View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF9789_low_24 (Length: 220)

Name: NF9789_low_24
Description: NF9789
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF9789_low_24
NF9789_low_24
[»] chr5 (13 HSPs)
chr5 (1-206)||(37261578-37261783)
chr5 (1-203)||(3690252-3690454)
chr5 (1-203)||(3876333-3876535)
chr5 (1-203)||(25542535-25542737)
chr5 (3-206)||(30346368-30346571)
chr5 (1-203)||(37373211-37373413)
chr5 (1-203)||(27881359-27881561)
chr5 (1-202)||(17871381-17871582)
chr5 (1-201)||(14192556-14192756)
chr5 (1-203)||(39883458-39883660)
chr5 (3-206)||(10025255-10025458)
chr5 (28-206)||(24629692-24629870)
chr5 (1-203)||(8428327-8428518)
[»] chr3 (11 HSPs)
chr3 (1-206)||(10038905-10039110)
chr3 (1-203)||(11368914-11369116)
chr3 (5-206)||(10110879-10111080)
chr3 (3-206)||(10237831-10238034)
chr3 (1-206)||(33046-33251)
chr3 (5-206)||(10000686-10000887)
chr3 (1-203)||(10968524-10968726)
chr3 (1-203)||(13530314-13530516)
chr3 (1-203)||(50410443-50410645)
chr3 (32-203)||(52918332-52918503)
chr3 (7-146)||(11362542-11362681)
[»] scaffold0356 (1 HSPs)
scaffold0356 (1-202)||(17620-17820)
[»] scaffold0550 (1 HSPs)
scaffold0550 (1-203)||(314-516)
[»] chr1 (10 HSPs)
chr1 (1-203)||(2452859-2453061)
chr1 (1-203)||(36207490-36207692)
chr1 (1-206)||(48233653-48233858)
chr1 (1-206)||(37389891-37390096)
chr1 (1-203)||(16042300-16042502)
chr1 (1-203)||(48775077-48775279)
chr1 (1-201)||(2329441-2329641)
chr1 (2-206)||(6310733-6310937)
chr1 (28-206)||(52500879-52501057)
chr1 (3-112)||(18148965-18149074)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (1-202)||(321079-321280)
[»] chr7 (8 HSPs)
chr7 (3-203)||(5828297-5828497)
chr7 (1-203)||(21069804-21070006)
chr7 (1-203)||(9000887-9001089)
chr7 (1-203)||(7036995-7037197)
chr7 (3-200)||(42232276-42232473)
chr7 (3-202)||(22844080-22844279)
chr7 (1-206)||(12780887-12781092)
chr7 (1-144)||(12785790-12785922)
[»] scaffold0073 (2 HSPs)
scaffold0073 (1-203)||(32207-32409)
scaffold0073 (1-203)||(26-228)
[»] chr2 (12 HSPs)
chr2 (1-203)||(27509649-27509851)
chr2 (1-206)||(27192764-27192969)
chr2 (1-206)||(27842578-27842783)
chr2 (1-201)||(35609928-35610128)
chr2 (1-203)||(24246100-24246302)
chr2 (3-206)||(24268809-24269012)
chr2 (1-203)||(21395645-21395847)
chr2 (1-177)||(17683597-17683773)
chr2 (54-205)||(3642920-3643071)
chr2 (1-144)||(28665984-28666116)
chr2 (1-144)||(37824818-37824950)
chr2 (1-143)||(41919986-41920117)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (7-203)||(165814-166010)
scaffold0003 (1-203)||(183086-183288)
[»] chr4 (8 HSPs)
chr4 (3-194)||(1860954-1861145)
chr4 (3-206)||(55558862-55559065)
chr4 (1-203)||(35856182-35856384)
chr4 (1-203)||(38518371-38518573)
chr4 (1-203)||(13337510-13337712)
chr4 (1-206)||(617963-618168)
chr4 (1-206)||(49710447-49710652)
chr4 (1-144)||(49786640-49786772)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (1-203)||(186829-187031)
[»] chr8 (5 HSPs)
chr8 (1-203)||(25218307-25218509)
chr8 (3-206)||(21113483-21113686)
chr8 (1-203)||(25208789-25208991)
chr8 (1-203)||(7822113-7822315)
chr8 (1-124)||(30307452-30307575)
[»] chr6 (7 HSPs)
chr6 (1-203)||(2201921-2202123)
chr6 (1-203)||(12517549-12517751)
chr6 (1-206)||(18344400-18344605)
chr6 (1-202)||(30881601-30881802)
chr6 (1-167)||(10187819-10187985)
chr6 (34-179)||(18814054-18814199)
chr6 (1-102)||(15333918-15334019)
[»] scaffold0118 (1 HSPs)
scaffold0118 (3-206)||(28458-28661)
[»] scaffold0262 (1 HSPs)
scaffold0262 (20-206)||(19299-19485)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (3-206)||(4999-5202)
[»] scaffold0107 (1 HSPs)
scaffold0107 (1-145)||(40031-40175)
[»] scaffold1139 (1 HSPs)
scaffold1139 (1-144)||(1275-1418)
[»] scaffold0225 (1 HSPs)
scaffold0225 (60-205)||(14017-14162)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (1-144)||(48748-48880)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 158; Significance: 3e-84; HSPs: 13)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 37261578 - 37261783
Alignment:
Q  1 tgagagtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaa 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  37261578 tgagagtatccacttgccaaaattagcaatttcttcttgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaa 37261677  T
Q  101 taagcccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaa 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37261678 taagctcatatctttgatgaattgatcgagacatcaacaatatcctgcctcgttccttttcagacaacaggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaa 37261777  T
Q  201 ctattg 206  Q
    ||||||    
T  37261778 ctattg 37261783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 3690252 - 3690454
Alignment:
Q  1 tgagagtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaa 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||    
T  3690252 tgagagtatccacttgccaaaattagcagtttcttcctgctctgcaggtcccgaagatgcacccaatctcatattaactgtaagcctcaacacattacaa 3690351  T
Q  101 taagcccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||    
T  3690352 taagcccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcggacaacagacaatatctgcctgaaatcaccacctaaaa 3690451  T
Q  201 cta 203  Q
    |||    
T  3690452 cta 3690454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 3876535 - 3876333
Alignment:
Q  1 tgagagtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaa 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||    
T  3876535 tgagagtatccacttgccaaaattagcagtttcttcctgctctgcaggtcccgaagatgcacccaatctcatattaactgtaagcctcaacacattacaa 3876436  T
Q  101 taagcccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||    
T  3876435 taagcccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcggacaacagacaatatctgcctgaaatcaccacctaaaa 3876336  T
Q  201 cta 203  Q
    |||    
T  3876335 cta 3876333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 25542737 - 25542535
Alignment:
Q  1 tgagagtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaa 100  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  25542737 tgagagtatccacttgccaaagttagcaatttctttctgctttgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaa 25542638  T
Q  101 taagcccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||  |||||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||    
T  25542637 taagcccatatctttgatgaattgattgatgcatcaacaatattctgccacgttccttttcggacaacagacaatatctgcctgaaatcaccacctaaaa 25542538  T
Q  201 cta 203  Q
    |||    
T  25542537 cta 25542535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 3 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 30346571 - 30346368
Alignment:
Q  3 agagtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaata 102  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | ||||    
T  30346571 agagtatccacttgccaaaattagcaatttctttctgctctgcaggtaccaaagatgcacccaatctcatattaacagtaagtcttaacacattaaaata 30346472  T
Q  103 agcccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaact 202  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||  ||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  30346471 agcacatatctttgatgaattgattgatgcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcggacaacatgcaatatctgcctgacatcaccacctaaaact 30346372  T
Q  203 attg 206  Q
    ||||    
T  30346371 attg 30346368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 37373211 - 37373413
Alignment:
Q  1 tgagagtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaa 100  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  37373211 tgagagtatccacttgcaaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaa 37373310  T
Q  101 taagcccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaa 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||||  ||| ||||||  ||||||||| |||||||||| | | |||||||||| |||||    
T  37373311 taagcccatatctttgacgaattgaccgacgcatcaacaatatccggcctcgttcctcctcagacaacaggcaatatctgcttaaaatcaccacctaaaa 37373410  T
Q  201 cta 203  Q
    |||    
T  37373411 cta 37373413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 27881359 - 27881561
Alignment:
Q  1 tgagagtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaa 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||    
T  27881359 tgagagtatccacttgccaaaattagcaatttctacctgctctgcatgtaccgaagatgcacccaatctcatattaacggtaagcctcaacacattacaa 27881458  T
Q  101 taagcccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  ||| ||||||  || ||||||  ||||||||| ||| |||||||||| |||||    
