgtgtccaaacaata 34357288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 34359297 - 34359079
Alignment:
Q  1 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaaactt 99  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||    
T  34359297 ttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaactt 34359198  T
Q  100 gttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacac 199  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34359197 gttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacac 34359098  T
Q  200 cattcgtgtccaaacaata 218  Q
    |||||||||||||||||||    
T  34359097 cattcgtgtccaaacaata 34359079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 2957862 - 2958081
Alignment:
Q  1 ttcgacaccaaatatcattctaagtt-aaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtgaaact 98  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  2957862 ttcgacaccaaataccattccaagttgaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtgaaact 2957961  T
Q  99 tgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaaca 198  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2957962 tgttaggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaaca 2958061  T
Q  199 ccattcgtgtccaaacaata 218  Q
    | ||||||||||||||||||    
T  2958062 ctattcgtgtccaaacaata 2958081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 2966331 - 2966550
Alignment:
Q  1 ttcgacaccaaatatcattctaagtt-aaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtgaaact 98  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  2966331 ttcgacaccaaataccattccaagttgaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtgaaact 2966430  T
Q  99 tgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaaca 198  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2966431 tgttaggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaaca 2966530  T
Q  199 ccattcgtgtccaaacaata 218  Q
    | ||||||||||||||||||    
T  2966531 ctattcgtgtccaaacaata 2966550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 29980463 - 29980681
Alignment:
Q  1 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaaactt 99  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||| | |||||||||||| ||||| ||||||    
T  29980463 ttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgatacaattgagattaatagggcgtaaaactt 29980562  T
Q  100 gttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacac 199  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29980563 gttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacac 29980662  T
Q  200 cattcgtgtccaaacaata 218  Q
    |||||||||||||||||||    
T  29980663 cattcgtgtccaaacaata 29980681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 30041462 - 30041244
Alignment:
Q  1 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaaactt 99  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||| | |||||||||||| ||||| ||||||    
T  30041462 ttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgatacaattgagattaatagggcgtaaaactt 30041363  T
Q  100 gttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacac 199  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30041362 gttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacac 30041263  T
Q  200 cattcgtgtccaaacaata 218  Q
    |||||||||||||||||||    
T  30041262 cattcgtgtccaaacaata 30041244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 40958835 - 40958617
Alignment:
Q  1 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaaactt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| | ||||    
T  40958835 ttcgacaccaaatatcattccaagttaaaagataattggttatttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaacactt 40958736  T
Q  100 gttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacac 199  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  40958735 gttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacataacctaatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtattcctcgacaacac 40958636  T
Q  200 cattcgtgtccaaacaata 218  Q
     ||||||||||||||||||    
T  40958635 tattcgtgtccaaacaata 40958617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 25894868 - 25894649
Alignment:
Q  1 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtgaaact 98  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  25894868 ttcgacaccaaataccattccaagttaaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtgaaact 25894769  T
Q  99 tgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaaca 198  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25894768 tgttaggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatcgattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaaca 25894669  T
Q  199 ccattcgtgtccaaacaata 218  Q
    | ||||||||||||||||||    
T  25894668 ctattcgtgtccaaacaata 25894649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 7 - 218
Target Start/End: Original strand, 2438811 - 2439022
Alignment:
Q  7 accaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgttagt 105  Q
    |||||| |||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||     
T  2438811 accaaaaatcattataagttaaaagaaaatttgttgtttgttttagtaactaagttgcgaataataaaagtgagattaataaggcgtgaaacttgttagg 2438910  T
Q  106 attagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccattcg 205  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||| |    
T  2438911 attagagttccttaatcaagcgtcacacgtaacctaatga-catgcatggattctagcttttctttgatattatcatgtatccctcgacaacatcatttg 2439009  T
Q  206 tgtccaaacaata 218  Q
    |||||||||||||    
T  2439010 tgtccaaacaata 2439022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 12505991 - 12505765
Alignment:
Q  1 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttt------taa--taactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggcg 91  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||| |||| |||||||||| |||      |||  |||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  12505991 ttcgacaccaaataccattttaagttaaaagatagtttgttgtttatttagaaactaagttaactatgttgcgaataataaagttgagattaataaggcg 12505892  T
Q  92 tgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctc 191  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12505891 tgaaacttgttaggattagagttccttgatcaagagtcccacgtaacctaatgattatacatggattctagcttctctttgatattatcacgtatccctc 12505792  T
Q  192 aacaacaccattcgtgtccaaacaata 218  Q
     |||||| |||||||||||||||||||    
T  12505791 gacaacatcattcgtgtccaaacaata 12505765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 42150822 - 42151039
Alignment:
Q  1 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggcgtgaaact 98  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| || |||| |||||| |||||||||| ||||||| |||| || |  |||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  42150822 ttcgactccaaatatcattctaagttgaaagatagtttgtttgtttgttttagtaactaaattgctaaagtaaaagttgagagtaatagggcgtaaaact 42150921  T
Q  99 tgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaaca 198  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  42150922 tgttaggattagagttccttaatcaagcgtcacacataacctaatgaccatacatggattctagtttttctttgatattatcacgtatccctcgacaaca 42151021  T
Q  199 ccattcgtgtccaaacaa 216  Q
    | ||||||||||||||||    
T  42151022 ctattcgtgtccaaacaa 42151039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 5 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 29414883 - 29414669
Alignment:
Q  5 acaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgcaatgataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgtta 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||  || |   ||    ||||| |||| ||||| ||||| |||||| |||    
T  29414883 acaccaaatatcattctaagttaaaagataatttgtttgtttgttttagtaagcaaatataaaattgaaagtcgagagtaatagggcgtaaaacttatta 29414784  T
Q  104 gtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccatt 203  Q
    | |||||| || |||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  29414783 ggattagaatttcttgatcaagcgtcacacataacctaatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacatcatt 29414684  T
Q  204 cgtgtccaaacaata 218  Q
    | ||| |||||||||    
T  29414683 catgttcaaacaata 29414669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 4 - 213
Target Start/End: Original strand, 33794099 - 33794309
Alignment:
Q  4 gacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaatgataaa-gttgagattaataaggcgtgaaacttgtt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  |||||||||||||   |||| ||||||| ||||||||||| ||| | |||    
T  33794099 gacaccaaatatcattctaagttaaa-gataatttgttgtatgttttagaaactaagttgcaagagtaaaagttgagagtaataaggcgtaaaaat-gtt 33794196  T
Q  103 agtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatca--tacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacacc 200  Q
     | |||||||||| ||||| |||||||| || ||| ||||| ||||  || |||||||||||| |||   ||||||||||||||||| |||||||| |      
T  33794197 ggaattagagttctttgattaagcgtcaaacataacctaataatcacatatatggattctagcgttttactgatattatcacgtatcgctcaacaagatt 33794296  T
Q  201 attcgtgtccaaa 213  Q
    |||||| ||||||    
T  33794297 attcgtatccaaa 33794309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 9843353 - 9843566
Alignment:
Q  1 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaatgataaagttgagattaataaggcgtgaaacttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| |||| || |   || |  |||||||||| ||||| ||||| |||        
T  9843353 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaaccaaatataaaagtgaaagttgagagtaatagggcgt-aaaaaca 9843451  T
Q  101 ttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgat--catacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaaca 198  Q
    || | ||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||| ||  |||| |||||||||||| |||    |||||||||||||||| |||||||| |    
