View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF9842_low_19 (Length: 210)

Name: NF9842_low_19
Description: NF9842
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF9842_low_19
NF9842_low_19
[»] chr8 (15 HSPs)
chr8 (1-210)||(44562951-44563160)
chr8 (1-210)||(9354472-9354681)
chr8 (1-210)||(19659195-19659404)
chr8 (1-209)||(16283296-16283507)
chr8 (17-209)||(22081035-22081224)
chr8 (24-202)||(14557497-14557675)
chr8 (135-210)||(33244649-33244724)
chr8 (1-202)||(16277401-16277605)
chr8 (39-209)||(27609062-27609235)
chr8 (1-209)||(2137416-2137627)
chr8 (39-209)||(19687983-19688156)
chr8 (21-202)||(18710453-18710637)
chr8 (42-202)||(31489914-31490077)
chr8 (21-109)||(19286332-19286420)
chr8 (42-109)||(31354412-31354479)
[»] chr2 (23 HSPs)
chr2 (1-210)||(31891514-31891723)
chr2 (1-210)||(34156857-34157066)
chr2 (1-210)||(34303489-34303698)
chr2 (1-210)||(3784500-3784709)
chr2 (1-210)||(16163445-16163654)
chr2 (1-210)||(27118534-27118743)
chr2 (1-210)||(19456607-19456816)
chr2 (1-210)||(21703350-21703559)
chr2 (1-202)||(27434638-27434842)
chr2 (1-209)||(23128753-23128964)
chr2 (17-126)||(27392852-27392961)
chr2 (39-202)||(28882095-28882261)
chr2 (1-202)||(12655385-12655589)
chr2 (1-202)||(20837761-20837965)
chr2 (42-202)||(37925377-37925540)
chr2 (45-202)||(11635380-11635543)
chr2 (39-202)||(13936738-13936904)
chr2 (39-202)||(34279330-34279496)
chr2 (45-202)||(32049685-32049845)
chr2 (45-202)||(11641569-11641732)
chr2 (39-202)||(21677376-21677542)
chr2 (150-209)||(27392964-27393023)
chr2 (42-155)||(261009-261122)
[»] chr6 (29 HSPs)
chr6 (3-210)||(28162506-28162713)
chr6 (1-210)||(13522213-13522422)
chr6 (1-210)||(33374396-33374605)
chr6 (1-210)||(8892450-8892659)
chr6 (1-210)||(8903685-8903894)
chr6 (2-210)||(22477413-22477624)
chr6 (41-205)||(20160588-20160752)
chr6 (41-205)||(22172079-22172243)
chr6 (135-210)||(14143425-14143500)
chr6 (135-210)||(26787925-26788000)
chr6 (135-210)||(27196298-27196373)
chr6 (135-210)||(27252867-27252942)
chr6 (1-209)||(22935021-22935229)
chr6 (1-209)||(23857466-23857674)
chr6 (123-210)||(27290510-27290597)
chr6 (24-202)||(24304766-24304947)
chr6 (135-210)||(22457074-22457149)
chr6 (1-202)||(13299099-13299303)
chr6 (39-209)||(26918262-26918435)
chr6 (39-209)||(26988883-26989056)
chr6 (1-209)||(15424458-15424669)
chr6 (39-202)||(16749736-16749902)
chr6 (39-202)||(26999955-27000121)
chr6 (21-185)||(29549342-29549506)
chr6 (1-202)||(24863561-24863765)
chr6 (42-202)||(4525174-4525334)
chr6 (42-109)||(27044275-27044342)
chr6 (42-112)||(29501291-29501361)
chr6 (54-155)||(27629907-27630008)
[»] chr7 (21 HSPs)
chr7 (1-210)||(31088547-31088756)
chr7 (1-196)||(45733311-45733506)
chr7 (1-210)||(16450081-16450290)
chr7 (1-210)||(16041174-16041383)
chr7 (135-210)||(26484679-26484754)
chr7 (1-209)||(16503464-16503675)
chr7 (1-209)||(16518500-16518711)
chr7 (135-210)||(2109088-2109163)
chr7 (135-210)||(18540784-18540859)
chr7 (135-210)||(39211106-39211181)
chr7 (135-210)||(2775344-2775419)
chr7 (24-209)||(10916952-10917137)
chr7 (39-202)||(5127878-5128044)
chr7 (39-202)||(11424867-11425033)
chr7 (21-202)||(5147431-5147615)
chr7 (21-185)||(5159390-5159554)
chr7 (39-109)||(2154459-2154529)
chr7 (45-202)||(45387235-45387395)
chr7 (21-106)||(26435125-26435210)
chr7 (42-109)||(4145310-4145377)
chr7 (42-106)||(11441449-11441513)
[»] chr5 (25 HSPs)
chr5 (1-210)||(13184742-13184951)
chr5 (1-210)||(33877106-33877315)
chr5 (1-210)||(11325653-11325862)
chr5 (1-210)||(13440588-13440797)
chr5 (1-210)||(22888329-22888538)
chr5 (1-210)||(25198888-25199097)
chr5 (1-210)||(23892062-23892274)
chr5 (1-209)||(24969880-24970085)
chr5 (123-210)||(29889176-29889263)
chr5 (24-209)||(30934515-30934700)
chr5 (39-209)||(11549248-11549421)
chr5 (39-209)||(23718083-23718256)
chr5 (39-209)||(23752545-23752718)
chr5 (39-209)||(24688252-24688425)
chr5 (39-202)||(22999216-22999382)
chr5 (39-202)||(33777381-33777547)
chr5 (42-202)||(30168366-30168529)
chr5 (39-202)||(9548645-9548811)
chr5 (21-185)||(33292404-33292568)
chr5 (42-202)||(34616418-34616578)
chr5 (42-185)||(32599591-32599734)
chr5 (42-106)||(31431325-31431389)
chr5 (21-106)||(3789402-3789487)
chr5 (42-106)||(18500949-18501013)
chr5 (42-106)||(43078146-43078210)
[»] chr4 (18 HSPs)
chr4 (1-210)||(15227735-15227944)
chr4 (1-210)||(24460802-24461011)
chr4 (1-210)||(1900122-1900331)
chr4 (5-210)||(15285125-15285330)
chr4 (4-210)||(14235722-14235931)
chr4 (17-209)||(15391536-15391725)
chr4 (6-209)||(17013867-17014073)
chr4 (39-202)||(24592519-24592682)
chr4 (39-202)||(14664918-14665084)
chr4 (21-185)||(24112547-24112711)
chr4 (21-185)||(34189182-34189346)
chr4 (21-202)||(14763509-14763693)
chr4 (45-202)||(27163522-27163682)
chr4 (45-202)||(5005776-5005939)
chr4 (39-106)||(6569753-6569820)
chr4 (51-174)||(36344748-36344871)
chr4 (21-109)||(54833272-54833360)
chr4 (51-109)||(21969613-21969671)
[»] chr3 (43 HSPs)
chr3 (1-210)||(17994022-17994231)
chr3 (1-210)||(4625755-4625964)
chr3 (1-210)||(5652198-5652407)
chr3 (1-210)||(16626744-16626953)
chr3 (3-210)||(18530207-18530408)
chr3 (135-210)||(32292697-32292772)
chr3 (1-209)||(15892945-15893156)
chr3 (1-209)||(8301506-8301714)
chr3 (135-210)||(31034355-31034430)
chr3 (1-202)||(5713035-5713239)
chr3 (1-202)||(5723945-5724149)
chr3 (1-202)||(5757328-5757532)
chr3 (1-202)||(5768219-5768423)
chr3 (39-209)||(18051108-18051281)
chr3 (39-202)||(35880612-35880778)
chr3 (39-202)||(4721477-4721643)
chr3 (39-202)||(4796899-4797065)
chr3 (1-209)||(8295783-8295991)
chr3 (45-202)||(6192168-6192328)
chr3 (39-202)||(7073058-7073224)
chr3 (67-208)||(18330543-18330687)
chr3 (1-202)||(22387824-22388025)
chr3 (42-202)||(29149001-29149164)
chr3 (21-185)||(4893041-4893205)
chr3 (21-185)||(32438985-32439149)
chr3 (45-202)||(7996414-7996574)
chr3 (45-202)||(10642922-10643082)
chr3 (39-109)||(15741424-15741494)
chr3 (21-202)||(18277298-18277482)
chr3 (21-202)||(18292599-18292783)
chr3 (21-202)||(18307900-18308084)
chr3 (42-202)||(47023302-47023465)
chr3 (1-109)||(8211549-8211657)
chr3 (45-202)||(28116200-28116363)
chr3 (39-109)||(10395982-10396052)
chr3 (39-109)||(20065892-20065962)
chr3 (21-106)||(29665330-29665415)
chr3 (42-185)||(4346950-4347093)
chr3 (42-109)||(5466834-5466901)
chr3 (42-185)||(28021127-28021270)
chr3 (42-112)||(5596705-5596775)
chr3 (153-202)||(15741340-15741389)
chr3 (42-106)||(11110706-11110770)
[»] scaffold0260 (1 HSPs)
scaffold0260 (1-210)||(2855-3064)
[»] chr1 (6 HSPs)
chr1 (1-210)||(20340532-20340741)
chr1 (4-126)||(20460957-20461079)
chr1 (17-210)||(16208228-16208418)
chr1 (135-210)||(28151845-28151920)
chr1 (147-210)||(20461076-20461139)
chr1 (45-202)||(41793513-41793673)
[»] scaffold0124 (3 HSPs)
scaffold0124 (1-126)||(20259-20384)
scaffold0124 (143-210)||(20380-20447)
scaffold0124 (1-185)||(30300-30486)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (17-209)||(21430-21619)
[»] scaffold0089 (3 HSPs)
scaffold0089 (3-209)||(29612-29821)
scaffold0089 (4-209)||(40267-40475)
scaffold0089 (39-209)||(47183-47356)
[»] scaffold0558 (1 HSPs)
scaffold0558 (123-210)||(225-312)
[»] scaffold0143 (1 HSPs)
scaffold0143 (1-209)||(27139-27350)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (39-194)||(343-501)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (42-109)||(8120-8187)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 166; Significance: 5e-89; HSPs: 15)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 44562951 - 44563160
Alignment:
Q  1 cgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44562951 cgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggacaacctcaggtacccgttaatgc 44563050  T
Q  101 cattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttg 200  Q
    |   | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44563051 cgccgttcagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttg 44563150  T
Q  201 ctcccgactc 210  Q
    ||||||||||    
T  44563151 ctcccgactc 44563160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 154; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 9354472 - 9354681
Alignment:
Q  1 cgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9354472 cgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 9354571  T
Q  101 cattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttg 200  Q
    | | |  |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||     
T  9354572 cgtcgtccagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaatta 9354671  T
Q  201 ctcccgactc 210  Q
    ||||||||||    
T  9354672 ctcccgactc 9354681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 154; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 19659404 - 19659195
Alignment:
Q  1 cgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19659404 cgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 19659305  T
Q  101 cattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttg 200  Q
    | | |  |||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||     
T  19659304 cgtcgtccagcgaatgcaacaacaacctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaatta 19659205  T
Q  201 ctcccgactc 210  Q
    ||||||||||    
T  19659204 ctcccgactc 19659195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 16283296 - 16283507
Alignment:
Q  1 cgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 100  Q
    |||||||||| |||||||  |||||||||| | | || ||||| |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||    
T  16283296 cgtcgtacccatatgcgccgtactctcagcatcctttctttccgccattctatcattagtatcctttgccaccaggtcaacctcaggtacccattaatgc 16283395  T
Q  101 cattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagct---caacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgag 197  Q
     |||||||| || | | ||||||||   || | |   ||||||| ||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||| ||| | |||||||||    
T  16283396 aattgctcaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacaacatcaacaagctagacctaccttccctccgataccgatgttgtatgctgag 16283495  T
Q  198 ttgctcccgact 209  Q
    ||||| ||||||    
T  16283496 ttgcttccgact 16283507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 17 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 22081224 - 22081035
Alignment:
Q  17 gcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccat---cgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaa 113  Q
    |||||||||||||| | | || || |||||||| ||||| ||||||||   |||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22081224 gcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagtatcc---gccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaa 22081128  T
Q  114 acgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgact 209  Q
    | ||| ||||||||    ||||||||    |||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||| || || ||| |||||||||||    
T  22081127 atgcagcaacagccgttggctcaaca---gcagcagcaacaaaccagacctacctttcctccgataccaatgctgtacgccgagctgctcccgact 22081035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 24 - 202
Target Start/End: Original strand, 14557497 - 14557675
Alignment:
Q  24 tctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaacaac 123  Q
    ||||||| | |||| ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| || | | ||||||    
T  14557497 tctcagcatcccttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacctgttaatgcaatcgctcaacagatgaaacaac 14557596  T
Q  124 agcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgct 202  Q
    ||   |||| |||||||| |||  | || |||||||||||||| || |||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  14557597 agttgccagttcaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccaatgttatatgctgagttgct 14557675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 135 - 210
Target Start/End: Original strand, 33244649 - 33244724
Alignment:
Q  135 caacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactc 210  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| || ||||||||||    
T  33244649 caacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgttgaattactcccgactc 33244724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 55; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 16277401 - 16277605
Alignment:
Q  1 cgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 100  Q
    |||| ||||| |||||||  || ||||||| | | || ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16277401 cgtcatacccatatgcgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgc 16277500  T
Q  101 cattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagc---agcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgag 197  Q
     || ||||| || | | ||||||||   |||| |||||||| ||| |   | || |||||||||||||| || |||| |||||| ||| |||||||||||    
T  16277501 aatcgctcaacagatgaaacaacagttgccagttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgag 16277600  T
Q  198 ttgct 202  Q
    |||||    
T  16277601 ttgct 16277605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 39 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 27609235 - 27609062
Alignment:
Q  39 tttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaac 138  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| || | | ||||||||   |||| |||||    
T  27609235 tttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctcaacagatgaaacaacagttgccagttcaac 27609136  T
Q  139 aacgacagc---agcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgact 209  Q
    ||| ||| |   | || |||||||||||||| || |||| |||||| ||| | |||||||||||||| ||||||    
T  27609135 aacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgact 27609062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 2137627 - 2137416
Alignment:
Q  1 cgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 100  Q
    |||| ||||| |||||||  || ||||||| | | || |||||  |||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2137627 cgtcatacccatatgcgccgtattctcagcatcctttctttccgtcattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgc 2137528  T
Q  101 cattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagc---agcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgag 197  Q
     || ||||| || | | ||||||||   |||| |||||||| ||| |   | || |||||||||||||| || |||| |||||| ||| | |||||||||    
T  2137527 aatcgctcaacagatgaaacaacagttgccagttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgag 2137428  T
Q  198 ttgctcccgact 209  Q
    ||||| ||||||    
T  2137427 ttgcttccgact 2137416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 39 - 209
Target Start/End: Original strand, 19687983 - 19688156
Alignment:
Q  39 tttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaac 138  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || | | ||||||||    | | |||||    
T  19687983 tttccgccattctatcaccagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaattgctcaacagatgaaacaacagttgtcggttcaac 19688082  T
Q  139 aacgacagc---agcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgact 209  Q
    ||| ||| |   | || |||||||||||||| || |||| |||||| ||| | |||||||||||||| ||||||    
T  19688083 aacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgact 19688156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 202
Target Start/End: Original strand, 18710453 - 18710637
Alignment:
Q  21 tactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaac 120  Q
    |||||||||| | | || || ||||| || ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |||||  ||||||| || | | |||    
T  18710453 tactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccaacctcaggttcccgtcaatgcagttgctcaacagatgaaac 18710552  T
Q  121 aacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaa---gctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgct 202  Q
    |||||   || | ||||||||  |||||||| |||   |||||||| || |||||||  ||||||||| | ||||||||||||||    
T  18710553 aacagttgccggttcaacaacagcagcagcagcaatatgctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgct 18710637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 42 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 31490077 - 31489914
Alignment:
Q  42 ccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaac 141  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || || | | |||| |||   || | ||||||||    
