View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF9839A_low_197 (Length: 284)

Name: NF9839A_low_197
Description: NF9839A
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF9839A_low_197
NF9839A_low_197
[»] chr3 (76 HSPs)
chr3 (6-284)||(13943959-13944237)
chr3 (6-284)||(44779182-44779460)
chr3 (17-284)||(41179457-41179724)
chr3 (6-284)||(8745306-8745584)
chr3 (6-284)||(16378845-16379122)
chr3 (6-284)||(11959085-11959363)
chr3 (8-284)||(24189239-24189515)
chr3 (6-284)||(18132262-18132540)
chr3 (6-284)||(31940838-31941116)
chr3 (11-284)||(11949829-11950102)
chr3 (6-284)||(31693101-31693379)
chr3 (8-284)||(17188309-17188585)
chr3 (6-284)||(10407903-10408181)
chr3 (6-284)||(12358443-12358721)
chr3 (20-284)||(10417975-10418239)
chr3 (6-284)||(28756253-28756532)
chr3 (6-284)||(47125879-47126157)
chr3 (6-282)||(12180281-12180557)
chr3 (6-284)||(13318418-13318696)
chr3 (6-276)||(16826197-16826467)
chr3 (6-284)||(20059981-20060259)
chr3 (6-284)||(10007525-10007803)
chr3 (6-284)||(10908135-10908413)
chr3 (6-284)||(12888634-12888912)
chr3 (6-284)||(13254615-13254893)
chr3 (6-276)||(13970036-13970306)
chr3 (6-284)||(15346172-15346450)
chr3 (6-284)||(15587319-15587597)
chr3 (6-284)||(16637698-16637976)
chr3 (6-284)||(43164600-43164878)
chr3 (6-279)||(26791340-26791613)
chr3 (6-276)||(12510399-12510669)
chr3 (6-276)||(14088616-14088886)
chr3 (6-284)||(15713983-15714261)
chr3 (7-284)||(16804875-16805152)
chr3 (7-208)||(17493657-17493858)
chr3 (6-284)||(16694089-16694367)
chr3 (6-284)||(24185115-24185393)
chr3 (6-284)||(48427372-48427650)
chr3 (23-284)||(5108555-5108816)
chr3 (6-282)||(12272275-12272551)
chr3 (6-284)||(3687868-3688146)
chr3 (6-284)||(5422857-5423135)
chr3 (23-261)||(12844047-12844285)
chr3 (6-284)||(6602661-6602939)
chr3 (6-276)||(14291448-14291718)
chr3 (6-279)||(15229543-15229816)
chr3 (6-279)||(15235411-15235684)
chr3 (6-284)||(15400444-15400722)
chr3 (6-284)||(53382945-53383223)
chr3 (23-277)||(17491782-17492036)
chr3 (6-284)||(16754628-16754906)
chr3 (6-132)||(16832444-16832570)
chr3 (6-183)||(14575022-14575199)
chr3 (11-273)||(15013688-15013950)
chr3 (6-284)||(15358008-15358286)
chr3 (23-284)||(15261555-15261816)
chr3 (6-284)||(18437065-18437343)
chr3 (6-284)||(14579335-14579613)
chr3 (59-284)||(30139741-30139966)
chr3 (59-284)||(30149292-30149517)
chr3 (97-284)||(13965370-13965557)
chr3 (97-284)||(15612038-15612225)
chr3 (129-270)||(16834554-16834695)
chr3 (97-284)||(15948488-15948675)
chr3 (6-117)||(16327625-16327736)
chr3 (22-168)||(12071015-12071161)
chr3 (14-284)||(11888289-11888559)
chr3 (59-284)||(6150833-6151058)
chr3 (132-233)||(13304298-13304399)
chr3 (97-284)||(8272417-8272604)
chr3 (6-108)||(14874495-14874597)
chr3 (97-284)||(17200569-17200756)
chr3 (117-284)||(25768253-25768420)
chr3 (164-284)||(16327734-16327854)
chr3 (137-213)||(14874600-14874676)
[»] chr8 (55 HSPs)
chr8 (6-284)||(31568974-31569252)
chr8 (6-284)||(21323410-21323688)
chr8 (6-284)||(22053235-22053512)
chr8 (6-276)||(16269355-16269625)
chr8 (9-284)||(27356908-27357183)
chr8 (6-284)||(28983283-28983561)
chr8 (6-284)||(28988502-28988780)
chr8 (6-279)||(19984557-19984830)
chr8 (7-284)||(21164670-21164947)
chr8 (17-279)||(29301568-29301830)
chr8 (6-284)||(15535755-15536033)
chr8 (20-284)||(22042199-22042463)
chr8 (6-284)||(17672153-17672432)
chr8 (6-284)||(19980339-19980617)
chr8 (6-284)||(20016394-20016672)
chr8 (6-284)||(30311275-30311553)
chr8 (6-284)||(32602517-32602795)
chr8 (6-279)||(20390463-20390736)
chr8 (6-282)||(21927802-21928078)
chr8 (6-284)||(22118306-22118584)
chr8 (6-279)||(22373245-22373519)
chr8 (6-284)||(22127090-22127368)
chr8 (23-284)||(22522918-22523179)
chr8 (20-284)||(22030475-22030739)
chr8 (74-282)||(31414668-31414876)
chr8 (71-282)||(23657301-23657512)
chr8 (6-284)||(18858949-18859227)
chr8 (9-284)||(22131175-22131450)
chr8 (124-282)||(22060928-22061086)
chr8 (23-284)||(22422040-22422301)
chr8 (6-278)||(19482203-19482475)
chr8 (6-284)||(19864224-19864502)
chr8 (6-225)||(19114831-19115050)
chr8 (6-284)||(21391992-21392270)
chr8 (6-284)||(21781318-21781596)
chr8 (6-284)||(21786486-21786764)
chr8 (6-284)||(21253316-21253594)
chr8 (50-284)||(22375628-22375862)
chr8 (56-278)||(22246614-22246836)
chr8 (7-130)||(22028412-22028535)
chr8 (101-284)||(4984414-4984597)
chr8 (59-284)||(20650539-20650764)
chr8 (97-284)||(16875317-16875504)
chr8 (71-284)||(23887400-23887613)
chr8 (7-255)||(20394265-20394513)
chr8 (23-284)||(22989417-22989678)
chr8 (68-284)||(21848530-21848746)
chr8 (59-279)||(23902541-23902761)
chr8 (97-279)||(21194762-21194944)
chr8 (59-284)||(16414463-16414688)
chr8 (59-284)||(22436675-22436900)
chr8 (104-284)||(23155271-23155451)
chr8 (59-284)||(24932008-24932233)
chr8 (197-284)||(21782742-21782829)
chr8 (56-283)||(19870066-19870293)
[»] chr5 (49 HSPs)
chr5 (6-284)||(17267204-17267482)
chr5 (20-284)||(22464171-22464435)
chr5 (6-284)||(25850295-25850573)
chr5 (6-284)||(14884861-14885139)
chr5 (6-284)||(37541251-37541529)
chr5 (6-284)||(22504899-22505177)
chr5 (6-284)||(24796267-24796545)
chr5 (6-284)||(28892812-28893090)
chr5 (6-284)||(28921638-28921916)
chr5 (26-284)||(20823673-20823931)
chr5 (6-284)||(20344502-20344780)
chr5 (6-284)||(27520644-27520922)
chr5 (23-284)||(23473465-23473726)
chr5 (6-284)||(16358740-16359018)
chr5 (6-284)||(27666360-27666638)
chr5 (6-284)||(34568732-34569010)
chr5 (6-279)||(18781357-18781630)
chr5 (6-284)||(19772198-19772476)
chr5 (6-284)||(29473943-29474221)
chr5 (6-284)||(37289366-37289644)
chr5 (6-284)||(40711018-40711296)
chr5 (6-284)||(41773080-41773358)
chr5 (20-284)||(14997623-14997887)
chr5 (56-284)||(20778133-20778361)
chr5 (6-284)||(22136906-22137184)
chr5 (6-284)||(27683270-27683548)
chr5 (6-279)||(22233790-22234063)
chr5 (6-276)||(21676704-21676974)
chr5 (6-278)||(21561895-21562167)
chr5 (6-284)||(22330757-22331035)
chr5 (6-284)||(22350157-22350435)
chr5 (6-164)||(23078775-23078933)
chr5 (7-284)||(27612592-27612869)
chr5 (23-284)||(21337181-21337442)
chr5 (23-284)||(26736614-26736875)
chr5 (5-199)||(21984046-21984240)
chr5 (6-284)||(25428671-25428949)
chr5 (6-284)||(20465969-20466247)
chr5 (14-216)||(23564046-23564248)
chr5 (59-284)||(21935111-21935336)
chr5 (59-284)||(23507904-23508129)
chr5 (59-284)||(24583430-24583655)
chr5 (6-273)||(21409383-21409650)
chr5 (6-171)||(20802948-20803113)
chr5 (8-133)||(694-819)
chr5 (150-279)||(20250298-20250427)
chr5 (141-197)||(21625475-21625531)
chr5 (176-240)||(20801673-20801737)
chr5 (176-224)||(21220560-21220608)
[»] chr2 (42 HSPs)
chr2 (6-284)||(27789677-27789955)
chr2 (6-284)||(12576290-12576568)
chr2 (7-284)||(19717246-19717523)
chr2 (6-284)||(23278713-23278991)
chr2 (29-282)||(19650301-19650554)
chr2 (8-284)||(23098248-23098524)
chr2 (8-284)||(31832595-31832871)
chr2 (6-284)||(1065688-1065966)
chr2 (6-282)||(25255858-25256133)
chr2 (6-284)||(9337519-9337797)
chr2 (6-284)||(9486153-9486431)
chr2 (6-284)||(23073800-23074078)
chr2 (6-284)||(24264307-24264585)
chr2 (6-284)||(24711971-24712249)
chr2 (6-284)||(27219953-27220231)
chr2 (6-284)||(44383798-44384076)
chr2 (6-284)||(24677426-24677702)
chr2 (6-284)||(10870787-10871065)
chr2 (6-284)||(27373206-27373484)
chr2 (6-284)||(22734002-22734280)
chr2 (20-284)||(24705724-24705988)
chr2 (6-284)||(16927297-16927575)
chr2 (6-284)||(17000937-17001215)
chr2 (6-284)||(21323494-21323772)
chr2 (20-284)||(23105970-23106234)
chr2 (7-279)||(23112681-23112953)
chr2 (20-284)||(41606627-41606891)
chr2 (6-261)||(23204274-23204529)
chr2 (6-284)||(24874978-24875256)
chr2 (6-284)||(21143269-21143547)
chr2 (6-210)||(30010412-30010616)
chr2 (97-284)||(22280042-22280229)
chr2 (68-284)||(24829478-24829694)
chr2 (59-279)||(25130551-25130771)
chr2 (14-168)||(24818076-24818230)
chr2 (6-145)||(24657886-24658024)
chr2 (6-135)||(16983326-16983455)
chr2 (62-273)||(30209201-30209412)
chr2 (6-135)||(16924063-16924192)
chr2 (97-279)||(24567987-24568169)
chr2 (97-284)||(22759890-22760075)
chr2 (176-284)||(24818628-24818736)
[»] chr7 (55 HSPs)
chr7 (6-284)||(18051628-18051906)
chr7 (6-284)||(14139975-14140253)
chr7 (11-284)||(15342727-15343000)
chr7 (6-284)||(13023653-13023931)
chr7 (7-280)||(12458940-12459213)
chr7 (8-284)||(11386106-11386382)
chr7 (6-284)||(26092473-26092751)
chr7 (6-284)||(11300888-11301166)
chr7 (6-280)||(13675752-13676025)
chr7 (6-284)||(13966343-13966621)
chr7 (6-284)||(14284049-14284329)
chr7 (14-282)||(15100286-15100554)
chr7 (6-282)||(16948147-16948423)
chr7 (6-284)||(26116265-26116543)
chr7 (6-284)||(49154597-49154875)
chr7 (6-243)||(21754749-21754986)
chr7 (6-279)||(14261920-14262193)
chr7 (6-284)||(15158754-15159032)
chr7 (6-284)||(8709900-8710178)
chr7 (6-284)||(10872985-10873263)
chr7 (6-284)||(13688336-13688614)
chr7 (6-284)||(14334691-14334969)
chr7 (6-284)||(18587868-18588146)
chr7 (6-276)||(19614979-19615249)
chr7 (6-284)||(11550799-11551077)
chr7 (6-284)||(16727080-16727358)
chr7 (6-284)||(17704152-17704430)
chr7 (6-284)||(44789048-44789326)
chr7 (6-284)||(11234910-11235188)
chr7 (6-284)||(14956849-14957127)
chr7 (6-284)||(16069972-16070250)
chr7 (6-279)||(12204475-12204748)
chr7 (23-284)||(15146598-15146859)
chr7 (6-284)||(9590663-9590941)
chr7 (6-284)||(12689797-12690075)
chr7 (23-276)||(14041998-14042251)
chr7 (23-276)||(14352028-14352281)
chr7 (6-284)||(18180040-18180318)
chr7 (27-240)||(12799239-12799452)
chr7 (23-284)||(11770116-11770377)
chr7 (6-284)||(15626820-15627098)
chr7 (6-284)||(48812949-48813227)
chr7 (200-284)||(23503739-23503823)
chr7 (59-284)||(7826195-7826420)
chr7 (7-168)||(14150133-14150294)
chr7 (59-284)||(27105524-27105749)
chr7 (59-284)||(27172576-27172801)
chr7 (97-284)||(13379178-13379365)
chr7 (131-276)||(15172-15317)
chr7 (88-284)||(13458330-13458526)
chr7 (97-284)||(4442223-4442409)
chr7 (97-259)||(38934-39096)
chr7 (6-50)||(12799176-12799220)
chr7 (6-44)||(19149547-19149585)
chr7 (6-44)||(20748946-20748984)
[»] chr4 (41 HSPs)
chr4 (6-284)||(51604480-51604758)
chr4 (6-284)||(1646965-1647243)
chr4 (6-284)||(3262482-3262760)
chr4 (6-236)||(20892385-20892615)
chr4 (6-284)||(29451225-29451503)
chr4 (6-284)||(11204920-11205198)
chr4 (6-284)||(44659554-44659832)
chr4 (11-284)||(27902692-27902964)
chr4 (11-282)||(16150019-16150290)
chr4 (11-282)||(16154165-16154436)
chr4 (6-284)||(16251278-16251556)
chr4 (6-284)||(23958053-23958331)
chr4 (6-284)||(27713642-27713920)
chr4 (6-282)||(15356808-15357084)
chr4 (6-284)||(8388718-8388996)
chr4 (6-284)||(19776221-19776499)
chr4 (21-278)||(15145336-15145593)
chr4 (8-279)||(15258238-15258509)
chr4 (6-284)||(8051051-8051329)
chr4 (6-284)||(12478906-12479184)
chr4 (6-284)||(14301407-14301685)
chr4 (6-284)||(16234420-16234698)
chr4 (6-284)||(17092577-17092855)
chr4 (10-279)||(15072670-15072939)
chr4 (6-284)||(14682873-14683151)
chr4 (6-276)||(15001053-15001323)
chr4 (6-284)||(40475346-40475624)
chr4 (6-279)||(14696424-14696697)
chr4 (9-279)||(8708218-8708488)
chr4 (6-284)||(18224874-18225152)
chr4 (6-284)||(22632010-22632284)
chr4 (6-284)||(16352958-16353236)
chr4 (23-282)||(16218538-16218797)
chr4 (23-282)||(16221858-16222117)
chr4 (71-284)||(23443411-23443624)
chr4 (21-284)||(14161776-14162039)
chr4 (47-284)||(14848835-14849072)
chr4 (59-284)||(15290899-15291124)
chr4 (6-113)||(19634613-19634720)
chr4 (173-284)||(12340721-12340831)
chr4 (97-254)||(18547398-18547555)
[»] scaffold0348 (2 HSPs)
scaffold0348 (6-284)||(5540-5818)
scaffold0348 (6-284)||(18174-18452)
[»] scaffold0010 (3 HSPs)
scaffold0010 (6-284)||(45118-45396)
scaffold0010 (6-284)||(40024-40302)
scaffold0010 (23-284)||(4251-4511)
[»] scaffold0114 (3 HSPs)
scaffold0114 (12-284)||(22211-22483)
scaffold0114 (6-282)||(39395-39671)
scaffold0114 (6-284)||(18032-18310)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (8-282)||(99255-99529)
scaffold0020 (6-213)||(175399-175601)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (6-284)||(262561-262839)
[»] scaffold0058 (3 HSPs)
scaffold0058 (6-283)||(21458-21735)
scaffold0058 (116-273)||(27049-27206)
scaffold0058 (174-253)||(76791-76870)
[»] scaffold0046 (2 HSPs)
scaffold0046 (6-284)||(79522-79800)
scaffold0046 (6-270)||(60088-60352)
[»] scaffold0420 (2 HSPs)
scaffold0420 (6-284)||(980-1258)
scaffold0420 (6-284)||(7949-8227)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (6-284)||(31010-31288)
[»] scaffold0072 (1 HSPs)
scaffold0072 (6-284)||(53382-53660)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (6-282)||(250959-251235)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (6-284)||(1236-1514)
[»] chr6 (58 HSPs)
chr6 (6-283)||(14377749-14378026)
chr6 (23-284)||(10466699-10466960)
chr6 (23-284)||(18796860-18797121)
chr6 (6-284)||(24366582-24366860)
chr6 (6-284)||(21567824-21568102)
chr6 (9-282)||(19455196-19455468)
chr6 (6-284)||(15461506-15461784)
chr6 (14-284)||(19437172-19437442)
chr6 (7-284)||(19866857-19867134)
chr6 (6-284)||(27563666-27563944)
chr6 (14-282)||(8761593-8761861)
chr6 (6-284)||(2872636-2872914)
chr6 (6-284)||(21755103-21755380)
chr6 (6-284)||(34643419-34643697)
chr6 (8-284)||(24516249-24516519)
chr6 (6-284)||(16574060-16574338)
chr6 (6-284)||(16621042-16621320)
chr6 (23-284)||(25607711-25607972)
chr6 (6-284)||(24293615-24293893)
chr6 (20-284)||(23080593-23080857)
chr6 (89-283)||(14379382-14379576)
chr6 (6-284)||(25114722-25115000)
chr6 (6-284)||(28261030-28261308)
chr6 (6-284)||(28284608-28284886)
chr6 (6-284)||(28339779-28340057)
chr6 (6-284)||(18405777-18406055)
chr6 (6-240)||(21473814-21474048)
chr6 (6-284)||(22828188-22828466)
chr6 (20-284)||(27189606-27189870)
chr6 (20-284)||(27259370-27259634)
chr6 (17-284)||(18183211-18183478)
chr6 (6-284)||(22436039-22436317)
chr6 (6-279)||(25770019-25770292)
chr6 (20-261)||(28311823-28312064)
chr6 (9-284)||(22760291-22760566)
chr6 (71-284)||(18962986-18963199)
chr6 (23-284)||(23085621-23085882)
chr6 (20-284)||(16961329-16961593)
chr6 (59-284)||(16647855-16648080)
chr6 (59-284)||(23998418-23998643)
chr6 (59-284)||(16380259-16380484)
chr6 (97-284)||(1646738-1646925)
chr6 (160-284)||(19881468-19881591)
chr6 (8-284)||(30678843-30679118)
chr6 (101-284)||(5837147-5837330)
chr6 (29-168)||(20135260-20135399)
chr6 (29-168)||(22197470-22197609)
chr6 (213-284)||(28280853-28280924)
chr6 (20-260)||(16925487-16925726)
chr6 (10-141)||(19487129-19487260)
chr6 (6-120)||(29590272-29590386)
chr6 (86-168)||(13751853-13751935)
chr6 (59-284)||(23025632-23025857)
chr6 (131-261)||(23496150-23496280)
chr6 (97-284)||(14130639-14130826)
chr6 (194-284)||(20633961-20634051)
chr6 (103-284)||(16100185-16100366)
chr6 (62-140)||(18450761-18450839)
[»] chr1 (41 HSPs)
chr1 (20-284)||(20854534-20854798)
chr1 (6-284)||(20833660-20833938)
chr1 (6-284)||(31537757-31538035)
chr1 (6-284)||(48425225-48425503)
chr1 (6-284)||(52988093-52988371)
chr1 (6-284)||(37679401-37679679)
chr1 (6-284)||(38910586-38910864)
chr1 (11-284)||(21953230-21953503)
chr1 (9-276)||(20296741-20297008)
chr1 (6-282)||(19856628-19856904)
chr1 (6-282)||(24097375-24097639)
chr1 (24-284)||(20937841-20938101)
chr1 (6-284)||(33388789-33389067)
chr1 (7-284)||(21233492-21233769)
chr1 (5-284)||(22503048-22503327)
chr1 (6-284)||(51331252-51331531)
chr1 (6-284)||(19108689-19108967)
chr1 (6-284)||(21832623-21832901)
chr1 (6-284)||(21839271-21839549)
chr1 (7-284)||(22360005-22360282)
chr1 (6-270)||(21739796-21740060)
chr1 (6-284)||(16348355-16348633)
chr1 (6-284)||(17042775-17043053)
chr1 (6-234)||(22016505-22016733)
chr1 (6-276)||(21743312-21743582)
chr1 (6-284)||(50618158-50618436)
chr1 (23-284)||(21751261-21751519)
chr1 (6-284)||(429876-430154)
chr1 (6-276)||(41310886-41311156)
chr1 (95-282)||(19660985-19661172)
chr1 (29-284)||(21862156-21862411)
chr1 (6-284)||(20140404-20140682)
chr1 (6-270)||(41351428-41351693)
chr1 (59-284)||(20829205-20829430)
chr1 (29-284)||(16378416-16378671)
chr1 (97-284)||(20927375-20927562)
chr1 (59-284)||(41215669-41215894)
chr1 (97-284)||(20527374-20527561)
chr1 (101-284)||(21200809-21200992)
chr1 (151-284)||(35930730-35930863)
chr1 (173-279)||(22133681-22133787)
[»] scaffold0222 (2 HSPs)
scaffold0222 (6-284)||(9398-9676)
scaffold0222 (7-284)||(1181-1458)
[»] scaffold0239 (1 HSPs)
scaffold0239 (7-284)||(10478-10755)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (6-284)||(69707-69985)
scaffold0034 (6-282)||(2644-2920)
[»] scaffold0001 (4 HSPs)
scaffold0001 (6-284)||(515044-515322)
scaffold0001 (23-284)||(495355-495616)
scaffold0001 (6-279)||(452904-453177)
scaffold0001 (71-225)||(441084-441238)
[»] scaffold0708 (1 HSPs)
scaffold0708 (6-284)||(5836-6114)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (6-282)||(33673-33950)
[»] scaffold0076 (3 HSPs)
scaffold0076 (23-284)||(54119-54380)
scaffold0076 (6-276)||(31368-31638)
scaffold0076 (141-284)||(42595-42738)
[»] scaffold1373 (1 HSPs)
scaffold1373 (6-284)||(525-803)
[»] scaffold1477 (1 HSPs)
scaffold1477 (6-282)||(565-841)
[»] scaffold0104 (2 HSPs)
scaffold0104 (6-282)||(24553-24829)
scaffold0104 (6-276)||(44109-44378)
[»] scaffold0126 (1 HSPs)
scaffold0126 (6-284)||(43253-43531)
[»] scaffold1288 (1 HSPs)
scaffold1288 (6-282)||(546-822)
[»] scaffold0079 (3 HSPs)
scaffold0079 (6-282)||(3055-3331)
scaffold0079 (20-284)||(35833-36097)
scaffold0079 (6-284)||(28413-28691)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (23-284)||(21186-21447)
[»] scaffold0067 (4 HSPs)
scaffold0067 (23-284)||(49888-50149)
scaffold0067 (23-284)||(58922-59183)
scaffold0067 (23-284)||(65310-65571)
scaffold0067 (14-282)||(28961-29229)
[»] scaffold0149 (3 HSPs)
scaffold0149 (6-282)||(5042-5318)
scaffold0149 (6-282)||(9473-9749)
scaffold0149 (6-284)||(164-442)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (6-282)||(19325-19601)
[»] scaffold0206 (1 HSPs)
scaffold0206 (11-284)||(25450-25720)
[»] scaffold0029 (2 HSPs)
scaffold0029 (29-284)||(94608-94863)
scaffold0029 (45-276)||(114904-115136)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (6-284)||(325041-325320)
scaffold0004 (6-279)||(201159-201432)
[»] scaffold0102 (2 HSPs)
scaffold0102 (6-279)||(42038-42311)
scaffold0102 (20-284)||(51050-51314)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (6-276)||(11303-11573)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (6-276)||(29277-29547)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (6-282)||(150908-151180)
scaffold0011 (23-282)||(24241-24500)
[»] scaffold0523 (1 HSPs)
scaffold0523 (6-276)||(2214-2484)
[»] scaffold0244 (1 HSPs)
scaffold0244 (6-279)||(19694-19967)
[»] scaffold0404 (1 HSPs)
scaffold0404 (6-278)||(7085-7357)
[»] scaffold0235 (2 HSPs)
scaffold0235 (8-284)||(9154-9430)
scaffold0235 (8-284)||(19368-19644)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (6-282)||(14545-14821)
scaffold0124 (68-284)||(5560-5775)
[»] scaffold0055 (1 HSPs)
scaffold0055 (6-284)||(21582-21860)
[»] scaffold0304 (1 HSPs)
scaffold0304 (6-279)||(1176-1449)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (6-270)||(3861-4125)
[»] scaffold0109 (2 HSPs)
scaffold0109 (6-284)||(13815-14093)
scaffold0109 (6-284)||(40490-40768)
[»] scaffold0044 (2 HSPs)
scaffold0044 (6-284)||(2759-3037)
scaffold0044 (6-284)||(16495-16773)
[»] scaffold0042 (3 HSPs)
scaffold0042 (6-284)||(37511-37789)
scaffold0042 (133-284)||(23042-23193)
scaffold0042 (23-137)||(25834-25948)
[»] scaffold0585 (1 HSPs)
scaffold0585 (6-279)||(4780-5053)
[»] scaffold0751 (1 HSPs)
scaffold0751 (6-276)||(4524-4794)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (6-284)||(9275-9553)
[»] scaffold0081 (2 HSPs)
scaffold0081 (6-284)||(20939-21217)
scaffold0081 (6-284)||(36363-36641)
[»] scaffold0080 (5 HSPs)
scaffold0080 (6-284)||(36685-36963)
scaffold0080 (6-270)||(31233-31497)
scaffold0080 (6-284)||(13584-13863)
scaffold0080 (6-284)||(10929-11208)
scaffold0080 (23-284)||(53972-54233)
[»] scaffold0028 (5 HSPs)
scaffold0028 (6-276)||(48205-48475)
scaffold0028 (6-284)||(17273-17551)
scaffold0028 (29-284)||(10811-11066)
scaffold0028 (96-276)||(45496-45676)
scaffold0028 (7-86)||(53260-53339)
[»] scaffold0509 (1 HSPs)
scaffold0509 (6-279)||(11170-11443)
[»] scaffold2111 (1 HSPs)
scaffold2111 (6-270)||(278-542)
[»] scaffold0054 (1 HSPs)
scaffold0054 (6-278)||(64210-64482)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (104-284)||(268945-269125)
scaffold0007 (6-274)||(84211-84479)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (23-278)||(103568-103823)
[»] scaffold0241 (1 HSPs)
scaffold0241 (11-129)||(1-119)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (6-284)||(7558-7836)
[»] scaffold0865 (1 HSPs)
scaffold0865 (6-279)||(1963-2236)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (6-279)||(28976-29249)
[»] scaffold0261 (4 HSPs)
scaffold0261 (6-166)||(13056-13216)
scaffold0261 (6-166)||(21236-21395)
scaffold0261 (194-282)||(13215-13303)
scaffold0261 (194-282)||(21394-21482)
[»] scaffold0215 (1 HSPs)
scaffold0215 (7-255)||(28187-28435)
[»] scaffold0108 (1 HSPs)
scaffold0108 (6-278)||(49447-49718)
[»] scaffold0074 (3 HSPs)
scaffold0074 (7-183)||(14559-14735)
scaffold0074 (71-267)||(5465-5661)
scaffold0074 (179-284)||(11458-11563)
[»] scaffold0443 (1 HSPs)
scaffold0443 (7-182)||(11246-11421)
[»] scaffold0405 (1 HSPs)
scaffold0405 (33-284)||(837-1088)
[»] scaffold0266 (2 HSPs)
scaffold0266 (6-276)||(16457-16727)
scaffold0266 (59-284)||(7605-7830)
[»] scaffold0192 (1 HSPs)
scaffold0192 (9-279)||(28867-29137)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (6-276)||(36282-36552)
[»] scaffold0022 (4 HSPs)
scaffold0022 (6-284)||(56092-56370)
scaffold0022 (39-284)||(40969-41212)
scaffold0022 (39-284)||(74689-74932)
scaffold0022 (59-284)||(8570-8795)
[»] scaffold0375 (1 HSPs)
scaffold0375 (44-261)||(2656-2873)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (20-276)||(6792-7048)
[»] scaffold0035 (2 HSPs)
scaffold0035 (8-276)||(5094-5362)
scaffold0035 (56-273)||(41848-42065)
[»] scaffold0621 (1 HSPs)
scaffold0621 (6-284)||(3769-4047)
[»] scaffold0393 (1 HSPs)
scaffold0393 (6-284)||(15685-15963)
[»] scaffold0312 (1 HSPs)
scaffold0312 (6-284)||(396-674)
[»] scaffold0309 (2 HSPs)
scaffold0309 (6-276)||(12139-12409)
scaffold0309 (230-284)||(16978-17032)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (9-210)||(49571-49770)
[»] scaffold2004 (1 HSPs)
scaffold2004 (23-284)||(521-782)
[»] scaffold0331 (1 HSPs)
scaffold0331 (23-284)||(15686-15947)
[»] scaffold0018 (3 HSPs)
scaffold0018 (23-284)||(24006-24267)
scaffold0018 (14-168)||(10050-10204)
scaffold0018 (176-284)||(10602-10710)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (8-276)||(51155-51423)
scaffold0026 (80-255)||(31280-31455)
[»] scaffold1530 (1 HSPs)
scaffold1530 (6-201)||(1-196)
[»] scaffold0431 (1 HSPs)
scaffold0431 (20-279)||(9708-9967)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (50-284)||(14956-15190)
[»] scaffold0333 (1 HSPs)
scaffold0333 (6-284)||(17985-18263)
[»] scaffold0177 (1 HSPs)
scaffold0177 (6-284)||(12047-12325)
[»] scaffold0575 (1 HSPs)
scaffold0575 (23-284)||(3918-4179)
[»] scaffold0379 (1 HSPs)
scaffold0379 (23-284)||(5597-5858)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (6-279)||(4580-4853)
[»] scaffold0228 (1 HSPs)
scaffold0228 (6-282)||(20577-20853)
[»] scaffold0120 (2 HSPs)
scaffold0120 (6-284)||(8357-8635)
scaffold0120 (97-284)||(24513-24700)
[»] scaffold0017 (2 HSPs)
scaffold0017 (6-284)||(17757-18035)
scaffold0017 (74-284)||(58352-58562)
[»] scaffold0993 (1 HSPs)
scaffold0993 (23-284)||(217-478)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (23-284)||(787-1048)
[»] scaffold0181 (1 HSPs)
scaffold0181 (7-284)||(29608-29884)
[»] scaffold0023 (2 HSPs)
scaffold0023 (23-284)||(2213-2474)
scaffold0023 (104-284)||(151447-151627)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (23-284)||(217128-217389)
[»] scaffold0282 (1 HSPs)
scaffold0282 (23-267)||(14187-14431)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (66-284)||(14805-15023)
[»] scaffold0083 (3 HSPs)
scaffold0083 (23-284)||(8742-9003)
scaffold0083 (23-284)||(6673-6934)
scaffold0083 (179-284)||(1369-1474)
[»] scaffold0037 (1 HSPs)
scaffold0037 (8-284)||(114731-115007)
[»] scaffold0324 (1 HSPs)
scaffold0324 (23-284)||(12919-13180)
[»] scaffold0243 (2 HSPs)
scaffold0243 (23-284)||(24653-24914)
scaffold0243 (6-120)||(10463-10577)
[»] scaffold0122 (1 HSPs)
scaffold0122 (23-284)||(41213-41474)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (6-284)||(470-748)
[»] scaffold0647 (2 HSPs)
scaffold0647 (6-284)||(7350-7628)
scaffold0647 (83-284)||(3236-3437)
[»] scaffold0040 (2 HSPs)
scaffold0040 (23-284)||(17213-17474)
scaffold0040 (20-168)||(111612-111760)
[»] scaffold0031 (4 HSPs)
scaffold0031 (6-167)||(52616-52777)
scaffold0031 (89-276)||(109975-110162)
scaffold0031 (176-284)||(54852-54960)
scaffold0031 (6-42)||(110187-110223)
[»] scaffold0270 (2 HSPs)
scaffold0270 (23-283)||(6209-6469)
scaffold0270 (23-283)||(13339-13599)
[»] scaffold0008 (4 HSPs)
scaffold0008 (20-284)||(84935-85199)
scaffold0008 (59-284)||(132233-132458)
scaffold0008 (131-284)||(85612-85765)
scaffold0008 (173-284)||(26104-26215)
[»] scaffold1423 (1 HSPs)
scaffold1423 (7-279)||(1070-1346)
[»] scaffold0560 (1 HSPs)
scaffold0560 (6-284)||(8432-8711)
[»] scaffold0550 (1 HSPs)
scaffold0550 (6-284)||(10849-11128)
[»] scaffold0053 (2 HSPs)
scaffold0053 (138-284)||(55670-55816)
scaffold0053 (125-270)||(46844-46989)
[»] scaffold0467 (1 HSPs)
scaffold0467 (59-284)||(1365-1590)
[»] scaffold0225 (1 HSPs)
scaffold0225 (59-284)||(25731-25956)
[»] scaffold0298 (1 HSPs)
scaffold0298 (134-282)||(9877-10025)
[»] scaffold0148 (1 HSPs)
scaffold0148 (50-273)||(1345-1568)
[»] scaffold0170 (1 HSPs)
scaffold0170 (59-284)||(34422-34645)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (50-284)||(21921-22155)
[»] scaffold1985 (1 HSPs)
scaffold1985 (20-157)||(274-411)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (23-284)||(2936-3197)
[»] scaffold0162 (2 HSPs)
scaffold0162 (68-284)||(10927-11143)
scaffold0162 (68-284)||(15245-15461)
[»] scaffold0146 (3 HSPs)
scaffold0146 (122-282)||(9761-9921)
scaffold0146 (122-282)||(17428-17588)
scaffold0146 (10-117)||(5769-5876)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (23-279)||(176053-176308)
[»] scaffold0139 (1 HSPs)
scaffold0139 (143-282)||(37987-38126)
[»] scaffold0465 (1 HSPs)
scaffold0465 (97-284)||(13407-13594)
[»] scaffold0302 (2 HSPs)
scaffold0302 (97-284)||(548-735)
scaffold0302 (97-279)||(7495-7677)
[»] scaffold0876 (1 HSPs)
scaffold0876 (66-284)||(697-915)
[»] scaffold1881 (1 HSPs)
scaffold1881 (11-168)||(1093-1250)
[»] scaffold0218 (3 HSPs)
scaffold0218 (97-284)||(1734-1921)
scaffold0218 (6-111)||(25403-25508)
scaffold0218 (97-277)||(26671-26851)
[»] scaffold0092 (1 HSPs)
scaffold0092 (97-284)||(429-616)
[»] scaffold0021 (4 HSPs)
scaffold0021 (97-279)||(89842-90024)
scaffold0021 (97-284)||(7492-7679)
scaffold0021 (97-278)||(21637-21818)
scaffold0021 (97-278)||(31213-31394)
[»] scaffold0335 (1 HSPs)
scaffold0335 (59-284)||(6984-7209)
[»] scaffold0529 (1 HSPs)
scaffold0529 (71-206)||(4534-4669)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (182-284)||(8708-8810)
[»] scaffold0118 (1 HSPs)
scaffold0118 (6-79)||(1-74)
[»] scaffold1488 (1 HSPs)
scaffold1488 (97-284)||(587-772)
[»] scaffold1715 (1 HSPs)
scaffold1715 (194-284)||(1289-1379)
[»] scaffold0878 (1 HSPs)
scaffold0878 (59-180)||(4435-4556)
[»] scaffold0561 (1 HSPs)
scaffold0561 (97-278)||(6787-6968)
[»] scaffold0358 (2 HSPs)
scaffold0358 (184-284)||(8386-8486)
scaffold0358 (184-284)||(17582-17682)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (59-165)||(23417-23523)
[»] scaffold0501 (1 HSPs)
scaffold0501 (6-111)||(12171-12276)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (35-111)||(126489-126565)
[»] scaffold0610 (1 HSPs)
scaffold0610 (111-284)||(4722-4895)
[»] scaffold0673 (1 HSPs)
scaffold0673 (66-165)||(6055-6154)
[»] scaffold0259 (1 HSPs)
scaffold0259 (9-87)||(7790-7868)
[»] scaffold1615 (1 HSPs)
scaffold1615 (6-147)||(1424-1565)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (141-198)||(144460-144517)
[»] scaffold1208 (1 HSPs)
scaffold1208 (149-280)||(1523-1654)
[»] scaffold0481 (1 HSPs)
scaffold0481 (97-208)||(12149-12260)
[»] scaffold0369 (1 HSPs)
scaffold0369 (185-284)||(7081-7180)
[»] scaffold0692 (1 HSPs)
scaffold0692 (174-284)||(1743-1853)
[»] scaffold0387 (1 HSPs)
scaffold0387 (194-284)||(16395-16485)
[»] scaffold1459 (1 HSPs)
scaffold1459 (6-62)||(1723-1779)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 267; Significance: 1e-149; HSPs: 76)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 13944237 - 13943959
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13944237 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 13944138  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  13944137 gaaacagttggaagatttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaaaaaggatggtagtatg 13944038  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13944037 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 13943959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 44779460 - 44779182
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44779460 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcctggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 44779361  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  44779360 gaaacagttggaagatttacttgataagaagtttgtaagacccagtgtttcgccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaaaaaggatggtagtatg 44779261  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  44779260 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgagaattgatgacttga 44779182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 248; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 17 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 41179724 - 41179457
Alignment:
Q  17 gtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttgg 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41179724 gtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttgg 41179625  T
Q  117 aagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcat 216  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  41179624 aagatttacttgataagaagtttgtaagacccagtgtttcgccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaaaaaggatggtagtatgaggttgtgcat 41179525  T
Q  217 tgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41179524 tgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 41179457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Original strand, 8745306 - 8745584
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8745306 cagaaagggaggtggagttttcaattgaccttgttcctggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 8745405  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||    
T  8745406 gaaacagttggaagatttacttgataagaagtttgtaagacccagtgtttcgccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaaaaaggatggaagtatg 8745505  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8745506 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 8745584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Original strand, 16378845 - 16379122
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16378845 cagagagggaggtggagttttcgattgaccttgttccaggaataaagctggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 16378944  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    |||||||||| |||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || ||  |||| |||    
T  16378945 gaaacagttg-aagacttgcttgataagaagtttgttcgacccagtgtttcaccgtggggagtgcctgtgttgttggtgaagaaaaaggacagtagcatg 16379043  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||    
T  16379044 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaataggcatccacttccgaggattgatgacttga 16379122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Original strand, 11959085 - 11959363
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    |||| |||||||| || |||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11959085 cagaaagggaggttgaatttttaattgaccttgttccaggaacaaagctggtgtcgatggcaccttaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 11959184  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    |||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||| |||||||| |||    
T  11959185 gaaacagttggaggacttgcttgataagaagtttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttagttaagaagaaggatggtagcatg 11959284  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  11959285 aggttgtgcattgactaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgagaattgatgacttga 11959363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 8 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 24189515 - 24189239
Alignment:
Q  8 gagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaaga 107  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24189515 gagagagaggttgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcggcttctgagttagctgaattgaaga 24189416  T
Q  108 aacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgag 207  Q
    | ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||    
T  24189415 atcagttggaagacttgcttgataagaagtttgtaagaccgaatgtttcaccgtggggagcgcctgtgttgttagtaaagaaaaaggatggtagtatgag 24189316  T
Q  208 gttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    | | ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24189315 gctatgcattgactatcgtcagttgaataaagttacgataaagaacaggtatccacttccgaggattgatgacttga 24189239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Original strand, 18132262 - 18132540
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    |||| |||||||| || ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18132262 cagaaagggaggttgaattttcaattgaccttattccaggaacgaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 18132361  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  18132362 gaaacagttggaacacttgcttgataagaagtttgtaagaccaagtgtctcaccttggggagcgcctgtattgttggtaaagaagaaggatggtagtatg 18132461  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    ||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||    
T  18132462 aggttatgcattgtctatcgttaattgaataaagttacaattaagaacaggtatccacttccgaggattgacgacttga 18132540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 31941116 - 31940838
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    |||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31941116 cagaaagggaggttgaattttcaattgaccttgttccgggaacgaagccggtgtcgatggcaccttatcgcatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 31941017  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||| || || |||||||| |||||||| || ||||| |||    
T  31941016 gaaacagttggaagacttgcttgataagaagtttgtaagacacagtgtttcatcgtggggagcgccggtattgttggtaaagaagaaggacggtagcatg 31940917  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||    
T  31940916 aggctgtgcattgactatcgtcagttgaacaaagttacgataaagaacaggtatccacttccgaggattgacgacttga 31940838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 11 - 284
Target Start/End: Original strand, 11949829 - 11950102
Alignment:
Q  11 agggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaac 110  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11949829 agggaggttgaattttcaattgaccttgttctaggaacgaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagcttccgagttagctgaattgaagaaac 11949928  T
Q  111 agttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggtt 210  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||  | || |||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  11949929 agttggaagacttgcttgataagaagtttgtaagaccaagtgtctcaccttggggagcgtcggtattgttggtaaagaagaaggatggtagtatgaggtt 11950028  T
Q  211 gtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
     ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||    
T  11950029 atgcattgactatcgtcagttgaataaagttacaataaagaacaggtatccacttccgaggattgacgacttga 11950102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Original strand, 31693101 - 31693379
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    |||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||     
T  31693101 cagaaagggaggttgaactttcaattgaccttgttccgggaacgaagccggtgtcgatggcaccttatcgcatgtcagcttctgagttagctgaattgac 31693200  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  | | |||||| |||||||| || ||||| |||    
T  31693201 gaaacagttggaagacttgcttgataagaagtttgtaagacccagtgtttcaccgtggggagcgccgatatagttggtaaagaagaaggacggtagcatg 31693300  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| || ||||| ||||||||| |||| |||||||    
T  31693301 aggctgtgcattgactatcgtcagttgaacaaagttacgataaagaacaggtatccacttccgagggttgacgacttga 31693379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 8 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 17188585 - 17188309
Alignment:
Q  8 gagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaaga 107  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17188585 gagagagaggttgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagtcggtgtcgatggcaccgtaccatatgtcggcttctgagttagctgaattgaaga 17188486  T
Q  108 aacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgag 207  Q
    | ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| || ||||| || ||||||||||||||    
T  17188485 atcagttagaagacttgcttgataagaagtttgtaagaccgagtgtttcaccgtggggagcgcctttgttgttagtaaagaaaaaggatggtagtatgag 17188386  T
Q  208 gttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    | | ||||||||||||||| | ||||| |||||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  17188385 gctatgcattgactatcgttagttgaataaagttacgataaagaacaggtatccacttccgaggatggatgacttga 17188309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 10408181 - 10407903
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    |||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  10408181 cagagagggaagttgagttttcaatagaccttgttccaggaactaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgaattagctgagttgaa 10408082  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    |||||||||||| ||  |  | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  10408081 gaaacagttggaggacctgttagataagaagtttgtaagacccagtgtttcaccttggggagcaccggtgttgttggtcaagaagaaggatggtagtatg 10407982  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    ||  |||| || || || ||||| |||||||||||||| || ||||| || ||||||||||| || ||||| |||||||    
T  10407981 agactgtgtatagattaccgtcagttgaacaaagttacgatcaagaacaggtatccgcttcctagaattgacgacttga 10407903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Original strand, 12358443 - 12358721
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    |||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12358443 cagaaagggaggttgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagtcggtgccgatggcaccttatcgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 12358542  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    ||||||||||||  | |  ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || |||||| |||| |||||||| |||||||| |||    
T  12358543 gaaacagttggacaactagcttgataagaagtttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgatggttaagaagaaggatggtagcatg 12358642  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    ||||| |||||||| ||| |||| ||| ||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12358643 aggttatgcattgattattgtcagttgcacaaagttacaataaagaacaggtatccacttccgaggattgatgacttga 12358721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 20 - 284
Target Start/End: Original strand, 10417975 - 10418239
Alignment:
Q  20 gagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaag 119  Q
    ||||| || ||||| |||||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||| |    
T  10417975 gagttctcgattgatcttgttccgggaacgaaaccagtgtcgatggcgccgtatcgcatgtcagcttctgaattggctgagttaaagaaacagttggagg 10418074  T
Q  120 agttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattga 219  Q
    | || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  10418075 acttgcttgataagaagtttgtgagacctagtgtttcgccgtggggagcacccgtgttattggtgaaaaagaaagatggaagtatgaggttgtgcattga 10418174  T
Q  220 ctatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||    
T  10418175 ctatcgtcagttgaacaaagttacaataaagaatagatatccacttccgcggattgatgatttga 10418239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 28756532 - 28756253
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    |||| |||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  28756532 cagaaagggaggttgaattttcaattgatcttgttccaggaactaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttggctgagttgaa 28756433  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgt-ggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtat 204  Q
    |||||||||||| ||  |  | ||||| |||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  28756432 gaaacagttggaggacctgttagataaaaagtttgtaagacccagtgtttcaccttgggggagcaccggtgttgttggtaaagaagaaggatggtagtat 28756333  T
Q  205 gaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    |||  |||| || || || |||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||| || ||||| |||||||    
T  28756332 gagactgtgtatagattaccgtcaattgaacaaagttacgatcaagaacaggtatccgcttcctagaattgacgacttga 28756253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 47126157 - 47125879
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    |||| |||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  47126157 cagaaagggaggttgaattttcaattgatcttgttccaggaactaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttggctgagttgaa 47126058  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    |||||||||||| ||  |  | ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  47126057 gaaacagttggaggaactgttagataaaaagtttgtaagacccagtgtttcaccttggggagcaccggtgttgttagtaaagaagaaggatggtagtatg 47125958  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    ||  |||| || || || ||||| |||||||||||||| || ||||| || ||||||||||| || ||||| |||||||    
T  47125957 agactgtgtatagattaccgtcagttgaacaaagttacgatcaagaacaggtatccgcttcctagaattgacgacttga 47125879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 6 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 12180557 - 12180281
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||  || ||||||||  | || ||||| ||||| |||||    
T  12180557 cagagagggaggttgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccggtgtcgatagcactttatcgtatgtcgacgtccgagttggctgagttgaa 12180458  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    |||| ||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||  |||    
T  12180457 gaaatagttggaggacttacttgataagaaatttgtaagaccgagtgtttcaccgtggggagcgccagtattgttggttaagaagaatgatggtaccatg 12180358  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgactt 282  Q
    ||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  12180357 aggttattcattgattatcgtcagttgaacaaagttacgataaagaacaggtatccacttccgaggattgatgactt 12180281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Original strand, 13318418 - 13318696
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    |||| |||||| | ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||| || ||||||||  | |||||| |||| || |||||    
T  13318418 cagaaagggagattgagttctcaattgatcttgttccaggaacgaagccagtgtcgctggcaccttatcgtatgtcgacgtctgagctagccgagttgaa 13318517  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    |||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||    
T  13318518 gaaacagttggaggacttgcttgataagaaatttgtaagacccagtgtttcaccatggggaacgcctgtgttgttggtaaagaagaaggatggtagtgtg 13318617  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    || |||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||    
T  13318618 agattgtgcattgactatcatcagttgaataaagttacaataaagaacagatatccactcccgaggattgatgatttga 13318696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 6 - 276
Target Start/End: Original strand, 16826197 - 16826467
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||| |||||    
T  16826197 cagagagggaggttgaattttcaattaaccttgttccaggaacgaagccggtgtcgatggcaccttaccgtatgtcggcgtccgagttagctgagttgaa 16826296  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    |||||||||||| || || ||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| |||    
T  16826297 gaaacagttggaggacttgcttgataagaaatttgtgaaaccaagtgtttcaccgtggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtagcatg 16826396  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattga 276  Q
    | |||||| || || || |||||  |||| ||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  16826397 aagttgtgtatagattaccgtcagctgaataaagtgacgataaagaataggtatccacttccgaggattga 16826467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Original strand, 20059981 - 20060259
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||| || || |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||| |||| |||||    
T  20059981 cagagagagaagttgagttttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtctcgatggcaccttatcgtatgtctgcttctgagttatctgagttgaa 20060080  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  20060081 gaaacagttggaagacttgcttgagaagaagtttgttagaccgagtgtttcaccttggggagcgccggttttgttagtaaagaagaaagatggtagtatg 20060180  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
     ||||||| ||||| ||||| || |||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  20060181 cggttgtgtattgattatcgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttga 20060259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 10007803 - 10007525
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||| || || |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||| |||| |||||    
T  10007803 cagagagagaagttgagttttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtctcgatggcaccttatcgtatgtctgcttctgagttatctgagttgaa 10007704  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    ||||| ||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  10007703 gaaacggttggaagacttgcttgagaagaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggttttgttagtaaagaagaaagatggtagtatg 10007604  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
     ||||||| ||||| ||||| || |||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  10007603 cggttgtgtattgattatcgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttga 10007525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 10908413 - 10908135
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||| || || |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||| |||| |||||    
T  10908413 cagagagagaagttgagttttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtctcgatggcaccttatcgtatgtctgcttctgagttatctgagttgaa 10908314  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||| | || |||||||| ||||||||||||    
T  10908313 gaaacagttggaagacttgcttgagaagaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggttttgatagtaaagaagaaagatggtagtatg 10908214  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
     ||||||| ||||| ||||| || |||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  10908213 cggttgtgtattgattatcgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttga 10908135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 12888912 - 12888634
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||| || || |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||| |||| |||||    
T  12888912 cagagagagaagttgagttttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtctcgatggcaccttatcgtatgtctgcttctgagttatctgagttgaa 12888813  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||| | || |||||||| ||||||||||||    
T  12888812 gaaacagttggaagacttgcttgagaagaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggttttgctagtaaagaagaaagatggtagtatg 12888713  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
     ||||||| ||||| ||||| || |||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  12888712 cggttgtgtattgattatcggcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttga 12888634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 13254893 - 13254615
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||| || || |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||| || | |||||    
T  13254893 cagagagagaagttgagttttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtctcgatggcaccttatcgtatgtctgcttctgagttatctaagttgaa 13254794  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  13254793 gaaacagttggaagacttgcttgagaagaagtttgttagaccgagtgtttcaccttggggagcgccggttttgttagtaaagaagaaagatggtagtatg 13254694  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
     ||||||| ||||| ||||| || |||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  13254693 cggttgtgtattgattatcggcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttga 13254615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 6 - 276
Target Start/End: Original strand, 13970036 - 13970306
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    |||| |||||||| ||||| || || || || || || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| || || ||  | ||||| |||||    
T  13970036 cagaaagggaggttgagttctccatcgatctagtaccaggaacgaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtcggcatccgaacttgctgagttgaa 13970135  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    |||||||||||| || ||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||    
T  13970136 gaaacagttggaggacttactcgacaagaagtttgtaagaccaagtgtttcaccgtggggagcgcctgtgttgttggtaaagaagaaggatggtagcatg 13970235  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattga 276  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13970236 aggttatgtattgactaccgtcaattgaataaagttacgataaagaacagatatccgcttccgaggattga 13970306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Original strand, 15346172 - 15346450
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||| || || |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||| |||| |||||    
T  15346172 cagagagagaagttgagttttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtctcgatggcaccttatcgtatgtctgcttctgagttatctgagttgaa 15346271  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  15346272 gaaacagttagaagacttgcttgagaagaagtttgttagaccgagtgtttcaccttggggagcgccggttttgttagtaaagaagaaagatggtagtatg 15346371  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
     ||||||| ||||| ||||| || |||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  15346372 cggttgtgtattgattatcggcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttga 15346450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Original strand, 15587319 - 15587597
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||| || || |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||| |||| |||||    
T  15587319 cagagagagaagttgagttttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtctcgatggcaccttatcgtatgtctgcttccgagttatctgagttgaa 15587418  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  15587419 gaaacagttggaagacttgcttgagaagaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggttttgttagtaaagaagaaagatggtagtatg 15587518  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
     ||||||| ||||| ||||| || |||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  15587519 cggttgtgtattgattatcgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttga 15587597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 16637976 - 16637698
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||| || || |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||| |||| |||||    
T  16637976 cagagagagaagttgagttttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtctcgatggcaccttatcgtatgtctgcttctgagttatctgagttgaa 16637877  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||| | || |||||||| ||||||||||||    
T  16637876 gaaacagttggaagacttgcttgagaagaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggttttgctagtaaagaagaaagatggtagtatg 16637777  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
     ||||||| ||||| ||||| || |||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  16637776 cggttgtgtattgattatcggcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttga 16637698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 43164878 - 43164600
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||| || || |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||| |||| |||||    
T  43164878 cagagagagaagttgagttttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtctcgatggcaccttatcgtatgtctgcttctgagttatctgagttgaa 43164779  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||| | || |||||||| ||||||||||||    
T  43164778 gaaacagttggaagacttgcttgagaagaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggttttgctagtaaagaagaaagatggtagtatg 43164679  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
     ||||||| ||||| ||||| || |||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  43164678 cggttgtgtattgattatcggcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttga 43164600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 6 - 279
Target Start/End: Original strand, 26791340 - 26791613
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||| || || |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||| |||| |||||    
T  26791340 cagagagagaagttgagttttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtctcgatggcaccttatcgtatgtctgcttctgagttatctgagttgaa 26791439  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  26791440 gaaacagttggaagacttgcttgagaagaagtttgttagatcaagtgtttcaccttggggagcgccggttttgttagtaaagaagaaagatggtagtatg 26791539  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatga 279  Q
     ||||||| ||||| ||||| || |||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  26791540 cggttgtgtattgattatcggcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatga 26791613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 6 - 276
Target Start/End: Original strand, 12510399 - 12510669
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  12510399 cagagagagaggttgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaatccagtgtcgatggcaccataccgtatgtcagcttctaagttgactgaattgaa 12510498  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    ||||| |||||| ||  |  | |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  12510499 gaaacggttggaggacctgttagataagaaatttgtaagacccagtgtttcaccttggggagcaccggtgttgttggttaagaagaaggatggtagtatg 12510598  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattga 276  Q
    ||  ||||||| || || ||||| ||||| || ||||| || ||||| || |||||||||||||| |||||    
T  12510599 agactgtgcatagattaccgtcagttgaaaaaggttacgataaagaacaggtatccgcttccgagaattga 12510669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 6 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 14088886 - 14088616
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    |||| |||||||| ||||| || || || || || || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| || || ||  | ||||| |||||    
T  14088886 cagaaagggaggttgagttctccatcgatctggtgccaggaacgaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtcggcatccgaacttgctgagttgaa 14088787  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    |||||||||||| || ||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||    
T  14088786 gaaacagttggaggacttactcgacaagaagtttgtaagaccaagtgtttcaccgtggggagcgcctgtgttgttggtaaagaagaaggatggtagcatg 14088687  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattga 276  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  14088686 aggttatgcattgactaccgtcagttgaataaagttacgataaagaacagatatccgcttccgagaattga 14088616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Original strand, 15713983 - 15714261
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||| || || |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||| |||| |||||    
T  15713983 cagagagagaagttgagttttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtctcgatggcaccttatcgtatgtctgcttccgagttatctgagttgaa 15714082  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  15714083 gaaacagttggaagacttgcttgagaagaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggttttgttagtaaagaagaaagatggtagtatg 15714182  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
     |||| || ||||| ||||| || |||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  15714183 cggttatgtattgattatcggcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttga 15714261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 7 - 284
Target Start/End: Original strand, 16804875 - 16805152
Alignment:
Q  7 agagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaag 106  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||| ||  |||  |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||| | ||||||    
T  16804875 agagagggaagttgagttttctattgatctgattcttggaacaaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtctgcttccgagttggctaagttgaag 16804974  T
Q  107 aaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatga 206  Q
    |||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||| | ||||||||||| |||||||| ||||    
T  16804975 aaacagttagaagatttgcttgaaaagaaatttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccagttttgctagtgaagaagaaagatggtagcatga 16805074  T
Q  207 ggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    | ||||| |||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  16805075 gattgtgtattgactatcgtcagttgaacaaagtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttga 16805152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 7 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 17493858 - 17493657
Alignment:
Q  7 agagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaag 106  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17493858 agagagggaggttgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagcttccgagttagctgaattgaag 17493759  T
Q  107 aaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatga 206  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||  | |||||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  17493758 aaacagttggaggacttgcttgataagaagtttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccgatattgttggttaagaagaaggatggtactatga 17493659  T
Q  207 gg 208  Q
    ||    
T  17493658 gg 17493657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 16694367 - 16694089
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    |||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  16694367 cagagagggaagttgagttttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtgtagatggcaccttatcgtatgtctgcttccgagttagctgagttgaa 16694268  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||| || || ||| | || |||||||| |||||||| |||    
T  16694267 gaaacagttagaagatttgcttgaaaagaaatttgttagactaagtgtttcaccttggggagcgccagttttgctagtaaagaagaaagatggtagcatg 16694168  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    || ||||| |||||||||||||| ||||| || || || || |||||||  ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  16694167 agattgtgtattgactatcgtcagttgaataaggtaactatcaagaatatgtatccacttccgagaattgatgacttga 16694089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 24185393 - 24185115
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    |||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||| || ||| |||| |||||    
T  24185393 cagagagggaagttgagttttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtgttgatggcaccttatcgtatgtctgcttccgaattatctgagttgaa 24185294  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    ||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||  | || |||||||| ||||||||||||    
T  24185293 gaaacagttggaagatttgcttgagaagaaatttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcaccggttttactagtaaagaagaaagatggtagtatg 24185194  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    ||||| || ||||| ||||| || |||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  24185193 aggttatgtattgattatcgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttga 24185115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 48427650 - 48427372
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||| || || || ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||| |||| |||||    
T  48427650 cagagagagaagttgaattttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtctcgatggcaccttatcgtatgtctgcttctgagttatctgagttgaa 48427551  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||| | || |||||||| ||||||||||||    
T  48427550 gaaacagttagaagacttgcttgagaagaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggttttgctagtaaagaagaaagatggtagtatg 48427451  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
     ||||||| ||||| ||||| || |||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  48427450 cggttgtgtattgattatcgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttga 48427372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 23 - 284
Target Start/End: Original strand, 5108555 - 5108816
Alignment:
Q  23 ttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaagagt 122  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||| || |||| |||||||||||||||||||| |    
T  5108555 ttttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtctcgatggcaccttatcgtatgtctgcttctgagctatctgagttgaagaaacagttggaagact 5108654  T
Q  123 tacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattgacta 222  Q
    | ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| ||||||||||||||| | || ||||| ||    
T  5108655 tgcttgagaagaagtttgttagaccgagtgtttcaccttggggagcgccggttttgttagtaaagaagaaagatggtagtatgaggctatgtattgatta 5108754  T
Q  223 tcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    ||| || |||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  5108755 tcgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttga 5108816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 6 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 12272551 - 12272275
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||| ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||| || |  ||||||||||| |||||    
T  12272551 cagagagggaggttgaattttcaatcgacattgttccaggaacgaagtcggtgtcgatggcaccttaccgtatgtcggcgttcgagttagctgagttgaa 12272452  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    |||||||||||  || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | |||||||| ||  | |||||||| |||||||| |||||||| |||    
T  12272451 gaaacagttgggggacttgcttgataagaaatttgtaagacccagtgtttcaacttggggagcgccgatattgttggttaagaagaaggatggtagcatg 12272352  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgactt 282  Q
    ||||| |||||||| ||| |||  || ||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  12272351 aggttatgcattgattattgtccgtttaacaaggttacgataaagaacaggtatccacttccgaggattgatgactt 12272275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 3688146 - 3687868
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||| || || |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||| |||| |||||    
T  3688146 cagagagagaagttgagttttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtctcgatggcaccttatcgtatgtctgcttccgagttatctgagttgaa 3688047  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    |||||||||||| || || || || ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||| | || |||||||| ||||||||||||    
T  3688046 gaaacagttggaggacttgctcgaaaagaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggttttgctagtaaagaagaaagatggtagtatg 3687947  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
     ||||||| ||||| ||||| || |||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  3687946 cggttgtgtattgattatcgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttga 3687868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Original strand, 5422857 - 5423135
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||| || || |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||| |||| |||||    
T  5422857 cagagagagaagttgagttttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtctcgatggcaccttatcgtatgtctgcttccgagttatctgagttgaa 5422956  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    |||||| ||||| || || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||| | || |||||||| ||||||||||||    
T  5422957 gaaacaattggaggacttgcttgaaaagaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggttttgctagtaaagaagaaagatggtagtatg 5423056  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
     ||||||| ||||| ||||| || |||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  5423057 cggttgtgtattgattatcggcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttga 5423135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 23 - 261
Target Start/End: Original strand, 12844047 - 12844285
Alignment:
Q  23 ttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaagagt 122  Q
    ||||||||||| |||||  | || || ||||| ||||| ||| |||| |||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| || ||||| |    
T  12844047 ttttcaattgatcttgtatcgggtacgaagcctgtgtctatgacaccttaccgtatgtcagcttatgagttggctgagttgaagaaacaattagaagatt 12844146  T
Q  123 tacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattgacta 222  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||  | ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12844147 tgcttgataagaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccgattttgttagtgaagaagaaagatggtagtatgaggttgtgcattgacta 12844246  T
Q  223 tcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatcc 261  Q
    ||| || ||||||||||| || || |||||||| |||||    
T  12844247 tcgacagttgaacaaagtaacgataaagaataggtatcc 12844285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 6602939 - 6602661
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    |||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| || ||| |||| |||||    
T  6602939 cagagagggaagtcgagttttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtctcgatggcaccttatcgtatgtctgcttcagaattatctgagttgaa 6602840  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    |||||||||||| || || ||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| || || ||| | || |||||||| ||||||||||||    
T  6602839 gaaacagttggaggacttgcttgaaaagaagtttgttaggccaagtgtttcaccttggggagcgccggttttgctagtaaagaagaaagatggtagtatg 6602740  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
     ||||||| ||||| ||||| || |||| ||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  6602739 cggttgtgtattgattatcggcagttgagcaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttga 6602661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 6 - 276
Target Start/End: Original strand, 14291448 - 14291718
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    |||| |||||||| || |||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| || || ||| ||||||| || ||    
T  14291448 cagaaagggaggttgaattttcaatcgatcttgtgcccggaacgaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtcggcgtccgagatagctgagttaaa 14291547  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||    
T  14291548 gaaacagttggaagatttacttgataagaaatttgtaagaccgagtgtttcaccgtgggaagcaccggtgttgttggttaagaagaaggatggtagcatg 14291647  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattga 276  Q
    |||||| | || || || |||||  |||| ||||| || || ||||| || ||||| |||| ||| |||||    
T  14291648 aggttgagtatagattaccgtcagctgaataaagtgacgataaagaacaggtatccacttctgagaattga 14291718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 6 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 15229816 - 15229543
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| |||||    
T  15229816 cagagagagaggttgaattttcaattgatcttgttccgggtacgaagcctgtgtcgatggcgccttaccgtatgtcggcgtctgagttagctgagttgaa 15229717  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    |||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||||| || || |||||||| |||||||| |||||||| |||    
T  15229716 gaaacagttggaggatttacttgacaagaaatttgtaagaccgagagtttcaccttggggagcgccggtattgttggttaagaagaaggatggtagcatg 15229617  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatga 279  Q
    |||||||| || || || |||||  |||| | ||| || || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  15229616 aggttgtgtatagattaccgtcagctgaatatagtgacgataaagaataggtatccacttccgagaattgatga 15229543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 6 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 15235684 - 15235411
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| |||||    
T  15235684 cagagagagaggttgaattttcaattgatcttgttccgggtacgaagcctgtgtcgatggcgccttaccgtatgtcggcgtctgagttagctgagttgaa 15235585  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    |||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||||| || || |||||||| |||||||| |||||||| |||    
T  15235584 gaaacagttggaggatttacttgacaagaaatttgtaagaccgagagtttcaccttggggagcgccggtattgttggttaagaagaaggatggtagcatg 15235485  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatga 279  Q
    |||||||| || || || |||||  |||| | ||| || || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  15235484 aggttgtgtatagattaccgtcagctgaatatagtgacgataaagaataggtatccacttccgagaattgatga 15235411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Original strand, 15400444 - 15400722
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||| || || |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| || ||| | || |||||    
T  15400444 cagagagagaagttgagttttctattgatcttgttccgggaacgaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtctgcttccgaattatccgagttgaa 15400543  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    ||||||||||||||| || || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||| | || |||||||| ||||||||||||    
T  15400544 gaaacagttggaagatttgctcgagaagaaatttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggttttgctagtaaagaagaaagatggtagtatg 15400643  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    ||| | || ||||| ||||| || |||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  15400644 aggctatgtattgattatcgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttga 15400722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Original strand, 53382945 - 53383223
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||| || || |||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| || ||| |||| |||||    
T  53382945 cagagagagaagtcgagttttctattgatcttgttcctggaacgaaaccggtctcgatggcaccttatcgtatgtctgcttcagaattatctgagttgaa 53383044  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    |||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||| | || |||||||| ||||||| ||||    
T  53383045 gaaacagttggaggatttgcttgaaaagaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggttttgctagtaaagaagaaagatggtactatg 53383144  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
     ||||||| ||||| ||||| |  ||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  53383145 cggttgtgtattgattatcggccgttgaacaaagtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttga 53383223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 23 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 17492036 - 17491782
Alignment:
Q  23 ttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaagagt 122  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||| |||| || |||||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |    
T  17492036 ttttcgattgatcttgttcctggaacgaagcctgtgtctatgacaccttatcgtatgtcagcttctgagttggccgagttgaagaaacaattagaagatt 17491937  T
Q  123 tacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattgacta 222  Q
    ||||||| || |||||||||||||| ||| |||| || |||||||| || || ||| | ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  17491936 tacttgagaaaaagtttgttagaccaagtttttcgccttggggagcgccggttttgctagtgaagaagaaagatggtagcatgagattgtgtattgacta 17491837  T
Q  223 tcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgat 277  Q
    ||| || |||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  17491836 tcgacatttgaacaaggtgacaataaagaataggtatccacttccgagaattgat 17491782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Original strand, 16754628 - 16754906
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    |||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||| | | |||| ||||||||||| || |||||||| ||||| || ||| | || |||||    
T  16754628 cagagagggaagtcgagttttctattgatcttgttcctggaacgacgtcggtctcgatggcaccttatcgtatgtctgcttcagaattatccgagttgaa 16754727  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    |||||||||||| || || || || ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |  || ||| | || |||||||| ||||||||||||    
T  16754728 gaaacagttggaggacttgctagaaaagaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgcaggttttgctagtaaagaagaaagatggtagtatg 16754827  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
     ||||||| ||||| ||||| || |||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  16754828 cggttgtgtattgattatcggcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttga 16754906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 6 - 132
Target Start/End: Original strand, 16832444 - 16832570
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16832444 cagagagggaggttgagttttcgattgaccttgttccgggaacaaagccggtgtcgatggcaccataccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 16832543  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataa 132  Q
    ||||| ||||||||| || ||||||||    
T  16832544 gaaacggttggaagacttgcttgataa 16832570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 6 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 14575199 - 14575022
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| || ||||||||||||||    
T  14575199 cagagagggaggttgaattttcaattgactttgttccaggaacgaagccggtgtcgatggcaccttaccgtatgtatgcttccgaattagctgaattgaa 14575100  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggt 183  Q
    |||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| |||||    
T  14575099 gaaacagttggaggacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttattggt 14575022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 11 - 273
Target Start/End: Original strand, 15013688 - 15013950
Alignment:
Q  11 agggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaac 110  Q
    |||||||| || || || ||||| ||| |||| || ||||||||  ||||||||||||| |||| |||||||||||| || |||||||| ||||| || |    
T  15013688 agggaggtagaattgtcgattgatcttattccaggtacaaagcctatgtcgatggcaccttaccatatgtcagcttcggaattagctgagttgaaaaagc 15013787  T
Q  111 agttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggtt 210  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  15013788 agttagaagatttgcttgaaaagaagtttgtaagaccgagtgtgtcaccttggggagcgctggtgttgttggttaagaagaaagatggtagcatgaggtt 15013887  T
Q  211 gtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggat 273  Q
    ||| || ||  | || || ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  15013888 gtgtatagatcaccggcagttgaacaaagtgacaataaagaataggtatccacttccgaggat 15013950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 15358286 - 15358008
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||| || || |||||||  ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| || ||| | || |||||    
T  15358286 cagagagagaagttgagttttgtattgatcttgttccgggaacgaagccggtgtcaatggcaccttatcgtatgtctgcttccgaattatccgagttgaa 15358187  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    ||||||||||||||| || || || ||||| ||||||||||| ||| ||||||| |||||||| ||  | ||| | || |||||||| ||||||||||||    
T  15358186 gaaacagttggaagatttgctcgagaagaaatttgttagaccaagtatttcaccttggggagcgccgattttgctagtaaagaagaaagatggtagtatg 15358087  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    ||| | || ||||| ||||| || |||||||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  15358086 aggctatgtattgattatcgacagttgaacaaggttactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttga 15358008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 23 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 15261816 - 15261555
Alignment:
Q  23 ttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaagagt 122  Q
    ||||| |||||||||||||  ||||| ||||| ||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |    
T  15261816 ttttcgattgaccttgttctaggaacgaagcctgtgtctatgacaccttaccgtatgtcggcttctgagttggccgagttgaagaaacaattagaagact 15261717  T
Q  123 tacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattgacta 222  Q
    | ||||||||||||||||  ||||| | ||||||||  |||||||  ||  | ||| | || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  15261716 tgcttgataagaagtttgcaagaccaaatgtttcacattggggagtgccgatattgctagttaagaagaaagatggtagtatgagattgtgcattgatta 15261617  T
Q  223 tcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    ||| || || |||||||| || || |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  15261616 tcgacagttaaacaaagtgacgataaagaatagatatccacttccgagaattgatgaattga 15261555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 18437343 - 18437065
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    |||||||||| || || ||||| ||||| |||||||  ||||| |||||  |||| ||| |||| || |||||||||||||||||||| || || |||||    
T  18437343 cagagagggaagttgaattttctattgatcttgttcttggaacgaagcctatgtctatgacaccttatcgtatgtcagcttctgagttggccgagttgaa 18437244  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
     ||||| || ||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||| || |||||||| || || ||| | ||||||||||| |||||||| |||    
T  18437243 aaaacaattagaagatttacttgagaaaaagtttgttagaccaagtgtttcgccttggggagcgccggttttgctagtgaagaagaaagatggtaggatg 18437144  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    || ||||| ||||| ||||| || || |||||||| ||||| |||||||  ||||| || ||||| |||||||| ||||    
T  18437143 agattgtgtattgattatcgacagtttaacaaagtgacaataaagaatatgtatccactcccgagaattgatgatttga 18437065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Original strand, 14579335 - 14579613
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    |||| ||||| || || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||  |||| |||||    
T  14579335 cagaaagggaagttgaattttctattgatcttgttcctggaacgaagcctgtgtctatgacaccttatcgtatgtcagcttctgagttgactgagttgaa 14579434  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    |||||| || || || || ||||| || |||||||| ||||| |||||||| || |||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| ||||||    
T  14579435 gaaacaattagaggatttgcttgagaaaaagtttgtaagaccaagtgtttcgccttggggagcgcccgttttgttagtaaagaagaaagatggcagtatg 14579534  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    ||||| |||||||| |||||  | ||||| || || || || |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||    
T  14579535 aggttatgcattgattatcgatagttgaataaggtaacgataaagaataggtatccacttccaagaattgatgatttga 14579613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 59 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 30139966 - 30139741
Alignment:
Q  59 tcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcac 158  Q
    ||||| || ||||| || ||||| || || ||||| | |||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| ||||| ||||||| ||||||||||    
T  30139966 tcgattgcgccgtatcggatgtctgcatcggagttgggtgaattgaagaatcagttggaagagttgcttgagaagcagtttattagaccgagtgtttcac 30139867  T
Q  159 cgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagata 258  Q
    ||||||| || || ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||  | || ||||| || |||||||| || || ||||||||| | ||    
T  30139866 cgtggggtgctccagtgttgttggttaagaagaaagatggaagcatgaggttgtgtgtggattatcgacagttgaacaaggtgacgattaagaatcggta 30139767  T
Q  259 tccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    ||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  30139766 tccacttccaaggattgatgatttga 30139741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 59 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 30149517 - 30149292
Alignment:
Q  59 tcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcac 158  Q
    ||||| || ||||| || ||||| || || ||||| | |||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| ||||| ||||||| ||||||||||    
T  30149517 tcgattgcgccgtatcggatgtctgcatcggagttgggtgaattgaagaatcagttggaagagttgcttgagaagcagtttattagaccgagtgtttcac 30149418  T
Q  159 cgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagata 258  Q
    ||||||| || || ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||  | || ||||| || |||||||| || || ||||||||| | ||    
T  30149417 cgtggggtgctccagtgttgttggttaagaagaaagatggaagcatgaggttgtgtgtggattatcgacagttgaacaaggtgacgattaagaatcggta 30149318  T
Q  259 tccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    ||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  30149317 tccacttccaaggattgatgatttga 30149292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 97 - 284
Target Start/End: Original strand, 13965370 - 13965557
Alignment:
Q  97 tgaattgaagaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgat 196  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| |||    
T  13965370 tgaattgaagaatcagttggaagagttgcttgagaagcagtttattagaccgagtgtttcaccgtggggtgctccagtgttgttggttaagaagaaagat 13965469  T
Q  197 ggtagtatgaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    || || |||||||||||  | || ||||| || |||||||| || || ||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  13965470 ggaagcatgaggttgtgtgtggattatcggcagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttga 13965557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 97 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 15612225 - 15612038
Alignment:
Q  97 tgaattgaagaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgat 196  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| |||    
T  15612225 tgaattgaagaatcagttggaagagttgcttgagaagcagtttattagaccaagtgtttcaccgtggggtgctccagtgttgttggttaagaagaaggat 15612126  T
Q  197 ggtagtatgaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    || || |||||||||||  | || ||||| || |||||||| || || ||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  15612125 ggaagcatgaggttgtgtgtggattatcggcagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttga 15612038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 129 - 270
Target Start/End: Original strand, 16834554 - 16834695
Alignment:
Q  129 ataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattgactatcgtca 228  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||  |||||||||| || || || |||||    
T  16834554 ataagaagtttgttcgacccagtgtttcaccatggggagcgcctgtgttattggtaaagaagaaggatggtagcctgaggttgtgtatagattaccgtca 16834653  T
Q  229 attgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgag 270  Q
     ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  16834654 gttgaacaaagttacaataaagaacaggtatccgcttccgag 16834695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 97 - 284
Target Start/End: Original strand, 15948488 - 15948675
Alignment:
Q  97 tgaattgaagaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgat 196  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||  ||||| |||| || |||||||| |||||||| || || ||||||||||| |||||||| |||    
T  15948488 tgaattgaagaaacagttagaagagttgcttgagaaacagtttattaggccgagtgtttcgccgtggggtgctccagtgttgttggttaagaagaaagat 15948587  T
Q  197 ggtagtatgaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    || ||||||||||||||  | || ||||| || ||||||||||| || ||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  15948588 ggaagtatgaggttgtgtgtggattatcggcagttgaacaaagtaacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttga 15948675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 6 - 117
Target Start/End: Original strand, 16327625 - 16327736
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16327625 cagagagggaggttgaatttttaattgaccttgatccaggaacaaagccggtgtcgatggcactataccgtatgtcagcttctgagttagccgaattgaa 16327724  T
Q  106 gaaacagttgga 117  Q
    |||||| |||||    
T  16327725 gaaacaattgga 16327736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 22 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 12071161 - 12071015
Alignment:
Q  22 gttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaagag 121  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||     
T  12071161 gttttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtctcgatggcaccttatcgtatgtctgcttccgagttatctgagttgaagaaacagttggaagac 12071062  T
Q  122 ttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagc 168  Q
    ||  |||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  12071061 ttgtttgagaagaagtttgttaggccaagtgtttcaccttggggagc 12071015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Original strand, 11888289 - 11888559
Alignment:
Q  14 gaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagt 113  Q
    ||||| || ||||| ||||| |||||||| || || ||||  ||||| ||| | || |||| |||||| |||||||||||  | || ||||||||||| |    
T  11888289 gaggttgaattttcgattgatcttgttcctggtacgaagcatgtgtctatgacgccttaccatatgtcggcttctgagttgtccgagttgaagaaacaat 11888388  T
Q  114 tggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtg 213  Q
    | ||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||  ||  | ||||| || |||||||| || ||||| |||||||| ||    
T  11888389 tagaagatttgcttgataagaagtttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagtgccgattttgttagttaagaagaaagacggtagcatgaggttatg 11888488  T
Q  214 cattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    |||||| ||||| || ||||  ||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  11888489 cattgattatcgacagttgattaaagtaacgataaacaataggtatccacttccaaggattgatgatttga 11888559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 59 - 284
Target Start/End: Original strand, 6150833 - 6151058
Alignment:
Q  59 tcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcac 158  Q
    ||||| ||| |||| || ||||| || || ||||| | |||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||  ||||| | || || |||||||| |    
T  6150833 tcgattgcatcgtatcggatgtctgcatcagagttgggtgaattaaagaaacagttagaagagttgcttgagaaacagtttatcaggccgagtgtttctc 6150932  T
Q  159 cgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagata 258  Q
    ||||||| || || ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||  | || ||||| || |||||||| || || ||||||||| ||||    
T  6150933 cgtggggtgctccagtgttgttggttaagaagaaagatggaagcatgaggttgtgtgtggattatcggcagttgaacaaggtgacgattaagaatcgata 6151032  T
Q  259 tccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    ||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  6151033 tccacttccaaggattgatgatttga 6151058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 132 - 233
Target Start/End: Original strand, 13304298 - 13304399
Alignment:
Q  132 agaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattgactatcgtcaatt 231  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||    
T  13304298 agaaatttgtaagacccagtgtttcaccatggggagcgcctgtgttgttggtaaagaagaaggatggtagtatgagattgtgcagtgactatcatcagtt 13304397  T
Q  232 ga 233  Q
    ||    
T  13304398 ga 13304399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 97 - 284
Target Start/End: Original strand, 8272417 - 8272604
Alignment:
Q  97 tgaattgaagaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgat 196  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||| ||||| ||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||| || || |||||| | || ||||||||  ||    
T  8272417 tgaaatgaagaatcagttggaagagttgcttgagaagcagtttattagaccgagtgtttcaccgtggggtgctccagtgttgctagttaagaagaaatat 8272516  T
Q  197 ggtagtatgaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    || || |||||||||||  | || |||||  | |||||||| || || ||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  8272517 ggaagcatgaggttgtgtgtggattatcggtagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttga 8272604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 6 - 108
Target Start/End: Original strand, 14874495 - 14874597
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||| || || |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  14874495 cagagagagaagttgagttttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagcttccgagttagctgagttgaa 14874594  T
Q  106 gaa 108  Q
    |||    
T  14874595 gaa 14874597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 97 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 17200756 - 17200569
Alignment:
Q  97 tgaattgaagaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgat 196  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| || ||||| ||| ||||| | || || |||||||| |||||||| || || ||||||||||| |||||||| |||    
T  17200756 tgaattgaagaagcagttagaagaattgcttgagaagcagtttatcaggccgagtgtttctccgtggggtgctccagtgttgttggttaagaagaaagat 17200657  T
Q  197 ggtagtatgaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
     | || || || |||||  | || |||||||| |||||||| || || ||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  17200656 tgaagcataagattgtgtgtggattatcgtcagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccgctcccgaggattgatgatttga 17200569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 117 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 25768420 - 25768253
Alignment:
Q  117 aagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcat 216  Q
    ||||||| ||||| ||| ||||| | || || |||||||| || ||||| || || ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||  |    
T  25768420 aagagttgcttgagaagcagtttatcaggccgagtgtttctccatggggtgctccagtgttgttggttaagaagaaagatggaagcatgagattgtgtgt 25768321  T
Q  217 tgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
     || ||||| || ||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  25768320 ggattatcggcagttgaacaaagtgacgattaagaatcgatatccgcttctaaggattgatgatttga 25768253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 164 - 284
Target Start/End: Original strand, 16327734 - 16327854
Alignment:
Q  164 ggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgc 263  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||| || || ||||| ||||| || || |  || ||||| || ||||| |    
T  16327734 ggagcaccggtgttgttggttaagaagaaggatggtagtatgagactgtgcatagattaccgtcagttgaataaggtcatgataaagaacaggtatccac 16327833  T
Q  264 ttccgaggattgatgacttga 284  Q
    || |||| ||||| |||||||    
T  16327834 tttcgagaattgacgacttga 16327854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 213
Target Start/End: Original strand, 14874600 - 14874676
Alignment:
Q  137 tttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtg 213  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||  | ||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  14874600 tttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccagtttttctagtgaagaagaaagatggtagcatgagattgtg 14874676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 255; Significance: 1e-142; HSPs: 55)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Original strand, 31568974 - 31569252
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31568974 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcctggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 31569073  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  31569074 gaaacagttggaagacttacttgataagaagtttgtaagacccagtgtttcgccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaaaaaggatggtagtatg 31569173  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31569174 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 31569252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Original strand, 21323410 - 21323688
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21323410 cagagagggaggttgaattttcaattgaccttgttccatgaacgaagccggtgtcgatggcaccttaccgtatgtcagcttccgagttagctgaattgaa 21323509  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| || || |||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  21323510 gaaacagttggaagacttgcttgataagaagtttgtaagaccaagtgtctcaccttggggagcgccggtattgttggtaaagaagaaggatggtagtatg 21323609  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||    
T  21323610 aggttatgtattgactatcgtcagttgaataaagttacaataaagaataggtatccacttccgaggattgacgacttga 21323688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 22053512 - 22053235
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| |||||| ||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22053512 cagagagggaggttgaattttcaattgaccttgtcccaggaacgaagccgatgtcgatggcaccttatcgtatgtcatcttctgagttagctgaattgaa 22053413  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    |||||||||||| || |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||| |||    
T  22053412 gaaacagttggaggactagcttgataagaagtttgttagacccaatgtttcaccgt-gggagcgcctgtgttgttggtaaagaagaaggacggtagcatg 22053314  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||    
T  22053313 aggttgtgcattgactatcgtcagttgaacaaagttacaataaagaacaggtatccgcttccgagaattgatgacttga 22053235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 6 - 276
Target Start/End: Original strand, 16269355 - 16269625
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  16269355 cagagagagaggttgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccggtgtcgatggcaccataccgtatgtcaacttctgagttagctgagttgaa 16269454  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    |||||||||||||||  |  | |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  16269455 gaaacagttggaagacctgttggataagaaatttgtaagacccagtgtttcaccttggggagcaccggtgttgttggttaagaagaaggatggtagtatg 16269554  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattga 276  Q
    ||  ||||||| || || ||||| |||||||| ||||| || ||||| || |||||||||||||| |||||    
T  16269555 agactgtgcatagattaccgtcagttgaacaaggttacgataaagaacaggtatccgcttccgagaattga 16269625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 9 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 27357183 - 27356908
Alignment:
Q  9 agagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaa 108  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27357183 agagggaggttgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatagaaccataccgtatgtcagcttctgagttagctaaattgaagaa 27357084  T
Q  109 acagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgagg 208  Q
    |||||| || ||  |  | |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||     
T  27357083 acagtttgaggacctgttagataagaaatttgtaagacccagtgtttcaccttggggagcaccggtgttgttggttaagaagaaggatggtagtatgaga 27356984  T
Q  209 ttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    |||||||| || || ||||| |||||||||||| | || ||||| || ||||||||||| || ||||| |||||||    
T  27356983 ttgtgcatagattaccgtcagttgaacaaagtttcgataaagaacaggtatccgcttcctagaattgacgacttga 27356908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 28983561 - 28983283
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  28983561 cagagagggaggttgaattctcaattgatcttgttccaggaactaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttggctgagttgaa 28983462  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    |||||| ||||| ||  |  | |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  28983461 gaaacaattggaggacctgttagataagaaatttgtaagacccagtgtttcaccttggggagcaccggtgttgttggtaaagaagaaggatggtagtatg 28983362  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    ||  | || || || || ||||| |||||||||||||| || ||||| || ||||||||||| || ||||| |||||||    
T  28983361 agactttgtatagattaccgtcagttgaacaaagttacgatcaagaacaggtatccgcttcctagaattgacgacttga 28983283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 28988780 - 28988502
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  28988780 cagagagggaggttgaattctcaattgatcttgttccaggaactaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttggctgagttgaa 28988681  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    |||||| ||||| ||  |  | |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  28988680 gaaacaattggaggacctgttagataagaaatttgtaagacccagtgtttcaccttggggagcaccggtgttgttggtaaagaagaaggatggtagtatg 28988581  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    ||  | || || || || ||||| |||||||||||||| || ||||| || ||||||||||| || ||||| |||||||    
T  28988580 agactttgtatagattaccgtcagttgaacaaagttacgatcaagaacaggtatccgcttcctagaattgacgacttga 28988502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 6 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 19984830 - 19984557
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| || || |||||||||||||||||    
T  19984830 cagagagggaggttgaattttcaattgatcttgttcccggaacgaagccggtgtcgatggcaccttactgtatgtcggcgtccgagttagctgaattgaa 19984731  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    |||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||| |||| ||||||||||||||||| |||    
T  19984730 gaaacagttggaggacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcaccggtattgctggttaagaagaatgatggtagcatg 19984631  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatga 279  Q
    ||||| || || || || |||||  |||| ||||| || || |||||||| ||||| |||| ||||||||||||    
T  19984630 aggttatgtatagattaccgtcagctgaataaagtgacgataaagaataggtatccacttctgaggattgatga 19984557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 7 - 284
Target Start/End: Original strand, 21164670 - 21164947
Alignment:
Q  7 agagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaag 106  Q
    |||||| || || |||||||| ||||| ||| |||| |||||  ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||    
T  21164670 agagagagaagttgagttttctattgatcttattcctggaacggagccggtgtcgatggcaccttatcgtatatcagcttccgagttagctgagttgaag 21164769  T
Q  107 aaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatga 206  Q
    |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  21164770 aaacagttagaagatttgcttgagaagaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggttttgttagtgaagaagaaagatggtagtatga 21164869  T
Q  207 ggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    ||||||| || || |||||||| ||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  21164870 ggttgtgtatcgattatcgtcagttgaacaaagtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttga 21164947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 17 - 279
Target Start/End: Original strand, 29301568 - 29301830
Alignment:
Q  17 gtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttgg 116  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  29301568 gtggaattttcaatagaccttgttccgggtacaaagcctgtgtcgatggctccttaccgtatgtcggcgtctgagttagccgagttgaagaaacagttgg 29301667  T
Q  117 aagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcat 216  Q
    | || |||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| || |||||||| ||||| ||||||||    
T  29301668 aggacttacttgataagaaatttgtaaggccaagtgtttcaccttggggagcaccggtgttgttagtaaagaaaaaggatggtagcatgagattgtgcat 29301767  T
Q  217 tgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatga 279  Q
     || || ||||| |||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  29301768 cgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaacaggtatccgcttccgaggattgatga 29301830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 15536033 - 15535755
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    |||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  15536033 cagaaagggaagtcgagttttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtgtcgatggcaccatatcgtatgtctgcttccgagttagctgagttgaa 15535934  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||| | ||||||||||| |||||||| |||    
T  15535933 gaaacagttagaagatttgctcgaaaataaatttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccagttttgctagtgaagaagaaagatggtagcatg 15535834  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  15535833 agattgtgtattgactatcgtcagttgaacaaagtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttga 15535755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 20 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 22042463 - 22042199
Alignment:
Q  20 gagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaag 119  Q
    |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  22042463 gagttttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtctgcttccgagttagctgagttgaagaaacagttagaag 22042364  T
Q  120 agttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattga 219  Q
    | || ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||| || || ||| | ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  22042363 atttgcttgagaagaaatttgttagaccaagtgtttcaacttggggagcgccagttttgctagtgaagaagaaagatggtagcatgagattgtgtattga 22042264  T
Q  220 ctatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    ||||||||| |||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  22042263 ctatcgtcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttga 22042199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Original strand, 17672153 - 17672432
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttccc-ggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattga 104  Q
    ||||||| || || |||||||| ||||| ||||||||  ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||| |||| ||||    
T  17672153 cagagagagaagttgagttttctattgatcttgttccttggaacgaagccggtctcgatggcaccttatcgtatgtctgcttctgagttatctgagttga 17672252  T
Q  105 agaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtat 204  Q
    |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| |||||||||||    
T  17672253 agaaacagttggaagacttgcttgagaagaagtttgttagaccgagtgtttcaccttggggagcgccggttttgttagtaaagaagaaagatggtagtat 17672352  T
Q  205 gaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    | ||||||| ||||| ||||| || |||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  17672353 gcggttgtgtattgattatcggcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttga 17672432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 19980617 - 19980339
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||| || || |||||||| | ||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  19980617 cagagagagaagttgagttttctaatgatcttgttcctggaacgaagcccgtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagcttccgagttagctgagttgaa 19980518  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    ||||| ||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  19980517 gaaacggttagaagatttgcttgagaagaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgcccgttttgttagtaaagaagaaagatggtagtatg 19980418  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    || || || || || || ||||| ||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  19980417 agattatgtatcgattaccgtcagttgaacaaagtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgacttga 19980339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Original strand, 20016394 - 20016672
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||| || || |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||| |||| |||||    
T  20016394 cagagagagaagttgagttttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtctcgatggcaccttatcgtatgtctgcttctgagttatctgagttgaa 20016493  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  | || ||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  20016494 gaaacagttggaagacttgcttgagaagaagtttgttagaccgagtgtttcaccttggggagcgtcggttttgttagtaaagaagaaagatggtagtatg 20016593  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    ||| | || ||||| ||||| || |||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  20016594 aggctatgtattgattatcgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttga 20016672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Original strand, 30311275 - 30311553
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    |||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  30311275 cagagagggaagttgagttttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtctgcttccgagttagctgagttgaa 30311374  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||| | || |||||||| |||| ||| |||    
T  30311375 gaaacagttagaagatttgcttgagaagaaatttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccagttttgctagtaaagaagaaagatgatagcatg 30311474  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    || ||||| |||||||||||||| |||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||  |||||||| ||||    
T  30311475 agattgtgtattgactatcgtcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgataattgatgatttga 30311553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 32602795 - 32602517
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    |||| ||||| || || ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  32602795 cagaaagggaagtcgaattttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtctgcttccgagttagctgagttgaa 32602696  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    ||||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||| | || |||||||| ||| |||| |||    
T  32602695 gaaacagttagatgatttgcttgaaaagaaatttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccagttttgctagtaaagaagaaagatagtagcatg 32602596  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||    
T  32602595 aggttgtgtattgactatcgtcagttgaacaaagtaactatcaagaataggtatccactaccgagaattgatgatttga 32602517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 6 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 20390736 - 20390463
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    |||||||||| || || ||||||||||| |||||||| || || | || |||||||||||| || ||||||||||| |  |||||||||||||| |||||    
T  20390736 cagagagggaagttgaattttcaattgatcttgttccgggtacgatgctggtgtcgatggcgccttaccgtatgtcggtgtctgagttagctgagttgaa 20390637  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| |||    
T  20390636 gaaacagttggaagatttacttgacaagaagtttgtaagaccgagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaagatggtagcatg 20390537  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatga 279  Q
    |||||||| || |  || ||||| ||||| ||||| || || || ||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  20390536 aggttgtgtatagtttaccgtcagttgaataaagtgacgataaataataggtatccacttccgagaattgatga 20390463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 6 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 21928078 - 21927802
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| || |||||||| || || ||||||||| |||||||    
T  21928078 cagagagggaggttaaattttcaattgatcttgttcccagaacgaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtcggcgtccgagttagctaaattgaa 21927979  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| || |||||||| || |||||||| |||||||| |||||||| |||    
T  21927978 gaaacagttggaggacttacttgataagaaatttgtaagaccgagtgtttcaccttgtggagcaccggtattgttggttaagaagaaggatggtagcatg 21927879  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgactt 282  Q
    ||||| || || || || |||||  |||| ||||| |  || |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||    
T  21927878 aggttatgtatagattaccgtcagctgaataaagtgatgataaagaataggtatccacttccgagaattgacgactt 21927802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Original strand, 22118306 - 22118584
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||| || || |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| |||||| |||| |||||    
T  22118306 cagagagagaagttgagttttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtctcgatcgcaccttatcgtatgtctgcttccgagttatctgagttgaa 22118405  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    |||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  22118406 gaaacagttggaggacttgcttgagaagaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggttttgttagtaaagaagaaagatggtagtatg 22118505  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
     |||| || ||||| ||||| || |||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  22118506 cggttatgtattgattatcggcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttga 22118584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 6 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 22373519 - 22373245
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||| |||||||     
T  22373519 cagagagggaggttgaattttcaattgatcttgttcccggaacgaagccgctgtcgatggcaccttaccgtatgttggcgtctgagttagccgaattgat 22373420  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgata-agaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtat 204  Q
    |||||||||||| || ||||||||||  ||| ||| | ||||| ||||||||||| |||||||| |  || |||||||| |||||||| |||||||| ||    
T  22373419 gaaacagttggaggatttacttgatagggaaatttataagaccgagtgtttcaccttggggagcgctggtattgttggttaagaagaaggatggtagcat 22373320  T
Q  205 gaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatga 279  Q
    ||||||||| || || || ||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  22373319 gaggttgtgtatagattaccgtcagttgaataaagtgacgataaagaatagatatccacttccaagaattgatga 22373245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Original strand, 22127090 - 22127368
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||| || || |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| |||||| |||| |||||    
T  22127090 cagagagagaagttgagttttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtctcgatcgcaccttatcgtatttctgcttccgagttatctgagttgaa 22127189  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    |||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  22127190 gaaacagttggaggacttgcttgagaagaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggttttgttagtaaagaagaaagatggtagtatg 22127289  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
     |||| || ||||| ||||| || |||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  22127290 cggttatgtattgattatcggcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttga 22127368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 23 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 22523179 - 22522918
Alignment:
Q  23 ttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaagagt 122  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||| |||| |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| |    
T  22523179 ttttcgattgaccttgttccgggaacgaagcctgtgtctatgacaccttaccatatgtcagcttctgagttggctgagttgaagaaacaattagaagatt 22523080  T
Q  123 tacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattgacta 222  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| || || ||| | || |||||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||    
T  22523079 tgcttgataagaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggcgagcgccagtattgctagttaagaagaaggatggtagcatgagattatgcattgatta 22522980  T
Q  223 tcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    ||| || ||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||    
T  22522979 tcgacagttgaacaaagtaacgataaagaacaggtatccacttccaagaattgatgacttga 22522918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 20 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 22030739 - 22030475
Alignment:
Q  20 gagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaag 119  Q
    |||||||| ||||| ||||||||  |||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| ||| ||||    
T  22030739 gagttttctattgatcttgttcctcgaacgaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtctgcttccgagttagctgagttgaagaaacggttagaag 22030640  T
Q  120 agttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattga 219  Q
    | || ||||| || || ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||  | |||| |||||| |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  22030639 atttgcttgagaataaatttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgcccgtttttctagtgatgaagaaagatggtagcatgagattgtgtattga 22030540  T
Q  220 ctatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    ||||||||| |||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  22030539 ctatcgtcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttga 22030475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 74 - 282
Target Start/End: Original strand, 31414668 - 31414876
Alignment:
Q  74 cgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctg 173  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||  || |    
T  31414668 cgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaggacttgcttgataagaagtttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagtgccgg 31414767  T
Q  174 tgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggat 273  Q
    ||||||| || |||||||| |||||||| ||||  || |||||| | || ||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||    
T  31414768 tgttgttagttaagaagaaggatggtagcatgaaattatgcattaattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgagaat 31414867  T
Q  274 tgatgactt 282  Q
    |||||||||    
T  31414868 tgatgactt 31414876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 71 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 23657512 - 23657301
Alignment:
Q  71 taccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcac 170  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || || || || ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |    
T  23657512 taccgtatgtcagcttccgagttagctgaattgaaaaaacaatttgaggacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgc 23657413  T
Q  171 ctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgag 270  Q
      |||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||| ||||||||    
T  23657412 tggtgttgttagttaagaagaaggatggtagcatgagattatgcattgattatcgtcaattgaacaaagttacgataaagaacaggtatccacttccgag 23657313  T
Q  271 gattgatgactt 282  Q
    ||||||||||||    
T  23657312 gattgatgactt 23657301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 18859227 - 18858949
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||| || || |||||||| ||||| ||||||||  |||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||  ||||| |||| |||||    
T  18859227 cagagagagaagttgagttttctattgatcttgttcctagaacgaagccggtctcgatggcaccttatcgtatgtctgcttccaagttatctgagttgaa 18859128  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    |||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  18859127 gaaacagttggaggacttgcttgagaagaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggttttgttagtaaagaagaaagatggtagtatg 18859028  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
     |||| || ||||| ||||| || | |||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  18859027 cggttatgtattgattatcggcagtggaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttga 18858949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 9 - 284
Target Start/End: Original strand, 22131175 - 22131450
Alignment:
Q  9 agagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaa 108  Q
    ||||||| || |||||||| ||  | |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||    
T  22131175 agagggaagtcgagttttctatgaatcttgttcctggaacgaagccggtgtcgatggcaccttaccgtatgtctgcttccgagttagccgagttgaagaa 22131274  T
Q  109 acagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgagg 208  Q
    ||| || ||||| || ||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||| | ||||||||||| || ||| | |||||     
T  22131275 acaattagaagatttgcttgaaaagaaattcgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccagttttgctagtgaagaagaaagacggtggcatgaga 22131374  T
Q  209 ttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  22131375 ttgtgtattgactattgtcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttga 22131450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 124 - 282
Target Start/End: Original strand, 22060928 - 22061086
Alignment:
Q  124 acttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattgactat 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||    
T  22060928 acttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccttggggagcgcctgtgttgttggtaaagaagaaggacggtagcatgaggttgtgcattgattat 22061027  T
Q  224 cgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgactt 282  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  22061028 cgtcagttgaacaaagttacgataaagaacaggtatccacttcccaggattgatgactt 22061086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 23 - 284
Target Start/End: Original strand, 22422040 - 22422301
Alignment:
Q  23 ttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaagagt 122  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||  ||||| ||| |||| |||||||||||  |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |    
T  22422040 ttttcgattgatcttgttccgggaacgaagcttgtgtctatgacaccttaccgtatgtcgacttctgagttggctgagttgaagaaacagttagaagatt 22422139  T
Q  123 tacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattgacta 222  Q
    | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || || ||| |||| |||||||| |||||||| || || ||||| ||||||||    
T  22422140 tgcttgataagaagtttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtattgctggttaagaagaaagatggtagcataagattgtgtattgacta 22422239  T
Q  223 tcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    ||| || ||||| ||||| || || |||||||| ||| | |||||||| |||||||| ||||    
T  22422240 tcgacagttgaataaagtgacgataaagaataggtattcacttccgagaattgatgatttga 22422301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 6 - 278
Target Start/End: Original strand, 19482203 - 19482475
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||| || || |||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| || ||| |||| |||||    
T  19482203 cagagagagaagtcgagttttctattgatcttgttcctggaacgaaaccggtctcgatggcaccttatcgtatgtctgcttcagaattatctgagttgaa 19482302  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    |||||||||||| || || || || | ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||| | || |||||||| ||||||||||||    
T  19482303 gaaacagttggaggacttgctcgaaaggaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggttttgctagtaaagaagaaagatggtagtatg 19482402  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatg 278  Q
     ||||||| ||||| ||||| || |||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  19482403 cggttgtgtattgattatcggcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatg 19482475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Original strand, 19864224 - 19864502
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||| || || |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||| |||| || |||||||||||||||||||| || || |||||    
T  19864224 cagagagagaagttgagttttcgattgatcttgttcctggaacgaagcctgtgtctatgacaccctatcgtatgtcagcttctgagttggccgagttgaa 19864323  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    |||| | || || || || | ||| || |||||||||||||| || |||||||| |||||||| || || ||| | ||||||||||| |||||||| |||    
T  19864324 gaaataattagaggacttgcatgagaaaaagtttgttagaccaagagtttcaccttggggagcgccggttttgctagtgaagaagaaagatggtagcatg 19864423  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    || ||||| |||||||||||  | |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  19864424 agattgtgtattgactatcgaaagttgaacaaggtgacaataaagaataggtatccacttccgaggattgatgatttga 19864502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 6 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 19115050 - 19114831
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||  |||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||| |||| |||||    
T  19115050 cagagagagaagttgaattttctattgatcttgttcctagaacgaagccggtctcgatggcaccttatcgtatgtctgcttctgagttatctgagttgaa 19114951  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||| | || |||||||| ||||||||||||    
T  19114950 gaaacagttagaagacttgcttgagaagaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggttttgctagtaaagaagaaagatggtagtatg 19114851  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcg 225  Q
     ||||||| ||||| |||||    
T  19114850 cggttgtgtattgattatcg 19114831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Original strand, 21391992 - 21392270
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    |||||||||| || |||||||  ||||| |||||||| ||||  ||||| ||||| ||| |||| || ||||||||| ||| | |||| || || |||||    
T  21391992 cagagagggaagttgagtttttgattgatcttgttcctggaatgaagcctgtgtctatgacaccttatcgtatgtcaacttataagttggccgagttgaa 21392091  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    |||||| || || || || ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||  || || ||| | ||||||||||| || ||||| |||    
T  21392092 gaaacaattagaggacttgcttgagaaaaagtttgttagacccagtgtttcaccttggggagtgccggttttgctagtgaagaagaaagaaggtagcatg 21392191  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    || ||||| ||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  21392192 agattgtgtattgactatcgacagttgaacaaggtgacaataaagaataggtatccacttccgaggattgatgatttga 21392270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Original strand, 21781318 - 21781596
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    |||||||||| || |||||||  ||||| |||||||| ||||  ||||| ||||| ||| |||| || ||||||||| ||| | |||| || || |||||    
T  21781318 cagagagggaagttgagtttttgattgatcttgttcctggaatgaagcctgtgtctatgacaccttatcgtatgtcaacttataagttggccgagttgaa 21781417  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    |||||| || || || || ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||  || || ||| | ||||||||||| || ||||| |||    
T  21781418 gaaacaattagaggacttgcttgagaaaaagtttgttagacccagtgtttcaccttggggagtgccggttttgctagtgaagaagaaagaaggtagcatg 21781517  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    || ||||| ||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  21781518 agattgtgtattgactatcgacagttgaacaaggtgacaataaagaataggtatccacttccgaggattgatgatttga 21781596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Original strand, 21786486 - 21786764
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    |||||||||| || |||||||  ||||| |||||||| ||||  ||||| ||||| ||| |||| || ||||||||| ||| | |||| || || |||||    
T  21786486 cagagagggaagttgagtttttgattgatcttgttcctggaatgaagcctgtgtctatgacaccttatcgtatgtcaacttataagttggccgagttgaa 21786585  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    |||||| || || || || ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||  || || ||| | ||||||||||| || ||||| |||    
T  21786586 gaaacaattagaggacttgcttgagaaaaagtttgttagacccagtgtttcaccttggggagtgccggttttgctagtgaagaagaaagaaggtagcatg 21786685  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    || ||||| ||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  21786686 agattgtgtattgactatcgacagttgaacaaggtgacaataaagaataggtatccacttccgaggattgatgatttga 21786764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 21253594 - 21253316
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    |||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||  ||||| ||| |||| || ||||||||||||| |||||| || || |||||    
T  21253594 cagagagggaagttgagttttcgattgatcttgttcctggaacgaagcatgtgtctatgacaccttatcgtatgtcagcttttgagttggccgagttgaa 21253495  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    |||||| || || || || || || || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||| | ||||||||||| |||||||| |||    
T  21253494 gaaacaattagaggatttgctcgagaaaaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggttttgcttgtgaagaagaaagatggtagcatg 21253395  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    || ||||  ||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||| ||||  ||| |||| |||||||| ||||    
T  21253394 agattgtttattgactatcgacagttgaacaaggtgacaataaagaataggtatcaactttcgagaattgatgatttga 21253316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 50 - 284
Target Start/End: Original strand, 22375628 - 22375862
Alignment:
Q  50 aagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagaccca 149  Q
    ||||| ||||| ||| |||| | ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||| |    
T  22375628 aagcctgtgtctatgacaccttgccgtatgtcggcttctgagttggctgagttgaagaaacagttagaagatttgcttgataagaagtttgtaagaccaa 22375727  T
Q  150 gtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaa 249  Q
    || ||||||| |||||||| || || ||| | || |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||  | ||||| ||||| || || ||    
T  22375728 gtatttcaccttggggagcgccggtattgctagttaagaagaaagatggtagtatgagattgtgtattgattatcgatagttgaataaagtaacgataaa 22375827  T
Q  250 gaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    |||||||||||| ||||| || |||||||| ||||    
T  22375828 gaatagatatccacttccaagaattgatgatttga 22375862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 56 - 278
Target Start/End: Original strand, 22246614 - 22246836
Alignment:
Q  56 gtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgttt 155  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  22246614 gtgtctatgacaccttaccgtatgtcaacttctgatttggctgagttgaagaaacagttagaagatttgcttgataagatgtttgtaagaccaagtgttt 22246713  T
Q  156 caccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatag 255  Q
    |||| |||||||| || || ||| | || |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| || || || || |||||| |    
T  22246714 caccttggggagcgccggtattgctagttaagaagaaagatggtagtatgaggttgtgtattgattatcgacaattgaataaggtaacgataaagaatgg 22246813  T
Q  256 atatccgcttccgaggattgatg 278  Q
     ||||| ||||| || |||||||    
T  22246814 gtatccacttccaagaattgatg 22246836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 130
Target Start/End: Original strand, 22028412 - 22028535
Alignment:
Q  7 agagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaag 106  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22028412 agagagggaggttgagttctcaattgaccttgttccgggaacgaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagcgtctgagttagctgaattgaag 22028511  T
Q  107 aaacagttggaagagttacttgat 130  Q
    ||||||||||| || || ||||||    
T  22028512 aaacagttggaggacttgcttgat 22028535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 101 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 4984597 - 4984414
Alignment:
Q  101 ttgaagaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggta 200  Q
    ||||||||||||||||| ||  |  | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  4984597 ttgaagaaacagttggaggacctgttggataagaagtttgtaagacccagtgtttcaccttggggagcaccggtgttgttggtcaagaagaaggatggta 4984498  T
Q  201 gtatgaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    |||||||  |||| || || || ||||| |||||||||||||| || ||||| |  ||||||||||| || ||||| |||||||    
T  4984497 gtatgagactgtgtatagattaccgtcagttgaacaaagttacgatcaagaacaagtatccgcttcctagaattgacgacttga 4984414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 59 - 284
Target Start/End: Original strand, 20650539 - 20650764
Alignment:
Q  59 tcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcac 158  Q
    ||||| |||||||| || ||||| || || ||||| | |||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| | || ||  ||| ||| |    
T  20650539 tcgattgcaccgtatcggatgtctgcatcagagttggatgaattgaagaaacagttagaagagttgcttgagaagaagtttatcaggccttgtgcttctc 20650638  T
Q  159 cgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagata 258  Q
    ||||||| || || ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||  | || ||||| || |||||||| || |||||||||||| | ||    
T  20650639 cgtggggtgctccagtgttgttggttaagaagaaagatggaagcatgaggttgtgtgtggattatcggcagttgaacaaggtgacaattaagaatcggta 20650738  T
Q  259 tccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  20650739 tccacttccgaggattgatgatttga 20650764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 97 - 284
Target Start/End: Original strand, 16875317 - 16875504
Alignment:
Q  97 tgaattgaagaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgat 196  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||| || || |||||| |||| |||||||| |||    
T  16875317 tgaattgaagaatcagttggaagagttgcttgagaagcagtttattagaccgagtgtttcaccgtggggtgctccagtgttgctggttaagaagaaagat 16875416  T
Q  197 ggtagtatgaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    || || |||||||||||  | || ||||| || |||||||| || || ||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  16875417 ggaagcatgaggttgtgtgtggattatcggcagttgaacaaggtgacgattaagaattggtatccacttccaaggattgatgatttga 16875504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 71 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 23887613 - 23887400
Alignment:
Q  71 taccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcac 170  Q
    ||||||||||  ||||||||||| ||||  |||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||  |    
T  23887613 taccgtatgttggcttctgagttggctgcgttgaagaaacagtaagaagatttgcttgataagaagtttgtaagaccgagtgtttcaccttggggagtgc 23887514  T
Q  171 ctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgag 270  Q
    |  | ||||| || |||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| || || |||||||| ||||| ||||  ||    
T  23887513 cgattttgttagttaagaagaaagatggtagcatgaggttatgcattgattatcgacagttgaataaagtaacgataaagaataggtatccacttcgaag 23887414  T
Q  271 gattgatgacttga 284  Q
     |||||||| ||||    
T  23887413 aattgatgatttga 23887400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 7 - 255
Target Start/End: Original strand, 20394265 - 20394513
Alignment:
Q  7 agagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaag 106  Q
    ||||||||| || || ||||| ||||| |||||||  || || ||||  ||||| |||||||| || ||||||||  ||| ||| |||||||| |  |||    
T  20394265 agagagggaagttgaattttcgattgatcttgttctgggtacgaagcttgtgtctatggcaccttatcgtatgtcgacttttgaattagctgagtgtaag 20394364  T
Q  107 aaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatga 206  Q
    ||| |||| || || || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||  | ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  20394365 aaatagttagaggatttgcttgataagaagtttgtaagaccgagtgtttcaccttggggagcgtcggtgttgttggttaagaagaaagatggtagcatga 20394464  T
Q  207 ggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatag 255  Q
    |||||   || || || || |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  20394465 ggttggttatagattaccggcaattgaacaaagtgacaataaagaatag 20394513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 23 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 22989678 - 22989417
Alignment:
Q  23 ttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaagagt 122  Q
    ||||| |||||| ||||||| || || ||||| ||||| ||| || | |||||||||||  |||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |    
T  22989678 ttttcgattgacattgttccgggtacgaagcctgtgtctatgacaacttaccgtatgtcgacttctgagttggccgagttgaagaaacatttagaagatt 22989579  T
Q  123 tacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattgacta 222  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| |||| ||| ||  | ||| | || |||||||| |||||||| ||||  || |||||||| ||    
T  22989578 tacttgataagatgtttgtaagaccaagtgtttcaccttgggaagcgccgatattgctagttaagaagaaagatggtagcatgatattatgcattgatta 22989479  T
Q  223 tcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    ||| |  ||||| ||||| || || |||||||| ||||| ||||| |  |||||||||||||    
T  22989478 tcgacggttgaataaagtaacgataaagaataggtatccacttccaataattgatgacttga 22989417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 68 - 284
Target Start/End: Original strand, 21848530 - 21848746
Alignment:
Q  68 ccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggag 167  Q
    ||||| || ||||| || || ||||| | |||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| ||||| | ||||| |||||||| |||||||| |    
T  21848530 ccgtatcggatgtctgcatcagagttgggtgaattgaagaatcagttggaagagttgcttgagaagcagtttatcagaccaagtgtttcgccgtggggtg 21848629  T
Q  168 cacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttcc 267  Q
    | |  ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||  | || ||||| || |||||||| || || ||||||||| | |||||  ||||    
T  21848630 ctctagtgttgttggttaagaagaaagatggaagcatgaggttatgtgtggattatcggcagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccatttcc 21848729  T
Q  268 gaggattgatgacttga 284  Q
     ||||||||||| ||||    
T  21848730 aaggattgatgatttga 21848746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 59 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 23902761 - 23902541
Alignment:
Q  59 tcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcac 158  Q
    ||||| || ||||| || ||||| || || ||||| | |||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| ||||  ||||||  ||| |||| |    
T  23902761 tcgattgcgccgtatcggatgtctgcatcagagttgggtgaattgaagaagcagttggaagagttgcttgagaagcagttcattagactgagtttttctc 23902662  T
Q  159 cgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagata 258  Q
    ||||||| |  ||  |||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||  | || ||||| || |||||||| || || |||||||||   ||    
T  23902661 cgtggggtgttccaatgttgttggttaagaagaaggatgggagcatgaggttgtgtgtggattatcggcagttgaacaaggtgacgattaagaatcagta 23902562  T
Q  259 tccgcttccgaggattgatga 279  Q
    |||||||| ||||||||||||    
T  23902561 tccgcttctgaggattgatga 23902541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 97 - 279
Target Start/End: Original strand, 21194762 - 21194944
Alignment:
Q  97 tgaattgaagaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgat 196  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| || ||||| ||| ||||| | || || |||||||| |||||||| || || ||||||||||| |||||||| |||    
T  21194762 tgaattgaagaagcagttagaagaattgcttgagaagcagtttatcaggccgagtgtttctccgtggggtgctccagtgttgttggttaagaagaaagat 21194861  T
Q  197 ggtagtatgaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatga 279  Q
    || ||  ||||||||||  | || || || || |||||||| || || ||||||||| | |||||||||| ||||||||||||    
T  21194862 ggaagcgtgaggttgtgtgtggattaccgacagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccgcttctgaggattgatga 21194944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 59 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 16414688 - 16414463
Alignment:
Q  59 tcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcac 158  Q
    ||||| || ||||| || ||||| || || ||||| | |||||| ||| ||||||| ||||| || ||||| ||| ||||| | ||||| ||| |||| |    
T  16414688 tcgattgcgccgtatcgaatgtctgcatcagagttgggtgaatttaaggaacagttagaagaattgcttgagaagcagtttatcagaccgagtatttctc 16414589  T
Q  159 cgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagata 258  Q
    ||||||| || ||  |||||||||| |||||||| ||||| || |||||| ||||  | || ||||| || ||||||||||| || ||||||||| | ||    
T  16414588 cgtggggtgctccaatgttgttggttaagaagaaagatggaagcatgaggatgtgtgtggattatcggcagttgaacaaagtgacgattaagaatcggta 16414489  T
Q  259 tccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    ||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  16414488 tccacttccaaggattgatgatttga 16414463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 59 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 22436900 - 22436675
Alignment:
Q  59 tcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcac 158  Q
    ||||| || ||||| || ||||| || || ||||| | |||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||| ||||| | ||  | |||||||| |    
T  22436900 tcgattgcgccgtatcggatgtctgcatcggagttcggtgaattgaagaagcagttagaagagttgcttgagaagtagtttatcagggcgagtgtttctc 22436801  T
Q  159 cgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagata 258  Q
    ||||||| || || ||||||||||| |||||||| ||| | |  |||||||||||  | || ||||| || |||||||| || || ||||||||| | ||    
T  22436800 cgtggggtgctccagtgttgttggttaagaagaaagatagaaacatgaggttgtgtgtggattatcggcagttgaacaaggtgacgattaagaatcggta 22436701  T
Q  259 tccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    |||||||  |||||||||||| ||||    
T  22436700 tccgcttatgaggattgatgatttga 22436675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 104 - 284
Target Start/End: Original strand, 23155271 - 23155451
Alignment:
Q  104 aagaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagta 203  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||| ||| ||||| | || || |||||||| |||||||| || || ||||||||| | |||||||| ||||| || |    
T  23155271 aagaaacagttagaagaattgcttgagaagtagtttatcaggccgagtgtttctccgtggggtgctccagtgttgttgtttaagaagaaagatggaagca 23155370  T
Q  204 tgaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    ||||||||||  | || ||| | || |||||||| || || ||||||||| | |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  23155371 tgaggttgtgtgtggattattggcagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccgcttctgaggattgatgatttga 23155451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 59 - 284
Target Start/End: Original strand, 24932008 - 24932233
Alignment:
Q  59 tcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcac 158  Q
    ||||| || ||||| || ||||| || || ||||| | |||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| || || | || |  |||||||| |    
T  24932008 tcgattgcgccgtatcggatgtctgcatcagagttgggtgaattgaagaaacagttagaagagttgcttgagaagcaggttatcaggctgagtgtttcgc 24932107  T
Q  159 cgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagata 258  Q
    ||||||| ||    ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||  | || ||| | || ||||||||||| || ||||| ||| | ||    
T  24932108 cgtggggtgctatagtgttgttggttaagaagaaagatggaagcatgaggttgtgtgtggattattggcagttgaacaaagtgacgattaaaaatcggta 24932207  T
Q  259 tccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    ||| ||||| | ||||||||| ||||    
T  24932208 tccacttccaatgattgatgatttga 24932233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 197 - 284
Target Start/End: Original strand, 21782742 - 21782829
Alignment:
Q  197 ggtagtatgaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  21782742 ggtagcatgagattgtgtattgactatcgacagttgaacaaggtgacaataaagaataggtatccacttccgaggattgatgatttga 21782829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 56 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 19870293 - 19870066
Alignment:
Q  56 gtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgttt 155  Q
    ||||| |||||||| ||| | ||||| ||  | ||||| | |||||| |||||||| || ||||||||| | || || |||||| | || || ||||| |    
T  19870293 gtgtcaatggcaccctacaggatgtctgcgacggagttgggtgaattaaagaaacaattagaagagttattagagaaaaagtttatcaggcctagtgtct 19870194  T
Q  156 caccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatag 255  Q
    |||| |||||||||||||||||  | || || ||||| ||||| ||||||||| | ||  | || || ||||| ||||| ||||| || ||||||||||     
T  19870193 caccttggggagcacctgtgttactcgttaaaaagaaggatggcagtatgaggctatgtgtggattaccgtcagttgaataaagtcactattaagaataa 19870094  T
Q  256 atatccgcttccgaggattgatgacttg 283  Q
    ||| ||| | || || ||||| ||||||    
T  19870093 atacccgttgcccagaattgacgacttg 19870066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 255; Significance: 1e-142; HSPs: 49)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Original strand, 17267204 - 17267482
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17267204 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 17267303  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  17267304 gaaacagttggaagatttgcttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcgcctatgttgttggtgaagaaaaaggatggtagtatg 17267403  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17267404 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 17267482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 20 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 22464435 - 22464171
Alignment:
Q  20 gagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaag 119  Q
    ||||| || ||||| |||||||  ||||| || || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |    
T  22464435 gagttctcgattgatcttgttctgggaacgaaaccagtgtcgatggcaccgtatcgtatgtccgcttctgaattagccgagttgaagaaacagttggagg 22464336  T
Q  120 agttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattga 219  Q
    | || ||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22464335 acttgcttgataagaagtttgtaagacccaatgtttcgccgtggggagcgcctgtgttattggtgaagaagaaggatggtagtatgaggttgtgcattga 22464236  T
Q  220 ctatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  22464235 ctatcgtcagttgaacaaagttacaataaagaatagatatccacttccgcggattgatgacttga 22464171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 25850573 - 25850295
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25850573 cagagagggaggttgaattttcaattgaccttgttccaggaactaagccggtgtcgatggcaccataccgtatgtcagcttctgagttagctgagttgaa 25850474  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    |||||||||||| ||  |  | |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  25850473 gaaacagttggaggacctgttggataagaaatttgtaagacccagtgtttcaccttggggagcaccggtgttgttggtcaagaagaaggatggtagtatg 25850374  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    || ||||| || || || ||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  25850373 agattgtgtatagattaccgtcagttgaacaaggttacgataaagaacagatatccgcttccgagaattgacgacttga 25850295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Original strand, 14884861 - 14885139
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  14884861 cagagagggaggttgagttctcaattgatcttgttccaggaactaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttggctgagttgaa 14884960  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    |||||||||||| ||  || | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  14884961 gaaacagttggaggacctattagataagaagtttgtaagacccagtgtttcaccttggggagcaccggtgttgttggtaaagaagaaggatggtagtatg 14885060  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    ||  | ||||| || || ||||| |||||||||||||| || ||||| || ||||||||||| || ||||| |||||||    
T  14885061 agactttgcatagattaccgtcagttgaacaaagttacgatcaagaacaggtatccgcttcctagaattgacgacttga 14885139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Original strand, 37541251 - 37541529
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  37541251 cagagagggaggttgaattttcaattgatcttgttccaggaactaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttggctgagttgaa 37541350  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    |||||||||||| ||  |  | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  37541351 gaaacagttggaggacctgttagataagaagtttgtaagacccagtgtttcaccttggggagcaccggtgttgttggtcaagaagaaggatggtagtatg 37541450  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    ||  |||| || || || ||||| |||||||||||||| || ||||| || ||||||||||| || ||||| |||||||    
T  37541451 agactgtgtatagattaccgtcagttgaacaaagttacgatcaagaacaggtatccgcttcctagaattgacgacttga 37541529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 22505177 - 22504899
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22505177 cagagagggaggttgaattttcaattgacctcgttctaggaacgaagccggtgtcgatggcaccataccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 22505078  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    |||||||||||||||  |  | |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  22505077 gaaacagttggaagacctgttggataagaaatttgtaagacctagtgtttcaccttggggagcatcagtgttgttggttaagaagaaggatggtagtatg 22504978  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    ||  |||||||||| || ||||| |||||||| ||||| || ||||| || ||||||||||  || |||||||||||||    
T  22504977 agactgtgcattgattaccgtcagttgaacaaggttacgataaagaacaggtatccgcttcatagaattgatgacttga 22504899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Original strand, 24796267 - 24796545
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  24796267 cagagagggaggttgagttctcaattgatcttgttccaggaactaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttggctgagttgaa 24796366  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    |||||||||||| ||  |  | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  24796367 gaaacagttggaggacctgttagataagaagtttgtaagacccagtgtttcaccttggggagcaccggtgttgttagtaaagaagaaggatggtagtatg 24796466  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    ||  | ||||| || || ||||| |||||||||||||| || ||||| || ||||||||||| || ||||| |||||||    
T  24796467 agactttgcatagattaccgtcagttgaacaaagttacgatcaagaacaggtatccgcttcctagaattgacgacttga 24796545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Original strand, 28892812 - 28893090
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    |||| ||||| || ||||| || ||||| |||||||| ||||| || || || |||||||| ||||| || |||||||||||||| || ||||| || ||    
T  28892812 cagaaagggaagttgagttctcgattgatcttgttccgggaacgaaaccagtatcgatggcgccgtatcgcatgtcagcttctgaattggctgagttaaa 28892911  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    |||||||||||| || || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||    
T  28892912 gaaacagttggaggacttgcttgacaagaagtttgtaagacccagtgtttcgccgtggggagcgcccgtgttattggtgaagaagaaagatggaagtatg 28893011  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  28893012 aggttgtgcattgactatcgtcagttgaacaaagttacaataaagaatagatatccacttccgcggattgatgacttga 28893090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Original strand, 28921638 - 28921916
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    |||| ||||| || ||||| || ||||| |||||||| ||||| || || || |||||||| ||||| || |||||||||||||| || ||||| || ||    
T  28921638 cagaaagggaagttgagttctcgattgatcttgttccgggaacgaaaccagtatcgatggcgccgtatcgcatgtcagcttctgaattggctgagttaaa 28921737  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    |||||||||||| || || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||    
T  28921738 gaaacagttggaggacttgcttgacaagaagtttgtaagacccagtgtttcgccgtggggagcgcccgtgttattggtgaagaagaaagatggaagtatg 28921837  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  28921838 aggttgtgcattgactatcgtcagttgaacaaagttacaataaagaatagatatccacttccgcggattgatgacttga 28921916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 26 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 20823931 - 20823673
Alignment:
Q  26 tcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaagagttac 125  Q
    |||||||| |||||||| ||||| || ||  | || ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||| || || |    
T  20823931 tcaattgatcttgttccaggaacgaaaccaatatcaatggcgccgtaccgcatgtcagcttctgaattggctgagttaaagaaacagttggaggacttgc 20823832  T
Q  126 ttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattgactatcg 225  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20823831 ttgataagaagtttgtgagacctagtgtttcgccgtggggagcacccgtgttgttggtgaaaaagaaagatgggagtatgaggttgtgcattgactatcg 20823732  T
Q  226 tcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||    
T  20823731 tcagttgaacaaagttacaataaagaatagatatccacttccgcggattgatgatttga 20823673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 20344780 - 20344502
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20344780 cagagagggaggttgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccggtgtcgatggcaccataccgtatgtcagtttctgagttagctgaattgaa 20344681  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    ||| |||||||| ||  |  | |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  20344680 gaagcagttggaggacctgttagataagaaatttgtaagacccagtgtttcaccttggggaggaccggtgttattggttaagaagaaggatggtagtatg 20344581  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    ||  | ||||| || || ||||| ||||||||||| || || ||||| || ||||||||||| || ||||| |||||||    
T  20344580 agactatgcatagattaccgtcagttgaacaaagtcacgataaagaacaggtatccgcttcctagaattgacgacttga 20344502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 27520922 - 27520644
