View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF9839A_low_44 (Length: 415)

Name: NF9839A_low_44
Description: NF9839A
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF9839A_low_44
NF9839A_low_44
[»] chr3 (23 HSPs)
chr3 (20-402)||(55292325-55292707)
chr3 (61-402)||(54973244-54973586)
chr3 (61-402)||(54975854-54976196)
chr3 (61-402)||(54978464-54978806)
chr3 (20-402)||(10554262-10554635)
chr3 (20-256)||(16799640-16799876)
chr3 (65-256)||(10989622-10989812)
chr3 (66-256)||(603698-603885)
chr3 (66-256)||(15010208-15010395)
chr3 (78-256)||(54046607-54046782)
chr3 (20-256)||(2035036-2035263)
chr3 (20-256)||(2038543-2038770)
chr3 (20-256)||(2042284-2042511)
chr3 (20-256)||(14038017-14038244)
chr3 (20-256)||(14041485-14041712)
chr3 (20-256)||(18958736-18958963)
chr3 (63-155)||(39230602-39230693)
chr3 (20-126)||(6805873-6805982)
chr3 (75-136)||(10834231-10834292)
chr3 (93-126)||(9533379-9533412)
chr3 (20-49)||(54973230-54973259)
chr3 (20-49)||(54975840-54975869)
chr3 (20-49)||(54978450-54978479)
[»] chr6 (11 HSPs)
chr6 (20-402)||(8522749-8523132)
chr6 (20-406)||(15686017-15686392)
chr6 (20-256)||(2287966-2288202)
chr6 (20-256)||(15539104-15539340)
chr6 (20-256)||(16829638-16829865)
chr6 (20-256)||(16812618-16812845)
chr6 (20-256)||(16102183-16102410)
chr6 (20-155)||(12595797-12595925)
chr6 (20-149)||(29492595-29492717)
chr6 (72-136)||(23838104-23838168)
chr6 (20-51)||(1590542-1590573)
[»] chr2 (14 HSPs)
chr2 (20-405)||(21239023-21239409)
chr2 (20-402)||(21241576-21241959)
chr2 (20-402)||(24504520-24504903)
chr2 (20-402)||(20591006-20591388)
chr2 (61-402)||(31503458-31503799)
chr2 (61-402)||(31506024-31506365)
chr2 (63-256)||(28348947-28349139)
chr2 (66-256)||(12627942-12628129)
chr2 (20-155)||(41684914-41685042)
chr2 (64-256)||(44620806-44620995)
chr2 (20-147)||(23339328-23339446)
chr2 (20-147)||(31755778-31755896)
chr2 (75-136)||(21073620-21073681)
chr2 (72-136)||(9241856-9241920)
[»] chr5 (15 HSPs)
chr5 (20-402)||(29325141-29325524)
chr5 (20-402)||(26495703-26496086)
chr5 (20-256)||(4397549-4397776)
chr5 (63-256)||(22758711-22758903)
chr5 (26-155)||(23693304-23693426)
chr5 (20-255)||(26361136-26361361)
chr5 (20-149)||(16256091-16256213)
chr5 (20-149)||(22589888-22590010)
chr5 (20-149)||(22593443-22593565)
chr5 (20-149)||(22596998-22597120)
chr5 (20-148)||(16259725-16259846)
chr5 (20-147)||(43121017-43121135)
chr5 (20-147)||(43124550-43124668)
chr5 (99-147)||(22880138-22880186)
chr5 (293-366)||(27869316-27869390)
[»] chr4 (21 HSPs)
chr4 (20-402)||(41791489-41791872)
chr4 (20-402)||(14698535-14698916)
chr4 (20-402)||(4170843-4171224)
chr4 (20-402)||(53387621-53387997)
chr4 (20-402)||(16278011-16278385)
chr4 (63-256)||(56115656-56115848)
chr4 (20-256)||(286930-287157)
chr4 (20-256)||(15280136-15280362)
chr4 (20-256)||(28382664-28382891)
chr4 (20-256)||(47126878-47127105)
chr4 (20-155)||(16359344-16359472)
chr4 (20-147)||(31117194-31117312)
chr4 (20-147)||(33848748-33848866)
chr4 (20-147)||(55502889-55503007)
chr4 (20-155)||(10313555-10313683)
chr4 (262-342)||(21189768-21189848)
chr4 (75-136)||(24047427-24047488)
chr4 (20-67)||(9388310-9388357)
chr4 (20-88)||(15242314-15242382)
chr4 (59-117)||(15448273-15448331)
chr4 (75-117)||(15990201-15990242)
[»] chr7 (24 HSPs)
chr7 (20-402)||(16006235-16006618)
chr7 (20-402)||(21743206-21743587)
chr7 (20-400)||(8776180-8776558)
chr7 (20-402)||(17505688-17506064)
chr7 (20-402)||(17547150-17547526)
chr7 (20-258)||(38828065-38828302)
chr7 (61-256)||(35366101-35366293)
chr7 (20-256)||(13395517-13395744)
chr7 (64-161)||(21065304-21065400)
chr7 (20-256)||(48785153-48785380)
chr7 (64-256)||(13733586-13733774)
chr7 (20-147)||(124333-124451)
chr7 (99-147)||(4993397-4993445)
chr7 (20-126)||(709467-709573)
chr7 (20-126)||(41055512-41055615)
chr7 (75-126)||(14421882-14421933)
chr7 (75-126)||(47975822-47975873)
chr7 (75-136)||(11661204-11661265)
chr7 (20-126)||(16462073-16462176)
chr7 (26-117)||(12755568-12755659)
chr7 (20-117)||(44190789-44190889)
chr7 (60-117)||(14416355-14416412)
chr7 (60-117)||(39431767-39431824)
chr7 (72-120)||(147595-147643)
[»] chr8 (15 HSPs)
chr8 (20-400)||(45134828-45135209)
chr8 (20-402)||(6608175-6608556)
chr8 (61-402)||(7300983-7301322)
chr8 (255-402)||(21415147-21415294)
chr8 (63-256)||(363828-364020)
chr8 (20-256)||(24707859-24708087)
chr8 (63-256)||(44431901-44432093)
chr8 (63-155)||(22059542-22059633)
chr8 (64-256)||(22145439-22145628)
chr8 (20-147)||(17795238-17795356)
chr8 (20-147)||(17614759-17614879)
chr8 (99-147)||(28853862-28853910)
chr8 (20-49)||(7301307-7301336)
chr8 (60-117)||(18024576-18024633)
chr8 (72-120)||(27941716-27941764)
[»] scaffold0525 (2 HSPs)
scaffold0525 (20-402)||(8988-9371)
scaffold0525 (20-155)||(11026-11154)
[»] chr1 (16 HSPs)
chr1 (61-402)||(20579321-20579665)
chr1 (20-258)||(2333021-2333258)
chr1 (63-256)||(294075-294267)
chr1 (20-256)||(20631156-20631383)
chr1 (20-256)||(37358312-37358538)
chr1 (20-155)||(36181415-36181543)
chr1 (64-155)||(14432505-14432595)
chr1 (78-161)||(24087311-24087393)
chr1 (20-149)||(22900409-22900531)
chr1 (20-143)||(45307131-45307245)
chr1 (99-147)||(296431-296479)
chr1 (75-136)||(28312446-28312507)
chr1 (75-126)||(20438131-20438182)
chr1 (63-117)||(16400803-16400857)
chr1 (20-49)||(20579307-20579336)
chr1 (20-49)||(20587000-20587029)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (63-256)||(8548-8740)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (63-255)||(2379-2570)
[»] scaffold0586 (1 HSPs)
scaffold0586 (262-402)||(1914-2054)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (63-256)||(137815-138007)
[»] scaffold0023 (1 HSPs)
scaffold0023 (95-255)||(162355-162515)
[»] scaffold0021 (1 HSPs)
scaffold0021 (64-250)||(134027-134209)
[»] scaffold0131 (1 HSPs)
scaffold0131 (20-155)||(1540-1668)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (20-147)||(33007-33125)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (20-147)||(81687-81805)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (90-136)||(132864-132910)
[»] scaffold0337 (1 HSPs)
scaffold0337 (75-136)||(9847-9908)
[»] scaffold0026 (1 HSPs)
scaffold0026 (75-126)||(21170-21221)
[»] scaffold0070 (1 HSPs)
scaffold0070 (63-117)||(8193-8247)
[»] scaffold0453 (1 HSPs)
scaffold0453 (20-114)||(3131-3222)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 335; Significance: 0; HSPs: 23)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 55292707 - 55292325
Alignment:
Q  20 atcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacat 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55292707 atcaacatacaactcaactacgacaacgacaacataggcaacgacaacgacaacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacat 55292608  T
Q  120 caacaacctatgactccgttacttagaacgtcaacttgcaaccttacaacctgaatcaacatcttgtataatcccatggaatgcatttatgcataaacca 219  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  55292607 caacaacctatgactccgttacttggaacgacaacttgcaaccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgcatttatgcataaacca 55292508  T
Q  220 acaatcagcatcaaatcatattcaatcaacagcaacatatagtaataagcagcgagacaacaacgataataaccatcatatacaacaagtaggactcata 319  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55292507 acaatcagcagcaaatcatattcaatcaacagcaacatataataataagcagcgagacaacaacgataataaccatcatatacaacaagtaggactcata 55292408  T
Q  320 tcaacatctttcatgatatataactatctcctcatttgttcatcaacctaagtcgacgtcattaaacattataaacatcctct 402  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55292407 tcaacatctttcataatatataactatctcctcatttgttcatcaacctaagtcgacgtcattaaacattataaacatcctct 55292325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 61 - 402
Target Start/End: Original strand, 54973244 - 54973586
Alignment:
Q  61 caacaacgataacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgtcaacttgcaa 160  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  54973244 caactacgacaacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaa 54973343  T
Q  161 ccttacaacctgaatcaacatcttgtataatcccatggaatgcatttatgcataaaccaacaatcagcatcaaatcatattcaa-tcaacagcaacatat 259  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  54973344 ccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgcatttatgcataaaccaacaatcagcagcaaatcatattcaattcaacaacaacatat 54973443  T
Q  260 agtaataagcagcgagacaacaacgataataaccatcatatacaacaagtaggactcatatcaacatctttcatgatatataactatctcctcatttgtt 359  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  54973444 aataataagcagcgagacaacaacaataataaccatcatatacaacgagtaggactcatatcaacatctttcataatatataactatctcctcatttgtt 54973543  T
Q  360 catcaacctaagtcgacgtcattaaacattataaacatcctct 402  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  54973544 catcaacctaagtcgacgtcattaaacattacaaacatcctct 54973586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 61 - 402
Target Start/End: Original strand, 54975854 - 54976196
Alignment:
Q  61 caacaacgataacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgtcaacttgcaa 160  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  54975854 caactacgacaacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaa 54975953  T
Q  161 ccttacaacctgaatcaacatcttgtataatcccatggaatgcatttatgcataaaccaacaatcagcatcaaatcatattcaa-tcaacagcaacatat 259  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  54975954 ccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgcatttatgcataaaccaacaatcagcagcaaatcatattcaattcaacaacaacatat 54976053  T
Q  260 agtaataagcagcgagacaacaacgataataaccatcatatacaacaagtaggactcatatcaacatctttcatgatatataactatctcctcatttgtt 359  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  54976054 aataataagcagcgagacaacaacaataataaccatcatatacaacgagtaggactcatatcaacatctttcataatatataactatctcctcatttgtt 54976153  T
Q  360 catcaacctaagtcgacgtcattaaacattataaacatcctct 402  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  54976154 catcaacctaagtcgacgtcattaaacattacaaacatcctct 54976196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 61 - 402
Target Start/End: Original strand, 54978464 - 54978806
Alignment:
Q  61 caacaacgataacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgtcaacttgcaa 160  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  54978464 caactacgacaacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaa 54978563  T
Q  161 ccttacaacctgaatcaacatcttgtataatcccatggaatgcatttatgcataaaccaacaatcagcatcaaatcatattcaa-tcaacagcaacatat 259  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  54978564 ccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgcatttatgcataaaccaacaatcagcagcaaatcatattcaattcaacaacaacatat 54978663  T
Q  260 agtaataagcagcgagacaacaacgataataaccatcatatacaacaagtaggactcatatcaacatctttcatgatatataactatctcctcatttgtt 359  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  54978664 aataataagcagcgagacaacaacaataataaccatcatatacaacgagtaggactcatatcaacatctttcataatatataactatctcctcatttgtt 54978763  T
Q  360 catcaacctaagtcgacgtcattaaacattataaacatcctct 402  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  54978764 catcaacctaagtcgacgtcattaaacattacaaacatcctct 54978806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 20 - 402
Target Start/End: Original strand, 10554262 - 10554635
Alignment:
Q  20 atcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacat 119  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||       ||||||||||||| |   || |||||||||||||||||||||    
T  10554262 atcagcatacaactcaactacgacaacaacaacataggcaacgacaacgatc------gtgcataataactca---ctcactccccaacttggtcaacat 10554352  T
Q  120 caacaacctatgactccgttacttagaacgtcaacttgcaaccttacaacctgaatcaacatcttgtataatcccatggaatgcatttatgcataaacca 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||    
T  10554353 caacaacctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaaccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgcatttatccataaacca 10554452  T
Q  220 acaatcagcatcaaatcatattcaatcaacagcaacatatagtaataagcagcgagacaacaacgataataaccatcatatacaacaagtaggactcata 319  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10554453 acaatcagcagcaaatcatattcaatcaacagcaacatataataataagcagcgagacaacaacgataataaccatcatatacaacaagtaggactcata 10554552  T
Q  320 tcaacatctttcatgatatataactatctcctcatttgttcatcaacctaagtcgacgtcattaaacattataaacatcctct 402  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10554553 tcaacatctttcataatatataactatctcctcatttgttcatcaacctaagtcgacgtcaataaacattataaacatcctct 10554635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 20 - 256
Target Start/End: Original strand, 16799640 - 16799876
Alignment:
Q  20 atcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacat 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16799640 atcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggttaacat 16799739  T
Q  120 caacaacctatgactccgttacttagaacgtcaacttgcaaccttacaacctgaatcaacatcttgtataatcccatggaatgcatttatgcataaacca 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16799740 caacaacctatgactccgttacttagaacgtcaacttgcaaccttacaacctgaatcaacatcttgtataatcccatggaatgcatttatgcataaacca 16799839  T
Q  220 acaatcagcatcaaatcatattcaatcaacagcaaca 256  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16799840 acaatcaacatcaaatcatattcaatcaacaacaaca 16799876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 65 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 10989812 - 10989622
Alignment:
Q  65 aacgataacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgtcaacttgcaac-ct 163  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||  |    
T  10989812 aacgacaacaactgtgcataataact-atgacttactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactcctttacttagaacgacaacttgcaacttt 10989714  T
Q  164 tacaacctgaatcaacatcttgtataatcccatggaatgcatttatgcataaaccaacaatcagcatcaaatcatattcaatcaacagcaaca 256  Q
    ||||||  ||| | ||| ||||| || ||  |||||||||| |||  |||||| |||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||    
T  10989713 tacaactcgaacctacaccttgtgtattctaatggaatgcagttaaacataaatcaacaatcagcaac-aatcatactcaatcaacagcaaca 10989622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 66 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 603885 - 603698
Alignment:
Q  66 acgataacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgtcaacttgcaacctta 165  Q
    |||| |||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||    
T  603885 acgacaacgaccgtgcataataact-atgacatactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgacaactcgcaa-ctta 603788  T
Q  166 caacctgaatcaacatcttgtataatcccatggaatgcatttatgcataaaccaacaatcagcatcaaatcatattcaatcaacagcaaca 256  Q
    ||||  ||| ||||| ||| |||| ||  || ||||||| ||| |||||||||  |||||| || | ||||||| ||||||||||||||||    
T  603787 caactcgaaccaacaccttatatattctaattgaatgcagttaagcataaacctgcaatcatcaac-aatcataatcaatcaacagcaaca 603698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 66 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 15010395 - 15010208
Alignment:
Q  66 acgataacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgtcaacttgcaacctta 165  Q
    |||| |||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||    
T  15010395 acgacaacgaccgtgcataataact-atgacatactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgacaactctcaa-ctta 15010298  T
Q  166 caacctgaatcaacatcttgtataatcccatggaatgcatttatgcataaaccaacaatcagcatcaaatcatattcaatcaacagcaaca 256  Q
