View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF9839A_low_389 (Length: 235)

Name: NF9839A_low_389
Description: NF9839A
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF9839A_low_389
NF9839A_low_389
[»] chr3 (57 HSPs)
chr3 (1-235)||(31031851-31032085)
chr3 (1-235)||(8000971-8001205)
chr3 (1-235)||(10647484-10647718)
chr3 (1-235)||(11105974-11106208)
chr3 (1-235)||(35885177-35885411)
chr3 (1-235)||(51786434-51786668)
chr3 (1-235)||(4421326-4421560)
chr3 (1-235)||(4688066-4688300)
chr3 (1-235)||(15736709-15736943)
chr3 (1-235)||(18055673-18055907)
chr3 (1-235)||(29144371-29144605)
chr3 (4-235)||(4792253-4792484)
chr3 (4-235)||(22383196-22383427)
chr3 (1-235)||(4726041-4726275)
chr3 (1-235)||(5591972-5592206)
chr3 (1-235)||(6538357-6538591)
chr3 (1-235)||(7077617-7077851)
chr3 (1-235)||(8285085-8285319)
chr3 (1-235)||(15888320-15888554)
chr3 (1-235)||(18335041-18335275)
chr3 (1-235)||(21679114-21679348)
chr3 (1-235)||(28111569-28111803)
chr3 (1-235)||(28343588-28343822)
chr3 (1-235)||(29660585-29660819)
chr3 (1-235)||(32443562-32443796)
chr3 (1-235)||(5471399-5471633)
chr3 (1-235)||(5604929-5605163)
chr3 (1-235)||(5715484-5715718)
chr3 (1-235)||(5726394-5726628)
chr3 (1-235)||(5765740-5765974)
chr3 (1-235)||(18287968-18288202)
chr3 (1-235)||(18303269-18303503)
chr3 (1-235)||(20572458-20572692)
chr3 (1-235)||(22866463-22866697)
chr3 (1-235)||(22881522-22881756)
chr3 (1-235)||(24332574-24332808)
chr3 (1-235)||(31960070-31960304)
chr3 (1-235)||(32295039-32295273)
chr3 (1-235)||(48470338-48470572)
chr3 (1-235)||(5018125-5018359)
chr3 (1-235)||(6206315-6206549)
chr3 (1-235)||(17980564-17980798)
chr3 (1-235)||(18229607-18229841)
chr3 (1-235)||(47027864-47028098)
chr3 (1-235)||(4342291-4342525)
chr3 (1-234)||(19698902-19699135)
chr3 (1-235)||(20070451-20070685)
chr3 (1-235)||(28025692-28025926)
chr3 (1-234)||(16620105-16620338)
chr3 (1-230)||(17972476-17972705)
chr3 (1-180)||(4628251-4628430)
chr3 (1-235)||(10400555-10400789)
chr3 (1-235)||(18247152-18247386)
chr3 (3-143)||(5656637-5656777)
chr3 (1-56)||(8216224-8216279)
chr3 (150-235)||(5654496-5654581)
chr3 (155-235)||(8216146-8216226)
[»] chr6 (45 HSPs)
chr6 (1-235)||(27625226-27625460)
chr6 (1-235)||(27285879-27286113)
chr6 (1-235)||(24868163-24868397)
chr6 (1-235)||(13294466-13294700)
chr6 (1-235)||(27357625-27357859)
chr6 (1-235)||(28164938-28165172)
chr6 (1-235)||(14140909-14141143)
chr6 (1-235)||(16754268-16754502)
chr6 (1-235)||(26774142-26774376)
chr6 (1-235)||(26922824-26923058)
chr6 (3-235)||(24301274-24301506)
chr6 (1-235)||(8901218-8901452)
chr6 (1-235)||(13519709-13519943)
chr6 (1-235)||(15408048-15408282)
chr6 (1-235)||(15419835-15420069)
chr6 (1-235)||(27012178-27012412)
chr6 (1-235)||(27023584-27023818)
chr6 (1-235)||(29554004-29554238)
chr6 (1-230)||(22930399-22930628)
chr6 (1-230)||(23852844-23853073)
chr6 (1-228)||(4541289-4541516)
chr6 (1-228)||(4719650-4719877)
chr6 (1-235)||(16678587-16678821)
chr6 (1-235)||(16939542-16939776)
chr6 (1-235)||(27061953-27062187)
chr6 (1-235)||(27183376-27183610)
chr6 (1-235)||(27265629-27265863)
chr6 (1-235)||(29505863-29506097)
chr6 (1-235)||(33371946-33372180)
chr6 (1-235)||(34460021-34460255)
chr6 (1-235)||(4529732-4529966)
chr6 (1-235)||(4762210-4762444)
chr6 (1-235)||(26790263-26790497)
chr6 (1-235)||(27198632-27198866)
chr6 (1-235)||(27489580-27489814)
chr6 (1-235)||(30553531-30553765)
chr6 (1-235)||(3700530-3700764)
chr6 (1-235)||(28211901-28212135)
chr6 (1-230)||(29577466-29577695)
chr6 (1-235)||(27250368-27250603)
chr6 (1-235)||(4777327-4777561)
chr6 (1-235)||(26111927-26112161)
chr6 (1-235)||(17087958-17088192)
chr6 (9-197)||(20173032-20173220)
chr6 (9-197)||(22162771-22162959)
[»] chr7 (32 HSPs)
chr7 (1-235)||(16513887-16514121)
chr7 (1-232)||(16045765-16045996)
chr7 (1-235)||(2105620-2105854)
chr7 (1-235)||(4140703-4140937)
chr7 (1-235)||(24587991-24588225)
chr7 (1-235)||(26270543-26270777)
chr7 (1-235)||(26533330-26533564)
chr7 (4-229)||(2159027-2159252)
chr7 (1-235)||(11420236-11420470)
chr7 (1-235)||(11445334-11445568)
chr7 (1-235)||(16445463-16445697)
chr7 (1-235)||(26511153-26511387)
chr7 (1-235)||(26665371-26665605)
chr7 (1-235)||(26680563-26680797)
chr7 (1-235)||(39208596-39208830)
chr7 (1-235)||(45735754-45735988)
chr7 (1-235)||(4203836-4204070)
chr7 (1-235)||(5162830-5163064)
chr7 (1-235)||(10912326-10912560)
chr7 (1-235)||(45391667-45391901)
chr7 (1-235)||(3449753-3449987)
chr7 (1-235)||(5132443-5132677)
chr7 (1-235)||(26439704-26439938)
chr7 (1-235)||(26517239-26517473)
chr7 (1-235)||(31086079-31086313)
chr7 (1-235)||(31128354-31128588)
chr7 (1-235)||(2777701-2777935)
chr7 (1-230)||(26315305-26315534)
chr7 (1-235)||(5142797-5143031)
chr7 (1-235)||(16746974-16747208)
chr7 (1-235)||(31559847-31560081)
chr7 (1-230)||(10846072-10846301)
[»] scaffold0143 (2 HSPs)
scaffold0143 (1-230)||(31748-31977)
scaffold0143 (1-235)||(8410-8644)
[»] chr8 (24 HSPs)
chr8 (1-230)||(16287407-16287635)
chr8 (1-235)||(19912695-19912929)
chr8 (1-235)||(19692547-19692781)
chr8 (1-235)||(22137359-22137593)
chr8 (1-235)||(2132793-2133027)
chr8 (1-235)||(18795153-18795387)
chr8 (1-235)||(19203895-19204129)
chr8 (1-235)||(9359074-9359308)
chr8 (1-235)||(19678896-19679130)
chr8 (1-227)||(27604438-27604664)
chr8 (1-235)||(44565433-44565667)
chr8 (3-235)||(33246819-33247051)
chr8 (1-227)||(19656874-19657100)
chr8 (1-235)||(21343704-21343938)
chr8 (1-235)||(28357485-28357719)
chr8 (1-235)||(33263183-33263417)
chr8 (1-235)||(12088256-12088490)
chr8 (1-235)||(31358977-31359211)
chr8 (1-235)||(31485404-31485638)
chr8 (3-235)||(14562073-14562305)
chr8 (7-235)||(29833774-29834002)
chr8 (1-235)||(15772023-15772257)
chr8 (1-235)||(22076458-22076692)
chr8 (1-229)||(18713939-18714167)
[»] chr2 (39 HSPs)
chr2 (1-235)||(20842362-20842596)
chr2 (1-235)||(256214-256448)
chr2 (1-235)||(27430002-27430236)
chr2 (1-235)||(11630745-11630979)
chr2 (1-235)||(12591257-12591491)
chr2 (1-235)||(12659985-12660219)
chr2 (1-235)||(12712162-12712396)
chr2 (1-235)||(27780683-27780917)
chr2 (1-235)||(27820440-27820674)
chr2 (1-235)||(39894518-39894752)
chr2 (1-235)||(40237957-40238191)
chr2 (1-235)||(9345547-9345781)
chr2 (1-235)||(19412062-19412296)
chr2 (1-235)||(21698732-21698966)
chr2 (1-235)||(28886728-28886962)
chr2 (1-235)||(34295603-34295837)
chr2 (1-235)||(21672736-21672970)
chr2 (1-235)||(23124130-23124364)
chr2 (1-235)||(27808152-27808386)
chr2 (1-235)||(31880735-31880969)
chr2 (1-235)||(34159293-34159527)
chr2 (1-235)||(34866133-34866367)
chr2 (1-235)||(37382126-37382360)
chr2 (1-235)||(37681456-37681690)
chr2 (1-235)||(37696721-37696955)
chr2 (1-235)||(3786942-3787176)
chr2 (1-235)||(22923709-22923943)
chr2 (1-235)||(27120973-27121207)
chr2 (1-235)||(16165929-16166163)
chr2 (1-235)||(16824899-16825133)
chr2 (1-235)||(16896347-16896581)
chr2 (1-235)||(31889052-31889286)
chr2 (1-235)||(32054252-32054486)
chr2 (1-235)||(37929818-37930052)
chr2 (1-235)||(37947423-37947657)
chr2 (1-235)||(13932108-13932342)
chr2 (1-235)||(34270481-34270715)
chr2 (1-235)||(39047380-39047614)
chr2 (1-235)||(19451984-19452218)
[»] chr1 (11 HSPs)
chr1 (1-235)||(20335988-20336222)
chr1 (1-235)||(10949529-10949763)
chr1 (1-235)||(16203606-16203840)
chr1 (1-235)||(10967117-10967351)
chr1 (1-235)||(28154188-28154422)
chr1 (1-235)||(3645594-3645829)
chr1 (1-235)||(21893320-21893554)
chr1 (1-235)||(28589532-28589766)
chr1 (1-235)||(41788882-41789116)
chr1 (1-235)||(51642670-51642904)
chr1 (1-235)||(20465428-20465662)
[»] chr5 (52 HSPs)
chr5 (1-235)||(25204735-25204969)
chr5 (1-235)||(25268890-25269124)
chr5 (1-235)||(13182262-13182496)
chr5 (1-235)||(22892920-22893154)
chr5 (1-235)||(28955254-28955488)
chr5 (1-235)||(29886666-29886900)
chr5 (1-235)||(30172926-30173160)
chr5 (1-235)||(3793998-3794232)
chr5 (1-235)||(6878762-6878996)
chr5 (1-235)||(13438152-13438386)
chr5 (1-235)||(23630427-23630660)
chr5 (1-235)||(24728426-24728660)
chr5 (1-235)||(30939092-30939326)
chr5 (1-235)||(40469019-40469253)
chr5 (1-230)||(41679167-41679396)
chr5 (3-235)||(24587831-24588063)
chr5 (1-235)||(8660944-8661178)
chr5 (1-235)||(9321933-9322167)
chr5 (1-235)||(11328094-11328328)
chr5 (1-235)||(15654227-15654461)
chr5 (1-235)||(18371003-18371237)
chr5 (1-235)||(22994586-22994820)
chr5 (1-235)||(31435921-31436155)
chr5 (1-235)||(33781942-33782176)
chr5 (1-235)||(33879585-33879819)
chr5 (1-235)||(34620975-34621209)
chr5 (1-235)||(43082712-43082946)
chr5 (1-230)||(26484856-26485085)
chr5 (7-235)||(31821882-31822110)
chr5 (1-235)||(2515519-2515753)
chr5 (1-235)||(11553812-11554046)
chr5 (1-235)||(13320299-13320533)
chr5 (1-235)||(18123885-18124119)
chr5 (1-235)||(28653700-28653934)
chr5 (1-235)||(33296985-33297219)
chr5 (1-235)||(5642245-5642479)
chr5 (1-235)||(9546178-9546412)
chr5 (1-235)||(30033885-30034119)
chr5 (1-235)||(30156488-30156722)
chr5 (1-235)||(33520837-33521071)
chr5 (1-235)||(18496194-18496428)
chr5 (1-230)||(12136637-12136866)
chr5 (1-235)||(15754321-15754555)
chr5 (29-235)||(24974363-24974569)
chr5 (1-235)||(37666955-37667189)
chr5 (1-235)||(37759440-37759674)
chr5 (1-235)||(32591743-32591977)
chr5 (1-235)||(37354112-37354346)
chr5 (15-235)||(37766474-37766694)
chr5 (5-235)||(23896332-23896562)
chr5 (91-209)||(36374545-36374663)
chr5 (91-209)||(36999199-36999317)
[»] chr4 (26 HSPs)
chr4 (1-235)||(40101209-40101443)
chr4 (1-235)||(14669476-14669710)
chr4 (1-235)||(15232279-15232513)
chr4 (1-235)||(33669372-33669606)
chr4 (1-235)||(5698998-5699232)
chr4 (1-235)||(17017509-17017743)
chr4 (1-235)||(20333993-20334227)
chr4 (1-235)||(18312750-18312984)
chr4 (1-235)||(18796186-18796420)
chr4 (1-235)||(24587933-24588167)
chr4 (1-235)||(34184532-34184766)
chr4 (1-235)||(36340089-36340323)
chr4 (1-235)||(39855100-39855334)
chr4 (1-235)||(54837854-54838088)
chr4 (1-235)||(6574321-6574555)
chr4 (1-235)||(14755064-14755298)
chr4 (1-235)||(30758223-30758457)
chr4 (1-235)||(5010338-5010572)
chr4 (1-235)||(21974164-21974398)
chr4 (1-235)||(24117125-24117359)
chr4 (1-235)||(31122084-31122318)
chr4 (1-235)||(14103006-14103240)
chr4 (1-235)||(27158889-27159123)
chr4 (1-235)||(15381805-15382039)
chr4 (1-235)||(1904717-1904951)
chr4 (1-235)||(15278199-15278433)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (1-235)||(17032-17266)
[»] scaffold0322 (2 HSPs)
scaffold0322 (1-235)||(108-342)
scaffold0322 (1-235)||(10495-10729)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (1-235)||(10500-10734)
[»] scaffold0089 (1 HSPs)
scaffold0089 (3-235)||(4517-4749)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (1-235)||(14021-14255)
[»] scaffold0144 (1 HSPs)
scaffold0144 (1-235)||(21763-21997)
[»] scaffold0418 (1 HSPs)
scaffold0418 (1-235)||(10486-10720)
[»] scaffold0159 (4 HSPs)
scaffold0159 (1-235)||(4751-4985)
scaffold0159 (1-182)||(24076-24257)
scaffold0159 (30-235)||(11774-11979)
scaffold0159 (124-235)||(9712-9823)
[»] scaffold0415 (1 HSPs)
scaffold0415 (1-235)||(10472-10707)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (1-235)||(12399-12633)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (1-235)||(23566-23800)
[»] scaffold0099 (1 HSPs)
scaffold0099 (36-227)||(42285-42479)
[»] scaffold0547 (1 HSPs)
scaffold0547 (1-98)||(11162-11259)
[»] scaffold0240 (1 HSPs)
scaffold0240 (1-29)||(26471-26499)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 57)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 31031851 - 31032085
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  31031851 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctta 31031950  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31031951 acaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagctcc 31032050  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     |||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  31032051 cggtggatacttacagcttagcaagaactgcttga 31032085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 8001205 - 8000971
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  8001205 aactttcttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctta 8001106  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||| ||    
T  8001105 acaataccatgtcgtagtttctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctactggccaatcttctcaaggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 8001006  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
    ||| ||||| | |||||| ||||||||||||||||    
T  8001005 tggcggatactcacggctcagcaagaactgcttga 8000971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 10647718 - 10647484
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  10647718 aactttcttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctta 10647619  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||| ||    
T  10647618 acaataccatgtcgtagtttctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctactggccaatcttctcaaggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 10647519  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
    ||| ||||| | |||||| ||||||||||||||||    
T  10647518 tggcggatactcacggctcagcaagaactgcttga 10647484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 11105974 - 11106208
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  11105974 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctta 11106073  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||| ||    
T  11106074 acaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctactggccaatcttctcaaggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 11106173  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
      | ||||| | |||||| ||||||||||||||||    
T  11106174 cagcggatactcacggctcagcaagaactgcttga 11106208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 35885411 - 35885177
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  35885411 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcgtgttcatcaacacatctta 35885312  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| ||    
T  35885311 acaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 35885212  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     || ||||| | |||||||||||||||||| ||||    
T  35885211 cggcggatactcacggcttagcaagaactgtttga 35885177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 51786668 - 51786434
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  51786668 aactttcttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctta 51786569  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| ||    
T  51786568 acaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatctctccatctaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 51786469  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
    ||| ||||| | |||||| ||||||||||||||||    
T  51786468 tggcggatactcacggctcagcaagaactgcttga 51786434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 4421560 - 4421326
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4421560 aactttcttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctta 4421461  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||| ||    
T  4421460 acaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctactggccaatcttctcaaggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 4421361  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     || ||||| | |||||| ||||||||||| ||||    
T  4421360 cggcggatactcacggctcagcaagaactgtttga 4421326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 4688300 - 4688066
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4688300 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctta 4688201  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| ||    
T  4688200 acaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccgtctaacaggaatctactggtcaatcttctcagggtcttcttatcttggttggaagcacc 4688101  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     |  ||||| | |||||||||||||||||| ||||    
T  4688100 cgacggatactcacggcttagcaagaactgtttga 4688066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 15736709 - 15736943
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15736709 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctta 15736808  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||| ||    
T  15736809 acaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctactggccaatcttctcaaggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 15736908  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
      | ||||| | |||||| ||||||||||| ||||    
T  15736909 cagcggatactcacggctcagcaagaactgtttga 15736943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 18055907 - 18055673
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18055907 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctta 18055808  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||| ||    
T  18055807 acaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctactggccaatcttctcaaggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 18055708  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     || ||||| | ||| || ||||||||||| ||||    
T  18055707 cggcggatactcacgactcagcaagaactgtttga 18055673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 29144371 - 29144605
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  29144371 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaattgctctgcttcatgttcatcaacacatctta 29144470  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||   |||||||| ||    
T  29144471 acaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctactggccaatctcctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 29144570  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
    ||| ||||| | |||||| ||||||||||| ||||    
T  29144571 tggcggatactcacggctcagcaagaactgtttga 29144605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 4 - 235
Target Start/End: Original strand, 4792253 - 4792484
Alignment:
Q  4 ttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctcaaca 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4792253 ttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctccgcttcatgttcatcaacacatcttaaca 4792352  T
Q  104 ataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcctgg 203  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| || ||    
T  4792353 ataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacccgg 4792452  T
Q  204 tggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     ||||| | ||||||  |||||||||||||||    
T  4792453 cggatactcacggctccgcaagaactgcttga 4792484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 4 - 235
Target Start/End: Original strand, 22383196 - 22383427
Alignment:
Q  4 ttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctcaaca 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22383196 ttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgttctgcttcatgttcatcaacacatcttaaca 22383295  T
Q  104 ataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcctgg 203  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||| |||||    
T  22383296 ataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctactggccaatcttctcaaggtcttcttgtcttgtttggaagcacctgg 22383395  T
Q  204 tggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     ||||| | |||||| ||||||||||| ||||    
T  22383396 cggatactcacggctcagcaagaactgtttga 22383427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 4726275 - 4726041
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  4726275 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctccgcttcatgttcatcaacacatctta 4726176  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||| ||    
T  4726175 acaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctactggccaatcttctcaaggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 4726076  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
      | ||||| | |||||| ||||||||||| ||||    
T  4726075 cagcggatactcacggctcagcaagaactgtttga 4726041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 5591972 - 5592206
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  5591972 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctta 5592071  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    |||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| ||    
T  5592072 acaacaccatgtcatagttcctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctaccggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 5592171  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     || ||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  5592172 cggcggatattcgcggcttagcaagaactgcttga 5592206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 6538357 - 6538591
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6538357 aactttcttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctta 6538456  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||    
T  6538457 ataataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 6538556  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     |  ||||| | |||||| ||||||||||| ||||    
T  6538557 cgacggatactcacggctcagcaagaactgtttga 6538591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 7077851 - 7077617
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  7077851 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctta 7077752  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||   |||||||| ||    
T  7077751 acaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatccccatctaacagaaatctactagccaatcttctcaaggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 7077652  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     || ||||| | |||||| ||||||||||||||||    
T  7077651 cggcggatactcacggctcagcaagaactgcttga 7077617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 8285085 - 8285319
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  8285085 aactttcttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaacgtcatgtacatcatgcatcaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctta 8285184  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| ||    
T  8285185 acaataccatgtcataatttctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttatcttggttggaagcacc 8285284  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
    ||| ||||| | |||||| ||||||||||| ||||    
T  8285285 tggcggatactcacggctcagcaagaactgtttga 8285319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 15888320 - 15888554
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15888320 aacttccttgacatagtgtgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatacattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctta 15888419  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  ||||||||| ||    
T  15888420 acaatactatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctactggccaatctgctcagggtcttcttatcttggttggaagcacc 15888519  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     || ||||| | |||||||||||||||||| ||||    
T  15888520 cggcggatactcacggcttagcaagaactgtttga 15888554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 18335275 - 18335041
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  18335275 aacttcctcgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaagataccgtcatgtacatcatgcattaactgctccgcttcatgttcatcaacacatctta 18335176  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||    
T  18335175 acaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatccccatctaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 18335076  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     || ||||| | |||||||||||||||||| ||||    
T  18335075 aggcggatactcacggcttagcaagaactgtttga 18335041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 21679348 - 21679114
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  21679348 aacttcctcgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctccgcttcatgttcatcaacacatctta 21679249  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||| ||    
T  21679248 acaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctactggccaatcttctcaaggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 21679149  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     || ||||| | |||||| ||||||||||| ||||    
T  21679148 cggcggatactcacggctcagcaagaactgtttga 21679114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 28111569 - 28111803
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  28111569 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctta 28111668  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||  |    
T  28111669 acaacaccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctgctggccaatcttctcagggtcttcttgtcttgtttggaagcaac 28111768  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     || ||||| | |||||| ||||||||||| ||||    
T  28111769 cggcggatactcacggctcagcaagaactgtttga 28111803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 28343822 - 28343588
