View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF9839A_low_72 (Length: 385)

Name: NF9839A_low_72
Description: NF9839A
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF9839A_low_72
NF9839A_low_72
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (16-384)||(183239-183606)
scaffold0003 (1-153)||(165946-166098)
[»] chr3 (15 HSPs)
chr3 (1-371)||(52918439-52918808)
chr3 (1-376)||(11369052-11369425)
chr3 (1-369)||(10968221-10968588)
chr3 (1-374)||(50410581-50410953)
chr3 (33-372)||(33216-33554)
chr3 (1-374)||(10111013-10111384)
chr3 (1-371)||(10000820-10001188)
chr3 (1-371)||(13530452-13530821)
chr3 (1-357)||(10039043-10039386)
chr3 (1-229)||(10237967-10238194)
chr3 (224-384)||(10244920-10245079)
chr3 (250-355)||(10250418-10250523)
chr3 (250-355)||(10013718-10013823)
chr3 (250-355)||(10113314-10113419)
chr3 (246-384)||(27275059-27275190)
[»] chr7 (8 HSPs)
chr7 (22-374)||(9000579-9000930)
chr7 (16-384)||(42232427-42232794)
chr7 (47-371)||(12780585-12780908)
chr7 (56-383)||(12785427-12785753)
chr7 (1-384)||(21069497-21069868)
chr7 (22-371)||(7037154-7037502)
chr7 (1-320)||(22844216-22844534)
chr7 (1-188)||(5828174-5828361)
[»] chr5 (13 HSPs)
chr5 (1-376)||(3690390-3690764)
chr5 (1-376)||(3876023-3876397)
chr5 (33-383)||(27881529-27881878)
chr5 (22-383)||(8428010-8428370)
chr5 (16-384)||(25542218-25542584)
chr5 (47-383)||(37373395-37373730)
chr5 (1-384)||(14192236-14192618)
chr5 (1-374)||(30346064-30346435)
chr5 (1-384)||(37261716-37262097)
chr5 (16-384)||(10025406-10025772)
chr5 (1-384)||(24629384-24629759)
chr5 (32-384)||(39883627-39883970)
chr5 (1-320)||(17871127-17871444)
[»] chr8 (5 HSPs)
chr8 (22-383)||(25217990-25218350)
chr8 (22-383)||(30325909-30326269)
chr8 (1-384)||(21113169-21113550)
chr8 (22-384)||(7822272-7822627)
chr8 (32-372)||(25208483-25208822)
[»] chr4 (9 HSPs)
chr4 (22-383)||(35856341-35856701)
chr4 (32-384)||(49710616-49710967)
chr4 (16-374)||(55558558-55558914)
chr4 (94-383)||(13344441-13344729)
chr4 (56-371)||(49786289-49786603)
chr4 (22-275)||(13337669-13337921)
chr4 (1-100)||(1861090-1861189)
chr4 (333-380)||(5337035-5337082)
chr4 (1-75)||(617956-618030)
[»] chr2 (12 HSPs)
chr2 (19-371)||(24246256-24246605)
chr2 (22-384)||(21395804-21396165)
chr2 (1-384)||(27192902-27193283)
chr2 (1-384)||(27842716-27843097)
chr2 (16-371)||(27509802-27510156)
chr2 (1-384)||(35610066-35610447)
chr2 (56-383)||(41919622-41919948)
chr2 (1-384)||(24268495-24268876)
chr2 (56-383)||(28665621-28665947)
chr2 (56-383)||(37824455-37824781)
chr2 (126-371)||(17683350-17683594)
chr2 (1-65)||(3643005-3643069)
[»] scaffold0107 (1 HSPs)
scaffold0107 (47-384)||(42434-42770)
[»] scaffold0225 (1 HSPs)
scaffold0225 (1-384)||(13702-14083)
[»] scaffold0118 (1 HSPs)
scaffold0118 (1-384)||(28144-28525)
[»] chr6 (9 HSPs)
chr6 (22-384)||(12517708-12518069)
chr6 (1-320)||(30881739-30882056)
chr6 (144-384)||(2200322-2200561)
chr6 (126-371)||(10188560-10188804)
chr6 (1-148)||(2201838-2201985)
chr6 (309-384)||(15334016-15334091)
chr6 (294-371)||(18857238-18857318)
chr6 (1-75)||(18344538-18344612)
chr6 (44-110)||(18857161-18857227)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (1-384)||(186967-187346)
[»] chr1 (10 HSPs)
chr1 (34-383)||(6310419-6310767)
chr1 (32-384)||(16042469-16042818)
chr1 (16-384)||(36207643-36208010)
chr1 (1-384)||(52500990-52501365)
chr1 (1-234)||(2452690-2452923)
chr1 (37-374)||(2329615-2329951)
chr1 (22-327)||(37389633-37389937)
chr1 (1-218)||(48774924-48775141)
chr1 (269-384)||(48774807-48774922)
chr1 (16-75)||(48233806-48233865)
[»] scaffold1139 (1 HSPs)
scaffold1139 (14-385)||(1443-1813)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (1-384)||(4685-5066)
[»] scaffold0073 (2 HSPs)
scaffold0073 (22-384)||(32366-32727)
scaffold0073 (32-371)||(195-533)
[»] scaffold0262 (1 HSPs)
scaffold0262 (1-370)||(19418-19785)
[»] scaffold0550 (1 HSPs)
scaffold0550 (9-374)||(2-370)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (56-383)||(48385-48711)
[»] scaffold0356 (1 HSPs)
scaffold0356 (1-320)||(17365-17683)
[»] scaffold0002 (2 HSPs)
scaffold0002 (1-320)||(320824-321142)
scaffold0002 (207-371)||(319153-319314)


Alignment Details
Target: scaffold0003 (Bit Score: 265; Significance: 1e-148; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 16 - 384
Target Start/End: Original strand, 183239 - 183606
Alignment:
Q  16 tccttttcggacaatgggcaatatcttccagaaatcaccacctaaaactactgtcattccaccaaaaggtctaaactcgtttagggggtcattcttggac 115  Q
    ||||||||||||||  | |||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  183239 tccttttcggacaacagacaatatctgcctgaaatcaccacctaaaactactatcattccaccaaaaggtctaaactcgtttaggggatcattcttggat 183338  T
Q  116 atgatatcacgcattgatcggtcaactgcctcaaaacaccatcagtgcatcattggagcctcattccaaattatcaactttgcagcacgcaccaggtctg 215  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  183339 atgatatcatgcattgattggtcaactgcctcaaaacaccatcggtacatcattggagcctaatcccaaattattaactttgcagcacgcaccaggtctg 183438  T
Q  216 cccctaggactatccttttccatcgtaagcgatgatgcctcattaatcttaacagggactgttagcgtcgaatgcgcagttcttccacctggtaatagaa 315  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  183439 -ccctaggactatccttttccatcgtaagcgatgatgcctcattaatctcaatagggactggtagcgtcgagtgcgcggttcttccacctggtaatagaa 183537  T
Q  316 gagccgctataccactggatgcaacattcaatacaattaaccccttcgatctaacagcaaccaacaatg 384  Q
    ||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  183538 gagtcgctatatcgctggatgcaacattcaatacaattaaccccttcgatctaacagcaactaacaatg 183606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Original strand, 165946 - 166098
Alignment:
Q  1 aatatcatgccttgatccttttcggacaatgggcaatatcttccagaaatcaccacctaaaactactgtcattccaccaaaaggtctaaactcgtttagg 100  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||||||  | |||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  165946 aatatcctgcctcgttccttttcggacaacagacaatatctgcctgaaatcaccacctaaaactactatcattccaccaaaaggtctaaactcgtttagg 166045  T
Q  101 gggtcattcttggacatgatatcacgcattgatcggtcaactgcctcaaaaca 153  Q
     | ||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  166046 tgatcattcttggatatgatatcatgcattgattggtcaactgcctcaaaaca 166098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 259; Significance: 1e-144; HSPs: 15)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 1 - 371
Target Start/End: Original strand, 52918439 - 52918808
Alignment:
Q  1 aatatcatgccttgatccttttcggacaatgggcaatatcttccagaaatcaccacctaaaactactgtcattccaccaaaaggtctaaactcgtttagg 100  Q
    |||||| | ||| |||||||||||||| |   ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  52918439 aatatcctccctcgatccttttcggactacatgcaatatctgcctgaaatcaccacctaaaactactgtcattccaccaaaaggtctaaacttgtttagg 52918538  T
Q  101 gggtcattcttggacatgatatcacgcattgatcggtcaactgcctcaaaacaccatcagtgcatcattggagcctcattccaaattatcaactttgcag 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  52918539 ggatcattcttggacatgatatcacgcaatgatcggtcaactgcctcaaaacaccatcggtgcatcattggagcctcatcccaaattatcaactttgcag 52918638  T
Q  201 cacgcaccaggtctgcccctaggactatccttttccatcgtaagcgatgatgcctcattaatcttaacagggactgttagcgtcgaatgcgcagttcttc 300  Q
    ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| || | ||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  52918639 cacgcaccaggtct-accctaggattatccttttccatcgtaagcgatgacggctcattaatctcaataaggactgtcagcgtcgagtgcgcggttcttc 52918737  T
Q  301 cacctggtaatagaagagccgctataccactggatgcaacattcaatacaattaaccccttcgatctaaca 371  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52918738 cacctggtaatagaagagccgatataccgctggatgcaacattcaatacaattaaccccttcgatctaaca 52918808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 376
Target Start/End: Original strand, 11369052 - 11369425
Alignment:
Q  1 aatatcatgccttgatccttttcggacaatgggcaatatcttccagaaatcaccacctaaaactactgtcattccaccaaaaggtctaaactcgtttagg 100  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||||||  | |||||| | || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11369052 aatatcctgcctcgttccttttcggacaacagacaatatatgcctgaaatcaccacttaaaactactgtcattccaccaaaaggtctaaactcgtatagg 11369151  T
Q  101 gggtcattcttggacatgatatcacgcattgatcggtcaactgcctcaaaacaccatcagtgcatcattggagcctcattccaaattatcaactttgcag 200  Q
    || ||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  11369152 ggatcattcttggatatgatatcatgcattgattggtcaactgcctcaaaacaccatcggtgcatcattggagcctcatcccaaattatcaactttgaag 11369251  T
Q  201 cacgcaccaggtctgcccctaggactatccttttccatcgtaagcgatgatgcctcattaatcttaacagggactgttagcgtcgaatgcgcagttcttc 300  Q
    || ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| | |||||||    
T  11369252 catgcaccaggtctg--cctaggactatccttttccatcttaagcgatgatgcctcattaatctcaacagggactgttagcgtcgagtgcacggttcttc 11369349  T
Q  301 cacctggtaatagaagagccgctataccactggatgcaacattcaatacaattaaccccttcgatctaacagcaac 376  Q
    |||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11369350 cacctggtaatagaagagtcgatataccgctggatgcaacattcaatacaattaaccccttcgatctaacagcaac 11369425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 10968588 - 10968221
Alignment:
Q  1 aatatcatgccttgatccttttcggacaatgggcaatatcttccagaaatcaccacctaaaactactgtcattccaccaaaaggtctaaactcgtttagg 100  Q
    |||||| | ||| ||||| |||||||| |  | |||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10968588 aatatcctccctcgatccgtttcggactacagacaatatctgcctgaaatcaccatctaaaactactgtcattccaccaaaaggtctaaaatcgtttagg 10968489  T
Q  101 gggtcattcttggacatgatatcacgcattgatcggtcaactgcctcaaaacaccatcagtgcatcattggagcctcattccaaattatcaactttgcag 200  Q
    || |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10968488 ggatcattcttggacctgatatcatgcattgatcggtcaactgcctcaaaacaccatcggtgcatcattggagcctcatcccaaattatcaactttgcag 10968389  T
Q  201 cacgcaccaggtctgcccctaggactatccttttccatcgtaagcgatgatgcctcattaatcttaacagggactgttagcgtcgaatgcgcagttcttc 300  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  10968388 cacgcaccaggtctg-ccctaggactatccttttccatcgtaagcgatgacgcctcattaatctcaatagggactgtcggcgtcgagtgcgcagttcttc 10968290  T
Q  301 cacctggtaatagaagagccgctataccactggatgcaacattcaatacaattaaccccttcgatctaa 369  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10968289 cacctggtaatagaatagtcgctataccgttggatgcagcattcaatacaattaaccccttcgatctaa 10968221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 374
Target Start/End: Original strand, 50410581 - 50410953
Alignment:
Q  1 aatatcatgccttgatccttttcggacaatgggcaatatcttccagaaatcaccacctaaaactactgtcattccaccaaaaggtctaaactcgtttagg 100  Q
    |||||| ||||| | | |||| |||||||  |||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  50410581 aatatcgtgcctcgttgctttacggacaacaggcagtatctgcctgaaatcaccacctaaaactactgtcattccacgaaaaggtataaactcgtttagg 50410680  T
Q  101 gggtcattcttggacatgatatcacgcattgatcggtcaactgcctcaaaacaccatcagtgcatcattggagcctcattccaaattatcaactttgcag 200  Q
    || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  50410681 ggatcattcttggacatgatatcacacattgatcggtcaactgcctcaaaacaccattggtgcatcattggagcctcatcacaaattatcaactttgcag 50410780  T
Q  201 cacgcaccaggtctgcccctaggactatccttttccatcgtaagcgatgatgcctcattaatcttaacagggactgttagcgtcgaatgcgcagttcttc 300  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||| || ||| ||||| ||||| |||||||    
T  50410781 cacgcaccaggtctg-ccctaggactatccttttccatcgtaagcgatgatgcctccttaatctcaatagggattgctagtgtcgagtgcgcggttcttc 50410879  T
Q  301 cacctggtaatagaagagccgctataccactggatgcaacattcaatacaattaaccccttcgatctaacagca 374  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  50410880 cacctggtaatagaagagctgctataccgctggatgcagcattcaatacaattaaccctttcgatctaacagca 50410953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 33 - 372
Target Start/End: Original strand, 33216 - 33554
Alignment:
Q  33 gcaatatcttccagaaatcaccacctaaaactactgtcattccaccaaaaggtctaaactcgtttagggggtcattcttggacatgatatcacgcattga 132  Q
    ||||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  33216 gcaatatctgcctaaaatcaccacctaaaactattgtcattccaccaaaaggtttaagtgcgtttaggggatcattcttggacatgatatcacgcaatga 33315  T
Q  133 tcggtcaactgcctcaaaacaccatcagtgcatcattggagcctcattccaaattatcaactttgcagcacgcaccaggtctgcccctaggactatcctt 232  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33316 tcggtcaactgcctcaaaacaccatcggtgcatcatcggagcctcatcccaaattatcaactatgcagcacgcaccaggtctg-ccctaggactatcctt 33414  T
Q  233 ttccatcgtaagcgatgatgcctcattaatcttaacagggactgttagcgtcgaatgcgcagttcttccacctggtaatagaagagccgctataccactg 332  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||  |||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||    
T  33415 ttccatcgtaagcgatgatgcctcattaatctcaatagggactgtcggcgtggagtgcgcggttcttccacctggtaatagaagagccgctatacggttg 33514  T
Q  333 gatgcaacattcaatacaattaaccccttcgatctaacag 372  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33515 gatgcaacattcaatacaattaacccattcgatctaacag 33554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 374
Target Start/End: Original strand, 10111013 - 10111384
Alignment:
Q  1 aatatcatgccttgatccttttcggacaatgggcaatatcttccagaaatcaccacctaaaactactgtcattccaccaaaaggtctaaactcgtttagg 100  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||||||  |||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  10111013 aatatcctgcctcgttccttttcggacaacaggcaatatctgcctgaaatcaccacctaaaactattgtcattccatcaaatggtttaaactcgtttagg 10111112  T
Q  101 gggtcattcttggacatgatatcacgcattgatcggtcaactgcctcaaaacaccatcagtgcatcattggagcctcattccaaattatcaactttgcag 200  Q
    |  |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10111113 gaatcattcttggacatgataccacacattgatcggtcaactgcctcaaaacaccatcagtgcatcattagagcctcatcccaaattatcaactttgcag 10111212  T
Q  201 cacgcaccaggtctgcccctaggactatccttttccatcgtaagcgatgatgcctcattaatcttaacagggactgttagcgtcgaatgcgcagttcttc 300  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| || ||||||||| ||||||   || || |||||||    
T  10111213 cacgcaccaagtctg-ccctaggactatccttttccatcgtaagagatgatgcctca-taatctcaatagggactgtcagcgtcaggtgtgcggttcttc 10111310  T
Q  301 cacctggtaatagaagagccgctataccactggatgcaacattcaatacaattaaccccttcgatctaacagca 374  Q
    | |||| ||||||||||| | ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10111311 ctcctgctaatagaagagtcactataccgctagatgcaacattcaatacaattaaccccttcgatctaacagca 10111384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 371
Target Start/End: Original strand, 10000820 - 10001188
Alignment:
Q  1 aatatcatgccttgatccttttcggacaatgggcaatatcttccagaaatcaccacctaaaactactgtcattccaccaaaaggtctaaactcgtttagg 100  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||||||  ||||| |||| || |||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  10000820 aatatcctgcctcgttccttttcggacaacaggcaacatctgcctgaaatccccacctaaaactattgtcattccatcaaatggtttaaactcgtttagg 10000919  T
Q  101 gggtcattcttggacatgatatcacgcattgatcggtcaactgcctcaaaacaccatcagtgcatcattggagcctcattccaaattatcaactttgcag 200  Q
    |  |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10000920 gaatcattcttggacatgataccacacattgatcggtcaactgcctcaaaacaccatcagtgcatcattagagcctcatcccaaattatcaactttgcag 10001019  T
Q  201 cacgcaccaggtctgcccctaggactatccttttccatcgtaagcgatgatgcctcattaatcttaacagggactgttagcgtcgaatgcgcagttcttc 300  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||| |||||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  10001020 cacgcaccaagtctg-ccctaggactatccttttccatcgtaagagatgattcctca-taatctcaacagggactgtcagcgtcgagtgtgcggttcttc 10001117  T
Q  301 cacctggtaatagaagagccgctataccactggatgcaacattcaatacaattaaccccttcgatctaaca 371  Q
    | |||| ||||||||||| | ||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10001118 ctcctgctaatagaagagtcactataccgctagatgcaacattcaatataattaaccccttcgatctaaca 10001188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 371
Target Start/End: Original strand, 13530452 - 13530821
Alignment:
Q  1 aatatcatgccttgatccttttcggacaatgggcaatatcttccagaaatcaccacctaaaactactgtcattccaccaaaaggtctaaactcgtttagg 100  Q
    |||||| ||||| | ||||||| ||||||  |||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  13530452 aatatcgtgcctcgttcctttttggacaacaggcaatatctgcctgaaatcaccagctaaaactactgtcattccatcgaaaggtctaaactcgtttagg 13530551  T
Q  101 gggtcattcttggacatgatatcacgcattgatcggtcaactgcctcaaaacaccatcagtgcatcattggagcctcattccaaattatcaactttgcag 200  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  13530552 ggatcattcttggacatgatatgacgcattgatcggtcaactgtctcaaaacaccattggtgtatcatcggagccttatcccaaattatcaactttgcag 13530651  T
Q  201 cacgcaccaggtctgcccctaggactatccttttccatcgtaagcgatgatgcctcattaatcttaacagggactgttagcgtcgaatgcgcagttcttc 300  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| | || ||||| ||| | ||||||     
T  13530652 cacgcaccaggtctg-ccctaggactatccttttctatcgtaagcgatgatgcctcattaatctcaatagggactatcagtgtcgagtgcacggttcttt 13530750  T
Q  301 cacctggtaatagaagagccgctataccactggatgcaacattcaatacaattaaccccttcgatctaaca 371  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13530751 cacctggtaatagaagagtcactatactgctggatgcagcattcaatacaattaaccccttcgagctaaca 13530821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 357
Target Start/End: Original strand, 10039043 - 10039386
Alignment:
Q  1 aatatcatgccttgatccttttcggacaatgggcaatatcttccagaaatcaccacctaaaactactgtcattccaccaaaaggtctaaactcgtttagg 100  Q
    |||||| ||||| | |||||||| |||||   |||||||||||  ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  10039043 aatatcctgcctcgttccttttcagacaacatgcaatatcttcttgaaatcaccacataaaactattgtcattccaccaaaaggtctaaactcgtttaag 10039142  T
Q  101 gggtcattcttggacatgatatcacgcattgatcggtcaactgcctcaaaacaccatcagtgcatcattggagcctcattccaaattatcaactttgcag 200  Q
    || |||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||           ||||||| ||| |||||||||||| ||| |||    
T  10039143 ggatcattcctagacatgatatcacgcattgatcagtcaacttcctcaaaagaccat-----------tggagccccatcccaaattatcaattttacag 10039231  T
Q  201 cacgcaccaggtctgcccctaggactatccttttccatcgtaagcgatgatgcctcattaatcttaacagggactgttagcgtcgaatgcgcagttcttc 300  Q
     ||||||||||||||||| || |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  10039232 tacgcaccaggtctgccc-tatgactatccttctccagcgtaagcgatgatgcctcattaatctcaatagggactgtcagcgtcgagtgcgcggttcttc 10039330  T
Q  301 cacctggtaatagaagagccgctataccactggatgcaacattcaatacaattaacc 357  Q
    || |||||||||||||||| | |||||| ||||||||| |||| |||||||||||||    
T  10039331 ca-ctggtaatagaagagctgttataccgctggatgcagcatttaatacaattaacc 10039386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 10237967 - 10238194
Alignment:
Q  1 aatatcatgccttgatccttttcggacaatgggcaatatcttccagaaatcaccacctaaaactactgtcattccaccaaaaggtctaaactcgtttagg 100  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||||||   ||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  10237967 aatatcctgcctcgttccttttcggacaacaagcaatatctgcctgaaatcaccacctaaaactattgtcattccatcaaatggtttaaactcgtttagg 10238066  T
Q  101 gggtcattcttggacatgatatcacgcattgatcggtcaactgcctcaaaacaccatcagtgcatcattggagcctcattccaaattatcaactttgcag 200  Q
    |  |||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10238067 gaatcattcctggacatgataccacacattgatcggtcaactgcctcaaaacaccatcagtgcatcattagagcctcatcccaaattatcaactttgcag 10238166  T
Q  201 cacgcaccaggtctgcccctaggactatc 229  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10238167 cacgcaccaggtctg-ccctaggactatc 10238194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 224 - 384
Target Start/End: Original strand, 10244920 - 10245079
Alignment:
Q  224 actatccttttccatcgtaagcgatgatgcctcattaatcttaacagggactgttagcgtcgaatgcgcagttcttccacctggtaatagaagagccgct 323  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||||||| |||||||| || || |||||||| |||| ||||||||||| | ||    
T  10244920 actatccttttacatcgtaagagatgatgcctcat-aatctcaatagggactgtcagcgtcgagtgtgcggttcttcctcctgctaatagaagagtcact 10245018  T
Q  324 ataccactggatgcaacattcaatacaattaaccccttcgatctaacagcaaccaacaatg 384  Q
    ||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  10245019 atactgctagatgcaacattcaatacaattaaccccttcgatctaacagcagccgacaatg 10245079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 250 - 355
Target Start/End: Original strand, 10250418 - 10250523
Alignment:
Q  250 atgcctcattaatcttaacagggactgttagcgtcgaatgcgcagttcttccacctggtaatagaagagccgctataccactggatgcaacattcaatac 349  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | ||||||||||    
T  10250418 atgcctcattaatatcaatagggactgttagtgtcgagtgcgcggttcttcgacctggtaatagaagagccgttataccgctggatgtagcattcaatac 10250517  T
Q  350 aattaa 355  Q
    ||||||    
T  10250518 aattaa 10250523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 250 - 355
Target Start/End: Original strand, 10013718 - 10013823
Alignment:
Q  250 atgcctcattaatcttaacagggactgttagcgtcgaatgcgcagttcttccacctggtaatagaagagccgctataccactggatgcaacattcaatac 349  Q
    ||||||||||||| | || ||||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  10013718 atgcctcattaatatcaatagggactattagtgtcgaatgcgcggttcttcgacctggtaatagaagagtcattataccgctggatgcagcattcaatac 10013817  T
Q  350 aattaa 355  Q
    ||||||    
T  10013818 aattaa 10013823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 250 - 355
Target Start/End: Original strand, 10113314 - 10113419
Alignment:
Q  250 atgcctcattaatcttaacagggactgttagcgtcgaatgcgcagttcttccacctggtaatagaagagccgctataccactggatgcaacattcaatac 349  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| |||||||||     
T  10113314 atgcctcattaatatcaatagggactgttagtgtcgagtgcgcggttcttcgacctggtaatagaagagccgttataccgctgaatgcagcattcaatat 10113413  T
Q  350 aattaa 355  Q
    ||||||    
T  10113414 aattaa 10113419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 246 - 384
Target Start/End: Original strand, 27275059 - 27275190
Alignment:
Q  246 gatgatgcctcattaatcttaacagggactgttagcgtcgaatgcgcagttcttccacctggtaatagaagagccgctataccactggatgcaacattca 345  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||| || || |||||||| |||||||||||||||| |  |||||| || |||||||||||||    
T  27275059 gatgatgcctcat-aatcttaatagggactgtcagcgtcgagtgtgcggttcttcctcctggtaatagaagagtcattataccgctagatgcaacattca 27275157  T
Q  346 atacaattaaccccttcgatctaacagcaaccaacaatg 384  Q
    |      ||||||||| |||||||||||| || ||||||    
T  27275158 a------taaccccttagatctaacagcagccgacaatg 27275190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 253; Significance: 1e-140; HSPs: 8)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 22 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 9000930 - 9000579
Alignment:
Q  22 tcggacaatgggcaatatcttccagaaatcaccacctaaaactactgtcattccaccaaaaggtctaaactcgtttagggggtcattcttggacatgata 121  Q
    ||||||||| |||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9000930 tcggacaataggcaatatctgcctaaaatcacaacctaaaactactgtcattccaccaaaaggtttaagcgcgtttaggggatcattcttggacatgata 9000831  T
Q  122 tcacgcattgatcggtcaactgcctcaaaacaccatcagtgcatcattggagcctcattccaaattatcaactttgcagcacgcaccaggtctgccccta 221  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  9000830 tcacgcaatgatcggtcaactgcctcaaaacaccatcggtgcatcattggagcctcatcccaaattatcaactttgcagcacgcatcaggtctg-cccta 9000732  T
Q  222 ggactatccttttccatcgtaagcgatgatgcctcattaatcttaacagggactgttagcgtcgaatgcgcagttcttccacctggtaatagaagagccg 321  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9000731 ggactatccttttccatcttaagcgatgatgcctcattaatctcaatagggactgtcagcgtcgagtgcgcagttctaccacctggtaatagaagagccg 9000632  T
Q  322 ctataccactggatgcaacattcaatacaattaaccccttcgatctaacagca 374  Q
     |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9000631 atataccgctggatgcagcattcaatacaattaacccattcgatctaacagca 9000579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 16 - 384
Target Start/End: Original strand, 42232427 - 42232794
Alignment:
Q  16 tccttttcggacaatgggcaatatcttccagaaatcaccacctaaaa-ctactgtcattccaccaaaaggtctaaactcgtttagggggtcattcttgga 114  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| || || |||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  42232427 tccttttcggacaacaggcaatatctgcctgatatcaccacctaaaaactattgtcattccaccaaatggtttaaactcgtttaggggatcattcttgga 42232526  T
Q  115 catgatatcacgcattgatcggtcaactgcctcaaaacaccatcagtgcatcattggagcctcattccaaattatcaactttgcagcacgcaccaggtct 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42232527 catgatatcacgcattgatcggtcaactgcctcaaaacaccatcagtgcatcaatggagcctcatcccaaattatcaactttgcagcacgcaccaggtct 42232626  T
Q  215 gcccctaggactatccttttccatcgtaagcgatgatgcctcattaatcttaacagggactgttagcgtcgaatgcgcagttcttccacctggtaataga 314  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||| |||||||| || || ||||||||  |||||||||||    
T  42232627 g-ccctaggactatccttttccatcgtaagcgatgatgcctca-taatctcaatagggactgtcagcgtcgagtgtgcggttcttccttctggtaataga 42232724  T
Q  315 agagccgctataccactggatgcaacattcaatacaattaaccccttcgatctaacagcaaccaacaatg 384  Q
    |||| |  |||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  42232725 agagtcattataccgctagatgcagcattcaatacaattaaccccttcgatctaacagcagccgacaatg 42232794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 47 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 12780908 - 12780585
Alignment:
Q  47 aaatcaccacctaaaactactgtcattccaccaaaaggtctaaactcgtttagggggtcattcttggacatgatatcacgcattgatcggtcaactgcct 146  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||   |||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||| |||||||||    
T  12780908 aaatcaccacctaaaactattgtcattccaccaaaaggtttaagtgcgtttaggggatcattcttggacatgatatcaaacaatgatcggacaactgcct 12780809  T
Q  147 caaaacaccatcagtgcatcattggagcctcattccaaattatcaactttgcagcacgcaccaggtctgcccctaggactatccttttccatcgtaagcg 246  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12780808 caaaacaccatcggtgcatcattggagcctcatcccaaattatcaactttgtagcacgcaccaggtctg-ccctaggactatccttttccatcgtaagcg 12780710  T
Q  247 atgatgcctcattaatcttaacagggactgttagcgtcgaatgcgcagttcttccacctggtaatagaagagccgctataccactggatgcaacattcaa 346  Q
    ||||  |||||||||||| || |||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  12780709 atgacacctcattaatctcaatagggactgtcggcgtcgagtgcgcggttcttccacctggtaatagaagagccgctataccgttggatgcaacattcaa 12780610  T
Q  347 tacaattaaccccttcgatctaaca 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  12780609 tacaattaaccccttcgatctaaca 12780585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 56 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 12785753 - 12785427
Alignment:
Q  56 cctaaaactactgtcattccaccaaaaggtctaaactcgtttagggggtcattcttggacatgatatcacgcattgatcggtcaactgcctcaaaacacc 155  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| || |||   |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12785753 cctaaaactactgccattccaccaaaaagtttaagtgcgtttaggggatcattcttggacatgatatcaagcaatgatcggtcaactgcctcaaaacacc 12785654  T
Q  156 atcagtgcatcattggagcctcattccaaattatcaactttgcagcacgcaccaggtctgcccctaggactatccttttccatcgtaagcgatgatgcct 255  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12785653 atcggtgcatcattggagcctcatcccaaattatcaactttgcagcacacaccaggtctg-cccaaggactatccttttccatcgtaagcgatgacgcct 12785555  T
Q  256 cattaatcttaacagggactgttagcgtcgaatgcgcagttcttccacctggtaatagaagagccgctataccactggatgcaacattcaatacaattaa 355  Q
    ||||||||| || ||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  12785554 cattaatctcaatagggactgtcagcgtggagtgcgcggttcttccacctgataatagaagagccgctataccgttggatgcagcattcaatacaattaa 12785455  T
Q  356 ccccttcgatctaacagcaaccaacaat 383  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||    
T  12785454 ccccttcgatctaacagcagccgacaat 12785427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 21069868 - 21069497
Alignment:
Q  1 aatatcatgccttgatccttttcggacaatgggcaatatcttccagaaatcaccacctaaaactactgtcattccaccaaaaggtctaaactcgtttagg 100  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||||||  |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21069868 aatatcctgcctcgttccttttcggacaacaggcaatatctacctgaaatcaccacctaaaactactgtgattccaccaaatggtctaaactcgtttagg 21069769  T
Q  101 gggtcattcttggacatgatatcacgcattgatcggtcaactgcctcaaaacaccatcagtgcatcattggagcctcattccaaattatcaactttgcag 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| || | || |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||    
T  21069768 ggatcattcttggacatgatatcacgcattgaccgatgaaatgcctcaaaacaccatcaatacatcattggagcctcgttcgaaattatcaagtttgcag 21069669  T
Q  201 cacgcaccaggtctgcccctaggactatccttttccatcgtaagcgatgatgcctcattaatcttaacagggactgttagcgtcgaatgcgcagttcttc 300  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||| | |||||            |||    
T  21069668 cacgcaccaggtctg-ccctaggactatccttttccatcgtaagcgatgatgcctca-taatctcaatagggactgtcatcgtcg----------ggttc 21069581  T
Q  301 cacctggtaatagaagagccgctataccactggatgcaacattcaatacaattaaccccttcgatctaacagcaaccaacaatg 384  Q
    |||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  21069580 cacctggtaatagaagattcactataccgctggatgcaacattcaatacaattaaccccttcgatctaacagcaatcgacaatg 21069497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 22 - 371
Target Start/End: Original strand, 7037154 - 7037502
