View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF9821_low_21 (Length: 249)

Name: NF9821_low_21
Description: NF9821
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF9821_low_21
NF9821_low_21
[»] chr1 (31 HSPs)
chr1 (1-242)||(29003303-29003544)
chr1 (1-242)||(28997587-28997828)
chr1 (1-237)||(6996295-6996531)
chr1 (1-230)||(31736808-31737037)
chr1 (1-237)||(50078126-50078362)
chr1 (2-242)||(25250614-25250854)
chr1 (5-217)||(16429679-16429890)
chr1 (1-182)||(31424366-31424547)
chr1 (43-231)||(51750754-51750942)
chr1 (43-231)||(28841139-28841327)
chr1 (43-231)||(16226885-16227073)
chr1 (43-231)||(28203073-28203261)
chr1 (43-231)||(51758251-51758439)
chr1 (43-227)||(27338507-27338691)
chr1 (43-210)||(20300869-20301036)
chr1 (44-231)||(3805513-3805700)
chr1 (43-217)||(8348439-8348613)
chr1 (45-227)||(47178083-47178265)
chr1 (43-230)||(13127109-13127296)
chr1 (45-196)||(50168683-50168834)
chr1 (45-231)||(31657853-31658039)
chr1 (119-196)||(16456402-16456479)
chr1 (1-50)||(16227402-16227451)
chr1 (1-50)||(28841623-28841672)
chr1 (1-50)||(51751271-51751320)
chr1 (45-196)||(28222754-28222905)
chr1 (1-39)||(27338126-27338164)
chr1 (1-39)||(47178607-47178645)
chr1 (1-50)||(20301365-20301414)
chr1 (119-193)||(3157350-3157424)
chr1 (5-39)||(28202697-28202731)
[»] chr8 (17 HSPs)
chr8 (1-237)||(41383419-41383654)
chr8 (43-231)||(18811480-18811668)
chr8 (43-231)||(27827757-27827945)
chr8 (43-231)||(15069339-15069527)
chr8 (68-231)||(21481268-21481431)
chr8 (43-231)||(43080374-43080562)
chr8 (43-222)||(31577668-31577846)
chr8 (45-231)||(34255839-34256025)
chr8 (45-196)||(4732342-4732493)
chr8 (43-217)||(17848312-17848486)
chr8 (1-50)||(18811997-18812046)
chr8 (45-231)||(5591534-5591720)
chr8 (1-39)||(27828285-27828323)
chr8 (1-50)||(43080891-43080940)
chr8 (1-39)||(15069870-15069908)
chr8 (129-229)||(10684838-10684938)
chr8 (129-229)||(35744803-35744903)
[»] chr7 (39 HSPs)
chr7 (1-237)||(7471313-7471549)
chr7 (1-232)||(28486290-28486521)
chr7 (1-231)||(21678785-21679015)
chr7 (1-224)||(20298048-20298271)
chr7 (1-222)||(24749322-24749543)
chr7 (43-231)||(38394712-38394900)
chr7 (1-133)||(4294049-4294181)
chr7 (43-231)||(7093835-7094023)
chr7 (45-231)||(7351027-7351213)
chr7 (45-231)||(22135529-22135715)
chr7 (45-231)||(40550556-40550742)
chr7 (43-231)||(1048663-1048851)
chr7 (1-115)||(9679500-9679614)
chr7 (43-229)||(36178-36364)
chr7 (43-231)||(44725301-44725489)
chr7 (45-194)||(31159078-31159227)
chr7 (43-231)||(13289873-13290061)
chr7 (129-237)||(4295401-4295509)
chr7 (54-217)||(47675479-47675642)
chr7 (43-189)||(24816744-24816890)
chr7 (45-217)||(48490068-48490240)
chr7 (43-196)||(6047245-6047398)
chr7 (44-221)||(26213456-26213632)
chr7 (45-231)||(6593866-6594052)
chr7 (45-231)||(18391504-18391690)
chr7 (50-196)||(3890772-3890918)
chr7 (1-50)||(1048285-1048334)
chr7 (1-50)||(31157281-31157330)
chr7 (1-50)||(38395227-38395276)
chr7 (1-39)||(7093457-7093495)
chr7 (1-50)||(36693-36742)
chr7 (1-50)||(7350647-7350696)
chr7 (1-50)||(22136046-22136095)
chr7 (1-50)||(40551073-40551122)
chr7 (43-98)||(3903814-3903869)
chr7 (3-50)||(44725826-44725873)
chr7 (119-217)||(6570650-6570748)
chr7 (129-229)||(12405750-12405850)
chr7 (129-229)||(24261897-24261997)
[»] chr3 (50 HSPs)
chr3 (1-231)||(28101340-28101570)
chr3 (1-237)||(53917006-53917242)
chr3 (1-231)||(3315378-3315608)
chr3 (1-242)||(43422802-43423041)
chr3 (1-230)||(42990996-42991225)
chr3 (45-231)||(456603-456789)
chr3 (43-230)||(4309884-4310071)
chr3 (43-231)||(11168797-11168985)
chr3 (43-226)||(7769256-7769439)
chr3 (43-230)||(43226774-43226961)
chr3 (45-231)||(6065169-6065355)
chr3 (43-231)||(5192346-5192534)
chr3 (43-231)||(10957697-10957885)
chr3 (43-231)||(18098545-18098733)
chr3 (43-222)||(23634150-23634329)
chr3 (43-230)||(5898106-5898293)
chr3 (49-231)||(27421334-27421516)
chr3 (45-231)||(23199471-23199657)
chr3 (45-231)||(5259655-5259841)
chr3 (45-231)||(37407338-37407524)
chr3 (110-215)||(25634589-25634694)
chr3 (45-217)||(29811532-29811704)
chr3 (45-231)||(10209850-10210036)
chr3 (131-222)||(1619936-1620027)
chr3 (45-196)||(9635456-9635607)
chr3 (1-66)||(891239-891304)
chr3 (142-231)||(53597922-53598011)
chr3 (119-231)||(4600126-4600238)
chr3 (45-196)||(10056929-10057080)
chr3 (45-196)||(10061373-10061524)
chr3 (45-196)||(10063595-10063746)
chr3 (45-196)||(10065817-10065968)
chr3 (1-50)||(5898625-5898674)
chr3 (1-50)||(6064789-6064838)
chr3 (45-230)||(7762921-7763106)
chr3 (1-50)||(10957319-10957368)
chr3 (43-96)||(15822016-15822069)
chr3 (1-50)||(18098164-18098213)
chr3 (1-50)||(43227293-43227342)
chr3 (1-48)||(4309503-4309550)
chr3 (129-196)||(10059151-10059218)
chr3 (45-231)||(6717162-6717348)
chr3 (119-225)||(15830648-15830754)
chr3 (129-231)||(22834425-22834527)
chr3 (1-50)||(457120-457169)
chr3 (1-50)||(11169314-11169363)
chr3 (44-97)||(15830573-15830626)
chr3 (120-157)||(24933175-24933212)
chr3 (45-217)||(32891753-32891925)
chr3 (45-98)||(22834341-22834394)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (1-235)||(50731-50965)
[»] chr5 (32 HSPs)
chr5 (1-231)||(27911149-27911379)
chr5 (1-231)||(658735-658965)
chr5 (5-214)||(18510750-18510959)
chr5 (62-232)||(25806177-25806347)
chr5 (43-230)||(6745786-6745973)
chr5 (43-231)||(31543450-31543638)
chr5 (43-231)||(34478793-34478981)
chr5 (45-231)||(10750415-10750601)
chr5 (1-222)||(20043710-20043919)
chr5 (45-231)||(15356225-15356411)
chr5 (45-231)||(23665763-23665949)
chr5 (44-230)||(18467402-18467588)
chr5 (1-114)||(31467225-31467340)
chr5 (45-231)||(29721024-29721210)
chr5 (45-231)||(9788554-9788740)
chr5 (45-196)||(16408019-16408170)
chr5 (43-217)||(534422-534596)
chr5 (45-231)||(26171416-26171602)
chr5 (43-217)||(42427762-42427936)
chr5 (1-50)||(10750932-10750981)
chr5 (51-196)||(13694480-13694625)
chr5 (119-231)||(40380765-40380877)
chr5 (1-39)||(20505199-20505237)
chr5 (1-39)||(34478415-34478453)
chr5 (1-50)||(6746305-6746354)
chr5 (1-50)||(23666280-23666329)
chr5 (1-50)||(31543967-31544016)
chr5 (45-184)||(16545136-16545275)
chr5 (1-39)||(18467932-18467970)
chr5 (1-50)||(15355845-15355894)
chr5 (129-229)||(33790728-33790828)
chr5 (129-229)||(37557198-37557298)
[»] chr4 (33 HSPs)
chr4 (1-235)||(14788765-14788999)
chr4 (1-237)||(22802069-22802305)
chr4 (2-242)||(36920831-36921071)
chr4 (1-234)||(16454071-16454304)
chr4 (2-242)||(47563515-47563755)
chr4 (43-231)||(22133991-22134179)
chr4 (45-231)||(22782113-22782299)
chr4 (43-231)||(22046089-22046277)
chr4 (43-231)||(12402470-12402658)
chr4 (43-231)||(16933522-16933710)
chr4 (43-231)||(11007942-11008130)
chr4 (83-227)||(18536918-18537062)
chr4 (138-231)||(36379055-36379148)
chr4 (45-231)||(9175848-9176034)
chr4 (45-231)||(5872464-5872650)
chr4 (43-231)||(12395234-12395421)
chr4 (43-231)||(12400196-12400383)
chr4 (45-217)||(12743261-12743433)
chr4 (45-229)||(52094695-52094879)
chr4 (58-217)||(10113643-10113802)
chr4 (129-231)||(3578154-3578256)
chr4 (45-231)||(5136741-5136927)
chr4 (1-84)||(36379144-36379227)
chr4 (45-231)||(8394067-8394253)
chr4 (1-50)||(5099771-5099820)
chr4 (1-50)||(22045711-22045760)
chr4 (1-50)||(22133613-22133662)
chr4 (1-50)||(22781733-22781782)
chr4 (45-196)||(7123392-7123543)
chr4 (43-197)||(5206994-5207148)
chr4 (119-196)||(4588636-4588713)
chr4 (1-39)||(11007564-11007602)
chr4 (1-39)||(16933144-16933182)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (1-242)||(80572-80813)
[»] chr2 (15 HSPs)
chr2 (1-237)||(6263486-6263722)
chr2 (45-231)||(35217346-35217532)
chr2 (45-231)||(36560517-36560703)
chr2 (43-231)||(19503710-19503898)
chr2 (43-231)||(21520068-21520256)
chr2 (83-231)||(22405344-22405492)
chr2 (1-99)||(31734211-31734309)
chr2 (83-194)||(28569839-28569950)
chr2 (138-231)||(34574627-34574720)
chr2 (1-39)||(19503332-19503370)
chr2 (1-39)||(21519690-21519728)
chr2 (1-39)||(36560140-36560178)
chr2 (129-229)||(19348690-19348790)
chr2 (9-50)||(35216974-35217015)
chr2 (44-96)||(42019221-42019273)
[»] chr6 (22 HSPs)
chr6 (1-231)||(15533934-15534164)
chr6 (1-222)||(3631275-3631496)
chr6 (43-197)||(25462839-25462993)
chr6 (45-231)||(26931939-26932125)
chr6 (45-231)||(33309606-33309792)
chr6 (110-231)||(17012780-17012901)
chr6 (45-231)||(26067771-26067957)
chr6 (43-227)||(12157972-12158156)
chr6 (111-231)||(26944241-26944361)
chr6 (45-230)||(5408402-5408587)
chr6 (45-230)||(5412727-5412912)
chr6 (112-231)||(3395113-3395232)
chr6 (44-231)||(12936624-12936811)
chr6 (44-189)||(12910948-12911093)
chr6 (45-231)||(16553325-16553511)
chr6 (45-231)||(16629881-16630067)
chr6 (45-196)||(34165568-34165719)
chr6 (45-98)||(16567768-16567821)
chr6 (43-231)||(16651585-16651774)
chr6 (1-50)||(26067391-26067440)
chr6 (47-231)||(30444010-30444194)
chr6 (1-39)||(33310134-33310172)
[»] scaffold1674 (1 HSPs)
scaffold1674 (1-242)||(784-1025)
[»] scaffold0140 (2 HSPs)
scaffold0140 (45-231)||(22843-23029)
scaffold0140 (1-50)||(23360-23409)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (110-231)||(26331-26452)
[»] scaffold1899 (2 HSPs)
scaffold1899 (43-231)||(341-529)
scaffold1899 (1-50)||(858-907)
[»] scaffold0025 (2 HSPs)
scaffold0025 (43-222)||(72891-73070)
scaffold0025 (1-39)||(72510-72548)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (43-222)||(34276-34455)
scaffold0011 (1-39)||(34803-34841)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (56-231)||(115252-115427)
[»] scaffold1908 (1 HSPs)
scaffold1908 (45-98)||(148-201)
[»] scaffold0219 (1 HSPs)
scaffold0219 (43-222)||(26747-26926)
[»] scaffold0355 (1 HSPs)
scaffold0355 (129-226)||(454-551)
[»] scaffold0197 (1 HSPs)
scaffold0197 (129-229)||(14883-14983)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (129-229)||(149529-149629)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 218; Significance: 1e-120; HSPs: 31)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 242
Target Start/End: Original strand, 29003303 - 29003544
Alignment:
Q  1 cttcttcatcctccaaacaacaccacgccatcagagcactcacatcctcaagatgcacctcaatgtcctccaaatcaccaatgattttgttgaactccat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29003303 cttcttcatcctccaaacaacaccacaccatcagagcactcacatcctcaagatgcacctcaatgttctccaaatcaccaatgattttgttgaactccat 29003402  T
Q  101 aagcagctgcatgatagcctttgactttaccatctcgaatgagtaaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaaatat 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29003403 aagcagttgcatgatagcctttgactttaccatctcgaatgagtaaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagattttgtcatatacaaatat 29003502  T
Q  201 ttgaactttgaccacattgatgtcgcggttgtatcctatgct 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  29003503 ttgaactttgaccacattgatgtcgtggttgtatcctttgct 29003544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 242
Target Start/End: Original strand, 28997587 - 28997828
Alignment:
Q  1 cttcttcatcctccaaacaacaccacgccatcagagcactcacatcctcaagatgcacctcaatgtcctccaaatcaccaatgattttgttgaactccat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28997587 cttcttcatcctccaaacaacaccacaccatcagagcacaaacatcaacaagatgcacctcaatgttctccaaatcaccaatgattttgttgaactccat 28997686  T
Q  101 aagcagctgcatgatagcctttgactttaccatctcgaatgagtaaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaaatat 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28997687 aagcagttgcatgatagcctttgactttaccatctcgaatgagtaaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagattttgtcatatacaaatat 28997786  T
Q  201 ttgaactttgaccacattgatgtcgcggttgtatcctatgct 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  28997787 ttgaactttgaccacattgatgtcgtggttgtatcctttgct 28997828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 6996531 - 6996295
Alignment:
Q  1 cttcttcatcctccaaacaacaccacgccatcagagcactcacatcctcaagatgcacctcaatgtcctccaaatcaccaatgattttgttgaactccat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  6996531 cttcttcatcctccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatccccaagacgcacctcaatgttctccaaatcaccaatgattttgttgaactccac 6996432  T
Q  101 aagcagctgcatgatagcctttgactttaccatctcgaatgagtaaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaaatat 200  Q
    ||| |||| |||||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6996431 aagtagctccatgatggtctttgactttaccatcttaaatgagtaaagttgttgctttaggacttgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaatat 6996332  T
Q  201 ttgaactttgaccacattgatgtcgcggttgtatcct 237  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  6996331 tcgaactttgaccacatcgatgtcgcggttggatcct 6996295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 31736808 - 31737037
Alignment:
Q  1 cttcttcatcctccaaacaacaccacgccatcagagcactcacatcctcaagatgcacctcaatgtcctccaaatcaccaatgattttgttgaactccat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| ||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  31736808 cttcttcatcctccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctcaagacgcaacttaatgttctccaaatcaccaatgattttgttgaactccac 31736907  T
Q  101 aagcagctgcatgatagcctttgactttaccatctcgaatgagtaaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaaatat 200  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31736908 aagtagctccatgatagcctttgactttaccatcttgaatgagtaaagttgttgctttaggactttccgatgagccaaagactttgtcatatacaaatat 31737007  T
Q  201 ttgaactttgaccacattgatgtcgcggtt 230  Q
    | ||||||||||||||| |||| |||||||    
T  31737008 tcgaactttgaccacatcgatgccgcggtt 31737037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 50078126 - 50078362
Alignment:
Q  1 cttcttcatcctccaaacaacaccacgccatcagagcactcacatcctcaagatgcacctcaatgtcctccaaatcaccaatgattttgttgaactccat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  50078126 cttcttcatcctccaaacaacaccacaccatcagagcacctgcatctccaagatgcacctcaatgttctccaaatcaccaatgattttgttgaactccgt 50078225  T
Q  101 aagcagctgcatgatagcctttgactttaccatctcgaatgagtaaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaaatat 200  Q
    |||  ||| |||||| |||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||    
T  50078226 aagttgctccatgatggcctttgactctataatcttgaatgagtaaagttgttgctttaggacttgccgatgagcccaagattttgtcatatacaaatat 50078325  T
Q  201 ttgaactttgaccacattgatgtcgcggttgtatcct 237  Q
    |  ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||    
T  50078326 tcaaactttgaccacattgatgccgcagttgtttcct 50078362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Original strand, 25250614 - 25250854
Alignment:
Q  2 ttcttcatcctccaaacaacaccacgccatcagagcactcacatcctcaagatgcacctcaatgtcctccaaatcaccaatgattttgttgaactccata 101  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||| |||| || |||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  25250614 ttcttcaccctccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctcaaggtgcagcttaatgttgtccaaatcatcaatgattttgttgaactccgta 25250713  T
Q  102 agcagctgcatgatagcctttgactttaccatctcgaatgagtaaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaaatatt 201  Q
    ||   || |||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  25250714 agtttctccatgatggcctttgactctaccatcttgaatgagtagagttgttgctttaggaattaccgaagagccaaagactttgccatatacaaatatt 25250813  T
Q  202 tgaactttgaccacattgatgtcgcggttgtatcctatgct 242  Q
    |||||||| ||||||| |||  ||||||||| |||| ||||    
T  25250814 tgaactttaaccacatcgataccgcggttgtttcctttgct 25250854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 5 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 16429890 - 16429679
Alignment:
Q  5 ttcatcctccaaacaacaccacgccatcagagcactcacatcctcaagatgcacctcaatgtcctccaaatcaccaatgattttgttgaactccataagc 104  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||| | ||||||||||||||| |||     
T  16429890 ttcatcctccaaacaacaccacaccaccagagcac-cgcatcctcaagatgcacctcaataatctccaaatcatcaagggttttgttgaactccacaagt 16429792  T
Q  105 agctgcatgatagcctttgactttaccatctcgaatgagtaaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaaatatttga 204  Q
     ||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||    
T  16429791 tgctccatgatggcctttgactctaccatcttgaatgagtaaagttgttactttaggaatttctgatgagccaaagactttgtcatatacaaacacttga 16429692  T
Q  205 actttgaccacat 217  Q
    ||||| |||||||    
T  16429691 actttaaccacat 16429679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Original strand, 31424366 - 31424547
Alignment:
Q  1 cttcttcatcctccaaacaacaccacgccatcagagcactcacatcctcaagatgcacctcaatgtcctccaaatcaccaatgattttgttgaactccat 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  31424366 cttcttcatcctccaaacaataccacaccatcagagcacccgcatcctcaagacacacctcaatgttctccaaatcaccaatgattttgttgaactccac 31424465  T
Q  101 aagcagctgcatgatagcctttgactttaccatctcgaatgagtaaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagac 182  Q
    ||| || | |||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||  ||||||||||| | |||  |||||| |||||||    
T  31424466 aagtagatccatgatggcctttgactctaccatcttgaatgagtaaatatgttgctttagaaattgttgatgagccaaagac 31424547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 43 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 51750942 - 51750754
Alignment:
Q  43 catcctcaagatgcacctcaatgtcctccaaatcaccaatgattttgttgaactccataagcagctgcatgatagcctttgactttaccatctcgaatga 142  Q
    |||||||||| ||||||||||| | |||||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||  ||| |||||| |||||||||| |||||||  ||||||    
T  51750942 catcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttgactctaccatcctgaatga 51750843  T
Q  143 gtaaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaaatatttgaactttgaccacattgatgtcgcggttg 231  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||| |||||| |||| ||||||||    
T  51750842 gtagagttgttgctttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgccgcggttg 51750754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 43 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 28841327 - 28841139
Alignment:
Q  43 catcctcaagatgcacctcaatgtcctccaaatcaccaatgattttgttgaactccataagcagctgcatgatagcctttgactttaccatctcgaatga 142  Q
    |||||||||| | ||||||||| | |||||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||  ||| |||||| |||||||||| |||||||  ||||||    
T  28841327 catcctcaagtttcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttgactctaccatcctgaatga 28841228  T
Q  143 gtaaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaaatatttgaactttgaccacattgatgtcgcggttg 231  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||| |||||| |||| ||||||||    
T  28841227 gtagagttgttgctttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgccgcggttg 28841139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 43 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 16227073 - 16226885
Alignment:
Q  43 catcctcaagatgcacctcaatgtcctccaaatcaccaatgattttgttgaactccataagcagctgcatgatagcctttgactttaccatctcgaatga 142  Q
    |||||||||| ||||||||||| | |||||| ||| | | |||||||||||||||| ||||  ||| |||||| |||||||||| | |||||  ||||||    
T  16227073 catcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatctaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttgactcttccatcctgaatga 16226974  T
Q  143 gtaaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaaatatttgaactttgaccacattgatgtcgcggttg 231  Q
    ||| ||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||| |||||| |||| ||||||||    
T  16226973 gtagagtcgttgctttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgccgcggttg 16226885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 43 - 231
Target Start/End: Original strand, 28203073 - 28203261
Alignment:
Q  43 catcctcaagatgcacctcaatgtcctccaaatcaccaatgattttgttgaactccataagcagctgcatgatagcctttgactttaccatctcgaatga 142  Q
    |||||||||| ||||||||||| | |||||| ||| ||| |||||||||||||||| | ||  ||| |||||| || |||||||  ||||||| ||||||    
T  28203073 catcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtcagttgctccatgatggcttttgactccaccatcttgaatga 28203172  T
Q  143 gtaaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaaatatttgaactttgaccacattgatgtcgcggttg 231  Q
    ||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||  ||||||| |||||| |||| ||||||||    
T  28203173 gtagagttgttgctttaggaattgtcgatgagtcaaagactttgtcttatacaaagattccaactttgcccacatcgatgccgcggttg 28203261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 43 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 51758439 - 51758251
Alignment:
Q  43 catcctcaagatgcacctcaatgtcctccaaatcaccaatgattttgttgaactccataagcagctgcatgatagcctttgactttaccatctcgaatga 142  Q
    |||||||||| ||||||||||| | |||||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||   || |||||| |||||||||| |||||||  ||||||    
T  51758439 catcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttactccatgatggcctttgactctaccatcctgaatga 51758340  T
Q  143 gtaaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaaatatttgaactttgaccacattgatgtcgcggttg 231  Q
    ||| |||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| |||  || |||| |||||| |||||||||||||    
T  51758339 gtagagttgttgctttaggaattgtcgatgagccaaagactttgtcgtatacaaagattccaattttgcccacatcgatgtcgcggttg 51758251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 43 - 227
Target Start/End: Original strand, 27338507 - 27338691
Alignment:
Q  43 catcctcaagatgcacctcaatgtcctccaaatcaccaatgattttgttgaactccataagcagctgcatgatagcctttgactttaccatctcgaatga 142  Q
    |||||||||| ||||||||||| |  ||||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||  ||| |||||| | ||||||||  ||||||  ||||||    
T  27338507 catcctcaagttgcacctcaatattatccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggtctttgactccaccatcctgaatga 27338606  T
Q  143 gtaaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaaatatttgaactttgaccacattgatgtcgcg 227  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||| |||||| |||| ||||    
T  27338607 gtagagttgttgctttaggaattgccaatgagtcaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgccgcg 27338691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 43 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 20301036 - 20300869
Alignment:
Q  43 catcctcaagatgcacctcaatgtcctccaaatcaccaatgattttgttgaactccataagcagctgcatgatagcctttgactttaccatctcgaatga 142  Q
    |||||||||| ||||||||||| | |||||| ||  ||| |||||||||||||||| ||||  ||| |||||| |||||||||| |||||||  ||||||    
T  20301036 catcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcttcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttgactctaccatcctgaatga 20300937  T
Q  143 gtaaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaaatatttgaactttg 210  Q