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  28343822 aacttcctcgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctccgcttcatgttcatcaacacatctta 28343723  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| ||    
T  28343722 acaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctaccggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 28343623  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     || ||||| | |||||| ||||||||||||||||    
T  28343622 cggcggatactcacggctcagcaagaactgcttga 28343588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 29660585 - 29660819
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  29660585 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctccgcttcatgttcatcaacacatctta 29660684  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| ||    
T  29660685 acaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 29660784  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     |  ||||| | |||||| ||||||||||| ||||    
T  29660785 cgacggatactcacggctcagcaagaactgtttga 29660819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 32443796 - 32443562
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  32443796 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccaaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcgtgttcatcaacacatctta 32443697  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| ||    
T  32443696 acaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 32443597  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     || ||||| | |||||| ||||||||||| ||||    
T  32443596 cggcggatactcacggctcagcaagaactgtttga 32443562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 5471633 - 5471399
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  5471633 aactttcttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcatcaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctta 5471534  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| ||    
T  5471533 acaataccatgtcatagttcctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctaccggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 5471434  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     || ||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  5471433 cggcggatattcgcggcttagcaagaactgcttga 5471399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 5604929 - 5605163
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  5604929 aactttcttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacacctta 5605028  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| ||    
T  5605029 acaataccatgtcatagttcctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctaccggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 5605128  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     || ||||| | |||||| ||||||||||||||||    
T  5605129 cggcggatactcacggctcagcaagaactgcttga 5605163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 5715718 - 5715484
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |    
T  5715718 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcctcgtgttcatcaacacatctta 5715619  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| ||    
T  5715618 acaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 5715519  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     |  ||||| | |||||| ||||||||||| ||||    
T  5715518 cgacggatactcacggctcagcaagaactgtttga 5715484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 5726628 - 5726394
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |    
T  5726628 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcctcgtgttcatcaacacatctta 5726529  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| ||    
T  5726528 acaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 5726429  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     |  ||||| | |||||| ||||||||||| ||||    
T  5726428 cgacggatactcacggctcagcaagaactgtttga 5726394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 5765740 - 5765974
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |    
T  5765740 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcctcgtgttcatcaacacatctta 5765839  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| ||    
T  5765840 acaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 5765939  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     |  ||||| | |||||| ||||||||||| ||||    
T  5765940 cgacggatactcacggctcagcaagaactgtttga 5765974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 18287968 - 18288202
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  18287968 aactttcttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcgtgttcatcaacacatctta 18288067  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||   |||||||| ||    
T  18288068 acaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctactggccaatcttctcaaggtcttcttatcttgtttggaagcacc 18288167  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     || ||||| | | |||| ||||||||||||||||    
T  18288168 cggcggatactcatggctcagcaagaactgcttga 18288202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 18303269 - 18303503
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  18303269 aactttcttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcgtgttcatcaacacatctta 18303368  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||   |||||||| ||    
T  18303369 acaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctactggccaatcttctcaaggtcttcttatcttgtttggaagcacc 18303468  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     || ||||| | | |||| ||||||||||||||||    
T  18303469 cggcggatactcatggctcagcaagaactgcttga 18303503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 20572458 - 20572692
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |    
T  20572458 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgttccgcttcatgttcatcaacacatctta 20572557  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| ||    
T  20572558 acaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctaccggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 20572657  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     || ||||| | |||||| ||||||||||| ||||    
T  20572658 cggcggatactcacggctcagcaagaactgtttga 20572692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 22866463 - 22866697
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  22866463 aactttcttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacacctta 22866562  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||   |||||||| ||    
T  22866563 acaataccatgtcatagttcctcttgtacagaatatctctatctaacaggaatctaccggccaatcttctcaaggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 22866662  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
    ||| ||||| | |||||| ||||||||||||||||    
T  22866663 tggcggatactcacggctcagcaagaactgcttga 22866697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 22881522 - 22881756
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  22881522 aactttcttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacacctta 22881621  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||   |||||||| ||    
T  22881622 acaataccatgtcatagttcctcttgtacagaatatctctatctaacaggaatctaccggccaatcttctcaaggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 22881721  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
    ||| ||||| | |||||| ||||||||||||||||    
T  22881722 tggcggatactcacggctcagcaagaactgcttga 22881756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 24332808 - 24332574
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  24332808 aactttcttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacacctta 24332709  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||   |||||||| ||    
T  24332708 acaataccatgtcatagttcctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctaccggccaatcttctcaaggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 24332609  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     || ||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  24332608 cggcggatattcgcggcttagcaagaactgcttga 24332574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 31960070 - 31960304
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  31960070 aactttcttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacacctta 31960169  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| ||    
T  31960170 acaataccatgtcatagttcctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctaccggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 31960269  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     || ||||| | |||||| ||||||||||||||||    
T  31960270 cggcggatactcacggctcagcaagaactgcttga 31960304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 32295273 - 32295039
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  32295273 aactttcttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcgtgttcatcaacacatctta 32295174  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||   |||||||| ||    
T  32295173 acaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctactggccaatcttcttagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 32295074  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     || ||||| | |||||| ||||||||||| ||||    
T  32295073 aggcggatactcacggctcagcaagaactgtttga 32295039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 48470572 - 48470338
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  48470572 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtgccgtcatgtacatcatgcattaactgctccgcttcatgttcatcaacacatctta 48470473  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||  ||    
T  48470472 gcaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagtacc 48470373  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     || ||||| | |||||||||||||||||| ||||    
T  48470372 cggcggatactcacggcttagcaagaactgtttga 48470338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 5018359 - 5018125
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  5018359 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcgtgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctta 5018260  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| ||    
T  5018259 acaataccatgtcatagttcctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctaccggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 5018160  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     || ||||| | | |||| ||||||||||| ||||    
T  5018159 cggcggatactcatggctcagcaagaactgtttga 5018125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 6206549 - 6206315
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  6206549 aacttccttgacatagtatgtcctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactactccgcttcatgttcatcaacacatctta 6206450  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||| ||    
T  6206449 acaataccatgtcatagtttctcttgtacaaaatatctccatctaacaggaatctactggccaatcttctcaaggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 6206350  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     || ||||| | |||||| ||||||||||| ||||    
T  6206349 cggcggatactcacggctcagcaagaactgtttga 6206315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 17980564 - 17980798
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  17980564 aactttcttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacacctta 17980663  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
     |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| ||    
T  17980664 tcaataccatgtcatagttcctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctaccggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 17980763  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     || ||||| | |||||| ||||||||||||||||    
T  17980764 cggcggatactcacggctcagcaagaactgcttga 17980798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 18229841 - 18229607
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  18229841 aactttcttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacacctta 18229742  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
     |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| ||    
T  18229741 tcaataccatgtcatagttcctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctaccggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 18229642  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     || ||||| | |||||| ||||||||||||||||    
T  18229641 cggcggatactcacggctcagcaagaactgcttga 18229607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 47028098 - 47027864
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||| |    
T  47028098 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcactaactgttccgcttcatgttcatcaacacatctta 47027999  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| ||    
T  47027998 acaataccatgtcatagttcctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctaccggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 47027899  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     || ||||| | |||||||||||||||||| ||||    
T  47027898 cggcggatactcacggcttagcaagaactgtttga 47027864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 4342291 - 4342525
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  4342291 aactttcttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacacctta 4342390  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||   |||||||| ||    
T  4342391 acaataccatgtcatagttcctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctaccggccaatcttctcaaggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 4342490  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     |  ||||| | |||||| ||||||||||| ||||    
T  4342491 cgacggatactcacggctcagcaagaactgtttga 4342525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 19699135 - 19698902
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |    
T  19699135 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcgcgttcatcaacacatctta 19699036  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||||||| ||| |||||||| | || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  19699035 acaataccatgttgtagtttctcttgtacaaaatgtctccatctagcaagaatttactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 19698936  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttg 234  Q
     |||||||| |   ||||||||||||||||||||    
T  19698935 cggtggatactcgtggcttagcaagaactgcttg 19698902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 20070685 - 20070451
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |    
T  20070685 aacttccttgacatagtatgccttgtagcatgggtcccgaaggtaccatcatgtacatcatgcattaactgctccgcttcatgttcatcgacacatctta 20070586  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| ||    
T  20070585 acaacaccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 20070486  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     |  ||||| | |||||| ||||||||||| ||||    
T  20070485 cgacggatactcacggctcagcaagaactgtttga 20070451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 28025926 - 28025692
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  28025926 aacttcctcgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctccgcttcatgttcatcaacacatctta 28025827  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    ||| ||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||   |||||||| ||    
T  28025826 acagtaccatgtcatagttcctcttgtacagaatatccccatctaacaggaatctaccggccaatcttctcaaggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 28025727  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     || ||||| | |||||| ||||||||||| ||||    
T  28025726 cggcggatactcacggctcagcaagaactgtttga 28025692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 16620105 - 16620338
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  16620105 aactttcttgacatagtgtgccccgtagcgtgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctccgcttcatgttcatcaacacatctta 16620204  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| || ||||| |||| ||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  16620205 acaataccatgtcgtagtttcttttgtacaaaatgtccccatctaacaagaacctaccagccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 16620304  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttg 234  Q
     |||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  16620305 cggtggatactcacggcttagcaagaactgcttg 16620338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 17972476 - 17972705
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |    
T  17972476 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctccgcttcatgctcatcaacacatctta 17972575  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||| ||    
T  17972576 acaacaccatgtcatagtttctcttgtacataatatctccatctaacagaaatctgctggccaatcttctcggggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 17972675  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactg 230  Q
     || ||||| | |||||| |||||||||||    
T  17972676 cggcggatactcacggctcagcaagaactg 17972705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 4628430 - 4628251
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4628430 aactttcttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaattgctctgcttcatgttcatcaacacatctta 4628331  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttc 180  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4628330 acaataccatgtcatagttcctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctaccggccaatcttctcagggtcttc 4628251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 10400789 - 10400555
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  10400789 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccaaaggtaccatcatgtacatcatgcattaactgctccgcttcatgttcatcaacacatctta 10400690  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    ||| ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||| ||    
T  10400689 acagtaccatgtcatagttcctcttgtacaggatatctccatctaacaggaatctactggccaatcttctcaaggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 10400590  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     |  ||||| | |||||| ||||||||||| ||||    
T  10400589 cgacggatactcacggctcagcaagaactgtttga 10400555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 18247386 - 18247152
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |    
T  18247386 aactttcttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctccgcctcatgttcatcaacacatctta 18247287  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||   |||||||| |     
T  18247286 acaataccatgtcatagttcctcttgtacaaaatatctccatctaacaggaatctaccggccaatcttctcaaggtcttcttgtcttgtttggaagcact 18247187  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     || ||||| | |||||| ||||||||||| ||||    
T  18247186 cggcggatactcacggctcagcaagaactgtttga 18247152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 3 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 5656777 - 5656637
Alignment:
Q  3 cttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctcaac 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  5656777 cttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatcttaac 5656678  T
Q  103 aataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatc 143  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||| ||| | ||||||    
T  5656677 aatatcatgtcgtagtttctcttgtacaaaatgtttccatc 5656637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 8216279 - 8216224
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtac 56  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8216279 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtac 8216224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 150 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 5654581 - 5654496
Alignment:
Q  150 gaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcctggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || || ||||| | |||||||||||||||||| ||||    
T  5654581 gaatctaccggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacccggcggatactcacggcttagcaagaactgtttga 5654496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 155 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 8216226 - 8216146
Alignment:
Q  155 tactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcctggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||| || |  ||||| | |||||| ||||||||||| ||||    
T  8216226 tactggccaatcttctcaaggtcttcttgtcttgtttggaagcacccgacggatactcacggctcagcaagaactgtttga 8216146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 45)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 27625226 - 27625460
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27625226 aactttcttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctta 27625325  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||    
T  27625326 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 27625425  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
    ||| ||||| | |||||||||||||||||| ||||    
T  27625426 tggcggatactcacggcttagcaagaactgtttga 27625460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 27285879 - 27286113
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27285879 aacttcctcgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaacttctctgcttcatgttcatcaacacatctca 27285978  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  27285979 acaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatccccatctaaaaggaatttactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 27286078  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  27286079 tggtgggtacttacggcttagcaagaactgcttga 27286113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 24868397 - 24868163
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24868397 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcatcaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctta 24868298  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| ||    
T  24868297 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatctaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttatcttggttggaagcacc 24868198  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     |  ||||| | |||||||||||||||||| ||||    
T  24868197 cgacggatactcacggcttagcaagaactgtttga 24868163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 13294466 - 13294700
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  13294466 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcgtgttcatcaacacatctta 13294565  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |     
T  13294566 ataataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatctaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtcttggttggaagcact 13294665  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
    ||| | ||| | |||||| ||||||||||| ||||    
T  13294666 tggcgaatactcacggctcagcaagaactgtttga 13294700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 27357625 - 27357859
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  27357625 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccaaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcgtgttcatcaacacatctta 27357724  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||    
T  27357725 acaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 27357824  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     || ||||| | |||||||||||||||||| ||||    
T  27357825 cggcggatactcacggcttagcaagaactgtttga 27357859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 28165172 - 28164938
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  28165172 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctta 28165073  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||    
T  28165072 acaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 28164973  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     || ||||| | |||||| | ||||||||| ||||    
T  28164972 cggcggatactcacggctcaacaagaactgtttga 28164938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 14140909 - 14141143
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  14140909 aacttccttgacatagtatgccctgtagcgtgggtcccaaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcgtgttcatcaacacatctta 14141008  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||    
T  14141009 acaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 14141108  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     || ||||| | |||||||||||||||||| ||||    
T  14141109 cggcggatactcacggcttagcaagaactgtttga 14141143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 16754502 - 16754268
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16754502 aacttccttgacatagtatgtcctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctta 16754403  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| ||    
T  16754402 acaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 16754303  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     || ||||| | |||||| ||||||||||| ||||    
