View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF9839A_low_149 (Length: 310)

Name: NF9839A_low_149
Description: NF9839A
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF9839A_low_149
NF9839A_low_149
[»] chr7 (39 HSPs)
chr7 (3-310)||(14335641-14335948)
chr7 (3-310)||(18586889-18587196)
chr7 (3-310)||(44788069-44788376)
chr7 (3-310)||(8710850-8711157)
chr7 (1-310)||(10873706-10874015)
chr7 (1-310)||(15157773-15158082)
chr7 (1-310)||(13689286-13689595)
chr7 (1-310)||(11233929-11234238)
chr7 (1-310)||(18180988-18181296)
chr7 (3-310)||(12690746-12691053)
chr7 (3-310)||(11549820-11550127)
chr7 (3-310)||(14957753-14958060)
chr7 (3-310)||(9591609-9591919)
chr7 (3-310)||(11984237-11984547)
chr7 (45-310)||(17703212-17703480)
chr7 (45-310)||(16726198-16726466)
chr7 (45-256)||(26091533-26091747)
chr7 (57-270)||(15145692-15145908)
chr7 (45-256)||(40924552-40924766)
chr7 (53-160)||(16947215-16947322)
chr7 (57-256)||(14042994-14043196)
chr7 (57-256)||(14353024-14353226)
chr7 (45-256)||(26115325-26115539)
chr7 (53-159)||(13004865-13004971)
chr7 (48-256)||(49155601-49155812)
chr7 (53-160)||(14260989-14261096)
chr7 (54-259)||(12459925-12460133)
chr7 (53-253)||(19150314-19150517)
chr7 (53-253)||(20749713-20749916)
chr7 (61-256)||(13965419-13965617)
chr7 (53-151)||(12712406-12712504)
chr7 (54-160)||(12798248-12798354)
chr7 (54-259)||(13024641-13024849)
chr7 (120-160)||(14145060-14145100)
chr7 (61-172)||(15627910-15628021)
chr7 (54-160)||(11385173-11385279)
chr7 (57-163)||(14283121-14283227)
chr7 (216-256)||(14261155-14261195)
chr7 (225-261)||(15099521-15099557)
[»] chr3 (51 HSPs)
chr3 (1-310)||(13255565-13255874)
chr3 (1-310)||(12889584-12889893)
chr3 (1-310)||(43165550-43165859)
chr3 (1-310)||(10008475-10008784)
chr3 (3-310)||(3688818-3689125)
chr3 (3-310)||(20059002-20059309)
chr3 (1-310)||(10909085-10909394)
chr3 (1-310)||(16638648-16638957)
chr3 (1-310)||(16753647-16753956)
chr3 (1-310)||(48428322-48428631)
chr3 (3-310)||(15586340-15586647)
chr3 (3-310)||(26790361-26790668)
chr3 (1-306)||(6603614-6603919)
chr3 (3-310)||(15345193-15345500)
chr3 (1-310)||(5421876-5422185)
chr3 (3-310)||(53381967-53382273)
chr3 (1-310)||(15713002-15713311)
chr3 (3-310)||(5110357-5110664)
chr3 (1-271)||(6596969-6597239)
chr3 (1-310)||(15399464-15399773)
chr3 (3-310)||(24186065-24186372)
chr3 (1-245)||(15358992-15359236)
chr3 (3-310)||(16803892-16804202)
chr3 (3-310)||(11861228-11861538)
chr3 (1-310)||(16695039-16695351)
chr3 (45-310)||(12501808-12502076)
chr3 (1-310)||(23414733-23415045)
chr3 (3-259)||(23078962-23079221)
chr3 (57-270)||(17497606-17497822)
chr3 (45-256)||(10408907-10409121)
chr3 (57-310)||(14578420-14578676)
chr3 (45-310)||(15065946-15066214)
chr3 (45-256)||(28757258-28757472)
chr3 (57-270)||(14873584-14873800)
chr3 (57-270)||(12843102-12843318)
chr3 (45-256)||(47126883-47127097)
chr3 (3-58)||(5108487-5108542)
chr3 (57-166)||(16326695-16326804)
chr3 (57-307)||(19727638-19727890)
chr3 (53-176)||(31692169-31692292)
chr3 (54-154)||(16825264-16825364)
chr3 (53-176)||(31941925-31942048)
chr3 (57-149)||(13028345-13028437)
chr3 (63-256)||(14290526-14290722)
chr3 (57-163)||(16831516-16831622)
chr3 (90-174)||(11958202-11958286)
chr3 (272-310)||(15358958-15358996)
chr3 (117-174)||(18131395-18131452)
chr3 (53-97)||(10417029-10417073)
chr3 (120-160)||(16384423-16384463)
chr3 (216-256)||(17494585-17494625)
[»] chr6 (37 HSPs)
chr6 (3-310)||(16575010-16575317)
chr6 (3-310)||(16620063-16620370)
chr6 (1-310)||(29589291-29589600)
chr6 (1-310)||(27205742-27206051)
chr6 (1-310)||(27243177-27243486)
chr6 (1-310)||(28312750-28313059)
chr6 (3-310)||(24292636-24292943)
chr6 (1-303)||(28260049-28260351)
chr6 (1-303)||(28285565-28285867)
chr6 (1-303)||(28338798-28339100)
chr6 (1-310)||(2871654-2871963)
chr6 (3-310)||(25115672-25115981)
chr6 (1-310)||(22829238-22829547)
chr6 (3-310)||(5836082-5836389)
chr6 (57-310)||(22436989-22437245)
chr6 (3-310)||(25756466-25756776)
chr6 (3-259)||(21764983-21765242)
chr6 (3-310)||(27558820-27559130)
chr6 (45-256)||(24367574-24367788)
chr6 (156-310)||(18404948-18405105)
chr6 (54-160)||(19438275-19438381)
chr6 (45-174)||(14376809-14376938)
chr6 (57-166)||(23081690-23081799)
chr6 (57-172)||(18182293-18182408)
chr6 (54-259)||(10465750-10465958)
chr6 (57-163)||(18660189-18660295)
chr6 (72-210)||(19867879-19868017)
chr6 (53-159)||(19881670-19881776)
chr6 (53-151)||(34642486-34642584)
chr6 (54-172)||(19456284-19456402)
chr6 (54-172)||(19466429-19466547)
chr6 (54-160)||(21566893-21566999)
chr6 (57-151)||(25958658-25958752)
chr6 (211-256)||(16813814-16813859)
chr6 (216-256)||(8720772-8720812)
chr6 (216-256)||(19456197-19456237)
chr6 (216-256)||(19466342-19466382)
[»] chr5 (33 HSPs)
chr5 (1-310)||(16359690-16359999)
chr5 (1-310)||(34569682-34569991)
chr5 (3-310)||(19773148-19773455)
chr5 (3-309)||(40711969-40712275)
chr5 (1-310)||(22329776-22330085)
chr5 (1-310)||(27682289-27682598)
chr5 (3-310)||(41774030-41774337)
chr5 (1-310)||(14996628-14996937)
chr5 (3-304)||(27521600-27521901)
chr5 (1-304)||(37288385-37288688)
chr5 (1-310)||(29472962-29473271)
chr5 (1-310)||(27613544-27613853)
chr5 (1-310)||(27665392-27665688)
chr5 (1-310)||(22137856-22138165)
chr5 (1-310)||(22351107-22351416)
chr5 (1-310)||(18782302-18782614)
chr5 (18-310)||(20803785-20804080)
chr5 (66-310)||(23461159-23461406)
chr5 (3-212)||(23537103-23537312)
chr5 (57-270)||(25429648-25429864)
chr5 (60-268)||(21883005-21883218)
chr5 (45-256)||(25851296-25851510)
chr5 (54-259)||(23077844-23078052)
chr5 (57-269)||(23526280-23526495)
chr5 (57-172)||(21331931-21332046)
chr5 (45-259)||(22505900-22506117)
chr5 (45-256)||(14883921-14884135)
chr5 (45-256)||(20345506-20345720)
chr5 (53-160)||(21870216-21870323)
chr5 (53-160)||(21874496-21874603)
chr5 (57-252)||(21631341-21631539)
chr5 (57-172)||(26735670-26735785)
chr5 (54-163)||(23474532-23474641)
[»] chr2 (33 HSPs)
chr2 (1-310)||(9338469-9338778)
chr2 (1-310)||(9487103-9487412)
chr2 (3-310)||(17001887-17002194)
chr2 (3-310)||(27374156-27374463)
chr2 (1-310)||(16984127-16984436)
chr2 (3-310)||(22322591-22322898)
chr2 (3-310)||(24712921-24713228)
chr2 (1-310)||(44382817-44383126)
chr2 (3-310)||(10871737-10872044)
chr2 (3-310)||(24265257-24265564)
chr2 (1-310)||(24873997-24874306)
chr2 (51-310)||(22462775-22463037)
chr2 (1-310)||(23116303-23116615)
chr2 (3-310)||(24704728-24705038)
chr2 (1-310)||(24678374-24678686)
chr2 (165-310)||(21139392-21139537)
chr2 (54-154)||(16931598-16931698)
chr2 (3-310)||(24656904-24657214)
chr2 (57-310)||(23039877-23040133)
chr2 (66-310)||(23028771-23029017)
chr2 (57-268)||(22742266-22742480)
chr2 (46-268)||(21320292-21320517)
chr2 (57-270)||(22733074-22733290)
chr2 (177-310)||(23205201-23205337)
chr2 (177-310)||(23676805-23676941)
chr2 (57-310)||(23105027-23105283)
chr2 (54-160)||(23274633-23274739)
chr2 (57-146)||(23029815-23029904)
chr2 (211-259)||(11351168-11351216)
chr2 (45-180)||(20848606-20848741)
chr2 (168-257)||(23065353-23065445)
chr2 (168-257)||(23074803-23074895)
chr2 (211-256)||(28350816-28350861)
[»] chr8 (29 HSPs)
chr8 (3-310)||(19115722-19116029)
chr8 (1-310)||(19481223-19481531)
chr8 (3-310)||(17671174-17671481)
chr8 (1-310)||(18859899-18860208)
chr8 (3-310)||(22126111-22126418)
chr8 (1-310)||(20015413-20015722)
chr8 (3-310)||(22117327-22117634)
chr8 (3-310)||(22043149-22043459)
chr8 (1-310)||(30310291-30310603)
chr8 (1-310)||(32603467-32603779)
chr8 (1-310)||(15536705-15537017)
chr8 (57-270)||(18880860-18881076)
chr8 (57-268)||(19981331-19981545)
chr8 (57-310)||(21671837-21672093)
chr8 (57-270)||(22421096-22421312)
chr8 (3-259)||(21163679-21163938)
chr8 (57-310)||(21391064-21391320)
chr8 (57-310)||(21780390-21780646)
chr8 (57-172)||(22523973-22524088)
chr8 (54-179)||(29300626-29300751)
chr8 (45-256)||(16268415-16268629)
chr8 (183-310)||(22031425-22031554)
chr8 (45-256)||(28984287-28984501)
chr8 (60-201)||(19985614-19985755)
chr8 (54-174)||(21928889-21929009)
chr8 (120-163)||(22054335-22054378)
chr8 (54-151)||(3274589-3274686)
chr8 (120-160)||(22027546-22027586)
chr8 (66-172)||(20391549-20391655)
[»] chr4 (35 HSPs)
chr4 (3-310)||(16233441-16233748)
chr4 (3-310)||(23959003-23959310)
chr4 (1-310)||(19775240-19775549)
chr4 (3-310)||(27714592-27714899)
chr4 (1-310)||(8389668-8389977)
chr4 (1-310)||(17091596-17091905)
chr4 (3-310)||(12479856-12480163)
chr4 (1-310)||(14300426-14300735)
chr4 (1-310)||(8050070-8050379)
chr4 (1-310)||(19635392-19635701)
chr4 (1-310)||(40476296-40476605)
chr4 (3-310)||(14683823-14684130)
chr4 (3-310)||(13513606-13513916)
chr4 (51-310)||(18223967-18224229)
chr4 (1-309)||(18604263-18604574)
chr4 (3-256)||(16248122-16248378)
chr4 (3-212)||(16350188-16350397)
chr4 (45-256)||(3261542-3261756)
chr4 (57-270)||(8332-8548)
chr4 (12-259)||(7357574-7357824)
chr4 (57-256)||(15536-15738)
chr4 (57-198)||(14162841-14162982)
chr4 (84-259)||(20893338-20893516)
chr4 (45-256)||(29450285-29450499)
chr4 (45-256)||(44658614-44658828)
chr4 (57-184)||(15144448-15144575)
chr4 (54-172)||(16219585-16219703)
chr4 (54-172)||(16222905-16223023)
chr4 (71-163)||(14697507-14697599)
chr4 (53-176)||(16151029-16151152)
chr4 (53-176)||(16155175-16155298)
chr4 (53-160)||(18259850-18259957)
chr4 (66-259)||(11204001-11204197)
chr4 (57-160)||(14993127-14993230)
chr4 (53-174)||(15073754-15073875)
[»] chr1 (35 HSPs)
chr1 (1-310)||(41350448-41350756)
chr1 (3-310)||(16347375-16347683)
chr1 (3-310)||(21833573-21833880)
chr1 (3-310)||(51330273-51330580)
chr1 (1-310)||(33387808-33388117)
chr1 (1-310)||(21842483-21842792)
chr1 (1-310)||(22400591-22400900)
chr1 (3-310)||(19109639-19109947)
chr1 (3-180)||(16354024-16354201)
chr1 (3-310)||(21228334-21228644)
chr1 (45-310)||(24784677-24784945)
chr1 (1-310)||(17041792-17042103)
chr1 (72-268)||(20081223-20081422)
chr1 (45-259)||(21176689-21176906)
chr1 (53-270)||(22401903-22402123)
chr1 (3-310)||(22435521-22435821)
chr1 (45-256)||(48426229-48426443)
chr1 (57-174)||(16379504-16379621)
chr1 (45-256)||(37680405-37680619)
chr1 (57-257)||(22496088-22496291)
chr1 (66-259)||(20074550-20074746)
chr1 (57-310)||(21752318-21752574)
chr1 (45-256)||(20297739-20297953)
chr1 (104-259)||(52989094-52989252)
chr1 (66-256)||(38909667-38909860)
chr1 (54-160)||(22015574-22015680)
chr1 (75-172)||(22117126-22117223)
chr1 (53-151)||(21742380-21742478)
chr1 (66-259)||(21961380-21961576)
chr1 (66-259)||(31536838-31537034)
chr1 (53-97)||(21738864-21738908)
chr1 (62-256)||(19857630-19857827)
chr1 (126-163)||(20921860-20921897)
chr1 (216-256)||(21739030-21739070)
chr1 (216-256)||(21742546-21742586)
[»] scaffold0055 (1 HSPs)
scaffold0055 (3-310)||(22532-22839)
[»] scaffold0052 (1 HSPs)
scaffold0052 (3-310)||(7521-7828)
[»] scaffold0044 (2 HSPs)
scaffold0044 (1-309)||(3710-4018)
scaffold0044 (3-310)||(17445-17755)
[»] scaffold0431 (1 HSPs)
scaffold0431 (1-310)||(10653-10961)
[»] scaffold0259 (1 HSPs)
scaffold0259 (3-310)||(8543-8850)
[»] scaffold0109 (2 HSPs)
scaffold0109 (1-310)||(41440-41749)
scaffold0109 (51-310)||(12881-13143)
[»] scaffold0029 (3 HSPs)
scaffold0029 (1-210)||(107484-107693)
scaffold0029 (57-269)||(8540-8755)
scaffold0029 (53-97)||(93653-93697)
[»] scaffold0028 (3 HSPs)
scaffold0028 (1-310)||(21282-21574)
scaffold0028 (3-310)||(55289-55596)
scaffold0028 (1-310)||(11754-12046)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (3-310)||(424593-424903)
scaffold0003 (57-160)||(203819-203922)
[»] scaffold0789 (1 HSPs)
scaffold0789 (3-310)||(223-519)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (3-310)||(48950-49257)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (3-310)||(229561-229871)
[»] scaffold1881 (1 HSPs)
scaffold1881 (3-310)||(189-499)
[»] scaffold0285 (1 HSPs)
scaffold0285 (3-310)||(5283-5593)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (1-310)||(135-446)
scaffold0008 (1-310)||(139317-139629)
[»] scaffold0177 (2 HSPs)
scaffold0177 (3-310)||(14750-15060)
scaffold0177 (3-310)||(11065-11375)
[»] scaffold0010 (4 HSPs)
scaffold0010 (3-310)||(14709-15019)
scaffold0010 (57-172)||(5341-5456)
scaffold0010 (211-256)||(39253-39298)
scaffold0010 (53-97)||(180598-180642)
[»] scaffold0297 (1 HSPs)
scaffold0297 (1-259)||(7364-7625)
[»] scaffold0289 (1 HSPs)
scaffold0289 (3-274)||(109-383)
[»] scaffold0079 (1 HSPs)
scaffold0079 (3-310)||(36783-37093)
[»] scaffold2059 (1 HSPs)
scaffold2059 (1-310)||(476-788)
[»] scaffold0451 (1 HSPs)
scaffold0451 (3-309)||(13739-14050)
[»] scaffold0412 (1 HSPs)
scaffold0412 (3-310)||(15288-15598)
[»] scaffold1423 (1 HSPs)
scaffold1423 (57-310)||(141-397)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (59-268)||(30614-30826)
[»] scaffold0080 (4 HSPs)
scaffold0080 (51-310)||(9996-10258)
scaffold0080 (51-310)||(12651-12913)
scaffold0080 (57-270)||(32204-32420)
scaffold0080 (57-212)||(55023-55178)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (3-257)||(121885-122142)
scaffold0034 (54-166)||(11666-11778)
[»] scaffold0501 (1 HSPs)
scaffold0501 (59-259)||(260-463)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (60-310)||(7545-7798)
[»] scaffold1220 (1 HSPs)
scaffold1220 (30-310)||(21-304)
[»] scaffold0546 (1 HSPs)
scaffold0546 (51-310)||(164-426)
[»] scaffold0273 (1 HSPs)
scaffold0273 (57-268)||(367-581)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (57-268)||(50108-50322)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (75-310)||(171403-171641)
[»] scaffold0490 (2 HSPs)
scaffold0490 (57-310)||(176-432)
scaffold0490 (56-160)||(3303-3407)
[»] scaffold0120 (2 HSPs)
scaffold0120 (57-310)||(11548-11804)
scaffold0120 (72-256)||(14423-14610)
[»] scaffold0081 (2 HSPs)
scaffold0081 (57-310)||(21889-22145)
scaffold0081 (57-310)||(37313-37569)
[»] scaffold0305 (1 HSPs)
scaffold0305 (3-310)||(3149-3459)
[»] scaffold0819 (1 HSPs)
scaffold0819 (45-259)||(450-667)
[»] scaffold0621 (2 HSPs)
scaffold0621 (57-270)||(342-558)
scaffold0621 (57-270)||(4759-4975)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (57-310)||(4318-4574)
[»] scaffold0114 (2 HSPs)
scaffold0114 (57-310)||(17112-17368)
scaffold0114 (120-160)||(40496-40536)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (57-310)||(8508-8764)
[»] scaffold0042 (1 HSPs)
scaffold0042 (1-310)||(36527-36839)
[»] scaffold0023 (2 HSPs)
scaffold0023 (69-310)||(30349-30593)
scaffold0023 (53-174)||(164160-164281)
[»] scaffold0324 (1 HSPs)
scaffold0324 (57-310)||(2274-2530)
[»] scaffold1459 (1 HSPs)
scaffold1459 (3-310)||(801-1111)
[»] scaffold0611 (1 HSPs)
scaffold0611 (71-270)||(9220-9422)
[»] scaffold0017 (2 HSPs)
scaffold0017 (3-310)||(16775-17085)
scaffold0017 (123-236)||(194697-194813)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (57-212)||(15297-15452)
[»] scaffold0319 (1 HSPs)
scaffold0319 (57-212)||(6886-7041)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (57-270)||(23708-23924)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (57-310)||(10643-10899)
[»] scaffold0411 (1 HSPs)
scaffold0411 (57-310)||(8696-8952)
[»] scaffold0075 (2 HSPs)
scaffold0075 (57-270)||(48055-48271)
scaffold0075 (57-256)||(55234-55436)
[»] scaffold0040 (2 HSPs)
scaffold0040 (57-310)||(110670-110926)
scaffold0040 (57-163)||(18280-18386)
[»] scaffold0041 (1 HSPs)
scaffold0041 (45-256)||(42074-42288)
[»] scaffold0550 (1 HSPs)
scaffold0550 (168-310)||(10032-10177)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (72-310)||(3836-4077)
[»] scaffold0122 (1 HSPs)
scaffold0122 (57-270)||(40270-40486)
[»] scaffold0022 (3 HSPs)
scaffold0022 (57-211)||(42019-42173)
scaffold0022 (57-211)||(75739-75893)
scaffold0022 (57-184)||(34534-34661)
[»] scaffold0276 (1 HSPs)
scaffold0276 (45-256)||(23674-23888)
[»] scaffold0181 (1 HSPs)
scaffold0181 (3-310)||(28637-28947)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (57-256)||(104565-104767)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (57-184)||(19812-19939)
[»] scaffold0118 (1 HSPs)
scaffold0118 (45-259)||(797-1014)
[»] scaffold0410 (1 HSPs)
scaffold0410 (45-310)||(426-694)
[»] scaffold0222 (1 HSPs)
scaffold0222 (53-256)||(21153-21359)
[»] scaffold1845 (1 HSPs)
scaffold1845 (57-259)||(1067-1272)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (57-172)||(11454-11569)
[»] scaffold1517 (1 HSPs)
scaffold1517 (54-259)||(1247-1455)
[»] scaffold0575 (1 HSPs)
scaffold0575 (57-270)||(9944-10160)
[»] scaffold0333 (1 HSPs)
scaffold0333 (57-310)||(18935-19190)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (54-259)||(30086-30294)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (45-175)||(30333-30463)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (66-212)||(66302-66448)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (73-163)||(216199-216289)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (66-259)||(514125-514321)
[»] scaffold1433 (1 HSPs)
scaffold1433 (54-174)||(1071-1191)
[»] scaffold0404 (1 HSPs)
scaffold0404 (54-174)||(8168-8288)
[»] scaffold0358 (1 HSPs)
scaffold0358 (60-310)||(9232-9485)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (57-172)||(14028-14143)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (57-172)||(15836-15951)
[»] scaffold0053 (2 HSPs)
scaffold0053 (53-160)||(62531-62638)
scaffold0053 (53-163)||(65081-65191)
[»] scaffold0993 (1 HSPs)
scaffold0993 (73-270)||(1307-1507)
[»] scaffold0108 (1 HSPs)
scaffold0108 (54-160)||(50543-50649)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (45-151)||(66859-66965)
[»] scaffold0523 (3 HSPs)
scaffold0523 (12-256)||(11461-11708)
scaffold0523 (225-261)||(5774-5810)
scaffold0523 (53-97)||(5938-5982)
[»] scaffold0188 (1 HSPs)
scaffold0188 (54-262)||(33132-33343)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (54-151)||(98343-98440)
scaffold0020 (53-151)||(176434-176532)
[»] scaffold1274 (1 HSPs)
scaffold1274 (63-163)||(53-152)
[»] scaffold0357 (1 HSPs)
scaffold0357 (57-256)||(17740-17942)
[»] scaffold0423 (1 HSPs)
scaffold0423 (156-310)||(2125-2282)
[»] scaffold0203 (1 HSPs)
scaffold0203 (53-160)||(3810-3917)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (57-172)||(23296-23411)
[»] scaffold1299 (1 HSPs)
scaffold1299 (54-160)||(1608-1714)
[»] scaffold0664 (1 HSPs)
scaffold0664 (53-151)||(7485-7583)
[»] scaffold0434 (1 HSPs)
scaffold0434 (54-160)||(5662-5768)
[»] scaffold0239 (1 HSPs)
scaffold0239 (57-163)||(9550-9656)
[»] scaffold0457 (1 HSPs)
scaffold0457 (45-166)||(13805-13926)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (115-176)||(9036-9097)
[»] scaffold0348 (2 HSPs)
scaffold0348 (57-160)||(17247-17350)
scaffold0348 (120-154)||(4675-4709)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (53-160)||(15510-15617)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (53-160)||(319681-319788)
[»] scaffold0529 (1 HSPs)
scaffold0529 (57-115)||(5571-5629)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (54-160)||(305-411)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (57-151)||(17686-17780)
[»] scaffold0067 (5 HSPs)
scaffold0067 (54-160)||(30062-30168)
scaffold0067 (225-261)||(29958-29994)
scaffold0067 (120-160)||(49006-49046)
scaffold0067 (120-160)||(58040-58080)
scaffold0067 (120-160)||(64428-64468)
[»] scaffold0310 (1 HSPs)
scaffold0310 (45-166)||(11409-11530)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (57-166)||(16372-16481)
[»] scaffold0072 (1 HSPs)
scaffold0072 (53-174)||(54471-54592)
[»] scaffold0765 (1 HSPs)
scaffold0765 (120-160)||(6083-6123)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (120-160)||(263664-263704)
[»] scaffold0192 (1 HSPs)
scaffold0192 (63-166)||(29959-30062)
[»] scaffold0518 (1 HSPs)
scaffold0518 (120-154)||(2275-2309)
[»] scaffold0505 (1 HSPs)
scaffold0505 (57-151)||(2199-2292)
[»] scaffold0443 (1 HSPs)
scaffold0443 (214-256)||(12136-12178)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (54-160)||(116062-116168)
[»] scaffold0266 (1 HSPs)
scaffold0266 (66-151)||(17084-17169)
[»] scaffold0235 (2 HSPs)
scaffold0235 (55-160)||(8223-8328)
scaffold0235 (55-160)||(18437-18542)
[»] scaffold0056 (1 HSPs)
scaffold0056 (216-261)||(808-853)
[»] scaffold0054 (1 HSPs)
scaffold0054 (53-97)||(63298-63342)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 284; Significance: 1e-159; HSPs: 39)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 3 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 14335948 - 14335641
Alignment:
Q  3 aagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtga 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14335948 aagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggatttggttaatagctgcaggatctacgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtga 14335849  T
Q  103 atgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaa 202  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14335848 atgaaaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacaatgcccccgctgacaaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaa 14335749  T
Q  203 gaaggatgctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggtaag 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14335748 gaaggatgctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggtaag 14335649  T
Q  303 aagggtca 310  Q
    ||||||||    
T  14335648 aagggtca 14335641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 3 - 310
Target Start/End: Original strand, 18586889 - 18587196
Alignment:
Q  3 aagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtga 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18586889 aagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggatttggttaatagctgcaggatctacgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtga 18586988  T
Q  103 atgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaa 202  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18586989 atgaaaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacaatgcccccgctgacaaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaa 18587088  T
Q  203 gaaggatgctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggtaag 302  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18587089 gaaggatgctacagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggtaag 18587188  T
Q  303 aagggtca 310  Q
    ||||||||    
T  18587189 aagggtca 18587196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 3 - 310
Target Start/End: Original strand, 44788069 - 44788376
Alignment:
Q  3 aagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtga 102  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  44788069 aagagggcgattggataccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaggaggataccaaggctcactacaaggtagtga 44788168  T
Q  103 atgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaa 202  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44788169 atgaaaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccctactgataaaggaaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaa 44788268  T
Q  203 gaaggatgctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggtaag 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44788269 gaaggatgctgcagagattgtgtgcttcaattgtggcgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggtaag 44788368  T
Q  303 aagggtca 310  Q
    ||||||||    
T  44788369 aagggtca 44788376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 3 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 8711157 - 8710850
Alignment:
Q  3 aagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtga 102  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8711157 aagagggcgatcggataccaacagctgagagtttttcaggatttggttaatagctgcaggatctacgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtga 8711058  T
Q  103 atgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaa 202  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8711057 atgaaaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgacaaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaa 8710958  T
Q  203 gaaggatgctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggtaag 302  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8710957 gaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaaaagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggtaag 8710858  T
Q  303 aagggtca 310  Q
    || |||||    
T  8710857 aaaggtca 8710850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 1 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 10874015 - 10873706
Alignment:
Q  1 tcaagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagt 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10874015 tcaagagggcgattgggtatcaacagctgagagtttttccagatttggttaacagctgcaggatctatgaggaggataccaaggctcactacaaggtagt 10873916  T
Q  101 gaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaag 200  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10873915 gaatgagaggaagggcaggggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgacaaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaag 10873816  T
Q  201 aagaaggatgctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggta 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10873815 aagaaggatgctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaagaccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggta 10873716  T
Q  301 agaagggtca 310  Q
    ||||||||||    
T  10873715 agaagggtca 10873706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 1 - 310
Target Start/End: Original strand, 15157773 - 15158082
Alignment:
Q  1 tcaagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagt 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15157773 tcaagagggcgattggataccaacagctgagagtttttcaggatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagt 15157872  T
Q  101 gaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaag 200  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15157873 gaatgagagaaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccctgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaag 15157972  T
Q  201 aagaaggatgctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggta 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15157973 aagaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaaaagcaacgtctgccctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggca 15158072  T
Q  301 agaagggtca 310  Q
    |||| |||||    
T  15158073 agaaaggtca 15158082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 1 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 13689595 - 13689286
Alignment:
Q  1 tcaagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagt 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13689595 tcaagagggcgattgggtatcaacagctgagagtttttccagacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagt 13689496  T
Q  101 gaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaag 200  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13689495 gaatgagagaaagggcaagggacaccagagtcgtcctaagccgtacagtgcccctactgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaag 13689396  T
Q  201 aagaaggatgctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggta 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13689395 aagaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaaaagcaacgtctgccctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggca 13689296  T
Q  301 agaagggtca 310  Q
    |||| |||||    
T  13689295 agaaaggtca 13689286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 310
Target Start/End: Original strand, 11233929 - 11234238
Alignment:
Q  1 tcaagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagt 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11233929 tcaagagggcgattggataccaacagcttagagtttttcaggatttggtcaatagctgcaggatctacgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagt 11234028  T
Q  101 gaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaag 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  11234029 gaatgagaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaggatggtcgatgataggcggcctaag 11234128  T
Q  201 aagaaggatgctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggta 300  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  11234129 aagaaggatgctacagagattgtgtgtttcaattgtggtgggaaaggccacaaaagcaacgtctgccctgaagaaatcaagaagtgtgttcggtgtggca 11234228  T
Q  301 agaagggtca 310  Q
    |||| |||||    
T  11234229 agaaaggtca 11234238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 18181296 - 18180988
Alignment:
Q  1 tcaagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagt 100  Q
    ||||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18181296 tcaagagggcgattggg-attaacaactgagagtttttccggatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagt 18181198  T
Q  101 gaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaag 200  Q
    ||||||||||||||| || ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18181197 gaatgagaggaagggtaagggacaacagagtcttcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgaggttaggcggcctaag 18181098  T
Q  201 aagaaggatgctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggta 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18181097 aagaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggcgagaaaggccacgaaagcaatgtctgccctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggca 18180998  T
Q  301 agaagggtca 310  Q
    |||| |||||    
T  18180997 agaaaggtca 18180988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 3 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 12691053 - 12690746
Alignment:
Q  3 aagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtga 102  Q
    |||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||    
T  12691053 aagagggcgattggataccaacagattagagtttttccagatttggtcaatagctgcaggatctatgaagaggatactaaggctcactataagattgtga 12690954  T
Q  103 atgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaa 202  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  12690953 acgagaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccctgctgataaagggaaacagaggatggtcgatgataggcggcctaagaa 12690854  T
Q  203 gaaggatgctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggtaag 302  Q
    |||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| ||||| | ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||    
T  12690853 gaaggatgctaccgagattgtgtgtttcaattgtggtgtgaaagtccacaaaagcaatgtctgtcctgaagagatcaagaagtgtgtccggtgtggcaag 12690754  T
Q  303 aagggtca 310  Q
    ||||||||    
T  12690753 aagggtca 12690746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 3 - 310
Target Start/End: Original strand, 11549820 - 11550127
Alignment:
Q  3 aagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtga 102  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||    
T  11549820 aagagggcgattggataccaacagcttagagtttttccagatttggtcaatagctgcaggatctatgaagaggatactaaggctcactataagattgtga 11549919  T
Q  103 atgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaa 202  Q
    | ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  11549920 acgagaggaaggggaagggacaacagagtcgtcctaagccgtacagtgcccctgctgataaagggaaacagaggatggtcgatgataggcggcctaagaa 11550019  T
Q  203 gaaggatgctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggtaag 302  Q
    |||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| | ||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| |||    
T  11550020 gaaggatgctaccgagattgtgtgtttcaattgtggtgtgaaaggccacaaaagcaatgtctgtcctgaagagatcaagaagtgtgtctggtgtggcaag 11550119  T
Q  303 aagggtca 310  Q
    ||||||||    
T  11550120 aagggtca 11550127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 3 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 14958060 - 14957753
Alignment:
Q  3 aagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtga 102  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| | ||||||||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||    
T  14958060 aagagggtgattggataccaacagattagagtttttccagatttggtcaatagctgcaggatctatgaagaggatactaaggctcactataagattgtga 14957961  T
Q  103 atgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaa 202  Q
    | |||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  14957960 acgagaggaagggcaagggacagtagggtcgtcctaagccgtacagtgcccctgctgataaagggaaacagaggatggtcgatgataggcggcctaagaa 14957861  T
Q  203 gaaggatgctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggtaag 302  Q
    ||||||| || | ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| | ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||    
T  14957860 gaaggatactaccgagattgtgtgtttcaattgtggtgtgaaaggccacaaaagcaatgtctgtcctgaagagatcaagaagtgtgtccggtgtggcaag 14957761  T
Q  303 aagggtca 310  Q
    ||||||||    
T  14957760 aagggtca 14957753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 3 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 9591919 - 9591609
Alignment:
Q  3 aagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtga 102  Q
    ||||||||||| || ||||||||| |  |||||||||  || ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |  ||||| |||||||| || |    
T  9591919 aagagggcgatcggataccaacagatccgagtttttcctgatttggtgaatagctgcagaatctatgaggaggataccagagctcattacaaggttgtta 9591820  T
Q  103 atgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaa 202  Q
    |||||||||||  ||| || ||||||||||| |||||||| || |||||||| | |||||| || || ||||  ||||| |||| |||||||||||||||    
T  9591819 atgagaggaagaccaagggccagcagagtcgccctaagccttatagtgcccctgttgataagggcaagcagagaatggttgatgataggcggcctaagaa 9591720  T
Q  203 gaaggatg---ctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggt 299  Q
    ||||||||   ||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||| || |||||||| ||||||||||||||     
T  9591719 gaaggatgctcctgcagagattgtctgtttcaactgtggcgagaaaggccacaagagcaatgtttgtcctgaagagatcaagaaatgtgtccggtgtggc 9591620  T
Q  300 aagaagggtca 310  Q
    |||||||||||    
T  9591619 aagaagggtca 9591609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 3 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 11984547 - 11984237
Alignment:
Q  3 aagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtga 102  Q
    ||||||||||| || ||||||||  |  |||||||||  || |||||||| || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  11984547 aagagggcgatcggataccaacaaatccgagtttttcctgatttggttaacagttgtaggatctacgaagaagataccaaggctcattacaaggttgtga 11984448  T
Q  103 atgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaa 202  Q
    ||||| |||||  ||| || ||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| || |||||||  |||||||||| ||| |||||||||||    
T  11984447 atgagcggaagaccaagggccagcagagtcgccctaagccctatagtgcccctgctgataagggcaaacagagaatggtcgatgatagacggcctaagaa 11984348  T
Q  203 gaaggatgct---gcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggt 299  Q
    ||||||||||   || ||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||| || |||||||| ||||||||||||||     
T  11984347 gaaggatgctccagctgagattacttgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaatgtttgtactgaagagatcaagaaatgtgtccggtgtggc 11984248  T
Q  300 aagaagggtca 310  Q
    |||||||||||    
T  11984247 aagaagggtca 11984237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 45 - 310
Target Start/End: Original strand, 17703212 - 17703480
Alignment:
Q  45 ttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgt 144  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |  ||||| |||||||| ||||||||| |||||  ||| || ||||||||||| ||||| || |    
T  17703212 ttggtgaacagctgtaggatctatgaagaggataccagagctcattacaaggttgtgaatgagcggaagaccaagggccagcagagtcgccctaaacctt 17703311  T
Q  145 acagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtga 241  Q
    | ||||||||  ||||||| || |||||||  |||||||||| ||||||||| |||||||||||||   |||| || ||||| || ||||| ||||| |     
T  17703312 atagtgcccctactgataagggcaaacagagaatggtcgatgataggcggccaaagaagaaggatgctcctgcggatattgtttgtttcaactgtggcgg 17703411  T
Q  242 gaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggtaagaagggtca 310  Q
    ||||||||||||||| || |  |||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||||||||    
T  17703412 gaaaggccacaagagtaatgtttgtcctgaagagatcaagaaatgtgtccgatgtggcaaaaagggtca 17703480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 45 - 310
Target Start/End: Original strand, 16726198 - 16726466
Alignment:
Q  45 ttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgt 144  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |  ||||| |||||||| ||||||||| | |||  ||| || ||||||||||| ||||| || |    
T  16726198 ttggtgaacagctgtaggatctatgaagaggataccagagctcattacaaggttgtgaatgagcgaaagaccaagggccagcagagtcgccctaaacctt 16726297  T
Q  145 acagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtga 241  Q
    | ||||||||  ||||||| || |||||||  |||||||||| ||||||||| |||||||||||||   |||| || ||||| || ||||| ||||| |     
T  16726298 aaagtgcccctactgataagggcaaacagagaatggtcgatgataggcggccaaagaagaaggatgctcctgcggatattgtttgtttcaactgtggcgg 16726397  T
Q  242 gaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggtaagaagggtca 310  Q
    ||||||||||||||| || |  |||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || ||||||||    
T  16726398 gaaaggccacaagagtaatgtttgtcctgaagagatcaagaaatgtgtccgatgtggcaaaaagggtca 16726466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 45 - 256
Target Start/End: Original strand, 26091533 - 26091747
Alignment:
Q  45 ttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgt 144  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||| || || || ||||| |||||| || ||| |||||||| ||| || |||||||||| |||||||||||| |    
T  26091533 ttggttaataggtgcagaatctatgaagaagacaccaaagctcattacaagataatgagtgagaggaggggtaagggacagcagaatcgtcctaagcctt 26091632  T
Q  145 acagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtga 241  Q
    ||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||  |||| |||| |||| |||| ||  ||||   |||  |||||||| |||| ||| ||||||||    
T  26091633 acagtgctcctgctgacaaaggaaagcagaagatgggtgatgataggaggcccaagaggagagatgctcctgttgagattgtttgctacaagtgtggtga 26091732  T
Q  242 gaaaggccacaagag 256  Q
    |||||||||||||||    
T  26091733 gaaaggccacaagag 26091747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 57 - 270
Target Start/End: Original strand, 15145692 - 15145908
Alignment:
Q  57 tgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 156  Q
    |||||||||| ||| || ||||| ||| |||| |||||| | ||||||||| | |||| ||| || || ||||||||||||||||| || ||| |||| |    
T  15145692 tgcaggatctttgaggaagataccaagactcattacaagattgtgaatgagcgaaaggccaagggtcaacagagtcgtcctaagccttatagtccccctg 15145791  T
Q  157 ctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaa 253  Q
    ||||||| || |||||||   | || |||| |||||| ||||||||||||||||   |||| |||||||| | ||| | ||||||||||||||||||||     
T  15145792 ctgataagggcaaacagagagtagttgatgataggcgccctaagaagaaggatgctcctgctgagattgtcttctttacttgtggtgagaaaggccacag 15145891  T
Q  254 gagcaacgcctgtcctg 270  Q
    ||| || || |||||||    
T  15145892 gagtaatgcttgtcctg 15145908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 45 - 256
Target Start/End: Original strand, 40924552 - 40924766
Alignment:
Q  45 ttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgt 144  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||| || || || ||||| || ||| |  ||| |||||||| ||| || ||||| |||| |||||||||||| |    
T  40924552 ttggttaataggtgcagaatctatgaagaagacaccaaagctcattataagattatgagtgagaggaggggtaagggacaacagaatcgtcctaagcctt 40924651  T
Q  145 acagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtga 241  Q
    ||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||  |||| |||| |||| |||| ||  ||||   |||  |||||||| |||| ||| ||||||||    
T  40924652 acagtgctcctgctgacaaaggaaagcagaagatgggtgatgataggaggcccaagaggagagatgctcctgttgagattgtttgctacaagtgtggtga 40924751  T
Q  242 gaaaggccacaagag 256  Q
    |||||||||||||||    
T  40924752 gaaaggccacaagag 40924766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 53 - 160
Target Start/End: Original strand, 16947215 - 16947322
Alignment:
Q  53 tagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcc 152  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||| |||||| | ||| || |||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  16947215 tagctgcagaatctatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagagaaggggtaagggacagcagagtcgtcctaaaccatacagtgcc 16947314  T
Q  153 cccgctga 160  Q
    || |||||    
T  16947315 cctgctga 16947322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 57 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 14043196 - 14042994
Alignment:
Q  57 tgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 156  Q
    |||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||| | ||||||||| |||| | |||||| || |||||| |||| ||||| || ||||| || |    
T  14043196 tgcaggatttatgaggaggatactaaggctcattacaagattgtgaatgagcggaaagtcaaaggtcaacagagttgtccaaagccttatagtgctcctg 14043097  T
Q  157 ctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaagaaggatgct---gcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaa 253  Q
    ||||||| || |||||||  ||||| ||||  ||||| ||||  ||||| ||||||   |  |||||||| ||||  | |||||||||||||||||||||    
T  14043096 ctgataagggtaaacagagaatggttgatgagaggcgccctagaaagaaagatgctcatgttgagattgtatgctatacttgtggtgagaaaggccacaa 14042997  T
Q  254 gag 256  Q
    |||    
T  14042996 gag 14042994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 57 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 14353226 - 14353024
Alignment:
Q  57 tgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 156  Q
    |||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||| | ||||||||| |||| | |||||| || |||||| |||| ||||| || ||||| || |    
T  14353226 tgcaggatttatgaggaggatactaaggctcattacaagattgtgaatgagcggaaagtcaaaggtcaacagagttgtccaaagccttatagtgctcctg 14353127  T
Q  157 ctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaagaaggatgct---gcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaa 253  Q
    ||||||| || |||||||  ||||| ||||  ||||| ||||  ||||| ||||||   |  |||||||| ||||  | |||||||||||||||||||||    
T  14353126 ctgataagggtaaacagagaatggttgatgagaggcgccctagaaagaaagatgctcatgttgagattgtatgctatacttgtggtgagaaaggccacaa 14353027  T
Q  254 gag 256  Q
    |||    
T  14353026 gag 14353024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 45 - 256
Target Start/End: Original strand, 26115325 - 26115539
Alignment:
Q  45 ttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgt 144  Q
    |||||||| || || || ||||||||||| || || || ||||| |||||| || ||| |||||||| ||| || ||| | |||| |||||||||||| |    
T  26115325 ttggttaacaggtgtagaatctatgaagaagacaccaaagctcattacaagataatgagtgagaggaggggtaagggataacagaatcgtcctaagcctt 26115424  T
Q  145 acagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaagaaggatgct---gcagagattgtgtgcttcaattgtggtga 241  Q
    ||||||| || ||||| ||||| || |||||||||   |||| |||| |||| |||| ||  ||||||   || |||||||| || | ||| ||||||||    
T  26115425 acagtgctcctgctgacaaaggaaagcagaagatgagtgatgataggaggcccaagaggagagatgctccggctgagattgtttgttacaagtgtggtga 26115524  T
Q  242 gaaaggccacaagag 256  Q
    |||||||||||||||    
T  26115525 gaaaggccacaagag 26115539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 53 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 13004971 - 13004865
Alignment:
Q  53 tagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcc 152  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||  ||| |||  ||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  13004971 tagctgcagaatctatgaagaagattcaaaggctcattacaaggtgatgagtgaacggaggggcaagggacaacagagtcgtcctaagccgtacagcgcc 13004872  T
Q  153 cccgctg 159  Q
    || ||||    
T  13004871 cctgctg 13004865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 48 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 49155812 - 49155601
Alignment:
Q  48 gttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtaca 147  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| || || || ||||| || ||| |  ||| |||||||| ||| || ||||| |||| |||||||||||| ||||    
T  49155812 gttaatagatgcagaatctatgaagaagacaccaaagctcattataagattatgagtgagaggaggggtaagggacaacagaatcgtcctaagccttaca 49155713  T
Q  148 gtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaa 244  Q
    |||| || ||||| ||||| || |||| |||||  || | |||| |||| |||| ||  ||||   |||  |||||||| |||| ||| |||||||||||    
T  49155712 gtgctcctgctgacaaaggaaagcagaggatgggtgaggataggaggcccaagaggagagatgctcctgttgagattgtttgctacaagtgtggtgagaa 49155613  T
Q  245 aggccacaagag 256  Q
    ||||||||||||    
T  49155612 aggccacaagag 49155601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 53 - 160
Target Start/End: Original strand, 14260989 - 14261096
Alignment:
Q  53 tagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcc 152  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||  | | |||| | || || || |||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  14260989 tagctgcaggatatatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatcagtgagcgcaaaggtaagggacagtagagtcgtccgaagccgtatagtgcc 14261088  T
Q  153 cccgctga 160  Q
    || |||||    
T  14261089 cctgctga 14261096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 12460133 - 12459925
Alignment:
Q  54 agctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgccc 153  Q
    ||||||||||| ||||| || || || || ||||| ||||||||  ||| |||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| |||| ||| |    
T  12460133 agctgcaggatatatgaggaagacacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagaggaggggtaagggacagcagagtcgtcctaagccttacaatgctc 12460034  T
Q  154 ccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggcca 250  Q
      ||||| || || || ||||| |||   |||| |||| |||| |||| ||  ||||   |||| |||||||| || | ||| |||||||| ||||||||    
T  12460033 ttgctgacaagggaaagcagaaaatgaatgatgataggaggcccaagaggagagatgttcctgctgagattgtctgttacaagtgtggtgaaaaaggcca 12459934  T
Q  251 caagagcaa 259  Q
    |||||||||    
T  12459933 caagagcaa 12459925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 53 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 19150517 - 19150314
Alignment:
Q  53 tagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcc 152  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||  ||| |||| | |  || || ||||||||||||||||| |||||||  ||||||    
T  19150517 tagctgcaggatatatgaagaggataccaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgcataggtaagggacagcagagtcgtccgaagccgtttagtgcc 19150418  T
Q  153 cccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggcc 249  Q
    || ||||| || || || |||| | ||   ||||  ||| ||||||||| ||  ||||   || | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  19150417 cctgctgacaagggtaagcagaggttgaatgatgagaggaggcctaagaggagagatgctcctactgatattgtttgcttcaagtgtggtgagaaaggcc 19150318  T
Q  250 acaa 253  Q
    ||||    
T  19150317 acaa 19150314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 53 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 20749916 - 20749713
Alignment:
Q  53 tagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcc 152  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||  ||| |||| | |  || || ||||||||||||||||| |||||||  ||||||    
T  20749916 tagctgcaggatatatgaagaggataccaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgcataggtaagggacagcagagtcgtccgaagccgtttagtgcc 20749817  T
Q  153 cccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggcc 249  Q
    || ||||| || || || |||| | ||   ||||  ||| ||||||||| ||  ||||   || | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  20749816 cctgctgacaagggtaagcagaggttgaatgatgagaggaggcctaagaggagagatgctcctactgatattgtttgcttcaagtgtggtgagaaaggcc 20749717  T
Q  250 acaa 253  Q
    ||||    
T  20749716 acaa 20749713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 61 - 256
Target Start/End: Original strand, 13965419 - 13965617
Alignment:
Q  61 ggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctga 160  Q
    |||| |||||||| || || || ||||| ||| || || ||| |||||||| ||| || ||||| || | |||||||||||| |||||||| || |||||    
T  13965419 ggatttatgaagaagacaccaaagctcattaccagataatgagtgagaggaggggtaagggacaacataatcgtcctaagccttacagtgctcctgctga 13965518  T
Q  161 taaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagag 256  Q
     ||||| || ||||||||||  |||| |||| |||| |||| ||  ||||   |||| |||||||  |||| ||| ||||||||||||| |||||||||    
T  13965519 caaaggaaagcagaagatgggtgatgataggaggcccaagaggagagatgctcctgctgagattgattgctacaagtgtggtgagaaagaccacaagag 13965617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 53 - 151
Target Start/End: Original strand, 12712406 - 12712504
Alignment:
Q  53 tagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgc 151  Q
    ||||||||| |||||||| || ||| | |||||||| | ||||||  ||| |||  ||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12712406 tagctgcagaatctatgaggaagattcaaaggctcattccaaggtgatgagtgaacggaggggcaagggacaacagagtcgtcctaagccgtacagtgc 12712504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 54 - 160
Target Start/End: Original strand, 12798248 - 12798354
Alignment:
Q  54 agctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgccc 153  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||  ||| |||| | |  ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |    
T  12798248 agctgtaggatttatgaagaggatacgaaagctctttacaaggtgatgagtgagcgcagaggcaagggacagcagagtcgtccgaagccgtatagtgctc 12798347  T
Q  154 ccgctga 160  Q
    | |||||    
T  12798348 ctgctga 12798354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 54 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 13024849 - 13024641
Alignment:
Q  54 agctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgccc 153  Q
    ||||||||||| ||||| || || || || ||||| ||||||||  ||| |||||||| ||| || |||||| ||| ||||||||| || |||||||| |    
T  13024849 agctgcaggatatatgaggaagacaccaaagctcattacaaggtgatgagtgagaggaggggtaagggacagtagaatcgtcctaaaccttacagtgctc 13024750  T
Q  154 ccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggcca 250  Q
    | ||||| |||||||| |||| ||||   |||| |||| |||| |||| ||  ||||   |||| || ||||| || | ||| |||||||| ||||||||    
T  13024749 ctgctgacaaagggaagcagaggatgaatgatgataggaggcccaagaggagagatgctcctgctgaaattgtttgttacaagtgtggtgaaaaaggcca 13024650  T
Q  251 caagagcaa 259  Q
    ||| |||||    
T  13024649 caaaagcaa 13024641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 120 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 14145100 - 14145060
Alignment:
Q  120 ggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctga 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14145100 ggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccctgctga 14145060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 61 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 15628021 - 15627910
Alignment:
Q  61 ggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctga 160  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||  |||||||||||||  | ||  | || || |||||||| ||||| |||||||| || |||||    
T  15628021 ggatctatgaggaggatacgaaagctcattacaaggttatgaatgagaggaaaagtaagagtcaacaaagtcgtccaaagccttacagtgctcctgctga 15627922  T
Q  161 taaagggaaaca 172  Q
    ||| || |||||    
T  15627921 taagggtaaaca 15627910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 54 - 160
Target Start/End: Original strand, 11385173 - 11385279
Alignment:
Q  54 agctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgccc 153  Q
    |||||||| |||||||| || ||| | || ||||| |||||| |  ||| |||| ||| ||| || ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11385173 agctgcagaatctatgaggaagattcaaaagctcattacaagatgatgagtgagcggaggggtaagggacaacagagtcatcctaagccgtacagtgccc 11385272  T
Q  154 ccgctga 160  Q
    | |||||    
T  11385273 ctgctga 11385279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 57 - 163
Target Start/End: Original strand, 14283121 - 14283227
Alignment:
Q  57 tgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 156  Q
    |||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||  ||| |||||| | |   || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| |    
T  14283121 tgcaggatctatgaggaggacactaaagctcattacaaggtgatgagtgagagaaggaataagggacagcagagtcgcccgaagccgtatagtgcccctg 14283220  T
Q  157 ctgataa 163  Q
    |||||||    
T  14283221 ctgataa 14283227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 216 - 256
Target Start/End: Original strand, 14261155 - 14261195
Alignment:
Q  216 gagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagag 256  Q
    |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14261155 gagattatttgcttcaagtgtggtgagaaaggccacaagag 14261195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 225 - 261
Target Start/End: Original strand, 15099521 - 15099557
Alignment:
Q  225 tgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacg 261  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15099521 tgcttcaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaacg 15099557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 282; Significance: 1e-158; HSPs: 51)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 1 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 13255874 - 13255565
Alignment:
Q  1 tcaagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13255874 tcaagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctacgaagaggacacgaaggctcactacaaggtagt 13255775  T
Q  101 gaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaag 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13255774 gaatgagaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgacaaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaag 13255675  T
Q  201 aagaaggatgctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggta 300  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13255674 aggaaggatgctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcttgttctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggta 13255575  T
Q  301 agaagggtca 310  Q
    ||||||||||    
T  13255574 agaagggtca 13255565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 1 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 12889893 - 12889584
Alignment:
Q  1 tcaagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagt 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12889893 tcaagagggcgattggataccaacagctgagagtttttcaggatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagt 12889794  T
Q  101 gaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaag 200  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12889793 gaatgaaaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgacaaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaag 12889694  T
Q  201 aagaaggatgctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggta 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12889693 aagaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggta 12889594  T
Q  301 agaagggtca 310  Q
    ||||||||||    
T  12889593 agaagggtca 12889584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 1 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 43165859 - 43165550
Alignment:
Q  1 tcaagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagt 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  43165859 tcaagagggcgattggataccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaggaggataccaaggctcactacaaggtagt 43165760  T
Q  101 gaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaag 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43165759 gaatgagaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgacaaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaag 43165660  T
Q  201 aagaaggatgctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggta 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43165659 aagaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggta 43165560  T
Q  301 agaagggtca 310  Q
    ||||||||||    
T  43165559 agaagggtca 43165550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 1 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 10008784 - 10008475
Alignment:
Q  1 tcaagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10008784 tcaagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttagttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagt 10008685  T
Q  101 gaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaag 200  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10008684 gaatgagaggaagggtaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccctgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaag 10008585  T
Q  201 aagaaggatgctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggta 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  10008584 aagaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaaaagcaacgtctgccctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggca 10008485  T
Q  301 agaagggtca 310  Q
    |||| |||||    
T  10008484 agaaaggtca 10008475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 3 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 3689125 - 3688818
Alignment:
Q  3 aagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtga 102  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3689125 aagagggcgattggataccaacagctgagagtttttcaggatttggttaatagctgcaggatctacgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtga 3689026  T
Q  103 atgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaa 202  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3689025 atgagaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgacaagggtaaacagaagatggtcgacgttaggcggcctaagaa 3688926  T
Q  203 gaaggatgctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggtaag 302  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3688925 gaaggatgctgctgagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgttctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggtaag 3688826  T
Q  303 aagggtca 310  Q
    ||||||||    
T  3688825 aagggtca 3688818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 3 - 310
Target Start/End: Original strand, 20059002 - 20059309
Alignment:
Q  3 aagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtga 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20059002 aagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctacgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtga 20059101  T
Q  103 atgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaa 202  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20059102 atgaaaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccctgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaa 20059201  T
Q  203 gaaggatgctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggtaag 302  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20059202 gaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaaaagcaacgtctgccctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggcaag 20059301  T
Q  303 aagggtca 310  Q
    || |||||    
T  20059302 aaaggtca 20059309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 10909394 - 10909085
Alignment:
Q  1 tcaagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10909394 tcaagagggcgattgggtaccaacagcttagagtttttcaggacttagttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagt 10909295  T
Q  101 gaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaag 200  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10909294 gaatgagaggaagggtaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccctgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaag 10909195  T
Q  201 aagaaggatgctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggta 300  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  10909194 aagaaggatgttgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaaaagcaacgtctgccctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggca 10909095  T
Q  301 agaagggtca 310  Q
    |||| |||||    
T  10909094 agaaaggtca 10909085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 16638957 - 16638648
Alignment:
Q  1 tcaagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagt 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16638957 tcaagagggcgattggataccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaggaggataccaaggctcactacaaggtagt 16638858  T
Q  101 gaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaag 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16638857 gaatgagaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgacaaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaag 16638758  T
Q  201 aagaaggatgctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggta 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |    
T  16638757 aagaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaagaaatcaagaagtgtgcccggtgtggca 16638658  T
Q  301 agaagggtca 310  Q
    |||| |||||    
T  16638657 agaaaggtca 16638648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 310
Target Start/End: Original strand, 16753647 - 16753956
Alignment:
Q  1 tcaagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagt 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16753647 tcaagagggcgattgggtatcaacagctgagagtttttctagatttggttaacagctgcaggatctatgaggaggataccaaggctcactacaaggtagt 16753746  T
Q  101 gaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaag 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16753747 gaatgagaggaagggcaagggacagcatagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgacaaagggaaacaaaagatggtcgatgttaggcggcctaag 16753846  T
Q  201 aagaaggatgctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggta 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16753847 aagaaggatgctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtctggtgtggta 16753946  T
Q  301 agaagggtca 310  Q
    ||||||||||    
T  16753947 agaagggtca 16753956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 48428631 - 48428322
Alignment:
Q  1 tcaagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagt 100  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  48428631 tcaagagggcgattggataccagcagctgagagtttttcaggatttggttaacagctgcaggatctatgaggaggataccaaggctcactacaaggtagt 48428532  T
Q  101 gaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaag 200  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48428531 gaatgaaaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgacaaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaag 48428432  T
Q  201 aagaaggatgctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggta 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48428431 aagaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggta 48428332  T
Q  301 agaagggtca 310  Q
    ||||||||||    
T  48428331 agaagggtca 48428322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 3 - 310
Target Start/End: Original strand, 15586340 - 15586647
Alignment:
Q  3 aagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtga 102  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15586340 aagagggcgattggataccaacagctgagagtttttcaggatttggttaatagctgcaggatctacaaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtga 15586439  T
Q  103 atgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaa 202  Q
    |||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  15586440 atgaaaggaagggcaagggacaacaaagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgacaaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagag 15586539  T
Q  203 gaaggatgctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggtaag 302  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15586540 gaaggatgctgcggagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgttctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggtaag 15586639  T
Q  303 aagggtca 310  Q
    ||||||||    
T  15586640 aagggtca 15586647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 3 - 310
Target Start/End: Original strand, 26790361 - 26790668
Alignment:
Q  3 aagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtga 102  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26790361 aagagggcgattgggtaccaacaactgagagtttttcaggatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtga 26790460  T
Q  103 atgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaa 202  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26790461 atgaaaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccaatgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaa 26790560  T
Q  203 gaaggatgctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggtaag 302  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26790561 gaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctaccctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggcaag 26790660  T
Q  303 aagggtca 310  Q
    || |||||    
T  26790661 aaaggtca 26790668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 258; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 6603919 - 6603614
Alignment:
Q  1 tcaagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagt 100  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6603919 tcaagagggcgatcgggtatcaacagctgagagtttttccagatttggttaacagctgtaggatctatgaggaggataccaaggctcactacaaggtagt 6603820  T
Q  101 gaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaag 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6603819 gaatgagaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgacaaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaag 6603720  T
Q  201 aagaaggatgctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggta 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6603719 aagaaggatgctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaactgtgtccggtgtggta 6603620  T
Q  301 agaagg 306  Q
    ||||||    
T  6603619 agaagg 6603614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 3 - 310
Target Start/End: Original strand, 15345193 - 15345500
Alignment:
Q  3 aagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtga 102  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15345193 aagagggcgattggataccaacagctgagagtttttcaggatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtga 15345292  T
Q  103 atgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaa 202  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15345293 atgaaaggaagggcaagggacagcagagtcctcctaagccgtacagtgcccccgctgacaaaggtaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaa 15345392  T
Q  203 gaaggatgctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggtaag 302  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15345393 gaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaaaagcaacgtctgccctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggcaag 15345492  T
Q  303 aagggtca 310  Q
    || |||||    
T  15345493 aaaggtca 15345500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 1 - 310
Target Start/End: Original strand, 5421876 - 5422185
Alignment:
Q  1 tcaagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagt 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5421876 tcaagagggcgattgggtatcaacagctgagagtttttccagatttggttaacagctgcaggatctatgaggaggataccaaggctcactacaaggtagt 5421975  T
