View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF9839A_low_183 (Length: 291)

Name: NF9839A_low_183
Description: NF9839A
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF9839A_low_183
NF9839A_low_183
[»] chr5 (51 HSPs)
chr5 (1-283)||(22892920-22893202)
chr5 (1-285)||(25204735-25205019)
chr5 (1-285)||(25268890-25269174)
chr5 (1-285)||(6878762-6879046)
chr5 (1-285)||(13182212-13182496)
chr5 (1-284)||(9321933-9322216)
chr5 (1-283)||(3793998-3794280)
chr5 (1-284)||(9546129-9546412)
chr5 (1-284)||(30172926-30173209)
chr5 (1-283)||(40468971-40469253)
chr5 (1-285)||(18123835-18124119)
chr5 (1-285)||(22994536-22994820)
chr5 (1-285)||(29886616-29886900)
chr5 (1-285)||(30939092-30939376)
chr5 (1-285)||(33781942-33782226)
chr5 (1-284)||(13438103-13438386)
chr5 (1-284)||(15654178-15654461)
chr5 (1-280)||(23630427-23630705)
chr5 (1-284)||(24728426-24728709)
chr5 (6-285)||(26484856-26485135)
chr5 (1-283)||(28653700-28653982)
chr5 (6-284)||(41679167-41679445)
chr5 (1-285)||(11553812-11554096)
chr5 (1-285)||(18370953-18371237)
chr5 (1-280)||(28955209-28955488)
chr5 (6-284)||(12136637-12136915)
chr5 (1-283)||(43082712-43082994)
chr5 (1-285)||(23896332-23896616)
chr5 (1-285)||(24587831-24588115)
chr5 (1-285)||(33296985-33297269)
chr5 (1-284)||(2515519-2515802)
chr5 (1-284)||(13320250-13320533)
chr5 (1-284)||(18496145-18496428)
chr5 (1-283)||(8660896-8661178)
chr5 (1-285)||(30033885-30034169)
chr5 (1-284)||(11328094-11328377)
chr5 (1-284)||(33879585-33879868)
chr5 (1-283)||(33520837-33521119)
chr5 (1-283)||(30156488-30156770)
chr5 (1-284)||(31821827-31822110)
chr5 (1-284)||(34620975-34621258)
chr5 (1-284)||(37666906-37667189)
chr5 (1-284)||(37759440-37759723)
chr5 (1-283)||(5642245-5642527)
chr5 (1-284)||(15754272-15754555)
chr5 (1-283)||(32591695-32591977)
chr5 (1-284)||(31435921-31436204)
chr5 (1-284)||(37354063-37354346)
chr5 (1-207)||(24974363-24974569)
chr5 (1-221)||(37766474-37766694)
chr5 (216-284)||(37747749-37747817)
[»] chr7 (33 HSPs)
chr7 (1-285)||(16445413-16445697)
chr7 (1-285)||(45735754-45736038)
chr7 (4-285)||(16045765-16046046)
chr7 (1-285)||(26533280-26533564)
chr7 (1-284)||(4140654-4140937)
chr7 (1-284)||(24587942-24588225)
chr7 (1-285)||(11420186-11420470)
chr7 (1-284)||(2105571-2105854)
chr7 (1-285)||(2777701-2777985)
chr7 (1-285)||(4203836-4204120)
chr7 (1-285)||(3449753-3450037)
chr7 (1-285)||(10912276-10912560)
chr7 (7-285)||(2159027-2159305)
chr7 (1-283)||(26511105-26511387)
chr7 (1-283)||(26517239-26517521)
chr7 (1-283)||(39208548-39208830)
chr7 (1-285)||(16513837-16514121)
chr7 (1-285)||(26270493-26270777)
chr7 (1-284)||(5142748-5143031)
chr7 (1-284)||(31128354-31128637)
chr7 (6-284)||(26315256-26315534)
chr7 (1-283)||(26665323-26665605)
chr7 (1-283)||(26680515-26680797)
chr7 (1-285)||(5162830-5163114)
chr7 (1-284)||(11445334-11445617)
chr7 (1-284)||(31559798-31560081)
chr7 (1-284)||(26439704-26439987)
chr7 (1-280)||(31086034-31086313)
chr7 (1-284)||(45391667-45391950)
chr7 (6-283)||(10846072-10846349)
chr7 (1-256)||(5132443-5132698)
chr7 (1-284)||(16746925-16747208)
chr7 (252-285)||(5152782-5152815)
[»] scaffold0143 (2 HSPs)
scaffold0143 (6-285)||(31748-32027)
scaffold0143 (1-285)||(8410-8694)
[»] chr8 (24 HSPs)
chr8 (1-285)||(22137359-22137643)
chr8 (6-285)||(16287407-16287685)
chr8 (9-285)||(19656824-19657100)
chr8 (1-285)||(18795153-18795437)
chr8 (9-285)||(27604388-27604664)
chr8 (1-283)||(22076410-22076692)
chr8 (1-285)||(2132743-2133027)
chr8 (1-285)||(19692547-19692831)
chr8 (1-285)||(19912645-19912929)
chr8 (1-282)||(21343657-21343938)
chr8 (1-285)||(33246819-33247103)
chr8 (1-285)||(44565433-44565717)
chr8 (1-284)||(33263183-33263466)
chr8 (1-283)||(9359074-9359356)
chr8 (1-283)||(28357437-28357719)
chr8 (7-285)||(18713939-18714217)
chr8 (1-284)||(15772023-15772306)
chr8 (1-283)||(19203847-19204129)
chr8 (1-285)||(14562073-14562357)
chr8 (1-284)||(29833774-29834057)
chr8 (1-285)||(19678896-19679180)
chr8 (1-285)||(31485354-31485638)
chr8 (1-284)||(12088207-12088490)
chr8 (1-284)||(31358977-31359260)
[»] chr6 (45 HSPs)
chr6 (1-285)||(27357575-27357859)
chr6 (1-285)||(14140859-14141143)
chr6 (1-283)||(26774094-26774376)
chr6 (1-285)||(24868163-24868447)
chr6 (1-285)||(26922824-26923108)
chr6 (1-285)||(27023584-27023868)
chr6 (1-284)||(29554004-29554287)
chr6 (1-285)||(24301222-24301506)
chr6 (1-285)||(27625176-27625460)
chr6 (1-285)||(28164938-28165222)
chr6 (1-285)||(16754268-16754552)
chr6 (1-280)||(15408003-15408282)
chr6 (1-280)||(15419790-15420069)
chr6 (1-283)||(16678587-16678869)
chr6 (1-285)||(13294416-13294700)
chr6 (1-284)||(4762210-4762493)
chr6 (6-285)||(22930349-22930628)
chr6 (6-285)||(23852794-23853073)
chr6 (1-284)||(27489580-27489863)
chr6 (1-283)||(27285831-27286113)
chr6 (6-284)||(29577466-29577744)
chr6 (1-284)||(8901169-8901452)
chr6 (1-284)||(27061953-27062236)
chr6 (1-283)||(16939494-16939776)
chr6 (1-283)||(29505863-29506145)
chr6 (1-285)||(27183376-27183660)
chr6 (1-285)||(27265579-27265863)
chr6 (1-284)||(4777327-4777610)
chr6 (1-284)||(13519660-13519943)
chr6 (1-284)||(27198632-27198915)
chr6 (1-283)||(17087910-17088192)
chr6 (1-283)||(30553483-30553765)
chr6 (8-284)||(4541240-4541516)
chr6 (1-284)||(3700530-3700813)
chr6 (8-283)||(4719602-4719877)
chr6 (1-284)||(26790263-26790546)
chr6 (1-283)||(26111879-26112161)
chr6 (1-284)||(27250319-27250603)
chr6 (1-284)||(33371897-33372180)
chr6 (1-283)||(4529732-4530014)
chr6 (1-284)||(28211901-28212184)
chr6 (1-283)||(34459973-34460255)
chr6 (1-284)||(27012178-27012461)
chr6 (1-283)||(20172994-20173276)
chr6 (1-283)||(22162715-22162997)
[»] chr1 (11 HSPs)
chr1 (1-285)||(20465428-20465712)
chr1 (1-285)||(16203556-16203840)
chr1 (1-285)||(28154188-28154472)
chr1 (1-285)||(20335938-20336222)
chr1 (1-285)||(21893270-21893554)
chr1 (1-284)||(10949529-10949812)
chr1 (1-285)||(3645594-3645879)
chr1 (1-283)||(10967117-10967399)
chr1 (1-284)||(51642670-51642953)
chr1 (1-284)||(28589532-28589815)
chr1 (1-284)||(41788833-41789116)
[»] chr4 (26 HSPs)
chr4 (1-283)||(15232279-15232561)
chr4 (1-285)||(20333943-20334227)
chr4 (1-284)||(18796137-18796420)
chr4 (1-284)||(40101160-40101443)
chr4 (1-283)||(54837854-54838136)
chr4 (1-285)||(30758223-30758507)
chr4 (1-284)||(6574321-6574604)
chr4 (1-285)||(14669476-14669760)
chr4 (1-285)||(24587883-24588167)
chr4 (1-285)||(34184482-34184766)
chr4 (1-285)||(36340039-36340323)
chr4 (1-284)||(14755015-14755298)
chr4 (1-280)||(17017509-17017788)
chr4 (1-284)||(18312701-18312984)
chr4 (1-283)||(33669324-33669606)
chr4 (1-283)||(39855100-39855382)
chr4 (1-285)||(1904717-1905001)
chr4 (1-284)||(5010338-5010621)
chr4 (1-283)||(14103006-14103288)
chr4 (1-284)||(24117125-24117408)
chr4 (1-283)||(5698998-5699280)
chr4 (1-283)||(15381757-15382039)
chr4 (1-283)||(21974164-21974446)
chr4 (1-283)||(31122036-31122318)
chr4 (1-285)||(27158839-27159123)
chr4 (1-283)||(15278151-15278433)
[»] chr2 (39 HSPs)
chr2 (1-285)||(21698682-21698966)
chr2 (1-285)||(27780683-27780967)
chr2 (1-285)||(27820440-27820724)
chr2 (1-285)||(19412012-19412296)
chr2 (1-284)||(256165-256448)
chr2 (1-285)||(27429952-27430236)
chr2 (1-283)||(9345499-9345781)
chr2 (1-285)||(20842362-20842646)
chr2 (1-285)||(23124080-23124364)
chr2 (1-285)||(27120973-27121257)
chr2 (1-284)||(11630696-11630979)
chr2 (1-283)||(12591257-12591539)
chr2 (1-285)||(28886728-28887012)
chr2 (1-284)||(34295603-34295886)
chr2 (1-280)||(37382126-37382405)
chr2 (1-283)||(13932060-13932342)
chr2 (1-284)||(3786942-3787225)
chr2 (1-284)||(40237957-40238240)
chr2 (1-283)||(27808152-27808434)
chr2 (1-283)||(34159293-34159575)
chr2 (1-283)||(34866133-34866415)
chr2 (1-283)||(37947375-37947657)
chr2 (1-285)||(31889002-31889286)
chr2 (1-285)||(39894518-39894802)
chr2 (1-284)||(12712113-12712396)
chr2 (1-283)||(37681408-37681690)
chr2 (1-283)||(37696673-37696955)
chr2 (1-283)||(16165929-16166211)
chr2 (1-283)||(16824851-16825133)
chr2 (1-283)||(16896347-16896629)
chr2 (1-283)||(19451936-19452218)
chr2 (1-283)||(21672688-21672970)
chr2 (1-283)||(34270433-34270715)
chr2 (1-280)||(12659985-12660264)
chr2 (1-284)||(31880735-31881018)
chr2 (1-283)||(32054252-32054534)
chr2 (1-283)||(37929818-37930100)
chr2 (1-284)||(22923660-22923943)
chr2 (1-283)||(39047332-39047614)
[»] chr3 (57 HSPs)
chr3 (1-285)||(35885177-35885461)
chr3 (2-285)||(19698902-19699185)
chr3 (1-283)||(31031803-31032085)
chr3 (1-285)||(32443562-32443846)
chr3 (1-284)||(29660536-29660819)
chr3 (1-283)||(11105926-11106208)
chr3 (2-283)||(16620057-16620338)
chr3 (1-285)||(4726041-4726325)
chr3 (1-285)||(4792200-4792484)
chr3 (1-285)||(15736659-15736943)
chr3 (1-285)||(21679114-21679398)
chr3 (1-284)||(5715484-5715767)
chr3 (1-284)||(5726394-5726677)
chr3 (1-284)||(5765691-5765974)
chr3 (1-284)||(6206315-6206598)
chr3 (1-284)||(10400555-10400838)
chr3 (1-284)||(20572409-20572692)
chr3 (1-284)||(48470338-48470621)
chr3 (1-283)||(28343588-28343870)
chr3 (1-285)||(4688066-4688350)
chr3 (1-285)||(18335041-18335325)
chr3 (1-284)||(6538308-6538591)
chr3 (1-284)||(8000971-8001254)
chr3 (1-284)||(10647484-10647767)
chr3 (1-284)||(18287919-18288202)
chr3 (1-284)||(18303220-18303503)
chr3 (1-284)||(47027864-47028147)
chr3 (1-285)||(18055673-18055957)
chr3 (1-285)||(20070451-20070735)
chr3 (1-285)||(22383143-22383427)
chr3 (1-284)||(7077617-7077900)
chr3 (1-283)||(5591924-5592206)
chr3 (6-284)||(17972427-17972705)
chr3 (1-285)||(5471399-5471683)
chr3 (1-285)||(8285035-8285319)
chr3 (1-285)||(15888270-15888554)
chr3 (1-285)||(29144321-29144605)
chr3 (1-284)||(4421326-4421609)
chr3 (1-284)||(17980515-17980798)
chr3 (1-284)||(18229607-18229890)
chr3 (1-284)||(51786434-51786717)
chr3 (1-283)||(32295039-32295321)
chr3 (1-281)||(28111523-28111803)
chr3 (1-284)||(18247152-18247435)
chr3 (1-283)||(28025692-28025974)
chr3 (1-285)||(24332574-24332858)
chr3 (1-284)||(5018125-5018408)
chr3 (1-285)||(4628196-4628480)
chr3 (1-284)||(4342242-4342525)
chr3 (1-284)||(22866414-22866697)
chr3 (1-284)||(22881473-22881756)
chr3 (1-284)||(31960021-31960304)
chr3 (1-283)||(5604881-5605163)
chr3 (81-285)||(5656625-5656829)
chr3 (181-285)||(8216225-8216329)
chr3 (1-86)||(5654496-5654581)
chr3 (1-81)||(8216146-8216226)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (1-284)||(17032-17315)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (1-283)||(14021-14303)
[»] scaffold0418 (1 HSPs)
scaffold0418 (1-285)||(10486-10770)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (1-283)||(23566-23848)
[»] scaffold0144 (1 HSPs)
scaffold0144 (1-284)||(21714-21997)
[»] scaffold0089 (1 HSPs)
scaffold0089 (1-285)||(4517-4801)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (1-284)||(10451-10734)
[»] scaffold0322 (2 HSPs)
scaffold0322 (1-283)||(10495-10777)
scaffold0322 (1-284)||(108-391)
[»] scaffold0415 (1 HSPs)
scaffold0415 (1-283)||(10472-10755)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (1-284)||(12399-12682)
[»] scaffold0159 (4 HSPs)
scaffold0159 (1-284)||(4702-4985)
scaffold0159 (54-283)||(24076-24305)
scaffold0159 (1-206)||(11774-11979)
scaffold0159 (1-112)||(9712-9823)
[»] scaffold0547 (1 HSPs)
scaffold0547 (135-285)||(11112-11262)
[»] scaffold0099 (1 HSPs)
scaffold0099 (9-192)||(42294-42479)
[»] scaffold0240 (1 HSPs)
scaffold0240 (207-285)||(26421-26499)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 227; Significance: 1e-125; HSPs: 51)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Original strand, 22892920 - 22893202
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  22892920 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccaggtgcttccaacagggacaagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagctggaga 22893019  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    | || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||| |||    
T  22893020 tgttctgtacaaaagaaactacgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagtagttaatgcatgacgtacatgacggtaccttcggg 22893119  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctacca 283  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22893120 acccatgctacagggcatactatgtcaagaaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctacca 22893202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Original strand, 25204735 - 25205019
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||| ||||||||||    
T  25204735 tcaagcagttcttgctaagtcgtaagtatccaccgggtgcttccaacaaagacaagaagaccctgagaagattggctagtaaattcctgctagatggaga 25204834  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  25204835 tattctgtacaagagaaactacgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 25204934  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccagc 285  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25204935 acccatgctacagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccagc 25205019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Original strand, 25268890 - 25269174
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||| ||||||||||    
T  25268890 tcaagcagttcttgctaagtcgtaagtatccaccgggtgcttccaacaaagacaagaagaccctgagaagattggctagtaaattcctgctagatggaga 25268989  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  25268990 tattctgtacaagagaaactacgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 25269089  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccagc 285  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25269090 acccatgctacagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccagc 25269174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Original strand, 6878762 - 6879046
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6878762 tcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggaga 6878861  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
     ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  6878862 gattttgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 6878961  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccagc 285  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6878962 acccatgctacagggcatactatgtcaaggaagttgttacgggcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccagc 6879046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 13182496 - 13182212
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13182496 tcaaacagttcttgctaagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggaga 13182397  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  13182396 tattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcggagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 13182297  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccagc 285  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13182296 acccatgctacagggcatactatgtcgaggaagttgttacgggcaggttactactggatggccatggagcatgattgctaccagc 13182212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Original strand, 9321933 - 9322216
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9321933 tcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggaga 9322032  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||    
T  9322033 tattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcagagcagttaatgcatgacgtacatgacggtaccttcggg 9322132  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccag 284  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  9322133 acccatgctacagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatggccatggaacatgattgctaccag 9322216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Original strand, 3793998 - 3794280
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3793998 tcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaagcaagacaagaagaccttgagaagattggccagtagattcctgttagatggaga 3794097  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  3794098 tattctgtacaagagaaactacgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 3794197  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctacca 283  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3794198 acccatgctacagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatggccatggagcatgattgctacca 3794280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 9546412 - 9546129
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9546412 tcaaacagttcttgctgagccgggagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggaga 9546313  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  9546312 tattttgtacaagagaaactatgacatggtattattaagatgtgttgatgaacatgaagcggagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 9546213  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccag 284  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9546212 acccatgctacagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatggccatggagcatgattgctaccag 9546129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Original strand, 30172926 - 30173209
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30172926 tcaagcagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccagtagattcctgttagatggaga 30173025  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  30173026 tattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 30173125  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccag 284  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30173126 acccatgctacagggcatactatgtcaagaaagttgttacgagcaggttactactggatggccatggagcatgattgctaccag 30173209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 40469253 - 40468971
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40469253 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggaga 40469154  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| |||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||| |||    
T  40469153 tattctgtacaaaaggaactatgacatggtactgttaagatgtgttgatgaacatgaagcggagcagttaatgcatgatgtccatgacggtaccttcggg 40469054  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctacca 283  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40469053 acccatgctacagggcacactatgtcaaggaagttgctacgagcagattactactggatgaccatggagcatgattgctacca 40468971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 18124119 - 18123835
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||  | |||||||||||    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  18124119 tcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgacaggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatgaaga 18124020  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  18124019 tattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtacctttggg 18123920  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccagc 285  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18123919 acccatgctacagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatggccatggagcatgattgctaccagc 18123835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 22994820 - 22994536
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22994820 tcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggaga 22994721  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  22994720 tattctgtacaaaagaaactatgacatggtattattaagatgtgttgatgaacacgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 22994621  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccagc 285  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22994620 acccatgctacagggcataccatgtcaaggaagttgttacgggcaggttactactggatggccatggagcatgattgctaccagc 22994536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 29886900 - 29886616
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||  | |||||||||||    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  | ||||||||    
T  29886900 tcaagcagttcttgctgagccgtgagtatccgtcaggtgcttccaaccaagacaagaagaccctaagaagattggccagtagattccttttggatggaga 29886801  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||    
T  29886800 tattctgtacaaaagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcggaacagttaatgcatgacgtacatgacggtaccttcggg 29886701  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccagc 285  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29886700 acccatgctacagggcatactatgtcaaggaagttgttgcgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccagc 29886616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Original strand, 30939092 - 30939376
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30939092 tcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggaga 30939191  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  | ||||| |||||||| |||    
T  30939192 tattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgtgcatgacggtaccttcggg 30939291  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccagc 285  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30939292 acccatgctacagggcatactatgtcaaggaagttgttacgggcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccagc 30939376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Original strand, 33781942 - 33782226
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  33781942 tcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatgggga 33782041  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  33782042 tattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcggagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 33782141  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccagc 285  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33782142 acccatgctacagggcatactatgtcgaggaagttgttacgggcaggttactactggatggccatggagcatgattgctaccagc 33782226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 13438386 - 13438103
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13438386 tcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaagcaagacaagaagaccttgagaagattggccagtagattcctgttagatggaga 13438287  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    | || ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  13438286 tgttctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 13438187  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccag 284  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13438186 acccatgctacagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatggccatggagcatgattgctaccag 13438103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 15654461 - 15654178
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15654461 tcaagcaattcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggaga 15654362  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  15654361 tattctgtacaagagaaactatgacatggtattattaagatgtgttgatgaacatgaagcggagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 15654262  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccag 284  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15654261 acccatgctacagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcgggttactactggatggccatggagcatgattgctaccag 15654178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Original strand, 23630427 - 23630705
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23630427 tcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggaga 23630526  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  23630527 tattctgtacaaaagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaaca-gaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 23630625  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgcta 280  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23630626 acccatgctacagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatggccatggagcatgattgcta 23630705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Original strand, 24728426 - 24728709
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24728426 tcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgcctggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggaga 24728525  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  24728526 tattctgtacaaaagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 24728625  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccag 284  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24728626 acccatgctacagggcatactatgtcgaggaagttgttacgggcaggttactactggatggccatggagcatgattgctaccag 24728709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 6 - 285
Target Start/End: Original strand, 26484856 - 26485135
Alignment:
Q  6 cagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggagatattt 105  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||     
T  26484856 cagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccctgagaagattggccagcagatttctgttagatggagatatta 26484955  T
Q  106 tgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttgggaccca 205  Q
    ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||    
T  26484956 tgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcgggaccca 26485055  T
Q  206 tgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccagc 285  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26485056 tgctacagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgactatggagcatgattgctaccagc 26485135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Original strand, 28653700 - 28653982
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||    || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  28653700 tcaagcagttcttgctaagccgcgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccggtagattcctgttagatggaga 28653799  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| || ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||    
T  28653800 tattctgtacaagaggaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagctgagcagttaatgcatgatgtacatgatggtaccttcggg 28653899  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctacca 283  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28653900 acccatgctacagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatggccatggagcatgattgctacca 28653982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Original strand, 41679167 - 41679445
Alignment:
Q  6 cagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggagatattt 105  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  41679167 cagttcttgctgagccgtgagtatccgtcgggtgcttccaaacaagacaagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggagatattc 41679266  T
Q  106 tgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttgggaccca 205  Q
    ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||    
T  41679267 tgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcgggaccca 41679366  T
Q  206 tgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccag 284  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41679367 tgctacaggacatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatggccatggagcatgattgctaccag 41679445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Original strand, 11553812 - 11554096
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||| | ||||||||||||    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11553812 tcaagcagttcttgcggagccgtgagtatccgctgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggaga 11553911  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  11553912 tattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcggagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 11554011  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccagc 285  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11554012 acccatgctacagggcatactatatcaaggaagttgttacgggcaggttactactggatggccatggagcatgattgctaccagc 11554096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 18371237 - 18370953
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18371237 tcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgtcgggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccagtagattcctgttagatggaga 18371138  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| || ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  18371137 tattctgtacaagaggaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 18371038  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccagc 285  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18371037 acccatgctacagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatggccatggagcatgattgctaccagc 18370953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 28955488 - 28955209
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28955488 tcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaagcaagacaagaagaccttgagaagattggccagtagattcctgttagatggaga 28955389  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  28955388 tattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 28955289  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgcta 280  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  28955288 acccatgctacagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactattggatggccatggagcatgattgcta 28955209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Original strand, 12136637 - 12136915
Alignment:
Q  6 cagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggagatattt 105  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||     
T  12136637 cagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccctgagaagattggccagcagatttctgttagatggagatatta 12136736  T