T  31490077 ccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcgattgcccaacagatgaaacagcagatgccggttcaacaac 31489978  T
Q  142 gacagc---agcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgct 202  Q
     ||| |   | || |||||||| ||||| || |||| |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  31489977 aacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgct 31489914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 109
Target Start/End: Original strand, 19286332 - 19286420
Alignment:
Q  21 tactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctca 109  Q
    |||||||||| | | || || ||||| || ||||||||||| ||||| ||| |||| ||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  19286332 tactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttaccaccgggccaacctcaggttcctgtcaatgccattgctca 19286420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 42 - 109
Target Start/End: Original strand, 31354412 - 31354479
Alignment:
Q  42 ccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctca 109  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| || || |||||||| |||||    
T  31354412 ccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccaacctcaggttcctgtcaatgccatcgctca 31354479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 158; Significance: 3e-84; HSPs: 23)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 31891723 - 31891514
Alignment:
Q  1 cgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31891723 cgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggacaacctcaggtacccgttaatgc 31891624  T
Q  101 cattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttg 200  Q
    | | | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||     
T  31891623 cgtcgttcagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaatta 31891524  T
Q  201 ctcccgactc 210  Q
    ||||||||||    
T  31891523 ctcccgactc 31891514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 154; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 34156857 - 34157066
Alignment:
Q  1 cgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34156857 cgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 34156956  T
Q  101 cattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttg 200  Q
    | | |  |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||     
T  34156957 cgtcgtccagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaatta 34157056  T
Q  201 ctcccgactc 210  Q
    ||||||||||    
T  34157057 ctcccgactc 34157066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 154; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 34303698 - 34303489
Alignment:
Q  1 cgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  34303698 cgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgt 34303599  T
Q  101 cattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttg 200  Q
    | | |  |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||     
T  34303598 cgtcgtccagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaatta 34303499  T
Q  201 ctcccgactc 210  Q
    ||||||||||    
T  34303498 ctcccgactc 34303489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 3784500 - 3784709
Alignment:
Q  1 cgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3784500 cgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 3784599  T
Q  101 cattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttg 200  Q
    | | |  |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||     
T  3784600 cgtcgtccagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagtagcaacaggctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaatta 3784699  T
Q  201 ctcccgactc 210  Q
    ||||||||||    
T  3784700 ctcccgactc 3784709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 16163445 - 16163654
Alignment:
Q  1 cgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16163445 cgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtattctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 16163544  T
Q  101 cattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttg 200  Q
    | | |  |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||     
T  16163545 cgtcgtccagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaatta 16163644  T
Q  201 ctcccgactc 210  Q
    ||||||||||    
T  16163645 ctcccgactc 16163654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 146; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 27118534 - 27118743
Alignment:
Q  1 cgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27118534 cgtcgtacccgcatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 27118633  T
Q  101 cattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttg 200  Q
    | | | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||| | |||||||| ||     
T  27118634 cgtcgttcagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctaccttccctccgataccgatgttgtatgctgaatta 27118733  T
Q  201 ctcccgactc 210  Q
    ||||||||||    
T  27118734 ctcccgactc 27118743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 19456816 - 19456607
Alignment:
Q  1 cgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||| | | || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19456816 cgtcgtacccatatgcgcaatactttcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctaccatcgggtcaacctcaggtgcccgttaatgc 19456717  T
Q  101 cattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttg 200  Q
    ||| | | |||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||     
T  19456716 catcgtttagcaaatgcaacaacagccaccagctcaacaacaacagcagcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgctatatgccgagtta 19456617  T
Q  201 ctcccgactc 210  Q
    ||||||||||    
T  19456616 ctcccgactc 19456607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 134; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 21703559 - 21703350
Alignment:
Q  1 cgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 100  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21703559 cgtcgtacccatatgcgccatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 21703460  T
Q  101 cattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttg 200  Q
    | | | ||| |||| |||||||||||| |||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||| | |||||||||||     
T  21703459 cgtcgttcaacaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctaccttccctccgataccaatgttgtatgctgagtta 21703360  T
Q  201 ctcccgactc 210  Q
    ||||||||||    
T  21703359 ctcccgactc 21703350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 27434842 - 27434638
Alignment:
Q  1 cgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 100  Q
    |||||||||| |||||||  |||||||||| | | || ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27434842 cgtcgtacccatatgcgccgtactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtaccctttgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgc 27434743  T
Q  101 cattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagc---agcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgag 197  Q
     |||||||| || | | ||||||||   || | |||||||| ||| |   | || |||||||||||||| || |||| |||||| ||| | |||||||||    
T  27434742 aattgctcaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgag 27434643  T
Q  198 ttgct 202  Q
    |||||    
T  27434642 ttgct 27434638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 23128964 - 23128753
Alignment:
Q  1 cgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 100  Q
    |||| ||||| |||||||  || ||||||| | | || ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23128964 cgtcatacccatatgcgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgc 23128865  T
Q  101 cattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagc---agcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgag 197  Q
     || ||||| || | | ||||||||   |||| |||||||| ||| |   | || |||||||||||||| || |||| |||||| ||| | |||||||||    
T  23128864 aatcgctcaacagatgaaacaacagttgccagttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgag 23128765  T
Q  198 ttgctcccgact 209  Q
    ||||| ||||||    
T  23128764 ttgcttccgact 23128753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 17 - 126
Target Start/End: Original strand, 27392852 - 27392961
Alignment:
Q  17 gcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacg 116  Q
    |||||||||||||| | | || || |||||||||||||| ||||||||    ||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  27392852 gcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatg 27392951  T
Q  117 caacaacagc 126  Q
    ||||||||||    
T  27392952 caacaacagc 27392961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 39 - 202
Target Start/End: Original strand, 28882095 - 28882261
Alignment:
Q  39 tttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaac 138  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| || | | ||||||||   |||| |||||    
T  28882095 tttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctcaacagatgaaacaacagttgccagttcaac 28882194  T
Q  139 aacgacagc---agcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgct 202  Q
    ||| ||| |   | || |||||||||||||| || |||| |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  28882195 aacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgct 28882261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 12655385 - 12655589
Alignment:
Q  1 cgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 100  Q
    |||| ||||| |||||||  || ||||||| | | || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12655385 cgtcctacccatatgcgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccccctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgc 12655484  T
Q  101 cattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagc---agcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgag 197  Q
     || ||||| || | | ||||||||   |||| |||||||| ||| |   | || |||||||||||||| || |||| |||||| ||| |||||||||||    
T  12655485 aatcgctcaacagatgaaacaacagttgccagttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgag 12655584  T
Q  198 ttgct 202  Q
    |||||    
T  12655585 ttgct 12655589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 20837761 - 20837965
Alignment:
Q  1 cgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 100  Q
    |||| ||||| |||||||  || ||||||| | | || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20837761 cgtcctacccatatgcgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccccctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgc 20837860  T
Q  101 cattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagc---agcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgag 197  Q
     || ||||| || | | ||||||||   |||| |||||||| ||| |   | || |||||||||||||| || |||| |||||| ||| |||||||||||    
T  20837861 aatcgctcaacagatgaaacaacagttgccagttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgag 20837960  T
Q  198 ttgct 202  Q
    |||||    
T  20837961 ttgct 20837965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 42 - 202
Target Start/End: Original strand, 37925377 - 37925540
Alignment:
Q  42 ccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaac 141  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || || | | ||||||||   || | ||||||||    
T  37925377 ccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcgattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaac 37925476  T
Q  142 gacagc---agcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgct 202  Q
     ||| |   | || |||||||| ||||| || |||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  37925477 aacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccaatgttatatgctgagttgct 37925540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 45 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 11635543 - 11635380
Alignment:
Q  45 ccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgac 144  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || || | | ||||||||   || | |||||||| ||    
T  11635543 ccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaac 11635444  T
Q  145 agcagcaa------caagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgct 202  Q
    | || |||      |||||||||||||| || |||| |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  11635443 aacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgct 11635380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 13936904 - 13936738
Alignment:
Q  39 tttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaac 138  Q
    ||||| ||||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || || | | |||||||||  || | |||||    
T  13936904 tttccgccattttaccatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagctgccggttcaac 13936805  T
Q  139 aacgacagca---gcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgct 202  Q
    ||| ||||||    || ||||| |||||||| || |||| |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  13936804 aacaacagcaaagtcagcaagccagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgct 13936738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 202
Target Start/End: Original strand, 34279330 - 34279496
Alignment:
Q  39 tttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaac 138  Q
    ||||| ||||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| || | | ||||||||   || | |||||    
T  34279330 tttccgccattttaccatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgctcaacagatgaaacaacagttgccggttcaac 34279429  T
Q  139 aacgacagc---agcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgct 202  Q
    ||| ||| |   | || |||||||||||||| || |||| |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  34279430 aacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgct 34279496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 45 - 202
Target Start/End: Original strand, 32049685 - 32049845
Alignment:
Q  45 ccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgac 144  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| || | | ||||||||   || | |||||||| ||    
T  32049685 ccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgctcaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaac 32049784  T
Q  145 agc---agcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgct 202  Q
    | |   | || |||||||| ||||| || |||| |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  32049785 aacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgct 32049845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 45 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 11641732 - 11641569
Alignment:
Q  45 ccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgac 144  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || || | | ||||||||   || | |||||||| ||    
T  11641732 ccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaac 11641633  T
Q  145 agcagcaa------caagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgct 202  Q
    | || |||      |||||||||||||| || |||| |||||  ||| ||||||||||||||||    
T  11641632 aacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgatacagatgttatatgctgagttgct 11641569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 39 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 21677542 - 21677376
Alignment:
Q  39 tttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaac 138  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || || | | ||||||||   || | |||||    
T  21677542 tttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcgattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaac 21677443  T
Q  139 aacgacagc---agcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgct 202  Q
    ||| ||| |   | || |||||||| ||||| || |||| |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  21677442 aacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgct 21677376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 150 - 209
Target Start/End: Original strand, 27392964 - 27393023
Alignment:
Q  150 caacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgact 209  Q
    |||||| | |||||||||||||||| |||||||||| | ||||| ||| |||||||||||    
T  27392964 caacaaaccagacctacctttcctccgataccaatgatgtatgccgagctgctcccgact 27393023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 42 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 261122 - 261009
Alignment:
Q  42 ccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaac 141  Q
    ||||| || ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || || | | ||||||||   |||| ||||||||    
T  261122 ccaccgttttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccagttcaacaac 261023  T
Q  142 gacagcagcaacaa 155  Q
     ||| || ||||||    
T  261022 aacaacaacaacaa 261009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 156; Significance: 5e-83; HSPs: 29)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 3 - 210
Target Start/End: Original strand, 28162506 - 28162713
Alignment:
Q  3 tcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgcca 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  28162506 tcgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggacaacctcaggtacccgttaatgccg 28162605  T
Q  103 ttgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgct 202  Q
    | | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||    
T  28162606 tcgttcagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattact 28162705  T
Q  203 cccgactc 210  Q
    ||||||||    
T  28162706 cccgactc 28162713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 154; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 13522422 - 13522213
Alignment:
Q  1 cgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13522422 cgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 13522323  T
Q  101 cattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttg 200  Q
    | | |  |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||     
T  13522322 cgtcgtccagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaatta 13522223  T
Q  201 ctcccgactc 210  Q
    ||||||||||    
T  13522222 ctcccgactc 13522213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 154; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 33374605 - 33374396
Alignment:
Q  1 cgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33374605 cgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 33374506  T
Q  101 cattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttg 200  Q
    | | |  |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||     
T  33374505 cgtcgtccagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaatta 33374406  T
Q  201 ctcccgactc 210  Q
    ||||||||||    
T  33374405 ctcccgactc 33374396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 8892659 - 8892450
Alignment:
Q  1 cgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8892659 cgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattatatcatcagtattctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 8892560  T
Q  101 cattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttg 200  Q
    | | | ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||     
T  8892559 cgtcgttcagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaatta 8892460  T
Q  201 ctcccgactc 210  Q
    ||||||||||    
T  8892459 ctcccgactc 8892450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 8903894 - 8903685
Alignment:
Q  1 cgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8903894 cgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatctcttctttccaccattctatcatcagtattctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 8903795  T
Q  101 cattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttg 200  Q
    | | | ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||     
T  8903794 cgtcgttcagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaatta 8903695  T
Q  201 ctcccgactc 210  Q
    ||||||||||    
T  8903694 ctcccgactc 8903685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 130; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 2 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 22477624 - 22477413
Alignment:
Q  2 gtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgcc 101  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| | |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22477624 gtcgtacccgtatgcgcagtactctcagcatcccttctttccaccattctatcattagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgca 22477525  T
Q  102 attgctcagcaaacgcaacaacagcctccagct---caacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagt 198  Q
    |||||||| |||| |||||||||| | || | |   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||    
T  22477524 attgctcaacaaatgcaacaacagtcaccggttcaacaacaacgacaacagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgatgtatgccgagt 22477425  T
Q  199 tgctcccgactc 210  Q
    | ||||||||||    
T  22477424 tactcccgactc 22477413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 41 - 205
Target Start/End: Original strand, 20160588 - 20160752
Alignment:
Q  41 tccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaa 140  Q
    ||||||||| || |||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||    
T  20160588 tccaccattttaccatcagtatcctctaccaccgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaaaacagcaacagccaccagctcaacaa 20160687  T
Q  141 cgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctccc 205  Q
    | ||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| |||||    
T  20160688 caacaacagcaacaaactagacctacctttcctccgataccgatgttatatgctgagttactccc 20160752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 41 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 22172243 - 22172079
Alignment:
Q  41 tccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaa 140  Q
    ||||||||| || |||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||    
T  22172243 tccaccattttaccatcagtatcctctaccaccgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaaaacagcaacagccaccagctcaacaa 22172144  T
Q  141 cgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctccc 205  Q
    | ||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| |||||    
T  22172143 caacaacagcaacaaactagacctacctttcctccgataccgatgttatatgctgagttactccc 22172079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 76; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 135 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 14143500 - 14143425
Alignment:
Q  135 caacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactc 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14143500 caacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactc 14143425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 76; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 135 - 210
Target Start/End: Original strand, 26787925 - 26788000
Alignment:
Q  135 caacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactc 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26787925 caacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactc 26788000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 76; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 135 - 210
Target Start/End: Original strand, 27196298 - 27196373
Alignment:
Q  135 caacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactc 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27196298 caacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactc 27196373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 76; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 135 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 27252942 - 27252867
Alignment:
Q  135 caacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactc 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27252942 caacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactc 27252867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 22935229 - 22935021
Alignment:
Q  1 cgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 100  Q
    |||| ||||| |||||||  || ||||| | | |||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  22935229 cgtcatacccatatgcgccgtattctcaacatcccttctttccgccattctatcatcagtatcccttgccaccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgc 22935130  T
Q  101 cattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttg 200  Q
     |||||||| || | | ||||||||   || | |||||||| |||  | || |||||||||||||| || |||| |||||| ||| ||||||||||||||    
T  22935129 aattgctcaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttg 22935030  T
Q  201 ctcccgact 209  Q
    || ||||||    
T  22935029 cttccgact 22935021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 23857674 - 23857466
Alignment:
Q  1 cgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 100  Q
    |||| ||||| |||||||  || ||||| | | |||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  23857674 cgtcatacccatatgcgccgtattctcaacatcccttctttccgccattctatcatcagtatcccttgccaccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgc 23857575  T
Q  101 cattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttg 200  Q
     |||||||| || | | ||||||||   || | |||||||| |||  | || |||||||||||||| || |||| |||||| ||| ||||||||||||||    
T  23857574 aattgctcaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttg 23857475  T
Q  201 ctcccgact 209  Q
    || ||||||    
T  23857474 cttccgact 23857466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 123 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 27290597 - 27290510
Alignment:
Q  123 cagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactc 210  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27290597 cagccaccggctcaacaacgacagcagcaataagctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgagttgctcccgactc 27290510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 24 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 24304947 - 24304766
Alignment:
Q  24 tctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaacaac 123  Q
    ||||||| | |||| ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| || | | ||||||    
T  24304947 tctcagcatcccttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctcaacagatgaaacaac 24304848  T
Q  124 agcctccagctcaacaacgacagc---agcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgct 202  Q
    ||  ||||| |||||||| ||| |   | || |||||||||||||| || |||| |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  24304847 agtttccagttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgct 24304766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 135 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 22457149 - 22457074
Alignment:
Q  135 caacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactc 210  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||    
T  22457149 caacaacgacaacagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgatgtatgccgagttactcccgactc 22457074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 55; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 13299303 - 13299099
Alignment:
Q  1 cgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 100  Q
    |||| ||||| |||||||  || ||||||| | | || ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13299303 cgtcatacccatatgcgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgc 13299204  T
Q  101 cattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagc---agcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgag 197  Q
     || ||||| || | | ||||||||   |||| |||||||| ||| |   | || |||||||||||||| || |||| |||||| ||| |||||||||||    
T  13299203 aatcgctcaacagatgaaacaacagttgccagttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgag 13299104  T
Q  198 ttgct 202  Q
    |||||    
T  13299103 ttgct 13299099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 39 - 209
Target Start/End: Original strand, 26918262 - 26918435
Alignment:
Q  39 tttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaac 138  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||| ||||||||   || | |||||    
T  26918262 tttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgctcaacagacgaaacaacagttgccggttcaac 26918361  T
Q  139 aacgacagc---agcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgact 209  Q
    ||| ||| |   | || |||||||||||||| || |||| |||||| ||| | |||||||||||||| ||||||    
T  26918362 aacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgact 26918435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 39 - 209
Target Start/End: Original strand, 26988883 - 26989056
Alignment:
Q  39 tttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaac 138  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| || | | ||||||||   |||| |||||    
T  26988883 tttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctcaacagatgaaacaacagttgccagttcaac 26988982  T
Q  139 aa---cgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgact 209  Q
    ||   | |||  | || |||||||||||||| || |||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  26988983 aacatcaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgact 26989056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 15424669 - 15424458
Alignment:
Q  1 cgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 100  Q
    |||| ||||| |||||||  || ||||||| | | || ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15424669 cgtcatacccatatgcgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgc 15424570  T
Q  101 cattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagct---caacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgag 197  Q
     || ||||| || | | ||||||||   |||| |   ||||||| |||  | || |||||||||||||| || |||| |||||| ||| | |||||||||    
T  15424569 aatcgctcaacagatgaaacaacagttgccagttgaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgag 15424470  T
Q  198 ttgctcccgact 209  Q
    ||||| ||||||    
T  15424469 ttgcttccgact 15424458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 39 - 202
Target Start/End: Original strand, 16749736 - 16749902
Alignment:
Q  39 tttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaac 138  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| || | | ||||||||   || | |||||    
T  16749736 tttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctcaacagatgaaacaacagttgccggttcaac 16749835  T
Q  139 aacgacagc---agcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgct 202  Q
    ||| ||| |   | || |||||||||||||| || |||| |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  16749836 aacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgct 16749902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 39 - 202
Target Start/End: Original strand, 26999955 - 27000121
Alignment:
Q  39 tttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaac 138  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || | | ||||||||   || | |||||    
T  26999955 tttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaattgctcaacagatgaaacaacagttgccggttcaac 27000054  T
Q  139 aacgacagc---agcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgct 202  Q
    ||| ||| |   | || |||||||||||||| || |||| |||||| ||| | ||||||||||||||    
T  27000055 aacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgct 27000121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 21 - 185
Target Start/End: Original strand, 29549342 - 29549506
Alignment:
Q  21 tactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaac 120  Q
    |||||||||| | | || || ||||| || ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| || || |||||||| ||||| ||   |||||    
T  29549342 tactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccaacctcaggttcctgtcaatgccatcgctcaacaggtgcaac 29549441  T
Q  121 aacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatg 185  Q
    | || || |||| ||||||||  ||||||||| | |||||||| || |||||||  |||||||||    
T  29549442 atcaaccgccagttcaacaacagcagcagcaatacgctagaccaacttttcctcctataccaatg 29549506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 24863561 - 24863765
Alignment:
Q  1 cgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 100  Q
    |||| ||||| |||||||  || ||||||| | | || ||||| ||||||||||||||||| ||| | ||| || ||||||| || ||||||||||||||    
T  24863561 cgtcctacccatatgcgccgtattctcagcatcctttctttccgccattctatcatcagtaccctctaccaccgagtcaaccccaagtacccgttaatgc 24863660  T
Q  101 cattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagc---agcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgag 197  Q
     |||||||| || | | ||||||||   || | |||||||| ||| |   | || |||||||||||||| || |||| |||||| ||| | |||||||||    
T  24863661 aattgctcaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgag 24863760  T
