View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF9839A_low_40 (Length: 422)

Name: NF9839A_low_40
Description: NF9839A
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF9839A_low_40
NF9839A_low_40
[»] scaffold0105 (1 HSPs)
scaffold0105 (50-422)||(46488-46860)
[»] chr3 (35 HSPs)
chr3 (50-422)||(38195729-38196101)
chr3 (50-422)||(39373058-39373431)
chr3 (50-422)||(28323707-28324080)
chr3 (50-422)||(8775680-8776034)
chr3 (184-422)||(18485129-18485367)
chr3 (99-422)||(12248335-12248658)
chr3 (126-422)||(23758314-23758610)
chr3 (170-422)||(13382159-13382413)
chr3 (170-422)||(13392753-13393007)
chr3 (169-422)||(4744814-4745068)
chr3 (169-422)||(5546511-5546765)
chr3 (171-422)||(5511772-5512024)
chr3 (171-422)||(5626867-5627118)
chr3 (171-422)||(12295710-12295961)
chr3 (171-422)||(41684753-41685004)
chr3 (171-422)||(5875152-5875404)
chr3 (227-422)||(9992800-9992998)
chr3 (171-422)||(24660994-24661245)
chr3 (171-422)||(16477355-16477609)
chr3 (171-422)||(24392962-24393214)
chr3 (227-422)||(6499870-6500068)
chr3 (256-422)||(6219544-6219710)
chr3 (119-338)||(10654248-10654464)
chr3 (255-422)||(16390431-16390598)
chr3 (255-422)||(19779600-19779767)
chr3 (254-422)||(37867664-37867832)
chr3 (254-422)||(37876182-37876350)
chr3 (258-422)||(20682623-20682787)
chr3 (258-422)||(14466815-14466979)
chr3 (258-422)||(13122889-13123053)
chr3 (240-421)||(29470675-29470856)
chr3 (50-133)||(18485049-18485132)
chr3 (334-422)||(10635926-10636014)
chr3 (121-193)||(9993040-9993111)
chr3 (121-189)||(6500112-6500179)
[»] chr2 (16 HSPs)
chr2 (50-422)||(27222360-27222732)
chr2 (50-422)||(35253972-35254345)
chr2 (50-422)||(35264581-35264954)
chr2 (99-422)||(9907066-9907389)
chr2 (170-422)||(40223392-40223645)
chr2 (171-422)||(43346459-43346711)
chr2 (171-422)||(9772237-9772492)
chr2 (171-422)||(10268043-10268294)
chr2 (171-422)||(10278620-10278871)
chr2 (171-422)||(11404351-11404607)
chr2 (170-398)||(34803301-34803530)
chr2 (256-422)||(24337270-24337436)
chr2 (254-422)||(29245393-29245561)
chr2 (254-422)||(43083835-43084003)
chr2 (258-422)||(22959209-22959373)
chr2 (259-422)||(4211085-4211248)
[»] chr8 (17 HSPs)
chr8 (50-422)||(13687504-13687877)
chr8 (72-422)||(36078953-36079284)
chr8 (50-342)||(44482103-44482396)
chr8 (170-422)||(15766087-15766343)
chr8 (170-422)||(15790224-15790480)
chr8 (169-422)||(32087209-32087463)
chr8 (171-422)||(209093-209345)
chr8 (171-422)||(722716-722968)
chr8 (171-422)||(29077808-29078060)
chr8 (171-422)||(242911-243162)
chr8 (171-422)||(796281-796532)
chr8 (171-422)||(3358145-3358396)
chr8 (171-422)||(36294027-36294279)
chr8 (171-422)||(9342233-9342484)
chr8 (254-422)||(26112468-26112636)
chr8 (254-422)||(19129938-19130106)
chr8 (258-422)||(6152292-6152456)
[»] chr4 (15 HSPs)
chr4 (50-422)||(24641288-24641661)
chr4 (50-422)||(27657621-27657994)
chr4 (50-422)||(18761975-18762346)
chr4 (171-419)||(451670-451919)
chr4 (171-419)||(30935988-30936237)
chr4 (171-419)||(21997510-21997759)
chr4 (171-422)||(36019430-36019681)
chr4 (171-422)||(10750062-10750313)
chr4 (171-422)||(10963831-10964082)
chr4 (227-422)||(55754722-55754918)
chr4 (254-422)||(24026932-24027100)
chr4 (256-422)||(17919294-17919460)
chr4 (254-422)||(19953849-19954017)
chr4 (254-421)||(40469487-40469654)
chr4 (258-422)||(16257112-16257276)
[»] chr1 (17 HSPs)
chr1 (50-422)||(35400049-35400422)
chr1 (50-422)||(35647574-35647947)
chr1 (50-422)||(3172540-3172914)
chr1 (50-422)||(47617443-47617795)
chr1 (72-422)||(5834189-5834518)
chr1 (171-419)||(12731549-12731798)
chr1 (171-419)||(12742142-12742391)
chr1 (171-422)||(7508340-7508591)
chr1 (171-422)||(36245937-36246188)
chr1 (171-422)||(51655381-51655632)
chr1 (169-422)||(38096121-38096377)
chr1 (254-422)||(4168401-4168569)
chr1 (254-422)||(19180085-19180253)
chr1 (256-422)||(21864824-21864990)
chr1 (256-422)||(5649263-5649429)
chr1 (258-422)||(12622683-12622847)
chr1 (240-421)||(153158-153339)
[»] chr7 (22 HSPs)
chr7 (50-422)||(11006172-11006546)
chr7 (50-422)||(42866834-42867187)
chr7 (72-422)||(1988566-1988897)
chr7 (99-419)||(466550-466869)
chr7 (170-422)||(2715191-2715444)
chr7 (171-422)||(9086334-9086586)
chr7 (171-422)||(26698683-26698935)
chr7 (171-422)||(40051658-40051909)
chr7 (169-422)||(8011641-8011897)
chr7 (171-422)||(24735831-24736082)
chr7 (171-422)||(26399650-26399902)
chr7 (171-422)||(11097114-11097370)
chr7 (253-422)||(21001962-21002131)
chr7 (254-422)||(5686723-5686891)
chr7 (254-422)||(9434427-9434595)
chr7 (254-422)||(6876797-6876965)
chr7 (252-422)||(19992970-19993140)
chr7 (256-422)||(22090372-22090538)
chr7 (258-422)||(4213219-4213383)
chr7 (258-422)||(17959629-17959793)
chr7 (260-422)||(8618587-8618749)
chr7 (258-422)||(168090-168254)
[»] chr5 (34 HSPs)
chr5 (72-422)||(35225090-35225419)
chr5 (51-342)||(36697303-36697595)
chr5 (169-422)||(9345568-9345822)
chr5 (171-422)||(23371537-23371789)
chr5 (171-422)||(23706384-23706636)
chr5 (171-422)||(36583523-36583775)
chr5 (171-422)||(42052396-42052648)
chr5 (171-420)||(30228470-30228720)
chr5 (171-422)||(24589078-24589330)
chr5 (171-419)||(15994307-15994556)
chr5 (171-422)||(14559082-14559334)
chr5 (169-422)||(15768368-15768624)
chr5 (171-422)||(6985326-6985577)
chr5 (171-422)||(14039625-14039876)
chr5 (171-422)||(22685031-22685282)
chr5 (171-422)||(23305874-23306125)
chr5 (171-418)||(24817866-24818113)
chr5 (171-422)||(27469589-27469840)
chr5 (171-422)||(31842993-31843245)
chr5 (169-422)||(37730970-37731228)
chr5 (169-422)||(17728504-17728762)
chr5 (169-422)||(31358121-31358379)
chr5 (171-422)||(39491912-39492163)
chr5 (227-422)||(14448106-14448302)
chr5 (227-422)||(17616647-17616843)
chr5 (169-422)||(27043229-27043485)
chr5 (255-422)||(39361276-39361443)
chr5 (252-422)||(31447512-31447682)
chr5 (254-422)||(5291675-5291843)
chr5 (254-422)||(27604554-27604722)
chr5 (256-422)||(40399995-40400161)
chr5 (258-422)||(22156080-22156244)
chr5 (240-389)||(1110282-1110431)
chr5 (240-421)||(20796650-20796831)
[»] chr6 (23 HSPs)
chr6 (50-342)||(4631834-4632127)
chr6 (51-342)||(32310650-32310942)
chr6 (50-342)||(27385360-27385653)
chr6 (50-342)||(27475773-27476066)
chr6 (170-422)||(12856014-12856267)
chr6 (169-422)||(3662408-3662662)
chr6 (171-422)||(25788794-25789046)
chr6 (171-422)||(26865858-26866110)
chr6 (171-422)||(27342794-27343045)
chr6 (171-422)||(27403534-27403785)
chr6 (171-422)||(17983624-17983880)
chr6 (171-422)||(26026486-26026737)
chr6 (171-422)||(16931460-16931712)
chr6 (227-422)||(12726323-12726519)
chr6 (253-422)||(9122019-9122188)
chr6 (252-422)||(27373931-27374101)
chr6 (252-422)||(27464284-27464454)
chr6 (254-422)||(25590360-25590528)
chr6 (258-422)||(34816661-34816825)
chr6 (260-422)||(32971364-32971526)
chr6 (254-345)||(7669375-7669466)
chr6 (360-422)||(27385692-27385754)
chr6 (360-422)||(27476105-27476167)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (50-342)||(2243-2535)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (171-422)||(32231-32483)
[»] scaffold0906 (1 HSPs)
scaffold0906 (51-422)||(3430-3793)
[»] scaffold1216 (1 HSPs)
scaffold1216 (254-421)||(267-434)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (253-421)||(52481-52649)
[»] scaffold0199 (2 HSPs)
scaffold0199 (99-342)||(23641-23892)
scaffold0199 (360-422)||(23931-23993)
[»] scaffold0747 (1 HSPs)
scaffold0747 (364-422)||(3567-3625)
[»] scaffold0398 (2 HSPs)
scaffold0398 (227-303)||(3366-3442)
scaffold0398 (227-303)||(11621-11697)


Alignment Details
Target: scaffold0105 (Bit Score: 321; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0105
Description:

Target: scaffold0105; HSP #1
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 50 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 46860 - 46488
Alignment:
Q  50 cagagtagcagagcatataaccaaataaaaacataagaagtatcagagcaagaagtattagatcataggatattaaaaacaataaatatcattagagtta 149  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  46860 cagagtagcagagcatataaccaaataaaaacataataagtatcagagcaagaagtatcagagcatatgacattaaaatcaataaatatcattagagtta 46761  T
Q  150 aaagaatagaacataatatttcagaaacaatgataatatttataaatgaaggttaaggtacaaagataagactacacagaacaaaagtaaaaacaagcta 249  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46760 aaaaaatagaacataatatttcagaaacaatgataatatttataaatgaaggttaaggtacaaagataagactacacagaacaaaagtaaaaacaagcta 46661  T
Q  250 gagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctc 349  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46660 gagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgatctgttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctc 46561  T
Q  350 attcttcttatatgcccagcacgaattctagcagcccttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 422  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46560 attcttcttacatgcccagcatgaattcttgcagctcttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 46488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 321; Significance: 0; HSPs: 35)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 50 - 422
Target Start/End: Original strand, 38195729 - 38196101
Alignment:
Q  50 cagagtagcagagcatataaccaaataaaaacataagaagtatcagagcaagaagtattagatcataggatattaaaaacaataaatatcattagagtta 149  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38195729 cagagtagcagagcatataaccaaataaaaacataataagtatcagagcaagaagtatcagagcatatgacattaaaatcaataaatatcattagagtta 38195828  T
Q  150 aaagaatagaacataatatttcagaaacaatgataatatttataaatgaaggttaaggtacaaagataagactacacagaacaaaagtaaaaacaagcta 249  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38195829 aaaaaatagaacataatatttcagaaacaatgataatatttataaatgaaggttaaggtacaaagataagactacacagaacaaaagtaaaaacaagcta 38195928  T
Q  250 gagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctc 349  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38195929 gagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgatctgttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctc 38196028  T
Q  350 attcttcttatatgcccagcacgaattctagcagcccttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 422  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38196029 attcttcttacatgcccagcatgaattcttgcagctcttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 38196101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 50 - 422
Target Start/End: Original strand, 39373058 - 39373431
Alignment:
Q  50 cagagtagcagagcatataaccaaataaaaacataagaagtatcagagcaagaagtattagatcataggatattaaaaacaataaatatcattagagtta 149  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  39373058 cagagtagcagagcatataaccaaataaaaacataataagtatcagagcaagaagtatcagagcatatgacattaaaatcaataaatatcattagagtta 39373157  T
Q  150 aaagaa-tagaacataatatttcagaaacaatgataatatttataaatgaaggttaaggtacaaagataagactacacagaacaaaagtaaaaacaagct 248  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39373158 aaaaaaatagaacataatatttcagaaacaatgataatatttataaatgaaggttaaggtacaaagataagactacacagaacaaaagtaaaaacaagct 39373257  T
Q  249 agagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccct 348  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39373258 agagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgatctgttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccct 39373357  T
Q  349 cattcttcttatatgcccagcacgaattctagcagcccttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 422  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39373358 cattcttcttacatgcccagcatgaattcttgcagctcttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 39373431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 50 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 28324080 - 28323707
Alignment:
Q  50 cagagtagcagagcatataaccaaataaaaacataagaagtatcagagcaagaagtattagatcataggatattaaaaacaataaatatcattagagtta 149  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28324080 cagagtagtagagcatataaccaaataaaaacataataagtatcagagcaagaagtatcagagcatatgacattaaaatcaataaatatcattagagtta 28323981  T
Q  150 aaagaa-tagaacataatatttcagaaacaatgataatatttataaatgaaggttaaggtacaaagataagactacacagaacaaaagtaaaaacaagct 248  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28323980 aaaaaaatagaacataatatttcagaaacaatgataatatttataaatgaaggttaaggtacaaagataagactacacagaacaaaagtaaaaacaagct 28323881  T
Q  249 agagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccct 348  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28323880 agagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgatctgttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccct 28323781  T
Q  349 cattcttcttatatgcccagcacgaattctagcagcccttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 422  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28323780 cattcttcttacatgcccagcatgaattcttgcagctcttgagatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 28323707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 50 - 422
Target Start/End: Original strand, 8775680 - 8776034
Alignment:
Q  50 cagagtagcagagcatataaccaaataaaaacataagaagtatcagagcaagaagtattagatcataggatattaaaaacaataaatatcattagagtta 149  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||  || ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8775680 cagagtagcagagcatataaccaaataaaaacataataagtatcagagcaagaagtatcagagcatgtgacattaaaatcaataaatatcattagagtta 8775779  T
Q  150 aaagaatagaacataatatttcagaaacaatgataatatttataaatgaaggttaaggtacaaagataagactacacagaacaaaagtaaaaacaagcta 249  Q
    ||| ||        ||||       ||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8775780 aaaaaa--------aatag------aaca----taatatttataaatgaaggttaaggtacaaagataagactacacagaacaaaagtaaaaacaagcta 8775861  T
Q  250 gagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctc 349  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8775862 gagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgatctgttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctc 8775961  T
Q  350 attcttcttatatgcccagcacgaattctagcagcccttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 422  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8775962 attcttcttacatgcccagcatgaattcttgcagctcttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 8776034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 184 - 422
Target Start/End: Original strand, 18485129 - 18485367
Alignment:
Q  184 aatatttataaatgaaggttaaggtacaaagataagactacacagaacaaaagtaaaaacaagctagagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgctta 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18485129 aatatttataaatgaaggttaaggtacaaagataagactacacagaacaaaagtaaaaacaagctagagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgctta 18485228  T
Q  284 tacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctcattcttcttatatgcccagcacgaattctagcag 383  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||    
T  18485229 tacagctgttctaagagatacttgatctgttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctcattcttcttacatgcccagcatgaattcttgcag 18485328  T
Q  384 cccttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 422  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18485329 ctcttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 18485367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 99 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 12248658 - 12248335
Alignment:
Q  99 aagaagtattagatcataggatattaaaaacaataaatatcattagagttaaaagaatagaacataatatttcagaaacaatgataatatttataaatga 198  Q
    ||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||||  |    
T  12248658 aagaagtattagagcataagacattaaaaacaataaatatcatcagaattaaaagtatagaacatatgatttaa-aaacaatgataatatttataaagaa 12248560  T
Q  199 aggttaaggtacaaagataagactacacagaacaaaagtaaaaa-caagctagagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacagctgttctaa 297  Q
    |||||||| |||||||||||  ||||  |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  12248559 aggttaagatacaaagataaagctactaagaacaaaagtaaaaaacaagctagtgttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttaaacaactgttctaa 12248460  T
Q  298 gagatacttgattttttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctcattcttcttatatgcccagcacgaattctagcagcccttgtgatatac 397  Q
    ||||| |||||| |  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | | | ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||     
T  12248459 gagatgcttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttcccttaatttccttttatgcccagcatgaattctagcagcccttgtgatgtat 12248360  T
Q  398 tcttcttcaggatagaaaggagtga 422  Q
    |||||||| |||||| |||||||||    
T  12248359 tcttcttctggatagtaaggagtga 12248335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 126 - 422
Target Start/End: Original strand, 23758314 - 23758610
Alignment:
Q  126 aaacaataaatatcattagagttaaaagaatagaacataatatttcagaaacaatgataatatttataaatgaaggttaaggtacaaagataagactaca 225  Q
    ||||||||||||| || ||| ||||||| ||||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||  ||||     
T  23758314 aaacaataaatattatcagaattaaaagtatagaacatatgattt-ataaacaatgataatatttataaataaaggttaagatacaaagacaaagctact 23758412  T
Q  226 cagaacaaaagtaaaaa-caagctagagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttctt 324  Q
     |||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||| |||||    
T  23758413 aagaacaaaagtaaaaaacaagttagtgttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttctt 23758512  T
Q  325 cttaagtagctcatccttttccctcattcttcttatatgcccagcacgaattctagcagcccttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 422  Q
    || ||||||||||||||||||||| | | | ||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||    
T  23758513 ctgaagtagctcatccttttcccttaatttccttttatgcccagcatgaattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagtaaggagtga 23758610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 170 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 13382413 - 13382159
Alignment:
Q  170 tcagaaacaatgataatatttataaatgaaggttaaggtacaaagataagactacacagaacaaaagtaaaaa--caagctagagttgggtgtgcaacta 267  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||| |||||||| ||  ||||  ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  13382413 tcagaaacaatgataatatatataaagaaagattaagatacaaagacaaagctactaagaacaaaagtaaaaaaacaagctagtgttgggtgtgcaacta 13382314  T
Q  268 aggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctcattcttcttatatgccca 367  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  13382313 aggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctcattcttcttttataccca 13382214  T
Q  368 gcacgaattctagcagcccttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 422  Q
    ||  |||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||    
T  13382213 gcctgaattctagcagcccttgtgatgtactcttcctctggatagaaaggagtga 13382159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 170 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 13393007 - 13392753
Alignment:
Q  170 tcagaaacaatgataatatttataaatgaaggttaaggtacaaagataagactacacagaacaaaagtaaaaa--caagctagagttgggtgtgcaacta 267  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||| |||||||| ||  ||||  ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  13393007 tcagaaacaatgataatatatataaagaaagattaagatacaaagacaaagctactaagaacaaaagtaaaaaaacaagctagtgttgggtgtgcaacta 13392908  T
Q  268 aggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctcattcttcttatatgccca 367  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  13392907 aggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctcattcttcttttataccca 13392808  T
Q  368 gcacgaattctagcagcccttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 422  Q
    ||  |||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||    
T  13392807 gcctgaattctagcagcccttgtgatgtactcttcctctggatagaaaggagtga 13392753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 169 - 422
Target Start/End: Original strand, 4744814 - 4745068
Alignment:
Q  169 ttcagaaacaatgataatatttataaatgaaggttaaggtacaaagataagactacacagaacaaaagtaaaa-acaagctagagttgggtgtgcaacta 267  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||| |||||||| |   ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4744814 ttcagaaacaatgataatatatataaagaaagattaagatacaaagacacagctactaagaacaaaagtaaaaaacaagctagagttgggtgtgcaacta 4744913  T
Q  268 aggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctcattcttcttatatgccca 367  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||    
T  4744914 aggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctcattcttcttttatatcca 4745013  T
Q  368 gcacgaattctagcagcccttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 422  Q
    ||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4745014 gcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 4745068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 169 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 5546765 - 5546511
Alignment:
Q  169 ttcagaaacaatgataatatttataaatgaaggttaaggtacaaagataagactacacagaacaaaagtaaaaa-caagctagagttgggtgtgcaacta 267  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||| |||||||| |   ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5546765 ttcagaaacaatgataatatatataaagaaagattaagatacaaagacacagctactaagaacaaaagtaaaaaacaagctagagttgggtgtgcaacta 5546666  T
Q  268 aggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctcattcttcttatatgccca 367  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||    
T  5546665 aggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctcattcttcttttatatcca 5546566  T
Q  368 gcacgaattctagcagcccttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 422  Q
    ||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5546565 gcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 5546511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 171 - 422
Target Start/End: Original strand, 5511772 - 5512024
Alignment:
Q  171 cagaaacaatgataatatttataaatgaaggttaaggtacaaagataagactacacagaacaaaagtaaaa-acaagctagagttgggtgtgcaactaag 269  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||| |||||||| |   ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5511772 cagaaacaatgataatatatataaagaaagattaagatacaaagacacagctactaagaacaaaagtaaaaaacaagctagagttgggtgtgcaactaag 5511871  T
Q  270 gttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctcattcttcttatatgcccagc 369  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||    
T  5511872 gttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctcattcttcttttatatccagc 5511971  T
Q  370 acgaattctagcagcccttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 422  Q
      |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5511972 ctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 5512024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 171 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 5627118 - 5626867
Alignment:
Q  171 cagaaacaatgataatatttataaatgaaggttaaggtacaaagataagactacacagaacaaaagtaaaaa-caagctagagttgggtgtgcaactaag 269  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||| || |   ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5627118 cagaaacaatgataatatatataaa-gaagattaagatacaaggacacagctacgaagaacaaaagtaaaaaacaagctagagttgggtgtgcaactaag 5627020  T
Q  270 gttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctcattcttcttatatgcccagc 369  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||  |||||    
T  5627019 gttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctcattcttcgtttatatccagc 5626920  T
Q  370 acgaattctagcagcccttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 422  Q
      |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5626919 ctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 5626867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 171 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 12295961 - 12295710
Alignment:
Q  171 cagaaacaatgataatatttataaatgaaggttaaggtacaaagataagactacacagaacaaaagtaaaaa-caagctagagttgggtgtgcaactaag 269  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||| || |   ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12295961 cagaaacaatgataatatatataaa-gaagattaagatacaaggacacagctacgaagaacaaaagtaaaaaacaagctagagttgggtgtgcaactaag 12295863  T
Q  270 gttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctcattcttcttatatgcccagc 369  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||  |||||    
T  12295862 gttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctcattcttcgtttatatccagc 12295763  T
Q  370 acgaattctagcagcccttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 422  Q
      |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12295762 ctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 12295710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 171 - 422
Target Start/End: Original strand, 41684753 - 41685004
Alignment:
Q  171 cagaaacaatgataatatttataaatgaaggttaaggtacaaagataagactacacagaacaaaagtaaaa-acaagctagagttgggtgtgcaactaag 269  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||| || |   ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41684753 cagaaacaatgataatatatataaa-gaagattaagatacaaggacacagctacgaagaacaaaagtaaaaaacaagctagagttgggtgtgcaactaag 41684851  T
Q  270 gttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctcattcttcttatatgcccagc 369  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||  |||||    
T  41684852 gttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctcattcttcgtttatatccagc 41684951  T
Q  370 acgaattctagcagcccttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 422  Q
      |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41684952 ctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 41685004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 171 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 5875404 - 5875152
Alignment:
Q  171 cagaaacaatgataatatttataaatgaaggttaaggtacaaagataagactacacagaacaaaagtaaaaa-caagctagagttgggtgtgcaactaag 269  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||| |||||||| |   ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5875404 cagaaacaatgataatatatataaagaaagattaagatacaaagacacagctactaagaacaaaagtaaaaaacaagctagagttgggtgtgcaactaag 5875305  T
Q  270 gttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctcattcttcttatatgcccagc 369  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | ||   |||||    
T  5875304 gttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctcattctttgtttaaatccagc 5875205  T
Q  370 acgaattctagcagcccttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 422  Q
      |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5875204 ctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 5875152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 227 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 9992998 - 9992800
Alignment:
Q  227 agaacaaaagtaaaaacaagcta---gagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttct 323  Q
    ||||| |||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||    
T  9992998 agaaccaaagtaaaaacaagctaagagtgttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatatgatcatccttct 9992899  T
Q  324 tcttaagtagctcatccttttccctcattcttcttatatgcccagcacgaattctagcagcccttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 422  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9992898 tcttaagtagctcatccttttctctcattcttcttttatgcccagcatgaattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttcgggatagaaaggagtga 9992800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 171 - 422
Target Start/End: Original strand, 24660994 - 24661245
Alignment:
Q  171 cagaaacaatgataatatttataaatgaaggttaaggtacaaagataagactacacagaacaaaagtaaaa-acaagctagagttgggtgtgcaactaag 269  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||| || |   ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24660994 cagaaacaatgataatatatataaa-gaagattaagatacaaggacacagctacgaagaacaaaagtaaaaaacaagctagagttgggtgtgcaactaag 24661092  T
Q  270 gttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctcattcttcttatatgcccagc 369  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||   |||||    
T  24661093 gttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctcattcttcgtttaaatccagc 24661192  T
Q  370 acgaattctagcagcccttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 422  Q
      |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24661193 ctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 24661245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 171 - 422
Target Start/End: Original strand, 16477355 - 16477609
Alignment:
Q  171 cagaaacaatgataatatttata--aatgaaggttaaggtacaaagataagactacacagaacaaaagtaaaa-acaagctagagttgggtgtgcaacta 267  Q
    |||||||||||||||||| ||||  ||  ||| ||||| |||||||| |   ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16477355 cagaaacaatgataatatatatataaagaaagattaagatacaaagacacagctactaagaacaaaagtaaaaaacaagctagagttgggtgtgcaacta 16477454  T
Q  268 aggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctcattcttcttatatgccca 367  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||  |||    
T  16477455 aggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctcattcttcgtttatatcca 16477554  T
Q  368 gcacgaattctagcagcccttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 422  Q
    ||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16477555 gcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 16477609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 171 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 24393214 - 24392962
Alignment:
Q  171 cagaaacaatgataatatttataaatgaaggttaaggtacaaagataagactacacagaacaaaagtaaaaa--caagctagagttgggtgtgcaactaa 268  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||| || |   ||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  24393214 cagaaacaatgataatatatataaa-gaagattaagatacaaggacacagctacgaagaacaaaagtaaaaaaacaagctagagttgggtgtgcaactaa 24393116  T
Q  269 ggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctcattcttcttatatgcccag 368  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||   ||||    
T  24393115 ggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctcattcttcgtttaaatccag 24393016  T
Q  369 cacgaattctagcagcccttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 422  Q
    |  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||||||||||||||    
T  24393015 cctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctgaatagaaaggagtga 24392962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 227 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 6500068 - 6499870
Alignment:
Q  227 agaacaaaagtaaaaacaagctaga---gttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttct 323  Q
    |||||| |||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||| |  ||||| ||||    
T  6500068 agaacacaagtaaaaacaagctaaaagtgttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttct 6499969  T
Q  324 tcttaagtagctcatccttttccctcattcttcttatatgcccagcacgaattctagcagcccttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 422  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||    
T  6499968 tctgaagtagctcatccttttctctcattcttcttttaagcccagcatgaattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttcttgatagaaaggagtga 6499870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 256 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 6219710 - 6219544
Alignment:
Q  256 ggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctcattctt 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6219710 ggtgtgcaactaaggttgggcttgcttgtacatctgttccaagagatacttaatttgttcatccttctgcttaagtagctcatccttttctctcattctt 6219611  T
Q  356 cttatatgcccagcacgaattctagcagcccttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 422  Q
    ||| ||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6219610 cttttatacccagcatgaattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 6219544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 119 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 10654464 - 10654248
Alignment:
Q  119 atattaaaaacaataaatatcattagagttaaaagaatagaacataatatttcagaaacaatgataatatttataaatgaaggttaaggtacaaagataa 218  Q
    |||||||||||| ||||||| || ||| ||||||| ||||||||||  |||| | |||||||||| |||||||||||  |||  |||  |||||||  ||    
T  10654464 atattaaaaacagtaaatattatcagaattaaaagtatagaacatatgattt-ataaacaatgatgatatttataaagaaagtataa--tacaaaggcaa 10654368  T
Q  219 gactacacagaacaaaagtaaaaacaagctagagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatc 318  Q
      ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||  |||||    
T  10654367 agctacagagaacaaaagtaaaaacaagctagagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactattctaagagatacttgatttgatcatc 10654268  T
Q  319 tttcttcttaagtagctcat 338  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  10654267 tttcttctgaagtagctcat 10654248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 255 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 16390598 - 16390431
Alignment:
Q  255 gggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctcattct 354  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  16390598 gggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaagagatacttaatttgctcatccttcttctgaagtagctcatccttttctctcattct 16390499  T
Q  355 tcttatatgcccagcacgaattctagcagcccttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 422  Q
    |||| ||  ||||||| ||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16390498 tcttttaaacccagcatgaattctggctgcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 16390431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 255 - 422
Target Start/End: Original strand, 19779600 - 19779767
Alignment:
Q  255 gggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctcattct 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19779600 gggtgtgcaactaaggttgggcttgcttgtacatctgttccaaaagatacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcattct 19779699  T
Q  355 tcttatatgcccagcacgaattctagcagcccttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 422  Q
    |||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19779700 tcttttatacccagcatgaattcttgcagcccttatgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 19779767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 254 - 422
Target Start/End: Original strand, 37867664 - 37867832
Alignment:
Q  254 tgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctcattc 353  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||| || |||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  37867664 tgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttgtacatctattccaaaagatacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcattc 37867763  T
Q  354 ttcttatatgcccagcacgaattctagcagcccttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 422  Q
    ||||| ||  ||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37867764 ttcttttaaacccagcatgaattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 37867832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 254 - 422
Target Start/End: Original strand, 37876182 - 37876350
Alignment:
Q  254 tgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctcattc 353  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||| || |||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  37876182 tgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttgtacatctattccaaaagatacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcattc 37876281  T
Q  354 ttcttatatgcccagcacgaattctagcagcccttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 422  Q
    ||||| ||  ||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37876282 ttcttttaaacccagcatgaattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 37876350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 258 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 20682787 - 20682623
Alignment:
Q  258 tgtgcaactaaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctcattcttct 357  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||| |||||| || |||||||||||||  ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20682787 tgtgcaactaaggttgggtttgcttgtacatctgttccaatagatacttgatttgctcatccttcttcttgagtagctcatccttttccctcattcttct 20682688  T
Q  358 tatatgcccagcacgaattctagcagcccttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 422  Q
    | ||| ||||||| ||||||| |  ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||    
T  20682687 tttatacccagcatgaattcttgatgcccttgtgatgtactcttcttctgtatagaaaggagtga 20682623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 258 - 422
Target Start/End: Original strand, 14466815 - 14466979
Alignment:
Q  258 tgtgcaactaaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctcattcttct 357  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||| |||||| || |||||||||||||  ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14466815 tgtgcaactaaggttgggtttgcttgtacatctgttccaatagatacttgatttgctcatccttctttttgagtagctcatccttttccctcaatcttct 14466914  T
Q  358 tatatgcccagcacgaattctagcagcccttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 422  Q
    | | | ||||||| ||||||| |  ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14466915 tttgtacccagcatgaattcttgttgcccttgagatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 14466979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 258 - 422
Target Start/End: Original strand, 13122889 - 13123053
Alignment:
Q  258 tgtgcaactaaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctcattcttct 357  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||| |||||| || |||||||||||||  ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13122889 tgtgcaactaaggttgggtttgcttgtacatctgttccaatagatacttgatttgctcatccttctttttgagtagctcatccttttccctcaatcttct 13122988  T
Q  358 tatatgcccagcacgaattctagcagcccttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 422  Q
    | | | ||||| | ||||||| |  ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13122989 tttgtacccagaatgaattcttgttgcccttgagatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 13123053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 240 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 29470856 - 29470675
Alignment:
Q  240 aaacaagctagagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttcttaagtagctcatc 339  Q
    |||||||| | | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| || |||||||| ||||  ||||| ||||||| |||| | |||||    
T  29470856 aaacaagcaaaaattgggtgtgcaactaaggtttggcttgcttatacaactgttccaatagatacttaatttgctcatccttcttctgaagttgttcatc 29470757  T
Q  340 cttttccctcattcttcttatatgcccagcacgaattctagcagcccttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtg 421  Q
    |||| | |||| ||| ||| |   ||||||| |||||||||||| |||||  || | ||| ||||| |||||||||||||||    
T  29470756 ctttgctctcagtctacttttcaacccagcatgaattctagcagtccttgaaatgtcctcatcttctggatagaaaggagtg 29470675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 50 - 133
Target Start/End: Original strand, 18485049 - 18485132
Alignment:
Q  50 cagagtagcagagcatataaccaaataaaaacataagaagtatcagagcaagaagtattagatcataggatattaaaaacaata 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||| |||||    
T  18485049 cagagtagcagagcatataaccaaataaaaacataataagtatcagagcaagaagtatcagagcatatgacattaaaatcaata 18485132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 334 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 10636014 - 10635926
Alignment:
Q  334 ctcatccttttccctcattcttcttatatgcccagcacgaattctagcagcccttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 422  Q
    |||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||    
T  10636014 ctcatccttttctctcattttccttttatgcccagcatgaattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagtaaggagtga 10635926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 121 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 9993111 - 9993040
Alignment:
Q  121 attaaaaacaataaatatcattagagttaaaagaatagaacataatatttcagaaacaatgataatatttata 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||    
T  9993111 attaaaaacaataaatatcattagagttaaaactgtagaacat-atttttcagaaataatgataatatttata 9993040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 121 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 6500179 - 6500112
Alignment:
Q  121 attaaaaacaataaatatcattagagttaaaagaatagaacataatatttcagaaacaatgataatatt 189  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||   |||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  6500179 attaaaaacaataaacatcatcagagttaaaactgtagaacat-atttttcagaaacaatgataatatt 6500112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 321; Significance: 0; HSPs: 16)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 50 - 422
Target Start/End: Original strand, 27222360 - 27222732
Alignment:
Q  50 cagagtagcagagcatataaccaaataaaaacataagaagtatcagagcaagaagtattagatcataggatattaaaaacaataaatatcattagagtta 149  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27222360 cagagtagcagagcatataaccaaataaaaacataataagtatcagagcaagaagtatcagagcatatgacattaaaatcaataaatatcattagagtta 27222459  T
Q  150 aaagaatagaacataatatttcagaaacaatgataatatttataaatgaaggttaaggtacaaagataagactacacagaacaaaagtaaaaacaagcta 249  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27222460 aaaaaatagaacataatatttcagaaacaatgataatatttataaatgaaggttaaggtacaaagataagactacacagaacaaaagtaaaaacaagcta 27222559  T
Q  250 gagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctc 349  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27222560 gagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgatctgttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctc 27222659  T
Q  350 attcttcttatatgcccagcacgaattctagcagcccttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 422  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27222660 attcttcttacatgcccagcatgaattcttgcagctcttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 27222732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 50 - 422
Target Start/End: Original strand, 35253972 - 35254345
Alignment:
Q  50 cagagtagcagagcatataaccaaataaaaacataagaagtatcagagcaagaagtattagatcataggatattaaaaacaataaatatcattagagtta 149  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  35253972 cagagtagcagagcatataaccaaataaaaacataataagtatcagagcaagaagtatcagagcatatgacattaaaatcaataaatatcattagagtta 35254071  T
Q  150 aaagaa-tagaacataatatttcagaaacaatgataatatttataaatgaaggttaaggtacaaagataagactacacagaacaaaagtaaaaacaagct 248  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35254072 aaaaaaatagaacataatatttcagaaacaatgataatatttataaatgaaggttaaggtacaaagataagactacacagaacaaaagtaaaaacaagct 35254171  T
Q  249 agagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccct 348  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35254172 agagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccct 35254271  T
Q  349 cattcttcttatatgcccagcacgaattctagcagcccttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 422  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35254272 cattcttcttacatgcccagcatgaattcttgcagctcttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 35254345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 50 - 422
Target Start/End: Original strand, 35264581 - 35264954
Alignment:
Q  50 cagagtagcagagcatataaccaaataaaaacataagaagtatcagagcaagaagtattagatcataggatattaaaaacaataaatatcattagagtta 149  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  35264581 cagagtagcagagcatataaccaaataaaaacataataagtatcagagcaagaagtatcagagcatatgacattaaaatcaataaatatcattagagtta 35264680  T
Q  150 aaagaa-tagaacataatatttcagaaacaatgataatatttataaatgaaggttaaggtacaaagataagactacacagaacaaaagtaaaaacaagct 248  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35264681 aaaaaaatagaacataatatttcagaaacaatgataatatttataaatgaaggttaaggtacaaagataagactacacagaacaaaagtaaaaacaagct 35264780  T
Q  249 agagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccct 348  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35264781 agagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccct 35264880  T
Q  349 cattcttcttatatgcccagcacgaattctagcagcccttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 422  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35264881 cattcttcttacatgcccagcatgaattcttgcagctcttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 35264954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 99 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 9907389 - 9907066
Alignment:
Q  99 aagaagtattagatcataggatattaaaaacaataaatatcattagagttaaaagaatagaacataatatttcagaaacaatgataatatttataaatga 198  Q
    ||||| ||| ||| |||| || |||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||||  |    
T  9907389 aagaaatatgagagcataagacattaaaaacaataaatattatcagaattaaaagtatagaacatatgattt-ataaacaatgataatatttataaagaa 9907291  T
Q  199 aggttaaggtacaaagataagactacacagaacaaaagtaaaaa-caagctagagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacagctgttctaa 297  Q
    |||||||| |||||||| ||  ||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  9907290 aggttaagatacaaagacaaagctactaagaacaaaagtaaaaaacaagctagtgttgggtgtgcaactaaggttgggcttacttatacaactgttctaa 9907191  T
Q  298 gagatacttgattttttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctcattcttcttatatgcccagcacgaattctagcagcccttgtgatatac 397  Q
    |||||||||||| |  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | | | ||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||    
T  9907190 gagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttcccttaatttccttttatgcccagcatgaattcttgcagcccttgtgatgtac 9907091  T
Q  398 tcttcttcaggatagaaaggagtga 422  Q
    |||||||| |||||| |||||||||    
T  9907090 tcttcttctggatagtaaggagtga 9907066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 170 - 422
Target Start/End: Original strand, 40223392 - 40223645
Alignment:
Q  170 tcagaaacaatgataatatttataaatgaagg-ttaaggtacaaagataagactacacagaacaaaagtaaaa-acaagctagagttgggtgtgcaacta 267  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||| ||  ||||  ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  40223392 tcagaaacaatgataatatatataaa-gaaggattaagatacaaagacaaagctactaagaacaaaagtaaaaaacaagctagtgttgggtgtgcaacta 40223490  T
Q  268 aggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctcattcttcttatatgccca 367  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  40223491 aggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctcattcttcttttataccca 40223590  T
Q  368 gcacgaattctagcagcccttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 422  Q
    ||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40223591 gcctgaattctagcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 40223645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 171 - 422
