View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF9839A_low_13 (Length: 483)

Name: NF9839A_low_13
Description: NF9839A
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF9839A_low_13
NF9839A_low_13
[»] chr3 (21 HSPs)
chr3 (21-480)||(6150077-6150536)
chr3 (24-480)||(17201092-17201549)
chr3 (87-480)||(8271689-8272082)
chr3 (89-480)||(30149814-30150205)
chr3 (87-480)||(13964645-13965035)
chr3 (13-463)||(22149962-22150403)
chr3 (26-330)||(15943824-15944128)
chr3 (340-480)||(15948014-15948154)
chr3 (381-480)||(15612559-15612658)
chr3 (384-480)||(30140263-30140359)
chr3 (412-480)||(12796024-12796092)
chr3 (412-480)||(16258930-16258998)
chr3 (412-480)||(18915514-18915582)
chr3 (228-279)||(10408626-10408677)
chr3 (228-279)||(12509903-12509954)
chr3 (228-279)||(28756977-28757028)
chr3 (228-279)||(47126602-47126653)
chr3 (228-270)||(31692605-31692647)
chr3 (26-58)||(8271628-8271660)
chr3 (26-58)||(13964584-13964616)
chr3 (26-58)||(30150236-30150268)
[»] chr2 (10 HSPs)
chr2 (31-478)||(22739189-22739636)
chr2 (24-480)||(22280564-22281020)
chr2 (224-480)||(25131068-25131324)
chr2 (253-480)||(24567425-24567652)
chr2 (384-476)||(25878531-25878623)
chr2 (412-480)||(12638818-12638886)
chr2 (412-480)||(12644485-12644553)
chr2 (412-480)||(24829105-24829172)
chr2 (413-480)||(34821609-34821675)
chr2 (228-268)||(23113394-23113434)
[»] scaffold0021 (6 HSPs)
scaffold0021 (17-480)||(90359-90822)
scaffold0021 (21-480)||(8014-8473)
scaffold0021 (24-415)||(20867-21257)
scaffold0021 (24-415)||(30443-30833)
scaffold0021 (434-480)||(21255-21301)
scaffold0021 (434-480)||(30831-30877)
[»] chr8 (12 HSPs)
chr8 (21-480)||(20649783-20650242)
chr8 (17-480)||(21193976-21194439)
chr8 (90-480)||(22437184-22437574)
chr8 (87-480)||(21847831-21848224)
chr8 (21-480)||(16414985-16415439)
chr8 (111-480)||(23903056-23903424)
chr8 (384-480)||(24931619-24931711)
chr8 (388-469)||(23154838-23154919)
chr8 (228-279)||(16268859-16268910)
chr8 (228-270)||(28984015-28984057)
chr8 (228-270)||(28989234-28989276)
chr8 (228-270)||(31414167-31414209)
[»] chr6 (17 HSPs)
chr6 (18-480)||(16100707-16101169)
chr6 (89-480)||(16379571-16379962)
chr6 (87-480)||(16647165-16647558)
chr6 (224-480)||(18401337-18401593)
chr6 (87-263)||(14149316-14149492)
chr6 (316-480)||(1646239-1646403)
chr6 (381-480)||(18578113-18578212)
chr6 (17-176)||(21412652-21412811)
chr6 (260-444)||(14133824-14133993)
chr6 (381-480)||(23025251-23025350)
chr6 (381-480)||(16235051-16235149)
chr6 (384-476)||(19985697-19985789)
chr6 (412-480)||(18836178-18836246)
chr6 (229-268)||(18182705-18182744)
chr6 (204-270)||(21474502-21474568)
chr6 (26-58)||(16379508-16379540)
chr6 (26-58)||(16647104-16647136)
[»] chr7 (22 HSPs)
chr7 (24-483)||(4442741-4443200)
chr7 (89-480)||(7826717-7827108)
chr7 (89-480)||(27104836-27105227)
chr7 (89-480)||(27173098-27173489)
chr7 (96-480)||(13458852-13459234)
chr7 (159-354)||(14207264-14207456)
chr7 (159-354)||(14215954-14216146)
chr7 (381-480)||(11284627-11284726)
chr7 (129-344)||(22034950-22035165)
chr7 (129-307)||(17142404-17142582)
chr7 (415-480)||(17926436-17926501)
chr7 (211-424)||(17131545-17131758)
chr7 (228-279)||(21755431-21755482)
chr7 (228-279)||(26115769-26115820)
chr7 (228-279)||(13965847-13965898)
chr7 (228-279)||(26091977-26092028)
chr7 (228-279)||(40924996-40925047)
chr7 (228-279)||(49155320-49155371)
chr7 (80-153)||(14218206-14218279)
chr7 (26-58)||(7827139-7827171)
chr7 (26-58)||(27104773-27104805)
chr7 (26-58)||(27173520-27173552)
[»] chr4 (10 HSPs)
chr4 (87-482)||(14999472-14999867)
chr4 (87-480)||(15290209-15290602)
chr4 (80-478)||(12339909-12340309)
chr4 (381-480)||(9292994-9293093)
chr4 (381-480)||(15139015-15139113)
chr4 (228-279)||(3261986-3262037)
chr4 (228-279)||(7357296-7357347)
chr4 (228-279)||(11204424-11204475)
chr4 (228-279)||(29450729-29450780)
chr4 (26-58)||(14999896-14999928)
[»] scaffold0225 (2 HSPs)
scaffold0225 (87-480)||(26253-26646)
scaffold0225 (26-58)||(26675-26707)
[»] scaffold0120 (1 HSPs)
scaffold0120 (18-480)||(25035-25498)
[»] scaffold0141 (2 HSPs)
scaffold0141 (87-480)||(23820-24213)
scaffold0141 (26-58)||(24242-24274)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (87-480)||(131543-131936)
scaffold0008 (21-480)||(26634-27092)
[»] chr1 (15 HSPs)
chr1 (87-480)||(20527896-20528289)
chr1 (91-480)||(20927897-20928286)
chr1 (89-480)||(20828517-20828908)
chr1 (17-480)||(41214913-41215372)
chr1 (227-480)||(22133015-22133268)
chr1 (18-233)||(22129493-22129708)
chr1 (186-474)||(20172011-20172300)
chr1 (228-279)||(20074973-20075024)
chr1 (228-279)||(20297456-20297507)
chr1 (228-279)||(31537261-31537312)
chr1 (228-279)||(38910090-38910141)
chr1 (228-279)||(48425948-48425999)
chr1 (228-279)||(52988816-52988867)
chr1 (232-268)||(16379149-16379185)
chr1 (26-58)||(20828454-20828486)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (21-480)||(939-1399)
[»] scaffold0467 (2 HSPs)
scaffold0467 (18-480)||(606-1068)
scaffold0467 (18-322)||(13316-13620)
[»] scaffold0561 (1 HSPs)
scaffold0561 (90-480)||(6061-6452)
[»] scaffold0011 (4 HSPs)
scaffold0011 (21-480)||(73585-74044)
scaffold0011 (21-480)||(77966-78425)
scaffold0011 (25-393)||(181934-182302)
scaffold0011 (221-478)||(175701-175958)
[»] scaffold0962 (1 HSPs)
scaffold0962 (24-480)||(2431-2884)
[»] scaffold0170 (1 HSPs)
scaffold0170 (90-480)||(34942-35332)
[»] chr5 (8 HSPs)
chr5 (87-480)||(23508426-23508810)
chr5 (26-480)||(24583952-24584397)
chr5 (309-480)||(21934643-21934814)
chr5 (412-480)||(23505316-23505383)
chr5 (228-279)||(14884365-14884416)
chr5 (228-279)||(20345225-20345276)
chr5 (228-279)||(22505622-22505673)
chr5 (203-279)||(25851015-25851091)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (26-480)||(1068-1522)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (87-480)||(4859-5253)
scaffold0124 (26-58)||(4798-4830)
[»] scaffold0465 (1 HSPs)
scaffold0465 (87-480)||(12679-13072)
[»] scaffold0266 (1 HSPs)
scaffold0266 (87-480)||(6914-7308)
[»] scaffold0610 (1 HSPs)
scaffold0610 (18-480)||(3888-4349)
[»] scaffold0673 (1 HSPs)
scaffold0673 (109-480)||(5380-5751)
[»] scaffold0162 (2 HSPs)
scaffold0162 (90-480)||(15767-16157)
scaffold0162 (412-480)||(10553-10621)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (18-344)||(25685-26012)
[»] scaffold0112 (1 HSPs)
scaffold0112 (114-480)||(3356-3722)
[»] scaffold0462 (2 HSPs)
scaffold0462 (18-331)||(2703-3022)
scaffold0462 (367-480)||(2579-2692)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (17-226)||(96637-96847)
[»] scaffold0233 (1 HSPs)
scaffold0233 (114-475)||(20807-21168)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (114-428)||(77339-77653)
[»] scaffold0269 (1 HSPs)
scaffold0269 (381-480)||(2335-2434)
[»] scaffold0244 (1 HSPs)
scaffold0244 (381-480)||(24913-25012)
[»] scaffold0615 (1 HSPs)
scaffold0615 (90-244)||(9429-9583)
[»] scaffold1164 (1 HSPs)
scaffold1164 (346-438)||(2292-2384)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (384-480)||(3340-3436)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (384-480)||(93791-93887)
[»] scaffold1486 (1 HSPs)
scaffold1486 (389-480)||(364-455)
[»] scaffold0139 (1 HSPs)
scaffold0139 (381-480)||(17696-17794)
[»] scaffold0023 (1 HSPs)
scaffold0023 (389-480)||(53967-54058)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (381-480)||(46431-46529)
[»] scaffold0092 (1 HSPs)
scaffold0092 (412-480)||(929-997)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (406-480)||(8199-8273)
[»] scaffold0409 (2 HSPs)
scaffold0409 (412-480)||(3331-3399)
scaffold0409 (412-480)||(11586-11654)
[»] scaffold0335 (1 HSPs)
scaffold0335 (412-480)||(10757-10826)
[»] scaffold1424 (1 HSPs)
scaffold1424 (412-480)||(131-198)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (412-480)||(51698-51766)
[»] scaffold1488 (1 HSPs)
scaffold1488 (430-480)||(202-252)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (24-106)||(36163-36245)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (229-268)||(15479-15518)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (228-279)||(29992-30043)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (228-279)||(67303-67354)
[»] scaffold0041 (1 HSPs)
scaffold0041 (228-279)||(41793-41844)
[»] scaffold0010 (1 HSPs)
scaffold0010 (228-279)||(39528-39579)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (228-279)||(514548-514599)
[»] scaffold0585 (1 HSPs)
scaffold0585 (228-270)||(4284-4326)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (213-246)||(29941-29974)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 292; Significance: 1e-164; HSPs: 21)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 21 - 480
Target Start/End: Original strand, 6150077 - 6150536
Alignment:
Q  21 atcagttgttacaagtgtgggaaagcgggtcacaaggcctatgagtgtaaggatgtttcgaagaatattacttgctacaattgtggaaagaatggtcata 120  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||  ||||   ||| | ||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  6150077 atcagttgtcacaagtgtgggaaagcgggtcacaaggcttatgaatgcaagagtgttgtaaaggagattacttgctacaattgtggagagaagggtcata 6150176  T
Q  121 ttagtaataagtgtaccaagccgaagaaggcggccggaaaggtgtttgctttgaatgcagaggaagtggagcagccaaataatcttatccgaggtatgtg 220  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||    
T  6150177 ttagtactaagtgtaccaagccgaagaaggcggtgggaaaggtgtttgctttgaatgcggaggaggtggagcaaccggataatcttatccgaggtatgtg 6150276  T
Q  221 ttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatattggtgctactctttcttttacctcggttagttttgttgagcatttgaaattggttgtaact 320  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  6150277 ttttatcaatagtactcatttgattgcaattattgatattggtgctactcattcttttatatcggttagttgtgttgagcgtttgaaattggttgtaact 6150376  T
Q  321 ccgttgttgcgagatatggtcatcaacaccccagctagtggttcggtgactacttgttttgtgtgtgctaagtgtcctgttaatattggtaatgttgatt 420  Q
    || |||||||| |  ||||| ||  ||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6150377 cccttgttgcggggaatggttattgacaccccggctagaggttcggttactacttcttttatgtgtgctaagtgtcctgttaattttggtaatgttgatt 6150476  T
Q  421 ttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatggatgtgatttttggtatggatt 480  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6150477 ttgagttggatcttgtttgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggatt 6150536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 24 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 17201549 - 17201092
Alignment:
Q  24 agttgttacaagtgtgggaaagcgggtcacaaggcctatgagtgtaaggatgtttcgaagaatattacttgctacaattgtggaaagaatggtcatatta 123  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||   ||| |||| | ||||   |||  | ||  |||| |||||||||||| |||| |||||||| |    
T  17201549 agttgctacaagtgtgggaaagcgggtcacaatgcaattgattgtacgaatgtggagaaagagatcgcttgttacaattgtggagagaagggtcatatca 17201450  T
Q  124 gtaataagtgtaccaagccgaagaaggcggccggaaaggtgtttgctttgaatgcagaggaagtggagcagccaaataatcttatccgaggtatgtgttt 223  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||    
T  17201449 gtactaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgcattgaatgcggaggaaatggagcatccagataatcttatctgatgtatgtgttt 17201350  T
Q  224 t-atcaatagtactcctttgattgcaattattgatattggtgctactctttcttttacctcggttagttttgttgagcatttgaaattggttgtaactcc 322  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17201349 ttatcaatagtactccattgattgcaattattgatactagtgctactcattcttttatctcggttagttgtgttgagcgtttgaaattggttgtaactcc 17201250  T
Q  323 gttgttgcgagatatggtcatcaacaccccagctagtggttcggtgactacttgttttgtgtgtgctaagtgtcctgttaatattggtaatgttgatttt 422  Q
     ||||||||||  ||||||||| ||||||  ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||    
T  17201249 tttgttgcgagggatggtcatcgacacccgtgctagcggttcggtgactacttcttttgtgtgtgctaattgtcctgttaatttaggtaatgttgatttt 17201150  T
Q  423 gagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatggatgtgatttttggtatggatt 480  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17201149 gagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggatt 17201092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 87 - 480
Target Start/End: Original strand, 8271689 - 8272082
Alignment:
Q  87 attacttgctacaattgtggaaagaatggtcatattagtaataagtgtaccaagccgaagaaggcggccggaaaggtgtttgctttgaatgcagaggaag 186  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  8271689 attacttgttacaattgtggagagaagggtcatattagtaccaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcggaggagg 8271788  T
Q  187 tggagcagccaaataatcttatccgaggtatgtgttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatattggtgctactctttcttttacctcggt 286  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||     
T  8271789 tggagcagccggataatcttatccgaggtatgtgttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttatctcggc 8271888  T
Q  287 tagttttgttgagcatttgaaattggttgtaactccgttgttgcgagatatggtcatcaacaccccagctagtggttcggtgactacttgttttgtgtgt 386  Q
    ||||| |||||| | |||| | |||||||||||||| |||||||| |  ||||| ||  ||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| |||||    
T  8271889 tagttgtgttgaacgtttggatttggttgtaactcctttgttgcgtggaatggttattgacaccccggctagcggttcggtgactacttcttttatgtgt 8271988  T
Q  387 gctaagtgtcctgttaatattggtaatgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatggatgtgatttttggtatggatt 480  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8271989 gctaaatgtcctgttaattttggtgatgttgattttgagttggatcttgtttgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggatt 8272082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 89 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 30150205 - 30149814
Alignment:
Q  89 tacttgctacaattgtggaaagaatggtcatattagtaataagtgtaccaagccgaagaaggcggccggaaaggtgtttgctttgaatgcagaggaagtg 188  Q
    |||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||    
T  30150205 tacttgttacaattgtggagagaagggtcatattagtaccaagtgtaccaagccaaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaacgccgaggaggtg 30150106  T
Q  189 gagcagccaaataatcttatccgaggtatgtgttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatattggtgctactctttcttttacctcggtta 288  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  30150105 gagcagccggataatcttatccgaggtatgtgttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttatctcggcta 30150006  T
Q  289 gttttgttgagcatttgaaattggttgtaactccgttgttgcgagatatggtcatcaacaccccagctagtggttcggtgactacttgttttgtgtgtgc 388  Q
    ||| |||||| | |||| | |||||||||||||| |||||||| |  ||||| ||  ||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| |||||||    
T  30150005 gttgtgttgaacgtttggatttggttgtaactcctttgttgcgtggaatggttattgacaccccggctagcggttcggtgactacttcttttatgtgtgc 30149906  T
Q  389 taagtgtcctgttaatattggtaatgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatggatgtgatttttggtatggatt 480  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  30149905 taagtgtcctgttaattttggtgatgttgattttgagttggatcttgtttgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggatt 30149814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 87 - 480
Target Start/End: Original strand, 13964645 - 13965035
Alignment:
Q  87 attacttgctacaattgtggaaagaatggtcatattagtaataagtgtaccaagccgaagaaggcggccggaaaggtgtttgctttgaatgcagaggaag 186  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  13964645 attacttgttacaattgtggagagaagggtcatattagtaccaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcggaggagg 13964744  T
Q  187 tggagcagccaaataatcttatccgaggtatgtgttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatattggtgctactctttcttttacctcggt 286  Q
     |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||     
T  13964745 cggagcagccggataatcttatccgaggtatgtgttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttatctcggc 13964844  T
Q  287 tagttttgttgagcatttgaaattggttgtaactccgttgttgcgagatatggtcatcaacaccccagctagtggttcggtgactacttgttttgtgtgt 386  Q
    ||||| ||||||   |||| | |||||||||||||  |||||||| |  ||||| ||  | ||||| ||||| ||||||||||||||   |||| |||||    
T  13964845 tagttgtgttgaaagtttggatttggttgtaactcgtttgttgcgtggaatggttattgataccccggctagcggttcggtgactac---ttttatgtgt 13964941  T
Q  387 gctaagtgtcctgttaatattggtaatgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatggatgtgatttttggtatggatt 480  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13964942 gctaagtgtcctgttaattttggtgatgttgattttgagttggatcttgtttgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggatt 13965035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 13 - 463
Target Start/End: Original strand, 22149962 - 22150403
Alignment:
Q  13 agatggacatcagttgttacaagtgtgggaaagcgggtcacaaggcctatgagtgtaaggatgtttcgaagaatattacttgctacaattgtggaaagaa 112  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| | ||| || | || |||| | ||  | ||||||||||||||||||||| ||||    
T  22149962 agatggatatcagttgtcacaagtgtgggaaagcgagtcacaaggcttttgaatgcatgggtgttgcaaaagagattacttgctacaattgtggagagaa 22150061  T
Q  113 tggtcatattagtaataagtgtaccaagccgaagaaggcggccggaaaggtgtttgctttgaatgcagaggaagtggagcagccaaataatcttatccga 212  Q
     ||||| |||||||         ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||    
T  22150062 gggtcacattagta---------ccaagccgaagaaggcggcgggaaaagtgtttgctttgaatgctgaggaggtggagcaaccagataatcttatctga 22150152  T
Q  213 ggtatgtgttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatattggtgctactctttcttttacctcggttagttttgttgagcatttgaaattgg 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| || |||||| | |||||||| |||||||||||    
T  22150153 ggtatgtgttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctagtcattcttttatcttggttagctgtgttgagcgtttgaaattgg 22150252  T
Q  313 ttgtaactccgttgttgcgagatatggtcatcaacaccccagctagtggttcggtgactacttgttttgtgtgtgctaagtgtcctgttaatattggtaa 412  Q
    |||||||||| |||||||| |  | ||| ||  | ||||| ||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| |    
T  22150253 ttgtaactcctttgttgcggggaacggttattgataccccggctagcggttcggtgactacttcttttatgtgtgctaagtgtcttgttaattttggtta 22150352  T
Q  413 tgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatggatgt 463  Q
    |||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  22150353 tgttaattttgagttgggtcttgtttgtcttccgttgaagcatatggatgt 22150403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 26 - 330
Target Start/End: Original strand, 15943824 - 15944128
Alignment:
Q  26 ttgttacaagtgtgggaaagcgggtcacaaggcctatgagtgtaaggatgtttcgaaga-atattacttgctacaattgtggaaagaatggtcatattag 124  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||   ||| || |||  |||| | |||| | |||||||| |||||||| ||| |||| |||||||||||    
T  15943824 ttgtcacaagtgtgggaaaacgggtcacaaggcggctgattgcaagagtgttgc-aagagagattacttgttacaattgcggagagaagggtcatattag 15943922  T
Q  125 taataagtgtaccaagccgaagaaggcggccggaaaggtgtttgctttgaatgcagaggaagtggagcagccaaataatcttatccgaggtatgtgtttt 224  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||    
T  15943923 tactaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttaaatgcggaggaggtggagcagccggataatcttatacgaggtatgtgtttt 15944022  T
Q  225 atcaatagtactcctttgattgcaattattgatattggtgctactctttcttttacctcggttagttttgttgagcatttgaaattggttgtaactccgt 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| | |||||| |||||||||||| | |    
T  15944023 atcaatagtactcctttgattgcaattattgatattggtgctactcattcttttatctcggttagttgtgttgaacgtttgaatttggttgtaacttctt 15944122  T
Q  325 tgttgc 330  Q
    ||||||    
T  15944123 tgttgc 15944128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 340 - 480
Target Start/End: Original strand, 15948014 - 15948154
Alignment:
Q  340 tcatcaacaccccagctagtggttcggtgactacttgttttgtgtgtgctaagtgtcctgttaatattggtaatgttgattttgagttggatcttgtgtg 439  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15948014 tcatcaacaccccggctagcggttcggtgactacttcttttatgtgtgctaagtgtcctgttaattttggtaatgttgattttgagttggatcttgtttg 15948113  T
Q  440 tcttccgttgaagtatatggatgtgatttttggtatggatt 480  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15948114 tcttccgtttaagcatatggatgtgatttttggtatggatt 15948154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 381 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 15612658 - 15612559
Alignment:
Q  381 gtgtgtgctaagtgtcctgttaatattggtaatgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatggatgtgatttttggtatggatt 480  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15612658 gtgtgtgctaagtgtcctgttaattttggtaatgttgattttgagttggatcttgtttgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggatt 15612559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 384 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 30140359 - 30140263
Alignment:
Q  384 tgtgctaagtgtcctgttaatattggtaatgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatggatgtgatttttggtatggatt 480  Q
    |||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  30140359 tgtgttaagtgttctgttaattttggtgatgttgattttgagttggatcttgtttgtcttccgttgaagcatatggatgttatttttggtatggatt 30140263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 412 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 12796092 - 12796024
Alignment:
Q  412 atgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatggatgtgatttttggtatggatt 480  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12796092 atgttgattttgagttggatcttgtttgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggatt 12796024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 412 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 16258998 - 16258930
Alignment:
Q  412 atgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatggatgtgatttttggtatggatt 480  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  16258998 atgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagaatatggatgttatttttggtatggatt 16258930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 412 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 18915582 - 18915514
Alignment:
Q  412 atgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatggatgtgatttttggtatggatt 480  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18915582 atgttgactttgagttggatcttgtttggcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggatt 18915514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 228 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 10408677 - 10408626
Alignment:
Q  228 aatagtactcctttgattgcaattattgatattggtgctactctttctttta 279  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  10408677 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgtttta 10408626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 228 - 279
Target Start/End: Original strand, 12509903 - 12509954
Alignment:
Q  228 aatagtactcctttgattgcaattattgatattggtgctactctttctttta 279  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  12509903 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgtttta 12509954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 228 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 28757028 - 28756977
Alignment:
Q  228 aatagtactcctttgattgcaattattgatattggtgctactctttctttta 279  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  28757028 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgtttta 28756977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 228 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 47126653 - 47126602
Alignment:
Q  228 aatagtactcctttgattgcaattattgatattggtgctactctttctttta 279  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  47126653 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgtttta 47126602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 228 - 270
Target Start/End: Original strand, 31692605 - 31692647
Alignment:
Q  228 aatagtactcctttgattgcaattattgatattggtgctactc 270  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  31692605 aatagtactcctttaattgctattatagatattggtgctactc 31692647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 26 - 58
Target Start/End: Original strand, 8271628 - 8271660
Alignment:
Q  26 ttgttacaagtgtgggaaagcgggtcacaaggc 58  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8271628 ttgtcacaagtgtgggaaagcgggtcacaaggc 8271660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 26 - 58
Target Start/End: Original strand, 13964584 - 13964616
Alignment:
Q  26 ttgttacaagtgtgggaaagcgggtcacaaggc 58  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13964584 ttgtcacaagtgtgggaaagcgggtcacaaggc 13964616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 26 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 30150268 - 30150236
Alignment:
Q  26 ttgttacaagtgtgggaaagcgggtcacaaggc 58  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30150268 ttgtcacaagtgtgggaaagcgggtcacaaggc 30150236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 292; Significance: 1e-164; HSPs: 10)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 31 - 478
Target Start/End: Original strand, 22739189 - 22739636
Alignment:
Q  31 acaagtgtgggaaagcgggtcacaaggcctatgagtgtaaggatgtttcgaagaatattacttgctacaattgtggaaagaatggtcatattagtaataa 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||    
T  22739189 acaagtgtgggaaagcgggtcacaaggcttttgaatgtaagggtgttgcgaaggatgttacttgctacaattgtggagagaagggtcatattagtactaa 22739288  T
Q  131 gtgtaccaagccgaagaaggcggccggaaaggtgtttgctttgaatgcagaggaagtggagcagccaaataatcttatccgaggtatgtgttttatcaat 230  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  22739289 gtgtaccaagccgaagaaggcggcaggaaaggtgtttgctttgaatgcggaggaagtggagcagccggataaatttatcagaggtatgtgttttatcaat 22739388  T
Q  231 agtactcctttgattgcaattattgatattggtgctactctttcttttacctcggttagttttgttgagcatttgaaattggttgtaactccgttgttgc 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22739389 agtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttatctcggttagttgtgttgtgcgtttgaaattggttgtaactcctttgttgc 22739488  T
Q  331 gagatatggtcatcaacaccccagctagtggttcggtgactacttgttttgtgtgtgctaagtgtcctgttaatattggtaatgttgattttgagttgga 430  Q
    | |  ||||| ||| ||||| | ||||| |||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  22739489 gggggatggttatcgacacctcggctagcggttcggtaactacttcttttatgtgtgctaagtgtcctgttaatttttgtaatgttgattttgagttgga 22739588  T
Q  431 tcttgtgtgtcttccgttgaagtatatggatgtgatttttggtatgga 478  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  22739589 tcttgtgtgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggcatgga 22739636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 24 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 22281020 - 22280564
Alignment:
Q  24 agttgttacaagtgtgggaaagcgggtcacaaggcctatgagtgtaaggatgtttcgaaga-atattacttgctacaattgtggaaagaatggtcatatt 122  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||   ||| || |||  |||| | |||| | |||||||| |||||||||||| ||||  ||||||||    
T  22281020 agttgtcacaagtgtgggaaagcgggtcacaaggcggctgattgcaagagtgttgc-aagagagattacttgttacaattgtggagagaaatgtcatatt 22280922  T
Q  123 agtaataagtgtaccaagccgaagaaggcggccggaaaggtgtttgctttgaatgcagaggaagtggagcagccaaataatcttatccgaggtatgtgtt 222  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||    
T  22280921 agtactaagtgtacaaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcggaggaggtggagcagcaggataatcttatcagaggtatgtgtt 22280822  T
Q  223 ttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatattggtgctactctttcttttacctcggttagttttgttgagcatttgaaattggttgtaactcc 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||| ||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||    
T  22280821 ttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctagtcattcatttatctcggttagttgtgttgaacgtttgaaattggttgtaactcc 22280722  T
Q  323 gttgttgcgagatatggtcatcaacaccccagctagtggttcggtgactacttgttttgtgtgtgctaagtgtcctgttaatattggtaatgttgatttt 422  Q
     |||||||| |  ||||| ||  ||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  22280721 tttgttgcggggaatggttattgacaccccggctagcggttcggtgactacttcttttatgtgtgctaagtgtcctgttaatttaggtaatgttgatttt 22280622  T
Q  423 gagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatggatgtgatttttggtatggatt 480  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22280621 gagttggatcttgtttgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggatt 22280564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 224 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 25131324 - 25131068
Alignment:
Q  224 tatcaatagtactcctttgattgcaattattgatattggtgctactctttcttttacctcggttagttttgttgagcatttgaaattggttgtaactccg 323  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||| | | | |||| |||||||||||||||    
T  25131324 tatcaatagtactcatttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttctatctcggttagttgtgtttaacgtctgaatttggttgtaactccg 25131225  T
Q  324 ttgttgcgagatatggtcatcaacaccccagctagtggttcggtgactacttgttttgtgtgtgctaagtgtcctgttaatattggtaatgttgattttg 423  Q
    |||| |||||  ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||    
T  25131224 ttgtcgcgagggatggtcatcgacaccccggctagtggttcggtgactacttccttagtgtgtgctaagtgccctgttaattttggtaatattgattttg 25131125  T
Q  424 agttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatggatgtgatttttggtatggatt 480  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25131124 agttggatcttgtgtgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggatt 25131068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 253 - 480
Target Start/End: Original strand, 24567425 - 24567652
Alignment:
Q  253 ttgatattggtgctactctttcttttacctcggttagttttgttgagcatttgaaattggttgtaactccgttgttgcgagatatggtcatcaacacccc 352  Q
    |||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  |  ||| | ||  |||||||    
T  24567425 ttgatactagtgctactcattcttttatctcggttagttgtgttgagcgtttgaaattggttgtaactcctttgttgcagggaatgattattgacacccc 24567524  T
Q  353 agctagtggttcggtgactacttgttttgtgtgtgctaagtgtcctgttaatattggtaatgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaag 452  Q
      |||| |||||| |||| |||| |||| |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  24567525 gactagcggttcgatgacaacttcttttatgtgtgctaagtgtcctgttgattttggtactgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccatggaag 24567624  T
Q  453 tatatggatgtgatttttggtatggatt 480  Q
     |||||||||||||||||||||||||||    
T  24567625 catatggatgtgatttttggtatggatt 24567652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 384 - 476
Target Start/End: Original strand, 25878531 - 25878623
Alignment:
Q  384 tgtgctaagtgtcctgttaatattggtaatgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatggatgtgatttttggtatg 476  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25878531 tgtgttaagtgtcctgttaattttggtaatgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatg 25878623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 412 - 480
Target Start/End: Original strand, 12638818 - 12638886
Alignment:
Q  412 atgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatggatgtgatttttggtatggatt 480  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12638818 atgttgattttgagttggattttgtttgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggatt 12638886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 412 - 480
Target Start/End: Original strand, 12644485 - 12644553
Alignment:
Q  412 atgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatggatgtgatttttggtatggatt 480  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12644485 atgttgattttgagttggattttgtttgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggatt 12644553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 412 - 480
Target Start/End: Original strand, 24829105 - 24829172
Alignment:
Q  412 atgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatggatgtgatttttggtatggatt 480  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  24829105 atgttgattttgagttggatctttt-tgtcttccgttgaagcatatgaatgtgatttttggtatggatt 24829172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 413 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 34821675 - 34821609
Alignment:
Q  413 tgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatggatgtgatttttggtatggatt 480  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||    
T  34821675 tgttgattttgagttggatcttgtttgtcttccgttgaagcatatggatgcga-ttttggtatggatt 34821609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 228 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 23113434 - 23113394
Alignment:
Q  228 aatagtactcctttgattgcaattattgatattggtgctac 268  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||    
T  23113434 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctac 23113394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 284; Significance: 1e-159; HSPs: 6)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 17 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 90822 - 90359
Alignment:
Q  17 ggacatcagttgttacaagtgtgggaaagcgggtcacaaggcctatgagtgtaaggatgtttcgaagaatattacttgctacaattgtggaaagaatggt 116  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||  ||||   ||| | |||||||| |||||||||||| |||| |||    
T  90822 ggacatcagttgtcacaagtgtgggaaagcgggtcacaaggcttatgaatgcaagagtgttgaaaaggagattacttgatacaattgtggagagaaaggt 90723  T
Q  117 catattagtaataagtgtaccaagccgaagaaggcggccggaaaggtgtttgctttgaatgcagaggaagtggagcagccaaataatcttatccgaggta 216  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| ||  ||||||||||| ||||||    
T  90722 tatattagtactaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtatgctttgaatgcggaggaggtggagcaaccggataatcttatctgaggta 90623  T
Q  217 tgtgttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatattggtgctactctttcttttacctcggttagttttgttgagcatttgaaattggttgt 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  90622 tgtgttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttatctcggttagttgtgttgagcgtttgaaattggttgt 90523  T
Q  317 aactccgttgttgcgagatatggtcatcaacaccccagctagtggttcggtgactacttgttttgtgtgtgctaagtgtcctgttaatattggtaatgtt 416  Q
    |||||| |||||||| |  ||||| ||  ||||||| ||| | |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  90522 aactcctttgttgcggggaatggttattgacaccccggctggcggttcggtgactacttcttttatgtgtgctaagtgtcctgttaattttggtaatgtt 90423  T
Q  417 gattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatggatgtgatttttggtatggatt 480  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  90422 gattttgagttggatcttgtttgtcttccgttgaagcgtatggatgtgatttttggtatggatt 90359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 21 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 8473 - 8014
Alignment:
Q  21 atcagttgttacaagtgtgggaaagcgggtcacaaggcctatgagtgtaaggatgtttcgaagaatattacttgctacaattgtggaaagaatggtcata 120  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| | | | || |||| |||| | ||| | |||||||||||||||| |||| |||| |||||||    
T  8473 atcagttgtcacaagtgtgggaaagcggatcacaaggcttttaaatgcaagggtgttgcaaaggagattacttgctacaattctggagagaagggtcata 8374  T
Q  121 ttagtaataagtgtaccaagccgaagaaggcggccggaaaggtgtttgctttgaatgcagaggaagtggagcagccaaataatcttatccgaggtatgtg 220  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  8373 ttagtactaagtgtaccaatccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcggaagaagtggagcagccgaataatcttatctgaggtatgtg 8274  T
Q  221 ttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatattggtgctactctttcttttacctcggttagttttgttgagcatttgaaattggttgtaact 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||     
T  8273 ttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttatctcggttagttgtgttgagcgtttgaaaatggttgtaacc 8174  T
Q  321 ccgttgttgcgagatatggtcatcaacaccccagctagtggttcggtgactacttgttttgtgtgtgctaagtgtcctgttaatattggtaatgttgatt 420  Q
    || ||||| || |  ||||| ||  ||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||    
T  8173 cctttgttccggggaatggttattgacaccccggctagcggttcggtgactacttcttttatgtgtgctaagtgtcctgtcaattttggtgatgttgatt 8074  T
Q  421 ttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatggatgtgatttttggtatggatt 480  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8073 ttaagttgtatcttgtgtgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggatt 8014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 24 - 415
Target Start/End: Original strand, 20867 - 21257
Alignment:
Q  24 agttgttacaagtgtgggaaagcgggtcacaaggcctatgagtgtaaggatgtttcgaagaatattacttgctacaattgtggaaagaatggtcatatta 123  Q
    ||||| ||| ||||||  |||| |||||||||||| |  ||||||  | ||||| ||||| | |||||||| ||||||||| |  |||| || ||||| |    
T  20867 agttgctaccagtgtgaaaaagagggtcacaaggcttccgagtgttcgaatgttgcgaaggagattacttgttacaattgttgtgagaaaggacatatca 20966  T
Q  124 gtaataagtgtaccaagccgaagaaggcggccggaaaggtgtttgctttgaatgcagaggaagtggagcagccaaataatcttatccgaggtatgtgttt 223  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||    
T  20967 gtactaagtgtaccaagccaaagaaggcggcaggaaaggtgtttgctttgattgcggaggaagtggagcagccggataatcttatctgaggtatgtgttt 21066  T
Q  224 tatcaatagtactcctttgattgcaattattgatattggtgctactctttcttttacctcggttagttttgttgagcatttgaaattggttgtaactccg 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| | ||||||  | |||||||||| |    
T  21067 tatcaatagtactcctttgattgcaattattgatagtggtgctactcattcttttatctcggttagttgtgttgaccgtttgaacat-gttgtaactctg 21165  T
Q  324 ttgttgcgagatatggtcatcaacaccccagctagtggttcggtgactacttgttttgtgtgtgctaagtgtcctgttaatattggtaatgt 415  Q
    ||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  21166 ttgttgcgagggatggtcatcgacaccccggctagtggttcggtgactacttctttagtgtgtgctaagtgtcctattaattttggtaatgt 21257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 24 - 415
Target Start/End: Original strand, 30443 - 30833
Alignment:
Q  24 agttgttacaagtgtgggaaagcgggtcacaaggcctatgagtgtaaggatgtttcgaagaatattacttgctacaattgtggaaagaatggtcatatta 123  Q
    ||||| ||| ||||||  |||| |||||||||||| |  ||||||  | ||||| ||||| | |||||||| ||||||||| |  |||| || ||||| |    
T  30443 agttgctaccagtgtgaaaaagagggtcacaaggcttccgagtgttcgaatgttgcgaaggagattacttgttacaattgttgtgagaaaggacatatca 30542  T
Q  124 gtaataagtgtaccaagccgaagaaggcggccggaaaggtgtttgctttgaatgcagaggaagtggagcagccaaataatcttatccgaggtatgtgttt 223  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||    
T  30543 gtactaagtgtaccaagccaaagaaggcggcaggaaaggtgtttgctttgattgcggaggaagtggagcagccggataatcttatctgaggtatgtgttt 30642  T
Q  224 tatcaatagtactcctttgattgcaattattgatattggtgctactctttcttttacctcggttagttttgttgagcatttgaaattggttgtaactccg 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| | ||||||  | |||||||||| |    
T  30643 tatcaatagtactcctttgattgcaattattgatagtggtgctactcattcttttatctcggttagttgtgttgaccgtttgaacat-gttgtaactctg 30741  T
Q  324 ttgttgcgagatatggtcatcaacaccccagctagtggttcggtgactacttgttttgtgtgtgctaagtgtcctgttaatattggtaatgt 415  Q
    ||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  30742 ttgttgcgagggatggtcatcgacaccccggctagtggttcggtgactacttctttagtgtgtgctaagtgtcctattaattttggtaatgt 30833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #5
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 434 - 480
Target Start/End: Original strand, 21255 - 21301
Alignment:
Q  434 tgtgtgtcttccgttgaagtatatggatgtgatttttggtatggatt 480  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||    
T  21255 tgtgtgtcttccgttgaagcatatagatgtgatttttggtatcgatt 21301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #6
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 434 - 480
Target Start/End: Original strand, 30831 - 30877
Alignment:
Q  434 tgtgtgtcttccgttgaagtatatggatgtgatttttggtatggatt 480  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||    
T  30831 tgtgtgtcttccgttgaagcatatagatgtgatttttggtatcgatt 30877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 284; Significance: 1e-159; HSPs: 12)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 21 - 480
Target Start/End: Original strand, 20649783 - 20650242
Alignment:
Q  21 atcagttgttacaagtgtgggaaagcgggtcacaaggcctatgagtgtaaggatgtttcgaagaatattacttgctacaattgtggaaagaatggtcata 120  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | ||| || |||| || | | ||  | ||||||||||||||||||||  |||| |||||||    
T  20649783 atcagttgtcacaagtgtgggaaagcgggtcacaaggattttgaatgcaagggtgatgcaaaagagattacttgctacaattgtggggagaagggtcata 20649882  T
Q  121 ttagtaataagtgtaccaagccgaagaaggcggccggaaaggtgtttgctttgaatgcagaggaagtggagcagccaaataatcttatccgaggtatgtg 220  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  20649883 ttagtactaagtgtaccaggccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcggaggaggtggagcagccggataatcttatccgaggtatgtg 20649982  T
Q  221 ttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatattggtgctactctttcttttacctcggttagttttgttgagcatttgaaattggttgtaact 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  20649983 ttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttatctcggttagttgtgttgagcgtttgaaattggttgtaact 20650082  T
Q  321 ccgttgttgcgagatatggtcatcaacaccccagctagtggttcggtgactacttgttttgtgtgtgctaagtgtcctgttaatattggtaatgttgatt 420  Q
    || |||||||| |  ||||| ||  |||||||  | || |||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20650083 cctttgttgcgggggatggttattgacaccccgaccagcggttcggtgactacttcttttatgtgtgataagtgtcctgttaattttggtaatgttgatt 20650182  T
Q  421 ttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatggatgtgatttttggtatggatt 480  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20650183 ttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggatt 20650242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 17 - 480
Target Start/End: Original strand, 21193976 - 21194439
Alignment:
Q  17 ggacatcagttgttacaagtgtgggaaagcgggtcacaaggcctatgagtgtaaggatgtttcgaagaatattacttgctacaattgtggaaagaatggt 116  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||   ||| || ||||||||| | | | || ||||||| |||||||||||| |||| ||     
T  21193976 ggacattagttgtcacaagtgtgggaaagcgggtcacaaggctgctgaatgcaaggatgttgcaagggatgttacttgttacaattgtggagagaagggc 21194075  T
Q  117 catattagtaataagtgtaccaagccgaagaaggcggccggaaaggtgtttgctttgaatgcagaggaagtggagcagccaaataatcttatccgaggta 216  Q
    ||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  21194076 catatcagtaccaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgcattgaatgcggaggaggtggagcagccggataatcttatccgaggta 21194175  T
Q  217 tgtgttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatattggtgctactctttcttttacctcggttagttttgttgagcatttgaaattggttgt 316  Q
    ||||||| |||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||    
T  21194176 tgtgtttcatcaatagcactcatttgattggaattattgatattggtgctactcattcttttatctcggttagttgtgttaagcgtttgaaattggttgt 21194275  T
Q  317 aactccgttgttgcgagatatggtcatcaacaccccagctagtggttcggtgactacttgttttgtgtgtgctaagtgtcctgttaatattggtaatgtt 416  Q
    |||||| |||||||| |  ||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21194276 aactcctttgttgcgggggatggttatcgacaccccggctagaggttcggtgactacttcttttatgtgtgctaagtgtcctgttaattttggtaatgtt 21194375  T
Q  417 gattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatggatgtgatttttggtatggatt 480  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21194376 gattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggatt 21194439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 90 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 22437574 - 22437184
Alignment:
Q  90 acttgctacaattgtggaaagaatggtcatattagtaataagtgtaccaagccgaagaaggcggccggaaaggtgtttgctttgaatgcagaggaagtgg 189  Q
    ||||| |||||||||||  |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||| |||||||  ||||||||||    
T  22437574 acttgttacaattgtggtgagaagggtcatatcagtactaagtgtaccaagccgaagaaggcggtggaaaaggtgtttgcattgaatgtggaggaagtgg 22437475  T
Q  190 agcagccaaataatcttatccgaggtatgtgttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatattggtgctactctttcttttacctcggttag 289  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||||    