    ||| |||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  20300936 gtagagttgttgctttaggaattgacgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttg 20300869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 44 - 231
Target Start/End: Original strand, 3805513 - 3805700
Alignment:
Q  44 atcctcaagatgcacctcaatgtcctccaaatcaccaatgattttgttgaactccataagcagctgcatgatagcctttgactttaccatctcgaatgag 143  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||  ||||||||||||||| ||||  ||| |||||| |||||||||| | |||||| ||||||     
T  3805513 atcctcaagatgcacctcaatgttctccaagtcatcaagaattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttgactctgccatcttgaatgat 3805612  T
Q  144 taaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaaatatttgaactttgaccacattgatgtcgcggttg 231  Q
    || |||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| || |||||| ||||  | |  ||| |||||||||| |||||||||||||    
T  3805613 tacagttgttgctttaggaattgccaatgagccaaagatttggtcataaacaacaactctaacgttgaccacatcgatgtcgcggttg 3805700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 43 - 217
Target Start/End: Original strand, 8348439 - 8348613
Alignment:
Q  43 catcctcaagatgcacctcaatgtcctccaaatcaccaatgattttgttgaactccataagcagctgcatgatagcctttgactttaccatctcgaatga 142  Q
    |||||||||||||||||||| | |  ||||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||  ||| |||||| ||||||||||  ||||||| ||||||    
T  8348439 catcctcaagatgcacctcattattttccaagtcatcaaagattttgttgaactccgtaagttgctacatgatggcctttgactccaccatcttgaatga 8348538  T
Q  143 gtaaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaaatatttgaactttgaccacat 217  Q
    ||| |||||||||||||||| ||| |||||   |||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||    
T  8348539 gtagagttgttgctttaggaattgtcgatgtcccaaagactttgtcatatacaaagactctaactttgaccacat 8348613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 45 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 47178265 - 47178083
Alignment:
Q  45 tcctcaagatgcacctcaatgtcctccaaatcaccaatgattttgttgaactccataagcagctgcatgatagcctttgactttaccatctcgaatgagt 144  Q
    |||||||| ||||||||||| | |||||| ||| | | |||||||||||||||| ||||  ||| |||||| |||||||||| | |||||  ||||||||    
T  47178265 tcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatctaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttgactcttccatcctgaatgagt 47178166  T
Q  145 aaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaaatatttgaactttgaccacattgatgtcgcg 227  Q
    | ||| |||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||  ||||||| |||||| |||| ||||    
T  47178165 agagtcgttgttttaggaattgccgatgagccaatgactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgccgcg 47178083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 43 - 230
Target Start/End: Original strand, 13127109 - 13127296
Alignment:
Q  43 catcctcaagatgcacctcaatgtcctccaaatcaccaatgattttgttgaactccataagcagctgcatgatagcctttgactttaccatctcgaatga 142  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||  ||| ||||||   ||||||||   |||| | ||||||    
T  13127109 catcctcaagatgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttaaactccataagttgctacatgatgatctttgactccgccatattgaatga 13127208  T
Q  143 gtaaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaaatatttgaactttgaccacattgatgtcgcggtt 230  Q
    ||| ||||||| ||||| || ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| | |  ||||||||  |||| ||||||||||||    
T  13127209 gtatagttgtttctttaagaattgtcgatgagccaaagaatttgtcatatacaaagactccaactttgaagacatcgatgtcgcggtt 13127296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 45 - 196
Target Start/End: Original strand, 50168683 - 50168834
Alignment:
Q  45 tcctcaagatgcacctcaatgtcctccaaatcaccaatgattttgttgaactccataagcagctgcatgatagcctttgactttaccatctcgaatgagt 144  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||| |   ||| ||| |  | ||||||||  ||||||| |||||| |    
T  50168683 tcctcaagttgcacctcaatgttctccaaatcatcaaggattttgttgaactccattaattgctccatcacggtctttgactccaccatcttgaatgaat 50168782  T
Q  145 aaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaa 196  Q
    | ||||||||||| |||| ||||| ||||| |||| |||| |||||||||||    
T  50168783 agagttgttgcttaaggaattgcctatgagccaaaaacttggtcatatacaa 50168834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 45 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 31658039 - 31657853
Alignment:
Q  45 tcctcaagatgcacctcaatgtcctccaaatcaccaatgattttgttgaactccataagcagctgcatgatagcctttgactttaccatctcgaatgagt 144  Q
    |||||||| | ||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| | |   |||   | |  | ||||||||  ||||||| ||||||||    
T  31658039 tcctcaagcttcacctcaatgttctccaaatcatcaaggattttgttgaactccgttaattgctctgtcacggtctttgactccaccatcttgaatgagt 31657940  T
Q  145 aaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaaatatttgaactttgaccacattgatgtcgcggttg 231  Q
    ||||||||||||| |||| || || || || |||||| || |||||||||||  | |  |||||||||||||| || | ||||||||    
T  31657939 aaagttgttgcttaaggaatttcctataagccaaagatttggtcatatacaatgactccaactttgaccacatcgacgccgcggttg 31657853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 119 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 16456479 - 16456402
Alignment:
Q  119 ctttgactttaccatctcgaatgagtaaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaa 196  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||    
T  16456479 ctttgactctatcatcttgaatgagtagagttgttgctttaggatttgcctatgagccaaagtcttggtcatatacaa 16456402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 16227451 - 16227402
Alignment:
Q  1 cttcttcatcctccaaacaacaccacgccatcagagcactcacatcctca 50  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||    
T  16227451 cttcttcatcctccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctca 16227402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 28841672 - 28841623
Alignment:
Q  1 cttcttcatcctccaaacaacaccacgccatcagagcactcacatcctca 50  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||    
T  28841672 cttcttcatcctccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctca 28841623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 51751320 - 51751271
Alignment:
Q  1 cttcttcatcctccaaacaacaccacgccatcagagcactcacatcctca 50  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||    
T  51751320 cttcttcatcctccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctca 51751271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 45 - 196
Target Start/End: Original strand, 28222754 - 28222905
Alignment:
Q  45 tcctcaagatgcacctcaatgtcctccaaatcaccaatgattttgttgaactccataagcagctgcatgatagcctttgactttaccatctcgaatgagt 144  Q
    |||||||| | ||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||  | |   |||   | |  | ||||||||  ||||||| |||||| |    
T  28222754 tcctcaagtttcacctcaatgttctccaaatcatcaaggattttgttgaactctgtcaattgctctgtcacggtctttgactccaccatcttgaatgaat 28222853  T
Q  145 aaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaa 196  Q
    | ||||||||||| |||| ||||| ||||| |||||| || |||||||||||    
T  28222854 agagttgttgcttaaggaattgcctatgagccaaagatttggtcatatacaa 28222905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 39
Target Start/End: Original strand, 27338126 - 27338164
Alignment:
Q  1 cttcttcatcctccaaacaacaccacgccatcagagcac 39  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27338126 cttcttcatcctccaaacaacaccacaccatcagagcac 27338164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 47178645 - 47178607
Alignment:
Q  1 cttcttcatcctccaaacaacaccacgccatcagagcac 39  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  47178645 cttcttcatcctccaaacaacaccacaccatcagagcac 47178607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 20301414 - 20301365
Alignment:
Q  1 cttcttcatcctccaaacaacaccacgccatcagagcactcacatcctca 50  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | ||||||||    
T  20301414 cttcttcatcctccaaacaacaccacatcatcagagcacccgcatcctca 20301365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 119 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 3157424 - 3157350
Alignment:
Q  119 ctttgactttaccatctcgaatgagtaaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatata 193  Q
    ||||||||  ||||||| |||||| || ||||||||||| |||| ||| | ||||| ||||||||| ||||||||    
T  3157424 ctttgactccaccatcttgaatgaatagagttgttgcttaaggaattgtctatgagccaaagacttggtcatata 3157350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 39
Target Start/End: Original strand, 28202697 - 28202731
Alignment:
Q  5 ttcatcctccaaacaacaccacgccatcagagcac 39  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28202697 ttcatcctccaaacaacaccacaccatcagagcac 28202731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 17)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 41383654 - 41383419
Alignment:
Q  1 cttcttcatcctccaaacaacaccacgccatcagagcactcacatcctcaagatgcacctcaatgtcctccaaatcaccaatgattttgttgaactccat 100  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  41383654 cttcatcatcctccaaacaa-accacaccatcagagcagtcacatcctcaagatgcacctcaatgttctccaaatcaccaatgattttgttgaactccac 41383556  T
Q  101 aagcagctgcatgatagcctttgactttaccatctcgaatgagtaaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaaatat 200  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41383555 aagtagctccatgatagcctttgactttaccatctcaaatgagtaaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaaatat 41383456  T
Q  201 ttgaactttgaccacattgatgtcgcggttgtatcct 237  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  41383455 ttgaactttgaccacatcgatgtcgcggttgtttcct 41383419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 43 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 18811668 - 18811480
Alignment:
Q  43 catcctcaagatgcacctcaatgtcctccaaatcaccaatgattttgttgaactccataagcagctgcatgatagcctttgactttaccatctcgaatga 142  Q
    |||||||||| ||||||||||| | |||||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||  ||| |||||| |||||||||| |||||||  ||||||    
T  18811668 catcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttgactctaccatcctgaatga 18811569  T
Q  143 gtaaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaaatatttgaactttgaccacattgatgtcgcggttg 231  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  | ||||| |||||| |||| ||||||||    
T  18811568 gtagagttgttgctttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccatctttgcccacatcgatgccgcggttg 18811480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 43 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 27827945 - 27827757
Alignment:
Q  43 catcctcaagatgcacctcaatgtcctccaaatcaccaatgattttgttgaactccataagcagctgcatgatagcctttgactttaccatctcgaatga 142  Q
    |||||||||| ||||||||||| | |||||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||  ||| |||||| |||||||||| |||||||  ||||||    
T  27827945 catcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttgactctaccatcctgaatga 27827846  T
Q  143 gtaaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaaatatttgaactttgaccacattgatgtcgcggttg 231  Q
    ||| ||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||| |||||| |||| ||||||||    
T  27827845 gtagagtcgttgctttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgccgcggttg 27827757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 43 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 15069527 - 15069339
Alignment:
Q  43 catcctcaagatgcacctcaatgtcctccaaatcaccaatgattttgttgaactccataagcagctgcatgatagcctttgactttaccatctcgaatga 142  Q
    |||||||||| ||||||||||| | |||||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||  ||| |||||| ||||||||||  ||||||  ||||||    
T  15069527 catcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttgactccaccatcctgaatga 15069428  T
Q  143 gtaaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaaatatttgaactttgaccacattgatgtcgcggttg 231  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||| |||||| |||| ||| ||||    
T  15069427 gtagagttgttgctttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgccgcagttg 15069339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 68 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 21481431 - 21481268
Alignment:
Q  68 ctccaaatcaccaatgattttgttgaactccataagcagctgcatgatagcctttgactttaccatctcgaatgagtaaagttgttgctttaggacttgc 167  Q
    |||||| ||| ||| |||| |||||||||||  |||   || |||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||     
T  21481431 ctccaagtcatcaaggattctgttgaactccgcaaggttctccatgatggtctttgactctaccatcttgaatgagtaaaattgtttctttaggaattgg 21481332  T
Q  168 cgatgagtcaaagactttgtcatatacaaatatttgaactttgaccacattgatgtcgcggttg 231  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21481331 cgatgagccaaagactttgtcatatacaaatattcgaactttgaccacattgatgtcgcggttg 21481268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 43 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 43080562 - 43080374
Alignment:
Q  43 catcctcaagatgcacctcaatgtcctccaaatcaccaatgattttgttgaactccataagcagctgcatgatagcctttgactttaccatctcgaatga 142  Q
    |||||||||| ||||||||||| | |||||| ||| | | |||||||||||||||| ||||  ||| |||||| |||||||||| | |||||  ||||||    
T  43080562 catcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatctaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttgactcttccatcctgaatga 43080463  T
Q  143 gtaaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaaatatttgaactttgaccacattgatgtcgcggttg 231  Q
    ||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||| |||||| |||| ||||||||    
T  43080462 gtagagtcgttgttttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgccgcggttg 43080374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 43 - 222
Target Start/End: Original strand, 31577668 - 31577846
Alignment:
Q  43 catcctcaagatgcacctcaatgtcctccaaatcaccaatgattttgttgaactccataagcagctgcatgatagcctttgactttaccatctcgaatga 142  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||| ||| ||  |||||||||||||||| ||||  ||| |||||| ||| ||||||  ||||||| |||| |    
T  31577668 catcctcaagatgcacctcaatattctccaagtcatcatggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggccattgactccaccatcttgaat-a 31577766  T
Q  143 gtaaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaaatatttgaactttgaccacattgatg 222  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||| | | |  |||||||||||||| ||||    
T  31577767 gtagagttgttgctttaggaattgccgaagagccaaagactttgtcatatacacagactccaactttgaccacatcgatg 31577846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 45 - 231
Target Start/End: Original strand, 34255839 - 34256025
Alignment:
Q  45 tcctcaagatgcacctcaatgtcctccaaatcaccaatgattttgttgaactccataagcagctgcatgatagcctttgactttaccatctcgaatgagt 144  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||   |   ||| ||| |  | ||||||||  ||||||| ||||||||    
T  34255839 tcctcaagttgcacctcaatgttctccaaatcatcaaggattttgttgaactccgccaattgctccatcacggtctttgactccaccatcttgaatgagt 34255938  T
Q  145 aaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaaatatttgaactttgaccacattgatgtcgcggttg 231  Q
    | ||||||||||| |||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||  | |  |||||||||||||| ||||| |||||||    
T  34255939 agagttgttgcttaaggaattgcctatgagccaaagacttggtcatatacaacgactccaactttgaccacatcgatgttgcggttg 34256025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 45 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 4732493 - 4732342
Alignment:
Q  45 tcctcaagatgcacctcaatgtcctccaaatcaccaatgattttgttgaactccataagcagctgcatgatagcctttgactttaccatctcgaatgagt 144  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| | |   ||| ||| |  | ||||||||  ||||||| ||||||||    
T  4732493 tcctcaagttgcacctcaatgttctccaaatcatcaaggattttgttgaactccgttaattgctccatcacggtctttgactccaccatcttgaatgagt 4732394  T
Q  145 aaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaa 196  Q
    | ||||||||||| |||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||    
T  4732393 agagttgttgcttaaggaattgcctatgagccaaagacttggtcatatacaa 4732342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 43 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 17848486 - 17848312
Alignment:
Q  43 catcctcaagatgcacctcaatgtcctccaaatcaccaatgattttgttgaactccataagcagctgcatgatagcctttgactttaccatctcgaatga 142  Q
    |||||| ||||||||||||||| | |||||| ||| ||| |||| | ||||||| | ||||   || ||||||   ||||||||  | |||||  |||||    
T  17848486 catccttaagatgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattgtattgaacttcgtaagttactccatgatgaactttgactccaacatcttcaatga 17848387  T
Q  143 gtaaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaaatatttgaactttgaccacat 217  Q
    ||| |||||||||||||||| || |||||||| ||||||  |||||||||||||| | |  ||||||||||||||    
T  17848386 gtagagttgttgctttaggaatttccgatgagccaaagagattgtcatatacaaagactccaactttgaccacat 17848312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 18812046 - 18811997
Alignment:
Q  1 cttcttcatcctccaaacaacaccacgccatcagagcactcacatcctca 50  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||    
T  18812046 cttcttcatcctccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctca 18811997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 45 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 5591720 - 5591534
Alignment:
Q  45 tcctcaagatgcacctcaatgtcctccaaatcaccaatgattttgttgaactccataagcagctgcatgatagcctttgactttaccatctcgaatgagt 144  Q
    |||||||  ||||||||||||| |||||||||| |||  ||||||||||||||| | |   |||   | |  | |||| |||  ||||||| |||||| |    
T  5591720 tcctcaatttgcacctcaatgttctccaaatcatcaagaattttgttgaactccgtcaattgctctgtcacggtctttaactccaccatcttgaatgaat 5591621  T
Q  145 aaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaaatatttgaactttgaccacattgatgtcgcggttg 231  Q
    | ||||||||||| |||| ||||| ||||| |||||||||  ||||||||||  | |  |||||||||||||| || | ||||||||    
T  5591620 agagttgttgcttaaggaattgcctatgagccaaagacttgatcatatacaatgactccaactttgaccacatcgacgccgcggttg 5591534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 27828323 - 27828285
Alignment:
Q  1 cttcttcatcctccaaacaacaccacgccatcagagcac 39  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27828323 cttcttcatcctccaaacaacaccacaccatcagagcac 27828285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 43080940 - 43080891
Alignment:
Q  1 cttcttcatcctccaaacaacaccacgccatcagagcactcacatcctca 50  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||    
T  43080940 cttcttcttcctccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctca 43080891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 15069908 - 15069870
Alignment:
Q  1 cttcttcatcctccaaacaacaccacgccatcagagcac 39  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  15069908 cttcttcatcctccaaacaacaccacaccatcaaagcac 15069870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 129 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 10684938 - 10684838
Alignment:
Q  129 accatctcgaatgagtaaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaaatatttgaactttgaccacattgatgtcgcgg 228  Q
    ||||||| |||||| || ||||||||||| | || ||||| ||||| |||||| || |||||||||||  | |  ||||||| |||||| |||| |||||    
T  10684938 accatcttgaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcgg 10684839  T
Q  229 t 229  Q
    |    
T  10684838 t 10684838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 129 - 229
Target Start/End: Original strand, 35744803 - 35744903
Alignment:
Q  129 accatctcgaatgagtaaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaaatatttgaactttgaccacattgatgtcgcgg 228  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||| | || ||| | ||||| |||||| || |||||||||||  | |  ||||||| |||||| |||| |||||    
T  35744803 accatcttgaatgagtagagttgttgcttcaagagttgtctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcgg 35744902  T
Q  229 t 229  Q
    |    
T  35744903 t 35744903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 169; Significance: 9e-91; HSPs: 39)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 7471313 - 7471549
Alignment:
Q  1 cttcttcatcctccaaacaacaccacgccatcagagcactcacatcctcaagatgcacctcaatgtcctccaaatcaccaatgattttgttgaactccat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  7471313 cttcttcatcctccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatccccaagacgcacctcaatgttctccaaatcaccaatgattttgttgaactccac 7471412  T
Q  101 aagcagctgcatgatagcctttgactttaccatctcgaatgagtaaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaaatat 200  Q
    ||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  7471413 aagtagctccatgatagccttttactttaccatcttgaatgagtaaagttgttgctttaggacttgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagat 7471512  T
Q  201 ttgaactttgaccacattgatgtcgcggttgtatcct 237  Q
    |  |||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  7471513 tccaactttgaccacatcgatgccgcggttgtatcct 7471549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 28486521 - 28486290
Alignment:
Q  1 cttcttcatcctccaaacaacaccacgccatcagagcactcacatcctcaagatgcacctcaatgtcctccaaatcaccaatgattttgttgaactccat 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||   ||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  28486521 cttcttcattctccaaacaacaccacaccatcagagcacctgcatccccaagacgcacctcaatgttctccaaatcaccaatgattttgttgaactccac 28486422  T
Q  101 aagcagctgcatgatagcctttgactttaccatctcgaatgagtaaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaaatat 200  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28486421 aagtagctccatgatagcctttgactttaccatcttgaatgagtaaagttgttgctttaggactttccgatgagccaaagactttgtcatatacaaatat 28486322  T
Q  201 ttgaactttgaccacattgatgtcgcggttgt 232  Q
    | ||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  28486321 tcgaactttgaccacatcgatgccgcggttgt 28486290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 21679015 - 21678785
Alignment:
Q  1 cttcttcatcctccaaacaacaccacgccatcagagcactcacatcctcaagatgcacctcaatgtcctccaaatcaccaatgattttgttgaactccat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  21679015 cttcttcatcctccaaacaacactacgccatcagagtacccgcatcctcaagacgcacctcaatgttctccaaatcaccaatgattttgttgaactccac 21678916  T
Q  101 aagcagctgcatgatagcctttgactttaccatctcgaatgagtaaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaaatat 200  Q
    ||| |||| |||||| |||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||| | ||||||| ||    
T  21678915 aagtagctccatgattgccttttattttaccatcttgaatgagtaaagttgttgctttaggaactgccgatgagccaaagactttgtaaaatacaaagat 21678816  T
Q  201 ttgaactttgaccacattgatgtcgcggttg 231  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21678815 tcgaactttgaccacatcgatgtcgcggttg 21678785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 20298271 - 20298048
Alignment:
Q  1 cttcttcatcctccaaacaacaccacgccatcagagcactcacatcctcaagatgcacctcaatgtcctccaaatcaccaatgattttgttgaactccat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||  || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  20298271 cttcttcatcctccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctcaagacacaacttaatgttctccaaatcaccaatgattttgttgaactccac 20298172  T
Q  101 aagcagctgcatgatagcctttgactttaccatctcgaatgagtaaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaaatat 200  Q
    |||||||| |||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  20298171 aagcagctccatgaaggcctttgactttaccatcttgaatgagtaaagttgttgctttaggacttgtcgatgagccaaagactttgtcatatacaaagat 20298072  T
Q  201 ttgaactttgaccacattgatgtc 224  Q
    |   |||||| |||||| ||||||    
T  20298071 tccgactttgcccacatcgatgtc 20298048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 24749543 - 24749322
Alignment:
Q  1 cttcttcatcctccaaacaacaccacgccatcagagcactcacatcctcaagatgcacctcaatgtcctccaaatcaccaatgattttgttgaactccat 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  24749543 cttcttcatcttccaaacaacaccacaccatcagagcacccacatcctcaagatgcacctcaatgttctccaaatcaccaatgattttgttgaactccac 24749444  T
Q  101 aagcagctgcatgatagcctttgactttaccatctcgaatgagtaaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaaatat 200  Q
    ||| |||| |||||| ||||||||||  ||||||  ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||| ||    
T  24749443 aagtagctccatgatggcctttgactccaccatcctgaatgagtagagttattgctttaggaattgccgatcagccaaagactttgtcatatacaaagat 24749344  T
Q  201 ttgaactttgaccacattgatg 222  Q
    || ||||||| |||||| ||||    
T  24749343 ttcaactttgcccacatcgatg 24749322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 43 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 38394900 - 38394712
Alignment:
Q  43 catcctcaagatgcacctcaatgtcctccaaatcaccaatgattttgttgaactccataagcagctgcatgatagcctttgactttaccatctcgaatga 142  Q
    |||||||||| ||||||||||| | |||||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||  ||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  38394900 catcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttgactctaccatcttgaatga 38394801  T
Q  143 gtaaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaaatatttgaactttgaccacattgatgtcgcggttg 231  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||| |||||| |||| ||||||||    
T  38394800 gtagagttgttgctttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgccgcggttg 38394712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 4294049 - 4294181
Alignment:
Q  1 cttcttcatcctccaaacaacaccacgccatcagagcactcacatcctcaagatgcacctcaatgtcctccaaatcaccaatgattttgttgaactccat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4294049 cttcttcatcctccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatccccaagatgcacctcaatgttctccaaatcaccaatgattttgttgaactccat 4294148  T
Q  101 aagcagctgcatgatagcctttgactttaccat 133  Q
    ||| |||| |||||  |||||||||||||||||    
T  4294149 aagtagctccatgaaggcctttgactttaccat 4294181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 43 - 231
Target Start/End: Original strand, 7093835 - 7094023
Alignment:
Q  43 catcctcaagatgcacctcaatgtcctccaaatcaccaatgattttgttgaactccataagcagctgcatgatagcctttgactttaccatctcgaatga 142  Q
    |||||||||| ||||||||||| | |||||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||  ||| |||||| |||||||||| |||||||  ||||||    
T  7093835 catcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttgactctaccatcctgaatga 7093934  T
Q  143 gtaaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaaatatttgaactttgaccacattgatgtcgcggttg 231  Q
    ||| |||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||| | |  ||||||| |||||| |||||||||||||    
T  7093935 gtagagttgttgctttaggaattgtcgatgagccaaagactttgtcatatacaaagactccaactttgcccacatcgatgtcgcggttg 7094023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 45 - 231
Target Start/End: Original strand, 7351027 - 7351213
Alignment:
Q  45 tcctcaagatgcacctcaatgtcctccaaatcaccaatgattttgttgaactccataagcagctgcatgatagcctttgactttaccatctcgaatgagt 144  Q
    |||||||| ||||||||||| | |||||| ||| | | |||||||||||||||| ||||  ||| ||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||    
T  7351027 tcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatctaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatgacctttgactctaccatcttgaatgagt 7351126  T
Q  145 aaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaaatatttgaactttgaccacattgatgtcgcggttg 231  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||| |||||| |||| ||||||||    
T  7351127 agagttgttgctttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgccgcggttg 7351213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 45 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 22135715 - 22135529
Alignment:
Q  45 tcctcaagatgcacctcaatgtcctccaaatcaccaatgattttgttgaactccataagcagctgcatgatagcctttgactttaccatctcgaatgagt 144  Q
    |||||||| ||||||||||| | |||||| ||| | | |||||||||||||||| ||||  ||| |||||| |||||||||| |||||||  ||||||||    
T  22135715 tcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatctaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttgactctaccatcctgaatgagt 22135616  T
Q  145 aaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaaatatttgaactttgaccacattgatgtcgcggttg 231  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  22135615 agagttgttgctttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccatattgatgccgcggttg 22135529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 45 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 40550742 - 40550556
Alignment:
Q  45 tcctcaagatgcacctcaatgtcctccaaatcaccaatgattttgttgaactccataagcagctgcatgatagcctttgactttaccatctcgaatgagt 144  Q
    |||||||| ||||||||||| | |||||| ||| | | |||||||||||||||| ||||  ||| |||||| |||||||||| |||||||  ||||||||    
T  40550742 tcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatctaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttgactctaccatcctgaatgagt 40550643  T
Q  145 aaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaaatatttgaactttgaccacattgatgtcgcggttg 231  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  40550642 agagttgttgctttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccatattgatgccgcggttg 40550556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 43 - 231
Target Start/End: Original strand, 1048663 - 1048851
Alignment:
Q  43 catcctcaagatgcacctcaatgtcctccaaatcaccaatgattttgttgaactccataagcagctgcatgatagcctttgactttaccatctcgaatga 142  Q
    |||||||||| ||||||||||| | |||||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||  ||| |||||| |||||||||| |||||||  ||||||    
T  1048663 catcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttgactctaccatcctgaatga 1048762  T
Q  143 gtaaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaaatatttgaactttgaccacattgatgtcgcggttg 231  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||  ||||||| ||| || |||| ||||||||    
T  1048763 gtagagttgttgctttaggaattgccgatgcgccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccatatcgatgccgcggttg 1048851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 9679614 - 9679500
Alignment:
Q  1 cttcttcatcctccaaacaacaccacgccatcagagcactcacatcctcaagatgcacctcaatgtcctccaaatcaccaatgattttgttgaactccat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  9679614 cttcttcatcctccaaacaacaccacaccataagaacactcacatcctcaagatgcacctcaatgttctccaaatcaccaatgattttgttgaactccac 9679515  T
Q  101 aagcagctgcatgat 115  Q
    ||| |||| ||||||    
T  9679514 aagtagctccatgat 9679500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 43 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 36364 - 36178
Alignment:
Q  43 catcctcaagatgcacctcaatgtcctccaaatcaccaatgattttgttgaactccataagcagctgcatgatagcctttgactttaccatctcgaatga 142  Q
    |||||||||| || |||||||| | |||||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||  ||| |||||| ||||||||||  ||||||  ||||||    
T  36364 catcctcaagttgtacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttgactccaccatcctgaatga 36265  T
Q  143 gtaaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaaatatttgaactttgaccacattgatgtcgcggt 229  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||  ||||||| |||||| |||| ||||||    
T  36264 gtagagttgttgctttaggaattgccgatgagctaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgccgcggt 36178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 43 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 44725489 - 44725301
Alignment:
Q  43 catcctcaagatgcacctcaatgtcctccaaatcaccaatgattttgttgaactccataagcagctgcatgatagcctttgactttaccatctcgaatga 142  Q
    |||||||||| ||||||||||| | |||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||  |||  ||||| ||||||||||  ||||||  |||| |    
T  44725489 catcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccataagttgctctatgatggcctttgactccaccatcctgaataa 44725390  T
Q  143 gtaaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaaatatttgaactttgaccacattgatgtcgcggttg 231  Q
    ||| ||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||| ||| || |||| ||||||||    
T  44725389 gtagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccaaatcgatgccgcggttg 44725301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 45 - 194
Target Start/End: Original strand, 31159078 - 31159227
Alignment:
Q  45 tcctcaagatgcacctcaatgtcctccaaatcaccaatgattttgttgaactccataagcagctgcatgatagcctttgactttaccatctcgaatgagt 144  Q
    |||||||| ||||||||||| | |||||| ||| | | |||||||||||||||| ||||  ||| |||||| |||||||||| |||||||  ||||||||    
T  31159078 tcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatctaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttgactctaccatcctgaatgagt 31159177  T
Q  145 aaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatac 194  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31159178 agagttgttgctttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatac 31159227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 43 - 231
Target Start/End: Original strand, 13289873 - 13290061
Alignment:
Q  43 catcctcaagatgcacctcaatgtcctccaaatcaccaatgattttgttgaactccataagcagctgcatgatagcctttgactttaccatctcgaatga 142  Q
    |||| |||||||||||||| || | |||||| ||| ||| || ||||||||||||||||||  ||| |||||| |||||| |||  ||||||| ||||||    
T  13289873 catcgtcaagatgcacctccatattctccaagtcatcaaggaatttgttgaactccataagttgctccatgatggcctttaactccaccatcttgaatga 13289972  T
Q  143 gtaaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaaatatttgaactttgaccacattgatgtcgcggttg 231  Q
    ||| |||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||  | |  ||||||||||||||  ||||| ||||||    
T  13289973 gtagagttgttgctttaggaattaccgatgagccaaagactttgtcatatacaatgactccaactttgaccacatcaatgtcccggttg 13290061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 129 - 237
Target Start/End: Original strand, 4295401 - 4295509
Alignment:
Q  129 accatctcgaatgagtaaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaaatatttgaactttgaccacattgatgtcgcgg 228  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||  |||||| |||| |||||    
T  4295401 accatcttgaatgagtaaagttgttgctttaggacttgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaacttttcccacatcgatgccgcgg 4295500  T
Q  229 ttgtatcct 237  Q
    || ||||||    
T  4295501 ttttatcct 4295509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 54 - 217
Target Start/End: Original strand, 47675479 - 47675642
Alignment:
Q  54 tgcacctcaatgtcctccaaatcaccaatgattttgttgaactccataagcagctgcatgatagcctttgactttaccatctcgaatgagtaaagttgtt 153  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| | |   ||| ||| | || ||||||||  ||||||| |||||| || |||||||    
T  47675479 tgcacctcaatgttctccaaatcatcaaggattttgttgaactccgttaattgctccatcacagtctttgactccaccatcttgaatgattagagttgtt 47675578  T
Q  154 gctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaaatatttgaactttgaccacat 217  Q
    |||| |||| ||||| ||||| |||||| || |||||||||||  | |  ||||||||||||||    
T  47675579 gcttaaggaattgcctatgagccaaagatttggtcatatacaatgactcaaactttgaccacat 47675642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 43 - 189
Target Start/End: Original strand, 24816744 - 24816890
Alignment:
Q  43 catcctcaagatgcacctcaatgtcctccaaatcaccaatgattttgttgaactccataagcagctgcatgatagcctttgactttaccatctcgaatga 142  Q
    |||| ||||||||||||| |||   |||||| ||| |||  ||||||||||||||| ||||  ||| ||||||  ||||||| |  ||||||| ||||||    
T  24816744 catcttcaagatgcaccttaatcatctccaagtcatcaagaattttgttgaactccgtaagttgctccatgatgacctttgaatccaccatcttgaatga 24816843  T
Q  143 gtaaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtca 189  Q
    ||| |||||||||||||||| |||  |||||| ||||||||||||||    
T  24816844 gtagagttgttgctttaggaattgtagatgagccaaagactttgtca 24816890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 45 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 48490240 - 48490068
Alignment:
Q  45 tcctcaagatgcacctcaatgtcctccaaatcaccaatgattttgttgaactccataagcagctgcatgatagcctttgactttaccatctcgaatgagt 144  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||||| | |   ||| ||| |  | ||||||||  ||||||| ||||||||    
T  48490240 tcctcaagtttcacctcaatgttctccaaatcattaaggattttgttgaactccgttaaatgctccatcacggtctttgactccaccatcttgaatgagt 48490141  T
Q  145 aaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaaatatttgaactttgaccacat 217  Q
    | ||||||||||| |||| ||||| ||||| |||||| ||||| ||||||||  | |  ||||||||||||||    
T  48490140 agagttgttgcttaaggaattgcctatgagccaaagattttgtaatatacaatgactccaactttgaccacat 48490068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 43 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 6047398 - 6047245
Alignment:
Q  43 catcctcaagatgcacctcaatgtcctccaaatcaccaatgattttgttgaactccataagcagctgcatgatagcctttgactttaccatctcgaatga 142  Q
    |||||| || ||||| |||||||| |||||| ||| ||| ||| ||||| |||||| ||||   ||| ||||| | ||||||||  ||||||| ||||||    
T  6047398 catcctaaaaatgcatctcaatgttctccaagtcatcaaggatattgtttaactccgtaagttactgaatgatggactttgactccaccatcttgaatga 6047299  T
Q  143 gtaaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaa 196  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||  ||||| |||||| ||  ||||||||||    
T  6047298 gtagagttgttgctttaggaattgcgtatgagccaaagatttgttcatatacaa 6047245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 44 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 26213632 - 26213456
Alignment:
Q  44 atcctcaagatgcacctcaatgtcctccaaatcaccaatgattttgttgaactccataagcagctgcatgatagcctttgactttaccatctcgaatgag 143  Q
    |||||||| | |||||||||| | |||||| ||| ||| |||||||||||||||  ||||   || |||||  ||||||||||  ||||||| |||||||    
T  26213632 atcctcaataggcacctcaatattctccaagtcatcaaagattttgttgaactctgtaagtttctccatgag-gcctttgactccaccatcttgaatgag 26213534  T
Q  144 taaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaaatatttgaactttgaccacattgat 221  Q
    || |||||||||||||||| ||||  ||||| |||||| || ||| |||||||  | |  || |||||||||||||||    
T  26213533 tagagttgttgctttaggaattgcaaatgagccaaagatttggtcctatacaatgactccaaatttgaccacattgat 26213456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 45 - 231
Target Start/End: Original strand, 6593866 - 6594052
Alignment:
Q  45 tcctcaagatgcacctcaatgtcctccaaatcaccaatgattttgttgaactccataagcagctgcatgatagcctttgactttaccatctcgaatgagt 144  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||  | | ||| ||||||||||||   |   ||| ||| |  | ||||||||  ||||||| ||||||||    
T  6593866 tcctcaagttgcacctcaatgttctccaaatcgtcgaggatcttgttgaactccgccaattgctccatcacggtctttgactccaccatcttgaatgagt 6593965  T
Q  145 aaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaaatatttgaactttgaccacattgatgtcgcggttg 231  Q
    | ||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| ||||| |||||||||||  |||  ||||| ||||| || |||| ||||||||    
T  6593966 agagttgttgcttaaggaattgcctatgagccaacgacttggtcatatacaacgattccaacttagaccatatcgatgccgcggttg 6594052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 45 - 231
Target Start/End: Original strand, 18391504 - 18391690
Alignment:
Q  45 tcctcaagatgcacctcaatgtcctccaaatcaccaatgattttgttgaactccataagcagctgcatgatagcctttgactttaccatctcgaatgagt 144  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||  | | ||| ||||||||||||   |   ||| ||| |  | ||||||||  ||||||| ||||||||    
T  18391504 tcctcaagttgcacctcaatgttctccaaatcgtcgaggatcttgttgaactccgccaattgctccatcacggtctttgactccaccatcttgaatgagt 18391603  T
Q  145 aaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaaatatttgaactttgaccacattgatgtcgcggttg 231  Q
    | ||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| ||||| |||||||||||  |||  ||||| ||||| || |||| ||||||||    
T  18391604 agagttgttgcttaaggaattgcctatgagccaacgacttggtcatatacaacgattccaacttagaccatatcgatgccgcggttg 18391690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 50 - 196
Target Start/End: Original strand, 3890772 - 3890918
Alignment:
Q  50 aagatgcacctcaatgtcctccaaatcaccaatgattttgttgaactccataagcagctgcatgatagcctttgactttaccatctcgaatgagtaaagt 149  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||  || ||||||||||||||| || ||  ||| ||||||  |||||||||   |||| |  ||||| || |||    
T  3890772 aagatgcacctcaatgttctccatatcattaaggattttgttgaactctattagttgcttcatgatgacctttgactcccccatatttaatgaatagagt 3890871  T
Q  150 tgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaa 196  Q
    | | | ||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||    
T  3890872 tttggttttaggaattgcctatgagtcaaaggcttggtcatatacaa 3890918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Original strand, 1048285 - 1048334
Alignment:
Q  1 cttcttcatcctccaaacaacaccacgccatcagagcactcacatcctca 50  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||    
T  1048285 cttcttcatcctccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctca 1048334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Original strand, 31157281 - 31157330
Alignment:
Q  1 cttcttcatcctccaaacaacaccacgccatcagagcactcacatcctca 50  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||    
T  31157281 cttcttcatcctccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctca 31157330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 38395276 - 38395227
Alignment:
Q  1 cttcttcatcctccaaacaacaccacgccatcagagcactcacatcctca 50  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||    
T  38395276 cttcttcatcctccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctca 38395227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 39
Target Start/End: Original strand, 7093457 - 7093495
Alignment:
Q  1 cttcttcatcctccaaacaacaccacgccatcagagcac 39  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7093457 cttcttcatcctccaaacaacaccacaccatcagagcac 7093495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 36742 - 36693
Alignment:
Q  1 cttcttcatcctccaaacaacaccacgccatcagagcactcacatcctca 50  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  |||||||||    
T  36742 cttcttcatcctccaaacaacaccacaccattagagcacctacatcctca 36693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Original strand, 7350647 - 7350696
Alignment:
Q  1 cttcttcatcctccaaacaacaccacgccatcagagcactcacatcctca 50  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||    
T  7350647 cttcttcttcctccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctca 7350696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 22136095 - 22136046
Alignment:
Q  1 cttcttcatcctccaaacaacaccacgccatcagagcactcacatcctca 50  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||    
T  22136095 cttcttcttcctccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctca 22136046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 40551122 - 40551073
Alignment:
Q  1 cttcttcatcctccaaacaacaccacgccatcagagcactcacatcctca 50  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||    
T  40551122 cttcttcttcctccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctca 40551073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 43 - 98
Target Start/End: Original strand, 3903814 - 3903869
Alignment:
Q  43 catcctcaagatgcacctcaatgtcctccaaatcaccaatgattttgttgaactcc 98  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||| | |||  |||||||||||||||    
T  3903814 catcttcaagatgcacctcaatgttctccaaattatcaagaattttgttgaactcc 3903869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 3 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 44725873 - 44725826
Alignment:
Q  3 tcttcatcctccaaacaacaccacgccatcagagcactcacatcctca 50  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||    
T  44725873 tcttcgtcctccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctca 44725826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 119 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 6570748 - 6570650
Alignment:
Q  119 ctttgactttaccatctcgaatgagtaaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaaatatttgaactttgaccacat 217  Q
    ||||||||  || |||| ||||||| | ||||||||||| |||| ||||| ||||| |||||| || |||||||||||  | |  ||||||||||||||    
T  6570748 ctttgactccacaatcttgaatgaggagagttgttgcttaaggaattgcctatgagccaaagatttggtcatatacaatgactgcaactttgaccacat 6570650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 129 - 229
Target Start/End: Original strand, 12405750 - 12405850
Alignment:
Q  129 accatctcgaatgagtaaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaaatatttgaactttgaccacattgatgtcgcgg 228  Q
    ||||||| |||||| || ||||||||||| | || ||||| ||||| |||||| || |||||||||||  | |  ||||| | |||||| ||||||||||    
T  12405750 accatcttgaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgtcgcgg 12405849  T
Q  229 t 229  Q
    |    
T  12405850 t 12405850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 129 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 24261997 - 24261897
Alignment:
Q  129 accatctcgaatgagtaaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaaatatttgaactttgaccacattgatgtcgcgg 228  Q
    ||||||| |||||| || ||||||||||| | || ||||| ||||| |||||| || |||||||||||  | |  ||||||| |||||| |||| |||||    
T  24261997 accatcttgaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcgg 24261898  T
Q  229 t 229  Q
    |    
T  24261897 t 24261897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 167; Significance: 1e-89; HSPs: 50)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 28101340 - 28101570
Alignment:
Q  1 cttcttcatcctccaaacaacaccacgccatcagagcactcacatcctcaagatgcacctcaatgtcctccaaatcaccaatgattttgttgaactccat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28101340 cttcttcatcctccaaacaacaccacaccatcagagaacccgcatcctcaagatgcacctcaatgttctccaaatcaccaatgattttgttgaactccat 28101439  T