Q  106 tgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttgggaccca 205  Q
    ||||||| |||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||    
T  12136737 tgtacaagagaaactatgacatggtgttgttaagatgtgttgatgagcatgaagcggagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcgggaccca 12136836  T
Q  206 tgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccag 284  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12136837 tgctacagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatggccatggagcatgattgctaccag 12136915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Original strand, 43082712 - 43082994
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43082712 tcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgcctggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggaga 43082811  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  43082812 tattctgtacaagagaaactgtgacatggtactgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 43082911  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctacca 283  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  43082912 acccatgctacagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatggccatggagcaggattgctacca 43082994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Original strand, 23896332 - 23896616
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| || |||||||| |    
T  23896332 tcaaacagttcttgctaagtcgtgagtatccgccggatgcttccaacaaagacaagaagaccctgagaagattggccagtaaattcttgctagatggaaa 23896431  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
     ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  ||||| |  ||||||| |||    
T  23896432 cattttgtacaagagaaactacgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacgcgaagcagagcagttaatgcatgatgtacataacagtaccttcggg 23896531  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccagc 285  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23896532 acccatgctacagggcatactatgtcaaggacgttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccagc 23896616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Original strand, 24587831 - 24588115
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  24587831 tcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccaagtgcttccaaccaagacaagaagaccctgagaagattggccagtagattccttttagatggaga 24587930  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  24587931 tattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcggagcagttgatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 24588030  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccagc 285  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24588031 acccatgctacagggcatactatgtcaaggaagctgttacgggcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccagc 24588115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Original strand, 33296985 - 33297269
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33296985 tcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccagtagattcctgttagatggaga 33297084  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| || ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  33297085 tattctgtacaagaggaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcggagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 33297184  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccagc 285  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  33297185 acccatgctacagggcataccatgtcaaggaagttgttacgggcaggttactactggatagccatggagcatgattgctaccagc 33297269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Original strand, 2515519 - 2515802
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  2515519 tcaaacagttcttgctaagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccctgagaagattggccagtagatttctgttagatggaga 2515618  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  2515619 tattctgtacaagagaaactatgacatggtgttgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtacctttggg 2515718  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccag 284  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2515719 acccatgctacagggcacactatgtcaagaaagttgctacgggcaggttactactggatgactatggagcatgattgctaccag 2515802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 13320533 - 13320250
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||| || |||||||||||    |||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  13320533 tcaagcagttcttgttgagccgtgagtatccgccaggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccggtagattcctgttagatggaga 13320434  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| || ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  13320433 tattctgtacaagaggaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaggcggagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 13320334  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccag 284  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13320333 acccatgctacagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatggccatggagcatgattgctaccag 13320250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 18496428 - 18496145
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18496428 tcaaacagttcttgctgagccgggagtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccagtagattcctgttagatggaga 18496329  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| || ||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  18496328 tattctgtacaagaggaactatgacatggtattattaagatgtgttgatgaacatgaagcggagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 18496229  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccag 284  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18496228 acccatgctacaggacatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatggccatggagcatgattgctaccag 18496145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 8661178 - 8660896
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8661178 tcaaacagttcttgctgagtcgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggaga 8661079  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  8661078 tattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 8660979  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctacca 283  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8660978 acccatgctacagggcatactatgtcaagaaagttgttacgagcaggttattactggatggccatggagcatgattgctacca 8660896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Original strand, 30033885 - 30034169
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    |||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |    
T  30033885 tcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccggtagattcctgttagatggaaa 30033984  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| || ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  30033985 tattctgtacaagaggaactatgacatggtattgttaaggtgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 30034084  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccagc 285  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30034085 acccatgctacagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatggccatggagcatgattgctaccagc 30034169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Original strand, 11328094 - 11328377
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11328094 tcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccagtagattcctgttagatggaga 11328193  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
     ||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  11328194 gattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 11328293  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccag 284  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  11328294 acccatgctacagggcatactatgtcaagaaagttgttacgagcaggttattactggatggctatggagcatgattgctaccag 11328377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Original strand, 33879585 - 33879868
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    |||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  33879585 tcaagcagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggtcagtagattcctgttagatggaga 33879684  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
     ||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  33879685 gattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 33879784  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccag 284  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  33879785 acccatgctacagggcatactatgtcaagaaagttgttacgagcaggttattactggatggctatggagcatgattgctaccag 33879868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Original strand, 33520837 - 33521119
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  33520837 tcaagcagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccggtagattcctgttagatggaga 33520936  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| || ||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  33520937 tattctgtacaagaggaactatgacatggtattgctaagatgtgttgatgaacacgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 33521036  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctacca 283  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33521037 acccatgctacagggcatactatgtcaagaaagttgctacgggcaggttactactggatggccatggagcatgattgctacca 33521119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Original strand, 30156488 - 30156770
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |    
T  30156488 tcaagcagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccggtagattcctgttagatggaaa 30156587  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| || ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  30156588 tattctgtacaagaggaactatgacatggtattgttaaggtgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 30156687  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctacca 283  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30156688 acccatgctacagggcatactatgtcaagaaagttgttacgagcaggttattactggatggccatggagcatgattgctacca 30156770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 31822110 - 31821827
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| |||||||    || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  31822110 tcaagcagttcttgctgagccgtgagtatccgccaggtacttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccggtagattcctgttagatggaga 31822011  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| || ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  31822010 tattctgtacaagaggaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 31821911  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccag 284  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31821910 acccatgctacagggcatactatgtcaagaaagctgctacgggcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccag 31821827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Original strand, 34620975 - 34621258
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||    |||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  34620975 tcaagcagttcttgctgagccgtgagtatccgccaggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccggtagattcctgttagatggaga 34621074  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| || ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  34621075 tattctgtacaagaggaactatgacatggtattgttaaggtgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 34621174  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccag 284  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34621175 acccatgctacagggcatactatgtcaagaaagttgctacgggcaggttactactggatgactatggagcatgattgctaccag 34621258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 37667189 - 37666906
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37667189 tcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccagtagattcctgttagatggaga 37667090  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||  ||||||| || ||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  37667089 tatcctgtacaagaggaactatgacatggtactgttaagatgtgttgatgaacatgaggcggagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 37666990  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccag 284  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  37666989 acccatgctacagggcatactatgtcaagtaagttgttacgggcaggttactactggatgactaaggagcatgattgctaccag 37666906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Original strand, 37759440 - 37759723
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||| |||    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37759440 tcaaacagttcttcctgagccgtgagtatccgccgggtgcttacaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccagtagattcctgttagatggaga 37759539  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| || ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  37759540 tattctgtacaagaggaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaggcggagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 37759639  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccag 284  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37759640 acccatgctacagggcatactatgtcaagaaagttgctacgggcaggttactactggatgactatggagcatgattgctaccag 37759723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Original strand, 5642245 - 5642527
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||    || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  5642245 tcaagcagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcctccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccggtagattcctgttagatggaga 5642344  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| | ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  5642345 tattctatacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaatatgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 5642444  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctacca 283  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5642445 acccatgctacagggcatactatgtcaagaaagttgctacgggcaggttactactggatggccatggagcatgattgctacca 5642527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 15754555 - 15754272
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  15754555 tcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgtcgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagacggaga 15754456  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| || ||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  15754455 tattctgtacaagaggaactatgacatggtattattaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 15754356  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccag 284  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15754355 acccatgctacaggacatactatgtcaagaaagttgctacgagcaggttactactggatggccatggagcatgattgctaccag 15754272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 32591977 - 32591695
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||    |||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32591977 tcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgtcgggtgcttccaaacaagacaagaaaaccttgagaagattggccagtagattcctgttagatggaga 32591878  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||  ||||||| || ||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  32591877 tatcctgtacaagaggaactatgacatggtactgttaagatgtgttgatgaacacgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 32591778  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctacca 283  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32591777 acccatgctacagggcatactatgtcaagaaagttgctacgggcaggttactactggatggccatggagcatgattgctacca 32591695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Original strand, 31435921 - 31436204
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||    |||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  31435921 tcaagcagttcttgctgagccgtgagtatccgccaggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccggtagattcctgttagatggaga 31436020  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| || ||||  ||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  31436021 tattctgtacaagaggaactatgacatggtactgttgaggtgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 31436120  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccag 284  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31436121 acccatgctacagggcatactatgtcaagaaagttgctacgggcaggttactactggatgactatggagcatgattgctaccag 31436204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 37354346 - 37354063
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||    |||||||||||| || ||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  37354346 tcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccgagtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaaaattggccggtagattcctgttagatggaga 37354247  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| || ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  37354246 tattctgtacaagaggaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaggcggagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 37354147  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccag 284  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  37354146 acccatgctacagggcatactatgtcaagaaagttgctacgggcaggttactactggatggctatggagcatgattgctaccag 37354063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 24974363 - 24974569
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  24974363 tcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccaggtgcttccaaccaagacaagaagaccctgagaagattggccagtagattcatgttagatggaga 24974462  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  24974463 tattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 24974562  T
Q  201 acccatg 207  Q
    |||||||    
T  24974563 acccatg 24974569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 37766694 - 37766474
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  37766694 tcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccggatgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccagtagattcctgttagatggaaa 37766595  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| || ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  37766594 tattctgtacaagaggaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaggcggagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 37766495  T
Q  201 acccatgctatagggcatact 221  Q
    |||||||||| ||||||||||    
T  37766494 acccatgctacagggcatact 37766474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 216 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 37747817 - 37747749
Alignment:
Q  216 catactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccag 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37747817 catactatgtcaaggaagttgttacgggcaggttactactggatggccatggagcatgattgctaccag 37747749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 33)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 16445697 - 16445413
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16445697 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccactgggtgcttccaacagagacaagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggaga 16445598  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||    
T  16445597 tattatgtacaaaagaaactacgacatggtattgttaagatgtgttggtgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacgtacatgacggtaccttcggg 16445498  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccagc 285  Q
    | |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16445497 agccatgctacagggcatactatgtcatggaagttgttacgagcaggttactactagatgaccatggagcatgattgctaccagc 16445413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Original strand, 45735754 - 45736038
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  45735754 tcaaacagttcttgctaagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggaga 45735853  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| |||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  45735854 tattctgtacaagagaaactatgacatagtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtacctttggg 45735953  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccagc 285  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  45735954 acccatgctacagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatggccatggagcatgattgctaccagc 45736038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 4 - 285
Target Start/End: Original strand, 16045765 - 16046046
Alignment:
Q  4 agcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggagatat 103  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||    
T  16045765 agcagttcttgctaagccgtaagtatccaccgggtgcttccaacaaagacaagaaaaccctgagaagattggccagtaaattcctgctagagggagatat 16045864  T
Q  104 tttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttgggacc 203  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||    
T  16045865 tctgtacaaaagaaactacgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcgggacc 16045964  T
Q  204 catgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccagc 285  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16045965 catgctacagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcgggttactactggatgaccatagagcatgattgctaccagc 16046046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 26533564 - 26533280
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26533564 tcaaacagttcttgctaagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggaga 26533465  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  26533464 tattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcggagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 26533365  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccagc 285  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26533364 acccacgctacagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatggccatggagcatgattgctaccagc 26533280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 4140937 - 4140654
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4140937 tcaaacagttcttgctaagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccagtagattcctgttagatggaga 4140838  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  4140837 tattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 4140738  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccag 284  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4140737 acccatgctacagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatggccatggagcatgattgctaccag 4140654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 24588225 - 24587942
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24588225 tcaaacagttcttgctaagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccagtagattcctgttagatggaga 24588126  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  24588125 tattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 24588026  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccag 284  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24588025 acccatgctacagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatggccatggagcatgattgctaccag 24587942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 11420470 - 11420186
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11420470 tcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccagtagattcctgttagatggaga 11420371  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  11420370 tattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcggagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 11420271  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccagc 285  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11420270 acccatgctacagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatggccatggagcatgattgctaccagc 11420186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 2105854 - 2105571
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2105854 tcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggaga 2105755  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  2105754 tattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 2105655  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccag 284  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2105654 acccatgctacagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccag 2105571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Original strand, 2777701 - 2777985
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2777701 tcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgtcgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggaga 2777800  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| | ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  2777801 tattctctacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtacctttggg 2777900  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccagc 285  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2777901 acccatgctacagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatggccatggagcatgattgctaccagc 2777985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Original strand, 4203836 - 4204120
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4203836 tcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggaga 4203935  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  4203936 tattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 4204035  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccagc 285  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4204036 acccatgctacggggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatggccatggagcatgattgctaccagc 4204120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Original strand, 3449753 - 3450037
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3449753 tcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggaga 3449852  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| || ||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  3449853 tattctgtacaagaggaactatgacatggtactgttaagatgtgttgatgaacatgaagcggaacagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 3449952  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccagc 285  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3449953 acccatgctacagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatggccatggagcatgattgctaccagc 3450037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 10912560 - 10912276
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10912560 tcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggaga 10912461  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  10912460 tattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcggagcagttgatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 10912361  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccagc 285  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10912360 acccatgctacagggcatactatgtcaaggaagttgttacgggcaggttactactggatggccatggagcatgattgctaccagc 10912276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 7 - 285
Target Start/End: Original strand, 2159027 - 2159305
Alignment:
Q  7 agttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggagatatttt 106  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  2159027 agttcttgctgagccgtgagtatccaccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggagatattct 2159126  T
Q  107 gtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttgggacccat 206  Q
    |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||    
T  2159127 gtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcgggacccat 2159226  T
Q  207 gctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccagc 285  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2159227 gctacagggcatactatgtcaaggaaattgttacgagcaagttactactggatggccatggagcatgattgctaccagc 2159305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 26511387 - 26511105
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26511387 tcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggaga 26511288  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  26511287 tattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 26511188  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctacca 283  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26511187 acccatgctacggggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatggccatggagcatgattgctacca 26511105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Original strand, 26517239 - 26517521
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26517239 tcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccagtagattcctgttagatggaga 26517338  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
     ||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  26517339 aattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 26517438  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctacca 283  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26517439 acccacgctacagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatggccatggagcatgattgctacca 26517521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 39208830 - 39208548