Alignment:
Q  22 tcggacaatgggcaatatcttccagaaatcaccacctaaaactactgtcattccaccaaaaggtctaaactcgtttagggggtcattcttggacatgata 121  Q
    ||||||||  |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||| ||| ||||||||| ||||||||    
T  7037154 tcggacaacaggcaatatctgcctaaaatcaccacctaaaactactgtcattccaccaaaaggtttaagtgcgtttaagggatcattcttgaacatgata 7037253  T
Q  122 tcacgcattgatcggtcaactgcctcaaaacaccatcagtgcatcattggagcctcattccaaattatcaactttgcagcacgcaccaggtctgccccta 221  Q
    ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||  ||||||| |||||    
T  7037254 tcacgtaatgatcggtcaactacctcaaaacaccattggtgcatcattggagcctcaccccaaattatcaactttgcagcatgcattaggtctg-cccta 7037352  T
Q  222 ggactatccttttccatcgtaagcgatgatgcctcattaatcttaacagggactgttagcgtcgaatgcgcagttcttccacctggtaatagaagagccg 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||  |||| || || || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7037353 ggactatccttttccatcgtaagcgatgacgcctcattaatctcaatagggactgtcggcgtggagtgtgcggttcttccacctggtaatagaagagccg 7037452  T
Q  322 ctataccactggatgcaacattcaatacaattaaccccttcgatctaaca 371  Q
     ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7037453 ttataccgtttgatgcaacattcaatacaattaaccccttcgatctaaca 7037502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 320
Target Start/End: Original strand, 22844216 - 22844534
Alignment:
Q  1 aatatcatgccttgatccttttcggacaatgggcaatatcttccagaaatcaccacctaaaactactgtcattccaccaaaaggtctaaactcgtttagg 100  Q
    |||||||||||| | |||||||||||  |   ||||||||| |  |||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22844216 aatatcatgcctcgttccttttcggatgacatgcaatatctgcatgaaatcaccacctaaaacttttgtctttccaccaaaaggtctaaactcgtttagg 22844315  T
Q  101 gggtcattcttggacatgatatcacgcattgatcggtcaactgcctcaaaacaccatcagtgcatcattggagcctcattccaaattatcaactttgcag 200  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||      
T  22844316 ggatcattcttggacatgatatcacgcattgatcgatcaactgcctcaaaacaccatcggtgcatcattggagcctcatcccaaattatcaactttgcta 22844415  T
Q  201 cacgcaccaggtctgcccctaggactatccttttccatcgtaagcgatgatgcctcattaatcttaacagggactgttagcgtcgaatgcgcagttcttc 300  Q
    || |||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  22844416 catgcaccaggtct-tccctaggactatccttttcaatcgtaagcgatgatgcctcattaatctcaatagggactgtcagcgtcgagtgcgcggttcttc 22844514  T
Q  301 cacctggtaatagaagagcc 320  Q
    ||||| |||| |||||||||    
T  22844515 cacctagtaagagaagagcc 22844534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 5828361 - 5828174
Alignment:
Q  1 aatatcatgccttgatccttttcggacaatgggcaatatcttccagaaatcaccacctaaaactactgtcattccaccaaaaggtctaaactcgtttagg 100  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||||||  |||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  5828361 aatatcctgcctcgttccttttcggacaacaggcaatatctgcctgaaatcaccacctaaaactaatatcattccaccaaatggtttaaactcgtttagg 5828262  T
Q  101 gggtcattcttggacatgatatcacgcattgatcggtcaactgcctcaaaacaccatcagtgcatcattggagcctcattccaaatta 188  Q
    || |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5828261 ggatcattcttggacatgatatcacacattgatcgatcaactgcctcaaaacaccatcagtgcatcattggagcctcatcccaaatta 5828174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 252; Significance: 1e-140; HSPs: 13)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 376
Target Start/End: Original strand, 3690390 - 3690764
Alignment:
Q  1 aatatcatgccttgatccttttcggacaatgggcaatatcttccagaaatcaccacctaaaactactgtcattccaccaaaaggtctaaactcgtttagg 100  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||||||  | |||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3690390 aatatcctgcctcgttccttttcggacaacagacaatatctgcctgaaatcaccacctaaaactactatcattccaccaaaaggtctaaactcgtttagg 3690489  T
Q  101 gggtcattcttggacatgatatcacgcattgatcggtcaactgcctcaaaacaccatcagtgcatcattggagcctcattccaaattatcaactttgcag 200  Q
    || ||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3690490 ggatcattcttggatatgatatcatgcattgattggtcaactgcctcaaaacaccatcggttcatcattggagcctcatcccaaattatcaactttgcag 3690589  T
Q  201 cacgcaccaggtctgcccctaggactatccttttccatcgtaagcgatgatgcctcattaatcttaacagggactgttagcgtcgaatgcgcagttcttc 300  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||||| |||||||    
T  3690590 caggcaccaggtctg-ccctaggactatccttttccatcgtaagtgatgatgcctcattaatctcaatagggactgttagcatcgagtgcgcggttcttc 3690688  T
Q  301 cacctggtaatagaagagccgctataccactggatgcaacattcaatacaattaaccccttcgatctaacagcaac 376  Q
    |||||||||||||||||| || |||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  3690689 cacctggtaatagaagagtcgttatatctctggatgcaacattcaatacaattaaccctttcgatctaacaacaac 3690764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 3876397 - 3876023
Alignment:
Q  1 aatatcatgccttgatccttttcggacaatgggcaatatcttccagaaatcaccacctaaaactactgtcattccaccaaaaggtctaaactcgtttagg 100  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||||||  | |||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3876397 aatatcctgcctcgttccttttcggacaacagacaatatctgcctgaaatcaccacctaaaactactatcattccaccaaaaggtctaaactcgtttagg 3876298  T
Q  101 gggtcattcttggacatgatatcacgcattgatcggtcaactgcctcaaaacaccatcagtgcatcattggagcctcattccaaattatcaactttgcag 200  Q
    || ||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3876297 ggatcattcttggatatgatatcatgcattgattggtcaactgcctcaaaacatcatcggttcatcattggagcctcatcccaaattatcaactttgcag 3876198  T
Q  201 cacgcaccaggtctgcccctaggactatccttttccatcgtaagcgatgatgcctcattaatcttaacagggactgttagcgtcgaatgcgcagttcttc 300  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||||| |||||||    
T  3876197 caggcaccaggtctg-ccctaggactatccttttccatcgtaagtgatgatgcctcattaatctcaatagggactgttagcatcgagtgcgcggttcttc 3876099  T
Q  301 cacctggtaatagaagagccgctataccactggatgcaacattcaatacaattaaccccttcgatctaacagcaac 376  Q
    |||||||||||||||||| || |||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  3876098 cacctggtaatagaagagtcgttatatctctggatgcaacattcaatacaattaaccctttcgatctaacaacaac 3876023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 33 - 383
Target Start/End: Original strand, 27881529 - 27881878
Alignment:
Q  33 gcaatatcttccagaaatcaccacctaaaactactgtcattccaccaaaaggtctaaactcgtttagggggtcattcttggacatgatatcacgcattga 132  Q
    ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27881529 gcaatatctgcctaaaatcaccacctaaaactactgtcattccaccaaaaggtttaagcgcgtttaggggatcattcttggacatgatatcacgcaatga 27881628  T
Q  133 tcggtcaactgcctcaaaacaccatcagtgcatcattggagcctcattccaaattatcaactttgcagcacgcaccaggtctgcccctaggactatcctt 232  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  27881629 tcggtcaactgcctcaaaacaccatcggtgcatcattggagcctcatcccaaattatcaactttgcagcacgcatcaggtttg-ccctaggactatcctt 27881727  T
Q  233 ttccatcgtaagcgatgatgcctcattaatcttaacagggactgttagcgtcgaatgcgcagttcttccacctggtaatagaagagccgctataccactg 332  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||  |||| || ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |    
T  27881728 ttccatcgtaagcgatgacgcctcattaatctcaatagggactgtcggcgtggagtgcgcggttcttccacctggtaatagaaaagccgctataccatcg 27881827  T
Q  333 gatgcaacattcaatacaattaaccccttcgatctaacagcaaccaacaat 383  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  27881828 gatacaacattcaatacaattaaccccttcgatctaacagcagccgacaat 27881878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 22 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 8428370 - 8428010
Alignment:
Q  22 tcggacaatgggcaatatcttccagaaatcaccacctaaaactactgtcattccaccaaaaggtctaaactcgtttagggggtcattcttggacatgata 121  Q
    ||||||||  |||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||   |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8428370 tcggacaacaggcaatatctgcctaaaatcaccacctaaaactactgccattccaccaaaaggtttaagtgcgtttaggggatcattcttggacatgata 8428271  T
Q  122 tcacgcattgatcggtcaactgcctcaaaacaccatcagtgcatcattggagcctcattccaaattatcaactttgcagcacgcaccaggtctgccccta 221  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8428270 tcaagcaatgatcggtcaactgcctcaaaacaccatcggtgcatcattggagcctcatcccaaattatcaactttgcagcacgcaccaggtctg-cccta 8428172  T
Q  222 ggactatccttttccatcgtaagcgatgatgcctcattaatcttaacagggactgttagcgtcgaatgcgcagttcttccacctggtaatagaagagccg 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||  |||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8428171 ggactatccttttccatcgtaagcgatgacgcctcattaatctcaatagggactgtcggcgtggagtgcgcggttcttccacctggtaatagaagagccg 8428072  T
Q  322 ctataccactggatgcaacattcaatacaattaaccccttcgatctaacagcaaccaacaat 383  Q
     ||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  8428071 ttataccgttggatgcagcattcaatacaattaaccccttcgatctaacagcagccgacaat 8428010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 16 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 25542584 - 25542218
Alignment:
Q  16 tccttttcggacaatgggcaatatcttccagaaatcaccacctaaaactactgtcattccaccaaaaggtctaaactcgtttagggggtcattcttggac 115  Q
    ||||||||||||||  | |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25542584 tccttttcggacaacagacaatatctgcctgaaatcaccacctaaaactactgtcattccaccaaatggtttaaactcgtttaggggatcattcttggac 25542485  T
Q  116 atgatatcacgcattgatcggtcaactgcctcaaaacaccatcagtgcatcattggagcctcattccaaattatcaactttgcagcacgcaccaggtctg 215  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25542484 atgatatcacgcattaatcggtcaacttcctcaaaacaccatcagtgcatcattggagcctcatcttaaattatcaactttgcagcacgcaccaggtctg 25542385  T
Q  216 cccctaggactatccttttccatcgtaagcgatgatgcctcattaatcttaacagggactgttagcgtcgaatgcgcagttcttccacctggtaatagaa 315  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||| | |||||||| |  || ||||||||||||||||||||||    
T  25542384 -ccctaggactatccttttccatcgtaagcgatgatgcctca-taatctcaatagggactatcagcgtcgagtatgcggttcttccacctggtaatagaa 25542287  T
Q  316 gagccgctataccactggatgcaacattcaatacaattaaccccttcgatctaacagcaaccaacaatg 384  Q
    ||| | ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| || || ||||||    
T  25542286 gagtcactataccgctggatgcatcattcaatacaattaaccccttcggtctaacaacagccgacaatg 25542218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 47 - 383
Target Start/End: Original strand, 37373395 - 37373730
Alignment:
Q  47 aaatcaccacctaaaactactgtcattccaccaaaaggtctaaactcgtttagggggtcattcttggacatgatatcacgcattgatcggtcaactgcct 146  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37373395 aaatcaccacctaaaactactgtgattccaccaaaaggtttaagtgcgtttaggggatcattcttggacatgatatcacgcaatgatcggtcaactgcct 37373494  T
Q  147 caaaacaccatcagtgcatcattggagcctcattccaaattatcaactttgcagcacgcaccaggtctgcccctaggactatccttttccatcgtaagcg 246  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37373495 caaaacaccatcggtgcatcattggagtctcatcccaaattatcaactttgcagcacgcaccaggtctg-ccctaggactatccttttccatcgtaagcg 37373593  T
Q  247 atgatgcctcattaatcttaacagggactgttagcgtcgaatgcgcagttcttccacctggtaatagaagagccgctataccactggatgcaacattcaa 346  Q
    |||| ||||||||||||| || |||||||||  || | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  37373594 atgacgcctcattaatctcaatagggactgtcggcatggagtgcgcggttcttccacctggtaatagaagagccgctataccgttggatgcaacattcaa 37373693  T
Q  347 tacaattaaccccttcgatctaacagcaaccaacaat 383  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  37373694 tacaattaaccccttcgatctaacagcagccgacaat 37373730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 14192618 - 14192236
Alignment:
Q  1 aatatcatgccttgatccttttcggacaatgggcaatatcttccagaaatcaccacctaaaactactgtcattccaccaaaaggtctaaactcgtttagg 100  Q
    |||||| ||||| | |||||||||| |||   ||||||| | || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14192618 aatatcctgcctcgttccttttcgggcaacatgcaatatatgcctgaaatcaccacctaaaacaactgtcattccaccaaaaggtctaaactcgtttagg 14192519  T
Q  101 ggg-tcattcttggacatgatatcacgcattgatcggtcaactgcctcaaaacaccatcagtgcatcattggagcctcattccaaattatcaactttgca 199  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14192518 gggatcattcttggacatgatatcacgcattgatcggtcaattgcttcaaaacaccatcggtgca-cattggagcctcatcccaaattatcaactttgca 14192420  T
Q  200 gcacgcaccaggtctgcccctaggactatccttttccatcgtaagcgatgatgcctcattaatcttaacagggactgttagcgtcgaatgcgcagttctt 299  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| || ||||  ||| || ||||| ||||| ||| ||    
T  14192419 gcacgcaccaggtctgccc-taggactatccttttccatcgtaagtgatgatgcctaattaatctcaatagggtatgtcagtgtcgagtgcgcggttgtt 14192321  T
Q  300 ccacctggtaatagaagagccgctataccactggatgcaacattcaatacaattaaccccttcgatctaacagcaaccaacaatg 384  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14192320 tcacctggtaatagaagagccgttataccgctggatacaacatttaatacaattaaccccttcgatctaacagcaaccgacaatg 14192236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 30346435 - 30346064
Alignment:
Q  1 aatatcatgccttgatccttttcggacaatgggcaatatcttccagaaatcaccacctaaaactactgtcattccaccaaaaggtctaaactcgtttagg 100  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||||||   ||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  30346435 aatatcctgcctcgttccttttcggacaacatgcaatatctgcctgacatcaccacctaaaactattgtcattccaccaaatagtttaaactcgtttagg 30346336  T
Q  101 gggtcattcttggacatgatatcacgcattgatcggtcaactgcctcaaaacaccatcagtgcatcattggagcctcattccaaattatcaactttgcag 200  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  30346335 ggatcaatcttggacatgatatcacgcattgatcggtcaactgcctcaaaacaccatcagtgcatcaatggagtctcatcccaaattatcaactttgcag 30346236  T
Q  201 cacgcaccaggtctgcccctaggactatccttttccatcgtaagcgatgatgcctcattaatcttaacagggactgttagcgtcgaatgcgcagttcttc 300  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| || ||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  30346235 cacgcatcaggtctg-ccctaggactatccttttccatcgtaagtgatgatgcctca-taatctcaatagggactgtcagcgtcgagtgtgcggttcttc 30346138  T
Q  301 cacctggtaatagaagagccgctataccactggatgcaacattcaatacaattaaccccttcgatctaacagca 374  Q
    | |||||||||||||||| |  |||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30346137 ctcctggtaatagaagagtcattataccgctagatgcagcattcaatacaattaaccccttcgatctaacagca 30346064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Original strand, 37261716 - 37262097
Alignment:
Q  1 aatatcatgccttgatccttttcggacaatgggcaatatcttccagaaatcaccacctaaaactactgtcattccaccaaaaggtctaaactcgtttagg 100  Q
    |||||| ||||| | |||||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||      
T  37261716 aatatcctgcctcgttccttttcagacaacaggcaatatcttcctgaaatcaccacataaaactattgtcattccaccgaaaggtctaaactcgtttaaa 37261815  T
Q  101 gggtcattcttggacatgatatcacgcattgatcggtcaactgcctcaaaacaccatcagtgcatcattggagcctcattccaaattatcaactttgcag 200  Q
