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This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
|
Alignment Overview
Query: NF9795A_low_142 (Length: 291)
Name: NF9795A_low_142
Description: NF9795A
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF9795A_low_142 |
 |  |
|
| [»] scaffold0444 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0036 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] chr8 (56 HSPs) |
 |  |
|
| [»] chr7 (55 HSPs) |
 |  |
|
| [»] chr6 (26 HSPs) |
 |  |
|
| [»] chr4 (59 HSPs) |
 |  |
|
| [»] chr3 (51 HSPs) |
 |  |
|
| [»] chr2 (27 HSPs) |
 |  |
|
| [»] chr1 (71 HSPs) |
 |  |
|
| [»] chr5 (55 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0022 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0060 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0057 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0343 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0001 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0007 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0041 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0095 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0572 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0498 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0006 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0320 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0287 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
Alignment Details
Target: scaffold0444 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 1)
Name: scaffold0444
Description:
Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 17 - 291
Target Start/End: Original strand, 7277 - 7551
Alignment:
| Q |
17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
7277 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgtatttttaaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaataat |
7376 |
T |
 |
| Q |
116 |
cagatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaa |
215 |
Q |
| |
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|
|
| T |
7377 |
cagatttaaatttatattttctccttcaccatcttagtcttttaactcctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttaaactacacaacccccaa |
7476 |
T |
 |
| Q |
216 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacatannnnnnncccattttggagcctattttga |
291 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
7477 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata-tttttccccattttggagcctattttga |
7551 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0036 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 1)
Name: scaffold0036
Description:
Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 17 - 291
Target Start/End: Original strand, 12592 - 12866
Alignment:
| Q |
17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
12592 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgtatttttaaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaataat |
12691 |
T |
 |
| Q |
116 |
cagatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaa |
215 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
12692 |
cagatttaaatttatattttctccttcaccatcttagtcttttaactcctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttaaactacacaacccccaa |
12791 |
T |
 |
| Q |
216 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacatannnnnnncccattttggagcctattttga |
291 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12792 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata-tttttccccattttggagcctattttga |
12866 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 56)
Name: chr8
Description:
Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 17 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 7723702 - 7723428
Alignment:
| Q |
17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
7723702 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgtatttttaaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaataat |
7723603 |
T |
 |
| Q |
116 |
cagatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaa |
215 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
7723602 |
cagatttaaatttatattttctccttcaccatcttagtcttttaactcctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttaaactacacaacccccaa |
7723503 |
T |
 |
| Q |
216 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacatannnnnnncccattttggagcctattttga |
291 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7723502 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata-tttttccccattttggagcctattttga |
7723428 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 17 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 36894338 - 36894064
Alignment:
| Q |
17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
36894338 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgtatttttaaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaataat |
36894239 |
T |
 |
| Q |
116 |
cagatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaa |
215 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
36894238 |
cagatttaaatttatattttctccttcaccatcttagtcttttaactcctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttaaactacacaacccccaa |
36894139 |
T |
 |
| Q |
216 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacatannnnnnncccattttggagcctattttga |
291 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36894138 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata-tttttccccattttggagcctattttga |
36894064 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 17 - 291
Target Start/End: Original strand, 43433202 - 43433476
Alignment:
| Q |
17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
43433202 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgtatttttaaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaataat |
43433301 |
T |
 |
| Q |
116 |
cagatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaa |
215 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
43433302 |
cagatttaaatttatattttctccttcaccatcttagtcttttaactcctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttaaactacacaacccccaa |
43433401 |
T |
 |
| Q |
216 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacatannnnnnncccattttggagcctattttga |
291 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43433402 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata-ttttctcccattttggagcctattttga |
43433476 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 17 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 41257882 - 41257608
Alignment:
| Q |
17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
41257882 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgtttttttaaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaataat |
41257783 |
T |
 |
| Q |
116 |
cagatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaa |
215 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
41257782 |
cagatttaaatttatattttctccttcaccatcttagtcttttaactcctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttaaactacacaacccccaa |
41257683 |
T |
 |
| Q |
216 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacatannnnnnncccattttggagcctattttga |
291 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41257682 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata-ttttcccccattttggagcctattttga |
41257608 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 17 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 2657391 - 2657117
Alignment:
| Q |
17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
2657391 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgtatttttaaagtgacaataatgattatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaataat |
2657292 |
T |
 |
| Q |
116 |
cagatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaa |
215 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| |
|
|
| T |
2657291 |
cagatttaaatttatattttctccttcaccatcttagtcttttaactcctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttaaattacacaacccccaa |
2657192 |
T |
 |
| Q |
216 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacatannnnnnncccattttggagcctattttga |
291 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2657191 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata-tttttccccattttggagcctattttga |
2657117 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 17 - 291
Target Start/End: Original strand, 1077486 - 1077760
Alignment:
| Q |
17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
1077486 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgtatttttaaagtgacaataatggttatttctaatagataaattattatttttagatgtttataaacaaattaataat |
1077585 |
T |
 |
| Q |
116 |
cagatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaa |
215 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
1077586 |
cagatttaaatttatattttctccttcaccatcttagtcttttaactcctccaactccttcaacaacttgctcaaaccatttaaactacacaacccccaa |
1077685 |
T |
 |
| Q |
216 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacatannnnnnncccattttggagcctattttga |
291 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1077686 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata-tttttccccattttggagcctattttga |
1077760 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 17 - 291
Target Start/End: Original strand, 14450269 - 14450543
Alignment:
| Q |
17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
14450269 |
acatcaaaatagggaaaaaaatgtatttttaaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaataat |
14450368 |
T |
 |
| Q |
116 |
cagatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaa |
215 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
14450369 |
cagatttaaatttatattttctccttcaccatcttagtcttttaactcctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttaaactacacaacccccaa |
14450468 |
T |
 |
| Q |
216 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacatannnnnnncccattttggagcctattttga |
291 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14450469 |
tattaatccacaaatcatcctattattgtcactttaaaaaatacata-tttttccccattttggagcctattttga |
14450543 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 17 - 291
Target Start/End: Original strand, 17960629 - 17960903
Alignment:
| Q |
17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
17960629 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgtatttttaaagtgacaataatggttatttccaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaataat |
17960728 |
T |
 |
| Q |
116 |
cagatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaa |
215 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
17960729 |
cagatttaaatttatattttctccttcaccatcttagttttttaactcctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttaaactacacaacccccaa |
17960828 |
T |
 |
| Q |
216 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacatannnnnnncccattttggagcctattttga |
291 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17960829 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcaatttaaaaaatacata-tttttccccattttggagcctattttga |
17960903 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 17 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 29119663 - 29119390
Alignment:
| Q |
17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
29119663 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgaatttttaaagtgacaataatg-ttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaataat |
29119565 |
T |
 |
| Q |
116 |
cagatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaa |
215 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||| |
|
|
| T |
29119564 |
cagatttaaatttatattttctccttcaccatcttagtcttttaactcctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttaaactacacagcccccaa |
29119465 |
T |
 |
| Q |
216 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacatannnnnnncccattttggagcctattttga |
291 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29119464 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata-tttttccccattttggagcctattttga |
29119390 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 17 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 39407640 - 39407366
Alignment:
| Q |
17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| || |
|
|
| T |
39407640 |
acatcaaaatagagaaaaatgtgtatttttaaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttaaaggtttataaacaaactaataat |
39407541 |
T |
 |
| Q |
116 |
cagatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaa |
215 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
39407540 |
cagatttaaatttatattttctccttcaccatcttagtcttttaactcctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttaaactacacaacccccaa |
39407441 |
T |
 |
| Q |
216 |
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291 |
Q |
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| T |
39407440 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata-tttttccccattttggagcctattttga |
39407366 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 17 - 262
Target Start/End: Original strand, 355473 - 355719
Alignment:
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acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
| |
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| T |
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acatcaaaatagggaaaaatgtgtatttttaaagtgacaataattattatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaataat |
355572 |
T |
 |
| Q |
116 |
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215 |
Q |
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| T |
355573 |
caaatttaaatttatattttctccttcaccatcttagtcttttaactcctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttaaactacacaacccccaa |
355672 |
T |
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| Q |
216 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata |
262 |
Q |
| |
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| T |
355673 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata |
355719 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 17 - 262
Target Start/End: Original strand, 13001686 - 13001931
Alignment:
| Q |
17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgcattttaaag-tgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
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acatcaaaatagggaaaaatgtgtatttttaatatgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaataat |
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T |
 |
| Q |
116 |
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215 |
Q |
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cagatttaaatttatattttctccttcaccatcttagtcttttaac-tctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttaaactacacaacccccaa |
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T |
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| Q |
216 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata |
262 |
Q |
| |
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| T |
13001885 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata |
13001931 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 17 - 262
Target Start/End: Original strand, 14053486 - 14053732
Alignment:
| Q |
17 |
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115 |
Q |
| |
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acatcaaaataggaaaaaatgtgtatttttaaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttatatacaaattaataat |
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T |
 |
| Q |
116 |
cagatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaa |
215 |
Q |
| |
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| T |
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caaatttaaatttatattttctccttcaccatcttagtcttttaactcctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttaaactacacaacccccaa |
14053685 |
T |
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| Q |
216 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata |
262 |
Q |
| |
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| T |
14053686 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata |
14053732 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 17 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 15731935 - 15731689
Alignment:
| Q |
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acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
| |
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| T |
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acatcaaaatagggaaaaatgtgtatttttaaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattatcatttttagaggtttataaacaaattaataat |
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T |
 |
| Q |
116 |
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215 |
Q |
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| T |
15731835 |
cagatttaaatttatattttctccttcaccatcatggtcttttaactcctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttaaactacacaacccccaa |
15731736 |
T |
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| Q |
216 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata |
262 |
Q |
| |
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| T |
15731735 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata |
15731689 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 17 - 258
Target Start/End: Original strand, 36508050 - 36508292
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| Q |
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acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
| |
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| T |
36508050 |
acatcaaaatagaaaaaaatgtgtatttttaaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaataat |
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T |
 |
| Q |
116 |
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215 |
Q |
| |
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| T |
36508150 |
cagatttaaatttatattttctccttcaccatcttagtcttttaactcctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttaaactacacaacccccaa |
36508249 |
T |
 |
| Q |
216 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaata |
258 |
Q |
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| T |
36508250 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaata |
36508292 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 17 - 291
Target Start/End: Original strand, 5794881 - 5795155
Alignment:
| Q |
17 |
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115 |
Q |
| |
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acatcaaaatagggaaaaatgtgtatttttaaagtgacaatgatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaataat |
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T |
 |
| Q |
116 |
cagatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaa |
215 |
Q |
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| T |
5794981 |
cagatttaaatttatattttctccttcaccatcttgggcttttaactcctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttaaactacataacccccaa |
5795080 |
T |
 |
| Q |
216 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacatannnnnnncccattttggagcctattttga |
291 |
Q |
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| T |
5795081 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata-tttttccccattttggagcctattttga |
5795155 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 17 - 291
Target Start/End: Original strand, 32989435 - 32989708
Alignment:
| Q |
17 |
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115 |
Q |
| |
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|
| T |
32989435 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgtatttttaaagtgacaataatgattatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaataat |
32989534 |
T |
 |
| Q |
116 |
cagatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaa |
215 |
Q |
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| T |
32989535 |
cagatttaaatttatattttctccttcaccatcttagtcttttaactcctccaactccttcaacaatttgatcaaaccatttaaactacacaacccccaa |
32989634 |
T |
 |
| Q |
216 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacatannnnnnncccattttggagcctattttga |
291 |
Q |
| |
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|
| T |
32989635 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcacttt-aaaaatacata-tttttccccattttggagcctattttga |
32989708 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 17 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 35942582 - 35942335
Alignment:
| Q |
17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
| |
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|
| T |
35942582 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgtatttttaaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaataat |
35942483 |
T |
 |
| Q |
116 |
cagatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaa |
215 |
Q |
| |
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| T |
35942482 |
catatttaaatttatattttctccttcaccatcttagtcttttaactcctccagctccttcaacaatttgctcaaaccatttaaactacacaacccccaa |
35942383 |
T |
 |
| Q |
216 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcac-tttaaaaaatacata |
262 |
Q |
| |
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|
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| T |
35942382 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcacttttaaaaaatacata |
35942335 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 17 - 262
Target Start/End: Original strand, 39324760 - 39325006
Alignment:
| Q |
17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
39324760 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgtatttttaaagtgacaataatgattatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaataat |
39324859 |
T |
 |
| Q |
116 |
cagatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaa |
215 |
Q |
| |
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| T |
39324860 |
catatttaaatttatattttttccttcaccatcttagtcttttaactcctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttaaactacacaacccccaa |
39324959 |
T |
 |
| Q |
216 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata |
262 |
Q |
| |
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| T |
39324960 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaagaatacata |
39325006 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 17 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 14244843 - 14244598
Alignment:
| Q |
17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
| |
|
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|
| T |
14244843 |
acatcaaaataggaaaaaatgtgtatttttaaagtgacaacaatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaataat |
14244744 |
T |
 |
| Q |
116 |
cagatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaa |
215 |
Q |
| |
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| T |
14244743 |
cagatttaaatttatattttctccttcaccatcatagccttttaactcctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttaaactacacaacccccaa |
14244644 |
T |
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| Q |
216 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacat |
261 |
Q |
| |
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| T |
14244643 |
tattaatccacaaatcatctcattattgtcactttaaaaaatacat |
14244598 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 17 - 291
Target Start/End: Original strand, 31918106 - 31918377
Alignment:
| Q |
17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
| |
|
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|
| T |
31918106 |
acatcaaaatagg-aaaaatgtgtatttttaaagtgacaataattgttatttctaatagacaaattattatttttagaggtatataaacaaattaataat |
31918204 |
T |
 |
| Q |
116 |
cagatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaa |
215 |
Q |
| |
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| T |
31918205 |
cagatttaaatttatattttctccttcaccatcttagtcttttaactccttcaactccttcaacaatttgctcaaaccatttaaactacacaacctccaa |
31918304 |
T |
 |
| Q |
216 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacatannnnnnncccattttggagcctattttga |
291 |
Q |
| |
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|
| T |
31918305 |
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31918377 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 17 - 291
Target Start/End: Original strand, 28776298 - 28776575
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17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
| |
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|
| T |
28776298 |
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28776397 |
T |
 |
| Q |
116 |
cagatttaaatttatatttcctccttca----ctatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccc |
211 |
Q |
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| T |
28776398 |
cagatttaaatttatattttctccttcaccatcgatcttagtcttttaactcctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttaaactacacaaccc |
28776497 |
T |
 |
| Q |
212 |
tcaatattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacatannnnnnncccattttggagcctattttga |
291 |
Q |
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| T |
28776498 |
-ccatattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata-tttttccccattttggagcctattttga |
28776575 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 17 - 243
Target Start/End: Original strand, 10443356 - 10443583
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Q |
| |
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10443455 |
T |
 |
| Q |
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cagatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaa |
215 |
Q |
| |
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| T |
10443456 |
cagatttaaatttatattttctcctccaccatcttagtcttttaactcctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttaaactacacaacccccaa |
10443555 |
T |
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| Q |
216 |
tattaatccacaaatcatcccattattg |
243 |
Q |
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| T |
10443556 |
tattaatccacaaatcatcctattattg |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 17 - 262
Target Start/End: Original strand, 1588148 - 1588398
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114 |
Q |
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1588148 |
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211 |
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T |
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1588398 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
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Target Start/End: Original strand, 43284517 - 43284786
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115 |
Q |
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| T |
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43284616 |
T |
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| Q |
116 |
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211 |
Q |
| |
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|
| T |
43284617 |
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43284707 |
T |
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291 |
Q |
| |
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43284786 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 17 - 234
Target Start/End: Original strand, 10825595 - 10825813
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| Q |
17 |
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115 |
Q |
| |
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| T |
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T |
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Q |
| |
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Q |
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| T |
10825795 |
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T |
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Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 53 - 262
Target Start/End: Original strand, 43085297 - 43085506
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Q |
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T |
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| Q |
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252 |
Q |
| |
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| T |
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43085496 |
T |
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| Q |
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262 |
Q |
| |
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|||||||||| |
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| T |
43085497 |
aaaatacata |
43085506 |
T |
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Target: chr8; HSP #28
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Q |
| |
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| T |
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T |
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Q |
| |
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| T |
3927349 |
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Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
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Target Start/End: Original strand, 33880199 - 33880448
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Q |
| |
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|
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T |
 |
| Q |
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240 |
Q |
| |
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| T |
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T |
 |
| Q |
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Q |
| |
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| T |
33880399 |
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T |
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Target: chr8; HSP #30
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 |
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Q |
| |
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| T |
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5220267 |
T |
 |
| Q |
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Q |
| |
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| T |
5220268 |
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T |
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Target: chr8; HSP #31
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Q |
| |
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|
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T |
 |
| Q |
116 |
cagatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaa |
215 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |
|
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| T |
9115413 |
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9115314 |
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 |
| Q |
216 |
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Q |
| |
|
|||| |
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9115313 |
tatt |
9115310 |
T |
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Target: chr8; HSP #32
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Q |
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T |
 |
| Q |
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282 |
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| |
|
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|
| T |
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10308388 |
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Q |
| |
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|
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T |
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Target: chr8; HSP #33
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Q |
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|
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|
| T |
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43923676 |
T |
 |
| Q |
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215 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| |
|
|
| T |
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43923776 |
T |
 |
| Q |
216 |
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Q |
| |
|
|||| |
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43923777 |
tatt |
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T |
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Target: chr8; HSP #34
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115 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| || |
|
|
| T |
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acatcaaaatagggaaaaatgtgtatttttaaagtgacaataatggttatttctaataaacaaattattatttttaggggtttatagacaaattaataat |
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T |
 |
| Q |
116 |
cagatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaa |
215 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
26430928 |
cagttttaaatttatattttctccttcaccatcttagtcttttaactcatccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttaaactacacaacccccaa |
26431027 |
T |
 |
| Q |
216 |
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219 |
Q |
| |
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|||| |
|
|
| T |
26431028 |
tatt |
26431031 |
T |
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Target: chr8; HSP #35
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
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aggtttataaacaaattaataatcagatttaaatttatattttctccttcaccatcttagtcttttaactcctccaactccttcaacaatttgctcaaac |
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T |
 |
| Q |
193 |
catttcaactacacaaccctcaatattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata |
262 |
Q |
| |
|
||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15211239 |
catataaactacacaacccccaatattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata |
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T |
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Target: chr8; HSP #36
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catcaaaatagggaaaaatgtgcattttaaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcatca |
117 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||| || | |
|
|
| T |
21559627 |
catcgaaatagggaaaaatgtgtattttaaagtgacaataatgattatttctaatagaaaaattattatttttaggggtttatagacaaattaataatta |
21559528 |
T |
 |
| Q |
118 |
gatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaata |
217 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
21559527 |
gttttaaatttatattttctccttcaccatcttagtcttttaactcctccaactccttcaacaatttgctcaaactatttaaactacacaacccccaata |
21559428 |
T |
 |
| Q |
218 |
tt |
219 |
Q |
| |
|
|| |
|
|
| T |
21559427 |
tt |
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T |
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Target: chr8; HSP #37
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acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
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Q |
| |
|
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|
|
| T |
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acatcaaaatagggaaaaatgtgtatttttaaagtgacaataatgattatttctaatagacaaattattatttttagagatttatagacaaattaataat |
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T |
 |
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cagatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaa |
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Q |
| |
|
|| ||||||||||||||| ||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |
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T |
 |
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216 |
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Q |
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|
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|
|
| T |
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tatt |
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Target: chr8; HSP #38
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Q |
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|
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|
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T |
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cactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaatatt |
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| |
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Target: chr8; HSP #39
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| Q |
17 |
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115 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
9736944 |
acatcaaaataggtaaaaatgtgtatttttaaagtgacaataatgattatttctaatagacaaattattatttttaggggtttatagacaaattaataat |
9736845 |
T |
 |
| Q |
116 |
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211 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
9736844 |
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9736748 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 17 - 171
Target Start/End: Original strand, 6080888 - 6081043
Alignment:
| Q |
17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
6080888 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgtatttttaaagtgacaataatggttatttttaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaataat |
6080987 |
T |
 |
| Q |
116 |
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171 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
6080988 |
tagatttaaatttatattttctccttcaccatcttagtcttttaactcctccaact |
6081043 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 17 - 219
Target Start/End: Original strand, 3454933 - 3455127
Alignment:
| Q |
17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||| ||| || |
|
|
| T |
3454933 |
acatcaaaatagggaaaaatttgtatttttaaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagggatttatagacaaataaataat |
3455032 |
T |
 |
| Q |
116 |
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215 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |
|
|
| T |
3455033 |
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3455123 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 17 - 140
Target Start/End: Original strand, 12383367 - 12383495
Alignment:
| Q |
17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggt----ttataaacaaattaa |
111 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
12383367 |
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12383466 |
T |
 |
| Q |
112 |
tcatcagatttaaatttatatttcctcct |
140 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
12383467 |
taatcagatttaaatttatattttctcct |
12383495 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 17 - 97
Target Start/End: Original strand, 10308002 - 10308083
Alignment:
| Q |
17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtt |
97 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10308002 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgtatttttaaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtt |
10308083 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 17 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 29101055 - 29100968
Alignment:
| Q |
17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaac |
104 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29101055 |
acatcaaaatagg-aaaaatgtgtatttttaaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaac |
29100968 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 199 - 262
Target Start/End: Original strand, 40520649 - 40520712
Alignment:
| Q |
199 |
aactacacaaccctcaatattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata |
262 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40520649 |
aactacacaacccccaatattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata |
40520712 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 17 - 98
Target Start/End: Original strand, 15207744 - 15207826
Alignment:
| Q |
17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggttt |
98 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15207744 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgtatttttaaagtggcaataatgattatttctaacagacaaattattatttttagaggttt |
15207826 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 217 - 260
Target Start/End: Original strand, 3455389 - 3455432
Alignment:
| Q |
217 |
attaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaataca |
260 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3455389 |
attaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaataca |
3455432 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 217 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 9115041 - 9114998
Alignment:
| Q |
217 |
attaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaataca |
260 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9115041 |
attaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaataca |
9114998 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 217 - 260
Target Start/End: Original strand, 33872512 - 33872555
Alignment:
| Q |
217 |
attaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaataca |
260 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33872512 |
attaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaataca |
33872555 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 217 - 262
Target Start/End: Original strand, 43924049 - 43924094
Alignment:
| Q |
217 |
attaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata |
262 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
43924049 |
attaatccacaaatcatcccattattgtcgctttaaaaaatacata |
43924094 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 217 - 260
Target Start/End: Original strand, 26431300 - 26431343
Alignment:
| Q |
217 |
attaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaataca |
260 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26431300 |
attaatccacaattcatcccattattgtcactttaaaaaataca |
26431343 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 225 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 1650716 - 1650679
Alignment:
| Q |
225 |
acaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata |
262 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1650716 |
acaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata |
1650679 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 217 - 260
Target Start/End: Original strand, 37429304 - 37429347
Alignment:
| Q |
217 |
attaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaataca |
260 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37429304 |
attaatccataaatcatcccattgttgtcactttaaaaaataca |
37429347 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 217 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 9736472 - 9736427
Alignment:
| Q |
217 |
attaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata |
262 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9736472 |
attaatccacaaatcattcaattattgttactttaaaaaatacata |
9736427 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 217 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 21559136 - 21559093
Alignment:
| Q |
217 |
attaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaataca |
260 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
21559136 |
attaatccacaaattatcctattattgccactttaaaaaataca |
21559093 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 21 - 67
Target Start/End: Original strand, 43085101 - 43085148
Alignment:
| Q |
21 |
caaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttattt |
67 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
43085101 |
caaaatagggaaaaatgtgtatttttaaagtgacaataattgttattt |
43085148 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 55)
Name: chr7
Description:
Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 17 - 291
Target Start/End: Original strand, 17272083 - 17272357
Alignment:
| Q |
17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
17272083 |
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17272182 |
T |
 |
| Q |
116 |
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215 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
17272183 |
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17272282 |
T |
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| Q |
216 |
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291 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17272283 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata-tttttccccattttggagcctattttga |
17272357 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 17 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 41080839 - 41080565
Alignment:
| Q |
17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
41080839 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgtatttttaaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaataat |
41080740 |
T |
 |
| Q |
116 |
cagatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaa |
215 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
41080739 |
cagatttaaatttatattttctccttcaccatcttagtcttttaactcctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttaaactacacaacccccaa |
41080640 |
T |
 |
| Q |
216 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacatannnnnnncccattttggagcctattttga |
291 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41080639 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata-tttttccccattttggagcctattttga |
41080565 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 17 - 291
Target Start/End: Original strand, 44335446 - 44335720
Alignment:
| Q |
17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
44335446 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgtatttttaaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaataat |
44335545 |
T |
 |
| Q |
116 |
cagatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaa |
215 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
44335546 |
cagatttaaatttatattttctccttcaccatcttagtcttttaactcctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttaaactacacaacccccaa |
44335645 |
T |
 |
| Q |
216 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacatannnnnnncccattttggagcctattttga |
291 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44335646 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata-tttttccccattttggagcctattttga |
44335720 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 17 - 291
Target Start/End: Original strand, 46100426 - 46100700
Alignment:
| Q |
17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
46100426 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgtatttttaaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaataat |
46100525 |
T |
 |
| Q |
116 |
cagatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaa |
215 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
46100526 |
cagatttaaatttatattttctccttcaccatcttagtcttttaactcctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttaaactacacaacccccaa |
46100625 |
T |
 |
| Q |
216 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacatannnnnnncccattttggagcctattttga |
291 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
46100626 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata-tttttccccattttggagcctattttga |
46100700 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 17 - 262
Target Start/End: Original strand, 8641199 - 8641445
Alignment:
| Q |
17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
8641199 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgtatttttaaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaataat |
8641298 |
T |
 |
| Q |
116 |
cagatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaa |
215 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8641299 |
cagatttaaatttatattttctccttcaccatcttagtcttttaactcctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttaaactacacaaccctcaa |
8641398 |
T |
 |
| Q |
216 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata |
262 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8641399 |
tattaatccacaaatcatcctattattgtcactttaaaaaatacata |
8641445 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 17 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 38354548 - 38354302
Alignment:
| Q |
17 |
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115 |
Q |
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38354548 |
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38354449 |
T |
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116 |
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215 |
Q |
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| T |
38354448 |
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38354349 |
T |
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216 |
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262 |
Q |
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| T |
38354348 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata |
38354302 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 17 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 35004765 - 35004491
Alignment:
| Q |
17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
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T |
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| Q |
116 |
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215 |
Q |
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| T |
35004665 |
cagatttaaatttatattttctccttcaccatcttagtcttttaactcctctaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaacccccaa |
35004566 |
T |
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| Q |
216 |
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291 |
Q |
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| T |
35004565 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata-ttttttcccattttggagcctattttga |
35004491 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 17 - 291
Target Start/End: Original strand, 39403081 - 39403355
Alignment:
| Q |
17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
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| T |
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acatcaaaatagggaaaaatgtgtatttttaaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaataat |
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T |
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| Q |
116 |
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215 |
Q |
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| T |
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catatttaaatttatattttctccttcaccatcttagtcttttaactcctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttaaactacacaacccccaa |
39403280 |
T |
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| Q |
216 |
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291 |
Q |
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| T |
39403281 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata-tttttccccattttggagcctattttga |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 17 - 262
Target Start/End: Original strand, 18031249 - 18031495
Alignment:
| Q |
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115 |
Q |
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T |
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| Q |
116 |
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215 |
Q |
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| T |
18031349 |
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18031448 |
T |
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| Q |
216 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata |
262 |
Q |
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| T |
18031449 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata |
18031495 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 17 - 262
Target Start/End: Original strand, 45155211 - 45155457
Alignment:
| Q |
17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
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45155310 |
T |
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| Q |
116 |
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215 |
Q |
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| T |
45155311 |
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45155410 |
T |
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| Q |
216 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata |
262 |
Q |
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| T |
45155411 |
tattaattcacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata |
45155457 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 17 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 3628512 - 3628239
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| Q |
17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
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| T |
3628512 |
acatcaaaatagg-aaaaatgtgtatttttaaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaataat |
3628414 |
T |
 |
| Q |
116 |
cagatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaa |
215 |
Q |
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| T |
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cagatttaaatttatattttctccttcaccatcttagtcttttaactcctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttaaactacacaacccccaa |
3628314 |
T |
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| Q |
216 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacatannnnnnncccattttggagcctattttga |
291 |
Q |
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| T |
3628313 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata-tttttccccattttggagcctattttga |
3628239 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 17 - 291
Target Start/End: Original strand, 44781488 - 44781762
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| Q |
17 |
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115 |
Q |
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| T |
44781488 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgtatttttaaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaataat |
44781587 |
T |
 |
| Q |
116 |
cagatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaa |
215 |
Q |
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| T |
44781588 |
cagatttaaatttatattttctccttcaccatcttagtcttttaactcctccaactcctttaacaatttgctcaaaccatttaaactacacaacccccaa |
44781687 |
T |
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| Q |
216 |
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291 |
Q |
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| T |
44781688 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaataaata-tttttccccattttggagcctattttga |
44781762 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 17 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 36787215 - 36786941
Alignment:
| Q |
17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
| |
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|
| T |
36787215 |
acatcaaaatagggaaaaatatgtatttttaaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaataat |
36787116 |
T |
 |
| Q |
116 |
cagatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaa |
215 |
Q |
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| T |
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cagatttaaatttatattttctccttcaccatcttagtcttttaactcctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttaaactacacaacccccaa |
36787016 |
T |
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| Q |
216 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacatannnnnnncccattttggagcctattttga |
291 |
Q |
| |
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| T |
36787015 |
tattaatttacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata-ttttttcccattttggagcctattttga |
36786941 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 17 - 291
Target Start/End: Original strand, 38171195 - 38171469
Alignment:
| Q |
17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
| |
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|
| T |
38171195 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgtatttttaaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaataat |
38171294 |
T |
 |
| Q |
116 |
cagatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaa |
215 |
Q |
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| T |
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catatttaaatttatattttctccttcaccatcttagtcttttaactcctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttaaactactcaacccccaa |
38171394 |
T |
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| Q |
216 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacatannnnnnncccattttggagcctattttga |
291 |
Q |
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| T |
38171395 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatatata-tttttccccattttggagcctattttga |
38171469 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 17 - 262
Target Start/End: Original strand, 26303584 - 26303830
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| Q |
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acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
| |
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| T |
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acatcaaaatagggaaaaatgtgtatttttaaagtgacaataataattatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaataat |
26303683 |
T |
 |
| Q |
116 |
cagatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaa |
215 |
Q |
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| T |
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cagatttaaatttatattttctccttcaccatcttagtcttttaactcctccaactccttcaacaatttgctcaaaccacctaaactacacaaccctcaa |
26303783 |
T |
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| Q |
216 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata |
262 |
Q |
| |
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| T |
26303784 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata |
26303830 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 17 - 262
Target Start/End: Original strand, 37007354 - 37007600
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acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
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acatcaaaataggaaaaaatgtgtatttttaaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaataat |
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T |
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| Q |
116 |
cagatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaa |
215 |
Q |
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| T |
37007454 |
cagatttaaatttatattttctccttcgccatcttagtcttttaactcctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttaaactacacaacccccaa |
37007553 |
T |
 |
| Q |
216 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata |
262 |
Q |
| |
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| T |
37007554 |
tattaatcaacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata |
37007600 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 17 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 40668502 - 40668228
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| Q |
17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
| |
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40668403 |
T |
 |
| Q |
116 |
cagatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaa |
215 |
Q |
| |
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| T |
40668402 |
cagatttaaatttatattttctccttcaccatcttagtcttttaactcctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttaaactacataacccccaa |
40668303 |
T |
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| Q |
216 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacatannnnnnncccattttggagcctattttga |
291 |
Q |
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| T |
40668302 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata-ttttcccccattttggagcctattttga |
40668228 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 17 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 47170766 - 47170492
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| Q |
17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
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Q |
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| T |
47170766 |
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47170667 |
T |
 |
| Q |
116 |
cagatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaa |
215 |
Q |
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| T |
47170666 |
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47170567 |
T |
 |
| Q |
216 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacatannnnnnncccattttggagcctattttga |
291 |
Q |
| |
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|
| T |
47170566 |
tattaatctacaaatcatctcattattgtcactttaaaaaatacata-tttttccccattttggagcctattttga |
47170492 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 17 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 26931863 - 26931589
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Q |
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| T |
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 |
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cagatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaa |
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Q |
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T |
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291 |
Q |
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26931663 |
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26931589 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #20
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Query Start/End: Original strand, 17 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 35788735 - 35788485
Alignment:
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17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggtta----tttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaa |
111 |
Q |
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| T |
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35788636 |
T |
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211 |
Q |
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| T |
35788635 |
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35788536 |
T |
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262 |
Q |
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| T |
35788535 |
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35788485 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 17 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 41409390 - 41409147
Alignment:
| Q |
17 |
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115 |
Q |
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T |
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215 |
Q |
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41409192 |
T |
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| Q |
216 |
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260 |
Q |
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| T |
41409191 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaataca |
41409147 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 17 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 21176534 - 21176289
Alignment:
| Q |
17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
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| T |
21176534 |
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21176436 |
T |
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| Q |
116 |
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215 |
Q |
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| T |
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21176336 |
T |
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262 |
Q |
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| T |
21176335 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 17 - 262
Target Start/End: Original strand, 24646427 - 24646673
Alignment:
| Q |
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acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
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| T |
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T |
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| Q |
116 |
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215 |
Q |
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| T |
24646527 |
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24646626 |
T |
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262 |
Q |
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| T |
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tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata |
24646673 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 17 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 46230027 - 46229781
Alignment:
| Q |
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115 |
Q |
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| T |
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215 |
Q |
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| T |
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T |
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262 |
Q |
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| T |
46229827 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 17 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 24182453 - 24182179
Alignment:
| Q |
17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
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| T |
24182453 |
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24182354 |
T |
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| Q |
116 |
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215 |
Q |
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| T |
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24182254 |
T |
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291 |
Q |
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| T |
24182253 |
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24182179 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 17 - 244
Target Start/End: Original strand, 30838713 - 30838941
Alignment:
| Q |
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115 |
Q |
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| T |
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T |
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| Q |
116 |
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215 |
Q |
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| T |
30838813 |
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30838912 |
T |
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| Q |
216 |
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244 |
Q |
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30838913 |
tattaatccacaaatcatcccattattgt |
30838941 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 17 - 262
Target Start/End: Original strand, 34962673 - 34962914
Alignment:
| Q |
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115 |
Q |
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34962772 |
T |
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| Q |
116 |
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215 |
Q |
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| T |
34962773 |
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T |
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| Q |
216 |
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262 |
Q |
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| T |
34962868 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 17 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 42029030 - 42028756
Alignment:
| Q |
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acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
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| T |
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42028931 |
T |
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| Q |
116 |
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215 |
Q |
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| T |
42028930 |
caaatttatatttatattttctccttcaccatcttagttttttaactcctccaacttcttcaaaaatttgctcaaaccatttaaactacacaacccccaa |
42028831 |
T |
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| Q |
216 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacatannnnnnncccattttggagcctattttga |
291 |
Q |
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| T |
42028830 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata-ttttttcccattttggagcctattttga |
42028756 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 42 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 30890764 - 30890544
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ttttaaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcatcagatttaaatttatatttcctcctt |
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Q |
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|
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ttttaaaatgacaataatggttatttataatagacaaattattatttttagaagtttataaacaaattaataatcagatttaaatttatattttctcctt |
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T |
 |
| Q |
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cactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaatattaatccacaaatcatcccattat |
241 |
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| T |
30890664 |
caccatcttagtgttttaactcctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttaaactacacaacccccaatattaatccacaaatcatcccattat |
30890565 |
T |
 |
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242 |
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262 |
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| T |
30890564 |
tgtcactttaaaaaatacata |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 17 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 44744837 - 44744590
Alignment:
| Q |
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acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
| |
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|
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| T |
44744837 |
acatcaaaataggaaaaaatatgtatttttaaagtgacaataatggttatttttaatagacaaattattatttttagtggtttataaacaaattaataat |
44744738 |
T |
 |
| Q |
116 |
cagatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccattt-caactacacaaccctca |
214 |
Q |
| |
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| T |
44744737 |
catatttaaatttatattttctccttcaccatcttagtcttttaactcctctaactccttcaacaatttgctcaaaccatttaaaactacacaaccccca |
44744638 |
T |
 |
| Q |
215 |
atattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata |
262 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
44744637 |
atattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata |
44744590 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 17 - 262
Target Start/End: Original strand, 28290308 - 28290553
Alignment:
| Q |
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acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
| |
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| T |
28290308 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgtatttttaaagtgacaataatgattatttctaatagacaa-ttattatttttagaggtttataaacaaattaataat |
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T |
 |
| Q |
116 |
cagatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaa |
215 |
Q |
| |
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| T |
28290407 |
caaatttatatttatattttctccttcaccatcttattcttttaactcctccaactcctttaacaatttgctcaaacaatttaaactacacaacccccaa |
28290506 |
T |
 |
| Q |
216 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata |
262 |
Q |
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| T |
28290507 |
tattaatccacaaatcatccgattattgtcactttaaaaaatacata |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 17 - 291
Target Start/End: Original strand, 7337463 - 7337727
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Q |
| |
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cagatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaa |
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Q |
| |
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| T |
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T |
 |
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216 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacatannnnnnncccattttggagcctattttga |
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Q |
| |
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|
| T |
7337653 |
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7337727 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 17 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 40340997 - 40340732
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| Q |
17 |
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115 |
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40340898 |
T |
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116 |
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215 |
Q |
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| T |
40340897 |
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40340807 |
T |
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216 |
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291 |
Q |
| |
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| T |
40340806 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcacttaaaaaaatacata-tttttccccattttggagcctattttga |
40340732 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
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Target Start/End: Original strand, 46330006 - 46330231
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141 |
Q |
| |
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|
|
| T |
46330006 |
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46330105 |
T |
 |
| Q |
142 |
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236 |
Q |
| |
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| T |
46330106 |
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46330205 |
T |
 |
| Q |
237 |
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262 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
46330206 |
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46330231 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
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Target Start/End: Complemental strand, 7462754 - 7462551
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| Q |
17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
| |
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|
| T |
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T |
 |
| Q |
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| |
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| T |
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T |
 |
| Q |
216 |
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219 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
7462554 |
tatt |
7462551 |
T |
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Target: chr7; HSP #36
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acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
18928386 |
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18928485 |
T |
 |
| Q |
116 |
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215 |
Q |
| |
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| T |