Target Start/End: Original strand, 43346459 - 43346711
Alignment:
Q  171 cagaaacaatgataatatttataaatgaaggttaaggtacaaagataagactacacagaacaaaagtaaaa-acaagctagagttgggtgtgcaactaag 269  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||| |||||||| |   ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43346459 cagaaacaatgataatatatataaagaaagattaagatacaaagacacagctactaagaacaaaagtaaaaaacaagctagagttgggtgtgcaactaag 43346558  T
Q  270 gttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctcattcttcttatatgcccagc 369  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||    
T  43346559 gttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctcattcttcttttatatccagc 43346658  T
Q  370 acgaattctagcagcccttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 422  Q
      |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43346659 ctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 43346711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 171 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 9772492 - 9772237
Alignment:
Q  171 cagaaacaatgataatatttataaatgaaggttaaggtacaaagataagactacacagaacaaaagtaaaaa----caagctagagttgggtgtgcaact 266  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| |||||||| ||  ||||  ||||||||||||||||    |||||||| |||||||||||||||    
T  9772492 cagaaacaatgataatatatataaagaaaggttaagatacaaagacaaagctacgaagaacaaaagtaaaaaaaaacaagctagtgttgggtgtgcaact 9772393  T
Q  267 aaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctcattcttcttatatgccc 366  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | | ||| |||||||    
T  9772392 aaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatctttcttctgaagtagctcatccttttcccttaatttccttttatgccc 9772293  T
Q  367 agcacgaattctagcagcccttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 422  Q
    |||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||    
T  9772292 agcatgaattcttgcagctcttgtgatgtactcttcttctggatagtaaggagtga 9772237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 171 - 422
Target Start/End: Original strand, 10268043 - 10268294
Alignment:
Q  171 cagaaacaatgataatatttataaatgaaggttaaggtacaaagataagactacacagaacaaaagtaaaa-acaagctagagttgggtgtgcaactaag 269  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||| || |   ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10268043 cagaaacaatgataatatatataaa-gaagattaagatacaaggacacagctacgaagaacaaaagtaaaaaacaagctagagttgggtgtgcaactaag 10268141  T
Q  270 gttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctcattcttcttatatgcccagc 369  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||  |||||    
T  10268142 gttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatcctttttctgaagtagctcatccttttccctcattcttcgtttatatccagc 10268241  T
Q  370 acgaattctagcagcccttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 422  Q
      |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10268242 ctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 10268294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 171 - 422
Target Start/End: Original strand, 10278620 - 10278871
Alignment:
Q  171 cagaaacaatgataatatttataaatgaaggttaaggtacaaagataagactacacagaacaaaagtaaaa-acaagctagagttgggtgtgcaactaag 269  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||| || |   ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10278620 cagaaacaatgataatatatataaa-gaagattaagatacaaggacacagctacgaagaacaaaagtaaaaaacaagctagagttgggtgtgcaactaag 10278718  T
Q  270 gttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctcattcttcttatatgcccagc 369  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||  |||||    
T  10278719 gttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatcctttttctgaagtagctcatccttttccctcattcttcgtttatatccagc 10278818  T
Q  370 acgaattctagcagcccttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 422  Q
      |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10278819 ctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 10278871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 171 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 11404607 - 11404351
Alignment:
Q  171 cagaaacaatgataatatttataaatgaaggttaaggtacaaagataagactacacagaacaaaagt-----aaaaacaagctagagttgggtgtgcaac 265  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||| |||||||| |   ||||  |||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11404607 cagaaacaatgataatatatataaagaaagattaagatacaaagacacagctactaagaacaaaagtaaaaaaaaaacaagctagagttgggtgtgcaac 11404508  T
Q  266 taaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctcattcttcttatatgcc 365  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||   |    
T  11404507 taaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctcattcttcgtttaaatc 11404408  T
Q  366 cagcacgaattctagcagcccttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 422  Q
    ||||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11404407 cagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 11404351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 170 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 34803530 - 34803301
Alignment:
Q  170 tcagaaacaatgataatatttataaatgaaggttaaggtacaaagataagactacacagaacaaaagtaaaaa-caagctagagttgggtgtgcaactaa 268  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||| |||||||| ||  ||||  |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  34803530 tcagaaacaatgataatatatataaagaaagattaagatacaaagacaaagctactaagaacaaaagtaaaaaacaagctagtgttgggtgtgcaactaa 34803431  T
Q  269 ggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctcattcttcttatatgcccag 368  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  34803430 ggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagttcatccttttccctcattcttcttttatacccag 34803331  T
Q  369 cacgaattctagcagcccttgtgatatact 398  Q
    |  ||||||||||| |||||||||| ||||    
T  34803330 cctgaattctagcaacccttgtgatgtact 34803301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 256 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 24337436 - 24337270
Alignment:
Q  256 ggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctcattctt 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||| ||||  ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  24337436 ggtgtgcaactaaggttgggcttgcttgtacatctgttccaaaagatacttaatttgctcatccttcttcttgagtagctcatccttttctctcattctt 24337337  T
Q  356 cttatatgcccagcacgaattctagcagcccttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 422  Q
    ||| ||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24337336 cttttatacccagcatgaattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 24337270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 254 - 422
Target Start/End: Original strand, 29245393 - 29245561
Alignment:
Q  254 tgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctcattc 353  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29245393 tgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttgtacatctgttccaaaagatacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcattc 29245492  T
Q  354 ttcttatatgcccagcacgaattctagcagcccttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 422  Q
    ||||| ||  ||||||| ||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29245493 ttcttttaaacccagcatgaattcttgcagcccttgtaatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 29245561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 254 - 422
Target Start/End: Original strand, 43083835 - 43084003
Alignment:
Q  254 tgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctcattc 353  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  43083835 tgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttgtacatctgttccaaaagatacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcattc 43083934  T
Q  354 ttcttatatgcccagcacgaattctagcagcccttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 422  Q
    ||||| ||  |||| || ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43083935 ttcttttaaacccaacatgaattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 43084003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 258 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 22959373 - 22959209
Alignment:
Q  258 tgtgcaactaaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctcattcttct 357  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||| |||||| || |||||||||||||  ||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  22959373 tgtgcaactaaggttgggtttgcttgtacatctgttccaatagatacttgatttgctcatccttctttttgagtagctcatctttttccctcaatcttct 22959274  T
Q  358 tatatgcccagcacgaattctagcagcccttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 422  Q
    | | | ||||||| ||||||| |  ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22959273 tttgtacccagcatgaattcttgttgcccttgagatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 22959209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 259 - 422
Target Start/End: Original strand, 4211085 - 4211248
Alignment:
Q  259 gtgcaactaaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctcattcttctt 358  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||| || |||||||||||||  ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4211085 gtgcaactaaggttgggtttgcttgtacatctgttccaatagatacttgatttgctcatccttctttttgagtagctcatccttttctctcattcttctt 4211184  T
Q  359 atatgcccagcacgaattctagcagcccttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 422  Q
     | |  |||||| ||||||| |  ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4211185 ttgtatccagcatgaattcttgttgcccttgagatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 4211248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 314; Significance: 1e-177; HSPs: 17)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 50 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 13687877 - 13687504
Alignment:
Q  50 cagagtagcagagcatataaccaaataaaaacataagaagtatcagagcaagaagtattagatcataggatattaaaaacaataaatatcattagagtta 149  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13687877 cagagtagcagagcatataaccaaataaaaacataataagtatcagagcaagaagtatcagagcatatgacattaaaatcaataaatatcattagagtta 13687778  T
Q  150 aaagaa-tagaacataatatttcagaaacaatgataatatttataaatgaaggttaaggtacaaagataagactacacagaacaaaagtaaaaacaagct 248  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13687777 aaaaaaatagaacataatatttcagaaacaatgataatatttataaatgaaggttaaggtacaaagataagactacacagaacaaaagtaaaaacaagct 13687678  T
Q  249 agagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccct 348  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13687677 agagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgatctgttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccct 13687578  T
Q  349 cattcttcttatatgcccagcacgaattctagcagcccttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 422  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13687577 cattcttcttacatgcccagcatgaattcttgcagctcttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 13687504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 72 - 422
Target Start/End: Original strand, 36078953 - 36079284
Alignment:
Q  72 aaataaaaacataagaagtatcagagcaagaagtattagatcataggatattaaaaacaataaatatcattagagttaaaagaa-tagaacataatattt 170  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||         
T  36078953 aaataaaaacataataagtatcagagcaagaagtatcagagcatatgacattaaaatcaataaatatcattagagttaaaaaaaatagaacataa----- 36079047  T
Q  171 cagaaacaatgataatatttataaatgaaggttaaggtacaaagataagactacacagaacaaaagtaaaaacaagctagagttgggtgtgcaactaagg 270  Q
                   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36079048 ---------------tatttataaatgaaggttaaggtacaaagataagactacacagaacaaaagtaaaaacaagctagagttgggtgtgcaactaagg 36079132  T
Q  271 ttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctcattcttcttatatgcccagca 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36079133 ttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgatctgttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctcattcttcttacatgcccagca 36079232  T
Q  371 cgaattctagcagcccttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 422  Q
     ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36079233 tgaattcttgcagctcttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 36079284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 50 - 342
Target Start/End: Original strand, 44482103 - 44482396
Alignment:
Q  50 cagagtagcagagcatataaccaaataaaaacataagaagtatcagagcaagaagtattagatcataggatattaaaaacaataaatatcattagagtt- 148  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||| ||||||||||||||||||||     
T  44482103 cagagtagcagagcatataaccaaataaaaacataagaagtatcagagcaagaagtatcagagcatatgacattaaaatcaataaatatcattagagttt 44482202  T
Q  149 aaaagaatagaacataatatttcagaaacaatgataatatttataaatgaaggttaaggtacaaagataagactacacagaacaaaagtaaaaacaagct 248  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  44482203 aaaagaaaagagcataatatttcagaaacaatgataatatttataaagaaaggttaaggtacaaggataaaactacacagaacaaaagtaagaacaagct 44482302  T
Q  249 agagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttcttaagtagctcatcctt 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    | || | |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  44482303 agagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttcttcagctgttctaagagaagtctaatctgttcatccttcttctgaagtagctcatcctt 44482396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 170 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 15766343 - 15766087
Alignment:
Q  170 tcagaaacaatgataatatttataaatgaaggttaaggtacaaagataagactacacagaacaaaagtaaaaa----caagctagagttgggtgtgcaac 265  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||| |||||||| ||  ||||  ||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||    
T  15766343 tcagaaacaatgataatatatataaagaaagattaagatacaaagacaaagctactaagaacaaaagtaaaaaaaaacaagctagagttgggtgtgcaac 15766244  T
Q  266 taaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctcattcttcttatatgcc 365  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||    
T  15766243 taaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctaaagtagctcattcttttccctcattcttcttttatacc 15766144  T
Q  366 cagcacgaattctagcagcccttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 422  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15766143 cagcctgaattctagcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 15766087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 170 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 15790480 - 15790224
Alignment:
Q  170 tcagaaacaatgataatatttataaatgaaggttaaggtacaaagataagactacacagaacaaaagtaaaaa----caagctagagttgggtgtgcaac 265  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||| |||||||| ||  ||||  ||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||    
T  15790480 tcagaaacaatgataatatatataaagaaagattaagatacaaagacaaagctactaagaacaaaagtaaaaaaaaacaagctagagttgggtgtgcaac 15790381  T
Q  266 taaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctcattcttcttatatgcc 365  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  15790380 taaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatccgatcatccttcttctaaagtagctcatccttttccctcattcttcttttatacc 15790281  T
Q  366 cagcacgaattctagcagcccttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 422  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15790280 cagcctgaattctagcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 15790224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 169 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 32087463 - 32087209
Alignment:
Q  169 ttcagaaacaatgataatatttataaatgaaggttaaggtacaaagataagactacacagaacaaaagtaaaaa-caagctagagttgggtgtgcaacta 267  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||| |||||||| |   ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  32087463 ttcagaaacaatgataatatatataaagaaagattaagatacaaagacacagctactaagaacaaaagtaaaaaacaagctagagttgggtgtgcaacta 32087364  T
Q  268 aggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctcattcttcttatatgccca 367  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||    
T  32087363 aggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctcattcttcttttatatcca 32087264  T
Q  368 gcacgaattctagcagcccttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 422  Q
    ||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32087263 gcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 32087209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 171 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 209345 - 209093
Alignment:
Q  171 cagaaacaatgataatatttataaatgaaggttaaggtacaaagataagactacacagaacaaaagtaaaaa-caagctagagttgggtgtgcaactaag 269  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||| |||||||| |   ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  209345 cagaaacaatgataatatatataaagaaagattaagatacaaagacacagctactaagaacaaaagtaaaaaacaagctagagttgggtgtgcaactaag 209246  T
Q  270 gttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctcattcttcttatatgcccagc 369  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||    
T  209245 gttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctcattcttcttttatatccagc 209146  T
Q  370 acgaattctagcagcccttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 422  Q
      |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  209145 ctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 209093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 171 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 722968 - 722716
Alignment:
Q  171 cagaaacaatgataatatttataaatgaaggttaaggtacaaagataagactacacagaacaaaagtaaaaa-caagctagagttgggtgtgcaactaag 269  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||| |||||||| |   ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  722968 cagaaacaatgataatatatataaagaaagattaagatacaaagacacagctactaagaacaaaagtaaaaaacaagctagagttgggtgtgcaactaag 722869  T
Q  270 gttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctcattcttcttatatgcccagc 369  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||    
T  722868 gttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctcattcttcttttatatccagc 722769  T
Q  370 acgaattctagcagcccttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 422  Q
      |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  722768 ctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 722716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 171 - 422
Target Start/End: Original strand, 29077808 - 29078060
Alignment:
Q  171 cagaaacaatgataatatttataaatgaaggttaaggtacaaagataagactacacagaacaaaagtaaaa-acaagctagagttgggtgtgcaactaag 269  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||| |||||||| |   ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29077808 cagaaacaatgataatatatataaagaaagattaagatacaaagacacagctactaagaacaaaagtaaaaaacaagctagagttgggtgtgcaactaag 29077907  T
Q  270 gttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctcattcttcttatatgcccagc 369  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||    
T  29077908 gttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctcattcttcttttatatccagc 29078007  T
Q  370 acgaattctagcagcccttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 422  Q
      |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29078008 ctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 29078060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 171 - 422
Target Start/End: Original strand, 242911 - 243162
Alignment:
Q  171 cagaaacaatgataatatttataaatgaaggttaaggtacaaagataagactacacagaacaaaagtaaaaacaagctagagttgggtgtgcaactaagg 270  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||| |||||||| |   ||||  ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  242911 cagaaacaatgataatatatataaagaaagattaagatacaaagacacagctactaagaacaaagtaaaaaacaagctagagttgggtgtgcaactaagg 243010  T
Q  271 ttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctcattcttcttatatgcccagca 370  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||     
T  243011 ttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctcattcttcttttatatccagcc 243110  T
Q  371 cgaattctagcagcccttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 422  Q
     |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  243111 tgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 243162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 171 - 422
Target Start/End: Original strand, 796281 - 796532
Alignment:
Q  171 cagaaacaatgataatatttataaatgaaggttaaggtacaaagataagactacacagaacaaaagtaaaaacaagctagagttgggtgtgcaactaagg 270  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||| |||||||| |   ||||  ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  796281 cagaaacaatgataatatatataaagaaagattaagatacaaagacacagctactaagaacaaagtaaaaaacaagctagagttgggtgtgcaactaagg 796380  T
Q  271 ttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctcattcttcttatatgcccagca 370  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||     
T  796381 ttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctcattcttcttttatatccagcc 796480  T
Q  371 cgaattctagcagcccttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 422  Q
     |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  796481 tgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 796532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 171 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 3358396 - 3358145
Alignment:
Q  171 cagaaacaatgataatatttataaatgaaggttaaggtacaaagata-agactacacagaacaaaagtaaaaa-caagctagagttgggtgtgcaactaa 268  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||| || | ||| |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3358396 cagaaacaatgataatatatataaa-gaagattaagatacaaggacacaga-tacgaagaacaaaagtaaaaaacaagctagagttgggtgtgcaactaa 3358299  T
Q  269 ggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctcattcttcttatatgcccag 368  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||   ||||    
T  3358298 ggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctcattcttcgtttaaatccag 3358199  T
Q  369 cacgaattctagcagcccttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 422  Q
    |  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3358198 cctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 3358145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 171 - 422
Target Start/End: Original strand, 36294027 - 36294279
Alignment:
Q  171 cagaaacaatgataatatttataaatgaagg-ttaaggtacaaagataagactacacagaacaaaagtaaaa-acaagctagagttgggtgtgcaactaa 268  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||| |   ||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  36294027 cagaaacaatgataatatatataaa-gaaggattaagatacaaagacacagctactgagaacaaaagtaaaaaacaagctagagttgggtgtgcaactaa 36294125  T
Q  269 ggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctcattcttcttatatgcccag 368  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| | ||   ||||    
T  36294126 ggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctctcattcttcgtttaaatccag 36294225  T
Q  369 cacgaattctagcagcccttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 422  Q
    |  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  36294226 cctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 36294279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 171 - 422