Q  101 gaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaag 200  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5421976 gaacgagaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgacaaaggtaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaag 5422075  T
Q  201 aagaaggatgctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggta 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5422076 aagaaggatgctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagtaacgcctgccctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggta 5422175  T
Q  301 agaagggtca 310  Q
    |||| |||||    
T  5422176 agaaaggtca 5422185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 248; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 3 - 310
Target Start/End: Original strand, 53381967 - 53382273
Alignment:
Q  3 aagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtga 102  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  53381967 aagagggcgattgggtatcaacagctgagagtttttccagatttggttaacagctgcaggatctatgagaaggataccaaggctcactacaaggtagtga 53382066  T
Q  103 atgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaa 202  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53382067 atgagaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgccccc-ctgacaaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaa 53382165  T
Q  203 gaaggatgctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggtaag 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53382166 gaaggatgctgcagagattgtgtgcttcaactgtggcgagaaaggccacaagagcaacgtctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggtaag 53382265  T
Q  303 aagggtca 310  Q
    ||||||||    
T  53382266 aagggtca 53382273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 310
Target Start/End: Original strand, 15713002 - 15713311
Alignment:
Q  1 tcaagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15713002 tcaagagggcgattgggtaccaacaactgagagtttttccggatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagt 15713101  T
Q  101 gaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaag 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  15713102 gaatgagaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaagcagaggatggtcgatgataggcggcctaag 15713201  T
Q  201 aagaaggatgctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggta 300  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  15713202 aagaaggatgctacagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaaaagcaacgtctgccctgaagaaatcaagaagtgtgttcggtgtggca 15713301  T
Q  301 agaagggtca 310  Q
    |||| |||||    
T  15713302 agaaaggtca 15713311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 3 - 310
Target Start/End: Original strand, 5110357 - 5110664
Alignment:
Q  3 aagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtga 102  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5110357 aagagggcgattggataccaacagctgagagtttttcaggatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtga 5110456  T
Q  103 atgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaa 202  Q
    |||| ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5110457 atgaaaggaagggcaagggacaatagagtcgtcctaagccgtacagtgtccccgctgacaaaggtaaacagaagatggtcgatgttaggcagcctaagaa 5110556  T
Q  203 gaaggatgctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggtaag 302  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  5110557 gaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaaaagcaacgtctgccctgaggaaattaagaagtgtgtccggtgtggcaag 5110656  T
Q  303 aagggtca 310  Q
    || |||||    
T  5110657 aaaggtca 5110664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 6597239 - 6596969
Alignment:
Q  1 tcaagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagt 100  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6597239 tcaagagggcgatcgggtatcaacagctgagagtttttccagatttggttaacagctgcaggatctatgaggaggataccaaggctcactacaaggtagt 6597140  T
Q  101 gaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaag 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6597139 gaatgagaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgacaaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaag 6597040  T
Q  201 aagaaggatgctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctga 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6597039 aagaaggatgctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctga 6596969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 310
Target Start/End: Original strand, 15399464 - 15399773
Alignment:
Q  1 tcaagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagt 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| ||||    
T  15399464 tcaagagggcgattggataccaacagcttagagtttttcagaatttggtcaatagctgcaggatctaggaagaggataccaaggttcactacaagatagt 15399563  T
Q  101 gaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaag 200  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15399564 gaacgagaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgataggcggcctaag 15399663  T
Q  201 aagaaggatgctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggta 300  Q
    |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15399664 aagaaggatgctactgagattgtgtgtttcaattgtggtgggaaaggccacaaaagcaatgtctgccctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggca 15399763  T
Q  301 agaagggtca 310  Q
    |||| |||||    
T  15399764 agaaaggtca 15399773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 3 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 24186372 - 24186065
Alignment:
Q  3 aagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtga 102  Q
    |||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||    
T  24186372 aagagggcgattggataccaacagattagagtttttccagaattggtcaatagctgcaggatctatgaagaggatactaaggctcactataagattgtga 24186273  T
Q  103 atgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaa 202  Q
    | ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  24186272 acgagtggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccacgctgataaagggaaacagaggatggtcgatgataggcggcctaagaa 24186173  T
Q  203 gaaggatgctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggtaag 302  Q
    |||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| | ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||    
T  24186172 gaaggatgctactgagattgtgtgtttcaattgtggtgtgaaaggccacaaaagcaatgtctgtcctgaagagatcaagaagtgtgtccggtgtggcaag 24186073  T
Q  303 aagggtca 310  Q
    ||||||||    
T  24186072 aagggtca 24186065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 15359236 - 15358992
Alignment:
Q  1 tcaagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagt 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  15359236 tcaagagggcgattggataccaacagcttagagtttttcaggatttggtcaatagctgcaggatctatgaagaggataccaaggctcactacaagatagt 15359137  T
Q  101 gaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaag 200  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15359136 gaacgagaggaagggcaagggacagcagagtcgccctaagccgtacagtgcccccgctgataaagtgaaacagaagatggtcgatgataggcggcctaag 15359037  T
Q  201 aagaaggatgctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaa 245  Q
    ||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  15359036 aagaaggatgctattgagattgtgtgtttcaattgtggtgggaaa 15358992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 3 - 310
Target Start/End: Original strand, 16803892 - 16804202
Alignment:
Q  3 aagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtga 102  Q
    ||||||||||| |  ||||||||| |  |||||||||  || ||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  16803892 aagagggcgatcgaataccaacagatccgagtttttcctgatttggttaatagctgcagaatttatgaggaggataccaaggctcattacaaggttgtga 16803991  T
Q  103 atgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaa 202  Q
    ||||| |||||  ||| || ||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| || |||||||  |||||||||| |||||||||||||||    
T  16803992 atgagcggaagaccaagggccagcagagtcgccctaagccctatagtgcccctgctgataagggcaaacagagaatggtcgatgataggcggcctaagaa 16804091  T
Q  203 gaaggatgct---gcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggt 299  Q
    ||||||||||   || ||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| || |||||||| ||||||||||||||     
T  16804092 gaaggatgctccagctgagattacttgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaatgtttgtcctgaagagatcaagaaatgtgtccggtgtggc 16804191  T
Q  300 aagaagggtca 310  Q
    ||||| |||||    
T  16804192 aagaaaggtca 16804202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 3 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 11861538 - 11861228
Alignment:
Q  3 aagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtga 102  Q
    |||||||| || || ||||||||| |  |||||||||  || ||||| |||||||| || |||||||| || || || |||||||| |||||||| ||||    
T  11861538 aagagggcaatcggataccaacagatctgagtttttcctgagttggtgaatagctgtagaatctatgaggaagacaccaaggctcattacaaggttgtga 11861439  T
Q  103 atgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaa 202  Q
    ||||| ||||| | || || || |||||||  |||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||| |||||||||||||||    
T  11861438 atgagtggaagagtaagggccaccagagtcaccctaagccctatagtgcccctgctgataaaggcaaacagagaatggtcgatgataggcggcctaagaa 11861339  T
Q  203 gaaggatg---ctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggt 299  Q
    ||||||||   |||| |||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| |||||  | ||||| ||| || ||||||||    
T  11861338 gaaggatgctcctgcggagattgtctatttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaatgtttgtccagaggaggtgaagaaatgtttctggtgtggt 11861239  T
Q  300 aagaagggtca 310  Q
    |||||||||||    
T  11861238 aagaagggtca 11861228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 16695351 - 16695039
Alignment:
Q  1 tcaagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagt 100  Q
    ||||||||||||| || ||||||||| |  ||||||| |  || || || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||    
T  16695351 tcaagagggcgatcggataccaacagatccgagttttccctgatttagtgaatagctgcaggatctatgaggaggatactaaggctcattacaaggttgt 16695252  T
Q  101 gaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaag 200  Q
     |||||| |||||  ||| || || |||||||| || ||||| || |||||||| ||||||||  | |||||||  |||||||||| |||||||||||||    
T  16695251 aaatgagtggaagaccaagggccatcagagtcgcccgaagccttatagtgcccctgctgataagtgcaaacagagaatggtcgatgataggcggcctaag 16695152  T
Q  201 aagaaggatgct---gcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtg 297  Q
    ||||||||||||   || ||||||   || ||||||||||| |||||||||| |||||| || |  ||||| | ||| |||||||| |||||||||||||    
T  16695151 aagaaggatgctccagctgagattacttgtttcaattgtggcgagaaaggccgcaagagtaatgtttgtccggtggagatcaagaaatgtgtccggtgtg 16695052  T
Q  298 gtaagaagggtca 310  Q
    | |||||||||||    
T  16695051 gcaagaagggtca 16695039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 45 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 12502076 - 12501808
Alignment:
Q  45 ttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgt 144  Q
    ||||| |||||||| || |||||||| |||||||| | |||||| |||||||| ||||||||| |||||  ||| || ||| ||||||| |||||||| |    
T  12502076 ttggtgaatagctgtagaatctatgaggaggataccagggctcattacaaggttgtgaatgagcggaagaccaagggccagtagagtcgccctaagccct 12501977  T
Q  145 acagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtga 241  Q
    | |||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||| |  || |||||||||||||||||||   |||| ||||||   || ||||||||||| ||    
T  12501976 atagtgcccctgctgataagggaaaacagaggatggtcgaggaaagacggcctaagaagaaggatgttcctgctgagattacctgtttcaattgtggcga 12501877  T
Q  242 gaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggtaagaagggtca 310  Q
    |||||||||||||||||| |  |||||||||||  | ||||| ||| |||||||||| |||||||||||    
T  12501876 gaaaggccacaagagcaatgtttgtcctgaggaggtaaagaaatgtttccggtgtggcaagaagggtca 12501808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 310
Target Start/End: Original strand, 23414733 - 23415045
Alignment:
Q  1 tcaagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagt 100  Q
    |||||||||| || || |||||||||||  ||||||| |  || || || |||| |||||| ||||| || |||||||| ||||||||  ||||||| ||    
T  23414733 tcaagagggcaatcggataccaacagctccgagttttccctgatttagtgaatacctgcagaatctacgaggaggatactaaggctcatgacaaggttgt 23414832  T
Q  101 gaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaag 200  Q
    ||||||| |||||  ||| || ||  ||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| || |||||||  |||||||||| |||||||||||||    
T  23414833 gaatgagcggaagaccaagggccaatagagtcgccctaagccttatagtgcccctgctgataagggcaaacagagaatggtcgatgataggcggcctaag 23414932  T
Q  201 aagaaggatg---ctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtg 297  Q
    ||||||||||   |||| |||||||| || ||||| | ||| ||||||||||||||||| || |  |||||| | || |||||||| |||||||||||||    
T  23414933 aagaaggatgctcctgcggagattgtctgtttcaactatggcgagaaaggccacaagagtaatgtttgtcctaaagagatcaagaaatgtgtccggtgtg 23415032  T
Q  298 gtaagaagggtca 310  Q
      |||||||||||    
T  23415033 acaagaagggtca 23415045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 3 - 259
Target Start/End: Original strand, 23078962 - 23079221
Alignment:
Q  3 aagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtga 102  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| |  |||||||    || ||||| || || |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | ||||    
T  23078962 aagagggcaattaggtaccaacagattcgagttttctccgagttggtgaacagttgcaggatttatgaagaggataccaaggctcattacaagattgtga 23079061  T
Q  103 atgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaa 202  Q
    ||||| |||||   || || ||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||| | ||| ||||| | |||    
T  23079062 atgagcggaagactaagggccagcagagtcgccctaagccttatagtgcccctgctgataagggaaaacagaggatggtcgaggatagacggccaaggaa 23079161  T
Q  203 gaaggatg---ctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaa 259  Q
    ||||||||   |||| | |||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23079162 gaaggatgctcctgctgtgattgtttgttttaattgtggtgagaaaggccacaagagcaa 23079221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 57 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 17497822 - 17497606
Alignment:
Q  57 tgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 156  Q
    ||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||| | ||||||||| |||||   || || ||||||||||| |||||||| |||||| |||  |    
T  17497822 tgcaggatctaggaggaggataccaaggctcattacaagattgtgaatgagcggaagactaagggtcagcagagtcgccctaagccttacagtacccttg 17497723  T
Q  157 ctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaa 253  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| | |||   |||||||||||||||||   ||||||||||||| || || | |||||||||||||||||||||    
T  17497722 ctgataagggcaaacagaagatggtcgaagatagatagcctaagaagaaggatgctcctgcagagattgtctgttttacttgtggtgagaaaggccacaa 17497623  T
Q  254 gagcaacgcctgtcctg 270  Q
    ||| || || |||||||    
T  17497622 gagtaatgcttgtcctg 17497606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 45 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 10409121 - 10408907
Alignment:
Q  45 ttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgt 144  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||| || || || ||||| |||||| || ||| |||||||| ||| || ||||| ||||||||||||||||| |    
T  10409121 ttggttaataggtgcagaatctatgaagaagacaccaaagctcattacaagataatgagtgagaggaggggtaagggacaccagagtcgtcctaagcctt 10409022  T
Q  145 acagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaagaaggatgct---gcagagattgtgtgcttcaattgtggtga 241  Q
    ||||||| || ||||| || || |||||||||||||  |||| |||| |||| |||| ||  ||||||   || |||||||| || | ||| ||||||||    
T  10409021 acagtgctcctgctgacaagggtaaacagaagatgggtgatgataggaggcccaagaggagagatgctccagctgagattgtttgttacaaatgtggtga 10408922  T
Q  242 gaaaggccacaagag 256  Q
    |||||||||||||||    
T  10408921 gaaaggccacaagag 10408907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 57 - 310
Target Start/End: Original strand, 14578420 - 14578676
Alignment:
Q  57 tgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 156  Q
    |||||||| ||||| || ||||| |||||||| |||||| | ||||||||| |||||| ||| || |||||||| ||||||||||| |||| ||| || |    
T  14578420 tgcaggatttatgaggatgataccaaggctcattacaagattgtgaatgagcggaaggccaagggtcagcagagccgtcctaagccttacaatgctcctg 14578519  T
Q  157 ctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaa 253  Q
    | ||||| || |||||||  ||||| |||| |||||| ||||  ||||| ||||   |||  |||||||||||||    |||||||||||||||||||||    
T  14578520 ccgataagggtaaacagagaatggttgatgataggcgccctagaaagaaagatgctcctgttgagattgtgtgctatgcttgtggtgagaaaggccacaa 14578619  T
Q  254 gagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggtaagaagggtca 310  Q
    ||| || || ||||||| |||  | |||| |||| |||| ||||||||||| |||||    
T  14578620 gagtaatgcttgtcctggggatgtgaagaggtgtttccgttgtggtaagaaaggtca 14578676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 45 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 15066214 - 15065946
Alignment:
Q  45 ttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgt 144  Q
    ||||| || ||||| || || ||||| || ||||| |||||||| |||||| | ||||||||| |||||   || || ||||||||||| |||||||| |    
T  15066214 ttggtgaacagctgtagaatttatgaggaagataccaaggctcattacaagatggtgaatgagcggaagactaagggccagcagagtcgccctaagccct 15066115  T
Q  145 acagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtga 241  Q
    | ||| |||| |||||||| || |||||||  |||||||||| ||| ||||| | |||||||||||   |||| | |||||| || || |||||||||||    
T  15066114 atagttcccctgctgataagggcaaacagagaatggtcgatgatagacggccaaggaagaaggatgctcctgctgcgattgtctgttttaattgtggtga 15066015  T
Q  242 gaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggtaagaagggtca 310  Q
    |||||||||||||||||| |  ||||| || ||  | || |  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  15066014 gaaaggccacaagagcaatgtttgtccagaagaggtaaaaagatgtttccggtgtggtaagaagggtca 15065946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 45 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 28757472 - 28757258
Alignment:
Q  45 ttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgt 144  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||| || || || ||||| |||||| || ||| |||||||| ||| || ||||| |||| |||||||||||| |    
T  28757472 ttggttaataggtgcagaatctatgaagaagacaccaaagctcattacaagataatgagtgagaggaggggtaagggacaacagaatcgtcctaagcctt 28757373  T
Q  145 acagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtga 241  Q
    ||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||  |||| |||| |||| |||| ||  ||||   |||  |||||||| |||| ||| ||||||||    
T  28757372 acagtgctcctgctgacaaaggaaagcagaagatgggtgatgataggaggcccaagaggagagatgctcctgttgagattgtttgctacaagtgtggtga 28757273  T
Q  242 gaaaggccacaagag 256  Q
    |||||||||||||||    
T  28757272 gaaaggccacaagag 28757258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 57 - 270
Target Start/End: Original strand, 14873584 - 14873800
Alignment:
Q  57 tgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 156  Q
    |||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||| | ||||||| | |||||   || || || |||||||| |||||||| || | |||||  |    
T  14873584 tgcaggatatatgaggaggataccaaggctcattacaagattgtgaatgtgcggaagactaagggccaacagagtcgccctaagccctataatgcccttg 14873683  T
Q  157 ctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaagaaggatgc---tgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaa 253  Q
    ||||||| || ||||||| ||||||||| | ||| ||||| | ||||||||||||   ||| |||||||| || || |||||||||||||||||||| ||    
T  14873684 ctgataagggcaaacagaggatggtcgaggatagacggccgaggaagaaggatgctcatgctgagattgtctgttttaattgtggtgagaaaggccataa 14873783  T
Q  254 gagcaacgcctgtcctg 270  Q
    |||||| || |||||||    
T  14873784 gagcaatgcttgtcctg 14873800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 57 - 270
Target Start/End: Original strand, 12843102 - 12843318
Alignment:
Q  57 tgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 156  Q
    |||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||| | ||||||||| | || | |||||| |||||||||||||| ||||  || ||||| || |    
T  12843102 tgcaggatttatgaggaggatactaaggctcattacaagattgtgaatgagcgaaaagtcaaaggtcagcagagtcgtccaaagctttatagtgctcctg 12843201  T
Q  157 ctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaa 253  Q
    ||||||| || |||||||  ||| | ||||  |||||||||| |||||| ||||   |||  |||||||| ||||  | |||||||||||||||||||||    
T  12843202 ctgataagggcaaacagagaatgattgatgagaggcggcctaggaagaaagatgctcctgttgagattgtctgctatacttgtggtgagaaaggccacaa 12843301  T
Q  254 gagcaacgcctgtcctg 270  Q
    ||| || || |||||||    
T  12843302 gagtaatgcttgtcctg 12843318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 45 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 47127097 - 47126883
Alignment:
Q  45 ttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgt 144  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||| || || || ||||| || ||| |  ||| |||||||| ||| || ||||| |||| |||||||||||| |    
T  47127097 ttggttaataggtgcagaatctatgaagaagacaccaaagctcattataagattatgagtgagaggaggggtaagggacaacagaatcgtcctaagcctt 47126998  T
Q  145 acagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtga 241  Q
    ||||||| || ||||| ||||| || |||| |||||  |||| |||| |||| |||| ||  ||||   |||  |||||||| |||| ||| ||||||||    
T  47126997 acagtgctcctgctgacaaaggaaagcagaggatgggtgatgataggaggcccaagaggagagatgctcctgttgagattgtttgctacaagtgtggtga 47126898  T
Q  242 gaaaggccacaagag 256  Q
    |||||||||||||||    
T  47126897 gaaaggccacaagag 47126883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 3 - 58
Target Start/End: Original strand, 5108487 - 5108542
Alignment:
Q  3 aagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctg 58  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5108487 aagagggcgattggataccaacagctgagagtttttcaggatttggttaatagctg 5108542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 57 - 166
Target Start/End: Original strand, 16326695 - 16326804
Alignment:
Q  57 tgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 156  Q
    |||||||| |||||||| || || || ||||| |||||| || ||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| || |    
T  16326695 tgcaggatttatgaagaagacaccaaagctcattacaagataatgagtgagaggaggggcaagggacagcagagtcgtcctaagcctgacagtgctcctg 16326794  T
Q  157 ctgataaagg 166  Q
    |||| |||||    
T  16326795 ctgacaaagg 16326804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 57 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 19727890 - 19727638
Alignment:
Q  57 tgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 156  Q
    ||||| || ||||| || ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| || ||| |||| ||||| |||| ||| ||||| |||||||| || |    
T  19727890 tgcagaatatatgaggaagatactaaggctcattacaaggttgtgaatgagagaaaaggc-aaggtcagcaaagtcttccaaagccttacagtgctcctg 19727792  T
Q  157 ctgataaagggaaacagaaga-tggtcgatgttaggcggcctaagaagaagga---tgctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccaca 252  Q
    ||||||| || ||||| |||| ||   ||||  ||| ||||||| ||||| ||   || ||| |||||||| ||||  | |||||||||||||||||| |    
T  19727791 ctgataagggcaaaca-aagattgaatgatgagaggaggcctaaaaagaaagatgttgttgctgagattgtttgctatacttgtggtgagaaaggccata 19727693  T
Q  253 agagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggtaagaaggg 307  Q
    |||| ||||| ||||||| |||  | |||| |||| | || ||||||||||||||    
T  19727692 agagtaacgcttgtcctggggatgtaaagaggtgttttcgttgtggtaagaaggg 19727638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 53 - 176
Target Start/End: Original strand, 31692169 - 31692292
Alignment:
Q  53 tagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcc 152  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||  ||| |||  | | | |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||     
T  31692169 tagctgcagaatctatgaggaggacacgaaagctcattataaggtgatgagtgatcgaaggagcaaaggacagcagagtcgtccgaagccgtatagtgct 31692268  T
Q  153 cccgctgataaagggaaacagaag 176  Q
    || ||||| |||||||| ||||||    
T  31692269 cctgctgacaaagggaagcagaag 31692292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 54 - 154
Target Start/End: Original strand, 16825264 - 16825364
Alignment:
Q  54 agctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgccc 153  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||  ||| |||| | |  ||||| ||||||| ||||||||| |||||||| |||||||    
T  16825264 agctgtaggatctatgaagaagatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgcagaggcaagggacagctgagtcgtccgaagccgtatagtgccc 16825363  T
Q  154 c 154  Q
    |    
T  16825364 c 16825364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 53 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 31942048 - 31941925
Alignment:
Q  53 tagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcc 152  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||  ||| |||  | | | |||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||     
T  31942048 tagctgcagaatctatgaggaggacacgaaagctcattataaggtgatgagtgatcgaaggagcaaaggatagcagagtcgtccgaagccgtatagtgct 31941949  T
Q  153 cccgctgataaagggaaacagaag 176  Q
    || ||||| |||||||| ||||||    
T  31941948 cctgctgacaaagggaagcagaag 31941925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 57 - 149
Target Start/End: Original strand, 13028345 - 13028437
Alignment:
Q  57 tgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagt 149  Q
    ||||||||||| || |||||||| || ||||| | |||| |||||||||||| || | | ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||    
T  13028345 tgcaggatctaggaggaggataccaaagctcatttcaagatagtgaatgagaagaggagtaaaggccagcagagtcgtccaaagccttacagt 13028437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 63 - 256
Target Start/End: Original strand, 14290526 - 14290722
Alignment:
Q  63 atctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgata 162  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| || || ||  ||| |||| | |  || || ||||||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||| |    
T  14290526 atctatgaagaggataccaaagctcattataaagtgatgagtgagcgcagaggtaagggacagcagagtcgtccgaaaccgtatagtgctcctgctgaca 14290625  T
Q  163 aagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaagaaggatgctgca---gagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagag 256  Q
    |||| ||||||| | ||   ||||  ||| ||||||||| ||  |||||| |    |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14290626 aaggtaaacagaggctgaatgatgagaggaggcctaagaggagagatgctcctactgagattatttgcttcaagtgtggtgagaaaggccacaagag 14290722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 57 - 163
Target Start/End: Original strand, 16831516 - 16831622
Alignment:
Q  57 tgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 156  Q
    |||||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||  ||| |||| | |  || || ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |    
T  16831516 tgcaggatctatgaggaggacaccaaagctcattataaggtgatgagtgagcgaagaggtaagggacagcagagtcatcctaagccgtatagtgcccctg 16831615  T
Q  157 ctgataa 163  Q
    |||||||    
T  16831616 ctgataa 16831622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 90 - 174
Target Start/End: Original strand, 11958202 - 11958286
Alignment:
Q  90 tacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacaga 174  Q
    ||||||||  ||| ||||||||  || || |||||||||| ||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  11958202 tacaaggtgatgagtgagaggagaggtaagggacagcagaatcgtcctaaaccttacagtgctcctgctgacaaagggaaacaga 11958286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 272 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 15358996 - 15358958
Alignment:
Q  272 ggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggtaagaagggtca 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  15358996 ggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggcaagaaaggtca 15358958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 117 - 174
Target Start/End: Original strand, 18131395 - 18131452
Alignment:
Q  117 aaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacaga 174  Q
    ||||||||||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| |||||||    
T  18131395 aaaggacagcagagtcgtcctaaaccatatagtgctcctgctgacaaaggaaaacaga 18131452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 53 - 97
Target Start/End: Original strand, 10417029 - 10417073
Alignment:
Q  53 tagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggt 97  Q
    ||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  10417029 tagctgcagaatttatgaggaggatacgaaggctcattacaaggt 10417073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 120 - 160
Target Start/End: Original strand, 16384423 - 16384463
Alignment:
Q  120 ggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctga 160  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  16384423 ggacaacagagtcgtcctaagccatacagtgcccctgctga 16384463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 216 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 17494625 - 17494585
Alignment:
Q  216 gagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagag 256  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  17494625 gagattgtttgcttcaaatgtggtgaaaaaggccacaagag 17494585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 280; Significance: 1e-157; HSPs: 37)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 3 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 16575317 - 16575010
Alignment:
Q  3 aagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtga 102  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16575317 aagagggcgattggataccaacagctgagagtttttcaggatttggttaatagctgcaggatctacgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtga 16575218  T
Q  103 atgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaa 202  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16575217 atgaaaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgacaaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaa 16575118  T
Q  203 gaaggatgctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggtaag 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16575117 gaaggatgctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggtaag 16575018  T
Q  303 aagggtca 310  Q
    || |||||    
T  16575017 aaaggtca 16575010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 3 - 310
Target Start/End: Original strand, 16620063 - 16620370
Alignment:
Q  3 aagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtga 102  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16620063 aagagggcgattggataccaacagctgagagtttttcaggatttggttaatagctgcaggatctacgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtga 16620162  T
Q  103 atgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaa 202  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16620163 atgaaaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgacaaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaa 16620262  T
Q  203 gaaggatgctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggtaag 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16620263 gaaggatgctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggtaag 16620362  T
Q  303 aagggtca 310  Q
    || |||||    
T  16620363 aaaggtca 16620370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 1 - 310
Target Start/End: Original strand, 29589291 - 29589600
Alignment:
Q  1 tcaagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagt 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29589291 tcaagagggcgattggataccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaggaggataccaaggctcactacaaggtagt 29589390  T
Q  101 gaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaag 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29589391 gaatgagaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccactgacaaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaag 29589490  T
Q  201 aagaaggatgctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggta 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29589491 aagaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggta 29589590  T
Q  301 agaagggtca 310  Q
    ||||||||||    
T  29589591 agaagggtca 29589600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 1 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 27206051 - 27205742
Alignment:
Q  1 tcaagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagt 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27206051 tcaagagggcgcttgggtaccaacagctgagagtttttcaagacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagt 27205952  T
Q  101 gaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaag 200  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27205951 gaatgagaggaagggtaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgctcccgccgataaagggaaacaaaagatggtcgatgttaggcggcctaag 27205852  T
Q  201 aagaaggatgctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggta 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27205851 aagaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgccctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggta 27205752  T
Q  301 agaagggtca 310  Q
    |||| |||||    
T  27205751 agaaaggtca 27205742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 1 - 310
Target Start/End: Original strand, 27243177 - 27243486
Alignment:
Q  1 tcaagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagt 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27243177 tcaagagggcgcttgggtaccaacagctgagagtttttcaagacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagt 27243276  T
Q  101 gaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaag 200  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27243277 gaatgagaggaagggtaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgctcccgccgataaagggaaacaaaagatggtcgatgttaggcggcctaag 27243376  T
Q  201 aagaaggatgctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggta 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27243377 aagaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgccctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggta 27243476  T
Q  301 agaagggtca 310  Q
    |||| |||||    
T  27243477 agaaaggtca 27243486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 1 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 28313059 - 28312750
Alignment:
Q  1 tcaagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagt 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28313059 tcaagagggcgcttgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagt 28312960  T
Q  101 gaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaag 200  Q
    |||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28312959 gaatgaaaggaagggtaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgacaaaggtaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaag 28312860  T
Q  201 aagaaggatgctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggta 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  28312859 aagaaggatgctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgttccgaggaaatcaagaagtgtgcccggtgtggca 28312760  T
Q  301 agaagggtca 310  Q
    |||| |||||    
T  28312759 agaaaggtca 28312750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 3 - 310
Target Start/End: Original strand, 24292636 - 24292943
Alignment:
Q  3 aagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtga 102  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24292636 aagagggcgattggataccaacagctgagagtttttcaggatttggttaatagctgcagaatctacgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtga 24292735  T
Q  103 atgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaa 202  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24292736 atgaaaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgaggttaggcggcctaagaa 24292835  T
Q  203 gaaggatgctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggtaag 302  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24292836 gaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggcgagaaaggccacaagagcaacgcctgccctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggcaag 24292935  T
Q  303 aagggtca 310  Q
    || |||||    
T  24292936 aaaggtca 24292943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 28260049 - 28260351
Alignment:
Q  1 tcaagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagt 100  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28260049 tcaagagggcgcttgggtatcaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagt 28260148  T
Q  101 gaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaag 200  Q
    ||| || |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28260149 gaacgaaaggaagggtaaggggcagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgacaaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaag 28260248  T
Q  201 aagaaggatgctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggta 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28260249 aagaaggatgctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgggaaaggccacaagagcaacgcctgtcccgaagaaatcaagaagtgtgtccggtgtggta 28260348  T
Q  301 aga 303  Q
    |||    
T  28260349 aga 28260351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 28285867 - 28285565
Alignment:
Q  1 tcaagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagt 100  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28285867 tcaagagggcgcttgggtatcaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagt 28285768  T
Q  101 gaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaag 200  Q
    ||| || |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28285767 gaacgaaaggaagggtaaggggcagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgacaaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaag 28285668  T
Q  201 aagaaggatgctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggta 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28285667 aagaaggatgctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgggaaaggccacaagagcaacgcctgtcccgaagaaatcaagaagtgtgtccggtgtggta 28285568  T
Q  301 aga 303  Q
    |||    
T  28285567 aga 28285565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 1 - 303
Target Start/End: Original strand, 28338798 - 28339100
Alignment:
Q  1 tcaagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagt 100  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28338798 tcaagagggcgcttgggtatcaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagt 28338897  T
Q  101 gaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaag 200  Q
    ||| || |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28338898 gaacgaaaggaagggtaaggggcagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgacaaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaag 28338997  T
Q  201 aagaaggatgctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggta 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28338998 aagaaggatgctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgggaaaggccacaagagcaacgcctgtcccgaagaaatcaagaagtgtgtccggtgtggta 28339097  T
Q  301 aga 303  Q
    |||    
T  28339098 aga 28339100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 310
Target Start/End: Original strand, 2871654 - 2871963
Alignment:
Q  1 tcaagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagt 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  2871654 tcaagagggcgattggataccaacagcttagagtttttcaggatttggtcaatagctgcaggatctatgaagaggataccaaggctcactacaagatagt 2871753  T
Q  101 gaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaag 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2871754 gaatgagaggaagggcaagggacaacagagtcgtcctaagctgtacagtgcccctgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaag 2871853  T
Q  201 aagaaggatgctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggta 300  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  2871854 aagaaggatgctacagagattgtgtgtttcaattgtggtgggaaaggccacaaaagcaacgtctgccctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggca 2871953  T
Q  301 agaagggtca 310  Q
    |||| |||||    
T  2871954 agaaaggtca 2871963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 3 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 25115981 - 25115672
Alignment:
Q  3 aagagggcgattgggtaccaacagctg-agagtttttca-ggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagt 100  Q
    |||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  25115981 aagagggcaattggataccaacaactggagagtttttcccggatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggataccaaggctcactacaagatagt 25115882  T
Q  101 gaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaag 200  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| |||||||    
T  25115881 gaacgagaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccctgctgataaagggaaacagagaatggtcgatgataggcagcctaag 25115782  T
Q  201 aagaaggatgctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggta 300  Q
    |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  25115781 aagaaggatgctactgagattgtgtgtttcaattgtggtgggaaaggccacaaaagcaatgtctgccctgaggaaatcaagaagtgtgttcggtgtggca 25115682  T
Q  301 agaagggtca 310  Q
    |||| |||||    
T  25115681 agaaaggtca 25115672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 310
Target Start/End: Original strand, 22829238 - 22829547
Alignment:
Q  1 tcaagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagt 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||    
T  22829238 tcaagagggcgattggataccaacagcttagagtttttccagatttggtcaatagctgcaggatctatgaagaggataccaaggctcactataagattgt 22829337  T
Q  101 gaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaag 200  Q
    ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||||||| |||||||||||||    
T  22829338 gaacgagaggaagggcaagggacaacagagtcgtcctaagccgtacagtgcccctgctgataaagggaaatagagaatggtcgatgataggcggcctaag 22829437  T
Q  201 aagaaggatgctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggta 300  Q
    |||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||| | ||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| |    
T  22829438 aagaaggatgctactgagattgtgtgtttcaattgtggtggaaaaggccacaaaagcaatgtctgtcctgaagagatcaagaagtgtgtctggtgtggca 22829537  T
Q  301 agaagggtca 310  Q
    ||||||||||    
T  22829538 agaagggtca 22829547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 3 - 310
Target Start/End: Original strand, 5836082 - 5836389
Alignment:
Q  3 aagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtga 102  Q
    ||||||||||||||||||||| || | |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||   ||||    
T  5836082 aagagggcgattgggtaccaatagattagagtttttccggatttggttaatagctgcaggatttacgaagaggataccaaagctcactacaagactgtga 5836181  T
Q  103 atgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaa 202  Q
    ||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| || |||||    
T  5836182 atgagcggaagggcaagggacaacagagtcgtcctaagccgtatagtgcccctgctgataaagggaaacagaggatggtcgatgataggcgacccaagaa 5836281  T
Q  203 gaaggatgctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggtaag 302  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| | ||||| |  ||||| || || |||||||| |||||||||||||| |||    
T  5836282 gaaggatgctgctgagattgtgtgtttcaactgtggtgggaaaggccacgaaagcaatgtttgtccagaagagatcaagaaatgtgtccggtgtggcaag 5836381  T
Q  303 aagggtca 310  Q
    ||||||||    
T  5836382 aagggtca 5836389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 57 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 22437245 - 22436989
Alignment:
Q  57 tgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 156  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | ||||||||| | |||   || || ||||||||||| |||||||| || || ||||| |    
T  22437245 tgcaggatttatgaagaggataccaaggctcattacaagattgtgaatgagcgaaagactaagggccagcagagtcgccctaagccttatagcgcccctg 22437146  T
Q  157 ctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaa 253  Q
    ||||||| |  ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22437145 ctgataaggccaaatagaggatggtcgatgataggcggcctaagaagaaggatgttcctgctgagattgtctgctttaattgtggtgagaaaggccacaa 22437046  T
Q  254 gagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggtaagaagggtca 310  Q
    |||||| || ||||| |  ||  | ||||  ||| |||| |||||||||||||||||    
T  22437045 gagcaatgcttgtccgggtgaggtaaagagatgtttccgatgtggtaagaagggtca 22436989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 3 - 310
Target Start/End: Original strand, 25756466 - 25756776
Alignment:
Q  3 aagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtga 102  Q
    ||||||||||| || ||||||||| |   |||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| ||    ||||| |||||||| || |    
T  25756466 aagagggcgataggataccaacaggtccaagtttttcaggatttagtgaatagctgcaggatctatgaggaggacacccgagctcattacaaggtggtta 25756565  T
Q  103 atgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaa 202  Q
    ||||  |||||   || || ||||||||||| |||||||| || |||||||  | |||||| || |||||||  |||||||||| |||||||||||||||    
T  25756566 atgaccggaagactaagggccagcagagtcgccctaagccctatagtgccctagttgataagggcaaacagagaatggtcgatgataggcggcctaagaa 25756665  T
Q  203 gaaggatg---ctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggt 299  Q
    ||||||||   |||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||| |||| |  | ||| || || || ||||| ||||||||||| ||     
T  25756666 gaaggatgctcctgcggagattgtctgttttaattgtggtgagaaaggccacaagtgcaatgtttttccagaagagataaagaaatgtgtccggtgcggc 25756765  T
Q  300 aagaagggtca 310  Q
    |||||||||||    
T  25756766 aagaagggtca 25756776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 3 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 21765242 - 21764983
Alignment:
Q  3 aagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtga 102  Q
    |||||||| ||||| ||||||||| |  ||||||||   || ||||| || ||||| |  |||||||| ||||| || || ||||| |||||||| ||||    
T  21765242 aagagggcaattggataccaacagatccgagtttttgctgatttggtgaacagctgtaaaatctatgaggaggacaccaaagctcattacaaggttgtga 21765143  T
Q  103 atgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaa 202  Q
    ||||| ||||     | || ||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| || ||  |||  |||||||||| |||||||||||||||    
T  21765142 atgagtggaacactgagggccagcagagtcgccctaagccctatagtgcccctgctgataagggcaattagagaatggtcgatgataggcggcctaagaa 21765043  T
Q  203 gaaggatg---ctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaa 259  Q
    ||||||||   |||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21765042 gaaggatgctcctgcggagattgtctgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaa 21764983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 3 - 310
Target Start/End: Original strand, 27558820 - 27559130
Alignment:
Q  3 aagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtga 102  Q
    ||||||||||| || ||||||||  |  |||||||||  || ||||  ||||||||||| || ||||| ||||| || |  ||||| |||||||| || |    
T  27558820 aagagggcgatcggataccaacaaatccgagtttttccagatttggagaatagctgcagaatttatgaggaggacaccagagctcattacaaggttgtta 27558919  T
Q  103 atgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaa 202  Q
    ||||| |||||   || || ||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||| |  || |||||||||||    
T  27558920 atgagcggaagactaagggccagcagagtcgccctaagccctatagtgcccctgctgataagggcaaacagaggatggtcgaggaaagacggcctaagaa 27559019  T
Q  203 gaaggatg---ctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggt 299  Q
     ||| |||   |||| ||||||   || ||||||||||||||||||||||||||||| |  |  |||||||||||  | ||||||||| ||||||||||     
T  27559020 aaagcatgttcctgctgagattacttgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagtactgtttgtcctgaggaggtgaagaagtgtttccggtgtggc 27559119  T
Q  300 aagaagggtca 310  Q
    |||||||||||    
T  27559120 aagaagggtca 27559130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 45 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 24367788 - 24367574
Alignment:
Q  45 ttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgt 144  Q
    |||||||| || || || |||||| |||| || || || ||||| |||||| || ||| |||||||| ||| || |||||||||| |||||||||||| |    
T  24367788 ttggttaacaggtgtagaatctatcaagaagacaccaaagctcattacaagataatgagtgagaggaggggtaagggacagcagaatcgtcctaagcctt 24367689  T
Q  145 acagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaagaaggatgc---tgcagagattgtgtgcttcaattgtggtga 241  Q
    ||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||  |||| |||| |||| |||| ||  |||||   ||  |||||||| |||| ||| ||||||||    
T  24367688 acagtgctcctgctgacaaaggaaagcagaagatgggtgatgataggaggcccaagaggagagatgctcatgttgagattgtttgctacaagtgtggtga 24367589  T
Q  242 gaaaggccacaagag 256  Q
    |||||||||||||||    
T  24367588 gaaaggccacaagag 24367574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 156 - 310
Target Start/End: Original strand, 18404948 - 18405105
Alignment:
Q  156 gctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaagaaggatgct---gcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccaca 252  Q
    |||||||| || |||||||  |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||   ||| ||||||| || |||| ||||||||||||||||||||    
T  18404948 gctgataagggcaaacagagaatggtcgaagataggcggcctaacaagaaggatgctcctgcaaagattgtctgtttcacttgtggtgagaaaggccaca 18405047  T
Q  253 agagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggtaagaagggtca 310  Q
    |||| || || ||||||| |||  | |||| |||| | || |||||||||||||||||    
T  18405048 agagtaatgcttgtcctggggatgttaagaggtgttttcgctgtggtaagaagggtca 18405105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 54 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 19438381 - 19438275
Alignment:
Q  54 agctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgccc 153  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||  || || ||||||||||||||||| ||||| || ||||| |    
T  19438381 agctgtaggatctatgaagaggatacgaaggcttattacaaggtagtgagtgaaaggagaggtaagggacagcagagtcgtccgaagccatatagtgctc 19438282  T
Q  154 ccgctga 160  Q
    | |||||    
T  19438281 ctgctga 19438275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 45 - 174
Target Start/End: Original strand, 14376809 - 14376938
Alignment:
Q  45 ttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgt 144  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||  ||| |||  | | | |||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  14376809 ttggttagtagctgcaggatctatgaggaggacacgaaagctcattacaaggtgatgagtgatcgaaggagcaagggacagcagagtcgtccgaagccgt 14376908  T
Q  145 acagtgcccccgctgataaagggaaacaga 174  Q
    | ||||| || ||||| || || |||||||    
T  14376909 atagtgctcctgctgacaagggaaaacaga 14376938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 57 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 23081799 - 23081690
Alignment:
Q  57 tgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 156  Q
    ||||| || ||||| |||||||| |||||||| |||||| | ||||||||| |||| | |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||  | |    
T  23081799 tgcagaatttatgaggaggatactaaggctcattacaagattgtgaatgagcggaaagtcaaaggtcagcagagtcgtccaaagccttacagtgctgctg 23081700  T
Q  157 ctgataaagg 166  Q
    ||||||||||    
T  23081699 ctgataaagg 23081690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 57 - 172
Target Start/End: Original strand, 18182293 - 18182408
Alignment:
Q  57 tgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 156  Q
    ||||| || ||||| | |||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||| ||||||||| ||| |||| || |    
T  18182293 tgcagaatttatgaggcggatactaaggctcattagaaggttgtgaatgagaggaaaggtaaaggtcagcagagtcatcctaagccttaccgtgctcctg 18182392  T
Q  157 ctgataaagggaaaca 172  Q
    ||||||| | ||||||    
T  18182393 ctgataaggagaaaca 18182408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 259
Target Start/End: Original strand, 10465750 - 10465958
Alignment:
Q  54 agctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgccc 153  Q
    ||||||||||| ||||| || || || || ||||| ||||||||  ||| |||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| |||| ||| |    
T  10465750 agctgcaggatatatgaggaagacacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagaggaggggtaagggacagcagagtcgtcctaagccttacaatgctc 10465849  T
Q  154 ccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggcca 250  Q
      ||||| || || || ||||| |||   |||| |||| |||| |||| ||  ||||   |||| |||||||| || | ||| |||||||| ||||||||    
T  10465850 ttgctgacaagggaaagcagaaaatgaatgatgataggaggcccaagaggagagatgttcctgctgagattgtctgttacaagtgtggtgaaaaaggcca 10465949  T
Q  251 caagagcaa 259  Q
    |||||||||    
T  10465950 caagagcaa 10465958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 57 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 18660295 - 18660189
Alignment:
Q  57 tgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 156  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||  |||| ||||||||| || ||  | ||||| |||||||| ||||| |||||||| || |    
T  18660295 tgcagaatctatgaggaggatacgaaagctcattacaaggctgtgagtgagaggaaaggtaagagtcagcaaagtcgtccaaagccttacagtgctcctg 18660196  T
Q  157 ctgataa 163  Q
    |||||||    
T  18660195 ctgataa 18660189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 72 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 19868017 - 19867879
Alignment:
Q  72 gaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaac 171  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| || ||   || || ||||||||||| |||||||| || || ||||| |||||||| || ||||    
T  19868017 gaggataccaaggctcattacaaggtcgtgaatgagtggcagactaagggccagcagagtcgccctaagccttatagagcccctgctgataagggcaaac 19867918  T
Q  172 agaagatggtcgatgttaggcggcctaagaagaaggatg 210  Q
    |||  |||||||| | ||| ||||| | |||||| ||||    
T  19867917 agagaatggtcgaagatagacggccgaggaagaaagatg 19867879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 53 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 19881776 - 19881670
Alignment:
Q  53 tagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcc 152  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||  ||| |||  ||| |||||| | ||| || |||||||||||||||||||| |||    
T  19881776 tagctgcagaatctatgaagaagattcaaaggctcattacaaggtgatgagtgaacggaggggcaaggaacaacaaagtcgtcctaagccgtacagcgcc 19881677  T
Q  153 cccgctg 159  Q
    || ||||    
T  19881676 cctgctg 19881670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 53 - 151
Target Start/End: Original strand, 34642486 - 34642584
Alignment:
Q  53 tagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgc 151  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||| | | |||||| ||||||||  ||| |||  ||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  34642486 tagctgcagaatctatgaagaagattcaagggctcattacaaggtgatgagtgaacggaggggcaagggacaacagagtcgtcctaagccgtatagtgc 34642584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 54 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 19456402 - 19456284
Alignment:
Q  54 agctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgccc 153  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||| |||  | |  || || ||||| |||||||||||||| || || ||||| |    
T  19456402 agctgcaggatatatgaagaggatactaaggctcattacaagctggtgagtgaacgcagaggtaagggacaacagagtcgtcctaaaccatatagtgctc 19456303  T
Q  154 ccgctgataaagggaaaca 172  Q
    | ||||| ||||| |||||    
T  19456302 ctgctgacaaaggaaaaca 19456284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 54 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 19466547 - 19466429
Alignment:
Q  54 agctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgccc 153  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||| |||  | |  || || ||||| |||||||||||||| || || ||||| |    
T  19466547 agctgcaggatatatgaagaggatactaaggctcattacaagctggtgagtgaacgcagaggtaagggacaacagagtcgtcctaaaccatatagtgctc 19466448  T
Q  154 ccgctgataaagggaaaca 172  Q
    | ||||| ||||| |||||    
T  19466447 ctgctgacaaaggaaaaca 19466429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 54 - 160
Target Start/End: Original strand, 21566893 - 21566999
Alignment:
Q  54 agctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgccc 153  Q
    ||||| || |||||||| || ||| | || ||||| ||||||||  ||| |||| ||| | | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21566893 agctgtagaatctatgaggaagattcaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcggaggagtaagggacaacagagtcgtcctaagccgtacagtgccc 21566992  T
Q  154 ccgctga 160  Q
    | |||||    
T  21566993 ctgctga 21566999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 57 - 151
Target Start/End: Original strand, 25958658 - 25958752
Alignment:
Q  57 tgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgc 151  Q
    |||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||||| ||||||| |||| ||  || ||||| ||||| |||||||| ||||| || |||||    
T  25958658 tgcaggatttatgaggaggatactagagctcactacaagatagtgaaagagaagagaggaaaagggcagcaaagtcgtccaaagccttatagtgc 25958752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 211 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 16813859 - 16813814
Alignment:
Q  211 ctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagag 256  Q
    |||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  16813859 ctgctgagattgtttgctacaagtgtggtgagaaaggccacaagag 16813814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 216 - 256
Target Start/End: Original strand, 8720772 - 8720812
Alignment:
Q  216 gagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagag 256  Q
    |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  8720772 gagattgtttgctacaagtgtggtgagaaaggccacaagag 8720812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 216 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 19456237 - 19456197
Alignment:
Q  216 gagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagag 256  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  19456237 gagattgtttgcttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagag 19456197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 216 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 19466382 - 19466342
Alignment:
Q  216 gagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagag 256  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  19466382 gagattgtttgcttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagag 19466342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 278; Significance: 1e-155; HSPs: 33)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 1 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 16359999 - 16359690
Alignment:
Q  1 tcaagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagt 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16359999 tcaagagggcgattggataccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaggaggataccaaggctcactacaaggtagt 16359900  T
Q  101 gaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaag 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16359899 gaatgagaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgacaaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaag 16359800  T
Q  201 aagaaggatgctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggta 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16359799 aagaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggta 16359700  T
Q  301 agaagggtca 310  Q
    ||||||||||    
T  16359699 agaagggtca 16359690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 1 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 34569991 - 34569682
Alignment:
Q  1 tcaagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagt 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34569991 tcaagagggcgattggataccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaggaggataccaaggctcactacaaggtagt 34569892  T
Q  101 gaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaag 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34569891 gaatgagaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgacaaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaag 34569792  T
Q  201 aagaaggatgctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggta 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34569791 aagaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggta 34569692  T
Q  301 agaagggtca 310  Q
    ||||||||||    
T  34569691 agaagggtca 34569682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 3 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 19773455 - 19773148
Alignment:
Q  3 aagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtga 102  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19773455 aagagggcgattggataccaacagctgagagtttttcaggatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtga 19773356  T
Q  103 atgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaa 202  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19773355 atgagaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaa 19773256  T
Q  203 gaaggatgctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggtaag 302  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19773255 gaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaaaagcaacgtctgccctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggcaag 19773156  T
Q  303 aagggtca 310  Q
    || |||||    
T  19773155 aaaggtca 19773148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 3 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 40712275 - 40711969
Alignment:
Q  3 aagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtga 102  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40712275 aagagggcgattggataccaacagctgagagtttttcaggatttggttaacagctgcaggatctatgaggaggataccaaggctcactacaaggtagtga 40712176  T
Q  103 atgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaa 202  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40712175 atgaaaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgacaaaggtaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaa 40712076  T
Q  203 gaaggatgctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggtaag 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  40712075 gaaggatgctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgcgtccggtgtggtaag 40711976  T
Q  303 aagggtc 309  Q
    |||||||    
T  40711975 aagggtc 40711969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 258; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 1 - 310
Target Start/End: Original strand, 22329776 - 22330085
Alignment:
Q  1 tcaagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagt 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22329776 tcaagagggcaattgggtaccaacagctgagagtttttccagatttggtcaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagt 22329875  T
Q  101 gaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaag 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22329876 gaatgagaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccctgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaag 22329975  T
Q  201 aagaaggatgctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggta 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22329976 aagaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaaaagcaacgtctgccctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggca 22330075  T
Q  301 agaagggtca 310  Q
    |||| |||||    
T  22330076 agaaaggtca 22330085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 1 - 310
Target Start/End: Original strand, 27682289 - 27682598
Alignment:
Q  1 tcaagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagt 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27682289 tcaagagggcgattggataccaacagctgagagtttttcaggatttggttaatagctacaggatctacgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagt 27682388  T
Q  101 gaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaag 200  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27682389 gaatgagagaaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccctgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcgtcctaag 27682488  T
Q  201 aagaaggatgctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggta 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27682489 aagaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaaaagcaacgtctgccctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggca 27682588  T
Q  301 agaagggtca 310  Q
    |||| |||||    
T  27682589 agaaaggtca 27682598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 3 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 41774337 - 41774030
Alignment:
Q  3 aagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtga 102  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41774337 aagagggcgattggataccaacagctgagagtttttcaggatttggttaatagctgcagaatctacgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtga 41774238  T
Q  103 atgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaa 202  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41774237 atgaaaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaa 41774138  T
Q  203 gaaggatgctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggtaag 302  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  41774137 gaagaatgctgctgagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaaaagcaacgtctgccctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggcaag 41774038  T
Q  303 aagggtca 310  Q
    || |||||    
T  41774037 aaaggtca 41774030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 310
Target Start/End: Original strand, 14996628 - 14996937
Alignment:
Q  1 tcaagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagt 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14996628 tcaagagggcgattgggtatcaacagttgagagtttttccagacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacgaggtagt 14996727  T
Q  101 gaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaag 200  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  14996728 gaatgagagaaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccctgctgataaagggaaacagaagatggttgatgttaggcgacctaag 14996827  T
Q  201 aagaaggatgctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggta 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14996828 aagaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaaaagcaacgtctgccctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggca 14996927  T
Q  301 agaagggtca 310  Q
    |||| |||||    
T  14996928 agaaaggtca 14996937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 3 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 27521901 - 27521600
Alignment:
Q  3 aagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtga 102  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27521901 aagagggcgattggataccaacagttgagagtttttcaggatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggacacgaaggctcactacaaggtagtga 27521802  T
Q  103 atgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaa 202  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27521801 atgagaggaagggtaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccctgctgacaaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggtctaagaa 27521702  T