    ||||  ||| ||||| |||||||| ||  || ||||||| ||| |||||||||| |||||| || | ||||||| |||||||||| |||||    
T  15010297 caactcgaaccaacaccttgtatattctaattgaatgcagttaagcataaaccatcaatcatcaac-aatcataatcaatcaacaacaaca 15010208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 78 - 256
Target Start/End: Original strand, 54046607 - 54046782
Alignment:
Q  78 gtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgtcaacttgcaaccttacaacctgaatca 177  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||  ||| ||    
T  54046607 gtgcataataact-atgacatactccccaacttggtcaacatcaacaaactatgactccgttacttagaacgacaactcgcaa-cttacaactcgaacca 54046704  T
Q  178 acatcttgtataatcccatggaatgcatttatgcataaaccaacaatcagcatcaaatcatattcaatcaacagcaaca 256  Q
    ||| |||||||| ||  || ||||||| ||| ||||||||||||||||| || | ||||||| |||||||||| |||||    
T  54046705 acaccttgtatattctaattgaatgcagttaagcataaaccaacaatcatcaac-aatcataatcaatcaacaacaaca 54046782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 20 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 2035263 - 2035036
Alignment:
Q  20 atcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacat 119  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||      |||||| |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||    
T  2035263 atcagcatacaactcaactacgacaacgacaacatagg------caacgacaacgaccgtgcataataact-atgactcactccccaacttgatcaacat 2035171  T
Q  120 caacaacctatgactccgttacttagaacgtcaacttgcaaccttacaacctgaatcaacatcttgtataatcccatggaatgcatttatgcataaacca 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||  ||| |||||  ||||| | ||  || ||||||| ||| | ||||||||    
T  2035170 caacaacctatgactccgttacttagaacgacaactcgcca-cttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaacca 2035072  T
Q  220 acaatcagcatcaaatcatattcaatcaacagcaaca 256  Q
     | ||||  | | ||||||| ||||||||||||||||    
T  2035071 gcgatcattaac-aatcataatcaatcaacagcaaca 2035036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 20 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 2038770 - 2038543
Alignment:
Q  20 atcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacat 119  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||      |||||| |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||    
T  2038770 atcagcatacaactcaactacgacaacgacaacatagg------caacgacaacgaccgtgcataataact-atgactcactccccaacttgatcaacat 2038678  T
Q  120 caacaacctatgactccgttacttagaacgtcaacttgcaaccttacaacctgaatcaacatcttgtataatcccatggaatgcatttatgcataaacca 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||  ||| |||||  ||||| | ||  || ||||||| ||| | ||||||||    
T  2038677 caacaacctatgactccgttacttagaacgacaactcgcca-cttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaacca 2038579  T
Q  220 acaatcagcatcaaatcatattcaatcaacagcaaca 256  Q
     | ||||  | | ||||||| ||||||||||||||||    
T  2038578 gcgatcattaac-aatcataatcaatcaacagcaaca 2038543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 20 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 2042511 - 2042284
Alignment:
Q  20 atcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacat 119  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||      |||||| |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||    
T  2042511 atcagcatacaactcaactacgacaacgacaacatagg------caacgacaacgaccgtgcataataact-atgactcactccccaacttgatcaacat 2042419  T
Q  120 caacaacctatgactccgttacttagaacgtcaacttgcaaccttacaacctgaatcaacatcttgtataatcccatggaatgcatttatgcataaacca 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||  ||| |||||  ||||| | ||  || ||||||| ||| | ||||||||    
T  2042418 caacaacctatgactccgttacttagaacgacaactcgcca-cttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaacca 2042320  T
Q  220 acaatcagcatcaaatcatattcaatcaacagcaaca 256  Q
     | ||||  | | ||||||| ||||||||||||||||    
T  2042319 gcgatcattaac-aatcataatcaatcaacagcaaca 2042284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 20 - 256
Target Start/End: Original strand, 14038017 - 14038244
Alignment:
Q  20 atcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacat 119  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||      |||||| |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||    
T  14038017 atcagcatacaactcaactacgacaacgacaacatagg------caacgacaacgaccgtgcataataact-atgactcactccccaacttgatcaacat 14038109  T
Q  120 caacaacctatgactccgttacttagaacgtcaacttgcaaccttacaacctgaatcaacatcttgtataatcccatggaatgcatttatgcataaacca 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||  ||| |||||  ||||| | ||  || ||||||| ||| | ||||||||    
T  14038110 caacaacctatgactccgttacttagaacgacaactcgcca-cttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaacca 14038208  T
Q  220 acaatcagcatcaaatcatattcaatcaacagcaaca 256  Q
     | ||||  | | ||||||| ||||||||||||||||    
T  14038209 gcgatcattaac-aatcataatcaatcaacagcaaca 14038244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 20 - 256
Target Start/End: Original strand, 14041485 - 14041712
Alignment:
Q  20 atcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacat 119  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||      |||||| |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||    
T  14041485 atcagcatacaactcaactacgacaacgacaacatagg------caacgacaacgaccgtgcataataact-atgactcactccccaacttgatcaacat 14041577  T
Q  120 caacaacctatgactccgttacttagaacgtcaacttgcaaccttacaacctgaatcaacatcttgtataatcccatggaatgcatttatgcataaacca 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||  ||| |||||  ||||| | ||  || ||||||| ||| | ||||||||    
T  14041578 caacaacctatgactccgttacttagaacgacaactcgcca-cttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaacca 14041676  T
Q  220 acaatcagcatcaaatcatattcaatcaacagcaaca 256  Q
     | ||||  | | ||||||| ||||||||||||||||    
T  14041677 gcgatcattaac-aatcataatcaatcaacagcaaca 14041712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 20 - 256
Target Start/End: Original strand, 18958736 - 18958963
Alignment:
Q  20 atcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacat 119  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||      |||||| |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||| | |||||||    
T  18958736 atcagcatacaactcaactacgacaacgacaacatagg------caacgacaacgaccgtgcataataact-atgactcactccccaactagatcaacat 18958828  T
Q  120 caacaacctatgactccgttacttagaacgtcaacttgcaaccttacaacctgaatcaacatcttgtataatcccatggaatgcatttatgcataaacca 219  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| || | ||||||||  ||| |||||| ||||| | ||  || ||||||| ||| | |||| |||    
T  18958829 caacaacctataactacgttacttagaacgacaactcgcca-cttacaactcgaaccaacatattgtacattctaattgaatgcaattaagtataatcca 18958927  T
Q  220 acaatcagcatcaaatcatattcaatcaacagcaaca 256  Q
     | |||| || | ||||||| ||||||||||||||||    
T  18958928 gcgatcatcaac-aatcataatcaatcaacagcaaca 18958963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 63 - 155
Target Start/End: Original strand, 39230602 - 39230693
Alignment:
Q  63 acaacgataacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgtcaact 155  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  39230602 acaacgacaacgaccgtgcataataact-atgactcactccccaacttgatcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgacaact 39230693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 20 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 6805982 - 6805873
Alignment:
Q  20 atcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggta---acaacaacgataacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaa 116  Q
    |||||||||||||||| | ||  |||||||||| |||  |   ||||| |||| ||| ||| |||||||  | |||||||||||||| ||||||||||||    
T  6805982 atcaacatacaactcagcaacatcaacgacaatgtagacaacgacaacgacgacaacaactatgcataaataattatgacttactccacaacttggtcaa 6805883  T
Q  117 catcaacaac 126  Q
    ||||||||||    
T  6805882 catcaacaac 6805873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 75 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 10834292 - 10834231
Alignment:
Q  75 actgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactcc 136  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  10834292 actgtgcataaataattatgacttactccacaacttggtcgacatcaacaacttaagactcc 10834231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 93 - 126
Target Start/End: Original strand, 9533379 - 9533412
Alignment:
Q  93 tgacttactccccaacttggtcaacatcaacaac 126  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9533379 tgacttactccacaacttggtcaacatcaacaac 9533412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 49
Target Start/End: Original strand, 54973230 - 54973259
Alignment:
Q  20 atcaacatacaactcaactacgacaacgac 49  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54973230 atcaacatacaactcaactacgacaacgac 54973259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 49
Target Start/End: Original strand, 54975840 - 54975869
Alignment:
Q  20 atcaacatacaactcaactacgacaacgac 49  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54975840 atcaacatacaactcaactacgacaacgac 54975869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 49
Target Start/End: Original strand, 54978450 - 54978479
Alignment:
Q  20 atcaacatacaactcaactacgacaacgac 49  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54978450 atcaacatacaactcaactacgacaacgac 54978479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 320; Significance: 1e-180; HSPs: 11)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 20 - 402
Target Start/End: Original strand, 8522749 - 8523132
Alignment:
Q  20 atcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacat 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8522749 atcaacatacaactcaactacgacaacgacaacataggcaacaacaacgacaacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacat 8522848  T
Q  120 caacaacctatgactccgttacttagaacgtcaacttgcaaccttacaacctgaatcaacatcttgtataatcccatggaatgcatttatgcataaacca 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  8522849 caacaacctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaaccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgcatttatgcataaacca 8522948  T
Q  220 acaatcagcatcaaatcatattcaa-tcaacagcaacatatagtaataagcagcgagacaacaacgataataaccatcatatacaacaagtaggactcat 318  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8522949 acaatcagcagcaaatcatattcaattcaacaacaacatataataataagcagcgagacaacaacaataataaccatcatatacaacgagtaggactcat 8523048  T
Q  319 atcaacatctttcatgatatataactatctcctcatttgttcatcaacctaagtcgacgtcattaaacattataaacatcctct 402  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8523049 atcaacatctttcataatatataactatctcctcatttgttcatcaacctaagtcgacgtcattaaacattacaaacatcctct 8523132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 20 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 15686392 - 15686017
Alignment:
Q  20 atcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacat 119  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| |      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15686392 atcagcatacaactcaactacgacaacgacaacataggcaactacaacaa------ctgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacat 15686299  T
Q  120 caacaacctatgactccgttacttagaacgtcaacttgcaaccttacaacctgaatcaacatcttgtataatcccatggaatgcatttatgcataaacca 219  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||    
T  15686298 caacaacctaggactccgttacttagaacgacaacttgcaaccttacaaccggcaccaacatcttgtataatccaattgaatgcgtttatgcataaacca 15686199  T
Q  220 acaatcagcatcaaatcatattcaatcaacagcaacatatagtaataagcagcgagacaacaacgataataaccatcatatacaacaagtaggactcata 319  Q
    |||||||||| |||||     |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15686198 acaatcagcagcaaat-----tcaatcaacagcaacatataataataagcagcgagacaacagcaataataaccatcatatacaacaagtaggactcata 15686104  T
Q  320 tcaacatctttcatgatatataactatctcctcatttgttcatcaacctaagtcgacgtcattaaacattataaacatcctctttgc 406  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15686103 tcaacatctttcataatatataactatatcctcatttgttcatcaacctaagtcgacgtcattaaacattataaacatcctctttgc 15686017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 20 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 2288202 - 2287966
Alignment:
Q  20 atcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacat 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  2288202 atcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacac 2288103  T
Q  120 caacaacctatgactccgttacttagaacgtcaacttgcaaccttacaacctgaatcaacatcttgtataatcccatggaatgcatttatgcataaacca 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2288102 caacaacctatgactccgttacttagaacgtcaacttgcaaccttacaacctgaatcaacatcttgtataatcccatggaatgcatttatgcataaacca 2288003  T
Q  220 acaatcagcatcaaatcatattcaatcaacagcaaca 256  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2288002 acaatcagcatcaaatcatattcaatcaacagcaaca 2287966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 20 - 256
Target Start/End: Original strand, 15539104 - 15539340
Alignment:
Q  20 atcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacat 119  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  15539104 atcaacatacaacacaactacgacaacgacaacataggtaacaacaacgacaacgactgtgcataataacttatcacttactccccaacttcgtcaacat 15539203  T
Q  120 caacaacctatgactccgttacttagaacgtcaacttgcaaccttacaacctgaatcaacatcttgtataatcccatggaatgcatttatgcataaacca 219  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15539204 caacaacctatgactctgttacttagaacgacaacttgcaaccttacaacctgaaccaacatcttgtataatcccatggaatgcatttatgcataaacta 15539303  T
Q  220 acaatcagcatcaaatcatattcaatcaacagcaaca 256  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15539304 acaatcagcatcaaatcatattcaatcaacagcaaca 15539340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 20 - 256
Target Start/End: Original strand, 16829638 - 16829865
Alignment:
Q  20 atcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacat 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||      ||||||| ||||||| || ||| |||||||||||||||||||||    
T  16829638 atcaacatacaactcaactacgacaacgacaacataggcaacaacaacga------ctgtgcacaataact-atcactcactccccaacttggtcaacat 16829730  T
Q  120 caacaacctatgactccgttacttagaacgtcaacttgcaaccttacaacctgaatcaacatcttgtataatcccatggaatgcatttatgcataaacca 219  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||| |||||  ||| ||||||||| ||| ||||| |||||||| ||  || ||||||| ||| | ||||||||    
T  16829731 caacaacctatgactctgttacttataacgacaactaacaa-cttacaacccgaaccaacaccttgtatattctaattgaatgcagttaagtataaacca 16829829  T
Q  220 acaatcagcatcaaatcatattcaatcaacagcaaca 256  Q
     || ||| || | ||||||| |||||||||| |||||    
T  16829830 gcattcatcaac-aatcataatcaatcaacatcaaca 16829865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 20 - 256
Target Start/End: Original strand, 16812618 - 16812845
Alignment:
Q  20 atcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacat 119  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||      |||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  16812618 atcatcataaaactcaactacgacaacgacaacataggcaacgacaacgat------tgtgcacaataact-atgactcactccccaacttggtcaacat 16812710  T
Q  120 caacaacctatgactccgttacttagaacgtcaacttgcaaccttacaacctgaatcaacatcttgtataatcccatggaatgcatttatgcataaacca 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  ||| ||||||||| ||| ||||| |||||||| ||  || |||| || ||| | ||||||||    