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39208830 tcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggaga 39208731  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  39208730 tattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 39208631  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctacca 283  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  39208630 acccatgctacggggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatggccatggagcatgattgctacca 39208548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 16514121 - 16513837
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| ||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||||||    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16514121 tcaaacagttcttgctgagccgtaagtatccgccaggtgcttccaaccaagacaagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggaga 16514022  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  16514021 tattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttgatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 16513922  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccagc 285  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16513921 acccatgctacagggcatactatgtcaaggaagttgttacgggcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccagc 16513837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 26270777 - 26270493
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  26270777 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccctgagaagattggccagcagatttctgttagatggaga 26270678  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  26270677 tattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 26270578  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccagc 285  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26270577 acccatgctacagggcatactatgtcaagaaagttgctacgggcaggttactactggatgactatggagcatgattgctaccagc 26270493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 5143031 - 5142748
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||   ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5143031 tcaaacagttcttgctgagtcgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaggataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggaga 5142932  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||  ||||||| || ||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  5142931 tatcctgtacaagaggaactatgacatggtactgttaagatgtgttgatgaacatgaagcggagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 5142832  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccag 284  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5142831 acccatgctacagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcacgattgctaccag 5142748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Original strand, 31128354 - 31128637
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31128354 tcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggaga 31128453  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| || ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  31128454 tattctgtacaagaggaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaggcggagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 31128553  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccag 284  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31128554 acccatgctacagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcatgttactactggatggccatggagcatgattgctaccag 31128637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 26315534 - 26315256
Alignment:
Q  6 cagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggagatattt 105  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||     
T  26315534 cagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccctgagaagattggccagcagatttctgttagatggagatatta 26315435  T
Q  106 tgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttgggaccca 205  Q
    ||||||| |||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||    
T  26315434 tgtacaagagaaactatgacatggtgttgttaagatgtgttgatgagcatgaagcggagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcgggaccca 26315335  T
Q  206 tgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccag 284  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26315334 tgctacagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatggccatggagcatgattgctaccag 26315256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 26665605 - 26665323
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  26665605 tcaagcagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccggtagattcctgttagatggaga 26665506  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| || ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  26665505 tattctgtacaagaggaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 26665406  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctacca 283  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26665405 acccatgctacagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttattactggatggccatggagcatgattgctacca 26665323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 26680797 - 26680515
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  26680797 tcaagcagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccggtagattcctgttagatggaga 26680698  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| || ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  26680697 tattctgtacaagaggaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 26680598  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctacca 283  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26680597 acccatgctacagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttattactggatggccatggagcatgattgctacca 26680515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Original strand, 5162830 - 5163114
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    || |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  5162830 tcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattgaccagtagattcctgttagatggaga 5162929  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||  ||    
T  5162930 tattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcagg 5163029  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccagc 285  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5163030 acccatgctacagggcatactatgtcaaggaagttgttacgggcaggttactactggatggccatggagcatgattgctaccagc 5163114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Original strand, 11445334 - 11445617
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||    |||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  11445334 tcaagcagttcttgctgagccgtgagtatccgccaggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccggtagattcctgttagatggaga 11445433  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| || ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  11445434 tattctgtacaagaggaactatgacatggtattgttaaggtgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 11445533  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccag 284  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11445534 acccatgctacagggcatactatgtcaaggaagttgttacgggcaggttactactggatggccatggagcatgattgctaccag 11445617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 31560081 - 31559798
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    |||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  31560081 tcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccggtagattcctgttagatggaga 31559982  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  31559981 tattttgtacaagaggaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaggcggagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 31559882  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccag 284  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31559881 acccatgctacagggcatactatgtcaagaaagttgctacgggcaggttactactggatgactatggagcatgattgctaccag 31559798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Original strand, 26439704 - 26439987
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||    || |||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  26439704 tcaagcagttcttgctaagccgcgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgaggagattggccggtagattcctgttagatggaga 26439803  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| || ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  26439804 tattctgtacaagaggaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaatatgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 26439903  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccag 284  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  26439904 acccatgctacagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatggccatggagcacgattgctaccag 26439987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 31086313 - 31086034
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    || |||||||||||| |||||||||||||||| |||| | ||||||| ||    
T  31086313 tcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtaggttccggttagatgggga 31086214  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  31086213 tattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 31086114  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgcta 280  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  31086113 acccatgctacagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgggcatggagcatgattgcta 31086034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Original strand, 45391667 - 45391950
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||    || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  45391667 tcaagcagttcttgctgagccgtgagtatccgccaggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccggtagattcctgttagatggaga 45391766  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| || ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  45391767 tattctgtacaagaggaactatgacatggtattgttaaggtgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 45391866  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccag 284  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  45391867 acccatgctacagggcatactatgtcgaggaagttgttacgggcaggttactactggatggccatggagcatgattgctaccag 45391950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 6 - 283
Target Start/End: Original strand, 10846072 - 10846349
Alignment:
Q  6 cagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggagatattt 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||| ||  |||||||||| ||||| ||| |  ||||||| || ||||    
T  10846072 cagttcttgctaagccgtgagtatccacagggtgcttccaacaaagacaagaagactctaagaagattggctagtaggttcttattagatggggacattt 10846171  T
Q  106 tgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttgggaccca 205  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||    
T  10846172 tgtacaagagaaactacgacatggtattgttaagatgtattgatgaacacgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcgggaccca 10846271  T
Q  206 tgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctacca 283  Q
     ||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10846272 cgctacggggcacactatgtcaagaaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctacca 10846349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 5132443 - 5132698
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    || |||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  5132443 tcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcttgttagatggaga 5132542  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| || ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  5132543 tattatgtacaagaggaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 5132642  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactg 256  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5132643 acccatgctacagggcatactatgtcaaggaagttgttgcgagcaggttactactg 5132698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 16747208 - 16746925
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||    || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||    
T  16747208 tcaagcagttcttgctaagccgcgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccggtagattcctgttagacggaga 16747109  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| |||| || || ||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  16747108 tattctgtataagaggaactatgacatggtattattaagatgtgttgatgaacacgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 16747009  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccag 284  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  16747008 acccatgctacagggcatactatgtcaagaaagttgctacgggcaggttattactggatggctatggagcatgattgctaccag 16746925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 252 - 285
Target Start/End: Original strand, 5152782 - 5152815
Alignment:
Q  252 tactggatgaccatggagcatgattgctaccagc 285  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5152782 tactggatggccatggagcatgattgctaccagc 5152815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 224; Significance: 1e-123; HSPs: 2)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 6 - 285
Target Start/End: Original strand, 31748 - 32027
Alignment:
Q  6 cagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggagatattt 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  31748 cagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaacaaagacaagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggagatattc 31847  T
Q  106 tgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttgggaccca 205  Q
    ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  31848 tgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgatggtaccttcgggaccca 31947  T
Q  206 tgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccagc 285  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31948 tgctacagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccagc 32027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143; HSP #2
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Original strand, 8410 - 8694
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    || |||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  8410 tcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcatgttagatggaga 8509  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  8510 tattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcggagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 8609  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccagc 285  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8610 acccatgctacagggcatactatgtcaaggaagttgttacgggcaggttactactggatggccatggagcatgattgctaccagc 8694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 24)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Original strand, 22137359 - 22137643
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22137359 tcaaacagttcttgctaagccgagagtatccgccgggtgcttccaacaaagacaagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggaga 22137458  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||    
T  22137459 tattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatatacatgacggtaccttcggg 22137558  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccagc 285  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22137559 acccatgctacagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccagc 22137643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 6 - 285
Target Start/End: Original strand, 16287407 - 16287685
Alignment:
Q  6 cagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggagatattt 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  16287407 cagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaacaag-acaagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggagatattc 16287505  T
Q  106 tgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttgggaccca 205  Q
    ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||    
T  16287506 tgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcggagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcgggaccca 16287605  T
Q  206 tgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccagc 285  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16287606 tgctacagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccagc 16287685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 9 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 19657100 - 19656824
Alignment:
Q  9 ttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggagatattttgt 108  Q
    |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||| |  ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  19657100 ttcttgctgagccgtgagtatctgccgggtgcttccaacaaagacaagaagaccctaagaagattggccagtagattcctgttagatggagatattctgt 19657001  T
Q  109 acaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttgggacccatgc 208  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||    
T  19657000 acaaaagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcgaagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcgggacccatgc 19656901  T
Q  209 tatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccagc 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19656900 tatagggcatactatgtcaaggaagttattacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccagc 19656824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Original strand, 18795153 - 18795437
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18795153 tcaagcagttcttgcggagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggaga 18795252  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  18795253 tattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcggagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 18795352  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccagc 285  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18795353 acccatgctacagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatggccatggagcatgattgctaccagc 18795437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 9 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 27604664 - 27604388
Alignment:
Q  9 ttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggagatattttgt 108  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  27604664 ttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggagatattctgt 27604565  T
Q  109 acaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttgggacccatgc 208  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||    
T  27604564 acaaaagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcgggacccatgc 27604465  T
Q  209 tatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccagc 285  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27604464 tacaaggcatactatgtcaaggaagttgttacgggcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccagc 27604388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 22076692 - 22076410
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||| |||||||||| ||||| ||| || ||||||| ||    
T  22076692 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaacaaagacaagaagactctgagaagattggctagtaggttcttgttagatgggga 22076593  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || || || ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| |||    
T  22076592 cattttgtacaaaagaaactacgacatggtattgttaagatgtgttgatgagcatgaggcagagcaattaatgcatgacgtacatgacggtaccttcggg 22076493  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctacca 283  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22076492 acccatgctacagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagccggttactactggatgaccatggagcatgattgctacca 22076410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 2133027 - 2132743
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2133027 tcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggaga 2132928  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  2132927 tattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 2132828  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccagc 285  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2132827 acccatgctacaggacatactatgtcaaggaagttattacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccagc 2132743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Original strand, 19692547 - 19692831
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19692547 tcaaacagttcttgctaagccgtgagtatccgtcgggtgcttccaaccaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggaga 19692646  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  19692647 tattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 19692746  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccagc 285  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19692747 acccatgctacagggcatactatgtcaaggaagttgttacgggcaggttactactggatggccatggagcatgattgctaccagc 19692831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 19912929 - 19912645
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19912929 tcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccaggtgcttccaaccaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggaga 19912830  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  19912829 tattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 19912730  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccagc 285  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19912729 acccatgctacagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatggccatggagcatgattgctaccagc 19912645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 21343938 - 21343657
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21343938 tcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccagtagattcctgttagatggaga 21343839  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  21343838 tattctgtacaagagaaactatgacatggtatttttaagatgtgttgatgaacatgaggcggagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 21343739  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctacc 282  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21343738 acccatgctacagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatggccatggagcatgattgctacc 21343657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Original strand, 33246819 - 33247103
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33246819 tcaaacagttcttactgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggaga 33246918  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  33246919 tattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 33247018  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccagc 285  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33247019 acccatgctacaggacatactatgtcaaggaagctgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccagc 33247103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Original strand, 44565433 - 44565717
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    |||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44565433 tcaaacagttcttgctaagccgtgagtatccgtcgggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaatattggccagtagattcctgttagatggaga 44565532  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  44565533 tattctgtacaagagaaactatgacatggtattattaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 44565632  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccagc 285  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44565633 acccatgctacagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatggccatggagcatgattgctaccagc 44565717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Original strand, 33263183 - 33263466
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33263183 tcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccagtagattcctgttagatggaga 33263282  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    | || ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  33263283 tgttctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcggagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 33263382  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccag 284  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33263383 acccatgctacagggcatactatgtcgaggaagttgttacgggcaggttactactggatggccatggagcatgattgctaccag 33263466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Original strand, 9359074 - 9359356
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||    || |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  9359074 tcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgtttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtaaattcctgttagatggaga 9359173  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  9359174 tattctgtacaaaagaaactatgacatggtactgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 9359273  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctacca 283  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9359274 acccatgctacagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatggccatggagcatgattgctacca 9359356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 28357719 - 28357437
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    |||||||||||| || ||||||||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  28357719 tcaaacagttcttgctaagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccggcagattcctgttagatggaga 28357620  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  28357619 tattctgtacaagagaaactatgacatggtattgctaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtacctttggg 28357520  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctacca 283  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28357519 acccatgctacagggcatactatgtcaaggaagttgttgcgagcaggttactactggatggccatggagcatgattgctacca 28357437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 7 - 285
Target Start/End: Original strand, 18713939 - 18714217
Alignment:
Q  7 agttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggagatatttt 106  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||    |||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |    
T  18713939 agttcttgctgagccgtgagtatccgtcgggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccagtagattcatgttagatggagatattct 18714038  T
Q  107 gtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttgggacccat 206  Q
    |||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  18714039 gtacaagagaaactatgacatggtattgctaagatgtgttgatgaacacgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtacctttggaacccat 18714138  T
Q  207 gctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccagc 285  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18714139 gctacagggcatactatgtcaaggaagttgttgcgagcaggttactactggatggccatggagcatgattgctaccagc 18714217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Original strand, 15772023 - 15772306
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    || |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  15772023 tcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccaatagattcctgctagatggaga 15772122  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| |||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  15772123 tattctgtacaagagaaactatgacatggtactgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagtagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 15772222  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccag 284  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15772223 acccatgctacagggcatactatgtcaagaaagttgttacgagcaggttactactggatggccatggagcatgattgctaccag 15772306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 19204129 - 19203847
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||    || |||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  19204129 tcaagcagttcttgctaagccgcgaatatccgccaggtgcttccaaacaagataagaagaccctgaggagattggccggtagattcctgttagatggaga 19204030  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| || ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  19204029 tattctgtacaagaggaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 19203930  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctacca 283  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19203929 acccatgctacagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatggccatggagcatgattgctacca 19203847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Original strand, 14562073 - 14562357
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  14562073 tcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccaggtgcctccaaccaagacaagaagaccctgagaagattggccagtagattcatgttagatggaga 14562172  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||||| |||    
T  14562173 tattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcggagcagttaatgcctgatgtacatgacagtaccttcggg 14562272  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccagc 285  Q
    |||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14562273 acccctgctacaggacatactatgtcaaggaagctgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccagc 14562357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Original strand, 29833774 - 29834057