Q  198 ttgct 202  Q
    |||||    
T  24863761 ttgct 24863765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 42 - 202
Target Start/End: Original strand, 4525174 - 4525334
Alignment:
Q  42 ccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaac 141  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||| | || ||||||||||| || || |||||||| ||||| ||    ||||| || || |||| |||||| |    
T  4525174 ccaccgttttatcatcagtatcctttgccaccaggccaacctcaggttcctgtcaatgccatcgctcaacaggtacaacatcaaccgccagttcaacagc 4525273  T
Q  142 gacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgct 202  Q
      ||||||||  |  ||||||| || |||||||  ||||||||| | ||||||||||||||    
T  4525274 agcagcagcagtatactagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgct 4525334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 42 - 109
Target Start/End: Original strand, 27044275 - 27044342
Alignment:
Q  42 ccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctca 109  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| || || |||||||| |||||    
T  27044275 ccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccaacctcaggttcctgtcaatgccatcgctca 27044342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 42 - 112
Target Start/End: Original strand, 29501291 - 29501361
Alignment:
Q  42 ccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctcagca 112  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||||||| | || ||||||||||| || || |||||||| ||||||||    
T  29501291 ccaccgttttatcatcagtaccctttgccacccggccaacctcaggttcctgtcaatgccatcgctcagca 29501361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 54 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 27630008 - 27629907
Alignment:
Q  54 catcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaac 153  Q
    ||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||| ||||| ||||  || || | || |||||| || |||| ||| |||| ||| |||||||    
T  27630008 catcaatatcctttgccatcaggaccacctcaggtacccgtgaatgctattgtgcaacagaagccacaacaaccaccagttcagcaacaacaacagcaac 27629909  T
Q  154 aa 155  Q
    ||    
T  27629908 aa 27629907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 154; Significance: 7e-82; HSPs: 21)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 31088756 - 31088547
Alignment:
Q  1 cgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31088756 cgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 31088657  T
Q  101 cattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttg 200  Q
    | | |  |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||     
T  31088656 cgtcgtccagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaatta 31088557  T
Q  201 ctcccgactc 210  Q
    ||||||||||    
T  31088556 ctcccgactc 31088547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 45733311 - 45733506
Alignment:
Q  1 cgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45733311 cgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 45733410  T
Q  101 cattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctga 196  Q
    | | |  |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  45733411 cgtcgtccagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctga 45733506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 16450290 - 16450081
Alignment:
Q  1 cgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 100  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||| | |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16450290 cgtcgtacccgtacgcgcagtactctcagcatcccttctttccaccattttatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccattaatgc 16450191  T
Q  101 cattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttg 200  Q
    | | | |||||||  |||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||     
T  16450190 cgtcgttcagcaagtgcaacaacagccaccagctcaacagcaacagcagcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgctatatgccgagtta 16450091  T
Q  201 ctcccgactc 210  Q
    ||||||||||    
T  16450090 ctcccgactc 16450081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 16041174 - 16041383
Alignment:
Q  1 cgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 100  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16041174 cgtcgtacccatatgcgccatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgtcatcgggtcaacctcaggtacccgttaattc 16041273  T
Q  101 cattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttg 200  Q
    | | | |||||||| |||||||||||| |||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||| | ||||| |||||     
T  16041274 cgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctaccttccctccgataccaatgttgtatgccgagtta 16041373  T
Q  201 ctcccgactc 210  Q
    ||||||||||    
T  16041374 ctcccgactc 16041383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 76; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 135 - 210
Target Start/End: Original strand, 26484679 - 26484754
Alignment:
Q  135 caacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactc 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26484679 caacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactc 26484754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 16503675 - 16503464
Alignment:
Q  1 cgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 100  Q
    |||| ||||| |||||||  |||||||||| | | || ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16503675 cgtcatacccatatgcgccgtactctcagcatcctttctttccgccattctatcatcagtatcccttgccaccgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 16503576  T
Q  101 cattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagc---agcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgag 197  Q
     |||||||| || | | |||||||||  || | |||||||| ||| |   | || |||||||||||||| || |||| |||||| ||| | |||||||||    
T  16503575 aattgctcaacagatgaaacaacagctgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgag 16503476  T
Q  198 ttgctcccgact 209  Q
    ||||| ||||||    
T  16503475 ttgcttccgact 16503464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 16518711 - 16518500
Alignment:
Q  1 cgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 100  Q
    |||| ||||| |||||||  |||||||||| | | || ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16518711 cgtcatacccatatgcgccgtactctcagcatcctttctttccgccattctatcatcagtatcccttgccaccgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 16518612  T
Q  101 cattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagc---agcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgag 197  Q
     |||||||| || | | |||||||||  || | |||||||| ||| |   | || |||||||||||||| || |||| |||||| ||| | |||||||||    
T  16518611 aattgctcaacagatgaaacaacagctgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgag 16518512  T
Q  198 ttgctcccgact 209  Q
    ||||| ||||||    
T  16518511 ttgcttccgact 16518500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 135 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 2109163 - 2109088
Alignment:
Q  135 caacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactc 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2109163 caacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgatatatgctgagttgctcccgactc 2109088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 135 - 210
Target Start/End: Original strand, 18540784 - 18540859
Alignment:
Q  135 caacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactc 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18540784 caacaacgacagcagcaacaagctagacctacttttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactc 18540859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 135 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 39211181 - 39211106
Alignment:
Q  135 caacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactc 210  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39211181 caacaacgaccgcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactc 39211106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 135 - 210
Target Start/End: Original strand, 2775344 - 2775419
Alignment:
Q  135 caacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactc 210  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2775344 caacaacgacagtagcaacaggctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagtagctcccgactc 2775419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 24 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 10917137 - 10916952
Alignment:
Q  24 tctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaacaac 123  Q
    ||||||| | |||| ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| || | | ||||||    
T  10917137 tctcagcatcccttctttccgccattttatcatcagtatcctctgccaccgggtcaacctcaagtacctgttaatgcaatcgctcaacagatgaaacaac 10917038  T
Q  124 agcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgact 209  Q
    ||   |||| |||||||| |||  | || |||||||||||||| || |||| |||||| ||| | |||||||||||||| ||||||    
T  10917037 agttgccagttcaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgact 10916952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 39 - 202
Target Start/End: Original strand, 5127878 - 5128044
Alignment:
Q  39 tttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaac 138  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || | | ||||||||   || | |||||    
T  5127878 tttccgccattttatcatcagtatcctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaattgctcaacagatgaaacaacagttgccggttcaac 5127977  T
Q  139 aacgacagc---agcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgct 202  Q
    ||| ||| |   | || |||||||||||||| ||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||    
T  5127978 aacaacaacaaaatcagcaagctagacctacttttcctccgataccgatgttgtatgctgagttgct 5128044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 39 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 11425033 - 11424867
Alignment:
Q  39 tttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaac 138  Q
    ||||| ||||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| || | | ||||||||   |||| |||||    
T  11425033 tttccgccattttaccatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctcaacagatgaaacaacagttgccagttcaac 11424934  T
Q  139 aacgacagc---agcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgct 202  Q
    ||| ||| |   | || |||||||||||||| || |||| |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  11424933 aacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgct 11424867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 21 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 5147615 - 5147431
Alignment:
Q  21 tactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaac 120  Q
    |||||||||| | | || || ||||| || ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || || | | |||    
T  5147615 tactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaac 5147516  T
Q  121 aacagcctccagctcaacaacgacagcag---caacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgct 202  Q
    |||||   ||   |||||||| ||| ||    ||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  5147515 aacagatgccgattcaacaacaacaacaaaatcaacaagctagacctacttttcctccgataccgatgttatatgctgagttgct 5147431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 185
Target Start/End: Original strand, 5159390 - 5159554
Alignment:
Q  21 tactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaac 120  Q
    |||||||||| | | || || ||||| || ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| || || |||||||| ||||| ||   |||||    
T  5159390 tactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccaacctcaggtccctgtcaatgccatcgctcaacaggtgcaac 5159489  T
Q  121 aacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatg 185  Q
    | || || |||| |||||| |  ||||||||| | |||||||| || |||||||  |||||||||    
T  5159490 atcaaccgccagttcaacagcagcagcagcaatatgctagaccaacttttcctcctataccaatg 5159554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 39 - 109
Target Start/End: Original strand, 2154459 - 2154529
Alignment:
Q  39 tttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctca 109  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||    
T  2154459 tttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtatccgttaatgcaattgctca 2154529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 45 - 202
Target Start/End: Original strand, 45387235 - 45387395
Alignment:
Q  45 ccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgac 144  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || || | | ||||||||   || | |||||||| ||    
T  45387235 ccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaac 45387334  T
Q  145 agc---agcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgct 202  Q
    | |   | || |||||||| ||||| || |||| |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  45387335 aacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgct 45387395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 21 - 106
Target Start/End: Original strand, 26435125 - 26435210
Alignment:
Q  21 tactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgc 106  Q
    |||||||||| | | || || ||||| || ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  26435125 tactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgc 26435210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 42 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 4145377 - 4145310
Alignment:
Q  42 ccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctca 109  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| || || |||||||| |||||    
T  4145377 ccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccaacctcaggttcctgtcaatgccatcgctca 4145310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 42 - 106
Target Start/End: Original strand, 11441449 - 11441513
Alignment:
Q  42 ccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgc 106  Q
    ||||| || ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| || ||||| ||||| |||||    
T  11441449 ccaccgttttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgc 11441513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 154; Significance: 7e-82; HSPs: 25)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 13184951 - 13184742
Alignment:
Q  1 cgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13184951 cgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 13184852  T
Q  101 cattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttg 200  Q
    | | |  |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||     
T  13184851 cgtcgtccagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaatta 13184752  T
Q  201 ctcccgactc 210  Q
    ||||||||||    
T  13184751 ctcccgactc 13184742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 154; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 33877106 - 33877315
Alignment:
Q  1 cgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33877106 cgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 33877205  T
Q  101 cattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttg 200  Q
    | | |  |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||     
T  33877206 cgtcgtccagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaatta 33877305  T
Q  201 ctcccgactc 210  Q
    ||||||||||    
T  33877306 ctcccgactc 33877315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 11325653 - 11325862
Alignment:
Q  1 cgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  11325653 cgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccattgggacaacctcaggtacccgttaatgc 11325752  T
Q  101 cattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttg 200  Q
    | | | ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||     
T  11325753 cgtcgttcagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaatta 11325852  T
Q  201 ctcccgactc 210  Q
    ||||||||||    
T  11325853 ctcccgactc 11325862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 13440797 - 13440588
Alignment:
Q  1 cgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13440797 cgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 13440698  T
Q  101 cattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttg 200  Q
    | | |  |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||     
T  13440697 cgtcgtccagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctaaatta 13440598  T