Target Start/End: Original strand, 9342233 - 9342484
Alignment:
Q  171 cagaaacaatgataatatttataaatgaaggttaaggtacaaagataagactacacagaacaaaagtaaaaacaa-gctagagttgggtgtgcaactaag 269  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||| || |   ||||  ||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||    
T  9342233 cagaaacaatgataatatatataaa-gaagattaagatacaaggacacagctacgaagaacaaaagtaaaaaatatgctagagttgggtgtgcaactaag 9342331  T
Q  270 gttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctcattcttcttatatgcccagc 369  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||   |||||    
T  9342332 gttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctcattcttcgtttaaatccagc 9342431  T
Q  370 acgaattctagcagcccttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 422  Q
      |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9342432 ctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 9342484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 254 - 422
Target Start/End: Original strand, 26112468 - 26112636
Alignment:
Q  254 tgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctcattc 353  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||| |||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26112468 tgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttgtacatctgttccaaaagatacttaatttgttcatccttctgcttaagtagctcatccttttctctcattc 26112567  T
Q  354 ttcttatatgcccagcacgaattctagcagcccttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 422  Q
    ||||| ||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26112568 ttcttttatacccagcatgaattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 26112636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 254 - 422
Target Start/End: Original strand, 19129938 - 19130106
Alignment:
Q  254 tgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctcattc 353  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||| ||||  | ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19129938 tgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttgtacatctgttccaaaagatacttaatttgctgatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcattc 19130037  T
Q  354 ttcttatatgcccagcacgaattctagcagcccttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 422  Q
    ||||| ||  |||| || ||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19130038 ttcttttaaacccaacatgaattcttgcagcccttgtaatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 19130106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 258 - 422
Target Start/End: Original strand, 6152292 - 6152456
Alignment:
Q  258 tgtgcaactaaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctcattcttct 357  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||| |||||| || |||||||||||||  ||||  ||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6152292 tgtgcaactaaggttgggtttgcttgtacatctgttccaatagatacttgatttgctcattcttctttttgagtagctcatccttttccctcaatcttct 6152391  T
Q  358 tatatgcccagcacgaattctagcagcccttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 422  Q
    | | | ||||||| ||||||| |  ||||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||||    
T  6152392 tttgtacccagcatgaattcttgttgcccttgagatgtactcttcttctcgatagaaaggagtga 6152456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 314; Significance: 1e-177; HSPs: 15)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 50 - 422
Target Start/End: Original strand, 24641288 - 24641661
Alignment:
Q  50 cagagtagcagagcatataaccaaataaaaacataagaagtatcagagcaagaagtattagatcataggatattaaaaacaataaatatcattagagtta 149  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24641288 cagagtagcagagcatataaccaaataaaaacataataagtatcagagcaagaagtatcagagcatatgacattaaaatcaataaatatcattagagtta 24641387  T
Q  150 aaagaa-tagaacataatatttcagaaacaatgataatatttataaatgaaggttaaggtacaaagataagactacacagaacaaaagtaaaaacaagct 248  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24641388 aaaaaaatagaacataatatttcagaaacaatgataatatttataaatgaaggttaaggtacaaagataagactacacagaacaaaagtaaaaacaagct 24641487  T
Q  249 agagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccct 348  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24641488 agagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgatctgttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccct 24641587  T
Q  349 cattcttcttatatgcccagcacgaattctagcagcccttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 422  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24641588 cattcttcttacatgcccagcatgaattcttgcagctcttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 24641661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 50 - 422
Target Start/End: Original strand, 27657621 - 27657994
Alignment:
Q  50 cagagtagcagagcatataaccaaataaaaacataagaagtatcagagcaagaagtattagatcataggatattaaaaacaataaatatcattagagtta 149  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27657621 cagagtagcagagcatataaccaaataaaaacataataagtatcagagcaagaagtatcagagcatatgacattaaaaacaataaatatcattagagtta 27657720  T
Q  150 aaagaa-tagaacataatatttcagaaacaatgataatatttataaatgaaggttaaggtacaaagataagactacacagaacaaaagtaaaaacaagct 248  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27657721 aaaaaaatagaacataatatttcagaaacaatgataatatttataaatgaaggttaaggtacaaagataagactacacagaacaaaagtaaaaacaagct 27657820  T
Q  249 agagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccct 348  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27657821 agagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgatctgttcatctttctttttaagtagctcatccttttccct 27657920  T
Q  349 cattcttcttatatgcccagcacgaattctagcagcccttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 422  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27657921 cattcttcttacatgcccagcatgaatccttgcagctcttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 27657994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 50 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 18762346 - 18761975
Alignment:
Q  50 cagagtagcagagcatataaccaaataaaaacataagaagtatcagagcaagaagtattagatcataggatattaaaaacaataaatatcattagagtta 149  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18762346 cagagtagcagagcatataaccaaataaaaacataagaagtatcagagcaagaagtatcagagcataggacattaaaaacaataaatatcattagagtta 18762247  T
Q  150 aaagaatagaacataatatttcagaaacaatgataatatttataaatgaaggttaaggtacaaagataagactacacagaacaaaagtaaaaacaagcta 249  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18762246 aaagaatagagcataatatttcagaaacaatgataatatttataag-gaaggttaaggtacaaagataaaactacacagaacaagagtaaaaacaagcta 18762148  T
Q  250 gagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctc 349  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18762147 gagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgatttgttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctc 18762048  T
Q  350 attcttcttatatgcccagcacgaattctagcagcccttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 422  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| |||||| || || ||||| ||||||||||||||||    
T  18762047 attcttcttacatgcccagcatgaattcttgcagcccatgtgatgtattcctcttctggatagaaaggagtga 18761975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 171 - 419
Target Start/End: Original strand, 451670 - 451919
Alignment:
Q  171 cagaaacaatgataatatttataaatgaaggttaaggtacaaagataagactacacagaacaaaagtaaaa-acaagctagagttgggtgtgcaactaag 269  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| |||||||| ||  ||||  ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  451670 cagaaacaatgataatatatataaagaaaggttaagatacaaagacaaagctactaagaacaaaagtaaaaaacaagctagtgttgggtgtgcaactaag 451769  T
Q  270 gttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctcattcttcttatatgcccagc 369  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | | ||| ||||||||||    
T  451770 gttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatctttcttctgaagtagctcatccttttcccttaatttccttttatgcccagc 451869  T
Q  370 acgaattctagcagcccttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggag 419  Q
    | ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||    
T  451870 atgaattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagtaaggag 451919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 171 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 30936237 - 30935988
Alignment:
Q  171 cagaaacaatgataatatttataaatgaaggttaaggtacaaagataagactacacagaacaaaagtaaaaa-caagctagagttgggtgtgcaactaag 269  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| |||||||| ||  ||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  30936237 cagaaacaatgataatatatataaagaaaggttaagatacaaagacaaagctactaagaacaaaagtaaaaaacaagctagtgttgggtgtgcaactaag 30936138  T
Q  270 gttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctcattcttcttatatgcccagc 369  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | | ||| ||||||||||    
T  30936137 gttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatctttcttctgaagtagctcatccttttcccttaatttccttttatgcccagc 30936038  T
Q  370 acgaattctagcagcccttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggag 419  Q
    | ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||    
T  30936037 atgaattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagtaaggag 30935988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 171 - 419
Target Start/End: Original strand, 21997510 - 21997759
Alignment:
Q  171 cagaaacaatgataatatttataaatgaaggttaaggtacaaagataagactacacagaacaaaagtaaaa-acaagctagagttgggtgtgcaactaag 269  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| |||||||| ||  ||||  ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21997510 cagaaacaatgataatatatataaagaaaggttaagatacaaagacaaagctactaagaacaaaagtaaaaaacaagctagtgttgggtgtgcaactaag 21997609  T
Q  270 gttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctcattcttcttatatgcccagc 369  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | | ||| |||||||| |    
T  21997610 gttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatctttcttctgaagtagctcatccttttcccttaatttccttttatgcccaac 21997709  T
Q  370 acgaattctagcagcccttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggag 419  Q
    | ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||    
T  21997710 atgaattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagtaaggag 21997759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 171 - 422
Target Start/End: Original strand, 36019430 - 36019681
Alignment:
Q  171 cagaaacaatgataatatttataaatgaaggttaaggtacaaagataagactacacagaacaaaagtaaaa-acaagctagagttgggtgtgcaactaag 269  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||| || |   ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36019430 cagaaacaatgataatatatataaa-gaagattaagatacaaggacacagctacgaagaacaaaagtaaaaaacaagctagagttgggtgtgcaactaag 36019528  T
Q  270 gttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctcattcttcttatatgcccagc 369  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||  |||||    
T  36019529 gttgggcttgcttatacaattgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctcattcttcgtttatatccagc 36019628  T
Q  370 acgaattctagcagcccttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 422  Q
      |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  36019629 ctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 36019681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 171 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 10750313 - 10750062
Alignment:
Q  171 cagaaacaatgataatatttataaatgaaggttaaggtacaaagataagactacacagaacaaaagtaaaaa-caagctagagttgggtgtgcaactaag 269  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||| || |   ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10750313 cagaaacaatgataatatatataaa-gaagattaagatacaaggacacagctacgaagaacaaaagtaaaaaacaagctagagttgggtgtgcaactaag 10750215  T
Q  270 gttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctcattcttcttatatgcccagc 369  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||   |||||    
T  10750214 gttgggcttgcttagacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctcattcttcgtttaaatccagc 10750115  T
Q  370 acgaattctagcagcccttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 422  Q
      |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10750114 ctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 10750062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 171 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 10964082 - 10963831
Alignment:
Q  171 cagaaacaatgataatatttataaatgaaggttaaggtacaaagataagactacacagaacaaaagtaaaaa-caagctagagttgggtgtgcaactaag 269  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||| || |   ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10964082 cagaaacaatgataatatatataaa-gaagattaagatacaaggacacagctacgaagaacaaaagtaaaaaacaagctagagttgggtgtgcaactaag 10963984  T
Q  270 gttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctcattcttcttatatgcccagc 369  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||   |||||    
T  10963983 gttgggcttgcttagacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctcattcttcgtttaaatccagc 10963884  T
Q  370 acgaattctagcagcccttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 422  Q
      |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10963883 ctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 10963831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 227 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 55754918 - 55754722
Alignment:
Q  227 agaacaaaagtaaaaa-caagctagagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttc 325  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||    
T  55754918 agaacaaaagtaaaaaacaagctagagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttc 55754819  T
Q  326 ttaagtagctcatccttttccctcattcttcttatatgcccagcacgaattctagcagcccttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 422  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||| |||  |||||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  55754818 tgaagtagctcatccttttctctcattcttcttttatatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 55754722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 254 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 24027100 - 24026932
Alignment:
Q  254 tgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctcattc 353  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||||||||  ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24027100 tgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttgtacatctgttccaaaagatacttgatttgctcatccttcttcttgagtagctcatccttttccctcattc 24027001  T
Q  354 ttcttatatgcccagcacgaattctagcagcccttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 422  Q
    ||||| ||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24027000 ttcttttatacccagcatgaattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 24026932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 256 - 422
Target Start/End: Original strand, 17919294 - 17919460
Alignment:
Q  256 ggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctcattctt 355  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||| || |||||||||||||  ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17919294 ggtgtgcaactaaggttgggctttcttgtacatctgttccaaaagatacttgatttgctcatccttcttcttgagtagctcatccttttccctcattctt 17919393  T
Q  356 cttatatgcccagcacgaattctagcagcccttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 422  Q
    ||| ||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17919394 cttttatacccagcatgaattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 17919460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 254 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 19954017 - 19953849
Alignment:
Q  254 tgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctcattc 353  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| || |||||||| ||||  ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  19954017 tgggtgtgcaactaaggttggacttgcttgtacatctgttccaaaagatacttaatttgctcatccttcttcttgagtagctcatccttttcccttattc 19953918  T
Q  354 ttcttatatgcccagcacgaattctagcagcccttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 422  Q
    ||||| ||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| |||||| || |||||||||||||    
T  19953917 ttcttttatacccagcatgaattcttgcagcccttgtgatgtactattcttctgggtagaaaggagtga 19953849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 254 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 40469654 - 40469487
Alignment:
Q  254 tgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctcattc 353  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| || || ||||| ||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  40469654 tgggtgtgcaactaaggtttggcttgcttatacatttgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttctgaagtagctcatccttttctctcattc 40469555  T
Q  354 ttcttatatgcccagcacgaattctagcagcccttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtg 421  Q
    ||||| ||   |||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||  ||||||| ||||||    
T  40469554 ttcttttaaatccagcatgaattctagcagcccttgtaatgtactcttcttctagatagaagggagtg 40469487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 258 - 422
Target Start/End: Original strand, 16257112 - 16257276
Alignment:
Q  258 tgtgcaactaaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctcattcttct 357  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||| |||||| || |||||||||||||  ||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  16257112 tgtgcaactaaggttgggtttgcttgtacatctgttccaatagatacttgatttgctcatccttctttttgagtagctcatctttttccctcaatcttct 16257211  T
Q  358 tatatgcccagcacgaattctagcagcccttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 422  Q
    | | | ||||||| ||||||| |  ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16257212 tttgtacccagcatgaattcttgttgcccttgagatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 16257276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 314; Significance: 1e-177; HSPs: 17)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 50 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 35400422 - 35400049
Alignment:
Q  50 cagagtagcagagcatataaccaaataaaaacataagaagtatcagagcaagaagtattagatcataggatattaaaaacaataaatatcattagagtta 149  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  35400422 cagagtagcagagcatataaccaaataaaaacataataagtatcagagcaagaagtatcagagcatatgacattaaaatcaataaatatcattagagtta 35400323  T
Q  150 aaagaa-tagaacataatatttcagaaacaatgataatatttataaatgaaggttaaggtacaaagataagactacacagaacaaaagtaaaaacaagct 248  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35400322 aaaaaaatagaacataatatttcagaaacaatgataatatttataaatgaaggttaaggtacaaagataagactacacagaacaaaagtaaaaacaagct 35400223  T
Q  249 agagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccct 348  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35400222 agagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgatctgttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccct 35400123  T
Q  349 cattcttcttatatgcccagcacgaattctagcagcccttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 422  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35400122 cattcttcttacatgcccagcatgaattcttgcagctcttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 35400049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 50 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 35647947 - 35647574
Alignment:
Q  50 cagagtagcagagcatataaccaaataaaaacataagaagtatcagagcaagaagtattagatcataggatattaaaaacaataaatatcattagagtta 149  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  35647947 cagagtagcagagcatataaccaaataaaaacataataagtatcagagcaagaagtatcagagcatatgacattaaaatcaataaatatcattagagtta 35647848  T
Q  150 aaagaa-tagaacataatatttcagaaacaatgataatatttataaatgaaggttaaggtacaaagataagactacacagaacaaaagtaaaaacaagct 248  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35647847 aaaaaaatagaacataatatttcagaaacaatgataatatttataaatgaaggttaaggtacaaagataagactacacagaacaaaagtaaaaacaagct 35647748  T
Q  249 agagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccct 348  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35647747 agagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgatctgttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccct 35647648  T
Q  349 cattcttcttatatgcccagcacgaattctagcagcccttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 422  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35647647 cattcttcttacatgcccagcatgaattcttgcagctcttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 35647574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 50 - 422
Target Start/End: Original strand, 3172540 - 3172914
Alignment:
Q  50 cagagtagcagagcatataaccaaataaaaacataagaagtatcagagcaagaagtattagatcataggatattaaaaacaataaatatcattagagtta 149  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3172540 cagagtagcagagcatataaccaaataaaaacataataagtatcagagcaagaagtatcagagcatatgacattaaaaacaataaatatcattagagtta 3172639  T
Q  150 aaagaa--tagaacataatatttcagaaacaatgataatatttataaatgaaggttaaggtacaaagataagactacacagaacaaaagtaaaaacaagc 247  Q
    ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3172640 aaaaaaaatagaacataatatttcagaaacaatgataatatttataaatgaaggttaaggtacaaagataagactacacagaacaaaagtaaaaacaagc 3172739  T
Q  248 tagagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccc 347  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3172740 tagagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgatctgttcatctttctttttaagtagctcatccttttccc 3172839  T
Q  348 tcattcttcttatatgcccagcacgaattctagcagcccttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 422  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3172840 tcattcttcttacatgcccagcatgaatccttgcagctcttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 3172914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 50 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 47617795 - 47617443
Alignment:
Q  50 cagagtagcagagcatataaccaaataaaaacataagaagtatcagagcaagaagtattagatcataggatattaaaaacaataaatatcattagagtta 149  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  47617795 cagagtagtagagcatataaccaaataaaaacataataagtatcagagcaagaagtatcagagcatatgacattaaaatcaataaatatcattagagtta 47617696  T
Q  150 aaagaa-tagaacataatatttcagaaacaatgataatatttataaatgaaggttaaggtacaaagataagactacacagaacaaaagtaaaaacaagct 248  Q
    ||| || |||||||||||                    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  47617695 aaaaaaatagaacataat--------------------atttataaatgaaggttaaggtacaaagataagactacacagaacaaaagtaaaa-caagct 47617617  T
Q  249 agagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccct 348  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47617616 agagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgatctgttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccct 47617517  T
Q  349 cattcttcttatatgcccagcacgaattctagcagcccttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 422  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47617516 cattcttcttacatgcccagcatgaattcttgcagctcttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 47617443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 72 - 422