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    |||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  29833774 tcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccggtagattcctgttagatggaga 29833873  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  29833874 tattttgtacaagaggaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 29833973  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccag 284  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||| || |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29833974 acccatgctacagggcatactatgtcaagaaagctgctacgggcaggttactactggatgactatggagcatgattgctaccag 29834057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Original strand, 19678896 - 19679180
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||    |||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  19678896 tcaagcagttcttgctgagccgtgagtatccgccaggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccggtagattcctgttagatggaga 19678995  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| || ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  19678996 tattctgtacaagaggaactatgacatggtattgttaaggtgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 19679095  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccagc 285  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19679096 acccatgctacagggcatactatgtcaagaaagttgctacgggcaggttactactggatgactatggagcatgattgctaccagc 19679180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 31485638 - 31485354
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||    || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  31485638 tcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccaggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccggtagattcctgttagatggaga 31485539  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| || ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  31485538 tattctgtacaagaggaactatgacatggtattgttaaggtgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 31485439  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccagc 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31485438 acccatgctatagggcatactatgtcgaggaagttgctacgggcaggttactactggatggccatggagcatgattgctaccagc 31485354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 12088490 - 12088207
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||    |||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  12088490 tcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccgagtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccggtagattcctgttagatggaga 12088391  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  12088390 tattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaggcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 12088291  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccag 284  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12088290 acccatgctacagggcatactatgtcaagaaagttgctacgggcaggttactactggatgactatggagcatgattgctaccag 12088207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Original strand, 31358977 - 31359260
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    || ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  31358977 tcaagcagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaaaaccctgagaagattggccggtagattcctgttagatggaga 31359076  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| || ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  31359077 tattctgtacaagaggaactatgacatggtattgttaaggtgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 31359176  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccag 284  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  31359177 acccatgctacagggcatactatgtcaagaaagttgctacgggcaggttattactggatggctatggagcatgattgctaccag 31359260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 45)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 27357859 - 27357575
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27357859 tcaaacagttcttgctaagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggaga 27357760  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  27357759 tattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtacctttggg 27357660  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccagc 285  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27357659 acccatgctacagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccagc 27357575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 14141143 - 14140859
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14141143 tcaaacagttcttgctaagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggaga 14141044  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  14141043 tattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtacctttggg 14140944  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccagc 285  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14140943 acccacgctacagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatggccatggagcatgattgctaccagc 14140859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 26774376 - 26774094
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26774376 tcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaagcaagacaagaagaccttgagaagattggccagtagattcctgttagatggaga 26774277  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  26774276 tattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcggagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 26774177  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctacca 283  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26774176 acccatgctacagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctacca 26774094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Original strand, 24868163 - 24868447
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24868163 tcaaacagttcttgctaagccgtgagtatccgtcgggtgcttccaaccaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggaga 24868262  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  24868263 tattctgtacaaaagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttgatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 24868362  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccagc 285  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24868363 acccatgctacagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccagc 24868447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Original strand, 26922824 - 26923108
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26922824 tcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccagtagattcctgttagatggaga 26922923  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  26922924 tattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcggagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 26923023  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccagc 285  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26923024 acccatgctacagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatggccatggagcatgattgctaccagc 26923108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Original strand, 27023584 - 27023868
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27023584 tcaagcagttcttgctgagccgtgagtatcagccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggaga 27023683  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  27023684 tattatgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcggagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 27023783  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccagc 285  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27023784 acccatgctacagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatggccatggagcatgattgctaccagc 27023868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Original strand, 29554004 - 29554287
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29554004 tcaagcagttcttgctgagccgcgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggaga 29554103  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  29554104 tattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtacctttggg 29554203  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccag 284  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29554204 acccatgctacagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcgggttactactggatggccatggagcatgattgctaccag 29554287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 24301506 - 24301222
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  24301506 tcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccaggtgcttccaaccaagacaagaagaccctgagaagattggccagtagattcatgttagatggaga 24301407  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  24301406 tattttgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcggagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 24301307  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccagc 285  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24301306 acccatgctacaggacatactatgtcaaggaagctgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccagc 24301222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 27625460 - 27625176
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  27625460 tcaaacagttcttgctaagccgtgagtatccgccaggtgcttccaaacaagacaagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttggatggaga 27625361  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  27625360 tattctgtacaaaagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 27625261  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccagc 285  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27625260 acccatgctacagggcatactatgtcaagaaagttgttacgggcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccagc 27625176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Original strand, 28164938 - 28165222
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| ||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28164938 tcaaacagttcttgttgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggaga 28165037  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  28165038 tattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 28165137  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccagc 285  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28165138 acccatgctacagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatggccatggagcatgattgctaccagc 28165222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Original strand, 16754268 - 16754552
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16754268 tcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggaga 16754367  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  16754368 tattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 16754467  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccagc 285  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16754468 acccatgctacaggacatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatggccatggagcatgattgctaccagc 16754552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 15408282 - 15408003
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  15408282 tcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccaggtgcttccaatcaagacaagaagaccctgagaagattggccagtagattcatgttagatggaga 15408183  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| |||||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||    
T  15408182 tattctgtacaaaagaaactatgacatggtattattaaggtgtgttgatgaacacgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgatggtaccttcggg 15408083  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgcta 280  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15408082 acccatgctacagggcatactatgtcaaggaagttgttacgggcaggttactactggatggccatggagcatgattgcta 15408003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 15420069 - 15419790
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  15420069 tcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccaggtgcttccaatcaagacaagaagaccctgagaagattggccagtagattcatgttagatggaga 15419970  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| |||||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||    
T  15419969 tattctgtacaaaagaaactatgacatggtattattaaggtgtgttgatgaacacgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgatggtaccttcggg 15419870  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgcta 280  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15419869 acccatgctacagggcatactatgtcaaggaagttgttacgggcaggttactactggatggccatggagcatgattgcta 15419790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Original strand, 16678587 - 16678869
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16678587 tcaaacagttcttgctaagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggaga 16678686  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||  | ||||| || ||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  16678687 tatcctatacaagaggaactatgacatggtactgttaagatgtgttgatgaacatgaagcggagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 16678786  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctacca 283  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16678787 acccatgctacagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatggccatggagcatgattgctacca 16678869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 13294700 - 13294416
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||| | ||  ||||||||||    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13294700 tcaaacagttcttgctgagccgtgagtattcgccaagtgcttccaaccaagacaagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggaga 13294601  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  13294600 tattctgtacaaaagaaactatgacatggtattattaagatgtgttgatgaacacgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 13294501  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccagc 285  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13294500 acccatgctacagggcatactatgtcaaggaagttgttacgggcaggttactactggatggccatggagcatgattgctaccagc 13294416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Original strand, 4762210 - 4762493
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4762210 tcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccagtagattcctgttagatggaga 4762309  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| || ||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  4762310 tattctgtacaagaggaactatgacatggtatggttaagatgtgttgatgaacatgaggcggagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 4762409  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccag 284  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4762410 acccatgctacagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatggccatggagcatgattgctaccag 4762493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 6 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 22930628 - 22930349
Alignment:
Q  6 cagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggagatattt 105  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  22930628 cagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggagatattc 22930529  T
Q  106 tgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttgggaccca 205  Q
    ||||||| |||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||    
T  22930528 tgtacaagagaaactatgacatggtattgttaaggtgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcgggaccca 22930429  T
Q  206 tgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccagc 285  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22930428 tgctacagggcatactatgtcaagaaagttgctacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccagc 22930349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 6 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 23853073 - 23852794
Alignment:
Q  6 cagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggagatattt 105  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  23853073 cagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggagatattc 23852974  T
Q  106 tgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttgggaccca 205  Q
    ||||||| |||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||    
T  23852973 tgtacaagagaaactatgacatggtattgttaaggtgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcgggaccca 23852874  T
Q  206 tgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccagc 285  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23852873 tgctacagggcatactatgtcaagaaagttgctacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccagc 23852794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Original strand, 27489580 - 27489863
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    |||||||||||  || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  27489580 tcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagactttgagaagattggccggtagattcctgttagatggaga 27489679  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  27489680 tattttgtacaagaggaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 27489779  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccag 284  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27489780 acccatgctacagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatggccatggagcatgattgctaccag 27489863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 27286113 - 27285831
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||    
T  27286113 tcaagcagttcttgctaagccgtaagtacccaccaggtgcttccaacaaagacaagaagaccctgagaagattggccagtaaattccttttagatgggga 27286014  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  27286013 tattctgtacaaaagaaactacgacatggtattgttgagatgtgttgatgaacatgaagcagagaagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 27285914  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctacca 283  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27285913 acccatgctacagggcatactatgtcgaggaagttgttgcgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctacca 27285831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Original strand, 29577466 - 29577744
Alignment:
Q  6 cagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggagatattt 105  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||     
T  29577466 cagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccctgagaagattggccagcagatttctgttagatggagatatta 29577565  T
Q  106 tgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttgggaccca 205  Q
    ||||||| |||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||    
T  29577566 tgtacaagagaaactatgacatggtgttgttaagatgtgttgatgagcatgaagcggagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcgggaccca 29577665  T
Q  206 tgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccag 284  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29577666 tgctacagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatggccatggagcatgattgctaccag 29577744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 8901452 - 8901169
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||   ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8901452 tcaaacagttcttgctgagccgtgaatatccgtcgggtgcttccaagcaggataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggaga 8901353  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  8901352 tattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 8901253  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccag 284  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  8901252 acccatgctacagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaagttactactggatggccatggaacatgattgctaccag 8901169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Original strand, 27061953 - 27062236
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  27061953 tcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgtcgggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccagtagattcctgttaaatggaga 27062052  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  27062053 tattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 27062152  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccag 284  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27062153 acccatgctacaggacatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatggccatggagcatgattgctaccag 27062236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 16939776 - 16939494
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16939776 tcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccaggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccagtagattcctgttagatggaga 16939677  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| || ||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  ||||||| |||||||| |||    
T  16939676 tattctgtacaagaggaactatgacatggtattgctaagatgtgttgatgaacacgaagcagagcagttaatgcacgatgtacatgacggtaccttcggg 16939577  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctacca 283  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16939576 acccatgctacagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatggccatggagcatgattgctacca 16939494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Original strand, 29505863 - 29506145
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29505863 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctaagaagattggccagtagattcctgttagatggaga 29505962  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| | ||||| || ||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  29505963 tattctttacaagaggaactatgacatggtgttgataagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 29506062  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctacca 283  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29506063 acccatgctacagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatggccatggagcatgattgctacca 29506145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Original strand, 27183376 - 27183660
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| ||||||||| | ||||||||||||||  |||||||||||||    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27183376 tcaaacagttcttgttgagccgtgagtatccgtcgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggaga 27183475  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  27183476 tattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 27183575  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccagc 285  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27183576 acccatgctacaggacatactatgtcaaggaagttgttgcgagcaggttactactggatggccatggagcatgattgctaccagc 27183660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 27265863 - 27265579
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| ||||||||| | ||||||||||||||  |||||||||||||    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27265863 tcaaacagttcttgttgagccgtgagtatccgtcgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggaga 27265764  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  27265763 tattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 27265664  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccagc 285  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27265663 acccatgctacaggacatactatgtcaaggaagttgttgcgagcaggttactactggatggccatggagcatgattgctaccagc 27265579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Original strand, 4777327 - 4777610
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    |||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  4777327 tcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccggtagattcctgttagatggaga 4777426  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  4777427 tattttgtacaagaggaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaggcggagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 4777526  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccag 284  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4777527 acccatgctacagggcatactatgtcaagaaagttgctacgggcaggttactactggatgactatggagcatgattgctaccag 4777610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 13519943 - 13519660
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    |||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  13519943 tcaagcagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggtcagtagattcctgttagatggaga 13519844  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
     ||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  13519843 gattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 13519744  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccag 284  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  13519743 acccatgctacagggcatactatgtcaagaaagttgttacgagcaggttattactggatggctatggagcatgattgctaccag 13519660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Original strand, 27198632 - 27198915
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||    |||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  27198632 tcaagcagttcttgctgagccgtgagtatccgccaggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccggtagattcctgttagatggaga 27198731  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  27198732 tattttgtacaagaggaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaggcggagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 27198831  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccag 284  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27198832 acccatgctacagggcatactatgtcaagaaagttgctacgggcaggttactactggatgactatggagcatgattgctaccag 27198915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 17088192 - 17087910
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    ||||||||||||||| ||  | |||||||||| ||||||||||||| |  ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| || ||||||| ||    
T  17088192 tcaagcagttcttgcaaaatcatgagtatccatcgggtgcttccaacaaagacaagaagaccctgagaagattggccagtaggttcttgttagatgggga 17088093  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || || || |||||||||||| ||||||| |||||||| |||    
T  17088092 tattctgtacaaaagaaactacgacatggtattgttaaaatgtgttgatgagcacgaggcagaacaattaatgcatgacgtacatgacggtaccttcggg 17087993  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctacca 283  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17087992 acccatgctacagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgtccatggagcatgattgctacca 17087910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 30553765 - 30553483
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  30553765 tcaagcagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccggtagattcctgttagatggaga 30553666  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| || ||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  30553665 tattctgtacaagaggaactatgacatggtattgctaagatgtgttgatgaacacgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 30553566  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctacca 283  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30553565 acccatgctacagggcatactatgtcaagaaagttgctacgggcaggttactactggatggccatggagcatgattgctacca 30553483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 8 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 4541516 - 4541240
Alignment:
Q  8 gttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggagatattttg 107  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  4541516 gttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccagtagattcctgttagatggagatattctg 4541417  T
Q  108 tacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttgggacccatg 207  Q
    ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||    
T  4541416 tacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaggcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcgggacccatg 4541317  T
Q  208 ctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccag 284  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4541316 ctacagggcatactatgtcaagaaagttgctacgggcaggttactactggatgactatggagcatgattgctaccag 4541240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Original strand, 3700530 - 3700813
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    || |||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  3700530 tcaagcagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagactctgagaagattggccggtagattcctgttagatggaga 3700629  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  3700630 tattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgtcgatgaacatgaagcggaacagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 3700729  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccag 284  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3700730 acccatgctacagggcatactatgtcaagaaagttgctacgggcaggttactactggatgactatggagcatgattgctaccag 3700813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 8 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 4719877 - 4719602
Alignment:
Q  8 gttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggagatattttg 107  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  4719877 gttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccagtagattcctgttagatggagatattctg 4719778  T
Q  108 tacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttgggacccatg 207  Q
    ||||| |||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||    
T  4719777 tacaagagaaactatgacatggtattgttaaggtgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcgggacccatg 4719678  T