T  9843452 ttggaattagagttccttgatcaagcatcaaatataatctaataatcacatatatggattctagcgttttaccgatattatcacgtatcgctcaacaaga 9843551  T
Q  199 ccattcgtgtccaaa 213  Q
      |||||||||||||    
T  9843552 ttattcgtgtccaaa 9843566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 2156336 - 2156125
Alignment:
Q  1 ttcgacaccaaatatcattctaagtt-aaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaatgataaagttgagattaataaggcgtgaaactt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||   ||||||| |||| ||||   || |  |||||||||| ||||||||||| |||       
T  2156336 ttcgacaccaaatatcattctaagtttaaaagataatttgtt---tgttttagtaaccaagtgtaaaagtgaaagttgagagtaataaggcgtaaaaac- 2156241  T
Q  100 gttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatca--tacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaac 197  Q
    ||| | |||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||| ||||  || |||||||||||  |||    |||||||||||||||| ||||||||     
T  2156240 gttggaattagagttccttgattaagcgtcaaacataacctaataatcacatatatggattctagtgttttaccgatattatcacgtatcgctcaacaag 2156141  T
Q  198 accattcgtgtccaaa 213  Q
    |  |||||||||||||    
T  2156140 attattcgtgtccaaa 2156125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 107 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 19853588 - 19853484
Alignment:
Q  107 ttagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatca--tacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccattc 204  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||| ||||  || |||||||||||| |||    |||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  19853588 ttagagttcgttgattaagcgtcaaacataatctaataatcacatatatggattctagcgttttaccgatattatcacgtatcactcaacaacatcattc 19853489  T
Q  205 gtgtc 209  Q
     ||||    
T  19853488 atgtc 19853484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 106 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 12919064 - 12918955
Alignment:
Q  106 attagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatca--tacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccatt 203  Q
    |||||||||||||| | |||||||| || ||| ||||| | ||  || |||||||||||| |||    |||||||||||||||| |||||||| || |||    
T  12919064 attagagttccttggttaagcgtcaaacataacctaataaccacatatatggattctagcgttttaccgatattatcacgtatcgctcaacaagactatt 12918965  T
Q  204 cgtgtccaaa 213  Q
    ||||||||||    
T  12918964 cgtgtccaaa 12918955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 106 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 30580304 - 30580195
Alignment:
Q  106 attagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatca--tacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccatt 203  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| || ||| ||||| ||||  || |||||||||||| |||  | ||||||||||||||||  || || ||| ||||    
T  30580304 attagagttcgttgattaagcgtcaaacataacctaataatcacatatatggattctagcgttttatcgatattatcacgtatcggtcgacgacatcatt 30580205  T
Q  204 cgtgtccaaa 213  Q
    ||||||||||    
T  30580204 cgtgtccaaa 30580195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 171; Significance: 9e-92; HSPs: 24)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 2021666 - 2021448
Alignment:
Q  1 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaaactt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||    
T  2021666 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgtttgaataactaagttgcaaatgataaagttgagattaatagggtgtaaaactt 2021567  T
Q  100 gttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacac 199  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2021566 gttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacataacctaatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacac 2021467  T
Q  200 cattcgtgtccaaacaata 218  Q
     ||||||||||||||||||    
T  2021466 tattcgtgtccaaacaata 2021448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 21342100 - 21341882
Alignment:
Q  1 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaaactt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  21342100 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaaagataattggttgtttgttttaatgactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtgaaactt 21342001  T
Q  100 gttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacac 199  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21342000 gttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacac 21341901  T
Q  200 cattcgtgtccaaacaata 218  Q
    ||||| |||||||||||||    
T  21341900 cattcatgtccaaacaata 21341882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 21332212 - 21331994
Alignment:
Q  1 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaaactt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||| ||||| || ||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  21332212 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaaagatagttggttgtttgttttaatgactaaatttcaaatgataaaattgagattaatagggcgtgaaactt 21332113  T
Q  100 gttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacac 199  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21332112 gttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacac 21332013  T
Q  200 cattcgtgtccaaacaata 218  Q
    ||||| |||||||||||||    
T  21332012 cattcatgtccaaacaata 21331994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 42931590 - 42931372
Alignment:
Q  1 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaaactt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  42931590 ttcgacaccaaatatcattccaagttaacagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtgaaactt 42931491  T
Q  100 gttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacac 199  Q
    ||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  42931490 gttaggattagagttccttgatcaaatgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacac 42931391  T
Q  200 cattcgtgtccaaacaata 218  Q
     ||||||||||||||||||    
T  42931390 tattcgtgtccaaacaata 42931372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 16856704 - 16856487
Alignment:
Q  1 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaaactt 99  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||    
T  16856704 ttcgacagcaaatatcattcaaagttaaa-gataatttgttgtttgtttgaataactaagttgcaaatgataaagttgagattaatagggcgtaanactt 16856606  T
Q  100 gttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacac 199  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  16856605 gttaggattagagtttcttgatcaagcgtcacacataacctaatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcacatatccctcgacaacac 16856506  T
Q  200 cattcgtgtccaaacaata 218  Q
    |||||||||||||||||||    
T  16856505 cattcgtgtccaaacaata 16856487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 12950800 - 12951018
Alignment:
Q  1 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaaactt 99  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  12950800 ttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaataaggcgtaaaactt 12950899  T
Q  100 gttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacac 199  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12950900 gttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacac 12950999  T
Q  200 cattcgtgtccaaacaata 218  Q
    |||||||||||||||||||    
T  12951000 cattcgtgtccaaacaata 12951018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 16817547 - 16817330
Alignment:
Q  1 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaaactt 99  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||    
T  16817547 ttcgacagcaaatatcattcaaagttaaa-gataatttgttgtttgtttgaataactaagttgcaaatgataaagttgagattaatagggcgtaacactt 16817449  T
Q  100 gttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacac 199  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  16817448 gttaggattagagtttcttgatcaagcgtcacacataacctaatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcacatatccctcgacaacac 16817349  T
Q  200 cattcgtgtccaaacaata 218  Q
    |||||||||||||||||||    
T  16817348 cattcgtgtccaaacaata 16817330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 36782403 - 36782184
Alignment:
Q  1 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaaact 98  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| | |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |||||    
T  36782403 ttcgacaccaaataccattccaagttaaaaagataattggttgtttgttttagtaactcaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaact 36782304  T
Q  99 tgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaaca 198  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36782303 tgttaggattagagttccttgatcgagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaaca 36782204  T
Q  199 ccattcgtgtccaaacaata 218  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  36782203 ccattcgtgtccaaacaata 36782184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 34835030 - 34834812
Alignment:
Q  1 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaaactt 99  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||  |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||    
T  34835030 ttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactagattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaactt 34834931  T
Q  100 gttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacac 199  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34834930 gttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacac 34834831  T
Q  200 cattcgtgtccaaacaata 218  Q
    |||||||||||||||||||    
T  34834830 cattcgtgtccaaacaata 34834812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 34841474 - 34841256
Alignment:
Q  1 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaaactt 99  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||  |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||    
