View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF9839A_low_20 (Length: 448)

Name: NF9839A_low_20
Description: NF9839A
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF9839A_low_20
NF9839A_low_20
[»] chr7 (33 HSPs)
chr7 (149-430)||(19230632-19230913)
chr7 (145-430)||(18406829-18407113)
chr7 (151-430)||(15729498-15729776)
chr7 (151-430)||(18399851-18400129)
chr7 (151-430)||(48808773-48809051)
chr7 (150-430)||(30253884-30254163)
chr7 (151-430)||(19858869-19859147)
chr7 (149-430)||(2204296-2204577)
chr7 (149-430)||(34128320-34128598)
chr7 (149-430)||(8464744-8465024)
chr7 (149-430)||(47167136-47167415)
chr7 (150-430)||(10669179-10669457)
chr7 (150-430)||(18139615-18139896)
chr7 (150-429)||(18259402-18259679)
chr7 (151-430)||(28130309-28130586)
chr7 (177-430)||(41681250-41681502)
chr7 (166-426)||(19393705-19393963)
chr7 (156-430)||(14585913-14586191)
chr7 (212-430)||(15999791-16000007)
chr7 (149-268)||(22994053-22994172)
chr7 (216-430)||(2935846-2936056)
chr7 (151-430)||(3587657-3587934)
chr7 (151-422)||(42150363-42150626)
chr7 (154-429)||(15170307-15170581)
chr7 (150-430)||(22968696-22968975)
chr7 (259-430)||(24443604-24443772)
chr7 (148-293)||(24443932-24444077)
chr7 (221-428)||(31190722-31190926)
chr7 (151-224)||(48813749-48813822)
chr7 (166-430)||(25846172-25846443)
chr7 (259-430)||(5982988-5983157)
chr7 (149-194)||(31190957-31191002)
chr7 (303-435)||(19388452-19388582)
[»] chr6 (22 HSPs)
chr6 (149-430)||(8612662-8612940)
chr6 (150-430)||(16788817-16789096)
chr6 (151-430)||(1586385-1586663)
chr6 (150-430)||(18020118-18020397)
chr6 (151-430)||(13995220-13995498)
chr6 (151-430)||(22860165-22860443)
chr6 (149-430)||(5758758-5759036)
chr6 (145-430)||(27508624-27508909)
chr6 (151-430)||(14074227-14074505)
chr6 (149-430)||(27528210-27528491)
chr6 (150-430)||(20736605-20736883)
chr6 (151-415)||(17120741-17121002)
chr6 (151-354)||(13947501-13947704)
chr6 (151-430)||(19218179-19218454)
chr6 (145-430)||(22560461-22560746)
chr6 (145-300)||(14996853-14997007)
chr6 (151-424)||(4073320-4073595)
chr6 (221-430)||(21994406-21994613)
chr6 (152-339)||(10359401-10359588)
chr6 (151-185)||(11248531-11248565)
chr6 (150-224)||(21993710-21993783)
chr6 (332-426)||(23846668-23846760)
[»] chr8 (23 HSPs)
chr8 (145-430)||(27007794-27008078)
chr8 (151-430)||(22659771-22660049)
chr8 (150-430)||(27014937-27015216)
chr8 (150-430)||(28498239-28498518)
chr8 (151-430)||(12561870-12562148)
chr8 (151-430)||(21969080-21969358)
chr8 (151-430)||(26240231-26240509)
chr8 (149-430)||(8371530-8371810)
chr8 (151-430)||(22130886-22131164)
chr8 (151-430)||(45534550-45534828)
chr8 (151-430)||(27880764-27881043)
chr8 (151-430)||(28020945-28021224)
chr8 (151-426)||(2963217-2963489)
chr8 (151-430)||(25610941-25611220)
chr8 (150-415)||(6430691-6430952)
chr8 (151-383)||(36970023-36970253)
chr8 (254-430)||(21916525-21916701)
chr8 (169-429)||(18835119-18835374)
chr8 (150-354)||(20539751-20539954)
chr8 (145-231)||(21914304-21914390)
chr8 (151-352)||(8782166-8782365)
chr8 (151-231)||(21862147-21862227)
chr8 (150-218)||(12642209-12642277)
[»] chr4 (29 HSPs)
chr4 (145-430)||(15461238-15461522)
chr4 (149-430)||(2676758-2677038)
chr4 (145-430)||(18111320-18111604)
chr4 (145-430)||(18162903-18163187)
chr4 (149-430)||(20243682-20243962)
chr4 (151-430)||(4676260-4676538)
chr4 (151-430)||(15814768-15815046)
chr4 (151-430)||(26531360-26531638)
chr4 (151-430)||(34975298-34975576)
chr4 (150-430)||(3369300-3369579)
chr4 (151-430)||(17300236-17300514)
chr4 (149-430)||(1941470-1941749)
chr4 (151-430)||(5870159-5870443)
chr4 (153-429)||(9487301-9487575)
chr4 (151-386)||(38816460-38816694)
chr4 (151-430)||(30040751-30041028)
chr4 (155-430)||(11420768-11421041)
chr4 (150-359)||(11484265-11484473)
chr4 (271-429)||(4545948-4546104)
chr4 (273-430)||(19365389-19365544)
chr4 (151-241)||(4545860-4545950)
chr4 (216-385)||(19362229-19362397)
chr4 (150-368)||(9537709-9537926)
chr4 (171-424)||(5528762-5529013)
chr4 (151-420)||(39422426-39422694)
chr4 (155-350)||(56515990-56516184)
chr4 (150-215)||(19361596-19361661)
chr4 (386-430)||(32636465-32636509)
chr4 (259-351)||(21797983-21798075)
[»] chr5 (18 HSPs)
chr5 (149-430)||(7865711-7865989)
chr5 (149-430)||(12765271-12765549)
chr5 (145-430)||(31096557-31096841)
chr5 (149-430)||(22940995-22941275)
chr5 (151-430)||(24933583-24933861)
chr5 (151-430)||(25805662-25805940)
chr5 (149-430)||(12704155-12704433)
chr5 (151-430)||(31646-31924)
chr5 (151-430)||(23545669-23545947)
chr5 (145-430)||(20940768-20941052)
chr5 (151-430)||(12789940-12790218)
chr5 (149-430)||(9812014-9812292)
chr5 (151-430)||(26244850-26245127)
chr5 (165-430)||(5097414-5097676)
chr5 (151-430)||(39535211-39535489)
chr5 (153-430)||(20100520-20100793)
chr5 (151-426)||(26129974-26130249)
chr5 (154-353)||(31652136-31652338)
[»] scaffold0264 (2 HSPs)
scaffold0264 (149-430)||(3952-4232)
scaffold0264 (147-386)||(10851-11089)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (149-430)||(130501-130781)
scaffold0001 (192-371)||(138471-138649)
scaffold0001 (151-185)||(141113-141147)
[»] chr3 (16 HSPs)
chr3 (149-430)||(21033983-21034263)
chr3 (151-429)||(25979006-25979282)
chr3 (151-430)||(14890138-14890416)
chr3 (151-430)||(15846813-15847091)
chr3 (151-426)||(21398539-21398813)
chr3 (151-430)||(55426768-55427046)
chr3 (149-430)||(12299656-12299936)
chr3 (150-430)||(20147831-20148111)
chr3 (153-398)||(28087967-28088211)
chr3 (198-429)||(11787382-11787611)
chr3 (150-429)||(15526502-15526777)
chr3 (150-430)||(14146768-14147046)
chr3 (61-158)||(3578986-3579083)
chr3 (74-158)||(3579148-3579236)
chr3 (308-430)||(27432490-27432610)
chr3 (151-224)||(14225954-14226028)
[»] scaffold0378 (1 HSPs)
scaffold0378 (151-430)||(8052-8330)
[»] chr2 (11 HSPs)
chr2 (151-430)||(24229492-24229770)
chr2 (151-430)||(30174124-30174402)
chr2 (149-430)||(24250309-24250589)
chr2 (154-430)||(19616186-19616460)
chr2 (157-430)||(24763834-24764105)
chr2 (160-430)||(15342280-15342548)
chr2 (146-293)||(29800170-29800317)
chr2 (151-369)||(21626429-21626647)
chr2 (187-368)||(28719132-28719314)
chr2 (151-320)||(18852167-18852337)
chr2 (388-435)||(28719053-28719100)
[»] chr1 (20 HSPs)
chr1 (151-430)||(9455863-9456141)
chr1 (151-430)||(42817266-42817544)
chr1 (145-430)||(22670534-22670818)
chr1 (149-430)||(35930327-35930607)
chr1 (150-430)||(19706716-19706995)
chr1 (151-430)||(20391516-20391794)
chr1 (151-430)||(43802642-43802920)
chr1 (151-430)||(47667751-47668029)
chr1 (145-430)||(28135000-28135284)
chr1 (151-430)||(20779922-20780200)
chr1 (151-430)||(22612234-22612517)
chr1 (150-354)||(22234827-22235030)
chr1 (144-380)||(26923675-26923907)
chr1 (228-430)||(633773-633959)
chr1 (146-430)||(8727407-8727692)
chr1 (150-430)||(21881653-21881932)
chr1 (227-421)||(29096548-29096739)
chr1 (150-185)||(14482298-14482333)
chr1 (203-282)||(16435649-16435728)
chr1 (389-429)||(16435837-16435877)
[»] scaffold0393 (1 HSPs)
scaffold0393 (153-430)||(15100-15376)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (151-430)||(119477-119755)
[»] scaffold0376 (1 HSPs)
scaffold0376 (149-430)||(11807-12085)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (149-430)||(67651-67930)
[»] scaffold0063 (1 HSPs)
scaffold0063 (151-429)||(45226-45502)
[»] scaffold2089 (1 HSPs)
scaffold2089 (150-420)||(1-274)
[»] scaffold0037 (1 HSPs)
scaffold0037 (149-386)||(40015-40251)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (151-381)||(19160-19389)
[»] scaffold0061 (1 HSPs)
scaffold0061 (151-341)||(76307-76496)
[»] scaffold0099 (1 HSPs)
scaffold0099 (151-430)||(8847-9135)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (151-430)||(40265-40542)
[»] scaffold0086 (1 HSPs)
scaffold0086 (151-430)||(53521-53790)
[»] scaffold0466 (1 HSPs)
scaffold0466 (166-430)||(13226-13489)
[»] scaffold0139 (1 HSPs)
scaffold0139 (150-332)||(18789-18970)
[»] scaffold0112 (1 HSPs)
scaffold0112 (226-430)||(5-208)
[»] scaffold1948 (1 HSPs)
scaffold1948 (149-360)||(961-1171)
[»] scaffold0611 (1 HSPs)
scaffold0611 (151-308)||(9516-9672)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (149-268)||(13738-13857)
[»] scaffold0111 (1 HSPs)
scaffold0111 (210-364)||(26413-26567)
[»] scaffold0059 (1 HSPs)
scaffold0059 (151-285)||(33927-34060)
[»] scaffold0136 (1 HSPs)
scaffold0136 (149-430)||(8477-8756)
[»] scaffold0783 (1 HSPs)
scaffold0783 (151-208)||(6227-6284)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (297-430)||(83292-83423)
[»] scaffold1400 (1 HSPs)
scaffold1400 (151-200)||(1826-1875)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 238; Significance: 1e-131; HSPs: 33)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 149 - 430
Target Start/End: Original strand, 19230632 - 19230913
Alignment:
Q  149 attgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgtaaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaatactatatgacactctttattatatt 248  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19230632 attgttggtgtacgccctagaggccaatagttaatgttaaacttatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatgacactctttattatatt 19230731  T
Q  249 tatagtaatgttaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattc 348  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19230732 tatagtaatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtaacttaatcatgagattacattatcataaagaacgctattc 19230831  T
Q  349 ttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagcctattatgtatgtagactgatg 430  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19230832 ttaaatgtatccgtagtcaaaacattaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 19230913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 145 - 430
Target Start/End: Original strand, 18406829 - 18407113
Alignment:
Q  145 ggagattgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgtaaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaatactatatgacactctttatta 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  18406829 ggagattgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttatta 18406928  T
Q  245 tatttatagtaatgttaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacact 344  Q
    |||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||    
T  18406929 tatttaga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgct 18407027  T
Q  345 attcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagcctattatgtatgtagactgatg 430  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18407028 attcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 18407113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 151 - 430
Target Start/End: Original strand, 15729498 - 15729776
Alignment:
Q  151 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgtaaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaatactatatgacactctttattatattta 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  15729498 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaatctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 15729597  T
Q  251 tagtaatgttaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattctt 350  Q
     | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  15729598 ga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacactattctt 15729696  T
Q  351 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagcctattatgtatgtagactgatg 430  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15729697 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 15729776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 151 - 430
Target Start/End: Original strand, 18399851 - 18400129
Alignment:
Q  151 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgtaaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaatactatatgacactctttattatattta 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  18399851 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 18399950  T
Q  251 tagtaatgttaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattctt 350  Q
     | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  18399951 ga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctt 18400049  T
Q  351 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagcctattatgtatgtagactgatg 430  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18400050 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 18400129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 151 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 48809051 - 48808773
Alignment:
Q  151 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgtaaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaatactatatgacactctttattatattta 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  48809051 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaatctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 48808952  T
Q  251 tagtaatgttaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattctt 350  Q
     | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  48808951 ga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctt 48808853  T
Q  351 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagcctattatgtatgtagactgatg 430  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  48808852 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 48808773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 150 - 430
Target Start/End: Original strand, 30253884 - 30254163
Alignment:
Q  150 ttgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgtaaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaatactatatgacactctttattatattt 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  30253884 ttgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttataatattt 30253983  T
Q  250 atagtaatgttaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattct 349  Q
    | | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | |||||||    
T  30253984 aga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagatcgctattct 30254082  T
Q  350 taaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagcctattatgtatgtagactgatg 430  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30254083 taaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 30254163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 151 - 430
Target Start/End: Original strand, 19858869 - 19859147
Alignment:
Q  151 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgtaaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaatactatatgacactctttattatattta 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  19858869 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 19858968  T
Q  251 tagtaatgttaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattctt 350  Q
     | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  19858969 ga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtttaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctt 19859067  T
Q  351 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagcctattatgtatgtagactgatg 430  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19859068 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataacaaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 19859147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 149 - 430
Target Start/End: Original strand, 2204296 - 2204577
Alignment:
Q  149 attgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgtaaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaatactatatgacactctttattatatt 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  2204296 attgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattggataatatatgacactctttattatatt 2204395  T
Q  249 tatagtaatgttaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattc 348  Q
    || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||    
T  2204396 taga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattc 2204494  T
Q  349 ttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaat-aaaggataataataaagcgtcgagcctattatgtatgtagactgatg 430  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2204495 ttaaatgaatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 2204577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 149 - 430
Target Start/End: Original strand, 34128320 - 34128598
Alignment:
Q  149 attgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgtaaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaatactatatgacactctttattatatt 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34128320 attgttggtgtaagccctagaggccaataatttatgttaaacttatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatgacactctttattatatt 34128419  T
Q  249 tatagtaatgttaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattc 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  34128420 tatagtaatgttaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacattattt 34128519  T
Q  349 ttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagcctattatgtatgtagactgatg 430  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  34128520 ttaaatgtatccgtagt-taagctttaatataatt--aggataataataaagcgtcgagattattatgtatgtagactgatg 34128598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 149 - 430
Target Start/End: Original strand, 8464744 - 8465024
Alignment:
Q  149 attgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgtaaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaatactatatgacactctttattatatt 248  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  8464744 attgttggtgtaagtcctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgaatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatt 8464843  T
Q  249 tatagtaatgttaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattc 348  Q
    || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  8464844 taga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttaaagaacgctattc 8464942  T
Q  349 ttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagcctattatgtatgtagactgatg 430  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  8464943 ttaaatgtatccgtagtcgaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgacgagactattatgtatgtagactgatg 8465024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 149 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 47167415 - 47167136
Alignment:
Q  149 attgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgtaaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaatactatatgacactctttattatatt 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  47167415 attgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacttatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatgtgacactctttattatatt 47167316  T
Q  249 tatagtaatgttaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattc 348  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  47167315 tatagtaatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgactttatcatgagattacattatcataaagaacgttattc 47167216  T
Q  349 ttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagcctattatgtatgtagactgatg 430  Q
    ||||||||||  |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  47167215 ttaaatgtatttgtagtc-aagctttaatatgaat-taggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 47167136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 150 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 10669457 - 10669179
Alignment:
Q  150 ttgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgtaaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaatactatatgacactctttattatattt 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10669457 ttgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatgacactctttattatattt 10669358  T
Q  250 atagtaatgttaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattct 349  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  10669357 atagtaatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatataataagtgtgacttaatcatcagattacattatcataaagaacgttattct 10669258  T
Q  350 taaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagcctattatgtatgtagactgatg 430  Q
    ||||||||||||||||| || |||| |||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10669257 taaatgtatccgtagtc-aatcttt-atattaataaatgataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 10669179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 150 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 18139896 - 18139615
Alignment:
Q  150 ttgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgtaaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaatactatatgacactctttattatattt 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18139896 ttgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacctttattattgaataatatatgacactctttattatattt 18139797  T
Q  250 atagtaatgttaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattct 349  Q
    | | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  ||||||    
T  18139796 aga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgttattct 18139698  T
Q  350 taa--atgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagcctattatgtatgtagactgatg 430  Q
    |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18139697 taaatatatatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 18139615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 150 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 18259679 - 18259402
Alignment:
Q  150 ttgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgtaaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaatactatatgacactctttattatattt 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  18259679 ttgttggtgtaagccctagaggccaataatttatgttaaacttatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattt 18259580  T
Q  250 atagtaatgttaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattct 349  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18259579 atagtaatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacattattct 18259480  T
Q  350 taaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagcctattatgtatgtagactgat 429  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||    
T  18259479 taaatgtatccatagtc-aagctttaatatgaat-taggataataataaatcgtcgagagtattatgtatgttgactgat 18259402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 151 - 430
Target Start/End: Original strand, 28130309 - 28130586
Alignment:
Q  151 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgtaaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaatactatatgacactctttattatattta 250  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  28130309 tgttggtgtaagccctatatgccaatagtttatgttgaacttatcttatgtatcataacttttattattgaatagtatgtgacactctttattatattta 28130408  T
Q  251 tagtaatgttaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattctt 350  Q
    || |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  28130409 taataatgttaatgaagtccttataatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaaaaacgctattctt 28130508  T
Q  351 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagcctattatgtatgtagactgatg 430  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  28130509 aaatgtatctgtagtc-aagctttaatatgaat-aaggataataataaagcgtcgagactattatgcatgtagactgatg 28130586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 177 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 41681502 - 41681250
Alignment:
Q  177 agtttatgtaaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaatactatatgacactctttattatatttatagtaatgttaataaagttcttagaa 276  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||| |||    
T  41681502 agtttatattaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaataatatataacactctttattatatttaga-taatgttaataaagtccttggaa 41681404  T
Q  277 tagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaa 376  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41681403 tagatagtttatgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattactttatcttatagaatgttattcttaaatgtatctgtagtcaaagctttaa 41681304  T
Q  377 tatgaataaaggataataataaagcgtcgagcctattatgtatgtagactgatg 430  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||    
T  41681303 tatgaataaaggataataataaagctttgagactattatgtatgtagactgatg 41681250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 166 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 19393963 - 19393705
Alignment:
Q  166 tagaggccaatagtttatgtaaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaatactatatgacactctttattatatttatagtaatgttaataa 265  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  19393963 tagaggccaatagtttatgttaaacttatcttatgtatcatgacttttattattaaataatatatgatactctttattatatctgtagtaatgttaataa 19393864  T
Q  266 agttcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattcttaaatgtatccgtagt 365  Q
    |||   || |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  19393863 agtctctataatagatagttcatgtaatgatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattaacataaagaatgctattcttaaatgtatctgtagt 19393764  T
Q  366 caaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagcctattatgtatgtagact 426  Q
    | |||||||||||||| |   ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19393763 c-aagctttaatatgagt-tgggataattataaagcgtcgagactattatgtatgtagact 19393705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 156 - 430
Target Start/End: Original strand, 14585913 - 14586191
Alignment:
Q  156 gtgtaagccctagaggccaatagtttatgtaaaacttatcttatgtatcatgatttttatta------ttgaatactatatgacactctttattatattt 249  Q
    ||||||||| || | |||||||||||| || ||| |||| ||||||||||||| ||||||||      || |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  14585913 gtgtaagccgtaaatgccaatagtttaagttaaatttatgttatgtatcatgacttttattactattattaaataatatatgtcactctttattatattt 14586012  T
Q  250 atagtaatgttaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattct 349  Q
     | |||||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| |    
T  14586013 gttgtaatgttaataaagtccctaaaatagatagttcgtataatggtatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttaatgaacgctattat 14586112  T
Q  350 taaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagcctattatgtatgtagactgatg 430  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||   | ||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||    
T  14586113 taaatgtatccttagtcaaa-ctttaatatgaat-tggaataataataaagcgtcgagacttttatgtatgcagactgatg 14586191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 212 - 430
Target Start/End: Original strand, 15999791 - 16000007
Alignment:
Q  212 ttattattgaatactatatgacactctttattatatttatagtaatgttaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgact 311  Q
    |||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| |||| | || |||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||    
T  15999791 ttattattaaataatatatgtcactctttattatatttgttgtaatgttaattaagtacctaaaatagatagttcgtataatggtatattaagtgtgact 15999890  T
Q  312 taatcatgagattacattatcataaagaacactattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagccta 411  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||     
T  15999891 taatcatgagattacattaccttaaagaacgctattattaaatgtatccttagtcaaa-ctttaatatgaat-taggataataataaagcgtcgagactt 15999988  T
Q  412 ttatgtatgtagactgatg 430  Q
    ||||||||| |||||||||    
T  15999989 ttatgtatgcagactgatg 16000007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 149 - 268
Target Start/End: Original strand, 22994053 - 22994172
Alignment:
Q  149 attgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgtaaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaatactatatgacactctttattatatt 248  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22994053 attgttggtgtaagccctagagaccaatagtttatgttaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaataatatatgacactctttattatatt 22994152  T
Q  249 tatagtaatgttaataaagt 268  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  22994153 tatagtaatgttaataaagt 22994172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 216 - 430
Target Start/End: Original strand, 2935846 - 2936056
Alignment:
Q  216 tattgaatactatatgacactctttattatatttatagtaatgttaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaat 315  Q
    |||| |||| |||||| ||||||| ||||||||| | |||||||||||||||| | ||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||  |||||||    
T  2935846 tattaaataatatatgtcactcttcattatatttgttgtaatgttaataaagtccctagaataaatagttcatgtaattatatattaagtg--acttaat 2935943  T
Q  316 catgagattacattatcataaagaacactattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagcctattat 415  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    |||||||||||||| ||||| || ||||    
T  2935944 catgagattacattaacataaagaacgttattcttaaatgtatccgtagtc-aagctttaatatgaat-tgcgataataataaagcatcgagactgttat 2936041  T
Q  416 gtatgtagactgatg 430  Q
     ||||||||||||||    
T  2936042 ttatgtagactgatg 2936056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 151 - 430
Target Start/End: Original strand, 3587657 - 3587934
Alignment:
Q  151 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgtaaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaatactatatgacactctttattatattta 250  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| |||||||||| ||||  |||||  | ||||||||||| ||     
T  3587657 tgttggtgtaagccctaaatgtcaatagtttatgtgaaacttatgctatgtatcatgacttttattattaaataacatatgcaattctttattataattg 3587756  T
Q  251 tagtaatgttaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattctt 350  Q
    | ||||  |||||||||| | |||||||| |||||  ||| || | ||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||  |||||||    
T  3587757 ttgtaagattaataaagtccatagaataggtagtttatgtgatgaaatattaactgtgacttaatcatgagattactttaacataaaaaacgttattctt 3587856  T
Q  351 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagcctattatgtatgtagactgatg 430  Q
    ||||| |||  ||||| |||||||||||| |||   ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  3587857 aaatgaatctatagtc-aagctttaatataaat-tgggataataataaagcgtagagactattatgtatatagaccgatg 3587934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 151 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 42150626 - 42150363
Alignment:
Q  151 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgtaaaacttatc-ttatgtatcatgatttttattattgaatactatatgacactctttattatattt 249  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  42150626 tgttggtataagccctagaggccaatagtttatgttaaacttatctttatgtatcgtgacttttattattgaataatatatgacactctttgttatattt 42150527  T
Q  250 ----atagtaatgttaataaagttc--ttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacac 343  Q
         |||||||||||||||||  |   ||||||||||||||| |||             ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||      