    || |||||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  37261816 ggatcattcctagacatgatatcgcgcattgatcagtcaacttcctcaaaacaccatcaatgcatcattggagcctcatcccaaattatcaactttacag 37261915  T
Q  201 cacgcaccaggtctgcccctaggactatccttttccatcgtaagcgatgatgcctcattaatcttaacagggactgttagcgtcgaatgcgcagttcttc 300  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  37261916 cacgcaccaggtctg-tcctaggactatccttttccatcgtaagcaatgatgcctcattaatctcaatagggactgtcagcgtcgagtgcgcggttcttc 37262014  T
Q  301 cacctggtaatagaagagccgctataccactggatgcaacattcaatacaattaaccccttcgatctaacagcaaccaacaatg 384  Q
    || |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| || ||||||||| || || ||||||    
T  37262015 ca-ctggtaatagaagagccgttataccgctggatgcagcatttaatacaattaacccttttgatctaacaacagccgacaatg 37262097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 16 - 384
Target Start/End: Original strand, 10025406 - 10025772
Alignment:
Q  16 tccttttcggacaatgggcaatatcttccagaaatcaccacctaaaactactgtcattccaccaaaaggtctaaactcgtttagggggtcattcttggac 115  Q
    |||||||||||||   |||||||||| ||  | ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10025406 tccttttcggacagcaggcaatatctgcctaatatcaccacctaaaactattgtcattccaccaaatggtttaaactcgtttaggggatcattcttggac 10025505  T
Q  116 atgatatcacgcattgatcggtcaactgcctcaaaacaccatcagtgcatcattggagcctcattccaaattatcaactttgcagcacgcaccaggtctg 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10025506 atgatatcacgcattgatcggtcaactgcctcaaaacaccatcagtgcatcaatggagcctcatcccaaattatcaactttgcagcacgcactaggtctg 10025605  T
Q  216 cccctaggactatccttttccatcgtaagcgatgatgcctcattaatcttaacagggactgttagcgtcgaatgcgcagttcttccacctggtaatagaa 315  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||| || | | |||| || || ||||||||  ||||||||||||    
T  10025606 cccc-aggactatccttttccatcgtaagcgatgatgcctca-taatctcaatagggaccgtcaacttcgagtgtgcggttcttccttctggtaatagaa 10025703  T
Q  316 gagccgctataccactggatgcaacattcaatacaattaaccccttcgatctaacagcaaccaacaatg 384  Q
    ||| |  |||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||    
T  10025704 gagtcattataccgctagatgcagcattcaatacaattaaccccttcgatctaatagcagccgacaatg 10025772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 24629759 - 24629384
Alignment:
Q  1 aatatcatgccttgatccttttcggacaatgggcaatatcttccagaaatcaccacctaaaactactgtcattccaccaaaaggtctaaactcgtttagg 100  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||||||   ||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  24629759 aatatcctgcctcgttccttttcggacaacatgcaatatctgcctgatatcaccacctaaaactattgtcattccaccaaatggtttaaactcgtttagg 24629660  T
Q  101 gggtcattcttggacatgatatcacgcattgatcggtcaactgcctcaaaacaccatcagtgcatcattggagcctcattccaaattatcaactttgcag 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24629659 ggatcattcttggacatgatatcacgcattgatcggccaactgcctcaaaacaccatcagtgcatcaatggagcctcatcccaaattatcaactttgcag 24629560  T
Q  201 cacgcaccaggtctgcccctaggactatccttttccatcgtaagcgatgatgcctcattaatcttaacagggactgttagcgtcgaatgcgcagttcttc 300  Q
    |||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  24629559 cacgcatcaggtct-tccctaggactatccttttccatcgtaagcgatgatgcctca-taatcttaatagggactgtcagcgtcgagtgtgcggttcttc 24629462  T
Q  301 cacctggtaatagaagagccgctataccactggatgcaacattcaatacaattaaccccttcgatctaacagcaaccaacaatg 384  Q
    | |||||||||||||||| |  |||||| || ||||||||||||||      ||||||||| |||||||||||| || ||||||    
T  24629461 ctcctggtaatagaagagtcattataccgctagatgcaacattcaa------taaccccttagatctaacagcagccgacaatg 24629384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 32 - 384
Target Start/End: Original strand, 39883627 - 39883970
Alignment:
Q  32 ggcaatatcttccagaaatcaccacctaaaactactgtcattccaccaaaaggtctaaactcgtttagggggtcattcttggacatgatatcacgcattg 131  Q
    |||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||| |||||||||||||||        || ||    
T  39883627 ggcaatatctgcctgaaatcaccacgtaaaactactgtcattccaccaaaaggtttaagcgcgtttaggggatcattcttggacatg--------caatg 39883718  T
Q  132 atcggtcaactgcctcaaaacaccatcagtgcatcattggagcctcattccaaattatcaactttgcagcacgcaccaggtctgcccctaggactatcct 231  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  39883719 atcggtcagctgcctcaaaacaccatcggtgcatcattggagcctcatcccaaattatcagctttgcagcacgcaccaggtctgcct-taggactatcct 39883817  T
Q  232 tttccatcgtaagcgatgatgcctcattaatcttaacagggactgttagcgtcgaatgcgcagttcttccacctggtaatagaagagccgctataccact 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||| | |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  39883818 tttccatcgtaagcgatgatgcctcattaatctcaataaggactatcagcgtcgagtgcgcggttcttccacctggtaatagaagagccgctataccgct 39883917  T
Q  332 ggatgcaacattcaatacaattaaccccttcgatctaacagcaaccaacaatg 384  Q
    |||||||  |||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||    
T  39883918 ggatgcagtattcaatacaattaactcattcgatctaacagcagccgacaatg 39883970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 17871444 - 17871127
Alignment:
Q  1 aatatcatgccttgatccttttcggacaatgggcaatatcttccagaaatcaccacctaaaactactgtcattccaccaaaaggtctaaactcgtttagg 100  Q
    |||||||||||| | |||||||||||  |   ||||||||| || |||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17871444 aatatcatgcctcgttccttttcggatgacatgcaatatctgcctgaaatcaccacctaaaacttttgtctttccaccaaaaggtctaaactcgtttagg 17871345  T
Q  101 gggtcattcttggacatgatatcacgcattgatcggtcaactgcctcaaaacaccatcagtgcatcattggagcctcattccaaattatcaactttgcag 200  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |      
T  17871344 ggatcattcttggacatgatat-acgcattgatcgatcaactgcctcaaaacaccatcggtgcatcattggagcctcattccatattatcaacttttcta 17871246  T
Q  201 cacgcaccaggtctgcccctaggactatccttttccatcgtaagcgatgatgcctcattaatcttaacagggactgttagcgtcgaatgcgcagttcttc 300  Q
    || |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  17871245 catgcaccatgtcttccc-taggactatccttttccatcgtaagcgatgatgcctcattaatctcaatagggactgtcagcgtcgagtgcgcggttcttc 17871147  T
Q  301 cacctggtaatagaagagcc 320  Q
    |||| ||||| |||||||||    
T  17871146 caccaggtaagagaagagcc 17871127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 250; Significance: 1e-139; HSPs: 5)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 22 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 25218350 - 25217990
Alignment:
Q  22 tcggacaatgggcaatatcttccagaaatcaccacctaaaactactgtcattccaccaaaaggtctaaactcgtttagggggtcattcttggacatgata 121  Q
    ||||||||  |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25218350 tcggacaacaggcaatatctgcctaaaatcaccacctaaaactactgtcattccaccaaaaggtttaagtgcgtttaggggatcattcttggacatgata 25218251  T
Q  122 tcacgcattgatcggtcaactgcctcaaaacaccatcagtgcatcattggagcctcattccaaattatcaactttgcagcacgcaccaggtctgccccta 221  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25218250 tcacgcaatgatcggtcaactgcctcaaaacaccatcggtgcatcattggagcctcatcccaaattatcaactttgcagcacgcaccaggtctg-cccta 25218152  T
Q  222 ggactatccttttccatcgtaagcgatgatgcctcattaatcttaacagggactgttagcgtcgaatgcgcagttcttccacctggtaatagaagagccg 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||  |||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25218151 ggactatccttttccatcgtaagcgatgacgcctcattaatctcaatagggactgtcggcgtggagtgcgcggttcttccacctggtaatagaagagccg 25218052  T
Q  322 ctataccactggatgcaacattcaatacaattaaccccttcgatctaacagcaaccaacaat 383  Q
    |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  25218051 ctataccgttggatgcagcattcaatacaattaaccccttcgatctaacagcagccgacaat 25217990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 22 - 383
Target Start/End: Original strand, 30325909 - 30326269
Alignment:
Q  22 tcggacaatgggcaatatcttccagaaatcaccacctaaaactactgtcattccaccaaaaggtctaaactcgtttagggggtcattcttggacatgata 121  Q
    ||||||||| |||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30325909 tcggacaataggcaatatctgcctaaaatcacaacctaaaactactgtcattccaccaaaaggtttaagtgcgtttaggggatcattcttggacatgata 30326008  T
Q  122 tcacgcattgatcggtcaactgcctcaaaacaccatcagtgcatcattggagcctcattccaaattatcaactttgcagcacgcaccaggtctgccccta 221  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  30326009 tcacgcaatgatcggtcaactgcctcaaaacaccatcggtgcatcattggagcctcatcccaaattatcaactttgcagcatgcaccaggtctg-cccta 30326107  T
Q  222 ggactatccttttccatcgtaagcgatgatgcctcattaatcttaacagggactgttagcgtcgaatgcgcagttcttccacctggtaatagaagagccg 321  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| |  |||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30326108 ggactatcattttccatcgtaagcgatgacgcctcattaatctcaatagggactatcggcgtggagtgcgcggttcttccacctggtaatagaagagccg 30326207  T
Q  322 ctataccactggatgcaacattcaatacaattaaccccttcgatctaacagcaaccaacaat 383  Q
    |||||||  | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  30326208 ctataccgttagatgcagcattcaatacaattaaccccttcgatctaacagcagccgacaat 30326269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 21113550 - 21113169
Alignment:
Q  1 aatatcatgccttgatccttttcggacaatgggcaatatcttccagaaatcaccacctaaaactactgtcattccaccaaaaggtctaaactcgtttagg 100  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||||||  |||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||| |||||||    
T  21113550 aatatcctgcctcgttccttttcggacaacaggcaatatctgcctgatatcaccacctaaaactattgtcattccaccaaatggtttaaacttgtttagg 21113451  T
Q  101 gggtcattcttggacatgatatcacgcattgatcggtcaactgcctcaaaacaccatcagtgcatcattggagcctcattccaaattatcaactttgcag 200  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21113450 ggatcattcttggacatgatatcacgcattgatcggtcaactgccgcaaaacaccatcagtgcatcaatggagcctcatcccaaattatcaactttgcag 21113351  T
Q  201 cacgcaccaggtctgcccctaggactatccttttccatcgtaagcgatgatgcctcattaatcttaacagggactgttagcgtcgaatgcgcagttcttc 300  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||| | |||||| || || |||||||    
T  21113350 cacgcaccaggtctg-tcctaggactatccttttccatcgtaagcgatgatgcctca-taatctcaatagggactgtcaacgtcgagtgtgcggttcttc 21113253  T
Q  301 cacctggtaatagaagagccgctataccactggatgcaacattcaatacaattaaccccttcgatctaacagcaaccaacaatg 384  Q
    | |||||||||||||||| |  |||||| || |||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||    
T  21113252 ctcctggtaatagaagagtcattataccgctagatgcagcattcaatacaattaacgcattcgatctaacagcagccgacaatg 21113169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 22 - 384
Target Start/End: Original strand, 7822272 - 7822627
Alignment:
Q  22 tcggacaatgggcaatatcttccagaaatcaccacctaaaactactgtcattccaccaaaaggtctaaactcgtttagggggtcattcttggacatgata 121  Q
    ||||||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    ||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  7822272 tcggacaataggcaatatctgcctaaaatcaccacctaaaactactgtcattccaccaaaaggtttaagtgtgtttaggggatcatttttggacatgata 7822371  T
Q  122 tcacgcattgatcggtcaactgcctcaaaacaccatcagtgcatcattggagcctcattccaaattatcaactttgcagcacgcaccaggtctgccccta 221  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7822372 tcatgcaatgatcggtcaactgcctcaaaacaccatcggtgcatcattggagcctcatcccaaattatcaactttgcagcacgcaccaggtctg-cccta 7822470  T
Q  222 ggactatccttttccatcgtaagcgatgatgcctcattaatcttaacagggactgttagcgtcgaatgcgcagttcttccacctggtaatagaagagccg 321  Q
    |||||||||| || ||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||| |||||||  ||    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7822471 ggactatcctctttcatcgcaagcgatgacgcctcattaatctcaatagggactgtcagcgtcg--tg----gttcttccacctggtaatagaagagccg 7822564  T
Q  322 ctataccactggatgcaacattcaatacaattaaccccttcgatctaacagcaaccaacaatg 384  Q
     |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  7822565 ttatactgctggatgcagcattcaatacaattaacccattcgatctaacagcaaccgacaatg 7822627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 32 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 25208822 - 25208483
Alignment:
Q  32 ggcaatatcttccagaaatcaccacctaaaactactgtcattccaccaaaaggtctaaactcgtttagggggtcattcttggacatgatatcacgcattg 131  Q
    |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     |||||||| |||||||||||||||||||||| || ||    
T  25208822 ggcaatatctgcctaaaatcaccacctaaaactactgtcattccaccaaaaggtttaagtgtctttaggggatcattcttggacatgatatcacacaatg 25208723  T
Q  132 atcggtcaactgcctcaaaacaccatcagtgcatcattggagcctcattccaaattatcaactttgcagcacgcaccaggtctgcccctaggactatcct 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||    
T  25208722 atcggtcaactgcctcaaaacaccatcggtgcatcattggagtctcatcccaaattatcaactttggagcacgcatcaggtctgccc-taggactttcct 25208624  T
Q  232 tttccatcgtaagcgatgatgcctcattaatcttaacagggactgttagcgtcgaatgcgcagttcttccacctggtaatagaagagccgctataccact 331  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||  |||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  25208623 tttccatcgtaagcgatgacgcctcattaatctcaatagggactgtcggcgtggagcgcgcggttcttccacctggtaatagaagagccgctataccgtt 25208524  T
Q  332 ggatgcaacattcaatacaattaaccccttcgatctaacag 372  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25208523 ggatgcaacattcaatacaattaaccccatcgatctaacag 25208483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 250; Significance: 1e-139; HSPs: 9)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 22 - 383
Target Start/End: Original strand, 35856341 - 35856701
Alignment:
Q  22 tcggacaatgggcaatatcttccagaaatcaccacctaaaactactgtcattccaccaaaaggtctaaactcgtttagggggtcattcttggacatgata 121  Q
    ||||||||  |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35856341 tcggacaacaggcaatatctgcctaaaatcaccacctaaaactactgtcattccaccaaaaggtttaagtgcgtttaggggatcattcttggacatgata 35856440  T
Q  122 tcacgcattgatcggtcaactgcctcaaaacaccatcagtgcatcattggagcctcattccaaattatcaactttgcagcacgcaccaggtctgccccta 221  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  35856441 tcacgcaatgatcggtcaactgcctcaaaacaccatcggtgcatcattggagcctcatcccaaattatcaactttgcagcacgcaccaggtctg-cccta 35856539  T
Q  222 ggactatccttttccatcgtaagcgatgatgcctcattaatcttaacagggactgttagcgtcgaatgcgcagttcttccacctggtaatagaagagccg 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||  |||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35856540 ggactatccttttccatcgtaagcgatgacgcctcattaatctcaatagggactgtcggcgtggagtgcgcggttcttccacctggtaatagaagagccg 35856639  T
Q  322 ctataccactggatgcaacattcaatacaattaaccccttcgatctaacagcaaccaacaat 383  Q
    |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  35856640 ctataccgttggatgcagcattcaatacaattaaccccttcgatctaacagcagccgacaat 35856701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 32 - 384
Target Start/End: Original strand, 49710616 - 49710967
Alignment:
Q  32 ggcaatatcttccagaaatcaccacctaaaactactgtcattccaccaaaaggtctaaactcgtttagggggtcattcttggacatgatatcacgcattg 131  Q