Q  101 aagcagctgcatgatagcctttgactttaccatctcgaatgagtaaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaaatat 200  Q
    ||| |||| |||||| |||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28101440 aagtagctccatgatggcctttaactttaccatcttgaatgagtagagttgttactttaggaattaccgatgagccaaagactttgtcatatacaaatat 28101539  T
Q  201 ttgaactttgaccacattgatgtcgcggttg 231  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28101540 tcgaactttgaccacattgatgtcgcggttg 28101570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 53917006 - 53917242
Alignment:
Q  1 cttcttcatcctccaaacaacaccacgccatcagagcactcacatcctcaagatgcacctcaatgtcctccaaatcaccaatgattttgttgaactccat 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  53917006 cttcttcatcctacaaacaacaccacaccatcagagcactcgcatcctcaagacgcaacttaatgttctccaaatcaccaatgattttgttgaactccac 53917105  T
Q  101 aagcagctgcatgatagcctttgactttaccatctcgaatgagtaaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaaatat 200  Q
    ||| |||| |||||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  53917106 aagtagctccatgatggtctttgactttaccatcttaaatgagtaaagttgttgctttaggacttgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaatat 53917205  T
Q  201 ttgaactttgaccacattgatgtcgcggttgtatcct 237  Q
    | ||||||||||||||| |||| ||| ||||| ||||    
T  53917206 tcgaactttgaccacatcgatgccgcagttgtttcct 53917242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 3315608 - 3315378
Alignment:
Q  1 cttcttcatcctccaaacaacaccacgccatcagagcactcacatcctcaagatgcacctcaatgtcctccaaatcaccaatgattttgttgaactccat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  3315608 cttcttcatcctccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctcaagatgcacctcaatgttctctaaatcaccaatgattttgttgaactccac 3315509  T
Q  101 aagcagctgcatgatagcctttgactttaccatctcgaatgagtaaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaaatat 200  Q
    ||| |||| | |||| |||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3315508 aagtagctccgtgatggcctttgactctaccatcttgaatgaataaagttgttgctttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaatat 3315409  T
Q  201 ttgaactttgaccacattgatgtcgcggttg 231  Q
    |  |||||||  ||||| |||||||||||||    
T  3315408 tccaactttgcacacatcgatgtcgcggttg 3315378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 242
Target Start/End: Original strand, 43422802 - 43423041
Alignment:
Q  1 cttcttcatcctccaaacaacaccacgccatcagagcactcacatcctcaagatgcacctcaatgtcctccaaatcaccaatgattttgttgaactccat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |     
T  43422802 cttcttcatcctccaaacaacaccacaccatcagagcacctgcatcctcaagatgcacctcaatgttcttcaaatcaccaatgattttgttgaactcgac 43422901  T
Q  101 aagcagctgcatgatagcctttgactttaccatctcgaatgagtaaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaaatat 200  Q
    ||| |||| |||||| |||||||||||||| |  || ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  43422902 aagtagctccatgatggcctttgactttacaa--tccaatgagtaaagttgttgatttgggacttgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagat 43422999  T
Q  201 ttgaactttgaccacattgatgtcgcggttgtatcctatgct 242  Q
    |  ||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  43423000 tccaactttgcccacatcgatgtcgcggttgtaacctttgct 43423041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 42991225 - 42990996
Alignment:
Q  1 cttcttcatcctccaaacaacaccacgccatcagagcactcacatcctcaagatgcacctcaatgtcctccaaatcaccaatgattttgttgaactccat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||  ||| || ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  42991225 cttcttcatcctccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctcaagtcgcaacttaatgttctccaaatcagcaatgattttgttgaactccac 42991126  T
Q  101 aagcagctgcatgatagcctttgactttaccatctcgaatgagtaaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaaatat 200  Q
    |||||||| || ||  ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||    
T  42991125 aagcagctccaagaaggcctttgactttaccatattgaatgagtaaagttgttgctttaggacttgccgatgagccaaagactttgtcatatataaagat 42991026  T
Q  201 ttgaactttgaccacattgatgtcgcggtt 230  Q
    |  ||||||| |||||| ||||||||||||    
T  42991025 tccaactttgcccacatcgatgtcgcggtt 42990996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 45 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 456789 - 456603
Alignment:
Q  45 tcctcaagatgcacctcaatgtcctccaaatcaccaatgattttgttgaactccataagcagctgcatgatagcctttgactttaccatctcgaatgagt 144  Q
    |||||||| ||||||||||| | |||||| ||| | | |||||||||||||||| ||||  ||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||||||    
T  456789 tcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatctaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttgactctaccatcttgaatgagt 456690  T
Q  145 aaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaaatatttgaactttgaccacattgatgtcgcggttg 231  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||| |||||| |||||||||||||    
T  456689 agagttgttgctttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttg 456603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 43 - 230
Target Start/End: Original strand, 4309884 - 4310071
Alignment:
Q  43 catcctcaagatgcacctcaatgtcctccaaatcaccaatgattttgttgaactccataagcagctgcatgatagcctttgactttaccatctcgaatga 142  Q
    |||||||||| ||||||||||| | |||||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||  ||| |||||| | ||||||||  ||||||  ||||||    
T  4309884 catcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggtctttgactccaccatcctgaatga 4309983  T
Q  143 gtaaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaaatatttgaactttgaccacattgatgtcgcggtt 230  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| ||||||| |||||||    
T  4309984 gtagagttgttgctttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagatttcaactttgcccatattgatgccgcggtt 4310071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 43 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 11168985 - 11168797
Alignment:
Q  43 catcctcaagatgcacctcaatgtcctccaaatcaccaatgattttgttgaactccataagcagctgcatgatagcctttgactttaccatctcgaatga 142  Q
    |||||||||| ||||||||||| | |||||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||  ||| |||||| |||||||||| |||||||  ||||||    
T  11168985 catcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttgactctaccatccagaatga 11168886  T
Q  143 gtaaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaaatatttgaactttgaccacattgatgtcgcggttg 231  Q
    ||| ||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||| |||||| ||||  |||||||    
T  11168885 gtagagtagttgctttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgctgcggttg 11168797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 43 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 7769439 - 7769256
Alignment:
Q  43 catcctcaagatgcacctcaatgtcctccaaatcaccaatgattttgttgaactccataagcagctgcatgatagcctttgactttaccatctcgaatga 142  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||  ||| ||| |||||| | ||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||||    
T  7769439 catcctcaagatgcacctcaatattctccacgtcatcaaggattttttagaactccgtaagttgctccatgatagcctttgactccaccatcttgaatga 7769340  T
Q  143 gtaaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaaatatttgaactttgaccacattgatgtcgc 226  Q
    ||| ||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||||| ||||||||    
T  7769339 gtagagttgtttctttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagactccaactttgaccacatcgatgtcgc 7769256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 43 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 43226961 - 43226774
Alignment:
Q  43 catcctcaagatgcacctcaatgtcctccaaatcaccaatgattttgttgaactccataagcagctgcatgatagcctttgactttaccatctcgaatga 142  Q
    |||||||||| ||||||||||| | |||||| ||| ||| |||||||||||||| | ||||  ||| |||||| | ||||||||  ||||||| ||||||    
T  43226961 catcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaacttcgtaagttgctccatgatggtctttgactccaccatcttgaatga 43226862  T
Q  143 gtaaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaaatatttgaactttgaccacattgatgtcgcggtt 230  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||| |||||| |||| |||||||    
T  43226861 gtagagttgttgctttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgccgcggtt 43226774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 45 - 231
Target Start/End: Original strand, 6065169 - 6065355
Alignment:
Q  45 tcctcaagatgcacctcaatgtcctccaaatcaccaatgattttgttgaactccataagcagctgcatgatagcctttgactttaccatctcgaatgagt 144  Q
    |||||||| ||||||||||| | |||||| ||| | | |||||||||||||||| ||||  ||| |||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||    
T  6065169 tcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatctaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttgactctacgatcttgaatgagt 6065268  T
Q  145 aaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaaatatttgaactttgaccacattgatgtcgcggttg 231  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||  ||||||| |||||| |||| ||||||||    
T  6065269 agagttgttgctttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcgtatacaaagattccaactttgcccacatcgatgccgcggttg 6065355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 43 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 5192534 - 5192346
Alignment:
Q  43 catcctcaagatgcacctcaatgtcctccaaatcaccaatgattttgttgaactccataagcagctgcatgatagcctttgactttaccatctcgaatga 142  Q
    |||||||||| ||||||||||| | |||||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||  |||  ||||| |||||||||| |||||||  ||||||    
T  5192534 catcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctcaatgatggcctttgactctaccatcctgaatga 5192435  T
Q  143 gtaaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaaatatttgaactttgaccacattgatgtcgcggttg 231  Q
    ||| ||| |||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||| |||||| |||||||| ||||    
T  5192434 gtagagtcgttgctttaggaattgctgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcagttg 5192346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 43 - 231
Target Start/End: Original strand, 10957697 - 10957885
Alignment:
Q  43 catcctcaagatgcacctcaatgtcctccaaatcaccaatgattttgttgaactccataagcagctgcatgatagcctttgactttaccatctcgaatga 142  Q
    |||||||||| ||||||||||| | |||||| ||| ||| |||||||||||||| | ||||  ||| |||||| |||||||||| |||||||  ||||||    
T  10957697 catcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaacttcgtaagttgctccatgatggcctttgactctaccatcctgaatga 10957796  T
Q  143 gtaaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaaatatttgaactttgaccacattgatgtcgcggttg 231  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||| ||| || |||| | ||||||    
T  10957797 gtagagttgttgctttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccaaatcgatgccacggttg 10957885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 43 - 231
Target Start/End: Original strand, 18098545 - 18098733
Alignment:
Q  43 catcctcaagatgcacctcaatgtcctccaaatcaccaatgattttgttgaactccataagcagctgcatgatagcctttgactttaccatctcgaatga 142  Q
    |||||||||| ||||||||||| | |||||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||  ||| |||||| ||||||||||  ||||||  |||| |    
T  18098545 catcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttgactcaaccatcctgaataa 18098644  T
Q  143 gtaaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaaatatttgaactttgaccacattgatgtcgcggttg 231  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||  | ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  18098645 gtagagttgttgctttaggaattgcctatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccatctttgcccacattgatgccgcggttg 18098733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 43 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 23634329 - 23634150
Alignment:
Q  43 catcctcaagatgcacctcaatgtcctccaaatcaccaatgattttgttgaactccataagcagctgcatgatagcctttgactttaccatctcgaatga 142  Q
    |||||||||| ||||||||||| | |||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||   ||| |||||| ||||||||||  ||||||| ||||||    
T  23634329 catcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactctataaattgctccatgatggcctttgactccaccatcttgaatga 23634230  T
Q  143 gtaaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaaatatttgaactttgaccacattgatg 222  Q
     || |||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||| ||||    
T  23634229 ctagagttgttgctttagaaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgacctcatcgatg 23634150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 43 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 5898293 - 5898106
Alignment:
Q  43 catcctcaagatgcacctcaatgtcctccaaatcaccaatgattttgttgaactccataagcagctgcatgatagcctttgactttaccatctcgaatga 142  Q
    |||||||||| ||||||||||| | |||||| ||| | | |||||||||||||||| ||||  ||| |||||| | ||| ||||  |||||||  |||||    
T  5898293 catcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatctaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggtcttcgactccaccatcttaaatga 5898194  T
Q  143 gtaaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaaatatttgaactttgaccacattgatgtcgcggtt 230  Q
    ||| ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||| ||| || ||||||||||||    
T  5898193 gtagagttgttgctttaagaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccatatcgatgtcgcggtt 5898106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 49 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 27421516 - 27421334
Alignment:
Q  49 caagatgcacctcaatgtcctccaaatcaccaatgattttgttgaactccataagcagctgcatgatagcctttgactttaccatctcgaatgagtaaag 148  Q
    |||||||||||||||| | |||||| ||| ||| ||| |||||||||||| ||||  ||| ||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  27421516 caagatgcacctcaatattctccaagtcatcaaggatcttgttgaactccgtaagttgctccatgatgacctttgactctaccatcttgaatgagtaaag 27421417  T
Q  149 ttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaaatatttgaactttgaccacattgatgtcgcggttg 231  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||| |||||| |||||||   ||||  | |  ||||||||||||||  ||||||||||||    
T  27421416 ttgttgttttaggaattgccgatgagccaaagattttgtcaataacaacgactccaactttgaccacatcaatgtcgcggttg 27421334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 45 - 231
Target Start/End: Original strand, 23199471 - 23199657
Alignment:
Q  45 tcctcaagatgcacctcaatgtcctccaaatcaccaatgattttgttgaactccataagcagctgcatgatagcctttgactttaccatctcgaatgagt 144  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||||   |   ||| ||| || | ||||||||  ||||||| |||||| |    
T  23199471 tcctcaagttgcacctcaatgttctctaaatcatcaaggattttgttgaactccgccaattgctccatcatggtctttgactccaccatcttgaatgatt 23199570  T
Q  145 aaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaaatatttgaactttgaccacattgatgtcgcggttg 231  Q
    | ||||||||||| |||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||  |||  ||||||||||| || |||||||||||||    
T  23199571 agagttgttgcttaaggaattgcctatgagccaaagacttggtcatatacaacgattccaactttgaccatatcgatgtcgcggttg 23199657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 45 - 231
Target Start/End: Original strand, 5259655 - 5259841
Alignment:
Q  45 tcctcaagatgcacctcaatgtcctccaaatcaccaatgattttgttgaactccataagcagctgcatgatagcctttgactttaccatctcgaatgagt 144  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||    |   ||| ||| |  | ||||||||  ||||||| ||||||||    
T  5259655 tcctcaagttgcacctcaatgttctccaaatcatcaaggattttgttgaactctgccaattgctccatcaaggtctttgactccaccatcttgaatgagt 5259754  T
Q  145 aaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaaatatttgaactttgaccacattgatgtcgcggttg 231  Q
    | ||||||||||| |||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||  | |  |||||||||||||| |||| ||||||||    
T  5259755 agagttgttgcttaaggaattgcctatgagccaaagacttggtcatatacaacgactccaactttgaccacatagatgccgcggttg 5259841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 45 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 37407524 - 37407338
Alignment:
Q  45 tcctcaagatgcacctcaatgtcctccaaatcaccaatgattttgttgaactccataagcagctgcatgatagcctttgactttaccatctcgaatgagt 144  Q
    |||||||| |||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||||   |   ||| ||| |  | |||| |||  ||||||| ||||||||    
T  37407524 tcctcaagttgcacctcaatgttttccaaatcatcaaggattttgttgaactccgccaattgctccatcacggtctttaactccaccatcttgaatgagt 37407425  T
Q  145 aaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaaatatttgaactttgaccacattgatgtcgcggttg 231  Q
    | ||||||||||| |||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||  | |  ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37407424 agagttgttgcttaaggaattgcctatgagccaaagacttggtcatatacaacgactccaactttgaccacattgatgccgcggttg 37407338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 110 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 25634694 - 25634589
Alignment:
Q  110 catgatagcctttgactttaccatctcgaatgagtaaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaaatatttgaacttt 209  Q
    |||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | |  ||||||    
T  25634694 catgatggcctttgactccaccatcttgaatgagtagagttgtggctttaggaattgctgatgagtcaaagactttgtcatatataaagactctaacttt 25634595  T
Q  210 gaccac 215  Q
    ||||||    
T  25634594 gaccac 25634589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 45 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 29811704 - 29811532
Alignment:
Q  45 tcctcaagatgcacctcaatgtcctccaaatcaccaatgattttgttgaactccataagcagctgcatgatagcctttgactttaccatctcgaatgagt 144  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| | |   ||| ||| |  | ||||||||  ||||||| ||||||||    
T  29811704 tcctcaagttgcacctcaatgttctccaaatcatcaaggattttgttgaactccgttaattgctccatcacggtctttgactccaccatcttgaatgagt 29811605  T
Q  145 aaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaaatatttgaactttgaccacat 217  Q
    | ||||||||||| |||| ||||  ||||| ||||||| | || ||||||||  | |  ||||||||||||||    
T  29811604 agagttgttgcttaaggaattgcttatgagccaaagacctggttatatacaatgactccaactttgaccacat 29811532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 45 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 10210036 - 10209850
Alignment:
Q  45 tcctcaagatgcacctcaatgtcctccaaatcaccaatgattttgttgaactccataagcagctgcatgatagcctttgactttaccatctcgaatgagt 144  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||  ||| ||| ||||||||||||   |   ||| ||| |  | ||||||||  ||||||| ||||||||    
T  10210036 tcctcaagttgcacctcaatgttctccaaatcgtcaaggatcttgttgaactccgccaattgctccatcacggtctttgactccaccatcttgaatgagt 10209937  T
Q  145 aaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaaatatttgaactttgaccacattgatgtcgcggttg 231  Q
    | ||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| ||||| |||||||||||  |||  ||||| ||||| || |||| ||||||||    
T  10209936 agagttgttgcttaaggaattgcctatgagccaacgacttggtcatatacaatgattccaacttagaccatatcgatgccgcggttg 10209850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 131 - 222
Target Start/End: Original strand, 1619936 - 1620027
Alignment:
Q  131 catctcgaatgagtaaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaaatatttgaactttgaccacattgatg 222  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||| |||| | |  |||||||||||||| ||||    
T  1619936 catcttgaatgagtagagttgttgctttaggaattaccaatgagccaaagactttgtcatatgcaaagactccaactttgaccacatcgatg 1620027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 45 - 196
Target Start/End: Original strand, 9635456 - 9635607
Alignment:
Q  45 tcctcaagatgcacctcaatgtcctccaaatcaccaatgattttgttgaactccataagcagctgcatgatagcctttgactttaccatctcgaatgagt 144  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| |   |   ||| ||| |  | |||||| |  ||||||| ||||||||    
T  9635456 tcctcaagttgcacctcaatgttctccaaatcatcaaggattttgttgaactacgccaattgctccatcacggtctttgaatgcaccatcttgaatgagt 9635555  T
Q  145 aaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaa 196  Q
    | | ||||||||| |||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||    
T  9635556 agatttgttgcttaaggaattgcctatgagccaaagacttggtcatatacaa 9635607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 66
Target Start/End: Original strand, 891239 - 891304
Alignment:
Q  1 cttcttcatcctccaaacaacaccacgccatcagagcactcacatcctcaagatgcacctcaatgt 66  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||    
T  891239 cttcttcatcttccaaacaacaccacaccaccagagcaccctcatcctcaagacgcacctcaatgt 891304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 142 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 53598011 - 53597922
Alignment:
Q  142 agtaaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaaatatttgaactttgaccacattgatgtcgcggttg 231  Q
    |||| |||| ||||||||| | |||||||||||  ||||||||||||||||||||| | || || ||||||||||| |||| ||||||||    
T  53598011 agtagagttcttgctttagaaattgccgatgaggtaaagactttgtcatatacaaagacttcaattttgaccacatcgatgccgcggttg 53597922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 119 - 231
Target Start/End: Original strand, 4600126 - 4600238
Alignment:
Q  119 ctttgactttaccatctcgaatgagtaaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaaatatttgaactttgaccacatt 218  Q
    ||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| ||||| |||||||||||  |||  ||||| ||||| ||     
T  4600126 ctttgactccaccatcttgaatgagtagagttgttgcttaaggaattgcctatgagccaacgacttggtcatatacaacgattccaacttagaccatatc 4600225  T
Q  219 gatgtcgcggttg 231  Q
    |||| ||||||||    
T  4600226 gatgccgcggttg 4600238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 45 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 10057080 - 10056929
Alignment:
Q  45 tcctcaagatgcacctcaatgtcctccaaatcaccaatgattttgttgaactccataagcagctgcatgatagcctttgactttaccatctcgaatgagt 144  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||  | | ||| ||||||||||||   |   ||| ||| |  | ||||||||  ||||||| ||||||||    
T  10057080 tcctcaagttgcacctcaatgttctccaaatcgtcgaggatcttgttgaactccgccaattgctccatcacggtctttgactccaccatcttgaatgagt 10056981  T
Q  145 aaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaa 196  Q
    | ||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| ||||| |||||||||||    
T  10056980 agagttgttgcttaaggaattgcctatgagccaacgacttggtcatatacaa 10056929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 45 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 10061524 - 10061373
Alignment:
Q  45 tcctcaagatgcacctcaatgtcctccaaatcaccaatgattttgttgaactccataagcagctgcatgatagcctttgactttaccatctcgaatgagt 144  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||  | | ||| ||||||||||||   |   ||| ||| |  | ||||||||  ||||||| ||||||||    
T  10061524 tcctcaagttgcacctcaatgttctccaaatcgtcgaggatcttgttgaactccgccaattgctccatcacggtctttgactccaccatcttgaatgagt 10061425  T