Q  208 ctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctacca 283  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4719677 ctacagggcatactatgtcaagaaagttgctacgggcaggttactactggatggccatggagcatgattgctacca 4719602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Original strand, 26790263 - 26790546
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    |||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  26790263 tcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccggtagattcctgttagatggaga 26790362  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| || ||||  ||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||    
T  26790363 tattctgtacaagaggaactatgacatggtactgttgaggtgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatatacatgacggtaccttcggg 26790462  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccag 284  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26790463 acccatgctacagggcatactatgtcaaggaagttgttgcgagcaggttactactggatgactatggagcatgattgctaccag 26790546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 26112161 - 26111879
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||    |||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  26112161 tcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccgagtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccggtagattcctgttagatggaga 26112062  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  26112061 tattttgtacaagaggaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaggcggagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 26111962  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctacca 283  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26111961 acccatgctacagggcatactatgtcaagaaagttgctacgggcaggttactactggatggccatggagcatgattgctacca 26111879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 27250603 - 27250319
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||    |||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  27250603 tcaagcagttcttgctgagccgtgagtatccgccaggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccggtagattcctgttagatggaga 27250504  T
Q  101 tattttgtacaaaaga-aactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttgg 199  Q
    |||||||||||| ||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||    
T  27250503 tattttgtacaagagggaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaggcggagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcgg 27250404  T
Q  200 gacccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccag 284  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27250403 gacccatgctacagggcatactatgtcaagaaagttgctacgggcaggttactactggatgactatggagcatgattgctaccag 27250319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 33372180 - 33371897
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33372180 tcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccagtagattcctgttagatggaga 33372081  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| | ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  |||| || |||||||| |||    
T  33372080 tattctatacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgtacacgacggtaccttcggg 33371981  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccag 284  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  33371980 acccatgctacagggcatactatgtcaagaaagttgctacgggcaggttactactggatggccatggagcatgactgctaccag 33371897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Original strand, 4529732 - 4530014
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    |||||||||||| || ||||||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  4529732 tcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccggtagattcttgttagatggaga 4529831  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| || ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  4529832 tattctgtacaagaggaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 4529931  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctacca 283  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4529932 acccatgctacagggcatactatgtcaagaaagttgctacgggcaggttactactggatggccatggagcatgattgctacca 4530014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Original strand, 28211901 - 28212184
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| ||||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||||||    |||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  28211901 tcaaacagttcttgccgagccgtgagtatccgccgagtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccggtagattcctgttagatggaga 28212000  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  28212001 tattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaggcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 28212100  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccag 284  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28212101 acccatgctacagggcatactatgtcaagaaagttgctacgggcaggttactactggatgactatggagcatgattgctaccag 28212184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 34460255 - 34459973
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||  | |||||||||||    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  34460255 tcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgtcaggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccagtagattcctgttaaatggaga 34460156  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| || ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||| ||| |||    
T  34460155 tattctgtacaagaggaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtagcttcggg 34460056  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctacca 283  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34460055 acccatgctacagggcatactatgtcaaggaagttgctacgggcaggttactactggatggccatggagcatgattgctacca 34459973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Original strand, 27012178 - 27012461
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||    |||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  27012178 tcaagcagttcttgctgagccgtgagtatccgccaggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccggtagattcctgttagatggaga 27012277  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| || ||||  ||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  27012278 tattctgtacaagaggaactatgacatggtactgttgaggtgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 27012377  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccag 284  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27012378 acccatgctacagggcatactatgtcaagaaagttgctacgggcaggttactactggatgactatggagcatgattgctaccag 27012461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Original strand, 20172994 - 20173276
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||||||||||||||  |  | ||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  20172994 tcaagcagttcttgcagaatcatgagtatccacggggtgcttccaacagagacaagaagaccttgagaagattagccggtagattcctgttagatggaga 20173093  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  |||| || |||||||| |||    
T  20173094 tattctatacaagaggaactacgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacgcgaagcagagcagttaatgcatgatgtacacgacggtaccttcggg 20173193  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctacca 283  Q
    ||||| ||||  ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20173194 acccacgctacggggcacactatgtcacgaaagttgttacgagcaggttactattggatgaccatggagcatgattgctacca 20173276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 22162997 - 22162715
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||||||||||||||  |  | ||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  22162997 tcaagcagttcttgcagaatcatgagtatccacggggtgcttccaacagagacaagaagaccttgagaagattagccggtagattcctgttagatggaga 22162898  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  |||| || |||||||| |||    
T  22162897 tattctatacaagaggaactacgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacgcgaagcagagcagttaatgcatgatgtacacgacggtaccttcggg 22162798  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctacca 283  Q
    ||||| ||||  ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22162797 acccacgctacggggcacactatgtcacgaaagttgttacgagcaggttactattggatgaccatggagcatgattgctacca 22162715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 11)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Original strand, 20465428 - 20465712
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20465428 tcaagcagttcttgctaagtcgtgagtatccaccgggtgcttccaacagggacaagaagaccttgagaagattggccagtagattcctgttagatggaga 20465527  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  20465528 cattttgtacaaaagaaactacgacatggtattgctaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 20465627  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccagc 285  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20465628 acccatgctacaaggcatactatgtcaaagaagttgttacgggcaggttactactggataaccatggagcatgattgctaccagc 20465712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 16203840 - 16203556
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16203840 tcaaacagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaacaaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggaga 16203741  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  16203740 tattctgtacaagagaaactacgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacgcgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 16203641  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccagc 285  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16203640 acccatgctacagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcgggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccagc 16203556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Original strand, 28154188 - 28154472
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28154188 tcaaacagttcttgctaagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggaga 28154287  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  28154288 tattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtacctttggg 28154387  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccagc 285  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28154388 acccatgctacagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatggccatggagcatgattgctaccagc 28154472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 20336222 - 20335938
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20336222 tcaagcagttcttgctaagccgtaagtatccaccgggtgcttccaacagagacaagaagaccttgagaagattggccagtagattcctgttagatggaga 20336123  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||    
T  20336122 tattctgtacaaaagaaactacgacatggtattgctaagatgtgttgatgaaaatgaagcagagcagttaatgcatgacgtacatgacggtaccttcggg 20336023  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccagc 285  Q
    |||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20336022 acccatgctacaggacgtactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactattggatgaccatggagcacgattgctaccagc 20335938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 21893554 - 21893270
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  21893554 tcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccggtagattcctgttagatggaga 21893455  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  21893454 tattctgtacaaaagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 21893355  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccagc 285  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21893354 acccatgctacagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccagc 21893270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Original strand, 10949529 - 10949812
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10949529 tcaaacagttcttgctaagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccagtagattcctgttagatggaga 10949628  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  10949629 tattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 10949728  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccag 284  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10949729 acccatgctacagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatggccatggagcatgattgctaccag 10949812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Original strand, 3645594 - 3645879
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3645594 tcaaacagttcttgctaagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggaga 3645693  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctt-tgg 199  Q
    |||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||  ||    
T  3645694 tattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttccgg 3645793  T
Q  200 gacccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccagc 285  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3645794 gacccatgctacagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatggccatggagcatgattgctaccagc 3645879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Original strand, 10967117 - 10967399
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||    || ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10967117 tcaagcagttcttgctaagccgcgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccttgagaagattggccagtagattcctgttagatggaga 10967216  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  10967217 tattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 10967316  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctacca 283  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10967317 acccatgctacagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatggccatggagcatgattgctacca 10967399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Original strand, 51642670 - 51642953
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  51642670 tcaaacagttcttgctaagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccagtagattcctgttagatggaga 51642769  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||    
T  51642770 tattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcaggatgtacatgatggtaccttcggg 51642869  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccag 284  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  51642870 acccatgctacagggcatactatgtcaagaaagttgctacgggcaggttactactggatggccatggagcatgattgctaccag 51642953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Original strand, 28589532 - 28589815
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28589532 tcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccaggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccagtagattcctgttagatggaga 28589631  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  28589632 tattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaggcggagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 28589731  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccag 284  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28589732 acccatgctacagggcatactatgtcgaggaagttgttacgggcaggttactactggatggccatggagcatgattgctaccag 28589815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 41789116 - 41788833
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41789116 tcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccagtagattcctgttagatggaga 41789017  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  41789016 tattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgacgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 41788917  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccag 284  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41788916 acccatgctacagggcatactatgtcaagaaagttgctacgggcaggttactactggatgactatggagcatgattgctaccag 41788833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 26)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Original strand, 15232279 - 15232561
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15232279 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaacaaagacaagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggaga 15232378  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  15232379 tattttgtacaagagaaactacgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 15232478  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctacca 283  Q
    ||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15232479 acccacgctacggggcacactatgtcaaggaagttgttacgagtaggttactactggatgaccatggagcatgattgctacca 15232561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 20334227 - 20333943
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20334227 tcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggaga 20334128  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  20334127 tattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 20334028  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccagc 285  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20334027 acccatgctacagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatggccatggagcatgattgctaccagc 20333943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 18796420 - 18796137
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18796420 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggaga 18796321  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| |||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  18796320 tattctgtacaaaaggaactacgacatggtactgttaagatgtgttgatgaacatgaagcggagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 18796221  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccag 284  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18796220 acccatgctacggggcatactatgtcgaggaagttgttacgagcaggatactactggatggccatggagcatgattgctaccag 18796137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 40101443 - 40101160
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40101443 tcaaacagttcttgctaagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccagtagattcctgttagatggaga 40101344  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  40101343 tattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 40101244  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccag 284  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40101243 acccatgctacagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactattggatggccatggagcatgattgctaccag 40101160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Original strand, 54837854 - 54838136
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  54837854 tcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggaga 54837953  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  54837954 tattttgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagaacagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 54838053  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctacca 283  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  54838054 acccatgctacagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatggccatggagcatgattgctacca 54838136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Original strand, 30758223 - 30758507
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  30758223 tcaaacagttcttactaagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattccggttagatggaga 30758322  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| |||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||    
T  30758323 tattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaaggtgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgatggtaccttcggg 30758422  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccagc 285  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30758423 acccatgctacagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgactatggagcatgattgctaccagc 30758507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Original strand, 6574321 - 6574604
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6574321 tcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggaga 6574420  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| || ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  6574421 tattctgtacaagaggaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaggcggagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 6574520  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccag 284  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6574521 acccatgctacagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatggccatggagcatgattgctaccag 6574604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Original strand, 14669476 - 14669760
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14669476 tcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaccaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggaga 14669575  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  14669576 tattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttgatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 14669675  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccagc 285  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14669676 acccatgctacagggcatactatgtcaaggaagttgttacgggcaggttactactggatggccatggagcatgattgctaccagc 14669760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 24588167 - 24587883
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    || |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24588167 tcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaaggccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggaga 24588068  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  24588067 tattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 24587968  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccagc 285  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24587967 acccatgctacaggacatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatggccatggagcatgattgctaccagc 24587883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 34184766 - 34184482
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| ||||||||||| | |||||||||||| || |||||||||||    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34184766 tcaaacagttcttgctgaaccgtgagtatccgccaggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggaga 34184667  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  34184666 tattctgtacaaaagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacgtgaagcggagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 34184567  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccagc 285  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34184566 acccatgctacagggcatactatgtcaagaaagttgttacgagcaggttactactggatggccatggagcatgattgctaccagc 34184482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 36340323 - 36340039
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36340323 tcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggaga 36340224  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||  ||||||| || ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  36340223 tatcctgtacaagaggaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 36340124  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccagc 285  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36340123 acccatgctacagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatggccatggagcatgattgctaccagc 36340039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 14755298 - 14755015
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||    || ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14755298 tcaagcagttcttgctgagccatgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccttgagaagattggccagtagattcctgttagatggaga 14755199  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  14755198 tattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 14755099  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccag 284  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14755098 acccatgctacagggcatactatgtcaagaaagttgttacgagcaggttactattggatggccatggagcatgattgctaccag 14755015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Original strand, 17017509 - 17017788
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17017509 tcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggaga 17017608  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  17017609 tattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagtagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 17017708  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgcta 280  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17017709 acccatgctacagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatggccatggagcatgattgcta 17017788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 18312984 - 18312701
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    |||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  18312984 tcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccggtagattcctgttagatggaga 18312885  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| || ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  18312884 tattctgtacaagaggaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 18312785  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccag 284  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18312784 acccatgctacagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgactatggagcatgattgctaccag 18312701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 33669606 - 33669324
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33669606 tcaaacagttcttgctaagccgtgagtatccgtcgggtgcttccaaccaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggaga 33669507  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  33669506 tattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 33669407  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctacca 283  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33669406 acccatgctacagggcatactatgtcgaggaagttgttacgggcaggttactactggatggccatggagcatgattgctacca 33669324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Original strand, 39855100 - 39855382
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39855100 tcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgcctggtgcttccaaacaagacaagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggaga 39855199  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  39855200 tattctgtacaagagaaactatgacatggtgttgttaagatgtgttgatgaacacgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 39855299  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctacca 283  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  39855300 acccatgccacagggcatactatgtcaaggaagttgttacgggcaggttactactggatggccatggagcatgattgctacca 39855382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Original strand, 1904717 - 1905001
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||| |||||||||| ||||| ||| |  ||||||| ||    
T  1904717 tcaagcagttcctgctaagccatgagtatccaccgggtgcttccaacaaagacaagaagactctgagaagattggctagtaggttcttattagatgggga 1904816  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
     ||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  1904817 cattttgtacaagagaaactacaacatggtattgttaagatgtgttgatgagcacgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 1904916  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccagc 285  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1904917 acccatgctacagggcatactatgtgaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccagc 1905001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Original strand, 5010338 - 5010621
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||    ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5010338 tcaaacagttcttgctgagccgtgaatatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagactctgagaagattggccagcagattcctgatagatggaga 5010437  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  5010438 tattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 5010537  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccag 284  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5010538 acccatgccacagggcatactatgtcaagaaagttgttacgagcaggttactactggatggccatggagcatgattgctaccag 5010621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Original strand, 14103006 - 14103288
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    |||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  14103006 tcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccggtagattcctgttagatggaga 14103105  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| || ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  14103106 tattctgtacaagaggaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaggcggagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 14103205  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctacca 283  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14103206 acccacgctacagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatggccatggagcatgattgctacca 14103288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Original strand, 24117125 - 24117408
