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This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
|
Alignment Overview
Query: NF9815_low_9 (Length: 297)
Name: NF9815_low_9
Description: NF9815
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF9815_low_9 |
 |  |
|
| [»] scaffold0117 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
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 |  |  |
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 |  |  |
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 |  |  |
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 |  |  |
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 |  |  |
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| [»] scaffold0156 (1 HSPs) |
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| [»] scaffold0484 (1 HSPs) |
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 |  |  |
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 |  |  |
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 |  |  |
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 |  |  |
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 |  |  |
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 |  |  |
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| [»] scaffold0347 (1 HSPs) |
 |  |  |
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| [»] scaffold0123 (2 HSPs) |
 |  |  |
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 |  |  |
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 |  |  |
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 |  |  |
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 |  |  |
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 |  |  |
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 |  |  |
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| [»] scaffold0525 (1 HSPs) |
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 |  |  |
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 |  |  |
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| [»] scaffold0016 (1 HSPs) |
 |  |  |
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 |  |  |
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 |  |  |
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 |  |  |
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| [»] scaffold0014 (1 HSPs) |
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 |  |  |
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| [»] scaffold0317 (1 HSPs) |
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 |  |  |
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 |  |  |
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 |  |  |
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 |  |  |
|
| [»] scaffold0485 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
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 |  |  |
|
| [»] scaffold0507 (2 HSPs) |
 |  |  |
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| [»] scaffold0061 (1 HSPs) |
 |  |  |
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 |  |  |
|
| [»] scaffold0004 (1 HSPs) |
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| [»] scaffold0106 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0877 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0169 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
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 |  |  |
|
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 |  |  |
|
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 |  |  |
|
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 |  |  |
|
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 |  |  |
|
| [»] scaffold0006 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0914 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0513 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0108 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0100 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
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 |  |  |
|
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 |  |  |
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 |  |  |
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 |  |  |
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 |  |  |
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 |  |  |
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 |  |  |
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 |  |  |
|
| [»] scaffold0476 (1 HSPs) |
 |  |  |
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| [»] scaffold0379 (1 HSPs) |
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 |  |  |
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| [»] scaffold1984 (1 HSPs) |
 |  |  |
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| [»] scaffold1257 (1 HSPs) |
 |  |  |
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| [»] scaffold0359 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0075 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0073 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
Alignment Details
Target: scaffold0117 (Bit Score: 255; Significance: 1e-142; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:
Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 18 - 288
Target Start/End: Original strand, 39259 - 39529
Alignment:
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catacatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgata |
117 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39259 |
catacatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacataggcgacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgata |
39358 |
T |
 |
| Q |
118 |
atcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaatcatattataatagcttcacagat |
217 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
39359 |
atcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaatcatattataatagtttcacagat |
39458 |
T |
 |
| Q |
218 |
catcagtaatattatattcaacccacattcctaccccaacactaaatcatattattatacttttaaacacc |
288 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
39459 |
catcagtaatattatattcaacccacattcctaccccaacactaaatcatattattatactcttaaacacc |
39529 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6 (Bit Score: 255; Significance: 1e-142; HSPs: 73)
Name: chr6
Description:
Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 18 - 288
Target Start/End: Original strand, 23414891 - 23415161
Alignment:
| Q |
18 |
catacatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgata |
117 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23414891 |
catacatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacataggcgacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgata |
23414990 |
T |
 |
| Q |
118 |
atcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaatcatattataatagcttcacagat |
217 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23414991 |
atcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaatcatattataatagcttcacagat |
23415090 |
T |
 |
| Q |
218 |
catcagtaatattatattcaacccacattcctaccccaacactaaatcatattattatacttttaaacacc |
288 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |
|
|
| T |
23415091 |
catcagtaatattatattcaacccacattcctaccccaacactaaatcatattattatattcttaaacacc |
23415161 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 18 - 288
Target Start/End: Original strand, 27556649 - 27556919
Alignment:
| Q |
18 |
catacatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgata |
117 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
27556649 |
catacatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacataggcgacacgtaaacatctcaatatataacaacatcaaatgatg |
27556748 |
T |
 |
| Q |
118 |
atcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaatcatattataatagcttcacagat |
217 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27556749 |
atcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaatcatattataatagcttcacagat |
27556848 |
T |
 |
| Q |
218 |
catcagtaatattatattcaacccacattcctaccccaacactaaatcatattattatacttttaaacacc |
288 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
27556849 |
catcagtaatattatattcaacccacattcctaccccaacactaaatcatattattatactcttaaacacc |
27556919 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 18 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 14979501 - 14979263
Alignment:
| Q |
18 |
catacatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgata |
117 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
14979501 |
catacattttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacataggcatcacttaaacatcttgagatataacaacatcaaatgata |
14979402 |
T |
 |
| Q |
118 |
atcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaatcatattataatagcttcacagat |
217 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
14979401 |
atcaacatcaacttaaacatcttatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacattaaatcatattataacagcttcacagat |
14979302 |
T |
 |
| Q |
218 |
catcagtaatattatattcaacccacattcctaccccaa |
256 |
Q |
| |
|
| |||||||| |||||||||||| ||| |||||||||| |
|
|
| T |
14979301 |
cctcagtaatgttatattcaacctccatccctaccccaa |
14979263 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 18 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 15817635 - 15817398
Alignment:
| Q |
18 |
catacatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgata |
117 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15817635 |
catacattttccacataagacatataattatttcacataaccaacaacaacaacatatgcagcacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgata |
15817536 |
T |
 |
| Q |
118 |
atcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaatcatattataatagcttcacagat |
217 |
Q |
| |
|
|| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| | |||||||||||| |
|
|
| T |
15817535 |
attaacatcaacttaaacatcatatataattcacataatgcatattcaaatataccacattactaacaacatcaaatcatattat-acagcttcacagat |
15817437 |
T |
 |
| Q |
218 |
catcagtaatattatattcaacccacattcctaccccaa |
256 |
Q |
| |
|
||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
15817436 |
catcattaatatcatattcaacctccattcctaccccaa |
15817398 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 18 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 19773656 - 19773474
Alignment:
| Q |
18 |
catacatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgata |
117 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19773656 |
catacattttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatatgcagcacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgata |
19773557 |
T |
 |
| Q |
118 |
atcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaatcatatt |
200 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
19773556 |
atcaagaacaacttaaacatcttatataattcacataatgcatatacaaatatattacattaccatcaacatcaaatcatatt |
19773474 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 18 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 15705557 - 15705387
Alignment:
| Q |
18 |
catacatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgata |
117 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15705557 |
catacattttccacataagacatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagaaaacaagtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgata |
15705458 |
T |
 |
| Q |
118 |
atcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaaca |
188 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
15705457 |
atcaacaacaacttaaacatcttatataattcacataatgcataaacaaatatattacattaccatcaaca |
15705387 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 18 - 200
Target Start/End: Original strand, 22805939 - 22806120
Alignment:
| Q |
18 |
catacatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgata |
117 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22805939 |
catacattttccacataacgaatataaatatttcacataaccaacaacagcaacataggcagcacgtaaacatcacaagatataacaatatcaaatgata |
22806038 |
T |
 |
| Q |
118 |
atcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaatcatatt |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
22806039 |
atcaacaacaac-taaacatcttatataattcacataatgcatatacaaatatattacattaccatcaacattaaatcatatt |
22806120 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 97 - 256
Target Start/End: Original strand, 25754972 - 25755131
Alignment:
| Q |
97 |
atataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaatca |
196 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
25754972 |
atataacaacatcaaatcataatcaacatcaacttaaacatcttataaaattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacattaaatca |
25755071 |
T |
 |
| Q |
197 |
tattataatagcttcacagatcatcagtaatattatattcaacccacattcctaccccaa |
256 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25755072 |
tattataatagcttcaaagatcatcagtaatattatattcaacccacattcctaccccaa |
25755131 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 97 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 20556893 - 20556737
Alignment:
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97 |
atataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaatca |
196 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
20556893 |
atataacaacatcaaatcataatcaacatcaacttaaacatcttatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacattaaatca |
20556794 |
T |
 |
| Q |
197 |
tattataatagcttcacagatcatcagtaatattatattcaacccacattcctaccc |
253 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
20556793 |
tattataatagcttctcatatcatcagtaatattatattcaaccctcattcctaccc |
20556737 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #10
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Query Start/End: Original strand, 18 - 256
Target Start/End: Original strand, 18696494 - 18696732
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18 |
catacatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaa-catctcaagatataacaatatcaaatgat |
116 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||| || ||| ||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
18696494 |
catacattttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacataggcaatacataaaacagttcatgatataacaatatcaaagca- |
18696592 |
T |
 |
| Q |
117 |
aatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaatcatattataatagcttcacaga |
216 |
Q |
| |
|
|||||| |||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| || ||||| |||||||||| |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
18696593 |
aatcaataacatctccaacatcatatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacattaaatcatatgataacagcttcacaga |
18696692 |
T |
 |
| Q |
217 |
tcatcagtaatattatattcaacccacattcctaccccaa |
256 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
18696693 |
tcatcagtaatattatattcaacctccattcctaccccaa |
18696732 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 85 - 253
Target Start/End: Original strand, 33443122 - 33443287
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| Q |
85 |
aaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatc |
184 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33443122 |
aaacatctcaagatataacaatatcaaataataatcaac---aacttaaacatcttaaataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatc |
33443218 |
T |
 |
| Q |
185 |
aacactaaatcatattataatagcttcacagatcatcagtaatattatattcaacccacattcctaccc |
253 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
33443219 |
aacattaaatcatattataacagcttcacagatcatcaataatattatattcaacctccattcctaccc |
33443287 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
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Target Start/End: Complemental strand, 25619770 - 25619598
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| Q |
84 |
taaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactat |
183 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25619770 |
taaacatcttgagatataacaacatcaaatgataatcaacatcaacttaaaaatcttatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactat |
25619671 |
T |
 |
| Q |
184 |
caacactaaatcatattataatagcttcacagatcatcagtaatattatattcaacccacattcctaccccaa |
256 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||| | | |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
25619670 |
caacattaaatcatattataacaacatcacagatcatcagtaatgttatattcaacctccattcctaccccaa |
25619598 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #13
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Query Start/End: Original strand, 18 - 251
Target Start/End: Original strand, 18706312 - 18706545
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| Q |
18 |
catacatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaa-catctcaagatataacaatatcaaatgat |
116 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||| || ||| ||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
18706312 |
catacattttccacataaggcatataaatatttcacataaccaaaaacagcaacataggcaatatataaaacagttcatgatataacaatatcaaagca- |
18706410 |
T |
 |
| Q |
117 |
aatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaatcatattataatagcttcacaga |
216 |
Q |
| |
|
|||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
18706411 |
aatcaataacatcttaaacatcatatataattcatgtaatgcatatacatttatatgacattattaacaacatcaaatcatattataacagcttcacaga |
18706510 |
T |
 |
| Q |
217 |
tcatcagtaatattatattcaacccacattcctac |
251 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
18706511 |
tcatcagtaatattatattcaacctccattcctac |
18706545 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #14
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Query Start/End: Original strand, 18 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 28104012 - 28103831
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| Q |
18 |
catacatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgata |
117 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
28104012 |
catacattttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacaacaacataggcagcacgtaaacatctcaaggtataacaacatcaaatgata |
28103913 |
T |
 |
| Q |
118 |
atcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaatcatat |
199 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| || ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
28103912 |
atcaacatcaacttaaacaacttatataattcacataatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcatat |
28103831 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 133 - 256
Target Start/End: Original strand, 25752838 - 25752961
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aacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaatcatattataatagcttcacagatcatcagtaatattat |
232 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25752838 |
aacatcttatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacattaaatcatattataatagcttcatagatcatcagtaatattat |
25752937 |
T |
 |
| Q |
233 |
attcaacccacattcctaccccaa |
256 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
25752938 |
attcaaccctcattcctaccccaa |
25752961 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 86 - 256
Target Start/End: Original strand, 20224018 - 20224188
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| Q |
86 |
aacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatca |
185 |
Q |
| |
|
||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20224018 |
aacatatccagatataataatatcaagtgataatcaacaacaacttaaacatcttaaataattcacataattcatacacaaatatattacattactatca |
20224117 |
T |
 |
| Q |
186 |
acactaaatcatattataatagcttcacagatcatcagtaatattatattcaacccacattcctaccccaa |
256 |
Q |
| |
|
||| |||||||| |||||| || |||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
20224118 |
acattaaatcatgttataacagattcacagaacatcagcaatattatattcaacctccattcctaccccaa |
20224188 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 86 - 256
Target Start/End: Original strand, 22118002 - 22118172
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| Q |
86 |
aacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatca |
185 |
Q |
| |
|
||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22118002 |
aacatatccagatataataatatcaagtgataatcaacaacaacttaaacatcttaaataattcacataattcatacacaaatatattacattactatca |
22118101 |
T |
 |
| Q |
186 |
acactaaatcatattataatagcttcacagatcatcagtaatattatattcaacccacattcctaccccaa |
256 |
Q |
| |
|
||| |||||||| |||||| || |||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
22118102 |
acattaaatcatgttataacagattcacagaacatcagcaatattatattcaacctccattcctaccccaa |
22118172 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 18 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 31478005 - 31477893
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| Q |
18 |
catacatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgata |
117 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31478005 |
catacatcttccacataagtcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacgacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgata |
31477906 |
T |
 |
| Q |
118 |
atcaacaacaact |
130 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |
|
|
| T |
31477905 |
atcaacaacaact |
31477893 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 18 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 18955958 - 18955846
Alignment:
| Q |
18 |
catacatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgata |
117 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18955958 |
catacatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacataggcgacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgata |
18955859 |
T |
 |
| Q |
118 |
atcaacaacaact |
130 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| |
|
|
| T |
18955858 |
atcaaccacaact |
18955846 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 61 - 203
Target Start/End: Original strand, 23838224 - 23838366
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| Q |
61 |
acaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcat |
160 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
23838224 |
acaacagcaacataggcagcacataaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacatcaacttaaacatcttatataatccacataatgcat |
23838323 |
T |
 |
| Q |
161 |
atacaaatatattacattactatcaacactaaatcatattata |
203 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
23838324 |
atacaaatatatctcattactaacaacatcaaatcatattata |
23838366 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 18 - 130
Target Start/End: Original strand, 16760206 - 16760318
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| Q |
18 |
catacatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgata |
117 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16760206 |
catatatcttccacataagtcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacataggcgacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgata |
16760305 |
T |
 |
| Q |
118 |
atcaacaacaact |
130 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |
|
|
| T |
16760306 |
atcaacaacaact |
16760318 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 19 - 130
Target Start/End: Original strand, 14472183 - 14472294
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| Q |
19 |
atacatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataa |
118 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14472183 |
atacatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacataggcgacacataaacatctcaggatataacaatatcaaatgataa |
14472282 |
T |
 |
| Q |
119 |
tcaacaacaact |
130 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |
|
|
| T |
14472283 |
tcaacaacaact |
14472294 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 21 - 130
Target Start/End: Original strand, 11566776 - 11566885
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acatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatc |
120 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11566776 |
acatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacataggcgacacataaacatctcaggatataacaatatcaaatgataatc |
11566875 |
T |
 |
| Q |
121 |
aacaacaact |
130 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
11566876 |
aacaacaact |
11566885 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 21 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 18917458 - 18917349
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| Q |
21 |
acatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatc |
120 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18917458 |
acatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacataggcgacacataaacatctcaggatataacaatatcaaatgataatc |
18917359 |
T |
 |
| Q |
121 |
aacaacaact |
130 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
18917358 |
aacaacaact |
18917349 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 21 - 130
Target Start/End: Original strand, 19870504 - 19870613
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| Q |
21 |
acatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatc |
120 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19870504 |
acatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacataggcgacacataaacatctcaggatataacaatatcaaatgataatc |
19870603 |
T |
 |
| Q |
121 |
aacaacaact |
130 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
19870604 |
aacaacaact |
19870613 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 21 - 130
Target Start/End: Original strand, 23394982 - 23395091
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| Q |
21 |
acatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatc |
120 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23394982 |
acatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacataggcgacacataaacatctcaggatataacaatatcaaatgataatc |
23395081 |
T |
 |
| Q |
121 |
aacaacaact |
130 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
23395082 |
aacaacaact |
23395091 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 18 - 130
Target Start/End: Original strand, 22949019 - 22949131
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| Q |
18 |
catacatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgata |
117 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22949019 |
catacatcttccacataagttatataaatatttcacataaccaacaacaacaacataggcgacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgata |
22949118 |
T |
 |
| Q |
118 |
atcaacaacaact |
130 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |
|
|
| T |
22949119 |
atcaacaacaact |
22949131 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #28
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Query Start/End: Original strand, 18 - 130
Target Start/End: Original strand, 22952975 - 22953087
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18 |
catacatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgata |
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22952975 |
catacatcttccacataagttatataaatatttcacataaccaacaacaacaacataggcgacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgata |
22953074 |
T |
 |
| Q |
118 |
atcaacaacaact |
130 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |
|
|
| T |
22953075 |
atcaacaacaact |
22953087 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #29
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Target Start/End: Original strand, 23871463 - 23871575
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117 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23871463 |
catacatcttccacataagttatataaatatttcacataaccaacaacaacaacataggcgacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgata |
23871562 |
T |
 |
| Q |
118 |
atcaacaacaact |
130 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |
|
|
| T |
23871563 |
atcaacaacaact |
23871575 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #30
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Query Start/End: Original strand, 18 - 130
Target Start/End: Original strand, 23875419 - 23875531
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18 |
catacatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgata |
117 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23875419 |
catacatcttccacataagttatataaatatttcacataaccaacaacaacaacataggcgacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgata |
23875518 |
T |
 |
| Q |
118 |
atcaacaacaact |
130 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |
|
|
| T |
23875519 |
atcaacaacaact |
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T |
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Target: chr6; HSP #31
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Target Start/End: Original strand, 18453232 - 18453427
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160 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
18453232 |
acaacagcaacataggcagcacataaacatctcaagatataacaaaatcaaatgataatcaacatcaacttaaacatcttatataattcacaaaatgcat |
18453331 |
T |
 |
| Q |
161 |
atacaaatatattacattactatcaacactaaatcatattataatagcttcacagatcatcagtaatattatattcaacccacattcctaccccaa |
256 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||||| ||| || |||| || ||||| | || |||| |||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
18453332 |
atacaactatatcacattactaacaacatcaaatcatataatatcagactcactgaacatcaacagtagtataatcaacctccattcctaccccaa |
18453427 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #32
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162 |
Q |
| |
|
||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |
|
|
| T |
20136722 |
aacagcaacataggcagcacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataatccacataatg-atat |
20136820 |
T |
 |
| Q |
163 |
acaaatatattacattactatcaacactaaatcat |
197 |
Q |
| |
|
|||| ||||| |||| |||| ||||| ||||||| |
|
|
| T |
20136821 |
acaattatatcacataactaacaacatcaaatcat |
20136855 |
T |
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Target: chr6; HSP #33
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Query Start/End: Original strand, 63 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 22196147 - 22196014
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| Q |
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aacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatat |
162 |
Q |
| |
|
||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |
|
|
| T |
22196147 |
aacagcaacataggcagcacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataatccacataatg-atat |
22196049 |
T |
 |
| Q |
163 |
acaaatatattacattactatcaacactaaatcat |
197 |
Q |
| |
|
|||| ||||| |||| |||| ||||| ||||||| |
|
|
| T |
22196048 |
acaattatatcacataactaacaacatcaaatcat |
22196014 |
T |
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Target: chr6; HSP #34
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Target Start/End: Original strand, 4476872 - 4477017
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59 |
caacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgc |
158 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
4476872 |
caacaacggcaacataggcagcacataaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaatatcaacttaaacatcttatataatccacataatgc |
4476971 |
T |
 |
| Q |
159 |
atatacaaatatattacattactatcaacactaaatcatattataa |
204 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||| ||||| |||| ||||||||| |
|
|
| T |
4476972 |
atatacaaatatatctcattactaacaacatcaaattatattataa |
4477017 |
T |
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Target: chr6; HSP #35
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21 |
acatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatc |
120 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8243775 |
acatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacataggtgacacataaacatctcaggatataacaatatcaaatgataatc |
8243874 |
T |
 |
| Q |
121 |
aacaacaact |
130 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
8243875 |
aacaacaact |
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T |
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Target: chr6; HSP #36
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Target Start/End: Original strand, 22862860 - 22862969
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acatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatc |
120 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22862860 |
acatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacaacaacataggcgacacataaacatctcaggatataacaatatcaaatgataatc |
22862959 |
T |
 |
| Q |
121 |
aacaacaact |
130 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
22862960 |
aacaacaact |
22862969 |
T |
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Target: chr6; HSP #37
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Target Start/End: Original strand, 23989834 - 23989943
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21 |
acatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatc |
120 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23989834 |
acatcttccacataaggcatataaatatttcacctaaccaacaacagcaacataggcgacacataaacatctcaggatataacaatatcaaatgataatc |
23989933 |
T |
 |
| Q |
121 |
aacaacaact |
130 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
23989934 |
aacaacaact |
23989943 |
T |
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Target: chr6; HSP #38
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tcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacacta |
191 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || |
|
|
| T |
18896354 |
tcaagatataacaatatcaa-tgacaatcaacaacaacttaaacatcttatataattcacataatgcatatacaattatatcccattactaacaacatta |
18896256 |
T |
 |
| Q |
192 |
aatcatattataatagcttcacagatcatcagtaatattata |
233 |
Q |
| |
|
|||| | |||||| || ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18896255 |
aatc-ttttataacagattcacagatcatcagtaatattata |
18896215 |
T |
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Target: chr6; HSP #39
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21 |
acatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatc |
120 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1644622 |
acatcttccacataaggcatataagtatttcacataaccaacaacagcaacataggcgacacataaacatctcagaatataacaatatcaaatgataatc |
1644721 |
T |
 |
| Q |
121 |
aacaac |
126 |
Q |
| |
|
|||||| |
|
|
| T |
1644722 |
aacaac |
1644727 |
T |
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Target: chr6; HSP #40
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| Q |
92 |
tcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacacta |
191 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| ||||| || |
|
|
| T |
19362507 |
tcaagatataacaatatcaa-tgacaatcaacaacaacttgaacatcttaaataattcacataatgcatataaaattatatcacattactaacaacatta |
19362605 |
T |
 |
| Q |
192 |
aatcatattataatagcttcacagatcatcagtaatattata |
233 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19362606 |
aatcat-ttataacagtttcacagatcatcagtaatattata |
19362646 |
T |
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Target: chr6; HSP #41
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Target Start/End: Original strand, 23539020 - 23539160
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| Q |
62 |
caacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcata |
161 |
Q |
| |
|
||||||||||| || || ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
23539020 |
caacagcaacacaggcagcacatatacatctcaagatataacaatatcaaatgataattaacatcaacataaacatcatatataatccacataatgcatt |
23539119 |
T |
 |
| Q |
162 |
tacaaatatattacattactatcaacactaaatcatattat |
202 |
Q |
| |
|
||||||||||| || ||| ||| |||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
23539120 |
tacaaatatatcaccttattattaacattaaatcatcttat |
23539160 |
T |
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Target: chr6; HSP #42
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66 |
agcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatataca |
165 |
Q |
| |
|
||||| |||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
20182848 |
agcaatataggcagcacataaacatctcaagatataacaatatcaaatgataattaacaacaacttaaacatcatacataattcac--aatgcatataca |
20182945 |
T |
 |
| Q |
166 |
aatatattacattacta |
182 |
Q |
| |
|
| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
20182946 |
actatatcacattacta |
20182962 |
T |
 |
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Target: chr6; HSP #43
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66 |
agcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatataca |
165 |
Q |
| |
|
||||| |||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
22153143 |
agcaatataggcagcacataaacatctcaagatataacaatatcaaatgataattaacaacaacttaaacatcatacataattcac--aatgcatataca |
22153046 |
T |
 |
| Q |
166 |
aatatattacattacta |
182 |
Q |
| |
|
| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
22153045 |
actatatcacattacta |
22153029 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 21 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 12619034 - 12618927
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| Q |
21 |
acatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatc |
120 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12619034 |
acatcttccacataagacata--aatatttcacataaccaacaacaacaacataggagacacataaacatctcaggatataacaatatcaaatgataatc |
12618937 |
T |
 |
| Q |
121 |
aacaacaact |
130 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
12618936 |
aacaacaact |
12618927 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #45
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Target Start/End: Original strand, 23076806 - 23076918
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85 |
aaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatc |
184 |
Q |
| |
|
|||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || | |
|
|
| T |
23076806 |
aaacatatccagatataataatatcaagtgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattaac |
23076905 |
T |
 |
| Q |
185 |
aacactaaatcat |
197 |
Q |
| |
|
|||| ||||||| |
|
|
| T |
23076906 |
aacatcaaatcat |
23076918 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #46
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| Q |
18 |
catacatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaa |
111 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| ||||| |
|
|
| T |
17377911 |
catacattttccacataacgcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatatgcagcacgtaaacatctcaagatatgacaacatcaa |
17377818 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #47
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Query Start/End: Original strand, 18 - 97
Target Start/End: Original strand, 17743384 - 17743463
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| Q |
18 |
catacatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaaga |
97 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17743384 |
catacattttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacataggtagcacgtaaacatctcaaga |
17743463 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #48
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Query Start/End: Original strand, 18 - 124
Target Start/End: Original strand, 15875390 - 15875496
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| Q |
18 |
catacatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgata |
117 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| || ||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| |
|
|
| T |
15875390 |
catacattttccacataagacatataattatttcacataaccaacatcagcaacatatgcagcacttaaacacctcaagatataacaacatcaaataata |
15875489 |
T |
 |
| Q |
118 |
atcaaca |
124 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
|
| T |
15875490 |
atcaaca |
15875496 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #49
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Query Start/End: Original strand, 85 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 18177719 - 18177606
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| Q |
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aaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaa-cttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactat |
183 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| || |
|
|
| T |
18177719 |
aaacaactcatgatataacaatatcaaatgataatcaacatcaatcttaaacatcatatataattcacttaatgcatatacatttatatcacattattaa |
18177620 |
T |
 |
| Q |
184 |
caacactaaatcat |
197 |
Q |
| |
|
||||| ||||||| |
|
|
| T |
18177619 |
caacatcaaatcat |
18177606 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
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85 |
aaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaa-cttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactat |
183 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| || |
|
|
| T |
18199463 |
aaacaactcatgatataacaatatcaaatgataatcaacatcaatcttaaacatcatatataattcacttaatgcatatacatttatatcacattattaa |
18199364 |
T |
 |
| Q |
184 |
caacactaaatcat |
197 |
Q |
| |
|
||||| ||||||| |
|
|
| T |
18199363 |
caacatcaaatcat |
18199350 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #51
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Target Start/End: Original strand, 18204152 - 18204265
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aaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaa-cttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactat |
183 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| || |
|
|
| T |
18204152 |
aaacaactcatgatataacaatatcaaatgataatcaacatcaatcttaaacatcatatataattcacttaatgcatatacatttatatcacattattaa |
18204251 |
T |
 |
| Q |
184 |
caacactaaatcat |
197 |
Q |
| |
|
||||| ||||||| |
|
|
| T |
18204252 |
caacatcaaatcat |
18204265 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #52
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85 |
aaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatc |
184 |
Q |
| |
|
|||||| || |||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| || | |
|
|
| T |
35008224 |
aaacatatccagatataataatatcaagtgataatcaaaaacaacttaaacatcatatataattcatgtaatgaatatacaaatatatcacattattaac |
35008323 |
T |
 |
| Q |
185 |
aacactaaatcat |
197 |
Q |
| |
|
|||| ||||||| |
|
|
| T |
35008324 |
aacatcaaatcat |
35008336 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #53
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Query Start/End: Original strand, 85 - 179
Target Start/End: Original strand, 23538884 - 23538978
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| Q |
85 |
aaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacatta |
179 |
Q |
| |
|
||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| |||||| |
|
|
| T |
23538884 |
aaacagctcatgatataacaatatcaaatgacaatcaacatcaacctaaacatcatatatcattcacataacgcatatacaactatatcacatta |
23538978 |
T |
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Target Start/End: Complemental strand, 23528150 - 23528036
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86 |
aacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatca |
185 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||| |||| || ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||| |
|
|
| T |
23528150 |
aacatctcaagatgtaacaat--caaaggacgatcaacatcgacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaactacatcacattactatca |
23528053 |
T |
 |
| Q |
186 |
acactaaatcatattat |
202 |
Q |
| |
|
||| ||||||| |||| |
|
|
| T |
23528052 |
acatcaaatcatcttat |
23528036 |
T |
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Target: chr6; HSP #55
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Target Start/End: Complemental strand, 29416949 - 29416865
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| Q |
87 |
acatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataatt-cacataatgcatatacaaatata |
171 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| |
|
|
| T |
29416949 |
acatctcaagatataacaatatcaaatgataattaac-acaacttaaacatcatatataattccacataatgcatttgcaaatata |
29416865 |
T |
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Target: chr6; HSP #56
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Target Start/End: Complemental strand, 27416053 - 27415996
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| Q |
18 |
catacatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatag |
75 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27416053 |
catacattttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatag |
27415996 |
T |
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Target: chr6; HSP #57
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| Q |
61 |
acaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataat-caacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgca |
159 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| || || |||||||||||||||| ||||| | ||||| ||| | ||||| ||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| |
|
|
| T |
16493196 |
acaacagcaacataggcagaacataaacatctcaagatagaacaacaccaaataatatttcaacatcaacttaaacatcttatgtaaatcacataatgca |
16493295 |
T |
 |
| Q |
160 |
tatacaaatatattacattactatcaac |
187 |
Q |
| |
|
||||| ||||||| ||||||||| |||| |
|
|
| T |
16493296 |
tatac-aatatatcacattactaacaac |
16493322 |
T |
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Target: chr6; HSP #58
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| Q |
87 |
acatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcat |
160 |
Q |
| |
|
||||| ||| |||| |||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7429918 |
acatcccaaaatatgacaataccaaatgataatcaaca-ctacttaaacatcatacataattcacataatgcat |
7429990 |
T |
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Target: chr6; HSP #59
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| Q |
18 |
catacatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaaca |
66 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18913952 |
catacattttccacataaggcatataattatttcacataaccaacaaca |
18914000 |
T |
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Target: chr6; HSP #60
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Target Start/End: Original strand, 18937210 - 18937258
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| Q |
18 |
catacatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaaca |
66 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18937210 |
catacattttccacataaggcatataattatttcacataaccaacaaca |
18937258 |
T |
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Target: chr6; HSP #61
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Target Start/End: Original strand, 25738457 - 25738540
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| Q |
87 |
acatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatata |
171 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | |||||||| |
|
|
| T |
25738457 |
acatctcaagatatgacaatatcaattaataatcaact-caacttaaacatcattcataatccacataatgcatttgcaaatata |
25738540 |
T |
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Target: chr6; HSP #62
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Target Start/End: Original strand, 25644406 - 25644545
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96 |
gatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacat-catatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaat |
194 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| | ||| ||||| || |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| |||| | | ||||| |||| |
|
|
| T |
25644406 |
gatataacaatatcaaatgtaagtcatcaacatctcaaacattcatatataattcaagtaatgcgtatacaattatatcacatcaaaaacaacatcaaat |
25644505 |
T |
 |
| Q |
195 |
catattataatagcttcacagatcatcagtaatattatat |
234 |
Q |
| |
|
||| |||| ||||||||||||||||| |||||| |||| |
|
|
| T |
25644506 |
catcatatatcagcttcacagatcatcattaatatcatat |
25644545 |
T |
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Target: chr6; HSP #63
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Query Start/End: Original strand, 87 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 14594282 - 14594210
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| Q |
87 |
acatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcat |
160 |
Q |
| |
|
||||| ||| |||| |||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
14594282 |
acatcccaaaatatgacaataccaaatgataatcaaca-ctacttaaacatcatacataatccacataatgcat |
14594210 |
T |
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Target: chr6; HSP #64
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| Q |
18 |
catacatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaaca |
66 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15174211 |
catacattttccacataagtcatataattatttcacataaccaacaaca |
15174163 |
T |
 |
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Target: chr6; HSP #65
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Target Start/End: Original strand, 23956158 - 23956206
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| Q |
18 |
catacatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaaca |
66 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23956158 |
catacattttccacataaggcatatagttatttcacataaccaacaaca |
23956206 |
T |
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Back To:
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Target: chr6; HSP #66
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| Q |
96 |
gatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacatta |
179 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||| | |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||| |
|
|
| T |
23019491 |
gatataacaatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacatta |
23019574 |
T |
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Target: chr6; HSP #67
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Target Start/End: Complemental strand, 8227506 - 8227409
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| Q |
136 |
atcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaatcatattataatagcttcacagatcatcagtaatattata |
233 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| | ||||| ||||||| || | ||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
8227506 |
atcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcatcataaatcagcttcacagatcatcattaatattata |
8227409 |
T |
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Target: chr6; HSP #68
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Target Start/End: Original strand, 19668458 - 19668560
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| Q |
96 |
gatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaatc |
195 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||| | |||||||| ||| |
|
|
| T |
19668458 |
gatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatc-acaacatcatacgtaattcatgtaatgtatatacaactatataacattatcaacaacactacatc |
19668556 |
T |
 |
| Q |
196 |
atat |
199 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
19668557 |
atat |
19668560 |
T |
 |
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Target: chr6; HSP #69
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| Q |
114 |
gataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaaca |
188 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||||||| ||||||||| ||| | |||||||||||| || || ||||| ||||||||| ||||| |
|
|
| T |
19656150 |
gataaacaaccacaacttcaacatcatacatattccacataatgcatgtataagtatatcacattactaacaaca |
19656076 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
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| Q |
141 |
atataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaatcatattataatagcttcacagatcatcagtaatattatat |
234 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| || || ||||| ||||||| || | ||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
18456846 |
atataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaata-taacaacatcaaatcatcataaatcagcttcacagatcatcattaatattatat |
18456938 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #71
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| Q |
128 |
acttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatat |
172 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| |
|
|
| T |
17105849 |
actttaacatcatacataattcacataattcatatacaactatat |
17105893 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
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| Q |
111 |
aatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatata |
163 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||| || | |||||||| |||||| |
|
|
| T |
18259970 |
aatgataatcaacaacaacttgaacatcatacattttccacataatacatata |
18259918 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #73
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Query Start/End: Original strand, 87 - 163
Target Start/End: Original strand, 23956108 - 23956183
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| Q |
87 |
acatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatata |
163 |
Q |
| |
|
||||| ||| |||| |||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||| || | ||||||| ||||||| |
|
|
| T |
23956108 |
acatcccaaaatatgacaataccaaatgataatcaac-actacttaaacatcatacattttccacataaggcatata |
23956183 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0200 (Bit Score: 249; Significance: 1e-138; HSPs: 1)
Name: scaffold0200
Description:
Target: scaffold0200; HSP #1
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 18 - 286
Target Start/End: Original strand, 17580 - 17848
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| Q |
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catacatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgata |
117 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17580 |
catacatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacataggcgacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgata |
17679 |
T |
 |
| Q |
118 |
atcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaatcatattataatagcttcacagat |
217 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
17680 |
atcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataattcatatacaaatatattacattactatcaacactaaatcatattataatagtttcacagat |
17779 |
T |
 |
| Q |
218 |
catcagtaatattatattcaacccacattcctaccccaacactaaatcatattattatacttttaaaca |
286 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
17780 |
catcagtaatattatattcaacccacattcctaccccaacactaaatcatattattatactcttaaaca |
17848 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7 (Bit Score: 247; Significance: 1e-137; HSPs: 94)
Name: chr7
Description:
Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 18 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 1858945 - 1858675
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| Q |
18 |
catacatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgata |
117 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1858945 |
catacattttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacaacaacataggcgacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgata |
1858846 |
T |
 |
| Q |
118 |
atcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaatcatattataatagcttcacagat |
217 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1858845 |
atcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaatcatattataatagcttcacagat |
1858746 |
T |
 |
| Q |
218 |
catcagtaatattatattcaacccacattcctaccccaacactaaatcatattattatacttttaaacacc |
288 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
1858745 |
catcaataatattatattcaacccacattcctaccccaacactaaatcatattattatactcttaaacacc |