T  22437474 agcagccggataatcttatccgaggtatgtgttttatcaatagtactcctttgattgcgattattgatactgatgttactcattcttttatctcggttag 22437375  T
Q  290 ttttgttgagcatttgaaattggttgtaactccgttgttgcgagatatggtcatcaacaccccagctagtggttcggtgactacttgttttgtgtgtgct 389  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||  |||||||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  22437374 ttgtgttgagcgtttgaaattggttgtaactccgttgttgcgagggatggtcatcgacaccccgactagtggttcagtgactacttctttagtgtgtgct 22437275  T
Q  390 aagtgtcctgttaatattggtaatgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatggatgtgatttttggtatggatt 480  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| |||||||||    
T  22437274 aagtgtcatgttaattttggtaatgttgattttgagttagatcttgtgtgtcttccattgaatcatatggatgtgattttttgtatggatt 22437184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 87 - 480
Target Start/End: Original strand, 21847831 - 21848224
Alignment:
Q  87 attacttgctacaattgtggaaagaatggtcatattagtaataagtgtaccaagccgaagaaggcggccggaaaggtgtttgctttgaatgcagaggaag 186  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| |    
T  21847831 attacttgttacaattgtggagagaagggtcatattagtaccaagtgtaccatgccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaacgcggaggagg 21847930  T
Q  187 tggagcagccaaataatcttatccgaggtatgtgttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatattggtgctactctttcttttacctcggt 286  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||     
T  21847931 tggagcagccggataatcttatccgaggtatgtgttttatcaatagtactcttttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttatctcggc 21848030  T
Q  287 tagttttgttgagcatttgaaattggttgtaactccgttgttgcgagatatggtcatcaacaccccagctagtggttcggtgactacttgttttgtgtgt 386  Q
    ||||| |||||| | |||| | |||||||||||||| |||||||| |  ||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| |||||    
T  21848031 tagttgtgttgaacgtttggatttggttgtaactcctttgttgcgtggaatggttattgacaccccggctagtggttcggtgactacttcgtttatgtgt 21848130  T
Q  387 gctaagtgtcctgttaatattggtaatgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatggatgtgatttttggtatggatt 480  Q
    |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  21848131 gctaagtgtcctgttaattttgttgatgttgattttgagttggatcttgtttgtcttccgttgaagcatatggatgttatttttggtatggatt 21848224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 21 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 16415439 - 16414985
Alignment:
Q  21 atcagttgttacaagtgtgggaaagcgggtcacaaggcctatgagtgtaaggatgtttcgaagaatattacttgctacaattgtggaaagaatggtcata 120  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || |||  |||| | ||| | |||||||||||||||| |||| |||| |||||||    
T  16415439 atcagttgtcacaagtgtgagaaagcgggtcacaaggcttatgaatgcaagagtgttgcaaaggagattacttgctacaattatggagagaaaggtcata 16415340  T
Q  121 ttagtaataagtgtaccaagccgaagaaggcggccggaaaggtgtttgctttgaatgcagaggaagtggagcagccaaataatcttatccgaggtatgtg 220  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||  |||| |||||||||||||||||    
T  16415339 ttagtactaagtgtaccaagccgaagaaggtggtgggaaaggtgtttgccttgaatgcggaggaggtggagcaaccggataaccttatccgaggtatgtg 16415240  T
Q  221 ttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatattggtgctactctttcttttacctcggttagttttgttgagcatttgaaattggttgtaact 320  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| | |||||||||| || | |||    
T  16415239 ttttatcaatagtattccattgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttatctcggttagttgtgttgaacgtttgaaattgattttgact 16415140  T
Q  321 ccgttgttgcgagatatggtcatcaacaccccagctagtggttcggtgactacttgttttgtgtgtgctaagtgtcctgttaatattggtaatgttgatt 420  Q
    || |||||||| |  ||||| ||  ||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16415139 cctttgttgcggggaatggttattgacaccccggctagcggttcggtgactacttcttttatgtgtgctaagtgtcctgttaattttggtaatgttgatt 16415040  T
Q  421 ttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatggatgtgatttttggtatggatt 480  Q
    |||||||||||||||||  |      |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16415039 ttgagttggatcttgtgatt-----tttgaagcatatggatgtgatttttggtatggatt 16414985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 111 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 23903424 - 23903056
Alignment:
Q  111 aatggtcatattagtaataagtgtaccaagccgaagaaggcggccggaaaggtgtttgctttgaatgcagaggaagtggagcagccaaataatcttatcc 210  Q
    ||||||||||| |||  ||||||||||||||| ||||||| ||| | |||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||  ||||||||||      
T  23903424 aatggtcatatcagtgctaagtgtaccaagccaaagaaggtggcagaaaaggtgtttgcattgaatgcagaagaggtggagcagccggataatcttatat 23903325  T
Q  211 gaggtatgtgttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatattggtgctactctttcttttacctcggttagttttgttgagcatttgaaatt 310  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| ||    
T  23903324 gaggtatatgttttatcaatagtactcctt-gattataattattgatactggtgctactcattcttttatctcggctagttgtgttgagcatttgaattt 23903226  T
Q  311 ggttgtaactccgttgttgcgagatatggtcatcaacaccccagctagtggttcggtgactacttgttttgtgtgtgctaagtgtcctgttaatattggt 410  Q
    ||||||||||||||| | |||||  ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||||     
T  23903225 ggttgtaactccgttatcgcgagggatggtcatcgacaccccggctagtggttcggtgactacttccttagtgtgtgctaagtgtcctgttaattttgga 23903126  T
Q  411 aatgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatggatgtgatttttggtatggatt 480  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  23903125 aatgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagcatatggatgtgattttttgtatggatt 23903056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 384 - 480
Target Start/End: Original strand, 24931619 - 24931711
Alignment:
Q  384 tgtgctaagtgtcctgttaatattggtaatgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatggatgtgatttttggtatggatt 480  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24931619 tgtgctaagtgtcctgttaattttggtaatgttgattttgagttggatct----tgttttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggatt 24931711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 388 - 469
Target Start/End: Original strand, 23154838 - 23154919
Alignment:
Q  388 ctaagtgtcctgttaatattggtaatgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatggatgtgatttt 469  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23154838 ctaagtgtcatgttaattatggtaatgttgattttgagtttgatcttgtgtatcttccgttgaagcatatggatgtgatttt 23154919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 228 - 279
Target Start/End: Original strand, 16268859 - 16268910
Alignment:
Q  228 aatagtactcctttgattgcaattattgatattggtgctactctttctttta 279  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  16268859 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgtttta 16268910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 228 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 28984057 - 28984015
Alignment:
Q  228 aatagtactcctttgattgcaattattgatattggtgctactc 270  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  28984057 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactc 28984015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 228 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 28989276 - 28989234
Alignment:
Q  228 aatagtactcctttgattgcaattattgatattggtgctactc 270  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  28989276 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactc 28989234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 228 - 270
Target Start/End: Original strand, 31414167 - 31414209
Alignment:
Q  228 aatagtactcctttgattgcaattattgatattggtgctactc 270  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  31414167 aatagtactcctttaattgctattatagatattggtgctactc 31414209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 267; Significance: 1e-149; HSPs: 17)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 18 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 16101169 - 16100707
Alignment:
Q  18 gacatcagttgttacaagtgtgggaaagcgggtcacaaggcctatgagtgtaaggatgtttcgaagaatattacttgctacaattgtggaaagaatggtc 117  Q
    ||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||   ||| || ||||   || |||   || |||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  16101169 gacattagttgtcataagtgtgggaaagcgggtcacaaggctgttgaatgcaagggaattgcgagagatgttacttgctacaattgtggagagaagggtc 16101070  T
Q  118 atattagtaataagtgtaccaagccgaagaaggcggccggaaaggtgtttgctttgaatgcagaggaagtggagcagccaaataatcttatccgaggtat 217  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||  |||||||||||||| ||||    
T  16101069 atattagtactaagtgtaccaagccaaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcggaagaggtggagcaaccggataatcttatccgaagtat 16100970  T
Q  218 gtgttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatattggtgctactctttcttttacctcggttagttttgttgagcatttgaaattggttgta 317  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  16100969 ttgttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatattggtgctactcatttttttatctcggttagttgtgttgagcgtttgaaattggttgta 16100870  T
Q  318 actccgttgttgcgagatatggtcatcaacaccccagctagtggttcggtgactacttgttttgtgtgtgctaagtgtcctgttaatattggtaatgttg 417  Q
    ||||| |||||||| |  ||||| ||  |||||||  |||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16100869 actcctttgttgcggggaatggttattgacaccccgactagcggttcggtgactacttcttttatgtgtgctaagtgtcctgttaattttggtaatgttg 16100770  T
Q  418 attttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatggatgtgatttttggtatggatt 480  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16100769 attttgagttggatcttgcgtgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggatt 16100707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 89 - 480
Target Start/End: Original strand, 16379571 - 16379962
Alignment:
Q  89 tacttgctacaattgtggaaagaatggtcatattagtaataagtgtaccaagccgaagaaggcggccggaaaggtgtttgctttgaatgcagaggaagtg 188  Q
    |||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||    
T  16379571 tacttgttacaattgtggagagaagggtcatattagtaccaagtgtaccaagccaaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaacgccgaggaggtg 16379670  T
Q  189 gagcagccaaataatcttatccgaggtatgtgttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatattggtgctactctttcttttacctcggtta 288  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  16379671 gagcagccggataatcttatccgaggtatgtgttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttatctcggcta 16379770  T
Q  289 gttttgttgagcatttgaaattggttgtaactccgttgttgcgagatatggtcatcaacaccccagctagtggttcggtgactacttgttttgtgtgtgc 388  Q
    ||| |||||| | |||| | |||||||||||||| |||||||| |  ||||| ||  ||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| |||||||    
T  16379771 gttgtgttgaacgtttggatttggttgtaactcctttgttgcgtggaatggttattgacaccccggctagcggttcggtgactacttcttttatgtgtgc 16379870  T
Q  389 taagtgtcctgttaatattggtaatgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatggatgtgatttttggtatggatt 480  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16379871 taagtgtcctgttaattttggtgatgttgattttgagttggatcttgtttgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggatt 16379962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 87 - 480
Target Start/End: Original strand, 16647165 - 16647558
Alignment:
Q  87 attacttgctacaattgtggaaagaatggtcatattagtaataagtgtaccaagccgaagaaggcggccggaaaggtgtttgctttgaatgcagaggaag 186  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  16647165 attacttgttacaattgtggagagaagggtcatattagtaccaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcggaggagg 16647264  T
Q  187 tggagcagccaaataatcttatccgaggtatgtgttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatattggtgctactctttcttttacctcggt 286  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||     
T  16647265 tggagcagccggataatcttatccgaggtatgtgttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttatctcggc 16647364  T
Q  287 tagttttgttgagcatttgaaattggttgtaactccgttgttgcgagatatggtcatcaacaccccagctagtggttcggtgactacttgttttgtgtgt 386  Q
    ||||| |||| | | |||| | |||||||||||||  |||||||| |  ||||| ||  |||||||  |||| |||||||||||||||| |||| |||||    
T  16647365 tagttgtgttaaacgtttggatttggttgtaactcatttgttgcgtggaatggttattgacaccccgactagcggttcggtgactacttcttttatgtgt 16647464  T
Q  387 gctaagtgtcctgttaatattggtaatgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatggatgtgatttttggtatggatt 480  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16647465 gctaagtgtcctgttaattttggtgatgttgattttgagttggatcttgtttgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggatt 16647558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 224 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 18401593 - 18401337
Alignment:
Q  224 tatcaatagtactcctttgattgcaattattgatattggtgctactctttcttttacctcggttagttttgttgagcatttgaaattggttgtaactccg 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  | |||||| ||||||||||| |||||| | |||||||||||||| ||||||     
T  18401593 tatcaatagtactcctttgattgcaattattgatattggtgttactgatacttttatctcggttagttgtgttgaacgtttgaaattggttggaactcct 18401494  T
Q  324 ttgttgcgagatatggtcatcaacaccccagctagtggttcggtgactacttgttttgtgtgtgctaagtgtcctgttaatattggtaatgttgattttg 423  Q
    |||||||| |  ||||| ||  ||||||   |||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  18401493 ttgttgcggggaatggttattgacaccctgactagcggttcagtgactacttcttttatgtgtgctaagtgtcctgttaatttcggtaatgttgattttg 18401394  T
Q  424 agttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatggatgtgatttttggtatggatt 480  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18401393 agttggatcttgtgtctcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggatt 18401337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 87 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 14149492 - 14149316
Alignment:
Q  87 attacttgctacaattgtggaaagaatggtcatattagtaataagtgtaccaagccgaagaaggcggccggaaaggtgtttgctttgaatgcagaggaag 186  Q
    |||||||| |||||||||||  |||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  14149492 attacttgttacaattgtggtgagaagggtcatatcagtactaattgtaccaagccgaagaaggcggcagggaaggtgtttgcattgaatgcggaggaag 14149393  T
Q  187 tggagcagccaaataatcttatccgaggtatgtgttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatattggt 263  Q
    |||| || |   ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14149392 tggaacaactggataatcttatccgaggtatgtgttttatcgatagtactcctttgattgcaattattgatactggt 14149316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 316 - 480
Target Start/End: Original strand, 1646239 - 1646403
Alignment:
Q  316 taactccgttgttgcgagatatggtcatcaacaccccagctagtggttcggtgactacttgttttgtgtgtgctaagtgtcctgttaatattggtaatgt 415  Q
    ||||||| |||||||| |  ||||| ||  ||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  1646239 taactcctttgttgcggggaatggttattgacaccccggctagcggttcggtgactacttcttttatgtgtgctaagtgtcctgttaattttggtgatgt 1646338  T
Q  416 tgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatggatgtgatttttggtatggatt 480  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1646339 tgattttgagttggatcttgtttttcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggatt 1646403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 381 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 18578212 - 18578113
Alignment:
Q  381 gtgtgtgctaagtgtcctgttaatattggtaatgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatggatgtgatttttggtatggatt 480  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18578212 gtgtgtgctaagtgtcttgttaattttggtaatgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggatt 18578113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 17 - 176
Target Start/End: Original strand, 21412652 - 21412811
Alignment:
Q  17 ggacatcagttgttacaagtgtgggaaagcgggtcacaaggcctatgagtgtaaggatgtttcgaagaatattacttgctacaattgtggaaagaatggt 116  Q
    |||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| |||| ||||| || ||||||| |||||||||||| |||| |||    
T  21412652 ggacattagttgtcataagtgtgggaaagcgggtcacaaggcttttgaatgtaagggtgttgcgaaggatgttacttgatacaattgtggagagaagggt 21412751  T
Q  117 catattagtaataagtgtaccaagccgaagaaggcggccggaaaggtgtttgctttgaat 176  Q
     ||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  21412752 tatattagtactaagtgtatcaagtcgaagaaggcggcgggaacagtgtttgctttgaat 21412811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 260 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 14133993 - 14133824
Alignment:
Q  260 tggtgctactctttcttttacctcggttagttttgttgagcatttgaaattggttgtaactccgttgttgcgagatatggtcatcaacaccccagctagt 359  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||          
T  14133993 tggtgctactcattcttttatctcggttagttgtgttgagcgtttgaaattggttgtaactccgttgttgcgagggatggtcattgacacccca------ 14133900  T
Q  360 ggttcggtgactacttgttttgtgtgtgctaagtgtcctgttaatattggtaatgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttc 444  Q
             |||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14133899 ---------actacttccttagtgtgtgctaagtgtcctgttaattttggtaaggttgattttgagctggatcttgtgtgtcttc 14133824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 381 - 480
Target Start/End: Original strand, 23025251 - 23025350
Alignment:
Q  381 gtgtgtgctaagtgtcctgttaatattggtaatgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatggatgtgatttttggtatggatt 480  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23025251 gtgtgtgctaagtgtcttgttaattttggtaacattgattttgagttggatcttgtgcgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggatt 23025350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 381 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 16235149 - 16235051
Alignment:
Q  381 gtgtgtgctaagtgtcctgttaatattggtaatgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatggatgtgatttttggtatggatt 480  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||| | ||||||    
T  16235149 gtgtgtgctaagtgtcctgttaat-ttggtaatgttgattttgagttggatcttgtttgtcttccattgaagcatatggatgtgatttttgttttggatt 16235051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 384 - 476
Target Start/End: Original strand, 19985697 - 19985789
Alignment:
Q  384 tgtgctaagtgtcctgttaatattggtaatgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatggatgtgatttttggtatg 476  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||    
T  19985697 tgtgttaagtgtcctgttaattttggtaatgttgattttgagttggatcctgtttgtcttccgttgaagcatatagatgtgattttttgtatg 19985789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 412 - 480
Target Start/End: Original strand, 18836178 - 18836246
Alignment:
Q  412 atgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatggatgtgatttttggtatggatt 480  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18836178 atgttgattttgagttggatcttgtctgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggatt 18836246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 229 - 268
Target Start/End: Original strand, 18182705 - 18182744
Alignment:
Q  229 atagtactcctttgattgcaattattgatattggtgctac 268  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  18182705 atagtactcctttaattgctattattgatattggtgctac 18182744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 204 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 21474568 - 21474502
Alignment:
Q  204 cttatccgaggtatgtgttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatattggtgctactc 270  Q
    |||||| ||||||| |||||  | |||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||||||||    
T  21474568 cttatcagaggtatttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactc 21474502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 26 - 58
Target Start/End: Original strand, 16379508 - 16379540
Alignment:
Q  26 ttgttacaagtgtgggaaagcgggtcacaaggc 58  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16379508 ttgtcacaagtgtgggaaagcgggtcacaaggc 16379540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 26 - 58
Target Start/End: Original strand, 16647104 - 16647136
Alignment:
Q  26 ttgttacaagtgtgggaaagcgggtcacaaggc 58  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16647104 ttgtcacaagtgtgggaaagcgggtcacaaggc 16647136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 264; Significance: 1e-147; HSPs: 22)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 24 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 4443200 - 4442741
Alignment:
Q  24 agttgttacaagtgtgggaaagcgggtcacaaggcctatgagtgtaaggatgtttcgaagaatattacttgctacaattgtggaaagaatggtcatatta 123  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| | ||||   |||| |  ||||||| |||||||||||  |||| |||||||| |    
T  4443200 agttgctacaagtgtgggaaagtgggtcacaaggcttttgagtgtacgaatgtcgagaaggaggttacttgttacaattgtggtgagaaaggtcatatca 4443101  T
Q  124 gtaataagtgtaccaagccgaagaaggcggccggaaaggtgtttgctttgaatgcagaggaagtggagcagccaaataatcttatccgaggtatgtgttt 223  Q
    ||  ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  4443100 gttctaagtgtaccaagccaaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgtatgtggaggaagtggagcagccggataatcttatccgaggtatgtgttt 4443001  T
Q  224 tatcaatagtactcctttgattgcaattattgatattggtgctactctttcttttacctcggttagttttgttgagcatttgaaattggttgtaactccg 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  4443000 tatcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttctacctcggttagttgtgttgagcgtttgaatttggttgtaactccg 4442901  T
Q  324 ttgttgcgagatatggtcatcaacaccccagctagtggttcggtgactacttgttttgtgtgtgctaagtgtcctgttaatattggtaatgttgattttg 423  Q
    ||||||||||  ||||||||  ||||||| |||||||||||||| |||||||  || |||||||||| ||||| || |||| |||||||  |||||||||    
T  4442900 ttgttgcgagggatggtcattgacaccccggctagtggttcggtaactacttccttagtgtgtgctaggtgtcatgctaattttggtaacattgattttg 4442801  T
Q  424 agttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatggatgtgatttttggtatggatttga 483  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4442800 agttgtatcttgtgtgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggatttga 4442741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 89 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 7827108 - 7826717
Alignment:
Q  89 tacttgctacaattgtggaaagaatggtcatattagtaataagtgtaccaagccgaagaaggcggccggaaaggtgtttgctttgaatgcagaggaagtg 188  Q
    |||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||    
T  7827108 tacttgttacaattgtggagagaagggtcatattagtaccaagtgtaccaagccaaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaacgccgaggaggtg 7827009  T
Q  189 gagcagccaaataatcttatccgaggtatgtgttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatattggtgctactctttcttttacctcggtta 288  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  7827008 gagcagccggataatcttatccgaggtatgtgttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttatctcggcta 7826909  T
Q  289 gttttgttgagcatttgaaattggttgtaactccgttgttgcgagatatggtcatcaacaccccagctagtggttcggtgactacttgttttgtgtgtgc 388  Q
    ||| |||||| | |||| | |||||||||||||| |||||||| |  ||||| ||  ||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| |||||||    
T  7826908 gttgtgttgaacgtttggatttggttgtaactcctttgttgcgtggaatggttattgacaccccggctagcggttcggtgactacttcttttatgtgtgc 7826809  T
Q  389 taagtgtcctgttaatattggtaatgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatggatgtgatttttggtatggatt 480  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7826808 taagtgtcctgttaattttggtgatgttgattttgagttggatcttgtttgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggatt 7826717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 89 - 480
Target Start/End: Original strand, 27104836 - 27105227
Alignment:
Q  89 tacttgctacaattgtggaaagaatggtcatattagtaataagtgtaccaagccgaagaaggcggccggaaaggtgtttgctttgaatgcagaggaagtg 188  Q
    |||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||    
T  27104836 tacttgttacaattgtggagagaagggtcatattagtaccaagtgtaccaagccaaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaacgccgaggaggtg 27104935  T
Q  189 gagcagccaaataatcttatccgaggtatgtgttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatattggtgctactctttcttttacctcggtta 288  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  27104936 gagcagccggataatcttatccgaggtatgtgttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttatctcggcta 27105035  T
Q  289 gttttgttgagcatttgaaattggttgtaactccgttgttgcgagatatggtcatcaacaccccagctagtggttcggtgactacttgttttgtgtgtgc 388  Q
    ||| |||||| | |||| | |||||||||||||| |||||||| |  ||||| ||  ||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| |||||||    
T  27105036 gttgtgttgaacgtttggatttggttgtaactcctttgttgcgtggaatggttattgacaccccggctagcggttcggtgactacttcttttatgtgtgc 27105135  T
Q  389 taagtgtcctgttaatattggtaatgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatggatgtgatttttggtatggatt 480  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27105136 taagtgtcctgttaattttggtgatgttgattttgagttggatcttgtttgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggatt 27105227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 89 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 27173489 - 27173098
Alignment:
Q  89 tacttgctacaattgtggaaagaatggtcatattagtaataagtgtaccaagccgaagaaggcggccggaaaggtgtttgctttgaatgcagaggaagtg 188  Q
    |||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||    
T  27173489 tacttgttacaattgtggagagaagggtcatattagtaccaagtgtaccaagccaaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaacgccgaggaggtg 27173390  T
Q  189 gagcagccaaataatcttatccgaggtatgtgttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatattggtgctactctttcttttacctcggtta 288  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  27173389 gagcagccggataatcttatccgaggtatgtgttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttatctcggcta 27173290  T
Q  289 gttttgttgagcatttgaaattggttgtaactccgttgttgcgagatatggtcatcaacaccccagctagtggttcggtgactacttgttttgtgtgtgc 388  Q
    ||| |||||| | ||||   |||||||||||||| |||||||| |  ||||| ||  ||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| |||||||    
T  27173289 gttgtgttgaacgtttgggtttggttgtaactcctttgttgcggggaatggttattgacaccccggctagcggttcggtgactacttcttttatgtgtgc 27173190  T
Q  389 taagtgtcctgttaatattggtaatgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatggatgtgatttttggtatggatt 480  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27173189 taagtgtcctgttaattttggtaatgttgattttgagttggatcttgtttgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggatt 27173098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 96 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 13459234 - 13458852
Alignment:
Q  96 tacaattgtggaaagaatggtcatattagtaataagtgtaccaagccgaagaaggcggccggaaaggtgtttgctttgaatgcagaggaagtggagcagc 195  Q
    |||||||||||  |||| |||||||| |||| |||||||||||||  |||||||| | | ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||     
T  13459234 tacaattgtggcgagaagggtcatatcagtactaagtgtaccaagttgaagaaggtgacgggaaaagtgtttgcattgaatgcggaggaagtggagcaga 13459135  T
Q  196 caaataatcttatccgaggtatgtgttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatattggtgctactctttcttttacctcggttagttttgt 295  Q
    |  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  |||||||||| |||    
T  13459134 cggataatcttctccgaggtatgtgttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttatttcggttagttgtgt 13459035  T
Q  296 tgagcatttgaaattggttgtaactccgttgttgcgagatatggtcatcaacaccccagctagtggttcggtgactacttgttttgtgtgtgctaagtgt 395  Q
    |||||||||||| || |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||   |||||||||||||    
T  13459034 tgagcatttgaatttagttgtaactctgttgttgcgagggatggtcatcaacaccccggctagtggttaggtgactacttcttt--agtgtgctaagtgt 13458937  T
Q  396 cctgttaatattggtaatgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatggatgtgatttttggtatggatt 480  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  13458936 cctgttaattttggtaatgttgattttgagttggattttgtgtgtatgccgttgaaccatatggatgtgatttttggtatggatt 13458852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 159 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 14207456 - 14207264
Alignment:
Q  159 aaggtgtttgctttgaatgcagaggaagtggagcagccaaataatcttatccgaggtatgtgttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgata 258  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  14207456 aaggtgttcgctttgaatgcggagtaagtggagcagccatataatcttatt-gaggtatgtgttttatcaatagtactcctttaattgcaattattaata 14207358  T
Q  259 ttggtgctactctttcttttacctcggttagttttgttgagcatttgaaattggttgtaactccgttgttgcgagatatggtcatcaacaccccag 354  Q
     ||| ||||||| |  |||   ||||||||||| |||||| | |||||| ||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||| | |||||||    
T  14207357 ctggcgctactcat--tttggtctcggttagttgtgttgaacgtttgaatttggttgtaactccgttgtcgcgtggaatggtcatcgataccccag 14207264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 159 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 14216146 - 14215954
Alignment:
Q  159 aaggtgtttgctttgaatgcagaggaagtggagcagccaaataatcttatccgaggtatgtgttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgata 258  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  14216146 aaggtgttcgctttgaatgcggagtaagtggagcagccatataatcttatt-gaggtatgtgttttatcaatagtactcctttaattgcaattattaata 14216048  T
Q  259 ttggtgctactctttcttttacctcggttagttttgttgagcatttgaaattggttgtaactccgttgttgcgagatatggtcatcaacaccccag 354  Q
     ||| ||||||| |  |||   ||||||||||| |||||| | |||||| ||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||| | |||||||    
T  14216047 ctggcgctactcat--tttggtctcggttagttgtgttgaacgtttgaatttggttgtaactccgttgtcgcgtggaatggtcatcgataccccag 14215954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 381 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 11284726 - 11284627
Alignment:
Q  381 gtgtgtgctaagtgtcctgttaatattggtaatgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatggatgtgatttttggtatggatt 480  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11284726 gtgtgtgctaagtgtcctgttaattttggtaatgttgattttgagttggattttgtgtgtcttccattgaagcatatggatgtgatttttggtatggatt 11284627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 129 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 22035165 - 22034950
Alignment:
Q  129 aagtgtaccaagccgaagaaggcggccggaaaggtgtttgctttgaatgcagaggaagtggagcagccaaataatcttatccgaggtatgtgttttatca 228  Q
    |||||||||||||||||||||||    ||||  || ||||| |||||||  ||||| |||||||||||  ||||| | ||  ||||||||||||||||||    
T  22035165 aagtgtaccaagccgaagaaggccatgggaagagtttttgcattgaatgttgaggacgtggagcagccggataatttaatatgaggtatgtgttttatca 22035066  T
Q  229 atagtactcctttgattgcaattattgatattggtgctactctttcttttacctcggttagttttgttgagcatttgaaattggttgtaactccgttgtt 328  Q
    ||||||||| ||||||||||| | |||||| | ||||||| | |||||| | |||| |||||| |||||| | |||||| |||||| ||||||| || ||    
T  22035065 atagtactcatttgattgcaaatgttgatacttgtgctacgcattctttcatctcgcttagttgtgttgaacctttgaatttggttttaactccattctt 22034966  T
Q  329 gcgagatatggtcatc 344  Q
    | |||  |||||||||    
T  22034965 gagagggatggtcatc 22034950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 129 - 307
Target Start/End: Original strand, 17142404 - 17142582
Alignment:
Q  129 aagtgtaccaagccgaagaaggcggccggaaaggtgtttgctttgaatgcagaggaagtggagcagccaaataatcttatccgaggtatgtgttttatca 228  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||| || ||| ||||| | |||||| | ||  |||| |||||||||||||    
T  17142404 aagtgtaccaaaccgaagaaggcgggaggaaaggtctttgcattgaatgcagaagaggtgaagcagacgaataatttaatttgagggatgtgttttatca 17142503  T
Q  229 atagtactcctttgattgcaattattgatattggtgctactctttcttttacctcggttagttttgttgagcatttgaa 307  Q
      |||| ||  ||||||||||||||||||   ||||||  || |||||||| |||| |||||| |||||| | ||||||    
T  17142504 tcagtattcaattgattgcaattattgattcgggtgcttttcattcttttatctcgcttagttgtgttgaacgtttgaa 17142582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 415 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 17926501 - 17926436
Alignment:
Q  415 ttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatggatgtgatttttggtatggatt 480  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||    
T  17926501 ttgattttgagttggatcctgtgtgtcttccgttgaagcatatggatgtgatctctggtatggatt 17926436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 211 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 17131758 - 17131545
Alignment:
Q  211 gaggtatgtgttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatattggtgctactctttcttttacctcggttagttttgttgagcatttgaaatt 310  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||| |||||||||||  |||||||| | ||||||||  ||| |||||| ||  || | ||||||  |    
T  17131758 gaggtatgtgttttaacaacagtactccattgattgtaattattgatacgggtgctacccattcttttatatcgcttagttgtgcggaacgtttgaatat 17131659  T
Q  311 ggttgtaactccgttgttgcgagatatggtcatcaacaccccagctagtggttcggtgactacttgttttgtgtgtgctaagtgtcctgttaatattggt 410  Q
     ||| | |||||| ||||| ||   ||||||||| | |||||  | | | | |||||||||||||  || || |||| |||||||| ||||||| ||||     
T  17131658 tgttatgactccgatgttgagatggatggtcatcgataccccgaccaatagctcggtgactacttccttggtttgtgttaagtgtcttgttaattttgga 17131559  T
Q  411 aatgttgattttga 424  Q
    ||||| ||||||||    
T  17131558 aatgtggattttga 17131545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 228 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 21755482 - 21755431
Alignment:
Q  228 aatagtactcctttgattgcaattattgatattggtgctactctttctttta 279  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| || |||||    
T  21755482 aatagtactcctttaattgctattattgatattggtgctactcattgtttta 21755431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 228 - 279
Target Start/End: Original strand, 26115769 - 26115820
Alignment:
Q  228 aatagtactcctttgattgcaattattgatattggtgctactctttctttta 279  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| || |||||    
T  26115769 aatagtactcctttaattgctattattgatattggtgctactcattgtttta 26115820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 228 - 279
Target Start/End: Original strand, 13965847 - 13965898
Alignment:
Q  228 aatagtactcctttgattgcaattattgatattggtgctactctttctttta 279  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  13965847 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgtttta 13965898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 228 - 279
Target Start/End: Original strand, 26091977 - 26092028
Alignment:
Q  228 aatagtactcctttgattgcaattattgatattggtgctactctttctttta 279  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  26091977 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgtttta 26092028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 228 - 279
Target Start/End: Original strand, 40924996 - 40925047
Alignment:
Q  228 aatagtactcctttgattgcaattattgatattggtgctactctttctttta 279  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  40924996 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgtttta 40925047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 228 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 49155371 - 49155320
Alignment:
Q  228 aatagtactcctttgattgcaattattgatattggtgctactctttctttta 279  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  49155371 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgtttta 49155320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 80 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 14218279 - 14218206
Alignment:
Q  80 gaagaatattacttgctacaattgtggaaagaatggtcatattagtaataagtgtaccaagccgaagaaggcgg 153  Q
    |||| |||||||||| | ||| |||||| ||   || ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14218279 gaaggatattacttgtttcaactgtggagaggcaggccatatcagtactaagtgtaccaagccgaagaaggcgg 14218206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 26 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 7827171 - 7827139
Alignment:
Q  26 ttgttacaagtgtgggaaagcgggtcacaaggc 58  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7827171 ttgtcacaagtgtgggaaagcgggtcacaaggc 7827139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 26 - 58
Target Start/End: Original strand, 27104773 - 27104805
Alignment:
Q  26 ttgttacaagtgtgggaaagcgggtcacaaggc 58  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27104773 ttgtcacaagtgtgggaaagcgggtcacaaggc 27104805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 26 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 27173552 - 27173520
Alignment:
Q  26 ttgttacaagtgtgggaaagcgggtcacaaggc 58  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27173552 ttgtcacaagtgtgggaaagcgggtcacaaggc 27173520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 260; Significance: 1e-144; HSPs: 10)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 87 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 14999867 - 14999472
Alignment:
Q  87 attacttgctacaattgtggaaagaatggtcatattagtaataagtgtaccaagccgaagaaggcggccggaaaggtgtttgctttgaatgcagaggaag 186  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  14999867 attacttgttacaattgtggagagaagggtcatattagtaccaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcggaggagg 14999768  T
Q  187 tggagcagccaaataatcttatccgaggtatgtgttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatattggtgctactctttcttttacctcggt 286  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||     
T  14999767 tggagcagccagataatcttatccgaggtatgcgttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttatctcggc 14999668  T
Q  287 tagttttgttgagcatttgaaattggttgtaactccgttgttgcgagatatggtcatcaacaccccagctagtggttcggtgactacttgttttgtgtgt 386  Q
    ||||| |||||| | |||| | |||||||||||||| |||||||| |  ||||| ||  ||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| |||||    
T  14999667 tagttgtgttgaacgtttggatttggttgtaactcctttgttgcggggaatggttattgacaccccggctagcggttcggtgactacttcttttatgtgt 14999568  T
Q  387 gctaagtgtcctgttaatattggtaatgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatggatgtgatttttggtatggatttg 482  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14999567 gctaagtgtcctgttaattttggtgatgttgattttgagttggatcttgtttgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggatttg 14999472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 87 - 480
Target Start/End: Original strand, 15290209 - 15290602
Alignment:
Q  87 attacttgctacaattgtggaaagaatggtcatattagtaataagtgtaccaagccgaagaaggcggccggaaaggtgtttgctttgaatgcagaggaag 186  Q
    |||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| || |||||||    
T  15290209 attacttgctacaattatggagagaagggtcatattagtaccaagtgtacccaaccgaagaaggcggcgagaaaggtgttttctttgaacgcggaggaag 15290308  T
Q  187 tggagcagccaaataatcttatccgaggtatgtgttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatattggtgctactctttcttttacctcggt 286  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||     
T  15290309 tggagcagccggataatcttatccgaggtatgtgttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatagtggtgctactcattcttttatctcggc 15290408  T
Q  287 tagttttgttgagcatttgaaattggttgtaactccgttgttgcgagatatggtcatcaacaccccagctagtggttcggtgactacttgttttgtgtgt 386  Q
    ||||| |||||| | |||| | |||||||||||||| |||||||| |  ||||| ||  ||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| |||||    
T  15290409 tagttgtgttgaacgtttggatttggttgtaactcctttgttgcgtggaatggttattgacaccccggctagcggttcggtgactacttcttttatgtgt 15290508  T
Q  387 gctaagtgtcctgttaatattggtaatgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatggatgtgatttttggtatggatt 480  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15290509 gctaagtgtcctgttaattttggtgatgttgattttgagttggatcttgtttgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggatt 15290602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 178; E-Value: 8e-96
Query Start/End: Original strand, 80 - 478
Target Start/End: Original strand, 12339909 - 12340309
Alignment:
Q  80 gaagaatattacttgctacaattgtggaaagaatggtcatattagtaataagtgtaccaagccgaagaaggcggccggaaaggtgtttgctttgaatgca 179  Q
    |||| |||||||||| ||||| || ||| ||   |||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||| | || |||||||||| |||||||||     
T  12339909 gaaggatattacttgttacaactgcggagagtcaggtcatatcagtactaagtgtaccaaaccgaagaaggcgtcgggtaaggtgtttgatttgaatgcg 12340008  T
Q  180 gaggaagtggagcagccaaataatcttatccgaggtatgtgtttt--atcaatagtactcctttgattgcaattattgatattggtgctactctttcttt 277  Q
    || || || || || | | ||||||| ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  12340009 gatgaggtcgaacaacaagataatctcatccgaggtatgtattttttatcaatagtactcctttgattgcgattattgatattggtcctactcattcttt 12340108  T
Q  278 tacctcggttagttttgttgagcatttgaaattggttgtaactccgttgttgcgagatatggtcatcaacaccccagctagtggttcggtgactacttgt 377  Q
    || ||||||||||| |||||| | |||||| |||||||| ||||||||||||||||  | ||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||      
T  12340109 tatctcggttagttgtgttgaacgtttgaatttggttgtgactccgttgttgcgagggagggtcatcgacaccccgaccagtggttcggtgactacttcc 12340208  T
Q  378 tttgtgtgtgctaagtgtcctgttaatattggtaatgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatggatgtgatttttggtatgg 477  Q
    || ||||| |||||||||| ||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||    
T  12340209 ttggtgtgcgctaagtgtcatgttaactctggtaatgttgactttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagcacatggacgtgatttttggtatgg 12340308  T
Q  478 a 478  Q
    |    
T  12340309 a 12340309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 381 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 9293093 - 9292994
Alignment:
Q  381 gtgtgtgctaagtgtcctgttaatattggtaatgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatggatgtgatttttggtatggatt 480  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9293093 gtgtgtgctaagtgtcctgttaattttggtaatgttgattttgagttggattttgtgtgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggatt 9292994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 381 - 480
Target Start/End: Original strand, 15139015 - 15139113
Alignment:
Q  381 gtgtgtgctaagtgtcctgttaatattggtaatgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatggatgtgatttttggtatggatt 480  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||    
T  15139015 gtgtgtgctaagtgtcctgttaattttggtaatgttgattttgagttggatcttgt-tgtcttccgttgaagcttatggatgtaatttttggtatggatt 15139113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 228 - 279
Target Start/End: Original strand, 3261986 - 3262037
Alignment:
Q  228 aatagtactcctttgattgcaattattgatattggtgctactctttctttta 279  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  3261986 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgtttta 3262037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 228 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 7357347 - 7357296
Alignment:
Q  228 aatagtactcctttgattgcaattattgatattggtgctactctttctttta 279  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  7357347 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgtttta 7357296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 228 - 279
Target Start/End: Original strand, 11204424 - 11204475
Alignment:
Q  228 aatagtactcctttgattgcaattattgatattggtgctactctttctttta 279  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  11204424 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgtttta 11204475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 228 - 279
Target Start/End: Original strand, 29450729 - 29450780
Alignment:
Q  228 aatagtactcctttgattgcaattattgatattggtgctactctttctttta 279  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  29450729 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgtttta 29450780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 26 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 14999928 - 14999896
Alignment:
Q  26 ttgttacaagtgtgggaaagcgggtcacaaggc 58  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14999928 ttgtcacaagtgtgggaaagcgggtcacaaggc 14999896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225 (Bit Score: 258; Significance: 1e-143; HSPs: 2)
Name: scaffold0225
Description:

Target: scaffold0225; HSP #1
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 87 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 26646 - 26253
Alignment:
Q  87 attacttgctacaattgtggaaagaatggtcatattagtaataagtgtaccaagccgaagaaggcggccggaaaggtgtttgctttgaatgcagaggaag 186  Q
    |||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  26646 attacttgctacaattgtcgagagaagggtcatattagtaccaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcggaggagg 26547  T
Q  187 tggagcagccaaataatcttatccgaggtatgtgttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatattggtgctactctttcttttacctcggt 286  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||     
T  26546 tggagcagccggataatcttatccgaggtatgtgttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttatctcggc 26447  T
Q  287 tagttttgttgagcatttgaaattggttgtaactccgttgttgcgagatatggtcatcaacaccccagctagtggttcggtgactacttgttttgtgtgt 386  Q
    ||||| |||||| | |||| | |||||||||||||| |||||||| |  ||||| ||  ||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| |||||    
T  26446 tagttgtgttgaacgtttggatttggttgtaactcctttgttgcgtggaatggttattgacaccccggctagcggttcggtgactacttcttttatgtgt 26347  T
Q  387 gctaagtgtcctgttaatattggtaatgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatggatgtgatttttggtatggatt 480  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26346 gctaagtgtcctgttaattttggtgatgttgattttgagttggatcttgtttgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggatt 26253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 26 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 26707 - 26675
Alignment:
Q  26 ttgttacaagtgtgggaaagcgggtcacaaggc 58  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26707 ttgtcacaagtgtgggaaagcgggtcacaaggc 26675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 256; Significance: 1e-142; HSPs: 1)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 18 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 25498 - 25035
Alignment:
Q  18 gacatcagttgttacaagtgtgggaaagcgggtcacaaggcctatgagtgtaaggatgtttcgaagaatattacttgctacaattgtggaaagaatggtc 117  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||   |||||| |||  | || | ||| | ||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  25498 gacattagttgtcacaagtgtgggaaagcgggtcacaaggctgctgagtgcaagagttttgcaaaggagattacttgctacaattgtggagagaagggtc 25399  T
Q  118 atattagtaataagtgtaccaagccgaagaaggcggccggaaaggtgtttgctttgaatgcagaggaagtggagcagccaaataatcttatccgaggtat 217  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||  |||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  25398 atattagtactaagtgtacaaagccggagaaggcggcaagaaaggcgtttgctttgaatgcggaggaactggagcaaccggataatcttatccgaggtat 25299  T
Q  218 gtgtttt-atcaatagtactcctttgattgcaattattgatattggtgctactctttcttttacctcggttagttttgttgagcatttgaaattggttgt 316  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  25298 gtgtttttatcaatagtactcctttaattgcaattattgatactggtgctactcattcttttatctcggttagttatgttgagcgtttgaaattggttgt 25199  T
Q  317 aactccgttgttgcgagatatggtcatcaacaccccagctagtggttcggtgactacttgttttgtgtgtgctaagtgtcctgttaatattggtaatgtt 416  Q
    |||||| |||||||| |  ||||| ||  ||||||| ||||| || ||||||||||||| |||| || ||||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  25198 aactcctttgttgcggggaatggttattgacaccccggctagcggatcggtgactacttcttttatgggtgctaaatgtcctattaattttggtaatgtt 25099  T
Q  417 gattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatggatgtgatttttggtatggatt 480  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25098 gattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttaaagcatatggatgtgatttttggtatggatt 25035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 254; Significance: 1e-141; HSPs: 2)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 87 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 24213 - 23820
Alignment:
Q  87 attacttgctacaattgtggaaagaatggtcatattagtaataagtgtaccaagccgaagaaggcggccggaaaggtgtttgctttgaatgcagaggaag 186  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  24213 attacttgttacaattgtggagagaagggtcatattagtaccaagtgtaccaagccaaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaacgcagaggagg 24114  T
Q  187 tggagcagccaaataatcttatccgaggtatgtgttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatattggtgctactctttcttttacctcggt 286  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||     
T  24113 tggagcagccggataatcttatccgaggtatgtgttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttatctcggc 24014  T
Q  287 tagttttgttgagcatttgaaattggttgtaactccgttgttgcgagatatggtcatcaacaccccagctagtggttcggtgactacttgttttgtgtgt 386  Q
    ||||| |||||| | |||| | |||||||||||||| |||||||| |  ||||| ||  ||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| |||||    
T  24013 tagttgtgttgaacgtttggatttggttgtaactcctttgttgcgtggaatggttattgacaccccggctagcggttcggtgactacttcttttatgtgt 23914  T
Q  387 gctaagtgtcctgttaatattggtaatgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatggatgtgatttttggtatggatt 480  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23913 gctaagtgtcctgttaattttggtgatgttgattttgagttggatcttgtttgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggatt 23820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 26 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 24274 - 24242
Alignment:
Q  26 ttgttacaagtgtgggaaagcgggtcacaaggc 58  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24274 ttgtcacaagtgtgggaaagcgggtcacaaggc 24242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 254; Significance: 1e-141; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 87 - 480
Target Start/End: Original strand, 131543 - 131936
Alignment:
Q  87 attacttgctacaattgtggaaagaatggtcatattagtaataagtgtaccaagccgaagaaggcggccggaaaggtgtttgctttgaatgcagaggaag 186  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  131543 attacttgctacaattgtggagagaagggtcatattagtactaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcggaggagg 131642  T
Q  187 tggagcagccaaataatcttatccgaggtatgtgttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatattggtgctactctttcttttacctcggt 286  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||| ||||||    
T  131643 tggagcagccggataatcttatccgaggtatgtgttttatcaatagaactcctttgattgcaattattgatacttgtgctactcattattttatctcggt 131742  T
Q  287 tagttttgttgagcatttgaaattggttgtaactccgttgttgcgagatatggtcatcaacaccccagctagtggttcggtgactacttgttttgtgtgt 386  Q
    ||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||| ||  ||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| |||||    
T  131743 tagttgtgttgatcgtttgaaattggttgtaactcctttgttgcggggaatggttattgacaccccggctagcggttcggtgactacttcttttatgtgt 131842  T
Q  387 gctaagtgtcctgttaatattggtaatgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatggatgtgatttttggtatggatt 480  Q
    ||||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  131843 gctaaatgtcctattaattttggtaatgttaattttaagttggatcttgtttgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggatt 131936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 21 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 27092 - 26634
Alignment:
Q  21 atcagttgttacaagtgtgggaaagcgggtcacaaggcctatgagtgtaaggatgtttcgaagaatattacttgctacaattgtggaaagaatggtcata 120  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||| | ||| | ||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  27092 atcagttgtcacaagtgtgggaaagcgggtcacaaggcttatgaatgtaagagtgttgcaaaggagattacttgctacaattgtggagagaaaggtcata 26993  T
Q  121 ttagtaataagtgtaccaagccgaagaaggcggccggaaaggtgtttgctttgaatgcagaggaagtggagcagccaaataatcttatccgaggtatgtg 220  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||    
T  26992 ttagtactaagtttaccaagccgaagaagggggcggaaaaggtgtttgctttgaatgcggaggaagtggagcaaccggataatcttatccgaggtatgtg 26893  T
Q  221 ttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatattggtgctactctttcttttacctcggttagttttgttgagcatttgaaattggttgtaact 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  |||||||| |||  |||||| |||| |   ||||   |||||||| |||    
T  26892 ttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatactgttgctacttattcttttatctcttttagttgtgtttattgtttgtttttggttgttact 26793  T
Q  321 ccgttgttgcgagatatggtcatcaacaccccagctagtggttcggtgactacttgttttgtgtgtgctaagtgtcctgttaatattggtaatgttgatt 420  Q
    || |||||||| | |||||| ||  ||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |    
T  26792 cctttgttgcgtggtatggttattgacaccccggctagcggttcggtgactacttcttttatgtgtgctaagtgtcctgttaattttggtaatgtt-aat 26694  T
Q  421 ttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatggatgtgatttttggtatggatt 480  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  26693 ttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatagatt 26634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 254; Significance: 1e-141; HSPs: 15)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 87 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 20528289 - 20527896
Alignment:
Q  87 attacttgctacaattgtggaaagaatggtcatattagtaataagtgtaccaagccgaagaaggcggccggaaaggtgtttgctttgaatgcagaggaag 186  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  20528289 attacttgttacaattgtggagagaaaggtcatattagtactaagtgtaccaagccgaagaaggcagcgggaaaggtgtttgctttgaatgcggaggagg 20528190  T
Q  187 tggagcagccaaataatcttatccgaggtatgtgttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatattggtgctactctttcttttacctcggt 286  Q
    |||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  20528189 tggaacagccgcataatcttatccgaggtatgtgttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatcctggtgctactcattcttttatctcggt 20528090  T
Q  287 tagttttgttgagcatttgaaattggttgtaactccgttgttgcgagatatggtcatcaacaccccagctagtggttcggtgactacttgttttgtgtgt 386  Q
    ||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||| ||  |||||||  |||| |||||||||||||||| |||| |||||    
T  20528089 tagttgtgttgaacgtttgaaattggttgtaactcctttgttgcggggaatggttattgacaccccgactagaggttcggtgactacttcttttatgtgt 20527990  T
Q  387 gctaagtgtcctgttaatattggtaatgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatggatgtgatttttggtatggatt 480  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  20527989 gctaagtgtcctgttaattttggtaatgttgattttgagttggatcttgtttgtcttccgttaaagcatatggatgtgatttttgatatggatt 20527896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 91 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 20928286 - 20927897
Alignment:
Q  91 cttgctacaattgtggaaagaatggtcatattagtaataagtgtaccaagccgaagaaggcggccggaaaggtgtttgctttgaatgcagaggaagtgga 190  Q
    |||| |||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20928286 cttgttacaattgtggagagaaaggtcatattagtactaagtgtaccaagccgaagaaggcggcaggaaaggtgtttgctttgaatgcagaggaggtgga 20928187  T
Q  191 gcagccaaataatcttatccgaggtatgtgttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatattggtgctactctttcttttacctcggttagt 290  Q
    ||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  20928186 gcagccggataatcttatttgaggtatgtgttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttatctcggttagt 20928087  T
Q  291 tttgttgagcatttgaaattggttgtaactccgttgttgcgagatatggtcatcaacaccccagctagtggttcggtgactacttgttttgtgtgtgcta 390  Q
    | |||||| | ||||||||||||| ||||||| ||||| || |  ||||| ||  ||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  20928086 tgtgttgatcgtttgaaattggttataactcctttgttacggggaatggttattgacaccccggctagcggttcggtgactacttcttttatgtgtgcta 20927987  T
Q  391 agtgtcctgttaatattggtaatgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatggatgtgatttttggtatggatt 480  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  20927986 aatgtcctgttaattttggtaatgttgattttgagttagatcttgtttgtcttccgttgaagcatatagatgtgatttttggtatggatt 20927897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 89 - 480
Target Start/End: Original strand, 20828517 - 20828908
Alignment:
Q  89 tacttgctacaattgtggaaagaatggtcatattagtaataagtgtaccaagccgaagaaggcggccggaaaggtgtttgctttgaatgcagaggaagtg 188  Q
    |||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||    
T  20828517 tacttgttacaattgtggagagaagggtcatattagtaccaagtgtaccaagccaaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaacgccgaggaggtg 20828616  T
Q  189 gagcagccaaataatcttatccgaggtatgtgttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatattggtgctactctttcttttacctcggtta 288  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  20828617 gagcagccggataatcttatccgaggtatgtgttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttatctcggcta 20828716  T
Q  289 gttttgttgagcatttgaaattggttgtaactccgttgttgcgagatatggtcatcaacaccccagctagtggttcggtgactacttgttttgtgtgtgc 388  Q
    ||| |||||| | |||| | |||||||||||||| |||||||| |  ||||| ||  ||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| |||||||    
T  20828717 gttgtgttgaacgtttggatttggttgtaactcctttgttgcgtggaatggttattgacaccccggctagcggttcggtgactacttcttttatgtgtgc 20828816  T
Q  389 taagtgtcctgttaatattggtaatgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatggatgtgatttttggtatggatt 480  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20828817 taagtgtcctgttaattttggtgatgttgattttgagttggatcttgtttgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggatt 20828908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 17 - 480
Target Start/End: Original strand, 41214913 - 41215372
Alignment:
Q  17 ggacatcagttgttacaagtgtgggaaagcgggtcacaaggcctatgagtgtaaggatgtttcgaagaatattacttgctacaattgtgga-aagaatgg 115  Q
    |||||| |||||  ||||||||||||| || ||||||||||| | ||||||||||  |||| | ||| || ||||||| |||||||||||  ||| | ||    
T  41214913 ggacattagttgccacaagtgtgggaaggcaggtcacaaggcttttgagtgtaagattgttgcaaaggatgttacttgttacaattgtggtgaagca-gg 41215011  T
Q  116 tcatattagtaataagtgtaccaagccgaagaaggcggccggaaaggtgtttgctttgaatgcagaggaagtggagcagccaaataatcttatccgaggt 215  Q
    ||||   ||||||| |||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||| ||    
T  41215012 tcattacagtaatatgtgtaccaagccaaagaaggcgacgggaaaggtgtttgcattgaatgccgaggaagtggagcaaccggataatcttatccgatgt 41215111  T
Q  216 atgtgttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatattggtgctactctttcttttacctcggttagttttgttgagcatttgaaattggttg 315  Q
    |||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  41215112 atgtgttttatcagcagtactccttggattgcaattattgatactggtgctactcattcttttatctcggttagttgtgttgagcgtttgaatttggttg 41215211  T
Q  316 taactccgttgttgcgagatatggtcatcaacaccccagctagtggttcggtgactacttgttttgtgtgtgctaagtgtcctgttaatattggtaatgt 415  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||||| |||||    |||||||||||||  || |||||||||||||||| ||||||| |||||||  |    
T  41215212 taactccgttgttgcgagggatggttatcgacaccccggctag----tcggtgactacttccttagtgtgtgctaagtgtcatgttaattttggtaacat 41215307  T
Q  416 tgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatggatgtgatttttggtatggatt 480  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||||||||  || |||||||||||||||||||||| ||||    
T  41215308 taattttgagttggatcttgtttgtcttccgttttagcatatggatgtgatttttggtattgatt 41215372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 227 - 480
Target Start/End: Original strand, 22133015 - 22133268
Alignment:
Q  227 caatagtactcctttgattgcaattattgatattggtgctactctttcttttacctcggttagttttgttgagcatttgaaattggttgtaactccgttg 326  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22133015 caatagtaatcctttgattgcaattattgataccggtgctactcattcttttacctcggttagttgtgttgagcatttgaaattggttctaactccgttg 22133114  T
Q  327 ttgcgagatatggtcatcaacaccccagctagtggttcggtgactacttgttttgtgtgtgctaagtgtcctgttaatattggtaatgttgattttgagt 426  Q
    |||||||  ||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  22133115 ttgcgagggatggtcatcgacaccccggctaatggttcggtgactacttgttttgtgtgcgctaagtgtcctattaattttggtaatgttgattttgagt 22133214  T
Q  427 tggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatggatgtgatttttggtatggatt 480  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22133215 tggatcttgtgtgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggatt 22133268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 168; E-Value: 8e-90
Query Start/End: Original strand, 18 - 233
Target Start/End: Original strand, 22129493 - 22129708
Alignment:
Q  18 gacatcagttgttacaagtgtgggaaagcgggtcacaaggcctatgagtgtaaggatgtttcgaagaatattacttgctacaattgtggaaagaatggtc 117  Q
    ||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  22129493 gacattagttgccacaagtgtgggaaagcgggtcacaaggcctatgagtgtaaggatgttttgaaggatattacttgctacaattgtggagagaagggtc 22129592  T
Q  118 atattagtaataagtgtaccaagccgaagaaggcggccggaaaggtgtttgctttgaatgcagaggaagtggagcagccaaataatcttatccgaggtat 217  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  22129593 atattagtactaagtgtaccaagccgaagaaggcggcaggaaaggtgtttgctttgaatgcagaggaagtggagcagccagataatcttacccgaggtat 22129692  T
Q  218 gtgttttatcaatagt 233  Q
     |||||||||||||||    
T  22129693 ttgttttatcaatagt 22129708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 186 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 20172300 - 20172011
Alignment:
Q  186 gtggagcagccaaataatcttatccgaggtatgtgtttt-atcaatagtactcctttgattgcaattattgatattggtgctactctttcttttacctcg 284  Q
    |||||||||||  ||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||| |||||| | |||||||   |||||| | ||||    
T  20172300 gtggagcagccggataatctcatttgaggtatgtgtttttatcaatagtactcatttgattgaaattgttgatactagtgctacgtattctttcatctcg 20172201  T
Q  285 gttagttttgttgagcatttgaaattggttgtaactccgttgttgcgagatatggtcatcaacaccccagctagtggttcggtgactacttgttttgtgt 384  Q
     |||||| |||||| | |||||  |||||| |||||| ||||||| |||  ||| ||||| | |||||  |   ||| |||||| | ||||  || || |    
T  20172200 cttagttgtgttgaacgtttgagtttggttttaactctgttgttgagaggaatgttcatcgataccccgaccgatggctcggtggcaacttccttagttt 20172101  T
Q  385 gtgctaagtgtcctgttaatattggtaatgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatggatgtgatttttggta 474  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||  | |||||||||||||||| ||||    
T  20172100 gtgctaagtgtcctgttaattttggtgatgttgattttgagttggatcttgtttgcttgccgttggtgaatatggatgtgattttcggta 20172011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 228 - 279
Target Start/End: Original strand, 20074973 - 20075024
Alignment:
Q  228 aatagtactcctttgattgcaattattgatattggtgctactctttctttta 279  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  20074973 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgtttta 20075024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 228 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 20297507 - 20297456
Alignment:
Q  228 aatagtactcctttgattgcaattattgatattggtgctactctttctttta 279  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  20297507 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgtttta 20297456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 228 - 279
Target Start/End: Original strand, 31537261 - 31537312
Alignment:
Q  228 aatagtactcctttgattgcaattattgatattggtgctactctttctttta 279  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  31537261 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgtttta 31537312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 228 - 279
Target Start/End: Original strand, 38910090 - 38910141
Alignment:
Q  228 aatagtactcctttgattgcaattattgatattggtgctactctttctttta 279  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  38910090 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgtttta 38910141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 228 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 48425999 - 48425948
Alignment:
Q  228 aatagtactcctttgattgcaattattgatattggtgctactctttctttta 279  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  48425999 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgtttta 48425948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 228 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 52988867 - 52988816
Alignment:
Q  228 aatagtactcctttgattgcaattattgatattggtgctactctttctttta 279  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  52988867 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgtttta 52988816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 232 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 16379185 - 16379149
Alignment:
Q  232 gtactcctttgattgcaattattgatattggtgctac 268  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  16379185 gtactcctttaattgctattattgatattggtgctac 16379149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 26 - 58
Target Start/End: Original strand, 20828454 - 20828486
Alignment:
Q  26 ttgttacaagtgtgggaaagcgggtcacaaggc 58  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20828454 ttgtcacaagtgtgggaaagcgggtcacaaggc 20828486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 253; Significance: 1e-140; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 21 - 480
Target Start/End: Original strand, 939 - 1399
Alignment:
Q  21 atcagttgttacaagtgtgggaaagcgggtcacaaggcctatgagtgtaa-ggatgtttcgaagaatattacttgctacaattgtggaaagaatggtcat 119  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||  ||||| || || || || | | ||| | ||||||||||||||||||||| |||| |||||     
T  939 atcagttgtcacaagtgtggaaaagcaggtcacaagggttatgaatgcaaagggtggtgcaaaggagattacttgctacaattgtggagagaagggtcac 1038  T
Q  120 attagtaataagtgtaccaagccgaagaaggcggccggaaaggtgtttgctttgaatgcagaggaagtggagcagccaaataatcttatccgaggtatgt 219  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||    
T  1039 attagtactaagtgtaccaagccgaagaaggcggtgggaaaggtgtttgctttgaatgcggaggaagtggagcagctggataatcttatccgaggtatgt 1138  T
Q  220 gttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatattggtgctactctttcttttacctcggttagttttgttgagcatttgaaattggttgtaac 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||| |||||| | |||||||||||| |||||    
T  1139 gttttatcaatagtactcctttgattgcaattatagatactggtgctactcattcttttatctcgattagttgtgttgaacgtttgaaattggtcgtaac 1238  T
Q  320 tccgttgttgcgagatatggtcatcaacaccccagctagtggttcggtgactacttgttttgtgtgtgctaagtgtcctgttaatattggtaatgttgat 419  Q
    ||| |||||||| |  ||||| ||| |||||   ||||| | |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  1239 tcctttgttgcggggaatggttatcgacaccttggctagcgtttcggtgactacttcttttatgtgtgctaagtgtcctattaattttggtaatgttgat 1338  T
Q  420 tttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatggatgtgatttttggtatggatt 480  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1339 tttgagttggatcttgtttgtcttctgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggatt 1399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467 (Bit Score: 251; Significance: 1e-139; HSPs: 2)
Name: scaffold0467
Description:

Target: scaffold0467; HSP #1
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 18 - 480
Target Start/End: Original strand, 606 - 1068
Alignment:
Q  18 gacatcagttgttacaagtgtgggaaagcgggtcacaaggcctatgagtgtaaggatgtttcgaagaatattacttgctacaattgtggaaagaatggtc 117  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||   ||| || |||  |||| | | | | || ||||| || ||||||||| |||| ||||    
T  606 gacatgagttgtcacaagtgtgggaaagcgggtcacagggcggctgattgcaagagtgttgcaagggagatcacttgttataattgtggagagaaaggtc 705  T
Q  118 atattagtaataagtgtaccaagccgaagaaggcggccggaaaggtgtttgctttgaatgcagaggaagtggagcagccaaataatcttatccgaggtat 217  Q
    |||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  706 atattagtaccaagtgtaccaaaccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcggaggaggtggagcagccggataatcttatctgaggtat 805  T
Q  218 gtgttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatattggtgctactctttcttttacctcggttagttttgttgagcatttgaaattggttgta 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| | |||| | ||||||||||||||||    
T  806 gtgttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttatctcggttagttgtattgaacgtttgaaattggttgta 905  T
Q  318 actccgttgttgcgagatatggtcatcaacaccccagctagtggttcggtgactacttgttttgtgtgtgctaagtgtcctgttaatattggtaatgttg 417  Q
    ||||| |||| ||  |  ||||| ||  ||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||    
T  906 actcctttgtcgcaggggatggttattgacaccccggctagtggttcggtgactacttcttttatgtgtgctaagtgtcctgttaattttggtaatactg 1005  T
Q  418 attttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatggatgtgatttttggtatggatt 480  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1006 attttgagttggatcttgtttgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggatt 1068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 18 - 322
Target Start/End: Original strand, 13316 - 13620
Alignment:
Q  18 gacatcagttgttacaagtgtgggaaagcgggtcacaaggcctatgagtgtaaggatgtttcgaagaatattacttgctacaattgtggaaagaatggtc 117  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||   ||| || |||  |||| | | | | || ||||| || ||||||||| |||| ||||    
T  13316 gacatgagttgtcacaagtgtgggaaagcgggtcacagggcggctgattgcaagagtgttgcaagggagatcacttgttataattgtggagagaaaggtc 13415  T
Q  118 atattagtaataagtgtaccaagccgaagaaggcggccggaaaggtgtttgctttgaatgcagaggaagtggagcagccaaataatcttatccgaggtat 217  Q
    |||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  13416 atattagtaccaagtgtaccaaaccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcggaagaggtggagcagccggataatcttatcagaggtat 13515  T
Q  218 gtgttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatattggtgctactctttcttttacctcggttagttttgttgagcatttgaaattggttgta 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||    
T  13516 gtgttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttatctcggttagttgtgttgaacgtttgaaattggttgta 13615  T
Q  318 actcc 322  Q
    |||||    
T  13616 actcc 13620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0561 (Bit Score: 248; Significance: 1e-137; HSPs: 1)
Name: scaffold0561
Description:

Target: scaffold0561; HSP #1
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 90 - 480
Target Start/End: Original strand, 6061 - 6452
Alignment:
Q  90 acttgctacaattgtggaaagaatggtcatattagtaataagtgtaccaagccgaagaaggcggccggaaaggtgtttgctttgaatgcagaggaagtgg 189  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  6061 acttgttacaattgtggtaagaagggtcatatcagtactaagtgtaccaagccaaagaaggcggcgggaaaggtgtttgcattgaatgcggaggaagtgg 6160  T
Q  190 agcagccaaataatcttatccgaggtatgtgttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatattggtgctactctttcttttacctcggttag 289  Q
    |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  6161 agcagccggataatcttatctgaggtatgtgttttatcaatagtactactttgattgcaataattgatactggtgctactcattcttttatctcggttag 6260  T
Q  290 ttttgttgagcatttgaaattggttgtaactccgttgttgcgagatatggtcatcaacaccccagctagtggttcggtgactacttgttttgtgtgtgct 389  Q
    || |||||||| |||||| |||||||| |||||||| |||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||  || |||||||||    
T  6261 ttgtgttgagcgtttgaatttggttgtgactccgttattgcgaggaatggtcatcgacaccccggctagtggttcagtgactacttccttagtgtgtgct 6360  T
Q  390 aagtgtcctgttaa-tattggtaatgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatggatgtgatttttggtatggatt 480  Q
    ||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6361 aagtgccctgttaatttttggtaatgttgattttgagttggatcttgtgtgtgttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggatt 6452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 248; Significance: 1e-137; HSPs: 4)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 21 - 480
Target Start/End: Original strand, 73585 - 74044
Alignment:
Q  21 atcagttgttacaagtgtgggaaagcgggtcacaaggcctatgagtgtaaggatgtttcgaagaatattacttgctacaattgtggaaagaatggtcata 120  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    ||||| || |||  |||| | ||| | ||||||||||||||||| ||| |||| |||||||    
T  73585 atcagttgtcacaagtgtggaaaagcgggtcacaaatgatatgaatgaaagagtgttgcaaaggagattacttgctacaattgcggagagaagggtcata 73684  T
Q  121 ttagtaataagtgtaccaagccgaagaaggcggccggaaaggtgtttgctttgaatgcagaggaagtggagcagccaaataatcttatccgaggtatgtg 220  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||  ||||||||||  ||||||||||    
T  73685 ttagtactaagtgtaccaagccgaagaaggcggtgggaaaggtgtttgctttgaatgtcgaggaggtggagcaaccggataatcttatatgaggtatgtg 73784  T
Q  221 ttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatattggtgctactctttcttttacctcggttagttttgttgagcatttgaaattggttgtaact 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  73785 ttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattgttttatctcggttagttgtgttgaacgtttgaaattggttgtaact 73884  T
Q  321 ccgttgttgcgagatatggtcatcaacaccccagctagtggttcggtgactacttgttttgtgtgtgctaagtgtcctgttaatattggtaatgttgatt 420  Q
    ||  | ||||| |  ||||| ||  ||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  73885 cctctattgcggggaatggttattgacaccccggctagcggttcggtgactacttcttttatgtgtgctaagtgtcctgttaattttgttaatgttgatt 73984  T
Q  421 ttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatggatgtgatttttggtatggatt 480  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  73985 ttgagttcgatcttgtttgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggatt 74044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 21 - 480
Target Start/End: Original strand, 77966 - 78425
Alignment:
Q  21 atcagttgttacaagtgtgggaaagcgggtcacaaggcctatgagtgtaaggatgtttcgaagaatattacttgctacaattgtggaaagaatggtcata 120  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    ||||| || |||  |||| | ||| | ||||||||||||||||| ||| |||| |||||||    
T  77966 atcagttgtcacaagtgtggaaaagcgggtcacaaatgatatgaatgaaagagtgttgcaaaggagattacttgctacaattgcggagagaagggtcata 78065  T
Q  121 ttagtaataagtgtaccaagccgaagaaggcggccggaaaggtgtttgctttgaatgcagaggaagtggagcagccaaataatcttatccgaggtatgtg 220  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||  ||||||||||  ||||||||||    
T  78066 ttagtactaagtgtaccaagccgaagaaggcggtgggaaaggtgtttgctttgaatgtcgaggaggtggagcaaccggataatcttatatgaggtatgtg 78165  T
Q  221 ttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatattggtgctactctttcttttacctcggttagttttgttgagcatttgaaattggttgtaact 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  78166 ttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattgttttatctcggttagttgtgttgaacgtttgaaattggttgtaact 78265  T
Q  321 ccgttgttgcgagatatggtcatcaacaccccagctagtggttcggtgactacttgttttgtgtgtgctaagtgtcctgttaatattggtaatgttgatt 420  Q
    ||  | ||||| |  ||||| ||  ||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  78266 cctctattgcggggaatggttattgacaccccggctagcggttcggtgactacttcttttatgtgtgctaagtgtcctgttaattttgttaatgttgatt 78365  T
Q  421 ttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatggatgtgatttttggtatggatt 480  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  78366 ttgagttcgatcttgtttgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggatt 78425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 25 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 182302 - 181934
Alignment:
Q  25 gttgttacaagtgtgggaaagcgggtcacaaggcctatgagtgtaaggatgtttcgaagaatattacttgctacaattgtggaaagaatggtcatattag 124  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |  ||||| || |||| |||| | ||| | ||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||    
T  182302 gttgtcacaagtgtgggaaagtgggtcacaaaggttatgaatgcaagggtgttgcaaaggagattacttgctacaattgtggagagaagggtcagattag 182203  T
Q  125 taataagtgtaccaagccgaagaaggcggccggaaaggtgtttgctttgaatgcagaggaagtggagcagccaaataatcttatccgaggtatgtgtttt 224  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  182202 tactaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgtgaaaggtgtttgctttgaatgcggaggaggtggagcagccggataatcttatccgaggtatgtgtttt 182103  T
Q  225 atcaatagtactcctttgattgcaattattgatattggtgctactctttcttttacctcggttagttttgttgagcatttgaaattggttgtaactccgt 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| | ||||||||| ||||||||||| |    
T  182102 atcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttatctcggttagttgtgttgaacgtttgaaattcgttgtaactcctt 182003  T
Q  325 tgttgcgagatatggtcatcaacaccccagctagtggttcggtgactacttgttttgtgtgtgctaagt 393  Q
    | ||||| |  ||||| ||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||    
T  182002 ttttgcggggaatggttattgacaccccggctagcggttcggtgactacttcatttatgtctgctaagt 181934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #4
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 221 - 478
Target Start/End: Original strand, 175701 - 175958
Alignment:
Q  221 ttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatattggtgctactctttcttttacctcggttagttttgttgagcatttgaaattggttgtaact 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| | ||| ||||||| |||| | | |||||| |||||||| |||    
T  175701 ttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattctttcatctccgttagttgtgttaaacgtttgaatttggttgtgact 175800  T
Q  321 ccgttgttgcgagatatggtcatcaacaccccagctagtggttcggtgactacttgttttgtgtgtgctaagtgtcctgttaatattggtaatgttgatt 420  Q
    ||||| ||| |||  ||||||||| | |||||  | |||||||||||||||||||  ||   |||| |||||||||| |||||  |||||||||||||||    
T  175801 ccgttattgtgaggaatggtcatcgataccccgaccagtggttcggtgactacttccttgaggtgttctaagtgtcccgttaactttggtaatgttgatt 175900  T
Q  421 ttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatggatgtgatttttggtatgga 478  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||    
T  175901 ttgagttggttcttgtgtttcttccgttaaagcacatggatgtgatttttggtatgga 175958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0962 (Bit Score: 243; Significance: 1e-134; HSPs: 1)
Name: scaffold0962
Description:

Target: scaffold0962; HSP #1
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 24 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 2884 - 2431
Alignment:
Q  24 agttgttacaagtgtgggaaagcgggtcacaaggcctatgagtgtaaggatgtttcgaagaatattacttgctacaattgtgga-aagaatggtcatatt 122  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||| || ||||||| |||||||||||  ||| | ||||||       
T  2884 agttgtttcaagtgtgggaaggcgggtcacacggcttttgagtgtaagaatgttgcgaaggatgttacttgttacaattgtggtgaagca-ggtcattac 2786  T
Q  123 agtaataagtgtaccaagccgaagaaggcggccggaaaggtgtttgctttgaatgcagaggaagtggagcagccaaataatcttatccgaggtatgtgtt 222  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  2785 agtaataagtgtaccaagctgaagaaggcggcgggaaaagtgtttgcattgaatgcagaggaagtggagcagtcggataatcttatccgaggtatgtgtt 2686  T
Q  223 ttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatattggtgctactctttcttttacctcggttagttttgttgagcatttgaaattggttgtaactcc 322  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||  || |||||| ||||||||||||||    
T  2685 ttatcaataatactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttatctcggttagttgtgtt--gcgtttgaatttggttgtaactcc 2588  T
Q  323 gttgttgcgagatatggtcatcaacaccccagctagtggttcggtgactacttgttttgtgtgtgctaagtgtcctgttaatattggtaatgttgatttt 422  Q
    ||| |||||||  ||||||||| |||||||  ||||| |||||||||||||||  || |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  2587 gtttttgcgagggatggtcatcgacaccccgactagttgttcggtgactacttccttagtgtgtgctaagtgtcctattaattttggtaattttgatttt 2488  T
Q  423 gagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatggatgtgatttttggtatggatt 480  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  2487 gagttggatcttgtgtgtctt-cgttaaagcatatgggtgtgatttttggtatggatt 2431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0170 (Bit Score: 235; Significance: 1e-130; HSPs: 1)
Name: scaffold0170
Description:

Target: scaffold0170; HSP #1
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 90 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 35332 - 34942
Alignment:
Q  90 acttgctacaattgtggaaagaatggtcatattagtaataagtgtaccaagccgaagaaggcggccggaaaggtgtttgctttgaatgcagaggaagtgg 189  Q
    |||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||  || ||||||||||| ||||||||||  || || |||||||||||||||||||| || ||||    
T  35332 acttgctataattgtggagagaagggtcatattagtaccaattgtaccaagccaaagaaggcggtggggaaagtgtttgctttgaatgcagaagaggtgg 35233  T
Q  190 agcagccaaataatcttatccgaggtatgtgttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatattggtgctactctttcttttacctcggttag 289  Q
    | |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  35232 aacagccggataatcttatccgaggtatgtgttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttatctcggttag 35133  T
Q  290 ttttgttgagcatttgaaattggttgtaactccgttgttgcgagatatggtcatcaacaccccagctagtggttcggtgactacttgttttgtgtgtgct 389  Q
    || |||||| | |||| | |||||||||||||| |||||||| |  ||||| ||  ||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  35132 ttgtgttgaacgtttgtatttggttgtaactcctttgttgcgtggaatggttattgacaccccggctagcggttcggtgactacttcttttatgtgtgct 35033  T
Q  390 aagtgtcctgttaatattggtaatgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatggatgtgatttttggtatggatt 480  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  35032 aaatgtcctgttaattttggtaatgttgattttgagttggatcttgtttgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggatt 34942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 234; Significance: 1e-129; HSPs: 8)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 87 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 23508810 - 23508426
Alignment:
Q  87 attacttgctacaattgtggaaagaatggtcatattagtaataagtgtaccaagccgaagaaggcggccggaaaggtgtttgctttgaatgcagaggaag 186  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||            
T  23508810 attacttgctacaattgtggagagaagagtcatattagtactaagtgtaccaagccgaagaaggcagcgggaaaggtgtttgctttgaatgc-------- 23508719  T
Q  187 tggagcagccaaataatcttatccgaggtatgtgttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatattggtgctactctttcttttacctcggt 286  Q
     ||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  23508718 -ggagcagtcggataatcttatccgaggtatgtgttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttatctcggt 23508620  T
Q  287 tagttttgttgagcatttgaaattggttgtaactccgttgttgcgagatatggtcatcaacaccccagctagtggttcggtgactacttgttttgtgtgt 386  Q
    ||||| |||||| | ||||||||||| ||||||||| |||||||| |  ||||| || |||||||| ||||| |||| ||||||||||| |||| |||||    
T  23508619 tagttgtgttgaacgtttgaaattggctgtaactcctttgttgcggggaatggttattaacaccccggctagcggtttggtgactacttcttttatgtgt 23508520  T
Q  387 gctaagtgtcctgttaatattggtaatgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatggatgtgatttttggtatggatt 480  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23508519 gttaagtgtcctgttaattttggtaatgttgattttgagttagatcttgtttgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggatt 23508426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 26 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 24584397 - 24583952
Alignment:
Q  26 ttgttacaagtgtgggaaagcgggtcacaaggcctatgagtgtaaggatgtttcgaaga-atattacttgctacaattgtggaaagaatggtcatattag 124  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||    || || |  | |||||| |||| | |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||    
T  24584397 ttgtcacaagtgtgggaaagcgggtcacaaggcggccgattgcagaggtgtttc-aagagagattacttgttacaattgtggagagaagggtcatattag 24584299  T
Q  125 taataagtgtaccaagccgaagaaggcggccggaaaggtgtttgctttgaatgcagaggaagtggagcagccaaataatcttatccgaggtatgtgtttt 224  Q
    ||         |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  24584298 ta---------ccaagccgaagaaggcagcgggaaaggtgtttgctttgaatgcggaggaggtggagcagccggataatcttatccgaggtatgtgtttt 24584208  T
Q  225 atcaatagtactcctttgattgcaattattgatattggtgctactctttcttttacctcggttagttttgttgagcatttgaaattggttgtaactccgt 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||| | |||| | |||||||||||||| |    
T  24584207 atcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttatctcggctagttgtgttgaacgtttggatttggttgtaactcctt 24584108  T
Q  325 tgttgcgagatatggtcatcaacaccccagctagtggttcggtgactacttgttttgtgtgtgctaagtgtcctgttaatattggtaatgttgattttga 424  Q
    ||||||| |  ||||| ||  ||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||    
T  24584107 tgttgcgtggaatggttattgacaccccggctagcggttcggtgactacttcttttatgtgtgctaagtgtcctgttaattttggtgatattgattttga 24584008  T
Q  425 gttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatggatgtgatttttggtatggatt 480  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24584007 gttggatcttgtttgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggatt 24583952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 309 - 480
Target Start/End: Original strand, 21934643 - 21934814
Alignment:
Q  309 ttggttgtaactccgttgttgcgagatatggtcatcaacaccccagctagtggttcggtgactacttgttttgtgtgtgctaagtgtcctgttaatattg 408  Q
    |||||||||||||| |||||||| |  ||||| ||  ||||||  ||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  21934643 ttggttgtaactcctttgttgcgtggaatggttattgacaccctggctagcggttcggtgactacttcttttatgtgtgctaagtgtcctgttaattttg 21934742  T
Q  409 gtaatgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatggatgtgatttttggtatggatt 480  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21934743 gtgatgttgattttgagttggatcttgtttgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggatt 21934814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 412 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 23505383 - 23505316
Alignment:
Q  412 atgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatggatgtgatttttggtatggatt 480  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  23505383 atgttgattttgagttggatcttgtttgtcttctgttgaagcatatggatgtgattttt-gtatggatt 23505316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 228 - 279
Target Start/End: Original strand, 14884365 - 14884416
Alignment:
Q  228 aatagtactcctttgattgcaattattgatattggtgctactctttctttta 279  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  14884365 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgtttta 14884416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 228 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 20345276 - 20345225
Alignment:
Q  228 aatagtactcctttgattgcaattattgatattggtgctactctttctttta 279  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  20345276 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgtttta 20345225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 228 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 22505673 - 22505622
Alignment:
Q  228 aatagtactcctttgattgcaattattgatattggtgctactctttctttta 279  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  22505673 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgtttta 22505622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 203 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 25851091 - 25851015
Alignment:
Q  203 tcttatccgaggtatgtgttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatattggtgctactctttctttta 279  Q
    ||||||| ||||||  |||||  | |||||||||| ||| ||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  25851091 tcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcatttaattgctattattgatactggtgctactcattgtttta 25851015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 232; Significance: 1e-128; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 26 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 1522 - 1068
Alignment:
Q  26 ttgttacaagtgtgggaaagcgggtcacaaggcctatgagtgtaaggatgtttcgaaga-atattacttgctacaattgtggaaagaatggtcatattag 124  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||   ||| || |  | |||| | |||| | |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||    
T  1522 ttgtcacaagtgtgggaaagcgggtcacaaggcggctgattgcagaggtgttgc-aagagagattacttgttacaattgtggagagaaaggtcatattag 1424  T
Q  125 taataagtgtaccaagccgaagaaggcggccggaaaggtgtttgctttgaatgcagaggaagtggagcagccaaataatcttatccgaggtatgtgtttt 224  Q
    || |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  1423 tactaagtgtaccaagccgaagaaggcagcggcaaaggtgtttgctttgaatgcggaggagctggagcagctggataatcttatccgaggtatgtgtttt 1324  T
Q  225 atcaatagtactcctttgattgcaattattgatattggtgctactctttcttttacctcggttagttttgttgagcatttgaaattggttgtaactccgt 324  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| | ||||   |||||||||||||| |    
T  1323 atcaatagtactcttttgatttcaattattgatactggtgctactcattcttttatctcggttagttgtgttgaacgtttgtttttggttgtaactcctt 1224  T
Q  325 tgttgcgagatatggtcatcaacaccccagctagtggttcggtgactacttgttttgtgtgtgctaagtgtcctgttaatattggtaatgttgattttga 424  Q
    ||||||| |  ||||| ||  ||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  1223 tgttgcggggaatggttattgacaccccggctagcggttcggtgactacttcttttatgtgtgctaagtgtcttgttaattttggtgatgttgattttga 1124  T
Q  425 gttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatggatgtgatttttggtatggatt 480  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1123 gttggatcttgtttctcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggatt 1068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 231; Significance: 1e-127; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 87 - 480
Target Start/End: Original strand, 4859 - 5253
Alignment:
Q  87 attacttgctacaattgtggaaagaatggtcatattagtaataagtgtaccaagccgaagaaggcggccggaaaggtgtttgctttgaatgcagaggaag 186  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  4859 attacttgttacaattgtggagagaagggtcatattagtaccaagtgtaccaagccaaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaacgcagaggagg 4958  T
Q  187 tggagcagccaaataatcttatccgaggtatgtgttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatattggtgctactctttcttttacctcggt 286  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| |||||     
T  4959 tggagcagccggataatcttatccgaggtatgtgttttatcaataatactcctttgattgcaattatcgatactggtgctactcattcttttatctcggc 5058  T
Q  287 tagttttgttgagcatttgaaattggttgtaactccgttgttgcgagatatggtcatcaaca-ccccagctagtggttcggtgactacttgttttgtgtg 385  Q
    ||||| |||||| | |||| | |||||||||||||| |||||||| |  ||||| ||  ||| |||| ||||| |||||||||||||||| |||| ||||    
T  5059 tagttgtgttgaacgtttggatttggttgtaactcctttgttgcgtggaatggttattgacacccccggctagcggttcggtgactacttcttttatgtg 5158  T
Q  386 tgctaagtgtcctgttaatattggtaatgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatggatgtgatttttggtatggatt 480  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5159 tgctaagtgttctgttaattttggtgatgttgattttgtgttggatcttgtttgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggatt 5253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 26 - 58
Target Start/End: Original strand, 4798 - 4830
Alignment:
Q  26 ttgttacaagtgtgggaaagcgggtcacaaggc 58  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4798 ttgtcacaagtgtgggaaagcgggtcacaaggc 4830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 230; Significance: 1e-127; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 87 - 480
Target Start/End: Original strand, 12679 - 13072
Alignment:
Q  87 attacttgctacaattgtggaaagaatggtcatattagtaataagtgtaccaagccgaagaaggcggccggaaaggtgtttgctttgaatgcagaggaag 186  Q
    |||||||| ||||||| |||| |||| | |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| |    
T  12679 attacttgttacaattctggagagaaagttcatattagtaccaagtgtaccaagccaaagaaggcggcgggaaaggtgattgctttgaatgcggaggagg 12778  T
Q  187 tggagcagccaaataatcttatccgaggtatgtgttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatattggtgctactctttcttttacctcggt 286  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||  | |||||| ||||||    
T  12779 tggagcagccggataatcttatccgaggtatgtgttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgataatggagatactaatacttttatctcggt 12878  T
Q  287 tagttttgttgagcatttgaaattggttgtaactccgttgttgcgagatatggtcatcaacaccccagctagtggttcggtgactacttgttttgtgtgt 386  Q
    ||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||| ||  ||||||| ||||| ||||  |||||||||| |||| |||||    
T  12879 tagttgtgttgaacgtttgaaattggttgtaactcctttgttgcggggaatggttattgacaccccggctagcggtttagtgactacttcttttatgtgt 12978  T
Q  387 gctaagtgtcctgttaatattggtaatgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatggatgtgatttttggtatggatt 480  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  12979 gctaagtgtcctgttaattttggtaatgttgattttgagttggatcttgtttgtcttccgttgaagcatatggatgtgaattttggtatggatt 13072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 1)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 87 - 480
Target Start/End: Original strand, 6914 - 7308
Alignment:
Q  87 attacttgctacaattgtggaaagaatggtcatat--tagtaataagtgtaccaagccgaagaaggcggccggaaaggtgtttgctttgaatgcagagga 184  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  6914 attacttgctataattgtggagagaagggtcatatattagtaccaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttactttgaatgtagagga 7013  T
Q  185 agtggagcagccaaataatcttatccgaggtatgtgttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatattggtgctactctttcttttacctcg 284  Q
     |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||    
T  7014 ggtggagcagccggataatcttatccgaggtatgtgttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctacttattcttttatctcg 7113  T
Q  285 gttagttttgttgagcatttgaaattggttgtaactccgttgttgcgagatatggtcatcaacaccccagctagtggttcggtgactacttgttttgtgt 384  Q
    |||||||  ||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||| ||  ||||||| ||||| ||||| ||||||||||  ||| |||    
T  7114 gttagttgcgttgatcgtttgaaattggttgtaactcctttgttgcggggaatggttattgacaccccggctagcggttcagtgactactt-ctttatgt 7212  T
Q  385 gtgctaagtgtcctgttaatattggtaatgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatggatgtgatttttggtatggatt 480  Q
    ||||||| ||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7213 gtgctaaatgtccagttaattttggtgatgttgattttgagttggatcttgtttgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggatt 7308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610 (Bit Score: 227; Significance: 1e-125; HSPs: 1)
Name: scaffold0610
Description:

Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 18 - 480
Target Start/End: Original strand, 3888 - 4349
Alignment:
Q  18 gacatcagttgttacaagtgtgggaaagcgggtcacaaggcctatgagtgtaaggatgtttcgaagaatattacttgctacaattgtggaaagaatggtc 117  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||   |||||| |||  | || ||| | || ||||||| |||||||||||  |||| ||||    
T  3888 gacattagttgtcacaagtgtgggaaagcgggtcacaaggctgctgagtgcaagagtattgcgagggatgttacttgttacaattgtggtgagaagggtc 3987  T
Q  118 atattagtaataagtgtaccaagccgaagaaggcggccggaaaggtgtttgctttgaatgcagaggaagtggagcagccaaataatcttatccgaggtat 217  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | ||||||| || ||||| |||||| ||| | ||||||||||| ||| |||    
T  3988 atatcagtactaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaagtgtcttctttgaacgcggaggaggtggagtagctagataatcttatctgagctat 4087  T
Q  218 gtgttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatattggtgctactctttcttttacctcggttagttttgttgagcatttgaaattggttgta 317  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| |||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||    
T  4088 gtgttt-atcaatagtactccgttgattgcaattatcgatactggtgctactcattcttttatctcgattaattgtgttgagcgtttgaaattggttgta 4186  T
Q  318 actccgttgttgcgagatatggtcatcaacaccccagctagtggttcggtgactacttgttttgtgtgtgctaagtgtcctgttaatattggtaatgttg 417  Q
    ||||| |||||||| |  ||||| ||  | ||||| ||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| || ||||||||| ||||||||||||    
T  4187 actcctttgttgcggggaatggttattgataccccggctagcggttcggtgactacttcttttatgtgtgctaaatgccctgttaattttggtaatgttg 4286  T
Q  418 attttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatggatgtgatttttggtatggatt 480  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4287 actttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggatt 4349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0673 (Bit Score: 220; Significance: 1e-121; HSPs: 1)
Name: scaffold0673
Description:

Target: scaffold0673; HSP #1
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 109 - 480
Target Start/End: Original strand, 5380 - 5751
Alignment:
Q  109 agaatggtcatattagtaataagtgtaccaagccgaagaaggcggccggaaaggtgtttgctttgaatgcagaggaagtggagcagccaaataatcttat 208  Q
    |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| | |||||| ||  ||||||||||    
T  5380 agaaaggtcaaattagtactaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaagtgtttgctttgaatgcggaggaggcggagcaaccggataatcttat 5479  T
Q  209 ccgaggtatgtgttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatattggtgctactctttcttttacctcggttagttttgttgagcatttgaaa 308  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| |||||||    
T  5480 tcgtggtatgtgttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttatcttggttagttatgttgagcgtttgaaa 5579  T
Q  309 ttggttgtaactccgttgttgcgagatatggtcatcaacaccccagctagtggttcggtgactacttgttttgtgtgtgctaagtgtcctgttaatattg 408  Q
    |||||| ||||||| |||||||| |  ||||| ||  ||||||| |||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  5580 ttggttataactcctttgttgcggggaatggttattgacacccctgctagcagttcggtgactacttcttttatgtgtgctaagtgtcctgttaattttg 5679  T
Q  409 gtaatgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatggatgtgatttttggtatggatt 480  Q
    |||||||||||||||| || |||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5680 gtaatgttgattttgaatttgatcttgtttgtcttctgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggatt 5751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 2)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 90 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 16157 - 15767
Alignment:
Q  90 acttgctacaattgtggaaagaatggtcatattagtaataagtgtaccaagccgaagaaggcggccggaaaggtgtttgctttgaatgcagaggaagtgg 189  Q
    ||||| || ||||||||| |||| || ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||   | ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  16157 acttgttataattgtggagagaagggccatattagtaccaagtgtaccaagccgaataaggtaacgggaaaagtgtttgctttgaattcagaggaggtgg 16058  T
Q  190 agcagccaaataatcttatccgaggtatgtgttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatattggtgctactctttcttttacctcggttag 289  Q
    |||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||||||||    
T  16057 agcaaccgcataatcttatccgaggtatgtgttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatattggtgttacttattcttttatctcggttag 15958  T
Q  290 ttttgttgagcatttgaaattggttgtaactccgttgttgcgagatatggtcatcaacaccccagctagtggttcggtgactacttgttttgtgtgtgct 389  Q
    || |||||| | |||| | |||||||||||||| ||||||   |  ||||| ||  ||||||   |||| |||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  15957 ttgtgttgaacgtttgtatttggttgtaactcctttgttgtttggaatggttattgacaccctgtctagcggttcggtgactacttcttttatgtgtgct 15858  T
Q  390 aagtgtcctgttaatattggtaatgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatggatgtgatttttggtatggatt 480  Q
    || |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  15857 aaatgtcctgttaattttggtaatgctgattttgagttggatcttgtttgccttccgttgaagcatatggatgtgagttttggtatggatt 15767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 412 - 480
Target Start/End: Original strand, 10553 - 10621
Alignment:
Q  412 atgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatggatgtgatttttggtatggatt 480  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  10553 atgttgattttgagttggatcttgtatgtcttccgttgaagaatatggatgtaatttttggtatggatt 10621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 18 - 344
Target Start/End: Original strand, 25685 - 26012
Alignment:
Q  18 gacatcagttgttacaagtgtgggaaagcgggtcacaaggcctatgagtgtaaggatgtttcgaagaatattacttgctacaattgtggaaagaatggtc 117  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||   ||| || |||| |||| | | | || ||||||| |||||||||||| |||| ||||    
T  25685 gacattagttgtcacaagtgtgggaaagcgggtcacaaggctactgattgcaagggtgttgcaagggatgttacttgttacaattgtggagagaaaggtc 25784  T
Q  118 atattagtaataagtgtaccaagccgaagaaggcggccggaaaggtgtttgctttgaatgcagaggaagtggagcagccaaataatcttatccgaggtat 217  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  25785 atattagtactaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaaagcagaagaagtggagcagccggataatcttatccgaggtat 25884  T
Q  218 gtgttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatattggtgctactc-tttcttttacctcggttagttttgttgagcatttgaaattggttgt 316  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| |||||||||||  ||||||| |||||||||| ||||    
T  25885 gtgttttatcaatagtactcatttgattgcaattattgatattagtgctactcattttttttatctcggttagttgcgttgagcgtttgaaattgattgt 25984  T
Q  317 aactccgttgttgcgagatatggtcatc 344  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||||    
T  25985 aactccgttgttgcgtgggatggtcatc 26012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0112 (Bit Score: 167; Significance: 3e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0112
Description:

Target: scaffold0112; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 114 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 3722 - 3356
Alignment:
Q  114 ggtcatattagtaataagtgtaccaagccgaagaaggcggccggaaaggtgtttgctttgaatgcagaggaagtggagcagccaaataatcttatccgag 213  Q
    |||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||   |||||| || ||||||||||| ||| ||||||||||| |||    
T  3722 ggtcatttcagtactaagtgtaccaagccgaagaaggcggaggaaaaagtgtttgcaccgaatgcggatgaagtggagcaaccagataatcttatctgag 3623  T
Q  214 gtatgtgttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatattggtgctactctttcttttacctcggttagttttgttgagcatttgaaattggt 313  Q
    | |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||| |||| | | |||||| ||| |    
T  3622 gaacatgttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatattggtgctactcattctttcatctcggttagttgtgttcaacgtttgaatttgtt 3523  T
Q  314 tgtaactccgttgttgcgagatatggtcatcaacaccccagctagtggttcggtgactacttgttttgtgtgtgctaagtgtcctgttaatattggtaat 413  Q
    || ||||| |||||||||||  ||||||||| |||||||  | ||||| || ||||||||||  || | |||||||||||||| ||||  | |||||| |    
T  3522 tggaactctgttgttgcgagggatggtcatcgacaccccgaccagtggctcagtgactacttcgttagggtgtgctaagtgtcttgttcgttttggtagt 3423  T
Q  414 gttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatggatgtgatttttggtatggatt 480  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  3422 gttgatttagagttggatcttgtgtgtctttcgttgaagcacatggatgtgatttttggtatggatt 3356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0462 (Bit Score: 141; Significance: 1e-73; HSPs: 2)
Name: scaffold0462
Description:

Target: scaffold0462; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 18 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 3022 - 2703
Alignment:
Q  18 gacatcagttgttacaagtgtgggaaagcgggtcacaaggcctatgagtgtaaggatgtttcgaagaatattacttgctacaattgtggaaagaatggtc 117  Q
    ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||   |||||| |||  ||||   ||| | ||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  3022 gacattagttgtcacaagtgcgggaaagcgggtcataaggctgctgagtgcaagagtgttggaaaggagattacttgctacaattgtggagagaagggtc 2923  T
Q  118 atattagtaataagtgtaccaagccgaagaaggcggccggaaaggtgtttgctttgaatgcagaggaagtggagcagccaaataatcttatccgaggtat 217  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| |    
T  2922 atattagtactaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgagaaaggtgtttgctttgaatgcggaggaagtggagcaaccggataatcttatccgaggtct 2823  T
Q  218 gtgttttatcaatagta------ctcctttgattgcaattattgatattggtgctactctttcttttacctcggttagttttgttgagcatttgaaattg 311  Q
    ||||| |   |||||||        ||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  2822 gtgttgtgcgaatagtagcatagtacctttgattgcaattattgataccggtgctactcattcttttatctcggttagttgtgttgagcttttgaaattg 2723  T
Q  312 gttgtaactccgttgttgcg 331  Q
    | ||||||||| ||||||||    
T  2722 gctgtaactcctttgttgcg 2703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0462; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 367 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 2692 - 2579
Alignment:
Q  367 tgactacttgttttgtgtgtgctaagtgtcctgttaatattggtaatgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatggatgtgat 466  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  2692 tgactacttcttttatgtgcgctaagtgtcctgttaattttggtaatgttgattttgagttagatcttgtgtgttttccgttaaagcatatggatgtgat 2593  T
Q  467 ttttggtatggatt 480  Q
    ||||||||||||||    
T  2592 ttttggtatggatt 2579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 99; Significance: 1e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 96847 - 96637
Alignment:
Q  17 ggacatcagttgttacaagtgtgggaaagcgggtcacaa-ggcctatgagtgtaaggatgtttcgaagaatattacttgctacaattgtggaaagaatgg 115  Q
    |||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| || |||| |||| | ||  || |||||||||||||||||||| |||| ||    
T  96847 ggacattaattgtcacaagtgtgggaaagcgggtcacaaaggcttttgaatgcaagggtgttgcaaatgatgttacttgctacaattgtggagagaaggg 96748  T
Q  116 tcatattagtaataagtgtaccaagccgaagaaggcggccggaaaggtgtttgctttgaatgcagaggaagtggagcagccaaataatcttatccgaggt 215  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| |||||||| | |||||||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  96747 tcatatcagtactaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaaatgttttctttgaatacggaggaagtggagcagccggattatcttatccgaggt 96648  T
Q  216 atgtgttttat 226  Q
    |||||||||||    
T  96647 atgtgttttat 96637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0233 (Bit Score: 98; Significance: 4e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0233
Description:

Target: scaffold0233; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 114 - 475
Target Start/End: Original strand, 20807 - 21168
Alignment:
Q  114 ggtcatattagtaataagtgtaccaagccgaagaaggcggccggaaaggtgtttgctttgaatgcagaggaagtggagcagccaaataatcttatccgag 213  Q
    |||||||| ||||  ||||| ||||||||||| ||||||||  | |  || || || ||||| |||||||||||||||  ||   |||||||||||||||    
T  20807 ggtcatatcagtaccaagtgaaccaagccgaaaaaggcggcgtggagagttttcgcattgaacgcagaggaagtggagttgctggataatcttatccgag 20906  T
Q  214 gtatgtgttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatattggtgctactctttcttttacctcggttagttttgttgagcatttgaaattggt 313  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||| |||||| | || |||||| ||||||   ||||  ||||| |||||| | |||||| |||||    
T  20907 gtatgtgtttcatcaatagtgctcctttgattgtaattgttgatactagttctactcattctttcttctcgactagttgtgttgatcgtttgaatttggt 21006  T
Q  314 tgtaactccgttgttgcgagatatggtcatcaacaccccagctagtggttcggtgactacttgttttgtgtgtgctaagtgtcctgttaatattggtaat 413  Q
     ||||||||||| |   ||| || ||||||| | |||||  | | ||| |||||||||||||  |||   |||||||||||||| |||| | ||||||      
T  21007 agtaactccgttatcaggaggtaaggtcatcgataccccgaccaatgggtcggtgactacttcctttagttgtgctaagtgtcccgttagttttggtagc 21106  T
Q  414 gttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatggatgtgatttttggtat 475  Q
    || |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  21107 gtcgattttgagttgtatcttgtttgtcttctgttgaagcatatggatgtgattttcggtat 21168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 95; Significance: 3e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 114 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 77653 - 77339
Alignment:
Q  114 ggtcatattagtaataagtgtaccaagccgaagaaggcggccggaaaggtgtttgctttgaatgcagaggaagtggagcagccaaataatcttatccgag 213  Q
    |||||||| ||||  ||||||||||||| |||||| |||||  | |  || ||||| ||||| || ||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||    
T  77653 ggtcatatcagtaccaagtgtaccaagctgaagaaagcggcgtggagagtttttgcattgaacgctgaggaggtggagcaaccagataatctaatccgag 77554  T
Q  214 gtatgtgttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatattggtgctactctttcttttacctcggttagttttgttgagcatttgaaattggt 313  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||| ||||||||| | |||||| | |||| |||||| |||||| | |||||| |||||    
T  77553 atatgtattttatcaatagtactcctttgtttggaattgttgatactggtgctacgcattctttcatctcgcttagttatgttgaacgtttgaatttggt 77454  T
Q  314 tgtaactccgttgttgcgagatatggtcatcaacaccccagctagtggttcggtgactacttgttttgtgtgtgctaagtgtcctgttaatattggtaat 413  Q
    | |||||| ||| ||   ||  ||||||||| |||||| ||| | ||| | | |||||||||  || || |||||||||| |||||||||| |||||||     
T  77453 tttaactctgttttttaaagggatggtcatcgacaccctagccaatggcttgatgactacttccttagtttgtgctaagtttcctgttaattttggtaac 77354  T
Q  414 gttgattttgagttg 428  Q
    |||||||||||||||    
T  77353 gttgattttgagttg 77339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269 (Bit Score: 88; Significance: 4e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0269
Description:

Target: scaffold0269; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 381 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 2434 - 2335
Alignment:
Q  381 gtgtgtgctaagtgtcctgttaatattggtaatgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatggatgtgatttttggtatggatt 480  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2434 gtgtgtgctaagtgtcttgttaattttggtaatgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggatt 2335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244 (Bit Score: 88; Significance: 4e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0244
Description:

Target: scaffold0244; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 381 - 480
Target Start/End: Original strand, 24913 - 25012
Alignment:
Q  381 gtgtgtgctaagtgtcctgttaatattggtaatgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatggatgtgatttttggtatggatt 480  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24913 gtgtgtgctaagtgtcctgttaattttggtaatgttgattttgagttggatcttgtgtgtctcccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggatt 25012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0615 (Bit Score: 87; Significance: 2e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0615
Description:

Target: scaffold0615; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 90 - 244
Target Start/End: Original strand, 9429 - 9583
Alignment:
Q  90 acttgctacaattgtggaaagaatggtcatattagtaataagtgtaccaagccgaagaaggcggccggaaaggtgtttgctttgaatgcagaggaagtgg 189  Q
    |||||||||||||||||  |||| | |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| | | || ||||    
T  9429 acttgctacaattgtggggagaaggatcatattagtaccaattgtaccaagccgaagaaggcggcggggaaggtgtttgctttgaatgaaaaagaggtgg 9528  T
Q  190 agcagccaaataatcttatccgaggtatgtgttttatcaatagtactcctttgat 244  Q
    | |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9529 aacagccggataatcttatccgaggtatgtgttttatcaatagtactcatttgat 9583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1164 (Bit Score: 77; Significance: 2e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold1164
Description:

Target: scaffold1164; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 346 - 438
Target Start/End: Original strand, 2292 - 2384
Alignment:
Q  346 acaccccagctagtggttcggtgactacttgttttgtgtgtgctaagtgtcctgttaatattggtaatgttgattttgagttggatcttgtgt 438  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2292 acaccccggctagtggttcggtgactacttcttttgtgtgtgctaagtgtcttgttaattttggtaatgttgattttgagttggatcttgtgt 2384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 77; Significance: 2e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 384 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 3436 - 3340
Alignment:
Q  384 tgtgctaagtgtcctgttaatattggtaatgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatggatgtgatttttggtatggatt 480  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  3436 tgtggtaagtgtcctgttaattttggtaatgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccattgaagcatatgaatgtgatttttggtatggatt 3340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 73; Significance: 4e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 384 - 480
Target Start/End: Original strand, 93791 - 93887
Alignment:
Q  384 tgtgctaagtgtcctgttaatattggtaatgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatggatgtgatttttggtatggatt 480  Q
    |||| |||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  93791 tgtgttaagtgtcctgttaatttcggtaatgttgatttggagttggatcttgtttgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggatt 93887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1486 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold1486
Description:

Target: scaffold1486; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 389 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 455 - 364
Alignment:
Q  389 taagtgtcctgttaatattggtaatgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatggatgtgatttttggtatggatt 480  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  455 taagtgtcctgttaattttgataatgttgattttaagttggatcttgtttgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggatt 364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 381 - 480
Target Start/End: Original strand, 17696 - 17794
Alignment:
Q  381 gtgtgtgctaagtgtcctgttaatattggtaatgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatggatgtgatttttggtatggatt 480  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17696 gtgtgtgctaagtgtcctgttaatttcggtaatgttgatttt-agttgaatcttgtgtgtcttccattgaagcatatggatgtgatttttggtatggatt 17794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 389 - 480
Target Start/End: Original strand, 53967 - 54058
Alignment:
Q  389 taagtgtcctgttaatattggtaatgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatggatgtgatttttggtatggatt 480  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  53967 taagtgtcctgttaattttgataatgttgattttaagttggatcttgtttgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggatt 54058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 68; Significance: 4e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 381 - 480
Target Start/End: Original strand, 46431 - 46529
Alignment:
Q  381 gtgtgtgctaagtgtcctgttaatattggtaatgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatggatgtgatttttggtatggatt 480  Q
    |||| ||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  46431 gtgtttgctaagtgtcctgtaaatttcggtaatgttgattttgagttggatcttgtttgtcttccgttgaagcatatggatgtga-ttttggtatggatt 46529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 412 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 997 - 929
Alignment:
Q  412 atgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatggatgtgatttttggtatggatt 480  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  997 atgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggatt 929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 406 - 480
Target Start/End: Original strand, 8199 - 8273
Alignment:
Q  406 ttggtaatgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatggatgtgatttttggtatggatt 480  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||    
T  8199 ttggtgatgttgattttgagttggatcttgtttgtcttccgttgaagcatatggattttatttttggtatggatt 8273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0409 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0409
Description:

Target: scaffold0409; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 412 - 480
Target Start/End: Original strand, 3331 - 3399
Alignment:
Q  412 atgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatggatgtgatttttggtatggatt 480  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  3331 atgttgattttgagttggatcttttgtgtcttcggttgaagcatatagatgtgatttttggtatggatt 3399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0409; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 412 - 480
Target Start/End: Original strand, 11586 - 11654
Alignment:
Q  412 atgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatggatgtgatttttggtatggatt 480  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  11586 atgttgattttgagttggatcttttgtgtcttcggttgaagcatatagatgtgatttttggtatggatt 11654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 412 - 480
Target Start/End: Original strand, 10757 - 10826
Alignment:
Q  412 atgttgattttg-agttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatggatgtgatttttggtatggatt 480  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10757 atgttgattttggagttggatcttgtttgtcttccgttaaagcatatggatgtgatttttggtatggatt 10826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1424 (Bit Score: 49; Significance: 8e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold1424
Description:

Target: scaffold1424; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 412 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 198 - 131
Alignment:
Q  412 atgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatggatgtgatttttggtatggatt 480  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  198 atgttgattttgagttggat-ttgtttgtcttccgttgaagcatatggatgttatttttggtatggatt 131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 49; Significance: 8e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 412 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 51766 - 51698
Alignment:
Q  412 atgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagtatatggatgtgatttttggtatggatt 480  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  51766 atgttgattttgaattggatcttgtttatcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggcatggatt 51698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1488 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold1488
Description:

Target: scaffold1488; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 430 - 480
Target Start/End: Original strand, 202 - 252
Alignment:
Q  430 atcttgtgtgtcttccgttgaagtatatggatgtgatttttggtatggatt 480  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  202 atcttgtgtgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggatt 252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 24 - 106
Target Start/End: Original strand, 36163 - 36245
Alignment:
Q  24 agttgttacaagtgtgggaaagcgggtcacaaggcctatgagtgtaaggatgtttcgaagaatattacttgctacaattgtgg 106  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||| ||||| ||||| || ||||||| |||||||||||    
T  36163 agttgtttcaagtgtgggaaggcgggtcacaaggcttttgagtgtaagaatgttgcgaaggatgttacttgttacaattgtgg 36245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 229 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 15518 - 15479
Alignment:
Q  229 atagtactcctttgattgcaattattgatattggtgctac 268  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  15518 atagtactcctttaattgctattattgatattggtgctac 15479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 228 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 30043 - 29992
Alignment:
Q  228 aatagtactcctttgattgcaattattgatattggtgctactctttctttta 279  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  30043 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgtttta 29992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 228 - 279
Target Start/End: Original strand, 67303 - 67354
Alignment:
Q  228 aatagtactcctttgattgcaattattgatattggtgctactctttctttta 279  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  67303 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgtttta 67354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0041 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0041
Description:

Target: scaffold0041; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 228 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 41844 - 41793
Alignment:
Q  228 aatagtactcctttgattgcaattattgatattggtgctactctttctttta 279  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  41844 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgtttta 41793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 228 - 279
Target Start/End: Original strand, 39528 - 39579
Alignment:
Q  228 aatagtactcctttgattgcaattattgatattggtgctactctttctttta 279  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  39528 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgtttta 39579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 228 - 279
Target Start/End: Original strand, 514548 - 514599
Alignment:
Q  228 aatagtactcctttgattgcaattattgatattggtgctactctttctttta 279  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  514548 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgtttta 514599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0585
Description:

Target: scaffold0585; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 228 - 270
Target Start/End: Original strand, 4284 - 4326
Alignment:
Q  228 aatagtactcctttgattgcaattattgatattggtgctactc 270  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  4284 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactc 4326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 213 - 246
Target Start/End: Original strand, 29941 - 29974
Alignment:
Q  213 ggtatgtgttttatcaatagtactcctttgattg 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29941 ggtatgtgttttatcaatagtactcttttgattg 29974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University