T  16812711 caacaacctatgactccgttacttataacgacaactcacaa-cttacaacccgaaccaacaccttgtatattctaattgaatacagttaagtataaacca 16812809  T
Q  220 acaatcagcatcaaatcatattcaatcaacagcaaca 256  Q
    ||| ||| || | ||||||| |||||||||| |||||    
T  16812810 acattcatcaac-aatcataatcaatcaacaacaaca 16812845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 20 - 256
Target Start/End: Original strand, 16102183 - 16102410
Alignment:
Q  20 atcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacat 119  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||      |||||| |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||    
T  16102183 atcagcatacaactcaactacgacaacgacaacatagg------caacgacaacgaccgtgcataataact-atgactcactccccaacttgatcaacat 16102275  T
Q  120 caacaacctatgactccgttacttagaacgtcaacttgcaaccttacaacctgaatcaacatcttgtataatcccatggaatgcatttatgcataaacca 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||  ||| |||||  ||||| | ||  || ||||||| ||| | ||||||||    
T  16102276 caacaacctatgactccgttacttagaacgacaactcgcca-cttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaacca 16102374  T
Q  220 acaatcagcatcaaatcatattcaatcaacagcaaca 256  Q
     | ||||  | | ||||||| ||||||||||||||||    
T  16102375 gcgatcattaac-aatcataatcaatcaacagcaaca 16102410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 20 - 155
Target Start/End: Original strand, 12595797 - 12595925
Alignment:
Q  20 atcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacat 119  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||      |||||| |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||    
T  12595797 atcagcatacacctcaactacgacaacgacaacatagg------caacgacaacgaccgtgcataataact-atgactcactccccaacttgatcaacat 12595889  T
Q  120 caacaacctatgactccgttacttagaacgtcaact 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12595890 caacaacctatgactccgttacttagaacgacaact 12595925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 20 - 149
Target Start/End: Original strand, 29492595 - 29492717
Alignment:
Q  20 atcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacat 119  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||      |||||| |||||| ||||| ||| ||| | |||| ||||||||||||||||||| |    
T  29492595 atcagcatacaactcaactacgacaacgacaacatagg------caacgacaacgaccgtgcacaatgact-acgactcactccccaacttggtcaacgt 29492687  T
Q  120 caacaacctatgactccgttacttagaacg 149  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  29492688 caacaacttatgactccgttacttataacg 29492717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 72 - 136
Target Start/End: Original strand, 23838104 - 23838168
Alignment:
Q  72 acgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactcc 136  Q
    ||||||||||||||  | |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  23838104 acgactgtgcataaataattataacttactccacaacttggtcaacatcaacaacttaagactcc 23838168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 20 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 1590573 - 1590542
Alignment:
Q  20 atcaacatacaactcaactacgacaacgacaa 51  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1590573 atcaacatacaactcaactacgacaacgacaa 1590542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 319; Significance: 1e-180; HSPs: 14)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 20 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 21239409 - 21239023
Alignment:
Q  20 atcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacat 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21239409 atcaacatacaactcaactacgacaacgacaacataggcaacaacaacgacaacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcatcat 21239310  T
Q  120 caacaacctatgactccgttacttagaacgtcaacttgcaaccttacaacctgaatcaacatcttgtataatcccatggaatgcatttatgcataaacca 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  21239309 caacaacctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaaccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgcatttatgcataaacca 21239210  T
Q  220 acaatcagcatcaaatcatattcaa-tcaacagcaacatatagtaataagcagcgagacaacaacgataataaccatcatatacaacaagtaggactcat 318  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21239209 acaatcagcagcaaatcatattcaattcaacaacaacatataataataagcagcgagacaacaacaataataaccatcatatacaacgagtaggactcat 21239110  T
Q  319 atcaacatctttcatgatatataactatctcctcatttgttcatcaacctaagtcgacgtcattaaacattataaacatcctctttg 405  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21239109 atcaacatctttcataatatataactatctcctcatttgttcatcaacctaagtcgacgtcattaaacattacaaacatcctctttg 21239023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 20 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 21241959 - 21241576
Alignment:
Q  20 atcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacat 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21241959 atcaacatacaactcaactacgacaacgacaacataggcaacaacaacgacaacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcatcat 21241860  T
Q  120 caacaacctatgactccgttacttagaacgtcaacttgcaaccttacaacctgaatcaacatcttgtataatcccatggaatgcatttatgcataaacca 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  21241859 caacaacctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaaccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgcatttatgcataaacca 21241760  T
Q  220 acaatcagcatcaaatcatattcaa-tcaacagcaacatatagtaataagcagcgagacaacaacgataataaccatcatatacaacaagtaggactcat 318  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21241759 acaatcagcagcaaatcatattcaattcaacaacaacatataataataagcagcgagacaacaacaataataaccatcatatacaacgagtaggactcat 21241660  T
Q  319 atcaacatctttcatgatatataactatctcctcatttgttcatcaacctaagtcgacgtcattaaacattataaacatcctct 402  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21241659 atcaacatctttcataatatataactatctcctcatttgttcatcaacctaagtcgacgtcattaaacattacaaacatcctct 21241576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 20 - 402
Target Start/End: Original strand, 24504520 - 24504903
Alignment:
Q  20 atcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacat 119  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24504520 atcagcatacaactcaactacgacaacgacaacataggcaacaacaacgacaacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacat 24504619  T
Q  120 caacaacctatgactccgttacttagaacgtcaacttgcaaccttacaacctgaatcaacatcttgtataatcccatggaatgcatttatgcataaacca 219  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  24504620 caacaatctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaaccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgcatttatgcataaacca 24504719  T
Q  220 acaatcagcatcaaatcatattcaa-tcaacagcaacatatagtaataagcagcgagacaacaacgataataaccatcatatacaacaagtaggactcat 318  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24504720 acaatcagcagcaaatcatattcaattcaacaacaacatataataataagcagcgagacaacaacaataataaccatcatatacaacgagtaggactcat 24504819  T
Q  319 atcaacatctttcatgatatataactatctcctcatttgttcatcaacctaagtcgacgtcattaaacattataaacatcctct 402  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  24504820 atcaacatctttcataatatataactatctcctcatttgttcatcaacctaagtcgacatcattaaacattacaaacatcctct 24504903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 20 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 20591388 - 20591006
Alignment:
Q  20 atcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |    |    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20591388 atcaacatacaactcaactacgacaacgacaactttttcattttcaacgacaacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacat 20591289  T
Q  120 caacaacctatgactccgttacttagaacgtcaacttgcaaccttacaacctgaatcaacatcttgtataatcccatggaatgcatttatgcataaacca 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||    
T  20591288 caacaacctatgactccgttacttagaacgacaacttgcagccttacaacctaaaccaacatcttgtataatccaattgaatgcatttatgcatacacca 20591189  T
Q  220 acaatcagcatcaaatcatattcaatcaacagcaacatatagtaataagcagcgagacaacaacgataataaccatcatatacaacaagtaggactcata 319  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20591188 acaatcagcagcaaatcatattcaatcaacagcaacatataataacaagcagcgagacaacaataataataaccatcatatacaacaagtaggactcata 20591089  T
Q  320 tcaacatctttcatgatatataactatctcctcatttgttcatcaacctaagtcgacgtcattaaacattataaacatcctct 402  Q
    |||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20591088 tcaaaatctttcatattatataactatctcctcatttgttcatcaacctaagtcgacgtcattaaacattataaacattctct 20591006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 61 - 402
Target Start/End: Original strand, 31503458 - 31503799
Alignment:
Q  61 caacaacgataacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgtcaacttgcaa 160  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31503458 caactacgacaacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacatcaacaatctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaa 31503557  T
Q  161 ccttacaacctgaatcaacatcttgtataatcccatggaatgcatttatgcataaaccaacaatcagcatcaaatcatattcaatcaacagcaacatata 260  Q
    |||||||||  ||| |||||  ||||| | ||  || |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31503558 ccttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcatgtatgcatacaccaacaatcagcagcaaatcatattcaatcaacagcaacatata 31503657  T
Q  261 gtaataagcagcgagacaacaacgataataaccatcatatacaacaagtaggactcatatcaacatctttcatgatatataactatctcctcatttgttc 360  Q
     ||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31503658 ataacaagcagcgagacaacaataataataatcatcatatacaacaagtaggactcatatcaacatatttcataatatataactatctcctcatttgttc 31503757  T
Q  361 atcaacctaagtcgacgtcattaaacattataaacatcctct 402  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31503758 atcaacctaagtcgacgtcattaaacattataaacatcctct 31503799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 61 - 402
Target Start/End: Original strand, 31506024 - 31506365
Alignment:
Q  61 caacaacgataacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgtcaacttgcaa 160  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31506024 caactacgacaacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacatcaacaatctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaa 31506123  T
Q  161 ccttacaacctgaatcaacatcttgtataatcccatggaatgcatttatgcataaaccaacaatcagcatcaaatcatattcaatcaacagcaacatata 260  Q
    |||||||||  ||| |||||  ||||| | ||  || |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31506124 ccttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcatgtatgcatacaccaacaatcagcagcaaatcatattcaatcaacagcaacatata 31506223  T
Q  261 gtaataagcagcgagacaacaacgataataaccatcatatacaacaagtaggactcatatcaacatctttcatgatatataactatctcctcatttgttc 360  Q
     ||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31506224 ataacaagcagcgagacaacaataataataatcatcatatacaacaagtaggactcatatcaacatatttcataatatataactatctcctcatttgttc 31506323  T
Q  361 atcaacctaagtcgacgtcattaaacattataaacatcctct 402  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31506324 atcaacctaagtcgacgtcattaaacattataaacatcctct 31506365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 63 - 256
Target Start/End: Original strand, 28348947 - 28349139
Alignment:
Q  63 acaacgataacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgtcaacttgcaacc 162  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  28348947 acaacgacaacaactgtgcataataact-atgacttactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaact 28349045  T
Q  163 t-tacaacctgaatcaacatcttgtataatcccatggaatgcatttatgcataaaccaacaatcagcatcaaatcatattcaatcaacagcaaca 256  Q
    | ||||||  ||| | ||| ||||| || ||  |||||||||| ||| |||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  28349046 tctacaactcgaacctacaccttgtgtattctaatggaatgcagttaagcataaaccagcaatcagcaac-aatcatattcaatcaacagcaaca 28349139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 66 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 12628129 - 12627942
Alignment:
Q  66 acgataacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgtcaacttgcaacctta 165  Q
    |||| |||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||    
T  12628129 acgacaacgaccgtgcataataact-atgacatactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgacaactcgcaa-ctta 12628032  T
Q  166 caacctgaatcaacatcttgtataatcccatggaatgcatttatgcataaaccaacaatcagcatcaaatcatattcaatcaacagcaaca 256  Q
    ||||  ||| ||||| |||||||  ||  || ||||||| ||| |||||||||| |||||| || | ||||||| |||||||||| |||||    
T  12628031 caactcgaaccaacaccttgtatgttctaattgaatgcagttaagcataaaccagcaatcatcaac-aatcataatcaatcaacaacaaca 12627942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 20 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 41685042 - 41684914
Alignment:
Q  20 atcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacat 119  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||      |||||| |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||| |    
T  41685042 atcagcatacaactcaactacgacaacgacaacatagg------caacgacaacgaccgtgcataataact-atgactcactccccaacttgatcaacgt 41684950  T
Q  120 caacaacctatgactccgttacttagaacgtcaact 155  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  41684949 caacaacctatgactccgttacctagaacgacaact 41684914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 64 - 256
Target Start/End: Original strand, 44620806 - 44620995
Alignment:
Q  64 caacgataacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgtcaacttgcaacct 163  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||    
T  44620806 caacgacaacgaccgtgcataataact-atgactcactccccaacttgatcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgacaactcgcca-ct 44620903  T
Q  164 tacaacctgaatcaacatcttgtataatcccatggaatgcatttatgcataaaccaacaatcagcatcaaatcatattcaatcaacagcaaca 256  Q
    ||||||  ||| |||||  ||||| | ||  || ||||||| ||| | |||||||| | ||||  | | ||||||| ||||||||||||||||    
T  44620904 tacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcgatcattaac-aatcataatcaatcaacagcaaca 44620995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 20 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 23339446 - 23339328
Alignment:
Q  20 atcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacat 119  Q
    |||| |||||||||||||||||||| | |||| ||||| ||| ||||||||       ||||||||||||| |   || |||||||||||||||||||||    
T  23339446 atcagcatacaactcaactacgacagcaacaacataggcaacgacaacgatc------gtgcataataactca---ctcactccccaacttggtcaacat 23339356  T
Q  120 caacaacctatgactccgttacttagaa 147  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23339355 caacaacctatgactccgttacttagaa 23339328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 20 - 147
Target Start/End: Original strand, 31755778 - 31755896
Alignment:
Q  20 atcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacat 119  Q
    |||| |||||||||||||||||||||  |||| |||||| || ||||||||      |||||||||||||| |   || |||||||||||||||||||||    
T  31755778 atcagcatacaactcaactacgacaataacaacataggtgacgacaacgat------tgtgcataataactca---ctcactccccaacttggtcaacat 31755868  T
Q  120 caacaacctatgactccgttacttagaa 147  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||    
T  31755869 caacaacctatgactctgttacttagaa 31755896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 75 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 21073681 - 21073620
Alignment:
Q  75 actgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactcc 136  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  21073681 actgtgcataaataattatgacttactccacaacttggtcaacatcaacaacttaagactcc 21073620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 72 - 136
Target Start/End: Original strand, 9241856 - 9241920
Alignment:
Q  72 acgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactcc 136  Q
    ||||||||||||||  | |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  9241856 acgactgtgcataaataattataacttactccacaacttggtcaacatcaacaacttaagactcc 9241920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 316; Significance: 1e-178; HSPs: 15)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 20 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 29325524 - 29325141
Alignment:
Q  20 atcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacat 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29325524 atcaacatacaactcaactacgacaacgacaacataggcaacaacaacgacaacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacat 29325425  T
Q  120 caacaacctatgactccgttacttagaacgtcaacttgcaaccttacaacctgaatcaacatcttgtataatcccatggaatgcatttatgcataaacca 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  29325424 caacaacctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaaccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgcatttatgcataaacca 29325325  T
Q  220 acaatcagcatcaaatcatattcaa-tcaacagcaacatatagtaataagcagcgagacaacaacgataataaccatcatatacaacaagtaggactcat 318  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  29325324 acaatcagcagcaaatcatattcaattcaacaacaacatataataataagcagcgagacaacaacaataataaccatcatatacaacgagtaggactcat 29325225  T
Q  319 atcaacatctttcatgatatataactatctcctcatttgttcatcaacctaagtcgacgtcattaaacattataaacatcctct 402  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  29325224 atcaacatctttcataatatataactatctcctcatttgttcatcaacctaagtcgacgtcattaaacattacagacatcctct 29325141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 312; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 20 - 402
Target Start/End: Original strand, 26495703 - 26496086
Alignment:
Q  20 atcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacat 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26495703 atcaacatacaactcaactacgacaacgacaacataggcaacaacaacgacaacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcatcat 26495802  T
Q  120 caacaacctatgactccgttacttagaacgtcaacttgcaaccttacaacctgaatcaacatcttgtataatcccatggaatgcatttatgcataaacca 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  26495803 caacaacctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaaccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgcatttatgcataaacca 26495902  T
Q  220 acaatcagcatcaaatcatattcaa-tcaacagcaacatatagtaataagcagcgagacaacaacgataataaccatcatatacaacaagtaggactcat 318  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26495903 acaatcagcagcaaatcatattcaattcaacaacaacatataataataagcagcgagacaacaacaataataaccatcatatacaacgagtaggactcat 26496002  T
Q  319 atcaacatctttcatgatatataactatctcctcatttgttcatcaacctaagtcgacgtcattaaacattataaacatcctct 402  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26496003 atcaacatcttacataatatataactatctcctcatttgttcatcaacctaagtcgacgtcattaaacattacaaacatcctct 26496086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 20 - 256
Target Start/End: Original strand, 4397549 - 4397776
Alignment:
Q  20 atcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacat 119  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||      |||||| |||||| ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  4397549 atcagcatacaactcaactacgacaacgacaacatagg------caacgacaacgaccgtgcacaataact-atgactcactccccaacttggtcaacat 4397641  T
Q  120 caacaacctatgactccgttacttagaacgtcaacttgcaaccttacaacctgaatcaacatcttgtataatcccatggaatgcatttatgcataaacca 219  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||| |||||  ||| ||||||||| ||| ||||| |||||||| ||  || ||||||| ||| | ||||||||    
T  4397642 caacaacctatgactccgtttcttataacgacaactcacaa-cttacaacccgaaccaacaccttgtatattcgaattgaatgcagttaagtataaacca 4397740  T
Q  220 acaatcagcatcaaatcatattcaatcaacagcaaca 256  Q
     || ||| || | ||||||| ||||||||||||||||    
T  4397741 gcattcatcaac-aatcataatcaatcaacagcaaca 4397776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 63 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 22758903 - 22758711
Alignment:
Q  63 acaacgataacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgtcaacttgcaac- 161  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||     
T  22758903 acaacgacaacaactgtgcataataact-atgacttactccccaacttggtcaacatcaacaacctttgactccattacttagaacgacaacttgcaact 22758805  T
Q  162 cttacaacctgaatcaacatcttgtataatcccatggaatgcatttatgcataaaccaacaatcagcatcaaatcatattcaatcaacagcaaca 256  Q
     |||||||  ||| | ||| ||||| || ||  |||||||||| |||  ||||||||| ||||||||| | ||||||| |||||||| |||||||    
T  22758804 tttacaactcgaacctacaccttgtgtattctaatggaatgcagttaaacataaaccagcaatcagcaac-aatcatactcaatcaatagcaaca 22758711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 26 - 155
Target Start/End: Original strand, 23693304 - 23693426
Alignment:
Q  26 atacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacatcaacaa 125  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||      |||||| |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23693304 atacaactcaactacgacagcgacaatatagg------caacgacaacgaccgtgcataataact-atgactcactccccaacttggtcaacatcaacaa 23693396  T
Q  126 cctatgactccgttacttagaacgtcaact 155  Q
    |||||||||  ||||||||||||| |||||    
T  23693397 cctatgactttgttacttagaacgacaact 23693426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 20 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 26361361 - 26361136
Alignment:
Q  20 atcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacat 119  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||      |||||| |||||| ||||| ||||||| || ||| |||||||||||||||||||||    
T  26361361 atcagcatacaactcaactacggcaacgacaacatagg------caacgacaacgaccgtgcacaataact-ataactcactccccaacttggtcaacat 26361269  T
Q  120 caacaacctatgactccgttacttagaacgtcaacttgcaaccttacaacctgaatcaacatcttgtataatcccatggaatgcatttatgcataaacca 219  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||| |||||  ||| ||||||||| ||| |||||  ||||||| ||  || ||||||| ||| | ||||||||    
T  26361268 caacaacctatgactccgtttcttataacgacaactcacaa-cttacaacc-gaaccaacacattgtatattctaattgaatgcagttaagtataaacca 26361171  T
Q  220 acaatcagcatcaaatcatattcaatcaacagcaac 255  Q
     || ||| || | ||||||| |||||||||||||||    
T  26361170 gcattcatcaac-aatcataatcaatcaacagcaac 26361136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 20 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 16256213 - 16256091
Alignment:
Q  20 atcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacat 119  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||      |||||| |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||| | |||||||    
T  16256213 atcagcatacaactcaactacgacaacgacaacatagg------caacgacaacgaccgtgcataataact-atgactcactccccaactcgatcaacat 16256121  T
Q  120 caacaacctatgactccgttacttagaacg 149  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  16256120 caaccacctatgactccgttacttggaacg 16256091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 20 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 22590010 - 22589888
Alignment:
Q  20 atcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacat 119  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||      |||||| |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||| | |||||||    
T  22590010 atcagcatacaactcaactacgacaacgacaacatagg------caacgacaacgaccgtgcataataact-atgactcactccccaactcgatcaacat 22589918  T
Q  120 caacaacctatgactccgttacttagaacg 149  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  22589917 caaccacctatgactccgttacttggaacg 22589888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 20 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 22593565 - 22593443
Alignment:
Q  20 atcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacat 119  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||      |||||| |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||| | |||||||    
T  22593565 atcagcatacaactcaactacgacaacgacaacatagg------caacgacaacgaccgtgcataataact-atgactcactccccaactcgatcaacat 22593473  T
Q  120 caacaacctatgactccgttacttagaacg 149  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  22593472 caaccacctatgactccgttacttggaacg 22593443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 20 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 22597120 - 22596998
Alignment:
Q  20 atcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacat 119  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||      |||||| |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||| | |||||||    
T  22597120 atcagcatacaactcaactacgacaacgacaacatagg------caacgacaacgaccgtgcataataact-atgactcactccccaactcgatcaacat 22597028  T
Q  120 caacaacctatgactccgttacttagaacg 149  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  22597027 caaccacctatgactccgttacttggaacg 22596998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 20 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 16259846 - 16259725
Alignment:
Q  20 atcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacat 119  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||      |||||| |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||| | |||||||    
T  16259846 atcagcatacaactcaactacgacaacgacaacatagg------caacgacaacgaccgtgcataataact-atgactcactccccaactcgatcaacat 16259754  T
Q  120 caacaacctatgactccgttacttagaac 148  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  16259753 caaccacctatgactccgttacttggaac 16259725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 20 - 147
Target Start/End: Original strand, 43121017 - 43121135
Alignment:
Q  20 atcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacat 119  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||       ||||||||||||| |   || |||||||||||||||||||||    
T  43121017 atcagcatacaactcaactacgacaacaacaacataggtgacgacaacgatc------gtgcataataactca---ctcactccccaacttggtcaacat 43121107  T
Q  120 caacaacctatgactccgttacttagaa 147  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||    
T  43121108 caacaacctatgactctgttacttagaa 43121135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 20 - 147
Target Start/End: Original strand, 43124550 - 43124668
Alignment:
Q  20 atcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacat 119  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||       ||||||||||||| |   || |||||||||||||||||||||    
T  43124550 atcagcatacaactcaactacgacaacaacaacataggtgacgacaacgatc------gtgcataataactca---ctcactccccaacttggtcaacat 43124640  T
Q  120 caacaacctatgactccgttacttagaa 147  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||    
T  43124641 caacaacctatgactctgttacttagaa 43124668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 99 - 147
Target Start/End: Original strand, 22880138 - 22880186
Alignment:
Q  99 actccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaa 147  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22880138 actccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactctgttacttagaa 22880186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 293 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 27869390 - 27869316
Alignment:
Q  293 catcatatacaacaagtaggactcatatcaacatctttcatgatatataactatctcctcatttg-ttcatcaac 366  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | |||| |||||||||    
T  27869390 catcatatacaacaagtgtaactcatatcaacatctttcatgatatataattatttccacttttgattcatcaac 27869316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 316; Significance: 1e-178; HSPs: 21)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 20 - 402
Target Start/End: Original strand, 41791489 - 41791872
Alignment:
Q  20 atcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacat 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41791489 atcaacatacaactcaactacgacaacgacaacataggcaacaacaacgacaacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacctggtcaacat 41791588  T
Q  120 caacaacctatgactccgttacttagaacgtcaacttgcaaccttacaacctgaatcaacatcttgtataatcccatggaatgcatttatgcataaacca 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  41791589 caacaacctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaaccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgcatttatgcataaacca 41791688  T
Q  220 acaatcagcatcaaatcatattcaa-tcaacagcaacatatagtaataagcagcgagacaacaacgataataaccatcatatacaacaagtaggactcat 318  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41791689 acaatcagcagcaaatcatattcaattcaacaacaacatataataataagcagcgagacaacaacaataataaccatcatatacaacgagtaggactcat 41791788  T
Q  319 atcaacatctttcatgatatataactatctcctcatttgttcatcaacctaagtcgacgtcattaaacattataaacatcctct 402  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  41791789 atcaacatctttcataatatataactatctcctcatttgttcatcaacctaagtcgacgtcattaaacattacaaacatcctct 41791872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 20 - 402
Target Start/End: Original strand, 14698535 - 14698916
Alignment:
Q  20 atcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacat 119  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14698535 atcagcatacaactcaactacgacaacgacaacataggcaacaacaacgacaacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacat 14698634  T
Q  120 caacaacctatgactccgttacttagaacgtcaacttgcaaccttacaacctgaatcaacatcttgtataatcccatggaatgcatttatgcataaacca 219  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||    
T  14698635 caacaatctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaaccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgcatgtatgcatacacca 14698734  T
Q  220 acaatcagcatcaaatcatattcaatcaacagcaacatatagtaataagcagcgagacaacaacgataataaccatcatatacaacaagtaggactcata 319  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14698735 acaatcagcagcaaatcatattcaatcaacagcaacatataataacaagcagcgagacaacaataataataatcatcatatacaacaagtaggactcata 14698834  T
Q  320 tcaacatctttcatgatatataactatctcctcatttgttcatcaacctaagtcgacgtcattaaacattataaacatcctct 402  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14698835 tcaacatctttcatattatataactatcccctca-ttgttcatcaacctaagtcgacgtcattaaacattataaacatcctct 14698916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 20 - 402
Target Start/End: Original strand, 4170843 - 4171224
Alignment:
Q  20 atcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacat 119  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4170843 atcagcatacaactcaactacgacaacgacaacataggcaacaacaacgacaacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacat 4170942  T
Q  120 caacaacctatgactccgttacttagaacgtcaacttgcaaccttacaacctgaatcaacatcttgtataatcccatggaatgcatttatgcataaacca 219  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||    
T  4170943 caacaatctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaaccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgcatgtatgcatacacca 4171042  T
Q  220 acaatcagcatcaaatcatattcaatcaacagcaacatatagtaataagcagcgagacaacaacgataataaccatcatatacaacaagtaggactcata 319  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4171043 acaatcagcagcaaatcatattcaatcaacagcaacatataataacaagcagcgagacaacaataataataatcatcatatacaacaagtaggactcata 4171142  T