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18928584 |
T |
 |
| Q |
216 |
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241 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
18928585 |
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18928610 |
T |
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Target: chr7; HSP #37
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115 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| || |
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| T |
34993942 |
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34994041 |
T |
 |
| Q |
116 |
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215 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
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34994141 |
T |
 |
| Q |
216 |
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219 |
Q |
| |
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|
|
| T |
34994142 |
tatt |
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T |
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Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
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Target Start/End: Original strand, 48936455 - 48936658
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| Q |
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acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
48936455 |
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48936554 |
T |
 |
| Q |
116 |
cagatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaa |
215 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
48936555 |
cagttttaaatttatattttctctttcaccatcttagtcttttaactcctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttaaactacacaacccccaa |
48936654 |
T |
 |
| Q |
216 |
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219 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
48936655 |
tatt |
48936658 |
T |
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Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
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| Q |
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atcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcatca |
117 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| |
|
|
| T |
43775356 |
atcaaaatagggaaaaatgtgtatttttaaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttaagggtttatagacaaattaataatca |
43775257 |
T |
 |
| Q |
118 |
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217 |
Q |
| |
|
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| T |
43775256 |
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43775157 |
T |
 |
| Q |
218 |
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218 |
Q |
| |
|
| |
|
|
| T |
43775156 |
t |
43775156 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 17 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 6804725 - 6804522
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| Q |
17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
6804725 |
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6804626 |
T |
 |
| Q |
116 |
cagatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaa |
215 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| |
|
|
| T |
6804625 |
cagatttaaatttatattttctccttcaccatcttagtcttttaactcctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttaaaccgtacaacccccaa |
6804526 |
T |
 |
| Q |
216 |
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219 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
6804525 |
tatt |
6804522 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 27 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 43671432 - 43671247
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125 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||| |
|
|
| T |
43671432 |
agggaaaaatgtgtatttttaaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttaggggtttatagacaaattaataatcagttttaaa |
43671333 |
T |
 |
| Q |
126 |
tttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccc |
211 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
43671332 |
tttatattttctccttcaccatcttagtcttttaactcctccaactccttcaacaatttgctcaaactatttaaactacacaaccc |
43671247 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 17 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 40245909 - 40245706
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Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| || |
|
|
| T |
40245909 |
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40245810 |
T |
 |
| Q |
116 |
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215 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
40245809 |
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40245710 |
T |
 |
| Q |
216 |
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219 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
40245709 |
tatt |
40245706 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 17 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 11456265 - 11456064
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acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| || |
|
|
| T |
11456265 |
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11456168 |
T |
 |
| Q |
116 |
cagatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaa |
215 |
Q |
| |
|
||| ||| ||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
11456167 |
cagttttcaatttatattttctccttcaccatcgtagtcatttaactcctctaactccttcaacaatttgctcaaacaatttaaactacacaacccccaa |
11456068 |
T |
 |
| Q |
216 |
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219 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
11456067 |
tatt |
11456064 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 17 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 18121259 - 18121123
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acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
18121259 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgtatttttaaagtgacaataatgattatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaataat |
18121160 |
T |
 |
| Q |
116 |
cagatttaaatttatatttcctccttcactatcttag |
152 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| |
|
|
| T |
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cagatttaaatttatattttctccttcgccatcttag |
18121123 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #45
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Query Start/End: Original strand, 152 - 262
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gtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaatattaatccacaaatcatcccattattgtcacttta |
251 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18120689 |
gtcttttaactcctctaactccttcaacaatttgctcaaaccatttaaactacacaacccccaatattaatccacaaatcatcccattattgtcacttta |
18120590 |
T |
 |
| Q |
252 |
aaaaatacata |
262 |
Q |
| |
|
||||||||||| |
|
|
| T |
18120589 |
aaaaatacata |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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| Q |
17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
39628674 |
acatcaaaatagg-aaaaatgtgtatttttaaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaataat |
39628772 |
T |
 |
| Q |
116 |
cagattt |
122 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
|
| T |
39628773 |
cagattt |
39628779 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 215 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 24466678 - 24466603
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215 |
atattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacatannnnnnncccattttggagcctattttga |
291 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24466678 |
atattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata-tttttccccattttggagcctattttga |
24466603 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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Query Start/End: Original strand, 217 - 262
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Q |
| |
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|
|
| T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #49
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Q |
| |
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|
|
| T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 213 - 262
Target Start/End: Original strand, 41641977 - 41642026
Alignment:
| Q |
213 |
caatattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata |
262 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41641977 |
caatattaatccacaaatcatcttattattgtcactttaaaaaatacata |
41642026 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 217 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 43670967 - 43670924
Alignment:
| Q |
217 |
attaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaataca |
260 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43670967 |
attaatccacaaatcatctcattattgtcactttaaaaaataca |
43670924 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 217 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 43774890 - 43774851
Alignment:
| Q |
217 |
attaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaa |
256 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43774890 |
attaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaa |
43774851 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 220 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 40245436 - 40245398
Alignment:
| Q |
220 |
aatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaata |
258 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40245436 |
aatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaata |
40245398 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 217 - 260
Target Start/End: Original strand, 34994414 - 34994457
Alignment:
| Q |
217 |
attaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaataca |
260 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
34994414 |
attaatccacaaatcatcacattattgtcacattaaaaaataca |
34994457 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 26)
Name: chr6
Description:
Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 17 - 291
Target Start/End: Original strand, 2317989 - 2318263
Alignment:
| Q |
17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
2317989 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgtatttttaaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaataat |
2318088 |
T |
 |
| Q |
116 |
cagatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaa |
215 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
2318089 |
cagatttaaatttatattttctccttcaccatcttagtcttttaactcctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttaaactacacaacccccaa |
2318188 |
T |
 |
| Q |
216 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacatannnnnnncccattttggagcctattttga |
291 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2318189 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata-tttttccccattttggagcctattttga |
2318263 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 17 - 291
Target Start/End: Original strand, 15146078 - 15146351
Alignment:
| Q |
17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
15146078 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgtatttttaaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaataat |
15146177 |
T |
 |
| Q |
116 |
cagatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaa |
215 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
15146178 |
cagatttaaatttatattttctccttcaccatcttaatcttttaactcctccaactctttcaacaatttgctcaaaccatttaaactacacaaccc-caa |
15146276 |
T |
 |
| Q |
216 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacatannnnnnncccattttggagcctattttga |
291 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15146277 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata-ttttcccccattttggagcctattttga |
15146351 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 19 - 262
Target Start/End: Original strand, 8812371 - 8812615
Alignment:
| Q |
19 |
atcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcatca |
117 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
8812371 |
atcaaaatagggaaaaatgtgtatttttaaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaataatca |
8812470 |
T |
 |
| Q |
118 |
gatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaata |
217 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
8812471 |
aatttaaatttatattttctccttcaccatcttagtcttttaactcctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttaaattacacaacccccaata |
8812570 |
T |
 |
| Q |
218 |
ttaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata |
262 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8812571 |
ttaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata |
8812615 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 17 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 29678767 - 29678493
Alignment:
| Q |
17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
29678767 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgtatttttaaagtgacaataatgattatttttaatagataaattattatttttagaggtttataaacaaattaataat |
29678668 |
T |
 |
| Q |
116 |
cagatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaa |
215 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |
|
|
| T |
29678667 |
cagatttaaatttatattttctccttcaccatcttagtcttttaactcctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttaaactaaacaacccccaa |
29678568 |
T |
 |
| Q |
216 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacatannnnnnncccattttggagcctattttga |
291 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29678567 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata-tttttccccattttggagcctattttga |
29678493 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 17 - 291
Target Start/End: Original strand, 24110572 - 24110845
Alignment:
| Q |
17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
24110572 |
acatcaaaataggggaaaatgtgtatttttaaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaataat |
24110671 |
T |
 |
| Q |
116 |
cagatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaa |
215 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
24110672 |
cagatttaaatttatattttctccttcaccaacttagtcttttaactcctccaactccttcaagaatttgctcaaaccatttaaactacacaaccc-caa |
24110770 |
T |
 |
| Q |
216 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacatannnnnnncccattttggagcctattttga |
291 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24110771 |
tattaatccacaaatcatcccattactgtcactttaaaaaatacata-tttttccccattttggagcctattttga |
24110845 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 18739112 - 18738872
Alignment:
| Q |
17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
18739112 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgtatttttaaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaataat |
18739013 |
T |
 |
| Q |
116 |
cagatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaa |
215 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
18739012 |
cagatttaaatttatattttctccttcaccatcttagtcttttaactcctccaattgcttcaacaatttgctcaaaccatttaaactacacaacccccaa |
18738913 |
T |
 |
| Q |
216 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaa |
256 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18738912 |
tattaatccacaaatcatcacattattgtcactttaaaaaa |
18738872 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 17 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 1327038 - 1326773
Alignment:
| Q |
17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
1327038 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgtatttttaaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaataat |
1326939 |
T |
 |
| Q |
116 |
cagatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaa |
215 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1326938 |
cagatttaaatttatattttctccttcaccatcttagtctttt---------aactccttcaacaatttgctcaaaccatttaaactacacaaccctcaa |
1326848 |
T |
 |
| Q |
216 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacatannnnnnncccattttggagcctattttga |
291 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1326847 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata-tttttccccattttggagcctattttga |
1326773 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 17 - 290
Target Start/End: Original strand, 20857013 - 20857285
Alignment:
| Q |
17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
20857013 |
acatcaaaataaggaaaaatgtgtatttttaaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaataat |
20857112 |
T |
 |
| Q |
116 |
cagatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaa |
215 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||| |
|
|
| T |
20857113 |
cagatttaaatttatattttctcctacaccatcttagtcttttaactcctccaactccttcaacaatttgctc-aaccatttaaactacacaacctccaa |
20857211 |
T |
 |
| Q |
216 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacatannnnnnncccattttggagcctattttg |
290 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20857212 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaataaata-tttttccccattttggagcctattttg |
20857285 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 17 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 17994632 - 17994386
Alignment:
| Q |
17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgca-ttttaaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
17994632 |
acatcaaaatagaaaaaaatgtgtaattttaaagcgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttaaaggtttataaacaaattaataat |
17994533 |
T |
 |
| Q |
116 |
cagatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaa |
215 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
17994532 |
cagatttaaatttatattttccccttcaccatcttagtcttttaactcctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttaaactacacaacccccaa |
17994433 |
T |
 |
| Q |
216 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata |
262 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17994432 |
tattaattcacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata |
17994386 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 17 - 291
Target Start/End: Original strand, 1059901 - 1060174
Alignment:
| Q |
17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
1059901 |
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1059999 |
T |
 |
| Q |
116 |
cagatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaa |
215 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
1060000 |
cagatttaaatttaaattttctccttcaccatcttagtcttttaactcttccaactccttcaacaatttcttcaaaccatttaaactacacaacccccaa |
1060099 |
T |
 |
| Q |
216 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacatannnnnnncccattttggagcctattttga |
291 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1060100 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatgcata-tttttccccattttggagcctattttga |
1060174 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 17 - 291
Target Start/End: Original strand, 748932 - 749197
Alignment:
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17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
748932 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgtatttttaaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaataat |
749031 |
T |
 |
| Q |
116 |
cagatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaa |
215 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
749032 |
aagatttaaatttatattttctccttcaccatcttagtctttt---------aactccttcaacaatttgctcaaaccatttaaactacacaacccccaa |
749122 |
T |
 |
| Q |
216 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacatannnnnnncccattttggagcctattttga |
291 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
749123 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata-tttttccccattttggagcctattttga |
749197 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 17 - 291
Target Start/End: Original strand, 25404377 - 25404650
Alignment:
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17 |
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Q |
| |
|
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|
|
| T |
25404377 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgtatttttaaagtgacaacaatggttatttctaatagacaaatt-ttatttttagaggtttataaaaaaattaataat |
25404475 |
T |
 |
| Q |
116 |
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215 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |
|
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| T |
25404476 |
catatttaaatttatattttctccttcaccatcttagtcttttaactcctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttaaactacacaaccaccaa |
25404575 |
T |
 |
| Q |
216 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacatannnnnnncccattttggagcctattttga |
291 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25404576 |
tattaatccacaattcatcccattattgtcactttaaaaaatatata-tttttccccattttggagcctattttga |
25404650 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 17 - 262
Target Start/End: Original strand, 11624901 - 11625147
Alignment:
| Q |
17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
11624901 |
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11625000 |
T |
 |
| Q |
116 |
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215 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||| |
|
|
| T |
11625001 |
cagatttaaatttatattttctccttcaccatcttagtcttttaactcctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttaaactacacaactcccaa |
11625100 |
T |
 |
| Q |
216 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata |
262 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11625101 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata |
11625147 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 17 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 11158585 - 11158340
Alignment:
| Q |
17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
11158585 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgtatttttaaagtgacaataatggttatttctaatagaaaaattattatttttagaggtttataaacaaattaataat |
11158486 |
T |
 |
| Q |
116 |
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215 |
Q |
| |
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| T |
11158485 |
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11158386 |
T |
 |
| Q |
216 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacat |
261 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11158385 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacat |
11158340 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 17 - 262
Target Start/End: Original strand, 13209378 - 13209623
Alignment:
| Q |
17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
13209378 |
acatcaaaatagaaaaaaatgtgtatttttaaagtgacaataatagttatttctaatagacaaatt-tgatttttagaggtttataaacaaattaataat |
13209476 |
T |
 |
| Q |
116 |
cagatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaa |
215 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
13209477 |
catatttaaatttatattttctccttcaccatcttagtcttttaactcctccaactccttcaacaatgtgctcaaaccatttaaactacacaacccgcaa |
13209576 |
T |
 |
| Q |
216 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata |
262 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13209577 |
tattaatccacaaatcatctcattattgtcactttaaaaaatacata |
13209623 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 17 - 217
Target Start/End: Original strand, 22821434 - 22821635
Alignment:
| Q |
17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
22821434 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgtatttttaaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaataat |
22821533 |
T |
 |
| Q |
116 |
cagatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaa |
215 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
22821534 |
cagatttaaatttatattttctccttcaccatcttagtcttttaactcctccaactccttcaacaatttgttcaaaccatttaaactacacaacccccaa |
22821633 |
T |
 |
| Q |
216 |
ta |
217 |
Q |
| |
|
|| |
|
|
| T |
22821634 |
ta |
22821635 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 21 - 208
Target Start/End: Original strand, 8749011 - 8749199
Alignment:
| Q |
21 |
caaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcatcaga |
119 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
8749011 |
caaaatagggaaaaatgtgtatttttaaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaataatcaga |
8749110 |
T |
 |
| Q |
120 |
tttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaa |
208 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
8749111 |
tttaaatttatattttctccttcaccatcttagtcttttaactcctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttaaactacacaa |
8749199 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 17 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 26610233 - 26610017
Alignment:
| Q |
17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
26610233 |
acatcaaaataggtaaaaatgtgtatttttaaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaataat |
26610134 |
T |
 |
| Q |
116 |
cagatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaa |
215 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||| |
|
|
| T |
26610133 |
-------aaatttatattttctccttcaccatcttagtcttttaactcctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttaaactacacatcccccaa |
26610041 |
T |
 |
| Q |
216 |
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239 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26610040 |
tattaatccacaaatcatcccatt |
26610017 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 17 - 219
Target Start/End: Original strand, 23066938 - 23067141
Alignment:
| Q |
17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| || |
|
|
| T |
23066938 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgtatttttaaagtgacaataatgtttatttctaatagacaaattattatttttaggggtttatagacaaattaataat |
23067037 |
T |
 |
| Q |
116 |
cagatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaa |
215 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
23067038 |
cagttttaaatttatattttctccttcaccatcttagtcttttaactgctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttaaactacacaacccccaa |
23067137 |
T |
 |
| Q |
216 |
tatt |
219 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
23067138 |
tatt |
23067141 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 17 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 23767554 - 23767399
Alignment:
| Q |
17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
23767554 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgtatttttaaagtgacaataatgattatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaataat |
23767455 |
T |
 |
| Q |
116 |
cagatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaact |
171 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
23767454 |
cagatttaaatttatattttctccttcaccatcttagtcttttaactcctccaact |
23767399 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 17 - 118
Target Start/End: Original strand, 5430488 - 5430590
Alignment:
| Q |
17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| || |
|
|
| T |
5430488 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgtatttttaaagtgataataatgattatttctaatagacaaattattatttttaggggtttatagacaaattaataat |
5430587 |
T |
 |
| Q |
116 |
cag |
118 |
Q |
| |
|
||| |
|
|
| T |
5430588 |
cag |
5430590 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 199 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 23767353 - 23767262
Alignment:
| Q |
199 |
aactacacaaccctcaatattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacatannnnnnncccattttggagcctattttga |
291 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23767353 |
aactacacaacccccaatattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata-tttttccccattttggagcctattttga |
23767262 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 217 - 291
Target Start/End: Original strand, 22821906 - 22821979
Alignment:
| Q |
217 |
attaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacatannnnnnncccattttggagcctattttga |
291 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22821906 |
attaatccacaaatcataccattattgtcactttaaaaaatacaca-ttttcccccattttggagcctattttga |
22821979 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 217 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 22504601 - 22504558
Alignment:
| Q |
217 |
attaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaataca |
260 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22504601 |
attaatccacaaatcatgccattattgtcactttaaaaaataca |
22504558 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 217 - 260
Target Start/End: Original strand, 23067410 - 23067453
Alignment:
| Q |
217 |
attaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaataca |
260 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23067410 |
attaatccacaaatcatctcattattgtcactttaaaaaataca |
23067453 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 17 - 71
Target Start/End: Original strand, 15968804 - 15968859
Alignment:
| Q |
17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaa |
71 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||| ||||| ||| || ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15968804 |
acatcaaaatagagaaaaatgtgtatttttaaaatggcaataatggttatttctaa |
15968859 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 59)
Name: chr4
Description:
Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 17 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 6259621 - 6259347
Alignment:
| Q |
17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
6259621 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgtatttttaaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaataat |
6259522 |
T |
 |
| Q |
116 |
cagatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaa |
215 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
6259521 |
cagatttaaatttatattttctccttcaccatcttagtcttttaactcctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttaaactacacaacccccaa |
6259422 |
T |
 |
| Q |
216 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacatannnnnnncccattttggagcctattttga |
291 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6259421 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata-tttttccccattttggagcctattttga |
6259347 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 17 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 21659796 - 21659522
Alignment:
| Q |
17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
21659796 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgtatttttaaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaataat |
21659697 |
T |
 |
| Q |
116 |
cagatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaa |
215 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
21659696 |
cagatttaaatttatattttctccttcaccatcttagtcttttaactcctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttaaactacacaacccccaa |
21659597 |
T |
 |
| Q |
216 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacatannnnnnncccattttggagcctattttga |
291 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21659596 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata-ttttcccccattttggagcctattttga |
21659522 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 17 - 291
Target Start/End: Original strand, 23465908 - 23466182
Alignment:
| Q |
17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
23465908 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgtatttttaaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaataat |
23466007 |
T |
 |
| Q |
116 |
cagatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaa |
215 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
23466008 |
cagatttaaatttatattttctccttcaccatcttagtcttttaactcctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttaaactacacaacccccaa |
23466107 |
T |
 |
| Q |
216 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacatannnnnnncccattttggagcctattttga |
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23466108 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata-tttttccccattttggagcctattttga |
23466182 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 17 - 291
Target Start/End: Original strand, 28255448 - 28255722
Alignment:
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115 |
Q |
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| T |
28255448 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgtatttttaaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaataat |
28255547 |
T |
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| Q |
116 |
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215 |
Q |
| |
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| T |
28255548 |
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28255647 |
T |
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| Q |
216 |
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291 |
Q |
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| T |
28255648 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata-tttttccccattttggagcctattttga |
28255722 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 17 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 30357055 - 30356781
Alignment:
| Q |
17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
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| T |
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T |
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| Q |
116 |
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215 |
Q |
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| T |
30356955 |
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30356856 |
T |
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| Q |
216 |
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291 |
Q |
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tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata-tttttccccattttggagcctattttga |
30356781 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 17 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 918350 - 918076
Alignment:
| Q |
17 |
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115 |
Q |
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918350 |
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918251 |
T |
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| Q |
116 |
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215 |
Q |
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| T |
918250 |
cagatttaaatttatattttctccttcaccatcttagtcttttaactcctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttaaactacacaaccctcaa |
918151 |
T |
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| Q |
216 |
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291 |
Q |
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| T |
918150 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 17 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 13994309 - 13994035
Alignment:
| Q |
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acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
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| T |
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acatcaaaatagggaaaaatgtgtatttttaaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaataat |
13994210 |
T |
 |
| Q |
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215 |
Q |
| |
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| T |
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T |
 |
| Q |
216 |
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291 |
Q |
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| T |
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13994035 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 23 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 45895936 - 45895668
Alignment:
| Q |
23 |
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Q |
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| T |
45895936 |
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45895837 |
T |
 |
| Q |
122 |
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221 |
Q |
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| T |
45895836 |
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45895737 |
T |
 |
| Q |
222 |
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291 |
Q |
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| T |
45895736 |
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45895668 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 17 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 50605021 - 50604747
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acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
| |
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| T |
50605021 |
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50604922 |
T |
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| Q |
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215 |
Q |
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| T |
50604921 |
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50604822 |
T |
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| Q |
216 |
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291 |
Q |
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| T |
50604821 |
tattaatccacaaatcattccattattgtcactttaaaaaatatata-tttttccccattttggagcctattttga |
50604747 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 17 - 262
Target Start/End: Original strand, 17971238 - 17971484
Alignment:
| Q |
17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
| |
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| T |
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T |
 |
| Q |
116 |
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215 |
Q |
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| T |
17971338 |
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17971437 |
T |
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| Q |