T  42150526 gtaggtagtaatgttaataaagcccctatagaatagatagttc-tgt-------------gtgtgacttaatcatgagattacattaacataaagaacgt 42150441  T
Q  344 tattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagcct--attatgtatgta 422  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||    
T  42150440 tattc-taaatgtatccgtagtc-aagctttaatatgaat-tgggataataataaagcgtcgagactaaattatgtatgta 42150363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 154 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 15170581 - 15170307
Alignment:
Q  154 tggtgtaagccctagaggccaatagtttatgtaaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaatactatatgacactctttattatatttatag 253  Q
    ||||||||||| |  |||| |||||||||||| ||| ||||  |||||||| ||| ||||| |||| |||| |||| |||| ||||||||||| || | |    
T  15170581 tggtgtaagccttgaaggctaatagtttatgttaaatttattctatgtatcgtgagttttaatattaaataatatacgacattctttattataattgttg 15170482  T
Q  254 taatgttaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattcttaaa 353  Q
    |||  |||||||||| | || ||||||| |||| ||||||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||  ||||||||||    
T  15170481 taaaattaataaagtccataaaatagat-gttcatgtaatggaatattaagtgggacttaatcatgagattacattaacataaaaaacgttattcttaaa 15170383  T
Q  354 tgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaa---ggataataataaagcgtcgagcctattatgtatgtagactgat 429  Q
    | |||  |||||| ||||||||||||  |||||   ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  15170382 tatatttgtagtc-aagctttaatat--ataaattgggataataataaagcgtagagactattatatatgtagactgat 15170307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 150 - 430
Target Start/End: Original strand, 22968696 - 22968975
Alignment:
Q  150 ttgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgtaaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaatactatat--gacactctttattatat 247  Q
    |||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| | |||||| |  || ||||||||| ||||||||||||||| |||||  | || | ||||||||||    
T  22968696 ttgttggtgtaagctctataggtcaatagtttatcttaaacttttgctacgtatcatgacttttattattgaataatatatatggcatt-tttattatat 22968794  T
Q  248 ttatagtaatgttaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactatt 347  Q
    || | ||||  | |||||||| |  |||||||||||||||||| ||   ||||||||||| | ||||||||||||||||||||   |||||||  | |||    
T  22968795 ttgttgtaagataaataaagtccagagaatagatagttcgtgtgatggaatattaagtgttaattaatcatgagattacattaatgtaaagaatgcaatt 22968894  T
Q  348 cttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagcctattatgtatgtagactgatg 430  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||| |||  |||||||| |||||| ||| || ||||||| ||||||||| ||||    
T  22968895 cttaaatgtatccgtagtc-aatctttaatataaat-taggataatgataaagtgtcaagactattatttatgtagaccgatg 22968975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 259 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 24443772 - 24443604
Alignment:
Q  259 ttaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattcttaaatgtat 358  Q
    |||||||||| | || |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  24443772 ttaataaagtccctataatagatagttcgtgtaatggaatattaagtgtgacttaatcacgagattacattaacataaagaacgatattcttaaatgtat 24443673  T
Q  359 ccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagcctattatgtatgtagactgatg 430  Q
    |||||| | |||||||||||| |||   |||| |||| |||| ||  || ||||||||||||||||||||||    
T  24443672 ccgtag-ccaagctttaatataaat--gggatgataacaaagtgtaaagactattatgtatgtagactgatg 24443604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 148 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 24444077 - 24443932
Alignment:
Q  148 gattgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgtaaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaatactatatgacactctttattatat 247  Q
    ||||||||||||||| | |||||| |||||| |||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||||    
T  24444077 gattgttggtgtaagtcttagaggtcaatagcttatgttaaacttatgttatctatcatgatttttattattgaataatatattgcattctttattatat 24443978  T
Q  248 ttatagtaatgttaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaat 293  Q
    || |  |||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  24443977 ttgttataagattaataaaattcatagaatagatagttcgtgtaat 24443932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 221 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 31190926 - 31190722
Alignment:
Q  221 aatactatatgacactctttattatatttatagtaatgttaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatga 320  Q
    |||| |||||| |||| |||||||||||| | |||||||||||||||| |  ||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| |      
T  31190926 aataatatatggcactttttattatatttgttgtaatgttaataaagtccccaga-tagatagttcatgtaatggtatattaagtgtgacttaatcgttt 31190828  T
Q  321 gattacattatcataaagaacactattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagcctattatgtatg 420  Q
    | |||||||| |||||| |||| |||| |||||| ||||| ||||| |||||||| ||| |||   |||||||||||||||  |||| |||||| |||||    
T  31190827 gcttacattaacataaataacattattattaaatatatccttagtc-aagctttagtataaat-tgggataataataaagcaccgagactattacgtatg 31190730  T
Q  421 tagactga 428  Q
    ||| ||||    
T  31190729 taggctga 31190722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 151 - 224
Target Start/End: Original strand, 48813749 - 48813822
Alignment:
Q  151 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgtaaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaata 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  48813749 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaata 48813822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 166 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 25846443 - 25846172
Alignment:
Q  166 tagaggccaatagtttatgtaaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaata----ctatatgacactctttattatatttatagtaatgtta 261  Q
    |||||| ||||| ||||||| ||| ||||  |||||||||||| |||||||||| ||||     ||||||||| |||||||||| ||| | ||||  |||    
T  25846443 tagaggtcaatattttatgttaaatttatgctatgtatcatgacttttattattaaataaaatatatatgacattctttattatgtttgttgtaagatta 25846344  T
Q  262 ataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatca-----taaagaacactattcttaaatgt 356  Q
    ||||| |   || |||||||||||| ||||||   | ||||| |||||||||||||| || |||| ||| ||      |||||| || ||||||||| ||    
T  25846343 ataaaatctctaaaatagatagttcatgtaatggaacattaaatgtgacttaatcattaggttaccttaacagaaagaaaagaaaacaattcttaaaagt 25846244  T
Q  357 atccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagcctattatgtatgtagactgatg 430  Q
    ||  ||| || |||||||||||| ||    ||||||||||||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||    
T  25846243 atatgtattc-aagctttaatat-aagtccggataataataaatcgtagagactattatgcatgtagactgatg 25846172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 259 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 5983157 - 5982988
Alignment:
Q  259 ttaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattcttaaatgtat 358  Q
    |||||||||||| |||||| |||| |||  ||||| | | |||||||| ||||||||| |||||| || |||  |||||||| | |||||||||| |||     
T  5983157 ttaataaagttcctagaattgatatttcaagtaatgaaacattaagtgagacttaatcgtgagataactttaatataaagaataatattcttaaaagtag 5983058  T
Q  359 ccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagcctattatgtatgtagactgatg 430  Q
      |||||| ||| |||||||| |||   ||||| |||||||| ||  || |||||||||||||||| |||||    
T  5983057 ttgtagtc-aagatttaatataaat-tgggatagtaataaagtgtgtagactattatgtatgtagattgatg 5982988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 149 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 31191002 - 31190957
Alignment:
Q  149 attgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgtaaaacttat 194  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  31191002 attgttggtgtaagccttagaggccaataatttatgttaaacttat 31190957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 303 - 435
Target Start/End: Original strand, 19388452 - 19388582
Alignment:
Q  303 agtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcg 402  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||  ||||| |||||| |||||| ||||| |||   ||||||||| |||||     
T  19388452 agtgagacttaatcgtgagattacatcaatataaagaacactatttttaatagtatctgtagtc-aagcttaaatataaat-tgggataataaaaaagca 19388549  T
Q  403 tcgagcctattatgtatgtagactgatgtccat 435  Q
    | |||  |||||||||| |||| ||||| ||||    
T  19388550 tagagattattatgtatatagattgatgaccat 19388582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 235; Significance: 1e-130; HSPs: 22)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 149 - 430
Target Start/End: Original strand, 8612662 - 8612940
Alignment:
Q  149 attgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgtaaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaatactatatgacactctttattatatt 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8612662 attgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaataatatatgacactctttattatatt 8612761  T
Q  249 tatagtaatgttaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattc 348  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8612762 catagtaatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattc 8612861  T
Q  349 ttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagcctattatgtatgtagactgatg 430  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| | |  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8612862 ttaaatgtatccgtagtc-aagctttaatataatt--aggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 8612940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 150 - 430
Target Start/End: Original strand, 16788817 - 16789096
Alignment:
Q  150 ttgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgtaaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaatactatatgacactctttattatattt 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  16788817 ttgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattt 16788916  T
Q  250 atagtaatgttaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattct 349  Q
    | | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||    
T  16788917 aga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattct 16789015  T
Q  350 taaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagcctattatgtatgtagactgatg 430  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16789016 taaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 16789096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 151 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 1586663 - 1586385
Alignment:
Q  151 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgtaaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaatactatatgacactctttattatattta 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  1586663 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaatctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 1586564  T
Q  251 tagtaatgttaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattctt 350  Q
     | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  1586563 ga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacactattctt 1586465  T
Q  351 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagcctattatgtatgtagactgatg 430  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1586464 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 1586385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 150 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 18020397 - 18020118
Alignment:
Q  150 ttgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgtaaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaatactatatgacactctttattatattt 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||     
T  18020397 ttgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattc 18020298  T
Q  250 atagtaatgttaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattct 349  Q
    | | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||    
T  18020297 aga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattattttaaagaacgctattct 18020199  T
Q  350 taaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagcctattatgtatgtagactgatg 430  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18020198 taaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 18020118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 151 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 13995498 - 13995220
Alignment:
Q  151 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgtaaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaatactatatgacactctttattatattta 250  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13995498 tgttggtataagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatgacactctttattatattta 13995399  T
Q  251 tagtaatgttaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattctt 350  Q
     | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||    
T  13995398 ga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaatgctattctt 13995300  T
Q  351 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagcctattatgtatgtagactgatg 430  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13995299 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 13995220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 151 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 22860443 - 22860165
Alignment:
Q  151 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgtaaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaatactatatgacactctttattatattta 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  22860443 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattggataatatatggcactctttattatattta 22860344  T
Q  251 tagtaatgttaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattctt 350  Q
     | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  22860343 ga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctt 22860245  T
Q  351 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagcctattatgtatgtagactgatg 430  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22860244 aaatgaatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 22860165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 149 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 5759036 - 5758758
Alignment:
Q  149 attgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgtaaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaatactatatgacactctttattatatt 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  5759036 attgttggtgtaagccctagaggccaataatttatgttaaacttatcttatgtatgatgacttttattattgaataatatatgatactctttattatatt 5758937  T
Q  249 tatagtaatgttaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattc 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  5758936 tatagtaatgttaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacaatatta 5758837  T
Q  349 ttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagcctattatgtatgtagactgatg 430  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  5758836 ttaaatgtatccgtagt-aaagctttaatataatt--aggataataataaagcgtcgagaatattatgtatgtagactgatg 5758758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 145 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 27508909 - 27508624
Alignment:
Q  145 ggagattgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgtaaaacttatcttatgtatcatgatttttattattg-aatactatatgacactctttatt 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  27508909 ggagattgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctattttatgtatcatgacttttattattgtaataatatatgacactctttatt 27508810  T
Q  244 atatttatagtaatgttaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacac 343  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| |    
T  27508809 atatttaga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatattatagaacgc 27508711  T
Q  344 tattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagcctattatgtatgtagactgatg 430  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  27508710 tattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgtataaaggataataataaagcgtcgagactgttatgtatgtagactgatg 27508624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 151 - 430
Target Start/End: Original strand, 14074227 - 14074505
Alignment:
Q  151 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgtaaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaatactatatgacactctttattatattta 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  14074227 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaaaatatcttatgtatcatgactattattattgaataatatatggcactctttattatattta 14074326  T
Q  251 tagtaatgttaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattctt 350  Q
     | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14074327 ga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcatgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactagtctt 14074425  T
Q  351 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagcctattatgtatgtagactgatg 430  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14074426 aaatgtatatgtagtcaaagctttaatatgaataaagtataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 14074505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 149 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 27528491 - 27528210
Alignment:
Q  149 attgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgtaaaacttatcttatgtatcatgatttttattattg-aatactatatgacactctttattatat 247  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  27528491 attgttggtgtaagccctaaaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgtaataatatatgacactctttattatat 27528392  T
Q  248 ttatagtaatgttaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactatt 347  Q
    ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||| |||||    
T  27528391 ttaga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgaaattacattatattatagaacgctatt 27528293  T
Q  348 cttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagcctattatgtatgtagactgatg 430  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  27528292 cttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactgttatgtatgtagactgatg 27528210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 150 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 20736883 - 20736605
Alignment:
Q  150 ttgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgtaaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaatactatatgacactctttattatattt 249  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  20736883 ttgttggtgtatgccctagaggccaataggttatgttaatcttatgttatgtatcatgacttttattattaaataatatatgccactctttattatattt 20736784  T
Q  250 atagtaatgttaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattct 349  Q
     | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  20736783 gttgtaatgttaataaagttcctagaatagatagttcgtgtaatggtatattaagtttgacttaatcatgagattacattaacataaagaacattattct 20736684  T
Q  350 taaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagcctattatgtatgtagactgatg 430  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||| |||    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20736683 taaatgtatctgtagtc-aagctttaataagaa-ctgggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 20736605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 151 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 17121002 - 17120741
Alignment:
Q  151 tgttggtgtaagccc-tagaggccaatagtttatgtaaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaatactatatgacactctttattatattt 249  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||    
T  17121002 tgttggtgtaagcccctagaggtcaatagtttatgttaaactcatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatgac--tctttattatattt 17120905  T
Q  250 atagtaatgttaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattct 349  Q
    ||| ||||||||||||| | | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||    
T  17120904 ataataatgttaataaaatccctagaatagatagttcgtataataatatattaagtgtgacttagtcatgagattatattatcataaagaacgttattct 17120805  T
Q  350 taaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagcctattat 415  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17120804 taaatgtatccattgtc-aagctttaatatgaat-taggataataataaagcgtcgagactattat 17120741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 151 - 354
Target Start/End: Original strand, 13947501 - 13947704
Alignment:
Q  151 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgtaaaacttatcttatgtatcatgatttttattattg-aatactatatgacactctttattatattt 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  13947501 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgtaataatatatggcactctttattatattt 13947600  T
Q  250 atagtaatgttaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattct 349  Q
    | | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||    
T  13947601 aga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattct 13947699  T
Q  350 taaat 354  Q
    |||||    
T  13947700 taaat 13947704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 151 - 430
Target Start/End: Original strand, 19218179 - 19218454
Alignment:
Q  151 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgtaaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaatactatatgacactctttattatattta 250  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||| |||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||     
T  19218179 tgttggtgtaacccctatagtccaatagtttatgttaaatttatgctatgtatcatgacttttattattaaataatatatggcattctttattatatttg 19218278  T
Q  251 tagtaatgttaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattctt 350  Q
    | ||||  ||||||||||   |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  19218279 ttgtaagattaataaagtctctagaatagatagttcgtgtaatagaatattaagtgtgacttaatcatgtgattacattatcataaagaatgctattctt 19218378  T
Q  351 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagcctattatgtatgtagactgatg 430  Q
    ||| | ||| |||||| ||||||||||||  | |  |||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||    
T  19218379 aaa-gcatcagtagtc-aagctttaatat--aaaggggataataataaagtgtagagactattatgtatgtagactgatg 19218454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 145 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 22560746 - 22560461
Alignment:
Q  145 ggagattgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgtaaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaatactatatgacactctttatta 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||||    |||||||||| || ||||||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  22560746 ggagattgttggtgtaagccctagaagccgatagtttatgttaaaattatgcagtgtatcatgacttctattattaaataatatatgacactttttatta 22560647  T
Q  245 tatttatagtaatgttaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaa--ca 342  Q
    ||||||| | ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||        
T  22560646 tatttattgcaatattaataaggtccttagaatagatagttcgtgtaatgggatattaagtgtgactcaatcatgagatgacattaacattaagaatgtt 22560547  T
Q  343 ctattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagcctattatgtatgtagactgatg 430  Q
     ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||   ||||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||| ||||    
T  22560546 ttatccttaaatgtatccatagtc-aagctttaatataaat-tgggataataataaagcgcagagactattatgcatgtagaccgatg 22560461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 145 - 300
Target Start/End: Original strand, 14996853 - 14997007
Alignment:
Q  145 ggagattgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgtaaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaatactatatgacactctttatta 244  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14996853 ggagattgttggtgtaagatctagaggccaatattttatgttaaacttatcttatgtattatgactttaattattgaataatatatgacactctttatta 14996952  T
Q  245 tatttatagtaatgttaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatatat 300  Q
    |||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14996953 tatttata-taattttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatat 14997007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 151 - 424
Target Start/End: Original strand, 4073320 - 4073595
Alignment:
Q  151 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgtaaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaatactatatgacactctttattatattta 250  Q
    |||||||||||| | |||| ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||  ||||| || ||||||||| ||||     
T  4073320 tgttggtgtaagtcttagatgccaataatttatgttaaacttatgttatgtatcatgatttttatcattaaataaaatatggcattctttattacatttg 4073419  T
Q  251 ta----gtaatgttaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactat 346  Q
    |     ||||  |||||||||| | |||||| |||||||| | ||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||| |||    
T  4073420 tttgttgtaagattaataaagtccatagaattgatagttcatataatggaacattaagtgtgacttaatcatgagattacattaatggaaagaacattat 4073519  T
Q  347 tcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagcctattatgtatgtaga 424  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||  |||||||||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||    
T  4073520 tcttaaaagtatccgtagtcaaa-ctttaatataaat-caggataataataaaacgtagagactattatgtttgtaga 4073595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 221 - 430
Target Start/End: Original strand, 21994406 - 21994613
Alignment:
Q  221 aatactatatgacactctttattatatttatagtaatgttaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatga 320  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||| || | ||||| |||||||||| |  | |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  21994406 aataatatatgatactctttattatacttgttgtaatattaataaagtcccaataatagatagttcgtgtaatggtatattaattgtgacttaatcatga 21994505  T
Q  321 gattacattatcataaagaacactattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagcctattatgtatg 420  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| |||   | ||||||||||||||   || ||||||| ||||    
T  21994506 gattacattaatataaagaacactattcttaaatgtatccatagtc-gagctttaatataaat-tggaataataataaagcgcaaagactattatatatg 21994603  T
Q  421 tagactgatg 430  Q
    ||||||||||    
T  21994604 tagactgatg 21994613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 152 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 10359588 - 10359401
Alignment:
Q  152 gttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgtaaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaatactatatgacactctttattatatttat 251  Q
    |||||||||||   |||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| |||| ||||  |||||||| | ||||| ||| || |    
T  10359588 gttggtgtaagttttagaggtcaatagtttatgttaaacttatcgtatgtattatgatttttaatattaaataaaatatgacattatttatcataattgt 10359489  T
Q  252 agtaatgttaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaaga 339  Q
      |||  ||||||||||   || |||| ||||||  ||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  10359488 tataagattaataaagtctctataatatatagttgatgtgatggaatattaagtgtgacttaatcatgagattacattaatataaaga 10359401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 185
Target Start/End: Original strand, 11248531 - 11248565
Alignment:
Q  151 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgt 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11248531 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgt 11248565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 150 - 224
Target Start/End: Original strand, 21993710 - 21993783
Alignment:
Q  150 ttgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgtaaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaata 224  Q
    |||||||||||||||||| || |||||| ||||||| |||| |||  |||||||||||| |||||||||| ||||    
T  21993710 ttgttggtgtaagccctatag-ccaataatttatgttaaacctatgatatgtatcatgacttttattattaaata 21993783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 332 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 23846760 - 23846668
Alignment:
Q  332 cataaagaacactattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagcctattatgtatgtagact 426  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||   ||||||||||| ||    ||| ||||||||||||||||||    
T  23846760 cataaagaacactattcttaaaagtatctgtagtcaaa-ctttaatataaat-tgggataataatatagtacagagactattatgtatgtagact 23846668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 234; Significance: 1e-129; HSPs: 23)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 145 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 27008078 - 27007794
Alignment:
Q  145 ggagattgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgtaaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaatactatatgacactctttatta 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  27008078 ggagattgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttatta 27007979  T
Q  245 tatttatagtaatgttaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacact 344  Q
    |||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||    
T  27007978 tatttaga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgct 27007880  T
Q  345 attcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagcctattatgtatgtagactgatg 430  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27007879 attcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 27007794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 151 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 22660049 - 22659771
Alignment:
Q  151 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgtaaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaatactatatgacactctttattatattta 250  Q
    |||||||||||| || | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22660049 tgttggtgtaagtccaaaaggccaatagtttatgttaaacttatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatgacactctttattatattta 22659950  T
Q  251 tagtaatgttaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattctt 350  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22659949 ta-taatgttaataaagtccttagaatagatagtttgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattctt 22659851  T
Q  351 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagcctattatgtatgtagactgatg 430  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  22659850 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcaagactattatgtatgtagactgatg 22659771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 150 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 27015216 - 27014937
Alignment:
Q  150 ttgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgtaaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaatactatatgacactctttattatattt 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  27015216 ttgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattt 27015117  T