Q  320 tcaacatctttcatgatatataactatctcctcatttgttcatcaacctaagtcgacgtcattaaacattataaacatcctct 402  Q
    ||||||| ||||||  |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4171143 tcaacatttttcatattatataactatcccctca-ttgttcatcaacctaagtcgacgtcattaaacattataaacatcctct 4171224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 20 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 53387997 - 53387621
Alignment:
Q  20 atcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacat 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||      |||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  53387997 atcaacatacaactcaactacgacaacgacaacatagg------caacgacatcgactgtgcataataacttatgactcactccccaacttggccaacat 53387904  T
Q  120 caacaacctatgactccgttacttagaacgtcaacttgcaaccttacaacctgaatcaacatcttgtataatcccatggaatgcatttatgcataaacca 219  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||  ||||||| ||||    
T  53387903 caacatcctctgactccgttacttagaacgacaacttgcaaccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgcatgcatgcatacacca 53387804  T
Q  220 acaatcagcatcaaatcatattcaatcaacagcaacatatagtaataagcagcgagacaacaacgataataaccatcatatacaacaagtaggactcata 319  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53387803 acaatcagtagcaaatcatattcaatcaacagcaacatataataacaagcagcgagacaacaataataataaccatcatatacaacaagtaggactcata 53387704  T
Q  320 tcaacatctttcatgatatataactatctcctcatttgttcatcaacctaagtcgacgtcattaaacattataaacatcctct 402  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  53387703 tcaacatctttcatattatataactatctcctcatttgttcatcaacctaagtcgacgtcattaaacattataaacattctct 53387621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 20 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 16278385 - 16278011
Alignment:
Q  20 atcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacat 119  Q
    |||| |||||||||||||||||||| | |||| ||||| ||| ||||||||     || |||||||||||| |   || |||||||||||||||||||||    
T  16278385 atcagcatacaactcaactacgacagcaacaacataggcaacgacaacgat-----ct-tgcataataactca---ctcactccccaacttggtcaacat 16278295  T
Q  120 caacaacctatgactccgttacttagaa-cgtcaacttgcaaccttacaacctgaatcaacatcttgtataatcccatggaatgcatttatgcataaacc 218  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||    
T  16278294 caacaacctatgactccattacttagaaacgacaacttgcaaccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgcatgtatgcatacacc 16278195  T
Q  219 aacaatcagcatcaaatcatattcaatcaacagcaacatatagtaataagcagcgagacaacaacgataataaccatcatatacaacaagtaggactcat 318  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16278194 aacaatcagcagcaaatcatattcaatcaacaacaacatataataacaagcagcgagacaacaataataataaccatcatatacaacaagtaggactcat 16278095  T
Q  319 atcaacatctttcatgatatataactatctcctcatttgttcatcaacctaagtcgacgtcattaaacattataaacatcctct 402  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16278094 ataaacatctttcataatatataactatctcctcatttgttcatcaacctaagtcgacgtcattaaacattataaacatcctct 16278011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 63 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 56115848 - 56115656
Alignment:
Q  63 acaacgataacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgtcaacttgcaac- 161  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  56115848 acaacgacaacaactgtgcataataact-atgacttactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaact 56115750  T
Q  162 cttacaacctgaatcaacatcttgtataatcccatggaatgcatttatgcataaaccaacaatcagcatcaaatcatattcaatcaacagcaaca 256  Q
     |||||||  ||| | ||| ||||| || ||  |||||||||| |||  ||||||| | ||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||    
T  56115749 tttacaactcgaacctacaccttgtgtattctaatggaatgcagttaaacataaactagcaatcagcaac-aatcatactcaatcaacagcaaca 56115656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 20 - 256
Target Start/End: Original strand, 286930 - 287157
Alignment:
Q  20 atcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacat 119  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||      |||||| |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||    
T  286930 atcagcatacaactcaactacgacaacgacaacatagg------caacgacaacgaccgtgcataataact-atgactcactccccaacttgatcaacat 287022  T
Q  120 caacaacctatgactccgttacttagaacgtcaacttgcaaccttacaacctgaatcaacatcttgtataatcccatggaatgcatttatgcataaacca 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||  ||| |||||  ||||| | ||  || ||||||| ||| | ||||||||    
T  287023 caacaacctatgactccgttacttagaacgacaactcgcca-cttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaacca 287121  T
Q  220 acaatcagcatcaaatcatattcaatcaacagcaaca 256  Q
     | ||||  | | ||||||| ||||||||||||||||    
T  287122 gcgatcattaac-aatcataatcaatcaacagcaaca 287157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 20 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 15280362 - 15280136
Alignment:
Q  20 atcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacat 119  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||      |||||| |||||| ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  15280362 atcagcatacaactcaactacgacaacgacaacatagg------caacgacaacgaccgtgcacaataact-atgactcactccccaacttggtcaacat 15280270  T
Q  120 caacaacctatgactccgttacttagaacgtcaacttgcaaccttacaacctgaatcaacatcttgtataatcccatggaatgcatttatgcataaacca 219  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||  ||| ||||||||| ||| |||||  ||||||| ||  || ||||||| ||| | ||||||||    
T  15280269 caacaacctatgactccattacttataacgacaactcacaa-cttacaacc-gaaccaacacattgtatattctaattgaatgcagttaagtataaacca 15280172  T
Q  220 acaatcagcatcaaatcatattcaatcaacagcaaca 256  Q
     || ||| || | ||||||| ||||||||||||||||    
T  15280171 gcattcatcaac-aatcataatcaatcaacagcaaca 15280136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 20 - 256
Target Start/End: Original strand, 28382664 - 28382891
Alignment:
Q  20 atcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacat 119  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||      |||||| |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||    
T  28382664 atcagcatacaactcaactacgacaacgacaacatagg------caacgacaacgaccgtgcataataact-atgactcactccccaacttgatcaacat 28382756  T
Q  120 caacaacctatgactccgttacttagaacgtcaacttgcaaccttacaacctgaatcaacatcttgtataatcccatggaatgcatttatgcataaacca 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||  ||| |||||  ||||| | ||  || ||||||| ||| | ||||||||    
T  28382757 caacaacctatgactccgttacttagaacgacaactcgcca-cttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaacca 28382855  T
Q  220 acaatcagcatcaaatcatattcaatcaacagcaaca 256  Q
     | ||||  | | ||||||| ||||||||||||||||    
T  28382856 gcgatcattaac-aatcataatcaatcaacagcaaca 28382891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 20 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 47127105 - 47126878
Alignment:
Q  20 atcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacat 119  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||      |||||| |||||| ||||||||||||| |||||| |||| |||||||| |||||||    
T  47127105 atcagcatacaactcaactacgacaacgacaacatagg------caacgacaacgaccgtgcataataact-atgactcactctccaacttgatcaacat 47127013  T
Q  120 caacaacctatgactccgttacttagaacgtcaacttgcaaccttacaacctgaatcaacatcttgtataatcccatggaatgcatttatgcataaacca 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||  ||| |||||  ||||| | ||  || ||||||| ||| | ||||||||    
T  47127012 caacaacctatgactccgttacttagaacgacaactcgcca-cttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaacca 47126914  T
Q  220 acaatcagcatcaaatcatattcaatcaacagcaaca 256  Q
     | ||||  | | ||||||| ||||||||||||||||    
T  47126913 gcgatcattaac-aatcataatcaatcaacagcaaca 47126878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 20 - 155
Target Start/End: Original strand, 16359344 - 16359472
Alignment:
Q  20 atcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacat 119  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||      |||||| |||||| ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  16359344 atcagcatacaactcaactacgacaacgacaacatagg------caacgacaacgaccgtgcacaataact-atgactcactccccaacttggtcaacat 16359436  T
Q  120 caacaacctatgactccgttacttagaacgtcaact 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  16359437 caacaacctatgactccgttacttataacgacaact 16359472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 20 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 31117312 - 31117194
Alignment:
Q  20 atcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||       ||||||||||||| |   || |||||||||||||||||||||    
T  31117312 atcaacatacaactcaactacgacaacaacaacataggtgacgacaacgatc------gtgcataataactca---ctcactccccaacttggtcaacat 31117222  T
Q  120 caacaacctatgactccgttacttagaa 147  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||    
T  31117221 caacaacctatgactctgttacttagaa 31117194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 20 - 147
Target Start/End: Original strand, 33848748 - 33848866
Alignment:
Q  20 atcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacat 119  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||       ||||||||||||| |   || |||||||||||||||||||||    
T  33848748 atcagcatacaactcaactacgacaacaacaacataggcaacgacaacgatc------gtgcataataactca---ctcactccccaacttggtcaacat 33848838  T
Q  120 caacaacctatgactccgttacttagaa 147  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33848839 caacaacctatgactccgttacttagaa 33848866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 20 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 55503007 - 55502889
Alignment:
Q  20 atcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacat 119  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||      |||||||||||||| |   || |||||||||||||||||||||    
T  55503007 atcagcatacaactcaactacgacaacaacaacataggtgacgacaacgat------tgtgcataataactca---ctcactccccaacttggtcaacat 55502917  T
Q  120 caacaacctatgactccgttacttagaa 147  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||    
T  55502916 caacaacctatgactctgttacttagaa 55502889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 20 - 155
Target Start/End: Original strand, 10313555 - 10313683
Alignment:
Q  20 atcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacat 119  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||      | ||| ||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||    
T  10313555 atcagcatacaattcaactacgacagcgacaacataggcaacaacaacga------ccgtgtataataact-atgactcactcctcaacttggtcaacat 10313647  T
Q  120 caacaacctatgactccgttacttagaacgtcaact 155  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  10313648 caacaacctatgacttcgttgcttagaacgacaact 10313683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 262 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 21189848 - 21189768
Alignment:
Q  262 taataagcagcgagacaacaacgataataaccatcatatacaacaagtaggactcatatcaacatctttcatgatatataa 342  Q
    ||||||||||| || || |||| ||||||| ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| | ||||||    
T  21189848 taataagcagcaagtcaccaacaataataatcatcatatacaacaagtataactgatatcaacatctttcataacatataa 21189768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 75 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 24047488 - 24047427
Alignment:
Q  75 actgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactcc 136  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  24047488 actgtgcataaataattatgacttactccacaacttggtcaacatcaacaacttaagactcc 24047427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 20 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 9388357 - 9388310
Alignment:
Q  20 atcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaac 67  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||    
T  9388357 atcaacatacaactcaactacgacaacgacaacataggcaacgacaac 9388310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 15242382 - 15242314
Alignment:
Q  20 atcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataa 88  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||| ||| ||||| ||||    
T  15242382 atcagcatataactcaactacgacaacgacaacataggcaacgacaacgacaacaactttgcatcataa 15242314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 59 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 15448331 - 15448273
Alignment:
Q  59 aacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaac 117  Q
    ||||||||| | ||| |||||||||||  | |||||||||||||| |||||||||||||    
T  15448331 aacaacaacaacaacaactgtgcataaataattatgacttactccacaacttggtcaac 15448273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 75 - 117
Target Start/End: Original strand, 15990201 - 15990242
Alignment:
Q  75 actgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaac 117  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  15990201 actgtgcataataa-ttatgacttactccacaacttggtcaac 15990242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 308; Significance: 1e-173; HSPs: 24)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 20 - 402
Target Start/End: Original strand, 16006235 - 16006618
Alignment:
Q  20 atcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacat 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16006235 atcaacatacaactcaactacgacaacgacaacataggcaacaacaacgacaacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacat 16006334  T
Q  120 caacaacctatgactccgttacttagaacgtcaacttgcaaccttacaacctgaatcaacatcttgtataatcccatggaatgcatttatgcataaacca 219  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  16006335 caacaacttatgactccgttacttagaacgacaacttgcaaccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgcatttatgcataaacca 16006434  T
Q  220 acaatcagcatcaaatcatattcaa-tcaacagcaacatatagtaataagcagcgagacaacaacgataataaccatcatatacaacaagtaggactcat 318  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16006435 acaatcagcagcaaatcatattcaattcaacaacaacatataataataagcagcgagactacaacaataataaccatcatatacaacgagtaggactcat 16006534  T
Q  319 atcaacatctttcatgatatataactatctcctcatttgttcatcaacctaagtcgacgtcattaaacattataaacatcctct 402  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16006535 atcaacatctttcataatatataattatctcctcatttgttcatcaacctaagtcgacgtcattaaacattacaaacatcctct 16006618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 20 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 21743587 - 21743206
Alignment:
Q  20 atcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacat 119  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21743587 atcagcatacaactcaactacgacaacgacaacataggcaacaacaacgacaacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacat 21743488  T
Q  120 caacaacctatgactccgttacttagaacgtcaacttgcaaccttacaacctgaatcaacatcttgtataatcccatggaatgcatttatgcataaacca 219  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||    
T  21743487 caacaatctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaaccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgcatgtatgcatacacca 21743388  T
Q  220 acaatcagcatcaaatcatattcaatcaacagcaacatatagtaataagcagcgagacaacaacgataataaccatcatatacaacaagtaggactcata 319  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21743387 acaatcagcagcaaatcatattcaatcaacagcaacatataataacaagcagcgagacaacaataataataatcatcatatacaacaagtaggactcata 21743288  T