T  27881459 taagcccatatctttgatgaattgaccgaggcatcaacaatatccggccttgttcctcctcggacaacatgcaatatctgcctaaaatcaccacctaaaa 27881558  T
Q  201 cta 203  Q
    |||    
T  27881559 cta 27881561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 17871582 - 17871381
Alignment:
Q  1 tgagagtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaa 100  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  17871582 tgagagtatccatttgccaaaattagcaatttattcctgctctgcaggtaccaaagatgcacccaatcccatattaacagtaagcctcaacacattacaa 17871483  T
Q  101 taagcccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaa 200  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||| ||  ||  ||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  17871482 taagctcatatctttgatgaactgattgaggcatcaacaatatcatgcctcgttccttttcggatgacatgcaatatctgcctgaaatcaccacctaaaa 17871383  T
Q  201 ct 202  Q
    ||    
T  17871382 ct 17871381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 14192756 - 14192556
Alignment:
Q  1 tgagagtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaa 100  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||    
T  14192756 tgagagtatccacttgtcaaaattagcaatttcttcctactctacaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacacattataa 14192657  T
Q  101 taagcccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaa 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||  ||||||| | |||||||||||||| |||||    
T  14192656 taagcccatatctttaatgaattaattggggcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcgggcaacatgcaatatatgcctgaaatcaccacctaaaa 14192557  T
Q  201 c 201  Q
    |    
T  14192556 c 14192556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 39883458 - 39883660
Alignment:
Q  1 tgagagtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaa 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||    
T  39883458 tgagagtatccacttgccaaaattagcaatttcttcatgctctgcatgtaccgaagctgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacatattacaa 39883557  T
Q  101 taagcccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaa 200  Q
    |||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||  |  |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  39883558 taagccaatatctttgacgaattgactgaggcatcaacaatatccggcctcgttcctcctaggacaacaggcaatatctgcctgaaatcaccacgtaaaa 39883657  T
Q  201 cta 203  Q
    |||    
T  39883658 cta 39883660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 3 - 206
Target Start/End: Original strand, 10025255 - 10025458
Alignment:
Q  3 agagtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaata 102  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||    
T  10025255 agagtatccacttgccaaaattagcaatttctttctgctctgcaggtaccaaagatgcacccagtctcatattaacagtaagtctcaacacatcaaaata 10025354  T
Q  103 agcccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaact 202  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | ||| |||||||||| |||| | |||||||||| ||| | |||||||| |||||||    
T  10025355 agcacatatctttgatgaattgattgatgcatcaacaatatattgcctcgttccttttcggacagcaggcaatatctgcctaatatcaccacctaaaact 10025454  T
Q  203 attg 206  Q
    ||||    
T  10025455 attg 10025458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 28 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 24629870 - 24629692
Alignment:
Q  28 aatttcttcctgctctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataagcccatatctttgatgaattgatt 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24629870 aatttctttctgctctgcaggtaccaaagatgcacccaatctcatattaacagtaagtctcaacacattaaaataagcacatatctttgatgaattgatt 24629771  T
Q  128 gaggcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaactattg 206  Q
    || |||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||  ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  24629770 gatgcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcggacaacatgcaatatctgcctgatatcaccacctaaaactattg 24629692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 8428518 - 8428327
Alignment:
Q  1 tgagagtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaa 100  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||           || |||||||||  ||| ||||    
T  8428518 tgagagtatccacttgcaaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtaccgaagatgcatccaat-----------agcaagcctcaaaacattacaa 8428430  T
Q  101 taagcccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaa 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||   ||| ||||||  || |||||| |||||||||| ||| |||||||||| |||||    
T  8428429 taagcccatatctttgacgaattgaccgaggcatcaacaatatctggcctcgttcctcctcggacaacaggcaatatctgcctaaaatcaccacctaaaa 8428330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 158; Significance: 3e-84; HSPs: 11)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 10038905 - 10039110
Alignment:
Q  1 tgagagtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaa 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||    
T  10038905 tgagagtatccacttgccaaaattagcaatttcttcttgctctgcacgtaccgaagatgcacctaatctcatattaacaataagcctcaacacattacaa 10039004  T
Q  101 taagcccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10039005 taagcccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcagacaacatgcaatatcttcttgaaatcaccacataaaa 10039104  T
Q  201 ctattg 206  Q
    ||||||    
T  10039105 ctattg 10039110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 11368914 - 11369116
Alignment:
Q  1 tgagagtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaa 100  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  11368914 tgagggtatccacttgccaaaattatcagtttcttccttctctgcaggtcccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaa 11369013  T
Q  101 taagcccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaa 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| | |||||| | |||||||||||||| |||||    
T  11369014 taagtccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcggacaacagacaatatatgcctgaaatcaccacttaaaa 11369113  T
Q  201 cta 203  Q
    |||    
T  11369114 cta 11369116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 134; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 5 - 206
Target Start/End: Original strand, 10110879 - 10111080
Alignment:
Q  5 agtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataag 104  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| | ||||||    
T  10110879 agtatccacttgccaaaattagcaatttctttctgctctgtaggtaccaaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcattaacacattaaaataag 10110978  T
Q  105 cccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaactat 204  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  10110979 ctcatatctttgatgaattgattgatgcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcggacaacaggcaatatctgcctgaaatcaccacctaaaactat 10111078  T
Q  205 tg 206  Q
    ||    
T  10111079 tg 10111080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 3 - 206
Target Start/End: Original strand, 10237831 - 10238034
Alignment:
Q  3 agagtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaata 102  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| | ||||    
T  10237831 agagtatccacttgccaaaattagcaatttctttctgctcagcaggtaccaaagatgcatccaatcttatattaacagtaagccttaacacattaaaata 10237930  T
Q  103 agcccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaact 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||  ||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  10237931 agcccatatctttgatgaattgattgatgcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcggacaacaagcaatatctgcctgaaatcaccacctaaaact 10238030  T
Q  203 attg 206  Q
    ||||    
T  10238031 attg 10238034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 33046 - 33251
Alignment:
Q  1 tgagagtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaa 100  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  33046 tgagagtatccacttgcaaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaa 33145  T
Q  101 taagcccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaa 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||  | | ||||||  || ||||||  ||||||||| ||| |||||||||| |||||    
T  33146 taagcccatatctttgacgaattgaccgaggcatcaacaatatccggcgtcgttcctcctcggacaacatgcaatatctgcctaaaatcaccacctaaaa 33245  T
Q  201 ctattg 206  Q
    ||||||    
T  33246 ctattg 33251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 5 - 206
Target Start/End: Original strand, 10000686 - 10000887
Alignment:
Q  5 agtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataag 104  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||||||    