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262 |
Q |
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| T |
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tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata |
17971484 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 17 - 262
Target Start/End: Original strand, 22731357 - 22731603
Alignment:
| Q |
17 |
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115 |
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215 |
Q |
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| T |
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22731556 |
T |
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| Q |
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tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata |
262 |
Q |
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| T |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 17 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 29246001 - 29245726
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| Q |
17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
| |
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| T |
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acatcaaaatagggaaaaatgtgtatttttaaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaataat |
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T |
 |
| Q |
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215 |
Q |
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| T |
29245901 |
cagatttaaatttatattttctccttcatcatcttagtcttttaactcctccaactccttcaacaattttctcaaaccatttaaactacacaacccccaa |
29245802 |
T |
 |
| Q |
216 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacatannnnnnncccattttggagcctattttga |
291 |
Q |
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| T |
29245801 |
tattaatctacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacatatttttttctcattttggagcctattttga |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 17 - 262
Target Start/End: Original strand, 37998302 - 37998548
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| Q |
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acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
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| |
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|
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T |
 |
| Q |
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cagatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaa |
215 |
Q |
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cggatttaaatttatattttctccttcactaccttagtcttttaactcctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttaaactacacaacccccaa |
37998501 |
T |
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262 |
Q |
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| T |
37998502 |
tattaatccacaaatcatcctattattgtcactttaaaaaatacata |
37998548 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 17 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 50181829 - 50181583
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acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
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T |
 |
| Q |
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cagatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaa |
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Q |
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| T |
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cggatttaaatttatattttctccttcactaccttagtcttttaactcctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttaaactacacaacccccaa |
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T |
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| Q |
216 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata |
262 |
Q |
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| T |
50181629 |
tattaatccacaaatcatcctattattgtcactttaaaaaatacata |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 17 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 6238917 - 6238643
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cagatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaa |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 17 - 291
Target Start/End: Original strand, 18963606 - 18963880
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T |
 |
| Q |
116 |
cagatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaa |
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Q |
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| T |
18963706 |
cagatttaaatttatattttctccttcaccatcttactcttttaactcctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttaaactacacaacccccaa |
18963805 |
T |
 |
| Q |
216 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacatannnnnnncccattttggagcctattttga |
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18963806 |
tattgatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata-tttttccccattttggagcctattttga |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 17 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 48613886 - 48613640
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T |
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Target: chr4; HSP #18
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Q |
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Q |
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Target: chr4; HSP #19
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262 |
Q |
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33821438 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 17 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 34476611 - 34476337
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Q |
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T |
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Q |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 17 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 42593371 - 42593097
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Q |
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T |
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Target: chr4; HSP #22
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Query Start/End: Original strand, 17 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 21861797 - 21861522
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Q |
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T |
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| Q |
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Q |
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T |
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T |
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Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 17 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 21917658 - 21917383
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Q |
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215 |
Q |
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| T |
21917558 |
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T |
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Target: chr4; HSP #24
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T |
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Q |
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T |
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Target: chr4; HSP #25
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216 |
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Target: chr4; HSP #26
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Target Start/End: Original strand, 23475429 - 23475675
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T |
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Q |
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23475629 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #27
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T |
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T |
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Target: chr4; HSP #28
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cagatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaa |
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T |
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tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacatannnnnnncccattttggagcctattttga |
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Q |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #29
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Query Start/End: Original strand, 17 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 20599270 - 20599028
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T |
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tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaata |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #30
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Query Start/End: Original strand, 17 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 38901927 - 38901682
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tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata |
262 |
Q |
| |
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||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
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| T |
38901728 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata |
38901682 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 17 - 262
Target Start/End: Original strand, 1618140 - 1618385
Alignment:
| Q |
17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |
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| T |
1618140 |
acatcaaaatagggaaaaatttgtatttttaaagtgacaataatggttatttctattagacaaatt-ttatttttagaggtttataaacaaattaataat |
1618238 |
T |
 |
| Q |
116 |
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215 |
Q |
| |
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| T |
1618239 |
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1618338 |
T |
 |
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216 |
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262 |
Q |
| |
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||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
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| T |
1618339 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata |
1618385 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 17 - 291
Target Start/End: Original strand, 1195234 - 1195508
Alignment:
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17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
| |
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|
|
| T |
1195234 |
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1195333 |
T |
 |
| Q |
116 |
cagatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaa |
215 |
Q |
| |
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| T |
1195334 |
cagattaaaatttatattttctccttcaccatcttagtcttttaactcctccaactccttcaacaatttgctgaaaccatttaaactatacaacccccaa |
1195433 |
T |
 |
| Q |
216 |
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291 |
Q |
| |
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||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1195434 |
tattaatccacaaatcatctcattattgtcacctttaaaaatacata-tttttccccattttggagcctattttga |
1195508 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 17 - 219
Target Start/End: Original strand, 15031121 - 15031324
Alignment:
| Q |
17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
| |
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||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |
|
|
| T |
15031121 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgtatttttaaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttatagacaaattaataat |
15031220 |
T |
 |
| Q |
116 |
cagatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaa |
215 |
Q |
| |
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||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |
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| T |
15031221 |
cagttttaaatttatattttctccttcaccatcttagtcttttaacttctctaactccttcaacaatttgctcaaaccatttaaactacacaacccccaa |
15031320 |
T |
 |
| Q |
216 |
tatt |
219 |
Q |
| |
|
|||| |
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| T |
15031321 |
tatt |
15031324 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 23 - 219
Target Start/End: Original strand, 24317925 - 24318122
Alignment:
| Q |
23 |
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121 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| || |
|
|
| T |
24317925 |
aaatagggaaaaatgtgtatttttaaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttaggggtttatagacaaattaataatcagttt |
24318024 |
T |
 |
| Q |
122 |
taaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaatatt |
219 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |
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|
| T |
24318025 |
taaatttatattttctccttcaccatcttagtcttttaactcctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttaaactacacaacccccaatatt |
24318122 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 17 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 7972733 - 7972537
Alignment:
| Q |
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acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||| || |
|
|
| T |
7972733 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgtatttttaaagtgacaataatggttatttctaatagacaaatttttatttttaggggtttatagacaaattaataat |
7972634 |
T |
 |
| Q |
116 |
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211 |
Q |
| |
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|
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| T |
7972633 |
caattttaaatttatattttctccttcaccatcttagtcttttaactcctccaactccttcaacaatttgctcaaaaccatttaaactacacaaccc |
7972537 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 17 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 13967549 - 13967354
Alignment:
| Q |
17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
13967549 |
acatcaaaatagggaaaactgtgtatttttaaagtgacaataatggttatttctaatagacaatttattatttttagggatttatagacaaattaataat |
13967450 |
T |
 |
| Q |
116 |
cagatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccc |
211 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
13967449 |
cagttttaaatttatattttctccttcaccatcttagtcttttaactcctctaactccttcaacaatttgctcaaaccatttaaactacacaaccc |
13967354 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 17 - 219
Target Start/End: Original strand, 29761669 - 29761871
Alignment:
| Q |
17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
29761669 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgtatttttaaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttaggggtttatagacaaattaataat |
29761768 |
T |
 |
| Q |
116 |
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215 |
Q |
| |
|
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|
| T |
29761769 |
tagttttaaatttatatattctccttcaccat-ttagtcctttaactcctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttaaactacacaacccccaa |
29761867 |
T |
 |
| Q |
216 |
tatt |
219 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
29761868 |
tatt |
29761871 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 17 - 171
Target Start/End: Original strand, 6194420 - 6194574
Alignment:
| Q |
17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgcattttaaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcatc |
116 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
6194420 |
acatcaaaataggagaaaatgtgtattttaaagtgacaataatggttatttctaatagataaattattatttttaggggtttataaacaaattaacaatc |
6194519 |
T |
 |
| Q |
117 |
agatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaact |
171 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
6194520 |
agttttaaatttatattttctccttcaccatcttagtcttttaactcctccaact |
6194574 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 17 - 162
Target Start/End: Original strand, 51110347 - 51110493
Alignment:
| Q |
17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
51110347 |
acatcaaaatagggaaaaacgtgtatttttaaagtgaaaataatagttatttctaataaacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaataat |
51110446 |
T |
 |
| Q |
116 |
cagatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaact |
162 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
51110447 |
cagatttaaatttatattttctccttcaccatcttagtcttttaact |
51110493 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 17 - 262
Target Start/End: Original strand, 40131363 - 40131610
Alignment:
| Q |
17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgcat-tttaaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||| |||| || ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||| || |
|
|
| T |
40131363 |
acatcaaaataggtaaaagtgtgtatatttaaagggacaataatgattatttctaatagacaaattattatttttagagggtgattaacaaattaataat |
40131462 |
T |
 |
| Q |
116 |
cagatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaa |
215 |
Q |
| |
|
| |||| |||||| ||||| ||||||||| |||||| |||| ||||| |||| ||| ||||||||||| | ||||||||||| ||||||| |||| | | |
|
|
| T |
40131463 |
cggattgaaatttttattttctccttcaccatcttaatcttgtaactcctcccactacttcaacaattgggtcaaaccatttatactacacgacccccta |
40131562 |
T |
 |
| Q |
216 |
tattaatccacaaatcatcccattatt-gtcactttaaaaaatacata |
262 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||| ||| || || || | ||||||||||||||| |
|
|
| T |
40131563 |
tatgtatccacaaatcacccccttgttggtaattttaaaaaatacata |
40131610 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 17 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 30113857 - 30113729
Alignment:
| Q |
17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
30113857 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgtatttttaaagtgacaataatagttatttctaatagacaaattattatttttaaaggtttataaacaaattaataat |
30113758 |
T |
 |
| Q |
116 |
cagatttaaatttatatttcctccttcac |
144 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
30113757 |
catatttaaatttatattttctccttcac |
30113729 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 114 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 44255119 - 44254952
Alignment:
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atcagatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctc |
213 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | | |
|
|
| T |
44255119 |
atcagatttaaatttatattttctccttcaccatcttagtcttttaact---------ccttcaacaatttgctcaaaccatttaaactacacaacgccc |
44255029 |
T |
 |
| Q |
214 |
aatattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacatannnnnnncccattttggagcctattttga |
291 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44255028 |
aatattaatccacacatcatctcattattgtcactttaaaaaatacata-ttttcccccattttggagcctattttga |
44254952 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 17 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 41789994 - 41789906
Alignment:
| Q |
17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaac |
104 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41789994 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgtatttttaaagtgacaataatgtttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaac |
41789906 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 199 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 41789582 - 41789491
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| Q |
199 |
aactacacaaccctcaatattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacatannnnnnncccattttggagcctattttga |
291 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41789582 |
aactacacaacccccaatattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata-tttttccccattttggagcctattttga |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 191 - 256
Target Start/End: Original strand, 40132233 - 40132298
Alignment:
| Q |
191 |
accatttcaactacacaaccctcaatattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaa |
256 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40132233 |
accatttaaactacacaacccccaatattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaa |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 217 - 262
Target Start/End: Original strand, 29762140 - 29762185
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217 |
attaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata |
262 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29762140 |
attaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 217 - 262
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| Q |
217 |
attaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata |
262 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30289032 |
attaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata |
30288987 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 17 - 89
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acatcaaaatagggaaaaatgtgcatt-ttaaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttt |
89 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||| || ||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30289412 |
acatcaaaatagggagaaatatgtattcttaaagtgacaataatgattacttctaatagacaaattattatttt |
30289339 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 217 - 262
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217 |
attaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata |
262 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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attaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 17 - 89
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Q |
| |
|
||||||||||||||| |||| || ||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 17 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 44255174 - 44255118
Alignment:
| Q |
17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaat |
72 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44255174 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgtatttttaaagtgacaataatggttatttctaat |
44255118 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 217 - 260
Target Start/End: Original strand, 6194620 - 6194663
Alignment:
| Q |
217 |
attaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaataca |
260 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6194620 |
attaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaataca |
6194663 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 217 - 260
Target Start/End: Original strand, 24318391 - 24318434
Alignment:
| Q |
217 |
attaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaataca |
260 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24318391 |
attaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaataca |
24318434 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 217 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 7972260 - 7972216
Alignment:
| Q |
217 |
attaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacat |
261 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7972260 |
attaatccacaaattatcccattattgtcactttaaaaaatacat |
7972216 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 220 - 262
Target Start/End: Original strand, 51110521 - 51110563
Alignment:
| Q |
220 |
aatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata |
262 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
51110521 |
aatccataaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata |
51110563 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 217 - 260
Target Start/End: Original strand, 15031582 - 15031625
Alignment:
| Q |
217 |
attaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaataca |
260 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
15031582 |
attaatccaaaaatcatcccattattgccactttaaaaaataca |
15031625 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 217 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 13967077 - 13967038
Alignment:
| Q |
217 |
attaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaa |
256 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
13967077 |
attaatccacaaatcatcacattattgtcactataaaaaa |
13967038 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 17 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 41744690 - 41744647
Alignment:
| Q |
17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgca-ttttaaagtgacaataat |
59 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41744690 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgtatttttaaagtgacaataat |
41744647 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 99 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 40131273 - 40131239
Alignment:
| Q |
99 |
ataaacaaattaatcatcagatttaaatttatatt |
133 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40131273 |
ataaacaaattaataatcagatttaaatttatatt |
40131239 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 51)
Name: chr3
Description:
Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 17 - 291
Target Start/End: Original strand, 13341895 - 13342169
Alignment:
| Q |
17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
13341895 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgtatttttaaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaataat |
13341994 |
T |
 |
| Q |
116 |
cagatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaa |
215 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
13341995 |
cagatttaaatttatattttctccttcaccatcttagtcttttaactcctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttaaactacacaacccccaa |
13342094 |
T |
 |
| Q |
216 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacatannnnnnncccattttggagcctattttga |
291 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13342095 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata-ttttttcccattttggagcctattttga |
13342169 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 17 - 291
Target Start/End: Original strand, 23908648 - 23908922
Alignment:
| Q |
17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
23908648 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgtatttttaaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaataat |
23908747 |
T |
 |
| Q |
116 |
cagatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaa |
215 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
23908748 |
cagatttaaatttatattttctccttcaccatcttagtcttttaactcctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttaaactacacaacccccaa |
23908847 |
T |
 |
| Q |
216 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacatannnnnnncccattttggagcctattttga |
291 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23908848 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata-tttttccccattttggagcctattttga |
23908922 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 17 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 10120480 - 10120205
Alignment:
| Q |
17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
10120480 |
acatcaaaatagggaaaaaagtgtatttttaaagtgacaataatagttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaataat |
10120381 |
T |
 |
| Q |
116 |
cagatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaa |
215 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10120380 |
cagatttaaatttatattttctccttcaccatcttagtcttttaactcctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttaaactacacaaccctcaa |
10120281 |
T |
 |
| Q |
216 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacatannnnnnncccattttggagcctattttga |
291 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10120280 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacatattttttttccattttggagcctattttga |
10120205 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 17 - 262
Target Start/End: Original strand, 44518554 - 44518800
Alignment:
| Q |
17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
44518554 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgtatttttaaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaataat |
44518653 |
T |
 |
| Q |
116 |
cagatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaa |
215 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
44518654 |
cagatttaaatttatattttctccttcaccatcttagtcttttaactcctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttaaactacacaacccccaa |
44518753 |
T |
 |
| Q |
216 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata |
262 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44518754 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata |
44518800 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 17 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 52171505 - 52171232
Alignment:
| Q |
17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
52171505 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgtatttttaaagtgacaataatgattatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaataat |
52171406 |
T |
 |
| Q |
116 |
cagatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaa |
215 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
52171405 |
cagatttaaatttatattttctccttcaccatcttagtcttttaactcctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttaaactacacaacccccaa |
52171306 |
T |
 |
| Q |
216 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacatannnnnnncccattttggagcctattttga |
291 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
52171305 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata--ttttccccattttggagcctattttga |
52171232 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 17 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 36736452 - 36736206
Alignment:
| Q |
17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
36736452 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgtatttttaaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaataat |
36736353 |
T |
 |
| Q |
116 |
cagatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaa |
215 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
36736352 |
cagatttaaatttatattttctccttcaccatcttagtcttttaactcctccaactccttcaacaatttgctcaaatcatttaaactacacaacccccaa |
36736253 |
T |
 |
| Q |
216 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata |
262 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36736252 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata |
36736206 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 17 - 291
Target Start/End: Original strand, 883677 - 883950
Alignment:
| Q |
17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
883677 |
acatcaaaatagg-aaaaatgtgtatttttaaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaataat |
883775 |
T |
 |
| Q |
116 |
cagatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaa |
215 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
883776 |
cagatttaaatttatattttctccttcaccatcttagtcttttaactcctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttaaactacacaacccccaa |
883875 |
T |
 |
| Q |
216 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacatannnnnnncccattttggagcctattttga |
291 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
883876 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata-tttttccccattttggagcctattttga |
883950 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 17 - 291
Target Start/End: Original strand, 24086393 - 24086667
Alignment:
| Q |
17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
24086393 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgtatttttaaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattacttttagaggtttataaacaaattaataat |
24086492 |
T |
 |
| Q |
116 |
cagatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaa |
215 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
24086493 |
cagatttaaatttatattttctctttcaccatcttagtcttttaactcctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttaaactacacaacccccaa |
24086592 |
T |
 |
| Q |
216 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacatannnnnnncccattttggagcctattttga |
291 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24086593 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata-ttttcccccattttggagcctattttga |
24086667 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 17 - 291
Target Start/End: Original strand, 55153652 - 55153926
Alignment:
| Q |
17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |
|
|
| T |
55153652 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgtatttttaaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaaaaaattaataat |
55153751 |
T |
 |
| Q |
116 |
cagatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaa |
215 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
55153752 |
cagatttaaatttatattttctccttcaccatcttagtcttttaactcctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttaaactacacaacccccaa |
55153851 |
T |
 |
| Q |
216 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacatannnnnnncccattttggagcctattttga |
291 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
55153852 |
tattaatccac-aatcatcccattattgtcactttaaaaaatacatatttttttcccattttggaacctattttga |
55153926 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 17 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 13737531 - 13737257
Alignment:
| Q |
17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
13737531 |
acatcaaaataggaaaaaatgtgtatttttaaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaataat |
13737432 |
T |
 |
| Q |
116 |
cagatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaa |
215 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
13737431 |
cagatttaaatttatattttctccttcaccatcttagtcttttaactcctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttaaactacacaacccccaa |
13737332 |
T |
 |
| Q |
216 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacatannnnnnncccattttggagcctattttga |
291 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13737331 |
tattaatccacaaatcatctcattattgtcacttaaaaaaatacata-tttttccccattttggagcctattttga |
13737257 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #11
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Query Start/End: Original strand, 17 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 31583170 - 31582896
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115 |
Q |
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acatcaaaatagggaaaaatgtgtatttttaaaatgacaataatgattatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaataat |
31583071 |
T |
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116 |
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215 |
Q |
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| T |
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31582971 |
T |
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| Q |
216 |
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291 |
Q |
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| T |
31582970 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata-tttttccccattttggagcctattttga |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 17 - 291
Target Start/End: Original strand, 35154191 - 35154465
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| Q |
17 |
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115 |
Q |
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T |
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| Q |
116 |
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215 |
Q |
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T |
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| Q |
216 |
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291 |
Q |
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tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata-tttttccccattttggagcctattttga |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 17 - 262
Target Start/End: Original strand, 5152677 - 5152923
Alignment:
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115 |
Q |
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T |
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| Q |
116 |
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215 |
Q |
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| T |
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T |
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| Q |
216 |
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262 |
Q |
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| T |
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tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata |
5152923 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 17 - 291
Target Start/End: Original strand, 6071274 - 6071548
Alignment:
| Q |
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115 |
Q |
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T |
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| Q |
116 |
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215 |
Q |
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| T |
6071374 |
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T |
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| Q |
216 |
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291 |
Q |
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6071473 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacatatttttttcccatttttgagcctattttga |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 17 - 291
Target Start/End: Original strand, 34941210 - 34941485
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| Q |
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acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
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| T |
34941210 |
acatcaaaatagggtaaaatgtgtatttttaaagtgacaataatggttatttctaatagacaagttattatttttagaggtttataaataaattaataat |
34941309 |
T |
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| Q |
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215 |