1858675 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #2
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Query Start/End: Original strand, 18 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 25927362 - 25927095
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Q |
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catacatcttccacataagacatataaatatttcacataaccaacaacagcaacataggcgacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgata |
25927263 |
T |
 |
| Q |
118 |
atcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaatcatattataatagcttcacagat |
217 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25927262 |
atcaacaac---ttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaatcatattataatagcttcacagat |
25927166 |
T |
 |
| Q |
218 |
catcagtaatattatattcaacccacattcctaccccaacactaaatcatattattatacttttaaacacc |
288 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
25927165 |
catcagtaatattatattcaacccacattcctaccccgacactaaatcatattattatactcttaaacacc |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #3
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117 |
Q |
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|
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|
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13918540 |
T |
 |
| Q |
118 |
atcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaatcatattataatagcttcacagat |
217 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13918539 |
attaacaacaacttaaacatcatatataattcacaaaatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaatcatattataatagcttcacagat |
13918440 |
T |
 |
| Q |
218 |
catcagtaatattatattcaacccacattcctaccccaacactaaatcatattattatacttttaaacacc |
288 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
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T |
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Target: chr7; HSP #4
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Q |
| |
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|
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T |
 |
| Q |
118 |
atcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaatcatattataatagcttcacagat |
217 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
46580689 |
atcaacatcaacttaaacatcttatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacattaaatcatattataacagcttcacagat |
46580590 |
T |
 |
| Q |
218 |
catcagtaatattatattcaacccacattcctaccccaa |
256 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
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46580589 |
catcagtaatattatattcaacctccattcctaccccaa |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 18 - 256
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Q |
| |
|
||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
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T |
 |
| Q |
118 |
atcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaatcatattataatagcttcacagat |
217 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
14273621 |
atcaacatcaacttaaacatcttatataattcacataatacatatacaaatatattacattactatcaacattaaatcatattataacagcttcacagat |
14273720 |
T |
 |
| Q |
218 |
catcagtaatattatattcaacccacattcctaccccaa |
256 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #6
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Q |
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|
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T |
 |
| Q |
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ttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaatcatattataatagcttcacagatcatcagtaatat |
229 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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ttaaacatcttatataattcacataatgcatatacaaatatattacattattatcaacattaaatcatattataactgcttcacagatcatcagtaatat |
16998810 |
T |
 |
| Q |
230 |
tatattcaacccacattcctaccccaa |
256 |
Q |
| |
|
||||||||| | |||||||||||||| |
|
|
| T |
16998811 |
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T |
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Target: chr7; HSP #7
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117 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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catacattttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacataggcagcacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgata |
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T |
 |
| Q |
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atcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaatcatatt |
200 |
Q |
| |
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||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||| |
|
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T |
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Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
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T |
 |
| Q |
118 |
atcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaatcatatt |
200 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
32301394 |
atcaacatcaacttaaagatcttatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacattaaatcatatt |
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T |
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Target: chr7; HSP #9
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Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
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catacattttccacataaggcatataaatatttcacataactaacaacaacaacataggcagcacgtaaacatctcaagatataacaacatcaaatgata |
16460780 |
T |
 |
| Q |
118 |
atcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaatcatatt |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |
|
|
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T |
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| |
|
|||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
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atacattttacacataaggcgtataaatatttcacataaccaacaacagcaacataggcagcacgtaaacatctcaagatataacaacatcaaatgataa |
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T |
 |
| Q |
119 |
tcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaatcatatt |
200 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
16579866 |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #11
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Query Start/End: Original strand, 19 - 200
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Q |
| |
|
|||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
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atacattttacacataaggcgtataaatatttcacataaccaacaacagcaacataggcagcacgtaaacatctcaagatataacaacatcaaatgataa |
16585798 |
T |
 |
| Q |
119 |
tcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaatcatatt |
200 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
16585797 |
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T |
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Q |
| |
|
||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
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catacattttccacataaggaatataaatatttcacataaccaacaacaacaacatatgcagcacataaacatctcaaaatataacaatatcaaacgata |
17060439 |
T |
 |
| Q |
118 |
atcaacaacaacttaaa-catcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaatcatattataatagcttcacaga |
216 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||||| || |||| ||| |
|
|
| T |
17060438 |
atcaacttcaacttaaaacatcttatataattcacataatgcatatacaaatatttgacattactatcaacattaaatcatgttataacagattcataga |
17060339 |
T |
 |
| Q |
217 |
tcatcagtaatattatattcaacc |
240 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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acatcagtaatattatattcaacc |
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Target: chr7; HSP #13
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| |
|
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|
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T |
 |
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caacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaatcatatt |
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |
|
|
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 |
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-atattataatagcttcacagatcatcagtaatattatattcaacccacattcctaccccaa |
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|
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
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Q |
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|
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
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atataataatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcttaaataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacattaaatca |
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T |
 |
| Q |
197 |
tattataatagcttcacagatcatcagtaatattatattcaacccacattcctaccccaa |
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Q |
| |
|
| ||| || ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |
|
|
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T |
 |
| Q |
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acactaaatcatattataatagcttcacagatcatcagtaatattatattcaacccacattcctaccccaa |
256 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |
|
|
| T |
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acattaaatcatattataacagcttcacagaacattagtaatactatattcaacctccatccctaccccaa |
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Target: chr7; HSP #17
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|
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T |
 |
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atcaacaacaacttaaacatcatatata |
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Q |
| |
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|
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atcaacatcaacttaaacatcatatata |
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|
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18 |
catacatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgata |
117 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
45170201 |
catacatcttccacataagtcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacataggcgacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgata |
45170102 |
T |
 |
| Q |
118 |
atcaacaacaact |
130 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |
|
|
| T |
45170101 |
atcaacaacaact |
45170089 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 61 - 203
Target Start/End: Original strand, 11661322 - 11661464
Alignment:
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61 |
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160 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
11661322 |
acaacagcaacataggcagcacataaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacatcaacttaaacatcttatataatccacataatgcat |
11661421 |
T |
 |
| Q |
161 |
atacaaatatattacattactatcaacactaaatcatattata |
203 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
11661422 |
atacaaatatatctcattactaacaacatcaaatcatattata |
11661464 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #21
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Target Start/End: Original strand, 18279317 - 18279426
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| Q |
21 |
acatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatc |
120 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18279317 |
acatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacataggcgacacataaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatc |
18279416 |
T |
 |
| Q |
121 |
aacaacaact |
130 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
18279417 |
aacaacaact |
18279426 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 21 - 130
Target Start/End: Original strand, 18283280 - 18283389
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| Q |
21 |
acatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatc |
120 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18283280 |
acatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacataggcgacacataaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatc |
18283379 |
T |
 |
| Q |
121 |
aacaacaact |
130 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
18283380 |
aacaacaact |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #23
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Target Start/End: Original strand, 15720002 - 15720140
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18 |
catacatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgata |
117 |
Q |
| |
|
||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
15720002 |
catacatttttcacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagaaacatatgcagcacgtaaacatctcaagatataacaacatcaaatgata |
15720101 |
T |
 |
| Q |
118 |
atcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataat |
156 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||| ||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
15720102 |
atcaacatcaacttaaacatcttatctaattcacttaat |
15720140 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 61 - 203
Target Start/End: Original strand, 42461999 - 42462141
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| Q |
61 |
acaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcat |
160 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||| || |
|
|
| T |
42461999 |
acaacagcaacataggcaacacataaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacatcaacttaaacatcttatataatccacataatgaat |
42462098 |
T |
 |
| Q |
161 |
atacaaatatattacattactatcaacactaaatcatattata |
203 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| ||||||||| ||||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
42462099 |
atacaactatatcacattactaacaacatcaaattatattata |
42462141 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 21 - 130
Target Start/End: Original strand, 33021 - 33130
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| Q |
21 |
acatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatc |
120 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33021 |
acatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacataggcgacacataaacatctcaggatataacaatatcaaatgataatc |
33120 |
T |
 |
| Q |
121 |
aacaacaact |
130 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
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33121 |
aacaacaact |
33130 |
T |
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Target: chr7; HSP #26
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Target Start/End: Complemental strand, 70957 - 70848
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| Q |
21 |
acatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatc |
120 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
70957 |
acatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacataggcgacacataaacatctcaggatataacaatatcaaatgataatc |
70858 |
T |
 |
| Q |
121 |
aacaacaact |
130 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
70857 |
aacaacaact |
70848 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #27
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Query Start/End: Original strand, 21 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 75066 - 74957
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| Q |
21 |
acatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatc |
120 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
75066 |
acatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacataggcgacacataaacatctcaggatataacaatatcaaatgataatc |
74967 |
T |
 |
| Q |
121 |
aacaacaact |
130 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
74966 |
aacaacaact |
74957 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 21 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 12704851 - 12704742
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| Q |
21 |
acatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatc |
120 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12704851 |
acatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacataggcgacacataaacatctcaggatataacaatatcaaatgataatc |
12704752 |
T |
 |
| Q |
121 |
aacaacaact |
130 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
12704751 |
aacaacaact |
12704742 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 21 - 130
Target Start/End: Original strand, 12714778 - 12714887
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| Q |
21 |
acatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatc |
120 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12714778 |
acatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacataggcgacacataaacatctcaggatataacaatatcaaatgataatc |
12714877 |
T |
 |
| Q |
121 |
aacaacaact |
130 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
12714878 |
aacaacaact |
12714887 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 21 - 130
Target Start/End: Original strand, 12718582 - 12718691
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| Q |
21 |
acatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatc |
120 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12718582 |
acatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacataggcgacacataaacatctcaggatataacaatatcaaatgataatc |
12718681 |
T |
 |
| Q |
121 |
aacaacaact |
130 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
12718682 |
aacaacaact |
12718691 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 21 - 130
Target Start/End: Original strand, 12723493 - 12723602
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| Q |
21 |
acatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatc |
120 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12723493 |
acatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacataggcgacacataaacatctcaggatataacaatatcaaatgataatc |
12723592 |
T |
 |
| Q |
121 |
aacaacaact |
130 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
12723593 |
aacaacaact |
12723602 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 21 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 16907393 - 16907284
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| Q |
21 |
acatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatc |
120 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16907393 |
acatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacataggcgacacataaacatctcaggatataacaatatcaaatgataatc |
16907294 |
T |
 |
| Q |
121 |
aacaacaact |
130 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
16907293 |
aacaacaact |
16907284 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 61 - 250
Target Start/End: Original strand, 16996272 - 16996460
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| Q |
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acaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcat |
160 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
16996272 |
acaacagcaacgtaggcagcacataaacatctcaagatataacaatatcaaatgaaaatcaacaacat-ttaaacatcttatataatccacataatgcat |
16996370 |
T |
 |
| Q |
161 |
atacaaatatattacattactatcaacactaaatcatattataatagcttcacagatcatcagtaatattatattcaacccacattccta |
250 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| || |||| || ||||| |||||||||| |||||| |||||||| |
|
|
| T |
16996371 |
atacaaatatatcacattactaacaacatcaaatcatattatatcagactcactgaacatcaataatattataatcaacctccattccta |
16996460 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 62 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 10501493 - 10501373
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| Q |
62 |
caacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcata |
161 |
Q |
| |
|
||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10501493 |
caacaacaacataggcaacacataaacatctcaagatataacaacatcaaatgataatcaacatcaacttaaacatcatatataattcacataatgcata |
10501394 |
T |
 |
| Q |
162 |
tacaaatatattacattacta |
182 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
10501393 |
tacaactatatcacattacta |
10501373 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
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Target Start/End: Original strand, 14566216 - 14566360
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| Q |
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caacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgc |
158 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
14566216 |
caacaacggcaacataggcagcacataaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaatatcaacttaaacatcttatataatccacataatgc |
14566315 |
T |
 |
| Q |
159 |
atatacaaatatattacattactatcaacactaaatcatattata |
203 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
14566316 |
atatacaaatatatctcattactaacaacatcaaatcatattata |
14566360 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #36
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Query Start/End: Original strand, 59 - 203
Target Start/End: Original strand, 16008592 - 16008736
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| Q |
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caacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgc |
158 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
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caacaacggcaacataggcaacacataaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaatatcaacttaaacatcttatataatccacataatgc |
16008691 |
T |
 |
| Q |
159 |
atatacaaatatattacattactatcaacactaaatcatattata |
203 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||| ||||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
16008692 |
atatacaaatatatctcattactaacaacatcaaattatattata |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #37
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Query Start/End: Original strand, 59 - 203
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| Q |
59 |
caacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgc |
158 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
18872374 |
caacaacggcaacataggcagcacataaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaatatcaacttaaacatcttatataatccacataatgc |
18872473 |
T |
 |
| Q |
159 |
atatacaaatatattacattactatcaacactaaatcatattata |
203 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
18872474 |
atatacaaatatatctcattactaacaacatcaaatcatattata |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 18 - 130
Target Start/End: Original strand, 39722177 - 39722289
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| Q |
18 |
catacatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgata |
117 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39722177 |
catacatcttccacataaggcatataagtatttcacataaccaacaacagcaacataggcgacacataaacatctcaggatataacaatatcaaatgata |
39722276 |
T |
 |
| Q |
118 |
atcaacaacaact |
130 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |
|
|
| T |
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atcaacaacaact |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 61 - 203
Target Start/End: Original strand, 18607503 - 18607645
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acaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcat |
160 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| || ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
18607503 |
acaacagcaacataggcagcacataaacatctcaatatataaaaatatcaaatgataatcaacatcaacttaaacatcttatataatccacataatgcat |
18607602 |
T |
 |
| Q |
161 |
atacaaatatattacattactatcaacactaaatcatattata |
203 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
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atacaaatatatctcattactaacaacatcaaatcatattata |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #40
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Target Start/End: Original strand, 26292309 - 26292418
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21 |
acatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatc |
120 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26292309 |
acatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacatcaacattgacgacacataaacatctcaggatataacaatatcaaatgataatc |
26292408 |
T |
 |
| Q |
121 |
aacaacaact |
130 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
26292409 |
aacaacaact |
26292418 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 61 - 203
Target Start/End: Original strand, 38519422 - 38519564
Alignment:
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61 |
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160 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||| |
|
|
| T |
38519422 |
acaacaacaacataggcagcacataaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacatcaacttaaacatcttatacaatccacataatgcat |
38519521 |
T |
 |
| Q |
161 |
atacaaatatattacattactatcaacactaaatcatattata |
203 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
38519522 |
atacaactatatcacattactaataacatcaaatcatattata |
38519564 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 95 - 253
Target Start/End: Original strand, 48991266 - 48991422
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95 |
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194 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
48991266 |
agatataataatatcaagtgataatcaacaacaacttaaacatcttaaataattcagataatgcatatac-aatatatca-attactatcaacattaaat |
48991363 |
T |
 |
| Q |
195 |
catattataatagcttcacagatcatcagtaatattatattcaacccacattcctaccc |
253 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
48991364 |
catattataacagcttcacagatcatcatcaatattgtattcaacctctattcctaccc |
48991422 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 133 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 2530052 - 2529951
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133 |
aacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaatcatattataatagcttcacagatcatcagtaatattat |
232 |
Q |
| |
|
|||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2530052 |
aacatcttaaataattcacataatgcatatacaaatatattacatcactatcaacattaaatcatattataatagcttcacagatcatcagtaatattat |
2529953 |
T |
 |
| Q |
233 |
at |
234 |
Q |
| |
|
|| |
|
|
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2529952 |
at |
2529951 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #44
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Query Start/End: Original strand, 97 - 256
Target Start/End: Original strand, 16091844 - 16092002
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| Q |
97 |
atataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaatca |
196 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| | |||||| || ||||| ||| ||| |
|
|
| T |
16091844 |
atataataatatcaaatgataatcaacaaca-cttaatcatcatatataatccacataatgcgtatacaaatatgtaacattattaacaacaataattca |
16091942 |
T |
 |
| Q |
197 |
tattataatagcttcacagatcatcagtaatattatattcaacccacattcctaccccaa |
256 |
Q |
| |
|
|| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
16091943 |
tagtataacagcttcacatatcatcattaatattatatacaacctccattcctaccccaa |
16092002 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
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Target Start/End: Original strand, 16114155 - 16114264
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| Q |
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acatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatc |
120 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | |||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16114155 |
acatcttccacataaggcatataaatatttcacataatcaacaacaacaacataggcgacacatgaacatctcaggatataacaatatcaaatgataatc |
16114254 |
T |
 |
| Q |
121 |
aacaacaact |
130 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
16114255 |
aacaacaact |
16114264 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 21 - 130
Target Start/End: Original strand, 16117308 - 16117417
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| Q |
21 |
acatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatc |
120 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | |||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16117308 |
acatcttccacataaggcatataaatatttcacataatcaacaacaacaacataggcgacacatgaacatctcaggatataacaatatcaaatgataatc |
16117407 |
T |
 |
| Q |
121 |
aacaacaact |
130 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
16117408 |
aacaacaact |
16117417 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #47
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Target Start/End: Original strand, 20619430 - 20619570
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| Q |
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acaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaa-caacaacttaaacatcatatataattcacataatgca |
159 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || |||||||| ||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20619430 |
acaacaacaacataggcaacacataaacatctcaagatataacaatgtcaaataataatcaatcatcaacttaagcatattatataattcacataatgca |
20619529 |
T |
 |
| Q |
160 |
tatacaaatatattacattactatcaacactaaatcatatt |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
20619530 |
tatacaaatatatcacattactaacaacatcaaatcatatt |
20619570 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 61 - 203
Target Start/End: Original strand, 14422000 - 14422143
Alignment:
| Q |
61 |
acaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaactt-aaacatcatatataattcacataatgca |
159 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||| || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| || ||||||||||| |
|
|
| T |
14422000 |
acaacagtaacataggcagcacataaacacctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacatcaacttaaaacatcttatatgatccacataatgca |
14422099 |
T |
 |
| Q |
160 |
tatacaaatatattacattactatcaacactaaatcatattata |
203 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
14422100 |
tatacaaatatatctcattactaacaacatcaaatcatattata |
14422143 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
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Target Start/End: Complemental strand, 14929257 - 14929152
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| Q |
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agatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaat |
194 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
14929257 |
agatacaacaatatcaaatgataatcaacatcaacttaaacatcttaaatacttcacataatgcatatccaaatatattacattactatcaacattaaat |
14929158 |
T |
 |
| Q |
195 |
catatt |
200 |
Q |
| |
|
|||||| |
|
|
| T |
14929157 |
catatt |
14929152 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 95 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 15352723 - 15352618
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| Q |
95 |
agatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaat |
194 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
15352723 |
agatacaacaatatcaaatgataatcaacatcaacttaaacatcttaaatacttcacataatgcatatccaaatatattacattactatcaacattaaat |
15352624 |
T |
 |
| Q |
195 |
catatt |
200 |
Q |
| |
|
|||||| |
|
|
| T |
15352623 |
catatt |
15352618 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 61 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 9033417 - 9033274
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| Q |
61 |
acaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataat-caacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgca |
159 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9033417 |
acaacaacaacataggcaacacataaatatctcaggatataacaatatcaaataataatgcaacatcaacttaaacatcttatataattcacataatgca |
9033318 |
T |
 |
| Q |
160 |
tatacaaatatattacattactatcaacactaaatcatattata |
203 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| |||||| || ||||| |||||| |||||| |
|
|
| T |
9033317 |
tatacaactatatcacattattaacaacatcaaatcacattata |
9033274 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 61 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 130888 - 130745
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| Q |
61 |
acaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaa-caacaacttaaacatcatatataattcacataatgca |
159 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| | |||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
130888 |
acaacatcaacataggcagcacagaaacatctcaagatataacaatatcaaataataatcaatcatcaacttaaacaccttatataatccacataatgca |
130789 |
T |
 |
| Q |
160 |
tatacaaatatattacattactatcaacactaaatcatattata |
203 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
130788 |
tatacaactatatcacattactaataacatcaaatcatattata |
130745 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 27 - 145
Target Start/End: Original strand, 8468733 - 8468849
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| Q |
27 |
tccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaac |
126 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| | |
|
|
| T |
8468733 |
tccacataaggcatatgaacatttcacataaccaacaacagcaacataggcaacacttaaacacctcaagatataacaacatcaaataataatcaacatc |
8468832 |
T |
 |
| Q |
127 |
aacttaaacatcatatata |
145 |
Q |
| |
|
| | |||||||||||||| |
|
|
| T |
8468833 |
a--taaaacatcatatata |
8468849 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 61 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 11525635 - 11525492
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| Q |
61 |
acaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaa-caacaacttaaacatcatatataattcacataatgca |
159 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| || ||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11525635 |
acaacaacaacataggcagcacataaacatctcaggatataacaatatcaaataataatcaatcatcaacttaaacatcttatataattcacataatgca |
11525536 |
T |
 |
| Q |
160 |
tatacaaatatattacattactatcaacactaaatcatattata |
203 |
Q |
| |
|
||||| ||||||| | ||||||| |||| | ||||||||||| |
|
|
| T |
11525535 |
tataccaatatatcaaattactaataacatcatatcatattata |
11525492 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 88 - 256
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| Q |
88 |
catctcaagatataacaatatcaaatgataat--caacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatca |
185 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |
|
|
| T |
11768964 |
catctcaagatataacaatatcaaataatattttcaacatcaacttaaacatcttatataattcacataatgcatatacaaatatatcacattactaaca |
11768865 |
T |
 |
| Q |
186 |
acactaaatcatattataatagcttcacagatcatcagtaatattatattcaacccacattcctaccccaa |
256 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| ||| |||| || ||| | | || |||| |||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
11768864 |
acctcaaatcatattatattagactcactgaacataaacagtactataatcaacctccattcctaccccaa |
11768794 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
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Target Start/End: Complemental strand, 15008533 - 15008390
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| Q |
96 |
gatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaatc |
195 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||| |
|
|
| T |
15008533 |
gatataacaatatcaa-tgcaaatcaacaacacctcaaacatcatatataattcaagtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaatc |
15008435 |
T |
 |
| Q |
196 |
atattataatagcttcacagatcatcagtaatattatattcaacc |
240 |
Q |
| |
|
|| |||||| |||||||||||| |||| |||||| |||| ||||| |
|
|
| T |
15008434 |
atcttataacagcttcacagattatcattaatatcatatacaacc |
15008390 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 18 - 114
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18 |
catacatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatg |
114 |
Q |
| |
|
||||||| ||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15112950 |
catacattttctacataaggcatatgaacatttcacataaccaacaacatcaacataggcaacacttaaacatctcaagatataacaatatcaaatg |
15113046 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #58
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Query Start/End: Original strand, 85 - 253
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| Q |
85 |
aaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatc |
184 |
Q |
| |
|
||||| |||| |||||||||||||||| || ||| ||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || | |
|
|
| T |
1868040 |
aaacagctcatgatataacaatatcaa-tgcaaatgaacaacatctcaaacatcatatataattcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattaac |
1867942 |
T |
 |
| Q |
185 |
aacactaaatcatattataatagcttcacagatcatcagtaatattatattcaacccacattcctaccc |
253 |
Q |
| |
|
|||| ||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||||| |||| |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
1867941 |
aacatcaaatcatctta-aaaagcttcacagatcatcattaatatcatatataacctccattcctaccc |
1867874 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #59
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87 |
acatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataatt-cacataatgcatatacaaatata |
171 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| |
|
|
| T |
837401 |
acatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaac-acaacttaaacatcatatataattccacataatgcatttgcaaatata |
837317 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #60
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Query Start/End: Original strand, 87 - 171
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| Q |
87 |
acatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataatt-cacataatgcatatacaaatata |
171 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| |
|
|
| T |
1202581 |
acatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaac-acaacttaaacatcatatataattccacataatgcatttgcaaatata |
1202497 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
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| Q |
27 |
tccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaaca |
124 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
14270131 |
tccacataaagcatatgaacatttcacataaccaacaacaacaacataggcaacacttaaacacctcaagatataacaacatcaaataataatcaaca |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 18 - 111
Target Start/End: Original strand, 15116487 - 15116580
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18 |
catacatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaa |
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Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15116487 |
catacattttccacataaggcatatgcacatttcacataacaaacaacagcaacataggcagcacttaaacatctcaagatataacaatatcaa |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 87 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 16109558 - 16109474
Alignment:
| Q |
87 |
acatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataatt-cacataatgcatatacaaatata |
171 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
16109558 |
acatctcaagatatagcaatatcaaatgataatcaac-acaacttaaacatcatatataattccacataatgcatttacaaatata |
16109474 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 26 - 114
Target Start/End: Original strand, 16324066 - 16324153
Alignment:
| Q |
26 |
ttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatg |
114 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
16324066 |
ttccacaaaaggcatataac-atttcacataaccaacaacagcaacataggcaacacttaaacatctcaagatataacaatatcgaatg |
16324153 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 121 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 9725670 - 9725535
Alignment:
| Q |
121 |
aacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaatcatattataatagcttcacagatcat |
220 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||| || |||| || ||| |
|
|
| T |
9725670 |
aacatcaacttaaacatcttatatgattcacataatgcatatacaactatatcacattactaacaacattaaatcacattatatcagactcactgaacat |
9725571 |
T |
 |
| Q |
221 |
cagtaatattatattcaacccacattcctaccccaa |
256 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
9725570 |
tagtaatattataaacaacctccattcctaccccaa |
9725535 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 87 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 833405 - 833321
Alignment:
| Q |
87 |
acatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataa-ttcacataatgcatatacaaatata |
171 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||| |
|
|
| T |
833405 |
acatctcaagatataacaatatcaattgataatcaac-acaacttaaacatcatatataatttcacataatgcatttgcaaatata |
833321 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 87 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 1198585 - 1198501
Alignment:
| Q |
87 |
acatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataa-ttcacataatgcatatacaaatata |
171 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||| |
|
|
| T |
1198585 |
acatctcaagatataacaatatcaattgataatcaac-acaacttaaacatcatatataatttcacataatgcatttgcaaatata |
1198501 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 60 - 164
Target Start/End: Original strand, 18203861 - 18203965
Alignment:
| Q |
60 |
aacaacagcaacatagacaacacgtaaa-catctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgc |
158 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||| ||||| |
|
|
| T |
18203861 |
aacaacaacaacatagacagtacataaaacatctcaagatataacaatatcaaataataatcaacaac-acttaatcatcatatataatccacacaatgc |
18203959 |
T |
 |
| Q |
159 |
atatac |
164 |
Q |
| |
|
|||||| |
|
|
| T |
18203960 |
atatac |
18203965 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 123 - 256
Target Start/End: Original strand, 14044860 - 14044993
Alignment:
| Q |
123 |
caacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaatcatattataatagcttcacagatcatca |
222 |
Q |
| |
|
||||| || ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||| | |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14044860 |
caacatctcaaacatcatatataattcatgtaatgtatatacaactatataacattatcaaaaacattaaatcatagtataacagcttcacagatcatca |
14044959 |
T |
 |
| Q |
223 |
gtaatattatattcaacccacattcctaccccaa |
256 |
Q |
| |
|
||| || |||| ||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
14044960 |
ttaacatcatatacaacctccattcctaccccaa |
14044993 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 123 - 256
Target Start/End: Original strand, 14354890 - 14355023
Alignment:
| Q |
123 |
caacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaatcatattataatagcttcacagatcatca |
222 |
Q |
| |
|
||||| || ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||| | |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14354890 |
caacatctcaaacatcatatataattcatgtaatgtatatacaactatataacattatcaaaaacattaaatcatagtataacagcttcacagatcatca |
14354989 |
T |
 |
| Q |
223 |
gtaatattatattcaacccacattcctaccccaa |
256 |
Q |
| |
|
||| || |||| ||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
14354990 |
ttaacatcatatacaacctccattcctaccccaa |
14355023 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 85 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 38898241 - 38898181
Alignment:
| Q |
85 |
aaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatata |
145 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38898241 |
aaacatctctagatataacaacatcaaatgataatcaacatcaacttaaacatcatatata |
38898181 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 96 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 2280155 - 2280028
Alignment:
| Q |
96 |
gatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacat-catatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaat |
194 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||| || ||||||||||||| ||||| |||||| || ||||| |||||| | ||||| |||| |
|
|
| T |
2280155 |
gatataataatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaatattcatatataattcaaataatacatataaaattatatcacattataaacaacatcaaat |
2280056 |
T |
 |
| Q |
195 |
catattataatagcttcacagatcatca |
222 |
Q |
| |
|
||| |||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2280055 |
catcttataacagcttcacagatcatca |
2280028 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 18 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 2530249 - 2530187
Alignment:
| Q |
18 |
catacatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaaca |
81 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
2530249 |
catacattttccacataaggcatataa-tatttcacataaccaacaacagcaacataggcaaca |
2530187 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 87 - 160
Target Start/End: Original strand, 38828304 - 38828377
Alignment:
| Q |
87 |
acatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataa-ttcacataatgcat |
160 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| |
|
|
| T |
38828304 |
acatctcaagatataataatatcaaatgataatcaac-acaacttaaacatcctatataagtccacataatgcat |
38828377 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 94 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 10896748 - 10896687
Alignment:
| Q |
94 |
aagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataa |
155 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| |
|
|
| T |
10896748 |
aagatataacaatatcaaatggtaatcaacatcaacttaaacatcttatataatccacataa |
10896687 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 94 - 155
Target Start/End: Original strand, 15167285 - 15167346
Alignment:
| Q |
94 |
aagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataa |
155 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| |
|
|
| T |
15167285 |
aagatataacaatatcaaatggtaatcaacatcaacttaaacatcttatataatccacataa |
15167346 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 12255827 - 12255694
Alignment:
| Q |
96 |
gatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacat-catatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaat |
194 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| | || |||||| || |||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| |||||| | ||||| | ||| |
|
|
| T |
12255827 |
gatataacaatatcaaatgaaattctacaacatctcaaacattcatatataattcaagtaatacatatacaattatatcacattataaacaaca-tcaat |
12255729 |
T |
 |
| Q |
195 |
catattataatagcttcacagatcatcagtaatat |
229 |
Q |
| |
|
||| |||||| | ||||| ||||||||| |||||| |
|
|
| T |
12255728 |
catcttataacaacttcatagatcatcattaatat |
12255694 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 87 - 160
Target Start/End: Original strand, 13892670 - 13892742
Alignment:
| Q |
87 |
acatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcat |
160 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
13892670 |
acatctcaaaatatgacaataccaaatgataatcaac-actacttaaacatcatacataatccacataatgcat |
13892742 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 179
Target Start/End: Original strand, 16056412 - 16056495
Alignment:
| Q |
96 |
gatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacatta |
179 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| | |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||| |
|
|
| T |
16056412 |
gatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacatta |
16056495 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 20220222 - 20220124
Alignment:
| Q |
96 |
gatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaatc |
195 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||| | | ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| || ||||| ||||| |
|
|
| T |
20220222 |
gatataacaatatcaaatgcaaatcaacatc---tcaaacatcatatataattcatgtaatgcatatacaattatatcacattattaacaacatcaaatc |
20220126 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 87 - 160
Target Start/End: Original strand, 34957416 - 34957488
Alignment:
| Q |
87 |
acatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcat |
160 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
34957416 |
acatctcaaaatatgacaatatcaaatgatagtcaac-cctacttaaacatcatacataatccacataatgcat |
34957488 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 97 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 15081948 - 15081900
Alignment:
| Q |
97 |
atataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatata |
145 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15081948 |
atataacaacatcaaatcataatcaacatcaacttaaacatcatatata |
15081900 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 26 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 16550752 - 16550712
Alignment:
| Q |
26 |
ttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaaca |
66 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16550752 |
ttccacataaggcatataattatttcacataaccaacaaca |
16550712 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 26 - 66
Target Start/End: Original strand, 16614910 - 16614950
Alignment:
| Q |
26 |
ttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaaca |
66 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16614910 |
ttccacataaggcatataattatttcacataaccaacaaca |
16614950 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 26 - 66
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Alignment:
| Q |
26 |
ttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaaca |
66 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32160950 |
ttccacataaggcatataattatttcacataaccaacaaca |
32160910 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 84 - 155
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Alignment:
| Q |
84 |
taaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataa |
155 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||| |||||| ||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||| |
|
|
| T |
29004063 |
taaacatctcaaaatatgacaataccaaatgatagtcaac-actacttaaacatcatacataatccacataa |
29004133 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 131 - 203
Target Start/End: Original strand, 147704 - 147776
Alignment:
| Q |
131 |
taaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaatcatattata |
203 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
147704 |
taaacatctcatataatccacataatgcttatacaaatatatctcattactcacaacatcaaatcatattata |
147776 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #88
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Query Start/End: Original strand, 200 - 256
Target Start/End: Original strand, 14036387 - 14036443
Alignment:
| Q |
200 |
tataatagcttcacagatcatcagtaatattatattcaacccacattcctaccccaa |
256 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
14036387 |
tataacagcttcacagatcatcattaatatcatatacaacctccattcctaccccaa |
14036443 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 200 - 256
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| Q |
200 |
tataatagcttcacagatcatcagtaatattatattcaacccacattcctaccccaa |
256 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
14346417 |
tataacagcttcacagatcatcattaatatcatatacaacctccattcctaccccaa |
14346473 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 96 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 16219753 - 16219670
Alignment:
| Q |
96 |
gatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacatta |
179 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| | ||| ||||| ||||||||||| | |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||| |
|
|
| T |
16219753 |
gatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatcttaaacatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacatta |
16219670 |
T |
 |
Back To:
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Target: chr7; HSP #91
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Query Start/End: Original strand, 27 - 66
Target Start/End: Original strand, 17232934 - 17232973
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| Q |
27 |
tccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaaca |
66 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17232934 |
tccacataaggcatatgaacatttcacataaccaacaaca |
17232973 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #92
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Query Start/End: Original strand, 96 - 179
Target Start/End: Original strand, 47831892 - 47831975
Alignment:
| Q |
96 |
gatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacatta |
179 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| | ||| ||||| | ||||||||| | |||||||| |||||| |||||||| ||||| |||||| |
|
|
| T |
47831892 |
gatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatcataaacatcaaacataattcatataatgtatatacaattatataacatta |
47831975 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 51
Target Start/End: Original strand, 15084107 - 15084140
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| Q |
18 |
catacatcttccacataaggcatataaatatttc |
51 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
15084107 |
catacatcttccacataagtcatataaatatttc |
15084140 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 201
Target Start/End: Original strand, 18005731 - 18005835
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| Q |
96 |
gatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaatc |
195 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| ||||||||||| || ||| |||| | |||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||| | ||||| || ||| |
|
|
| T |
18005731 |
gatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatc |
18005829 |
T |
 |
| Q |
196 |
atatta |
201 |
Q |
| |
|
|||||| |
|
|
| T |
18005830 |
atatta |
18005835 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3 (Bit Score: 247; Significance: 1e-137; HSPs: 87)
Name: chr3
Description:
Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 18 - 288
Target Start/End: Original strand, 5223310 - 5223580
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| Q |
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catacatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgata |
117 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5223310 |
catacatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacagcagcaacataggcgacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgata |
5223409 |
T |
 |
| Q |
118 |
atcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaatcatattataatagcttcacagat |
217 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5223410 |
atcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaatcatattataatagcttcacagat |
5223509 |
T |
 |
| Q |
218 |
catcagtaatattatattcaacccacattcctaccccaacactaaatcatattattatacttttaaacacc |
288 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
5223510 |
catcagtaatattatattcaacccacattcctaccccgacactaaataatattattatactcttaaacacc |
5223580 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 18 - 288
Target Start/End: Original strand, 15465081 - 15465351
Alignment:
| Q |
18 |
catacatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgata |
117 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15465081 |
catacattttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacaacaacataggcgacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgata |
15465180 |
T |
 |
| Q |
118 |
atcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaatcatattataatagcttcacagat |
217 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15465181 |
atcaacaacaacttaagcatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaattatattataatagcttcacagat |
15465280 |
T |
 |
| Q |
218 |
catcagtaatattatattcaacccacattcctaccccaacactaaatcatattattatacttttaaacacc |
288 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
15465281 |
catcagtaatattatattcaacccacattcctaccccaacactaaatcatattattatactcttaaacacc |
15465351 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 18 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 52989836 - 52989601