T  16754302 cggcggatactcacggctcagcaagaactgtttga 16754268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 26774142 - 26774376
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  26774142 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctccgcttcatgttcatcaacacatctta 26774241  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||| ||    
T  26774242 acaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctactggccaatcttctcaaggtcttcttgtcttgcttggaagcacc 26774341  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     || ||||| | |||||| ||||||||||| ||||    
T  26774342 cggcggatactcacggctcagcaagaactgtttga 26774376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 26923058 - 26922824
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  26923058 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctccgcttcatgttcatcaacacatctta 26922959  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||| ||    
T  26922958 acaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctactggccaatcttctcaaggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 26922859  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     || ||||| | |||||| ||||||||||| ||||    
T  26922858 cggcggatactcacggctcagcaagaactgtttga 26922824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 3 - 235
Target Start/End: Original strand, 24301274 - 24301506
Alignment:
Q  3 cttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctcaac 102  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  24301274 cttccttgacatagtatgtcctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctccgcttcatgttcatcaacacatcttaac 24301373  T
Q  103 aataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcctg 202  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  24301374 aataccatgtcatagtttctcttgtacaaaatatctccatctaacatgaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtcttggttggaagcacctg 24301473  T
Q  203 gtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
    | ||||| | |||||| ||||||||||| ||||    
T  24301474 gcggatactcacggctcagcaagaactgtttga 24301506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 8901218 - 8901452
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  8901218 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctta 8901317  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctg-ttggaagctc 199  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||| |    
T  8901318 acaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttatc-ctgcttggaagcac 8901416  T
Q  200 ctggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
    | |  ||||| | |||||| ||||||||||| ||||    
T  8901417 ccgacggatattcacggctcagcaagaactgtttga 8901452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 13519709 - 13519943
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13519709 aactttcttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctta 13519808  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||   |||||||| ||    
T  13519809 acaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatctctccatctaacaggaatctactgaccaatcttctcaaggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 13519908  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     || ||||| | |||||| ||||||||||||||||    
T  13519909 cggcggatactcacggctcagcaagaactgcttga 13519943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 15408048 - 15408282
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |    
T  15408048 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccatcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcgtgttcatcaacacacctta 15408147  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||    
T  15408148 ataataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatctaacatgaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtcttgattggaagcacc 15408247  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
    ||| ||||| | |||||| ||||||||||| ||||    
T  15408248 tggcggatactcacggctcagcaagaactgtttga 15408282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 15419835 - 15420069
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |    
T  15419835 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccatcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcgtgttcatcaacacacctta 15419934  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||    
T  15419935 ataataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatctaacatgaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtcttgattggaagcacc 15420034  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
    ||| ||||| | |||||| ||||||||||| ||||    
T  15420035 tggcggatactcacggctcagcaagaactgtttga 15420069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 27012412 - 27012178
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27012412 aactttcttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacacctca 27012313  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    ||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||   |||||||| ||    
T  27012312 acagtaccatgtcatagttcctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctaccggccaatcttctcaaggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 27012213  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
    ||| ||||| | |||||| ||||||||||||||||    
T  27012212 tggcggatactcacggctcagcaagaactgcttga 27012178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 27023818 - 27023584
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  27023818 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctccgcttcatgttcatcaacacatctta 27023719  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| ||    
T  27023718 acaataccatgtcatagtttctcttgtacataatatctccatctaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 27023619  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     ||  |||| | |||||| ||||||||||||||||    
T  27023618 cggctgatactcacggctcagcaagaactgcttga 27023584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 29554238 - 29554004
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  29554238 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccaaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcgtgttcatcaacacatctta 29554139  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| ||    
T  29554138 acaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 29554039  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     || ||||| |  ||||| ||||||||||||||||    
T  29554038 cggcggatactcgcggctcagcaagaactgcttga 29554004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 22930399 - 22930628
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  22930399 aactttcttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacacctta 22930498  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| ||    
T  22930499 acaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 22930598  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactg 230  Q
     || ||||| | |||||| |||||||||||    
T  22930599 cggcggatactcacggctcagcaagaactg 22930628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 23852844 - 23853073
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  23852844 aactttcttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacacctta 23852943  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| ||    
T  23852944 acaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 23853043  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactg 230  Q
     || ||||| | |||||| |||||||||||    
T  23853044 cggcggatactcacggctcagcaagaactg 23853073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 4541289 - 4541516
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  4541289 aactttcttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcctcatgttcatcaacacatctta 4541388  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||| ||    
T  4541389 acaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctactggccaatcttctcaaggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 4541488  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaac 228  Q
     || ||||| | |||||| |||||||||    
T  4541489 cggcggatactcacggctcagcaagaac 4541516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 4719650 - 4719877
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  4719650 aactttcttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacacctta 4719749  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||| ||    
T  4719750 acaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctactggccaatcttctcaaggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 4719849  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaac 228  Q
     || ||||| | |||||| |||||||||    
T  4719850 cggcggatactcacggctcagcaagaac 4719877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 16678821 - 16678587
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  16678821 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctccgcttcatgttcatcaacacatctta 16678722  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    ||| ||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||    
T  16678721 acagtaccatgtcatagttcctcttgtataggatatctccatctaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 16678622  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     || ||||| | |||||||||||||||||| ||||    
T  16678621 cggcggatactcacggcttagcaagaactgtttga 16678587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 16939542 - 16939776
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  16939542 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcgtgcattaactgctctgcttcgtgttcatcaacacatctta 16939641  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
     |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||| ||    
T  16939642 gcaataccatgtcatagttcctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctactggccaatcttctcaaggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 16939741  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
    ||| ||||| | |||||| ||||||||||| ||||    
T  16939742 tggcggatactcacggctcagcaagaactgtttga 16939776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 27062187 - 27061953
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27062187 aacttccttgacatagtatgtcctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctta 27062088  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||| ||    
T  27062087 acaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatttaacaggaatctactggccaatcttctcaaggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 27061988  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     |  ||||| | |||||| ||||||||||| ||||    
T  27061987 cgacggatactcacggctcagcaagaactgtttga 27061953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 27183610 - 27183376
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27183610 aacttccttgacatagtatgtcctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctta 27183511  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| ||    
T  27183510 acaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 27183411  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     |  ||||| | |||||| | ||||||||| ||||    
T  27183410 cgacggatactcacggctcaacaagaactgtttga 27183376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 27265629 - 27265863
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27265629 aacttccttgacatagtatgtcctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctta 27265728  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| ||    
T  27265729 acaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 27265828  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     |  ||||| | |||||| | ||||||||| ||||    
T  27265829 cgacggatactcacggctcaacaagaactgtttga 27265863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 29506097 - 29505863
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  29506097 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctta 29505998  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
     ||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||   |||||||| ||    
T  29505997 tcaacaccatgtcatagttcctcttgtaaagaatatctccatctaacaggaatctactggccaatcttcttagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 29505898  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     || ||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  29505897 cggcggatactcacggcttagcaagaactgcttga 29505863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 33371946 - 33372180
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  33371946 aactttcttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcgtgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctta 33372045  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||| ||    
T  33372046 acaataccatgtcatagtttctcttgtatagaatatctccatctaacaggaatctactggccaatcttctcaaggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 33372145  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     || ||||| | |||||| ||||||||||| ||||    
T  33372146 cggcggatactcacggctcagcaagaactgtttga 33372180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 34460021 - 34460255
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  34460021 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaagctaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctta 34460120  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||| ||    
T  34460121 acaataccatgtcatagttcctcttgtacagaatatctccatttaacaggaatctactggccaatcttctcaaggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 34460220  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
    ||  ||||| | |||||| ||||||||||| ||||    
T  34460221 tgacggatactcacggctcagcaagaactgtttga 34460255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 4529966 - 4529732
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4529966 aactttcttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctta 4529867  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||   |||||||| ||    
T  4529866 acaataccatgtcatagttcctcttgtacagaatatctccatctaacaagaatctaccggccaatcttctcaaggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 4529767  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     || ||||| | |||||| ||||||||||| ||||    
T  4529766 cggcggatactcacggctcagcaagaactgtttga 4529732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 4762444 - 4762210
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |    
T  4762444 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctccgcctcatgttcatcaacacatctta 4762345  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    || |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||| ||    
T  4762344 accataccatgtcatagttcctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctactggccaatcttctcaaggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 4762245  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     || ||||| | |||||| ||||||||||| ||||    
T  4762244 cggcggatactcacggctcagcaagaactgtttga 4762210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 26790497 - 26790263
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26790497 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtatatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacacctca 26790398  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    ||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||   |||||||| ||    
T  26790397 acagtaccatgtcatagttcctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctaccggccaatcttctcaaggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 26790298  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     || ||||| | |||||| ||||||||||| ||||    
T  26790297 cggcggatactcacggctcagcaagaactgtttga 26790263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 27198866 - 27198632
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |    
T  27198866 aactttcttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctccgcctcatgttcatcaacacatctta 27198767  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||   |||||||| ||    
T  27198766 acaataccatgtcatagttcctcttgtacaaaatatctccatctaacaggaatctaccggccaatcttctcaaggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 27198667  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
    ||| ||||| | |||||| ||||||||||||||||    
T  27198666 tggcggatactcacggctcagcaagaactgcttga 27198632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 27489814 - 27489580
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27489814 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctta 27489715  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||   |||||||| ||    
T  27489714 acaataccatgtcatagttcctcttgtacaaaatatctccatctaacaggaatctaccggccaatcttctcaaagtcttcttgtcttgtttggaagcacc 27489615  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     || ||||| | |||||| ||||||||||| ||||    
T  27489614 cggcggatactcacggctcagcaagaactgtttga 27489580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 30553531 - 30553765
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  30553531 aactttcttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcgtgttcatcaacacatctta 30553630  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
     |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| ||    
T  30553631 gcaataccatgtcatagttcctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctaccggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 30553730  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     || ||||| | |||||| ||||||||||||||||    
T  30553731 cggcggatactcacggctcagcaagaactgcttga 30553765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 3700764 - 3700530
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |    
T  3700764 aactttcttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgttccgcttcatgttcatcgacacatctta 3700665  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||   |||||||| ||    
T  3700664 acaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctaccggccaatcttctcagagtcttcttatcttgtttggaagcacc 3700565  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     || ||||| | |||||| ||||||||||||||||    
T  3700564 cggcggatactcacggctcagcaagaactgcttga 3700530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 28212135 - 28211901
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  28212135 aactttcttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcctcatgttcatcaacacatctta 28212036  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||   |||||||| |     
T  28212035 acaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctaccggccaatcttctcaaggtcttcttgtcttgtttggaagcact 28211936  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     || ||||| | ||||||  |||||||||| ||||    
T  28211935 cggcggatactcacggctcggcaagaactgtttga 28211901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 29577695 - 29577466
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |    
T  29577695 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctccgcttcatgctcatcaacacatctta 29577596  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||    
T  29577595 acaacaccatgtcatagtttctcttgtacataatatctccatctaacagaaatctgctggccaatcttctcagggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 29577496  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactg 230  Q
     || ||||| | |||||| |||||||||||    
T  29577495 cggcggatactcacggctcagcaagaactg 29577466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 27250368 - 27250603
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |    
T  27250368 aactttcttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctccgcctcatgttcatcaacacatctta 27250467  T
Q  101 acaataccatgtcatagtt-tcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctc 199  Q
    |||||||||||||||||||  || ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||   |||||||| |    
T  27250468 acaataccatgtcatagttccctcttgtacaaaatatctccatctaacaggaatctaccggccaatcttctcaaggtcttcttgtcttgtttggaagcac 27250567  T
Q  200 ctggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
    |||| ||||| | |||||| ||||||||||||||||    
T  27250568 ctggcggatactcacggctcagcaagaactgcttga 27250603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 4777561 - 4777327
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |    
T  4777561 aactttcttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctccgcctcatgttcatcaacacatctta 4777462  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||   |||||||| ||    
T  4777461 acaataccatgtcatagttcctcttgtacaaaatatctccatctaacaggaatctaccggccaatcttctcaaggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 4777362  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     || ||||| | |||||| ||||||||||| ||||    
T  4777361 cggcggatactcacggctcagcaagaactgtttga 4777327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 26111927 - 26112161
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |    
T  26111927 aactttcttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctccgcctcatgttcatcaacacatctta 26112026  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||   |||||||| |     
T  26112027 acaataccatgtcatagttcctcttgtacaaaatatctccatctaacaggaatctaccggccaatcttctcaaggtcttcttgtcttgtttggaagcact 26112126  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     || ||||| | |||||| ||||||||||| ||||    
T  26112127 cggcggatactcacggctcagcaagaactgtttga 26112161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 17087958 - 17088192
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| || || |||||||||||| | |    
T  17087958 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacgtcatgcattaattgttctgcctcgtgctcatcaacacatttta 17088057  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  17088058 acaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatccccatctaacaagaacctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 17088157  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     | |||||| | | |  || |||||||||||||||    
T  17088158 cgatggatactcatgattttgcaagaactgcttga 17088192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 9 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 20173220 - 20173032
Alignment:
Q  9 tgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctcaacaatacc 108  Q
    ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||    
T  20173220 tgacatagtgtgccccgtagcgtgggtcccgaaggtaccgtcgtgtacatcatgcattaactgctctgcttcgcgttcatcaacacatcttaacaatacc 20173121  T
Q  109 atgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagc 197  Q
    ||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20173120 atgtcgtagttcctcttgtatagaatatctccatctaacaggaatctaccggctaatcttctcaaggtcttcttgtctctgttggaagc 20173032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 9 - 197
Target Start/End: Original strand, 22162771 - 22162959
Alignment:
Q  9 tgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctcaacaatacc 108  Q
    ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||    
T  22162771 tgacatagtgtgccccgtagcgtgggtcccgaaggtaccgtcgtgtacatcatgcattaactgctctgcttcgcgttcatcaacacatcttaacaatacc 22162870  T
Q  109 atgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagc 197  Q
    ||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22162871 atgtcgtagttcctcttgtatagaatatctccatctaacaggaatctaccggctaatcttctcaaggtcttcttgtctctgttggaagc 22162959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 191; Significance: 1e-104; HSPs: 32)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 16513887 - 16514121
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16513887 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcatcaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctta 16513986  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||    
T  16513987 acaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtcttggttggaagcacc 16514086  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
    ||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||    
T  16514087 tggcggatacttacggctcagcaagaactgtttga 16514121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 16045996 - 16045765
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  16045996 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcgtgttcatcaacacatctta 16045897  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||    
T  16045896 acaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccctctagcaggaatttactggccaatcttctcagggttttcttgtctttgttggaagcacc 16045797  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgct 232  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16045796 cggtggatacttacggcttagcaagaactgct 16045765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 2105620 - 2105854
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  2105620 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctta 2105719  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| ||    