Q |
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| T |
34941310 |
caaatttaaatttatattttctccttcaccatattagtcttttaactcctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttaaactacacaacccccaa |
34941409 |
T |
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| Q |
216 |
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291 |
Q |
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| T |
34941410 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacatattttccccccattttggagcctattttga |
34941485 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 17 - 262
Target Start/End: Original strand, 43727324 - 43727570
Alignment:
| Q |
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acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
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| T |
43727324 |
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43727423 |
T |
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| Q |
116 |
cagatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaa |
215 |
Q |
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| T |
43727424 |
cagatttaaatttatattttctccttcaccatcttagtcttttaactcctccaactccttcaacaatttgctcaaatcatttaaactacacaacccccaa |
43727523 |
T |
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| Q |
216 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata |
262 |
Q |
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| T |
43727524 |
tattaatccacaaatcatctcattattgtcactttaaaaaatacata |
43727570 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 17 - 262
Target Start/End: Original strand, 49255949 - 49256195
Alignment:
| Q |
17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
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| T |
49255949 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgtatttttaaagtgataataatggttatttttaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaataat |
49256048 |
T |
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| Q |
116 |
cagatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaa |
215 |
Q |
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| T |
49256049 |
cagatttaaatttatattttctccttcaccatcttaatcttttaactcctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttaaactacacaacccccaa |
49256148 |
T |
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| Q |
216 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata |
262 |
Q |
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| T |
49256149 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata |
49256195 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 17 - 291
Target Start/End: Original strand, 9718216 - 9718490
Alignment:
| Q |
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acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
| |
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| T |
9718216 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgtatttttaaagtgacaataatggttatttctaatagacagattattatttttagaggtttataaacaaattaataat |
9718315 |
T |
 |
| Q |
116 |
cagatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaa |
215 |
Q |
| |
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| T |
9718316 |
cagatttaaatttatattttctccttcaccatcttagtcttttaactcccctaactccttcaacaatttgctcaaaccatttaaactacacaacccctaa |
9718415 |
T |
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| Q |
216 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacatannnnnnncccattttggagcctattttga |
291 |
Q |
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| T |
9718416 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata-ttttttcccattttggagcctattttga |
9718490 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 17 - 291
Target Start/End: Original strand, 20495604 - 20495878
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| Q |
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Q |
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| T |
20495604 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgtatttttaaagtgacaataattgttatttctaatagacaaagtattatttttagaggtttataaacaaattaataat |
20495703 |
T |
 |
| Q |
116 |
cagatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaa |
215 |
Q |
| |
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| T |
20495704 |
cagatttaaatttatattttctcattcaccatcttagtcttttaaatcctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttaaactacacaacccccaa |
20495803 |
T |
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| Q |
216 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacatannnnnnncccattttggagcctattttga |
291 |
Q |
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| T |
20495804 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata-tttttccccattttggagcctattttga |
20495878 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 17 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 23781581 - 23781307
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acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttta-aagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
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Q |
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| T |
23781581 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgtattttttaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatgat |
23781482 |
T |
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| Q |
116 |
cagatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaa |
215 |
Q |
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| T |
23781481 |
tagatttaaatttatattttctccttcaccatcttagtcttttaactcatccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttaaactacacaacccccaa |
23781382 |
T |
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| Q |
216 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacatannnnnnncccattttggagcctattttga |
291 |
Q |
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| T |
23781381 |
tattaatccacaaatcatcacattattgtcactttaaaaaatacata-tttttccccattttggagcctattttga |
23781307 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 19 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 52961485 - 52961213
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Q |
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| T |
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atcaaaatagagaaaaatatgtatttttaaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaataatca |
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T |
 |
| Q |
118 |
gatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaata |
217 |
Q |
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| T |
52961385 |
gatttaaatttatattttctccttcaccatcttagtcttttaactcctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttaaactacacaacccccaata |
52961286 |
T |
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| Q |
218 |
ttaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacatannnnnnncccattttggagcctattttga |
291 |
Q |
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| T |
52961285 |
ttaatccacaaatcatcccattattgtcacttaaaaaaatacaca-tttttccccattttggagcctattttga |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 17 - 291
Target Start/End: Original strand, 23323509 - 23323783
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| Q |
17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
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23323608 |
T |
 |
| Q |
116 |
cagatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaa |
215 |
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| T |
23323609 |
cagatttaaatttatattttctctttcaccatcttagttttttaactcctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttaaactacacaacccctaa |
23323708 |
T |
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| Q |
216 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacatannnnnnncccattttggagcctattttga |
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tattaatccacaaatgatcccattattgtcactttaaaaaatacata-tttccccccattttggagcctattttga |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 18 - 262
Target Start/End: Original strand, 31586128 - 31586373
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Q |
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catcaaaatagggaaaaatgtgtatttttaaaatgacaataatgattatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaataatc |
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T |
 |
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117 |
agatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaat |
216 |
Q |
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| T |
31586228 |
agatttaaatttatattttctccttcaccattttagtcttttaactcatccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttaaactacacaacccccaat |
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T |
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| Q |
217 |
attaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata |
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attaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 17 - 291
Target Start/End: Original strand, 42389676 - 42389950
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215 |
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291 |
Q |
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42389950 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 19 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 39669364 - 39669120
Alignment:
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117 |
Q |
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| T |
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T |
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118 |
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217 |
Q |
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| T |
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T |
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Q |
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| T |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 17 - 262
Target Start/End: Original strand, 37703886 - 37704132
Alignment:
| Q |
17 |
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115 |
Q |
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T |
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| T |
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T |
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Q |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 17 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 38599444 - 38599198
Alignment:
| Q |
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acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
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Q |
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| T |
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38599345 |
T |
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116 |
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215 |
Q |
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| T |
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38599245 |
T |
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Q |
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| T |
38599244 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 17 - 262
Target Start/End: Original strand, 40782952 - 40783198
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| Q |
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Q |
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40783151 |
T |
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| T |
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40783198 |
T |
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Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 17 - 291
Target Start/End: Original strand, 10656379 - 10656651
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Q |
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T |
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Q |
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| T |
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T |
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291 |
Q |
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| T |
10656578 |
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10656651 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 17 - 291
Target Start/End: Original strand, 36259670 - 36259944
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| Q |
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acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
| |
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| T |
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T |
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215 |
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| T |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 17 - 262
Target Start/End: Original strand, 40163337 - 40163574
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| Q |
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Q |
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| T |
40163337 |
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T |
 |
| Q |
116 |
cagatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaa |
215 |
Q |
| |
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| T |
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40163527 |
T |
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262 |
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| T |
40163528 |
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40163574 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 42 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 33305704 - 33305457
Alignment:
| Q |
42 |
ttttaaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcatcagatttaaatttatatttcctcctt |
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Q |
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33305605 |
T |
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241 |
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33305604 |
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33305505 |
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| T |
33305504 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 18 - 291
Target Start/End: Original strand, 21627565 - 21627838
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| Q |
18 |
catcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcatc |
116 |
Q |
| |
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| T |
21627565 |
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216 |
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21627764 |
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291 |
Q |
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|
| T |
21627765 |
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21627838 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 17 - 291
Target Start/End: Original strand, 47799293 - 47799562
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Q |
| |
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|
| T |
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T |
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| Q |
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211 |
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| |
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| T |
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47799483 |
T |
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291 |
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| T |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 17 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 38771148 - 38770945
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acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
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Q |
| |
|
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acatcaaaataggaaaaaatgtgtatttttaaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttaggggtttatagataaattaataat |
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T |
 |
| Q |
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cagatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaa |
215 |
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| T |
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cagttttaaatttatattttctccttcaccatcttagtcttttaactcctccaactccttcaacaatttgctcaaatcatttaaactacacaacccccaa |
38770949 |
T |
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| T |
38770948 |
tatt |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 17 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 42856589 - 42856387
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acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
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Q |
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| T |
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acatcaaaatagggaaaa-tgtgtatttttaaagtgaaaataatggttatttctaatagacaaattattatttttaggggtttatagacaagttaataat |
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T |
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| Q |
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cagatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaa |
215 |
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| T |
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T |
 |
| Q |
216 |
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219 |
Q |
| |
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42856390 |
tatt |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 17 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 36027818 - 36027624
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acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
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| |
|
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| T |
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T |
 |
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cagatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccc |
211 |
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| |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 17 - 219
Target Start/End: Original strand, 53627479 - 53627682
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| Q |
17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||||||||| || |
|
|
| T |
53627479 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgtatttttaaagtgacaataatggttatttctaataaacaaattattatttttagggatttatagacaaattaataat |
53627578 |
T |
 |
| Q |
116 |
cagatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaa |
215 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
53627579 |
cagttttaaatttatattttctccttcaccatcttaatctttaaactccttcaactccttcaacaatttgctcaaaccatttaaactacgcaacccccaa |
53627678 |
T |
 |
| Q |
216 |
tatt |
219 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
53627679 |
tatt |
53627682 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 17 - 219
Target Start/End: Original strand, 46976118 - 46976321
Alignment:
| Q |
17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||| || |
|
|
| T |
46976118 |
acatcaaaataggaaaaaatgtgtatttttaaagtgacaataatggttatttttaatagacaaattattatgtttatgggtttatagacaaactaataat |
46976217 |
T |
 |
| Q |
116 |
cagatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaa |
215 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
46976218 |
cagttttaaatttatattttctctttcaccatcttagtcttttaactcctctaactccttcaacaatttgctcaaatcatttaaactacacaacccccaa |
46976317 |
T |
 |
| Q |
216 |
tatt |
219 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
46976318 |
tatt |
46976321 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 50 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 20189317 - 20189148
Alignment:
| Q |
50 |
tgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcatcagatttaaatttatatttcctccttcactatct |
149 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| || || ||||||||||||||| |||| ||| |||| |
|
|
| T |
20189317 |
tgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttaggggtttatagacaaattaataataagttttaaatttatattttctccaacaccatct |
20189218 |
T |
 |
| Q |
150 |
tagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaatatt |
219 |
Q |
| |
|
|||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
20189217 |
tagttttttaactcctctaactccttcaacaatttgctcaaactatttaaactacacaacccccaatatt |
20189148 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 155 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 24814512 - 24814376
Alignment:
| Q |
155 |
ttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaatattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaa |
254 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24814512 |
ttttaactcctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttaaactacacaaccctcaatattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaa |
24814413 |
T |
 |
| Q |
255 |
aatacatannnnnnncccattttggagcctattttga |
291 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24814412 |
aatacatattttttttccattttggagcctattttga |
24814376 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 177 - 291
Target Start/End: Original strand, 25068012 - 25068125
Alignment:
| Q |
177 |
aacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaatattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacatannnnnnncccattt |
276 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
25068012 |
aacaatttgctcaaaccatttaaactacacaacccccaatattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata-ttttttcccattt |
25068110 |
T |
 |
| Q |
277 |
tggagcctattttga |
291 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |
|
|
| T |
25068111 |
tggagcctattttga |
25068125 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 17 - 117
Target Start/End: Original strand, 25067843 - 25067944
Alignment:
| Q |
17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
25067843 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgtatttttaaagtgacaatagtgattatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaataat |
25067942 |
T |
 |
| Q |
116 |
ca |
117 |
Q |
| |
|
|| |
|
|
| T |
25067943 |
ca |
25067944 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 217 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 36027347 - 36027302
Alignment:
| Q |
217 |
attaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata |
262 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36027347 |
attaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata |
36027302 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 217 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 20186777 - 20186734
Alignment:
| Q |
217 |
attaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaataca |
260 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20186777 |
attaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaataca |
20186734 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 217 - 260
Target Start/End: Original strand, 53627951 - 53627994
Alignment:
| Q |
217 |
attaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaataca |
260 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
53627951 |
attaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaataca |
53627994 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 219 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 42856116 - 42856045
Alignment:
| Q |
219 |
taatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacatannnnnnncccattttggagcctattttga |
291 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42856116 |
taatccacaaatcatccaattattgtcactttaaaaaatacaca-ttttcccccattttggagcctattttga |
42856045 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 217 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 38770673 - 38770628
Alignment:
| Q |
217 |
attaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata |
262 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38770673 |
attaatccacaaatgatctcattattgtcactttaaaaaatacata |
38770628 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 227 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 36791383 - 36791348
Alignment:
| Q |
227 |
aaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata |
262 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36791383 |
aaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata |
36791348 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 217 - 260
Target Start/End: Original strand, 46976591 - 46976634
Alignment:
| Q |
217 |
attaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaataca |
260 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
46976591 |
attaatccacaaatcatctcattactgtcactttaaaaaataca |
46976634 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 36791549 - 36791505
Alignment:
| Q |
17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgca-ttttaaagtgacaataatg |
60 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36791549 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgtatttttaaagtgacaataatg |
36791505 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 27)
Name: chr2
Description:
Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 17 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 12178506 - 12178232
Alignment:
| Q |
17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
12178506 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgtatttttaaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaataat |
12178407 |
T |
 |
| Q |
116 |
cagatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaa |
215 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
12178406 |
cagatttaaatttatattttctccttcaccatcttagtcttttaactcctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttaaactacacaacccccaa |
12178307 |
T |
 |
| Q |
216 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacatannnnnnncccattttggagcctattttga |
291 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12178306 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata-tttttccccattttggagcctattttga |
12178232 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 17 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 19223441 - 19223167
Alignment:
| Q |
17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
19223441 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgtatttttaaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaataat |
19223342 |
T |
 |
| Q |
116 |
cagatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaa |
215 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
19223341 |
cagatttaaatttatattttctccttcaccatcttagtcttttaactcctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttaaactacacaacccccaa |
19223242 |
T |
 |
| Q |
216 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacatannnnnnncccattttggagcctattttga |
291 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19223241 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata-tttttccccattttggagcctattttga |
19223167 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 17 - 291
Target Start/End: Original strand, 40651051 - 40651325
Alignment:
| Q |
17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
40651051 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgtatttttaaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaataat |
40651150 |
T |
 |
| Q |
116 |
cagatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaa |
215 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
40651151 |
cagatttaaatttatattttctccttcaccatcttagtcttttaactcctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttaaactacacaacccccaa |
40651250 |
T |
 |
| Q |
216 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacatannnnnnncccattttggagcctattttga |
291 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40651251 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata-tttttccccattttggagcctattttga |
40651325 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 17 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 26367906 - 26367632
Alignment:
| Q |
17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
26367906 |
acataaaaatagggaaaaatgtgtatttttaaagtgacaataatggttatttctaatagacaaatttttatttttagaggtttataaacaaattaataat |
26367807 |
T |
 |
| Q |
116 |
cagatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaa |
215 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
26367806 |
cagatttaaatttatattttctccttcaccatcttagtcttttaactcctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttaaactacacaacccccaa |
26367707 |
T |
 |
| Q |
216 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacatannnnnnncccattttggagcctattttga |
291 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26367706 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata-tttttccccattttggagcctattttga |
26367632 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 17 - 262
Target Start/End: Original strand, 3074508 - 3074754
Alignment:
| Q |
17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
3074508 |
acatcaaaatagggaaaaatatgtatttttaaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaataat |
3074607 |
T |
 |
| Q |
116 |
cagatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaa |
215 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
3074608 |
cagatttaaatttatattttctccttcaccatcttagtcttttaactcctccaactctttcaacaatttgctcaaaccatttaaactacacaacccccaa |
3074707 |
T |
 |
| Q |
216 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata |
262 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3074708 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata |
3074754 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 17 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 32892674 - 32892429
Alignment:
| Q |
17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
32892674 |
acatcaaaatagg-aaaaatgtgtatttttaaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaataat |
32892576 |
T |
 |
| Q |
116 |
cagatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaa |
215 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32892575 |
cagatttaaatttatattttctccttcaccatcttagtcttttaactcctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttaaactacacaaccctcaa |
32892476 |
T |
 |
| Q |
216 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata |
262 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32892475 |
tattaatccacaaatcatctcattattgtcactttaaaaaatacata |
32892429 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 17 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 33437795 - 33437549
Alignment:
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17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
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33437795 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgtatttttaaagtgacaataatgattatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaataat |
33437696 |
T |
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| Q |
116 |
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215 |
Q |
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| T |
33437695 |
cagatttaaatttatattttctccttcaccatcttagtcttttaactcctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttaaactacactacccccaa |
33437596 |
T |
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| Q |
216 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata |
262 |
Q |
| |
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| T |
33437595 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata |
33437549 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 17 - 291
Target Start/End: Original strand, 16057570 - 16057844
Alignment:
| Q |
17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
| |
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|
|
| T |
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acatcaaaatagggaaaaatgtgtatttttaaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaataat |
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T |
 |
| Q |
116 |
cagatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaa |
215 |
Q |
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| T |
16057670 |
cagatttaaatttatattttttccttcaccatcttagtcttttaactccttcaactccttcaacaatttgctcaaaccatttaaactacacaacccccaa |
16057769 |
T |
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216 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacatannnnnnncccattttggagcctattttga |
291 |
Q |
| |
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| T |
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tattaatccacaaatcatctcattattgtcactttaaaaaatacata-tttttccccattttggagcctattttga |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 17 - 262
Target Start/End: Original strand, 42793311 - 42793557
Alignment:
| Q |
17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
| |
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|
| T |
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acatcaaaatagggaaaaatgtgtatttttaaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattattcttagaggtttataaacaaattaataat |
42793410 |
T |
 |
| Q |
116 |
cagatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaa |
215 |
Q |
| |
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| T |
42793411 |
cagatttaaatttatattttctccttcaacatcttagtcttttaactcctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttaaactacataacccccaa |
42793510 |
T |
 |
| Q |
216 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata |
262 |
Q |
| |
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| T |
42793511 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata |
42793557 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 17 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 41799776 - 41799502
Alignment:
| Q |
17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
| |
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| T |
41799776 |
acatcaaaataaggaaaaatgtgtatttttaaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaataat |
41799677 |
T |
 |
| Q |
116 |
cagatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaa |
215 |
Q |
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| T |
41799676 |
cagatttaaatttatattttttccttcaccatcttagtcttttaactcctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttaaattacacaacccccaa |
41799577 |
T |
 |
| Q |
216 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacatannnnnnncccattttggagcctattttga |
291 |
Q |
| |
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| T |
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tattaatccacaaatcatccaattattgtcactttaaaaaatacata-tttttccccattttggagcctattttga |
41799502 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 17 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 3435022 - 3434776
Alignment:
| Q |
17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
| |
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|
| T |
3435022 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgtatttttaaagtgacaataatggttatttctaatagaaaaattattatttttagaggattataaacaaattaataat |
3434923 |
T |
 |
| Q |
116 |
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215 |
Q |
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| T |
3434922 |
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3434823 |
T |
 |
| Q |
216 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata |
262 |
Q |
| |
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| T |
3434822 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata |
3434776 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 17 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 122056 - 121782
Alignment:
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17 |
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115 |
Q |
| |
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|
| T |
122056 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgtatttttaaagtgacaataatggttatttctaatagataaattattatttttagaggtttataaaaaaattaataat |
121957 |
T |
 |
| Q |
116 |
cagatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaa |
215 |
Q |
| |
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| T |
121956 |
cagatttaaatttatattttctccttcaccatctcagtcttttaactcctccaactctttcaacaatttgctcaaaccatttaaactacacaacccccaa |
121857 |
T |
 |
| Q |
216 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacatannnnnnncccattttggagcctattttga |
291 |
Q |
| |
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| T |
121856 |
tattaatccacaaatcatctcattattgtcactttaaaaaatacata-ttttttcccattttggagcctattttga |
121782 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 17 - 291
Target Start/End: Original strand, 25992160 - 25992433
Alignment:
| Q |
17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
| |
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|
| T |
25992160 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgtatttttaaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaataat |
25992259 |
T |
 |
| Q |
116 |
cagatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaa |
215 |
Q |
| |
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| T |
25992260 |
cagatttaaatttatattttctccttcaccatcttagtcttttaactcct-caactccttcaacaatttgctcaaaccacttaaactacacaacccctaa |
25992358 |
T |
 |
| Q |
216 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacatannnnnnncccattttggagcctattttga |
291 |
Q |
| |
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|
| T |
25992359 |
tattaatccacaaatcatctcattattgtcactttaaaaaatacata-tttttccccattttggagcctattttga |
25992433 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 17 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 4357280 - 4357005
Alignment:
| Q |
17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaat-aatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatca |
114 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