Alignment:
| Q |
18 |
catacatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgata |
117 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
52989836 |
catacattttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacataggcagcacgtaaacatctcaagatataacaacatcaaatgata |
52989737 |
T |
 |
| Q |
118 |
atcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaatcatattataatagcttcacagat |
217 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
52989736 |
atcaacatcaacttaaacatcttatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacattaaatcatattataacagcttcacagat |
52989637 |
T |
 |
| Q |
218 |
catcagtaatattatattcaacccacattcctaccc |
253 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
52989636 |
catcagtaatattatattcaaccttcattcctaccc |
52989601 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 18 - 256
Target Start/End: Original strand, 324241 - 324479
Alignment:
| Q |
18 |
catacatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgata |
117 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
324241 |
catacattttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacataggcagcacgtaaacatctcaagatataacaacatcaaatgata |
324340 |
T |
 |
| Q |
118 |
atcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaatcatattataatagcttcacagat |
217 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
324341 |
atcaacatcaacttaaacatcttatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacattaaatcatattataacagcttcacagat |
324440 |
T |
 |
| Q |
218 |
catcagtaatattatattcaacccacattcctaccccaa |
256 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
324441 |
cattagtaatattatattcaacctccattcctaccccaa |
324479 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 26 - 256
Target Start/End: Original strand, 14966183 - 14966413
Alignment:
| Q |
26 |
ttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaa |
125 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14966183 |
ttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacatcaacataggcagcacgtaaacatctcaagatataacaacatcaaatgataatcaacat |
14966282 |
T |
 |
| Q |
126 |
caacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaatcatattataatagcttcacagatcatcagta |
225 |
Q |
| |
|
||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14966283 |
caatttaaacatcttatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacattaaatcatattataacagcttcacagatcatcagta |
14966382 |
T |
 |
| Q |
226 |
atattatattcaacccacattcctaccccaa |
256 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
14966383 |
atattatattcaacctccattcctaccccaa |
14966413 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 18 - 256
Target Start/End: Original strand, 16643178 - 16643416
Alignment:
| Q |
18 |
catacatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgata |
117 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
16643178 |
catacattttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacaacaacttagacatcacataaacatcttgagatataacaacatcaaatgata |
16643277 |
T |
 |
| Q |
118 |
atcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaatcatattataatagcttcacagat |
217 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
16643278 |
atcaacatcaacttaaacatcctatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacattaaatcatattataacagcttcacagat |
16643377 |
T |
 |
| Q |
218 |
catcagtaatattatattcaacccacattcctaccccaa |
256 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||| ||||| | |||||||||||||| |
|
|
| T |
16643378 |
catcagtaatgttatcttcaatctccattcctaccccaa |
16643416 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 18 - 253
Target Start/End: Original strand, 21837431 - 21837665
Alignment:
| Q |
18 |
catacatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgata |
117 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
21837431 |
catacattttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacatcaacaacataggcagcacgtaaacatctcaagatataacaacatcaaatgata |
21837530 |
T |
 |
| Q |
118 |
atcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaatcatattataatagcttcacagat |
217 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||| ||| |
|
|
| T |
21837531 |
atcaacatcaacttaaacatcttatataattcaca-aatgcatatacaaatttattacattactatcatcattaaatcatattgtaacagcttcactgat |
21837629 |
T |
 |
| Q |
218 |
catcagtaatattatattcaacccacattcctaccc |
253 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
21837630 |
catcagtaatattatattcaacctcaattcctaccc |
21837665 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 18 - 200
Target Start/End: Original strand, 12339712 - 12339894
Alignment:
| Q |
18 |
catacatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgata |
117 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12339712 |
catacatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacataggcgacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgata |
12339811 |
T |
 |
| Q |
118 |
atcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaatcatatt |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
12339812 |
atcaacaacaacttaaacatcttatataattcacataatgcatatacaaatatattacattaccatcaacatcaaatcatatt |
12339894 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 18 - 200
Target Start/End: Original strand, 16796492 - 16796674
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| Q |
18 |
catacatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgata |
117 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16796492 |
catacatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacataggcagcacgtaaacatttcaagatataacaatatcaaatgata |
16796591 |
T |
 |
| Q |
118 |
atcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaatcatatt |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
16796592 |
atcaacaacaacttaaacatcttatataattcacataatgcatatacaaatatattacattaccatcaacatcaaatcatatt |
16796674 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 18 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 43889740 - 43889558
Alignment:
| Q |
18 |
catacatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgata |
117 |
Q |
| |
|
||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43889740 |
catacattttctacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacataggcagcacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgata |
43889641 |
T |
 |
| Q |
118 |
atcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaatcatatt |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
43889640 |
atcaacaacaacttaaacatcttatataattcacataatgcatatacaaatatattacattaccatcaacatcaaatcatatt |
43889558 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 20 - 200
Target Start/End: Original strand, 14670931 - 14671111
Alignment:
| Q |
20 |
tacatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataat |
119 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
14670931 |
tacattttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacataggcagcacataaacatctcaagatataacaacatcaaatgataat |
14671030 |
T |
 |
| Q |
120 |
caacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaatcatatt |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
14671031 |
caacaacaacttaaacatcttatataattcacataatgcatatacaaatatattacattaccatcaacatcaaatcatatt |
14671111 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 21 - 188
Target Start/End: Original strand, 12469910 - 12470077
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| Q |
21 |
acatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatc |
120 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12469910 |
acattttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacataggcagcacgtgaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatc |
12470009 |
T |
 |
| Q |
121 |
aacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaaca |
188 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
12470010 |
aacaacaacttaaacatcttatataattcacataatgcatatacaaatatattacattaccatcaaca |
12470077 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 26 - 200
Target Start/End: Original strand, 14682436 - 14682610
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ttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaa |
125 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14682436 |
ttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacataggcagcacataaacatctcaagatataacaagatcaaatgataatcaacaa |
14682535 |
T |
 |
| Q |
126 |
caacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaatcatatt |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
14682536 |
caacttaaacatcttatataattcacataatgcatatacaaatatattacattaccatcaacatcaaatcatatt |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 18 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 54876504 - 54876322
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catacatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaaca---tagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatg |
114 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
54876504 |
catacattttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacaacaacaacatagacagcacgtaaacatctcaagatataacaacatcaaatg |
54876405 |
T |
 |
| Q |
115 |
ataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaatcat |
197 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
54876404 |
ataatcaacatcaacttaaacatcttatataattcacaaaatgcatatacaaatatattacattactatcaacattaaatcat |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 18 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 17691822 - 17691644
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Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| || |||||||||| |
|
|
| T |
17691822 |
catacattttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacataggcagcacgtaaacatctca-gatataataacatcaaatgatt |
17691724 |
T |
 |
| Q |
118 |
atcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaatcat |
197 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
17691723 |
atcaacatcaacttaaacatcttatataattcacaaaatgcatatacaaatatattacattactatcaacattaaatcat |
17691644 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 97 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 43550477 - 43550318
Alignment:
| Q |
97 |
atataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaatca |
196 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||| |||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
43550477 |
atataacaacatcaaatcataatcaacatcaactttaacatcttatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacattaaatca |
43550378 |
T |
 |
| Q |
197 |
tattataatagcttcacagatcatcagtaatattatattcaacccacattcctaccccaa |
256 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
43550377 |
tattataatagcttcacagatcatcagtaatattatattcaacccccattcctaccccaa |
43550318 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 18 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 18700421 - 18700251
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18 |
catacatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgata |
117 |
Q |
| |
|
||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18700421 |
catacatttcccacataaggcatataattatttcacataaccaacaacaacaacataggcagcacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgata |
18700322 |
T |
 |
| Q |
118 |
atcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaaca |
188 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |
|
|
| T |
18700321 |
attaacaacaacttaaacatcttatataattcacataatgcatatacaaatatattatattaccatcaaca |
18700251 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 97 - 256
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| Q |
97 |
atataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaatca |
196 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
50242985 |
atataacaacatcaaatcataatcaacatcaacttaaacatcttatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacattaaatca |
50243084 |
T |
 |
| Q |
197 |
tattataatagcttcacagatcatcagtaatattatattcaacccacattcctaccccaa |
256 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |
|
|
| T |
50243085 |
tattataatagcttcacagatcatcagtaatattatatttaaccctcattcataccccaa |
50243144 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
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Target Start/End: Original strand, 14179427 - 14179559
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68 |
caacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaa |
167 |
Q |
| |
|
|||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14179427 |
caacataggcagcacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcttatataattcacataatgcatatacaaa |
14179526 |
T |
 |
| Q |
168 |
tatattacattactatcaacactaaatcatatt |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
14179527 |
tatattacattaccatcaacatcaaatcatatt |
14179559 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
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Target Start/End: Original strand, 13919408 - 13919574
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89 |
atctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaaca |
188 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |
|
|
| T |
13919408 |
atctcaagatataacattatcacataataatcaacaaca-cttaaacatcttaaataattcacataatgcatatacaaatatattacatcgctataaaca |
13919506 |
T |
 |
| Q |
189 |
ctaaatcatattataatagcttcacagatcatcagtaatattatattcaacccacattcctaccccaa |
256 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
13919507 |
ttaaatcatattataacagcttcacataacattagtaatattatattcaacctccattcctaccccaa |
13919574 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #21
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Query Start/End: Original strand, 61 - 240
Target Start/End: Original strand, 9577674 - 9577851
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| Q |
61 |
acaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcat |
160 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9577674 |
acaacagcaacataggcaacacataaa--tctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaccttaaacatcttatataattcacataatgcat |
9577771 |
T |
 |
| Q |
161 |
atacaaatatattacattactatcaacactaaatcatattataatagcttcacagatcatcagtaatattatattcaacc |
240 |
Q |
| |
|
|||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||||||| || |||| || ||||| ||||||||| |||||| |
|
|
| T |
9577772 |
atacaaatatgtcacattactaacaacatcaaatcatattatatcagactcactgaacatcaacaatattataatcaacc |
9577851 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 18 - 130
Target Start/End: Original strand, 15964883 - 15964995
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| Q |
18 |
catacatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgata |
117 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15964883 |
catacatcttccacataagtcatataaatatttcacataaccaacaacaacaacataggcgacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgata |
15964982 |
T |
 |
| Q |
118 |
atcaacaacaact |
130 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |
|
|
| T |
15964983 |
atcaacaacaact |
15964995 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 18 - 130
Target Start/End: Original strand, 15968807 - 15968919
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| Q |
18 |
catacatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgata |
117 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15968807 |
catacatcttccacataagtcatataaatatttcacataaccaacaacaacaacataggcgacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgata |
15968906 |
T |
 |
| Q |
118 |
atcaacaacaact |
130 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |
|
|
| T |
15968907 |
atcaacaacaact |
15968919 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 18 - 130
Target Start/End: Original strand, 15972731 - 15972843
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| Q |
18 |
catacatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgata |
117 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15972731 |
catacatcttccacataagtcatataaatatttcacataaccaacaacaacaacataggcgacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgata |
15972830 |
T |
 |
| Q |
118 |
atcaacaacaact |
130 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |
|
|
| T |
15972831 |
atcaacaacaact |
15972843 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 18 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 11914130 - 11914003
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| Q |
18 |
catacatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgata |
117 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
11914130 |
catacattttccacataacgcatataaatatttcacatagccaacaacaacaacatagccagcacgtaaacatctcaagatataacaacatcaaatgata |
11914031 |
T |
 |
| Q |
118 |
atcaacaacaacttaaacatcatatata |
145 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11914030 |
atcaacatcaacttaaacatcatatata |
11914003 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 91 - 253
Target Start/End: Original strand, 12378003 - 12378164
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91 |
ctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacact |
190 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||| | |
|
|
| T |
12378003 |
ctcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacaacttaaacatcttaaataattcaaataatacatatacaa-tatattaaattactatcaacatt |
12378101 |
T |
 |
| Q |
191 |
aaatcatattataatagcttcacagatcatcagtaatattatattcaacccacattcctaccc |
253 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| |||| |||||| |
|
|
| T |
12378102 |
aaatcatattataatagcttcacagatcatcattaatattgtatttaacctccattgctaccc |
12378164 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 21 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 4107589 - 4107480
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| Q |
21 |
acatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatc |
120 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4107589 |
acatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacataggcgacacataaacatctcaggatataacaatatcaaatgataatc |
4107490 |
T |
 |
| Q |
121 |
aacaacaact |
130 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
4107489 |
aacaacaact |
4107480 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 21 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 4111441 - 4111332
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| Q |
21 |
acatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatc |
120 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4111441 |
acatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacataggcgacacataaacatctcaggatataacaatatcaaatgataatc |
4111342 |
T |
 |
| Q |
121 |
aacaacaact |
130 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
4111341 |
aacaacaact |
4111332 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 21 - 130
Target Start/End: Original strand, 7109615 - 7109724
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| Q |
21 |
acatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatc |
120 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7109615 |
acatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacataggcgacacataaacatctcaggatataacaatatcaaatgataatc |
7109714 |
T |
 |
| Q |
121 |
aacaacaact |
130 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
7109715 |
aacaacaact |
7109724 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 21 - 130
Target Start/End: Original strand, 7113550 - 7113659
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| Q |
21 |
acatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatc |
120 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7113550 |
acatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacataggcgacacataaacatctcaggatataacaatatcaaatgataatc |
7113649 |
T |
 |
| Q |
121 |
aacaacaact |
130 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
7113650 |
aacaacaact |
7113659 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 68 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 10542497 - 10542364
Alignment:
| Q |
68 |
caacatagacaaca-cgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaa |
166 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10542497 |
caacttagacaacatcataaacatctcaagatataacaacatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcttatataattcacataatgcatatacaa |
10542398 |
T |
 |
| Q |
167 |
atatattacattactatcaacactaaatcatatt |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||| ||| |||||||||| |
|
|
| T |
10542397 |
atatattacattaccatcgacatcaaatcatatt |
10542364 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 21 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 11165721 - 11165612
Alignment:
| Q |
21 |
acatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatc |
120 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11165721 |
acatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacataggcgacacataaacatctcaggatataacaatatcaaatgataatc |
11165622 |
T |
 |
| Q |
121 |
aacaacaact |
130 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
11165621 |
aacaacaact |
11165612 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 21 - 130
Target Start/End: Original strand, 22321581 - 22321690
Alignment:
| Q |
21 |
acatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatc |
120 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22321581 |
acatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacataggcgacacataaacatctcaggatataacaatatcaaatgataatc |
22321680 |
T |
 |
| Q |
121 |
aacaacaact |
130 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
22321681 |
aacaacaact |
22321690 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 21 - 130
Target Start/End: Original strand, 22336636 - 22336745
Alignment:
| Q |
21 |
acatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatc |
120 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22336636 |
acatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacataggcgacacataaacatctcaggatataacaatatcaaatgataatc |
22336735 |
T |
 |
| Q |
121 |
aacaacaact |
130 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
22336736 |
aacaacaact |
22336745 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 21 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 27409836 - 27409727
Alignment:
| Q |
21 |
acatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatc |
120 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27409836 |
acatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacataggcgacacataaacatctcaggatataacaatatcaaatgataatc |
27409737 |
T |
 |
| Q |
121 |
aacaacaact |
130 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
27409736 |
aacaacaact |
27409727 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 21 - 130
Target Start/End: Original strand, 28949641 - 28949750
Alignment:
| Q |
21 |
acatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatc |
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28949641 |
acatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacataggcgacacataaacatctcaggatataacaatatcaaatgataatc |
28949740 |
T |
 |
| Q |
121 |
aacaacaact |
130 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
28949741 |
aacaacaact |
28949750 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 21 - 130
Target Start/End: Original strand, 55022784 - 55022893
Alignment:
| Q |
21 |
acatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatc |
120 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
55022784 |
acatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacataggcgacacataaacatctcaggatataacaatatcaaatgataatc |
55022883 |
T |
 |
| Q |
121 |
aacaacaact |
130 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
55022884 |
aacaacaact |
55022893 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 18 - 130
Target Start/End: Original strand, 19775679 - 19775791
Alignment:
| Q |
18 |
catacatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgata |
117 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19775679 |
catacatcttccacataagtcatataaatatttcacataaccaacaatagcaacataggcgacatgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgata |
19775778 |
T |
 |
| Q |
118 |
atcaacaacaact |
130 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |
|
|
| T |
19775779 |
atcaacaacaact |
19775791 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 59 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 23371545 - 23371401
Alignment:
| Q |
59 |
caacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgc |
158 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
23371545 |
caacaacggcaacataggcagcacataaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaatatcaacttaaacatcttatataatccacataatgc |
23371446 |
T |
 |
| Q |
159 |
atatacaaatatattacattactatcaacactaaatcatattata |
203 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
23371445 |
atatacaaatatatctcattactaacaacatcaaatcatattata |
23371401 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 18 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 37439831 - 37439719
Alignment:
| Q |
18 |
catacatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgata |
117 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |
|
|
| T |
37439831 |
catacatcttccacataagtcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacataggcgacacgtaaacatctcaagatataaccatatcaaataata |
37439732 |
T |
 |
| Q |
118 |
atcaacaacaact |
130 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |
|
|
| T |
37439731 |
atcaacaacaact |
37439719 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 61 - 203
Target Start/End: Original strand, 51300611 - 51300753
Alignment:
| Q |
61 |
acaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcat |
160 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
51300611 |
acaacggcaacataggcagcacataaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaatatcaacttaaacatcttatataatccacataatgcat |
51300710 |
T |
 |
| Q |
161 |
atacaaatatattacattactatcaacactaaatcatattata |
203 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
51300711 |
atacaaatatatctcattactaacaacatcaaatcatattata |
51300753 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 21 - 130
Target Start/End: Original strand, 11069985 - 11070094
Alignment:
| Q |
21 |
acatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatc |
120 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11069985 |
acatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacaacaacataggcgacacataaacatctcaggatataacaatatcaaatgataatc |
11070084 |
T |
 |
| Q |
121 |
aacaacaact |
130 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
11070085 |
aacaacaact |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 18 - 130
Target Start/End: Original strand, 11854647 - 11854759
Alignment:
| Q |
18 |
catacatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgata |
117 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
11854647 |
catacatcttcctcataagacatataaacatttcacataaccaacaacagcaacataggcgacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaataata |
11854746 |
T |
 |
| Q |
118 |
atcaacaacaact |
130 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |
|
|
| T |
11854747 |
atcaacaacaact |
11854759 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 59 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 14763799 - 14763655
Alignment:
| Q |
59 |
caacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgc |
158 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
14763799 |
caacaacggcaacataggcagcacataaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaatatcaacttaaacatcttatataatccacataatgc |
14763700 |
T |
 |
| Q |
159 |
atatacaaatatattacattactatcaacactaaatcatattata |
203 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||| ||||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
14763699 |
atatacaaatatatctcattactaacaacatcaaattatattata |
14763655 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 21 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 4588965 - 4588858
Alignment:
| Q |
21 |
acatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatc |
120 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
4588965 |
acatcttccacataaggcatataaatatttcacataatcaacaacagcaacataggcgacacataaacatctcaagatataacaatttcaaatgataatc |
4588866 |
T |
 |
| Q |
121 |
aacaacaa |
128 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
4588865 |
aacaacaa |
4588858 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 18 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 11300625 - 11300532
Alignment:
| Q |
18 |
catacatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaa |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11300625 |
catacatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacataggcgacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaa |
11300532 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 21 - 130
Target Start/End: Original strand, 30065863 - 30065972
Alignment:
| Q |
21 |
acatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatc |
120 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30065863 |
acatcttccacataaggcatataaatatttcacataatcaacaacagcagcataggcgacacataaacatctcaggatataacaatatcaaatgataatc |
30065962 |
T |
 |
| Q |
121 |
aacaacaact |
130 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
30065963 |
aacaacaact |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 63 - 197
Target Start/End: Original strand, 28194743 - 28194878
Alignment:
| Q |
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aacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaa-caacaacttaaacatcatatataattcacataatgcata |
161 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28194743 |
aacagcaacatagacagcacataaacatctcaagatataacaatgtcaaataataatcaatcatcaacttaaacattttatataattcacataatgcata |
28194842 |
T |
 |
| Q |
162 |
tacaaatatattacattactatcaacactaaatcat |
197 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| |
|
|
| T |
28194843 |
tacaaatatatcacattactaacaacatcaaatcat |
28194878 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 61 - 188
Target Start/End: Original strand, 37427764 - 37427891
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| Q |
61 |
acaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcat |
160 |
Q |
| |
|
||||||||| || || || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
37427764 |
acaacagcagcacaggcagcacataaacatctcaagatataacagtatcaaatgataatcatcaacaacttaaacatcatatataatccacataatgcat |
37427863 |
T |
 |
| Q |
161 |
atacaaatatattacattactatcaaca |
188 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| ||||||||| ||||| |
|
|
| T |
37427864 |
atacaactatatcacattactaacaaca |
37427891 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 95 - 240
Target Start/End: Original strand, 316202 - 316348
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| Q |
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agatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaa-catcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaa |
193 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
316202 |
agatataacaatatccaagaataatcaacatcaacttaaaacatctcatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacattaaa |
316301 |
T |
 |
| Q |
194 |
tcatattataatagcttcacagatcatcagtaatattatattcaacc |
240 |
Q |
| |
|
||| |||| ||||| |||||| | |||||||||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
316302 |
tcacattacaatagattcacatagcatcagtaatatcataatcaacc |
316348 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 21 - 130
Target Start/End: Original strand, 15617291 - 15617400
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| Q |
21 |
acatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatc |
120 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15617291 |
acatcttccacataaggcatataaatatttcacataatcaacagcagcagcataggcgacacataaacatctcaggatataacaatatcaaatgataatc |
15617390 |
T |
 |
| Q |
121 |
aacaacaact |
130 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
15617391 |
aacaacaact |
15617400 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 92 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 23318754 - 23318615
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| Q |
92 |
tcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacacta |
191 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| || |
|
|
| T |
23318754 |
tcaagatataacaatatcaa-tgacaatcaacaacaacttgaacaacttatataattcacataatgcatatacaattatatcacattactaacaacatta |
23318656 |
T |
 |
| Q |
192 |
aatcatattataatagcttcacagatcatcagtaatattata |
233 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| || ||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23318655 |
aatcat-ttataacagattcacagttcatcagtaatattata |
23318615 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #53
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| Q |
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taaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactat |
183 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||| |
|
|
| T |
10834151 |
taaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacatcaacttaaacatcttatataatccacataatgcatatac-aatatatctcattactaa |
10834053 |
T |
 |
| Q |
184 |
caacactaaatcatattata |
203 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
10834052 |
caacatcaaatcatattata |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
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99 |
ataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaat |
194 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
44494893 |
ataataatatcaaatgataatcaacatcaacttaaacatcttatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacattaaat |
44494988 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #55
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| Q |
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caacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattca |
150 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36527794 |
caacagcaacataggcaacacataaatatctcaagatataacaacatcaaatgataatcaacatcaacttaaacatcatatataattca |
36527882 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 21 - 130
Target Start/End: Original strand, 14499242 - 14499351
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| Q |
21 |
acatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatc |
120 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| |||| | | |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
14499242 |
acatcttccacataaggcatattaatattttacataacccacaacagccacattggcgacacataaacatctcaggatataacaatatccaatgataatt |
14499341 |
T |
 |
| Q |
121 |
aacaacaact |
130 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
14499342 |
aacaacaact |
14499351 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 62 - 150
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| Q |
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caacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattca |
150 |
Q |
| |
|
||||| |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3265085 |
caacaacaacataggcaacacataaacatctcatgatataacaacatcaaatgataatcaacatcaacttaaacatcatatataattca |
3264997 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #58
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acaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatata-taattcacataatgca |
159 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| || ||| ||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
15246068 |
acaacagcaacataggcagcacaataacatatccagacataacaatatcaaaggataatcaacatcaacttaaacatcttatattaattcacataatgca |
15246167 |
T |
 |
| Q |
160 |
tatacaaatatattacattactatcaacactaaatcatattata |
203 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| |||||| || ||||| |||||| |||||| |
|
|
| T |
15246168 |
tatacaattatatcacattaataacaacatcaaatcacattata |
15246211 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
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61 |
acaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatata-taattcacataatgca |
159 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| || ||| ||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
15265189 |
acaacagcaacataggcagcacaataacatatccagacataacaatatcaaaggataatcaacatcaacttaaacatcttatattaattcacataatgca |
15265288 |
T |
 |
| Q |
160 |
tatacaaatatattacattactatcaacactaaatcatattata |
203 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| |||||| || ||||| |||||| |||||| |
|
|
| T |
15265289 |
tatacaattatatcacattaataacaacatcaaatcacattata |
15265332 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 61 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 32403030 - 32402892
Alignment:
| Q |
61 |
acaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaactt-aaacatcatatataattcacataatgca |
159 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| ||||||| || ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32403030 |
acaacagcaacatagacagcacataa-cgtctcaagatataacaatatcaaataataatcaatagcaactttaaacatcttagataattcacataatgca |
32402932 |
T |
 |
| Q |
160 |
tatacaaatatattacattactatcaacactaaatcatat |
199 |
Q |
| |
|
|||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
32402931 |
tataaaactatatcacattactcgcaacaacaaatcatat |
32402892 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 87 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 8928474 - 8928390
Alignment:
| Q |
87 |
acatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataatt-cacataatgcatatacaaatata |
171 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| |
|
|
| T |
8928474 |
acatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaac-acaacttaaacatcatatataattccacataatgcatttgcaaatata |
8928390 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 87 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 34852701 - 34852617
Alignment:
| Q |
87 |
acatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataatt-cacataatgcatatacaaatata |
171 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| |
|
|
| T |
34852701 |
acatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaac-acaacttaaacatcatatataattccacataatgcatttgcaaatata |
34852617 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 18 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 14569075 - 14568921
Alignment:
| Q |
18 |
catacatcttccacataaggcatataaatatttcac-ataaccaacaacagcaacatagacaaca-cgta-aacatctcaagatataacaatatcaaatg |
114 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||| ||||| |||||| || |||||||||||||||| |||||||| | || |||| |||| |||||||||||||||| || |
|
|
| T |
14569075 |
catacattttccacataaggtatatacatattttaccataaccaacaacagcag---agacaacaacatacaacagctcatgatataacaatatcaagtg |
14568979 |
T |
 |
| Q |
115 |
ataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatat |
172 |
Q |
| |
|
| | |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
14568978 |
acagtcaacatcaacctaaacatcatatataattcacataacgcatatacaattatat |
14568921 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 104 - 203
Target Start/End: Original strand, 15207029 - 15207129
Alignment:
| Q |
104 |
aatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatat-aattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaatcatattat |
202 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||| || ||||| |||||| ||||| |
|
|
| T |
15207029 |
aatatcaaaggataatcaacatcaacttaaacatcttatattaattcacataatgcatatacaattatatcacattaataacaacatcaaatcacattat |
15207128 |
T |
 |
| Q |
203 |
a |
203 |
Q |
| |
|
| |
|
|
| T |
15207129 |
a |
15207129 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 96 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 2051235 - 2051102
Alignment:
| Q |
96 |
gatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacat-catatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaat |
194 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| | ||||| | ||| |
|
|
| T |
2051235 |
gatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacattcatatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaaca-tcaat |
2051137 |
T |
 |
| Q |
195 |
catattataatagcttcacagatcatcagtaatat |
229 |
Q |
| |
|
||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||| |
|
|
| T |
2051136 |
catcttatagcagcttcacaaatcatcattaatat |
2051102 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 96 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 52523763 - 52523630
Alignment:
| Q |
96 |
gatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacat-catatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaat |
194 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| ||||||||||| || |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| | ||||| | ||| |
|
|
| T |
52523763 |
gatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaacattcatatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaaca-tcaat |
52523665 |
T |
 |
| Q |
195 |
catattataatagcttcacagatcatcagtaatat |
229 |
Q |
| |
|
||| |||||| |||||| |||||||||| |||||| |
|
|
| T |
52523664 |
catcttataacagcttctcagatcatcattaatat |
52523630 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 123 - 203
Target Start/End: Original strand, 9533406 - 9533487
Alignment:
| Q |
123 |
caacaacttaaa-catcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaatcatattata |
203 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
9533406 |
caacaacttaaaacatcttatataatccacataatgcatatacaaatatatctcattactaacaacatcaaatcatattata |
9533487 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 94 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 38311820 - 38311759
Alignment:
| Q |
94 |
aagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataa |
155 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| |
|
|
| T |
38311820 |
aagatataacaatatcaaatggtaatcaacatcaacttaaacatcttatataatccacataa |
38311759 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 85 - 165
Target Start/End: Original strand, 43926034 - 43926114
Alignment:
| Q |
85 |
aaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatataca |
165 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
43926034 |
aaacagctcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacatcatatacaattcatgtaatgcatataca |
43926114 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 18 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 35961644 - 35961596
Alignment:
| Q |
18 |
catacatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaaca |
66 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35961644 |
catacattttccacataaggcatataattatttcacataaccaacaaca |
35961596 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 37251202 - 37251100
Alignment:
| Q |
96 |
gatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaatc |
195 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| || ||||| ||||| |
|
|
| T |
37251202 |
gatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaa-catcataaataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatc |
37251104 |
T |
 |
| Q |
196 |
atat |
199 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
37251103 |
atat |
37251100 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 94 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 20248803 - 20248741
Alignment:
| Q |
94 |
aagatataacaatatcaaatgataat-caacaacaacttaaacatcatatataattcacataa |
155 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| |
|
|
| T |
20248803 |
aagatataacagtatcaaatgataattcaacatcaacttaaacatcttatataatccacataa |
20248741 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 87 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 14647760 - 14647688
Alignment:
| Q |
87 |
acatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcat |
160 |
Q |
| |
|
||||| ||| |||| |||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
14647760 |
acatcccaaaatatgacaataccaaatgataatcaaca-ctacttaaacatcatacataatccacataatgcat |
14647688 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 18 - 66
Target Start/End: Original strand, 41823 - 41871
Alignment:
| Q |
18 |
catacatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaaca |
66 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41823 |
catacattttccacataaggcatatagttatttcacataaccaacaaca |
41871 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 62 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 14568871 - 14568804
Alignment:
| Q |
62 |
caacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaac |
129 |
Q |
| |
|
||||||||||| || || ||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||| |
|
|
| T |
14568871 |
caacagcaacacaggcagcacatatacatctcaagatataagaatatcaaatgataattaacaccaac |
14568804 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 87 - 156
Target Start/End: Original strand, 13436357 - 13436425
Alignment:
| Q |
87 |
acatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataat |
156 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| |||||| ||||||||| |||||| | |||||||||||||| ||||| |||||||| |
|
|
| T |
13436357 |
acatctcaaaatatgacaataccaaatgatagtcaaca-ctacttaaacatcatacataatccacataat |
13436425 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 16325297 - 16325249
Alignment:
| Q |
18 |
catacatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaaca |
66 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16325297 |
catacattttccacgtaaggcatatagttatttcacataaccaacaaca |
16325249 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 66
Target Start/End: Original strand, 22652134 - 22652174
Alignment:
| Q |
26 |
ttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaaca |
66 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22652134 |
ttccacataatgcatataattatttcacataaccaacaaca |
22652174 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 102 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 16839699 - 16839642
Alignment:
| Q |
102 |
acaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcat |
160 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
16839699 |
acaataccaaatgataatcaacatta-cttaaacatcatacataatccacataatgcat |
16839642 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 114 - 188
Target Start/End: Original strand, 17046293 - 17046367
Alignment:
| Q |
114 |
gataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaaca |
188 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||||||| ||||||||||||| | |||||||||||| || || ||||| ||| ||||| ||||| |
|
|
| T |
17046293 |
gataaacaaccacaacttcaacatcatatatattccacataatgcatgtataagtatatcacaatactaacaaca |
17046367 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 136 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 22147520 - 22147427
Alignment:
| Q |
136 |
atcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaatcatattataatagcttcacagatcatcagtaatatt |
230 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| | ||||| |||||||| || | ||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
22147520 |
atcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaaca-taaatcatcataaatcagcttcacagatcatcattaatatt |
22147427 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 206 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 24153135 - 24153085
Alignment:
| Q |
206 |
agcttcacagatcatcagtaatattatattcaacccacattcctaccccaa |
256 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || | ||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
24153135 |
agcttcacagattataattaatattatattcaacctccattcctaccccaa |
24153085 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 141 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 29172618 - 29172556
Alignment:
| Q |
141 |
atataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaatcatattata |
203 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
29172618 |
atataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatactatcaacatcaaattatattata |
29172556 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #84
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Query Start/End: Original strand, 136 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 37642260 - 37642166
Alignment:
| Q |
136 |
atcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaatcatattataatagcttcacagatcatcagtaatatt |
230 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| | ||||| ||||||| || | ||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
37642260 |
atcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcatcataaatcagcttcacagatcatcattaatatt |
37642166 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #85
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Target Start/End: Original strand, 14441300 - 14441365
Alignment:
| Q |
115 |
ataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattac |
180 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||| ||||||||| ||| | |||||||||||| || || ||||| ||||||| |
|
|
| T |
14441300 |
ataaacaacaacaacttcaacatcatacatattccacataatgcatgtataagtatatcacattac |
14441365 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #86
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Query Start/End: Original strand, 141 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 24340713 - 24340624
Alignment:
| Q |
141 |
atataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaatcatattataatagcttcacagatcatcagtaatatt |
230 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| | ||||| ||||||| || | ||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
24340713 |
atataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcatcataaatcagcttcacagatcatcattaatatt |
24340624 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 30 - 66
Target Start/End: Original strand, 16979218 - 16979254
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| Q |
30 |
acataaggcatataaatatttcacataaccaacaaca |
66 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16979218 |
acataagacatataattatttcacataaccaacaaca |
16979254 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2 (Bit Score: 247; Significance: 1e-137; HSPs: 52)
Name: chr2
Description:
Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 18 - 288
Target Start/End: Original strand, 31345123 - 31345393
Alignment:
| Q |
18 |
catacatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgata |
117 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31345123 |
catacatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacataggcgacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgata |
31345222 |
T |
 |
| Q |
118 |
atcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaatcatattataatagcttcacagat |
217 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
31345223 |
atcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaattcatattataatagcttcacaaat |
31345322 |
T |
 |
| Q |
218 |
catcagtaatattatattcaacccacattcctaccccaacactaaatcatattattatacttttaaacacc |
288 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
31345323 |
catcaataatattatattcaacccacattcctaccccaacactaaatcatattattatactcttaaacacc |
31345393 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 18 - 256
Target Start/End: Original strand, 27472426 - 27472664
Alignment:
| Q |
18 |
catacatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgata |
117 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
27472426 |
catacattttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacagcacgtaaacatctcaagatataacaacatcaaatgata |
27472525 |
T |
 |
| Q |
118 |
atcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaatcatattataatagcttcacagat |
217 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| |
|
|
| T |
27472526 |
atcaacatcaacttaaacatattatataattcacataatgcatatacaaatatattatattactatcaacattaaatcatattttaacagcttcacagat |
27472625 |
T |
 |
| Q |
218 |
catcagtaatattatattcaacccacattcctaccccaa |
256 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||| |
|
|
| T |
27472626 |
cattagtaatattatattcaacctccagtcctaccccaa |
27472664 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 18 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 21081850 - 21081612
Alignment:
| Q |
18 |
catacatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgata |
117 |
Q |
| |
|
||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| |
|
|
| T |
21081850 |
catacatttttcacataaggtatataaatatttcacataaccaacaacagcaacataggcagcacgtaaacatctaaagatataaaaacatcaaatgata |
21081751 |
T |
 |
| Q |
118 |
atcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaatcatattataatagcttcacagat |
217 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || |
|
|
| T |
21081750 |
atcaacatcaacttaaacatcttatataattcacataatgcatatacaaatatattacattagtatcaacattaaatcatattataacagcttcacatat |
21081651 |
T |
 |
| Q |
218 |
catcagtaatattatattcaacccacattcctaccccaa |
256 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |
|
|
| T |
21081650 |
catcagtaatattatattcatcctccattcctaccccaa |
21081612 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 18 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 34874326 - 34874088
Alignment:
| Q |
18 |
catacatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgata |
117 |
Q |
| |
|
||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
34874326 |
catacatttttcacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacaacaacataggcggcacttaaacatctcaagatataacaacatcaaatgata |
34874227 |
T |
 |
| Q |
118 |
atcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaatcatattataatagcttcacagat |
217 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||| || |
|
|
| T |
34874226 |
atcaacatcaacttaaacatcttatataattcacataatgcatatacaaatatattacaatactttcaacattaaatcatattataacagcttcacatat |
34874127 |
T |
 |
| Q |
218 |
catcagtaatattatattcaacccacattcctaccccaa |
256 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |
|
|
| T |
34874126 |
catcagtaatattatattcaacctccattcctatcccaa |
34874088 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 20 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 18358845 - 18358610
Alignment:
| Q |
20 |
tacatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataat |
119 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |
|
|
| T |
18358845 |
tacattttccacataaggcatataaacatttcacaaaaccaacaacagcaacataggcggtacttaaacatctcaagatataacaacatcaaataataat |
18358746 |
T |
 |
| Q |
120 |
caacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaatcatattataatagcttcacagatca |
219 |
Q |
| |
|
||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| ||||||| |
|
|
| T |
18358745 |
caacatcaacttaagcatcttatataattcacatattgcatatacaaatataatacattactatcaacattaaatcata-tataacagcttcgcagatca |
18358647 |
T |
 |
| Q |
220 |
tcagtaatattatattcaacccacattcctaccccaa |
256 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
18358646 |
tcggtaatattatattcaacctccattcctaccccaa |
18358610 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 18 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 23069397 - 23069215
Alignment:
| Q |
18 |
catacatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgata |
117 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23069397 |
catacattttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacataggtagcacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgata |
23069298 |
T |
 |
| Q |
118 |
atcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaatcatatt |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
23069297 |
atcaacaacaacttaaacatcttatataattcacataatgcatataaaaatatattacattgccatcaacatcaaatcatatt |
23069215 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 97 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 22173828 - 22173669
Alignment:
| Q |
97 |
atataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaatca |
196 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
22173828 |
atataacaacatcaaatcataatcaacatcaacttaaacatcttatataattcacttaatgcatatacaaatatattacattactatcaacattaaatca |
22173729 |
T |
 |
| Q |
197 |
tattataatagcttcacagatcatcagtaatattatattcaacccacattcctaccccaa |
256 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
22173728 |
tattataatagcttcacagatcatcagtaatattatattcaacccccattcctaccccaa |
22173669 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 20 - 200
Target Start/End: Original strand, 9784690 - 9784869
Alignment:
| Q |
20 |
tacatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataat |
119 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
9784690 |
tacattttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacataggcagcacataaacatctcaagatataacaacatccaatgataat |
9784789 |
T |
 |
| Q |
120 |
caacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacact-aaatcatatt |
200 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||| |
|
|
| T |
9784790 |
caacaac--cttaaacatcttatataattcacataatgcatatacaaatatattacattaccatcaacaatcaaatcatatt |
9784869 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 18 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 23707402 - 23707275
Alignment:
| Q |
18 |
catacatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgata |
117 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
23707402 |
catacattttccacataatgcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacataggcagcacgtaaacatctcaagatataacaacatcaaatgata |
23707303 |
T |
 |
| Q |
118 |
atcaacaacaacttaaacatcatatata |
145 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23707302 |
atcaacatcaacttaaacatcatatata |
23707275 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 18 - 145
Target Start/End: Original strand, 24918117 - 24918244
Alignment:
| Q |
18 |
catacatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgata |
117 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
24918117 |
catacattttccacataacgcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacataggcagcacgtaaacatctcaagatataacaacatcaaatgata |
24918216 |
T |
 |
| Q |
118 |
atcaacaacaacttaaacatcatatata |
145 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24918217 |
atcaacatcaacttaaacatcatatata |
24918244 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 18 - 130
Target Start/End: Original strand, 1283300 - 1283412
Alignment:
| Q |
18 |
catacatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgata |
117 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1283300 |
catacatcttccacataagtcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacataggcgacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgata |
1283399 |
T |
 |
| Q |
118 |
atcaacaacaact |
130 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |
|
|
| T |
1283400 |
atcaacaacaact |
1283412 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 18 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 30345186 - 30345074
Alignment:
| Q |
18 |
catacatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgata |
117 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30345186 |
catacatcttccacataagtcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacataggcgacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgata |
30345087 |
T |
 |
| Q |
118 |
atcaacaacaact |
130 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |
|
|
| T |
30345086 |
atcaacaacaact |
30345074 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 18 - 145
Target Start/End: Original strand, 24671002 - 24671129
Alignment:
| Q |
18 |
catacatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgata |
117 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24671002 |
catacattttccacataacccatataaatatttcacataaccaacaacagcaacataggcagtacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgata |
24671101 |
T |
 |
| Q |
118 |
atcaacaacaacttaaacatcatatata |
145 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24671102 |
atcaacatcaacttaaacatcatatata |
24671129 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 18 - 145
Target Start/End: Original strand, 24681421 - 24681548
Alignment:
| Q |
18 |
catacatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgata |
117 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
24681421 |
catacattttccacataacgcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacataggcagcacgtaaacatctcaagatataacaacatcaaatgatg |
24681520 |
T |
 |
| Q |
118 |
atcaacaacaacttaaacatcatatata |
145 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24681521 |
atcaacatcaacttaaacatcatatata |
24681548 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 61 - 203
Target Start/End: Original strand, 9241976 - 9242118
Alignment:
| Q |
61 |
acaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcat |
160 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
9241976 |
acaacagcaacataggcagcacataaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacatcaacttaaacatcttatataatccacataatgcat |
9242075 |
T |
 |
| Q |
161 |
atacaaatatattacattactatcaacactaaatcatattata |
203 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
9242076 |
atacaaatatatctcattactaacaacatcaaatcatattata |
9242118 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 18 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 41531199 - 41531087
Alignment:
| Q |
18 |
catacatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgata |
117 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41531199 |
catacatcttccacataagtcatataaatatttcacataaccaacaacagtaacataggcgacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgata |
41531100 |
T |
 |
| Q |
118 |
atcaacaacaact |
130 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |
|
|
| T |
41531099 |
atcaacaacaact |
41531087 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 61 - 256
Target Start/End: Original strand, 34136990 - 34137185
Alignment:
| Q |
61 |
acaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcat |
160 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34136990 |
acaacagcaacataggcaacacataaacatctcaagagataacaatatcaaatgataatcaacatcaacttaaacatcttatataattcacataatgcat |
34137089 |
T |
 |
| Q |
161 |
atacaaatatattacattactatcaacactaaatcatattataatagcttcacagatcatcagtaatattatattcaacccacattcctaccccaa |
256 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| ||||||||| |||| | ||||||||||| || |||| || ||| | |||| |||| |||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
34137090 |
atacaattatatcacattactagtaacatcacatcatattatatcagactcactgaacattaacaatactataatcaacctccattcctaccccaa |
34137185 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 60 - 253
Target Start/End: Original strand, 23287412 - 23287605
Alignment:
| Q |
60 |
aacaacagcaacatagacaacacgtaaa-catctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgc |
158 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||| |
|
|
| T |
23287412 |
aacaacagcaacataggcagtacataaaacatctcaagatataacaatatcaaataataatcaacaaca-cttaatcatcatatataatccacatattgc |
23287510 |
T |
 |
| Q |
159 |
atatacaaatatattacattactatcaacactaaatcatattataatagcttcacagatcatcagtaatattatattcaacccacattcctaccc |
253 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||| | ||||| || |||||| || | |||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
23287511 |
atatacaaatatatcacattactatcatcgttaaataatgttataacagatccacagaacatcagtaatattataatcaacctccattcctaccc |
23287605 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 21 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 24628671 - 24628562
Alignment:
| Q |
21 |
acatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatc |
120 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24628671 |
acatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacataggcgacacataaacatctcaggatataacaatatcaaatgataatc |
24628572 |
T |
 |
| Q |
121 |
aacaacaact |
130 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
24628571 |
aacaacaact |
24628562 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 21 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 27379625 - 27379516
Alignment:
| Q |
21 |
acatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatc |
120 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27379625 |
acatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacataggcgacacataaacatctcaggatataacaatatcaaatgataatc |
27379526 |
T |
 |
| Q |
121 |
aacaacaact |
130 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
27379525 |
aacaacaact |
27379516 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 21 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 27383671 - 27383562
Alignment:
| Q |
21 |
acatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatc |
120 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27383671 |
acatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacataggcgacacataaacatctcaggatataacaatatcaaatgataatc |
27383572 |
T |
 |
| Q |
121 |
aacaacaact |
130 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
27383571 |
aacaacaact |
27383562 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 21 - 130
Target Start/End: Original strand, 27601710 - 27601819
Alignment:
| Q |
21 |
acatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatc |
120 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27601710 |
acatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacataggcgacacataaacatctcaggatataacaatatcaaatgataatc |
27601809 |
T |
 |
| Q |
121 |
aacaacaact |
130 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
27601810 |
aacaacaact |
27601819 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 59 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 19662493 - 19662349
Alignment:
| Q |
59 |
caacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgc |
158 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
19662493 |
caacaacggcaacataggcagcacataaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaatatcaacttaaacatcttatataatccacataatgc |
19662394 |
T |
 |
| Q |
159 |
atatacaaatatattacattactatcaacactaaatcatattata |
203 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
19662393 |
atatacaaatatatctcattactaacaacatcaaatcatattata |
19662349 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 60 - 256
Target Start/End: Original strand, 26392431 - 26392626
Alignment:
| Q |
60 |
aacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgca |
159 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| || | ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||| ||| |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
26392431 |
aacaacagcaacataggcagtgcataaacatctcaggatataacaatatcaaataataatcaacaata-cttaaacatcttatctaatccacataatgca |
26392529 |
T |
 |
| Q |
160 |
tatacaaatatattacattactatcaacactaaatcatattataatagcttcacagatcatcagtaatattatattcaacccacattcctaccccaa |
256 |
Q |
| |
|
||||||||||||| || || ||||||||| || ||||| | |||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
26392530 |
tatacaaatatatcacctttctatcaacattagatcatgtaataacaaattcacagaacatcagtaatattatattcaacctccattcctaccccaa |
26392626 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 21 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 12901704 - 12901595
Alignment:
| Q |
21 |
acatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatc |
120 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12901704 |
acatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaatagcaacataggcgacacataaacatctcaggatataacaatatcaaatgataatc |
12901605 |
T |
 |
| Q |
121 |
aacaacaact |
130 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
12901604 |
aacaacaact |
12901595 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 61 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 21073563 - 21073421
Alignment:
| Q |
61 |
acaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcat |
160 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||| ||||||||| || |
|
|
| T |
21073563 |
acaacagcaacatatgcagcacataaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacatcaacttaaatatcttatataatccacataatgaat |
21073464 |
T |
 |
| Q |
161 |
atacaaatatattacattactatcaacactaaatcatattata |
203 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
21073463 |
atacaaatatatctcattactaacaacatcaaatcatattata |
21073421 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 21 - 130
Target Start/End: Original strand, 24649271 - 24649380
Alignment:
| Q |
21 |
acatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatc |
120 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| | |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24649271 |
acatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacaacaacctaggcgacacataaacatctcaggatataacaatatcaaatgataatc |
24649370 |
T |
 |
| Q |
121 |
aacaacaact |
130 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
24649371 |
aacaacaact |
24649380 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 21 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 10101837 - 10101728
Alignment:
| Q |
21 |
acatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatc |
120 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | |||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10101837 |
acatcttccacataaggcatataaatatttcacataatcaacaacaacaacataggcgacacatgaacatctcaggatataacaatatcaaatgataatc |
10101738 |
T |
 |
| Q |
121 |
aacaacaact |
130 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
10101737 |
aacaacaact |
10101728 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 61 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 19202046 - 19201906
Alignment:
| Q |
61 |
acaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaa-caacaacttaaacatcatatataattcacataatgca |
159 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || |||||||| |||| ||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
19202046 |
acaacagcaacataggcaacacataaacatctcaagatataacaatgtcaaataataatcaatcatcaacttaagcatcttatataattcatataatgca |
19201947 |
T |
 |
| Q |
160 |
tatacaaatatattacattactatcaacactaaatcatatt |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||| |
|
|
| T |
19201946 |
tatacaaatatatcacattactaacaacttcaaatcatatt |
19201906 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 59 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 6261217 - 6261072
Alignment:
| Q |
59 |
caacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgc |
158 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
6261217 |
caacaacggcaacataggcagcacataaacgtctcaagatataacaatatcaaatgataatcaatatcaacttaaacatcttatataatccacataatgc |
6261118 |
T |
 |
| Q |
159 |
-atatacaaatatattacattactatcaacactaaatcatattata |
203 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||| ||||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
6261117 |
aatatacaaatatatctcattactaacaacatcaaattatattata |
6261072 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 19 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 22459675 - 22459514
Alignment:
| Q |
19 |
atacatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataa |
118 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||| | |
|
|
| T |
22459675 |
atacattttccacataaggcatataaatatttcacataaccgacaacagcaacataggcaacacataaacatctaaagatataacaacatcaaatgaaag |
22459576 |
T |
 |
| Q |
119 |
tcaacaacaacttaaaca-tcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacatta |
179 |
Q |
| |
|
||| ||||| || ||| | ||| |||||| ||| ||||| |||||||| ||||| |||||| |
|
|
| T |
22459575 |
tcatcaacatctcaaatattcacatataactcaagtaatgtatatacaattatatcacatta |
22459514 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 96 - 253
Target Start/End: Original strand, 23004835 - 23004992
Alignment:
| Q |
96 |
gatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaatc |
195 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||| | || |||| |||||| |
|
|
| T |
23004835 |
gatataataatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacatcatatataatccacataatgcatatacaaatatttaacatcattaacaacgttaaatc |
23004934 |
T |
 |
| Q |
196 |
atattataatagcttcacagatcatcagtaatattatattcaacccacattcctaccc |
253 |
Q |
| |
|
||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
23004935 |
atagtataacagcttcacatatcatcattaatattatatacaacctccattcctaccc |
23004992 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 59 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 30644119 - 30643990
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| Q |
59 |
caacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgc |
158 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
30644119 |
caacaacggcaacataggcagcacataaacgtctcaagatataacaatatcaaatgataatcaatatctacttaaacatcttatataatccacataatgc |
30644020 |
T |
 |
| Q |
159 |
atatacaaatatattacattactatcaaca |
188 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||| ||||| |
|
|
| T |
30644019 |
atatacaaatatatctcattactaacaaca |
30643990 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 61 - 188
Target Start/End: Original strand, 21237803 - 21237930
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| Q |
61 |
acaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataat-caacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgca |
159 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21237803 |
acaacagcaacat-gacagcacataaacatctcaagatataacaatatcaaataataattcatcatcaacttaaacatcttatataattcacataatgca |
21237901 |
T |
 |
| Q |
160 |
tatacaaatatattacattactatcaaca |
188 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| ||||||||| ||||| |
|
|
| T |
21237902 |
tatacaactatatcacattactaacaaca |
21237930 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 96 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 20520227 - 20520068
Alignment:
| Q |
96 |
gatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaatc |
195 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || | ||| ||||| |
|
|
| T |
20520227 |
gatataacaatatcaa-tgcaaatcaacaacatctcaaacatcatatataattcaagtaatgcatatacaaatatatcacattattaacgacatcaaatc |
20520129 |
T |
 |
| Q |
196 |
atattataatagcttcacagatcatcagtaatattatattcaacccacattcctaccccaa |
256 |
Q |
| |
|
|| |||||| | |||||||||| |||| |||||| |||| ||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
20520128 |
atcttataacaacttcacagattatcattaatatcatatacaacctccattcctaccccaa |
20520068 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 87 - 171
Target Start/End: Original strand, 22703174 - 22703258
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| Q |
87 |
acatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataatt-cacataatgcatatacaaatata |
171 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| |
|
|
| T |
22703174 |
acatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaac-acaatttaaacatcatatataattccacataatgcatttgcaaatata |
22703258 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 96 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 24697641 - 24697485
Alignment:
| Q |
96 |
gatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaatc |
195 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||| ||||||| |||||| ||||||||||||| ||||| |||||| || ||||| ||||| |
|
|
| T |
24697641 |
gatataacaatatcaaatgcaattcaacaacatctcaaacttcatatacaattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacataaaatc |
24697542 |
T |
 |
| Q |
196 |
atattataatagcttcacagatcatcagtaatattatattcaacccacattcctaccc |
253 |
Q |
| |
|
||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| || ||||| || |||||||| |
|
|
| T |
24697541 |
atattat-acagcttcacagatcatcattaatattaaatacaacctccactcctaccc |
24697485 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 85 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 22413183 - 22413011
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| Q |
85 |
aaacatctcaagatataacaatat--caaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattacta |
182 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| || |
|
|
| T |
22413183 |
aaacagctcatgatataacaatatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaa-catcataaataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattatta |
22413085 |
T |
 |
| Q |
183 |
tcaacactaaatcatattataatagcttcacagatcatcagtaatattatattcaacccacattcctaccccaa |
256 |
Q |
| |
|
||||| ||||||| |||||| |||||||||||| | || |||||| |||| ||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
22413084 |
acaacatcaaatcatcttataacagcttcacagattaacattaatatcatatacaacctccattcctaccccaa |
22413011 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 87 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 13101682 - 13101597
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87 |
acatctcaagatataacaat-atcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataatt-cacataatgcatatacaaatata |
171 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| |
|
|
| T |
13101682 |
acatctcaagatataaaaattatcaaatgataatcaaca-caacttaaacatcatatataattccacataatgcatttgcaaatata |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 61 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 18547016 - 18546888
Alignment:
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61 |
acaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatat-aattcacataatgca |
159 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | || ||| ||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| || || |||| |||||||||| |
|
|
| T |
18547016 |
acaacagcaacatgggcatcacaataacatatccagacataacaatatcaaaggataatcaacatcaacttagacatcttacattaatttacataatgca |
18546917 |
T |
 |
| Q |
160 |
tatacaaatatattacattactatcaaca |
188 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| ||||||||| ||||| |
|
|
| T |
18546916 |
tatacaaatgtatcacattactaacaaca |
18546888 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 96 - 199
Target Start/End: Original strand, 23791360 - 23791463
Alignment:
| Q |
96 |
gatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaatc |
195 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| || ||||| ||||| |
|
|
| T |
23791360 |
gatataaaaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacattatatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatc |
23791459 |
T |
 |
| Q |
196 |
atat |
199 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
23791460 |
atat |
23791463 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 95 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 43947408 - 43947306
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| Q |
95 |
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193 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| || |||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||| || ||||| |||| |
|
|
| T |
43947408 |
agatataacaatatccaagaataatcaacatcaacttacaacatctcatataattcacatagtgcatatac-aatatatcacattattaacaacattaaa |
43947310 |
T |
 |
| Q |
194 |
tcat |
197 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
43947309 |
tcat |
43947306 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
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Target Start/End: Complemental strand, 23708655 - 23708521
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| Q |
96 |
gatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacat-catatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaat |
194 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| || ||||| | ||| || |||||| || |||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| | ||||| || | |
|
|
| T |
23708655 |
gatataacaatatcaattgcaaatcatcgacatctcaaacattcaaatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaatt |
23708556 |
T |
 |
| Q |
195 |
catattataatagcttcacagatcatcagtaatat |
229 |
Q |
| |
|
||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
23708555 |
catcttataacagcttcacagatcatcattaatat |
23708521 |
T |
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Target: chr2; HSP #44
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| Q |
94 |
aagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataa |
155 |
Q |
| |
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||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| |
|
|
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6482838 |
aagatataacaatatcaaatggtaattaacatcaacttaaacatcttatataatccacataa |
6482899 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
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Target Start/End: Original strand, 6486305 - 6486366
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| Q |
94 |
aagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataa |
155 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| |
|
|
| T |
6486305 |
aagatataacaatatcaaatggtaattaacatcaacttaaacatcttatataatccacataa |
6486366 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #46
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| Q |
96 |
gatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaatc |
195 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| | ||||||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | |||| || ||||| ||||| |
|
|
| T |
25108974 |
gatataacaatatcaaagcaaaatcaacaatatctcaaacatcatatataattcatgtaatgcatatacatttatatcatattattaacaacatcaaatc |
25109073 |
T |
 |
| Q |
196 |
atat |
199 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
25109074 |
atat |
25109077 |
T |
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Back To:
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Target: chr2; HSP #47
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| Q |
96 |
gatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacat-catatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaat |
194 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| | ||| ||||| || |||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||| | ||||| ||||| |
|
|
| T |
7769 |
gatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatctcaaacattcatatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacattaacaacaacattaaat |
7670 |
T |
 |
| Q |
195 |
catat |
199 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
| T |
7669 |
catat |
7665 |
T |
 |
Back To:
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Target: chr2; HSP #48
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Query Start/End: Original strand, 97 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 24642855 - 24642807
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| Q |
97 |
atataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatata |
145 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24642855 |
atataacaacatcaaatcataatcaacatcaacttaaacatcatatata |
24642807 |
T |
 |
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Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 34492247 - 34492200
Alignment:
| Q |
19 |
atacatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaaca |
66 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34492247 |
atacattttccacataaggtatataattatttcacataaccaacaaca |
34492200 |
T |
 |
Back To:
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Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
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| Q |
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aatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaaca |
188 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| ||||| || ||||||||| ||| | ||||||||||||||| || ||||| ||||||||| ||||| |
|
|
| T |
24834882 |
aatgataaacaataacaatttcaacatcatacatattccacataatgcatatataactatatcacattactaacaaca |
24834805 |
T |
 |
Back To:
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Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 66
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| Q |
26 |
ttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaaca |
66 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
21914926 |
ttccacataaggcatataattatttcacataacctacaaca |
21914966 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 96 - 199
Target Start/End: Original strand, 23207364 - 23207466
Alignment:
| Q |
96 |
gatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaatc |
195 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||| ||| || || ||| ||| |||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| || ||||| ||||| |
|
|
| T |
23207364 |
gatataacaatatcaaatgcaaatcaacgacatctcaa-cattataaataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatc |
23207462 |
T |
 |
| Q |
196 |
atat |
199 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
23207463 |
atat |
23207466 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0051 (Bit Score: 243; Significance: 1e-135; HSPs: 1)
Name: scaffold0051
Description:
Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 18 - 288
Target Start/End: Original strand, 31130 - 31400
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| Q |
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117 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31130 |
catacatcttccacataaggcatataaatatttcacataactaacaacagcaacataggcgacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgata |
31229 |
T |
 |
| Q |
118 |
atcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaatcatattataatagcttcacagat |
217 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
31230 |
ataaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaatcatattataatagcttcacaaat |
31329 |
T |
 |
| Q |
218 |
catcagtaatattatattcaacccacattcctaccccaacactaaatcatattattatacttttaaacacc |
288 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
31330 |
catcagtaatattatattcaacccacattcctaccccaacactaaattatattattatactcttaaacacc |
31400 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8 (Bit Score: 232; Significance: 1e-128; HSPs: 78)
Name: chr8
Description:
Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 37 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 14397957 - 14397706
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37 |
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136 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
14397957 |
gcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacataggcgacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaattgataatcaacagcaacttaaaca |
14397858 |
T |
 |
| Q |
137 |
tcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaatcatattataatagcttcacagatcatcagtaatattatattc |
236 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14397857 |
tcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaatcatattataatagcttcacagatcatcagtaatattatattc |
14397758 |
T |
 |
| Q |
237 |
aacccacattcctaccccaacactaaatcatattattatacttttaaacacc |
288 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
14397757 |
aacccacattcctaccccaacactaaatcatattattatactcttaaacacc |
14397706 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 18 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 19808476 - 19808238
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| Q |
18 |
catacatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgata |
117 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
19808476 |
catacattttccacatgaggcatataaatatttcacataaccaacaatagcaacatagacagcacgtaaacatctcaagatataacaacatcaaatgata |
19808377 |
T |
 |
| Q |
118 |
atcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaatcatattataatagcttcacagat |
217 |
Q |
| |
|
||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |
|
|
| T |
19808376 |
atcaacatcaacataaacatcttatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacattaaatcatattataacagtttcacagat |
19808277 |
T |
 |
| Q |
218 |
catcagtaatattatattcaacccacattcctaccccaa |
256 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
19808276 |
catcagtaatattatattcaacctccattcctaccccaa |
19808238 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 26 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 22238125 - 22237895
Alignment:
| Q |
26 |
ttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaa |
125 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22238125 |
ttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacaacaacataagaaacacgtaaacatctcaagatataacaacatcaaatgataatcaacat |
22238026 |
T |
 |
| Q |
126 |
caacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaatcatattataatagcttcacagatcatcagta |
225 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22238025 |
caacttaaacatcttatataattcacataatgcatatacaaatataatacattactatcaacattaaatcatattataacagcttcacagatcatcagta |
22237926 |
T |
 |
| Q |
226 |
atattatattcaacccacattcctaccccaa |
256 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
22237925 |
atattatattcaacctccattcctaccccaa |
22237895 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 20 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 17461164 - 17460928
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| Q |
20 |
tacatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataat |
119 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
17461164 |
tacattttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacaacaacataggaaacacataaacatctagagatataacaacatcaaatgataat |
17461065 |
T |
 |
| Q |
120 |
caacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaatcatattataatagcttcacagatca |
219 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||| |
|
|
| T |
17461064 |
caacatcaacttaaacatcttatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacattaaatcatattataacaacttcacagatca |
17460965 |
T |
 |
| Q |
220 |
tcagtaatattatattcaacccacattcctaccccaa |
256 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
17460964 |
tcagtaatattatattcaacctccattcctaccccaa |
17460928 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 18 - 204
Target Start/End: Original strand, 23659414 - 23659600
Alignment:
| Q |
18 |
catacatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgata |
117 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
23659414 |
catacattttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacataggcatcacataaacatcttgagatataacaacatcaaatgata |
23659513 |
T |
 |
| Q |
118 |
atcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaatcatattataa |
204 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
23659514 |
atcaacatcaacttaaacatcttatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacattaaatcatattataa |
23659600 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 26 - 256
Target Start/End: Original strand, 37515720 - 37515950
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26 |
ttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaa |
125 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37515720 |
ttccacataaggcacataaatatttcacataaccaacaacagcaacataggcagcacataaacatatcaagatataacaatatcaaatgataatcaacat |
37515819 |
T |
 |
| Q |
126 |
caacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaatcatattataatagcttcacagatcatcagta |
225 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||| || ||| | | ||| |||| |
|
|
| T |
37515820 |
caacttaaacatcttatataattcacataatgcatatacaattatatcacattactaacaacattaaatcacattatatcagactcataaaacattagta |
37515919 |
T |
 |
| Q |
226 |
atattatattcaacccacattcctaccccaa |
256 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
37515920 |
atattataaacaacctccattcctaccccaa |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 97 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 25484274 - 25484115
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| |
|
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| T |
25484274 |
atataataacatcaaatcataatcaacatcaacttaaacatcttatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacattaaatca |
25484175 |
T |
 |
| Q |
197 |
tattataatagcttcacagatcatcagtaatattatattcaacccacattcctaccccaa |
256 |
Q |
| |
|
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|
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| T |
25484174 |
tattataatagcttcacagatcatcagtaatattatattcaacccccattcctaccccaa |
25484115 |
T |
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Target: chr8; HSP #8
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Target Start/End: Complemental strand, 23944060 - 23943876
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164 |
Q |
| |
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|||||||||| || ||| | ||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23944060 |
cagcaacatatgcagcacattaacatatccagatataataatatcaagtgataatcaacaacaacttaaacatcttaaataattcacataatgcatatac |
23943961 |
T |
 |
| Q |
165 |
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249 |
Q |
| |
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|
|
| T |
23943960 |
aaatatattacattactatcaacatcaaatcatattataacagcttcacagaacatcagtaatattatattcaacctccattcct |
23943876 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #9
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Q |
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|
| T |
18833569 |
catacattttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacataggcagcacataaacatctc-agatataacaatatcaaataata |
18833667 |
T |
 |
| Q |
118 |
atcaacaacaactt-aaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaatcatatt |
200 |
Q |
| |
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| ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
18833668 |
aacaacatcaacttaaaacatcttatataattcacataatgcatatacacatatatcacattactaacaacatcaaatcatatt |
18833751 |
T |
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Target: chr8; HSP #10
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Target Start/End: Complemental strand, 20533481 - 20533284
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60 |
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158 |
Q |
| |
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||||||||||||||| ||| || |||| ||| || |||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||| |
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| T |
20533481 |
aacaacagcaacataaacagtacataaaacatatccagatataataatatcaagtgatgatcaacaacaacttaaacatcttaaataattcacaaaatgc |
20533382 |
T |
 |
| Q |
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256 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |
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|
| T |
20533381 |
atatacaattatattacattactatcaacaataaatcacattataacagcttcacagaacatcagtaatgttatattcaacctccattcctaccccaa |
20533284 |
T |
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Target: chr8; HSP #11
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Target Start/End: Complemental strand, 25363255 - 25363134
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178 |
Q |
| |
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| T |
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acacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcttatataattcacataatgcatatacaaatatattacatt |
25363156 |
T |
 |
| Q |
179 |
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200 |
Q |
| |
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|| ||||||| |||||||||| |
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| T |
25363155 |
accatcaacatcaaatcatatt |
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T |
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Target: chr8; HSP #12
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184 |
Q |
| |
|
||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
16799561 |
aacatatccagatataacaatatcaaatgataatcaacatcaacttaaaacatcttatatatttcacataatgcatatacaaatatattacattactatc |
16799660 |
T |
 |
| Q |
185 |
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256 |
Q |
| |
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|||| |||||||| |||||| || |||||||| |||||||||||||||| ||| || ||||| |||||||| |
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| T |
16799661 |
aacattaaatcatgttataacagattcacagaacatcagtaatattataatcatcctccattcataccccaa |
16799732 |
T |
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Target Start/End: Original strand, 23914046 - 23914183
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119 |
Q |
| |
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||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
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|
| T |
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tacattttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacataggcatcacataaacatctcaagatataacaacatcaaatgataat |
23914145 |
T |
 |
| Q |
120 |
caacaacaacttaaacatcatata-taattcacataat |
156 |
Q |
| |
|
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| T |
23914146 |
cagcaacaacttaaacatcttatattaattcacataat |
23914183 |
T |
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catacatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgata |
117 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
21828209 |
catacatcttccacataagtcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacataggcgacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgata |
21828110 |
T |
 |
| Q |
118 |
atcaacaacaact |
130 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |
|
|
| T |
21828109 |
atcaacaacaact |
21828097 |
T |
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Target Start/End: Complemental strand, 17439541 - 17439381
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195 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| |
|
|
| T |
17439541 |
gatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacatcatatataattcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattatcaacattaaatc |
17439442 |
T |
 |
| Q |
196 |
atattataatagcttcacagatcatcagtaatattatattcaacccacattcctaccccaa |
256 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
17439441 |
atattataacagcttcacatatcatcattaatactgtattcaacctccattcctaccccaa |
17439381 |
T |
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Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
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Target Start/End: Complemental strand, 18862840 - 18862728
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| Q |
18 |
catacatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgata |
117 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18862840 |
catacatcttccacataagtcatataaatatttcacataaccaacaacaacaacataggcgacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgata |
18862741 |
T |
 |
| Q |
118 |
atcaacaacaact |
130 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |
|
|
| T |
18862740 |
atcaacaacaact |
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T |
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Target: chr8; HSP #17
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Target Start/End: Original strand, 21410861 - 21410973
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| Q |
18 |
catacatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgata |
117 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
21410861 |
catacatcttccacataagttatataaatatttcacataaccaacaacagcaacataggcgacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgata |
21410960 |
T |
 |
| Q |
118 |
atcaacaacaact |
130 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |
|
|
| T |
21410961 |
atcaacaacaact |
21410973 |
T |
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Target Start/End: Original strand, 21805353 - 21805465
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| Q |
18 |
catacatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgata |
117 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21805353 |
catacatcttccacataagttatataaatatttcacataaccaacaacagcaacataggcgacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgata |
21805452 |
T |
 |
| Q |
118 |
atcaacaacaact |
130 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |
|
|
| T |
21805453 |
atcaacaacaact |
21805465 |
T |
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aaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatc |
184 |
Q |
| |
|
|||||| || |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
19154932 |
aaacatatccagatataataatatcaagtgctaatcaacaacaacttaaacatcttaaataattcagataatgcatatacaaatatattacattagtatc |
19154833 |
T |
 |
| Q |
185 |
aacactaaatcatattataatagcttcacagatcatcagtaatattatattcaacccacattcctaccccaa |
256 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| || |||| ||||||||| |||| |
|
|
| T |
19154832 |
aacattaaatcatattataacagcttcacaaatcatcattaatattacatataacctccattcctacaccaa |
19154761 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #20
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acaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcat |
160 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| || ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20502172 |
acaacagcaacataggcagcacataaatatctcaagatataacaatatcaaatgataaccaacaacaacataaacatcttatataattcacataatgcat |
20502073 |
T |
 |
| Q |
161 |
atacaaatatattacattactatcaacactaaatcatattataatagcttcacagatcatcagtaatattatattcaacccacattcctaccccaa |
256 |
Q |
| |
|
|||||||||| | | ||||||| ||||| ||||||||||||| || ||||| || ||||| ||| |||| |||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
20502072 |
atacaaatatgtcatattactaacaacatcaaatcatattatatcagattcactgaacatcaacaattatataatcaacctccattcctaccccaa |
20501977 |
T |
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acatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatc |
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Q |
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|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
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acatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacataggcgacacataaacatctcaggatataacaatatcaaatgataatc |
19278376 |
T |
 |
| Q |
121 |
aacaacaact |
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Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
19278375 |
aacaacaact |
19278366 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #22
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acatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatc |
120 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21972777 |
acatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacataggcgacacataaacatctcaggatataacaatatcaaatgataatc |
21972678 |
T |
 |
| Q |
121 |
aacaacaact |
130 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
21972677 |
aacaacaact |
21972668 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #23
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acatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatc |
120 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21976862 |
acatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacataggcgacacataaacatctcaggatataacaatatcaaatgataatc |
21976763 |
T |
 |
| Q |
121 |
aacaacaact |
130 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
21976762 |
aacaacaact |
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T |
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ttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaa |
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Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23409810 |
ttccacataaggtatataaatatttcacataaccaacaacaacaacataggcagcacgtaaacatctcaagatataacaacatcaaatgataatcaacat |
23409909 |
T |
 |
| Q |
126 |
caacttaaacatcatatataa |
146 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
23409910 |
caacttaaacatcttatataa |
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T |
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Target: chr8; HSP #25
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acatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatc |
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43251727 |
acatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacaacaacataggcgacacataaacatctcaggatataacaatatcaaatgataatc |
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T |
 |
| Q |
121 |
aacaacaact |
130 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
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aacaacaact |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #26
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |
|
|
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gatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacatcataaataattcatg-attgcatatacaaatatattacatcactatcaacattaaatc |
40492789 |
T |
 |
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atattataatagcttcacagatcatcagtaatattatattcaacccacattcctacc |
252 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
40492788 |
atattataacagcttcacagatcatcattaatattatatacaacctccattcctacc |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #27
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18 |
catacatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaata------tcaa |
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Q |
| |
|
||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| | |||| |
|
|
| T |
16402116 |
catacattttccacataacgcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacataggcagcacgtaaacatctcaagatataacaacatcaaattcaa |
16402017 |
T |
 |
| Q |
112 |
atgataatcaacaacaacttaaacatcatatata |
145 |
Q |
| |
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|
|
| T |
16402016 |
atgataatcaacatcaacttaaacatcatatata |
16401983 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 61 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 17086224 - 17086082
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61 |
acaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcat |
160 |
Q |
| |
|
|||| ||||| |||| || ||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17086224 |
acaaaagcaaaataggcagcacataaacatctcaagatataacaataccaaataataatcaacatcaacttaaatatcttatataattcacataatgcat |
17086125 |
T |
 |
| Q |
161 |
atacaaatatattacattactatcaacactaaatcatattata |
203 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
17086124 |
atacaactatatcacattactatcaacatcaaatcatattata |
17086082 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 61 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 17438288 - 17438148
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| Q |
61 |
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159 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || |||||||| ||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17438288 |
acaacagaaacataggcaacacataaacatctcaagatataacaatgtcaaataataatcaatcatcaacttaagcatattatataattcacataatgca |
17438189 |
T |
 |
| Q |
160 |
tatacaaatatattacattactatcaacactaaatcatatt |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
17438188 |
tatacaaatatatcacattactaacaacatcaaatcatatt |
17438148 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 94 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 14103262 - 14103100
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| Q |
94 |
aagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacact-aa |
192 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| |||||| |||||||| | || |
|
|
| T |
14103262 |
aagatataacaacatcaaatgataatcaacatcaacttaaacatcatatataattcatgtaatgcgtatacaattatatcacattaatatcaacattaaa |
14103163 |
T |
 |
| Q |
193 |
atcatattataatagcttcacagatcatcagtaatattatattcaacccacattcctaccccaa |
256 |
Q |
| |
|
|||||||||| | | ||||| ||||||||| | |||| |||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
14103162 |
atcatattat-acaacttcatagatcatcatttatatcatattcaacctccattcctaccccaa |
14103100 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 68 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 5083218 - 5083085
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| Q |
68 |
caacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaa-caacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaa |
166 |
Q |
| |
|
|||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5083218 |
caacataggcagcacataaacatctcaagatataacaatgtcaaataataatcaatcatcaacttaaggatcttatatgattcacataatgcatatacaa |
5083119 |
T |
 |
| Q |
167 |
atatattacattactatcaacactaaatcatatt |
200 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
5083118 |
atatatcacattactaacaacatcaaatcatatt |
5083085 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 61 - 256
Target Start/End: Original strand, 23667859 - 23668054
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| Q |
61 |
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159 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | || ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| | |||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
23667859 |
acaacagcaacatgg-cagcacataaccatctcaagatataacaatatcaaataatattttaacatcaacttaaacatcttatataattcatataatgca |
23667957 |
T |
 |
| Q |
160 |
tatacaaatatattacattactatcaacactaaatcatattataatagcttcacagatcatcagtaatattatattcaacccacattcctaccccaa |
256 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| ||| ||| |||| || ||| | | ||||||| |||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
23667958 |
tatacaaatatatcacattactaacaacctcaaatcatatcatattagactcactgaacattaacagtattataatcaacctccattcctaccccaa |
23668054 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #33
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Query Start/End: Original strand, 61 - 179
Target Start/End: Original strand, 22995893 - 22996011
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| Q |
61 |
acaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcat |
160 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| || ||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
22995893 |
acaacagcaacataggcagcacaataacatattcagatataacaatatcaaatgataatcaacatcaacttaaacatcttacataaatcacataatgcat |
22995992 |
T |
 |
| Q |
161 |
atacaaatatattacatta |
179 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| |||||| |
|
|
| T |
22995993 |
atacaactatatcacatta |
22996011 |
T |
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Target: chr8; HSP #34
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Query Start/End: Original strand, 87 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 22253210 - 22253094
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| Q |
87 |
acatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaa |
186 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||| | || ||||||||||||||| || | ||| ||||||||| || |
|
|
| T |
22253210 |
acatctcaagatataacaatatcaaatgataattaacatcaacttaaacatcttatgtgatccacataatgcatatataactttatcacattactaagaa |
22253111 |
T |
 |
| Q |
187 |
cactaaatcatattata |
203 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| |
|
|
| T |
22253110 |
catcaaatcatattata |
22253094 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 61 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 22963484 - 22963364
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| Q |
61 |
acaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataa-tcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgca |
159 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||| ||||| | ||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
22963484 |
acaacagcaacataggcagtacataaacatctcaagatataacaatatcaaataataattcaacatcaactttaacatattttataattcacacaatgca |
22963385 |
T |
 |
| Q |
160 |
tatacaaatatattacattac |
180 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| ||||||| |
|
|
| T |
22963384 |
tatacaattatatcacattac |
22963364 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 27 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 1327112 - 1327015
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| Q |