Q  201 ctcccgactc 210  Q
    ||||||||||    
T  13440597 ctcccgactc 13440588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 134; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 22888329 - 22888538
Alignment:
Q  1 cgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 100  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22888329 cgtcgtacccatatgcgccatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtaaccgttaatgc 22888428  T
Q  101 cattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttg 200  Q
    | | | |||||||| |||||||||||| |||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||| | |||||||||||     
T  22888429 cgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctaccttccctccgataccaatgttgtatgctgagtta 22888528  T
Q  201 ctcccgactc 210  Q
    ||||||||||    
T  22888529 ctcccgactc 22888538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 25198888 - 25199097
Alignment:
Q  1 cgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 100  Q
    |||||||||| |||||||  |||||||||| | | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  25198888 cgtcgtacccatatgcgccgtactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtactcgttaacgc 25198987  T
Q  101 cattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttg 200  Q
    | | | |||||||| |||||||||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||| |||||     
T  25198988 cgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctaccttttctccgataccaatgttgtatgccgagtta 25199087  T
Q  201 ctcccgactc 210  Q
    ||||||||||    
T  25199088 ctcccgactc 25199097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 23892062 - 23892274
Alignment:
Q  1 cgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 100  Q
    |||||||||| |||||||  |||||||||| | | || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23892062 cgtcgtacccatatgcgccgtactctcagcatcctttctttccaacattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgtcaatgc 23892161  T
Q  101 cattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagct---caacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgag 197  Q
    ||| | |||||||| |||||||||||| || | |   ||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  | ||||| |||    
T  23892162 catcgttcagcaaatgcaacaacagccaccggttcaacaacaacaacaacatcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatcatgtatgccgag 23892261  T
Q  198 ttgctcccgactc 210  Q
    ||||| |||||||    
T  23892262 ttgcttccgactc 23892274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 24969880 - 24970085
Alignment:
Q  1 cgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 100  Q
    |||||||||| |||||||  || ||||||| | | || ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24969880 cgtcgtacccatatgcgccgtattctcagcatcctttctttccgccattctatcatcagtatcccttgccaccgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 24969979  T
Q  101 cattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttg 200  Q
     |||||||| || | | |||||||||  || | ||||||   ||| || ||||||||||||||||| || |||| |||||| ||| | ||||||||||||    
T  24969980 aattgctcaacagatgaaacaacagctgccggttcaaca---acaacatcaacaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttg 24970076  T
Q  201 ctcccgact 209  Q
    || ||||||    
T  24970077 cttccgact 24970085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 68; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 123 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 29889263 - 29889176
Alignment:
Q  123 cagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactc 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| | ||||| ||||    
T  29889263 cagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgctgagctactcccaactc 29889176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 24 - 209
Target Start/End: Original strand, 30934515 - 30934700
Alignment:
Q  24 tctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaacaac 123  Q
    ||||||| | |||| ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| || | | ||||||    
T  30934515 tctcagcatcccttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctcaacagatgaaacaac 30934614  T
Q  124 agcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgact 209  Q
    ||   |||| |||||||| |||  | || |||||||||||||| || |||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  30934615 agttgccagttcaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgact 30934700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 39 - 209
Target Start/End: Original strand, 11549248 - 11549421
Alignment:
Q  39 tttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaac 138  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| || | | ||||||||   |||| |||||    
T  11549248 tttccaccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctcaacagatgaaacaacagttgccagttcaac 11549347  T
Q  139 aacgacagc---agcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgact 209  Q
    ||| ||| |   | || |||||||||||||| || |||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  11549348 aacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgact 11549421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 39 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 23718256 - 23718083
Alignment:
Q  39 tttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaac 138  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| || | | ||||||||   |||| |||||    
T  23718256 tttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctcaacagatgaaacaacagttgccagttcaac 23718157  T
Q  139 aacgacagc---agcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgact 209  Q
    ||| ||| |   | || |||||||||||||| || |||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  23718156 aacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgact 23718083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 39 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 23752718 - 23752545
Alignment:
Q  39 tttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaac 138  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| || | | ||||||||   |||| |||||    
T  23752718 tttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctcaacagatgaaacaacagttgccagttcaac 23752619  T
Q  139 aacgacagc---agcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgact 209  Q
    ||| ||| |   | || |||||||||||||| || |||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  23752618 aacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgact 23752545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 39 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 24688425 - 24688252
Alignment:
Q  39 tttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaac 138  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| || | | ||||||||   |||| |||||    
T  24688425 tttccgccattctatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatacaattgctcaacagatgaaacaacagttgccagttcaac 24688326  T
Q  139 aacgacagc---agcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgact 209  Q
    ||| ||| |   | || |||||||||||||| || |||| |||||| ||  | |||||||||||||| ||||||    
T  24688325 aacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatattgtatgctgagttgcttccgact 24688252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 39 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 22999382 - 22999216
Alignment:
Q  39 tttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaac 138  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||  ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| || | | ||||||||   |||| |||||    
T  22999382 tttccgccattttatcatcagtaccctctgccgccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctcaacagatgaaacaacagttgccagttcaac 22999283  T
Q  139 aacgacagc---agcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgct 202  Q
    ||| ||| |   | || |||||||||||||| || |||| |||||| ||| | ||||||||||||||    
T  22999282 aacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgct 22999216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 39 - 202
Target Start/End: Original strand, 33777381 - 33777547
Alignment:
Q  39 tttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaac 138  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| || | | ||||||||   || | |||||    
T  33777381 tttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctcaacagatgaaacaacagttgccggttcaac 33777480  T
Q  139 aacgacagc---agcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgct 202  Q
    ||| ||| |   | || |||||||||||||| || |||| |||||| ||| | ||||||||||||||    
T  33777481 aacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgct 33777547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 42 - 202
Target Start/End: Original strand, 30168366 - 30168529
Alignment:
Q  42 ccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaac 141  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || || | | ||||||||   || | ||||||||    
T  30168366 ccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaac 30168465  T
Q  142 gacagc---agcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgct 202  Q
     ||| |   | || |||||||| ||||| || |||| |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  30168466 aacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgct 30168529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 39 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 9548811 - 9548645
Alignment:
Q  39 tttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaac 138  Q
    ||||| ||||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || | | ||||||||   ||   |||||    
T  9548811 tttccgccattttaccatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgctcaacagatgaaacaacagatgccgattcaac 9548712  T
Q  139 aacgacagc---agcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgct 202  Q
    ||| ||| |   | || |||||||||||||| || |||| |||||| ||| |||||||||| |||||    
T  9548711 aacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgct 9548645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 21 - 185
Target Start/End: Original strand, 33292404 - 33292568
Alignment:
Q  21 tactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaac 120  Q
    |||||||||| | | || || ||||| || ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| || || |||||||| ||||| ||   |||||    
T  33292404 tactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccaacctcaggtccctgtcaatgccatcgctcaacaggtgcaac 33292503  T
Q  121 aacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatg 185  Q
    | || || |||| |||||| |  ||||| ||| | |||||||| || |||||||  |||||||||    
T  33292504 atcaaccgccagttcaacagcagcagcaacaatatgctagaccaacttttcctcctataccaatg 33292568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 42 - 202
Target Start/End: Original strand, 34616418 - 34616578
Alignment:
Q  42 ccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaac 141  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||||||| | ||  |||||||||| || || |||||||| ||||| ||    ||||| || || |||| |||||| |    
T  34616418 ccaccgttttatcatcagtaccctttgccacccggctaacctcaggttcctgtcaatgccatcgctcaacaggtacaacatcaaccgccagttcaacagc 34616517  T
Q  142 gacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgct 202  Q
      ||||||||| | |||||||| || |||||||  ||||||||| | ||||||||||||||    
T  34616518 agcagcagcaatatgctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgct 34616578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 42 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 32599734 - 32599591
Alignment:
Q  42 ccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaac 141  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||||||| | || ||||||||||| || || |||||||| ||||||||    ||||| || || |||| |||||| |    
T  32599734 ccaccgttttatcatcagtaccctttgccacccggccaacctcaggttcctgtcaatgccatcgctcagcaggtacaacatcaaccgccagttcaacagc 32599635  T
Q  142 gacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatg 185  Q
      ||||||||| | |||||||| || |||||||  |||||||||    
T  32599634 agcagcagcaatatgctagaccaacttttcctcctataccaatg 32599591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 42 - 106
Target Start/End: Original strand, 31431325 - 31431389
Alignment:
Q  42 ccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgc 106  Q
    ||||| || ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  31431325 ccaccgttttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgc 31431389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 21 - 106
Target Start/End: Original strand, 3789402 - 3789487
Alignment:
Q  21 tactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgc 106  Q
    |||||||||| | | || || ||||| || ||||||||||| ||||||||| |||| || |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  3789402 tactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccagcctcaggtgcccgtcaatgcaattgc 3789487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 42 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 18501013 - 18500949
Alignment:
Q  42 ccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgc 106  Q
    ||||| || ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| || ||||| ||||| |||||    
T  18501013 ccaccgttttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgc 18500949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 42 - 106
Target Start/End: Original strand, 43078146 - 43078210
Alignment:
Q  42 ccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgc 106  Q
    ||||| || ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| || ||||| ||||| |||||    
T  43078146 ccaccgttttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgc 43078210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 154; Significance: 7e-82; HSPs: 18)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 15227735 - 15227944
Alignment:
Q  1 cgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15227735 cgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 15227834  T
Q  101 cattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttg 200  Q
      | | |||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||     
T  15227835 tgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagctcaacaacaacagcagcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgctatatgccgagtta 15227934  T
Q  201 ctcccgactc 210  Q
    ||||||||||    
T  15227935 ctcccgactc 15227944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 24461011 - 24460802
Alignment:
Q  1 cgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24461011 cgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtattctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 24460912  T
Q  101 cattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttg 200  Q
    | | |  |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||     
T  24460911 cgtcgtccagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaatta 24460812  T
Q  201 ctcccgactc 210  Q
    ||||||||||    
T  24460811 ctcccgactc 24460802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 134; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 1900122 - 1900331
Alignment:
Q  1 cgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 100  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1900122 cgtcgtacccatatgcgccatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 1900221  T
Q  101 cattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttg 200  Q
    | | | |||||||| |||||||||||| |||| |||||| | ||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||     
T  1900222 cgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacagcaacaacatcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgctgtatgccgagtta 1900321  T
Q  201 ctcccgactc 210  Q
    ||||||||||    
T  1900322 ctcccgactc 1900331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 130; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 5 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 15285330 - 15285125
Alignment:
Q  5 gtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccatt 104  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| | | || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  15285330 gtacccatatgcgcaatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctaccatcgggtcaacctcaggtgcccgttaatgccatc 15285231  T