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||    ||||||| |||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  24117125 tcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgtcgggtgcttccaaacaagacaagaggactttgagaagattggccagtagattcctgttagatgggga 24117224  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  24117225 tattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 24117324  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccag 284  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24117325 acccatgctacagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatggccatggagcatgattgctaccag 24117408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Original strand, 5698998 - 5699280
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||    || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  5698998 tcaagcagttcttgctgagccgtgagtatccgccaggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccggtagattcctgttagatggaga 5699097  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| || ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  5699098 tattctgtacaagaggaactatgacatggtattgttaaggtgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 5699197  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctacca 283  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5699198 acccatgctacagggcatactatgtcaaggaagttgttacgggcaggttactactggatggccatggagcatgattgctacca 5699280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 15382039 - 15381757
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||| ||| |||||||||| ||||| ||| |  ||||||| ||    
T  15382039 tcaagcagttcttgataagccgtgagtatccaccaggtgcttccaacaaagacaagaagactctgagaagattggctagtaggttctttttagatgggga 15381940  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || || || ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| | |    
T  15381939 cattttgtacaaaagaaactacgacatggtattgttaagatgtgttgatgagcatgaggcagagcaattaatgcatgacgtacatgacggtaccttcgtg 15381840  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctacca 283  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15381839 acccatgctacagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagccggttactactggatgaccatggagcatgattgctacca 15381757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Original strand, 21974164 - 21974446
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  21974164 tcaagcagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccggtagattcctgttagatggaga 21974263  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| || ||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  21974264 tattctgtacaagaggaactatgacatggtattgctaagatgtgttgatgaacacgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 21974363  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctacca 283  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21974364 acccatgctacagggcatactatgtcaagaaagttgctacgggcaggttactactggatggccatggagcatgattgctacca 21974446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 31122318 - 31122036
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  31122318 tcaagcagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccggtagattcctgttagatggaga 31122219  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| || ||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  31122218 tattctgtacaagaggaactatgacatggtattgctaagatgtgttgatgaacacgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 31122119  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctacca 283  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31122118 acccatgctacagggcatactatgtcaagaaagttgctacgggcaggttactactggatggccatggagcatgattgctacca 31122036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 27159123 - 27158839
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||    || ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27159123 tcaagcagttcttgctaagccgcgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccttgagaagattggccagtagattcctgttagatggaga 27159024  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||  ||||||| || ||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  27159023 tatcctgtacaagaggaactatgacatggtactgttaagatgtgttgatgaacatgaagcggagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 27158924  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccagc 285  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27158923 acccatgctacagggcatactatgtcgaggaagttgttacgggcaggttactactggatggccatggagcatgattgctaccagc 27158839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 15278433 - 15278151
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||| |||||||||| ||||| ||| |  ||||||| ||    
T  15278433 tcaaacagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaacaaagacaagaagactctgagaagattggctagtaggttcttattagatgggga 15278334  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
     ||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||  ||    
T  15278333 cattttgtacaagagaaactacaacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcagg 15278234  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctacca 283  Q
    ||||| ||||  ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15278233 acccacgctacggggcacactatgtcaagaaagttgttgcgagcaggttactactggatgaccgtggagcatgattgctacca 15278151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 213; Significance: 1e-117; HSPs: 39)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 21698966 - 21698682
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |  ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  21698966 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccggatgcttccaacaaagacaagaagaccctgaggagattggccagtagatttctgttagatggaga 21698867  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  21698866 cattttgtacaaaagaaactacgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 21698767  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccagc 285  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21698766 acccatgctacagagcatactatgtcaaggaagttgttacgagcgggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccagc 21698682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Original strand, 27780683 - 27780967
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27780683 tcaaacagttcttgctaagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggaga 27780782  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  27780783 tattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtacctttggg 27780882  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccagc 285  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27780883 acccatgctacagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatggccatggagcatgattgctaccagc 27780967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Original strand, 27820440 - 27820724
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27820440 tcaaacagttcttgctaagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggaga 27820539  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  27820540 tattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtacctttggg 27820639  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccagc 285  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27820640 acccatgctacagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatggccatggagcatgattgctaccagc 27820724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 19412296 - 19412012
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19412296 tcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggaga 19412197  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  19412196 tattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtacctttggg 19412097  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccagc 285  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19412096 acccatgctacagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatggccatggagcatgattgctaccagc 19412012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 256448 - 256165
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  256448 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccagtagattcctgttagatggaga 256349  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  256348 tattttgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 256249  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccag 284  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  256248 acccatgctacagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatggccatggagcatgattgctaccag 256165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 27430236 - 27429952
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |  || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27430236 tcaaacagttcttgctaagccgtgagtatccgtcgggtgcttccaacaaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggaga 27430137  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  27430136 tattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 27430037  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccagc 285  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27430036 acccatgctacagggcatactatgtcaaggaagttgttgcgggcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccagc 27429952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 9345781 - 9345499
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9345781 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggaga 9345682  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| |||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||| |||    
T  9345681 tattctgtacaaaaggaactatgacatggtactgttaagatgtgttgatgaacatgaagcggagcagttaatgcatgatgtccatgacggtaccttcggg 9345582  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctacca 283  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9345581 acccatgctacagggcacactatgtcaaggaagttgctacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctacca 9345499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Original strand, 20842362 - 20842646
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20842362 tcaaacagttcttgctaagccgtgagtatccgtcgggtgctttcaacaaagacaagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggaga 20842461  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  20842462 tattctgtacaaaagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgctgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 20842561  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccagc 285  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20842562 acccatgctacagggcatactatgtcaaggaagttgttacgggcaggtcactactggatgaccatggagcatgattgctaccagc 20842646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 23124364 - 23124080
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    || ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23124364 tcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaaaaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggaga 23124265  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  23124264 tattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcggagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 23124165  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccagc 285  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23124164 acccatgctacagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatggccatggagcatgattgctaccagc 23124080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Original strand, 27120973 - 27121257
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    || ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27120973 tcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccttgagaagattggccagtagattcctgttagatggaga 27121072  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  27121073 tattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtacctttggg 27121172  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccagc 285  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27121173 acccatgctacagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagccggttactactggatggccatggagcatgattgctaccagc 27121257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 11630979 - 11630696
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11630979 tcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccaggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggaga 11630880  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||    
T  11630879 tattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgacgtacatgacggtaccttcggg 11630780  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccag 284  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11630779 acccatgctacagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatggccatggagcatgattgctaccag 11630696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Original strand, 12591257 - 12591539
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12591257 tcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccaggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggaga 12591356  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  12591357 tattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcggagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 12591456  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctacca 283  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12591457 acccatgctacagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatggccatggagcatgattgctacca 12591539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Original strand, 28886728 - 28887012
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28886728 tcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggaga 28886827  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  28886828 tattctgtacaagagaaactatgacatggtatggttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 28886927  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccagc 285  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28886928 acccatgctacagggcatactatgtcaaggaagttgttacgggcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccagc 28887012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Original strand, 34295603 - 34295886
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    || |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  34295603 tcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagagtcctgttagatggaga 34295702  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  34295703 tattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 34295802  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccag 284  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34295803 acccatgctacagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatggccatggagcatgattgctaccag 34295886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Original strand, 37382126 - 37382405
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37382126 tcaaacagttcttgctaagccgtgagtatccgccgggtacttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggaga 37382225  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  37382226 tattctgtacaagagaaactatgacatggtattattaagatgtgttgatgaacatgaagcggagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 37382325  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgcta 280  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37382326 acccatgctacagggcatactatgtcaaggaagttgttacgggcaggttactactggatgaccatggagcatgattgcta 37382405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 13932342 - 13932060
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||    |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  13932342 tcaaacagttcttgctgagtcgtgagtatccgccgggtgcttccaagcaagacaagaagaccttgagaagattggccagcagattcctgttagatggaga 13932243  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||    
T  13932242 tattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcagagcagttaatgcatgatatacatgacggtaccttcggg 13932143  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctacca 283  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13932142 acccacgctacagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatggccatggagcatgattgctacca 13932060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Original strand, 3786942 - 3787225
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3786942 tcaaacagttcttactaagncgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggaga 3787041  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  3787042 tattctgtacaagagaaactacgacatggtattgttaaggtgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 3787141  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccag 284  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3787142 acccatgctacagggcatactatgtcaaggaagttattacgagcaggttactactggatggccatggagcatgattgctaccag 3787225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Original strand, 40237957 - 40238240
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||    || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  40237957 tcaagcagttcttgctaagccgcgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccggtagattcctgttagatggaga 40238056  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  40238057 tattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 40238156  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccag 284  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  40238157 acccatgctacagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatggccatggaacatgattgctaccag 40238240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Original strand, 27808152 - 27808434
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| ||||||||||| | |||||||||||| || |||||||||||    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27808152 tcaaacagttcttgctgaaccgtgagtatccgccaggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggaga 27808251  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  27808252 tattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 27808351  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctacca 283  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27808352 acccacgctacagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatggccatggagcatgattgctacca 27808434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Original strand, 34159293 - 34159575
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34159293 tcaaacagttcttgctgagccatgagtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccagtagattcctgttagatggaga 34159392  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| || ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  34159393 tattctgtacaagaggaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 34159492  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctacca 283  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34159493 acccatgctacagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatggccatggagcatgattgctacca 34159575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Original strand, 34866133 - 34866415
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  34866133 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccctgagaagattggccggtagattcctgttagatggaga 34866232  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| | |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  34866233 tattctatacaaaaggaactacgacatggtattgttaagatgtgttgatgaatatgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 34866332  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctacca 283  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34866333 acccatgctacagggcatactatgtcaagaaagttgctacgggcaggttactactggatggccatggagcatgattgctacca 34866415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 37947657 - 37947375
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  37947657 tcaaacagtttttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccggtagattcctgttagatggaga 37947558  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  37947557 tattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcggaacagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 37947458  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctacca 283  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  37947457 acccatgctacagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatggccatggagcatgattgctacca 37947375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 31889286 - 31889002
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||    |||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  31889286 tcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgcctggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattagccagtagattcctgttagatggaga 31889187  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  31889186 tattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttaatgaacatgaagcggagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 31889087  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccagc 285  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31889086 acccatgctacagggcatactatgtcaaagaagttgttacgagcaggttactactggatggccatggagcatgattgctaccagc 31889002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Original strand, 39894518 - 39894802
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    ||||| |||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39894518 tcaagtagttcttgctgagccgtgaatatccgccaggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccagtagattcctgttagatggaga 39894617  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  39894618 tattctgtacaagagaaactatgacatggtattattaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 39894717  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccagc 285  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  39894718 acccatgctacagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatggccatggagcatgattgctaccagc 39894802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 12712396 - 12712113
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||    |||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  12712396 tcaagcagttcttgctgagccgtgagtatccgccaggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccggtagattcctgttagatggaga 12712297  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| || ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  12712296 tattctgtacaagaggaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 12712197  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccag 284  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12712196 acccatgctacagggcatactatgtcaaggaagttattacgagcaggttactactggatggccatggagcatgattgctaccag 12712113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 37681690 - 37681408
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37681690 tcaaacagttcttgctgagtcgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggaga 37681591  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  37681590 tattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 37681491  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctacca 283  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  37681490 acccatgctacagggcatactatgtcaagaaagttgttacgagcaggttattactggatggccatggagcatgattgctacca 37681408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 37696955 - 37696673
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37696955 tcaaacagttcttgctgagtcgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggaga 37696856  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  37696855 tattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 37696756  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctacca 283  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  37696755 acccatgctacagggcatactatgtcaagaaagttgttacgagcaggttattactggatggccatggagcatgattgctacca 37696673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Original strand, 16165929 - 16166211
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| ||||||||||| | | |||||||||| ||  ||||||||||    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16165929 tcaaacagttcttgctgaactgtgagtatccgccaagtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggaga 16166028  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  16166029 tattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 16166128  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctacca 283  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16166129 acccacgctacagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatggccatggagcatgattgctacca 16166211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 16825133 - 16824851
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  16825133 tcaagcagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccggtagattcctgttagatggaga 16825034  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| || ||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  16825033 tattctgtacaagaggaactatgacatggtattgctaagatgtgttgatgaacacgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 16824934  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctacca 283  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16824933 acccatgctacagggcatactatgtcaagaaagttgctacgggcaggttactactggatggccatggagcatgattgctacca 16824851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Original strand, 16896347 - 16896629
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  16896347 tcaagcagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccggtagattcctgttagatggaga 16896446  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| || ||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  16896447 tattctgtacaagaggaactatgacatggtattgctaagatgtgttgatgaacacgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 16896546  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctacca 283  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16896547 acccatgctacagggcatactatgtcaagaaagttgctacgggcaggttactactggatggccatggagcatgattgctacca 16896629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 19452218 - 19451936
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| |  ||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| |  ||||||| ||    
T  19452218 tcaagcagttcttgctaagccgtgggtatccgtcgggtgcttccaacaaagacaagaagaccctgagaagattggctagtaggttcttattagatgggga 19452119  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
     ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  19452118 cattttgtacaagagaaactacgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 19452019  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctacca 283  Q
    ||||| ||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19452018 acccacgctacggggcacactatgtcaagaaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctacca 19451936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 21672970 - 21672688
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||    |||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||     
T  21672970 tcaagcagttcttgctgagccgtgaatatccgccaggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccggtagattcctgttagatggagg 21672871  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| || ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  21672870 tattctgtacaagaggaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcggagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 21672771  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctacca 283  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21672770 acccatgctacagggcatactatgtcaaggaagttgttgcgagcaggttactactggatggccatggagcatgattgctacca 21672688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 34270715 - 34270433
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| |||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34270715 tcaaacagttcttactgagccgtgagtatccgtcgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggaga 34270616  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  34270615 tattctgtacaagagacactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagttgagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 34270516  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctacca 283  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34270515 acccatgctacagggcatactatgtcaaggaagttgttacgggcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctacca 34270433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Original strand, 12659985 - 12660264
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12659985 tcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccaggtgcttccaaccaagacaagaagaccctgaggagattggccagtagattcctgttagatggaga 12660084  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| |||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  12660085 tattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaaggtgtgttgatgaacatgaagcagagcagttgatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 12660184  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgcta 280  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  12660185 acccatgctacagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactagatggccatggagcatgattgcta 12660264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Original strand, 31880735 - 31881018