Q  250 atagtaatgttaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattct 349  Q
    | | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||    
T  27015116 aga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattct 27015018  T
Q  350 taaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagcctattatgtatgtagactgatg 430  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27015017 taaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 27014937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 150 - 430
Target Start/End: Original strand, 28498239 - 28498518
Alignment:
Q  150 ttgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgtaaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaatactatatgacactctttattatattt 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  28498239 ttgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattt 28498338  T
Q  250 atagtaatgttaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattct 349  Q
    | | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||    
T  28498339 aga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattct 28498437  T
Q  350 taaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagcctattatgtatgtagactgatg 430  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28498438 taaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 28498518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 151 - 430
Target Start/End: Original strand, 12561870 - 12562148
Alignment:
Q  151 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgtaaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaatactatatgacactctttattatattta 250  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12561870 tgttggcgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatgacactctttattatattta 12561969  T
Q  251 tagtaatgttaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattctt 350  Q
     | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  12561970 ga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctt 12562068  T
Q  351 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagcctattatgtatgtagactgatg 430  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12562069 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 12562148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 151 - 430
Target Start/End: Original strand, 21969080 - 21969358
Alignment:
Q  151 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgtaaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaatactatatgacactctttattatattta 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  21969080 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 21969179  T
Q  251 tagtaatgttaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattctt 350  Q
     | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  21969180 ga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctt 21969278  T
Q  351 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagcctattatgtatgtagactgatg 430  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21969279 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 21969358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 151 - 430
Target Start/End: Original strand, 26240231 - 26240509
Alignment:
Q  151 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgtaaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaatactatatgacactctttattatattta 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  26240231 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacttatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 26240330  T
Q  251 tagtaatgttaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattctt 350  Q
     | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  26240331 ga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttaaagaacgctattctt 26240429  T
Q  351 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagcctattatgtatgtagactgatg 430  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  26240430 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaagataataataaagcgtcgagactattatgtatgaagactgatg 26240509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 149 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 8371810 - 8371530
Alignment:
Q  149 attgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgtaaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaatactatatgacactctttattatatt 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  8371810 attgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacttatcttatgtatcatgacttttattattgaataatgtatgacactctttattatatt 8371711  T
Q  249 tatagtaatgttaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattc 348  Q
    || | ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  8371710 taga-taatgttaataaagtccttagaatagataattcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttaaataacactattc 8371612  T
Q  349 ttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagcctattatgtatgtagactgatg 430  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8371611 ttaaatgtgtctgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcatcgagactattatgtatgtagactgatg 8371530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 151 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 22131164 - 22130886
Alignment:
Q  151 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgtaaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaatactatatgacactctttattatattta 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  22131164 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcgtgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 22131065  T
Q  251 tagtaatgttaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattctt 350  Q
     | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  22131064 ga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctt 22130966  T
Q  351 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagcctattatgtatgtagactgatg 430  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22130965 aaatttatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 22130886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 151 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 45534828 - 45534550
Alignment:
Q  151 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgtaaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaatactatatgacactctttattatattta 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  45534828 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaatctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 45534729  T
Q  251 tagtaatgttaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattctt 350  Q
     | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||    
T  45534728 ga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaatgctattctt 45534630  T
Q  351 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagcctattatgtatgtagactgatg 430  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  45534629 aaatgtatctgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 45534550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 151 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 27881043 - 27880764
Alignment:
Q  151 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgtaaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaatactatatgacactctttattatattta 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  27881043 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattggataatatatggcactctttattatattta 27880944  T
Q  251 tagtaatgttaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattctt 350  Q
     | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  27880943 ga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaatgatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctt 27880845  T
Q  351 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaat-aaaggataataataaagcgtcgagcctattatgtatgtagactgatg 430  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27880844 aaatgaatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 27880764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 151 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 28021224 - 28020945
Alignment:
Q  151 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgtaaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaatactatatgacactctttattatattta 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  28021224 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattggataatatatggcactctttattatattta 28021125  T
Q  251 tagtaatgttaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattctt 350  Q
     | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  28021124 ga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaatgatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctt 28021026  T
Q  351 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaat-aaaggataataataaagcgtcgagcctattatgtatgtagactgatg 430  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28021025 aaatgaatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 28020945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 151 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 2963489 - 2963217
Alignment:
Q  151 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgtaaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaatactatatgacactctttattatattta 250  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  2963489 tgttggtgtaagccctagatgccaatagtttatgttaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaataatatatgacactttttattatattta 2963390  T
Q  251 tagtaatgtt-aataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattct 349  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2963389 tagtaatgtttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattct 2963290  T
Q  350 taaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagcctattatgtatgtagact 426  Q
    ||||||||| ||| |||||| ||||||||| | |  |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  2963289 taaatgtattcgt-gtcaaa-ctttaatataatt--aggataataataaagcgtagagactattatgtatgtagact 2963217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 151 - 430
Target Start/End: Original strand, 25610941 - 25611220
Alignment:
Q  151 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgtaaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaatactatatgacactctttattatattta 250  Q
    |||| ||||||||||||| ||| |||||||||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  25610941 tgtttgtgtaagccctaggggcaaatagtttatgataaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactccttattatattta 25611040  T
Q  251 tagtaatgttaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattctt 350  Q
     | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  25611041 ga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttagagaacgctattctt 25611139  T
Q  351 -aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagcctattatgtatgtagactgatg 430  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25611140 aaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 25611220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 150 - 415
Target Start/End: Original strand, 6430691 - 6430952
Alignment:
Q  150 ttgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgtaaaacttatcttatgtatcatgatttttatt-attgaatactatatgacactctttattatatt 248  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||| || ||| |||||||||||||||| | ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  6430691 ttgttggtgtaagctctagagaccaatagtttacgttaaatttatcttatgtatcataacttttatttattaaataatatatgacactctttattatatt 6430790  T
Q  249 tatagtaatgttaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattc 348  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6430791 tatagtaatgttaataaagtccttataatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgactta---atgagattacattatcataaataacactattc 6430887  T
Q  349 ttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagcctattat 415  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6430888 ttaaatgtattcgtagtc-aagctttaatatgaat-taggataataataaagcgtcgagactattat 6430952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 151 - 383
Target Start/End: Original strand, 36970023 - 36970253
Alignment:
Q  151 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgtaaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaatactatatgacactctttattatattta 250  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  36970023 tgttggtgtaagcccta-aggccaatagtttatgttaaatttatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatgatactctttattatattta 36970121  T
Q  251 tagtaatgttaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattctt 350  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||    
T  36970122 tagtaatgttaataaagtccctagaatagatagttcatgtaataatatattatgtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacgttgttctt 36970221  T
Q  351 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaat 383  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  36970222 aaatgtatccgtagtc-aagctttaatatgaat 36970253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 254 - 430
Target Start/End: Original strand, 21916525 - 21916701
Alignment:
Q  254 taatgttaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattcttaaa 353  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  21916525 taatgttaataaagtccttagaatagataattcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattcttaaa 21916624  T
Q  354 tgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagcctattatgtatgtagactgatg 430  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21916625 tgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 21916701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 169 - 429
Target Start/End: Original strand, 18835119 - 18835374
Alignment:
Q  169 aggccaatagtttatgtaaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaatactatatgacactctttattatatttatagtaatgttaataaagt 268  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||| ||||| |||| ||||||||| | ||| |||||||| |  |||||||||||||||    
T  18835119 aggcgaatagtttatgttaaacttattttatttatcatgacttttgttattaaataatatatgacaatttttgttatatttgttataatgttaataaagt 18835218  T
Q  269 tcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattcttaaatgtatccgtagtcaa 368  Q
    |||||||||||||||||   | | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  ||||||||||| |||| ||||||      
T  18835219 tcttagaatagatagtt---gcagtagtatattaagtgtgacttaatcatgagattacattaacataaaaaacgttattcttaaatatatctgtagtc-c 18835314  T
Q  369 agctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagcctattatgtatgtagactgat 429  Q
    |||||||||||| ||  |  ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  18835315 agctttaatatggattga-aataataataaagcatcgagactattatgtatgtagactgat 18835374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 150 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 20539954 - 20539751
Alignment:
Q  150 ttgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgtaaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaatactatatgacactctttattatattt 249  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| ||    
T  20539954 ttgttggtgtaagccattgagaccaatagtttatgttaaacttgtgttatgtatcatgacttttattattaaataatatatgacattctttattataatt 20539855  T
Q  250 atagtaatgttaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattct 349  Q
     | ||||  |||||||||| | ||||||||||||||| | ||||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||    
T  20539854 gttgtaagattaataaagtccatagaatagatagttcat-taatggaatattaagtgtgacttaatcatgtgattacattaacataaagaacgttattct 20539756  T
Q  350 taaat 354  Q
    |||||    
T  20539755 taaat 20539751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 145 - 231
Target Start/End: Original strand, 21914304 - 21914390
Alignment:
Q  145 ggagattgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgtaaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaatactatatg 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  21914304 ggagattgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatg 21914390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 151 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 8782365 - 8782166
Alignment:
Q  151 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgtaaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaatactatatgacactctttattatattta 250  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| | ||| ||| || ||||  ||||| || ||||||||||| ||     
T  8782365 tgttggtgtaagccctataggtcaatagtttatgttaaacttatattatgtatcattacttt-attttt-aataaaatatgtcattctttattataattg 8782268  T
Q  251 tagtaatgttaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattctt 350  Q
    | ||||  |||||||||| |||| |||||||||||  ||| ||   ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| || |||||||  |||||||    
T  8782267 ttgtaagattaataaagtccttaaaatagatagttaatgtgatggaatattaaatgtgacttaatcatgggattacattaacagaaagaactatattctt 8782168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 151 - 231
Target Start/End: Original strand, 21862147 - 21862227
Alignment:
Q  151 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgtaaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaatactatatg 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  21862147 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatg 21862227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 150 - 218
Target Start/End: Original strand, 12642209 - 12642277
Alignment:
Q  150 ttgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgtaaaacttatcttatgtatcatgatttttattat 218  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||  || |||||||||| |||||||||    
T  12642209 ttgttggtgtaagccctagaagcctatagtttatgttaaacttacgttgtgtatcatgacttttattat 12642277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 234; Significance: 1e-129; HSPs: 29)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 145 - 430
Target Start/End: Original strand, 15461238 - 15461522
Alignment:
Q  145 ggagattgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgtaaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaatactatatgacactctttatta 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  15461238 ggagattgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttatta 15461337  T
Q  245 tatttatagtaatgttaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacact 344  Q
    |||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||    
T  15461338 tatttaga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgct 15461436  T
Q  345 attcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagcctattatgtatgtagactgatg 430  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15461437 attcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 15461522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 149 - 430
Target Start/End: Original strand, 2676758 - 2677038
Alignment:
Q  149 attgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgtaaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaatactatatgacactctttattatatt 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  2676758 attgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatt 2676857  T
Q  249 tatagtaatgttaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattc 348  Q
    || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||    
T  2676858 taga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattc 2676956  T
Q  349 ttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagcctattatgtatgtagactgatg 430  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2676957 ttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 2677038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 145 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 18111604 - 18111320
Alignment:
Q  145 ggagattgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgtaaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaatactatatgacactctttatta 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  18111604 ggagattgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttgaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttatta 18111505  T
Q  245 tatttatagtaatgttaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacact 344  Q
    |||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||    
T  18111504 tatttaga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgct 18111406  T
Q  345 attcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagcctattatgtatgtagactgatg 430  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18111405 attcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 18111320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 145 - 430
Target Start/End: Original strand, 18162903 - 18163187
Alignment:
Q  145 ggagattgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgtaaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaatactatatgacactctttatta 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  18162903 ggagattgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaatctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttatta 18163002  T
Q  245 tatttatagtaatgttaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacact 344  Q
     ||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||    
T  18163003 catttaga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgct 18163101  T
Q  345 attcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagcctattatgtatgtagactgatg 430  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18163102 attcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 18163187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 149 - 430
Target Start/End: Original strand, 20243682 - 20243962
Alignment:
Q  149 attgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgtaaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaatactatatgacactctttattatatt 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  20243682 attgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaatctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatt 20243781  T
Q  249 tatagtaatgttaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattc 348  Q
    || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||    
T  20243782 taga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattc 20243880  T
Q  349 ttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagcctattatgtatgtagactgatg 430  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20243881 ttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 20243962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 151 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 4676538 - 4676260
Alignment:
Q  151 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgtaaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaatactatatgacactctttattatattta 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  4676538 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaatctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatgacactctttataatattta 4676439  T
Q  251 tagtaatgttaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattctt 350  Q
     | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  4676438 ga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctt 4676340  T
Q  351 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagcctattatgtatgtagactgatg 430  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4676339 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 4676260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 151 - 430
Target Start/End: Original strand, 15814768 - 15815046
Alignment:
Q  151 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgtaaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaatactatatgacactctttattatattta 250  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  15814768 tgttggtgtaagtcctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 15814867  T
Q  251 tagtaatgttaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattctt 350  Q
     | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  15814868 ga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctt 15814966  T
Q  351 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagcctattatgtatgtagactgatg 430  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15814967 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 15815046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 151 - 430
Target Start/End: Original strand, 26531360 - 26531638
Alignment:
Q  151 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgtaaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaatactatatgacactctttattatattta 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  26531360 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatattaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 26531459  T
Q  251 tagtaatgttaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattctt 350  Q
     | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  26531460 ga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctt 26531558  T
Q  351 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagcctattatgtatgtagactgatg 430  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26531559 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 26531638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 151 - 430
Target Start/End: Original strand, 34975298 - 34975576
Alignment:
Q  151 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgtaaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaatactatatgacactctttattatattta 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  34975298 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacttatcttatgtatcatgacttttattattgattaatatatgacactctttattatattta 34975397  T
Q  251 tagtaatgttaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattctt 350  Q
     | ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34975398 ga-taatgttaataaagtccttagaatagatggttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacgctattctt 34975496  T
Q  351 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagcctattatgtatgtagactgatg 430  Q
    ||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34975497 aaatgtatttgtagtcaaagttttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 34975576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 150 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 3369579 - 3369300
Alignment:
Q  150 ttgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgtaaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaatactatatgacactctttattatattt 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  3369579 ttgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattt 3369480  T
Q  250 atagtaatgttaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattct 349  Q
    | | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||    
T  3369479 aga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattct 3369381  T
Q  350 taaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagcctattatgtatgtagactgatg 430  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3369380 taaatatatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaagataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 3369300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 151 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 17300514 - 17300236
Alignment:
Q  151 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgtaaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaatactatatgacactctttattatattta 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  17300514 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcttgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 17300415  T
Q  251 tagtaatgttaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattctt 350  Q
     | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  17300414 ga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgaaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctt 17300316  T
Q  351 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagcctattatgtatgtagactgatg 430  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17300315 aaatgtatccatagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 17300236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 149 - 430
Target Start/End: Original strand, 1941470 - 1941749
Alignment:
Q  149 attgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgtaaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaatactatatgacactctttattatatt 248  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1941470 attgttggtgtaagccctagaggtcaatagtttatgttaaacttattttatgtatcatgacttttattattgaataatatatgacactctttattatatt 1941569  T
Q  249 tatagtaatgttaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattc 348  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  1941570 tatagtaatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacagtatcataaagaacgttattc 1941669  T
Q  349 ttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagcctattatgtatgtagactgatg 430  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  1941670 ttaaatgtattcgtagtc-aagctttaatatgaat-taggataataataaagcgtcgagactattatgtatatagactgatg 1941749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 151 - 430
Target Start/End: Original strand, 5870159 - 5870443
Alignment:
Q  151 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgtaaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaatactatatgacactctttatt------a 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||      |    
T  5870159 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacctttattattgaataatatatgacactctttatttttatta 5870258  T
Q  245 tatttatagtaatgttaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacact 344  Q
    |||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||    
T  5870259 tatttaga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgct 5870357  T
Q  345 attcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagcctattatgtatgtagactgatg 430  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  5870358 attcttaaatgtatctgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcaagactattatgtatgtagactgatg 5870443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 153 - 429
Target Start/End: Original strand, 9487301 - 9487575
Alignment:
Q  153 ttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgtaaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaatactatatgacactctttattatatttata 252  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9487301 ttggtgtaagccctaggggccaataatttatgttaaacttatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatgacactctttattatatttata 9487400  T