Q  105 gctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcc 204  Q
    | |||||||| |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||| ||||    
T  15285230 gttcagcaaatgcaacaacagccaccaactcaacaacaacagcagcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgctatatttcgagttactcc 15285131  T
Q  205 cgactc 210  Q
    ||||||    
T  15285130 cgactc 15285125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 4 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 14235931 - 14235722
Alignment:
Q  4 cgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccat 103  Q
    |||||| ||||  |||||||||||||| | | || || |||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  14235931 cgtaccagtatatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcatcagtaccctctaccatcgggtcacccataggtacccgttaatgccat 14235832  T
Q  104 tgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagca---acaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttg 200  Q
    ||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||| |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| ||    
T  14235831 tgctcagcaaatgcaacaacagccgccggctcagcaacaacagcagcaacaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagctg 14235732  T
Q  201 ctcccgactc 210  Q
    ||||||||||    
T  14235731 ctcccgactc 14235722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 17 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 15391725 - 15391536
Alignment:
Q  17 gcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccat---cgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaa 113  Q
    |||||||||||||| | | || || |||||||| ||||| ||||||||   |||||   |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  15391725 gcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagtatcc---gccatcgccgggtcaacctcaggtacccatcaatgccattgctcagcaa 15391629  T
Q  114 acgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgact 209  Q
    | ||| |||||||| |  ||||||||   ||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||| || || |||||||||||||||    
T  15391628 atgcagcaacagccgctggctcaaca---acagcagcaacaaaccagacctacctttcctccgataccaatgctgtacgccgagttgctcccgact 15391536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 6 - 209
Target Start/End: Original strand, 17013867 - 17014073
Alignment:
Q  6 tacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattg 105  Q
    ||||| |||||||  || ||||||| | | || ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  17013867 tacccatatgcgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaattg 17013966  T
Q  106 ctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagc---agcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgct 202  Q
    |||| || | | ||||||||   |||| |||||||| ||| |   | || |||||||||||||| || |||| |||||| ||| | ||||||||||||||    
T  17013967 ctcaacagatgaaacaacagttgccagttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgct 17014066  T
Q  203 cccgact 209  Q
     ||||||    
T  17014067 tccgact 17014073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 39 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 24592682 - 24592519
Alignment:
Q  39 tttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaac 138  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| || | | ||||||||   || | |||||    
T  24592682 tttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctcaacagatgaaacaacagttgccggttcaac 24592583  T
Q  139 aacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgct 202  Q
    ||| |||  | || |||||||||||||| || |||| |||||| ||| | ||||||||||||||    
T  24592582 aacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgct 24592519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 39 - 202
Target Start/End: Original strand, 14664918 - 14665084
Alignment:
Q  39 tttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaac 138  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| || | | ||||||||   |||| |||||    
T  14664918 tttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctcaacagatgaaacaacagttgccagttcaac 14665017  T
Q  139 aacgacagc---agcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgct 202  Q
    ||| ||| |   | || |||||||||||||| || |||| |||||| ||| | ||||||||||||||    
T  14665018 aacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgct 14665084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 185
Target Start/End: Original strand, 24112547 - 24112711
Alignment:
Q  21 tactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaac 120  Q
    |||||||||| | | || || ||||| || ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| || || |||||||| ||||| ||   |||||    
T  24112547 tactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccaacctcaggtccctgtcaatgccatcgctcaacaggtgcaac 24112646  T
Q  121 aacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatg 185  Q
    | || || |||| |||||| |  ||||||||| | |||||||| || |||||||  |||||||||    
T  24112647 atcaaccgccagttcaacagcagcagcagcaatatgctagaccaacttttcctcctataccaatg 24112711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 34189346 - 34189182
Alignment:
Q  21 tactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaac 120  Q
    |||||||||| | | || || ||||| || ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| || || |||||||| ||||| ||   |||||    
T  34189346 tactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccaacctcaggtccctgtcaatgccatcgctcaacaggtgcaac 34189247  T
Q  121 aacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatg 185  Q
    | || || |||| |||||| |  ||||||||| | |||||||| || |||||||  |||||||||    
T  34189246 atcaaccgccagttcaacagcagcagcagcaatatgctagaccaacttttcctcctataccaatg 34189182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 21 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 14763693 - 14763509
Alignment:
Q  21 tactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaac 120  Q
    |||||||||| | | || || ||||| || ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| || || |||||||| ||||| ||   |||||    
T  14763693 tactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccaacctcaggttcctgtcaatgccatcgctcaacaggtgcaac 14763594  T
Q  121 aacagcctccagctcaacaacgacagc---agcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgct 202  Q
    | || |  || | |||||||| ||| |   | || |||||||||||||| || |||| |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  14763593 atcaactgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgct 14763509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 45 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 27163682 - 27163522
Alignment:
Q  45 ccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgac 144  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| || | | ||||||||   || | |||||||| ||    
T  27163682 ccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgctcaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaac 27163583  T
Q  145 agc---agcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgct 202  Q
    | |   | || |||||||| ||||| || |||| |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  27163582 aacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgct 27163522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 45 - 202
Target Start/End: Original strand, 5005776 - 5005939
Alignment:
Q  45 ccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgac 144  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || || | | ||||||||   || | |||||||| ||    
T  5005776 ccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaac 5005875  T
Q  145 agcagcaa------caagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgct 202  Q
    | || |||      |||||||| ||||| || |||| |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  5005876 aacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgct 5005939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 106
Target Start/End: Original strand, 6569753 - 6569820
Alignment:
Q  39 tttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgc 106  Q
    ||||| ||||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  6569753 tttccgccattttaccatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaattgc 6569820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 51 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 36344871 - 36344748
Alignment:
Q  51 tatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagc 150  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| || || |||||||| ||||| ||   |||||| || || |||| |||||| |  |||||||    
T  36344871 tatcatcagtatcctttgccaccgggccaacctcaggttcctgtcaatgccatcgctcaacaggtgcaacatcaaccgccagttcaacagcagcagcagc 36344772  T
Q  151 aacaagctagacctacctttcctc 174  Q
    || |  ||||||| || |||||||    
T  36344771 aatatactagaccaacttttcctc 36344748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 109
Target Start/End: Original strand, 54833272 - 54833360
Alignment:
Q  21 tactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctca 109  Q
    |||||||||| | | || || ||||| || ||||||||||| ||||| ||| |||| ||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  54833272 tactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttaccaccgggccaacctcaggttcctgtcaatgccattgctca 54833360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 51 - 109
Target Start/End: Original strand, 21969613 - 21969671
Alignment:
Q  51 tatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctca 109  Q
    ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||    
T  21969613 tatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgctca 21969671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 154; Significance: 7e-82; HSPs: 43)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 17994231 - 17994022
Alignment:
Q  1 cgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17994231 cgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 17994132  T
Q  101 cattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttg 200  Q
    | | |  |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||     
T  17994131 cgtcgtccagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaatta 17994032  T
Q  201 ctcccgactc 210  Q
    ||||||||||    
T  17994031 ctcccgactc 17994022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 146; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 4625755 - 4625964
Alignment:
Q  1 cgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  4625755 cgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattatatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgt 4625854  T
Q  101 cattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttg 200  Q
    | | |  |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||     
T  4625855 cgtcgtccagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaatta 4625954  T
Q  201 ctcccgactc 210  Q
    ||||||||||    
T  4625955 ctcccgactc 4625964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 146; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 5652198 - 5652407
Alignment:
Q  1 cgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5652198 cgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcgtttgcaatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 5652297  T
Q  101 cattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttg 200  Q
    | | |  |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||     
T  5652298 cgtcgtccagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaatta 5652397  T
Q  201 ctcccgactc 210  Q
    ||||||||||    
T  5652398 ctcccgactc 5652407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 134; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 16626953 - 16626744
Alignment:
Q  1 cgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16626953 cgtcgtacccgtatgcacaatactctcagcatcccttctttccaccgttctatcatcagtatcctctaccatcgggtcaacctccggtacccgttaatgc 16626854  T
Q  101 cattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttg 200  Q
    ||| | |||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||     
T  16626853 catcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagctcaacaacaacagcagcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgatatatgtcgagtta 16626754  T
Q  201 ctcccgactc 210  Q
    ||||| ||||    
T  16626753 ctccctactc 16626744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 3 - 210
Target Start/End: Original strand, 18530207 - 18530408
Alignment:
Q  3 tcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgcca 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | | || ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||     
T  18530207 tcgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctaccatcgggtcaacctcaagtgcccgttaatgccg 18530306  T
Q  103 ttgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgct 202  Q
    | | |||||||| |||||||||||| ||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||| ||    
T  18530307 tcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagctca------acagcagcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgctgagttact 18530400  T
Q  203 cccgactc 210  Q
    || |||||    
T  18530401 cctgactc 18530408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 76; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 135 - 210
Target Start/End: Original strand, 32292697 - 32292772
Alignment:
Q  135 caacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactc 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32292697 caacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactc 32292772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 15893156 - 15892945
Alignment:
Q  1 cgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 100  Q
    |||||||||| |||||||  |||||||||| | | || ||||| || |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15893156 cgtcgtacccatatgcgccgtactctcagcatcctttctttccgcccttctatcatcagtaccctttgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgc 15893057  T
Q  101 cattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagct---caacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgag 197  Q
     |||||||| || | | ||||||||   || | |   ||||||| ||| || ||||||||||||||||| || |||| |||||||||| | |||||||||    
T  15893056 aattgctcaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacaacatcaacaagctagacctactttccctccgataccaatgttgtatgctgag 15892957  T
Q  198 ttgctcccgact 209  Q
    ||||| ||||||    
T  15892956 ttgcttccgact 15892945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 8301714 - 8301506
Alignment:
Q  1 cgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 100  Q
    |||||||| | |||||||  || ||||||| | | || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8301714 cgtcgtactcatatgcgccgtattctcagcatcctttctttccgccattctatcatcagtaccctttgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgc 8301615  T
Q  101 cattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttg 200  Q
     |||||||| || | | ||||||||   |||| |||||||| |||  | || |||||||||||||| || |||| |||||| ||| | ||||||||||||    
T  8301614 aattgctcaacagatgaaacaacagttgccagttcaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttg 8301515  T
Q  201 ctcccgact 209  Q
    || ||||||    
T  8301514 cttccgact 8301506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 135 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 31034430 - 31034355
Alignment:
Q  135 caacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactc 210  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31034430 caacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactc 31034355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 5713035 - 5713239
Alignment:
Q  1 cgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||    
T  5713035 cgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgc 5713134  T
Q  101 cattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagc---agcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgag 197  Q
     || || || || | | ||||||||   || | |||||||| ||| |   | || ||||| |||||||| || |||| |||||| ||| |||||||||||    
T  5713135 aatcgcccaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagccagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgag 5713234  T
Q  198 ttgct 202  Q
    |||||    
T  5713235 ttgct 5713239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 5723945 - 5724149
Alignment:
Q  1 cgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||    
T  5723945 cgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgc 5724044  T
Q  101 cattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagc---agcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgag 197  Q
     || || || || | | ||||||||   || | |||||||| ||| |   | || ||||| |||||||| || |||| |||||| ||| |||||||||||    
T  5724045 aatcgcccaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagccagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgag 5724144  T
Q  198 ttgct 202  Q
    |||||    
T  5724145 ttgct 5724149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 5757532 - 5757328
Alignment:
Q  1 cgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||    
T  5757532 cgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgc 5757433  T
Q  101 cattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagc---agcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgag 197  Q
     || || || || | | ||||||||   || | |||||||| ||| |   | || ||||| |||||||| || |||| |||||| ||| |||||||||||    
T  5757432 aatcgcccaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagccagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgag 5757333  T
Q  198 ttgct 202  Q
    |||||    
T  5757332 ttgct 5757328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 5768423 - 5768219
Alignment:
Q  1 cgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||    
T  5768423 cgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgc 5768324  T
Q  101 cattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagc---agcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgag 197  Q
     || || || || | | ||||||||   || | |||||||| ||| |   | || ||||| |||||||| || |||| |||||| ||| |||||||||||    
T  5768323 aatcgcccaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagccagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgag 5768224  T
Q  198 ttgct 202  Q
    |||||    
T  5768223 ttgct 5768219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 39 - 209
Target Start/End: Original strand, 18051108 - 18051281
Alignment:
Q  39 tttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaac 138  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| || | | ||||||||   |||| |||||    
T  18051108 tttccgccattctatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctcaacagatgaaacaacagttgccagttcaac 18051207  T
Q  139 aacgacagc---agcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgact 209  Q
    ||| ||| |   | || |||||||||||||| || |||| |||||| ||| | |||||||||||||| ||||||    
T  18051208 aacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgact 18051281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 39 - 202
Target Start/End: Original strand, 35880612 - 35880778
Alignment:
Q  39 tttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaac 138  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| || | | ||||||||   |||| |||||    
T  35880612 tttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctcaacagatgaaacaacagttgccagttcaac 35880711  T
Q  139 aacgacagc---agcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgct 202  Q
    ||| ||| |   | || |||||||||||||| || |||| |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  35880712 aacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgct 35880778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 39 - 202
Target Start/End: Original strand, 4721477 - 4721643
Alignment:
Q  39 tttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaac 138  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |   ||||||||   |||| |||||    
T  4721477 tttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgctcaacagataaaacaacagttgccagttcaac 4721576  T
Q  139 aacgacagc---agcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgct 202  Q
    ||| ||| |   | || |||||||||||||| || |||| |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  4721577 aacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgct 4721643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 39 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 4797065 - 4796899
Alignment:
Q  39 tttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaac 138  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || | | ||||||||   || | |||||    
T  4797065 tttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaattgctcaacagatgaaacaacagttgccggttcaac 4796966  T
Q  139 aacgacagc---agcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgct 202  Q
    ||| ||| |   | || |||||||||||||| || |||| |||||| ||| | ||||||||||||||    
T  4796965 aacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgct 4796899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 8295783 - 8295991
Alignment:
Q  1 cgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 100  Q
    |||| ||||| |||||||  || ||||||| | | || ||||| ||||| ||||||||||| ||| || || ||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  8295783 cgtcatacccatatgcgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgtcaccgggtcaacctcaagtacctgttaatgc 8295882  T
Q  101 cattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttg 200  Q
     || ||||| || | | ||||||||   |||  |||||||| |||  | || |||||||||||||| || |||| |||||| ||| | ||||||||||||    
T  8295883 aatcgctcaacagatgaaacaacagttgccaattcaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttg 8295982  T
Q  201 ctcccgact 209  Q
    || ||||||    
T  8295983 cttccgact 8295991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 45 - 202
Target Start/End: Original strand, 6192168 - 6192328
Alignment:
Q  45 ccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgac 144  Q
    ||||| |||||| |||| ||| ||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || | | ||||||||   |||| |||||||| ||    
T  6192168 ccattttatcattagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgctcaacagatgaaacaacagttgccagttcaacaacaac 6192267  T
Q  145 agc---agcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgct 202  Q
    | |   | || |||||||||||||| || |||| |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  6192268 aacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgct 6192328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 39 - 202
Target Start/End: Original strand, 7073058 - 7073224
Alignment:
Q  39 tttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaac 138  Q
    ||||| ||||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| || | | ||||||||   || | |||||    
T  7073058 tttccgccattttaccatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgctcaacagatgaaacaacagttgccggttcaac 7073157  T
Q  139 aacgacagcag---caacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgct 202  Q
    ||| ||| ||    || |||||||||||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  7073158 aacaacaacaaaatcagcaagctagacctacttttcctccgataccgatgttatatgctgagttgct 7073224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 208
Target Start/End: Original strand, 18330543 - 18330687
Alignment:
Q  67 tgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcag---caacaagctagacc 163  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| || | | ||||||||   |||| |||||||| ||| ||    || |||||||||||    
T  18330543 tgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctcaacagatgaaacaacagttgccagttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacc 18330642  T
Q  164 tacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgac 208  Q
    ||| || |||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||    
T  18330643 tactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgac 18330687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 22388025 - 22387824
Alignment:
Q  1 cgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 100  Q
    |||| ||||| ||||| | ||||||||||| | | || || ||| | || ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| || || |||||    
T  22388025 cgtcctacccttatgcaccatactctcagcatccgttcttcccatcgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccaacctcaggtccctgtcaatgc 22387926  T
Q  101 cattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttg 200  Q
    ||| ||||| ||   |||||| || || |||| |||||| |  ||||| ||| | |||||||| || |||||||  ||||||||| | ||||| ||||||    
T  22387925 catcgctcaacaggtgcaacatcaaccgccagttcaacagcagcagcaacaatatgctagaccgacttttcctcctataccaatgttgtatgcagagttg 22387826  T
Q  201 ct 202  Q
    ||    
T  22387825 ct 22387824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 42 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 29149164 - 29149001
Alignment:
Q  42 ccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaac 141  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| || | | ||||||||   || | ||||||||    
T  29149164 ccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggtcaacctcaagtgcccgttaatgcaatcgctcaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaac 29149065  T
Q  142 gacagc---agcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgct 202  Q
     ||| |   | || |||||||||||||| || |||| |||||| ||| | ||||||||||||||    
T  29149064 aacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgct 29149001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 185
Target Start/End: Original strand, 4893041 - 4893205
Alignment:
Q  21 tactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaac 120  Q
    |||||||||| | | || || ||||| || ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| || || |||||||| ||||| ||   |||||    
T  4893041 tactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccaacctcaggtccctgtcaatgccatcgctcaacaggtgcaac 4893140  T
Q  121 aacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatg 185  Q
    | || || |||| |||||| |  ||||||||| | |||||||| || |||||||  |||||||||    
T  4893141 atcaaccgccagttcaacagcagcagcagcaatatgctagaccaacttttcctcctataccaatg 4893205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 185
Target Start/End: Original strand, 32438985 - 32439149
Alignment:
Q  21 tactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaac 120  Q
    |||||||||| | | || || ||||| || ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| || || |||||||| ||||| ||   |||||    
T  32438985 tactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccaacctcaggtccctgtcaatgccatcgctcaacaggtgcaac 32439084  T
Q  121 aacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatg 185  Q
    | || || |||| |||||| |  ||||||||| | |||||||| || |||||||  |||||||||    
T  32439085 atcaaccgccagttcaacagcagcagcagcaatatgctagaccaacttttcctcctataccaatg 32439149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 45 - 202
Target Start/End: Original strand, 7996414 - 7996574
Alignment:
Q  45 ccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgac 144  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| || | | ||||||||   || | |||||||| ||    
T  7996414 ccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgctcaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaac 7996513  T
Q  145 agc---agcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgct 202  Q
    | |   | || |||||||| ||||| || |||| |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  7996514 aacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgct 7996574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 45 - 202
Target Start/End: Original strand, 10642922 - 10643082
Alignment:
Q  45 ccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgac 144  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| || | | ||||||||   || | |||||||| ||    
T  10642922 ccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgctcaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaac 10643021  T
Q  145 agc---agcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgct 202  Q
    | |   | || |||||||| ||||| || |||| |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  10643022 aacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgct 10643082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 39 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 15741494 - 15741424
Alignment:
Q  39 tttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctca 109  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || |||||    
T  15741494 tttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctca 15741424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 21 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 18277482 - 18277298
Alignment:
Q  21 tactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaac 120  Q
    |||||||||| | | || || ||||| || ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| || || |||||||| ||||| ||   |||||    
T  18277482 tactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccaacctcaggttcctgtcaatgccatcgctcaacaggtgcaac 18277383  T
Q  121 aacagcctccagctcaacaacgacagc---agcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgct 202  Q
    | || |  || | |||||||| ||| |   | || |||||||||||||| || |||| |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  18277382 atcaactgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgct 18277298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 21 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 18292783 - 18292599
Alignment:
Q  21 tactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaac 120  Q
    |||||||||| | | || || ||||| || ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| || || |||||||| ||||| ||   |||||    
T  18292783 tactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccaacctcaggttcctgtcaatgccatcgctcaacaggtgcaac 18292684  T
Q  121 aacagcctccagctcaacaacgacagc---agcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgct 202  Q
    | || |  || | |||||||| ||| |   | || |||||||||||||| || |||| |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  18292683 atcaactgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgct 18292599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 21 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 18308084 - 18307900
Alignment:
Q  21 tactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaac 120  Q
    |||||||||| | | || || ||||| || ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| || || |||||||| ||||| ||   |||||    
T  18308084 tactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccaacctcaggttcctgtcaatgccatcgctcaacaggtgcaac 18307985  T
Q  121 aacagcctccagctcaacaacgacagc---agcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgct 202  Q
    | || |  || | |||||||| ||| |   | || |||||||||||||| || |||| |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  18307984 atcaactgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgct 18307900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 42 - 202
Target Start/End: Original strand, 47023302 - 47023465
Alignment:
Q  42 ccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaac 141  Q
    ||||| || ||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || | | ||||||||   || | ||||||||    
T  47023302 ccaccgttttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaggtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaac 47023401  T
Q  142 gacagc---agcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgct 202  Q
     ||| |   | || |||||||| ||||| || |||| |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  47023402 aacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgct 47023465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Original strand, 8211549 - 8211657
Alignment:
Q  1 cgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 100  Q
    |||| ||||| |||||||  |||||||||| | | || || ||||| || ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| || || |||||    
T  8211549 cgtcatacccatatgcgccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccaacctcaggttcctgtcaatgc 8211648  T
Q  101 cattgctca 109  Q
    ||| |||||    
T  8211649 catcgctca 8211657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 45 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 28116363 - 28116200
Alignment:
Q  45 ccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgac 144  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || || | | ||||||||   || | |||||||| ||    
T  28116363 ccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaac 28116264  T