T  10000686 agtatccacttgccaaaattaacaatttctttctactctgcaggtaccaaagatgcacccaatctcatattaacagtaagccttaacacattaaaataag 10000785  T
Q  105 cccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaactat 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||||| |||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  10000786 cccatatctttgatgaattgattgatgcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcggacaacaggcaacatctgcctgaaatccccacctaaaactat 10000885  T
Q  205 tg 206  Q
    ||    
T  10000886 tg 10000887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 10968726 - 10968524
Alignment:
Q  1 tgagagtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaa 100  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  10968726 tgagagtgtccacttgccaaaattagcaatttcttcctgctctataggtactgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaa 10968627  T
Q  101 taagcccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaa 200  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||| ||| || | |||||||| |||||||||||||  |||||    
T  10968626 taaacccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctccctcgatccgtttcggactacagacaatatctgcctgaaatcaccatctaaaa 10968527  T
Q  201 cta 203  Q
    |||    
T  10968526 cta 10968524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 13530314 - 13530516
Alignment:
Q  1 tgagagtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaa 100  Q
    |||||||||  || |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||    
T  13530314 tgagagtatatacttgccaaaattagcaatttattcctgctctacaggtaccgaagatgcactcaatctcatattaacagtaagcctctacacattacaa 13530413  T
Q  101 taagcccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaa 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||  |||||| |||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  13530414 taagcccatatctgtgatgaattgattgaggcatcaacaatatcgtgcctcgttcctttttggacaacaggcaatatctgcctgaaatcaccagctaaaa 13530513  T
Q  201 cta 203  Q
    |||    
T  13530514 cta 13530516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 50410443 - 50410645
Alignment:
Q  1 tgagagtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaa 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||    
T  50410443 tgagagtatccacttgccaaaattagcaatttattcctgctctacaggtaccgaagatgcactcaatctcatattaacagtaagcctcaacacattagaa 50410542  T
Q  101 taagcccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaa 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||| |||| | |||||| |||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  50410543 taagccaatatctttgatgaattgattgaggcatcaaaaatatcgtgcctcgttgctttacggacaacaggcagtatctgcctgaaatcaccacctaaaa 50410642  T
Q  201 cta 203  Q
    |||    
T  50410643 cta 50410645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 32 - 203
Target Start/End: Original strand, 52918332 - 52918503
Alignment:
Q  32 tcttcctgctctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataagcccatatctttgatgaattgattgagg 131  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  52918332 tcttcctactctacaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataagctcgtatctttgatgaattgattgagg 52918431  T
Q  132 catcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaacta 203  Q
    ||||||||||||||| ||| | |||||||| ||| ||  ||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  52918432 catcaacaatatcctccctcgatccttttcggactacatgcaatatctgcctgaaatcaccacctaaaacta 52918503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 7 - 146
Target Start/End: Original strand, 11362542 - 11362681
Alignment:
Q  7 tatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataagcc 106  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||    
T  11362542 tatccacttgccaaaattagcagtttattcttgctctgcaggtcccgaagatgcacccaatctcatattaactgtaagcctcaacacattacaataagcc 11362641  T
Q  107 catatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcct 146  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11362642 catatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcct 11362681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0356 (Bit Score: 150; Significance: 2e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0356
Description:

Target: scaffold0356; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 17820 - 17620
Alignment:
Q  1 tgagagtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaa 100  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  17820 tgagagtatccacttgctaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaa 17721  T
Q  101 taagcccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaa 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||  |||||| || ||||||||||||||||||||    
T  17720 -aagcccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcggacaacatgcaatagctgcctgaaatcaccacataaaa 17622  T
Q  201 ct 202  Q
    ||    
T  17621 ct 17620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0550 (Bit Score: 143; Significance: 3e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0550
Description:

Target: scaffold0550; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 516 - 314
Alignment:
Q  1 tgagagtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaa 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||    
T  516 tgagagtatccacttgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaatagtaagcctcaacacattacaa 417  T
Q  101 taagcccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaa 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||  || |||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||    
T  416 taagcccatatctttgacgaattgattgaggcatcaacaatatccggccttgttcctcctcggacaacagacaatatctgcctgaaatcaccacctaaaa 317  T
Q  201 cta 203  Q
    |||    
T  316 cta 314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 143; Significance: 3e-75; HSPs: 10)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 2453061 - 2452859
Alignment:
Q  1 tgagagtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaa 100  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||    
T  2453061 tgagagtatccacttgtcaaaattagcaatttcttcatgctctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcgacacattacaa 2452962  T
Q  101 taagcccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaa 200  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2452961 tatgcctatatctttgatgaattgattgaagcatcaacaatatcctgcctcgatccttttcggacaatgggcaatatcttcctgaaatcaccacctaaaa 2452862  T
Q  201 cta 203  Q
    |||    
T  2452861 cta 2452859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 36207490 - 36207692
Alignment:
Q  1 tgagagtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaa 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  36207490 tgagagtatccacttgccaaaattatcaatttcttcctgctttgcaggtaccgaagatgaacccaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaa 36207589  T
Q  101 taagcccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaa 200  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| |||||    
T  36207590 taaactcatatctttgatgaattgattgaggcatcaataatatcctgcctctttccttttcagacaacaggcaatatctgtctgaaatcaccacctaaaa 36207689  T
Q  201 cta 203  Q
    |||    
T  36207690 cta 36207692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 134; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 48233653 - 48233858
Alignment:
Q  1 tgagagtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaa 100  Q
    ||||||||| ||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||    
T  48233653 tgagagtattcacttgtcaaaattaggaatttcttcctgctctgcaggtaccaaagatgcacccaatctcatatcaacagtaagcctcaacaaattacaa 48233752  T
Q  101 taagcccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaa 200  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  48233753 taaacacatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctgtctcgttccttttcggacaacaggcaatatctgcctgaaatcaccacctaaaa 48233852  T
Q  201 ctattg 206  Q
    ||||||    
T  48233853 ctattg 48233858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 37390096 - 37389891
Alignment:
Q  1 tgagagtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaa 100  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||    
T  37390096 tgagaatatccacttgcaaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaatagtaagcctcaacacattacaa 37389997  T
Q  101 taagcccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaa 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||  ||| ||||||  || |||||| |||||||||| ||| |||||||||| |||||    