Q  145 aaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaa 196  Q
    | ||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| ||||| |||||||||||    
T  10061424 agagttgttgcttaaggaattgcctatgagccaacgacttggtcatatacaa 10061373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 45 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 10063746 - 10063595
Alignment:
Q  45 tcctcaagatgcacctcaatgtcctccaaatcaccaatgattttgttgaactccataagcagctgcatgatagcctttgactttaccatctcgaatgagt 144  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||  | | ||| ||||||||||||   |   ||| ||| |  | ||||||||  ||||||| ||||||||    
T  10063746 tcctcaagttgcacctcaatgttctccaaatcgtcgaggatcttgttgaactccgccaattgctccatcacggtctttgactccaccatcttgaatgagt 10063647  T
Q  145 aaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaa 196  Q
    | ||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| ||||| |||||||||||    
T  10063646 agagttgttgcttaaggaattgcctatgagccaacgacttggtcatatacaa 10063595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 45 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 10065968 - 10065817
Alignment:
Q  45 tcctcaagatgcacctcaatgtcctccaaatcaccaatgattttgttgaactccataagcagctgcatgatagcctttgactttaccatctcgaatgagt 144  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||  | | ||| ||||||||||||   |   ||| ||| |  | ||||||||  ||||||| ||||||||    
T  10065968 tcctcaagttgcacctcaatgttctccaaatcgtcgaggatcttgttgaactccgccaattgctccatcacggtctttgactccaccatcttgaatgagt 10065869  T
Q  145 aaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaa 196  Q
    | ||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| ||||| |||||||||||    
T  10065868 agagttgttgcttaaggaattgcctatgagccaacgacttggtcatatacaa 10065817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 5898674 - 5898625
Alignment:
Q  1 cttcttcatcctccaaacaacaccacgccatcagagcactcacatcctca 50  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||    
T  5898674 cttcttcatcctccaaacaacaccacaccatcagagcacttgcatcctca 5898625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Original strand, 6064789 - 6064838
Alignment:
Q  1 cttcttcatcctccaaacaacaccacgccatcagagcactcacatcctca 50  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||    
T  6064789 cttcttcatcctccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctca 6064838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 45 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 7763106 - 7762921
Alignment:
Q  45 tcctcaagatgcacctcaatgtcctccaaatcaccaatgattttgttgaactccataagcagctgcatgatagcctttgactttaccatctcgaatgagt 144  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| | |   ||| ||| |  | ||||||||  |||||||  ||||| |    
T  7763106 tcctcaagttgcacctcaatgttctcaaaatcatcaaggattttgttgaactccgttaattgctccatcacggtctttgactccaccatcttaaatgaat 7763007  T
Q  145 aaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaaatatttgaactttgaccacattgatgtcgcggtt 230  Q
    | ||||||||||| | || ||||  ||||| ||||||||| |||||||| ||  | |  |||||||||||||| |||  |||||||    
T  7763006 agagttgttgcttaaagaattgcttatgagccaaagacttggtcatatataatgactccaactttgaccacatcgattccgcggtt 7762921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Original strand, 10957319 - 10957368
Alignment:
Q  1 cttcttcatcctccaaacaacaccacgccatcagagcactcacatcctca 50  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||    
T  10957319 cttcttcatcctccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctca 10957368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 43 - 96
Target Start/End: Original strand, 15822016 - 15822069
Alignment:
Q  43 catcctcaagatgcacctcaatgtcctccaaatcaccaatgattttgttgaact 96  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||||    
T  15822016 catcctcaagatgcacctcaatgttctccaaatcattaaggattttgttgaact 15822069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Original strand, 18098164 - 18098213
Alignment:
Q  1 cttcttcatcctccaaacaacaccacgccatcagagcactcacatcctca 50  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||    
T  18098164 cttcttcatcctccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctca 18098213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 43227342 - 43227293
Alignment:
Q  1 cttcttcatcctccaaacaacaccacgccatcagagcactcacatcctca 50  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||    
T  43227342 cttcttcatcctccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctca 43227293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 48
Target Start/End: Original strand, 4309503 - 4309550
Alignment:
Q  1 cttcttcatcctccaaacaacaccacgccatcagagcactcacatcct 48  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||    
T  4309503 cttcttcatcctccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcct 4309550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 129 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 10059218 - 10059151
Alignment:
Q  129 accatctcgaatgagtaaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaa 196  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| ||||| |||||||||||    
T  10059218 accatcttgaatgagtagagttgttgcttaaggaattgcctatgagccaacgacttggtcatatacaa 10059151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 45 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 6717348 - 6717162
Alignment:
Q  45 tcctcaagatgcacctcaatgtcctccaaatcaccaatgattttgttgaactccataagcagctgcatgatagcctttgactttaccatctcgaatgagt 144  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| ||| ||||||||||||   |   |||  || |  | ||||||||  ||||||| ||||||||    
T  6717348 tcctcaagttgcacctcaatgttctccaaatcatcaaggatcttgttgaactccgccaattgctctatcacggtctttgactccaccatcttgaatgagt 6717249  T
Q  145 aaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaaatatttgaactttgaccacattgatgtcgcggttg 231  Q
    | |||||| |||| ||||  || | ||||| ||| ||||| |||||||||||  |||  ||||| ||||| || |||| ||||||||    
T  6717248 agagttgtcgcttaaggaaatgtctatgagccaacgacttggtcatatacaacgattccaacttagaccatatcgatgccgcggttg 6717162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 119 - 225
Target Start/End: Original strand, 15830648 - 15830754
Alignment:
Q  119 ctttgactttaccatctcgaatgagtaaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaaatatttgaactttgaccacatt 218  Q
    ||||||||  |||||||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||  || |||||| |||||||||||  | |  |||||||||||| |     
T  15830648 ctttgactccaccatcttaaatgagtaaagttcttgctttaggaattgcctatgaaccatagacttagtcatatacaataactccaactttgaccacctc 15830747  T
Q  219 gatgtcg 225  Q
    |||||||    
T  15830748 gatgtcg 15830754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 129 - 231
Target Start/End: Original strand, 22834425 - 22834527
Alignment:
Q  129 accatctcgaatgagtaaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaaatatttgaactttgaccacattgatgtcgcgg 228  Q
    ||||||| |||||| || ||||||||||| |||| ||||| ||||| |||||||||  ||||||||||  | |  |||||||||||||| || | |||||    
T  22834425 accatcttgaatgaatagagttgttgcttaaggaattgcctatgagccaaagacttgatcatatacaatgactccaactttgaccacatcgacgccgcgg 22834524  T
Q  229 ttg 231  Q
    |||    
T  22834525 ttg 22834527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 457169 - 457120
Alignment:
Q  1 cttcttcatcctccaaacaacaccacgccatcagagcactcacatcctca 50  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||    
T  457169 cttcttcttcctccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctca 457120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 11169363 - 11169314
Alignment:
Q  1 cttcttcatcctccaaacaacaccacgccatcagagcactcacatcctca 50  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | ||||||||    
T  11169363 cttcttcatcctccaaacaacaccacaccatcagagctcccgcatcctca 11169314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 44 - 97
Target Start/End: Original strand, 15830573 - 15830626
Alignment:
Q  44 atcctcaagatgcacctcaatgtcctccaaatcaccaatgattttgttgaactc 97  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||    
T  15830573 atcctcaagatgcgcctcaatgttctctaaatcatcaaggattttgttgaactc 15830626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 120 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 24933212 - 24933175
Alignment:
Q  120 tttgactttaccatctcgaatgagtaaagttgttgctt 157  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24933212 tttgactttaccatcttgaatgagtaaagttgttgctt 24933175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 45 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 32891925 - 32891753
Alignment:
Q  45 tcctcaagatgcacctcaatgtcctccaaatcaccaatgattttgttgaactccataagcagctgcatgatagcctttgactttaccatctcgaatgagt 144  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||  ||||||||||||| || | |   |||   | |  | ||||||||  |||| ||  |||||||    
T  32891925 tcctcaagatccacctcaatgttctccaaatcatcatggattttgttgaaccccgttaattgctttgtcacggtctttgactccaccaccttaaatgagt 32891826  T
Q  145 aaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaaatatttgaactttgaccacat 217  Q
    | ||||||||||| |||| ||||| ||||| |||||| || |||||||||||  | |  ||||||||||||||    
T  32891825 agagttgttgcttaaggaattgcctatgagccaaagatttggtcatatacaatgactccaactttgaccacat 32891753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 45 - 98
Target Start/End: Original strand, 22834341 - 22834394
Alignment:
Q  45 tcctcaagatgcacctcaatgtcctccaaatcaccaatgattttgttgaactcc 98  Q
    |||||||  ||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||    
T  22834341 tcctcaatttgcacctcaatgttctccaaatcatcaagaattttgttgaactcc 22834394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 163; Significance: 4e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 50965 - 50731
Alignment:
Q  1 cttcttcatcctccaaacaacaccacgccatcagagcactcacatcctcaagatgcacctcaatgtcctccaaatcaccaatgattttgttgaactccat 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| ||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  50965 cttcttcatcctcgaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctcaagacgcaacttaatgttctccaaatcaccaatgattttgttgaactccac 50866  T
Q  101 aagcagctgcatgatagcctttgactttaccatctcgaatgagtaaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaaatat 200  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  50865 aagtagctccatgatagcctttgactttaccatcttgaatgagtaaagttgttgctttaggacttgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaatat 50766  T
Q  201 ttgaactttgaccacattgatgtcgcggttgtatc 235  Q
    | || |||||||||||| |||| |||||| |||||    
T  50765 tcgatctttgaccacatcgatgccgcggtagtatc 50731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 163; Significance: 4e-87; HSPs: 32)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 27911379 - 27911149
Alignment:
Q  1 cttcttcatcctccaaacaacaccacgccatcagagcactcacatcctcaagatgcacctcaatgtcctccaaatcaccaatgattttgttgaactccat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| ||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  27911379 cttcttcatcctccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctcaagacgcaacttaatgttctccaaatcaccaatgattttgttgaactccac 27911280  T
Q  101 aagcagctgcatgatagcctttgactttaccatctcgaatgagtaaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaaatat 200  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27911279 aagtagctccatgatagcctttgactttaccatcttgaatgagtaaagttgttgctttaggactttccgatgagccaaagactttgtcatatacaaatat 27911180  T
Q  201 ttgaactttgaccacattgatgtcgcggttg 231  Q
    | ||||||||||||||| |||| ||| ||||    
T  27911179 tcgaactttgaccacatcgatgccgcagttg 27911149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 658965 - 658735
Alignment:
Q  1 cttcttcatcctccaaacaacaccacgccatcagagcactcacatcctcaagatgcacctcaatgtcctccaaatcaccaatgattttgttgaactccat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||| || ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  658965 cttcttcatcctccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatccccaagacgcgcctcaatattctccaaatcaccaatgattttgttgaactctac 658866  T
Q  101 aagcagctgcatgatagcctttgactttaccatctcgaatgagtaaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaaatat 200  Q
    ||| || | |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  658865 aagtaggtccatgatggcctttgactttaccatcttgaatgagtaaagttgttgctttaggacttgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaatat 658766  T
Q  201 ttgaactttgaccacattgatgtcgcggttg 231  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  658765 tcgaactttgaccacatcgatgtcgcggttg 658735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 5 - 214
Target Start/End: Original strand, 18510750 - 18510959
Alignment:
Q  5 ttcatcctccaaacaacaccacgccatcagagcactcacatcctcaagatgcacctcaatgtcctccaaatcaccaatgattttgttgaactccataagc 104  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||     
T  18510750 ttcatcgtccaaacaacaccacaccatcagagcacccacatcctcaagacgcaacttaatgttctccaaatcaccaatgattttgttgaactgcacaagt 18510849  T
Q  105 agctgcatgatagcctttgactttaccatctcgaatgagtaaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaaatatttga 204  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18510850 agctccatgatagcctttgactttaccatcttgaatgagtaaagttgttgctttaggacttgccgataagccaaagactttgtcatatacaaatattcga 18510949  T
Q  205 actttgacca 214  Q
    ||||||||||    
T  18510950 actttgacca 18510959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 62 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 25806347 - 25806177
Alignment:
Q  62 aatgtcctccaaatcaccaatgattttgttgaactccataagcagctgcatgatagcctttgactttaccatctcgaatgagtaaagttgttgctttagg 161  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25806347 aatgttctccaaatcaccaatgattttgttgaactccacaagtagctccatgatagcctttgactttaccatcttgaatgagtaaagttgttgctttagg 25806248  T
Q  162 acttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaaatatttgaactttgaccacattgatgtcgcggttgt 232  Q
    |||| || ||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  25806247 actttccaatgagccaaagactttgtaatatacaaatattcgaactttgaccacatcgatgctgcggttgt 25806177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 43 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 6745973 - 6745786
Alignment:
Q  43 catcctcaagatgcacctcaatgtcctccaaatcaccaatgattttgttgaactccataagcagctgcatgatagcctttgactttaccatctcgaatga 142  Q
    |||||||||| ||||||||||| | |||||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||  ||| |||||| ||||||||||  ||||||  ||||||    
T  6745973 catcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttgactccaccatcctgaatga 6745874  T
Q  143 gtaaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaaatatttgaactttgaccacattgatgtcgcggtt 230  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||| ||||||||||| |||||||    
T  6745873 gtagagttgttgctttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattacaactttgcccacattgatgccgcggtt 6745786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 43 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 31543638 - 31543450
Alignment:
Q  43 catcctcaagatgcacctcaatgtcctccaaatcaccaatgattttgttgaactccataagcagctgcatgatagcctttgactttaccatctcgaatga 142  Q
    |||||||||| ||||||||||| | |||||| ||| | | |||||||||||||||| ||||  ||| |||||| |||||||||| | |||||| ||||||    
T  31543638 catcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatctaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttgactcttccatcttgaatga 31543539  T
Q  143 gtaaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaaatatttgaactttgaccacattgatgtcgcggttg 231  Q
    ||| ||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||| |||||| |||||||||||||    
T  31543538 gtagagtcgttgctttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattctaactttgcccacatcgatgtcgcggttg 31543450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 43 - 231
Target Start/End: Original strand, 34478793 - 34478981
Alignment:
Q  43 catcctcaagatgcacctcaatgtcctccaaatcaccaatgattttgttgaactccataagcagctgcatgatagcctttgactttaccatctcgaatga 142  Q
    |||||||||| ||||||||||| |  ||||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||  ||| |||||| |||||||||| |||||||  ||||||    
T  34478793 catcctcaagttgcacctcaatattttccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttgactctaccatcctgaatga 34478892  T
Q  143 gtaaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaaatatttgaactttgaccacattgatgtcgcggttg 231  Q
    ||| |||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||| |||||| |||||||||||||    
T  34478893 gtagagttgttgctttaggaattgtcgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttg 34478981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 45 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 10750601 - 10750415
Alignment:
Q  45 tcctcaagatgcacctcaatgtcctccaaatcaccaatgattttgttgaactccataagcagctgcatgatagcctttgactttaccatctcgaatgagt 144  Q
    |||||||| ||||||||||| | |||||| ||| | | |||||||||||||||| ||||  ||| |||||| |||||||||| |||||||  ||||||||    
T  10750601 tcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatctaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttgactctaccatcctgaatgagt 10750502  T
Q  145 aaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaaatatttgaactttgaccacattgatgtcgcggttg 231  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||| |||||| |||| ||||||||    
T  10750501 agagttgttgctttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgccgcggttg 10750415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 20043919 - 20043710
Alignment:
Q  1 cttcttcatcctccaaacaacaccacgccatcagagcactcacatcctcaagatgcacctcaatgtcctccaaatcaccaatgattttgttgaactccat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||            ||||||||| |||||| ||| ||| |||| | ||||||||||     
T  20043919 cttcttcatcctccaaacaacaccacaccatcagagcacctgcat------------cctcaatgttctccaagtcatcaaggattgttttgaactccac 20043832  T
Q  101 aagcagctgcatgatagcctttgactttaccatctcgaatgagtaaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaaatat 200  Q
    |||  ||| |||||| |||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20043831 aagttgctccatgatggcctttgactctgccatcttgaatgagtaaagttgttgctttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaatat 20043732  T
Q  201 ttgaactttgaccacattgatg 222  Q
    | |||||||||| |||| ||||    
T  20043731 tcgaactttgactacatcgatg 20043710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 45 - 231
Target Start/End: Original strand, 15356225 - 15356411
Alignment:
Q  45 tcctcaagatgcacctcaatgtcctccaaatcaccaatgattttgttgaactccataagcagctgcatgatagcctttgactttaccatctcgaatgagt 144  Q
    |||||||| ||||||||||| | |||||| ||| | | |||||||||||||||| ||||  ||| |||||| |||||||||| |||||||  ||||||||    
T  15356225 tcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatctaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttgactctaccatcctgaatgagt 15356324  T
Q  145 aaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaaatatttgaactttgaccacattgatgtcgcggttg 231  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||| ||| || |||| ||||||||    
T  15356325 agagttgttgctttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccatatcgatgccgcggttg 15356411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 45 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 23665949 - 23665763
Alignment:
Q  45 tcctcaagatgcacctcaatgtcctccaaatcaccaatgattttgttgaactccataagcagctgcatgatagcctttgactttaccatctcgaatgagt 144  Q
    |||||||| ||||||||||| | |||||| ||| | | |||||||||||||||| ||||  ||| |||||| |||||||||| |||||||  ||||||||    
T  23665949 tcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatctaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttgactctaccatcctgaatgagt 23665850  T
Q  145 aaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaaatatttgaactttgaccacattgatgtcgcggttg 231  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||| ||| || |||| ||||||||    
T  23665849 agagttgttgctttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccatatcgatgccgcggttg 23665763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 44 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 18467588 - 18467402
Alignment:
Q  44 atcctcaagatgcacctcaatgtcctccaaatcaccaatgattttgttgaactccataagcagctgcatgatagcctttgactttaccatctcgaatgag 143  Q
    |||| |||| ||||||||||| | |||||| ||| ||| |||||||||||||||| |||   ||| |||||| | ||||||||  ||||||  |||||||    
T  18467588 atccacaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaaattgctccatgatggtctttgactccaccatcctgaatgag 18467489  T
Q  144 taaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaaatatttgaactttgaccacattgatgtcgcggtt 230  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||| ||| || ||||||||||||    
T  18467488 tagagttgttgctttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccatatcgatgtcgcggtt 18467402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Original strand, 31467225 - 31467340
Alignment:
Q  1 cttcttcatcctccaaacaacaccacgccatcagagcactcacatcctcaag--atgcacctcaatgtcctccaaatcaccaatgattttgttgaactcc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31467225 cttcttcatcctccaaacaacaccacaccatcagagcacccacatcctcaagacacgcacctcaatgttctccaaatcaccaatgattttgttgagctcc 31467324  T
Q  99 ataagcagctgcatga 114  Q
    | ||| |||| |||||    
T  31467325 acaagtagctccatga 31467340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 45 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 29721210 - 29721024
Alignment:
Q  45 tcctcaagatgcacctcaatgtcctccaaatcaccaatgattttgttgaactccataagcagctgcatgatagcctttgactttaccatctcgaatgagt 144  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||   |   ||| ||| |  | ||||||||  ||||||| ||||||||    
T  29721210 tcctcaagttgcacctcaatgttctccaaatcatcaaggattttgttgaactccgccaattgctccatcacggtctttgactccaccatcttgaatgagt 29721111  T
Q  145 aaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaaatatttgaactttgaccacattgatgtcgcggttg 231  Q
    | ||||||||||| |||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||  |||  |||||||||||||| |||| ||||||||    
T  29721110 agagttgttgcttaaggaattgcctatgagccaaagacttggtcatatacaacgattccaactttgaccacatcgatgccgcggttg 29721024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 45 - 231
Target Start/End: Original strand, 9788554 - 9788740
Alignment:
Q  45 tcctcaagatgcacctcaatgtcctccaaatcaccaatgattttgttgaactccataagcagctgcatgatagcctttgactttaccatctcgaatgagt 144  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||   |   ||| ||| |  | ||||||||  ||||||| ||||||||    
T  9788554 tcctcaagttgcacctcaatgttctccaaatcatcaaggattttgttgaactccgccaattgctccatcacggtctttgactccaccatcttgaatgagt 9788653  T
Q  145 aaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaaatatttgaactttgaccacattgatgtcgcggttg 231  Q