T  2105720 acaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 2105819  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     || ||||| | |||||| ||||||||||| ||||    
T  2105820 cggcggatactcacggctcagcaagaactgtttga 2105854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 4140703 - 4140937
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  4140703 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcgtgttcatcaacacatctta 4140802  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||| ||    
T  4140803 acaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctactggccaatcttctcaaggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 4140902  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     || ||||| | |||||||||||||||||| ||||    
T  4140903 cggcggatactcacggcttagcaagaactgtttga 4140937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 24587991 - 24588225
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  24587991 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcgtgttcatcaacacatctta 24588090  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||| ||    
T  24588091 acaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctactggccaatcttctcaaggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 24588190  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     || ||||| | |||||||||||||||||| ||||    
T  24588191 cggcggatactcacggcttagcaagaactgtttga 24588225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 26270543 - 26270777
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26270543 aactttcttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctta 26270642  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||    
T  26270643 acaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacagaaatctgctggccaatcttctcagggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 26270742  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     || ||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  26270743 cggcggatactcacggcttagcaagaactgcttga 26270777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 26533330 - 26533564
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  26533330 aacttccttgacatagtatgccctgtagcgtgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctccgcttcatgttcatcaacacatctta 26533429  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||    
T  26533430 acaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 26533529  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     || ||||| | |||||||||||||||||| ||||    
T  26533530 cggcggatactcacggcttagcaagaactgtttga 26533564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 4 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 2159252 - 2159027
Alignment:
Q  4 ttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctcaaca 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2159252 ttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatcttaaca 2159153  T
Q  104 ataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcctgg 203  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| || ||    
T  2159152 ataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacccgg 2159053  T
Q  204 tggatagttacggcttagcaagaact 229  Q
    |||||| | |||||| ||||||||||    
T  2159052 tggatactcacggctcagcaagaact 2159027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 11420236 - 11420470
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  11420236 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctccgcttcatgttcatcaacacatctta 11420335  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||| ||    
T  11420336 acaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctactggccaatcttctcaaggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 11420435  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     || ||||| | |||||| ||||||||||| ||||    
T  11420436 cggcggatactcacggctcagcaagaactgtttga 11420470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 11445568 - 11445334
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  11445568 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacacctta 11445469  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||   |||||||| ||    
T  11445468 acaataccatgtcatagttcctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctaccggccaatcttctcaaggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 11445369  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
    ||| ||||| | |||||| ||||||||||||||||    
T  11445368 tggcggatactcacggctcagcaagaactgcttga 11445334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 16445463 - 16445697
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| |    
T  16445463 aacttccatgacatagtatgccctgtagcatggctcccgaaggtaccgtcatgtacgtcatgcattaactgctccgcttcgtgttcaccaacacatctta 16445562  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16445563 acaataccatgtcgtagtttcttttgtacataatatctccatctaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagcacc 16445662  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
      ||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  16445663 cagtggatactcacggcttagcaagaactgcttga 16445697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 26511153 - 26511387
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26511153 aacttccttgacatagtatgccccgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctta 26511252  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| ||    
T  26511253 acaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 26511352  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     || ||||| | |||||| ||||||||||| ||||    
T  26511353 cggcggatactcacggctcagcaagaactgtttga 26511387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 26665371 - 26665605
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26665371 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctta 26665470  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| ||    
T  26665471 acaataccatgtcatagttcctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctaccggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 26665570  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     || ||||| | |||||| ||||||||||||||||    
T  26665571 cggcggatactcacggctcagcaagaactgcttga 26665605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 26680563 - 26680797
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26680563 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctta 26680662  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| ||    
T  26680663 acaataccatgtcatagttcctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctaccggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 26680762  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     || ||||| | |||||| ||||||||||||||||    
T  26680763 cggcggatactcacggctcagcaagaactgcttga 26680797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 39208596 - 39208830
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  39208596 aacttccttgacatagtatgccccgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctta 39208695  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| ||    
T  39208696 acaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 39208795  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     || ||||| | |||||| ||||||||||| ||||    
T  39208796 cggcggatactcacggctcagcaagaactgtttga 39208830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 45735988 - 45735754
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  45735988 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccaaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcgtgttcatcaacacatctta 45735889  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||    
T  45735888 acaatactatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 45735789  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     || ||||| | |||||||||||||||||| ||||    
T  45735788 cggcggatactcacggcttagcaagaactgtttga 45735754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 4204070 - 4203836
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  4204070 aacttccttgacatagtatgccccgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcgtgttcatcaacacatctta 4203971  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| ||    
T  4203970 acaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 4203871  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     || ||||| | |||||| ||||||||||| ||||    
T  4203870 cggcggatactcacggctcagcaagaactgtttga 4203836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 5163064 - 5162830
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  5163064 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcctgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctta 5162965  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||   |||||||| ||    
T  5162964 acaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctactggtcaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 5162865  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     || ||||| | |||||| ||||||||||| ||||    
T  5162864 cggcggatactcacggctcagcaagaactgtttga 5162830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 10912326 - 10912560
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  10912326 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcatcaactgctccgcttcatgttcatcaacacatctta 10912425  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| ||    
T  10912426 acaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 10912525  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     || ||||| | |||||| ||||||||||| ||||    
T  10912526 cggcggatactcacggctcagcaagaactgtttga 10912560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 45391901 - 45391667
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  45391901 aacttcctcgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacacctta 45391802  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| ||    
T  45391801 acaataccatgtcatagttcctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctaccggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 45391702  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
    ||| ||||| | |||||| ||||||||||||||||    
T  45391701 tggcggatactcacggctcagcaagaactgcttga 45391667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 3449987 - 3449753
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |    
T  3449987 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgttccgcttcatgttcatcaacacatctta 3449888  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    ||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||    
T  3449887 acagtaccatgtcatagttcctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 3449788  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     || ||||| | |||||| ||||||||||| ||||    
T  3449787 cggcggatactcacggctcagcaagaactgtttga 3449753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 5132677 - 5132443
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  5132677 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctta 5132578  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| ||    
T  5132577 acaataccatgtcatagttcctcttgtacataatatctccatctaacaagaatctactggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 5132478  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     || ||||| | |||||| ||||||||||| ||||    
T  5132477 cggcggatactcacggctcagcaagaactgtttga 5132443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 26439938 - 26439704
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  26439938 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatattcatcaacacatctta 26439839  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||   |||||||| ||    
T  26439838 acaataccatgtcatagttcctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctaccggccaatctcctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 26439739  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     || ||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  26439738 cggcggatattcgcggcttagcaagaactgcttga 26439704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 26517473 - 26517239
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  26517473 aacttccttgacatagtatgccctgtagcgtgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcgtgttcatcaacacatctta 26517374  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||| ||    
T  26517373 acaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatttctccatctaacaggaatctactggccaatcttctcaaggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 26517274  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     || ||||| | |||||| ||||||||||| ||||    
T  26517273 cggcggatactcacggctcagcaagaactgtttga 26517239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 31086079 - 31086313
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  31086079 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctta 31086178  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| ||    
T  31086179 acaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatccccatctaaccggaacctactggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 31086278  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     || ||||| | |||||| ||||||||||| ||||    
T  31086279 cggcggatactcacggctcagcaagaactgtttga 31086313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 31128588 - 31128354
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |    
T  31128588 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctccgcctcatgttcatcaacacatctta 31128489  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| ||    
T  31128488 acaataccatgtcatagttcctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 31128389  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     || ||||| | |||||| ||||||||||| ||||    
T  31128388 cggcggatactcacggctcagcaagaactgtttga 31128354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 2777935 - 2777701
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  2777935 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccaaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcgtgttcatcaacacatctta 2777836  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| ||    
T  2777835 acaataccatgtcatagtttctcttgtagagaatatctccatctaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 2777736  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     |  ||||| | |||||| ||||||||||| ||||    
T  2777735 cgacggatactcacggctcagcaagaactgtttga 2777701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 26315305 - 26315534
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |    
T  26315305 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctccgcttcatgctcatcaacacatctta 26315404  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||    
T  26315405 acaacaccatgtcatagtttctcttgtacataatatctccatctaacagaaatctgctggccaatcttctcagggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 26315504  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactg 230  Q
     || ||||| | |||||| |||||||||||    
T  26315505 cggcggatactcacggctcagcaagaactg 26315534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 5142797 - 5143031
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  5142797 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctccgcttcatgttcatcaacacatctta 5142896  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctg-ttggaagctc 199  Q
    ||| ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||| |    
T  5142897 acagtaccatgtcatagttcctcttgtacaggatatctccatctaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttatc-ctgtttggaagcac 5142995  T
Q  200 ctggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
    | || ||||| | ||| || ||||||||||| ||||    
T  5142996 ccggcggatactcacgactcagcaagaactgtttga 5143031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 16746974 - 16747208
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  16746974 aactttcttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcgtgttcatcaacacatctta 16747073  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    | ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| ||    
T  16747074 ataataccatgtcatagttcctcttatacagaatatctccgtctaacaggaatctaccggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 16747173  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     || ||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  16747174 cggcggatattcgcggcttagcaagaactgcttga 16747208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 31559847 - 31560081
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |    
T  31559847 aactttcttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctccgcctcatgttcatcaacacatctta 31559946  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||   |||||||| ||    
T  31559947 acaataccatgtcatagttcctcttgtacaaaatatctccatctaacaggaatctaccggccaatcttctcaaggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 31560046  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     || ||||| | |||||| ||||||||||| ||||    
T  31560047 cggcggatactcacggctcagcaagaactgtttga 31560081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 10846301 - 10846072
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |    
T  10846301 aactttcttgacatagtgtgccccgtagcgtgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcgtgttcatcaatacatctta 10846202  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| || ||||| || | ||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||| |||||||||| ||    
T  10846201 acaataccatgtcgtagtttctcttgtacaaaatgtccccatctaataagaacctactagccaatcttcttagagtcttcttgtctttgttggaagcacc 10846102  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactg 230  Q
      ||||||| | ||||||||||||||||||    
T  10846101 ctgtggatactcacggcttagcaagaactg 10846072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 2)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 31977 - 31748
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  31977 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccatcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcgtgttcatcaacacatctta 31878  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  31877 acaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 31778  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactg 230  Q
     |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  31777 cggtggatactcacggcttagcaagaactg 31748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143; HSP #2
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 8644 - 8410
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  8644 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctccgcttcatgttcatcaacacatctta 8545  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| ||    
T  8544 acaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacatgaatctactggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 8445  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     || ||||| | |||||| ||||||||||| ||||    
T  8444 cggcggatactcacggctcagcaagaactgtttga 8410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 24)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 16287635 - 16287407
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  16287635 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctccgcttcatgttcatcaacacatctta 16287536  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  16287535 acaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtct-tgttggaagcacc 16287437  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactg 230  Q
     |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  16287436 cggtggatactcacggcttagcaagaactg 16287407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 19912695 - 19912929
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19912695 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctta 19912794  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| ||    
T  19912795 acaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttatcttggttggaagcacc 19912894  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
    ||| ||||| | |||||| ||||||||||| ||||    
T  19912895 tggcggatactcacggctcagcaagaactgtttga 19912929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 19692781 - 19692547
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19692781 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctta 19692682  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| ||    
T  19692681 acaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttatcttggttggaagcacc 19692582  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     |  ||||| | |||||||||||||||||| ||||    
T  19692581 cgacggatactcacggcttagcaagaactgtttga 19692547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 22137593 - 22137359
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |    
T  22137593 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtatatcatgcattaactgctccgcttcgtgttcatcaacacatctta 22137494  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  22137493 acaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 22137394  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     || ||||| |  ||||||||||||||||| ||||    
T  22137393 cggcggatactctcggcttagcaagaactgtttga 22137359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 2132793 - 2133027
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  2132793 aacttccttgacatagtatgtcctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctta 2132892  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| ||    
T  2132893 acaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 2132992  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     || ||||| | |||||| ||||||||||| ||||    
T  2132993 cggcggatactcacggctcagcaagaactgtttga 2133027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 18795387 - 18795153
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  18795387 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctccgcttcatgttcatcaacacatctta 18795288  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| ||    
T  18795287 acaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 18795188  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     || ||||| | ||||||  |||||||||||||||    
T  18795187 cggcggatactcacggctccgcaagaactgcttga 18795153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 19203895 - 19204129
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19203895 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctta 19203994  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||   |||||||| ||    
T  19203995 acaataccatgtcatagttcctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctaccggccaatctcctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 19204094  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
    ||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  19204095 tggcggatattcgcggcttagcaagaactgcttga 19204129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 9359308 - 9359074
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  9359308 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctta 9359209  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||| | ||    
T  9359208 acagtaccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatctaacaggaatttactggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaaacacc 9359109  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     || ||||| | |||||| ||||||||||| ||||    
T  9359108 cggcggatactcacggctcagcaagaactgtttga 9359074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 19679130 - 19678896
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  19679130 aactttcttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacacctta 19679031  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||   |||||||| ||    
T  19679030 acaataccatgtcatagttcctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctaccggccaatcttctcaaggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 19678931  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
    ||| ||||| | |||||| ||||||||||||||||    
T  19678930 tggcggatactcacggctcagcaagaactgcttga 19678896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 27604438 - 27604664
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  27604438 aacttccttgacatagtatgccttgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcgtgttcatcaacacatctta 27604537  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| ||    
T  27604538 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatctaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 27604637  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaa 227  Q
     || ||||| | |||||| ||||||||    