T  37389996 taagcccatatctttgacgaattgaccgaggcatcaacaatatccagcctcgttcctcctcggacaacaggcaatatctgcctaaaatcaccacctaaaa 37389897  T
Q  201 ctattg 206  Q
    ||||||    
T  37389896 ctattg 37389891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 16042300 - 16042502
Alignment:
Q  1 tgagagtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaa 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  16042300 tgagagtatccacttgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcatgtaccgaagctgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaa 16042399  T
Q  101 taagcccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaa 200  Q
    |||||| |||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||  ||| ||||||  |  |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  16042400 taagccaatatctttgacgaattaactgaggcatcaacaatatccggcctcgttcctcctaggacaacaggcaatatctgcctgaaatcaccacgtaaaa 16042499  T
Q  201 cta 203  Q
    |||    
T  16042500 cta 16042502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 48775279 - 48775077
Alignment:
Q  1 tgagagtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaa 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  48775279 tgagagtatccacttgccaaaattagcagtttctttctgctctgtaggtcccgaagatgcacccaatctgatattaacagtaagcctcaacacattacaa 48775180  T
Q  101 taagcccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaa 200  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||   |||||| |  ||||||||||||| |||||    
T  48775179 taagcccatatatttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcggacaacatacaatatttgtctgaaatcaccacctaaaa 48775080  T
Q  201 cta 203  Q
    |||    
T  48775079 cta 48775077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 2329441 - 2329641
Alignment:
Q  1 tgagagtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaa 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||    
T  2329441 tgagagtatccacttgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtaacgaagaggcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacatattacaa 2329540  T
Q  101 taagcccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| | ||| ||| |||  | |||||| || | ||||| |||||||||||||| |||||    
T  2329541 taagcccatatctttgatgaattgattaaggcattaacaatatcgtgcctcgttgcttcacggacaacaggtagtatctgcctgaaatcaccacctaaaa 2329640  T
Q  201 c 201  Q
    |    
T  2329641 c 2329641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 2 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 6310937 - 6310733
Alignment:
Q  2 gagagtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaat 101  Q
    |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  6310937 gagactatccacttgcaaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaat 6310838  T
Q  102 aagcccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaac 201  Q
    |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||   |||  |||||  || |||||| | |||||||| ||| |||||||||| ||||||    
T  6310837 aagcccatatctttgacgaattgaccgaggcatcaacaatatcaggcctcattcctcctcggacaacagacaatatctgcctaaaatcaccacctaaaac 6310738  T
Q  202 tattg 206  Q
    |||||    
T  6310737 tattg 6310733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 28 - 206
Target Start/End: Original strand, 52500879 - 52501057
Alignment:
Q  28 aatttcttcctgctctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataagcccatatctttgatgaattgatt 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  52500879 aatttctttctgctctgcaggtaccaaagatgcacccaatctcatattaacagtaagtctcaacacattaaaataagcacatatctttgatgaattgatt 52500978  T
Q  128 gaggcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaactattg 206  Q
    || |||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||  ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  52500979 gatgcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcggacaacatgcaatatctgcctgatatcaccacctaaaactattg 52501057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 3 - 112
Target Start/End: Original strand, 18148965 - 18149074
Alignment:
Q  3 agagtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaata 102  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||||    
T  18148965 agagtatccacttgccaaaattagcaatttctttctgctctgcaggtaccaaagatgcacccaatctcatattaacagtaagccttaacacattaaaata 18149064  T
Q  103 agcccatatc 112  Q
    || |||||||    
T  18149065 agtccatatc 18149074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 142; Significance: 1e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 321280 - 321079
Alignment:
Q  1 tgagagtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaa 100  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||    
T  321280 tgagaatatccacttgcaaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaaaagtaagcctcaacacattacaa 321181  T
Q  101 taagcccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaa 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||    
T  321180 taagcccatatcgttgatgaattgattaaggcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcggacaacagacaatatctgcctgaaatcaccacctaaaa 321081  T
Q  201 ct 202  Q
    ||    
T  321080 ct 321079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 141; Significance: 4e-74; HSPs: 8)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 3 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 5828497 - 5828297
Alignment:
Q  3 agagtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaata 102  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||||    
T  5828497 agagtatccacttgccaaaattagcaatttctttctgctctgcaggtaccgaagatgcactcaatctcatattaatagtaagcctcaacacattaaaata 5828398  T
Q  103 agcccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaact 202  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  5828397 aacccatatctttgatgaattgattgatgcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcggacaacaggcaatatctgcctgaaatcaccacctaaaact 5828298  T
Q  203 a 203  Q
    |    
T  5828297 a 5828297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 21070006 - 21069804
Alignment:
Q  1 tgagagtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaa 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| ||||    
T  21070006 tgagagtatccacttgtcaaaattagcaatttctttctgctctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcgatacattacaa 21069907  T
Q  101 taagcccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaa 200  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  21069906 taaacccatatctttaatgaattgattgatgcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcggacaacaggcaatatctacctgaaatcaccacctaaaa 21069807  T
Q  201 cta 203  Q
    |||    
T  21069806 cta 21069804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 9001089 - 9000887
Alignment:
Q  1 tgagagtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaa 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  9001089 tgagagtatccacttgccaaaattagcaatttcttcctgctatgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaa 9000990  T
Q  101 taagcccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaa 200  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||  || |||||  |||||||||| ||| ||||||| || |||||    
T  9000989 taagcccatatctttgacgaattgactgaggcatcaacaatatccggcctcgttcctcctcggacaataggcaatatctgcctaaaatcacaacctaaaa 9000890  T
Q  201 cta 203  Q
    |||    
T  9000889 cta 9000887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 7036995 - 7037197
Alignment:
Q  1 tgagagtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaa 100  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  7036995 tgagagtatccacttgcaaaaattagcaatttcttcttgctctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaa 7037094  T
Q  101 taagcccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaa 200  Q
    |||||| |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||  ||| ||||||  || |||||| |||||||||| ||| |||||||||| |||||    
T  7037095 taagcctatatctttgacgaattgaccgaggcatcaacaatatccggcctcgttcctcctcggacaacaggcaatatctgcctaaaatcaccacctaaaa 7037194  T
Q  201 cta 203  Q
    |||    
T  7037195 cta 7037197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 3 - 200
Target Start/End: Original strand, 42232276 - 42232473
Alignment:
Q  3 agagtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaata 102  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||    
T  42232276 agagtatccacttgccaaaattagcaatttctttctactctgcaggtaccaaagatgcacccaatctcatattaacagtaagtctcaacacattaaaata 42232375  T