T  34841474 ttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactagattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaactt 34841375  T
Q  100 gttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacac 199  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34841374 gttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacac 34841275  T
Q  200 cattcgtgtccaaacaata 218  Q
    |||||||||||||||||||    
T  34841274 cattcgtgtccaaacaata 34841256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 29484930 - 29485149
Alignment:
Q  1 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtgaaact 98  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  29484930 ttcgacaccaaataccattccaagttaaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtgaaact 29485029  T
Q  99 tgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaaca 198  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29485030 tgttaggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaaca 29485129  T
Q  199 ccattcgtgtccaaacaata 218  Q
    | ||||||||||||||||||    
T  29485130 ctattcgtgtccaaacaata 29485149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 45011986 - 45012205
Alignment:
Q  1 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtgaaact 98  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  45011986 ttcgacaccaaataccattccaagttaaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtgaaact 45012085  T
Q  99 tgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaaca 198  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  45012086 tgttaggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaaca 45012185  T
Q  199 ccattcgtgtccaaacaata 218  Q
    | ||||||||||||||||||    
T  45012186 ctattcgtgtccaaacaata 45012205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 15852553 - 15852772
Alignment:
Q  1 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtgaaact 98  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  15852553 ttcgacaccaaataccattccaagttaaaaagataattggttgtttgttttagtaactcaattgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtgaaact 15852652  T
Q  99 tgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaaca 198  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15852653 tgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacttaacctaatgatcacacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaaca 15852752  T
Q  199 ccattcgtgtccaaacaata 218  Q
    | ||||||||||||||||||    
T  15852753 ctattcgtgtccaaacaata 15852772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 43267862 - 43268081
Alignment:
Q  1 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaaact 98  Q
    ||||||||||| |||||||  |||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||| | |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |||||    
T  43267862 ttcgacaccaattatcatttcaagttaaaagataagttgtttgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaact 43267961  T
Q  99 tgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaaca 198  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  43267962 tgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaaca 43268061  T
Q  199 ccattcgtgtccaaacaata 218  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  43268062 ccattcgtgtccaaacaata 43268081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 2157616 - 2157834
Alignment:
Q  1 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaaactt 99  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||| | |||||||||||| ||||| ||||||    
T  2157616 ttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgatacaattgagattaatagggcgtaaaactt 2157715  T
Q  100 gttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacac 199  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2157716 gttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctatcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacac 2157815  T
Q  200 cattcgtgtccaaacaata 218  Q
    |||||||||||||||||||    
T  2157816 cattcgtgtccaaacaata 2157834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 2164032 - 2164250
Alignment:
Q  1 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaaactt 99  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||| | |||||||||||| ||||| ||||||    
T  2164032 ttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgatacaattgagattaatagggcgtaaaactt 2164131  T
Q  100 gttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacac 199  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2164132 gttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgattatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacac 2164231  T
Q  200 cattcgtgtccaaacaata 218  Q
    |||||||||||||||||||    
T  2164232 cattcgtgtccaaacaata 2164250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 13902175 - 13901957
Alignment:
Q  1 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaaactt 99  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||| | |||||||||||| ||||| ||||||    
T  13902175 ttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgatacaattgagattaatagggcgtaaaactt 13902076  T
Q  100 gttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacac 199  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13902075 gttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgagcatacatggattctagcttgtctttgatattatcacgtatccctcgacaacac 13901976  T
Q  200 cattcgtgtccaaacaata 218  Q
    |||||||||||||||||||    
T  13901975 cattcgtgtccaaacaata 13901957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 21068176 - 21067958
Alignment:
Q  1 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgcaatgataaa-gttgagattaataaggcgtgaaact 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||||   |||| ||||||| ||||| || ||||||||    
T  21068176 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaaagataatttgtttgtttgtattagtaactaaattgcaaaagtaaaagttgagagtaatagggtgtgaaact 21068077  T
Q  99 tgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaaca 198  Q
    | |||| ||||||||||||||| || || |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21068076 t-ttaggattagagttccttgagcaggcatcacacgtaacctaatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaaca 21067978  T
Q  199 ccattcgtgtccaaacaata 218  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  21067977 ccattcgtgtccaaacaata 21067958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 69 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 45700793 - 45700644
Alignment:
Q  69 ataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttc 168  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  45700793 ataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgttagaattagagttccttgatcaaacgtcacacataacctaatgatcatacctggattctagcttttc 45700694  T
Q  169 tttgatattatcacgtatccctcaacaacaccattcgtgtccaaacaata 218  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  45700693 tttgatattatcacgtatccctcgacaacatcattcgtgtccaaacaata 45700644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 41455610 - 41455823
Alignment:
Q  1 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaatgataaagttgagattaataaggcgtgaaacttg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||   || |  |||||||||| ||||||||||| |||   |    
T  41455610 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaaagataatttgttgtttgttttagtaaccaagtgcaaaagtaaaagttgagagtaataaggcgt-aaaaacg 41455708  T
Q  101 ttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgat--catacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaaca 198  Q
    || | |||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||| ||  |||| |||||||| | | |||    |||||||||||||||| |||||||| |    
T  41455709 ttggaattagagttccttgattaagcgtcaaacataacctaataatcacatatatggattccaccgttttaccgatattatcacgtatcactcaacaaga 41455808  T
Q  199 ccattcgtgtccaaa 213  Q
      |||||||||||||    
T  41455809 ttattcgtgtccaaa 41455823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 54 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 11910116 - 11909950
Alignment:
Q  54 aactaagttgcaatgataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatga--tcatac 151  Q
    |||||| ||||||  |||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||  ||||| |||||   ||||     
T  11910116 aactaatttgcaagaataaaagtgagattaataaggcgtaaaacttgttaggattagagttccttgatcaagcatcccatataatccaatgaccacatat 11910017  T
Q  152 atggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccattcgtgtccaaacaata 218  Q
    | ||||||||||||||  |  |||||||||||||||  || |||| |  ||||||||||||| ||||    
T  11910016 acggattctagcttttaatctatattatcacgtatcagtcgacaatattattcgtgtccaaataata 11909950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 54 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 17784604 - 17784443
Alignment:
Q  54 aactaagttgcaatgataaa-gttgagattaataaggcgtgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatca--ta 150  Q
    |||||| |||||| |||||| ||||||| ||||||||||| |||   ||| | |||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||| ||||  ||    
T  17784604 aactaatttgcaaagataaaagttgagagtaataaggcgtaaaagc-gttggaattagagttccttgattaagcgtcaaacataacctaataatcacata 17784506  T
Q  151 catggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccattcgtgtccaaa 213  Q
     ||| |||||||| |||    |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||    
T  17784505 tatgaattctagcgttttaccgatattatcacgtatcgctcgacaacatcattcgtgtccaaa 17784443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 71 - 209
Target Start/End: Original strand, 13162892 - 13163032
Alignment:
Q  71 aaagttgagattaataaggcgtgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgat--catacatggattctagcttttc 168  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||| ||||  || ||  |||  |||||||  |||| |  |||||||||||||     