Q  145 agcagcaa------caagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgct 202  Q
    | || |||      |||||||||||||| || |||| |||||| ||| |||||||||| |||||    
T  28116263 aacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgct 28116200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 39 - 109
Target Start/End: Original strand, 10395982 - 10396052
Alignment:
Q  39 tttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctca 109  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| || || |||||||| |||||    
T  10395982 tttccgccattttatcatcagtaccctttgccaccgggccaacctcaggttcctgtcaatgccatcgctca 10396052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 39 - 109
Target Start/End: Original strand, 20065892 - 20065962
Alignment:
Q  39 tttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctca 109  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| || || |||||||| |||||    
T  20065892 tttccgccattttatcatcagtaccctttgccaccgggccaacctcaggttcctgtcaatgccatcgctca 20065962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 21 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 29665415 - 29665330
Alignment:
Q  21 tactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgc 106  Q
    |||||||||| | | || || ||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||| |||||    
T  29665415 tactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgc 29665330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 42 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 4347093 - 4346950
Alignment:
Q  42 ccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaac 141  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||||||| | || ||||||||||| || || |||||||| ||||| ||    ||||| || || |||| |||||| |    
T  4347093 ccaccgttttatcatcagtaccctttgccacccggccaacctcaggttcctgtcaatgccatcgctcaacaggtacaacatcaaccgccagttcaacagc 4346994  T
Q  142 gacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatg 185  Q
      ||||||||| | |||||||| || |||||||  |||||||||    
T  4346993 agcagcagcaatatgctagaccaacttttcctcctataccaatg 4346950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 42 - 109
Target Start/End: Original strand, 5466834 - 5466901
Alignment:
Q  42 ccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctca 109  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||| | || ||||||||||| || || |||||||| |||||    
T  5466834 ccaccattttatcatcagtaccctttgccacccggccaacctcaggttcctgtcaatgccatcgctca 5466901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 42 - 185
Target Start/End: Original strand, 28021127 - 28021270
Alignment:
Q  42 ccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaac 141  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||||||| | || ||||||||||| || || |||||||| ||||| ||    ||||| || || |||| |||||| |    
T  28021127 ccaccgttttatcatcagtaccctttgccacccggccaacctcaggttcctgtcaatgccatcgctcaacaggtacaacatcaaccgccagttcaacagc 28021226  T
Q  142 gacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatg 185  Q
      ||||||||| | |||||||| || |||||||  |||||||||    
T  28021227 agcagcagcaatatgctagaccaacttttcctcctataccaatg 28021270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 42 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 5596775 - 5596705
Alignment:
Q  42 ccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctcagca 112  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||||||| | || ||||||||||| || || |||||||| ||||||||    
T  5596775 ccaccgttttatcatcagtaccctttgccacccggccaacctcaggttcctgtcaatgccatcgctcagca 5596705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 153 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 15741389 - 15741340
Alignment:
Q  153 caagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgct 202  Q
    |||||||||||||| || |||| |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  15741389 caagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgct 15741340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 42 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 11110770 - 11110706
Alignment:
Q  42 ccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgc 106  Q
    ||||| || ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| || ||||| ||||| |||||    
T  11110770 ccaccgttttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgc 11110706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0260 (Bit Score: 138; Significance: 3e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0260
Description:

Target: scaffold0260; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 3064 - 2855
Alignment:
Q  1 cgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3064 cgtcgtacccgtacgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgtcaatgc 2965  T
Q  101 cattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttg 200  Q
    | | | ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |     
T  2964 cgtcgttcaacaaatgcaacaacagcctccagctcaacaacaacagcatcagcaagctagacctacctttcctccgataccaatgctatatgccgagcta 2865  T
Q  201 ctcccgactc 210  Q
    ||||| ||||    
T  2864 ctcccaactc 2855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 138; Significance: 3e-72; HSPs: 6)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 20340741 - 20340532
Alignment:
Q  1 cgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20340741 cgtcgtacccgtacgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgtcaatgc 20340642  T
Q  101 cattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttg 200  Q
    | | | ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |     
T  20340641 cgtcgttcaacaaatgcaacaacagcctccagctcaacaacaacagcatcagcaagctagacctacctttcctccgataccaatgctatatgccgagcta 20340542  T
Q  201 ctcccgactc 210  Q
    ||||| ||||    
T  20340541 ctcccaactc 20340532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 4 - 126
Target Start/End: Original strand, 20460957 - 20461079
Alignment:
Q  4 cgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccat 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | | || |||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20460957 cgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcaatatcctctaccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccat 20461056  T
Q  104 tgctcagcaaacgcaacaacagc 126  Q
     | |||||||| |||||||||||    
T  20461057 cgttcagcaaatgcaacaacagc 20461079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 17 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 16208418 - 16208228
Alignment:
Q  17 gcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacg 116  Q
    |||||||||||||| | | || || |||||||||||||| ||||||||    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| | |||||||| |    
T  16208418 gcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccaccaccatcgggtcagcctcaggtacccattaatgccatcgttcagcaaatg 16208319  T
Q  117 caacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactc 210  Q
    ||||||||||| |||| ||||||   ||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||| | ||||| ||||||||||    
T  16208318 caacaacagccaccagttcaaca---acaacatcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtataccgagttactcccgactc 16208228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 76; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 135 - 210
Target Start/End: Original strand, 28151845 - 28151920
Alignment:
Q  135 caacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactc 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28151845 caacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactc 28151920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 147 - 210
Target Start/End: Original strand, 20461076 - 20461139
Alignment:
Q  147 cagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactc 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  20461076 cagcaacaagctagacctacctttcctccgatactaatgctatatgccgagttactcccgactc 20461139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 45 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 41793673 - 41793513
Alignment:
Q  45 ccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgac 144  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||  || | | ||||||||   || | |||||||| ||    
T  41793673 ccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgctccacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaac 41793574  T
Q  145 agc---agcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgct 202  Q
    | |   | || |||||||| ||||| || |||| |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  41793573 aacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgct 41793513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 86; Significance: 3e-41; HSPs: 3)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Original strand, 20259 - 20384
Alignment:
Q  1 cgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 100  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||| | |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20259 cgtcgtacccatatgcgccatactctcagcatcccttctttccatcattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 20358  T
Q  101 cattgctcagcaaacgcaacaacagc 126  Q
    | | | |||||||| |||||||||||    
T  20359 cgtcgttcagcaaatgcaacaacagc 20384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 143 - 210
Target Start/End: Original strand, 20380 - 20447
Alignment:
Q  143 acagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactc 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| | ||||||||||| ||||||||||    
T  20380 acagcagcaacaagctagacctacctttcccccgataccaatgttgtatgctgagttactcccgactc 20447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #3
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Original strand, 30300 - 30486
Alignment:
Q  1 cgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 100  Q
    |||| ||||| |||||||  || ||||||| | |||| ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30300 cgtcatacccatatgcgccgtattctcagcatcccttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgc 30399  T
Q  101 cattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagc---agcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatg 185  Q
     || ||||| || | | ||||||||   |||| |||||||| ||| |   | || ||||||||||||| ||||||||  |||||||||    
T  30400 aatcgctcaacagatgaaacaacagttgccagttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagaccta-ctttcctcctataccaatg 30486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 17 - 209
Target Start/End: Original strand, 21430 - 21619
Alignment:
Q  17 gcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacg 116  Q
    |||||||||||||| | | || || |||||||||||||| ||||||||    ||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  21430 gcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccaccaccgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatg 21529  T
Q  117 caacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgact 209  Q
    ||||||||||  |  ||| ||||    ||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  21530 caacaacagctgctggcttaaca---gcagcaacaacaaaccagacctacctttcctccgataccaatgctatatgccgagctgctcccgact 21619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 68; Significance: 1e-30; HSPs: 3)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 3 - 209
Target Start/End: Original strand, 29612 - 29821
Alignment:
Q  3 tcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgcca 102  Q
    ||||||||||||||||  || ||||||| | | || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  29612 tcgtacccgtatgcgccgtattctcagcatcctttctttccgccattctatcatcagtaccctttgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaa 29711  T
Q  103 ttgctcagcaaacgcaacaacagcctccagct---caacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagtt 199  Q
    | ||||| || | | ||||||||   || | |   ||||||| ||| || ||||||||||||||||| || |||| |||||| ||| | |||||||||||    
T  29712 tagctcaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacaacatcaacaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagtt 29811  T
Q  200 gctcccgact 209  Q
    ||| ||||||    
T  29812 gcttccgact 29821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 4 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 40475 - 40267
Alignment:
Q  4 cgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccat 103  Q
    ||||||| |||||||  || ||||||| | | || ||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  40475 cgtacccatatgcgccgtattctcagcatcctttctttctgccattctatcatcagtaccctttgccaccgggtcaacctcaggtacccgtaaatgcaat 40376  T
Q  104 tgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagc---agcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttg 200  Q
    |||||| || | | ||||||||   || | |||||||| ||| |   | || |||||||||||||| || |||| |||||| ||| | ||||||||||||    
T  40375 tgctcaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttg 40276  T
Q  201 ctcccgact 209  Q
    || ||||||    
T  40275 cttccgact 40267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #3
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 39 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 47356 - 47183
Alignment:
Q  39 tttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaac 138  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| || | | ||||||||   |||| |||||    
T  47356 tttccgccattttatcatcagtaccccctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctcaacagatgaaacaacagttgccagttcaac 47257  T
Q  139 aacgacagc---agcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgact 209  Q
    ||| ||| |   | || |||||||||||||| || |||| |||||| ||| | |||||||||||||| ||||||    
T  47256 aacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgact 47183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0558 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0558
Description:

Target: scaffold0558; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 123 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 312 - 225
Alignment:
Q  123 cagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactc 210  Q
    ||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  312 cagccaccagctcaacagcaacagcagcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactc 225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 54; Significance: 3e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 27139 - 27350
Alignment:
Q  1 cgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 100  Q
    |||| ||||| |||||||  || ||||||| | | || ||||| ||||| ||||||||||| ||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27139 cgtcatacccatatgcgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctaccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgc 27238  T
Q  101 cattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagc---agcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgag 197  Q
     || ||||| || | | ||||||||   |||| |||||||| ||| |   | || |||||||||||||| || |||| |||||| ||| |||||||||||    
T  27239 aatcgctcaacagatgaaacaacagttgccagttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgag 27338  T
Q  198 ttgctcccgact 209  Q
    ||||| ||||||    
T  27339 ttgcttccgact 27350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 45; Significance: 8e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 39 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 501 - 343
Alignment:
Q  39 tttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaacgcaacaacagcctccagctcaac 138  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || | | ||||||||   || | |||||    
T  501 tttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaattgctcaacagatgaaacaacagttgccggttcaac 402  T
Q  139 aacgacagc---agcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgct 194  Q
    ||| ||| |   | || |||||||||||||| || |||| |||||| ||| ||||||||    
T  401 aacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgct 343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 42 - 109
Target Start/End: Original strand, 8120 - 8187
Alignment:
Q  42 ccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctca 109  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||| | || ||||||||||| || || |||||||| |||||    
T  8120 ccaccgttttatcatcagtatcctttgccaccaggccaacctcaggttcctgtcaatgccatcgctca 8187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University