Q  103 agcccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaa 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  42232376 agcacatatctttgatgaattgattgatgcatcaacaatatactgcctcgttccttttcggacaacaggcaatatctgcctgatatcaccacctaaaa 42232473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 3 - 202
Target Start/End: Original strand, 22844080 - 22844279
Alignment:
Q  3 agagtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaata 102  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  22844080 agagtatccaattgccaaaattagcaatttattcctgctctacaggtaccaaagatgcacccaatcccatattaacagtaagcctcaacacattacaata 22844179  T
Q  103 agcccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaact 202  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||| ||  ||  ||||||||| | |||||||||||| |||||||    
T  22844180 agctcatatctttgatgaactgattgaggcatcaacaatatcatgcctcgttccttttcggatgacatgcaatatctgcatgaaatcaccacctaaaact 22844279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 12781092 - 12780887
Alignment:
Q  1 tgagagtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaa 100  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  12781092 tgagagtatccacttgcaaaaattagcaatttcttcttgctctacaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaa 12780993  T
Q  101 taagcccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaa 200  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||  ||| ||||||  |  ||| || ||||| |||| ||| |||||||||| |||||    
T  12780992 taagctcatatctttgacgaattgaccgaggcatcaacaatatccggcctcgttcctccttggactacaggcaacatctgcctaaaatcaccacctaaaa 12780893  T
Q  201 ctattg 206  Q
    ||||||    
T  12780892 ctattg 12780887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 12785922 - 12785790
Alignment:
Q  1 tgagagtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaa 100  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||           || |||||||||  ||| ||||    
T  12785922 tgagagtatccacttgcaaaaattagcaatttcttcctgctctgtaggtaccgaagatgcatccaat-----------agcaagcctcaaaacattacaa 12785834  T
Q  101 taagcccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatc 144  Q
    |||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||    
T  12785833 taagtccatatctttgacgaattgaccgaggcatcaacaatatc 12785790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0073 (Bit Score: 139; Significance: 7e-73; HSPs: 2)
Name: scaffold0073
Description:

Target: scaffold0073; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 32207 - 32409
Alignment:
Q  1 tgagagtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaa 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  32207 tgagagtatccacttgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaa 32306  T
Q  101 taagcccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaa 200  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||   ||| ||||||  || |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  32307 taagcacatatctttgacgaattgactgaggcatcaacaatatctggcctcgttcctcgtcggacaacaggcaatatctgcctgaaatcaccacctaaaa 32406  T
Q  201 cta 203  Q
    |||    
T  32407 cta 32409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0073; HSP #2
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 26 - 228
Alignment:
Q  1 tgagagtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaa 100  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||    
T  26 tgagagtatccacttgcaaaaattagcaatttcttcttgctctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaaaacattacaa 125  T
Q  101 taagcccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaa 200  Q
    |||||| |||| ||||| |||||||  ||| ||||||||||||||  ||| ||||||  || || ||  |||||||||| ||| |||||||||| |||||    
T  126 taagccaatatatttgacgaattgaccgagacatcaacaatatccggcctcgttcctcctcggaaaaaaggcaatatctgcctaaaatcaccacctaaaa 225  T
Q  201 cta 203  Q
    |||    
T  226 cta 228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 139; Significance: 7e-73; HSPs: 12)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 27509649 - 27509851
Alignment:
Q  1 tgagagtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaa 100  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||    
T  27509649 tgagagtatctacttgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtagcaaagatgcacccaatcttatattaacagtaagcctcaatacattacaa 27509748  T
Q  101 taagcccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||  |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  27509749 taagcccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctgtctcgttcctttttggacaacaggcaatatctgcctgaaatcaccacctaaaa 27509848  T
Q  201 cta 203  Q
    |||    
T  27509849 cta 27509851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 134; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 27192764 - 27192969
Alignment:
Q  1 tgagagtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaa 100  Q
    ||||||||||||| || ||||||||  |||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||  || ||||    
T  27192764 tgagagtatccacttgtcaaaattatgaatttcttcctgctctacaggtatcaaagatgcacccaatctcatattaacaatcagcctcaacaaattacaa 27192863  T
Q  101 taagcccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  27192864 taagcccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcggacaacaggcaatatctgcctgaaatcaccacctaaaa 27192963  T
Q  201 ctattg 206  Q
    ||||||    
T  27192964 ctattg 27192969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 134; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 27842578 - 27842783
Alignment:
Q  1 tgagagtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaa 100  Q
    ||||||||||||| || ||||||||  |||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||  || ||||    
T  27842578 tgagagtatccacttgtcaaaattatgaatttcttcctgctctacaggtatcaaagatgcacccaatctcatattaacaatcagcctcaacaaattacaa 27842677  T
Q  101 taagcccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  27842678 taagcccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcggacaacaggcaatatctgcctgaaatcaccacctaaaa 27842777  T
Q  201 ctattg 206  Q
    ||||||    
T  27842778 ctattg 27842783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 35609928 - 35610128
Alignment:
Q  1 tgagagtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaa 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| | ||    
T  35609928 tgagagtatccacttgccaaaattagcaatttcttcctgctctaaaggtaccgaagatgcacccaatgtcatattaacagtaagcctcaacacattataa 35610027  T
Q  101 taagcccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaa 200  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||| |||||||| | |||||||||||||| |||||    
T  35610028 taagtccatatctttaatgaattgattggggcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcgggcaacaggcaatatatgcctgaaatcaccacctaaaa 35610127  T
Q  201 c 201  Q
    |    
T  35610128 c 35610128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 24246100 - 24246302
Alignment:
Q  1 tgagagtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaa 100  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  24246100 tgagagaatccacatgccaacattagcaatttcttcctgctctgcaggtaccgaagattcacc-aatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaa 24246198  T
Q  101 taagcccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctacctagttcc-ttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  |||| ||||| ||||||  ||||||||| ||| |||||||||| ||||    
T  24246199 taagcccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctgcatcattcctttttcggacaacatgcaatatctgccttaaatcaccacctaaa 24246298  T
Q  200 acta 203  Q
    ||||    
T  24246299 acta 24246302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 3 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 24269012 - 24268809
Alignment:
Q  3 agagtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaata 102  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||| | ||||    
T  24269012 agagtatccacttgccaaaattagcaatttctttctgctctgcaggtaccaaagatgcacccaatcgcatattaacaataagcgtcaacacattaaaata 24268913  T
Q  103 agcccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaact 202  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  24268912 agcacatatctgtgatgaattgattgatgcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcggacaacaggcaatatctgcctgatatcaccacctaaaact 24268813  T
Q  203 attg 206  Q
    ||||    
T  24268812 attg 24268809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 21395645 - 21395847
Alignment:
Q  1 tgagagtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaa 100  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  21395645 tgagagtatccacttgccgaaattagcaatttcttcctgatctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaa 21395744  T