27 |
tccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaaca |
124 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
1327112 |
tccacataaggcatatgaacatttcacataacctacaacagcaacttaggcagcacttaaacacctcaagatataacaacatcaaataataatcaaca |
1327015 |
T |
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Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
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Target Start/End: Original strand, 37116434 - 37116535
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| Q |
96 |
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195 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||| |
|
|
| T |
37116434 |
gatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacatcatatataattcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaatc |
37116533 |
T |
 |
| Q |
196 |
at |
197 |
Q |
| |
|
|| |
|
|
| T |
37116534 |
at |
37116535 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 122 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 21346243 - 21346164
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| Q |
122 |
acaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacact-aaatcatatt |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||| |
|
|
| T |
21346243 |
acaacaacttaaatatcttatataattcacataatgcatatacaaatatattacattaccatcaacaatcaaatcatatt |
21346164 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 21 - 75
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| Q |
21 |
acatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatag |
75 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22111845 |
acatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatag |
22111899 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 89 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 35026903 - 35026797
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| Q |
89 |
atctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaaca |
188 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||| || ||||| |
|
|
| T |
35026903 |
atctcaagatataacaatatcaaacgataatcaacatct--taaaacatcatatataattcacataatgcatataaaatcatatcacattattaacaaca |
35026806 |
T |
 |
| Q |
189 |
ctaaatcat |
197 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
|
| T |
35026805 |
tcaaatcat |
35026797 |
T |
 |
Back To:
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Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 96 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 17267028 - 17266925
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| Q |
96 |
gatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaatc |
195 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| || ||||| ||||| |
|
|
| T |
17267028 |
gatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacatcatatataattcttgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatc |
17266929 |
T |
 |
| Q |
196 |
atat |
199 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
17266928 |
atat |
17266925 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 89 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 22419455 - 22419349
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| Q |
89 |
atctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaaca |
188 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | | |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| | ||||| |
|
|
| T |
22419455 |
atctcaagatataacaatttcaaacgataatcaacatct--taaaacatcataaataattcacataatgcatatacaatcatatcacattattgacaaca |
22419358 |
T |
 |
| Q |
189 |
ctaaatcat |
197 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
22419357 |
ttaaatcat |
22419349 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 97 - 197
Target Start/End: Original strand, 28397635 - 28397735
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| Q |
97 |
atataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaa-catcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaatc |
195 |
Q |
| |
|
||||||||||||| || |||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| || ||||| |||||| |
|
|
| T |
28397635 |
atataacaatatccaagaataatcaacatcaacttaaaacatctcatataattcacataatgcatatac-aatatatcacattattaacaacattaaatc |
28397733 |
T |
 |
| Q |
196 |
at |
197 |
Q |
| |
|
|| |
|
|
| T |
28397734 |
at |
28397735 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 94 - 155
Target Start/End: Original strand, 44476753 - 44476814
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| Q |
94 |
aagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataa |
155 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| |
|
|
| T |
44476753 |
aagatataacaatatcaaatggtaatcaacatcaacttaaacatcttatataatccacataa |
44476814 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 94 - 155
Target Start/End: Original strand, 44480015 - 44480076
Alignment:
| Q |
94 |
aagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataa |
155 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| |
|
|
| T |
44480015 |
aagatataacaatatcaaatggtaatcaacatcaacttaaacatcttatataatccacataa |
44480076 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 96 - 199
Target Start/End: Original strand, 22364748 - 22364850
Alignment:
| Q |
96 |
gatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaatc |
195 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || ||| || ||||| ||||| |
|
|
| T |
22364748 |
gatataacaatatcaaa-gaaaatcaacaacatctcaaacatcatatataattcatgtaatgcatatacatttatatcactttattaacaacatcaaatc |
22364846 |
T |
 |
| Q |
196 |
atat |
199 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
22364847 |
atat |
22364850 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 2418906 - 2418839
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| Q |
97 |
atataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaa |
166 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2418906 |
atataacaatatcaaacgataatcaacatct--tgaaacatcatatataattcacataatgcatatacaa |
2418839 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
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Target Start/End: Original strand, 22525659 - 22525761
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| Q |
154 |
aatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaatcatattataatagcttcacagatcatcagtaatattatattcaacccacattcctaccc |
253 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||| | ||||| |||||||| |||||| || |||||| | |||||| | ||||||| | |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
22525659 |
aatgcatatacaaatatatgacattaccaacaacattaaatcatgttataacagattcacaaaacatcaggagtattataattaacctccattcctaccc |
22525758 |
T |
 |
| Q |
254 |
caa |
256 |
Q |
| |
|
||| |
|
|
| T |
22525759 |
caa |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #49
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18 |
catacatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaaca |
66 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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catacattttccacataaggcatataattatttcacataaccaacaaca |
19880172 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #50
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atataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatata |
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Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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atataacaacatcaaatgataatcaacatcaacttaaacatcatatata |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
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taaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaatcatattata |
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Q |
| |
|
|||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
27941655 |
taaacatctcatataatccacataatgcatatacaaatatatctcattactaacaacatcaaatcatattata |
27941583 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 18 - 64
Target Start/End: Original strand, 23478376 - 23478422
Alignment:
| Q |
18 |
catacatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaa |
64 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23478376 |
catacattttccacataaggcatataattatttcacataaccaacaa |
23478422 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 87 - 160
Target Start/End: Original strand, 21329104 - 21329176
Alignment:
| Q |
87 |
acatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcat |
160 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||| || || |||||||||||| |
|
|
| T |
21329104 |
acatctcaaaatatgacaataccaaatgataatcaac-actacttaaacatcatacattatccacataatgcat |
21329176 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 87 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 21967612 - 21967540
Alignment:
| Q |
87 |
acatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcat |
160 |
Q |
| |
|
||||| ||| |||| |||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
21967612 |
acatcccaaaatatgacaataccaaatgataatcaaca-ctacttaaacatcatacataatccacataatgcat |
21967540 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 87 - 160
Target Start/End: Original strand, 34950622 - 34950694
Alignment:
| Q |
87 |
acatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcat |
160 |
Q |
| |
|
||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||| |||| |||||||||||| |
|
|
| T |
34950622 |
acatcccaaaatataacaataccaaatgataatcaac-actacttaaacatcatacttaatccacataatgcat |
34950694 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 18 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 8414466 - 8414418
Alignment:
| Q |
18 |
catacatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaaca |
66 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8414466 |
catacattttccacataaggcatatagttatttcacataaccaacaaca |
8414418 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 18 - 66
Target Start/End: Original strand, 11775018 - 11775066
Alignment:
| Q |
18 |
catacatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaaca |
66 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11775018 |
catacattttccacataaggcatatagttatttcacataaccaacaaca |
11775066 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 94 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 8728682 - 8728620
Alignment:
| Q |
94 |
aagatataacaatatcaaatgataat-caacaacaacttaaacatcatatataattcacataa |
155 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| |
|
|
| T |
8728682 |
aagatataacagtatcaaatggtaattcaacatcaacttaaacatcttatataatccacataa |
8728620 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 102 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 21980322 - 21980265
Alignment:
| Q |
102 |
acaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcat |
160 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
21980322 |
acaataccaaatgataatcaaca-ctacttaaacatcatacataatccacataatgcat |
21980265 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 102 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 21985305 - 21985248
Alignment:
| Q |
102 |
acaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcat |
160 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
21985305 |
acaataccaaatgataatcaaca-ctacttaaacatcatacataatccacataatgcat |
21985248 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 102 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 22000341 - 22000284
Alignment:
| Q |
102 |
acaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcat |
160 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
22000341 |
acaataccaaatgataatcaaca-ctacttaaacatcatacataatccacataatgcat |
22000284 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 102 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 22005319 - 22005262
Alignment:
| Q |
102 |
acaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcat |
160 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
22005319 |
acaataccaaatgataatcaaca-ctacttaaacatcatacataatccacataatgcat |
22005262 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 111 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 21346282 - 21346241
Alignment:
| Q |
111 |
aatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcaca |
152 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
21346282 |
aatgataatcaacaacaacttaaatatcttatataattcaca |
21346241 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 87 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 11251696 - 11251625
Alignment:
| Q |
87 |
acatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgca |
159 |
Q |
| |
|
||||| ||| |||| |||||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
11251696 |
acatcccaaaatatgacaataccaaatgataatcgaca-ctacttaaacatcatacataatccacataatgca |
11251625 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 179
Target Start/End: Original strand, 20498647 - 20498731
Alignment:
| Q |
96 |
gatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacat-catatataattcacataatgcatatacaaatatattacatta |
179 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| | ||| ||||| || |||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||| |
|
|
| T |
20498647 |
gatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatctcaaacattcatatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacatta |
20498731 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 172
Target Start/End: Original strand, 21285682 - 21285758
Alignment:
| Q |
96 |
gatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatat |
172 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| | ||| |||| ||||| |||||||| ||||| |
|
|
| T |
21285682 |
gatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacatcaaacatagttcatgtaatgtatatacaattatat |
21285758 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 66
Target Start/End: Original strand, 26454006 - 26454054
Alignment:
| Q |
18 |
catacatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaaca |
66 |
Q |
| |
|
||||||| || |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26454006 |
catacatttttcacataagacatataattatttcacataaccaacaaca |
26454054 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 96 - 199
Target Start/End: Original strand, 24353107 - 24353209
Alignment:
| Q |
96 |
gatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaatc |
195 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||| |||| |||||| ||||||||||||| ||||| | |||| || ||||| ||||| |
|
|
| T |
24353107 |
gatataacaatatcaa-tgcaaatcaacaacatctcaaacatcgtatacaattcatgtaatgcatatacatttatatcatattattaacaacatcaaatc |
24353205 |
T |
 |
| Q |
196 |
atat |
199 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
24353206 |
atat |
24353209 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 89 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 25658255 - 25658189
Alignment:
| Q |
89 |
atctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataat |
156 |
Q |
| |
|
||||||| |||| |||||| ||||||||| |||||| | |||||||||||||| ||||| |||||||| |
|
|
| T |
25658255 |
atctcaaaatatgacaataccaaatgatagtcaaca-ctacttaaacatcatacataatccacataat |
25658189 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 96 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 38855287 - 38855205
Alignment:
| Q |
96 |
gatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacatta |
179 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| ||||||||||| || ||| |||| | |||||||| |||||| |||||||| ||||| |||||| |
|
|
| T |
38855287 |
gatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataacatta |
38855205 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 13665263 - 13665190
Alignment:
| Q |
115 |
ataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaaca |
188 |
Q |
| |
|
|||| ||| |||||||| ||||||||| ||| | | ||||||||||||| || ||||| ||||||||| ||||| |
|
|
| T |
13665263 |
ataaacaataacaacttcaacatcatacatattccgcataatgcatatataactatatcacattactaacaaca |
13665190 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 13724538 - 13724465
Alignment:
| Q |
115 |
ataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaaca |
188 |
Q |
| |
|
|||| ||| |||||||| ||||||||| ||| | | ||||||||||||| || ||||| ||||||||| ||||| |
|
|
| T |
13724538 |
ataaacaataacaacttcaacatcatacatattccgcataatgcatatataactatatcacattactaacaaca |
13724465 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 87 - 156
Target Start/End: Original strand, 16197952 - 16198020
Alignment:
| Q |
87 |
acatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataat |
156 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| |||||| |||||| || |||||| | |||||||||||||| ||||| |||||||| |
|
|
| T |
16197952 |
acatctcaaaatatgacaataccaaatgctagtcaaca-ctacttaaacatcatacataatccacataat |
16198020 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 19929597 - 19929556
Alignment:
| Q |
26 |
ttccacataaggcatataaatatttcac-ataaccaacaaca |
66 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
19929597 |
ttccacataaggcatataaatatttcacaataatcaacaaca |
19929556 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 114
Target Start/End: Original strand, 22525633 - 22525662
Alignment:
| Q |
85 |
aaacatctcaagatataacaatatcaaatg |
114 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22525633 |
aaacatctcaagatataacaatatcaaatg |
22525662 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 87 - 163
Target Start/End: Original strand, 11774968 - 11775043
Alignment:
| Q |
87 |
acatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatata |
163 |
Q |
| |
|
||||| ||| |||| |||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||| || | ||||||| ||||||| |
|
|
| T |
11774968 |
acatcccaaaatatgacaataccaaatgataatcaac-actacttaaacatcatacattttccacataaggcatata |
11775043 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 111 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 21322182 - 21322130
Alignment:
| Q |
111 |
aatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatata |
163 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||| |||||| |
|
|
| T |
21322182 |
aatgatagtcaacaacaacttcaacgtcatatatttttcacataatacatata |
21322130 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 111 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 21326770 - 21326718
Alignment:
| Q |
111 |
aatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatata |
163 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||| |
|
|
| T |
21326770 |
aatgatagtcaacaacaacttcaacatcatatattttccacataatacatata |
21326718 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0293 (Bit Score: 223; Significance: 1e-123; HSPs: 2)
Name: scaffold0293
Description:
Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 18 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 20324 - 20054
Alignment:
| Q |
18 |
catacatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgata |
117 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |
|
|
| T |
20324 |
catacatcttccacataagttatataaatatttcacataaccaacaacagcaacataggcgacacgtaaacatctcaagatttaacaatatcaaatgcta |
20225 |
T |
 |
| Q |
118 |
atcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaatcatattataatagcttcacagat |
217 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20224 |
atcaacaacaacttaaacattatatataattcacatagtgcatataaaaatatattacattactatcaacactaaatcatattataatagcttcacagat |
20125 |
T |
 |
| Q |
218 |
catcagtaatattatattcaacccacattcctaccccaacactaaatcatattattatacttttaaacacc |
288 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
20124 |
catcagtaatattatattcaatccacattcctacccctacactaaatcatattattatactcttaaacacc |
20054 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0293; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 61 - 256
Target Start/End: Original strand, 17552 - 17747
Alignment:
| Q |
61 |
acaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcat |
160 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
17552 |
acaacagcaacttaggcagtacataaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacatcaacttaaacatcttatataattcacataaggcat |
17651 |
T |
 |
| Q |
161 |
atacaaatatattacattactatcaacactaaatcatattataatagcttcacagatcatcagtaatattatattcaacccacattcctaccccaa |
256 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| ||||||| | |||| ||||||||||||| || |||| || ||||| | || |||| |||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
17652 |
atacaactatatcacattaccaacaacttcaaatcatattatatcagtctcactgaacatcaacattactataatcaacctccattcctaccccaa |
17747 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 64)
Name: chr4
Description:
Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 26 - 253
Target Start/End: Original strand, 10056653 - 10056880
Alignment:
| Q |
26 |
ttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaa |
125 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10056653 |
ttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacataggcagcacgtaaacatctcaagatataacaacatcaaatgataatcaacat |
10056752 |
T |
 |
| Q |
126 |
caacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaatcatattataatagcttcacagatcatcagta |
225 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10056753 |
caacttaaacatcttatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacattaaatcatattataacagcttcacagatcatcagta |
10056852 |
T |
 |
| Q |
226 |
atattatattcaacccacattcctaccc |
253 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
10056853 |
atattatattcaacctccattcctaccc |
10056880 |
T |
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Target: chr4; HSP #2
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Target Start/End: Complemental strand, 17048248 - 17048066
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117 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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17048149 |
T |
 |
| Q |
118 |
atcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaatcatatt |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
17048148 |
atcaacaacaacttaaacatcttatataattcacataatgcatgtacaaatatattacattaccatcaacatcaaatcatatt |
17048066 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #3
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Target Start/End: Complemental strand, 13592032 - 13591802
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| Q |
26 |
ttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaa |
125 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13592032 |
ttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacataggcagcacataaacatctcaaaatataacaatatcaaatgataatcaacat |
13591933 |
T |
 |
| Q |
126 |
caacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaatcatattataatagcttcacagatcatcagta |
225 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||| || |||| || ||| |||| |
|
|
| T |
13591932 |
caacttaaacatcttatatgattcacataatgcatatacaactatatcacattactaacaacattaaatcacattatatcagactcactgaacattagta |
13591833 |
T |
 |
| Q |
226 |
atattatattcaacccacattcctaccccaa |
256 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
13591832 |
atattataaacaacctccattcctaccccaa |
13591802 |
T |
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Target: chr4; HSP #4
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Target Start/End: Complemental strand, 23803264 - 23803105
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196 |
Q |
| |
|
||||||||| || |||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
23803264 |
atataacaacataaaatcataatcaacatcaacttaaacatcttatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacattaaatca |
23803165 |
T |
 |
| Q |
197 |
tattataatagcttcacagatcatcagtaatattatattcaacccacattcctaccccaa |
256 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
23803164 |
tattataatagcttcacagatcatcagtaatattatattcaaccctcattcctaccccaa |
23803105 |
T |
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Target: chr4; HSP #5
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196 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
51463867 |
atataacaacatcaaatcataatcaacatcaacttaaacatcttatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacattaaatca |
51463768 |
T |
 |
| Q |
197 |
tattataatagcttcacagatcatcagtaatattatattcaacccacattcctaccccaa |
256 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
51463767 |
tattataatagcttcacagatcatcaataatattatattcaaccctcattcctaccccaa |
51463708 |
T |
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Target: chr4; HSP #6
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Target Start/End: Original strand, 17333326 - 17333525
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156 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
17333326 |
aacaacagcaacatagacagtacataaaacatctcaagatataacaatatcaaataataataatcaacaacacttaatcatcatatataatccacataat |
17333425 |
T |
 |
| Q |
157 |
gcatatacaaatatattacattactatcaacactaaatcatattataatagcttcacagatcatcagtaatattatattcaacccacattcctaccccaa |
256 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
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gcatatacaaatatattacattactaacaacattaaatcatattataacagcttcacagaacatcagtattattatattcaacctccattcctaccccaa |
17333525 |
T |
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196 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
12611106 |
atataacaacatcaaatcataatcaacatcaacttaaacatcttatataattca---aatgcatatacaaatatattacattactatcaacattaaatca |
12611202 |
T |
 |
| Q |
197 |
tattataatagcttcacagatcatcagtaatattatattcaacccacattcctaccccaa |
256 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
12611203 |
tattataatagcttcatagatcatcagtaatattatattcaaccctcattcctaccccaa |
12611262 |
T |
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Target: chr4; HSP #8
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206 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||| |||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
630693 |
atcaaatcataatcaacatcaactttaacatcttatataatccacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacattaaatcatattataata |
630594 |
T |
 |
| Q |
207 |
gcttcacagatcatcagtaatattatattcaacccacattcctaccccaa |
256 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |
|
|
| T |
630593 |
gcttcacagatcatcagtaatattatattcaacctccattcataccccaa |
630544 |
T |
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Target: chr4; HSP #9
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162 |
Q |
| |
|
||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18212784 |
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18212883 |
T |
 |
| Q |
163 |
acaaatatattacattactatcaacactaaatcatattata |
203 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
18212884 |
acaaatatatctcattactaacaacatcaaatcatattata |
18212924 |
T |
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Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
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Target Start/End: Original strand, 27533937 - 27534049
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| Q |
18 |
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117 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27533937 |
catacatcttccacataaggcatataagtatttcacataaccaacaacagcaacataggcgacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgata |
27534036 |
T |
 |
| Q |
118 |
atcaacaacaact |
130 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |
|
|
| T |
27534037 |
atcaacaacaact |
27534049 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 18 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 14746697 - 14746570
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| Q |
18 |
catacatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgata |
117 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
14746697 |
catacattttccacataacgcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacataggtagcacgtaaacatctcaagatataacaacatcaaatgata |
14746598 |
T |
 |
| Q |
118 |
atcaacaacaacttaaacatcatatata |
145 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14746597 |
atcaacatcaacttaaacatcatatata |
14746570 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
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Target Start/End: Original strand, 10712767 - 10712875
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| Q |
18 |
catacatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgata |
117 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10712767 |
catacatcttccacataagtcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacataggcgacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgata |
10712866 |
T |
 |
| Q |
118 |
atcaacaac |
126 |
Q |
| |
|
||||||||| |
|
|
| T |
10712867 |
atcaacaac |
10712875 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 18 - 126
Target Start/End: Original strand, 10926537 - 10926645
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| Q |
18 |
catacatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgata |
117 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10926537 |
catacatcttccacataagtcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacataggcgacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgata |
10926636 |
T |
 |
| Q |
118 |
atcaacaac |
126 |
Q |
| |
|
||||||||| |
|
|
| T |
10926637 |
atcaacaac |
10926645 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #14
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Query Start/End: Original strand, 18 - 130
Target Start/End: Original strand, 12487622 - 12487734
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| Q |
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catacatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgata |
117 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12487622 |
catacatctttcacataagtcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacataggcgacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgata |
12487721 |
T |
 |
| Q |
118 |
atcaacaacaact |
130 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |
|
|
| T |
12487722 |
atcaacaacaact |
12487734 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 18 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 14954362 - 14954250
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| Q |
18 |
catacatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgata |
117 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14954362 |
catacatcttccacataagtcatataaatatttcacataaccaacaacaacaacataggcgacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgata |
14954263 |
T |
 |
| Q |
118 |
atcaacaacaact |
130 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |
|
|
| T |
14954262 |
atcaacaacaact |
14954250 |
T |
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Target: chr4; HSP #16
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| Q |
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acaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcat |
160 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
26050545 |
acaacagcaaaataggcagcacaaaaacatctcaagatataacaatatcaaatgaaaatcaacaaca-cttaaacatcttatataatccacataatgcat |
26050447 |
T |
 |
| Q |
161 |
atacaaatatattacattactatcaacactaaatcatattataatagcttcacagatcatcagtaatattatattcaacccacattcctaccccaa |
256 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || ||| || ||||| |||||||||| |||||| |||||||| ||||| |
|
|
| T |
26050446 |
atacaaatatatcacattactatcaacatcaaatcatattatatcagactcattgaacatcaataatattataatcaacctccattcctaacccaa |
26050351 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #17
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Query Start/End: Original strand, 61 - 203
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| Q |
61 |
acaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcat |
160 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| || ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
24047370 |
acaacagcaacataggcagcacataaacatcttaagatataacaatatcaaatgataatcaacatcaacttaaacatcttatataatccacataatgcat |
24047271 |
T |
 |
| Q |
161 |
atacaaatatattacattactatcaacactaaatcatattata |
203 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
24047270 |
atacaaatatatctcattactaacaacatcaaatcatattata |
24047228 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #18
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acatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatc |
120 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4561526 |
acatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacataggcgacacataaacatctcaggatataacaatatcaaatgataatc |
4561427 |
T |
 |
| Q |
121 |
aacaacaact |
130 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
4561426 |
aacaacaact |
4561417 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #19
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acatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatc |
120 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5757130 |
acatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacataggcgacacataaacatctcaggatataacaatatcaaatgataatc |
5757031 |
T |
 |
| Q |
121 |
aacaacaact |
130 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
5757030 |
aacaacaact |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #20
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Query Start/End: Original strand, 21 - 130
Target Start/End: Original strand, 9556444 - 9556553
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9556444 |
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T |
 |
| Q |
121 |
aacaacaact |
130 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
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aacaacaact |
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T |
 |
Back To:
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Target: chr4; HSP #21
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18 |
catacatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgata |
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25689781 |
catacatcttccacataagttatataaatatttcacataaccaacaacaacaacataggcgacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgata |
25689880 |
T |
 |
| Q |
118 |
atcaacaacaact |
130 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |
|
|
| T |
25689881 |
atcaacaacaact |
25689893 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 95 - 256
Target Start/End: Original strand, 14825551 - 14825713
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95 |
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193 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
14825551 |
agatataacaatatccaagaataatcaacatcaacttaaaacatctcatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacattaaa |
14825650 |
T |
 |
| Q |
194 |
tcatattataatagcttcacagatcatcagtaatattatattcaacccacattcctaccccaa |
256 |
Q |
| |
|
||| |||| || || |||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
14825651 |
tcacattacaacagattcacagaacatcagtaatatcataatcaaccttcattcctaccccaa |
14825713 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #23
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Query Start/End: Original strand, 21 - 130
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21 |
acatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatc |
120 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14757614 |
acatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacaacaacataggcgacacataaacatctcaggatataacaatatcaaatgataatc |
14757515 |
T |
 |
| Q |
121 |
aacaacaact |
130 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
14757514 |
aacaacaact |
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T |
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Target: chr4; HSP #24
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Query Start/End: Original strand, 84 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 32307043 - 32306871
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| Q |
84 |
taaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactat |
183 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
32307043 |
taaacatctcaagatataacaatattaaataataatcaacatcaacttaaacatcttatataattcacataatgcatatacaactatatcacattactat |
32306944 |
T |
 |
| Q |
184 |
caacactaaatcatattataatagcttcacagatcatcagtaatattatattcaacccacattcctaccccaa |
256 |
Q |
| |
|
||||| ||| ||||||||| || | || || ||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
32306943 |
caacatcaaaccatattatatcagacttactgaacatcaataatactataatcaacctccattcctaccccaa |
32306871 |
T |
 |
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Target: chr4; HSP #25
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Target Start/End: Original strand, 16043087 - 16043203
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| Q |
86 |
aacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatca |
185 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| || |
|
|
| T |
16043087 |
aacatctcaagatataacaacatcaaatgataatcaacatcaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaactatatcacattactaaca |
16043186 |
T |
 |
| Q |
186 |
acactaaatcatattat |
202 |
Q |
| |
|
||| ||||||| |||| |
|
|
| T |
16043187 |
acatcaaatcatcttat |
16043203 |
T |
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Target: chr4; HSP #26
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Query Start/End: Original strand, 21 - 130
Target Start/End: Original strand, 17810186 - 17810295
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| Q |
21 |
acatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatc |
120 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | |||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17810186 |
acatcttccacataaggcatataaatatttcacataatcaacaacaacaacataggcgacacatgaacatctcaggatataacaatatcaaatgataatc |
17810285 |
T |
 |
| Q |
121 |
aacaacaact |
130 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
17810286 |
aacaacaact |
17810295 |
T |
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Target: chr4; HSP #27
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caacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcata |
161 |
Q |
| |
|
||||||||||| | ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |
|
|
| T |
40906965 |
caacagcaacacaaacatcacataaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaac-acaacttaaacatcatatataatccacatcatgcata |
40907063 |
T |
 |
| Q |
162 |
tacaaatatattacattactatcaaca |
188 |
Q |
| |
|
|| || ||||| ||||||||| ||||| |
|
|
| T |
40907064 |
tataactatatcacattactaacaaca |
40907090 |
T |
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Target: chr4; HSP #28
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Target Start/End: Original strand, 40907122 - 40907230
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caacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcata |
161 |
Q |
| |
|
||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
40907122 |
caacagcaacacaggcaacacataaacatctcaagatataaaaatatcaaatgataatcaacatcaacataaacatcatatataatccacataatgcatt |
40907221 |
T |
 |
| Q |
162 |
tacaaatat |
170 |
Q |
| |
|
||||||||| |
|
|
| T |
40907222 |
tacaaatat |
40907230 |
T |
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Target: chr4; HSP #29
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Target Start/End: Original strand, 33742294 - 33742401
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21 |
acatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatc |
120 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33742294 |
acatcttccacataagacata--aatatttcacataaccaacaacagcaacataggagacacataaacatctcaggatataacaatatcaaatgataatc |
33742391 |
T |
 |
| Q |
121 |
aacaacaact |
130 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
33742392 |
aacaacaact |
33742401 |
T |
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Target: chr4; HSP #30
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Target Start/End: Complemental strand, 14852924 - 14852804
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| Q |
84 |
taaacatctcaagatataacaatatcaaatgataat-caacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattacta |
182 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
14852924 |
taaacatctcaagatataacaatatcaaataatatttcaacatcaacttaaacatcttatataattcacataatgcatatgcaaatatatcacattacta |
14852825 |
T |
 |
| Q |
183 |
tcaacactaaatcatattata |
203 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
14852824 |
acaacctcaaatcatattata |
14852804 |
T |
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Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
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Target Start/End: Original strand, 19857537 - 19857634
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| Q |
27 |
tccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaaca |
124 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
19857537 |
tccacataaggcttatgaacatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacttaaacacctcaagatataacaacatcaaataataatcaaca |
19857634 |
T |
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Target Start/End: Complemental strand, 15497149 - 15497043
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| Q |
18 |
catacatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgata |
117 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| |
|
|
| T |
15497149 |
catacattttccacataagacatataattatttcacataaccaacaacatcaacataggcagcacttaaacacctcaagatataacaacatcaaataata |
15497050 |
T |
 |
| Q |
118 |
atcaaca |
124 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
|
| T |
15497049 |
atcaaca |
15497043 |
T |
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acaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaa-caacaacttaaacatcatatataattcacataatgca |
159 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| || ||| ||||||||| |||||||| |||| |||||| |||||||| || |||||||| |||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15042033 |
acaacaacaacatatgcagcacataaacatcttaagatatatcaatgtcaaataataatcaatcatcaacttaatcatcttatataattcacataatgca |
15041934 |
T |
 |
| Q |
160 |
tatacaaatatattacattactatcaacactaaatcatatt |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||| |
|
|
| T |
15041933 |
tatacaaatatatcacattactaagaacatcaaatcatatt |
15041893 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 61 - 200
Target Start/End: Original strand, 15112391 - 15112531
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| Q |
61 |
acaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaa-caacaacttaaacatcatatataattcacataatgca |
159 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| || ||| ||||||||| |||||||| |||| |||||| |||||||| || |||||||| |||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15112391 |
acaacaacaacatatgcagcacataaacatcttaagatatatcaatgtcaaataataatcaatcatcaacttaatcatcttatataattcacataatgca |
15112490 |
T |
 |
| Q |
160 |
tatacaaatatattacattactatcaacactaaatcatatt |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||| |
|
|
| T |
15112491 |
tatacaaatatatcacattactaaaaacatcaaatcatatt |
15112531 |
T |
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Target: chr4; HSP #35
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Query Start/End: Original strand, 87 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 4831580 - 4831496
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| Q |
87 |
acatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataatt-cacataatgcatatacaaatata |
171 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| |
|
|
| T |
4831580 |
acatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaac-acaacttaaacatcatatataattccacataatgcatttgcaaatata |
4831496 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 87 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 4834875 - 4834791
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| Q |
87 |
acatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataatt-cacataatgcatatacaaatata |
171 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| |
|
|
| T |
4834875 |
acatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaac-acaacttaaacatcatatataattccacataatgcatttgcaaatata |
4834791 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 87 - 171
Target Start/End: Original strand, 14047715 - 14047799
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| Q |
87 |
acatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataatt-cacataatgcatatacaaatata |
171 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
14047715 |
acatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaac-acaacttaaacatcatatataattccacataatgcatttacgaatata |
14047799 |
T |
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Back To:
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Target: chr4; HSP #38
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Target Start/End: Original strand, 30146453 - 30146546
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78 |
aacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataatt-cacataatgcatatacaaatata |
171 |
Q |
| |
|
||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| | |||||||| |
|
|
| T |
30146453 |
aacacatagacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaac-acaacttaaacatcatatataattccacttaatgcatttgcaaatata |
30146546 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #39
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| Q |
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gatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacat-catatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaat |
194 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||| |||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||| | ||||| |||| |
|
|
| T |
52243230 |
gatataacaatatcaaatgaaattcaacaacatctcaaacattcatatataatccaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaat |
52243131 |
T |
 |
| Q |
195 |
catattataatagcttcacagatcatcagtaatat |
229 |
Q |
| |
|
||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
52243130 |
catcttataacagcttcacagatcatcattaatat |
52243096 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #40
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34 |
aaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaaca |
124 |
Q |
| |
|
||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
52873240 |
aaggcatatgaacatttcacataaccaacaacagcaacatagccaacacttaaacacctcaaggtataacaacatcaaataataatcaaca |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #41
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acaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgc |
158 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
26045364 |
acaacagcaaaataggcagcacaaaaacatctcaagatataacaatatcaaatgaaaatcaacaac-acttaaacatcttatataatccacataatgc |
26045268 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #42
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95 |
agatataacaatatcaaatgataat-caacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaa |
193 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| || ||||| ||| |
|
|
| T |
15791857 |
agatataacaatatcaaaggataattcaacatcaacttaaacatcttgtataattcacataatgcatatacaactatatcacattattaacaacatcaaa |
15791956 |
T |
 |
| Q |
194 |
tcat |
197 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
15791957 |
tcat |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #43
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acaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatc |
138 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
14185029 |
acaacagcaacataggcaacacataaacgtctcaagatataacatcatcaaatgataatcaacatcaacttaaacatc |
14185106 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #44
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18 |
catacatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatag |
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Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43256272 |
catacattttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatag |
43256215 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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115 |
ataatcaacaacaacttaaacatcatatat-aattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaaca |
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Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| |
|
|
| T |
26789441 |
ataatcaacatcaacttaaacatcttatattaattcacataatgcatatacaaatatatcacattattaacaaca |
26789515 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #46
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Query Start/End: Original strand, 96 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 46640490 - 46640388
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96 |
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195 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||| |||| || || |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| | || ||||| ||||| |
|
|
| T |
46640490 |
gatataacaatatcaaatgaaaatcaataacatctcaa-catcatatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacatcattaacaacatcaaatc |
46640392 |
T |
 |
| Q |
196 |
atat |
199 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
46640391 |
atat |
46640388 |
T |
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Target: chr4; HSP #47
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| Q |
96 |
gatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaatc |
195 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| | |||||| |||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| || ||||| ||||| |
|
|
| T |
53082186 |
gatataacaatatcaaagca-aatcaataacatctcaaacatcatatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatc |
53082088 |
T |
 |
| Q |
196 |
atat |
199 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
53082087 |
atat |
53082084 |
T |
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Target: chr4; HSP #48
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| Q |
96 |
gatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaaca-tcatatataattcacataatgcatatacaaatatat |
172 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
15464967 |
gatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacattcatatataattcaagtattgcatatacaattatat |
15464890 |
T |
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Target: chr4; HSP #49
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| Q |
115 |
ataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaaca |
188 |
Q |
| |
|
|||| ||| |||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
19738351 |
ataaacaataacaacttcaacatcatacatattccacataatgcatatataactatataacattactatcaaca |
19738424 |
T |
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Target: chr4; HSP #50
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18 |
catacatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaaca |
66 |
Q |
| |
|
||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15884171 |
catacatttttcacataaggcatataattatttcacataaccaacaaca |
15884123 |
T |
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Target: chr4; HSP #51
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| Q |
18 |
catacatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaaca |
66 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28385539 |
catacattttccacataaggcatatagttatttcacataaccaacaaca |
28385587 |
T |
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Target: chr4; HSP #52
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20 |
tacatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaa |
64 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40619828 |
tacattttccacataaggcatataattatttcacataaccaacaa |
40619872 |
T |
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Target: chr4; HSP #53
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| Q |
18 |
catacatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaaca |
66 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
10695003 |
catacattttccacataaggaatataattattttacataaccaacaaca |
10694955 |
T |
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Target: chr4; HSP #54
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| Q |
18 |
catacatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaaca |
66 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
10908769 |
catacattttccacataaggaatataattattttacataaccaacaaca |
10908721 |
T |
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Target: chr4; HSP #55
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| Q |
18 |
catacatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaaca |
66 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15008261 |
catacattttccacataagatatataattatttcacataaccaacaaca |
15008309 |
T |
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Target: chr4; HSP #56
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| Q |
96 |
gatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaatc |
195 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||| | |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||| | ||||| |||||| |
|
|
| T |
12288244 |
gatataacaatatcaaatgcaattcaacaacatc-acaacatcaaacataattcatgtaatgtatatacaactatataacattaccaacaacattaaatc |
12288146 |
T |
 |
| Q |
196 |
atat |
199 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
12288145 |
atat |
12288142 |
T |
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Target: chr4; HSP #57
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Query Start/End: Original strand, 89 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 49547781 - 49547746
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| Q |
89 |
atctcaagatataacaatatcaaatgataatcaaca |
124 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
49547781 |
atctcaagatataacaacatcaaatgataatcaaca |
49547746 |
T |
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Target: chr4; HSP #58
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| Q |
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atataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaatcatattataatagcttcacagatcatcagtaatattatat |
234 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| || || ||||| |||||||| || | || |||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
22353964 |
atataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaata-taacaacaataaatcatcataaatcagtttcacagatcatcattaatattatat |
22354056 |
T |
 |
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Target: chr4; HSP #59
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| Q |
115 |
ataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaaca |
188 |
Q |
| |
|
|||| ||| |||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||| || | ||| ||||||||| ||||| |
|
|
| T |
27996016 |
ataaacaataacaacttcaacatcatacatattccacataatgcatatataattgtatcacattactaacaaca |
27996089 |
T |
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Target: chr4; HSP #60
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Target Start/End: Complemental strand, 44928914 - 44928821
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| Q |
141 |
atataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaatcatattataatagcttcacagatcatcagtaatattatat |
234 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| || | ||||| ||||||| || | ||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
44928914 |
atataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataaacaacataaaatcatcataaatcagcttcacagatcatcattaatattatat |
44928821 |
T |
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Target: chr4; HSP #61