    |||||||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  49710616 ggcaatatctgcctaaaatcaccacctaaaactattgtcattccaccgaaaggtttaagcgcgtttaggggatcattcttggacatgatatcacgcaatg 49710715  T
Q  132 atcggtcaactgcctcaaaacaccatcagtgcatcattggagcctcattccaaattatcaactttgcagcacgcaccaggtctgcccctaggactatcct 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  49710716 atcggtcaactgcctcaaaacaccatcgatgcatcattggagcctcatcccaaattatcaactttgcagcacgcacaaggtctg-ccctaggactatcct 49710814  T
Q  232 tttccatcgtaagcgatgatgcctcattaatcttaacagggactgttagcgtcgaatgcgcagttcttccacctggtaatagaagagccgctataccact 331  Q
    ||| |||| |||||||||||||||| ||||||| || ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  49710815 tttgcatcttaagcgatgatgcctcgttaatctcaatagggactgtcagcgtcgagtgcgcggttcttccacctggtaatagaagagccgctataccgct 49710914  T
Q  332 ggatgcaacattcaatacaattaaccccttcgatctaacagcaaccaacaatg 384  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  49710915 ggatgcagcattcaatacaattaaccccttcgatctaacagcagccgacaatg 49710967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 16 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 55558914 - 55558558
Alignment:
Q  16 tccttttcggacaatgggcaatatcttccagaaatcaccacctaaaactactgtcattccaccaaaaggtctaaactcgtttagggggtcattcttggac 115  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  55558914 tccttttcggacaacaggcaatatctgcctgatatcaccacctaaaactattgtcattccaccaaatggtttaaactcgtttaggggatcatttttggac 55558815  T
Q  116 atgatatcacgcattgatcggtcaactgcctcaaaacaccatcagtgcatcattggagcctcattccaaattatcaactttgcagcacgcaccaggtctg 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55558814 atgatatcacgcattgatcggtcaactgcctcaaaacaccatcagtgcatcaatggagcctcatcccaaattatcaactttgcagcacgcaccaggtctg 55558715  T
Q  216 cccctaggactatccttttccatcgtaagcgatgatgcctcattaatcttaacagggactgttagcgtcgaatgcgcagttcttccacctggtaatagaa 315  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||| |||||||| || || ||||||||  ||||||||||||    
T  55558714 -ccctaggactatccttttccatcgtaagcgatgatgcctca-taatctcaatagggactgtcagcgtcgagtgtgcggttcttccttctggtaatagaa 55558617  T
Q  316 gagccgctataccactggatgcaacattcaatacaattaaccccttcgatctaacagca 374  Q
    ||| |  |||||| || |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  55558616 gagtcattataccgctagatgcatcattcaatagaattaaccccttcgatctaacagca 55558558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 94 - 383
Target Start/End: Original strand, 13344441 - 13344729
Alignment:
Q  94 gtttagggggtcattcttggacatgatatcacgcattgatcggtcaactgcctcaaaacaccatcagtgcatcattggagcctcattccaaattatcaac 193  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13344441 gtttaggggatcattcttggacatgatatcacgcaatgatcggtcaactgcctcaaaccaccatcggtgcatcattggagcctcatcccaaattatcaac 13344540  T
Q  194 tttgcagcacgcaccaggtctgcccctaggactatccttttccatcgtaagcgatgatgcctcattaatcttaacagggactgttagcgtcgaatgcgca 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| |  |||| || ||| |     
T  13344541 tttgcagcacgcaccaggtctgccc-taggactatccttttccatcgtaagcgatgacgcctcattaatctcaatagggactatcggcgtggagtgcacg 13344639  T
Q  294 gttcttccacctggtaatagaagagccgctataccactggatgcaacattcaatacaattaaccccttcgatctaacagcaaccaacaat 383  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  13344640 gttcttccacctggtaatagaagagccgctataccgttggatgcagcattcaatacaattaaccccttcgatctaacagcagccgacaat 13344729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 56 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 49786603 - 49786289
Alignment:
Q  56 cctaaaactactgtcattccaccaaaaggtctaaactcgtttagggggtcattcttggacatgatatcacgcattgatcggtcaactgcctcaaaacacc 155  Q
    |||||||||| || ||||||||||||| || |||    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  49786603 cctaaaactattgccattccaccaaaaagtttaagtgtgtttaggggatcattcttggacatgatatcaagcaatgatcggtcaactgcctcaaaacacc 49786504  T
Q  156 atcagtgcatcattggagcctcattccaaattatcaactttgcagcacgcaccaggtctgcccctaggactatccttttccatcgtaagcgatgatgcct 255  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  49786503 atcggtgcatcattggagcctcatcccaaattatcaactttgcagcacacaccaggtctgccca-aggactatccttttccatcgtaagcgatgacgcct 49786405  T
Q  256 cattaatcttaacagggactgttagcgtcgaatgcgcagttcttccacctggtaatagaagagccgctataccactggatgcaacattcaatacaattaa 355  Q
    ||||||||| || |||||||||  |||| || ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  49786404 cattaatctcaatagggactgtcggcgtggagtgcgcggttcttccacctgataatagaagagccgctataccgttggatgcagcattcaatacaattaa 49786305  T
Q  356 ccccttcgatctaaca 371  Q
    ||||||||||||||||    
T  49786304 ccccttcgatctaaca 49786289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 22 - 275
Target Start/End: Original strand, 13337669 - 13337921
Alignment:
Q  22 tcggacaatgggcaatatcttccagaaatcaccacctaaaactactgtcattccaccaaaaggtctaaactcgtttagggggtcattcttggacatgata 121  Q
    ||||||||  |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13337669 tcggacaacaggcaatatctgcctaaaatcaccacctaaaactactgtcattccaccaaaaggtttaagtgtgtttaggggatcattcttggacatgata 13337768  T
Q  122 tcacgcattgatcggtcaactgcctcaaaacaccatcagtgcatcattggagcctcattccaaattatcaactttgcagcacgcaccaggtctgccccta 221  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13337769 tcacgcaatgatcggtcaactgcctcaaaccaccatcggtgcatcattggagcctcatcccaaattatcaactttgcagcacgcaccaggtctg-cccta 13337867  T
Q  222 ggactatccttttccatcgtaagcgatgatgcctcattaatcttaacagggact 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||    
T  13337868 ggactatccttttccatcgtaagcgatgacgcctcattaatctcaatagggact 13337921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Original strand, 1861090 - 1861189
Alignment:
Q  1 aatatcatgccttgatccttttcggacaatgggcaatatcttccagaaatcaccacctaaaactactgtcattccaccaaaaggtctaaactcgtttagg 100  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||||||  |||||||| | || ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  1861090 aatatcctgcctcgttccttttcggacaacaggcaatatttgcctgaaatcaccaccttacactattgtcattccaccaaatggtttaaactcgtttagg 1861189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 333 - 380
Target Start/End: Original strand, 5337035 - 5337082
Alignment:
Q  333 gatgcaacattcaatacaattaaccccttcgatctaacagcaaccaac 380  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  5337035 gatgcagcattcaaaacaattaaccccttcgatctaacaacagccaac 5337082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 618030 - 617956
Alignment:
Q  1 aatatcatgccttgatccttttcggacaatgggcaatatcttccagaaatcaccacctaaaactactgtcattcc 75  Q
    |||||||||||| | |||||||| |||||   ||||||||| |  |||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  618030 aatatcatgcctcgttccttttcagacaacatgcaatatctgcttgaaatcaccacctaaagctattgtcattcc 617956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 250; Significance: 1e-139; HSPs: 12)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 19 - 371
Target Start/End: Original strand, 24246256 - 24246605
Alignment:
Q  19 ttttcggacaatgggcaatatcttccagaaatcaccacctaaaactactgtcattccaccaaaaggtctaaactcgtttagggggtcattcttggacatg 118  Q
    |||||||||||   ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  24246256 ttttcggacaacatgcaatatctgccttaaatcaccacctaaaactactatgattccaccaaaaggtctaaactcatttaggggatcattcttggacatg 24246355  T
Q  119 atatcacgcattgatcggtcaactgcctcaaaacaccatcagtgcatcattggagcctcattccaaattatcaactttgcagcacgcaccaggtctgccc 218  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24246356 atatcacgtattgatcggtcaactgcctcaaaataccatcagtgcatcattggagcctcat--caaattatcaactttgcagcacgcaccaagtctgccc 24246453  T
Q  219 ctaggactatccttttccatcgtaagcgatgatgcctcattaatcttaacagggactgttagcgtcgaatgcgcagttcttccacctggtaatagaagag 318  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||    
T  24246454 -taggactatccttttccatcgtaagcgatgatgcctcattaatctcaatagggactgtcagcgtcgagtgtgcggttcttccacctggtaatagaagag 24246552  T
Q  319 ccgctataccactggatgcaacattcaatacaattaaccccttcgatctaaca 371  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24246553 ccgctataccgctggatgcagcattcaatacaattaaccccttcgatctaaca 24246605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 22 - 384
Target Start/End: Original strand, 21395804 - 21396165
Alignment:
Q  22 tcggacaatgggcaatatcttccagaaatcaccacctaaaactactgtcattccaccaaaaggtctaaactcgtttagggggtcattcttggacatgata 121  Q
    ||||||||  |||||||||| ||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| | |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21395804 tcggacaacaggcaatatctgcctaaaatcaccacctaaaactacggtcattccaccaaaaggtttaagcgcgtttaggggatcattcttggacatgata 21395903  T
Q  122 tcacgcattgatcggtcaactgcctcaaaacaccatcagtgcatcattggagcctcattccaaattatcaactttgcagcacgcaccaggtctgccccta 221  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  21395904 tcacgcaatgatcggtcaacagcctcaaaacaccatcggtgcatcattggagcctcatcccaaattatcaactttgcagcacgcaccaagtctg-cccta 21396002  T
Q  222 ggactatccttttccatcgtaagcgatgatgcctcattaatcttaacagggactgttagcgtcgaatgcgcagttcttccacctggtaatagaagagccg 321  Q
    ||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21396003 ggactatcctttagcatcttaagcgatgatgcctcattaatctcaacagggactgtcagcgccgagtgcgcggttcttccacctggtaatagaagagccg 21396102  T
Q  322 ctataccactggatgcaacattcaatacaattaaccccttcgatctaacagcaaccaacaatg 384  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  21396103 ctataccgctggatgcagcattcaatacaattaaccccttcgatctaacagcagccgacaatg 21396165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Original strand, 27192902 - 27193283
Alignment:
Q  1 aatatcatgccttgatccttttcggacaatgggcaatatcttccagaaatcaccacctaaaactactgtcattccaccaaaaggtctaaactcgtttagg 100  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||||||  |||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27192902 aatatcctgcctcgttccttttcggacaacaggcaatatctgcctgaaatcaccacctaaaactattgtcattccaccaaaaggtctaaactcgtttagg 27193001  T
Q  101 gggtcattcttggacatgatatcacgcattgatcggtcaactgcctcaaaacaccatcagtgcatcattggagcctcattccaaattatcaactttgcag 200  Q
    || ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  27193002 ggatcattcttgtacatgatataacgcattgatcggtcaactgcctcaaagcaccatcggtgcatcattggagcctcatcccaaattatcaattttgcag 27193101  T
Q  201 cacgcaccaggtctgcccctaggactatccttttccatcgtaagcgatgatgcctcattaatcttaacagggactgttagcgtcgaatgcgcagttcttc 300  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||| ||| ||||| || || || |||||||    
T  27193102 cacgcaccaggtcag-ccctaggactatccttttccatcataagcgatgatgcctcattaatctcaata-ggaatgtaagcgttgagtgtgcggttcttc 27193199  T
Q  301 cacctggtaatagaagagccgctataccactggatgcaacattcaatacaattaaccccttcgatctaacagcaaccaacaatg 384  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||    
T  27193200 cacctggtaattgaagagctgctataccgcttgatgcagcattcaatacaattaaccccttcgatctaacaacatccgacaatg 27193283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Original strand, 27842716 - 27843097
Alignment:
Q  1 aatatcatgccttgatccttttcggacaatgggcaatatcttccagaaatcaccacctaaaactactgtcattccaccaaaaggtctaaactcgtttagg 100  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||||||  |||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27842716 aatatcctgcctcgttccttttcggacaacaggcaatatctgcctgaaatcaccacctaaaactattgtcattccaccaaaaggtctaaactcgtttagg 27842815  T
Q  101 gggtcattcttggacatgatatcacgcattgatcggtcaactgcctcaaaacaccatcagtgcatcattggagcctcattccaaattatcaactttgcag 200  Q
    || ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  27842816 ggatcattcttgtacatgatataacgcattgatcggtcaactgcctcaaagcaccatcggtgcatcattggagcctcatcccaaattatcaattttgcag 27842915  T
Q  201 cacgcaccaggtctgcccctaggactatccttttccatcgtaagcgatgatgcctcattaatcttaacagggactgttagcgtcgaatgcgcagttcttc 300  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||| ||| ||||| || || || |||||||    
T  27842916 cacgcaccaggtcag-ccctaggactatccttttccatcataagcgatgatgcctcattaatctcaata-ggaatgtaagcgttgagtgtgcggttcttc 27843013  T
Q  301 cacctggtaatagaagagccgctataccactggatgcaacattcaatacaattaaccccttcgatctaacagcaaccaacaatg 384  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||    
T  27843014 cacctggtaattgaagagctgctataccgcttgatgcagcattcaatacaattaaccccttcgatctaacaacatccgacaatg 27843097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 16 - 371
Target Start/End: Original strand, 27509802 - 27510156
Alignment:
Q  16 tccttttcggacaatgggcaatatcttccagaaatcaccacctaaaactactgtcattccaccaaaaggtctaaactcgtttagggggtcattcttggac 115  Q
    ||||||| ||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  27509802 tcctttttggacaacaggcaatatctgcctgaaatcaccacctaaaactactgtcattccaccaaaatgtctaaactcatttaggggatcattcttggac 27509901  T
Q  116 atgatatcacgcattgatcggtcaactgcctcaaaacaccatcagtgcatcattggagcctcattccaaattatcaactttgcagcacgcaccaggtctg 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  27509902 atgatatcacgcattgatcggtcaactgcctcaaaacaccatcggtgcatcattgaagcctcatcctaaattatcaactttgcagcatgcaccagatctg 27510001  T
Q  216 cccctaggactatccttttccatcgtaagcgatgatgcctcattaatcttaacagggactgttagcgtcgaatgcgcagttcttccacctggtaatagaa 315  Q
     ||||||| || ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  27510002 -ccctaggtctgtccttttgcatcgtaagcaatgatgcctcattaatctcaatagggactgtcagtgtcgagtgcgaggttcttccacctggtaatagaa 27510100  T
Q  316 gagccgctataccactggatgcaacattcaatacaattaaccccttcgatctaaca 371  Q
    |||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27510101 gagccgctataccaccagatgcaaaattcaatacaattaacccctccgatctaaca 27510156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Original strand, 35610066 - 35610447
Alignment:
Q  1 aatatcatgccttgatccttttcggacaatgggcaatatcttccagaaatcaccacctaaaactactgtcattccaccaaaaggtctaaactcgtttagg 100  Q
    |||||| ||||| | |||||||||| |||  |||||||| | || |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  35610066 aatatcctgcctcgttccttttcgggcaacaggcaatatatgcctgaaatcaccacctaaaacaactgtcattctaccaaaaggtctaaactcgtttagg 35610165  T
Q  101 gggtcattcttggacatgatatcacgcattgatcggtcaactgcctcaaaacaccatcagtgcatcattggagcctcattccaaattatcaactttgcag 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  35610166 ggatcattcttggacatgatatcacgtattgatcggtcaattgcttcaaaacaccatcggtgca-cattggagcctcatcccaaattatcaactttgcag 35610264  T
Q  201 cacgcaccaggtctgcccctaggactatccttttccatcgtaagcgatgatgcctcattaatcttaacagggactgttagcgtcgaatgcgcagttcttc 300  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| || | ||  ||| |||||||| ||||| ||| ||     
T  35610265 cacgcaccaggtctgcct-taggactatccttttccatcgtaagtgatgatgcctaattaatctcaataaggtatgtcagcgtcgactgcgcggttgttt 35610363  T