Target Start/End: Original strand, 5834189 - 5834518
Alignment:
Q  72 aaataaaaacataagaagtatcagagcaagaagtattagatcataggatattaaaaacaataaatatcattagagttaaaagaatagaacataatatttc 171  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||          
T  5834189 aaataaaaacataataagtatcagagcaagaagtatcagagcatatgacattaaaatcaataaatatcattagagttaaaa-aatagaacataa------ 5834281  T
Q  172 agaaacaatgataatatttataaatgaaggttaaggtacaaagataagactacacagaacaaaagtaaaaacaagctagagttgggtgtgcaactaaggt 271  Q
                  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5834282 --------------tatttataaatgaaggttaaggtacaaagataagactacacagaacaaaagtaaaaacaagctagagttgggtgtgcaactaaggt 5834367  T
Q  272 tgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctcattcttcttatatgcccagcac 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  5834368 tgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgatctgttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctcattcttcttacatgcccagcat 5834467  T
Q  372 gaattctagcagcccttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 422  Q
    |||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5834468 gaatccttgcagctcttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 5834518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 171 - 419
Target Start/End: Original strand, 12731549 - 12731798
Alignment:
Q  171 cagaaacaatgataatatttataaatgaaggttaaggtacaaagataagactacacagaacaaaagtaaaa-acaagctagagttgggtgtgcaactaag 269  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| |||||||| ||  ||||  ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12731549 cagaaacaatgataatatatataaagaaaggttaagatacaaagacaaagctactaagaacaaaagtaaaaaacaagctagtgttgggtgtgcaactaag 12731648  T
Q  270 gttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctcattcttcttatatgcccagc 369  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | | ||| ||||||||||    
T  12731649 gttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatctttcttctgaagtagctcatccttttcccttaatttccttttatgcccagc 12731748  T
Q  370 acgaattctagcagcccttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggag 419  Q
    | ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||    
T  12731749 atgaattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagtaaggag 12731798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 171 - 419
Target Start/End: Original strand, 12742142 - 12742391
Alignment:
Q  171 cagaaacaatgataatatttataaatgaaggttaaggtacaaagataagactacacagaacaaaagtaaaa-acaagctagagttgggtgtgcaactaag 269  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| |||||||| ||  ||||  ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12742142 cagaaacaatgataatatatataaagaaaggttaagatacaaagacaaagctactaagaacaaaagtaaaaaacaagctagtgttgggtgtgcaactaag 12742241  T
Q  270 gttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctcattcttcttatatgcccagc 369  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | | ||| ||||||||||    
T  12742242 gttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatctttcttctgaagtagctcatccttttcccttaatttccttttatgcccagc 12742341  T
Q  370 acgaattctagcagcccttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggag 419  Q
    | ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||    
T  12742342 atgaattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagtaaggag 12742391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 171 - 422
Target Start/End: Original strand, 7508340 - 7508591
Alignment:
Q  171 cagaaacaatgataatatttataaatgaaggttaaggtacaaagataagactacacagaacaaaagtaaaa-acaagctagagttgggtgtgcaactaag 269  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||| || |   ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7508340 cagaaacaatgataatatatataaa-gaagattaagatacaaggacacagctacgaagaacaaaagtaaaaaacaagctagagttgggtgtgcaactaag 7508438  T
Q  270 gttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctcattcttcttatatgcccagc 369  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||  |||||    
T  7508439 gttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctcattcttcgtttatatccagc 7508538  T
Q  370 acgaattctagcagcccttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 422  Q
      |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7508539 ctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 7508591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 171 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 36246188 - 36245937
Alignment:
Q  171 cagaaacaatgataatatttataaatgaaggttaaggtacaaagataagactacacagaacaaaagtaaaaa-caagctagagttgggtgtgcaactaag 269  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||| || |   ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  36246188 cagaaacaatgataatatatataaa-gaagattaagatacaaggacacagctacgaagaacaaaagtaaaaaacaagctagagttgggtgtgcaactaag 36246090  T
Q  270 gttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctcattcttcttatatgcccagc 369  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||    
T  36246089 gttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctcattcttcttttatatccagc 36245990  T
Q  370 acgaattctagcagcccttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 422  Q
      |||||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||    
T  36245989 ctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttatggatagaaaggagtga 36245937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 171 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 51655632 - 51655381
Alignment:
Q  171 cagaaacaatgataatatttataaatgaaggttaaggtacaaagataagactacacagaacaaaagtaaaaa-caagctagagttgggtgtgcaactaag 269  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||| || |   ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  51655632 cagaaacaatgataatatatataaa-gaagattaagatacaaggacacagctacgaagaacaaaagtaaaaaacaagctagagttgggtgtgcaactaag 51655534  T
Q  270 gttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctcattcttcttatatgcccagc 369  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||   |||||    
T  51655533 gttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctcattcttcgtttaaatccagc 51655434  T
Q  370 acgaattctagcagcccttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 422  Q
      |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  51655433 ctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 51655381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 169 - 422
Target Start/End: Original strand, 38096121 - 38096377
Alignment:
Q  169 ttcagaaacaatgataatatttata--aatgaaggttaaggtacaaagataagactacacagaacaaaagtaaaa-acaagctagagttgggtgtgcaac 265  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  ||  ||| ||||| |||||||| |   ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38096121 ttcagaaacaatgataatatatatagaaagaaagattaagatacaaagacacagctactaagaacaaaagtaaaaaacaagctagagttgggtgtgcaac 38096220  T
Q  266 taaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctcattcttcttatatgcc 365  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| |||  |    
T  38096221 taaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttttgaagtagctcatccttttctctcattcttcttttatatc 38096320  T
Q  366 cagcacgaattctagcagcccttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 422  Q
    ||||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38096321 cagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 38096377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 254 - 422
Target Start/End: Original strand, 4168401 - 4168569
Alignment:
Q  254 tgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctcattc 353  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4168401 tgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttgtacatctgttccaaaagatacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcattc 4168500  T
Q  354 ttcttatatgcccagcacgaattctagcagcccttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 422  Q
    ||||| ||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4168501 ttcttttatacccagcatgaattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 4168569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 254 - 422
Target Start/End: Original strand, 19180085 - 19180253
Alignment:
Q  254 tgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctcattc 353  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19180085 tgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaagagatacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcattc 19180184  T
Q  354 ttcttatatgcccagcacgaattctagcagcccttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 422  Q
    ||||| ||  ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  19180185 ttcttttaaacccagcatgaattcttgcagcccttgtaatatactcttcttctagatagaaaggagtga 19180253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 256 - 422
Target Start/End: Original strand, 21864824 - 21864990
Alignment:
Q  256 ggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctcattctt 355  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||| || |||||||||||||  ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  21864824 ggtgtgcaactaaggttgggtttgcttgtacatctgttccaatagatacttgatttgctcatccttctttttgagtagctcatccttttccctcattctt 21864923  T
Q  356 cttatatgcccagcacgaattctagcagcccttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 422  Q
    ||| ||| ||||||| ||||||| |  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21864924 cttttatacccagcatgaattcttgttgcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 21864990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 256 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 5649429 - 5649263
Alignment:
Q  256 ggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctcattctt 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||| || |  ||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||    
T  5649429 ggtgtgcaactaaggttgggcttgcttgtacatctgttccaaaagatacttaatctgctcatccttcttattgagtagctcatccttttctctcattctt 5649330  T
Q  356 cttatatgcccagcacgaattctagcagcccttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 422  Q
    ||| ||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||    
T  5649329 cttttatacccagcatgaattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctgggtagaaaggagtga 5649263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 258 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 12622847 - 12622683
Alignment:
Q  258 tgtgcaactaaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctcattcttct 357  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||| |||||| || |||||||||||||  || || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12622847 tgtgcaactaaggttgggtttgcttgtacatctgttccaatagatacttgatttgctcgtccttctttttgagtagctcatccttttccctcattcttct 12622748  T
Q  358 tatatgcccagcacgaattctagcagcccttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 422  Q
    | | |  |||||| ||||||| |  ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12622747 tttgtatccagcatgaattcttgttgcccttgagatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 12622683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 240 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 153339 - 153158
Alignment:
Q  240 aaacaagctagagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttcttaagtagctcatc 339  Q
    |||||||| | | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| || |||||||| ||||  ||||| ||||||| |||| | ||||     
T  153339 aaacaagcaaaaattgggtgtgcaactaaggtttggcttgcttatacaactgttccaatagatacttaatttgctcatccttcttctgaagttgttcatt 153240  T
Q  340 cttttccctcattcttcttatatgcccagcacgaattctagcagcccttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtg 421  Q
    |||| | |||| ||| ||| |   ||||||| |||||||||||| |||||  || ||||| ||||| |||||||||||||||    
T  153239 ctttgctctcagtctacttttcaacccagcatgaattctagcagtccttgaaatgtactcatcttctggatagaaaggagtg 153158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 308; Significance: 1e-173; HSPs: 22)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 50 - 422
Target Start/End: Original strand, 11006172 - 11006546
Alignment:
Q  50 cagagtagcagagcatataaccaaataaaaacataagaagtatcagagcaagaagtattagatcataggatattaaaaacaataaatatcattagagtta 149  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11006172 cagagtagtagagcatataaccaaataaaaacataataagtatcagagcaagaagtatcagagcatatgacattaaaatcaataaatatcattagagtta 11006271  T
Q  150 aaagaa--tagaacataatatttcagaaacaatgataatatttataaatgaaggttaaggtacaaagataagactacacagaacaaaagtaaaaacaagc 247  Q
    ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11006272 aaaaaaaatagaacataatatttcagaaacaatgataatatttataaatgaaggttaaggtacaaagataagactacacagaacaaaagtaaaaacaagc 11006371  T
Q  248 tagagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccc 347  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11006372 tagagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgatctgttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccc 11006471  T
Q  348 tcattcttcttatatgcccagcacgaattctagcagcccttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 422  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11006472 tcattcttcttacatgcccagcatgaattcttgcagctcttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 11006546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 50 - 422
Target Start/End: Original strand, 42866834 - 42867187
Alignment:
Q  50 cagagtagcagagcatataaccaaataaaaacataagaagtatcagagcaagaagtattagatcataggatattaaaaacaataaatatcattagagtta 149  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  42866834 cagagtagcagagcatataaccaaataaaaacataataagtatcagagcaagaagtatcagagcatatgacattaaaatcaataaatatcattagagtta 42866933  T
Q  150 aaagaa-tagaacataatatttcagaaacaatgataatatttataaatgaaggttaaggtacaaagataagactacacagaacaaaagtaaaaacaagct 248  Q
    ||| || ||||||||||                    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42866934 aaaaaaatagaacataa--------------------tatttataaatgaaggttaaggtacaaagataagactacacagaacaaaagtaaaaacaagct 42867013  T
Q  249 agagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccct 348  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42867014 agagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgatctgttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccct 42867113  T
Q  349 cattcttcttatatgcccagcacgaattctagcagcccttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 422  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42867114 cattcttcttacatgcccagcatgaattcttgcagctcttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 42867187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 72 - 422
Target Start/End: Original strand, 1988566 - 1988897
Alignment:
Q  72 aaataaaaacataagaagtatcagagcaagaagtattagatcataggatattaaaaacaataaatatcattagagttaaaagaa-tagaacataatattt 170  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||         
T  1988566 aaataaaaacataataagtatcagagcaagaagtatcagagcatatgacattaaaatcaataaatatcattagagttaaaaaaaatagaacataa----- 1988660  T
Q  171 cagaaacaatgataatatttataaatgaaggttaaggtacaaagataagactacacagaacaaaagtaaaaacaagctagagttgggtgtgcaactaagg 270  Q
                   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1988661 ---------------tatttataaatgaaggttaaggtacaaagataagactacacagaacaaaagtaaaaacaagctagagttgggtgtgcaactaagg 1988745  T
Q  271 ttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctcattcttcttatatgcccagca 370  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||  |||||     
T  1988746 ttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctctcattcttcttttatatccagcc 1988845  T
Q  371 cgaattctagcagcccttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 422  Q
     |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1988846 tgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 1988897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 99 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 466869 - 466550
Alignment:
Q  99 aagaagtattagatcataggatattaaaaacaataaatatcattagagttaaaagaatagaacataatatttcagaaacaatgataatatttataaatga 198  Q
    ||||| ||| ||| |||| || |||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||||||||  | || | ||||||||||||||||||||||  |    
T  466869 aagaaatatgagagcataagacattaaaaacaataaatattatcagaattaaaagtatagaacatatgagtt-ataaacaatgataatatttataaagaa 466771  T
Q  199 aggttaaggtacaaagataagactacacagaacaaaagtaaaaacaagctagagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacagctgttctaag 298  Q
    |||||||| |||||||| ||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  466770 aggttaagatacaaagagaaagctactaagaacaaaagtaaaaacaagctagagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaag 466671  T
Q  299 agatacttgattttttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctcattcttcttatatgcccagcacgaattctagcagcccttgtgatatact 398  Q
    ||||||||||| |  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | | ||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  466670 agatacttgatctgatcatctttcttctgaagtagctcatccttttcccttaatttccttttatgcccagcatgaattcttgcagcccttgtgatgtact 466571  T
Q  399 cttcttcaggatagaaaggag 419  Q
    ||||||| |||||| ||||||    
T  466570 cttcttctggatagtaaggag 466550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 170 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 2715444 - 2715191
Alignment:
Q  170 tcagaaacaatgataatatttataaatgaaggttaaggtacaaagataagactacacagaacaaaagtaaaaa-caagctagagttgggtgtgcaactaa 268  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||| |||||||| |   ||||  |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  2715444 tcagaaacaatgataatatatataaagaaagattaagatacaaagacacagctactaagaacaaaagtaaaaaacaagctagtgttgggtgtgcaactaa 2715345  T
Q  269 ggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctcattcttcttatatgcccag 368  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  2715344 ggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttttgaagtagctcatccttttccctcattcttcttttatacccag 2715245  T
Q  369 cacgaattctagcagcccttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 422  Q
    |  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||    
T  2715244 cctgaattctagcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagtaaggagtga 2715191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 171 - 422
Target Start/End: Original strand, 9086334 - 9086586
Alignment:
Q  171 cagaaacaatgataatatttataaatgaaggttaaggtacaaagataagactacacagaacaaaagtaaaa-acaagctagagttgggtgtgcaactaag 269  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||| |||||||| |   ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9086334 cagaaacaatgataatatatataaagaaagattaagatacaaagacacagctactaagaacaaaagtaaaaaacaagctagagttgggtgtgcaactaag 9086433  T
Q  270 gttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctcattcttcttatatgcccagc 369  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||  |||||    
T  9086434 gttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctcattcttcgtttatatccagc 9086533  T
Q  370 acgaattctagcagcccttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 422  Q
      |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9086534 ctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 9086586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 171 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 26698935 - 26698683
Alignment:
Q  171 cagaaacaatgataatatttataaatgaaggttaaggtacaaagataagactacacagaacaaaagtaaaaa-caagctagagttgggtgtgcaactaag 269  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||| |||||||| |   ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  26698935 cagaaacaatgataatatatataaagaaagattaagatacaaagacacagctactaagaacaaaagtaaaaaacaagctagagttggatgtgcaactaag 26698836  T
Q  270 gttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctcattcttcttatatgcccagc 369  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||    
T  26698835 gttgggcttgcttatacaactattctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctcattcttcttttatatccagc 26698736  T
Q  370 acgaattctagcagcccttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 422  Q
      |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26698735 ctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 26698683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 171 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 40051909 - 40051658
Alignment:
Q  171 cagaaacaatgataatatttataaatgaaggttaaggtacaaagataagactacacagaacaaaagtaaaaa-caagctagagttgggtgtgcaactaag 269  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||| || |   ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  40051909 cagaaacaatgataatatatataaa-gaagattaagatacaaggacacagctacgaagaacaaaagtaaaaaacaagctagagttgggtgtgcaactaag 40051811  T
Q  270 gttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctcattcttcttatatgcccagc 369  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  |||||    
T  40051810 gttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctcattattcttttatatccagc 40051711  T
Q  370 acgaattctagcagcccttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 422  Q
      |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40051710 ctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 40051658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 169 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 8011897 - 8011641
Alignment:
Q  169 ttcagaaacaatgataatatttata--aatgaaggttaaggtacaaagataagactacacagaacaaaagtaaaaa-caagctagagttgggtgtgcaac 265  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  ||  ||| ||||| |||||||| |   ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8011897 ttcagaaacaatgataatatatatagaaagaaagattaagatacaaagacacagctactaagaacaaaagtaaaaaacaagctagagttgggtgtgcaac 8011798  T
Q  266 taaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctcattcttcttatatgcc 365  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||  |    
T  8011797 taaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctctcattcttcttttatatc 8011698  T
Q  366 cagcacgaattctagcagcccttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 422  Q
    ||||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8011697 cagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 8011641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 171 - 422
Target Start/End: Original strand, 24735831 - 24736082
Alignment:
Q  171 cagaaacaatgataatatttataaatgaaggttaaggtacaaagataagactacacagaacaaaagtaaaa-acaagctagagttgggtgtgcaactaag 269  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||| || |   ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24735831 cagaaacaatgataatatatataaa-gaagattaagatacaaggacacagctacgaagaacaaaagtaaaaaacaagctagagttgggtgtgcaactaag 24735929  T
Q  270 gttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctcattcttcttatatgcccagc 369  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||   |||||    
T  24735930 gttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctcattcttcgtttaaatccagc 24736029  T
Q  370 acgaattctagcagcccttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 422  Q
      |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24736030 ctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 24736082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 171 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 26399902 - 26399650
Alignment:
Q  171 cagaaacaatgataatatttataaatgaaggttaaggtacaaagataagactacacagaacaaaagtaaaaa-caagctagagttgggtgtgcaactaag 269  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||| |||||||| |   ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26399902 cagaaacaatgataatatatataaagaaagattaagatacaaagacacagctactaagaacaaaagtaaaaaacaagctagagttgggtgtgcaactaag 26399803  T
Q  270 gttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctcattcttcttatatgcccagc 369  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||   |||||    
T  26399802 gttgggcttgcttatacaacagttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctcattcttcgtttaaatccagc 26399703  T
Q  370 acgaattctagcagcccttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 422  Q
      |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26399702 ctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 26399650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 171 - 422
Target Start/End: Original strand, 11097114 - 11097370
Alignment:
Q  171 cagaaacaatgataatatttataaatgaaggttaaggtacaaagataagactacacagaacaaaagtaaaa----acaagctagagttgggtgtgcaact 266  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||| |||||||| |   ||||  |||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||    
T  11097114 cagaaacaatgataatatatataaagaaagattaagatacaaagacacagctactaagaacaaaagtaaaaaaaaacaagctagagttgggtgtgcaact 11097213  T
Q  267 aaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctcattcttcttatatgccc 366  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||    
T  11097214 aaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctcattcttcttttatatcc 11097313  T
Q  367 agcacgaattctagcagcc-cttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 422  Q
    |||  |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11097314 agcctgaattctagcagccactagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 11097370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 253 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 21002131 - 21001962
Alignment:
Q  253 ttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctcatt 352  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21002131 ttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaagagatacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcatt 21002032  T
Q  353 cttcttatatgcccagcacgaattctagcagcccttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 422  Q
    |||||| ||  ||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21002031 cttcttttaaacccagcatgaattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 21001962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 254 - 422
Target Start/End: Original strand, 5686723 - 5686891
Alignment:
Q  254 tgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctcattc 353  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5686723 tgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaagagatacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcattc 5686822  T
Q  354 ttcttatatgcccagcacgaattctagcagcccttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 422  Q
    ||||| ||  ||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5686823 ttcttttaaacccagcatgaattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 5686891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 254 - 422
Target Start/End: Original strand, 9434427 - 9434595
Alignment:
Q  254 tgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctcattc 353  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9434427 tgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaagagatacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcattc 9434526  T
Q  354 ttcttatatgcccagcacgaattctagcagcccttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 422  Q
    ||||| ||  ||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9434527 ttcttttaaacccagcatgaattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 9434595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 254 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 6876965 - 6876797
Alignment:
Q  254 tgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctcattc 353  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6876965 tgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttgtacatctgttccaaaagatacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcattc 6876866  T
Q  354 ttcttatatgcccagcacgaattctagcagcccttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 422  Q
    ||||| ||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6876865 ttcttttatacccagcatgaattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 6876797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 252 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 19993140 - 19992970
Alignment:
Q  252 gttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctcat 351  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  19993140 gttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaagagatacttaatttgctcatccttcttcttaagtaactcatccttttctctcat 19993041  T
Q  352 tcttcttatatgcccagcacgaattctagcagcccttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 422  Q
    ||||||| |    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19993040 tcttcttttgaatccagcatgaattctagcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 19992970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 256 - 422
Target Start/End: Original strand, 22090372 - 22090538
Alignment:
Q  256 ggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctcattctt 355  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||| || |||||||||||||  ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  22090372 ggtgtgcaactaaggttgggtttgcttgtacatctgttccaatagatacttgatttgctcatccttctttttgagtagctcatccttttccctcattctt 22090471  T
Q  356 cttatatgcccagcacgaattctagcagcccttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 422  Q
    ||| ||| ||||||| ||||||| |  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22090472 cttttatacccagcatgaattctggttgcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 22090538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 258 - 422
Target Start/End: Original strand, 4213219 - 4213383
Alignment:
Q  258 tgtgcaactaaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctcattcttct 357  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||| |||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4213219 tgtgcaactaaggttgggtttgcttgtacatctgttccaatagatacttgattttctcatccttcttcttgagtagctcatcattttccctcattcttct 4213318  T
Q  358 tatatgcccagcacgaattctagcagcccttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 422  Q
    | ||| ||||||| ||||||| |  |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4213319 tttatacccagcatgaattcttgatgcccttgtaatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 4213383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 258 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 17959793 - 17959629
Alignment:
Q  258 tgtgcaactaaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctcattcttct 357  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||| |||||| || |||||||||||||  ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17959793 tgtgcaactaaggttgggtttgcttgtacatctgttccaatagatacttgatttgctcatccttctttttgagtagctcatccttttccctcattcttct 17959694  T
Q  358 tatatgcccagcacgaattctagcagcccttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 422  Q
    | | | ||||||| ||||||| |  ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17959693 tttgtacccagcatgaattcttgttgcccttgagatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 17959629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 260 - 422
Target Start/End: Original strand, 8618587 - 8618749
Alignment:
Q  260 tgcaactaaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctcattcttctta 359  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||| |||||| || |||||||||||||  ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  8618587 tgcaactaaggttgggtttgcttgtacatctgttccaatagatacttgatttgctcatccttctttttgagtagctcatccttttccctcattcttattt 8618686  T
Q  360 tatgcccagcacgaattctagcagcccttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 422  Q
    | | ||||||| ||||||| |  ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8618687 tgtacccagcatgaattcttgttgcccttgagatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 8618749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 258 - 422
Target Start/End: Original strand, 168090 - 168254
Alignment:
Q  258 tgtgcaactaaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctcattcttct 357  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||| |||||| || |||||||||||||  ||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  168090 tgtgcaactaaggttgggtttgcttgtacatctgttccaatagatacttgatttgctcatccttctttttgagtagctcatctttttccctcaatcttct 168189  T
Q  358 tatatgcccagcacgaattctagcagcccttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 422  Q
    | | | ||||||| ||||||| |  ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  168190 tttgtacccagcatgaattcttgttgcccttgagatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 168254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 34)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 72 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 35225419 - 35225090
Alignment:
Q  72 aaataaaaacataagaagtatcagagcaagaagtattagatcataggatattaaaaacaataaatatcattagagttaaaagaatagaacataatatttc 171  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||         
T  35225419 aaataaaaacataataagtatcagagcaagaagtatcagagcatatgacattaaaatcaataaatatcattagagttaaaa-aatagaacataat----- 35225326  T
Q  172 agaaacaatgataatatttataaatgaaggttaaggtacaaagataagactacacagaacaaaagtaaaaacaagctagagttgggtgtgcaactaaggt 271  Q
                   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35225325 ---------------atttataaatgaaggttaaggtacaaagataagactacacagaacaaaagtaaaaacaagctagagttgggtgtgcaactaaggt 35225241  T
Q  272 tgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctcattcttcttatatgcccagcac 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  35225240 tgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgatctgttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctcattcttcttacatgcccagcat 35225141  T
Q  372 gaattctagcagcccttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 422  Q
    |||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35225140 gaatccttgcagctcttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 35225090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 51 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 36697595 - 36697303
Alignment:
Q  51 agagtagcagagcatataaccaaataaaaacataagaagtatcagagcaagaagtattagatcataggatattaaaaacaataaatatcattagagtt-a 149  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  36697595 agagtagcagagcatataaccaaataaaaacataagaagtatcagagcaagaagtatcagagcatatgacattaaaatcaataaatatcattagagttta 36697496  T
Q  150 aaagaatagaacataatatttcagaaacaatgataatatttataaatgaaggttaaggtacaaagataagactacacagaacaaaagtaaaaacaagcta 249  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  36697495 aaagaaaagagcataatatttcagaaacaatgataatatttataaagaaaggttaaggtacaaggataaaactacacagaacaaaagtaagaacaagcta 36697396  T
Q  250 gagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttcttaagtagctcatcctt 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||    | || | |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  36697395 gagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttcttcaactgttctaagagaagtctaatctgttcatccttcttctgaagtagctcatcctt 36697303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 169 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 9345822 - 9345568
Alignment:
Q  169 ttcagaaacaatgataatatttataaatgaaggttaaggtacaaagataagactacacagaacaaaagtaaaaa-caagctagagttgggtgtgcaacta 267  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||| |||||||| |   ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9345822 ttcagaaacaatgataatatatataaagaaagattaagatacaaagacacagctactaagaacaaaagtaaaaaacaagctagagttgggtgtgcaacta 9345723  T
Q  268 aggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctcattcttcttatatgccca 367  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||    
T  9345722 aggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctaaagtagctcatccttttccctcattcttcttttatatcca 9345623  T
Q  368 gcacgaattctagcagcccttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 422  Q
    ||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9345622 gcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 9345568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 171 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 23371789 - 23371537
Alignment:
Q  171 cagaaacaatgataatatttataaatgaaggttaaggtacaaagataagactacacagaacaaaagtaaaaa-caagctagagttgggtgtgcaactaag 269  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||| |||||||| |   ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23371789 cagaaacaatgataatatatataaagaaagattaagatacaaagacacagctactaagaacaaaagtaaaaaacaagctagagttgggtgtgcaactaag 23371690  T
Q  270 gttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctcattcttcttatatgcccagc 369  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||    
T  23371689 gttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctcattcttcttttatatccagc 23371590  T
Q  370 acgaattctagcagcccttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 422  Q
      |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23371589 ctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 23371537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 171 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 23706636 - 23706384
Alignment:
Q  171 cagaaacaatgataatatttataaatgaaggttaaggtacaaagataagactacacagaacaaaagtaaaaa-caagctagagttgggtgtgcaactaag 269  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||| |||||||| |   ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23706636 cagaaacaatgataatatatataaagaaagattaagatacaaagacacagctactaagaacaaaagtaaaaaacaagctagagttgggtgtgcaactaag 23706537  T
Q  270 gttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctcattcttcttatatgcccagc 369  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||    
T  23706536 gttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctcattcttcttttatatccagc 23706437  T
Q  370 acgaattctagcagcccttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 422  Q
      |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23706436 ctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 23706384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 171 - 422
Target Start/End: Original strand, 36583523 - 36583775
Alignment:
Q  171 cagaaacaatgataatatttataaatgaaggttaaggtacaaagataagactacacagaacaaaagtaaaa-acaagctagagttgggtgtgcaactaag 269  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||| |||||||| |   ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36583523 cagaaacaatgataatatatataaagaaagattaagatacaaagacacagctactaagaacaaaagtaaaaaacaagctagagttgggtgtgcaactaag 36583622  T
Q  270 gttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctcattcttcttatatgcccagc 369  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||    
T  36583623 gttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctcattcttcttttatatccagc 36583722  T
Q  370 acgaattctagcagcccttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 422  Q
      |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  36583723 ctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 36583775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 171 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 42052648 - 42052396
Alignment:
Q  171 cagaaacaatgataatatttataaatgaaggttaaggtacaaagataagactacacagaacaaaagtaaaaa-caagctagagttgggtgtgcaactaag 269  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||| |||||||| |   ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  42052648 cagaaacaatgataatatatataaagaaagattaagatacaaagacacagctactaagaacaaaagtaaaaaacaagctagagttgggtgtgcaactaag 42052549  T
Q  270 gttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctcattcttcttatatgcccagc 369  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||    
T  42052548 gttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctcattcttcttttatatccagc 42052449  T
Q  370 acgaattctagcagcccttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 422  Q
      |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  42052448 ctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 42052396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 171 - 420
Target Start/End: Original strand, 30228470 - 30228720
Alignment:
Q  171 cagaaacaatgataatatttataaatgaaggttaaggtacaaagataagactacacagaacaaaagtaaaa-acaagctagagttgggtgtgcaactaag 269  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||| |||||||| |   ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30228470 cagaaacaatgataatatatataaagaaagattaagatacaaagacacagctactaagaacaaaagtaaaaaacaagctagagttgggtgtgcaactaag 30228569  T
Q  270 gttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctcattcttcttatatgcccagc 369  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||    
T  30228570 gttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctcattcttcttttatatccagc 30228669  T
Q  370 acgaattctagcagcccttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagt 420  Q
      |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  30228670 ctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagt 30228720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 171 - 422
Target Start/End: Original strand, 24589078 - 24589330
Alignment:
Q  171 cagaaacaatgataatatttataaatgaaggttaaggtacaaagataagactacacagaacaaaagtaaaa-acaagctagagttgggtgtgcaactaag 269  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||| |||||||| |   ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24589078 cagaaacaatgataatatatataaagaaagattaagatacaaagacacagctactaagaacaaaagtaaaaaacaagctagagttgggtgtgcaactaag 24589177  T
Q  270 gttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctcattcttcttatatgcccagc 369  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||  |||||    
T  24589178 gttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttacctcattcttcttttatatccagc 24589277  T
Q  370 acgaattctagcagcccttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 422  Q
      |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24589278 ctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 24589330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 171 - 419
Target Start/End: Original strand, 15994307 - 15994556
Alignment:
Q  171 cagaaacaatgataatatttataaatgaaggttaaggtacaaagataagactacacagaacaaaagtaaaa-acaagctagagttgggtgtgcaactaag 269  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| |||||||| ||  ||||  ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15994307 cagaaacaatgataatatatataaagaaaggttaagatacaaagacaaagctactaagaacaaaagtaaaaaacaagctagtgttgggtgtgcaactaag 15994406  T
Q  270 gttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctcattcttcttatatgcccagc 369  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | | | ||| ||||||||||    
T  15994407 gttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatctttcttctgaagtagctcatcattttcccttaatttccttttatgcccagc 15994506  T
Q  370 acgaattctagcagcccttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggag 419  Q
    | ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||    
T  15994507 atgaattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagtaaggag 15994556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 171 - 422
Target Start/End: Original strand, 14559082 - 14559334
Alignment:
Q  171 cagaaacaatgataatatttataaatgaaggttaaggtacaaagataagactacacagaacaaaagtaaaa-acaagctagagttgggtgtgcaactaag 269  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||| |||||||| |   ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14559082 cagaaacaatgataatatatataaagaaagattaagatacaaagacacagctactgagaacaaaagtaaaaaacaagctagagttgggtgtgcaactaag 14559181  T
Q  270 gttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctcattcttcttatatgcccagc 369  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||   |||||    
T  14559182 gttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctcattcttcgtttaaatccagc 14559281  T
Q  370 acgaattctagcagcccttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 422  Q
      |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14559282 ctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 14559334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 169 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 15768624 - 15768368
Alignment:
Q  169 ttcagaaacaatgataatatttata--aatgaaggttaaggtacaaagataagactacacagaacaaaagtaaaaa-caagctagagttgggtgtgcaac 265  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  ||  ||| ||||| |||||||| |   ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15768624 ttcagaaacaatgataatatatatagaaagaaagattaagatacaaagacacagctactaagaacaaaagtaaaaaacaagctagagttgggtgtgcaac 15768525  T
Q  266 taaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctcattcttcttatatgcc 365  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||  |    
T  15768524 taaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctctcattcttcttttatatc 15768425  T
Q  366 cagcacgaattctagcagcccttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 422  Q
    ||||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15768424 cagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 15768368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 171 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 6985577 - 6985326
Alignment:
Q  171 cagaaacaatgataatatttataaatgaaggttaaggtacaaagataagactacacagaacaaaagtaaaaa-caagctagagttgggtgtgcaactaag 269  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||| || |   ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6985577 cagaaacaatgataatatatataaa-gaagattaagatacaaggacacagctacgaagaacaaaagtaaaaaacaagctagagttgggtgtgcaactaag 6985479  T
Q  270 gttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctcattcttcttatatgcccagc 369  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||   |||||    
T  6985478 gttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctcattcttcgtttaaatccagc 6985379  T
Q  370 acgaattctagcagcccttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 422  Q
      |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6985378 ctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 6985326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 171 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 14039876 - 14039625
Alignment:
Q  171 cagaaacaatgataatatttataaatgaaggttaaggtacaaagataagactacacagaacaaaagtaaaaa-caagctagagttgggtgtgcaactaag 269  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||| || |   ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14039876 cagaaacaatgataatatatataaa-gaagattaagatacaaggacacagctacgaagaacaaaagtaaaaaacaagctagagttgggtgtgcaactaag 14039778  T
Q  270 gttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctcattcttcttatatgcccagc 369  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||   |||||    
T  14039777 gttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctcattcttcgtttaaatccagc 14039678  T