4357280 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgtatttttaaagtgacaattaatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaataa |
4357181 |
T |
 |
| Q |
115 |
tcagatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacac-aaccctc |
213 |
Q |
| |
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| T |
4357180 |
tcagatttaaatttatattttctccttcaccatcttagtgttttaactcctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttaaactacacaaaccccc |
4357081 |
T |
 |
| Q |
214 |
aatattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacatannnnnnncccattttggagcctattttga |
291 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
4357080 |
aatattgatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata--ttttccccattttggagcctattttga |
4357005 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 17 - 262
Target Start/End: Original strand, 25775097 - 25775343
Alignment:
| Q |
17 |
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115 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
25775097 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgtatttttaaagtgacaataatagttatttctaatagacaaattattatttttaaaggtttataaacaaattaataat |
25775196 |
T |
 |
| Q |
116 |
cagatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaa |
215 |
Q |
| |
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| T |
25775197 |
catatttaaatttatattttctccttcaccatcttagtcttttaactcctcaaactccttcaacaatttactcaaaccatttaaactacacaacccccaa |
25775296 |
T |
 |
| Q |
216 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata |
262 |
Q |
| |
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| T |
25775297 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata |
25775343 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 17 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 44258561 - 44258316
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| Q |
17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
| |
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|
| T |
44258561 |
acatcaaaatagg-aaaaatgtgtatttttaaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaataat |
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T |
 |
| Q |
116 |
cagatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaa |
215 |
Q |
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| T |
44258462 |
cagatttaaatttatattttctccttcaccatcttagtcttttaactcctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttaaactacacaacccccaa |
44258363 |
T |
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| Q |
216 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata |
262 |
Q |
| |
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| T |
44258362 |
tattaatccataaatcatcctattattgtcacttaaaaaaatacata |
44258316 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 17 - 291
Target Start/End: Original strand, 28242913 - 28243189
Alignment:
| Q |
17 |
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115 |
Q |
| |
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|
| T |
28242913 |
acatcaaaatagggaaaaatgtatatttttaaagtgacaataatggttatttctaataaactaattattatttttagaggtttataaacaaattaataat |
28243012 |
T |
 |
| Q |
116 |
cagatttaaatttatatttcctccttcactatctt--agtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctc |
213 |
Q |
| |
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|
| T |
28243013 |
cagatttaaatttatattttctccttcaccatgttttagtcttttaactcctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttaaactacacaaccccc |
28243112 |
T |
 |
| Q |
214 |
aatattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacatannnnnnncccattttggagcctattttga |
291 |
Q |
| |
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|
| T |
28243113 |
aatattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata-ttttcccccattttggagcctattttga |
28243189 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 17 - 262
Target Start/End: Original strand, 8346062 - 8346307
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17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
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Q |
| |
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| T |
8346062 |
acatcaaaatagggaaaa-tgtgtatttttaaagtgacaatcatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaataaataaataat |
8346160 |
T |
 |
| Q |
116 |
cagatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaa |
215 |
Q |
| |
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| T |
8346161 |
cagatttaaatttatattttctccttcaccatcttagtcttttaactcctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttaaactacacaacccccaa |
8346260 |
T |
 |
| Q |
216 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata |
262 |
Q |
| |
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| T |
8346261 |
tattaatccacaaatcatctcattattgtcactttaaaaaatacata |
8346307 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 17 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 37225024 - 37224759
Alignment:
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acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
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Q |
| |
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|
| T |
37225024 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgtatttttaaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaataat |
37224925 |
T |
 |
| Q |
116 |
cagatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaa |
215 |
Q |
| |
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|
| T |
37224924 |
cagatttaaatttatattttctccttcaccatcttagtctttt---------aactccttcaacaatttgctcaaactatttaaactacacaacccccaa |
37224834 |
T |
 |
| Q |
216 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacatannnnnnncccattttggagcctattttga |
291 |
Q |
| |
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|
| T |
37224833 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata-tttttccccattttggagcctattttga |
37224759 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 19 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 6166757 - 6166513
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| Q |
118 |
gatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaata |
217 |
Q |
| |
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||||| |||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |
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| T |
6166657 |
aatttatatttatattttctctttcaccatcttagtcttttaactcctccaaccccttcaacaatttgctcaaaccatttaaactacacaacccccaata |
6166558 |
T |
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| Q |
218 |
ttaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata |
262 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
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| T |
6166557 |
ttaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatgcata |
6166513 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 17 - 197
Target Start/End: Original strand, 1550280 - 1550461
Alignment:
| Q |
17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
| |
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| T |
1550280 |
acatcaaaatatggaaaaatgtgtatttttaaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaataat |
1550379 |
T |
 |
| Q |
116 |
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197 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1550380 |
cagatttaaatttatattttatccttcaccatcttagtcttttaactcctccaactccttcaacaatttgctcaaaccattt |
1550461 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 17 - 219
Target Start/End: Original strand, 7777762 - 7777972
Alignment:
| Q |
17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
| |
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| T |
7777762 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgtatttttaaagtgtcaataattgttatttctaatagacaaattattatttttaggggtttatagacaaattaataat |
7777861 |
T |
 |
| Q |
116 |
ca-------gatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaa |
208 |
Q |
| |
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| T |
7777862 |
cactaatcagttttaaatttatattttctccttcaccatcttagtcttttaactcctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttaaactacacaa |
7777961 |
T |
 |
| Q |
209 |
ccctcaatatt |
219 |
Q |
| |
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||| ||||||| |
|
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| T |
7777962 |
cccccaatatt |
7777972 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 17 - 117
Target Start/End: Original strand, 2695162 - 2695263
Alignment:
| Q |
17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgcattttaaa-gtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
| |
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| T |
2695162 |
acatcaaaataaggaaaaatgtgtattttaaaagtggcaataatggttatttctaatagacaaattattatttttaggggtttatagaaaaattaataat |
2695261 |
T |
 |
| Q |
116 |
ca |
117 |
Q |
| |
|
|| |
|
|
| T |
2695262 |
ca |
2695263 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 217 - 262
Target Start/End: Original strand, 2695582 - 2695627
Alignment:
| Q |
217 |
attaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata |
262 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2695582 |
attaatccacaaatcatctcattattgtcactttaaaaaatacata |
2695627 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 227 - 291
Target Start/End: Original strand, 1550462 - 1550525
Alignment:
| Q |
227 |
aaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacatannnnnnncccattttggagcctattttga |
291 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1550462 |
aaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata-ttttttcccattttggagcctattttga |
1550525 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 221 - 260
Target Start/End: Original strand, 7778244 - 7778283
Alignment:
| Q |
221 |
atccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaataca |
260 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7778244 |
atccacaaatcatcccattattatcactttaaaaaataca |
7778283 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 17 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 38964698 - 38964655
Alignment:
| Q |
17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgca-ttttaaagtgacaataat |
59 |
Q |
| |
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||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |
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| T |
38964698 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgtatttttaaagtgacaataat |
38964655 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 71)
Name: chr1
Description:
Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 17 - 291
Target Start/End: Original strand, 4469756 - 4470030
Alignment:
| Q |
17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
| |
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|
|
| T |
4469756 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgtatttttaaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaataat |
4469855 |
T |
 |
| Q |
116 |
cagatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaa |
215 |
Q |
| |
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| T |
4469856 |
cagatttaaatttatattttctccttcaccatcttagtcttttaactcctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttaaactacacaacccccaa |
4469955 |
T |
 |
| Q |
216 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacatannnnnnncccattttggagcctattttga |
291 |
Q |
| |
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|
|
| T |
4469956 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata-tttttccccattttggagcctattttga |
4470030 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 17 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 11992564 - 11992290
Alignment:
| Q |
17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
11992564 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgtatttttaaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaataat |
11992465 |
T |
 |
| Q |
116 |
cagatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaa |
215 |
Q |
| |
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| T |
11992464 |
cagatttaaatttatattttctccttcaccatcttagtcttttaactcctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttaaactacacaacccccaa |
11992365 |
T |
 |
| Q |
216 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacatannnnnnncccattttggagcctattttga |
291 |
Q |
| |
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|
|
| T |
11992364 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata-tttttccccattttggagcctattttga |
11992290 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 17 - 291
Target Start/End: Original strand, 29329589 - 29329863
Alignment:
| Q |
17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
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|
| T |
29329589 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgtatttttaaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaataat |
29329688 |
T |
 |
| Q |
116 |
cagatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaa |
215 |
Q |
| |
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| T |
29329689 |
cagatttaaatttatattttctccttcaccatcttagtcttttaactcctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttaaactacacaacccccaa |
29329788 |
T |
 |
| Q |
216 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacatannnnnnncccattttggagcctattttga |
291 |
Q |
| |
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|
|
| T |
29329789 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata-tttttccccattttggagcctattttga |
29329863 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 17 - 291
Target Start/End: Original strand, 35894366 - 35894640
Alignment:
| Q |
17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
35894366 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgtatttttaaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaataat |
35894465 |
T |
 |
| Q |
116 |
cagatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaa |
215 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
35894466 |
cagatttaaatttatattttctccttcaccatcttagtcttttaactcctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttaaactacacaacccccaa |
35894565 |
T |
 |
| Q |
216 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacatannnnnnncccattttggagcctattttga |
291 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35894566 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata-tttttccccattttggagcctattttga |
35894640 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 17 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 37812932 - 37812658
Alignment:
| Q |
17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
37812932 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgtatttttaaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaataat |
37812833 |
T |
 |
| Q |
116 |
cagatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaa |
215 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
37812832 |
cagatttaaatttatattttctccttcaccatcttagtcttttaactcctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttaaactacacaacccccaa |
37812733 |
T |
 |
| Q |
216 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacatannnnnnncccattttggagcctattttga |
291 |
Q |
| |
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|
|
| T |
37812732 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata-tttttccccattttggagcctattttga |
37812658 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 17 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 47434094 - 47433820
Alignment:
| Q |
17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
47434094 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgtatttttaaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaataat |
47433995 |
T |
 |
| Q |
116 |
cagatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaa |
215 |
Q |
| |
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| T |
47433994 |
cagatttaaatttatattttctccttcaccatcttagtcttttaactcctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttaaactacacaacccccaa |
47433895 |
T |
 |
| Q |
216 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacatannnnnnncccattttggagcctattttga |
291 |
Q |
| |
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|
|
| T |
47433894 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata-tttttccccattttggagcctattttga |
47433820 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 17 - 291
Target Start/End: Original strand, 29674593 - 29674867
Alignment:
| Q |
17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
29674593 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgtatttttaaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaataat |
29674692 |
T |
 |
| Q |
116 |
cagatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaa |
215 |
Q |
| |
|
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|
| T |
29674693 |
cagatttaaatttatattttctccttcaccatcttagtcttttaactcctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttaaactacacaacccccaa |
29674792 |
T |
 |
| Q |
216 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacatannnnnnncccattttggagcctattttga |
291 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
29674793 |
tattaatccacaaatcatcccattattgccactttaaaaaatacata-tttttccccattttggagcctattttga |
29674867 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 17 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 38457151 - 38456877
Alignment:
| Q |
17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
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|
| T |
38457151 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgtatttttaaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaataat |
38457052 |
T |
 |
| Q |
116 |
cagatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaa |
215 |
Q |
| |
|
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| T |
38457051 |
cagatttaaatttatattttcttcttcaccatcttagtcttttaactcctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttaaactacacaacccccaa |
38456952 |
T |
 |
| Q |
216 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacatannnnnnncccattttggagcctattttga |
291 |
Q |
| |
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|
|
| T |
38456951 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata-atttcccccattttggagcctattttga |
38456877 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 17 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 13265167 - 13264921
Alignment:
| Q |
17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
13265167 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgtatttttaaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaataat |
13265068 |
T |
 |
| Q |
116 |
cagatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaa |
215 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |
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|
| T |
13265067 |
cagatttaaatttatattttctccttcaccatcttagtcttttaactcctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttaaactatacaacccccaa |
13264968 |
T |
 |
| Q |
216 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata |
262 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13264967 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata |
13264921 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 17 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 25227983 - 25227709
Alignment:
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Q |
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25227884 |
T |
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116 |
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215 |
Q |
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| T |
25227883 |
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T |
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291 |
Q |
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| T |
25227783 |
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25227709 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 17 - 262
Target Start/End: Original strand, 45508189 - 45508432
Alignment:
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17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgcattttaaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcatc |
116 |
Q |
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T |
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216 |
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T |
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217 |
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262 |
Q |
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attaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 17 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 10387414 - 10387140
Alignment:
| Q |
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115 |
Q |
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T |
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215 |
Q |
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| T |
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10387215 |
T |
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216 |
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291 |
Q |
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tattaatccacaaatcatctcattattgtcactttaaaaaatacata-tttttccccattttggagcctattttga |
10387140 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 17 - 291
Target Start/End: Original strand, 20898815 - 20899089
Alignment:
| Q |
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115 |
Q |
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T |
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215 |
Q |
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| T |
20898915 |
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20899014 |
T |
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| Q |
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291 |
Q |
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20899015 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 17 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 37276162 - 37275888
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acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
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Q |
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T |
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215 |
Q |
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T |
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| Q |
216 |
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291 |
Q |
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37275962 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 17 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 37613408 - 37613134
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| Q |
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acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
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Q |
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T |
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215 |
Q |
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| T |
37613308 |
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T |
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291 |
Q |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 17 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 46804339 - 46804065
Alignment:
| Q |
17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
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T |
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| Q |
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215 |
Q |
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T |
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216 |
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291 |
Q |
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| T |
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tattaatccataaatcatctcattattgtcactttaaaaaatacata-tttttccccattttggagcctattttga |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 19 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 1024005 - 1023761
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217 |
Q |
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T |
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| T |
1023805 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 17 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 22775976 - 22775730
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acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
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Q |
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22775877 |
T |
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Q |
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22775777 |
T |
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262 |
Q |
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| T |
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tattaatccacaaatcattccattattgtcactttaaaaaatacata |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 17 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 7437121 - 7436848
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Q |
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T |
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Q |
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tattaatccacaaatcatcccattattgtcacttta-aaaatacata-tttttccccattttggagcctattttga |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 17 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 38617754 - 38617517
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Q |
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T |
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tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaa |
253 |
Q |
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38617554 |
tattaatccataaatcatcccattattgtcactttaaa |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 17 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 32832230 - 32831984
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| T |
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T |
 |
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116 |
cagatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaa |
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Q |
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T |
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216 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata |
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| T |
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 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 17 - 262
Target Start/End: Original strand, 37587300 - 37587546
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 |
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cagatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaa |
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| |
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T |
 |
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tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata |
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| |
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| T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 17 - 291
Target Start/End: Original strand, 31435037 - 31435310
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31435037 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgtatttttaaagtaacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaataat |
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31435310 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 17 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 38834083 - 38833810
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115 |
Q |
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215 |
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| T |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 17 - 291
Target Start/End: Original strand, 8383654 - 8383928
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| Q |
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115 |
Q |
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T |
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215 |
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8383853 |
T |
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291 |
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| T |
8383854 |
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8383928 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 17 - 291
Target Start/End: Original strand, 31196326 - 31196599
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| Q |
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115 |
Q |
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| T |
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T |
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| Q |
116 |
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215 |
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| T |
31196426 |
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T |
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31196526 |
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31196599 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 17 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 4632219 - 4631946
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| Q |
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Q |
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| T |
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T |
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| Q |
116 |
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215 |
Q |
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| T |
4632119 |
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4632020 |
T |
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| Q |
216 |
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290 |
Q |
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| T |
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T |
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Back To:
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Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 17 - 291
Target Start/End: Original strand, 42148672 - 42148946
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| Q |
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115 |
Q |
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| T |
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T |
 |
| Q |
116 |
cagatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaa |
215 |
Q |
| |
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| T |
42148772 |
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42148871 |
T |
 |
| Q |
216 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacatannnnnnncccattttggagcctattttga |
291 |
Q |
| |
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| T |
42148872 |
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42148946 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 17 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 17273495 - 17273252
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| Q |
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115 |
Q |
| |
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| T |
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T |
 |
| Q |
116 |
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211 |
Q |
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| T |
17273395 |
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17273296 |
T |
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| Q |
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255 |
Q |
| |
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| T |
17273295 |
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17273252 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 17 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 18054266 - 18053994
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| Q |
17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
18054266 |
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18054168 |
T |
 |
| Q |
116 |
cagatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaa |
215 |
Q |
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| T |
18054167 |
catatttaa-tttatattttctccttcaccatcttagtcttttaactcctccaacttcttcaacaatttgctcaaaccatttaaactacacaacctccaa |
18054069 |
T |
 |
| Q |
216 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacatannnnnnncccattttggagcctattttga |
291 |
Q |
| |
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|
| T |
18054068 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata-tttttccccattttggagcctattttga |
18053994 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 17 - 291
Target Start/End: Original strand, 13242521 - 13242786
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| Q |
17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
13242521 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgtatttttaaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaataat |
13242620 |
T |
 |
| Q |
116 |
cagatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaa |
215 |
Q |
| |
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|
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| T |
13242621 |
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13242711 |
T |
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291 |
Q |
| |
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|
|
| T |
13242712 |
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13242786 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 17 - 262
Target Start/End: Original strand, 42246465 - 42246702
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115 |
Q |
| |
|
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|
| T |
42246465 |
acatcaaaataggggaaaatgtgtatttttaaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaataat |
42246564 |
T |
 |
| Q |
116 |
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215 |
Q |
| |
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| T |
42246565 |
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42246655 |
T |
 |
| Q |
216 |
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262 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42246656 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 17 - 219
Target Start/End: Original strand, 30753239 - 30753442
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Q |
| |
|
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|
| T |
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30753338 |
T |
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116 |
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215 |
Q |
| |
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| T |
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 |
| Q |
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Q |
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|||| |
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| T |
30753439 |
tatt |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 17 - 219
Target Start/End: Original strand, 31675685 - 31675888
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acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
| |
|
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|
| T |
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31675784 |
T |
 |
| Q |
116 |
cagatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaa |
215 |
Q |
| |
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| T |
31675785 |
cagttttaaatttatattttctcctttaccatcttagtcttttaactcctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttaaactacacaacccccaa |
31675884 |
T |
 |
| Q |
216 |
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219 |
Q |
| |
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| T |
31675885 |
tatt |
31675888 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 17 - 219
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acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
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Q |
| |
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||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| || |
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| T |
32074497 |
acatcaaaataaggaaaaatgtgtatttttaaagtgacaataatagttatttctaatagacaaattattatttttaggggtttatagacaaattaataat |
32074398 |
T |
 |
| Q |
116 |
cagatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaa |
215 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| |
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| T |
32074397 |
cagctttaaatttatattttctccttcaccatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccttttaaactacacaacccccaa |
32074298 |
T |
 |
| Q |
216 |
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219 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
32074297 |
tatt |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 17 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 52360124 - 52359921
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acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
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Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| || |
|
|
| T |
52360124 |
acatcaaaataggaaaaaatgtgtatttttaaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttaggggtttatagacaaattaataat |
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T |
 |