Q  101 taagcccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaa 200  Q
    |||||||||| |||||| |||||||  ||||||||||||||||||  ||| ||||||  || |||||| |||||||||| ||| |||||||||| |||||    
T  21395745 taagcccataactttgacgaattgacggaggcatcaacaatatccggcctcgttcctcctcggacaacaggcaatatctgcctaaaatcaccacctaaaa 21395844  T
Q  201 cta 203  Q
    |||    
T  21395845 cta 21395847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 17683773 - 17683597
Alignment:
Q  1 tgagagtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaa 100  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||    
T  17683773 tgagagtatccacttgcaaaaattagcaatttcttcctgctctacaggtatcgaagatgcacccaatctcatattaacaataagccttaacacattacaa 17683674  T
Q  101 taagcccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatat 177  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||  |||||||    
T  17683673 taagctcatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcggacaacaagcaatat 17683597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 54 - 205
Target Start/End: Original strand, 3642920 - 3643071
Alignment:
Q  54 aagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataagcccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctacctagt 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  3642920 aagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacaaattacaataagcccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctgcctcgt 3643019  T
Q  154 tccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaactatt 205  Q
    |||||||| | |||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  3643020 tccttttcgggcaacaggcaatatctacctgaaatcaccacctaaaactatt 3643071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 28666116 - 28665984
Alignment:
Q  1 tgagagtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaa 100  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||           || |||||||||  ||| ||||    
T  28666116 tgagagtatccacttgcaaaaattagcaatttcttcctgctctgtaggtaccgaagatgcatccaat-----------agcaagcctcaaaacattacaa 28666028  T
Q  101 taagcccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatc 144  Q
    |||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||    
T  28666027 taagtccatatctttgacgaattgaccgaggcatcaacaatatc 28665984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 37824950 - 37824818
Alignment:
Q  1 tgagagtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaa 100  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||           || |||||||||  ||| ||||    
T  37824950 tgagagtatccacttgcaaaaattagcaatttcttcctgctctgtaggtaccgaagatgcatccaat-----------agcaagcctcaaaacattacaa 37824862  T
Q  101 taagcccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatc 144  Q
    |||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||    
T  37824861 taagtccatatctttgacgaattgaccgaggcatcaacaatatc 37824818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 41920117 - 41919986
Alignment:
Q  1 tgagagtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaa 100  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||           || |||||||||  ||| ||||    
T  41920117 tgagagtatccacttgcaaaaattatcaatttcttcctgctctacaggtaccaaagatgcatccaat-----------agcaagcctcaaaacattacaa 41920029  T
Q  101 taagcccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatat 143  Q
    |||| |||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  41920028 taagtccatatctttgacgaattgaccgaggcatcaacaatat 41919986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 137; Significance: 1e-71; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 7 - 203
Target Start/End: Original strand, 165814 - 166010
Alignment:
Q  7 tatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataagcc 106  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||    
T  165814 tatccacttgccaaaattagcagtttattcttgctctgcaggtcccgaagatgcacccaatctcatattaactgtaagcctcaacacattacaataagcc 165913  T
Q  107 catatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaacta 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  165914 catatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcggacaacagacaatatctgcctgaaatcaccacctaaaacta 166010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 183086 - 183288
Alignment:
Q  1 tgagagtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaa 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||||    
T  183086 tgagagtatccacttgccaaaattagcagtttcttcctgctctgcaggtcccgaagatgcacccaatatcatattaactgtaagcctcaacacattacaa 183185  T
Q  101 taagcccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaa 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  ||||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||    
T  183186 taaggccatatctttgatgaattgattgatgcatcaacaatatcctgcctcattccttttcggacaacagacaatatctgcctgaaatcaccacctaaaa 183285  T
Q  201 cta 203  Q
    |||    
T  183286 cta 183288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 136; Significance: 4e-71; HSPs: 8)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 3 - 194
Target Start/End: Original strand, 1860954 - 1861145
Alignment:
Q  3 agagtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaata 102  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||    
T  1860954 agagtatccacttgccaaaattagcaatttctttctgctctgcaggtaccaaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacacattaaaata 1861053  T
Q  103 agcccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccac 194  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  1861054 agcccatatctttaatgaattgattgatgcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcggacaacaggcaatatttgcctgaaatcaccac 1861145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 3 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 55559065 - 55558862
Alignment:
Q  3 agagtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaata 102  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||    
T  55559065 agagtatccacttgccaaaattagcaatttctttctgctctgcaggtaccaaagatgcacccaatctcatattaacagtaagtctcaacacattaaaata 55558966  T
Q  103 agcccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaact 202  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  55558965 agcacatatctttgatgaattgattgatgcatcaacaatatactgcctcgttccttttcggacaacaggcaatatctgcctgatatcaccacctaaaact 55558866  T
Q  203 attg 206  Q
    ||||    
T  55558865 attg 55558862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 35856182 - 35856384
Alignment:
Q  1 tgagagtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaa 100  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  35856182 tgagagtatccacttgcaaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaa 35856281  T
Q  101 taagcccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaa 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||  ||| ||||||  || |||||| |||||||||| ||| |||||||||| |||||    
T  35856282 taagcccatatctttgacgaattgaccgaggcatcaacaatatccggcctcgttcctcctcggacaacaggcaatatctgcctaaaatcaccacctaaaa 35856381  T
Q  201 cta 203  Q
    |||    
T  35856382 cta 35856384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 38518371 - 38518573
Alignment:
Q  1 tgagagtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaa 100  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  38518371 tgagagtatccacttgcaaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaa 38518470  T
Q  101 taagcccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaa 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||   || ||||||  ||||||||| |  ||||||| ||| |||||||||| |||||    
T  38518471 taagcccatatctttgacgaattgaccgaggcattaacaatatccggtctcgttcctcctcagacaacagttaatatctgcctaaaatcaccacctaaaa 38518570  T
Q  201 cta 203  Q
    |||    
T  38518571 cta 38518573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 13337510 - 13337712
Alignment:
Q  1 tgagagtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaa 100  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||    
T  13337510 tgagagtatccacttgcaaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaaacctcaacacattacaa 13337609  T
Q  101 taagcccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaa 200  Q
    |||   ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||  ||| ||||||  || |||||| |||||||||| ||| |||||||||| |||||    
T  13337610 taatatcatatctttgacgaattgaccgaggcatcaacaatatccggcctcgttcctcctcggacaacaggcaatatctgcctaaaatcaccacctaaaa 13337709  T
Q  201 cta 203  Q
    |||    