Q  370 acgaattctagcagcccttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 422  Q
      |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14039677 ctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 14039625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 171 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 22685282 - 22685031
Alignment:
Q  171 cagaaacaatgataatatttataaatgaaggttaaggtacaaagataagactacacagaacaaaagtaaaaa-caagctagagttgggtgtgcaactaag 269  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||| || |   ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22685282 cagaaacaatgataatatatataaa-gaagattaagatacaaggacacagctacgaagaacaaaagtaaaaaacaagctagagttgggtgtgcaactaag 22685184  T
Q  270 gttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctcattcttcttatatgcccagc 369  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||   |||||    
T  22685183 gttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctcattcttcgtttaaatccagc 22685084  T
Q  370 acgaattctagcagcccttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 422  Q
      |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22685083 ctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 22685031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 171 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 23306125 - 23305874
Alignment:
Q  171 cagaaacaatgataatatttataaatgaaggttaaggtacaaagataagactacacagaacaaaagtaaaaa-caagctagagttgggtgtgcaactaag 269  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||| || |   ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23306125 cagaaacaatgataatatatataaa-gaagattaagatacaaggacacagctacgaagaacaaaagtaaaaaacaagctagagttgggtgtgcaactaag 23306027  T
Q  270 gttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctcattcttcttatatgcccagc 369  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||   |||||    
T  23306026 gttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctcattcttcgtttaaatccagc 23305927  T
Q  370 acgaattctagcagcccttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 422  Q
      |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23305926 ctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 23305874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 171 - 418
Target Start/End: Original strand, 24817866 - 24818113
Alignment:
Q  171 cagaaacaatgataatatttataaatgaaggttaaggtacaaagataagactacacagaacaaaagtaaaa-acaagctagagttgggtgtgcaactaag 269  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||| || |   ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24817866 cagaaacaatgataatatatataaa-gaagattaagatacaaggacacagctacgaagaacaaaagtaaaaaacaagctagagttgggtgtgcaactaag 24817964  T
Q  270 gttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctcattcttcttatatgcccagc 369  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||  |||||    
T  24817965 gttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctcattcttcgtttatatccagc 24818064  T
Q  370 acgaattctagcagcccttgtgatatactcttcttcaggatagaaagga 418  Q
      |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  24818065 ctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaagga 24818113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 171 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 27469840 - 27469589
Alignment:
Q  171 cagaaacaatgataatatttataaatgaaggttaaggtacaaagataagactacacagaacaaaagtaaaaa-caagctagagttgggtgtgcaactaag 269  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||| || |   ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27469840 cagaaacaatgataatatatataaa-gaagattaagatacaaggacacagctacgaagaacaaaagtaaaaaacaagctagagttgggtgtgcaactaag 27469742  T
Q  270 gttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctcattcttcttatatgcccagc 369  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||   |||||    
T  27469741 gttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctcattcttcgtttaaatccagc 27469642  T
Q  370 acgaattctagcagcccttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 422  Q
      |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27469641 ctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 27469589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 171 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 31843245 - 31842993
Alignment:
Q  171 cagaaacaatgataatatttataaatgaaggttaaggtacaaagataagactacacagaacaaaagtaaaaa-caagctagagttgggtgtgcaactaag 269  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| |||||||| ||  ||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  31843245 cagaaacaatgataatatatataaagaaaggttaagatacaaagacaaagctactaagaacaaaagtaaaaaacaagctagtgttgggtgtgcaactaag 31843146  T
Q  270 gttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctcattcttcttatatgcccagc 369  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| |  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | | ||| ||||||||||    
T  31843145 gttgggcttgcttatacaactattctaagaaatacttgatctgatcatctttcttctgaagtagctcatccttttcccttaatttccttttatgcccagc 31843046  T
Q  370 acgaattctagcagcccttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 422  Q
    | ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||    
T  31843045 atgaattcttgcagctcttgtgatgtactcttcttctggatagtaaggagtga 31842993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 169 - 422
Target Start/End: Original strand, 37730970 - 37731228
Alignment:
Q  169 ttcagaaacaatgataatatttata---aatgaagg-ttaaggtacaaagataagactacacagaacaaaagtaaaa-acaagctagagttgggtgtgca 263  Q
    |||||||||||||||||||| ||||   || ||||| ||||| |||||||| |   ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  37730970 ttcagaaacaatgataatatatatatagaaagaaggattaagatacaaagacacagctactaagaacaaaagtaaaaaacaagctagagttgggtgtgca 37731069  T
Q  264 actaaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctcattcttcttatatg 363  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||     
T  37731070 actaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctctcattcttcttttata 37731169  T
Q  364 cccagcacgaattctagcagcccttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 422  Q
     |||||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37731170 tccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 37731228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 169 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 17728762 - 17728504
Alignment:
Q  169 ttcagaaacaatgataatatttata---aatgaagg-ttaaggtacaaagataagactacacagaacaaaagtaaaaa-caagctagagttgggtgtgca 263  Q
    |||||||||||||||||||| ||||   || ||||| ||||| |||||||| |   ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17728762 ttcagaaacaatgataatatatatatagaaagaaggattaagatacaaagacacagctactaagaacaaaagtaaaaaacaagctagagttgggtgtgca 17728663  T
Q  264 actaaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctcattcttcttatatg 363  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| | |     
T  17728662 actaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctctcattcttcttttgta 17728563  T
Q  364 cccagcacgaattctagcagcccttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 422  Q
     |||||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17728562 tccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 17728504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 169 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 31358379 - 31358121
Alignment:
Q  169 ttcagaaacaatgataatatttata---aatgaagg-ttaaggtacaaagataagactacacagaacaaaagtaaaaa-caagctagagttgggtgtgca 263  Q
    |||||||||||||||||||| ||||   || ||||| ||||| |||||||| |   ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31358379 ttcagaaacaatgataatatatatatagaaagaaggattaagatacaaagacacagctactaagaacaaaagtaaaaaacaagctagagttgggtgtgca 31358280  T
Q  264 actaaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctcattcttcttatatg 363  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| | |     
T  31358279 actaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctctcattcttcttttgta 31358180  T
Q  364 cccagcacgaattctagcagcccttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 422  Q
     |||||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31358179 tccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 31358121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 171 - 422
Target Start/End: Original strand, 39491912 - 39492163
Alignment:
Q  171 cagaaacaatgataatatttataaatgaaggttaaggtacaaagataagactacacagaacaaaagtaaaa-acaagctagagttgggtgtgcaactaag 269  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||| || |   ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  39491912 cagaaacaatgataatatatataaa-gaagattaagatacaaggacacagctacgaagaacaaaagtaaaaaacaagctagagttgggtgtgcaactaag 39492010  T
Q  270 gttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctcattcttcttatatgcccagc 369  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| | ||   |||||    
T  39492011 gttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatcctttttcctcattcttcgtttaaatccagc 39492110  T
Q  370 acgaattctagcagcccttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 422  Q
      |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39492111 ctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 39492163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 227 - 422
Target Start/End: Original strand, 14448106 - 14448302
Alignment:
Q  227 agaacaaaagtaaaa-acaagctagagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttc 325  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||    
T  14448106 agaacaaaagtaaaaaacaagctagagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttc 14448205  T
Q  326 ttaagtagctcatccttttccctcattcttcttatatgcccagcacgaattctagcagcccttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 422  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| | ||   |||||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14448206 tgaagtagctcatccttttccctcattcttcgtttaaatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 14448302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 227 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 17616843 - 17616647
Alignment:
Q  227 agaacaaaagtaaaaa-caagctagagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttc 325  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||    
T  17616843 agaacaaaagtaaaaaacaagctagagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttc 17616744  T
Q  326 ttaagtagctcatccttttccctcattcttcttatatgcccagcacgaattctagcagcccttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 422  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||| | |  |||||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17616743 tgaagtagctcatccttttctctcattcttcttttgtatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 17616647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 169 - 422
Target Start/End: Original strand, 27043229 - 27043485
Alignment:
Q  169 ttcagaaacaatgataatatttata--aatgaaggttaaggtacaaagataagactacacagaacaaaagtaaaaa-caagctagagttgggtgtgcaac 265  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  ||  ||| ||||| |||||||| |   ||||  |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||    
T  27043229 ttcagaaacaatgataatatatatagaaagaaagattaagatacaaagacacagctactaagaacaaaagtaaaaaacaagttggagttgggtgtgcaac 27043328  T
Q  266 taaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctcattcttcttatatgcc 365  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||   |    
T  27043329 taaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctcattcttcgtttaaatc 27043428  T
Q  366 cagcacgaattctagcagcccttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 422  Q
    ||||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27043429 cagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 27043485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 255 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 39361443 - 39361276
Alignment:
Q  255 gggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctcattct 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||| ||||  ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  39361443 gggtgtgcaactaaggttgggcttgcttgtacatctgttccaaaagatacttaatttgctcatcattcttcttgagtagctcatccttttccctcattct 39361344  T
Q  355 tcttatatgcccagcacgaattctagcagcccttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 422  Q
    |||| ||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||    
T  39361343 tcttttatacccagcatgaattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctgggtagaaaggagtga 39361276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 252 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 31447682 - 31447512
Alignment:
Q  252 gttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctcat 351  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || | |||||| ||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  31447682 gttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaatatacttaatttgctcatccttcttctgaagtagctcatccttttctctcat 31447583  T
Q  352 tcttcttatatgcccagcacgaattctagcagcccttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 422  Q
    ||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31447582 tcttcttttaaacccagcatgaattctagcagcccttgtaatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 31447512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 254 - 422
Target Start/End: Original strand, 5291675 - 5291843
Alignment:
Q  254 tgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctcattc 353  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5291675 tgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctattccaagagatacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcattc 5291774  T
Q  354 ttcttatatgcccagcacgaattctagcagcccttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 422  Q
    ||||| ||  ||||||| ||||||| ||||||||| | || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5291775 ttcttttaaacccagcatgaattcttgcagcccttataatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 5291843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 254 - 422
Target Start/End: Original strand, 27604554 - 27604722
Alignment:
Q  254 tgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctcattc 353  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27604554 tgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttgtacatctgttccaaaagatacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcattc 27604653  T
Q  354 ttcttatatgcccagcacgaattctagcagcccttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 422  Q
    ||||| ||  ||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27604654 ttcttttaaacccagcatgaattcttgcagtccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 27604722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 256 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 40400161 - 40399995
Alignment:
Q  256 ggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctcattctt 355  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| || |||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  40400161 ggtgtgcaactagggttgggcttgcttgtacatctgttccaaaagatacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcattctt 40400062  T
Q  356 cttatatgcccagcacgaattctagcagcccttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 422  Q
    ||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||    
T  40400061 cttttatacccagcatgaattcttgcagcccttgtaatgtattcttcttctggatagaaaggagtga 40399995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 258 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 22156244 - 22156080
Alignment:
Q  258 tgtgcaactaaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctcattcttct 357  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||| |||||| || |||||||||||||  ||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  22156244 tgtgcaactaaggttgggtttgcttgtacatctgttccaatagatacttgatttgctcatccttctttttgagtagctcatctttttccctcaatcttct 22156145  T
Q  358 tatatgcccagcacgaattctagcagcccttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 422  Q
    | | | ||||||| ||||||| |  ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22156144 tttgtacccagcatgaattcttgttgcccttgagatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 22156080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 240 - 389
Target Start/End: Original strand, 1110282 - 1110431
Alignment:
Q  240 aaacaagctagagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttcttaagtagctcatc 339  Q
    |||||||| | | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| || |||||||| ||||  ||||| ||||||| |||| | |||||    
T  1110282 aaacaagcaaaaattgggtgtgcaactaaggtttggcttgcttatacaactgttccaatagatacttaatttgctcatccttcttctgaagttgttcatc 1110381  T
Q  340 cttttccctcattcttcttatatgcccagcacgaattctagcagcccttg 389  Q
    |||| | |||| ||| ||| |   ||||||| |||||||||||| |||||    
T  1110382 ctttgctctcagtctacttttcaacccagcatgaattctagcagtccttg 1110431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 240 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 20796831 - 20796650
Alignment:
Q  240 aaacaagctagagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttcttaagtagctcatc 339  Q
    |||||||| | | |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| || ||||| || || |  ||||| ||||||| |||| | |||||    
T  20796831 aaacaagcaacatttgggtgtgcaactaaggtttggctagcttatacatctgttccaaaagatatttaatctgctcatccttcttctgaagttgttcatc 20796732  T
Q  340 cttttccctcattcttcttatatgcccagcacgaattctagcagcccttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtg 421  Q
    |||| | |||| ||||||| |   ||| ||  |||||||| |||  ||||  || ||||| ||||| |||||||||||||||    
T  20796731 ctttgctctcagtcttcttttcaacccggcttgaattctaacagttcttgaaatgtactcatcttctggatagaaaggagtg 20796650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 23)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 50 - 342
Target Start/End: Original strand, 4631834 - 4632127
Alignment:
Q  50 cagagtagcagagcatataaccaaataaaaacataagaagtatcagagcaagaagtattagatcataggatattaaaaacaataaatatcattagagtt- 148  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||| ||||||||||||||||||||     
T  4631834 cagagtagcagagcatataaccaaataaaaacataagaagtatcagagcaagaagtatcagagcatatgacattaaaatcaataaatatcattagagttt 4631933  T
Q  149 aaaagaatagaacataatatttcagaaacaatgataatatttataaatgaaggttaaggtacaaagataagactacacagaacaaaagtaaaaacaagct 248  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4631934 aaaagaaaagagcataatatttcagaaacaatgataatatttataaagaaaggttaaggtacaaggataaaactacacagaacaaaagtaagaacaagct 4632033  T
Q  249 agagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttcttaagtagctcatcctt 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||    | || | |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  4632034 agagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttcttcaactgttctaagagaagtctaatctgttcatccttcttctgaagtagctcatcctt 4632127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 51 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 32310942 - 32310650
Alignment:
Q  51 agagtagcagagcatataaccaaataaaaacataagaagtatcagagcaagaagtattagatcataggatattaaaaacaataaatatcattagagtt-a 149  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  32310942 agagtagcagagcatataaccaaataaaaacataagaagtatcagagcaagaagtatcagagcatatgacattaaaatcaataaatatcattagagttta 32310843  T
Q  150 aaagaatagaacataatatttcagaaacaatgataatatttataaatgaaggttaaggtacaaagataagactacacagaacaaaagtaaaaacaagcta 249  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32310842 aaagaaaagagcataatatttcagaaacaatgataatatttataaagaaaggttaaggtacaaggataaaactacacagaacaaaagtaagaacaagcta 32310743  T
Q  250 gagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttcttaagtagctcatcctt 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||    | || | |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  32310742 gagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttcttcaactgttctaagagaagtctaatctgttcatccttcttctgaagtagctcatcctt 32310650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 50 - 342
Target Start/End: Original strand, 27385360 - 27385653
Alignment:
Q  50 cagagtagcagagcatataaccaaataaaaacataagaagtatcagagcaagaagtattagatcataggatattaaaaacaataaatatcattagagtt- 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||| ||||||||||||||||||||     
T  27385360 cagagtagcagagcatataaccaaataaaaacagaagaagaatcagagcaagaagtatcagagcatatgacattaaaatcaataaatatcattagagttt 27385459  T
Q  149 aaaagaatagaacataatatttcagaaacaatgataatatttataaatgaaggttaaggtacaaagataagactacacagaacaaaagtaaaaacaagct 248  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27385460 aaaagaaaagagcataatatttcagaaacattgataatatttataaagaaaggttaaggtacaaggataaaactacacagaacaaaagtaaaaacaagct 27385559  T
Q  249 agagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttcttaagtagctcatcctt 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||    | || | |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  27385560 agagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttcttcaactgttctaagagaagtctaatctgttcatccttcttctgaagtagctcatcctt 27385653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 50 - 342
Target Start/End: Original strand, 27475773 - 27476066
Alignment:
Q  50 cagagtagcagagcatataaccaaataaaaacataagaagtatcagagcaagaagtattagatcataggatattaaaaacaataaatatcattagagtt- 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||| ||||||||||||||||||||     
T  27475773 cagagtagcagagcatataaccaaataaaaacagaagaagaatcagagcaagaagtatcagagcatatgacattaaaatcaataaatatcattagagttt 27475872  T
Q  149 aaaagaatagaacataatatttcagaaacaatgataatatttataaatgaaggttaaggtacaaagataagactacacagaacaaaagtaaaaacaagct 248  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27475873 aaaagaaaagagcataatatttcagaaacattgataatatttataaagaaaggttaaggtacaaggataaaactacacagaacaaaagtaaaaacaagct 27475972  T
Q  249 agagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttcttaagtagctcatcctt 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||    | || | |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  27475973 agagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttcttcaactgttctaagagaagtctaatctgttcatccttcttctgaagtagctcatcctt 27476066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 170 - 422
Target Start/End: Original strand, 12856014 - 12856267
Alignment:
Q  170 tcagaaacaatgataatatttataaatgaagg-ttaaggtacaaagataagactacacagaacaaaagtaaaa-acaagctagagttgggtgtgcaacta 267  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||| ||  ||||  ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  12856014 tcagaaacaatgataatatatataaa-gaaggattaagatacaaagacaaagctactaagaacaaaagtaaaaaacaagctagtgttgggtgtgcaacta 12856112  T
Q  268 aggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctcattcttcttatatgccca 367  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  12856113 aggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctcattcttcttttataccca 12856212  T
Q  368 gcacgaattctagcagcccttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 422  Q
    ||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12856213 gcctgaattctagcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 12856267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 169 - 422
Target Start/End: Original strand, 3662408 - 3662662
