View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF9812_high_4 (Length: 523)

Name: NF9812_high_4
Description: NF9812
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF9812_high_4
NF9812_high_4
[»] chr3 (79 HSPs)
chr3 (252-511)||(6603664-6603923)
chr3 (252-511)||(6596984-6597243)
chr3 (249-511)||(5421872-5422134)
chr3 (252-511)||(16753643-16753902)
chr3 (252-511)||(53381961-53382219)
chr3 (252-511)||(16638702-16638961)
chr3 (252-511)||(43165604-43165863)
chr3 (252-511)||(48428376-48428635)
chr3 (1-455)||(16825263-16825722)
chr3 (252-511)||(12889638-12889897)
chr3 (252-511)||(13255619-13255878)
chr3 (255-511)||(10008532-10008788)
chr3 (255-511)||(20058996-20059252)
chr3 (1-451)||(14290520-14290973)
chr3 (1-451)||(35982869-35983322)
chr3 (255-511)||(10909142-10909398)
chr3 (255-511)||(15345187-15345443)
chr3 (255-511)||(15712998-15713254)
chr3 (252-511)||(3688872-3689131)
chr3 (252-511)||(26790355-26790614)
chr3 (252-511)||(15586334-15586593)
chr3 (255-511)||(5110351-5110607)
chr3 (246-511)||(15399460-15399725)
chr3 (263-511)||(15358992-15359240)
chr3 (1-511)||(10408656-10409169)
chr3 (246-511)||(24186113-24186378)
chr3 (1-463)||(28757007-28757472)
chr3 (1-454)||(31692170-31692626)
chr3 (1-391)||(12357575-12357968)
chr3 (1-463)||(16326683-16327150)
chr3 (1-463)||(47126632-47127097)
chr3 (1-454)||(31941591-31942047)
chr3 (1-388)||(18131398-18131788)
chr3 (1-454)||(12857481-12857936)
chr3 (1-292)||(17494335-17494625)
chr3 (1-447)||(11958173-11958622)
chr3 (1-453)||(12181032-12181487)
chr3 (242-477)||(16803920-16804158)
chr3 (242-477)||(11861272-11861510)
chr3 (1-260)||(11949107-11949366)
chr3 (1-448)||(16831519-16831969)
chr3 (242-477)||(12501852-12502090)
chr3 (242-511)||(16695083-16695355)
chr3 (1-274)||(17189062-17189335)
chr3 (242-511)||(23414729-23415001)
chr3 (1-454)||(15230291-15230747)
chr3 (1-454)||(15236159-15236615)
chr3 (242-448)||(17497610-17497819)
chr3 (242-463)||(15065990-15066214)
chr3 (242-463)||(23079004-23079228)
chr3 (1-274)||(24189992-24190265)
chr3 (242-448)||(14578423-14578632)
chr3 (86-453)||(16384358-16384728)
chr3 (242-463)||(14873572-14873796)
chr3 (1-297)||(13944712-13945008)
chr3 (242-448)||(12843105-12843314)
chr3 (1-297)||(8744535-8744831)
chr3 (1-142)||(10417345-10417486)
chr3 (1-112)||(13317864-13317975)
chr3 (1-58)||(12509867-12509924)
chr3 (66-172)||(2247124-2247230)
chr3 (1-91)||(16378285-16378375)
chr3 (106-297)||(2037057-2037248)
chr3 (106-297)||(2040798-2040989)
chr3 (106-297)||(14039539-14039730)
chr3 (5-96)||(15013115-15013206)
chr3 (249-442)||(19727686-19727881)
chr3 (359-448)||(13028348-13028437)
chr3 (348-445)||(15262658-15262755)
chr3 (345-454)||(17189409-17189518)
chr3 (243-297)||(15008729-15008783)
chr3 (450-511)||(5108481-5108542)
chr3 (345-454)||(24190339-24190447)
chr3 (138-274)||(13317737-13317873)
chr3 (411-455)||(17494751-17494795)
chr3 (354-453)||(13945068-13945167)
chr3 (417-511)||(2036840-2036934)
chr3 (417-511)||(2040581-2040675)
chr3 (413-511)||(14039849-14039947)
[»] chr2 (45 HSPs)
chr2 (247-511)||(44382813-44383077)
chr2 (252-511)||(9338523-9338782)
chr2 (252-511)||(9487157-9487416)
chr2 (252-511)||(16984181-16984440)
chr2 (255-511)||(24265314-24265570)
chr2 (252-511)||(17001941-17002200)
chr2 (252-511)||(27374210-27374469)
chr2 (255-511)||(10871794-10872050)
chr2 (255-511)||(22322585-22322841)
chr2 (255-511)||(24712978-24713234)
chr2 (246-511)||(24873993-24874258)
chr2 (1-511)||(20848279-20848789)
chr2 (1-455)||(23274283-23274740)
chr2 (1-274)||(19716497-19716770)
chr2 (1-274)||(19721060-19721333)
chr2 (242-511)||(23116299-23116571)
chr2 (242-475)||(24704758-24704994)
chr2 (354-454)||(16931598-16931698)
chr2 (1-297)||(23097475-23097771)
chr2 (242-511)||(24656898-24657170)
chr2 (242-463)||(24678418-24678642)
chr2 (242-454)||(22462778-22462993)
chr2 (242-448)||(22733077-22733286)
chr2 (242-448)||(23039880-23040089)
chr2 (242-463)||(23028750-23028973)
chr2 (242-436)||(22742281-22742478)
chr2 (1-297)||(12577043-12577339)
chr2 (246-343)||(21139392-21139489)
chr2 (242-442)||(21320312-21320515)
chr2 (242-448)||(23105030-23105239)
chr2 (69-297)||(28350633-28350861)
chr2 (296-448)||(20320968-20321120)
chr2 (1-181)||(23113413-23113592)
chr2 (362-448)||(23029815-23029901)
chr2 (242-331)||(23205245-23205337)
chr2 (242-331)||(23676849-23676941)
chr2 (242-297)||(11351168-11351223)
chr2 (243-292)||(21901469-21901518)
chr2 (5-88)||(19817541-19817624)
chr2 (345-391)||(19716377-19716423)
chr2 (345-391)||(19720940-19720986)
chr2 (106-207)||(24705029-24705130)
chr2 (252-331)||(23065354-23065436)
chr2 (252-331)||(23074804-23074886)
chr2 (338-382)||(23097387-23097430)
[»] chr7 (50 HSPs)
chr7 (252-511)||(10873760-10874019)
chr7 (1-455)||(12798247-12798701)
chr7 (255-511)||(13689343-13689599)
chr7 (255-511)||(15157769-15158025)
chr7 (252-511)||(14335695-14335954)
chr7 (252-511)||(18586883-18587142)
chr7 (252-511)||(44788063-44788322)
chr7 (1-454)||(19150060-19150516)
chr7 (1-454)||(20749459-20749915)
chr7 (255-511)||(8710907-8711163)
chr7 (1-454)||(14260990-14261446)
chr7 (257-511)||(18181047-18181300)
chr7 (255-511)||(11233925-11234181)
chr7 (1-283)||(15099521-15099803)
chr7 (246-511)||(11549814-11550079)
chr7 (246-511)||(12690794-12691059)
chr7 (1-463)||(26091533-26091998)
chr7 (246-511)||(14957801-14958066)
chr7 (1-512)||(13965354-13965868)
chr7 (1-463)||(26115325-26115790)
chr7 (1-463)||(40924552-40925017)
chr7 (1-455)||(13024394-13024850)
chr7 (1-463)||(21755461-21755926)
chr7 (1-508)||(12459677-12460187)
chr7 (1-445)||(49155350-49155797)
chr7 (1-454)||(16947216-16947672)
chr7 (1-387)||(13676500-13676889)
chr7 (242-477)||(11984281-11984519)
chr7 (1-455)||(11385172-11385629)
chr7 (242-505)||(9591653-9591919)
chr7 (1-454)||(12203544-12204000)
chr7 (1-274)||(14283301-14283574)
chr7 (242-511)||(17703164-17703436)
chr7 (242-511)||(16726150-16726422)
chr7 (1-193)||(14140728-14140920)
chr7 (242-448)||(15145695-15145904)
chr7 (1-297)||(18050857-18051153)
chr7 (242-448)||(14042984-14043193)
chr7 (242-448)||(14353014-14353223)
chr7 (345-448)||(14145057-14145160)
chr7 (349-454)||(12712407-12712512)
chr7 (349-454)||(13004865-13004970)
chr7 (1-88)||(15343480-15343567)
chr7 (5-158)||(15627576-15627729)
chr7 (348-448)||(14283124-14283224)
chr7 (17-292)||(12712572-12712847)
chr7 (348-447)||(15627922-15628021)
chr7 (106-166)||(15114355-15114415)
chr7 (345-394)||(15099407-15099456)
chr7 (357-453)||(18050698-18050794)
[»] scaffold0102 (2 HSPs)
scaffold0102 (1-466)||(42786-43254)
scaffold0102 (242-448)||(50111-50320)
[»] chr5 (57 HSPs)
chr5 (252-511)||(16359744-16360003)
chr5 (252-511)||(34569736-34569995)
chr5 (252-511)||(40712022-40712281)
chr5 (255-511)||(22329772-22330028)
chr5 (255-511)||(14996624-14996880)
chr5 (255-511)||(19773205-19773461)
chr5 (255-511)||(27521651-27521907)
chr5 (255-511)||(27682285-27682541)
chr5 (246-511)||(29472958-29473223)
chr5 (255-511)||(41774087-41774343)
chr5 (246-511)||(22351155-22351420)
chr5 (255-511)||(37288381-37288637)
chr5 (284-511)||(27665388-27665615)
chr5 (246-511)||(27613592-27613857)
chr5 (1-455)||(23077843-23078300)
chr5 (246-511)||(22137904-22138169)
chr5 (1-511)||(20345255-20345768)
chr5 (4-289)||(23563275-23563560)
chr5 (1-463)||(22505652-22506117)
chr5 (1-511)||(25851045-25851558)
chr5 (1-511)||(14883873-14884386)
chr5 (243-477)||(20803830-20804067)
chr5 (242-511)||(18782346-18782618)
chr5 (242-442)||(23461203-23461406)
chr5 (296-511)||(23537097-23537312)
chr5 (242-448)||(25429652-25429861)
chr5 (1-297)||(21561124-21561420)
chr5 (242-451)||(21883007-21883221)
chr5 (5-274)||(21983299-21983568)
chr5 (242-463)||(23526283-23526507)
chr5 (236-454)||(21870217-21870438)
chr5 (236-454)||(21874497-21874718)
chr5 (1-297)||(17266433-17266729)
chr5 (1-145)||(20824426-20824570)
chr5 (69-181)||(43122508-43122620)
chr5 (348-448)||(21331934-21332034)
chr5 (242-445)||(21631347-21631553)
chr5 (1-158)||(21631637-21631794)
chr5 (348-441)||(23474535-23474628)
chr5 (1-58)||(20778886-20778943)
chr5 (1-55)||(22464923-22464977)
chr5 (1-58)||(28892280-28892337)
chr5 (342-442)||(26735679-26735779)
chr5 (106-297)||(16258135-16258326)
chr5 (106-297)||(22591854-22592045)
chr5 (106-297)||(22595409-22595600)
chr5 (345-453)||(17266274-17266382)
chr5 (5-93)||(21410129-21410217)
chr5 (105-168)||(21882869-21882932)
chr5 (243-274)||(23669847-23669878)
chr5 (417-511)||(16257918-16258012)
chr5 (417-511)||(22591637-22591731)
chr5 (417-511)||(22595192-22595286)
chr5 (242-292)||(23474426-23474476)
chr5 (342-455)||(20779230-20779343)
chr5 (338-455)||(21560963-21561080)
chr5 (339-455)||(21983115-21983231)
[»] chr4 (44 HSPs)
chr4 (252-511)||(17091592-17091851)
chr4 (252-511)||(8389722-8389981)
chr4 (255-511)||(14300422-14300678)
chr4 (252-511)||(19775236-19775495)
chr4 (252-511)||(23959057-23959316)
chr4 (1-394)||(14993184-14993580)
chr4 (252-511)||(12479910-12480169)
chr4 (252-511)||(27714646-27714905)
chr4 (252-511)||(8050066-8050325)
chr4 (252-511)||(16233435-16233694)
chr4 (246-511)||(19635440-19635705)
chr4 (255-511)||(40476353-40476609)
chr4 (1-430)||(20893090-20893522)
chr4 (255-511)||(14683880-14684136)
chr4 (1-463)||(3261542-3262007)
chr4 (1-454)||(15073418-15073874)
chr4 (1-454)||(15266835-15267291)
chr4 (1-511)||(7357326-7357839)
chr4 (1-463)||(44658614-44659079)
chr4 (1-463)||(11203980-11204445)
chr4 (1-404)||(29450344-29450750)
chr4 (1-454)||(16150695-16151151)
chr4 (1-454)||(16154841-16155297)
chr4 (242-505)||(13513650-13513916)
chr4 (242-477)||(16248150-16248388)
chr4 (242-511)||(18604259-18604531)
chr4 (130-448)||(18259629-18259950)
chr4 (242-476)||(18223948-18224185)
chr4 (296-477)||(16350216-16350397)
chr4 (242-442)||(8336-8539)
chr4 (1-297)||(51603709-51604005)
chr4 (1-297)||(53750387-53750683)
chr4 (247-442)||(15545-15743)
chr4 (1-274)||(27903444-27903717)
chr4 (348-436)||(14697510-14697598)
chr4 (348-448)||(15144451-15144551)
chr4 (242-448)||(14162770-14162979)
chr4 (4-56)||(15354234-15354286)
chr4 (106-297)||(8708841-8709032)
chr4 (348-455)||(16219597-16219704)
chr4 (348-455)||(16222917-16223024)
chr4 (341-451)||(13879511-13879621)
chr4 (106-168)||(15144678-15144740)
chr4 (107-168)||(13879274-13879335)
[»] scaffold0309 (2 HSPs)
scaffold0309 (1-267)||(12815-13081)
scaffold0309 (324-448)||(19812-19936)
[»] scaffold0108 (1 HSPs)
scaffold0108 (1-455)||(50193-50650)
[»] scaffold0046 (1 HSPs)
scaffold0046 (1-455)||(70196-70653)
[»] chr6 (46 HSPs)
chr6 (252-511)||(29589287-29589546)
chr6 (252-511)||(16575064-16575323)
chr6 (252-511)||(16620057-16620316)
chr6 (252-511)||(28312804-28313063)
chr6 (252-511)||(28260045-28260304)
chr6 (252-511)||(28285612-28285871)
chr6 (252-511)||(28338794-28339053)
chr6 (252-511)||(27205796-27206055)
chr6 (252-511)||(27243173-27243432)
chr6 (255-511)||(2871650-2871906)
chr6 (252-511)||(24292630-24292889)
chr6 (246-511)||(22829234-22829499)
chr6 (246-479)||(25115720-25115954)
chr6 (1-463)||(14376809-14377274)
chr6 (1-463)||(24367323-24367788)
chr6 (242-511)||(5836076-5836345)
chr6 (1-508)||(10465696-10466206)
chr6 (1-455)||(19437925-19438382)
chr6 (1-455)||(19455946-19456403)
chr6 (1-455)||(19466091-19466548)
chr6 (1-292)||(21474523-21474814)
chr6 (1-391)||(25770767-25771160)
chr6 (1-394)||(24515376-24515772)
chr6 (242-477)||(21764976-21765214)
chr6 (1-274)||(18797613-18797886)
chr6 (242-457)||(22437033-22437251)
chr6 (4-292)||(19486361-19486649)
chr6 (1-455)||(21566892-21567349)
chr6 (1-297)||(34642648-34642944)
chr6 (242-477)||(27558848-27559086)
chr6 (244-476)||(25756495-25756730)
chr6 (1-133)||(15462259-15462391)
chr6 (298-448)||(19867879-19868029)
chr6 (242-442)||(23081587-23081790)
chr6 (1-158)||(30678225-30678382)
chr6 (348-442)||(18182302-18182396)
chr6 (242-331)||(18404969-18405061)
chr6 (348-445)||(18660192-18660289)
chr6 (106-297)||(16813668-16813859)
chr6 (243-292)||(8720772-8720821)
chr6 (349-454)||(19881670-19881775)
chr6 (349-454)||(34642487-34642592)
chr6 (338-394)||(18797954-18798009)
chr6 (413-454)||(8720607-8720648)
chr6 (339-451)||(19486199-19486311)
chr6 (348-448)||(30677932-30678032)
[»] scaffold0751 (2 HSPs)
scaffold0751 (1-289)||(5269-5557)
scaffold0751 (345-392)||(5615-5662)
[»] chr1 (41 HSPs)
chr1 (5-292)||(21739030-21739317)
chr1 (1-454)||(21742381-21742837)
chr1 (255-511)||(33387804-33388060)
chr1 (255-511)||(21833630-21833886)
chr1 (1-466)||(22015562-22016030)
chr1 (252-511)||(16347369-16347629)
chr1 (255-511)||(51330267-51330523)
chr1 (252-511)||(41350444-41350702)
chr1 (246-511)||(21842531-21842796)
chr1 (1-463)||(48425978-48426443)
chr1 (246-511)||(22400639-22400904)
chr1 (4-430)||(21961135-21961564)
chr1 (1-463)||(20074529-20074994)
chr1 (1-391)||(24096507-24096900)
chr1 (1-463)||(52988846-52989310)
chr1 (1-463)||(37680154-37680619)
chr1 (1-463)||(38909646-38910111)
chr1 (328-511)||(16354018-16354201)
chr1 (1-455)||(19857379-19857836)
chr1 (282-511)||(19109725-19109953)
chr1 (242-511)||(21228328-21228600)
chr1 (1-463)||(20297486-20297953)
chr1 (242-473)||(24784667-24784901)
chr1 (1-463)||(31536817-31537282)
chr1 (1-289)||(20832897-20833185)
chr1 (242-475)||(21176682-21176918)
chr1 (244-511)||(17041788-17042057)
chr1 (242-439)||(20081220-20081420)
chr1 (242-454)||(22401907-22402122)
chr1 (242-505)||(22435521-22435777)
chr1 (348-448)||(16379518-16379618)
chr1 (252-448)||(22496091-22496290)
chr1 (1-97)||(18710490-18710586)
chr1 (348-448)||(21752471-21752571)
chr1 (348-439)||(22117138-22117229)
chr1 (1-55)||(20853991-20854045)
chr1 (341-454)||(18273215-18273328)
chr1 (106-184)||(20081478-20081556)
chr1 (106-172)||(22496370-22496436)
chr1 (242-275)||(16379409-16379442)
chr1 (243-292)||(18273114-18273163)
[»] scaffold0054 (1 HSPs)
scaffold0054 (1-289)||(63447-63735)
[»] scaffold0335 (1 HSPs)
scaffold0335 (5-451)||(4067-4516)
[»] chr8 (36 HSPs)
chr8 (252-511)||(19115776-19116035)
chr8 (246-511)||(18859947-18860212)
chr8 (246-511)||(17671168-17671433)
chr8 (249-511)||(20015409-20015671)
chr8 (252-511)||(19481219-19481477)
chr8 (255-511)||(22126105-22126361)
chr8 (1-466)||(19985305-19985773)
chr8 (255-511)||(22117321-22117577)
chr8 (1-454)||(22373994-22374450)
chr8 (1-511)||(16268367-16268880)
chr8 (1-455)||(21928553-21929010)
chr8 (1-511)||(28984036-28984549)
chr8 (1-455)||(29300625-29301082)
chr8 (1-463)||(31413723-31414188)
chr8 (1-448)||(22027486-22027936)
chr8 (242-511)||(22043193-22043465)
chr8 (242-511)||(32603511-32603783)
chr8 (5-455)||(20391215-20391668)
chr8 (1-448)||(22053988-22054438)
chr8 (242-511)||(30310287-30310559)
chr8 (69-292)||(6606834-6607057)
chr8 (242-448)||(18880863-18881072)
chr8 (242-448)||(19981333-19981542)
chr8 (242-511)||(15536749-15537021)
chr8 (242-448)||(21671881-21672090)
chr8 (242-448)||(21391067-21391276)
chr8 (242-448)||(21780393-21780602)
chr8 (242-448)||(22421099-22421308)
chr8 (242-463)||(21163721-21163945)
chr8 (1-145)||(28989255-28989399)
chr8 (242-448)||(22523876-22524085)
chr8 (106-172)||(21982427-21982493)
chr8 (106-172)||(21998913-21998979)
chr8 (351-455)||(3274583-3274687)
chr8 (420-511)||(17830113-17830204)
chr8 (106-172)||(21329801-21329867)
[»] scaffold0053 (2 HSPs)
scaffold0053 (43-454)||(62532-62946)
scaffold0053 (1-274)||(65241-65514)
[»] scaffold0044 (2 HSPs)
scaffold0044 (255-511)||(3766-4022)
scaffold0044 (242-477)||(17489-17727)
[»] scaffold0523 (3 HSPs)
scaffold0523 (35-283)||(5562-5810)
scaffold0523 (1-496)||(11461-11959)
scaffold0523 (1-45)||(2959-3003)
[»] scaffold0055 (1 HSPs)
scaffold0055 (252-511)||(22586-22845)
[»] scaffold0052 (1 HSPs)
scaffold0052 (252-511)||(7575-7834)
[»] scaffold0104 (1 HSPs)
scaffold0104 (1-468)||(43165-43635)
[»] scaffold0026 (1 HSPs)
scaffold0026 (1-455)||(51739-52196)
[»] scaffold1433 (1 HSPs)
scaffold1433 (1-466)||(1059-1527)
[»] scaffold0404 (1 HSPs)
scaffold0404 (1-466)||(7832-8300)
[»] scaffold0431 (1 HSPs)
scaffold0431 (246-511)||(10701-10965)
[»] scaffold1056 (1 HSPs)
scaffold1056 (1-283)||(1809-2090)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (1-454)||(34425-34881)
[»] scaffold0067 (7 HSPs)
scaffold0067 (1-466)||(29712-30180)
scaffold0067 (1-274)||(64545-64818)
scaffold0067 (1-274)||(49123-49396)
scaffold0067 (1-274)||(58157-58430)
scaffold0067 (345-391)||(49003-49049)
scaffold0067 (345-391)||(58037-58083)
scaffold0067 (345-391)||(64425-64471)
[»] scaffold1517 (1 HSPs)
scaffold1517 (1-455)||(1246-1703)
[»] scaffold0266 (1 HSPs)
scaffold0266 (37-451)||(16761-17178)
[»] scaffold0010 (4 HSPs)
scaffold0010 (1-454)||(39093-39549)
scaffold0010 (242-511)||(14753-15025)
scaffold0010 (348-442)||(5353-5447)
scaffold0010 (242-292)||(5244-5294)
[»] scaffold0029 (4 HSPs)
scaffold0029 (298-511)||(107480-107693)
scaffold0029 (1-283)||(115650-115932)
scaffold0029 (242-442)||(8543-8746)
scaffold0029 (1-142)||(93969-94110)
[»] scaffold0118 (1 HSPs)
scaffold0118 (1-463)||(549-1014)
[»] scaffold0056 (1 HSPs)
scaffold0056 (1-292)||(808-1099)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (1-254)||(12048-12301)
[»] scaffold0259 (1 HSPs)
scaffold0259 (246-511)||(8591-8856)
[»] scaffold0109 (3 HSPs)
scaffold0109 (242-511)||(41484-41753)
scaffold0109 (242-454)||(12884-13099)
scaffold0109 (109-192)||(13149-13232)
[»] scaffold1426 (1 HSPs)
scaffold1426 (1-463)||(1358-1823)
[»] scaffold0310 (1 HSPs)
scaffold0310 (1-463)||(11065-11530)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (1-454)||(176076-176531)
scaffold0020 (1-455)||(98342-98799)
[»] scaffold0001 (2 HSPs)
scaffold0001 (1-463)||(514104-514569)
scaffold0001 (108-172)||(168146-168210)
[»] scaffold1032 (2 HSPs)
scaffold1032 (1-283)||(749-1031)
scaffold1032 (339-394)||(635-690)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (1-283)||(37027-37309)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (242-511)||(424637-424909)
scaffold0003 (1-448)||(203469-203919)
[»] scaffold0192 (1 HSPs)
scaffold0192 (1-451)||(29615-30068)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (1-455)||(30085-30542)
[»] scaffold0041 (1 HSPs)
scaffold0041 (1-463)||(41823-42288)
[»] scaffold0034 (4 HSPs)
scaffold0034 (1-391)||(1775-2168)
scaffold0034 (252-477)||(121913-122141)
scaffold0034 (124-466)||(11654-11999)
scaffold0034 (1-181)||(70460-70640)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (1-291)||(8947-9237)
[»] scaffold0028 (3 HSPs)
scaffold0028 (255-511)||(21339-21578)
scaffold0028 (242-511)||(55333-55602)
scaffold0028 (255-511)||(11811-12050)
[»] scaffold0789 (1 HSPs)
scaffold0789 (242-510)||(267-524)
[»] scaffold0004 (3 HSPs)
scaffold0004 (1-297)||(325795-326091)
scaffold0004 (1-292)||(200402-200684)
scaffold0004 (153-395)||(319483-319728)
[»] scaffold0405 (1 HSPs)
scaffold0405 (1-391)||(5690-6083)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (1-466)||(66856-67324)
[»] scaffold0009 (2 HSPs)
scaffold0009 (1-455)||(251710-252164)
scaffold0009 (242-477)||(229589-229827)
[»] scaffold0706 (1 HSPs)
scaffold0706 (1-297)||(5129-5425)
[»] scaffold0289 (1 HSPs)
scaffold0289 (242-505)||(117-383)
[»] scaffold2165 (1 HSPs)
scaffold2165 (1-463)||(554-1019)
[»] scaffold0222 (2 HSPs)
scaffold0222 (1-442)||(20902-21346)
scaffold0222 (1-451)||(250-703)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (1-393)||(8702-9097)
[»] scaffold0243 (2 HSPs)
scaffold0243 (1-289)||(9700-9988)
scaffold0243 (242-448)||(23711-23920)
[»] scaffold0865 (1 HSPs)
scaffold0865 (1-291)||(1198-1488)
[»] scaffold0664 (1 HSPs)
scaffold0664 (1-454)||(7126-7582)
[»] scaffold0146 (2 HSPs)
scaffold0146 (63-289)||(212-438)
scaffold0146 (345-394)||(104-153)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (1-291)||(28211-28501)
[»] scaffold2062 (1 HSPs)
scaffold2062 (1-289)||(800-1093)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (242-511)||(48994-49263)
[»] scaffold0203 (2 HSPs)
scaffold0203 (1-297)||(774-1070)
scaffold0203 (345-454)||(3811-3920)
[»] scaffold0035 (2 HSPs)
scaffold0035 (4-455)||(5896-6349)
scaffold0035 (5-89)||(41236-41320)
[»] scaffold0167 (2 HSPs)
scaffold0167 (63-297)||(5203-5437)
scaffold0167 (1-46)||(1208-1253)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (242-511)||(139313-139585)
scaffold0008 (242-511)||(179-450)
[»] scaffold1881 (1 HSPs)
scaffold1881 (242-505)||(189-455)
[»] scaffold0177 (2 HSPs)
scaffold0177 (242-505)||(14750-15016)
scaffold0177 (242-505)||(11065-11331)
[»] scaffold0023 (3 HSPs)
scaffold0023 (1-388)||(164227-164617)
scaffold0023 (242-448)||(43219-43428)
scaffold0023 (242-463)||(30325-30549)
[»] scaffold1220 (1 HSPs)
scaffold1220 (242-478)||(65-304)
[»] scaffold0072 (2 HSPs)
scaffold0072 (1-274)||(54135-54408)
scaffold0072 (339-393)||(54476-54530)
[»] scaffold0079 (1 HSPs)
scaffold0079 (242-477)||(36827-37065)
[»] scaffold0285 (1 HSPs)
scaffold0285 (242-511)||(5327-5599)
[»] scaffold0348 (3 HSPs)
scaffold0348 (1-448)||(17250-17700)
scaffold0348 (4-267)||(4799-5062)
scaffold0348 (353-391)||(4672-4710)
[»] scaffold0114 (2 HSPs)
scaffold0114 (1-389)||(40146-40537)
scaffold0114 (242-448)||(17115-17324)
[»] scaffold0088 (2 HSPs)
scaffold0088 (1-291)||(30022-30312)
scaffold0088 (342-463)||(30342-30463)
[»] scaffold1299 (1 HSPs)
scaffold1299 (1-455)||(1607-2064)
[»] scaffold0297 (1 HSPs)
scaffold0297 (242-508)||(7363-7632)
[»] scaffold0708 (1 HSPs)
scaffold0708 (1-377)||(4982-5361)
[»] scaffold0451 (1 HSPs)
scaffold0451 (242-477)||(13769-14007)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (1-455)||(304-761)
[»] scaffold0058 (2 HSPs)
scaffold0058 (4-274)||(22213-22483)
scaffold0058 (342-391)||(22554-22603)
[»] scaffold1423 (1 HSPs)
scaffold1423 (242-448)||(144-353)
[»] scaffold0509 (1 HSPs)
scaffold0509 (1-292)||(11916-12207)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (242-448)||(30616-30825)
[»] scaffold0235 (4 HSPs)
scaffold0235 (1-274)||(8405-8678)
scaffold0235 (1-274)||(18619-18892)
scaffold0235 (345-445)||(8231-8331)
scaffold0235 (345-445)||(18445-18545)
[»] scaffold2059 (1 HSPs)
scaffold2059 (242-510)||(473-744)
[»] scaffold0317 (1 HSPs)
scaffold0317 (63-387)||(2781-3108)
[»] scaffold0120 (2 HSPs)
scaffold0120 (242-442)||(11592-11795)
scaffold0120 (242-438)||(14413-14612)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (1-448)||(263314-263764)
[»] scaffold0819 (1 HSPs)
scaffold0819 (244-463)||(445-667)
[»] scaffold0412 (1 HSPs)
scaffold0412 (242-477)||(15316-15554)
[»] scaffold0011 (4 HSPs)
scaffold0011 (120-292)||(153699-153871)
scaffold0011 (1-112)||(151655-151766)
scaffold0011 (242-442)||(23305-23508)
scaffold0011 (345-455)||(153927-154037)
[»] scaffold0501 (2 HSPs)
scaffold0501 (242-448)||(253-462)
scaffold0501 (105-145)||(116-156)
[»] scaffold0324 (1 HSPs)
scaffold0324 (242-448)||(2318-2527)
[»] scaffold0017 (4 HSPs)
scaffold0017 (242-476)||(16804-17041)
scaffold0017 (176-466)||(4202-4494)
scaffold0017 (377-476)||(21326-21425)
scaffold0017 (272-448)||(194634-194813)
[»] scaffold0130 (2 HSPs)
scaffold0130 (242-511)||(7482-7754)
scaffold0130 (13-117)||(3992-4096)
[»] scaffold0080 (4 HSPs)
scaffold0080 (242-463)||(32208-32432)
scaffold0080 (242-454)||(9999-10214)
scaffold0080 (242-454)||(12654-12869)
scaffold0080 (296-448)||(55023-55175)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (242-454)||(171447-171662)
[»] scaffold0276 (1 HSPs)
scaffold0276 (133-404)||(23733-24007)
[»] scaffold0621 (2 HSPs)
scaffold0621 (242-448)||(346-555)
scaffold0621 (242-448)||(4763-4972)
[»] scaffold0490 (2 HSPs)
scaffold0490 (242-448)||(220-429)
scaffold0490 (345-448)||(3300-3403)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (242-442)||(8552-8755)
[»] scaffold0261 (6 HSPs)
scaffold0261 (123-283)||(12346-12506)
scaffold0261 (123-283)||(20526-20686)
scaffold0261 (345-466)||(12162-12283)
scaffold0261 (345-466)||(20342-20463)
scaffold0261 (7-61)||(12504-12558)
scaffold0261 (7-61)||(20684-20738)
[»] scaffold0273 (1 HSPs)
scaffold0273 (242-448)||(369-578)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (242-448)||(4321-4530)
[»] scaffold0081 (2 HSPs)
scaffold0081 (253-463)||(21944-22157)
scaffold0081 (253-463)||(37368-37581)
[»] scaffold0239 (2 HSPs)
scaffold0239 (1-274)||(9730-10002)
scaffold0239 (348-448)||(9553-9653)
[»] scaffold0139 (1 HSPs)
scaffold0139 (5-163)||(19023-19181)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (1-274)||(53366-53639)
[»] scaffold1845 (1 HSPs)
scaffold1845 (219-463)||(1055-1302)
[»] scaffold0765 (1 HSPs)
scaffold0765 (1-391)||(6080-6473)
[»] scaffold0611 (1 HSPs)
scaffold0611 (242-436)||(9221-9418)
[»] scaffold0403 (2 HSPs)
scaffold0403 (242-448)||(15240-15449)
scaffold0403 (348-476)||(15-143)
[»] scaffold0042 (2 HSPs)
scaffold0042 (242-508)||(36526-36795)
scaffold0042 (242-275)||(26681-26714)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (242-446)||(10648-10855)
[»] scaffold0075 (2 HSPs)
scaffold0075 (242-442)||(48059-48262)
scaffold0075 (247-442)||(55243-55441)
[»] scaffold0443 (1 HSPs)
scaffold0443 (1-294)||(11897-12178)
[»] scaffold0411 (1 HSPs)
scaffold0411 (242-448)||(8740-8949)
[»] scaffold0040 (3 HSPs)
scaffold0040 (242-448)||(110673-110882)
scaffold0040 (242-297)||(18174-18229)
scaffold0040 (348-442)||(18283-18377)
[»] scaffold0305 (1 HSPs)
scaffold0305 (250-511)||(3201-3465)
[»] scaffold1459 (1 HSPs)
scaffold1459 (242-477)||(829-1067)
[»] scaffold0319 (1 HSPs)
scaffold0319 (296-448)||(6886-7038)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (242-449)||(3880-4090)
[»] scaffold0122 (1 HSPs)
scaffold0122 (242-448)||(40273-40482)
[»] scaffold0074 (3 HSPs)
scaffold0074 (117-274)||(15276-15433)
scaffold0074 (1-58)||(15211-15268)
scaffold0074 (345-454)||(15507-15616)
[»] scaffold0457 (1 HSPs)
scaffold0457 (342-463)||(13805-13926)
[»] scaffold0357 (1 HSPs)
scaffold0357 (242-442)||(17749-17952)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (348-457)||(66287-66396)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (348-442)||(11466-11560)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (1-445)||(15498-15945)
[»] scaffold0181 (1 HSPs)
scaffold0181 (242-511)||(28631-28903)
[»] scaffold0100 (2 HSPs)
scaffold0100 (1-158)||(16668-16825)
scaffold0100 (242-448)||(16375-16584)
[»] scaffold0012 (2 HSPs)
scaffold0012 (348-442)||(216192-216286)
scaffold0012 (242-292)||(216345-216395)
[»] scaffold1530 (2 HSPs)
scaffold1530 (1-130)||(671-800)
scaffold1530 (213-442)||(804-1036)
[»] scaffold0575 (1 HSPs)
scaffold0575 (242-442)||(9948-10151)
[»] scaffold0546 (2 HSPs)
scaffold0546 (242-454)||(208-423)
scaffold0546 (109-192)||(75-158)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (248-448)||(104561-104764)
[»] scaffold0434 (1 HSPs)
scaffold0434 (231-466)||(5650-5888)
[»] scaffold0188 (1 HSPs)
scaffold0188 (252-455)||(33131-33337)
[»] scaffold0585 (2 HSPs)
scaffold0585 (1-64)||(4242-4305)
scaffold0585 (334-455)||(620-740)
[»] scaffold0022 (4 HSPs)
scaffold0022 (297-448)||(42019-42170)
scaffold0022 (297-448)||(75739-75890)
scaffold0022 (348-448)||(34537-34637)
scaffold0022 (106-168)||(34764-34826)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (352-442)||(14037-14127)
[»] scaffold1288 (1 HSPs)
scaffold1288 (1-58)||(14-71)
[»] scaffold1274 (1 HSPs)
scaffold1274 (348-445)||(56-152)
[»] scaffold0550 (1 HSPs)
scaffold0550 (242-354)||(10018-10133)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (223-466)||(115934-116180)
[»] scaffold0333 (1 HSPs)
scaffold0333 (242-448)||(18979-19187)
[»] scaffold0298 (1 HSPs)
scaffold0298 (1-56)||(9388-9443)
[»] scaffold0518 (1 HSPs)
scaffold0518 (342-446)||(2263-2367)
[»] scaffold0358 (1 HSPs)
scaffold0358 (242-449)||(9276-9486)
[»] scaffold0151 (1 HSPs)
scaffold0151 (189-289)||(470-570)
[»] scaffold0993 (1 HSPs)
scaffold0993 (242-435)||(1311-1507)
[»] scaffold1373 (1 HSPs)
scaffold1373 (1-50)||(1-50)
[»] scaffold0410 (1 HSPs)
scaffold0410 (250-442)||(478-673)
[»] scaffold0679 (1 HSPs)
scaffold0679 (106-172)||(1068-1134)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (357-463)||(17686-17792)
[»] scaffold0098 (1 HSPs)
scaffold0098 (70-172)||(25629-25731)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (242-442)||(3871-4074)
[»] scaffold1600 (1 HSPs)
scaffold1600 (348-444)||(504-600)
[»] scaffold0609 (2 HSPs)
scaffold0609 (69-292)||(1095-1318)
scaffold0609 (342-451)||(7989-8098)
[»] scaffold0529 (2 HSPs)
scaffold0529 (358-445)||(5536-5623)
scaffold0529 (1-151)||(5176-5326)
[»] scaffold0282 (2 HSPs)
scaffold0282 (242-451)||(13237-13449)
scaffold0282 (1-88)||(13608-13695)
[»] scaffold0180 (1 HSPs)
scaffold0180 (218-297)||(30933-31012)
[»] scaffold0148 (1 HSPs)
scaffold0148 (5-96)||(2091-2182)
[»] scaffold0605 (1 HSPs)
scaffold0605 (1-55)||(1368-1422)
[»] scaffold0848 (1 HSPs)
scaffold0848 (66-172)||(5044-5150)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (106-451)||(57377-57725)
[»] scaffold0429 (1 HSPs)
scaffold0429 (348-445)||(1191-1288)
[»] scaffold0161 (1 HSPs)
scaffold0161 (246-291)||(36161-36206)
[»] scaffold0505 (1 HSPs)
scaffold0505 (357-445)||(2199-2286)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 240; Significance: 1e-133; HSPs: 79)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 252 - 511
Target Start/End: Original strand, 6603664 - 6603923
Alignment:
Q  252 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcag 351  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6603664 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttgtcag 6603763  T
Q  352 caggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctaca 451  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6603764 cgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctaca 6603863  T
Q  452 gctgttaaccaaatctggaaaaactctcagccgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 511  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  6603864 gctgttaaccaaatctggaaaaactctcagctgttgatacccgatcgccctcttgatgtc 6603923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 252 - 511
Target Start/End: Original strand, 6596984 - 6597243
Alignment:
Q  252 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcag 351  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6596984 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttgtcag 6597083  T
Q  352 caggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctaca 451  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  6597084 cgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctgca 6597183  T
Q  452 gctgttaaccaaatctggaaaaactctcagccgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 511  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  6597184 gctgttaaccaaatctggaaaaactctcagctgttgatacccgatcgccctcttgatgtc 6597243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 249 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 5422134 - 5421872
Alignment:
Q  249 ttactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgt 348  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  5422134 ttactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttacctttgt 5422035  T
Q  349 cagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcct 448  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5422034 cagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcgttcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcct 5421935  T
Q  449 acagctgttaaccaaatctggaaaaactctcagccgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 511  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5421934 gcagctgttaaccaaatctggaaaaactctcagctgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 5421872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 252 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 16753902 - 16753643
Alignment:
Q  252 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcag 351  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  16753902 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttccctttgtcag 16753803  T
Q  352 caggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctaca 451  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16753802 cgggggcactgtacggcttaggacgactatgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctgca 16753703  T
Q  452 gctgttaaccaaatctggaaaaactctcagccgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 511  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16753702 gctgttaaccaaatctagaaaaactctcagctgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 16753643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 252 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 53382219 - 53381961
Alignment:
Q  252 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcag 351  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  53382219 ctcttgtggcctttctcgccacagttgaagcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttgtcag 53382120  T
Q  352 caggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctaca 451  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  53382119 g-ggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatccttctcatagatcctgca 53382021  T
Q  452 gctgttaaccaaatctggaaaaactctcagccgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 511  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  53382020 gctgttaaccaaatctggaaaaactctcagctgttgatacccaatcgccctcttaatgtc 53381961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 252 - 511
Target Start/End: Original strand, 16638702 - 16638961
Alignment:
Q  252 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcag 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16638702 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttgtcag 16638801  T
Q  352 caggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctaca 451  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16638802 cgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctgca 16638901  T
Q  452 gctgttaaccaaatctggaaaaactctcagccgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 511  Q
    ||| |||||||| ||  |||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||    
T  16638902 gctattaaccaagtcctgaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccctcttgatgtc 16638961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 252 - 511
Target Start/End: Original strand, 43165604 - 43165863
Alignment:
Q  252 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcag 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43165604 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttgtcag 43165703  T
Q  352 caggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctaca 451  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  43165704 cgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctgca 43165803  T
Q  452 gctgttaaccaaatctggaaaaactctcagccgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 511  Q
    ||| |||||||| ||  |||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||    
T  43165804 gctattaaccaagtcctgaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccctcttgatgtc 43165863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 252 - 511
Target Start/End: Original strand, 48428376 - 48428635
Alignment:
Q  252 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcag 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  48428376 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttgtcag 48428475  T
Q  352 caggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctaca 451  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  48428476 cgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctgca 48428575  T
Q  452 gctgttaaccaaatctggaaaaactctcagccgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 511  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||| | || || ||||||||||||||||||||    
T  48428576 gctgttaaccaaatcctgaaaaactctcagctgctggtatccaatcgccctcttgatgtc 48428635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 16825722 - 16825263
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactat--taatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacct 98  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  16825722 tagcaattaaaggagtactatattaaagaaacaagtacctctgataagtcagtcctcattcaccgtttgcgtaccagtcaaagcaaacaccttgccacct 16825623  T
Q  99 gtcctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||    
T  16825622 gtcctaaccttcttaggctgcgtacactgcaaactgatatgaccttcctcattgaagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacaatcagctaaagtgt 16825523  T
Q  199 gtcctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctc---tgc 295  Q
    ||||||| | ||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||    |     
T  16825522 gtccttttttaccacacctgaagcacttcttctcatcacggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtagg 16825423  T
Q  296 agcatctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgccc 395  Q
    ||||||| || |||| |||| |||  ||||   ||   |||| || || ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||     
T  16825422 agcatctctcatcttgggcctcctctcatctttcaatctctacttacccttgtcaggaggggcactatacggcttcggacgactcagctgtcccttgcct 16825323  T
Q  396 ttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctacagctg 455  Q
     | | |||| |||  |||||||| ||||| || ||||| || ||||||||||||||||||    
T  16825322 ctgcgctcactcatcaccttgtaatgagctttcgtatcttcttcatagatcctacagctg 16825263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 252 - 511
Target Start/End: Original strand, 12889638 - 12889897
Alignment:
Q  252 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcag 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12889638 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttgtcag 12889737  T
Q  352 caggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctaca 451  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||    
T  12889738 cgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgca 12889837  T
Q  452 gctgttaaccaaatctggaaaaactctcagccgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 511  Q
    ||| |||||||||||  |||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||    
T  12889838 gctattaaccaaatcctgaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccctcttgatgtc 12889897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 252 - 511
Target Start/End: Original strand, 13255619 - 13255878
Alignment:
Q  252 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcag 351  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13255619 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatccttcctcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttgtcag 13255718  T
Q  352 caggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctaca 451  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||    
T  13255719 cgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtgtcctcttcgtagatcctgca 13255818  T
Q  452 gctgttaaccaaatctggaaaaactctcagccgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 511  Q
    ||| |||||||| ||  |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  13255819 gctattaaccaagtcctgaaaaactctcagctgttggtacccaatcgccctcttgatgtc 13255878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 255 - 511
Target Start/End: Original strand, 10008532 - 10008788
Alignment:
Q  255 ttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcagcag 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  10008532 ttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcag 10008631  T
Q  355 gggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctacagct 454  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  10008632 gggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagct 10008731  T
Q  455 gttaaccaaatctggaaaaactctcagccgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 511  Q
     ||||| || ||  |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  10008732 attaactaagtcctgaaaaactctcagctgttggtacccaatcgccctcttgatgtc 10008788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 255 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 20059252 - 20058996
Alignment:
Q  255 ttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcagcag 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  20059252 ttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcag 20059153  T
Q  355 gggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctacagct 454  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||    
T  20059152 gggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcgtagatcctgcagct 20059053  T
Q  455 gttaaccaaatctggaaaaactctcagccgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 511  Q
     |||||||| ||  |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||    
T  20059052 attaaccaagtcctgaaaaactctcagctgttggtacccaatcgccctcttaatgtc 20058996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 14290973 - 14290520
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  14290973 tagcaattaaatgagtactattaaagaaacaagtacctctgataagtcggtcctcattcacggtttgcgtaccagtcaaagcaaacaccttgccacctgt 14290874  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgt 200  Q
    || |||||||||||||| | | |||||||| || ||||| || ||||||| ||| || ||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  14290873 ccgaaccttcttaggcttcttgcactgcgagctaatatgtccctcttcatcacaattatagcaaataacatccccacgcttacaatcagctaaagtgtgt 14290774  T
Q  201 cctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctc---tgcag 297  Q
    |||||||  |  |||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||    | ||    
T  14290773 cctttctgtccacacctaaagcacttcttctcatctcaatcacacacattactcttgtggcctttctcaccacacttgaagcaaataatctcagtaggag 14290674  T
Q  298 catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgccctt 397  Q
    ||||| || ||||||||| |||  ||||   || | ||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||  |    
T  14290673 catctctcctcttaggcctcctctcatcattcagcctctgtttacctttgtcagcaggagcactatacggtttcggacgactctgctgtcccttacctct 14290574  T
Q  398 cctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctaca 451  Q
     | |||| |||  || || || ||||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  14290573 gcgctcactcatcactttataatgagctttggtatcctcttcatagattctaca 14290520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 451
Target Start/End: Original strand, 35982869 - 35983322
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  35982869 tagcaattaaaagagtactattaaagaaacaagtatctctgataagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaacagtcaaagcaaacaccttgccacctgt 35982968  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||| || ||||||    
T  35982969 cctaaccttcttaggctgcgtacaatgcgaactaatatgtccttcctcattacagttgtagcaaacaatatccccacgcttgcaatcagccaatgtgtgt 35983068  T
Q  201 cctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctc---tgcag 297  Q
    |||||||  |  || || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||| |    | ||    
T  35983069 cctttctgtccacatctgaaacacttcttctcatctcggtcacacacattactcttgtggcctttctcaccacacttgaagcaaataatcacagtaggag 35983168  T
Q  298 catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgccctt 397  Q
    ||||| || ||||||||| |||  ||||   || | ||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||| || |||| ||||||||||||||| ||  |    
T  35983169 catctctcctcttaggcctcctctcatcattcagcctctgtttacctttgtcagcaggagcactatacggtttcggacaactctgctgtcccttacctct 35983268  T
Q  398 cctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctaca 451  Q
     | |||| |||  || || || ||||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  35983269 gcactcactcatcactttataatgagctttggtatcctcttcatagattctaca 35983322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 255 - 511
Target Start/End: Original strand, 10909142 - 10909398
Alignment:
Q  255 ttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcagcag 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  10909142 ttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcaacatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcag 10909241  T
Q  355 gggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctacagct 454  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  10909242 gggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagct 10909341  T
Q  455 gttaaccaaatctggaaaaactctcagccgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 511  Q
     ||||| || ||  |||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  10909342 attaactaagtcctgaaaaactctaagctgttggtacccaatcgccctcttgatgtc 10909398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 255 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 15345443 - 15345187
Alignment:
Q  255 ttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcagcag 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |    
T  15345443 ttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttacctttgtcagcgg 15345344  T
Q  355 gggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctacagct 454  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  15345343 gggcactgtacggcttaggaggactctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagct 15345244  T
Q  455 gttaaccaaatctggaaaaactctcagccgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 511  Q
     |||||||||||  |||||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||    
T  15345243 attaaccaaatcctgaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 15345187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 255 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 15713254 - 15712998
Alignment:
Q  255 ttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcagcag 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||| ||||| |    
T  15713254 ttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgtagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccatcctctgcttccctttatcagcgg 15713155  T
Q  355 gggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctacagct 454  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  15713154 gggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagct 15713055  T
Q  455 gttaaccaaatctggaaaaactctcagccgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 511  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  15713054 attaaccaaatccggaaaaactctcagttgttggtacccaatcgccctcttgatgtc 15712998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 252 - 511
Target Start/End: Original strand, 3688872 - 3689131
Alignment:
Q  252 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcag 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| || |||||||    
T  3688872 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctcagcagcatccttcttcttaggccgcctaacgtcgaccatcttctgtttacccttgtcag 3688971  T
Q  352 caggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctaca 451  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||    
T  3688972 cgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcgtagatcctgca 3689071  T
Q  452 gctgttaaccaaatctggaaaaactctcagccgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 511  Q
    ||| |||||||||||  |||||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||    
T  3689072 gctattaaccaaatcctgaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 3689131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 252 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 26790614 - 26790355
Alignment:
Q  252 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcag 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||     
T  26790614 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcat 26790515  T
Q  352 caggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctaca 451  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||    
T  26790514 tgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgca 26790415  T
Q  452 gctgttaaccaaatctggaaaaactctcagccgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 511  Q
    ||| |||||||||||  |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| |||||    
T  26790414 gctattaaccaaatcctgaaaaactctcagttgttggtacccaatcgccctcttaatgtc 26790355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 252 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 15586593 - 15586334
Alignment:
Q  252 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcag 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15586593 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctccgcagcatccttcctcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttgtcag 15586494  T
Q  352 caggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctaca 451  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||| ||    
T  15586493 cgggggcactgtacggcttaggacgactttgttgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctctttgtagatcctgca 15586394  T
Q  452 gctgttaaccaaatctggaaaaactctcagccgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 511  Q
    ||| |||||||||||  |||||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||    
T  15586393 gctattaaccaaatcctgaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 15586334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 255 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 5110607 - 5110351
Alignment:
Q  255 ttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcagcag 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |    
T  5110607 ttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggctgcctaacatcgaccatcttctgtttacctttgtcagcgg 5110508  T
Q  355 gggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctacagct 454  Q
    || ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  5110507 ggacactgtacggcttaggacgactctattgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagct 5110408  T
Q  455 gttaaccaaatctggaaaaactctcagccgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 511  Q
     |||||||||||  |||||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||    
T  5110407 attaaccaaatcctgaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 5110351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 246 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 15399725 - 15399460
Alignment:
Q  246 acattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctt 345  Q
    ||||| || |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  15399725 acattgcttttgtggcctttcccaccacaattgaaacacacaatctcagtagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccatcttctgtttccctt 15399626  T
Q  346 tgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagat 445  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  15399625 tatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcgttcactatcttgtagtgaaccttggtatcctcttcctagat 15399526  T
Q  446 cctacagctgttaaccaaatctggaaaaactctcagccgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 511  Q
    ||| ||||| || |||||||   |||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||    
T  15399525 cctgcagctattgaccaaattctgaaaaactctaagctgttggtatccaatcgccctcttgatgtc 15399460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 263 - 511
Target Start/End: Original strand, 15358992 - 15359240
Alignment:
Q  263 tttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcagcaggggcactg 362  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||   |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||| |||||||||    
T  15358992 tttcccaccacaattgaaacacacaatctcaatagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccatcttctgtttcactttatcagcgggggcactg 15359091  T
Q  363 tacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctacagctgttaacca 462  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||    
T  15359092 tacggcttagggcgactctgctgtcccttgcccttcctctcgttcactatcttgtagtgagccttggtatcctcttcatagatcctgcagctattgacca 15359191  T
Q  463 aatctggaaaaactctcagccgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 511  Q
    ||||  |||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||    
T  15359192 aatcctgaaaaactctaagctgttggtatccaatcgccctcttgatgtc 15359240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 511
Target Start/End: Original strand, 10408656 - 10409169
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||    || |||||||||||  ||||||||||||| |||||  |    
T  10408656 tagcaattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctctgataagttggtcctcattaggagtctgcgtaccagtcaaagcaaacacctttccaccaat 10408755  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgt 200  Q
     |||  |||||| ||||  | |||||| |||||||||||||||||  |||| |||||||| || ||||  |||| |||||| || | ||||||| ||||     
T  10408756 tctagtcttcttcggctcaggacactgtgaactgatatgaccttccccattgcagttgtaacagacaatgtccccacgcttgcattcagctaaactgtga 10408855  T
Q  201 cctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgc---ag 297  Q
    || |||| ||  ||||| ||||||||| | |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | || |||||||| ||   ||    
T  10408856 cccttctgaccacacctgaagcacttcctatcatctcttccacaaacattactcttgtggcctttctcaccacatttgtaacaaacaatctcagctggag 10408955  T
Q  298 catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgccctt 397  Q
    ||||| || |||| |||| |||| ||||  ||||||||| ||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| |    
T  10408956 catctctcctcttgggcctcctatcatcacccatcttctgtttacccttgtcagcaggagcactgtaaggcttaggacgactctggtgtcccttacccct 10409055  T
Q  398 cctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctacagctgttaaccaaatctggaaaaactctcagccgttgatacccaatc 497  Q
    ||||||| ||| || |||||| ||||| ||||| || || |||||||| || || || |||||||| || | ||||||||| | | | ||||| |||||     
T  10409056 cctctcactcattatcttgtaatgagctttggtgtcttcttcatagattctgcacctattaaccaactcagaaaaaactctgatctgctgatatccaata 10409155  T
Q  498 gccctcttgatgtc 511  Q
    || || ||||||||    
T  10409156 gctcttttgatgtc 10409169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 246 - 511
Target Start/End: Original strand, 24186113 - 24186378
Alignment:
Q  246 acattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctt 345  Q
    ||||| || |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||    
T  24186113 acattgcttttgtggcctttcacaccacaattgaaacacacaatctcagtagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccatcctctgtttccctt 24186212  T
Q  346 tgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagat 445  Q
    | |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | ||| ||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  24186213 tatcagcgtgggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttccactcgttcacaatcttatagtgagccttagtatcctcttcatagat 24186312  T
Q  446 cctacagctgttaaccaaatctggaaaaactctcagccgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 511  Q
    ||| ||||| || ||||| |||||||||||||| | | |||| || |||||||||||||| |||||    
T  24186313 cctgcagctattgaccaattctggaaaaactctaatctgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 24186378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 463
Target Start/End: Original strand, 28757007 - 28757472
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    || |||||||||||  ||||||||||||| || ||  |    
T  28757007 tagcaattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctctgataagtcggtcctcattaggagtctgcgtaccagtcaaagcaaacacctttcccccaat 28757106  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgt 200  Q
     |||  |||||| ||||  | |||||| ||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||  |||| |||||| || | ||||||| ||||     
T  28757107 tctagtcttcttcggctcaggacactgtgaactaatatgaccttctccattgcaattgtaacagacaatgtccccacgcttgcattcagctaaactgtga 28757206  T
Q  201 cctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatct---ctgcag 297  Q
    || |||| ||  ||||| ||||||||| | |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||   | | ||    
T  28757207 cccttctgaccacacctgaagcacttcctatcatctcttccacaaacattactcttgtggcctttctcaccacacttgtagcaaacaatctcaacaggag 28757306  T
Q  298 catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgccctt 397  Q
    ||||| || |||| |||| |||| ||||  |||||||||  || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| |||||||| ||| |    
T  28757307 catctctcctcttgggcctcctatcatcacccatcttctgctttcctttgtcagcaggagcactgtaaggcttaggacgattctgttgtcccttacccct 28757406  T
Q  398 cctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctacagctgttaaccaa 463  Q
    ||||||| ||| || |||||| ||||| ||||| || || |||||||| || || || ||||||||    
T  28757407 cctctcactcattatcttgtaatgagctttggtgtcttcttcatagattctgcacctattaaccaa 28757472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 31692626 - 31692170
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| |    ||||||||||||||   |||||||||||| ||||| ||    
T  31692626 tagcaattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctctgataagtcgatcctcactagtggtttgcgtaccagtcagagcaaacaccttaccaccagt 31692527  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgt 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||| | || ||| || | ||||| |||||||    
T  31692526 cctaaccttcttcggctgcgtacactgtgaactgatatggccctcctcattgcagttataacaaacaacatcaccactcttgcagtcagctagagtgtgt 31692427  T
Q  201 cctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgc---ag 297  Q
    || |||||||  ||||| || |||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | || || ||||| ||   ||    
T  31692426 cccttctaaccacacctgaaacacttcttctcatctttggtacaaacattactcttgtggcctttctcaccacacttgtaacaaacgatctcagcagaag 31692327  T
Q  298 catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgccctt 397  Q
    ||| | || | || |||| |||  ||||   || |||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| | |    
T  31692326 catttctcctattgggcctcctctcatcattcaacttctgcttccctttgtcagcaggagcactatacggcttcggacgactctgctgtcctttgctcct 31692227  T
Q  398 cctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctacagct 454  Q
     |  ||| |||  ||||| || ||||| || || |||||||||||||| || |||||    
T  31692226 tcgatcactcatcaccttataatgagctttcgtgtcctcctcatagattctgcagct 31692170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 12357968 - 12357575
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| |    ||||||||||||||   ||||||||| || ||||| ||    
T  12357968 tagcaattaaaggtgtactattaaagaaacaagtacctctgataagtcgatcctcactagtggtttgcgtaccagtcagagcaaacactttaccaccggt 12357869  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgt 200  Q
    |||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| || |  |||||||||| |||||| ||||||    
T  12357868 cctaaccttcttcggttgtgtacactgcgaactgatatgaccttcctcattgcagttatagcaaacaacgtctccccgcttacaatcagctaatgtgtgt 12357769  T
Q  201 cctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgc---ag 297  Q
    ||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||| |||| |||||||| ||   ||    
T  12357768 cctttctgaccacacctgaagcacttcttctcatctttatcacagacattactcttgtggcctttttcgccacacttgtagcaaacaatctcagcaggag 12357669  T
Q  298 catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtccctt 391  Q
     |||| || |||| |||| |||  ||||   || | |||| || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||||||    
T  12357668 tatctctcctcttgggcctcctctcatcattcagcctctactttcccttgtcagcaggagcactatatggtttaggacgactctgatgtccctt 12357575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 16327150 - 16326683
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||    || |||||||||||  | ||||||||||| ||||| ||    
T  16327150 tagcaattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctctaataagtcggtcctcattggtagtctgcgtaccagtcaatgcaaacacctttccaccagt 16327051  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgt 200  Q
     ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||  |||| ||||||||| | ||||||| |||||    
T  16327050 tctaaccttcttcggcttagtacactgcgaactgatatgaccctctccattgcagttgtagcagacaatgtccccacgcttacattcagctaaattgtgt 16326951  T
Q  201 cctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaa-tctctgcagca 299  Q
    || |||| ||  ||||| || || ||| |||||||||   |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||  | || |||| |||| |||| |    
T  16326950 cccttctgaccacacctgaaacatttcctctcatctctaccacaaacattgctcttgtggcctttttcaccacacttataacaaacaagtctcagcagga 16326851  T
Q  300 ----tctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgccc 395  Q
        ||| || |||| || | |||| ||||   || ||| |  || |||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16326850 gcagtctctcctcttgggtctcctatcatcattcaccttttgctttcctttgtcagcaggagcactgtcaggcttaggacgactctgctgtcccttgccc 16326751  T
Q  396 ttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctacagctgttaaccaa 463  Q
     |||||||| ||| || |||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||| || ||||| |||||    
T  16326750 ctcctctcactcattatcttgtaatgagctttggtgtcttcttcataaatcctgcaactgtttaccaa 16326683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 463
Target Start/End: Original strand, 47126632 - 47127097
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||    || |||||||||||  ||||||||||||| |||||  |    
T  47126632 tagcaattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctctgataagtcggtcctcgttaggagtctgcgtaccagtcaaagcaaacaccttaccaccaat 47126731  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgt 200  Q
     |||  |||||| ||||  | |||||| |||||||||||||||||  |||| |||||||| || ||||  |||| |||||| || | ||||||| ||||     
T  47126732 tctagtcttcttcggctcaggacactgtgaactgatatgaccttccccattgcagttgtaacagacaatgtccccacgcttgcattcagctaaactgtga 47126831  T
Q  201 cctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatct---ctgcag 297  Q
    || |||| ||  ||||| ||||||||| | |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||   | | ||    
T  47126832 cccttctgaccacacctgaagcacttcctatcatctcttccacaaacattactcttgtggcctttctcaccacacttgtagcaaacaatctcaacaggag 47126931  T
Q  298 catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgccctt 397  Q
    ||||| || |||| |||| |||| ||||  ||||| |||  || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| |||||||| ||| |    
T  47126932 catctctcctcttgggcctcctatcatcacccatcctctgctttcctttgtcagcaggagcactgtaaggcttaggacgattctgttgtcccttacccct 47127031  T
Q  398 cctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctacagctgttaaccaa 463  Q
    ||||||| |||  | ||| || ||||| ||||| || || |||||||| || || || ||||||||    
T  47127032 cctctcactcataatcttataatgagctttggtgtcttcttcatagattctgcacctattaaccaa 47127097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 454
Target Start/End: Original strand, 31941591 - 31942047
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| |    ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| ||    
T  31941591 tagcaattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctctgataagtcgatcctcactagtggtttgcgtaccagtcaaagcaaacaccttaccaccagt 31941690  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgt 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| || || ||||| || || || ||||||||||| | |||||| || | ||||| |||||||    
T  31941691 cctaaccttcttcggctgcgtacactatgaactgatatggccctcctcattgcaattataacaaacaacatcaccacgcttgcagtcagctagagtgtgt 31941790  T
Q  201 cctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgc---ag 297  Q
    || |||| ||  ||||| || |||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | || || ||||| ||   ||    
T  31941791 cccttctgaccacacctgaaacacttcttctcatctttggtacaaacattactcttgtggcctttctcgccacacttgtaacaaacgatctcagcaggag 31941890  T
Q  298 catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgccctt 397  Q
    ||| | || | || |||| |||  ||||   || |||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |||| | |    
T  31941891 catttctcctattgggcctcctctcatcattcaacttctgcttccctttgtcagcaggagcactatacggcttcggacgactctgctatcctttgctcct 31941990  T
Q  398 cctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctacagct 454  Q
     |  ||| |||  ||||| || ||||| || || |||||||||||||| || |||||    
T  31941991 tcgatcactcatcaccttataatgagctttcgtgtcctcctcatagattctgcagct 31942047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 18131788 - 18131398
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| |    ||||||||||||||   || |||||| || ||||| ||    
T  18131788 tagcaattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctctgataagtcgatcctcactagtggtttgcgtaccagtcagagtaaacactttaccaccggt 18131689  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgt 200  Q
     |||||||||||  | || |||||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||| ||||| || ||||||| |||||||||||||||||| | ||||    
T  18131688 tctaaccttcttcagttgagtacactgcgaactaatatgactttcctcattgcagttatagcacactacatccccacgcttacaattagctaatgcgtgt 18131589  T
Q  201 cctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatct---ctgcag 297  Q
    ||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||  ||||||   | | ||    
T  18131588 cctttctgaccacacctgaagcacttcttctcatctttatcacaaacattactcttgtggcctttctcgccacacttgtagcaatcaatctcaacaggag 18131489  T
Q  298 catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcc 388  Q
    ||||| || |||| |||| |||  |||    ||   ||| ||| |||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||    
T  18131488 catctctcctcttgggcctcctctcattattcagtctctgttttcctttgtcagcaggagcactatatggtttaggacgactctgctgtcc 18131398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 12857936 - 12857481
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  12857936 tagcaattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctctgataagtcg-tcctcattaacagtttgcgtaccagtcaaagcaaacaccttgccacctgt 12857838  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgt 200  Q
    |  | |||||||||||| | | |||| ||| || |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| | |||||| || | |||||   |||||    
T  12857837 cagagccttcttaggcttcctgcactacgagctaatatgaccttcttcatcacaattgtagcaaacaatatcacgacgcttgcactcagctattatgtgt 12857738  T
Q  201 cctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctc---tgcag 297  Q
    |||||||  |  || |  || |||||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||| || |||||||| ||||| || ||||||||    | ||    
T  12857737 cctttctttccacatcggaaacacttcttctcatcacagtcacatacattactcatgtggcccttttcaccacacttgaaacagacaatctcagtaggag 12857638  T
Q  298 catctttcttcttaggccgcctaacatcgacca-tcttctatttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgccct 396  Q
    ||||| || | ||||||| |||  ||||   || || | | ||| |||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||| ||||||||||||      
T  12857637 catctctccttttaggcctcctctcatcattcagtcct-tgtttacctttgtcagcaggagcactatacggttttggacgactctactgtcccttgcctc 12857539  T
Q  397 tcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctacagct 454  Q
    | | |||| |||  ||||| || ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||    
T  12857538 tacgctcactcatcaccttataatgagcttttgtatcctcctcatagattctacagct 12857481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 292
Target Start/End: Original strand, 17494335 - 17494625
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||   ||||||| | |  ||||||||||||||   ||||||||| || ||||| ||    
T  17494335 tagcaattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctctgataagcatgtcctcactaatggtttgcgtaccagtcagagcaaacactttaccaccggt 17494434  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgt 200  Q
    |||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||  || | || |||||| | |||||  ||||||    
T  17494435 cctaaccttcttcggttgagtacactgcgaactaatatgaccttcctcgttgcagttatagcaaacaatgtctccacacttacagtcagctagtgtgtgt 17494534  T
Q  201 cctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctc 292  Q
    ||||||| ||  |||||  ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  17494535 cctttctgaccacacct-gagcacttcttctcatctctatcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacatttgaagcaaacaatctc 17494625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 11958622 - 11958173
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    || |||||||||||  | |||||||| || ||||| ||    
T  11958622 tagcaattaaaggattactattaaagaaacaagtacctctgataagtcggtcctcattggtagtctgcgtaccagtcaatgcaaacactttcccaccggt 11958523  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgt 200  Q
    |||| ||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||| |||||| || ||||||||||| ||||  |||  ||||||||| | |||||  || |||    
T  11958522 cctagccttcttcggctgagtacactatgaactgatatgactttcttcgttgcagttgtagcagacaatgtcctcacgcttacattcagctagtgtatgt 11958423  T
Q  201 cctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgc---ag 297  Q
    ||||||| ||  ||||| || |||||| |||||||||   ||||| |||| || ||||||||||| |||||||| ||  | || ||||| || ||   ||    
T  11958422 cctttctgaccacacctgaaacacttcctctcatctctaccacaagcattgcttttgtggcctttttcaccacacttataacaaacaatttcagcaggag 11958323  T
Q  298 catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgccctt 397  Q
    ||||| || ||||| ||| |||| ||||   |||  ||| |||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||  |    
T  11958322 catctctcctcttaagcctcctatcatcattcattctctgtttccctttgtcagcaggagcactgtaaggtttaggacgattctgctgtcccttacctct 11958223  T
Q  398 cctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcc 447  Q
    ||||||| |||  |||||||| ||| | || || || |||||||| ||||    
T  11958222 cctctcactcatcaccttgtaatgaacttttgtgtcttcctcataaatcc 11958173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 453
Target Start/End: Original strand, 12181032 - 12181487
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |    |||| |||||||||  |||||||||| || ||||| ||    
T  12181032 tagcaactaaaggagtactattaaagaaacaagtacctctgataagtcggtcctcactagtggtttacgtaccagtcaaagcaaacactttaccaccggt 12181131  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgt 200  Q
    |||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||| |  || || || || |||||||  |||| | ||||||||| |||||  ||||||    
T  12181132 cctaaccttcttcggttgcgtacactacgaactgatatgaccttccttgttgcaattataacaaacaatgtccccaagcttacaatcagctagtgtgtgt 12181231  T
Q  201 cctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctc---tgcag 297  Q
    ||||||  ||  || || |||||||||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | ||| ||    | ||    
T  12181232 cctttccgaccacaactgaagcacttcttctcatctctatcacagactttactcttgtggcctttttcaccacacttgaagcaaaaaatgtcagtaggag 12181331  T
Q  298 catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcc-ct 396  Q
    ||||| || |||| | || |||  ||||    | | |||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||    
T  12181332 catctctcctcttggtcctcctctcatcatttaacctctacttacccttgtcagcaggagcactatacggcttcagacgactctgttgtcccttgcctct 12181431  T
Q  397 tcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctacagc 453  Q
    || | ||| |||  |||||||| ||||| || || ||||||||||| ||||||||||    
T  12181432 tcgt-tcactcatcaccttgtaatgagctttcgtgtcctcctcataaatcctacagc 12181487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 242 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 16804158 - 16803920
Alignment:
Q  242 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgc---agcatctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctat 338  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||| ||   |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  ||| |    
T  16804158 acaaacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacaagtaatctcagctggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgt 16804059  T
Q  339 ttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcct 438  Q
    || || || |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  16804058 ttgcccttatcagcaggggcactatagggcttagggcgactctgctggcccttggtcttccgctcattcacaaccttgtaatgagccttggtatcctcct 16803959  T
Q  439 catagatcctacagctgttaaccaaatctggaaaaactc 477  Q
    |||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  16803958 cataaattctgcagctattaaccaaatcaggaaaaactc 16803920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 242 - 477
Target Start/End: Original strand, 11861272 - 11861510
Alignment:
Q  242 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctat 338  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||||   |||| |||||||||||||||||| ||||||||||  ||| |    
T  11861272 acaaacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaatagacaatctccgcaggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgt 11861371  T
Q  339 ttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcct 438  Q
    || ||||| |||||||||||||| || ||||||||  ||||||| || ||||| | ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||    
T  11861372 ttgcctttatcagcaggggcactatagggcttagggtgactctggtggcccttactcttccactcattcacaaccttgtaatgagccttggtgtcttcct 11861471  T
Q  439 catagatcctacagctgttaaccaaatctggaaaaactc 477  Q
    ||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||    
T  11861472 catagattctacagctattcaccaactcaggaaaaactc 11861510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 11949366 - 11949107
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| | |||||| |    ||||||||||||||   ||||||||| || |||||  |    
T  11949366 tagcaattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctctgataagttgatcctcactagtggtttgcgtaccagtcagagcaaacactttaccaccgat 11949267  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgt 200  Q
    |||||||||||| | || |||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |  |||||||||| ||||||  |||||    
T  11949266 cctaaccttcttcgtctacgtacactgcaaactgatgtgaccttcctcattgcagttatagcaaacaacatctccccgcttacaatcagctaatatgtgt 11949167  T
Q  201 cctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtgg 260  Q
    ||||||| ||  || || ||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||    
T  11949166 cctttctgaccacatctgaagcacttcttctcatctttagtacaaacattactcttgtgg 11949107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 16831969 - 16831519
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||    || |||||||||||  ||||||||||||| ||||| ||    
T  16831969 tagcaattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctctgataagacggtcctcattagtagtctgcgtaccagtcaaagcaaacacctttccaccagt 16831870  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgt 200  Q
     ||||||||||| ||||| || ||||| | ||||||||| || ||||| || ||||| || || |||||||| | |||||| || |  |||||   |||     
T  16831869 tctaaccttcttcggctgtgtgcactgtgtactgatatggccctcttcgttgcagttataacatacaacatcaccacgcttgcagtccgctaacacgtga 16831770  T
Q  201 cctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcat-ctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgc---a 296  Q
    || |||| ||  ||||| |||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || || || ||||| ||   |    
T  16831769 cccttctgaccacacctgaagcacttcttctcatccttggt-acaaacattactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacaaactatctcagcagga 16831671  T
Q  297 gcatctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgccct 396  Q
    |||||| || | || |||| |||  ||||    |   |||  || || || |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||      
T  16831670 gcatctctcctattcggcctcctctcatcattaagtctctgcttacccttatcagcaggggcactatacggcttaggatgactctgctgtcccttacctc 16831571  T
Q  397 tcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcct 448  Q
    | | |||| |||  ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  16831570 ttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcatagatcct 16831519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 242 - 477
Target Start/End: Original strand, 12501852 - 12502090
Alignment:
Q  242 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctat 338  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||   |||||| ||||   |||| |||||||||||||| ||  | ||||||||| ||| |    
T  12501852 acaaacattgctcttgtggcctttctcgccacaattgaaacaggtaatctcagcaggaacatccttcttcttaggccgtctttcctcgaccatcctctgt 12501951  T
Q  339 ttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcct 438  Q
    || || || |||||||||||||| || |||||||| ||||||| ||| ||||||  ||||| ||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||    
T  12501952 tttcccttatcagcaggggcactatagggcttagggcgactctactggcccttggtcttccgctcattcacaaccttgtaatgagccctggtatcctcct 12502051  T
Q  439 catagatcctacagctgttaaccaaatctggaaaaactc 477  Q
    ||||||| |||||||| || |||||||||| ||||||||    
T  12502052 catagattctacagctattcaccaaatctgaaaaaactc 12502090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 242 - 511
Target Start/End: Original strand, 16695083 - 16695355
Alignment:
Q  242 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgc---agcatctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctat 338  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||   |||||| ||   |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  ||| |    
T  16695083 acaaacattactcttgcggcctttctcgccacaattgaaacaagtaatctcagctggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgt 16695182  T
Q  339 ttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcct 438  Q
    || |  || |||||||||||||| || ||||| || |||||||| || ||||||  ||||| |||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||    
T  16695183 ttgcacttatcagcaggggcactataaggcttcgggcgactctgatggcccttggtcttccactcatttacaaccttgtaatgagccttagtatcctcct 16695282  T
Q  439 catagatcctacagctgttaaccaaatctggaaaaactctcagccgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 511  Q
    |||||||||| ||||| || || ||||| || |||||||  | | |||| || || |||||||||||||||||    
T  16695283 catagatcctgcagctattcactaaatcagggaaaactcggatctgttggtatccgatcgccctcttgatgtc 16695355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Original strand, 17189062 - 17189335
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| | |||||||||    ||||||||||||||  | |||||||| || ||||| ||    
T  17189062 tagcaattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctctgataagcctgtcctcattagtagtttgcgtaccagtcaacgcaaacactttcccaccggt 17189161  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgt 200  Q
     |||| |||||| ||||| |||||||| |||||||| || || || |||| ||| || || ||||||||||| |  | ||| || ||||| || ||||||    
T  17189162 tctaatcttctttggctgagtacactgtgaactgatgtggccctcctcatcacaattataacaaacaacatcaccccacttgcagttagccaacgtgtgt 17189261  T
Q  201 cctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccaca 274  Q
    ||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||  |  |||||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  17189262 cctttctgaccacacctgaagcacttcttctcatctttggtacaaacgttacttttgtggcctttctcgccaca 17189335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 242 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 23415001 - 23414729
Alignment:
Q  242 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctat 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| || |||||||| ||||   |||| |||||||||||||||||| ||||||||||  ||| |    
T  23415001 acaaacattactcttgtggcctttctcgccatagttgaaacagacaatctccgcaggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgt 23414902  T
Q  339 ttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcct 438  Q
    || || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||  || ||||||  ||||| ||||||||| |||||||  |||||||| ||||||||||    
T  23414901 ttgcccttatcagcaggggcactataaggcttagggcgactctattggcccttggtcttccgctcattcacaaccttgtcatgagccttagtatcctcct 23414802  T
Q  439 catagatcctacagctgttaaccaaatctggaaaaactctcagccgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 511  Q
    | ||||| || ||| | || || ||||| || |||||||  ||| |||| || || || ||||||||||||||    
T  23414801 cgtagattctgcaggtattcactaaatcagggaaaactcggagctgttggtatccgattgccctcttgatgtc 23414729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 454
Target Start/End: Original strand, 15230291 - 15230747
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||  |||||||| |||||  | ||||| ||  | ||||||||||| ||||||||    
T  15230291 tagcaattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctatgataagtcaatcctcattaaccgtccgtgtaccggtcaatgcaaacacctttccacctgt 15230390  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgt 200  Q
    |  | |||||||||||| | | || ||||| || | |||||||||||||| ||| ||| ||||||||| ||| | |||||| || | |||||  || ||     
T  15230391 ctgatccttcttaggcttcctgcattgcgagctaagatgaccttcttcatcacaattgaagcaaacaatatcaccacgcttgcattcagctatcgtatgc 15230490  T
Q  201 cctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag--- 297  Q
    |||||||  |  || |  || ||||| |||||||| |  | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| |||| |||||||| ||||       
T  15230491 cctttcttcccacatcagaaacactttttctcatcaccattacaaacattactcttgtggcccttttcaccacacttgtagcaaacaatctcagcaggaa 15230590  T
Q  298 catctttcttcttaggccgcctaacatc-gaccatcttctatttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgccct 396  Q
    |||||||  ||||||||| |||  ||||     ||||| |  ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||  || || || |||  |     
T  15230591 catcttttctcttaggcctcctctcatcatttaatctt-tgcttccctttgtcagcaggagcactatagggcttaggacgaccttgttggcctttgttcc 15230689  T
Q  397 tcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctacagct 454  Q
    || ||||| |||  ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15230690 tcttctcactcataaccttataatgagctttggtatcctcctcatagattctacagct 15230747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 454
Target Start/End: Original strand, 15236159 - 15236615
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||  |||||||| |||||  | ||||| ||  | ||||||||||| ||||||||    
T  15236159 tagcaattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctatgataagtcaatcctcattaaccgtccgtgtaccggtcaatgcaaacacctttccacctgt 15236258  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgt 200  Q
    |  | |||||||||||| | | || ||||| || | |||||||||||||| ||| ||| ||||||||| ||| | |||||| || | |||||  || ||     
T  15236259 ctgatccttcttaggcttcctgcattgcgagctaagatgaccttcttcatcacaattgaagcaaacaatatcaccacgcttgcattcagctatcgtatgc 15236358  T
Q  201 cctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag--- 297  Q
    |||||||  |  || |  || ||||| |||||||| |  | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| |||| |||||||| ||||       
T  15236359 cctttcttcccacatcagaaacactttttctcatcaccattacaaacattactcttgtggcccttttcaccacacttgtagcaaacaatctcagcaggaa 15236458  T
Q  298 catctttcttcttaggccgcctaacatc-gaccatcttctatttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgccct 396  Q
    |||||||  ||||||||| |||  ||||     ||||| |  ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||  || || || |||  |     
T  15236459 catcttttctcttaggcctcctctcatcatttaatctt-tgcttccctttgtcagcaggagcactatagggcttaggacgaccttgttggcctttgttcc 15236557  T
Q  397 tcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctacagct 454  Q
    || ||||| |||  ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15236558 tcttctcactcataaccttataatgagctttggtatcctcctcatagattctacagct 15236615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 242 - 448
Target Start/End: Original strand, 17497610 - 17497819
Alignment:
Q  242 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctat 338  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | || || |||||||||||||   |||| ||||||||||||   ||| | ||||||||||||| |    
T  17497610 acaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctgcaggagcatccttcttcttaggctatctatcttcgaccatcttctgt 17497709  T
Q  339 ttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcct 438  Q
    || || || |||||| ||| |||||| |||||||| ||||||||||| |||||   ||||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||    
T  17497710 ttgcccttatcagcaagggtactgtaaggcttagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcct 17497809  T
Q  439 catagatcct 448  Q
    | ||||||||    
T  17497810 cctagatcct 17497819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 242 - 463
Target Start/End: Original strand, 15065990 - 15066214
Alignment:
Q  242 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctat 338  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||| | ||||   |||| |||||| | ||||| ||| ||||||||||  ||| |    
T  15065990 acaaacattgctcttgtggcctttctcaccacaattaaaacagacaatcgcagcaggagcatccttcttccttggccgtctatcatcgaccattctctgt 15066089  T
Q  339 ttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcct 438  Q
    || || || |||||||||| ||| || |||||||| ||||||||||| |||||   ||||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||| ||||    
T  15066090 ttgcccttatcagcaggggaactatagggcttagggcgactctgctggcccttagtcttccgctcattcaccatcttgtaatgagccttggtatcttcct 15066189  T
Q  439 catagatcctacagctgttaaccaa 463  Q
    |||| || ||||||||||| |||||    
T  15066190 cataaattctacagctgttcaccaa 15066214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 242 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 23079228 - 23079004
Alignment:
Q  242 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctat 338  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||| | ||||   |||| |||||| | ||||| ||| | ||||||||| ||| |    
T  23079228 acaaacattgctcttgtggcctttctcaccacaattaaaacaaacaatcacagcaggagcatccttcttccttggccgtctatcctcgaccatcctctgt 23079129  T
Q  339 ttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcct 438  Q
    || || || |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||   ||||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| |    
T  23079128 tttcccttatcagcaggggcactataaggcttagggcgactctgctggcccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctctt 23079029  T
Q  439 catagatcctacagctgttaaccaa 463  Q
    |||| ||||| || ||||| |||||    
T  23079028 cataaatcctgcaactgttcaccaa 23079004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Original strand, 24189992 - 24190265
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| | |||||| ||    || |||||||||||  | |||||| | || ||||| ||    
T  24189992 tagcaattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctctgataagcctgtcctcgttagtagtctgcgtaccagtcaacgcaaactctttcccaccggt 24190091  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgt 200  Q
     |||| |||||| ||||| |||||||| |||||||| || || || |||| ||| || || ||||||||||| |  | ||| || ||||| || ||||||    
T  24190092 tctaatcttctttggctgagtacactgtgaactgatgtggccctcctcatcacaattataacaaacaacatcaccccacttgcagttagccaacgtgtgt 24190191  T
Q  201 cctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccaca 274  Q
    ||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||  |  |||||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  24190192 cctttctgaccacacctgaagcacttcttctcatctttggtacaaacgttacttttgtggcctttctcgccaca 24190265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 242 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 14578632 - 14578423
Alignment:
Q  242 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctat 338  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||  |||   ||||||||||  |||| |||||| |||| |||||  ||| |    
T  14578632 acaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagcatagcacacaatctcaacaggagcatctttctttctagggcgcctatcatcaaccattctctgt 14578533  T
Q  339 ttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcct 438  Q
    || || || || ||||| ||| |||| ||||||||||| |||||||| |||||| |||||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||| ||||    
T  14578532 ttacccttatcggcaggagcattgtaaggcttaggacggctctgctgacccttggccttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcatcct 14578433  T
Q  439 catagatcct 448  Q
    |||| |||||    
T  14578432 cataaatcct 14578423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 86 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 16384728 - 16384358
Alignment:
Q  86 caccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaa 185  Q
    |||||| ||||| || ||||||||||| ||||| || ||||| | ||||||||| || ||||||||||| || ||||| |||||||| | |||||| |||    
T  16384728 cacctttccaccagttctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatatggccctcttcattacaattatagcatacaacatcaccacgcttgcaa 16384629  T
Q  186 ttagctaaagtgtgtcctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcat-ctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcac 284  Q
    | ||| ||  |||| || |||| ||  ||||| |||||||||||||||| || ||| |||||| |||||||||||| ||||||| ||||| || || ||     
T  16384628 tcagccaacatgtgacccttctgaccacacctgaagcacttcttctcatccttggt-acaaacgttactcttgtggactttctcgccacacttaaaacaa 16384530  T
Q  285 acaatctctgc---agcatctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactct 381  Q
    || ||||| ||   ||||||| || | || |||| |||  ||||    |   |||  || || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16384529 actatctcagcaggagcatctctcctattcggcctcctctcatcattaagtctctgcttacccttgtcagcaggggcactgtatggcttaggacgactct 16384430  T
Q  382 gctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctacagc 453  Q
    | |||||||| ||  | | |||| |||  ||||| || ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  16384429 gttgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttgctgtcctcctcatagatcctacagc 16384358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 242 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 14873796 - 14873572
Alignment:
Q  242 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgca---gcatctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctat 338  Q
    |||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| |||   ||||| |||||| | ||||| ||| | ||||||||| ||| |    
T  14873796 acaagcattgctcttatggcctttctcaccacaattaaaacagacaatctcagcatgagcatccttcttcctcggccgtctatcctcgaccatcctctgt 14873697  T
Q  339 ttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcct 438  Q
    || || || |||||| ||||| | || |||||||| |||||||| || |||||   ||||| | ||||||| | |||||| |||||||||||||||||||    
T  14873696 ttgcccttatcagcaagggcattatagggcttagggcgactctgttggcccttagtcttccgcacattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcct 14873597  T
Q  439 catagatcctacagctgttaaccaa 463  Q
    |||| ||||| || ||||| |||||    
T  14873596 catatatcctgcaactgttcaccaa 14873572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Original strand, 13944712 - 13945008
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||  | || || ||||||||  ||||||| || || |||||       
T  13944712 tagcaattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctctgatgagacggtcctcattagcagtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaac 13944811  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgt 200  Q
     ||||||||||| ||||| || ||||| | |||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||| |  ||||| ||||  ||||   ||||     
T  13944812 tctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtggccctcttcattacaattatagcatacaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtga 13944911  T
Q  201 cctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcat-ctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag 297  Q
    || ||||  |  || || || ||||||||||||| || ||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||    
T  13944912 cccttctgtccacatctgaaacacttcttctcatccttggt-acaaacgttactcttgtgacctttctcgccacacttaaagcacactatctcagcag 13945008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 242 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 12843314 - 12843105
Alignment:
Q  242 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctat 338  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||  |||   ||||||||||| ||||||||||  |||| | |||  ||| |    
T  12843314 acaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtatagcagacaatctcaacaggagcatctttcttcctaggccgcctctcatcaatcattctctgt 12843215  T
Q  339 ttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcct 438  Q
    || || || |||||||| ||||| ||  |||| |||||||||||||| || ||| | || | ||||||||| | |||||| |||||||| ||||||||||    
T  12843214 ttgcccttatcagcaggagcactataaagctttggacgactctgctgacctttgacttttcgctcattcacaatcttgtaatgagccttagtatcctcct 12843115  T
Q  439 catagatcct 448  Q
    |||| |||||    
T  12843114 cataaatcct 12843105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 8744831 - 8744535
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||  | || || ||||||||  ||||||| || || |||||       
T  8744831 tagcaattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctctgatgagacggtcctcattagcagtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaac 8744732  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgt 200  Q
     ||||||||||| || || || ||||| | |||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||| |  ||||| ||||  ||||   ||||     
T  8744731 tctaaccttcttcggttgtgtgcactgagtactgatgtggccctcttcattacaattatagcatacaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtga 8744632  T
Q  201 cctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcat-ctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag 297  Q
    || ||||  |  || || || ||||||||||||| || ||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||    
T  8744631 cccttctgtccacatctgaaacacttcttctcatccttggt-acaaacgttactcttgtgacctttctcgccacacttaaagcacactatctcagcag 8744535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 10417486 - 10417345
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||    || |||||||||||  ||||||| || || || || ||    
T  10417486 tagcaattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctctgataagtcgatcctcattggtagtctgcgtaccagtcaaagcaaatacttttcctccagt 10417387  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgacc 142  Q
     || ||||||||||| ||||  ||||||||||| || |||||    
T  10417386 tctgaccttcttaggttgcgggcactgcgaactaatgtgacc 10417345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 13317975 - 13317864
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||    || |||||||||||  |||||||||| || ||||| ||    
T  13317975 tagcaattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctctgataagacggtcctcattagtagtctgcgtaccagtcaaagcaaacacttttccaccagt 13317876  T
Q  101 cctaaccttctt 112  Q
     || ||||||||    
T  13317875 tctgaccttctt 13317864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 12509924 - 12509867
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcatt 58  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12509924 tagcaattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctctgataagtcggtcctcatt 12509867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 66 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 2247230 - 2247124
Alignment:
Q  66 tgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaa 165  Q
    |||||||||||  ||||||| ||||| ||||| |||    |||||||||||| | | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2247230 tgcgtaccagtcaaagcaaaaaccttcccaccagtctgggccttcttaggcttcttgcactgcgaactaatatgaccttcttcattacagttatagcaaa 2247131  T
Q  166 caacatc 172  Q
    | |||||    
T  2247130 ctacatc 2247124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 16378375 - 16378285
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacacctt 91  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||| |||||||||||    || |||||||||||  ||||||| |||||    
T  16378375 tagcaattaaaggagtactattaaagaaacaagcacctctgataagacggtcctcattagtagtctgcgtaccagtccaagcaaatacctt 16378285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 2037248 - 2037057
Alignment:
Q  106 ccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgtccttt 205  Q
    |||||||||||| | | ||||||||||| | ||||||||| |||| ||| ||| | ||||||| ||| | |||||| || | |||||  || || |||||    
T  2037248 ccttcttaggcttcttgcactgcgaactaagatgaccttcctcatcacaattgaaacaaacaatatcaccacgcttgcattcagctattgtatgcccttt 2037149  T
Q  206 ctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag 297  Q
    ||  |  || |  |||||||||||||| || |  |  |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||    
T  2037148 cttcccacatcggaagcacttcttctcctcaccattgcaaacattactcttgtggcccttctcaccacacttgtagcaaacaatctcagcag 2037057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 2040989 - 2040798
Alignment:
Q  106 ccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgtccttt 205  Q
    |||||||||||| | | ||||||||||| | ||||||||| |||| ||| ||| | ||||||| ||| | |||||| || | |||||  || || |||||    
T  2040989 ccttcttaggcttcttgcactgcgaactaagatgaccttcctcatcacaattgaaacaaacaatatcaccacgcttgcattcagctattgtatgcccttt 2040890  T
Q  206 ctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag 297  Q
    ||  |  || |  |||||||||||||| || |  |  |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||    
T  2040889 cttcccacatcggaagcacttcttctcctcaccattgcaaacattactcttgtggcccttctcaccacacttgtagcaaacaatctcagcag 2040798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 297
Target Start/End: Original strand, 14039539 - 14039730
Alignment:
Q  106 ccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgtccttt 205  Q
    |||||||||||| | | ||||||||||| | ||||||||| |||| ||| ||| | ||||||| ||| | |||||| || | |||||  || || |||||    
T  14039539 ccttcttaggcttcttgcactgcgaactaagatgaccttcctcatcacaattgaaacaaacaatatcaccacgcttgcattcagctattgtatgcccttt 14039638  T
Q  206 ctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag 297  Q
    ||  |  || |  |||||||||||||| || |  |  |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||    
T  14039639 cttcccacatcggaagcacttcttctcctcaccattgcaaacattactcttgtggcccttctcaccacacttgtagcaaacaatctcagcag 14039730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 15013206 - 15013115
Alignment:
Q  5 aattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccac 96  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | || || ||||||||| | || || ||||||| | ||||||||||||| ||||    
T  15013206 aattaaaggagtgctattaatgaaacatgtacctctgattagacgatcctcattcgctgtctgagtaccagctaaagcaaacaccttcccac 15013115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 249 - 442
Target Start/End: Original strand, 19727686 - 19727881
Alignment:
Q  249 ttactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagca---tctttcttcttaggccgcctaacatcgacca-tcttctatttccct 344  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |  |||| |||||||| ||| ||   |||||||| ||||||| |||  ||||   || |||| | ||| ||     
T  19727686 ttactcttatggcctttctcaccacaagtatagcaaacaatctcagcaacaacatctttctttttaggcctcctctcatcattcaatctt-tgtttgccc 19727784  T
Q  345 ttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcata 442  Q
    || |||||||| |||||||| ||||| ||| |||| ||||| || ||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  19727785 ttatcagcaggagcactgtaaggctttggaagactttgctgacc-ttgccttttctctcattcacaaccttgtaatgagccttagtatcttcctcata 19727881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 359 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 13028437 - 13028348
Alignment:
Q  359 actgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcct 448  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||| || || | | || |||||||||||| |||| | ||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  13028437 actgtaaggctttggacgactctgctggcctttactcctcttctcattcactatcttgaaatgagctttggtatcctcctcctagatcct 13028348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 348 - 445
Target Start/End: Original strand, 15262658 - 15262755
Alignment:
Q  348 tcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagat 445  Q
    |||||||| ||  |||| ||||| |||||||| || ||  | ||||| |||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  15262658 tcagcaggagcgttgtaaggctttggacgactttgttgatctttgcctttccgctcattcacaaccttgtaatgagccttagtatcctcctcatagat 15262755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 345 - 454
Target Start/End: Original strand, 17189409 - 17189518
Alignment:
Q  345 ttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcataga 444  Q
    |||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  | |  ||| |||  |||||||| ||||| || || ||||| |||||||    
T  17189409 ttgttagcaggagcactgtacggcttcggacgactctgctggcccttgcctctgcggtcactcatcaccttgtaatgagcttttgtgtcctcttcataga 17189508  T
Q  445 tcctacagct 454  Q
    | ||||||||    
T  17189509 ttctacagct 17189518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 243 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 15008783 - 15008729
Alignment:
Q  243 caaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag 297  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| |||||||| ||||    
T  15008783 caaacattactcttgtggcctctctcaccacacttgtagcaaacaatctcagcag 15008729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 450 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 5108542 - 5108481
Alignment:
Q  450 cagctgttaaccaaatctggaaaaactctcagccgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 511  Q
    ||||| |||||||||||  |||||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||    
T  5108542 cagctattaaccaaatcctgaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 5108481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 345 - 454
Target Start/End: Original strand, 24190339 - 24190447
Alignment:
Q  345 ttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcataga 444  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||  | |  ||| |||  |||||||| ||||| || || ||||| |||||||    
T  24190339 ttgtcagcaggagcactgtacggcttcggacgactctgctg-gccttgcctctgcggtcagtcatcaccttgtaatgagctttcgtgtcctcttcataga 24190437  T
Q  445 tcctacagct 454  Q
    | ||||||||    
T  24190438 ttctacagct 24190447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 138 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 13317873 - 13317737
Alignment:
Q  138 tgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgtcctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctc 237  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| |||||| ||||  ||||||   || ||||| | ||  || || || |||||||||||||||     
T  13317873 tgaccttcttcattacagttataacaaaccacatccccacgcttgcaatccgctaaaacatgacctttttgaccacatctgaaacacttcttctcatctt 13317774  T
Q  238 ggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccaca 274  Q
     |   ||||||||||| |||||||||||  |||||||    
T  13317773 tggtgcaaacattacttttgtggccttttgcaccaca 13317737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 411 - 455
Target Start/End: Original strand, 17494751 - 17494795
Alignment:
Q  411 accttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctacagctg 455  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17494751 accttgtaatgagctttggtatcctcctcatagattctacagctg 17494795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 354 - 453
Target Start/End: Original strand, 13945068 - 13945167
Alignment:
Q  354 ggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctacagc 453  Q
    |||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| ||  | | |||| |||  ||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  13945068 ggggcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctacagc 13945167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 417 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 2036934 - 2036840
Alignment:
Q  417 tagtgagccttggtatcctcctcatagatcctacagctgttaaccaaatctggaaaaactctcagccgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 511  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| || | ||| ||||| | | | ||||||||||| || ||||| |||||    
T  2036934 tagtgagctttggtatcctcctcatatatcctgcagctattcaccaactcggaaaagactctgatctgctgatacccaatagctctcttaatgtc 2036840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 417 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 2040675 - 2040581
Alignment:
Q  417 tagtgagccttggtatcctcctcatagatcctacagctgttaaccaaatctggaaaaactctcagccgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 511  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| || | ||| ||||| | | | ||||||||||| || ||||| |||||    
T  2040675 tagtgagctttggtatcctcctcatatatcctgcagctattcaccaactcggaaaagactctgatctgctgatacccaatagctctcttaatgtc 2040581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 413 - 511
Target Start/End: Original strand, 14039849 - 14039947
Alignment:
Q  413 cttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctacagctgttaaccaaatctggaaaaactctcagccgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 511  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| || | ||| ||||| | | | ||||||||||| || ||||| |||||    
T  14039849 cttatagtgagctttggtatcctcctcatatatcctgcagctattcaccaactcggaaaagactctgatctgctgatacccaatagctctcttaatgtc 14039947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 237; Significance: 1e-131; HSPs: 45)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 247 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 44383077 - 44382813
Alignment:
Q  247 cattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttcccttt 346  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  44383077 cattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcaacatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttcccctt 44382978  T
Q  347 gtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatc 446  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44382977 gtcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatc 44382878  T
Q  447 ctacagctgttaaccaaatctggaaaaactctcagccgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 511  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44382877 ctgcagctgttaaccaaatctggaaaaactctcagccgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 44382813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 252 - 511
Target Start/End: Original strand, 9338523 - 9338782
Alignment:
Q  252 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcag 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9338523 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttgtcag 9338622  T
Q  352 caggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctaca 451  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  9338623 cgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctgca 9338722  T
Q  452 gctgttaaccaaatctggaaaaactctcagccgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 511  Q
    ||| |||||||| ||  |||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||    
T  9338723 gctattaaccaagtcctgaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccctcttgatgtc 9338782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 252 - 511
Target Start/End: Original strand, 9487157 - 9487416
Alignment:
Q  252 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcag 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9487157 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttgtcag 9487256  T
Q  352 caggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctaca 451  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  9487257 cgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctgca 9487356  T
Q  452 gctgttaaccaaatctggaaaaactctcagccgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 511  Q
    ||| |||||||| ||  |||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||    
T  9487357 gctattaaccaagtcctgaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccctcttgatgtc 9487416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 252 - 511
Target Start/End: Original strand, 16984181 - 16984440
Alignment:
Q  252 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcag 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16984181 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcattcttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttgtcag 16984280  T
Q  352 caggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctaca 451  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16984281 cgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctgca 16984380  T
Q  452 gctgttaaccaaatctggaaaaactctcagccgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 511  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||| | || || ||||||||||||||||||||    
T  16984381 gctgttaaccaaatcctgaaaaactctcagctgctggtatccaatcgccctcttgatgtc 16984440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 255 - 511
Target Start/End: Original strand, 24265314 - 24265570
Alignment:
Q  255 ttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcagcag 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24265314 ttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttatcagcag 24265413  T
Q  355 gggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctacagct 454  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||    
T  24265414 gggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgccctttctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcgtagatcctgcagct 24265513  T
Q  455 gttaaccaaatctggaaaaactctcagccgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 511  Q
     |||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  24265514 attaaccaagtctgaaaaaactctcagctgttgatacccaatcgccctcttaatgtc 24265570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 252 - 511
Target Start/End: Original strand, 17001941 - 17002200
Alignment:
Q  252 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcag 351  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||    
T  17001941 ctcttgtggcctttctcgccacaattgaagcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgttttcctttatcag 17002040  T
Q  352 caggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctaca 451  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  17002041 caggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctgca 17002140  T
Q  452 gctgttaaccaaatctggaaaaactctcagccgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 511  Q
    ||| |||||||| ||  |||||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||    
T  17002141 gctattaaccaagtcctgaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 17002200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 252 - 511
Target Start/End: Original strand, 27374210 - 27374469
Alignment:
Q  252 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcag 351  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27374210 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttgtcag 27374309  T
Q  352 caggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctaca 451  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||    
T  27374310 cgggggcactgtacggcttaggacgactctgcagtcccttgcccttcctttcattcactaccttatagtgagccttcgtatcctcttcgtagatcctgca 27374409  T
Q  452 gctgttaaccaaatctggaaaaactctcagccgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 511  Q
    ||| |||||||||||  |||||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||    
T  27374410 gctattaaccaaatcctgaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 27374469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 255 - 511
Target Start/End: Original strand, 10871794 - 10872050
Alignment:
Q  255 ttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcagcag 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  10871794 ttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaagctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcag 10871893  T
Q  355 gggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctacagct 454  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  10871894 gggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcttcgtagatcctgcagct 10871993  T
Q  455 gttaaccaaatctggaaaaactctcagccgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 511  Q
     |||||||||||  |||||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||    
T  10871994 attaaccaaatcctgaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 10872050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 255 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 22322841 - 22322585
Alignment:
Q  255 ttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcagcag 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |    
T  22322841 ttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctccgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttacctttgtcagcgg 22322742  T
Q  355 gggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctacagct 454  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  22322741 gggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagct 22322642  T
Q  455 gttaaccaaatctggaaaaactctcagccgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 511  Q
     |||||||||||  |||||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||    
T  22322641 attaaccaaatcctgaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 22322585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 255 - 511
Target Start/End: Original strand, 24712978 - 24713234
Alignment:
Q  255 ttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcagcag 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |    
T  24712978 ttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttacctttgtcagcgg 24713077  T
Q  355 gggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctacagct 454  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  24713078 gggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgccctttctttcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagct 24713177  T
Q  455 gttaaccaaatctggaaaaactctcagccgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 511  Q
     |||||||||||  |||||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||    
T  24713178 attaaccaaatcctgaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 24713234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 246 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 24874258 - 24873993
Alignment:
Q  246 acattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctt 345  Q
    ||||| || |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| | | |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||    
T  24874258 acattgcttttgtggcctttcccaccacagttgaaacacacaatctcagtaacatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccatcctctgtttccctt 24874159  T
Q  346 tgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagat 445  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  24874158 tatcagcaggggcactgtacggcttagaacgactctgccgtcccttgcccttcctctcgttcactatcttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagat 24874059  T
Q  446 cctacagctgttaaccaaatctggaaaaactctcagccgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 511  Q
    ||| || || || |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24874058 cctgcaactatttaccaaatctggaaaaactctaagctgttgatacccaatcgcccttttgatgtc 24873993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 511
Target Start/End: Original strand, 20848279 - 20848789
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    || |||||||||||  ||||||||||||| |||||  |    
T  20848279 tagcaattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctctgataagtcggtcctcattaggagtctgcgtaccagtcaaagcaaacacctttccaccaat 20848378  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgt 200  Q
     |||  |||||| ||||  | |||||| |||||||||||||||||  |||| |||||||| || ||||  |||| |||||| || | ||||||| ||||     
T  20848379 tctagtcttcttcggctcaggacactgtgaactgatatgaccttccccattgcagttgtaacagacaatgtccccacgcttgcattcagctaaactgtga 20848478  T
Q  201 cctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatct---ctgcag 297  Q
    || |||| ||  ||||| ||||||||| | |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||   | | ||    
T  20848479 cccttctgaccacacctgaagcacttcctatcatctcttccacaaacattactcttgtggcctttctcaccacacttgtagca-acaatctcaacaggag 20848577  T
Q  298 catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgccctt 397  Q
    ||||| || ||||  |   |||| ||||  |||||||||  || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| |||||||| ||| |    
T  20848578 catctctcctctt--ggatcctatcatcacccatcttctgctttcctttgtcagcaggagcactgtaaggcttaggacgattctgttgtcccttacccct 20848675  T
Q  398 cctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctacagctgttaaccaaatctggaaaaactctcagccgttgatacccaatc 497  Q
    ||||||| |||  | ||| || ||||| ||||| || || ||||| || || || ||||||||||| || | ||| | ||| | | ||||||| |||||     
T  20848676 cctctcactcataatcttataatgagctttggtgtcttcttcataaattctgcacctgttaaccaactcagaaaagattctgatctgttgatatccaata 20848775  T
Q  498 gccctcttgatgtc 511  Q
    || |||||||||||    
T  20848776 gctctcttgatgtc 20848789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 455
Target Start/End: Original strand, 23274283 - 23274740
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| |    |||||| |||||||   ||||||||| || ||||| ||    
T  23274283 tagcaattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctctgataagtcgatcctcactagtggtttgcataccagtcagagcaaacactttaccaccagt 23274382  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgt 200  Q
    |||||||||||| || || || ||||| ||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||| |  || |  |||||||||| |||||| ||||||    
T  23274383 cctaaccttcttcggttgtgtgcactgtgaactgatatggccctcctcattgcagttatagcaaactatgtctccccgcttacaatcagctaatgtgtgt 23274482  T
Q  201 cctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctc---tgcag 297  Q
    || ||||  |  ||||| ||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||| ||    | ||    
T  23274483 cccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatctttagtacaaacattactcttgtggcctttctcaccacacttgttgcaaacaatttcagtaggag 23274582  T
Q  298 catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgccctt 397  Q
    ||||| || |||| |||| |||  ||||    | | |||  || || ||||||||||| ||||| ||| |||| ||||||||||| |||||||||||| |    
T  23274583 catctctcctcttgggcctcctctcatcatttaacctctgcttacccttgtcagcaggagcactatactgcttcggacgactctgttgtcccttgcccct 23274682  T
Q  398 cctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctacagctg 455  Q
     |  ||| |||  |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  23274683 acgttcactcatcaccttgtaatgagccttcgtatcctcttcatagatcctacagctg 23274740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 19716770 - 19716497
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||| |    || |||||||||||  | |||||||| || ||||| ||    
T  19716770 tagcaattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctttgataagtcggtcctcactagtagtctgcgtaccagtcaatgcaaacactttcccaccggt 19716671  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgt 200  Q
     ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || ||||  || ||||| || ||||||||||| |||||||| |||| ||||| |||||||    
T  19716670 tctaaccttcttcggctgtgtgcactgcgaactgatatggccctctttgttgcagttataacaaacaacatcactacgcttgcaatcagctagagtgtgt 19716571  T
Q  201 cctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccaca 274  Q
    ||||||| ||  ||||| || |||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19716570 cctttctgaccacacctgaaacacttcttctcatctttagtacaaacattactcttgtggcctttctcgccaca 19716497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 19721333 - 19721060
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||| |    || |||||||||||  | |||||||| || ||||| ||    
T  19721333 tagcaattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctttgataagtcggtcctcactagtagtctgcgtaccagtcaatgcaaacactttcccaccggt 19721234  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgt 200  Q
     ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || ||||  || ||||| || ||||||||||| |||||||| |||| ||||| |||||||    
T  19721233 tctaaccttcttcggctgtgtgcactgcgaactgatatggccctctttgttgcagttataacaaacaacatcactacgcttgcaatcagctagagtgtgt 19721134  T
Q  201 cctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccaca 274  Q
    ||||||| ||  ||||| || |||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19721133 cctttctgaccacacctgaaacacttcttctcatctttagtacaaacattactcttgtggcctttctcgccaca 19721060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 242 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 23116571 - 23116299
Alignment:
Q  242 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctat 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| || |||||||||| ||   |||| |||||||||||||||||| ||||||||||  |||      
T  23116571 acaaacattactcttgtggcctttcccgccacagttgaaacaaacaatctctgaaggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgc 23116472  T
Q  339 ttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcct 438  Q
    || || || |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||  |||||   |||||||||||| || |||||||| |||||  |||||||||| |    
T  23116471 ttgcccttatcagcaggggcactataaggcttagggcgactctgcttgcccttagtcttcctctcattaacaaccttgtaatgagctctggtatcctctt 23116372  T
Q  439 catagatcctacagctgttaaccaaatctggaaaaactctcagccgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 511  Q
    | ||||||||||||||||| || ||||| || |||||||  ||  |||| || || |||||||||||||||||    
T  23116371 cgtagatcctacagctgttcactaaatcagggaaaactcggagttgttggtatccgatcgccctcttgatgtc 23116299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 242 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 24704994 - 24704758
Alignment:
Q  242 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctat 338  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||   |||| ||||||||||| || ||  | ||||||||| | | |    
T  24704994 acaaacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacagataatctcagcaggaacatccttcttcttaggtcgtctttcctcgaccatcctatgt 24704895  T
Q  339 ttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcct 438  Q
    || || || |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||   ||||  ||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||    
T  24704894 ttgcccttatcagcaggggcactatagggcttagggcgactctgctggcccttagtcttctgctcattcacaaccttgtaatgagccctggtatcctcct 24704795  T
Q  439 catagatcctacagctgttaaccaaatctggaaaaac 475  Q
    ||||||| |||||||| || |||||||||||||||||    
T  24704794 catagattctacagctattcaccaaatctggaaaaac 24704758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 354 - 454
Target Start/End: Original strand, 16931598 - 16931698
Alignment:
Q  354 ggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctacagc 453  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16931598 ggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctgcagc 16931697  T
Q  454 t 454  Q
    |    
T  16931698 t 16931698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 23097771 - 23097475
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||  |||| | |||||||||    || |||||||||||  ||||||||||||| ||||| ||    
T  23097771 tagcaattaaaggagtactattaaagaatcaagtacctcttataagcctgtcctcattagtagtctgcgtaccagtcaaagcaaacaccttcccaccagt 23097672  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgt 200  Q
     |||| |||||| ||||| || ||||| |||||||| || || || |||| ||| || || ||||||||||| |  | ||| || ||||| || ||||||    
T  23097671 tctaatcttctttggctgagtgcactgtgaactgatgtggccctcctcatcacaattataacaaacaacatcacccctcttgcagttagccaatgtgtgt 23097572  T
Q  201 cctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag 297  Q
    ||||||| ||  ||| | ||||||||||||| ||||  |  |||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||    
T  23097571 cctttctgaccacacttgaagcacttcttctgatctttggtacaaacattacttttgtggcctttctcgccacacttaaagcaaactatctcagcag 23097475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 242 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 24657170 - 24656898
Alignment:
Q  242 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctat 338  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||| ||||   |||| || ||||||||||| ||  | ||||||||| ||| |    
T  24657170 acaaacagtactcttgtggcctttctcaccacaattgaaacaagtaatctcagcaggaacatcctttttcttaggccgtctctcctcgaccatcctctgt 24657071  T
Q  339 ttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcct 438  Q
    || || || |||| ||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||   ||||| |||||| || |||||||| |||||  |||| |||||||    
T  24657070 ttgcccttatcagtaggggcactatagggcttagggcgactctgctggcccttagtcttccgctcattaacaaccttgtaatgagctctggtgtcctcct 24656971  T
Q  439 catagatcctacagctgttaaccaaatctggaaaaactctcagccgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 511  Q
    ||||||| || ||||| || | |||||||||||||||||  | | |||| || || ||||||||||| |||||    
T  24656970 catagattctgcagctattcatcaaatctggaaaaactcggatctgttggtatccgatcgccctcttaatgtc 24656898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 242 - 463
Target Start/End: Original strand, 24678418 - 24678642
Alignment:
Q  242 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctat 338  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||   |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| |    
T  24678418 acaagcattgctcttgtggcctttctcaccacaattaaagcagacaatctcagcaggaacatccttcttcttaggccgtctatcatcgaccatcctctgt 24678517  T
Q  339 ttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcct 438  Q
    || || || ||||||||||| || || |||||||| |||||||  || |||||   ||||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| |    
T  24678518 ttgcccttatcagcaggggcgctatagggcttagggcgactctattggcccttagtcttccgctcattcacgatcttgtaatgagccttggtatcctcgt 24678617  T
Q  439 catagatcctacagctgttaaccaa 463  Q
    |||| || || || ||||| |||||    
T  24678618 cataaattctgcaactgttcaccaa 24678642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 242 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 22462993 - 22462778
Alignment:
Q  242 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctat 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||   |||| ||||||||||||| |||| ||||||||||  ||| |    
T  22462993 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacagttgaaacaaacaatctccgcaggagcatccttcttcttaggccacctatcatcgaccattctctgt 22462894  T
Q  339 ttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcct 438  Q
    |  || || | || ||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||  ||||| |||||| || |||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  22462893 tcgcccttattagaaggggcactataaggcttagggcgactctgctggcccttggtcttccgctcatttacaaccttgtaatgagcctttgtatcttcct 22462794  T
Q  439 catagatcctacagct 454  Q
    | ||||| || |||||    
T  22462793 cgtagattctgcagct 22462778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 242 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 22733286 - 22733077
Alignment:
Q  242 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctat 338  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | || || ||||| |||| ||   |||| |||||||||||| | ||| | ||||||||  ||| |    
T  22733286 acaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatttctggaggagcatccttcttcttaggctgtctatcttcgaccattctctct 22733187  T
Q  339 ttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcct 438  Q
    || || || |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| |||||   ||||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||    
T  22733186 ttgcccttatcagcaggggcactgtaaagcttagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcct 22733087  T
Q  439 catagatcct 448  Q
    | || |||||    
T  22733086 cgtaaatcct 22733077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 242 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 23040089 - 23039880
Alignment:
Q  242 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctat 338  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||   || || |||||||||| ||   |||| |||||||||||||| ||| | ||||||||| ||| |    
T  23040089 acaagcattactcttgtggcccttctcaccacaagaaaaacagacaatctctgtaggagcatccttcttcttaggccgtctaccttcgaccatcctctgt 23039990  T
Q  339 ttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcct 438  Q
    || || || ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||   ||||| ||||||||| | |||||| ||||||||  |||||||||    
T  23039989 ttgcccttatcagcaggggcactgtaaggcttagggagactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttaatatcctcct 23039890  T
Q  439 catagatcct 448  Q
    | ||||||||    
T  23039889 cgtagatcct 23039880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 242 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 23028973 - 23028750
Alignment:
Q  242 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctat 338  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||  || || |||||||| ||||   |||| |||||| | ||||| ||| | ||||||||| ||| |    
T  23028973 acaagcattgctcttgtggcctttctcaccacaataaaa-cagacaatctcagcaggagcatccttcttccttggccgtctatcctcgaccatcctctgt 23028875  T
Q  339 ttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcct 438  Q
    || || || |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| || ||    |||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||    
T  23028874 ttgcccttatcagcaggggcactatagggcttagggcgactctgctggcctttagtattccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcct 23028775  T
Q  439 catagatcctacagctgttaaccaa 463  Q
    |||| || ||||| ||||| |||||    
T  23028774 cataaattctacaactgttcaccaa 23028750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 242 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 22742478 - 22742281
Alignment:
Q  242 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagca---tctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctat 338  Q
    |||| |||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||  |||||   || |||||| | ||||| ||| | || |||||  ||| |    
T  22742478 acaagcattgctcttgtggcatttctcaccacaattaaagcagacaatctcaccagcaacatccttcttcctcggccgtctatcctcaaccattctctgt 22742379  T
Q  339 ttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctc 436  Q
    || || || |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||   ||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  22742378 ttgcccttatcagcaggggcactataaggcttagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacgaccttgtaatgagccttggtatcctc 22742281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Original strand, 12577043 - 12577339
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||  | || || ||||||||  ||||||| || || |||||       
T  12577043 tagcaattaaaggaatactattaaagaaacaagtacctctgatgaggcggtcctcattagcagtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaac 12577142  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgt 200  Q
     ||||||||||| ||||| || ||||| | |||||| ||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| |  ||||| ||||  ||||   ||||     
T  12577143 tctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatagcatacaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtga 12577242  T
Q  201 cctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcat-ctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag 297  Q
    || ||||  |  || || || ||||||||||||| || ||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||    
T  12577243 cccttctgtccacatctgaaacacttcttctcatccttggt-acaaacgttactcttgtgacctttctcgccacacttaaagcacactatctcagcag 12577339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 246 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 21139489 - 21139392
Alignment:
Q  246 acattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccc 343  Q
    ||||| || |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||    
T  21139489 acattgcttttgtggccttttccaccacaattgaaacacacaatctctgtagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccatcctctgtttccc 21139392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 242 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 21320515 - 21320312
Alignment:
Q  242 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctat 338  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||| ||||   |||| |||||||||||||||||| | ||||||||  | | |    
T  21320515 acaagcattgctcttgtggcctttctcgccacaattaaaacagacaatctcagcagggacatccttcttcttaggccgcctatcctcgaccattctttgt 21320416  T
Q  339 ttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcct 438  Q
    || || || ||||||||||  || || |||||||| | ||||||||| ||| |   ||||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||| ||||    
T  21320415 ttgcccttatcagcaggggtgctataaggcttagggcaactctgctggcccctagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcatcct 21320316  T
Q  439 cata 442  Q
    ||||    
T  21320315 cata 21320312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 242 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 23105239 - 23105030
Alignment:
Q  242 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctat 338  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||  ||| || | |||||| ||||   |||| |||||| | ||||| ||| | ||||||||  ||| |    
T  23105239 acaagcattactcttgtggcccttctcaccacaagagaaacaaataatctcagcaggagcatccttcttcctcggccgtctatcttcgaccattctctgt 23105140  T
Q  339 ttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcct 438  Q
    || || || |||||||| |||||||| |||||||| || |||||||| |||||   ||||  ||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||    
T  23105139 ttgcccttatcagcaggtgcactgtaaggcttagggcggctctgctggcccttagtcttctgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcct 23105040  T
Q  439 catagatcct 448  Q
    | || |||||    
T  23105039 cgtaaatcct 23105030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 69 - 297
Target Start/End: Original strand, 28350633 - 28350861
Alignment:
Q  69 gtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaa 168  Q
    ||||||| | ||||||||||| | |||| || |  | |||||||||||| | | ||||||||||||| |||||||||||| | ||| ||| |||||||||    
T  28350633 gtaccagataaagcaaacacccttccacttgcctgagccttcttaggcttcttgcactgcgaactgagatgaccttcttcgtcacaattgaagcaaacaa 28350732  T
Q  169 catccctacgcttacaattagctaaagtgtgtcctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctc 268  Q
     ||| | |||||| || | |||||  || || |||||||  |  || |  |||||||| |||||||| |  |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  28350733 tatcaccacgcttgcattcagctatcgtatgccctttcttcccacatcggaagcactttttctcatcaccattgcaaacattactcttgtggcctttctc 28350832  T
Q  269 accacaattgaagcacacaatctctgcag 297  Q
    |||||| ||| |||| |||||||| ||||    
T  28350833 accacacttgtagcaaacaatctcagcag 28350861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 296 - 448
Target Start/End: Original strand, 20320968 - 20321120
Alignment:
Q  296 agcatctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgccc 395  Q
    |||||| |||||||| ||||| ||| | ||||||||  ||| ||| || || |||||||||||||| || ||||||||  |||||||||| |||||   |    
T  20320968 agcatcattcttcttcggccgtctatcttcgaccattatctgttttcccttatcagcaggggcactataaggcttagggtgactctgctgacccttagtc 20321067  T
Q  396 ttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcct 448  Q
    |||| ||||||||| | |||||| |||||||| ||||||||||| || |||||    
T  20321068 ttccgctcattcacgatcttgtaatgagccttagtatcctcctcgtaaatcct 20321120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Original strand, 23113413 - 23113592
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||| ||||||| | || |  || || |||||  | ||||||||||| ||||||||    
T  23113413 tagcaattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctttgataagtc-gtcctcaataactgcctgtgttccagtcaatgcaaacacctttccacctgt 23113511  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgctt 181  Q
    |  | |||||||||||| | | |||||||| || | |||||||| ||| | ||| ||| ||||||||| ||| | ||||||    
T  23113512 ctgagccttcttaggcttcctgcactgcgagctaagatgaccttattcgtcacaattgaagcaaacaatatcaccacgctt 23113592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 362 - 448
Target Start/End: Original strand, 23029815 - 23029901
Alignment:
Q  362 gtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcct 448  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||  ||||| ||||||||| | |||||| |||||||| || ||||||||||| |||||    
T  23029815 gtacggcttaggacgactctgttgtcccctggtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttagtgtcctcctcataaatcct 23029901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 242 - 331
Target Start/End: Original strand, 23205245 - 23205337
Alignment:
Q  242 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctc---tgcagcatctttcttcttaggccgcctaacatcgaccat 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||    | |||||  |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23205245 acaaacattactcttgtggcctttctcgccacagttgaaacaaacaatctccgaaggagcattcttcttcttaggccgcctatcatcgaccat 23205337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 242 - 331
Target Start/End: Original strand, 23676849 - 23676941
Alignment:
Q  242 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctc---tgcagcatctttcttcttaggccgcctaacatcgaccat 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||    | |||||  |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23676849 acaaacattactcttgtggcctttctcgccacagttgaaacaaacaatctccgaaggagcattcttcttcttaggccgcctatcatcgaccat 23676941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 242 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 11351223 - 11351168
Alignment:
Q  242 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag 297  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||    
T  11351223 acaaacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacagacaatctccgcag 11351168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 243 - 292
Target Start/End: Original strand, 21901469 - 21901518
Alignment:
Q  243 caaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctc 292  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||    
T  21901469 caaacattactcttgtggcccttctcaccacacttgtagcaaacaatctc 21901518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 88
Target Start/End: Original strand, 19817541 - 19817624
Alignment:
Q  5 aattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacac 88  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | || || |||||||||   || || ||||||| | ||||||||||    
T  19817541 aattaagggagtactattaatgaaacatgtacctctgatcagacgatcctcattcgatgtctgagtaccagctaaagcaaacac 19817624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 345 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 19716423 - 19716377
Alignment:
Q  345 ttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtccctt 391  Q
    |||||| || |||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  19716423 ttgtcaacaagggcactgtatggtttaggacgactctgctgtccctt 19716377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 345 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 19720986 - 19720940
Alignment:
Q  345 ttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtccctt 391  Q
    |||||| || |||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  19720986 ttgtcaacaagggcactgtatggtttaggacgactctgctgtccctt 19720940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 24705130 - 24705029
Alignment:
Q  106 ccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgtccttt 205  Q
    |||||||||||||| | ||||| ||||  || ||||| ||||||||||| ||| |||| ||||  ||  ||||||| |||| |||||||||||| || ||    
T  24705130 ccttcttaggctgcttgcactgagaacctatgtgaccctcttcattacaattgaagcacacaatgtcattacgcttgcaatcagctaaagtgtgaccctt 24705031  T
Q  206 ct 207  Q
    ||    
T  24705030 ct 24705029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 252 - 331
Target Start/End: Original strand, 23065354 - 23065436
Alignment:
Q  252 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccat 331  Q
    ||||||||||| ||||||||| || | ||  | |||||||||||||   |||| |||||||||||||||||| | ||||||||    
T  23065354 ctcttgtggcccttctcaccataagtaaaatagacaatctctgcaggaccatccttcttcttaggccgcctatcttcgaccat 23065436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 252 - 331
Target Start/End: Original strand, 23074804 - 23074886
Alignment:
Q  252 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccat 331  Q
    ||||||||||| ||||||||| || | ||  | |||||||||||||   |||| |||||||||||||||||| | ||||||||    
T  23074804 ctcttgtggcccttctcaccataagtaaaatagacaatctctgcaggaccatccttcttcttaggccgcctatcttcgaccat 23074886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 338 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 23097430 - 23097387
Alignment:
Q  338 tttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctg 382  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  23097430 tttccctt-gtcagcaggggcactgtacggcttagggagactctg 23097387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 232; Significance: 1e-128; HSPs: 50)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 252 - 511
Target Start/End: Original strand, 10873760 - 10874019
Alignment:
Q  252 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcag 351  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10873760 ctcttgtggtctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttgtcag 10873859  T
Q  352 caggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctaca 451  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10873860 cgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccctgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctgca 10873959  T
Q  452 gctgttaaccaaatctggaaaaactctcagccgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 511  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10873960 gctgttaaccaaatctggaaaaactctcagctgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 10874019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 12798701 - 12798247
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||    
T  12798701 tagcaattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctctgataagtcggtcctcattcactgtttgcgtaccagtcaacgcaaaaaccttgccacctgt 12798602  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgt 200  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  12798601 cctagccttcttaggctgtgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccccacgctcacaatcagctaaagtgtgt 12798502  T
Q  201 cctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctg---cag 297  Q
    ||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||| ||||| || ||||| || |    ||    
T  12798501 cctttctgaccacacctgaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggccttt---tccacacttgaaacaaacaatatcagtatgag 12798405  T
Q  298 catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgccctt 397  Q
    ||||| || ||||  ||| |||  ||||   ||   |||  || || ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||  |    
T  12798404 catctctcctcttgagcctcctctcatcattcaatctctgcttacccttgtcagcaggagcactatacggcttcggacgactctgctgtcccttgcctct 12798305  T
Q  398 cctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctacagctg 455  Q
     | |||| |||  ||||||||  |||| || |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  12798304 gcgctcactcatcaccttgtaaagagctttcgtatcctcttcataaatcctacagctg 12798247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 255 - 511
Target Start/End: Original strand, 13689343 - 13689599
Alignment:
Q  255 ttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcagcag 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||    
T  13689343 ttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagtag 13689442  T
Q  355 gggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctacagct 454  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  13689443 gggcactgtacggcttaggacgactctggtgtcccttgccctttctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagct 13689542  T
Q  455 gttaaccaaatctggaaaaactctcagccgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 511  Q
     |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13689543 attaaccaagtctggaaaaactctcagctgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 13689599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 255 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 15158025 - 15157769
Alignment:
Q  255 ttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcagcag 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  15158025 ttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcag 15157926  T
Q  355 gggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctacagct 454  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  15157925 gggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgccctttctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagct 15157826  T
Q  455 gttaaccaaatctggaaaaactctcagccgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 511  Q
     |||||||||||  |||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||    
T  15157825 attaaccaaatcctgaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccctcttgatgtc 15157769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 252 - 511
Target Start/End: Original strand, 14335695 - 14335954
Alignment:
Q  252 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcag 351  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14335695 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttgtcag 14335794  T
Q  352 caggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctaca 451  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||    
T  14335795 cgggggcattgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcgtagatcctgca 14335894  T
Q  452 gctgttaaccaaatctggaaaaactctcagccgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 511  Q
    ||| |||||||||||  |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||    
T  14335895 gctattaaccaaatcctgaaaaactctcagctgttggtacccaatcgccctcttaatgtc 14335954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 252 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 18587142 - 18586883
Alignment:
Q  252 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcag 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18587142 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgtagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttgtcag 18587043  T
Q  352 caggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctaca 451  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||    
T  18587042 cgggggcattgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcgtagatcctgca 18586943  T
Q  452 gctgttaaccaaatctggaaaaactctcagccgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 511  Q
    ||| |||||||||||  |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||    
T  18586942 gctattaaccaaatcctgaaaaactctcagctgttggtacccaatcgccctcttaatgtc 18586883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 252 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 44788322 - 44788063
Alignment:
Q  252 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcag 351  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||    
T  44788322 ctcttgtggcctttctcgccacaattgaagcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgttttcctttatcag 44788223  T
Q  352 caggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctaca 451  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  44788222 taggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctgca 44788123  T
Q  452 gctgttaaccaaatctggaaaaactctcagccgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 511  Q
    ||| |||||||| ||  |||||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||    
T  44788122 gctattaaccaagtcctgaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 44788063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 454
Target Start/End: Original strand, 19150060 - 19150516
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | ||||| || || |||||| |    
T  19150060 tagcaattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctctgataagtcggtcctcattcacagtttgcgtaccagtcaacgcaaatactttaccacctat 19150159  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgt 200  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||| |||| ||| || ||||||    
T  19150160 cctagccttcttaggttgcgtacactgcgaactaatatgtccttcttcattacagttgtagcaaacaatatctccacgcttgcaatcagccaatgtgtgt 19150259  T
Q  201 cctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctc---tgcag 297  Q
    ||||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    | ||    
T  19150260 cctttctgaccacacctaaagcacttcttctgatctcgatcacacacattactgttgtggcctttctcaccacacttgaagcaaacaatatcagtaggag 19150359  T
Q  298 catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgccctt 397  Q
    ||||| || ||||||||| |||  ||||   || | |||  || || |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||| ||  |    
T  19150360 catctctcctcttaggcctcctctcatcattcaacctctgcttacccttgtcagcaggggcactaaacggcttcggacgactctgctgtcccttacctat 19150459  T
Q  398 cctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctacagct 454  Q
     | |||| |||  |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  19150460 gcgctcactcatcaccttgtaatgagctttggtatcctcttcatatatcctgcagct 19150516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 454
Target Start/End: Original strand, 20749459 - 20749915
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | ||||| || || |||||| |    
T  20749459 tagcaattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctctgataagtcggtcctcattcacagtttgcgtaccagtcaacgcaaatactttaccacctat 20749558  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgt 200  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||| |||| ||| || ||||||    
T  20749559 cctagccttcttaggttgcgtacactgcgaactaatatgtccttcttcattacagttgtagcaaacaatatctccacgcttgcaatcagccaatgtgtgt 20749658  T
Q  201 cctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctc---tgcag 297  Q
    ||||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    | ||    
T  20749659 cctttctgaccacacctaaagcacttcttctgatctcgatcacacacattactgttgtggcctttctcaccacacttgaagcaaacaatatcagtaggag 20749758  T
Q  298 catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgccctt 397  Q
    ||||| || ||||||||| |||  ||||   || | |||  || || |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||| ||  |    
T  20749759 catctctcctcttaggcctcctctcatcattcaacctctgcttacccttgtcagcaggggcactaaacggcttcggacgactctgctgtcccttacctat 20749858  T
Q  398 cctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctacagct 454  Q
     | |||| |||  |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  20749859 gcgctcactcatcaccttgtaatgagctttggtatcctcttcatatatcctgcagct 20749915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 255 - 511
Target Start/End: Original strand, 8710907 - 8711163
Alignment:
Q  255 ttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcagcag 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  8710907 ttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttgtcagcgg 8711006  T
Q  355 gggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctacagct 454  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||    
T  8711007 gggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcgtagatcctgcagct 8711106  T
Q  455 gttaaccaaatctggaaaaactctcagccgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 511  Q
     |||||||||||  |||||||||||||| |||| || || ||||||||||| |||||    
T  8711107 attaaccaaatcctgaaaaactctcagctgttggtatccgatcgccctcttaatgtc 8711163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 14261446 - 14260990
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||    
T  14261446 tagcaattaaaggagtactattaaagaaataagtacctctgataagtcggtcctcattcatagtttgcgtaccagtcaacgcaaataccttgccacctgt 14261347  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgt 200  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||| || ||||||    
T  14261346 cctaaccttcttaggctgcataaactgcgaactaatatgtccttcctcattacagttgtagcaaacaatatccccacgcttgcaatcagccaatgtgtgt 14261247  T
Q  201 cctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctc---tgcag 297  Q
    ||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||    | ||    
T  14261246 cctttctgactacacctaaagtacttcttctcatctcgatgacgcacattactcttgtggcctttctcaccacacttgaagcaaataatctcagtaggag 14261147  T
Q  298 catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgccctt 397  Q
    ||| | ||  |||||||| |||  ||||   ||   |||| || || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| || ||    
T  14261146 catatctccccttaggcctcctctcatcattcagtctctacttacccttgtcagcaggggcactatacggcttcggacgactctactgtcccttaccttt 14261047  T
Q  398 cctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctacagct 454  Q
     | |||| | |  |||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  14261046 gcgctcactgatcaccttgtaatgagctttcgtatcctcttcatatatcctgcagct 14260990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 257 - 511
Target Start/End: Original strand, 18181047 - 18181300
Alignment:
Q  257 gtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcagcaggg 356  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||    
T  18181047 gtggcctttctcgccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacctcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggg 18181146  T
Q  357 gcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctacagctgt 456  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |    
T  18181147 gcactgtacggcttaggaagactctgttgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctat 18181246  T
Q  457 taaccaaatctggaaaaactctcagccgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 511  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  ||| || |||||||||||||||||||||    
T  18181247 taaccaaatccggaaaaactctcagttgttaat-cccaatcgccctcttgatgtc 18181300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 173; E-Value: 9e-93
Query Start/End: Original strand, 255 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 11234181 - 11233925
Alignment:
Q  255 ttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcagcag 354  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||||| |    
T  11234181 ttgtggcctttcccaccacaattgaaacacacaatctctgtagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccatcctctgtttccctttatcagcgg 11234082  T
Q  355 gggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctacagct 454  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||    
T  11234081 gggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcgtagatcctgcagct 11233982  T
Q  455 gttaaccaaatctggaaaaactctcagccgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 511  Q
     || ||||||||  |||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||    
T  11233981 attgaccaaatcctgaaaaactctaagctgttggtatccaatcgccctcttgatgtc 11233925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 163; E-Value: 8e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 15099803 - 15099521
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||| || || ||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  15099803 tagcaattaaaggagtactattaaagaaacaagtacatctgataagtcggtcctcattaactgtctgcataccagttaaagcaaacaccttaccacctgt 15099704  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgt 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| |  |||| ||||||||||| | ||| |||||||    
T  15099703 cctaaccttcttcggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcctcattgcagttataacaaacgatgtccccacgcttacaatcatctagagtgtgt 15099604  T
Q  201 cctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagca 283  Q
    || |||| ||  ||||| |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15099603 cccttctgaccacacctgaagcacttcttctcatctctatcacaaacgttactcttgtggcctttctcaccacacttgaagca 15099521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 158; E-Value: 8e-84
Query Start/End: Original strand, 246 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 11550079 - 11549814
Alignment:
Q  246 acattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctt 345  Q
    ||||| || |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||    
T  11550079 acattgcttttgtggcctttcacaccacaattgaaacacacaatctcggtagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccatcctctgtttccctt 11549980  T
Q  346 tgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagat 445  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  11549979 tatcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttccccttcctctcgttcacaatcttatagtgagccttagtatcctcttcatagat 11549880  T
Q  446 cctacagctgttaaccaaatctggaaaaactctcagccgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 511  Q
    ||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||| |||| || |||||||||||||| |||||    
T  11549879 cctgcagctattgaccaaatctggaaaaactctaagctgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 11549814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 158; E-Value: 8e-84
Query Start/End: Original strand, 246 - 511
Target Start/End: Original strand, 12690794 - 12691059
Alignment:
Q  246 acattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctt 345  Q
    ||||| || |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||    
T  12690794 acattgcttttgtggactttcacaccacaattgaaacacacaatctcggtagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccatcctctgtttccctt 12690893  T
Q  346 tgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagat 445  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  12690894 tatcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcgttcacaatcttatagtgagccttagtatcctcttcatagat 12690993  T
Q  446 cctacagctgttaaccaaatctggaaaaactctcagccgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 511  Q
    ||| ||||| || |||||||||||||||||||| | | |||| || |||||||||||||| |||||    
T  12690994 cctgcagctattgaccaaatctggaaaaactctaatctgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 12691059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 26091998 - 26091533
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    || |||||||||||  ||||||||||||| |||||  |    
T  26091998 tagcaattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctctgataagtcggtcctcattaggagtctgcgtaccagtcaaagcaaacacctttccaccaat 26091899  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgt 200  Q
     |||  |||||| ||||  | |||||| |||||||||||||||||  |||| |||||||| || ||||  |||| |||||| || | ||||||| ||||     
T  26091898 tctagtcttcttcggctcaggacactgtgaactgatatgaccttccccattgcagttgtaacagacaatgtccccacgcttgcattcagctaaactgtga 26091799  T
Q  201 cctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatct---ctgcag 297  Q
    || |||| ||  ||||| ||||||||| | |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||   | | ||    
T  26091798 cccttctgaccacacctgaagcacttcctatcatctcttccacaaacattactcttgtggcctttctcaccacacttgtagcaaacaatctcaacaggag 26091699  T
Q  298 catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgccctt 397  Q
    ||||| || |||| |||| |||| ||||  |||||||||  || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| |    
T  26091698 catctctcctcttgggcctcctatcatcacccatcttctgctttcctttgtcagcaggagcactgtaaggcttaggacgattctgctgtcccttacccct 26091599  T
Q  398 cctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctacagctgttaaccaa 463  Q
    ||||||| ||| || |||||| ||||| ||||| || || |||||||| || || || ||||||||    
T  26091598 cctctcactcattatcttgtaatgagctttggtgtcttcttcatagattctgcacctattaaccaa 26091533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 246 - 511
Target Start/End: Original strand, 14957801 - 14958066
Alignment:
Q  246 acattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctt 345  Q
    ||||| || |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| | || ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||    
T  14957801 acattgcttttgtggcctttcacaccacaattgaaacacacaatctcggtagtatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccatcctctgtttccctt 14957900  T
Q  346 tgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagat 445  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  14957901 tatcagcaggggcactgtacggcttaggacgaccctactgtcccttgcccttcctctcgttcacaatcttatagtgagccttagtatcctcttcatagat 14958000  T
Q  446 cctacagctgttaaccaaatctggaaaaactctcagccgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 511  Q
    ||| ||||| || |||||||||||||||||||| | | |||| || |||||| ||||||| |||||    
T  14958001 cctgcagctattgaccaaatctggaaaaactctaatctgttggtatccaatcaccctcttaatgtc 14958066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 13965868 - 13965354
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    || |||||||||||  | ||||||||||| ||||| ||    
T  13965868 tagcaattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctctgataagtcggtcctcattggtagtctgcgtaccagtcaatgcaaacaccttcccaccagt 13965769  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgt 200  Q
     ||| ||||||| ||||  | |||||| |||||||||||||| ||| |||| || |||||||| |||| ||||| |||||| || | ||||| | ||||     
T  13965768 tctagccttcttcggctcaggacactgtgaactgatatgaccctctccattgcaattgtagcagacaatatccccacgcttgcattcagctagactgtga 13965669  T
Q  201 cctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag--- 297  Q
    || |||| ||  ||||| ||||| ||  | ||||||    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||  ||||||| ||||       
T  13965668 cccttctgaccacacctgaagcattttctatcatctttaccacaaacattactcttgtggtctttctcaccacacttgtagcaatcaatctcagcaggag 13965569  T
Q  298 catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgccctt 397  Q
    ||||| || |||| |||| |||| ||||  |||||||||  || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| | || |||||||| ||| |    
T  13965568 catctctcctcttgggcctcctatcatcacccatcttctgctttcctttgtcagcaggagcactgtaaggcttaggacgattatgttgtcccttacccct 13965469  T
Q  398 cctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctacagctgttaaccaaatctggaaaaactctcagccgttgatacccaatc 497  Q
    ||||||| ||| || || ||| ||||| ||||| || || ||||| |||| ||| ||||||||||| || | ||| ||||| | | | |||||||||||     
T  13965468 cctctcactcattatctggtaatgagctttggtgtcttcttcataaatccaacacctgttaaccaactcagaaaagactctgatctgctgatacccaata 13965369  T
Q  498 gccctcttgatgtcc 512  Q
    || || |||||||||    
T  13965368 gctcttttgatgtcc 13965354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 26115790 - 26115325
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||    || |||||||||||  ||||||||||||| ||||| ||    
T  26115790 tagcaattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctctgatgagtcggtcctcattaggagtgtgcgtaccagtcaaagcaaacacctttccaccagt 26115691  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgt 200  Q
     |||  |||||| || |  | |||||| | ||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||  |||| |||||| || | ||||||| ||||     
T  26115690 tctagtcttcttcggttcaggacactgtgtactaatatgaccttctccattgcaattgtaacagacaatgtccccacgcttgcattcagctaaactgtga 26115591  T
Q  201 cctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgc---ag 297  Q
    || |||| ||  ||||| ||||||||| | |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | || |||||||| ||   ||    
T  26115590 cccttctgaccacacctgaagcacttcctatcatctcttccacaaacattactcttgtggcctttctcaccacacttgtaacaaacaatctcagccggag 26115491  T
Q  298 catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgccctt 397  Q
    ||||| || |||| |||| |||| ||||   ||||||||  || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| | |||||| ||| |    
T  26115490 catctctcctcttgggcctcctatcatcactcatcttctgctttcctttgtcagcaggagcactgtaaggcttaggacgattctgttatcccttacccct 26115391  T
Q  398 cctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctacagctgttaaccaa 463  Q
    ||||||| ||| || |||||| ||||| ||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||    
T  26115390 cctctcactcattatcttgtaatgagctttggtgtcttcttcatagattctacacctgttaaccaa 26115325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 40925017 - 40924552
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    || |||||||||||  ||||||||||||| || ||  |    
T  40925017 tagcaattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctctgataagtcggtcctcattaggagtctgcgtaccagtcaaagcaaacacctttcccccaat 40924918  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgt 200  Q
     |||  |||||| ||||  | |||||| |||||||||||||||||  |||| |||||||| || ||||  |||| |||||| || | ||||||| ||||     
T  40924917 tctagtcttcttcggctcaggacactgtgaactgatatgaccttccccattgcagttgtaacagacaatgtccccacgcttgcattcagctaaactgtga 40924818  T
Q  201 cctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatct---ctgcag 297  Q
    || |||| ||  ||||| ||||||||| | |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||   | | ||    
T  40924817 cccttctgaccacacctgaagcacttcctatcatctcttccacaaacattactcttgtggcctttctcaccacacttgtagcaaacaatctcaacaggag 40924718  T
Q  298 catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgccctt 397  Q
    ||||| || |||| |||| |||| ||||  |||||||||  || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| |||||||| ||| |    
T  40924717 catctctcctcttgggcctcctatcatcacccatcttctgctttcctttgtcagcaggagcactgtaaggcttaggacgattctgttgtcccttacccct 40924618  T
Q  398 cctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctacagctgttaaccaa 463  Q
    ||||||| |||  | ||| || ||||| ||||| || || |||||||| || || || ||||||||    
T  40924617 cctctcactcataatcttataatgagctttggtgtcttcttcatagattctgcacctattaaccaa 40924552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 455
Target Start/End: Original strand, 13024394 - 13024850
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    || |||||||||||  | |||||||| || ||||| ||    
T  13024394 tagcaattaaaggagt-ctattaaagaaacaagtacctctgataagtcggtcctcatttgtagtctgcgtaccagtcaatgcaaacactttcccaccggt 13024492  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgt 200  Q
    |||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||  || | ||||||||| | |||||  ||||||    
T  13024493 cctagccttcttcggctgagtacactgagaactgatatgaccttcttcgttgcagttgtagcagacaatgtctccacgcttacattcagctagggtgtgt 13024592  T
Q  201 cctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgc---ag 297  Q
    ||||||||||  ||||| || || ||| |||||| ||   || || |||| || ||||||||||| |||||||| ||| | || ||||| || ||   ||    
T  13024593 cctttctaaccacacctgaaacatttcctctcatatctaccataagcattgcttttgtggcctttttcaccacacttgtaacaaacaatttcagcaggag 13024692  T
Q  298 catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgccctt 397  Q
    ||||| || |||| |||| |||| ||||   |||| |||  ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||| ||| ||||||||| ||| |    
T  13024693 catctctcctcttgggcctcctatcatcattcatcctctgcttccctttgtcagcaggagcactgtaaggtttaggacgattctactgtcccttacccct 13024792  T
Q  398 cctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctacagctg 455  Q
    ||||||| |||  |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||    
T  13024793 cctctcactcatcaccttgtaatgagctttggtgtcttcctcatatatcctgcagctg 13024850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 463
Target Start/End: Original strand, 21755461 - 21755926
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    || |||||||||||  | |||||||||||||| || ||    
T  21755461 tagcaattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctctgataagtcggtcctcattggtagtctgcgtaccagtcaatgcaaacaccttgcccccagt 21755560  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgt 200  Q