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Target Start/End: Complemental strand, 13887 - 13803
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96 |
gatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacat-catatataattcacataatgcatatacaaatatattacatta |
179 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| | ||| ||||| || ||| || ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||| |
|
|
| T |
13887 |
gatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatctcaaatattcatatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacatta |
13803 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #62
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| Q |
26 |
ttccacataaggcatataaatatttcaca |
54 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14650838 |
ttccacataaggcatataaatatttcaca |
14650866 |
T |
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Target: chr4; HSP #63
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Target Start/End: Complemental strand, 15884198 - 15884146
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| Q |
111 |
aatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatata |
163 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
15884198 |
aatgaaaatcatcaacaacttaaacatcatacatttttcacataaggcatata |
15884146 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #64
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Query Start/End: Original strand, 87 - 163
Target Start/End: Original strand, 28385489 - 28385564
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| Q |
87 |
acatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatata |
163 |
Q |
| |
|
||||| ||| |||| |||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||| || | ||||||| ||||||| |
|
|
| T |
28385489 |
acatcccaaaatatgacaataccaaatgataatcaac-actacttaaacatcatacattttccacataaggcatata |
28385564 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0290 (Bit Score: 191; Significance: 1e-104; HSPs: 1)
Name: scaffold0290
Description:
Target: scaffold0290; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
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catacatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgata |
117 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
166 |
catacattttccacctaaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacataggcaacacgtaaacatatcaagatataacaacatcaaatgata |
265 |
T |
 |
| Q |
118 |
atcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaatcatattataatagcttcacagat |
217 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
266 |
atcaacatcaacttaaacatcttatataattcaaataatgcatatacaaatatattacattactatcaacattaaatcatattataacagcttcacagat |
365 |
T |
 |
| Q |
218 |
catcagtaatattatattcaacccacattcctaccccaa |
256 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
366 |
catcagtaatattatattcaacctccattcctaccccaa |
404 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1 (Bit Score: 183; Significance: 5e-99; HSPs: 56)
Name: chr1
Description:
Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
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Target Start/End: Complemental strand, 13881495 - 13881257
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| Q |
18 |
catacatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgata |
117 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
13881495 |
catacattttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacataggcatcacataaacatcttgagatataacaacatcaaatgata |
13881396 |
T |
 |
| Q |
118 |
atcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaatcatattataatagcttcacagat |
217 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
13881395 |
atcaacatcaacttaaacatcttatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacattaaatcatattataacagcttcacagat |
13881296 |
T |
 |
| Q |
218 |
catcagtaatattatattcaacccacattcctaccccaa |
256 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
13881295 |
catcagtaatgttatattcaacctccattcctaccccaa |
13881257 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 30 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 27653324 - 27653098
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| Q |
30 |
acataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaac |
129 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
27653324 |
acataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacataggcagcacttaaacatctcaagatataacaacatcaaatgataatcaacatcaac |
27653225 |
T |
 |
| Q |
130 |
ttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaatcatattataatagcttcacagatcatcagtaatat |
229 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27653224 |
ttaaacatcttatataattctcataatgcatatacaaatataatacattactatcaacattaaatcatattataactgcttctcagatcatcagtaatat |
27653125 |
T |
 |
| Q |
230 |
tatattcaacccacattcctaccccaa |
256 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
27653124 |
tatattcaacctccattcctaccccaa |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 18 - 200
Target Start/End: Original strand, 48603459 - 48603641
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| Q |
18 |
catacatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgata |
117 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48603459 |
catacatcttccacataaggcatataaatatttcacatagccaacaacagcaacataggcagcacgtaaacatctcaagatctaacaatatcaaatgata |
48603558 |
T |
 |
| Q |
118 |
atcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaatcatatt |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
48603559 |
atcaacaacaacttaaacatcttatataattcacataatgtatatacaaatatattacattaccatcaacatcaaatcatatt |
48603641 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #4
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Query Start/End: Original strand, 97 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 45574841 - 45574682
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97 |
atataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaatca |
196 |
Q |
| |
|
|||||| || ||||||| |||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
45574841 |
atataagaacatcaaatcataatcaacatcaactttaacatcttatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacattaaatca |
45574742 |
T |
 |
| Q |
197 |
tattataatagcttcacagatcatcagtaatattatattcaacccacattcctaccccaa |
256 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
45574741 |
tattataatagcttcacagatcatcagtaatattatattcaacccacattcctaccccaa |
45574682 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 26 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 41781694 - 41781534
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| Q |
26 |
ttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaa |
125 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41781694 |
ttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacaacaacataggcagcacataaacatttcaagatataacaacatcaaatgataatcaacaa |
41781595 |
T |
 |
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caacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaaca |
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| |
|
| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
41781594 |
c--cttaaacatcttatataattcacataatgcatatacaaatatattacattaccatcaaca |
41781534 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 107 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 22130854 - 22130706
Alignment:
| Q |
107 |
atcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaatcatattataata |
206 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||| || |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |
|
|
| T |
22130854 |
atcaaatcataatca-catcaactttaacatcttatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacattaaatcatattatagta |
22130756 |
T |
 |
| Q |
207 |
gcttcacagatcatcagtaatattatattcaacccacattcctaccccaa |
256 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
22130755 |
gcttcacagatcatcagtaatattatattcaacttccattcctaccccaa |
22130706 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 64 - 256
Target Start/End: Original strand, 22124338 - 22124530
Alignment:
| Q |
64 |
acagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatata |
163 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22124338 |
acagcaacataggcagcacataaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcttatataattcacataatgcatata |
22124437 |
T |
 |
| Q |
164 |
caaatatattacattactatcaacactaaatcatattataatagcttcacagatcatcagtaatattatattcaacccacattcctaccccaa |
256 |
Q |
| |
|
||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| || |||| || ||||| | || |||| |||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
22124438 |
caactatatcacattactaacaacatcaaatcatattatatcagactcactgaacatcaacagtactatagtcaaccttcattcctaccccaa |
22124530 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 18 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 1925324 - 1925212
Alignment:
| Q |
18 |
catacatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgata |
117 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1925324 |
catacatcttccacataagtcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacataggcgacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgata |
1925225 |
T |
 |
| Q |
118 |
atcaacaacaact |
130 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |
|
|
| T |
1925224 |
atcaacaacaact |
1925212 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 18 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 20924338 - 20924226
Alignment:
| Q |
18 |
catacatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgata |
117 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20924338 |
catacatcttccacataagtcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacataggcgacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgata |
20924239 |
T |
 |
| Q |
118 |
atcaacaacaact |
130 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |
|
|
| T |
20924238 |
atcaacaacaact |
20924226 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 61 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 52940947 - 52940753
Alignment:
| Q |
61 |
acaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcat |
160 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| || ||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
52940947 |
acaacaacaacataggcagcacataa-catctcaagatataacaataccaaataataatcaacatcaacttaaacatcttatataattcacataatgcat |
52940849 |
T |
 |
| Q |
161 |
atacaaatatattacattactatcaacactaaatcatattataatagcttcacagatcatcagtaatattatattcaacccacattcctaccccaa |
256 |
Q |
| |
|
|||||| || || ||||||||| ||||| ||||||||||||| || |||| || |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
52940848 |
atacaactacatcacattactaacaacatcaaatcatattatatcagagtcactgaacatcagtaatattataatcaaccttcattcctaccccaa |
52940753 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 21 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 20229001 - 20228892
Alignment:
| Q |
21 |
acatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatc |
120 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20229001 |
acatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacataggcgacacataaacatctcaggatataacaatatcaaatgataatc |
20228902 |
T |
 |
| Q |
121 |
aacaacaact |
130 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
20228901 |
aacaacaact |
20228892 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 21 - 130
Target Start/End: Original strand, 21407269 - 21407378
Alignment:
| Q |
21 |
acatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatc |
120 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21407269 |
acatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacataggcgacacataaacatctcaggatataacaatatcaaatgataatc |
21407368 |
T |
 |
| Q |
121 |
aacaacaact |
130 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
21407369 |
aacaacaact |
21407378 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 61 - 203
Target Start/End: Original strand, 20958158 - 20958300
Alignment:
| Q |
61 |
acaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcat |
160 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
20958158 |
acaacagcaacataggcagcacataaacatctcaagatatgacaatatcaaatgataatcaacatcaacttaaacatcttatataatccacataatgcat |
20958257 |
T |
 |
| Q |
161 |
atacaaatatattacattactatcaacactaaatcatattata |
203 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| ||||||||| ||||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
20958258 |
atacaactatatcacattactaacaacatcaaaacatattata |
20958300 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 21 - 130
Target Start/End: Original strand, 1010637 - 1010746
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| Q |
21 |
acatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatc |
120 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1010637 |
acatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacaacaacataggcgacacataaacatctcaggatataacaatatcaaatgataatc |
1010736 |
T |
 |
| Q |
121 |
aacaacaact |
130 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
1010737 |
aacaacaact |
1010746 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 96 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 21533908 - 21533752
Alignment:
| Q |
96 |
gatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaatc |
195 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| |
|
|
| T |
21533908 |
gatataacaatatcaaataataatcaacaaca-cttaaacatcttatataatccacataatgcatatacaaatatatcacatttctatcaacattaaatc |
21533810 |
T |
 |
| Q |
196 |
atattataatagcttcacagatcatcagtaatattatattcaacccacattcctaccc |
253 |
Q |
| |
|
|| | |||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
21533809 |
atgtaataataaattcacagaacattagtaatattataatcaacctccattcctaccc |
21533752 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 19 - 179
Target Start/End: Original strand, 48520519 - 48520679
Alignment:
| Q |
19 |
atacatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataa |
118 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || | |||||||| ||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
48520519 |
atacattttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacagcagcaacataggtagaacatgaacatctc-agatataacaatatcaaataataa |
48520617 |
T |
 |
| Q |
119 |
tcaacaacaactt-aaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacatta |
179 |
Q |
| |
|
||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |
|
|
| T |
48520618 |
acaacatcaacttaaaacatcttatataattcacataatgcatatacaactatatcacatta |
48520679 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 61 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 21043352 - 21043157
Alignment:
| Q |
61 |
acaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcat |
160 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
21043352 |
acaacaacaacataggcagcacataaacatctcaagatataacaatatcaaatgataataaaaatcaacttaaacatcttatataatccacataatgcat |
21043253 |
T |
 |
| Q |
161 |
atacaaatatattacattactatcaacactaaatcatattataatagcttcacagatcatcagtaatattatattcaacccacattcctaccccaa |
256 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| || |||| || ||||| | || |||| |||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
21043252 |
atacaaatatatctcattactaacaacatcaaatcatattatatcagactcactgaacatcaacagtactataatcaacctccattcctaccccaa |
21043157 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 61 - 203
Target Start/End: Original strand, 28312564 - 28312706
Alignment:
| Q |
61 |
acaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcat |
160 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| ||||||||| || |
|
|
| T |
28312564 |
acaacatcaacatagacagcacataaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacatcaacttaaacatcttataaaatccacataatgtat |
28312663 |
T |
 |
| Q |
161 |
atacaaatatattacattactatcaacactaaatcatattata |
203 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
28312664 |
atacaaatatatctcattactaaaaacatcaaatcatattata |
28312706 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 21 - 130
Target Start/End: Original strand, 52639455 - 52639564
Alignment:
| Q |
21 |
acatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatc |
120 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
52639455 |
acatcttccacataaggcgtataaatatttcacataaccaacaacagcaacataggcgacacataaacatctcaggatataacaatatcgaatgataatc |
52639554 |
T |
 |
| Q |
121 |
aacaacaact |
130 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
52639555 |
aacaacaact |
52639564 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 61 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 20438064 - 20437921
Alignment:
| Q |
61 |
acaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaactt-aaacatcatatataattcacataatgca |
159 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
20438064 |
acaacagcaacataggcagcacataaacacctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacatcaacttaaaacatcttatataatccacataatgca |
20437965 |
T |
 |
| Q |
160 |
tatacaaatatattacattactatcaacactaaatcatattata |
203 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||| |
|
|
| T |
20437964 |
tatacaaatatatctcattactaacagcatcaaatcatattata |
20437921 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 21 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 16375651 - 16375541
Alignment:
| Q |
21 |
acatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaata-tcaaatgataat |
119 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
16375651 |
acatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacaacaacataggcgacacataaacatctcaggatataacaatattcaaatgataat |
16375552 |
T |
 |
| Q |
120 |
caacaacaact |
130 |
Q |
| |
|
||||||||||| |
|
|
| T |
16375551 |
caacaacaact |
16375541 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 18 - 124
Target Start/End: Original strand, 51326799 - 51326905
Alignment:
| Q |
18 |
catacatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgata |
117 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |
|
|
| T |
51326799 |
catacattttccacataaggcatataaacatttcacataaccaacaacagcaacatagacagcacctaaacatctcaagatataacaacatcaaataata |
51326898 |
T |
 |
| Q |
118 |
atcaaca |
124 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
|
| T |
51326899 |
atcaaca |
51326905 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 18 - 114
Target Start/End: Original strand, 12271561 - 12271657
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| Q |
18 |
catacatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatg |
114 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12271561 |
catacattttccacataaggcatatgaacatttcacataaccaacaacagcaacataggcagcacttaaacatctcaagatataacaatatcaaatg |
12271657 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 54 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 23819457 - 23819381
Alignment:
| Q |
54 |
ataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaact |
130 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23819457 |
ataaccaacaacagcaacataggcgacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaact |
23819381 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 65 - 172
Target Start/End: Original strand, 14800583 - 14800690
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| Q |
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cagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatac |
164 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
14800583 |
cagcaacatatgcagcacataaacatatcaagatataacaatatcaaataataatcaacatcaacttaaacatcttatataatccacataatgcatatac |
14800682 |
T |
 |
| Q |
165 |
aaatatat |
172 |
Q |
| |
|
|| ||||| |
|
|
| T |
14800683 |
aactatat |
14800690 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 65 - 172
Target Start/End: Original strand, 14809457 - 14809564
Alignment:
| Q |
65 |
cagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatac |
164 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
14809457 |
cagcaacatatgcagcacataaacatatcaagatataacaatatcaaataataatcaacatcaacttaaacatcttatataatccacataatgcatatac |
14809556 |
T |
 |
| Q |
165 |
aaatatat |
172 |
Q |
| |
|
|| ||||| |
|
|
| T |
14809557 |
aactatat |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 27 - 124
Target Start/End: Original strand, 43543144 - 43543241
Alignment:
| Q |
27 |
tccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaaca |
124 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
43543144 |
tccacataaggcatatgaacatttcacataaccaacaacagcaacataggcagcacttaaacacctcaagatataacaacatcaaataataatcaaca |
43543241 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 59 - 155
Target Start/End: Original strand, 16372045 - 16372141
Alignment:
| Q |
59 |
caacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataa |
155 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| ||||||| |
|
|
| T |
16372045 |
caacaacggcaacataggcagcacataaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaatatcaacttaaacatcttatataatccacataa |
16372141 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 87 - 171
Target Start/End: Original strand, 32649787 - 32649871
Alignment:
| Q |
87 |
acatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataatt-cacataatgcatatacaaatata |
171 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| |
|
|
| T |
32649787 |
acatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaac-acaacttaaacatcatatataattccacataatgcatttgcaaatata |
32649871 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 85 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 16093930 - 16093777
Alignment:
| Q |
85 |
aaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaa-caacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactat |
183 |
Q |
| |
|
||||| |||| |||||||||||||||| || |||||| ||||| || |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| || |
|
|
| T |
16093930 |
aaacagctcatgatataacaatatcaa-tgcaaatcaaacaacatctcaaacatcataggtaattcatgtaatgtatatacaaatatatcacattaaaat |
16093832 |
T |
 |
| Q |
184 |
caacactaaatcatattataatagcttcacagatcatcagtaatattatattcaa |
238 |
Q |
| |
|
||||| | |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |
|
|
| T |
16093831 |
caacattcaatcatcttataacagcttcacagatcatcactaacattatattcaa |
16093777 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 179 - 256
Target Start/End: Original strand, 20345972 - 20346049
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| Q |
179 |
actatcaacactaaatcatattataatagcttcacagatcatcagtaatattatattcaacccacattcctaccccaa |
256 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
20345972 |
actatcaacattaaatcatattataacagcttcaaagatcatcagtaatattatattcaacctccattcctaccccaa |
20346049 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 61 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 636053 - 635914
Alignment:
| Q |
61 |
acaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaa-caacaacttaaacatcatatataattcacataatgca |
159 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| || ||| |||| || ||||||||||||||| |||||| ||| |||| || |||||||| ||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
636053 |
acaacagcaacataggcagcacataaatatttcaagatataacaatgtcaaataatattcaatcatcaacttaagcattttatataattcacataatgca |
635954 |
T |
 |
| Q |
160 |
tatacaaatatattacattactatcaacactaaatcatatt |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||| ||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
635953 |
tatacaaata-atcacattgctaacaacatcaaatcatatt |
635914 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 18 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 22131020 - 22130963
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| Q |
18 |
catacatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatag |
75 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22131020 |
catacattttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatag |
22130963 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 18 - 74
Target Start/End: Original strand, 33797528 - 33797584
Alignment:
| Q |
18 |
catacatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacata |
74 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33797528 |
catacattttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacata |
33797584 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 95 - 197
Target Start/End: Original strand, 47190684 - 47190787
Alignment:
| Q |
95 |
agatataacaatatcaaat-gataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaa |
193 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| ||| |
|
|
| T |
47190684 |
agatataacaatatcaaagaggaaatcaacatcaacttaaacatcttatataatttacataatgcatatacaactatatcacattactaacaacatcaaa |
47190783 |
T |
 |
| Q |
194 |
tcat |
197 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
47190784 |
tcat |
47190787 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 87 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 2333019 - 2332946
Alignment:
| Q |
87 |
acatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataa-ttcacataatgcat |
160 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| |
|
|
| T |
2333019 |
acatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaac-acaacttaaacatcctatataagtccacataatgcat |
2332946 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 63 - 172
Target Start/End: Original strand, 16381233 - 16381346
Alignment:
| Q |
63 |
aacagcaacatagacaacacgtaaa-catctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaac--ttaaacatcatatataattcacat-aatgc |
158 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| ||| |||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| | |||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
16381233 |
aacagcagcatagacatcacataaaacaactcatgatataacaatatcaaatgataatcaacatcaacatttaaacatattgtataattcacatcaatgc |
16381332 |
T |
 |
| Q |
159 |
atatacaaatatat |
172 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |
|
|
| T |
16381333 |
atatacaaatatat |
16381346 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 87 - 160
Target Start/End: Original strand, 29534624 - 29534697
Alignment:
| Q |
87 |
acatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataatt-cacataatgcat |
160 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |
|
|
| T |
29534624 |
acatctcaagatataacgatatcaaatgataatcaac-acaacttaaacatcatataaaattccacataatgcat |
29534697 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 137 - 229
Target Start/End: Original strand, 16758777 - 16758869
Alignment:
| Q |
137 |
tcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaatcatattataatagcttcacagatcatcagtaatat |
229 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| | ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
16758777 |
tcatatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacaacaaatcatattataacagcttcacagatcatcattaatat |
16758869 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 96 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 41050070 - 41049988
Alignment:
| Q |
96 |
gatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacatta |
179 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
41050070 |
gatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaa-catcatatataattcaagtaatgcatatacaaatatatcacatta |
41049988 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 96 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 50614151 - 50614048
Alignment:
| Q |
96 |
gatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaatc |
195 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||| | ||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| ||||| |
|
|
| T |
50614151 |
gatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacatcttttataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattaatatcaacatcaaatc |
50614052 |
T |
 |
| Q |
196 |
atat |
199 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
50614051 |
atat |
50614048 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 96 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 50621979 - 50621876
Alignment:
| Q |
96 |
gatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaatc |
195 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||| | ||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| ||||| |
|
|
| T |
50621979 |
gatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacatcttttataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattaatatcaacatcaaatc |
50621880 |
T |
 |
| Q |
196 |
atat |
199 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
50621879 |
atat |
50621876 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 119 - 181
Target Start/End: Original strand, 11945564 - 11945626
Alignment:
| Q |
119 |
tcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattact |
181 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11945564 |
tcaacagcaacttaaacatcttatataattcacagaatgtatatacaaatatattacattact |
11945626 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 120 - 183
Target Start/End: Original strand, 20329118 - 20329182
Alignment:
| Q |
120 |
caacaacaacttaaa-catcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactat |
183 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20329118 |
caacatcaacttaaaacatcttatataattaacataatgcatatacaaatatattacattactat |
20329182 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 96 - 188
Target Start/End: Original strand, 50686698 - 50686790
Alignment:
| Q |
96 |
gatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaaca |
188 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| || ||||| |
|
|
| T |
50686698 |
gatataacaatgtcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacatcatatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaaca |
50686790 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 96 - 256
Target Start/End: Original strand, 26065025 - 26065184
Alignment:
| Q |
96 |
gatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaatc |
195 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||| || ||||||||||| || ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| || ||| ||||| |
|
|
| T |
26065025 |
gatataacaataccaa-tgcaaatcaacaacatctcaaagatcatatataattcaagtaatacatatacaaatatatcacattattaatgacatcaaatc |
26065123 |
T |
 |
| Q |
196 |
atattataatagcttcacagatcatcagtaatattatattcaacccacattcctaccccaa |
256 |
Q |
| |
|
| |||||| | |||||||||| |||| ||| || |||| |||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
26065124 |
ctcttataacaacttcacagattatcattaacatcatatacaacatccattcctaccccaa |
26065184 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 18 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 29764394 - 29764346
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| Q |
18 |
catacatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaaca |
66 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29764394 |
catacattttccacataaggcatataattatttcacataaccaacaaca |
29764346 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 18 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 46198481 - 46198433
Alignment:
| Q |
18 |
catacatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaaca |
66 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
46198481 |
catacattttccacataaggcatataattatttcacataaccaacaaca |
46198433 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 18 - 66
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| Q |
18 |
catacatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaaca |
66 |
Q |
| |
|
||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
50000769 |
catacatttttcacataaggcatataattatttcacataaccaacaaca |
50000817 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 60 - 136
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| Q |
60 |
aacaacagcaacatagacaacacgtaaa-catctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaaca |
136 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| || ||| |||| || |||| | |||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| |
|
|
| T |
20454625 |
aacaacagcaacataggcagcacataaaacagctcatggtataacaatatcaaatgacaatcaacatcaacttcaaca |
20454548 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #51
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Target Start/End: Complemental strand, 21861606 - 21861522
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| Q |
96 |
gatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacat-catatataattcacataatgcatatacaaatatattacatta |
179 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| | ||| ||||| || |||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||| |
|
|
| T |
21861606 |
gatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatctcaaacattcatatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacatta |
21861522 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 21896292 - 21896208
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| Q |
96 |
gatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacat-catatataattcacataatgcatatacaaatatattacatta |
179 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| | ||| ||||| || |||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||| |
|
|
| T |
21896292 |
gatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatctcaaacattcatatataattcatgtaatgtatatacaattatatcacatta |
21896208 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #53
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Target Start/End: Complemental strand, 35261114 - 35260956
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| Q |
96 |
gatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacat-catatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaat |
194 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||| | | |||||| |||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||| || ||||| |||| |
|
|
| T |
35261114 |
gatataacaatatcaaatgcaaatcaacatc---tcaaacattcatacataattcaagtaatgcatatacaattacatcacattattaacaacatcaaat |
35261018 |
T |
 |
| Q |
195 |
catattataatagcttcacagatcatcagtaatattatattcaacccacattcctaccccaa |
256 |
Q |
| |
|
||| |||||| | ||||||| || ||| |||||| |||| ||| | |||| ||||||||| |
|
|
| T |
35261017 |
catcttataacaacttcacatattatcgttaatatcatatacaatctccattactaccccaa |
35260956 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #54
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| Q |
87 |
acatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcat |
160 |
Q |
| |
|
||||| ||| |||| |||||| ||||||||| |||||| | |||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |
|
|
| T |
20031698 |
acatcccaaaatatgacaataccaaatgatagtcaaca-ctacttaaacatcatacataatccacataaggcat |
20031626 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #55
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Target Start/End: Complemental strand, 22921905 - 22921801
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96 |
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195 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| ||||||||||| || ||| |||| | | |||||| |||||| |||||||| ||||| |||||| | ||||| || ||| |
|
|
| T |
22921905 |
gatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatca-acaaaattcatataatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagatc |
22921807 |
T |
 |
| Q |
196 |
atatta |
201 |
Q |
| |
|
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|
|
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22921806 |
atatta |
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T |
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aatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatata |
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Q |
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aatgaaaatcatcaacaacttaaacatcatacatttttcacataaggcatata |
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T |
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Target: scaffold0020; HSP #1
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Q |
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|
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catacattttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacataggcagcacgtaaacatctcaagatataacaacatcaaatgata |
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T |
 |
| Q |
118 |
atcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaatcatattataatagcttcacagat |
217 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||| ||||| |||||| |
|
|
| T |
169763 |
atcaacatcaacttaaacatcttatataattcacataatgcatatacaaatatattacattattataaatattaaatcatattataacagctttacagat |
169664 |
T |
 |
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218 |
catcagtaatattatattcaacccacattcctaccccaa |
256 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |
|
|
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catcagtaatattatattcaaccttcattcctatcccaa |
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T |
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159 |
Q |
| |
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||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || |||||||| |||| |||||||||||||||||||| |
|
|
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acaacagcaacataggcagcacataaacatctcaagatataacaatgtcaaataataatcaatcatcaacttaagcatcttatataattcacataatgca |
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T |
 |
| Q |
160 |
tatacaaatatattacattactatcaacactaaatcatatt |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
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142731 |
tatacaaatatatcacattactaacaacatcaaatcatatt |
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T |
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Target: scaffold0125; HSP #1
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Q |
| |
|
||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
1988 |
catacattttccacataagacatataaatatttcacataaccaataacagcaacaaaggcagcacgtaaacatctcaagatataacatcatcaaatgata |
1889 |
T |
 |
| Q |
118 |
atcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaatcatattataatagcttcacagat |
217 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||| |
|
|
| T |
1888 |
atcaacatcaacttaaacatcttatatgattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacattaaatcatattataacattttcacagat |
1789 |
T |
 |
| Q |
218 |
catcagtaatattatattcaacccacattcctaccccaa |
256 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
1788 |
catcagtaatattatattcaacctccattcctaccccaa |
1750 |
T |
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Target: scaffold0107 (Bit Score: 171; Significance: 7e-92; HSPs: 3)
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Target: scaffold0107; HSP #1
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Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
10198 |
catacattttccacataaggcatataaacatttcacataaccaatagcagaaacataggcagcacgtaaacatctcaagatataacaacatcaaatgata |
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T |
 |
| Q |
118 |
atcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaatcatattataatagcttcacagat |
217 |
Q |
| |
|
||||||| || |||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
10098 |
atcaacatcatcttaaacatcttatataattcacagaatgtatatacaaatatattacattactatcaacattaaatcatattataacagcttcacagat |
9999 |
T |
 |
| Q |
218 |
catcagtaatattatattcaacccacattcctaccccaa |
256 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
9998 |
catcagtaatattatattcaacctccattcctaccccaa |
9960 |
T |
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Target: scaffold0107; HSP #2
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160 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
36230 |
acaacaacaacataggcagcacataaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacgacaacttaaacatcttatataatccacataatgcat |
36329 |
T |
 |
| Q |
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atacaaatatattacattactatcaacactaaatcatattataatagcttcacagatcatcagtaatattatattcaacccacattcctac |
251 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| ||| |||| || ||||| || ||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
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atacaactatatcacattactaacaacatcaaatcatattatattagactcactgaacatcaatagtattataatcaacctccattcctac |
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T |
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Target: scaffold0107; HSP #3
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Q |
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|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
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15528 |
catacattttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacatcaacatag |
15471 |
T |
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Target: scaffold0076; HSP #1
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Q |
| |
|
||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
24711 |
catacattttccagataaggcatataaatatttcacataaccatcaacatcaacataggcaacacttaaacatttcaagatataacaacatcaaatgata |
24612 |
T |
 |
| Q |
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atcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaatcatattataatagcttcacagat |
217 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| |
|
|
| T |
24611 |
atcaacatcaacttaaacatcttatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacattaaatcatattataacagctttgcagat |
24512 |
T |
 |
| Q |
218 |
catcagtaatattatattcaacccacattcctaccccaa |
256 |
Q |
| |
|
||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
24511 |
catcattaatatcatattcaacctccattcctaccccaa |
24473 |
T |
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Target: scaffold0780 (Bit Score: 155; Significance: 3e-82; HSPs: 1)
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Target: scaffold0780; HSP #1
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Q |
| |
|
||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||| |||| | ||||||||| || |||||||| |
|
|
| T |
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catacattttccacataattcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacataggcagcacttaaatatcttattatataacaacattaaatgata |
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T |
 |
| Q |
118 |
atcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaatcatattataatagcttcacagat |
217 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
3341 |
atcaacattaacttaaacatcttatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacattaaatgatattataacagcttcacagat |
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T |
 |
| Q |
218 |
catcagtaatattatattcaacccacattcctaccccaa |
256 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |
|
|
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3241 |
catcagtaatatcatattcaacctccattcctaccccaa |
3203 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0011 (Bit Score: 155; Significance: 3e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
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Target: scaffold0011; HSP #1
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Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
125962 |
catacattttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacataggcagcacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgata |
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T |
 |
| Q |
118 |
atcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaatcatatt |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
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atcaacaacaacttaaacatcttatataattcacataatgcatatacaaatatattacattaccatcaacatcaaatcatatt |
126144 |
T |
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Target: scaffold0156 (Bit Score: 154; Significance: 1e-81; HSPs: 1)
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Target: scaffold0156; HSP #1
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Q |
| |
|
||||||| ||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
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catacattttccacataagacatataatatttttcacataaccaacaacagcaacataggtaacacgtaaacatctcaagatataacaacatcaaatgat |
15847 |
T |
 |
| Q |
117 |
aatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaatcatattataatagcttcacaga |
216 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
15848 |
aatcaacatcaacttaaacatcttatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacatta---tatgttataacagcttcacaga |
15944 |
T |
 |
| Q |
217 |
tcatcagtaatattatattcaacccacattcctaccccaa |
256 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
15945 |
tcatcaccaatattatattcaacctccattcctaccccaa |
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T |
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Back To:
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Target: scaffold0484 (Bit Score: 151; Significance: 6e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0484
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Target: scaffold0484; HSP #1
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
859 |
catacatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacagcacataaacatctcaagatataacaatatcaaatgata |
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T |
 |
| Q |
118 |
atcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaatcatatt |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
959 |
atcaacaacaacttaaacatcttatataattcacataatacatatataaatatattacattaccatcaacatcaaatcatatt |
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T |
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Target: chr5; HSP #1
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catacatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgata |
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Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |
|
|
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catacattttccacataaggcatataaacatttcacacaaccaacaacagcaacataggcggcacttaaacatctcaagatataacaacatcaaataata |
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T |
 |
| Q |
118 |
atcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaatcatattataatagcttcacagat |
217 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
6765935 |
atcaacatcaacttaagcatcttatataattcacataatgcatatacaaatataatacattactatcaacattaaatcata-tataacagcttcacagat |
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T |
 |
| Q |
218 |
catcagtaatattatattcaacccacattcctaccccaa |
256 |
Q |
| |
|
|| ||| |||||||||||| ||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
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caacagcaatattatattccacctccattcctaccccaa |
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Q |
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|
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
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acgtaaacatctcaagatataacaacatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcttatataattcacataatgcatatacaaatatattacattac |
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T |
 |
| Q |
181 |
tatcaacactaaatcatattataatagcttcacagatcatcagtaatattatattcaacccacattcctaccccaa |
256 |
Q |
| |
|
|| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
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tacgaacattaaatcatattataatagcttcacagatcatcagtaatattatattcaacctccattcctaccccaa |
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T |
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Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
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22107449 |
T |
 |
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atcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaa |
186 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
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22107448 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
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 |
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atcaacaacaacttaaacatcata |
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| |
|
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|
|
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| |
|
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|
| T |
20911030 |
catacatcttccacataagacatataaatatttcacataaccaacaacagcaacataggcgacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgata |
20910931 |
T |
 |
| Q |
118 |
atcaacaacaacttaaacatcata |
141 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
20910930 |
atcaacaacaacttatacatcata |
20910907 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #6
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117 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
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33895759 |
catacattttccacataaggcatataaatatttcacaaaacccacaacagcaacataggcagcacgtaaacatctcaagatacaacaatatca------- |
33895667 |
T |
 |
| Q |
118 |
atcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaatcatatt |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
33895666 |
---aacaacaacttaaacatcttatataattcacataatgcatatacaaatatattacattaccatcaacatcaaatcatatt |
33895587 |
T |
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26 |
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124 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || | |||| || |||| ||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
29448018 |
ttccacataaggcatataattatttcacataaccaacaacagcaacataggcagtatataaaacagctcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaaca |
29448117 |
T |
 |
| Q |
125 |
acaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaatcatattataatagcttcacagatcatcagt |
224 |
Q |
| |
|
||| || |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || || ||| |||||||| |||||||||||||| | ||||||| ||||||| | |
|
|
| T |
29448118 |
acatctcaaacatcatacgtaattcatgtaatgcatatacaaatacatcaccttattatcaacatcaaatcatattataacaacttcacaaatcatcatt |
29448217 |
T |
 |
| Q |
225 |
aatattatattcaacccacattcctaccccaa |
256 |
Q |
| |
|
||||| |||||| || |||||||||||||| |
|
|
| T |
29448218 |
aatatagtattcatcctccattcctaccccaa |
29448249 |
T |
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Target: chr5; HSP #8
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18 |
catacatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgata |
117 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10753275 |
catacatcttccacataagtcatataaatatttcacataaccaacaatagcaacataggcaacatgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgata |
10753374 |
T |
 |
| Q |
118 |
atcaacaacaact |
130 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |
|
|
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atcaacaacaact |
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T |
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158 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
42960590 |
caacaacggcaacataggcaacacataaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaatatcaacttaaacatcttatataatccacataatgc |
42960689 |
T |
 |
| Q |
159 |
atatacaaatatattacattactatcaacactaaatcatattata |
203 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
42960690 |
atatacaaatatatctcattactaacaacatcaaatcatattata |
42960734 |
T |
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acatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatc |
120 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20295761 |
acatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacataggcgacacataaacatctcaggatataacaatatcaaatgataatc |
20295860 |
T |
 |
| Q |
121 |
aacaacaact |
130 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
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20295861 |
aacaacaact |
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T |
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183 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
25576902 |
taaacatctcaagatataacaatatcaa-taataatcaacatcaacttaaacatcttatataattcacatcatgcatatacaactatatcacattactat |
25576804 |
T |
 |
| Q |
184 |
caacactaaatcatattataatagcttcacagatcatcagtaatattatattcaacccacattcctaccccaa |
256 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||| || |||| || |||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
25576803 |
caacataaaatcatattatatcagactcactgaacatctgtaatattataatcaacctccattcctaccccaa |
25576731 |
T |
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60 |
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159 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| | ||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
26740717 |
aacaacagcaacatagacagtgcataaacatctaaggatataacaatatcaaataataatcaacaaca-cttaaacatcttatttaatccacataatgca |
26740619 |
T |
 |
| Q |
160 |
tatacaaatatattacattactatcaacactaaatcatattataatagcttcacagatcatcagtaatattatattcaacccacattcctaccccaa |
256 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| | |||| | |||||||| ||||||||| |||||| |||||| || ||||||||||| |
|
|
| T |
26740618 |
tatacaaatatatcacatttctatcaacattaaatcatgtaataacaaattcacagaacatcagtaacattataatcaacctccactcctaccccaa |
26740522 |
T |
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caacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgc |
158 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
37598955 |
caacaacggcaacataggcagcacataaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaatatcaacttaaacatcttatataatccacataatgc |
37598856 |
T |
 |
| Q |
159 |
atatacaaatatattacattactatcaacactaaatcatattata |
203 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
37598855 |
atatacaaatatatctcattactaacaacatcaaatcatattata |
37598811 |
T |
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Target: chr5; HSP #14
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catacatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgata |
117 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |
|
|
| T |
40723782 |
catacatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacaacaacataggcgacacgtaaacatctcaagatatatcaatattaaatgata |
40723683 |
T |
 |
| Q |
118 |
atcaacaacaact |
130 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |
|
|
| T |
40723682 |
atcaacaacaact |
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T |
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160 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
23469853 |
acaacagcaacataggcagcacataaacatctcaagatatacca-tatcaaatgataatcaacatcaacttaaacatcttatataatccacataatgcat |
23469951 |
T |
 |
| Q |
161 |
atacaaatatattacattactatcaacactaaatcatattataatagcttcacagatcatcagtaatattatattcaacccacattcctaccccaa |
256 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||| || ||||| | || |||| |||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
23469952 |
atacaactatatcacattactaacaacatcaaatcatattataacagactcactgaacatcaacattactataatcaacctccattcctaccccaa |
23470047 |
T |
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acatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatc |
120 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19472912 |
acatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacaacaacataggcgacacataaacatctcaggatataacaatatcaaatgataatc |
19472813 |
T |
 |
| Q |
121 |
aacaacaact |
130 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
19472812 |
aacaacaact |
19472803 |
T |
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159 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| || | ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
26732904 |
aacaacagcaacataggcagtgcataaacatctcaggatataacaatatcaaataataatcaacgaca-cttaaacatcttatttaatccacataatgca |
26732806 |
T |
 |
| Q |
160 |
tatacaaatatattacattactatcaacactaaatcatattataatagcttcacagatcatcagtaatattatattcaacccacattcctaccccaa |