T  27604638 cggcggatactcacggctcagcaagaa 27604664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 44565667 - 44565433
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  44565667 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctta 44565568  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||   |||||||| ||    
T  44565567 ataataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctactggccaatattctcaaggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 44565468  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     |  ||||| | |||||||||||||||||| ||||    
T  44565467 cgacggatactcacggcttagcaagaactgtttga 44565433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 3 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 33247051 - 33246819
Alignment:
Q  3 cttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctcaac 102  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  33247051 cttccttgacatagtatgtcctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatcttaac 33246952  T
Q  103 aataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcctg 202  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| || |    
T  33246951 aataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacccg 33246852  T
Q  203 gtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
    | ||||| | |||||| || |||||||| ||||    
T  33246851 gcggatactcacggctcagtaagaactgtttga 33246819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 19656874 - 19657100
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |    
T  19656874 aacttccttgacatagtatgccctatagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgcttcgcttcgtgttcatcaacacatctta 19656973  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  19656974 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatctaacaggaatctactggccaatcttcttagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 19657073  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaa 227  Q
     ||  |||| | |||||| ||||||||    
T  19657074 cggcagatactcacggctcagcaagaa 19657100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 21343704 - 21343938
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |    
T  21343704 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctccgcctcatgttcatcaacacatctta 21343803  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||| ||    
T  21343804 aaaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctactggccaatcttctcaaggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 21343903  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     || ||||| | |||||| ||||||||||| ||||    
T  21343904 cggcggatactcacggctcagcaagaactgtttga 21343938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 28357485 - 28357719
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  28357485 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccaaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctta 28357584  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||   |||||||| ||    
T  28357585 gcaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctgccggccaatcttctcaaggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 28357684  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     || ||||| | |||||||||||||||||| ||||    
T  28357685 cggcggatactcacggcttagcaagaactgtttga 28357719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 33263417 - 33263183
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  33263417 aacttcctcgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctccgcttcatgttcatcaacacatctta 33263318  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||| ||    
T  33263317 acaataccatgtcatagtttctcttgtacagaacatctccatctaacaggaatctactggccaatcttctcaaggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 33263218  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     || ||||| | |||||| ||||||||||| ||||    
T  33263217 cggcggatactcacggctcagcaagaactgtttga 33263183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 12088256 - 12088490
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  12088256 aactttcttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcctcatgttcatcaacacatctta 12088355  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||   |||||||| |     
T  12088356 acaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctaccggccaatcttctcaaggtcttcttgtcttgtttggaagcact 12088455  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     || ||||| | |||||| ||||||||||| ||||    
T  12088456 cggcggatactcacggctcagcaagaactgtttga 12088490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 31359211 - 31358977
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  31359211 aactttcttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacacctta 31359112  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||   |||||||| ||    
T  31359111 acaataccatgtcatagttcctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctaccggccaatcttctcagggttttcttatcttgtttggaagcacc 31359012  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     || ||||| | |||||| ||||||||||||||||    
T  31359011 cggcggatactcacggctcagcaagaactgcttga 31358977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 31485404 - 31485638
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  31485404 aacttcctcgacatagtatgccctatagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacacctta 31485503  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| ||    
T  31485504 acaataccatgtcatagttcctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctaccggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 31485603  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
    ||| ||||| | |||||| ||||||||||| ||||    
T  31485604 tggcggatactcacggctcagcaagaactgtttga 31485638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 3 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 14562305 - 14562073
Alignment:
Q  3 cttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctcaac 102  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  14562305 cttccttgacatagtatgtcctgtagcaggggtcccgaaggtactgtcatgtacatcaggcattaactgctccgcttcatgttcatcaacacatcttaac 14562206  T
Q  103 aataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcctg 202  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| || ||||    
T  14562205 aataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacatgaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtcttggttggaggcacctg 14562106  T
Q  203 gtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
    | ||||| | |||||| ||||||||||| ||||    
T  14562105 gcggatactcacggctcagcaagaactgtttga 14562073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 7 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 29834002 - 29833774
Alignment:
Q  7 cttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctcaacaata 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29834002 cttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatcttaacaata 29833903  T
Q  107 ccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcctggtgg 206  Q
    ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||   |||||||| || || ||    
T  29833902 ccatgtcatagttcctcttgtacaaaatatctccatctaacaggaatctaccggccaatcttctcaaggtcttcttgtcttgtttggaagcacccggcgg 29833803  T
Q  207 atagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
    ||| | |||||| ||||||||||| ||||    
T  29833802 atactcacggctcagcaagaactgtttga 29833774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 15772257 - 15772023
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15772257 aactttcttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactactctgcttcatgttcatcaacacatctta 15772158  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| ||    
T  15772157 acagtaccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctagcaggaatctattggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 15772058  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     || ||||| | |||||| ||||||||||| ||||    
T  15772057 cggcggatactcacggctcagcaagaactgtttga 15772023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 22076458 - 22076692
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |    
T  22076458 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacgtcatgcattaattgctctgcctcatgctcatcaacacatctta 22076557  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| || ||||| |||| ||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||    
T  22076558 acaataccatgtcgtagtttcttttgtacaaaatgtccccatctaacaagaacctactagccaatcttctcagagtcttcttgtctttgttggaagcacc 22076657  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     |||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  22076658 cggtggatactcacggcttagcaagaactgcttga 22076692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 18714167 - 18713939
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  18714167 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccaaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcgtgttcatcaacacatctta 18714068  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||| ||    
T  18714067 gcaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacatgaatctactggccaatcttctcaaggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 18713968  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaact 229  Q
     |  ||||| | |||||| ||||||||||    
T  18713967 cgacggatactcacggctcagcaagaact 18713939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 39)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 20842596 - 20842362
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  20842596 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcagcaacacatctta 20842497  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||    
T  20842496 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatctaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttgaaagcacc 20842397  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     |  ||||| | |||||||||||||||||| ||||    
T  20842396 cgacggatactcacggcttagcaagaactgtttga 20842362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 256214 - 256448
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  256214 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctta 256313  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||| ||    
T  256314 acaataccatgtcatagtttctcttgtacaaaatatctccatctaacaggaatctactggccaatcttctcaaggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 256413  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     || ||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  256414 cggcggatactcacggcttagcaagaactgcttga 256448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 27430002 - 27430236
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  27430002 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcgtgttcatcaacacatctta 27430101  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||    
T  27430102 acaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttatctttgttggaagcacc 27430201  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     |  ||||| | |||||||||||||||||| ||||    
T  27430202 cgacggatactcacggcttagcaagaactgtttga 27430236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 11630745 - 11630979
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  11630745 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacgtcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctta 11630844  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| ||    
T  11630845 acaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 11630944  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
    ||| ||||| | |||||| ||||||||||| ||||    
T  11630945 tggcggatactcacggctcagcaagaactgtttga 11630979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 12591491 - 12591257
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  12591491 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctccgcttcatgttcatcaacacatctta 12591392  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| ||    
T  12591391 acaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 12591292  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
    ||| ||||| | |||||| ||||||||||| ||||    
T  12591291 tggcggatactcacggctcagcaagaactgtttga 12591257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 12660219 - 12659985
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  12660219 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcatcaactgctctgcttcatgttcatcaacacacctta 12660120  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| ||    
T  12660119 acaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctactggccaatctcctcagggtcttcttgtcttggttggaagcacc 12660020  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
    ||| ||||| | |||||| ||||||||||| ||||    
T  12660019 tggcggatactcacggctcagcaagaactgtttga 12659985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 12712162 - 12712396
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12712162 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctta 12712261  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||   |||||||| ||    
T  12712262 acaataccatgtcatagttcctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctaccggccaatcttctcaaggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 12712361  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
    ||| ||||| | |||||| ||||||||||||||||    
T  12712362 tggcggatactcacggctcagcaagaactgcttga 12712396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 27780917 - 27780683
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  27780917 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccaaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcgtgttcatcaacacatctta 27780818  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||    
T  27780817 acaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 27780718  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     || ||||| | |||||||||||||||||| ||||    
T  27780717 cggcggatactcacggcttagcaagaactgtttga 27780683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 27820674 - 27820440
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  27820674 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccaaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcgtgttcatcaacacatctta 27820575  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||    
T  27820574 acaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 27820475  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     || ||||| | |||||||||||||||||| ||||    
T  27820474 cggcggatactcacggcttagcaagaactgtttga 27820440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 39894752 - 39894518
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  39894752 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctta 39894653  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||| ||    
T  39894652 ataataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctactggccaatcttctcaaggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 39894553  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
    ||| ||||| | |||||| |||||||||| |||||    
T  39894552 tggcggatattcacggctcagcaagaactacttga 39894518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 40238191 - 40237957
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  40238191 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctta 40238092  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| ||    
T  40238091 acaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctaccggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 40237992  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     || ||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  40237991 cggcggatattcgcggcttagcaagaactgcttga 40237957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 9345547 - 9345781
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  9345547 aacttccttgacatagtgtgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatggacatcatgcattaactgctccgcttcatgttcatcaacacatctta 9345646  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||    
T  9345647 acagtaccatgtcatagttccttttgtacagaatatctccatctaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 9345746  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     || ||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  9345747 cggcggatactcacggcttagcaagaactgcttga 9345781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 19412062 - 19412296
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  19412062 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccaaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcgtgttcatcaacacatctta 19412161  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||    
T  19412162 acaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 19412261  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     || ||||| | |||||| ||||||||||| ||||    
T  19412262 cggcggatactcacggctcagcaagaactgtttga 19412296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 21698732 - 21698966
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  21698732 aacttccttgacatagtatgctctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcgtgttcatcaacacatctta 21698831  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  |    
T  21698832 acaataccatgtcgtagtttcttttgtacaaaatgtctccatctaacagaaatctactggccaatctcctcagggtcttcttgtctttgttggaagcatc 21698931  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     |||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  21698932 cggtggatactcacggcttagcaagaactgcttga 21698966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 28886962 - 28886728
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  28886962 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctta 28886863  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| ||    
T  28886862 accataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 28886763  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     || ||||| | |||||| ||||||||||| ||||    
T  28886762 cggcggatactcacggctcagcaagaactgtttga 28886728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 34295837 - 34295603
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  34295837 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctta 34295738  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| ||    
T  34295737 acaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacaggactctactggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 34295638  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     || ||||| | |||||| ||||||||||| ||||    
T  34295637 cggcggatactcacggctcagcaagaactgtttga 34295603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 21672736 - 21672970
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  21672736 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctccgcttcatgttcatcaacacatctta 21672835  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||   |||||||| ||    
T  21672836 acaataccatgtcatagttcctcttgtacagaatacctccatctaacaggaatctaccggccaatcttctcaaggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 21672935  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
    ||| ||||| | |||||| ||||||||||||||||    
T  21672936 tggcggatattcacggctcagcaagaactgcttga 21672970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 23124130 - 23124364
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  23124130 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctccgcttcatgttcatcaacacatctta 23124229  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||   |||||||| ||    
T  23124230 acaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctactggccaatcttctcagggttttcttatcttgtttggaagcacc 23124329  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     || ||||| | |||||| ||||||||||| ||||    
T  23124330 cggcggatactcacggctcagcaagaactgtttga 23124364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 27808386 - 27808152
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  27808386 aacttccttgacatagtatgccctgtagcgtgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcgtgttcatcaacacatctta 27808287  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| ||    
T  27808286 acaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 27808187  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
    ||| ||||| | |||| | ||||||||||| ||||    
T  27808186 tggcggatactcacggttcagcaagaactgtttga 27808152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 31880969 - 31880735
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  31880969 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctta 31880870  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| ||    
T  31880869 acaataccatgtcatagttcctcttgtacagaatatttccatctaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 31880770  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
    ||  ||||| | |||| ||||||||||||| ||||    
T  31880769 tgtcggatactcacggtttagcaagaactgtttga 31880735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 34159527 - 34159293
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  34159527 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctta 34159428  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||| ||    
T  34159427 acaataccatgtcatagttcctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctactggccaatcttctcaaggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 34159328  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     || ||||| | | |||| ||||||||||| ||||    
T  34159327 cggcggatactcatggctcagcaagaactgtttga 34159293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 34866367 - 34866133
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  34866367 aactttcttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatattcatcaacacatctta 34866268  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||    
T  34866267 acaataccatgtcgtagttccttttgtatagaatatctccatctaacaggaatctaccggccaatcttctcagggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 34866168  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     || ||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  34866167 cggcggatactcacggcttagcaagaactgcttga 34866133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 37382360 - 37382126
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  37382360 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctccgcttcatgttcatcaacacatctta 37382261  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||  ||    
T  37382260 ataataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagtacc 37382161  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     || ||||| | |||||||||||||||||| ||||    
T  37382160 cggcggatactcacggcttagcaagaactgtttga 37382126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 37681456 - 37681690
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  37681456 aactttcttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctta 37681555  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| ||    
T  37681556 acaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 37681655  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     || ||||| | ||| || ||||||||||| ||||    
T  37681656 cggcggatactcacgactcagcaagaactgtttga 37681690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 37696721 - 37696955
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  37696721 aactttcttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctta 37696820  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| ||    
T  37696821 acaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 37696920  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     || ||||| | ||| || ||||||||||| ||||    
T  37696921 cggcggatactcacgactcagcaagaactgtttga 37696955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 3787176 - 3786942
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  3787176 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacacctta 3787077  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| ||    
T  3787076 acaataccatgtcgtagtttctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 3786977  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     || ||||| | ||| ||||| |||||||| ||||    
T  3786976 cggcggatactcacgncttagtaagaactgtttga 3786942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 22923709 - 22923943
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  22923709 aactttcttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacacctta 22923808  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| ||    
T  22923809 acaataccatgtcatagttcctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctaccggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 22923908  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     || ||||| | |||||| ||||||||||||||||    