Q  253 gtaatgttaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattcttaa 352  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  9487401 gtaatgttaataaagcccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattactttatcataaagaacgttattcttaa 9487500  T
Q  353 atgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagcctattatgtatgtagactgat 429  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||    
T  9487501 atgtatccgtagtc-aagatttaatatgaat-taggataataataaagcgttgagactattatgtatgttgactgat 9487575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 151 - 386
Target Start/End: Original strand, 38816460 - 38816694
Alignment:
Q  151 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgtaaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaatactatatgacactctttattatattta 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  38816460 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattggataatatatggcactctttattatattta 38816559  T
Q  251 tagtaatgttaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattctt 350  Q
     | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  38816560 ga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctt 38816658  T
Q  351 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaa 386  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38816659 aaatgaatccgtagtcaaagctttaatatgaataaa 38816694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 151 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 30041028 - 30040751
Alignment:
Q  151 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgtaaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaatactatatgacactctttattatattta 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||  | || ||||||| ||||||||||||||||     
T  30041028 tgttggtgtaagccctagaggccaataatttatgttaaacttatgttatgtatcatgacttttattatcaattaatatatgatactctttattatatttg 30040929  T
Q  251 tagtaatgttaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattctt 350  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30040928 ttgtaatgttaataaagttcctagaatagatagttcgtgtaatagtatattaagtgtgacttaatcatgagattacattaacataaagaacactattctt 30040829  T
Q  351 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagcctattatgtatgtagactgatg 430  Q
    |||||||||  ||||| |||| |||||||||||   ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  30040828 aaatgtatctatagtc-aagcgttaatatgaat-tgggataataataaagcatcgagactattatgtatatagactgatg 30040751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 155 - 430
Target Start/End: Original strand, 11420768 - 11421041
Alignment:
Q  155 ggtgtaagccctagaggccaatagtttatgtaaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaatactatatgacactctttattatatttatagt 254  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| | ||    
T  11420768 ggtggaagccctagaggccaatggtttatgttaaacttatgttatgtatcatgacttttattattaaataatatatggcactctttattatattttttgt 11420867  T
Q  255 aatgttaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattcttaaat 354  Q
    |||||||||||||| | || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  11420868 aatgttaataaagtccctaaaatagatagttcgtgcaatgatatattaagtgtgatttaatcattagattacattaacataaagaacgctattcttaaat 11420967  T
Q  355 gtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagcctattatgtatgtagactgatg 430  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11420968 gtatccgtagtcaaa-ctttaatatgaat-taggataataataaagcttcgagactattatgtatgtagactgatg 11421041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 150 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 11484473 - 11484265
Alignment:
Q  150 ttgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgtaaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaatactatatgacactctttattatattt 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  11484473 ttgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattt 11484374  T
Q  250 atagtaatgttaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattct 349  Q
    | | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||    
T  11484373 aga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcatgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattct 11484275  T
Q  350 taaatgtatc 359  Q
    ||||||||||    
T  11484274 taaatgtatc 11484265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 271 - 429
Target Start/End: Original strand, 4545948 - 4546104
Alignment:
Q  271 ttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattcttaaatgtatccgtagtcaaag 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||    
T  4545948 ttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttagtcatgagaatactttatcataaagaacgttattcttaaatgtatccgtagt-taag 4546046  T
Q  371 ctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagcctattatgtatgtagactgat 429  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  4546047 ctttaatatgaat-taggataataataaagcgtcgagactattatgtatgttgactgat 4546104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 273 - 430
Target Start/End: Original strand, 19365389 - 19365544
Alignment:
Q  273 agaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattcttaaatgtatccgtagtcaaagct 372  Q
    |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19365389 agaatagatagttcgtgtaatggaatattaagtgtgacttaatcatgagattacattaacgtaaagaacgctattcttaaatgtatccgtagtc-aagct 19365487  T
Q  373 ttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagcctattatgtatgtagactgatg 430  Q
    ||||||| |||   || ||||||||||| || ||| ||||||| || |||||||||||    
T  19365488 ttaatataaat-tggggtaataataaagtgttgagactattatatacgtagactgatg 19365544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 151 - 241
Target Start/End: Original strand, 4545860 - 4545950
Alignment:
Q  151 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgtaaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaatactatatgacactcttta 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4545860 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacttatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatgacactcttta 4545950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 216 - 385
Target Start/End: Original strand, 19362229 - 19362397
Alignment:
Q  216 tattgaatactatatgacactctttattatatttatagtaatgttaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaat 315  Q
    |||| |||| ||||||||| |||||||||||||| | ||||  | |||||||||| ||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||| |||||    
T  19362229 tattaaataatatatgacattctttattatatttgttgtaagatcaataaagttcctagaatagatagttcatgtaatgtaatattaagtgtgagttaat 19362328  T
Q  316 catgagattacattatcataaagaacactattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataa 385  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||| || |||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||    
T  19362329 catgagattacattaacgtaaggaacgcttttcttaaatgtatcagtagtc-aagctttaatataaataa 19362397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 150 - 368
Target Start/End: Original strand, 9537709 - 9537926
Alignment:
Q  150 ttgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgtaaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaatactatatgacactctttattatattt 249  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||  ||||||||| |||| |||||| || | ||||||||| ||    
T  9537709 ttgttggtgtaagccccagaggccaatagtttatgttaaatttatgttatgtatcatga-ctttattattaaataatatatgtca-tttttattataatt 9537806  T
Q  250 atagtaatgttaataaagt-tcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattc 348  Q
     | ||||  ||||||||||  | |||||||||||||||||| |||   |||| ||||||||||  || | ||| |||||||| |||||||||| ||||||    
T  9537807 gttgtaagattaataaagtcccctagaatagatagttcgtgcaatggaatatcaagtgtgactctataaagagtttacattaacataaagaacgctattc 9537906  T
Q  349 ttaaatgtatccgtagtcaa 368  Q
    ||||||||||  ||||||||    
T  9537907 ttaaatgtatatgtagtcaa 9537926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 171 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 5529013 - 5528762
Alignment:
Q  171 gccaatagtttatgtaaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaatactatatgacactctttattatatttatagtaatgttaataaagttc 270  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||  ||||||||| ||||  |||||||| | ||||||||| || | ||||  |||||||| | |    
T  5529013 gccaatagtttatgttaaacttatgttatgtatcatgacatttattattaaatataatatgacattttttattataattgttgtaagattaataaaatcc 5528914  T
Q  271 ttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattcttaaatgtatccgtagtcaaag 370  Q
     ||||||||||||| | ||| ||   ||||| |||| |||||||||| |||||||||||| || |||||||  |||||||||| || | | ||||| |||    
T  5528913 ctagaatagatagtgcatgtgatggaatattcagtgcgacttaatcacgagattacattaacacaaagaactatattcttaaaagtgttcatagtc-aag 5528815  T
Q  371 ctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagcctattatgtatgtaga 424  Q
    |||||| || ||   | ||||||||||||||||  || ||||||||| ||||||    
T  5528814 ctttaa-attaaatcatgataataataaagcgtatagactattatgtttgtaga 5528762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 151 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 39422694 - 39422426
Alignment:
Q  151 tgttggtgtaagccctagaggccaatag-tttatgtaaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaatactatatgacactctttattatattt 249  Q
    |||||||||||| | |||||| |||||| ||||||| |||||||| |||  |||||||||| |||||||| ||||  ||    |||| ||||||||||||    
T  39422694 tgttggtgtaagtcgtagaggtcaatagttttatgttaaacttatgttacatatcatgattgttattattaaataaaatgacgcactatttattatattt 39422595  T
Q  250 atagtaatgttaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattct 349  Q
     | ||||  ||||||| || | || |||| ||||||| ||||||   | |||||  | ||||||||| ||||||||||||| |||| |  ||| ||||||    
T  39422594 gttgtaagattaataatgtccctaaaataaatagttcatgtaatggaaaattaaacgagacttaatcgtgagattacattaacatataagacattattct 39422495  T
Q  350 taaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagcctattatgtatg 420  Q
    |||| ||||  |||| |||| ||||||||||||| |||| || |||||||||||  || ||||||| ||||    
T  39422494 taaaagtatttgtagacaaa-ctttaatatgaattaagg-tagtaataaagcgtatagactattatttatg 39422426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 155 - 350
Target Start/End: Original strand, 56515990 - 56516184
Alignment:
Q  155 ggtgtaagccctagaggccaatagttt-atgtaaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaatactatatgacactctttattatatttatag 253  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||| | || ||| |||| || |||||||| | |||||||||| ||||  ||  |||  |||||||||||||| |      
T  56515990 ggtgtcagccctagaggtcaatagttttaagttaaagttatattttgtatcattacttttattattaaata--atgagactttctttattatatttgttt 56516087  T
Q  254 taatgttaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattctt 350  Q
    |||  |||||||||| |||||||||||| ||| | ||||| | | ||||| |||||||||||  ||||| | ||||| |||| |||||| |||||||    
T  56516088 taagattaataaagtccttagaatagatggttagagtaatgaaacattaattgtgacttaattgtgagacttcattaacatatagaacattattctt 56516184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 150 - 215
Target Start/End: Original strand, 19361596 - 19361661
Alignment:
Q  150 ttgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgtaaaacttatcttatgtatcatgatttttat 215  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||||    
T  19361596 ttgttggtttaagccctataggccaattgtttatgttaaacttatgctatgtatcatgaattttat 19361661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 386 - 430
Target Start/End: Original strand, 32636465 - 32636509
Alignment:
Q  386 aggataataataaagcgtcgagcctattatgtatgtagactgatg 430  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  32636465 aggataataataaagcgtggagactattatgtatgtagactgatg 32636509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 259 - 351
Target Start/End: Original strand, 21797983 - 21798075
Alignment:
Q  259 ttaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattctta 351  Q
    |||||||||||| || |||| |||| ||| ||||||| | |||||| | ||||||||| | |||||| |||| |||| | || ||||||||||    
T  21797983 ttaataaagttcctaaaatatatagatcgagtaataaaacattaagggagacttaatcgtaagattatattaacatacaaaaaactattctta 21798075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 231; Significance: 1e-127; HSPs: 18)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 149 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 7865989 - 7865711
Alignment:
Q  149 attgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgtaaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaatactatatgacactctttattatatt 248  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7865989 attgttggtttaagccctagaggccaatagtttatgttaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaataatatatgacactctttattatatt 7865890  T
Q  249 tatagtaatgttaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattc 348  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7865889 catagtaatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattc 7865790  T
Q  349 ttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagcctattatgtatgtagactgatg 430  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| | |  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7865789 ttaaatgtatccgtagtc-aagctttaatataatt--aggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 7865711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 149 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 12765549 - 12765271
Alignment:
Q  149 attgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgtaaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaatactatatgacactctttattatatt 248  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12765549 attgctggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaataatatatgacactctttattatatt 12765450  T
Q  249 tatagtaatgttaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattc 348  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12765449 tatagtaatgttaataaagtccttaaaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattc 12765350  T
Q  349 ttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagcctattatgtatgtagactgatg 430  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| | |  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12765349 ttaaatgtatccgtagtc-aagctttaatataatt--aggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 12765271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 145 - 430
Target Start/End: Original strand, 31096557 - 31096841
Alignment:
Q  145 ggagattgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgtaaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaatactatatgacactctttatta 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  31096557 ggagattgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacttatcttatgtatcatgactcttattattgaataatatatggcactctttatta 31096656  T
Q  245 tatttatagtaatgttaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacact 344  Q
    |||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  |    
T  31096657 tatttaga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgggattacattatcttaaagaacgtt 31096755  T
Q  345 attcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagcctattatgtatgtagactgatg 430  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31096756 attcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 31096841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 149 - 430
Target Start/End: Original strand, 22940995 - 22941275
Alignment:
Q  149 attgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgtaaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaatactatatgacactctttattatatt 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22940995 attgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatgacactctttattatatt 22941094  T
Q  249 tatagtaatgttaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattc 348  Q
    || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||    
T  22941095 taga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttaaagaatgttattc 22941193  T
Q  349 ttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagcctattatgtatgtagactgatg 430  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22941194 ttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatttgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 22941275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 151 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 24933861 - 24933583
Alignment:
Q  151 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgtaaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaatactatatgacactctttattatattta 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  24933861 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaatctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 24933762  T
Q  251 tagtaatgttaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattctt 350  Q
     | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  24933761 ga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctt 24933663  T
Q  351 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagcctattatgtatgtagactgatg 430  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24933662 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 24933583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 151 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 25805940 - 25805662
Alignment:
Q  151 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgtaaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaatactatatgacactctttattatattta 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  25805940 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 25805841  T
Q  251 tagtaatgttaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattctt 350  Q
     | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  25805840 ga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttaaagaacgctattctt 25805742  T
Q  351 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagcctattatgtatgtagactgatg 430  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25805741 aaatatatccgtagtcgaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 25805662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 149 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 12704433 - 12704155
Alignment:
Q  149 attgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgtaaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaatactatatgacactctttattatatt 248  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12704433 attgctggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaataatatatgacactctttattatatt 12704334  T
Q  249 tatagtaatgttaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattc 348  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12704333 tatagtaatgttaataaagtccttaaaatagatagttcgtgtaataatatattaattgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattc 12704234  T
Q  349 ttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagcctattatgtatgtagactgatg 430  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| | |  |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  12704233 ttaaatgtatccgtagtc-aagctttaatataatt--aggataataataaagcgtcgagactactatgtatgtagactgatg 12704155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 151 - 430
Target Start/End: Original strand, 31646 - 31924
Alignment:
Q  151 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgtaaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaatactatatgacactctttattatattta 250  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  31646 tgttggtgtaagccttagaggccaatagtttatgttaaacctattttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 31745  T
Q  251 tagtaatgttaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattctt 350  Q
     | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  31746 ga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctt 31844  T
Q  351 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagcctattatgtatgtagactgatg 430  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31845 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 31924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 151 - 430
Target Start/End: Original strand, 23545669 - 23545947
Alignment:
Q  151 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgtaaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaatactatatgacactctttattatattta 250  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||    
T  23545669 tgttggtgtgagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgattaatatatggcactctttattatattta 23545768  T
Q  251 tagtaatgttaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattctt 350  Q
     | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  23545769 ga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctt 23545867  T
Q  351 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagcctattatgtatgtagactgatg 430  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23545868 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 23545947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 145 - 430
Target Start/End: Original strand, 20940768 - 20941052
Alignment:
Q  145 ggagattgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgtaaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaatactatatgacactctttatta 244  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  20940768 ggagattgtttgtgtaagccctaaaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttatta 20940867  T
Q  245 tatttatagtaatgttaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacact 344  Q
    |||||| | |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |    
T  20940868 tatttaga-taatgttaataatgtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaactgtgacttaatcatgagattacattatcttaaagaacgtt 20940966  T
Q  345 attcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagcctattatgtatgtagactgatg 430  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20940967 attcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 20941052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 151 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 12790218 - 12789940
Alignment:
Q  151 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgtaaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaatactatatgacactctttattatattta 250  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  12790218 tgttggtgtaagccctaaaggccaatagtttatgttaaatctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 12790119  T
Q  251 tagtaatgttaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattctt 350  Q
     | |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  12790118 ga-taattttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctt 12790020  T
Q  351 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagcctattatgtatgtagactgatg 430  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12790019 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 12789940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 149 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 9812292 - 9812014
Alignment:
Q  149 attgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgtaaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaatactatatgacactctttattatatt 248  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9812292 attgctggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaataatatatgacactctttattatatt 9812193  T
Q  249 tatagtaatgttaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattc 348  Q
    |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  9812192 tatagtaatgctaataaagtccttaaaatagatagttcgtgtaataatatattaattgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactatta 9812093  T
Q  349 ttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagcctattatgtatgtagactgatg 430  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| | |  |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  9812092 ttaaatgtatccgtagtc-aagctttaatataatt--aggataataataaagcgtcgagactactatgtatgtagactgatg 9812014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 151 - 430
Target Start/End: Original strand, 26244850 - 26245127
Alignment:
Q  151 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgtaaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaatactatatgacactctttattatattta 250  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||    
T  26244850 tgttggtgtaagctctggaggccaatagtttatgttaaacttatcttatatatcatgacttttattattgaataatatatgatactcttttttatattta 26244949  T
Q  251 tagtaatgttaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattctt 350  Q
    |||||||||||||||||| | | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||    
T  26244950 tagtaatgttaataaagtccctcgaatagatagttcatgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaatgttattctt 26245049  T
Q  351 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagcctattatgtatgtagactgatg 430  Q
    ||||||||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26245050 aaatgtatctgtaatc-aagctttaatatgaat-aaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 26245127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 165 - 430
Target Start/End: Original strand, 5097414 - 5097676
Alignment:
Q  165 ctagaggccaatagtttatgtaaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaatactatatgacactctttattatatttatagtaatgttaata 264  Q
    |||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| || | |||||||||||||||||||||||||||    
T  5097414 ctagaggctaata-tttatgttaaacttatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcaatttttattatatttatagtaatgttaata 5097512  T
Q  265 aagttcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattcttaaatgtatccgtag 364  Q
    |||| | | ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||  ||||    
T  5097513 aagtccctggaatagatagttcatgtaatgatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattaacataaagaacgttattcttaaatgtatttgtag 5097612  T
Q  365 tcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagcctattatgtatgtagactgatg 430  Q
    || ||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5097613 tc-aagttttaatatgaat-taggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 5097676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 151 - 430
Target Start/End: Original strand, 39535211 - 39535489
Alignment:
Q  151 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgtaaaacttatcttatgtatcatga-tttttattattgaatactatatgacactctttattatattt 249  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  39535211 tgttggtgtatgccctagaggtcaatagtttatgttaaatttacgttatgtatcatgaattttttttattaaataatatatgacactctttattatattt 39535310  T
Q  250 atagtaatgttaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattct 349  Q
     |  ||||||||||||||| | | ||||||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  ||||||    
T  39535311 gttataatgttaataaagtccctggaatagatagttcatataatggtatattaagtgtgacttaatcatgagattacattaccttaaagaacgatattct 39535410  T
Q  350 taaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagcctattatgtatgtagactgatg 430  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  39535411 taaatgtatccgtactcaaa-ctttaatatgaat-tgggataataataaagcgtcaagactattatgtatgtagactgatg 39535489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 153 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 20100793 - 20100520
Alignment:
Q  153 ttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgtaaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaatactatatgacactctttattatatttata 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||  |||||||| |||||||||||||| |     
T  20100793 ttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgtcagacttatgttatgtatcatgacttttattattcaata--atatgacattctttattatatttgtt 20100696  T
Q  253 gtaatgttaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattcttaa 352  Q
    ||||  |||||||||| | ||||||||||||||| | ||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||  |||||||||    
T  20100695 gtaagattaataaagtccatagaatagatagttcatataatggaatattaagtgtgacttaatcatgagattacattaacgtaaataacgttattcttaa 20100596  T
Q  353 atgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagcctattatgtatgtagactgatg 430  Q
    |||||| |||||| ||| ||||||||| |||   ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  20100595 atgtattcgtagttaaa-ctttaatataaat-tgggataataataaagcgtcacgactattatgtatgtagactgatg 20100520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 151 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 26130249 - 26129974
Alignment:
Q  151 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgtaaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaatactatatgacactctttatt--atatt 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||  ||| |    
T  26130249 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgataaacttatgttatgtaacatgacttttattattaaataatatatgacactctttatttaatact 26130150  T
Q  249 tatagtaatgttaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattc 348  Q
    | | ||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||| | | ||||| ||| ||| |||||| || |||    
T  26130149 tgttgtaatattaataaagtctctagaatagatagttcgtgtaatggaatatttagtgtgacttaatcctaatattactttaacattaagaacgctcttc 26130050  T
Q  349 ttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagcctattatgtatgtagact 426  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||   ||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||    
T  26130049 ttaaatgtatccgtagtc-aagctttaatataaat-tgggataataataaagcgcagagaatattatgtatgtagact 26129974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 154 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 31652338 - 31652136
Alignment:
Q  154 tggtgtaagccctagaggccaatagtttatgtaaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaatactatatgacactctttattatatttatag 253  Q
    ||||||||||| || ||||||||| ||||||| |||||||   | |||||||||| |||||||||| ||||  |||   || |||||||||||||| | |    
T  31652338 tggtgtaagccttaaaggccaata-tttatgttaaacttacgctttgtatcatgacttttattattaaataaaataaagcattctttattatatttgttg 31652240  T
Q  254 taatgttaataaagttcttagaatagatagttcg-tgtaat--aatat-attaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattct 349  Q
    |||  |||||||||| | |||||||||||||| | ||| ||  || || |||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||||||| | ||||||    
T  31652239 taagattaataaagtccctagaatagatagtttgttgtgatggaacatcattaagtgagacttaatcgtaagattacattaacataaagaatattattct 31652140  T
Q  350 taaa 353  Q
    ||||    
T  31652139 taaa 31652136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0264 (Bit Score: 230; Significance: 1e-127; HSPs: 2)
Name: scaffold0264
Description:

Target: scaffold0264; HSP #1
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 149 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 4232 - 3952
Alignment:
Q  149 attgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgtaaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaatactatatgacactctttattatatt 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  4232 attgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatt 4133  T
Q  249 tatagtaatgttaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattc 348  Q
    || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||    
T  4132 taga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattc 4034  T
Q  349 ttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagcctattatgtatgtagactgatg 430  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4033 ttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 3952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0264; HSP #2
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 147 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 11089 - 10851
Alignment:
Q  147 agattgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgtaaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaatactatatgacactctttattata 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  11089 agattgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattata 10990  T
Q  247 tttatagtaatgttaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactat 346  Q
    |||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  10989 tttaga-taatgttaataaagtccttagaatagatagtttgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctat 10891  T
Q  347 tcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaa 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10890 tcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaa 10851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 230; Significance: 1e-127; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 149 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 130781 - 130501
Alignment:
Q  149 attgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgtaaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaatactatatgacactctttattatatt 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  130781 attgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatt 130682  T
Q  249 tatagtaatgttaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattc 348  Q
    || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||    
T  130681 taga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattc 130583  T
Q  349 ttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagcctattatgtatgtagactgatg 430  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  130582 ttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 130501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 192 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 138649 - 138471
Alignment:
Q  192 tatcttatgtatcatgatttttattattgaatactatatgacactctttattatatttatagtaatgttaataaagttcttagaatagatagttcgtgta 291  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  138649 tatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatgtcactctttattatatttata-taatgttaataaagtccttagaatagatagtttgtgta 138551  T
Q  292 ataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattcttaaatgtatccgtagtcaaagc 371  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  138550 ataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttaaagaacactattcttaaatgtatccgtagtcaaagc 138471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 141147 - 141113
Alignment:
Q  151 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgt 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  141147 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgt 141113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 230; Significance: 1e-127; HSPs: 16)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 149 - 430
Target Start/End: Original strand, 21033983 - 21034263
Alignment:
Q  149 attgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgtaaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaatactatatgacactctttattatatt 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  21033983 attgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatt 21034082  T
Q  249 tatagtaatgttaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattc 348  Q
    || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||    
T  21034083 taga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattc 21034181  T
Q  349 ttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagcctattatgtatgtagactgatg 430  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21034182 ttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 21034263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 151 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 25979282 - 25979006
Alignment:
Q  151 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgtaaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaatactatatgacactctttattatattta 250  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25979282 tgttggtgtaagtcctagaggccaatagtttatgttaaacttatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatgacactctttattatattta 25979183  T
Q  251 tagtaatgttaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattctt 350  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25979182 tagtaatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacgctattctt 25979083  T
Q  351 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagcctattatgtatgtagactgat 429  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  25979082 aaatgtatccgtagtc-aagctttaatatgaat-taggataataataaagcgtcgagactattatgtatgttgactgat 25979006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 151 - 430
Target Start/End: Original strand, 14890138 - 14890416
Alignment:
Q  151 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgtaaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaatactatatgacactctttattatattta 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14890138 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatgacactctttattatattta 14890237  T
Q  251 tagtaatgttaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattctt 350  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  14890238 ta-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctt 14890336  T
Q  351 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagcctattatgtatgtagactgatg 430  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||    
T  14890337 aaatgtatccgtattcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagtgttgagactattatgtatgtagactgatg 14890416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 151 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 15847091 - 15846813
Alignment:
Q  151 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgtaaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaatactatatgacactctttattatattta 250  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  15847091 tgttggtgtaagcgctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 15846992  T
Q  251 tagtaatgttaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattctt 350  Q
     | ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  15846991 ga-taatgttaataaattccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattttcttaaagaacgctattctt 15846893  T
Q  351 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagcctattatgtatgtagactgatg 430  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15846892 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 15846813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 151 - 426
Target Start/End: Original strand, 21398539 - 21398813
Alignment:
Q  151 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgtaaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaatactatatgacactctttattatattta 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21398539 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacttatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatgacactctttattatattta 21398638  T
Q  251 tagtaatgttaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattctt 350  Q
     | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  21398639 ga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcatgtaattatatattaattgtgacttaatcatgagattacattatcttaaagaacgctattctt 21398737  T
Q  351 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagcctattatgtatgtagact 426  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  21398738 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagtgtcgagactattatgtatgtagact 21398813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 151 - 430
Target Start/End: Original strand, 55426768 - 55427046
Alignment:
Q  151 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgtaaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaatactatatgacactctttattatattta 250  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  55426768 tgttggtgtaagccctagagaccaatagtttatgttaaatctatcttatgtattatgacttttattattgaataatatatgacactctttattatattta 55426867  T
Q  251 tagtaatgttaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattctt 350  Q
     | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  55426868 ga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtatgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctt 55426966  T
Q  351 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagcctattatgtatgtagactgatg 430  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  55426967 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 55427046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 149 - 430
Target Start/End: Original strand, 12299656 - 12299936
Alignment:
Q  149 attgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgtaaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaatactatatgacactctttattatatt 248  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||    
T  12299656 attgttgatgtaagtcctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcgctctttattatatt 12299755  T
Q  249 tatagtaatgttaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattc 348  Q
    || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||    
T  12299756 taga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattc 12299854  T
Q  349 ttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagcctattatgtatgtagactgatg 430  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12299855 ttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaatgataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 12299936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 150 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 20148111 - 20147831
Alignment:
Q  150 ttgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgtaaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaatactatatgacactctttattatattt 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||    
T  20148111 ttgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattggataatatatggcactctttattatattt 20148012  T
Q  250 atagtaatgttaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattct 349  Q
    | | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  20148011 aga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtaacttaatcatgagattacattatcttatagaacactattct 20147913  T
Q  350 taaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaat-aaaggataataataaagcgtcgagcctattatgtatgtagactgatg 430  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20147912 taaatgaatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 20147831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 153 - 398
Target Start/End: Original strand, 28087967 - 28088211
Alignment:
Q  153 ttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgtaaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaatactatatgacactctttattatatttata 252  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  28087967 ttggtgtaatccctaaaggccaatagtttatgttaaacttatcttatgtatcatgacttttattattaaataatatatgacactctttattatatttaga 28088066  T
Q  253 gtaatgttaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattcttaa 352  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28088067 -taatattaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattcttaa 28088165  T
Q  353 atgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataa 398  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28088166 atagatccgtagtcaaagctttaatatgaataaatgataataataa 28088211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 198 - 429
Target Start/End: Original strand, 11787382 - 11787611
Alignment:
Q  198 atgtatcatgatttttattattgaatactatatgacactctttattatatttatagtaatgttaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataata 297  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11787382 atgtatcatgacttttcttattgaataatatatgacactctttattatatttatagtaatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataata 11787481  T
Q  298 tattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataata 397  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  11787482 tattaaatgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacgttattcttaaatgtatctgtagtc-aagctttaatatgaat-taggataataata 11787579  T
Q  398 aagcgtcgagcctattatgtatgtagactgat 429  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  11787580 aagcgtcgagactattatgtatgttgactgat 11787611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 150 - 429
Target Start/End: Original strand, 15526502 - 15526777
Alignment:
Q  150 ttgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgtaaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaatactatatgacactctttattatattt 249  Q
    |||||||||||||||||| |||||| || ||||||| |||||||   || ||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  15526502 ttgttggtgtaagccctataggccattaatttatgttaaacttaagctacgtatcatgacttttattattaaataatatatgacattctttattatattt 15526601  T
Q  250 atagtaatgttaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattct 349  Q
     |  |||  |||||||| | | ||||||| ||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15526602 gttataagattaataaa-tccctagaatatatagttcgtgtaatggaatattaagggtgacttaatcatgagattacattaacataaagaacactattct 15526700  T
Q  350 taaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagcctattatgtatgtagactgat 429  Q
    |||||| ||  |||||| |||||||||||| ||| |  |||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||    
T  15526701 taaatgcatatgtagtc-aagctttaatataaatga--gataataataaagcgtagagactattatgtttgtagactgat 15526777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 150 - 430
Target Start/End: Original strand, 14146768 - 14147046
Alignment:
Q  150 ttgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgtaaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaatactatatgacactctttattatattt 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  14146768 ttgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacttatgttatgtatcatgacttttattattaaataatatatggcactctttattatattt 14146867  T
Q  250 atagtaatgttaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattct 349  Q
     |  |||  ||||||  || | ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| || ||  |||||      
T  14146868 gttataagattaatacggtccatagaatagatagttcgtgtaatggaatattaagtgtgacttaatcatgaaactacattaacattaacaaagctatttc 14146967  T
Q  350 taaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagcctattatgtatgtagactgatg 430  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||| || |||   |||||||||||||||   ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  14146968 taaatgtatctgtagtc-aagctttaacataaat-tgggataataataaagcacagagactattatatatgtagactgatg 14147046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 61 - 158
Target Start/End: Original strand, 3578986 - 3579083
Alignment:
Q  61 cgggctgttacaggagggaccatgagattggtggtgaggggagcttgtgatggtgagtgatgagggtgatgaggggaatgagcaggagattgttggtg 158  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3578986 cgggctgttacaggagggaccatgagattggtggtgaggggagcttgtgatggtgagtgatgagggtggtgaggggaatgagcaggagattggtggtg 3579083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 74 - 158
Target Start/End: Original strand, 3579148 - 3579236
Alignment:
Q  74 gagggaccatgagattggtggtgagggga----gcttgtgatggtgagtgatgagggtgatgaggggaatgagcaggagattgttggtg 158  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3579148 gagggaccatgagattgatggtgaggggatggagcttgtgatggtgagtgatgggggtggtgaggggaatgagcaggagattggtggtg 3579236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 308 - 430
Target Start/End: Original strand, 27432490 - 27432610
Alignment:
Q  308 gacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgag 407  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  || |||| ||| |||   ||||||||||||||||| |||    
T  27432490 gacttaatcgtgagattacattcacataaagattactattcttaaaagtatccgtagtc-gagttttattataaat-tgggataataataaagcgtggag 27432587  T
Q  408 cctattatgtatgtagactgatg 430  Q
      ||||||||||||||| |||||    
T  27432588 gttattatgtatgtagattgatg 27432610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 224
Target Start/End: Original strand, 14225954 - 14226028
Alignment:
Q  151 tgttggtgtaagccctagaggccaatagttt-atgtaaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaata 224  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||| ||| |||| ||| |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  14225954 tgttggtgtaagctctagagaccaatatttttatgttaaatttatgttatgtatcatgacttttattattaaata 14226028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0378 (Bit Score: 228; Significance: 1e-125; HSPs: 1)
Name: scaffold0378
Description:

Target: scaffold0378; HSP #1
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 151 - 430
Target Start/End: Original strand, 8052 - 8330
Alignment:
Q  151 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgtaaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaatactatatgacactctttattatattta 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  8052 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 8151  T
Q  251 tagtaatgttaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattctt 350  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  8152 ta-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctt 8250  T
Q  351 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagcctattatgtatgtagactgatg 430  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8251 aaatgtatccatagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 8330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 228; Significance: 1e-125; HSPs: 11)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 151 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 24229770 - 24229492
Alignment:
Q  151 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgtaaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaatactatatgacactctttattatattta 250  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24229770 tgttggtgtaagccctagaggccaatggtttatgttaaacttatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatgacactctttattatattta 24229671  T
Q  251 tagtaatgttaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattctt 350  Q
     | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  24229670 aa-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcatgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattactttatcataaagaacattattctt 24229572  T
Q  351 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagcctattatgtatgtagactgatg 430  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24229571 aaatgtgtccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 24229492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 151 - 430
Target Start/End: Original strand, 30174124 - 30174402
Alignment:
Q  151 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgtaaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaatactatatgacactctttattatattta 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  30174124 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 30174223  T
Q  251 tagtaatgttaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattctt 350  Q
     | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  30174224 ga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctt 30174322  T
Q  351 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagcctattatgtatgtagactgatg 430  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30174323 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 30174402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 149 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 24250589 - 24250309
Alignment:
Q  149 attgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgtaaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaatactatatgacactctttattatatt 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  24250589 attgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataaaatatggcactctttattatatt 24250490  T
Q  249 tatagtaatgttaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattc 348  Q
    || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||    
T  24250489 taga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgcgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattc 24250391  T
Q  349 ttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagcctattatgtatgtagactgatg 430  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24250390 ttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 24250309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 154 - 430
Target Start/End: Original strand, 19616186 - 19616460
Alignment:
Q  154 tggtgtaagccctagaggccaatagtttatgtaaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaatactatatgacactcttt-attatatttata 252  Q
    |||||||||  |||| || ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| || |||||| |     
T  19616186 tggtgtaagttctagcggtcaatagtttatgttaaacttatattatgtatcatgatttttattattaaataatatatgacactcttttataatatttgtt 19616285  T
Q  253 gtaatgttaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattcttaa 352  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19616286 gtaatgttaataaagttcctagaatagatagttcgtgtaatgatatattaagtgtgacttaatcataagattacattaacataaagaacactattcttaa 19616385  T
Q  353 atgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagcctattatgtatgtagactgatg 430  Q
    ||||||  |||||| ||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19616386 atgtatttgtagtc-aagctttaatatgaat-tgggataataat-aagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 19616460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 157 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 24764105 - 24763834
Alignment:
Q  157 tgtaagccctagaggccaatagtttatgtaaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaatactatatgacactctttattatatttatagtaa 256  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||| |||||||||| |||| || |||  | |||||||||||||| |  |||    
T  24764105 tgtaagccctggaggccaatagtttatgttaaacttatgttatgtataatgacttttattattaaataatacatggaaatctttattatatttgttataa 24764006  T
Q  257 tgttaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattcttaaatgt 356  Q
    |||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||| |||  ||||||||||||     
T  24764005 tgttaataaagtcccaagaatagatagttcatgtaatagtatattaagcgtgacttaatcatgagattatattaacataaaaaacgatattcttaaatgc 24763906  T
Q  357 atccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagcctattatgtatgtagactgatg 430  Q
    ||| ||| || ||||||||||||||||  | |||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  24763905 atctgtactc-aagctttaatatgaattga-gataataataaagcatcgagactattatttatgtagactgatg 24763834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 160 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 15342548 - 15342280
Alignment:
Q  160 aagccctagaggccaatagtttatgtaaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaatactatatgacactctttattatatttatagtaatgt 259  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||| || |||| ||||||||| || |||||||| || | |||   |    
T  15342548 aagccttagaggccaatagtttatgttaaacttatattatgtatcatgacttttattgttaaataatatatgacattcgttattataattcttgtatgat 15342449  T
Q  260 taataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattcttaaatgtatc 359  Q
    ||||||||| | || ||||||| |||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||     
T  15342448 taataaagtccctaaaatagatggttcgtgtaatggaatattaagtgtgatttaatcatgagattacattaccataaagaacactattctttaatgtata 15342349  T
Q  360 cgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagcctattatgtatgtagactgatg 430  Q
     |||||| ||| |||||||| |||   ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||    
T  15342348 tgtagtc-aagatttaatataaat-tgggataataataaagcgtggagactattatgtatgtagattgatg 15342280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 146 - 293
Target Start/End: Original strand, 29800170 - 29800317
Alignment:
Q  146 gagattgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgtaaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaatactatatgacactctttattat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||  || ||||||||| ||||||||||||||| |||||| || ||||||||||    
T  29800170 gagattgttggtgtaagccctagaggacaatattttatgttaaacttatactacgtatcatgacttttattattgaataatatatgtcattctttattat 29800269  T
Q  246 atttatagtaatgttaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaat 293  Q
    | |||| ||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  29800270 aattattgtaagattaataaagtccctagaatagatagttcgtgtaat 29800317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 151 - 369
Target Start/End: Original strand, 21626429 - 21626647
Alignment:
Q  151 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgtaaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaatactatatgacactctttattatattta 250  Q
    |||||||||||| |||||| | ||||||||||||| ||||||||  |||| |||||||  ||||||||||||||  ||| | || ||||||||||||||     
T  21626429 tgttggtgtaagtcctagatgtcaatagtttatgttaaacttatgatatgcatcatgacatttattattgaataaaataaggcattctttattatatttg 21626528  T
Q  251 tagtaatgttaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattctt 350  Q
    |  |||  |||||||||| | | ||||||||||||| ||| ||   | |||||||  ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  21626529 ttataagattaataaagtccctcgaatagatagttcatgtgatggaacattaagtaagacttaatcatgacattacattaacataaagaacaatattctt 21626628  T
Q  351 aaatgtatccgtagtcaaa 369  Q
    ||| ||||||| |||||||    
T  21626629 aaaagtatccgaagtcaaa 21626647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 187 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 28719314 - 28719132
Alignment:
Q  187 aaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaatactatatgacactcttt-attatatttatagtaatgttaataaagttcttagaatagatagtt 285  Q
    ||||||||  |||||||||||| |||||||||| || |  ||| |||| ||||| |||||| |||| ||||  |||||||||| ||||||||| ||||||    
T  28719314 aaacttattatatgtatcatgacttttattattaaacaaaataagacattcttttattatacttattgtaaaattaataaagtccttagaatatatagtt 28719215  T
Q  286 cgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattcttaaatgtatccgtagtcaa 368  Q
    | ||| ||   | |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| | |||||||||| ||||  ||||||||    
T  28719214 catgtgatggaacattaagtgtgacttaatcatgagattacattaacagaaagaatattattcttaaaagtatttgtagtcaa 28719132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 151 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 18852337 - 18852167
Alignment:
Q  151 tgttggtgtaagccctagaggccaatagttt-atgtaaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaatactatatgacactctttattatattt 249  Q
    |||||||||||||| || |  |||||| ||| | || |||||||| || | |||||||| |||||||| | |||| ||   | || ||||||||||||||    
T  18852337 tgttggtgtaagccataaaaaccaataattttaagttaaacttatgttttctatcatgacttttattaataaataatacgaggcattctttattatattt 18852238  T
Q  250 atagtaatgttaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatga 320  Q
     | ||||  |||||||||| | || ||||||||||||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||    
T  18852237 tttgtaagattaataaagtccatataatagatagttcgagtaatgaaacgttaagtgtgacttaatcatga 18852167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 388 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 28719100 - 28719053
Alignment:
Q  388 gataataataaagcgtcgagcctattatgtatgtagactgatgtccat 435  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  28719100 gataataataaaacgtagagactattatgtatgtagactgatgaccat 28719053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 228; Significance: 1e-125; HSPs: 20)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 151 - 430
Target Start/End: Original strand, 9455863 - 9456141
Alignment:
Q  151 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgtaaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaatactatatgacactctttattatattta 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  9455863 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 9455962  T
Q  251 tagtaatgttaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattctt 350  Q
     | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  9455963 ga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctt 9456061  T
Q  351 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagcctattatgtatgtagactgatg 430  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9456062 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 9456141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 151 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 42817544 - 42817266
Alignment:
Q  151 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgtaaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaatactatatgacactctttattatattta 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  42817544 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 42817445  T
Q  251 tagtaatgttaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattctt 350  Q
     | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  42817444 ga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctt 42817346  T
Q  351 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagcctattatgtatgtagactgatg 430  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  42817345 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 42817266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 145 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 22670818 - 22670534
Alignment:
Q  145 ggagattgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgtaaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaatactatatgacactctttatta 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||    
T  22670818 ggagattgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattggataatatatggcactctttatta 22670719  T
Q  245 tatttatagtaatgttaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacact 344  Q
    |||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||    
T  22670718 tatttaga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgct 22670620  T
Q  345 attcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagcctattatgtatgtagactgatg 430  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22670619 attcttaaatgaatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 22670534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 149 - 430
Target Start/End: Original strand, 35930327 - 35930607
Alignment:
Q  149 attgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgtaaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaatactatatgacactctttattatatt 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  35930327 attgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacttatcttatgtataatgacttttattattgaataatatatgacactctttattatatt 35930426  T
Q  249 tatagtaatgttaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattc 348  Q
    || | ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  35930427 taga-taatgttaataaagtccttagaatagatagtttgtgtaataatatattaagtgcgacttaatcatgagattacattatcataaagaacgctattc 35930525  T
Q  349 ttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagcctattatgtatgtagactgatg 430  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  35930526 ttaaatgtatccgtagtcaaaactttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatatagactgatg 35930607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 150 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 19706995 - 19706716
Alignment:
Q  150 ttgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgtaaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaatactatatgacactctttattatattt 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  19706995 ttgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatgtcactctttattatattt 19706896  T
Q  250 atagtaatgttaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattct 349  Q
    | |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  19706895 aaac-aatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaatgatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttaaagaacgctattct 19706797  T
Q  350 taaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagcctattatgtatgtagactgatg 430  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19706796 taaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 19706716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 151 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 20391794 - 20391516
Alignment:
Q  151 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgtaaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaatactatatgacactctttattatattta 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  20391794 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgagaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 20391695  T
Q  251 tagtaatgttaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattctt 350  Q
     | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  20391694 ga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctt 20391596  T
Q  351 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagcctattatgtatgtagactgatg 430  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20391595 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 20391516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 151 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 43802920 - 43802642
Alignment:
Q  151 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgtaaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaatactatatgacactctttattatattta 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  43802920 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacatatcttatgtatcatgacttttaatattgaataatatatgacactctttattatattta 43802821  T
Q  251 tagtaatgttaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattctt 350  Q
     | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  43802820 ga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaattatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttaaagaacgctattctt 43802722  T
Q  351 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagcctattatgtatgtagactgatg 430  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  43802721 aaatgtattcgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 43802642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 151 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 47668029 - 47667751
Alignment:
Q  151 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgtaaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaatactatatgacactctttattatattta 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  47668029 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 47667930  T
Q  251 tagtaatgttaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattctt 350  Q
     | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  47667929 ga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcatgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctt 47667831  T
Q  351 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagcctattatgtatgtagactgatg 430  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  47667830 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 47667751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 145 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 28135284 - 28135000
Alignment:
Q  145 ggagattgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgtaaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaatactatatgacactctttatta 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  28135284 ggagattgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttatta 28135185  T
Q  245 tatttatagtaatgttaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacact 344  Q
    |||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||    
T  28135184 tatttaga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatctttaagaacgct 28135086  T
Q  345 attcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagcctattatgtatgtagactgatg 430  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  28135085 attattaaatgtatctgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagacaattatgtatgtagactgatg 28135000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 151 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 20780200 - 20779922
Alignment:
Q  151 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgtaaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaatactatatgacactctttattatattta 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  20780200 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttatatttatcttatgtatcatgacttttattattgtataatatatggcactctttattatattta 20780101  T
Q  251 tagtaatgttaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattctt 350  Q
     | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  20780100 ga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctt 20780002  T
Q  351 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagcctattatgtatgtagactgatg 430  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20780001 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 20779922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 151 - 430
Target Start/End: Original strand, 22612234 - 22612517
Alignment:
Q  151 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgtaaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaa-tactatatgacactctttattatattt 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||    
T  22612234 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaaataatatatggcactctttattatattt 22612333  T
Q  250 atagtaatgttaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattct 349  Q
    | | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||    
T  22612334 aga-taatgttaataaagtccttagaatagaaagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattct 22612432  T
Q  350 taaatgtatc----cgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagcctattatgtatgtagactgatg 430  Q
    ||||| |||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22612433 taaatatatatattcgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagactgatg 22612517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 150 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 22235030 - 22234827
Alignment:
Q  150 ttgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgtaaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaatactatatgacactctttattatattt 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  22235030 ttgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaatctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattt 22234931  T
Q  250 atagtaatgttaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattct 349  Q
    | | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||    
T  22234930 aga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattct 22234832  T
Q  350 taaat 354  Q
    |||||    
T  22234831 taaat 22234827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 144 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 26923907 - 26923675
Alignment:
Q  144 aggagattgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgtaaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaatactatatgacactctttatt 243  Q
    ||||||||||||||||||| || | || ||| ||| |||||| |||||||||||||||||||    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  26923907 aggagattgttggtgtaagtcccaaagtccattaggttatgttaaacttatcttatgtatcac---ttttattattaaataatatatgacactctttatt 26923811  T
Q  244 atatttatagtaatgttaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacac 343  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||       
T  26923810 atatttgtagtgatgttaataaagtttctagaatagatagttcgtgtaattgtatattgagtgtgacttaatcattagattacattaacataaataatgt 26923711  T
Q  344 tattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatg 380  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26923710 tattcttaaatgtatccgtagtc-aagctttaatatg 26923675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 228 - 430
Target Start/End: Original strand, 633773 - 633959
Alignment:
Q  228 tatgacactctttattatatttatagtaatgttaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattaca 327  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||              ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  633773 tatgccactctttattatatttatagtaatgttaataaagt--------------gttcgtgtaataatatattaagtgtaacttaatcatgagattaaa 633858  T
Q  328 ttatcataaagaacactattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagcctattatgtatgtagactg 427  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  633859 ttatcataaagaacattatttttaaatgtatccgtagtc-aagctttaatatgaat-aaggataataacaaagcgtcgagactattatgtatgtagactg 633956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 146 - 430
Target Start/End: Original strand, 8727407 - 8727692
Alignment:
Q  146 gagattgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgtaa-aacttatcttatgtatcatgatttttattattgaatactatatgacactctttatta 244  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||| |||  |||||| |  |||| |||| |||| |||||| |||||||||| |    
T  8727407 gagaatgttggtgtaagccctagaggccaatggtttatgttataacttatattacatatcataacatttactattaaataatatatggcactctttatca 8727506  T
Q  245 tatttatagtaatgttaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacact 344  Q
    || || |  ||||||||||||||| | ||||||| ||  ||||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||  |    
T  8727507 tacttgttataatgttaataaagtccctagaataaatt-ttcgtgtaattttatattaagtgtgactaaatcataagattactttaacataaagaacgtt 8727605  T
Q  345 attcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaat--aaaggataataataaagcgtcgagcctattatgtatgtagactgatg 430  Q
    ||||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||||  | |  ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  8727606 attctgaaatctatctgtagtcaaa-ctttaatatgaattgagataataataataaagcgtcgagactattatctatgtagactgatg 8727692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 150 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 21881932 - 21881653
Alignment:
Q  150 ttgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgtaaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaatactatat--gacactctttattatat 247  Q
    |||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| | |||||| |  || ||||||||| ||||||||||||||| |||||  | || | ||||||||||    
T  21881932 ttgttggtgtaagctctataggtcaatagtttatcttaaacttttgctacgtatcatgacttttattattgaataatatatatggcatt-tttattatat 21881834  T
Q  248 ttatagtaatgttaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactatt 347  Q
    || | ||||  | |||||||| |  |||||||||||||||||| ||   ||||||||||| | ||||||||||||||||||||   |||||||  | |||    
T  21881833 ttgttgtaagataaataaagtccagagaatagatagttcgtgtgatggaatattaagtgttaattaatcatgagattacattaatgtaaagaatgcaatt 21881734  T
Q  348 cttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagcctattatgtatgtagactgatg 430  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||| |||  |||||||| |||||| ||| || ||||||| ||||||||| ||||    
T  21881733 cttaaatgtatccgtagtc-aatctttaatataaat-taggataatgataaagtgtcaagactattatttatgtagaccgatg 21881653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 227 - 421
Target Start/End: Original strand, 29096548 - 29096739
Alignment:
Q  227 atatgacactctttattatatttatagtaatgttaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattac 326  Q
    |||||||| ||||||||||| || |  |||  |||||||||| | ||||||||||||||| ||| ||   |||||||||||||||||||| | |||||||    
T  29096548 atatgacattctttattataattgttctaagattaataaagtccctagaatagatagttcatgtgatggaatattaagtgtgacttaatcgtaagattac 29096647  T
Q  327 attatcataaagaacactattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagcctattatgtatgt 421  Q
    |||| || |||||||  |||||||||| ||||  |||||| ||||||| ||||  ||  | |||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  29096648 attaacaaaaagaactttattcttaaaagtatatgtagtc-aagcttt-atatatatcga-gataataataaagcgtagagactattatgtatgt 29096739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 150 - 185
Target Start/End: Original strand, 14482298 - 14482333
Alignment:
Q  150 ttgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgt 185  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14482298 ttgttagtgtaagccctagaggccaatagtttatgt 14482333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 203 - 282
Target Start/End: Original strand, 16435649 - 16435728
Alignment:
Q  203 tcatgatttttattattgaatactatatgacactctttattatattt-atagtaatgttaataaagttcttagaatagata 282  Q
    |||||| |||||||||| ||||  ||  |||| |||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||||||||||||||    
T  16435649 tcatgacttttattattaaataaaatgagacattctttattatattttata-taagattaataaagttcttagaatagata 16435728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 389 - 429
Target Start/End: Original strand, 16435837 - 16435877
Alignment:
Q  389 ataataataaagcgtcgagcctattatgtatgtagactgat 429  Q
    ||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||    
T  16435837 ataataataaagcgtagagactaatatgtatgtagactgat 16435877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0393 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 1)
Name: scaffold0393
Description:

Target: scaffold0393; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 153 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 15376 - 15100
Alignment:
Q  153 ttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgtaaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaatactatatgacactctttattatatttata 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |    
T  15376 ttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatttaga 15277  T
Q  253 gtaatgttaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattcttaa 352  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  15276 -taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttaaagaacgctattcttaa 15178  T
Q  353 atgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagcctattatgtatgtagactgatg 430  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15177 atgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcatcgagactattatgtatgtagactgatg 15100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 224; Significance: 1e-123; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 151 - 430
Target Start/End: Original strand, 119477 - 119755
Alignment:
Q  151 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgtaaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaatactatatgacactctttattatattta 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  119477 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 119576  T
Q  251 tagtaatgttaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattctt 350  Q
     | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  119577 ga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctt 119675  T
Q  351 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagcctattatgtatgtagactgatg 430  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  119676 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtacgtagactgatg 119755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0376 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 1)
Name: scaffold0376
Description:

Target: scaffold0376; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 149 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 12085 - 11807
Alignment:
Q  149 attgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgtaaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaatactatatgacactctttattatatt 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||    
T  12085 attgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaataatatatgacattctttattgtatt 11986  T
Q  249 tatagtaatgttaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattc 348  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11985 tatagtaatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattc 11886  T
Q  349 ttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagcctattatgtatgtagactgatg 430  Q
    ||||||||||| |||||| || ||||||||| | |  |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||    
T  11885 ttaaatgtatctgtagtc-aatctttaatataatt--aggataataataaagcgtcgaaactattatgtatgtagattgatg 11807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 149 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 67930 - 67651
Alignment:
Q  149 attgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgtaaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaatactatatgacactctttattatatt 248  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  67930 attgttggtgtaagccctagaggtcaatagtttatgttaaacttattttatgtatcatgacttttattattgaataatatatgacactctttattatatt 67831  T
Q  249 tatagtaatgttaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattc 348  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  67830 tatagtaatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacagtatcataaagaacgttattc 67731  T
Q  349 ttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagcctattatgtatgtagactgatg 430  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  67730 ttaaatgtattcgtagtc-aagctttaatatgaat-taggataataataaagcgtcgagactattatgtatatagactgatg 67651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 1)
Name: scaffold0063
Description:

Target: scaffold0063; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 151 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 45502 - 45226
Alignment:
Q  151 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgtaaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaatactatatgacactctttattatattta 250  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  45502 tgttggtgtaagcccaaaaggccaatagtttctgttaaacttatcttatgcatcatgacttttattattgaataatatatgacactctttattatattta 45403  T
Q  251 tagtaatgttaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattctt 350  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  45402 tagtaatgttaataaagtccttacaatagatagttcttgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacgctattctt 45303  T
Q  351 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagcctattatgtatgtagactgat 429  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  45302 aaatgtatccgtagtc-aagctttaatattaat-taggataataataaagcgtcgagactattatgtatgttgactgat 45226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2089 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: scaffold2089
Description:

Target: scaffold2089; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 150 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 274 - 1
Alignment:
Q  150 ttgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgtaaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaatactatatgacactctttattatattt 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  274 ttgttggtgtaagccctagaggccaatagtttttgttaaacctatcttatgtatcatgacctttattattgaataatatatggcactctttattatattt 175  T
Q  250 atagtaatgttaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattct 349  Q
    | | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||    
T  174 aga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgcgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattct 76  T
Q  350 taa----atgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagcctattatgtatg 420  Q
    |||    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  75 taaatatatatatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagactattatgtatg 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 186; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 149 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 40251 - 40015
Alignment:
Q  149 attgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgtaaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaatactatatgacactctttattatatt 248  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  40251 attgttggtgtaagccctagaggtcaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatt 40152  T
Q  249 tatagtaatgttaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattc 348  Q
    || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||    
T  40151 taga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttaaagaacgttattc 40053  T
Q  349 ttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaa 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40052 ttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaa 40015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 175; Significance: 5e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 151 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 19389 - 19160
Alignment:
Q  151 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgtaaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaatactatatgacactctttattatattta 250  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  19389 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttataaaaaaaatatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattta 19290  T
Q  251 tagtaatgttaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattctt 350  Q
     | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  19289 ga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagaacgctattctt 19191  T
Q  351 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatga 381  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19190 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatga 19160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061 (Bit Score: 155; Significance: 4e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0061
Description:

Target: scaffold0061; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 151 - 341
Target Start/End: Original strand, 76307 - 76496
Alignment:
Q  151 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgtaaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaatactatatgacactctttattatattta 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  76307 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacttatcttatgtatcatgacttttaatattgaataaaatatgacactctttattatattta 76406  T
Q  251 tagtaatgttaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaac 341  Q
     | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  76407 ga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaac 76496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 154; Significance: 2e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 151 - 430
Target Start/End: Original strand, 8847 - 9135
Alignment:
Q  151 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgtaaaacttatcttatgtatcatg-atttttattatt-gaatactatatgacactctttattatatt 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| | |||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  8847 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaatctatcttatgtatcatgtacttttattattagaataatatatggcactctttattatatt 8946  T
Q  249 tatagtaatgttaataaagttc-ttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaag-aacactat 346  Q
    || | ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||| ||||    
T  8947 taga-taatgttaataaagtaccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcttatagtaacgctat 9045  T
Q  347 tctt-aaatgtatccgtagtc-aaagc-tttaatatgaat-aaaggataat-aataaagcgt-cgagcctattatgtatgtagactgatg 430  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  9046 tcttaaaatgtatccgtagtcaaaagcttttaatatgaataaaaggataataaataaagcgtacgagactattatgtatgtagactgatg 9135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 152; Significance: 2e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 151 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 40542 - 40265
Alignment:
Q  151 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgtaaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaatactatatgacactctttattatattta 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||     
T  40542 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacttatgctatgtagcatgacttttattattaaataatatatgacactctttattatatttt 40443  T
Q  251 tagtaatgttaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattctt 350  Q
    | ||||| ||||||||||   | ||||||||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||| ||||||||    
T  40442 ttgtaatattaataaagtctctggaatagataattcatgtaatggtatattaagtgtgacttaatcatgagaatacattaacgtaaagaacgctattctt 40343  T
Q  351 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagcctattatgtatgtagactgatg 430  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||| |||  | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  40342 aaatgtatccatagtc-aagctttaatataaattga-gataataataaagcgccgagactattatgtatgtagactgatg 40265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0086 (Bit Score: 151; Significance: 1e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0086
Description:

Target: scaffold0086; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 151 - 430
Target Start/End: Original strand, 53521 - 53790
Alignment:
Q  151 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgtaaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaatactatatgacactctttattatattta 250  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||| |    
T  53521 tgttggtgtaagccctagaggtcaatagtttatgttaaacttatcttatatatcatgacttttattattgaataatatatgacactctttattcgattca 53620  T
Q  251 tagtaatgttaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattctt 350  Q
    |||||||||||||||||| | |||| || ||||||| |||||| ||||||||||||||        |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  53621 tagtaatgttaataaagtccctagagtaaatagttcatgtaatgatatattaagtgtg--------atgagattacattaacataaagaacactattctt 53712  T
Q  351 aaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagcctattatgtatgtagactgatg 430  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||| |||||    
T  53713 aaatgtatccgtattc-aagctttaatatgaat-taggataataataaagtgtcaagactattatgtatgtagattgatg 53790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0466 (Bit Score: 150; Significance: 4e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0466
Description:

Target: scaffold0466; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 166 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 13489 - 13226
Alignment:
Q  166 tagaggccaatagtttatgtaaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaatactatatgacactctttattatatttatagtaatgttaataa 265  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| | ||||| ||||||||| |||||||| ||||||    
T  13489 tagaggccaatagtttatgttaaatttatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggctctcttaattatatttgtagtaatgctaataa 13390  T
Q  266 agttcttagaatagatagttcgtgt-aataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattcttaaatgtatccgtag 364  Q
    ||| | ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |||    
T  13389 agtccctagaatagatagttcatgtaaatgatatattaagtgtgatttaatcatgagattacattaacataaaaaacagtattcttaaatgtatccatag 13290  T
Q  365 tcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagcctattatgtatgtagactgatg 430  Q
    || |||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  13289 tc-aagctttaatattaat-tgggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtagaccgatg 13226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 147; Significance: 2e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 150 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 18970 - 18789
Alignment:
Q  150 ttgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgtaaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaatactatatgacactctttattatattt 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  18970 ttgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatattt 18871  T
Q  250 atagtaatgttaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatc 332  Q
    | | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18870 aga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatc 18789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0112 (Bit Score: 145; Significance: 4e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0112
Description:

Target: scaffold0112; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 226 - 430
Target Start/End: Original strand, 5 - 208
Alignment:
Q  226 tatatgacactctttattatatttatagtaatgttaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagatta 325  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5 tatatggcactctttattatatttaga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcatgtaataatatattaagtgtgacttaataatgagatta 103  T
Q  326 cattatcataaagaacactattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagcctattatgtatgtagac 425  Q
    ||||||| || ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  104 cattatcttatagaacgctgttcttaaatgtatctgtagtcaaagctttaatatgaataatggataataataaagcgtcgagactattatgtatgtcgac 203  T
Q  426 tgatg 430  Q
    |||||    
T  204 tgatg 208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1948 (Bit Score: 144; Significance: 1e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold1948
Description:

Target: scaffold1948; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 149 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 1171 - 961
Alignment:
Q  149 attgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgtaaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaatactatatgacactctttattatatt 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  1171 attgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatatggcactctttattatatt 1072  T
Q  249 tatagtaatgttaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattc 348  Q
    || | ||||||||||||||| |||| |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  |||||    
T  1071 taga-taatgttaataaagtccttataatagatagtttttttaataatatattaagtgtgacttaatcatgtgattacattatcttaaagaacgttattc 973  T
Q  349 ttaaatgtatcc 360  Q
    ||||||||||||    
T  972 ttaaatgtatcc 961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0611 (Bit Score: 110; Significance: 3e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0611
Description:

Target: scaffold0611; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 151 - 308
Target Start/End: Original strand, 9516 - 9672
Alignment:
Q  151 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgtaaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaatactatatgacactctttattatattta 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| || |||||||||| |||||||    
T  9516 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattatggaataatatgtggcactctttataatattta 9615  T
Q  251 tagtaatgttaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtg 308  Q
     | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9616 ga-taatgttaataaagtccttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtg 9672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 108; Significance: 4e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 149 - 268
Target Start/End: Original strand, 13738 - 13857
Alignment:
Q  149 attgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgtaaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaatactatatgacactctttattatatt 248  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13738 attgttggtgtaagccctagagaccaatagtttatgttaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaataatatatgacactctttattatatt 13837  T
Q  249 tatagtaatgttaataaagt 268  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  13838 tatagtaatgttaataaagt 13857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 99; Significance: 1e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 210 - 364
Target Start/End: Original strand, 26413 - 26567
Alignment:
Q  210 ttttattattgaatactatatgacactctttattatatttatagtaatgttaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtga 309  Q
    |||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||  | |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  26413 ttttattattaaataatatatggcactctttattatattcgttgtaatgttaataaagtccctagaatagatagttcgtgtaatcgtatattaagtgtga 26512  T
Q  310 cttaatcatgagattacattatcataaagaacactattcttaaatgtatccgtag 364  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| ||||    
T  26513 cttaatcatgagattacattataataaagaacgttattcttaaatgtatcagtag 26567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0059 (Bit Score: 95; Significance: 3e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0059
Description:

Target: scaffold0059; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 151 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 34060 - 33927
Alignment:
Q  151 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgtaaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaatactatatgacactctttattatattta 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||    
T  34060 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatgacttttattattgaataatatgtggcactctttattatattta 33961  T
Q  251 tagtaatgttaataaagttcttagaatagatagtt 285  Q
     | ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33960 ga-taatgttaataaagtccttagaatagatagtt 33927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0136 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0136
Description:

Target: scaffold0136; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 149 - 430
Target Start/End: Original strand, 8477 - 8756
Alignment:
Q  149 attgttggtgtaagccctagaggccaatagttt-atgtaaaacttatcttatgtatcatgatttttattattgaatactatatgacactctttattatat 247  Q
    |||||||||||||  ||||||||  |||||||| |||| ||| |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||  ||  |  | ||||||| | ||    
T  8477 attgttggtgtaaatcctagaggttaatagttttatgttaaaattattttatgtatcgtgatttttattattaaataaaatgaggtattctttatgaaat 8576  T
Q  248 tt-atagtaatgttaataaagttcttagaatagatagttcgtgtaataatatattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactat 346  Q
    || ||| |||| |||||||||| ||||||||| |||||||  |||||   | |||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8577 ttgata-taatattaataaagtccttagaatatatagttcaagtaatgg-acattatgtgagacttaatcatgagattacattaacataaagaacactat 8674  T
Q  347 tcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataataaagcgtcgagcctattatgtatgtagactgatg 430  Q
    ||||||| ||||  |||||| ||| |||||||| |||  | |||| ||||||||||| ||| ||| |||||||||||| |||||    
T  8675 tcttaaaagtatttgtagtc-aagttttaatataaattga-gatagtaataaagcgtagagactaatatgtatgtagattgatg 8756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0783 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0783
Description:

Target: scaffold0783; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 151 - 208
Target Start/End: Original strand, 6227 - 6284
Alignment:
Q  151 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgtaaaacttatcttatgtatcatga 208  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  6227 tgttggtgtaagccctagaagccaatagtttatgttaaacctatcttatgtatcatga 6284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 297 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 83423 - 83292
Alignment:
Q  297 atattaagtgtgacttaatcatgagattacattatcataaagaacactattcttaaatgtatccgtagtcaaagctttaatatgaataaaggataataat 396  Q
    |||||||||| ||||||||  |||||||| |||  || |||||| |||||||||||| |||||||||||| ||  |||||||| |||  | |||||||||    
T  83423 atattaagtgagacttaattgtgagattaaattcacacaaagaatactattcttaaaagtatccgtagtcgaa-atttaatataaattga-gataataat 83326  T
Q  397 aaagcgtcgagcctattatgtatgtagactgatg 430  Q
    |||| ||  || ||||||||||||||||||||||    
T  83325 aaagtgtatagactattatgtatgtagactgatg 83292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1400 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1400
Description:

Target: scaffold1400; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 200
Target Start/End: Original strand, 1826 - 1875
Alignment:
Q  151 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgtaaaacttatcttatg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  1826 tgttggtgtaagccctagaggccaatagtttatgttaaacctatcttatg 1875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University