Q  320 tcaacatctttcatgatatataactatctcctcatttgttcatcaacctaagtcgacgtcattaaacattataaacatcctct 402  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21743287 tcaacatctttcatattatataactatcccctca-ttgttcatcaacctaagtcgacgtcattaaacattataaacatcctct 21743206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 20 - 400
Target Start/End: Original strand, 8776180 - 8776558
Alignment:
Q  20 atcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8776180 atcaacatacaactcaactacgacaacgacaacgtaggcaacaacaacgacaacgactgtgaataataacttatgacttactccccaacttggtcaacat 8776279  T
Q  120 caacaacctatgactccgttacttagaacgtcaacttgcaaccttacaacctgaatcaacatcttgtataatcccatggaatgcatttatgcataaacca 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||    
T  8776280 caacaacctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaaccttaccacttgaaccaacatcttgtataattcaattgaatgcatttatgcataaacca 8776379  T
Q  220 acaatcagcatcaaatcatattcaatcaacagcaacatatagtaataagcagcgagacaacaacgataataaccatcatatacaacaagtaggactcata 319  Q
    |||||||||| |||||||||||||||   || ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8776380 acaatcagcagcaaatcatattcaat--tcaacaacatataataataagcagcgagacaacaacaataataaccatcatatacaacgagtaggactcata 8776477  T
Q  320 tcaacatctttcatgatatataactatctcctcatttgttcatcaacctaagtcgacgtcattaaacattataaacatcct 400  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8776478 ttaacatctttcataatatataactatctcctcatttgttcatcaacctaagtcgacgtcattaaacattacaaacatcct 8776558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 20 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 17506064 - 17505688
Alignment:
Q  20 atcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacat 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||      |||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17506064 atcaacatacaactcaactacgacaacgacaacatagg------caacgacaacgactgtgcagaataacttatgactcactccccaacttggtcaacat 17505971  T
Q  120 caacaacctatgactccgttacttagaacgtcaacttgcaaccttacaacctgaatcaacatcttgtataatcccatggaatgcatttatgcataaacca 219  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||    
T  17505970 caacaccctctgactccgttacttagaacgacaacttgcaaccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgcatgtatgcatacacca 17505871  T
Q  220 acaatcagcatcaaatcatattcaatcaacagcaacatatagtaataagcagcgagacaacaacgataataaccatcatatacaacaagtaggactcata 319  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17505870 acaatcagtagcaaatcatattcaatcaacagcaacatataataacaagcagcgagacaacaataataataaccatcatatacaacaagtaggactcata 17505771  T
Q  320 tcaacatctttcatgatatataactatctcctcatttgttcatcaacctaagtcgacgtcattaaacattataaacatcctct 402  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17505770 tcaacatctttcatattatataactatctcctcatttgttcatcaacctaagtcgacgtcattaaacattataaacattctct 17505688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 20 - 402
Target Start/End: Original strand, 17547150 - 17547526
Alignment:
Q  20 atcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacat 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||      |||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17547150 atcaacatacaactcaactacgacaacgacaacatagg------caacgacaacgactgtgcagaataacttatgactcactccccaacttggtcaacat 17547243  T
Q  120 caacaacctatgactccgttacttagaacgtcaacttgcaaccttacaacctgaatcaacatcttgtataatcccatggaatgcatttatgcataaacca 219  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||    
T  17547244 caacaccctctgactccgttacttagaacgacaacttgcaaccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgcatgtatgcatacacca 17547343  T
Q  220 acaatcagcatcaaatcatattcaatcaacagcaacatatagtaataagcagcgagacaacaacgataataaccatcatatacaacaagtaggactcata 319  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17547344 acaatcagtagcaaatcatattcaatcaacagcaacatataataacaagcagcgagacaacaataataataaccatcatatacaacaagtaggactcata 17547443  T
Q  320 tcaacatctttcatgatatataactatctcctcatttgttcatcaacctaagtcgacgtcattaaacattataaacatcctct 402  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17547444 tcaacatctttcatattatataactatctcctcatttgttcatcaacctaagtcgacgtcattaaacattataaacattctct 17547526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 20 - 258
Target Start/End: Original strand, 38828065 - 38828302
Alignment:
Q  20 atcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacat 119  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| || || ||| ||||| | |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38828065 atcagcatacaactcaactacgacaacgacaacatgggcaacgacaaccacaacgatggtgcataataact-atgacttactccccaacttggtcaacat 38828163  T
Q  120 caacaacctatgactccgttacttagaacgtcaacttgcaaccttacaacctgaatcaacatcttgtataatcccatggaatgcatttatgcataaacca 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||| | ||| |||||||| ||  || |||||||  |||||| ||||||    
T  38828164 caacaacctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaactttacaactcgaacccacaccttgtatattctaattgaatgcagctatgcacaaacca 38828263  T
Q  220 acaatcagcatcaaatcatattcaatcaacagcaacata 258  Q
     || |||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  38828264 gcagtcagcaacaaatcatattcaatcaatagcaacata 38828302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 61 - 256
Target Start/End: Original strand, 35366101 - 35366293
Alignment:
Q  61 caacaacgataacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgtcaacttgcaa 160  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  ||    
T  35366101 caactacgacaacgactgtgcataataact-atgacttactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgacaac-tcaaa 35366198  T
Q  161 ccttacaacctgaatcaacatcttgtataatcccatggaatgcatttatgcataaaccaacaatcagcatcaaatcatattcaatcaacagcaaca 256  Q
     ||||||||  ||| ||||| |||||||| ||  || ||||||| ||| |||||||||| |||||| || | ||||||||||||||||||||||||    
T  35366199 acttacaactcgaaccaacaccttgtatattctaattgaatgcaattaagcataaaccagcaatcatcaac-aatcatattcaatcaacagcaaca 35366293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 20 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 13395744 - 13395517
Alignment:
Q  20 atcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacat 119  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||      |||||| |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||    
T  13395744 atcagcatacaactcaactacgacaacgacaacatagg------caacgacaacgaccgtgcataataact-atgactcactccccaacttgatcaacat 13395652  T
Q  120 caacaacctatgactccgttacttagaacgtcaacttgcaaccttacaacctgaatcaacatcttgtataatcccatggaatgcatttatgcataaacca 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||  ||| |||||  ||||| | ||  || ||||||| ||| | ||||||||    
T  13395651 caacaacctatgactccgttacttagaacgacaactcgcca-cttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaacca 13395553  T
Q  220 acaatcagcatcaaatcatattcaatcaacagcaaca 256  Q
     | ||||  | | ||||||| ||||||||||||||||    
T  13395552 gcgatcattaac-aatcataatcaatcaacagcaaca 13395517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 64 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 21065400 - 21065304
Alignment:
Q  64 caacgataacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgtcaacttgcaac 161  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21065400 caacgacaacaactgtgcataataact-atgacttactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaac 21065304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 20 - 256
Target Start/End: Original strand, 48785153 - 48785380
Alignment:
Q  20 atcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacat 119  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||      |||||| |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||    
T  48785153 atcagcatacaactcaactacgacaacgacaacatagg------caacgacaacgaccgtgcataataact-atgactcactccccaacttgatcaacat 48785245  T
Q  120 caacaacctatgactccgttacttagaacgtcaacttgcaaccttacaacctgaatcaacatcttgtataatcccatggaatgcatttatgcataaacca 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||  ||| |||||  ||||| | ||  || ||||||| ||| | ||||||||    
T  48785246 caacaacctatgactccgttacttagaacgacaactcgcca-cttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaacca 48785344  T
Q  220 acaatcagcatcaaatcatattcaatcaacagcaaca 256  Q
     | ||||  | | ||||||| ||||||||||||||||    
T  48785345 gcgatcattaac-aatcataatcaatcaacagcaaca 48785380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 64 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 13733774 - 13733586
Alignment:
Q  64 caacgataacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgtcaacttgcaacct 163  Q
    |||||| |||||| ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  ||| ||    
T  13733774 caacgacaacgaccgtgcacaataact-atgactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttataacgacaactcacaa-ct 13733677  T
Q  164 tacaacctgaatcaacatcttgtataatcccatggaatgcatttatgcataaaccaacaatcagcatcaaatcatattcaatcaacagcaaca 256  Q
    ||||||| ||| |||||  ||||||| ||  || ||||||| ||| | |||||||| || ||| || | ||||||| ||||||||||||||||    
T  13733676 tacaacc-gaaccaacacattgtatattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcattcatcaac-aatcataatcaatcaacagcaaca 13733586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 20 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 124451 - 124333
Alignment:
Q  20 atcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacat 119  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||      |||||||||||||| |   || |||||||||||||||||||||    
T  124451 atcagcatacaactcaactacgacaacaacaacataggtgacgacaacgat------tgtgcataataactca---ctcactccccaacttggtcaacat 124361  T
Q  120 caacaacctatgactccgttacttagaa 147  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||    
T  124360 caacaacctatgactctgttacttagaa 124333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 99 - 147
Target Start/End: Original strand, 4993397 - 4993445
Alignment:
Q  99 actccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaa 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4993397 actccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaa 4993445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 20 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 709573 - 709467
Alignment:
Q  20 atcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacat 119  Q
    |||||||||||||||| | ||  |||||||||  |||  ||| ||||| | ||| |||||||||||  | |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  709573 atcaacatacaactcagcaacatcaacgacaacgtagacaacgacaacaacaacaactgtgcataaataattatgacttactccacaacttggtcaacat 709474  T
Q  120 caacaac 126  Q
    |||||||    
T  709473 caacaac 709467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 126
Target Start/End: Original strand, 41055512 - 41055615
Alignment:
Q  20 atcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacat 119  Q
    |||||||||||||||| | ||  |||||||||  |||  ||| |||||   ||| |||||||||||  | |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41055512 atcaacatacaactcatcaacatcaacgacaacgtagacaacgacaac---aacaactgtgcataaataattatgacttactccacaacttggtcaacat 41055608  T
Q  120 caacaac 126  Q
    |||||||    
T  41055609 caacaac 41055615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 75 - 126
Target Start/End: Original strand, 14421882 - 14421933
Alignment:
Q  75 actgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacatcaacaac 126  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14421882 actgtgcataaataattatgacttactccacaacttggtcaacatcaacaac 14421933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 75 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 47975873 - 47975822
Alignment:
Q  75 actgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacatcaacaac 126  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  47975873 actgtgcataaataattatgacttactccacaacttggtcaacatcaacaac 47975822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 75 - 136
Target Start/End: Original strand, 11661204 - 11661265
Alignment:
Q  75 actgtgcat-aataacttatgacttactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactcc 136  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  11661204 actgtgcataaataac-tatgacttactccacaacttggtcaacatcaacaacttaagactcc 11661265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 126
Target Start/End: Original strand, 16462073 - 16462176
Alignment:
Q  20 atcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacat 119  Q
    |||||||||||||||| | ||  |||||||||  |||  ||| |||||   ||| |||||||||||  | |||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  16462073 atcaacatacaactcagcaacatcaacgacaacgtagacaacgacaac---aacaactgtgcataaataattatgacttactccacaacttggtcaatat 16462169  T
Q  120 caacaac 126  Q
    |||||||    
T  16462170 caacaac 16462176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 26 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 12755659 - 12755568
Alignment:
Q  26 atacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaac 117  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||  |||  ||| |||| || ||| |||||||||||  | |||||||||||||| |||||||||||||    
T  12755659 atacaactcaacaacatcaacgacaacgtagacaacgacaatgacaacaactgtgcataaataattatgacttactccacaacttggtcaac 12755568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 20 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 44190889 - 44190789
Alignment:
Q  20 atcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgac---tgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaa 116  Q
    |||||||||||||||| | ||  |||||||||  |||  ||| ||||||| ||||||   |||||||||  | |||||||||||||| ||||||||||||    
T  44190889 atcaacatacaactcagcaacatcaacgacaacgtagacaacgacaacgacaacgacaactgtgcataaataattatgacttactccacaacttggtcaa 44190790  T
Q  117 c 117  Q
    |    
T  44190789 c 44190789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 60 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 14416412 - 14416355
Alignment:
Q  60 acaacaacgataacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaac 117  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||||  | |||||||||||||| |||||||||||||    
T  14416412 acaacgacgacaacaactgtgcataaataattatgacttactccacaacttggtcaac 14416355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 60 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 39431824 - 39431767
Alignment:
Q  60 acaacaacgataacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaac 117  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||||  | |||||||||||||| |||||||||||||    
T  39431824 acaacgacgacaacaactgtgcataaataattatgacttactccacaacttggtcaac 39431767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 72 - 120
Target Start/End: Original strand, 147595 - 147643
Alignment:
Q  72 acgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacatc 120  Q
    ||||||||||||||  | |||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  147595 acgactgtgcataaataattataacttactccacaacttggtcaacatc 147643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 298; Significance: 1e-167; HSPs: 15)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 20 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 45135209 - 45134828
Alignment:
Q  20 atcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  45135209 atcaacatacaactcaactacgacaacgacaacgtaggcaacaacaacgacaacgactgtgcataataacttatgacttacttcccaacttggtcaacat 45135110  T