T  22923909 cggcggatactcacggctcagcaagaactgcttga 22923943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 27121207 - 27120973
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  27121207 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccaaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcgtgttcatcaacacatctta 27121108  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||   |||||||| ||    
T  27121107 acaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctactggccaatcttctcaaggtcttcttatcttgtttggaagcacc 27121008  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     || ||||| | |||||| ||||||||||| ||||    
T  27121007 cggcggatactcacggctcagcaagaactgtttga 27120973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 16166163 - 16165929
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  16166163 aacttccttgacatagtatgccctgtagcgtgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcgtgttcatcaacacatctta 16166064  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| |     
T  16166063 acaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcact 16165964  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
    ||| ||||| | || | | ||||||||||| ||||    
T  16165963 tggcggatactcacagttcagcaagaactgtttga 16165929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 16824899 - 16825133
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  16824899 aactttcttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcgtgttcatcaacacatctta 16824998  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
     |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| ||    
T  16824999 gcaataccatgtcatagttcctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctaccggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 16825098  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     || ||||| | |||||| ||||||||||||||||    
T  16825099 cggcggatactcacggctcagcaagaactgcttga 16825133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 16896581 - 16896347
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  16896581 aactttcttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcgtgttcatcaacacatctta 16896482  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
     |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| ||    
T  16896481 gcaataccatgtcatagttcctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctaccggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 16896382  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     || ||||| | |||||| ||||||||||||||||    
T  16896381 cggcggatactcacggctcagcaagaactgcttga 16896347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 31889052 - 31889286
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |    
T  31889052 aacttctttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctccgcttcatgttcattaacacatctta 31889151  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||   |||||||| ||    
T  31889152 acaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctactggctaatcttctcaaggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 31889251  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     || ||||| | |||||| ||||||||||| ||||    
T  31889252 aggcggatactcacggctcagcaagaactgtttga 31889286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 32054486 - 32054252
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  32054486 aactttcttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacacctta 32054387  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| ||    
T  32054386 acaataccatgtcatagttcctcttgtacagaatatttccatctaacaggaatctaccggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 32054287  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     || ||||| | |||||| ||||||||||||||||    
T  32054286 cggcggatactcacggctcagcaagaactgcttga 32054252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 37930052 - 37929818
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  37930052 aactttcttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacacctta 37929953  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| ||    
T  37929952 acaataccatgtcatagttcctcttgtacagaatatttccatctaacaggaatctaccggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 37929853  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     || ||||| | |||||| ||||||||||||||||    
T  37929852 cggcggatactcacggctcagcaagaactgcttga 37929818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 37947423 - 37947657
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |    
T  37947423 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgttccgcttcatgttcatcaacacatctta 37947522  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| ||    
T  37947523 acaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctaccggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 37947622  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     || ||||| | |||||| ||||| ||||| ||||    
T  37947623 cggcggatactcacggctcagcaaaaactgtttga 37947657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 13932108 - 13932342
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  13932108 aacttccttgacatagtatgccctgtagcgtgggtcccgaaggtaccgtcatgtatatcatgcattaactgctctgcttcgtgttcatcaacacatctta 13932207  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||| ||    
T  13932208 acaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctgctggccaatcttctcaaggtcttcttgtcttgcttggaagcacc 13932307  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     || ||||| | ||| || ||||||||||| ||||    
T  13932308 cggcggatactcacgactcagcaagaactgtttga 13932342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 34270481 - 34270715
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |    
T  34270481 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctcaacttcatgttcatcaacacatctta 34270580  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| ||    
T  34270581 acaataccatgtcatagtgtctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 34270680  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     |  ||||| | |||||| || |||||||| ||||    
T  34270681 cgacggatactcacggctcagtaagaactgtttga 34270715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 39047380 - 39047614
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  39047380 aactttcttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcgtgttcatcaacacatctta 39047479  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    ||| ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||   |||||||| ||    
T  39047480 acagtaccatgtcatagttcctcttgtacaggatatctccatctaacaggaatctactggccaaccttctcaaggttttcttgtcttgtttggaagcacc 39047579  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     |  ||||| | |||||| ||||||||||| ||||    
T  39047580 cgacggatactcacggctcagcaagaactgtttga 39047614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 19451984 - 19452218
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  19451984 aactttcttgacatagtgtgccccgtagcgtgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcgtgttcatcaacacatctta 19452083  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| || ||||| || | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  19452084 acaataccatgtcgtagtttctcttgtacaaaatgtccccatctaataagaacctactagccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 19452183  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     |  |||||   |||||||||||||||||||||||    
T  19452184 cgacggatacccacggcttagcaagaactgcttga 19452218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 11)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 20335988 - 20336222
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  20335988 aacttccttgacatagtacgtcctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacgtcatgcattaactgctctgcttcattttcatcaacacatctta 20336087  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  20336088 gcaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaatatctccatctaacaggaatctactggccaatcttctcaaggtcttcttgtctctgttggaagcacc 20336187  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20336188 cggtggatacttacggcttagcaagaactgcttga 20336222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 10949763 - 10949529
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  10949763 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctta 10949664  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||| ||    
T  10949663 acaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctactggccaatcttctcaaggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 10949564  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     || ||||| | |||||||||||||||||| ||||    
T  10949563 cggcggatactcacggcttagcaagaactgtttga 10949529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 16203606 - 16203840
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |    
T  16203606 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcgcgttcatcaacacatctta 16203705  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||    
T  16203706 acaataccatgtcgtagtttctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttatctttgttggaagcacc 16203805  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     |||||||| | |||||||||||||||||| ||||    
T  16203806 cggtggatactcacggcttagcaagaactgtttga 16203840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 10967351 - 10967117
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  10967351 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctta 10967252  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||   |||||||| ||    
T  10967251 acaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctactggccaatcttctcaaggtcttcttatcttgtttggaagcacc 10967152  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     || ||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  10967151 cggcggatattcgcggcttagcaagaactgcttga 10967117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 28154422 - 28154188
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  28154422 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccaaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcgtgttcatcaacacatctta 28154323  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||    
T  28154322 acaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 28154223  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     || ||||| | |||||||||||||||||| ||||    
T  28154222 cggcggatactcacggcttagcaagaactgtttga 28154188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 3645829 - 3645594
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccg-aaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  3645829 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccggaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctt 3645730  T
Q  100 aacaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctc 199  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| |    
T  3645729 aacaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcac 3645630  T
Q  200 ctggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
    | || ||||| | |||||||||||||||||| ||||    
T  3645629 ccggcggatactcacggcttagcaagaactgtttga 3645594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 21893320 - 21893554
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  21893320 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcgtgttcatcaacacatctta 21893419  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| ||    
T  21893420 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatctaacaggaatctaccggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 21893519  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     || ||||| | |||||| ||||||||||| ||||    
T  21893520 cggcggatactcacggctcagcaagaactgtttga 21893554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 28589766 - 28589532
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |    
T  28589766 aacttcctcgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctccgcctcatgttcatcaacacatctta 28589667  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||| ||    
T  28589666 acaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctactggccaatcttctcaaggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 28589567  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
    ||| ||||| | |||||| ||||||||||| ||||    
T  28589566 tggcggatactcacggctcagcaagaactgtttga 28589532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 41788882 - 41789116
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  41788882 aactttcttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcgtcaacacatctta 41788981  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||| ||    
T  41788982 acaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctactggccaatcttctcaaggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 41789081  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     || ||||| | |||||| ||||||||||| ||||    
T  41789082 cggcggatactcacggctcagcaagaactgtttga 41789116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 51642904 - 51642670
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  51642904 aactttcttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccatcatgtacatcctgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctta 51642805  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||| ||    
T  51642804 acaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctactggccaatcttctcaaggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 51642705  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     || ||||| | |||||||||||||||||| ||||    
T  51642704 cggcggatactcacggcttagcaagaactgtttga 51642670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 20465662 - 20465428
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |    
T  20465662 aacttctttgacatagtatgccttgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctccgcttcgtgttcatcaacacatctta 20465563  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||    
T  20465562 gcaataccatgtcgtagtttcttttgtacaaaatgtctccatctaacaggaatctactggccaatcttctcaaggtcttcttgtccctgttggaagcacc 20465463  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     |||||||| | ||| |||||||||||||||||||    
T  20465462 cggtggatactcacgacttagcaagaactgcttga 20465428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 183; Significance: 4e-99; HSPs: 52)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 25204969 - 25204735
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  25204969 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcgtgttcatcaacacatctta 25204870  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  25204869 acaataccatgtcgtagtttctcttgtacagaatatctccatctagcaggaatttactagccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 25204770  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  25204769 cggtggatacttacgacttagcaagaactgcttga 25204735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 25269124 - 25268890
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  25269124 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcgtgttcatcaacacatctta 25269025  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  25269024 acaataccatgtcgtagtttctcttgtacagaatatctccatctagcaggaatttactagccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 25268925  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  25268924 cggtggatacttacgacttagcaagaactgcttga 25268890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 13182262 - 13182496
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  13182262 aacttcctcgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctccgcttcatgttcatcaacacatctta 13182361  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||    
T  13182362 acaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 13182461  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     || ||||| | |||||||||||||||||| ||||    
T  13182462 cggcggatactcacggcttagcaagaactgtttga 13182496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 22893154 - 22892920
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |    
T  22893154 aactttcttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacgtcatgcattaactactccgcttcgtgttcatcaacacatctta 22893055  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  22893054 acaataccatgtcgtagtttcttttgtacagaacatctccagctaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtccctgttggaagcacc 22892955  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  22892954 tggtggatactcacggcttagcaagaactgcttga 22892920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 28955254 - 28955488
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  28955254 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctta 28955353  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||| ||    
T  28955354 acaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctactggccaatcttctcaaggtcttcttgtcttgcttggaagcacc 28955453  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     || ||||| | |||||| ||||||||||| ||||    
T  28955454 cggcggatactcacggctcagcaagaactgtttga 28955488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 29886666 - 29886900
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |    
T  29886666 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacgtcatgcattaactgttccgcttcatgttcatcaacacatctta 29886765  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| ||    
T  29886766 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaaaaggaatctactggccaatcttcttagggtcttcttgtcttggttggaagcacc 29886865  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
    ||  ||||| | |||||| ||||||||||||||||    
T  29886866 tgacggatactcacggctcagcaagaactgcttga 29886900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 30173160 - 30172926
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  30173160 aactttcttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctta 30173061  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||| ||    
T  30173060 acaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctactggccaatcttctcaaggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 30172961  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     || ||||| | |||||| ||||||||||||||||    
T  30172960 cggcggatactcacggctcagcaagaactgcttga 30172926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 3794232 - 3793998
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  3794232 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctta 3794133  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||| ||    
T  3794132 acaataccatgtcgtagtttctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctactggccaatcttctcaaggtcttcttgtcttgcttggaagcacc 3794033  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     || ||||| | |||||| ||||||||||| ||||    
T  3794032 cggcggatactcacggctcagcaagaactgtttga 3793998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 6878996 - 6878762
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6878996 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctta 6878897  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||    
T  6878896 acaataccatgtcatagtttctcttgtacaaaatctctccatctaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 6878797  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     || ||||| | |||||| ||||||||||| ||||    
T  6878796 cggcggatactcacggctcagcaagaactgtttga 6878762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 13438152 - 13438386
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13438152 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctta 13438251  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||| ||    
T  13438252 acaataccatgtcatagtttctcttgtacagaacatctccatctaacaggaatctactggccaatcttctcaaggtcttcttgtcttgcttggaagcacc 13438351  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     || ||||| | |||||| ||||||||||| ||||    
T  13438352 cggcggatactcacggctcagcaagaactgtttga 13438386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 23630660 - 23630427
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  23630660 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttc-tgttcatcaacacatctta 23630562  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| ||    
T  23630561 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatctaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 23630462  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     || ||||| | |||||| ||||||||||| ||||    
T  23630461 cggcggatactcacggctcagcaagaactgtttga 23630427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 24728660 - 24728426
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  24728660 aacttcctcgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcgtgttcatcaacacatctta 24728561  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| ||    
T  24728560 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatctaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 24728461  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     || ||||| | |||||| ||||||||||| ||||    
T  24728460 aggcggatactcacggctcagcaagaactgtttga 24728426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 30939326 - 30939092
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  30939326 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgcacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctta 30939227  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| ||    
T  30939226 acaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 30939127  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     || ||||| | |||||| ||||||||||| ||||    
T  30939126 cggcggatactcacggctcagcaagaactgtttga 30939092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 40469019 - 40469253
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  40469019 aacttccttgacatagtgtgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatggacatcatgcattaactgctccgcttcatgttcatcaacacatctta 40469118  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||    
T  40469119 acagtaccatgtcatagttccttttgtacagaatatctccatctaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 40469218  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     || ||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  40469219 cggcggatactcacggcttagcaagaactgcttga 40469253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 41679396 - 41679167
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  41679396 aacttccttgacatagtatgtcctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctta 41679297  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||    
T  41679296 acaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 41679197  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactg 230  Q
     |  ||||| | |||||| |||||||||||    
T  41679196 cgacggatactcacggctcagcaagaactg 41679167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 3 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 24588063 - 24587831
Alignment:
Q  3 cttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctcaac 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  24588063 cttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcatcaactgctccgcttcatgttcatcaacacatcttaac 24587964  T
Q  103 aataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcctg 202  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | ||    
T  24587963 aataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaaaaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtcttggttggaagcacttg 24587864  T
Q  203 gtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
    | ||||| | |||||| ||||||||||| ||||    
T  24587863 gcggatactcacggctcagcaagaactgtttga 24587831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 8660944 - 8661178
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  8660944 aactttcttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctta 8661043  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| ||    
T  8661044 acaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 8661143  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     || ||||| | ||| || ||||||||||| ||||    
T  8661144 cggcggatactcacgactcagcaagaactgtttga 8661178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 9322167 - 9321933
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  9322167 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacgtcatgcattaactgctctgcttcgtgttcatcaacacatctta 9322068  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| ||    
T  9322067 acaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 9321968  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     || ||||| | |||||| ||||||||||| ||||    
T  9321967 cggcggatactcacggctcagcaagaactgtttga 9321933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 11328328 - 11328094