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||| || || |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||| |||| |||||    
T  27520922 cagagagagaagttgagttttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtctgcttctgagttatctgagttgaa 27520823  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  27520822 gaaacagttagaagacttgcttgagaagaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggttttgttagtaaagaagaaagatggtagtatg 27520723  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
     ||||||| ||||| ||||| || |||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  27520722 cggttgtgtattgattatcggcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttga 27520644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 23 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 23473726 - 23473465
Alignment:
Q  23 ttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaagagt 122  Q
    ||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |    
T  23473726 ttttcgattgaccttgttccaggtacgaagcctgtgtctatgacaccttaccgtatgtcagcttctgagttggctgagttgaagaaacagttagaagatt 23473627  T
Q  123 tacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattgacta 222  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || ||| | || |||||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||    
T  23473626 tacttgataagaagtttgtaagaccaagtgtttcaccgtggggagcgccggtattgctagttaagaagaaagatggtagcatgagattatgcattgatta 23473527  T
Q  223 tcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    ||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||    
T  23473526 tcgacaattgaacaaagtaacgataaagaataggtatccacttccaagaattgatgacttga 23473465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 16359018 - 16358740
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||| || || |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||| |||| |||||    
T  16359018 cagagagagaagttgagttttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtctcgatggcaccttatcgtatgtctgcttctgagttatctgagttgaa 16358919  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||| | || |||||||| ||||||||||||    
T  16358918 gaaacagttggaagacttgcttgagaagaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggttttgctagtaaagaagaaagatggtagtatg 16358819  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
     ||||||| ||||| ||||| || |||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  16358818 cggttgtgtattgattatcggcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttga 16358740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Original strand, 27666360 - 27666638
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||| || || |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||| |||| |||||    
T  27666360 cagagagagaagttgagttttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtctcgatggcaccttatcgtatgtctgcttctgagttatctgagttgaa 27666459  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||| | || |||||||| ||||||||||||    
T  27666460 gaaacagttggaagacttgcttgagaagaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggttttgctagtaaagaagaaagatggtagtatg 27666559  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
     ||||||| ||||| ||||| || |||||||| || || || |||||||| ||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  27666560 cggttgtgtattgattatcggcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccactttcgagaattgatgacttga 27666638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 34569010 - 34568732
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||| || || |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||| |||| |||||    
T  34569010 cagagagagaagttgagttttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtctcgatggcaccttatcgtatgtctgcttctgagttatctgagttgaa 34568911  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||| | || |||||||| ||||||||||||    
T  34568910 gaaacagttggaagacttgcttgagaagaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggttttgctagtaaagaagaaagatggtagtatg 34568811  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
     ||||||| ||||| ||||| || |||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  34568810 cggttgtgtattgattatcggcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttga 34568732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 6 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 18781630 - 18781357
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    |||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  18781630 cagagagggaagtcgagttttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtgtccatggcaccttatcgtatgtctgcttccgagttagctgagttgaa 18781531  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||| | ||||||||||| |||||||| |||    
T  18781530 gaaacagttagaagatttgcttgagaagaaatttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcaccagttttgctagtgaagaagaaagatggtagcatg 18781431  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatga 279  Q
    || ||||| ||||||||||| || |||||||| || || || |||||||| ||||| | |||||| ||||||||    
T  18781430 agattgtgtattgactatcgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacctccgagaattgatga 18781357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 19772476 - 19772198
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||| || || |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||| |||| |||||    
T  19772476 cagagagagaagttgagttttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtctcgatggcaccttatcgtatgtctgcttctgagttatctgagttgaa 19772377  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |  || ||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  19772376 gaaacagttggaagacttgcttgagaagaagtttgttagaccgagtgtttcaccttggggagcgctggttttgttagtaaagaagaaagatggtagtatg 19772277  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    ||| | || ||||| ||||| || |||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  19772276 aggctatgtattgattatcggcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttga 19772198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Original strand, 29473943 - 29474221
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||| || || |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||| |||| |||||    
T  29473943 cagagagagaagttgagttttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtctcgatggcaccttatcgtatgtctgcttccgagttatctgagttgaa 29474042  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  29474043 gaaacagttggaagacttgcttgagaagaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccagttttgttagtaaagaagaaagatggtagtatg 29474142  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
     |||| || ||||| ||||| || |||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  29474143 cggttatgtattgattatcggcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttga 29474221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Original strand, 37289366 - 37289644
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||| || || |||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||| |||| |||||    
T  37289366 cagagagagaagttgagttttctattgatcttgtccctggaacgaagccggtctcgatggcaccttatcgtatgtctgcttctgagttatctgagttgaa 37289465  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    |||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  37289466 gaaacagttggaggacttgcttgagaagaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcaccggttttgttagtaaagaagaaagatggtagtatg 37289565  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
     |||| || ||||| ||||| || ||||| ||||| || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  37289566 cggttatgtattgattatcgacagttgaataaagtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttga 37289644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 40711296 - 40711018
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||| || || |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||| |||| |||||    
T  40711296 cagagagagaagttgagttttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtctcgatggcaccttatcgtatgtctgcttccgagttatctgagttgaa 40711197  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||| | || |||||||| ||||||||||||    
T  40711196 gaaacagttggaagacttgcttgagaagaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggttttgctagtaaagaagaaagatggtagtatg 40711097  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
     ||||||| ||||| ||||| || |||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  40711096 cggttgtgtattgattatcggcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttga 40711018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 41773358 - 41773080
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||| || || |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||| |||| |||||    
T  41773358 cagagagagaagttgagttttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtctcgatggcaccttatcgtatgtctgcttctgagttatctgagttgaa 41773259  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||  | ||||| || || ||||| ||||||||||||    
T  41773258 gaaacagttggaagacttgcttgagaagaagtttgttagaccgagtgtttcaccttggggagcgccgattttgttagtaaaaaagaaagatggtagtatg 41773159  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
     ||||||| ||||| ||||| || |||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  41773158 cggttgtgtattgattatcggcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttga 41773080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 20 - 284
Target Start/End: Original strand, 14997623 - 14997887
Alignment:
Q  20 gagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaag 119  Q
    |||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  14997623 gagttttctattgatcttgtccctggaacgaagccggtctcgatggcaccttatcgtatgtctgcttctgagttatctgagttgaagaaacagttggaag 14997722  T
Q  120 agttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattga 219  Q
    | || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| |||||||||||| |||| || |||||    
T  14997723 acttgcttgagaagaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggttttgttagtaaagaagaaagatggtagtatgcggttatgtattga 14997822  T
Q  220 ctatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
     ||||| || |||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  14997823 ttatcggcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttga 14997887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 56 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 20778361 - 20778133
Alignment:
Q  56 gtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgttt 155  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  20778361 gtgtcgatggcgccgtatcgcatgtcagcttctgaattggctgagttaaagaaacagttggaggacttgcttgataagaagtttgtgagacctagtgttt 20778262  T
Q  156 caccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatag 255  Q
    | ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  20778261 cgccgtggggagcgcccgtgttattggtaaagaagaaagatggaagtatgaggttgtgcattgactatcgtcagttgaacaaggttacaataaagaatag 20778162  T
Q  256 atatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
     ||||| || ||| ||||||| |||||||    
T  20778161 gtatccactcccgcggattgacgacttga 20778133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 22137184 - 22136906
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||| || || |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||| |||| |||||    
T  22137184 cagagagagaagttgagttttctattgatcttgttcctggaacgaagccgatgtcgatggcaccttatcgtatgtctgcttccgagttatctgagttgaa 22137085  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    ||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  22137084 gaaacagttggaagatttgcttgagaagaaatttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggttttgttagtaaagaagaaagatggtagtatg 22136985  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
     |||| || ||||| ||||| || |||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  22136984 cggttatgtattgattatcggcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttga 22136906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Original strand, 27683270 - 27683548
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||| || || |||||||| ||||| ||||| |  ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||| |||| |||||    
T  27683270 cagagagagaagttgagttttctattgatcttgtccttggaacgaagccggtctcgatggcaccttatcgtatgtctgcttctgagttatctgagttgaa 27683369  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  27683370 gaaacagttggaagacttgcttgagaagaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggttttgttagtaaagaagaaagatggtagtatg 27683469  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
     |||| || ||||| ||||| || |||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  27683470 cggttatgtattgattatcggcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttga 27683548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 6 - 279
Target Start/End: Original strand, 22233790 - 22234063
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    |||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||| |||| || |||||||| || || |||||||||||||||||    
T  22233790 cagagagggaagttgaattttcaatagaccttgttcccggaatgaagtcggtgtcgatgacaccttatcgtatgtcggcgtccgagttagctgaattgaa 22233889  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||||| |||||||| |||||||| |||    
T  22233890 gaaacagttggaggatttacttgataagaaatttgtaagaccgagtgtttcaccatggggagcgccggtattgttggttaagaagaaggatggtagcatg 22233989  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatga 279  Q
    ||||| || || ||| | ||||   |||| ||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  22233990 aggttatgtatagacaaccgtccgctgaataaagtgacgataaagaataggtatccacttccgaggattgatga 22234063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 6 - 276
Target Start/End: Original strand, 21676704 - 21676974
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| || || || || ||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||| || || ||  | ||||| |||||    
T  21676704 cagaaagggaggttgagttctcaatcgatctggtgccaggaacgaagccggtgtcgatggcaccttattgtatgtcggcatccgaacttgctgagttgaa 21676803  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    ||||||||| || || || || || ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  21676804 gaaacagttagaggacttgctcgacaagaagtttgtaagaccaagtgttccaccgtggggagcgcctgtgttgttggtaaagaagaaagatggtagtatg 21676903  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattga 276  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21676904 aggttatgcattgactaccgtcagttgaataaagttacggtaaagaatagatatccgcttccgagaattga 21676974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 6 - 278
Target Start/End: Original strand, 21561895 - 21562167
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    |||||||||| || || ||||||||||| |||||||  || || ||||| ||||||||||  || ||||||||||| || |||||| ||||||| |||||    
T  21561895 cagagagggaagttgaattttcaattgatcttgttctgggtacgaagcctgtgtcgatggagccttaccgtatgtcggcctctgaggtagctgagttgaa 21561994  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||| |  ||||||||||| |||||||| |||||||| |||    
T  21561995 gaaacagttggaggatttacttgataagaagtttgtaagaccaagtatttcaccttggggagcgcaggtgttgttggttaagaagaaagatggtagcatg 21562094  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatg 278  Q
    |||||||| || || || ||||| ||||| ||||| || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  21562095 aggttgtgtatagattaccgtcagttgaataaagtgacgataaagaataggtatccacttccgagaattgatg 21562167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Original strand, 22330757 - 22331035
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||| || || |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||| |||| |||||    
T  22330757 cagagagagaagttgagttttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtctcgatggcaccttatcgtatgtctgcttccgagttatctgagttgaa 22330856  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    |||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| || || ||||| ||||||||||||    
T  22330857 gaaacagttggaggacttgcttgagaagaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggttttgttagtaaacaagaaagatggtagtatg 22330956  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
      ||| || ||||| ||||| || |||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  22330957 cagttatgtattgattatcggcatttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttga 22331035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 22350435 - 22350157
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||| || || |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| || ||| |||| |||||    
T  22350435 cagagagagaagttgagttttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtgtcgatggcaccatatcgtatgtctgcttccgaattatctgagttgaa 22350336  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    ||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||| | || |||||||| ||||||||||||    
T  22350335 gaaacagttggaagatttgcttgagaagaaatttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggttttgctagtaaagaagaaagatggtagtatg 22350236  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    ||| | || ||||| ||||| || |||||||| || || || |||||||| |||||  ||||||| |||||||| ||||    
T  22350235 aggctatgtattgattatcgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccatttccgagaattgatgatttga 22350157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 6 - 164
Target Start/End: Original strand, 23078775 - 23078933
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23078775 cagaaagggaggtggaattttcaattgaccttattccaggaacgaagccggtgtcgatggcaccttaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 23078874  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggg 164  Q
    |||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  23078875 gaaacagttggaggacttgcttgataagaagtttgtaagaccaagtgtttcaccttggg 23078933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 7 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 27612869 - 27612592
Alignment:
Q  7 agagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaag 106  Q
    |||||| || || |||||||| ||||| |||||||| ||||  |||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||| |||| ||||||    
T  27612869 agagagagaagttgagttttctattgatcttgttcctggaatgaagccggtctcgatggcaccttatcgtatgtctgcttccgagttatctgagttgaag 27612770  T
Q  107 aaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatga 206  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||  | ||| | || |||||||| ||||||||||||     
T  27612769 aaacagttggaagacttgcttgagaagaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccgattttgctagtaaagaagaaagatggtagtatgc 27612670  T
Q  207 ggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    ||||||| ||||| ||||| || |||||||| || || || || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  27612669 ggttgtgtattgattatcgacagttgaacaaggtaactatcaaaaataggtatccacttccgagaattgatgatttga 27612592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 23 - 284
Target Start/End: Original strand, 21337181 - 21337442
Alignment:
Q  23 ttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaagagt 122  Q
    |||||||||||||||||||| || || ||||| ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |    
T  21337181 ttttcaattgaccttgttccgggtacgaagcctgtgtctatgacaccttaccgtatgtcagcttctgagttggccgagttgaagaaacaattagaagatt 21337280  T
Q  123 tacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattgacta 222  Q
    | ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||| ||| | ||| |||| ||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  21337281 tgcttgataagaagtttgtaagaccaaatgtttcaccttggggagcgcctatattgctggttaagaagaaaaatggtagcatgagattgtgcattgatta 21337380  T
Q  223 tcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    ||| || |||| |||||| || || |||||||| |||||  |||| || |||||||||||||    
T  21337381 tcgacagttgaccaaagtaacgataaagaataggtatccaattccaagaattgatgacttga 21337442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 23 - 284
Target Start/End: Original strand, 26736614 - 26736875
Alignment:
Q  23 ttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaagagt 122  Q
    ||||| ||||| |||||||  ||||| ||||| ||||| ||| |||| |||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| ||||| |    
T  26736614 ttttcgattgatcttgttctgggaacgaagcctgtgtctatgacaccttaccgtatgtcagcttctaagttggctgagttgaagaaacagttagaagatt 26736713  T
Q  123 tacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattgacta 222  Q
    | |||||||| |||||||| ||||  ||||||||||| |||||||| || || ||| | |||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||    
T  26736714 tgcttgataaaaagtttgtaagactaagtgtttcaccttggggagcgccggtattgctagtgaaggagaaagatggtagtatgagattgtgtattgatta 26736813  T
Q  223 tcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    ||| || ||||||||||| || || |||||||  ||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  26736814 tcgacagttgaacaaagtaacgataaagaatatgtatccacttccgagaattgatgatttga 26736875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 5 - 199
Target Start/End: Original strand, 21984046 - 21984240
Alignment:
Q  5 tcagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattga 104  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| || || ||||| |||||||||||||| |||||||||||| | | |||||||||||| ||||    
T  21984046 tcagagagggaagttgaattttcaattgatcttgttccgggtacgaagccagtgtcgatggcaccttaccgtatgtcaacgtatgagttagctgagttga 21984145  T
Q  105 agaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggt 199  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  21984146 agaaacaattggaggatttacttgataagaagattgtaagaccgagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaagatggt 21984240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 25428949 - 25428671
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||  |||| ||||  ||||| ||| |||| || ||||||||| |||||||||| || ||  ||||    
T  25428949 cagagagagaagttgaattttcgattgatcttgttcctagaacgaagcatgtgtctatgacaccttatcgtatgtcaacttctgagttggccgagctgaa 25428850  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    |||||| || || || || ||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||  | ||||| ||||||||||| |||||||| |||    
T  25428849 gaaacaattagaggatttgcttgagaaaaagttggttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccgattttgttagtgaagaagaaggatggtagcatg 25428750  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    |||||||| ||||| ||||| || |||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  25428749 aggttgtgtattgattatcgacagttgaacaaggtaacaataaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttga 25428671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Original strand, 20465969 - 20466247
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    |||| ||||| || || ||||| ||||| |||||| | || || ||||| ||||| ||| | || ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  20465969 cagaaagggaagttgaattttcgattgatcttgtttcgggtacgaagcctgtgtctatgactccttaccgtatgtcggcttctgagttggctgagttgaa 20466068  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| ||| |||| || || ||||| || || ||||| |||||||| |||    
T  20466069 gaaacagttagacgatttacttgataagaagtttgtaaaaccgagtgtttcaccttggcgagcgccagtattgttagttaataagaaagatggtagcatg 20466168  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    ||||| |||||| | ||||| || ||||| ||| | ||||| |||||||  ||||| ||||| || |||||||| ||||    
T  20466169 aggttatgcatttattatcgacagttgaataaactaacaataaagaataagtatccacttccaagaattgatgatttga 20466247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 14 - 216
Target Start/End: Original strand, 23564046 - 23564248
Alignment:
Q  14 gaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagt 113  Q
    ||||| || ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| || || |||||||| || ||||||||| |||    
T  23564046 gaggttgaattttcaattgaccttattccaggaacgaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtcggcgtccgagttagcggagttgaagaaatagt 23564145  T
Q  114 tggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtg 213  Q
    |||| |  || ||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||| |||| ||| || ||||||||||| |||||||| |||||||  |||||||| ||    
T  23564146 tggaggtcttgcttgataagaaatttgtaagacaaagtgtttcaccatgggaagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtaccatgaggttatg 23564245  T
Q  214 cat 216  Q
    |||    
T  23564246 cat 23564248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 59 - 284
Target Start/End: Original strand, 21935111 - 21935336
Alignment:
Q  59 tcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcac 158  Q
    ||||| || ||||| || ||||| || || ||||| | |||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| ||||| ||||||| ||||||||||    
T  21935111 tcgattgcgccgtatcggatgtctgcatcggagttgggtgaattgaagaatcagttggaagagttgcttgagaagcagtttattagaccgagtgtttcac 21935210  T
Q  159 cgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagata 258  Q
    ||||||| || || ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||  | || ||||| || |||||||| || || ||||||||| | ||    
T  21935211 cgtggggtgctccagtgttgttggttaagaagaaagatggaagcatgaggttgtgtgtggattatcgacagttgaacaaggtgacgattaagaatcggta 21935310  T
Q  259 tccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    ||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  21935311 tccacttccaaggattgatgatttga 21935336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 59 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 23508129 - 23507904
Alignment:
Q  59 tcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcac 158  Q
    ||||| || ||||| || ||||| || || ||||| | |||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| ||||| ||||||| ||||||||||    
T  23508129 tcgattgcgccgtatcggatgtctgcatcggagttgggtgaattgaagaatcagttggaagagttgcttgagaagcagtttattagaccgagtgtttcac 23508030  T
Q  159 cgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagata 258  Q
    ||||||| || || ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||  | || ||||| || |||||||| || || ||||||||| | ||    
T  23508029 cgtggggtgctccagtgttgttggttaagaagaaagatggaagcatgaggttgtgtgtggattatcgacagttgaacaaggtgacgattaagaatcggta 23507930  T
Q  259 tccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    ||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  23507929 tccacttccaaggattgatgatttga 23507904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 59 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 24583655 - 24583430
Alignment:
Q  59 tcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcac 158  Q
    ||||| || ||||| || ||||| || || ||||| | |||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||  ||||| ||||||| ||||||||||    
T  24583655 tcgattgcgccgtatcggatgtctgcatcggagttgggtgaattgaagaatcagttggaagagttgcttgagaaacagtttattagaccgagtgtttcac 24583556  T
Q  159 cgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagata 258  Q
    ||||||| || || ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||  | || ||||| || |||||||| || || ||||||||| | ||    
T  24583555 cgtggggtgctccagtgttgttggttaagaagaaagatggaagcatgaggttgtgtgtggattatcggcagttgaacaaggtgacgattaagaatcggta 24583456  T
Q  259 tccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    ||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  24583455 tccacttccaaggattgatgatttga 24583430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 6 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 21409650 - 21409383
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    |||||||||| || || ||||| ||||| ||| |||| || || || || || || |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||  |||||    
T  21409650 cagagagggaagtagaattttctattgaacttattccgggtacgaaacctgtttctatggcaccttaccgtatgtcagcttccgaattagctgggttgaa 21409551  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
     || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| ||||| || || |||||||   | ||||| ||||| |||||||| |||||||| |||    
T  21409550 aaagcagttagaagatttgcttgataaaaagtttgtaagaccgagtgtatcgccttggggagtgtcggtgttattggttaagaagaaagatggtagcatg 21409451  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggat 273  Q
    ||||| || || || || ||  | ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| | |||||||||    
T  21409450 aggttatgtatagattaccggaagttgaataaagtgacaataaagaatagatatccacctccgaggat 21409383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 6 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 20803113 - 20802948
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||| || || ||||||||  |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||| ||||||| |||||    
T  20803113 cagagagagaagtcgagttttctgttgatcttgttcctggaacgaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtctgcttccgagctagctgagttgaa 20803014  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacc 171  Q
    |||||| || ||||| || ||||| || || ||||||||||| ||||||||| | ||| |||||||    
T  20803013 gaaacaattagaagatttgcttgagaataattttgttagaccaagtgtttcatcttggagagcacc 20802948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 8 - 133
Target Start/End: Original strand, 694 - 819
Alignment:
Q  8 gagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaaga 107  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| || |||||||| || || ||||||||||| |||||||    
T  694 gagagagaggttgaattttcaattgaccttgttccaggaaggaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtcggcgtccgagttagctgagttgaaga 793  T
Q  108 aacagttggaagagttacttgataag 133  Q
    || ||||||| || || |||||||||    
T  794 aaaagttggaggacttgcttgataag 819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 150 - 279
Target Start/End: Original strand, 20250298 - 20250427
Alignment:
Q  150 gtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaa 249  Q
    |||||||| ||||||||||| |   |||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||| | || ||||| ||||||||||| || || |||||    
T  20250298 gtgtttcatcgtggggagcatcgacgttgctggtgaagaagaatgatggtagtatgagctcgtgcgtggattatcgacaattgaacaaggtaaccattaa 20250397  T
Q  250 gaatagatatccgcttccgaggattgatga 279  Q
    ||| | |||||| ||||| ||||| |||||    
T  20250398 gaacaaatatcctcttccaaggatagatga 20250427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 141 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 21625531 - 21625475
Alignment:
Q  141 ttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatg 197  Q
    ||||||| ||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  21625531 ttagaccaagtgtttcatcttggggagcaccagtgttgttggtgaagaagaaagatg 21625475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 20801737 - 20801673
Alignment:
Q  176 ttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagt 240  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||||||||| || || || |||||||| |||||||||||    
T  20801737 ttgttagtaaagaagaaagatggtagtatgaggttatgtatcgattatcgtcagttgaacaaagt 20801673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 224
Target Start/End: Original strand, 21220560 - 21220608
Alignment:
Q  176 ttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattgactatc 224  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  21220560 ttgttggttaagaagaaggatggtagtatgaggttatgtattgactatc 21220608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 255; Significance: 1e-142; HSPs: 42)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 27789955 - 27789677
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27789955 cagaaagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 27789856  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  27789855 gaaacagttggaagatttacttgataagaagtttgtaagacccagtgtttcgccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaaaaaggatggtagtatg 27789756  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27789755 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 27789677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 12576568 - 12576290
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12576568 cagaaagggaggtggagttttcaattgaccttattcctggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 12576469  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  12576468 gaaacagttggaagatttacttgataagaagtttgtaagacccagtgtttcgccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaaaaaggatggtagtatg 12576369  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12576368 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 12576290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 7 - 284
Target Start/End: Original strand, 19717246 - 19717523
Alignment:
Q  7 agagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaag 106  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  19717246 agagagggaggtcgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagtcggtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagcttccgagttagctgaattaaag 19717345  T
Q  107 aaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatga 206  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| || ||||| ||||    
T  19717346 aaacagttggaagacttgcttgataagaagtttgtaagaccaagtgtctcaccgtggggagcgcttgtgttgttggtaaagaagaaggacggtagcatga 19717445  T
Q  207 ggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  19717446 ggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaacagatatccacttctgaggattgatgacttga 19717523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 23278991 - 23278713
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23278991 cagagagggaggttgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccagtgtcgatgtcaccttatcgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 23278892  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    |||||||||| | || || ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| | || ||| || || || ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  23278891 gaaacagttgtaggacttgcttgataagaagtttgtaagaccaagtgtctcaccttaggaagcgccggtattattggtaaagaagaaggatggtagtatg 23278792  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23278791 aggttatgcattgactatcgtcagttgaacaaagttacaatcaagaacaggtatccacttccgaggattgatgacttga 23278713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 29 - 282
Target Start/End: Original strand, 19650301 - 19650554
Alignment:
Q  29 attgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaagagttacttg 128  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||    
T  19650301 attgaccttgttccaggaacaaagtcggtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaggacttgcttg 19650400  T
Q  129 ataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattgactatcgtca 228  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || ||||| || |||||    
T  19650401 ataagaagtttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttagttaagaagaaggatggtagcatgagattatgtattgattaccgtca 19650500  T
Q  229 attgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgactt 282  Q
     |||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  19650501 gttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgaggattgatgactt 19650554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 8 - 284
Target Start/End: Original strand, 23098248 - 23098524
Alignment:
Q  8 gagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaaga 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  23098248 gagagggaggtggagttttcaattgaccttgttccaagaacgaagccggtgtcgatggcaccatatcgtatgtcagcatcggagttggctgaattgaaga 23098347  T
Q  108 aacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgag 207  Q
    |||||||||||||  | |||||||||||| |||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||| |||||||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  23098348 aacagttggaagacgtgcttgataagaagcttgtaagaccgagtgtctcgccgtggggagcgcctatgttgttggtaaagaagaaggatggtagcatgag 23098447  T
Q  208 gttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
     |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| || |||||||||| ||||||||| |||||||    
T  23098448 attgtgcatagactaccgtcagttgaacaaagtgacgataaagaacaggtatccgcttctgaggattgacgacttga 23098524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 8 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 31832871 - 31832595
Alignment:
Q  8 gagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaaga 107  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  31832871 gagagggaggttgaattttcaattgatcttgttccaggaactaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttggctgagttgaaga 31832772  T
Q  108 aacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgag 207  Q
    |||||||||| ||  |  | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  31832771 aacagttggaggacctgttagataagaagtttgtaagacccagtgtttcaccttggggagcaccggtgttgttggtaaagaaaaaggatggtagtatgag 31832672  T
Q  208 gttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
      |||| || || || ||||| |||||||||||||| || ||||| || ||||||||||| || ||||| |||||||    
T  31832671 actgtgtatagattaccgtcagttgaacaaagttacgatcaagaacaggtatccgcttcctagaattgacgacttga 31832595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 1065966 - 1065688
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1065966 cagagagggaggttgaattttcaattgatgttgttccaggaactaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgagttgaa 1065867  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    ||| |||||||| ||  |  | |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  1065866 gaagcagttggaggacctgttagataagaagtttgtaagacccagtgtttcgccttggggagcaccggtgttgttggtaaagaagaaggatggtagtatg 1065767  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    ||  |||| || || || ||||| |||||||||||||| || ||||| || ||||||||||| || ||||| |||||||    
T  1065766 agactgtgtatagattaccgtcagttgaacaaagttacgatcaagaacaggtatccgcttcctagaattgacgacttga 1065688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 6 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 25256133 - 25255858
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||||||||| || ||| ||||||| ||| ||| |||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||  | |||||||||||||||||    
T  25256133 cagagagggaggttgaatttgcaattgatcttattctcggaacgaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtcggcacccgagttagctgaattgaa 25256034  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    |||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| |||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| |||    
T  25256033 gaaacagttggaggacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccgt-gggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtagcatg 25255935  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgactt 282  Q
    ||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  25255934 aggttatgcattgattatcgtcagttgaacaaggttacgataaagaataggtatccacttccgaggattgatgactt 25255858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 9337797 - 9337519
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||| || || |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||| |||| |||||    
T  9337797 cagagagagaagttgagttttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtctcgatggcaccttatcgtatgtctgcttctgagttatctgagttgaa 9337698  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||| | || |||||||| ||||||||||||    
T  9337697 gaaacagttggaagacttgcttgagaagaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggttttgctagtaaagaagaaagatggtagtatg 9337598  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
     ||||||| ||||| ||||| || |||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  9337597 cggttgtgtattgattatcggcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttga 9337519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 9486431 - 9486153
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||| || || |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||| |||| |||||    
T  9486431 cagagagagaagttgagttttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtctcgatggcaccttatcgtatgtctgcttctgagttatctgagttgaa 9486332  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||| | || |||||||| ||||||||||||    
T  9486331 gaaacagttggaagacttgcttgagaagaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggttttgctagtaaagaagaaagatggtagtatg 9486232  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
     ||||||| ||||| ||||| || |||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  9486231 cggttgtgtattgattatcggcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttga 9486153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 23074078 - 23073800
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    |||||||||| || || ||||| ||||| |||||||  ||||||||||| ||||| ||| |||| || |||||||||||||||||||||||  | |||||    
T  23074078 cagagagggaagttgaattttctattgatcttgttcttggaacaaagcctgtgtctatgacaccttatcgtatgtcagcttctgagttagccaagttgaa 23073979  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    |||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| | ||||||||| |||||||| |||    
T  23073978 gaaacaattagaagatttgcttgagaagaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggttttgttagggaagaagaaggatggtagcatg 23073879  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  23073878 aggttgtgtattgactatcgacagttgaacaaagtaacaataaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttga 23073800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 24264585 - 24264307
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||| || || |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||| |||| |||||    
T  24264585 cagagagagaagttgagttttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtctcgatggcaccttatcgtatgtctgcttctgagttatctgagttgaa 24264486  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  24264485 gaaacagttggaagacttgcttgagaagaagtttgttagaccgagtgtttcaccttggggagcgccggttttgttagtaaagaagaaagatggtagtatg 24264386  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
     |||| || ||||| ||||| || |||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  24264385 cggttatgtattgattatcgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttga 24264307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 24712249 - 24711971
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||| || || |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||| |||| |||||    
T  24712249 cagagagagaagttgagttttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtttcgatggcaccttatcgtatgtctgcttctgagttatctgagttgaa 24712150  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  24712149 gaaacagttggaagacttgcttgagaagaagtttgttagaccgagtgtttcaccttggggagcaccggttttgttagtaaagaagaaagatggtagtatg 24712050  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    ||| | || ||||| |||||  | |||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  24712049 aggctatgtattgattatcgatagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttga 24711971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 27220231 - 27219953
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||| || || |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||| |||| |||||    
T  27220231 cagagagagaagttgagttttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtctcgatggcaccttatcgtatgtctgcttctgagttatctgagttgaa 27220132  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||| | || |||||||| ||||||||||||    
T  27220131 gaaacagttggaagacttgcttgagaagaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggttttgctagtaaagaagaaagatggtagtatg 27220032  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
     ||||||| ||||| ||||| || |||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  27220031 cggttgtgtattgattatcgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttga 27219953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Original strand, 44383798 - 44384076
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||| || || |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||| |||| |||||    
T  44383798 cagagagagaagttgagttttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtctcgatggcaccttatcgtatgtctgcttctgagttatctgagttgaa 44383897  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||| | || |||||||| ||||||||||||    
T  44383898 gaaacagttggaagacttgcttgagaagaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggttttgctagtaaagaagaaagatggtagtatg 44383997  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
     ||||||| ||||| ||||| || |||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  44383998 cggttgtgtattgattatcggcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttga 44384076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 24677702 - 24677426
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||| || || |||||||| ||||| ||| |||| ||||| ||||| |||||  ||||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| |||||    
T  24677702 cagagagagaagttgagttttctattgatctttttcctggaacgaagcctgtgtc--tggcaccttatcgtatgtcaacttccgagttagctgagttgaa 24677605  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    ||| ||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  24677604 gaagcagttagaagatttgcttgagaagaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcaccggttttgttagtaaagaagaaagatggtagtatg 24677505  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  24677504 aggttgtgtattgattatcgtcagttgaacaaagtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttga 24677426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 10871065 - 10870787
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||| || || |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||| |||| |||||    
T  10871065 cagagagagaagttgagttttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtctcgatggcaccttatcgtatgtctgcttctgagttatctgagttgaa 10870966  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||| | || |||||||| ||||||||||||    
T  10870965 gaaacagttggaagacttgcttgagaagaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggttttgctagtaaagaagaaagatggtagtatg 10870866  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
     ||||||| ||||| ||||| || |||||||| || || || ||||| || ||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  10870865 cggttgtgtattgattatcgacagttgaacaaggtaactatcaagaacaggtatccacttccgagaattgatgatttga 10870787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 27373484 - 27373206
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||| || || |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||| |||| |||||    
T  27373484 cagagagagaagttgagttttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtctcgatggcaccttatcgtatgtctgcttccgagttatctgagttgaa 27373385  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    |||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  27373384 gaaacagttggaggacttgcttgagaagaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcaccggttttgttagtaaagaagaaagatggtagtatg 27373285  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
     |||| || ||||| ||||| || |||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  27373284 cggttatgtattgattatcgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttga 27373206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Original strand, 22734002 - 22734280
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||| || || |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||| |||| || ||||||||| |||||||||| || || |||||    
T  22734002 cagagagagaagttgagttttcgattgatcttgttcctggaacgaagcctgtgtctatgacaccttatcgtatgtcaacttctgagttggccgagttgaa 22734101  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    |||||| || ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||| | ||||||||||| |||||||| |||    
T  22734102 gaaacaattagaagatttacttgagaaaaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggttttgctagtgaagaagaaagatggtagcatg 22734201  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  22734202 agattgtgtattgactatcgacaattgaacaaggtaacaataaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttga 22734280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 20 - 284
Target Start/End: Original strand, 24705724 - 24705988
Alignment:
Q  20 gagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaag 119  Q
    |||||||| ||||| ||||||||  |||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  24705724 gagttttctattgatcttgttcctagaacgaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtctgcttctgagttagctgagttgaagaaacagttagaag 24705823  T
Q  120 agttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattga 219  Q
    | || ||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||| | ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  24705824 atttgcttgagaagagatttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccagttttgctagtgaagaagaaagatggtagcatgagattgtgtattga 24705923  T
Q  220 ctatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    |||||| || |||||||| || || || || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  24705924 ctatcgacagttgaacaaggtaactatcaaaaataggtatccacttccgagaattgatgatttga 24705988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 16927575 - 16927297
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||| || || || ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||| |||| |||||    
T  16927575 cagagagagaagttgaattttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtctcgatggcaccttatcgtatgtctgcttctgagttatctgagttgaa 16927476  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| || || ||| | || |||||||| ||||||||||||    
T  16927475 gaaacagttagaagacttgcttgagaagaagtttgttagaccaagtgtttcaccttgggaagcgccggttttgctagtaaagaagaaagatggtagtatg 16927376  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
     ||||||| ||||| ||||| || |||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  16927375 cggttgtgtattgattatcgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttga 16927297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 17001215 - 17000937
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||| || || || ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||| |||| |||||    
T  17001215 cagagagagaagttgaattttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtctcgatggcaccttatcgtatgtctgcttctgagttatctgagttgaa 17001116  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| || || ||| | || |||||||| ||||||||||||    
T  17001115 gaaacagttagaagacttgcttgagaagaagtttgttagaccaagtgtttcaccttgggaagcgccggttttgctagtaaagaagaaagatggtagtatg 17001016  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
     ||||||| ||||| ||||| || |||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  17001015 cggttgtgtattgattatcgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttga 17000937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Original strand, 21323494 - 21323772
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||| || || |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  21323494 cagagagagaagtcgagttttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtgtcgatggcaccttatcggatgtcagcttccgagttagctgagttgaa 21323593  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    ||||||||| |||||  | ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||| | || |||||||| |||||||| |||    
T  21323594 gaaacagttagaagatctgcttgagaagaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccagttttgctagtaaagaagaaagatggtagcatg 21323693  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    || ||||| |||||||||   || || ||||| || || || |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  21323694 agattgtgtattgactataaacagttaaacaaggtaactatcaagaatagatatccacttccgagaattgatgatttga 21323772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 20 - 284
Target Start/End: Original strand, 23105970 - 23106234
Alignment:
Q  20 gagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaag 119  Q
    |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||| |||| || |||||||||||||||||||| || || || |||||||| || || |    
T  23105970 gagttttctattgatcttgttcctggaacgaagcctgtgtctatgacaccttatcgtatgtcagcttctgagttcgccgagttaaagaaacaattagagg 23106069  T
Q  120 agttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattga 219  Q
    | ||||| || || ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||| ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  23106070 atttactcgagaaaaagttcgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgcccgttttgctggtgaagaagaaagatggtagcatgagattgtgtattga 23106169  T
Q  220 ctatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    |||||| || |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23106170 ctatcgacagttgaacaaggtgacaataaagaataggtatccacttccgaggattgatgacttga 23106234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 7 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 23112953 - 23112681
Alignment:
Q  7 agagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaag 106  Q
    ||||||||| || || ||| ||||||| |||||||| || || ||||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||    
T  23112953 agagagggaagttgaatttacaattgatcttgttccgggtacgaagcctgtgtcgatggcgccttaccgtatgtcggcgtctgagttagctgagttgaag 23112854  T
Q  107 aaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatga 206  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||  || || || |||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  23112853 aaacaattggaggatttacttgataagaagtttgtaagaccgagtgtttcaacttgggatgcgccggtattgttggttaagaagaaggatggtagcatga 23112754  T
Q  207 ggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatga 279  Q
    ||||||| || || ||||||||| |||| ||||| || || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  23112753 ggttgtgtatagattatcgtcaactgaataaagtgacgataaagaataggtatccacttccgagaattgatga 23112681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 20 - 284
Target Start/End: Original strand, 41606627 - 41606891
Alignment:
Q  20 gagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaag 119  Q
    |||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||  |||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |    
T  41606627 gagttttctattgatcttgtccctggaacgaagccggtctcgatggcaccttatcgtatgtctacttccgagttatctgagttgaagaaacagttggagg 41606726  T
Q  120 agttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattga 219  Q
    | || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| |||||||||||| |||| || |||||    
T  41606727 acttgcttgagaagaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggttttgttagtaaagaagaaagatggtagtatgcggttatgtattga 41606826  T
Q  220 ctatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
     ||||| || |||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  41606827 ttatcggcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttga 41606891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 6 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 23204529 - 23204274
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    |||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  23204529 cagaaagggaagtcgagttttctattgatcttgttcctgggacaaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtctgcttccgagttagctgagttgaa 23204430  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||| || || ||| | || |||||||| |||||||| |||    
T  23204429 gaaacagttagaagatttgctcgaaaagaaatttgttagaccaagtgtttcaccttagggagcgccagttttgatagtaaagaagaaagatggtagcatg 23204330  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatcc 261  Q
    || ||||| |||||||||||||| |||||||| || || || |||||||| |||||    
T  23204329 agattgtgtattgactatcgtcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatcc 23204274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Original strand, 24874978 - 24875256
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||| || || |||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||  ||||| || ||| |||| |||||    
T  24874978 cagagagagaagttgagttttctattgatctagtccctggaacgaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtttgcttccgaattatctgagttgaa 24875077  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    ||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||| | || |||||||| ||||||||||||    
T  24875078 gaaacagttggaagatttgcttgagaagaaatttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggttttgctagtaaagaagaaagatggtagtatg 24875177  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    ||| | || ||||| ||||| || |||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  24875178 aggctatgtattgattatcgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttga 24875256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Original strand, 21143269 - 21143547
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||| || || |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||| || | |||||| ||||| || ||| |||| |||||    
T  21143269 cagagagagaagttgagttttctattgatctagttcctggaacgaagccggtgtcgatggcaccttatcttatgtctgcttccgaattatctgagttgaa 21143368  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    ||||||||||||||  || ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||| | || |||||||| ||||||||||||    
T  21143369 gaaacagttggaagccttgcttgagaagaaatttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggttttgctagtaaagaagaaagatggtagtatg 21143468  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    ||| | || ||||| ||||| || |||||||| || || || |||||||| ||||  |||||||| |||||||| ||||    
T  21143469 aggctatgtattgattatcgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatcaacttccgagaattgatgatttga 21143547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 6 - 210
Target Start/End: Original strand, 30010412 - 30010616
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    |||||||||| || || ||||| ||||| ||| |||| || || |||||  | || |||||||| |||| |||||||||||| || |||||||| |||||    
T  30010412 cagagagggaagtagaattttctattgatcttattccgggtacgaagcctatttctatggcaccttaccatatgtcagcttccgaattagctgagttgaa 30010511  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
     |||||||| ||||| || |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| |||    
T  30010512 aaaacagttagaagatttgcttgataaaaaatttgtaagacccagtgtttcaccttggggagcaccggtgttattggttaagaagaaagatggtagcatg 30010611  T
Q  206 aggtt 210  Q
    |||||    
T  30010612 aggtt 30010616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 97 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 22280229 - 22280042
Alignment:
Q  97 tgaattgaagaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgat 196  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| ||| | ||| ||||| ||||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||||| |||||||| |||    
T  22280229 tgaattgaagaaacaattagaagagttgcttcagaagcagtttattagaccaagtgtttcgccgtggggggctccagtgttgttggttaagaagaaagat 22280130  T
Q  197 ggtagtatgaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    || || |||||||||||  | || ||||| ||||||||||| || || ||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  22280129 ggaagcatgaggttgtgtgtggattatcggcaattgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttga 22280042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 68 - 284
Target Start/End: Original strand, 24829478 - 24829694
Alignment:
Q  68 ccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggag 167  Q
    ||||| || ||||| || || ||||| | ||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||| ||||| ||||||| |||||||| || ||||| |    
T  24829478 ccgtatcggatgtctgcatcagagttgggtgaattgaaaaatcagttggaagagttgcttgagaagcagtttattagaccgagtgtttcgccatggggtg 24829577  T
Q  168 cacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttcc 267  Q
    | || ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||  | || ||||| || |||||||| || || ||||||||| | ||||| |||||    
T  24829578 ctccagtgttgttggttaagaagaaagatggaagcatgaggttgtgtgtggattatcggcagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttcc 24829677  T
Q  268 gaggattgatgacttga 284  Q
     ||||||||||| ||||    
T  24829678 aaggattgatgatttga 24829694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 59 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 25130771 - 25130551
Alignment:
Q  59 tcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcac 158  Q
    ||||| || ||||| || ||||| || || ||||| | |||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||| ||||| |||| || |||||||| |    
T  25130771 tcgattgcgccgtatcggatgtctgcatcagagttgggtgaattgaagaagcagttagaagagttgcttgagaagcagtttattaggccaagtgtttctc 25130672  T
Q  159 cgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagata 258  Q
    ||||||| || |  ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||| |  | || ||||| || |||||| | || || ||||||||| | ||    
T  25130671 cgtggggtgctctagtgttgttggttaagaagaaagatggaagcatgaggttgagtgtggattatcggcagttgaactaggtgacgattaagaatcggta 25130572  T
Q  259 tccgcttccgaggattgatga 279  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  25130571 tccgcttccgaggattgatga 25130551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 14 - 168
Target Start/End: Original strand, 24818076 - 24818230
Alignment:
Q  14 gaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagt 113  Q
    ||||| || ||||| ||||| |||||||| || || ||||| ||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| | |    
T  24818076 gaggttgaattttctattgatcttgttccgggtacgaagcctgtgtctatgacgccttaccgtatgtcagcttctgagttggccgaattgaagaaataat 24818175  T
Q  114 tggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagc 168  Q
    |  |||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  24818176 tacaagatttgcttgataagaagtttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagc 24818230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 6 - 145
Target Start/End: Original strand, 24657886 - 24658024
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    |||||||||| || |||||||| ||||| |||||||  ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||| ||| |||||    
T  24657886 cagagagggaagttgagttttctattgatcttgttcgtggaacgaagccggtgtcgatggcacctta-cgtatgtctgcttccgagttagttgagttgaa 24657984  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttaga 145  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| ||||| || ||||||    
T  24657985 gaaacagttagaagatttgcttgagaagaaattcgttaga 24658024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 6 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 16983455 - 16983326
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||| || || || ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||| |||| |||||    
T  16983455 cagagagagaagttgaattttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtctcgatggcaccttatcgtatgtctgcttctgagttatctgagttgaa 16983356  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaa 135  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| |||||    
T  16983355 gaaacagttagaagacttgcttgagaagaa 16983326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 62 - 273
Target Start/End: Original strand, 30209201 - 30209412
Alignment:
Q  62 atggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgt 161  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| || |||||  |||| || |||||||| |||||||| ||||| ||||| || || |    
T  30209201 atggcaccttaccgtatgtcagcttccgaattagctgagttgaaaaagcagttaaaagatttgcttgataaaaagtttgtaagaccgagtgtatcgccct 30209300  T
Q  162 ggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatcc 261  Q
    ||||||| ||  |||| ||||| |||||||| |||||| | |||||||| || || || ||  | || || || ||||| ||||| |||||||  |||||    
T  30209301 ggggagcgccgatgttattggttaagaagaaagatggtcgcatgaggttatgtatagattactgacagttaaataaagtgacaataaagaataagtatcc 30209400  T
Q  262 gcttccgaggat 273  Q
     |||||||||||    
T  30209401 acttccgaggat 30209412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 6 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 16924192 - 16924063
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||| || || || ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| || || |||||||| |||||||||||| |||| |||||    
T  16924192 cagagagagaagttgaattttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtctcgatggcgccttatcgtatgtctgcttctgagttatctgagttgaa 16924093  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaa 135  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| |||||    
T  16924092 gaaacagttagaagacttgcttgagaagaa 16924063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 97 - 279
Target Start/End: Original strand, 24567987 - 24568169
Alignment:
Q  97 tgaattgaagaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgat 196  Q
    |||||||||| | ||||| |||||||| ||||| ||| ||||| | |  || |||||||| |||| ||| || || || |||||||| |||||||| |||    
T  24567987 tgaattgaagcagcagttagaagagtttcttgagaagcagtttatcaagccgagtgtttctccgttgggtgctccagtcttgttggttaagaagaaagat 24568086  T
Q  197 ggtagtatgaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatga 279  Q
    || || |||||||||||  | || ||||| || ||||||||||| || ||||||||| | |||| |||||| |||||||||||    
T  24568087 ggaagcatgaggttgtgtgtggattatcggcagttgaacaaagtgacgattaagaatcggtatctgcttccaaggattgatga 24568169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 97 - 284
Target Start/End: Original strand, 22759890 - 22760075
Alignment:
Q  97 tgaattgaagaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgat 196  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| ||||| | || ||  ||||||| || ||||| || || ||||||||||| |||||||| |||    
T  22759890 tgaattgaagaagcagttggaagagttgcttgagaagcagtttatcaggcc--gtgtttctccatggggtgctccagtgttgttggttaagaagaaagat 22759987  T
Q  197 ggtagtatgaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    || || |||||||||||  | || ||||| || ||||| || |  || ||||||||| | || |||||||| ||||||||||| ||||    
T  22759988 ggaagcatgaggttgtgtgtggattatcggcagttgaagaatgggacgattaagaatcggtacccgcttccaaggattgatgatttga 22760075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 176 - 284
Target Start/End: Original strand, 24818628 - 24818736
Alignment:
Q  176 ttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattg 275  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| |||| ||||| || ||||| || || || || |||||||| ||||| ||||| || | ||    
T  24818628 ttgttggttaagaagaaagatggtagtatgaggttatgccttgattatcgacagttgaataaggtaacgataaagaataggtatccacttccaagaactg 24818727  T
Q  276 atgacttga 284  Q
    |||| ||||    
T  24818728 atgatttga 24818736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 251; Significance: 1e-139; HSPs: 55)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Original strand, 18051628 - 18051906
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18051628 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcctggaacaaagccggtgtcgatgacaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 18051727  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  18051728 gaaacagttggaagatttacttgataagaagtttgtaagacccagtgtttcgccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaaaaaggatggtagtatg 18051827  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18051828 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 18051906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 14140253 - 14139975
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  14140253 cagagagggaggtggagttttcgattgaccttgttccaggaacgaagccggtgtcgatggcaccttatcatatgtcagcatctgaattagctgaattgaa 14140154  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| |||    
T  14140153 gaaacagttggaagacttgcttgataagaagtttgtaagacccagtgtttcaccgtggggagcgcctgtgttgttggtaaagaaaaaggaaggtagcatg 14140054  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14140053 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaataggtatccacttccgaggattgatgacttga 14139975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 11 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 15343000 - 15342727
Alignment:
Q  11 agggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaac 110  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  15343000 agggaggttgagttttccattgaccttgttccgggaacaaagccgatgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcctctgagttagctgaattgaagaaaa 15342901  T
Q  111 agttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggtt 210  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  15342900 agttggaagacttgcttgataagaagtttgtttgacccagtgtttcaccgtggggagcgcctgtgttgttggtaaagaagaaggatggtagcatgaggtt 15342801  T
Q  211 gtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    ||| ||  | || ||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| |||||||| |||||||||    
T  15342800 gtgtatatattaccgtcagttgaacaaagttacaataaagaacaggtatccgctttcgaggatttatgacttga 15342727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 13023931 - 13023653
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    |||| |||||||| || |||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13023931 cagaaagggaggttgaattttcaattgaccttgttctaggaacgaagccggtgtcgatggcaccttaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 13023832  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    |||||| ||||| || || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  13023831 gaaacaattggaggacttgcttgataagaagtttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagctccggtgttgttggtaaagaagaaggatggtagtatg 13023732  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  13023731 aggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaatagatatccacttccgagaattgatgatttga 13023653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 7 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 12459213 - 12458940
Alignment:
Q  7 agagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaag 106  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12459213 agagagggaggtggaattttcaattgaccttgttccaggaatgaagccggtgtcgatggcaccttttcgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaag 12459114  T
Q  107 aaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatga 206  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  12459113 aaacagttggaagacttgcttgataagaagtttgtaagaccaagtgtttcaccttgaggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtagtatga 12459014  T
Q  207 ggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgac 280  Q
    |  |||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  12459013 gactgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacaataaagaacaggtatccgcttccgaggattgatgac 12458940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 8 - 284
Target Start/End: Original strand, 11386106 - 11386382
Alignment:
Q  8 gagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaaga 107  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  11386106 gagagggaggtagagttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccggtgtcgatggcaccatatcgtatgtcagcatcggagttggctgaattgaaga 11386205  T
Q  108 aacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgag 207  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||||||||||| | ||| ||||| || ||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||| |||||    
T  11386206 aacagttggaagacttgtttgataagaagtttgtaaaaccgagtgtctcgccgtggggagcgcctgtgttgctggtaaagaagaaggatggtagcatgag 11386305  T
Q  208 gttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
     |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||    
T  11386306 attgtgcatagactaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaacaggtatccgcttccgaggattgacgacttga 11386382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Original strand, 26092473 - 26092751
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26092473 cagagagggaggttgaattttcaattgatcttgttccaggaactaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgagttgaa 26092572  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    |||||||||||| ||  |  | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  26092573 gaaacagttggaggacctgttagataagaagtttgtaagacccagtgtttcaccttggggagcaccggtgttgttggtaaagaagaaggatggtagtatg 26092672  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    ||  |||| || || || ||||| |||||||||||||| || ||||| || ||||||||||| || ||||| |||||||    
T  26092673 agactgtgtatagattaccgtcagttgaacaaagttacgatcaagaacaggtatccgcttcctagaattgacgacttga 26092751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Original strand, 11300888 - 11301166
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  11300888 cagagagggaggttgaattttcaattgatcttgttccaggaactaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttggctgagttgaa 11300987  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    |||||||||||| ||  |  |  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  11300988 gaaacagttggaggacctgttatataagaagtttgtaagacccagtgtttcaccttggggagcaccggtgttgttggtaaagaagaaggatggtagtatg 11301087  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    ||  |||| || || || ||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||    
T  11301088 agactgtgtatagattaccgtcagttgaacaaagttacgatcaagaacagatatccgcttcctagaattgacgacttga 11301166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 6 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 13676025 - 13675752
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||||||||| || |||| ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13676025 cagagagggaggttgaatttt-aattgaccttgttctaggaacgaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagcttctgagttagctgaattaaa 13675927  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    |||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||| || | ||| |||    
T  13675926 gaaacagttggaggacttgcttgataagaagtttgtaagactaagtgtttcaccttggggagcaccgatgttgttggttaagaagaaagacgatagcatg 13675827  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgac 280  Q
    || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  13675826 agattatgcattgactatcgtcagttgaacaaagttacaataaagaacaggtatccacttccgaggattgatgac 13675752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Original strand, 13966343 - 13966621
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13966343 cagagagggaggttgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccggtgtcgatggcaccataccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 13966442  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    |||||||||||| ||  |  | |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  13966443 gaaacagttggaggacctgttagataagaaatttgtaagacccagtgtttcaccttggggagcaccggtgttattggttaagaagaaggatggtagtatg 13966542  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    ||  ||||||| || || ||||| ||||||||||| || || ||||| || ||||||||||| || ||||| |||||||    
T  13966543 agactgtgcatagattaccgtcagttgaacaaagtcacgataaagaacaggtatccgcttcctagaattgacgacttga 13966621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Original strand, 14284049 - 14284329
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||    
T  14284049 cagagagggaggtggagttttcgattgaccttgttccaggaacaaagccggtgtcgatggcaccataccgtatgtcagcatctgagttggctgaactgaa 14284148  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||| |||    
T  14284149 gaaacagttagaagatttacttgataagaagtttgtaagaccgagtgtctcaccgtggggagcgcttgtgttgttggtaaagaagaaggatggtagcatg 14284248  T
Q  206 aggt--tgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    || |  |||| || || || ||||| |||||||||||| | || ||||| || ||||||||||||| |||||  |||||||    
T  14284249 agattgtgtgtatagattaccgtcagttgaacaaagttgcgataaagaacaggtatccgcttccgaagattggcgacttga 14284329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 14 - 282
Target Start/End: Original strand, 15100286 - 15100554
Alignment:
Q  14 gaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagt 113  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |    
T  15100286 gaggttgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtcggcgtccgagttagctgaattgaagaaacaat 15100385  T
Q  114 tggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtg 213  Q
    |||| || || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||    
T  15100386 tggaggacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccgtggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggcagcatgaggttatg 15100485  T
Q  214 cattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgactt 282  Q
    |||||| |||||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  15100486 cattgattatcgtcagttgaacaaggttacgataaagaataggtatccacttccgaggattgatgactt 15100554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 6 - 282
Target Start/End: Original strand, 16948147 - 16948423
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16948147 cagagagggaggttgaattttcaattgaccttgttccaggaacaaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagcttctgagttagctaaattgaa 16948246  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    |||||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||| |  |||||||| || |||||||| |||||||| |||    
T  16948247 gaaacagttggaagacctgcttgataagaagtttgtaagaccaagtttttcaccttggggagcgctggtgttgttagttaagaagaaggatggtagcatg 16948346  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgactt 282  Q
    || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||  || |||||||| ||||| || ||||| |||||||||||    
T  16948347 agattgtgcattgattaccgtcagttgaataaagttatgataaagaataggtatccactcccgagaattgatgactt 16948423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Original strand, 26116265 - 26116543
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    |||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26116265 cagaaagggaggttgaattttcaattgaccttgttccaggaactaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgagttgaa 26116364  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    |||||||||||| ||  |  | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  26116365 gaaacagttggaggacctgttagataagaagtttgtaagacccagtgtttcaccttggggagcaccggtnttgttggtcaagaagaaggatggtagtatg 26116464  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    || ||||| ||  |  | ||||| |||||||||||||| || ||||| || ||||||||||| || ||||| |||||||    
T  26116465 agattgtgtatatatcaccgtcagttgaacaaagttacgatcaagaacaggtatccgcttcctagaattgacgacttga 26116543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 49154875 - 49154597
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  49154875 cagagagggaggttgaattctcaattgatcttgttccaggaactaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttggctgagttgaa 49154776  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    |||||||||||| ||  |  | ||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  49154775 gaaacagttggaggacctgttagataaaaaatttgtaagacccagtgtttcaccttggggagcaccggtgttgttggtaaagaagaaggatggtagtatg 49154676  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    || ||||| || || || ||||| |||||||||||||| || ||||| || ||||||||||| || ||||| |||||||    
T  49154675 agattgtgtatagattaccgtcagttgaacaaagttacgatcaagaacaggtatccgcttcctagaattgacgacttga 49154597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 6 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 21754986 - 21754749
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21754986 cagagagggagattgaattttcaattgaccttgttcccggaacgaagccggtgtcgatggcaccataccgtatgtcagcttctgagttagctgagttgaa 21754887  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    |||||||||||||||  |  | |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  21754886 gaaacagttggaagacctgttggataagaaatttgtaagacccagtgtttcaccttggggagcaccggtgttgttggttaagaagaaggatggtagtatg 21754787  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttac 243  Q
    || |||||||| || || ||||| ||||| || |||||    
T  21754786 agattgtgcatagattaccgtcagttgaataaggttac 21754749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 6 - 279
Target Start/End: Original strand, 14261920 - 14262193
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||||||||| || |||||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||    
T  14261920 cagagagggaggttgaattttcaatcgatcttgtgcctggaacgaagccggtgtcgatggcaccttaccgtatgtcggcgtccgagttagctgaattgaa 14262019  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    |||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| |||    
T  14262020 gaaacagttggaggacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccgtggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtagcatg 14262119  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatga 279  Q
    |||||||| || || ||  ||||  |||| ||||| || || |||||||| ||||| ||||||||| |||||||    
T  14262120 aggttgtgtatagattactgtcagctgaataaagtgacgataaagaataggtatccacttccgaggtttgatga 14262193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Original strand, 15158754 - 15159032
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||| || || |||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||| |||| |||||    
T  15158754 cagagagagaagttgagttttctattgatcttgtccctggaacaaagccggtctcgatggcaccttatcgtatgtctgcttctgagttatctgagttgaa 15158853  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  15158854 gaaacagttggaagacttgcttgagaagaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggttttgttagtaaagaagaaagatggtagtatg 15158953  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
     |||| || ||||| ||||| || |||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  15158954 cggttatgtattgattatcggcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttga 15159032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 8710178 - 8709900
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||| || || |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||| |||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||| |||| |||||    
T  8710178 cagagagagaagttgagttttctattgatcttgttcctggaacgaagtcggtctcgatggcaccttatcgtatgtctgcttctgagttatctgagttgaa 8710079  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  8710078 gaaacagttggaagacttgcttgagaagaagtttgttagaccgagtgtttcaccttggggagcgccggttttgttagtaaagaagaaagatggtagtatg 8709979  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    ||| | || ||||| ||||| || |||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  8709978 aggctatgtattgattatcgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttga 8709900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 10873263 - 10872985
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||| || || |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||  ||| |||||    
T  10873263 cagagagagaagttgagttttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtctcgatggcaccttatcgtatgtctgcttctgagttatttgagttgaa 10873164  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||| | || |||||||| ||||||||||||    
T  10873163 gaaacagttggaagacttgcttgagaagaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggttttgctagtaaagaagaaagatggtagtatg 10873064  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
     ||||||| ||||| ||||| || |||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  10873063 cggttgtgtattgattatcgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttga 10872985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 13688614 - 13688336
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||| || || |||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||| |||| |||||    
T  13688614 cagagagagaagttgagttttctattgatcttgtccctggaacgaagccggtctcgatggcaccttatcgtatgtctgcttctgagttatctgagttgaa 13688515  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  13688514 gaaacagttggaagacttgcttgagaagaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggttttgttagtaaagaagaaagatggtagtatg 13688415  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
     |||| || ||||| ||||| || |||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  13688414 cggttatgtattgattatcgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttga 13688336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 14334969 - 14334691
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||| || || |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||| |||| |||||    
T  14334969 cagagagagaagttgagttttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtctcgatggcaccttatcgtatgtctgcttctgagttatctgagttgaa 14334870  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| || |||||||||    
T  14334869 gaaacagttggaagacttgcttgagaagaagtttgttagaccgagtgtttcaccttggggagcgccggttttgttagtaaagaagaaagacggtagtatg 14334770  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    ||| | || ||||| ||||| || |||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  14334769 aggctatgtattgattatcgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttga 14334691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Original strand, 18587868 - 18588146
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||| || || |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||| |||| |||||    
T  18587868 cagagagagaagttgagttttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtctcgatggcaccttatcgtatgtctgcttctgagttatctgagttgaa 18587967  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  18587968 gaaacagttggaagacttgcttgagaagaagtttgttaaaccgagtgtttcaccttggggagcgccggttttgttagtaaagaagaaagatggtagtatg 18588067  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    ||| | || ||||| ||||| || |||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  18588068 aggctatgtattgattatcgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttga 18588146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 6 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 19615249 - 19614979
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    |||| |||||||| ||||| || || || || || || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| || || ||  | ||||| |||||    
T  19615249 cagaaagggaggttgagttctccatcgatctagtaccaggaacgaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtcggcatccgaacttgctgagttgaa 19615150  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    |||||||||||| || ||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||    
T  19615149 gaaacagttggaggacttactcgacaagaagtttgtaagaccaagtgtttcaccgtggggagcgcctgtgttgttggtaaagaagaaggatggtagcatg 19615050  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattga 276  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  19615049 aggttatgcattgactaccgtcagttgaataaagttacgataaagaacagatatccgcttccgagaattga 19614979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Original strand, 11550799 - 11551077
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    |||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| || ||| |||| |||||    
T  11550799 cagagagggaagttgagttttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtctgcttccgaattatctgagttgaa 11550898  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    ||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||| | || |||||||| ||||||||||||    
T  11550899 gaaacagttggaagatttgcttgagaagaaatttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggttttgctagtaaagaagaaagatggtagtatg 11550998  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    ||||| || ||||| ||||| || |||||||| || || || |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||    
T  11550999 aggttatgtattgattatcgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccaagaattgatgatttga 11551077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Original strand, 16727080 - 16727358
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    |||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| || || ||||||||||| |||||    
T  16727080 cagagagggaagtcgagttttctattgatcttgttccgggaacgaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtctgcatccgagttagctgagttgaa 16727179  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    || |||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| || || ||| | ||||||||||| |||||||| |||    
T  16727180 gagacagttagaagatttgcttgaaaagaaatttgttagaccaagtgtgtcaccttggggagcgccagttttgctagtgaagaagaaagatggtagcatg 16727279  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    || ||||| |||||||||||||| |||||||| || || || |||||||| ||||| |||| ||| |||||||| ||||    
T  16727280 agattgtgtattgactatcgtcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttctgagaattgatgatttga 16727358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Original strand, 17704152 - 17704430
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    |||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| || || ||||||||||| |||||    
T  17704152 cagagagggaagtcgagttttctattgatcttgttccgggaacgaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtctgcatccgagttagctgagttgaa 17704251  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    || |||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| || || ||| | ||||||||||| |||||||| |||    
T  17704252 gagacagttagaagatttgcttgaaaagaaatttgttagaccaagtgtgtcaccttggggagcgccagttttgctagtgaagaagaaagatggtagcatg 17704351  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    || ||||| |||||||||||||| |||||||| || || || |||||||| ||||| |||| ||| |||||||| ||||    
T  17704352 agattgtgtattgactatcgtcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttctgagaattgatgatttga 17704430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Original strand, 44789048 - 44789326
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||| || || || ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||| |||| |||||    
T  44789048 cagagagagaagttgaattttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtctcgatggcaccttatcgtatgtctgcttctgagttatctgagttgaa 44789147  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||| | || |||||||| ||||||||||||    
T  44789148 gaaacagttagaagacttgcttgagaagaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggttttgctagtaaagaagaaagatggtagtatg 44789247  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
     ||||||| ||||| ||||| || |||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  44789248 cggttgtgtattgattatcgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttga 44789326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Original strand, 11234910 - 11235188
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||| || || |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||| |||| |||||    
T  11234910 cagagagagaagttgagttttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtctcgatggcaccttatcgtatgtctgcttccgagttatctgagttgaa 11235009  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    |||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||| | || |||||||| ||||||||||||    
T  11235010 gaaacagttggaggacttgcttgagaagaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggttttgctagtaaagaagaaagatggtagtatg 11235109  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    ||| | || ||||| ||||| || |||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  11235110 aggctatgtattgattatcgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttga 11235188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 14957127 - 14956849
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    |||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| || ||| ||||  ||||    
T  14957127 cagagagggaagttgagttttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtctgcttccgaattatctgagctgaa 14957028  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    ||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||  | || |||||||| ||||||||||||    
T  14957027 gaaacagttggaagatttgcttgagaagaaatttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggttttactagtaaagaagaaagatggtagtatg 14956928  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    ||||| || ||||| ||||| || |||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  14956927 aggttatgtattgattatcgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttga 14956849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Original strand, 16069972 - 16070250
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| || |||||||| || || ||||||||| | | |||    
T  16069972 cagagagggaggttgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccgatgtcgatggcaccttatcgtatgtcggcgtccgagttagctaagtagaa 16070071  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    |||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||| |||||| |    
T  16070072 gaaacagttggaggatttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccgtggggagcgccggtattgttggttaagaagaaggatagtagtacg 16070171  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    |||||||| || || || |||||  |||| ||||| || || ||||| |  ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  16070172 aggttgtgtatagattaccgtcagctgaataaagtgacgataaagaacaagtatccacttccgagaattgatgacttga 16070250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 6 - 279
Target Start/End: Original strand, 12204475 - 12204748
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||| ||| ||| |||||    
T  12204475 cagagagggaggttgaattttcaattgatcttgttccgggtacgaagcctgtgtcgatggcgccttaccgtatgtcagcgtctgagctagttgagttgaa 12204574  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||| |||||||| || || |||||||  || ||||| |||||||| |||    
T  12204575 gaaacagttggaggatttacttgataagaaatttgtaagacggagtgtttcaccatggggagcgccggtattgttggataaaaagaaggatggtagcatg 12204674  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatga 279  Q
    ||||||||||| || || |||||  |||| ||||| || || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  12204675 aggttgtgcatagattaccgtcagctgaataaagtgacgataaagaataggtatccacttccgagaattgatga 12204748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 23 - 284
Target Start/End: Original strand, 15146598 - 15146859
Alignment:
Q  23 ttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaagagt 122  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||  ||||  ||| |||| || ||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |    
T  15146598 ttttcgattgatcttgttcctggaacgaagcttgtgtttatgacaccttatcgtatgtcaacttctgagttagctgagttaaagaaacagttagaagatt 15146697  T
Q  123 tacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattgacta 222  Q
    | ||||| || |||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||    
T  15146698 tgcttgagaaaaagtttgttataccaagtgtttcaccttggggagcacctgttttgttagtgaagaagaaagacggtagtatgaggttatgcattgatta 15146797  T
Q  223 tcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    |||||| ||||| ||||| || || |||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||    
T  15146798 tcgtcagttgaataaagtaactatgaagaataggtatccacttccaagaattgatgacttga 15146859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 9590941 - 9590663
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    |||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| | ||||||||| |||||    
T  9590941 cagagagggaagtcgagttttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtctgcttccgtgttagctgagttgaa 9590842  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    |||||| || ||||| || || || ||||| ||| ||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||| | || |||||||| |||||||| |||    
T  9590841 gaaacaattagaagatttgctcgaaaagaaatttattagaccaagtgtttcaccttggggagcgccagttttgctagtaaagaagaaagatggtagcatg 9590742  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||| || || || ||| |||| ||||| |||| ||| |||||||| ||||    
T  9590741 aggttgtgtattgactatcgtcagttgaacaaggtaactatcaagtataggtatccacttctgagaattgatgatttga 9590663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 12690075 - 12689797
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    |||||||||| || |||||||| ||| | |||||||| || || |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| || ||| |||| |||||    
T  12690075 cagagagggaagttgagttttctattaatcttgttcctggcacgaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtctgcttccgaattatctgagttgaa 12689976  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    ||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||| |||||||| || || ||  | || |||||||| ||||||||||||    
T  12689975 gaaacagttggaagatttgcttgagaagaaatttgttcgaccaagtgtttcaccttggggagcgccagttttactagtaaagaagaaagatggtagtatg 12689876  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    ||||| || ||||| ||||| || ||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  12689875 aggttatgtattgattatcgacagttgaacaaagtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttga 12689797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 23 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 14042251 - 14041998
Alignment:
Q  23 ttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaagagt 122  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||| | ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  | || || |    
T  14042251 ttttcgattgatcttgttccgggaacaaagtctgtgtctatgacaccttaccgtatgtcagcttctgagttggctgagttgaagaaacaactagaggatt 14042152  T
Q  123 tacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattgacta 222  Q
    | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || || ||| | || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14042151 tgcttgataagaagtttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtattgctagtaaagaagaaagatggtagtatgagattgtgcattgacta 14042052  T
Q  223 tcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattga 276  Q
    ||| |||||||||||||| || || |||||||| | ||| ||||| || |||||    
T  14042051 tcgacaattgaacaaagtaacgataaagaataggtgtccacttccaagaattga 14041998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 23 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 14352281 - 14352028
Alignment:
Q  23 ttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaagagt 122  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||| | ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  | || || |    
T  14352281 ttttcgattgatcttgttccgggaacaaagtctgtgtctatgacaccttaccgtatgtcagcttctgagttggctgagttgaagaaacaactagaggatt 14352182  T
Q  123 tacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattgacta 222  Q
    | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || || ||| | || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14352181 tgcttgataagaagtttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtattgctagtaaagaagaaagatggtagtatgagattgtgcattgacta 14352082  T
Q  223 tcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattga 276  Q
    ||| |||||||||||||| || || |||||||| | ||| ||||| || |||||    
T  14352081 tcgacaattgaacaaagtaacgataaagaataggtgtccacttccaagaattga 14352028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 18180318 - 18180040
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||| || || |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||  |||| |||||| |||| |||||    
T  18180318 cagagagagaagtcgagttttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtctcgatggcaccttatcgtatgtctacttccgagttatctgagttgaa 18180219  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    |||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||| | || |||||||| ||||||||||||    
T  18180218 gaaacagttggaggacttgcttgagaagaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggttttgctagtaaagaagaaagatggtagtatg 18180119  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
     |||| || ||||| ||||| || |||||||| || || || |||||||| ||||| |||| ||| |||||||| ||||    
T  18180118 cggttatgtattgattatcggcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttcagagaattgatgatttga 18180040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 27 - 240
Target Start/End: Original strand, 12799239 - 12799452
Alignment:
Q  27 caattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaagagttact 126  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||    
T  12799239 caattgaccttgttccaggaacgaagccggtatcgatggcaccttaccgtatgtcggcgtccgagttagctgagttgaagaaacagttggaggacttgct 12799338  T
Q  127 tgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattgactatcgt 226  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||| || || || || |||    
T  12799339 tgataagaaatttgtaagaccgagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtagcattaggttatgtatagattaccgt 12799438  T
Q  227 caattgaacaaagt 240  Q
    || ||||| |||||    
T  12799439 cagttgaataaagt 12799452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 23 - 284
Target Start/End: Original strand, 11770116 - 11770377
Alignment:
Q  23 ttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaagagt 122  Q
    ||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||| ||| |||| || |||||||| ||||||||||| |||||   ||||||||| || ||||| |    
T  11770116 ttttcgattgaccttgttccgggtacgaagcctgtgtctatgacaccttatcgtatgtcggcttctgagttggctgagcagaagaaacaattagaagatt 11770215  T
Q  123 tacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattgacta 222  Q
    | |||||||| | |||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  | ||| | || |||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||    
T  11770216 tgcttgataaaatgtttgtaagaccaagtgtttcaccgtggggagcgccgatattgctagttaagaagaaagatggtagcatgaggttatgcattgatta 11770315  T
Q  223 tcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    ||| || ||||||||||| || || |||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||    
T  11770316 tcgacagttgaacaaagtaacgataaagaataggtatccacttccaagaattgatgacttga 11770377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 15627098 - 15626820
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    |||||||||| ||  | ||||| ||||| |||||||| || || ||||| ||||| |||   || ||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||    
T  15627098 cagagagggaagtttaattttcgattgatcttgttccgggtacgaagcctgtgtctatgatgccttaccgtatgtcggcttatgagttggctgagttgaa 15626999  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    ||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| |||    
T  15626998 gaaacagttagaagatttgcttgataagaagtttgtaagaccgagtgtttcaccttgaggagcaccggtgttgttggttaaaaagaaagatggtagcatg 15626899  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    ||||| |||||| | ||||  || ||||| ||| | || || |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||    
T  15626898 aggttatgcattaattatcagcagttgaataaaatgacgataaagaataggtatccacttccaagaattgatgatttga 15626820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Original strand, 48812949 - 48813227
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    |||| ||||| || || ||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| ||| |  | ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  48812949 cagaaagggaagttgaattttcaattgatcttgttccgggtacgaagcctgtgtctatgacttcttaccgtatgtcggcttctgagttggctgagttgaa 48813048  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    ||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||| || |||||  | || |||||||| |||||||| |||    
T  48813049 gaaacagttagaagatttgcttgataagaagtttgtaagatcgagtgtttcaccttggggagcgccggtgttacttgttaagaagaaagatggtagcatg 48813148  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    ||||| || ||||| ||||| || ||||| ||||| || || ||| || | ||||| ||||| || |||||||| ||||    
T  48813149 aggttatgtattgattatcgacagttgaataaagtaacgataaagtattggtatccacttccaagaattgatgatttga 48813227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 200 - 284
Target Start/End: Original strand, 23503739 - 23503823
Alignment:
Q  200 agtatgaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23503739 agtatgaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 23503823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 59 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 7826420 - 7826195
Alignment:
Q  59 tcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcac 158  Q
    ||||| || ||||| || ||||| || || ||||| | |||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| ||||| ||||||| ||||||||||    
T  7826420 tcgattgcgccgtatcggatgtctgcatcggagttgggtgaattgaagaatcagttggaagagttgcttgagaagcagtttattagaccgagtgtttcac 7826321  T
Q  159 cgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagata 258  Q
    ||||||| || || ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||  | || ||||| || |||||||| || || ||||||||| | ||    
T  7826320 cgtggggtgctccagtgttgttggttaagaagaaagatggaagcatgaggttgtgtgtggattatcgacagttgaacaaggtgacgattaagaatcggta 7826221  T
Q  259 tccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    ||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  7826220 tccacttccaaggattgatgatttga 7826195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 7 - 168
Target Start/End: Original strand, 14150133 - 14150294
Alignment:
Q  7 agagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaag 106  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||| |||||||  ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||    
T  14150133 agagagggaagtcgagttttctattgatcttgttcttggaacgaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtctgcttccgagttagctgagttgaag 14150232  T
Q  107 aaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagc 168  Q
    ||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  14150233 aaacaattagaagatttgcttgagaagaaatttgttagaccaagtgtttcaccttggggagc 14150294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 59 - 284
Target Start/End: Original strand, 27105524 - 27105749
Alignment:
Q  59 tcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcac 158  Q
    ||||| || ||||| || ||||| || || ||||| | |||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| ||||| ||||||| ||||||||||    
T  27105524 tcgattgcgccgtatcggatgtctgcatcggagttgggtgaattgaagaatcagttggaagagttgcttgagaagcagtttattagaccgagtgtttcac 27105623  T
Q  159 cgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagata 258  Q
    ||||||| || || ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||  | || ||||| || |||||||| || || ||||||||| | ||    
T  27105624 cgtggggtgctccagtgttgttggttaagaagaaagatggaagcatgaggttgtgtgtggattatcgacagttgaacaaggtgacgattaagaatcggta 27105723  T
Q  259 tccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    ||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  27105724 tccacttccaaggattgatgatttga 27105749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 59 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 27172801 - 27172576
Alignment:
Q  59 tcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcac 158  Q
    ||||| || ||||| || ||||| || || ||||| | |||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| ||||| ||||||| ||||||||||    
T  27172801 tcgattgcgccgtatcggatgtctgcatcggagttgggtgaattgaagaatcagttggaagagttgcttgagaagcagtttattagaccgagtgtttcac 27172702  T
Q  159 cgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagata 258  Q
    ||||||| || || ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||  | || ||||| || |||||||| || || ||||||||| | ||    
T  27172701 cgtggggtgctccagtgttgttggttaagaagaaagatggaagcatgaggttgtgtgtggattatcgacagttgaacaaggtgacgattaagaatcggta 27172602  T
Q  259 tccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    ||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  27172601 tccacttccaaggattgatgatttga 27172576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 97 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 13379365 - 13379178
Alignment:
Q  97 tgaattgaagaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgat 196  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| ||||| | || || |||||||| |||||||| || || ||||||||||| |||||||| |||    
T  13379365 tgaattgaagaagcagttggaagagttgcttgagaagcagtttatcaggccgagtgtttctccgtggggtgctccagtgttgttggttaagaagaaagat 13379266  T
Q  197 ggtagtatgaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    || || |||||||||||  | || ||||| || |||||||| || || |||||||||   ||||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  13379265 ggaaggatgaggttgtgtgtggattatcggcagttgaacaaggtgactattaagaatctttatcctcttccaaggattgatgatttga 13379178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 131 - 276
Target Start/End: Original strand, 15172 - 15317
Alignment:
Q  131 aagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattgactatcgtcaat 230  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||| | ||||||||||| |||||||| ||||| | ||| |||||||||||||| |    
T  15172 aagaaatttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccagttttgctagtgaagaagaaagatggtagcatgagatagtgtattgactatcgtcagt 15271  T
Q  231 tgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattga 276  Q
    ||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  15272 tgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattga 15317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 88 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 13458526 - 13458330
Alignment:
Q  88 tgagttagctgaattgaagaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaag 187  Q
    |||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||  ||||||  ||||||||  ||||||| || || ||||||||||| |||    
T  13458526 tgagttaggtgaattgaagaagcacttggaagagttacttgagaagcagttcattagactgagtgtttcttcgtggggtgctccagtgttgttggttaag 13458427  T
Q  188 aagaatgatggtagtatgaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    ||||| ||||  || |||||||||||  | || ||||| || || ||||| |  || ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  13458426 aagaaggatgaaagcatgaggttgtgtgtggattatcggcagttaaacaaggcaacgattaagaatcgatatccgcttcaaaggattgatgatttga 13458330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 97 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 4442409 - 4442223
Alignment:
Q  97 tgaattgaagaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgat 196  Q
    |||||||||||  ||||| |||||||| ||||| ||| ||||| | || || |||||||| |||||||| || || ||||| ||||| |||||||| |||    
T  4442409 tgaattgaagag-cagttagaagagttgcttgagaagcagtttatcaggccgagtgtttctccgtggggtgctccagtgttattggttaagaagaaagat 4442311  T
Q  197 ggtagtatgaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    || || |||||||||||  | || ||||| || ||||| || || || ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4442310 ggaagcatgaggttgtgtgtggattatcggcagttgaagaaggtgacgattaagaatcggtatccgcttccgaggattgatgatttga 4442223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 97 - 259
Target Start/End: Original strand, 38934 - 39096
Alignment:
Q  97 tgaattgaagaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgat 196  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||| | || || |||||| | || || ||||| ||||| |||||||||||||||||  | || || ||||| |||    
T  38934 tgaattaaagaaacagttagaagagttattagagaaaaagtttatcaggcctagtgtctcaccttggggagcacctgtgttactcgttaaaaagaaggat 39033  T
Q  197 ggtagtatgaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatat 259  Q
    || ||||||||| | ||  | || || ||||| ||||| ||||| || |||||||||| ||||    
T  39034 ggcagtatgaggctatgtgtggattaccgtcagttgaataaagtcactattaagaataaatat 39096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 6 - 50
Target Start/End: Original strand, 12799176 - 12799220
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaa 50  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||    
T  12799176 cagagagggaggttgaattttcaattgaccttgttccaggaacaa 12799220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 6 - 44
Target Start/End: Complemental strand, 19149585 - 19149547
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccg 44  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  19149585 cagagagggaggttgaattttcaattgaccttgttcccg 19149547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 6 - 44
Target Start/End: Complemental strand, 20748984 - 20748946
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccg 44  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  20748984 cagagagggaggttgaattttcaattgaccttgttcccg 20748946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 251; Significance: 1e-139; HSPs: 41)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Original strand, 51604480 - 51604758
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51604480 cagaaagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 51604579  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  51604580 gaaacagttggaagatttacttgataagaagtttgtaagacccagcgtttcgccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaaaaaggatggtagtatg 51604679  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51604680 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 51604758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Original strand, 1646965 - 1647243
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    |||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| |||||    
T  1646965 cagaaagggaagttgagttctcgattgatcttgtcccgggaacgaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagcttctgaattggctgagttgaa 1647064  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    |||||||||||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  1647065 gaaacagttggaggatttgcttgacaagaagtttgtaagacccagtgtctcaccgtggggagcacctgtgttgttagtaaagaagaaagatggtagtatg 1647164  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1647165 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaataaagttacaataaagaataggtatccacttccgaggattgatgacttga 1647243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Original strand, 3262482 - 3262760
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3262482 cagagagggaggttgaattttcaattgatcttgttccaggaactaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgagttgaa 3262581  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    |||||||||||| ||  |  | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  3262582 gaaacagttggaggacctgttagataagaagtttgtaagacccagtgtttcaccttggggagcaccggtgttgttggtaaagaagaaggatggtagtatg 3262681  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    ||  |||| || || || ||||| |||||||||||||| || ||||| || ||||||||||| || ||||| |||||||    
T  3262682 agactgtgtatagattaccgtcagttgaacaaagttacgatcaagaacaggtatccgcttcctagaattgacgacttga 3262760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 6 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 20892615 - 20892385
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20892615 cagagagggaggttgaattttcaattgaccttgttccaggaacaaagccggtgtcgatggcaccataccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 20892516  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    |||||||||| | || ||  | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  20892515 gaaacagttgaaggacttgttggataagaagtttgtaagacccagtgtttcaccttggggagcaccggtgttgttggttaagaagaaggatggtagtatg 20892416  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaaca 236  Q
    ||  |||||||||| || ||||| |||||||    
T  20892415 agactgtgcattgattaccgtcagttgaaca 20892385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Original strand, 29451225 - 29451503
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||| ||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29451225 cagagcgggaggttgaattttcaattgatcttgttccaggaacaaagccggtgtcgatgacaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgagttgaa 29451324  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    |||||||||||| ||  |  | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  29451325 gaaacagttggaggacctgttagataagaagtttgtaagacccagtgtttcaccttggggagcaccggtgttgttggtcaagaagaaggatggtagtatg 29451424  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    ||  | || || || || ||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||    
T  29451425 agactatgtatagattaccgtcagttgaacaaggttacgatcaagaacagatatccgcttcctagaattgacgacttga 29451503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Original strand, 11204920 - 11205198
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  11204920 cagagagggaggttgaattttcaattgagcttgttccaggaacgaagccggtgtcgatggcaccataccgtatgtcagcttctgagttagctgaattaaa 11205019  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    ||| |||||||| ||  |  | |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  11205020 gaagcagttggaggacctgttagataagaaatttgtaagacccagtgtttcaccttggggagcaccggtgttgttggttaagaagaaggatggtagtatg 11205119  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    ||  ||||||| || || ||||| |||||||| ||||| || ||||| || ||||||||||| || ||||| |||||||    
T  11205120 agactgtgcatagattaccgtcagttgaacaaggttacgataaagaacaggtatccgcttcctagaattgacgacttga 11205198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Original strand, 44659554 - 44659832
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    |||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  44659554 cagagagggaagttgaattttcaattgaccttgttccaggaactaagccggtgtcgatggcaccgtaccatatgtcagcttctgagttagctgagttgaa 44659653  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    |||||||||||| ||  |  | |||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  44659654 gaaacagttggaggacctgttagataagaagtttgtaagactcagtgtttcaccttggggagcaccggtgttgttggtcaagaagaaggatggtagtatg 44659753  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    ||  |||| || || || ||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| || || ||||| |||||||    
T  44659754 agactgtgtatagattaccgtcagttgaacaaggttacgatcaagaacagatatccgctccctagaattgacgacttga 44659832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 11 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 27902964 - 27902692
Alignment:
Q  11 agggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaac 110  Q
    ||||| || ||||| || ||||| ||| |||| ||||| || ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||| || ||||||||||    
T  27902964 agggaagttgagttctcgattgatcttattccgggaacgaaaccggtgtcgatggcaccatatcgcatgtcagcttctgaattagccgagttgaagaaac 27902865  T
Q  111 agttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggtt 210  Q
    ||||| | || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||    
T  27902864 agttg-aggacttgcttgataagaagtttgtaagacccagtgtttcgttgtggggagcgcttgtgttgttggtaaagaagaaggatggtagtatgagatt 27902766  T
Q  211 gtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27902765 gtgcattgactatcgtcagttgaacaaagttacaataaagaacagatatccacttccgaggattgatgacttga 27902692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 16150290 - 16150019
Alignment:
Q  11 agggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaac 110  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| || || ||  | |||||||||||||||     
T  16150290 agggaggttgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtcggcatccgaacttgctgaattgaagaaat 16150191  T
Q  111 agttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggtt 210  Q
    ||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||  | ||||||||||| ||||| || ||||||| |||||||||    
T  16150190 agttggaggacttgcttgataagaattttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgtcagtgttgttggttaagaataaggatggtactatgaggtt 16150091  T
Q  211 gtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgactt 282  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  16150090 gtgcattgattatcgtcagttgaataaagttacaataaagaacaggtatccacttccgaggattgatgactt 16150019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 16154436 - 16154165
Alignment:
Q  11 agggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaac 110  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| || || ||  | |||||||||||||||     
T  16154436 agggaggttgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtcggcatccgaacttgctgaattgaagaaat 16154337  T
Q  111 agttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggtt 210  Q
    ||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||  | ||||||||||| ||||| || ||||||| |||||||||    
T  16154336 agttggaggacttgcttgataagaattttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgtcagtgttgttggttaagaataaggatggtactatgaggtt 16154237  T
Q  211 gtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgactt 282  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  16154236 gtgcattgattatcgtcagttgaataaagttacaataaagaacaggtatccacttccgaggattgatgactt 16154165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Original strand, 16251278 - 16251556
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    |||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  16251278 cagagagggaagtcgagttttctattgatcttgttcctggaacgaagcaggtgtcgatggcaccttatcgtatgtctgcttccgagttagctgaattgaa 16251377  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||| | ||||||||||| |||||||| |||    
T  16251378 gaaacagttagaagatttgcttgagaagaaatttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccagttttgctagtgaagaagaaagatggtagcatg 16251477  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    || ||||| |||||||||||||| |||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  16251478 agattgtgtattgactatcgtcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttga 16251556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 23958331 - 23958053
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||| || || |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||| |||| |||||    
T  23958331 cagagagagaagttgagttttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtctcgatggcaccttatcgtatgtctgcttctgagttatctgagttgaa 23958232  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  23958231 gaaacagttggaagacttgcttgagaagaagtttgttagaccgagtgtttcaccttggggagcgccggttttgttagtaaagaagaaagatggtagtatg 23958132  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    ||| | || ||||| ||||| || |||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  23958131 aggctatgtattgattatcgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttga 23958053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 27713920 - 27713642
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||| || || |||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||| |||| |||||    
T  27713920 cagagagagaagttgagttttctattgatcttgtccctggaacgaagccggtctcgatggcaccttatcgtatgtctgcttctgagttatctgagttgaa 27713821  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  27713820 gaaacagttggaagacttgcttgagaagaagtttgttagaccgagtgtttcaccttggggagcgccggttttgttagtaaagaagaaagatggtagtatg 27713721  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    ||||| || ||||| ||||| || |||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  27713720 aggttatgtattgattatcgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttga 27713642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 6 - 282
Target Start/End: Original strand, 15356808 - 15357084
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    |||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| || || ||||| ||||| |||||    
T  15356808 cagaaagggaggttgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccggtgtcaatggcaccttatcgtatgtcggcgtccgagttggctgagttgaa 15356907  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    |||||| |||||||| || ||||||||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||  | |||||||| |||||||| |||||||  |||    
T  15356908 gaaacaattggaagacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgttttaccgtggggagcgccgatattgttggttaagaagaaggatggtaccatg 15357007  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgactt 282  Q
    || || ||||| || |||||||| |||||||||||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  15357008 agattatgcatcgattatcgtcagttgaacaaagttacgataaagaacaggtatccacttccgaggattgatgactt 15357084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 8388996 - 8388718
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||| || || |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||| |||| |||||    
T  8388996 cagagagagaagttgagttttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtctcgatggcaccttatcgtatgtctgcttctgagttatctgagttgaa 8388897  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||| | || |||||||| ||||||||||||    
T  8388896 gaaacagttagaagacttgcttgagaagaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggttttgctagtaaagaagaaagatggtagtatg 8388797  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
     ||||||| ||||| ||||| || |||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  8388796 cggttgtgtattgattatcggcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttga 8388718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Original strand, 19776221 - 19776499
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||| || || |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||| |||| |||||    
T  19776221 cagagagagaagttgagttttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtctcgatggcaccttatcgtatgtctgcttctgagttatctgagttgaa 19776320  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||  | ||| | || |||||||| ||||||||||||    
T  19776321 gaaacagttggaagacttgcttgagaagaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccgattttgctagtaaagaagaaagatggtagtatg 19776420  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
     ||||||| ||||| ||||| || |||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  19776421 cggttgtgtattgattatcgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttga 19776499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 21 - 278
Target Start/End: Original strand, 15145336 - 15145593
Alignment:
Q  21 agttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaaga 120  Q
    ||||||| ||||| |||||||  ||||  ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  15145336 agttttctattgatcttgttcttggaatgaagccggtgtctatggcaccttatcgtatgtcagcttccgagttagctgagttgaagaaacagttagaaga 15145435  T
Q  121 gttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattgac 220  Q
     || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||| | ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || || ||     
T  15145436 cttgcttgagaagaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccttttttgttagtgaagaagaaagatggtagtatgagattatgtatcgat 15145535  T
Q  221 tatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatg 278  Q
    |||||||| ||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  15145536 tatcgtcagttgaacaaagtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatg 15145593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 8 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 15258509 - 15258238
Alignment:
Q  8 gagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaaga 107  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15258509 gagagggaggttgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagcttccgagttagctgaattgaaga 15258410  T
Q  108 aacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgag 207  Q
    ||| |||||| || || || |||||||| ||||| ||||| |||| |||||| ||||||||  | |||||| |||| |||||||| || ||||| |||||    
T  15258409 aactgttggaggacttgctcgataagaaatttgtaagaccaagtgattcaccttggggagcgtcggtgttgctggttaagaagaaggacggtagcatgag 15258310  T
Q  208 gttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatga 279  Q
    ||| |||||||| || || || ||||| || ||||| || ||||| || ||||| ||| |||||||||||||    
T  15258309 gttatgcattgattaccgacagttgaataaggttacgataaagaacaggtatccactttcgaggattgatga 15258238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Original strand, 8051051 - 8051329
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||| || || |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||| |||| |||||    
T  8051051 cagagagagaagttgagttttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtctcgatggcaccttatcgtatgtctgcttctgagttatctgagttgaa 8051150  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||  || || ||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  8051151 gaaacagttggaagacttgcttgagaagaagtttgttagaccaagtgtttcgccttggggagtgccggttttgttagtaaagaagaaagatggtagtatg 8051250  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    ||| | || ||||| ||||| || |||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  8051251 aggctatgtattgattatcgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttga 8051329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 12479184 - 12478906
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||| || || |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| || |||||||| |||||||||||| |||| |||||    
T  12479184 cagagagagaagttgagttttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtctcgatggtaccttatcgtatgtctgcttctgagttatctgagttgaa 12479085  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||| | || |||||||| ||||||||||||    
T  12479084 gaaacagttagaagacttgcttgaaaagaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggttttgctagtaaagaagaaagatggtagtatg 12478985  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
     ||||||| ||||| ||||| || |||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  12478984 cggttgtgtattgattatcgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttga 12478906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Original strand, 14301407 - 14301685
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||| || || |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||| |||| |||||    
T  14301407 cagagagagaagttgagttttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtctcgatggcaccttatcgtatgtctgcttccgagttatctgagttgaa 14301506  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    |||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  14301507 gaaacagttggaggacttgcttgagaagaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggttttgttagtaaagaagaaagatggtagtatg 14301606  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
     |||| || ||||| ||||| || |||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  14301607 cggttatgtattgattatcggcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttga 14301685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Original strand, 16234420 - 16234698
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||| || || |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||| |||| |||||    
T  16234420 cagagagagaagttgagttttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtctcgatggcaccttatcgtatgtctgcttccgagttatctgagttgaa 16234519  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||| | || |||||||| ||||||||||||    
T  16234520 gaaacagttagaagacttgcttgagaagaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggttttgctagtaaagaagaaagatggtagtatg 16234619  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
     ||||||| ||||| ||||| || |||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  16234620 cggttgtgtattgattatcgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttga 16234698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Original strand, 17092577 - 17092855
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||| || || || ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||| |||| |||||    
T  17092577 cagagagagaagttgaattttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtctcgatggcaccttatcgtatgtctgcttctgagttatctgagttgaa 17092676  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||| | || |||||||| ||||||||||||    
T  17092677 gaaacagttagaagacttgcttgagaagaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggttttgctagtaaagaagaaagatggtagtatg 17092776  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
     ||||||| ||||| ||||| || |||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  17092777 cggttgtgtattgattatcgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttga 17092855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 10 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 15072939 - 15072670
Alignment:
Q  10 gagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaa 109  Q
    ||||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  15072939 gagggaggttgaattttcgattgatcttgtccccggaacgaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagcgtccgagttagctgaattgaagaaa 15072840  T
Q  110 cagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggt 209  Q
    |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||  | || || ||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  15072839 cagttggaggatttacttgataagaaatttgtaagaccgagtgtttcaccttggggagcgtcggtattattggttaagaagaatgatggcagtatgaggt 15072740  T
Q  210 tgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatga 279  Q
    |||| || |  || |||||  |||| ||||| || || ||||| |||||||| |||||||  ||||||||    
T  15072739 tgtgtataggttaccgtcagctgaataaagtgacgataaagaacagatatccacttccgataattgatga 15072670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 14683151 - 14682873
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    |||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| || ||| |||| | |||    
T  14683151 cagagagggaagttgagttttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtctgcttccgaattatctgagtcgaa 14683052  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    ||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||  | || |||||||| ||||||||||||    
T  14683051 gaaacagttggaagatttgcttgagaagaaatttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggttttactagtaaagaagaaagatggtagtatg 14682952  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    ||||| || ||||| ||||| || |||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  14682951 aggttatgtattgattatcgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttga 14682873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 6 - 276
Target Start/End: Original strand, 15001053 - 15001323
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||| || |||||||| || || ||||||||||| |||||    
T  15001053 cagagagggaggttgaattttcaattgaccttgttctaggaacgaagccggtgtcgaaggcaccttatcgtatgtcggcgtccgagttagctgagttgaa 15001152  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    ||||||||||||  | || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||  || || |||||||| |||||||| |||||||| |||    
T  15001153 gaaacagttggagaacttgcttgacaagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccgtgaggagtgccggtattgttggttaagaagaaggatggtagcatg 15001252  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattga 276  Q
    |||||||| || || || ||||| ||||| ||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  15001253 aggttgtgtatagattaccgtcagttgaataaagtgacgataaagaataggtatccacttccgaggattga 15001323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 40475624 - 40475346
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||| || || |||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||| |||| |||||    
T  40475624 cagagagagaagtcgagttttctattgatcttgtccctggaacgaagccggtctcgatggcaccttatcgtatgtctgcttccgagttatctgagttgaa 40475525  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    ||||| ||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  40475524 gaaactgttggaagatttgcttgagaagaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggttttgttagtaaagaagaaggatggtagtatg 40475425  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
     |||| || ||||| ||||| || |||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  40475424 cggttatgtattgattatcggcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttga 40475346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 6 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 14696697 - 14696424
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    |||| ||||| || || ||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||| | ||| |||||    
T  14696697 cagaaagggaagttgaattttcgattgaccttgttccgggtacgaagcctgtgtctatgacaccttaccgtatgtcggcttctgagttggttgagttgaa 14696598  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || ||| | || |||||||| |||||||| |||    
T  14696597 gaaacagttagaagatttacttgataagaagtttgtaagaccaagtgtttcaccgtggggagcgccagtattgctagttaagaagaaagatggtagcatg 14696498  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatga 279  Q
    ||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| || || |||||||  ||||  ||||| || ||||||||    
T  14696497 aggttatgcattgattatcgacagttgaacaaagtaacgataaagaatatgtatctacttccaagaattgatga 14696424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 9 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 8708488 - 8708218
Alignment:
Q  9 agagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaa 108  Q
    ||||||| || || |||||||| || |||||||| |  || |||||  |||||||| | || ||| |||||||||| |||||| |||| || ||||||||    
T  8708488 agagggaagttgaattttcaatcgatcttgttccagatacgaagcctatgtcgatgacgccttactgtatgtcagcatctgagctagcagagttgaagaa 8708389  T
Q  109 acagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgagg 208  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||  |||||    
T  8708388 acagttggaggatttacttgataagaagtttgtaagaccgagtgtttcaccttggggagcaccggtgttgttggttaagaagaaagatggtagcgtgagg 8708289  T
Q  209 ttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatga 279  Q
    ||||| || || || ||||| ||||| ||||| || || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  8708288 ttgtgtatagattaccgtcagttgaataaagtgacgataaagaataggtatccacttccgagaattgatga 8708218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Original strand, 18224874 - 18225152
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    |||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||  ||| ||||||||||| || |||||||| ||||  ||||||||||| ||||     
T  18224874 cagagagggaagttgagttttctattgatcttgttcctggaacgaagttggtatcgatggcaccttatcgtatgtctgctttcgagttagctgagttgac 18224973  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
     |||||||| ||||| || ||  | ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||| | || |||||||| |||||||| |||    
T  18224974 aaaacagttagaagatttgctcaagaagaaatttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccagttttgctagtcaagaagaaagatggtagcatg 18225073  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    || ||||| |||||||||||||| |||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  18225074 agattgtgtattgactatcgtcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttga 18225152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 22632284 - 22632010
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    |||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||  |||||  |||| ||| |||| || |||||||||||||||||||| || || |||||    
T  22632284 cagagagggaagttgagttttcgattgatcttgttcctggaatgaagcctatgtctatgacaccttatcgtatgtcagcttctgagttggccgagttgaa 22632185  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||   | || ||||| ||||||||||| ||||     |||    
T  22632184 gaaacagttagaagatttacttgagaaaaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggggagtgtcggttttgttagtgaagaagaaagatgc----atg 22632089  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    || ||||| ||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  22632088 agattgtgtattgactatcgacagttgaacaaggtgacaataaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttga 22632010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Original strand, 16352958 - 16353236
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||| || || |||||||| | ||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||| |||| |||||    
T  16352958 cagagagagaagtcgagttttctaatgatcttgttcctggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtctgcttccgagttaactgagttgaa 16353057  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
     ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| || ||||| || || ||||| || ||||| || ||||||||||||    
T  16353058 taaacaattagaagatttgcttgagaagaagtttgttagaccaagtttttcaccttgaggagcgcccgttttgttagtaaagaaaaaagatggtagtatg 16353157  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    ||||| || || || |||| ||| ||||| ||||| || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  16353158 aggttatgtatcgattatcatcagttgaataaagtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttga 16353236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 23 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 16218797 - 16218538
Alignment:
Q  23 ttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaagagt 122  Q
    ||||| ||||| || ||||| || || ||||| ||||| ||| |||| |||||||||||||||| |||||| | ||| |||||||| ||||| ||||| |    
T  16218797 ttttcgattgatctggttccgggtacgaagcctgtgtctatgacaccttaccgtatgtcagcttatgagttggttgagttgaagaagcagttagaagatt 16218698  T
Q  123 tacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattgacta 222  Q
    ||||| ||||||||||| | ||||| ||||||||||| || |||||||| || ||| | || |||||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||    
T  16218697 tacttcataagaagtttataagaccaagtgtttcaccttgtggagcaccggtattgctagttaagaagaaagatggtagcatgagattatgcattgatta 16218598  T
Q  223 tcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgactt 282  Q
    |||  | ||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  16218597 tcgatagttgaacaaagtaacgataaagaataggtatccacttccgagaattgatgactt 16218538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 23 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 16222117 - 16221858
Alignment:
Q  23 ttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaagagt 122  Q
    ||||| ||||| || ||||| || || ||||| ||||| ||| |||| |||||||||||||||| |||||| | ||| |||||||| ||||| ||||| |    
T  16222117 ttttcgattgatctggttccgggtacgaagcctgtgtctatgacaccttaccgtatgtcagcttatgagttggttgagttgaagaagcagttagaagatt 16222018  T
Q  123 tacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattgacta 222  Q
    ||||| ||||||||||| | ||||| ||||||||||| || |||||||| || ||| | || |||||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||    
T  16222017 tacttcataagaagtttataagaccaagtgtttcaccttgtggagcaccggtattgctagttaagaagaaagatggtagcatgagattatgcattgatta 16221918  T
Q  223 tcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgactt 282  Q
    |||  | ||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  16221917 tcgatagttgaacaaagtaacgataaagaataggtatccacttccgagaattgatgactt 16221858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 71 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 23443624 - 23443411
Alignment:
Q  71 taccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcac 170  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| | ||||||||| || ||||| |    
T  23443624 taccgtatgtcagcttctgagttggctgaattgaagaaacagttagaagatttgcttgataaaaagtttgtaagaccaaatgtttcaccttgaggagcgc 23443525  T
Q  171 ctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgag 270  Q
    |  | ||| |  | |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || |||||||  ||||| ||||||||    
T  23443524 cgatattgctaattaagaagaaagatggtagtatgagattgtgtattgactatcgatagttgaacaaagtaacgataaagaatatgtatccacttccgag 23443425  T
Q  271 gattgatgacttga 284  Q
     |||||||||||||    
T  23443424 aattgatgacttga 23443411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 21 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 14162039 - 14161776
Alignment:
Q  21 agttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaaga 120  Q
    |||||||||| || ||| || | ||||| |||||  | || ||| |||| || |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14162039 agttttcaatcgatcttatttcgggaacgaagcctatatctatgacaccttatcgtatgtctgcttctaagttagctgaattgaagaaacagttggagga 14161940  T
Q  121 gttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattgac 220  Q
     || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||| || |||||||| || |||||||| ||||||||||||||  |||| |||||     
T  14161939 tttgcttgacaagaaatttgtgagaccaagtgtttctccttggggagcgccagtgttgttagtcaagaagaaagatggtagtatgagactgtgtattgat 14161840  T
Q  221 tatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    ||||| || |||||||| || || ||  ||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||    
T  14161839 tatcgacagttgaacaaggtaacgatacagaataggtatccacttccaagaattgatgatttga 14161776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 47 - 284
Target Start/End: Original strand, 14848835 - 14849072
Alignment:
Q  47 acaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagac 146  Q
    |||||||| ||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||| | || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||    
T  14848835 acaaagcctgtgtctatgacaccttaccgtatgtcggcttctgagttggccgagttgaagaaataattagaagatttacttgagaagaagtttgtaagac 14848934  T
Q  147 ccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaat 246  Q
    | ||||||||||| | |||||| ||  | ||| | || || ||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| || ||    
T  14848935 caagtgtttcaccttagggagcgccgatattgctagttaaaaagaaagatggtagcatgaggttatgcattgattatcgacagttgaataaagtaacgat 14849034  T
Q  247 taagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
     |||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||    
T  14849035 aaagaatagatatccacttccaaaaattgatgacttga 14849072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 59 - 284
Target Start/End: Original strand, 15290899 - 15291124
Alignment:
Q  59 tcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcac 158  Q
    ||||| || ||||| || ||||| || || ||||| | |||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| ||||| ||||||| |||| |||||    
T  15290899 tcgattgcgccgtatcggatgtctgcatcagagttgggtgaattgaagaatcagttggaagagttgcttgagaagcagtttattagaccgagtggttcac 15290998  T
Q  159 cgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagata 258  Q
    ||||||| || ||  |||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||  | || ||||  || |||||||| || || ||||||||| | ||    
T  15290999 cgtggggtgctccaatgttgttggttaagaagaaagatggaagcatgaggttgtgtgtggattatctgcagttgaacaaggtgacgattaagaatcggta 15291098  T
Q  259 tccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    ||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  15291099 tccacttccaaggattgatgatttga 15291124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 6 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 19634720 - 19634613
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||| || || |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||| |||| |||||    
T  19634720 cagagagagaagttgagttttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtctcgatggcaccttatcgtatgtctgcttccgagttatctgagttgaa 19634621  T
Q  106 gaaacagt 113  Q
    ||||||||    
T  19634620 gaaacagt 19634613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 173 - 284
Target Start/End: Original strand, 12340721 - 12340831
Alignment:
Q  173 gtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgagga 272  Q
    |||||||| || |||||||| |||||| |||||||||||||  | || ||||  || |||||||| || || ||||| ||| | |||||||| |||||||    
T  12340721 gtgttgttagttaagaagaaggatggt-gtatgaggttgtgtgtggattatcagcatttgaacaaggtgacgattaacaattggtatccgctcccgagga 12340819  T
Q  273 ttgatgacttga 284  Q
    ||||||| ||||    
T  12340820 ttgatgatttga 12340831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 97 - 254
Target Start/End: Original strand, 18547398 - 18547555
Alignment:
Q  97 tgaattgaagaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgat 196  Q
    |||||| |||||||| || ||||||||| | || || |||||| | || |  ||||| ||||| ||||||||||| |||||  | || || ||||| |||    
T  18547398 tgaattaaagaaacaattagaagagttattagagaaaaagtttatcaggcttagtgtctcaccttggggagcacccgtgttacttgttaaaaagaaggat 18547497  T
Q  197 ggtagtatgaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaata 254  Q
    || ||||||||| | ||  | || || ||||||||||| ||||| || ||||||||||    
T  18547498 ggcagtatgaggctatgtgtggattaccgtcaattgaataaagtcactattaagaata 18547555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 2)
Name: scaffold0348
Description:

Target: scaffold0348; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Original strand, 5540 - 5818
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5540 cagagagggaggttgagttctccatcgaccttgttccaggaacgaagccggtgtcgatggcaccatatcgtatgtcagcatctgagttagctgaattgaa 5639  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    |||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| |||    
T  5640 gaaacagtcggaagacttgcttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgtttgtaaagaagaaggacggtagcatg 5739  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5740 aggttgtgcattgactatcgtcagttgaacaaagttacgataaagaacaggtatccacttccgaggattgatgacttga 5818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Original strand, 18174 - 18452
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||||||||| ||||| || || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||| | ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18174 cagagagggaggttgagttctccatcgaccttgtcccaggaacgaagccggtgtcgatggcaacttattgtatgtcagcatctgagttagctgaattgaa 18273  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||    
T  18274 gaaacagttggaagacttgcttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcgcctgtgttgttggtaaagaagaaggatggtagcatg 18373  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| || ||||| | ||||||||||||||||||||    
T  18374 aggttgtgcattgattatcgtcagttgaacaaagttacgataaagaacaggtatccacatccgaggattgatgacttga 18452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 183; Significance: 5e-99; HSPs: 3)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Original strand, 45118 - 45396
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    |||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  || ||||||| |||||| |||||||||||||| ||    
T  45118 cagaaagggaggttgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccggtgtcgatggcactttatcgtatgttagcttccgagttagctgaattaaa 45217  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| || || |||||||| ||||| || ||||||||||||    
T  45218 gaagcagttggaagacttgcttgataagaagtttgtaagaccaagtgtctcaccttggggagcgccggtattgttggtaaagaaaaaggatggtagtatg 45317  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45318 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 45396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Original strand, 40024 - 40302
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  40024 cagagagggaggttgaattttcaattgatcttgttccaggaactaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgagttgaa 40123  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    |||||||||||| ||  |  | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  40124 gaaacagttggaggacctgttagataagaagtttgtaagacccagtgtttcaccttggggagcaccggtgttgttggtaaagaagaaggatggtagtatg 40223  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    ||  |||| || || || ||||| |||||||||||||| || ||||| || ||||||||||| || ||||| |||||||    
T  40224 agactgtgtatagattaccgtcagttgaacaaagttacgatcaagaacaggtatccgcttcctagaattgacgacttga 40302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 23 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 4511 - 4251
Alignment:
Q  23 ttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaagagt 122  Q
    ||||| ||| |||||||||| || || ||||| ||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |    
T  4511 ttttcgattaaccttgttcc-ggtacgaagcctgtgtctatgacaccttaccgtatgtcggcttctgagttggctgagttgaagaaacagttagaagatt 4413  T
Q  123 tacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattgacta 222  Q
    | ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |   | ||| | || |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||    
T  4412 tgcttgataagaagtttgtaagaccaagtgtttcaccgtggggagcgctgatattgcttgttaagaagaaagatggtagtatgagattgtgtattgatta 4313  T
Q  223 tcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    ||| || ||||| | ||| || || |||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||    
T  4312 tcgacagttgaatagagtaacgataaagaataggtatccgcttccaagaattgatgatttga 4251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 181; Significance: 8e-98; HSPs: 3)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 12 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 22483 - 22211
Alignment:
Q  12 gggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaaca 111  Q
    ||||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22483 gggaggttgagttctccatcgaccttgttccaggaacgaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagcatctgagttagctgaattgaagaaaca 22384  T
Q  112 gttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttg 211  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||| |||||||||    
T  22383 gttggaagacttgcttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcgcctgtgttgttgttaaagaagaaggatggtagcatgaggttg 22284  T
Q  212 tgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    |||||||| |||| ||| |||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22283 tgcattgattatcatcagttgaacaaagttacgataaagaacagatatccacttccgaggattgatgacttga 22211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 6 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 39671 - 39395
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  39671 cagagagggaggttgagttctccatcgaccttgttccaggaacgaagtcggtgtcgatggcaccatatcgtatgtcagcatctgagttagctgaattgaa 39572  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||| |||||||| || ||||| | |    
T  39571 gaaacagttggaagacttgcttgataagaagtttgttagacccagtgtttcactgtggggagcgcttgtgttgttggtaaagaagaaggacggtagcacg 39472  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgactt 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  39471 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacgataaagaacaggtatccacttccgaggattgatgactt 39395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #3
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Original strand, 18032 - 18310
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    |||||||||| || |||||||| ||||| ||| ||||  |||| |||||  |||| ||| || | || |||||||||||||||||||| || || |||||    
T  18032 cagagagggaagttgagttttcgattgatcttcttccacgaacgaagcctatgtctatgacatcttatcgtatgtcagcttctgagttggccgagttgaa 18131  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    |||||| || || || || || || || |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| || || ||| | ||||||||||| |||||||| |||    
T  18132 gaaacaattagaggatttgctcgagaaaaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggagagcgccggttttgctagtgaagaagaaagatggtagcatg 18231  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    || ||||| ||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||| |||||||||||| ||||    
T  18232 agattgtgtattgactatcgacagttgaacaaggtgacaataaagaataggtatccacttctgaggattgatgatttga 18310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 179; Significance: 1e-96; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 8 - 282
Target Start/End: Original strand, 99255 - 99529
Alignment:
Q  8 gagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaaga 107  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  99255 gagagggaggttgagttttcaattgaccttgctccgggaacgaagccggtgtcgatggcaccttatcgcatgtcagcttctgagttagctgaattgaaga 99354  T
Q  108 aacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgag 207  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||    
T  99355 aacagttggaagacttgcttgataagaattttgtaagaccaagtgtctcaccgtggggagcacctgtgttgttggtaaagaagaaggacggtagcatgag 99454  T
Q  208 gttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgactt 282  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  99455 gttgtgcattgattatcgtcagttgaataaagttacaataaagaacaggtatccacttccgaggattgatgactt 99529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 6 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 175601 - 175399
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| || || |||||||||||||||||    
T  175601 cagagagagaggttgaattttcaattgatcttgatcccggaacgaagccggtgtcgatggcaccttaacgtatgtcggcatccgagttagctgaattgaa 175502  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    |||||     || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| |||||||| |||    
T  175501 gaaac-----gaggatttacttgataagaaatttgtaagaccgagtgtttcaccttgaggagcgccggtattgttggttaagaagaaggatggtagcatg 175407  T
Q  206 aggttgtg 213  Q
    ||||||||    
T  175406 aggttgtg 175399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 179; Significance: 1e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 262839 - 262561
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    |||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  262839 cagacagggaggttgagttttccattgaccttgttccgggaacaaagccgatgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcctctgagttagctgaattgaa 262740  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    |||| |||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||    
T  262739 gaaaaagttggaagacttgcttgataagaagtttgtttgacccagtgtttcaccgtggggagcgcctgtgttgttggtaaagaagaaggatggtagcatg 262640  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    |||||||| ||  | || ||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| |||||||| |||||||||    
T  262639 aggttgtgtatatattaccgtcagttgaacaaagttacaataaagaacaggtatccgctttcgaggatttatgacttga 262561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 178; Significance: 5e-96; HSPs: 3)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 6 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 21735 - 21458
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    |||| |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21735 cagatagggaggttgaattttcaattgaccttgttccaggaacaaagccggtgttgatggcaccttatcgtatgtcagcgtctgagttagctgaattgaa 21636  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    |||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||| |||    
T  21635 gaaacagttggaggacttgcttgataagaagtttgttagacctagtgtttcaccgtggggagcgcctgtgttgttggtaaagaagaaggacggtagcatg 21536  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttg 283  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  21535 aggttgtgcattgattatcgtcagttgaacaaagttacgataaagaacaggtatccacttccgaggattgacgacttg 21458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 116 - 273
Target Start/End: Original strand, 27049 - 27206
Alignment:
Q  116 gaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgca 215  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| || || ||||| || || |||||||| || ||||| ||||| || ||||| |||||||| |||||||| || |    
T  27049 gaagatttgcttgataagaagtttgtaaggccgagtgtgtcgccttggggagcgccggtgttattggttaaaaagaaagatggtagcatgaggttatgta 27148  T
Q  216 ttgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggat 273  Q
    | || || || || ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  27149 tagattaccggcagttgaataaagtgacaataaagaataggtatccacttccgaggat 27206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 174 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 76870 - 76791
Alignment:
Q  174 tgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaat 253  Q
    ||||||| || |||| ||| ||||| ||||||||||||||  | || ||||| || |||||||||||||| |||||||||    
T  76870 tgttgttagttaagatgaaggatggcagtatgaggttgtgtgtggattatcgacagttgaacaaagttacgattaagaat 76791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 175; Significance: 3e-94; HSPs: 2)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Original strand, 79522 - 79800
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  79522 cagagagggaggttgagttctccatcgaccttgttccaggaacgaagccggtgtcgatggcacattatcgtatgtcagcatctgaattagctgaattgaa 79621  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||    
T  79622 gaaacagttggaagacttgcttgataagaagtttgtaagacccagtgtttcaccgtggggagcgcctgtgttgttggtaaagaagaaggatggtagaatg 79721  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| || ||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  79722 agattgtgcattgactatcgtcagttgaacaaagttaccataaagaacaggtatccactttcgaggattgatgacttga 79800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 6 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 60352 - 60088
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| || || |||||||||||||||||    
T  60352 cagagagggaggttgaattttcaatcgatcttgtgcccggaacgaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtcggcgtccgagttagctgaattgaa 60253  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    |||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||||| |||||||| |||||||| |||    
T  60252 gaaacagttggaggatttactagataagaaatttgtaagaccgagtgtttcaccttggggagcgccggtattgttggttaagaagaaggatggtagcatg 60153  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgag 270  Q
    ||||| || || || ||  ||||  |||| ||||| || || ||||| |||||||| ||||||||    
T  60152 aggttatgtatagattactgtcagctgaataaagtgacgataaagaacagatatccacttccgag 60088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 171; Significance: 7e-92; HSPs: 2)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 1258 - 980
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1258 cagagagggaggttgagttctccatcgaccttgttccaggaacgaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagcatctgagttagctgaattgaa 1159  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    ||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||| ||     
T  1158 gaaacagttagaagacttgcttgataagaagtttgtaagacccagtgtttcaccgtggggagcgcctgtgttgttggtaaagaagaaggacggtagcata 1059  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1058 aggttgtgcattgattatcgtcagttgaataaagttacgataaagaacaggtatccacttccgaggattgatgacttga 980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420; HSP #2
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 8227 - 7949
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  8227 cagagagggaggttgagttctccatcgaccttgttccaggaacgaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagcatctgagttagttgaattgaa 8128  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    ||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||| ||     
T  8127 gaaacagtttgaagacttgcttgataagaagtttgttagacccagtgtttcactgtggggagcgcctgtgttgttggtaaagaagaaggacggtagcata 8028  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8027 aggttgtgcattgattatcgtcagttgaataaagttacgataaagaacaggtatccacttccgaggattgatgacttga 7949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 171; Significance: 7e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Original strand, 31010 - 31288
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    |||||||||| || || |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  31010 cagagagggaagttgaattttcaattgaccttgttctaggaacaaagccggtgtcgatggcaccataccgtatgtcaacttatgagttagctgaattgaa 31109  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  31110 gaaacagttggaggatttgcttgataacaagtttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtagtatg 31209  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  31210 aggttgtgcattgattaccgtcaatttaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgagaattgatgacttga 31288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072 (Bit Score: 171; Significance: 7e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0072
Description:

Target: scaffold0072; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 53660 - 53382
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    |||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  53660 cagaaagggaggttgaattttcaattgaccttgttccgggaatgaagccggtgtcgatggcaccttatcgcatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 53561  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||| |||    
T  53560 gaaacagttggaagacttgcttgataagaagtttgtaagacctagtgtttcaccgtggggagcgcctgtgttgttggtaaagaagaaggacggtagcatg 53461  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    ||||| |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||    
T  53460 aggttatgcattgactattgtcagttgaataaagttacaataaagaacagatatccactttctaggattgatgacttga 53382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 169; Significance: 1e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 6 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 251235 - 250959
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  251235 cagagagggaggttgaattttcaattgaccttattccaggaacaaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagcttctgagttagctgaattaaa 251136  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    |||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| || || |||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  251135 gaaacagttggaggacttgcttgataagaagtttgtaagaccaagtgtctcaccttggggagcgccggtattgttggtaaagaagaaggatggtagtatg 251036  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgactt 282  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  251035 aggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgagaattgatgactt 250959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 167; Significance: 2e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Original strand, 1236 - 1514
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    |||| ||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  1236 cagaaagggaagttgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagcatctgagttggctgaattgaa 1335  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  1336 gaatcagttggaagacttgcttgataagaagtttgtaagaccgagtgtttcaccgtggggagcgcctgtgttgttggtaaagaagaaggatggaagtatg 1435  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    ||| | |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  1436 aggctatgcattgaatatcgtcagttgaataaagttacaataaagaacagacatccgctcccgaggattgatgacttga 1514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 166; Significance: 7e-89; HSPs: 58)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 6 - 283
Target Start/End: Original strand, 14377749 - 14378026
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14377749 cagagagggaggttgaattttcaattgaccttgttccgggaacgaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagcttccgagttagctgaattgaa 14377848  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    |||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||||    
T  14377849 gaaacagttggaggacttgcttgataagaagtttgtaagaccaagtgtctcaccgtggggagcgcctgtgttgttggtaaagaagaaggacggtagtatg 14377948  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttg 283  Q
    |||||||||||| | |||||| | ||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  14377949 aggttgtgcatttattatcgttagttgaataaagttacaataaagaacaggtatccacttcctaggatttatgacttg 14378026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 23 - 284
Target Start/End: Original strand, 10466699 - 10466960
Alignment:
Q  23 ttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaagagt 122  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  10466699 ttttcaattgaacttgttccaggaacaaagccggtgtcgatggcaccttaccgtatgtcagcttccgagttagctgaattgaagaaacagttggaggact 10466798  T
Q  123 tacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattgacta 222  Q
    | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  10466799 tgcttgataagaagtttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttagttaagaagaaggatggtagcatgaggttgtgcattgatta 10466898  T
Q  223 tcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
     ||||| ||||||||||||||| | ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  10466899 ccgtcagttgaacaaagttacagtaaagaacaggtatccacttccgagaattgatgacttga 10466960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 23 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 18797121 - 18796860
Alignment:
Q  23 ttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaagagt 122  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  18797121 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagcatctgagtttgctgaattgaagaaacaattggaagact 18797022  T
Q  123 tacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattgacta 222  Q
    | |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||    
T  18797021 tgcttgataagaagttcgtaagaccgagtgtttcaccgtggggagcgcctgtgttgttggtaaagaagaaggatagtagtatgaggctatgcattgacta 18796922  T
Q  223 tcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    |||| | ||||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||    
T  18796921 tcgttagttgaataaagttacgataaagaacaggtatccgcttccgaggattgacgacttga 18796860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 24366860 - 24366582
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24366860 cagagagggaggttgaattttcaattgaccttgttcaaggaactaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgagttgaa 24366761  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    |||||||||||| ||  |  | |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  24366760 gaaacagttggaggacctgttagataagaagtttgtaagacctagtgtttcaccttggggagcaccggtgttgttggtcaagaagaaggatggtagtatg 24366661  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    || ||||| || || || ||||| |||||||||||||| || ||||| || ||||||||||| || ||||| |||||||    
T  24366660 agattgtgtatagattaccgtcagttgaacaaagttacgatcaagaacaggtatccgcttcctagaattgacgacttga 24366582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Original strand, 21567824 - 21568102
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  21567824 cagagagggaggtggagttctcgattgaccttgttccaggaacgaagccggtgtcgatggcgccatatcgtatgtcagcatctgagttggctgaattgaa 21567923  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  21567924 gaaacagttggaagacttgcttgataagaagtttgtaagaccgagtgtctcaccgtggggagcgcctgtattgttggtagagaagaaggatggtagcatg 21568023  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    || |||||||| ||||| ||| | ||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  21568024 agattgtgcatagactaccgttagttgaacaaagtgacgataaagaacaggtatccgctgccgaggattgacgacttga 21568102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 9 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 19455468 - 19455196
Alignment:
Q  9 agagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaa 108  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19455468 agagggaggttgaattttcaattgaccttgttccaggaacaaagccggcgtcgatgacaccttaccgtatgtcagcttccgagttagctgaattgaagaa 19455369  T
Q  109 acagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgagg 208  Q
    ||| ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||    
T  19455368 acatttggaggacttgcttgataagaattttgtaagaccaagtgtttcaccttgaggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtactatgagg 19455269  T
Q  209 ttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgactt 282  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||| || | ||| ||  |||| | ||||||||||||||||||    
T  19455268 ttatgcattgactatcgtcagttgaacaaagttacgataacgaacaggaatccac-tccgaggattgatgactt 19455196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 15461784 - 15461506
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    |||| ||||| || ||||| || ||||| |||||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||    
T  15461784 cagaaagggaagttgagttctcgattgatcttgttccgggaacgaaaccagtgtcgatggcgccgtatcgcatgtcagcttctgagttggctgagttaaa 15461685  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||    
T  15461684 gaaacagttggaggacttgcttgataaaaagtttgtgagaccaagtgtttcgccgtggggagcgcccgtgttattggtgaagaagaaagatggaagtatg 15461585  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||    
T  15461584 aggttgtgcattgactatcggcagttgaacaaagttacaatcaagaatagatatccacttccgcggattgatgatttga 15461506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 14 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 19437442 - 19437172
Alignment:
Q  14 gaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagt 113  Q
    ||||| || |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19437442 gaggttgaatttttaattgaccttgttccgggaacgaagccggtgtcgatgacaccttatcgcatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagt 19437343  T
Q  114 tggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtg 213  Q
    ||||||| || |||||||| |||||||| | ||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || || | ||| ||||||| |||    
T  19437342 tggaagacttgcttgataataagtttgtaaaaccaagtgtctcaccgtggggagcgcctgtgttgttggtaaagaaaaaggacgatagcatgaggtcgtg 19437243  T
Q  214 cattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    |||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||| |||||||||    
T  19437242 cattgattatcgtcagttgaataaagttacaataaagaacaggtatccacttccgaggatttatgacttga 19437172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 7 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 19867134 - 19866857
Alignment:
Q  7 agagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaag 106  Q
    |||||| || || |||||||| ||||| |||||||  ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  19867134 agagagagaagttgagttttctattgatcttgttcttggaacgaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagcttccgagttagctgagttgaag 19867035  T
Q  107 aaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatga 206  Q
    |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  19867034 aaacagttagaagatttgcttgagaagaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggttttgttagtgaagaagaaagatggtagtatga 19866935  T
Q  207 ggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    | || || || || |||||||| ||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  19866934 gattatgtatcgattatcgtcagttgaacaaagtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttga 19866857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Original strand, 27563666 - 27563944
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    |||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  27563666 cagagagggaagtcgagttttctattgatcttgttcctggaatgaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtctgcttccgagttagctgagttgaa 27563765  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    |||| |||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||| | ||||||||||| |||||||| | |    
T  27563766 gaaatagttagaagaattgcttgagaagaaatttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccagttttgctagtgaagaagaaagatggtagcagg 27563865  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  27563866 agattgtgtattgactatcgtcagttgaacaaagttactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttga 27563944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 14 - 282
Target Start/End: Original strand, 8761593 - 8761861
Alignment:
Q  14 gaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagt 113  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| || || ||  | ||||| |||||||||||||    
T  8761593 gaggttgaattttcaattgaccttgtcccaggaacgaagccggtgtcgatggcaccatatcgtatgtcggcatccgaacttgctgagttgaagaaacagt 8761692  T
Q  114 tggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtg 213  Q
    |||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||| || || |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  8761693 tggaggacttacttgataagaagtttgtaagaccaagtgtctcgccttggggagcgccggtattgttggtaaagaagaagaatggtagtatgaggttgtg 8761792  T
Q  214 cattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgactt 282  Q
     |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  8761793 tattgactatcgtcagttgaacaaaggtacaataaagaacaagtatccacttccgaggattgatgactt 8761861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Original strand, 2872636 - 2872914
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||| || || |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||| |||| |||||    
T  2872636 cagagagagaagttgagttttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtctcgatggcaccttatcgtatgtctgcttccgagttatctgagttgaa 2872735  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    |||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  2872736 gaaacagttggaggacttgcttgagaagaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcaccggttttgttagtaaagaagaaagatggtagtatg 2872835  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
     |||| || ||||| ||||| || |||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  2872836 cggttatgtattgattatcggcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttga 2872914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 21755380 - 21755103
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||| || || |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| || ||||||||  |||| ||||||||||| |||||    
T  21755380 cagagagagaagtcgagttttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtgtcgatgacaccttatcgtatgtctacttccgagttagctgagttgaa 21755281  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  21755280 gaaacagttagaagatttgcttgagaagaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggttttgttagtaaagaagaaagatggtagtatg 21755181  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    || || || || || |||||||| |||||| |||| || || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21755180 agattatgtatcgattatcgtcagttgaac-aagtaactatcaagaataggtatccacttccgaggattgatgacttga 21755103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Original strand, 34643419 - 34643697
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||||||||| ||||| || ||||| || || || ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| || |||||  | ||||| || ||    
T  34643419 cagagagggaggttgagttctccattgatctagtaccaggaacgaagccggtatcgatggcaccttatcgtatgtcggcatctgaacttgctgagttaaa 34643518  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
     ||||||||||| || ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  34643519 aaaacagttggaggatttactcgacaagaagtttgtaagaccaagtgtctcaccgtggggagcgcctgtgttgttggtaaagaagaaggatggtagtatg 34643618  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  34643619 aggttgtgtattgactaccgtcagttgaataaagttacgataaagaacagatatcctcttccgagaattgacgacttga 34643697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 8 - 284
Target Start/End: Original strand, 24516249 - 24516519
Alignment:
Q  8 gagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaaga 107  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||  ||  | ||||| |||||||    
T  24516249 gagagagaggttgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccggtgtcgatagcaccttatcgtatgtcggctttcgaacttgctgagttgaaga 24516348  T
Q  108 aacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgag 207  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||| ||||| | ||| |||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||     
T  24516349 aacagttggaggacttgcttgataagaagtttgtaagaccaagtgtctaaccttggggagcgccggtgttgttggtaaagaagaaggatggtagtatga- 24516447  T
Q  208 gttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
         |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24516448 -----gcattgactatcgtcagttgaataaagttacaataaagaacaggtatccacttccgaggattgatgacttga 24516519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 16574338 - 16574060
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||| || || |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| | |||||||||| |||| |||||    
T  16574338 cagagagagaagttgagttttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtctcgatggcaccttatcgtatgtctgtttctgagttatctgagttgaa 16574239  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  16574238 gaaacagttggaagacttgcttgagaagaagtttgttagaccgagtgtttcaccttggggagcgccggttttgttagtcaagaagaaagatggtagtatg 16574139  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    ||| | || ||| | ||||| || |||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  16574138 aggctatgtattaattatcgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttga 16574060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Original strand, 16621042 - 16621320
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||| || || |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| | |||||||||| |||| |||||    
T  16621042 cagagagagaagttgagttttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtctcgatggcaccttatcgtatgtctgtttctgagttatctgagttgaa 16621141  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  16621142 gaaacagttggaagacttgcttgagaagaagtttgttagaccgagtgtttcaccttggggagcgccggttttgttagtcaagaagaaagatggtagtatg 16621241  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    ||| | || ||| | ||||| || |||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  16621242 aggctatgtattaattatcgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttga 16621320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 23 - 284
Target Start/End: Original strand, 25607711 - 25607972
Alignment:
Q  23 ttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaagagt 122  Q
    ||||| ||||| |||||||  ||||| ||||| ||||| ||| |||| || |||||||||| ||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |    
T  25607711 ttttcgattgatcttgttcttggaacgaagcctgtgtctatgacaccttatcgtatgtcaggttctgagttggcagagttgaagaaacaattagaagatt 25607810  T
Q  123 tacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattgacta 222  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||    
T  25607811 tacttgaaaagaagtttgttagaccaagtgtttcgccttggagagcacctgttttgttagtgaagaagaaagatggtagcataaggttgtgtattgatta 25607910  T
Q  223 tcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    ||| ||||||||||| || || || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25607911 tcgacaattgaacaaggtgactataaagaataggtatccacttccgaggattgatgacttga 25607972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Original strand, 24293615 - 24293893
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||| || || |||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||| |||| |||||    
T  24293615 cagagagagaagttgagttttctattgatcttgtccctggaacgaagccggtctcgatggcaccttatcgtatgtctgcttctgagttatctgagttgaa 24293714  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||  | ||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  24293715 gaaacagttggaagacttgcttgagaagaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccgattttgttagtaaagaagaaagatggtagtatg 24293814  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    ||| | || ||||| |||||  | |||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  24293815 aggctatgtattgattatcgatagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttga 24293893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 20 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 23080857 - 23080593
Alignment:
Q  20 gagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaag 119  Q
    |||||||| ||||| ||| |||| ||||| ||||  ||||| ||| |||| |||||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||| ||||    
T  23080857 gagttttcgattgatcttattccgggaacgaagcatgtgtctatgacaccttaccgtatgtcagcttctaatttggctgagttgaagaaacagttagaag 23080758  T
Q  120 agttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattga 219  Q
    | || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||| ||| |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  23080757 atttgcttgataaaaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgcatgtattgctggttaagaagaaagatggtagtatgagattgtgcattga 23080658  T
Q  220 ctatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
     ||||| || ||||| ||||| || || |||||||||||| | ||||| || |||||||||||||    
T  23080657 ttatcgacagttgaataaagtaacgataaagaatagatattcacttccaagaattgatgacttga 23080593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 89 - 283
Target Start/End: Original strand, 14379382 - 14379576
Alignment:
Q  89 gagttagctgaattgaagaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaaga 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  14379382 gagttagctgaattgaagaaacagttggaggacttgcttgataagaagtttgtaagaccaagtgtctcaccgtggggagcgcctgtgttgttggtaaaga 14379481  T
Q  189 agaatgatggtagtatgaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttg 283  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||| | |||||| | ||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  14379482 agaaggacggtagtatgaggttgtgcatttattatcgttagttgaataaagttacaataaagaacaggtatccacttcctaggatttatgacttg 14379576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 25115000 - 25114722
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||| || || |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| || ||| ||||||||||    
T  25115000 cagagagagaagtcgagttttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtgtcaatggcaccatatcgtatgtctgcttccgaattatctgaattgaa 25114901  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    ||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||| | || |||||||| ||||||||||||    
T  25114900 gaaacagttggaagacttgcttgagaagaaatttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggttttgctagtaaagaagaaagatggtagtatg 25114801  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    ||| | || ||||| || || || |||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  25114800 aggctatgtattgattaccgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttga 25114722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Original strand, 28261030 - 28261308
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||| || || |||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| || ||| |||| |||||    
T  28261030 cagagagagaagtcgagttttctattgatcttgttcctggaacgaaaccggtctcgatggcaccttatcgtatgtctgcttcagaattatctgagttgaa 28261129  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    | |||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||| | || |||||||| ||||||||||||    
T  28261130 ggaacagttggaggacttgcttgaaaagaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggttttgctagtaaagaagaaagatggtagtatg 28261229  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
     ||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  28261230 cggttgtgtattgattatcggcagttgaacaaagtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttga 28261308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 28284886 - 28284608
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||| || || |||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| || ||| |||| |||||    
T  28284886 cagagagagaagtcgagttttctattgatcttgttcctggaacgaaaccggtctcgatggcaccttatcgtatgtctgcttcagaattatctgagttgaa 28284787  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    | |||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||| | || |||||||| ||||||||||||    
T  28284786 ggaacagttggaggacttgcttgaaaagaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggttttgctagtaaagaagaaagatggtagtatg 28284687  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
     ||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  28284686 cggttgtgtattgattatcggcagttgaacaaagtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttga 28284608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Original strand, 28339779 - 28340057
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||| || || |||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| || ||| |||| |||||    
T  28339779 cagagagagaagtcgagttttctattgatcttgttcctggaacgaaaccggtctcgatggcaccttatcgtatgtctgcttcagaattatctgagttgaa 28339878  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    | |||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||| | || |||||||| ||||||||||||    
T  28339879 ggaacagttggaggacttgcttgaaaagaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggttttgctagtaaagaagaaagatggtagtatg 28339978  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
     ||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  28339979 cggttgtgtattgattatcggcagttgaacaaagtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttga 28340057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Original strand, 18405777 - 18406055
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    |||||||||| ||  | ||||| | ||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||| |||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  18405777 cagagagggaagttaaattttcgactgatcttgttcctggaacgaagcctgtgtctatgacaccttatcgtatgtcagcttcagagttagctgagttgaa 18405876  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    |||| | || ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| || || ||||| ||||||||||| |||||||| |||    
T  18405877 gaaataattagaagatttacttgagaaaaagtttgttagaccaagtgtatcaccttggggagcgccggttttgttagtgaagaagaaggatggtagcatg 18405976  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    |||||||| ||||| ||||| || |||||||| || ||||| |||||||| ||||| | |||||| |||||||| ||||    
T  18405977 aggttgtgtattgattatcgacagttgaacaaggtaacaataaagaataggtatccacctccgagaattgatgatttga 18406055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 6 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 21474048 - 21473814
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||||||||| || ||| ||||||| ||||||||  |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||| || |||||    
T  21474048 cagagagggaggttgaatttgcaattgatcttgttcctagaacgaagccggtgtcgatggcaccttaccgtatgtcggcgtccgagttagcggagttgaa 21473949  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    |||| ||||||| || |||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||| |||||||| |||    
T  21473948 gaaatagttggaggatttactttataagaaatttgtaagaccgagtgtttcaccgtggggagcgccggtattgttggttaagaagaaggatggtagcatg 21473849  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagt 240  Q
    |||||||| || || || ||||| ||||| |||||    
T  21473848 aggttgtgtatagattaccgtcagttgaataaagt 21473814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Original strand, 22828188 - 22828466
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||| || || |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| || ||| |||| |||||    
T  22828188 cagagagagaagtcgagttttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtctgcttccgaattatctgagttgaa 22828287  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    ||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| | ||  | ||| | || |||||||| ||||||||||||    
T  22828288 gaaacagttggaagacttgcttgagaagaaatttgttagaccaagtgtttcaccttggggaacgccgattttgctagtaaagaagaaagatggtagtatg 22828387  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    ||||| || ||||| ||||| || ||||| || || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  22828388 aggttatgtattgattatcgacagttgaataaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttga 22828466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 20 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 27189870 - 27189606
Alignment:
Q  20 gagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaag 119  Q
    |||||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| || ||| |||| ||||||||||||||||| |    
T  27189870 gagttttctattgatcttgtccctggaacgaaaccggtctcgatggcaccttatcgtatgtctgcttcagaattatctgagttgaagaaacagttggagg 27189771  T
Q  120 agttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattga 219  Q
    | || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||| | || |||||||| |||||||||||| ||||||| |||||    
T  27189770 acttgcttgaaaagaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggttttgctagtaaagaagaaagatggtagtatgcggttgtgtattga 27189671  T
Q  220 ctatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
     ||||| || |||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  27189670 ttatcggcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttga 27189606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 20 - 284
Target Start/End: Original strand, 27259370 - 27259634
Alignment:
Q  20 gagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaag 119  Q
    |||||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| || ||| |||| ||||||||||||||||| |    
T  27259370 gagttttctattgatcttgtccctggaacgaaaccggtctcgatggcaccttatcgtatgtctgcttcagaattatctgagttgaagaaacagttggagg 27259469  T
Q  120 agttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattga 219  Q
    | || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||| | || |||||||| |||||||||||| ||||||| |||||    
T  27259470 acttgcttgaaaagaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggttttgctagtaaagaagaaagatggtagtatgcggttgtgtattga 27259569  T
Q  220 ctatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
     ||||| || |||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  27259570 ttatcggcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttga 27259634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 17 - 284
Target Start/End: Original strand, 18183211 - 18183478
Alignment:
Q  17 gtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttgg 116  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||  | ||||| ||||| ||| |||| |||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  18183211 gtggagttttcgattgatcttgttccgggttcgaagcctgtgtctatgacaccttaccatatgtcggcttctgagttagctgagttgaagaaacagttag 18183310  T
Q  117 aagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcat 216  Q
    |||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||| |  || ||||| || |||||||| |||||||| ||||  ||||| ||    
T  18183311 aagatttacttgataagaagtttataagaccaagtgtttcaccgtggggagctctggtattgttagttaagaagaaagatggtagcatgacattgtgtat 18183410  T
Q  217 tgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    ||| |||||  | ||||| || || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  18183411 tgattatcgatagttgaataaggtaacgataaagaataggtatccacttccgagaattgatgacttga 18183478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 22436317 - 22436039
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||| || || ||||||||  |||| |||||||| ||||| ||||  ||||| ||| |||  || |||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  22436317 cagagagagaagttgagttttctgttgatcttgttcctggaacgaagcatgtgtctatgacacgttatcgtatgtcagcttccgagttagctgagttgaa 22436218  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  22436217 gaaacagttagaagatttgcttgagaagaagtttgtcagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggttttgttagtgaagaagaaagatggtagtatg 22436118  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    || || || || || |||||||| || |||||||| || || || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  22436117 agattatgtatcgattatcgtcagttaaacaaagtaactatcaataataggtatccacttccgagaattgatgatttga 22436039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 6 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 25770292 - 25770019
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||||||||| || ||| ||||||| || ||||| ||||| ||||||||||  |||| ||| || |||||||| || | ||||||||| || |||||    
T  25770292 cagagagggaggttgaatttgcaattgatctagttcctggaacgaagccggtgttaatggtaccttatcgtatgtcggcgtttgagttagcggagttgaa 25770193  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    ||| |||||||| ||  ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||| |||||||| |||    
T  25770192 gaagcagttggatgatgtacttgataagaaatttgtaagaccgagtgtttcaccgtggggagcgccggtattgttggttaagaagaaggatggtagcatg 25770093  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatga 279  Q
    |||||||| || || || ||||| ||||| ||||| || || ||||| || ||||| |||||||| ||||||||    
T  25770092 aggttgtgtatagattaccgtcagttgaataaagtgacgataaagaacaggtatccacttccgagaattgatga 25770019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 20 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 28312064 - 28311823
Alignment:
Q  20 gagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaag 119  Q
    |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| || ||| |||| |||||||||||||| ||||    
T  28312064 gagttttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtctcgatggcaccttatcgtatgtctgcttcagaattatctgagttgaagaaacagttagaag 28311965  T
Q  120 agttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattga 219  Q
    | || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||| | || |||||||| |||||||||||| ||||||| |||||    
T  28311964 acttgcttgagaagaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggttttgctagtaaagaagaaagatggtagtatgcggttgtgtattga 28311865  T
Q  220 ctatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatcc 261  Q
     ||||| || |||||||| || || || |||||||| |||||    
T  28311864 ttatcggcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatcc 28311823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 9 - 284
Target Start/End: Original strand, 22760291 - 22760566
Alignment:
Q  9 agagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaa 108  Q
    ||||||| || || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||| |||| || |||||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  22760291 agagggaagttgaattttcgattgatcttgttcctggaacgaagcctgtgtctatgacaccttatcgtatgtcagcttctgagttggccgagttgaagaa 22760390  T
Q  109 acagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgagg 208  Q
    | | || ||||| |||||||| || |||||||||||||  |||||||| || |||||||| || || ||| | ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  22760391 ataattagaagatttacttgagaaaaagtttgttagactaagtgtttcgccttggggagcgcccgttttgctagtgaagaagaaagatggtagcatgagg 22760490  T
Q  209 ttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    ||||| ||||| ||||  || |||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  22760491 ttgtgtattgattatcaacagttgaacaatgtaacaataaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttga 22760566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 71 - 284
Target Start/End: Original strand, 18962986 - 18963199
Alignment:
Q  71 taccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcac 170  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||  |    
T  18962986 taccgtatgtcggcttctgagttggctgagttgaagaaacagttagaagatttgcttgataagaagtttgtaagaccgagtgtttcacgttggggagagc 18963085  T
Q  171 ctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgag 270  Q
    | ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| || ||||| ||||| || ||||| ||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||    
T  18963086 cggtgttgttggttaagaagaaagatggtagcatgaggttatgtattgattatcgacagttgaataaagtgacgataaagaataggtatccacttccaag 18963185  T
Q  271 gattgatgacttga 284  Q
     |||||||| ||||    
T  18963186 aattgatgatttga 18963199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 23 - 284
Target Start/End: Original strand, 23085621 - 23085882
Alignment:
Q  23 ttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaagagt 122  Q
    ||||| ||||| |||||||| || || ||||| ||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||| | |    
T  23085621 ttttcgattgatcttgttccaggtacgaagcctgtgtctatgacaccttaccgtatgtcggcttctgagttggccgagttgaagaaacaattagaatatt 23085720  T
Q  123 tacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattgacta 222  Q
    | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||  ||    
T  23085721 tgcttgataagaagtttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggttttgttagtcaagaagaaagatggaagtatgaggttatgcattggtta 23085820  T
Q  223 tcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    ||| || ||||| ||||| || || |||||||| ||| | ||||| || ||||| |||||||    
T  23085821 tcgacagttgaataaagtaacgataaagaataggtattcccttccaagaattgacgacttga 23085882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 20 - 284
Target Start/End: Original strand, 16961329 - 16961593
Alignment:
Q  20 gagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaag 119  Q
    |||||||| ||||| |||||  | ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||  |||||||| || ||||||||||| || ||||    
T  16961329 gagttttctattgatcttgtgactggaacgaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtctgctttcgagttagccgagttgaagaaacaattagaag 16961428  T
Q  120 agttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattga 219  Q
    |  | || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||| | || |||||||| ||||||||  |||| ||||| |||||    
T  16961429 atctgctcgagaagaaatttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgcctgttttgctagttaagaagaaagatggtagcctgagattgtgtattga 16961528  T
Q  220 ctatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    ||||||| | |||||||| || || || |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||    
T  16961529 ctatcgttagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccaagaattgatgatttga 16961593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 59 - 284
Target Start/End: Original strand, 16647855 - 16648080
Alignment:
Q  59 tcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcac 158  Q
    ||||| || ||||| || ||||| || || ||||| | |||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| ||||| ||||||| ||||||||||    
T  16647855 tcgattgcgccgtatcggatgtctgcatcagagttgggtgaattgaagaatcagttggaagagttgcttgagaagcagtttattagaccgagtgtttcac 16647954  T
Q  159 cgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagata 258  Q
    ||||||| || || ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| || || ||||| || |||||||| || || ||||||||| | ||    
T  16647955 cgtggggtgctccagtgttgttggttaagaagaaagatggaagcatgaggttgtgtatggattatcggcagttgaacaaggtgacgattaagaatcggta 16648054  T
Q  259 tccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    ||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  16648055 tccacttccaaggattgatgatttga 16648080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 59 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 23998643 - 23998418
Alignment:
Q  59 tcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcac 158  Q
    ||||| || ||||| || ||||| || || ||||| | |||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| ||||| ||||||| ||||||||||    
T  23998643 tcgattgcgccgtatcggatgtctgcatcggagttgggtgaattgaagaatcagttggaagagttgcttgagaagcagtttattagaccgagtgtttcac 23998544  T
Q  159 cgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagata 258  Q
    ||||||| || || ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| || || ||||| || |||||||| || || ||||||||| | ||    
T  23998543 cgtggggtgctccagtgttgttggttaagaagaaagatggaagcatgaggttgtgtatggattatcggcagttgaacaaggtgacgattaagaatcggta 23998444  T
Q  259 tccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    ||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  23998443 tccacttccaaggattgatgatttga 23998418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 59 - 284
Target Start/End: Original strand, 16380259 - 16380484
Alignment:
Q  59 tcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcac 158  Q
    ||||| || ||||| || ||||| || || ||||| | |||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| ||||| ||||||| ||||||||||    
T  16380259 tcgattgcgccgtatcggatgtctgcatcggagttgggtgaattgaagaatcagttggaagagttgcttgagaagcagtttattagaccgagtgtttcac 16380358  T
Q  159 cgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagata 258  Q
    ||||||| || || ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||  | || ||||| || |||||||| || || ||||||||| | ||    
T  16380359 cgtggggtgctccagtgttgttggttaagaagaaagatggaagcatgaggttgtgtgtggattatcgacagttgaacaaggtgacgattaagaatcggta 16380458  T
Q  259 tccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    ||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  16380459 tccacttccaaggattgatgatttga 16380484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 97 - 284
Target Start/End: Original strand, 1646738 - 1646925
Alignment:
Q  97 tgaattgaagaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgat 196  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| |||    
T  1646738 tgaattgaagaatcagttggaagagttgcttgagaagcagtttattagaccaagtgtttcaccgtggggtgctccagtgttgttggttaagaagaaggat 1646837  T
Q  197 ggtagtatgaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    || || |||||||||||  | || ||||| || |||||||| || || ||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  1646838 ggaagcatgaggttgtgtgtggattatcggcagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttga 1646925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 160 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 19881591 - 19881468
Alignment:
Q  160 gtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatat 259  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| | ||| |||||||||    
T  19881591 gtggggagcgcctgtgttgttggtaaagaagaaggatggtagtatgaggttatgcattgactaccgtcagttgaataaagttacga-taaaaatagatat 19881493  T
Q  260 ccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    ||||||||||||||||| |||||||    
T  19881492 ccgcttccgaggattgacgacttga 19881468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 8 - 284
Target Start/End: Original strand, 30678843 - 30679118
Alignment:
Q  8 gagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaaga 107  Q
    |||||||| || || ||||| ||||| |||||||| || |||||||  ||||| ||||| |  ||| ||||||| |||||||| |||| ||| ||||| |    
T  30678843 gagagggaagttgaattttcgattgatcttgttccgggtacaaagcatgtgtctatggcgctttactgtatgtcggcttctgaattagatgagttgaaaa 30678942  T
Q  108 aacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgag 207  Q
    | ||||||||||| || ||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||| |||||||| || | |||||| || |||||||| |||||||| || ||    
T  30678943 agcagttggaagatttgcttgataagaagtttataagaccgagtgtctcaccttggggagcgcc-gggttgttagttaagaagaaagatggtagcataag 30679041  T
Q  208 gttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    |||||| || || || || || ||||||||||| ||||| |||||||| ||||  ||||| || |||||||| ||||    
T  30679042 gttgtgtatagattaccggcagttgaacaaagtgacaataaagaataggtatctacttccaagaattgatgatttga 30679118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 101 - 284
Target Start/End: Original strand, 5837147 - 5837330
Alignment:
Q  101 ttgaagaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggta 200  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| || || ||| | || |||||||| ||||||     
T  5837147 ttgaagaaacagttagaagatttgcttgagaagaagtttgttagaccaagtgtttcgccttggggagcgccagttttgctagtaaagaagaaagatggtt 5837246  T
Q  201 gtatgaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
     |||||| || || || || |||||||| ||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  5837247 ttatgagattatgtatcgattatcgtcagttgaacaaagtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttga 5837330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 29 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 20135399 - 20135260
Alignment:
Q  29 attgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaagagttacttg 128  Q
    ||||| |||||||| || || ||||| ||||| ||| |||| ||||||||||| |||  |||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  20135399 attgatcttgttccgggtacgaagcctgtgtctatgacaccttaccgtatgtcggctcatgagttggctgagttgaagaaacagttagaagatttactag 20135300  T
Q  129 ataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagc 168  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  20135299 ataagaagtttgtaagaccaagtgtttcaccgtggggagc 20135260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 29 - 168
Target Start/End: Original strand, 22197470 - 22197609
Alignment:
Q  29 attgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaagagttacttg 128  Q
    ||||| |||||||| || || ||||| ||||| ||| |||| ||||||||||| |||  |||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  22197470 attgatcttgttccgggtacgaagcctgtgtctatgacaccttaccgtatgtcggctcatgagttggctgagttgaagaaacagttagaagatttactag 22197569  T
Q  129 ataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagc 168  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  22197570 ataagaagtttgtaagaccaagtgtttcaccgtggggagc 22197609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 213 - 284
Target Start/End: Original strand, 28280853 - 28280924
Alignment:
Q  213 gcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28280853 gcattgactaccgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 28280924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 20 - 260
Target Start/End: Original strand, 16925487 - 16925726
Alignment:
Q  20 gagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaag 119  Q
    |||||||| |||||| ||||||| ||||| || |||||||| |||||||| || |||||||| | ||| |||||||| || ||||||||||| || ||||    
T  16925487 gagttttctattgac-ttgttcctggaacgaaaccggtgtccatggcaccttatcgtatgtctgtttccgagttagccgagttgaagaaacaattagaag 16925585  T
Q  120 agttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattga 219  Q
    |  |  |||| | ||| ||| ||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||| | || |||||||| ||||| || ||||| ||| | |||||    
T  16925586 atctggttgagatgaaattttttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccagttttgctagttaagaagaaagatggaagcatgagattgcgtattga 16925685  T
Q  220 ctatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatc 260  Q
    ||||||||| |||||||| || || || |||||||| ||||    
T  16925686 ctatcgtcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatc 16925726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 141
Target Start/End: Original strand, 19487129 - 19487260
Alignment:
Q  10 gagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaa 109  Q
    |||||| || || ||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||||||||| || |||||||||||| | ||||||||||  || |||||||||    
T  19487129 gagggaagttgaattttcaattgatcttgttccgggtacgaagcctgtgtcgatggcgccttaccgtatgtcaacgtctgagttagaagagttgaagaaa 19487228  T
Q  110 cagttggaagagttacttgataagaagtttgt 141  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  19487229 cagttggaggatttacttgataagaagtttgt 19487260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 6 - 120
Target Start/End: Original strand, 29590272 - 29590386
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||| || || |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||| |||| |||||    
T  29590272 cagagagagaagttgagttttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtctcgatggcaccttatcgtatgtctgcttctgagttatctgagttgaa 29590371  T
Q  106 gaaacagttggaaga 120  Q
    |||||||||||||||    
T  29590372 gaaacagttggaaga 29590386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 86 - 168
Target Start/End: Original strand, 13751853 - 13751935
Alignment:
Q  86 tctgagttagctgaattgaagaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagc 168  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  13751853 tctgagttagcagagttgaagaaacagttggaagatttacttgataagaagtttgtaagaccgagtgtttcaccttggggagc 13751935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 59 - 284
Target Start/End: Original strand, 23025632 - 23025857
Alignment:
Q  59 tcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcac 158  Q
    ||||| || ||||| || ||||| || || ||||| | |||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||  ||||| | || || |||||||| |    
T  23025632 tcgattgcgccgtatcggatgtctgcatcagagttgggtgaattgaagaagcagttagaagagttgcttgagaaatagtttatcaggccgagtgtttctc 23025731  T
Q  159 cgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagata 258  Q
    ||||||  || || ||| ||||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||  | || ||||| || |||||||| || || ||||||||| | ||    
T  23025732 cgtgggatgctccagtgatgttggttaagaagaaagatggaagcatgaggttttgtgtggattatcggcagttgaacaaggtgacgattaagaatcggta 23025831  T
Q  259 tccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||    
T  23025832 tccgcttccgaggattgatgatttga 23025857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 131 - 261
Target Start/End: Original strand, 23496150 - 23496280
Alignment:
Q  131 aagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattgactatcgtcaat 230  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||| || || ||| | || |||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |    
T  23496150 aagaaatttgttagaccaagtgtttcaccttagggagcgccagttttgatagtaaagaagaaagatggtagcatgagattgtgtattgactatcgtcagt 23496249  T
Q  231 tgaacaaagttacaattaagaatagatatcc 261  Q
    ||||||| || || || |||||||| |||||    
T  23496250 tgaacaaggtaactatcaagaataggtatcc 23496280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 97 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 14130826 - 14130639
Alignment:
Q  97 tgaattgaagaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgat 196  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| ||  || || ||||||| |||||||| |||||||| || |  ||||||| ||| ||||||||||||    
T  14130826 tgaattaaagaaccagttagaagagttgcttgagaaacagattattagaccgagtgtttctccgtggggtgctcaagtgttgtcggttaagaagaatgat 14130727  T
Q  197 ggtagtatgaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
     | || ||||||||||   | || ||||| || ||||||||||| || ||||| ||| | ||||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  14130726 tgaagcatgaggttgtttgtggattatcggcagttgaacaaagtgacgattaaaaatcggtatccacttccaaggattgatgatttga 14130639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 194 - 284
Target Start/End: Original strand, 20633961 - 20634051
Alignment:
Q  194 gatggtagtatgaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  20633961 gatggtagcatgagattgtgtattgactatcgacagttgaacaaggtgacaataaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttga 20634051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 103 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 16100366 - 16100185
Alignment:
Q  103 gaagaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagt 202  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||  |  ||||| | || || |||||||| |||||||| || || ||||||||||| |||||||| ||||  |      
T  16100366 gaagaagcagttagaagagttacttgagtaacagtttatcaggccgagtgtttctccgtggggtgctccagtgttgttggttaagaagaaagatgaaacc 16100267  T
Q  203 atgaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    ||||||||| |  | || ||||| || |||||||| || || ||||||||| | ||||| || || ||||||||||| ||||    
T  16100266 atgaggttgcgtgtggattatcggcagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccactaccaaggattgatgatttga 16100185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 62 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 18450839 - 18450761
Alignment:
Q  62 atggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaagagttacttgataagaagtttg 140  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| || || || || || || ||||||||||||||||    
T  18450839 atggcaccttaccgtatgtcagcttccgaattagctgagttgaaaaagcacttagaggatttgcttgataagaagtttg 18450761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 165; Significance: 3e-88; HSPs: 41)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 20 - 284
Target Start/End: Original strand, 20854534 - 20854798
Alignment:
Q  20 gagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaag 119  Q
    ||||| || ||||| |||||||| ||||| || || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |    
T  20854534 gagttctcgattgatcttgttccgggaacgaaaccagtgtcgatggcaccgtatcgcatgtcagcttctgaattagccgagttgaagaaacagttggagg 20854633  T
Q  120 agttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattga 219  Q
    | || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  20854634 acttgcttgataagaagtttgtgagacccagtgtttcgccgtggggagcacccgtgttattggtgaagaagaaagatggaagtatgaggttgtgcattga 20854733  T
Q  220 ctatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  20854734 ctatcgtcagttgaacaaagttacaataaagaatagatatccacttccgcggattgatgacttga 20854798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Original strand, 20833660 - 20833938
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | || |||||||| || |||||  | ||||| |||||    
T  20833660 cagagagggaggttgagttttcaattgaccttgttccgggaacgaagccggtgtcgatggcatcttatcgtatgtcggcgtctgaacttgctgagttgaa 20833759  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    |||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  20833760 gaaacagttggaggacttgcttgataagaagtttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttagtaaagaagaaggatggtagtatg 20833859  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20833860 aggttgtgcattgactatcgtcagtttaataaagttacaataaagaacagatatccacttccgaggattgatgacttga 20833938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Original strand, 31537757 - 31538035
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31537757 cagagagggaggttgaattttcaattgatcttgttccaggaactaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgagttgaa 31537856  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    ||| |||||||| ||  |  | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  31537857 gaagcagttggaggacctgttagataagaagtttgtaagacccagtgtttcaccttggggagcaccggtgttgttggtaaagaagaaggatggtagtatg 31537956  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    ||  |||| || || || ||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||    
T  31537957 agactgtgtatagattaccgtcagttgaacaaagttacgatcaagaacagatatccgcttcctagaattgacgacttga 31538035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 48425503 - 48425225
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  48425503 cagagagggaggttgaattttcaattgatcttgttccaggaactaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgagttgaa 48425404  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    |||||||||||| ||  |  | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  48425403 gaaacagttggaggacctgttagataagaagtttgtaagacccagtgtttcaccttggggagcaccggtgttgttggtaaagaagaaggatggtagtatg 48425304  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    ||  |||| || || || ||||| |||||||||||||| || ||||| || ||||||||||| || ||||| |||||||    
T  48425303 agactgtgtatagattaccgtcagttgaacaaagttacgatcaagaacaggtatccgcttcctagaattgacgacttga 48425225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 52988371 - 52988093
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  52988371 cagagagggaggttgaattttcaattgatcttgttccaggaactaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgagttgaa 52988272  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    |||||||||||| ||  |  | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  52988271 gaaacagttggaggacctgttagataagaagtttgtaagacccagtgtttcaccttggggagcaccggtgttgttggtaaagaagaaggatggtagtatg 52988172  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    ||  |||| || || || ||||| |||||||||||||| || ||||| || ||||||||||| || ||||| |||||||    
T  52988171 agactgtgtatagattaccgtcagttgaacaaagttacgatcaagaacaggtatccgcttcctagaattgacgacttga 52988093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 37679679 - 37679401
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37679679 cagagagggaggttgaattttcaattgatcttgttccaggaactaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgagttgaa 37679580  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    |||||||||||| ||  |  | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||    
T  37679579 gaaacagttggaggacctgttagataagaagtttgtaagacccagtgtttcaccttggggagcaccggtgttgttggtcaaaaagaaggatggtagtatg 37679480  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    ||  |||| || || || ||||| |||||||||||||| || ||||| || ||||||||||| || ||||| |||||||    
T  37679479 agactgtgtatagattaccgtcagttgaacaaagttacgatcaagaacaggtatccgcttcctagaattgacgacttga 37679401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Original strand, 38910586 - 38910864
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  38910586 cagagagggaggttgaattttcaattgatcttgttccaggaactaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagttgagttgaa 38910685  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    ||| |||||||| ||  |  | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  38910686 gaagcagttggaggatctgttagataagaagtttgtaagacccagtgtttcaccttggggagcaccggtgttgttggtaaagaagaaggatggtagtatg 38910785  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    ||  |||| || || || ||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||    
T  38910786 agactgtgtatagattaccgtcagttgaacaaagttacgatcaagaacagatatccgcttcctagaattgacgacttga 38910864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 11 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 21953503 - 21953230
Alignment:
Q  11 agggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaac 110  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21953503 agggaggttgaattttcaattgaccttgttccaggaacaaagccggtgtcgatggcaccataccgtatgtcagcttcggagttagctgaattgaagaaac 21953404  T
Q  111 agttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggtt 210  Q
    ||||||| ||  |  | |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  |    
T  21953403 agttggaggacctgttagataagaaatttgtaagacccaatgtttcaccttggggagcaccggtgttgttggttaagaagaaggatggtagtatgagact 21953304  T
Q  211 gtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    ||||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||| || |||||||||||  | ||||| |||||||    
T  21953303 gtgcattgattaccgtcagttgaacaaagttacgataaagaacaggtatccgcttcctggaattgacgacttga 21953230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 9 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 20297008 - 20296741
Alignment:
Q  9 agagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaa 108  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20297008 agagggaggttgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccggtgtcgatggcaccataccgcatgtcagcttctgagttagctgagttgaagaa 20296909  T
Q  109 acagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgagg 208  Q
    ||||||||||||  |  | |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||     
T  20296908 acagttggaagacctgttggataagaaatttgtaagacccagtgtttcaccttggggagcaccggtgttgttggttaagaagaaggatggtagtatgaga 20296809  T
Q  209 ttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattga 276  Q
     ||||||| || || ||||| |||||||| ||||| || ||||| || |||||||||||||| |||||    
T  20296808 ctgtgcatagattaccgtcagttgaacaaggttacgataaagaacaggtatccgcttccgagaattga 20296741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 6 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 19856904 - 19856628
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| || |||||||| || |||||  | |||||||||||    
T  19856904 cagagagagaggttgaattttcaattgaccttgttccaagaacgaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtcggcgtctgaacttgctgaattgaa 19856805  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||| ||||    
T  19856804 gaaacagttggaagacttacttgataaaaagtttgtaagaccaagtgtgtcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtactatg 19856705  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgactt 282  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||    
T  19856704 aggttatgcattgactatcatcagttgaataaagttacaataaagaacaggtatccacttccgagaattgacgactt 19856628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 6 - 282
Target Start/End: Original strand, 24097375 - 24097639
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24097375 cagagagggaggttgaattttcaattgaccttgttccaggaacaaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagcttctaagttagctgaattgaa 24097474  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    |||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||            |||||||| || |||||||| |||||||| |||    
T  24097475 gaaacagttggaggacttgcttgataagaagtttgtaagaccaagtgtttcaccg------------gtgttgttagttaagaagaaggatggtagcatg 24097562  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgactt 282  Q
    || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||    
T  24097563 agattgtgcattgattaccgtcaattgaacaaagttacgataaagaacaggtatccacttccgagaattgatgactt 24097639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 24 - 284
Target Start/End: Original strand, 20937841 - 20938101
Alignment:
Q  24 tttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaagagtt 123  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| || || |||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || ||    
T  20937841 tttcaattgaccttgttccaggaatgaagccggtgtcgatggcaccttatcgcatgttagcttccgagttagctgtattgaagaaacagttggaggattt 20937940  T
Q  124 acttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattgactat 223  Q
     ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| || || |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20937941 gcttgataagaagtttgtaagaccaagtgtctcaccttggggagcgccggtattgttggtaaagaataaggatggtagtatgaggttatgcattgactat 20938040  T
Q  224 cgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  20938041 cgtcagttgaataaagttacaataaagaacaggtatccacttcctaggattgacgacttga 20938101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Original strand, 33388789 - 33389067
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||| || || |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||| |||| |||||    
T  33388789 cagagagagaagttgagttttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtctcgatggcaccttatcgtatgtctgcttctgagttatctgagttgaa 33388888  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    ||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  33388889 gaaacagttggaagacttgcttgagaaaaagtttgttagaccgagtgtttcaccttggggagcgccggttttgttagtaaagaagaaagatggtagtatg 33388988  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
     ||||||| ||||| ||||| || |||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  33388989 cggttgtgtattgattatcggcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttga 33389067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 7 - 284
Target Start/End: Original strand, 21233492 - 21233769
Alignment:
Q  7 agagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaag 106  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| | || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  21233492 agagagggaagtcgagttttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtgtcgatggcatcttatcgtatgtctgcttccgagttagctgaattgaag 21233591  T
Q  107 aaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatga 206  Q
    |||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| | || || ||| | |||||||||||  ||||||| ||||    
T  21233592 aaacagttagaagaattgcttgagaagaaatttgttagaccaagtgtttcaccttggggaacgccagttttgctagtgaagaagaaatatggtagcatga 21233691  T
Q  207 ggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    | ||||| |||||||||||||| |||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  21233692 gtttgtgtattgactatcgtcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttga 21233769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 5 - 284
Target Start/End: Original strand, 22503048 - 22503327
Alignment:
Q  5 tcagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattga 104  Q
    |||||||| || || |||||||| ||||| |||||||  ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  22503048 tcagagagagaagttgagttttctattgatcttgttcttggaacgaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtcaggttctgagttagctgagttga 22503147  T
Q  105 agaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtat 204  Q
    |||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || ||| | |||||||||||  ||||||| ||    
T  22503148 agaaacagttagaagatttgcttgagaagaagtttgtaagacccagtgtttcaccctggggagcgccggttttgctagtgaagaagaaaaatggtagcat 22503247  T
Q  205 gaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    ||| ||||| ||||| |||||| | ||||| | ||| || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  22503248 gagattgtgtattgattatcgtaagttgaatagagtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttga 22503327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Original strand, 51331252 - 51331531
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||| || || |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||| |||| |||||    
T  51331252 cagagagagaagttgagttttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtctcgatggcaccttatcgtatgtctgcttctgagttatctgagttgaa 51331351  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttc-accgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtat 204  Q
    ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| || || ||| | || |||||||| |||||||||||    
T  51331352 gaaacagttggaagacttgcttgagaagaagtttgttagaccaagtgtttcaaccttggggagcgccggttttgctagtaaagaagaaagatggtagtat 51331451  T
Q  205 gaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    | ||||||| ||||| ||||| || |||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  51331452 gcggttgtgtattgattatcggcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttga 51331531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 19108967 - 19108689
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    |||| ||||| || |||||||| ||| | |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||| |||| |||||    
T  19108967 cagaaagggaagtcgagttttctattaatcttgttcctggaacgaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtctgcttctgaattatctgagttgaa 19108868  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    ||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||| | || |||||||| ||||||||||||    
T  19108867 gaaacagttggaagatttgcttgagaagaaatttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggttttgctagtaaagaagaaagatggtagtatg 19108768  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    ||||| || ||||| ||||| || |||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  19108767 aggttatgtattgattatcgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttga 19108689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 21832901 - 21832623
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||| || || |||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||| |||| |||||    
T  21832901 cagagagagaagttgagttttctattgatcttgtccctggaacgaagccggtctcgatggcaccttatcgtatgtctgcttctgagttatctgagttgaa 21832802  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  21832801 gaaacagttggaagacttgcttgagaagaagtttgttagaccgagtgtttcaccttggggagcgccggttttgttagtaaagaagaaagatggtagtatg 21832702  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    ||| | || ||||| ||||| || |||||||| || || || |||| ||| ||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  21832701 aggctatgtattgattatcgacagttgaacaaggtaactatcaagattaggtatccacttccgagaattgatgatttga 21832623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 21839549 - 21839271
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||| || || |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||| |||| |||||    
T  21839549 cagagagagaagttgagttttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtctcgatggcaccttatcgtatgtctgcttccgagttatctgagttgaa 21839450  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    |||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  21839449 gaaacagttggaggacttgcttgagaagaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggttttgttagtaaagaagaaagatggtagtatg 21839350  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
     |||| || ||||| ||||| || |||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  21839349 cggttatgtattgattatcggcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttga 21839271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 7 - 284
Target Start/End: Original strand, 22360005 - 22360282
Alignment:
Q  7 agagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaag 106  Q
    ||||||||| || || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| || || ||| |||| || |||||||||||||||||||| || || ||||||    
T  22360005 agagagggaagttgaattttcgattgatcttgttcctggaacgaagcctgtttctatgacaccttatcgtatgtcagcttctgagttggccgagttgaag 22360104  T
Q  107 aaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatga 206  Q
    ||||| || ||||| |||||||| || |||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| || || ||| | |||||||||||  ||||||| ||||    
T  22360105 aaacaattagaagatttacttgagaaaaagtttgttaaaccaagtgtttcaccttggggagcgccggttttgctagtgaagaagaaaaatggtagcatga 22360204  T
Q  207 ggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    | ||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  22360205 gattgtgtattgactatcgtcagttgaacaaggtgacaataaagaatagatatccacttccgaggattgatgatttga 22360282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 6 - 270
Target Start/End: Original strand, 21739796 - 21740060
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||||||||| || ||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||  |||||| |||||||||    
T  21739796 cagagagggaggttgaattttctatcgatcttgttcccggaacgaagccggtgtcgatggcaccttaccgtatgtcagtgtccaagttagttgaattgaa 21739895  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    |||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||| |||||||| |||    
T  21739896 gaaacagttggaggacttgcttgataagaaatttgtaagaccgagtgtttcaccgtggggagcgccgatgttgttggttaagaagaaggatggtagcatg 21739995  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgag 270  Q
    | |||||| || || || |||||  |||| ||||| || || |||||||| ||||| ||||||||    
T  21739996 atgttgtgtatagattaccgtcagctgaataaagtgacgataaagaataggtatccacttccgag 21740060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Original strand, 16348355 - 16348633
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||| || || |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||| |||| |||||    
T  16348355 cagagagagaagttgagttttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtctcgatggcaccttatcgtatgtctgcttccgagttatctgagttgaa 16348454  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    |||||||||||| || || || || ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||| | || |||||||| ||||||||||||    
T  16348455 gaaacagttggaggacttgctcgaaaagaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggttttgctagtaaagaagaaagatggtagtatg 16348554  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
     ||||||| ||||| ||||| || |||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  16348555 cggttgtgtattgattatcgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttga 16348633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Original strand, 17042775 - 17043053
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    |||| ||||| || || ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||  ||||| ||||||||||| |||||    
T  17042775 cagaaagggaagtcgaattttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtttgcttccgagttagctgagttgaa 17042874  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    ||||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||| | || |||||||| |||||||| |||    
T  17042875 gaaacagttagaggatttgcttgaaaagaaatttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccagttttgctagtaaagaagaaagatggtagcatg 17042974  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||    
T  17042975 agattgtgtattgactatcgtcagttgaacaaagtaactatcaagaataggtatccactaccgagaattgatgatttga 17043053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 6 - 234
Target Start/End: Original strand, 22016505 - 22016733
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    |||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| || || ||||||||| || ||||    
T  22016505 cagagagggacgttgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccggtgtcgatagcaccttatcgtatgtcggcgtccgagttagcttaactgaa 22016604  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    |||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||  |||||||||| |||||||| |||||||| |||    
T  22016605 gaaacagttggaggacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccgatgttgttggtaaagaagaaggatggtagcatg 22016704  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaa 234  Q
    ||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  22016705 aggttatgcattgattatcgtcagttgaa 22016733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 6 - 276
Target Start/End: Original strand, 21743312 - 21743582
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    |||||||  |||| || |||||||| || ||| | |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||    
T  21743312 cagagagaaaggttgaattttcaatcgatcttatgcccggaacgaagccggtgtcgatggcaccttaccgtatgtcggcgtccgagttagctgaattgaa 21743411  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    |||| ||||||| || || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||| |||||||| |||    
T  21743412 gaaatagttggaggacttgcttgataataaatttgtaagaccgagtgtttcaccgtggggagcgccggtattgttggttaagaagaaggatggtagcatg 21743511  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattga 276  Q
    |||||||| || || || |||||  |||| ||||| || || |||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  21743512 aggttgtgtatagattaccgtcagctgaataaagtgacgataaagaataggtatccacttccgagaattga 21743582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Original strand, 50618158 - 50618436
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||| || || || ||||||||||||||| |||| || || ||||| ||||| ||| |||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  50618158 cagagagagaagttgaattttcaattgaccttattccgggtacgaagcctgtgtctatgacaccttaccgtatgtcagtttctgagttggctgagttgaa 50618257  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    ||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |  || ||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  50618258 gaaacagttagaagatttgcttgataagaagtttgtaagaccaagtgtttcaccgtggggagcgcacgttttgttagtaaagaagaaagatggtagtatg 50618357  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    || ||||| ||||||| |||  | ||||||||| |    || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  50618358 agattgtgtattgactgtcggtagttgaacaaaatgttgataaagaataggtatccacttccgagaattgatgacttga 50618436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 23 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 21751519 - 21751261
Alignment:
Q  23 ttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaagagt 122  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||  ||||| ||| |||| || |||||||||||||||||||| |   | ||||||||||||||| |||| |    
T  21751519 ttttctattgatcttgttcctggaacgaagcttgtgtctatgacaccttatcgtatgtcagcttctgagttgg---agttgaagaaacagttgaaagatt 21751423  T
Q  123 tacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattgacta 222  Q
    | ||||| || |||||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||| | ||    
T  21751422 tgcttgagaaaaagtttgttagaccaagtgtttcactttggggagcgcctgtgttgttagtaaagaagaaggatggtagcatgaggttgtgtatttatta 21751323  T
Q  223 tcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    ||| || ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  21751322 tcgacagttgaacaaagtaacaataaagaataggtatccacttccgaggattgatgatttga 21751261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Original strand, 429876 - 430154
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||| || || |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||| |||| || |||||||||||||||||||| || || |||||    
T  429876 cagagagagaagttgagttttcgattgatcttgttcctggaacgaagcctgtgtctatgacaccttatcgtatgtcagcttctgagttggccgagttgaa 429975  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    |||||| || |||||  | ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| || || ||| | || |||||||| |||||||| |||    
T  429976 gaaacaattagaagatctccttgagaagaagtttgttagaccaagtgtttcgccttggggagcgccggttttgctagtaaagaagaaagatggtagcatg 430075  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    || ||||| ||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  430076 agattgtgtattgactatcgacagttgaacaaggtgacaataaagaataggtatcaacttccaaggattgatgacttga 430154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 6 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 41311156 - 41310886
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    |||||||||||||  | |||||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| || || ||||||||| |||||||    
T  41311156 cagagagggaggttaaattttcaatcgatcttgtgcctggaacgaagccggtgtccatggcaccttatcgtatgtcggcgtccgagttagcttaattgaa 41311057  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||||| ||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| |||    
T  41311056 gaaacagttggaggatttacttgataagaaatttgtaagaccgagtgattcaccgtgggaagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtagcatg 41310957  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattga 276  Q
    || ||||| || || || | ||| ||||| ||||| || || |||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  41310956 agtttgtgtatagattaccatcagttgaataaagtgacgataaagaataggtatccacttccgagaattga 41310886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 95 - 282
Target Start/End: Original strand, 19660985 - 19661172
Alignment:
Q  95 gctgaattgaagaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatg 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| ||||  ||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||| |    
T  19660985 gctgaattgaagaaacagttggaagacttgcttgataaaaagtttgtaagaccaagtgcgtcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaagg 19661084  T
Q  195 atggtagtatgaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgactt 282  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||    
T  19661085 atggtactatgaggttatgcattgactatcgtcagttgaataaagttacgataaagaacaggtatccacttccgagaattgacgactt 19661172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 29 - 284
Target Start/End: Original strand, 21862156 - 21862411
Alignment:
Q  29 attgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaagagttacttg 128  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||| | ||||| ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || || || |||     
T  21862156 attgatcttgttcctggaacgaagtcagtgtctatgacaccttatcgtatgtcagcttctgagttagctgagttgaagaaacaattagaggatttgcttt 21862255  T
Q  129 ataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattgactatcgtca 228  Q
    | || |||||||||||| | ||||||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||    
T  21862256 agaaaaagtttgttagaacaagtgtttcaccttggggagcgccggttttgttagtaaagaagaaagatggtagcatgagattgtgcattgattatcgaca 21862355  T
Q  229 attgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
     ||||||||||| || |  |||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||    
T  21862356 gttgaacaaagtaacgagaaagaataggtatccacttccaagaatagatgacttga 21862411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 20140682 - 20140404
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||| || || || ||||| || || |||||||| ||||| |||||  |||| ||| |||| || |||||||||||||||||||| || || |||||    
T  20140682 cagagagagaagttgaattttcgatcgatcttgttcctggaacgaagcctatgtccatgacaccttatcgtatgtcagcttctgagttggccgagttgaa 20140583  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    |||||| || || || || ||||| || |||||||||||||| ||||| || || |||||||| || || |||||||| |||||||| || |||||||||    
T  20140582 gaaacaattagaggatttgcttgagaaaaagtttgttagaccaagtgtctcgccttggggagcgcccgttttgttggtaaagaagaaagacggtagtatg 20140483  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    | ||| |||||||  |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||    
T  20140482 aagttatgcattgcttatcgtcagttgaacaaagtgacaataaagaataggtatccacttccgagaatcgatgatttga 20140404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 6 - 270
Target Start/End: Original strand, 41351428 - 41351693
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||| || || |||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| || ||| |||| |||||    
T  41351428 cagagagagaagtcgagttttctattgatcttgttcctggaacgaaaccggtctcgatggcaccttatcgtatgtctgcttcagaattatctgagttgaa 41351527  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    |||||||||||| || || || || | ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||| | || |||||||| ||||||||||||    
T  41351528 gaaacagttggaggacttgctcgaaaggaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggttttgctagtaaagaagaaagatggtagtatg 41351627  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaag-aatagatatccgcttccgag 270  Q
     ||||||| ||||| ||||| || |||||||| || || || ||| ||||| ||||| ||||||||    
T  41351628 cggttgtgtattgattatcggcagttgaacaaggtaactatcaagaaataggtatccacttccgag 41351693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 59 - 284
Target Start/End: Original strand, 20829205 - 20829430
Alignment:
Q  59 tcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcac 158  Q
    ||||| || ||||| || ||||| || || ||||| | |||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| ||||| ||||||| ||||||||||    
T  20829205 tcgattgcgccgtatcggatgtctgcatcggagttgggtgaattgaagaatcagttggaagagttgcttgagaagcagtttattagaccgagtgtttcac 20829304  T
Q  159 cgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagata 258  Q
    ||||||| || || ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||  | || ||||| || |||||||| || || ||||||||| | ||    
T  20829305 cgtggggtgctccagtgttgttggttaagaagaaagatggaagcatgaggttgtgtgtggattatcgacagttgaacaaggtgacgattaagaatcggta 20829404  T
Q  259 tccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    ||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  20829405 tccacttccaaggattgatgatttga 20829430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 29 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 16378671 - 16378416
Alignment:
Q  29 attgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaagagttacttg 128  Q
    ||||| ||||||||  |||| ||||| ||||| ||| |||| || |||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| || || || ||||    
T  16378671 attgatcttgttccgagaacgaagcctgtgtctatgacaccttatcgtatgtcagcttctgagttggctaagttgaagaaacagttagaggatttgcttg 16378572  T
Q  129 ataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattgactatcgtca 228  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||  | ||||| || || ||||| |||||||||||||  ||||| ||||| || || ||    
T  16378571 ataagaagtttgtgagaccaagtgtttctccttggggagcgccgatattgttagttaaaaagaaagatggtagtatgaaattgtgtattgattaccgaca 16378472  T
Q  229 attgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
     ||||| ||||| || || |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||    
T  16378471 gttgaataaagtaacgataaagaataggtatccacttccaagaattgatgatttga 16378416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 97 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 20927562 - 20927375
Alignment:
Q  97 tgaattgaagaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgat 196  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||  ||||| ||||||  ||||| || |||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||    
T  20927562 tgaattgaagaaacagttagaagagttgcttgagaaacagtttattagacgaagtgtatctccgtggggtgctccagtgttgttggttaagaagaatgat 20927463  T
Q  197 ggtagtatgaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    || || |||||||||||  | || ||||| || ||||||||||| || ||||||||| ||||||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  20927462 ggaagcatgaggttgtgtgtggattatcggcagttgaacaaagtgacgattaagaatcgatatccacttcaaaggattgatgatttga 20927375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 59 - 284
Target Start/End: Original strand, 41215669 - 41215894
Alignment:
Q  59 tcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcac 158  Q
    ||||| || ||||| || ||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||| | ||| ||||| | || || |||||||| |    
T  41215669 tcgattgcgccgtatcggatgtctgcatcagagttggctgagttgaagaaacagttagaagagttacttaagaagtagtttatcaggccgagtgtttctc 41215768  T
Q  159 cgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagata 258  Q
    ||||||| || |  ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||  | || ||||| || |||||||| || || ||||||||| | ||    
T  41215769 cgtggggtgctctagtgttgttggttaagaagaaagatggaagcatgaggttgtgtgtggattatcggcagttgaacaaggtgacgattaagaatcggta 41215868  T
Q  259 tccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  41215869 tccgcttccaaggattgatgatttga 41215894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 97 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 20527561 - 20527374
Alignment:
Q  97 tgaattgaagaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgat 196  Q
    ||||||| |||| ||||| |||||||| ||||| ||| ||||| | || || |||||||| |||||||| || || |||||||| || |||||||| |||    
T  20527561 tgaattgcagaagcagttagaagagttgcttgagaagcagtttatcaggccgagtgtttctccgtggggtgctccagtgttgttagttaagaagaaagat 20527462  T
Q  197 ggtagtatgaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    || || |||||||||||  | || ||||| || ||||||||||| || ||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  20527461 ggaagcatgaggttgtgtgtggattatcggcagttgaacaaagtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttga 20527374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 101 - 284
Target Start/End: Original strand, 21200809 - 21200992
Alignment:
Q  101 ttgaagaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| || || ||| | ||| | || || |||||||| || | ||| || ||  ||||||| || |||||||| |||||||    
T  21200809 ttgaagaaacagttggaagagttgctcgagaagcattttatcaggccgagtgtttcgccattgggtgctccactgttgttagttaagaagaaggatggta 21200908  T
Q  201 gtatgaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    ||||||||||||| || || ||||| || ||||| || || |  ||||||||| ||||||| || |||||||||||||| ||||    
T  21200909 gtatgaggttgtgtatggattatcggcagttgaataaggtaatgattaagaatcgatatccactcccgaggattgatgatttga 21200992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 151 - 284
Target Start/End: Original strand, 35930730 - 35930863
Alignment:
Q  151 tgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaag 250  Q
    |||||| |||||||| || || ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||  | || ||||| || |||||||| || || ||||||    
T  35930730 tgtttcgccgtggggtgctccagtgttgttggttaagaagaaagatggaagcatgaggttgtgtgtggattatcggcagttgaacaaggtgacgattaag 35930829  T
Q  251 aatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    ||| | ||||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  35930830 aatcggtatccacttccaaggattgatgatttga 35930863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 173 - 279
Target Start/End: Original strand, 22133681 - 22133787
Alignment:
Q  173 gtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgagga 272  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||  | || ||||| || |||||||| || || ||||||||| | ||||||||||| |||     
T  22133681 gtgttgttggttaagaagaaagatggaagcatgaggttgtgtgtggattatcggcagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccgcttccaaggg 22133780  T
Q  273 ttgatga 279  Q
    |||||||    
T  22133781 ttgatga 22133787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222 (Bit Score: 163; Significance: 4e-87; HSPs: 2)
Name: scaffold0222
Description:

Target: scaffold0222; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 9676 - 9398
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    |||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9676 cagaaagggaggttgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccggtgtttatggcaccttatcgtatgtcagcttccgagttagctgaattgaa 9577  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| || || |||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  9576 gaaacagttggaagacttgcttgataagaagtttgtaagaccaagtgtctcaccttggggagcgccggtattgttggtaaagaagaaggatggtagtatg 9477  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9476 aggttatgcattgattatcgtcagttgaataaagttacaataaagaacaggtatccacttccgaggattgatgacttga 9398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 7 - 284
Target Start/End: Original strand, 1181 - 1458
Alignment:
Q  7 agagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaag 106  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1181 agagagagaggttgagttctcaattgaccttgttccgggaacgaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagcgtctgagttagctgaattgaag 1280  T
Q  107 aaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatga 206  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||| |||||||||| |||||||| || ||||| ||||    
T  1281 aaacagttggaggacttgcttgataagaagtttgtaagaccaagtgtctcgccgtggggagcgcctatgttgttggtaaagaagaaggacggtagcatga 1380  T
Q  207 ggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
       ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1381 ccctgtgcattgactatcgtcagttgaacaaagttacgataaagaacagatatccacttccgaggattgatgacttga 1458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239 (Bit Score: 162; Significance: 2e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0239
Description:

Target: scaffold0239; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 7 - 284
Target Start/End: Original strand, 10478 - 10755
Alignment:
Q  7 agagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaag 106  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |||||    
T  10478 agagagggaggtggagttttcgattgaccttgttccgggaacaaagccggtgtcgatggcaccataccgtatgtcagcatctgagttggctgaactgaag 10577  T
Q  107 aaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatga 206  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  10578 aaacagttagaagatttacttgataagaagtttgtaagaccgagtgtcttaccgtggggagcgactgtgttgttggtaaagaagaaagatggtagcatga 10677  T
Q  207 ggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    | ||||| || || || ||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||| || ||||||||||||||    
T  10678 gattgtgtatagattaccgtcagttgaacaaagttacaataaagaacaggtatctgcttctgaagattgatgacttga 10755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 159; Significance: 1e-84; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 69985 - 69707
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    |||| ||||| || ||||| || ||||| |||||||| ||||| ||  |||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||| || |||||    
T  69985 cagaaagggaagttgagttctcgattgatcttgttccgggaacgaaatcggtgtcgatggcaccttatcgcatgtcagcttctgaattagccgagttgaa 69886  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    |||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  69885 gaaacagttggaggacttgcttgataagaagtttgtaagacctagtgtttcgccgtggggagcgcctgtgttgttggtaaagaagaaggatggtagtatg 69786  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  69785 agattgtgcattgactatcgtcagttgaacaaagttacaataaagaacagatatccacttccgaggattgatgacttga 69707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 6 - 282
Target Start/End: Original strand, 2644 - 2920
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||| ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  2644 cagagcgggaggttgaattttcaattgaccttgttccaggaactaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaa 2743  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    |||||||||||| || || || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||| |||||||| ||   ||| |||    
T  2744 gaaacagttggaggacttgctcgataagaagtttgtaagacccagtgtttcaccgtggggagcgtcgatgttgttggttaagaagaaggacaatagcatg 2843  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgactt 282  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  2844 aggttatgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaataaataacaggtatccacttccgaggattgatgactt 2920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 159; Significance: 1e-84; HSPs: 4)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Original strand, 515044 - 515322
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  515044 cagagagagaggttgaattttcaattgacctcattccaggaacaaagccggtgtcgatggcaccataccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 515143  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    |||||||||||||||  |  | |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  515144 gaaacagttggaagacctgttggataagaaatttgtaagacccagtgtttcaccttggggagcaccggtgttgttggttaagaagaaggatggtagtatg 515243  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    ||  ||||||| || || ||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||    
T  515244 agactgtgcatagattaccgtcagttgaacaaggttacgataaagaataggtatccgcttcctagaattgatgacttga 515322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 23 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 495616 - 495355
Alignment:
Q  23 ttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaagagt 122  Q
    ||||| ||||| ||| |||| || || ||| | ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | || || || |    
T  495616 ttttcgattgatctttttccgggtactaagtctgtgtctatgacaccttaccgtatgtcagcttctgagttggctgagttgaagaaatatttagatgatt 495517  T
Q  123 tacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattgacta 222  Q
    | ||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| || || ||| | || |||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||    
T  495516 tgcttgataagaagtttgtaagaccaagtgttgcaccgtggggagcgccggtattgctagttaagaagaaagatggtagtatgagattatgcattgatta 495417  T
Q  223 tcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    ||| || ||||||||||| || || |||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||    
T  495416 tcgacagttgaacaaagtaacgataaagaataggtatccacttccaagaattgatgacttga 495355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 6 - 279
Target Start/End: Original strand, 452904 - 453177
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    |||||||||| || || || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||| |||| || || ||||||||||| |||||    
T  452904 cagagagggaagttgaattatcaattgaccttgttccaggaacgaagccggtgtcgatggcaccttatcgtttgtcggcgtccgagttagctgagttgaa 453003  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    ||||||||| || || || ||||||||||| ||||| ||| | |||||||||||||||||||  ||  | ||| |||| |||||||| |||||||| | |    
T  453004 gaaacagttagaggacttgcttgataagaaatttgtaagatcgagtgtttcaccgtggggagtgccgatattgctggttaagaagaaggatggtagcacg 453103  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatga 279  Q
    ||||| || || || || |||||  |||| ||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  453104 aggttatgtatagattaccgtcagctgaataaagtgacgataaagaataggtatccacttccgaggatcgatga 453177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 71 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 441238 - 441084
Alignment:
Q  71 taccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcac 170  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||| |    
T  441238 taccgtatgtcggcttctgagttggctgagttgaagaaatagttagaagatttacttgataagaagtttgtaagaccaagtgtttcaccttgggtagcgc 441139  T
Q  171 ctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattgactatcg 225  Q
    | || ||| | || |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  441138 cggtattgctagttaagaagaaagatggtagtatgaggttgtgtattgattatcg 441084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0708 (Bit Score: 155; Significance: 2e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0708
Description:

Target: scaffold0708; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Original strand, 5836 - 6114
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    |||| |||||||| || ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5836 cagaaagggaggttgaattttcaattgaccttattccaggaacgaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 5935  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    |||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || |||||  | || |||||||| ||||||||||||    
T  5936 gaaacagttggaggacttgcttgataagaagtttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttactagtaaagaagaaggatggtagtatg 6035  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| || ||||| || |||||||||| ||||||||| |||||||    
T  6036 aggttgtgcattgattaccgtcagttgaacaaggttacgataaagaacaggtatccgcttctgaggattgacgacttga 6114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 154; Significance: 1e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 6 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 33950 - 33673
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    |||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33950 cagaaagggaggttgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaatccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 33851  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    |||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| ||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||  ||    
T  33850 gaaacagttggaggacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccgtgggaagcgccagtgttgttggttaagaagaaggatggtagcttg 33751  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaatt-aagaatagatatccgcttccgaggattgatgactt 282  Q
    ||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  33750 aggttatgcattgattatcgtcagttgaacaaggttaccattaaagaacaggtatccacttccgaggattgatgactt 33673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 154; Significance: 1e-81; HSPs: 3)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 23 - 284
Target Start/End: Original strand, 54119 - 54380
Alignment:
Q  23 ttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaagagt 122  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||      
T  54119 ttttcaattaaccttgttccgggaacgatgccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagcttccgagttagctgaattgaggaaacagttggaagacc 54218  T
Q  123 tacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattgacta 222  Q
    | ||||||||||||||||| ||||| |||||||  || |||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||    
T  54219 tgcttgataagaagtttgtaagaccaagtgttttgccttggggagcgcctgtgttgttggtaaagaagaaggacggtagtatgaggttgtgcattgatta 54318  T
Q  223 tcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    |||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  54319 tcgtcagttgaacaaagttacgataaagaatagatatccacttccgagaattgatgatttga 54380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 6 - 276
Target Start/End: Original strand, 31368 - 31638
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| || || ||  | ||||| |||||    
T  31368 cagagagagaggttgaattttcaattgaccttgttccaggaactaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtcggcatccgaacttgctgagttgaa 31467  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    ||||||||| || || || ||  | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  31468 gaaacagttagaggacttgctcaacaagaagtttgtaagaccaagtgtttcaccgtggggagcgcctgtgttgttggtaaagaagaaagatggtagtatg 31567  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattga 276  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  31568 aggttatgcattgactaccgtcagttgaataaagttacaataaagaaaagatatccacttccgagaattga 31638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 141 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 42738 - 42595
Alignment:
Q  141 ttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagt 240  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| || ||  ||||||||||  ||||||| ||||| || |||||||||||  | || ||||| || |||||||| ||    
T  42738 ttagaccgagtgtttcgccgtggggtgctccaatgttgttggttgagaagaaagatggaagcatgaggttgtgtgtggattatcgccagttgaacaaggt 42639  T
Q  241 tacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
     || ||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  42638 gacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttga 42595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1373 (Bit Score: 151; Significance: 6e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold1373
Description:

Target: scaffold1373; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Original strand, 525 - 803
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  525 cagagagggaggttgaattttcaatagaccttgttccaggaacaaagccggtgtcgatagcaccataccgtacgtcagcttatgagttagctgaattgaa 624  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    |||||||||||| || ||  | |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  625 gaaacagttggaggacttgttagataagaagtttgtaagacccagtgtttcaccctggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtagtatg 724  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    ||  |||||||||| || ||| | |||||||||||||| || |||||  | |||| ||||||||||||||| |||||||    
T  725 agactgtgcattgattaccgttagttgaacaaagttacgataaagaaccggtatctgcttccgaggattgacgacttga 803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1477 (Bit Score: 149; Significance: 9e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold1477
Description:

Target: scaffold1477; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 6 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 841 - 565
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    |||| |||| ||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  || |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  841 cagaaagggtggttgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccggtgtcgatggcacgttatcgtatgtcagcttccgagttagctgaattgaa 742  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    |||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | |||||| ||  | |||||||| |||||||| ||||||| ||||    
T  741 gaaacagttggaggacttgcttgataagaagtttgtaagaccaagtgtttcaccttagggagcgccgatattgttggttaagaagaaggatggtactatg 642  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgactt 282  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  | ||||| |||||||||||||| |||||    
T  641 aggttatgcattgactatcgtcagttgaacaaagttacaataaagaacgggtatccacttccgaggattgacgactt 565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 149; Significance: 9e-79; HSPs: 2)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 6 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 24829 - 24553
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    |||| |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24829 cagaaagggaggttgaattttcaattgaccttgttccaggaacaaagccgatgtcgatggcaccttatcgtatgtcagcttctgaattagctgaattgaa 24730  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    |||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||| |||||||| |||    
T  24729 gaaacagttggaggacttgcttgataagaagtttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttagtcaagaagaaggatggtagcatg 24630  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgactt 282  Q
    || || |||||||| ||  |||| || ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  24629 agattatgcattgattactgtcagttaaacaaagttacgataaagaataggtatccacttccgagaattgatgactt 24553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 6 - 276
Target Start/End: Original strand, 44109 - 44378
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||||||||| || ||||||||  | ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||  || |||||||| || || |||||||||||||||||    
T  44109 cagagagggaggttgaattttcaatc-atcttgtgcccgtaacgaagccggtgtcgatggcacattatcgtatgtcggcgtccgagttagctgaattgaa 44207  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    ||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||  | |||||||| |||||||| ||||||||  ||    
T  44208 gaaccagttggaggatttacttgataagaagtttgtaagaccgagtgtttaaccgtggggagcgccgatattgttggttaagaagaaggatggtagcgtg 44307  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattga 276  Q
    ||||| || || || || |||||  |||| ||||| || || ||||| || ||||| |||||||| |||||    
T  44308 aggttatgtatagattaccgtcagctgaataaagtgacgataaagaacaggtatccacttccgagaattga 44378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126 (Bit Score: 147; Significance: 1e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0126
Description:

Target: scaffold0126; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 43531 - 43253
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  43531 cagagaggaaggttgagttttcaattgaccttgttccgggaacgaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagcttccgagttagctgaattgaa 43432  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||    || |||||||| |||||||| ||  |||| |||    
T  43431 gaaacagttggaagacttgcttgataagaattttgtaagaccaagtgtctcaccttggggagcgttggtattgttggtaaagaagaaggacagtagcatg 43332  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||| |||||||||| |||||||    
T  43331 aggttatgcattgactatcgtcagttgaataaagttacaataaagaacaggtatccactttcgaggattgacgacttga 43253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1288 (Bit Score: 145; Significance: 2e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold1288
Description:

Target: scaffold1288; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 6 - 282
Target Start/End: Original strand, 546 - 822
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  546 cagagagggaggttgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccggtgtcaatggcaccttatcgtatgtcagcttccgagttagctgaattgaa 645  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    |||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||  |||||||||| |||||||| |||||||  |||    
T  646 gaaacagttggaggacttgcttgataagaagtttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccgatgttgttggttaagaagaaggatggtaccatg 745  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgactt 282  Q
    || || || ||| | |||||||| |||||||||||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||    
T  746 agattatgtatttattatcgtcagttgaacaaagttacgataaagaacaggtatccacttccgaggattgacgactt 822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 145; Significance: 2e-76; HSPs: 3)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 6 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 3331 - 3055
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  3331 cagagagggaggttgaattttcaattgagcttgttctaggaacgaagccggtgtcgatggcaccttaccgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaa 3232  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    |||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||||| |||||||| |||||||  |||    
T  3231 gaaacagttggaggacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtattgttggttaagaagaaggatggtaccatg 3132  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgactt 282  Q
    ||| | |||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| || ||||| ||||||| ||||||||||||    
T  3131 aggctatgcattgattatcgtcagttgaacaaagttacgataaagaacaggtatccacttccgacgattgatgactt 3055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079; HSP #2
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 20 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 36097 - 35833
Alignment:
Q  20 gagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaag 119  Q
    |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||    
T  36097 gagttttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtctgcttccgagttagctgagttgaagaaacaattagaag 35998  T
Q  120 agttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattga 219  Q
    | || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| ||||||||||||||||| || || ||    
T  35997 aattgcttgagaagaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccagttttgttagtaaagaagaaagatggtagtatgaggttatgtatcga 35898  T
Q  220 ctatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
     |||||||| ||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  35897 ttatcgtcagttgaacaaagtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttga 35833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079; HSP #3
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 28691 - 28413
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||| || || |||||||| | ||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||| |||| |||||    
T  28691 cagagagagaagtcgagttttctaatgatcttgttcctggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtctgcttccgagttaactgagttgaa 28592  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
     ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| || ||||| || || ||||| || ||||| || ||||||||||||    
T  28591 taaacaattagaagatttgcttgagaagaagtttgttagaccaagtttttcaccttgaggagcgcccgttttgttagtaaagaaaaaagatggtagtatg 28492  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    ||||| || || || |||| ||| ||||| ||||| || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  28491 aggttatgtatcgattatcatcagttgaataaagtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttga 28413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 142; Significance: 1e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 23 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 21447 - 21186
Alignment:
Q  23 ttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaagagt 122  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||  | ||||| ||||||||||||||||  || |    
T  21447 ttttcaattgaccttgtaccaggaacgaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagcatccgaacttgctgagttgaagaaacagttggtggatt 21348  T
Q  123 tacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattgacta 222  Q
    | || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||    
T  21347 ttctcgacaagaagtttgtaagaccaagtgtttcaccgtggggagcgcctgtgttgttggtaaagaagaaggatggtagtatgaggctatgcattgacta 21248  T
Q  223 tcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    |||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21247 tcgtcagttgaataaagttacgataaagaacagatatccgcttccgagaattgatgacttga 21186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067 (Bit Score: 142; Significance: 1e-74; HSPs: 4)
Name: scaffold0067
Description:

Target: scaffold0067; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 23 - 284
Target Start/End: Original strand, 49888 - 50149
Alignment:
Q  23 ttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaagagt 122  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||| |||| || |||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |    
T  49888 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagctggtgtcgatgtcaccttatcgtatgtcggcgtctgagttagcagagttgaagaaacagttggaagact 49987  T
Q  123 tacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattgacta 222  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  49988 tgcttgataagaagttcgtaagaccaagtgtttcaccatggggagcgcctgtgttgttggttaagaagaaggatggtagcatgagattgtgcatcgacta 50087  T
Q  223 tcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    |||| | ||||| ||||||||||| ||||| || ||||| || |||||||||||||||||||    
T  50088 tcgttagttgaataaagttacaataaagaacaggtatccactaccgaggattgatgacttga 50149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #2
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 23 - 284
Target Start/End: Original strand, 58922 - 59183
Alignment:
Q  23 ttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaagagt 122  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||| |||| || |||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |    
T  58922 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagctggtgtcgatgtcaccttatcgtatgtcggcgtctgagttagcagagttgaagaaacagttggaagact 59021  T
Q  123 tacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattgacta 222  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  59022 tgcttgataagaagttcgtaagaccaagtgtttcaccatggggagcgcctgtgttgttggttaagaagaaggatggtagcatgagattgtgcatcgacta 59121  T
Q  223 tcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    |||| | ||||| ||||||||||| ||||| || ||||| || |||||||||||||||||||    
T  59122 tcgttagttgaataaagttacaataaagaacaggtatccactaccgaggattgatgacttga 59183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #3
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 23 - 284
Target Start/End: Original strand, 65310 - 65571
Alignment:
Q  23 ttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaagagt 122  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||| |||| || |||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |    
T  65310 ttttcaattgaccttgttccaggaacgaagctggtgtcgatgtcaccttatcgtatgtcggcgtctgagttagcagagttgaagaaacagttggaagact 65409  T
Q  123 tacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattgacta 222  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  65410 tgcttgataagaagttcgtaagaccaagtgtttcaccatggggagcgcctgtgttgttggttaagaagaaggatggtagcatgagattgtgcatcgacta 65509  T
Q  223 tcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    |||| | ||||| ||||||||||| ||||| || ||||| || |||||||||||||||||||    
T  65510 tcgttagttgaataaagttacaataaagaacaggtatccactaccgaggattgatgacttga 65571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #4
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 14 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 29229 - 28961
Alignment:
Q  14 gaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagt 113  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||    
T  29229 gaggttgaattttcaattgaccttgttctaggaacgaagccagtgtcgatggcaccttatcgtatgtcggcgtccgagttagctgaattgaagaaacagt 29130  T
Q  114 tggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtg 213  Q
    |||| || || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |  |||| ||| ||    
T  29129 tggaggacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccgtggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggcaacatgacgttatg 29030  T
Q  214 cattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgactt 282  Q
    |||||| ||||| || |||||||| || || || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  29029 cattgattatcggcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgaggattgatgactt 28961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 141; Significance: 6e-74; HSPs: 3)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 6 - 282
Target Start/End: Original strand, 5042 - 5318
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||||||||| ||||| ||| | |||||    
T  5042 cagagagggaggttgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccggtgtcgatggtaccttagcgtatgtcagcttccgagttggctaagttgaa 5141  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    |||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||||| |||||||| |||||||| |||    
T  5142 gaaacaattggaggacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtattgttggttaagaagaaggatggtagcatg 5241  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgactt 282  Q
    ||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  5242 aggttttgcattgattatcgtcagttgaacaaggttacgataaagaacaggtatccacttccgaggattgatgactt 5318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #2
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 6 - 282
Target Start/End: Original strand, 9473 - 9749
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||||||||| ||||| ||| | |||||    
T  9473 cagagagggaggttgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccggtgtcgatggtaccttagcgtatgtcagcttccgagttggctaagttgaa 9572  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    |||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||||| |||||||| |||||||| |||    
T  9573 gaaacaattggaggacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtattgttggttaagaagaaggatggtagcatg 9672  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgactt 282  Q
    ||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  9673 aggttttgcattgattatcgtcagttgaacaaggttacgataaagaacaggtatccacttccgaggattgatgactt 9749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #3
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 442 - 164
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||| || || |||||||| ||| | |||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  442 cagagagagaagttgagttttctattaatcttgttcctggaacgaagccggtgttgatggcaccttagcgtatgtcagcttccgagttagctgagttgaa 343  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  342 gaaacagttagaagatttgcttgagaagaagttttttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggttttgttagtaaagaagaaagatggtagtatg 243  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    || || || || || |||||||| |||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  242 agattatgtatcgattatcgtcacttgaacaatgtgactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttga 164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 141; Significance: 6e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 6 - 282
Target Start/End: Original strand, 19325 - 19601
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||  || |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19325 cagagagggaggttgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccggtgtaaatggcacattaacgtatgtcagcttccgagttagctgaattgaa 19424  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    |||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| || || ||| |||| |||||||| |||||||| |||    
T  19425 gaaacagttggaggacttgcttgataagaagtttgtaagaccaagtgtttcgccttggggagcgccggtattgctggttaagaagaaggatggtagcatg 19524  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgactt 282  Q
    ||||| |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||| |||||    
T  19525 aggttatgcattgactattgtcagttgaataaagttacaataaagaacaggtatccacttctgaggattgacgactt 19601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0206 (Bit Score: 140; Significance: 2e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0206
Description:

Target: scaffold0206; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 11 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 25720 - 25450
Alignment:
Q  11 agggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaac 110  Q
    ||||| || ||||| || ||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| | || ||||||||||    
T  25720 agggaagttgagttctcgattgatcttgttccgggaacgaaaccggtgtcgatggcaccgtatcgcatgtcagcttctgaattatccgagttgaagaaac 25621  T
Q  111 agttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggtt 210  Q
    ||||||| || || | ||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||   |||||||||||||| ||    
T  25620 agttggaggacttgcatgataagaagtttgtaagacccagtgtttcgccatggggagcgcctgtgttgttggtaaagaag---gatggtagtatgagatt 25524  T
Q  211 gtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  25523 gtgcattgactatcgtcagttgaacaaagttacaataaagaacagatatccacttccgagatttgatgacttga 25450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 140; Significance: 2e-73; HSPs: 2)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 29 - 284
Target Start/End: Original strand, 94608 - 94863
Alignment:
Q  29 attgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaagagttacttg 128  Q
    ||||| |||||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||| || || ||||    
T  94608 attgatcttgttccgggaacgaaaccagtgtcgatggcgccgtatcgcatgtcagcttctgaattggctgagttaaagaaacagttggaggacttgcttg 94707  T
Q  129 ataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattgactatcgtca 228  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  94708 acaagaagtttgtaagacccagtgtttcgccgtggggggcgcccgtgttattggtaaagaagaaagatggaagtatgaggttgtgcattgactatcgtca 94807  T
Q  229 attgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  94808 gttgaacaaagttacaataaagaatagatatccacttccgcggattgatgacttga 94863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 45 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 115136 - 114904
Alignment:
Q  45 gaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttag 144  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || |||||||| || || ||  | ||||| |||||||| ||||| || || ||||| || ||||||||||| ||    
T  115136 gaacgaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtcggcatccgaacttgctgagttgaagaatcagttagaggacttactcgacaagaagtttgtaag 115037  T
Q  145 acccagtgtttcacc-gtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttac 243  Q
    | | ||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||  |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | ||| ||||| ||||||||    
T  115036 agcaagtgtttcacccgtggggagcgcctgtgttgctggcaaagaagaaggatggtagtatgaggttgtgtattgactaccatcagttgaataaagttac 114937  T
Q  244 aattaagaatagatatccgcttccgaggattga 276  Q
     || ||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  114936 gataaagaacagatatcctcttccgagaattga 114904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 140; Significance: 2e-73; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 325320 - 325041
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  325320 cagagagggaggtttagttttcaattgaccttgttacgggaacgaagccggcgtcgatggcaacgtatcgcatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 325221  T
Q  106 gaaacagtt-ggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtat 204  Q
    ||||| ||| |||||| || |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| || || |||||||| |||||||| || ||||| ||    
T  325220 gaaacggtttggaagacttgcttgataaaaagtttgtaagaccaagtgtctcaccttggggagcgccggtattgttggtaaagaagaaggacggtagcat 325121  T
Q  205 gaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||| |  ||||| |||||||||||||| |||||||    
T  325120 gaggttgtgcattgactatcgttagttgaataaagttacaataaagaacaagtatccacttccgaggattgacgacttga 325041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 6 - 279
Target Start/End: Original strand, 201159 - 201432
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    |||||||||| || ||||||||||| || |||||||| || |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| | || |||||    
T  201159 cagagagggaagttgagttttcaatcgatcttgttccgggtacaaagcctgtgtcgatggcgccttaccgtatgtcagcgtctgagttatcagagttgaa 201258  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    |||||||||||  || |||| ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| |||    
T  201259 gaaacagttggtggatttacctgataagaattttgtaagaccgagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaagatggtagcatg 201358  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatga 279  Q
    |||||||| || || || ||||| ||||| ||||| || || || ||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  201359 aggttgtgtatagattaccgtcagttgaataaagtgacgataaaaaataggtatccacttccgagaattgatga 201432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 138; Significance: 3e-72; HSPs: 2)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 6 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 42311 - 42038
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  42311 cagagagggaggttgaattttcaattgaccttgttctaggaacgaagtcggtgtcgatggcaccttaccgtatgtcagcttccgagttagctgagttgaa 42212  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    |||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| |||    
T  42211 gaaacagttggaggacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcgccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtagcatg 42112  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatga 279  Q
    |||||||| || || || ||||| ||||| ||||| || |||||||| || ||||| |||||||| ||||||||    
T  42111 aggttgtgtatagattaccgtcagttgaataaagtgacgattaagaacaggtatccacttccgagaattgatga 42038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 20 - 284
Target Start/End: Original strand, 51050 - 51314
Alignment:
Q  20 gagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaag 119  Q
    ||||| || |||||||||||||| ||||  |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||    
T  51050 gagttatctattgaccttgttcctggaaagaagccggtgttgatggcaccttatcgtatgtcagcttccgagttagctgagttgaagaaacaattagaag 51149  T
Q  120 agttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattga 219  Q
    | || ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| || || ||||| ||||||||||| || ||||||||||| || || || ||    
T  51150 atttgcttgagaagaagtttgttagaccaattgtttcaccatggggagcgccggttttgttagtgaagaagaaagacggtagtatgagattatgtatcga 51249  T
Q  220 ctatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
     |||||| | ||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  51250 ttatcgttagttgaacaaagtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttga 51314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 135; Significance: 2e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 6 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 11573 - 11303
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||    
T  11573 cagagagggaggttgaattttcaatcgaccttgttcccggaacgaagccggtgtcgatggcaccttaccgtatgtcggcgtccgagttagctgaattgaa 11474  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||||| |||||||| |||    
T  11473 gaaacagttcgaggatttacttgataagaaatttgtaagaccgagtgtttcaccgtggggagcaccggtattgtcggttaagaagaaggatggtagcatg 11374  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattga 276  Q
    |||||||| || || || |||||  | || ||||| || || |||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  11373 aggttgtgtatagattaccgtcagctaaataaagtgacgataaagaataggtatccacttccgagaattga 11303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 135; Significance: 2e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 6 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 29547 - 29277
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||||||| | || ||||||||||| |||||| | ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29547 cagagagggagattgaattttcaattgatcttgttacaggaacgaagccggtgtcgatggcaccataccgtatgtcagcttctgagttagctgatttgaa 29448  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    |||||||||||| ||  |  | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  29447 gaaacagttggaggacctgttggataagaagtttgtaagacccagtgtttcaccttggggggcaccggtgttgttggttaagaagaaggatggtagtatg 29348  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattga 276  Q
    ||  ||||||| || || ||||| ||||| || ||||| || ||||| || |||||||||||||| |||||    
T  29347 agactgtgcatagattaccgtcagttgaataaggttacgataaagaacaggtatccgcttccgagaattga 29277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 132; Significance: 1e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 6 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 151180 - 150908
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||    | || || ||  | ||||| |||||    
T  151180 cagagagggaggttgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccggtgtcgatggcaccttatcgt----cggcgtccgaacttgctgagttgaa 151085  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    |||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || || ||| |||| |||||||| ||||||| ||||    
T  151084 gaaacagttggaggacttgcttgataagaagtttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtattgctggttaagaagaaggatggtactatg 150985  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgactt 282  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  150984 aggttatgcattgactatcgtcagttgaacaaagttacaataaagaacaggtatccacttccgaggattgatgactt 150908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 23 - 282
Target Start/End: Original strand, 24241 - 24500
Alignment:
Q  23 ttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaagagt 122  Q
    ||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| || ||||| |    
T  24241 ttttcgattgaccttgttccgggtacgaagcctgtgtctatgacaccttaccgtatgtcagcttctgagttggctgagatgaagaaacaattagaagatt 24340  T
Q  123 tacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattgacta 222  Q
    | ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  | ||| | || |||||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||    
T  24341 ttcttgataagtagtttgtaagaccaagtgtttcaccgtggggagcgccgatattgctagtaaagaagaaagatggtagtatgatattgtgcattgatta 24440  T
Q  223 tcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgactt 282  Q
    | | || ||||| ||||| || || |||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||    
T  24441 ttgacagttgaataaagtaacgataaagaataggtatccacttccaagaattgacgactt 24500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0523 (Bit Score: 131; Significance: 5e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0523
Description:

Target: scaffold0523; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 6 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 2484 - 2214
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||||||||| || |||||||| || | ||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||| || ||||||||||||||||||||    
T  2484 cagagagggaggttgaattttcaatcgatcatgtgcccggaacgaagccggtgtcgatggcaccttaccgtacgtcggcgtctgagttagctgaattgaa 2385  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    |||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| |||    
T  2384 gaaacagttggaggatttgcttgataagaaatttgtaagaccgagtgtttcaccgtggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtagcatg 2285  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattga 276  Q
    |||||||| ||  | || ||||| ||||| ||||| || || |||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  2284 aggttgtgtatatattaccgtcagttgaataaagtgacgataaagaataggtatccacttccgagaattga 2214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0244
Description:

Target: scaffold0244; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 6 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 19967 - 19694
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    |||||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |  || ||||||||||| |||||    
T  19967 cagagagggaggtaaaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccggtgtcaatggcaccataccgtatgtcggtgtccgagttagctgagttgaa 19868  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||| |||||||| |||    
T  19867 gaaacagttggaagacttgcttgataagaaatttgtaagaccgagtgtttcaccgtggggagcgccggtattgttggttaagaagaaggatggtagcatg 19768  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatga 279  Q
    ||||| || || || || |||||  |||| ||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  19767 aggttatgtatagattaccgtcagctgaataaagtgacgataaagaataggtatccacttccgaggattgatga 19694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404 (Bit Score: 129; Significance: 8e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0404
Description:

Target: scaffold0404; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 6 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 7357 - 7085
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| || || ||||||||||| |||||    
T  7357 cagagagggaggttgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtcggcgtccgagttagctgagttgaa 7258  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    ||||||||||||  | || ||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| |||    
T  7257 gaaacagttggagaacttgcttgataagaaatttgtaagatcaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtagcatg 7158  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatg 278  Q
    ||||| || || ||||  ||||| ||||| |||||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  7157 aggttatgtatagacttccgtcagttgaataaagttacgataaagaacaggtatccacttccgaggattgatg 7085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 129; Significance: 8e-67; HSPs: 2)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 8 - 284
Target Start/End: Original strand, 9154 - 9430
Alignment:
Q  8 gagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaaga 107  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| || ||  |  | ||||| |||||||    
T  9154 gagagagaggttgaattttcaattgacgttgttccaggaacgaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtcggcgtcctaacttgctgagttgaaga 9253  T
Q  108 aacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgag 207  Q
    ||| ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| || || |||||||| |||||| | |||||||||||||     
T  9254 aacggttggaagacttgcttgataagaagtttgtaagaccaagtgtctcaccttggggagcgccggttttgttggtaaagaaggaggatggtagtatgaa 9353  T
Q  208 gttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||||||||||    
T  9354 gttgtgcattgactatcgtcagttgaataaagttacaataaagaacaggtatccacttctgaggattgatgacttga 9430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 8 - 284
Target Start/End: Original strand, 19368 - 19644
Alignment:
Q  8 gagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaaga 107  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| || ||  |  | ||||| |||||||    
T  19368 gagagagaggttgaattttcaattgacgttgttccaggaacgaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtcggcgtcctaacttgctgagttgaaga 19467  T
Q  108 aacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgag 207  Q
    ||| ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| || || |||||||| |||||| | |||||||||||||     
T  19468 aacggttggaagacttgcttgataagaagtttgtaagaccaagtgtctcaccttggggagcgccggttttgttggtaaagaaggaggatggtagtatgaa 19567  T
Q  208 gttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||||||||||    
T  19568 gttgtgcattgactatcgtcagttgaataaagttacaataaagaacaggtatccacttctgaggattgatgacttga 19644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 129; Significance: 8e-67; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 6 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 14821 - 14545
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||| | || || ||  | |||||||||||    
T  14821 cagagagggaggttgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgccggcgtccgaacttgctgaattgaa 14722  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    ||||||||||||  | || |||||||| || ||||| | ||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||| |||||||  |||    
T  14721 gaaacagttggagaacttgcttgataataaatttgtaataccaagtgtttcaccgtggggagcgccagtattgttggttaagaagaaggatggtaccatg 14622  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgactt 282  Q
    ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  14621 aggttatgcattgattatcgtcagttgaacaaagttacgataaagaacaggtatccacttccgaggattgatgactt 14545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 68 - 284
Target Start/End: Original strand, 5560 - 5775
Alignment:
Q  68 ccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggag 167  Q
    ||||| || ||||| || || ||||| | |||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||| ||||| ||||||| ||||||||||||| ||| |    
T  5560 ccgtatcggatgtctgcatcagagttgggtgaattgaagaatcagttggaggagttgcttgagaagcagtttattagaccaagtgtttcaccgt-gggtg 5658  T
Q  168 cacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttcc 267  Q
    | || ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||  | || ||||| || |||||||| || || ||||||||| | ||||| |||||    
T  5659 ctccagtgttgttggttaagaagaaggatggaagcatgaggttgtgtgtggattatcggcagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttcc 5758  T
Q  268 gaggattgatgacttga 284  Q
     ||||||||||| ||||    
T  5759 aaggattgatgatttga 5775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0055 (Bit Score: 127; Significance: 1e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0055
Description:

Target: scaffold0055; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 21860 - 21582
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||| || || |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||| |||| |||||    
T  21860 cagagagagaagttgagttttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtctcgatggcaccttatcgtatgtctgcttctgagttatctgagttgaa 21761  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  21760 gaaacagttggaagacttgcttgagaagaagtttgttagaccgagtgtttcaccttggggagcgccggttttgttagtaaagaagaaagatggtagtatg 21661  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    ||| | || ||||| ||||| || |||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  21660 aggctatgtattgattatcgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttga 21582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0304 (Bit Score: 126; Significance: 5e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0304
Description:

Target: scaffold0304; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 6 - 279
Target Start/End: Original strand, 1176 - 1449
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| || || ||||||| |||||||||    
T  1176 cagagagggaggttgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccggtgtcgatggcaccttagcgtatgtcggcgtccgagttagttgaattgaa 1275  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    |||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||||| |||||||| |||||||  |||    
T  1276 gaaacagttggaggacttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtattgttggttaagaagaaggatggtaccatg 1375  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatga 279  Q
    ||||| |||||| | |||||||| || || ||||| || || ||||| || |||||  ||||||||||||||||    
T  1376 aggttatgcatttattatcgtcagttaaataaagtgacgataaagaacaggtatccatttccgaggattgatga 1449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 6 - 270
Target Start/End: Original strand, 3861 - 4125
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||||||||| ||||| || || || || || || ||||| ||||||||||||||| |||| || |||||||| || || ||  | ||||| |||||    
T  3861 cagagagggaggttgagttctccatcgatctagtaccaggaacgaagccggtgtcgatgacaccttatcgtatgtcggcatccgaacttgctgagttgaa 3960  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    ||||||||| |||||  |||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  3961 gaaacagttagaagatctactcgacaagaagtttgtaagaccaagtgtttcaccgtggggagcgcctgtgttgttggtaaagaagaaggatggtagtatg 4060  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgag 270  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  4061 aggttgtgcattgactaccgtcagttgaataaagttacgataaagaacagatatccgcttccgag 4125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 123; Significance: 3e-63; HSPs: 2)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Original strand, 13815 - 14093
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    |||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  13815 cagagagggaagtcgagttttctattgatcttgttcctgggacgaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtctgcttccgagttagctgagttgaa 13914  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    |||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||| | ||||||||||| |||||||| |||    
T  13915 gaaacaattagaagatttgcttgaaaagaaatttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccagttttgctagtgaagaagaaagatggtagcatg 14014  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    || ||||| |||||||||| ||| |||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  14015 agattgtgtattgactatcatcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttga 14093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 40768 - 40490
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||| || || |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||  || |||| |||||    
T  40768 cagagagagaagtcgagttttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtctgcttccgaactatctgagttgaa 40669  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    |||| |||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||  | ||| | || |||||||| ||||||||||||    
T  40668 gaaatagttggaagacttgcttgagaagaaatttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccgattttgctagtaaagaagaaagatggtagtatg 40569  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    ||| | || ||||| ||||| || |||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| | |||||| ||||    
T  40568 aggctatgtattgattatcgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaactgatgatttga 40490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 123; Significance: 3e-63; HSPs: 2)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 3037 - 2759
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||| || || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||| ||||||||||    
T  3037 cagagagagaagttgagttttctattgatcttgttcctggaacaaagccagtctcgatggcaccttatcgtatgtctgcttccgagttatctgaattgaa 2938  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    |||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  2937 gaaacagttggaggacttgcttgagaagaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggttttgttagtaaagaagaaagatggtagtatg 2838  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
     |||| || ||||| ||||| || |||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  2837 cggttatgtattgattatcggcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttga 2759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 16773 - 16495
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    |||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  16773 cagagagggaagtcgagttttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtctgcttccgagttagctgagttgaa 16674  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    ||||||||| |||||  | || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||| | ||||||||||| ||||| || |||    
T  16673 gaaacagtttgaagatctgctcgagaagaaatttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccagttttggtagtgaagaagaaagatggaagcatg 16574  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    || ||||| |||||||||||||| |||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  16573 agattgtgtattgactatcgtcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttga 16495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 123; Significance: 3e-63; HSPs: 3)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Original strand, 37511 - 37789
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||| || || |||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||| ||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| | |||||    
T  37511 cagagagagaagtcgagttttctattgatcttgtacctggaacgaagccgatgtcgatggcaccttatcgtatgtcagcttccgagttagctcagttgaa 37610  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||| |||| ||||||| ||| |||||||| || || ||||| ||||||||||| |||||| |||||    
T  37611 gaaacagttagaagatttgcttgagaagaagtttgttcgaccaagtgttttaccttggggagcgccggttttgttcgtgaagaagaaagatggttgtatg 37710  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    |||||||| || || |||||||| ||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  37711 aggttgtgtatcgattatcgtcagttgaacaaagtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttga 37789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 133 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 23193 - 23042
Alignment:
Q  133 gaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattgactatcgtcaattg 232  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||| || |||    
T  23193 gaagtttgtaagaccgagtgtttcaccttggggagcgccggtattgttagttaagaagaaagatggtagtatgaggttgtgtatagattatcgacagttg 23094  T
Q  233 aacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    || ||||| || || |||||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||    
T  23093 aataaagtaacgataaagaataggtatccacttccaagaatagatgatttga 23042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 23 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 25948 - 25834
Alignment:
Q  23 ttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaagagt 122  Q
    ||||| ||||| |||||||| || || ||||| ||||| ||| | || ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| |    
T  25948 ttttcgattgatcttgttccgggtacgaagcctgtgtctatgacgccttaccgtatgtcggcttctgagttggctgagttgaagaaacaattagaagatt 25849  T
Q  123 tacttgataagaagt 137  Q
    | ||||||| |||||    
T  25848 tgcttgataggaagt 25834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0585
Description:

Target: scaffold0585; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 6 - 279
Target Start/End: Original strand, 4780 - 5053
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||  ||||| |||||||||||||| |  |||||||| || || |||||||||||||| ||    
T  4780 cagagagggaggttgaattttcaattgatcttgttccgggaatgaagccagtgtcgatggcaccttctcgtatgtcggcgtccgagttagctgaattaaa 4879  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    |||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  4880 gaaacaattggaggatttacttgataagaaatttgtaagaccgagtgtttcaccttggggagcccctgtattgttggttaagaagaaggatggtagtatg 4979  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatga 279  Q
    || ||||| || || || |||||  |||| ||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  4980 agattgtgtatagattaccgtcagctgaataaagtgacgataaagaatagatatccacttccgagaattgatga 5053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0751 (Bit Score: 119; Significance: 8e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0751
Description:

Target: scaffold0751; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 6 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 4794 - 4524
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||| |||||    
T  4794 cagagagggaggttgaattttcaatcgatcttgtgcccggaacgaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtcggcgtctgagttagctgacttgaa 4695  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || || ||||| |||||||| |||||||| |||    
T  4694 gaaacagttggaggatttacttgataagaaatttgtaagaccgagtgtttcaccgtggggagcgccggtattattggttaagaagaaagatggtagcatg 4595  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattga 276  Q
    |||||||| || || || |||||  | || ||||| || || ||||| || ||||| |||||||| |||||    
T  4594 aggttgtgtatagattaccgtcagctaaataaagtgacgataaagaacaggtatccacttccgagaattga 4524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 119; Significance: 8e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 9553 - 9275
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||| || || |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||| |||| |||||    
T  9553 cagagagagaagttgagttttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtctcgatggcaccttatcgtatgtctgcttccgagttatctgagttgaa 9454  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    |||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  9453 gaaacagttggaggacttgcttgagaagaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggttttgttagtaaagaagaaagatggtagtatg 9354  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
     |||| || ||||| ||||| || |||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  9353 cggttatgtattgattatcggcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttga 9275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 119; Significance: 8e-61; HSPs: 2)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 21217 - 20939
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||| || || |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  21217 cagagagagaagttgagttttctattgatcttgttcctggaacgaagccggcgtcgatggcaccttatcgtatgtcagcttccgagttagctgagttgaa 21118  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    |||||| || ||||| || ||| | || |||||||||||||| | ||||||||| |||||||| || || ||| | ||||||||||| |||||||| |||    
T  21117 gaaacaattagaagattttcttaagaaaaagtttgttagaccaactgtttcaccttggggagcgccggttttgctagtgaagaagaaagatggtagcatg 21018  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||| |||| ||||    
T  21017 agattgtgtattgactatcgacaattgaacaaggtgacaataaagaataggtatccacttccgagaattaatgatttga 20939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #2
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 36641 - 36363
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||| || || |||||||| ||||| |||||||| ||||  || |  ||||| |||| ||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  36641 cagagagagaagttgagttttctattgatcttgttcctggaatgaatcttgtgtctatggtaccttatcgtatgtcagcttccgagttagctgagttgaa 36542  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    |||||| || ||||| || ||| | || |||||||||||||| | ||||||||| |||||||| || || ||| | ||||||||||| |||||||| |||    
T  36541 gaaacaattagaagattttcttaagaaaaagtttgttagaccaactgtttcaccttggggagcgccggttttgctagtgaagaagaaagatggtagcatg 36442  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    || ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||| |||| ||||    
T  36441 agattgtgtattgactatcgacaattgaacaaggtgacaataaagaataggtatccacttccgagaattaatgatttga 36363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 119; Significance: 8e-61; HSPs: 5)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 36963 - 36685
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||| || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||| ||| |||||    
T  36963 cagagagagaagtcgagttttctattgatcttgttcctggaacaaagctggtgtcgatggcaccttatcgtatgtctgcttccgagttaggtgagttgaa 36864  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || || || ||  ||||||| ||||||||||||    
T  36863 gaaacagttagaagatttgcttgagaagaagtttgttagaccaagtgtttcaccatggggagcgccggttttattagtacagaagaaagatggtagtatg 36764  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    || || || || || |||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||    
T  36763 agattatgtatcgattatcgtcaattgaacaaagtaactatcaagaataggtatccacttccgagatttgatgatttga 36685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 6 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 31497 - 31233
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||| || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||| ||| |||||    
T  31497 cagagagagaagtcgagttttctattgatcttgttcctggaacaaagctggtgtcgatggcaccttatcgtatgtctgcttccgagttaggtgagttgaa 31398  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || || || ||  ||||||| ||||||||||||    
T  31397 gaaacagttagaagatttgcttgagaagaagtttgttagaccaagtgtttcaccatggggagcgccggttttattagtacagaagaaagatggtagtatg 31298  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgag 270  Q
    || || || || || |||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| ||||||||    
T  31297 agattatgtatcgattatcgtcaattgaacaaagtaactatcaagaataggtatccacttccgag 31233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #3
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Original strand, 13584 - 13863
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    |||||||||| || |||||||| ||||| || | ||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||  |||||||||| |||||    
T  13584 cagagagggaagtcgagttttctattgatctagatcctggaacgaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtctgcttccaagttagctgagttgaa 13683  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcac--ctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagta 203  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||   ||||||||||| |||||||| |  | || ||| | || |||||||| |||||||| |    
T  13684 gaaacagttagaagatttgcttgaaaagaaatttgttagaaa-agtgtttcaccttggggagcgcgccagttttgctagtaaagaagaaagatggtagca 13782  T
Q  204 tgaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  13783 tgagattgtgtattgactatcgtcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttga 13863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #4
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Original strand, 10929 - 11208
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    |||||||||| || |||||||| ||||| |||| ||| || || |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||  |||||||||| |||||    
T  10929 cagagagggaagtcgagttttctattgatcttgctcctgggacgaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtctgcttccaagttagctgagttgaa 11028  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcac--ctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagta 203  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||   ||||||||||| |||||||| |  | || ||| | || |||||||| ||||||||      
T  11029 gaaacagttagaagatttgcttgaaaagaaatttgttagaaa-agtgtttcaccttggggagcgcgccagttttgctagtaaagaagaaagatggtagcc 11127  T
Q  204 tgaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  11128 tgagattgtgtattgactatcgtcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttga 11208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #5
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 23 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 54233 - 53972
Alignment:
Q  23 ttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaagagt 122  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||| |||| || |||||||||||||||||||| || || ||||||||| | || || || |    
T  54233 ttttctattgatcttgttcctggaacgaagcctgtgtctatgacaccttatcgtatgtcagcttctgagttggccgagttgaagaaaaaattagaggatt 54134  T
Q  123 tacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattgacta 222  Q
    | || || || ||||||||||||||  ||||||||||  ||||||| || || ||| | || |||||||| |||||||| ||||  ||||| ||||||||    
T  54133 tgctcgagaaaaagtttgttagaccacgtgtttcacctaggggagcgcccgttttgctagtaaagaagaaagatggtagcatgacattgtgtattgacta 54034  T
Q  223 tcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    ||| || |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  54033 tcgacagttgaacaaggtgacaataaagaataggtatccacttccgaggattgatgatttga 53972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 119; Significance: 8e-61; HSPs: 5)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 6 - 276
Target Start/End: Original strand, 48205 - 48475
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    |||| |||||||| ||||| || || || || || || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| || || ||  | | ||| |||||    
T  48205 cagaaagggaggttgagttctccatcgatctggtgccaggaacgaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtcggcatccgaacttgttgagttgaa 48304  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    ||||||||| || || || || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  48305 gaaacagttagaggacttgctcgacaagaagtttgtaagaccaagtgtttcaccgtggggagcgcctgtgttgttggtaaagaagaaagatggtagtatg 48404  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattga 276  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  48405 aggttatgcattgactaccgtcagttgaataaagttacagtaaagaatagatatccgcttccgagaattga 48475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 17551 - 17273
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||| || || |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || | |||||| ||||| || ||| |||| |||||    
T  17551 cagagagagaagtcgagttttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtgtcgatggcaccttatcatatgtccgcttccgaattatctgagttgaa 17452  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    ||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||| | || |||||||| ||||||||||||    
T  17451 gaaacagttggaagatttgcttgagaagaaatttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgctagtaaagaagaaagatggtagtatg 17352  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| || || || |||||||| ||||  ||||| || |||||||| ||||    
T  17351 aggttatgtattgattatcgacaattgaacaaggtaactatcaagaataggtatcgacttccaagaattgatgatttga 17273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 29 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 11066 - 10811
Alignment:
Q  29 attgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaagagttacttg 128  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| || ||| |||| |||||||||||||||||||| || ||||    
T  11066 attgatcttgttcctggaacgaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtccgcttccgaattatctgagttgaagaaacagttggaagatttgcttg 10967  T
Q  129 ataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattgactatcgtca 228  Q
    | ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |  || ||| | || |||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||    
T  10966 agaagaaatttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgctggttttgctagtaaagaagaaagatggtagtatgaggttatgtattgattatcgaca 10867  T
Q  229 attgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    ||||||||| || || || |||||||| ||||  ||||| || |||||||| ||||    
T  10866 attgaacaaggtaactatcaagaataggtatcgacttccaagaattgatgatttga 10811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 96 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 45676 - 45496
Alignment:
Q  96 ctgaattgaagaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatga 195  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||| | || |||||||| ||    
T  45676 ctgagttgaagaaacagttggaagatttgcttgagaagaaatttgttagaccgagtgtttcaccttggggagcgccggttttgctagtaaagaagaaaga 45577  T
Q  196 tggtagtatgaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattga 276  Q
    ||||||||||||| | || ||||| ||||| ||  ||||||| || || || |||||||| ||||||||||| || |||||    
T  45576 tggtagtatgaggctatgtattgattatcgacaggtgaacaaggtaactatcaagaataggtatccgcttccaagaattga 45496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 53339 - 53260
Alignment:
Q  7 agagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagctt 86  Q
    |||||| || || |||||||| ||||| |||||||  ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||    
T  53339 agagagagaagtcgagttttctattgatcttgttcttggaacgaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtctgctt 53260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0509 (Bit Score: 118; Significance: 3e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0509
Description:

Target: scaffold0509; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 6 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 11443 - 11170
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    |||||||||| || || ||||||||||| ||| |||| || || ||||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||| ||||||| |||||    
T  11443 cagagagggaagttgaattttcaattgatcttattccgggtacgaagcctgtgtcgatggcgccttaccgtatgtcggcgtctgagctagctgagttgaa 11344  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| |||    
T  11343 gaaacagttggaggatttacttgataagaagtttgtaagaccgagcgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaagatggtagcatg 11244  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatga 279  Q
    || ||||| || || || | ||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  11243 agattgtgtatagattaccttcagttgaataaagtgacaataaagaataggtatccacttccgagaattgatga 11170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2111 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold2111
Description:

Target: scaffold2111; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 6 - 270
Target Start/End: Original strand, 278 - 542
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    |||| |||||||| ||||| || || || || || || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| || || ||| | || || || ||    
T  278 cagaaagggaggttgagttctccatcgatctagtaccaggaacgaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtcggcatccgagcttgcagagttaaa 377  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    |||| |||| || || ||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  378 gaaatagttagaggatttactcgacaagaagtttgtaagaccaagtgtttcaccgtggggagcgcctgtgttgttggtaaagaagaaggatggtagtatg 477  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgag 270  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  478 aggttgtgcattgactaccgtcaactgaataaagttacgataaagaacagatatccgcttccgag 542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0054
Description:

Target: scaffold0054; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 6 - 278
Target Start/End: Original strand, 64210 - 64482
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||| |||||    
T  64210 cagagagggaggttgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccggtgtcgatggcaccttaccgtatgtcggcgtccgagttagctgagttgaa 64309  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    |||||||||| | || || ||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||| ||||||||  | || |||||||| |||||||| |||||||| |||    
T  64310 gaaacagttgaaggacttgcttgataagaaatttgtaacaccaagtgtttcaccttggggagcgtcggtattgttggttaagaagaaggatggtagcatg 64409  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatg 278  Q
    ||||| || || || || |||||  |||| ||||| || || |||||||| ||||| ||| ||||||||||||    
T  64410 aggttatgtatagattaccgtcagctgaataaagtgacgataaagaataggtatccacttacgaggattgatg 64482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 104 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 269125 - 268945
Alignment:
Q  104 aagaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagta 203  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  269125 aagaaacagttggaggacttgcttgataagaagtttgtgagacctagtgtttcgccgtggggagcacccgtgttattggtgaagaagaaagatggaagta 269026  T
Q  204 tgaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||| |||||||||||||||    
T  269025 tgaggttgtgcattgactatcgtcagttgaacaaagttacaataaagaataggtatccactcccgcggattgatgacttga 268945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 6 - 274
Target Start/End: Original strand, 84211 - 84479
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    |||||||||| || || ||||| ||||| ||| |||| || || || || || || ||| |||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  84211 cagagagggaagtagaattttctattgatcttattccgggtacgaaacctgtttctatgacaccttaccgtatgtcagcttccgaattagctgagttgaa 84310  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
     || ||||| ||||| ||  |||||||||||||||| || || ||||| |  || |||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| |||    
T  84311 aaagcagttagaagatttgtttgataagaagtttgtaaggccaagtgtgttgccttggggagcgccggtgttattggttaagaagaaagatggtagcatg 84410  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggatt 274  Q
    ||||| || || || ||| | || ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||  ||||||||||||    
T  84411 aggttatgtatagattataggcagttgaataaagtgacaataaagaataggtatcgacttccgaggatt 84479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 116; Significance: 5e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 23 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 103823 - 103568
Alignment:
Q  23 ttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaagagt 122  Q
    ||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |    
T  103823 ttttcgattgaccttgttccgggtacgaagcctgtgtctatgacaccttaccgtatgtcagcttctgagttggctgagttgaagaaacagttagaagatt 103724  T
Q  123 tacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattgacta 222  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||  | ||| | || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  103723 tacttgataaaaagtttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccgatattgctagttaagaagaaagatggtagtatgagattgtgcattgatta 103624  T
Q  223 tcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatg 278  Q
    |||  | ||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  103623 tcgatagttgaacaaagtaacgataaagaataggtatccacttccgagaattgatg 103568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0241 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0241
Description:

Target: scaffold0241; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 11 - 129
Target Start/End: Original strand, 1 - 119
Alignment:
Q  11 agggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaac 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1 agggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaac 100  T
Q  111 agttggaagagttacttga 129  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  101 agttggaagatttacttga 119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 7836 - 7558
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||| || || || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||| |||| || |||||||||||||||||||| || || |||||    
T  7836 cagagagagaagttgaattttctattgatcttgttcctggaacgaagcctgtgtctatgacaccttatcgtatgtcagcttctgagttggccgagttgaa 7737  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    |||||| || || || |||||||| || |||||||||||||  ||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||||| ||| |||||||| |||    
T  7736 gaaacaattagaggatttacttgagaaaaagtttgttagacgaagtgtttcaccttggggagcgcccgttttgttagtgaagaggaaagatggtagcatg 7637  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    ||||||||  |||||||||| || ||||||||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7636 aggttgtgtgttgactatcgacagttgaacaaagtaacgataaagaataggtatccacttccgaggattgatgacttga 7558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0865 (Bit Score: 114; Significance: 7e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0865
Description:

Target: scaffold0865; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 6 - 279
Target Start/End: Original strand, 1963 - 2236
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||||||||| || ||| ||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||||||||  || |||||||| || || |||||||| || |||||    
T  1963 cagagagggaggttgaatttgcaattgatctagttcctggaacgaatccggtgtcgatggcactttatcgtatgtcggcgtccgagttagcggagttgaa 2062  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||||| || || || ||||| |||||||| |||||||| |||    
T  2063 gaaacagttggaggacttacttgataagaaatttgtaagaccgagtgtttaaccgtggggagcgccagtatttttggttaagaagaaggatggtagcatg 2162  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatga 279  Q
    |||||||| || || |||||||| ||||| |||||||| || ||||| || ||||| |||||||| ||||||||    
T  2163 aggttgtgtatagattatcgtcagttgaataaagttacgataaagaacaggtatccacttccgagaattgatga 2236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 114; Significance: 7e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 6 - 279
Target Start/End: Original strand, 28976 - 29249
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||||||||| || ||| ||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||||||||  || |||||||| || || |||||||| || |||||    
T  28976 cagagagggaggttgaatttgcaattgatctagttcctggaacgaatccggtgtcgatggcactttatcgtatgtcggcgtccgagttagcggagttgaa 29075  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||||| || || || ||||| |||||||| |||||||| |||    
T  29076 gaaacagttggaggacttacttgataagaaatttgtaagaccgagtgtttaaccgtggggagcgccagtatttttggttaagaagaaggatggtagcatg 29175  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatga 279  Q
    |||||||| || || |||||||| ||||| |||||||| || ||||| || ||||| |||||||| ||||||||    
T  29176 aggttgtgtatagattatcgtcagttgaataaagttacgataaagaacaggtatccacttccgagaattgatga 29249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 113; Significance: 3e-57; HSPs: 4)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 6 - 166
Target Start/End: Original strand, 13056 - 13216
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13056 cagagagggaggttgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccggtgtcgatggcaccataccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 13155  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtgggga 166  Q
    |||||||||||| |  || ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  13156 gaaacagttggaggtcttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccgtgggga 13216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #2
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 6 - 166
Target Start/End: Original strand, 21236 - 21395
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  21236 cagagagggaggttgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccggtgtcgatggcaccttaccgtatgtc-gcttccgagttagctgaattgaa 21334  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtgggga 166  Q
    |||||||||||| |  || ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  21335 gaaacagttggaggtcttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccgtgggga 21395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 194 - 282
Target Start/End: Original strand, 13215 - 13303
Alignment:
Q  194 gatggtagtatgaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgactt 282  Q
    ||||||||  ||||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||    
T  13215 gatggtagcctgaggttatgcattgattatcgtcagttgaataaggttacgataaagaacaggtatccacttccgaggattgataactt 13303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #4
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 194 - 282
Target Start/End: Original strand, 21394 - 21482
Alignment:
Q  194 gatggtagtatgaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgactt 282  Q
    ||||||||  ||||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||    
T  21394 gatggtagcctgaggttatgcattgattatcgtcagttgaataaggttacgataaagaacaggtatccacttccgaggattgataactt 21482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 113; Significance: 3e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 7 - 255
Target Start/End: Original strand, 28187 - 28435
Alignment:
Q  7 agagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaag 106  Q
    |||||| || || |||||||| ||||| |||||||  ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||    
T  28187 agagagagaagtcgagttttctattgatcttgttcatggaactaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtctgcttccgagttagctgagttgaag 28286  T
Q  107 aaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatga 206  Q
    |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  28287 aaacagttagaagatttgcttgagaagaagtttgttagaccgagtgtttcaccttggggagcgccggttttgttagtaaagaagaaagatggtagtatga 28386  T
Q  207 ggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatag 255  Q
    |||| || ||  | |||||||| ||||||||||| || || ||||||||    
T  28387 ggttatgtatcaattatcgtcagttgaacaaagtaactatcaagaatag 28435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 113; Significance: 3e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 6 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 49718 - 49447
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    |||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||| | ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  49718 cagaaagggaggttgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccgatatcgatggcaccttaccgtatgtcagcgtccgagttagctgagttgaa 49619  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    |||||||||||| || || |||||||||||  |||| ||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| |||    
T  49618 gaaacagttggaggacttgcttgataagaa-attgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtagcatg 49520  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatg 278  Q
    ||||| || ||||| || ||| | ||||| ||||| || || |||| ||| ||||| |||| |||||| ||||    
T  49519 aggttatgtattgattaccgttagttgaataaagtgacgataaagattaggtatccacttctgaggatcgatg 49447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 113; Significance: 3e-57; HSPs: 3)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 7 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 14735 - 14559
Alignment:
Q  7 agagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaag 106  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14735 agagagggaggttgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagctggtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagcttccgagttagctgaattgaag 14636  T
Q  107 aaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggt 183  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  14635 aaacagttggaggatttgcttgataagaagtttgtaagaccaagtgtctcaccttggggagcgcctgtgttgttggt 14559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 71 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 5661 - 5465
Alignment:
Q  71 taccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcac 170  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |    
T  5661 taccgtatgtcagtttctgagttggctgagttgaaaaaacaattagaagatttacttgagaagaagtttgtaagaccaagtgtttcaccgtggggagcgc 5562  T
Q  171 ctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttcc 267  Q
    | || ||| | |  |||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||  | ||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||    
T  5561 cggtattgctagataagaagaaggatggtagcatgaggttatgcattgattatcgatagttgaacaaagtaacgataaagaataggtatccacttcc 5465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074; HSP #3
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 179 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 11563 - 11458
Alignment:
Q  179 ttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatg 278  Q
    ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||| || ||||| |  ||||| ||||||||||||||||    
T  11563 ttggtaaagaagaaggacggtagcatgaggttgtgcattgattattgtcaattgaataaagttacgataaagaacatgtatccacttccgaggattgatg 11464  T
Q  279 acttga 284  Q
    ||||||    
T  11463 acttga 11458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0443 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0443
Description:

Target: scaffold0443; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 7 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 11421 - 11246
Alignment:
Q  7 agagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaag 106  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11421 agagagggaggttgaattttcaattgaccttgttccgggaactaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgagttgaag 11322  T
Q  107 aaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttgg 182  Q
    ||||||||||| ||  |  | |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||    
T  11321 aaacagttggaggacctgttagataagaagtttgtaagacctagtgtttcaccttggggagcaccggcgttgttgg 11246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0405 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0405
Description:

Target: scaffold0405; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 33 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 1088 - 837
Alignment:
Q  33 accttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaagagttacttgataa 132  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||   || ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  1088 accttgttcccggaacgaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtcaatgtccgagttagctgagttgaagaaacagttggaggatttacttgataa 989  T
Q  133 gaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattgactatcgtcaattg 232  Q
    ||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||  |||| |||    
T  988 gaaatttgtaagaccgaatgtttcaccgtggggagcgccggtattgttggttaagaagaaggatggtagcatgaggttgtgtatagattaatgtcagttg 889  T
Q  233 aacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    || ||||| || || |||||||| ||||  |||||||| |||||||| ||||    
T  888 aataaagtgacgataaagaataggtatcaacttccgagaattgatgatttga 837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 111; Significance: 4e-56; HSPs: 2)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 6 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 16727 - 16457
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||    
T  16727 cagagagggaggttgaattttcaatcgatcttgtgcccggaacgaagccggtgtcgatggcaccttaccgtatgtcggcgcctgagctagctgaattgaa 16628  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    |||||||||||| || ||||| ||||||||  |||| ||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||| |||||||| |||    
T  16627 gaaacagttggaggatttactggataagaaagttgtaagaccgagtgtttcaccgtggggagcgccggtattgttggttaagaagaaggatggtagcatg 16528  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattga 276  Q
    ||||| || || || || |||||  |||| ||||| || || ||||| || |||||  ||||||| |||||    
T  16527 aggttatgtatagattaccgtcagctgaataaagtgacgataaagaacaggtatccagttccgagaattga 16457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 59 - 284
Target Start/End: Original strand, 7605 - 7830
Alignment:
Q  59 tcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcac 158  Q
    ||||| || ||||| || ||||| || || ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| |||| || ||||||||||    
T  7605 tcgattgcgccgtatcggatgtctgcatcagagttgggtgaattgaagaaacagttggaagagttgcttgagaagcagtttattaggccaagtgtttcac 7704  T
Q  159 cgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagata 258  Q
    ||||||| || || || |||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||  | || ||||  || |||||||| || || ||||||||| ||||    
T  7705 cgtggggtgctcccgtattgttggttaagaagaaagatggaaatatgaggttgtgtgtggattatcaacagttgaacaaggtgacgattaagaatcgata 7804  T
Q  259 tccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    ||| |||||  |||||||||| ||||    
T  7805 tccacttccacggattgatgatttga 7830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 111; Significance: 4e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 9 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 29137 - 28867
Alignment:
Q  9 agagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaa 108  Q
    |||||||||| || ||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |  || |||||||| |||||||||||    
T  29137 agagggaggttgaatttgcaattgatcttgttcccggaacgaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtcggtgtccgagttagccgaattgaagaa 29038  T
Q  109 acagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgagg 208  Q
    ||||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| | |||||| |||||     
T  29037 acagttggaggatttactggataagaaatttgtaagaccgagtgtttcaccttggggagcgccggtattgttagttaagaagaagggtggtagcatgaga 28938  T
Q  209 ttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatga 279  Q
    ||||| || || || |||||  |||| ||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  28937 ttgtgtatagattaccgtcagctgaataaagtgacgataaagaatagatatccacttccgagaattgatga 28867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 111; Significance: 4e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 6 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 36552 - 36282
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||| || || ||  | |||||||||||    
T  36552 cagagagggaggttgaattttcaattgaccttgttctaggaacgaagcctgtgtcgatggcaccttatcgtatgtcggcgtccgaacttgctgaattgaa 36453  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    ||||||||||||  | || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||  | |||||||| |||||||| |||||||| |||    
T  36452 gaaacagttggagaacttgcttgataagaagtttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccgattttgttggttaagaagaaggatggtagcatg 36353  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattga 276  Q
    ||||| |||||||| ||| |||||||||| || ||||| || || || || ||||| |||| |||||||||    
T  36352 aggttatgcattgattattgtcaattgaataaggttacgataaacaacaggtatccacttctgaggattga 36282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 111; Significance: 4e-56; HSPs: 4)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 56370 - 56092
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||| || || || ||||||||||||||| |||| || || ||||| ||||| ||| |||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  56370 cagagagagaagttgaattttcaattgaccttattccgggtacgaagcctgtgtctatgacaccttaccgtatgtcagtttctgagttggctgagttgaa 56271  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    ||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |  || ||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  56270 gaaacagttagaagatttgcttgataagaagtttgtaagaccaagtgtttcaccgtggggagcgcacgttttgttagtaaagaagaaagatggtagtatg 56171  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    || ||||| ||||||| |||  | ||||||||| |    || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  56170 agattgtgtattgactgtcggtagttgaacaaaatgttgataaagaataggtatccacttccgagaattgatgacttga 56092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 39 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 41212 - 40969
Alignment:
Q  39 ttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaagagttacttgataagaagtt 138  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| ||| |||| ||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||    
T  41212 ttccgggaacgaagcctgtgtctatgacaccttacc--atgtcagcttctgagttggctgagttgaagaaacacttagaagatttgcttgataagaagtt 41115  T
Q  139 tgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaa 238  Q
    ||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||  | ||  | || |||||||| |||||||||| ||| ||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  41114 tgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccaatttttctagttaagaagaaagatggtagtacgagattgtgtattgactatcgacagttgaacaaa 41015  T
Q  239 gttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    || ||||| |||||||| ||||| ||||| || | |||||||||||    
T  41014 gtaacaataaagaataggtatccacttccaagaactgatgacttga 40969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 39 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 74932 - 74689
Alignment:
Q  39 ttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaagagttacttgataagaagtt 138  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| ||| |||| ||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||    
T  74932 ttccgggaacgaagcctgtgtctatgacaccttacc--atgtcagcttctgagttggctgagttgaagaaacacttagaagatttgcttgataagaagtt 74835  T
Q  139 tgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaa 238  Q
    ||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||  | ||  | || |||||||| |||||||||| ||| ||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  74834 tgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccaatttttctagttaagaagaaagatggtagtacgagattgtgtattgactatcgacagttgaacaaa 74735  T
Q  239 gttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    || ||||| |||||||| ||||| ||||| || | |||||||||||    
T  74734 gtaacaataaagaataggtatccacttccaagaactgatgacttga 74689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #4
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 59 - 284
Target Start/End: Original strand, 8570 - 8795
Alignment:
Q  59 tcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcac 158  Q
    ||||| || ||||| || ||||| || || ||||| | |||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| ||||| ||||||| |||||||| |    
T  8570 tcgattgcgccgtatcggatgtctgcatcagagttgggtgaattgaagaatcagttggaagagttgcttgagaagcagtttattagaccaagtgtttcgc 8669  T
Q  159 cgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagata 258  Q
    ||||||| || || |||||||| || |||||||| ||||| || |||||||||||  | || ||||| || ||||||||  | || ||||||||| | ||    
T  8670 cgtggggtgctccagtgttgttagttaagaagaaagatgggagcatgaggttgtgtgtggattatcggcagttgaacaatttgactattaagaatcggta 8769  T
Q  259 tccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    ||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  8770 tccacttccaaggattgatgatttga 8795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0375 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0375
Description:

Target: scaffold0375; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 44 - 261
Target Start/End: Original strand, 2656 - 2873
Alignment:
Q  44 ggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgtta 143  Q
    ||||| |||||||||||||||||||  || |||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||    
T  2656 ggaacgaagccggtgtcgatggcacgttatcgtatgtcagcttccgagttagctaagttgaagaaacagttagaagatttgcttgagaagaagtttgtta 2755  T
Q  144 gacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttac 243  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| || || ||||  || |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||    
T  2756 gaccaagtgtttcaccttggggagcgccggttttgtaagtaaagaagaaagatggtagtatgaggttgtgtattgattatcgtcagttgaacaaagtaac 2855  T
Q  244 aattaagaatagatatcc 261  Q
     || |||||||| |||||    
T  2856 tatcaagaataggtatcc 2873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 109; Significance: 7e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 20 - 276
Target Start/End: Original strand, 6792 - 7048
Alignment:
Q  20 gagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaag 119  Q
    ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||| |||| ||| ||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| || ||||    
T  6792 gagttctcgattgaccttgttccgggaacgaagcctgtgtctatgacaccttactgtatgtcagcttctgagttggttgagttgaagaaacaattagaag 6891  T
Q  120 agttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattga 219  Q
    | || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||    
T  6892 attttcttgataagaagtttgtaagaccaagtgtttcaccgtggggagcgcccgttttgttagtgaagaagaaagatggcagtatgagattgtgtattga 6991  T
Q  220 ctatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattga 276  Q
     ||||| || || |||||||| || || |||||||| ||||| ||||| || |||||    
T  6992 ttatcgacagttaaacaaagtgacgataaagaataggtatccacttccaagaattga 7048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 109; Significance: 7e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 8 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 5362 - 5094
Alignment:
Q  8 gagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaaga 107  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| || || ||  | |||||||||||||    
T  5362 gagagtgaggttgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtcggcgtccgaacttgctgaattgaaga 5263  T
Q  108 aacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgag 207  Q
    || ||||||| || || ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||    
T  5262 aatagttggaggacttgcttgataagaagtttgtaagacaaagtgtttcaccttggggagcgctggtgttgttggttaagaagaatgatggtaccatgag 5163  T
Q  208 gttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattga 276  Q
    ||| |||||||| || || || ||||| || ||||| || ||||| || ||||| |||||||| |||||    
T  5162 gttatgcattgattaccgacagttgaataaggttacgataaagaacaggtatccacttccgagaattga 5094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 56 - 273
Target Start/End: Original strand, 41848 - 42065
Alignment:
Q  56 gtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgttt 155  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||  |||| || || ||  | |||||||||||||| ||| | ||||| |    
T  41848 gtgtcgatggcaccttaccgtatgtcagcttcggaattagctgagttgaaaaagtagttagacgatttgttggataagaagtttgtgagatcgagtgtgt 41947  T
Q  156 caccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatag 255  Q
    |||| ||||||||  | ||||||||||| |||||||| |||||||| |||| |||||| || || || || || ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  41948 caccttggggagcgtcggtgttgttggttaagaagaaagatggtagcatgaagttgtgtatagattaccggcagttgaacaaagtgacaataaagaatag 42047  T
Q  256 atatccgcttccgaggat 273  Q
     ||||| |||| ||||||    
T  42048 gtatccacttctgaggat 42065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 4047 - 3769
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||| || || || ||||| ||| | |||||||| ||||| ||||| ||||| ||| |||| || |||||||||||||| |||||||| || |||||    
T  4047 cagagagagaagttgaattttctattaatcttgttcctggaacgaagcctgtgtctatgacaccttatcgtatgtcagcttcagagttagcggagttgaa 3948  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    |||||| || ||||| || ||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||| || | ||||||||||| || |||||||| |||||||| |||    
T  3947 gaaacaattagaagatttgcttgagaaaaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggcgaacgcctgtgttgttagtaaagaagaaggatggtagcatg 3848  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||| |||| |||||||| ||||    
T  3847 aggttgtgtattgattatcgacagttgaacaaagtaacaataaagaataggtatccactttcgagaattgatgatttga 3769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0393 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0393
Description:

Target: scaffold0393; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Original strand, 15685 - 15963
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    |||||||| | || ||||||||  |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| || ||| | || |||||    
T  15685 cagagaggtaagttgagttttctgttgatcttgttcctggaacgaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtctgcttccgaattatcagagttgaa 15784  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    ||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||  | ||| | || |||||||| ||||||||||||    
T  15785 gaaacagttggaagatttgcttgagaagaaatttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccaattttgctagtaaagaagaaagatggtagtatg 15884  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    ||||| || ||||| ||||| || |||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  15885 aggttatgtattgattatcgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttga 15963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0312 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0312
Description:

Target: scaffold0312; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 674 - 396
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||| || || |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||| |||| || |||||||||||||||||||| || || |||||    
T  674 cagagagagaagttgagttttcgattgatcttgttcctggaacgaagcctgtgtctatgacaccttatcgtatgtcagcttctgagttggccgagttgaa 575  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    |||||| || |||||  | ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| || || ||| | || |||||||| |||||||| |||    
T  574 gaaacaattagaagatctccttgagaagaagtttgttagaccaagtgtttcgccttggggagcgccggttttgctagtaaagaagaaagatggtagcatg 475  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    || ||||| ||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  474 agattgtgtattgactatcgacagttgaacaaggtgacaataaagaataggtatcaacttccaaggattgatgacttga 396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 6 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 12409 - 12139
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||    
T  12409 cagagagggaggttgaattttcaatcgatcttgtgcccggaacgaagccggtgtcgatggcaccttaccgtatgtctgcgtccgagttagctgaattgaa 12310  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    |||||||||||| || || ||||||||||| ||| | |||||  |||||||||| |||||||| || || |||||||| |||||||| |||||||| |||    
T  12309 gaaacagttggaggatttccttgataagaaatttataagaccgggtgtttcaccatggggagcgccggtattgttggttaagaagaaggatggtagcatg 12210  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattga 276  Q
    ||||| || || || || |  ||| |||| ||||| || || ||||| || ||||| |||||||| |||||    
T  12209 aggttatgtatagattaccaacaactgaataaagtgacgataaagaacaggtatccacttccgagaattga 12139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 230 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 17032 - 16978
Alignment:
Q  230 ttgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  17032 ttgaacaaggtgacaataaagaataggtatccacttccgaggattgatgatttga 16978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 9 - 210
Target Start/End: Original strand, 49571 - 49770
Alignment:
Q  9 agagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaa 108  Q
    |||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||    
T  49571 agagggaggttgaattttcaattgatcttgtgcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccttaccgtatgtcggcgtccgagttagccgaattgaagaa 49670  T
Q  109 acagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgagg 208  Q
    ||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||  ||||||||| || || |||||||| |||||||| |||||||| ||||||    
T  49671 acagttggaggatttgcttgataagaaatttgtaagaccgagtgtttca--gtggggagcgccggtattgttggttaagaagaaggatggtagcatgagg 49768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2004 (Bit Score: 106; Significance: 4e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold2004
Description:

Target: scaffold2004; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 23 - 284
Target Start/End: Original strand, 521 - 782
Alignment:
Q  23 ttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaagagt 122  Q
    ||||| ||||| ||||||||  |||| ||| | ||||| ||| |||| || ||||||| |||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |    
T  521 ttttctattgatcttgttcctagaacgaaggctgtgtctatgacaccttatcgtatgttagcttctgagttggccgagttgaagaaacaattagaagatt 620  T
Q  123 tacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattgacta 222  Q
    | ||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||    
T  621 tgcttgagaaaaagtttgttagaccaagtgtttcaccatggggagcgcctgtgttgttagtaaagaagaaggatggtagcatgaggttgtgtattgatta 720  T
Q  223 tcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    ||| || ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  721 tcgacagttgaaaaaagtaacaataaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttga 782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0331 (Bit Score: 106; Significance: 4e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0331
Description:

Target: scaffold0331; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 23 - 284
Target Start/End: Original strand, 15686 - 15947
Alignment:
Q  23 ttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaagagt 122  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |    
T  15686 ttttcgattgatcttgttccgggaacgaagcctgtgtctatgacgccttaccgtatgtcagcttctgagttggccgagttgaagaaacaattagaagatt 15785  T
Q  123 tacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattgacta 222  Q
    | ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| |||||||| || || ||| | || |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||    
T  15786 tgcttgataagaagtttgtgagaccaagtgttccaccttggggagcgccggtattgctagttaagaagaaagatgctagtatgaggttgtgtattgatta 15885  T
Q  223 tcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    ||| || ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  15886 tcgacagttgaataaagtgacaataaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttga 15947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 106; Significance: 4e-53; HSPs: 3)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 23 - 284
Target Start/End: Original strand, 24006 - 24267
Alignment:
Q  23 ttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaagagt 122  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||   ||||| ||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |    
T  24006 ttttcgattgatcttgttccgggattgaagcctgtgtctatgacaccttaccgtatgtcggcttctgagttagctgaattgaagaaacaattagaagatt 24105  T
Q  123 tacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattgacta 222  Q
    | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||| | || |||||||| |||||||| ||||| || || ||||| ||    
T  24106 tgcttgataagaagtttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcaccggtattgctagttaagaagaaagatggtagcatgagattatgtattgatta 24205  T
Q  223 tcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    ||| || ||||| || || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  24206 tcgacagttgaataaggtaacgataaagaataggtatccacttccgagaattgatgacttga 24267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 14 - 168
Target Start/End: Original strand, 10050 - 10204
Alignment:
Q  14 gaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagt 113  Q
    ||||| || ||||| ||||| |||||||| || || ||||| ||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| | |    
T  10050 gaggttgaattttctattgatcttgttccgggtacgaagcctgtgtctatgacgccttaccgtatgtcagcttctgagttggccgaattgaagaaataat 10149  T
Q  114 tggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagc 168  Q
    |  |||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  10150 tacaagatttgcttgataagaagtttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagc 10204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 176 - 284
Target Start/End: Original strand, 10602 - 10710
Alignment:
Q  176 ttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattg 275  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| |||| ||||| || ||||| || || || || |||||||| ||||| ||||| || | ||    
T  10602 ttgttggttaagaagaaagatggtagtatgaggttatgccttgattatcgacagttgaataaggtaacgataaagaataggtatccacttccaagaactg 10701  T
Q  276 atgacttga 284  Q
    |||| ||||    
T  10702 atgatttga 10710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 8 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 51423 - 51155
Alignment:
Q  8 gagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaaga 107  Q
    ||||||||||| || |||||||| || ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || |||||||||||| |||||||||    
T  51423 gagagggaggttgaattttcaatcgatcttgtgcccagaacaaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtcggcgtctgagttagctaaattgaaga 51324  T
Q  108 aacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgag 207  Q
    |||| || ||||| |||||||||||||| | ||| ||| | |||||||||| ||||||||| || || |||||| | |||||||| |||||||| |||||    
T  51323 aacaatttgaagatttacttgataagaaatatgtaagatcgagtgtttcactgtggggagcgccggtattgttgtttaagaagaaggatggtagcatgag 51224  T
Q  208 gttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattga 276  Q
    |||||| || || || |||||  |||| ||||| || || |||||||| ||||| ||| |||| |||||    
T  51223 gttgtgtatagattaccgtcagctgaagaaagtgacgataaagaataggtatccactttcgagaattga 51155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 80 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 31455 - 31280
Alignment:
Q  80 tcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgt 179  Q
    |||||||| ||||| || |||||||||||||| || ||||| || ||||| || |||||| ||||||| ||| |||| || |||||||| || || ||||    
T  31455 tcagcttcagagttggccgaattgaagaaacaattagaagatttgcttgagaaaaagttttttagaccaagtttttcgccttggggagcgccggttttgt 31356  T
Q  180 tggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatag 255  Q
    | ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||  | ||||| ||||||||    
T  31355 tagtgaagaagaaggatggtagcatgaggttgtgtattgattatcgacagttgaacaagatgacaataaagaatag 31280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1530 (Bit Score: 104; Significance: 7e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold1530
Description:

Target: scaffold1530; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 6 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 196 - 1
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    |||| |||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| || || ||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  196 cagaaagggaggttgaattttcaattgaacttgttccaggaacgaagccggtgtcgatgacaccttatcgcatgtcagcttccgagttagctgagttgaa 97  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtag 201  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| || || |||||||| |||||||| ||||||||    
T  96 gaaacagttggaagacttgcttgataagaagtttgtaagaccaagtgtctcaccttggggagcgccggtattgttggtaaagaagaaggatggtag 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0431 (Bit Score: 104; Significance: 7e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0431
Description:

Target: scaffold0431; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 20 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 9967 - 9708
Alignment:
Q  20 gagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaag 119  Q
    |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||| || ||| |||| |||||||||||||||||||    
T  9967 gagttttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtgtcgatggaaccatatcgtatgtctgcttccgaattatctgagttgaagaaacagttggaag 9868  T
Q  120 agttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattga 219  Q
    | || ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||| | || |||||||| ||||||||||||||| | || |||||    
T  9867 acttgcttgagaagaaatttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggttttgctagtaaagaagaaagatggtagtatgaggctatgtattga 9768  T
Q  220 ctatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatga 279  Q
     || || || |||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  9767 ttaccgacagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatga 9708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 103; Significance: 3e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 50 - 284
Target Start/End: Original strand, 14956 - 15190
Alignment:
Q  50 aagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagaccca 149  Q
    ||||| ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||| |||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||| |    
T  14956 aagcctgtgtctatgacaccttaccgtatgtcagcttctgagttggcggagttgaagaaatagttagaagatttacttaataagaagtttgtaagaccaa 15055  T
Q  150 gtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaa 249  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||| |  ||||| ||||| ||||| ||    
T  15056 gtgtttcaccgtggggagcgccggtattgttagttaagaagaaagatggtagcatgaggttatgcattgattatcgacggttgaagaaagtaacaataaa 15155  T
Q  250 gaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    |||||| ||| | ||||| || |||||||||||||    
T  15156 gaataggtatacacttccaagaattgatgacttga 15190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 103; Significance: 3e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 18263 - 17985
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||| || || || ||||| ||||| ||| |||| ||||| ||||| ||||| ||| |||| || ||||||| |||||||||||| || || |||||    
T  18263 cagagagagaagttgaattttctattgatcttattcctggaacgaagcctgtgtctatgacaccttatcgtatgttagcttctgagttggccgagttgaa 18164  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    |||||| || ||||| || ||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| |||    
T  18163 gaaacaattagaagatttgcttgagaaaaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcacccgttttgttagtgaagaagaaagatggtagcatg 18064  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    || ||||  ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |  |||||||||||||    
T  18063 agattgtttattgattatcgacagttgaacaaagtaacaataaagaataggtatccacttccaataattgatgacttga 17985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0177 (Bit Score: 103; Significance: 3e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0177
Description:

Target: scaffold0177; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Original strand, 12047 - 12325
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    |||||||||| || |||||||| ||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||| |||| || |||||||| ||||| ||||||| ||| |||||    
T  12047 cagagagggaagtcgagttttctattgatcttgtccctggaacgaagctggtgtcgatgacaccttatcgtatgtctgcttccgagttagatgagttgaa 12146  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    |||||| || ||||| || || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |  || ||| | || |||||||| |||||||| |||    
T  12147 gaaacaattagaagatttgctcgagaagaaatttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgctagttttgctagtaaagaagaaagatggtagcatg 12246  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    || ||||| |||||||||||||| |||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  12247 agattgtgtattgactatcgtcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttga 12325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0575 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0575
Description:

Target: scaffold0575; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 23 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 4179 - 3918
Alignment:
Q  23 ttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaagagt 122  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||  ||||| ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |    
T  4179 ttttcgattgatcttgttccgggaacgaagcttgtgtctatgacaccttatcgtatgtcagcttctgagttagctgagttgaagaaacaattagaagatt 4080  T
Q  123 tacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattgacta 222  Q
    | ||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||| | || |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||    
T  4079 tgcttgagaaaaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggttttgctagtaaagaagaaagatggtagtatgagattgtacattgacta 3980  T
Q  223 tcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    | |  | ||||||||||| || || || ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||    
T  3979 ttggtagttgaacaaagtaacgataaaaaataggtatccacttccaagaattgatgacttga 3918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0379
Description:

Target: scaffold0379; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 23 - 284
Target Start/End: Original strand, 5597 - 5858
Alignment:
Q  23 ttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaagagt 122  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||| |  || ||||||||||| || ||||| |    
T  5597 ttttcgattgatcttgttccaggaacaaagcctgtgtctatgacaccttaccgtatgtcggcttctgagttggtcgagttgaagaaacaattagaagatt 5696  T
Q  123 tacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattgacta 222  Q
    | || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| |||||||| |||||||| || ||||| ||    
T  5697 tgctggataagaagtttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgcccgttttgttagttaagaagaaagatggtagcatgaggttatgtattgatta 5796  T
Q  223 tcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    ||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||    
T  5797 tcgacaattgaataaagtaacgataaagaataggtatccacttccaagaattgacgacttga 5858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 6 - 279
Target Start/End: Original strand, 4580 - 4853
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    |||| ||||| || || ||||||||||| |||||||  || || ||||| ||||||||||| || ||||||||||| || ||| || ||||||| |||||    
T  4580 cagaaagggaagttgaattttcaattgatcttgttctgggtacgaagcctgtgtcgatggcgccttaccgtatgtcggcgtctaagctagctgagttgaa 4679  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| | |||||| ||  | |||||||| |||||||| |||||||  |||    
T  4680 gaaacagttggaggatttacttgataagaaatttgtaagaccgagtgtttcaccttagggagcgccgatattgttggttaagaagaaagatggtatcatg 4779  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatga 279  Q
    ||||||||||| || || |||||| |||| ||||| || || |||||||||||||| |||| ||| ||||||||    
T  4780 aggttgtgcatagattaccgtcaactgaataaagtgacgataaagaatagatatccacttctgagaattgatga 4853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 101; Significance: 4e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 6 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 20853 - 20577
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||| || || || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| | ||| ||| |||| || |||||| ||||||||||||| || || |||||    
T  20853 cagagagagaagttgaattttctattgatcttgttcctggaacgaagcctgcgtctatgacaccttatcgtatgccagcttctgagttggccgagttgaa 20754  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    |||||| || ||||| || || || || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||  | ||||| ||||||||||| |||||||| |||    
T  20753 gaaacacttagaagatttgctcgagaaaaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccaatcttgttagtgaagaagaaagatggtagcatg 20654  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgactt 282  Q
    || ||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||||||    
T  20653 agattgtgtattgactatcgacagttgaacaaagtgacaataaagaataggtatccacttccaagaattgatgactt 20577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 99; Significance: 6e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 8635 - 8357
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    |||||||||| || || ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||  |||| ||| |||| || |||||||||||||||||||| || || |||||    
T  8635 cagagagggaagttgaattttctattgatcttgttcctggaacgaagcctatgtctatgacaccttatcgtatgtcagcttctgagttggccgagttgaa 8536  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    |||||| ||  | || || ||||| || |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| || ||  |||| ||||||||||| |||||||| |||    
T  8535 gaaacaattaaaggatttgcttgagaaaaagtttgttagaccaagtctttcaccttggggagcgccggttctgttagtgaagaagaaggatggtagcatg 8436  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    |||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  8435 aggttgtgtattgattatcgacagttgaataaagtgacaataaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttga 8357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 97 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 24700 - 24513
Alignment:
Q  97 tgaattgaagaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgat 196  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||| ||||| | || |  |||||||| |||||||| || || ||||||||||| |||||||| |||    
T  24700 tgaattgaagaagcagttagaagagttgcttgagaagcagtttatcaggctgagtgtttctccgtggggtgctccagtgttgttggttaagaagaaagat 24601  T
Q  197 ggtagtatgaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    || || |||||||||||  | || | ||| || |||||||| || || ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  24600 ggaagcatgaggttgtgtgtggattttcggcagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccgcttccaaggattgatgatttga 24513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 99; Significance: 6e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Original strand, 17757 - 18035
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||| || || |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  |||| ||||||||||| |||||    
T  17757 cagagagagaagtcgagttttctattgatcttgttcctggaacgaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtctacttccgagttagctgagttgaa 17856  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    ||||||||| ||||| || | ||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||| | ||||||||||  |||||||| |||    
T  17857 gaaacagttagaagattttcctgagaagaaattttttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccagttttgctagtgaagaagatagatggtagcatg 17956  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    || ||||| ||||| || | ||| ||||||||||| || || || ||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||    
T  17957 agattgtgtattgattaccatcagttgaacaaagtaactatcaaaaataggtatccactaccgagaattgatgatttga 18035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 74 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 58562 - 58352
Alignment:
Q  74 cgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctg 173  Q
    |||||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| ||| ||||||| |||||||| || |    
T  58562 cgtatgtctgcttcctagttagctgagttgaagaaacagttagaagatttgctcgaaaagaaatttgttagaccaagtatttcaccttggggagcgccag 58463  T
Q  174 tgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggat 273  Q
    | ||| | || |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| ||    
T  58462 ttttgctagtaaagaagaaagatggtagcatgagattgtgcattgactatcgtcagttgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttccgagaat 58363  T
Q  274 tgatgacttga 284  Q
    |||||| ||||    
T  58362 tgatgatttga 58352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0993 (Bit Score: 98; Significance: 3e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0993
Description:

Target: scaffold0993; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 23 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 478 - 217
Alignment:
Q  23 ttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaagagt 122  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||| ||| | ||||| |||  ||| || | ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| |    
T  478 ttttctattgatcttgttcctggaacgaagactgtgtctatgaaaccttatcatatgtcaacttctgagttggctgagttgaagaaacaattagaagatt 379  T
Q  123 tacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattgacta 222  Q
    | ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||| | || |||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||    
T  378 ttcttgagaagaagtttgttagaccaagtgtttcgccttggggagcacccgtgttgctagtaaagaagaaagatggtagtatgagattatgcattgatta 279  T
Q  223 tcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    | |||| ||||| ||||| || || |||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||    
T  278 ttgtcagttgaaaaaagtaactataaagaataggtatccacttccaagaattgatgacttga 217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 98; Significance: 3e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 23 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 1048 - 787
Alignment:
Q  23 ttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaagagt 122  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||| |||| || ||||||| |||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |    
T  1048 ttttctattgatcttgttcctggaacgaagcctgtgtctatgacaccttatcgtatgttagcttctgagttggccgagttgaagaaacaattagaagatt 949  T
Q  123 tacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattgacta 222  Q
    | ||||| || |||||||||||||| ||||||||||| || ||||| || || ||||| || |||||||||||| |||| ||||| ||||| ||||||||    
T  948 tgcttgagaaaaagtttgttagaccaagtgtttcaccttgaggagcgccagttttgttagtaaagaagaatgatagtagcatgagattgtgtattgacta 849  T
Q  223 tcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    ||| ||  |||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  848 tcgacagctgaataaagtaacaataaagaataggtatccacttccgagaattgataacttga 787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0181 (Bit Score: 98; Significance: 3e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0181
Description:

Target: scaffold0181; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 7 - 284
Target Start/End: Original strand, 29608 - 29884
Alignment:
Q  7 agagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaag 106  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||  |||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||    
T  29608 agagagggaagttgagttttctattgatcttgttcctggaacgaaatcggtgtcgatggcaccttatcgtatgtctgcttccgagttagttgagttgaag 29707  T
Q  107 aaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatga 206  Q
    |||||||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||| ||| |||| || |||||||  || || ||| | ||||||||||| |||||||| ||||    
T  29708 aaacagttagaagatttgcttgagaagaa-ttcgttagaccaagtatttctccttggggagtgccagttttgctagtgaagaagaaagatggtagcatga 29806  T
Q  207 ggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    | | ||| |||||||||||| | |||||||||||||  || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  29807 gatcgtgtattgactatcgttagttgaacaaagttagtatcaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttga 29884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 98; Significance: 3e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 23 - 284
Target Start/End: Original strand, 2213 - 2474
Alignment:
Q  23 ttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaagagt 122  Q
    ||||| ||||| || ||||| || || || || ||||| ||| |||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |    
T  2213 ttttcgattgatctggttccgggtacgaaccctgtgtctatgacaccttaccatatgtcggcttctgagttggctgagttgaagaaacagttagaagatt 2312  T
Q  123 tacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattgacta 222  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||| ||  | ||| | || |||||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||    
T  2313 tacttgataagaagtttgtaagacgaagtgtttcaccttggggagcgccgatattgctagttaagaagaaagatggtagcatgagattatgcattgatta 2412  T
Q  223 tcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    ||| || ||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  2413 tcgacagttgaacaaagtaacgataaagaataggtatccacttccgagaattgatgacttga 2474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 104 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 151627 - 151447
Alignment:
Q  104 aagaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagta 203  Q
    |||||||| || ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||| |||| || |||| ||| || || ||| ||||||||||||| |||||||| |    
T  151627 aagaaacaattagaagatttacttgagaaaaagtttgttagaccaagtatttcgccttgggtagcgccggttttgctggtgaagaagaaagatggtagca 151528  T
Q  204 tgaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    |||| ||||| ||||||||| | || |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  151527 tgagattgtgtattgactattgacagttgaacaaggtgacaataaagaataggtatccacttccgaggattgatgatttga 151447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 98; Significance: 3e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 23 - 284
Target Start/End: Original strand, 217128 - 217389
Alignment:
Q  23 ttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaagagt 122  Q
    ||||| ||||| ||| |||| || || ||||| ||||  ||| |||| |||| |||||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |    
T  217128 ttttcgattgatcttattccgggtacgaagcctgtgtttatgacaccttaccatatgtatgcttctgagttggctgagttgaagaaacagttagaagatt 217227  T
Q  123 tacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattgacta 222  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  ||  | ||| | || |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||    
T  217228 tacttgataagaagtttgtaagaccaagtgtttcaccgtggggagtgccgatattgctagttaagaagaaagatggtagtatgagattgtgtattgatta 217327  T
Q  223 tcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    ||| |||||||||||||| || || |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||    
T  217328 tcgacaattgaacaaagtgacgataaagaataggtatccacttccaagaattgatgatttga 217389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0282
Description:

Target: scaffold0282; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 23 - 267
Target Start/End: Original strand, 14187 - 14431
Alignment:
Q  23 ttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaagagt 122  Q
    ||||| ||||| |||||||| || || ||||| ||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| |||| ||||| |    
T  14187 ttttcgattgatcttgttcctggtacgaagcctgtgtctatgacaccttaccgtatgtcggcttctgagttggctgagttgaagaaaaagttagaagatt 14286  T
Q  123 tacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattgacta 222  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||  | ||| | || |||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||    
T  14287 tacttgataagaagtttgtaagaccaagtgtttcaccgtggagagcgccgatattgctagttaagaagaaagatggtagcatgaggttatgcattgatta 14386  T
Q  223 tcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttcc 267  Q
    ||| || ||||| ||||| || || ||||||| |||||| |||||    
T  14387 tcgacacttgaataaagtaacgataaagaataaatatccacttcc 14431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 66 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 15023 - 14805
Alignment:
Q  66 caccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtgggg 165  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  15023 caccttaccgtatgtcggcttctgatttggctgagttgaagaaacagttagaagatttacttgataagaagtttgtaagaccaagtgtttcaccgcgggg 14924  T
Q  166 agcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgctt 265  Q
    |||||  || ||  | || |||||||| |||||||| |||||||| |||||||| || |||||| |||| ||||| || || |||||||| ||||| |||    
T  14923 agcactggtattactagttaagaagaaagatggtagcatgaggttatgcattgattaccgtcaagtgaataaagtgacgataaagaataggtatccactt 14824  T
Q  266 ccgaggattgatgacttga 284  Q
    || || |||||||||||||    
T  14823 ccaagaattgatgacttga 14805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 94; Significance: 6e-46; HSPs: 3)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 23 - 284
Target Start/End: Original strand, 8742 - 9003
Alignment:
Q  23 ttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaagagt 122  Q
    ||||| ||||| |||||||| || || ||||| ||||| ||  |||| ||||||||||| |||||||||||  | || |||||||||||||| ||||| |    
T  8742 ttttcgattgatcttgttccgggtacgaagcctgtgtctataacaccttaccgtatgtcggcttctgagttgaccgagttgaagaaacagttagaagatt 8841  T
Q  123 tacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattgacta 222  Q
    ||||  ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||  | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8842 tactcaataagaagtttgtaagaccgagtgtttcaccttggggagccccgatatttttggttaagaagaaagatggtagtatgaggttatgcattgacta 8941  T
Q  223 tcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    ||| || ||||  ||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||    
T  8942 tcgacagttgagtaaagtaacgataaagaataggtatccacttccaaggatagatgatttga 9003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 23 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 6934 - 6673
Alignment:
Q  23 ttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaagagt 122  Q
    ||||| ||||| |||||||| || || ||||| ||||| ||| |||| ||||||||||| |||||||||||  | || |||||||||||||| ||||| |    
T  6934 ttttcgattgatcttgttccgggtacgaagcctgtgtctatgacaccttaccgtatgtcggcttctgagttgaccgagttgaagaaacagttagaagatt 6835  T
Q  123 tacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattgacta 222  Q
    ||||  ||||||||||||| | ||| ||||||||||| |||||||  ||  | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6834 tactcaataagaagtttgtaacaccgagtgtttcaccttggggagtgccgatatttttggttaagaagaaagatggtagtatgaggttatgcattgacta 6735  T
Q  223 tcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    ||| || ||||  ||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||    
T  6734 tcgacagttgagtaaagtaacgataaagaataggtatccacttccaaggatagatgatttga 6673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083; HSP #3
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 179 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 1474 - 1369
Alignment:
Q  179 ttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatg 278  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||  ||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||    
T  1474 ttggttaagaagaaagatggtagtatgaggttatgcattgactatcgacagttgagtaaagtaacgataaagaataggtatccacttccaaggatagatg 1375  T
Q  279 acttga 284  Q
    | ||||    
T  1374 atttga 1369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 8 - 284
Target Start/End: Original strand, 114731 - 115007
Alignment:
Q  8 gagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaaga 107  Q
    |||||||| || || ||||  ||||| |||||||| || || ||||  ||||  ||||| || || |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  114731 gagagggaagttgaatttttgattgatcttgttccgggtacgaagcttgtgtttatggcgccatatcgtatgtcggcttctgagttggctgagttgaaga 114830  T
Q  108 aacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgag 207  Q
    |||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| |  | || ||||| || |||||||| |||||||| |||||    
T  114831 aacaattagaagatttacttgataagaagtttgtaagaccgagtgtttcaccttggggatcgtcggtattgttagttaagaagaaagatggtagcatgag 114930  T
Q  208 gttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    ||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| || || |||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||    
T  114931 gttatgcattgattatcgacagttgaataaagtaacgataaagaataggtatccacttccaagaattgatgacttga 115007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 23 - 284
Target Start/End: Original strand, 12919 - 13180
Alignment:
Q  23 ttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaagagt 122  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||  |||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |    
T  12919 ttttcgattgatcttgttccgggaacgaagcctgtgtctataacaccttatcgtatgtcagcttctgagttagctgagttgaagaaacaattagaagatt 13018  T
Q  123 tacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattgacta 222  Q
    | |||| ||| |||||||| ||||| ||||||||||  |||||||| || || ||| | || |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||    
T  13019 tgcttggtaaaaagtttgtaagaccaagtgtttcacgttggggagcgccggttttgctagttaagaagaaagatggtagcatgagattgtgtattgatta 13118  T
Q  223 tcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    ||  || ||||||||||| || || |||||||  ||||| ||||| || |||||||||||||    
T  13119 tccgcagttgaacaaagtaacgataaagaataagtatccacttccaagaattgatgacttga 13180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 23 - 284
Target Start/End: Original strand, 24653 - 24914
Alignment:
Q  23 ttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaagagt 122  Q
    ||||| ||||| |||||||| || || ||||| ||||| ||| |||| || |||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||  | ||||| |    
T  24653 ttttcgattgatcttgttccgggtacgaagcctgtgtctatgacaccttatcgtatgtcagcttccgagttagctaagttgaagaaacaaatagaagatt 24752  T
Q  123 tacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattgacta 222  Q
    | || || || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  24753 tgctcgagaaaaagtttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgcctgtcttgttagtaaagaagaaggatggtagcatgagattgtgtattgacta 24852  T
Q  223 tcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    ||| || ||||||||| | || || |||||||| ||||| |||||||  |||||||| ||||    
T  24853 tcgacagttgaacaaaataacgataaagaataggtatccacttccgataattgatgatttga 24914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 6 - 120
Target Start/End: Original strand, 10463 - 10577
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    |||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  10463 cagaaagggaggttgaattttcaattgaccttgttccaggaacgaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagcttccgagttagctgagttgaa 10562  T
Q  106 gaaacagttggaaga 120  Q
    |||||||||||||||    
T  10563 gaaacagttggaaga 10577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 23 - 284
Target Start/End: Original strand, 41213 - 41474
Alignment:
Q  23 ttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaagagt 122  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||  ||||| ||| |||| || |||||||||||||||||||| || || ||||||||||| || || || |    
T  41213 ttttctattgatcttgttcctggaacgaagcatgtgtctatgacaccttatcgtatgtcagcttctgagttggccgagttgaagaaacaattagaggatt 41312  T
Q  123 tacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattgacta 222  Q
    | ||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||  |||| |||||||||||  ||||||  ||||| ||||| ||||||||    
T  41313 tgcttgagaaaaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggttctgttagtgaagaagaaaaatggtatcatgagattgtgtattgacta 41412  T
Q  223 tcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    ||| || |||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  41413 tcgacagttgaacaaggtgaccataaagaataggtatccacttccgagaattgatgatttga 41474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 87; Significance: 9e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Original strand, 470 - 748
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    |||||||||| || || ||| | ||||| |||||||| ||||  ||||| ||||| ||| |||| || |||||||||||||||||||| |  || |||||    
T  470 cagagagggaagttgaatttgctattgatcttgttcctggaatgaagcctgtgtctatgacaccttatcgtatgtcagcttctgagttggacgagttgaa 569  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    |||||| || || || || ||||| || |||||||||||||| |||||||| || |||||||| || || ||||| ||||||||||| |||||||| |||    
T  570 gaaacaattagaggatttgcttgagaaaaagtttgttagaccaagtgtttcgccttggggagcgccggttttgttagtgaagaagaaggatggtagcatg 669  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    |||||||| ||||| || || || ||||| || || ||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||    
T  670 aggttgtgtattgattaccgacagttgaataaggtaacaataaagaataggtatccacttccaagaattgatgatttga 748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 87; Significance: 9e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Original strand, 7350 - 7628
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    |||||||||| || || ||||| |||||  ||||||| ||||| ||||| |||||  || |||| || |||||||||||||||||||| || || |||||    
T  7350 cagagagggaagttgaattttcgattgatattgttcctggaacgaagcctgtgtctgtgacaccttatcgtatgtcagcttctgagttggccgagttgaa 7449  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    |||||| || |||||  | ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||| |||||||| || || ||| | || |||||||| |||||||| |||    
T  7450 gaaacaattagaagatctgcttgagaagaaatttgttagaccaagtatttcaccttggggagcgccggttttgctagtaaagaagaaagatggtagcatg 7549  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    || ||||| ||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||| | || |||||||| ||||    
T  7550 agattgtgtattgactatcgacagttgaacaaggtgacaataaagaataggtatccactttcaagaattgatgatttga 7628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 83 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 3437 - 3236
Alignment:
Q  83 gcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttgg 182  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| | || ||||||||||    
T  3437 gcttctgagttggctgaattgaagaaacagttagaagatttgcttgataagaagtttgtaagaccgagtgtttcaccttggggaacgcccgtgttgttgg 3338  T
Q  183 tgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgactt 282  Q
    | |||||||| || ||||| |||||||| || ||||| ||||| || ||||| ||||| || || |||||||| || || ||||| || |||||||| ||    
T  3337 ttaagaagaaagacggtagcatgaggttatgtattgattatcggcagttgaataaagtgacgataaagaataggtacccacttccaagaattgatgattt 3238  T
Q  283 ga 284  Q
    ||    
T  3237 ga 3236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 86; Significance: 4e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 23 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 17474 - 17213
Alignment:
Q  23 ttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaagagt 122  Q
    ||||| ||||| |||||||| || || ||||| ||||  ||| | || ||||||||||| |||||| ||||   ||| |||||||| ||| | ||||| |    
T  17474 ttttcgattgatcttgttccgggtacgaagcctgtgtttatgactccttaccgtatgtcggcttcttagttgattgagttgaagaagcagctagaagatt 17375  T
Q  123 tacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattgacta 222  Q
    | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||  ||||| ||    
T  17374 ttcttgataagaagtttgtaagaccaagtgtttcaccgtggggagcaccggtattgttagttaagaagaaagatggtagtatgagattgtttattgatta 17275  T
Q  223 tcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    ||| || ||||| ||||| || || |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||    
T  17274 tcgacagttgaataaagtaacgataaagaataggtatccacttccaagaattgatgatttga 17213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 20 - 168
Target Start/End: Original strand, 111612 - 111760
Alignment:
Q  20 gagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaag 119  Q
    |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||    
T  111612 gagttttcgattgatcttgttccaggaacgaagcctgtgtctatgacaccttaccgtatgtcagcttctgagttggctgagttgaagaaacaattagaag 111711  T
Q  120 agttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagc 168  Q
    | || ||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  111712 atttgcttgagaaaaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggggagc 111760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 86; Significance: 4e-41; HSPs: 4)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 6 - 167
Target Start/End: Original strand, 52616 - 52777
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||| || || |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  52616 cagagagagaagttgagttttctattgatcttgttcctggaacgaagcctgtgtctatggcaccttatcgtatgtcagcttccgagttagctgagttgaa 52715  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggag 167  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  52716 gaaacagttagaagaattgcttgagaagaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggggag 52777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 89 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 110162 - 109975
Alignment:
Q  89 gagttagctgaattgaagaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaaga 188  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||| || ||||| || || ||||    
T  110162 gagttagccgaattgaagaaacaattggaggagttgcttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcatcgtggggagcgccggtgttatttgttaaga 110063  T
Q  189 agaatgatggtagtatgaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattga 276  Q
    |||| ||||| || | |||||| |||||||| |||||| | |||||||  ||||| || ||||| || |||||||||||||| |||||    
T  110062 agaaggatggcagcacgaggttatgcattgattatcgtaagttgaacatggttacgataaagaacaggtatccgcttccgagaattga 109975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #3
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 176 - 284
Target Start/End: Original strand, 54852 - 54960
Alignment:
Q  176 ttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattg 275  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||||||||| || || |||||||||||||| ||||| || ||||    
T  54852 ttgttagtgaagaagaaagatggtagtatgagattatgtattgattaccgtcagttgaacaaagtaactatcaagaatagatatccacttccaagaattg 54951  T
Q  276 atgacttga 284  Q
    |||| ||||    
T  54952 atgatttga 54960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 6 - 42
Target Start/End: Complemental strand, 110223 - 110187
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcc 42  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  110223 cagagagggaggttgaattttcaattgaccttgttcc 110187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0270
Description:

Target: scaffold0270; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 23 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 6469 - 6209
Alignment:
Q  23 ttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaagagt 122  Q
    ||||| ||||||||| |||| || || ||||| ||||  ||| |||| |||| |||||||||||||||| | ||||| || |||||||| || ||||| |    
T  6469 ttttcgattgaccttattccgggtacgaagcctgtgtttatgacaccttaccatatgtcagcttctgagctggctgagttaaagaaacatttagaagatt 6370  T
Q  123 tacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattgacta 222  Q
    | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||| || || ||  | || |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  6369 tgcttgataagaagtttgtaagaccaagtgtttcaacttggggagcgccggtatttctagttaagaagaaagatggtagtatgagattgtgtattgacta 6270  T
Q  223 tcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttg 283  Q
    ||   | ||||||||||| || || |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||    
T  6269 tcaatagttgaacaaagtaacgataaagaataggtatccacttccaagaattgatgacttg 6209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 23 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 13599 - 13339
Alignment:
Q  23 ttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaagagt 122  Q
    ||||| ||||||||| |||| || || ||||| ||||  ||| |||| |||| |||||||||||||||| | ||||| || |||||||| || ||||| |    
T  13599 ttttcgattgaccttattccgggtacgaagcctgtgtttatgacaccttaccatatgtcagcttctgagctggctgagttaaagaaacatttagaagatt 13500  T
Q  123 tacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattgacta 222  Q
    | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||| || || ||  | || |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  13499 tgcttgataagaagtttgtaagaccaagtgtttcaacttggggagcgccggtatttctagttaagaagaaagatggtagtatgagattgtgtattgacta 13400  T
Q  223 tcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttg 283  Q
    ||   | ||||||||||| || || |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||    
T  13399 tcaatagttgaacaaagtaacgataaagaataggtatccacttccaagaattgatgacttg 13339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 4)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 20 - 284
Target Start/End: Original strand, 84935 - 85199
Alignment:
Q  20 gagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaag 119  Q
    |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||  ||||| ||| |||| || |||||||||||||||||| |  | || ||||||||| | || || |    
T  84935 gagttttcgattgatcttgttcctggaacgaagcatgtgtctatgacaccttatcgtatgtcagcttctgagatgacagagttgaagaaaaaattagagg 85034  T
Q  120 agttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattga 219  Q
    | || || || ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || || ||| | || |||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  85035 atttgctcgagaagaagtttgtcagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggttttgctagtaaagaagaaagatggtagaatgagattgtgtattga 85134  T
Q  220 ctatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    |||||| || |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  85135 ctatcgacagttgaacaaggtgacaataaagaataggtatccacttacgaggattgatgatttga 85199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 59 - 284
Target Start/End: Original strand, 132233 - 132458
Alignment:
Q  59 tcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcac 158  Q
    ||||| || ||||| || ||||| || || ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||| |||||||  || |||| |    
T  132233 tcgattgcgccgtatcggatgtctgcatcagagttgggtgaattgaagaaacagttggaagagttgcttgagaaacagtttattagaccacgtttttcgc 132332  T
Q  159 cgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagata 258  Q
    | ||||| || || ||||||||||| |||||||| ||||| |||| |||||||||  | || ||||| || |||||||||||  | ||||||||| | ||    
T  132333 catggggtgctccagtgttgttggttaagaagaaagatggaagtacgaggttgtgtgtggattatcggcagttgaacaaagtggcgattaagaatcggta 132432  T
Q  259 tccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    ||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  132433 tccacttccaaggattgatgatttga 132458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #3
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 131 - 284
Target Start/End: Original strand, 85612 - 85765
Alignment:
Q  131 aagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattgactatcgtcaat 230  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||| | ||||||||||| |||||||||| ||| ||||| |||||||||||  | |    
T  85612 aagaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtattggtagtgaagaagaaagatggtagtaagagattgtgtattgactatcgatagt 85711  T
Q  231 tgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    ||||||| || || || |||||||| ||||| ||| |||| |||||||| ||||    
T  85712 tgaacaaggtaactatcaagaataggtatccacttacgagaattgatgatttga 85765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #4
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 173 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 26215 - 26104
Alignment:
Q  173 gtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgagga 272  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||  | || |||||||| |||||||  || || ||||||||| | ||||| ||||| ||||    
T  26215 gtgttgttggttaagaagaaagatggaagcatgaggttgtgtgtggattatcgtcagttgaacattgtgacgattaagaatcggtatccacttccaagga 26116  T
Q  273 ttgatgacttga 284  Q
    ||||||| ||||    
T  26115 ttgatgatttga 26104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1423 (Bit Score: 84; Significance: 6e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold1423
Description:

Target: scaffold1423; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 279
Target Start/End: Original strand, 1070 - 1346
Alignment:
Q  7 agagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaag 106  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||| || ||||||| ||||| |||||| || || ||||||    
T  1070 agagagggaagttgagttttcgattgatcttgttcctggaacaaagcctgtgtctatgacaccttatcgtatgttagcttatgagttggccgagttgaag 1169  T
Q  107 aaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatg----atggtagt 202  Q
    ||||| || |||||  ||||||| || |||||||||||||| |||||||| || |||||||| |  || ||| | ||||||||||| |    |||||||     
T  1170 aaacaattagaagatctacttgagaaaaagtttgttagaccaagtgtttcgccttggggagcgctggttttgctagtgaagaagaaagatatatggtagc 1269  T
Q  203 atgaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatga 279  Q
    ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  1270 atgatattgtgtattgactatcgacagttaaacaaggtgacaataaagaaaaggtatccacttccgaggattgatga 1346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0560 (Bit Score: 84; Significance: 6e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0560
Description:

Target: scaffold0560; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Original strand, 8432 - 8711
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||| || || |||||||| ||||| || ||||| || || |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||  || ||| |||| |||||    
T  8432 cagagagagaagttgagttttctattgatctagttcctgggacgaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtctgctttcgaattatctgagttgaa 8531  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctg-tgttgttggtgaagaagaatgatggtagtat 204  Q
    ||||||||||||||| ||  |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  | | ||| | || |||||||| |||||||||||    
T  8532 gaaacagttggaagacttgtttgagaagaaatttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcactggtttttgctagtaaagaagaaagatggtagtat 8631  T
Q  205 gaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    |||| | || | ||| ||||| |||||||| || || || || ||||||||  |||| |||||||| |||||||| ||||    
T  8632 gaggctatggaatgattatcgacaattgaagaaggtaactatcaagaataggaatccacttccgagaattgatgatttga 8711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0550 (Bit Score: 84; Significance: 6e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0550
Description:

Target: scaffold0550; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Original strand, 10849 - 11128
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||| || || |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||  | | || |||||||| ||||| ||||||||||  |||||    
T  10849 cagagagagaagttgagttttctattgatcttgttcctggaacgaagccgatgtcgatgaaaacttatcgtatgtctgcttccgagttagctgtgttgaa 10948  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatg 205  Q
    ||| ||||| ||||| || || || || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||| | ||||||||||| |||||||| |||    
T  10949 gaatcagttagaagatttgctcgagaaaaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccagttttgctagtgaagaagaaagatggtagcatg 11048  T
Q  206 aggttgtgcattgactatcgtcaattgaac-aaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    || ||||| || || || | ||| |||||| ||||| || |||||||| || ||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  11049 agattgtgtatcgattaacatcagttgaacaaaagtaactattaagaacaggtatccacttccgagaattgatgatttga 11128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 138 - 284
Target Start/End: Original strand, 55670 - 55816
Alignment:
Q  138 ttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaa 237  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||| || |||||    
T  55670 ttgttcgacctagtgtttcaccgtggggagcgcctgtgctgttggtaaagaagaaggatggtagcatgaggttgtgcattgattaccgtcagttaaacaa 55769  T
Q  238 agttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    |||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  55770 agttatgataaagaacagatatccgcttccgaggattgacgacttga 55816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 125 - 270
Target Start/End: Original strand, 46844 - 46989
Alignment:
Q  125 cttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattgactatc 224  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||  || || |||||||| |||||||| |||||||| |||||||| || |  || || |    
T  46844 cttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccgtggggagtgccggtattgttggttaagaagaaggatggtagcatgaggttatgtacagattacc 46943  T
Q  225 gtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgag 270  Q
    ||||  |||| ||||| || || |||||||| ||||| ||||||||    
T  46944 gtcagctgaataaagtgacgataaagaataggtatccacttccgag 46989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467 (Bit Score: 82; Significance: 9e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0467
Description:

Target: scaffold0467; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 59 - 284
Target Start/End: Original strand, 1365 - 1590
Alignment:
Q  59 tcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcac 158  Q
    |||||||| ||||| |  ||||| || || ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| ||||||| |||||||| |    
T  1365 tcgatggcgccgtatcagatgtctgcatcagagttgggtgaattgaagaaacagttggaagagttgcttgagaagcagtttattagaccaagtgtttcgc 1464  T
Q  159 cgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagata 258  Q
    ||||||| || |  ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||  | || ||||| || ||||||||||| || ||||||||| | ||    
T  1465 cgtggggtgctctagtgttgttggttaagaagaaagatggaagaatgaggttgtgtgtggattatcggcagttgaacaaagtgacgattaagaatcggta 1564  T
Q  259 tccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    ||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  1565 tccacttccaaggattgatgatttga 1590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225 (Bit Score: 82; Significance: 9e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0225
Description:

Target: scaffold0225; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 59 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 25956 - 25731
Alignment:
Q  59 tcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcac 158  Q
    ||||| || ||||| || ||||| || || ||||| | |||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| ||||| ||||||| ||||||||||    
T  25956 tcgattgcgccgtatcggatgtctgcatcggagttgggtgaattgaagaatcagttggaagagttgcttgagaagcagtttattagaccgagtgtttcac 25857  T
Q  159 cgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagata 258  Q
    ||||||| || || ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||  | || ||||| || |||||||| || || ||||||||| | ||    
T  25856 cgtggggtgctccagtgttgttggttaagaagaaagatggaagcatgaggttgtgtgtggattatcgacagttgaacaaggtgacgattaagaatcggta 25757  T
Q  259 tccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    ||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  25756 tccacttccaaggattgatgatttga 25731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298 (Bit Score: 81; Significance: 4e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0298
Description:

Target: scaffold0298; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 134 - 282
Target Start/End: Original strand, 9877 - 10025
Alignment:
Q  134 aagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattgactatcgtcaattga 233  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  9877 aagtttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtagcatgaggttatgcattgattatcgtcagttga 9976  T
Q  234 acaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgactt 282  Q
    |||||||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||    
T  9977 acaaagttacgataaagaacaggtatccacttccgaggattgacgactt 10025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 50 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 1568 - 1345
Alignment:
Q  50 aagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagaccca 149  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||| |||| ||||| || ||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||| |    
T  1568 aagcctgtgtcgatggcaccttaccgtatgtcagcttcgaaattaactgagttgaaaaagcagttagaagatttgctggataagaagtttgtaagaccga 1469  T
Q  150 gtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaa 249  Q
    |||| ||||| ||||||||  | ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| || || || ||||| || ||||||||||| ||||| ||    
T  1468 gtgtgtcaccttggggagcgtcagtgttgttggttaagaagaaagatggtagcatgaggttttgtatagattatcggcagttgaacaaagtgacaataaa 1369  T
Q  250 gaatagatatccgcttccgaggat 273  Q
      | || ||||| |||||||||||    
T  1368 ttacaggtatccacttccgaggat 1345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0170 (Bit Score: 79; Significance: 6e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0170
Description:

Target: scaffold0170; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 59 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 34645 - 34422
Alignment:
Q  59 tcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcac 158  Q
    ||||| || ||||| || ||||| || |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||| ||||||| |||||||| |    
T  34645 tcgattgcgccgtatcggatgtctgcatctgagttgggtgaattgaagaaacagttggaagagttgcttga--agcagtttattagaccgagtgtttctc 34548  T
Q  159 cgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagata 258  Q
    ||||||| || || ||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||  | || ||||| || |||||||| || || ||||||||| | ||    
T  34547 cgtggggtgctccagtgttgttggttaagaaaaaagatggaagtatgaggttgtgtgtggattatcggcagttgaacaaggtgacgattaagaatcggta 34448  T
Q  259 tccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    | | ||||||||||||||||| ||||    
T  34447 tgcacttccgaggattgatgatttga 34422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 79; Significance: 6e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 50 - 284
Target Start/End: Original strand, 21921 - 22155
Alignment:
Q  50 aagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagaccca 149  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||  | |||||||| || ||||||||||||||||| | ||| |    
T  21921 aagcctgtgtcaatggcgccttaccgtatgtcggcttctgaattagctgagttgaaaaagaatttggaagatttgcttgataagaagtttgtaataccga 22020  T
Q  150 gtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaa 249  Q
    |||||||||| |||||||| || |||||| | || |||||||| |||||||| ||||||||||| || || || ||  | ||||||||||| ||||| ||    
T  22021 gtgtttcaccttggggagcgccagtgttgctcgttaagaagaaagatggtagcatgaggttgtgtatagattaccggaagttgaacaaagtgacaataaa 22120  T
Q  250 gaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    |||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||    
T  22121 gaatagttatccacttccaagaatcgatgatttga 22155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1985 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold1985
Description:

Target: scaffold1985; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 20 - 157
Target Start/End: Original strand, 274 - 411
Alignment:
Q  20 gagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaag 119  Q
    |||||||| ||||| ||||||||  |||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||    
T  274 gagttttctattgatcttgttcctagaacgaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtcagcttctgagttagttgagttgaagaaacaattagaag 373  T
Q  120 agttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttca 157  Q
    | || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  374 atttgcttgagaagaagtttgttagaccaagtgtttca 411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 23 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 3197 - 2936
Alignment:
Q  23 ttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaagagt 122  Q
    ||||| ||||| |||||||  ||||| | |||  |||| ||| |||| || | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | || || |    
T  3197 ttttcgattgatcttgttctgggaacgacgcctatgtctatgacaccttatcatatgtcagcttctgagttagctgagttgaagaaacaactagaggatt 3098  T
Q  123 tacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattgacta 222  Q
    | ||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||  | ||| | || |||||| | |||||||||||||| ||||| |||||||     
T  3097 tgcttgagaaaaagtttgttagaccaagtgtttcaccttggggagcgccgattttgatagtaaagaagtaagatggtagtatgagattgtgtattgactg 2998  T
Q  223 tcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    ||| || ||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||  | |||||||||||||    
T  2997 tcggcagttgaacaaagtaacgataaagaataggtatccacttccatgaattgatgacttga 2936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 77; Significance: 9e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 68 - 284
Target Start/End: Original strand, 10927 - 11143
Alignment:
Q  68 ccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggag 167  Q
    ||||| || ||||| || || ||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||| ||||| ||||||| |||||||| |||||||| |    
T  10927 ccgtatcggatgtctgcatcagagttgggtgaattgaagaaacagttagaagagttatttgagaagcagtttattagaccaagtgtttcgccgtggggtg 11026  T
Q  168 cacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttcc 267  Q
    | |  ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||  | || ||||| || ||||||||||| || ||||||||| | ||||| |||||    
T  11027 ctctagtgttgttggttaagaagaaagatggaagcatgaggttgtgtgtggattatcggcacttgaacaaagtgacgattaagaatcggtatccacttcc 11126  T
Q  268 gaggattgatgacttga 284  Q
     ||||||||||| ||||    
T  11127 aaggattgatgatttga 11143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 68 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 15461 - 15245
Alignment:
Q  68 ccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggag 167  Q
    ||||| || ||||| || || ||||| | |||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||  ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||    
T  15461 ccgtatcggatgtctgcatcagagttgggtgaattgaagaaacagttagaagagttgcttgagaaacagtttattagaccaagtatttcaccgtggagag 15362  T
Q  168 cacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttcc 267  Q
    | || ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||  | || ||||| || |||||||| || || ||||||||| | ||||| |||||    
T  15361 ctccagtgttgttggttaagaagaaagatggaagtatgaggttgtgtgtggattatcggcagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttcc 15262  T
Q  268 gaggattgatgacttga 284  Q
     ||||||||||| ||||    
T  15261 aaggattgatgatttga 15245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0146 (Bit Score: 77; Significance: 9e-36; HSPs: 3)
Name: scaffold0146
Description:

Target: scaffold0146; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 122 - 282
Target Start/End: Original strand, 9761 - 9921
Alignment:
Q  122 ttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattgact 221  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || |||||| |||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||||| |    
T  9761 ttacttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgctggttaagaagaaggacggtagcatgaggttatgcattgatt 9860  T
Q  222 atcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgactt 282  Q
    ||||||| ||||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  9861 atcgtcagttgaataaggttacgataaagaacaggtatccacttccgaggattgatgactt 9921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0146; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 122 - 282
Target Start/End: Original strand, 17428 - 17588
Alignment:
Q  122 ttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattgact 221  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || |||||| |||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||||| |    
T  17428 ttacttgataagaaatttgtaagaccaagtgtttcaccttggggagcgccggtgttgctggttaagaagaaggacggtagcatgaggttatgcattgatt 17527  T
Q  222 atcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgactt 282  Q
    ||||||| ||||| || ||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  17528 atcgtcagttgaataaggttacgataaagaacaggtatccacttccgaggattgatgactt 17588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0146; HSP #3
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 10 - 117
Target Start/End: Original strand, 5769 - 5876
Alignment:
Q  10 gagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaa 109  Q
    ||||||||| || |||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  5769 gagggaggttgaattttcacttgaccttgttccaggagcgaagccggtgtcgatggcaccttaccgtatgtcagctttcgagttagctgaattgaagaaa 5868  T
Q  110 cagttgga 117  Q
    ||||||||    
T  5869 cagttgga 5876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 77; Significance: 9e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 23 - 279
Target Start/End: Original strand, 176053 - 176308
Alignment:
Q  23 ttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaagagt 122  Q
    ||||| ||||| |||||||| || || ||||| |||||||| ||  | |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| || |    
T  176053 ttttccattgatcttgttccgggtacgaagcctgtgtcgatagcgtcttaccgtatgtcagcgtctgagttagcagagttgaagaaacagttggaggatt 176152  T
Q  123 tacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattgacta 222  Q
    |||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||| | ||||||  | ||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||| || || ||    
T  176153 tacttgataaaaagtttgtaagatcgagtgtttcacc-ttgggagcgtcggtgttgttggttaagaagaaaaatggtagcatgaggttgtgtatagatta 176251  T
Q  223 tcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatga 279  Q
      ||||  |||| |||||  | || |||||||| ||||| |||||| | ||||||||    
T  176252 ctgtcacctgaataaagtggcgataaagaataggtatccacttccgcgaattgatga 176308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 143 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 38126 - 37987
Alignment:
Q  143 agacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagtta 242  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| | || ||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  38126 agaccaagtgtttcaccttggggaacgccggtgttgttggttaagaagaaggatggtactatgaggttatgcattgattatcgtcagttgaacaaagtta 38027  T
Q  243 caattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgactt 282  Q
    |||| ||||| || ||||| ||| ||||||||||||||||    
T  38026 caataaagaacaggtatccactttcgaggattgatgactt 37987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 72; Significance: 8e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 97 - 284
Target Start/End: Original strand, 13407 - 13594
Alignment:
Q  97 tgaattgaagaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgat 196  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| |||    
T  13407 tgaattgaagaaacagttagaagagttgcttgagaagcagtttattagaccaagtgtttcaccgtggggtgctccagtgttgttggttaagaagaaagat 13506  T
Q  197 ggtagtatgaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
     | || |||||||| ||  | || ||||| || ||||||||||| || |||||||||   ||||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  13507 agaagcatgaggttatgtgtggattatcggcagttgaacaaagtgacgattaagaatgagtatccacttccaaggattgatgatttga 13594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 72; Significance: 8e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 97 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 735 - 548
Alignment:
Q  97 tgaattgaagaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgat 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |  || ||||||| |||||||| |||||||| || || |||||||| || |||||||| |||    
T  735 tgaattgaagaaacagttggaagagttgcttgagaagcaacttattagaccaagtgtttcgccgtggggtgctccagtgttgttagttaagaagaaagat 636  T
Q  197 ggtagtatgaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    || || |||||||||||  | || |||||||| |||||||| || || ||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  635 ggaagcatgaggttgtgtgtggattatcgtcagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttga 548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 97 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 7677 - 7495
Alignment:
Q  97 tgaattgaagaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgat 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |  || ||||||| |||||||| |||||||| || || |||||||| || |||||||| |||    
T  7677 tgaattgaagaaacagttggaagagttgcttgagaagcaacttattagaccaagtgtttcgccgtggggtgctccagtgttgttagttaagaagaaagat 7578  T
Q  197 ggtagtatgaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatga 279  Q
    || || |||||||||||  | || |||||||| |||||||| || || ||||||||| | ||||| ||||| |||||||||||    
T  7577 ggaagcatgaggttgtgtgtggattatcgtcagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatga 7495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0876 (Bit Score: 67; Significance: 8e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0876
Description:

Target: scaffold0876; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 66 - 284
Target Start/End: Original strand, 697 - 915
Alignment:
Q  66 caccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtgggg 165  Q
    ||||||| || ||||| || || ||||| | |||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| ||||| | || || ||||| || ||||||||    
T  697 caccgtatcggatgtctgcatcagagttgggtgaattgaagaagcagttggaagagttgcttgaaaagcagtttatcaggccgagtgtatctccgtgggg 796  T
Q  166 agcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgctt 265  Q
     || || ||||| ||||| |||||||| ||||| || |||||||||||  | || |||||  | |||||||| || || ||||||||| | |||||||||    
T  797 tgctccagtgttattggttaagaagaaagatggaagcatgaggttgtgtgtggattatcgatagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccgctt 896  T
Q  266 ccgaggattgatgacttga 284  Q
    |||||||||||||| ||||    
T  897 ccgaggattgatgatttga 915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1881 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold1881
Description:

Target: scaffold1881; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 11 - 168
Target Start/End: Original strand, 1093 - 1250
Alignment:
Q  11 agggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaac 110  Q
    ||||| || |||||||| |||||  |||| || ||||| |||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||| |||||  |||| ||||||||||    
T  1093 agggaagtcgagttttctattgattttgtccctggaacgaagccggtgttgatggcaccttatcgtatgtctgcttccgagttgactgagttgaagaaac 1192  T
Q  111 agttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagc 168  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  1193 agttagaagatttgcttgaaaagaaatttgttagaccaagtgtttcaccttggggagc 1250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 64; Significance: 5e-28; HSPs: 3)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 97 - 284
Target Start/End: Original strand, 1734 - 1921
Alignment:
Q  97 tgaattgaagaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgat 196  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||| || || || ||| |||| |||||||| |||    
T  1734 tgaattgaagaaatagttagaagagttgcttgagaagtagtttattagaccaagtgtttcaccgtggggtgctccagtattgctggttaagaagaaagat 1833  T
Q  197 ggtagtatgaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    || || |||| ||||||  | || |||||  | ||||||||||| || ||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  1834 gggagcatgatgttgtgtgtggattatcggtagttgaacaaagtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatgatttga 1921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 6 - 111
Target Start/End: Original strand, 25403 - 25508
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    |||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||    
T  25403 cagagagggaagttgagttttcgattgatcttgttcctggaacgaagcctgtgtctatgacaccttaccgtatgtcagcttctgagttggccgagttgaa 25502  T
Q  106 gaaaca 111  Q
    ||||||    
T  25503 gaaaca 25508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 97 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 26851 - 26671
Alignment:
Q  97 tgaattgaagaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgat 196  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| || || ||| ||||| | |  || |||||| | |||||||| || || |||||||| || |||||||| |||    
T  26851 tgaattgaagaagcagttggaagagttgctcgagaagcagtttatcatgccaagtgttcctccgtggggtgctccagtgttgttagttaagaagaaggat 26752  T
Q  197 ggtagtatgaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgat 277  Q
    || || |||||||| ||  | || ||||| || |||||||  || || || |||||| | |||||||||||||||||||||    
T  26751 ggaagcatgaggttatgtgtggattatcggcagttgaacatggtgactataaagaattggtatccgcttccgaggattgat 26671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 97 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 616 - 429
Alignment:
Q  97 tgaattgaagaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgat 196  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || || ||| ||||| | || || | |||||| || ||||| || || ||||||||||| |||||||| |||    
T  616 tgaattgaagaaacagttagaagagttgctagagaagcagtttatcaggccgattgtttctccatggggtgctccagtgttgttggttaagaagaaggat 517  T
Q  197 ggtagtatgaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    || || |||||||||||  | || ||||| || ||||||||||| || ||||||||| |  |||| ||||||| ||||||||| ||||    
T  516 gggagcatgaggttgtgtgtggattatcggcagttgaacaaagtaacgattaagaatcggaatccacttccgaagattgatgatttga 429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 4)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 97 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 90024 - 89842
Alignment:
Q  97 tgaattgaagaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgat 196  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||| | || || |||||||| |||||||| || || || |||||||| |||||||| |||    
T  90024 tgaattgaagaaatagttggaagagttgcttgagaagcagtttatcaggccgagtgtttctccgtggggtgctccagtattgttggttaagaagaaagat 89925  T
Q  197 ggtagtatgaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatga 279  Q
    || |  |||||||||||  | || ||||| |  ||||| ||||| || ||||||||| | ||||| ||||| |||||||||||    
T  89924 ggaaccatgaggttgtgtgtggattatcggctgttgaataaagtgacgattaagaatcggtatccacttccaaggattgatga 89842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 97 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 7679 - 7492
Alignment:
Q  97 tgaattgaagaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgat 196  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||| ||||| | || || |||||||| |||||||| || |  ||||||||| |  |||||||  ||    
T  7679 tgaattgaagaagcagttagaagagttgcttgagaagcagtttatcaggccgagtgtttctccgtggggtgctctagtgttgttgctttagaagaaatat 7580  T
Q  197 ggtagtatgaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    || || |||||||||||  | || ||||| || |||||||| || || ||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| ||||    
T  7579 ggaagcatgaggttgtgtgtggattatcggcagttgaacaaggtgacgattaagaatcgatatccgcttccaaggactgatgatttga 7492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 97 - 278
Target Start/End: Original strand, 21637 - 21818
Alignment:
Q  97 tgaattgaagaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgat 196  Q
    ||||||||||||||||||  |||| || ||||| ||| ||| | | || || | ||| || |||||||| || ||  |||||||||| |||||||| |||    
T  21637 tgaattgaagaaacagttataagaattgcttgagaagcagtatatcaggcctaatgtgtctccgtggggtgctccaatgttgttggttaagaagaaagat 21736  T
Q  197 ggtagtatgaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatg 278  Q
    || || |||||||||||  | || ||||| || |||||||| || |||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||    
T  21737 ggaagcatgaggttgtgtgtggattatcggcagttgaacaaggtgacaattaagaatcggtatccgcttccgatgattgatg 21818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 97 - 278
Target Start/End: Original strand, 31213 - 31394
Alignment:
Q  97 tgaattgaagaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgat 196  Q
    ||||||||||||||||||  |||| || ||||| ||| ||| | | || || | ||| || |||||||| || ||  |||||||||| |||||||| |||    
T  31213 tgaattgaagaaacagttataagaattgcttgagaagcagtatatcaggcctaatgtgtctccgtggggtgctccaatgttgttggttaagaagaaagat 31312  T
Q  197 ggtagtatgaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatg 278  Q
    || || |||||||||||  | || ||||| || |||||||| || |||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||    
T  31313 ggaagcatgaggttgtgtgtggattatcggcagttgaacaaggtgacaattaagaatcggtatccgcttccgatgattgatg 31394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 59 - 284
Target Start/End: Original strand, 6984 - 7209
Alignment:
Q  59 tcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcac 158  Q
    ||||| || ||||| || ||||| || || ||||| | |||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||| | ||| | || || |||||||| |    
T  6984 tcgattgcgccgtatcggatgtcggcatcagagttgggtgaattgaagaaacagtcagaagagttgcttgagaagcattttatcaggccgagtgtttctc 7083  T
Q  159 cgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagata 258  Q
    ||||||| || |  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||    |  | || ||||| || ||||||||||| |||||||||||| | ||    
T  7084 cgtggggtgctctagtgttgttggttaagaagaaagatggaagtatgaggagaagtgtggattatcggcagttgaacaaagtgacaattaagaatcggta 7183  T
Q  259 tccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    ||||||||| |||||| |||| ||||    
T  7184 tccgcttccaaggatttatgatttga 7209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 52; Significance: 7e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 71 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 4669 - 4534
Alignment:
Q  71 taccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcac 170  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||||||| |||| || ||||| ||||||||||| |||||||| |    
T  4669 taccgcatgtcggcttctgagttggctgagttgaagaaacagttagaggatttgcttgataaggagttcgtaagaccgagtgtttcaccttggggagcgc 4570  T
Q  171 ctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatga 206  Q
    | |||||  | || |||||||| |||||||| ||||    
T  4569 cggtgttactagttaagaagaaagatggtagcatga 4534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 182 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 8810 - 8708
Alignment:
Q  182 gtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgact 281  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| || || ||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||    
T  8810 gtgaagaagaaagatggtagcatgagattgtgtattgactatcgacagttgaaaaaggtgacaataaagaataggtattcacttccgaggattgatgact 8711  T
Q  282 tga 284  Q
    |||    
T  8710 tga 8708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0118
Description:

Target: scaffold0118; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 6 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 74 - 1
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatg 79  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  74 cagagagggaggttgaattttcaattgacctcgttccaggaacgaagccggtgtcgatggcaccataccgtatg 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1488 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold1488
Description:

Target: scaffold1488; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 97 - 284
Target Start/End: Original strand, 587 - 772
Alignment:
Q  97 tgaattgaagaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgat 196  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||| ||||| ||| | ||| |||| || ||||| || ||| |||| || || ||||||||||| |||| ||| |||    
T  587 tgaattgaagaagtagttggaagagttgcttgagaagtattttattaggccgagtgtgtctccg-ggggtgctccagtgttgttggttaaga-gaaagat 684  T
Q  197 ggtagtatgaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    || || |||||||||||  | || ||||| || |||||||| || || ||||||||| | |||||| |||||||||||||||| ||||    
T  685 ggaagcatgaggttgtgtgtggattatcggcagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccgattccgaggattgatgatttga 772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1715 (Bit Score: 47; Significance: 7e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold1715
Description:

Target: scaffold1715; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 194 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 1379 - 1289
Alignment:
Q  194 gatggtagtatgaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| || ||||| |||||||| ||||| || ||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1379 gatggtagtatgagactgtgcattgattaccgtcagttgaacaaggttacgataaagaacatatatccgcttccgaggattgacgacttga 1289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0878 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0878
Description:

Target: scaffold0878; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 59 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 4556 - 4435
Alignment:
Q  59 tcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcac 158  Q
    ||||| || ||||| || ||||| || || ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| ||||||  |||||||| |    
T  4556 tcgattgcgccgtatcggatgtctgcatcagagttgggtgaattgaagaaacagttggaagagttgcttgagaagcagtttattagactaagtgtttcgc 4457  T
Q  159 cgtggggagcacctgtgttgtt 180  Q
    ||||||| || || ||||||||    
T  4456 cgtggggtgctccagtgttgtt 4435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0561 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0561
Description:

Target: scaffold0561; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 97 - 278
Target Start/End: Original strand, 6787 - 6968
Alignment:
Q  97 tgaattgaagaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgat 196  Q
    ||||||||||||  |||| |||||||| ||||  ||| ||||| | || || |||||||| |||||||  || || |||||||| || | |||||| |||    
T  6787 tgaattgaagaagtagttagaagagttgcttgtgaagcagtttatcaggccgagtgtttctccgtgggatgctccagtgttgttcgttaggaagaaggat 6886  T
Q  197 ggtagtatgaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatg 278  Q
    || || |||||||||||  | || ||||| || | |||||| || || ||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  6887 gggagcatgaggttgtgtgtggattatcggcagtcgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccgcttccgaggattgatg 6968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 184 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 8486 - 8386
Alignment:
Q  184 gaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttg 283  Q
    ||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||| ||  |||| |||||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||    
T  8486 gaagaagaaagatggtagtatgagattatgtattgactatcgacagttgaacaaggtgtcaataaagaataggtatccactttcgaggattgatgatttg 8387  T
Q  284 a 284  Q
    |    
T  8386 a 8386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 184 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 17682 - 17582
Alignment:
Q  184 gaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttg 283  Q
    ||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||| ||  |||| |||||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||    
T  17682 gaagaagaaagatggtagtatgagattatgtattgactatcgacagttgaacaaggtgtcaataaagaataggtatccactttcgaggattgatgatttg 17583  T
Q  284 a 284  Q
    |    
T  17582 a 17582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 59 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 23523 - 23417
Alignment:
Q  59 tcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcac 158  Q
    ||||| || ||||| || ||||| || || ||||| | |||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||| ||||| ||||||| ||||||||||    
T  23523 tcgattgcgccgtatcggatgtctgcatcagagttgggtgaattgaagaatcagttggaggagttgcttgagaagcagtttattagaccaagtgtttcac 23424  T
Q  159 cgtgggg 165  Q
    |||||||    
T  23423 cgtgggg 23417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0501 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0501
Description:

Target: scaffold0501; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 6 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 12276 - 12171
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    ||||||| || || |||||||| ||||| |||||||| ||||| || |  ||||| |||| ||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  12276 cagagagagaagttgagttttctattgatcttgttcctggaacgaaacttgtgtctatggaaccttatcgtatgtcagcttccgagttagctgagttgaa 12177  T
Q  106 gaaaca 111  Q
    ||||||    
T  12176 gaaaca 12171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 35 - 111
Target Start/End: Original strand, 126489 - 126565
Alignment:
Q  35 cttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaaca 111  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||| || |||||||||||||||||||| || || |||||||||||    
T  126489 cttgttcccggaacgaagcctgtgtctatgacaccttatcgtatgtcagcttctgagttggccgagttgaagaaaca 126565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0610
Description:

Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 111 - 284
Target Start/End: Original strand, 4722 - 4895
Alignment:
Q  111 agttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggtt 210  Q
    |||| |||||||| ||| | ||| ||||| | || || || ||||| |||||||| || || || ||||| || |||||||| ||||| || ||||||||    
T  4722 agttagaagagttgcttaagaagcagtttatcaggccgagggtttctccgtggggtgctccagttttgttcgttaagaagaaagatggaagcatgaggtt 4821  T
Q  211 gtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    |||  | || ||| | || |||||||| || || ||||||||| | |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  4822 gtgtgtggattattggcagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatctgcttccgaggattgatgatttga 4895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0673 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0673
Description:

Target: scaffold0673; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 66 - 165
Target Start/End: Original strand, 6055 - 6154
Alignment:
Q  66 caccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaagaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtgggg 165  Q
    ||||||| || ||||| || || ||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||  |||| | ||||| |||||||| ||||||||    
T  6055 caccgtatcggatgtctgcatcagagttggatgagttgaagaaacagttagaagagttacttgaaaagcggtttatcagaccgagtgtttctccgtgggg 6154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0259 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0259
Description:

Target: scaffold0259; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 7868 - 7790
Alignment:
Q  9 agagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttc 87  Q
    ||||||| || ||||| || ||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  7868 agagggaagttgagttctctattgatcttgttcctgaaacgaagccggtgtcgatggcaccttatcgtatgtctgcttc 7790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1615 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold1615
Description:

Target: scaffold1615; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 6 - 147
Target Start/End: Original strand, 1424 - 1565
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcgatggcaccgtaccgtatgtcagcttctgagttagctgaattgaa 105  Q
    |||||| ||| || |||||||||| ||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||| |||| || |||||||||  ||||||||| || || |||||    
T  1424 cagagatggaagttgagttttcaaatgatcttgtacctggaacgaagcctgtgtctatgacaccttatcgtatgtcaagttctgagttggccgagttgaa 1523  T
Q  106 gaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacc 147  Q
    |||||| || || || || |||||  | || |||||||||||    
T  1524 gaaacaattagaggatttgcttgagtaaaattttgttagacc 1565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 141 - 198
Target Start/End: Original strand, 144460 - 144517
Alignment:
Q  141 ttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatgg 198  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| || | |||||||||||||||||||| |||||    
T  144460 ttagaccaagtgtttcaccttggggaccagcagtgttgttggtgaagaagaaagatgg 144517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1208 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold1208
Description:

Target: scaffold1208; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 149 - 280
Target Start/End: Original strand, 1523 - 1654
Alignment:
Q  149 agtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaatta 248  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||  | |||||| |||||  | || || || || || ||||| ||||| ||||    
T  1523 agtgtgtcaccttggggtgcacctgtgttgttggtcaaaaagaaagatgagactatgagattgtgtgtagattaccgccagttaaacaaggttactatta 1622  T
Q  249 agaatagatatccgcttccgaggattgatgac 280  Q
    |||||| ||| || |||||  |||||||||||    
T  1623 agaataaataccctcttcctgggattgatgac 1654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0481 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0481
Description:

Target: scaffold0481; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 97 - 208
Target Start/End: Original strand, 12149 - 12260
Alignment:
Q  97 tgaattgaagaaacagttggaagagttacttgataagaagtttgttagacccagtgtttcaccgtggggagcacctgtgttgttggtgaagaagaatgat 196  Q
    |||||| |||||||| || ||||||||| | || || |||||| | || || ||||| ||||| |||||||||||||||||  | || || ||||| |||    
T  12149 tgaattaaagaaacaattagaagagttattagagaaaaagtttatcaggcctagtgtctcaccttggggagcacctgtgttactcgttaaaaagaaggat 12248  T
Q  197 ggtagtatgagg 208  Q
    || |||||||||    
T  12249 ggcagtatgagg 12260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 185 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 7180 - 7081
Alignment:
Q  185 aagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    |||||||| ||||| || |||||||||||  | || ||||| ||||||||||| || || ||||| ||| | ||||| |||| |||||||||||| ||||    
T  7180 aagaagaaagatggaagcatgaggttgtgtgtggattatcggcaattgaacaaggtgacgattaaaaatcggtatccacttcagaggattgatgatttga 7081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0692 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0692
Description:

Target: scaffold0692; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 174 - 284
Target Start/End: Original strand, 1743 - 1853
Alignment:
Q  174 tgttgttggtgaagaagaatgatggtagtatgaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggat 273  Q
    |||||||||| ||||||||  |||| || |||||||||||  | || |||||  | ||||||||||| || |||| |||| | ||||| ||||| |||||    
T  1743 tgttgttggttaagaagaaatatggaagcatgaggttgtgtctggattatcggtagttgaacaaagtgacgattatgaatcggtatccacttccaaggat 1842  T
Q  274 tgatgacttga 284  Q
    |||||| ||||    
T  1843 tgatgatttga 1853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0387 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0387
Description:

Target: scaffold0387; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 194 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 16485 - 16395
Alignment:
Q  194 gatggtagtatgaggttgtgcattgactatcgtcaattgaacaaagttacaattaagaatagatatccgcttccgaggattgatgacttga 284  Q
    ||||| || |||||||||||  | || |||||| | |||||||| || || ||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  16485 gatggaagcatgaggttgtgtgtggattatcgttagttgaacaaggtgacgattaagaatcggtatccacttccgaggattgatgatttga 16395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1459 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold1459
Description:

Target: scaffold1459; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 6 - 62
Target Start/End: Original strand, 1723 - 1779
Alignment:
Q  6 cagagagggaggtggagttttcaattgaccttgttcccggaacaaagccggtgtcga 62  Q
    ||||||| || || |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  1723 cagagagagaagtcgagttttctattgatcttgttccaggaacgaagccggtgtcga 1779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University