    | ||||||||||| |||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||  |||  ||||||||||| || |||| ||||||||    
T  9788654 agagttgttgcttaaggaattgcctatgagccaaagacttggtcatatacaacgattccaactttgaccatatcgatgccgcggttg 9788740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 45 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 16408170 - 16408019
Alignment:
Q  45 tcctcaagatgcacctcaatgtcctccaaatcaccaatgattttgttgaactccataagcagctgcatgatagcctttgactttaccatctcgaatgagt 144  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||   |   ||| ||| |  | |||| |||  ||||||| ||||||||    
T  16408170 tcctcaagttgcacctcaatgttctccaaatcatcaaggattttgttgaactccgccaattgctccatcacggtcttttactccaccatcttgaatgagt 16408071  T
Q  145 aaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaa 196  Q
    | ||||||||||| |||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||    
T  16408070 agagttgttgcttaaggaattgcctatgagccaaagacttggtcatatacaa 16408019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 43 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 534596 - 534422
Alignment:
Q  43 catcctcaagatgcacctcaatgtcctccaaatcaccaatgattttgttgaactccataagcagctgcatgatagcctttgactttaccatctcgaatga 142  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||  ||||||||||||||| | |   ||| ||| |  | ||||||||  ||||||| ||||||    
T  534596 catcctcaagttgcacctcaatgttctccaaatcatcaagtattttgttgaactccgttaattgctccatcacggtctttgactccaccatcttgaatga 534497  T
Q  143 gtaaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaaatatttgaactttgaccacat 217  Q
    ||| ||||||||||| |||| ||||| || |  ||||||||| |||||||||||  | |  ||||||||||||||    
T  534496 gtagagttgttgcttaaggaattgcctatcaaccaaagacttggtcatatacaatgactccaactttgaccacat 534422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 45 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 26171602 - 26171416
Alignment:
Q  45 tcctcaagatgcacctcaatgtcctccaaatcaccaatgattttgttgaactccataagcagctgcatgatagcctttgactttaccatctcgaatgagt 144  Q
    |||||||  ||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||   |   ||| ||| |  | ||||||||  ||||||| ||||||||    
T  26171602 tcctcaatttgcaccttaatgttctccaaatcatcaaggattttgttgaactccgccaattgctccatcacggtctttgactccaccatcttgaatgagt 26171503  T
Q  145 aaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaaatatttgaactttgaccacattgatgtcgcggttg 231  Q
    | ||||||||||| |||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||  |||  ||||||||||| || |||| | ||||||    
T  26171502 agagttgttgcttaaggaattgcctatgagccaaagacttggtcatatacaacgattccaactttgaccatatcgatgccacggttg 26171416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 43 - 217
Target Start/End: Original strand, 42427762 - 42427936
Alignment:
Q  43 catcctcaagatgcacctcaatgtcctccaaatcaccaatgattttgttgaactccataagcagctgcatgatagcctttgactttaccatctcgaatga 142  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||  | |   | | | | |  | ||||||||  ||||||| ||||||    
T  42427762 catcctcaagttgcacctcaatgttctcaaaatcatcaaggattttgttgaactctgttaattgttccgtcacggtctttgactccaccatcttgaatga 42427861  T
Q  143 gtaaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaaatatttgaactttgaccacat 217  Q
     || ||||||||||| |||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||  | |  ||||||||||||||    
T  42427862 atagagttgttgcttaaggaattgcctatgagccaaagacttggtcatatacaatgactacaactttgaccacat 42427936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 10750981 - 10750932
Alignment:
Q  1 cttcttcatcctccaaacaacaccacgccatcagagcactcacatcctca 50  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||    
T  10750981 cttcttcatcctccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctca 10750932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 196
Target Start/End: Original strand, 13694480 - 13694625
Alignment:
Q  51 agatgcacctcaatgtcctccaaatcaccaatgattttgttgaactccataagcagctgcatgatagcctttgactttaccatctcgaatgagtaaagtt 150  Q
    ||||||||||||||||  ||||| ||| ||| |||||||||||||||| | ||  ||| ||||||  | |||||||  |||||||  ||| |||| ||||    
T  13694480 agatgcacctcaatgttttccaactcatcaaggattttgttgaactccgttagttgctccatgatgacatttgactccaccatcttaaataagtagagtt 13694579  T
Q  151 gttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaa 196  Q
    |||| | ||||| ||||  ||||| |||||| || |||||||||||    
T  13694580 gttgatataggaattgcatatgagccaaagatttggtcatatacaa 13694625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 119 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 40380877 - 40380765
Alignment:
Q  119 ctttgactttaccatctcgaatgagtaaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaaatatttgaactttgaccacatt 218  Q
    ||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| ||| | ||||| ||| ||||| |||||||||||  |||  ||||| ||||| ||     
T  40380877 ctttgactccaccatcttgaatgagtagagttgttgcttaaggaattgtctatgagccaacgacttggtcatatacaacgattccaacttagaccatatc 40380778  T
Q  219 gatgtcgcggttg 231  Q
    |||| ||||||||    
T  40380777 gatgccgcggttg 40380765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 39
Target Start/End: Original strand, 20505199 - 20505237
Alignment:
Q  1 cttcttcatcctccaaacaacaccacgccatcagagcac 39  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20505199 cttcttcatcctccaaacaacaccacaccatcagagcac 20505237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 39
Target Start/End: Original strand, 34478415 - 34478453
Alignment:
Q  1 cttcttcatcctccaaacaacaccacgccatcagagcac 39  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  34478415 cttcttcatcctccaaacaacaccacaccatcagagcac 34478453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 6746354 - 6746305
Alignment:
Q  1 cttcttcatcctccaaacaacaccacgccatcagagcactcacatcctca 50  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||    
T  6746354 cttcttcatcctccaaacaacaccacaccattagagcacccgcatcctca 6746305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 23666329 - 23666280
Alignment:
Q  1 cttcttcatcctccaaacaacaccacgccatcagagcactcacatcctca 50  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||    
T  23666329 cttcttcttcctccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctca 23666280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 31544016 - 31543967
Alignment:
Q  1 cttcttcatcctccaaacaacaccacgccatcagagcactcacatcctca 50  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||    
T  31544016 cttcttcttcctccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctca 31543967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 45 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 16545275 - 16545136
Alignment:
Q  45 tcctcaagatgcacctcaatgtcctccaaatcaccaatgattttgttgaactccataagcagctgcatgatagcctttgactttaccatctcgaatgagt 144  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||  | | ||| ||||||||||||   |   ||| ||| |  | ||||||||  ||||||| ||||||||    
T  16545275 tcctcaagttgcacctcaatgttctccaaatcgtcgaggatcttgttgaactccgccaattgctccatcacggtctttgactccaccatcttgaatgagt 16545176  T
Q  145 aaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactt 184  Q
    | ||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||    
T  16545175 agagttgttgcttaaggaattgcctatgagccaacgactt 16545136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 18467970 - 18467932
Alignment:
Q  1 cttcttcatcctccaaacaacaccacgccatcagagcac 39  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  18467970 cttcttcatcctccaaacaacaccacaccatcatagcac 18467932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Original strand, 15355845 - 15355894
Alignment:
Q  1 cttcttcatcctccaaacaacaccacgccatcagagcactcacatcctca 50  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||| | ||||||||    
T  15355845 cttcttcttcctccaaacaacaccacaccatcaaagcacccgcatcctca 15355894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 129 - 229
Target Start/End: Original strand, 33790728 - 33790828
Alignment:
Q  129 accatctcgaatgagtaaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaaatatttgaactttgaccacattgatgtcgcgg 228  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||| | || ||| | ||||| |||||| || |||||||||||  | |  ||||||| |||||| |||| |||||    
T  33790728 accatcttgaatgagtagagttgttgcttcaagagttgtctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcgg 33790827  T
Q  229 t 229  Q
    |    
T  33790828 t 33790828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 129 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 37557298 - 37557198
Alignment:
Q  129 accatctcgaatgagtaaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaaatatttgaactttgaccacattgatgtcgcgg 228  Q
    ||||||| |||||| || ||||||||||| | || ||||| ||||| |||||| || |||||||||||  | |  ||||| | |||||| ||||||||||    
T  37557298 accatcttgaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgtcgcgg 37557199  T
Q  229 t 229  Q
    |    
T  37557198 t 37557198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 163; Significance: 4e-87; HSPs: 33)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 14788765 - 14788999
Alignment:
Q  1 cttcttcatcctccaaacaacaccacgccatcagagcactcacatcctcaagatgcacctcaatgtcctccaaatcaccaatgattttgttgaactccat 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| ||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  14788765 cttcttcatcctcgaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctcaagacgcaacttaatgttctccaaatcaccaatgattttgttgaactccac 14788864  T
Q  101 aagcagctgcatgatagcctttgactttaccatctcgaatgagtaaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaaatat 200  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14788865 aagtagctccatgatagcctttgactttaccatcttgaatgagtaaagttgttgctttaggacttgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaatat 14788964  T
Q  201 ttgaactttgaccacattgatgtcgcggttgtatc 235  Q
    | || |||||||||||| |||| |||||| |||||    
T  14788965 tcgatctttgaccacatcgatgccgcggtagtatc 14788999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 22802069 - 22802305
Alignment:
Q  1 cttcttcatcctccaaacaacaccacgccatcagagcactcacatcctcaagatgcacctcaatgtcctccaaatcaccaatgattttgttgaactccat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||||||||| || ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  22802069 cttcttcatcctccaaacaacaccacaccattagagcacccgcatcctcaagatgcaacttaatgttctcaaaatcaccaatgattttgttgaactccac 22802168  T
Q  101 aagcagctgcatgatagcctttgactttaccatctcgaatgagtaaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaaatat 200  Q
    ||| |||| || ||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22802169 aagtagctccacgacgacctttgactttaccatcttgaatgagtaaagttgttgctttaggacttgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaatat 22802268  T
Q  201 ttgaactttgaccacattgatgtcgcggttgtatcct 237  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22802269 tcgaactttgaccacattgatgtcgcggttgtttcct 22802305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Original strand, 36920831 - 36921071
Alignment:
Q  2 ttcttcatcctccaaacaacaccacgccatcagagcactcacatcctcaagatgcacctcaatgtcctccaaatcaccaatgattttgttgaactccata 101  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| | |||||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  36920831 ttcttcatcctccaaacatcaccacaccatcagagcacccgcatccctaagacgcacctcaatgttctccaaatcaccaatgattttgttgaactccaca 36920930  T
Q  102 agcagctgcatgatagcctttgactttaccatctcgaatgagtaaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaaatatt 201  Q
    || |||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  36920931 agtagctccatgatggcctttgactttaccatcttgaatgagtaaagttgttgctttaagacttgccaatgagccaaagactttgtcatatacaaatatt 36921030  T
Q  202 tgaactttgaccacattgatgtcgcggttgtatcctatgct 242  Q
      |||||||||||||| |||| |||| ||| ||||| ||||    
T  36921031 caaactttgaccacatcgatgccgcgattggatcctttgct 36921071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 16454304 - 16454071
Alignment:
Q  1 cttcttcatcctccaaacaacaccacgccatcagagcactcacatcctcaagatgcacctcaatgtcctccaaatcaccaatgattttgttgaactccat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16454304 cttcttcatcctccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctcaagacgcacctcaatgttctccaaatcaccaatgattttgttgaactccac 16454205  T
Q  101 aagcagctgcatgatagcctttgactttaccatctcgaatgagtaaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaaatat 200  Q
    ||  ||||  ||| | ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||    
T  16454204 aattagctctatggtggcctttgactttaccatcttgaattagtaaagttgttgctttaggacttgtcgatgagccaaagtctttgtcgtatacaaatat 16454105  T
Q  201 ttgaactttgaccacattgatgtcgcggttgtat 234  Q
    |  || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16454104 tcaaaatttgaccacatcgatgtcgcggttgtat 16454071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 47563755 - 47563515
Alignment:
Q  2 ttcttcatcctccaaacaacaccacgccatcagagcactcacatcctcaagatgcacctcaatgtcctccaaatcaccaatgattttgttgaactccata 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||| |||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  47563755 ttcttcatcctccaaacaacaccacaccatcagagcacctgcatccccaagacacacctcaatgctctccaaatcaccaatgattttgttgaactccaca 47563656  T
Q  102 agcagctgcatgatagcctttgactttaccatctcgaatgagtaaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaaatatt 201  Q
    || |||| |||||| |||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| |||    
T  47563655 agtagctccatgatggcctttaaatttaccatcttgaatgagtaaagttgttgctttaggaattgtcgatgagccaacgactttgtcatatacaaagatt 47563556  T
Q  202 tgaactttgaccacattgatgtcgcggttgtatcctatgct 242  Q
      ||||||  |||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  47563555 ccaacttttcccacatcgatgtcgcggttgtatcctttgct 47563515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 43 - 231
Target Start/End: Original strand, 22133991 - 22134179
Alignment:
Q  43 catcctcaagatgcacctcaatgtcctccaaatcaccaatgattttgttgaactccataagcagctgcatgatagcctttgactttaccatctcgaatga 142  Q
    |||||||||| ||||||||||| | |||||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||  ||| |||||| |||||||||| |||||||  ||||||    
T  22133991 catcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttgactctaccatcctgaatga 22134090  T
Q  143 gtaaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaaatatttgaactttgaccacattgatgtcgcggttg 231  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||  ||||||| |||||| |||| ||||||||    
T  22134091 gtagagttgttgctttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatataaaaagattccaactttgcccacatcgatgccgcggttg 22134179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 45 - 231
Target Start/End: Original strand, 22782113 - 22782299
Alignment:
Q  45 tcctcaagatgcacctcaatgtcctccaaatcaccaatgattttgttgaactccataagcagctgcatgatagcctttgactttaccatctcgaatgagt 144  Q
    |||||||| ||||||||||| | |||||| ||| | | |||||||||||||||| ||||  ||| |||||| |||||||||| |||||||  ||||||||    
T  22782113 tcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatctaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttgactctaccatcctgaatgagt 22782212  T
Q  145 aaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaaatatttgaactttgaccacattgatgtcgcggttg 231  Q
    | |||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||| |||||| |||| ||||||||    
T  22782213 agagttgttgctttaggaattgtcgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgccgcggttg 22782299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 43 - 231
Target Start/End: Original strand, 22046089 - 22046277
Alignment:
Q  43 catcctcaagatgcacctcaatgtcctccaaatcaccaatgattttgttgaactccataagcagctgcatgatagcctttgactttaccatctcgaatga 142  Q
    |||||||||| ||||||||||| | |||||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||  ||| |||||| |||||||||| |||||||  ||||||    
T  22046089 catcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttgactctaccatcctgaatga 22046188  T
Q  143 gtaaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaaatatttgaactttgaccacattgatgtcgcggttg 231  Q
    ||| ||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  || |||| |||||| |||| || |||||    
T  22046189 gtagagtcgttgctttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaaatttgcccacatcgatgccgaggttg 22046277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 43 - 231
Target Start/End: Original strand, 12402470 - 12402658
Alignment:
Q  43 catcctcaagatgcacctcaatgtcctccaaatcaccaatgattttgttgaactccataagcagctgcatgatagcctttgactttaccatctcgaatga 142  Q
    |||||| ||| ||||||||||| | |||||| ||| ||  |||||||||||||||| ||||  ||| |||||| ||||| ||||  ||||||  ||||||    
T  12402470 catccttaagttgcacctcaatattctccaagtcatcacggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggccttcgactccaccatcctgaatga 12402569  T
Q  143 gtaaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaaatatttgaactttgaccacattgatgtcgcggttg 231  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||| |||||| |||||| ||||||    
T  12402570 gtagagttgttgctttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcacggttg 12402658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 43 - 231
Target Start/End: Original strand, 16933522 - 16933710
Alignment:
Q  43 catcctcaagatgcacctcaatgtcctccaaatcaccaatgattttgttgaactccataagcagctgcatgatagcctttgactttaccatctcgaatga 142  Q
    |||||||||| ||||||||||| | |||||| ||| | | |||||||||||||||| ||||  ||| |||||| |||||||||| | |||||  ||||||    
T  16933522 catcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatctaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttgactcttccatcctgaatga 16933621  T
Q  143 gtaaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaaatatttgaactttgaccacattgatgtcgcggttg 231  Q
    ||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||| |||||| |||| ||||||||    
T  16933622 gtagagtcgttgttttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgccgcggttg 16933710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 43 - 231
Target Start/End: Original strand, 11007942 - 11008130
Alignment:
Q  43 catcctcaagatgcacctcaatgtcctccaaatcaccaatgattttgttgaactccataagcagctgcatgatagcctttgactttaccatctcgaatga 142  Q
    ||||||||||  |||||||||| | |||||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||  ||| |||||| |||||||||| |||||||  ||||||    
T  11007942 catcctcaagtcgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttgactctaccatcctgaatga 11008041  T
Q  143 gtaaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaaatatttgaactttgaccacattgatgtcgcggttg 231  Q
    ||| | | |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  | ||||  |||||| |||| ||||||||    
T  11008042 gtagattcgttgctttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccatcttttcccacatcgatgccgcggttg 11008130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 83 - 227
Target Start/End: Original strand, 18536918 - 18537062
Alignment:
Q  83 gattttgttgaactccataagcagctgcatgatagcctttgactttaccatctcgaatgagtaaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagac 182  Q
    |||| |||||||||||  |||  ||| |||||| ||||| |||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  18536918 gattctgttgaactccgcaagttgctccatgatggccttcgactcttccatcttgaatgagtaaagttgttgctttaggaattgccgatgagccaaagac 18537017  T
Q  183 tttgtcatatacaaatatttgaactttgaccacattgatgtcgcg 227  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||    
T  18537018 tttgtcatatacaaatatacgaactttgaccacatcgatgccgcg 18537062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 138 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 36379148 - 36379055
Alignment:
Q  138 aatgagtaaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaaatatttgaactttgaccacattgatgtcgcggttg 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| | ||||||    
T  36379148 aatgagtaaagttgttgctttaggacttgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaatattcgaactttgactacatcgatgccacggttg 36379055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 45 - 231
Target Start/End: Original strand, 9175848 - 9176034
Alignment:
Q  45 tcctcaagatgcacctcaatgtcctccaaatcaccaatgattttgttgaactccataagcagctgcatgatagcctttgactttaccatctcgaatgagt 144  Q
    |||||||| ||||||||||| | |||||| ||| | | |||||||||||||||| ||||  ||| |||||| |||||||| | | |||||  ||||||||    
T  9175848 tcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatctaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttgagtcttccatcctgaatgagt 9175947  T
Q  145 aaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaaatatttgaactttgaccacattgatgtcgcggttg 231  Q
    | ||| |||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||| |||   |||||  |||||| ||||||| |||||    
T  9175948 agagtcgttgctttaggaattgccgatcagccaaagactttgtcatatacaaagattcccacttttcccacatcgatgtcgtggttg 9176034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 45 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 5872650 - 5872464
Alignment:
Q  45 tcctcaagatgcacctcaatgtcctccaaatcaccaatgattttgttgaactccataagcagctgcatgatagcctttgactttaccatctcgaatgagt 144  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||| |   ||| ||| || | ||||||||  ||||||| ||||||||    
T  5872650 tcctcaagttgcacctcaatgttctccaaatcatcaaggattttgttgaactccattaattgctccatcatggtctttgactccaccatcttgaatgagt 5872551  T
Q  145 aaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaaatatttgaactttgaccacattgatgtcgcggttg 231  Q
    | | ||||||||| |||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||  | |  |||||||||||||| || | ||||||||    
T  5872550 agatttgttgcttaaggaattgcctatgagccaaagacttggtcatatgcaacgactccaactttgaccacatcgacggcgcggttg 5872464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 43 - 231
Target Start/End: Original strand, 12395234 - 12395421
Alignment:
Q  43 catcctcaagatgcacctcaatgtcctccaaatcaccaatgattttgttgaactccataagcagctgcatgatagcctttgactttaccatctcgaatga 142  Q
    |||||||||| | | ||||||| | |||||| ||| ||  |||||||||||||||| ||||  ||| |||||| ||||| || |  ||||||  ||||||    
T  12395234 catcctcaagttactcctcaatattctccaagtcatcacggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggccttcgattccaccatcctgaatga 12395333  T
Q  143 gtaaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaaatatttgaactttgaccacattgatgtcgcggttg 231  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||  ||||||| |||||| |||||| ||||||    
T  12395334 gtagagttgttgctttaggaattgccgatgagccaaagactttttca-atacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcacggttg 12395421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 43 - 231
Target Start/End: Original strand, 12400196 - 12400383
Alignment:
Q  43 catcctcaagatgcacctcaatgtcctccaaatcaccaatgattttgttgaactccataagcagctgcatgatagcctttgactttaccatctcgaatga 142  Q
    |||||||||| | | ||||||| | |||||| ||| ||  |||||||||||||||| ||||  ||| |||||| ||||| || |  ||||||  ||||||    