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||  | |||||||||||    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  31880735 tcaaacagttcttgctaaaccgtgagtatccgacaggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggaaa 31880834  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| || ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  31880835 tattctgtacaagaggaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 31880934  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccag 284  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31880935 acccatgctacagggcatactatgtcaaggaagttgttacgggcaggttactactggatggccatggagcatgattgctaccag 31881018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Original strand, 32054252 - 32054534
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |    
T  32054252 tcaagcagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccggtagattcctgttagatggaaa 32054351  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| || ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  32054352 tattctgtacaagaggaactatgacatggtattgttaaggtgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 32054451  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctacca 283  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32054452 acccatgctacagggcatactatgtcaagaaagttgttacgagcaggttattactggatggccatggagcatgattgctacca 32054534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Original strand, 37929818 - 37930100
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |    
T  37929818 tcaagcagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccggtagattcctgttagatggaaa 37929917  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| || ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  37929918 tattctgtacaagaggaactatgacatggtattgttaaggtgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 37930017  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctacca 283  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  37930018 acccatgctacagggcatactatgtcaagaaagttgttacgagcaggttattactggatggccatggagcatgattgctacca 37930100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 22923943 - 22923660
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  22923943 tcaagcagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccggtagattcctgttagatggaga 22923844  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| || ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  22923843 tattctgtacaagaggaactatgacatggtattgttaaggtgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 22923744  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccag 284  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  22923743 acccatgctacagggcatactatgtcaagaaagttgctacgggcaggttattactggatggctatggagcatgattgctaccag 22923660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 39047614 - 39047332
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||    |||||||| ||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39047614 tcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgtcgggtgcttccaaacaagacaagaaaaccttgagaaggttggccagtagattcctgttagatggaga 39047515  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||  ||||||| || ||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  39047514 tatcctgtacaagaggaactatgacatggtactgttaagatgtgttgatgaacacgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 39047415  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctacca 283  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  39047414 acccatgctacagggcatactatgtcaagaaagttgctacgggcaggttactactggatggccatggagcatgattgctacca 39047332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 57)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Original strand, 35885177 - 35885461
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35885177 tcaaacagttcttgctaagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggaga 35885276  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  35885277 tattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 35885376  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccagc 285  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  35885377 acccatgctacagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatggccatggagcatgattgctaccagc 35885461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 2 - 285
Target Start/End: Original strand, 19698902 - 19699185
Alignment:
Q  2 caagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggagat 101  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| || ||||||||||     
T  19698902 caagcagttcttgctaagccacgagtatccaccgggtgcttccaacaaagacaagaagaccctgagaagattggccagtaaattcttgctagatggagac 19699001  T
Q  102 attttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggga 201  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||    
T  19699002 attttgtacaagagaaactacaacatggtattgttaagatgtgttgatgaacgcgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggga 19699101  T
Q  202 cccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccagc 285  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19699102 cccatgctacagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccagc 19699185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 31032085 - 31031803
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31032085 tcaagcagttcttgctaagctgtaagtatccaccgggagcttccaacaaagacaagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggaga 31031986  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  31031985 tattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 31031886  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctacca 283  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31031885 acccatgctacagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatggccatggagcatgattgctacca 31031803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Original strand, 32443562 - 32443846
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32443562 tcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggaga 32443661  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  32443662 tattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtacctttggg 32443761  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccagc 285  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32443762 acccatgctacagggcatactatgtcaaggaagttgttacgggcaggttactactggatggccatggagcatgattgctaccagc 32443846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 29660819 - 29660536
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29660819 tcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgtcgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggaga 29660720  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  29660719 tattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcggagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 29660620  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccag 284  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29660619 acccatgctacagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatggccatggagcatgattgctaccag 29660536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 11106208 - 11105926
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11106208 tcaagcagttcttgctgagccgtgagtatccgctgggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccagtagattcctgttagatggaga 11106109  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  11106108 tattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 11106009  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctacca 283  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11106008 acccatgctacagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatggccatggagcatgattgctacca 11105926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 2 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 16620338 - 16620057
Alignment:
Q  2 caagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggagat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||  |||| ||| || ||||||| ||     
T  16620338 caagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaacaaagacaagaagaccctgagaagattggctggtaggttcttgttagatggggac 16620239  T
Q  102 attttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggga 201  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||    
T  16620238 attttgtacaaaagaaactacgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcggagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggga 16620139  T
Q  202 cccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctacca 283  Q
    |||| ||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16620138 cccacgctacggggcacactatgtcaagaaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctacca 16620057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Original strand, 4726041 - 4726325
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4726041 tcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgctgggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccagtagattcctgttagatggaga 4726140  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  4726141 tattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcggagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 4726240  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccagc 285  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4726241 acccatgctacagggcatactatgtcaaggaagttgttacgaggaggttactactggatggccatggagcatgattgctaccagc 4726325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 4792484 - 4792200
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4792484 tcaagcagttcttgcggagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggaga 4792385  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  4792384 tattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcggagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 4792285  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccagc 285  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4792284 acccatgctacagggcatactatgtcaaggaaattgttacaagcaggttactactggatggccatggagcatgattgctaccagc 4792200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 15736943 - 15736659
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15736943 tcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgctgggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccagtagattcctgttagatggaga 15736844  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  15736843 tattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 15736744  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccagc 285  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15736743 acccatgctacagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatggccatggagcatgattgctaccagc 15736659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Original strand, 21679114 - 21679398
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21679114 tcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccagtagattcctgttagatggaga 21679213  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  21679214 tattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcggagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 21679313  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccagc 285  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21679314 acccatgctacagggcatactatgtcgaggaagttgttacgggcaggttactactggatggccatggagcatgattgctaccagc 21679398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Original strand, 5715484 - 5715767
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5715484 tcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgtcgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggaga 5715583  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  5715584 tattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaggcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 5715683  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccag 284  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5715684 acccatgctacagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatggccatggagcatgattgctaccag 5715767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Original strand, 5726394 - 5726677
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5726394 tcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgtcgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggaga 5726493  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  5726494 tattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaggcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 5726593  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccag 284  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5726594 acccatgctacagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatggccatggagcatgattgctaccag 5726677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 5765974 - 5765691
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5765974 tcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgtcgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggaga 5765875  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  5765874 tattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaggcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 5765775  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccag 284  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5765774 acccatgctacagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatggccatggagcatgattgctaccag 5765691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Original strand, 6206315 - 6206598
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6206315 tcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccagtagattcctgttagatggaga 6206414  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  6206415 tattttgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcggagtagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 6206514  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccag 284  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  6206515 acccatgctacaggacatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatggccatggagtatgattgctaccag 6206598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Original strand, 10400555 - 10400838
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10400555 tcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgtcgggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccagtagattcctgttagatggaga 10400654  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||  ||||||| || ||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  10400655 tatcctgtacaagaggaactatgacatggtactgttaagatgtgttgatgaacatgaagcggagcagttaatgcatgatgtacatgatggtacctttggg 10400754  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccag 284  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10400755 acccatgctacagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatggccatggagcatgattgctaccag 10400838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 20572692 - 20572409
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  20572692 tcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccggtagattcctgttagatggaga 20572593  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  20572592 tattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcggaacagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 20572493  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccag 284  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20572492 acccatgctacagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatggccatggagcatgattgctaccag 20572409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Original strand, 48470338 - 48470621
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  48470338 tcaaacagttcttgctaagccgtgagtatccgccgggtacttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggaga 48470437  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||| |||    
T  48470438 tattctgtacaagagaaactatgacatggtattgctaagatgtgttgatgaacatgaagcggagcagttaatgcatgatgtacatgacggcaccttcggg 48470537  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccag 284  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  48470538 acccatgctacagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatggccatggagcatgattgctaccag 48470621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Original strand, 28343588 - 28343870
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  28343588 tcaagcagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccggtagattcctgttagatggaga 28343687  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  28343688 tattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcggagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 28343787  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctacca 283  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28343788 acccatgctacagggcatactatgtcgaggaagttgttgcgagcaggttactactggatggccatggagcatgattgctacca 28343870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Original strand, 4688066 - 4688350
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    || |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  4688066 tcaaacagttcttgctaagccgtgagtatccgtcgggtgcttccaaccaagataagaagaccctgagaagattgaccagtagattcctgttagacggaga 4688165  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  4688166 tattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 4688265  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccagc 285  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4688266 acccatgctacagggcatactatgtcaaggaagttgttacgggcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccagc 4688350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Original strand, 18335041 - 18335325
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  18335041 tcaaacagttcttgctaagccgtgagtatccgcctggtgcttccaaacaagacaagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatgggga 18335140  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| ||| |||    
T  18335141 tattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcggagcagttaatgcatgatgtacatgacggtatcttcggg 18335240  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccagc 285  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18335241 acccatgctacagggcatactatgtcgaggaagttgttacgggcaggttactactggatggccatggagcatgattgctaccagc 18335325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 6538591 - 6538308
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6538591 tcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgtcgggtgcttccaaacaagacaagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggaga 6538492  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  6538491 tattctgtacaagagaaactatgacatggtattattaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 6538392  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccag 284  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6538391 acccatgctacagggcatactatgtcaagaaagttgttacgagcaggttactactggatggccatggagcatgattgctaccag 6538308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Original strand, 8000971 - 8001254
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8000971 tcaagcagttcttgctgagccgtgagtatccgccaggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccagtagattcctgttagatggaga 8001070  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  8001071 tattctgtacaagagaaactacgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 8001170  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccag 284  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8001171 acccatgctacagggcatactatgtcaagaaagttgctacgggcaggttactactggatgactatggagcatgattgctaccag 8001254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Original strand, 10647484 - 10647767
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10647484 tcaagcagttcttgctgagccgtgagtatccgccaggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccagtagattcctgttagatggaga 10647583  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  10647584 tattctgtacaagagaaactacgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 10647683  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccag 284  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10647684 acccatgctacagggcatactatgtcaagaaagttgctacgggcaggttactactggatgactatggagcatgattgctaccag 10647767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 18288202 - 18287919
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||    || ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18288202 tcaagcagttcttgctgagccatgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccttgagaagattggccagtagattcctgttagatggaga 18288103  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  18288102 tattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 18288003  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccag 284  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18288002 acccatgctacagggcatactatgtcaagaaagttgttacgagcaggttactattggatggccatggagcatgattgctaccag 18287919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 18303503 - 18303220
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||    || ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18303503 tcaagcagttcttgctgagccatgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccttgagaagattggccagtagattcctgttagatggaga 18303404  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  18303403 tattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 18303304  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccag 284  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18303303 acccatgctacagggcatactatgtcaagaaagttgttacgagcaggttactattggatggccatggagcatgattgctaccag 18303220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Original strand, 47027864 - 47028147
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  47027864 tcaaacagttcttgctaagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccggtagattcctgttagatggaga 47027963  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| || ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  47027964 tattctgtacaagaggaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcggaacagttagtgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 47028063  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccag 284  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  47028064 acccatgctacagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatggccatggagcatgattgctaccag 47028147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Original strand, 18055673 - 18055957
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18055673 tcaaacagttcttgctgagtcgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccagtagattcctgttagatggaga 18055772  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  18055773 tattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 18055872  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccagc 285  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18055873 acccatgctacagggcatactatgtcaaggaagttgctacgggcaggttactactggatggccatggagcatgattgctaccagc 18055957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Original strand, 20070451 - 20070735
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20070451 tcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgtcgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggaga 20070550  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| |||||||  |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||    
T  20070551 tattctgtacaagagaaactatgacatggtgttgttaagatgtgtcgatgaacatgaagcggagcagttaatgcatgatgtacatgatggtaccttcggg 20070650  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccagc 285  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20070651 acccatgctacaaggcatactatgtcaaggaagttgttgcgagcaggttactactggatggccatggagcatgattgctaccagc 20070735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 22383427 - 22383143
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22383427 tcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccaggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccagtagattcctgttagatggaga 22383328  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||     
T  22383327 tattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagaacagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcgga 22383228  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccagc 285  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22383227 acccatgctacagggcatactatgtcaaggaaattgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccagc 22383143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Original strand, 7077617 - 7077900
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    |||||||||||| || |||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||    
T  7077617 tcaagcagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggctagtagatttctgttagatgggga 7077716  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  7077717 tattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 7077816  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccag 284  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7077817 acccatgctacagggcatactatgtcaaggaagttgttacgggcaggttactactggatggccatggagcatgattgctaccag 7077900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 5592206 - 5591924
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||    || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  5592206 tcaagcagttcttgctaagccgcgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccggtagattcctgttagatggaga 5592107  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| || ||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  5592106 tattctgtacaagaggaactatgacatggtgttgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 5592007  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctacca 283  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5592006 acccatgctacagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatggccatggagcatgattgctacca 5591924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 17972705 - 17972427
Alignment:
Q  6 cagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggagatattt 105  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||     
T  17972705 cagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccccgagaagattggccagcagatttctgttagatggagatatta 17972606  T
Q  106 tgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttgggaccca 205  Q
    ||||||| |||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||    
T  17972605 tgtacaagagaaactatgacatggtgttgttaagatgtgttgatgagcatgaagcggagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcgggaccca 17972506  T
Q  206 tgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccag 284  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17972505 tgctacagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatggccatggagcatgattgctaccag 17972427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Original strand, 5471399 - 5471683
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||    || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  5471399 tcaagcagttcttgctaagccgcgaatatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccggtagattcctgttagatggaga 5471498  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| || ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  5471499 tattctgtacaagaggaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttgatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 5471598  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccagc 285  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5471599 acccatgctacagggcatactatgtcaagaaagttgttacgagcaggttactactggatggccatggagcatgattgctaccagc 5471683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 8285319 - 8285035
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8285319 tcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccaggtgcttccaaccaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggaga 8285220  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||  ||||||| | |||||| |||    
T  8285219 tattctgtacaagagaaattatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttgatgcatgatgtacatgacgttaccttcggg 8285120  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccagc 285  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8285119 acccatgctacagggcatactatgtcaagaaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccagc 8285035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 15888554 - 15888270
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    || |||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15888554 tcaaacagttcttgctaagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaccaagataagaagaccctgagcagattggccagtagattcctgttagatggaga 15888455  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| |||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||  ||||||| |||||||| |||    