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  11328328 aactttcttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctta 11328229  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||| ||    
T  11328228 acaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatctctccatctaacaggaatctactggccaatcttctcaaggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 11328129  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     || ||||| | |||||| ||||||||||| ||||    
T  11328128 cggcggatactcacggctcagcaagaactgtttga 11328094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 15654227 - 15654461
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  15654227 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctccgcttcatgttcatcaacacatctta 15654326  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| ||    
T  15654327 ataataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 15654426  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     || ||||| | |||||| |||||||| |||||||    
T  15654427 cggcggatactcacggctcagcaagaattgcttga 15654461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 18371003 - 18371237
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18371003 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctta 18371102  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||| ||    
T  18371103 acaataccatgtcatagttcctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctactggccaatcttctcaaggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 18371202  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     |  ||||| | |||||| ||||||||||| ||||    
T  18371203 cgacggatactcacggctcagcaagaactgtttga 18371237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 22994586 - 22994820
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  22994586 aacttccttgacatggtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcgtgttcatcaacacatctta 22994685  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| ||    
T  22994686 ataataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatctaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 22994785  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     || ||||| | |||||| ||||||||||| ||||    
T  22994786 cggcggatactcacggctcagcaagaactgtttga 22994820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 31436155 - 31435921
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31436155 aactttcttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacacctca 31436056  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    ||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||   |||||||| ||    
T  31436055 acagtaccatgtcatagttcctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctaccggccaatcttctcaaggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 31435956  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
    ||| ||||| | |||||| ||||||||||||||||    
T  31435955 tggcggatactcacggctcagcaagaactgcttga 31435921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 33782176 - 33781942
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  33782176 aacttcctcgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctccgcttcatgttcatcaacacatctta 33782077  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||    
T  33782076 acaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatccccatctaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 33781977  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     || ||||| | |||||| ||||||||||| ||||    
T  33781976 cggcggatactcacggctcagcaagaactgtttga 33781942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 33879819 - 33879585
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  33879819 aactttcttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctta 33879720  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||   |||||||| ||    
T  33879719 acaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatctctccatctaacaggaatctactgaccaatcttctcaaggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 33879620  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     || ||||| | |||||| ||||||||||||||||    
T  33879619 cggcggatactcacggctcagcaagaactgcttga 33879585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 34621209 - 34620975
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  34621209 aactttcttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacacctta 34621110  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||   |||||||| ||    
T  34621109 acaataccatgtcatagttcctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctaccggccaatcttctcaaggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 34621010  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
    ||| ||||| | |||||| ||||||||||||||||    
T  34621009 tggcggatactcacggctcagcaagaactgcttga 34620975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 43082946 - 43082712
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  43082946 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctta 43082847  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    ||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| ||    
T  43082846 acagtaccatgtcacagtttctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 43082747  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     || ||||| | |||||| ||||||||||| ||||    
T  43082746 aggcggatactcacggctcagcaagaactgtttga 43082712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 26485085 - 26484856
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26485085 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctta 26484986  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||    
T  26484985 acaataccatgtcatagtttctcttgtacataatatctccatctaacagaaatctgctggccaatcttctcagggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 26484886  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactg 230  Q
     || ||||| | |||||| |||||||||||    
T  26484885 cggcggatactcacggctcagcaagaactg 26484856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 7 - 235
Target Start/End: Original strand, 31821882 - 31822110
Alignment:
Q  7 cttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctcaacaata 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31821882 cttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatcttaacaata 31821981  T
Q  107 ccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcctggtgg 206  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||   |||||||  ||||| ||    
T  31821982 ccatgtcatagttcctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctaccggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagtacctggcgg 31822081  T
Q  207 atagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
    ||| | |||||| ||||||||||||||||    
T  31822082 atactcacggctcagcaagaactgcttga 31822110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 2515753 - 2515519
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  2515753 aactttcttgacatagtgtgccctgtagcatgggtcccaaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctta 2515654  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||    
T  2515653 acaacaccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacagaaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 2515554  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     || ||||| | |||||||||||||||||| ||||    
T  2515553 cggcggatactcacggcttagcaagaactgtttga 2515519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 11554046 - 11553812
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  11554046 aacttccttgatatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctccgcttcatgttcatcaacacatctta 11553947  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| ||    
T  11553946 acaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 11553847  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
      | ||||| | ||||||  |||||||||||||||    
T  11553846 cagcggatactcacggctccgcaagaactgcttga 11553812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 13320299 - 13320533
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |    
T  13320299 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctccgcctcatgttcatcaacacatctta 13320398  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||   |||||||| ||    
T  13320399 acaataccatgtcatagttcctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctaccggccaatcttctcaaggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 13320498  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
    ||| ||||| | |||||| | ||||||||||||||    
T  13320499 tggcggatactcacggctcaacaagaactgcttga 13320533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 18123885 - 18124119
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  18123885 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccaaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcgtgttcatcaacacatctta 18123984  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| ||    
T  18123985 acaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatcttcatctaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 18124084  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
    ||  ||||| | |||||| ||||||||||| ||||    
T  18124085 tgtcggatactcacggctcagcaagaactgtttga 18124119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 28653934 - 28653700
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  28653934 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccatcatgtacatcatgcattaactgctcagcttcatgttcatcaacacatctta 28653835  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| ||    
T  28653834 acaataccatgtcatagttcctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctaccggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 28653735  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     || ||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  28653734 cggcggatattcgcggcttagcaagaactgcttga 28653700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 33297219 - 33296985
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  33297219 aacttccttgacatggtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctccgcttcatgttcatcaacacatctta 33297120  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||| ||    
T  33297119 acaataccatgtcatagttcctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctactggccaatcttctcaaggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 33297020  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     || ||||| | |||||| ||||||||||| ||||    
T  33297019 cggcggatactcacggctcagcaagaactgtttga 33296985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 5642479 - 5642245
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  5642479 aactttcttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatattcatcaacacatctta 5642380  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||   ||||| || ||    
T  5642379 acaataccatgtcatagtttctcttgtatagaatatctccatctaacaggaatctaccggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaggcacc 5642280  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     || ||||| | |||||| ||||||||||||||||    
T  5642279 cggcggatactcacggctcagcaagaactgcttga 5642245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 9546178 - 9546412
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  9546178 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctccgcttcatgttcatcaacacatctta 9546277  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| ||    
T  9546278 ataataccatgtcatagtttctcttgtacaaaatatctccatctaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 9546377  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     || ||||| |  ||||| ||||||||||| ||||    
T  9546378 cggcggatactcccggctcagcaagaactgtttga 9546412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 30034119 - 30033885
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  30034119 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacacctta 30034020  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||   |||||||| ||    
T  30034019 acaataccatgtcatagttcctcttgtacagaatatttccatctaacaggaatctaccggccaatcttctcaaggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 30033920  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     || ||||| | |||||| ||||||||||| ||||    
T  30033919 cggcggatactcacggctcagcaagaactgtttga 30033885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 30156722 - 30156488
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  30156722 aactttcttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacacctta 30156623  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| ||    
T  30156622 acaataccatgtcatagttcctcttgtacagaatatttccatctaacaggaatctaccggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 30156523  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     || ||||| | |||||| ||||||||||||||||    
T  30156522 cggcggatactcacggctcagcaagaactgcttga 30156488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 33521071 - 33520837
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  33521071 aactttcttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcgtgttcatcaacacatctta 33520972  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
     |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| ||    
T  33520971 gcaataccatgtcatagttcctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctaccggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 33520872  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     || ||||| | |||||| ||||||||||||||||    
T  33520871 cggcggatactcacggctcagcaagaactgcttga 33520837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 18496194 - 18496428
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  18496194 aacttccttgacatagtatgtcctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctccgcttcatgttcatcaacacatctta 18496293  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||| ||    
T  18496294 ataataccatgtcatagttcctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctactggccaatcttctcaaggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 18496393  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     || ||||| |  ||||| ||||||||||| ||||    
T  18496394 cggcggatactcccggctcagcaagaactgtttga 18496428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 12136866 - 12136637
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |    
T  12136866 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctccgcttcatgctcatcaacacatctta 12136767  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||    
T  12136766 acaacaccatgtcatagtttctcttgtacataatatctccatctaacagaaatctgctggccaatcttctcagggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 12136667  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactg 230  Q
     || ||||| | |||||| |||||||||||    
T  12136666 cggcggatactcacggctcagcaagaactg 12136637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 15754321 - 15754555
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15754321 aactttcttgacatagtatgtcctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctta 15754420  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| ||    
T  15754421 ataataccatgtcatagttcctcttgtacagaatatctccgtctaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 15754520  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     |  ||||| | |||||| ||||||||||| ||||    
T  15754521 cgacggatactcacggctcagcaagaactgtttga 15754555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 29 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 24974569 - 24974363
Alignment:
Q  29 catgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctcaacaataccatgtcatagtttcttttgta 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24974569 catgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcgtgttcatcaacacatcttaacaataccatgtcatagtttctcttgta 24974470  T
Q  129 cagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcctggtggatagttacggcttagcaagaac 228  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||||| | |||||| |||||||||    
T  24974469 cagaatatctccatctaacatgaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtcttggttggaagcacctggcggatactcacggctcagcaagaac 24974370  T
Q  229 tgcttga 235  Q
    || ||||    
T  24974369 tgtttga 24974363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 37666955 - 37667189
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |    
T  37666955 aacttacttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctccgcctcatgttcatcaacacatctta 37667054  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    ||| ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||| ||    
T  37667055 acagtaccatgtcatagttcctcttgtacaggatatctccatctaacaggaatctactggccaatcttctcaaggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 37667154  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     || ||||| | |||||| ||||||||||| ||||    
T  37667155 cggcggatactcacggctcagcaagaactgtttga 37667189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 37759674 - 37759440
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |    
T  37759674 aactttcttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctccgcctcatgttcatcaacacatctta 37759575  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   ||| |||| ||    
T  37759574 acaataccatgtcatagttcctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctactggccaatcttctcaaggtcttcttgtcttgtttgtaagcacc 37759475  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     || ||||| | |||||| || |||||||| ||||    
T  37759474 cggcggatactcacggctcaggaagaactgtttga 37759440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 32591743 - 32591977
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  32591743 aactttcttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcgtgttcatcaacacatctta 32591842  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    ||| ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||   |||||||| ||    
T  32591843 acagtaccatgtcatagttcctcttgtacaggatatctccatctaacaggaatctactggccaatcttctcaaggttttcttgtcttgtttggaagcacc 32591942  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     |  ||||| | |||||| ||||||||||| ||||    
T  32591943 cgacggatactcacggctcagcaagaactgtttga 32591977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 37354112 - 37354346
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |    
T  37354112 aactttcttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctccgcctcatgttcatcaacacatctta 37354211  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||   |||||||| |     
T  37354212 acaataccatgtcatagttcctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctaccggccaattttctcaaggtcttcttgtcttgtttggaagcact 37354311  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     || ||||| | |||||| ||||||||||| ||||    
T  37354312 cggcggatactcacggctcagcaagaactgtttga 37354346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 15 - 235
Target Start/End: Original strand, 37766474 - 37766694
Alignment:
Q  15 agtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctcaacaataccatgtca 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37766474 agtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctccgcctcatgttcatcaacacatcttaacaataccatgtca 37766573  T
Q  115 tagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcctggtggatagttac 214  Q
    ||||| || ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||  | || ||||| | ||    
T  37766574 tagttcctcttgtacagaatatttccatctaacaggaatctactggccaatcttctcaaggtcttcttgtcttgtttggaagcatccggcggatactcac 37766673  T
Q  215 ggcttagcaagaactgcttga 235  Q
    |||| ||||||||||| ||||    
T  37766674 ggctcagcaagaactgtttga 37766694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 23896562 - 23896332
Alignment:
Q  5 tccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctcaacaa 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||    
T  23896562 tccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtactgttatgtacatcatgcattaactgctctgcttcgcgttcatcaacacatcttaacaa 23896463  T
Q  105 taccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcctggt 204  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||| ||| | |||||| | || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  | ||     
T  23896462 taccatgtcgtagtttctcttgtacaaaatgtttccatctagcaagaatttactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcatccggc 23896363  T
Q  205 ggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
    ||||| | ||| |||||||||||||| ||||    
T  23896362 ggatactcacgacttagcaagaactgtttga 23896332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 209
Target Start/End: Original strand, 36374545 - 36374663
Alignment:
Q  91 acacatctcaacaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgt 190  Q
    |||||||| | ||| ||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| ||| | |||  |||| |  |||||||| || |||||||| ||| |||    
T  36374545 acacatctgagcaagaccgtgtcaaagtttcttttgtacaagatatctccattcaagaagaaattactagataatcttctgagagtcttcttatctttgt 36374644  T
Q  191 tggaagctcctggtggata 209  Q
    |||| ||||| || |||||    
T  36374645 tggatgctccaggaggata 36374663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 209
Target Start/End: Original strand, 36999199 - 36999317
Alignment:
Q  91 acacatctcaacaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgt 190  Q
    |||||||| | ||| ||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| ||| | |||  |||| |  |||||||| || |||||||| ||| |||    
T  36999199 acacatctgagcaagaccgtgtcaaagtttcttttgtacaagatatctccattcaagaagaaattactagataatcttctgagagtcttcttatctttgt 36999298  T
Q  191 tggaagctcctggtggata 209  Q
    |||| ||||| || |||||    
T  36999299 tggatgctccaggaggata 36999317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 183; Significance: 4e-99; HSPs: 26)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 40101209 - 40101443
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  40101209 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctta 40101308  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||| ||    
T  40101309 acaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctactggccaatcttctcaaggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 40101408  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     || ||||| | |||||||||||||||||| ||||    
T  40101409 cggcggatactcacggcttagcaagaactgtttga 40101443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 14669710 - 14669476
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14669710 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcatcaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctta 14669611  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| ||    
T  14669610 acaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttatcttggttggaagcacc 14669511  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     || ||||| | |||||| ||||||||||| ||||    
T  14669510 cggcggatactcacggctcagcaagaactgtttga 14669476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 15232513 - 15232279
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  15232513 aacttccttgacatagtgtgccccgtagcgtgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcgtgttcatcaacacatctta 15232414  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  15232413 acaataccatgtcgtagtttctcttgtacaaaatatctccatctaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctttgttggaagcacc 15232314  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     |||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  15232313 cggtggatactcacggcttagcaagaactgcttga 15232279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 33669372 - 33669606
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  33669372 aacttcctcgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctta 33669471  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| ||    
T  33669472 acaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttatcttggttggaagcacc 33669571  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     |  ||||| | |||||||||||||||||| ||||    
T  33669572 cgacggatactcacggcttagcaagaactgtttga 33669606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 5699232 - 5698998
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  5699232 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacacctta 5699133  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| ||    
T  5699132 acaataccatgtcatagttcctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctaccggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 5699033  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
    ||| ||||| | |||||| ||||||||||||||||    
T  5699032 tggcggatactcacggctcagcaagaactgcttga 5698998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 17017743 - 17017509
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  17017743 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactactctgcttcatgttcatcaacacatctta 17017644  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| ||    