T  13162892 aaagttgagagtaataaggcgtaaaacttgttaggattagagttcattgaccaagaatcgcatataacataatgatcacatatacagattctagctttta 13162991  T
Q  169 tttgatattatcacgtatccctcaacaacaccattcgtgtc 209  Q
     |  ||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  13162992 atcaatattatcacgtatccctcgacaacatcattcatgtc 13163032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 54 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 17789257 - 17789096
Alignment:
Q  54 aactaagttgcaatgataaa-gttgagattaataaggcgtgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatca--ta 150  Q
    |||||| |||||| |||||| ||||||| ||||||||||| |||   ||| | |||||||||||||||| |||||||| || |||  |||| ||||  ||    
T  17789257 aactaatttgcaaagataaaagttgagagtaataaggcgtaaaagc-gttggaattagagttccttgattaagcgtcaaacataacataataatcacata 17789159  T
Q  151 catggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccattcgtgtccaaa 213  Q
     |||||||||||| |||    |||||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||    
T  17789158 tatggattctagcgttttaccgatattatcacgtatcgctcgacaacatcattcctgtccaaa 17789096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 167; Significance: 2e-89; HSPs: 17)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 55462990 - 55462772
Alignment:
Q  1 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaaactt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  55462990 ttcgacaccaaatatcattccaagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtgaaactt 55462891  T
Q  100 gttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacac 199  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  55462890 gttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacac 55462791  T
Q  200 cattcgtgtccaaacaata 218  Q
     ||||||||||||||||||    
T  55462790 tattcgtgtccaaacaata 55462772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 16405346 - 16405568
Alignment:
Q  1 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaaactt 99  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16405346 ttcgacaccaaatatcgttctaagttaaacgataatttgttgtttgtttgaataactaagttgcaaatgataaagttgagattaataaggcgtaaaactt 16405445  T
Q  100 gttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttg----atattatcacgtatccctcaaca 195  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||| | ||||||||| |||    
T  16405446 gttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatatatattataatgtatccctcgaca 16405545  T
Q  196 acaccattcgtgtccaaacaata 218  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  16405546 acaccattcgtgtccaaacaata 16405568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 16838573 - 16838359
Alignment:
Q  4 gacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaatgataaa-gttgagattaataaggcgtgaaacttgtt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16838573 gacaccaaatatcattctaagttaaa-gatgatttgttgtttgttttagtaactaagttgcaagagtaaaagttgagattaataaggcgtgaaacttgtt 16838475  T
Q  103 agtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccat 202  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  16838474 aggattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacctaatgaccatacatggattctatcttttctttgatattatcatgtatccctcgacaacaccat 16838375  T
Q  203 tcgtgtccaaacaata 218  Q
    ||||||||||||||||    
T  16838374 tcgtgtccaaacaata 16838359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 27590309 - 27590527
Alignment:
Q  1 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtgaaactt 99  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  27590309 ttcgacaccaaataccattccaagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtgaaactt 27590408  T
Q  100 gttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacac 199  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27590409 gttaggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacac 27590508  T
Q  200 cattcgtgtccaaacaata 218  Q
     ||||||||||||||||||    
T  27590509 tattcgtgtccaaacaata 27590527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 41372990 - 41373209
Alignment:
Q  1 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaaact 98  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |||||    
T  41372990 ttcgacaccaattatcattctaagttaaaagataagttgtttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaact 41373089  T
Q  99 tgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaaca 198  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  41373090 tgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaaca 41373189  T
Q  199 ccattcgtgtccaaacaata 218  Q
     |||||||||||||||||||    
T  41373190 tcattcgtgtccaaacaata 41373209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 37368533 - 37368315
Alignment:
Q  1 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtgaaact 98  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  37368533 ttcgacaccaaataccattccaagttaaaaagataattggttgtttgttttagtaactcaattgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtgaaact 37368434  T
Q  99 tgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaaca 198  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  37368433 tgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaaca 37368334  T
Q  199 ccattcgtgtccaaacaat 217  Q
    | |||||||||||||||||    
T  37368333 ctattcgtgtccaaacaat 37368315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 13594110 - 13594330
Alignment:
Q  1 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggcgtgaaac 97  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||| |||||||||| ||||||| |||| ||||  |||||||||||||| | ||||| ||||    
T  13594110 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaaaagataatatgtttgtttgttttagtaactaaattgctaatgtaaaagttgagattaacagggcgtaaaac 13594209  T
Q  98 ttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaac 197  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13594210 ttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaac 13594309  T
Q  198 accattcgtgtccaaacaata 218  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  13594310 accattcgtgtccaaacaata 13594330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 7780411 - 7780629
Alignment:
Q  1 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaa-gttgagattaataaggcgtgaaact 98  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| || |||||| ||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||    
T  7780411 ttcgacactaaatatcattctaagttaaa-gatgatttgttgtttgttttagtaacgaaattgcaaatgataaaagttgagagtaatagggcgtaaaact 7780509  T
Q  99 tgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaaca 198  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7780510 tgttaggattagagttccttgattaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaaca 7780609  T
Q  199 ccattcgtgtccaaacaata 218  Q
     |||||||||||||||||||    
T  7780610 tcattcgtgtccaaacaata 7780629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 8103885 - 8104104
Alignment:
Q  1 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtgaaact 98  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  8103885 ttcgacaccaaataccattccaagttaaaaagataattggttgtttgttttagtaactcaattgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtgaaact 8103984  T
Q  99 tgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaaca 198  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8103985 tgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacctaatgatcacacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaaca 8104084  T
Q  199 ccattcgtgtccaaacaata 218  Q
    | ||||||||||||||||||    
T  8104085 ctattcgtgtccaaacaata 8104104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 30238264 - 30238482
Alignment:
Q  1 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaaactt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||    
T  30238264 ttcgacaccaaatatcattccaagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaactt 30238363  T
Q  100 gttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacac 199  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||    
T  30238364 gttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacataacctaatgaccatacatgtattctagcttttctttgatattatcatttatccctcgacaacac 30238463  T
Q  200 cattcgtgtccaaacaata 218  Q
     ||||||||||||||||||    
T  30238464 tattcgtgtccaaacaata 30238482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 17456858 - 17457077
Alignment:
Q  1 ttcgacaccaaatatcattctaagtt-aaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtgaaact 98  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  || ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  17456858 ttcgacaccaaataccattccaagttgaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgacaaaattgagattaatagggcgtgaaact 17456957  T
Q  99 tgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaaca 198  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17456958 tgttaggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaaca 17457057  T
Q  199 ccattcgtgtccaaacaata 218  Q
    | |||| |||||||||||||    
T  17457058 ctattcatgtccaaacaata 17457077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 36755017 - 36754791
Alignment:
Q  1 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagtt---------gcaatgataaagttgagattaataaggcg 91  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||         | |||||||||||||||||||||||||||    
T  36755017 ttcgacaccaaatatcattctaaattaaaagatagtttgttgtttgttttagtaactaagttaactatattgaaatgataaagttgagattaataaggcg 36754918  T
Q  92 tgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctc 191  Q
    |||||||| |||| |||  |||||||| |||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  36754917 tgaaacttattaggattgaagttccttaatcaagcgtcacacattacctaatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcatgtatccctc 36754818  T
Q  192 aacaacaccattcgtgtccaaacaata 218  Q
     ||||||||||||||||||||||||||    