Q  120 caacaacctatgactccgttacttagaacgtcaacttgcaaccttacaacctgaatcaacatcttgtataatcccatggaatgcatttatgcataaacca 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||    
T  45135109 caacaacctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaaccttaccacttgaaccaacatcttgtataattcaattgaatgcatttatgcataaacca 45135010  T
Q  220 acaatcagcatcaaatcatattcaa-tcaacagcaacatatagtaataagcagcgagacaacaacgataataaccatcatatacaacaagtaggactcat 318  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  45135009 acaatcagcagcaaatcatattcaattcaacaacaacatataataataagcagcgagacaacaacaataataaccatcatatacaacgagtaggactcat 45134910  T
Q  319 atcaacatctttcatgatatataactatctcctcatttgttcatcaacctaagtcgacgtcattaaacattataaacatcct 400  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  45134909 atcaacatctttcataatatataactatctcctcatttgttcatcaacctaagtcgacgtcattaaacattacaaacatcct 45134828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 20 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 6608556 - 6608175
Alignment:
Q  20 atcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacat 119  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6608556 atcagcatacaacttaactacgacaacgacaacataggcaacaacaacgacaacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacat 6608457  T
Q  120 caacaacctatgactccgttacttagaacgtcaacttgcaaccttacaacctgaatcaacatcttgtataatcccatggaatgcatttatgcataaacca 219  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||    
T  6608456 caacaatctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaaccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgcatgtatgcatacacca 6608357  T
Q  220 acaatcagcatcaaatcatattcaatcaacagcaacatatagtaataagcagcgagacaacaacgataataaccatcatatacaacaagtaggactcata 319  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6608356 acaatcagcagcaaatcatattcaatcaacaacaacatataataacaagcagcgagacaacaataataataatcatcatatacaacaagtaggactcata 6608257  T
Q  320 tcaacatctttcatgatatataactatctcctcatttgttcatcaacctaagtcgacgtcattaaacattataaacatcctct 402  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6608256 tcaacatctttcatattatataactatcccctc-gttgttcatcaacctaagtcgacgtcattaaacattataaacatcctct 6608175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 61 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 7301322 - 7300983
Alignment:
Q  61 caacaacgataacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgtcaacttgcaa 160  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7301322 caactacgacaacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggccaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaa 7301223  T
Q  161 ccttacaacctgaatcaacatcttgtataatcccatggaatgcatttatgcataaaccaacaatcagcatcaaatcatattcaatcaacagcaacatata 260  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||   || |||||||||    
T  7301222 ccttacaacctgaactaacatcttgtataatctaattgaatgcatttatgcataaaccaacaatcaacagcaaatcatattcaat--tcaacaacatata 7301125  T
Q  261 gtaataagcagcgagacaacaacgataataaccatcatatacaacaagtaggactcatatcaacatctttcatgatatataactatctcctcatttgttc 360  Q
     ||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7301124 ataacaagcagcgagacaacgaccataataaccatcatatacaacgagtaggactcatatcaacatctttcataatatataactatctcctcatttgttc 7301025  T
Q  361 atcaacctaagtcgacgtcattaaacattataaacatcctct 402  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||    
T  7301024 atcaacctaagtcgatgtcattaaacattacaaacgtcctct 7300983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 255 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 21415294 - 21415147
Alignment:
Q  255 catatagtaataagcagcgagacaacaacgataataaccatcatatacaacaagtaggactcatatcaacatctttcatgatatataactatctcctcat 354  Q
    |||||| ||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  21415294 catataataataagcagcaagtcaacaacaataataatcatcatatacaacaagtataactcatatcaacatctttcataatatttaactatctcctcat 21415195  T
Q  355 ttgttcatcaacctaagtcgacgtcattaaacattataaacatcctct 402  Q
    ||||| || ||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21415194 ttgtttattaacttaaatcgacgtcattaaacattatatacatcctct 21415147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 63 - 256
Target Start/End: Original strand, 363828 - 364020
Alignment:
Q  63 acaacgataacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgtcaacttgcaac- 161  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  363828 acaacgacaacaactgtgcataataact-atgacttactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaact 363926  T
Q  162 cttacaacctgaatcaacatcttgtataatcccatggaatgcatttatgcataaaccaacaatcagcatcaaatcatattcaatcaacagcaaca 256  Q
     |||||||  ||| | ||| ||||| || ||  |||||||||| |||  ||||||| | ||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||    
T  363927 tttacaactcgaacctacaccttgtgtattctaatggaatgcagttaaacataaactagcaatcagcaac-aatcatactcaatcaacagcaaca 364020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 20 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 24708087 - 24707859
Alignment:
Q  20 atcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacat 119  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||      | ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  24708087 atcagcatacaactcaactacgacaacgacaacataggcaacaacaacga------ccgtgcacaataact-atgactcactccccaacttggtcaacat 24707995  T
Q  120 caacaacctatgactccgttacttagaacgtcaacttgcaaccttacaacctgaatcaacatcttgtataatcccatggaatgcatttatgcataaacca 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || | |||||  ||| ||||||||| ||| |||||  ||||||| ||  || ||||||| ||| | ||||||||    
T  24707994 caacaacctatgactccgttacttataatgacaactcacaa-cttacaacccgaaccaacacattgtatattctaattgaatgcagttaagtataaacca 24707896  T
Q  220 acaatcagcatcaaatcat-attcaatcaacagcaaca 256  Q
     || ||| || | |||||| ||||||||||||||||||    
T  24707895 gcattcatcaac-aatcataattcaatcaacagcaaca 24707859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 63 - 256
Target Start/End: Original strand, 44431901 - 44432093
Alignment:
Q  63 acaacgataacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgtcaacttgcaac- 161  Q
    ||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||     
T  44431901 acaacgacaacaattgtgcataataact-atgacttactccccaacttggtcaacatcaacaacatatgactccgttatttagaacgacaacttgcaact 44431999  T
Q  162 cttacaacctgaatcaacatcttgtataatcccatggaatgcatttatgcataaaccaacaatcagcatcaaatcatattcaatcaacagcaaca 256  Q
     |||||||  ||| | ||| ||||| || ||  |||||||| | |||  ||||||||| ||||||||| | ||||||| |||||||||| |||||    
T  44432000 tttacaactcgaacctacaccttgtgtattctaatggaatgtagttaaacataaaccatcaatcagcaac-aatcatactcaatcaacaacaaca 44432093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 63 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 22059633 - 22059542
Alignment:
Q  63 acaacgataacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgtcaact 155  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22059633 acaacgacaacgaccgtgcataataact-atgactcactccccaacttgatcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgacaact 22059542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 64 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 22145628 - 22145439
Alignment:
Q  64 caacgataacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgtcaacttgcaacct 163  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||    
T  22145628 caacgacaacgaccgtgcataataact-atgactcactccccaacttgatcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgacaactcgcca-ct 22145531  T
Q  164 tacaacctgaatcaacatcttgtataatcccatggaatgcatttatgcataaaccaacaatcagcatcaaatcatattcaatcaacagcaaca 256  Q
    ||||||  ||| |||||  ||||| | ||  || ||||||| ||| | |||||||| | ||||  | | ||||||| ||||||||||||||||    
T  22145530 tacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcgatcattaac-aatcataatcaatcaacagcaaca 22145439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 20 - 147
Target Start/End: Original strand, 17795238 - 17795356
Alignment:
Q  20 atcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacat 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||| ||||||||       ||||||||||||| |   || |||||||||||||||||||||    
T  17795238 atcaacatacaactcaactacgacagcgacaacataggcaacgacaacgatc------gtgcataataactca---ctcactccccaacttggtcaacat 17795328  T
Q  120 caacaacctatgactccgttacttagaa 147  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17795329 caacaacctatgactccgttacttagaa 17795356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 20 - 147
Target Start/End: Original strand, 17614759 - 17614879
Alignment:
Q  20 atcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacat 119  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||      |||||| |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||| | |||||||    
T  17614759 atcagcatacaactcgactacgacaacgacaacatagg------caacgacaacgaccgtgcataataact-atgactcactccccaactcgatcaacat 17614851  T
Q  120 caacaacctatgactccgttacttagaa 147  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||    
T  17614852 caaccacctatgactccgttacttagaa 17614879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 99 - 147
Target Start/End: Original strand, 28853862 - 28853910
Alignment:
Q  99 actccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaa 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28853862 actccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaa 28853910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 49
Target Start/End: Complemental strand, 7301336 - 7301307
Alignment:
Q  20 atcaacatacaactcaactacgacaacgac 49  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7301336 atcaacatacaactcaactacgacaacgac 7301307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 60 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 18024633 - 18024576
Alignment:
Q  60 acaacaacgataacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaac 117  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||||  | |||||||||||||| |||||||||||||    
T  18024633 acaacgacgacaacaactgtgcataaataattatgacttactccacaacttggtcaac 18024576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 72 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 27941764 - 27941716
Alignment:
Q  72 acgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacatc 120  Q
    ||||||||||||||  | |||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  27941764 acgactgtgcataaataattataacttactccacaacttggtcaacatc 27941716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525 (Bit Score: 296; Significance: 1e-166; HSPs: 2)
Name: scaffold0525
Description:

Target: scaffold0525; HSP #1
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 20 - 402
Target Start/End: Original strand, 8988 - 9371
Alignment:
Q  20 atcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacat 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8988 atcaacatacaactcaactacgacaacgacaacataggcaacaacaacgacaacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacatggtcaacat 9087  T
Q  120 caacaacctatgactccgttacttagaacgtcaacttgcaaccttacaacctgaatcaacatcttgtataatcccatggaatgcatttatgcataaacca 219  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  9088 caacaacctatgactcagttacttagaacgacaacttgcaaccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgcatttatgcataaacca 9187  T
Q  220 acaatcagcatcaaatcatattcaa-tcaacagcaacatatagtaataagcagcgagacaacaacgataataaccatcatatacaacaagtaggactcat 318  Q
    |||||||||| | |||||||||||| |||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9188 acaatcagcagcgaatcatattcaattcaacaacaacatataacaataagcagcgagacaacaacaataataaccatcatatacaacgagtaggactcat 9287  T
Q  319 atcaacatctttcatgatatataactatctcctcatttgttcatcaacctaagtcgacgtcattaaacattataaacatcctct 402  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  9288 atcaacatctttcataatatataactatctcctcatttgttcatcaacctaagtcgacgtcattaaaccttaccaacatcctct 9371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 20 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 11154 - 11026
Alignment:
Q  20 atcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacat 119  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||      | |||| |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||    
T  11154 atcagcatacaactcaactacgacaacgacaacatagg------cgacgacaacgaccgtgcataataact-atgactcactccccaacttgatcaacat 11062  T
Q  120 caacaacctatgactccgttacttagaacgtcaact 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11061 caacaacctatgactccgttacttagaacgacaact 11026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 232; Significance: 1e-128; HSPs: 16)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 61 - 402
Target Start/End: Original strand, 20579321 - 20579665
Alignment:
Q  61 caacaacgataacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgtcaacttgcaa 160  Q
    |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20579321 caactacgacaacgactgtgcatagtaacttatgacttactccccaacttggccaacatcaacaacctatggctccgttacttagaacgacaacttgcaa 20579420  T
Q  161 ccttacaacctgaatcaacatcttgtataatcccatggaatgcatttatgcataaaccaacaatcagcatcaaatcatattcaa-tcaacagcaacat-- 257  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||      
T  20579421 ccttacaacccgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgcatttatgcataaaccaacaatcagcagcaaatcatattcaattcaacaacaacatat 20579520  T
Q  258 -atagtaataagcagcgagacaacaacgataataaccatcatatacaacaagtaggactcatatcaacatctttcatgatatataactatctcctcattt 356  Q
     ||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  20579521 aataataataagtagcgagac-acaacaataataaccatcatatacaacgagtaggactcatatcaacatctttcataacatataactatctcctcattt 20579619  T
Q  357 gttcatcaacctaagtcgacgtcattaaacattataaacatcctct 402  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  20579620 gttcatcgacctaagtcgacgtcattaaacactacaaacatcctct 20579665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 20 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 2333258 - 2333021
Alignment:
Q  20 atcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacat 119  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||  | ||| ||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2333258 atcagcatacaacttaactacgacaacgacaacatgtgcaacgacaaccacaacgacggtgcataataact-atgacttactccccaacttggtcaacat 2333160  T
Q  120 caacaacctatgactccgttacttagaacgtcaacttgcaaccttacaacctgaatcaacatcttgtataatcccatggaatgcatttatgcataaacca 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||   ||| |||||||| ||  || ||||||| ||||||| ||||||    
T  2333159 caacaacctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaactttacaactcgaactcacaccttgtatattctaattgaatgcagttatgcacaaacca 2333060  T
Q  220 acaatcagcatcaaatcatattcaatcaacagcaacata 258  Q
     || |||||| |||| ||||||||||||| |||||||||    
T  2333059 gcagtcagcaacaaaacatattcaatcaatagcaacata 2333021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 63 - 256
Target Start/End: Original strand, 294075 - 294267
Alignment:
Q  63 acaacgataacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgtcaacttgcaacc 162  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  294075 acaacgacaacaactgtgcataataact-atgacttactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaact 294173  T
Q  163 t-tacaacctgaatcaacatcttgtataatcccatggaatgcatttatgcataaaccaacaatcagcatcaaatcatattcaatcaacagcaaca 256  Q
    | ||||||  |||   ||| ||||| || ||  |||||||||| ||| |||||||| | ||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||    