T  17017643 acaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 17017544  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     || ||||| | |||||| ||||||||||| ||||    
T  17017543 cggcggatactcacggctcagcaagaactgtttga 17017509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 20333993 - 20334227
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  20333993 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcgtgttcatcaacacatctta 20334092  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| ||    
T  20334093 acaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 20334192  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     || ||||| | |||||| ||||||||||| ||||    
T  20334193 cggcggatactcacggctcagcaagaactgtttga 20334227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 18312750 - 18312984
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18312750 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctta 18312849  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||   |||||||| ||    
T  18312850 acaataccatgtcatagttcctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctaccggccaatcttctcaaggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 18312949  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     || ||||| | |||||| ||||||||||| ||||    
T  18312950 cggcggatactcacggctcagcaagaactgtttga 18312984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 18796186 - 18796420
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  18796186 aacttcctcgacatagtatgccccgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctccgcttcatgttcatcaacacatctta 18796285  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    ||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||    
T  18796286 acagtaccatgtcgtagttccttttgtacagaatatctccatctaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 18796385  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     || ||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  18796386 cggcggatactcacggcttagcaagaactgcttga 18796420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 24587933 - 24588167
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24587933 aacttccttgacatagtatgtcctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctta 24588032  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||   |||||||| ||    
T  24588033 acaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctactggccaatcttctcagggccttcttatcttgtttggaagcacc 24588132  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     || ||||| | |||||| ||||||||||| ||||    
T  24588133 cggcggatactcacggctcagcaagaactgtttga 24588167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 34184532 - 34184766
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |    
T  34184532 aactttcttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctccgcttcacgttcatcaacacatctta 34184631  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| ||    
T  34184632 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatctaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 34184731  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
    ||| ||||| | |||| | ||||||||||| ||||    
T  34184732 tggcggatactcacggttcagcaagaactgtttga 34184766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 36340089 - 36340323
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  36340089 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctta 36340188  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| ||    
T  36340189 acaataccatgtcatagttcctcttgtacaggatatctccatctaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 36340288  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     || ||||| | |||||| ||||||||||| ||||    
T  36340289 cggcggatactcacggctcagcaagaactgtttga 36340323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 39855334 - 39855100
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  39855334 aacttccttgacatagtatgccctgtggcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcgtgttcatcaacacatctta 39855235  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||    
T  39855234 acaacaccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 39855135  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     || ||||| | |||||| ||||||||||| ||||    
T  39855134 aggcggatactcacggctcagcaagaactgtttga 39855100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 54838088 - 54837854
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  54838088 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgttctgcttcatgttcatcaacacatctta 54837989  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| ||    
T  54837988 acaataccatgtcatagtttctcttgtacaaaatatctccatctaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 54837889  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     || ||||| | |||||| ||||||||||| ||||    
T  54837888 cggcggatactcacggctcagcaagaactgtttga 54837854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 6574555 - 6574321
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |    
T  6574555 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctccgcctcatgttcatcaacacatctta 6574456  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| ||    
T  6574455 acaataccatgtcatagttcctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 6574356  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     || ||||| | |||||| ||||||||||| ||||    
T  6574355 cggcggatactcacggctcagcaagaactgtttga 6574321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 14755064 - 14755298
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  14755064 aactttcttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcgtgttcatcaacacatctta 14755163  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||   |||||||| ||    
T  14755164 acaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctactggccaatcttctcaaggtcttcttatcttgtttggaagcacc 14755263  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     || ||||| | | |||| ||||||||||||||||    
T  14755264 cggcggatactcatggctcagcaagaactgcttga 14755298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 30758457 - 30758223
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  30758457 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccatcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacacctta 30758358  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| ||    
T  30758357 acaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaaccggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 30758258  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     || ||||| | ||||||||| |||||||| ||||    
T  30758257 cggcggatactcacggcttagtaagaactgtttga 30758223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 5010572 - 5010338
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  5010572 aactttcttgacatagtatgccctgtggcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctta 5010473  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||| ||    
T  5010472 acaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctatcaggaatctgctggccaatcttctcagagtcttcttgtcttgtttggaagcacc 5010373  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     || ||||| | |||||| ||||||||||| ||||    
T  5010372 cggcggatattcacggctcagcaagaactgtttga 5010338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 21974398 - 21974164
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  21974398 aactttcttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcgtgttcatcaacacatctta 21974299  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
     |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| ||    
T  21974298 gcaataccatgtcatagttcctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctaccggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 21974199  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     || ||||| | |||||| ||||||||||||||||    
T  21974198 cggcggatactcacggctcagcaagaactgcttga 21974164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 24117359 - 24117125
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24117359 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctta 24117260  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||   |||||||| ||    
T  24117259 acaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatccccatctaacaggaatctactggccaatcttctcaaagtcctcttgtcttgtttggaagcacc 24117160  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     |  ||||| | |||||| ||||||||||| ||||    
T  24117159 cgacggatactcacggctcagcaagaactgtttga 24117125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 31122084 - 31122318
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  31122084 aactttcttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcgtgttcatcaacacatctta 31122183  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
     |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| ||    
T  31122184 gcaataccatgtcatagttcctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctaccggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 31122283  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     || ||||| | |||||| ||||||||||||||||    
T  31122284 cggcggatactcacggctcagcaagaactgcttga 31122318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 14103240 - 14103006
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |    
T  14103240 aacttccttgacatagtatgccctgtagcgtgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctccgcctcatgttcatcaacacatctta 14103141  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||   |||||||| ||    
T  14103140 acaataccatgtcatagttcctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctaccggccaatcttctcaaggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 14103041  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     || ||||| | |||||| ||||||||||| ||||    
T  14103040 cggcggatactcacggctcagcaagaactgtttga 14103006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 27158889 - 27159123
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  27158889 aacttcctcgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctccgcttcatgttcatcaacacatctta 27158988  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    ||| ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||   |||||||| ||    
T  27158989 acagtaccatgtcatagttcctcttgtacaggatatctccatctaacaggaatctactggccaatcttctcaaggtcttcttatcttgtttggaagcacc 27159088  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     || ||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  27159089 cggcggatattcgcggcttagcaagaactgcttga 27159123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 15381805 - 15382039
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |    
T  15381805 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcacgaaggtaccgtcatgtacgtcatgcattaattgctctgcctcatgctcatcaacacatctta 15381904  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| || ||||| || | ||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||    
T  15381905 acaataccatgtcgtagtttcttttgtacaaaatgtccccatctaaaaagaacctactagccaatcttctcagagtcttcttgtctttgttggaagcacc 15382004  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
    ||||||||| | |||||||| ||||||||||||||    
T  15382005 tggtggatactcacggcttatcaagaactgcttga 15382039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 1904951 - 1904717
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |    
T  1904951 aacttccttcacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcgtgctcatcaacacatctta 1904852  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||||||| ||| || ||||| || | ||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||    
T  1904851 acaataccatgttgtagtttctcttgtacaaaatgtccccatctaataagaacctactagccaatcttctcagagtcttcttgtctttgttggaagcacc 1904752  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     |||||||| | | ||||||||| |||||||||||    
T  1904751 cggtggatactcatggcttagcaggaactgcttga 1904717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 15278199 - 15278433
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  15278199 aactttcttgacatagtgtgccccgtagcgtgggtcctgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcgtgttcatcaacacatctta 15278298  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||||||| ||| || ||||| || | ||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||    
T  15278299 acaataccatgttgtagtttctcttgtacaaaatgtccccatctaataagaacctactagccaatcttctcagagtcttcttgtctttgttggaagcacc 15278398  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     |||||||| | |||||||||||||||||| ||||    
T  15278399 cggtggatactcacggcttagcaagaactgtttga 15278433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 179; Significance: 1e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 17266 - 17032
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  17266 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctta 17167  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| ||    
T  17166 acaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 17067  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     || ||||| | |||||| ||||||||||| ||||    
T  17066 cggcggatactcacggctcagcaagaactgtttga 17032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 175; Significance: 2e-94; HSPs: 2)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 342 - 108
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  342 aactttcttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctta 243  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||   |||||||| ||    
T  242 acaataccatgtcatagttcctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctaccggccaatcttctcaaggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 143  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
    ||| ||||| | |||||| ||||||||||||||||    
T  142 tggcggatactcacggctcagcaagaactgcttga 108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322; HSP #2
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 10729 - 10495
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  10729 aactttcttgacatagtgtgccccgtagcgtgggtcccgaaagtaccgtcgtgtacgtcatgcattaactgctccgcttcatgttcatcaacacatctta 10630  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| ||    
T  10629 acaataccatgtcgtagtttcttttatacagaatatctccatctaacaagaacctactagccaatcttctcagagtcttcttgtcttagttggaagcacc 10530  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     || ||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  10529 cggcggatactcacggcttagcaagaactgcttga 10495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 175; Significance: 2e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 10500 - 10734
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  10500 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacacctta 10599  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| ||    
T  10600 acaataccatgtcatagttcctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctaccggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 10699  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
    ||| ||||| | |||||| ||||||||||||||||    
T  10700 tggcggatactcacggctcagcaagaactgcttga 10734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 173; Significance: 4e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 3 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 4749 - 4517
Alignment:
Q  3 cttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctcaac 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||| |||    
T  4749 cttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcatcaactgctccgctttatgttcatcaacacatcttaac 4650  T
Q  103 aataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcctg 202  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  4649 aataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacatgaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtcttggttggaagcacctg 4550  T
Q  203 gtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
    | ||||| | |||||| ||||||||||| ||||    
T  4549 gcggatactcacggctcagcaagaactgtttga 4517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 171; Significance: 6e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 14255 - 14021
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  14255 aacttctttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctccgcttcatgttcatcaacacatctta 14156  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| ||    
T  14155 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatctaacaggaatctgctggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 14056  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     || ||||| | |||||| ||||||||||| ||||    
T  14055 aggcggatactcacggctcagcaagaactgtttga 14021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0144 (Bit Score: 171; Significance: 6e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0144
Description:

Target: scaffold0144; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 21763 - 21997
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21763 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctta 21862  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||   |||||||| ||    
T  21863 acaataccatgtcatagttcctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctaccggtcaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacc 21962  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     || ||||| | |||||| ||||||||||||||||    
T  21963 cggcggatactcacggctcagcaagaactgcttga 21997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0418 (Bit Score: 167; Significance: 1e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0418
Description:

Target: scaffold0418; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 10720 - 10486
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  10720 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggttccaaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctta 10621  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||| ||    
T  10620 acaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctactggccaatcttctcaaggtcttcttgtcttgtttggaagcacc 10521  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     |  ||||| | |||||| ||||||||||| ||||    
T  10520 cgacggatactcacggctcagcaagaactgtttga 10486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 167; Significance: 1e-89; HSPs: 4)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 4751 - 4985
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  4751 aactttcttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacacctta 4850  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||   |||||||  ||    
T  4851 acaataccatgtcatagttcctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctaccggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagtacc 4950  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
    ||| ||||| | |||||| ||||||||||||||||    
T  4951 tggcggatactcacggctcagcaagaactgcttga 4985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #2
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 24257 - 24076
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  24257 aactttcttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacacctta 24158  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttctt 182  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24157 acaataccatgtcatagttcctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctaccggccaatcttctcagggtcttctt 24076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #3
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 30 - 235
Target Start/End: Original strand, 11774 - 11979
Alignment:
Q  30 atgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctcaacaataccatgtcatagtttcttttgtac 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||    
T  11774 atgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacaccttaacaataccatgtcatagttcctcttgtac 11873  T
Q  130 agaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcctggtggatagttacggcttagcaagaact 229  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| || || ||||| | |||||| ||||||||||    
T  11874 agaatatctccatctaacaggaatctaccggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacccggcggatactcacggctcagcaagaact 11973  T
Q  230 gcttga 235  Q
    ||||||    
T  11974 gcttga 11979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #4
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 124 - 235
Target Start/End: Original strand, 9712 - 9823
Alignment:
Q  124 ttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcctggtggatagttacggcttagca 223  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| || || ||||| | |||||| ||||    
T  9712 ttgtacagaatatctccatctaacaggaatctaccggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcacccggcggatactcacggctcagca 9811  T
Q  224 agaactgcttga 235  Q
    ||||||||||||    
T  9812 agaactgcttga 9823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 164; Significance: 9e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 10707 - 10472
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatc-tc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  10707 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctta 10608  T
Q  100 aacaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctc 199  Q
    || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| |    
T  10607 aataataccatgtcatagttcctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctaccggccaatcttctcagggtcttcttatcttgtttggaagcac 10508  T
Q  200 ctggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
    | || ||||| | |||||| ||||||||||||||||    
T  10507 ccggcggatactcacggctcagcaagaactgcttga 10472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 159; Significance: 8e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 12633 - 12399
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  12633 aactttcttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcctcatgttcatcaacacatctta 12534  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||   |||||||| |     
T  12533 acaataccatgtcatagtttctcttgtacagaatatctccatctaacaggaatctaccggccaatcttctcaaggtcttcttgtcttgtttggaagcact 12434  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     || ||||| | ||||||  |||||||||| ||||    
T  12433 cggcggatactcacggctcggcaagaactgtttga 12399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 151; Significance: 5e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 23800 - 23566
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |    
T  23800 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaagtaccgtcatgtacgtcatgcattaattgctctgcctcatgctcatcaacacatctta 23701  T
Q  101 acaataccatgtcatagtttcttttgtacagaatatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcc 200  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||| ||| || ||||| |||| ||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||    
T  23700 acaataccatgttgtagtttcttttgtacaaaatgtccccatctaacaagaacctactagccaatcttctcagagtcttcttgtctttgttggaagcacc 23601  T
Q  201 tggtggatagttacggcttagcaagaactgcttga 235  Q
     |||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  23600 cggtggatactcacggcttagcaagaactgcttga 23566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 123; Significance: 3e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 36 - 227
Target Start/End: Original strand, 42285 - 42479
Alignment:
Q  36 cccgaaggt-accgtcatgtacatcatgca-ttaactgctctgcttcatgttcatcaacacatctcaa-caataccatgtcatagtttcttttgtacaga 132  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  42285 cccgaaggttaccgtcatgtacatcatgcaattaactgctctgcttcgtgttcatcaacacatcttaaacaataccatgtcatagtttctcttgtacaga 42384  T
Q  133 atatctccatccaacaggaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtctctgttggaagctcctggtggatagttacggcttagcaagaa 227  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||||| | |||||| ||||||||    
T  42385 atatctccatctaacatgaatctactggccaatcttctcagggtcttcttgtcttggttggaagcacctggcggatactcacggctcagcaagaa 42479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0547 (Bit Score: 94; Significance: 5e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0547
Description:

Target: scaffold0547; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Original strand, 11162 - 11259
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctctgcttcatgttcatcaacacatct 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11162 aacttccttgacatagtatgccctgtagcatgggtcccgaaggtaccgtcatgtacatcatgcattaactgctccgcttcatgttcatcaacacatct 11259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 29
Target Start/End: Original strand, 26471 - 26499
Alignment:
Q  1 aacttccttgacatagtatgccctgtagc 29  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26471 aacttccttgacatagtatgccctgtagc 26499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University