Q  203 gaaggatgctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggtaag 302  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27521701 gaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaaaagcaacgtctgccctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggcaag 27521602  T
Q  303 aa 304  Q
    ||    
T  27521601 aa 27521600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 37288385 - 37288688
Alignment:
Q  1 tcaagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagt 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37288385 tcaagagggcgattggataccaacaactgagagtttttcaggatttggttaatagctgcagaatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagt 37288484  T
Q  101 gaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaag 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  37288485 gaatgagaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgctcccgctgataaagggaaacagaggatggtcgatgataggcggcctaag 37288584  T
Q  201 aagaaggatgctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggta 300  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  37288585 aagaaggatgctacagagattgtgtgtttcaattgtggtgggaaaggccacaaaagcaacgtctgccctgaagaaatcaagaagtgtgtccggtgtggca 37288684  T
Q  301 agaa 304  Q
    ||||    
T  37288685 agaa 37288688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 310
Target Start/End: Original strand, 29472962 - 29473271
Alignment:
Q  1 tcaagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagt 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29472962 tcaagagggcgattgggtaccaacagctaagagtttttccggatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaatgctcactacaaggtagt 29473061  T
Q  101 gaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaag 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  29473062 gaatgagaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgtccccgctgataaagggaaacagaggatggtcgatgataggcggcctaag 29473161  T
Q  201 aagaaggatgctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggta 300  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||| |    
T  29473162 aagaaggatgctacagagattgtgtgtttcaattgtggtgggaaaggccacaaaagcaatgtctgccctgaagaaatcaagaagtgtgttcgatgtggca 29473261  T
Q  301 agaagggtca 310  Q
    |||| |||||    
T  29473262 agaaaggtca 29473271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 27613853 - 27613544
Alignment:
Q  1 tcaagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagt 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27613853 tcaagagggcgattggataccaacaactgagagtttttcaggatttggttaatagctgcagaatctacgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagt 27613754  T
Q  101 gaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaag 200  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||    
T  27613753 gaatgaaaggaagggcaagggacaacagagtcgtcctaagccgtacagtgcccctgctgataaagggaaacagaaggtggtcgatgtgagacggcctaag 27613654  T
Q  201 aagaaggatgctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggta 300  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  27613653 aagagggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaagggccacaagagcaatgtctgccctgaagaaatcaagaagtgtgtccggtgtggca 27613554  T
Q  301 agaagggtca 310  Q
    |||| |||||    
T  27613553 agaaaggtca 27613544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 310
Target Start/End: Original strand, 27665392 - 27665688
Alignment:
Q  1 tcaagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagt 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27665392 tcaagagggcgattgggtatcaacagctgagagtttttcaggatttggttaatagctgcagaatctacgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagt 27665491  T
Q  101 gaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaag 200  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27665492 gaatgaaaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgacaaaggtaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaag 27665591  T
Q  201 aagaaggatgctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggta 300  Q
    ||||||||||||||||||             |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27665592 aagaaggatgctgcagag-------------attgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgccctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggta 27665678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 22138165 - 22137856
Alignment:
Q  1 tcaagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagt 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| | ||    
T  22138165 tcaagagggcgattggataccaacagcttagagtttttcaggatttggtcaatagctgcaggatctatgaagaagatactaaggctcactataagattgt 22138066  T
Q  101 gaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaag 200  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||    
T  22138065 gaacgagaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccctgctgataaagggaaacagagaatggtcgatgataggcggcctaag 22137966  T
Q  201 aagaaggatgctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggta 300  Q
    ||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22137965 aagaaggatgctattgagattgtgtgtttcaattgtggtgggaaaggccacaaaagcaatgtctgccctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggca 22137866  T
Q  301 agaagggtca 310  Q
    |||| |||||    
T  22137865 agaaaggtca 22137856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 22351416 - 22351107
Alignment:
Q  1 tcaagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagt 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  22351416 tcaagagggcgattggataccaacagcttagagtttttccagatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatactaaggctcactacaagatagt 22351317  T
Q  101 gaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaag 200  Q
    ||| |||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22351316 gaacgagaggaagggcaaggggcagcagagtcgtcataagccgtacagtgcccctgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgataggcggcctaag 22351217  T
Q  201 aagaaggatgctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggta 300  Q
    |||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||||| | ||| || || ||||| |||||||||||||||||||| |    
T  22351216 aagaaggatgctactgagattgtgtgtttcaactgtggtgggaaaggccacaaaagcaatgtctgccccgaagaaatgaagaagtgtgtccggtgtggca 22351117  T
Q  301 agaagggtca 310  Q
    |||| |||||    
T  22351116 agaaaggtca 22351107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 18782614 - 18782302
Alignment:
Q  1 tcaagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagt 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |  ||||||| |   | || || ||||||||||| ||||| || || ||||| |||||| | |||||||| ||    
T  18782614 tcaagagggcgattggataccaacagatccgagttttccctaatttagtgaatagctgcagaatctacgaggaagatactaaggctaattacaaggttgt 18782515  T
Q  101 gaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaag 200  Q
    ||||||| |||||  ||| || || |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| || |||||||  |||||||||| |||| || |||||    
T  18782514 gaatgagcggaagaccaagggccaacagagtcgccctaagccttatagtgcccctgctgataagggcaaacagagaatggtcgatgataggtggtctaag 18782415  T
Q  201 aagaaggatg---ctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtg 297  Q
    ||||||||||   |||| |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| || |  |||||||| || ||||| || |||||||||||||    
T  18782414 aagaaggatgctcctgcggagattgtttgtttcaactgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttgtcctgaagagatcaaaaaatgtgtccggtgtg 18782315  T
Q  298 gtaagaagggtca 310  Q
    | |||||||||||    
T  18782314 gcaagaagggtca 18782302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 20804080 - 20803785
Alignment:
Q  18 taccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggca 117  Q
    ||||||||| |  |||||||||  || ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||| |||||  ||||   |    
T  20804080 taccaacagatccgagtttttcctgagttggtaaatagctgcagaatctatgaggaggataccaaggctcattacaaggttgtggatgagcagaagacta 20803981  T
Q  118 aaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaagaaggatg---ctgc 214  Q
    | || || || ||||  |||||||| || |||||||| |||||||| || ||| |||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||    
T  20803980 agggccaacaaagtctccctaagccctatagtgcccctgctgataagggcaaatagagaatggtcgatgataggcggcctaagaagaaggatgctcctgc 20803881  T
Q  215 agagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggtaagaagggtca 310  Q
     |||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| || |  || ||||||||  | ||||| ||| || ||||||| |||||||||||    
T  20803880 ggagattgtctgtttcaattatggtgagaaaggccacaagagaaatgtttgccctgaggaggtgaagaaatgtttctggtgtggcaagaagggtca 20803785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 66 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 23461406 - 23461159
Alignment:
Q  66 tatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaag 165  Q
    ||||||||||| || || ||||| |||||||| ||||||||| |||||   || || ||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| |    
T  23461406 tatgaagaggacaccaaagctcattacaaggttgtgaatgagcggaagactaagggccagcagagtcgccctaagccctatagtgcccctgctgataagg 23461307  T
Q  166 ggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaagaaggatgct---gcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgc 262  Q
    | ||| |||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||   || || ||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  23461306 gaaaatagagaatggtcgatgataggcggcctaagaagaaggatgctcctgcggaaattgtctatttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaatgt 23461207  T
Q  263 ctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggtaagaagggtca 310  Q
     ||||| |||||  | ||||| ||| |||||||||| |||||| ||||    
T  23461206 ttgtccagaggaggtgaagaaatgtttccggtgtggcaagaagagtca 23461159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Original strand, 23537103 - 23537312
Alignment:
Q  3 aagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtga 102  Q
    ||||||||||| || ||||||||| |  |||||||||  || ||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  23537103 aagagggcgatcggataccaacagatctgagtttttcctgatttggttaatagctgcagaatttatgaggaggataccaaggctcattacaaggttgtga 23537202  T
Q  103 atgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaa 202  Q
    ||||| |||||   || || ||||||||||| |||| ||| || ||||||||  ||||||| || |||||||  |||||||||| |||||||||||||||    
T  23537203 atgagcggaagactaagggccagcagagtcgccctatgccctatagtgcccctcctgataagggcaaacagagaatggtcgatgataggcggcctaagaa 23537302  T
Q  203 gaaggatgct 212  Q
    ||||||||||    
T  23537303 gaaggatgct 23537312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 57 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 25429864 - 25429648
Alignment:
Q  57 tgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 156  Q
    |||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||| | ||||||||| |||||   || || ||||||||||| | |||||| ||||||||||| |    
T  25429864 tgcaggatttatgaggaggataccaaggctcattacaagattgtgaatgagcggaagactaagggtcagcagagtcgccttaagccttacagtgcccctg 25429765  T
Q  157 ctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaagaagga---tgctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaa 253  Q
    || |||| || ||| ||| |||||| || | |||||||||||||||||||||   | ||||||||||||| || || | |||||||||||||||||||||    
T  25429764 ctaataagggcaaatagaggatggttgaagataggcggcctaagaagaaggatactcctgcagagattgtctgttttacttgtggtgagaaaggccacaa 25429665  T
Q  254 gagcaacgcctgtcctg 270  Q
    |||||| || |||||||    
T  25429664 gagcaatgcttgtcctg 25429648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 60 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 21883218 - 21883005
Alignment:
Q  60 aggatctatgaagaggatacgaag--gctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgc 157  Q
    ||||||||||| |||||||| |||  ||||| |||||||| ||||||||| |||||   || || ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||    
T  21883218 aggatctatgaggaggatactaagaggctcattacaaggttgtgaatgagcggaagactaagggccagcagagtcgccctaagccctatagtgcccctgc 21883119  T
Q  158 tgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaag 254  Q
    |||||| || |||||||  |||||||| | ||| ||||| | |||||| ||||   |||| |||||||| || || |||||||| |||||||||||||||    
T  21883118 tgataagggcaaacagagaatggtcgaggatagacggccgaggaagaaagatgtttctgctgagattgtctgttttaattgtggcgagaaaggccacaag 21883019  T
Q  255 agcaacgcctgtcc 268  Q
    ||||| || |||||    
T  21883018 agcaatgcttgtcc 21883005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 45 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 25851510 - 25851296
Alignment:
Q  45 ttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgt 144  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||||| || || || ||||| |||||| || ||| |||||||| ||| || |||||||||| |||||||||||| |    
T  25851510 ttggttaataggtgcagaatttatgaagaagacaccaaagctcattacaagataatgagtgagaggaggggtaagggacagcagaatcgtcctaagcctt 25851411  T
Q  145 acagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaagaaggatgc---tgcagagattgtgtgcttcaattgtggtga 241  Q
    ||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||  |||| |||| |||| |||| ||  |||||   ||  |||||||| |||| ||| ||||||||    
T  25851410 acagtgctcctgctgacaaaggaaagcagaagatgggtgatgataggaggcccaagaggagagatgctcttgttgagattgtttgctacaagtgtggtga 25851311  T
Q  242 gaaaggccacaagag 256  Q
    |||||||||||||||    
T  25851310 gaaaggccacaagag 25851296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 54 - 259
Target Start/End: Original strand, 23077844 - 23078052
Alignment:
Q  54 agctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgccc 153  Q
    ||||||||||| ||||| || || || || ||||| ||||||||| ||| |||||||| ||| || |||||||||||||||||||| || |||||||| |    
T  23077844 agctgcaggatatatgaggaagacaccaaagctcattacaaggtaatgagtgagaggaggggtaagggacagcagagtcgtcctaaaccttacagtgctc 23077943  T
Q  154 ccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggcca 250  Q
    | ||||| |||||||| |||||||||   |||| |||| |||| |||| ||  ||||   |||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||||||    
T  23077944 ctgctgacaaagggaagcagaagatgaatgatgataggaggcccaagaggagagatgctcctgctgagattgtatgtttcaagtgtggtgaaaaaggcca 23078043  T
Q  251 caagagcaa 259  Q
    ||| |||||    
T  23078044 caaaagcaa 23078052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 57 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 23526495 - 23526280
Alignment:
Q  57 tgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 156  Q
    |||||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||| | ||||||||| |||||   || || |||||||||||  ||||||| || ||||| |  |    
T  23526495 tgcaggatttatgaggaggacacaaaggctcattacaagattgtgaatgagtggaagactaagggccagcagagtcgcactaagccctatagtgctcttg 23526396  T
Q  157 ctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaa 253  Q
    |||| || || ||| ||| ||||||||| | ||| ||||| | |||||||||||   |||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||    
T  23526395 ctgacaagggcaaatagaggatggtcgaggatagacggccaaggaagaaggatgctcctgctgagattgtctgttttaattgtggtgagaaaggccacaa 23526296  T
Q  254 gagcaacgcctgtcct 269  Q
    |||||| || ||||||    
T  23526295 gagcaatgcttgtcct 23526280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 57 - 172
Target Start/End: Original strand, 21331931 - 21332046
Alignment:
Q  57 tgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 156  Q
    |||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||| | | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| || |    
T  21331931 tgcaggatttatgaggaggatactaaggctcattacaggattgtgaatgagaggaaaggcaaaggtcagcagagtcgtccaaagccttacagtgctcctg 21332030  T
Q  157 ctgataaagggaaaca 172  Q
    ||||||| || |||||    
T  21332031 ctgataagggaaaaca 21332046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 45 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 22506117 - 22505900
Alignment:
Q  45 ttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgt 144  Q
    |||||||| || ||||| || |||||||| || || || ||||| || ||| || ||| |||||||| ||| || |||||||||| |||||||||||| |    
T  22506117 ttggttaacaggtgcagaatttatgaagaagacaccaaagctcattataagataatgagtgagaggaggggtaagggacagcagaatcgtcctaagcctt 22506018  T
Q  145 acagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtga 241  Q
    ||||||| || ||||| ||||| || |||||||||   |||| |||| ||||||||| ||  ||||   || | |||||||| || | ||| ||||||||    
T  22506017 acagtgctcctgctgacaaaggaaagcagaagatgaatgatgataggaggcctaagaggagagatgctccttctgagattgtttgttacaagtgtggtga 22505918  T
Q  242 gaaaggccacaagagcaa 259  Q
    ||||||||||||||||||    
T  22505917 gaaaggccacaagagcaa 22505900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 45 - 256
Target Start/End: Original strand, 14883921 - 14884135
Alignment:
Q  45 ttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgt 144  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||| || || || ||||| || ||| |  ||| |||||||| ||| || ||||| |||| |||||||||||| |    
T  14883921 ttggttaataggtgcagaatctatgaagaagacaccaaagctcattataagattatgagtgagaggaggggtaagggacaacagaatcgtcctaagcctt 14884020  T
Q  145 acagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaagaaggatgct---gcagagattgtgtgcttcaattgtggtga 241  Q
    ||||||| ||  |||| ||||| || |||| |||||  |||| |||| |||| |||| ||  ||||||   || |||||||| || | ||| ||||||||    
T  14884021 acagtgctcctactgacaaaggaaagcagaggatgggtgatgataggaggcccaagaggagagatgctccagctgagattgtttgttacaagtgtggtga 14884120  T
Q  242 gaaaggccacaagag 256  Q
    |||||||||||||||    
T  14884121 gaaaggccacaagag 14884135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 45 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 20345720 - 20345506
Alignment:
Q  45 ttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgt 144  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||| || || || || ||||| |||||| || ||| |||||||| ||| || |||||| ||| |||||||||||| |    
T  20345720 ttggttaataggtgcagaatttatgaggaagacaccaaagctcattacaagataatgagtgagaggaggggtaagggacagtagaatcgtcctaagcctt 20345621  T
Q  145 acagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtga 241  Q
    | ||||| || ||||| ||||| || ||||||||||  |||| |||| |||| |||| ||  ||||   |||| |||||||| || | ||| ||||||||    
T  20345620 atagtgctcctgctgacaaaggaaagcagaagatgggtgatgataggaggcccaagaggagagatgctcctgctgagattgtttgttacaagtgtggtga 20345521  T
Q  242 gaaaggccacaagag 256  Q
    ||||| |||||||||    
T  20345520 gaaagcccacaagag 20345506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 53 - 160
Target Start/End: Original strand, 21870216 - 21870323
Alignment:
Q  53 tagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcc 152  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||  ||| |||| | |  ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  21870216 tagctgcaggatatatgaagaggataccaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacagcagagtcgtccgaagccgtatagtgcc 21870315  T
Q  153 cccgctga 160  Q
    || |||||    
T  21870316 cctgctga 21870323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 53 - 160
Target Start/End: Original strand, 21874496 - 21874603
Alignment:
Q  53 tagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcc 152  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||  ||| |||| | |  ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  21874496 tagctgcaggatatatgaagaggataccaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacagcagagtcgtccgaagccgtatagtgcc 21874595  T
Q  153 cccgctga 160  Q
    || |||||    
T  21874596 cctgctga 21874603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 57 - 252
Target Start/End: Original strand, 21631341 - 21631539
Alignment:
Q  57 tgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 156  Q
    ||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |   | ||||| |||||||| ||||| |||||||| || |    
T  21631341 tgcagaatctatgaggaagatacgaaagctcattacaaggttgtgaatgagaggaagggtaggagtcagcaaagtcgtccaaagccttacagtgctcctg 21631440  T
Q  157 ctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaagaagga---tgctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccaca 252  Q
    ||||||| || ||||| | | ||   ||||| ||| ||||||  ||||| ||   | |||| ||| |||| |||| || ||||||||||||||||||||    
T  21631441 ctgataagggtaaacaaagggtgaatgatgtgaggaggcctagaaagaaagatactactgctgaggttgtttgctacacttgtggtgagaaaggccaca 21631539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 57 - 172
Target Start/End: Original strand, 26735670 - 26735785
Alignment:
Q  57 tgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 156  Q
    ||||| || ||||| |||||||| |||||||| |||||| | || |||||| |||| | |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||      
T  26735670 tgcagaatttatgaggaggatactaaggctcattacaagattgtaaatgagcggaaagtcaaaggtcagcagagtcgtccaaagccttacagtgctccta 26735769  T
Q  157 ctgataaagggaaaca 172  Q
    |||||||||| |||||    
T  26735770 ctgataaaggaaaaca 26735785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 54 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 23474641 - 23474532
Alignment:
Q  54 agctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgccc 153  Q
    |||||||| ||  |||| || ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||| ||| |    
T  23474641 agctgcagaatacatgaggaagatactaaggctcattacaaggttgtgaatgagaggaaaggcaagggtcagcaaagtcgtccaaagccttacattgctc 23474542  T
Q  154 ccgctgataa 163  Q
    | ||||||||    
T  23474541 ctgctgataa 23474532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 278; Significance: 1e-155; HSPs: 33)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 1 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 9338778 - 9338469
Alignment:
Q  1 tcaagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagt 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9338778 tcaagagggcgattggataccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaggaggataccaaggctcactacaaggtagt 9338679  T
Q  101 gaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaag 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9338678 gaatgagaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgacaaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaag 9338579  T
Q  201 aagaaggatgctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggta 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9338578 aagaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggta 9338479  T
Q  301 agaagggtca 310  Q
    ||||||||||    
T  9338478 agaagggtca 9338469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 1 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 9487412 - 9487103
Alignment:
Q  1 tcaagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagt 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9487412 tcaagagggcgattggataccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaggaggataccaaggctcactacaaggtagt 9487313  T
Q  101 gaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaag 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9487312 gaatgagaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgacaaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaag 9487213  T
Q  201 aagaaggatgctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggta 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9487212 aagaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggta 9487113  T
Q  301 agaagggtca 310  Q
    ||||||||||    
T  9487112 agaagggtca 9487103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 3 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 17002194 - 17001887
Alignment:
Q  3 aagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtga 102  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17002194 aagagggcgattggataccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaggaggataccaaggctcactacaaggtagtga 17002095  T
Q  103 atgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaa 202  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17002094 atgaaaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccctgctgataaaggaaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaa 17001995  T
Q  203 gaaggatgctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggtaag 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17001994 gaaggatgctgcagagattgtgtgcttcaattgtggcgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggtaag 17001895  T
Q  303 aagggtca 310  Q
    ||||||||    
T  17001894 aagggtca 17001887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 3 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 27374463 - 27374156
Alignment:
Q  3 aagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtga 102  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27374463 aagagggcgattggataccaacagctgagagtttttcaggatttggttaatagctgcaggatctacgaagaggatacgaaggctcactataaggtagtga 27374364  T
Q  103 atgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaa 202  Q
    |||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27374363 atgaaaggaagggcaagggactgcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgacaaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaa 27374264  T
Q  203 gaaggatgctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggtaag 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27374263 gaaggatgctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggtaag 27374164  T
Q  303 aagggtca 310  Q
    || |||||    
T  27374163 aaaggtca 27374156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 258; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 1 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 16984436 - 16984127
Alignment:
Q  1 tcaagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagt 100  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16984436 tcaagagggcgattggataccagcagctgagagtttttcaggatttggttaacagctgcaggatctatgaggaggataccaaggctcactacaaggtagt 16984337  T
Q  101 gaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaag 200  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16984336 gaatgaaaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgacaaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaag 16984237  T
Q  201 aagaaggatgctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggta 300  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16984236 aagaagaatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggta 16984137  T
Q  301 agaagggtca 310  Q
    ||||||||||    
T  16984136 agaagggtca 16984127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 3 - 310
Target Start/End: Original strand, 22322591 - 22322898
Alignment:
Q  3 aagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtga 102  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22322591 aagagggcgattggataccaacagctgagagtttttcaggatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtga 22322690  T
Q  103 atgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaa 202  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22322691 atgaaaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgacaaaggtaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaa 22322790  T
Q  203 gaaggatgctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggtaag 302  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22322791 gaaggatgctgcggagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaaaagcaacgtctgccctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggcaag 22322890  T
Q  303 aagggtca 310  Q
    || |||||    
T  22322891 aaaggtca 22322898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 3 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 24713228 - 24712921
Alignment:
Q  3 aagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtga 102  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24713228 aagagggcgattggataccaacagctgagagtttttcaggatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtga 24713129  T
Q  103 atgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaa 202  Q
    |||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24713128 atgaaagaaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgacaaaggtaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaa 24713029  T
Q  203 gaaggatgctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggtaag 302  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24713028 gaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaaaagcaacgtctgccctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggcaag 24712929  T
Q  303 aagggtca 310  Q
    || |||||    
T  24712928 aaaggtca 24712921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 310
Target Start/End: Original strand, 44382817 - 44383126
Alignment:
Q  1 tcaagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagt 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  44382817 tcaagagggcgattgggtatcaacggctgagagtttttccagatttggttaacagctgcaggatctatgaggaggataccaaggctcactacaaggtagt 44382916  T
Q  101 gaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaag 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44382917 gaatgagaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgacaaggggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaag 44383016  T
Q  201 aagaaggatgctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggta 300  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44383017 aagaaggatgttgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaatgcctgccctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggta 44383116  T
Q  301 agaagggtca 310  Q
    |||| |||||    
T  44383117 agaaaggtca 44383126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 248; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 3 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 10872044 - 10871737
Alignment:
Q  3 aagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtga 102  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10872044 aagagggcgattggataccaacagctgagagtttttcaggatttggttaatagctgcaggatctacgaagaggataccaaggctcactacaaggtagtga 10871945  T
Q  103 atgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaa 202  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10871944 atgagaggaagggtaagggacaacagagtcgtcctaagccgtacagtgcccctgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaa 10871845  T
Q  203 gaaggatgctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggtaag 302  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10871844 gaaggatgctgcagagcttgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaaaagcaacgtctgccctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggcaag 10871745  T
Q  303 aagggtca 310  Q
    || |||||    
T  10871744 aaaggtca 10871737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 248; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 3 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 24265564 - 24265257
Alignment:
Q  3 aagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtga 102  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24265564 aagagggcgattgggtatcaacagctgagagttttttcagacttggttaatagctgcaggatctacgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtga 24265465  T
Q  103 atgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaa 202  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24265464 atgagagaaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccctgctgataaagggaaatagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaa 24265365  T
Q  203 gaaggatgctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggtaag 302  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24265364 gaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaaaagcaacgtctgccctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggcaag 24265265  T
Q  303 aagggtca 310  Q
    || |||||    
T  24265264 aaaggtca 24265257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 310
Target Start/End: Original strand, 24873997 - 24874306
Alignment:
Q  1 tcaagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagt 100  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||  || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24873997 tcaaaagggcgattgggtatcaacagcttagagtttttccagatttggtaaatagttgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaagatagt 24874096  T
Q  101 gaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaag 200  Q
    ||| |||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  24874097 gaacgagaggaagggcaagggacggcagagtcgttctaagccgtacagtgcccctgctgataaagggaaacagaggatggtcgatgataggcggcctaag 24874196  T
Q  201 aagaaggatgctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggta 300  Q
    |||||||||| | | ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||||| | ||| | ||| ||||| ||||| |||||||||||||| |    
T  24874197 aagaaggatgttactgagattgtgtgtttcaactgtggtgggaaaggccacaaaagcaatgtctgccatgaagaaattaagaaatgtgtccggtgtggca 24874296  T
Q  301 agaagggtca 310  Q
    |||| |||||    
T  24874297 agaaaggtca 24874306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 51 - 310
Target Start/End: Original strand, 22462775 - 22463037
Alignment:
Q  51 aatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtg 150  Q
    ||||||||||| ||||| || || ||||| |||||||| |||||||| || |||||| |||||  ||| || ||||||||||| |||||||| || ||||    
T  22462775 aatagctgcagaatctacgaggaagatacaaaggctcattacaaggttgtaaatgagcggaagaccaagggccagcagagtcgccctaagccttatagtg 22462874  T
Q  151 cccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaagg 247  Q
    ||||  || |||| ||  ||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||||||||   |||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  22462875 ccccttctaataagggcgaacagagaatggtcgatgataggtggcctaagaagaaggatgctcctgcggagattgtttgtttcaactgtggtgagaaagg 22462974  T
Q  248 ccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggtaagaagggtca 310  Q
    ||||||||| || |  |||||||| || |||||||| ||||||| |||||| |||||||||||    
T  22462975 ccacaagagtaatgtttgtcctgaagagatcaagaaatgtgtccagtgtggcaagaagggtca 22463037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 310
Target Start/End: Original strand, 23116303 - 23116615
Alignment:
Q  1 tcaagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagt 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||| ||  ||||||| |  || || || || ||||| |||||||| ||||||||||| |  ||||| |||||||| ||    
T  23116303 tcaagagggcgatcggataccaacaactccgagttttccctgatttagtgaacagctgtaggatctacgaagaggataccagagctcattacaaggttgt 23116402  T
Q  101 gaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaag 200  Q
     ||||||||||||   || ||  |||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| || || ||||  |||||||||| |||||||||||||    
T  23116403 taatgagaggaagactaagggcaagcagagtcgccctaagccttatagtgcccctgctgataagggcaagcagagaatggtcgatgataggcggcctaag 23116502  T
Q  201 aagaaggatg---ctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtg 297  Q
    ||||||||||   || |||||||||| || ||||| ||||| | ||||||||||||||| || |  |||||||| || |||||||| ||||||||||||     
T  23116503 aagaaggatgctccttcagagattgtttgtttcaactgtggcgggaaaggccacaagagtaatgtttgtcctgaagagatcaagaaatgtgtccggtgta 23116602  T
Q  298 gtaagaagggtca 310  Q
    | |||| ||||||    
T  23116603 gcaagaggggtca 23116615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 3 - 310
Target Start/End: Original strand, 24704728 - 24705038
Alignment:
Q  3 aagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtga 102  Q
    |||||||||||  | ||||||||| |  | |||||||  || ||||| |||||||| || |||||||| |||||||| | |||||| |||||||| ||||    
T  24704728 aagagggcgatcagataccaacagatacgtgtttttccagatttggtgaatagctgtagaatctatgaggaggataccagggctcattacaaggttgtga 24704827  T
Q  103 atgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaa 202  Q
    |||||  ||||   || || ||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| || ||||| | ||||||||| |  || || ||||||||    
T  24704828 atgagcagaagactaagggccagcagagtcgccctaagccctatagtgcccctgctgataagggcaaacataggatggtcgaggaaagacgacctaagaa 24704927  T
Q  203 gaaggatg---ctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggt 299  Q
    ||||||||   |||| |||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||  | ||||| ||| ||| ||||||     
T  24704928 gaaggatgttcctgctgagattatctgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaatgtttgtcctgaggaggtaaagaaatgtttccagtgtggc 24705027  T
Q  300 aagaagggtca 310  Q
    |||||||||||    
T  24705028 aagaagggtca 24705038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 24678686 - 24678374
Alignment:
Q  1 tcaagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagt 100  Q
    |||||||||| ||||| |||||| || |  ||||||||   || ||||| || || ||||| || ||||| |||||||| |||||||| |||||| | ||    
T  24678686 tcaagagggcaattggataccaatagatccgagttttttgcgagttggtgaacagttgcagaatttatgacgaggataccaaggctcattacaagatcgt 24678587  T
Q  101 gaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaag 200  Q
    ||||||| |||||   || || ||  ||||||| |||||||| || || ||||| |||||||| || ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  24678586 gaatgagcggaagactaagggccaatagagtcgccctaagccctatagcgcccctgctgataagggcaaacagaggatggtcgatgatagacggcctaag 24678487  T
Q  201 aagaaggatg---ctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtg 297  Q
    ||||||||||   |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |  ||  | ||||  ||| |||| ||||    
T  24678486 aagaaggatgttcctgctgagattgtctgctttaattgtggtgagaaaggccacaagagcaatgcttgtccgggagaggttaagagatgtttccgttgtg 24678387  T
Q  298 gtaagaagggtca 310  Q
    |||||||||||||    
T  24678386 gtaagaagggtca 24678374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 165 - 310
Target Start/End: Original strand, 21139392 - 21139537
Alignment:
Q  165 gggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaagaaggatgctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcct 264  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||| | ||    
T  21139392 gggaaacagaggatggtcgatgataggcggcctaagaagaaggatgctacagagattgtgtgtttcaattgtggtggaaaaggccacaaaagcaatgtct 21139491  T
Q  265 gtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggtaagaagggtca 310  Q
    ||| ||| || ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  21139492 gtcgtgaagagatcaagaaccgtgtccggtgtggcaagaagggtca 21139537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 54 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 16931698 - 16931598
Alignment:
Q  54 agctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgccc 153  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16931698 agctgcaggatctatgaggaggataccaaggctcactacaaggtagtgaatgaaaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgccc 16931599  T
Q  154 c 154  Q
    |    
T  16931598 c 16931598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 3 - 310
Target Start/End: Original strand, 24656904 - 24657214
Alignment:
Q  3 aagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtga 102  Q
    ||||||||||| || ||||||||| |  |||||||||  || ||| | ||||||||||| |||||||| ||||| || |  ||||| |||||||| || |    
T  24656904 aagagggcgatcggataccaacagatccgagtttttccagatttgatgaatagctgcagaatctatgaggaggacaccagagctcattacaaggttgtta 24657003  T
Q  103 atgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaa 202  Q
    ||||| |||||   || || ||||||||||| |||||||| || ||||||||  ||||||| || ||||||| ||||||||| |  || |||||||||||    
T  24657004 atgagcggaagactaagggccagcagagtcgccctaagccctatagtgcccctactgataagggcaaacagaggatggtcgaggagagacggcctaagaa 24657103  T
Q  203 gaaggatg---ctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggt 299  Q
     |||||||   |||| ||||||   || ||||||||||||||||||||||||||||| |  |  |||||||||||  | ||||||||| ||||||||||     
T  24657104 aaaggatgttcctgctgagattacttgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagtactgtttgtcctgaggaggtgaagaagtgtttccggtgtggc 24657203  T
Q  300 aagaagggtca 310  Q
    |||||||||||    
T  24657204 aagaagggtca 24657214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 57 - 310
Target Start/End: Original strand, 23039877 - 23040133
Alignment:
Q  57 tgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 156  Q
    ||||||||||| || |||||||  |||||||| |||||| | ||||||||| |||||   || || ||||||||||  |||||||| ||||||||||| |    
T  23039877 tgcaggatctacgaggaggatattaaggctcattacaagattgtgaatgagcggaagactaagggtcagcagagtctccctaagccttacagtgcccctg 23039976  T
Q  157 ctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaa 253  Q
    ||||||| || ||||||| ||||||||| | ||| |||||||||||||||||||   || |||||||||| || ||   |||||||||||| ||||||||    
T  23039977 ctgataagggcaaacagaggatggtcgaaggtagacggcctaagaagaaggatgctcctacagagattgtctgtttttcttgtggtgagaagggccacaa 23040076  T
Q  254 gagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggtaagaagggtca 310  Q
    ||| || || ||||||| ||| | |||||  ||| |||| ||||| |||||||||||    
T  23040077 gagtaatgcttgtcctggggataccaagagatgtttccgatgtggaaagaagggtca 23040133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 66 - 310
Target Start/End: Original strand, 23028771 - 23029017
Alignment:
Q  66 tatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaag 165  Q
    ||||| |||||||| |||||||| |||||| | ||||||||| ||||    ||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| |    
T  23028771 tatgaggaggataccaaggctcattacaagattgtgaatgagcggaatactaaaggccagcagagtcgccctaagccctatagtgcccctgctgataagg 23028870  T
Q  166 ggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgc 262  Q
    | ||||||| ||||||||| | ||| ||||| | |||||||||||   |||| |||||||| || ||  |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  23028871 gcaaacagaggatggtcgaggatagacggccaaggaagaaggatgctcctgctgagattgtctg-ttttattgtggtgagaaaggccacaagagcaatgc 23028969  T
Q  263 ctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggtaagaagggtca 310  Q
     |||||||  ||  | ||||  ||| |||| |||||||||||||||||    
T  23028970 ttgtcctggagaggtaaagagatgtttccgatgtggtaagaagggtca 23029017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 57 - 268
Target Start/End: Original strand, 22742266 - 22742480
Alignment:
Q  57 tgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 156  Q
    |||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| |||||   || || ||||||||||| |||||||| || |||||||| |    
T  22742266 tgcaggatttacgaagaggataccaaggctcattacaaggtcgtgaatgagcggaagactaagggtcagcagagtcgccctaagccttatagtgcccctg 22742365  T
Q  157 ctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaagaagga---tgctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaa 253  Q
    ||||||| || |||||||  ||||| || | ||| ||||| | |||||||||   |||||  |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  22742366 ctgataagggcaaacagagaatggttgaggatagacggccgaggaagaaggatgttgctggtgagattgtctgctttaattgtggtgagaaatgccacaa 22742465  T
Q  254 gagcaacgcctgtcc 268  Q
    |||||| || |||||    
T  22742466 gagcaatgcttgtcc 22742480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 46 - 268
Target Start/End: Original strand, 21320292 - 21320517
Alignment:
Q  46 tggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgta 145  Q
    |||| ||||||||||| || ||||| || ||||| |||||||| |||||| | ||||||||| |||||   |  || ||||||||| | |||||||| ||    
T  21320292 tggtgaatagctgcagaatttatgaggatgataccaaggctcattacaagattgtgaatgagcggaagactaggggccagcagagttgccctaagcctta 21320391  T
Q  146 cagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgag 242  Q
     ||  |||| |||||||| || ||||| |  |||||||| | |||||||||||||||||||||||   |||| |||||||| || || |||||||| |||    
T  21320392 tagcacccctgctgataagggcaaacaaagaatggtcgaggataggcggcctaagaagaaggatgtccctgctgagattgtctgttttaattgtggcgag 21320491  T
Q  243 aaaggccacaagagcaacgcctgtcc 268  Q
    ||||||||||||||||| || |||||    
T  21320492 aaaggccacaagagcaatgcttgtcc 21320517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 57 - 270
Target Start/End: Original strand, 22733074 - 22733290
Alignment:
Q  57 tgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 156  Q
    |||||||| || || |||||||| |||||||| |||||| | ||||||||| |||||   || || ||||||||||| |||||||  ||||||||||| |    
T  22733074 tgcaggatttacgaggaggataccaaggctcattacaagattgtgaatgagcggaagactaagggtcagcagagtcgccctaagctttacagtgcccctg 22733173  T
Q  157 ctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaa 253  Q
    ||||||| || ||| |||  |||||||| | ||| | |||||||||||||||||   || |||| ||||| || || | |||||||||||||||||||||    
T  22733174 ctgataagggcaaagagagaatggtcgaagatagacagcctaagaagaaggatgctcctccagaaattgtctgttttacttgtggtgagaaaggccacaa 22733273  T
Q  254 gagcaacgcctgtcctg 270  Q
    ||| || || |||||||    
T  22733274 gagtaatgcttgtcctg 22733290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 177 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 23205337 - 23205201
Alignment:
Q  177 atggtcgatgttaggcggcctaagaagaaggatgctgca---gagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgagg 273  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |    |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| || |  |||||||| |    
T  23205337 atggtcgatgataggcggcctaagaagaagaatgctccttcggagattgtttgtttcaactgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttgtcctgaag 23205238  T
Q  274 aaatcaagaagtgtgtccggtgtggtaagaagggtca 310  Q
    | |||||||| ||||||| |||||| |||||||||||    
T  23205237 agatcaagaaatgtgtccagtgtggcaagaagggtca 23205201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 177 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 23676941 - 23676805
Alignment:
Q  177 atggtcgatgttaggcggcctaagaagaaggatgctgca---gagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgagg 273  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |    |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| || |  |||||||| |    
T  23676941 atggtcgatgataggcggcctaagaagaagaatgctccttcggagattgtttgtttcaactgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttgtcctgaag 23676842  T
Q  274 aaatcaagaagtgtgtccggtgtggtaagaagggtca 310  Q
    | |||||||| ||||||| |||||| |||||||||||    
T  23676841 agatcaagaaatgtgtccagtgtggcaagaagggtca 23676805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 57 - 310
Target Start/End: Original strand, 23105027 - 23105283
Alignment:
Q  57 tgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 156  Q
    |||||||| || || |||||||| |||||||| |||||| | |||||||||  ||||   || || |||||||| || |||||||| |||||||| || |    
T  23105027 tgcaggatttacgaggaggataccaaggctcattacaagattgtgaatgagcagaagactaagggccagcagagccgccctaagccttacagtgcacctg 23105126  T
Q  157 ctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaa 253  Q
    ||||||| || |||||||  |||||||| | ||| ||||| | |||||||||||   |||| |||||| | || |||  |||||||||||| ||||||||    
T  23105127 ctgataagggcaaacagagaatggtcgaagatagacggccgaggaagaaggatgctcctgctgagattatttgtttctcttgtggtgagaagggccacaa 23105226  T
Q  254 gagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggtaagaagggtca 310  Q
    ||| || || |||||| | ||  ||||||  ||| | || ||||| |||||||||||    
T  23105227 gagtaatgcttgtccttaagacgtcaagagatgttttcgctgtggaaagaagggtca 23105283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 23274739 - 23274633
Alignment:
Q  54 agctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgccc 153  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||  | | |||||| ||||| ||||||||||| |||| ||| ||||| |    
T  23274739 agctgtaggatctatgaagaggatacgaaggctcattacaaggtgatgagtgaacgtaggggcaagggacaacagagtcgtccgaagcagtatagtgctc 23274640  T
Q  154 ccgctga 160  Q
    | |||||    
T  23274639 ctgctga 23274633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 57 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 23029904 - 23029815
Alignment:
Q  57 tgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtac 146  Q
    |||||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||| | ||||||||| |||||  ||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  23029904 tgcaggatttatgaggaggacactaaggctcattacaagattgtgaatgagcggaagaccaggggacaacagagtcgtcctaagccgtac 23029815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 211 - 259
Target Start/End: Original strand, 11351168 - 11351216
Alignment:
Q  211 ctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaa 259  Q
    |||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11351168 ctgcggagattgtctgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaa 11351216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 45 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 20848741 - 20848606
Alignment:
Q  45 ttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgt 144  Q
    |||||||| || ||||| || |||||||| || || || ||||| || ||| |  ||| |||||||| ||| || ||||| |||| |||||||||||| |    
T  20848741 ttggttaacaggtgcagaatttatgaagaagacaccaaagctcattataagattatgagtgagaggaggggtaagggacaacagaatcgtcctaagcctt 20848642  T
Q  145 acagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatgg 180  Q
    ||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||    
T  20848641 acagtgctcctgctgacaaaggaaagcagaagatgg 20848606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 168 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 23065445 - 23065353
Alignment:
Q  168 aaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagc 257  Q
    |||||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| |  || | || ||||||||| ||||||||||||    
T  23065445 aaacagagaatggtcgaagataggcggcctaagaagaaggatggtcctgcagagattgtctattttacttatggtgagaagggccacaagagc 23065353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 168 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 23074895 - 23074803
Alignment:
Q  168 aaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagc 257  Q
    |||||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| |  || | || ||||||||| ||||||||||||    
T  23074895 aaacagagaatggtcgaagataggcggcctaagaagaaggatggtcctgcagagattgtctattttacttatggtgagaagggccacaagagc 23074803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 211 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 28350861 - 28350816
Alignment:
Q  211 ctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagag 256  Q
    |||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  28350861 ctgctgagattgtttgctacaagtgtggtgagaaaggccacaagag 28350816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 272; Significance: 1e-152; HSPs: 29)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 3 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 19116029 - 19115722
Alignment:
Q  3 aagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtga 102  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19116029 aagagggcgattggataccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaggaggataccaaggctcactacaaggtagtga 19115930  T
Q  103 atgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaa 202  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19115929 atgaaaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccctgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaa 19115830  T
Q  203 gaaggatgctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggtaag 302  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19115829 gaaggatgctgcagaggttgtgtgcttcaattgtggcgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgcgtccggtgtggtaag 19115730  T
Q  303 aagggtca 310  Q
    ||||||||    
T  19115729 aagggtca 19115722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 1 - 310
Target Start/End: Original strand, 19481223 - 19481531
Alignment:
Q  1 tcaagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagt 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19481223 tcaagagggcgcttgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttcatagctgcagg-tctatgaagaggatacgaaggcttactacaaggtagt 19481321  T
Q  101 gaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaag 200  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19481322 gaatgagaggaagggtaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgacaagggtaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaag 19481421  T
Q  201 aagaaggatgctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggta 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19481422 aagaaggatgctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgttctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggta 19481521  T
Q  301 agaagggtca 310  Q
    ||||||||||    
T  19481522 agaagggtca 19481531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 248; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 3 - 310
Target Start/End: Original strand, 17671174 - 17671481
Alignment:
Q  3 aagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtga 102  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17671174 aagagggcgattggataccaacagctgagagtttttcaggatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtga 17671273  T
Q  103 atgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaa 202  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17671274 atgaaaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgacaaaggtaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaa 17671373  T
Q  203 gaaggatgctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggtaag 302  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  17671374 gaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaaaagcaatgtctgcccggaggaaatcaagaagtgtgtctggtgtggcaag 17671473  T
Q  303 aagggtca 310  Q
    || |||||    
T  17671474 aaaggtca 17671481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 18860208 - 18859899
Alignment:
Q  1 tcaagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18860208 tcaagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttccggatttggttaatagctgtaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagt 18860109  T
Q  101 gaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaag 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||    
T  18860108 gaatgagaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacaggggatggtcgatgataggcggcctaag 18860009  T
Q  201 aagaaggatgctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggta 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| |  || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  18860008 aagaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgggaaaggccacaaaagcaatgtatgccctgaagaaatcaagaagtgtgttcggtgtggca 18859909  T
Q  301 agaagggtca 310  Q
    |||| |||||    
T  18859908 agaaaggtca 18859899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 3 - 310
Target Start/End: Original strand, 22126111 - 22126418
Alignment:
Q  3 aagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtga 102  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22126111 aagagggcgattggataccaacagcttagagtttttcaggatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtga 22126210  T
Q  103 atgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaa 202  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  22126211 atgagaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaggatggtcgatgataggcggcctaagaa 22126310  T
Q  203 gaaggatgctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggtaag 302  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||  | ||| ||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  22126311 gaaggatgctacagagattgtgtgtttcaattgtggtgggaaaggccacaaaagcaacgtcttccttgaagaaatcaagaagtgtgttcggtgtggcaag 22126410  T
Q  303 aagggtca 310  Q
    || |||||    
T  22126411 aaaggtca 22126418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 310
Target Start/End: Original strand, 20015413 - 20015722
Alignment:
Q  1 tcaagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagt 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20015413 tcaagagggcgattggataccaacagctgagagtttttcaggatttggtcaatagctgcaggatctacgaagaggataccaaggctcactacaaggtagt 20015512  T
Q  101 gaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaag 200  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  20015513 gaatgaaaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccctgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgtgagacggcctaag 20015612  T
Q  201 aagaaggatgctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggta 300  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  20015613 aagagggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaagggccacaagagtaacgtctgccctgaggaaatcaagaagtgtgttcggtgtggca 20015712  T
Q  301 agaagggtca 310  Q
    |||| |||||    
T  20015713 agaaaggtca 20015722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 3 - 310
Target Start/End: Original strand, 22117327 - 22117634
Alignment:
Q  3 aagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtga 102  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22117327 aagagggcgattggataccaacagcttagagtttttcaggatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtga 22117426  T
Q  103 atgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaa 202  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||    
T  22117427 atgagaggaagggcaagggacagcaaagtcgtcctaagccgtacagtgcccccactgataaagggaaacagagaatggtcgatgataggcggcctaagaa 22117526  T
Q  203 gaaggatgctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggtaag 302  Q
     |||||||||  |||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  22117527 taaggatgctatagagattgtgtgtttcaatcgtggtgggaaaggccacaaaagcaacgtctgccctgaagaaatcaagaagtgtgttcggtgtggcaag 22117626  T
Q  303 aagggtca 310  Q
    || |||||    
T  22117627 aaaggtca 22117634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 3 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 22043459 - 22043149
Alignment:
Q  3 aagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtga 102  Q
    ||||||||||| || ||||||||| |  ||||||| |  || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  22043459 aagagggcgatcggataccaacagatccgagttttccctgatttggttaatagatgcaggatttatgaggaggataccaaggctcattacaaggttgtga 22043360  T
Q  103 atgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaa 202  Q
    ||||| |||||  ||| || ||||||||||  |||||||| || ||||||||  |||| || || |||||||  |||||||||| |||||||||||||||    
T  22043359 atgagcggaagaccaagggccagcagagtcaccctaagccttatagtgcccctactgacaagggcaaacagagaatggtcgatgataggcggcctaagaa 22043260  T
Q  203 gaaggatgctgca---gagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggt 299  Q
    |||||||||| ||   ||||||   || ||||||||||||||||||||||||||||| || |  ||||| || || |||||||| ||||| ||||||||     
T  22043259 gaaggatgctccaactgagattacttgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgtccagaagagatcaagaaatgtgttcggtgtggc 22043160  T
Q  300 aagaagggtca 310  Q
    |||||||||||    
T  22043159 aagaagggtca 22043149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 310
Target Start/End: Original strand, 30310291 - 30310603
Alignment:
Q  1 tcaagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagt 100  Q
    |||||||||||||  | |||||||| ||  ||||||| |  || || || ||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||||| |||||||| ||    
T  30310291 tcaagagggcgatcagataccaacaactccgagttttccctgatttagtgaatagttgcagaatctacgaggaggatactaaggctcattacaaggttgt 30310390  T
Q  101 gaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaag 200  Q
    ||||||| |||||  ||| || ||||||||||| ||||| || || |||||||| |||||||| || |||||||  |||||||||| ||||||||| |||    
T  30310391 gaatgagcggaagaccaagggtcagcagagtcgccctaaaccttatagtgcccctgctgataagggcaaacagagaatggtcgatgataggcggccaaag 30310490  T
Q  201 aagaaggatg---ctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtg 297  Q
    ||||||||||   |||| || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| || |  |||||||| || |||||||| |||||| ||||||    
T  30310491 aagaaggatgctcctgcggatattgtttgtttcaactgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttgtcctgaagagatcaagaaatgtgtctggtgtg 30310590  T
Q  298 gtaagaagggtca 310  Q
    | |||||||||||    
T  30310591 gcaagaagggtca 30310603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 32603779 - 32603467
Alignment:
Q  1 tcaagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagt 100  Q
    ||||||||||||| || || ||||| ||  ||||||| |  || ||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| |  ||||| |||||||| ||    
T  32603779 tcaagagggcgatcggatatcaacaactccgagttttccctgatttggtgaacagctgtaggatctacgaagaggataccagagctcattacaaggttgt 32603680  T
Q  101 gaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaag 200  Q
     ||||||||||||   || || ||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| || || ||||  |||||||||| |||||| ||||||    
T  32603679 taatgagaggaagactaagggccagcagagtcgccctaagccttatagtgcccctgctgataagggcaagcagagaatggtcgatgataggcgacctaag 32603580  T
Q  201 aagaaggatgctgca---gagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtg 297  Q
    |||||||||||| |    || ||||| || ||||| ||||||| ||||||||||||||| || |  |||| ||| || |||||||| |||||||||||||    
T  32603579 aagaaggatgctccttcggaaattgtttgtttcaactgtggtgggaaaggccacaagagtaatgtttgtcttgaagagatcaagaaatgtgtccggtgtg 32603480  T
Q  298 gtaagaagggtca 310  Q
    | |||||||||||    
T  32603479 gcaagaagggtca 32603467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 15537017 - 15536705
Alignment:
Q  1 tcaagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagt 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||| ||  ||||||| |  || || || ||||||||||||||||| || || ||||  |||||||| |||||||| ||    
T  15537017 tcaagagggcgatcggataccaacaacttcgagttttccctgatttagtgaatagctgcaggatctacgaggaagatagtaaggctcattacaaggttgt 15536918  T
Q  101 gaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaag 200  Q
    ||||||| |||||  ||| || ||||||||||| |||||||| || |||||||| || ||||| || || ||||  |||||||||| |||||||||||||    
T  15536917 gaatgagcggaagaccaagggccagcagagtcgccctaagccttatagtgcccctgccgataagggcaagcagagaatggtcgatgataggcggcctaag 15536818  T
Q  201 aagaaggatgctgca---gagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtg 297  Q
    |||||||||||| |    |||||| | || || |||||||| ||  ||||||||||||| || |  |||||| | || |||||||| |||||||||||||    
T  15536817 aagaaggatgctccttcggagattatttgttttaattgtggcgaagaaggccacaagagtaatgtttgtcctaaagagatcaagaaatgtgtccggtgtg 15536718  T
Q  298 gtaagaagggtca 310  Q
    | || ||||||||    
T  15536717 gcaaaaagggtca 15536705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 57 - 270
Target Start/End: Original strand, 18880860 - 18881076
Alignment:
Q  57 tgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 156  Q
    |||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||| |||||   || || ||||||||||| |||||||| |||||||||||      
T  18880860 tgcaggatttatgaggaggatactaaggctcattacaagatagtgaatgagcggaagactaagggtcagcagagtcgccctaagccttacagtgccccta 18880959  T
Q  157 ctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaa 253  Q
    ||||||| || |||||||  |||||||| | ||| |||||||||||||||||||   ||||| | ||||| || || | |||||||||||||||||||||    
T  18880960 ctgataagggcaaacagagaatggtcgaagatagacggcctaagaagaaggatgctcctgcaaaaattgtctgttttacttgtggtgagaaaggccacaa 18881059  T
Q  254 gagcaacgcctgtcctg 270  Q
    ||| || || |||||||    
T  18881060 gagtaatgcttgtcctg 18881076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 57 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 19981545 - 19981331
Alignment:
Q  57 tgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 156  Q
    |||||||| || || |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| |||||   || || ||||||||||| |||||||| || || ||||| |    
T  19981545 tgcaggatttacgaggaggataccaaggctcattacaaggtcgtgaatgagtggaagactaagggccagcagagtcgccctaagccttatagcgcccctg 19981446  T
Q  157 ctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaa 253  Q
    ||||||| || ||| ||| ||||||||| | |||||| || | |||||||||||   |||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||    
T  19981445 ctgataagggcaaatagaggatggtcgaagataggcgaccaaggaagaaggatgttcctgctgagattgtcttctttaattgtggtgagaaaggccacaa 19981346  T
Q  254 gagcaacgcctgtcc 268  Q
    |||||| || |||||    
T  19981345 gagcaatgcttgtcc 19981331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 57 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 21672093 - 21671837
Alignment:
Q  57 tgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 156  Q
    |||||||| ||||| |||||| | ||| |||| |||||| | ||||||||| | |||| ||| || |||||||||||||||||||| |||||||| || |    
T  21672093 tgcaggatttatgaggaggatgccaagactcattacaagattgtgaatgagcgaaaggccaagggtcagcagagtcgtcctaagccttacagtgctcctg 21671994  T
Q  157 ctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaa 253  Q
    ||||||| || |||||||  ||||| |||| ||||||  |||  ||||| ||||   |||  |||||||| ||||  | |||||||||||||||||||||    
T  21671993 ctgataagggtaaacagagaatggtagatgataggcgctctagaaagaaagatgctcctgttgagattgtctgctatacttgtggtgagaaaggccacaa 21671894  T
Q  254 gagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggtaagaagggtca 310  Q
    ||| || || ||||||| |||  | |||| |||| | || |||||||| ||||||||    
T  21671893 gagtaatgcttgtcctggggatgtgaagaggtgttttcgctgtggtaaaaagggtca 21671837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 57 - 270
Target Start/End: Original strand, 22421096 - 22421312
Alignment:
Q  57 tgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 156  Q
    |||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||| | ||||||||| |||| | |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| || |    
T  22421096 tgcaggatttatgaggaggatactaaggctcattacaagattgtgaatgagcggaaagtcaaaggtcagcagagtcgtccaaagccttacagtgctcctg 22421195  T
Q  157 ctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaagaaggatgct---gcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaa 253  Q
    || |||| || |||||||  ||||| ||||  |||||||||| |||||| ||||||   |  || ||||| ||||  | |||||||||||||||||||||    
T  22421196 ctaataagggcaaacagagaatggttgatgagaggcggcctaggaagaaagatgcttcggttgatattgtctgctatacttgtggtgagaaaggccacaa 22421295  T
Q  254 gagcaacgcctgtcctg 270  Q
     || || || |||||||    
T  22421296 aagtaatgcttgtcctg 22421312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 3 - 259
Target Start/End: Original strand, 21163679 - 21163938
Alignment:
Q  3 aagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtga 102  Q
    |||||||| ||||| ||||||||| |  |||||||    || ||||| || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||| | ||||    
T  21163679 aagagggcaattggataccaacagatccgagttttctccgagttggtgaacagttgcaggatttatgaggaggataccaaggctcattacaagattgtga 21163778  T
Q  103 atgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaa 202  Q
    ||||| |||||   || || || || ||||| |||||||| || |||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||| | ||| || || | |||    
T  21163779 atgagcggaagactaagggccaacaaagtcgccctaagccctatagtgcccctgctgataagggcaaacagaggatggtcgaggatagacgaccaaggaa 21163878  T
Q  203 gaaggatg---ctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaa 259  Q
    ||||||||   |||| |||||||| || || |||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  21163879 gaaggatgctcctgctgagattgtctgttttaattgtggcgagaaagaccacaagagcaa 21163938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 57 - 310
Target Start/End: Original strand, 21391064 - 21391320
Alignment:
Q  57 tgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 156  Q
    |||||||| || || |||||||| |||||||| |||||| | |||||||||||||||   || || ||||||||||| |||||||| || |||||||  |    
T  21391064 tgcaggatttacgaggaggatactaaggctcattacaagatcgtgaatgagaggaagactaagggccagcagagtcgccctaagccttatagtgcccttg 21391163  T
Q  157 ctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaa 253  Q