Q  301 cacctggtaatagaagagccgctataccactggatgcaacattcaatacaattaaccccttcgatctaacagcaaccaacaatg 384  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  35610364 cacctggtaatagaagagccgttataccgctggatacaacattcaatacaattaaccccttcgatctaacagcaaccgacaatg 35610447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 56 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 41919948 - 41919622
Alignment:
Q  56 cctaaaactactgtcattccaccaaaaggtctaaactcgtttagggggtcattcttggacatgatatcacgcattgatcggtcaactgcctcaaaacacc 155  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||   |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  41919948 cctaaaactactgccattccaccaaaaggtttaagtgcgtttaggggatcattcttggacatgatatcaagcaatgatcggtcaactgcctcaaaacacc 41919849  T
Q  156 atcagtgcatcattggagcctcattccaaattatcaactttgcagcacgcaccaggtctgcccctaggactatccttttccatcgtaagcgatgatgcct 255  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41919848 atcggtgcatcattggagcctcatcccaaattatcaactttgcagcacgcaccaggtctg-ccctaggactatccttttccatcgtaagcgatgacgcct 41919750  T
Q  256 cattaatcttaacagggactgttagcgtcgaatgcgcagttcttccacctggtaatagaagagccgctataccactggatgcaacattcaatacaattaa 355  Q
    ||||||||| || |||||||||| |||| || ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  41919749 cattaatctcaatagggactgttggcgtggagtgcgcggttcttccacctgataatagaagagccgctataccattggatgcagcattcaatacaattaa 41919650  T
Q  356 ccccttcgatctaacagcaaccaacaat 383  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||    
T  41919649 ccccttcgatctaacagcagccgacaat 41919622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 24268876 - 24268495
Alignment:
Q  1 aatatcatgccttgatccttttcggacaatgggcaatatcttccagaaatcaccacctaaaactactgtcattccaccaaaaggtctaaactcgtttagg 100  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||||||  |||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||| |||||||    
T  24268876 aatatcctgcctcgttccttttcggacaacaggcaatatctgcctgatatcaccacctaaaactattgtcattccaccaaatggtttaaacttgtttagg 24268777  T
Q  101 gggtcattcttggacatgatatcacgcattgatcggtcaactgcctcaaaacaccatcagtgcatcattggagcctcattccaaattatcaactttgcag 200  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24268776 ggatcattcttggacatgatatcacgcattgatcggtcaactgcctcaaaacaccatcagtgcatcagtggagcctcatcccaaattatcaactttgcag 24268677  T
Q  201 cacgcaccaggtctgcccctaggactatccttttccatcgtaagcgatgatgcctcattaatcttaacagggactgttagcgtcgaatgcgcagttcttc 300  Q
    || ||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  24268676 catgcaccaggtctg-tcctaggactatcattttccatcgtaagcgatgatgcctca-aaatctcaatagggactgtcagcgtcgagtgtgcggttcttc 24268579  T
Q  301 cacctggtaatagaagagccgctataccactggatgcaacattcaatacaattaaccccttcgatctaacagcaaccaacaatg 384  Q
    | |||||||||||||||| |  |||||| || |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||    
T  24268578 ctcctggtaatagaagagtcattataccgctagatgcaacattcaatacaattaactcattcgatctaacagcagccgacaatg 24268495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 56 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 28665947 - 28665621
Alignment:
Q  56 cctaaaactactgtcattccaccaaaaggtctaaactcgtttagggggtcattcttggacatgatatcacgcattgatcggtcaactgcctcaaaacacc 155  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| || |||   |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28665947 cctaaaactactgccattccaccaaaaagtttaagtgcgtttaggggatcattcttggacatgatatcaagcaatgatcggtcaactgcctcaaaacacc 28665848  T
Q  156 atcagtgcatcattggagcctcattccaaattatcaactttgcagcacgcaccaggtctgcccctaggactatccttttccatcgtaagcgatgatgcct 255  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28665847 atcggtgcatcattggagcctcatcccaaattatcaactttgcagcacacaccaggtctg-cccaaggactatccttttccatcgtaagcgatgacgcct 28665749  T
Q  256 cattaatcttaacagggactgttagcgtcgaatgcgcagttcttccacctggtaatagaagagccgctataccactggatgcaacattcaatacaattaa 355  Q
    ||||||||| || ||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  28665748 cattaatctcaatagggactgtcagcgtggagtgcgcggttcttccacctgataatagaagagccgctataccgttggatgcagcattcaatacaattaa 28665649  T
Q  356 ccccttcgatctaacagcaaccaacaat 383  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||    
T  28665648 ccccttcgatctaacagcagccgacaat 28665621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 56 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 37824781 - 37824455
Alignment:
Q  56 cctaaaactactgtcattccaccaaaaggtctaaactcgtttagggggtcattcttggacatgatatcacgcattgatcggtcaactgcctcaaaacacc 155  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| || |||   |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  37824781 cctaaaactactgccattccaccaaaaagtttaagtgcgtttaggggatcattcttggacatgatatcaagcaatgatcggtcaactgcctcaaaacacc 37824682  T
Q  156 atcagtgcatcattggagcctcattccaaattatcaactttgcagcacgcaccaggtctgcccctaggactatccttttccatcgtaagcgatgatgcct 255  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37824681 atcggtgcatcattggagcctcatcccaaattatcaactttgcagcacacaccaggtctg-cccaaggactatccttttccatcgtaagcgatgacgcct 37824583  T
Q  256 cattaatcttaacagggactgttagcgtcgaatgcgcagttcttccacctggtaatagaagagccgctataccactggatgcaacattcaatacaattaa 355  Q
    ||||||||| || ||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  37824582 cattaatctcaatagggactgtcagcgtggagtgcgcggttcttccacctgataatagaagagccgctataccgttggatgcagcattcaatacaattaa 37824483  T
Q  356 ccccttcgatctaacagcaaccaacaat 383  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||    
T  37824482 ccccttcgatctaacagcagccgacaat 37824455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 126 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 17683594 - 17683350
Alignment:
Q  126 gcattgatcggtcaactgcctcaaaacaccatcagtgcatcattggagcctcattccaaattatcaactttgcagcacgcaccaggtctgcccctaggac 225  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  17683594 gcattgatgagtcaactgcctcaaaacaccattggtgcatcattagagcctcattccaaattatcaactttgcagcacgcaccaggtctg-ccctacgac 17683496  T
Q  226 tatccttttccatcgtaagcgatgatgcctcattaatcttaacagggactgttagcgtcgaatgcgcagttcttccacctggtaatagaagagccgctat 325  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| | | || | || || |||||||||| || |||||||||||||| |||    
T  17683495 tatcctttttcatcgtaagcgatgatgcctcattaatctcgatagggactgtcaacatcaagtgtgcggttcttccacatgataatagaagagccgttat 17683396  T
Q  326 accactggatgcaacattcaatacaattaaccccttcgatctaaca 371  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  17683395 accgctggctgcaacattcaatacaattcaccccttcaatctaaca 17683350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 65
Target Start/End: Original strand, 3643005 - 3643069
Alignment:
Q  1 aatatcatgccttgatccttttcggacaatgggcaatatcttccagaaatcaccacctaaaacta 65  Q
    |||||| ||||| | |||||||||| |||  |||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  3643005 aatatcctgcctcgttccttttcgggcaacaggcaatatctacctgaaatcaccacctaaaacta 3643069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 242; Significance: 1e-134; HSPs: 1)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 47 - 384
Target Start/End: Original strand, 42434 - 42770
Alignment:
Q  47 aaatcaccacctaaaactactgtcattccaccaaaaggtctaaactcgtttagggggtcattcttggacatgatatcacgcattgatcggtcaactgcct 146  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  42434 aaatcaccacctaaaactactgtcattccaccaaaaggtttaagcacgtttaggggatcattcttggacatgatatcacgcaatgatcggtcaactgcct 42533  T
Q  147 caaaacaccatcagtgcatcattggagcctcattccaaattatcaactttgcagcacgcaccaggtctgcccctaggactatccttttccatcgtaagcg 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  42534 caaaacaccatcagtgcatcattggagcctcatcccaaattatcaactttgcagcacgcaccaagtatg-ccctaagactatccttttccatcttaagcg 42632  T
Q  247 atgatgcctcattaatcttaacagggactgttagcgtcgaatgcgcagttcttccacctggtaatagaagagccgctataccactggatgcaacattcaa 346  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||     
T  42633 atgatgcctcattaatctcaatagggactgtcggcgtcgagtgcgcggttcttccacctggtaatagaagagccgttataccgctggatgcagcattcat 42732  T
Q  347 tacaattaaccccttcgatctaacagcaaccaacaatg 384  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  42733 tacaattaaccccttcgatctaacagcagccgacaatg 42770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225 (Bit Score: 240; Significance: 1e-133; HSPs: 1)
Name: scaffold0225
Description:

Target: scaffold0225; HSP #1
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 14083 - 13702
Alignment:
Q  1 aatatcatgccttgatccttttcggacaatgggcaatatcttccagaaatcaccacctaaaactactgtcattccaccaaaaggtctaaactcgtttagg 100  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||||||  |||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  14083 aatatcttgcctcgttccttttcggacaacaggcaatatctgcctgaaatcaccacctaaaactattatcattccaccaaatggtttaaactcgtttagg 13984  T
Q  101 gggtcattcttggacatgatatcacgcattgatcggtcaactgcctcaaaacaccatcagtgcatcattggagcctcattccaaattatcaactttgcag 200  Q
    || |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  13983 ggatcattcttggacatgatatcactcattgatctgtcaactgcctcaaaacaccattagtgcatcattggagcctcatcccaaattatcatctttgcag 13884  T
Q  201 cacgcaccaggtctgcccctaggactatccttttccatcgtaagcgatgatgcctcattaatcttaacagggactgttagcgtcgaatgcgcagttcttc 300  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| || ||||||||| || ||||| || ||  ||||||    
T  13883 cacgcaccaggtctg-ccctaagactatccttttccatcgtaagcaatgatgcctca-taatctcaatagggactgtcagtgtcgagtgtgcgattcttc 13786  T
Q  301 cacctggtaatagaagagccgctataccactggatgcaacattcaatacaattaaccccttcgatctaacagcaaccaacaatg 384  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||    
T  13785 cacctggtaatagaagagtcactataccactggatgcaacattcaatacaattaaccccttcgatctaacaacagccgacaatg 13702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118 (Bit Score: 240; Significance: 1e-133; HSPs: 1)
Name: scaffold0118
Description:

Target: scaffold0118; HSP #1
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 28525 - 28144
Alignment:
Q  1 aatatcatgccttgatccttttcggacaatgggcaatatcttccagaaatcaccacctaaaactactgtcattccaccaaaaggtctaaactcgtttagg 100  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||||||   ||||||||| || || |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  28525 aatatcctgcctcgttccttttcggacaacatgcaatatctgcctgatatcaccaccttaaactattgtcattccaccaaatggtttaaactcgtttagg 28426  T
Q  101 gggtcattcttggacatgatatcacgcattgatcggtcaactgcctcaaaacaccatcagtgcatcattggagcctcattccaaattatcaactttgcag 200  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28425 ggatcattcttggacatgatatcacgcattgatcggtcaactgcctcaaaacaccatcagtgcatcaatggagcctcatcccaaattatcaactttgcag 28326  T
Q  201 cacgcaccaggtctgcccctaggactatccttttccatcgtaagcgatgatgcctcattaatcttaacagggactgttagcgtcgaatgcgcagttcttc 300  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  28325 cacgcaccaggtctg-ccctaggactatccttttccatcgtaagcgatgatgcctca-taatctcaatagggactgtcagcgtcgagtgtgcggttcttc 28228  T
Q  301 cacctggtaatagaagagccgctataccactggatgcaacattcaatacaattaaccccttcgatctaacagcaaccaacaatg 384  Q
    |  ||||||||||||||| |  |||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  28227 cttctggtaatagaagagtcattataccgctagatgcagcattcaatacaattaaccccttcgatctaacagcagccgacaatg 28144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 239; Significance: 1e-132; HSPs: 9)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 22 - 384
Target Start/End: Original strand, 12517708 - 12518069
Alignment:
Q  22 tcggacaatgggcaatatcttccagaaatcaccacctaaaactactgtcattccaccaaaaggtctaaactcgtttagggggtcattcttggacatgata 121  Q
    ||||||||  |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| || ||||||||||||||||||    
T  12517708 tcggacaacaggcaatatctgcctgaaatcaccacctaaaactactgtcattccaccaaaaggtttaagcgcgtttagaggatcattcttggacatgata 12517807  T
Q  122 tcacgcattgatcggtcaactgcctcaaaacaccatcagtgcatcattggagcctcattccaaattatcaactttgcagcacgcaccaggtctgccccta 221  Q
    |||| || |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||    
T  12517808 tcacacaatgatcggtcagctgcctcaaaacaccatcggtgcatcattggagcctcatcccaaattatcaactttgcagcacgcaccatgcctg-cccta 12517906  T
Q  222 ggactatccttttccatcgtaagcgatgatgcctcattaatcttaacagggactgttagcgtcgaatgcgcagttcttccacctggtaatagaagagccg 321  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12517907 ggactatcattttccatcgtaagcgatgatgcctcattaatctcaatagggactgtcagcgtcgagtgtacggttcttccacctggtaatagaagagccg 12518006  T
Q  322 ctataccactggatgcaacattcaatacaattaaccccttcgatctaacagcaaccaacaatg 384  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||    
T  12518007 ctatatcgctggatgcaacattcaatacaattaaccccttcgatctaacaacagccgacaatg 12518069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 320
Target Start/End: Original strand, 30881739 - 30882056
Alignment:
Q  1 aatatcatgccttgatccttttcggacaatgggcaatatcttccagaaatcaccacctaaaactactgtcattccaccaaaaggtctaaactcgtttagg 100  Q
    |||||||||||| | |||||||||||  |   ||||||||| || |||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  30881739 aatatcatgcctcgttccttttcggatgacatgcaatatctgcctgaaatcaccacctaaaacttttgtctttccaccaaaaggtctaaactcgtttagg 30881838  T
Q  101 gggtcattcttggacatgatatcacgcattgatcggtcaactgcctcaaaacaccatcagtgcatcattggagcctcattccaaattatcaactttgcag 200  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |      
T  30881839 ggatcattcttggacatgatat-acgcattgatcgatcaactgcctcaaaacaccatcggtgcatcattggagcctcattccatattatcaacttttcta 30881937  T
Q  201 cacgcaccaggtctgcccctaggactatccttttccatcgtaagcgatgatgcctcattaatcttaacagggactgttagcgtcgaatgcgcagttcttc 300  Q
    || ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  30881938 catgcaccaggtcttccc-taggactatccttttccatcgtaagcgatgatgcctcattaatctcaatagggactgtcagcgtcgagtgcgcggttcttc 30882036  T
Q  301 cacctggtaatagaagagcc 320  Q
    |||| ||||| |||||||||    
T  30882037 caccaggtaagagaagagcc 30882056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 144 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 2200561 - 2200322
Alignment:
Q  144 cctcaaaacaccatcagtgcatcattggagcctcattccaaattatcaactttgcagcacgcaccaggtctgcccctaggactatccttttccatcgtaa 243  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  2200561 cctcaaaacactatcggtgcatcattggagcctcattccaaattatcaactttgcagcacgcaccaggtct-cccctaggactatctttttccatcgtaa 2200463  T
Q  244 gcgatgatgcctcattaatcttaacagggactgttagcgtcgaatgcgcagttcttccacctggtaatagaagagccgctataccactggatgcaacatt 343  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||| || ||||||  |||||| | ||||    
T  2200462 gcgatgatgcctcattaatcttaatagggactgtcagcgtcgagtgcgcggttcttcaacctggtaatagtagagacgttataccgttggatgtagcatt 2200363  T
Q  344 caatacaattaaccccttcgatctaacagcaaccaacaatg 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  2200362 caatacaattaaccccttcgatctaacagcagccgacaatg 2200322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 126 - 371