T  36754817 gacaacaccattcgtgtccaaacaata 36754791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 24 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 30211731 - 30211536
Alignment:
Q  24 gttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgttagtattagagttccttgatc 122  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||    
T  30211731 gttaaaagataatttgttgtttgttttagtaactaagttgcgaataataaaattgagattaataaggcatgaaacttgttatgattagagttccttaatc 30211632  T
Q  123 aagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccattcgtgtccaaacaata 218  Q
    ||||||||||| |||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  30211631 aagcgtcacacataacttaatgaccatacatggattctagattttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccattcgtgtccaaaaaata 30211536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 71 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 5660696 - 5660549
Alignment:
Q  71 aaagttgagattaataaggcgtgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctt 170  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||| | |||||||| ||||||||    
T  5660696 aaagttgagattaataaggcgtgaaacttgttaggattagagttccttgatcaagcatcacatgtaacctaatgatcatatacggattctaacttttctt 5660597  T
Q  171 tgatattatcacgtatccctcaacaacaccattcgtgtccaaacaata 218  Q
    |||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||| ||||    
T  5660596 tgatataatcacgtatccctcgacaatatcattcgtgtccaaataata 5660549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 13004005 - 13003809
Alignment:
Q  1 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaaactt 99  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||| |||||||||  |  |||||||||| ||||||||||| |||       
T  13004005 ttcgacaccaaatatcattataagttaaaagacaatttgttgtttgttttagtaacaaagttgcaagagtaaaagttgagagtaataaggcgt-aaaaac 13003907  T
Q  100 gttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgat--catacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaaca 195  Q
    ||| | |||||||||| ||||| |||||||| || ||| ||||| ||  |||| |||||||||||| |||    |||||||||||||||| |||||||    
T  13003906 gttggaattagagttctttgattaagcgtcaaacataacctaataatcacatatatggattctagcgttttaccgatattatcacgtatcactcaaca 13003809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 2947849 - 2948062
Alignment:
Q  1 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaatgataaagttgagattaataaggcgtgaaacttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| |||| || |   || |  |||||||||| ||||| ||||| |||        
T  2947849 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaaccaaatataaaagtgaaagttgagagtaatagggcgt-aaaaaca 2947947  T
Q  101 ttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgat--catacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaaca 198  Q
    || | ||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||| ||  |||| |||||||||||| |||    |||||||||||||||| |||||||| |    
T  2947948 ttggaattagagttccttgatcaagcatcaaatataatctaataatcacatatatggattctagcgttttaccgatattatcacgtatcgctcaacaaga 2948047  T
Q  199 ccattcgtgtccaaa 213  Q
      |||||||||||||    
T  2948048 ttattcgtgtccaaa 2948062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 92
Target Start/End: Original strand, 48914903 - 48914996
Alignment:
Q  1 ttcgacaccaaatatcattctaagtt-aaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggcgt 92  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||| | |||| || |||||| |||||||||||| |||||    
T  48914903 ttcgacaccaaataccattccaagttgaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgt 48914996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 163; Significance: 5e-87; HSPs: 18)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 12768748 - 12768966
Alignment:
Q  1 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaaactt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12768748 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaatgataattcgttgtttgttttaataactaaattgcaaatgataaagttgagattaataaggcgtgaaactt 12768847  T
Q  100 gttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacac 199  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||    
T  12768848 gttaggattagagttctttgatcaagcttcacacgtaacctaatgattatacatggattctagattttctttgatattatcatgtatccctcgacaagac 12768947  T
Q  200 cattcgtgtccaaacaata 218  Q
    |||||||||||||||||||    
T  12768948 cattcgtgtccaaacaata 12768966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 11358412 - 11358193
Alignment:
Q  1 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtgaaact 98  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  11358412 ttcgacaccaaataccattccaagttaaaaagataattggttgtttgttttagtaactcaattgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtgaaact 11358313  T
Q  99 tgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaaca 198  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11358312 tgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaaca 11358213  T
Q  199 ccattcgtgtccaaacaata 218  Q
    | ||||||||||||||||||    
T  11358212 ctattcgtgtccaaacaata 11358193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 7311353 - 7311571
Alignment:
Q  1 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaaactt 99  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||    
T  7311353 ttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaactt 7311452  T
Q  100 gttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacac 199  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7311453 gttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacac 7311552  T
Q  200 cattcgtgtccaaacaata 218  Q
    |||||||||||||||||||    
T  7311553 cattcgtgtccaaacaata 7311571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 8013538 - 8013320
Alignment:
Q  1 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaaactt 99  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||    
T  8013538 ttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaactt 8013439  T
Q  100 gttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacac 199  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8013438 gttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacac 8013339  T
Q  200 cattcgtgtccaaacaata 218  Q
    |||||||||||||||||||    
T  8013338 cattcgtgtccaaacaata 8013320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 36005700 - 36005482
Alignment:
Q  1 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaaactt 99  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||    
T  36005700 ttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaactt 36005601  T
Q  100 gttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacac 199  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  36005600 gttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacac 36005501  T
Q  200 cattcgtgtccaaacaata 218  Q
    |||||||||||||||||||    
T  36005500 cattcgtgtccaaacaata 36005482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 36425949 - 36425730
Alignment:
Q  1 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtgaaact 98  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  36425949 ttcgacaccaaataccattccaagttaaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtgaaact 36425850  T
Q  99 tgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaaca 198  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36425849 tgttaggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaaca 36425750  T
Q  199 ccattcgtgtccaaacaata 218  Q
    | ||||||||||||||||||    
T  36425749 ctattcgtgtccaaacaata 36425730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 6464794 - 6464576
Alignment:
Q  1 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaaactt 99  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |||||     
T  6464794 ttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaactc 6464695  T
Q  100 gttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacac 199  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6464694 gttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacac 6464595  T
Q  200 cattcgtgtccaaacaata 218  Q
    |||||||||||||||||||    
T  6464594 cattcgtgtccaaacaata 6464576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 36075971 - 36076189
Alignment:
Q  1 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaaactt 99  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| ||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||    
T  36075971 ttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacaatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaactt 36076070  T
Q  100 gttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacac 199  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  36076071 gttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacac 36076170  T
Q  200 cattcgtgtccaaacaata 218  Q
    |||||||||||||||||||    
T  36076171 cattcgtgtccaaacaata 36076189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 218
Target Start/End: Original strand, 15012393 - 15012610
Alignment:
Q  2 tcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaatgataaa-gttgagattaataaggcgtgaaacttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||   |||| ||||||| ||||| || ||||||||||    
T  15012393 tcgacaccaaatatcattctaagttaaaagataatttgttgtttgttttagttactaagttgcaagagtaaaagttgagagtaatagggtgtgaaacttg 15012492  T
Q  101 ttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacacc 200  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15012493 ttaggattagagttccttaatcaagcgtcacacggaacctaatgactatacatggattctatcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacacc 15012592  T
Q  201 attcgtgtccaaacaata 218  Q
    ||||||||||||||||||    
T  15012593 attcgtgtccaaacaata 15012610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 36022018 - 36021799
Alignment:
Q  1 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaaact 98  Q
    ||||||||||| |||||||  |||| ||| ||||| ||||| |||||||||| ||||| | |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |||||    
T  36022018 ttcgacaccaattatcatttcaagtaaaaagataagttgtttgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaact 36021919  T
Q  99 tgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaaca 198  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36021918 tgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaaca 36021819  T
Q  199 ccattcgtgtccaaacaata 218  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  36021818 ccattcgtgtccaaacaata 36021799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 41242331 - 41242116
Alignment:
Q  4 gacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgtt 102  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||| |||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||    
T  41242331 gacaccaaatatcttttcaagttaaatgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaacttgtt 41242232  T
Q  103 agtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccat 202  Q
    || ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41242231 aggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccat 41242132  T
Q  203 tcgtgtccaaacaata 218  Q
    ||||||||||||||||    
T  41242131 tcgtgtccaaacaata 41242116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 1238217 - 1238436
Alignment:
Q  1 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttg-ttgtttgttttaataactaagttg-caatgataaagttgagattaataaggcgtgaaact 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| ||||||| |||  || |  |||||||||| |||||  |||| |||||    
T  1238217 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaaaaataatttgtttgtttgttttagtaactaaattgaaaaagtaaaagttgagagtaatagagcgtaaaact 1238316  T
Q  99 tgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaaca 198  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1238317 tgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacaaataacctgatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaaca 1238416  T
Q  199 ccattcgtgtccaaacaata 218  Q
    | ||||||||||||||||||    
T  1238417 ctattcgtgtccaaacaata 1238436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 16710887 - 16710668
Alignment:
Q  1 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggcgtgaaact 98  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| || |||| | |||| |||||||||| ||||||| |||| || |  ||||||||||  |||| ||| | |||||    
T  16710887 ttcgactccaaatatcattctaagttgaaagatagtatgtttgtttgttttagtaactaaattgctaaagtaaaagttgagagcaatagggcataaaact 16710788  T
Q  99 tgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaaca 198  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16710787 tgttaggattagagttccttgatcgagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatgaattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaaca 16710688  T
Q  199 ccattcgtgtccaaacaata 218  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  16710687 ccattcgtgtccaaacaata 16710668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 75 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 26250734 - 26250591
Alignment:
Q  75 ttgagattaataaggcgtgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgat 174  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||||||||||    
T  26250734 ttgagattaataaggcgtgaaatttgttaggattagagttccttaatcaagcgtcacacgtaatctaataaccatacatggtttatagcttttctttgat 26250635  T
Q  175 attatcacgtatccctcaacaacaccattcgtgtccaaacaata 218  Q
    ||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||    
T  26250634 attatcacgtatccctcgacaatatcattcgtgtccaaacaata 26250591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 31017403 - 31017608
Alignment:
Q  1 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaatgataaagttgagattaataaggcgtgaaacttg 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||              || ||||||||||||||||| |    
T  31017403 ttcgacaccaaatatcattttaagttaaaagataatttgttgtttgttttagtaacaaagttgc--------------gaataataaggcgtgaaactag 31017488  T
Q  101 ttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcata--catggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaaca 198  Q
    |||| |||||||||| || ||||||||||||| |||| ||||||| ||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31017489 ttaggattagagttctttaatcaagcgtcacatgtaacctaatgaccatatacatggattctaatttttctttgatattatcacgtatccctcgacaaca 31017588  T
Q  199 ccattcgtgtccaaacaata 218  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  31017589 ccattcgtgtccaaaaaata 31017608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 26 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 45068609 - 45068416
Alignment:
Q  26 taaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaatgataaa-gttgagattaataaggcgtgaaacttgttagtattagagttccttgatcaa 124  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||| ||||||| ||||||  ||| ||| ||||||| |||||||||| || |||||    
T  45068609 taaaagataatttgttgtttgttttagtaactaagttgcaagagtaaaagttgagagtaataaaacgtaaaatttgttaggattagagttctttaatcaa 45068510  T
Q  125 gcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccattcgtgtccaaacaata 218  Q
    ||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||| |||||||    
T  45068509 gcgtcgcacgtaacctaatgaccatacatggattctagtttttctttgatattatcatgtaaccctcgataacaccattcgtgtccgaacaata 45068416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 7934145 - 7933931
Alignment:
Q  1 ttcgacaccaaatatcattctaag-ttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaatgataaagttgagattaataaggcgtgaaactt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||  | |||||||||| |||| || |   || |  |||||||||| ||||| ||||| |||       
T  7934145 ttcgacaccaaatatcattctaaggttaaacgatagttgatggtttgttttagtaaccaaatataaaagtgaaagttgagagtaatagggcgtaaaaaca 7934046  T
Q  100 gttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatca--tacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaac 197  Q
     || | ||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||| ||||  || |||||||||||| |||    |||||||||||||||| ||||||||     
T  7934045 -ttggaattagagttccttgatcaagcatcaaatataatctaataatcacatatatggattctagcgttttaccgatattatcacgtatcgctcaacaag 7933947  T
Q  198 accattcgtgtccaaa 213  Q
    |  |||||||||||||    
T  7933946 attattcgtgtccaaa 7933931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Original strand, 14393738 - 14393786
Alignment:
Q  1 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttt 49  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| | | ||| |||||||||||    
T  14393738 ttcgacaccaaatatcattttaagttaaaggttgattggttgtttgttt 14393786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 159; Significance: 1e-84; HSPs: 21)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 5 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 4311700 - 4311486
Alignment:
Q  5 acaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgtta 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  4311700 acaccaaatatcattctaagttaaatgataatttgttgtttgtttgaataactaagttgcaaatgataaagttgagattaatagggcgtaaaacttgtta 4311601  T
Q  104 gtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccatt 203  Q
    | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  4311600 ggattagagttccttgatcaatcgtcgcacataacctaatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacactatt 4311501  T
Q  204 cgtgtccaaacaata 218  Q
    |||||||||||||||    
T  4311500 cgtgtccaaacaata 4311486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 10941519 - 10941304
Alignment:
Q  4 gacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgtt 102  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10941519 gacacctaatataattctaagttaaaagataatttgttgtttgttttagtaactaagttgcgaataataaaattgagattaataaggcgtgaaacttgtt 10941420  T
Q  103 agtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccat 202  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10941419 aggattagagttccttaatcaagcgtcacacgtaacctaatgaccatatatggattctaacttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccat 10941320  T
Q  203 tcgtgtccaaacaata 218  Q
    ||||||||||||||||    
T  10941319 tcgtgtccaaacaata 10941304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 32746374 - 32746592
Alignment:
Q  1 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaaactt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||    
T  32746374 ttcgacaccaaatatcattccaagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaactt 32746473  T
Q  100 gttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacac 199  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32746474 gttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacataacctaatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacac 32746573  T
Q  200 cattcgtgtccaaacaata 218  Q
     ||||||||||||||||||    
T  32746574 tattcgtgtccaaacaata 32746592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 4 - 218
Target Start/End: Original strand, 6036273 - 6036488
Alignment:
Q  4 gacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgtt 102  Q
    |||||||||||| |||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| || ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  6036273 gacaccaaatataattccaagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgaaaatgataaaattgagattaatagggcgtgaaacttgtt 6036372  T
Q  103 agtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccat 202  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  6036373 aggattagagttccttgatcaagcgtcactcgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacactat 6036472  T
Q  203 tcgtgtccaaacaata 218  Q
    ||||||||||||||||    
T  6036473 tcgtgtccaaacaata 6036488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 24179077 - 24179296