Alignment:
Q  169 ttcagaaacaatgataatatttataaatgaaggttaaggtacaaagataagactacacagaacaaaagtaaaa-acaagctagagttgggtgtgcaacta 267  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||| |||||||| |   ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3662408 ttcagaaacaatgataatatatataaagaaagattaagatacaaagacacagctactaagaacaaaagtaaaaaacaagctagagttgggtgtgcaacta 3662507  T
Q  268 aggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctcattcttcttatatgccca 367  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||    
T  3662508 aggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctcattcttcttttatatcca 3662607  T
Q  368 gcacgaattctagcagcccttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 422  Q
    ||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3662608 gcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 3662662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 171 - 422
Target Start/End: Original strand, 25788794 - 25789046
Alignment:
Q  171 cagaaacaatgataatatttataaatgaaggttaaggtacaaagataagactacacagaacaaaagtaaaa-acaagctagagttgggtgtgcaactaag 269  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||| |||||||| |   ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25788794 cagaaacaatgataatatatataaagaaagattaagatacaaagacacagctactaagaacaaaagtaaaaaacaagctagagttgggtgtgcaactaag 25788893  T
Q  270 gttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctcattcttcttatatgcccagc 369  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||    
T  25788894 gttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctcattcttcttttatatccagc 25788993  T
Q  370 acgaattctagcagcccttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 422  Q
      |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25788994 ctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 25789046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 171 - 422
Target Start/End: Original strand, 26865858 - 26866110
Alignment:
Q  171 cagaaacaatgataatatttataaatgaaggttaaggtacaaagataagactacacagaacaaaagtaaaa-acaagctagagttgggtgtgcaactaag 269  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||| ||||| || |   ||||  ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26865858 cagaaacaatgataatatatataaagaaagattaagatacaaggacatagctactaagaacaaaagtaaaaaacaagctagtgttgggtgtgcaactaag 26865957  T
Q  270 gttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctcattcttcttatatgcccagc 369  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||    
T  26865958 gttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctcattcttcttttatatccagc 26866057  T
Q  370 acgaattctagcagcccttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 422  Q
      |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26866058 ctgaattctagcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 26866110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 171 - 422
Target Start/End: Original strand, 27342794 - 27343045
Alignment:
Q  171 cagaaacaatgataatatttataaatgaaggttaaggtacaaagataagactacacagaacaaaagtaaaa-acaagctagagttgggtgtgcaactaag 269  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||| || |   ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27342794 cagaaacaatgataatatatataaa-gaagattaagatacaaggacacagctacgaagaacaaaagtaaaaaacaagctagagttgggtgtgcaactaag 27342892  T
Q  270 gttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctcattcttcttatatgcccagc 369  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||    
T  27342893 gttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctcattcttcttttatatccagc 27342992  T
Q  370 acgaattctagcagcccttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 422  Q
      |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27342993 ctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 27343045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 171 - 422
Target Start/End: Original strand, 27403534 - 27403785
Alignment:
Q  171 cagaaacaatgataatatttataaatgaaggttaaggtacaaagataagactacacagaacaaaagtaaaa-acaagctagagttgggtgtgcaactaag 269  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||| || |   ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27403534 cagaaacaatgataatatatataaa-gaagattaagatacaaggacacagctacgaagaacaaaagtaaaaaacaagctagagttgggtgtgcaactaag 27403632  T
Q  270 gttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctcattcttcttatatgcccagc 369  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||    
T  27403633 gttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctcattcttcttttatatccagc 27403732  T
Q  370 acgaattctagcagcccttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 422  Q
      |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27403733 ctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 27403785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 171 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 17983880 - 17983624
Alignment:
Q  171 cagaaacaatgataatatttataaatgaaggttaaggtacaaagataagactacacagaacaaaagt-----aaaaacaagctagagttgggtgtgcaac 265  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||| |||||||| |   ||||  |||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17983880 cagaaacaatgataatatatataaagaaagattaagatacaaagacacagctactaagaacaaaagtaaaaaaaaaacaagctagagttgggtgtgcaac 17983781  T
Q  266 taaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctcattcttcttatatgcc 365  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |    
T  17983780 taaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctcattcttcttttatatc 17983681  T
Q  366 cagcacgaattctagcagcccttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 422  Q
    ||||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17983680 cagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 17983624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 171 - 422
Target Start/End: Original strand, 26026486 - 26026737
Alignment:
Q  171 cagaaacaatgataatatttataaatgaaggttaaggtacaaagataagactacacagaacaaaagtaaaa-acaagctagagttgggtgtgcaactaag 269  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||| || |   ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26026486 cagaaacaatgataatatatataaa-gaagattaagatacaaggacacagctacgaagaacaaaagtaaaaaacaagctagagttgggtgtgcaactaag 26026584  T
Q  270 gttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctcattcttcttatatgcccagc 369  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||   |||||    
T  26026585 gttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctcattcttcgtttaaatccagc 26026684  T
Q  370 acgaattctagcagcccttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 422  Q
      |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26026685 ctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 26026737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 171 - 422
Target Start/End: Original strand, 16931460 - 16931712
Alignment:
Q  171 cagaaacaatgata-atatttataaatgaaggttaaggtacaaagataagactacacagaacaaaagtaaaa-acaagctagagttgggtgtgcaactaa 268  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| |||| ||||| ||||| || |   ||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16931460 cagaaacaatgatatatatatataaa-gaagattaagatacaaggacacagctactaagaacaaaagtaaaaaacaagctagagttgggtgtgcaactaa 16931558  T
Q  269 ggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctcattcttcttatatgcccag 368  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||||    
T  16931559 ggttgggcttgcttatacnactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctcattcttcgtttatatccag 16931658  T
Q  369 cacgaattctagcagcccttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 422  Q
    |  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16931659 cctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 16931712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 227 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 12726519 - 12726323
Alignment:
Q  227 agaacaaaagtaaaaa-caagctagagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttc 325  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||    
T  12726519 agaacaaaagtaaaaaacaagctagagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttc 12726420  T
Q  326 ttaagtagctcatccttttccctcattcttcttatatgcccagcacgaattctagcagcccttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 422  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| | ||   |||||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12726419 tgaagtagctcatccttttccctcattcttcgtttaaatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 12726323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 253 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 9122188 - 9122019
Alignment:
Q  253 ttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctcatt 352  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9122188 ttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaagagatacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcatt 9122089  T
Q  353 cttcttatatgcccagcacgaattctagcagcccttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 422  Q
    |||||| ||  ||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9122088 cttcttttaaacccagcatgaattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 9122019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 252 - 422
Target Start/End: Original strand, 27373931 - 27374101
Alignment:
Q  252 gttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctcat 351  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| ||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  27373931 gttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctctcat 27374030  T
Q  352 tcttcttatatgcccagcacgaattctagcagcccttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 422  Q
    ||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  27374031 tcttcttttatacccagcatgaattcttgcagcccttgtgatatactcttcttctagatagaaaggagtga 27374101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 252 - 422
Target Start/End: Original strand, 27464284 - 27464454
Alignment:
Q  252 gttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctcat 351  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| ||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  27464284 gttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaaaaggtacttaatttgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctctcat 27464383  T
Q  352 tcttcttatatgcccagcacgaattctagcagcccttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 422  Q
    ||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  27464384 tcttcttttatacccagcatgaattcttgcagcccttgtgatatactcttcttctagatagaaaggagtga 27464454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 254 - 422
Target Start/End: Original strand, 25590360 - 25590528
Alignment:
Q  254 tgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctcattc 353  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||  ||||| ||||||||||| || |||||||| || ||||| |    
T  25590360 tgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttctaagaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagaagttcatccttctctctcatcc 25590459  T
Q  354 ttcttatatgcccagcacgaattctagcagcccttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 422  Q
    ||||| ||  ||||||| | ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25590460 ttcttttaaacccagcatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 25590528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 258 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 34816825 - 34816661
Alignment:
Q  258 tgtgcaactaaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctcattcttct 357  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||| |||||| || |||||||||||||  ||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  34816825 tgtgcaactaaggttgggtttgcttgtacatctgttccaatagatacttgatttgctcatccttctttttgagtagctcatctttttccctcaatcttct 34816726  T
Q  358 tatatgcccagcacgaattctagcagcccttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 422  Q
    | | | ||||||| ||||||| |  ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34816725 tttgtacccagcatgaattcttgttgcccttgagatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 34816661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 260 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 32971526 - 32971364
Alignment:
Q  260 tgcaactaaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctcattcttctta 359  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||| |||||| || |||||||||||||  ||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||     
T  32971526 tgcaactaaggttgggtttgcttgtacatctgttccaatagatacttgatttgctcatccttctttttgagtagctcatcattttccctcaatcttcttt 32971427  T
Q  360 tatgcccagcacgaattctagcagcccttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 422  Q
    | | ||||||| ||||||| |  ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32971426 tgtacccagcatgaattcttgttgcccttgagatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 32971364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 254 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 7669466 - 7669375
Alignment:
Q  254 tgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttcttaagtagctcatccttttc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||||||||  ||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  7669466 tgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttgtacatctgttccaaaagatacttgatttgctcatccttcttcttgagtagctcatccttttc 7669375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 360 - 422
Target Start/End: Original strand, 27385692 - 27385754
Alignment:
Q  360 tatgcccagcacgaattctagcagcccttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 422  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| || ||| | || ||||||||||||||||    
T  27385692 tatgcccagcatgaattcttgcagctcttgtgatgtattctgcctctggatagaaaggagtga 27385754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 360 - 422
Target Start/End: Original strand, 27476105 - 27476167
Alignment:
Q  360 tatgcccagcacgaattctagcagcccttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 422  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| || ||| | || ||||||||||||||||    
T  27476105 tatgcccagcatgaattcttgcagctcttgtgatgtattctgcctctggatagaaaggagtga 27476167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 171; Significance: 1e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 50 - 342
Target Start/End: Original strand, 2243 - 2535
Alignment:
Q  50 cagagtagcagagcatataaccaaataaaaacataagaagtatcagagcaagaagtattagatcataggatattaaaaacaataaatatcattagagtt- 148  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||| ||||||||||||||||||||     
T  2243 cagagtagcagagcatataaccaaataaaa-cataagaagtatcagagcaagaagtatcagagcatatgacattaaaatcaataaatatcattagagttt 2341  T
Q  149 aaaagaatagaacataatatttcagaaacaatgataatatttataaatgaaggttaaggtacaaagataagacta-cacagaacaaaagtaaaaacaagc 247  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||| |||||||    
T  2342 aaaagaaaagagcataatatttcagaaacaatgataatatttataaagaaaggttaaggtacaaggataa-actaacacagaacaaaagtaagaacaagc 2440  T
Q  248 tagagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttcttaagtagctcatcctt 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||    | || | |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  2441 tagagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttcttcaactgttctaagagaagtctaatctgttcatccttcttctgaagtagctcatcctt 2535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 133; Significance: 5e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 171 - 422
Target Start/End: Original strand, 32231 - 32483
Alignment:
Q  171 cagaaacaatgataatatttataaatgaaggttaaggtacaaagataagactacacagaacaaaagtaaaa-acaagctagagttgggtgtgcaactaag 269  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||| |||||||| |   ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32231 cagaaacaatgataatatatataaagaaagattaagatacaaagacacagctactaagaacaaaagtaaaaaacaagctagagttgggtgtgcaactaag 32330  T
Q  270 gttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctcattcttcttatatgcccagc 369  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| | ||   |||||    
T  32331 gttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttttgaagtagctcatccttttccctcattcttcgtttaaatccagc 32430  T
Q  370 acgaattctagcagcccttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 422  Q
      |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32431 ctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 32483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0906 (Bit Score: 116; Significance: 7e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0906
Description:

Target: scaffold0906; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 51 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 3793 - 3430
Alignment:
Q  51 agagtagcagagcatataaccaaataaaaacataagaagtatcagagcaagaagtattagatcataggatattaaaaacaataaatatcattagagttaa 150  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||               |||| || ||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  3793 agagtagcagagcatataaccatataaaaacataagatgtatcaaag---------------cataagacattaaaaacaataaatatcatcagaattaa 3709  T
Q  151 aagaatagaacataatatttcagaaacaatgataatatttataaatgaag-gttaaggtacaaagataagactacacagaacaaaagt-------aaaaa 242  Q
    ||| ||||||||||  |||| | |||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||  ||||  |||||||||||       |||||    
T  3708 aagtatagaacatatgatttaataaacaatgataatatttataaa-gaagagttaagatacaaggataaagctactaagaacaaaagtaaaaaaaaaaaa 3610  T
Q  243 caagctagagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttcttaagtagctcatcctt 342  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||  |||| |  ||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  3609 aaagctagaattgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgctctaagagatatctgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatcctt 3510  T
Q  343 ttccctcattcttcttatatgcccagcacgaattctagcagcccttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 422  Q
    |||||| | | ||||  ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| || ||||| || || ||||| |||||||    
T  3509 ttcccttaattttctcttatgcccagcatgaattcttgcagctcttgtgatgtattcttcctctgggtagaagggagtga 3430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1216 (Bit Score: 84; Significance: 9e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold1216
Description:

Target: scaffold1216; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 254 - 421
Target Start/End: Original strand, 267 - 434
Alignment:
Q  254 tgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctcattc 353  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| || || ||||| ||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  267 tgggtgtgcaactaaggtttggcttgcttatacatttgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttctgaagtagctcatccttttctctcattc 366  T
Q  354 ttcttatatgcccagcacgaattctagcagcccttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtg 421  Q
    ||||| ||   |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||||||||||||    
T  367 ttcttttaaatccagcatgaattctagcagcccttgtaatgtactcttcttatggatagaaaggagtg 434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 61; Significance: 5e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 253 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 52649 - 52481
Alignment:
Q  253 ttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccctcatt 352  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||| || |||||||| ||||  ||||| ||||||| |||| | ||||||||| | |||| |    
T  52649 ttgggtgtgcaactaaggtttgacttgcttatacatctgttccaatagatacttaatttgctcatccttcttctgaagttgttcatcctttgctctcagt 52550  T
Q  353 cttcttatatgcccagcacgaattctagcagcccttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtg 421  Q
    || ||| |   ||||||| |||||||||||| |||||  || ||||| ||||| |||||||||||||||    
T  52549 ctacttttcaacccagcatgaattctagcagtccttgaaatgtactcatcttctggatagaaaggagtg 52481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0199 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0199
Description:

Target: scaffold0199; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 99 - 342
Target Start/End: Original strand, 23641 - 23892
Alignment:
Q  99 aagaagtattagatcataggatattaaaaacaataaatatcattagagttaaaagaatagaacataatatttcagaaacaatgataatatttataaatga 198  Q
    ||||| ||| ||| |||| |||||||||| |||||||||| || |||  |||||| ||||||||||  |||| | |||||||||||||||||||||| ||    
T  23641 aagaaatatcagagcataagatattaaaa-caataaatattatcagaagtaaaagtatagaacatatgatttaacaaacaatgataatatttataaa-ga 23738  T
Q  199 ag-gttaaggtacaaagataagactac-------acag--aacaaaagtaaaaacaagctagagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacag 288  Q
    || |||||| ||||| |||||  ||||       | ||  || ||||  |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| || |  |     
T  23739 agagttaagttacaaggataaagctactaaaagcaaagttaaaaaaaaaaaaaacaagctagtattgggtgtgcaactaaggttgggcttgtttctttaa 23838  T
Q  289 ctgttctaagagatacttgattttttcatctttcttcttaagtagctcatcctt 342  Q
    ||| ||||||||||   | || | |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  23839 ctgctctaagagatgtctaatctgttcatccttcttctgaagtagctcatcctt 23892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0199; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 360 - 422
Target Start/End: Original strand, 23931 - 23993
Alignment:
Q  360 tatgcccagcacgaattctagcagcccttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 422  Q
    |||||||||| |||||||||||||  |||||||| || ||| | || ||||||||||||||||    
T  23931 tatgcccagctcgaattctagcagatcttgtgatgtaatctgcctctggatagaaaggagtga 23993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0747
Description:

Target: scaffold0747; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 364 - 422
Target Start/End: Original strand, 3567 - 3625
Alignment:
Q  364 cccagcacgaattctagcagcccttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtga 422  Q
    ||||||| | ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3567 cccagcatgtattcttgcagctcttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtga 3625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0398 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0398
Description:

Target: scaffold0398; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 227 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 3442 - 3366
Alignment:
Q  227 agaacaaaagtaaaaacaagctagagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagata 303  Q
    ||||||||| |  |||||||| | | |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| || |||||    
T  3442 agaacaaaaatctaaacaagcaacatttgggtgtgcaactaaggtttggctagcttatacatctgttccaatagata 3366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0398; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 227 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 11697 - 11621
Alignment:
Q  227 agaacaaaagtaaaaacaagctagagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagata 303  Q
    ||||||||| |  |||||||| | | |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| || |||||    
T  11697 agaacaaaaatctaaacaagcaacatttgggtgtgcaactaaggtttggctagcttatacatctgttccaatagata 11621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University