T  12400196 catcctcaagttactcctcaatattctccaagtcatcacggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggccttcgattccaccatcctgaatga 12400295  T
Q  143 gtaaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaaatatttgaactttgaccacattgatgtcgcggttg 231  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||  ||||||| |||||| |||||| ||||||    
T  12400296 gtagagttgttgctttaggaattgccgatgagccaaagactttttca-atacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcacggttg 12400383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 45 - 217
Target Start/End: Original strand, 12743261 - 12743433
Alignment:
Q  45 tcctcaagatgcacctcaatgtcctccaaatcaccaatgattttgttgaactccataagcagctgcatgatagcctttgactttaccatctcgaatgagt 144  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| | |   ||| ||| |  | ||||||||  ||||||| ||||||||    
T  12743261 tcctcaagttgcacctcaatgttctccaaatcatcaaagattttgttgaactccgttaattgctccatcacggtctttgactccaccatcttgaatgagt 12743360  T
Q  145 aaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaaatatttgaactttgaccacat 217  Q
    | ||||||| ||| |||| ||||| || || ||||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||||||    
T  12743361 atagttgtttcttaaggaattgcctataagccaaagacttggtcatatacaatgatttcaactttgaccacat 12743433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 45 - 229
Target Start/End: Original strand, 52094695 - 52094879
Alignment:
Q  45 tcctcaagatgcacctcaatgtcctccaaatcaccaatgattttgttgaactccataagcagctgcatgatagcctttgactttaccatctcgaatgagt 144  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| | |   ||| ||| |  | |||||| |  ||||||| ||||||||    
T  52094695 tcctcaagttgcacctcaatgttctccaaatcatcaaggattttgttgaactccgtcaattgctccatcacggtctttgaatccaccatcttgaatgagt 52094794  T
Q  145 aaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaaatatttgaactttgaccacattgatgtcgcggt 229  Q
    | ||||||||||| |||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||  | |  |||||||||||||| |||| ||||||    
T  52094795 agagttgttgcttaaggaattgcctatgagccaaagacttggtcatatacaatgactccaactttgaccacatcgatgccgcggt 52094879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 58 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 10113802 - 10113643
Alignment:
Q  58 cctcaatgtcctccaaatcaccaatgattttgttgaactccataagcagctgcatgatagcctttgactttaccatctcgaatgagtaaagttgttgctt 157  Q
    |||||||||  ||||||||| ||| |||||||||||||||  | ||  ||| |||||| ||||||||||  ||| ||| ||||||||| |||||||| ||    
T  10113802 cctcaatgttttccaaatcatcaaggattttgttgaactctgttagtcgctccatgatggcctttgactccaccgtcttgaatgagtagagttgttgatt 10113703  T
Q  158 taggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaaatatttgaactttgaccacat 217  Q
    ||||| |||||  |||| ||||||||| |||||||||||  | |  ||||||||||||||    
T  10113702 taggaattgcctgtgagccaaagacttagtcatatacaatgactccaactttgaccacat 10113643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 129 - 231
Target Start/End: Original strand, 3578154 - 3578256
Alignment:
Q  129 accatctcgaatgagtaaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaaatatttgaactttgaccacattgatgtcgcgg 228  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||  | ||| ||||||  |||||||||||||||||| ||| | |  |||||||||||||| ||||||||||    
T  3578154 accatcttgaatgagtagagttgttgctttaaaagttggcgatgatccaaagactttgtcatatataaagactccaactttgaccacatcgatgtcgcgg 3578253  T
Q  229 ttg 231  Q
    |||    
T  3578254 ttg 3578256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 45 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 5136927 - 5136741
Alignment:
Q  45 tcctcaagatgcacctcaatgtcctccaaatcaccaatgattttgttgaactccataagcagctgcatgatagcctttgactttaccatctcgaatgagt 144  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||  | | ||| ||||||||||||   |   ||| ||| |  | ||||||||  ||||||| ||||||||    
T  5136927 tcctcaagttgcacctcaatgttctccaaatcgtcgaggatcttgttgaactccgccaattgctccatcacggtctttgactccaccatcttgaatgagt 5136828  T
Q  145 aaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaaatatttgaactttgaccacattgatgtcgcggttg 231  Q
    | ||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| ||||| |||||||||||  |||  ||||| ||||| || |||| ||||||||    
T  5136827 agagttgttgcttaaggaattgcctatgagccaacgacttggtcatatacaacgattccaacttagaccatatcgatgccgcggttg 5136741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 36379227 - 36379144
Alignment:
Q  1 cttcttcatcctccaaacaacaccacgccatcagagcactcacatcctcaagatgcacctcaatgtcctccaaatcaccaatga 84  Q
    ||||||||||||||||||||||  || || ||||| ||| |||||||| |||| ||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  36379227 cttcttcatcctccaaacaacattacaccgtcagaccacccacatccttaagacgcaacttaatgttctccaaatcaccaatga 36379144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 45 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 8394253 - 8394067
Alignment:
Q  45 tcctcaagatgcacctcaatgtcctccaaatcaccaatgattttgttgaactccataagcagctgcatgatagcctttgactttaccatctcgaatgagt 144  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||  | | ||| ||||||||||||   |   ||| ||| |  | ||||||||  ||||||| ||||||||    
T  8394253 tcctcaagttgcacctcaatgttctccaaatcgtcgaggatcttgttgaactccgccaattgctccatcacggtctttgactccaccatcttgaatgagt 8394154  T
Q  145 aaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaaatatttgaactttgaccacattgatgtcgcggttg 231  Q
    | ||||||||||| |||| ||| | ||||| ||| ||||| |||||||||||  |||  ||||| ||||| || |||| ||||||||    
T  8394153 agagttgttgcttgaggaattgtctatgagccaacgacttggtcatatacaacgattccaacttagaccatatcgatgccgcggttg 8394067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 5099820 - 5099771
Alignment:
Q  1 cttcttcatcctccaaacaacaccacgccatcagagcactcacatcctca 50  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||    
T  5099820 cttcttcatcctccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctca 5099771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Original strand, 22045711 - 22045760
Alignment:
Q  1 cttcttcatcctccaaacaacaccacgccatcagagcactcacatcctca 50  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||    
T  22045711 cttcttcatcctccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctca 22045760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Original strand, 22133613 - 22133662
Alignment:
Q  1 cttcttcatcctccaaacaacaccacgccatcagagcactcacatcctca 50  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||    
T  22133613 cttcttcatcctccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctca 22133662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Original strand, 22781733 - 22781782
Alignment:
Q  1 cttcttcatcctccaaacaacaccacgccatcagagcactcacatcctca 50  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||    
T  22781733 cttcttcatcctccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctca 22781782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 45 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 7123543 - 7123392
Alignment:
Q  45 tcctcaagatgcacctcaatgtcctccaaatcaccaatgattttgttgaactccataagcagctgcatgatagcctttgactttaccatctcgaatgagt 144  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||  | | ||| ||||||||||||   |   ||| ||| |  | ||||||||  ||||||| ||||||||    
T  7123543 tcctcaagttgcacctcaatgttctccaaatcgtcgaggatcttgttgaactccgccaattgctccatcacggtctttgactccaccatcttgaatgagt 7123444  T
Q  145 aaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaa 196  Q
    | ||||||||||| |||| ||| | ||||| ||| ||||| |||||||||||    
T  7123443 agagttgttgcttaaggaattgtctatgagccaacgacttggtcatatacaa 7123392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 43 - 197
Target Start/End: Original strand, 5206994 - 5207148
Alignment:
Q  43 catcctcaagatgcacctcaatgtcctccaaatcaccaatgattttgttgaactccataagcagctgcatgatagcctttgactttaccatctcgaatga 142  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||  || |||||||||||||  | | ||  ||| ||| |  | |||| || | || ||||  |||||    
T  5206994 catccttaagatgcacctcaatgttctctaaatcataaaggattttgttgaacgtcgttagttgctccattacggtctttaacctcactatcttaaatga 5207093  T
Q  143 gtaaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaaa 197  Q
    ||| | |||||| ||||||| ||| | ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5207094 gtagatttgttgatttaggatttgtctatgagccaaagactttgtcatatacaaa 5207148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 119 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 4588713 - 4588636
Alignment:
Q  119 ctttgactttaccatctcgaatgagtaaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaa 196  Q
    ||||||||  ||||||| ||||||||| | ||||||||| |||| ||||| ||||| |||||| || |||||||||||    
T  4588713 ctttgactccaccatcttgaatgagtagaattgttgcttaaggaattgcctatgagccaaagatttggtcatatacaa 4588636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 39
Target Start/End: Original strand, 11007564 - 11007602
Alignment:
Q  1 cttcttcatcctccaaacaacaccacgccatcagagcac 39  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  11007564 cttcttcatccttcaaacaacaccacaccatcagagcac 11007602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 39
Target Start/End: Original strand, 16933144 - 16933182
Alignment:
Q  1 cttcttcatcctccaaacaacaccacgccatcagagcac 39  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16933144 cttcttcttcctccaaacaacaccacaccatcagagcac 16933182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 162; Significance: 1e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 80813 - 80572
Alignment:
Q  1 cttcttcatcctccaaacaacaccacgccatcagagcactcacatcctcaagatgcacctcaatgtcctccaaatcaccaatgattttgttgaactccat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||| ||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  80813 cttcttcatcctccaaacaacaccacaccatcagaacacccgcatcctcaagacgcaacttaatgttctccaaatcaccaatgattttgttgaactccac 80714  T
Q  101 aagcagctgcatgatagcctttgactttaccatctcgaatgagtaaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaaatat 200  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  80713 aagtagctccatgatagcctttgactttaccatcttgaatgagtaaagttgttgctttaggactttccgttgagccaaagactttgtcatatacaaatat 80614  T
Q  201 ttgaactttgaccacattgatgtcgcggttgtatcctatgct 242  Q
    | ||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| ||||    
T  80613 tcgaactttgaccacatcgatggcgcggttgtttcctttgct 80572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 161; Significance: 6e-86; HSPs: 15)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 6263486 - 6263722
Alignment:
Q  1 cttcttcatcctccaaacaacaccacgccatcagagcactcacatcctcaagatgcacctcaatgtcctccaaatcaccaatgattttgttgaactccat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  6263486 cttcttcatcctccaaacaacgccacaccatcagagcacccgcatcctcaagatgcacctcaatgttctccaaatcaccaactgttttgttgaactccat 6263585  T
Q  101 aagcagctgcatgatagcctttgactttaccatctcgaatgagtaaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaaatat 200  Q
    |||  ||| |||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6263586 aagttgctccatgatggcctttgactctaccatcttgaatgagtaaagttgttgctttaggacttgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaatat 6263685  T
Q  201 ttgaactttgaccacattgatgtcgcggttgtatcct 237  Q
     |||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||    
T  6263686 ctgaactttgaccacatcgatgccgcggttgtttcct 6263722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 45 - 231
Target Start/End: Original strand, 35217346 - 35217532
Alignment:
Q  45 tcctcaagatgcacctcaatgtcctccaaatcaccaatgattttgttgaactccataagcagctgcatgatagcctttgactttaccatctcgaatgagt 144  Q
    |||||||| ||||||||||| | |||||| ||| | | |||||||||||||||| ||||  ||| |||||| |||||||||| |||||||  ||||||||    
T  35217346 tcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatctaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttgactctaccatcctgaatgagt 35217445  T
Q  145 aaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaaatatttgaactttgaccacattgatgtcgcggttg 231  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||  ||||||| |||||| |||| ||||||||    
T  35217446 agagttgttgctttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatataaagattccaactttgcccacatcgatgccgcggttg 35217532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 45 - 231
Target Start/End: Original strand, 36560517 - 36560703
Alignment:
Q  45 tcctcaagatgcacctcaatgtcctccaaatcaccaatgattttgttgaactccataagcagctgcatgatagcctttgactttaccatctcgaatgagt 144  Q
    |||||||| ||||||||||| | |||||| ||| | | |||||||||||||||| ||||  ||| |||||| |||||||||| |||||||  ||||||||    
T  36560517 tcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatctaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttgactctaccatcctgaatgagt 36560616  T
Q  145 aaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaaatatttgaactttgaccacattgatgtcgcggttg 231  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||| ||| || |||| ||||||||    
T  36560617 agagttgttgctttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccatatcgatgccgcggttg 36560703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 43 - 231
Target Start/End: Original strand, 19503710 - 19503898
Alignment:
Q  43 catcctcaagatgcacctcaatgtcctccaaatcaccaatgattttgttgaactccataagcagctgcatgatagcctttgactttaccatctcgaatga 142  Q
    |||||||||| ||||||||||| | |||||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||  ||| |||||| |||||||||| || ||||  ||||||    
T  19503710 catcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttgactctatcatcctgaatga 19503809  T
Q  143 gtaaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaaatatttgaactttgaccacattgatgtcgcggttg 231  Q
    ||| |||  ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||| |||||| |||| ||||||||    
T  19503810 gtagagtcattgctttaggaattgccgatgaggcaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgccgcggttg 19503898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 43 - 231
Target Start/End: Original strand, 21520068 - 21520256
Alignment:
Q  43 catcctcaagatgcacctcaatgtcctccaaatcaccaatgattttgttgaactccataagcagctgcatgatagcctttgactttaccatctcgaatga 142  Q
    |||||| ||| ||||||| ||| | |||||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||  ||| |||||| || ||| |||  ||||||   |||||    
T  21520068 catccttaagttgcaccttaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcatttaactccaccatcctaaatga 21520167  T
Q  143 gtaaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaaatatttgaactttgaccacattgatgtcgcggttg 231  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||| |||||| ||||  |||||||    
T  21520168 gtagagttgttgctttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttggccacatcgatgctgcggttg 21520256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 83 - 231
Target Start/End: Original strand, 22405344 - 22405492
Alignment:
Q  83 gattttgttgaactccataagcagctgcatgatagcctttgactttaccatctcgaatgagtaaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagac 182  Q
    |||||||||||||||| ||||  ||| |||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||| | | |||||||||||| |||| ||| || |||||||    
T  22405344 gattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttgactccaccatcttgaatgagtagaatcgttgctttaggaattgctgataagccaaagac 22405443  T
Q  183 tttgtcatatacaaatatttgaactttgaccacattgatgtcgcggttg 231  Q
    ||||||||||||||| |||  ||||||| |||||| |||||||||||||    
T  22405444 tttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttg 22405492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Original strand, 31734211 - 31734309
Alignment:
Q  1 cttcttcatcctccaaacaacaccacgccatcagagcactcacatcctcaagatgcacctcaatgtcctccaaatcaccaatgattttgttgaactcca 99  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| ||||||| ||| || ||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31734211 cttctttatcctccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcattctcaagacgcaacttaatgttcttcaaatcatcaatgattttgttgaactcca 31734309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 83 - 194
Target Start/End: Original strand, 28569839 - 28569950
Alignment:
Q  83 gattttgttgaactccataagcagctgcatgatagcctttgactttaccatctcgaatgagtaaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagac 182  Q
    |||||||||||||||| ||||  | | |||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| |||||||  || |||||||  |||||     
T  28569839 gattttgttgaactccgtaagttgatccatgatggcctttgactctaccatcttgaatgagtaaagtttttgttttaggatctgtcgatgagctaaagat 28569938  T
Q  183 tttgtcatatac 194  Q
    || |||||||||    
T  28569939 ttggtcatatac 28569950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 138 - 231
Target Start/End: Original strand, 34574627 - 34574720
Alignment:
Q  138 aatgagtaaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaaatatttgaactttgaccacattgatgtcgcggttg 231  Q
    |||||||| ||||||||| || ||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| | |  |||||||||||||| |||| ||||||||    
T  34574627 aatgagtagagttgttgcatttggaattgcctatgagccaaaggctttgtcatatacaaagactccaactttgaccacatcgatgccgcggttg 34574720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 39
Target Start/End: Original strand, 19503332 - 19503370
Alignment:
Q  1 cttcttcatcctccaaacaacaccacgccatcagagcac 39  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19503332 cttcttcatcctccaaacaacaccacaccatcagagcac 19503370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 39
Target Start/End: Original strand, 21519690 - 21519728
Alignment:
Q  1 cttcttcatcctccaaacaacaccacgccatcagagcac 39  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21519690 cttcttcatcctccaaacaacaccacaccatcagagcac 21519728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 39
Target Start/End: Original strand, 36560140 - 36560178
Alignment:
Q  1 cttcttcatcctccaaacaacaccacgccatcagagcac 39  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36560140 cttcttcatcctccaaacaacaccacaccatcagagcac 36560178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 129 - 229
Target Start/End: Original strand, 19348690 - 19348790
Alignment:
Q  129 accatctcgaatgagtaaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaaatatttgaactttgaccacattgatgtcgcgg 228  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||| | || ||| | ||||| |||||| || |||||||||||  | |  ||||||| |||||| ||||||||||    
T  19348690 accatcttgaatgagtagagttgttgcttcaagagttgtctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgtcgcgg 19348789  T
Q  229 t 229  Q
    |    
T  19348790 t 19348790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 9 - 50
Target Start/End: Original strand, 35216974 - 35217015
Alignment:
Q  9 tcctccaaacaacaccacgccatcagagcactcacatcctca 50  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||    
T  35216974 tcctccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctca 35217015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 44 - 96
Target Start/End: Original strand, 42019221 - 42019273
Alignment:
Q  44 atcctcaagatgcacctcaatgtcctccaaatcaccaatgattttgttgaact 96  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||  ||||||||||||||    
T  42019221 atccttaagatgcacctcaatgttctccaagtcatcatggattttgttgaact 42019273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 159; Significance: 9e-85; HSPs: 22)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 15533934 - 15534164
Alignment:
Q  1 cttcttcatcctccaaacaacaccacgccatcagagcactcacatcctcaagatgcacctcaatgtcctccaaatcaccaatgattttgttgaactccat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  15533934 cttcttcatcctccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctcaagacgcacctcaatgttctccaaatcaccaatgattttgtcgaactccac 15534033  T
Q  101 aagcagctgcatgatagcctttgactttaccatctcgaatgagtaaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaaatat 200  Q
    ||| |||| |||||| |  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15534034 aagtagctccatgatggtttttgactctaccatcttgaatgagtaaagttgttgctttaggacttgccaatgagccaaagactttgtcatatacaaatat 15534133  T
Q  201 ttgaactttgaccacattgatgtcgcggttg 231  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15534134 tcgaactttgaccacatcgatgtcgcggttg 15534164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 3631275 - 3631496
Alignment:
Q  1 cttcttcatcctccaaacaacaccacgccatcagagcactcacatcctcaagatgcacctcaatgtcctccaaatcaccaatgattttgttgaactccat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |     
T  3631275 cttcttcatcctccaaacaacaccacaccatcagagcatccacatcctcaagacgcacctcaatgttctccaaatcaccaatgattttattgaactctac 3631374  T
Q  101 aagcagctgcatgatagcctttgactttaccatctcgaatgagtaaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaaatat 200  Q
    ||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  3631375 aagtagctccatgatggcctttgactttaccatcttgaatgagtaaagttattgctttaggaattgttgatgagtcaaagactttgtcatatacaaagct 3631474  T
Q  201 ttgaactttgaccacattgatg 222  Q
    |  ||||||| |||||| ||||    
T  3631475 tccaactttggccacatcgatg 3631496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 43 - 197
Target Start/End: Original strand, 25462839 - 25462993
Alignment:
Q  43 catcctcaagatgcacctcaatgtcctccaaatcaccaatgattttgttgaactccataagcagctgcatgatagcctttgactttaccatctcgaatga 142  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||  ||| |||||| ||||||||||  ||||||| ||||||    
T  25462839 catcctcaagatgcacctcaatattctccaagtcatcaaagattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttgactccaccatcttgaatga 25462938  T
Q  143 gtaaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaaa 197  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  25462939 gtagagttgttgctttaggaattgccgatgagcctaagactttgtcatatacaaa 25462993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 45 - 231
Target Start/End: Original strand, 26931939 - 26932125
Alignment:
Q  45 tcctcaagatgcacctcaatgtcctccaaatcaccaatgattttgttgaactccataagcagctgcatgatagcctttgactttaccatctcgaatgagt 144  Q
    |||||||| ||||||||||| | |||||| ||| | | |||||||||||||||| ||||  ||| |||||| |||||||||| | |||||| ||||||||    
T  26931939 tcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatctaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttgactcttccatcttgaatgagt 26932038  T
Q  145 aaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaaatatttgaactttgaccacattgatgtcgcggttg 231  Q
    | ||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||  |||| ||||||||    
T  26932039 agagtcgttgctttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagatttcaactttgcccacaacgatgccgcggttg 26932125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 45 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 33309792 - 33309606
Alignment:
Q  45 tcctcaagatgcacctcaatgtcctccaaatcaccaatgattttgttgaactccataagcagctgcatgatagcctttgactttaccatctcgaatgagt 144  Q