Alignment:
Q  1 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtgaaact 98  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  24179077 ttcgacaccaaataccattccaagttaaaaagataattggttgtttgttttagtaactcaattgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtgaaact 24179176  T
Q  99 tgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaaca 198  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24179177 tgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaaca 24179276  T
Q  199 ccattcgtgtccaaacaata 218  Q
    | ||||||||||||||||||    
T  24179277 ctattcgtgtccaaacaata 24179296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 9570768 - 9570548
Alignment:
Q  1 ttcgacaccaaatatcattctaagtt-aaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgca-atgataaagttgagattaataaggcgtgaaac 97  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| ||||| ||||    
T  9570768 ttcgacaccaattatcattctaagtttaaaagataagttgtttgtttgttttagtaactaaattgcagatgataaaattgagattaatagggcgtaaaac 9570669  T
Q  98 ttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaac 197  Q
    ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  9570668 ttgttaggattagaattccttgatcgagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaat 9570569  T
Q  198 accattcgtgtccaaacaata 218  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  9570568 accattcgtgtccaaacaata 9570548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 27502186 - 27501967
Alignment:
Q  1 ttcgacaccaaatatcattctaagtt-aaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtgaaact 98  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  27502186 ttcgacaccaaataccattccaagttgaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtgaaact 27502087  T
Q  99 tgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaaca 198  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27502086 tgttaggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaaca 27501987  T
Q  199 ccattcgtgtccaaacaata 218  Q
    | ||||||||||||||||||    
T  27501986 ctattcgtgtccaaacaata 27501967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 13014990 - 13015208
Alignment:
Q  1 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggcgtgaaactt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||| ||||  |||||||||||||| | ||||| ||||||    
T  13014990 ttcgacaccaaatatcattccaagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgctaatgtaaaagttgagattaacagggcgtaaaactt 13015089  T
Q  100 gttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacac 199  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13015090 gttaggattagagtttcttgatcaagcgtcacacataacctaatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacac 13015189  T
Q  200 cattcgtgtccaaacaata 218  Q
     ||||||||||||||||||    
T  13015190 tattcgtgtccaaacaata 13015208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 9577270 - 9577050
Alignment:
Q  1 ttcgacaccaaatatcattctaagtt-aaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgca-atgataaagttgagattaataaggcgtgaaac 97  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| ||||| ||||    
T  9577270 ttcgacaccaattattattctaagtttaaaagataagttgtttgtttgttttagtaactaaattgcagatgataaaattgagattaatagggcgtaaaac 9577171  T
Q  98 ttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaac 197  Q
    ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  9577170 ttgttaggattagaattccttgatcgagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaat 9577071  T
Q  198 accattcgtgtccaaacaata 218  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  9577070 accattcgtgtccaaacaata 9577050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 43995073 - 43995300
Alignment:
Q  1 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgc---------aatgataaagttgagattaataaggcg 91  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||          |||||||||||||||||||||||||||    
T  43995073 ttcgacatcaaatatcattctaagttaaaagatagtttgttgtttgttttagaaactaagttgactatgttgaaatgataaagttgagattaataaggcg 43995172  T
Q  92 tgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttc-tttgatattatcacgtatccct 190  Q
    |||||||||| || ||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  43995173 tgaaacttgtcaggattagagttccttaaccaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttcttttgatattattacgtatccct 43995272  T
Q  191 caacaacaccattcgtgtccaaacaata 218  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||    
T  43995273 cgacaacaccattcgtgtccaaacaata 43995300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 25893234 - 25893458
Alignment:
Q  1 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtgaaact 98  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  25893234 ttcgacaccaaataccattctaagttaaaaagttaattggttgtttgttttagtaactcaattgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtgaaact 25893333  T
Q  99 tgttagtattagagtt-----ccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 193  Q
    |||||| |||||||||     |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25893334 tgttaggattagagttaaattccttgatcaagcgtcacacgtaacttaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 25893433  T
Q  194 caacaccattcgtgtccaaacaata 218  Q
    ||| || ||||||||||||||||||    
T  25893434 caatactattcgtgtccaaacaata 25893458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 3 - 218
Target Start/End: Original strand, 43931588 - 43931799
Alignment:
Q  3 cgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgca-atgataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgt 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  43931588 cgacaccaaataccattctaagttaaaagataatttgttgtttgttttagtaactaagttgcggataataaaattgagattaataaggcgtgaaacttgt 43931687  T
Q  102 tagtattagagttccttgatcaagcgtcac--acgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacac 199  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||| |||||||    
T  43931688 taggattagagttccttaatcaagcgtcacatacgtaacctaatgaccatacatggattctagcttttc-------ttatcacgtatccctcgacaacac 43931780  T
Q  200 cattcgtgtccaaacaata 218  Q
    ||||||||| |||||||||    
T  43931781 cattcgtgttcaaacaata 43931799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 23068468 - 23068686
Alignment:
Q  1 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgcaatgataaa-gttgagattaataaggcgtgaaac 97  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| |||| |||||||||| ||||||| ||||||   |||| ||||| ||||||| |||| |||||    
T  23068468 ttcgtcaccaaatatcattctaagttaaaaagataatctgtttgtttgttttagtaactaaattgcaaaagtaaaagttgaaattaatagggcg-gaaac 23068566  T
Q  98 ttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaac 197  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| ||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23068567 ttgttaggattagagttctttgatcgagcatcgcacgtaacctaatgatcatacatggattcta-cttttctttgatattatcacgtatccctcgacaac 23068665  T
Q  198 accattcgtgtccaaacaata 218  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  23068666 accattcgtgtccaaacaata 23068686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 71 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 20651272 - 20651135
Alignment:
Q  71 aaagttgagattaataaggcgtgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctt 170  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||| ||||||||    
T  20651272 aaagttgagattaataaggcgtgaaactcgttaggattagagttccttgatcaagcatcacacgtaatttaatgatcatatacggattctaccttttctt 20651173  T
Q  171 tgatattatcacgtatccctcaacaacaccattcgtgt 208  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| | |||||||||    
T  20651172 tgatattatcacgtatcccttgacaatatcattcgtgt 20651135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 122
Target Start/End: Original strand, 41353865 - 41353987
Alignment:
Q  1 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggcgtgaaactt 99  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||| ||||||    
T  41353865 ttcgacaccaaatatcattttaagttaaacgataatttgttgtttgtttgaataactaagttgcaaatgataaagttgagattaataggacgtaaaactt 41353964  T
Q  100 gttagtattagagttccttgatc 122  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  41353965 gttaggattagagttccttgatc 41353987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 41354288 - 41354142
Alignment:
Q  1 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgcaatgataaa-gttgagattaataaggcgtgaaact 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||   |||| ||||||| ||||| |||||||||||    
T  41354288 ttcgacaccaaatatcattctaagttgaaa-ataatttgtttgtttgttttagtaactaaattgcaaaagtaaaagttgagagtaatagggcgtgaaact 41354190  T
Q  99 tgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgat 146  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  41354189 tgttaggattagagttccttgagcaagcgtcacacgtaacctaatgat 41354142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 4590798 - 4591012
Alignment:
Q  1 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgcaatgataaagttgagattaataaggcgtgaaactt 99  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||| || |   || | ||||||||||| ||||| ||||| |||       
T  4590798 ttcgacaccaattatcattccaagttaaaagataagttgtttgtttgttttagtaaccaaatataaaagttaaagttgagagtaatagggcgtaaaaac- 4590896  T
Q  100 gttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatca--tacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaac 197  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||| ||||  || |||||||||||| |||    |||||||||||||||| ||||||||     
T  4590897 gttggaattagagttccttgatcaagcatcaaatataatctaataatcacatatatggattctagcgttttaccgatattatcacgtatcgctcaacaag 4590996  T
Q  198 accattcgtgtccaaa 213  Q
    |  |||||||||||||    
T  4590997 attattcgtgtccaaa 4591012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 3577156 - 3577095
Alignment:
Q  1 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagtt 62  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3577156 ttcgacaccaaatattattctaagttaaatgataatttgttgtttgtttgaataactaagtt 3577095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 20952981 - 20952759
Alignment:
Q  1 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaacga-taatttgttgtttgttt-----taa--taactaagttgcaatgat-aaagttgagattaataaggcg 91  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||| |||     |||  ||||||| ||||||  || |||||||||| ||||||||||    
T  20952981 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaaagagtaattgtttgtttctttgcaactaagttaactaatttgcaagaataaaagttgagagtaataaggcg 20952882  T
Q  92 tgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgat--catacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccc 189  Q
    | |||   ||| | |||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||| ||  |||| ||||||||||||  ||    |||||||||||||||| |    
T  20952881 t-aaaaacgttggaattagagttccttgattaagcgtcaaacataacctaataatcgcatatatggattctagcgctttaccgatattatcacgtatcgc 20952783  T
Q  190 tcaacaacaccattcgtgtccaaa 213  Q
    ||||||| |  |||| ||||||||    
T  20952782 tcaacaagattattcatgtccaaa 20952759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 106 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 4644463 - 4644354
Alignment:
Q  106 attagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatca--tacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccatt 203  Q
    |||||||||||||| | |||||||| || |||  |||| ||||  || |||||||||||| |||    ||||||||||||||||  ||||||| || |||    
T  4644463 attagagttccttggttaagcgtcaaacataacataataatcacatatatggattctagcgttttaccgatattatcacgtatcgttcaacaagactatt 4644364  T
Q  204 cgtgtccaaa 213  Q
    ||||||||||    
T  4644363 cgtgtccaaa 4644354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 213
Target Start/End: Original strand, 2785865 - 2785922
Alignment:
Q  156 attctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccattcgtgtccaaa 213  Q
    ||||||||||||  | |||||||||||||||||||| |||| | |||| |||||||||    
T  2785865 attctagcttttaatcgatattatcacgtatccctcgacaaaatcatttgtgtccaaa 2785922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 155; Significance: 3e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 49695 - 49912
Alignment:
Q  1 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaaactt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  49695 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaa-gataatttgttgtttgtttgaataactaagttgcaaatgataaagttgagattaatagggcgtaaaactt 49793  T
Q  100 gttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacac 199  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| ||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  49794 gttaggattagagttccttcatcaagcgtcgcacataacctaatgaccatacacggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacac 49893  T
Q  200 cattcgtgtccaaacaata 218  Q
     ||||||||||||||||||    
T  49894 tattcgtgtccaaacaata 49912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0060 (Bit Score: 151; Significance: 8e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0060
Description:

Target: scaffold0060; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 15175 - 15393
Alignment:
Q  1 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggcgtgaaactt 99  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15175 ttcgacacaaaatatcattctaacttaaaagataatttgttgtttgttttagtaactaagttgcgaatagtaaaattgagattaataaggcgtgaaactt 15274  T
Q  100 gttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacac 199  Q
    ||||| |||||||||||||  || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  15275 gttaggattagagttccttattccagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcatgtatccctcgacaacac 15374  T
Q  200 cattcgtgtccaaacaata 218  Q
    | |||||||||||||||||    
T  15375 cgttcgtgtccaaacaata 15393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0936 (Bit Score: 147; Significance: 2e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0936
Description:

Target: scaffold0936; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 3481 - 3264
Alignment:
Q  1 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaatgataaa-gttgagattaataaggcgtgaaactt 99  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3481 ttcgacactaaatatcattctaagttaaa-gatgatttgttgtttgttttagtaactaagttgcaagagtaaaagttgagattaataaggcgtgaaactt 3383  T
Q  100 gttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacac 199  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  3382 gttaggattagagttccttgatcaagcttcacacttaacctaattaccatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacat 3283  T
Q  200 cattcgtgtccaaacaata 218  Q
    |||||||||||||||||||    
T  3282 cattcgtgtccaaacaata 3264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 147; Significance: 2e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 5223 - 5005
Alignment:
Q  1 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaaactt 99  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||    
T  5223 ttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaaactt 5124  T
Q  100 gttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacac 199  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5123 gttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacac 5024  T
Q  200 cattcgtgtccaaacaata 218  Q
    |||||||||||||||||||    
T  5023 cattcgtgtccaaacaata 5005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0510 (Bit Score: 128; Significance: 4e-66; HSPs: 2)
Name: scaffold0510
Description:

Target: scaffold0510; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 9100 - 8881
Alignment:
Q  1 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggcgtgaaact 98  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| || |||| |||||| |||||||||| ||||||| |||| || |  |||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  9100 ttcgactccaaatatcattctaagttgaaagatagtttgtttgtttgttttagtaactaaattgctaaagtaaaagttgagagtaatagggcgtaaaact 9001  T
Q  99 tgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaaca 198  Q
    |||||| ||||||||||||||||| | | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  9000 tgttaggattagagttccttgatcgatcctcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacatatccctcgacaaca 8901  T
Q  199 ccattcgtgtccaaacaata 218  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  8900 ccattcgtgtccaaacaata 8881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0510; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 2779 - 2560
Alignment:
Q  1 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgcaatgataaa-gttgagattaataaggcgtgaaact 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| ||||||| ||||||   |||| ||||||| ||||| ||||| |||||    
T  2779 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaaagataatttatttgtttgttttagtaactaaattgcaaaagtaaaagttgagagtaatagggcgtaaaact 2680  T
Q  99 tgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaaca 198  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  2679 tgttaggattagagttccttgattaagcgtcacatataacctaatgaccattcatggattcaagcttttctttgatattatcatgtatccctcgacaaca 2580  T
Q  199 ccattcgtgtccaaacaata 218  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  2579 ccattcatgtccaaacaata 2560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0513 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold0513
Description:

Target: scaffold0513; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 77 - 218
Target Start/End: Original strand, 12014 - 12155
Alignment:
Q  77 gagattaataaggcgtgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatat 176  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12014 gagagtaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcacacgtaacctaatgatcataaatggattctagcttttctttgatat 12113  T
Q  177 tatcacgtatccctcaacaacaccattcgtgtccaaacaata 218  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12114 tatcacgtatccctcgacaacaccattcgtgtccaaacaata 12155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0513; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Original strand, 11954 - 12014
Alignment:
Q  1 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttg-ttgtttgttttaataactaag 60  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| || |||| |||| |||||||||||| ||||||||    
T  11954 ttcgactccaaatatcattctaagttgaaagatagtttgtttgtttgttttagtaactaag 12014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 102
Target Start/End: Original strand, 99918 - 100020
Alignment:
Q  1 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggcgtgaaactt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  99918 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgtttgaataactaagttgcaaatgataaagttgagattaatagggcgtgaaactt 100017  T
Q  100 gtt 102  Q
    |||    
T  100018 gtt 100020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0173 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0173
Description:

Target: scaffold0173; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 24464 - 24268
Alignment:
Q  1 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaaactt 99  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||| |||||||||  |  |||||||||| ||||||||||| |||       
T  24464 ttcgacaccaaatatcattataagttaaaagacaatttgttgtttgttttagtaacaaagttgcaagagtaaaagttgagagtaataaggcgt-aaaaac 24366  T
Q  100 gttagtattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgat--catacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaaca 195  Q
    ||| | |||||||||| ||||| |||||||| || ||| ||||| ||  |||| |||||||||||| |||    |||||||||||||||| |||||||    
T  24365 gttggaattagagttctttgattaagcgtcaaacataacctaataatcacatatatggattctagcgttttaccgatattatcacgtatcactcaaca 24268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University