T  294174 tctacaactcgaacttacaccttgtgtattctaatggaatgcagttaagcataaactagcaatcagcaac-aatcatattcaattaacagcaaca 294267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 20 - 256
Target Start/End: Original strand, 20631156 - 20631383
Alignment:
Q  20 atcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacat 119  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||      |||||| |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||    
T  20631156 atcagcatacaactcaactacgacaacgacaacatagg------caacgacaacgaccgtgcataataact-atgactcactccccaacttgatcaacat 20631248  T
Q  120 caacaacctatgactccgttacttagaacgtcaacttgcaaccttacaacctgaatcaacatcttgtataatcccatggaatgcatttatgcataaacca 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||  ||| |||||  ||||| | ||  || ||||||| ||| | ||||||||    
T  20631249 caacaacctatgactccgttacttagaacgacaactcgcca-cttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcagttaagtataaacca 20631347  T
Q  220 acaatcagcatcaaatcatattcaatcaacagcaaca 256  Q
     | ||||  | | ||||||| ||||||||||||||||    
T  20631348 gcgatcattaac-aatcataatcaatcaacagcaaca 20631383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 20 - 256
Target Start/End: Original strand, 37358312 - 37358538
Alignment:
Q  20 atcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacat 119  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||      |||||| |||||| ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  37358312 atcagcatacaactcaactacgacaacgacaacatagg------caacgacaacgaccgtgcacaataact-atgactcactccccaacttggtcaacat 37358404  T
Q  120 caacaacctatgactccgttacttagaacgtcaacttgcaaccttacaacctgaatcaacatcttgtataatcccatggaatgcatttatgcataaacca 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  ||| ||||||||| ||| |||||  ||||||| ||  |  ||||||| ||| | ||||||||    
T  37358405 caacaacctatgactccgttacttataacgacaactcacaa-cttacaacc-gaaccaacacattgtatattctaactgaatgcagttaagtataaacca 37358502  T
Q  220 acaatcagcatcaaatcatattcaatcaacagcaaca 256  Q
     || ||| || | ||||||| ||||||||||||||||    
T  37358503 gcattcatcaac-aatcataatcaatcaacagcaaca 37358538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 20 - 155
Target Start/End: Original strand, 36181415 - 36181543
Alignment:
Q  20 atcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacat 119  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||      |||||| |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||    
T  36181415 atcagcatacaactcaactacgacaacgacaacatagg------caacgacaacgaccgtgcataataact-atgactcactccccaacttgatcaacat 36181507  T
Q  120 caacaacctatgactccgttacttagaacgtcaact 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  36181508 caacaacctatgactccgttacttagaacgacaact 36181543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 64 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 14432595 - 14432505
Alignment:
Q  64 caacgataacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgtcaact 155  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14432595 caacgacaacgaccgtgcataataact-atgactcactccccaacttgatcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgacaact 14432505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 78 - 161
Target Start/End: Original strand, 24087311 - 24087393
Alignment:
Q  78 gtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgtcaacttgcaac 161  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  24087311 gtgcataataact-atgacatactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgacaactcgcaac 24087393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 20 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 22900531 - 22900409
Alignment:
Q  20 atcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacat 119  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||      |||||| |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||| | |||||||    
T  22900531 atcagcatacaactcaactacgacaacgacaacatagg------caacgacaacgaccgtgcataataact-atgactcactccccaactcgatcaacat 22900439  T
Q  120 caacaacctatgactccgttacttagaacg 149  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  22900438 caaccacctatgactccgttacttggaacg 22900409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 20 - 143
Target Start/End: Original strand, 45307131 - 45307245
Alignment:
Q  20 atcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacat 119  Q
    |||| |||||||||||||||||||| | |||| ||||| ||| ||||||||       ||||||||||||| |   || |||||||||||||||||||||    
T  45307131 atcagcatacaactcaactacgacagcaacaacataggcaacgacaacgatc------gtgcataataactca---ctcactccccaacttggtcaacat 45307221  T
Q  120 caacaacctatgactccgttactt 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  45307222 caacaacctatgactccgttactt 45307245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 99 - 147
Target Start/End: Original strand, 296431 - 296479
Alignment:
Q  99 actccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaa 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  296431 actccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaa 296479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 75 - 136
Target Start/End: Original strand, 28312446 - 28312507
Alignment:
Q  75 actgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactcc 136  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  28312446 actgtgcataaataattatgacttactccacaacttggtcaacatcaacaacttaagactcc 28312507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 75 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 20438182 - 20438131
Alignment:
Q  75 actgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacatcaacaac 126  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20438182 actgtgcataaataattatgacttactccacaacttggtcaacatcaacaac 20438131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 63 - 117
Target Start/End: Original strand, 16400803 - 16400857
Alignment:
Q  63 acaacgataacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaac 117  Q
    ||||||| |||||||||||||||  | |||||||||||| | |||||||||||||    
T  16400803 acaacgacaacgactgtgcataaataattatgacttacttcacaacttggtcaac 16400857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 49
Target Start/End: Original strand, 20579307 - 20579336
Alignment:
Q  20 atcaacatacaactcaactacgacaacgac 49  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20579307 atcaacatacaactcaactacgacaacgac 20579336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 49
Target Start/End: Original strand, 20587000 - 20587029
Alignment:
Q  20 atcaacatacaactcaactacgacaacgac 49  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20587000 atcaacatacaactcaactacgacaacgac 20587029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 99; Significance: 1e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 63 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 8740 - 8548
Alignment:
Q  63 acaacgataacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgtcaacttgcaac- 161  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  8740 acaacgacaacaactgtgcataataact-atgacttactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaact 8642  T
Q  162 cttacaacctgaatcaacatcttgtataatcccatggaatgcatttatgcataaaccaacaatcagcatcaaatcatattcaatcaacagcaaca 256  Q
     |||||||  ||| | ||| ||||| || ||  |||||||||| ||| |||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  8641 tttacaactcgaacctacaccttgtgtattctaatggaatgcagttaagcataaaccagcaatcagcaac-aatcatattcaatcaacaacaaca 8548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 63 - 255
Target Start/End: Original strand, 2379 - 2570
Alignment:
Q  63 acaacgataacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgtcaacttgcaac- 161  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  2379 acaacgacaacaactgtgcataataact-atgacttactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaact 2477  T
Q  162 cttacaacctgaatcaacatcttgtataatcccatggaatgcatttatgcataaaccaacaatcagcatcaaatcatattcaatcaacagcaac 255  Q
     |||||||  ||| | ||| ||||| || ||  |||||||| | |||  ||||||||| ||||||||| | ||||||| |||||||||||||||    
T  2478 tttacaactcgaacctacaccttgtgtattctaatggaatgtagttaaacataaaccagcaatcagcaac-aatcatactcaatcaacagcaac 2570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0586 (Bit Score: 89; Significance: 9e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0586
Description:

Target: scaffold0586; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 262 - 402
Target Start/End: Original strand, 1914 - 2054
Alignment:
Q  262 taataagcagcgagacaacaacgataataaccatcatatacaacaagtaggactcatatcaacatctttcatgatatataactatctcctcatttgttca 361  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |    
T  1914 taataagcagcaagtcaacaacaataataatcatcatatacaacaagtataactcatatcaacatctttcataatatttaactatctcctcatttgttta 2013  T
Q  362 tcaacctaagtcgacgtcattaaacattataaacatcctct 402  Q
    | ||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2014 ttaacttaaatcgacgtcattaaacattatatacatcctct 2054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 63 - 256
Target Start/End: Original strand, 137815 - 138007
Alignment:
Q  63 acaacgataacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgtcaacttgcaacc 162  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||      
T  137815 acaacgacaacaactgtgcataataact-atgacttactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccattacttagaacgacaacttgcaaat 137913  T
Q  163 tt-acaacctgaatcaacatcttgtataatcccatggaatgcatttatgcataaaccaacaatcagcatcaaatcatattcaatcaacagcaaca 256  Q
    || |||||  ||| | ||| ||||| || ||  |||||||| | |||  ||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  137914 tttacaactcgaacctacaccttgtgtattctaatggaatgaagttaaacataaaccagcaatcagcaacaa-tcatactcaatcaacagcaaca 138007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 74; Significance: 8e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 95 - 255
Target Start/End: Original strand, 162355 - 162515
Alignment:
Q  95 acttactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgtcaacttgcaac-cttacaacctgaatcaacatcttgtataatcc 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||  ||| | ||| ||||| || ||     
T  162355 acttactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgacaacttgcaacttttacaactcgaacctacaccttgtgtattct 162454  T
Q  194 catggaatgcatttatgcataaaccaacaatcagcatcaaatcatattcaatcaacagcaac 255  Q
     |||||||||| |||  ||||||| | ||||||||| | ||||||| |||||||||||||||    
T  162455 aatggaatgcagttaaacataaactagcaatcagcaac-aatcataatcaatcaacagcaac 162515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 59; Significance: 7e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 64 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 134209 - 134027
Alignment:
Q  64 caacgataacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaacgtcaacttgcaacct 163  Q
    |||||| |||||| ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||  ||| ||    
T  134209 caacgacaacgaccgtgcacaataact-atgactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgtttcttataacgacaactcacaa-ct 134112  T
Q  164 tacaacctgaatcaacatcttgtataatcccatggaatgcatttatgcataaaccaacaatcagcatcaaatcatattcaatcaaca 250  Q
    ||||||| ||| |||||  ||||||| ||  || ||||||| ||| | |||||||| || ||| || | ||||||| ||||||||||    
T  134111 tacaacc-gaaccaacacattgtatattctaattgaatgcagttaagtataaaccagcattcatcaac-aatcataatcaatcaaca 134027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 20 - 155
Target Start/End: Original strand, 1540 - 1668
Alignment:
Q  20 atcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacat 119  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||      |||||| |||||| ||||||||||||| |||||| |||||| |||| | |||||||    
T  1540 atcagcatacaactcaactacgacaacgacaacatagg------caacgacaacgaccgtgcataataact-atgactcactcccaaactcgatcaacat 1632  T
Q  120 caacaacctatgactccgttacttagaacgtcaact 155  Q
    || | ||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  1633 cacccacctaagactccgttacttagaacgacaact 1668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 20 - 147
Target Start/End: Original strand, 33007 - 33125
Alignment:
Q  20 atcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacat 119  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||       ||||||||||||| |   || |||||||||||||||||||||    
T  33007 atcagcatacaactcaactacgacaacaacaacataggtgacgacaacgatc------gtgcataataactca---ctcactccccaacttggtcaacat 33097  T
Q  120 caacaacctatgactccgttacttagaa 147  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||    
T  33098 caacaacctatgactctgttacttagaa 33125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 20 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 81805 - 81687
Alignment:
Q  20 atcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacat 119  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||       ||||||||||||| |   || |||||||||||||||||||||    
T  81805 atcagcatacaactcaactacgacaacaacaacataggtgacgacaacgatc------gtgcataataactca---ctcactccccaacttggtcaacat 81715  T
Q  120 caacaacctatgactccgttacttagaa 147  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||    
T  81714 caacaacctatgactctgttacttagaa 81687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 90 - 136
Target Start/End: Original strand, 132864 - 132910
Alignment:
Q  90 ttatgacttactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactcc 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  132864 ttatgacttactccacaacttggtcaacatcaacaacttaagactcc 132910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0337 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0337
Description:

Target: scaffold0337; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 75 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 9908 - 9847
Alignment:
Q  75 actgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactcc 136  Q
    |||||||||||  | |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  9908 actgtgcataaataattataacttactccacaacttggtcaacatcaacaacttaagactcc 9847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 75 - 126
Target Start/End: Original strand, 21170 - 21221
Alignment:
Q  75 actgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacatcaacaac 126  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  21170 actgtgcataaataattatgacttactccacaacttggtcaacattaacaac 21221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 63 - 117
Target Start/End: Original strand, 8193 - 8247
Alignment:
Q  63 acaacgataacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaac 117  Q
    ||||||| ||| |||||||||||  | |||||||||||||| |||||||||||||    
T  8193 acaacgacaacaactgtgcataaataattatgacttactccacaacttggtcaac 8247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0453 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0453
Description:

Target: scaffold0453; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 20 - 114
Target Start/End: Original strand, 3131 - 3222
Alignment:
Q  20 atcaacatacaactcaactacgacaacgacaatataggtaacaacaacgataacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtc 114  Q
    |||||||||||||||| | ||  |||||||||  |||   ||||| || ||||| |||||||||||  | |||||||||||||| ||||||||||    
T  3131 atcaacatacaactcagcaacatcaacgacaacgtag---acaacgacaataacaactgtgcataaataattatgacttactccacaacttggtc 3222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University