    |||||||| ||||||||||| | |||||| ||| | | |||||||||||||||| ||||  ||| |||||| |||||||||| |||||||  ||||||||    
T  33309792 tcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatctaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttgactctaccatcctgaatgagt 33309693  T
Q  145 aaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaaatatttgaactttgaccacattgatgtcgcggttg 231  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||| ||| || ||||  |||||||    
T  33309692 agagttgttgctttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccatatcgatgctgcggttg 33309606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 110 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 17012901 - 17012780
Alignment:
Q  110 catgatagcctttgactttaccatctcgaatgagtaaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaaatatttgaacttt 209  Q
    |||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  17012901 catgatggcctttgactctaccatcttgaatgagtaaagttgttgcttttggaattgccgatgagccaaagactttatcatatacaaatattcgaacttt 17012802  T
Q  210 gaccacattgatgtcgcggttg 231  Q
    |||||||| |||||||| ||||    
T  17012801 gaccacatcgatgtcgcagttg 17012780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 45 - 231
Target Start/End: Original strand, 26067771 - 26067957
Alignment:
Q  45 tcctcaagatgcacctcaatgtcctccaaatcaccaatgattttgttgaactccataagcagctgcatgatagcctttgactttaccatctcgaatgagt 144  Q
    |||||||| ||||||||||| | |||||| ||| | | |||||| ||||||||| ||||  |||  ||||| |||||||||| | |||||  ||||||||    
T  26067771 tcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatctaggatttttttgaactccgtaagttgctcaatgatggcctttgactcttccatcctgaatgagt 26067870  T
Q  145 aaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaaatatttgaactttgaccacattgatgtcgcggttg 231  Q
    | ||| |||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||| |||||| |||| ||||||||    
T  26067871 agagtcgttgctttaggaattgctgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgccgcggttg 26067957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 43 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 12158156 - 12157972
Alignment:
Q  43 catcctcaagatgcacctcaatgtcctccaaatcaccaatgattttgttgaactccataagcagctgcatgatagcctttgactttaccatctcgaatga 142  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| |||||||||||  ||||   || |||| | | ||||||||  ||||||| ||||||    
T  12158156 catccacaagatgcacctcaatgttctccaaatcatcaaggatcttgttgaactctgtaagtttctccatggtggtctttgactccaccatcttgaatga 12158057  T
Q  143 gtaaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaaatatttgaactttgaccacattgatgtcgcg 227  Q
    ||| |||  ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||  | |  |||||||||||||| |||||||||    
T  12158056 gtagagtgcttgctttaggaattgccaatgagccaaagactttgtcatatacaatgactccaactttgaccacatcgatgtcgcg 12157972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 111 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 26944361 - 26944241
Alignment:
Q  111 atgatagcctttgactttaccatctcgaatgagtaaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaaatatttgaactttg 210  Q
    ||||| |||||||||| |||||||| |||| | ||||||||| ||||||||| ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26944361 atgatggcctttgactctaccatcttgaattattaaagttgtcgctttaggaattgtcgataagccaaagactttgtcatatacaaatattcgaactttg 26944262  T
Q  211 accacattgatgtcgcggttg 231  Q
    ||||||| |||| ||||||||    
T  26944261 accacatcgatggcgcggttg 26944241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 45 - 230
Target Start/End: Original strand, 5408402 - 5408587
Alignment:
Q  45 tcctcaagatgcacctcaatgtcctccaaatcaccaatgattttgttgaactccataagcagctgcatgatagcctttgactttaccatctcgaatgagt 144  Q
    |||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||||||||||   |   ||| ||| |  | ||||||||  ||||||| ||||||||    
T  5408402 tcctcaagttgcacctcaatgatctccaaatcatcaaggattttgttgaactccgccaattgctccatcacggtctttgactccaccatcttgaatgagt 5408501  T
Q  145 aaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaaatatttgaactttgaccacattgatgtcgcggtt 230  Q
    | ||||||||||| |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||  | |  |||||||||||||| ||||||||||||    
T  5408502 agagttgttgcttaaggaattgcctatgagccaaagactttgtcatatacaacgactccaactttgaccacatcgatgtcgcggtt 5408587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 45 - 230
Target Start/End: Original strand, 5412727 - 5412912
Alignment:
Q  45 tcctcaagatgcacctcaatgtcctccaaatcaccaatgattttgttgaactccataagcagctgcatgatagcctttgactttaccatctcgaatgagt 144  Q
    |||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||||||||||   |   ||| ||| |  | ||||||||  ||||||| ||||||||    
T  5412727 tcctcaagttgcacctcaatgatctccaaatcatcaaggattttgttgaactccgccaattgctccatcacggtctttgactccaccatcttgaatgagt 5412826  T
Q  145 aaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaaatatttgaactttgaccacattgatgtcgcggtt 230  Q
    | ||||||||||| |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||  | |  |||||||||||||| ||||||||||||    
T  5412827 agagttgttgcttaaggaattgcctatgagccaaagactttgtcatatacaacgactccaactttgaccacatcgatgtcgcggtt 5412912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 112 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 3395232 - 3395113
Alignment:
Q  112 tgatagcctttgactttaccatctcgaatgagtaaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaaatatttgaactttga 211  Q
    |||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||  |||||||     
T  3395232 tgatggcctttgactctaccatcttgaatgagtaaagttgttgctttaggaattgccaatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgc 3395133  T
Q  212 ccacattgatgtcgcggttg 231  Q
     ||||| ||||  |||||||    
T  3395132 acacatcgatgcggcggttg 3395113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 44 - 231
Target Start/End: Original strand, 12936624 - 12936811
Alignment:
Q  44 atcctcaagatgcacctcaatgtcctccaaatcaccaatgattttgttgaactccataagcagctgcatgatagcctttgactttaccatctcgaatgag 143  Q
    |||||||| ||||||||||||   ||  || ||| ||| ||||||||| |||||| ||||  ||| |||||| |||||| |||  |||||||  ||||||    
T  12936624 atcctcaatatgcacctcaatagtctttaagtcatcaaggattttgttaaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcttaaatgag 12936723  T
Q  144 taaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaaatatttgaactttgaccacattgatgtcgcggttg 231  Q
    || |||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||| | |  |||||||||||||| |||| ||||||||    
T  12936724 tagagttgttgctttaggaattgccaatgagccaaagattttgtcatatacaaagactccaactttgaccacatcgatggcgcggttg 12936811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 44 - 189
Target Start/End: Original strand, 12910948 - 12911093
Alignment:
Q  44 atcctcaagatgcacctcaatgtcctccaaatcaccaatgattttgttgaactccataagcagctgcatgatagcctttgactttaccatctcgaatgag 143  Q
    |||||||| ||||||||||||   ||  || ||| ||| ||||||||| |||||| ||||  ||| |||||| |||||| |||  ||||||| |||||||    
T  12910948 atcctcaatatgcacctcaatagtctttaagtcatcaaggattttgttaaactccgtaagttgctccatgatggcctttaactccaccatcttgaatgag 12911047  T
Q  144 taaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtca 189  Q
    || |||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||    
T  12911048 tagagttgttgctttaggaattcccaatgagccaaagactttgtca 12911093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 45 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 16553511 - 16553325
Alignment:
Q  45 tcctcaagatgcacctcaatgtcctccaaatcaccaatgattttgttgaactccataagcagctgcatgatagcctttgactttaccatctcgaatgagt 144  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||| ||| ||||||||||||   |   ||| ||| |  | ||||||||  ||||||| ||||||||    
T  16553511 tcctcaagttgcacctcaatgttctccaagtcatcaaggatcttgttgaactccgccaattgctccatcacggtctttgactccaccatcttgaatgagt 16553412  T
Q  145 aaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaaatatttgaactttgaccacattgatgtcgcggttg 231  Q
    | ||||||||||| |||| ||| | ||||| ||| ||||| |||||||||||  |||  ||||| ||||| || |||| ||||||||    
T  16553411 agagttgttgcttaaggaattgtctatgagccaacgacttggtcatatacaacgattccaacttagaccatatcgatgccgcggttg 16553325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 45 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 16630067 - 16629881
Alignment:
Q  45 tcctcaagatgcacctcaatgtcctccaaatcaccaatgattttgttgaactccataagcagctgcatgatagcctttgactttaccatctcgaatgagt 144  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||| ||| ||||||||||||   |   ||| ||| |  | ||||||||  ||||||| ||||||||    
T  16630067 tcctcaagttgcacctcaatgttctccaagtcatcaaggatcttgttgaactccgccaattgctccatcacggtctttgactccaccatcttgaatgagt 16629968  T
Q  145 aaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaaatatttgaactttgaccacattgatgtcgcggttg 231  Q
    | ||||||||||| |||| ||| | ||||| ||| ||||| |||||||||||  |||  ||||| ||||| || |||| ||||||||    
T  16629967 agagttgttgcttaaggaattgtctatgagccaacgacttggtcatatacaacgattccaacttagaccatatcgatgccgcggttg 16629881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 45 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 34165719 - 34165568
Alignment:
Q  45 tcctcaagatgcacctcaatgtcctccaaatcaccaatgattttgttgaactccataagcagctgcatgatagcctttgactttaccatctcgaatgagt 144  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||  | | ||| ||||||||||||   |   ||| ||| |  | ||||||||  ||||||| ||||||||    
T  34165719 tcctcaagttgcacctcaatgttctccaaatcgtcgaggatcttgttgaactccgccaattgctccatcacggtctttgactccaccatcttgaatgagt 34165620  T
Q  145 aaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaa 196  Q
    | ||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| ||||| |||||||||||    
T  34165619 agagttgttgcttaaggaattgcctatgagccaacgacttggtcatatacaa 34165568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 45 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 16567821 - 16567768
Alignment:
Q  45 tcctcaagatgcacctcaatgtcctccaaatcaccaatgattttgttgaactcc 98  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  16567821 tcctcaagttgcacctcaatgttctccaaatcatcaaggattttgttgaactcc 16567768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 43 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 16651774 - 16651585
Alignment:
Q  43 catcctcaagatgcacctcaatgtc-ctccaaatcaccaatgattttgttgaactccataagcagctgcatgatagcctttgactttaccatctcgaatg 141  Q
    |||||||||| |||||||||||||  |||||| ||| ||| ||| ||||||||||||   |   ||| ||| |  | ||||||||  ||||||| |||||    
T  16651774 catcctcaagttgcacctcaatgtgtctccaagtcatcaaggatcttgttgaactccgccaattgctccatcacggtctttgactccaccatcttgaatg 16651675  T
Q  142 agtaaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaaatatttgaactttgaccacattgatgtcgcggttg 231  Q
    |||| ||||||||||| |||| ||| | ||||| ||| ||||| |||||||||||  |||  ||||| ||||| || |||| ||||||||    
T  16651674 agtagagttgttgcttaaggaattgtctatgagccaacgacttggtcatatacaacgattccaacttagaccatatcgatgccgcggttg 16651585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Original strand, 26067391 - 26067440
Alignment:
Q  1 cttcttcatcctccaaacaacaccacgccatcagagcactcacatcctca 50  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||    
T  26067391 cttcttcatcctccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctca 26067440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 30444194 - 30444010
Alignment:
Q  47 ctcaagatgcacctcaatgtcctccaaatcaccaatgattttgttgaactccataagcagctgcatgatagcctttgactttaccatctcgaatgagtaa 146  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| |  || |||||||||||||| | ||||  ||| |||||| |  | | | |  | |||||  ||||||||     
T  30444194 ctcaagatacacctcaatgttctccaaattataaaggattttgttgaacttcgtaagttgctccatgatggtgtataaatccatcatcttaaatgagtag 30444095  T
Q  147 agttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaaatatttgaactttgaccacattgatgtcgcggttg 231  Q
    |||||| ||||||| | ||| | ||||| ||||||||| |||||||||||  | |  |||||||||||||| |||| || |||||    
T  30444094 agttgtggctttagaaattgtctatgagccaaagacttggtcatatacaacgactccaactttgaccacatcgatgccgtggttg 30444010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 33310172 - 33310134
Alignment:
Q  1 cttcttcatcctccaaacaacaccacgccatcagagcac 39  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33310172 cttcttcttcctccaaacaacaccacaccatcagagcac 33310134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1674 (Bit Score: 150; Significance: 2e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold1674
Description:

Target: scaffold1674; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 242
Target Start/End: Original strand, 784 - 1025
Alignment:
Q  1 cttcttcatcctccaaacaacaccacgccatcagagcactcacatcctcaagatgcacctcaatgtcctccaaatcaccaatgattttgttgaactccat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| ||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  784 cttcttcatcctccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctcaagacgcaacttaatgttctccaaatcaccaatgattttgttgaactccac 883  T
Q  101 aagcagctgcatgatagcctttgactttaccatctcgaatgagtaaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaaatat 200  Q
    ||| |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||| ||    
T  884 aagtagcaccatgatagcctttgactttaccatcttgaatgagtaaagttgttgctttaggactttccgataagccaaagactttgtcatatacaaaaat 983  T
Q  201 ttgaactttgaccacattgatgtcgcggttgtatcctatgct 242  Q
    |  || ||||||||||| |||| ||||||||| |||| ||||    
T  984 tcaaaatttgaccacatcgatgacgcggttgtttcctttgct 1025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140 (Bit Score: 87; Significance: 8e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0140
Description:

Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 45 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 23029 - 22843
Alignment:
Q  45 tcctcaagatgcacctcaatgtcctccaaatcaccaatgattttgttgaactccataagcagctgcatgatagcctttgactttaccatctcgaatgagt 144  Q
    |||||||| ||||||||||| | |||||| ||| | | |||||||||||||||| ||||  ||| |||||| |||||||||| |||||||  ||||||||    
T  23029 tcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatctaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttgactctaccatcctgaatgagt 22930  T
Q  145 aaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaaatatttgaactttgaccacattgatgtcgcggttg 231  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||| ||| || |||| ||||||||    
T  22929 agagttgttgctttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccatatcgatgccgcggttg 22843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 23409 - 23360
Alignment:
Q  1 cttcttcatcctccaaacaacaccacgccatcagagcactcacatcctca 50  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||    
T  23409 cttcttcttcctccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctca 23360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 82; Significance: 8e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 110 - 231
Target Start/End: Original strand, 26331 - 26452
Alignment:
Q  110 catgatagcctttgactttaccatctcgaatgagtaaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaaatatttgaacttt 209  Q
    |||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  26331 catgatggcctttgactctaccatcttgaatgagtaaagttgttgcttttggaattgccgatgagccaaagactttatcatatacaaatattcgaacttt 26430  T
Q  210 gaccacattgatgtcgcggttg 231  Q
    |||||||| |||||||| ||||    
T  26431 gaccacatcgatgtcgcagttg 26452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1899 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold1899
Description:

Target: scaffold1899; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 43 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 529 - 341
Alignment:
Q  43 catcctcaagatgcacctcaatgtcctccaaatcaccaatgattttgttgaactccataagcagctgcatgatagcctttgactttaccatctcgaatga 142  Q
    |||||||||| | ||||||||| | |||||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||  ||| |||||| |||||||||| |||||||  ||||||    
T  529 catcctcaagtttcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactccgtaagttgctccatgatggcctttgactctaccatcctgaatga 430  T
Q  143 gtaaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaaatatttgaactttgaccacattgatgtcgcggttg 231  Q
    ||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  ||||||| |||||| |||| | ||||||    
T  429 gtagagtcgttgctttaggaattgccgatgagccaaaggctttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgccacggttg 341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1899; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 907 - 858
Alignment:
Q  1 cttcttcatcctccaaacaacaccacgccatcagagcactcacatcctca 50  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||    
T  907 cttcttcatcctccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctca 858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 43 - 222
Target Start/End: Original strand, 72891 - 73070
Alignment:
Q  43 catcctcaagatgcacctcaatgtcctccaaatcaccaatgattttgttgaactccataagcagctgcatgatagcctttgactttaccatctcgaatga 142  Q
    |||||||||| ||||||||||| | |||||| ||| ||| |||||||||||||||  ||||  ||| |||||| | ||||||||  ||||||  ||||||    
T  72891 catcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgttgaactctgtaagttgctccatgatggtctttgactccaccatcctgaatga 72990  T
Q  143 gtaaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaaatatttgaactttgaccacattgatg 222  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  ||||||| |||||| ||||    
T  72991 gtagagttgttgctttaggaattgccgatgagtcaaagattttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatagatg 73070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 39
Target Start/End: Original strand, 72510 - 72548
Alignment:
Q  1 cttcttcatcctccaaacaacaccacgccatcagagcac 39  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  72510 cttcttcatcctccaaacaacaccacaccatcaaagcac 72548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 43 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 34455 - 34276
Alignment:
Q  43 catcctcaagatgcacctcaatgtcctccaaatcaccaatgattttgttgaactccataagcagctgcatgatagcctttgactttaccatctcgaatga 142  Q
    |||||||||| ||||||||||| | |||||| ||| ||| ||||||||| |||||| | ||  ||| |||||| ||||||||||  ||||||  ||||||    
T  34455 catcctcaagttgcacctcaatattctccaagtcatcaaggattttgtttaactccgtgagttgctccatgatggcctttgactccaccatcctgaatga 34356  T
Q  143 gtaaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaaatatttgaactttgaccacattgatg 222  Q
    ||  |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||| |||||| ||||    
T  34355 gtggagttgttgctttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatg 34276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 34841 - 34803
Alignment:
Q  1 cttcttcatcctccaaacaacaccacgccatcagagcac 39  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  34841 cttcttcatcctccaaacaacgccacaccatcagagcac 34803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 56 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 115427 - 115252
Alignment:
Q  56 cacctcaatgtcctccaaatcaccaatgattttgttgaactccataagcagctgcatgatagcctttgactttaccatctcgaatgagtaaagttgttgc 155  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||  | |   ||| ||| |  | |||||| |  ||||||| ||||||||| |||||||||    
T  115427 cacctcaatgttctccaaatcatcaaggattttgttgaactctgtcaattgctccatcacggtctttgaatccaccatcttgaatgagtagagttgttgc 115328  T
Q  156 tttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaaatatttgaactttgaccacattgatgtcgcggttg 231  Q
    || |||| ||| | ||||| ||||||||| |||||||||||  | |  |||||||||||| | |||| ||||||||    
T  115327 ttaaggaattgtctatgagccaaagacttggtcatatacaatgactacaactttgaccacgtcgatgccgcggttg 115252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1908 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1908
Description:

Target: scaffold1908; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 45 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 201 - 148
Alignment:
Q  45 tcctcaagatgcacctcaatgtcctccaaatcaccaatgattttgttgaactcc 98  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  201 tcctcaagttgcacctcaatgttctccaaatcatcaaggattttgttgaactcc 148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0219 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0219
Description:

Target: scaffold0219; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 43 - 222
Target Start/End: Original strand, 26747 - 26926
Alignment:
Q  43 catcctcaagatgcacctcaatgtcctccaaatcaccaatgattttgttgaactccataagcagctgcatgatagcctttgactttaccatctcgaatga 142  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||  ||||  ||||||||||| ||  ||| || || | |||||||||  |||||||  || ||    
T  26747 catcctcaagatgcacatcaatgttctccaaatcatcaagaatttgtttgaactccattagttgctccaagacaacctttgactccaccatcttaaacga 26846  T
Q  143 gtaaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaaatatttgaactttgaccacattgatg 222  Q
    ||| || ||| | ||||||| |||   ||||| |||||| ||||||| ||||||  | |  ||||||||||||| |||||    
T  26847 gtagagatgtagttttaggaattgtgtatgagccaaagaatttgtcacatacaacgactccaactttgaccacaatgatg 26926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0355 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0355
Description:

Target: scaffold0355; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 129 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 551 - 454
Alignment:
Q  129 accatctcgaatgagtaaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaaatatttgaactttgaccacattgatgtcgc 226  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||| | || ||||| ||||| |||||| || |||||||||||  | |  ||||||| |||||| ||||||||    
T  551 accatcttgaatgaataaagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgtcgc 454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0197
Description:

Target: scaffold0197; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 129 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 14983 - 14883
Alignment:
Q  129 accatctcgaatgagtaaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaaatatttgaactttgaccacattgatgtcgcgg 228  Q
    ||||||| |||||| || ||||||||||| | || ||||| ||||| |||||| || |||||||||||  | |  ||||||| |||||| |||| |||||    
T  14983 accatcttgaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcgg 14884  T
Q  229 t 229  Q
    |    
T  14883 t 14883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 129 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 149629 - 149529
Alignment:
Q  129 accatctcgaatgagtaaagttgttgctttaggacttgccgatgagtcaaagactttgtcatatacaaatatttgaactttgaccacattgatgtcgcgg 228  Q
    |||||||  ||||| || ||||||||||| | || ||||| ||||| |||||| || |||||||||||  | |  ||||||| ||||||||||| |||||    
T  149629 accatcttaaatgaatagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacattgatgccgcgg 149530  T
Q  229 t 229  Q
    |    
T  149529 t 149529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University