Target Start/End: Original strand, 10188560 - 10188804
Alignment:
Q  126 gcattgatcggtcaactgcctcaaaacaccatcagtgcatcattggagcctcattccaaattatcaactttgcagcacgcaccaggtctgcccctaggac 225  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  10188560 gcattgatgagtcaactgcctcaaaacaccattggtgcatcattagagcctcattccaaattatcaactttgcagcacgcaccaggtctg-ccctacgac 10188658  T
Q  226 tatccttttccatcgtaagcgatgatgcctcattaatcttaacagggactgttagcgtcgaatgcgcagttcttccacctggtaatagaagagccgctat 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | | || | || || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10188659 tatccttttccatcgtaagcgatgatgcctcattaatctcaatagggactgtcaacatcaagtgtgcggttcttccacctggtaatagaagagccgctat 10188758  T
Q  326 accactggatgcaacattcaatacaattaaccccttcgatctaaca 371  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  10188759 accgctggctgcaacattcaatacaattcaccccttcaatctaaca 10188804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 2201985 - 2201838
Alignment:
Q  1 aatatcatgccttgatccttttcggacaatgggcaatatcttccagaaatcaccacctaaaactactgtcattccaccaaaaggtctaaactcgtttagg 100  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2201985 aatatcctgcctcgatccttttcggacaatgggcaatatctgcctgaagtcaccacctaaaactactgtcattccaccaaaaggtctaaactcgtttagg 2201886  T
Q  101 gggtcattcttggacatgatatcacgcattgatcggtcaactgcctca 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2201885 gggtcattcttggacatgatatcacgctttgatcggtcaactgcctca 2201838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 309 - 384
Target Start/End: Original strand, 15334016 - 15334091
Alignment:
Q  309 aatagaagagccgctataccactggatgcaacattcaatacaattaaccccttcgatctaacagcaaccaacaatg 384  Q
    |||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  15334016 aatagaagagtcactataccgctggatgcaacattcaataaaattaaccccttcgatctaacagcagccgacaatg 15334091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 294 - 371
Target Start/End: Original strand, 18857238 - 18857318
Alignment:
Q  294 gttcttccacctggtaatagaagagccgctataccactggatgcaacattcaatacaattaa---ccccttcgatctaaca 371  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  18857238 gttcttccacttggtaatagaagagccgttataccgctagatgcaacattcaatacaattaacccccccttcgatctaaca 18857318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 75
Target Start/End: Original strand, 18344538 - 18344612
Alignment:
Q  1 aatatcatgccttgatccttttcggacaatgggcaatatcttccagaaatcaccacctaaaactactgtcattcc 75  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||||||   ||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18344538 aatatcctgcctcgttccttttcggacaacatgcaatatctgcctgaaatcaccacctaaaactattgtcattcc 18344612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 44 - 110
Target Start/End: Original strand, 18857161 - 18857227
Alignment:
Q  44 cagaaatcaccacctaaaactactgtcattccaccaaaaggtctaaactcgtttagggggtcattct 110  Q
    ||||||| ||||||||||||   |||||||||||| ||| |||||||||| ||| |||| |||||||    
T  18857161 cagaaattaccacctaaaacggatgtcattccaccgaaatgtctaaactcattttggggatcattct 18857227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 234; Significance: 1e-129; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Original strand, 186967 - 187346
Alignment:
Q  1 aatatcatgccttgatccttttcggacaatgggcaatatcttccagaaatcaccacctaaaactactgtcattccaccaaaaggtctaaactcgtttagg 100  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||||||  |||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  186967 aatatcctgcctcgttccttttcggacaacaggcaatatctgcttgaaatcaccacctaaaactactgtcattccaccaaatggtttaaactcgtttagg 187066  T
Q  101 gggtcattcttggacatgatatcacgcattgatcggtcaactgcctcaaaacaccatcagtgcatcattggagcctcattccaaattatcaactttgcag 200  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  187067 ggatcattcttggacatgatatcacgcattgatcgttcaactacctcaaaacaccatgagtgcatcattggagcctcatctcaaattatcaactttgcag 187166  T
Q  201 cacgcaccaggtctgcccctaggactatccttttccatcgtaagcgatgatgcctcattaatcttaacagggactgttagcgtcgaatgcgcagttcttc 300  Q
    ||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| || ||||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  187167 cacgcaccaggt---gccctaggactatccttttccatcgtaagcgatgatgcgtca-taatctcaatagggactgtcagcgtcgagtgtgcagttcttc 187262  T
Q  301 cacctggtaatagaagagccgctataccactggatgcaacattcaatacaattaaccccttcgatctaacagcaaccaacaatg 384  Q
    |||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| || || ||||||    
T  187263 cacctggtaatagaagagtcattataccgctggatgcatcattcaatacaattaacctcttcgatctaacaacagccgacaatg 187346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 230; Significance: 1e-127; HSPs: 10)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 34 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 6310767 - 6310419
Alignment:
Q  34 caatatcttccagaaatcaccacctaaaactactgtcattccaccaaaaggtctaaactcgtttagggggtcattcttggacatgatatcacgcattgat 133  Q
    |||||||| ||  ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6310767 caatatctgcctaaaatcaccacctaaaactattgtcgttccaccaaaaggtttaagtgcgtttaggggatcattcttggacatgatatcacgcaatgat 6310668  T
Q  134 cggtcaactgcctcaaaacaccatcagtgcatcattggagcctcattccaaattatcaactttgcagcacgcaccaggtctgcccctaggactatccttt 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  6310667 cggtcaactgcctcaaaacaccatcggtgcatcattggagcctcatcccaaattatcaactttgcagcatgcatcaggtctg-ccctaggactatccttt 6310569  T
Q  234 tccatcgtaagcgatgatgcctcattaatcttaacagggactgttagcgtcgaatgcgcagttcttccacctggtaatagaagagccgctataccactgg 333  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||| || |||||||||  |||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  6310568 tccatcgtaagcgataacgcctcattaatctcaaaagggactgtcggcgtggagtgcgcggttcttccacctggtaatagaagagccgctataccgttgg 6310469  T
Q  334 atgcaacattcaatacaattaaccccttcgatctaacagcaaccaacaat 383  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6310468 atgcagcattcaatacaattaaccccttcgatctaacagcaaccgacaat 6310419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 32 - 384
Target Start/End: Original strand, 16042469 - 16042818
Alignment:
Q  32 ggcaatatcttccagaaatcaccacctaaaactactgtcattccaccaaaaggtctaaactcgtttagggggtcattcttggacatgatatcacgcattg 131  Q
    |||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||    
T  16042469 ggcaatatctgcctgaaatcaccacgtaaaactactgtcattccaccaaaaggtttaagcgcgtttaggggatcattcttggacatgatatcacacaatg 16042568  T
Q  132 atcggtcaactgcctcaaaacaccatcagtgcatcattggagcctcattccaaattatcaactttgcagcacgcaccaggtctgcccctaggactatcct 231  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16042569 atcagtcagctgcctcaaaacaccatcggtgcatcatttgagcctcatcccaaattatcaactttgcagcacgcaccaggtctg-ccctaggactatcct 16042667  T
Q  232 tttccatcgtaagcgatgatgcctcattaatcttaacagggactgttagcgtcgaatgcgcagttcttccacctggtaatagaagagccgctataccact 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  || || ||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |    
T  16042668 tttccatcgtaagcgatgatgcctcatta--ctcaatagggactgtcagcgtcgagtgcacggttcttccacctggtaatagaagagcggctataccgtt 16042765  T
Q  332 ggatgcaacattcaatacaattaaccccttcgatctaacagcaaccaacaatg 384  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||    
T  16042766 ggatgcagtattcaatacaattaacccattcgatctaacagcagccgacaatg 16042818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 16 - 384
Target Start/End: Original strand, 36207643 - 36208010
Alignment:
Q  16 tccttttcggacaatgggcaatatcttccagaaatcaccacctaaaactactgtcattccaccaaaaggtctaaactcgtttagggggtcattcttggac 115  Q
    |||||||| |||||  ||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||    
T  36207643 tccttttcagacaacaggcaatatctgtctgaaatcaccacctaaaactactgtcattccaccaaaaggtctaaactcatttaagggatcattcttggac 36207742  T
Q  116 atgatatcacgcattgatcggtcaactgcctcaaaacaccatcagtgcatcattggagcctcattccaaattatcaactttgcagcacgcaccaggtctg 215  Q
    ||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  36207743 atggtatcacacattgatcagtcaactgcctcaaaacaccattagtgcatgattggagcctcatcccaaattatcaacgttgcagcacgcaccaggtct- 36207841  T
Q  216 cccctaggactatccttttccatcgtaagcgatgatgcctcattaatcttaacagggactgttagcgtcgaatgcgcagttcttccacctggtaatagaa 315  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||  ||||||| |||    |||||||||||||||||||||    
T  36207842 accctaggactattcttttccatcgtaagcgatgatgcctcgttaatcttaatagggactgtcggcgtcgagtgcatgattcttccacctggtaatagaa 36207941  T
Q  316 gagccgctataccactggatgcaacattcaatacaattaaccccttcgatctaacagcaaccaacaatg 384  Q
     ||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||    
T  36207942 aagccgttatactgctagatgcaacattcaatacaattaaccccttcgatctaacaacagccgacaatg 36208010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Original strand, 52500990 - 52501365
Alignment:
Q  1 aatatcatgccttgatccttttcggacaatgggcaatatcttccagaaatcaccacctaaaactactgtcattccaccaaaaggtctaaactcgtttagg 100  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||||||   ||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  52500990 aatatcctgcctcgttccttttcggacaacatgcaatatctgcctgatatcaccacctaaaactattgtcattccaccaaatggtttaaactcgtttagg 52501089  T
Q  101 gggtcattcttggacatgatatcacgcattgatcggtcaactgcctcaaaacaccatcagtgcatcattggagcctcattccaaattatcaactttgcag 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  52501090 ggatcattcttggacatgatatcacgcattgatcggccaactgcctcaaaacaccatcagtgcatcaatggagcctcatcccaaattatcaactttgcag 52501189  T
Q  201 cacgcaccaggtctgcccctaggactatccttttccatcgtaagcgatgatgcctcattaatcttaacagggactgttagcgtcgaatgcgcagttcttc 300  Q
    |||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  52501190 cacgcatcaggtct-tccctaggactatccttttccatcgtaagcgatgatgcctca-taatcttaatagggactgtcagcgtcgagtgtgcggttcttc 52501287  T
Q  301 cacctggtaatagaagagccgctataccactggatgcaacattcaatacaattaaccccttcgatctaacagcaaccaacaatg 384  Q
    | |||||||||||||||| |  |||||| || ||||||||||||||      ||||||||| |||||||||||| || ||||||    
T  52501288 ctcctggtaatagaagagtcattataccgctagatgcaacattcaa------taaccccttagatctaacagcagccgacaatg 52501365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 2452923 - 2452690
Alignment:
Q  1 aatatcatgccttgatccttttcggacaatgggcaatatcttccagaaatcaccacctaaaactactgtcattccaccaaaaggtctaaactcgtttagg 100  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  2452923 aatatcctgcctcgatccttttcggacaatgggcaatatcttcctgaaatcaccacctaaaactactgtcattccaccaaaagttctaaactcgtttaag 2452824  T
Q  101 gggtcattcttggacatgatatcacgcattgatcggtcaactgcctcaaaacaccatcagtgcatcattggagcctcattccaaattatcaactttgcag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||    
T  2452823 gggtcattcttggacatgatatcacacattgatcgatcaactgcctcaaaacaccatcggtgcatcattggagcctcatcccaaattatcaacattacag 2452724  T
Q  201 cacgcaccaggtctgcccctaggactatcctttt 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2452723 cacgcaccaggtctgcccctaggactatcctttt 2452690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 37 - 374
Target Start/End: Original strand, 2329615 - 2329951
Alignment:
Q  37 tatcttccagaaatcaccacctaaaactactgtcattccaccaaaaggtctaaactcgtttagggggtcattcttggacatgatatcacgcattgatcgg 136  Q
    ||||| || |||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2329615 tatctgcctgaaatcaccacctaaaaccactatcattccacgaaaaggtctaaacttgtttaggggatcattcttggacatgatatcacacattgatcgg 2329714  T
Q  137 tcaactgcctcaaaacaccatcagtgcatcattggagcctcattccaaattatcaactttgcagcacgcaccaggtctgcccctaggactatccttttcc 236  Q
    | ||||  |||||||||||||  |||||||||||||| |||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  2329715 taaactttctcaaaacaccattggtgcatcattggagactcataaaaaattatcaactttgcagcacacaccaggtctg-ccctaggactgtccttttcc 2329813  T
Q  237 atcgtaagcgatgatgcctcattaatcttaacagggactgttagcgtcgaatgcgcagttcttccacctggtaatagaagagccgctataccactggatg 336  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||  ||  |||| || || ||||||||||||||||||||||||| | ||||||| || ||||    
T  2329814 atagtaagcgatgatgcctccttaatctcaatagggactgccagtttcgagtgtgcggttcttccacctggtaatagaagagtctctataccgctagatg 2329913  T
Q  337 caacattcaatacaattaaccccttcgatctaacagca 374  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  2329914 caacattcaatacaattaaccctttcgatctaatagca 2329951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 22 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 37389937 - 37389633
Alignment:
Q  22 tcggacaatgggcaatatcttccagaaatcaccacctaaaactactgtcattccaccaaaaggtctaaactcgtttagggggtcattcttggacatgata 121  Q
    ||||||||  |||||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||   |||||| ||| |||||||||| |||||||    
T  37389937 tcggacaacaggcaatatctgcctaaaatcaccacctaaaactattgtcattccaccaaaaggtttaagtgcgtttaagggatcattcttggccatgata 37389838  T
Q  122 tcacgcattgatcggtcaactgcctcaaaacaccatcagtgcatcattggagcctcattccaaattatcaactttgcagcacgcaccaggtctgccccta 221  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  37389837 tcacgcaatgattggtcaactgcctcaaaacaccatcattgtatcattggagtctcatcccaaattatcaactttgcagcacgcaccaggtctg-ccctg 37389739  T
Q  222 ggactatccttttccatcgtaagcgatgatgcctcattaatcttaacagggactgttagcgtcgaatgcgcagttcttccacctggtaatagaagagccg 321  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||| || |||||||||  |||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  37389738 ggactatccttttccattgtaagcgatgacacctcattaatctcaatagggactgtcggcgtggagtgcgcgattcttccacctggtaatagaagagccg 37389639  T
Q  322 ctatac 327  Q
    ||||||    
T  37389638 ctatac 37389633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 48775141 - 48774924
Alignment:
Q  1 aatatcatgccttgatccttttcggacaatgggcaatatcttccagaaatcaccacctaaaactactgtcattccaccaaaaggtctaaactcgtttagg 100  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||||||    |||||| |  | ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  48775141 aatatcctgcctcgttccttttcggacaacatacaatatttgtctgaaatcaccacctaaaactaccgtcattcctccaaaaggtctaaactcgtttaag 48775042  T
Q  101 gggtcattcttggacatgatatcacgcattgatcggtcaactgcctcaaaacaccatcagtgcatcattggagcctcattccaaattatcaactttgcag 200  Q
    || ||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||    
T  48775041 ggatcattcttggatatgatatcatgcattgattggtcaactgcttcaaaacaccatcggtgcatcattggagcctcatcacaaattatcaactttgaag 48774942  T
Q  201 cacgcaccaggtctgccc 218  Q
    ||||||||||||||||||    
T  48774941 cacgcaccaggtctgccc 48774924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 269 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 48774922 - 48774807
Alignment:
Q  269 agggactgttagcgtcgaatgcgcagttcttccacctggtaatagaagagccgctataccactggatgcaacattcaatacaattaaccccttcgatcta 368  Q