T  13337710 cta 13337712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 618168 - 617963
Alignment:
Q  1 tgagagtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaa 100  Q
    ||||||||| ||| ||  |||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||  || ||||    
T  618168 tgagagtattcacttgttaaaattaggaatttcttcctgctctgcagataccaaagatgcactcaatctcatattaacagttagcctcaacaaattacaa 618069  T
Q  101 taagcccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaa 200  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||  ||||||||| | |||||||||||| ||||     
T  618068 taagcctatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcatgcctcgttccttttcagacaacatgcaatatctgcttgaaatcaccacctaaag 617969  T
Q  201 ctattg 206  Q
    ||||||    
T  617968 ctattg 617963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 49710447 - 49710652
Alignment:
Q  1 tgagagtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaa 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  49710447 tgagagtatccacttgccaaaattagcaatttctttctgttctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaa 49710546  T
Q  101 taagcccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaa 200  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||  |||||||||||||||||   ||| ||||||  ||  ||||| |||||||||| ||| |||||||||| |||||    
T  49710547 taagctcatatctttaacgaattgacggaggcatcaacaatatctggcctcgttcctcctcgaacaacaggcaatatctgcctaaaatcaccacctaaaa 49710646  T
Q  201 ctattg 206  Q
    ||||||    
T  49710647 ctattg 49710652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 49786772 - 49786640
Alignment:
Q  1 tgagagtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaa 100  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||           || |||||||||  ||| ||||    
T  49786772 tgagagtatccacttgcaaaaattagcaatttcttcctgctctgtaggtaccgaagatgcatccaat-----------agcaagcctcaaaacattacaa 49786684  T
Q  101 taagcccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatc 144  Q
    |||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||    
T  49786683 taagtccatatctttgacgaattgaccgaggcatcaacaatatc 49786640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 135; Significance: 2e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 186829 - 187031
Alignment:
Q  1 tgagagtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaa 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||| ||||    
T  186829 tgagagtatccacttgccaaaattagcaatttctttctgctctgcaagtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaggccttaaaacattacaa 186928  T
Q  101 taagcccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||    
T  186929 taagcccatatctttgatgaattgattggtgcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcggacaacaggcaatatctgcttgaaatcaccacctaaaa 187028  T
Q  201 cta 203  Q
    |||    
T  187029 cta 187031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 135; Significance: 2e-70; HSPs: 5)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 25218509 - 25218307
Alignment:
Q  1 tgagagtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaa 100  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  25218509 tgagagtatccacttgcaaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaa 25218410  T
Q  101 taagcccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaa 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||  ||| ||||||  || |||||| |||||||||| ||| |||||||||| |||||    
T  25218409 taagcccatatctttgacgaattgaccgaggcatcaacaatatccggcctcgttcctcctcggacaacaggcaatatctgcctaaaatcaccacctaaaa 25218310  T
Q  201 cta 203  Q
    |||    
T  25218309 cta 25218307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 3 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 21113686 - 21113483
Alignment:
Q  3 agagtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaata 102  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||| | ||||    
T  21113686 agagtatccacttgccaaaattagcaatttctttctgctctgcaggtaccaaagatgcacccaatcgcatattaacagtaagcgtcaacacattaaaata 21113587  T
Q  103 agcccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaact 202  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  21113586 agcacatatctgtgatgaattgattgatgcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcggacaacaggcaatatctgcctgatatcaccacctaaaact 21113487  T
Q  203 attg 206  Q
    ||||    
T  21113486 attg 21113483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 25208991 - 25208789
Alignment:
Q  1 tgagagtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaa 100  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||    
T  25208991 tgagagtatccacttgcaaaaattagtaatttcgtcctgctctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacattaagcctcaacacattacaa 25208892  T
Q  101 taagcccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaa 200  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||  ||| ||||||  || || ||| |||||||||| ||| |||||||||| |||||    
T  25208891 taagctcatatctttgacgaattgaccgaggcatcaacaatatccggcctcgttcctcctcggaaaacaggcaatatctgcctaaaatcaccacctaaaa 25208792  T
Q  201 cta 203  Q
    |||    
T  25208791 cta 25208789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 7822113 - 7822315
Alignment:
Q  1 tgagagtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaa 100  Q
    ||||||||||||| | | |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  7822113 tgagagtatccacttacaaaaattcgcaatttcttcctgctctacaggtaccgaagatgcactcaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaa 7822212  T
Q  101 taagcccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaa 200  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||  |  ||| ||||||  || |||||  |||||||||| ||| |||||||||| |||||    
T  7822213 taagctcatatctttgacgaattgaccgaggcatcaacaataatcggcctcgttcctcctcggacaataggcaatatctgcctaaaatcaccacctaaaa 7822312  T
Q  201 cta 203  Q
    |||    
T  7822313 cta 7822315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Original strand, 30307452 - 30307575
Alignment:
Q  1 tgagagtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaa 100  Q
    |||||||||| || ||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  30307452 tgagagtatctacttgcaaaaattagcaatttcttcccactctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaa 30307551  T
Q  101 taagcccatatctttgatgaattg 124  Q
    ||||||||||||||||| ||||||    
T  30307552 taagcccatatctttgacgaattg 30307575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 135; Significance: 2e-70; HSPs: 7)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 2202123 - 2201921
Alignment:
Q  1 tgagagtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaa 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||    
T  2202123 tgagagtatccacttgccaaaattagcaatttcttcatgctctgcaagtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcgacacattacaa 2202024  T
Q  101 taagcccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaa 200  Q
    || ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | |||||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||| |||||    
T  2202023 tatgcctatatctttgatgaattgatcgaggcatcaacaatatcctgcctcgatccttttcggacaatgggcaatatctgcctgaagtcaccacctaaaa 2201924  T
Q  201 cta 203  Q
    |||    
T  2201923 cta 2201921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 12517549 - 12517751
Alignment:
Q  1 tgagagtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaa 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  12517549 tgagagtatccacttgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggaacagaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcttcaacacattacaa 12517648  T
Q  101 taagcccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaa 200  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||  ||| ||||||  || |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  12517649 taagcccatatctttgacgaattaactgaggcatcaacaatatccggcctcgttcctcctcggacaacaggcaatatctgcctgaaatcaccacctaaaa 12517748  T
Q  201 cta 203  Q
    |||    
T  12517749 cta 12517751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 18344400 - 18344605
Alignment:
Q  1 tgagagtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaa 100  Q
    ||||||||| ||| || ||||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||    
T  18344400 tgagagtattcacttgtcaaaattaggaatttcttcctgctctgtagataccaaagatgcactcaatctcatattaacagtaagcctcaacaaattacaa 18344499  T