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cagatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaa |
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Q |
| |
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||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |
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| T |
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cagttttaaatttatattttctccttctccatcttagtcttttaactcctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttaaactacacaacccccaa |
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T |
 |
| Q |
216 |
tatt |
219 |
Q |
| |
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|||| |
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| T |
52359924 |
tatt |
52359921 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 17 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 13158628 - 13158424
Alignment:
| Q |
17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| || |
|
|
| T |
13158628 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgtatttttaaagtgacaataatggttatttccaatagacaaattattatttttaggggtttatagacaaattaataat |
13158529 |
T |
 |
| Q |
116 |
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214 |
Q |
| |
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|
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| T |
13158528 |
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13158429 |
T |
 |
| Q |
215 |
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219 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
| T |
13158428 |
atatt |
13158424 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 17 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 41115616 - 41115428
Alignment:
| Q |
17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
41115616 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgtatttttaaaatgacaataatggttatttctaatagacagattattatttttagaggtttataaacaaattaataat |
41115517 |
T |
 |
| Q |
116 |
cagatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactac |
204 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
41115516 |
cagatttaaatttattttttctccttcaccatcttagtcttttaactcctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttaaactac |
41115428 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 17 - 219
Target Start/End: Original strand, 44396763 - 44396966
Alignment:
| Q |
17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| || |
|
|
| T |
44396763 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgtatttttaaagtgacaataatggttatttctaataaacaaattattatttttaggggtttatagacaaattaataat |
44396862 |
T |
 |
| Q |
116 |
cagatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaa |
215 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |
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| T |
44396863 |
cagttttaaatttatattttctccttcaccatgttagtcttttaaatcctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttaaactacacaacccccaa |
44396962 |
T |
 |
| Q |
216 |
tatt |
219 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
44396963 |
tatt |
44396966 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 17 - 219
Target Start/End: Original strand, 51000264 - 51000465
Alignment:
| Q |
17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgcattttaaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcatc |
116 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| |
|
|
| T |
51000264 |
acatcgaaatagggaaaa-tgtgtattttaaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagagatttatagacaaattaataatc |
51000362 |
T |
 |
| Q |
117 |
agatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaat |
216 |
Q |
| |
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|| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| |
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| T |
51000363 |
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51000462 |
T |
 |
| Q |
217 |
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219 |
Q |
| |
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||| |
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| T |
51000463 |
att |
51000465 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 17 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 4513946 - 4513765
Alignment:
| Q |
17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
4513946 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgtatttttaaagtgacaataatggttatttctaatagaaaaattattatttttagaggtttataaacaaattaataat |
4513847 |
T |
 |
| Q |
116 |
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197 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4513846 |
caaatttaaatttatattttctccttcaccatcttaatcttttaactcctccaactccttcaacaatttgctcaaaccattt |
4513765 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 17 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 29358189 - 29357987
Alignment:
| Q |
17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| || |
|
|
| T |
29358189 |
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29358090 |
T |
 |
| Q |
116 |
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215 |
Q |
| |
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||| |||||| |||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |
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|
| T |
29358089 |
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29357991 |
T |
 |
| Q |
216 |
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219 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
29357990 |
tatt |
29357987 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 17 - 219
Target Start/End: Original strand, 38787834 - 38788037
Alignment:
| Q |
17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
38787834 |
acatcaaaataggggaaaatgtgtatttttaaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttaagggtttatagacaaattaataat |
38787933 |
T |
 |
| Q |
116 |
cagatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaa |
215 |
Q |
| |
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||| ||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |
|
|
| T |
38787934 |
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38788033 |
T |
 |
| Q |
216 |
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219 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
38788034 |
tatt |
38788037 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 85 - 262
Target Start/End: Original strand, 25859205 - 25859382
Alignment:
| Q |
85 |
atttttagaggtttataaacaaattaatcatcagatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaattt |
184 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25859205 |
atttttagaggtttataaacaaattaataatcatatttaaatttatattttctccttcaccatcttagtcttttaactcctccaactccttcaacaattt |
25859304 |
T |
 |
| Q |
185 |
gctcaaaccatttcaactacacaaccctcaatattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata |
262 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
25859305 |
gctcaaaccatttaaactagacaacccccaatattaatccataaatcatctcattattgtcacttttaaaaatacata |
25859382 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 17 - 219
Target Start/End: Original strand, 36304308 - 36304517
Alignment:
| Q |
17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| || |
|
|
| T |
36304308 |
acatcaaaatagggaaaa-tatgtatttttaaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttaggggtttatagacaaattaataat |
36304406 |
T |
 |
| Q |
116 |
ca-------gatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaa |
208 |
Q |
| |
|
|| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
36304407 |
cactaatcagttttaaatttatattttctccttcaccatcttagtcttttaactcctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttaaactacacaa |
36304506 |
T |
 |
| Q |
209 |
ccctcaatatt |
219 |
Q |
| |
|
||| ||||||| |
|
|
| T |
36304507 |
cccccaatatt |
36304517 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 17 - 219
Target Start/End: Original strand, 49203494 - 49203692
Alignment:
| Q |
17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| | ||||||| | |||||| || |
|
|
| T |
49203494 |
acatcaaaatagagaaaaatgtgtatttttaaagtgacaataatggttatttctaatagactaatt-ttttttttgggggtttat----agattaataat |
49203588 |
T |
 |
| Q |
116 |
cagatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaa |
215 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
49203589 |
cagttttaaatttatattttctcctacaccatcttagtcttttaactcctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttaaactacacaacccccaa |
49203688 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 17 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 42128481 - 42128305
Alignment:
| Q |
17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgcattttaaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcatc |
116 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||| |
|
|
| T |
42128481 |
acatcaaaatagggaaaa-tgtgtatttttaagtgacaataatgattatttctaatagacaaattattatttttaggggtttatagacaaattaataatc |
42128383 |
T |
 |
| Q |
117 |
agatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaacta |
203 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
42128382 |
agttttaaatttatattttctccttcaccatcttaatctttt---------aactccttcaacaatttgttcaaaccatttaaacta |
42128305 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 146 - 262
Target Start/End: Original strand, 20358303 - 20358418
Alignment:
| Q |
146 |
atcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaatattaatccacaaatcatcccattattgtc |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20358303 |
atcttagtcttttaactcctccaactccttcaaca-tttgctcaaaccatttaaactgcacaaccctcaatattaatccacaaatcatcccattattgtc |
20358401 |
T |
 |
| Q |
246 |
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262 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20358402 |
actttaaaaaatacata |
20358418 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 146 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 20561652 - 20561537
Alignment:
| Q |
146 |
atcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaatattaatccacaaatcatcccattattgtc |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20561652 |
atcttagtcttttaactcctccaactccttcaaca-tttgctcaaaccatttaaactgcacaaccctcaatattaatccacaaatcatcccattattgtc |
20561554 |
T |
 |
| Q |
246 |
actttaaaaaatacata |
262 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20561553 |
actttaaaaaatacata |
20561537 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 181 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 20552634 - 20552553
Alignment:
| Q |
181 |
atttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaatattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata |
262 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20552634 |
atttgctcaaaccatttaaactgcacaaccctcaatattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata |
20552553 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 17 - 99
Target Start/End: Original strand, 30751428 - 30751511
Alignment:
| Q |
17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggttta |
99 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
30751428 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgtatttttaaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttaggggttta |
30751511 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 17 - 219
Target Start/End: Original strand, 4213280 - 4213458
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| Q |
17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||| || |
|
|
| T |
4213280 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgtatttttaaagtgacaataatgattatttctaatagacaaattattattttaagtg--------aca--------at |
4213363 |
T |
 |
| Q |
116 |
cagatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaa |
215 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
4213364 |
cagttttaaatttatattttctccttcaccatcttagtctttt---------aactcctccaacaatttgctcaaacaatttaaactacacaacccccaa |
4213454 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 17 - 91
Target Start/End: Original strand, 20358225 - 20358300
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| Q |
17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattattttta |
91 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20358225 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgtatttttaaagtcacaataatggttatttctaatagacaaattattattttta |
20358300 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 17 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 20561730 - 20561655
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| Q |
17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattattttta |
91 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20561730 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgtatttttaaagtcacaataatggttatttctaatagacaaattattattttta |
20561655 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 214 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 31435008 - 31434932
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| Q |
214 |
aatattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacatannnnnnncccattttggagcctattttga |
291 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31435008 |
aatattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata-tttttccccattttggagcctattttga |
31434932 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 218 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 23742170 - 23742098
Alignment:
| Q |
218 |
ttaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacatannnnnnncccattttggagcctattttga |
291 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23742170 |
ttaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata-tttttccccattttggagcctattttga |
23742098 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 217 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 13149870 - 13149827
Alignment:
| Q |
217 |
attaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaataca |
260 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13149870 |
attaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaataca |
13149827 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 217 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 32074025 - 32073982
Alignment:
| Q |
217 |
attaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaataca |
260 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32074025 |
attaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaataca |
32073982 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 217 - 260
Target Start/End: Original strand, 36304786 - 36304829
Alignment:
| Q |
217 |
attaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaataca |
260 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36304786 |
attaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaataca |
36304829 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 217 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 52359654 - 52359611
Alignment:
| Q |
217 |
attaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaataca |
260 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
52359654 |
attaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaataca |
52359611 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 217 - 260
Target Start/End: Original strand, 4213727 - 4213770
Alignment:
| Q |
217 |
attaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaataca |
260 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4213727 |
attaatccacaaatcattccattattgtcactttaaaaaataca |
4213770 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 217 - 260
Target Start/End: Original strand, 38788306 - 38788349
Alignment:
| Q |
217 |
attaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaataca |
260 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38788306 |
attaatccacaaatcattccattattgtcactttaaaaaataca |
38788349 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 217 - 260
Target Start/End: Original strand, 44397237 - 44397280
Alignment:
| Q |
217 |
attaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaataca |
260 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44397237 |
attaatccacaaatcatcacattattgtcactttaaaaaataca |
44397280 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 214 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 23742205 - 23742167
Alignment:
| Q |
214 |
aatattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaa |
252 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23742205 |
aatattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaa |
23742167 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 217 - 255
Target Start/End: Original strand, 31676157 - 31676195
Alignment:
| Q |
217 |
attaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaa |
255 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31676157 |
attaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaa |
31676195 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 217 - 256
Target Start/End: Original strand, 30753711 - 30753750
Alignment:
| Q |
217 |
attaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaa |
256 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30753711 |
attaattcacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaa |
30753750 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 217 - 260
Target Start/End: Original strand, 49203961 - 49204004
Alignment:
| Q |
217 |
attaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaataca |
260 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
49203961 |
attattccacaaatcatcccattactgtcactttaaaaaataca |
49204004 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 218 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 29357717 - 29357680
Alignment:
| Q |
218 |
ttaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaa |
255 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29357717 |
ttaatccacaaatcatctcattattgtcactttaaaaa |
29357680 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 17 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 31676220 - 31676175
Alignment:
| Q |
17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgca-ttttaaagtgacaataatgg |
61 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31676220 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgtatttttaaagtgacaataatgg |
31676175 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 217 - 262
Target Start/End: Original strand, 51000750 - 51000795
Alignment:
| Q |
217 |
attaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata |
262 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
51000750 |
attaatccacaaattatctcattattgccactttaaaaaatacata |
51000795 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 60
Target Start/End: Original strand, 29357655 - 29357699
Alignment:
| Q |
17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgca-ttttaaagtgacaataatg |
60 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29357655 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgtatttttaaagtgacaataatg |
29357699 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5 (Bit Score: 210; Significance: 1e-115; HSPs: 55)
Name: chr5
Description:
Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 17 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 39761146 - 39760872
Alignment:
| Q |
17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
39761146 |
acatcaaaatagggaaaaatatgtatttttaaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaataat |
39761047 |
T |
 |
| Q |
116 |
cagatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaa |
215 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
39761046 |
cagatttaaatttatattttctccttcaccatcttagtcttttaactcctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttaaactacacaacccccaa |
39760947 |
T |
 |
| Q |
216 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacatannnnnnncccattttggagcctattttga |
291 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39760946 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata-ttttcccccattttggagcctattttga |
39760872 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 17 - 262
Target Start/End: Original strand, 459770 - 460016
Alignment:
| Q |
17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
459770 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgtatttttaaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaataat |
459869 |
T |
 |
| Q |
116 |
cagatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaa |
215 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
459870 |
cagatttaaatttatattttctccttcaccatcttagtcttttaactcctccaactccttgaacaatttgctcaaaccatttaaactacacaacccccaa |
459969 |
T |
 |
| Q |
216 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata |
262 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
459970 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata |
460016 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 17 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 12736853 - 12736607
Alignment:
| Q |
17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
12736853 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgtatttttaaagtgacaataatgattatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaataat |
12736754 |
T |
 |
| Q |
116 |
cagatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaa |
215 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
12736753 |
cagatttaaatttatattttctccttcaccatcttagtcttttaactcctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttaaactacacaacccccaa |
12736654 |
T |
 |
| Q |
216 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata |
262 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12736653 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata |
12736607 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 17 - 262
Target Start/End: Original strand, 29373517 - 29373763
Alignment:
| Q |
17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
29373517 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgtatttttaaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaataat |
29373616 |
T |
 |
| Q |
116 |
cagatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaa |
215 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29373617 |
cagatttaaatttatattttttccttcaccatcttagtcttttaactcctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttaaactacacaaccctcaa |
29373716 |
T |
 |
| Q |
216 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata |
262 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29373717 |
tattaatccacaaatcatctcattattgtcactttaaaaaatacata |
29373763 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 17 - 291
Target Start/End: Original strand, 6845243 - 6845517
Alignment:
| Q |
17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
6845243 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgtatttttaaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaataat |
6845342 |
T |
 |
| Q |
116 |
cagatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaa |
215 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
6845343 |
cagatttaaatttatattttctctttcaccatcttagtcttttaactcctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttaaactacacaacccccaa |
6845442 |
T |
 |
| Q |
216 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacatannnnnnncccattttggagcctattttga |
291 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6845443 |
tattaatccacaaatcatcccattattgttactttaaaaaatacata-ttttttcccattttggagcctattttga |
6845517 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 17 - 261
Target Start/End: Original strand, 15180749 - 15180994
Alignment:
| Q |
17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
15180749 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgtatttttaaagtgacaataatggttatttctaatagataaattattatttttagaggtttataaacaaattaataat |
15180848 |
T |
 |
| Q |
116 |
cagatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaa |
215 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
15180849 |
cagatttaaatttatattttctccttcaccatcttagtcttttaactcctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttaaactacacaacccccaa |
15180948 |
T |
 |
| Q |
216 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacat |
261 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15180949 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacat |
15180994 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 17 - 291
Target Start/End: Original strand, 21640202 - 21640476
Alignment:
| Q |
17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
21640202 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgtatttttaaagtgacaataatcgttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaataat |
21640301 |
T |
 |
| Q |
116 |
cagatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaa |
215 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
21640302 |
catatttaaatttatattttctccttcaccatcttagtcttttaactcctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttaaactacacaacccccaa |
21640401 |
T |
 |
| Q |
216 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacatannnnnnncccattttggagcctattttga |
291 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21640402 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata-tttttccccattttggagcctattttga |
21640476 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 17 - 291
Target Start/End: Original strand, 25482145 - 25482419
Alignment:
| Q |
17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
25482145 |
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25482419 |
T |
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Back To:
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Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 17 - 291
Target Start/End: Original strand, 32272660 - 32272933
Alignment:
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Q |
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T |
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Q |
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| T |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 17 - 291
Target Start/End: Original strand, 38483221 - 38483494
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Q |
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T |
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Q |
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291 |
Q |
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38483421 |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 17 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 4844238 - 4843996
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Q |
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T |
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215 |
Q |
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T |
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258 |
Q |
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| T |
4844038 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 17 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 4153001 - 4152727
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17 |
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115 |
Q |
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T |
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215 |
Q |
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T |
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Q |
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T |
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Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 19 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 36811385 - 36811113
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19 |
atcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcatca |
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Q |
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T |
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Q |
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| T |
36811285 |
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36811186 |
T |
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| Q |
218 |
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291 |
Q |
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| T |
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T |
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Back To:
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Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 17 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 6681068 - 6680822
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| Q |
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Q |
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215 |
Q |
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T |
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6680868 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 17 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 18146247 - 18146001
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115 |
Q |
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18146247 |
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T |
 |
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215 |
Q |
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| T |
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18146048 |
T |
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| Q |
216 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata |
262 |
Q |
| |
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| T |
18146047 |
tattaatccacaaatcataccattattgtcactttaaaaaatacata |
18146001 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 17 - 291
Target Start/End: Original strand, 19289418 - 19289693
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| Q |
17 |
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115 |
Q |
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19289517 |
T |
 |
| Q |
116 |
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215 |
Q |
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| T |
19289518 |
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19289617 |
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Q |
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19289693 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 17 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 8160513 - 8160239
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| Q |
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Q |
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T |
 |
| Q |
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215 |
Q |
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| T |
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T |
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291 |
Q |
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| T |
8160313 |
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8160239 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 17 - 291
Target Start/End: Original strand, 9475479 - 9475751
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Q |
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T |
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| Q |
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Q |
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| T |
9475579 |
cagatttaaatttatattttctccttcaccatcttagtcttttaactcctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttaaactacacaacccccaa |
9475678 |
T |
 |
| Q |
216 |
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291 |
Q |
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| T |
9475679 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcacttt-aaaaatacata--ttttccccattttggagcctattttga |
9475751 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 17 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 17526634 - 17526360
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Q |
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T |
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| Q |
116 |
cagatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaa |
215 |
Q |
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| T |
17526534 |
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17526435 |
T |
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216 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacatannnnnnncccattttggagcctattttga |
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Q |
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17526434 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata-tttttccccattttggagcctattttga |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 17 - 291
Target Start/End: Original strand, 25338426 - 25338700
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 |
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cagatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaa |
215 |
Q |
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T |
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216 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacatannnnnnncccattttggagcctattttga |
291 |
Q |
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| T |
25338626 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata-tttttccccattttggagcctattttga |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 17 - 291
Target Start/End: Original strand, 41412095 - 41412369
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41412294 |
T |
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291 |
Q |
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41412295 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata-tttttccccattttggagcctattttga |
41412369 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 18 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 13306903 - 13306631
Alignment:
| Q |
18 |
catcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcatc |
116 |
Q |
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| T |
13306903 |
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13306804 |
T |
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| Q |
117 |
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216 |
Q |
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| T |
13306803 |
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13306704 |
T |
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217 |
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290 |
Q |
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| T |
13306703 |
attaatccacaaatcatctcattattgtcactttaaaaaatacata-tttttccccattttggagcctattttg |
13306631 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 17 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 17587812 - 17587536
Alignment:
| Q |
17 |
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115 |
Q |
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T |
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| Q |
116 |
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215 |
Q |
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| T |
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17587613 |
T |
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291 |
Q |
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| T |
17587612 |
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17587536 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 17 - 291
Target Start/End: Original strand, 2060882 - 2061157
Alignment:
| Q |
17 |
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115 |
Q |
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2060882 |
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T |
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| Q |
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215 |
Q |
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| T |
2060982 |
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2061081 |
T |
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| Q |
216 |
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291 |
Q |
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| T |
2061082 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaaatacata-tttttccccattttggagcctattttga |
2061157 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 17 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 26395966 - 26395720
Alignment:
| Q |
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115 |
Q |
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| T |
26395966 |
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T |
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| Q |
116 |
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215 |
Q |
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| T |
26395866 |
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26395767 |
T |
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| Q |
216 |
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262 |
Q |
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| T |
26395766 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata |
26395720 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 17 - 291
Target Start/End: Original strand, 9772532 - 9772805
Alignment:
| Q |
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115 |
Q |
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T |
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| Q |
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215 |
Q |
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| T |
9772632 |
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9772730 |
T |
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| Q |
216 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacatannnnnnncccattttggagcctattttga |
291 |
Q |
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| T |
9772731 |
tattaatccacaaatcatcacattattgtcattttaaaaaatacata-tttttccccattttggagcctattttga |