    |||||||||| ||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||  |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  48774922 agggactgtttgcgtcgagtgcacggttcttccacctggtaatagaagagttgctatatcgctggatgcaacattcaatacaattaacctcttcgatcta 48774823  T
Q  369 acagcaaccaacaatg 384  Q
    ||| |||| |||||||    
T  48774822 acaacaactaacaatg 48774807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 75
Target Start/End: Original strand, 48233806 - 48233865
Alignment:
Q  16 tccttttcggacaatgggcaatatcttccagaaatcaccacctaaaactactgtcattcc 75  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  48233806 tccttttcggacaacaggcaatatctgcctgaaatcaccacctaaaactattgtcattcc 48233865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1139 (Bit Score: 224; Significance: 1e-123; HSPs: 1)
Name: scaffold1139
Description:

Target: scaffold1139; HSP #1
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 14 - 385
Target Start/End: Original strand, 1443 - 1813
Alignment:
Q  14 gatccttttcggacaatgggcaatatcttccagaaatcaccacctaaaactactgtcattccaccaaaaggtctaaactcgtttagggggtcattcttgg 113  Q
    |||| ||||||| |||  |||||||||| |  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  1443 gatctttttcgggcaacaggcaatatctacttgaaatcaccacctaaaactactatcattccaccaaaaggtctaaactcgtttaggggatcattattgg 1542  T
Q  114 acatgatatcacgcattgatcggtcaactgcctcaaaacaccatcagtgcatcattggagcctcattccaaattatcaactttgcagcacgcaccaggtc 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||  | ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1543 acatgatatcacgcattgatcggtcaactgcctcaaaacaccatcggtgcatcatttgagcctcaaccaaaattattaactttgcagcacgcaccaggtc 1642  T
Q  214 tgcccctaggactatccttttccatcgtaagcgatgatgcctcattaatcttaacagggactgttagcgtcgaatgcgcagttcttccacctggtaatag 313  Q
    || |||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| | || |||||||||||| ||||| ||| | ||||||| ||||||||||||    
T  1643 tg-ccctaggactatcctttttcattttaagcgatgatgcctcattaatatcaatagggactgttagtgtcgagtgcccggttcttcgacctggtaatag 1741  T
Q  314 aagagccgctataccactggatgcaacattcaatacaattaaccccttcgatctaacagcaaccaacaatga 385  Q
    |||||||| |||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||    
T  1742 aagagccgttataccgctggatgtagcattcaatacaattagcccattcgatctaacaacaaccgacaatga 1813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 224; Significance: 1e-123; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 5066 - 4685
Alignment:
Q  1 aatatcatgccttgatccttttcggacaatgggcaatatcttccagaaatcaccacctaaaactactgtcattccaccaaaaggtctaaactcgtttagg 100  Q
    |||||| ||||| | ||||||||| ||||| |||||||||| ||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  5066 aatatcctgcctcgttccttttcgaacaataggcaatatctgcctaaaatcaccatctaaaactattgtcattccaccaaatggtttaaactcgtttagg 4967  T
Q  101 gggtcattcttggacatgatatcacgcattgatcggtcaactgcctcaaaacaccatcagtgcatcattggagcctcattccaaattatcaactttgcag 200  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  4966 ggatcattcttggacatgatatcatgcattgatcggtcaactgcctcaaaacaccatcagtgcatcattggatcctcatcccaaattatcaactttgcag 4867  T
Q  201 cacgcaccaggtctgcccctaggactatccttttccatcgtaagcgatgatgcctcattaatcttaacagggactgttagcgtcgaatgcgcagttcttc 300  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||| || ||||| || || |||||||    
T  4866 cacgcaccaggtctg-ccctaggactatccttttctatcgtaagcgatgatgcctca-taatctcaatagggactgtcagggtcgagtgtgcggttcttc 4769  T
Q  301 cacctggtaatagaagagccgctataccactggatgcaacattcaatacaattaaccccttcgatctaacagcaaccaacaatg 384  Q
    | |||||||||||||||| | ||||||| |  || | |  |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  4768 ctcctggtaatagaagagtcactataccgccagaagaagtattcaatacaattaaccccttcgatctaacagcagccgacaatg 4685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0073 (Bit Score: 223; Significance: 1e-123; HSPs: 2)
Name: scaffold0073
Description:

Target: scaffold0073; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 22 - 384
Target Start/End: Original strand, 32366 - 32727
Alignment:
Q  22 tcggacaatgggcaatatcttccagaaatcaccacctaaaactactgtcattccaccaaaaggtctaaactcgtttagggggtcattcttggacatgata 121  Q
    ||||||||  |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||| ||| || | |||||||||||||    
T  32366 tcggacaacaggcaatatctgcctgaaatcaccacctaaaactactgtcattccaccaaaaggtttaagcgcgtttacgggatcgtgcttggacatgata 32465  T
Q  122 tcacgcattgatcggtcaactgcctcaaaacaccatcagtgcatcattggagcctcattccaaattatcaactttgcagcacgcaccaggtctgccccta 221  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  32466 tcacgcaatgatcggtcagctgcctcaaaacaccatcggtgcatcattggagcctcatcccaaattatcaactttgcagcacgcaccaggtctg-cccta 32564  T
Q  222 ggactatccttttccatcgtaagcgatgatgcctcattaatcttaacagggactgttagcgtcgaatgcgcagttcttccacctggtaatagaagagccg 321  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||| || | |||||||| | | | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32565 agactatccttttccattgtaagcgatgatgcctcattaatctcaatagggtctatcagcgtcgagtacacggttcttccacctggtaatagaagagccg 32664  T
Q  322 ctataccactggatgcaacattcaatacaattaaccccttcgatctaacagcaaccaacaatg 384  Q
     |||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||    
T  32665 ttatactgctggatgcagcattcaatacaattaaccccttcgatctaatagcagccgacaatg 32727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0073; HSP #2
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 32 - 371
Target Start/End: Original strand, 195 - 533
Alignment:
Q  32 ggcaatatcttccagaaatcaccacctaaaactactgtcattccaccaaaaggtctaaactcgtttagggggtcattcttggacatgatatcacgcattg 131  Q
    |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||| ||| ||||||||| ||||||||||||| | ||    
T  195 ggcaatatctgcctaaaatcaccacctaaaactactgtcattccaccaaaaggtttaagtgcgtttaagggatcattcttgaacatgatatcacgtaatg 294  T
Q  132 atcggtcaactgcctcaaaacaccatcagtgcatcattggagcctcattccaaattatcaactttgcagcacgcaccaggtctgcccctaggactatcct 231  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||  ||||||| |||||||||||||||    
T  295 atcggtcaactacctcaaaacaccattggtgcatcattggagcctcaccccaaattatcaactttgcagcatgcattaggtctg-ccctaggactatcct 393  T
Q  232 tttccatcgtaagcgatgatgcctcattaatcttaacagggactgttagcgtcgaatgcgcagttcttccacctggtaatagaagagccgctataccact 331  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||  |||| || || || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |    
T  394 tttccatcgtaagcgatgacgcctcattaatctcaatagggactgtcggcgtggagtgtgcggttcttccacctggtaatagaagagccgttataccgtt 493  T
Q  332 ggatgcaacattcaatacaattaaccccttcgatctaaca 371  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  494 tgatgcaacattcaatacaattaaccccttcgatctaaca 533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0262 (Bit Score: 218; Significance: 1e-120; HSPs: 1)
Name: scaffold0262
Description:

Target: scaffold0262; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 370
Target Start/End: Original strand, 19418 - 19785
Alignment:
Q  1 aatatcatgccttgatccttttcggacaatgggcaatatcttccagaaatcaccacctaaaactactgtcattccaccaaaaggtctaaactcgtttagg 100  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||||||  | |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | | ||||||||||||||    
T  19418 aatatcctgcctcgttccttttcggacaacagacaatatctgcctgaaattaccacctaaaactattgtcattccaccaaatgatttaaactcgtttagg 19517  T
Q  101 gggtcattcttggacatgatatcacgcattgatcggtcaactgcctcaaaacaccatcagtgcatcattggagcctcattccaaattatcaactttgcag 200  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19518 ggatcattcttggacatgatatcacgcattgatcggtcaactgcctcaaaacaccatcagtgcatcattggagcctcatcccaaattatcaactttgcag 19617  T
Q  201 cacgcaccaggtctgcccctaggactatccttttccatcgtaagcgatgatgcctcattaatcttaacagggactgttagcgtcgaatgcgcagttcttc 300  Q
    |||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||| |  ||||| || || |||||||    
T  19618 cacgcaccaggtctg-acctaagactatccttttccatcgtaagcgatgatgcctca-taatctcaatagggaatgtcaaagtcgagtgtgcggttcttc 19715  T
Q  301 cacctggtaatagaagagccgctataccactggatgcaacattcaatacaattaaccccttcgatctaac 370  Q
    | |||||||||||||||| |  |||||| || |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19716 ctcctggtaatagaagagtcattataccgctagatgcagcattcagtacaattaaccccttcgatctaac 19785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0550 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 1)
Name: scaffold0550
Description:

Target: scaffold0550; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 9 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 370 - 2
Alignment:
Q  9 gccttgatccttttcggacaatgggcaatatcttccagaaatcaccacctaaaactactgtcattccaccaaaaggtctaaactcgtttagggggtcatt 108  Q
    |||||| ||||  ||||||||  | |||||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| | |||||||||| ||||     
T  370 gccttgttcctcctcggacaacagacaatatctgcctgaaatcaccacctaaaactaccttcattccaccaaaaggtttaagcgcgtttaggggatcatg 271  T
Q  109 cttggacatga----tatcacgcattgatcggtcaactgcctcaaaacaccatcagtgcatcattggagcctcattccaaattatcaactttgcagcacg 204  Q
    |||||||||||    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  270 cttggacatgaatgatatcacgcaatgatcggtcagctgcctcaaaacaccattagtgcatcattggagccttaacccaaattatcaactttgcagcacg 171  T
Q  205 caccaggtctgcccctaggactatccttttccatcgtaagcgatgatgcctcattaatcttaacagggactgttagcgtcgaatgcgcagttcttccacc 304  Q
    |||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || || |||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  170 cacctggtctgccc-taagactatccttttccatcgtaagcgatgatgcctcgttaatttcaatagagactgtcagcgtcgagtgcgcggttcttccacc 72  T
Q  305 tggtaatagaagagccgctataccactggatgcaacattcaatacaattaaccccttcgatctaacagca 374  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  71 tggtaatagaagagccgctataccgctggatgcaacattcaatacaattaaccccttcgatctaacagca 2  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 216; Significance: 1e-118; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 56 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 48711 - 48385
Alignment:
Q  56 cctaaaactactgtcattccaccaaaaggtctaaactcgtttagggggtcattcttggacatgatatcacgcattgatcggtcaactgcctcaaaacacc 155  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| || |||   |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  48711 cctaaaactactgccattccaccaaaaagtttaagtgcgtttaggggatcattcttggacatgatatcaagcaatgatcggtcaactgcctcaaaacacc 48612  T
Q  156 atcagtgcatcattggagcctcattccaaattatcaactttgcagcacgcaccaggtctgcccctaggactatccttttccatcgtaagcgatgatgcct 255  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  48611 atcggtgcatcattggagcctcatcccaaattatcaactttgcagcacgcaccaggtctg-cccaaggactatccttttccatcgtaagcgatgacgcct 48513  T
Q  256 cattaatcttaacagggactgttagcgtcgaatgcgcagttcttccacctggtaatagaagagccgctataccactggatgcaacattcaatacaattaa 355  Q
    ||||||||| || |||||||||  |||| || ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  48512 cattaatctcaatagggactgtcggcgtggagtgcgcggttcttccacctgataatagaagagccgctataccgttggatgcagcattcaatacaattaa 48413  T
Q  356 ccccttcgatctaacagcaaccaacaat 383  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||    
T  48412 ccccttcgatctaacagcagccgacaat 48385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0356 (Bit Score: 184; Significance: 2e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0356
Description:

Target: scaffold0356; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 17683 - 17365
Alignment:
Q  1 aatatcatgccttgatccttttcggacaatgggcaatatcttccagaaatcaccacctaaaactactgtcattccaccaaaaggtctaaactcgtttagg 100  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||||||   |||||| || || ||||||||||| |||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  17683 aatatcctgcctcgttccttttcggacaacatgcaatagctgcctgaaatcaccacataaaactcttgtcattccacggaaaggtctaaactcgtttagg 17584  T
Q  101 gggtcattcttggacatgatatcacgcattgatcggtcaactgcctcaaaacaccatcagtgcatcattggagcctcattccaaattatcaactttgcag 200  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  17583 ggatcattcttggacatgatatcacgcattgatcgatcaactgcctcaaaacaccatcggtgcatcattggagcctcatcccaaactattaactttgcag 17484  T
Q  201 cacgcaccaggtctgcccctaggactatccttttccatcgtaagcgatgatgcctcattaatcttaacagggactgttagcgtcgaatgcgcagttcttc 300  Q
    |||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| || || |||||||    
T  17483 cacgcaccagttct-tccctaggactatccttttccattgtaagcgatgatgcctcattaatctcaatagggactgtcagcgtcgagtgtgcggttcttc 17385  T
Q  301 cacctggtaatagaagagcc 320  Q
    |||||| ||| |||| ||||    
T  17384 cacctgataagagaaaagcc 17365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 180; Significance: 4e-97; HSPs: 2)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 321142 - 320824
Alignment:
Q  1 aatatcatgccttgatccttttcggacaatgggcaatatcttccagaaatcaccacctaaaactactgtcattccaccaaaaggtctaaactcgtttagg 100  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||||||  | |||||||| || |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  321142 aatatcctgcctcgttccttttcggacaacagacaatatctgcctgaaatcaccacctaaaactcttgtcattccaccaaaaggtctaaagttgtttagg 321043  T
Q  101 gggtcattcttggacatgatatcacgcattgatcggtcaactgcctcaaaacaccatcagtgcatcattggagcctcattccaaattatcaactttgcag 200  Q
    || |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||  || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  321042 ggatcattcttggacatgatatcacccattgatcgatcaaatgcctcaaaacaccatcgatgtatcattggagcctcatcccaaattatcaactttgcag 320943  T
Q  201 cacgcaccaggtctgcccctaggactatccttttccatcgtaagcgatgatgcctcattaatcttaacagggactgttagcgtcgaatgcgcagttcttc 300  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | |||||| || |  |||||||    
T  320942 cacgcaccaggtct-tccctaggactatccttttctatcacaagcgatgatgcctcattaatctcaatagggactgtcaacgtcgagtgtggggttcttc 320844  T
Q  301 cacctggtaatagaagagcc 320  Q
    |||||||||| |||||||||    
T  320843 cacctggtaaaagaagagcc 320824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 207 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 319314 - 319153
Alignment:
Q  207 ccaggtctgcccctaggactatccttttccatcgtaagcgatgatgcctcattaatcttaacagggactgttagcgtcgaatgcgcagttcttccacctg 306  Q
    |||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||| || ||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||    
T  319314 ccaggtctgccc-taagactatc-ttttccatcgtaagcaatgatgactcat-aatctcaatagggactgtcagcgtcaagtgtgcagttcttccacctg 319218  T
Q  307 gtaatagaagagccgctataccactggatgcaacattcaatacaattaaccccttcgatctaaca 371  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  319217 gtaatagaagagtcactataccgctggatgcagcattcaatacaattaacccctttgatctaaca 319153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University