     ||||||||||| ||||  | |||||| || || |||||||| ||| |||| ||||||||||| |||| ||||| ||||||||| | ||||||||||||     
T  21755561 tctaaccttcttcggctcaggacactgtgagctaatatgaccctctccattgcagttgtagcagacaatatccccacgcttacattcagctaaagtgtga 21755660  T
Q  201 cctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctc---tgcag 297  Q
    || |||| ||  ||||| || |||||| ||||||||    |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| | || ||||||||    | ||    
T  21755661 cccttctgaccacacctgaaacacttcctctcatctttaccacaaacattgctcttgtggcctttttcaccacacttgtaacaaacaatctcagagggag 21755760  T
Q  298 catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgccctt 397  Q
    ||||| || ||||||||| | |  ||||   ||| ||||  || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| | || |||||||| ||| |    
T  21755761 catctctcctcttaggcctcatgtcatcactcatattctgctttcctttgtcagcaggagcactgtaaggcttaggacgattttgttgtcccttacccct 21755860  T
Q  398 cctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctacagctgttaaccaa 463  Q
    ||||||| ||| || |||||| ||||| ||| | || || ||||| || ||||| |||||||||||    
T  21755861 cctctcactcattatcttgtaatgagctttgatgtcttcttcataaattctacacctgttaaccaa 21755926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 508
Target Start/End: Original strand, 12459677 - 12460187
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    || ||||||||  |  |  ||||||| || || || ||    
T  12459677 tagcaattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctctgataagtcggtcctcatttgtagtctgcgtacctttcaattcaaacactttccctccggt 12459776  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgt 200  Q
    ||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||  |||| ||||||||| | |||||  ||||||    
T  12459777 cctgaccttcttcggctgagtacactgtgaactaatatgaccttcttcattgcagttatagcagacaatgtccccacgcttacattcagctagggtgtgt 12459876  T
Q  201 cctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag--- 297  Q
    || |||| ||  |||||||| || ||| |||||||||   ||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||| | || |||||||| ||||       
T  12459877 cccttctgaccacacctaaaacatttcctctcatctctaccacaagcattgctcttgtggcctttttcaccacacttgtaacagacaatctcagcaggaa 12459976  T
Q  298 catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgccctt 397  Q
    ||||| || |||| |||| |||| ||||   ||| ||||  || || ||||||||| | ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  12459977 catctctcctcttgggcctcctatcatcattcattttctgctttcccttgtcagcaagagcattgtaaggcttaggacgactctgctgtcccttacccct 12460076  T
Q  398 cctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctacagctgttaaccaaatctggaaaaactctcagccgttgatacccaatc 497  Q
    ||||||| |||  |||||||| ||||| || || || |||||||| ||||| |||||| | ||||| || |  |||||||| | |   |||||||| ||     
T  12460077 cctctcactcatcaccttgtaatgagcttttgtgtcttcctcatatatcctgcagctgctcaccaactcagagaaaactctaatcttctgataccctata 12460176  T
Q  498 gccctcttgat 508  Q
    |||||||||||    
T  12460177 gccctcttgat 12460187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 445
Target Start/End: Original strand, 49155350 - 49155797
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    || |||||||||||  ||||||||||||| |||||  |    
T  49155350 tagcaattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctctgataagtcggtcctcattaggagtctgcgtaccagtcaaagcaaacacctttccaccaat 49155449  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgt 200  Q
     |||  |||||| ||||  | |||||| |||||||||||||||||  |||| |||||||| || ||||  |||| |||||| || | ||||||| | ||     
T  49155450 tctagtcttcttcggctcaggacactgtgaactgatatgaccttccccattgcagttgtaacagacaatgtccccacgcttgcattcagctaaactatga 49155549  T
Q  201 cctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatct---ctgcag 297  Q
    || |||| ||  ||||| ||||||||| | |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||   | | ||    
T  49155550 cccttctgaccacacctgaagcacttcctatcatctcttccacaaacattactcttgtggcctttctcaccacacttgtagcaaacaatctcaacaggag 49155649  T
Q  298 catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgccctt 397  Q
    ||||| || |||| |||| |||| | ||  ||||| |||  || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| |||||||| ||| |    
T  49155650 catctctcctcttgggcctcctatcctcacccatcctctgctttcctttgtcagcaggagcactgtaaggcttaggacgattctgttgtcccttacccct 49155749  T
Q  398 cctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagat 445  Q
    ||||||| |||  | ||| || ||||| ||||| || || ||||||||    
T  49155750 cctctcactcataatcttataatgagctttggtgtcttcttcatagat 49155797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 16947672 - 16947216
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    || ||||||||| |  | |||||||| || ||||| ||    
T  16947672 tagcaattaaatgagtactattaaagaaacaagtacctctgataagtcggtcctcattagtagtctgcgtaccattcaatgcaaacactttcccaccggt 16947573  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgt 200  Q
     ||| |||||||  ||||  ||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||  || | ||||||||| | |||||  ||||||    
T  16947572 tctagccttcttcagctgaatacactgtgaactgatatgaccctcttcgttgcagttgtagcaaacaatgtctccacgcttacattcagctagtgtgtgt 16947473  T
Q  201 cctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatct---ctgcag 297  Q
    ||||||| ||  |||||||  |||||| |||||||||   ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| | || ||||| |   ||| ||    
T  16947472 cctttctgaccacacctaacacacttcctctcatctctaccacaagcattactcttgtggcctttttcaccacacttgtaacaaacaatttcaactggag 16947373  T
Q  298 catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgccctt 397  Q
    ||||| || |||| ||||  ||  ||||   |||  |||  || || |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  16947372 catctctcctcttgggccttctctcatcattcattctctgctttcccttgtcagcaggggcactgtatggtttaggacgactctgctgtcccttacccct 16947273  T
Q  398 cctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctacagct 454  Q
     |||||| |||  |||||||| ||||| || |||||||| |||||||| || |||||    
T  16947272 tctctcactcatcaccttgtaatgagctttcgtatcctcttcatagattctgcagct 16947216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 387
Target Start/End: Original strand, 13676500 - 13676889
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| |    ||||||||||||||   ||||||||| || ||||| ||    
T  13676500 tagcaattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctctgataagtcgatcctcactagtggtttgcgtaccagtcagagcaaacactttaccaccggt 13676599  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgt 200  Q
     ||||||||||| || || | |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||| |  || |  |||||||||| |||||| ||||||    
T  13676600 tctaaccttcttcggttgtgcacactgtgaactgatatggccctcctcattgcagttatagcaaactatgtctccccgcttacaatcagctaatgtgtgt 13676699  T
Q  201 cctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatct---ctgcag 297  Q
    || ||||  |  ||||| ||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| |||||||   | | ||    
T  13676700 cccttctgtccacacctgaagtacttcttctcatctttatcacaaacattactcttgtggcctttcttaccacacttgtagcaaacaatctcaacaggag 13676799  T
Q  298 catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtc 387  Q
    ||||| || |||| |||| |||  ||||   || | ||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||||    
T  13676800 catctctcctcttgggcctcctctcatcattcaacctctgttttcctttgtcagcaggagcactatacggtttaggatgactctgctgtc 13676889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 242 - 477
Target Start/End: Original strand, 11984281 - 11984519
Alignment:
Q  242 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgc---agcatctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctat 338  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||| ||   |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||  ||| |    
T  11984281 acaaacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacaagtaatctcagctggagcatccttcttcttaggccgtctatcatcgaccattctctgt 11984380  T
Q  339 ttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcct 438  Q
    || || || |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |    
T  11984381 ttgcccttatcagcaggggcactatagggcttagggcgactctgctggcccttggtcttccgctcattcacaaccttgtaatgagccttggtatcttctt 11984480  T
Q  439 catagatcctacagctgttaaccaaatctggaaaaactc 477  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  11984481 cgtagatcctacaactgttaaccaaatcaggaaaaactc 11984519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 11385629 - 11385172
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||    || |||||||||||  ||||||||||||| ||||| ||    
T  11385629 tagcaattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctctgataagtctgtcctcattagtagtctgcgtaccagtcaaagcaaacaccttcccaccagt 11385530  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgt 200  Q
     |||| |||||| || || || ||||| |||||||| || || || |||| ||| || || ||||||||||| |  | ||| || ||||| || ||||||    
T  11385529 tctaatcttctttggttgagtgcactgtgaactgatgtggccctcctcatcacaattataacaaacaacatcacccctcttgcagttagccaatgtgtgt 11385430  T
Q  201 cctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgc---ag 297  Q
    ||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||  |  |||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||  |||| || ||||| ||   ||    
T  11385429 cctttctgaccacacctgaagcacttcttctcatctttggtacaaacattacttttgtggcctttctcgccacacttatagcaaactatctcagcaggag 11385330  T
Q  298 catctttcttcttaggccgcctaacatcgacca-tcttctatttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgccct 396  Q
    ||||| || |||| ||||  ||  ||||   || || |   |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||     
T  11385329 catctctcctcttgggccttctctcatcattcagtcgttgctttccc-ttgtcagcaggggcactgtacggcttaggatgactctgttgtcccttacccc 11385231  T
Q  397 tcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctacagctg 455  Q
    ||| |||| |||  | |||||| ||||| || | ||| ||||||||||| || ||||||    
T  11385230 tccgctcactcatcatcttgtaatgagcttttgaatcttcctcatagattctgcagctg 11385172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 242 - 505
Target Start/End: Original strand, 9591653 - 9591919
Alignment:
Q  242 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctat 338  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||   |||| |||||||||||||||||| |||| |||||  |||      
T  9591653 acaaacattgctcttgtggcctttctcgccacagttgaaacagacaatctctgcaggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcaaccattctctgc 9591752  T
Q  339 ttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcct 438  Q
    || || || ||| |||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||||| || |||||||| |||||  ||||||||||||    
T  9591753 ttgcccttatcaacaggggcactataaggcttagggcgactctgctggcccttggtcttcctctcattaacaaccttgtaatgagctctggtatcctcct 9591852  T
Q  439 catagatcctacagctgttaaccaaatctggaaaaactctcagccgttgatacccaatcgccctctt 505  Q
    ||||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||  | | |||| || || |||||||||||    
T  9591853 catagattctgcagctattcaccaaatcaggaaaaactcggatctgttggtatccgatcgccctctt 9591919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 12204000 - 12203544
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| |  ||||| ||  | ||||||||||| ||||||||    
T  12204000 tagcaattaaaggattactattaaagaaacaagtacctctgataagtcgatcctcattaaccgtctatgtaccggtcaatgcaaacacctttccacctgt 12203901  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgt 200  Q
    |  | |||||||||||| | | || ||||| || | |||||||||||||| ||| ||| ||||||||| |||   |||||| || | |||||  || ||     
T  12203900 ctgagccttcttaggcttcctgcattgcgagctaagatgaccttcttcatcacaattgaagcaaacaatatcatcacgcttgcattcagctatcgtatgc 12203801  T
Q  201 cctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag--- 297  Q
    |||||||  |  || |  |||||||| |||||||| |  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| |||||| | ||||       
T  12203800 cctttcttcccacatcagaagcactttttctcatcaccattacaaacattactcttgtggcccttctcaccacacttgtagcaaacaatcacagcaggaa 12203701  T
Q  298 catctttcttcttaggccgcctaacatc-gaccatcttctatttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgccct 396  Q
    ||||| || ||||||| | |||  ||||   | ||||| | |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||  ||||| ||  ||  |     
T  12203700 catctctcctcttaggtctcctctcatcattcaatctt-tgtttccctttgtcagcaggagcactgtagggcttaggacgaccttgctggcctctgttcc 12203602  T
Q  397 tcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctacagct 454  Q
    || ||||| |||  ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12203601 tcttctcactcataaccttataatgaactttggtatcctcctcatagattctacagct 12203544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 14283574 - 14283301
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| | |||||||||    || |||||||||||  |||||||||| || ||||| ||    
T  14283574 tagcaatgaaaggagtactattaaagaaacaagtacctctgataagacagtcctcattagtagtctgcgtaccagtcaaagcaaacactttcccaccggt 14283475  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgt 200  Q
     ||||||||||| ||||| |  ||||| |  ||||||||||| ||||| || ||||| || || |||||||| | |||||| |||| |||||| |||||     
T  14283474 tctaaccttcttcggctgtgggcactgtgtgctgatatgaccctcttcgttgcagttataacatacaacatcaccacgcttgcaatcagctaatgtgtga 14283375  T
Q  201 cctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcat-ctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccaca 274  Q
    || |||| ||  ||||| |||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14283374 cccttctgaccacacctgaagcacttcttctcatccttggt-acaaacattactcttgtggcctttctcgccaca 14283301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 242 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 17703436 - 17703164
Alignment:
Q  242 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctat 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| || ||||| || ||||   |||| |||||||| ||||||||| ||||||||||  ||| |    
T  17703436 acaaacattactcttgtggcctttcccgccacagttgaaacaaacaatatccgcaggagcatccttcttctttggccgcctatcatcgaccattctctgt 17703337  T
Q  339 ttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcct 438  Q
    || || || |||| ||||||||| || || ||||| ||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||| |||||||| |||||  |||||||||| |    
T  17703336 ttgcccttatcagtaggggcactataaggtttagggcgactctgctggcccttggtcttccgctcattcacaaccttgtaatgagctctggtatcctctt 17703237  T
Q  439 catagatcctacagctgttaaccaaatctggaaaaactctcagccgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 511  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||  |  |||||||  | | |||| || || |||||||||||||||||    
T  17703236 catagatcctacagctgttcaccaaataggcgaaaactcggatctgttggtatccgatcgccctcttgatgtc 17703164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 242 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 16726422 - 16726150
Alignment:
Q  242 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctat 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| || ||||| || ||||   |||| |||||||| ||||||||| ||||||||||  ||| |    
T  16726422 acaaacattactcttgtggcctttcccgccacagttgaaacaaacaatatccgcaggagcatccttcttctttggccgcctatcatcgaccattctctgt 16726323  T
Q  339 ttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcct 438  Q
    || || || |||| ||||||||| || || ||||| ||||||||||| ||||||  ||| | ||||||||| |||||||| |||||  |||||||||| |    
T  16726322 ttgcccttatcagtaggggcactttaaggtttagggcgactctgctggcccttggtctttcgctcattcacaaccttgtaatgagctctggtatcctctt 16726223  T
Q  439 catagatcctacagctgttaaccaaatctggaaaaactctcagccgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 511  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||  |  |||||||  | | |||| || || |||||||||||||||||    
T  16726222 catagatcctacagctgttcaccaaataggcgaaaactcggatctgttggtatccgatcgccctcttgatgtc 16726150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 14140728 - 14140920
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||||||    || |||||||||||  ||||||| ||||| ||||| ||    
T  14140728 tagcaattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctctgataagtctttcctcattagtagtctgcgtaccagtcaaagcaaataccttcccaccagt 14140827  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaa 193  Q
     ||||||||||| ||||| || ||||| | |||||| || || ||||| ||||| || || || |||||||| | |||||| |||| ||||||    
T  14140828 tctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtggccctcttcgttacaattataacatacaacatcaccacgcttgcaatcagctaa 14140920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 242 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 15145904 - 15145695
Alignment:
Q  242 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctat 338  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||| | ||| | |||||||| ||||   |||| ||||||||||| |||||| |||| || |   ||| |    
T  15145904 acaagcattactcctgtggcctttctcaccacaagtaaagaagacaatctcagcaggagcatccttcttcttagggcgcctatcatcaactactctctgt 15145805  T
Q  339 ttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcct 438  Q
    || || || |||||||||| ||| || ||||||||||||||||| || |||||| |||| | ||||||||| | |||||| |||| ||||||||| ||||    
T  15145804 ttgcccttatcagcagggggactataaggcttaggacgactctgttgacccttggcctttcgctcattcacaatcttgtaatgagtcttggtatcttcct 15145705  T
Q  439 catagatcct 448  Q
    || |||||||    
T  15145704 caaagatcct 15145695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 18051153 - 18050857
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||  | || || ||||||||  ||||||| || || |||||       
T  18051153 tagcaattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctctgatgagacggtcctcattagcagtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaac 18051054  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgt 200  Q
     ||||||||||| ||||| || ||||| | |||||| ||||| ||||||||||| || || || |||||||| |  ||||| ||||  ||||   ||||     
T  18051053 tctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattataacatacaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtga 18050954  T
Q  201 cctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcat-ctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag 297  Q
    || ||||  |  || || || ||||||||||||| || ||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||    
T  18050953 cccttctgtccacatctgaaacacttcttctcatccttggt-acaaacgttactcttgtgacctttctcgccacacttaaagcacactatctcagcag 18050857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 242 - 448
Target Start/End: Original strand, 14042984 - 14043193
Alignment:
Q  242 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgc---agcatctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctat 338  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||  |   ||||||||||||  |||| |||||  |||| |||||  ||| |    
T  14042984 acaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtatagcatacaatctcaacatgagcatctttctttctagggcgcctctcatcaaccattctctgt 14043083  T
Q  339 ttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcct 438  Q
    || || || |||||||| ||||| || ||||| |||| |||||| || || ||| | |||| ||||||||| | |||||| |||||||| ||||||||||    
T  14043084 ttacccttatcagcaggagcactataaggctttggacaactctgttgacctttgactttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttagtatcctcct 14043183  T
Q  439 catagatcct 448  Q
    |||| |||||    
T  14043184 cataaatcct 14043193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 242 - 448
Target Start/End: Original strand, 14353014 - 14353223
Alignment:
Q  242 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgc---agcatctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctat 338  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||  |   ||||||||||||  |||| |||||  |||| |||||  ||| |    
T  14353014 acaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtatagcatacaatctcaacatgagcatctttctttctagggcgcctctcatcaaccattctctgt 14353113  T
Q  339 ttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcct 438  Q
    || || || |||||||| ||||| || ||||| |||| |||||| || || ||| | |||| ||||||||| | |||||| |||||||| ||||||||||    
T  14353114 ttacccttatcagcaggagcactataaggctttggacaactctgttgacctttgactttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttagtatcctcct 14353213  T
Q  439 catagatcct 448  Q
    |||| |||||    
T  14353214 cataaatcct 14353223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 345 - 448
Target Start/End: Original strand, 14145057 - 14145160
Alignment:
Q  345 ttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcataga 444  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | | |||| |||  ||||| || ||||| |||||  ||||||||||||    
T  14145057 ttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgccctcctcataga 14145156  T
Q  445 tcct 448  Q
    ||||    
T  14145157 tcct 14145160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 349 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 12712512 - 12712407
Alignment:
Q  349 cagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcct 448  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||| |||  |||||| | |||||||| | ||| ||||||||||| ||    
T  12712512 cagcaggagcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttgcccctccgttcactcatcaccttggaatgagcctttgaatcttcctcatagattct 12712413  T
Q  449 acagct 454  Q
     |||||    
T  12712412 gcagct 12712407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 349 - 454
Target Start/End: Original strand, 13004865 - 13004970
Alignment:
Q  349 cagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcct 448  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||| |||  |||||||| |||||||| | ||| || |||||||| ||    
T  13004865 cagcaggggcgctgtacggcttaggacgactctgttgtcccttgcccctccgttcactcatcaccttgtaatgagcctttgaatcttcttcatagattct 13004964  T
Q  449 acagct 454  Q
     |||||    
T  13004965 gcagct 13004970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 88
Target Start/End: Original strand, 15343480 - 15343567
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacac 88  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| | |||||||||    || |||||||||||  ||||||||||    
T  15343480 tagcaattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctctgataagcctgtcctcattagtagtctgcgtaccagtcaaagcaaacac 15343567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 158
Target Start/End: Original strand, 15627576 - 15627729
Alignment:
Q  5 aattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgtccta 104  Q
    ||||||||||||||||| || ||| || |||||| |  | |  |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| || ||||  ||   |    
T  15627576 aattaaaggagtactatcaaagaagcatgtacctataatcaaccggtcctcattcactgtttgcgtaccagtcaaagcaaacactttcccactagtttga 15627675  T
Q  105 accttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttg 158  Q
     |||||||||||| | | ||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||    
T  15627676 gccttcttaggctactttcactgcgaaccaatatgaccctcttcattgcagttg 15627729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 348 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 14283224 - 14283124
Alignment:
Q  348 tcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcc 447  Q
    |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||   | | |||||| |||  |||||||| ||||| || || ||||||||||||||||    
T  14283224 tcagcaggggcactatacggcttcgggcgactctgctgtcccttattccttctctcactcatcaccttgtaatgagctttagtgtcctcctcatagatcc 14283125  T
Q  448 t 448  Q
    |    
T  14283124 t 14283124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 12712847 - 12712572
Alignment:
Q  17 actattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggc 116  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||  || | |||    ||||||||||| |   | |||||||| || || |  ||||||||||||||  |     
T  12712847 actattaaagaaacaagtacctctgataagtctatcttgatttgtggtttgcgtacccgccaaggcaaacactttcccgctggtcctaaccttcttccgt 12712748  T
Q  117 tgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgtcctttctaacgtcacc 216  Q
    || || ||||| ||| |||||||||| ||  |||| ||||| ||||| |||| ||| | ||| || |||| ||||||   ||| || ||||  |  ||||    
T  12712747 tgagtgcactgagaattgatatgaccctccccattgcagttatagcatacaatatcaccacgtttgcaatcagctaacacgtgacccttctgtccacacc 12712648  T
Q  217 taaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctc 292  Q
    | ||||||||||||||||||  |  |||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| || |||||    
T  12712647 tgaagcacttcttctcatctttggtacaaacattacttttgtggcctttctcgccacacttaaagcaaactatctc 12712572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 348 - 447
Target Start/End: Original strand, 15627922 - 15628021
Alignment:
Q  348 tcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcc 447  Q
    |||||||| |||||||| ||||| |||||||| || || | ||| |  |||||||||||||  |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||    
T  15627922 tcagcaggagcactgtaaggctttggacgactttgttgactcttacttttcctctcattcataaccttgtaatgagctttcgtatcctcctcatagatcc 15628021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 106 - 166
Target Start/End: Original strand, 15114355 - 15114415
Alignment:
Q  106 ccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaac 166  Q
    |||||||||||| | | ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  15114355 ccttcttaggcttcttgcactgcgaactaatatgaccttcttccttacagttatagcaaac 15114415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 345 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 15099456 - 15099407
Alignment:
Q  345 ttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcc 394  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  15099456 ttgtcagcaggagcactatacggcgtcggacgactctgctgtcccttgcc 15099407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 357 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 18050794 - 18050698
Alignment:
Q  357 gcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctacagc 453  Q
    ||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| ||  | | |||| |||  ||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  18050794 gcactatacggtttaggacgattctgatgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctacagc 18050698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 2)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 466
Target Start/End: Original strand, 42786 - 43254
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  42786 tagcaaataaaggagtactattaaagaaacaagtacctctgataagtcggtcctcattaactgtttgcgcaccagtgaaagcaaacaccttgccacctgt 42885  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgt 200  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||    
T  42886 cctaatcttcttaggttgcgtacactgcgaactaatatgaccttctgcattacaattgtagcaaacaacatccccacgcttaaaatccgctaaagtgtgt 42985  T
Q  201 cctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctc---tgcag 297  Q
    ||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| || |  |||||    | ||    
T  42986 cctttctgactacacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcacaacacttgaaacaaattatctcagtaggag 43085  T
Q  298 catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgccctt 397  Q
    ||||| || ||||||||| |||  ||||   || | ||| ||| || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||       
T  43086 catctctcctcttaggcctcctctcatcattcaacctctgtttacccttgtcagcaggggcactatacggcttcggacgactctactgtcccttgcctcg 43185  T
Q  398 cctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctacagctgttaaccaaatc 466  Q
     | || | |||  |||||||| ||||| || |||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||    
T  43186 gcgcttactcatcaccttgtaatgagcttttgtatcctcatcatagatcttacagctgcttaccaaatc 43254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 242 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 50320 - 50111
Alignment:
Q  242 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctat 338  Q
    |||| |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||   |||| |||||||||||||||||| ||||||||||  ||| |    
T  50320 acaagcattgcttttgtggcctttctcaccacaattaaagcagacaatctcagcaggaacatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgt 50221  T
Q  339 ttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcct 438  Q
    || || || ||||||||||| || || ||||||||  |||||||||  ||| |  |||||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||    
T  50220 ttgcccttatcagcaggggcgctataaggcttagggagactctgctagcccatagccttccgctcattcacgatcttgtaatgagccttggtatcctcct 50121  T
Q  439 catagatcct 448  Q
    | || |||||    
T  50120 cgtaaatcct 50111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 57)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 252 - 511
Target Start/End: Original strand, 16359744 - 16360003
Alignment:
Q  252 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcag 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16359744 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttgtcag 16359843  T
Q  352 caggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctaca 451  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16359844 cgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctgca 16359943  T
Q  452 gctgttaaccaaatctggaaaaactctcagccgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 511  Q
    ||| |||||||| ||  |||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||    
T  16359944 gctattaaccaagtcctgaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccctcttgatgtc 16360003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 252 - 511
Target Start/End: Original strand, 34569736 - 34569995
Alignment:
Q  252 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcag 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34569736 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttgtcag 34569835  T
Q  352 caggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctaca 451  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  34569836 cgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctgca 34569935  T
Q  452 gctgttaaccaaatctggaaaaactctcagccgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 511  Q
    ||| |||||||| ||  |||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||    
T  34569936 gctattaaccaagtcctgaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccctcttgatgtc 34569995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 252 - 511
Target Start/End: Original strand, 40712022 - 40712281
Alignment:
Q  252 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcag 351  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  40712022 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttacctttgtcag 40712121  T
Q  352 caggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctaca 451  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  40712122 cgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctgca 40712221  T
Q  452 gctgttaaccaaatctggaaaaactctcagccgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 511  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||    
T  40712222 gctgttaaccaaatcctgaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 40712281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 255 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 22330028 - 22329772
Alignment:
Q  255 ttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcagcag 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  22330028 ttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcag 22329929  T
Q  355 gggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctacagct 454  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  22329928 gggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagct 22329829  T
Q  455 gttaaccaaatctggaaaaactctcagccgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 511  Q
     || |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||    
T  22329828 attgaccaaatctggaaaaactctcagctgttggtacccaattgccctcttgatgtc 22329772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 255 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 14996880 - 14996624
Alignment:
Q  255 ttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcagcag 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||    
T  14996880 ttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggtcgcctaacatcaaccatcttctgtttccctttatcagcag 14996781  T
Q  355 gggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctacagct 454  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  14996780 gggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgccctttctctcattcactacctcgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagct 14996681  T
Q  455 gttaaccaaatctggaaaaactctcagccgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 511  Q
     |||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14996680 attaaccaagtctggaaaaactctcaactgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 14996624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 255 - 511
Target Start/End: Original strand, 19773205 - 19773461
Alignment:
Q  255 ttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcagcag 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |    
T  19773205 ttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgg 19773304  T
Q  355 gggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctacagct 454  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  19773305 gggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagct 19773404  T
Q  455 gttaaccaaatctggaaaaactctcagccgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 511  Q
     |||||||||||  |||||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||    
T  19773405 attaaccaaatcctgaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 19773461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 255 - 511
Target Start/End: Original strand, 27521651 - 27521907
Alignment:
Q  255 ttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcagcag 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27521651 ttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttagaccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttgtcagcag 27521750  T
Q  355 gggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctacagct 454  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||    
T  27521751 gggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtgtcctcttcatagatcctgcagct 27521850  T
Q  455 gttaaccaaatctggaaaaactctcagccgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 511  Q
     |||||||||||  |||||||||||| | |||| || |||||||||||||| |||||    
T  27521851 attaaccaaatcctgaaaaactctcaactgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 27521907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 255 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 27682541 - 27682285
Alignment:
Q  255 ttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcagcag 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  27682541 ttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggacgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcag 27682442  T
Q  355 gggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctacagct 454  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||  ||||    
T  27682441 gggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgccctttctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcgtagatcctgtagct 27682342  T
Q  455 gttaaccaaatctggaaaaactctcagccgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 511  Q
     |||||||||||  |||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||    
T  27682341 attaaccaaatcctgaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccctcttgatgtc 27682285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 246 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 29473223 - 29472958
Alignment:
Q  246 acattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctt 345  Q
    ||||| || |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||    
T  29473223 acattgcttttgtggcctttcccaccacaattgaaacacacaatctctgtagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccatcctctgtttccctt 29473124  T
Q  346 tgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagat 445  Q
    | ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  29473123 tatcagcggggacactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcattcgtatcctcttcatagat 29473024  T
Q  446 cctacagctgttaaccaaatctggaaaaactctcagccgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 511  Q
    ||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  29473023 cctgcagctattaaccaaatccggaaaaactcttagctgttggtacccaatcgccctcttgatgtc 29472958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 255 - 511
Target Start/End: Original strand, 41774087 - 41774343
Alignment:
Q  255 ttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcagcag 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |    
T  41774087 ttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctcagcagcattcttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgg 41774186  T
Q  355 gggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctacagct 454  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| || |||||    
T  41774187 gggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcgtagattctgcagct 41774286  T
Q  455 gttaaccaaatctggaaaaactctcagccgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 511  Q
     |||||||||||  |||||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||    
T  41774287 attaaccaaatcctgaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 41774343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 246 - 511
Target Start/End: Original strand, 22351155 - 22351420
Alignment:
Q  246 acattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctt 345  Q
    ||||| || |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  22351155 acattgcttttgtggcctttcccaccacagttgaaacacacaatctcagtagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccatcttctgtttccctt 22351254  T
Q  346 tgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagat 445  Q
    | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  22351255 tatcagcaggggcactgtacggcttatgacgactctgctgccccttgcccttcctctcgttcactatcttgtagtgagccttagtatcctcttcatagat 22351354  T
Q  446 cctacagctgttaaccaaatctggaaaaactctcagccgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 511  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||    
T  22351355 cctgcagctattaaccaaatctggaaaaactctaagctgttggtatccaatcgccctcttgatgtc 22351420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 173; E-Value: 9e-93
Query Start/End: Original strand, 255 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 37288637 - 37288381
Alignment:
Q  255 ttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcagcag 354  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||||| |    
T  37288637 ttgtggcctttcccaccacaattgaaacacacaatctctgtagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccatcctctgtttccctttatcagcgg 37288538  T
Q  355 gggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctacagct 454  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||    
T  37288537 gagcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagattctgcagct 37288438  T
Q  455 gttaaccaaatctggaaaaactctcagccgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 511  Q
     |||||||||||  |||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||    
T  37288437 attaaccaaatcctgaaaaactctcagttgttggtatccaatcgccctcttgatgtc 37288381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 284 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 27665615 - 27665388
Alignment:
Q  284 cacaatctctgcagcatctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgc 383  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27665615 cacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttacctttgtcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgc 27665516  T
Q  384 tgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctacagctgttaaccaaatctggaaaaactctcagcc 483  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||| |||||||||||  ||||||||||||||     
T  27665515 tgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcgtagattctgcagctattaaccaaatcctgaaaaactctcagct 27665416  T
Q  484 gttgatacccaatcgccctcttgatgtc 511  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27665415 gttgatacccaatcgccctcttgatgtc 27665388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 246 - 511
Target Start/End: Original strand, 27613592 - 27613857
Alignment:
Q  246 acattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctt 345  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||||||| ||||| ||||||||    
T  27613592 acattgctcttgtggcccttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccctcttcttaggccgtctcacatcgaccaccttctgtttccctt 27613691  T
Q  346 tgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagat 445  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||    
T  27613692 tatcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcgtagat 27613791  T
Q  446 cctacagctgttaaccaaatctggaaaaactctcagccgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 511  Q
     || ||||| |||||||||||  |||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||    
T  27613792 tctgcagctattaaccaaatcctgaaaaactctcagttgttggtatccaatcgccctcttgatgtc 27613857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 23078300 - 23077843
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    || ||||||| |||  | |||||||| || ||||| ||    
T  23078300 tagcaattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctctgataagtcggtcctcattagtagtctgcgtactagtcaatgcaaacactttcccaccggt 23078201  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgt 200  Q
    |||| ||||||| ||||| |||||||  |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  || | ||||||||| | |||||  ||||||    
T  23078200 cctagccttcttcggctgagtacactatgaactgatatgaccttcttcgttgcagttgtagcaaacaatgtctccacgcttacattcagctagggtgtgt 23078101  T
Q  201 cctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgc---ag 297  Q
    ||||||| ||  ||||| || || ||| |||||||||   ||||| |||| || ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||   ||    
T  23078100 cctttctgaccacacctgaaacatttcctctcatctctaccacaagcattgcttttgtggcctttttcaccacacttgaaacatacaatctcagcaggag 23078001  T
Q  298 catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgccctt 397  Q
    ||||| || |||| |||| |||| ||||   ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  23078000 catctctcctcttgggcctcctatcatcattcatcttctgcttccctttgtcagcaggagcactgtaaggtttaggacgactctgctgtcccttacccct 23077901  T
Q  398 cctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctacagctg 455  Q
    ||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||    
T  23077900 cctctcactcattaccttgtaatgagctttggtgtcttcctcatatatcctgcagctg 23077843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 246 - 511
Target Start/End: Original strand, 22137904 - 22138169
Alignment:
Q  246 acattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctt 345  Q
    ||||| || |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||   |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||    
T  22137904 acattgcttttgtggcctttcccaccacaattgaaacacacaatctcaatagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgtttccctt 22138003  T
Q  346 tgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagat 445  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  22138004 tatcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcgttcacaatcttatagtgagccttagtatcttcttcatagat 22138103  T
Q  446 cctacagctgttaaccaaatctggaaaaactctcagccgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 511  Q
    ||| ||||| || ||||||||  |||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||    
T  22138104 cctgcagctattgaccaaatcctgaaaaactctaagctgttggtatccaatcgccctcttgatgtc 22138169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 511
Target Start/End: Original strand, 20345255 - 20345768
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    || |||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||    
T  20345255 tagcaattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctctgataagtcggtcctcattggtagtctgcgtaccagttaaagcaaataccttcccaccagt 20345354  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgt 200  Q
     ||| ||||||| ||||  | |||||| ||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||  |||| |||||| || | | ||| | ||||     
T  20345355 tctagccttcttcggctcaggacactgtgaactaatatgaccttccccattgcagttgtagcagacaatgtccccacgcttgcattcaactagactgtga 20345454  T
Q  201 cctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag--- 297  Q
    || |||| ||  ||||| ||||||||| | ||||||    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | || |||||||| ||||       
T  20345455 cccttctgaccacacctgaagcacttcctatcatctttaccacaaacattactcttgtgggctttctcaccacacttgtaacaaacaatctcagcaggag 20345554  T
Q  298 catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgccctt 397  Q
    ||||| || |||| |||| |||| ||||  |||||||||  || |||||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||| ||||||||| ||| |    
T  20345555 catctctcctcttgggcctcctatcatcacccatcttctgctttcctttgtcagcaggagcactataaggcttaggacgattctactgtcccttacccct 20345654  T
Q  398 cctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctacagctgttaaccaaatctggaaaaactctcagccgttgatacccaatc 497  Q
    ||||||| ||| || |||||| ||||| ||||| || |||||||| || || || || |||||||| || | ||| ||||| | | | |||||||||||     
T  20345655 cctctcactcattatcttgtaatgagctttggtgtcttcctcataaattctgcacctattaaccaactcagaaaagactctgatctgctgatacccaata 20345754  T
Q  498 gccctcttgatgtc 511  Q
    || || ||||||||    
T  20345755 gctcttttgatgtc 20345768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 4 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 23563560 - 23563275
Alignment:
Q  4 caattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgtcct 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    ||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||| |||||    
T  23563560 caattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctctgataagtcggtcctcattagttgtttgcgtaccggtcaaagcaaacaccttaccaccagtcct 23563461  T
Q  104 aaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgtcct 203  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||   || | || |||||| | |||||  |||||||||    
T  23563460 aaccttcttcggctgcgtacactgcgaactaatatgaccttcctcattgcagttataacaaacattgtctccacccttacagtcagctagtgtgtgtcct 23563361  T
Q  204 ttctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaat 289  Q
    |||| ||  ||||| |||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  23563360 ttctgaccacacctgaagcacttcttctcatctctatcacagacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaagcaaacaat 23563275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 463
Target Start/End: Original strand, 22505652 - 22506117
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||    || |||||||||||  | |||||||||||||| || ||    
T  22505652 tagcaattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctttgataagtcggtcctcattggtagtctgcgtaccagtcaatgcaaacaccttgcccccagt 22505751  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgt 200  Q
     ||||||||||| || |  | |||||| |||||||| ||||| ||| |||| ||||||||||| ||||  |||| ||||||||| | ||||||  | |||    
T  22505752 tctaaccttcttcggttcaggacactgtgaactgatgtgaccctctccattgcagttgtagcagacaatgtccccacgcttacattcagctaagctatgt 22505851  T
Q  201 cctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctc---tgcag 297  Q
    ||  ||| ||  ||||| ||||||||| |||| |||    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| | || ||||||||    | ||    
T  22505852 cccatctgaccacacctgaagcacttcctctcgtctttaccacaaacattgctcttgtggcctttctcaccacacttgtaacaaacaatctcagaaggag 22505951  T
Q  298 catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgccctt 397  Q
    ||||| || ||||||||| |||| ||||   ||||||||  || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| |    
T  22505952 catctctcctcttaggcctcctatcatcattcatcttctgctttcctttgtcagcaggagcactgtaaggcttaggacgattctgctgtcccttacccct 22506051  T
Q  398 cctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctacagctgttaaccaa 463  Q
    ||||||| ||| || ||| || ||||| ||||| || || ||||| || || || |||||||||||    
T  22506052 cctctcactcattatcttataatgagctttggtgtcttcttcataaattctgcacctgttaaccaa 22506117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 511
Target Start/End: Original strand, 25851045 - 25851558
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||    || |||||||||||  ||||||| ||||| ||||| ||    
T  25851045 tagcaattaaatgagtactattaaagaaacaagtacctctgataagacggtcctcattggtagtctgcgtaccagtcaaagcaaataccttcccaccagt 25851144  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgt 200  Q
     ||| ||||||| ||||  | |||||| ||||| |||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||  || | ||||||  | | ||||| | ||||     
T  25851145 tctagccttcttcggctcaggacactgtgaactaatatgaccctctccattgcagttgtagcagacaatgtctccacgcttgtattcagctagactgtga 25851244  T
Q  201 cctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgc---ag 297  Q
    || |||| ||  ||||| ||||||||| | ||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||  |   ||    
T  25851245 cccttctgaccacacctgaagcacttcctatcatctttaccacaaacattactcttgtggcctttctcaccacacttgtagcaaacaatctcaacaagag 25851344  T
Q  298 catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgccctt 397  Q
    ||||| || |||| |||| |||| ||||  |||||||||  || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| |    
T  25851345 catctctcctcttgggcctcctatcatcacccatcttctgctttcctttgtcagcaggagcactgtaaggcttaggacgattctgctgtcccttacccct 25851444  T
Q  398 cctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctacagctgttaaccaaatctggaaaaactctcagccgttgatacccaatc 497  Q
    ||||||| ||| || |||||| ||||| ||||| || || ||||| || || || || |||||||| || |  |||||||| | | | |||||||||||     
T  25851445 cctctcactcattatcttgtaatgagctttggtgtcttcttcataaattctgcacctattaaccaactcagagaaaactctgatctgctgatacccaata 25851544  T
Q  498 gccctcttgatgtc 511  Q
    || || ||||||||    
T  25851545 gctcttttgatgtc 25851558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 14884386 - 14883873
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    || |||||||||||  |||||||||| || |||||  |    
T  14884386 tagcaattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctctgataagtcggtcctcattaggagtctgcgtaccagtcaaagcaaacactttcccaccaat 14884287  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgt 200  Q
     |||  |||| | ||||  | |||||| ||||| |||||||||||  |||| |||||||| || ||||  |||| |||||| || | ||| ||| ||||     
T  14884286 tctagtcttcctcggctcaggacactgtgaactaatatgaccttccccattgcagttgtaacagacaatgtccccacgcttgcattcagccaaactgtga 14884187  T
Q  201 cctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatct---ctgcag 297  Q
    || |||| ||  ||||| ||||||||| | |||||||   |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | || |||||||   ||| ||    
T  14884186 cccttctgaccacacctgaagcacttcctatcatctctcccacagacattactcttgtggcctttctcaccacacttgtaacaaacaatctcagctggag 14884087  T
Q  298 catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgccctt 397  Q
    ||||| || |||| |||| |||| ||||  ||||| |||  || |||||||||| ||| |||||||| |||||||||||| |||| |||||||| ||| |    
T  14884086 catctctcctcttgggcctcctatcatcacccatcctctgctttcctttgtcagtaggagcactgtaaggcttaggacgattctgttgtcccttacccct 14883987  T
Q  398 cctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctacagctgttaaccaaatctggaaaaactctcagccgttgatacccaatc 497  Q
    ||||||| |||  | ||| || ||||| ||||| || || |||||||| || || || |||||||| || |  || ||||| | | | |||||||||||     
T  14883986 cctctcactcataatcttataatgagctttggtgtcttcttcatagattctgcacctattaaccaactcagagaagactctgatctgctgatacccaata 14883887  T
Q  498 gccctcttgatgtc 511  Q
    ||||| ||||||||    
T  14883886 gcccttttgatgtc 14883873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 243 - 477
Target Start/End: Original strand, 20803830 - 20804067
Alignment:
Q  243 caaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatt 339  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||| ||||   |||| |||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||    
T  20803830 caaacatttctcttgtggcctttctcaccataattgaaacagacaatctccgcaggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctatt 20803929  T
Q  340 tccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctc 439  Q
    | || || |||||||||||||| || ||||||||  |||| || || |||||   ||||  ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20803930 tgcccttatcagcaggggcactatagggcttagggagactttgttggcccttagtcttctgctcatccacaaccttgtaatgagccttggtatcctcctc 20804029  T
Q  440 atagatcctacagctgttaaccaaatctggaaaaactc 477  Q
    |||||| || ||||| || ||||| || ||||||||||    
T  20804030 atagattctgcagctatttaccaactcaggaaaaactc 20804067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 242 - 511
Target Start/End: Original strand, 18782346 - 18782618
Alignment:
Q  242 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctat 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||   |||| |||||||||| || |||| ||||||||||  ||| |    
T  18782346 acaaacattactcttgtggcctttctcgccacagttgaaacaaacaatctccgcaggagcatccttcttcttagaccacctatcatcgaccattctctgt 18782445  T
Q  339 ttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcct 438  Q
    || || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| || ||||||  ||||| ||||||||| |||||||| | |||||| ||||| ||||    
T  18782446 ttgcccttatcagcaggggcactataaggcttagggcgactctgttggcccttggtcttccgctcattcacaaccttgtaattagccttagtatcttcct 18782545  T
Q  439 catagatcctacagctgttaaccaaatctggaaaaactctcagccgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 511  Q
    | ||||| || ||||| || || ||||  || |||||||  | | |||| || ||||||||||||||||||||    
T  18782546 cgtagattctgcagctattcactaaattagggaaaactcggatctgttggtatccaatcgccctcttgatgtc 18782618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 242 - 442
Target Start/End: Original strand, 23461203 - 23461406
Alignment:
Q  242 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgc---agcatctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctat 338  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| || ||   |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||    
T  23461203 acaaacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaatagacaatttccgcaggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctat 23461302  T
Q  339 ttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcct 438  Q
    || || || |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||   ||||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |    
T  23461303 tttcccttatcagcaggggcactatagggcttagggcgactctgctggcccttagtcttccgctcattcacaaccttgtaatgagctttggtgtcctctt 23461402  T
Q  439 cata 442  Q
    ||||    
T  23461403 cata 23461406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 296 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 23537312 - 23537097
Alignment:
Q  296 agcatctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgccc 395  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||| || || |||| ||||||||| || ||| |||| ||||||||||| |||||   |    
T  23537312 agcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgtttgcccttatcaggaggggcactatagggcatagggcgactctgctggcccttagtc 23537213  T
Q  396 ttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctacagctgttaaccaaatctggaaaaactctcagccgttgatacccaa 495  Q
    |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||  | | |||| || || |    
T  23537212 ttccgctcattcacaaccttgtaatgagccttggtatcctcctcataaattctgcagctattaaccaaatcaggaaaaactcagatctgttggtatccga 23537113  T
Q  496 tcgccctcttgatgtc 511  Q
    |||||||||| |||||    
T  23537112 tcgccctcttaatgtc 23537097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 242 - 448
Target Start/End: Original strand, 25429652 - 25429861
Alignment:
Q  242 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagca---tctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctat 338  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||| | || || ||||||||||||| |   || |||||||||||||||||| | || |||||| |||||    
T  25429652 acaagcattgctcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctgcaggagtatccttcttcttaggccgcctatcttcaaccatcctctat 25429751  T
Q  339 ttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcct 438  Q
    || || || | ||||||||||||||| |||||| | ||||||||||| |||||   ||||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||    
T  25429752 ttgcccttattagcaggggcactgtaaggcttaaggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcct 25429851  T
Q  439 catagatcct 448  Q
    |||| |||||    
T  25429852 cataaatcct 25429861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 21561420 - 21561124
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||| |||||||  | ||||||||||| |||||||     
T  21561420 tagcaattaaagaagtactattaaagaaacaagtacctctgataagtcggtcctcattaactgtttgcataccagtcaatgcaaacacctttccacctg- 21561322  T
Q  101 cctaa-ccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtg 199  Q
    ||||| |||||||| ||| | | ||||||||||| | |||||||||||| | ||| ||| ||||||||| ||| | || ||| || || ||||  || ||    
T  21561321 cctaagccttcttatgcttcctgcactgcgaactaagatgaccttcttcgtcacaattgaagcaaacaatatcaccacacttgcatttcgctatcgtatg 21561222  T
Q  200 tcctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag 297  Q
     |||||||  |  || |  |||||||| |||||| | |  |  | |||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  21561221 ccctttcttcccacatcggaagcactttttctcaacaccattgctaacattactcttgtggcccttcttaccacacttgaagcaaacaatctcagcag 21561124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 242 - 451
Target Start/End: Original strand, 21883007 - 21883221
Alignment:
Q  242 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctat 338  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||| ||||   ||||||||||| | ||||| ||| | ||||||||  ||| |    
T  21883007 acaagcattgctcttgtggcctttctcgccacaattaaaacagacaatctcagcagaaacatctttcttcctcggccgtctatcctcgaccattctctgt 21883106  T
Q  339 ttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagc--cttggtatcctc 436  Q
    || || || |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||   ||||| ||||||||| |||||||| |||||  ||| ||||||||    
T  21883107 ttgcccttatcagcaggggcactatagggcttagggcgactctgctggcccttagtcttccgctcattcacaaccttgtaatgagcctcttagtatcctc 21883206  T
Q  437 ctcatagatcctaca 451  Q
    |||||||||||||||    
T  21883207 ctcatagatcctaca 21883221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 5 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 21983568 - 21983299
Alignment:
Q  5 aattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgtccta 104  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| || || |||||| ||||  | ||||||||||| ||||||| |  |    
T  21983568 aattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctctgataagtcggtcctcattaactgtctgcgtaacagtcaatgcaaacacctttccacctgcctga 21983469  T
Q  105 accttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgtcctt 204  Q
     |||||||||||| | | ||||||||||| | |||||||||||| | ||| ||| ||||||||| ||| | |||||| || |  ||||  || || ||||    
T  21983468 gccttcttaggcttcctgcactgcgaactaagatgaccttcttcgtcacaattgaagcaaacaatatcaccacgcttgcattccgctatcgtatgccctt 21983369  T
Q  205 tctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccaca 274  Q
    |||  |  || |  |||||||| |||||||| |  |  | |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21983368 tcttcccacatcggaagcactttttctcatcaccattgcgaacattactcttgtggcccttctcaccaca 21983299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 242 - 463
Target Start/End: Original strand, 23526283 - 23526507
Alignment:
Q  242 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctat 338  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||   |||| |||||| | ||||| ||| | ||||||||| |||||    
T  23526283 acaagcattgctcttgtggcctttctcaccacaattaaaacagacaatctcagcaggagcatccttcttccttggccgtctatcctcgaccatcctctat 23526382  T
Q  339 ttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcct 438  Q
    || || ||||||||| | ||||| || |||||||  ||||||||||| |||||   ||||| ||||||||| | |||||| |||||||| || |||||||    
T  23526383 ttgcccttgtcagcaagagcactatagggcttagtgcgactctgctggcccttagtcttccactcattcacaatcttgtaatgagcctttgtgtcctcct 23526482  T
Q  439 catagatcctacagctgttaaccaa 463  Q
    |||| ||||| || ||||| |||||    
T  23526483 cataaatcctgcaactgttcaccaa 23526507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 236 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 21870438 - 21870217
Alignment:
Q  236 tcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatc 332  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |  ||||| | ||   ||||| || ||||||||| |||  ||||   ||      
T  21870438 tcggtcacaaacattactcttgtggtctttctcaccacacttgaagcaaattatctcagtaggagcatctctcctcttaggcctcctcccatcattcaat 21870339  T
Q  333 ttctatttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtat 432  Q
    ||||  || || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||  | | |||| |||  |||||||| ||||| |||||||    
T  21870338 ttctgcttacccttgtcagcaggggcactatacggcttcggacgactctgctgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagctttggtat 21870239  T
Q  433 cctcctcatagatcctacagct 454  Q
    |||| ||||| ||||| |||||    
T  21870238 cctcttcatatatcctgcagct 21870217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 236 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 21874718 - 21874497
Alignment:
Q  236 tcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatc 332  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |  ||||| | ||   ||||| || ||||||||| |||  ||||   ||      
T  21874718 tcggtcacaaacattactcttgtggtctttctcaccacacttgaagcaaattatctcagtaggagcatctctcctcttaggcctcctcccatcattcaat 21874619  T
Q  333 ttctatttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtat 432  Q
    ||||  || || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||  | | |||| |||  |||||||| ||||| |||||||    
T  21874618 ttctgcttacccttgtcagcaggggcactatacggcttcggacgactctgctgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagctttggtat 21874519  T
Q  433 cctcctcatagatcctacagct 454  Q
    |||| ||||| ||||| |||||    
T  21874518 cctcttcatatatcctgcagct 21874497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 17266729 - 17266433
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | || |||||||||||  | || |  ||||||||  ||||||| || || |||||       
T  17266729 tagcaattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctttgatgagacggtcctcattagcagtctaggtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaac 17266630  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgt 200  Q
     ||||||||||| ||||| || ||||| | |||||| ||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| |  ||||| ||||  ||||   ||||     
T  17266629 tctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtgaccctcttcattacaattatagcatacaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtga 17266530  T
Q  201 cctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcat-ctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag 297  Q
    || ||||  |  ||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||    
T  17266529 cccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatcctcggt-acaaacgttactcttgtgacctttctcgccacacttaaaacacactatctcagcag 17266433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 20824426 - 20824570
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||    || |||||||||||  ||||||| || || || || ||    
T  20824426 tagcaattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctctgataagtcgatcctcattggtagtctgcgtaccagtcaaagcaaatacttttcctccagt 20824525  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttc 145  Q
    ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  20824526 cctgaccttcttaggttgcgtgcactgcgaactaatgtgaccttc 20824570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 69 - 181
Target Start/End: Original strand, 43122508 - 43122620
Alignment:
Q  69 gtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaa 168  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||| | ||| ||| |||||||||    
T  43122508 gtaccagctaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgtgtacactgtgaactgagatgtccttcttcgtcacaattgaagcaaacaa 43122607  T
Q  169 catccctacgctt 181  Q
     ||| | ||||||    
T  43122608 tatcaccacgctt 43122620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 348 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 21332034 - 21331934
Alignment:
Q  348 tcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcc 447  Q
    |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| | | |||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  21332034 tcagcaggagcactgtaaggctttggacgactctgctgacctttgcctttcctctcattcacaatcctgtaatgagccttagtatcctcctcataaatcc 21331935  T
Q  448 t 448  Q
    |    
T  21331934 t 21331934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 242 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 21631553 - 21631347
Alignment:
Q  242 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagca---tctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctat 338  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||| |||| ||| |||| |   ||||||||  |||||| ||| |||||   || | | | |    
T  21631553 acaagcattactcgtgtggcctttctcaccacaagtgtagcaaacaacctcagcagtagtatctttctttctaggcctcctcacatcattcaccctttgt 21631454  T
Q  339 ttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcct 438  Q
    || || || |||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| | | | ||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||    
T  21631453 ttacccttatcagcaggagcactgtaaggctttggacgactttgctgactcctacccttcctctcattcacaaccttgtaatgagctttcgtatcttcct 21631354  T
Q  439 catagat 445  Q
    |||||||    
T  21631353 catagat 21631347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 21631794 - 21631637
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    ||||||||||||||||||||| || | |||| ||||||||  | |  |||||||||||||| || || ||||||||  |||||||||| || ||||  ||    
T  21631794 tagcaattaaaggagtactatcaaagtaacatgtacctctaatcaaccggtcctcattcactgtctgtgtaccagtcaaagcaaacactttcccactagt 21631695  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttg 158  Q
    |  | |||||||||||| | | ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  21631694 ctgagccttcttaggcttcttgcactgcgaaccaatatgaccttcttcattgcagttg 21631637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 348 - 441
Target Start/End: Original strand, 23474535 - 23474628
Alignment:
Q  348 tcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcat 441  Q
    |||||||| ||| |||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  23474535 tcagcaggagcaatgtaaggctttggacgactttgctgacccttgcctttcctctcattcacaaccttgtaatgagccttagtatcttcctcat 23474628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 58
Target Start/End: Original strand, 20778886 - 20778943
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcatt 58  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  20778886 tagcaattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctctgataagtcgatcctcatt 20778943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 55
Target Start/End: Original strand, 22464923 - 22464977
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctc 55  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  22464923 tagcaattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctctgataagtcgatcctc 22464977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 28892337 - 28892280
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcatt 58  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  28892337 tagcaattaaaggagtaccattaaagaaacaagtacctctgataagtcgatcctcatt 28892280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 342 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 26735779 - 26735679
Alignment:
Q  342 cctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcat 441  Q
    ||||| |||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||||| || ||| | |||| |||||| || | |||||| |||||||| |||||||||||||    
T  26735779 cctttatcagtaggagcactgtaaggctttggacgactctgctgacctttgactttccgctcatttacaatcttgtaatgagccttagtatcctcctcat 26735680  T
Q  442 a 442  Q
    |    
T  26735679 a 26735679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 16258326 - 16258135
Alignment:
Q  106 ccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgtccttt 205  Q
    |||||||||||| | | ||||||||||| | ||||||||| |||| ||| ||| | ||||||| ||| | |||||| || | |||||  || || |||||    
T  16258326 ccttcttaggcttcttgcactgcgaactaagatgaccttcctcatcacaattgaaacaaacaatatcaccacgcttgcattcagctattgtatgcccttt 16258227  T
Q  206 ctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag 297  Q
    ||  |  || |  |||||||||||||| || |  |  |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||    
T  16258226 cttcccacatcggaagcacttcttctcctcaccattgcaaacattactcttgtggcccttctcaccacacttgtagcaaacaatctcagcag 16258135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 22592045 - 22591854
Alignment:
Q  106 ccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgtccttt 205  Q
    |||||||||||| | | ||||||||||| | ||||||||| |||| ||| ||| | ||||||| ||| | |||||| || | |||||  || || |||||    
T  22592045 ccttcttaggcttcttgcactgcgaactaagatgaccttcctcatcacaattgaaacaaacaatatcaccacgcttgcattcagctattgtatgcccttt 22591946  T
Q  206 ctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag 297  Q
    ||  |  || |  |||||||||||||| || |  |  |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||    
T  22591945 cttcccccatcggaagcacttcttctcctcaccattgcaaacattactcttgtggcccttctcaccacacttgtagcaaacaatctcagcag 22591854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 22595600 - 22595409
Alignment:
Q  106 ccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgtccttt 205  Q
    |||||||||||| | | ||||||||||| | ||||||||| |||| ||| ||| | ||||||| ||| | |||||| || | |||||  || || |||||    
T  22595600 ccttcttaggcttcttgcactgcgaactaagatgaccttcctcatcacaattgaaacaaacaatatcaccacgcttgcattcagctattgtatgcccttt 22595501  T
Q  206 ctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag 297  Q
    ||  |  || |  |||||||||||||| || |  |  |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||    
T  22595500 cttcccccatcggaagcacttcttctcctcaccattgcaaacattactcttgtggcccttctcaccacacttgtagcaaacaatctcagcag 22595409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 17266382 - 17266274
Alignment:
Q  345 ttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcataga 444  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||  | | |||| |||  ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||    
T  17266382 ttgtcagcaggggcactatacggtttaggacgactctgatgccctttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtaga 17266283  T
Q  445 tcctacagc 453  Q
    |||||||||    
T  17266282 tcctacagc 17266274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 93
Target Start/End: Original strand, 21410129 - 21410217
Alignment:
Q  5 aattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgc 93  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | || || ||||||||| | || |  ||||||| | |||||||||||||||    
T  21410129 aattaagggagtactattaatgaaacatgtacctctgatcagacgatcctcattctctgtctaagtaccagctaaagcaaacaccttgc 21410217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 168
Target Start/End: Original strand, 21882869 - 21882932
Alignment:
Q  105 accttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaa 168  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||  || ||||||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  21882869 accttcttaggctgcttacactgagaaccaatgtgaccttcttcattacaattgaagcacacaa 21882932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 243 - 274
Target Start/End: Original strand, 23669847 - 23669878
Alignment:
Q  243 caaacattactcttgtggcctttctcaccaca 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23669847 caaacattactcttgtggcctttctcaccaca 23669878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 417 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 16258012 - 16257918
Alignment:
Q  417 tagtgagccttggtatcctcctcatagatcctacagctgttaaccaaatctggaaaaactctcagccgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 511  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| || | ||| ||||| | | | ||||||||||| || ||||| |||||    
T  16258012 tagtgagctttggtatcctcctcatatatcctgcagctattcaccaactcggaaaagactctgatctgctgatacccaatagctctcttaatgtc 16257918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 417 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 22591731 - 22591637
Alignment:
Q  417 tagtgagccttggtatcctcctcatagatcctacagctgttaaccaaatctggaaaaactctcagccgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 511  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| || | ||| ||||| | | | ||||||||||| || ||||| |||||    
T  22591731 tagtgagctttggtatcctcctcatatatcctgcagctattcaccaactcggaaaagactctgatctgctgatacccaatagctctcttaatgtc 22591637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 417 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 22595286 - 22595192
Alignment:
Q  417 tagtgagccttggtatcctcctcatagatcctacagctgttaaccaaatctggaaaaactctcagccgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 511  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| || | ||| ||||| | | | ||||||||||| || ||||| |||||    
T  22595286 tagtgagctttggtatcctcctcatatatcctgcagctattcaccaactcggaaaagactctgatctgctgatacccaatagctctcttaatgtc 22595192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 242 - 292
Target Start/End: Original strand, 23474426 - 23474476
Alignment:
Q  242 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctc 292  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||| || |||| ||||||||    
T  23474426 acaagcattactcttatggcctttctcaccacaagtgtagcaaacaatctc 23474476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 342 - 455
Target Start/End: Original strand, 20779230 - 20779343
Alignment:
Q  342 cctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcat 441  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||| || || ||   |||||||||   | || ||||  |||  ||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  20779230 cctttgttagcaggggcactgtagggcttcgggcggctactctgtcccttattcctcttctcgctcatcaccttatagtgagcctttgtatcctcctcat 20779329  T
Q  442 agatcctacagctg 455  Q
    | || |||||||||    
T  20779330 aaattctacagctg 20779343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 338 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 21561080 - 21560963
Alignment:
Q  338 tttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcc 437  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||| |||||||  ||||| || |||  | |||||||| |||  ||||| ||  | || || |||||||||    
T  21561080 tttccctttgtcagcagtagcactgtagggcttcggacgaccttgctgacctttgttcctcctctcactcataaccttataacgggctttcgtatcctcc 21560981  T
Q  438 tcatagatcctacagctg 455  Q
    ||||| || |||||||||    
T  21560980 tcataaattctacagctg 21560963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 339 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 21983231 - 21983115
Alignment:
Q  339 ttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcct 438  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||  ||||| || |||  | ||| |||| |||  | ||| || ||||| || ||||||||||    
T  21983231 ttccctttgtcagcaggaacactgtagggcttcggacgaccttgctgacctttgttcctccgctcactcataaacttataatgagctttcgtatcctcct 21983132  T
Q  439 catagatcctacagctg 455  Q
    |||| || |||||||||    
T  21983131 cataaattctacagctg 21983115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 44)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 252 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 17091851 - 17091592
Alignment:
Q  252 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcag 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17091851 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttgtcag 17091752  T
Q  352 caggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctaca 451  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  17091751 cgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctgca 17091652  T
Q  452 gctgttaaccaaatctggaaaaactctcagccgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 511  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||| | || || ||||||||||||||||||||    
T  17091651 gctgttaaccaaatcctgaaaaactctcagctgctggtatccaatcgccctcttgatgtc 17091592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 252 - 511
Target Start/End: Original strand, 8389722 - 8389981
Alignment:
Q  252 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcag 351  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| || |||||||    
T  8389722 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggtcgcctaacatcgaccatcttctgtttacccttgtcag 8389821  T
Q  352 caggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctaca 451  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  8389822 cgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctgca 8389921  T
Q  452 gctgttaaccaaatctggaaaaactctcagccgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 511  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||| | || || ||||||||||||||||||||    
T  8389922 gctgttaaccaaatcctgaaaaactctcagctgctggtatccaatcgccctcttgatgtc 8389981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 255 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 14300678 - 14300422
Alignment:
Q  255 ttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcagcag 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  14300678 ttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcag 14300579  T
Q  355 gggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctacagct 454  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  14300578 gggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagct 14300479  T
Q  455 gttaaccaaatctggaaaaactctcagccgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 511  Q
     || ||||||||| |||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||    
T  14300478 attgaccaaatcttgaaaaactctaagctgttggtatccaatcgccctcttgatgtc 14300422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 252 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 19775495 - 19775236
Alignment:
Q  252 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcag 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  19775495 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaatcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttacctttgtcag 19775396  T
Q  352 caggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctaca 451  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| || ||    
T  19775395 cgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcgtagattctgca 19775296  T
Q  452 gctgttaaccaaatctggaaaaactctcagccgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 511  Q
    ||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19775295 gctattaaccaaatcctgaaaaactctcagctgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 19775236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 252 - 511
Target Start/End: Original strand, 23959057 - 23959316
Alignment:
Q  252 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcag 351  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  23959057 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttacctttgtcag 23959156  T
Q  352 caggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctaca 451  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| || ||    
T  23959157 cgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcgtagattctgca 23959256  T
Q  452 gctgttaaccaaatctggaaaaactctcagccgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 511  Q
    ||| |||||||||||  |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||    
T  23959257 gctattaaccaaatcctgaaaaactctcagctgttggtacccaatcgccctcttaatgtc 23959316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 14993580 - 14993184
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  14993580 tagcaattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctctgataagtcggtcctcattcactgtttgcgtaccattcaaagcaaacaccttgccacctgt 14993481  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgt 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||    
T  14993480 cctaaccttcttaggttgcgtacactgcgaactgatatgaccttcctcattgcagttgtagcaaacaacatccccatgcttgcaatcagctaaagtgtgt 14993381  T
Q  201 cctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctc---tgcag 297  Q
    ||||||| ||  ||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||    | ||    
T  14993380 cctttctgaccacacctgaagcacttcttcttctcacggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggag 14993281  T
Q  298 catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcc 394  Q
    ||||| || |||| |||| |||  ||||   ||   |||  || || ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  14993280 catctctcctcttgggcctcctctcatcattcaatctctgcttacccttgtcagcaggggcactatacggcttcagacgactctgttgtcccttgcc 14993184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 252 - 511
Target Start/End: Original strand, 12479910 - 12480169
Alignment:
Q  252 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcag 351  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12479910 ctcttatggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcctcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttgtcag 12480009  T
Q  352 caggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctaca 451  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||    
T  12480010 cgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcgtagatcctgca 12480109  T
Q  452 gctgttaaccaaatctggaaaaactctcagccgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 511  Q
    ||| |||||||||||  |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||    
T  12480110 gctattaaccaaatcctgaaaaactctcagctgttggtacccaatcgccctcttaatgtc 12480169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 252 - 511
Target Start/End: Original strand, 27714646 - 27714905
Alignment:
Q  252 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcag 351  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  27714646 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttacctttgtcag 27714745  T
Q  352 caggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctaca 451  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| || ||    
T  27714746 cgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcgtagattctgca 27714845  T
Q  452 gctgttaaccaaatctggaaaaactctcagccgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 511  Q
    ||| |||||||||||  |||||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||    
T  27714846 gctattaaccaaatcctgaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 27714905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 252 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 8050325 - 8050066
Alignment:
Q  252 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcag 351  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  8050325 ctcttgtggcccttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccctcttcttaggccgtctcacatcgaccatcttctgtttccctttatcag 8050226  T
Q  352 caggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctaca 451  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||    
T  8050225 caggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgca 8050126  T
Q  452 gctgttaaccaaatctggaaaaactctcagccgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 511  Q
    ||| || ||||||||  |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  8050125 gctattgaccaaatcctgaaaaactctcagctgttggtacccaatcgccctcttgatgtc 8050066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 252 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 16233694 - 16233435
Alignment:
Q  252 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcag 351  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  16233694 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaagtacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttccctttgtcag 16233595  T
Q  352 caggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctaca 451  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||| ||    
T  16233594 cgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcttcttcgtagatcctgca 16233495  T
Q  452 gctgttaaccaaatctggaaaaactctcagccgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 511  Q
    ||| |||||||||||  |||||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||    
T  16233494 gctattaaccaaatcctgaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 16233435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 246 - 511
Target Start/End: Original strand, 19635440 - 19635705
Alignment:
Q  246 acattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctt 345  Q
    ||||| || |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||    
T  19635440 acattgcttttgtggcctttcccaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccatcctctgtttccctt 19635539  T
Q  346 tgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagat 445  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  19635540 tatcagcgggggcactgtacggcttaggacaactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagat 19635639  T
Q  446 cctacagctgttaaccaaatctggaaaaactctcagccgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 511  Q
    ||| || || ||||||||||| ||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  19635640 cctgcaactattaaccaaatccggaaaaactctcagttgttggtacccaatcgccctcttgatgtc 19635705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 255 - 511
Target Start/End: Original strand, 40476353 - 40476609
Alignment:
Q  255 ttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcagcag 354  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  40476353 ttgtggcctttcccaccacaattgaaacacacaatctcagtagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccatcttctgtttccctttatcagcag 40476452  T
Q  355 gggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctacagct 454  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  40476453 gggcactgtacggcttaggacgactccgctgtcccttgcccttcctctcgttcactatcttgtagtgagccttggtatcctcttcatagatcctgcagct 40476552  T
Q  455 gttaaccaaatctggaaaaactctcagccgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 511  Q
     || ||||||||  |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  40476553 attgaccaaatcctgaaaaactctcagctgttggtacccaatcgccctcttgatgtc 40476609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 430
Target Start/End: Original strand, 20893090 - 20893522
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    || |||||||||||  ||||||||||||| ||||| ||    
T  20893090 tagcaattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctctgataagtcggtcctcattggtagtctgcgtaccagtcaaagcaaacacctttccaccagt 20893189  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgt 200  Q
     ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| | |||| ||||| |||||| || | ||||||| |||||    
T  20893190 tctaaccttcttcggctcagtacactgcgaactgatatgcccctcttcattgcagttgtagtagacaatatccccacgcttgcattcagctaaattgtgt 20893289  T
Q  201 cctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctc---tgcag 297  Q
    || |||| ||  ||||| ||||||||| |||||||||   |||||||||| ||||||| |||||| |||||||| ||| | || ||||||||    | ||    
T  20893290 cccttctgaccacacctgaagcacttcctctcatctctaccacaaacattgctcttgttgcctttttcaccacacttgtaacaaacaatctcagaaggag 20893389  T
Q  298 catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgccctt 397  Q
    ||||| || ||||||||| |||| ||||   ||||||||  || |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20893390 catctctcctcttaggcctcctatcatcattcatcttctgctttcctttgtcagcaggagcactttaaggcttaggacgactctgctgtcccttgcccct 20893489  T
Q  398 cctctcattcactaccttgtagtgagccttggt 430  Q
    ||||||| ||| || |||||| ||||| |||||    
T  20893490 cctctcactcattatcttgtaatgagctttggt 20893522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 255 - 511
Target Start/End: Original strand, 14683880 - 14684136
Alignment:
Q  255 ttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcagcag 354  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||||||    
T  14683880 ttgtggcctttcccaccacaattgaaacacacaatctcggtagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccatcctctgtttccctttatcagcag 14683979  T
Q  355 gggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctacagct 454  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||    
T  14683980 gggcactgtatggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcgttcacaatcttatagtgagccttagtatcctcttcatagatcctgcaact 14684079  T
Q  455 gttaaccaaatctggaaaaactctcagccgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 511  Q
     || |||||||||||||||||||| | | |||| || |||||||||||||| |||||    
T  14684080 attgaccaaatctggaaaaactctaatctgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 14684136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 3262007 - 3261542
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    || |||||||||||  ||||||||||||| |||||  |    
T  3262007 tagcaattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctctgataagtcggtcctcattaggagtctgcgtaccagtcaaagcaaacacctttccaccaat 3261908  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgt 200  Q
     |||  |||||| ||||  | |||||| |||||||||||||||||  |||| |||||||| || ||||  |||| |||||| || | ||||||| ||||     
T  3261907 tctagtcttcttcggctcaggacactgtgaactgatatgaccttccccattgcagttgtaacagacaatgtccccacgcttgcattcagctaaactgtga 3261808  T
Q  201 cctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatct---ctgcag 297  Q
    || |||| ||  ||||| ||||||||| | |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||   | | ||    
T  3261807 cccttctgaccacacctgaagcacttcctatcatctcttccacaaacattactcttgtggcctttctcaccacacttgtagcaaacaatctcaacaggag 3261708  T
Q  298 catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgccctt 397  Q
    ||||| || |||| |||| |||| ||||  |||||||||  || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| |    
T  3261707 catctctcctcttgggcctcctatcatcacccatcttctgctttcctttgtcagcaggagcactgtaaggcttaggacgattctgctgtcccttacccct 3261608  T
Q  398 cctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctacagctgttaaccaa 463  Q
    ||||||| ||| || |||||| ||||| ||||| || || |||||||| || || || ||||||||    
T  3261607 cctctcactcattatcttgtaatgagctttggtgtcttcttcatagattctgcacctattaaccaa 3261542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 454
Target Start/End: Original strand, 15073418 - 15073874
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||  ||| ||||||||||||||||||    
T  15073418 tagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtacctctgataagtcggtcctcattaacagtttgtgtaccagtcaaagaaaacaccttgccacctgt 15073517  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgt 200  Q
    |  | |||||||||||| | | ||||| || || |||||||||||||||| ||| || |||||||||||||| | | |||| |||| |||||| ||||||    
T  15073518 cagagccttcttaggcttcctgcactgtgagcttatatgaccttcttcatcacaattatagcaaacaacatcacaaagcttgcaatcagctaatgtgtgt 15073617  T
Q  201 cctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctc---tgcag 297  Q
    |||||||  |  |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||    | ||    
T  15073618 cctttctttccacacctaaaacacttcttctcatcacggtcacatacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacagacaatctcagtaggag 15073717  T
Q  298 catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgccctt 397  Q
    ||||| || || |||||| |||  ||||   ||   ||| |||  ||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||| |||||||||| ||  |    
T  15073718 catctctcctcctaggcctcctctcatcattcagtctctgtttaactttgtcagcaggagcactatacggtttcggacgactcagctgtcccttacctct 15073817  T
Q  398 cctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctacagct 454  Q
     | |||| |||  ||||| || ||||| || |||||||| |||||||||||||||||    
T  15073818 acgctcactcatcaccttataatgagcttttgtatcctcttcatagatcctacagct 15073874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 454
Target Start/End: Original strand, 15266835 - 15267291
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| ||| ||| |    ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||    
T  15266835 tagcaattaaaggagtactattaaagaaacaactacctctgataagtctgtcttcactagttgtttgcgtactggttaaagcaaacaccttgccaccggt 15266934  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgt 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||  || | | ||||||||| ||||| |||||||    
T  15266935 cctaaccttcttcggctgcgtacactacgaactgatatgaccttcttcgttgcagttatagcaaacaatgtctccatgcttacaatcagctagagtgtgt 15267034  T
Q  201 cctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaa---tctctgcag 297  Q
    ||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| |||||||| ||||   ||   | ||    
T  15267035 cctttctgaccacacctgaagcacttcttctcatctctgtcacaaacattactcttatggcccttctcatcacacttgaagcaaacaatattcgtaggag 15267134  T
Q  298 catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgccctt 397  Q
    ||||| || |||| |||| |||  ||||    | | |||  || || ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||  |    
T  15267135 catctctcctcttgggcctcctctcatcatttaacctctgcttacccttgtcagcaggagcactatacggcttcggacgactctgttgtcccttgcctct 15267234  T
Q  398 cctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctacagct 454  Q
     |  ||| |||  |||||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| |||||    
T  15267235 gcgttcactcatcaccttgtaatgagctttcgtgtcctcctcataaatcctgcagct 15267291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 511
Target Start/End: Original strand, 7357326 - 7357839
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    || || ||||||||  | ||||||||||| ||||  ||    
T  7357326 tagcaattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctctgataagtcggtcctcattggtagtctgtgtaccagtcaatgcaaacaccttcccactagt 7357425  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgt 200  Q
     ||| ||||||| ||||  | |||||| ||||| |||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||  || | |||||| || | ||||||| ||||     
T  7357426 tctagccttcttcggctcaggacactgtgaactaatatgaccctctccattgcagttgtagcagacaatgtctccacgcttgcattcagctaaattgtga 7357525  T
Q  201 cctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag--- 297  Q
    || |||| ||  ||||| ||||||||| ||||||||    || ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| | || |||||||| ||||       
T  7357526 cccttctgaccacacctgaagcacttcctctcatctttaccataaacattgctcttgtggcctttctcaccactcttgtaacaaacaatctcagcaggag 7357625  T
Q  298 catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgccctt 397  Q
    ||||| || |||| |||| |||| ||||  |||||||||  || |||||||||||||| ||| |||| |||||||||||| |||| |||||||| ||| |    
T  7357626 catctctcctcttgggcctcctatcatcacccatcttctgctttcctttgtcagcaggagcaatgtaaggcttaggacgattctgttgtcccttacccct 7357725  T
Q  398 cctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctacagctgttaaccaaatctggaaaaactctcagccgttgatacccaatc 497  Q
    ||||||| ||| || |||||| ||||||||||| || || ||||| |||||||| ||||||||||| || | ||| ||||| | | |||||||||||||     
T  7357726 cctctcactcattatcttgtaatgagccttggtgtcttcttcataaatcctacacctgttaaccaactcagaaaagactctgatctgttgatacccaata 7357825  T
Q  498 gccctcttgatgtc 511  Q
    || || ||||||||    
T  7357826 gctcttttgatgtc 7357839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 44659079 - 44658614
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    || ||||||||| |  ||||||||||||| ||||| ||    
T  44659079 tagcaattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctctgataagtcggtcctcattaggagtctgcgtaccattcaaagcaaacacctttccaccagt 44658980  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgt 200  Q
     |||  |||||| || |  | |||||| ||||| ||||||| |||| |||| || ||||| || |||| ||||| |||||| || | ||||||| ||||     
T  44658979 tctagtcttcttcggttcaggacactgtgaactaatatgacattctccattgcaattgtaacagacaatatccccacgcttgcattcagctaaactgtga 44658880  T
Q  201 cctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag--- 297  Q
    || |||| ||  ||||| ||||||||| | |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||  |||       
T  44658879 cccttctgaccacacctgaagcacttcctatcatctcttccacaaacattactcttgtggcctttctcaccacacttgtagcaaacaatctcaacaggag 44658780  T
Q  298 catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgccctt 397  Q
    ||||| || |||| |||| |||| |||   |||||||||  || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| |||||||| ||| |    
T  44658779 catctctcctcttgggcctcctatcatgacccatcttctgctttcctttgtccgcaggagcactgtaaggcttaggacgattctgttgtcccttacccct 44658680  T
Q  398 cctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctacagctgttaaccaa 463  Q
    ||||||| ||| || |||||| ||||| ||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||    
T  44658679 cctctcactcattatcttgtaatgagctttggtgtcttcttcatagattctacacctgttaaccaa 44658614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 11204445 - 11203980
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    || |||||||||||  ||||||||||||| ||||| ||    
T  11204445 tagcaattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctctgataagtcggtcctcattggtagtntgcgtaccagtcaaagcaaacaccttcccaccagt 11204346  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgt 200  Q
     ||| |||| || ||||  | |||||| |||||||||||||| ||| |||| || |||||||| |||| ||||| |||||| || | ||||| | ||||     
T  11204345 tctagcctttttcggctcaggacactgtgaactgatatgaccctctccattgcaattgtagcagacaatatccccacgcttgcattaagctagactgtga 11204246  T
Q  201 cctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctc---tgcag 297  Q
    || |||| ||  ||||| ||||| ||  | |||||||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  | || ||||||||    | ||    
T  11204245 cccttctgaccacacctgaagcattttctatcatctctaccacaaacattgctcttgtggcctttctcaccacacttataacaaacaatctcagaaggag 11204146  T
Q  298 catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgccctt 397  Q
    ||||| || |||| || | |||| ||||   ||||||||| || |||||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||||||||| ||| |    
T  11204145 catctctcctcttgggtctcctatcatcattcatcttctactttcctttgtcagcaggagcactataaggcttaggacgattctgctgtcccttacccct 11204046  T
Q  398 cctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctacagctgttaaccaa 463  Q
    ||||||| ||| || |||||| ||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| |||||    
T  11204045 cctctcactcattatcttgtaatgagctttggtgtcttcttcataaattctacatctgtttaccaa 11203980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 29450750 - 29450344
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    || |||||||||||  ||||||||||||| || ||  |    
T  29450750 tagcaattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctctgataagtcggtcctcattaggagtctgcgtaccagtcaaagcaaacacctttcccccaat 29450651  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgt 200  Q
     |||  |||||| ||||  | |||||| |||||||| ||||||||  |||| |||||||| || ||||  |||| |||||| || | ||||||| ||||     
T  29450650 tctagtcttcttcggctcaggacactgtgaactgatgtgaccttccccattgcagttgtaacagacaatgtccccacgcttgcattcagctaaactgtga 29450551  T
Q  201 cctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatct---ctgcag 297  Q
    || |||| ||  ||||| || |||||| | |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||   | | ||    
T  29450550 cccttctgaccacacctgaaacacttcctatcatctcctccacaaacattactcttgtggcctttctcaccacacttgtagcaaacaatctcaacaggag 29450451  T
Q  298 catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgccctt 397  Q
    ||||| || ||||||||| |||| ||||  |||||||||  || |||||||||||||| |||||||| || ||||||||| |||| |||||||| ||| |    
T  29450450 catctctcctcttaggcctcctatcatcacccatcttctgctttcctttgtcagcaggagcactgtaaggtttaggacgattctgttgtcccttacccct 29450351  T
Q  398 cctctca 404  Q
    |||||||    
T  29450350 cctctca 29450344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 454
Target Start/End: Original strand, 16150695 - 16151151
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||||| |    || | |||||||||  | |||||||| || ||||| ||    
T  16150695 tagcaactaaaggagtactattaaagaaacaagtacatctgataagtcgatcctcactagtggtctacgtaccagtcaatgcaaacactttcccaccggt 16150794  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgt 200  Q
     ||||||||||| || | | | || ||||| || ||||| || ||||||| |||||| |||||||||||||| | |||||| |||| |||||  ||||||    
T  16150795 tctaaccttcttcggtttcttgcattgcgagctaatatgcccctcttcatcacagttatagcaaacaacatcaccacgcttgcaatcagctagtgtgtgt 16150894  T
Q  201 cctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatct---ctgcag 297  Q
    ||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||| ||||| |   | | ||    
T  16150895 cctttctgaccacacctgaagcacttcttctcatctttagtacaaacattactcttgtggcctttctcgccacacttatagcaaacaatatcaacaggag 16150994  T
Q  298 catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgccctt 397  Q
    ||||| || |||| |||| |||  ||||   || |||||  || |||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||| |    
T  16150995 catctctcctcttgggcctcctctcatcattcaacttctgctttcctttgtcagtaggagcactatacggcttcggacgactctgctgtcctttgcccct 16151094  T
Q  398 cctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctacagct 454  Q
     |  ||| |||  |||||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||||    
T  16151095 tcgatcactcatcaccttgtaatgagcttttgtgtcctcctcatagattctgcagct 16151151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 454
Target Start/End: Original strand, 16154841 - 16155297
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||||| |    || | |||||||||  | |||||||| || ||||| ||    
T  16154841 tagcaactaaaggagtactattaaagaaacaagtacatctgataagtcgatcctcactagtggtctacgtaccagtcaatgcaaacactttcccaccggt 16154940  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgt 200  Q
     ||||||||||| || | | | || ||||| || ||||| || ||||||| |||||| |||||||||||||| | |||||| |||| |||||  ||||||    
T  16154941 tctaaccttcttcggtttcttgcattgcgagctaatatgcccctcttcatcacagttatagcaaacaacatcaccacgcttgcaatcagctagtgtgtgt 16155040  T
Q  201 cctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatct---ctgcag 297  Q
    ||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||| ||||| |   | | ||    
T  16155041 cctttctgaccacacctgaagcacttcttctcatctttagtacaaacattactcttgtggcctttctcgccacacttatagcaaacaatatcaacaggag 16155140  T
Q  298 catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgccctt 397  Q
    ||||| || |||| |||| |||  ||||   || |||||  || |||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||| |    
T  16155141 catctctcctcttgggcctcctctcatcattcaacttctgctttcctttgtcagtaggagcactatacggcttcggacgactctgctgtcctttgcccct 16155240  T
Q  398 cctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctacagct 454  Q
     |  ||| |||  |||||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||||    
T  16155241 tcgatcactcatcaccttgtaatgagcttttgtgtcctcctcatagattctgcagct 16155297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 242 - 505
Target Start/End: Original strand, 13513650 - 13513916
Alignment:
Q  242 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctat 338  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||   |||| |||||||||||||||||| |||| |||||  |||      
T  13513650 acaaacattgctcttgtggcctttctcgccacagttgaaacagacaatctctgcaggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcaaccattctctgc 13513749  T
Q  339 ttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcct 438  Q
    || || || ||| |||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||||| || |||||||| |||||  ||||||||||||    
T  13513750 ttgcccttatcaacaggggcactataaggcttagggcgactctgctggcccttggtcttcctctcattaacaaccttgtaatgagctctggtatcctcct 13513849  T
Q  439 catagatcctacagctgttaaccaaatctggaaaaactctcagccgttgatacccaatcgccctctt 505  Q
    ||||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||  | | |||| || || |||||||||||    
T  13513850 catagattctgcagctattcaccaaatcaggaaaaactcggatctgttggtatccgatcgccctctt 13513916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 242 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 16248388 - 16248150
Alignment:
Q  242 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctc---tgcagcatctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctat 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||   ||||||   || |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  ||| |    
T  16248388 acaaacattactcttgtggcctttctcaccataattgaaacatgtaatctcagttggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgt 16248289  T
Q  339 ttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcct 438  Q
    |  || || |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||   ||||  ||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||    
T  16248288 tggcccttatcagcaggggcactatagggcttagggcgactctgctggcccttagtcttctgctcattcacaaccttgtaatgagccttagtatcctcct 16248189  T
Q  439 catagatcctacagctgttaaccaaatctggaaaaactc 477  Q
     ||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||    
T  16248188 tatagatcctgcagctattaaccaaatcagggaaaactc 16248150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 242 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 18604531 - 18604259
Alignment:
Q  242 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctat 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || || | |||||| | ||   |||| |||||||||||||||||| ||||||||||  |||      
T  18604531 acaaacattactcttgtggcctttctcgccacagttaaaacaaataatctccgaaggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgc 18604432  T
Q  339 ttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcct 438  Q
    || || || |||||||||||| | || |||||||| ||||||||||| |||||   |||||||||||| || |||||||| |||||  |||||||||| |    
T  18604431 ttgcccttatcagcaggggcattataaggcttagggcgactctgctggcccttagtcttcctctcattaacaaccttgtaatgagctatggtatcctctt 18604332  T
Q  439 catagatcctacagctgttaaccaaatctggaaaaactctcagccgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 511  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||  ||  |||| || || |||||||||||||||||    
T  18604331 catagatcctacagctgttcaccaaatcagggaaaactcggagttgttggtatccgatcgccctcttgatgtc 18604259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 130 - 448
Target Start/End: Original strand, 18259629 - 18259950
Alignment:
Q  130 aactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgtcctttctaacgtcacctaaagcacttctt 229  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||  |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||    
T  18259629 aactgatatgaccttcctcattgcagttatagcaaacaatgtccccacgcttacaatcagctagagtgtgtcctttctgaccacacctgaagcacttctt 18259728  T
Q  230 ctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatct---ctgcagcatctttcttcttaggccgcctaacatcg 326  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |     | ||||||| || |||| |||| |||  ||||     
T  18259729 ctcatctctatcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttaaagcaaacaatattagtaggagcatctgtcctcttgggcctcctctcatca 18259828  T
Q  327 accatcttctatttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcct 426  Q
       | | |||  || || ||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| | | |||| |||  |||||||| ||||  |    
T  18259829 tttaacctctgcttacccttgtcagcaggagcactatacggcttcggatgactctgctgtcccttgcccctacgctcactcatcaccttgtaatgagatt 18259928  T
Q  427 tggtatcctcctcatagatcct 448  Q
    | ||||| || |||||||||||    
T  18259929 ttgtatcttcttcatagatcct 18259950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 242 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 18224185 - 18223948
Alignment:
Q  242 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctat 338  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||   |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||  ||| |    
T  18224185 acaaacattacacttgtggcctttctcgccacagttgaaacaaacaatctccgcaggagcatccttcttcttaggccgtctatcatcgaccattctctgt 18224086  T
Q  339 ttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcct 438  Q
    || || || ||| |||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  18224085 ttgcccttatcaacaggggcactataaggcttagggcgactctgctggcccttggtcttccgctcattcacaaccttgtaatgagccttggtatcttcct 18223986  T
Q  439 catagatcctacagctgttaaccaaatctggaaaaact 476  Q
    | ||||| || ||||| || || ||||| || ||||||    
T  18223985 cgtagattctgcagctattcactaaatcagggaaaact 18223948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 296 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 16350397 - 16350216
Alignment:
Q  296 agcatctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgccc 395  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||| || || |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||   |    
T  16350397 agcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgtttgcccttatcagcaggggcactatagggcttagggcgactctgctggcccttagtc 16350298  T
Q  396 ttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctacagctgttaaccaaatctggaaaaactc 477  Q
    |||| |||||| || |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||    
T  16350297 ttccgctcatttacaaccttgtaatgagctttggtgtcctcctcatagattctacagttgttcaccaaatcaggaaaaactc 16350216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 242 - 442
Target Start/End: Original strand, 8336 - 8539
Alignment:
Q  242 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctat 338  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||  |||   ||||||||||  |||| |||||  |||| |||||  ||| |    
T  8336 acaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtatagcagacaatctcaacaggagcatctttctttatagggcgcctctcatcaaccattctctgt 8435  T
Q  339 ttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcct 438  Q
    || || || |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||| | || | ||||||||| | |||||| |||| ||||||||||||||    
T  8436 ttacccttatcagcaggagcactgtaaggcttaggacgactctgctgacctttggcttttcgctcattcacaatcttgtaatgagtcttggtatcctcct 8535  T
Q  439 cata 442  Q
    ||||    
T  8536 cata 8539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 51604005 - 51603709
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||  | || || ||||||||  ||||||| || || |||||       
T  51604005 tagcaattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctctgatgagacggtcctcattagcagtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaac 51603906  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgt 200  Q
     ||||||||||| ||||| || ||||| | |||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||| |  ||||| ||||  ||||   ||||     
T  51603905 tctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtggccctcttcattacaattatagcacacaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtga 51603806  T
Q  201 cctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcat-ctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag 297  Q
    || ||||  |  || || || ||||||||||||| || ||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||    
T  51603805 cccttctgtccacatctgaaacacttcttctcatccttggt-acaaacgttactcttgtgacctttctcgccacacttaaagcacactatctcagcag 51603709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 53750683 - 53750387
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||  | || || ||||||||  ||||||| || || |||||       
T  53750683 tagcaattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctctgatgagacggtcctcattagcagtctgtgtaccagtcaaagcaaaaacttttccaccaac 53750584  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgt 200  Q
     ||||||||||| ||||| || ||||| | |||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||| |  ||||| ||||  ||||   ||||     
T  53750583 tctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatgtggccctcttcattacaattatagcatacaacatcaccgcgcttgcaatcggctagcatgtga 53750484  T
Q  201 cctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcat-ctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag 297  Q
    || ||||  |  || || || ||||||||||||| || ||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||    
T  53750483 cccttctgtccacatctgaaacacttcttctcatccttggt-acaaacgttactcttgtgacctttctcgccacacttaaagcacactatctcagcag 53750387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 247 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 15743 - 15545
Alignment:
Q  247 cattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccc 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||  |||   ||||||||||  |||| |||||  |||| |||||  ||| ||| ||    
T  15743 cattactcttgtggcctttctcaccacaagtatagcagacaatctcaacaggagcatctttctttctagggcgcctctcatcaaccattctctgtttacc 15644  T
Q  344 tttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcata 442  Q
     || |||||||| |||||||| | |||||||||||||||||| || ||| | || | ||||||||| | |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  15643 cttatcagcaggagcactgtaagtcttaggacgactctgctgacctttgacttttcgctcattcacaatcttgtaatgagtcttggtatcctcctcata 15545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Original strand, 27903444 - 27903717
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    || |||||||||||  ||||||| || || || |  ||    
T  27903444 tagcaattaaaggagtactattaaagaaacatgtacctctgataagtcgatcctcattggtagtctgcgtaccagtcaaagcaaatacttttcctcaagt 27903543  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgt 200  Q
     || ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |  || || ||||||||||| || ||||||| ||| | |||||| || | ||| ||    ||     
T  27903544 tctgaccttcttaggttgcgtgcactgtgaactaatgttgccctcctcattacagttataacaaacaatatctccacgcttgcattcagccaacacatga 27903643  T
Q  201 cctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccaca 274  Q
    ||||||| ||  || || || |||||||||||||||  |   || ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27903644 cctttctgaccacatctgaaacacttcttctcatctttggtgcagacattactcttgtggcctttcgcaccaca 27903717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 348 - 436
Target Start/End: Original strand, 14697510 - 14697598
Alignment:
Q  348 tcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctc 436  Q
    |||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  14697510 tcagcaggagcactgtaaggctttggacgactttgctgacccttgcctttcctctcattcacaactttgtaatgagctttggtatcctc 14697598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 348 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 15144551 - 15144451
Alignment:
Q  348 tcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcc 447  Q
    ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||| |||||   ||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||    
T  15144551 tcagcaggggcgctataaggcttagggcgactctgctggcccttagtcttccgctcattcacgaccttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcc 15144452  T
Q  448 t 448  Q
    |    
T  15144451 t 15144451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 242 - 448
Target Start/End: Original strand, 14162770 - 14162979
Alignment:
Q  242 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctat 338  Q
    |||| ||| |||||||||||||||| ||||||||    |||| ||||||||  |||   |||||||| |  |||| |||||| | ||||||||  ||| |    
T  14162770 acaagcatcactcttgtggcctttcacaccacaagcatagcagacaatctcaacaggagcatctttccttctagggcgcctatcctcgaccattctctgt 14162869  T
Q  339 ttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcct 438  Q
    || || || |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  | |||   || ||||| ||||||||||||||||| |||||||  |    
T  14162870 ttacccttatcagcaggagcactgtaaggcttaggacgactctgttgtcccttaactttctgttcgttcacaaccttgtagtgagccttagtatcctttt 14162969  T
Q  439 catagatcct 448  Q
    |||| |||||    
T  14162970 cataaatcct 14162979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 4 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 15354286 - 15354234
Alignment:
Q  4 caattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctca 56  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15354286 caattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctctgataagtcggtcctca 15354234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 106 - 297
Target Start/End: Original strand, 8708841 - 8709032
Alignment:
Q  106 ccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgtccttt 205  Q
    |||||||||||| | | ||||||||||| | ||| |||||||| | ||| ||| ||||||||| ||| | |||||| || |  ||||  || || |||||    
T  8708841 ccttcttaggcttcttgcactgcgaactaagatggccttcttcgtcacaattgaagcaaacaatatcaccacgcttgcattccgctatcgtatgcccttt 8708940  T
Q  206 ctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag 297  Q
    ||  |  || |  ||||||||||| ||||| |  |  |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||    
T  8708941 cttcccacatcggaagcacttcttttcatcaccattgcaaacattactcttgtggcccttctcaccacacttgtagcaaacaatctcagcag 8709032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 348 - 455
Target Start/End: Original strand, 16219597 - 16219704
Alignment:
Q  348 tcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcc 447  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||||||| |||| || ||||  |||||||||||||| | ||| || ||| |||| ||||| ||| ||||||| |    
T  16219597 tcagcaggagcactgtaaggctttggacgactcggctgacctttgcttttcctctcattcacaatcttataatgatccttcgtatcttccacatagattc 16219696  T
Q  448 tacagctg 455  Q
    | ||||||    
T  16219697 tgcagctg 16219704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 348 - 455
Target Start/End: Original strand, 16222917 - 16223024
Alignment:
Q  348 tcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcc 447  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||||||| |||| || ||||  |||||||||||||| | ||| || ||| |||| ||||| ||| ||||||| |    
T  16222917 tcagcaggagcactgtaaggctttggacgactcggctgacctttgcttttcctctcattcacaatcttataatgatccttcgtatcttccacatagattc 16223016  T
Q  448 tacagctg 455  Q
    | ||||||    
T  16223017 tgcagctg 16223024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 341 - 451
Target Start/End: Original strand, 13879511 - 13879621
Alignment:
Q  341 ccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctca 440  Q
    |||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||  ||||| ||||||  | ||| |||| ||   ||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  13879511 ccctttgtcatcaggagcactgtagggcttcggacgaccttgctgacccttgttcctccgctcactcctaaccttataatgagccttcgtatcctcctca 13879610  T
Q  441 tagatcctaca 451  Q
    || || |||||    
T  13879611 taaattctaca 13879621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 106 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 15144740 - 15144678
Alignment:
Q  106 ccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaa 168  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||  || ||||| ||||||||||||||| |||| ||||    
T  15144740 ccttcttaggcagcttacactgcgaaccaatgtgaccctcttcattacagttgaagcacacaa 15144678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 107 - 168
Target Start/End: Original strand, 13879274 - 13879335
Alignment:
Q  107 cttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaa 168  Q
    ||||||||||| | ||||||| ||||||| |||||||||||| | ||| ||| |||||||||    
T  13879274 cttcttaggcttcttacactgtgaactgagatgaccttcttcgtcacaattgaagcaaacaa 13879335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 2)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 267
Target Start/End: Original strand, 12815 - 13081
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  12815 tagcaattaaaggagtactattaaagaaacaagtacccctgataagttggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttaacgcaaacaccttgccacctgt 12914  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  12915 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccccacgcttacaatcagctaaagtgtgt 13014  T
Q  201 cctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttct 267  Q
    ||||||| ||  |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13015 cctttctgaccacacctaaagcacttcttctcgtcacggtcacatacattactcttgtggcctttct 13081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 324 - 448
Target Start/End: Original strand, 19812 - 19936
Alignment:
Q  324 tcgaccatcttctatttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgag 423  Q
    ||||||||| ||| ||| || || |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||  | |||| ||||||||| | |||||| ||||    
T  19812 tcgaccatcctctgttttcccttatcagcaggggcactataaggcttagggcgactctgctgacccttagctttccgctcattcacaatcttgtaatgag 19911  T
Q  424 ccttggtatcctcctcatagatcct 448  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  19912 tcttggtatcctcctcatagatcct 19936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 1)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 455
Target Start/End: Original strand, 50193 - 50650
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  50193 tagcaattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctctaataagtcggtcctcattcactgtttgcgtaccagtcaaagcaaacaccttgccacctgt 50292  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgt 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||    
T  50293 cctaaccttcttaggctgggtacactacgaactgatatgaccttcctcattgcagttgtagcaaacaatatccccacgcttacaatcagctaaggtgtgt 50392  T
Q  201 cctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctc---tgcag 297  Q
    ||||||| ||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| || ||||| ||    | ||    
T  50393 cctttctgaccacacctgaaacacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggtctttttcaccacacttgaaacaaacaatatcagtaggag 50492  T
Q  298 catctttcttcttaggccgcctaacatc-gaccatcttctatttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgccct 396  Q
    ||||| || |||| |||| |||  ||||   ||||| | |  || || ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||      
T  50493 catctctcctcttgggcctcctctcatcattccatc-tatgcttacccttgtcagcaggggcactatacggcttcggaccactctgctgtcccttgcctc 50591  T
Q  397 tcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctacagctg 455  Q
    | | |||| |||  |||||||| ||||| || ||||| || ||||||||||||||||||    
T  50592 tacgctcactcatcaccttgtaatgagctttcgtatcttcttcatagatcctacagctg 50650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 208; Significance: 1e-113; HSPs: 1)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 455
Target Start/End: Original strand, 70196 - 70653
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  70196 tagcaattaaaggaatactattaaagaaacaagtacctctgataagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagtcaaagcaaacaccttgccacctgt 70295  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||| || ||||||    
T  70296 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactaatatgtccttcctcattacagttgtagcaaacaatatccccacgcttgcaatcagccaatgtgtgt 70395  T
Q  201 cctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctc---tgcag 297  Q
    |||||||  |  || || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||||||    | ||    
T  70396 cctttctgtccacatctgaaacacttcttctcatctcggtcacacacattactcttgtggcctttctcaccacacttaaagcaaataatctcagtaggag 70495  T
Q  298 catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgccctt 397  Q
    ||||| || ||||||||| |||  ||||   || | ||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| ||  |    
T  70496 catctctcctcttaggcctcctctcatcattcagcctctgtttacctttgtcagcaggagcactatacggtttcggacgactctgttgtcccttacctct 70595  T
Q  398 cctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctacagctg 455  Q
     | |||| |||  || || || ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  70596 gcgctcactcatcactttataatgagctttggtatcctcttcatagattctacagctg 70653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 208; Significance: 1e-113; HSPs: 46)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 252 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 29589546 - 29589287
Alignment:
Q  252 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcag 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29589546 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttgtcag 29589447  T
Q  352 caggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctaca 451  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  29589446 tgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctgca 29589347  T
Q  452 gctgttaaccaaatctggaaaaactctcagccgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 511  Q
    ||| |||||||| ||  |||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||    
T  29589346 gctattaaccaagtcctgaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccctcttgatgtc 29589287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 252 - 511
Target Start/End: Original strand, 16575064 - 16575323
Alignment:
Q  252 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcag 351  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16575064 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttgtcag 16575163  T
Q  352 caggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctaca 451  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||    
T  16575164 cgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcgtagatcctgca 16575263  T
Q  452 gctgttaaccaaatctggaaaaactctcagccgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 511  Q
    ||| |||||||||||  |||||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||    
T  16575264 gctattaaccaaatcctgaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 16575323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 252 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 16620316 - 16620057
Alignment:
Q  252 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcag 351  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16620316 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttgtcag 16620217  T
Q  352 caggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctaca 451  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||    
T  16620216 cgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcgtagatcctgca 16620117  T
Q  452 gctgttaaccaaatctggaaaaactctcagccgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 511  Q
    ||| |||||||||||  |||||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||    
T  16620116 gctattaaccaaatcctgaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 16620057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 252 - 511
Target Start/End: Original strand, 28312804 - 28313063
Alignment:
Q  252 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcag 351  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  28312804 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttacctttgtcag 28312903  T
Q  352 caggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctaca 451  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||    
T  28312904 cgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttacccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgca 28313003  T
Q  452 gctgttaaccaaatctggaaaaactctcagccgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 511  Q
    ||| |||||||| ||  |||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||    
T  28313004 gctattaaccaagtcctgaaaaactctcagctgttggtacccaagcgccctcttgatgtc 28313063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 252 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 28260304 - 28260045
Alignment:
Q  252 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcag 351  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28260304 ctcttgtggcctttcccaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttgtcag 28260205  T
Q  352 caggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctaca 451  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||    
T  28260204 cgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgccccttacccttcctttcgttcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgca 28260105  T
Q  452 gctgttaaccaaatctggaaaaactctcagccgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 511  Q
    ||| |||||||| ||  |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  28260104 gctattaaccaagtcctgaaaaactctcagctgttgatacccaagcgccctcttgatgtc 28260045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 252 - 511
Target Start/End: Original strand, 28285612 - 28285871
Alignment:
Q  252 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcag 351  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28285612 ctcttgtggcctttcccaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttgtcag 28285711  T
Q  352 caggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctaca 451  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||    
T  28285712 cgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgccccttacccttcctttcgttcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgca 28285811  T
Q  452 gctgttaaccaaatctggaaaaactctcagccgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 511  Q
    ||| |||||||| ||  |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  28285812 gctattaaccaagtcctgaaaaactctcagctgttgatacccaagcgccctcttgatgtc 28285871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 252 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 28339053 - 28338794
Alignment:
Q  252 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcag 351  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28339053 ctcttgtggcctttcccaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttgtcag 28338954  T
Q  352 caggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctaca 451  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||    
T  28338953 cgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgccccttacccttcctttcgttcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgca 28338854  T
Q  452 gctgttaaccaaatctggaaaaactctcagccgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 511  Q
    ||| |||||||| ||  |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  28338853 gctattaaccaagtcctgaaaaactctcagctgttgatacccaagcgccctcttgatgtc 28338794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 252 - 511
Target Start/End: Original strand, 27205796 - 27206055
Alignment:
Q  252 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcag 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || |    
T  27205796 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttccctttatcgg 27205895  T
Q  352 caggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctaca 451  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||    
T  27205896 cgggagcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgca 27205995  T
Q  452 gctgttaaccaaatctggaaaaactctcagccgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 511  Q
    ||| |||||||| ||| |||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||    
T  27205996 gctattaaccaagtcttgaaaaactctcagctgttggtacccaagcgccctcttgatgtc 27206055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 252 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 27243432 - 27243173
Alignment:
Q  252 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcag 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || |    
T  27243432 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttttgtttccctttatcgg 27243333  T
Q  352 caggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctaca 451  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||    
T  27243332 cgggagcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgca 27243233  T
Q  452 gctgttaaccaaatctggaaaaactctcagccgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 511  Q
    ||| |||||||| ||| |||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||    
T  27243232 gctattaaccaagtcttgaaaaactctcagctgttggtacccaagcgccctcttgatgtc 27243173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 255 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 2871906 - 2871650
Alignment:
Q  255 ttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcagcag 354  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  2871906 ttgtggcctttcccaccacaattgaaacacacaatctctgtagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcag 2871807  T
Q  355 gggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctacagct 454  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  2871806 gggcactgtacagcttaggacgactctgttgtcccttgcccttcctctcattcactatcttgtagtgagccttggtatcctcttcatagatcctgcagct 2871707  T
Q  455 gttaaccaaatctggaaaaactctcagccgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 511  Q
     || ||||||||  |||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||    
T  2871706 attgaccaaatcctgaaaaactctaagctgttggtatccaatcgccctcttgatgtc 2871650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 252 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 24292889 - 24292630
Alignment:
Q  252 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcag 351  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  24292889 ctcttgtggcctttctcgccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacctcgaccatcttctgtttccctttatcag 24292790  T
Q  352 caggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctaca 451  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| || ||    
T  24292789 cgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcgtagattctgca 24292690  T
Q  452 gctgttaaccaaatctggaaaaactctcagccgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 511  Q
    ||| |||||||||||  |||||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||    
T  24292689 gctattaaccaaatcctgaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 24292630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 246 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 22829499 - 22829234
Alignment:
Q  246 acattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctt 345  Q
    ||||| || |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  22829499 acattgcttttgtggccttttccaccacaattgaaacacacaatctcagtagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctatttccctt 22829400  T
Q  346 tgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagat 445  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22829399 tatcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttgcccttcctctcgttcacaatcttatagtgagccttggtatcctcttcatagat 22829300  T
Q  446 cctacagctgttaaccaaatctggaaaaactctcagccgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 511  Q
    ||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||    
T  22829299 cctgcagctattgaccaaatctggaaaaactctaagctgttggtatccaatcgccctcttgatgtc 22829234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 246 - 479
Target Start/End: Original strand, 25115720 - 25115954
Alignment:
Q  246 acattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctt 345  Q
    ||||| || |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| | |||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||  ||| ||||||||    
T  25115720 acattgcttttgtggcctttcccaccacaattgaaacacacaatctcagtagcatccttcttcttaggctgcctatcatcgaccattctctgtttccctt 25115819  T
Q  346 tgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagat 445  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25115820 tatcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcgttcactatcttgtagtgagccttggtatcctcttcatagat 25115919  T
Q  446 cctacagctgttaaccaaat-ctggaaaaactctc 479  Q
    ||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||    
T  25115920 cctgcagctattaaccaaatccgggaaaaactctc 25115954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 14377274 - 14376809
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |    || |||||||||||  | |||||||| || ||||| ||    
T  14377274 tagcaattaaaggattactattaaagaaacaagtacctctgataagtcggtcctcactagtagtctgcgtaccagtcaatgcaaacacttttccaccggt 14377175  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgt 200  Q
     ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| || || |||||||| ||||| || ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  14377174 tctaaccttcttcggctgtgtacattgcgaactgatgtggccctcttcattgcagttataacaaacaacatcaccacgcttacaattagctaaagtgtgt 14377075  T
Q  201 cctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatct---ctgcag 297  Q
    ||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||| ||||  |   | | ||    
T  14377074 cctttctgaccacacctgaagcacttcttctcatctttagtacaaacattactcttgtggcctttctcaccgcacttgtagcaaacaacatcaacaggag 14376975  T
Q  298 catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgccctt 397  Q
    ||||| || | || || | |||  ||||   || | ||| ||| || ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| | |    
T  14376974 catctctcctattgggtctcctctcatcattcaacctctgttttcccttgtcagcaggagcactatacggcttcggacgactctgctgtcccttgctcct 14376875  T
Q  398 cctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctacagctgttaaccaa 463  Q
     |  ||| |||  |||||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |||||  |||||||    
T  14376874 tcgatcactcatcaccttgtaatgagctttcgtgtcctcctcatagatcctgcagctactaaccaa 14376809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 463
Target Start/End: Original strand, 24367323 - 24367788
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    || |||||||||||  ||||||||||||| ||||| ||    
T  24367323 tagcaattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctctgataagtcggtcctcattaggagtctgcgtaccagtcaaagcaaacaccttcccaccagt 24367422  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgt 200  Q
     |||   ||||| || |  |  ||||| ||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||  ||||  ||||| || | ||||||| ||||     
T  24367423 tctagttttcttcggttcagggcactgtgaactaatatgaccttctccattgcaattgtaacagacaatgtccccccgcttgcattcagctaaactgtga 24367522  T
Q  201 cctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgc---ag 297  Q
    || |||| ||  ||||| ||||||||| | |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||  |   ||    
T  24367523 cccttctgaccacacctgaagcacttcctatcatctcttccacaaacattactcttgtggcctttctcaccacacttgtagcaaacaatctcaacatgag 24367622  T
Q  298 catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgccctt 397  Q
    ||||| || |||| |||| |||| ||||  |||||||||  || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| |    
T  24367623 catctctcctcttgggcctcctatcatcacccatcttctgctttcctttgtcagcaggagcactgtaaggcttaggacgattctgctgtcccttacccct 24367722  T
Q  398 cctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctacagctgttaaccaa 463  Q
    ||||||| ||| || |||||| ||||| ||||| || || | |||||| ||||| |||||||||||    
T  24367723 cctctcactcattatcttgtaatgagctttggtgtcttcttgatagattctacacctgttaaccaa 24367788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 242 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 5836345 - 5836076
Alignment:
Q  242 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttc 341  Q
    ||||||||| || | |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||| ||||||||||| ||| ||||    
T  5836345 acaaacattgctttcgtggcctttcccaccacagttgaaacacacaatctcagcagcatccttcttcttgggtcgcctatcatcgaccatcctctgtttc 5836246  T
Q  342 cctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcat 441  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||   |||||||||||| ||||||||||| || |    
T  5836245 cctttatcagcaggggcactatacggcttaggacgactctgttgtcccttgcccttccgctcattcacagtcttgtagtgagctttggtatcctcttcgt 5836146  T
Q  442 agatcctacagctgttaaccaaatctggaaaaactctcagccgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 511  Q
    | ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| | |  ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  5836145 aaatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctaatctattggtacccaatcgccctcttaatgtc 5836076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 10466206 - 10465696
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    || ||||||||  |  |  ||||||| || || || ||    
T  10466206 tagcaattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctctgataagtcggtcctcattggtagtctgcgtaccgatcaatacaaacactttccctccggt 10466107  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgt 200  Q
    ||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||  |||| ||||||||| | |||||  ||||||    
T  10466106 cctgaccttcttcggctgagtacactgtgaactaatatgaccttcttcattgcagttatagcagacaatgtccccacgcttacattcagctagggtgtgt 10466007  T
Q  201 cctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag--- 297  Q
    || |||| ||  |||||||| || ||| |||||||||   ||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||| | || |||||||| ||||       
T  10466006 cccttctgaccacacctaaaacatttcctctcatctctaccacaagcattgctcttgtggcctttttcaccacacttgtaacagacaatctcagcaggaa 10465907  T
Q  298 catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgccctt 397  Q
    ||||| || |||| |||| |||| ||||   ||| ||||  || || ||||||||| | ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  10465906 catctctcctcttgggcctcctatcatcattcattttctgctttcccttgtcagcaagagcattgtaaggcttaggacgactctgctgtcccttacccct 10465807  T
Q  398 cctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctacagctgttaaccaaatctggaaaaactctcagccgttgatacccaatc 497  Q
    ||||||| |||  |||||||| ||||| || || || |||||||| ||||| |||||| | ||||| || |  |||||||| | |   |||||||| ||     
T  10465806 cctctcactcatcaccttgtaatgagcttttgtgtcttcctcatatatcctgcagctgctcaccaactcagagaaaactctaatcttctgataccctata 10465707  T
Q  498 gccctcttgat 508  Q
    |||||||||||    
T  10465706 gccctcttgat 10465696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 455
Target Start/End: Original strand, 19437925 - 19438382
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| | |    ||||||||||||||   |||||||||||| ||||  ||    
T  19437925 tagcaattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctctgataagtcgatccttactagtggtttgcgtaccagtcagagcaaacaccttaccactagt 19438024  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgt 200  Q
    |||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |  ||||| || ||||| || || |||||||| | |||||| |||| ||||| |||||||    
T  19438025 cctaaccttcttcggctgtgtgcactgcgaactgatatggcgctcttcgttgcagttataacatacaacatcaccacgcttgcaatcagctagagtgtgt 19438124  T
Q  201 cctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgc---ag 297  Q
    ||||||| ||  ||||| || ||||| |||||||||     |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||| | |  || ||||| ||   ||    
T  19438125 cctttctgaccacacctgaaacacttattctcatctttagtacaaacattactcaagtggcctttctcaccacacttgtaacgaacgatctcagcaggag 19438224  T
Q  298 catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgccctt 397  Q
    ||||| || |||| |||| |||  ||||    | | |||  || || ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||  |    
T  19438225 catctctcctcttgggcctcctctcatcatttaacctctgcttacccttgtcagcaggagcactatatggcttcggacgactctgctgtcccttacctct 19438324  T
Q  398 cctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctacagctg 455  Q
    ||| ||| ||||||||||||| | |||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  19438325 cctttcactcactaccttgtaataagccttcgtatcctcttcatagatcctacagctg 19438382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 455
Target Start/End: Original strand, 19455946 - 19456403
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    |||||| |    ||||||||||||||   ||||||||| || ||||| ||    
T  19455946 tagcaattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctctgataagaaaatcctcaatagtggtttgcgtaccagtcagagcaaacactttaccaccggt 19456045  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgt 200  Q
    |||||||||||| || || ||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||  || | ||||||||||| | |||  ||||||    
T  19456046 cctaaccttctttggttgagtacactacgaactaatatgaccttcctcgttgcagttatagcaaacaatgtctccacgcttacaatcatctagtgtgtgt 19456145  T
Q  201 cctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctc---tgcag 297  Q
    ||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||    | ||    
T  19456146 cctttctgacaccacctgaagcacttcttctcatctctatcacagacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaagcaaacaatctcagtaggag 19456245  T
Q  298 catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgccctt 397  Q
     |||| || |||| |||| |||  ||||   || | | | ||| |||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||  |    
T  19456246 tatctctcctcttgggcctcctctcatcattcagcctttgttttcctttgtcagcaggagcactatatggtttaggacgactctgttgtcccttacctct 19456345  T
Q  398 cctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctacagctg 455  Q
     |  ||| |||| | |||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  19456346 gcgttcactcaccagcttgtaatgagccttagtatcctcttcatatatcctgcagctg 19456403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 455
Target Start/End: Original strand, 19466091 - 19466548
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    |||||| |    ||||||||||||||   ||||||||| || ||||| ||    
T  19466091 tagcaattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctctgataagaaaatcctcaatagtggtttgcgtaccagtcagagcaaacactttaccaccggt 19466190  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgt 200  Q
    |||||||||||| || || ||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||  || | ||||||||||| | |||  ||||||    
T  19466191 cctaaccttctttggttgagtacactacgaactaatatgaccttcctcgttgcagttatagcaaacaatgtctccacgcttacaatcatctagtgtgtgt 19466290  T
Q  201 cctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctc---tgcag 297  Q
    ||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||    | ||    
T  19466291 cctttctgacaccacctgaagcacttcttctcatctctatcacagacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaagcaaacaatctcagtaggag 19466390  T
Q  298 catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgccctt 397  Q
     |||| || |||| |||| |||  ||||   || | | | ||| |||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||  |    
T  19466391 tatctctcctcttgggcctcctctcatcattcagcctttgttttcctttgtcagcaggagcactatatggtttaggacgactctgttgtcccttacctct 19466490  T
Q  398 cctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctacagctg 455  Q
     |  ||| |||| | |||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  19466491 gcgttcactcaccagcttgtaatgagccttagtatcctcttcatatatcctgcagctg 19466548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 292
Target Start/End: Original strand, 21474523 - 21474814
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  21474523 tagcaattaaaggagtactattaaagaaacaaatacctctgataagtcggtcctcattagaagtttgcgtaccagtcaaagcaaacaccttgccacctgt 21474622  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgt 200  Q
    |  | |||||||||| | | | ||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||| |||| ||| | |||||| || | ||| || ||||||    
T  21474623 cagagccttcttaggtttcctgcactgagaactaatatgaccctcttcatcacaattgtagcacacaatatcaccacgcttgcactcagccaatgtgtgt 21474722  T
Q  201 cctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctc 292  Q
    |||||||  |  || |  || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||    
T  21474723 cctttcttcccacatcggaaacacttcttctcatcacggtcacatacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatctc 21474814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 391
Target Start/End: Original strand, 25770767 - 25771160
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||| || |||||| ||| |||  ||| ||||||||||||||||||    
T  25770767 tagcaattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctctgataagtcggtccttattaacagtttgcttactagtcaaaggaaacaccttgccacctgt 25770866  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgt 200  Q
    |  | |||||||||| | | | ||||| || || |||||||||||||||| ||| |||||||| |||| ||| | |||||| |||| || ||| ||||||    
T  25770867 cagagccttcttaggtttcctgcactgagagctaatatgaccttcttcatcacaattgtagcacacaatatcaccacgcttgcaatcagataatgtgtgt 25770966  T
Q  201 cctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctc---tgcag 297  Q
    ||||||   |  || | ||| |||||||||||||| |||||||| | |||| ||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||    | ||    
T  25770967 cctttcgtcccacatcgaaaacacttcttctcatcacggtcacataaattattcttgtggcctttttcaccacacttgaaacagacaatctcagtaggag 25771066  T
Q  298 catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtccctt 391  Q
    ||||| || ||||||||| |||  ||||   || | ||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||| |  ||||||||||| ||||||||    
T  25771067 catctctcctcttaggcctcctctcatcattcagcctctgtttacctttgtcagcaggagcactatacggttacggacgactctgttgtccctt 25771160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 24515772 - 24515376
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| |    ||||||||||||||   || |||||| || ||||| ||    
T  24515772 tagcaattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctctgataagtcgatcctcactagtggtttgcgtaccagtcagagaaaacacgttaccaccggt 24515673  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgt 200  Q
    ||||||| || | || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| |  | ||| |||| |||||  ||||||    
T  24515672 cctaaccgtcctcggttgcgtacactgcgaactgatgtgaccttcctcattgcagttataacaaacaacatctcccctcttccaatcagctagtgtgtgt 24515573  T
Q  201 cctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatct---ctgcag 297  Q
    | ||||| ||  ||||| || |||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | || ||||| |   | | ||    
T  24515572 cttttctgaccacacctgaaacacttcttctcatctttagtacaaacattactcttgtggcctttctcaccacacttataacaaacaatatcaacaggag 24515473  T
Q  298 catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcc 394  Q
    ||||| || |||| |||| |||  ||||   || | ||| ||| || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| |||||||||||    
T  24515472 catctctcctcttgggcctcctctcatcattcagcctctgttttcccttgtcagcaggagcactatatggtttaggacgactctgttgtcccttgcc 24515376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 242 - 477
Target Start/End: Original strand, 21764976 - 21765214
Alignment:
Q  242 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctat 338  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||   |||| |||||||||||||||||| ||||||||||  ||||     
T  21764976 acaaacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacagacaatctccgcaggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctaa 21765075  T
Q  339 ttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcct 438  Q
    || || || |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||     |||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  21765076 ttgcccttatcagcaggggcactatagggcttagggcgactctgctggccctcagtgttccactcattcacaaccttgtaatgagctttggtgtcctcct 21765175  T
Q  439 catagatcctacagctgttaaccaaatctggaaaaactc 477  Q
    |||||||  |||||||||| |||||||| | ||||||||    
T  21765176 catagattttacagctgttcaccaaatcagcaaaaactc 21765214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Original strand, 18797613 - 18797886
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| |    || |||||||||||  | |||||||| || ||||| ||    
T  18797613 tagcaattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctctgataagtcgatcctcactagtagtctgcgtaccagtcaatgcaaacactttcccaccggt 18797712  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgt 200  Q
     ||||||||||| || || || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || | |||||| |||| ||||| |||||||    
T  18797713 tctaaccttctttggttgagtgcactgtgaactgatatggccttcatcattgcagttatagcaaacaacgtcaccacgcttgcaatcagctagagtgtgt 18797812  T
Q  201 cctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccaca 274  Q
    || |||| ||  ||||| || || |||| |||||||      |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18797813 cccttctgaccacacctgaaacatttctgctcatctttagtgcaaacattactcttgtggcctttctcgccaca 18797886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 242 - 457
Target Start/End: Original strand, 22437033 - 22437251
Alignment:
Q  242 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctat 338  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||   |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  22437033 acaagcattgctcttgtggcctttctcaccacaattaaagcagacaatctcagcaggaacatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccatcctctat 22437132  T
Q  339 ttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcct 438  Q
    ||  | || ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||| |||||   ||| | ||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| |    
T  22437133 ttggccttatcagcaggggcgctataaggcttagggcgactctgctggcccttagtctttcgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctctt 22437232  T
Q  439 catagatcctacagctgtt 457  Q
    |||| ||||| || |||||    
T  22437233 cataaatcctgcaactgtt 22437251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 19486649 - 19486361
Alignment:
Q  4 caattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgtcct 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||||||||  | ||||||| ||| ||||||| |      
T  19486649 caattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctctgataagtcggtcctcattaaatgtttgcgtaccagtcaatgcaaacaactttccacctgcctg 19486550  T
Q  104 aaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgtcct 203  Q
    | |||||||||||| | | ||||||||||| | |||||||||||| | ||| ||| ||||||||| ||| | | |||| || |  ||||  || || |||    
T  19486549 agccttcttaggcttcctgcactgcgaactaagatgaccttcttcgtcacaattgaagcaaacaatatcaccatgcttgcattccgctatcgtatgccct 19486450  T
Q  204 ttctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctc 292  Q
    ||||  |  || |  ||||||||||||||||| |  |  |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||    
T  19486449 ttcttcccacatcggaagcacttcttctcatcaccattgcaaacattactcttgtggcccttctcaccacacttgtagcaaacaatctc 19486361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 21567349 - 21566892
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    |||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||||||| ||||   ||||| |||    || |||||||||||  |||||||||| || ||||| ||    
T  21567349 tagcaattgaataagtactattaaagaaacaagtacctctgataagcatgtccttattagtagtctgcgtaccagtcaaagcaaacacttttccaccggt 21567250  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgt 200  Q
     |||| |||||| ||||| || ||||| |||||||| || || || | || ||| || || ||||||||||| |  | ||| || ||||| || ||||||    
T  21567249 tctaatcttctttggctgagtgcactgggaactgatgtggccctccttatcacaattataacaaacaacatcacccctcttgcagttagccaatgtgtgt 21567150  T
Q  201 cctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag--- 297  Q
    ||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||     |||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| || || || ||||       
T  21567149 cctttctgaccacacctgaagcacttcttctcatctttagtacaaacattacttttgtggcctttctcgccacacttaaagcaaactatttcagcaggag 21567050  T
Q  298 catctttcttcttaggccgcctaacatcgacca-tcttctatttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgccct 396  Q
    ||||| || |||| ||||  ||  ||||   || || |   |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |     
T  21567049 catctctcctcttgggccttctctcatcattcagtcgttgctttccctt-gtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttactcc 21566951  T
Q  397 tcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctacagctg 455  Q
    ||| |||| |||  |||||||| ||||| || | ||| ||||||||||| |||||||||    
T  21566950 tccgctcactcatcaccttgtaatgagcttttgaatcttcctcatagattctacagctg 21566892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 34642944 - 34642648
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    |||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| ||||||  || |||||| | |||||||||||||   | |||||||| || ||||| ||    
T  34642944 tagcgattaaagggatactattaaagaaacaagtacctctgataagtctatcttcattcgcggtttgcgtaccagccaaggcaaacactttcccaccggt 34642845  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgt 200  Q
    |||||||||||| || || || ||||| |||||||||||||| ||  |||| ||||||||||| |||| ||| | ||| ||||||| ||||||   |||     
T  34642844 cctaaccttcttcggttgagtgcactgagaactgatatgaccctccccattgcagttgtagcatacaatatcaccacgtttacaatcagctaacacgtga 34642745  T
Q  201 cctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag 297  Q
    || ||||  |  ||||| ||||||||||||||||||  |  |||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||    
T  34642744 cccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatctttggtacaaacattacttttgtggcccttctcgccacacttaaagcaaactatctccgcag 34642648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 242 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 27559086 - 27558848
Alignment:
Q  242 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctat 338  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||| ||||   |||  || ||||||||||| ||  | ||||||||| ||| |    
T  27559086 acaaacagtactcttgtggcctttctcaccacaattgaaacaagtaatctcagcaggaacatgctttttcttaggccgtctttcctcgaccatcctctgt 27558987  T
Q  339 ttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcct 438  Q
    || || || |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||   ||||| |||||| || |||||||| |||||  |||| |||||||    
T  27558986 ttgcccttatcagcaggggcactatagggcttagggcgactctgctggcccttagtcttccgctcattaacaaccttgtaatgagctctggtgtcctcct 27558887  T
Q  439 catagatcctacagctgttaaccaaatctggaaaaactc 477  Q
    |||| || || ||||| ||  ||||||||||||||||||    
T  27558886 cataaattctgcagctattctccaaatctggaaaaactc 27558848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 244 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 25756730 - 25756495
Alignment:
Q  244 aaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctattt 340  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||   |||| |||||||||||||||||| ||||||||||  ||| |||    
T  25756730 aaacattgcacttgtggcctttctcaccacaattaaaacagacaatctccgcaggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgttt 25756631  T
Q  341 ccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctca 440  Q
     || || ||| |  ||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||   |||||  ||||| || |||||||| |||||   ||| |||||||||    
T  25756630 gcccttatcaactagggcactatagggcttagggcgactctgctggcccttagtcttccggtcattaaccaccttgtaatgagctcgggtgtcctcctca 25756531  T
Q  441 tagatcctacagctgttaaccaaatctggaaaaact 476  Q
    |||||||| ||||| || || |||||  ||||||||    
T  25756530 tagatcctgcagctattcactaaatcctgaaaaact 25756495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 15462259 - 15462391
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||    || |||||||||||  | ||||| || || || || ||    
T  15462259 tagcaattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctctgataagtcgatcctcattggtagtctgcgtaccagtcaaggcaaatacttttcctccagt 15462358  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaact 133  Q
     || ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  15462359 tctgaccttcttaggttgcgtgcactgcgaact 15462391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 298 - 448
Target Start/End: Original strand, 19867879 - 19868029
Alignment:
Q  298 catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgccctt 397  Q
    ||||||||||| | ||||| ||| | ||||||||  ||| ||| || || ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||| |||||   ||     
T  19867879 catctttcttcctcggccgtctatcttcgaccattctctgtttgcccttatcagcaggggctctataaggcttagggcgactctgctggcccttagtctg 19867978  T
Q  398 cctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcct 448  Q
    || ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  19867979 ccactcattcacgaccttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcct 19868029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 242 - 442
Target Start/End: Original strand, 23081587 - 23081790
Alignment:
Q  242 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catctttcttcttaggccgcctaacatcgacca-tcttcta 337  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  | || ||||||||  |||   ||||||||||| ||||||||||  ||||    | ||||       
T  23081587 acaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtataacaaacaatctcaacaggagcatctttcttcctaggccgcctctcatcattaactctttgc 23081686  T
Q  338 tttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcc 437  Q
    ||||| ||| |||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||| || ||| | |||| ||||||||| | |||||| |||||||| |||||||||    
T  23081687 tttcc-tttatcagcagcagcactgtaaggctttggacgactctgctgacctttgactttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttagtatcctcc 23081785  T
Q  438 tcata 442  Q
    |||||    
T  23081786 tcata 23081790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 30678382 - 30678225
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||| | |  || ||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||   || ||||  |     
T  30678382 tagcaattaaagaagtactattaaagaaacatgtacctctgatcaaccgatcctcattcactgtttgtgtaccagtcaaagcaaacgttttcccactagc 30678283  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttg 158  Q
    |  | |||||||||||| | | ||||||||||  || |||||||||||||||||||||    
T  30678282 ctgagccttcttaggcttcttgcactgcgaaccaatgtgaccttcttcattacagttg 30678225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 348 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 18182396 - 18182302
Alignment:
Q  348 tcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcata 442  Q
    |||||||| |||| ||| ||||||||| |||||||||| || || || |||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||| |||||||    
T  18182396 tcagcaggagcacggtaaggcttaggatgactctgctgacctttacctttcctctcattcacaaccttctaatgagccttagtatccgcctcata 18182302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 242 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 18405061 - 18404969
Alignment:
Q  242 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgc---agcatctttcttcttaggccgcctaacatcgaccat 331  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||| |||   |||||| ||||| |||||||||||| | ||||||||    
T  18405061 acaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtgaaacagacaatctttgcaggagcatccttcttgttaggccgcctatcttcgaccat 18404969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 348 - 445
Target Start/End: Original strand, 18660192 - 18660289
Alignment:
Q  348 tcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagat 445  Q
    |||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| | ||| || ||||||||| ||||  ||||||| ||||| || |||||||||||||||||    
T  18660192 tcagcaggagcactgtaaggctttggacgactttgctgactcttacctttcctctcactcacagccttgtaatgagctttcgtatcctcctcatagat 18660289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 297
Target Start/End: Original strand, 16813668 - 16813859
Alignment:
Q  106 ccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgtccttt 205  Q
    |||||||||||| | | ||||| ||| | | |||||||||||||| ||| ||| | ||||||| ||| | |||||| || | |||||  ||||| | |||    
T  16813668 ccttcttaggcttcttgcactgtgaagtaagatgaccttcttcatcacaattgaaacaaacaatatcaccacgcttgcattcagctattgtgtgccattt 16813767  T
Q  206 ctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag 297  Q
    ||  |  || |  |||||||||||||| || |  |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||    
T  16813768 cttcccacatcggaagcacttcttctcctcaccattgcaaacattactcttgtggcctttctcaccacacttgtagcaaacaatctcagcag 16813859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 243 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 8720821 - 8720772
Alignment:
Q  243 caaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctc 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||    
T  8720821 caaacattactcttgtggcctttctcaccacacttgtagcaaacaatctc 8720772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 349 - 454
Target Start/End: Original strand, 19881670 - 19881775
Alignment:
Q  349 cagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcct 448  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| || ||| |||||||| |||  ||| |||  |||||||| |||||||| | ||| || |||||||| ||    
T  19881670 cagcaggggcgctgtacggcttaggacgactttgttgttccttgcccctccgttcactcatcaccttgtaatgagcctttgaatcttcttcatagattct 19881769  T
Q  449 acagct 454  Q
     |||||    
T  19881770 gcagct 19881775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 349 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 34642592 - 34642487
Alignment:
Q  349 cagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcct 448  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||| |||  |||||||| |||||| | | ||| || |||||||| ||    
T  34642592 cagcaggagcactatacggcttaggacgactctgttgtcccttgcccctccgttcactcatcaccttgtaatgagcccttgaatcttcttcatagattct 34642493  T
Q  449 acagct 454  Q
     |||||    
T  34642492 gcagct 34642487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 338 - 394
Target Start/End: Original strand, 18797954 - 18798009
Alignment:
Q  338 tttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcc 394  Q
    |||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18797954 tttccctt-gtcagcaggagcactatacggcttcggacgactctgctgtcccttgcc 18798009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 413 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 8720648 - 8720607
Alignment:
Q  413 cttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctacagct 454  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8720648 cttgtagtgagctttggtatcctcctcatatatcctacagct 8720607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 339 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 19486311 - 19486199
Alignment:
Q  339 ttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcct 438  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||  ||||| || |||  | ||| |||| |||  |||||||| ||||| ||||||||||| |    
T  19486311 ttccctttgtcagcaggagcactgtagggcttcgaacgaccttgctggcctttgttcctccgctcactcataaccttgtaatgagctttggtatcctctt 19486212  T
Q  439 catagatcctaca 451  Q
    | ||||| |||||    
T  19486211 cgtagattctaca 19486199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 348 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 30678032 - 30677932
Alignment:
Q  348 tcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcc 447  Q
    |||||||| ||  |||| ||||| |||||| ||||||| | ||| ||| ||| |||| |||  |||||||| | ||| |||||||| |||||||||||||    
T  30678032 tcagcaggagcgttgtaaggctttggacgattctgctgactcttacccctccgctcactcataaccttgtaattagctttggtatcttcctcatagatcc 30677933  T
Q  448 t 448  Q
    |    
T  30677932 t 30677932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0751 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 2)
Name: scaffold0751
Description:

Target: scaffold0751; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 289
Target Start/End: Original strand, 5269 - 5557
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | ||||| |||||||||||||     
T  5269 tagcaattaaatgagtactattaaagaaacaagtacctctgataagtcggtcctcattcactgtttgcgtaccagtcaacgcaaaaaccttgccacctga 5368  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgt 200  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  5369 cctagacttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccccacgcttacaatcagctaaagtgtgt 5468  T
Q  201 cctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaat 289  Q
    ||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||    
T  5469 cctttctgaccacacctgaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaat 5557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0751; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 392
Target Start/End: Original strand, 5615 - 5662
Alignment:
Q  345 ttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttg 392  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||    
T  5615 ttgtcagtaggggcactgtacggcttccgatgactctgctgtcccttg 5662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 41)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 5 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 21739317 - 21739030
Alignment:
Q  5 aattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgtccta 104  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  21739317 aattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctctgataagtcggtcctcattaaccgtttgcgtaccagtcaaagaaaacagcttgccacctgtccta 21739218  T
Q  105 accttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgtcctt 204  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||| | |||| ||||||||||    
T  21739217 accttcttaggctccgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattatagttgtagcaaaaaacatccccacgcttacaatcaactaaggtgtgtcctt 21739118  T
Q  205 tctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctc 292  Q
    ||| ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||    
T  21739117 tctgaccacacctaaagcacttcttctcatctcgatcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacacttgaagcaaataatctc 21739030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 21742837 - 21742381
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||    
T  21742837 tagcaattaaatgagtactattaaagaaacaagtacctctgataagtcggtcctcattcactgtttgcgtaccagtcaacgcaaataccttgccacctgt 21742738  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||| || ||||||    
T  21742737 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactaatatgtccttcctcattacagttgtagcaaacaacatccccacgcttgcaatcagccaatgtgtgt 21742638  T
Q  201 cctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctc---tgcag 297  Q
    ||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||    | ||    
T  21742637 cctttctgaccacacctaaagcacttcttctcatctcggtcacatacattactcttgtggcctttctcaccacacttgaagcaaataatctcagtaggag 21742538  T
Q  298 catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgccctt 397  Q
    ||||| || ||||||||| |||  ||||   ||   |||  || || ||||||| ||| ||||| ||||| || |||||||||| ||||||||| ||  |    
T  21742537 catctctcctcttaggcctcctctcatcattcagtctctgcttacccttgtcagtaggagcactatacggtttcggacgactctactgtcccttacctct 21742438  T
Q  398 cctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctacagct 454  Q
     | |||| |||  |||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  21742437 gcgctcactcatcaccttgtaatgagctttcgtatcctcttcatatatcctgcagct 21742381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 255 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 33388060 - 33387804
Alignment:
Q  255 ttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcagcag 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |    
T  33388060 ttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttacctttgtcagcgg 33387961  T
Q  355 gggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctacagct 454  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  33387960 gggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagct 33387861  T
Q  455 gttaaccaaatctggaaaaactctcagccgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 511  Q
     ||||||||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  33387860 attaaccaaattcggaaaaactctcagctgttggtacccaatcgccctcttgatgtc 33387804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 255 - 511
Target Start/End: Original strand, 21833630 - 21833886
Alignment:
Q  255 ttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcagcag 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  21833630 ttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttatcagcgg 21833729  T
Q  355 gggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctacagct 454  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||    
T  21833730 gggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctctccatagatcctgcagct 21833829  T
Q  455 gttaaccaaatctggaaaaactctcagccgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 511  Q
     |||||||||||  |||||||||| ||| |||| || |||||||||||||| |||||    
T  21833830 attaaccaaatcctgaaaaactcttagctgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 21833886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 22016030 - 22015562
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  22016030 tagcaattaaatgagtactattaaagaaacaagtacctctgataagtcggtcctcattcactgtttgcgtaccagtcaaagcaaacaccttgccacctgt 22015931  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgt 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||| |||| || || ||||| || ||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||    
T  22015930 cctaaccttcttcggctgcgtacactgcaaactaatatgatcttcctcgttgcagttataacaaacaacatccccacgcttgcaatcagctaaagtgtgt 22015831  T
Q  201 cctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctct---gcag 297  Q
    ||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| || ||||| | |   | ||    
T  22015830 cctttctgaccacacctgaagcacttcttctcatctctatcacaaacattacttttttggcctttttctccacacttgaatcaaacaatatttgtaggag 22015731  T
Q  298 catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgccctt 397  Q
    ||||| ||||||| |||| |||  ||||    ||  |||  || || ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |    
T  22015730 catctctcttctttggcctcctctcatcatttattctcttcttacccttgtcagcaggagcactatacggcttcggacgactctgctgtccctttcccct 22015631  T
Q  398 cctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctacagctgttaaccaaatc 466  Q
     | |||| |||  |||||||| ||||| || ||| | || |||||||||||||||||| | ||||||||    
T  22015630 acgctcactcatcaccttgtaatgagctttcgtaacttcttcatagatcctacagctgcttaccaaatc 22015562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 252 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 16347629 - 16347369
Alignment:
Q  252 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcag 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| || |||||||    
T  16347629 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctcagcagcatccttcttcttaggccgcctaacgtcgaccatcttctgtttacccttgtcag 16347530  T
Q  352 caggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctaca 451  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||    
T  16347529 cgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcgtagatcctgca 16347430  T
Q  452 gctgttaacc-aaatctggaaaaactctcagccgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 511  Q
    ||| |||||| |||||  |||||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||    
T  16347429 gctattaaccaaaatcctgaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 16347369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 255 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 51330523 - 51330267
Alignment:
Q  255 ttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcagcag 354  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  51330523 ttgtggcctctctctccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctgacatcgaccatcttctgtttccctttatcagcag 51330424  T
Q  355 gggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctacagct 454  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  51330423 gggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagct 51330324  T
Q  455 gttaaccaaatctggaaaaactctcagccgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 511  Q
     |||||||| ||  |||||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||    
T  51330323 attaaccaagtcctgaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 51330267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 252 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 41350702 - 41350444
Alignment:
Q  252 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcag 351  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||    
T  41350702 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttacccttgtcag 41350603  T
Q  352 caggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctaca 451  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| ||| ||    
T  41350602 cgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtaagccttcgtatcctcttcataga-cctgca 41350504  T
Q  452 gctgttaaccaaatctggaaaaactctcagccgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 511  Q
    ||| | |||||| ||  |||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||    
T  41350503 gctatgaaccaagtcctgaaaaactctcagctgttggtacccaagcgccctcttgatgtc 41350444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 246 - 511
Target Start/End: Original strand, 21842531 - 21842796
Alignment:
Q  246 acattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctt 345  Q
    ||||| || |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| | |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  21842531 acattgcttttgtggcctttcccaccacaattgaaacacacaatctcagtagcatccttcttcttaggccgtctatcatcgaccatcttctgtttccctt 21842630  T
Q  346 tgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagat 445  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21842631 tatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgatgtcccttgcccttcctctcgttcactatcttgtagtgagccttggtatcctcttcatagat 21842730  T
Q  446 cctacagctgttaaccaaatctggaaaaactctcagccgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 511  Q
    ||| ||||| || ||||||||  |||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||    
T  21842731 cctgcagctattgaccaaatcctgaaaaactctaagctgttggtatccaatcgccctcttgatgtc 21842796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 463
Target Start/End: Original strand, 48425978 - 48426443
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    || |||||||||||  ||||||||||||| |||||  |    
T  48425978 tagcaattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctctgataagtcggtcctcattaggagtctgcgtaccagtcaaagcaaacacctttccaccaat 48426077  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgt 200  Q
     |||  |||||| ||||  | |||||| |||||||||||||||||  |||| |||||||| || ||||  |||| |||||| || | ||||||| ||||     
T  48426078 tctagtcttcttcggctcaggacactgtgaactgatatgaccttccccattgcagttgtaacagacaatgtccccacgcttgcattcagctaaactgtga 48426177  T
Q  201 cctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatct---ctgcag 297  Q
    || |||| ||  ||||| ||||||||| | |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||   | | ||    
T  48426178 cccttctgaccacacctgaagcacttcctatcatctcttccacaaacattactcttgtggcctttctcaccacacttgtagcaaacaatctcaacaggag 48426277  T
Q  298 catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgccctt 397  Q
    ||||| || |||| |||| |||| ||||  |||||||||  || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| |||||||| ||| |    
T  48426278 catctctcctcttgggcctcctatcatcacccatcttctgctttcctttgtcagcaggagcactgtaaggcttaggacgattctgttgtcccttacccct 48426377  T
Q  398 cctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctacagctgttaaccaa 463  Q
    ||||||| ||| || |||||| ||||| ||||| || || |||||||| || || || ||||||||    
T  48426378 cctctcactcattatcttgtaatgagctttggtgtcttcttcatagattctgcacctattaaccaa 48426443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 246 - 511
Target Start/End: Original strand, 22400639 - 22400904
Alignment:
Q  246 acattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctt 345  Q
    |||||||| || ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| | ||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||    
T  22400639 acattacttttatggcctttccctccacaattgaaacacacaatctcagtagcatccatcttcttaggccgcctatcatcgaccatcctctgtttccctt 22400738  T
Q  346 tgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagat 445  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22400739 tatcagcaggggcactgtacagcttaggacgactctgctctcccttgcccttcctctcgttcacaatcttatagtgagccttggtatcctcttcatagat 22400838  T
Q  446 cctacagctgttaaccaaatctggaaaaactctcagccgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 511  Q
    ||| ||||| || ||||||||  |||||||||| ||| ||||  | ||||||||||| ||||||||    
T  22400839 cctgcagctattgaccaaatccagaaaaactctaagctgttggcatccaatcgcccttttgatgtc 22400904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 4 - 430
Target Start/End: Original strand, 21961135 - 21961564
Alignment:
Q  4 caattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgtcct 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    || |||||||||||  ||||||| ||||| ||||| || ||    
T  21961135 caattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctctgataagtcggtcctcattggtagtctgcgtaccagtcaaagcaaatacctttccaccagttct 21961234  T
Q  104 aaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgtcct 203  Q
    ||||||||| ||||  |  |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| |||| ||||| ||||||||| | ||||||| |||||||     
T  21961235 aaccttcttcggctcagggcactgcgaactgatatgaccctctccattgcagttgtagcagacaatatccccacgcttacattcagctaaactgtgtccc 21961334  T
Q  204 ttctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctc---tgcagcat 300  Q
    |||| ||  ||||| ||||||||| ||||||||    |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| | || ||||||||    | |||||    
T  21961335 ttctgaccacacctgaagcacttcctctcatctttaccacaaacattgctcttgtggcctttttcaccacacttgtaacaaacaatctcagaaggagcat 21961434  T
Q  301 ctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcct 400  Q
    || || |||| || | |||| ||||   ||||||||  || |||||||||| ||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||    
T  21961435 ctctcctcttgggtctcctatcatcattcatcttctgctttcctttgtcagaaggagcactgtaaggcttaggacgattctgctgtcccttacctctcct 21961534  T
Q  401 ctcattcactaccttgtagtgagccttggt 430  Q
    |||| ||| || |||||| ||||| |||||    
T  21961535 ctcactcattatcttgtaatgagctttggt 21961564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 20074994 - 20074529
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    || |||||||||||  | ||||||| |||||| || ||    
T  20074994 tagcaattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctctgataagtcggtcctcattggtagtctgcgtaccagtcaatgcaaacatcttgcccccagt 20074895  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgt 200  Q
     ||||||||||| ||||  | |||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||| |||| ||||| |||||| || | ||| ||  ||||     
T  20074894 tctaaccttcttcggctcaggacactgcgaattgatatgaccctctccattgcagttgtagcagacaatatccccacgcttgcattcagccaagctgtga 20074795  T
Q  201 cctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctc---tgcag 297  Q
    || |||| ||  ||||| ||||||||| ||||||||     ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||    | ||    
T  20074794 cccttctgaccacacctgaagcacttcctctcatctttactacaaacattgctcttgtggcctttctcaccacacttgtaacacacaatctcagtgggag 20074695  T
Q  298 catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgccctt 397  Q
    ||||| || ||||| ||| |||  ||||   ||||||||  || |||||||||||||  |||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| |    
T  20074694 catctctcctcttaagcctcctgtcatcactcatcttctgctttcctttgtcagcagaagcactgtaaggcttaggacgattctgctgtcccttacccct 20074595  T
Q  398 cctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctacagctgttaaccaa 463  Q
    ||||||| ||| || |||||| ||||| ||||| || || ||||| || |||||  ||||||||||    
T  20074594 cctctcactcattatcttgtaatgagctttggtgtcttcttcataaattctacacatgttaaccaa 20074529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 24096900 - 24096507
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||    || |||||||||||  | |||||||| || ||||| ||    
T  24096900 tagcaattaaaggagtattattaaagaaacaagtacctctgataagtcagtcctcattagtagtctgcgtaccagtcaatgcaaacactttcccaccggt 24096801  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgt 200  Q
     ||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  |||| ||||||||| | |||||  ||||||    
T  24096800 tctagccttcttcggctgagtacactgtgaactgatatgaccttcttcgttgcagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacattcagctagtgtgtgt 24096701  T
Q  201 cctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatct---ctgcag 297  Q
    ||||||| ||  |||||||| |||||| |||||||||   ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||   | | ||    
T  24096700 cctttctgaccacacctaaaacacttcctctcatctctaccacaagcattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatctcaacaggag 24096601  T
Q  298 catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtccctt 391  Q
    ||||| || |||| |||| |||  ||||   |||| ||| ||| |||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||||||    
T  24096600 catctctcctcttgggcctcctctcatcattcatcctctgttttcctttgtcagcaggagcactataaggtttaggacgactctgttgtccctt 24096507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 463
Target Start/End: Original strand, 52988846 - 52989310
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    || |||||||||||  | |||||||||||||| || ||    
T  52988846 tagcaattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctctgataagtcggtcctcattggtagtctgcgtaccagtcaatgcaaacaccttgcccccagt 52988945  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgt 200  Q
     ||||||||||| || |  | ||| || |||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||  |||| ||||||||| | ||||||| ||||     
T  52988946 tctaaccttcttcggttcaggacattgtgaactgatatgaccctctccattgcagttgtagcagacaatgtccccacgcttacattcagctaaattgtga 52989045  T
Q  201 cctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctc---tgcag 297  Q
    || |||| ||  ||||| || |||||| ||||||||    |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| | || ||||||||    | ||    
T  52989046 cccttctgaccacacctgaaacacttcctctcatctttaccacaaacattgctcttgtggcctttttcaccacacttgtaacaaacaatctcagaaggag 52989145  T
Q  298 catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgccctt 397  Q
    ||||| || ||||||||| |||| ||||   ||||||||  || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| | ||||||||||| ||| |    
T  52989146 catctctcctcttaggcctcctatcatcattcatcttctgctttcctttgtcagcaggagcactgtaaggcttaggacgattttgctgtcccttacccct 52989245  T
Q  398 cctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctacagctgttaaccaa 463  Q
    ||||||| ||| ||  ||||| ||||| ||||| || || ||||| || ||||| |||||||||||    
T  52989246 cctctcactcatta-tttgtaatgagctttggtgtcttcttcataaattctacacctgttaaccaa 52989310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 463
Target Start/End: Original strand, 37680154 - 37680619
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||    || |||||||||||  ||||||||||||| |||||  |    
T  37680154 tagcaattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctctgataagtctgtcctcattaggagtctgcgtaccagtcaaagcaaacaccttcccaccaat 37680253  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgt 200  Q
     |||  |||| | ||||  | |||||| ||||| |||||||||||| |||| || ||||| || ||||  |||| |||||| || | ||||||| ||||     
T  37680254 tctagtcttcctcggctcaggacactgtgaactaatatgaccttctccattgcaattgtaacagacaatgtccccacgcttgcattcagctaaactgtga 37680353  T
Q  201 cctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatct---ctgcag 297  Q
    || |||| ||  ||||| ||||||||| | |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||   | | ||    
T  37680354 cccttctgaccacacctgaagcacttcctatcatctcttccacaaacattactcttgtggcctttctcaccacacttgtagcaaacaatctcaacaggag 37680453  T
Q  298 catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgccctt 397  Q
     |||| || |||| |||| |||| ||||  |||||||||  || |||||||||| ||| |||||||| |||||||||||| |||| |||||||| ||| |    
T  37680454 tatctctcctcttgggcctcctatcatcacccatcttctgctttcctttgtcagtaggagcactgtaaggcttaggacgattctgttgtcccttacccct 37680553  T
Q  398 cctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctacagctgttaaccaa 463  Q
    ||||||| ||| || |||||| ||||| ||||| || || |||||||| || || || ||||||||    
T  37680554 cctctcactcattatcttgtaatgagctttggtgtcttcttcatagattctgcacctattaaccaa 37680619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 38910111 - 38909646
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    || |||||||||||  | ||||| ||||| |||||  |    
T  38910111 tagcaattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctctgataagtcggtcctcattaggagtctgcgtaccagtcaaggcaaaaacctttccaccaat 38910012  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgt 200  Q
     |||  |||||| ||||  | |||||| |||||||||||||||||  |||| |||||||| || ||||  |||| |||||| || | ||||||| ||||     
T  38910011 tctagtcttcttcggctcaggacactgtgaactgatatgaccttccccattgcagttgtaacagacaatgtccccacgcttgcattcagctaaactgtga 38909912  T
Q  201 cctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatct---ctgcag 297  Q
    || |||| ||  ||||| ||||||||| | |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||   | | ||    
T  38909911 cccttctgaccacacctgaagcacttcctatcatctcttccacaaacattactcttgtggcctttctcaccacacttgtagcaaacaatctcaacaggag 38909812  T
Q  298 catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgccctt 397  Q
    ||||| || |||| |||| |||| ||||  ||||| |||  || |||||||||||||| |||||||| || ||||||||| |||| |||||||| ||| |    
T  38909811 catctctcctcttgggcctcctatcatcacccatcctctgctttcctttgtcagcaggagcactgtaaggtttaggacgattctgttgtcccttacccct 38909712  T
Q  398 cctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctacagctgttaaccaa 463  Q
    |||| || ||| || |||||| ||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| |||||    
T  38909711 cctcccactcattatcttgtaatgagctttggtgtcttcttcataaattctacatctgtttaccaa 38909646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 328 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 16354201 - 16354018
Alignment:
Q  328 ccatcttctatttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctt 427  Q
    ||||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16354201 ccatcttctgtttacccttgtcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctt 16354102  T
Q  428 ggtatcctcctcatagatcctacagctgttaaccaaatctggaaaaactctcagccgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 511  Q
     |||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||  |||||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||    
T  16354101 cgtatcctcttcgtagatcctgcagctattaaccaaatcctgaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 16354018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 455
Target Start/End: Original strand, 19857379 - 19857836
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||| |||||| |    ||||||||||||||   ||||||||| || ||||  ||    
T  19857379 tagcagttaaaggagtactattaaagaaacaagtacctctaataagtcgatcctcactagtggtttgcgtaccagtcagagcaaacactttaccactggt 19857478  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgt 200  Q
    | |||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| |||||  |||| || |||||||  || |  |||||||||| |||||  ||||||    
T  19857479 cataaccttcttcggttgagtacactgcgaactaatatgaccttcctcattgtagttataacaaacaatgtctccccgcttacaatcagctagtgtgtgt 19857578  T
Q  201 cctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctc---tgcag 297  Q
    ||||||| ||  ||||| ||||| |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||    | ||    
T  19857579 cctttctgaccacacctgaagcatttcttctcatctctatcacagacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaagcaaacaatctcggtagaag 19857678  T
Q  298 catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgccctt 397  Q
    ||||| || ||||||||| |||  ||||   || | |||  || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||  |    
T  19857679 catctctcctcttaggcctcctctcatcattcaacctctgcttacccttgtcagcaggagcactatatggtttaggacgactctgttgtcccttacctct 19857778  T
Q  398 cctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctacagctg 455  Q
     |  ||| |||  |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||    
T  19857779 gcgttcactcatcaccttgtaatgagccttagtatcctcttcatagatcttacagctg 19857836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 282 - 511
Target Start/End: Original strand, 19109725 - 19109953
Alignment:
Q  282 cacacaatctctgcagcatctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactct 381  Q
    ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19109725 cacacaatctcggtagcatccttcttcttaggccgcctatcatcaaccatcctctgtttccctttatcagcaggggcactgtacggcttaggacgactct 19109824  T
Q  382 gctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctacagctgttaaccaaatctggaaaaactctcag 481  Q
    | ||||||||||||||||||||||| || | |||  |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| || |||||||| |     
T  19109825 gttgtcccttgcccttcctctcattgacaatcttacagtgagccttagtatcctcttcatagatcctgcagctattgaccaaatccgg-aaaactctaat 19109923  T
Q  482 ccgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 511  Q
    | |||| || |||||||||||||| |||||    
T  19109924 ctgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 19109953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 242 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 21228600 - 21228328
Alignment:
Q  242 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctat 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||   |||| |||||||||||||||||| ||||||||||  ||| |    
T  21228600 acaaacattactcttgtggcctttctcgccacagttgaaacaaacaatctccgcaggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgt 21228501  T
Q  339 ttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcct 438  Q
    || || || |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||   ||||  ||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||    
T  21228500 ttacccttatcagcaggggcactatagggcttagggcgactctgctggcccttagtcttctgctcattcacaaccttgtaatgagccttagtatcctcct 21228401  T
Q  439 catagatcctacagctgttaaccaaatctggaaaaactctcagccgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 511  Q
    |||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||  | | |||| || || ||||||||||| |||||    
T  21228400 catagatcctgcagctattaactaaatcagggaaaactcagatctgttggtatccgatcgccctcttaatgtc 21228328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 463
Target Start/End: Original strand, 20297486 - 20297953
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgta-ccagttgaagc-aaacaccttgccacct 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||    ||     || |||| | || | ||||||||| |||||     
T  20297486 tagcaattaaaggagtactattaaagaaaccagtacctctgataagtcggtcctcattggtagtggtaataaccagctcaaaccaaacaccttcccacca 20297585  T
Q  99 gtcctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgt 198  Q
    || ||||||||||| | ||  | |||||  ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||  |||| |||||| || | |||||   |||    
T  20297586 gttctaaccttcttcgactcaggacactatgaactaatatgaccttctccattgcagttgtagcagacaatgtccccacgcttgcattcagctaggctgt 20297685  T
Q  199 gtcctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag- 297  Q
    | || |||||||  ||||| ||||||||| ||||||||    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | || |||||||| ||||     
T  20297686 gacccttctaaccacacctgaagcacttcctctcatctttaccacaaacattactcttgtggcatttctcaccacacttgtaacaaacaatctcagcagg 20297785  T
Q  298 --catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgccc 395  Q
      ||||| || |||| |||| |||  ||||  ||||||||| ||| || ||||||| ||| |||||||| |||||||||||| |||| |||||||| |||    
T  20297786 agcatctctcctcttgggcctcctgtcatcacccatcttctgttttcccttgtcagtaggagcactgtaaggcttaggacgattctgatgtcccttaccc 20297885  T
Q  396 ttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctacagctgttaaccaa 463  Q
     |||||||| ||| || |||||| ||||| ||||| || || ||||| || ||||| |||||||||||    
T  20297886 ctcctctcactcattatcttgtaatgagctttggtgtcttcttcataaattctacacctgttaaccaa 20297953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 242 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 24784901 - 24784667
Alignment:
Q  242 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctat 338  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||| ||||   |||| |||||||||||||||||| ||||||||||  ||| |    
T  24784901 acaaacattgctcttgtggcctttctcaccataattgaaacagacaatctccgcaggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgt 24784802  T
Q  339 ttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcct 438  Q
    || || || ||||||| |||||| || ||||||||  ||||||| || |||||   ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||    
T  24784801 ttgcccttatcagcagaggcactatagggcttagggagactctgttggcccttagtcttccgctcattcacaaccttgtaatgagccttgttatcctcct 24784702  T
Q  439 catagatcctacagctgttaaccaaatctggaaaa 473  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  24784701 catagattctacagctgttcaccaaatcaggaaaa 24784667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 31537282 - 31536817
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||    || |||||||||||   |||||||||||| |||||  |    
T  31537282 tagcaattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctctgataagtcggtcttcattaggagtctgcgtaccagtcagagcaaacacctttccaccaat 31537183  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgt 200  Q
     |||  |||||| ||||  | |||||| ||||| ||||| |||||  |||| |||||||| || ||||  |||| |||||| || | ||||||| ||||     
T  31537182 tctagtcttcttcggctcaggacactgtgaactaatatggccttccccattgcagttgtaacagacaatgtccccacgcttgcattcagctaaactgtga 31537083  T
Q  201 cctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctc---tgcag 297  Q
    || |||| ||  ||||| ||||| ||  | |||||||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  | || ||||||||    | ||    
T  31537082 cccttctgaccacacctgaagcattttctatcatctctaccacaaacattgctcttgtggcctttctcaccacacttataacaaacaatctcagaaggag 31536983  T
Q  298 catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgccctt 397  Q
    ||||| || |||| || | |||| ||||   |||| |||  || |||||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||||||||| ||| |    
T  31536982 catctctcctcttgggtctcctatcatcattcatcctctgctttcctttgtcagcaggagcactataaggcttaggacgattctgctgtcccttacccct 31536883  T
Q  398 cctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctacagctgttaaccaa 463  Q
    ||||||| ||| || |||||| ||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| |||||    
T  31536882 cctctcactcattatcttgtaatgagctttggtgtcttcttcataaattctacatctgtttaccaa 31536817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 20833185 - 20832897
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| |    ||||||||||||||   ||||||||| || | ||| ||    
T  20833185 tagcaattaaaggaataatattaaagaaacaagtacctctgataagtcgatcctcactagtggtttgcgtaccagtcagagcaaacactttactaccggt 20833086  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgt 200  Q
    |||||||||| | || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| |  | ||| |||| |||||  ||||||    
T  20833085 cctaaccttcctcggttgcgtacactgcgaactgatgtgaccttcctcattgcagttataacaaacaacatctcccctcttgcaatcagctagtgtgtgt 20832986  T
Q  201 cctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaat 289  Q
    ||||||| ||  ||||| || || ||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| |||||    
T  20832985 cctttctgaccacacctgaaacaattcttctcatctttagtacaaacattactcttgtggcctttctcgccacacttgtagcaaacaat 20832897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 242 - 475
Target Start/End: Original strand, 21176682 - 21176918
Alignment:
Q  242 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatct---ctgcagcatctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctat 338  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  || |||||||   | | |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  ||| |    
T  21176682 acaaacattgctcttgtggactttctcaccacaattaatacagacaatctccacaggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgt 21176781  T
Q  339 ttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcct 438  Q
    || || || |||||||||||||| || | |||||| | ||||||||| |||||   ||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  21176782 ttgcccttatcagcaggggcactatatgtcttagggctactctgctggcccttagtcttccgctcattcacaaccttgtaatgagccttggtatcctcct 21176881  T
Q  439 catagatcctacagctgttaaccaaatctggaaaaac 475  Q
    ||||||| ||||| || || |||||||| ||||||||    
T  21176882 catagattctacaactattcaccaaatcaggaaaaac 21176918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 244 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 17042057 - 17041788
Alignment:
Q  244 aaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctattt 340  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| || | |||||| | ||   |||| |||||||||||||||||| ||||||||||  |||  ||    
T  17042057 aaacattactcttgtggcctttcccgccacagttgaaacaaa-aatctccgaaggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgctt 17041959  T
Q  341 ccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctca 440  Q
     || || |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||   |||||||||||| || |||||||| |||||  |||||||||| ||     
T  17041958 gcccttatcagcaggggcactataaggcttagggcgactctgctggcccttagtcttcctctcattaacaaccttgtaatgagctctggtatcctcttcg 17041859  T
Q  441 tagatcctacagctgttaaccaaatctggaaaaactctcagccgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 511  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||  ||  |||| || || |||||||||||||||||    
T  17041858 tagatcctacagctgttcaccaaatcagggaaaactcggagttgttggtatccgatcgccctcttgatgtc 17041788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 242 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 20081420 - 20081220
Alignment:
Q  242 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctat 338  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||  ||| |    
T  20081420 acaagcattgctcttgtggcctttctcaccacaattaaagcagacaatctcagcatgaacatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgt 20081321  T
Q  339 ttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcct 438  Q
    || || || ||||||||||| || || |||||| | ||||||||||| || ||   ||||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||    
T  20081320 ttgcccttatcagcaggggcgctataaggcttaaggcgactctgctggccgttagtcttccgctcattcacgatcttgtaatgagccttggtatcctcct 20081221  T
Q  439 c 439  Q
    |    
T  20081220 c 20081220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 242 - 454
Target Start/End: Original strand, 22401907 - 22402122
Alignment:
Q  242 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctat 338  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | || || | ||| |||||||   |||| ||||||||||| || ||| | ||||||||  ||| |    
T  22401907 acaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagaaaatttctgcaggagcatccttcttcttaggtcgtctatcttcgaccattctctgt 22402006  T
Q  339 ttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcct 438  Q
    || || || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||   ||||| |||||| || | |||||| |||||||| ||||||||||    
T  22402007 ttgcccttatcagcaggggcactgtaaggcttagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcatttacaatcttgtaatgagccttagtatcctcct 22402106  T
Q  439 catagatcctacagct 454  Q
    |||| ||||| |||||    
T  22402107 cataaatcctgcagct 22402122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 242 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 22435777 - 22435521
Alignment:
Q  242 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttc 341  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||  |||| | | | |||||       |||| ||| ||||||  ||| |||     
T  22435777 acaaacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaatagacaatcttcgcaggagcatccttct-------cctatcattgaccattctctgtttt 22435685  T
Q  342 cctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcat 441  Q
    || || |||| ||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||   ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22435684 cccttatcagtaggggcactatagggcttagggcgactctgctggcccttagtcttccgctcattcacaaccttgtaatgagccttggtatcctcctcat 22435585  T
Q  442 agatcctacagctgttaaccaaatctggaaaaactctcagccgttgatacccaatcgccctctt 505  Q
    |||| |||||| |||| ||||| || |||||||||   | | |||| || ||||||||||||||    
T  22435584 agattctacagttgttcaccaactcgggaaaaacttggatctgttggtatccaatcgccctctt 22435521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 348 - 448
Target Start/End: Original strand, 16379518 - 16379618
Alignment:
Q  348 tcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcc 447  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  16379518 tcagcagaggcactgtaaggcttaggacgactctgttgacccttgcctttccgctcattcacaaccttgtaatgagccttagtatcctcctcataaatcc 16379617  T
Q  448 t 448  Q
    |    
T  16379618 t 16379618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 252 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 22496290 - 22496091
Alignment:
Q  252 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgt 348  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||  |||   |||| |||||| | ||||| |||   ||||||||  ||| ||| || || |    
T  22496290 ctcttgtggcctttctcaccataattaaagcagacaatctcaacaggaacatccttcttccttggccgtctatactcgaccattctctgttttcccttat 22496191  T
Q  349 cagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcct 448  Q
    |||||||||| || || ||||||||  ||||||| || |||||   ||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  22496190 cagcaggggcgctataaggcttagggagactctggtggcccttcgtcttccgctcattcacgaccttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcct 22496091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Original strand, 18710490 - 18710586
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacc 97  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| |    ||||||||||||||   ||||||||| || |||||    
T  18710490 tagcaattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctctgataagtcgatcctcactagtggtttgcgtaccagtcagagcaaacactttaccacc 18710586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 348 - 448
Target Start/End: Original strand, 21752471 - 21752571
Alignment:
Q  348 tcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcc 447  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  | || | ||||||||| | |||||| |||| ||||||||| |||||||| ||||    
T  21752471 tcagcagtggcactgtaaggcttaggacgactctgctgacccttagcttttcgctcattcacaatcttgtaatgagtcttggtatcttcctcataaatcc 21752570  T
Q  448 t 448  Q
    |    
T  21752571 t 21752571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 348 - 439
Target Start/End: Original strand, 22117138 - 22117229
Alignment:
Q  348 tcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctc 439  Q
    ||||||||  ||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  22117138 tcagcaggaacactgtaaggctttggacgactttgctgacccttgcctttcctctcattcaaaaccttgtaatgagccttagtatcttcctc 22117229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 55
Target Start/End: Complemental strand, 20854045 - 20853991
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctc 55  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  20854045 tagcaattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctctgataagtcgatcctc 20853991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 341 - 454
Target Start/End: Original strand, 18273215 - 18273328
Alignment:
Q  341 ccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctca 440  Q
    |||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||  ||||| ||||||  | ||| |||| ||   ||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  18273215 ccctttgtcaacaggagcactgtagggcttcggacgaccttgctgacccttgttcctccgctcactcctaaccttataatgagccttcgtatcctcctca 18273314  T
Q  441 tagatcctacagct 454  Q
    || || ||||||||    
T  18273315 taaattctacagct 18273328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 106 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 20081556 - 20081478
Alignment:
Q  106 ccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttaca 184  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  || |||||||||||||| || ||| |||| ||||  ||  ||||||||||    
T  20081556 ccttcttaggccgcgtacactgcgaaccaatgtgaccttcttcattgcaattgaagcacacaatgtcattacgcttaca 20081478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 106 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 22496436 - 22496370
Alignment:
Q  106 ccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatc 172  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||| || ||| |||| |||| |||    
T  22496436 ccttcttaggctgcttacactgcgaactaatgtgaccctcttcattgcaattgaagcacacaatatc 22496370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 242 - 275
Target Start/End: Original strand, 16379409 - 16379442
Alignment:
Q  242 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacaa 275  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16379409 acaaacattacttttgtggcctttctcaccacaa 16379442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 243 - 292
Target Start/End: Original strand, 18273114 - 18273163
Alignment:
Q  243 caaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctc 292  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | || ||||||||    
T  18273114 caaacattactcttgtggcccttctcaccacacttgtaacaaacaatctc 18273163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 1)
Name: scaffold0054
Description:

Target: scaffold0054; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 63735 - 63447
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||    
T  63735 tagcaattaaaagagtactattaaagaaacaagtacctctgataagtcggtcctcattcactgtttgcgtaccagtcaaagcaaacaccttgccacttgt 63636  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  63635 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcctcattatagttgtagcaaacaatatccccatgcttacaatcagctaaagtgtgt 63536  T
Q  201 cctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaat 289  Q
    ||||||| ||  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||    
T  63535 cctttctgaccacacctgaaacacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttatcaccacacttgaaacaaacaat 63447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 1)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 5 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 4516 - 4067
Alignment:
Q  5 aattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgtccta 104  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  4516 aattaaatgagtactattaaagaaacaagtacctctgataagtcggtcctcattcaccgtctgcgtaccagtcaaagcaaacaccttgccacctgtccta 4417  T
Q  105 accttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgtcctt 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||| || ||||||||||    
T  4416 accttcttaggctgcgtacactgcgaactaatatgtccttcctcattacagttgtagcaaacaatatccccacgcttgcaatcagccaatgtgtgtcctt 4317  T
Q  205 tctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctc---tgcagcatc 301  Q
    ||| ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||| | ||||||    | ||||||    
T  4316 tctgaccacacctaaagcacttcttctcatctcgatcacacacattacttttgtagtctttctcaccacacttgaagcaaataatctcagtaggagcatc 4217  T
Q  302 tttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctc 401  Q
    | || ||||||||| |||  ||||   || | ||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||| ||||||||| ||  | | |    
T  4216 tctcctcttaggcctcctctcatcattcaacctctgtttacctttgtcagcaggagcactatacggtttcggacgactctactgtcccttacctctgcgc 4117  T
Q  402 tcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctaca 451  Q
    ||| |||  || || || ||||| || |||||||| ||||||||||||||    
T  4116 tcactcatcactttataatgagcttttgtatcctcttcatagatcctaca 4067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 36)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 252 - 511
Target Start/End: Original strand, 19115776 - 19116035
Alignment:
Q  252 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcag 351  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  19115776 ctcttgtggcctttctcgccacaattgaagcacacaacctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttatcag 19115875  T
Q  352 caggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctaca 451  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  19115876 caggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctgca 19115975  T
Q  452 gctgttaaccaaatctggaaaaactctcagccgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 511  Q
    ||| |||||||| ||  |||||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||    
T  19115976 gctattaaccaagtcctgaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 19116035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 246 - 511
Target Start/End: Original strand, 18859947 - 18860212
Alignment:
Q  246 acattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctt 345  Q
    ||||| || |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  || ||||||||    
T  18859947 acattgcttttgtggcctttcccaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccatcccctgtttccctt 18860046  T
Q  346 tgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagat 445  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  18860047 tatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagat 18860146  T
Q  446 cctacagctgttaaccaaatctggaaaaactctcagccgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 511  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  18860147 cctacagctattaaccaaatccggaaaaactctcagctgttggtacccaatcgccctcttgatgtc 18860212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 246 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 17671433 - 17671168
Alignment:
Q  246 acattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctt 345  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  17671433 acattgcttttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttacctt 17671334  T
Q  346 tgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagat 445  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  17671333 tgtcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagat 17671234  T
Q  446 cctacagctgttaaccaaatctggaaaaactctcagccgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 511  Q
    ||| ||||| |||||||||||  |||||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||    
T  17671233 cctgcagctattaaccaaatcctgaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 17671168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 249 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 20015671 - 20015409
Alignment:
Q  249 ttactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgt 348  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||| |    
T  20015671 ttactcttgtggcccttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagcatccctcttcttaggccgtctcacatcgaccatcttctgtttccctttat 20015572  T
Q  349 cagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcct 448  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  20015571 cagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcttcgtagatcct 20015472  T
Q  449 acagctgttaaccaaatctggaaaaactctcagccgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 511  Q
     ||||| || ||||||||  |||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||    
T  20015471 gcagctattgaccaaatcctgaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccctcttgatgtc 20015409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 252 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 19481477 - 19481219
Alignment:
Q  252 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcag 351  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||    
T  19481477 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttacccttgtcag 19481378  T
Q  352 caggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctaca 451  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| ||| ||    
T  19481377 cgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttacccttcctctcattcactaccttgtagtaagccttcgtatcctcttcataga-cctgca 19481279  T
Q  452 gctgttaaccaaatctggaaaaactctcagccgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 511  Q
    ||| | |||||| ||  |||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||    
T  19481278 gctatgaaccaagtcctgaaaaactctcagctgttggtacccaagcgccctcttgatgtc 19481219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 255 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 22126361 - 22126105
Alignment:
Q  255 ttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcagcag 354  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||||| |    
T  22126361 ttgtggcctttcccaccacaattgaaacacacaatctctgtagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccatcctctgtttccctttatcagcgg 22126262  T
Q  355 gggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctacagct 454  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  22126261 gggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagct 22126162  T
Q  455 gttaaccaaatctggaaaaactctcagccgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 511  Q
     |||||||||||  |||||||||| ||| |||| || |||||||||||||| |||||    
T  22126161 attaaccaaatcctgaaaaactctaagctgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 22126105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 466
Target Start/End: Original strand, 19985305 - 19985773
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||| || ||||||| |||  | ||||| ||||||||||||||    
T  19985305 tagcaattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctctgataagtcggtccttattcacagtctgcgtactagtcaatgcaaataccttgccacctgt 19985404  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgt 200  Q
    || |||||||||||||| | | ||||| || || ||||| || ||||||| ||| || |||||||||||||||| || ||| |||| |||||| ||||||    
T  19985405 ccgaaccttcttaggcttcttgcactgtgagctaatatgcccctcttcatcacaattatagcaaacaacatccccactcttgcaatcagctaatgtgtgt 19985504  T
Q  201 cctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctc---tgcag 297  Q
    | |||||  |  || || ||  ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| || ||||| ||||| || ||||||||    | ||    
T  19985505 catttctgtccacatctgaaatacttcttctcatcacggtcacatacattactcttgtggcttttttcgccacacttgaaacaaacaatctcagtaggag 19985604  T
Q  298 catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgccctt 397  Q
    ||||| || ||||||||| |||  |||| | |||| ||| ||| || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||  |    
T  19985605 catctctcctcttaggcctcctctcatcaatcatcctctgtttacccttgtccgcaggggcactatacggcttcggacgactctgctatcccttgccact 19985704  T
Q  398 cctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctacagctgttaaccaaatc 466  Q
     | |||| |||  |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| | ||||||||    
T  19985705 gcgctcactcatcaccttgtaatgagctttggtatcctcttcatatatcctacaactgcttaccaaatc 19985773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 255 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 22117577 - 22117321
Alignment:
Q  255 ttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcagcag 354  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||  |||||| || ||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||| ||||  |    
T  22117577 ttgtggcctttcccaccacgattgaaacacacaatctctatagcatccttattcttaggccgcctatcatcgaccattctctgtttccctttatcagtgg 22117478  T
Q  355 gggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctacagct 454  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  22117477 gggcactgtacggcttaggacgactttgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagct 22117378  T
Q  455 gttaaccaaatctggaaaaactctcagccgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 511  Q
     |||||||||||  |||||||||| ||| |||| || |||||||||||||| |||||    
T  22117377 attaaccaaatcctgaaaaactctaagctgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 22117321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 454
Target Start/End: Original strand, 22373994 - 22374450
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  22373994 tagcaattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctctgataagtcggtcctcattaacagtttgggtaccagtcaaagcaaacaccttgccacctgt 22374093  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgt 200  Q
       | |||||||||||| | | |||||||| || |||||||||||||||| ||| || |||||||||| ||| | |||||| |||| |||||| ||||||    
T  22374094 tagagccttcttaggcttcctgcactgcgagctaatatgaccttcttcatcacaattatagcaaacaatatcaccacgcttgcaatcagctaatgtgtgt 22374193  T
Q  201 cctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagca- 299  Q
    |||||||  |  |||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| || |||||||| | || |     
T  22374194 cctttctttccacacctaaaacacttcttttcatcacggtcacatacattactcttgtggtctttttcaccacacttgaaacagacaatctcagtaggag 22374293  T
Q  300 --tctttcttcttaggccgcctaacatcgacca-tcttctatttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgccct 396  Q
      ||| || || |||||| |||  | ||    | |||| | ||| |||||| ||||||||||||| ||||| || |||||||||| ||||||||| ||      
T  22374294 aatctctcctcctaggcctcctctcctcattaagtctt-tgtttacctttgacagcaggggcactatacggtttcggacgactctactgtcccttacctc 22374392  T
Q  397 tcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctacagct 454  Q
    | | |||| |||  ||||| || ||||| || |||||||||| |||||||||||||||    
T  22374393 tgcgctcactcatcaccttataatgagcttttgtatcctcctgatagatcctacagct 22374450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 16268880 - 16268367
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    || |||||||||||  |||||||||| || ||||| ||    
T  16268880 tagcaattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctctgataagtcggtcctcattggtagtctgcgtaccagtcaaagcaaacacttttccaccagt 16268781  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgt 200  Q
     ||| ||||||| ||||  | |||||| |||||||||||||| ||| |||| || |||||||| |||| ||||| |||||| || | |||||   | ||     
T  16268780 tctagccttcttcggctcaggacactgtgaactgatatgaccctctccattgcaattgtagcagacaatatccccacgcttgcattcagctaggctatga 16268681  T
Q  201 cctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctc---tgcag 297  Q
    || |||| ||  ||||| ||||||||| ||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | || ||||||||    | ||    
T  16268680 cccttctgaccacacctgaagcacttcctctcatctttaccacaaacattactcttgtggcctttctcaccacacttgtaacaaacaatctcagaaggag 16268581  T
Q  298 catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgccctt 397  Q
    ||||| |||||||||||| |||  ||||   ||||||||  || |||||||||||| | |||||||| |||||||||||| |||| |||||||| ||| |    
T  16268580 catctctcttcttaggcctcctgtcatcactcatcttctgctttcctttgtcagcaagagcactgtaaggcttaggacgattctgttgtcccttacccct 16268481  T
Q  398 cctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctacagctgttaaccaaatctggaaaaactctcagccgttgatacccaatc 497  Q
    ||||||| ||| ||  ||||| ||||| ||||| || || ||||| || ||||| || |||||||| || |  || ||||| | | | |||||||||||     
T  16268480 cctctcactcattatattgtaatgagctttggtgtcttcttcataaattctacaactattaaccaactcagagaagactctgatctgctgatacccaata 16268381  T
Q  498 gccctcttgatgtc 511  Q
    ||||| ||||||||    
T  16268380 gcccttttgatgtc 16268367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 455
Target Start/End: Original strand, 21928553 - 21929010
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||| ||| |||  ||||||||||||||||||||||    
T  21928553 tagcaattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctctgataagtcggtcttcattcacagtttgcttactagtcaaagcaaacaccttgccacctgt 21928652  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgt 200  Q
    || ||||||||| |||| | | || || || || ||||| || ||||||| ||| || |||||||| ||||| | |||||| |||| | | |||||||||    
T  21928653 ccgaaccttcttgggcttcttgcattgtgagctaatatgcccctcttcatcacaattatagcaaacgacatcaccacgcttgcaatcacccaaagtgtgt 21928752  T
Q  201 cctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctc---tgcag 297  Q
    |||||||  |  || || || ||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| || || ||||| ||||| || | ||||||    | ||    
T  21928753 cctttctgtccacatctgaaacacttcttctcatctcggtcacttacattactctcgtggcccttttcgccacacttgaaacaaagaatctcagtaggag 21928852  T
Q  298 catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgccctt 397  Q
    ||||| || || |||||| |||  ||||   || | ||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||  |    
T  21928853 catctctcctcctaggcctcctctcatcattcagcctctgttttcctttgtcagcaggagcactatacggtttaggacgactctgttgtcccttacctct 21928952  T
Q  398 cctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctacagctg 455  Q
     | |||| |||  |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  21928953 acgctcactcatcaccttgtaatgagctttggtatcctcttcatagattctacagctg 21929010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 511
Target Start/End: Original strand, 28984036 - 28984549
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    || || ||||||||   |||||||||||| |||||  |    
T  28984036 tagcaattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctctgataagtcggtcctcattaggagtctgtgtaccagtcagagcaaacacctttccaccaat 28984135  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgt 200  Q
     |||  |||||| ||||  | |||||| |||||||||||||||||  |||| |||||||| || ||||  |||| |||||| || | ||||||| ||||     
T  28984136 tctagtcttcttcggctcaggacactgtgaactgatatgaccttccccattgcagttgtaacagacaatgtccccacgcttgcattcagctaaactgtga 28984235  T
Q  201 cctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatct---ctgcag 297  Q
    || |||| ||  ||||| ||||||||| | |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | || |||||||   ||| ||    
T  28984236 cccttctgaccacacctgaagcacttcctatcatctcttccacaaacattactcttgtggcctttctcaccacacttgtaacaaacaatctcaactggag 28984335  T
Q  298 catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgccctt 397  Q
    ||||| || |||| |||| |||| ||||  ||||| |||  || || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| |||||||| ||| |    
T  28984336 catctctcctcttgggcctcctatcatcacccatcctctgctttcccttgtccgcaggagcactgtaaggcttaggacgattctgttgtcccttacccct 28984435  T
Q  398 cctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctacagctgttaaccaaatctggaaaaactctcagccgttgatacccaatc 497  Q
    ||||||| |||  | |||||| ||||| ||||| || || ||||| |||||||| ||||||||||| || | ||| ||||| | | ||||||| |||||     
T  28984436 cctctcactcataatcttgtaatgagctttggtgtcttcttcataaatcctacacctgttaaccaactcagaaaagactctgatctgttgatatccaatg 28984535  T
Q  498 gccctcttgatgtc 511  Q
    || || ||||||||    
T  28984536 gctcttttgatgtc 28984549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 29301082 - 29300625
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    || |||||||| ||  | | |||||| || |||||  |    
T  29301082 tagcaattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctctgataagtcggtcctcatttgtagtctgcgtacccgtcaatgaaaacactttcccaccgat 29300983  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgt 200  Q
    |||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||  |||| ||||||||| | |||||  ||||||    
T  29300982 cctagccttcttcggctgagtacactgagaactgatatgaccttcttcattgcagttatagtagacaatgtccccacgcttacattcagctagtgtgtgt 29300883  T
Q  201 cctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgc---ag 297  Q
    ||| ||| ||  |||||||| |||||| | |||||||   ||||| |||| |||||||||||| | |||||||| || || || ||||| || ||   |     
T  29300882 cctctctgaccacacctaaaacacttcctttcatctctaccacaagcattgctcttgtggcctctttcaccacacttaaaacaaacaatttcagcgggaa 29300783  T
Q  298 catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgccctt 397  Q
    |||||  | |||| |||| |||| ||||   ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||  |||||||| ||| |    
T  29300782 catctcccctcttgggcctcctatcatcattcatcttctgcttccctttgtcagcaggagcactgtaaggtttaggacgactctaatgtcccttacccct 29300683  T
Q  398 cctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctacagctg 455  Q
    ||||||| ||| ||||||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||    
T  29300682 cctctcactcattaccttgtaatgagcttttgtgtcctcctcatatatcctgcagctg 29300625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 31414188 - 31413723
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    || ||| |||||||  | |||||||| || ||||| ||    
T  31414188 tagcaattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctctgataagtcggtcctcattagtagtctgcataccagtcaatgcaaacactttcccaccggt 31414089  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgt 200  Q
     ||| ||||||| | ||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  |||| ||||||||| | |||||  ||||||    
T  31414088 tctagccttcttcgactgagtacactgtgaactgatatgaccttcttcgttgcagttgtagcaaacaatgtccccacgcttacattcagctagtgtgtgt 31413989  T
Q  201 cctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatct---ctgcag 297  Q
    ||||||| ||  |||||||| |||||| |||||||||   ||||| |||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||| |   | | ||    
T  31413988 cctttctgaccacacctaaaacacttcctctcatctctaccacaagcattgctcttatggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatttcaacaggag 31413889  T
Q  298 catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgccctt 397  Q
    ||||| || |||| |||| |||  ||||   |||  |||  || || |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  31413888 catctctcctcttgggcctcctctcatcattcattctctgctttcccttgtcagcaggggcgctgtaaggtttaggacgactctgctgtcccttacccct 31413789  T
Q  398 cctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctacagctgttaaccaa 463  Q
     | |||| |||  |  ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  31413788 tcgctcactcatcattttgtaatgagctttggtgtcttcctcatatatcctgcagctgtttaccaa 31413723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 22027936 - 22027486
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    || |||||||| ||  | |||||||| || ||||| ||    
T  22027936 tagcaattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctctgataagtcggtcctcattagtagtctgcgtaccggtcaatgcaaacacttttccaccggt 22027837  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgt 200  Q
     ||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| || ||||||||  |||| ||||||||||| || |  | |||||||| |||||| |||||     
T  22027836 tctaaccttcttcggctgtgtgcactgagaactgatatggccctcttcattgtagttatagcaaacaacgtctcccctcttacaatcagctaatgtgtga 22027737  T
Q  201 cctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgc---ag 297  Q
    || |||| ||  ||||| ||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| | || || ||||| ||   ||    
T  22027736 cccttctgaccacacctgaagcacttcttctcatctttggtacaaacattactcttgtggcctttatcgccacacttgtaacaaactatctcagcaggag 22027637  T
Q  298 catctttcttcttaggccgcctaacatc-gaccatcttctatttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgccct 396  Q
    ||||| || | || |||| |||  ||||   | |||||   |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||      
T  22027636 catctctcctattgggcctcctctcatcattcaatctttgctttccc-ttgtcagcaggggcactgtacggtttaggacgactctgctgtcccttaccac 22027538  T
Q  397 tcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcct 448  Q
    | | |||| |||  ||||| || ||| | || || |||||||||||||||||    
T  22027537 ttcgctcactcatcaccttataatgatcttttgtgtcctcctcatagatcct 22027486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 242 - 511
Target Start/End: Original strand, 22043193 - 22043465
Alignment:
Q  242 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctc---tgcagcatctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctat 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||||   || |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  ||| |    
T  22043193 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaaacaagtaatctcagttggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgt 22043292  T
Q  339 ttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcct 438  Q
    || || ||||||| ||||||||| || ||||||||  |||||||||| ||||||  ||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  22043293 ttgcccttgtcagtaggggcactataaggcttagggtgactctgctggcccttggtcttccgctcattcacaaccttgtaatgagccttggtatcctcct 22043392  T
Q  439 catagatcctacagctgttaaccaaatctggaaaaactctcagccgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 511  Q
    |||| ||||| || || ||||||||||| || |||||||  | | |||| || || ||||||||||| |||||    
T  22043393 cataaatcctgcatctattaaccaaatcagggaaaactcggatctgttggtatccgatcgccctcttaatgtc 22043465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 242 - 511
Target Start/End: Original strand, 32603511 - 32603783
Alignment:
Q  242 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctc---tgcagcatctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctat 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||| ||    | |||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||  |||      
T  32603511 acaaacattactcttgtggcctttcccaccacagttgaaacaaacaatttccgaaggagcatccttcttcttaggtcgcctatcatcgaccattctctgc 32603610  T
Q  339 ttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcct 438  Q
    || || || |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||   |||||||||||| || |||||||| |||||  |||||||||| |    
T  32603611 ttgcccttatcagcaggggcactataaggcttagggcgactctgctggcccttagtcttcctctcattaacaaccttgtaatgagctctggtatcctctt 32603710  T
Q  439 catagatcctacagctgttaaccaaatctggaaaaactctcagccgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 511  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||  ||  ||||||| || |||||||||||||||||    
T  32603711 cgtagatcctacagctgttcaccaaatcagggaaaactcggagttgttgatatccgatcgccctcttgatgtc 32603783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 5 - 455
Target Start/End: Original strand, 20391215 - 20391668
Alignment:
Q  5 aattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgtccta 104  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| || || |||||||||||  | ||||||||||| |||||||||  |    
T  20391215 aattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctctgataagtcggtcctcattaactgtctgcgtaccagtcaatgcaaacacctttccacctgtctga 20391314  T
Q  105 accttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgtcctt 204  Q
     |||||||||||| | | ||||||||||| | |||||||||||| | ||| ||| ||||||||| ||| | |||||| || |  |||| ||| || ||||    
T  20391315 gccttcttaggcttcctgcactgcgaactaagatgaccttcttcgtcacaattgaagcaaacaatatcaccacgcttgcattccgctatagtatgccctt 20391414  T
Q  205 tctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catc 301  Q
    |||  |  || |  |||||||| |||||||| |  |   ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| |||||||| | ||   ||||    
T  20391415 tcttcccacatcggaagcactttttctcatcaccattggaaacattactcttgtggcccttctcaccacacttgtagcaaacaatctcagaaggaacatc 20391514  T
Q  302 tttcttcttaggccgcctaacatc-gaccatcttctatttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcct 400  Q
    | |  ||||||| | |||  ||||   | ||||| | |||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||  ||||| || |||  | |||     
T  20391515 tctactcttaggtctcctctcatcattcaatctt-tgtttccctttgtcagcaggagcactgtagggcttcggacgaccttgctgacctttgttcctccg 20391613  T
Q  401 ctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctacagctg 455  Q
    |||| |||  ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||    
T  20391614 ctcactcataaccttataatgagctttggtatcctcttcataaattctacagctg 20391668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 448
Target Start/End: Original strand, 22053988 - 22054438
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||    || |||||||||||  |||||||||| || ||||| ||    
T  22053988 tagcaattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctctgataagacggtcctcattagtagtctgcgtaccagtcaaagcaaacacttttccaccagt 22054087  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgt 200  Q
     ||| ||||||| ||||| || ||||| | ||||||||| || ||||| || ||||| || || |||||||| | |||||| ||||  ||||||  |||     
T  22054088 tctatccttcttcggctgtgtgcactgtgtactgatatggccctcttcgttgcagttataacatacaacatcaccacgcttgcaatccgctaaaaggtga 22054187  T
Q  201 cctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcat-ctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgc---a 296  Q
    || |||| ||  || || |||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || || || ||||| ||   |    
T  22054188 cccttctgaccacatctgaagcacttcttctcatccttggt-acaaacattactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacaaactatctcagcagaa 22054286  T
Q  297 gcatctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgccct 396  Q
    |||||| || | || |||| |||  ||||    |   |||  || || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||      
T  22054287 gcatctctcctattcggcctcctctcatcattaagtctctgcttacccttatcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgccgtcccttacctc 22054386  T
Q  397 tcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcct 448  Q
    | | |||| |||  ||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||||||    
T  22054387 ttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcacagatcct 22054438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 242 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 30310559 - 30310287
Alignment:
Q  242 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctat 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||   |||| |||||||| ||||||||| ||||||||||  ||| |    
T  30310559 acaaacattactcttgtggcctttctcgccacagttgaaacaaacaatatccgcaggagcatccttcttctttggccgcctatcatcgaccattctctgt 30310460  T
Q  339 ttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcct 438  Q
    || || || |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||    
T  30310459 ttgcccttatcagcaggggcactataaggtttagggcgactctgctgacccttggtcttccgctcattcacaaccttgtaatgagccttagtatcctcct 30310360  T
Q  439 catagatcctacagctgttaaccaaatctggaaaaactctcagccgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 511  Q
    | ||||| || || || || || ||||| || |||||||  ||  |||| || |  |||||||||||||||||    
T  30310359 cgtagattctgcaactattcactaaatcagggaaaactcggagttgttggtatctgatcgccctcttgatgtc 30310287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 69 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 6607057 - 6606834
Alignment:
Q  69 gtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaa 168  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||||| ||| ||| |||||||||    
T  6607057 gtaccagctaaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgtgtacactgtgaactgagatgtccttcttcatcacaattgaagcaaacaa 6606958  T
Q  169 catccctacgcttacaattagctaaagtgtgtcctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctc 268  Q
     ||||| |||||| || | |||||  || || || ||||  |  || |  |||||||||||||| || |  |  |||||||||||||||||||| |||||    
T  6606957 tatccccacgcttgcattcagctatcgtatgccccttctttccacatcggaagcacttcttctcctcaccattgcaaacattactcttgtggcccttctc 6606858  T
Q  269 accacaattgaagcacacaatctc 292  Q
    |||||| ||| |||| ||||||||    
T  6606857 accacacttgtagcaaacaatctc 6606834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 242 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 18881072 - 18880863
Alignment:
Q  242 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctat 338  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | || || ||||| | |||||   |||| |||||||||||||| ||| | ||||||||  ||| |    
T  18881072 acaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatttttgcaggagcatccttcttcttaggccgtctatcttcgaccattctctgt 18880973  T
Q  339 ttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcct 438  Q
    || || || |||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||   ||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||    
T  18880972 ttgcccttatcagtaggggcactgtaaggcttagggcgactctgctgacccttagtcttccgctcattcactatcttgtaatgagccttagtatcctcct 18880873  T
Q  439 catagatcct 448  Q
    |||| |||||    
T  18880872 cataaatcct 18880863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 242 - 448
Target Start/End: Original strand, 19981333 - 19981542
Alignment:
Q  242 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctat 338  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| ||||   |||| |||||| | || |||||| | ||||||||| |||||    
T  19981333 acaagcattgctcttgtggcctttctcaccacaattaaagaagacaatctcagcaggaacatccttcttccttggtcgcctatcttcgaccatcctctat 19981432  T
Q  339 ttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcct 438  Q
    || || || ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||| |||||   ||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  19981433 ttgcccttatcagcaggggcgctataaggcttagggcgactctgctggcccttagtcttccactcattcacgaccttgtaatgagccttggtatcctcct 19981532  T
Q  439 catagatcct 448  Q
    | || |||||    
T  19981533 cgtaaatcct 19981542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 242 - 511
Target Start/End: Original strand, 15536749 - 15537021
Alignment:
Q  242 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctc---tgcagcatctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctat 338  Q
    |||||||||||||||||||||||  || |||||||| || || | ||||||    | |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  |||      
T  15536749 acaaacattactcttgtggccttcttcgccacaattaaaacaaataatctccgaaggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgc 15536848  T
Q  339 ttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcct 438  Q
    || || || || ||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||  |||| ||||    
T  15536849 ttgcccttatcggcaggggcactataaggcttagggcgactctgctggcccttggtcttccgctcattcacaaccttgtaatgagccttactatcttcct 15536948  T
Q  439 catagatcctacagctgttaaccaaatctggaaaaactctcagccgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 511  Q
    | |||||||| ||||| || || ||||| || |||||||  ||  |||| || || |||||||||||||||||    
T  15536949 cgtagatcctgcagctattcactaaatcagggaaaactcgaagttgttggtatccgatcgccctcttgatgtc 15537021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 242 - 448
Target Start/End: Original strand, 21671881 - 21672090
Alignment:
Q  242 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctat 338  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||  |||   ||||||||||  |||  |||||| |||| |||||  ||| |    
T  21671881 acaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtatagcagacaatctcaacaggagcatctttctttctagagcgcctatcatctaccattctctgt 21671980  T
Q  339 ttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcct 438  Q
    || || || |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| | ||||||||| | |||||| |||| ||||| ||||||||    
T  21671981 ttacccttatcagcaggagcactgtaaggcttaggacgactctgctgacccttggcctttcgctcattcacaatcttgtaatgagtcttggcatcctcct 21672080  T
Q  439 catagatcct 448  Q
    |||| |||||    
T  21672081 cataaatcct 21672090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 242 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 21391276 - 21391067
Alignment:
Q  242 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctat 338  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||   || || |||||||| ||||   |||| |||||| | ||||| ||| | ||||||||  |||||    
T  21391276 acaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagaaaaacaaacaatctcagcaggagcatccttcttcctcggccgtctatcttcgaccattctctat 21391177  T
Q  339 ttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcct 438  Q
    || || || ||| || ||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||   ||||||||||||||| | |||||| |||||||| ||||||||||    
T  21391176 ttgcccttatcaacaagggcactataaggcttagggcgactctgctggcccttagtcttcctctcattcacgatcttgtaatgagccttagtatcctcct 21391077  T
Q  439 catagatcct 448  Q
    | || |||||    
T  21391076 cgtaaatcct 21391067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 242 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 21780602 - 21780393
Alignment:
Q  242 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctat 338  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||   || || |||||||| ||||   |||| |||||| | ||||| ||| | ||||||||  |||||    
T  21780602 acaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagaaaaacaaacaatctcagcaggagcatccttcttcctcggccgtctatcttcgaccattctctat 21780503  T
Q  339 ttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcct 438  Q
    || || || ||| || ||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||   ||||||||||||||| | |||||| |||||||| ||||||||||    
T  21780502 ttgcccttatcaacaagggcactataaggcttagggcgactctgctggcccttagtcttcctctcattcacgatcttgtaatgagccttagtatcctcct 21780403  T
Q  439 catagatcct 448  Q
    | || |||||    
T  21780402 cgtaaatcct 21780393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 242 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 22421308 - 22421099
Alignment:
Q  242 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgc---agcatctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctat 338  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||| ||||| ||  |   ||||||||||||| ||||||||||  |||| |||||  ||| |    
T  22421308 acaagcattacttttgtggcctttctcaccacaagtatagcagacaatatcaaccgaagcatctttcttcctaggccgcctctcatcaaccattctctgt 22421209  T
Q  339 ttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcct 438  Q
    || || || | |||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| || ||| | |||| ||||||||| | |||||| |||||||| ||||||||||    
T  22421208 ttgcccttattagcaggagcactgtaaggctttggacgactctgctgacctttgactttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttagtatcctcct 22421109  T
Q  439 catagatcct 448  Q
    |||| |||||    
T  22421108 cataaatcct 22421099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 242 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 21163945 - 21163721
Alignment:
Q  242 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctat 338  Q
    |||| |||| ||||||||| ||||||| |||||||| || || |||||||| ||||   |||| |||||| | || || ||| | ||||||||| ||| |    
T  21163945 acaagcattgctcttgtggtctttctcgccacaattaaaacagacaatctcagcaggagcatccttcttccttggtcgtctatcctcgaccatcctctgt 21163846  T
Q  339 ttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcct 438  Q
    || || || |||||||||||||| || |||||||| ||||| || || |||||   ||||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||    
T  21163845 ttgcccttatcagcaggggcactatagggcttagggcgactttgttggcccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcct 21163746  T
Q  439 catagatcctacagctgttaaccaa 463  Q
    |||| ||||| || ||||| |||||    
T  21163745 cataaatcctgcaactgttcaccaa 21163721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 28989255 - 28989399
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    || || ||||||||   |||||||||||| |||||  |    
T  28989255 tagcaattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctctgataagtcggtcctcattaggagtctgtgtaccagtcagagcaaacacctttccaccaat 28989354  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttc 145  Q
     |||  |||||| ||||  | |||||| |||||||||||||||||    
T  28989355 tctagtcttcttcggctcaggacactgtgaactgatatgaccttc 28989399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 242 - 448
Target Start/End: Original strand, 22523876 - 22524085
Alignment:
Q  242 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catctttcttcttaggccgcctaacatcgacca-tcttcta 337  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||| |||||| |  |||||||||||||  |||   ||||||||||| ||||||||||  ||||    | ||||       
T  22523876 acaagcattactcctgtggcctttctcgccacaagtatagcacacaatctcaacaggagcatctttcttcctaggccgcctctcatcattaactctttgt 22523975  T
Q  338 tttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcc 437  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| || | ||||||||| | |||||| |||||||| |||||||||    
T  22523976 tttccctta-tcagcaggggcactgtaaggctttggacgactctgctgacctttgccttttcgctcattcacaatcttgtaatgagccttagtatcctcc 22524074  T
Q  438 tcatagatcct 448  Q
    | ||| |||||    
T  22524075 ttataaatcct 22524085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 21982493 - 21982427
Alignment:
Q  106 ccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatc 172  Q
    |||||||||||| | | ||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||    
T  21982493 ccttcttaggcttcttgcactgcgaactaatatgaccttcttccttgcagttatagcaaactacatc 21982427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 21998979 - 21998913
Alignment:
Q  106 ccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatc 172  Q
    |||||||||||| | | ||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||    
T  21998979 ccttcttaggcttcttgcactgcgaactaatatgaccttcttccttgcagttatagcaaactacatc 21998913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 351 - 455
Target Start/End: Original strand, 3274583 - 3274687
Alignment:
Q  351 gcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctac 450  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| || || ||  || ||||||||||||  ||||| |||||  | ||||||||||||||||| || |    
T  3274583 gcaggagcactgtaaggctttggacgactttgctggcctttacctctcttctcattcactattttgtaatgagctcttgtatcctcctcatagattctgc 3274682  T
Q  451 agctg 455  Q
    |||||    
T  3274683 agctg 3274687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 420 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 17830204 - 17830113
Alignment:
Q  420 tgagccttggtatcctcctcatagatcctacagctgttaaccaaatctggaaaaactctcagccgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 511  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| || || ||||| || |||||||  ||| ||||||| || ||||| |||||||||||    
T  17830204 tgagcctttgtatcttcctcgtagatcctgcagctattcactaaatcagggaaaactcggagctgttgatatccgatcgcactcttgatgtc 17830113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 106 - 172
Target Start/End: Original strand, 21329801 - 21329867
Alignment:
Q  106 ccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatc 172  Q
    |||| ||||||| | | |||| |||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  21329801 ccttattaggcttcttgcactacgaactaatatgaccttcttccttacagttatagcaaactacatc 21329867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 2)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 43 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 62946 - 62532
Alignment:
Q  43 taagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgacc 142  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  62946 taagtcggtcctcattcactgtttgcgtaccagtcaaagcaaacactttgccacctgtcctaactttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgacc 62847  T
Q  143 ttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgtcctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtca 242  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||||||||||  |||||    
T  62846 ttattcattacagttgtagaaaacaacatccccacgcttacaatcagctaaagtgtgtactttctgaccacacctaaagcacttcttctcatcatggtca 62747  T
Q  243 caaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctc---tgcagcatctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatt 339  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||| ||    | ||||||| || ||||||||| |||  ||||   ||   |||  |    
T  62746 catacattactcttgtggcctttctcaccacacttgaattaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttaggcctcctctcatcattcaatctctgct 62647  T
Q  340 tccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctc 439  Q
    | || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||  | | |||| |||  |||||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  62646 tacccttgtcagcaggggcactatacggcttcggacgactctgctgccccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagctttggtatcctcttc 62547  T
Q  440 atagatcctacagct 454  Q
    ||| ||||| |||||    
T  62546 atatatcctgcagct 62532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053; HSP #2
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 65514 - 65241
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||| | |||||||||    || |||||||||||  | ||| |||| || ||||| ||    
T  65514 tagcaattaaaggtgtactattaaagaaacaagtacctctgataagcctgtcctcattggtagtctgcgtaccagtcaatgcatacacttttccaccggt 65415  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgt 200  Q
    |||||||||||| ||||| || ||||| |||||||| || ||||| |||| ||| || || ||||||||||| |  | |||||||||||| || ||||||    
T  65414 cctaaccttctttggctgggtgcactgtgaactgatgtggccttcctcatcacaattataacaaacaacatctcctctcttacaattagccaacgtgtgt 65315  T
Q  201 cctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccaca 274  Q
    ||||||| ||  ||||| |||||||| |||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  65314 cctttctgaccacacctgaagcactttttctcatctttggtacaaacattactcttgtggcctttctcgccaca 65241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 2)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 255 - 511
Target Start/End: Original strand, 3766 - 4022
Alignment:
Q  255 ttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcagcag 354  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||||| |    
T  3766 ttgtggcctttcccaccacaattgaaacacacaatctctgtagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccatcctctgtttccctttatcagcgg 3865  T
Q  355 gggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctacagct 454  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| |||||    
T  3866 gggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttcgtatcctcttcataggtcctgcagct 3965  T
Q  455 gttaaccaaatctggaaaaactctcagccgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 511  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  3966 attaaccaaatccggaaaaactctcagctgttggtacccaatcgccctcttgatgtc 4022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 242 - 477
Target Start/End: Original strand, 17489 - 17727
Alignment:
Q  242 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctat 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||   |||| |||||||||||||||||| ||||||||||  | | |    
T  17489 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaaacagacaatctccgcaggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctatgt 17588  T
Q  339 ttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcct 438  Q
    || || || |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||   ||||| ||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||    
T  17589 ttgcccttatcagcaggggcactatagggcttagggcgactctgctggcccttagtcttccgctcattcacaaccgtgtaatgagccttggtatcctcct 17688  T
Q  439 catagatcctacagctgttaaccaaatctggaaaaactc 477  Q
    |||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  17689 cataaattctgcagctattaaccaaatcaggaaaaactc 17727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0523 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 3)
Name: scaffold0523
Description:

Target: scaffold0523; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 35 - 283
Target Start/End: Original strand, 5562 - 5810
Alignment:
Q  35 acctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactg 134  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5562 acctctgataagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagtcaacgcaaacactttgccacctgtcctaaccttcttaggttgcgtacactgcgaactg 5661  T
Q  135 atatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgtcctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcat 234  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||    
T  5662 atatgaccttcttcattacaattgtagcaaacaacatccccacgcttacaatcagctaaagtgtgtcctttctgaccacacctaaagcacttcttctcat 5761  T
Q  235 ctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagca 283  Q
    |||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5762 ctcgatcacacacgttactcttgtggcctttctcaccacacttgaagca 5810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0523; HSP #2
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 11959 - 11461
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |    ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| ||    
T  11959 tagcaattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctctgataagtcggtcctcactggtagtttgcgtaccagtcaaagcaaacaccttcccaccagt 11860  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgt 200  Q
     |||  |||||| || |  | |||||| | ||| |||||||||||| |||| |||||||| || ||||  |||| |||||| |  | ||||||| ||||     
T  11859 tctagtcttcttcggttcaggacactgtgtactaatatgaccttctccattgcagttgtaacagacaatgtccccacgcttgctttcagctaaactgtga 11760  T
Q  201 cctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctc---tgcag 297  Q
    || |||| ||  ||||| ||||||||| | |||||||   |||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||| | || ||||||||   ||  |    
T  11759 cccttctgaccacacctgaagcacttcctatcatctcttccacatacattactcttgtggcctttcttaccacacttgtatcatacaatctcatctggtg 11660  T
Q  298 catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgccctt 397  Q
    ||||| || |||| |||  |||| ||||  |||||||||  || |||||||||||| | ||| |||| |||||||||||| |||| |||||||| ||| |    
T  11659 catctctcctcttgggcttcctatcatcacccatcttctgctttcctttgtcagcaagagcaatgtaaggcttaggacgattctgttgtcccttacccct 11560  T
Q  398 cctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctacagctgttaaccaaatctggaaaaactctcagccgttgatacccaat 496  Q
    ||||||| ||| || |||||| ||||| ||||| || || ||||| |||||||| ||||||||||| || | ||| ||||| | | |||||||||||||    
T  11559 cctctcactcattatcttgtaatgagctttggtgtcttcttcataaatcctacacctgttaaccaactccgaaaagactctgatctgttgatacccaat 11461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0523; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 45
Target Start/End: Original strand, 2959 - 3003
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaa 45  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  2959 tagcaattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctcttgtaa 3003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0055 (Bit Score: 184; Significance: 2e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0055
Description:

Target: scaffold0055; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 252 - 511
Target Start/End: Original strand, 22586 - 22845
Alignment:
Q  252 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcag 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22586 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagtatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttgtcag 22685  T
Q  352 caggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctaca 451  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||| || |||||||| ||    
T  22686 cgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtctcttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccatcgtatcctcttcgtagatcctgca 22785  T
Q  452 gctgttaaccaaatctggaaaaactctcagccgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 511  Q
    ||| |||||||||||  |||||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||    
T  22786 gctattaaccaaatcctgaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 22845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0052 (Bit Score: 184; Significance: 2e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0052
Description:

Target: scaffold0052; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 252 - 511
Target Start/End: Original strand, 7575 - 7834
Alignment:
Q  252 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcag 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7575 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacacacaatctctgcagtatccttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctgtttccctttgtcag 7674  T
Q  352 caggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctaca 451  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||| || |||||||| ||    
T  7675 cgggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtctcttgcccttcctttcattcactaccttgtagtgagccatcgtatcctcttcgtagatcctgca 7774  T
Q  452 gctgttaaccaaatctggaaaaactctcagccgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 511  Q
    ||| |||||||||||  |||||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||    
T  7775 gctattaaccaaatcctgaaaaactctcagctgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 7834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 181; Significance: 1e-97; HSPs: 1)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 43635 - 43165
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  43635 tagcaattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctctgataagtcggtcctcattcactgtttgcgtaccagtcaaagcaaacaccttgccacctgt 43536  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgt 200  Q
    || ||||||||| |||| | | |||||||| || |||||||| ||||||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  43535 ccgaaccttcttgggcttcttgcactgcgagctaatatgaccctcttcatcacaattatagcaaacaacatccccacgcttacaatcagctaaagtgtgt 43436  T
Q  201 cctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctc---tgcag 297  Q
    |||||||  |  |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||| ||| ||||| || ||||||||    | ||    
T  43435 cctttctgtccacacctaaagcacttcttctcatctcgatcacacacattactcttgtggcccttttcacgacacttgaaacagacaatctcattaggag 43336  T
Q  298 catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgccctt 397  Q
    ||||| || ||||||||| |||  ||||   || | ||| ||| ||||||| || ||| ||||| ||| | || ||||||||||| |||||||| ||  |    
T  43335 catctctcctcttaggcctcctctcatcattcagcctctgtttacctttgttagaaggagcactatacagttttggacgactctgttgtcccttacctct 43236  T
Q  398 cctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctacagctgttaaccaaatctg 468  Q
     | |||| |||  |||||||| |||   ||||||||||| | ||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  43235 gcgctcactcatcaccttgtaatgacatttggtatcctcttaatatatcctacagctgcttaccaaatctg 43165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 176; Significance: 1e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 455
Target Start/End: Original strand, 51739 - 52196
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||  | |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||    
T  51739 tagcaattaaaggagtactattaaagaaataagtacctctgataagtcagtcctcattcacaatctgcgtaccagtcaaagtaaacaccttgccacctgt 51838  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgt 200  Q
    || ||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||| | | |||| |||| |||||||||||||    
T  51839 ccgaaccttctttggctgcgtacactgtgaactaatattaccttcttcatcacagttatagaaaacaacatcaccatgcttgcaataagctaaagtgtgt 51938  T
Q  201 cctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctc---tgcag 297  Q
    ||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||    | ||    
T  51939 cctttcttaccacacctaaagcacttcttctcatctcgatcacatacattactcttgtggcctttctcaccacacttgaaacagataatctcagtaggag 52038  T
Q  298 catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgccctt 397  Q
    ||||| || || |||||| |||  ||||   || | ||| ||| |||||||||||||| ||||| ||| | || ||||| |||||||||||||| ||  |    
T  52039 catctctcctcctaggcctcctctcatcattcagcctctgtttacctttgtcagcaggagcactatacagtttcggacggctctgctgtcccttacctct 52138  T
Q  398 cctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctacagctg 455  Q
     | |||| |||  || || || |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  52139 gcgctcactcatcactttataatgagcctttgtatcctcttcataaatcctacagctg 52196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1433 (Bit Score: 171; Significance: 1e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold1433
Description:

Target: scaffold1433; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 1527 - 1059
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |    || ||| | |||||  | || ||||| || ||||||||    
T  1527 tagcaattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctctgataagtcggtcctcactagtagtctgcatgccagtcaacgcgaacactttaccacctgt 1428  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgt 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||||    
T  1427 cctaaccttcttaggctgagtacactgcgaactgatatgaccttcctcattgcaagtgtagcaaacaatatccccacgcttacattcagctaaagtgtgt 1328  T
Q  201 cctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctc---tgcag 297  Q
    ||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || |  |||||    | ||    
T  1327 cctttctgaccacacctgaagcacttcttctcatctctatcacaagcattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaattatctcagtaggag 1228  T
Q  298 catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgccctt 397  Q
    ||||| || |||| |||| |||  ||||   || | ||| ||| || ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||  |    
T  1227 catctctcctcttgggcctcctctcatcattcagcctctgtttacccttgtcagcaggagcactgtatggcttcggacgactctgttgtcccttgcctct 1128  T
Q  398 cctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctacagctgttaaccaaatc 466  Q
     | |||| |||  |||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||    
T  1127 acgctcactcatcaccttgtaatgagctttcgtatcctcttcatagatcctacagctgcttaccaaatc 1059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404 (Bit Score: 171; Significance: 1e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0404
Description:

Target: scaffold0404; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 466
Target Start/End: Original strand, 7832 - 8300
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |    || ||| | |||||  | || ||||| || ||||||||    
T  7832 tagcaattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctctgataagtcggtcctcactagtagtctgcatgccagtcaacgcgaacactttaccacctgt 7931  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgt 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||||    
T  7932 cctaaccttcttaggctgagtacactgcgaactgatatgaccttcctcattgcaagtgtagcaaacaatatccccacgcttacattcagctaaagtgtgt 8031  T
Q  201 cctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctc---tgcag 297  Q
    ||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || |  |||||    | ||    
T  8032 cctttctgaccacacctgaagcacttcttctcatctctatcacaagcattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaattatctcagtaggag 8131  T
Q  298 catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgccctt 397  Q
    ||||| || |||| |||| |||  ||||   || | ||| ||| || ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||  |    
T  8132 catctctcctcttgggcctcctctcatcattcagcctctgtttacccttgtcagcaggagcactgtatggcttcggacgactctgttgtcccttgcctct 8231  T
Q  398 cctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctacagctgttaaccaaatc 466  Q
     | |||| |||  |||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||    
T  8232 acgctcactcatcaccttgtaatgagctttcgtatcctcttcatagatcctacagctgcttaccaaatc 8300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0431 (Bit Score: 170; Significance: 5e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0431
Description:

Target: scaffold0431; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 246 - 511
Target Start/End: Original strand, 10701 - 10965
Alignment:
Q  246 acattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctt 345  Q
    ||||| || |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  10701 acattgcttttgtggcctttcccaccacaattgaaacacacaatctcagtagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccatcttctgtttccctt 10800  T
Q  346 tgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagat 445  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10801 tatcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcccctcgttcactatcttgtagtgagccttggtatcctcttcatagat 10900  T
Q  446 cctacagctgttaaccaaatctggaaaaactctcagccgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 511  Q
    ||| ||||| || |||||||| || |||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||    
T  10901 cctgcagctattgaccaaatccgg-aaaactctaagctgttggtatccaatcgccctcttgatgtc 10965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1056 (Bit Score: 167; Significance: 3e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold1056
Description:

Target: scaffold1056; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Original strand, 1809 - 2090
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  1809 tagcaattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctttgataagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagtcaaagcaaacaccttgccacctgt 1908  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgt 200  Q
    || || |||||| |||| | | |||||||| || ||||| || ||||||| ||| || ||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||    
T  1909 ccgaaacttcttgggcttcttgcactgcgagctaatatgtccctcttcatcacaattatagcatacaacatccc-acgcttacaatcagctaaagtatgt 2007  T
Q  201 cctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagca 283  Q
    |||||||  |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2008 cctttctgtccacacctaaagcacttcttctcatctcggtcacacacattactcttgtggcctttctcaccacacttgaagca 2090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 167; Significance: 3e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 454
Target Start/End: Original strand, 34425 - 34881
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| || ||||||||||||||  | ||||||||||| ||||||||    
T  34425 tagcagttaaaggagtactattaaagaaacaagtacctctaataagtcggtcctcattaactgtttgcgtaccagtcaaggcaaacacctttccacctgt 34524  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgt 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| |||| ||||||||||| | |||| ||||||    
T  34525 cctaaccttcttcggctgcgtacactacgaactaatatgaccttcctcattgcagttataacaaacaacgtccccacgcttacaatcaactaatgtgtgt 34624  T
Q  201 cctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctc---tgcag 297  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||    | ||    
T  34625 cctttctaaccacacctgaagcacttcttctcatctctatcacagacattactcttgtggcctttctcaccacacttgaaacaaacaatgtcagtaggag 34724  T
Q  298 catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgccctt 397  Q
    ||||| || |||| |||| |||  ||||    | | | |  || || ||||||||||| ||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||  |    
T  34725 catctctcctcttgggcctcctctcatcatttaacctttgcttacccttgtcagcaggagcactatacagcttcggacgactctgctgtcccttgcctct 34824  T
Q  398 cctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctacagct 454  Q
     |  ||| |||  |||||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| |||||    
T  34825 gcgttcactcatcaccttgtaatgagcttttgtgtcctcctcataaatcctgcagct 34881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067 (Bit Score: 167; Significance: 3e-89; HSPs: 7)
Name: scaffold0067
Description:

Target: scaffold0067; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 466
Target Start/End: Original strand, 29712 - 30180
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| || || |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  29712 tagcaattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctctgataagtcggtcctcattaactgtctgcgtaccagtcaaagcaaacaccttaccacctgt 29811  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgt 200  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  | || ||||| |  |||| || |||||||| ||||| |||||||    
T  29812 cctaaccttcttcggttgcgtacactgcgaactgatatgaccttcctcattgcaaatataacaaacgatgtccccacacttacaatcagctagagtgtgt 29911  T
Q  201 cctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag--- 297  Q
    || || | ||  ||||| |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || || | ||       
T  29912 cccttttgaccacacctgaagcacttcttctcatctctatcacaaacgttactcttgtggcctttctcaccacacttgaagcaaactatgtcagtaggaa 30011  T
Q  298 catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgccctt 397  Q
    ||||| || |||| |||| |||  ||||    |   |||  || || ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||  |    
T  30012 catctctcctcttgggcctcctctcatcatttaaactctgcttacccttgtcagcaggagcactatacggcttcggacgactctgctgtcccttgcctct 30111  T
Q  398 cctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctacagctgttaaccaaatc 466  Q
     | |||| |||  |||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||||||||| | ||||||||    
T  30112 acgctcactcatcaccttgtaatgagctttcgtgtcctcctcataaatcctacagctgcttaccaaatc 30180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 64818 - 64545
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||    || ||||||||||   |||||||||| || | ||| ||    
T  64818 tagcaattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctctgataagacggtcctcattagtagtctgcgtaccagccaaagcaaacactttcctaccagt 64719  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgt 200  Q
     ||||||||||| || || || ||||| ||||| ||||| || ||||||| ||| || |||||||| ||||| | |||||| ||||||||||  ||||||    
T  64718 tctaaccttcttcggttgtgtgcactgtgaactaatatggccctcttcatcacaattatagcaaactacatcaccacgcttgcaattagctagtgtgtgt 64619  T
Q  201 cctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcat-ctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccaca 274  Q
    ||||||| ||  ||||| || || |||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  64618 cctttctgaccacacctgaaacatttcttctcatccttggt-acaaacattactcttgtggcctttctcgccaca 64545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #3
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 49396 - 49123
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||    || ||||||||||   |||||||||| || | ||| ||    
T  49396 tagcaattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctctgataagacggtcctcattagtagtctgcgtaccagccaaagcaaacactttcctaccagt 49297  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgt 200  Q
     ||||||||||| || || || ||||| ||||| ||||| || ||||||| ||| || |||||||| ||||| | |||||| ||||||||||  ||||||    
T  49296 tctaaccttcttcggttgtgtgcactgtgaactaatatggccctcttcatcacaattatagcaaactacatcaccacgcttgcaattagctagtgtgtgt 49197  T
Q  201 cctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcat-ctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccaca 274  Q
    ||||||| ||  ||||| || || |||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  49196 cctttctgaccacacctgaaacatttcttctcatccttggt-acaaacattactcttgtggcccttctcgccaca 49123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #4
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 58430 - 58157
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||    || ||||||||||   |||||||||| || | ||| ||    
T  58430 tagcaattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctctgataagacggtcctcattagtagtctgcgtaccagccaaagcaaacactttcctaccagt 58331  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgt 200  Q
     ||||||||||| || || || ||||| ||||| ||||| || ||||||| ||| || |||||||| ||||| | |||||| ||||||||||  ||||||    
T  58330 tctaaccttcttcggttgtgtgcactgtgaactaatatggccctcttcatcacaattatagcaaactacatcaccacgcttgcaattagctagtgtgtgt 58231  T
Q  201 cctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcat-ctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccaca 274  Q
    ||||||| ||  ||||| || || |||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  58230 cctttctgaccacacctgaaacatttcttctcatccttggt-acaaacattactcttgtggcccttctcgccaca 58157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #5
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 49049 - 49003
Alignment:
Q  345 ttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtccctt 391  Q
    |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  49049 ttgtcagccggggcactatacggtttaggacgactctgctgtccctt 49003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #6
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 58083 - 58037
Alignment:
Q  345 ttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtccctt 391  Q
    |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  58083 ttgtcagccggggcactatacggtttaggacgactctgctgtccctt 58037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #7
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 64471 - 64425
Alignment:
Q  345 ttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtccctt 391  Q
    |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  64471 ttgtcagccggggcactatacggtttaggacgactctgctgtccctt 64425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1517 (Bit Score: 164; Significance: 2e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold1517
Description:

Target: scaffold1517; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 1703 - 1246
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    || |||||||||||  | |||||||| || || || ||    
T  1703 tagcaattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctctgataagtcggtcctcattagtagtctgcgtaccagtcaatgcaaacactttccctccggt 1604  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgt 200  Q
    ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| || |||||| | |||||  ||||||    
T  1603 cctgaccttcttcggctgagtacactgcgaactgatatgaccttcttcattgcagttgtagcaaacaatgtccccacacttacattcagctagggtgtgt 1504  T
Q  201 cctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgc---ag 297  Q
    || |||||||  |||||||| || ||| || ||||||   ||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||| | || |||||||| ||   ||    
T  1503 cccttctaaccacacctaaaacatttcctcacatctctaccacaagcattgctcttgtggcctttttcaccacacttgtaacagacaatctcagcaggag 1404  T
Q  298 catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgccctt 397  Q
    ||||| || |||| |||| |||| ||||   ||| |||| ||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  |    
T  1403 catctctcctcttgggcctcctatcatcattcattttctgttttcccttgtcagcaggagcactgtaaggcttaggacgactctgctgtcccttacctct 1304  T
Q  398 cctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctacagctg 455  Q
    ||||||| |||  |||||||| ||||| || || || |||||||| ||||||||||||    
T  1303 cctctcactcatcaccttgtaatgagcttttgtgtcttcctcatatatcctacagctg 1246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 156; Significance: 1e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 37 - 451
Target Start/End: Original strand, 16761 - 17178
Alignment:
Q  37 ctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgat 136  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||   | | ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  16761 ctctgataagtcggtcctcattcacagtttgcataccagacaacgaaaataccttgccacctgtcctaaccttcttagtctgcgtacactgcgaactaat 16860  T
Q  137 atgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgtcctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcatct 236  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||| || ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  16861 atgtccttcctcattacagttgtagcaaacaatatccccacgcttgcaatcagccaatgtgtgtcctttctgaccacacctaaagcacttcttctcatct 16960  T
Q  237 cggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctc---tgcagcatctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatct 333  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || | ||||||    | ||||||| || ||||||||| |||  ||||   ||  |    
T  16961 cgatcacacacattactcttgtggcctttctctccacacttgaaacaaataatctcagtaggagcatctctcctcttaggcctcctctcatcattcagtt 17060  T
Q  334 tctatttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatc 433  Q
    |||  || || ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| || | |||| |||  |||||||| ||||| |||||||     
T  17061 tctgcttacccttgtcggcaggagcactatacggcttcggacgactctgttgtcccttgcctttgcgctcactcatcaccttgtaatgagctttggtatt 17160  T
Q  434 ctcctcatagatcctaca 451  Q
    ||| ||||| || |||||    
T  17161 ctcttcatatattctaca 17178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 156; Significance: 1e-82; HSPs: 4)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 39549 - 39093
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| |    ||||||||||||||   ||||||||| || ||||| ||    
T  39549 tagcaattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctctgataagtcgatcctcactagtggtttgcgtaccagtcagagcaaacactttaccaccggt 39450  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgt 200  Q
    |||||||||||| |  || |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||    
T  39449 cctaaccttcttcgattgtgtacactgcgaactgatacgaccttcctcattgcagttatagcaaacaacatctccccgcttacaattagctaatgtgtgt 39350  T
Q  201 cctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgc---ag 297  Q
    ||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||   ||    
T  39349 cctttctgaccacacctgaagcacttcttctcatctttatcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacacttgtagcaaacaatctcagcaggag 39250  T
Q  298 catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcc-ct 396  Q
    ||||| || |||| |||| |||  ||||   || | |||  || || ||||||||||| ||||| || || |||||| |||||||||||||||| || ||    
T  39249 catctctcctcttgggcctcctctcatcattcagcctctgctttcccttgtcagcaggagcactatatggtttaggaagactctgctgtcccttacctct 39150  T
Q  397 tcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctacagct 454  Q
    || | ||| |||  |||||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||    
T  39149 tcgt-tcactcatcaccttgtaatgagctttagtatcttcctcatatatcctgcagct 39093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 242 - 511
Target Start/End: Original strand, 14753 - 15025
Alignment:
Q  242 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctat 338  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||   |||| ||||||||||||||| || ||||||||||  ||| |    
T  14753 acaaacattactcttgtggccattctcgccacacttgaaacaaacaatctccgcaggagcatccttcttcttaggccgcatatcatcgaccattctctgt 14852  T
Q  339 ttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcct 438  Q
    || || || |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||| |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  14853 ttgcccttatcagcaggggcactataaggcttagggcgactctgctggcccttggtcttccgctcattcacaacctagtaatgagccttggtatcttcct 14952  T
Q  439 catagatcctacagctgttaaccaaatctggaaaaactctcagccgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 511  Q
    | ||||| || ||||| || || ||||| ||||||||||  | | |||| || || ||||||||||| |||||    
T  14953 cgtagattctgcagctattcactaaatcaggaaaaactcggatctgttggtatccgatcgccctcttaatgtc 15025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 348 - 442
Target Start/End: Original strand, 5353 - 5447
Alignment:
Q  348 tcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcata 442  Q
    |||||||| |||| ||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  5353 tcagcaggagcaccgtaaggctttggacgactttgctgacccttgcctttcctctcattcacaaccttgtaatgagccttagtatcttcctcata 5447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 242 - 292
Target Start/End: Original strand, 5244 - 5294
Alignment:
Q  242 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctc 292  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||| || |||| ||||||||    
T  5244 acaagcattactcttatggcctttctcaccacaagtgtagcaaacaatctc 5294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 154; Significance: 2e-81; HSPs: 4)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 298 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 107693 - 107480
Alignment:
Q  298 catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgccctt 397  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  107693 catctttcttcttaggccgcctatcatcgaccatcttctgtttccctttatcagcgggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttgccctt 107594  T
Q  398 cctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctacagctgttaaccaaatctggaaaaactctcagccgttgatacccaatc 497  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  107593 cctctcattcactatctcgtagtgagccttcgtatcctcttcatagatcctgcagctattaaccaaatccggaaaaactctcagctgttggtacccaatc 107494  T
Q  498 gccctcttgatgtc 511  Q
     |||||||||||||    
T  107493 tccctcttgatgtc 107480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Original strand, 115650 - 115932
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    |||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| ||||||  || |||||    |||||| ||||||   | |||||||| || ||||| ||    
T  115650 tagcaattaaagggatactattaaagaaacaagtacctctgataagtctatcttcatttgtggtttgcataccagccaaggcaaacactttcccaccggt 115749  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgt 200  Q
    |||||||||||| || || || ||||| |||||||||||||| ||  |||| || || ||||| || | ||| | |||||| |||| ||||||   |||     
T  115750 cctaaccttcttcggttgagtgcactgagaactgatatgaccctccccattgcaattatagcatactatatcaccacgcttgcaatcagctaacacgtga 115849  T
Q  201 cctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagca 283  Q
    || ||||  |  ||||| ||||||||||||||||||  |  |||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||    
T  115850 cccttctgtccacacctgaagcacttcttctcatctttggtacaaacattacttttgtggcctttctcgccacacttaaagca 115932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #3
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 242 - 442
Target Start/End: Original strand, 8543 - 8746
Alignment:
Q  242 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgca---gcatctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctat 338  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| || || | |||||| |||   || || |||||||| ||||| ||| | ||||||||| ||| |    
T  8543 acaagcattgctcttgtggcctttctcgccacaattaaaacagataatctcagcaagagcgtccttcttctttggccgtctatcctcgaccatcctctgt 8642  T
Q  339 ttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcct 438  Q
    || || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| || |||||   ||||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||| ||||    
T  8643 ttgcccttatcagcaggggcactatagggcttagggcgactctgttggcccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcatcct 8742  T
Q  439 cata 442  Q
    ||||    
T  8743 cata 8746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #4
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 94110 - 93969
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||    || |||||||||||  ||||||| || || || || ||    
T  94110 tagcaattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctctgataagtcgatcctcattagtagtctgcgtaccagtcaaagcaaatacttttcctccagt 94011  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgacc 142  Q
    ||| ||||||||||| || || ||||||||||| || |||||    
T  94010 cctgaccttcttaggttgagtgcactgcgaactaatgtgacc 93969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118 (Bit Score: 152; Significance: 3e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0118
Description:

Target: scaffold0118; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 463
Target Start/End: Original strand, 549 - 1014
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    || |||||||||||  | |||||||||||||| || ||    
T  549 tagcaattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctctgataagtcggtcctcattggtagtctgcgtaccagtcaatgcaaacaccttgcccccagt 648  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgt 200  Q
     ||||||||||| || |  | |||||| ||||| |||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||  |||| ||||||||| | ||||||| ||||     
T  649 tctaaccttcttcggttcaggacactgtgaacttatatgaccctctccattgcagttgtagcagacaatgtccccacgcttacattcagctaaattgtga 748  T
Q  201 cctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctc---tgcag 297  Q
    || |||| ||  ||||| ||||||||| ||||||||    |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| | || ||||||||    | ||    
T  749 cccttctgaccgcacctgaagcacttcctctcatctttaccacaaacattgctcttgtggcctttttcaccacacttgtaacaaacaatctcagaaggag 848  T
Q  298 catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgccctt 397  Q
    ||||| || ||||||||| |||| |||| | || |||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| |    
T  849 catctctcctcttaggcctcctatcatcaatcaacttctactttcctttgtcagcaggagcactgtaaggcttaggacgattctgctgtcccttacccct 948  T
Q  398 cctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctacagctgttaaccaa 463  Q
    ||||||| ||| || |||||| ||||| ||||| || || ||||| || || || |||||||||||    
T  949 cctctcactcattatcttgtaatgagctttggtgtcttcttcataaattctgcatctgttaaccaa 1014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 152; Significance: 3e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 1099 - 808
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||    ||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||| ||    
T  1099 tagcaattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctctgataagtctgtcctcattagttgtttgcgtaccggtcaaagcaaacaccttaccaccagt 1000  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgt 200  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||  ||||||  |||| ||||||||||| ||||| ||||| |    
T  999 cctaaccttcttcggttgcgtacactgcgaactgatatgaccttcctcattgcagttataataaacaatgtccccacgcttacaatcagctagagtgtat 900  T
Q  201 cctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctc 292  Q
    ||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  899 cctttctgaccacacctgaagcacttcttctcatctctatcacaaacgttactcttgtggcctttttcaccacacttgaagcaaacaatctc 808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 150; Significance: 5e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Original strand, 12048 - 12301
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||    
T  12048 tagcaattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctctgataagtcggtcctcattcacagtttgcgtaccagtcaacgcaaataccttgccacctgt 12147  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgt 200  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| |||| ||| || ||||||    
T  12148 ccgaaccttcttaggctgcgtacactgtgaactaatatgtccttcttcattacagttgtagcaaacaatatccccacacttgcaatcagccaatgtgtgt 12247  T
Q  201 cctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactc 254  Q
    |||||||  |  || || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12248 cctttctgtccacatctgaaacacttcttctcatctcggtcacatacattactc 12301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0259 (Bit Score: 146; Significance: 1e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0259
Description:

Target: scaffold0259; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 246 - 511
Target Start/End: Original strand, 8591 - 8856
Alignment:
Q  246 acattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctt 345  Q
    ||||| || ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||    
T  8591 acattgcttttgtggcctctcccaccacaattgaaacacacaatctcggtagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccatcctctgtttccctt 8690  T
Q  346 tgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagat 445  Q
    | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  8691 tatcagttggggcactgtacggcttaggacgactctgatgtcccttgcccttcctctcgttcacaatcttatagtgagccttagtatcttcttcatagat 8790  T
Q  446 cctacagctgttaaccaaatctggaaaaactctcagccgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 511  Q
    ||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||| |||| || |||||||||||||| |||||    
T  8791 cctgcagctattgaccaaatctggaaaaactctaagctgttggtatccaatcgccctcttaatgtc 8856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 146; Significance: 1e-76; HSPs: 3)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 242 - 511
Target Start/End: Original strand, 41484 - 41753
Alignment:
Q  242 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttc 341  Q
    ||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||    
T  41484 acaaacattgcttttgtggcctttcccaccacaattgaaacacacaatctcagtagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgtttc 41583  T
Q  342 cctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcat 441  Q
    ||||| | |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  41584 cctttattagcaggggcaatgtacggcttaggacaactctgctgtccattgcccttcctctcgttcacaatcttatagtgagccttggtattctcttcat 41683  T
Q  442 agatcctacagctgttaaccaaatctggaaaaactctcagccgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 511  Q
    ||||||| ||||| || |||||||  ||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||    
T  41684 agatcctgcagctattgaccaaattcggaaaaactctaagctgttggtatccaatcgccctcttgatgtc 41753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 242 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 13099 - 12884
Alignment:
Q  242 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctat 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| || ||||| || ||||   |||| |||||||| |||  |||| ||||||||||  |||      
T  13099 acaaacattactcttgtggcctttcccgccacagttgaaacaaacaatatccgcaggagcatccttcttctttggcttcctatcatcgaccattctctgc 13000  T
Q  339 ttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcct 438  Q
    || || || || ||||||||||| || || ||||| ||||||||||| | ||||  |||| ||||||| || | |||||| ||||| ||| ||||||| |    
T  12999 ttgcccttatctgcaggggcactataaggtttagggcgactctgctggctcttggtcttcttctcattaacaatcttgtaatgagctttgatatcctctt 12900  T
Q  439 catagatcctacagct 454  Q
    |||||||||| |||||    
T  12899 catagatcctgcagct 12884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 109 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 13232 - 13149
Alignment:
Q  109 tcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagcta 192  Q
    ||||||||||||| || |||||||  || ||||| ||||||||||||||| |||| |||| |||  ||||||| |||| |||||    
T  13232 tcttaggctgcgtgcattgcgaaccaatgtgaccctcttcattacagttgaagcacacaatatcattacgcttgcaatcagcta 13149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1426 (Bit Score: 144; Significance: 2e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold1426
Description:

Target: scaffold1426; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 1823 - 1358
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    || |||||||||||  | |||||||| ||||| || ||    
T  1823 tagcaattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctctgataagtcggtcctcattggtagtctgcgtaccagtcaatgcaaacactttgcccccagt 1724  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgt 200  Q
     ||||||||||| || |  | |||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| | ||  |||| |||||| || | ||||||| |||||    
T  1723 tctaaccttcttcggttcgggacactgtgaactgatatgaccctctccattgcagttgtagcagataatgtccccacgcttgcattcagctaaactgtgt 1624  T
Q  201 cctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctc---tgcag 297  Q
    || |||| ||  ||||| ||||||||| ||||||||    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | || ||||||||    | ||    
T  1623 cccttctgaccacacctgaagcacttcctctcatctttaccacaaacattactcttgtgtcctttctcaccacacttgtaacaaacaatctcagaaggag 1524  T
Q  298 catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgccctt 397  Q
    ||||| || ||||||||| |||| ||||   ||||||||  || |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||| |    
T  1523 catctctcctcttaggcctcctatcatcactcatcttctgctttcctttgtcagcaggagcactgtaaggcttatgacgattctgctgtcccttacccct 1424  T
Q  398 cctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctacagctgttaaccaa 463  Q
    ||||||| ||| ||  ||||| ||||| ||||| || || ||||| || ||||| |||||||||||    
T  1423 cctctcactcattatgttgtaatgagctttggtgtcttcttcataaattctacacctgttaaccaa 1358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310 (Bit Score: 144; Significance: 2e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0310
Description:

Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 463
Target Start/End: Original strand, 11065 - 11530
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |  || |||||||||||  | ||||||||||| || || ||    
T  11065 tagcaattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctctgataagtcggtcctcattaatagtctgcgtaccagtcaacgcaaacaccttccctccggt 11164  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgt 200  Q
    |||| ||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||  |||| ||||||||| | |||||  | ||||    
T  11165 cctagccttcttcggctgagtacactgtgagctgatatgaccctcttcattgcagttgtagcagacaatgtccccacgcttacattcagctagtgcgtgt 11264  T
Q  201 cctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctc---tgcag 297  Q
    || |||| ||  ||||| ||||||||| |||||||||   ||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||| | || ||||||||    | ||    
T  11265 cccttctgaccacacctgaagcacttcctctcatctctaccacaagcattgctcttgtggcctttttcaccacacttgtaacaaacaatctcagaaggag 11364  T
Q  298 catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgccctt 397  Q
    ||||| || ||||||| | |||| ||||   ||   |||  || |||||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||| ||||| ||| |    
T  11365 catctctcctcttaggactcctatcatcattcaaaatctgctttcctttgtcagcaggagcactataaggcttaggacgaatctgctgacccttacccct 11464  T
Q  398 cctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctacagctgttaaccaa 463  Q
    ||||||| ||| || |||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  11465 cctctcactcattatcttgtaatgagctttggtgtcttcctcataaatcctgcagctgtttaccaa 11530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 143; Significance: 7e-75; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 454
Target Start/End: Original strand, 176076 - 176531
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| |||||||||| | ||| || ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  176076 tagcaattaaaggagtactataaa-gaaataagtacctctgataagtcggtctttattaacagtttgcgtaccagtcaaagcaaacaccttgccacctgt 176174  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgt 200  Q
    |  | |||||| | ||| | | |||||||| || |||||||||||||||| ||| || |||||||||||||| | |||||| |||| |||||| ||||||    
T  176175 cagagccttctaaagcttcctgcactgcgagctaatatgaccttcttcatcacaattatagcaaacaacatcaccacgcttgcaatcagctaatgtgtgt 176274  T
Q  201 cctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctct---gcag 297  Q
    |||||||  |  |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||   | ||    
T  176275 cctttctttccacacctaaaacacttcttctcatcacggtcacatacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaaacagacaatctctgtaggag 176374  T
Q  298 catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgccctt 397  Q
    ||||| || || |||||| |||  ||||   ||   ||| |||  ||||||  ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||  |    
T  176375 catctctcctcctaggcctcctctcatcattcagtctctgtttaactttgttggcaggagcactatacggtttcggacgactctgctgtcccttacctct 176474  T
Q  398 cctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctacagct 454  Q
     | |||| |||  ||||| || ||||| || |||||||| |||||||||||||||||    
T  176475 acgctcactcatcaccttataatgagcttttgtatcctcttcatagatcctacagct 176531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 98799 - 98342
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||| |    ||||| ||||||||   |||||||||||| ||||| ||    
T  98799 tagcaattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctttgataagtcggtcctcactagtggtttgtgtaccagtcagagcaaacaccttaccaccagt 98700  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgt 200  Q
    |||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || ||||| || ||||| || || |||||||| | |||||| |||| ||||| |||||||    
T  98699 cctaaccttcttcggctgtgtgcactgcgaactgatatggccctcttcgttgcagttataacatacaacatcaccacgcttgcaatcagctagagtgtgt 98600  T
Q  201 cctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgc---ag 297  Q
    ||||||| ||  ||||| || |||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | || || ||||| ||   ||    
T  98599 cctttctgaccacacctgaaacacttcttctcatctttagtacaaacattactcttgtggcctttctcgccacacttgtaacaaacgatctcagcaggag 98500  T
Q  298 catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgccctt 397  Q
    ||||| ||  ||| |||| |||  ||||    | | |||  || || ||||||||| | ||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| ||  |    
T  98499 catctctccacttgggcctcctctcatcatttaacctctgcttacccttgtcagcatgagcactatatggcttcggacgactctgttgtcccttacctct 98400  T
Q  398 cctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctacagctg 455  Q
    ||| ||| ||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||| |||||||||||||    
T  98399 cctttcactcattaccttgtaatgagccttcgtatcctcttcattgatcctacagctg 98342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 140; Significance: 4e-73; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 514569 - 514104
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    || |||||||||||  | |||||||||||||| || ||    
T  514569 tagcaattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctctgataagtcggtcctcattggtagtctgcgtaccagtcaatgcaaacaccttgcccccagt 514470  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgt 200  Q
     ||||||||||| || |  | |||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||  |||| || |||||| | || |||  |||||    
T  514469 tctaaccttcttcggttcaggacactgtgaactgatatgaccctctccattgcagttgtagcagacaatgtccccacacttacattcagttaagctgtgt 514370  T
Q  201 cctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctc---tgcag 297  Q
    || |||| ||  ||||| ||||||||| |||| |||    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| | || ||||||||    | ||    
T  514369 cccttctgaccacacctgaagcacttcctctcgtctttaccacaaacattgctcttgtggcctttctcaccacacttgtaacaaacaatctcagaaggag 514270  T
Q  298 catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgccctt 397  Q
    ||||| || ||||||||| |||| ||||   ||||||||  || |||||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||||||||| ||| |    
T  514269 catctctcctcttaggcctcctatcatcattcatcttcttctttcctttgtcagcaggagcactttaaggcttaggacgattctgctgtcccttacccct 514170  T
Q  398 cctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctacagctgttaaccaa 463  Q
    ||||||| ||| || |||||| ||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| |||||    
T  514169 cctctcactcattatcttgtaatgagctttggtgtcttcttcataaattctacacctgtttaccaa 514104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 168210 - 168146
Alignment:
Q  108 ttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatc 172  Q
    |||||||||| | | ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  168210 ttcttaggcttctttcactgcgaactaatatgaccttcttccttacagttatagcaaactacatc 168146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1032 (Bit Score: 139; Significance: 2e-72; HSPs: 2)
Name: scaffold1032
Description:

Target: scaffold1032; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 1031 - 749
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || |||||| |||||||||    ||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||| ||    
T  1031 tagcaattaagggagtactattaaagaaacaagtacctttgataagtctgtcctcattagttgtttgcgtaccggtcaaagcaaacaccttaccaccagt 932  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgt 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||||  |||| ||||||||||| |||||  ||||||    
T  931 cctaaccttctttggctgcgtacactgcgaactgatatgtccttcctcgttgcagttataacaaacaatgtccccacgcttacaatcagctagtgtgtgt 832  T
Q  201 cctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagca 283  Q
    || |||| ||  ||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  831 cccttctgaccacacctgaagcacttcttctcatctctatcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaagca 749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1032; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 339 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 690 - 635
Alignment:
Q  339 ttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcc 394  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  690 ttccccttgtcggcaggagcactatacggcttcggacgactttgctgtcccttgcc 635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 139; Significance: 2e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Original strand, 37027 - 37309
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||| ||| |||||    ||||||||||| ||  ||| ||||||||| ||||| ||    
T  37027 tagcaattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctatgataagtctgtcttcattagttgtttgcgtaccggtcaaagaaaacaccttaccaccagt 37126  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgt 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||| || |||||||| |||||  ||||||    
T  37127 cctaaccttcttcggctgcgtacactgtgaactgatatgaccttcctcattgcagttatagcaaacaatatccccacacttacaatcagctagtgtgtgt 37226  T
Q  201 cctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagca 283  Q
    || |||| ||  ||||| ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  37227 cccttctgaccacacctgaagcacttcttctcatctttatcacaaacattactcttgtggcctttctcgccacacttgaagca 37309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 139; Significance: 2e-72; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 242 - 511
Target Start/End: Original strand, 424637 - 424909
Alignment:
Q  242 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctat 338  Q
    ||||||||| || |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| | ||   || | |||||| ||||||||||| |||||||||| || | |    
T  424637 acaaacattgcttttgtggcctttcacaccacagttgaagcacacaatctcagtaggagcacccttcttcgtaggccgcctatcatcgaccatattttgt 424736  T
Q  339 ttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcct 438  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||    
T  424737 ttccctttatcagcaggggcattgtacggcttaggacgactatgctgtcccttgcccttccgctcattcaccatcttgtaatgagccttggtatcctcct 424836  T
Q  439 catagatcctacagctgttaaccaaatctggaaaaactctcagccgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 511  Q
    ||||||| || ||||| |||||||||||  |||||||||| | | ||||||| |||||||||||||| |||||    
T  424837 catagattctgcagctattaaccaaatccagaaaaactctaatctgttgatatccaatcgccctcttaatgtc 424909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 448
Target Start/End: Original strand, 203469 - 203919
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| | |||||||||    || |||||||||||  |||||||||| || ||||  ||    
T  203469 tagcaattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctctaataagcctgtcctcattagtagtctgcgtaccagtcaaagcaaacacttttccactagt 203568  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgt 200  Q
     ||||||||||| | ||| || ||||| | ||||||||| || ||||| |||||||| || || |||||||| | |  ||| ||||  ||||||  |||     
T  203569 tctaaccttcttcgactgtgtgcactgtgtactgatatggccctcttcgttacagttataacatacaacatcaccatccttgcaatccgctaaaaggtga 203668  T
Q  201 cctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcat-ctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatct---ctgca 296  Q
    || |||| ||  ||||| |||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || || || ||||   | | |    
T  203669 cccttctgaccacacctgaagcacttcttctcatccttggt-acaaacattactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacaaactatctcaccagga 203767  T
Q  297 gcatctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgccct 396  Q
    |||||| || |    |||| |||  ||||   ||   |||  || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      
T  203768 gcatctctcctaacgggcctcctctcatcattcagtctctgcttacccttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttacctc 203867  T
Q  397 tcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcct 448  Q
    | | |||| |||  ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  203868 ttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcatagatcct 203919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 136; Significance: 1e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 451
Target Start/End: Original strand, 29615 - 30068
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||    
T  29615 tagcaattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctctgataagtcggtcctcattaacagtttgcgtaccagtcagagcaaacaccttgccacctgt 29714  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgt 200  Q
    |  | |||||||||||| | | |||||||| || |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | |||||| || | |||||  ||||||    
T  29715 cagagccttcttaggcttcctgcactgcgagctaatatgaccttcttcatcacaattgtagcaaacaacatcaccacgcttgcactcagctattgtgtgt 29814  T
Q  201 cctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctc---tgcag 297  Q
    ||||||   |  ||||  || ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||  | || |||||    | ||    
T  29815 cctttcgtcccacaccggaaacacttcttctcatcatggttacaaacattactcttgtggcccttttcaccacacttgaaatagactatctcaataggag 29914  T
Q  298 catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgccctt 397  Q
    ||||| || || |||||| |||  ||||   ||   |||  || |||||||||||||| |||||  |||| || |||||||||||||||||||||||  |    
T  29915 catctctcctcctaggcctcctctcatcattcagtctctgcttacctttgtcagcaggagcactagacggtttcggacgactctgctgtcccttgcctct 30014  T
Q  398 cctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctaca 451  Q
     | |||| |||  ||||| || |||||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  30015 acgctcactcatcaccttataatgagcctttgtatcctcttcatagattctaca 30068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 136; Significance: 1e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 30542 - 30085
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    || |||||||||||  | |||||||| || ||||| ||    
T  30542 tagcaattaaaggagtacttttaaagaaacaagtacctctgataagtcggtcctcatttgttgtctgcgtaccagtcaatgcaaacactttcccaccggt 30443  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgt 200  Q
    |||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||  |||| |  |||||| | |||||   |||||    
T  30442 cctagccttcttcggctgagtacacttcgaactgatatgaccttcttctttgcagttgtagcatacaatgtccccattcttacattcagctagtttgtgt 30343  T
Q  201 cctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag--- 297  Q
    ||||||| ||  |||||||| || ||| ||| |||||   ||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||  | || |||||||| ||||       
T  30342 cctttcttaccacacctaaaacatttcctcttatctctaccacaagcattgctcttgtggcctttttcaccacacttataacaaacaatctcagcaggag 30243  T
Q  298 catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgccctt 397  Q
    |||||||| |||| |||| |||  ||||   |||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||| |||| | |||||| ||| |    
T  30242 catctttcctcttgggcctcctgtcatcattcatcttctgtttccctttgtcagcaggagcactgtaaggtttaggacgattctgttatcccttacccct 30143  T
Q  398 cctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctacagctg 455  Q
    ||||||| ||| || || ||| ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||    
T  30142 cctctcactcattatctagtaatgagcttttgtgtcctcctcatatatcctgcagctg 30085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0041 (Bit Score: 136; Significance: 1e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0041
Description:

Target: scaffold0041; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 463
Target Start/End: Original strand, 41823 - 42288
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    || |||||||||||  ||||||||||||| || ||  |    
T  41823 tagcaattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctctgataagtcggtcctcattaggagtctgcgtaccagtcaaagcaaacacctttcccccaat 41922  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgt 200  Q
     |||  |||||| ||||  | |||||| |||||||||||||||||  |||| |||||||| || ||||  |||| |||||| || | ||||||| ||||     
T  41923 tctagtcttcttcggctcaggacactgtgaactgatatgaccttccccattgcagttgtaacagacaatgtccccacgcttgcattcagctaaactgtga 42022  T
Q  201 cctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatct---ctgcag 297  Q
    || |||| ||  ||||| ||||||||| | |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||   | | ||    
T  42023 cccttctgaccacacctgaagcacttcctatcatctcttccacaaacattactcttgtggcctttctcaccacacttgtagcaaacaatctcaacaggag 42122  T
Q  298 catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgccctt 397  Q
    ||||| || |||| |||| |||| ||||  |||||||||  || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| |||||||| ||| |    
T  42123 catctctcctcttgggcctcctatcatcacccatcttctgctttcctttgtcagcaggagcactgtaaggcttaggacgattctgttgtcccttacccct 42222  T
Q  398 cctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctacagctgttaaccaa 463  Q
    ||||||| |||  | ||| || ||||| ||||| || || |||||||| || || || ||||||||    
T  42223 cctctcactcataatcttataatgagctttggtgtcttcttcatagattctgcacctattaaccaa 42288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 132; Significance: 3e-68; HSPs: 4)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 2168 - 1775
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||    | |||| |    | ||||||||||||   ||||||||| || ||||| ||    
T  2168 tagcaattaaaggaatactattaaagaaacaagtacctctgataagcatcttctcactagtgggttgcgtaccagtcagagcaaacactttaccaccggt 2069  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgt 200  Q
    |||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| || |  |||||||||| |||||| ||||||    
T  2068 cctaaccttcttcggttgtgtacactgcgaactgatatgaccttcctcattgcagttatagcaaacaacgtctccccgcttacaatcagctaatgtgtgt 1969  T
Q  201 cctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgc---ag 297  Q
    ||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| || ||   ||    
T  1968 cctttctgaccacacctgaagcacttcttctcatctttatcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacacttgtagcaaacaatttcagcaggag 1869  T
Q  298 catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtccctt 391  Q
    ||||| || |||| |||| |||  ||||   || | ||| ||| |||||||||||||| ||||| || || |||||| ||||||||||||||||    
T  1868 catctatcctcttgggcctcctctcatcattcagcctctgttttcctttgtcagcaggagcactatatggtttaggatgactctgctgtccctt 1775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 252 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 122141 - 121913
Alignment:
Q  252 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgc---agcatctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgt 348  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||   |||||| ||   |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||| || || |    
T  122141 ctcttgtggcctttttcaccacaattgaaacaagtaatctcagctggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgtttgcccttat 122042  T
Q  349 cagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcct 448  Q
    ||||||||||||| || |||||||| |||||||  || |||||   | ||| |||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  122041 cagcaggggcactatagggcttagggcgactctattggcccttagtcgtccgctcatttacaaccttgtaatgagccttggtatcctcctcatagattct 121942  T
Q  449 acagctgttaaccaaatctggaaaaactc 477  Q
     ||||| || ||||| || ||||||||||    
T  121941 gcagctattcaccaactcaggaaaaactc 121913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 124 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 11999 - 11654
Alignment:
Q  124 actgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgtcctttctaacgtcacctaaagca 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||  |||| |||||||  || | |||||| |||| ||||| |||||||||||||| ||  ||||| |||||    
T  11999 actgcgaactgatatgaccttcttcgttccaaatgtaacaaacaatgtcaccacgcttgcaatcagctagagtgtgtcctttctgaccacacctgaagca 11900  T
Q  224 cttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctc---tgcagcatctttcttcttaggccgccta 320  Q
    |||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | || || |||||    | ||||||| || |||| |||| |||     
T  11899 cttcttctcatctttagtacaaacattactcttgtggcctttctcgccacacttgtaacaaacgatctcagtaggagcatctctcctcttgggcctcctc 11800  T
Q  321 acatcgaccatcttctatttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagt 420  Q
     ||||    |   |||  || |||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||  | |||||| |||  ||||| || |    
T  11799 tcatcattaagtctctgctttcctttgtcagcaggagcactatatggtttaggacgactctgctgtcccttacctcttctctcactcatcaccttataat 11700  T
Q  421 gagccttggtatcctcctcatagatcctacagctgttaaccaaatc 466  Q
    ||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||| | ||||||||    
T  11699 gagccttagtgtcctcttcatatatcctgcagctgcttaccaaatc 11654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #4
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Original strand, 70460 - 70640
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||    || |||||||||||  || |||| || || || || ||    
T  70460 tagcaattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctctgataagtcgatcctcattggtagtctgcgtaccagtcaaaacaaatacttttcctccagt 70559  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgctt 181  Q
     || ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || || || ||||||||||| || ||||||| ||| | ||||||    
T  70560 tctgaccttcttaggttgcgtgcactgtgaactaatgtggccctcctcattacagttataacaaacaatatctccacgctt 70640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 131; Significance: 1e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 9237 - 8947
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| |    ||||||||||||||   ||||||||| || ||||| ||    
T  9237 tagcaattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctctgataagtcgatcctcactagtggtttgcgtaccagtcagagcaaacacattaccaccggt 9138  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgt 200  Q
    |||||||||||| |  || |||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||    
T  9137 cctaaccttcttcgtttgtgtacactgcgaattgatttgaccttcctcattgcagttatagcaaacaacatctccccgcttacaattagctaatgtgtgt 9038  T
Q  201 cctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatct 291  Q
    ||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||| |||||||    
T  9037 cctttctgaccacacctgaagcacttcttctcatccttatcacagacattactcttgtggcttttctcaccacacttgtagcaaacaatct 8947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 129; Significance: 2e-66; HSPs: 3)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 255 - 511
Target Start/End: Original strand, 21339 - 21578
Alignment:
Q  255 ttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcagcag 354  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||                 ||    
T  21339 ttgtggcctttcccaccacaattgaaacacacaatctcagtagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccatcttc-----------------ag 21421  T
Q  355 gggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctacagct 454  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  21422 gggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgctcttcctctcgttcactatcttgtagtgagccttggtatcctcttcatagatcctgcagct 21521  T
Q  455 gttaaccaaatctggaaaaactctcagccgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 511  Q
     || |||||||| ||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||    
T  21522 attgaccaaatccggaaaaactctaagctgttggtatccaatcgccctcttgatgtc 21578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 242 - 511
Target Start/End: Original strand, 55333 - 55602
Alignment:
Q  242 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttc 341  Q
    |||| |||| ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| || | | |||| |||||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||    
T  55333 acaaccattgctcttgtggccttttccaccacagttgaagcacacaatttcagaaacatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgtttc 55432  T
Q  342 cctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcat 441  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| | |||||| |||||||| ||||| ||||| |    
T  55433 cctttatcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcctttgcccttcttctcattcaccatcttgtaatgagccttagtatcttcctcgt 55532  T
Q  442 agatcctacagctgttaaccaaatctggaaaaactctcagccgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 511  Q
    |||| || ||||| ||||||||||| |||||||  || | | || ||| ||||||||||||||| |||||    
T  55533 agattctgcagctattaaccaaatccggaaaaatcctaatctgtcgatgcccaatcgccctcttaatgtc 55602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 255 - 511
Target Start/End: Original strand, 11811 - 12050
Alignment:
Q  255 ttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcagcag 354  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||                 ||    
T  11811 ttgtggcctttcccaccacaattgaaacacacaatctcagtagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccatcttc-----------------ag 11893  T
Q  355 gggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctacagct 454  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  11894 gggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgctcttcctctcgttcactatcttgtagtgagccttggtatcctcttcatagatcctgcagct 11993  T
Q  455 gttaaccaaatctggaaaaactctcagccgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 511  Q
     || |||||||| ||||||||||| | | |||| || ||||||||||||||||||||    
T  11994 attgaccaaatccggaaaaactctaatctgttggtatccaatcgccctcttgatgtc 12050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0789 (Bit Score: 123; Significance: 6e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0789
Description:

Target: scaffold0789; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 242 - 510
Target Start/End: Original strand, 267 - 524
Alignment:
Q  242 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttc 341  Q
    ||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| || | |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||    
T  267 acaaacattgcttttgtggcctttcccaccataattgaaacacacaatttcagtagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccatcctctgtttc 366  T
Q  342 cctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcat 441  Q
    ||||  ||||||           ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  367 ccttcatcagca-----------cggcttaggacgactctgctgccccttgcccttcctctcgttcactatcttgtagtgagccttagtatcctcttcat 455  T
Q  442 agatcctacagctgttaaccaaatctggaaaaactctcagccgttgatacccaatcgccctcttgatgt 510  Q
    ||||||||||| | || |||||||||||||||||||| ||| |||| || |||||||||||||| ||||    
T  456 agatcctacagatattgaccaaatctggaaaaactctaagctgttggtatccaatcgccctcttaatgt 524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 121; Significance: 9e-62; HSPs: 3)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Original strand, 325795 - 326091
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| |    ||||||||||||||  |||||||||| || ||||| ||    
T  325795 tagcaattaaaggagtaatattaaagaaacaagtacctctgataagtcgatcctcactagtggtttgcgtaccagtcaaagcaaacactttaccaccggt 325894  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgt 200  Q
     ||||||||||| || || || ||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| || ||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||    
T  325895 tctaaccttctttggttgtgtgcactgtgaactgatatggccctcttcattgcagttataacaaacaacatctccccgcttacaattagctaatgtgtgt 325994  T
Q  201 cctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag 297  Q
    ||||||| ||  ||| | ||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||| |||||||| ||||    
T  325995 cctttctgaccacacttgaagcacttcttctcatctttatcacagacattactcttgtggtctttctcgccacacttgtagcaaacaatctcagcag 326091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 200684 - 200402
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||         |||||| |||||||     
T  200684 tagcaattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctctgataagtcggtcctcattaaccgtctgcgtaccagt---------cacctttccacctgc 200594  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgt 200  Q
    |  |||| ||||||||| | | ||||||||||| | |||||||||||| | ||| ||| ||||||||| ||| | |||||| || |  ||||  || ||     
T  200593 ctgaaccctcttaggcttcttgcactgcgaactaagatgaccttcttcgtcacaattgaagcaaacaatatcaccacgcttgcattccgctatcgtatgc 200494  T
Q  201 cctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctc 292  Q
    |||||||  |  || |  ||||||||||||||||| |  |  |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||    
T  200493 cctttcttcccacatcggaagcacttcttctcatcaccattgcaaacattactcttgtggcccttctcaccacacttgtagcaaacaatctc 200402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 153 - 395
Target Start/End: Original strand, 319483 - 319728
Alignment:
Q  153 cagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgtcctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattac 252  Q
    ||||| || ||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||   ||||| |||||||    
T  319483 cagttataacaaacaacatctccccgcttacaattagctaatgtgtgtcctttctgaccacacctgaagcacttcttctcatctttatcacagacattac 319582  T
Q  253 tcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgc---agcatctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtc 349  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||| |||| |||||| | ||   ||||||| || | || |||| |||  ||||   || | |||  ||  | |||||    
T  319583 tcttgtggcctttctcgccacacttgtagcaaacaatcccagcaggagcatctctcctattgggcctcctctcatcattcagcctctgcttatccttgtc 319682  T
Q  350 agcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgccc 395  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  319683 agcaggagcactatacggcttcggacgactctgctgtcctttgccc 319728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0405 (Bit Score: 120; Significance: 4e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0405
Description:

Target: scaffold0405; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 391
Target Start/End: Original strand, 5690 - 6083
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  |||||||||| ||||||| ||    
T  5690 tagcaattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctctgataagtcggtcctcattcactgtttgcgtaccaattagagcaaacaccatgccaccggt 5789  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgt 200  Q
     | |||||||||||| | | | |||| ||| || || || || ||||||| ||| || || ||||||||||||| |||||| |||| |||||| ||||||    
T  5790 tcgaaccttcttaggtttcttgcactacgagctaatgtgtccctcttcatcacaattataacaaacaacatccccacgcttgcaatcagctaatgtgtgt 5889  T
Q  201 cctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag--- 297  Q
    |||||||  |  || || || |||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||| ||||   ||       
T  5890 cctttctgtccacatctgaaacacttcttcttatctcaatcacacacattactcttgtggcctttctcaccacacttgaaatagacagtctcattagggg 5989  T
Q  298 catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtccctt 391  Q
    ||||| || || |||||| |||  ||||   || | ||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| |||||    
T  5990 catctctcctcctaggcctcctctcatcattcagcatctgttttcctttgtcagcaggagcactatacggtttcggacgactctgctgaccctt 6083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 119; Significance: 1e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 67324 - 66856
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||    || ||| |||||||  | |||||||| || ||||| ||    
T  67324 tagcaattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctctgatgagtcggtcctcattggtagtctgcataccagtcaatgcaaacacttttccaccagt 67225  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgt 200  Q
     |||||| |||| ||||   |||| |||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||  |||| | ||||||| | |||||   |||||    
T  67224 tctaaccctcttcggctcactacattgcgaactaatatgaccttctccattgcagttgtagcagacaatgtccccaagcttacattcagctaggttgtgt 67125  T
Q  201 cctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag--- 297  Q
    || || | ||  ||||| || || ||| |||||| ||   |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||  | || |||||||| | ||       
T  67124 cccttttgaccacacctgaaacatttcctctcatgtctaccacaaacattgctcttgtggcctttttcaccacacttataacaaacaatctcggaaggag 67025  T
Q  298 catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgccctt 397  Q
    ||||| || |||| || | |||| ||||   |||| |||| || ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  67024 catctctcctcttgggtctcctatcatcattcatcatctactttcctttgtcaacaggagcactgtaaggcttaggacgattctgctgtcccttgcccct 66925  T
Q  398 cctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctacagctgttaaccaaatc 466  Q
    ||||||| ||| || |||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  66924 cctctcactcattatcttgtaatgagctttggtgtcttcctcataaatcctgcagctgtttaccaaatc 66856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 118; Significance: 6e-60; HSPs: 2)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 455
Target Start/End: Original strand, 251710 - 252164
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||    || |||||||||||  | |||||||| |  ||||| ||    
T  251710 tagcaattaaagaagtactattaaagaaacaagtacctctgataagccggtcctcattagtagtctgcgtaccagtccatgcaaacacttccccaccggt 251809  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgt 200  Q
    |||| |||||   ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||  || | ||||||||| | |||||  ||||||    
T  251810 cctagccttc---ggctgagtacactgtgaactgatatgaccttcttcgttgcagttttagcaaacaatgtctccacgcttacattcagctagtgtgtgt 251906  T
Q  201 cctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgc---ag 297  Q
    ||||||| ||  |||||||| || ||| |||||||||   ||||| |||  || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||  |   ||    
T  251907 cctttctgaccacacctaaaacatttcctctcatctctaccacaagcatagcttttgtggcctttttcaccacacttgaaacacacaatctcaacaagag 252006  T
Q  298 catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgccctt 397  Q
    ||||| || |||| |||| |||| ||||   |||||| | ||| ||| || ||||||| |||||||| || ||||||||| | || |||||||| ||| |    
T  252007 catctctcctcttgggcctcctatcatcattcatcttatgttttcctgtggcagcaggagcactgtaaggtttaggacgattatgttgtcccttacccct 252106  T
Q  398 cctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctacagctg 455  Q
    ||||||| |||  |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||    
T  252107 cctctcactcatcaccttgtaatgagctttggtgtcttcctcatatatcctgcagctg 252164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 242 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 229827 - 229589
Alignment:
Q  242 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctat 338  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||   |||| ||||| |||||||||||| ||||||||||  ||| |    
T  229827 acaaacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacaaacaatctccgcaggagcatccttcttattaggccgcctatcatcgaccattctctgt 229728  T
Q  339 ttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcct 438  Q
    || || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||  ||||   ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  229727 ttgcccttatcagcaggggcactatagggcttagggcgactctgctggtccttagtcttcctctcattcacaaccttgtaatgagccttggtatcctcct 229628  T
Q  439 catagatcctacagctgttaaccaaatctggaaaaactc 477  Q
    |||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  229627 cataaattctgcagctattaaccaaatcaggaaaaactc 229589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0706 (Bit Score: 117; Significance: 2e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0706
Description:

Target: scaffold0706; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 5425 - 5129
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| |    ||||||||||||||   ||||||||| || ||||| ||    
T  5425 tagcaattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctctgataagtcgatcctcagtagtggtttgcgtaccagtcagagcaaacactttaccaccggt 5326  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgt 200  Q
     ||||||||||| || |  |||||||  ||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||    
T  5325 tctaaccttcttcggttatgtacactatgaactgatatggccctcctcattgcagttatagcaaacaacatctctccgcttacaatcagctaaagtgtgt 5226  T
Q  201 cctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag 297  Q
    || |||| ||  ||||| |||||||||||||||||    ||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||| |||| |||||||| ||||    
T  5225 cccttctgaccacacctgaagcacttcttctcatccttatcacagacattactcttgtggcctttttcgccacacttgtagcaaacaatctcagcag 5129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0289 (Bit Score: 117; Significance: 2e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0289
Description:

Target: scaffold0289; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 242 - 505
Target Start/End: Original strand, 117 - 383
Alignment:
Q  242 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctat 338  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||   |||| |||||||||||||||||| ||||||||||  ||| |    
T  117 acaaacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacagacaatctctgcaggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgt 216  T
Q  339 ttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcct 438  Q
    || || || |||||||||||||| || |||||||| ||||||||| | |||||   ||||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  217 tttcccttatcagcaggggcactatagggcttagggcgactctgccggcccttagtcttccgctcattcacaaccttgtaatgagctttggtgtcctcct 316  T
Q  439 catagatcctacagctgttaaccaaatctggaaaaactctcagccgttgatacccaatcgccctctt 505  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||  | | ||||||| ||||| ||||||||    
T  317 catagattctacagctgttcaccaaattaggaaaaactcggatctgttgatatccaattgccctctt 383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2165 (Bit Score: 116; Significance: 9e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold2165
Description:

Target: scaffold2165; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 1019 - 554
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||    |  |||||||||||  | |||||||||||||| |  ||    
T  1019 tagcaattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctctgataagttggtcctcattggtagactgcgtaccagtcaatgcaaacaccttgcccctagt 920  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgt 200  Q
     ||||||||||| || |  | |||||||||||| |||||||| ||| |||| ||||| ||||| ||||  |||| ||||||||| | ||||||| |||||    
T  919 tctaaccttcttcggttcaggacactgcgaactaatatgaccctctccatttcagttatagcagacaatgtccccacgcttacattcagctaaactgtgt 820  T
Q  201 cctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctc---tgcag 297  Q
    || || | ||  ||||| ||||||||| |||| |||    |||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| | || ||||||||    | ||    
T  819 cccttttgaccacacctgaagcacttcctctcgtctttaccacaaacattgctcttgtggcctttctcaccaaacttgtaacaaacaatctcagaaggag 720  T
Q  298 catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgccctt 397  Q
    ||||| || ||||||||| |||| ||||   ||||||||  || |||||||||  ||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| |    
T  719 catctctcctcttaggcctcctatcatcattcatcttctgctttcctttgtcaataggagcactgtaaggcttaggacgattctgctgtcccttacccct 620  T
Q  398 cctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctacagctgttaaccaa 463  Q
    ||||| | ||| || |||||| | | | ||||| || || ||||| || ||||| |||||||||||    
T  619 cctctaactcattatcttgtaataaactttggtgtcttcttcataaattctacacctgttaaccaa 554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222 (Bit Score: 115; Significance: 3e-58; HSPs: 2)
Name: scaffold0222
Description:

Target: scaffold0222; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 442
Target Start/End: Original strand, 20902 - 21346
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| | |||||| |    ||||||||||||||   ||||||||| || ||||| ||    
T  20902 tagcaattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctctgataagtagatcctcaatagtggtttgcgtaccagtcagagcaaacactttaccaccggt 21001  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgt 200  Q
     ||||||||||| || || |||||||| ||||||||| | || || ||||| ||||| |||||||  |  || |  |||||||||| | |||| ||||||    
T  21002 tctaaccttcttcggttgtgtacactgtgaactgatacggccctcctcattgcagttatagcaaattatgtctccccgcttacaatcaactaatgtgtgt 21101  T
Q  201 cctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgc---ag 297  Q
    || ||||  |  ||||| ||||||||||||||| ||     ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||   ||    
T  21102 cccttctgtccacacctgaagcacttcttctcacctttagtacaaacattactcttgtggcctttctcaccacacttgtagcaaacaatctcagcagaag 21201  T
Q  298 catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgccctt 397  Q
    ||||| || |||| |||| |||  ||||   || | ||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  21202 catctctcctcttgggcctcctctcatcattcagcctctgttttcctttgtcagcaggggcactatacggtttaggacgactctactgtcccttgccttt 21301  T
Q  398 cctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcata 442  Q
     | |||| |||  |||||||| ||||| ||  |||| ||||||||    
T  21302 acgctcactcatcaccttgtaatgagctttcctatcttcctcata 21346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 703 - 250
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    || || ||||||||  | |||||||| || ||| | ||    
T  703 tagcaattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctctgataagtcggtcctcattagtagtctgtgtaccagtcaatgcaaacactttcccatcggt 604  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgt 200  Q
     ||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| | |||||| |||| |||||   |||||    
T  603 tctaaccttcttcggctgtgtgcactgtgaactgatatggccctcttcattgcagttatagcaaacaacatcaccacgcttgcaatcagctaggctgtgt 504  T
Q  201 cctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcat-ctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgc---a 296  Q
    ||||||| ||  ||||| || ||||||||||||| || ||| |||||||| ||||||||||||||||   ||||| ||| | || || ||||| ||   |    
T  503 cctttctgaccacacctgaaacacttcttctcatccttggt-acaaacatcactcttgtggcctttcctgccacatttgtaacaaacgatctcagcagga 405  T
Q  297 gcatctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcc-c 395  Q
    |||||| || | || |||| |||  ||||   ||   |||  || || |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| || |    
T  404 gcatctctcctattgggcctcctctcatcattcaatatctgctttcccttgtcagcaggggcactgtacggcttagggtgactctgttgtcccttacctc 305  T
Q  396 ttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctaca 451  Q
    ||| | ||| |||  ||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  304 ttcgt-tcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcgtagatcctaca 250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 114; Significance: 1e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 393
Target Start/End: Original strand, 8702 - 9097
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| |    || |||||||||||  | |||||||| || ||||| ||    
T  8702 tagcaattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctctgataagtcgatcctcactagtagtatgcgtaccagtcaatgcaaacactttcccaccggt 8801  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgt 200  Q
     ||||||||||| || || || ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||  || | |||||| |||| ||||| |||||||    
T  8802 actaaccttcttcggttgagtgcactgcgaactgatatggccttcttcgttgcagttgtagcaaacaatgtcaccacgcttgcaatcagctagagtgtgt 8901  T
Q  201 cctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatc---tctgcag 297  Q
    ||||||| ||  ||||| || |||||||||||||||     ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||  | || ||||||   || | ||    
T  8902 cctttctgaccacacctgaaacacttcttctcatctttagtacaaacattactcttgtggccattctcgccacacttataacaaacaatctcatcaggag 9001  T
Q  298 catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgc 393  Q
    ||||| || |||| || |  ||  ||||   || |||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  9002 catctctcctcttgggtcttctctcatcattcagcttctgcttccctttgtcagcaggagcactatacggcttcggacgactctgctgtcctttgc 9097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 113; Significance: 5e-57; HSPs: 2)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 9988 - 9700
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| |||||| |    ||||||||||||||   |||||||||||| ||||| ||    
T  9988 tagcaattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctttgataagtcgatcctcactagtggtttgcgtaccagtcagagcaaacaccttaccaccagt 9889  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgt 200  Q
    |||||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||| |  |||||||||| | |||  ||||||    
T  9888 cctaaccttcttcggttgcgtacattgtgaacttatatggccctcctcattgcagttatagcaaacaacatctccccgcttacaatcaactagggtgtgt 9789  T
Q  201 cctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaat 289  Q
    ||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| |||||    
T  9788 cctttctgaccacacctgaagcacttcttctcatccttatcacagacattactcttgtggcccttctcaccacacttgtagcaaacaat 9700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 242 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 23920 - 23711
Alignment:
Q  242 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgca---gcatctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctat 338  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  | || ||||||||  ||   | ||||||||||||||||| |||| |||| |||||  ||| |    
T  23920 acaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtataacagacaatctcaacatgagtatctttcttcttaggccacctatcatcaaccattctctgt 23821  T
Q  339 ttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcct 438  Q
    || || || |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||  | |||  ||||||||| | ||| || |||||||||||||||||||    
T  23820 ttgcccttatcagcaggagcactgtatggcttaggacgactctgctgacctttagctttctgctcattcacaatcttataatgagccttggtatcctcct 23721  T
Q  439 catagatcct 448  Q
    |||| |||||    
T  23720 cataaatcct 23711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0865 (Bit Score: 111; Significance: 9e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0865
Description:

Target: scaffold0865; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 1488 - 1198
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  1488 tagcaattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctctgataagtcggtcctcattagtagttttcgtaccagtcaaagcaaacaccttgccacctgt 1389  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgt 200  Q
    |  | |||||||||||| | | ||||| || || |||||||| ||||||| ||| |||||||| |||| ||| | ||||||||| | ||| || ||||||    
T  1388 cagagccttcttaggcttcctgcactgagagctaatatgaccctcttcatcacaattgtagcacacaatatcaccacgcttacactcagccaatgtgtgt 1289  T
Q  201 cctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatct 291  Q
    |||||||  |  || |  || |||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| || || || |||||||    
T  1288 cctttcttcccacatcggaaacacttcttctcatcacggtcacatacattacccttgtggcctttttcaccacatttaaaacagacaatct 1198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0664 (Bit Score: 111; Significance: 9e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0664
Description:

Target: scaffold0664; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 454
Target Start/End: Original strand, 7126 - 7582
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| |    |||||||| ||||||  ||||||||| || ||||| ||    
T  7126 tagcaattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctctgataagtcgatcctcactagtggtttgcgtgccagttagagcaaacactttaccaccggt 7225  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgt 200  Q
    ||||| |||||| |||| | | || ||||| || ||||| || ||||||| | |||| || ||||||||||| | |||||| |||| ||||| |||||||    
T  7226 cctaatcttcttgggcttcttgcattgcgagctaatatgcccctcttcatcatagttataacaaacaacatcaccacgcttgcaatcagctagagtgtgt 7325  T
Q  201 cctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgc---ag 297  Q
    ||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | || |||||||| ||   ||    
T  7326 cctttctgaccacacctgaagcacttcttctcatctttagtacaaacattactcttgtggcctttctcgccacacttgtaacaaacaatctcagcaggag 7425  T
Q  298 catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgccctt 397  Q
    ||||| || | || |||| |||  ||||   || | |||  || || |||||| |||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| | |    
T  7426 catctctcctattgggcctcctctcatcattcaacctctgcttacccttgtcaacaggagcactatacggcttcggacgactctgctgtcctttgctcct 7525  T
Q  398 cctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctacagct 454  Q
     |  ||| |||  |||||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||||    
T  7526 tcgatcactcatcaccttgtaatgagctttcgtgtcctcctcatagattctgcagct 7582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0146 (Bit Score: 111; Significance: 9e-56; HSPs: 2)
Name: scaffold0146
Description:

Target: scaffold0146; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 63 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 438 - 212
Alignment:
Q  63 gtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagc 162  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || |    
T  438 gtttgcgtaccagtcaaagcaaacaccttgccaccggtcctaaccttcttcggttgcgtacattgcgaactaatatgaccttcctcattgcagttataac 339  T
Q  163 aaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgtcctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcc 262  Q
    ||||||  |||| ||||||||||| |||||  ||||||| ||||| ||  ||| | |||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  338 aaacaatgtccccacgcttacaatcagctagtgtgtgtcttttctgaccacacatgaagcacttcttctcatctctatcacagacattactcttgtggcc 239  T
Q  263 tttctcaccacaattgaagcacacaat 289  Q
    |||||| ||||| |||||||| |||||    
T  238 tttctcgccacacttgaagcaaacaat 212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0146; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 345 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 153 - 104
Alignment:
Q  345 ttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcc 394  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  153 ttgtcagcaggagcattttacggcttcggacgactctgctgtcccttgcc 104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 111; Significance: 9e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 28501 - 28211
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  28501 tagcaattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctctgataagtcggtcctcattagtagttttcgtaccagtcaaagcaaacaccttgccacctgt 28402  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgt 200  Q
    |  | |||||||||||| | | ||||| || || |||||||| ||||||| ||| |||||||| |||| ||| | ||||||||| | ||| || ||||||    
T  28401 cagagccttcttaggcttcctgcactgagagctaatatgaccctcttcatcacaattgtagcacacaatatcaccacgcttacactcagccaatgtgtgt 28302  T
Q  201 cctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatct 291  Q
    |||||||  |  || |  || |||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| || || || |||||||    
T  28301 cctttcttcccacatcggaaacacttcttctcatcacggtcacatacattacccttgtggcctttttcaccacatttaaaacagacaatct 28211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2062 (Bit Score: 110; Significance: 3e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold2062
Description:

Target: scaffold2062; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 1093 - 800
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| | |    ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| ||    
T  1093 tagcaattaaaggcgtattattaaagaaacaagtacctctgataagtctgtccttactagttgtttgcgtaccagtcaaagcaaacaccttaccaccagt 994  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactga-----tatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaag 195  Q
    |||||||||||| || || ||||||||||||||||     | |||||||| || || ||||| ||||||||||  || | ||||||||||| |||||  |    
T  993 cctaaccttcttcggttgtgtacactgcgaactgaactgatgtgaccttcctcgttgcagttatagcaaacaatgtcaccacgcttacaatcagctagtg 894  T
Q  196 tgtgtcctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaat 289  Q
    |||||||||||| ||  ||| | |||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  893 tgtgtcctttctgaccacacatgaagcacttcttctcatctctatcacagacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaagcaaacaat 800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 110; Significance: 3e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 242 - 511
Target Start/End: Original strand, 48994 - 49263
Alignment:
Q  242 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttc 341  Q
    |||| |||| ||||||||||||||| ||||| | ||||| |||| ||| || | |||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||  ||| ||||    
T  48994 acaaccattgctcttgtggcctttcccaccatagttgaaacacaaaatttcagaagcatccttcttcttaggccgcctatcatcggccattctctgtttc 49093  T
Q  342 cctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcat 441  Q
    ||||| |||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||| |||||||| ||||| ||||| |    
T  49094 cctttatcagtaggggcattgtacggtttaggacgactctgctgtcccttgcccttcttctcattcaccatcttgtaatgagccttagtatcttcctcgt 49193  T
Q  442 agatcctacagctgttaaccaaatctggaaaaactctcagccgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 511  Q
    |||| || ||||| ||||||||||| | |||||  || | | || ||| ||||||||||||||| |||||    
T  49194 agattctgcagctattaaccaaatccgtaaaaatcctaatctgtcgatgcccaatcgccctcttaatgtc 49263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203 (Bit Score: 109; Significance: 1e-54; HSPs: 2)
Name: scaffold0203
Description:

Target: scaffold0203; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 1070 - 774
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| |||||| |    |||||| |||||||  |||||||||| || ||||| ||    
T  1070 tagcaattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctctgataattcgatcctcactagtggtttgcataccagtcaaagcaaacactttaccaccggt 971  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgt 200  Q
     ||||||||| | || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||| ||| | |||||| |||| ||||| |||||||    
T  970 tctaaccttcctcggttgcgtacactgtgaactgatatgaccctcttcattgcagttataacaaacaatatcaccacgcttgcaatcagctagagtgtgt 871  T
Q  201 cctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag 297  Q
    ||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||     ||||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||| | || |||||||| ||||    
T  870 cctttctgaccacacctgaagcacttcttctcatctttagtacaaacattactcttatggcctttcttgccacacttgtaacaaacaatctcagcag 774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 345 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 3920 - 3811
Alignment:
Q  345 ttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcataga 444  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| | | |  ||| |||  |||||||| ||||| || || |||||||||||||    
T  3920 ttgtcagcaggagcactatacggcttcggacgactctgctgtcctttgctccttcgatcactcatcaccttgtaatgagctttcgtgtcctcctcataga 3821  T
Q  445 tcctacagct 454  Q
    | || |||||    
T  3820 ttctgcagct 3811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 109; Significance: 1e-54; HSPs: 2)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 4 - 455
Target Start/End: Original strand, 5896 - 6349
Alignment:
Q  4 caattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgtcct 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| | ||||||  |    ||||||||| |||||  ||||||||| || ||||| |||||    
T  5896 caattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctctgataagcctgtcctcgctagtggtttgcgtatcagttagagcaaacactttaccaccggtcct 5995  T
Q  104 aaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgtcct 203  Q
    ||||||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| || |||||||  |||| |||||| |||| |||||  |||||||||    
T  5996 aaccttcttcggttgtgtacactgtgaactaatatgtccttcctcgttgcagttataacaaacaatgtccccacgcttgcaatcagctagtgtgtgtcct 6095  T
Q  204 ttctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctg---cagcat 300  Q
    |||| ||  || || |||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || |    |||||    
T  6096 ttctgaccacatctgaagcacttcttctcatctctatcacagacattactcttgtggcctttttcaccacacttgaagcaaacaatgtcagtaagagcat 6195  T
Q  301 ctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcct 400  Q
    || || |||| |||| |||  ||||    | | | |  || || ||||||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||  | |     
T  6196 ctctcctcttgggcctcctctcatcatttaacct-tgcttacccttgtcagtaggagcactatacggcttcggacgactctgctgtcccttgcctctgcg 6294  T
Q  401 ctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctacagctg 455  Q
     ||| |||  |||||||| ||||| || || ||||||||||| ||||||||||||    
T  6295 ttcactcatcaccttgtaatgagctttcgtgtcctcctcataaatcctacagctg 6349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 5 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 41320 - 41236
Alignment:
Q  5 aattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacacc 89  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| | ||  | ||||||||| | || || ||||||| | |||||||||||    
T  41320 aattaagggagtactattaatgtaacatgtacctctgatcagatgatcctcattcgctgtctgagtaccagctaaagcaaacacc 41236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0167 (Bit Score: 107; Significance: 2e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0167
Description:

Target: scaffold0167; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 63 - 297
Target Start/End: Original strand, 5203 - 5437
Alignment:
Q  63 gtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagc 162  Q
    ||||||||||||||   ||||||||| || ||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |    
T  5203 gtttgcgtaccagtcagagcaaacactttaccaccggtcctaaccttcttcggttgagtacactgcgaactgatatgaccttcctcattgcagttataac 5302  T
Q  163 aaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgtcctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcc 262  Q
    ||||||| || |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||   ||||| ||||||||| |||||||    
T  5303 aaacaacgtctccccgcttacaattagctaatgtgtgtcctttctaaccacacctgaagcacttcttctcatctttatcacagacattactcctgtggcc 5402  T
Q  263 tttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag 297  Q
    |||||| || || ||| |||| |||||||| ||||    
T  5403 tttctcgccgcacttgtagcaaacaatctcagcag 5437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0167; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Original strand, 1208 - 1253
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaag 46  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  1208 tagcaattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctctgataag 1253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 107; Significance: 2e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 242 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 139585 - 139313
Alignment:
Q  242 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgc---agcatctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctat 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| ||   || |||  ||||||||||||||||| ||||||||||  ||| |    
T  139585 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcaagtaatctcagctggagtatccctcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgt 139486  T
Q  339 ttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcct 438  Q
    || || || |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  139485 ttgcccttatcagcaggggcactataaggcttagggcgactctgctggcccttggtcttccgctcattcacaaccttgtaatgagcctttgtatcttcct 139386  T
Q  439 catagatcctacagctgttaaccaaatctggaaaaactctcagccgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 511  Q
    | |||||||| ||||| || || ||||| || |||| ||  ||| ||||||| || |||||||||||||||||    
T  139385 cgtagatcctgcagctattcactaaatcagggaaaattcggagctgttgatatccgatcgccctcttgatgtc 139313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 242 - 511
Target Start/End: Original strand, 179 - 450
Alignment:
Q  242 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctc---tgcagcatctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctat 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||   || ||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||  ||| |    
T  179 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcaagtaatctcaactggagcatccctcttcttagggcgcctatcatcgaccattctctgt 278  T
Q  339 ttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcct 438  Q
    || || || |||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||| | |||||| |||||||| || || ||||    
T  279 ttgcccttatcagcaggggcactataaggcttag-acgactctgctggcccttggtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagcctttgtttcttcct 377  T
Q  439 catagatcctacagctgttaaccaaatctggaaaaactctcagccgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 511  Q
    | |||||||| ||||| || || ||||| || |||||||  ||| |||| || || |||||||||||||||||    
T  378 cgtagatcctgcagctattcactaaatcagggaaaactcggagctgttggtatccgatcgccctcttgatgtc 450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1881 (Bit Score: 105; Significance: 3e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold1881
Description:

Target: scaffold1881; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 242 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 455 - 189
Alignment:
Q  242 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctc---tgcagcatctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctat 338  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||    | |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  | | |    
T  455 acaaacattgctcttgtggcctttctcgccacaattgaaacaaacaatctccgtaggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctttgt 356  T
Q  339 ttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcct 438  Q
    || || || |||||||||||| | || |||||||| ||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |    
T  355 ttgcccttatcagcaggggcaatataaggcttagggcgactctgctggcccttggtcttccgctcattcacaaccttgtaatgagccttggtatcctctt 256  T
Q  439 catagatcctacagctgttaaccaaatctggaaaaactctcagccgttgatacccaatcgccctctt 505  Q
    ||||||| ||||| || || |||||||| ||||||||||  |   ||||||||||||| ||||||||    
T  255 catagattctacaactattcaccaaatcaggaaaaactcggatttgttgatacccaattgccctctt 189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0177 (Bit Score: 105; Significance: 3e-52; HSPs: 2)
Name: scaffold0177
Description:

Target: scaffold0177; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 242 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 15016 - 14750
Alignment:
Q  242 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctc---tgcagcatctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctat 338  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||    | |||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||  ||| |    
T  15016 acaaacattgctcttgtggcctttctcaccacaattaaaacagacaatctccgtaggagcatccttcttcttaggctgcctatcatcgaccattctctgt 14917  T
Q  339 ttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcct 438  Q
    || || || |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||   ||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  14916 ttgcccttatcagcaggggcactatagggcttagggcgactctgctggcccttagtcttccgctcattcacaaccttgtaatgagccttggtatcctcct 14817  T
Q  439 catagatcctacagctgttaaccaaatctggaaaaactctcagccgttgatacccaatcgccctctt 505  Q
     |||||| ||||| || || |||||||| ||||||||||  |   ||||||||||||| ||||||||    
T  14816 aatagattctacaactattcaccaaatcaggaaaaactcggatttgttgatacccaattgccctctt 14750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0177; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 242 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 11331 - 11065
Alignment:
Q  242 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctc---tgcagcatctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctat 338  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||    | |||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||  ||| |    
T  11331 acaaacattgctcttgtggcctttctcaccacaattaaaacagacaatctccgtaggagcatccttcttcttaggctgcctatcatcgaccattctctgt 11232  T
Q  339 ttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcct 438  Q
    || || || |||||||||||||| || ||||||||   ||| || || |||||   ||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  11231 ttgcccttatcagcaggggcactatagggcttagggtaactttgttggcccttagtcttccgctcattcacaaccttgtaatgagccttggtatcctcct 11132  T
Q  439 catagatcctacagctgttaaccaaatctggaaaaactctcagccgttgatacccaatcgccctctt 505  Q
     |||||| ||||| || || |||||||| ||||||||||  |   ||||||||||||| ||||||||    
T  11131 aatagattctacaactattcaccaaatcaggaaaaactcggatttgttgatacccaattgccctctt 11065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 105; Significance: 3e-52; HSPs: 3)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 164617 - 164227
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |    || | |||||| ||  | |||||||| || ||||| ||    
T  164617 tagcaattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctctgataagtcggtcctcactagtagtctacgtaccggtcaatgcaaacactttcccaccggt 164518  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgt 200  Q
     ||||||||||| ||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||  | |||||| |||| | |||||||||||    
T  164517 tctaaccttcttcggctgagtataatgcgaactgatatggccttcttcattgcagttataacaaacaacattaccacgcttgcaatcaactaaagtgtgt 164418  T
Q  201 cctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgc---ag 297  Q
    ||||||| ||  ||||| || ||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | || || ||||| ||   ||    
T  164417 cctttctgaccacacctgaaacacttcttctcatccttagaacaaacattactcttgtggcctttctcgccacacttgtaacaaacgatctcagcaggag 164318  T
Q  298 catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcc 388  Q
    | ||| || | || |||| |||  ||||   || | ||| ||| || |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||    
T  164317 cgtctctcctattgggcctcctctcatcattcaacctctgttttcccttgtcagcaggggcactgtatgatttaggacgactctgctgtcc 164227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 242 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 43428 - 43219
Alignment:
Q  242 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctat 338  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||| || |||    ||||||||||||| ||||||||| |||| || ||  ||| |    
T  43428 acaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtatagcagacaatttcagcaagaccatctttcttcttgggccgcctatcatcaactattctctgt 43329  T
Q  339 ttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcct 438  Q
    || || || |||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||  || |||   |||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||    
T  43328 ttacccttatcagcaggagcactataaggcttagggcgactctgcttacctttggttttccgctcattcacaatcttgtattgagccttggtatcctcct 43229  T
Q  439 catagatcct 448  Q
    |||| |||||    
T  43228 catatatcct 43219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 242 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 30549 - 30325
Alignment:
Q  242 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctat 338  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||   |||| |||||| | |||||  || | ||||||||| ||| |    
T  30549 acaagcattgctcttgtggcctttctcaccacaattaaaacagacaatctcagcaggagcatccttcttccttggccgtttatcctcgaccatcctctgt 30450  T
Q  339 ttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcct 438  Q
    || || || |||||||||| ||| || ||| |||| ||||||||||| || ||   ||||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| |    
T  30449 tttcccttatcagcaggggtactatagggcctagggcgactctgctggcctttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctctt 30350  T
Q  439 catagatcctacagctgttaaccaa 463  Q
    | || || ||||| ||||| |||||    
T  30349 cgtaaattctacaactgttcaccaa 30325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1220 (Bit Score: 102; Significance: 2e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold1220
Description:

Target: scaffold1220; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 242 - 478
Target Start/End: Original strand, 65 - 304
Alignment:
Q  242 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgca---gcatctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctat 338  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| || |||||||| |||   ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||    
T  65 acaaacattgcttttgtggcctttctcaccacaaatgaaacagacaatctccgcaagagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgacaatactctat 164  T
Q  339 ttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcct 438  Q
    || || || |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||   ||||| ||||||||| |||||||  ||||| ||||| || ||||    
T  165 ttgcccttatcagcaggggcactatagggcttagggcgactctgctggcccttagtcttccgctcattcacaaccttgtgatgagctttggtgtcttcct 264  T
Q  439 catagatcctacagctgttaaccaaatctggaaaaactct 478  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  265 cataaatcctacagctgttcaccaaatcaggaaaaactct 304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072 (Bit Score: 102; Significance: 2e-50; HSPs: 2)
Name: scaffold0072
Description:

Target: scaffold0072; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Original strand, 54135 - 54408
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| |    ||||||||||||||  |||||||||| || ||||  ||    
T  54135 tagcaattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctctgataagtcgatcctcactagtggtttgcgtaccagtgaaagcaaacactttaccactggt 54234  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgt 200  Q
    ||||||||| || || || || ||| | || ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| | |||||| |||| ||||| |||||||    
T  54235 cctaacctttttcggttgtgtgcaccgtgagctgatatgaccctcttcattgcagttataacaaacaacatcaccacgcttgcaataagctagagtgtgt 54334  T
Q  201 cctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccaca 274  Q
    || |||| ||  ||||| || |||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  54335 cccttctgaccacacctgaaacacttcttctcatctttagtacaaacattactcttgtggcctttctcgccaca 54408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 339 - 393
Target Start/End: Original strand, 54476 - 54530
Alignment:
Q  339 ttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgc 393  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  54476 ttccctttgtcagcaggagcactatacggctttggacgactctgatgtcctttgc 54530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 101; Significance: 8e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 242 - 477
Target Start/End: Original strand, 36827 - 37065
Alignment:
Q  242 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctat 338  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||   |||| |||||||||||||||||| ||||||||||  ||| |    
T  36827 acaaacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacagacgatctccgcaggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgt 36926  T
Q  339 ttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcct 438  Q
    || || || |||||||||||||| || ||||||||  |||||||||| |||||   ||||| |||||| || |||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  36927 ttgcccttatcagcaggggcactatagggcttagggagactctgctggcccttagtcttccgctcatttacaaccttgtaatgagctttggtgtcctcct 37026  T
Q  439 catagatcctacagctgttaaccaaatctggaaaaactc 477  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||    
T  37027 catagattctacagttgttcaccaaatcaggaaaaactc 37065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0285 (Bit Score: 99; Significance: 1e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0285
Description:

Target: scaffold0285; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 242 - 511
Target Start/End: Original strand, 5327 - 5599
Alignment:
Q  242 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctat 338  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||   |||| |||||||||||||||||| ||||||||||  ||| |    
T  5327 acaaacattactcttatggcccttctcgccacagttgaaacaaacaatctccgcaggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgt 5426  T
Q  339 ttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcct 438  Q
    || || || |||||| ||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |    
T  5427 ttgcccttatcagcaagggcactataaggcttagggcgactctgctggcccttggtcttccgctcattcacaaccttgtaatgagccttagtatcctcat 5526  T
Q  439 catagatcctacagctgttaaccaaatctggaaaaactctcagccgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 511  Q
    ||||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||  | | |||| || || ||||||||||| |||||    
T  5527 catagattctgcagctattcaccaaatcaggaaaaactcggatctgttggtatccgatcgccctcttaatgtc 5599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348 (Bit Score: 95; Significance: 3e-46; HSPs: 3)
Name: scaffold0348
Description:

Target: scaffold0348; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 17700 - 17250
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| || ||||||||    || |||||||||||  |||||||||  || ||||| ||    
T  17700 tagcaattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctctgataagacgatcctcattagtagtctgcgtaccagtcaaagcaaacattttcccaccagt 17601  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgt 200  Q
     ||||||||||| ||||| |||||||| | ||||||||| || ||||| || || ||||| || |||||||| | |||| |  |||  ||||| |||||     
T  17600 tctaaccttcttcggctgtgtacactgagtactgatatggccctcttcgttgcaattgtaacatacaacatcaccacgcatgtaatccgctaatgtgtga 17501  T
Q  201 cctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcat-ctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgc---a 296  Q
    || || | |   |||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  | || || ||||| ||   |    
T  17500 cccttttgatcacacctaaagcacttcttctcatccttggt-acaaacattactcttgtggcctttctcgccacacttataacaaactatctcagcagga 17402  T
Q  297 gcatctttcttcttaggccgcctaacatcgacca-tcttctatttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgccc 395  Q
    |||||| || | || |||| |||  ||||   || |||| | ||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||     
T  17401 gcatctctcctattcggcctcctctcatcattcagtctt-tgttttcccttgtcagcaggggcactgtacggtttaggacgactctgctgtcccttacct 17303  T
Q  396 ttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcct 448  Q
     | | |||| |||  ||||| || ||||| || || |||||||||||||||||    
T  17302 cttcgctcactcatcaccttataatgagcttttgtgtcctcctcatagatcct 17250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 4 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 5062 - 4799
Alignment:
Q  4 caattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgtcct 103  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||    || |||||   |||  |||||||||| || ||||| || ||    
T  5062 caattaaaggagtagtattaaagaaacaagtacctctgataagacggtcctcattagtagtctgcgtcatagtcaaagcaaacacttttccaccggttct 4963  T
Q  104 aaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgtcct 203  Q
    ||||||| | ||||| |||||||| | ||||||||| || || || || ||||| || || |||||||| | |||||| |||| ||||||  |||| ||     
T  4962 aaccttcctcggctgtgtacactgagtactgatatggccctcctcgttgcagttataacatacaacatcaccacgcttgcaatcagctaacatgtgaccc 4863  T
Q  204 ttctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttct 267  Q
    ||||  |  ||||| ||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  4862 ttctgtccacacctgaagcacttcttctcatctttggtacaaacattactcttgtggcctttct 4799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 353 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 4710 - 4672
Alignment:
Q  353 aggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtccctt 391  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4710 aggggcactgtacggtttaggacgactctgctgtccctt 4672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 95; Significance: 3e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 389
Target Start/End: Original strand, 40146 - 40537
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| |||||||||||    || |||||||||||  |||||||||| || ||||| ||    
T  40146 tagcaattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctctaataagacggtcctcattggtagtctgcgtaccagtcaaagcaaacactttcccaccggt 40245  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgt 200  Q
     ||||||||||| ||||| || ||||| | ||||||||| || ||||| || ||||| || || |||||||| | |||||| ||||  |||||  ||||     
T  40246 tctaaccttcttcggctgtgtgcactgagtactgatatggccctcttcgttgcagttataacatacaacatcacaacgcttgcaatccgctaacatgtga 40345  T
Q  201 cctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgc---ag 297  Q
    || |||||||  ||||| ||||||||||| ||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  | || || ||||| ||   ||    
T  40346 cccttctaaccacacctgaagcacttcttatcatctttggtacaaacattactcttgtggcctttctcgccacacttataacagactatctcagcaggag 40445  T
Q  298 catctttcttcttaggccgcctaacatcgacca-tcttctatttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtccc 389  Q
    ||||| || | || |||| |||  ||||   || ||||   |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  40446 catctctcctattcggcctcctctcatcattcagtctttgctttccc-ttgtcagcaggggcactgtacggtttaggacgactctgttgtccc 40537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 242 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 17324 - 17115
Alignment:
Q  242 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctat 338  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||   || || |||||||||| ||   |||| ||||||||||| || ||| | ||||||||| ||| |    
T  17324 acaagcattactcttgtggcccttctcaccacaagaaaaacaaacaatctctgtaggagcatccttcttcttaggtcgtctatcttcgaccatcctctgt 17225  T
Q  339 ttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcct 438  Q
    || || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| || |||||  | |||| ||||||||| | |||||| | || ||||||||||||||    
T  17224 ttgcccttatcagcaggggcactataaggcttagggcgactctgttgacccttagctttccgctcattcacaatcttgtaataagtcttggtatcctcct 17125  T
Q  439 catagatcct 448  Q
    ||||||||||    
T  17124 catagatcct 17115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 95; Significance: 3e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 291
Target Start/End: Original strand, 30022 - 30312
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    || ||||||||| |  | ||||||||||| |||||  |    
T  30022 tagcaattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctctgataagtcggtcctcattggtagtctgcgtaccaatcaatgcaaacacctttccaccatt 30121  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgt 200  Q
     ||||||||||| ||||  | ||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| || ||||  |||| ||||||||| | |||||   |||||    
T  30122 tctaaccttcttcggctcaggacactgcgaactgatatgaccctctccattgcagttgtaacagacaatgtccccacgcttacattcagctaggttgtgt 30221  T
Q  201 cctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatct 291  Q
    | ||||| ||  ||||| || |||||| |||||||||   ||||||| || || |||||||||||||||||||| ||| | || |||||||    
T  30222 cttttctgaccacacctgaatcacttcctctcatctctaccacaaacgttgcttttgtggcctttctcaccacacttgtaacaaacaatct 30312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 342 - 463
Target Start/End: Original strand, 30342 - 30463
Alignment:
Q  342 cctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcat 441  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |  |||||| ||||| ||||| || || ||||    
T  30342 cctttgtcagcaggagcactgtaaggcttaggacgactctgctgtcccttgcccctcctctcactcattgtcttgtaatgagctttggtgtcttcttcat 30441  T
Q  442 agatcctacagctgttaaccaa 463  Q
    | || || || |||||||||||    
T  30442 aaattctgcaactgttaaccaa 30463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1299 (Bit Score: 93; Significance: 5e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold1299
Description:

Target: scaffold1299; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 2064 - 1607
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| | ||||||| |  | || ||||||| |||  |||||||||| || ||||| ||    
T  2064 tagcaattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctctgataagcctgtcctcaatagcagtctgcgtactagtcaaagcaaacactttcccaccggt 1965  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgt 200  Q
     |||| |||||| ||||| || ||||| |||||||| || || || |||| ||| || || ||||||||||| |  | ||| || ||||| || ||||||    
T  1964 tctaatcttctttggctgagtgcactgggaactgatgtggccctcctcatcacaattataacaaacaacatcacccctcttgcagttagccaatgtgtgt 1865  T
Q  201 cctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgc---ag 297  Q
    ||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||  |  |||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||  |||| |  || || ||   ||    
T  1864 cctttctgaccacacctgaagcacttcttctcatctttggtacaaacattacttttgtggcctttctcgccacacttatagcaaattatttcagcagtag 1765  T
Q  298 catctttcttcttaggccgcctaacatcgacca-tcttctatttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgccct 396  Q
    ||||| || |||| ||||  ||  ||||   || || |   |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||     
T  1764 catctctcctcttgggccttctctcatcattcagtcgttgctttccc-ttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgttttcccttacccc 1666  T
Q  397 tcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctacagctg 455  Q
    ||| |||| |||  |||||||| ||||| || | ||| ||||||||||| || ||||||    
T  1665 tccgctcactcatcaccttgtaatgagcttttgaatcttcctcatagattctgcagctg 1607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 92; Significance: 2e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 242 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 7632 - 7363
Alignment:
Q  242 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctat 338  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||   |||| |||||||||||||||||| | ||||||||  ||| |    
T  7632 acaaatattgctcttgtggcctttctcaccacaattaaagcagacaatctcagcaggaacatccttcttcttaggccgcctatcttcgaccattctctgt 7533  T
Q  339 ttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcct 438  Q
    || || || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||   ||||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||| ||||    
T  7532 ttgcccttatcagcaggggcactgtaaggcttagggcgactctgctggcctttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcttcct 7433  T
Q  439 catagatcctacagctgttaaccaaatctggaaaaactctcagccgttgatacccaatcgccctcttgat 508  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||| || |  |||||||  | | |||| || ||||| |||||||||||    
T  7432 cataaatcctgcaactgttcaccaactcggagaaaactcggatctgttggtaaccaattgccctcttgat 7363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0708 (Bit Score: 90; Significance: 3e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0708
Description:

Target: scaffold0708; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 5361 - 4982
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    || |||||||||||  | |||||||| || ||||| ||    
T  5361 tagcaattaaatgagtactattaaagaaacaagtacctctgataagtcggtcctcatttgtagtctgcgtaccagtcaatgcaaacactttcccaccggt 5262  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgt 200  Q
    |||| ||||||| ||||| |||||||  |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||  || | ||||||||| | |||||  ||||||    
T  5261 cctagccttcttcggctgagtacactatgaactgatatgaccttcttcgttgcagttgtagcagacaatgtctccacgcttacattcagctagggtgtgt 5162  T
Q  201 cctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgc---ag 297  Q
    ||||||| ||  ||||| || || ||| |||||| ||   ||||| ||||  | ||||||||||| ||| |||  ||  | || ||||| || ||   ||    
T  5161 cctttctgaccacacctgaaacatttcctctcatttctaccacaagcattgtttttgtggcctttttcatcactcttttaacaaacaatttcagcaggag 5062  T
Q  298 catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacga 377  Q
    ||||| || |||| |||| |||| ||||   |||| |||  ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||    
T  5061 catctctcctcttgggcctcctatcatcattcatcctctgcttccctttgtcagcaggagcactgtaaggtttaggacga 4982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0451 (Bit Score: 89; Significance: 1e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0451
Description:

Target: scaffold0451; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 242 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 14007 - 13769
Alignment:
Q  242 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctat 338  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||   |||| |||||||||||||||||| ||||||||||  ||| |    
T  14007 acaaacattgctcttgtggcctttctcaccacaattaaaacagacaatctccgcaggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgt 13908  T
Q  339 ttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcct 438  Q
    || || || ||| |||||||||| || |||||||| |||||||| || |||||   ||||| |||||| || |||||||| |||||  |||| |||||||    
T  13907 ttgcccttatcatcaggggcactatagggcttagggcgactctgttggcccttagtcttccgctcattaacaaccttgtaatgagctctggtgtcctcct 13808  T
Q  439 catagatcctacagctgttaaccaaatctggaaaaactc 477  Q
    | |||||||| ||||| || || ||||||||||||||||    
T  13807 cgtagatcctgcagctattcactaaatctggaaaaactc 13769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 88; Significance: 5e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 761 - 304
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||   |||||||||    || |||||||||||  | |||||||| || ||||| ||    
T  761 tagcaattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctctgataagcttgtcctcattagtagtctgcgtaccagtcaacgcaaacactttcccaccggt 662  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgt 200  Q
     |||| |||||| ||||| || ||||| |||||||| || || || |||| ||| || || |||||||||||  | | ||| || ||||| || ||||||    
T  661 tctaatcttctttggctgagtgcactgtgaactgatgtggccctcctcatcacaattataacaaacaacatcattcctcttgcagttagccaatgtgtgt 562  T
Q  201 cctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctc---tgcag 297  Q
    ||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||  |  |||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| || |||||    | ||    
T  561 cctttctgaccacacctgaagcacttcttctcatctttggtacaaacattacttttgtggcctttctcgccacacttaaagcaaactatctcagtaggag 462  T
Q  298 catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgccctt 397  Q
    ||||| || |||| || |  ||  ||||   || |   |  || || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |    
T  461 catctctcctcttgggtcttctctcatcattcagccgttgctttcccttgtcagcagggggactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacccct 362  T
Q  398 cctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctacagctg 455  Q
    || |||| |||  |||||||| ||||| || | ||| ||||| ||||| || ||||||    
T  361 ccgctcactcatcaccttgtaatgagcttttgaatcttcctcgtagattctgcagctg 304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 88; Significance: 5e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 4 - 274
Target Start/End: Original strand, 22213 - 22483
Alignment:
Q  4 caattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgtcct 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    || || ||||||||  | ||||||||  | ||| | || ||    
T  22213 caattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctctgataagtcggtcctcattagtagtctgagtaccagtcaatgcaaacactataccaacggttct 22312  T
Q  104 aaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgtcct 203  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| | |||||| |||| | |||  |||||||||    
T  22313 aaccttcttcggctgtgtgcactgagaactgatatggccctcttcattgcagttatagcaaacaacatcaccacgcttgcaatcaactagggtgtgtcct 22412  T
Q  204 ttctaacgtcacctaaagcacttcttctcat-ctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccaca 274  Q
    |||| ||  ||| | ||||| |||||||||| ||  || | ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22413 ttctgaccacacttgaagcatttcttctcatccttagt-aaaaacattactcttgtggcctttctcgccaca 22483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 342 - 391
Target Start/End: Original strand, 22554 - 22603
Alignment:
Q  342 cctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtccctt 391  Q
    |||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||| |||||||||    
T  22554 cctttgtcggcaggggcactgtatggtttaggaagactctactgtccctt 22603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1423 (Bit Score: 84; Significance: 1e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold1423
Description:

Target: scaffold1423; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 242 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 353 - 144
Alignment:
Q  242 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctat 338  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | || || |||||||||||||   |||| |||||||||||||| ||| | ||||||||| ||| |    
T  353 acaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctgcaggagcatccttcttcttaggccgtctatcttcgaccatcctctgt 254  T
Q  339 ttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcct 438  Q
    || || || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||   ||||| ||||||||| | |||||| |||||||| |||||||| |    
T  253 ttgcccttatcagcaggggcactgtaaggcttagggcgactcttctgacccttagtcttccgctcattcacgatcttgtaatgagccttagtatcctcat 154  T
Q  439 catagatcct 448  Q
    |||| |||||    
T  153 cataaatcct 144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0509 (Bit Score: 84; Significance: 1e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0509
Description:

Target: scaffold0509; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 292
Target Start/End: Original strand, 11916 - 12207
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  |||||||||||||||| |  || |||||||||||  | ||||||||||| ||||||||    
T  11916 tagcaattaaaggagtactattaaagaaacaagtatctctaataagtcggtcctcattaattgtctgcgtaccagtcaatgcaaacacctttccacctgt 12015  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgt 200  Q
    |  | |||||||||||| | | ||||||||||| | |||||||||||| | ||| ||| ||||||||| ||| | |||||| || |  ||||  || ||     
T  12016 ctgagccttcttaggcttcctgcactgcgaactaagatgaccttcttcgtcacaattgaagcaaacaatatcaccacgcttgcattccgctatcgtatgc 12115  T
Q  201 cctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctc 292  Q
    |||||||  |  || | ||||||||| |||||||| |  |  ||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||    
T  12116 cctttcttcccacatcgaaagcactttttctcatcaccattgcaagcattactcttgtggcccttctcaccacacttgtagcaaacaatctc 12207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 84; Significance: 1e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 242 - 448
Target Start/End: Original strand, 30616 - 30825
Alignment:
Q  242 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctat 338  Q
    |||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||   |||| |||||||||| ||||||| | ||||||||  ||| |    
T  30616 acaagcattgctcttgtggtctttctcaccacaattaaagcagacaatctcagcaggaacatccttcttcttagaccgcctatcctcgaccattctctgt 30715  T
Q  339 ttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcct 438  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||  ||||| ||||||||| | |||||| ||| |||| || |||||||    
T  30716 ttgcctttatcagcaggggcactgtacggcttaggatgactctgttgtcccctggtcttccgctcattcacaatcttgtaatgaaccttagtgtcctcct 30815  T
Q  439 catagatcct 448  Q
    |||| |||||    
T  30816 cataaatcct 30825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 83; Significance: 4e-39; HSPs: 4)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 8678 - 8405
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| |    || |||||||||||  | |||||||| || ||||| ||    
T  8678 tagcaattaaaggattactattaaagaaacaagtacctctgataagtcgatcctcactagtagtctgcgtaccagtcaatgcaaacactttcccaccggt 8579  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgt 200  Q
     ||||||||||| || ||  | ||||||||||||||||| || | |||||| ||||| || |||||||| || | |||||| |||| ||||| |||||||    
T  8578 tctaaccttcttcggttgattgcactgcgaactgatatggccctattcattgcagttataacaaacaacgtcaccacgcttgcaatcagctagagtgtgt 8479  T
Q  201 cctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcat-ctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccaca 274  Q
    || |||| ||  ||||| || ||||||||||||| ||  || ||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  8478 cccttctgaccacacctgaaacacttcttctcatccttagt-acaaacattactcttgtggccattctcgccaca 8405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 18892 - 18619
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| |    || |||||||||||  | |||||||| || ||||| ||    
T  18892 tagcaattaaaggattactattaaagaaacaagtacctctgataagtcgatcctcactagtagtctgcgtaccagtcaatgcaaacactttcccaccggt 18793  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgt 200  Q
     ||||||||||| || ||  | ||||||||||||||||| || | |||||| ||||| || |||||||| || | |||||| |||| ||||| |||||||    
T  18792 tctaaccttcttcggttgattgcactgcgaactgatatggccctattcattgcagttataacaaacaacgtcaccacgcttgcaatcagctagagtgtgt 18693  T
Q  201 cctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcat-ctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccaca 274  Q
    || |||| ||  ||||| || ||||||||||||| ||  || ||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  18692 cccttctgaccacacctgaaacacttcttctcatccttagt-acaaacattactcttgtggccattctcgccaca 18619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 8331 - 8231
Alignment:
Q  345 ttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcataga 444  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||| | |  ||| |||  |||||||| ||||| ||  | |||||||||||||    
T  8331 ttgtcagcaggagcactatacggcttcggacgactctgttgtcccttgcccctgcggtcactcatcaccttgtaatgagctttcatgtcctcctcataga 8232  T
Q  445 t 445  Q
    |    
T  8231 t 8231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #4
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 18545 - 18445
Alignment:
Q  345 ttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcataga 444  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||| | |  ||| |||  |||||||| ||||| ||  | |||||||||||||    
T  18545 ttgtcagcaggagcactatacggcttcggacgactctgttgtcccttgcccctgcggtcactcatcaccttgtaatgagctttcatgtcctcctcataga 18446  T
Q  445 t 445  Q
    |    
T  18445 t 18445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2059 (Bit Score: 82; Significance: 2e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold2059
Description:

Target: scaffold2059; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 242 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 744 - 473
Alignment:
Q  242 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgc---agcatctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctat 338  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||   |||||| ||   ||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||  ||| |    
T  744 acaaacattactcttgtggtctttctcaccacaattgaaacaagtaatctcagctggagcatccctcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgt 645  T
Q  339 ttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcct 438  Q
    || || || |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||   |||||  ||||| ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  644 ttgcccttatcagcaggggcactataaggcttagggcgactctgcttgtccttggtcttccgctcattcacaaccttgtaatgagccttagtatcttcct 545  T
Q  439 catagatcctacagctgttaaccaaatctggaaaaactctcagccgttgatacccaatcgccctcttgatgt 510  Q
    | |||||||| ||| | || || ||||  || |||||||  ||  |||| || || ||||||||||||||||    
T  544 cgtagatcctgcagttattcactaaataagggaaaactcggagttgttggtatccgatcgccctcttgatgt 473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0317 (Bit Score: 82; Significance: 2e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0317
Description:

Target: scaffold0317; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 63 - 387
Target Start/End: Original strand, 2781 - 3108
Alignment:
Q  63 gtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagc 162  Q
    ||||||||||||||   ||||||||| || ||||| || ||||||||||| || || | |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||    
T  2781 gtttgcgtaccagtcagagcaaacactttaccaccggttctaaccttcttcggttgtgcacactgtgaactgatatggccctcctcattgcagttatagc 2880  T
Q  163 aaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgtcctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcc 262  Q
    |||| |  || |  |||||||||| |||||| |||||||| ||||  |  ||||| ||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  2881 aaactatgtctccccgcttacaatcagctaatgtgtgtcccttctgtccacacctgaagaacttcttctcatctttatcacaaacattactcttgtggcc 2980  T
Q  263 tttctcaccacaattgaagcacacaatct---ctgcagcatctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcagcaggggca 359  Q
    ||||| |||||| ||| |||| |||||||   | | ||||||| || |||| |||| |||  ||||   || | ||| ||| |||||||||||||| |||    
T  2981 tttcttaccacacttgtagcaaacaatctcaacaggagcatctctcctcttgggcctcctctcatcattcaacctctgttttcctttgtcagcaggagca 3080  T
Q  360 ctgtacggcttaggacgactctgctgtc 387  Q
    || ||||| |||||| ||||||||||||    
T  3081 ctatacggtttaggatgactctgctgtc 3108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 82; Significance: 2e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 242 - 442
Target Start/End: Original strand, 11592 - 11795
Alignment:
Q  242 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgca---gcatctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctat 338  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | || || ||||||||||||   ||||| |||||||||||||||||| | ||||||||  ||| |    
T  11592 acaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctgcatgagcatccttcttcttaggccgcctatcttcgaccattctctgt 11691  T
Q  339 ttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcct 438  Q
    || || || |||| ||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||  | |||| ||||||||| | |||| | |||||||||||||||||||    
T  11692 ttgcccttatcagtaggagcactgtaaggcttagggcgactctgctgacccttagctttccgctcattcacaatcttgaaatgagccttggtatcctcct 11791  T
Q  439 cata 442  Q
    ||||    
T  11792 cata 11795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 242 - 438
Target Start/End: Original strand, 14413 - 14612
Alignment:
Q  242 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctat 338  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||| |||||| | || || |||||||||||||   |||| |||||||||||||||||| ||| ||||||  ||| |    
T  14413 acaagcattactcttatggcctttctcgccacaagtaaaacagacaatctctgcaggagcatccttcttcttaggccgcctatcattgaccattctctgt 14512  T
Q  339 ttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcct 438  Q
    || || || ||||||| |||||| || |||||||| |||||||| || |||||   ||||| ||||||||| | |||||| |||||||| ||||||||||    
T  14513 ttgcccttatcagcagaggcactataaggcttagggcgactctgttgacccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttagtatcctcct 14612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 82; Significance: 2e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 448
Target Start/End: Original strand, 263314 - 263764
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| | |||||||||    || |||||||||||  |||||||||| || ||||  ||    
T  263314 tagcaattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctctaataagcctgtcctcattagtagtctgcgtaccagtcaaagcaaacacttttccactagt 263413  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgt 200  Q
     ||||||||||| | ||| || ||||| | ||||||||| || ||||| |||||||| || || |||||||| | |  ||| ||||  ||||||  |||     
T  263414 tctaaccttcttcgactgtgtgcactgtgtactgatatggccctcttcgttacagttataacatacaacatcaccatccttgcaatccgctaaaaggtga 263513  T
Q  201 cctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcat-ctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgc---a 296  Q
    || |||| ||  ||||| |||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || || || ||||| ||   |    
T  263514 cccttctgaccacacctgaagcacttcttctcatccttggt-acaaacattactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacaaactatctcagcagga 263612  T
Q  297 gcatctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgccct 396  Q
    |||||| || |    |||| |||  ||||   ||   |||  || || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||      
T  263613 gcatctctcctaacgggcctcctctcatcattcagtctctgcttacccttgtcagcaggggcactgtacggcttaagacgactctgctgtcccttacctc 263712  T
Q  397 tcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcct 448  Q
    | | |||| |||  ||||| || ||| | ||||| |||||||||||||||||    
T  263713 ttcgctcactcatcaccttataatgaactttggtgtcctcctcatagatcct 263764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0819 (Bit Score: 81; Significance: 7e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0819
Description:

Target: scaffold0819; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 244 - 463
Target Start/End: Original strand, 445 - 667
Alignment:
Q  244 aaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctattt 340  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||   |||  ||||||||||| |||||| ||||||||||  ||| |||    
T  445 aaacattgctcttgtggcctttctcaccacaattaaaacagacaatctcagcaggagcattcttcttcttaggtcgcctatcatcgaccattctctgttt 544  T
Q  341 ccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctca 440  Q
     || || |||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| |||||   ||||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||| || |||    
T  545 gcccttatcagcaggagcactatagggcttagggcgactctgctggcccttagtcttccgctcattcaccatcttgtaatgagccttggtatcttcgtca 644  T
Q  441 tagatcctacagctgttaaccaa 463  Q
    || || ||||||||||| |||||    
T  645 taaattctacagctgttcaccaa 667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0412 (Bit Score: 81; Significance: 7e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0412
Description:

Target: scaffold0412; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 242 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 15554 - 15316
Alignment:
Q  242 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgc---agcatctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctat 338  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |  ||||| ||   |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  ||| |    
T  15554 acaaaaattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacagatgatctccgcaggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctctgt 15455  T
Q  339 ttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcct 438  Q
    || || || ||||| |||||||| || |||||||| | ||||||||| | |||   ||||| |||||| || || ||||| ||||| || || |||||||    
T  15454 ttgcccttatcagctggggcactatagggcttagggcaactctgctggcgcttagtcttccactcatttacaacattgtaatgagctttcgtgtcctcct 15355  T
Q  439 catagatcctacagctgttaaccaaatctggaaaaactc 477  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  15354 catagattctacagctgttcaccaaatcaggaaaaactc 15316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 81; Significance: 7e-38; HSPs: 4)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 120 - 292
Target Start/End: Original strand, 153699 - 153871
Alignment:
Q  120 gtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgtcctttctaacgtcacctaa 219  Q
    |||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||||||||  || | ||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||  ||||| |    
T  153699 gtacactgcgaactaatgtgaccttcctcattgcagttatagcaaacaatgtctccacgcttacaatcagctaatgtgtgtcctttctgaccacacctga 153798  T
Q  220 agcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctc 292  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  153799 agcacttcttctcatctctatcacagacattactcttatggcttttttcaccacacttgaagcaaacaatctc 153871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Original strand, 151655 - 151766
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  |||| | ||||||| |    ||||||||||||||   ||||||||| || ||||| ||    
T  151655 tagcaattaaaggagtactattaaagaaacaaatacctctaataagcctgtcctcactagtggtttgcgtaccagtcagagcaaacactttaccaccggt 151754  T
Q  101 cctaaccttctt 112  Q
    ||||||||||||    
T  151755 cctaaccttctt 151766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 242 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 23508 - 23305
Alignment:
Q  242 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctg---cagcatctttcttcttaggccgcctaacatc-gaccatcttcta 337  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||| || |||| |||||||| |   || ||||||| ||  |||||| |||  ||||   | ||||| |     
T  23508 acaagcattactcttatggcctttctcaccacaagtgtagcaaacaatctcagcaacaacatctttatttctaggcctcctctcatcattcaatctt-tg 23410  T
Q  338 tttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcc 437  Q
    ||| || || |||||||| |||||||| ||||| |||||| | | ||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||| ||||| |||    
T  23409 ttttcccttatcagcaggagcactgtaaggctttggacgagtttactgacctttgcctttcctctcattcacaaccttgtaatgacccttagtatcttcc 23310  T
Q  438 tcata 442  Q
    |||||    
T  23309 tcata 23305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 455
Target Start/End: Original strand, 153927 - 154037
Alignment:
Q  345 ttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcc-cttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatag 443  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||  | |||  ||  |||||||| ||||| || || |||||||||||     
T  153927 ttgtcagcaggagcactatatggcttcggacgactctgctgtcccttacctctttgt-tcacccatcaccttgtaatgagctttcgtctcctcctcataa 154025  T
Q  444 atcctacagctg 455  Q
    ||||||||||||    
T  154026 atcctacagctg 154037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0501 (Bit Score: 80; Significance: 3e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0501
Description:

Target: scaffold0501; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 242 - 448
Target Start/End: Original strand, 253 - 462
Alignment:
Q  242 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctat 338  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||   |||| |||||||||||||| ||| | ||||||||  ||| |    
T  253 acaagcattgctcttgtggcctttctcaccacaattaaagcagacaatctcagcaggaacatccttcttcttaggccgtctatcctcgaccattctctgt 352  T
Q  339 ttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcct 438  Q
    || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||  ||||| ||||||||| | |||||| ||| |||| || || ||||    
T  353 ttgcccttatcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctattgtcccctggtcttccgctcattcacaatcttgtaatgaaccttagtgtcatcct 452  T
Q  439 catagatcct 448  Q
    |||| |||||    
T  453 cataaatcct 462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0501; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 105 - 145
Target Start/End: Original strand, 116 - 156
Alignment:
Q  105 accttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttc 145  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  116 accttcttaggcttcgtacactgtgaactaatatgaccttc 156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 80; Significance: 3e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 242 - 448
Target Start/End: Original strand, 2318 - 2527
Alignment:
Q  242 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctat 338  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| | ||   |||||||||||||||| || ||| |||| |||||  |||||    
T  2318 acaagcattgctcttgtggcctttctcaccacaagtatagcacacaatctcagtaggaacatctttcttcttagggcgtctatcatcaaccattctctat 2417  T
Q  339 ttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcct 438  Q
    || || || |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| |||| | ||||||||| | |||||| |||| ||||||||||||||    
T  2418 tttcccttatcagcaagggcactgtaaggcttaggacgactctgttgacccttggcctttcgctcattcacaatcttgtaatgagtcttggtatcctcct 2517  T
Q  439 catagatcct 448  Q
    | || |||||    
T  2518 cgtaaatcct 2527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 80; Significance: 3e-37; HSPs: 4)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 242 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 17041 - 16804
Alignment:
Q  242 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctat 338  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||| ||||   |||| || |||||||| ||  |  | ||||||||| ||| |    
T  17041 acaaacagtgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacaagtaatctcagcaggaacatcctttttcttaggtcgtttctcctcgaccatcctctgt 16942  T
Q  339 ttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcct 438  Q
    || || || |||||||||||||| || |||||||| | ||||||||| |||||   ||||| |||||| || |||||||| |||||  |||| |||||||    
T  16941 ttgcccttatcagcaggggcactatatggcttagggctactctgctggcccttagtcttccgctcattaacaaccttgtaatgagctctggtgtcctcct 16842  T
Q  439 catagatcctacagctgttaaccaaatctggaaaaact 476  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16841 catagatcctacagctgttcaccaaatctggaaaaact 16804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 176 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 4494 - 4202
Alignment:
Q  176 acgcttacaattagctaaagtgtgtcctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaa 275  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||  ||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||     
T  4494 acgcttacaatcagctaatgtgtgtcctttctgaccacacctgaagcatttcttctcatctctatcacaaacattactcttttggcctttctcgccacac 4395  T
Q  276 ttgaagcacacaatctc---tgcagcatctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttag 372  Q
    |||||||| ||||| ||    | ||||||| || |||| |||| |||  ||||    |   |||  || || ||||||||||| ||| |||||||||| |    
T  4394 ttgaagcaaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcctctcatcatttaaactctgcttacccttgtcagcaggagcagtgtacggcttcg 4295  T
Q  373 gacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctacagctgttaaccaaatc 466  Q
    |||||||||| |||||||||||  | |  ||| |||  |||||||| ||||  || |||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||    
T  4294 gacgactctgttgtcccttgcctctacgttcactcatcaccttgtaatgag-tttcgtatcctcctcataaatcctacagctgcttaccaaatc 4202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #3
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 377 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 21425 - 21326
Alignment:
Q  377 actctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctacagctgttaaccaaatctggaaaaact 476  Q
    ||||||||| |||||   ||||| |||||| || |||||||| |||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21425 actctgctggcccttagtcttccgctcattaacaaccttgtaatgagctctggtgtcctcctcatagatcctacagctgttcaccaaatctggaaaaact 21326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #4
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 272 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 194813 - 194634
Alignment:
Q  272 acaattgaagcacacaatctctgcag---catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcagcaggggcactgtacggc 368  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||||   |||| || ||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||| || || |||||||||||||| || |||    
T  194813 acaattaaagcagacaatctcagcagggacatccttattcttaggccgcctatcatcgaccattctctgtttgcccttatcagcaggggcactataaggc 194714  T
Q  369 ttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcct 448  Q
    ||||| ||||||||||| |||||   |||||  ||||| || | |||||| | |||||| || |||||||| || |||||    
T  194713 ttagggcgactctgctggcccttagtcttccgttcatttacaatcttgtaataagccttagtgtcctcctcgtaaatcct 194634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 79; Significance: 1e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 242 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 7754 - 7482
Alignment:
Q  242 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagcat---ctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctat 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| || ||||| || |||| |    | || ||||| ||||||||| | ||||||||  |||||    
T  7754 acaaacattactcttgtggcctttcccgccacagttgaaacaaacaatatccgcaggagtagccttattctttggccgcctatcgtcgaccattctctat 7655  T
Q  339 ttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcct 438  Q
    || ||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||| |||||||| |||||  |||||||||| |    
T  7654 ttgcctttatcagcaggggcactataaggtttagggcgactctgctggcccttggtcttccgctcattcacaaccttgtaatgagctctggtatcctctt 7555  T
Q  439 catagatcctacagctgttaaccaaatctggaaaaactctcagccgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 511  Q
    |||||||||||||| |||| || ||||| |  | |||||  | | |||| || || |||||||||||||||||    
T  7554 catagatcctacagatgttcactaaatcagcgacaactcggatctgttggtatccgatcgccctcttgatgtc 7482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 4096 - 3992
Alignment:
Q  13 gagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttctt 112  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||| || ||||| ||  | ||||||||||| |||||||||  | |||||||    
T  4096 gagtactattaaagaaacaagtacctcttataagtcggtcctcattaaccgtctgtgtaccggtcaatgcaaacacctttccacctgtctgagccttctt 3997  T
Q  113 aggct 117  Q
    |||||    
T  3996 aggct 3992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 79; Significance: 1e-36; HSPs: 4)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 242 - 463
Target Start/End: Original strand, 32208 - 32432
Alignment:
Q  242 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctat 338  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||| ||||   |||| |||||||||||||||||| ||||||||||  | | |    
T  32208 acaagcattgctcttgtggcctttctcgccacaattaaaacagacaatctcagcaggagcatccttcttcttaggccgcctatcatcgaccattctttgt 32307  T
Q  339 ttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcct 438  Q
    || || || |||||| |||| || || |||||||| ||||||||||| |||||   ||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  32308 ttgcccttatcagcaagggcgctatagggcttagggcgactctgctggcccttagtcttccgctcattcacaaccttgtaatgagccttggtatcctcct 32407  T
Q  439 catagatcctacagctgttaaccaa 463  Q
    |||| || || || ||||| |||||    
T  32408 cataaattctgcaactgttcaccaa 32432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 242 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 10214 - 9999
Alignment:
Q  242 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctat 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||| | ||||| || ||||| || ||||   |||| |||||||| ||||||||| ||||||||||  |||      
T  10214 acaaacattactcttgtggcctttcccgccatagttgaaacaaacaatatccgcaggagcatccttcttctttggccgcctatcatcgaccattctctgc 10115  T
Q  339 ttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcct 438  Q
    || || || |||||| ||||||| || || ||||| ||||||||||| ||||||  || | ||||||| || | |||||| |||||  |||||||||| |    
T  10114 ttgcccttatcagcaagggcactataaggtttagggcgactctgctgacccttggtctacttctcattaacaatcttgtaatgagctctggtatcctctt 10015  T
Q  439 catagatcctacagct 454  Q
    |||||||||| |||||    
T  10014 catagatcctgcagct 9999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #3
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 242 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 12869 - 12654
Alignment:
Q  242 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctat 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||| | ||||| || ||||| || ||||   |||| |||||||| ||||||||| ||||||||||  |||      
T  12869 acaaacattactcttgtggcctttcccgccatagttgaaacaaacaatatccgcaggagcatccttcttctttggccgcctatcatcgaccattctctgc 12770  T
Q  339 ttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcct 438  Q
    || || || |||||| ||||||| || || ||||| ||||||||||| ||||||  || | ||||||| || | |||||| |||||  |||||||||| |    
T  12769 ttgcccttatcagcaagggcactataaggtttagggcgactctgctgacccttggtctacttctcattaacaatcttgtaatgagctctggtatcctctt 12670  T
Q  439 catagatcctacagct 454  Q
    |||||||||| |||||    
T  12669 catagatcctgcagct 12654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #4
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 296 - 448
Target Start/End: Original strand, 55023 - 55175
Alignment:
Q  296 agcatctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgccc 395  Q
    |||||| |||||||| ||||| ||| | ||||||||| ||| ||| |  || |||||||||||||| || |||||| | ||||| || || | |||   |    
T  55023 agcatccttcttcttcggccgtctatcttcgaccatcctctgtttgctcttatcagcaggggcactataaggcttatggcgactttgttggcacttagtc 55122  T
Q  396 ttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcct 448  Q
    |||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  55123 ttccgctcattcaccatcttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcct 55175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 78; Significance: 4e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 242 - 454
Target Start/End: Original strand, 171447 - 171662
Alignment:
Q  242 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctc---tgcagcatctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctat 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||   ||||||   || |||||| |||||||| ||||||||| || |||||||  ||| |    
T  171447 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgtaacaagtaatctcaactggagcatccttcttctttggccgcctatcaacgaccattctctgt 171546  T
Q  339 ttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcct 438  Q
    || || || ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  171547 ttgcccttatcagcaggggcgctatagggcttagggcgactctgctggcccttggtcttccgctcattcacaaccttgtaatgagccttagtatcttcct 171646  T
Q  439 catagatcctacagct 454  Q
    | ||||| ||| ||||    
T  171647 cgtagattctatagct 171662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0276 (Bit Score: 77; Significance: 2e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0276
Description:

Target: scaffold0276; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 133 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 24007 - 23733
Alignment:
Q  133 tgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgtcctttctaacgtcacctaaagcacttcttctc 232  Q
    |||||||||||||  |||| || ||||| || ||||  |||| |||||| || | ||||||| |||| || |||| ||  ||||| ||||||||| | ||    
T  24007 tgatatgaccttccccattgcaattgtaacagacaatgtccccacgcttgcattcagctaaactgtgacccttctgaccacacctgaagcacttcctatc 23908  T
Q  233 atctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catctttcttcttaggccgcctaacatcgacc 329  Q
    |||||   |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | || ||||||||  |||   ||||| || |||| |||| |||| ||||  ||    
T  23907 atctcttccacatacattactcttgtggcctttctcaccacacttgtatcaaacaatctcaacaggagcatctctcctcttgggcctcctatcatcaccc 23808  T
Q  330 atcttctatttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctca 404  Q
    |||||||  || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||    
T  23807 atcttctgctttcctttgtcagcaggagcactgtaaggcttaggacgactctgttgtcccttacccctcctctca 23733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 76; Significance: 7e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 242 - 448
Target Start/End: Original strand, 346 - 555
Alignment:
Q  242 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgc---agcatctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctat 338  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||  |   |||||||||||||||||||| |||| |||| |||||  ||  |    
T  346 acaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtatagcagacaatctccacaagagcatctttcttcttaggccacctatcatcaaccattctcggt 445  T
Q  339 ttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcct 438  Q
    || || || |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||| | |||  ||||||||| | ||| || |||||||||||||||||||    
T  446 ttacccttatcagcaggagcactgtaaggcttaggacgactctgctgacctttggctttctgctcattcacaatcttataatgagccttggtatcctcct 545  T
Q  439 catagatcct 448  Q
    |||| |||||    
T  546 catatatcct 555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 242 - 448
Target Start/End: Original strand, 4763 - 4972
Alignment:
Q  242 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgc---agcatctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctat 338  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||  |   |||||||||||||||||||| |||| |||| |||||  ||  |    
T  4763 acaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtatagcagacaatctccacaagagcatctttcttcttaggccacctatcatcaaccattctcggt 4862  T
Q  339 ttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcct 438  Q
    || || || |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||| | |||  ||||||||| | ||| || |||||||||||||||||||    
T  4863 ttacccttatcagcaggagcactgtaaggcttaggacgactctgctgacctttggctttctgctcattcacaatcttataatgagccttggtatcctcct 4962  T
Q  439 catagatcct 448  Q
    |||| |||||    
T  4963 catatatcct 4972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 76; Significance: 7e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 242 - 448
Target Start/End: Original strand, 220 - 429
Alignment:
Q  242 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctat 338  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||   || || |||||||||||||   |||| |||||||| ||||| ||| | ||||||||| ||| |    
T  220 acaagcattactcttgtggcccttctcaccacaagaaaaacaaacaatctctgcaggagcatccttcttctttggccgtctatcttcgaccatcctctgt 319  T
Q  339 ttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcct 438  Q
    || || || ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||  | |||| ||||||||| | |||||| |||| ||||||||| ||||    
T  320 tttcccttatcagcaggggcactgtaaggcttagggagactctgctgacccttagctttccgctcattcacaatcttgtaatgagtcttggtatcttcct 419  T
Q  439 catagatcct 448  Q
    ||||||||||    
T  420 catagatcct 429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 448
Target Start/End: Original strand, 3300 - 3403
Alignment:
Q  345 ttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcataga 444  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||  | | |||| |||  ||||| || ||||| || |||||||| ||||| |    
T  3300 ttgtcagcaggggcactatacggcttcggacgactctgttgtcccttgcctctgcgctcactcatcaccttataatgagctttcgtatcctcttcatata 3399  T
Q  445 tcct 448  Q
    ||||    
T  3400 tcct 3403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 74; Significance: 1e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 242 - 442
Target Start/End: Original strand, 8552 - 8755
Alignment:
Q  242 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctat 338  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||| ||||||| |||||   |||| ||||||||||||||||||  |||||||||  ||| |    
T  8552 acaagcattactcttgtggcctttctgaccacaagtaaagcagacaatctttgcaggagcatccttcttcttaggccgcctattatcgaccattctctgt 8651  T
Q  339 ttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcct 438  Q
    || || || || ||| | |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||  | |||| ||||||||| | |||||| |||||||| ||||||||||    
T  8652 ttgcccttatcggcaagagcactgtaaggcttagggcgactctgctgacccttagctttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttagtatcctcct 8751  T
Q  439 cata 442  Q
    ||||    
T  8752 cata 8755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 73; Significance: 4e-33; HSPs: 6)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 123 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 12506 - 12346
Alignment:
Q  123 cactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgtcctttctaacgtcacctaaagc 222  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||  |||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||| |   ||||||||||    
T  12506 cactgcgaactgatatgaccttcctcattgcagttataacaaacaatgtccccacgcttacaatcatctaatgtgtgtcctttctgagcacacctaaagc 12407  T
Q  223 acttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagca 283  Q
    ||||||||||||||     | ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  12406 acttcttctcatctttacgaaaaacattactcttgtggcctttctcgccacacttgaagca 12346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 123 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 20686 - 20526
Alignment:
Q  123 cactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgtcctttctaacgtcacctaaagc 222  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||  |||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||| |   ||||||||||    
T  20686 cactgcgaactgatatgaccttcctcattgcagttataacaaacaatgtccccacgcttacaatcatctaatgtgtgtcctttctgagcacacctaaagc 20587  T
Q  223 acttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagca 283  Q
    ||||||||||||||     | ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  20586 acttcttctcatctttacgaaaaacattactcttgtggcctttctcgccacacttgaagca 20526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #3
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 345 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 12283 - 12162
Alignment:
Q  345 ttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcataga 444  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||  | |  ||| |||  |||||||| ||| | || |||||||||||||| |    
T  12283 ttgtcagcaggagcactgtacggcttcggacgactatgctatcccttgcctctacgatcactcatcaccttgtaatgatctttcgtatcctcctcataaa 12184  T
Q  445 tcctacagctgttaaccaaatc 466  Q
    ||||||||||| | ||||||||    
T  12183 tcctacagctgcttaccaaatc 12162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #4
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 345 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 20463 - 20342
Alignment:
Q  345 ttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcataga 444  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||  | |  ||| |||  |||||||| ||| | || |||||||||||||| |    
T  20463 ttgtcagcaggagcactgtacggcttcggacgactatgctatcccttgcctctacgatcactcatcaccttgtaatgatctttcgtatcctcctcataaa 20364  T
Q  445 tcctacagctgttaaccaaatc 466  Q
    ||||||||||| | ||||||||    
T  20363 tcctacagctgcttaccaaatc 20342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #5
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 12558 - 12504
Alignment:
Q  7 ttaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcac 61  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  12558 ttaaaggagtactatgaaagaaacaagtagctttgataagtcggtcctcattcac 12504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #6
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 20738 - 20684
Alignment:
Q  7 ttaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcac 61  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  20738 ttaaaggagtactatgaaagaaacaagtagctttgataagtcggtcctcattcac 20684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0273 (Bit Score: 72; Significance: 2e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0273
Description:

Target: scaffold0273; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 242 - 448
Target Start/End: Original strand, 369 - 578
Alignment:
Q  242 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctat 338  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||   |||| |||||| | ||||||||| | ||||||||| ||| |    
T  369 acaagcattgctcttgtggcctttctcaccacaattaaaacaaacaatctcagcaggaacatccttcttccttggccgcctatcttcgaccatcctctgt 468  T
Q  339 ttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcct 438  Q
    || || || ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||| |||||   ||||| ||||| ||| |||||||| |||||||| || |||||||    
T  469 ttgcccttatcagcaggggcgctataaggcttagggcgactctgctggcccttagtcttccgctcatacacaaccttgtaatgagccttagtgtcctcct 568  T
Q  439 catagatcct 448  Q
    |||| |||||    
T  569 cataaatcct 578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 72; Significance: 2e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 242 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 4530 - 4321
Alignment:
Q  242 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctat 338  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |  |||| ||||||||  |||   ||||||||||||||||||||||| |||| |||||  ||| |    
T  4530 acaagcattactcttgtggcctttttcaccacaagtatagcagacaatctccacaggagcatctttcttcttaggccgcctatcatcaaccattctctgt 4431  T
Q  339 ttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcct 438  Q
    ||  | || |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||   |||| ||||||||| | |||||| | || ||||||||||||||    
T  4430 ttatccttatcagcaggagcactgtaaggcttaggacgactctgctgacctttggttttccgctcattcacaatcttgtaataagtcttggtatcctcct 4331  T
Q  439 catagatcct 448  Q
    |||| |||||    
T  4330 catatatcct 4321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 72; Significance: 2e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 253 - 463
Target Start/End: Original strand, 21944 - 22157
Alignment:
Q  253 tcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtc 349  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||   |||| |||||| | ||||| ||| ||||||||||| ||| ||| || ||       
T  21944 tcttgtggcctttctcaccacaattaaaacagacaatctcagcaggagcatccttcttccttggccgtctatcatcgaccatcctctgtttgcccttaaa 22043  T
Q  350 agcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatccta 449  Q
    |||||||||||| || |||||| |||||||| |||| |||||   ||||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||     
T  22044 agcaggggcactatagggcttaagacgactcagctggcccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcataaatcctg 22143  T
Q  450 cagctgttaaccaa 463  Q
    || ||||| |||||    
T  22144 caactgttcaccaa 22157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 253 - 463
Target Start/End: Original strand, 37368 - 37581
Alignment:
Q  253 tcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtc 349  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||   |||| |||||| | ||||| ||| ||||||||||| ||| ||| || ||       
T  37368 tcttgtggcctttctcaccacaattaaaacagacaatctcagcaggagcatccttcttccttggccgtctatcatcgaccatcctctgtttgcccttaaa 37467  T
Q  350 agcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatccta 449  Q
    |||||||||||| || |||||| |||||||| |||| |||||   ||||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||     
T  37468 agcaggggcactatagggcttaagacgactcagctggcccttagtcttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcctcataaatcctg 37567  T
Q  450 cagctgttaaccaa 463  Q
    || ||||| |||||    
T  37568 caactgttcaccaa 37581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239 (Bit Score: 71; Significance: 6e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0239
Description:

Target: scaffold0239; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 10002 - 9730
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |  |  |||||    || |||||||||||  |||||||||| || ||||| ||    
T  10002 tagcaattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctctgataagcctata-tcattagtagtctgcgtaccagtcaaagcaaacacttttccaccagt 9904  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgt 200  Q
     ||||||||||| ||| | || ||||| | ||||||||| |  ||||| || ||||| || || |||||||| | |||||| ||||  ||||||  |||     
T  9903 tctaaccttcttcggcagtgtgcactgtgtactgatatggcactcttcgttgcagttataacatacaacatcaccacgcttgcaatccgctaaaaggtga 9804  T
Q  201 cctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcat-ctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccaca 274  Q
    || |||||||  ||||| |||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9803 cccttctaaccacacctgaagcacttcttctcatccttggt-acaaacattactcttgtggcctttctcgccaca 9730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 348 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 9653 - 9553
Alignment:
Q  348 tcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcc 447  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  | | |||| |||  ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  9653 tcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagctttggtgtcctcctcatagatcc 9554  T
Q  448 t 448  Q
    |    
T  9553 t 9553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 71; Significance: 6e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 5 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 19181 - 19023
Alignment:
Q  5 aattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgtccta 104  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||| | ||||||| |    ||||||||||||||   ||||||||| || ||||| ||||||    
T  19181 aattaaaggagtactattaaagaaacaagcacctctgataagcctgtcctcactagtggtttgcgtaccagtcagagcaaacactttaccaccggtccta 19082  T
Q  105 accttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagca 163  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  19081 accttcttcggttgtgtacactgcgaactgatatgaccttcctcattgcagttatagca 19023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 71; Significance: 6e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 53639 - 53366
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||    || |||||||||||  | ||||| || || ||||| ||    
T  53639 tagcaattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctctgataagttggtcctcattagtagtctgcgtaccagtcaatgcaaatactttcccaccggt 53540  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgt 200  Q
     ||||||||||| ||||  || || || ||||||||||| || |||||||||||||| || || || || || | |||||| |||| | |||   |||||    
T  53539 tctaaccttcttcggctatgtgcattgtgaactgatatggccctcttcattacagttataacataccacgtcaccacgcttgcaatcaactaggatgtgt 53440  T
Q  201 cctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcat-ctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccaca 274  Q
    ||||| | ||  ||||| || || |||||||||| ||  || ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  53439 cctttttgaccacacctgaatcatttcttctcatccttagt-acaaacattactcttgtggcctttctcgccaca 53366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1845 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold1845
Description:

Target: scaffold1845; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 219 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 1302 - 1055
Alignment:
Q  219 aagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catctttcttcttaggcc 315  Q
    ||||||||| |||||||||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| | || |||||||| ||||   ||||| || |||| || |    
T  1302 aagcacttcctctcatctctaccacaaacattgctcttgtggcctttctcaccacacttgtaacaaacaatctcagcaggagcatctctcctcttgggtc 1203  T
Q  316 gcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactacctt 415  Q
     |||| ||||   ||||||||  || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||||| ||| || |||    
T  1202 tcctatcatcattcatcttctgctttcctttgtcagcaggagcactgtaaggcttaggacgattcttctgtccctttcccctcctctcactcattatctt 1103  T
Q  416 gtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctacagctgttaaccaa 463  Q
    ||| ||||| ||||| || || || || ||||| || ||||| |||||    
T  1102 gtaatgagctttggtgtcttcttcgtaaatcctgcaactgtttaccaa 1055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0765 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0765
Description:

Target: scaffold0765; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 6473 - 6080
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| |||||||||||    || || ||||||||  ||||||| ||||| ||||| ||    
T  6473 tagcaattaaaggagtactattatagaaacaagtacctctgataagacggtcctcattagtagtctgtgtaccagtcaaagcaaatacctttccaccagt 6374  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgt 200  Q
     |||||||||||  | || || ||||| | |||||| || || | ||| ||||| || ||||| |||| ||| | ||||||||||| |||||    |||     
T  6373 tctaaccttcttctgttgtgtgcactgagtactgatgtggccctattcgttacaattatagcatacaatatcgccacgcttacaatcagctagcacgtga 6274  T
Q  201 cctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcat-ctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatct---ctgca 296  Q
    || |||| ||  ||||| |||||||||||||||| || ||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || || || ||||   | | |    
T  6273 cccttctgaccacacctgaagcacttcttctcatccttggt-acaaacgttactcttgtggcctttctcgccacacttaaaacaaactatctcgacagga 6175  T
Q  297 gcatctttcttcttaggccgcctaacatcgacca-tcttctatttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtccctt 391  Q
    |||||| || | || |||| |||  ||||   || |||| |  || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6174 gcatctctcctattcggcctcctctcatcattcagtctt-tgcttacccttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgttgtccctt 6080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0611 (Bit Score: 68; Significance: 4e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0611
Description:

Target: scaffold0611; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 242 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 9418 - 9221
Alignment:
Q  242 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctat 338  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | || || |||||||||||||   |||| ||||||| |||||||||| | ||||||||  ||  |    
T  9418 acaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtaaaacagacaatctctgcaggagcatccttcttctaaggccgcctatcttcgaccattctcggt 9319  T
Q  339 ttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctc 436  Q
    || || || |||||||||||||| || |||||| | ||||||||||| |||||   ||||  ||||||||| | |||||| |||||||||||||||||    
T  9318 ttgcccttatcagcaggggcactataaggcttaaggcgactctgctgacccttagtcttcggctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctc 9221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 68; Significance: 4e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 242 - 448
Target Start/End: Original strand, 15240 - 15449
Alignment:
Q  242 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctat 338  Q
    |||| |||||| ||||||||| ||||||||||||   ||  | |||||||||| ||   |||| |||||||||||||| ||| | ||||||||| ||| |    
T  15240 acaagcattacccttgtggcccttctcaccacaagaaaaaaaaacaatctctgtaggagcatccttcttcttaggccgtctatcttcgaccatcctctgt 15339  T
Q  339 ttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcct 438  Q
    || || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| || |||||  | |||| ||||||||| | |||||| |||| ||||||||||||||    
T  15340 ttgcccttatcagcaggggcactataaggcttagggcgactctgttgacccttagctttccgctcattcacaatcttgtaatgagtcttggtatcctcct 15439  T
Q  439 catagatcct 448  Q
    ||||||||||    
T  15440 catagatcct 15449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 348 - 476
Target Start/End: Original strand, 15 - 143
Alignment:
Q  348 tcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcc 447  Q
    |||||||||||||| || ||||||||  |||||||||| |||||   ||||| |||||| || |||||||| |||||  || | |||||||||||||| |    
T  15 tcagcaggggcactatagggcttagggtgactctgctggcccttagtcttccgctcattaacaaccttgtaatgagctctgatgtcctcctcatagattc 114  T
Q  448 tacagctgttaaccaaatctggaaaaact 476  Q
    | ||||| || |||||||||| |||||||    
T  115 ttcagctattcaccaaatctgcaaaaact 143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 68; Significance: 4e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 242 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 36795 - 36526
Alignment:
Q  242 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctat 338  Q
    |||| |||| ||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||||| ||||   |||| |||||| | ||||| ||| | ||||||||| | | |    
T  36795 acaagcattgctcttatggcctttctcgccacaattaaaacagacaatctcagcaggagcatccttcttccttggccgtctatcctcgaccatcctttgt 36696  T
Q  339 ttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcct 438  Q
    || || || |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||| | ||||| || |||||| | |||||| |||||||||||||||||||    
T  36695 ttgcccttatcagcaggggcactatagggcttagggcgactctgctggcccttactcttccgctaattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcct 36596  T
Q  439 catagatcctacagctgttaaccaaatctggaaaaactctcagccgttgatacccaatcgccctcttgat 508  Q
    |||| || || || ||||| ||||| || |  |||||||  | | |||| || ||||| |||||||||||    
T  36595 cataaattctgcaactgttcaccaactcggagaaaactcagatctgttggtatccaattgccctcttgat 36526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 242 - 275
Target Start/End: Original strand, 26681 - 26714
Alignment:
Q  242 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacaa 275  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26681 acaagcattactcttgtggcctttctcaccacaa 26714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 66; Significance: 6e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 242 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 10855 - 10648
Alignment:
Q  242 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctat 338  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||   || || |||||||||| ||   |||| |||||||||||||| ||  | ||||||||| ||| |    
T  10855 acaagcattactcttgtggcccttctcaccacaagaaaaacaaacaatctctgtaggagcatccttcttcttaggccgtctgtcttcgaccatcctctgt 10756  T
Q  339 ttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcct 438  Q
    || || || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||  || |||||  | |||| ||||||||| | |||||| |||  ||||||||||||||    
T  10755 ttgcccttatcagcaggggcactgtaaggcttagggcgactcttttgacccttagctttccgctcattcacaatcttgtaatgaatcttggtatcctcct 10656  T
Q  439 catagatc 446  Q
    ||||||||    
T  10655 catagatc 10648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 66; Significance: 6e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 242 - 442
Target Start/End: Original strand, 48059 - 48262
Alignment:
Q  242 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctat 338  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||  |||   ||||||||||  |||| |||||  |||| |||||  ||| |    
T  48059 acaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtatagcagacaatctcaacaggagcatctttctttctagggcgcctctcatcaaccattctctgt 48158  T
Q  339 ttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcct 438  Q
    || || || |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||| | || | ||||||||| | |||||| |||| ||||||||||||||    
T  48159 ttacccttatcagcaggagcactgtaaggcttaggacgactctgctgacctttggcttttcgctcattcacaatcttgtaatgagtcttggtatcctcct 48258  T
Q  439 cata 442  Q
    ||||    
T  48259 cata 48262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 247 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 55441 - 55243
Alignment:
Q  247 cattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccc 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||  |||   ||||||||||  |||| |||||  |||| |||||  ||| ||| ||    
T  55441 cattactcttgtggcctttctcaccacaagtatagcagacaatctcaacaggagcatctttctttctagggcgcctctcatcaaccattctctgtttacc 55342  T
Q  344 tttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcata 442  Q
     || |||||||| |||||||| | |||||||||||||||||| || ||| | || | ||||||||| | |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  55341 cttatcagcaggagcactgtaagtcttaggacgactctgctgacctttgtcttttcgctcattcacaatcttgtaatgagtcttggtatcctcctcata 55243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0443 (Bit Score: 64; Significance: 9e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0443
Description:

Target: scaffold0443; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 11897 - 12178
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    || || ||||||||  ||||||||||||| |||||  |    
T  11897 tagcaattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctctgataagtcggtcctcattaggagtctgtgtaccagtcaaagcaaacacctttccaccaat 11996  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgt 200  Q
     |||  |||||| ||||  | |||||| |||||       ||     |||| |||||||| || | ||  |||| |||||| || | ||||||| ||||     
T  11997 tctagtcttcttcggctcaggacactgtgaact-------cc-----cattgcagttgtaacagataatgtccccacgcttgcattcagctaaactgtga 12084  T
Q  201 cctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctg 294  Q
    || |||| ||  ||||| ||||||||| | |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||    
T  12085 cccttctgaccacacctgaagcacttcctatcatctcttccacaaacattactcttgtggcctttctcaccacacttgtagcaaacaatctctg 12178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0411 (Bit Score: 64; Significance: 9e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0411
Description:

Target: scaffold0411; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 242 - 448
Target Start/End: Original strand, 8740 - 8949
Alignment:
Q  242 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagca---tctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctat 338  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||   || || |||||||| | || |   || ||||||||||| || ||| | ||||||||| ||| |    
T  8740 acaagcattactcttgtggcccttctcaccacaagaaaaacaaacaatctcagtaggagtatccttcttcttaggtcgtctatcttcgaccatcctctgt 8839  T
Q  339 ttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcct 438  Q
    || || || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||  | |||| ||||||||| | |||||| |||| ||||||||||| ||    
T  8840 tttcccttatcagcaggggcactgtaaggcttagggcgactctgttgacccttagctttccgctcattcacaatcttgtaatgagtcttggtatccttct 8939  T
Q  439 catagatcct 448  Q
    ||||||||||    
T  8940 catagatcct 8949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 64; Significance: 9e-28; HSPs: 3)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 242 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 110882 - 110673
Alignment:
Q  242 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctat 338  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||  |||   ||||||||||  |||| |||||  |||| |||||  |||      
T  110882 acaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtatagcagacaatctcaacaggagcatctttctttctagggcgcctctcatcaaccattctctgc 110783  T
Q  339 ttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcct 438  Q
    ||||| || || ||||| |||||||  ||||||||||| |||||||| || ||| | |||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||    
T  110782 ttccccttatcggcaggagcactgtgaggcttaggacggctctgctgacctttgactttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttggtatcctcct 110683  T
Q  439 catagatcct 448  Q
    |||| |||||    
T  110682 cataaatcct 110673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 242 - 297
Target Start/End: Original strand, 18174 - 18229
Alignment:
Q  242 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag 297  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||| || |||| |||||||| ||||    
T  18174 acaagcattactcttatggcctttctcaccacaagtgtagcaaacaatctcagcag 18229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 348 - 442
Target Start/End: Original strand, 18283 - 18377
Alignment:
Q  348 tcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcata 442  Q
    |||||||| ||| |||| ||||| |||||||| | ||| || || || ||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||| || |||||    
T  18283 tcagcaggagcattgtaaggctttggacgacttttctgacctttacctttcctctcattcacagccttgtaatgagctttggtatcttcttcata 18377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0305 (Bit Score: 63; Significance: 4e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0305
Description:

Target: scaffold0305; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 250 - 511
Target Start/End: Original strand, 3201 - 3465
Alignment:
Q  250 tactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttcccttt 346  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |   |||||| ||||   |||| || ||||||||||| ||  | ||||||||| ||| ||| || ||    
T  3201 tactcttgtggcctttctcaccacaattgaaagaagtaatctcagcaggaacatcctttttcttaggccgtctctcctcgaccatcctctgtttgccctt 3300  T
Q  347 gtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatc 446  Q
     |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||   ||||| |||||| || |||||||| |||||  |||| ||||||| ||| ||     
T  3301 atcagcaggggcactataaggcttagggcgactctgctggcccttagtcttccgctcattaacaaccttgtaatgagctctggtgtcctccttataaatt 3400  T
Q  447 ctacagctgttaaccaaatctggaaaaactctcagccgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 511  Q
    ||  || | || |||||||||||||||||||  | | |||| || || ||||||||||| |||||    
T  3401 ctgtagttattcaccaaatctggaaaaactcggatctgttggtatccgatcgccctcttaatgtc 3465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1459 (Bit Score: 61; Significance: 6e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold1459
Description:

Target: scaffold1459; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 242 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 1067 - 829
Alignment:
Q  242 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctat 338  Q
    ||||||| | |||||| |||||||||| ||||||||||| ||   |||||| | ||   |||| |||||||||||||| ||  | || |||||| ||| |    
T  1067 acaaacaatgctcttgcggcctttctcgccacaattgaaacaggtaatctcagtaggaacatccttcttcttaggccgtctttcctctaccatcctctgt 968  T
Q  339 ttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcct 438  Q
     | |  || |||||||||||||| || |||||||| | |||||| || |||||   ||||| ||||||||| |||||||| |||||| |||||||||| |    
T  967 gtgcgcttatcagcaggggcactatagggcttagggcaactctgttggcccttagtcttccgctcattcacaaccttgtaatgagccctggtatcctcat 868  T
Q  439 catagatcctacagctgttaaccaaatctggaaaaactc 477  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||| |||||||||||    
T  867 catagattctacagctattcaccaaatatggaaaaactc 829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0319 (Bit Score: 61; Significance: 6e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0319
Description:

Target: scaffold0319; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 296 - 448
Target Start/End: Original strand, 6886 - 7038
Alignment:
Q  296 agcatctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgccc 395  Q
    |||||| ||||||||||| || ||| | ||||||||| ||| ||| |  || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||   |    
T  6886 agcatccttcttcttaggtcgtctatcttcgaccatcctctgtttgcacttatcagcaggggcactgtaaggcttagggcgactctgctgacccttagtc 6985  T
Q  396 ttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcct 448  Q
    |||| ||||||||| | |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  6986 ttccgctcattcacaatcttgtaatgagccttagtatcctcctcgtagatcct 7038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 61; Significance: 6e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 242 - 449
Target Start/End: Original strand, 3880 - 4090
Alignment:
Q  242 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgc---agcatctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctat 338  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| ||||| || |  |||| ||||| || ||   ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  ||| |    
T  3880 acaagcattactcttgtggtctttcacaccataagtatagcagacaatttcagcaggagcatctttcttcttaggccgcctatcatcaaccattctctgt 3979  T
Q  339 ttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcct 438  Q
    || || || |||||||| |||||||| | |||||||||||||||||| || |||   ||||||||||| || | |||||| |||| || |||||||||||    
T  3980 ttacccttatcagcaggagcactgtaagacttaggacgactctgctgacctttggttttcctctcatttacaatcttgtaatgagtctaggtatcctcct 4079  T
Q  439 catagatccta 449  Q
    | || ||||||    
T  4080 cgtaaatccta 4090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 242 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 40482 - 40273
Alignment:
Q  242 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctat 338  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||| |  || |  ||||||| ||||   ||||||||||  | || |||||| |||| ||||   ||| |    
T  40482 acaagcattgctcttgtggcctttctcaccacaagtatagaattcaatctcagcaggagcatctttctttctcgggcgcctatcatcaaccactctctgt 40383  T
Q  339 ttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcct 438  Q
    || || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| |||| | ||||||||| | |||||| |||| ||||||||||||||    
T  40382 tttcccttatcagcaggggcactgtaaggcttaggacgactctgttgacccttggcctttcgctcattcacaatcttgtaatgagtcttggtatcctcct 40283  T
Q  439 catagatcct 448  Q
    | || |||||    
T  40282 cgtaaatcct 40273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 59; Significance: 9e-25; HSPs: 3)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 117 - 274
Target Start/End: Original strand, 15276 - 15433
Alignment:
Q  117 tgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgtcctttctaacgtcacc 216  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| || ||||||||||| | |||||| |||| ||||| |||||||| ||||| ||  ||||    
T  15276 tgcgtgcactgtgaactgatatggccctcttcattgcagttataacaaacaacatcaccacgcttgcaatcagctagagtgtgtcatttctgaccacacc 15375  T
Q  217 taaagcacttcttctcat-ctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccaca 274  Q
    | |||||||||||||| | ||  || ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15376 tgaagcacttcttctcgtccttagt-acaaacattactcttgtggcctttctcgccaca 15433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 58
Target Start/End: Original strand, 15211 - 15268
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcatt 58  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  15211 tagcaattaaaggagtactataaaagaaacaagtacctctgataagtcgatcctcatt 15268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 345 - 454
Target Start/End: Original strand, 15507 - 15616
Alignment:
Q  345 ttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcataga 444  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||| | | |  ||| |||  |||||||| ||||| || || |||||||||||||    
T  15507 ttgtcagcaggagcactatacggcttcggacgactctgttgtcctttgctcattcgatcactcatcaccttgtaatgagctttcgtttcctcctcataga 15606  T
Q  445 tcctacagct 454  Q
    | || |||||    
T  15607 ttctgcagct 15616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0457 (Bit Score: 58; Significance: 4e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0457
Description:

Target: scaffold0457; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 342 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 13926 - 13805
Alignment:
Q  342 cctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcat 441  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||| ||| || ||| || ||||| ||||| || || ||||    
T  13926 cctttgtcagcaggagcactgtaaggcttaggacgattctgctgtcccttacccctcctctcactcattatcttttaatgagctttggtgtcttcttcat 13827  T
Q  442 agatcctacagctgttaaccaa 463  Q
    |||| ||||| |||||||||||    
T  13826 agattctacacctgttaaccaa 13805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 58; Significance: 4e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 242 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 17952 - 17749
Alignment:
Q  242 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctat 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    || | ||||||||  |||   ||||||||||  |||| |||||  |||| |||||  |||||    
T  17952 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacaagaatagtagacaatctcaacagaagcatctttctttctagggcgcctctcatcaaccattctctat 17853  T
Q  339 ttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcct 438  Q
    || || || |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  || ||| | || | ||||||||| | |||||| |||| ||| ||||||||||    
T  17852 ttacccttatcagcaggagcactgtaaggcttaggacgactctgctaacctttggcttttcgctcattcacgatcttgtaatgagtcttagtatcctcct 17753  T
Q  439 cata 442  Q
    ||||    
T  17752 cata 17749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 58; Significance: 4e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 348 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 66396 - 66287
Alignment:
Q  348 tcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcc 447  Q
    |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||   ||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| || |    
T  66396 tcagcaggggcactatagggcttagggcgactctgctggcccttagtcttccgctcattcacaaccttgtaatgagccttggtatcttcctcataaattc 66297  T
Q  448 tacagctgtt 457  Q
    ||||||||||    
T  66296 tacagctgtt 66287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 348 - 442
Target Start/End: Original strand, 11466 - 11560
Alignment:
Q  348 tcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcata 442  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  11466 tcagcaggggcactataaggcttgggacgactttgctgacccttgcctttcctctcattcacaaccttgtaatgagccttagtatcttcctcata 11560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 445
Target Start/End: Original strand, 15498 - 15945
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    ||||||||||||||||||||| || | |||| ||||||||| | | ||| ||||||||| | ||||||||||||||  ||||||| ||  | |||   ||    
T  15498 tagcaattaaaggagtactatcaaagtaacatgtacctctgatcaatcgatcctcattctctgtttgcgtaccagtcaaagcaaaaactcttccagtagt 15597  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgt 200  Q
    |  | |||||||||||| | |||| | |||||  ||||||||||||||||| |||||  | || ||||||||   | ||||||| | ||| | ||| ||     
T  15598 ctgagccttcttaggcttcttacattacgaaccaatatgaccttcttcattgcagttaaaacatacaacatcgtcatgcttacattcagcaagagtatgc 15697  T
Q  201 cctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagca- 299  Q
    || |||| ||  || | ||| |||   ||| |||| |    |||| |||||||||| |||||||||||||||||| || |||| |||||||| ||| ||     
T  15698 cccttcttaccacaacgaaaacaccgtttcacatccccaggacaagcattactcttatggcctttctcaccacaagtgtagcaaacaatctcagcaacaa 15797  T
Q  300 --tctttcttcttaggccgcctaacatcgacca-tcttctatttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgccct 396  Q
      ||||||||  | ||||||||  ||||    | |||| | ||| || || |||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||| |   |||||| |    
T  15798 catctttcttgctgggccgcctctcatcattaactctt-tgtttgcccttatcagcaggagcactgtaaggctttggacgactttgcggaaacttgcctt 15896  T
Q  397 tcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagat 445  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  15897 tcctctcattcacaaccttgtaatgagccttagtatcctcctcatagat 15945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0181 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0181
Description:

Target: scaffold0181; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 242 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 28903 - 28631
Alignment:
Q  242 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctat 338  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||   |||||  ||||   |||| |||||||||||||| ||  | ||||||||  ||| |    
T  28903 acaaacattgctcttgtggcctttctcgccacaattgaaacaggtaatcttagcaggaacatccttcttcttaggccgtctctcctcgaccattctctgt 28804  T
Q  339 ttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcct 438  Q
    || || || ||| |||||||||| || |||||||| | || |||||| |||||   ||||  |||||| || |||||||| |||||  |||| |||||||    
T  28803 ttgcccttatcaacaggggcactatatggcttagggcaacactgctggcccttagtcttctgctcattaacaaccttgtaatgagctctggtgtcctcct 28704  T
Q  439 catagatcctacagctgttaaccaaatctggaaaaactctcagccgttgatacccaatcgccctcttgatgtc 511  Q
    | ||||| || |||||||| || ||||||||||||| ||  | | |||| || || ||||||||||| |||||    
T  28703 cgtagattctgcagctgttcactaaatctggaaaaattcggatctgttggtatccgatcgccctcttaatgtc 28631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 16825 - 16668
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| | |  |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| || ||| |||     
T  16825 tagcaattaaaggagtacaattaaagaaacatgtacctctgatcaaccggtcctcattcactgtttgcgtaccagtcaaagcaaacactttccca-ctgg 16727  T
Q  101 cct-aaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttg 158  Q
    ||| |  ||||||||||| | | ||||||||||  || ||||||||||||||| |||||    
T  16726 cctgagtcttcttaggcttcttgcactgcgaaccaatgtgaccttcttcattatagttg 16668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 242 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 16584 - 16375
Alignment:
Q  242 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagca---tctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctat 338  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| |||| ||| |||| |   ||||||||  |||||| |||  ||||   || | | |      
T  16584 acaagcattactcttgtggcccttctcaccacacttgtagcaaacaacctcagcaggagtatctttctttctaggcctcctctcatcattcaccctttgc 16485  T
Q  339 ttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcct 438  Q
    || ||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| | ||| ||| ||| |||| |||  |||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  16484 ttacctttatcagcaggagcactataaggctttggacgactctgctgactcttacccctccgctcactcataaccttgtaatgagctttggtatcttcct 16385  T
Q  439 catagatcct 448  Q
    ||||||||||    
T  16384 catagatcct 16375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 348 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 216286 - 216192
Alignment:
Q  348 tcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcata 442  Q
    |||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| ||||||    
T  216286 tcagcaggagcactgtaaggctttggacgactttgctgacccttgcctttcctctcattcacaaccttgtaatgagccttagtatccttctcata 216192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 242 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 216395 - 216345
Alignment:
Q  242 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctc 292  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||| || |||| ||||||||    
T  216395 acaagcattactcttatggcctttctcaccacaagtgtagcaaacaatctc 216345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1530 (Bit Score: 54; Significance: 9e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold1530
Description:

Target: scaffold1530; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Original strand, 671 - 800
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| | |    ||||||||||||||   ||||||||| || |||||  |    
T  671 tagcaattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctctgataagtcgatccttactagtggtttgcgtaccagtcagagcaaacactttaccaccgat 770  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcga 130  Q
    |||||||||||| || || |||||||||||    
T  771 cctaaccttcttcggttgtgtacactgcga 800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1530; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 213 - 442
Target Start/End: Original strand, 804 - 1036
Alignment:
Q  213 cacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgc---agcatctttcttct 309  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| ||| |||| |||||||| ||   ||||||| || |||    
T  804 cacctgaagtacttcttctcatctttatcacagacattactcttgtggcctttctagccacacttgtagcaaacaatctcagcaggagcatctctcctct 903  T
Q  310 taggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcac 409  Q
    |||||| |||  ||||   ||   |||  || || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||  | | |||| |||     
T  904 taggcctcctctcatcattcaatctctgcttacccttgtcagcaggagcactatatggtttaggacgactctgttgtcccttacctctgcgctcactcat 1003  T
Q  410 taccttgtagtgagccttggtatcctcctcata 442  Q
     |||||||| ||||||||  |||||||||||||    
T  1004 caccttgtaatgagccttattatcctcctcata 1036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0575 (Bit Score: 54; Significance: 9e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0575
Description:

Target: scaffold0575; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 242 - 442
Target Start/End: Original strand, 9948 - 10151
Alignment:
Q  242 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctat 338  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||| |  | || ||||||||  |||   ||||||||||| |||| |||||  |||| |||||  | | |    
T  9948 acaagcattactcttatggcctttctcaccacaagtacaacatacaatctcgacaggagcatctttcttcctagggcgcctctcatcaaccattctttgt 10047  T
Q  339 ttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcct 438  Q
    || || || | |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||  || | |||| ||||||||| | |||||| |||| ||||||||||||||    
T  10048 ttacccttattagcaggagcactgtaaggcttaggacgactctgctgacctgtggctttccgctcattcacgatcttgtaatgagtcttggtatcctcct 10147  T
Q  439 cata 442  Q
    ||||    
T  10148 cata 10151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546 (Bit Score: 54; Significance: 9e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0546
Description:

Target: scaffold0546; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 242 - 454
Target Start/End: Original strand, 208 - 423
Alignment:
Q  242 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctat 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| || ||||| || ||||   |||| |||||||| |||  |||| ||||||||||  |||      
T  208 acaaacattactcttgtggcctttcccgccacagttgaaacaaacaatatccgcaggagcatccttcttctttggcttcctatcatcgaccattctctgc 307  T
Q  339 ttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcct 438  Q
    || || || || ||||||||||| || || ||||| ||||||||||| | ||||  |||| ||||||| || | |||||| ||||| ||| ||||||| |    
T  308 ttgcccttatctgcaggggcactataaggtttagggcgactctgctggctcttggtcttcttctcattaacaatcttgtaatgagctttgatatcctctt 407  T
Q  439 catagatcctacagct 454  Q
    |||||||||| |||||    
T  408 catagatcctgcagct 423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 109 - 192
Target Start/End: Original strand, 75 - 158
Alignment:
Q  109 tcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagcta 192  Q
    ||||||||||||| || |||||||  || ||||| ||||||||||||||| |||| |||| |||  ||||||| |||| |||||    
T  75 tcttaggctgcgtgcattgcgaaccaatgtgaccctcttcattacagttgaagcacacaatatcattacgcttgcaatcagcta 158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 54; Significance: 9e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 248 - 448
Target Start/End: Original strand, 104561 - 104764
Alignment:
Q  248 attactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccct 344  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||  |||   ||||||||||  ||||||||||  |||| | |||  ||| ||| ||     
T  104561 attactcttgtggcctttctcaccacaagtatagcaaacaatctcaacaggagcatctttctttctaggccgcctctcatcaatcattctctgttttccc 104660  T
Q  345 ttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcataga 444  Q
    || |||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| || ||| | || | ||||||||| | |||||| |||| ||| |||||||||||||| |    
T  104661 ttatcagcaggagcactataaggctttggacgactctgctgacctttgacttttcgctcattcacaatcttgtaatgagtcttagtatcctcctcataaa 104760  T
Q  445 tcct 448  Q
    ||||    
T  104761 tcct 104764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0434 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0434
Description:

Target: scaffold0434; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 231 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 5888 - 5650
Alignment:
Q  231 tcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catctttcttcttaggccgcctaacatcga 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |  | ||||| || | ||   ||||| || |||| |||| |||  ||||      
T  5888 tcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacttgtaataaacaatatcagtaggagcatctctcctcttgggcctcctctcatcat 5789  T
Q  328 ccatcttctatttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagcctt 427  Q
     ||   |||  || || ||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||  | | |||| |||  |||||||| ||||| ||    
T  5788 tcagtctctgcttacccttgtcagcaggagcactatacggcttcggatgactctgctgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaatgagcttt 5689  T
Q  428 ggtatcctcctcatagatcctacagctgttaaccaaatc 466  Q
     ||||| || |||||||||||||||||| | ||||||||    
T  5688 cgtatcttcttcatagatcctacagctgcttaccaaatc 5650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0188
Description:

Target: scaffold0188; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 252 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 33337 - 33131
Alignment:
Q  252 ctcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgt 348  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||  |||   ||||| || |||| |||| |||  ||||   |||| ||| ||| |||||||    
T  33337 ctcttgtggcctttttcaccacacttgaaacaaacaatttcaacaggagcatctctcctcttgggcctcctctcatcattcatcctctgttttcctttgt 33238  T
Q  349 cagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcct 448  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||| | | |||| |||  |||||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||    
T  33237 cagcaggagcactgtatggtttaggacgactctgctgtcccttaccccttcgctcactcatcaccttgtaatgagctttggtgtcttcctcatatatcct 33138  T
Q  449 acagctg 455  Q
     ||||||    
T  33137 gcagctg 33131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0585
Description:

Target: scaffold0585; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 4305 - 4242
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgt 64  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  4305 tagcaattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctctgataagtcggtcctcattaaccgt 4242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 334 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 740 - 620
Alignment:
Q  334 tctatttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatc 433  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||  | | |||| |||  ||||| | |||||| || |||||    
T  740 tctatttacctttgtcagcaggagcactgtacggtttcggacgactctgctgtcccttacctctacactcactcatcaccttat-gtgagcttttgtatc 642  T
Q  434 ctcctcatagatcctacagctg 455  Q
    ||| ||||| ||||||||||||    
T  641 ctcttcataaatcctacagctg 620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 4)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 297 - 448
Target Start/End: Original strand, 42019 - 42170
Alignment:
Q  297 gcatctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgccct 396  Q
    |||||||||||  |||| |||||  |||| |||||  ||| ||| || || |||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| || ||| | |    
T  42019 gcatctttctttctagggcgcctctcatcaaccattctctgtttacccttatcagcagaagcactgtaaggcttaggacgactctgctgacctttgactt 42118  T
Q  397 tcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcct 448  Q
    | | ||||||||| | |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  42119 ttcgctcattcacaatcttgtaatgagccttagtatcctcctcatagatcct 42170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 297 - 448
Target Start/End: Original strand, 75739 - 75890
Alignment:
Q  297 gcatctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgccct 396  Q
    |||||||||||  |||| |||||  |||| |||||  ||| ||| || || |||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| || ||| | |    
T  75739 gcatctttctttctagggcgcctctcatcaaccattctctgtttacccttatcagcagaagcactgtaaggcttaggacgactctgctgacctttgactt 75838  T
Q  397 tcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcct 448  Q
    | | ||||||||| | |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  75839 ttcgctcattcacaatcttgtaatgagccttagtatcctcctcatagatcct 75890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 348 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 34637 - 34537
Alignment:
Q  348 tcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcc 447  Q
    ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||| |||||   ||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||    
T  34637 tcagcaggggcgctataaggcttagggcgactctgctggcccttagtcttccgctcattcacgaccttgtaatgagccttggtatcctcctcgtaaatcc 34538  T
Q  448 t 448  Q
    |    
T  34537 t 34537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 106 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 34826 - 34764
Alignment:
Q  106 ccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaa 168  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||  || ||||| ||||||||||||||| |||| ||||    
T  34826 ccttcttaggcagcttacactgcgaaccaatgtgaccctcttcattacagttgaagcacacaa 34764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 51; Significance: 5e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 352 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 14127 - 14037
Alignment:
Q  352 caggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcata 442  Q
    |||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  14127 caggagcactgtaaggctttggacgactttgctgacccttgcctttcctctcattcacaaccttgtaatgagccttagtatcttcctcata 14037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1288 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold1288
Description:

Target: scaffold1288; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 71 - 14
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcatt 58  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  71 tagcaattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctctgataagtcggtcctcatt 14  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1274 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold1274
Description:

Target: scaffold1274; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 348 - 445
Target Start/End: Original strand, 56 - 152
Alignment:
Q  348 tcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagat 445  Q
    |||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  56 tcagcaggagcactgtaaggctttggacgactttgctgacc-ttgcctttcctctcattcacaaccttgtaatgagctttggtatcttcctcatagat 152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0550 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0550
Description:

Target: scaffold0550; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 242 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 10133 - 10018
Alignment:
Q  242 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctc---tgcagcatctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctat 338  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    | |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||  ||| |    
T  10133 acaaacattgctcttgtggcctttctcaccacaattgaaacagacaatctccgtaggagcatccttcttcttaggccgtctatcatcgaccattctctgt 10034  T
Q  339 ttccctttgtcagcag 354  Q
    || || ||||||||||    
T  10033 tttcccttgtcagcag 10018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 49; Significance: 8e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 223 - 466
Target Start/End: Original strand, 115934 - 116180
Alignment:
Q  223 acttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catctttcttcttaggccgcct 319  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||| || ||||| || | ||   ||||  || ||||||||| |||    
T  115934 acttcttctcatctctatcacaaacattactcttgtggcctttttcaccacacatgaaacaaacaatatcagtaggagcatccctcctcttaggcctcct 116033  T
Q  320 aacatcgaccatcttctatttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtag 419  Q
      ||||   ||   |||  || || ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||  | | |||| |||  ||||||||     
T  116034 ctcatcattcagtctcttcttacccttgtcagcaggagcactatacggcttcggacgactctgctgtcccttgcctctacgctcactcatcaccttgtaa 116133  T
Q  420 tgagccttggtatcctcctcatagatcctacagctgttaaccaaatc 466  Q
    ||||| ||   ||| || ||| |||||||||||||| | ||||||||    
T  116134 tgagctttcaaatcttcttcacagatcctacagctgcttaccaaatc 116180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 242 - 448
Target Start/End: Original strand, 18979 - 19187
Alignment:
Q  242 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatct---ctgcagcatctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctat 338  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||| |   | | ||| |||||||| || || |||||| |||| |||||  ||| |    
T  18979 acaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtatagcagacaatttcaacaggagcttctttctttttggggcgcctatcatcaaccattctctgt 19078  T
Q  339 ttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcct 438  Q
    || || || |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| | || ||  | || | ||||||||| | |||||| |||| ||||||||||||||    
T  19079 ttacccttatcagcaggagcactgtaaggcttaggacgactttgc-gacctttagcttttcgctcattcacaatcttgtaatgagtcttggtatcctcct 19177  T
Q  439 catagatcct 448  Q
    |||| |||||    
T  19178 cataaatcct 19187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0298
Description:

Target: scaffold0298; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 9443 - 9388
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctca 56  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  9443 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctgataagtcgatcctca 9388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0518 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0518
Description:

Target: scaffold0518; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 342 - 446
Target Start/End: Original strand, 2263 - 2367
Alignment:
Q  342 cctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcat 441  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  | | |||| |||  ||||| || ||||| || || ||||||||||    
T  2263 cctttgtcagtaggggcactgtacggtttaggacgactctgctgtcccttacctcttcgctcactcatcaccttataatgagcttttgtgtcctcctcat 2362  T
Q  442 agatc 446  Q
    |||||    
T  2363 agatc 2367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 242 - 449
Target Start/End: Original strand, 9276 - 9486
Alignment:
Q  242 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctat 338  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||   || || ||||||| |||||   |||| |||||||||||    ||| | ||||||||| ||| |    
T  9276 acaagcattactcttgtggcccttctcaccacaagaaaaacaaacaatctttgcaggagcatccttcttcttaggttatctatcttcgaccatcctctgt 9375  T
Q  339 ttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcct 438  Q
    || || || ||| |||||||||| || || ||||  |||||||| || |||||  | |||| ||| ||||| | || ||| |||| ||||||||||||||    
T  9376 ttgcccttatcaccaggggcactataaggattagcgcgactctgttgacccttagctttccgctccttcacaatctagtaatgagtcttggtatcctcct 9475  T
Q  439 catagatccta 449  Q
    |||||||||||    
T  9476 catagatccta 9486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0151
Description:

Target: scaffold0151; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 189 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 570 - 470
Alignment:
Q  189 gctaaagtgtgtcctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaa 288  Q
    ||||| ||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||   ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||    
T  570 gctaatgtgtgtcctttctgaccacacctgaagcacttcttctcatctgtatcacaaacactacttttgtggcctttctcgccacacttgaaacaaacaa 471  T
Q  289 t 289  Q
    |    
T  470 t 470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0993 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0993
Description:

Target: scaffold0993; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 242 - 435
Target Start/End: Original strand, 1311 - 1507
Alignment:
Q  242 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcagcatctt---tcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctat 338  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  | || ||||||||  ||| | |||   ||||  | || |||||| |||| |||||  ||| |    
T  1311 acaagcattactcttgtggcctttctcaccacaagtataacaaacaatctcaacaggagcttccatctttctcgggcgcctatcatcaaccattctctgt 1410  T
Q  339 ttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcct 435  Q
    || || || |||||||| |||||||| |||||||| |||||||| || ||||||  |||||  |||||||| | |||||| |||||||| |||||||    
T  1411 ttacccttatcagcaggagcactgtaaggcttagggcgactctgttggcccttggtcttccgttcattcacaatcttgtaatgagccttcgtatcct 1507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1373 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1373
Description:

Target: scaffold1373; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 50 - 1
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcgg 50  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  50 tagcaattaaaggagtactattaaagaaacaagtacctctgataagtcgg 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0410 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0410
Description:

Target: scaffold0410; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 250 - 442
Target Start/End: Original strand, 478 - 673
Alignment:
Q  250 tactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag---catctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttcccttt 346  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||||  |||   |||| || ||||| || || ||  | ||||||||| ||| ||| || ||    
T  478 tactcttgtggcctttctcaccacaattgaaacaagtaatctcaacaggaacatcctttttcttgggtcgtctctcctcgaccatcctctgtttgccctt 577  T
Q  347 gtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcata 442  Q
     ||| |||||| ||| || |||||||| ||||||||||| |||||   ||||| |||||| || |||||||| |||||  |||| |||||||||||    
T  578 atcaacaggggaactataaggcttagggcgactctgctggcccttagtcttccgctcattaacaaccttgtaatgagctctggtgtcctcctcata 673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0679 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0679
Description:

Target: scaffold0679; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 106 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 1134 - 1068
Alignment:
Q  106 ccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatc 172  Q
    |||||||||||| | | ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  1134 ccttcttaggcttcttgcactgcgaactaatatgaccttcttccttacagttatagcaaactacatc 1068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 357 - 463
Target Start/End: Original strand, 17686 - 17792
Alignment:
Q  357 gcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctacagctgt 456  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||| || ||| || ||||| ||||| || || ||||| || || || ||||    
T  17686 gcactgtaaggcttaggacgactctgctgtcccttacccctcctctcactcattatcttataatgagctttggtgtcttcttcataaattctgcaactgt 17785  T
Q  457 taaccaa 463  Q
    | |||||    
T  17786 ttaccaa 17792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0098 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0098
Description:

Target: scaffold0098; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 70 - 172
Target Start/End: Original strand, 25629 - 25731
Alignment:
Q  70 taccagttgaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaac 169  Q
    |||||||| ||||||| ||||| ||||| |||    |||||||||||| | | ||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| |||||||| ||    
T  25629 taccagttaaagcaaaaaccttcccaccagtctgggccttcttaggcttcttgcactgcgaactaatatgacctttttccttacagttatagcaaactac 25728  T
Q  170 atc 172  Q
    |||    
T  25729 atc 25731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 242 - 442
Target Start/End: Original strand, 3871 - 4074
Alignment:
Q  242 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatct---ctgcagcatctttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctat 338  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||    |||| |||||||   | | ||||||||||||  |||| |||||  |||| ||||| || | |    
T  3871 acaagcattacttttgtggcctttctcaccacaagaatagcagacaatctgaacaggagcatctttctttctagggcgcctctcatcaaccattttttgt 3970  T
Q  339 ttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcct 438  Q
    || || || |||| ||| |||||||| ||||||| | |||||| ||  || ||| | || | ||||||||| | |||||| |||| ||||||||||||||    
T  3971 ttacccttatcagtaggagcactgtaaggcttagcatgactctcctaacctttggcttttcgctcattcacgatcttgtaatgagtcttggtatcctcct 4070  T
Q  439 cata 442  Q
    ||||    
T  4071 cata 4074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1600 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1600
Description:

Target: scaffold1600; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 348 - 444
Target Start/End: Original strand, 504 - 600
Alignment:
Q  348 tcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcataga 444  Q
    |||||||| || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||||||| ||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  504 tcagcaggagcgctgtaaggctttgggcgactttgctgacccttacctttcctctcactcacagccttgtaatgagctttagtatcctcctcataga 600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0609 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0609
Description:

Target: scaffold0609; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 69 - 292
Target Start/End: Original strand, 1095 - 1318
Alignment:
Q  69 gtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaa 168  Q
    ||||||| | ||||||||||| | |||| || |  | |||||||||||| | ||||||| ||||||| |||||||| ||| | ||| ||| |||||||||    
T  1095 gtaccagctaaagcaaacacccttccacttgcctgagccttcttaggcttcttacactgtgaactgagatgaccttattcgtcacaattgaagcaaacaa 1194  T
Q  169 catccctacgcttacaattagctaaagtgtgtcctttctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctc 268  Q
     ||| | |||||| || | |||||  || || || ||||  |  || |  |||||||||||||| || |  |  |||||||||||||||||||| |||||    
T  1195 tatcaccacgcttgcattcagctatcgtatgccccttctttccacatcggaagcacttcttctcctcaccattgcaaacattactcttgtggcccttctc 1294  T
Q  269 accacaattgaagcacacaatctc 292  Q
    |||||| ||| | || ||||||||    
T  1295 accacacttgtaacaaacaatctc 1318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0609; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 342 - 451
Target Start/End: Original strand, 7989 - 8098
Alignment:
Q  342 cctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcat 441  Q
    ||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||  ||||| ||||||  | ||| |||| ||   ||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  7989 cctttgtcaacaggagcactgtagggcttcggacgaccttgctgacccttgttcctccgctcactcctaaccttataatgagccttcgtatcctcctcat 8088  T
Q  442 agatcctaca 451  Q
    | || |||||    
T  8089 aaattctaca 8098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 358 - 445
Target Start/End: Original strand, 5536 - 5623
Alignment:
Q  358 cactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagat 445  Q
    ||||||| |||||  ||||||| ||||| | | | ||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||||||||    
T  5536 cactgtaaggctttagacgactttgctgactcctacccttcctctcattcacaaccttgtaatgagctttcgtatcttcctcatagat 5623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Original strand, 5176 - 5326
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgt 100  Q
    ||||||||||| ||||||||| || | |||| ||||||||  | |  ||||||| |||||  || |||||||||||  |||||||||| || ||||  ||    
T  5176 tagcaattaaaagagtactatcaaagtaacatgtacctctaatcaaccggtccttattcaatgtctgcgtaccagtcaaagcaaacactttcccactagt 5275  T
Q  101 cctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcatt 151  Q
       | |||||||||||| | | ||||||||||  |||||||||||||||||    
T  5276 ttgagccttcttaggcttcttgcactgcgaaccaatatgaccttcttcatt 5326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0282
Description:

Target: scaffold0282; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 242 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 13449 - 13237
Alignment:
Q  242 acaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctg---cagcatctttcttcttaggccgcctaacatc-gaccatcttcta 337  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||| || |||| |||||||| |   || ||||||||||  |||||| |||  ||||   | ||||| |     
T  13449 acaagcattactcttatggcctttctcaccacaagtgtagcaaacaatctcagtaacaacatctttctttctaggcctcctctcatcattcaatctt-tg 13351  T
Q  338 tttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcc 437  Q
     || || || |||||||| |||||| | | ||| |||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||  ||||||| ||||| |||    
T  13350 cttacccttatcagcaggagcactgcaagactttggacaactttgctgacccttgcctttcctctcattcacaacctcgtaacgagccttagtatcttcc 13251  T
Q  438 tcatagatcctaca 451  Q
    ||||| || |||||    
T  13250 tcatatattctaca 13237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 13695 - 13608
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacac 88  Q
    ||||||||||||||||||||| || | |||| ||||||||| | |  || ||||||||| | ||||| ||||||||  ||||||||||    
T  13695 tagcaattaaaggagtactatcaaagtaacatgtacctctgatcaaacgatcctcattctctgtttgtgtaccagtcaaagcaaacac 13608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0180
Description:

Target: scaffold0180; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 218 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 31012 - 30933
Alignment:
Q  218 aaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatctctgcag 297  Q
    |||||||||||||||||| |  |  ||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||    
T  31012 aaagcacttcttctcatcaccattgcaagcattactcttgtggcccttctcaccacacttgtagcaaacaatctcagcag 30933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 5 - 96
Target Start/End: Original strand, 2091 - 2182
Alignment:
Q  5 aattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctcattcaccgtttgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccac 96  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || || ||||||||| | || ||  |||||| | ||| ||||||||| ||||    
T  2091 aattaaaggagtactattaatgaaacatgtacctctgattagacgatcctcattcgctgtctgattaccagctaaagaaaacaccttcccac 2182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0605 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0605
Description:

Target: scaffold0605; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 55
Target Start/End: Original strand, 1368 - 1422
Alignment:
Q  1 tagcaattaaaggagtactattaatgaaacaagtacctctggtaagtcggtcctc 55  Q
    |||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  1368 tagctattaaaggagtactattcaagaaacaagtacctctgataagtcgatcctc 1422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0848 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0848
Description:

Target: scaffold0848; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 66 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 5150 - 5044
Alignment:
Q  66 tgcgtaccagttgaagcaaacaccttgccacctgtcctaaccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaa 165  Q
    |||||||||||  ||||||| ||||| ||||| |||    |||||||||||| | | ||||  ||||| ||||||| |||||| || |||||||||||||    
T  5150 tgcgtaccagtcaaagcaaaaaccttcccaccagtctgggccttcttaggcttcttgcactttgaactaatatgactttcttccttgcagttgtagcaaa 5051  T
Q  166 caacatc 172  Q
    | |||||    
T  5050 ccacatc 5044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 106 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 57725 - 57377
Alignment:
Q  106 ccttcttaggctgcgtacactgcgaactgatatgaccttcttcattacagttgtagcaaacaacatccctacgcttacaattagctaaagtgtgtccttt 205  Q
    |||||||||||| | |||| |||||||  |||||||||||||||||||| ||| | || ||||| ||   | ||||||| | ||| |   | || |||||    
T  57725 ccttcttaggcttcttacattgcgaaccaatatgaccttcttcattacaattgaaacacacaacgtcatcatgcttacactcagcaagtctatgcccttt 57626  T
Q  206 ctaacgtcacctaaagcacttcttctcatctcggtcacaaacattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatct---ctgcagcatct 302  Q
    || ||  || | |||||||   ||| |||| |    |||| |||||||||| ||||||||||| |||||| |  || | |||||||   | | |||||||    
T  57625 cttaccacaacgaaagcaccgtttcacatcccaaggacaagcattactcttatggcctttctcgccacaagtatagtaaacaatctcaacaggagcatct 57526  T
Q  303 ttcttcttaggccgcctaacatcgaccatcttctatttccctttgtcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctct 402  Q
    |||||  |||||| |||  ||||   |||  | |  || || || |||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||| |||| ||    
T  57525 ttctttctaggcctcctctcatcattcattctttgcttacccttatcagcaggagcactgtaaggctttggacgactttgctgacctttgcctttccgct 57426  T
Q  403 cattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagatcctaca 451  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||    
T  57425 cattcacaaccttgtaatgagccttagtatcttcctcatatattctaca 57377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0429 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0429
Description:

Target: scaffold0429; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 348 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 1288 - 1191
Alignment:
Q  348 tcagcaggggcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagat 445  Q
    |||||||| | |||||| ||||| |||||| |||| || | ||| || ||||||||| ||||  ||||||  ||||| || |||||||||||||||||    
T  1288 tcagcaggagtactgtaaggctttggacgattctgttgactcttacctttcctctcactcacagccttgtgatgagctttcgtatcctcctcatagat 1191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 246 - 291
Target Start/End: Original strand, 36161 - 36206
Alignment:
Q  246 acattactcttgtggcctttctcaccacaattgaagcacacaatct 291  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  || |||| |||||||    
T  36161 acattactcttgtggcctttctcaccacacctgtagcaaacaatct 36206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0505 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0505
Description:

Target: scaffold0505; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 357 - 445
Target Start/End: Original strand, 2199 - 2286
Alignment:
Q  357 gcactgtacggcttaggacgactctgctgtcccttgcccttcctctcattcactaccttgtagtgagccttggtatcctcctcatagat 445  Q
    |||||||| ||||||| |||||| ||||| |  || || |||||||| ||||  |||||||| ||||| || |||||||||||||||||    
T  2199 gcactgtaaggcttag-acgactttgctgactattacctttcctctccttcaaaaccttgtaatgagctttcgtatcctcctcatagat 2286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University