     |||||| || ||| |||  |||||||| | ||| ||||| | |||||||||||   |||| |||||||| || ||   |||||||||||||||||||||    
T  21391164 ttgataagggcaaatagagaatggtcgaagatagacggccgaggaagaaggatgctcctgctgagattgtttgtttttcttgtggtgagaaaggccacaa 21391263  T
Q  254 gagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggtaagaagggtca 310  Q
    ||| || || ||||||| |||  ||||||  ||| | || ||||| |||||||||||    
T  21391264 gagtaatgcttgtcctggggacgtcaagagatgttttcgctgtggaaagaagggtca 21391320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 57 - 310
Target Start/End: Original strand, 21780390 - 21780646
Alignment:
Q  57 tgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 156  Q
    |||||||| || || |||||||| |||||||| |||||| | |||||||||||||||   || || ||||||||||| |||||||| || |||||||  |    
T  21780390 tgcaggatttacgaggaggatactaaggctcattacaagatcgtgaatgagaggaagactaagggccagcagagtcgccctaagccttatagtgcccttg 21780489  T
Q  157 ctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaa 253  Q
     |||||| || ||| |||  |||||||| | ||| ||||| | |||||||||||   |||| |||||||| || ||   |||||||||||||||||||||    
T  21780490 ttgataagggcaaatagagaatggtcgaagatagacggccgaggaagaaggatgctcctgctgagattgtttgtttttcttgtggtgagaaaggccacaa 21780589  T
Q  254 gagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggtaagaagggtca 310  Q
    ||| || || ||||||| |||  ||||||  ||| | || ||||| |||||||||||    
T  21780590 gagtaatgcttgtcctggggacgtcaagagatgttttcgctgtggaaagaagggtca 21780646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 57 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 22524088 - 22523973
Alignment:
Q  57 tgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 156  Q
    |||||||| ||| | |||||||| |||||||| |||||| | ||||||||| | || |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |    
T  22524088 tgcaggatttataaggaggatactaaggctcattacaagattgtgaatgagcgaaaaggcaaaggtcagcagagtcgtccaaagccttacagtgcccctg 22523989  T
Q  157 ctgataaagggaaaca 172  Q
    ||||||| || |||||    
T  22523988 ctgataagggaaaaca 22523973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 54 - 179
Target Start/End: Original strand, 29300626 - 29300751
Alignment:
Q  54 agctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgccc 153  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||||||| ||| |||||||| ||| || |||||  ||||||||||||| || |||||||| |    
T  29300626 agctgcaggatatatgaggaggacacaaaagctcattacaaggtaatgagtgagaggaggggtaagggacattagagtcgtcctaaaccttacagtgctc 29300725  T
Q  154 ccgctgataaagggaaacagaagatg 179  Q
    | ||||| |||||||| |||||||||    
T  29300726 ctgctgacaaagggaagcagaagatg 29300751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 45 - 256
Target Start/End: Original strand, 16268415 - 16268629
Alignment:
Q  45 ttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgt 144  Q
    ||||||||||| || || || |||||||| || || || ||||| |||||  || ||| |||||||| ||| || ||||| |||| |||||||||||| |    
T  16268415 ttggttaatagttgtagaatttatgaagaagacaccaaagctcattacaatataatgagtgagaggaggggtaagggacaacagaatcgtcctaagcctt 16268514  T
Q  145 acagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtga 241  Q
    ||||||| |  ||||| ||||| || |||||||||   ||||  ||| ||||||||||||  ||||   || | |||||||| || | ||| ||||||||    
T  16268515 acagtgctcttgctgacaaaggaaagcagaagatgagtgatgacaggaggcctaagaagagagatgctccttctgagattgtttgttacaagtgtggtga 16268614  T
Q  242 gaaaggccacaagag 256  Q
    |||||||||||||||    
T  16268615 gaaaggccacaagag 16268629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 183 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 22031554 - 22031425
Alignment:
Q  183 gatgttaggcggcctaagaagaaggatgctgcag---agattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatca 279  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||   |||||   || |||||||||||||| |||||||| |||||||| |  |||||| | || || |    
T  22031554 gatgataggcggcctaagaagaaggatgctccagctgagattacttgtttcaattgtggtga-aaaggccataagagcaatgtttgtcctaaagagataa 22031456  T
Q  280 agaagtgtgtccggtgtggtaagaagggtca 310  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  22031455 agaaatgtgtccggtgtggcaagaagggtca 22031425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 45 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 28984501 - 28984287
Alignment:
Q  45 ttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgt 144  Q
    |||||||| || || ||||| |||||||| || || || ||||| |||||| |  ||| |||||||| ||| || ||||| |||| |||||||||||| |    
T  28984501 ttggttaacaggtgtaggatttatgaagaagacaccaaagctcattacaagattatgagtgagaggaggggtaagggacaacagaatcgtcctaagcctt 28984402  T
Q  145 acagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaagaaggatgctgca---gagattgtgtgcttcaattgtggtga 241  Q
    ||||||| || || || || || || |||| |||||  |||| |||| |||| |||| ||  |||||| ||   |||||||| || | ||| ||||||||    
T  28984401 acagtgctcctgcggacaagggaaagcagaggatgggtgatgataggaggcccaagaggagagatgctccagttgagattgtttgttacaagtgtggtga 28984302  T
Q  242 gaaaggccacaagag 256  Q
    |||||||||||||||    
T  28984301 gaaaggccacaagag 28984287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 19985755 - 19985614
Alignment:
Q  60 aggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctg 159  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||  ||| |||| | |  ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||| || |    
T  19985755 aggatatatgaagaggataccaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgcagtggcaagggatagcagagtcgtccgaagccgtatagtgcccctgcgg 19985656  T
Q  160 ataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaaga 201  Q
    | || || ||||||| |||| | ||||  ||| |||||||||    
T  19985655 acaagggtaaacagaggatgattgatgagaggaggcctaaga 19985614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 54 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 21929009 - 21928889
Alignment:
Q  54 agctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgccc 153  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||  ||| |||| | |  || || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  21929009 agctgtagaatctatgaagaggataccaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggtaagggacaacagagtcgtcctaaaccgtatagtgctc 21928910  T
Q  154 ccgctgataaagggaaacaga 174  Q
    | ||||| ||||| |||||||    
T  21928909 ctgctgacaaaggaaaacaga 21928889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 120 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 22054378 - 22054335
Alignment:
Q  120 ggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataa 163  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22054378 ggacggcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccctgctgataa 22054335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 54 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 3274686 - 3274589
Alignment:
Q  54 agctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgc 151  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| |  ||||| |||||  |||||||||||| ||  || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  3274686 agctgcagaatctatgaggaggatacaagagctcattacaaaatagtgaatgagaagagaggtaaaggccagcaaagtcgtccaaagccttacagtgc 3274589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 160
Target Start/End: Original strand, 22027546 - 22027586
Alignment:
Q  120 ggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctga 160  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  22027546 ggacagcagagtcgtcctaaaccgtacagtgcccctgctga 22027586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 66 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 20391655 - 20391549
Alignment:
Q  66 tatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaag 165  Q
    |||||||||||||| || ||||| || |||||  ||| |||| ||| |  |||||| |||||  ||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||    
T  20391655 tatgaagaggataccaaagctcattataaggttatgagtgagcggaggaacaaaggtcagcaaggtcgtccgaagccctacagtgctcctgctgacaaag 20391556  T
Q  166 ggaaaca 172  Q
    |||||||    
T  20391555 ggaaaca 20391549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 272; Significance: 1e-152; HSPs: 35)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 3 - 310
Target Start/End: Original strand, 16233441 - 16233748
Alignment:
Q  3 aagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtga 102  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16233441 aagagggcgattggataccaacagctgagagtttttcaggatttggttaatagctgcaggatctacgaagaagatacgaaggctcactacaaggtagtga 16233540  T
Q  103 atgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaa 202  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16233541 atgaaaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgacaaagggaaacaaaagatggtcgatgttaggcggcctaagaa 16233640  T
Q  203 gaaggatgctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggtaag 302  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16233641 gaaggatgctgcagagattgtgtacttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggtaag 16233740  T
Q  303 aagggtca 310  Q
    ||||||||    
T  16233741 aagggtca 16233748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 3 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 23959310 - 23959003
Alignment:
Q  3 aagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtga 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23959310 aagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggatttggttaatagctgcagaatctacgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtga 23959211  T
Q  103 atgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaa 202  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23959210 atgaaaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgacaaaggtaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaa 23959111  T
Q  203 gaaggatgctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggtaag 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23959110 gaaggatgctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgccctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggtaag 23959011  T
Q  303 aagggtca 310  Q
    || |||||    
T  23959010 aaaggtca 23959003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 1 - 310
Target Start/End: Original strand, 19775240 - 19775549
Alignment:
Q  1 tcaagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagt 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19775240 tcaagagggcgattgggtatcaacagctgagagtttttcaggatttggttaatagctgcagaatctacgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagt 19775339  T
Q  101 gaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaag 200  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19775340 gaatgaaaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgacaaaggtaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaag 19775439  T
Q  201 aagaaggatgctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggta 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19775440 aagaaggatgctgcagagattgtgtgattcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgccctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggta 19775539  T
Q  301 agaagggtca 310  Q
    |||| |||||    
T  19775540 agaaaggtca 19775549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 3 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 27714899 - 27714592
Alignment:
Q  3 aagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtga 102  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27714899 aagagggcgattggataccaacagctgagagtttttcaggatttggttaatagctgcagaatctacgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtga 27714800  T
Q  103 atgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaa 202  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27714799 atgaaaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgacaaaggtaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaa 27714700  T
Q  203 gaaggatgctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggtaag 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27714699 gaaggatgctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgccctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggcaag 27714600  T
Q  303 aagggtca 310  Q
    || |||||    
T  27714599 aaaggtca 27714592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 8389977 - 8389668
Alignment:
Q  1 tcaagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagt 100  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8389977 tcaagagggcgattggataccagcagctgagagtttttcaggatttggttaacagctgcaggatctatgaggaggataccaaggctcactacaaggtagt 8389878  T
Q  101 gaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaag 200  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8389877 gaatgaaaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgacaagggtaaacagaagatggtcgatgttaggcgacctaag 8389778  T
Q  201 aagaaggatgctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggta 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8389777 aagaaggatgctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggta 8389678  T
Q  301 agaagggtca 310  Q
    ||||||||||    
T  8389677 agaagggtca 8389668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 310
Target Start/End: Original strand, 17091596 - 17091905
Alignment:
Q  1 tcaagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagt 100  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17091596 tcaagagggcgattggataccagcagctgagagtttttcaggatttggttaacagctgcaggatctatgaggaggataccaaggctcactacaaggtagt 17091695  T
Q  101 gaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaag 200  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17091696 gaatgaaaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgacaaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaag 17091795  T
Q  201 aagaaggatgctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggta 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17091796 aagaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggta 17091895  T
Q  301 agaagggtca 310  Q
    ||||||||||    
T  17091896 agaagggtca 17091905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 3 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 12480163 - 12479856
Alignment:
Q  3 aagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtga 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12480163 aagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggatttggttaatagctgcaggatctacgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtga 12480064  T
Q  103 atgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaa 202  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  12480063 atgaaaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgacaaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagag 12479964  T
Q  203 gaaggatgctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggtaag 302  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  12479963 gaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccataagagcaacgtctgccctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggcaag 12479864  T
Q  303 aagggtca 310  Q
    || |||||    
T  12479863 aaaggtca 12479856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 1 - 310
Target Start/End: Original strand, 14300426 - 14300735
Alignment:
Q  1 tcaagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagt 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14300426 tcaagagggcgattggataccaacagcttagagtttttcaagatttggtcaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagt 14300525  T
Q  101 gaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaag 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14300526 gaatgagaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccctgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaag 14300625  T
Q  201 aagaaggatgctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggta 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14300626 aagaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaaaagcaacgtctgccttgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggca 14300725  T
Q  301 agaagggtca 310  Q
    |||| |||||    
T  14300726 agaaaggtca 14300735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 310
Target Start/End: Original strand, 8050070 - 8050379
Alignment:
Q  1 tcaagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8050070 tcaagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggatttggtcaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagt 8050169  T
Q  101 gaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaag 200  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  8050170 gaatgaaaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccctgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgtgagacggcctaag 8050269  T
Q  201 aagaaggatgctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggta 300  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  8050270 aagagggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaagggccacaagagcaacgtctgccctgaggaaatcaagaagtgtgttcggtgtggca 8050369  T
Q  301 agaagggtca 310  Q
    |||| |||||    
T  8050370 agaaaggtca 8050379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 19635701 - 19635392
Alignment:
Q  1 tcaagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19635701 tcaagagggcgattgggtaccaacaactgagagtttttccggatttggttaatagttgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagt 19635602  T
Q  101 gaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaag 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  19635601 gaatgagaggaagggcaagggacagcagagttgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaggatggtcgatgataggcggcctaag 19635502  T
Q  201 aagaaggatgctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggta 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| |  || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  19635501 aagaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgggaaaggccacaaaagcaatgtatgccctgaagaaatcaagaagtgtgttcggtgtggca 19635402  T
Q  301 agaagggtca 310  Q
    |||| |||||    
T  19635401 agaaaggtca 19635392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 40476605 - 40476296
Alignment:
Q  1 tcaagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  40476605 tcaagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggatttggtcaatagctgcaggatctatgaagaggataccaaggctcactacaagatagt 40476506  T
Q  101 gaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaag 200  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40476505 gaacgagaggaagggcaagggacagcggagtcgtcctaagccgtacagtgcccctgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgataggcggcctaag 40476406  T
Q  201 aagaaggatgctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggta 300  Q
    |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| | |||||| |    
T  40476405 aagaaggatgctactgagattgtgtgtttcaattgtggtgggaaaggccacaaaagcaacgtctgccctgaagaaatcaagaagtgtgttcagtgtggca 40476306  T
Q  301 agaagggtca 310  Q
    |||| |||||    
T  40476305 agaaaggtca 40476296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 3 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 14684130 - 14683823
Alignment:
Q  3 aagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtga 102  Q
    |||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||  || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||    
T  14684130 aagagggcgattggataccaacagattagagtttttccagatttggtcaatagttgcaggatctatgaagaggatactaaggctcactataagattgtga 14684031  T
Q  103 atgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaa 202  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  14684030 acgagaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccatacagtgcccctgctgataaagggaaacagaggatggtcgatgataggcggcctaagaa 14683931  T
Q  203 gaaggatgctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggtaag 302  Q
    |||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||| | | ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||    
T  14683930 gaaggatgctaccgagattgtgtgtttcaattgtggtgggaaaggccacaaaagctatgtctgtcctgaagagatcaagaagtgtgtccggtgtggcaag 14683831  T
Q  303 aagggtca 310  Q
    ||||||||    
T  14683830 aagggtca 14683823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 3 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 13513916 - 13513606
Alignment:
Q  3 aagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtga 102  Q
    ||||||||||| || ||||||||| |  |||||||||  || ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |  ||||| |||||||| || |    
T  13513916 aagagggcgatcggataccaacagatccgagtttttcctgatttggtgaatagctgcagaatctatgaggaggataccagagctcattacaaggttgtta 13513817  T
Q  103 atgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaa 202  Q
    |||||||||||  ||| || ||||||||||| |||||||| || |||||||| | |||||| || || ||||  ||||| |||| |||||||||||||||    
T  13513816 atgagaggaagaccaagggccagcagagtcgccctaagccttatagtgcccctgttgataagggcaagcagagaatggttgatgataggcggcctaagaa 13513717  T
Q  203 gaaggatg---ctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggt 299  Q
    ||||||||   ||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||| || |||||||| ||||||||||||||     
T  13513716 gaaggatgctcctgcagagattgtctgtttcaactgtggcgagaaaggccacaagagcaatgtttgtcctgaagagatcaagaaatgtgtccggtgtggc 13513617  T
Q  300 aagaagggtca 310  Q
    |||||||||||    
T  13513616 aagaagggtca 13513606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 51 - 310
Target Start/End: Original strand, 18223967 - 18224229
Alignment:
Q  51 aatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtg 150  Q
    ||||||||||| ||||| || || ||||| |||||||| |||||||| ||||||||| |||||  ||| || ||||||||||| |||||||| || ||||    
T  18223967 aatagctgcagaatctacgaggaagataccaaggctcattacaaggttgtgaatgagcggaagaccaagggccagcagagtcgccctaagccttatagtg 18224066  T
Q  151 cccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaagg 247  Q
    |||| | |||||| || |||||||  |||||||||| ||| |||||||||||||||||||   |||| |||||||| || ||||| ||||| ||||||||    
T  18224067 cccctgttgataagggcaaacagagaatggtcgatgatagacggcctaagaagaaggatgctcctgcggagattgtttgtttcaactgtggcgagaaagg 18224166  T
Q  248 ccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggtaagaagggtca 310  Q
    ||||||| | || |  |||||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  18224167 ccacaagtgtaatgtttgtcctgaagagatcaagaaatgtgtccggtgtggcaagaagggtca 18224229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 309
Target Start/End: Original strand, 18604263 - 18604574
Alignment:
Q  1 tcaagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagt 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||| ||  ||||||| |  || ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |  ||||| |||||||| ||    
T  18604263 tcaagagggcgatcggataccaacaactccgagttttccctgatttggtgaacagctgtaggatctatgaagaggataccatagctcattacaaggttgt 18604362  T
Q  101 gaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaag 200  Q
     ||||||||||||   || || ||||||||||| |||||||| || | |||||| |||||||| || || ||||  |||||||||| |||||||||||||    
T  18604363 taatgagaggaagactaagggccagcagagtcgccctaagccttataatgcccctgctgataagggcaagcagagaatggtcgatgataggcggcctaag 18604462  T
Q  201 aagaaggatg---ctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtg 297  Q
    ||||||||||   || | |||||| | || || || ||||| ||||||||||||||||| || |  |||||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  18604463 aagaaggatgctccttcggagattatttgttttaactgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttgtcctgaagagatcaagaaatgtgtccggtgtg 18604562  T
Q  298 gtaagaagggtc 309  Q
    | || |||||||    
T  18604563 gcaaaaagggtc 18604574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 3 - 256
Target Start/End: Original strand, 16248122 - 16248378
Alignment:
Q  3 aagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtga 102  Q
    |||||||||||  | ||||||||| |  ||||||| |  || |||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  16248122 aagagggcgatcagataccaacagatccgagttttccctgatttggttaatagctgcaggatctataaggaggatactaaggctcattacaaggttgtga 16248221  T
Q  103 atgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaa 202  Q
    |||||  ||||   || || ||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||  ||||||  |||||||||| |||||||||||||||    
T  16248222 atgagcagaagactaagggccagcagagtcgccctaagccctatagtgcccctgctgataagggccaacagagaatggtcgatgataggcggcctaagaa 16248321  T
Q  203 gaaggatgctgca---gagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagag 256  Q
    |||||||||| ||   ||||||   || ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16248322 gaaggatgctccaactgagattacatgtttcaattatggtgagaaaggccacaagag 16248378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Original strand, 16350188 - 16350397
Alignment:
Q  3 aagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtga 102  Q
    |||||||| ||||| ||||||||| |  |||||||||  || ||||| || | ||| || |||||||| ||||| || || ||||| |||||||| || |    
T  16350188 aagagggcaattggataccaacagatccgagtttttcctgatttggtgaacaactgtagaatctatgaggaggacaccaaagctcattacaaggttgtaa 16350287  T
Q  103 atgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaa 202  Q
    ||||| |||||   || || ||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| || |||||||  |||||||||| |||||||||||||||    
T  16350288 atgagcggaagactaagggccagcagagtcgccctaagccctatagtgcccctgctgataagggcaaacagagaatggtcgatgataggcggcctaagaa 16350387  T
Q  203 gaaggatgct 212  Q
    ||||||||||    
T  16350388 gaaggatgct 16350397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 45 - 256
Target Start/End: Original strand, 3261542 - 3261756
Alignment:
Q  45 ttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgt 144  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||| || || || ||||| |||||| || ||| |||||||| ||| || |||||||||| |||||||||||| |    
T  3261542 ttggttaataggtgcagaatctatgaagaagacaccaaagctcattacaagataatgagtgagaggaggggtaagggacagcagaatcgtcctaagcctt 3261641  T
Q  145 acagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtga 241  Q
    ||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||  |||| |||| |||| |||| ||  ||||   |||  |||||||| |||| ||| ||||||||    
T  3261642 acagtgctcctgctgacaaaggaaagcagaagatgggtgatgataggaggcccaagaggagagatgctcctgttgagattgtttgctacaagtgtggtga 3261741  T
Q  242 gaaaggccacaagag 256  Q
    |||||||||||||||    
T  3261742 gaaaggccacaagag 3261756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 57 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 8548 - 8332
Alignment:
Q  57 tgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 156  Q
    ||||| || ||||| |||||||| ||| |||| |||||| | ||||||||| | || | |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |    
T  8548 tgcagaatttatgaggaggataccaagactcattacaagattgtgaatgagcgaaaagccaaaggtcagcagagtcgtcctaagccttacagtgctcctg 8449  T
Q  157 ctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaa 253  Q
    ||||||| || |||||||  ||||| ||||  ||||| ||||  ||||| ||||   |||  |||||||| ||||  | |||||||||||||||||||||    
T  8448 ctgataagggtaaacagagaatggttgatgagaggcgccctataaagaaagatgctcctgttgagattgtctgctatacttgtggtgagaaaggccacaa 8349  T
Q  254 gagcaacgcctgtcctg 270  Q
    ||| || || |||||||    
T  8348 gagtaatgcttgtcctg 8332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 7357824 - 7357574
Alignment:
Q  12 attgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagagga 111  Q
    |||||||| |||||| | ||||| |||   || |||||||| || || ||||| |||||||| || || |||||||| |||||| || ||| ||||||||    
T  7357824 attgggtatcaacagatcagagtcttttctgagttggttaacaggtgtaggatttatgaagaagacaccaaggctcattacaagataatgagtgagagga 7357725  T
Q  112 agggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaagaaggatg- 210  Q
     ||| || ||||| |||| |||||||||||| |||| ||| || ||||| ||||| || ||||||||||  |||| |||| |||| |||| ||  ||||     
T  7357724 ggggtaagggacaacagaatcgtcctaagccttacattgctcctgctgacaaaggaaagcagaagatgggtgatgataggaggcccaagaggagagatgc 7357625  T
Q  211 --ctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaa 259  Q
      |||| |||||||| || | |||  |||||||||||||||||||||||||    
T  7357624 tcctgctgagattgtttgttacaagagtggtgagaaaggccacaagagcaa 7357574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 57 - 256
Target Start/End: Original strand, 15536 - 15738
Alignment:
Q  57 tgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 156  Q
    ||||| || ||||| |||||||| ||| |||| |||||| | ||||||||| | || | |||||| |||||||||||||||||| | |||||||| || |    
T  15536 tgcagaatttatgaggaggataccaagactcattacaagattgtgaatgagcgaaaagtcaaaggtcagcagagtcgtcctaagacttacagtgctcctg 15635  T
Q  157 ctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaa 253  Q
    ||||||| || |||||||  ||||| ||||  ||||| ||||  ||||| ||||   |||  |||||||| ||||  | |||||||||||||||||||||    
T  15636 ctgataagggtaaacagagaatggttgatgagaggcgccctagaaagaaagatgctcctgttgagattgtctgctatacttgtggtgagaaaggccacaa 15735  T
Q  254 gag 256  Q
    |||    
T  15736 gag 15738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 57 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 14162982 - 14162841
Alignment:
Q  57 tgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 156  Q
    |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||   ||| |  || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |    
T  14162982 tgcaggatttatgaaaaggatactaaggctcactacaaggttgtgaacgaacagaaagttaagggacaacagagtcgtcctaagccttacagtgctcctg 14162883  T
Q  157 ctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggccta 198  Q
    ||||||| || |||||||  |||||||| | |||||| ||||    
T  14162882 ctgataagggtaaacagagaatggtcgaggataggcgcccta 14162841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 84 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 20893516 - 20893338
Alignment:
Q  84 gctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcg 183  Q
    ||||| |||||| || ||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||| ||||| || |||||||||   |    
T  20893516 gctcattacaagataatgagtgagaggaggggcaagggacagcagagtcgtcctaagccttaaagtgctcctgctgacaaaggaaagcagaagatgaatg 20893417  T
Q  184 atgttaggcggcctaagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaa 259  Q
    ||| |||| ||||||||| ||  ||||   || | |||||||| || | ||| |||||||| |||||| ||||||||||    
T  20893416 atgataggaggcctaagaggagagatgctccttctgagattgtttgttacaagtgtggtgaaaaaggcaacaagagcaa 20893338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 45 - 256
Target Start/End: Original strand, 29450285 - 29450499
Alignment:
Q  45 ttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgt 144  Q
    ||||||||||| ||||  || |||||||| || || || ||||| || ||| |  ||| |||||||| ||| || ||||| |||| ||||||||| || |    
T  29450285 ttggttaataggtgcaaaatttatgaagaagacaccaaagctcattataagattatgagtgagaggaggggtaagggacaacagaatcgtcctaaacctt 29450384  T
Q  145 acagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtga 241  Q
    ||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||  |||| |||| ||||||||| ||  ||||   |||  |||||||| |||| ||| ||||||||    
T  29450385 acagtgctcctgctgacaaaggaaagcagaagatgggtgatgataggaggcctaagaggagagatgctcctgttgagattgtttgctacaagtgtggtga 29450484  T
Q  242 gaaaggccacaagag 256  Q
    |||||||||||||||    
T  29450485 gaaaggccacaagag 29450499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 45 - 256
Target Start/End: Original strand, 44658614 - 44658828
Alignment:
Q  45 ttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgt 144  Q
    |||||||| || || || ||||||||||| || || || ||||| |||||| || ||| |||||||| ||| || ||||| |||| |||||||||||| |    
T  44658614 ttggttaacaggtgtagaatctatgaagaagacaccaaagctcattacaagataatgagtgagaggaggggtaagggacaacagaatcgtcctaagcctt 44658713  T
Q  145 acagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtga 241  Q
    ||||||| || || || ||||| || ||||||||||   ||| |||| |||| |||| ||  ||||   |||  |||||||| |||| ||| ||||||||    
T  44658714 acagtgctcctgcggacaaaggaaagcagaagatgggtcatgataggaggcccaagaggagagatgctcctgttgagattgtttgctacaagtgtggtga 44658813  T
Q  242 gaaaggccacaagag 256  Q
    |||||||||||||||    
T  44658814 gaaaggccacaagag 44658828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 57 - 184
Target Start/End: Original strand, 15144448 - 15144575
Alignment:
Q  57 tgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 156  Q
    |||||||| || || |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| |||||   || || ||||||||||| |||||||| || || ||||| |    
T  15144448 tgcaggatttacgaggaggataccaaggctcattacaaggtcgtgaatgagcggaagactaagggccagcagagtcgccctaagccttatagcgcccctg 15144547  T
Q  157 ctgataaagggaaacagaagatggtcga 184  Q
    ||||||| || |||||||  ||||||||    
T  15144548 ctgataagggcaaacagagaatggtcga 15144575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 16219703 - 16219585
Alignment:
Q  54 agctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgccc 153  Q
    |||||||| |||||||  || |||||||||| ||| || ||| | ||||||||||||||  ||||||| |||| ||||||||| ||||| |||||||| |    
T  16219703 agctgcagaatctatgtggaagatacgaaggatcattataagattgtgaatgagaggaaaagcaaaggtcagccgagtcgtccaaagccttacagtgctc 16219604  T
Q  154 ccgctgataaagggaaaca 172  Q
    | |||||||| || |||||    
T  16219603 ctgctgataagggaaaaca 16219585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 16223023 - 16222905
Alignment:
Q  54 agctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgccc 153  Q
    |||||||| |||||||  || |||||||||| ||| || ||| | ||||||||||||||  ||||||| |||| ||||||||| ||||| |||||||| |    
T  16223023 agctgcagaatctatgtggaagatacgaaggatcattataagattgtgaatgagaggaaaagcaaaggtcagccgagtcgtccaaagccttacagtgctc 16222924  T
Q  154 ccgctgataaagggaaaca 172  Q
    | |||||||| || |||||    
T  16222923 ctgctgataagggaaaaca 16222905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 71 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 14697599 - 14697507
Alignment:
Q  71 agaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataa 163  Q
    ||||||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||||||||    
T  14697599 agaggataccaaagctcattacaaagttgtgaatgagaggaaaggcaagggtcagcaaagtcgtccaaagccttacagtgctcctgctgataa 14697507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 53 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 16151152 - 16151029
Alignment:
Q  53 tagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcc 152  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| || || ||||| ||||||||  ||| |||  | | |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||     
T  16151152 tagctgcagaatctatgaggaggacacaaaagctcattacaaggtgatgagtgatcgaaggggcaaaggacagcagagtcgtccgaagccgtatagtgct 16151053  T
Q  153 cccgctgataaagggaaacagaag 176  Q
    ||  |||| ||||| || ||||||    
T  16151052 cctactgacaaaggaaagcagaag 16151029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 53 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 16155298 - 16155175
Alignment:
Q  53 tagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcc 152  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| || || ||||| ||||||||  ||| |||  | | |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||     
T  16155298 tagctgcagaatctatgaggaggacacaaaagctcattacaaggtgatgagtgatcgaaggggcaaaggacagcagagtcgtccgaagccgtatagtgct 16155199  T
Q  153 cccgctgataaagggaaacagaag 176  Q
    ||  |||| ||||| || ||||||    
T  16155198 cctactgacaaaggaaagcagaag 16155175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 53 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 18259957 - 18259850
Alignment:
Q  53 tagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcc 152  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||| ||  |||| ||||||||  ||| |||| | | |||||| ||||||||||||| ||| |||||||| |||||     
T  18259957 tagctacaggatctatgaagaagatacaaaatctcattacaaggtgatgagtgagcgtaggggcaagggacagcagagtcatccgaagccgtatagtgct 18259858  T
Q  153 cccgctga 160  Q
    || |||||    
T  18259857 cctgctga 18259850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 66 - 259
Target Start/End: Original strand, 11204001 - 11204197
Alignment:
Q  66 tatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaag 165  Q
    |||||||| || || || ||||| |||||| || ||| |||||||| ||| || |||||||||| |||||||||||| || ||||| || ||||| ||||    
T  11204001 tatgaagaagacaccaaagctcattacaagataatgagtgagaggaggggtaagggacagcagaatcgtcctaagccttatagtgctcctgctgacaaag 11204100  T
Q  166 ggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaa 259  Q
    | ||  ||||||||   |||| |||| | || |||| ||  ||||   || | |||||||| || |  || ||||||||||||||||||||||||||    
T  11204101 gaaagtagaagatgaatgatgataggagacccaagaggagagatgctccttctgagattgtttgttataagtgtggtgagaaaggccacaagagcaa 11204197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 57 - 160
Target Start/End: Original strand, 14993127 - 14993230
Alignment:
Q  57 tgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 156  Q
    ||||| || ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||  ||| |||| | |  ||||| ||||| ||||||||||  |||||||| |||||||| |    
T  14993127 tgcagaatttatgaagaggatatgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgtctgaagccgtatagtgcccctg 14993226  T
Q  157 ctga 160  Q
    ||||    
T  14993227 ctga 14993230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 53 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 15073875 - 15073754
Alignment:
Q  53 tagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcc 152  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| || ||||| || |||||  ||| |||| | |  || || ||||||| ||||||||| || ||||| |||||     
T  15073875 tagctgtaggatctatgaagaggatacaaaagctcattataaggtgatgagtgagcgtagaggtaagggacagctgagtcgtccgaaaccgtatagtgct 15073776  T
Q  153 cccgctgataaagggaaacaga 174  Q
    || ||||| ||||  |||||||    
T  15073775 cctgctgacaaagttaaacaga 15073754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 266; Significance: 1e-148; HSPs: 35)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 1 - 310
Target Start/End: Original strand, 41350448 - 41350756
Alignment:
Q  1 tcaagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagt 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  41350448 tcaagagggcgcttgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttcatagctgcagg-tctatgaagaggatacgaaggcttactacaaggtagt 41350546  T
Q  101 gaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaag 200  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41350547 gaatgagaggaagggtaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgacaagggtaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaag 41350646  T
Q  201 aagaaggatgctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggta 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41350647 aagaaggatgctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgttctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggta 41350746  T
Q  301 agaagggtca 310  Q
    ||||||||||    
T  41350747 agaagggtca 41350756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 3 - 310
Target Start/End: Original strand, 16347375 - 16347683
Alignment:
Q  3 aagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggactt-ggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtg 101  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16347375 aagagggcgattggataccaacagctgagagtttttcaggattttggttaatagctgcaggatctacgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtg 16347474  T
Q  102 aatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaaga 201  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16347475 aatgagaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgacaagggtaaacagaagatggtcgacgttaggcggcctaaga 16347574  T
Q  202 agaaggatgctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggtaa 301  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16347575 agaaggatgctgctgagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgttctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggtaa 16347674  T
Q  302 gaagggtca 310  Q
    |||||||||    
T  16347675 gaagggtca 16347683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 3 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 21833880 - 21833573
Alignment:
Q  3 aagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtga 102  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21833880 aagagggcgattggataccaacagctaagagtttttcaggatttggttaatagctgcaggatctatggagaggatacgaaggctcactacaaggtagtga 21833781  T
Q  103 atgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaa 202  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21833780 atgagaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaatagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaa 21833681  T
Q  203 gaaggatgctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggtaag 302  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21833680 gaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaaaagcaacgtctgccctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggcaag 21833581  T
Q  303 aagggtca 310  Q
    || |||||    
T  21833580 aaaggtca 21833573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 3 - 310
Target Start/End: Original strand, 51330273 - 51330580
Alignment:
Q  3 aagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtga 102  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51330273 aagagggcgattggataccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtga 51330372  T
Q  103 atgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaa 202  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  51330373 atgagaggaagggtaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccctgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgtcaggcggcctaagaa 51330472  T
Q  203 gaaggatgctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggtaag 302  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  51330473 gaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggagagagaggccacaaaagcaacgtctgccctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggcaag 51330572  T
Q  303 aagggtca 310  Q
    || |||||    
T  51330573 aaaggtca 51330580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 310
Target Start/End: Original strand, 33387808 - 33388117
Alignment:
Q  1 tcaagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33387808 tcaagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttccgaatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagt 33387907  T
Q  101 gaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaag 200  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33387908 gaatgaaaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgacaaaggtaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaag 33388007  T
Q  201 aagaaggatgctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggta 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||  || || ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  33388008 aagaaggatgctgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaaaagcaacgtttgcccggaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggca 33388107  T
Q  301 agaagggtca 310  Q
    |||| |||||    
T  33388108 agaaaggtca 33388117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 21842792 - 21842483
Alignment:
Q  1 tcaagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagt 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  21842792 tcaagagggcgattggataccaacagcttagagtttttcaggatttggtcaatagctgcaggatctatgaagaggataccaaggctcactacaagatagt 21842693  T
Q  101 gaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaag 200  Q
    ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  21842692 gaacgagaggaagggcaagggacatcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgatagacggcctaag 21842593  T
Q  201 aagaaggatgctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggta 300  Q
    |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  21842592 aagaaggatgctactgagattgtgtgtttcaattgtggtgggaaaggccacaaaagcaatgtctgccctgaggaaatcaagaagtgtgtccgatgtggca 21842493  T
Q  301 agaagggtca 310  Q
    |||| |||||    
T  21842492 agaaaggtca 21842483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 22400900 - 22400591
Alignment:
Q  1 tcaagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagt 100  Q
    |||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||    
T  22400900 tcaaaagggcgattggatgccaacagcttagagtttttctggatttggtcaatagctgcaggatctatgaagaggataccaaggctcactataagattgt 22400801  T
Q  101 gaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaag 200  Q
    ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  22400800 gaacgagaggaagggcaagggagagcagagtcgtcctaagctgtacagtgcccctgctgataaagggaaacagaggatggtcgatgataggcggcctaag 22400701  T
Q  201 aagaaggatgctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggta 300  Q
    |||| ||||||| | ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| || || || | ||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| |    
T  22400700 aagatggatgctactgagattgtgtgtttcaattgtggagggaaaggccataaaagtaatgtctgccctgaagagatcaagaagtgtgtccggtgtggca 22400601  T
Q  301 agaagggtca 310  Q
    ||||||||||    
T  22400600 agaagggtca 22400591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 3 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 19109947 - 19109639
Alignment:
Q  3 aagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtga 102  Q
    |||||||||||||| ||||||||| | |||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| | || |    
T  19109947 aagagggcgattggataccaacagattagagttttcc-ggatttggtcaatagctgcaggatctatgaagaggatactaaggctcactgtaagattgtca 19109849  T
Q  103 atgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaa 202  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||    
T  19109848 atgagaggaagggcaagggacaacagagtcgtcctaagccgtacagtgcccctgctgataaagggaaacagaggatggttgatgataggcggcctaagaa 19109749  T
Q  203 gaaggatgctgcagagattgtgtg--cttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggta 300  Q
    |||||||||| | |||||||||||   ||||||||| ||| |||||| ||| | ||||| | ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |    
T  19109748 gaaggatgctaccgagattgtgtgtttttcaattgttgtgtgaaaggtcactaaagcaatgtctgtcctgaagagatcaagaagtgtgtccggtgtggca 19109649  T
Q  301 agaagggtca 310  Q
    ||||||||||    
T  19109648 agaagggtca 19109639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 3 - 180
Target Start/End: Original strand, 16354024 - 16354201
Alignment:
Q  3 aagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtga 102  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16354024 aagagggcgattggataccaacagctgagagtttttcaggatttggttaatagctgcaggatctacgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtga 16354123  T
Q  103 atgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatgg 180  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  16354124 atgagaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgacaagggtaaacagaagatgg 16354201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 3 - 310
Target Start/End: Original strand, 21228334 - 21228644
Alignment:
Q  3 aagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtga 102  Q
    ||||||||||| || ||||||||| |  ||||||| |  || || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  21228334 aagagggcgatcggataccaacagatctgagttttccctgatttagttaatagctgcaggatctatgaggaggatactaaggctcattacaaggttgtga 21228433  T
Q  103 atgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaa 202  Q
    |||||  ||||   || || ||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| || |||||||  |||||||||| |||||||||||||||    
T  21228434 atgagcagaagactaagggccagcagagtcgccctaagccctatagtgcccctgctgataagggtaaacagagaatggtcgatgataggcggcctaagaa 21228533  T
Q  203 gaaggatg---ctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggt 299  Q
    ||||||||   |||| |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| || |  |||| ||  || |||||||| |||||| |||||||     
T  21228534 gaaggatgctcctgcggagattgtttgtttcaactgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttgtcttgtagagatcaagaaatgtgtcaggtgtggc 21228633  T
Q  300 aagaagggtca 310  Q
    |||||||||||    
T  21228634 aagaagggtca 21228644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 45 - 310
Target Start/End: Original strand, 24784677 - 24784945
Alignment:
Q  45 ttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgt 144  Q
    ||||| || ||||| || |||||||| |||||||  |||||||| |||||||| ||||||||| |||||   || || || |||||||  |||||||| |    
T  24784677 ttggtgaacagctgtagaatctatgaggaggataacaaggctcattacaaggttgtgaatgagcggaagactaagggccaacagagtctccctaagccct 24784776  T
Q  145 acagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaagaaggatgct---gcagagattgtgtgcttcaattgtggtga 241  Q
    | |||||| | |||||||| || |||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||   || |||||||| || ||||||| ||||||    
T  24784777 atagtgcctctgctgataagggcaaacagagaatggtcgatgataggcggcctaagaagaaggatgctcctgcggagattgtctgtttcaattatggtga 24784876  T
Q  242 gaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggtaagaagggtca 310  Q
    |||||||||||||||||| |  ||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||| |||||||||||    
T  24784877 gaaaggccacaagagcaatgtttgtccagaggagataaagaaatgtgcccggtgtggcaagaagggtca 24784945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 310
Target Start/End: Original strand, 17041792 - 17042103
Alignment:
Q  1 tcaagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagt 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||| ||  ||||||| |  || ||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| |  ||||| |||||||| ||    
T  17041792 tcaagagggcgatcggataccaacaactccgagttttccctgatttggtgaacagctgtaggatctacgaagaggataccagagctcattacaaggttgt 17041891  T
Q  101 gaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaag 200  Q
     ||||||||||||   || || ||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| || || ||||  |||||||||| |||||||||||||    
T  17041892 taatgagaggaagactaagggccagcagagtcgccctaagccttatagtgcccctgctgataagggcaagcagagaatggtcgatgataggcggcctaag 17041991  T
Q  201 aagaaggatg---ctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtg 297  Q
    ||||||||||   || | |||||| | || ||||| ||||| | ||||||||||||||| || |  | |||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  17041992 aagaaggatgctccttcggagatt-tttgtttcaactgtggcgggaaaggccacaagagtaatgtttatcctgaagagatcaagaaatgtgtccggtgtg 17042090  T
Q  298 gtaagaagggtca 310  Q
    | |||||||||||    
T  17042091 gcaagaagggtca 17042103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 72 - 268
Target Start/End: Original strand, 20081223 - 20081422
Alignment:
Q  72 gaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaac 171  Q
    |||||||| |||||||| |||||| | ||||||||| |||||   || || ||||||||||| | |||||| || || ||||| |||||||| || ||||    
T  20081223 gaggataccaaggctcattacaagatcgtgaatgagcggaagactaacggccagcagagtcgccttaagccttatagcgcccctgctgataagggcaaac 20081322  T
Q  172 agaagatggtcgatgttaggcggcctaagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcc 268  Q
    |||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||    ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  20081323 agagaatggtcgatgataggcggcctaagaagaaggatgttcatgctgagattgtctgctttaattgtggtgagaaaggccacaagagcaatgcttgtcc 20081422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 45 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 21176906 - 21176689
Alignment:
Q  45 ttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgt 144  Q
    ||||| ||||| || || |||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| |||||   || || ||||||||| | |||||| | |    
T  21176906 ttggtgaatagttgtagaatctatgaggaggataccaaggctcattacaaggttgtgaatgagcggaagactaagggccagcagagtagccctaagacat 21176807  T
Q  145 acagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaagaaggatgctgcag---agattgtgtgcttcaattgtggtga 241  Q
    | |||||||| |||||||| || |||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |   ||||||| ||  | |||||||||||    
T  21176806 atagtgcccctgctgataagggcaaacagagaatggtcgatgataggcggcctaagaagaaggatgctcctgtggagattgtctgtattaattgtggtga 21176707  T
Q  242 gaaaggccacaagagcaa 259  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  21176706 gaaagtccacaagagcaa 21176689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 53 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 22402123 - 22401903
Alignment:
Q  53 tagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcc 152  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||| | || |||||| |||||   || || ||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  22402123 tagctgcaggatttatgaggaggatactaaggctcattacaagattgtaaatgagcggaagactaagggtcagcagagtcgccctaagccttacagtgcc 22402024  T
Q  153 cccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggcc 249  Q
    || |||||||| || |||||||  |||||||| | ||| || ||||||||||||||||   ||||||| ||| | || || | |||||||||||||||||    
T  22402023 cctgctgataagggcaaacagagaatggtcgaagatagacgacctaagaagaaggatgctcctgcagaaattttctgttttacttgtggtgagaaaggcc 22401924  T
Q  250 acaagagcaacgcctgtcctg 270  Q
    ||||||| || || |||||||    
T  22401923 acaagagtaatgcttgtcctg 22401903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 3 - 310
Target Start/End: Original strand, 22435521 - 22435821
Alignment:
Q  3 aagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtga 102  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |   ||||||||  || ||||| || | ||| || |||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  22435521 aagagggcgattggataccaacagatccaagtttttcccgagttggtgaacaactgtagaatctatgaggaggataccaaggctcattacaaggttgtga 22435620  T
Q  103 atgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaa 202  Q
    ||||| |||||   || || ||||||||||| |||||||| || ||||||||  ||||||| || |||||||  |||||| ||| ||||       ||||    
T  22435621 atgagcggaagactaagggccagcagagtcgccctaagccctatagtgcccctactgataagggaaaacagagaatggtcaatgatagg-------agaa 22435713  T
Q  203 gaaggatgctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggtaag 302  Q
    | | | | ||||  ||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| |||||  | ||||| ||| |||| ||||| |||    
T  22435714 ggatgctcctgcgaagattgtctatttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaatgtttgtccagaggaggtaaagaaatgtttccgatgtggcaag 22435813  T
Q  303 aagggtca 310  Q
    ||||||||    
T  22435814 aagggtca 22435821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 45 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 48426443 - 48426229
Alignment:
Q  45 ttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgt 144  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||| || || || ||||| |||||| || ||| |||||||| ||| || ||||| |||| |||||||||||| |    
T  48426443 ttggttaataggtgcagaatctatgaagaagacaccaaagctcattacaagataatgagtgagaggaggggtaagggacaacagaatcgtcctaagcctt 48426344  T
Q  145 acagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtga 241  Q
    ||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||  |||| |||| |||| |||| ||  ||||   |||  |||||||| |||| ||| ||||||||    
T  48426343 acagtgctcctgctgacaaaggaaagcagaagatgggtgatgataggaggcccaagaggagagatgctcctgttgagattgtttgctacaagtgtggtga 48426244  T
Q  242 gaaaggccacaagag 256  Q
    |||||||||||||||    
T  48426243 gaaaggccacaagag 48426229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 57 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 16379621 - 16379504
Alignment:
Q  57 tgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 156  Q
    |||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| |||| ||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||| | |    
T  16379621 tgcaggatttatgaggaggatactaaggctcattacaaggttgtgaatgagcggaaaggcaagggtcaacagagtcgtcctaagccttacagtgcctctg 16379522  T
Q  157 ctgataaagggaaacaga 174  Q
    ||||||| || |||||||    
T  16379521 ctgataagggcaaacaga 16379504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 45 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 37680619 - 37680405
Alignment:
Q  45 ttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgt 144  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||| || || || ||||| |||||| || ||| |||||||| ||| || ||||| |||| |||||||||||| |    
T  37680619 ttggttaataggtgcagaatctatgaagaagacaccaaagctcattacaagataatgagtgagaggaggggtaagggacaacagaatcgtcctaagcctt 37680520  T
Q  145 acagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaagaagga---tgctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtga 241  Q
    ||||||| ||  |||| ||||| || ||||||||||  |||| |||| |||| |||| ||  ||   | |||  |||||||| |||| ||| ||||||||    
T  37680519 acagtgctcctactgacaaaggaaagcagaagatgggtgatgataggaggcccaagaggagagatactcctgttgagattgtttgctacaagtgtggtga 37680420  T
Q  242 gaaaggccacaagag 256  Q
    |||||||||||||||    
T  37680419 gaaaggccacaagag 37680405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 57 - 257
Target Start/End: Original strand, 22496088 - 22496291
Alignment:
Q  57 tgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 156  Q
    |||||||| || || |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| |||||   || || || |||||||  |||||||| || || ||||| |    
T  22496088 tgcaggatttacgaggaggataccaaggctcattacaaggtcgtgaatgagcggaagacgaagggccaccagagtctccctaagccttatagcgcccctg 22496187  T
Q  157 ctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaa 253  Q
    ||||||| || |||||||  ||||||||   ||| ||||| | |||||||||||   |||  |||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  22496188 ctgataagggaaaacagagaatggtcgagtatagacggccaaggaagaaggatgttcctgttgagattgtctgctttaattatggtgagaaaggccacaa 22496287  T
Q  254 gagc 257  Q
    ||||    
T  22496288 gagc 22496291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 66 - 259
Target Start/End: Original strand, 20074550 - 20074746
Alignment:
Q  66 tatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaag 165  Q
    |||||||| || || || ||||| |||||| || ||| |||||||| ||| || |||||||||| |||||||||||| ||||||||  | ||||| ||||    
T  20074550 tatgaagaagacaccaaagctcattacaagataatgagtgagaggaggggtaagggacagcagaatcgtcctaagccttacagtgcttctgctgacaaag 20074649  T
Q  166 ggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaagaaggatgct---gcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaa 259  Q
    | || |||||||||   ||||  ||| ||| ||||| ||  ||||||    | ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20074650 gaaagcagaagatgagtgatgacaggaggcttaagaggagagatgctcccactgagattgtgtgttacaagtgtggtgagaaaggccacaagagcaa 20074746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 57 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 21752574 - 21752318
Alignment:
Q  57 tgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 156  Q
    |||||||| ||||| || ||||| ||| |||| |||||| | ||||||||| | || |  || || |||||||||||||||||||| ||||||||| | |    
T  21752574 tgcaggatttatgaggaagataccaagactcattacaagattgtgaatgagcgaaaagctaagggtcagcagagtcgtcctaagccttacagtgccactg 21752475  T
Q  157 ctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaa 253  Q
    ||||||| || |||||||   |||| || | |||||  || |  ||||| ||||   |||  |||||||| ||||  | |||||||||||||||||| ||    
T  21752474 ctgataagggaaaacagagagtggttgaagataggcacccgagaaagaaagatgctcctgatgagattgtctgctatacttgtggtgagaaaggccaaaa 21752375  T
Q  254 gagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggtaagaagggtca 310  Q
    |||||| || ||| ||| |||  | |||| |||| | || |||||||||||||||||    
T  21752374 gagcaatgcttgtactggggatgttaagaggtgttttcgctgtggtaagaagggtca 21752318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 45 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 20297953 - 20297739
Alignment:
Q  45 ttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgt 144  Q
    |||||||| || || || || |||||||| || || || ||||| |||||| || ||| |||||||| ||| || ||||| |||| |||||||||||| |    
T  20297953 ttggttaacaggtgtagaatttatgaagaagacaccaaagctcattacaagataatgagtgagaggaggggtaagggacatcagaatcgtcctaagcctt 20297854  T
Q  145 acagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtga 241  Q
    ||||||| ||  |||| || || |||||||||||||  ||||  ||| |||| |||| ||  ||||   |||| |||||||| || | ||| ||||||||    
T  20297853 acagtgctcctactgacaagggaaaacagaagatgggtgatgacaggaggcccaagaggagagatgctcctgctgagattgtttgttacaagtgtggtga 20297754  T
Q  242 gaaaggccacaagag 256  Q
    |||| ||||||||||    
T  20297753 gaaatgccacaagag 20297739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 104 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 52989252 - 52989094
Alignment:
Q  104 tgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaag 203  Q
    |||||||| ||| || |||||||| | |||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| || |||||||||   |||| |||| ||||||||| |    
T  52989252 tgagaggaggggtaagggacagcaaaatcgtcctaagccttacagtgctcctgctgacaaaggaaagcagaagatgaatgatgataggaggcctaagagg 52989153  T
Q  204 aaggatg---ctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaa 259  Q
    |  ||||   || | |||||||| || | ||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  52989152 agagatgctccttctgagattgtttgttacaagtgtggtgaaaaaggccacaagagcaa 52989094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 66 - 256
Target Start/End: Original strand, 38909667 - 38909860
Alignment:
Q  66 tatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaag 165  Q
    |||||||| || || || ||||| |||||| || ||| || ||||| ||| || ||||| |||| ||||||||| || |||||||| || ||||| ||||    
T  38909667 tatgaagaagacaccaaagctcattacaagataatgagtgggaggaggggtaagggacaacagaatcgtcctaaaccttacagtgctcctgctgacaaag 38909766  T
Q  166 ggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaagaaggatgctgcag---agattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagag 256  Q
    | || |||| |||||  |||| |||| |||| |||| ||  |||||| | |   ||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  38909767 gaaagcagaggatgggtgatgataggaggcccaagaggagagatgctcctgttgagattgtttgctacaagtgtggtgagaaaggccacaagag 38909860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 54 - 160
Target Start/End: Original strand, 22015574 - 22015680
Alignment:
Q  54 agctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgccc 153  Q
    ||||| |||||||||||||| | |||||| ||||| ||||||||  ||| |||| | | ||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |    
T  22015574 agctgtaggatctatgaagaagttacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtaggggaaagggacagcagagtcgtccgaagccgtatagtgctc 22015673  T
Q  154 ccgctga 160  Q
    | |||||    
T  22015674 ctgctga 22015680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 75 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 22117223 - 22117126
Alignment:
Q  75 gatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaaca 172  Q
    ||||| |||||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||  || |||||||| || |||||    
T  22117223 gatactaaggctcattacaaggttttgaatgagaggaaaggcaagggtcagcaaagtcgtccaaagccttacagtgttcctgctgataagggaaaaca 22117126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 53 - 151
Target Start/End: Original strand, 21742380 - 21742478
Alignment:
Q  53 tagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgc 151  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||| |||| | |  || || |||||| |||||||||| || ||||| |||||    
T  21742380 tagctgcaggatatatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgcagaggtaagggacagtagagtcgtccgaaaccgtatagtgc 21742478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 66 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 21961576 - 21961380
Alignment:
Q  66 tatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaag 165  Q
    |||||||| || || || ||||| |||||| || ||| ||||||||  || || |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||  |||| ||||    
T  21961576 tatgaagaagacaccaaagctcattacaagataatgagtgagaggagaggtaagggacagcagaatcgtcctaagccttacagtgctccttctgacaaag 21961477  T
Q  166 ggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaa 259  Q
    | || |||||||||   |||| |||| | || |||| ||  ||||   || | |||||||| || | ||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  21961476 gaaagcagaagatgaatgatgataggagacccaagaggagagatgctccttctgagattgtttgttacaagtgtggtgaaaaaggccacaagagcaa 21961380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 66 - 259
Target Start/End: Original strand, 31536838 - 31537034
Alignment:
Q  66 tatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaag 165  Q
    |||||||| || || || ||||| |||||| || ||| |||||||| ||| || |||||||||| |||||||||||| || ||||| || ||||| ||||    
T  31536838 tatgaagaagacaccaaagctcattacaagataatgagtgagaggaggggtaagggacagcagaatcgtcctaagccttatagtgctcctgctgacaaag 31536937  T
Q  166 ggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaa 259  Q
    | || |||| ||||   |||| |||| | || |||| ||  ||||   || | |||||||| || |  || ||||||||||||||||||||||||||    
T  31536938 gaaagcagaggatgaatgatgataggagacccaagaggagagatgctccttctgagattgtttgttataagtgtggtgagaaaggccacaagagcaa 31537034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 53 - 97
Target Start/End: Original strand, 21738864 - 21738908
Alignment:
Q  53 tagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggt 97  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  21738864 tagctgcaggatatatgaagaggatacgaaagctcattacaaggt 21738908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 62 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 19857827 - 19857630
Alignment:
Q  62 gatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgat 161  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  ||| |||  | |  || || ||||| |||||||||||||| || || ||||| || |||||     
T  19857827 gatctatgaagaggatactaaggctcattacaaggtgatgagtgaacgcagaggtaagggacaacagagtcgtcctaaaccatatagtgctcctgctgac 19857728  T
Q  162 aaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaagaaggatgctgca---gagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagag 256  Q
    || || || |||| | ||   ||||  ||| ||||||||| ||  |||||| |    |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  19857727 aagggtaagcagaggttgaatgatgagaggaggcctaagaggagagatgcttctaccgagattgtttgcttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagag 19857630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 126 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 20921897 - 20921860
Alignment:
Q  126 cagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataa 163  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  20921897 cagagtcgtcctaagccttacagtgctcccgctgataa 20921860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 216 - 256
Target Start/End: Original strand, 21739030 - 21739070
Alignment:
Q  216 gagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagag 256  Q
    |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21739030 gagattatttgcttcaagtgtggtgagaaaggccacaagag 21739070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 216 - 256
Target Start/End: Original strand, 21742546 - 21742586
Alignment:
Q  216 gagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagag 256  Q
    |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21742546 gagattatttgcttcaagtgtggtgagaaaggccacaagag 21742586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0055 (Bit Score: 256; Significance: 1e-142; HSPs: 1)
Name: scaffold0055
Description:

Target: scaffold0055; HSP #1
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 3 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 22839 - 22532
Alignment:
Q  3 aagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtga 102  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22839 aagagggcgattggataccaacagctgagagtttttcaggatttggttaatagctgcaggatctacgaagaggatacgatggctcactacaaggtagtga 22740  T
Q  103 atgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaa 202  Q
    |||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22739 atgaaaggaagggcaagagacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgacaaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaa 22640  T
Q  203 gaaggatgctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggtaag 302  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22639 gaaggatactgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccccgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggtaag 22540  T
Q  303 aagggtca 310  Q
    ||||||||    
T  22539 aagggtca 22532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0052 (Bit Score: 256; Significance: 1e-142; HSPs: 1)
Name: scaffold0052
Description:

Target: scaffold0052; HSP #1
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 3 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 7828 - 7521
Alignment:
Q  3 aagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtga 102  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7828 aagagggcgattggataccaacagctgagagtttttcaggatttggttaatagctgcaggatctacgaagaggatacgatggctcactacaaggtagtga 7729  T
Q  103 atgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaa 202  Q
    |||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7728 atgaaaggaagggcaagagacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgacaaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaa 7629  T
Q  203 gaaggatgctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggtaag 302  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7628 gaaggatactgcagagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgtctgccccgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggtaag 7529  T
Q  303 aagggtca 310  Q
    ||||||||    
T  7528 aagggtca 7521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 249; Significance: 1e-138; HSPs: 2)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 4018 - 3710
Alignment:
Q  1 tcaagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4018 tcaagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttccggatttggttaatagctgcaggacctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagt 3919  T
Q  101 gaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaag 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  3918 gaatgagaggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaggatggtcgatgataggcggcctaag 3819  T
Q  201 aagaaggatgctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggta 300  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3818 aagaaggatgctacagagattgtgtgtttcaattgtggtgggaaaggccacaaaagcaacgtctgccctgaagaaatcaagaagtgtgttcggtgtggta 3719  T
Q  301 agaagggtc 309  Q
    |||| ||||    
T  3718 agaaaggtc 3710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 3 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 17755 - 17445
Alignment:
Q  3 aagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtga 102  Q
    |||||||| || || ||||||||| |  |||||||||  || ||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||| |||| ||| ||||    
T  17755 aagagggcaatcggataccaacagatccgagtttttcctgatttggttaatagctgcagaatttatgaggaggataccaaggctcattacacggttgtga 17656  T
Q  103 atgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaa 202  Q
    ||||| |||||   || || ||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| || ||||| |  |||||||||| |||||||||||||||    
T  17655 atgagcggaagactaagggccagcagagtcgccctaagccctatagtgcccctgctgataagggcaaacatagaatggtcgatgataggcggcctaagaa 17556  T
Q  203 gaaggatg---ctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggt 299  Q
    ||||||||   |||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || |  ||||| || || || ||||| ||||||||||||||     
T  17555 gaaggatgctcctgcggagattgtctgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgtccagaagagataaagaaatgtgtccggtgtggc 17456  T
Q  300 aagaagggtca 310  Q
    || ||||||||    
T  17455 aataagggtca 17445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0431 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 1)
Name: scaffold0431
Description:

Target: scaffold0431; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 10961 - 10653
Alignment:
Q  1 tcaagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagt 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  10961 tcaagagggcgattggataccaacagcttagagttttcc-ggatttggtcaatagctgcaggatctatgaagaggataccaaggctcactacaagatagt 10863  T
Q  101 gaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaag 200  Q
    ||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10862 gaacgaggggaagggcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccctgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgataggcggcctaag 10763  T
Q  201 aagaaggatgctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggta 300  Q
    |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  10762 aagaaggatgctactgagattgtgtgtttcaattgtggtgggaaaggccacaaaagcaatgtctgccctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggca 10663  T
Q  301 agaagggtca 310  Q
    |||| |||||    
T  10662 agaaaggtca 10653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0259 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0259
Description:

Target: scaffold0259; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 3 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 8850 - 8543
Alignment:
Q  3 aagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtga 102  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| | ||||    
T  8850 aagagggcgattggataccaacagcttagagtttttccagatttggtcaatagctgcaggatctatgaagaagatactaaggctcactataagattgtga 8751  T
Q  103 atgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaa 202  Q
    | |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  8750 acgagaggaagggcaagggacatcagagtcgtcctaagccgtacagtgccccaactgataaagggaaacagaggatggtcgatgataggcggcctaagaa 8651  T
Q  203 gaaggatgctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggtaag 302  Q
    |||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||| ||||| | ||||||||| || |||||||||||||||| |||||| |||    
T  8650 gaaggatgctaccgagattgtgtgtttcaattgtggtgggagaggccacaaaagcaatgtctgtcctgaagagatcaagaagtgtgtccagtgtggcaag 8551  T
Q  303 aagggtca 310  Q
    ||||||||    
T  8550 aagggtca 8543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 178; Significance: 5e-96; HSPs: 2)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 41749 - 41440
Alignment:
Q  1 tcaagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagt 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| | | ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| | ||    
T  41749 tcaagagggcgattggataccaacagcttagagtttttccgaatttggtcaatagctgcaggatctatgaagagaataccaaggctcactataagattgt 41650  T
Q  101 gaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaag 200  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||    
T  41649 gaacgagaggaagggcaatggacagcagagttgtcctaagccgtacattgcccctgctaataaagggaaacagagaatggtcgatgataggcggcctaag 41550  T
Q  201 aagaaggatgctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggta 300  Q
    |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| |  |||||||| || | ||||||||||||| ||||||| |    
T  41549 aagaaggatgctactgagattgtgtgtttcaattgtggtgggaaaggccacaaaagcaatgtttgtcctgaagagagcaagaagtgtgtctggtgtggca 41450  T
Q  301 agaagggtca 310  Q
    ||||||||||    
T  41449 agaagggtca 41440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 51 - 310
Target Start/End: Original strand, 12881 - 13143
Alignment:
Q  51 aatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtg 150  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| |||||| | || ||||||| ||||  |||  | ||||||||||| ||||| || || ||||    
T  12881 aatagctgcaggatctatgaagaggatatcaaagctcattacaagattgttaatgagaagaagaccaagagccagcagagtcgccctaaaccttatagtg 12980  T
Q  151 cccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaagg 247  Q
    |||| || ||||| || || ||||  |||||||||| ||||  ||| |||||||||||||   |||| || ||||| || ||||| ||||| | ||||||    
T  12981 cccctgcagataagggcaagcagagaatggtcgatgataggaagccaaagaagaaggatgctcctgcggatattgtttgtttcaactgtggcgggaaagg 13080  T
Q  248 ccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggtaagaagggtca 310  Q
    ||||||||| || |  |||||||| || |||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  13081 ccacaagagtaatgtttgtcctgaagagatcaagaaatgtgtctggtgtggtaagaagggtca 13143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 174; Significance: 1e-93; HSPs: 3)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 107484 - 107693
Alignment:
Q  1 tcaagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagt 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  107484 tcaagagggagattgggtaccaacagctgagagtttttccggatttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacgagatagt 107583  T
Q  101 gaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaag 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  107584 gaatgagaggaagggcaagggacaacagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgataggcggcctaag 107683  T
Q  201 aagaaggatg 210  Q
    ||||| ||||    
T  107684 aagaaagatg 107693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 57 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 8755 - 8540
Alignment:
Q  57 tgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 156  Q
    ||||| || ||||| || ||||| |||||||| |||||| | ||||||||| |||||   || || || |||||||| |||||||| || |||||||| |    
T  8755 tgcagaatttatgaggatgataccaaggctcattacaagattgtgaatgagcggaagactaagggccaacagagtcgccctaagccctatagtgcccctg 8656  T
Q  157 ctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaagaaggatgc---tgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaa 253  Q
    ||||||| || ||||||| ||||||||| | ||| ||||| ||||||||||| ||   ||| |||||| | || || |||||||| ||||||||||||||    
T  8655 ctgataagggcaaacagaggatggtcgaggatagacggccaaagaagaaggacgctcttgctgagattatctgttttaattgtggcgagaaaggccacaa 8556  T
Q  254 gagcaacgcctgtcct 269  Q
    |||||| || ||||||    
T  8555 gagcaatgcttgtcct 8540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 53 - 97
Target Start/End: Original strand, 93653 - 93697
Alignment:
Q  53 tagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggt 97  Q
    ||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  93653 tagctgcagaatttatgaggaggatacgaaggctcattacaaggt 93697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 170; Significance: 3e-91; HSPs: 3)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 21574 - 21282
Alignment:
Q  1 tcaagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagt 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  21574 tcaagagggcgattggataccaacagcttagagtttttccggatttggtcaatagctgcaggatctatgaagaggataccaaggctcactacaagatagt 21475  T
Q  101 gaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaag 200  Q
    ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||                 | |||||||||||||| |||||||||||||    
T  21474 gaacgagaggaagagcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgccc-----------------ctgaagatggtcgatgataggcggcctaag 21392  T
Q  201 aagaaggatgctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggta 300  Q
    |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21391 aagaaggatgctactgagattgtgtgtttcaattgtggtgggaaaggccacaaaagcaacgtctgccctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggca 21292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 3 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 55596 - 55289
Alignment:
Q  3 aagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtga 102  Q
    ||||||||||||||| | | |||| | ||  |||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| || || ||||| |||||||| |||||| | ||||    
T  55596 aagagggcgattgggcatcgacagattaggatttttccggatttggttaatagctgcagaatctacgaggaagatactaaggctcattacaagatggtga 55497  T
Q  103 atgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaa 202  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||    
T  55496 atgagaagaagggcaaaggacaacagagtcgtcctaagccgtacagtgcccctgctgataaagggaaacagagaatggtcgatgataggcggcctaagaa 55397  T
Q  203 gaaggatgctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggtaag 302  Q
    |||||||| | | || |||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| |  |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  55396 gaaggatgtttctgaaattgtgtgcttcaactgtggtggaaaaggccacaagagcaatggttgtcctgaagaaattaagaagtgtgtccggtgtggcaag 55297  T
Q  303 aagggtca 310  Q
    ||||||||    
T  55296 aagggtca 55289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 12046 - 11754
Alignment:
Q  1 tcaagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagt 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  12046 tcaagagggcgattggataccaacagattagagtttttccggatttggtcaatagctgcaggatctatgaagaggataccaaggctcactacaagatagt 11947  T
Q  101 gaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaag 200  Q
    ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||                 | |||||||||||||| |||||||||||||    
T  11946 gaacgagaggaagagcaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgccc-----------------ctgaagatggtcgatgataggcggcctaag 11864  T
Q  201 aagaaggatgctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggta 300  Q
    |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  11863 aagaaggatgctactgagattgtgtgtttcaattgtggtgggaaaggccacaaaagcaacgtctgccctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtcgca 11764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 153; Significance: 4e-81; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 3 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 424903 - 424593
Alignment:
Q  3 aagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtga 102  Q
    |||||||||||||| || |||||| | |||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||| | ||||    
T  424903 aagagggcgattggatatcaacagattagagtttttctggatttggttaatagctgcagaatctatgaggaggataccaaggctcattacaagatggtga 424804  T
Q  103 atgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaa 202  Q
    ||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||    
T  424803 atgagcggaagggcaagggacagcatagtcgtcctaagccgtacaatgcccctgctgataaagggaaacaaaatatggtcgatgataggcggcctacgaa 424704  T
Q  203 gaaggatgctgca---gagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggt 299  Q
    ||||| |||| |    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |  |||||||| || || ||||| |||||||| |||||     
T  424703 gaagggtgctcctactgagattgtgtgcttcaactgtggtgtgaaaggccacaaaagcaatgtttgtcctgaagagattaagaaatgtgtccgatgtggc 424604  T
Q  300 aagaagggtca 310  Q
    |||||||||||    
T  424603 aagaagggtca 424593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 57 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 203922 - 203819
Alignment:
Q  57 tgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 156  Q
    |||||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||  ||| |||| | |  || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  203922 tgcaggatctatgaggaggacaccaaagctcattataaggtgatgagtgagcgaagaggtaagggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccctg 203823  T
Q  157 ctga 160  Q
    ||||    
T  203822 ctga 203819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0789 (Bit Score: 146; Significance: 6e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0789
Description:

Target: scaffold0789; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 3 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 519 - 223
Alignment:
Q  3 aagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtga 102  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  || ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  519 aagagggcgattggataccaacagcttagagtttttccagatttggtcaatatctgtaggatctatgaagaggatactaaggctcactacaagatagtga 420  T
Q  103 atgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaa 202  Q
    | |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||           |||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  419 acgagaggaagggcaaggggcagcagagtcgtcctaagccgt-----------gctgatgaagggaaacagaggatggtcgatgataggcggcctaagaa 331  T
Q  203 gaaggatgctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggtaag 302  Q
    |||||||||| | || |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||| |  |||||||| || || ||||| |||||||||||||| |||    
T  330 gaaggatgctactgaaattgtgtgtttcaattatggtgggaaaggccacaaaagcaatgtttgtcctgaagagattaagaaatgtgtccggtgtggcaag 231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 132; Significance: 1e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 3 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 49257 - 48950
Alignment:
Q  3 aagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtga 102  Q
    ||||||||||||||| | | |||| | ||  |||||  ||| ||||||||||||||||| ||||| || || ||||| |||||||| |||||| | ||||    
T  49257 aagagggcgattgggcatcgacagattaggatttttacggatttggttaatagctgcagaatctacgaggaagatactaaggctcattacaagatggtga 49158  T
Q  103 atgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaa 202  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||||||||    
T  49157 atgagaagaagggcaagggacagcagagtcgtcctaaaccgtacaatgcccctactgataaagggaaacagagaatggccgatgataggcggcctaagaa 49058  T
Q  203 gaaggatgctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggtaag 302  Q
    |||||||||| | || ||| |||| ||||| | ||||| |||||||||||||||||| |  |||||||| ||||| |||||||||||||  ||||| |||    
T  49057 gaaggatgcttctgaaattttgtgtttcaactatggtgggaaaggccacaagagcaatggttgtcctgaagaaattaagaagtgtgtccaatgtggcaag 48958  T
Q  303 aagggtca 310  Q
    ||||||||    
T  48957 aagggtca 48950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 126; Significance: 5e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 3 - 310
Target Start/End: Original strand, 229561 - 229871
Alignment:
Q  3 aagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtga 102  Q
    |||||||||||  | ||||||||| |  |||||||||  || ||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  229561 aagagggcgatcagataccaacagatccgagtttttcctgatttggttaatagctgcagaatttatgaggaggataccaaggctcattacaaggttgtga 229660  T
Q  103 atgagaggaagggcaaaggac-agcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaaga 201  Q
    |||||||||||  | |||||| |||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| || |||||||  |||||||||| |||||||||||| |    
T  229661 atgagaggaaga-ctaaggaccagcagagtcgccctaagccctatagtgcccctgctgataagggcaaacagagaatggtcgatgataggcggcctaata 229759  T
Q  202 agaaggatgct---gcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtgg 298  Q
    |||||||||||   || |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| || || || ||||| ||||||||||||||    
T  229760 agaaggatgctcctgcggagattgtttgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaatgtttgtccagaagagataaagaaatgtgtccggtgtgg 229859  T
Q  299 taagaagggtca 310  Q
     |||||||||||    
T  229860 caagaagggtca 229871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1881 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold1881
Description:

Target: scaffold1881; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 3 - 310
Target Start/End: Original strand, 189 - 499
Alignment:
Q  3 aagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtga 102  Q
    |||||||| |||||||| |||||  |  |||||||||  || ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  189 aagagggcaattgggtatcaacaaatccgagtttttcctgatttggtgaatagttgtagaatctatgaagaggataccaaggctcattacaaggttgtga 288  T
Q  103 atgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaa 202  Q
    ||||| |||||  ||| || ||||||||||| |||||||| || | |||||| |||||||| || ||||| |  |||||||||| |||||||||||||||    
T  289 atgagcggaagaccaagggccagcagagtcgccctaagccttatattgcccctgctgataagggcaaacaaagaatggtcgatgataggcggcctaagaa 388  T
Q  203 gaaggatgctgca---gagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggt 299  Q
    |||||||||| |    |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||     
T  389 gaaggatgctcctacggagattgtttgtttcaattgtggcgagaaaggccacaagagcaatgtttgtcctgaggagatcaagaaatgtgtccggtgtggc 488  T
Q  300 aagaagggtca 310  Q
    |||||||||||    
T  489 aagaagggtca 499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0285 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0285
Description:

Target: scaffold0285; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 3 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 5593 - 5283
Alignment:
Q  3 aagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtga 102  Q
    ||||||||||| || ||||||||| |  |||||||||  || ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  5593 aagagggcgatcggataccaacagatccgagtttttcctgatttggtgaatagctgcagaatctatgatgaggatactaaggctcattacaaggttgtga 5494  T
Q  103 atgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaa 202  Q
    ||||| |||||  ||| || ||||||||||| |||||||| || |||||||  |||||||| || |||||||  |||||||||| |||||||||||||||    
T  5493 atgagcggaagaccaagggccagcagagtcgccctaagccttatagtgcccttgctgataagggcaaacagagaatggtcgatgataggcggcctaagaa 5394  T
Q  203 gaaggatg---ctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggt 299  Q
    ||||||||   |||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |  |||||||| || |||||||| |||||| |||||||     
T  5393 gaaggatgctcctgcggagattgtttgtttcaactgtggcgagaagggccataagagtaatgtttgtcctgaagagatcaagaaatgtgtctggtgtggc 5294  T
Q  300 aagaagggtca 310  Q
    |||||||||||    
T  5293 aagaagggtca 5283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 111; Significance: 5e-56; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 446 - 135
Alignment:
Q  1 tcaagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagt 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||  ||||||| |  || || || ||||||||||||||||| || || || || |||||||| |||||| | ||    
T  446 tcaagagggcgatcggataccaacagctccgagttttccctgatttagtgaatagctgcaggatctacgaggaagaaacaaaggctcattacaagattgt 347  T
Q  101 gaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaag 200  Q
    ||||||| |||||  ||| || ||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||||| || |||||||  |||||||||| |||||| ||||||    
T  346 gaatgagcggaagaccaagggccagcagagtcgtc-taagccttatagtgcccctgctgataagggcaaacagagaatggtcgatgataggcgccctaag 248  T
Q  201 aagaaggatgctgcag---agattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtg 297  Q
    |||| ||||||| |||   |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||  || |||||||| |||||||||||||    
T  247 aagagggatgctccagttgagattacttgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgtcctgtagagatcaagaaatgtgtccggtgtg 148  T
Q  298 gtaagaagggtca 310  Q
    |||||||||||||    
T  147 gtaagaagggtca 135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 310
Target Start/End: Original strand, 139317 - 139629
Alignment:
Q  1 tcaagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagt 100  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||  || |||| |  || || || ||||||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||| ||    
T  139317 tcaagagggcgatcggatatcaacagctccgaattttccctgatttagtgaatagctgcaggatctacgaggaagatacaaaggctcattacaaggttgt 139416  T
Q  101 gaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaag 200  Q
    ||||||| |||||  ||| || ||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| || |||||||  |||||||||| |||||||||||||    
T  139417 gaatgagcggaagaccaagggccagcagagtcgccctaagccttatagtgcccctgctgataagggcaaacagagaatggtcgatgataggcggcctaag 139516  T
Q  201 aagaaggatgct---gcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtg 297  Q
    |||| |||| ||   || ||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||  || |||||||| |||||||||||||    
T  139517 aagagggatactccagctgagattacttgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgtcctgtagagatcaagaaatgtgtccggtgtg 139616  T
Q  298 gtaagaagggtca 310  Q
    | |||||||||||    
T  139617 gcaagaagggtca 139629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0177 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 2)
Name: scaffold0177
Description:

Target: scaffold0177; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 3 - 310
Target Start/End: Original strand, 14750 - 15060
Alignment:
Q  3 aagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtga 102  Q
    |||||||| |||||||| |||||  |  |||||||||  || ||||| ||||| || || |||||| | |||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  14750 aagagggcaattgggtatcaacaaatccgagtttttcctgatttggtgaatagttgtagaatctattaggaggataccaaggctcattacaaggttgtga 14849  T
Q  103 atgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaa 202  Q
    ||||| |||||   || || ||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| || |||||||  |||||||||| ||||| |||||||||    
T  14850 atgagcggaagactaagggccagcagagtcgccctaagccctatagtgcccctgctgataagggcaaacagagaatggtcgatgataggcagcctaagaa 14949  T
Q  203 gaaggatgctgca---gagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggt 299  Q
    |||||||||| |    |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| || || || ||||| ||||||||||||||     
T  14950 gaaggatgctcctacggagattgtctgttttaattgtggtgagaaaggccacaagagcaatgtttgtccagaagagataaagaaatgtgtccggtgtggc 15049  T
Q  300 aagaagggtca 310  Q
    |||||||||||    
T  15050 aagaagggtca 15060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0177; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 3 - 310
Target Start/End: Original strand, 11065 - 11375
Alignment:
Q  3 aagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtga 102  Q
    |||||||| |||||||| |||||  |  |||||||||  || ||||| ||||| || || |||||| | |||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  11065 aagagggcaattgggtatcaacaaatccgagtttttcctgatttggtgaatagttgtagaatctattaggaggataccaaggctcattacaaggttgtga 11164  T
Q  103 atgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaa 202  Q
    ||||| |||||   || || || || |||   |||||||| || |||||||| |||||||| || |||||||  |||||||||| ||||| |||||||||    
T  11165 atgagcggaagactaagggccaacaaagttaccctaagccctatagtgcccctgctgataagggcaaacagagaatggtcgatgataggcagcctaagaa 11264  T
Q  203 gaaggatgctgca---gagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggt 299  Q
    |||||||||| |    |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| || || || ||||| ||||||||||||||     
T  11265 gaaggatgctcctacggagattgtctgttttaattgtggtgagaaaggccacaagagcaatgtttgtccagaagagataaagaaatgtgtccggtgtggc 11364  T
Q  300 aagaagggtca 310  Q
    |||||||||||    
T  11365 aagaagggtca 11375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 101; Significance: 5e-50; HSPs: 4)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 3 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 15019 - 14709
Alignment:
Q  3 aagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtga 102  Q
    ||||||||||| || ||||||||| |  |||||||||  || || || ||||||||||| ||||| || || ||||| |||||||| ||| |||| ||||    
T  15019 aagagggcgatcggataccaacagatccgagtttttcctgatttagtgaatagctgcagaatctacgaggaagataccaaggctcattactaggttgtga 14920  T
Q  103 atgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaa 202  Q
    ||||| |||||  ||| || ||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| || |||||||  |||||||||| || ||||||||||||    
T  14919 atgagcggaagaccaagggccagcagagtcgccctaagccttatagtgcccctgctgataagggcaaacagagaatggtcgatgatatgcggcctaagaa 14820  T
Q  203 gaaggatg---ctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggt 299  Q
    ||||||||   |||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || |  |||| ||| || |||||||| ||||||||||||||     
T  14819 gaaggatgctcctgcggagattgtttgtttcaagtgtggcgagaatggccacaagagtaatgtttgtcttgaagagatcaagaaatgtgtccggtgtggc 14720  T
Q  300 aagaagggtca 310  Q
    |||||| ||||    
T  14719 aagaagagtca 14709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 57 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 5456 - 5341
Alignment:
Q  57 tgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 156  Q
    ||||| || ||||| || ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||| ||| |||| || |    
T  5456 tgcagaatatatgaggaagatactaaggctcattacaaggttgtgaatgagaggaaaggcaagggtcagcaaagtcgtccaaagccttacggtgctcctg 5357  T
Q  157 ctgataaagggaaaca 172  Q
    ||||||| || |||||    
T  5356 ctgataagggcaaaca 5341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 211 - 256
Target Start/End: Original strand, 39253 - 39298
Alignment:
Q  211 ctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagag 256  Q
    |||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  39253 ctgctgagattgtttgctacaagtgtggtgagaaaggccacaagag 39298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 53 - 97
Target Start/End: Original strand, 180598 - 180642
Alignment:
Q  53 tagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggt 97  Q
    ||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  180598 tagctgcagaatttatgaggaggatacgaaggctcattacaaggt 180642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 259
Target Start/End: Original strand, 7364 - 7625
Alignment:
Q  1 tcaagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagt 100  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| |  |||||||    || ||||| || || |||||||| ||||| || ||||| |||||||| |||||| | ||    
T  7364 tcaagagggcaattggttaccaacagatccgagttttctccgagttggtgaacagttgcaggatttatgaggaagataccaaggctcattacaagattgt 7463  T
Q  101 gaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaag 200  Q
    ||||||| |||||   ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||  |||||||| | |||||||||||||    
T  7464 gaatgagcggaagactaaaggccagcagagtcgccctaagccttacagtgcccctgctgataagggcaaacagagaatggtcgaagataggcggcctaag 7563  T
Q  201 aagaaggatg---ctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaa 259  Q
    ||||||||||   |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7564 aagaaggatgttcctgctgagattgtctgctttaattgtggtgagaaaggccacaagagcaa 7625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0289 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0289
Description:

Target: scaffold0289; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 3 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 383 - 109
Alignment:
Q  3 aagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtga 102  Q
    |||||||| ||||| || |||||| |  |||||||||   | ||||| || ||||| || |||||||| ||||| || || ||||| |||||||| ||||    
T  383 aagagggcaattggatatcaacagatccgagtttttcctaatttggtgaacagctgtagaatctatgaggaggacaccaaagctcattacaaggttgtga 284  T
Q  103 atgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaa 202  Q
    ||||| |||||   || || | ||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| || |||||||  |||||||||| |||||||||||||||    
T  283 atgagcggaagactaagggccggcagagtcgccctaagccctatagtgcccctgctgataagggaaaacagagaatggtcgatgataggcggcctaagaa 184  T
Q  203 gaaggatg---ctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgagga 274  Q
    ||||||||   ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||    
T  183 gaaggatgctcctgcagagattgtctgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaatgtttgtcctgagga 109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 3 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 37093 - 36783
Alignment:
Q  3 aagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtga 102  Q
    |||||||| ||||| ||||||||| |  |||||||||  || ||||| || | ||| || |||||||| ||||| || || ||||| |||||||| || |    
T  37093 aagagggcaattggataccaacagatccgagtttttcctgatttggtgaacaactgtagaatctatgaggaggacaccaaagctcattacaaggttgtaa 36994  T
Q  103 atgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaa 202  Q
    ||||| |||||   || || ||||||||||  |||||||| || |||||||| |||||||| || |||||||  |||||||||| |||||||||||||||    
T  36993 atgagcggaagactaagggccagcagagtctccctaagccctatagtgcccctgctgataagggcaaacagagaatggtcgatgataggcggcctaagaa 36894  T
Q  203 gaaggatg---ctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggt 299  Q
    ||||||||   |||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| |||||  | ||||| ||| ||||||||||     
T  36893 gaaggatgctcctgcggagatcgtctgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaatgtttgtccagaggaggtgaagaaatgtttccggtgtggc 36794  T
Q  300 aagaagggtca 310  Q
    |||||||||||    
T  36793 aagaagggtca 36783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2059 (Bit Score: 96; Significance: 4e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold2059
Description:

Target: scaffold2059; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 310
Target Start/End: Original strand, 476 - 788
Alignment:
Q  1 tcaagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagt 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||| ||  ||||||| |   | || || |||| |||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||| ||    
T  476 tcaagagggcgatcggataccaacaactccgagttttcccttatttagtgaataactgcaggatctacgaggaagatactaaggctcattacaaggttgt 575  T
Q  101 gaatgagaggaagggcaaaggaca-gcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaa 199  Q
    ||||||| |||||  ||| ||||| ||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| || |||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  576 gaatgagcggaagaccaa-ggacaagcagagtcgccctaagccttatagtgcccctgctgataagggcaaacagagaatggtcgatgataggcggcctaa 674  T
Q  200 gaagaaggatgct---gcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgt 296  Q
    ||||| |||||||   || ||||||   || ||||||||||||||||||| ||||||||| || |  |||||||  || |||||||| ||||||||||||    
T  675 gaagagggatgctccagctgagattacttgtttcaattgtggtgagaaagaccacaagagtaatgtttgtcctgtagagatcaagaaatgtgtccggtgt 774  T
Q  297 ggtaagaagggtca 310  Q
    || |||||||||||    
T  775 ggcaagaagggtca 788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0451 (Bit Score: 91; Significance: 4e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0451
Description:

Target: scaffold0451; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 3 - 309
Target Start/End: Original strand, 13739 - 14050
Alignment:
Q  3 aagagggcgattgggtacc--aacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagt 100  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||| |  |||||||||  || || || ||||||||||||||||| || ||||| || |  ||||| |||||||| ||    
T  13739 aagagggcgattggataccgcaacagattcgagtttttccagatttagtgaatagctgcaggatctacgaggaggacaccagagctcattacaaggttgt 13838  T
Q  101 gaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaag 200  Q
     |||||| |||||   || || || |||||||| |||||||| || |||||||| | |||||| || |||||||  |||||||||| |||||||||||||    
T  13839 taatgagcggaagactaagggccaacagagtcgccctaagccctatagtgcccctgatgataagggcaaacagagaatggtcgatgataggcggcctaag 13938  T
Q  201 aagaaggatg---ctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtg 297  Q
    ||||||||||   |||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| || || || ||||| |||||| ||||||    
T  13939 aagaaggatgctcctgcggagattgtctgttttaattgtggtgagaaaggccacaagagcaatgtttgtccagaagagataaagaaatgtgtcaggtgtg 14038  T
Q  298 gtaagaagggtc 309  Q
    | ||||||||||    
T  14039 gcaagaagggtc 14050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0412 (Bit Score: 89; Significance: 7e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0412
Description:

Target: scaffold0412; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 3 - 310
Target Start/End: Original strand, 15288 - 15598
Alignment:
Q  3 aagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtga 102  Q
    |||||||| ||||| ||||||||| |  |||||||||  || ||||| || ||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || || |    
T  15288 aagagggcaattggataccaacagatctgagtttttcctgatttggtgaacagctgtagaatctatgaggaggacacgaaagctcattacaatgttgtaa 15387  T
Q  103 atgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaa 202  Q
    ||||| |||||   ||  | ||||||||| | |||||||| || |||||||| |||||||| || |||||||  |||||||||| |||||||||||||||    
T  15388 atgagtggaagactaagcgccagcagagttgccctaagccctatagtgccccagctgataagggcaaacagagaatggtcgatgataggcggcctaagaa 15487  T
Q  203 gaaggatgct---gcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggt 299  Q
    ||||||||||   || |||||  | || ||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||| |||||    ||||||||| ||||||||||     
T  15488 gaaggatgctcctgcggagatcatctgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaatttttgtccagaggaggcaaagaagtgtttccggtgtggc 15587  T
Q  300 aagaagggtca 310  Q
    |||||||||||    
T  15588 aagaagggtca 15598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1423 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold1423
Description:

Target: scaffold1423; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 57 - 310
Target Start/End: Original strand, 141 - 397
Alignment:
Q  57 tgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 156  Q
    |||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||| | ||||||||| |||||   || || ||| ||||||| |||||||| ||||||||||| |    
T  141 tgcaggatttatgatgaggatactaaggctcattacaagatcgtgaatgagcggaagactaagggtcagaagagtcgccctaagccttacagtgcccctg 240  T
Q  157 ctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaa 253  Q
    ||||||| || ||||||| ||||||||| | ||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||| || || | |||||||||||||||||||||    
T  241 ctgataagggcaaacagaggatggtcgaagatagacggcctaagaagaaggatgctcctgcagagattgtctgttttacttgtggtgagaaaggccacaa 340  T
Q  254 gagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggtaagaagggtca 310  Q
    ||| || || ||||||  |||   |||||  ||| |||| ||||| |||||||||||    
T  341 gagtaatgcttgtccttgggatgccaagagatgtttccgctgtggaaagaagggtca 397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 59 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 30826 - 30614
Alignment:
Q  59 caggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgct 158  Q
    |||||| ||||| ||||| || |||| ||| |||||| | ||||||||| |||||  ||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  30826 caggatttatgaggaggacactaaggttcattacaagattgtgaatgagcggaagaccaggggacaacagagtcatcctaagccgtacagtgcccctgct 30727  T
Q  159 gataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaaga 255  Q
    |||||||| |||||||  |||||||| | ||||||| |||||||||||||||   |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  30726 gataaaggcaaacagagaatggtcgaggataggcggtctaagaagaaggatgttcctgctgagattgtctgctttaattgtggtgagaaagaccacaaga 30627  T
Q  256 gcaacgcctgtcc 268  Q
    |||| || |||||    
T  30626 gcaatgcttgtcc 30614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 4)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 51 - 310
Target Start/End: Original strand, 9996 - 10258
Alignment:
Q  51 aatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtg 150  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| |||||| | || ||||||| | ||  ||| || ||||||||||| ||||| || || ||||    
T  9996 aatagctgcaggatctatgaagaggataccagagctcattacaagattgttaatgagaagtagaccaagggtcagcagagtcgccctaaaccttatagtg 10095  T
Q  151 cccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaagg 247  Q
    |||  |||||||| || || ||||  |||||||||| ||||||||| |||||||||||||   |||| || ||||| || ||||| | ||| | ||||||    
T  10096 cccttgctgataagggcaagcagagaatggtcgatgataggcggccaaagaagaaggatgctcctgcggatattgtttgtttcaactatggcgggaaagg 10195  T
Q  248 ccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggtaagaagggtca 310  Q
    ||||||||| || |  |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10196 ccacaagagtaatgtttgtcctgaagagatcaagaaatgtgtccggtgtggtaagaagggtca 10258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 51 - 310
Target Start/End: Original strand, 12651 - 12913
Alignment:
Q  51 aatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtg 150  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| |||||| | || ||||||| | ||  ||| || ||||||||||| ||||| || || ||||    
T  12651 aatagctgcaggatctatgaagaggataccagagctcattacaagattgttaatgagaagtagaccaagggtcagcagagtcgccctaaaccttatagtg 12750  T
Q  151 cccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaagg 247  Q
    |||  |||||||| || || ||||  |||||||||| ||||||||| |||||||||||||   |||| || ||||| || ||||| | ||| | ||||||    
T  12751 cccttgctgataagggcaagcagagaatggtcgatgataggcggccaaagaagaaggatgctcctgcggatattgtttgtttcaactatggcgggaaagg 12850  T
Q  248 ccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggtaagaagggtca 310  Q
    ||||||||| || |  |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12851 ccacaagagtaatgtttgtcctgaagagatcaagaaatgtgtccggtgtggtaagaagggtca 12913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #3
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 57 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 32420 - 32204
Alignment:
Q  57 tgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 156  Q
    ||||| || ||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| |||||   || || ||||||||||| |||||||| || || ||||  |    
T  32420 tgcagaatttatgaggaggataccaaggctcattacaaggttgtgaatgagcggaagactaagggccagcagagtcgccctaagccctatagcgcccttg 32321  T
Q  157 ctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaa 253  Q
    ||||||| || ||||| |  |||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||| |||||||| || || |||||||| ||||||||||||||    
T  32320 ctgataagggcaaacaaagaatggtcgatgataggcggcctaagaagaaggatgctcctgctgagattgtctgttttaattgtggcgagaaaggccacaa 32221  T
Q  254 gagcaacgcctgtcctg 270  Q
    |||||| || |||||||    
T  32220 gagcaatgcttgtcctg 32204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #4
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 57 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 55178 - 55023
Alignment:
Q  57 tgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 156  Q
    |||||||| || || |||||||| |||||||| |||||| | ||||||||| |||||   ||  | || || ||||| | |||||| || |||||||| |    
T  55178 tgcaggatttacgaggaggataccaaggctcattacaagatggtgaatgagcggaagactaagtgccaacaaagtcgccataagccttatagtgcccctg 55079  T
Q  157 ctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaagaaggatgct 212  Q
    |||||||  | ||||||| ||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||||    
T  55078 ctgataagagcaaacagaggatggtcgaagatagacggccgaagaagaaggatgct 55023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 84; Significance: 6e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 3 - 257
Target Start/End: Original strand, 121885 - 122142
Alignment:
Q  3 aagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtga 102  Q
    |||||||| || || ||||||||| |  |||||||||  || ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||| || |    
T  121885 aagagggcaatcggataccaacagatccgagtttttcctgagttggtgaatagctgcagaatctatgaggaggataccaaggctcattacaaggttgtaa 121984  T
Q  103 atgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaa 202  Q
    ||||| ||| |   || || ||  ||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| || |||||||  |||||||||| |||||||||||||||    
T  121985 atgagcggacgactaagggccaatagagtcgccctaagccctatagtgcccctgctgataagggcaaacagagaatggtcgatgataggcggcctaagaa 122084  T
Q  203 gaaggatgct---gcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagc 257  Q
    ||||||||||   || ||||||   || |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  122085 gaaggatgctccagctgagattacttgtttcaattgtggtgaaaaaggccacaagagc 122142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 54 - 166
Target Start/End: Original strand, 11666 - 11778
Alignment:
Q  54 agctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgccc 153  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| || |||||  ||| |||||| |  || || |||||||||||||||||||| || || ||||| |    
T  11666 agctgcaggatatatgaagaggacactaaggctcattataaggtgatgagtgagagaagaggtaagggacagcagagtcgtcctaaaccatatagtgctc 11765  T
Q  154 ccgctgataaagg 166  Q
    | ||||| |||||    
T  11766 ctgctgacaaagg 11778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0501 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0501
Description:

Target: scaffold0501; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 59 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 463 - 260
Alignment:
Q  59 caggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgct 158  Q
    |||||| ||||| || || || |||| ||| |||||| | ||||||||| |||||  ||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  463 caggatttatgaggatgacactaaggttcattacaagattgtgaatgagcggaagaccaggggacaatagagtcgtcctaagccgtacagtgcccctgct 364  T
Q  159 gataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaaga 255  Q
    ||||| || |||||||  |||||||| | ||| |||||||||||||||||||   |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  363 gataagggcaaacagagaatggtcgaggatagacggcctaagaagaaggatgttcctgctgagattgtctgctttaattgtggtgagaaaggccacaaga 264  T
Q  256 gcaa 259  Q
    ||||    
T  263 gcaa 260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 60 - 310
Target Start/End: Original strand, 7545 - 7798
Alignment:
Q  60 aggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctg 159  Q
    |||||||||||||||||||| |  ||||| |||||||| ||||||||| |||||  ||| || ||||||||||| ||||| || || |||||||| ||||    
T  7545 aggatctatgaagaggataccagagctcattacaaggttgtgaatgagcggaagaccaagggccagcagagtcgccctaaaccttatagtgcccctgctg 7644  T
Q  160 ataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaagaagg---atgctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagag 256  Q
    ||||||| ||| |||  |||||||| | ||||||||| ||||| ||||    | |||| || ||||| || ||||| ||||| | |||||||||||||||    
T  7645 ataaaggcaaatagagaatggtcgacgataggcggccaaagaataaggctactcctgcggatattgtttgtttcaactgtggcgggaaaggccacaagag 7744  T
Q  257 caacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggtaagaagggtca 310  Q
     || |  |||||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  7745 taatgtttgtcctgaagagatcaagaaatgtgtccggtgtggcaagaagggtca 7798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1220 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold1220
Description:

Target: scaffold1220; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 30 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 304 - 21
Alignment:
Q  30 agagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcaga 129  Q
    ||||||||||  || ||||| || ||||| ||||| ||||| || || || || |||||  ||||||| ||||||||| |||||   || || |||||||    
T  304 agagtttttcctgatttggtgaacagctgtaggatttatgaggaagacaccaaagctcatcacaaggttgtgaatgagcggaagactaagggccagcaga 205  T
Q  130 gtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaagaaggatgc---tgcagagattgtgtg 226  Q
    |||| |||||||| || |||||||| |||||||| || ||| |||  || ||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||| ||    
T  204 gtcgccctaagccctatagtgcccctgctgataagggcaaatagagtattgtcgatgataggcggcctaagaagaaggatgctcttgcggagattgtctg 105  T
Q  227 cttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggtaagaagggtca 310  Q
     |||| ||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||  ||||  | ||||| ||| |||||||||| |||||||||||    
T  104 tttcatttgtggtgagaaaggccacaaaagcaatgtttgtccaaaggaggtgaagaaatgtttccggtgtggcaagaagggtca 21  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0546
Description:

Target: scaffold0546; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 51 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 426 - 164
Alignment:
Q  51 aatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtg 150  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| |||||| | || ||||||| ||||  |||  | ||||||||||| ||||| || || ||||    
T  426 aatagctgcaggatctatgaagaggatatcaaagctcattacaagattgttaatgagaagaagaccaagagccagcagagtcgccctaaaccttatagtg 327  T
Q  151 cccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaagg 247  Q
    |||| || ||||| || || ||||  |||||||||| ||||  ||| |||||||||||||   |||| || ||||| || ||||| ||||| | ||||||    
T  326 cccctgcagataagggcaagcagagaatggtcgatgataggaagccaaagaagaaggatgctcctgcggatattgtttgtttcaactgtggcgggaaagg 227  T
Q  248 ccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggtaagaagggtca 310  Q
    ||||||||| || |  |||||||| || |||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  226 ccacaagagtaatgtttgtcctgaagagatcaagaaatgtgtctggtgtggtaagaagggtca 164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0273 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0273
Description:

Target: scaffold0273; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 57 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 581 - 367
Alignment:
Q  57 tgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 156  Q
    |||||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||| ||||| |||||   || || ||||||||||| |||||||| || || ||||| |    
T  581 tgcaggatttatgaggaggacactaaggctcattacaaggttgtgtatgagcggaagactaagggccagcagagtcgccctaagccttatagcgcccctg 482  T
Q  157 ctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaa 253  Q
    ||||||| || ||||||| ||||||||| | ||||||||| | |||||||||||   |||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||    
T  481 ctgataagggcaaacagaggatggtcgaagataggcggccaaggaagaaggatgttcctgctgagattgtttgttttaattgtggtgagaaaggccacaa 382  T
Q  254 gagcaacgcctgtcc 268  Q
    |||||| || |||||    
T  381 gagcaatgcttgtcc 367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 57 - 268
Target Start/End: Original strand, 50108 - 50322
Alignment:
Q  57 tgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 156  Q
    |||||||| || || |||||||| |||||||| |||||| | ||||||||| ||||||  |  ||  |||||||||  |||||||| || || ||||| |    
T  50108 tgcaggatttacgaggaggataccaaggctcattacaagatcgtgaatgagcggaaggctatgggctagcagagtctccctaagccttatagcgcccctg 50207  T
Q  157 ctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaa 253  Q
    ||||||| || |||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  50208 ctgataagggcaaacagagaatggtcgatgataggcggcctaagaagaaggatgttcctgctgagattgtctgctttaattgtggtgagaaaggccacaa 50307  T
Q  254 gagcaacgcctgtcc 268  Q
     ||||| || |||||    
T  50308 aagcaatgcttgtcc 50322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 75 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 171641 - 171403
Alignment:
Q  75 gatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacaga 174  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||||||| |||||  ||| || ||||||||||| |||||||| || || ||||| |||||||| || |||||||    
T  171641 gatactaaggctcattacaaggttgtgaatgagcggaagaccaagggccagcagagtcgccctaagccctatagcgcccctgctgataagggcaaacaga 171542  T
Q  175 agatggtcgatgttaggcggcctaagaagaaggatgctgca---gagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctga 271  Q
      ||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| ||   ||||||   || | ||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||     
T  171541 gaatggtcgttgataggcggccaaagaagaaggatgctccagttgagattacttgttacaattgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgtcctgt 171442  T
Q  272 ggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggtaagaagggtca 310  Q
     || |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||    
T  171441 agagatcaagaaatgtgttcggtgtggcaagaaaggtca 171403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 57 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 432 - 176
Alignment:
Q  57 tgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 156  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||| |||| |||||| | ||||||||| |||| |  || || ||||||||||  |||||||| ||||||||||| |    
T  432 tgcaggatctatgaggaagataccaagactcattacaagattgtgaatgagcggaaagctaagggtcagcagagtctccctaagccttacagtgcccctg 333  T
Q  157 ctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaa 253  Q
    ||||||| || ||||||| ||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||   ||||||||||||| || ||   |||||||||||| ||||||||    
T  332 ctgataagggaaaacagaggatggtcgaagatagacggccaaagaagaaggatgctcctgcagagattgtttgtttttcttgtggtgagaagggccacaa 233  T
Q  254 gagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggtaagaagggtca 310  Q
    ||| || || ||||||| |||  ||||||  ||| | || ||||| |||||||||||    
T  232 gagtaatgcttgtcctggggatgtcaagagatgttttcgctgtggaaagaagggtca 176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 56 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 3407 - 3303
Alignment:
Q  56 ctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgccccc 155  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||  ||| |||| | |  ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||     
T  3407 ctgcaggatatatgaagaggatacgaaagctcattataaggtgatgagtgagcgcagaggcaagggacaacagagtcgtccgaagccgtatagtgcccct 3308  T
Q  156 gctga 160  Q
    |||||    
T  3307 gctga 3303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 57 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 11804 - 11548
Alignment:
Q  57 tgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 156  Q
    ||||| || ||||| |||||||| |||||||| | |||| | ||||||||| |||| |  || || ||||||||||| |||||||| |||||||| ||      
T  11804 tgcagaatttatgaggaggataccaaggctcatttcaagattgtgaatgagcggaaagctaagggtcagcagagtcgccctaagccttacagtgctccta 11705  T
Q  157 ctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaagaaggatgc---tgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaa 253  Q
    ||||||| || |||||||  |||||||| | ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| || || | |||||||||||||||||||||    
T  11704 ctgataagggcaaacagagaatggtcgaagataggcggcctaagaagaaggatgctcatgcagagattgtctgttttacttgtggtgagaaaggccacaa 11605  T
Q  254 gagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggtaagaagggtca 310  Q
    ||| || || |||| || |||  ||||||  ||| | || ||||| |||||||||||    
T  11604 gagtaatgcttgtcttggggatgtcaagagatgttttcgctgtggaaagaagggtca 11548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 72 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 14610 - 14423
Alignment:
Q  72 gaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaac 171  Q
    |||||||| |||||||| |||||| | ||||||||| |||||   || || || |||||||| |||||||| || |||||| | |||||||| || ||||    
T  14610 gaggatactaaggctcattacaagattgtgaatgagcggaagactaagggtcaacagagtcgccctaagccttatagtgcctctgctgataagggcaaac 14511  T
Q  172 agaagatggtcgatgttaggcggcctaagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagag 256  Q
    |||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| || || | |||||| ||||||||||| |||||    
T  14510 agagaatggtcaatgataggcggcctaagaagaaggatgctcctgcagagattgtctgttttacttgtggcgagaaaggccataagag 14423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 57 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 22145 - 21889
Alignment:
Q  57 tgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 156  Q
    |||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||| | ||||||||| |||||   || || |||| |||||||| |||||| || |||||||| |    
T  22145 tgcaggatttatgaggaggataccaaggctcattacaagattgtgaatgagcggaagactaagggccagctgagtcgtcttaagccctatagtgcccctg 22046  T
Q  157 ctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaa 253  Q
    ||  ||| || ||||||| ||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||   |||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||    
T  22045 cttttaagggcaaacagaggatggtcgatgatagacggccaaggaagaaggatgctcctgctgagattgtctgttttaattgtggtgagaaaggccacaa 21946  T
Q  254 gagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggtaagaagggtca 310  Q
    || ||| || ||||||   || || ||||  ||| |||| |||||||||||||||||    
T  21945 gatcaatgcttgtcctcgagagataaagagatgtttccgatgtggtaagaagggtca 21889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 57 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 37569 - 37313
Alignment:
Q  57 tgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 156  Q
    |||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||| | ||||||||| |||||   || || |||| |||||||| |||||| || |||||||| |    
T  37569 tgcaggatttatgaggaggataccaaggctcattacaagattgtgaatgagcggaagactaagggccagctgagtcgtcttaagccctatagtgcccctg 37470  T
Q  157 ctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaa 253  Q
    ||  ||| || ||||||| ||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||   |||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||    
T  37469 cttttaagggcaaacagaggatggtcgatgatagacggccaaggaagaaggatgctcctgctgagattgtctgttttaattgtggtgagaaaggccacaa 37370  T
Q  254 gagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggtaagaagggtca 310  Q
    || ||| || ||||||   || || ||||  ||| |||| |||||||||||||||||    
T  37369 gatcaatgcttgtcctcgagagataaagagatgtttccgatgtggtaagaagggtca 37313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0305 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0305
Description:

Target: scaffold0305; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 3 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 3459 - 3149
Alignment:
Q  3 aagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtga 102  Q
    ||||||||||| || ||||||||| |  |||||||||  || ||||| |||| || ||| || ||| | ||||| || |  ||||| |||||||| || |    
T  3459 aagagggcgatcggataccaacagatccgagtttttccagatttggtgaataactacagaatttataaggaggacaccagagctcattacaaggttgtta 3360  T
Q  103 atgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaa 202  Q
    ||||| |||||   || || ||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||| |  || |||||||||||    
T  3359 atgagcggaagactaagggccagcagagtcgccctaagccttatagtgcccctgctgataagggcaaacagaggatggtcgaggagagacggcctaagaa 3260  T
Q  203 gaaggatg---ctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggt 299  Q
     |||||||   |||| ||||||   |  ||||||||||||||||||||||||||||| |  || |||||||||||  |  |||||||| ||||||||||     
T  3259 aaaggatgttcctgctgagattacttctttcaattgtggtgagaaaggccacaagagtactgcttgtcctgaggaggtggagaagtgtttccggtgtggc 3160  T
Q  300 aagaagggtca 310  Q
    |||||||||||    
T  3159 aagaagggtca 3149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0819 (Bit Score: 72; Significance: 9e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0819
Description:

Target: scaffold0819; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 45 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 667 - 450
Alignment:
Q  45 ttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgt 144  Q
    ||||| || ||||| || || ||||| || ||||| |||||||| |||||| | ||||||||| |||||   || || ||||||||||| |||||||| |    
T  667 ttggtgaacagctgtagaatttatgacgaagataccaaggctcattacaagatggtgaatgagcggaagactaagggccagcagagtcgccctaagccct 568  T
Q  145 acagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtga 241  Q
    | ||||| || |||||||| || |||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||| |||   |||| |||||||| || || |||||||||||    
T  567 atagtgctcctgctgataagggcaaacagagaatggtcgatgataggcgacctaagaagaagaatgctcctgctgagattgtctgttttaattgtggtga 468  T
Q  242 gaaaggccacaagagcaa 259  Q
    ||||||||||||||||||    
T  467 gaaaggccacaagagcaa 450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 57 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 558 - 342
Alignment:
Q  57 tgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 156  Q
    |||||||| ||||| |||||||| |||||||| || ||| | |||||||||  ||| | |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |    
T  558 tgcaggatatatgaggaggataccaaggctcattataagattgtgaatgagcagaaagccaaaggtcagcagagtcgtcctaagccttacagtgctcctg 459  T
Q  157 ctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaagaaggatgct---gcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaa 253  Q
    ||||||| || |||| ||  ||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||   |  |||||||| ||||  | |||||||||||||||||||||    
T  458 ctgataagggtaaaccgagaatggttgatgataggtggcctaagaagaaagatgctcttgtggagattgtctgctatacttgtggtgagaaaggccacaa 359  T
Q  254 gagcaacgcctgtcctg 270  Q
    ||| || || |||||||    
T  358 gagtaatgcttgtcctg 342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 57 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 4975 - 4759
Alignment:
Q  57 tgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 156  Q
    |||||||| ||||| |||||||| |||||||| || ||| | |||||||||  ||| | |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |    
T  4975 tgcaggatatatgaggaggataccaaggctcattataagattgtgaatgagcagaaagccaaaggtcagcagagtcgtcctaagccttacagtgctcctg 4876  T
Q  157 ctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaagaaggatgct---gcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaa 253  Q
    ||||||| || |||| ||  ||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||   |  |||||||| ||||  | |||||||||||||||||||||    
T  4875 ctgataagggtaaaccgagaatggttgatgataggtggcctaagaagaaagatgctcttgtggagattgtctgctatacttgtggtgagaaaggccacaa 4776  T
Q  254 gagcaacgcctgtcctg 270  Q
    ||| || || |||||||    
T  4775 gagtaatgcttgtcctg 4759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 57 - 310
Target Start/End: Original strand, 4318 - 4574
Alignment:
Q  57 tgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 156  Q
    |||||||| ||||| |||||||| ||| || | |||||| | ||||||||| ||||   |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |    
T  4318 tgcaggatatatgaggaggataccaagacttattacaagattgtgaatgagcggaaaaccaaaggtcagcagagtcgtcctaagccttacagtgctcctg 4417  T
Q  157 ctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaa 253  Q
    ||||||| |  |||||||  ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||   |||  |||||||| ||||  | ||||||||| |||||||||||    
T  4418 ctgataaggataaacagagaatggttgatgataggcggcctaagaagaaagatgctcctgtggagattgtctgctatacttgtggtgaaaaaggccacaa 4517  T
Q  254 gagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggtaagaagggtca 310  Q
    ||| || || ||||||| |||  | ||||  ||| | || |||||||||||||||||    
T  4518 gagtaatgcttgtcctggggatgtgaagagatgttttcgttgtggtaagaagggtca 4574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 57 - 310
Target Start/End: Original strand, 17112 - 17368
Alignment:
Q  57 tgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 156  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||| || | |||||| | ||||||||| |||| |  || || || |||||||| |||||||| || |||||||| |    
T  17112 tgcaggatctatgaggaggataccaagacttattacaagattgtgaatgagcggaaagctaagggtcaacagagtcgccctaagccttatagtgcccctg 17211  T
Q  157 ctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaa 253  Q
    ||||||| || ||||||| ||||||||| | ||| || ||||||||||||||||   || |||||||||| || ||   |||||||||||| ||||||||    
T  17212 ctgataagggcaaacagaggatggtcgaagatagacgacctaagaagaaggatgctcctacagagattgtttgtttttcttgtggtgagaagggccacaa 17311  T
Q  254 gagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggtaagaagggtca 310  Q
    ||| || || ||||||| ||| | |||||  ||| |||| ||||| |||||||||||    
T  17312 gagtaatgcttgtcctggggataccaagagatgtttccgatgtgggaagaagggtca 17368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 120 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 40536 - 40496
Alignment:
Q  120 ggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctga 160  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  40536 ggacaacagagtcgtcctaaaccgtacagtgcccctgctga 40496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 57 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 8764 - 8508
Alignment:
Q  57 tgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 156  Q
    ||||| || ||||| |||||||| |||||||| |||||| | ||||||||| |||| |  || || ||||||||||| |||||||| |||||||| |  |    
T  8764 tgcagaatttatgaggaggatactaaggctcattacaagattgtgaatgagcggaaagctaagggtcagcagagtcgccctaagccttacagtgctcttg 8665  T
Q  157 ctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaa 253  Q
    | ||||| || |||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||| ||||| | ||||||| |||||||||||||    
T  8664 ccgataagggcaaacagagaatggtcgataataggcggcctaagaagaaggatgctcctgcaaagattgtctgctttacttgtggtcagaaaggccacaa 8565  T
Q  254 gagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggtaagaagggtca 310  Q
    ||| || || ||||||  |||  | |||| |||| | || ||||| |||||||||||    
T  8564 gagtaatgcttgtcctagggatgttaagaggtgttttcgctgtggaaagaagggtca 8508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 310
Target Start/End: Original strand, 36527 - 36839
Alignment:
Q  1 tcaagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagt 100  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| |  |||||||    || ||||| || || ||||| || ||||| |||||||| |||||||| |||||| | ||    
T  36527 tcaagagggcaattggataccaacagatctgagttttctccgagttggtgaacagttgcagaatttatgaggaggataccaaggctcattacaagattgt 36626  T
Q  101 gaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaag 200  Q
    |||| || ||||| | || || ||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| || ||||| | ||||||||| | ||| ||||| | |    
T  36627 gaattagcggaagagtaagggccagcagagtcgccctaagccctatagtgcccctgctgataagggcaaacaaaggatggtcgaggatagacggccaagg 36726  T
Q  201 aagaaggatg---ctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtg 297  Q
    ||||||||||   |||| |||||||| || || |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||   || ||  |||  ||| |||| ||||    
T  36727 aagaaggatgctcctgctgagattgtctgttttaattgtggcgagaaaggccataagagcaatgcttgtcctagagagatacagagatgtttccgatgtg 36826  T
Q  298 gtaagaagggtca 310  Q
    |||||||||||||    
T  36827 gtaagaagggtca 36839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 69 - 310
Target Start/End: Original strand, 30349 - 30593
Alignment:
Q  69 gaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaaggga 168  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| | ||||||||| |||||   ||||| ||||||||||| |||| ||| || ||| |||| |||||||| || |    
T  30349 gaagaggataccaaggctcattacaagattgtgaatgagcggaagactaaaggccagcagagtcgccctaggccctatagtacccctgctgataagggaa 30448  T
Q  169 aacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctg 265  Q
    |||||| ||||||||| | ||  ||||| | |||||||||||   |||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  30449 aacagaggatggtcgaggataaacggccaaggaagaaggatgctcctgctgagattgtctgttttaattgtggtgagaaaggccacaagagcaatgcttg 30548  T
Q  266 tcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggtaagaagggtca 310  Q
    ||| |  ||  | ||||  ||| |||| |||||||||||||||||    
T  30549 tccaggagaggtaaagagatgtttccgatgtggtaagaagggtca 30593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 53 - 174
Target Start/End: Original strand, 164160 - 164281
Alignment:
Q  53 tagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaag-ggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgc 151  Q
    |||||||||||| ||||| ||| | ||||| ||||| ||||||||  ||| ||| | |||| || |||||||||||||||||||||||  | ||||||||    
T  164160 tagctgcaggatatatgaggagaacacgaaagctcattacaaggtgatgagtga-acgaagaggtaaaggacagcagagtcgtcctaaatcatacagtgc 164258  T
Q  152 ccccgctgataaagggaaacaga 174  Q
    ||| ||||| || || |||||||    
T  164259 ccctgctgacaagggaaaacaga 164281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 67; Significance: 9e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 57 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 2530 - 2274
Alignment:
Q  57 tgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 156  Q
    |||||||| || || |||||||| ||| |||| |||||| | ||||||||| | |||| ||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||  |    
T  2530 tgcaggatttacgaggaggataccaagactcattacaagattgtgaatgagcgaaaggccaagggtcaacagagtcgtcctaagccttacagtgcccttg 2431  T
Q  157 ctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaa 253  Q
    ||||||| || ||| |||  ||||| |||| ||| || ||||||||||| ||||   || | |||||||||||||  | |||||||||||||||||||||    
T  2430 ctgataagggaaaatagagaatggttgatgatagacgccctaagaagaaagatgttcctactgagattgtgtgctatacttgtggtgagaaaggccacaa 2331  T
Q  254 gagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggtaagaagggtca 310  Q
    |||||| || |||| || |||  | || | |||| | || |||||||||||||||||    
T  2330 gagcaatgcttgtcatggggatgttaataggtgttttcgctgtggtaagaagggtca 2274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1459 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold1459
Description:

Target: scaffold1459; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 3 - 310
Target Start/End: Original strand, 801 - 1111
Alignment:
Q  3 aagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtga 102  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| |  |||||||||   | ||||| |||||||| || |||||||| |||||||| | |||||| |||||||| ||||    
T  801 aagagggcgtttggataccaacagatccgagtttttccatatttggtgaatagctgtagaatctatgatgaggataccagggctcattacaaggttgtga 900  T
Q  103 atgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaa 202  Q
    ||||| |||||   || || || |||||| | |||||||| || |||||||| ||||||||  | | ||||| |||||| || |  || |||||||||||    
T  901 atgagcggaagactaagggccaacagagttgccctaagccctatagtgcccctgctgataagcgcacacagaggatggtagaggaaagacggcctaagaa 1000  T
Q  203 gaaggatg---ctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggt 299  Q
    ||||||||   || | ||||||   || ||||||||||| |||||||||| ||||||||  |  ||||| |||||  | ||||| ||| ||||||||||     
T  1001 gaaggatgttcctactgagattacctgtttcaattgtggcgagaaaggccgcaagagcattgtttgtccagaggaggtaaagaaatgtttccggtgtggc 1100  T
Q  300 aagaagggtca 310  Q
    |||||||||||    
T  1101 aagaagggtca 1111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0611 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0611
Description:

Target: scaffold0611; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 71 - 270
Target Start/End: Original strand, 9220 - 9422
Alignment:
Q  71 agaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaa 170  Q
    ||||||||| |||||||| |||||| | |||||||||  ||||   || || ||||||||||| | |||||| || |||||||| |||||||| || |||    
T  9220 agaggataccaaggctcattacaagattgtgaatgagccgaagactaagggtcagcagagtcgccttaagccttatagtgcccctgctgataagggcaaa 9319  T
Q  171 cagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtc 267  Q
    | ||  |||||||| | |||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||| || || | |||||||||||||||||||||||| || || ||||    
T  9320 ccgagaatggtcgaagataggcggccttagaagaaggatgctcctgcagagattgtctgttttacttgtggtgagaaaggccacaagagtaatgcttgtc 9419  T
Q  268 ctg 270  Q
    |||    
T  9420 ctg 9422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 3 - 310
Target Start/End: Original strand, 16775 - 17085
Alignment:
Q  3 aagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtga 102  Q
    ||||||||||| || ||||||||| |   ||||||||  || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| || |  ||||| |||||||| || |    
T  16775 aagagggcgatcggataccaacagatcccagtttttccagatttggtgaacagctgtaggatctatgaggaggacaccagagctcattacaaggttgtta 16874  T
Q  103 atgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaa 202  Q
    ||||| |||||   || || ||||||||| | |||||||| || |||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||| |  |  || ||||||||    
T  16875 atgagcggaagactaagggccagcagagtagccctaagccatatagtgcccctgctgataagggcaaacagaggatggtcgaggagaaacgacctaagaa 16974  T
Q  203 gaaggatg---ctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggt 299  Q
     |||||||   |||| ||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||||  |  ||||| |||||  | ||||| ||| || |||||||     
T  16975 aaaggatgttcctgctgagattacttgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcactgtttgtccagaggaggtgaagaaatgtttctggtgtggc 17074  T
Q  300 aagaagggtca 310  Q
    |||||||||||    
T  17075 aagaagggtca 17085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 123 - 236
Target Start/End: Original strand, 194697 - 194813
Alignment:
Q  123 cagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaagaaggatg---ctgcagaga 219  Q
    ||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| || |||||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||   |||| ||||    
T  194697 cagcagagtcgccctaagccttatagtgcccctgctgataagggcaaacagagaatggtcgatgataggcggcctaagaataaggatgtccctgctgaga 194796  T
Q  220 ttgtgtgcttcaattgt 236  Q
    |||| ||||| ||||||    
T  194797 ttgtctgctttaattgt 194813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 64; Significance: 5e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 57 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 15452 - 15297
Alignment:
Q  57 tgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 156  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||| |||| |||||| | ||||||||| |||| |  || || || |||||||| |||||||| || |||||||| |    
T  15452 tgcaggatctatgaggaggataccaagactcattacaagattgtgaatgagcggaaagctaagggtcaacagagtcgccctaagccttatagtgcccctg 15353  T
Q  157 ctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaagaaggatgct 212  Q
    ||||||| || ||||||| ||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||    
T  15352 ctgataagggcaaacagaggatggtcgaagatagacggcctaagaagaaggatgct 15297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0319 (Bit Score: 64; Significance: 5e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0319
Description:

Target: scaffold0319; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 57 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 7041 - 6886
Alignment:
Q  57 tgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 156  Q
    ||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||| | ||||||||| |||||   || || ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |    
T  7041 tgcaggatctacgaggaggatactaaggctcattacaagattgtgaatgagcggaagactaagggtcagcagagtcgccctaagccttacagtgcccctg 6942  T
Q  157 ctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaagaaggatgct 212  Q
    |||||||  | ||||||| ||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||    
T  6941 ctgataagtgcaaacagaggatggtcgaagatagacgacctaagaagaaggatgct 6886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 57 - 270
Target Start/End: Original strand, 23708 - 23924
Alignment:
Q  57 tgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 156  Q
    |||||||| ||||| |||||||| |||||||| || ||| | |||||||||  ||| |  ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |    
T  23708 tgcaggatttatgaggaggataccaaggctcattataagattgtgaatgagcagaaagctaaaggtcagcagagtcgtcctaagccatacagtgctcctg 23807  T
Q  157 ctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaagaaggatgc---tgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaa 253  Q
    ||||||| || |||||||  ||||| |||| |||| ||||||||||||| ||| |   ||  |||||||| || |  | |||||||||||||||||||||    
T  23808 ctgataagggcaaacagagaatggttgatgataggtggcctaagaagaaagatactcatgttgagattgtctgttatacttgtggtgagaaaggccacaa 23907  T
Q  254 gagcaacgcctgtcctg 270  Q
    ||| || || |||||||    
T  23908 gagtaatgcttgtcctg 23924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 59; Significance: 5e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 57 - 310
Target Start/End: Original strand, 10643 - 10899
Alignment:
Q  57 tgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 156  Q
    |||| ||||||||| |||||||| |||  ||| |||||| | ||||||||| |||| |  || || ||  ||||||| |||||||| ||||||||||| |    
T  10643 tgcaagatctatgaggaggataccaagattcattacaagattgtgaatgagcggaaagctaagggtcaaaagagtcgccctaagccttacagtgcccctg 10742  T
Q  157 ctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaa 253  Q
    ||||||| || ||||||| ||||||||| |  || |||||||||||||||||||   || |||||||||| || ||   |||||||||||| ||||||||    
T  10743 ctgataagggcaaacagaggatggtcgaagacagacggcctaagaagaaggatgctcctacagagattgtttgtttttcttgtggtgagaagggccacaa 10842  T
Q  254 gagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggtaagaagggtca 310  Q
    ||| || || ||||||  ||| | ||| |  ||| |||| ||||| |||||||||||    
T  10843 gagtaatgcttgtcctagggataccaacagatgtttccgatgtgggaagaagggtca 10899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0411 (Bit Score: 59; Significance: 5e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0411
Description:

Target: scaffold0411; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 57 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 8952 - 8696
Alignment:
Q  57 tgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 156  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||| |||| |||||| | ||||||||| |||| |  || || || |||||||| |||||||| ||||||||||| |    
T  8952 tgcaggatctatgagaaggataccaagactcattacaagattgtgaatgagcggaaagctaagggtcaacagagtcgccctaagccttacagtgcccctg 8853  T
Q  157 ctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaagaagga---tgctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaa 253  Q
    ||||||| || ||||||| ||||||||| | ||| || ||||||||||||||   | || | |||||||| || ||   |||||||||||| ||||||||    
T  8852 ctgataagggaaaacagaggatggtcgaagatagacgacctaagaagaaggatactcctactgagattgtttgtttttcttgtggtgagaagggccacaa 8753  T
Q  254 gagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggtaagaagggtca 310  Q
    ||| || || ||||||  ||| | |||||  ||| | || ||||| |||||||||||    
T  8752 gagtaatgcttgtcctagggataccaagagatgttttcgctgtggaaagaagggtca 8696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 59; Significance: 5e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 57 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 48271 - 48055
Alignment:
Q  57 tgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 156  Q
    ||||| || ||||| |||||||| ||| |||| |||||| | ||||||||| | || | |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |    
T  48271 tgcagaatttatgaggaggataccaagactcattacaagattgtgaatgagcgaaaagccaaaggtcagcagagtcgtcctaagccttacagtgctcctg 48172  T
Q  157 ctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaa 253  Q
    ||||||| || |||||||  ||||| ||||  ||||| ||||  ||||| ||||   |||  |||||||| ||||  | |||||||||||||||||||||    
T  48171 ctgataagggtaaacagagaatggttgatgagaggcgccctagaaagaaagatgctcctgttgagattgtctgctatacttgtggtgagaaaggccacaa 48072  T
Q  254 gagcaacgcctgtcctg 270  Q
    ||| || || |||||||    
T  48071 gagtaatgcttgtcctg 48055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 57 - 256
Target Start/End: Original strand, 55234 - 55436
Alignment:
Q  57 tgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 156  Q
    ||||| || ||||| |||||||| ||| |||| |||||| | ||||||||| | || | |||||| |||||||||||||||||| | |||||||| || |    
T  55234 tgcagaatttatgaggaggataccaagactcattacaagattgtgaatgagcgaaaagacaaaggtcagcagagtcgtcctaagacttacagtgctcctg 55333  T
Q  157 ctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaa 253  Q
    ||||||| || |||||||  ||||| ||||  ||||| ||||  ||||| ||||   |||  |||||||| ||||  | |||||||||||||||||||||    
T  55334 ctgataagggtaaacagagaatggttgatgagaggcgccctagaaagaaagatgctcctgttgagattgtctgctatacttgtggtgagaaaggccacaa 55433  T
Q  254 gag 256  Q
    |||    
T  55434 gag 55436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 59; Significance: 5e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 57 - 310
Target Start/End: Original strand, 110670 - 110926
Alignment:
Q  57 tgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 156  Q
    |||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||| | ||||||||| |||| | |||||| |||||||| |||||||||||  ||||||| || |    
T  110670 tgcaggatttatgaggaggataccaaggctcattacaagattgtgaatgagcggaaagtcaaaggtcagcagagccgtcctaagcctcacagtgctcctg 110769  T
Q  157 ctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaa 253  Q
    | ||||| ||||| ||||  ||||| ||||  ||||| ||||  ||||| ||||   |||  |||||||| ||||  | |||||||||||||||||||||    
T  110770 ccgataaggggaagcagagaatggttgatgagaggcgccctagaaagaaagatgctcctgttgagattgtctgctatacttgtggtgagaaaggccacaa 110869  T
Q  254 gagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggtaagaagggtca 310  Q
    ||| || || |||| || ||| || ||||  ||| | || ||||||||||| |||||    
T  110870 gagtaatgcttgtcttggggacatgaagagatgttttcgatgtggtaagaaaggtca 110926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 57 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 18386 - 18280
Alignment:
Q  57 tgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 156  Q
    ||||| || |||||||| ||||| || ||||| |||||||  |||||||||||||| || ||||| ||| | |||||||| ||||| |||| ||| || |    
T  18386 tgcagaatttatgaagaagataccaaagctcattacaaggctgtgaatgagaggaaaggtaaaggtcagaaaagtcgtccaaagccttacaatgctcctg 18287  T
Q  157 ctgataa 163  Q
    |||||||    
T  18286 ctgataa 18280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0041 (Bit Score: 57; Significance: 8e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0041
Description:

Target: scaffold0041; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 45 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 42288 - 42074
Alignment:
Q  45 ttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgt 144  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||| || || || ||||| || ||| |  ||| |||||||| ||| || ||||| |||| |||||||||||| |    
T  42288 ttggttaataggtgcagaatctatgaagaagacaccaaagctcattataagattatgagtgagaggaggggtaagggacaacagaatcgtcctaagcctt 42189  T
Q  145 acagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtga 241  Q
    ||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||  |||| |||| |||| |||| ||  ||||   |||  |||||||| |||| ||| ||||||||    
T  42188 acagtgctcctgctgacaaaggaaagcagaagatgggtgatgataggaggcccaagaggagagatgctcctgttgagattgtttgctacaagtgtggtga 42089  T
Q  242 gaaaggccacaagag 256  Q
    |||||||||||||||    
T  42088 gaaaggccacaagag 42074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0550 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0550
Description:

Target: scaffold0550; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 168 - 310
Target Start/End: Original strand, 10032 - 10177
Alignment:
Q  168 aaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaagaaggatgctgca---gagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcct 264  Q
    |||||||  |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |  |    
T  10032 aaacagagaatggtcgatgatagacggcctaagaagaaggatgctcctacggagattgtctgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaatgttt 10131  T
Q  265 gtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggtaagaagggtca 310  Q
    |||  |||||  | ||||| ||| |||||||||| |||||||||||    
T  10132 gtctagaggaggtaaagaaatgtttccggtgtggcaagaagggtca 10177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 72 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 4077 - 3836
Alignment:
Q  72 gaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaac 171  Q
    ||||||||  || |||| |||||| | || |||||||||||   |||||| |||||||||||||||||| | |||||||| || |||||||| || ||||    
T  4077 gaggatacctagactcattacaagattgtaaatgagaggaaaaccaaaggtcagcagagtcgtcctaagtcttacagtgctcctgctgataagggtaaac 3978  T
Q  172 agaagatggtcgatgttaggcggcctaagaagaaggatgct---gcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcc 268  Q
    |||  ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||   || || ||||| ||||  | || ||||| ||||| ||||||||| || || |||||    
T  3977 agagaatggttgatgataggcggcctaagaagaaagatgctcctgctgaaattgtctgctatacttatggtgtgaaagaccacaagagtaatgcttgtcc 3878  T
Q  269 tgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggtaagaagggtca 310  Q
    || |||  | |||| |||| | || ||||||||||| |||||    
T  3877 tggggatgtgaagaggtgttttcgttgtggtaagaaaggtca 3836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 57 - 270
Target Start/End: Original strand, 40270 - 40486
Alignment:
Q  57 tgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 156  Q
    |||||||| || || |||||||| ||| |||| |||||| | ||||||||| | |||| ||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  40270 tgcaggatttacgaggaggataccaagactcattacaagattgtgaatgagcgaaaggccaagggtcaacagagtcgtcctaagccttacagtgcccctg 40369  T
Q  157 ctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaa 253  Q
    ||||||| || |||||||   |||| |||| |||||| || |  ||||| ||||   |||| |||||||  | ||  | |||||||||||||||||||||    
T  40370 ctgataagggaaaacagagagtggttgatgataggcgcccgagaaagaaagatgctcctgctgagattgaattctatacttgtggtgagaaaggccacaa 40469  T
Q  254 gagcaacgcctgtcctg 270  Q
    |||||| || |||||||    
T  40470 gagcaatgcttgtcctg 40486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 3)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 57 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 42173 - 42019
Alignment:
Q  57 tgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 156  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| | ||||||||| | || | |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  | |    
T  42173 tgcaggatctatgaggaggatactaaggctcattacaagattgtgaatgagcgaaaagtcaaaggtcagcagagtcgtcctaagccttacagtgcttctg 42074  T
Q  157 ctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaagaaggatgc 211  Q
    ||||||| || |||||||  ||||| ||||  ||||| ||||  ||||| |||||    
T  42073 ctgataagggtaaacagagaatggttgatgagaggcgccctagaaagaaagatgc 42019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 57 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 75893 - 75739
Alignment:
Q  57 tgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 156  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| | ||||||||| | || | |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  | |    
T  75893 tgcaggatctatgaggaggatactaaggctcattacaagattgtgaatgagcgaaaagtcaaaggtcagcagagtcgtcctaagccttacagtgcttctg 75794  T
Q  157 ctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaagaaggatgc 211  Q
    ||||||| || |||||||  ||||| ||||  ||||| ||||  ||||| |||||    
T  75793 ctgataagggtaaacagagaatggttgatgagaggcgccctagaaagaaagatgc 75739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 57 - 184
Target Start/End: Original strand, 34534 - 34661
Alignment:
Q  57 tgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 156  Q
    |||||||| || || |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| |||||   || || ||||||||||| |||||||| || || ||||| |    
T  34534 tgcaggatttacgaggaggataccaaggctcattacaaggtcgtgaatgagcggaagactaagggccagcagagtcgccctaagccttatagcgcccctg 34633  T
Q  157 ctgataaagggaaacagaagatggtcga 184  Q
    ||||||| || |||||||  ||||||||    
T  34634 ctgataagggcaaacagagaatggtcga 34661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0276 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0276
Description:

Target: scaffold0276; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 45 - 256
Target Start/End: Original strand, 23674 - 23888
Alignment:
Q  45 ttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgt 144  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||| || || ||  |||| || ||| |  ||| |||||||| ||| || ||||| ||||||||||||||||| |    
T  23674 ttggttaataggtgcagaatctatgaagaagacaccaaaactcattataagattatgagtgagaggaggggtaagggacaacagagtcgtcctaagcctt 23773  T
Q  145 acagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtga 241  Q
    ||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||  |||| |||| |||| |||| ||  ||||   |||  |||||||| || | ||| ||||||||    
T  23774 acagtgctcctgctgacaaaggaaagcagaagatgggtgatgataggaggcccaagaggagagatgctcctgttgagattgtttgatacaagtgtggtga 23873  T
Q  242 gaaaggccacaagag 256  Q
    |||||||||||||||    
T  23874 gaaaggccacaagag 23888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0181 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0181
Description:

Target: scaffold0181; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 3 - 310
Target Start/End: Original strand, 28637 - 28947
Alignment:
Q  3 aagagggcgattgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtga 102  Q
    ||||||||||| || ||||||||| |  || ||||||  || || || || |||||||| ||||| || ||||| || |  ||||| |||||||| || |    
T  28637 aagagggcgatcggataccaacagatccgaatttttccagatttagtgaacagctgcagaatctacgaggaggacaccagagctcattacaaggttgtta 28736  T
Q  103 atgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaa 202  Q
    |||||  ||||   || || |||||| || | |||||||| || |||||||| | |||||| || |||||||  |||||||| |  || |||||||||||    
T  28737 atgagcagaagactaagggccagcagtgttgccctaagccatatagtgcccctgttgataagggcaaacagagaatggtcgaggagagacggcctaagaa 28836  T
Q  203 gaaggatg---ctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggt 299  Q
    ||||||||   ||||  |||||   || ||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||| ||||  | ||||| ||| ||||||||||     
T  28837 gaaggatgttcctgctaagattacctgtttcaattgtggcgagaaaggccacaagagcaatgtttgtcctaaggaggtaaagaaatgtttccggtgtggc 28936  T
Q  300 aagaagggtca 310  Q
    |||||||||||    
T  28937 aagaagggtca 28947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 57 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 104767 - 104565
Alignment:
Q  57 tgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 156  Q
    |||||||| ||||| |||||||| ||| |||| |||||| | ||||||||| | || | |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| || |    
T  104767 tgcaggatttatgaggaggatactaagactcattacaagattgtgaatgagcgaaaagtcaaaggtcagcagagtcgtccaaagccttatagtgctcctg 104668  T
Q  157 ctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaa 253  Q
    ||||||| || |||||||  ||| | ||||  ||||||||||  ||||| ||||   |||  |||||||| ||||  | |||||||||||||||||||||    
T  104667 ctgataagggaaaacagagaatgattgatgagaggcggcctagaaagaaagatgctcctgttgagattgtttgctatacttgtggtgagaaaggccacaa 104568  T
Q  254 gag 256  Q
    |||    
T  104567 gag 104565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 52; Significance: 8e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 57 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 19939 - 19812
Alignment:
Q  57 tgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 156  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||| |||| |||||| | ||||||||| |||| |  || || ||||||||||| |||||||| || |||||||| |    
T  19939 tgcaggatctatgaggaggataccaagactcattacaagattgtgaatgagcggaaagctaagggtcagcagagtcgccctaagccttatagtgcccctg 19840  T
Q  157 ctgataaagggaaacagaagatggtcga 184  Q
    ||||||| || ||||||| |||||||||    
T  19839 ctgataagggaaaacagaggatggtcga 19812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118 (Bit Score: 52; Significance: 8e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0118
Description:

Target: scaffold0118; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 45 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 1014 - 797
Alignment:
Q  45 ttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgt 144  Q
    |||||||| || ||||| || |||||||| || || || ||||| |||||| || ||| |||||||| ||| || |||||||||| |||||||||||| |    
T  1014 ttggttaacagatgcagaatttatgaagaagacaccaaagctcattacaagataatgagtgagaggaggggtaagggacagcagaatcgtcctaagcctt 915  T
Q  145 acagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtga 241  Q
    ||||||| || ||||| ||||| ||  ||||| || | |||| |||| ||||||||| ||  ||||   || | |||||||| || | ||| ||||||||    
T  914 acagtgctcctgctgacaaaggaaagtagaagttgattgatgataggaggcctaagaggagagatgctccttctgagattgtttgttacaagtgtggtga 815  T
Q  242 gaaaggccacaagagcaa 259  Q
     |||||||||||||||||    
T  814 aaaaggccacaagagcaa 797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0410 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0410
Description:

Target: scaffold0410; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 45 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 694 - 426
Alignment:
Q  45 ttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgt 144  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| || |  ||||| |||||||| || |||||| |||||   || || ||||||||||| |||||||| |    
T  694 ttggtgaatagttgcagaatttatgaggaggacaccagagctcattacaaggttgttaatgagcggaagactaagggccagcagagtcgccctaagcctt 595  T
Q  145 acagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtga 241  Q
    | ||| |||| | |||||| || ||||||| ||||||||| |  || || || ||||| |||||||   |||  ||||||   || ||||||||||||||    
T  594 atagttcccctgttgataagggcaaacagaggatggtcgaggagagacgacccaagaaaaaggatgttcctgttgagattacttgtttcaattgtggtga 495  T
Q  242 gaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggtaagaagggtca 310  Q
    ||||||||||||||| |  || |||| ||||||  | ||| ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  494 gaaaggccacaagagtactgcttgtcgtgaggaggtgaaggagtgtttccggtgtggcaagaagggtca 426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0222
Description:

Target: scaffold0222; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 53 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 21359 - 21153
Alignment:
Q  53 tagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcc 152  Q
    ||||||||| || ||||| || |||| ||| ||||| ||||||||  ||| |||| | || ||||| |||||| ||||||||||||| ||||| ||||||    
T  21359 tagctgcagaatatatgaggaagataggaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtaaaggcaagggacagtagagtcgtcctaaaccgtatagtgcc 21260  T
Q  153 cccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggcc 249  Q
    || ||||| ||||| ||||||| | ||   ||||  ||| |||| |||| ||  ||||   |||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||    
T  21259 cctgctgacaaaggaaaacagaggctgaatgatgagaggaggcccaagaggagagatgcttctgctgagattgtttgctacaagtgtggtgagaaaggcc 21160  T
Q  250 acaagag 256  Q
    |||||||    
T  21159 acaagag 21153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1845 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold1845
Description:

Target: scaffold1845; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 57 - 259
Target Start/End: Original strand, 1067 - 1272
Alignment:
Q  57 tgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 156  Q
    |||||||| || ||||| || || || ||||| |||||| || ||| |||||||| ||| || |||||| ||| |||||||||||| |||||||| || |    
T  1067 tgcaggatttacgaagaagacaccaaagctcattacaagataatgagtgagaggaggggaaagggacagaagaatcgtcctaagccttacagtgctcctg 1166  T
Q  157 ctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaa 253  Q
    |||| ||||| || |||||||||   |||| |||| | || |||| ||  ||||   |||| |||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||    
T  1167 ctgacaaaggaaagcagaagatgaatgatgataggagacccaagaggagagatgctcctgctgagattgtttgttacaagtgtggtgagaaaggccacaa 1266  T
Q  254 gagcaa 259  Q
    ||||||    
T  1267 gagcaa 1272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 57 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 11569 - 11454
Alignment:
Q  57 tgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 156  Q
    ||||| || ||||| || ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||| || |||||||| |    
T  11569 tgcagaatatatgaggaagatactaaggctcattacaaggttgtgaatgagaggaaaggcaagggtcagcaaagtcgtcccaagccttatagtgcccctg 11470  T
Q  157 ctgataaagggaaaca 172  Q
    ||||||| || |||||    
T  11469 ctgataagggcaaaca 11454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1517 (Bit Score: 47; Significance: 8e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold1517
Description:

Target: scaffold1517; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 54 - 259
Target Start/End: Original strand, 1247 - 1455
Alignment:
Q  54 agctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgccc 153  Q
    ||||| ||||| ||||| || || || || ||||| ||||||||  ||| ||||||||  || || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  1247 agctgtaggatatatgaggaagacacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagaggagaggtaagggacagcagagtcgtcctaagccttacagtgctc 1346  T
Q  154 ccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggcca 250  Q
    | ||||| || || |||||||| |||   |||| |||| |||| |||| ||  ||||   |||| |||||||| || | ||| |||||||| ||||||||    
T  1347 ctgctgacaagggaaaacagaaaatgaatgatgataggaggcccaagaggagagatgctcctgctgagattgtctgttacaagtgtggtgaaaaaggcca 1446  T
Q  251 caagagcaa 259  Q
    |||||||||    
T  1447 caagagcaa 1455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0575 (Bit Score: 47; Significance: 8e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0575
Description:

Target: scaffold0575; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 57 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 10160 - 9944
Alignment:
Q  57 tgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 156  Q
    ||||| || ||||| |||||||| ||| |||| |||||| | ||||||||| |||| | || ||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |    
T  10160 tgcagaatttatgaggaggataccaagactcattacaagatcgtgaatgagcggaaagccacaggtcagcagagtcgtcctaagccttacagtgctcctg 10061  T
Q  157 ctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaa 253  Q
    || |||| || ||||| |  ||||| ||||  ||||| |||| |||||| ||||   |||  |||||||| || |  | |||||||||||||||||| ||    
T  10060 ctaataagggtaaacaaagaatggttgatgagaggcgccctaggaagaaagatgctcctgtcgagattgtatgttgtacttgtggtgagaaaggccataa 9961  T
Q  254 gagcaacgcctgtcctg 270  Q
    ||| || || |||||||    
T  9960 gagtaatgcttgtcctg 9944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 47; Significance: 8e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 57 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 19190 - 18935
Alignment:
Q  57 tgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 156  Q
    |||||||| ||||| |||||||| ||| |||| |||||| | ||||||||| | || |  ||||| | ||| |||||||||||||| |||||||| || |    
T  19190 tgcaggatttatgaggaggataccaagactcattacaagattgtgaatgagcgaaaagctaaaggtc-gcaaagtcgtcctaagccttacagtgctcctg 19092  T
Q  157 ctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaagaagga---tgctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaa 253  Q
    ||||||| || |||||||  ||||| |||| |||||| || || ||||| ||   | |||  || ||||| ||||  | |||||||||||||||||||||    
T  19091 ctgataagggtaaacagagaatggttgatgataggcgccccaaaaagaaagaagctcctgttgaaattgtctgctatacttgtggtgagaaaggccacaa 18992  T
Q  254 gagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggtaagaagggtca 310  Q
    ||| || || ||||| | |||  | |||| |||| | || |||||||||||||||||    
T  18991 gagtaatgcttgtcccggggatgtgaagaggtgttttcgctgtggtaagaagggtca 18935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 47; Significance: 8e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 54 - 259
Target Start/End: Original strand, 30086 - 30294
Alignment:
Q  54 agctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgccc 153  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || || ||||| ||| || || ||| |||||||| ||| || ||| | |||| ||||||||| || |||||||| |    
T  30086 agctgcaggatatatgaggaggacacaaaagctcattactagataatgagtgagaggaggggtaagggataacagaatcgtcctaaaccttacagtgctc 30185  T
Q  154 ccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggcca 250  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||   ||||  ||| |||| |||| ||| ||||   |||| |||||||| || |  || |||||||| ||||||||    
T  30186 ctgctgacaaagggaaacagaagatgaatgatgacaggaggcccaagaggaaagatgctcctgctgagattgtttgttataagtgtggtgaaaaaggcca 30285  T
Q  251 caagagcaa 259  Q
    |||||||||    
T  30286 caagagcaa 30294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 47; Significance: 8e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 45 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 30463 - 30333
Alignment:
Q  45 ttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgt 144  Q
    |||||||| || ||||| || |||||||| || || || ||||| ||||||  | ||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  30463 ttggttaacagttgcagaatttatgaagaagacaccaaagctcattacaagacaatgagtgagaggaggggcaagggacagcagagtcgtcctaagcctt 30364  T
Q  145 acagtgcccccgctgataaagggaaacagaa 175  Q
    ||||||| || ||||| ||||| || |||||    
T  30363 acagtgctcctgctgacaaaggaaagcagaa 30333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 47; Significance: 8e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 66 - 212
Target Start/End: Original strand, 66302 - 66448
Alignment:
Q  66 tatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaag 165  Q
    ||||| || ||||| |||||||| |||||||| ||||||||| |||||   || || ||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| |    
T  66302 tatgaggaagataccaaggctcattacaaggttgtgaatgagcggaagactaagggccagcagagtcgccctaagccctatagtgcccctgctgataagg 66401  T
Q  166 ggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaagaaggatgct 212  Q
    | |||||||  ||||| || | ||| ||||| | |||||||||||||    
T  66402 gcaaacagagaatggttgaggatagacggccaaggaagaaggatgct 66448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 47; Significance: 8e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 73 - 163
Target Start/End: Original strand, 216199 - 216289
Alignment:
Q  73 aggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataa 163  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||||||||    
T  216199 aggatactaaggctcattacaaggttgtgaatgagaggaaaggcaagggtcagcaaagtcgtccaaagccttacagtgctcctgctgataa 216289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 47; Significance: 8e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 66 - 259
Target Start/End: Original strand, 514125 - 514321
Alignment:
Q  66 tatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaag 165  Q
    |||||||| || || || ||||| |||||| || ||| |||||||| ||| || |||||||||| |||||||||||| || ||||| || ||||| ||||    
T  514125 tatgaagaagacaccaaagctcattacaagataatgagtgagaggaggggtaagggacagcagaatcgtcctaagccttaaagtgctcctgctgacaaag 514224  T
Q  166 ggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaa 259  Q
    | ||  ||||||||   |||| |||| ||||||||| ||  ||||   || | |||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  514225 gaaagaagaagatgaatgatgataggaggcctaagaggagagatgctccttctgagattgtttgttacaagtgtggtgagaaaggccacaagagcaa 514321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1433 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold1433
Description:

Target: scaffold1433; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 54 - 174
Target Start/End: Original strand, 1071 - 1191
Alignment:
Q  54 agctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgccc 153  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||| |||| | |  ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |    
T  1071 agctgtaggatctatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgtccgaagccatacagtgctc 1170  T
Q  154 ccgctgataaagggaaacaga 174  Q
    | ||||| || || |||||||    
T  1171 ctgctgacaagggtaaacaga 1191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0404
Description:

Target: scaffold0404; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 54 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 8288 - 8168
Alignment:
Q  54 agctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgccc 153  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||| |||| | |  ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |    
T  8288 agctgtaggatctatgaagaggatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacaacagagtcgtccgaagccatacagtgctc 8189  T
Q  154 ccgctgataaagggaaacaga 174  Q
    | ||||| || || |||||||    
T  8188 ctgctgacaagggtaaacaga 8168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 60 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 9485 - 9232
Alignment:
Q  60 aggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctg 159  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| |||| ||| || | ||||| ||| |||| |  || || || ||||||||  |||| || || |||||||| | ||    
T  9485 aggatctatgaggaggataccaagactcattactagattgtgaaggagcggaaagctaagggtcaacagagtcgcgctaatccttatagtgcccctggtg 9386  T
Q  160 ataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaagaaggatgct---gcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagag 256  Q
    |||| || ||||||| ||||||||| | |||    ||||||||||||||||||   ||| ||||||| || ||   |||||||||||| |||||||||||    
T  9385 ataagggcaaacagaggatggtcgaagatagataacctaagaagaaggatgctcctgcaaagattgtttgtttttcttgtggtgagaagggccacaagag 9286  T
Q  257 caacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggtaagaagggtca 310  Q
     || || ||||||| ||| | |||||  ||| |||| ||||| |||||||||||    
T  9285 taatgcttgtcctggggataccaagagatgtttccgatgtgggaagaagggtca 9232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 57 - 172
Target Start/End: Original strand, 14028 - 14143
Alignment:
Q  57 tgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 156  Q
    ||||| || ||||| || ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||| || |    
T  14028 tgcagaatatatgaggaagatactaaggctcattacaaggttgtgaatgagaggaaaggcaagggtcagcaaagtcgtccaaagccttacagtgctcctg 14127  T
Q  157 ctgataaagggaaaca 172  Q
     |||||| || |||||    
T  14128 atgataagggaaaaca 14143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 57 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 15951 - 15836
Alignment:
Q  57 tgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 156  Q
    ||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||    | ||| |||||||| ||||| |||||||| || |    
T  15951 tgcagaatctatgaggaggatactaaggctcattacaaggttgtgaatgagaggaaaggcaagtttccgcaaagtcgtccaaagccttacagtgctcctg 15852  T
Q  157 ctgataaagggaaaca 172  Q
    ||||||| || |||||    
T  15851 ctgataagggcaaaca 15836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 53 - 160
Target Start/End: Original strand, 62531 - 62638
Alignment:
Q  53 tagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcc 152  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||  ||| |||| | |  ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  62531 tagctgcaggatatatgaagaggataccaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaaggggcagcagagtcgtccgaagccgtatagtgcc 62630  T
Q  153 cccgctga 160  Q
    || |||||    
T  62631 cctgctga 62638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 53 - 163
Target Start/End: Original strand, 65081 - 65191
Alignment:
Q  53 tagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcc 152  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||||||||  ||| |||||| | |   || ||||| |||||||| || ||||| || ||||||    
T  65081 tagctgcagaatttatgaagaggatacaaaagctcattacaaggtgatgagtgagagaaggaataatggacaacagagtcgcccgaagccatatagtgcc 65180  T
Q  153 cccgctgataa 163  Q
    || ||||||||    
T  65181 cctgctgataa 65191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0993 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0993
Description:

Target: scaffold0993; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 1507 - 1307
Alignment:
Q  73 aggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaaca 172  Q
    |||||||||||||||| |||||| | ||||||||  |||||  ||| || || |||||||| |||||||| |||||||| || |||||||| || |||||    
T  1507 aggatacgaaggctcattacaagattgtgaatgaacggaagaccaagggccaacagagtcgccctaagccttacagtgctcctgctgataagggtaaaca 1408  T
Q  173 gaagatggtcgatgttaggcggcctaagaagaagga---tgctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcct 269  Q
    ||  ||||| |||| |||||| || |  |||| |||   | |||  |||||||| || |  | |||||||||||||||||||||||| || || ||||||    
T  1407 gagaatggttgatgataggcgcccgagaaagatggaagctcctgttgagattgtttgttatacttgtggtgagaaaggccacaagagtaatgcttgtcct 1308  T
Q  270 g 270  Q
    |    
T  1307 g 1307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 50649 - 50543
Alignment:
Q  54 agctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgccc 153  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||  ||| |||| | |  ||||| |||||||||||| |||| |||||||| |||||||    
T  50649 agctgtaggatctatgaagaagatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacagcagagtggtccgaagccgtatagtgccc 50550  T
Q  154 ccgctga 160  Q
    | |||||    
T  50549 ctgctga 50543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 45 - 151
Target Start/End: Original strand, 66859 - 66965
Alignment:
Q  45 ttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgt 144  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||| || || || || ||||| |||||| || ||| |||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||| |    
T  66859 ttggtaaacagctgcaggatttatgaggaagacaccaaagctcattacaagataatgagtgagaggaggggcaagggacagcagaatcgtcctaagcctt 66958  T
Q  145 acagtgc 151  Q
    |||||||    
T  66959 acagtgc 66965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0523 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000007; HSPs: 3)
Name: scaffold0523
Description:

Target: scaffold0523; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 12 - 256
Target Start/End: Original strand, 11461 - 11708
Alignment:
Q  12 attgggtaccaacagctgagagtttttcaggacttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagagga 111  Q
    |||||||| |||||| | ||||| |||  ||| |||||||| || || ||||| |||||||| || || || ||||| |||||| || ||| ||||||||    
T  11461 attgggtatcaacagatcagagtcttttcggagttggttaacaggtgtaggatttatgaagaagacaccaaagctcattacaagataatgagtgagagga 11560  T
Q  112 agggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaagaaggatgc 211  Q
     ||| || ||||| |||| |||||||||||| |||| ||| |  ||||| ||||| || ||||||||||  |||| ||||  ||| |||| ||  |||||    
T  11561 ggggtaagggacaacagaatcgtcctaagccttacattgctcttgctgacaaaggaaagcagaagatgggtgatgataggaagcccaagaggagagatgc 11660  T
Q  212 tgca---gagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagag 256  Q
      ||   |||||||| || | ||| |||||| ||||||||||||||||    
T  11661 accagatgagattgtatgatacaagtgtggtaagaaaggccacaagag 11708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0523; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 225 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 5810 - 5774
Alignment:
Q  225 tgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacg 261  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5810 tgcttcaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaacg 5774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0523; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 53 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 5982 - 5938
Alignment:
Q  53 tagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggt 97  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||||    
T  5982 tagctgcaggatatatgaagaggatacgaaagcttattacaaggt 5938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0188
Description:

Target: scaffold0188; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 54 - 262
Target Start/End: Original strand, 33132 - 33343
Alignment:
Q  54 agctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgccc 153  Q
    ||||||||||| ||||| || || || || ||||| ||||||||  ||| |||| | | ||| || |||||||||||||||||||| || |||||||| |    
T  33132 agctgcaggatatatgaggaagacaccaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgaaggggtaagggacagcagagtcgtcctaaaccatacagtgctc 33231  T
Q  154 ccgctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggcca 250  Q
    | ||||| ||||| ||||||| ||||   ||||  ||| |||| |||| ||  ||||   |||  || ||||| || ||||| |||||||| ||||||||    
T  33232 ctgctgacaaaggaaaacagaggatgaatgatgagaggaggcccaagaggagagatgctcctgttgaaattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggcca 33331  T
Q  251 caagagcaacgc 262  Q
    ||||||||||||    
T  33332 caagagcaacgc 33343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 54 - 151
Target Start/End: Original strand, 98343 - 98440
Alignment:
Q  54 agctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgc 151  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||| ||||  || || ||||| ||||||||||| ||||| || |||||    
T  98343 agctgtaggatcaatgaagaggatacgaaggctcattacaaggtaatgagtgaaaggagaggtaagggacaacagagtcgtccgaagccatatagtgc 98440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 53 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 176532 - 176434
Alignment:
Q  53 tagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgc 151  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| || ||||| || |||||  ||| |||| | |  || || ||||||||||||||||| || ||||| |||||    
T  176532 tagctgtaggatctatgaagaggatacaaaagctcattataaggtgatgagtgagcgtagaggtaagggacagcagagtcgtccgaaaccgtatagtgc 176434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1274 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1274
Description:

Target: scaffold1274; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 63 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 152 - 53
Alignment:
Q  63 atctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgata 162  Q
    |||||||| || ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||    
T  152 atctatgaggaagataccaaagctcattacaaggttgtgaatgagaggaaaggc-aaggtcagcaaagtcgtccaaagccttacagtgctcctgctgata 54  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 57 - 256
Target Start/End: Original strand, 17740 - 17942
Alignment:
Q  57 tgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 156  Q
    ||||| || ||||| |||||||| ||| |||| |||||| | ||||||||| | || | ||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| || |    
T  17740 tgcagaatttatgaggaggatactaagactcattacaagatcgtgaatgagcgaaaagccaaaggttagcagagtcgtcctaagccttacagtgctcctg 17839  T
Q  157 ctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaa 253  Q
    ||||||| || ||| |||  ||||| ||||  ||||| ||||  ||||| ||||   |||  |||||||| | ||    |||||||||||||||||||||    
T  17840 ctgataagggtaaatagagaatggttgatgagaggcgccctagaaagaaagatgcttctgttgagattgtctactattcttgtggtgagaaaggccacaa 17939  T
Q  254 gag 256  Q
    |||    
T  17940 gag 17942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0423 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0423
Description:

Target: scaffold0423; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 310
Target Start/End: Original strand, 2125 - 2282
Alignment:
Q  156 gctgataaagggaaacagaagatggtcgatgttaggcggcctaagaagaaggatg---ctgcagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccaca 252  Q
    |||||||| || ||||||| ||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||   ||| ||||||||| || ||   ||||||||| || |||||||    
T  2125 gctgataagggcaaacagaggatggtcgaagatagacggccgaagaagaaggatgctcctgtagagattgtttgtttttcttgtggtgacaagggccaca 2224  T
Q  253 agagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggtaagaagggtca 310  Q
    |||| || || ||||||| ||| | |||||  ||| |||| ||||| |||||||||||    
T  2225 agagtaatgcttgtcctggggataccaagagatgtttccgatgtgggaagaagggtca 2282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0203
Description:

Target: scaffold0203; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 53 - 160
Target Start/End: Original strand, 3810 - 3917
Alignment:
Q  53 tagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcc 152  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||  ||| |||  | | | |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||     
T  3810 tagctgcagaatctatgaggaggacacgaaagctcattacaaggtgatgagtgatcgaaggagcaaaggacagcagagtcgtccgaagccgtatagtgct 3909  T
Q  153 cccgctga 160  Q
    || |||||    
T  3910 cctgctga 3917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 57 - 172
Target Start/End: Original strand, 23296 - 23411
Alignment:
Q  57 tgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 156  Q
    ||||| || ||||| || ||||| |||| ||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| | | |||||| ||||| |||||||| || |    
T  23296 tgcagaatatatgaggaagatactaagggtcattacaaggttgtgaatgagaggaaaggcaaaggtcagtaaactcgtccaaagccttacagtgctcctg 23395  T
Q  157 ctgataaagggaaaca 172  Q
    ||||||| || |||||    
T  23396 ctgataagggaaaaca 23411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1299 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold1299
Description:

Target: scaffold1299; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 54 - 160
Target Start/End: Original strand, 1608 - 1714
Alignment:
Q  54 agctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgccc 153  Q
    |||||||| |||||||| || ||| | || ||||| ||||||||  ||| |||| ||| ||| || ||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1608 agctgcagaatctatgaggaagattcaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcggaggggtaagggaaaacagagtcgtcctaagccgtacagtgccc 1707  T
Q  154 ccgctga 160  Q
    | |||||    
T  1708 ctgctga 1714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0664 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0664
Description:

Target: scaffold0664; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 53 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 7583 - 7485
Alignment:
Q  53 tagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgc 151  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||  ||| |||  | | | |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  7583 tagctgcagaatctatgaggaggacacgaaagctcattacaaggtgatgagtgatcgaaggagcaaaggacagcagagtcgtccgaagccgtatagtgc 7485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0434 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0434
Description:

Target: scaffold0434; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 54 - 160
Target Start/End: Original strand, 5662 - 5768
Alignment:
Q  54 agctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgccc 153  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||  ||| |||| | |  ||||| ||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |    
T  5662 agctgtaggatctatgaagaagatacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacagcagagtcatccgaagccgtatagtgctc 5761  T
Q  154 ccgctga 160  Q
    | |||||    
T  5762 ctgctga 5768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0239
Description:

Target: scaffold0239; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 57 - 163
Target Start/End: Original strand, 9550 - 9656
Alignment:
Q  57 tgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 156  Q
    |||||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||  ||| |||| | |  || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  9550 tgcaggatctatgaggaggacaccaaagctcattataaggtgatgagtgagcgaagaggtaagggacaacagagtcgtcctaagccgtacagtgcccctg 9649  T
Q  157 ctgataa 163  Q
    |||||||    
T  9650 ctgataa 9656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0457 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0457
Description:

Target: scaffold0457; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 45 - 166
Target Start/End: Original strand, 13805 - 13926
Alignment:
Q  45 ttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgt 144  Q
    |||||||| || || || ||||||||||| || || || ||||| || ||| || ||| |||||||| ||| || |||||||||| |||||||||||| |    
T  13805 ttggttaacaggtgtagaatctatgaagaagacaccaaagctcattaaaagataatgagtgagaggaggggtaagggacagcagaatcgtcctaagcctt 13904  T
Q  145 acagtgcccccgctgataaagg 166  Q
    ||||||| || ||||| |||||    
T  13905 acagtgctcctgctgacaaagg 13926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 9097 - 9036
Alignment:
Q  115 gcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgataaagggaaacagaag 176  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||||    
T  9097 gcaaaggacagcagagtcgtccgaagccgtatagtgctcctgctgacaaagggaagcagaag 9036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0348
Description:

Target: scaffold0348; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 57 - 160
Target Start/End: Original strand, 17247 - 17350
Alignment:
Q  57 tgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 156  Q
    |||||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||  ||| |||| | |  || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  17247 tgcaggatctatgaggaggacacaaaagctcattataaggtgatgagtgagcgaagaggtaagggacagcagagtcgtcctaaaccgtacagtgcccctg 17346  T
Q  157 ctga 160  Q
    ||||    
T  17347 ctga 17350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 120 - 154
Target Start/End: Original strand, 4675 - 4709
Alignment:
Q  120 ggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccc 154  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4675 ggacagcagagtcgtcctaaaccgtacagtgcccc 4709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 53 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 15617 - 15510
Alignment:
Q  53 tagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcc 152  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||  ||| |||  | | | |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||     
T  15617 tagctgcagaatctatgaggaggaaacgaaagctcattacaaggtgatgagtgatcgaatgagcaaaggacaacagagtcgtccgaagccgtatagtgct 15518  T
Q  153 cccgctga 160  Q
    || |||||    
T  15517 cctgctga 15510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 53 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 319788 - 319681
Alignment:
Q  53 tagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcc 152  Q
    ||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||  | | |||  | | |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||     
T  319788 tagctgcagaatttatgaggaggacacgaaagctcattacaaggtgataagtgatcgaaggggcaaaggacagcagagtcgtccgaagccgtatagtgct 319689  T
Q  153 cccgctga 160  Q
    || |||||    
T  319688 cctgctga 319681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 57 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 5629 - 5571
Alignment:
Q  57 tgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaaggg 115  Q
    ||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  5629 tgcagaatctatgaggaagatacgaaagctcattacaaggttgtgaatgagaggaaggg 5571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 54 - 160
Target Start/End: Original strand, 305 - 411
Alignment:
Q  54 agctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgccc 153  Q
    |||||||| ||||| || || ||| | || ||||| ||||||||  ||| |||| ||| ||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  305 agctgcagaatctacgaggaagattcaaaagctcattacaaggtgatgagtgagcggaggggtaagggacaacagagtcgtcctaagccgtacagtcccc 404  T
Q  154 ccgctga 160  Q
    | |||||    
T  405 ctgctga 411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 57 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 17780 - 17686
Alignment:
Q  57 tgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgc 151  Q
    ||||| || |||||||| || || || ||||| || ||| || ||| |||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17780 tgcagaatttatgaagaagacaccaaagctcattataagataatgagtgagaggaggggtaagggacagcagagtcgtcctaagccttacagtgc 17686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 5)
Name: scaffold0067
Description:

Target: scaffold0067; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 54 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 30168 - 30062
Alignment:
Q  54 agctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgccc 153  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||  ||| |||| | |  ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |    
T  30168 agctgtaggatttatgaggaggacacgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacagcagagtcgtccgaagccgtatagtgctc 30069  T
Q  154 ccgctga 160  Q
    | |||||    
T  30068 ctgctga 30062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 225 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 29994 - 29958
Alignment:
Q  225 tgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacg 261  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29994 tgcttcaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaacg 29958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 120 - 160
Target Start/End: Original strand, 49006 - 49046
Alignment:
Q  120 ggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctga 160  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  49006 ggacagcagagtcgtcctaaaccgtatagtgccccggctga 49046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 120 - 160
Target Start/End: Original strand, 58040 - 58080
Alignment:
Q  120 ggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctga 160  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  58040 ggacagcagagtcgtcctaaaccgtatagtgccccggctga 58080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #5
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 120 - 160
Target Start/End: Original strand, 64428 - 64468
Alignment:
Q  120 ggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctga 160  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  64428 ggacagcagagtcgtcctaaaccgtatagtgccccggctga 64468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0310
Description:

Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 45 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 11530 - 11409
Alignment:
Q  45 ttggttaatagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgt 144  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||| || || || || ||||| |||||| || ||| |||||||| ||| || || ||||||| |||||||||||| |    
T  11530 ttggtaaacagctgcaggatttatgaggaagacaccaaagctcattacaagataatgagtgagaggaggggtaagggtcagcagattcgtcctaagcctt 11431  T
Q  145 acagtgcccccgctgataaagg 166  Q
    | ||||| || ||||| |||||    
T  11430 atagtgctcctgctgacaaagg 11409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 57 - 166
Target Start/End: Original strand, 16372 - 16481
Alignment:
Q  57 tgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccg 156  Q
    |||||||||||||| || ||||| || ||||| ||||||||  ||| |||| ||| ||| ||  | |||||||||||||| ||||| || ||||| || |    
T  16372 tgcaggatctatgaggaagataccaaagctcattacaaggttatgagtgagcggaggggtaagagtcagcagagtcgtccaaagccttatagtgctcctg 16471  T
Q  157 ctgataaagg 166  Q
    ||||||||||    
T  16472 ctgataaagg 16481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0072
Description:

Target: scaffold0072; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 53 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 54592 - 54471
Alignment:
Q  53 tagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcc 152  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| | ||| ||||| || |||||  ||| |||  | | | |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||     
T  54592 tagctgcagaatctatgaggaggacatgaaagctcattataaggtgatgagtgatcgaaggagcaaaggacatcagagtcgtccaaagccgtatagtgct 54493  T
Q  153 cccgctgataaagggaaacaga 174  Q
    || ||||| |||||||| ||||    
T  54492 cctgctgacaaagggaagcaga 54471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0765 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0765
Description:

Target: scaffold0765; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 160
Target Start/End: Original strand, 6083 - 6123
Alignment:
Q  120 ggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctga 160  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6083 ggacaacagagtcgtcctaagccgtacagtgcccctgctga 6123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 263704 - 263664
Alignment:
Q  120 ggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctga 160  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  263704 ggacagcagagtcgtcttaagccgtacagtgcccctgctga 263664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 63 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 30062 - 29959
Alignment:
Q  63 atctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccccgctgata 162  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || |||||  ||| |||| | |  ||||| ||||||||||||||||| || ||||  ||||| || ||||| |    
T  30062 atctatgaagaggatacaaaggctcattataaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacagcagagtcgtccgaaaccgtctagtgctcctgctgaca 29963  T
Q  163 aagg 166  Q
    ||||    
T  29962 aagg 29959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0518 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0518
Description:

Target: scaffold0518; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 120 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 2309 - 2275
Alignment:
Q  120 ggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccc 154  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2309 ggacagcagagtcgtcctaaaccgtacagtgcccc 2275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0505 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0505
Description:

Target: scaffold0505; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 57 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 2292 - 2199
Alignment:
Q  57 tgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgc 151  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||  |||| |||||||| || ||  | ||||| |||||| ||||||| ||||||||    
T  2292 tgcagaatctatgaggaggatacgaaagctcattacaaggttttgaaggagaggaaaggtaatagtcagcaaagtcgt-ctaagccttacagtgc 2199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0443 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0443
Description:

Target: scaffold0443; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 214 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 12178 - 12136
Alignment:
Q  214 cagagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagag 256  Q
    |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  12178 cagagattgtttgctacaagtgtggtgagaaaggccacaagag 12136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 54 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 116168 - 116062
Alignment:
Q  54 agctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgccc 153  Q
    ||||| ||||||| |||||| |||  ||| ||||| ||||||||  ||| |||| | |  ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |    
T  116168 agctgtaggatctgtgaagaagatttgaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgtagaggcaagggacagcagagtcgtccgaagccgtatagtgctc 116069  T
Q  154 ccgctga 160  Q
    | |||||    
T  116068 ctgctga 116062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 66 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 17169 - 17084
Alignment:
Q  66 tatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgc 151  Q
    ||||||||| |||| || ||||| ||||||||  ||| |||| | || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  17169 tatgaagagaataccaaagctcattacaaggtgatgagtgagcgcaaaggcaagggacaacagagtcgtccgaagccgtatagtgc 17084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 160
Target Start/End: Original strand, 8223 - 8328
Alignment:
Q  55 gctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccc 154  Q
    ||||||| |||||||| ||||| | ||| ||||| ||||||||  ||| |||  | | |||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  8223 gctgcagaatctatgaggaggacatgaaagctcattacaaggtgatgagtgaccgcaggggcaagggacaacagagtcgtccgaagccgtatagtgctcc 8322  T
Q  155 cgctga 160  Q
     |||||    
T  8323 tgctga 8328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 160
Target Start/End: Original strand, 18437 - 18542
Alignment:
Q  55 gctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggtagtgaatgagaggaagggcaaaggacagcagagtcgtcctaagccgtacagtgcccc 154  Q
    ||||||| |||||||| ||||| | ||| ||||| ||||||||  ||| |||  | | |||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  18437 gctgcagaatctatgaggaggacatgaaagctcattacaaggtgatgagtgaccgcaggggcaagggacaacagagtcgtccgaagccgtatagtgctcc 18536  T
Q  155 cgctga 160  Q
     |||||    
T  18537 tgctga 18542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 216 - 261
Target Start/End: Original strand, 808 - 853
Alignment:
Q  216 gagattgtgtgcttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacg 261  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  808 gagattgtttgcttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaacg 853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0054
Description:

Target: scaffold0054; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 53 - 97
Target Start/End: Original strand, 63298 - 63342
Alignment:
Q  53 tagctgcaggatctatgaagaggatacgaaggctcactacaaggt 97  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  63298 tagctgtaggatttatgaagaggatacgaaagctcattacaaggt 63342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University