256 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| | |||| | |||||||| ||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||||| |
|
|
| T |
26732805 |
tatacaaatatatcacatttctatcaacattaaatcatgtaataacatattcacagaacatcagtaacattataatcaacctccattcttaccccaa |
26732709 |
T |
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21 |
acatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatc |
120 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15237027 |
acatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacaacaacataggcgacacataaacatctcaggatataacaatatcaaatgataatc |
15236928 |
T |
 |
| Q |
121 |
aacaaca |
127 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
|
| T |
15236927 |
aacaaca |
15236921 |
T |
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Target: chr5; HSP #19
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caacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgc |
158 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
28371094 |
caacaacggcaacataggcagcacataaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaatatcaacttaaacatcttatataatccacataatgc |
28370995 |
T |
 |
| Q |
159 |
atatacaaatatattacattactatcaacactaaatcatattata |
203 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||| |
|
|
| T |
28370994 |
atatgcaaatatatctcattactaacaacatcagatcatattata |
28370950 |
T |
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183 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| || |||| | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
25574516 |
taaacatctcaagatataactatttcaa-taataatcaacatcaacttaaacatcttatataattcacataatgcatatacaactatatcacattactat |
25574418 |
T |
 |
| Q |
184 |
caacactaaatcatattataatagcttcacagatcatcagtaatattatattcaacccacattcctaccccaa |
256 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||| || |||| || |||| ||| ||||||| |||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
25574417 |
caacatcaaatcatattatatcagactcactgaacatctgtagtattataatcaacctctattcctaccccaa |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #21
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| Q |
84 |
taaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactat |
183 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| || |||| | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
25575709 |
taaacatctcaagatataactatttcaa-taataatcaacatcaacttaaacatcttatataattcacataatgcatatacaactatatcacattactat |
25575611 |
T |
 |
| Q |
184 |
caacactaaatcatattataatagcttcacagatcatcagtaatattatattcaacccacattcctaccccaa |
256 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||| || |||| || |||| ||| ||||||| |||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
25575610 |
caacatcaaatcatattatatcagactcactgaacatctgtagtattataatcaacctctattcctaccccaa |
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T |
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caacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataa |
155 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| ||||||| |
|
|
| T |
22336615 |
caacaacgacaacataggcagcacataaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaatatcaacttaaacatcttatataatccacataa |
22336711 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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caacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataa |
155 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| ||||||| |
|
|
| T |
22340153 |
caacaacgacaacataggcagcacataaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaatatcaacttaaacatcttatataatccacataa |
22340249 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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160 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| | ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |
|
|
| T |
10816453 |
caacagcatcataggtagcacatagacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaac-acaacttaaacatcatatataactccacataatgcat |
10816551 |
T |
 |
| Q |
161 |
atacaaatata |
171 |
Q |
| |
|
| |||||||| |
|
|
| T |
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ttgcaaatata |
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T |
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Q |
| |
|
||||||||||| || ||| |||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21328282 |
cagcaacataggcagcacaaaaacatattcagatatagcaatatcaaatgataatcaacatcaacttaaacatcttacataaatcacataatgcatatac |
21328183 |
T |
 |
| Q |
165 |
aaatatattacatta |
179 |
Q |
| |
|
|| ||||| |||||| |
|
|
| T |
21328182 |
aactatatcacatta |
21328168 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 87 - 171
Target Start/End: Original strand, 23538504 - 23538588
Alignment:
| Q |
87 |
acatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataatt-cacataatgcatatacaaatata |
171 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| |
|
|
| T |
23538504 |
acatctcaagatataacaatatcaaatcataatcaac-acaacttaaacatcatatataattccacataatgcattttcaaatata |
23538588 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 61 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 21809652 - 21809526
Alignment:
| Q |
61 |
acaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataat-caacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgca |
159 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| || || |||||||||||||||| ||||| | ||||| ||| | ||||| ||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| |
|
|
| T |
21809652 |
acaacagcaacataggcagaacataaacatctcaagatagaacaacaccaaataatatttcaacatcaacttaaacatcttatgtaaatcacataatgca |
21809553 |
T |
 |
| Q |
160 |
tatacaaatatattacattactatcaac |
187 |
Q |
| |
|
||||| ||||||| ||||||||| |||| |
|
|
| T |
21809552 |
tatac-aatatatcacattactaacaac |
21809526 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 61 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 21731532 - 21731406
Alignment:
| Q |
61 |
acaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataat-caacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgca |
159 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| || || |||||||||||||||| ||||| | ||||| ||| | ||||| ||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| |
|
|
| T |
21731532 |
acaacagcaacataggcagaacataaacatctcaagatagaacaacaccaaataatatttcaacatcaacttaaacatcttatgtaaatcacataatgca |
21731433 |
T |
 |
| Q |
160 |
tatacaaatatattacattactatcaac |
187 |
Q |
| |
|
||||| ||||||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
21731432 |
tatac-aatatatctcattactaacaac |
21731406 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 85 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 22178266 - 22178163
Alignment:
| Q |
85 |
aaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatc |
184 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| || | |
|
|
| T |
22178266 |
aaacagctcatgatatgacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacatcatatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaac |
22178167 |
T |
 |
| Q |
185 |
aaca |
188 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
22178166 |
aaca |
22178163 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 85 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 27988978 - 27988892
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| Q |
85 |
aaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaac--ttaaacatcatatataattcacat-aatgcatatacaaat |
168 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
27988978 |
aaacagctcatgatataacaatatcaaatgataatcaacatcaacatttaaacatcttgtataattcacatcaatgcatatacaaat |
27988892 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 68 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 15236925 - 15236863
Alignment:
| Q |
68 |
caacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaact |
130 |
Q |
| |
|
|||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15236925 |
caacataggcgacacataaacatctcaggatataacaatatcaaatgataatcaacaacaact |
15236863 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 94 - 155
Target Start/End: Original strand, 22750264 - 22750325
Alignment:
| Q |
94 |
aagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataa |
155 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| |
|
|
| T |
22750264 |
aagatataacaatatcaaatggtaatcaacatcaacttaaacatcttatataatccacataa |
22750325 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 63 - 197
Target Start/End: Original strand, 15796471 - 15796607
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| Q |
63 |
aacagcaacatagacaacacgtaaa-catctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaa-cttaaacatcatatataattcacataatgcat |
160 |
Q |
| |
|
||||||||||||| || ||| |||| || |||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||| |||| || || |
|
|
| T |
15796471 |
aacagcaacataggcagcacataaaacagctcatgatatagcaatatcaaatgataatcaacatcaatcttaaacatctcttataattcgcatactgtat |
15796570 |
T |
 |
| Q |
161 |
atacaaatatattacattactatcaacactaaatcat |
197 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| |||||| || ||||| ||||||| |
|
|
| T |
15796571 |
atacaattatatcacattattagcaacatcaaatcat |
15796607 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 18 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 20910910 - 20910851
Alignment:
| Q |
18 |
catacatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagaca |
78 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20910910 |
catacattttcca-ataaggcatataaatatttcacataatcaacaacagcaacatagaca |
20910851 |
T |
 |
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Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 229
Target Start/End: Original strand, 22144134 - 22144268
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| Q |
96 |
gatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacat-catatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaat |
194 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| | ||||| || | |
|
|
| T |
22144134 |
gatataacaatatcaattgcaaatcaacaacatctcaaacattcatatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattgtaaacaacatcaatt |
22144233 |
T |
 |
| Q |
195 |
catattataatagcttcacagatcatcagtaatat |
229 |
Q |
| |
|
||| |||||| | |||||||| |||||| |||||| |
|
|
| T |
22144234 |
catcttataacaacttcacaggtcatcattaatat |
22144268 |
T |
 |
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Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 94 - 155
Target Start/End: Original strand, 19511516 - 19511577
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| Q |
94 |
aagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataa |
155 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| |
|
|
| T |
19511516 |
aagatataacgatatcaaatggtaatcaacatcaacttaaacatcttatataatccacataa |
19511577 |
T |
 |
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Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 18 - 66
Target Start/End: Original strand, 17011021 - 17011069
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| Q |
18 |
catacatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaaca |
66 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17011021 |
catacattttccacataaggcatataattatttcacataaccaacaaca |
17011069 |
T |
 |
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Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 75
Target Start/End: Original strand, 18356323 - 18356379
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| Q |
18 |
catacatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatag |
75 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18356323 |
catacattttcca-ataaagcatataaatatttcagataaccaacaacagcaacatag |
18356379 |
T |
 |
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Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 26012071 - 26011990
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| Q |
96 |
gatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacat |
177 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| | |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||| |
|
|
| T |
26012071 |
gatataacaatatcaaatgtgaatcaacaacatctcaaacatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacat |
26011990 |
T |
 |
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Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
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| Q |
18 |
catacatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaaca |
66 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
263153 |
catacattttccacataaggcacataattatttcacataaccaacaaca |
263201 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 18 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 33473320 - 33473272
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| Q |
18 |
catacatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaaca |
66 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33473320 |
catacattttccacataaggcatatagttatttcacataaccaacaaca |
33473272 |
T |
 |
Back To:
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Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
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Target Start/End: Original strand, 25743807 - 25743913
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| Q |
96 |
gatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatata--ttacattactatcaacactaaa |
193 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| | ||||||||||| | |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| || |||||| ||| |
|
|
| T |
25743807 |
gatataacaatatcaagtagtaatcaacaact--taaaacatcacaaataattcacataatgcatatataaatatatgtcacattaataacaacaccaaa |
25743904 |
T |
 |
| Q |
194 |
tcatattat |
202 |
Q |
| |
|
|||| |||| |
|
|
| T |
25743905 |
tcatcttat |
25743913 |
T |
 |
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Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
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| Q |
87 |
acatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcat |
160 |
Q |
| |
|
||||| ||| |||| |||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||| |||| |||||||||||| |
|
|
| T |
43243315 |
acatcccaaaatatgacaataccaaatgataatcaac-actacttaaacatcatacgtaatccacataatgcat |
43243243 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
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Target Start/End: Complemental strand, 38145492 - 38145432
Alignment:
| Q |
143 |
ataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaatcatattata |
203 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
38145492 |
ataatccacataatgcatatacaaatatatctcattactaacaacatcaaattatattata |
38145432 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #45
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Query Start/End: Original strand, 141 - 256
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| Q |
141 |
atataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaatcatattataatagcttcacagatcatcagtaatattatattcaacc |
240 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| || || ||||| | |||||| |||||| |||||||||| || ||| ||||||| || |||| |
|
|
| T |
18319068 |
atataattcaattaatgcatatacaattatatcacaata-taacaacattgaatcatgttataacagcttcacaggtcgtcattaatattgtaaacaact |
18318970 |
T |
 |
| Q |
241 |
cacattcctaccccaa |
256 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |
|
|
| T |
18318969 |
accattcctaccccaa |
18318954 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #46
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Query Start/End: Original strand, 150 - 197
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| Q |
150 |
acataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaatcat |
197 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| |
|
|
| T |
20572025 |
acataatgcatatacaactatattacattactaacaacatcaaatcat |
20572072 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #47
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Query Start/End: Original strand, 206 - 256
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| Q |
206 |
agcttcacagatcatcagtaatattatattcaacccacattcctaccccaa |
256 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || | ||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
22412368 |
agcttcacagattataattaatattatattcaacctccattcctaccccaa |
22412418 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #48
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atcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaatcatattataatagcttcacagatcatcagtaatatt |
230 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| | ||||| ||||||| || | ||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
40725979 |
atcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcatcataaatcagcttcacagatcatcattaatatt |
40726073 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #49
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Query Start/End: Original strand, 63 - 136
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| Q |
63 |
aacagcaacatagacaacacgtaaa-catctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaaca |
136 |
Q |
| |
|
||||||||||||| || ||| |||| || |||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||| |||| |
|
|
| T |
41861523 |
aacagcaacataggcagcacataaaacagctcatgatataacaatatcaaatgacaatcaccatcaacttcaaca |
41861449 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
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| Q |
96 |
gatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaatc |
195 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| | ||| || || ||||||||||| | |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||| | ||||| || ||| |
|
|
| T |
21502192 |
gatataacaatatcgaatgcaagtcatcatcatcttaaacatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagatc |
21502093 |
T |
 |
| Q |
196 |
atatta |
201 |
Q |
| |
|
|||||| |
|
|
| T |
21502092 |
atatta |
21502087 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #51
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Query Start/End: Original strand, 87 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 33473370 - 33473295
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| Q |
87 |
acatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatata |
163 |
Q |
| |
|
||||| ||| |||| |||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||| || | ||||||| ||||||| |
|
|
| T |
33473370 |
acatcccaaaatatgacaataccaaatgataatcaac-actacttaaacatcatacattttccacataaggcatata |
33473295 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0096 (Bit Score: 147; Significance: 2e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0096
Description:
Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 18 - 200
Target Start/End: Original strand, 21173 - 21355
Alignment:
| Q |
18 |
catacatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgata |
117 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21173 |
catacattttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacataggcagcacataaacatctcaagatataacaatatcaaatgata |
21272 |
T |
 |
| Q |
118 |
atcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaatcatatt |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
21273 |
atcaacaacaacttaaacatcttatataattaacataatgcatatacaaatatattacattaccatcaacatcaaatcatatt |
21355 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0032 (Bit Score: 147; Significance: 2e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:
Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 38 - 256
Target Start/End: Original strand, 67288 - 67505
Alignment:
| Q |
38 |
catataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacat |
137 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
67288 |
catataaatatttcacataaccaacaacagcaacataagcagcacgtaaacacc-caagatataacaacatcaaatgataatcaacatcaacttaaacat |
67386 |
T |
 |
| Q |
138 |
catatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaatcatattataatagcttcacagatcatcagtaatattatattca |
237 |
Q |
| |
|
| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
67387 |
cttatacaattcacataatgcatataaaaatatattacattactatcaacattaaatcatattataacaacttcacagatcataagtaatattatattca |
67486 |
T |
 |
| Q |
238 |
acccacattcctaccccaa |
256 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||| |
|
|
| T |
67487 |
acatccattcctaccccaa |
67505 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0018 (Bit Score: 143; Significance: 4e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:
Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 30 - 200
Target Start/End: Original strand, 20769 - 20939
Alignment:
| Q |
30 |
acataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaac |
129 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20769 |
acataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacataggcagcacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaac |
20868 |
T |
 |
| Q |
130 |
ttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaatcatatt |
200 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||| |
|
|
| T |
20869 |
ttaaacatcttatataattcacataatgcatatacaaatatattacattaccattaacatcaaatcatatt |
20939 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1783 (Bit Score: 139; Significance: 9e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold1783
Description:
Target: scaffold1783; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 26 - 256
Target Start/End: Original strand, 432 - 661
Alignment:
| Q |
26 |
ttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaa |
125 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
432 |
ttccacataaggcatataattatttcacataaccaacaacaacaacatagggagcacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataattaacat |
531 |
T |
 |
| Q |
126 |
caacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaatcatattataatagcttcacagatcatcagta |
225 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| ||||||| | ||||||| ||||||||| || |
|
|
| T |
532 |
taacttaaacatcttatataattcacataatgcatatacaaatatatcacattactaacaacatcaaattatattat-acagcttcatagatcatcatta |
630 |
T |
 |
| Q |
226 |
atattatattcaacccacattcctaccccaa |
256 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| ||||||||| |||| |
|
|
| T |
631 |
atatcatattcaacctccattcctactccaa |
661 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0575 (Bit Score: 139; Significance: 9e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0575
Description:
Target: scaffold0575; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 26 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 6265 - 6091
Alignment:
| Q |
26 |
ttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaa |
125 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6265 |
ttccacataagccatataaatatttcacataaccaacaacagcaacataggcagcacataaacatctcaagatataacaacatcaaatgataatcaacaa |
6166 |
T |
 |
| Q |
126 |
caacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaatcatatt |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
6165 |
caacttaaacatcttatataattcacataatgcatatacaaatatattacattaccatcaacatcaaatcatatt |
6091 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0023 (Bit Score: 139; Significance: 9e-73; HSPs: 2)
Name: scaffold0023
Description:
Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 18 - 256
Target Start/End: Original strand, 105087 - 105324
Alignment:
| Q |
18 |
catacatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgata |
117 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
105087 |
catacattttccacataaggcatataattatttcgcataaccgacaacaacaacataggcagcacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgata |
105186 |
T |
 |
| Q |
118 |
atcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaatcatattataatagcttcacagat |
217 |
Q |
| |
|
|| |||| ||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| | ||||||| |||| |
|
|
| T |
105187 |
attaacatcaaattaaacatcttatataattcaaaaaatgcatatacaaatatatcacattactaacaacatcaaatcatattat-acagcttcatagat |
105285 |
T |
 |
| Q |
218 |
catcagtaatattatattcaacccacattcctaccccaa |
256 |
Q |
| |
|
||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
105286 |
catcattaatatcatattcaacctccattcctaccccaa |
105324 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 96 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 40210 - 40135
Alignment:
| Q |
96 |
gatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatat |
172 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| ||||||||||| || ||| |||| | |||||||| |||||| |||||||| ||||| |
|
|
| T |
40210 |
gatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatat |
40135 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0034 (Bit Score: 135; Significance: 2e-70; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:
Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 18 - 188
Target Start/End: Original strand, 120015 - 120185
Alignment:
| Q |
18 |
catacatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgata |
117 |
Q |
| |
|
||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
120015 |
catacatttttcacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacataggcaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgata |
120114 |
T |
 |
| Q |
118 |
atcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaaca |
188 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
120115 |
atcaacaataacttaaacatctgatatagttcacataatgcatatacaaatatattacattatcatcaaca |
120185 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 96 - 179
Target Start/End: Original strand, 32621 - 32703
Alignment:
| Q |
96 |
gatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacatta |
179 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| | |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||| |
|
|
| T |
32621 |
gatataacaatatcaaatgc-aatcaacaacatctcaaacatcaaacataattcatgtaatgtatatacaactatataacatta |
32703 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1439 (Bit Score: 124; Significance: 8e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold1439
Description:
Target: scaffold1439; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 97 - 256
Target Start/End: Original strand, 269 - 428
Alignment:
| Q |
97 |
atataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaatca |
196 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||| |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
269 |
atataacaacatcaaatcataatcaacatcagcttaaacatcttatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacattaaatca |
368 |
T |
 |
| Q |
197 |
tattataatagcttcacagatcatcagtaatattatattcaacccacattcctaccccaa |
256 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
369 |
tattataaaagcttcacagatcatcagtaatattatattcaacctccattcctaccccaa |
428 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0394 (Bit Score: 124; Significance: 8e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:
Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 97 - 256
Target Start/End: Original strand, 12221 - 12380
Alignment:
| Q |
97 |
atataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaatca |
196 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||| |||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |
|
|
| T |
12221 |
atataacaacatcaaatcataatcaacatcaacttgaacatcttatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacattaaacca |
12320 |
T |
 |
| Q |
197 |
tattataatagcttcacagatcatcagtaatattatattcaacccacattcctaccccaa |
256 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
12321 |
tattataatagattcacagatcatcagtaatattatattcaacccccattcctaccccaa |
12380 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0347 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0347
Description:
Target: scaffold0347; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 107 - 256
Target Start/End: Original strand, 123 - 272
Alignment:
| Q |
107 |
atcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaatcatattataata |
206 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
123 |
atcaaatcataatcaacatcaactttaacatcttatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacattaaatcatattataata |
222 |
T |
 |
| Q |
207 |
gcttcacagatcatcagtaatattatattcaacccacattcctaccccaa |
256 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |
|
|
| T |
223 |
gcttcacagatcatcagtaatattatattcaacccccattcctatcccaa |
272 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0123 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 2)
Name: scaffold0123
Description:
Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 20 - 256
Target Start/End: Original strand, 546 - 782
Alignment:
| Q |
20 |
tacatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaa-catctcaagatataacaatatcaaatgataa |
118 |
Q |
| |
|
||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||| || ||| ||||||||||||||||| | || |
|
|
| T |
546 |
tacatttttcacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacaacaacatagacaatacataaaacagttcatgatataacaatatcaaagca-aa |
644 |
T |
 |
| Q |
119 |
tcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaatcatattataatagcttcacagatc |
218 |
Q |
| |
|
|||| |||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
645 |
tcaataacatctcaaacatcatatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcatattataacagcttcacagatc |
744 |
T |
 |
| Q |
219 |
atcagtaatattatattcaacccacattcctaccccaa |
256 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
745 |
atcagtaatattatattcaacctccattcctaccccaa |
782 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0123; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 85 - 256
Target Start/End: Original strand, 25182 - 25351
Alignment:
| Q |
85 |
aaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatc |
184 |
Q |
| |
|
||||| |||| |||||||| ||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| || | |
|
|
| T |
25182 |
aaacagctcatgatataacgatatcaa-tgcaaatcaacaacatctcaaacatcatatataattcatgtaatgtatatacaaatatatcacattatta-c |
25279 |
T |
 |
| Q |
185 |
aacactaaatcatattataatagcttcacagatcatcagtaatattatattcaacccacattcctaccccaa |
256 |
Q |
| |
|
|||| ||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||| |
|
|
| T |
25280 |
aacatcaaatcgtcttataacagcttcacagatcatcattaatattatattcaaccttcatttctaccccaa |
25351 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0081 (Bit Score: 116; Significance: 5e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0081
Description:
Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 61 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 4767 - 4572
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| Q |
61 |
acaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcat |
160 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| ||||||| | ||||| || |||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4767 |
acaacaacaacatatacaacacattaacatatccagatataataatatcatatgataatcatcaacaacttaaacatttcaaataattcacataatgcat |
4668 |
T |
 |
| Q |
161 |
atacaaatatattacattactatcaacactaaatcatattataatagcttcacagatcatcagtaatattatattcaacccacattcctaccccaa |
256 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
4667 |
atacaaatatattacattactatcatcattaaatcatattataacaacttcacagatcatcagtaatattgtattcaacctccattcctaccccaa |
4572 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0037 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:
Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
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Target Start/End: Original strand, 82235 - 82398
Alignment:
| Q |
97 |
atataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgc----atatacaaatatattacattactatcaacactaa |
192 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
82235 |
atataacaacatcaaatcataatcaacatcaacttaaacatcttatataattcacataatgcatgcatatacaaatatattacattactatcaacattaa |
82334 |
T |
 |
| Q |
193 |
atcatattataatagcttcacagatcatcagtaatattatattcaacccacattcctaccccaa |
256 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |
|
|
| T |
82335 |
atcatattacaatagcttcacagatcatcagtaatattatattcaacccccattccaaccccaa |
82398 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 18 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 80530 - 80420
Alignment:
| Q |
18 |
catacatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgata |
117 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
80530 |
catacatcttccacataaggcatataaatatttcatataaccaacaacagcaacataggcgacacataaacatctcaagatataacaatatcaaatgata |
80431 |
T |
 |
| Q |
118 |
atcaacaacaa |
128 |
Q |
| |
|
||||||||||| |
|
|
| T |
80430 |
atcaacaacaa |
80420 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0009 (Bit Score: 108; Significance: 3e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:
Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 26 - 256
Target Start/End: Original strand, 85560 - 85790
Alignment:
| Q |
26 |
ttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaa |
125 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
85560 |
ttccacataaggcatctgaacatttcacataaccaacaacagcaacataggcagcacttaaacacctcaagatataacaacatcaaataataatcaacat |
85659 |
T |
 |
| Q |
126 |
caacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacact-aaatcatattataatagcttcacagatcatcagt |
224 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| | ||||| |||||| |||| ||| | |||||||||||| |||||||| | |||||||| | |
|
|
| T |
85660 |
caacttaagcatcatatataattcatgtaatgcgtatacgattatatcacattaatatcgacattaaaatcatattat-atagcttcgcggatcatcatt |
85758 |
T |
 |
| Q |
225 |
aatattatattcaacccacattcctaccccaa |
256 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
85759 |
aatatcatatccaacctccattcctaccccaa |
85790 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0708 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0708
Description:
Target: scaffold0708; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 104 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 2454 - 2302
Alignment:
| Q |
104 |
aatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaatcatattata |
203 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
2454 |
aatatcaagcgataatcaactacaacttaaacatcttaaataattcacataatgcatatacaaatatattaaattactatcaacattaaatcatattata |
2355 |
T |
 |
| Q |
204 |
atagcttcacagatcatcagtaatattatattcaacccacattcctaccccaa |
256 |
Q |
| |
|
| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
2354 |
acagcttcacaggacatcagtaatattatattcaacctccattcctaccccaa |
2302 |
T |
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Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |
|
|
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7841 |
catacattttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacaacaacataggcaacacataaacatctc-agatataacaatatcaaataata |
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T |
 |
| Q |
118 |
atcaacaacaactt-aaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacat |
177 |
Q |
| |
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| ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |
|
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| T |
7940 |
agcaacatcaacttaaaacatcttatataattcacataatccatacacaaatatattacat |
8000 |
T |
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195 |
Q |
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|
|||||||||||||| |||| ||||||||||| || ||| |||| | |||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||| | ||||| || ||| |
|
|
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5728 |
gatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatc |
5826 |
T |
 |
| Q |
196 |
atatta |
201 |
Q |
| |
|
|||||| |
|
|
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5827 |
atatta |
5832 |
T |
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160 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
831 |
acaacaacaacataggcagcatataaacatctcaagatataacaatatcaaaagataatcaacaacaacttaaacatcttatataattcacataatgcat |
732 |
T |
 |
| Q |
161 |
atacaaatatattacattactatcaacactaaatcatattataatagcttcacagatcatcagtaatattatattcaacccacattcctaccccaa |
256 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||| | |||| |||||| || | || || ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||| |
|
|
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731 |
atacaaatatatcacattactatcaacatcagatcacattatatcaggcttactgaacatcaataatattataatcaacctccattcctaccccaa |
636 |
T |
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Q |
| |
|
||||| |||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| || |
|
|
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10524 |
caacaacaacataggcaacacataaacatctctagatgtaacaacatcaaatgataatcaacatcaacttaaacatcatatataattcatgtaatgcgta |
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T |
 |
| Q |
162 |
tacaaatatattacattactatcaacact-aaatcatattataatagcttcacagatcatcagtaatattatattcaacccacattcctaccc |
253 |
Q |
| |
|
||||| ||||| |||||| |||||||| | |||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| |
|
|
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10624 |
tacaattatatcacattaatatcaacattaaaatcatattat-acagcttcacagatcatcattaatatcatattcaacctccattcctaccc |
10715 |
T |
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
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catacatcttccacataaggcatataagtatttcacataaccaacaacagcaacataggcgacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgata |
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T |
 |
| Q |
118 |
atcaacaacaact |
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Q |
| |
|
||||||||||||| |
|
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atcaacaacaact |
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T |
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117 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
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catacatcttccacataagtcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacataggcgacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgata |
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T |
 |
| Q |
118 |
atcaacaacaact |
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Q |
| |
|
||||||||||||| |
|
|
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atcaacaacaact |
36169 |
T |
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
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catacatcttccacataagtcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacataggcgacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgata |
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T |
 |
| Q |
118 |
atcaacaacaact |
130 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |
|
|
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atcaacaacaact |
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T |
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Q |
| |
|
|||||| |||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| |||||||||||||| |
|
|
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221275 |
aacagctacataggcagcacataaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacatcaacttaaa-gtcttatataatccacataatgcatat |
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T |
 |
| Q |
163 |
acaaatatattacattactatcaacactaaatcatattata |
203 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||||||||| ||||| |||||| |||||| |
|
|
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acaactatatcacattactaacaacatcaaatcaaattata |
221136 |
T |
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194 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| | ||||| |||| |
|
|
| T |
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gatataataatatcaaatgc-aatcaacaacatctcaaacattcatatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaat |
225590 |
T |
 |
| Q |
195 |
catattataatagcttcacagatcatcagtaatattatat |
234 |
Q |
| |
|
||| |||| |||||||||| |||| | |||||| |||| |
|
|
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catcatatatcagcttcacagttcattattaatatcatat |
225630 |
T |
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117 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
566 |
catacattttccacataacgcatataaatatttcacataaccaacaacaacaacatagaaagcacgtaaacatctcaagatataacaacatcaaatgata |
665 |
T |
 |
| Q |
118 |
atcaacaacaacttaaacatcatatata |
145 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
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atcaacatcaacttaaacatcatatata |
693 |
T |
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catacatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgata |
117 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
53952 |
catacattttccacataacgcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacataggcagcacgtaaacatctcaagatataacaacatcaaatgata |
53853 |
T |
 |
| Q |
118 |
atcaacaacaacttaaacatcatatata |
145 |
Q |
| |
|
||||||| | |||||||||||||||||| |
|
|
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53852 |
atcaacatctacttaaacatcatatata |
53825 |
T |
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gatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaatc |
195 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| || ||||| ||||| |
|
|
| T |
129005 |
gatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacatcatatataattcatgtaatggatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaatc |
128906 |
T |
 |
| Q |
196 |
at |
197 |
Q |
| |
|
|| |
|
|
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128905 |
at |
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T |
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Q |
| |
|
||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
1944 |
acaacagcaacataggcagcacataaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacatcaacttaaacatcttatataatccacataatgcat |
2043 |
T |
 |
| Q |
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atacaaatatattacattactatcaacactaaatcatattata |
203 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
2044 |
atacaactatatcacattactaacaacatcaaatcatattata |
2086 |
T |
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acatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatc |
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
58911 |
acatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacataggcgacacataaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatc |
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T |
 |
| Q |
121 |
aacaacaact |
130 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
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58811 |
aacaacaact |
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T |
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catacatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgata |
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Q |
| |
|
|||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
306 |
catacatctttcacataagtcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacataggcgacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgata |
405 |
T |
 |
| Q |
118 |
atcaacaacaact |
130 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |
|
|
| T |
406 |
atcaacaacaact |
418 |
T |
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catacatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgata |
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Q |
| |
|
|||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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catacatctttcacataagtcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacataggcgacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgata |
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T |
 |
| Q |
118 |
atcaacaacaact |
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Q |
| |
|
||||||||||||| |
|
|
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atcaacaacaact |
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T |
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Q |
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|
|||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
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catacatctttcacataagtcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacataggcgacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgata |
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T |
 |
| Q |
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atcaacaacaact |
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Q |
| |
|
||||||||||||| |
|
|
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atcaacaacaact |
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catacatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgata |
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Q |
| |
|
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|
|
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T |
 |
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atcaacaacaacttaaacatcatatata |
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Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
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atcaacatcaacttaaacatcatatata |
4256 |
T |
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| |
|
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|
|
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T |
 |
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atcaacaacaacttaaacatcatatata |
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Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
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acatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacataggcgacacataaacatctcaggatataacaatatcaaatgataatc |
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aacaacaact |
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Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
3967 |
aacaacaact |
3958 |
T |
 |
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Name: scaffold0029
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Target: scaffold0029; HSP #1
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acatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatc |
120 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
65720 |
acatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacataggcgacacgtaaacatctcaggatataacaatatcaaacgataatc |
65621 |
T |
 |
| Q |
121 |
aacaacaact |
130 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
65620 |
aacaacaact |
65611 |
T |
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21 |
acatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatc |
120 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
80629 |
acatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacataggcgacacataaacatctcaggatataacaatattaaatgataatc |
80728 |
T |
 |
| Q |
121 |
aacaacaact |
130 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
80729 |
aacaacaact |
80738 |
T |
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Target: scaffold0029; HSP #3
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21 |
acatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatc |
120 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
61804 |
acatcttccacataaggcatataaatatttcacatattcaacaacagcaacataggcgacacataaacatctcaggatataacaatatctaatgataatc |
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T |
 |
| Q |
121 |
aacaacaact |
130 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
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61704 |
aacaacaact |
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T |
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Target: scaffold0436; HSP #1
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caacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcata |
161 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8082 |
caacagcaacatatgcaacacataaacatctcaagatataacaacatcaaatgataatcaacatcaacttaaacatcatatataattcacataatgcata |
8181 |
T |
 |
| Q |
162 |
tacaaatatattacattacta |
182 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||||||||| |
|
|
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8182 |
tacaactatatcacattacta |
8202 |
T |
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Target: scaffold0026; HSP #1
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59 |
caacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgc |
158 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
110701 |
caacaacggcaacataggcagcacataaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaatatcaacttaaacatcttatataatccacataatgc |
110800 |
T |
 |
| Q |
159 |
atatacaaatatattacattactatcaacactaaatcatattata |
203 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
110801 |
atatacaaatatatctcattactaacaacatcaaatcatattata |
110845 |
T |
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Target: scaffold0434; HSP #1
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catacatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgata |
117 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |
|
|
| T |
7055 |
catacattttccacataaggcatatacatatttcacataaccaacaacagcaacatagtcagcacgtaaacatctcaagatataacaacattaaatgata |
6956 |
T |
 |
| Q |
118 |
atcaacaacaacttaaaca |
136 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||| |
|
|
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6955 |
atcaacatcaacttaaaca |
6937 |
T |
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Target: scaffold0054; HSP #1
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162 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |
|
|
| T |
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aacagcaacgtaggcagcacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataatccacataatgcaaat |
75798 |
T |
 |
| Q |
163 |
acaaatatattacattactatcaacactaaatcat |
197 |
Q |
| |
|
|||| | ||| ||||||||| ||||| ||||||| |
|
|
| T |
75797 |
acaattttatcacattactaacaacatcaaatcat |
75763 |
T |
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Target: scaffold0047 (Bit Score: 91; Significance: 4e-44; HSPs: 1)
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Target: scaffold0047; HSP #1
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agatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaa-catcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaa |
193 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
22361 |
agatataacaatatccaagaataatcaacatcaacttaaaacatctcatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacattaaa |
22460 |
T |
 |
| Q |
194 |
tcatattataatagcttcacagatcatcagtaatattatattcaacccacattcctaccccaa |
256 |
Q |
| |
|
||| |||| || || |||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
22461 |
tcacattacaacagattcacagaacatcagtaatatcataatcaaccttcattcctaccccaa |
22523 |
T |
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Target: scaffold0016 (Bit Score: 91; Significance: 4e-44; HSPs: 1)
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Target: scaffold0016; HSP #1
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catacatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgata |
117 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
207697 |
catacatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacatcaacataggcgacacataaacatatcaagatataacaatatcaaatgata |
207598 |
T |
 |
| Q |
118 |
atcaacaacaa |
128 |
Q |
| |
|
||||||||||| |
|
|
| T |
207597 |
atcaacaacaa |
207587 |
T |
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Target: scaffold0005 (Bit Score: 91; Significance: 4e-44; HSPs: 3)
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Target: scaffold0005; HSP #1
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Target Start/End: Complemental strand, 14158 - 13996
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| Q |
95 |
agatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaa-catcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaa |
193 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
14158 |
agatataacaatatccaagaataatcaacatcaacttaaaacatctcatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacattaaa |
14059 |
T |
 |
| Q |
194 |
tcatattataatagcttcacagatcatcagtaatattatattcaacccacattcctaccccaa |
256 |
Q |
| |
|
||| |||| || || |||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
14058 |
tcacattacaacagattcacagaacatcagtaatatcataatcaaccttcattcctaccccaa |
13996 |
T |
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Target: scaffold0005; HSP #2
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gatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacatta |
179 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||| | || || |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| |
|
|
| T |
267747 |
gatataacaatatcaaatgcaaatcaacaatatctcaa-catcatatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacatta |
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T |
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26 |
ttccacataaggcatataaatatttcaca |
54 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
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166454 |
ttccacataaggcatataaatatttcaca |
166426 |
T |
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Target: scaffold0676; HSP #1
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acatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatc |
120 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
364 |
acatctttcacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacataggcgacacataaacatctcaggatataacaatatcaaatgataatc |
463 |
T |
 |
| Q |
121 |
aacaacaact |
130 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
464 |
aacaacaact |
473 |
T |
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Target: scaffold0372; HSP #1
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| Q |
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acatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatc |
120 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5293 |
acatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacatcagcaacataggcgacacataaacatctcaggatataacaatatcaaatgataatc |
5194 |
T |
 |
| Q |
121 |
aacaacaact |
130 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
5193 |
aacaacaact |
5184 |
T |
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Target: scaffold0349 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 1)
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Target: scaffold0349; HSP #1
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| Q |
21 |
acatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatc |
120 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12336 |
acatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaatagcaacataggcgacacataaacatctcaggatataacaatatcaaatgataatc |
12435 |
T |
 |
| Q |
121 |
aacaacaact |
130 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
12436 |
aacaacaact |
12445 |
T |
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Target: scaffold0014; HSP #1
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aacaacagcaacatagacaacacgtaaa-catctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgc |
158 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| | |||||| |||||||||| |
|
|
| T |
206596 |
aacaacagcaacataggcagtacataaaacatctcaagatataacaatatcaaataataatcaacaaca-cttaatcatcttgtataatccacataatgc |
206498 |
T |
 |
| Q |
159 |
atatacaaatatattacattactatcaacactaaatcatattataatagcttcacagatcatcagtaatattatattcaacc |
240 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||| | |||| ||| |||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