9772805 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 17 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 40315444 - 40315170
Alignment:
| Q |
17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
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| T |
40315444 |
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T |
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| Q |
116 |
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215 |
Q |
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| T |
40315344 |
cagatttaaatttatattttctccttcaccatcttagtctttcaactcctccaactctttcaacaatttgctcaaaccatttaaactacacaacctccaa |
40315245 |
T |
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| Q |
216 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacatannnnnnncccattttggagcctattttga |
291 |
Q |
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40315244 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata-tttttccccattttggagcctattttga |
40315170 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 16 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 16869030 - 16868785
Alignment:
| Q |
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gacatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatca |
114 |
Q |
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T |
 |
| Q |
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214 |
Q |
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| T |
16868930 |
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16868831 |
T |
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215 |
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262 |
Q |
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| T |
16868830 |
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16868785 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 17 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 4912367 - 4912122
Alignment:
| Q |
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acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
| |
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| T |
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4912268 |
T |
 |
| Q |
116 |
cagatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaa |
215 |
Q |
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| T |
4912267 |
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4912169 |
T |
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| Q |
216 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata |
262 |
Q |
| |
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| T |
4912168 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata |
4912122 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 17 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 12799676 - 12799431
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| Q |
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acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
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|
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| T |
12799676 |
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12799577 |
T |
 |
| Q |
116 |
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215 |
Q |
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| T |
12799576 |
cagatttaaatttatattttctccttcaccatcttagtcttttaactcctccaacttcttcaacaatttgctcaaaccatttaaactacacaaccc-caa |
12799478 |
T |
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| Q |
216 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata |
262 |
Q |
| |
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| T |
12799477 |
ttttaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata |
12799431 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 17 - 262
Target Start/End: Original strand, 24361266 - 24361512
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| Q |
17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
| |
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|
|
| T |
24361266 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgtatttttaaaatgataataatggttatttctaatagacagattattatttttagaggtttataaacaaattaataat |
24361365 |
T |
 |
| Q |
116 |
cagatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaa |
215 |
Q |
| |
|
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| T |
24361366 |
cagatttaaatttatattttctccttcaccatcttagtcttttaactcctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttaaactacacaacccccaa |
24361465 |
T |
 |
| Q |
216 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata |
262 |
Q |
| |
|
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|
| T |
24361466 |
tattaatctacaaatcatcctattattgtcactttaaaaaatacata |
24361512 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 17 - 291
Target Start/End: Original strand, 42341425 - 42341700
Alignment:
| Q |
17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
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|
| T |
42341425 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgtatttttaaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaataat |
42341524 |
T |
 |
| Q |
116 |
cagatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaa |
215 |
Q |
| |
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| T |
42341525 |
caaatttaaatttatattttctccttcaccatcttagtcttttaactcctccaactccttcacaaatttgctcaaaccatttaaactgcacaacccgcaa |
42341624 |
T |
 |
| Q |
216 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcacttt-aaaaaatacatannnnnnncccattttggagcctattttga |
291 |
Q |
| |
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| T |
42341625 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaaatacata-ttttttcccattttggagcctattttga |
42341700 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 17 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 1829977 - 1829703
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Q |
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1829977 |
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1829878 |
T |
 |
| Q |
116 |
cagatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaa |
215 |
Q |
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| T |
1829877 |
cagatttaaatttatattttctccttcaccatcttagtctttcaactcctccaactctttcaacaatttgctcaaaccatttaaactacacaatctccaa |
1829778 |
T |
 |
| Q |
216 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacatannnnnnncccattttggagcctattttga |
291 |
Q |
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|
| T |
1829777 |
tattaatccacaaatcattccattattgtcactttaaaaaatacata-tttttccccattttggagcctattttga |
1829703 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 17 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 3508628 - 3508354
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Q |
| |
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 |
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cagatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaa |
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Q |
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| T |
3508528 |
caaatttatatttatattttctccttcatcatcttagtcttttaactcctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttaaactacacaacccccaa |
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T |
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tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacatannnnnnncccattttggagcctattttga |
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tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatatata-attttccccattttggagcctattttga |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 17 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 12367063 - 12366791
Alignment:
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17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttta-aagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
12367063 |
acatcaaaatagggaaaa-tgtgtatttttcaagtgacaataatgattatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaataat |
12366965 |
T |
 |
| Q |
116 |
cagatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaa |
215 |
Q |
| |
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|
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| T |
12366964 |
cagatttaaatttatattttctccttcaccatcttagtcttttaactcctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttaaactacacaacccccaa |
12366865 |
T |
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| Q |
216 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacatannnnnnncccattttggagcctattttga |
291 |
Q |
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|
|
| T |
12366864 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcacttta-aaaatacata-tttttccccattttggagcctattttga |
12366791 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 17 - 255
Target Start/End: Original strand, 6166180 - 6166418
Alignment:
| Q |
17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
6166180 |
acatcaaaatagagaaaaatgtgtatttttaaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaataat |
6166279 |
T |
 |
| Q |
116 |
cagatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaa |
215 |
Q |
| |
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|
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| T |
6166280 |
cagatttaaatttatattttctccttcaccatcttagtcttttaactcctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttaaactacacaaccc-caa |
6166378 |
T |
 |
| Q |
216 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaa |
255 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
6166379 |
tattaatccacaaatcatctcattattgtcaccttaaaaa |
6166418 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 17 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 11445637 - 11445362
Alignment:
| Q |
17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
| |
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||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
11445637 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgtatttttaaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaataat |
11445538 |
T |
 |
| Q |
116 |
cagatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaa |
215 |
Q |
| |
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| T |
11445537 |
caaatttatatttatattttctccttcaccatcttagtcttttaactcctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttaaactacacaacccccaa |
11445438 |
T |
 |
| Q |
216 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaa-aaaatacatannnnnnncccattttggagcctattttga |
291 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11445437 |
tattaatccacaaatcatcttattattgttactttaaaaaaatacata-ttttttcccattttggagcctattttga |
11445362 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 17 - 262
Target Start/End: Original strand, 12403860 - 12404106
Alignment:
| Q |
17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
| |
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|
|
| T |
12403860 |
acatcaaaataggaaaaaatgtgtatttttaaagtgataataatagttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattgataat |
12403959 |
T |
 |
| Q |
116 |
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215 |
Q |
| |
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| T |
12403960 |
cagatttaaatttatattttctccttcaccatcttaatcttttaactcctccaactccttcaacaatttgctcaaactatttaaactacacaacccccaa |
12404059 |
T |
 |
| Q |
216 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata |
262 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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| T |
12404060 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata |
12404106 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 17 - 291
Target Start/End: Original strand, 38395681 - 38395949
Alignment:
| Q |
17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
38395681 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgtatttttaaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattgttatttttagaggtttataaacaaattaataat |
38395780 |
T |
 |
| Q |
116 |
cagatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaa |
215 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
38395781 |
cagatttaaatttt------ctccttcaccatcttagtcttttaactcctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttaaactacacaacccccaa |
38395874 |
T |
 |
| Q |
216 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacatannnnnnncccattttggagcctattttga |
291 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
38395875 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata-tttttccccattttggagcctattttga |
38395949 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 17 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 16353878 - 16353632
Alignment:
| Q |
17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
| |
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|
|
| T |
16353878 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgtatttttaaagtgacaataatggctatttctaatagacaaattattatttttagagatttataaacaaattaataat |
16353779 |
T |
 |
| Q |
116 |
cagatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaa |
215 |
Q |
| |
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| T |
16353778 |
cagatttaaatttatattttctccttcaccatcttagtcttttaactcctccaagttcttcaacaatttgctcgaaccatttaaactacacaacccctaa |
16353679 |
T |
 |
| Q |
216 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata |
262 |
Q |
| |
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||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
16353678 |
tattaatccactaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata |
16353632 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 17 - 262
Target Start/End: Original strand, 24324642 - 24324887
Alignment:
| Q |
17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
24324642 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgtatttttaaaatgataataatggttatttctaatagacagattattatttttagaggtttataaacaaattaataat |
24324741 |
T |
 |
| Q |
116 |
cagatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaa |
215 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
24324742 |
cagatttaaatttatattttctccttcaccatcttagtcttttaactcctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttaaactacacaacccccaa |
24324841 |
T |
 |
| Q |
216 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata |
262 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |
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|
| T |
24324842 |
tattaatctacaaatcatcctattattgtcac-ttaaaaaatacata |
24324887 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 17 - 262
Target Start/End: Original strand, 17086106 - 17086352
Alignment:
| Q |
17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
17086106 |
acattaaaatagggaaaaatgtgtatttttaaagtgacaataatgattatttctaatagacaaattcttatttttagaggtttataaacaaattaataat |
17086205 |
T |
 |
| Q |
116 |
cagatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaa |
215 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
17086206 |
cagatttaaatttatattttctccttcaccatcttactcttttaactcttccaactcattcaacaatttgctcaaatcatttaaactacacaacccccaa |
17086305 |
T |
 |
| Q |
216 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata |
262 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
17086306 |
tattaatccacaaatcatctcattattgtcacttaaaaaaatacata |
17086352 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 17 - 262
Target Start/End: Original strand, 40195529 - 40195766
Alignment:
| Q |
17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
40195529 |
acatcaaaataggaaaaaatgtgtatttttaaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaataat |
40195628 |
T |
 |
| Q |
116 |
cagatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaa |
215 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
40195629 |
cagatttaaatttatattttctccttcaccatcttagtctttt---------aactccttcaacaatttgctcaaaccatttaaactacacaacccccaa |
40195719 |
T |
 |
| Q |
216 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata |
262 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40195720 |
tattaatccacatatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata |
40195766 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 17 - 291
Target Start/End: Original strand, 7482534 - 7482798
Alignment:
| Q |
17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
7482534 |
acatcaaaataggaaaaaatgtgtatttttaaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaataat |
7482633 |
T |
 |
| Q |
116 |
cagatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaa |
215 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
7482634 |
cagatttaaatttatattttctccttcaccatcttagtctttt---------aactccttcaacaatttgctcaaaccatttaaactacacaacccccaa |
7482724 |
T |
 |
| Q |
216 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacatannnnnnncccattttggagcctattttga |
291 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7482725 |
tattaatccacaaatcatctcattattgtcacttt-aaaaatacata-tttttccccattttggagcctattttga |
7482798 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 42 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 8407936 - 8407712
Alignment:
| Q |
42 |
ttttaaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcatcagatttaaatttatatttcctcctt |
141 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
8407936 |
tttttaagtgacaataatgattatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaataaattaataatcagatttaaatttatattttctcctt |
8407837 |
T |
 |
| Q |
142 |
cactatc----ttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaatattaatccacaaatcatccca |
237 |
Q |
| |
|
||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| || |
|
|
| T |
8407836 |
caccatcgatcttagtcttttaactcctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttaaactacacaacccccaatattaatccagaaatcatcaca |
8407737 |
T |
 |
| Q |
238 |
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262 |
Q |
| |
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|
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| T |
8407736 |
ttattgtcactttaaaaaatacata |
8407712 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 82 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 38465611 - 38465402
Alignment:
| Q |
82 |
attatttttagaggtttataaacaaattaatcatcagatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaa |
181 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38465611 |
attatttttagaggtttataaacaaattaataatcagatttaaatttatattttctccttcaccatcttagtcttttaactcctccaactccttcaacaa |
38465512 |
T |
 |
| Q |
182 |
tttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaatattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacatannnnnnncccattttggag |
281 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
38465511 |
tttgctcaaatcatttaaactacacaacccccaatattaatgcacaaatcatctcattattgtcactttaaaaaatacatatgtttttcccattttggag |
38465412 |
T |
 |
| Q |
282 |
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291 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
38465411 |
cctattttga |
38465402 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 17 - 219
Target Start/End: Original strand, 6864631 - 6864834
Alignment:
| Q |
17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| || |
|
|
| T |
6864631 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgtatttttaaagtgacagtaatggttatttctaatagacaaattattatttttaagggtttatagacaaattaataat |
6864730 |
T |
 |
| Q |
116 |
cagatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaa |
215 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |
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|
| T |
6864731 |
cagttttaaatttatattttctccttcaccatcttagtcttttaactcctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttaaactacacaacccccaa |
6864830 |
T |
 |
| Q |
216 |
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219 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
6864831 |
tatt |
6864834 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 17 - 219
Target Start/End: Original strand, 4104225 - 4104427
Alignment:
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17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| || |
|
|
| T |
4104225 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgtatttttaaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttaggggtttatagacaaattaataat |
4104324 |
T |
 |
| Q |
116 |
cagatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaa |
215 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
4104325 |
cagttttaaatttatattttctccttcaccat-ttagtcttttaactcctccaattccttcaacaatttgctcaaaccatttaaactacacaacccccaa |
4104423 |
T |
 |
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216 |
tatt |
219 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
4104424 |
tatt |
4104427 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 94 - 291
Target Start/End: Original strand, 38143645 - 38143841
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| Q |
94 |
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193 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38143645 |
ggtttataaacaaattaataatcagatttaaatttatattttctccttcaccatcttagtcttttaactcctccaactctttcaacaatttgctcaaacc |
38143744 |
T |
 |
| Q |
194 |
atttcaactacacaaccctcaatattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacatannnnnnncccattttggagcctattttga |
291 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38143745 |
atttaaactacacaacccccaatattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaacaatacata-tttttccccattttggagcctattttga |
38143841 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 17 - 162
Target Start/End: Original strand, 42438054 - 42438200
Alignment:
| Q |
17 |
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115 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
42438054 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgtattgttaaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaataat |
42438153 |
T |
 |
| Q |
116 |
cagatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaact |
162 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42438154 |
cagatttaaatttatattttctccttcaccatcttagtcttttaact |
42438200 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 119 - 291
Target Start/End: Original strand, 42438204 - 42438365
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| Q |
119 |
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218 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
42438204 |
atttaaatttatattttctccttcaccatcttagtcttttaact---------ccttcaacaatttgctcaaaccatttaaactacacaacgcccaatat |
42438294 |
T |
 |
| Q |
219 |
taatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacatannnnnnncccattttggagcctattttga |
291 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42438295 |
taatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata--ttttccccattttggagcctattttga |
42438365 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 217 - 261
Target Start/End: Original strand, 6865103 - 6865147
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| Q |
217 |
attaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacat |
261 |
Q |
| |
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||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6865103 |
attaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacat |
6865147 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 217 - 256
Target Start/End: Original strand, 4104696 - 4104735
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| Q |
217 |
attaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaa |
256 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4104696 |
attaatccacaaatcatctcattattgtcactttaaaaaa |
4104735 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 219 - 262
Target Start/End: Original strand, 17086397 - 17086440
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| Q |
219 |
taatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata |
262 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
17086397 |
taatccacaaatcatctcattattgtcacttaaaaaaatacata |
17086440 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 217 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 7978808 - 7978763
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| Q |
217 |
attaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata |
262 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7978808 |
attaatccataaatcatctcattattttcactttaaaaaatacata |
7978763 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0022 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:
Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 17 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 121205 - 120959
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| Q |
17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
121205 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgtatttttaaagtgacaataatggttatttctaatagaaaaattattatttttagaggtttataaacaaattaataat |
121106 |
T |
 |
| Q |
116 |
cagatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaa |
215 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
121105 |
cagatttaaatttatattttctccttcaccatcttagtcttttaactcctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttaaactacacaacccccaa |
121006 |
T |
 |
| Q |
216 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata |
262 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
121005 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata |
120959 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0060 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 1)
Name: scaffold0060
Description:
Target: scaffold0060; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 17 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 7658 - 7419
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| Q |
17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
7658 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgtatttttaaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaataat |
7559 |
T |
 |
| Q |
116 |
cagatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaa |
215 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
7558 |
caaatttaaatttatattttctccttcaccatcttagtcttttaactcctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttaaactacacaacccccaa |
7459 |
T |
 |
| Q |
216 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaa |
255 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7458 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaa |
7419 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0057 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:
Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 17 - 254
Target Start/End: Original strand, 77252 - 77490
Alignment:
| Q |
17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
77252 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgtatttttaaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaataat |
77351 |
T |
 |
| Q |
116 |
cagatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaa |
215 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
77352 |
cagatttaaatttatattttctccttcaccatcttagtcttttaactcctccaattccttcaacaatttgctcataccatttaaactacacaacccccaa |
77451 |
T |
 |
| Q |
216 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaa |
254 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
77452 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaa |
77490 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0343 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold0343
Description:
Target: scaffold0343; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 17 - 291
Target Start/End: Original strand, 10427 - 10701
Alignment:
| Q |
17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
10427 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgtatttttaaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaataat |
10526 |
T |
 |
| Q |
116 |
cagatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaa |
215 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| || || ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
10527 |
cagatttaaatttatattttctactacaccatcttagtcttttaactcctccaactccttcaactatttgctcaaactatttaaactacacaacccccaa |
10626 |
T |
 |
| Q |
216 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacatannnnnnncccattttggagcctattttga |
291 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10627 |
tattaatccacaaatcatcctattattgtcactttaaaaaatacata-ttttcccccattttggagcctattttga |
10701 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0001 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:
Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 17 - 291
Target Start/End: Original strand, 187495 - 187768
Alignment:
| Q |
17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgcat-tttaaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
187495 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgtatgtttaaagggacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatatt |
187594 |
T |
 |
| Q |
116 |
cagatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaa |
215 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
187595 |
caaatttaaatttatattttctccttcaccatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaattttctcaaaccatttaaactacacaacccccaa |
187694 |
T |
 |
| Q |
216 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacatannnnnnncccattttggagcctattttga |
291 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
187695 |
tattaatccacaaatcatatcattattgtcactttaaaaaatacata--tttttcccattttggagcctattttga |
187768 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0007 (Bit Score: 191; Significance: 1e-104; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:
Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 17 - 262
Target Start/End: Original strand, 41446 - 41692
Alignment:
| Q |
17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
41446 |
acatcaaaatagggaaaactgtatatttttaaagtgacaataatggttatttataatcgacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaataat |
41545 |
T |
 |
| Q |
116 |
cagatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaa |
215 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
41546 |
cagatttaaatttataatttctccttcaccatcttagtcttttaactcctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttaaactacacaacccccaa |
41645 |
T |
 |
| Q |
216 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata |
262 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41646 |
tattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata |
41692 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0041 (Bit Score: 184; Significance: 1e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0041
Description:
Target: scaffold0041; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 17 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 7990 - 7745
Alignment:
| Q |
17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
7990 |
acatcaaaatagggaaaa-tgtgtatttttaaaatgacaataatggt-atttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaataat |
7893 |
T |
 |
| Q |
116 |
cagatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctcc-aactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctca |
214 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |
|
|
| T |
7892 |
cagatttaaatttatattttctccttcaccatcttagtcttttaactcctcccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttaaactacacaaccccca |
7793 |
T |
 |
| Q |
215 |
atattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata |
262 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7792 |
atattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata |
7745 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0095 (Bit Score: 176; Significance: 7e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0095
Description:
Target: scaffold0095; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 17 - 262
Target Start/End: Original strand, 52515 - 52762
Alignment:
| Q |
17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| || |
|
|
| T |
52515 |
acatcaaaatagagaaaaatgtgtatttttaaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttaaaggtttataaacaaactaataat |
52614 |
T |
 |
| Q |
116 |
cagatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaa |
215 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||| |
|
|
| T |
52615 |
cagatttaaatttatattttctccttcaccatcttagtcttttaactcctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttacactacacaaaccccaa |
52714 |
T |
 |
| Q |
216 |
tattaatccacaaatcatcccat-tattgtcactttaaaaaatacata |
262 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
52715 |
tattaatccacaaatcatcccatccattgtcactttacaaaatacata |
52762 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0572 (Bit Score: 151; Significance: 6e-80; HSPs: 2)
Name: scaffold0572
Description:
Target: scaffold0572; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 17 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 1522 - 1317
Alignment:
| Q |
17 |
acatcaaaataggg-aaaaatgtgcatttt--aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatc |
113 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
1522 |
acatcaaaataggggaaaaatgtgtattttttaaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttgtaaacaaattaata |
1423 |
T |
 |
| Q |
114 |
atcagatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctc |
213 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | |
|
|
| T |
1422 |
atcagatttaaatttatattttctccttcaccatcttagtcttttaactcctccaactccttcaacaatttgttcaaaccatttaaactacacaaccccc |
1323 |
T |
 |
| Q |
214 |
aatatt |
219 |
Q |
| |
|
|||||| |
|
|
| T |
1322 |
aatatt |
1317 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0572; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 217 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 1048 - 1005
Alignment:
| Q |
217 |
attaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaataca |
260 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1048 |
attaatccacaaatcataccattattgtcactttaaaaaataca |
1005 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0498 (Bit Score: 143; Significance: 4e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0498
Description:
Target: scaffold0498; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 62 - 291
Target Start/End: Original strand, 10911 - 11143
Alignment:
| Q |
62 |
ttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcatcagatttaaatttatatttcctccttcactatc----ttagtcttt |
157 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
10911 |
ttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaataaattaataatcagatttaaatttatattttctccttcaccatcgatcttagtcttt |
11010 |
T |
 |
| Q |
158 |
taacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaatattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaat |
257 |
Q |
| |
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|
|
| T |
11011 |
taactcctccaactccttcaataatttgcttaaaccatttaaactacacaacccctaatattaatccagaaatcatcacattattgtcactttaaaaaat |
11110 |
T |
 |
| Q |
258 |
acatannnnnnncccattttggagcctattttga |
291 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11111 |
acata-tttttccccattttggagcctattttga |
11143 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0006 (Bit Score: 128; Significance: 3e-66; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:
Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 17 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 43200 - 42997
Alignment:
| Q |
17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgcattttaaa-gtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaattaatcat |
115 |
Q |
| |
|
|||| ||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| | |
|
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| T |
43200 |
acattaaaatagagaaaaatgtgtatttttaacgtgacaataatgattatttctaatagacaaattattatttttaggggtttatggacaaattaataac |
43101 |
T |
 |
| Q |
116 |
cagatttaaatttatatttcctccttcactatcttagtcttttaacttctccaactccttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaa |
215 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| |
|
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| T |
43100 |
cagttttaaatttatattttctccttcaccatcttagtcttttaactcctccaactccttcaacaatttactcaaaccatttaaactacacaacccccaa |
43001 |
T |
 |
| Q |
216 |
tatt |
219 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
43000 |
tatt |
42997 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 217 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 42729 - 42686
Alignment:
| Q |
217 |
attaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaataca |
260 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42729 |
attaatccacaaatcatctcattattctcactttaaaaaataca |
42686 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0320 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0320
Description:
Target: scaffold0320; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 173 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 15955 - 15838
Alignment:
| Q |
173 |
cttcaacaatttgctcaaaccatttcaactacacaaccctcaatattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacatannnnnnnccc |
272 |
Q |
| |
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| T |
15955 |
cttcaacaatttgctcaaaccatttaaactacacaacccccaatattaatccacaaatcatcccattattgtcactttaaaaaatacata-tttttcccc |
15857 |
T |
 |
| Q |
273 |
attttggagcctattttga |
291 |
Q |
| |
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| T |
15856 |
attttggagcctattttga |
15838 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0287 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0287
Description:
Target: scaffold0287; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 17 - 108
Target Start/End: Original strand, 17573 - 17664
Alignment:
| Q |
17 |
acatcaaaatagggaaaaatgtgcatttt-aaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaat |
108 |
Q |
| |
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| T |
17573 |
acatcaaaatagg-aaaaatgtgtatttttaaagtgacaataatggttatttctaatagacaaattattatttttagaggtttataaacaaat |
17664 |
T |
 |
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