Q  101 taagcccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaa 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||  ||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  18344500 taagcccatatctttgataaattgattgaggcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcggacaacatgcaatatctgcctgaaatcaccacctaaaa 18344599  T
Q  201 ctattg 206  Q
    ||||||    
T  18344600 ctattg 18344605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 30881601 - 30881802
Alignment:
Q  1 tgagagtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaa 100  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  30881601 tgagagtatccatttgccaaaattagcaatttattcctgctctgcaggtaccaaagatgcacccaatcccatattaacagtaagcctcaacacattacaa 30881700  T
Q  101 taagcccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaa 200  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||| ||  ||  ||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  30881701 taagctcatatctttgatgaactgattgaggcatcaacaatatcatgcctcgttccttttcggatgacatgcaatatctgcctgaaatcaccacctaaaa 30881800  T
Q  201 ct 202  Q
    ||    
T  30881801 ct 30881802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 167
Target Start/End: Original strand, 10187819 - 10187985
Alignment:
Q  1 tgagagtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaa 100  Q
    |||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||    
T  10187819 tgagagcatccacgtgcgaaaattagcaatttcttcctgctctacaggtatcgaagatgcacccaatctcatattaacaataagcctcaacacattacaa 10187918  T
Q  101 taagcccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaa 167  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||| |||||    
T  10187919 taagctcatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctgtctcgttccttttcggacaa 10187985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 34 - 179
Target Start/End: Original strand, 18814054 - 18814199
Alignment:
Q  34 ttcctgctctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataagcccatatctttgatgaattgattgaggca 133  Q
    |||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |    
T  18814054 ttcctgctctacaggtaccaacgatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaataagctcatatctttgatgaattgattaaggga 18814153  T
Q  134 tcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatct 179  Q
    ||||||||||| |  || |||||||||| ||||||  |||||||||    
T  18814154 tcaacaatatcatgtctcgttccttttcggacaacatgcaatatct 18814199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 102
Target Start/End: Original strand, 15333918 - 15334019
Alignment:
Q  1 tgagagtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaa 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  15333918 tgagagtatccacttgccaaaattagcaatttcttcttgctctgcaggtatcgaagatgcacctaatctcatattaacagtaagcttcaacacattacaa 15334017  T
Q  101 ta 102  Q
    ||    
T  15334018 ta 15334019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118 (Bit Score: 128; Significance: 2e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0118
Description:

Target: scaffold0118; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 3 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 28661 - 28458
Alignment:
Q  3 agagtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaata 102  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||    
T  28661 agagtatccacttgccaaaattagcaatttctttctgctctgcaggtaccaaagatgcatccaatctcatattaacagtaagtctcaactcattaaaata 28562  T
Q  103 agcccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaact 202  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||  ||||||||| ||||| |||||||| | |||||    
T  28561 agcacatatctttgatgaattgattgatgcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcggacaacatgcaatatctgcctgatatcaccaccttaaact 28462  T
Q  203 attg 206  Q
    ||||    
T  28461 attg 28458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0262 (Bit Score: 127; Significance: 1e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0262
Description:

Target: scaffold0262; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 20 - 206
Target Start/End: Original strand, 19299 - 19485
Alignment:
Q  20 aaattagcaatttcttcctgctctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataagcccatatctttgatg 119  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||    
T  19299 aaattagcaatttctttctgctctgcaggtatcaaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacacattaaaataagcccatatctttgatg 19398  T
Q  120 aattgattgaggcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaactattg 206  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  19399 aattgattgatgcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcggacaacagacaatatctgcctgaaattaccacctaaaactattg 19485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 120; Significance: 1e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 3 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 5202 - 4999
Alignment:
Q  3 agagtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaata 102  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||    
T  5202 agagtatccacttgccaaaattagcaatttctttctgctttgcaggtatcaaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacacattaaaata 5103  T
Q  103 agcccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctacctagttccttttcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaact 202  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||||  |||||||||| ||| |||||||||  |||||||    
T  5102 agcacatatcttttatgaattgattgatgcatcaacaatatcctgcctcgttccttttcgaacaataggcaatatctgcctaaaatcaccatctaaaact 5003  T
Q  203 attg 206  Q
    ||||    
T  5002 attg 4999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 109; Significance: 5e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 40031 - 40175
Alignment:
Q  1 tgagagtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaa 100  Q
    ||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  40031 tgagagtattcacttgccaaagttagcaatttcttcctgctctgtaggtaccgaagatgcacacaatctcatattaacagtaagcctcaacacattacaa 40130  T
Q  101 taagcccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcc 145  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  40131 taagcccatatctttgacgaattgactgaggcatcaacaatatcc 40175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1139 (Bit Score: 92; Significance: 7e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold1139
Description:

Target: scaffold1139; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 144
Target Start/End: Original strand, 1275 - 1418
Alignment:
Q  1 tgagagtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaa 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  1275 tgagagtatccacttgccaaaattagaaatttcttcctgctatacatgtacctaagatgcacccaatcccatattaacagtaagcctcaacacattacaa 1374  T
Q  101 taagcccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatc 144  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||    
T  1375 taagctcatatctttgatgaattgattgatgcataaataatatc 1418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225 (Bit Score: 90; Significance: 1e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0225
Description:

Target: scaffold0225; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 60 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 14162 - 14017
Alignment:
Q  60 cacccaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaataagcccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatcctacctagttccttt 159  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||  || | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||||||||    
T  14162 cacccaatctcatattaatagtaagcctcaacatattaaaataagcccatatatttgatgaattgattgatgcatcaacaatatcttgcctcgttccttt 14063  T
Q  160 tcagacaacgggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaactatt 205  Q
    || |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  14062 tcggacaacaggcaatatctgcctgaaatcaccacctaaaactatt 14017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 58; Significance: 1e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 48880 - 48748
Alignment:
Q  1 tgagagtatccacatgccaaaattagcaatttcttcctgctctgcaggtaccgaagatgcacccaatctcatattaacagtaagcctcaacgcataacaa 100  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||           || |||||||||  ||| ||||    
T  48880 tgagagtatccacttgcaaaaattagcaatttcttcctgctctgtaggtaccgaagatgcatccaat-----------agcaagcctcaaaacattacaa 48792  T
Q  101 taagcccatatctttgatgaattgattgaggcatcaacaatatc 144  Q
    |||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||    
T  48791 taagtccatatctttgacgaattgaccgaggcatcaacaatatc 48748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University