206497 |
atatacaaatatattacattactaacaatattaaatcatgttataacatattcatagaacatcagtaatattataatcaacc |
206416 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0292 (Bit Score: 89; Significance: 6e-43; HSPs: 1)
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taaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactat |
183 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
6684 |
taaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcttatataattcacatactacatatacaaatatattacattaccat |
6783 |
T |
 |
| Q |
184 |
caacactaaatcatatt |
200 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| |
|
|
| T |
6784 |
caacctcaaatcatatt |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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Target: scaffold0141; HSP #1
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catacatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgata |
117 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14282 |
catatatcttccacataagtcatataaatatttcacataaccaacaacaggaacataggcgacacgtaaacatatcaagatataacaatatcaaatgata |
14183 |
T |
 |
| Q |
118 |
atcaacaacaact |
130 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |
|
|
| T |
14182 |
atcaacaacaact |
14170 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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Target: scaffold0317; HSP #1
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18 |
catacatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgata |
117 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |
|
|
| T |
7016 |
catacattttccacataacgcatataaaaatttcacataaccaacaacagtaacataggcagcacgtaaacatctcaagatataacaacattaaatgata |
6917 |
T |
 |
| Q |
118 |
atcaacaacaacttaaacatcatatata |
145 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6916 |
ctcaacatcaacttaaacatcatatata |
6889 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0306 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
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Description:
Target: scaffold0306; HSP #1
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18 |
catacatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgata |
117 |
Q |
| |
|
||||||| || | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
15004 |
catacatttttcccataacgcatataaatatttcacataaccaacaacaccaacataggccacatgtaaacatctcaagatataacaacatcaaatgata |
15103 |
T |
 |
| Q |
118 |
atcaacaacaacttaaacatcatatata |
145 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15104 |
atcaacatcaacttaaacatcatatata |
15131 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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Target: scaffold1539; HSP #1
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61 |
acaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaa-caacaacttaaacatcatatataattcacataatgca |
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Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||| || |||||||| |||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
988 |
acaacagcaacataggcaacacataaacatctcaagatataagaatgtcaaataataatcaatcatcaacttaagcatcttatataattcacataatgca |
1087 |
T |
 |
| Q |
160 |
tatacaaatatattacattactatcaacactaaatcatatt |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
1088 |
tatacaaatatatcacattactaacaacatcaaatcatatt |
1128 |
T |
 |
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Name: scaffold0331
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Target: scaffold0331; HSP #1
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Target Start/End: Original strand, 3917 - 4060
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61 |
acaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaactt-aaacatcatatataattcacataatgca |
159 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
3917 |
acaacagcaacataggcagcacataaacatctcaagatataacattaccaaatgataatcaacatcaacttaaaacatcttatataatccacataatgca |
4016 |
T |
 |
| Q |
160 |
tatacaaatatattacattactatcaacactaaatcatattata |
203 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
4017 |
tatacaaatatatctcattactaacaacatcaaatcatattata |
4060 |
T |
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Target: scaffold0282; HSP #1
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61 |
acaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcat |
160 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
18238 |
acaacaacaacataggcagcacataaatatctcaagatataacaatatcaaatgataataaacatcaacttaaacatcttatataatccacataatgcat |
18139 |
T |
 |
| Q |
161 |
atacaaatatattacattactatcaacactaaatcatattataatagcttcacagatcatcagtaatattatattcaacccacattcctaccccaa |
256 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| ||||||||| ||| | ||||||||||||| || |||| || ||||| | || |||| |||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
18138 |
atacaactatatcacattactaacaatatcaaatcatattatatcagactcactgaacatcaacagtactataatcaacctccattcctaccccaa |
18043 |
T |
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Target: scaffold0750; HSP #1
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Target Start/End: Original strand, 3687 - 3836
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102 |
acaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaatcatatta |
201 |
Q |
| |
|
||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |
|
|
| T |
3687 |
acaatatcaaagga-aatcaacattcacttaaacatcttatataatccacataatacatatacaaatatattacattactatcaacattaaatcatgtta |
3785 |
T |
 |
| Q |
202 |
taatagcttcacagatcatcagtaatattatattcaacccacattcctacc |
252 |
Q |
| |
|
||| || |||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||| |
|
|
| T |
3786 |
taacagattcacagaacatcagtaatattataatcaacctccattcctacc |
3836 |
T |
 |
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Target: scaffold0010 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 2)
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Target: scaffold0010; HSP #1
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61 |
acaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcat |
160 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| || |||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
697 |
acaacagcaacataggcaacacataaacatctcaagatatcacatcatgaaataataatcaacatcaacttaaacatcttatataatccacataatgcat |
796 |
T |
 |
| Q |
161 |
atacaaatatattacattactatcaacactaaatcatattata |
203 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
797 |
atacaactatatcacattactaacaacatcaaatcatattata |
839 |
T |
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Target: scaffold0010; HSP #2
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85 |
aaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacat-catatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactat |
183 |
Q |
| |
|
||||| |||| |||||| ||||||||| || ||||||||||| || |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| | || |
|
|
| T |
60761 |
aaacagctcatgatataccaatatcaa-tgcaaatcaacaacatctcaaacattcatatataattcaagtaatgcatatacaaatatatcacataattaa |
60663 |
T |
 |
| Q |
184 |
caacactaaatcatattataatagcttcacagatcatcagtaatattatattcaacccacattcctaccccaa |
256 |
Q |
| |
|
||||| ||||||| |||||| |||||||||||| |||| |||||| |||| ||| | |||||||||||||| |
|
|
| T |
60662 |
caacatcaaatcattttataacagcttcacagattatcattaatatcatatacaatctccattcctaccccaa |
60590 |
T |
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Target: scaffold0046 (Bit Score: 82; Significance: 9e-39; HSPs: 3)
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Target: scaffold0046; HSP #1
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92 |
tcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacacta |
191 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| || |
|
|
| T |
16957 |
tcaagatataacaatatcaa-tgacaatcaacaacaacttgaacatcttatataattcacataatgcatatacaattatatcacattactaacaacatta |
16859 |
T |
 |
| Q |
192 |
aatcatattataatagcttcacagatcatcagtaatattata |
233 |
Q |
| |
|
| | || |||||| || ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16858 |
actaat-ttataacagattcacagatcatcagtaatattata |
16818 |
T |
 |
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Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 92 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 26117 - 25978
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| Q |
92 |
tcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacacta |
191 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| || |
|
|
| T |
26117 |
tcaagatataacaatatcaag-gacaatcaacaacaacttgaacatcttatataattcacataatgcatatacaattatatcacattactaacaacatta |
26019 |
T |
 |
| Q |
192 |
aatcatattataatagcttcacagatcatcagtaatattata |
233 |
Q |
| |
|
||| || |||||| || |||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
26018 |
aataat-ttataacagattcacagatcataagtaatattata |
25978 |
T |
 |
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Target: scaffold0046; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
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| Q |
18 |
catacatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaaca |
66 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
22525 |
catacattttccacataagacatataattatttcacataatcaacaaca |
22477 |
T |
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Target: scaffold0019 (Bit Score: 81; Significance: 4e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0019
Description:
Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
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Target Start/End: Original strand, 132989 - 133161
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| Q |
84 |
taaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactat |
183 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
132989 |
taaacatttcaagatataacaatatcaaatgataatcaacatcaacttaaacatcttatataatccacataatgcatatacaaatatatcttattactaa |
133088 |
T |
 |
| Q |
184 |
caacactaaatcatattataatagcttcacagatcatcagtaatattatattcaacccacattcctaccccaa |
256 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||| | |||| | ||||| || ||||||| |||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
133089 |
caacatcaaatcatattatatctgactcactcaacatcaatagtattataatcaacctccattcctaccccaa |
133161 |
T |
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Target: scaffold0019; HSP #2
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Target Start/End: Original strand, 29261 - 29390
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62 |
caacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcata |
161 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| || ||||||||||||||| |
|
|
| T |
29261 |
caacaacaacatagacaacacaataacatatcaagatataacaatatcaaatgataatcaacatcatcttaaa---------tacttcacataatgcata |
29351 |
T |
 |
| Q |
162 |
tacaaatatattacattactatcaacactaaatcatatt |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
29352 |
tacaaatatattacattactatcaacagtaaatcatatt |
29390 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0431 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0431
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Target: scaffold0431; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
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| Q |
80 |
cacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaa |
167 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15117 |
cacgtaaacatctcaagatataacaacatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcttatataattcacataatgcatatacaaa |
15030 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0356 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0356
Description:
Target: scaffold0356; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
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| Q |
94 |
aagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacact-aa |
192 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| |||||| |||||||| | || |
|
|
| T |
699 |
aagatataacaacatcaaatgataatcaacatcaacttaaacatcatatataattcatgtaatgcgtatacaattatatcacattaatatcaacattaaa |
600 |
T |
 |
| Q |
193 |
atcatattataatagcttcacagatcatcagtaatattatattcaacccacattcctaccccaa |
256 |
Q |
| |
|
|||||||||| | | ||||| ||||||||| | |||| |||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
599 |
atcatattat-acaacttcatagatcatcatttatatcatattcaacctccattcctaccccaa |
537 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0040 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 2)
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Target: scaffold0040; HSP #1
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| Q |
61 |
acaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcat |
160 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || || ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |
|
|
| T |
11196 |
acaacagcaacacaggcagcacataaacatctcaggatataacaatatcaaatgataatcaac-acaacttaaacatcatatataatccaaataatgcat |
11294 |
T |
 |
| Q |
161 |
atacaaatatattacattacta |
182 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
11295 |
atacaactatatcacattacta |
11316 |
T |
 |
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Target: scaffold0040; HSP #2
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| Q |
61 |
acaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcat |
160 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || || ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |
|
|
| T |
22296 |
acaacagcaacacaggcagcacataaacatctcaggatataacaatatcaaatgataatcaac-acaacttaaacatcatatataatccatataatgcat |
22394 |
T |
 |
| Q |
161 |
atacaaatatattacattacta |
182 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
22395 |
atacaactatatcacattacta |
22416 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0013 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
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Target: scaffold0013; HSP #1
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acaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaa-caacaacttaaacatcatatataattcacataatgca |
159 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| || ||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30381 |
acaacagcaacataggcatcacataaacatctcaagacataacaatgtcaaataataatcaatcaacaacttaagcattttatataattcacataatgca |
30480 |
T |
 |
| Q |
160 |
tatacaaatatattacattactatcaacactaaatcat |
197 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| |
|
|
| T |
30481 |
tatacaaatatatcacattactaacaacatcaaatcat |
30518 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0170 (Bit Score: 77; Significance: 9e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0170
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Target: scaffold0170; HSP #1
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acaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaa-caacaacttaaacatcatatataattcacataatgca |
159 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || |||||||| |||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3006 |
acaacaacaacataggtagcacataaacatctcaagatataacaatgtcaaataataatcaatcatcaacttaagcatcttatataattcacataatgca |
3105 |
T |
 |
| Q |
160 |
tatacaaatatattacattactatcaacactaaatcatatt |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
3106 |
tatacaaatatatcacattactaacaacatcaaatcatatt |
3146 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0205 (Bit Score: 76; Significance: 4e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0205
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Target: scaffold0205; HSP #1
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62 |
caacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcata |
161 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||| ||||||||||||| | |
|
|
| T |
29723 |
caacaacaacatagacaacacaataacatatccagatataacaatatcaaatgataatcaacatcaacttaaacatcttaaatacttcacataatgcaca |
29822 |
T |
 |
| Q |
162 |
tac-aaatatattacattactatcaaca |
188 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29823 |
tacaaaatatattacattactatcaaca |
29850 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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Name: scaffold0337
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Target: scaffold0337; HSP #1
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acaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcat |
160 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| || ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| || | ||||||| |
|
|
| T |
9791 |
acaacaacaacataggcagcacatagacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacatc-acttaaacatcttatataatccatacaatgcat |
9693 |
T |
 |
| Q |
161 |
atacaaatatattacattactatcaacactaaatcatattata |
203 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
9692 |
atacaaatatatctcattactaacaacatcaaatcatattata |
9650 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0111 (Bit Score: 74; Significance: 6e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0111
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Target: scaffold0111; HSP #1
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acaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaa-caacaacttaaacatcatatataattcacataatgca |
159 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| || ||| |||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| || |||||||| |||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7481 |
acaacagcaacataggcagcacataaacatc--aagatataacaatgtcaaataataatcaatcatcaacttaagcatcttatataattcacataatgca |
7578 |
T |
 |
| Q |
160 |
tatacaaatatattacattactatcaacactaaatcatatt |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
7579 |
tatacaaatatatcacattactaacaacatcaaatcatatt |
7619 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0111; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
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Q |
| |
|
||||||||||||||| || ||| |||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| || |||||||| |||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14600 |
acaacagcaacataggcagcacataaacatc--aagatataacaatgtcaaataataatcaatcatcaacttaagcatcttatataattcacataatgca |
14697 |
T |
 |
| Q |
160 |
tatacaaatatattacattactatcaacactaaatcatatt |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
14698 |
tatacaaatatatcacattactaacaacatcaaatcatatt |
14738 |
T |
 |
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Target: scaffold0077; HSP #1
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taaacatctcaagatataacaatatcaaatgataat-caacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattacta |
182 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
55733 |
taaacatctcaagatataacaatatcaaataatatttcaacatcaacttaaacatcttatataattcacataatgcatatgcaaatatatcacattacta |
55634 |
T |
 |
| Q |
183 |
tcaacactaaatcatattataatagcttcacagatcatcagtaatattatattcaacccacattcctaccccaa |
256 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||| ||| |||| || ||| | | || |||| |||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
55633 |
acaacctcaaatcatattatattagactcactgaacattaacagtactataatcaacctccattcctaccccaa |
55560 |
T |
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92 |
tcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacacta |
191 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| || |
|
|
| T |
57898 |
tcaagatataacaatatcaa-tgacaatcaacaacaacttgaacattttaaataattcacataatgcatatacaattatatcacattactaacaacatta |
57996 |
T |
 |
| Q |
192 |
aatcatattataatagcttcacagatcatcagtaatattata |
233 |
Q |
| |
|
||| || |||||| || || |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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aataat-ttataacagtttaacagatcatcagtaatattata |
58037 |
T |
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Target: scaffold0485; HSP #1
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Target Start/End: Original strand, 10213 - 10340
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acaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcat |
160 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
10213 |
acaacagcaacataagcagcacataaacatctcaagatgtaacaatatcaaataataatcatcatcaacttaaacatcttatataatccacataatgcat |
10312 |
T |
 |
| Q |
161 |
atacaaatatattacattactatcaaca |
188 |
Q |
| |
|
|||||| || || ||||||||| ||||| |
|
|
| T |
10313 |
atacaactacatcacattactaacaaca |
10340 |
T |
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Target: scaffold0639 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 1)
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Target: scaffold0639; HSP #1
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acaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaa-caacaacttaaacatcatatataattcacataatgca |
159 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| || |||||||| |||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7560 |
acaacagcaacataggcagcacataaacatctcaagatatatcaatgtcaaataataatcaatcatcaacttaagcatcttatataattcacataatgca |
7461 |
T |
 |
| Q |
160 |
tatacaaatatattacattacta |
182 |
Q |
| |
|
|| |||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
7460 |
tacacaaatatatcacattacta |
7438 |
T |
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Target: scaffold0507 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 2)
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Target: scaffold0507; HSP #1
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68 |
caacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaa-caacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaa |
166 |
Q |
| |
|
|||||||| || ||| |||||||||||||||||| | || |||||| |||||||| || |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2735 |
caacatagtcagcacataaacatctcaagatatatccatgtcaaataataatcaatcatcaacttaagcatcttatataattcacataatgcatatacaa |
2636 |
T |
 |
| Q |
167 |
atatattacattactatcaacactaaatcatatt |
200 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
2635 |
atatatcacattactaacaacatcaaatcatatt |
2602 |
T |
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91 |
ctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaaca-tcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacatta |
179 |
Q |
| |
|
|||| ||||||| |||||||||||| | ||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||| |
|
|
| T |
8100 |
ctcatgatataataatatcaaatgaaattcaacaacatcttaaacattcatatataattcaagtaatgtatataaaattatatcacatta |
8011 |
T |
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Target: scaffold0061; HSP #1
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21 |
acatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataa |
118 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
67493 |
acatcttccacataaggcatataaatattt-acataaccaacaacaacaacataggcgacacataaacatctcaggatataacaatatcaaatgataa |
67397 |
T |
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Target: scaffold1419; HSP #1
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89 |
atctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaaca |
188 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||| || ||||| |
|
|
| T |
101 |
atctcaagatataacaatatcaaatgataaacatcatcaacttaaacatcatataaaattcacataatgcatatacaattatatcacattattaacaaca |
200 |
T |
 |
| Q |
189 |
ctaaatcat |
197 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
|
| T |
201 |
tcaaatcat |
209 |
T |
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Target: scaffold0004; HSP #1
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86 |
aacatctcaagatataacaatatcaaatgataat-caacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatc |
184 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||| | ||| | ||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |
|
|
| T |
332391 |
aacatctcaagatata-caatatcaa-taatatttcaacatcaacttaaacataatttataattcacataatgcatatacaaatatatcacattactttc |
332488 |
T |
 |
| Q |
185 |
aacactaaatcatattataatagcttcacagatcatcagtaatattata |
233 |
Q |
| |
|
|||| |||||||| ||||| || |||| ||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
332489 |
aacataaaatcataatataacagattcatagaacatcagtaatattata |
332537 |
T |
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Target: scaffold0106 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 2)
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Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
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| Q |
60 |
aacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatata |
145 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15310 |
aacaatagcaacataggcagcacgtaaacatctcaagatataacaacatcaaatgataatcaacatcaacttaaacatcatatata |
15225 |
T |
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Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
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Target Start/End: Complemental strand, 19693 - 19590
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85 |
aaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaaca-tcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactat |
183 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |
|
|
| T |
19693 |
aaacatctcaa-atataacaatgtcaaacaataatcaacatcaacttaaaaaatctcatataattcacataatgcatatacaaatatatcacattattat |
19595 |
T |
 |
| Q |
184 |
caaca |
188 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
| T |
19594 |
caaca |
19590 |
T |
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Target: scaffold0877 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
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Target: scaffold0877; HSP #1
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| Q |
18 |
catacatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctca |
94 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |
|
|
| T |
2827 |
catacattttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacataggcagcacgtaaacatctca |
2751 |
T |
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Target: scaffold0169 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
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Target: scaffold0169; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
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| Q |
61 |
acaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataat-caacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgca |
159 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | || ||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
29494 |
acaacagcaacatgg-cagcacataaacttctcaagatataacaatatcaaataatatttcaacatcaacttaaacatcttatataattcacataataca |
29396 |
T |
 |
| Q |
160 |
tatacaaatatattacattactatcaacactaaatcatattataatagcttcacagatcatcagtaatattatattcaacccacattcctaccccaa |
256 |
Q |
| |
|
||| ||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| ||| ||| |||| | ||| | |||| |||| |||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
29395 |
tatgcaaatatatcacattactaacaacctcaaatcatatcatattagactcacttaacattaacaatactataatcaacctccattcctaccccaa |
29299 |
T |
 |
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Target: scaffold0357 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 4)
Name: scaffold0357
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Target: scaffold0357; HSP #1
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Target Start/End: Original strand, 2849 - 2939
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| Q |
166 |
aatatattacattactatcaacactaaatcatattataatagcttcacagatcatcagtaatattatattcaacccacattcctaccccaa |
256 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
2849 |
aatatattacattactatcaacattaaatcatattataacagcttcacaggtcatcattaatattgtattcaacctccattcctaccccaa |
2939 |
T |
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Target: scaffold0357; HSP #2
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96 |
gatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacat-catatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaat |
194 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| | ||||| |||| |
|
|
| T |
16136 |
gatataacaatatcaaatgtaaatcaacaacatctcaaacattcttatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaccaacatcaaat |
16037 |
T |
 |
| Q |
195 |
catattataatagcttcacagatcatca |
222 |
Q |
| |
|
||| |||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16036 |
catcttataacagcttcacagatcatca |
16009 |
T |
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Target: scaffold0357; HSP #3
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| Q |
96 |
gatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaaca--tcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaa |
193 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| | ||||| ||| |
|
|
| T |
13213 |
gatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctgaaaccattcatatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaccaacatcaaa |
13312 |
T |
 |
| Q |
194 |
tcatattataatagcttcacagatcatca |
222 |
Q |
| |
|
|||| |||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13313 |
tcatcttataacagcttcacagatcatca |
13341 |
T |
 |
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Target: scaffold0357; HSP #4
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| Q |
85 |
aaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattca |
150 |
Q |
| |
|
|||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |
|
|
| T |
2737 |
aaacatatccagatataataatatcaagtgataatcaacaacaacttaaacatcttaaataattca |
2802 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0066 (Bit Score: 62; Significance: 8e-27; HSPs: 1)
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Target: scaffold0066; HSP #1
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acatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataatt-cacataatgcatatacaaatata |
171 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| |
|
|
| T |
48403 |
acatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaac-acaacttaaacatcatatataattccacataatgcatttgcaaatata |
48487 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0021 (Bit Score: 62; Significance: 8e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0021
Description:
Target: scaffold0021; HSP #1
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87 |
acatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataatt-cacataatgcatatacaaatata |
171 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| |
|
|
| T |
146261 |
acatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaac-acaacttaaacatcatatataattccacataatgcatttgcaaatata |
146345 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0790 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
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Target: scaffold0790; HSP #1
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tcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacatta |
179 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |
|
|
| T |
6116 |
tcaagatataacaatatcaaatgataaacatcctcaacttaaacatcatataaaattcacataatgcatatacaattatatcacatta |
6203 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0260 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
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Target: scaffold0260; HSP #1
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actatcaacactaaatcatattataatagcttcacagatcatcagtaatattatattcaacccacattcctaccccaa |
256 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
8295 |
actatcaacattaaatcatattataacagcttcaaagatcatcagtaatattatattcaacctccattcctaccccaa |
8372 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0006 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
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Target: scaffold0006; HSP #1
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gatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaatc |
195 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||| |
|
|
| T |
97092 |
gatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacatcatatataattcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaatc |
97191 |
T |
 |
| Q |
196 |
at |
197 |
Q |
| |
|
|| |
|
|
| T |
97192 |
at |
97193 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
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gatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaatc |
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||| |
|
|
| T |
106370 |
gatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacatcatatataattcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaatc |
106469 |
T |
 |
| Q |
196 |
at |
197 |
Q |
| |
|
|| |
|
|
| T |
106470 |
at |
106471 |
T |
 |
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Target: scaffold0914 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
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Target: scaffold0914; HSP #1
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Target Start/End: Original strand, 1785 - 1868
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| Q |
95 |
agatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatat-ataattcacataatgcatatacaaatatattacat |
177 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
1785 |
agatataacaatatcaaatgataatcaacatcaacttaaactccttataataattcacataatgcatatacaaatatatcacat |
1868 |
T |
 |
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Target: scaffold0513; HSP #1
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27 |
tccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaaca |
124 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
10956 |
tccacataatgcatatgaacatttcacataaccaacaacagcaatataagcaacacttaaacacctcaagatataacaacatcaaataatactcaaca |
10859 |
T |
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Target: scaffold0108; HSP #1
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Target Start/End: Original strand, 3307 - 3384
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| Q |
61 |
acaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatc |
138 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| |
|
|
| T |
3307 |
acaacagcaacataggcaacacataaatatctcaagatataacaatatcaaatgacaatcaacatcaactgaaacatc |
3384 |
T |
 |
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Target: scaffold0100 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 1)
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Target: scaffold0100; HSP #1
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Target Start/End: Complemental strand, 36135 - 36038
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| Q |
27 |
tccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatagacaacacgtaaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaaca |
124 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||| |||||||||||| || |||||| |||||||||| |
|
|
| T |
36135 |
tccacataaggcatatgaacatttcacataaccaacaacagcaacatatgcagcacttaaacacctcaagatataagaacatcaaaaaataatcaaca |
36038 |
T |
 |
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Target: scaffold0003; HSP #1
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Target Start/End: Original strand, 71308 - 71365
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| Q |
18 |
catacatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatag |
75 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
71308 |
catacattttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaacatag |
71365 |
T |
 |
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Target: scaffold0165 (Bit Score: 52; Significance: 8e-21; HSPs: 1)
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Target: scaffold0165; HSP #1
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Target Start/End: Complemental strand, 27785 - 27658
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| Q |
96 |
gatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacat-catatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaat |
194 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| || ||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| | ||||| |||| |
|
|
| T |
27785 |
gatataacaatatcaaatgtaaatcaacaacatctcaaacattcacatataattctagtaatgcatatacaattatatcacattataaccaacatcaaat |
27686 |
T |
 |
| Q |
195 |
catattataatagcttcacagatcatca |
222 |
Q |
| |
|
||| |||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27685 |
catcttataacagcttcacagatcatca |
27658 |
T |
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Target: scaffold0420 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
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Target: scaffold0420; HSP #1
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| Q |
85 |
aaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatc |
184 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| || | |
|
|
| T |
6329 |
aaacagctcatgatatgacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacatcatatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattaataac |
6230 |
T |
 |
| Q |
185 |
aacactaaatcatat |
199 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||| |
|
|
| T |
6229 |
aacatcaaatcatat |
6215 |
T |
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Target: scaffold0139 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0139
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Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
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Target Start/End: Original strand, 38392 - 38506
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| Q |
85 |
aaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatc |
184 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||||| ||||||||||||| | ||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||| | || |
|
|
| T |
38392 |
aaacagctcatgatatgacaatatcaaatgcaattcaacaacatctcaaacatcatatataattcatgtaatgcatatacatatatatcacattaatctc |
38491 |
T |
 |
| Q |
185 |
aacactaaatcatat |
199 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||| |
|
|
| T |
38492 |
aacatcaaatcatat |
38506 |
T |
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Target: scaffold0017; HSP #1
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| Q |
18 |
catacatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaa |
70 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1279 |
catacattttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaa |
1227 |
T |
 |
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Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 18 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 8030 - 7978
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| Q |
18 |
catacatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaa |
70 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8030 |
catacattttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaacagcaa |
7978 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0138 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0138
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Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
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Target Start/End: Complemental strand, 18284 - 18181
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| Q |
85 |
aaacatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatc |
184 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| || | |
|
|
| T |
18284 |
aaacagctcatgatatgacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacatcatatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattaataac |
18185 |
T |
 |
| Q |
185 |
aaca |
188 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
18184 |
aaca |
18181 |
T |
 |
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Target: scaffold0138; HSP #2
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Target Start/End: Original strand, 33213 - 33261
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| Q |
18 |
catacatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaaca |
66 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33213 |
catacattttccacataaggcatataattatttcacataaccaacaaca |
33261 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1766 (Bit Score: 47; Significance: 7e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold1766
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Target: scaffold1766; HSP #1
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| Q |
190 |
taaatcatattataatagcttcacagatcatcagtaatattatattcaacccacattcctaccccaa |
256 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |
|
|
| T |
1388 |
taaatcatattataacagctttacagatcatcagtaatattatattcaaccttcattcctatcccaa |
1322 |
T |
 |
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Target: scaffold0452 (Bit Score: 47; Significance: 7e-18; HSPs: 1)
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Target: scaffold0452; HSP #1
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Alignment:
| Q |
123 |
caacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaatcatatt |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
13505 |
caacaacttaaacatcttatataattcagataatgc--atacaaatatattacattaccatcaacatcaaatcatatt |
13430 |
T |
 |
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Target: scaffold0544 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
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Target: scaffold0544; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
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Target Start/End: Complemental strand, 2493 - 2421
Alignment:
| Q |
131 |
taaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaatcatattata |
203 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
2493 |
taaacatcttatataatccacataatgcatatacaaatatatctcattactaacaacatcaaatcatattata |
2421 |
T |
 |
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Target: scaffold1351 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000007; HSPs: 1)
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Target: scaffold1351; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
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Target Start/End: Original strand, 91 - 192
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| Q |
96 |
gatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaatc |
195 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||| |||||| |||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| || ||||| ||||| |
|
|
| T |
91 |
gatataacaatatcagatgcaaatcaataacatctcaaacatcatatataattcatgtaatgcatatacatttatataacattattaacaacatcaaatc |
190 |
T |
 |
| Q |
196 |
at |
197 |
Q |
| |
|
|| |
|
|
| T |
191 |
at |
192 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0462 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0462
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Target: scaffold0462; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
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| Q |
18 |
catacatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaaca |
66 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10516 |
catacattttccacataaggcatataattatttcacataaccaacaaca |
10564 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0301 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 3)
Name: scaffold0301
Description:
Target: scaffold0301; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
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| Q |
87 |
acatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcat |
160 |
Q |
| |
|
||||| ||| |||| |||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
16613 |
acatcccaaaatatgacaataccaaatgataatcaaca-ctacttaaacatcatacataatccacataatgcat |
16541 |
T |
 |
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Target: scaffold0301; HSP #2
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| Q |
87 |
acatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcat |
160 |
Q |
| |
|
||||| ||| |||| |||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||| |||||||| |
|
|
| T |
12213 |
acatcccaaaatatgacaataccaaatgataatcaac-actacttaaacatcatacataatccacgtaatgcat |
12141 |
T |
 |
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Target: scaffold0301; HSP #3
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| Q |
87 |
acatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcat |
160 |
Q |
| |
|
||||| ||| |||| |||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||| |||||||| |
|
|
| T |
15365 |
acatcccaaaatatgacaataccaaatgataatcaac-actacttaaacatcatacataatccacgtaatgcat |
15293 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0015 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:
Target: scaffold0015; HSP #1
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| Q |
87 |
acatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcat |
160 |
Q |
| |
|
||||| ||| |||| |||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
209001 |
acatcccaaaatatgacaataccaaatgataatcaaca-ctacttaaacatcatacataatccacataatgcat |
209073 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0001 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 7)
Name: scaffold0001
Description:
Target: scaffold0001; HSP #1
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| Q |
87 |
acatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcat |
160 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| |||||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
163143 |
acatctcaaaatatgacaataccaaatgataatctaca-ctacttaaacatcatacataatccacataatgcat |
163071 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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| Q |
18 |
catacatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaaca |
66 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
176088 |
catacattttccacataaggcatatagttatttcacataaccaacaaca |
176136 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0001; HSP #3
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| Q |
87 |
acatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcat |
160 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| ||||| ||||||||| |||||| | |||||||||||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
153018 |
acatctcaaaatatgacaatgccaaatgatactcaaca-ctacttaaacatcatacataatccacataatgcat |
152946 |
T |
 |
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Target: scaffold0001; HSP #4
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| Q |
115 |
ataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaaca |
188 |
Q |
| |
|
|||| ||| |||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||| || ||||| ||||||||| ||||| |
|
|
| T |
446597 |
ataaacaataacaacttcaacatcatacatattccacataatgcatatataactatatcacattactaacaaca |
446670 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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| Q |
18 |
catacatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaaca |
66 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
168734 |
catacattttccacataaggcatatagttatttcacataagcaacaaca |
168782 |
T |
 |
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Target: scaffold0001; HSP #6
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87 |
acatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatata |
163 |
Q |
| |
|
||||| ||| |||| |||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||| || | ||||||| ||||||| |
|
|
| T |
168684 |
acatcccaaaatatgacaataccaaatgataatcaac-actacttaaacatcatacattttccacataaggcatata |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0001; HSP #7
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87 |
acatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatata |
163 |
Q |
| |
|
||||| ||| |||| |||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||| || | ||||||| ||||||| |
|
|
| T |
176038 |
acatcccaaaatatgacaataccaaatgataatcaac-actacttaaacatcatacattttccacataaggcatata |
176113 |
T |
 |
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18 |
catacatcttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaaca |
66 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5754 |
catacattttccacataagacatataattatttcacataaccaacaaca |
5802 |
T |
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96 |
gatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacatta |
179 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||| | | |||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| |||||| |
|
|
| T |
1832 |
gatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatc-tcaacatcatatataatttatgtaatgcatatacatttatatcacatta |
1750 |
T |
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| Q |
96 |
gatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacatta |
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||| | |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||| |
|
|
| T |
8100 |
gatataacaatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacatta |
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T |
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96 |
gatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaatc |
195 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||| | ||||| |||||| |
|
|
| T |
8108 |
gatataacaatatcaaatacaaatcaacaacatcacaa-catcatatataattcatgtaatgtatatacaactatataacattatcaacaacattaaatc |
8010 |
T |
 |
| Q |
196 |
atat |
199 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
8009 |
atat |
8006 |
T |
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89 |
atctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcat |
160 |
Q |
| |
|
||||||| |||| |||||| ||||||||| |||||| | |||||||||||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
28978 |
atctcaaaatatgacaataccaaatgatagtcaaca-ctacttaaacatcatacataatccacataatgcat |
29048 |
T |
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89 |
atctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcat |
160 |
Q |
| |
|
||||||| |||| |||||| ||||||||| |||||| | |||||||||||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
34443 |
atctcaaaatatgacaataccaaatgatagtcaaca-ctacttaaacatcatacataatccacataatgcat |
34513 |
T |
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26 |
ttccacataaggcatataaatatttcacataaccaacaaca |
66 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
70576 |
ttccacataaggcatataattatttcacataaccaagaaca |
70536 |
T |
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96 |
gatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaatc |
195 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| | ||| ||||| | ||||||||| | |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||| || ||||| || ||| |
|
|
| T |
12851 |
gatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatcataaacatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattaataacaacattagatc |
12950 |
T |
 |
| Q |
196 |
atat |
199 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
12951 |
atat |
12954 |
T |
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111 |
aatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaatcat |
197 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||| ||| ||||| ||| ||| | ||||||||||||||| || ||||| ||||||| | |||| |||||||| |
|
|
| T |
14633 |
aatggtaatcaacaacagcttcaacataatacatattccacataatgcatatataattatatcacattaccaacaactttaaatcat |
14547 |
T |
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111 |
aatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatatt |
173 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||| |||||| || |||||| |
|
|
| T |
11609 |
aatgataatcaacaacaacttcaacatcatacacttttcacataatacatatataactatatt |
11547 |
T |
 |
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| Q |
87 |
acatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatg |
157 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| | |||||||||||| | ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
24289 |
acatctcaaaatatgacaataccaaatgacaatcaaca-ctacttaaacatcacacataatccacataatg |
24358 |
T |
 |
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| Q |
87 |
acatctcaagatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatg |
157 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| | |||||||||||| | ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
35159 |
acatctcaaaatatgacaataccaaatgacaatcaaca-ctacttaaacatcacacataatccacataatg |
35228 |
T |
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96 |
gatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaatc |
195 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| ||||||||||| || ||| |||| | |||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||| | ||||| || ||| |
|
|
| T |
6620 |
gatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatc |
6718 |
T |
 |
| Q |
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atatta |
201 |
Q |
| |
|
|||||| |
|
|
| T |
6719 |
atatta |
6724 |
T |
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141 |
atataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaatcatattataatagcttcacagatcatcagtaatatt |
230 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| | ||||| ||||||| || | ||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
18017 |
atataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcatcataaatcagcttcacagatcatcattaatatt |
17928 |
T |
 |
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| Q |
96 |
gatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatattacattactatcaacactaaatc |
195 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| ||||||||||| || ||| |||| | |||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||| | ||||| || ||| |
|
|
| T |
19349 |
gatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatca-acataattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatc |
19447 |
T |
 |
| Q |
196 |
atatta |
201 |
Q |
| |
|
|||||| |
|
|
| T |
19448 |
atatta |
19453 |
T |
 |
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| Q |
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gatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatat |
172 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| ||||||||||| || ||| |||| | |||||||| ||||| |||||||| ||||| |
|
|
| T |
214 |
gatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatat |
290 |
T |
 |
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gatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacatcatatataattcacataatgcatatacaaatatat |
172 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||| |||||||| |||||| |||||||| ||||| |
|
|
| T |
2254 |
gatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaatatca-gcataattcatataatgtatatacaattatat |
2179 |
T |
 |
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ttccacataaggcatataaatatttcaca |
54 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15597 |
ttccacataaggcatataaatatttcaca |
15625 |
T |
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gatataacaatatcaaatgataatcaacaacaacttaaacat-catatataattcacataatgcatatacaaatatattacatta |
179 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| | ||| ||||| || ||| || ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||| |
|
|
| T |
53585 |
gatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatctcaaatattcatatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacatta |
53501 |
T |
 |
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ttccacataaggcatataaatatttcaca |
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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ttccacataaggcatataaatatttcaca |
57011 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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