T  15888454 tattctgtacaagagaaactatgacatagtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgtatgatgtacatgacggtaccttcggg 15888355  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccagc 285  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15888354 acccatgctacagggcacactatgtcaaggaagttgttacgggcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctatcagc 15888270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 29144605 - 29144321
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||    || |||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29144605 tcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccaggtgcttccaaacaagataagaagaccctgaggagattggccagtagattcctgttagatggaga 29144506  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  29144505 tattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcaattaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 29144406  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccagc 285  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29144405 acccatgctacagggcatactatgtcaaggaagttgttgcgagcaggttactactggatggccatggagcatgattgctaccagc 29144321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Original strand, 4421326 - 4421609
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4421326 tcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccagtagattcctgttagatggaga 4421425  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  4421426 tattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 4421525  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccag 284  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4421526 acccatgctacagggcatactatgtcaagaaagttgctacgggcaggttactattggatgactatggagcatgattgctaccag 4421609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 17980798 - 17980515
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  17980798 tcaagcagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccggtagattcctgttagatggaga 17980699  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| || ||||  |||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  17980698 tattctgtacaagaggaactatgacatggtattgataaggtgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 17980599  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccag 284  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17980598 acccatgctacagggcatactatgtcaagaaagttgttacgagcaggttattactggatgaccatggagcatgattgctaccag 17980515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Original strand, 18229607 - 18229890
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  18229607 tcaagcagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccggtagattcctgttagatggaga 18229706  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| || ||||  |||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  18229707 tattctgtacaagaggaactatgacatggtattgataaggtgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 18229806  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccag 284  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18229807 acccatgctacagggcatactatgtcaagaaagttgttacgagcaggttattactggatgaccatggagcatgattgctaccag 18229890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Original strand, 51786434 - 51786717
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  51786434 tcaagcagttcttgctgagccgtgagtatccgccaggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggaga 51786533  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
     ||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  51786534 gattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 51786633  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccag 284  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  51786634 acccatgctacagggcatactatgtcaagaaagttgttacgagcaggttattactggatggctatggagcatgattgctaccag 51786717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Original strand, 32295039 - 32295321
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||    || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32295039 tcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgcctggtgcttccaaacaagataagaagaccctaagaagattggccagtagattcctgttagatggaga 32295138  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  32295139 tattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 32295238  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctacca 283  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32295239 acccatgctacagggcatactatgtcaagaaagttgctacgggcaggttactactggatggccatggagcatgattgctacca 32295321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 28111803 - 28111523
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  28111803 tcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccggttgcttccaaacaagacaagaagaccctgagaagattggccagcagattcctgttagatggaga 28111704  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  28111703 tattctgtacaagagaaactatgacatggtgttgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 28111604  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctac 281  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||    
T  28111603 acccatgctacagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactattggatggccatggaacatgattgctac 28111523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Original strand, 18247152 - 18247435
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||    |||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  18247152 tcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccgagtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccggtagattcctgttagatggaga 18247251  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  18247252 tattttgtacaagaggaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaggcggagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 18247351  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccag 284  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18247352 acccatgctacagggcatactatgtcaagaaagttgctacgggcaggttactactggatgactatggagcatgattgctaccag 18247435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Original strand, 28025692 - 28025974
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    |||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||    
T  28025692 tcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccggtagattcctgttagatgggga 28025791  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| || ||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  28025792 tattctgtacaagaggaactatgacatggtactgttaagatgtgttgatgaacatgaagcggagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 28025891  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctacca 283  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28025892 acccatgctacagggcatactatgtcgaggaagttgttacgggcaggttactactggatggccatggagcatgattgctacca 28025974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Original strand, 24332574 - 24332858
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||    |||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  24332574 tcaagcagttcttgctaagccgcgaatatccgccgggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccggtagattcctgttagatggaga 24332673  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| || ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  24332674 tattctgtacaagaggaactatgacatggtattgttaaggtgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 24332773  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccagc 285  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24332774 acccatgctacagggcatactatgtcaagaaagttgctacgggcaggttactactggatggccatggagcatgattgctaccagc 24332858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Original strand, 5018125 - 5018408
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||    || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  5018125 tcaaacagttcttgctgagccatgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccggtagattcctgttagatggaga 5018224  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| || ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  |||| || |||||||| |||    
T  5018225 tattctgtacaagaggaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgtacacgacggtaccttcggg 5018324  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccag 284  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  5018325 acccatgctacagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttattactggatggctatggagcatgattgctaccag 5018408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Original strand, 4628196 - 4628480
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||   ||| | |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  4628196 tcaaacagttcttgctgagtcgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaggataggaagaccctgagaagattggccggtagattcctgttagatggaga 4628295  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| || ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  4628296 tattctgtacaagaggaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcaattaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 4628395  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccagc 285  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4628396 acccatgctacagggcatactatgtcaagaaagttgctacgggcaggttactactggatggccatggagcatgattgctaccagc 4628480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 4342525 - 4342242
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||    |||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  4342525 tcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgtcgggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccggtagattcctgttagatggaga 4342426  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| || ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  4342425 tattctgtacaagaggaactatgacatggtattgttaaggtgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 4342326  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccag 284  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4342325 acccatgctacagggcatactatgtcaagaaagttgctacgggcaggttactactggatgactatggagcatgattgctaccag 4342242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 22866697 - 22866414
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||    |||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  22866697 tcaagcagttcttgctgagccgtgagtatccgccaggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccggtagattcctgttagatagaga 22866598  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| || ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  22866597 tattctgtacaagaggaactatgacatggtattgttaaggtgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 22866498  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccag 284  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22866497 acccatgctacagggcatactatgtcaagaaagttgctacgggcaggttactactggatgactatggagcatgattgctaccag 22866414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 22881756 - 22881473
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||    |||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  22881756 tcaagcagttcttgctgagccgtgagtatccgccaggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccggtagattcctgttagatagaga 22881657  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| || ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  22881656 tattctgtacaagaggaactatgacatggtattgttaaggtgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 22881557  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccag 284  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22881556 acccatgctacagggcatactatgtcaagaaagttgctacgggcaggttactactggatgactatggagcatgattgctaccag 22881473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 31960304 - 31960021
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  31960304 tcaagcagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccggtagattcctgttagatggaga 31960205  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| || ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  31960204 tattctgtacaagaggaactatgacatggtattgttaaggtgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 31960105  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccag 284  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  31960104 acccatgctacagggcatactatgtcaagaaagttgctacgggcaggttattactggatggctatggagcatgattgctaccag 31960021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 5605163 - 5604881
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  5605163 tcaagcagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccggtagattcctgttagatggaga 5605064  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| || ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  5605063 tattctgtacaagaggaactatgacatggtattgttaaggtgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 5604964  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctacca 283  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  5604963 acccatgctacagggcatactatgtcaagaaagttgctacgggcaggttattactggatggctatggagcatgattgctacca 5604881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 81 - 285
Target Start/End: Original strand, 5656625 - 5656829
Alignment:
Q  81 agattcctgatagatggagatattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgaca 180  Q
    |||||| || |||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||      
T  5656625 agattcttgctagatggaaacattttgtacaagagaaactacgacatgatattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatg 5656724  T
Q  181 tacatgatggtacctttgggacccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgcta 280  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5656725 tacatgacggtaccttcgggacccatgctacagggcatactatgtcaaggaagctgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgcta 5656824  T
Q  281 ccagc 285  Q
    |||||    
T  5656825 ccagc 5656829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 181 - 285
Target Start/End: Original strand, 8216225 - 8216329
Alignment:
Q  181 tacatgatggtacctttgggacccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgcta 280  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8216225 tacatgacggtaccttcgggacccatgctacagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatggccatggagcatgattgcta 8216324  T
Q  281 ccagc 285  Q
    |||||    
T  8216325 ccagc 8216329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 86
Target Start/End: Original strand, 5654496 - 5654581
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattc 86  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  5654496 tcaaacagttcttgctaagccgtgagtatccgccgggtgcttccaacaaagacaagaagaccctgagaagattggccggtagattc 5654581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 81
Target Start/End: Original strand, 8216146 - 8216226
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagta 81  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||    |||||||||||| || |||||||||||||||    
T  8216146 tcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgtcgggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccagta 8216226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 196; Significance: 1e-107; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Original strand, 17032 - 17315
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17032 tcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagtagattcctgttagatggaga 17131  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  17132 tattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 17231  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccag 284  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17232 acccatgctacagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatggccatggagcatgattgctaccag 17315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 191; Significance: 1e-104; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Original strand, 14021 - 14303
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||    || |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  14021 tcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgcctggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccagcagattcctgttagatggaga 14120  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  14121 tattctgtacaaaagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcggagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 14220  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctacca 283  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14221 acccatgctacagggcatactatgtcaaagaagttgttacgagcaggttactactggatggccatggagcatgattgctacca 14303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0418 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0418
Description:

Target: scaffold0418; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Original strand, 10486 - 10770
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10486 tcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgtcgggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccagtagattcctgttagatggaga 10585  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||     
T  10586 tattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtacctttgga 10685  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccagc 285  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10686 acccatgctacagggcatactatgtcaaggaagttgttgcgagcaggttactactggatggccatggagcatgattgctaccagc 10770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Original strand, 23566 - 23848
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||| |||||||||| ||||| ||| || ||||||| ||    
T  23566 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaacaaagacaagaagactctgagaagattggctagtaggttcttgttagatgggga 23665  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
     ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| || || || ||||| |||||||||||| ||||||| ||||| || |||    
T  23666 cattttgtacaaaagaaactacaacatggtattgttaagatgtgttgatgagcatgaggcagagcaattaatgcatgacgtacatgacggtactttcggg 23765  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctacca 283  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23766 acccatgctacagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagccggttactactggatgaccatggagcatgattgctacca 23848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0144 (Bit Score: 184; Significance: 1e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0144
Description:

Target: scaffold0144; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 21997 - 21714
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    || |||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  21997 tcaagcagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattgaccggtagattcctgttagatggaga 21898  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| || ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  21897 tattctgtacaagaggaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 21798  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccag 284  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21797 acccatgctacagggcatactatgtcaaggaagttgttacgggcaggttactactggatggccatggagcatgattgctaccag 21714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 181; Significance: 8e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Original strand, 4517 - 4801
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  4517 tcaaacagttcttgctgagccgtgagtatccgccaggtgcttccaaccaagacaagaagaccctgagaagattggccagtagattcatgttagatggaga 4616  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  4617 tattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacataaagcggagcagttgatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 4716  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccagc 285  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4717 acccatgctacagggcatactatgtcaaggaagctgttacgggcagggtactactggatgaccatggagcatgattgctaccagc 4801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 180; Significance: 3e-97; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 10734 - 10451
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||    || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  10734 tcaagcagttcttgctgagccgtgagtatccgccaggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccggtagattcctgttagatggaga 10635  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| || ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  10634 tattctgtacaagaggaactatgacatggtattgttaaggtgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 10535  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccag 284  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10534 acccatgctacagggcatactatgtcaaggaagttgttacgggcaggttactactggatggccatggagcatgattgctaccag 10451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 179; Significance: 1e-96; HSPs: 2)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Original strand, 10495 - 10777
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||| ||| |||||||||| ||||| ||| || ||||||||||    
T  10495 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccgccgggtgcttccaactaagacaagaagactctgagaagattggctagtaggttcttgttagatggaga 10594  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| || |||    
T  10595 tattctgtataaaagaaactacgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcggagcagttaatgcatgacgtacacgacggtactttcggg 10694  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctacca 283  Q
    ||||| ||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10695 acccacgctacggggcacactatgtcaagaaagttgttacgagcaggttactactggaggaccatggagcatgattgctacca 10777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322; HSP #2
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Original strand, 108 - 391
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||    |||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  108 tcaagcagttcttgctgagccgtgagtatccgccaggtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccggtagattcctgttagatggaga 207  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| || ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  208 tattctgtacaagaggaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 307  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccag 284  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  308 acccatgctacagggcatactatgtcaagaaagttgctacgggcaggttactactggatgactatggagcatgattgctaccag 391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 176; Significance: 7e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Original strand, 10472 - 10755
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  10472 tcaagcagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccggtagattcctgttagatggaga 10571  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgtt-aagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttgg 199  Q
    |||| ||||||| || ||||  ||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||    
T  10572 tattctgtacaagaggaactatgacatggtattatttaagatgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcgg 10671  T
Q  200 gacccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctacca 283  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10672 gacccatgctacagggcatactatgtcaaggaagttgttacgggcaggttactactggatggccatggagcatgattgctacca 10755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 168; Significance: 4e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Original strand, 12399 - 12682
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||| ||||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||||||    |||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  12399 tcaaacagttcttgccgagccgtgagtatccgccgagtgcttccaaacaagacaagaagaccttgagaagattggccggtagattcctgttagatggaga 12498  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  12499 tattctgtacaagagaaactatgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacatgaggcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 12598  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccag 284  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12599 acccatgctacagggcatactatgtcaagaaagttgctacgggcaggttactactggatgactatggagcatgattgctaccag 12682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 160; Significance: 3e-85; HSPs: 4)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 4985 - 4702
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| |||||||    || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  4985 tcaagcagttcttgctgagccgtgagtatccgccaggtacttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccggtagattcctgttagatggaga 4886  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| || ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  4885 tattctgtacaagaggaactatgacatggtattgttaaggtgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 4786  T
Q  201 acccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccag 284  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  4785 acccatgctacagggcatactatgtcaagaaagttgctacgggcaggttattactggatggctatggagcatgattgctaccag 4702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #2
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 54 - 283
Target Start/End: Original strand, 24076 - 24305
Alignment:
Q  54 aagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggagatattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaac 153  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| || ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24076 aagaagaccctgagaagattggccggtagattcctgttagatggagatattctgtacaagaggaactatgacatggtattgttaaggtgtgttgatgaac 24175  T
Q  154 acgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttgggacccatgctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttacta 253  Q
    | ||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||    
T  24176 atgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcgggacccatgctacagggcatactatgtcaagaaagttgctacgggcaggttatta 24275  T
Q  254 ctggatgaccatggagcatgattgctacca 283  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  24276 ctggatggctatggagcatgattgctacca 24305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #3
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 11979 - 11774
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  11979 tcaagcagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccggtagattcctgttagatggaga 11880  T
Q  101 tattttgtacaaaagaaactgcgacatggtattgttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttggg 200  Q
    |||| ||||||| || ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  11879 tattctgtacaagaggaactatgacatggtattgttaaggtgtgttgatgaacatgaagcagagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcggg 11780  T
Q  201 acccat 206  Q
    ||||||    
T  11779 acccat 11774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #4
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 9823 - 9712
Alignment:
Q  1 tcaagcagttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggaga 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  9823 tcaagcagttcttgctgagccgtgagtatccgccgggtgcttccaaacaagataagaagaccctgagaagattggccggtagattcctgttagatggaga 9724  T
Q  101 tattttgtacaa 112  Q
    |||| |||||||    
T  9723 tattctgtacaa 9712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0547 (Bit Score: 119; Significance: 8e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0547
Description:

Target: scaffold0547; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 135 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 11262 - 11112
Alignment:
Q  135 ttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaatgcatgacatacatgatggtacctttgggacccatgctatagggcatactatgtcaaggaagt 234  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11262 ttaagatgtgttgatgaacatgaagcggagcagttaatgcatgatgtacatgacggtaccttcgggacccatgctacagggcatactatgtcaaggaagt 11163  T
Q  235 tgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccagc 285  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11162 tgttacgggcaggttactactggatggccatggagcatgattgctaccagc 11112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 98; Significance: 3e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 9 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 42479 - 42294
Alignment:
Q  9 ttcttgctaagccgtgagtatccaccgggtgcttccaatagggacaagaagaccctgggaagattggccagtagattcctgatagatggagatattttgt 108  Q
    |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||    
T  42479 ttcttgctgagccgtgagtatccgccaggtgcttccaaccaagacaagaagaccctgagaagattggccagtagattcatgttagatggagatattctgt 42380  T
Q  109 acaaaagaaactgcgacatggtattg-ttaagatgtgttgatgaacacgaagcggagcagttaa-tgcatgacatacatgatggta 192  Q
    |||| |||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  ||||||| ||||    
T  42379 acaagagaaactatgacatggtattgtttaagatgtgttgatgaacacgaagcagagcagttaattgcatgatgtacatgacggta 42294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 207 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 26499 - 26421
Alignment:
Q  207 gctatagggcatactatgtcaaggaagttgttacgagcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccagc 285  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26499 gctacagggcatactatgtcaaggaagttgttacgggcaggttactactggatgaccatggagcatgattgctaccagc 26421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University